Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018648 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP), complete genome | 4 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,DinG,RT,WYL | 1 | 1 | 9 | 0 |
NC_018653 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence | 2 crisprs | NA | 0 | 5 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018648_1 | 592472-592577 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018648_1
|
1 spacers
spacers of NC_018648_1
>1.1|592496|58|NC_018648|CRISPRCasFinder TTTGAAAAACTGTAAAATTACTATTGAAATTATCGTTTAGTTAATCTATAATATAATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018648_1
The CRISPR arrays of NC_018648_1 >merge|NC_018648|1|592472-592577|CRISPRCasFinder AAATTAACTAAATGAAAATTAAATTTTGAAAAACTGTAAAATTACTATTGAAATTATCGTTTAGTTAATCTATAATATAATAAAATTAACTAAATGAAAATAAAAT >NC_018648|1|1|592472-592577|CRISPRCasFinder AAATTAACTAAATGAAAATTAAAT TTTGAAAAACTGTAAAATTACTATTGAAATTATCGTTTAGTTAATCTATAATATAATA AAATTAACTAAATGAAAATAAAAT
>NC_018648.1|WP_012423607.1|592045_592420_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSKFPERLKELRESKDLLSKDFAKIMNVEPATITNWEKGNRFPKDDVLIKIADYFDCSIDYILGRTDNPCAKIYLGKLHDKTVELEIDKDYPYKLTPKDVDNMLKQLDAVGLDIEKLINNSKNK >NC_018648.1|WP_012425763.1|591687_591861_-|hypothetical-protein MIWNNVLKITFGNKIVYEKSLYKKSICIQNTKTNFNEKNTSKCKTLNMEVLKHARKC >NC_018648.1|WP_012425469.1|590546_591704_-|site-specific-integrase MQGSVRKRGNKWYYYFDVAKSDGKRKKIERAGGNTKKEALEALRKALSEYDNVGTIITESNISVSDYFDYWFNEYVLINCKYSTQVSYKRLIKNHLKPSLGIYQLKKITSSRLQELINLKYRNGFSKNYLGNLYGVLSGAFKYAVYPSNFIKENPMTFVKMPKYNTKLINNPDDLKIITLEDYNNILKRFPYGSNMYIPLQISFNTGLRAAEVMSLTWDCIDFENQTLRVEKILYRNEFKKWVFGSPKTHSSYRTIKIGNTLLSLLKKFHKDQKENKLRYGPFYVKHDYDFVCLKENGELLTTDSLKYLSKVVNYELGIDFKFHSLRHTHATMLLEAGANIKDIQQRLGHSKLATTMDVYSHVTKKMSQDSVRLFEEAIKKLPPS >NC_018648.1|WP_012422699.1|589125_590478_+|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MKRGSEVKVKIEKTQFPSTGIGYLEDKPVYVKNTYPGQVVTGRVKKNRKEYAELKLTGVEERADYEIDAICPHFGSCGGCSSQTLSYEKQLQVLEDEIKDLFKEADVTTGEFLGVLGSSEQWEYRNKMEFTFGDEEKGGDLSIGMHMRGKSFGIMTVDHCKIVDEDYRRIIRLTADYFGKQDLPYYRVMKREGYLRHLVIRKAQNTGEILVNLVTTTQIDFDLSEYVELLKSQDYKGTLVSILHTENNSFSDAVIPEKVNVLYGRDYIQEKLLGLDFKISPFSFFQTNTKGAESLYSLVRDFMGSSENKVVFDLYCGTGTIGQIVAPNAKKVVGIELIEEAVEAAKENAKLNGLNNCEFLAGDVAEIIKTVKDKPDIIILDPPRSGVHPKALDYVIKFNAPEIVYVSCNPKTLVTDLKVLIERGYKIIQTQVKDMFPNTPHAETIVKLIK >NC_018648.1|WP_012423953.1|588731_589109_+|RDD-family-protein MSKEENNINEKEDTILNDTKAKEETNNETKELLMGETNENNSNEEEKPSLLKKIFASVIDQLVTISISGIALIIFDFIIGFMGYKVSMPIGILIIFYFIVNALYIPLMEKTKLRKSIGRKVINIK >NC_018648.1|WP_012424544.1|588001_588706_+|hypothetical-protein MSKKICTIIMTLMITTSLIGCISIDSNKAEDKNNASTATEVKNSDENLQGSWAEDYSLEKTKGYFKDYLSKMEKVTEELGMKYSKEDVVKENDGSTISVNSIYFDNEKPDPNKIESMYFGMKIFGEDLSSGEIELKLSLNFDSAEVIKSGNFDLGNTSFSKYIAAFTGQSSRDYSEINKKIIDGLKSEKAEGIIENSIDGLKEEIRFNKNYIVYKLSTKTYDFKNPNPTLENNN >NC_018648.1|WP_012425312.1|587198_587819_+|helix-hairpin-helix-domain-containing-protein MINKANKKIGIIAILVIILVVCLSTYIKSGKDKLVKNDNTSIFVEEENPNINEDEKIEKLKDKNIVVEIKGEVKKPDVYQLNDESIVKDVIEIAGGLTEEADISNINRAQKLKNHELIYIHNKSEVKDNVSYAQNTVTTSNNSGKININCAQLEELKNLNGIGEAKAKRIIEYRENIGAFNSIEDIKNIDGIGEKSFEKLKDQIDV >NC_018648.1|WP_041712129.1|585662_586982_-|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MKSHLKTLIFFLFIFLVSSINVMAVSSPPEINAEGSVLMDASTGEILFSKNPDKVLEPASTTKVMTAILTLENCDLNEEVVVTEDFTKIDGTTIGLLKGDIVTVKDLLLGLLLESGNDAANALACHVSSSIDKFAVLMNKKATEIGAVNTHFKNPSGLPDPEHLTTAHDLALIMNEAIKNDKFLELSKVMTYEIPIKNDSSRTIWINNKNHMINKNSMYYYQYTLTGKNGYTTKSNHTYTVAAENNGHILVASYLNALDKDKNFEDMRTVFNYGFNNFYFSNIYKKGQEIDSIKLHNGLTVPLIASKDVNCVVPNEDKDKLNTYIKFENKNLNRLSFNEGDVILKGTVYLNDKELCKLDLCAGISRNYSIKEDIYSFIEKNKRNLIIGAIISGVTLLIILTLAIEYNKKKNRKKRLLEITTSIPKIQDDQLKKRRRRQD >NC_018648.1|WP_012424742.1|584752_585649_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MSILQDKVSNIDGKIKIREYLKEKLDLSTRLIRSASKDQRIYVNNSAVRMNYMIKNGDIIKIDLNRNESQNINPEKIDLDIVYEDEDVLVINKQPFIIVHPTKNFQSGTLANGILYYFQETNQNCIVRLVSRLDMNTSGLIIIAKNQFSHSRLSKDMKEKLQKRYLAIVHGNLEEKEGTIDLPIYKPEGIEYGSMRVVDERGQRSITHYKVIESFEGGDLVECLLETGRTHQIRVHLSHLGHPIYGDELYGVGAEENLIKRQALHAYGLNFASPRSLKELSLRAELPDDMKELLEKIK >NC_018648.1|WP_012425670.1|583432_584728_+|LCP-family-protein MGKKRIKRSKRSNKSNKSNKNKTENIKMKNLLEEGILLILALVITFTIVVIGSGFLFLGKINKNDMIEPNKVSMSKPVNILLLGTDIGDPSQPNNKAIKRTDTIMVLNYNPDNKNLQVVSIPRDTLIDVNGRNLKINSAYAIGGEKRVKSEVEKLLNISVNYIAKIDYNAFREFIDAIGGIKMQIERNMIYDDEGQNLHINFKKGEVVKLDGKKAEEFFRWRKNNDGSGFANGDLDRIENQQKFMSKVIEKCTSPMIIFKIPNIIKALGDNIDTNMPPFKVISYGLKFARINSEKIDMKIAQGTPKDINGESFLVFDKNLNKDIITSLSSTGKGTEDVSKSDITIKVFNGTKITGLAATLRDELTKVGYTRVDVGNIPERNESSILTNNENIAGKVKSSIGISKIEKKPDKPEYKDYDVVIILGKDFKKFE >NC_018648.1|WP_012423892.1|592619_592808_+|DUF739-family-protein MYSRLKGLMVENSITQQNLAKILDISISTLNFKINGKSDFTIMEAKKVSRILNKSIEEVFNI >NC_018648.1|WP_012423366.1|592859_593069_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTRVLKTKEFRELKNLTVSKLSYKSGVAIGYITELENGKYKNPSLQIICKLSKALNITPNDLIDKNLWN >NC_018648.1|WP_012423488.1|593085_593307_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEAVLYTVSEAAELLKINRNSVYDLLKHNVIKGLKLGSLKITRNELLKFLEENNGKDLSNLKEIKELNFDKVD >NC_018648.1|WP_079991382.1|593384_594017_+|phage-replisome-organizer-N-terminal-domain-containing-protein MSDVKWIKITTNMFEDEKIRLIDAMPERDTIHYIWIRLLVQAGKNNANGFIFLSESIPYTDEMLSTIFCRPLTSIRLALKTLKDFGMIEVDEDNLIKITNWEKHQNVEGLDKVREQNRIRAKNYRDKKKQLKAADENEDIEDISSSENEEEIVQNLNEIEGNVTKKKRNVMQNENNVTVTEQNKRKSKNKNQKKNKNSIIDREKESNDTN >NC_018648.1|WP_041712131.1|594089_594377_+|DnaD-domain-protein MIGDLNLSAIKLAISKHGFNHVKMAIDKALEVNKTDMTYINGILKNWKREGYPSDEEDHKSNNNKSGSELKFDNFEAREYDYDSLEKRLLGWENE >NC_018648.1|WP_012423001.1|594559_594862_+|hypothetical-protein MNNLKHTKIGITSFILISIVVINTISSVVCPLKMPYVNPSAIEILGMTMISLISFILGLIAMFQKGSKKILPKITVIISGIFLIPAIAGLVKGIFLRLTI >NC_018648.1|WP_012425363.1|596526_597168_+|hypothetical-protein MRIEKIRVIQLKNEYIKTFEGQDKLKNIVENIINCDEKVEYSEDDFRISDIAMEAYYRDLYLDENSKNQKIFQDLFLGLKDFKYTYSRWESEMKIKNPTKEQIAKHIIDTWFYEISPDDTEEIENIDQSQAYVFHEDVDLKCIPADRVKEIILDFDKENIINTANNLKKELNSCGIFVEKFDDDDRKLIDDIMKIFEKSVEENTDILYIINYL >NC_018648.1|WP_012424263.1|597539_597740_-|YvrJ-family-protein MEINELVSLIGNVGFPVAVSAYLLIRLEKQLNSLSTSINKLNTIISTKLGVVIDTNKSNDDSNNVA >NC_018648.1|WP_012424262.1|598180_598657_-|hypothetical-protein MARKKEFKIEKDDIAYEEEVEEFGFTDYIPTGENSIQLFSIEEDSGPENENINDNNSILKTKEEVNTKMEQKTISINNNISSNPLLFDNRNTPIANGAAPPIDGEAANIKRSYTLRKSTVRKINELKSIHPDIGICVSTIVDIAIDYYHTHIVNNNMD >NC_018648.1|WP_012423348.1|598921_599164_+|hypothetical-protein MIKNNIKICSEDSDCFDKKQIALAIRNATLNDCLECSLIEGVIISGCEACSLKFICDGIEDLSDEYIEHTTKVVSTFNFD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018648_2 | 973905-974004 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018648_2
|
1 spacers
spacers of NC_018648_2
>2.1|973932|46|NC_018648|CRISPRCasFinder AAATTATAATAGAACTGTTAAACATAGTCATATCAATGACTTGCAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018648_2
The CRISPR arrays of NC_018648_2 >merge|NC_018648|2|973905-974004|CRISPRCasFinder TTACAACGAATTATAATTAATTACAATAAATTATAATAGAACTGTTAAACATAGTCATATCAATGACTTGCAGTTATAATTAATTACAATAAATTATAAT >NC_018648|2|2|973905-974004|CRISPRCasFinder TTACAACGAATTATAATTAATTACAAT AAATTATAATAGAACTGTTAAACATAGTCATATCAATGACTTGCAG TTATAATTAATTACAATAAATTATAAT
>NC_018648.1|WP_012423806.1|973230_973632_+|hypothetical-protein MKKIISILIGMLMLLSLVGCGFSEDFKQGYDSETKYVGININKIEELPVKNGNGEEIGKRGTVIYNADKITDESLTNFYNDKIKDSGYNYYTLINEKDKKQGIVSPGCIKILSHGEIDDTGSLIKADKDITID >NC_018648.1|WP_012424858.1|972238_973039_+|glycoside-hydrolase MNGIDVSNHNGSIDFNKVKEDNIEVVYIKATEGTTYKDPYLNQHYSGAKKAGLKTGFYHFLVGSSEPETQAENFYNNIKDKENDLKPCLDIETNNFNVMDYALRFIKKFECLCELELCIYTSPYFANENLDSRLAKYQCWIAHYGVETPMETNVWRDNYAGHQFTETGRINGINTNVDINTFTKDIFTNNKSQGYVVTQYLPNGYRGDNSFEGIDLEYVLSYFKDVRCYVRKDSKGVWIETQTLSMGKCLELKKVLGSWFYSIEIK >NC_018648.1|WP_012425609.1|972016_972193_+|hypothetical-protein MDRLLNKVTSARWLIAVIMTIVFAVLAFTNRLSTEFITIYTMVIAFYFSKEREKEIKE >NC_018648.1|WP_012423210.1|971790_972003_+|hemolysin-XhlA-family-protein MSEQDTIQEIKERLVRIEILLEKNTENWNEKIKVANYRIADLEDTIKWISRTAIGGLLTGLLGILFAFIK >NC_018648.1|WP_012423841.1|971480_971636_-|hypothetical-protein MTEKRIIKNTPNSSSSKPQASTNPTSVRRVNVRDDSGTKDNSRLESLFKNR >NC_018648.1|WP_012422674.1|970846_971494_+|hypothetical-protein MEKFIAMLLMIIPGFFVRKIKEEVKDIKEIKSDTEKTVISLIYSIPVLILNLIVLVFLFKFSGIDQLVLMFEDLQFIIEYALLSIISTAIISAIMIVIESKYKLNFFNWIRRKMDEPEKTSSITPWQDFFKSDGEMPIKIIKGEKIVAQGFVKHWDLDGKSEKDIVLEYADQMIENTQCFTRIRKQYIDYKNDLTILEYFFDEEKLQNNCESNDS >NC_018648.1|WP_012424618.1|970127_970679_+|hypothetical-protein MTIEEIKQQLDFLSDKIDLINVNLQFNITTFLAILSIALVIAGTSSVILAKYLFNKRFDIEIKKIDDKIKQMLIDEPPILSVTNTIISLTLNIEQEDNGKTIYRYKGLLILGKNVTKQSFISSEFYHFIPPGIRKEPLENYKLDIKNKVHLEIIIDCNQEMPKWWEFIEVNIAWKNPIYETFK >NC_018648.1|WP_012425683.1|969715_969871_+|hypothetical-protein MDFWKMCFDLKVIDSDFLRQAVITDKNKFGDITIEQFKEITGEDFIKVVSQ >NC_018648.1|WP_012422714.1|969383_969716_+|hypothetical-protein MNMAEKELFLNVILKEEDLQYCYISDDGKMFPPHYNTDGMIDVIGEDVYKNYLNNKNNPSKKEPTKEEVLLKEIANLKVDNMKKDVVVTSTLKSLAELKVEMMELKGGNK >NC_018648.1|WP_012423541.1|967929_969381_+|hypothetical-protein MIQELQTGILDINNRYGIDFTCKQLDDVILKIIVYDKSVPADLGNYTCRLKAFKTDQVPLIQNTNITIVNNVAEIKASKQLTTTLGIVKAELQFINKSTLEKKSTFYINIEVVASVLDVDGTVSTPTCTILEEIDHKLDQIENIGEVLDEAKEVRDTLTNTTIPGATSINSTLESNIKNASNKIVEVESSITNASKKTEEVEASTKNANSSKEELDLSKTNADTTKENLDTANVQAEKNIEELNKLGDVTELAKNVQTNTTDITNLKEDVENNTSQLKDVENDIKNLDDIKINKKVKYYTSEETTKGANPNNALEGCFVIAHELNPVQNGFCYYEQFFYGDISETANRIQYVTTYNGDLRRFIRRYFNGNWETKELATTEIAEIGLLNGWKKGYGELQITKTGSICYLNFQGTVGVSSVGTTIFNIPERFRPKYQQVFYIPQRDGKPFYGVAIDNNGNVDVSGVTSLPTQGTKTDFYMIWRID >NC_018648.1|WP_012423645.1|974881_975082_+|UviB-like-protein MDEIMKMALSQGLGYALFVFLLLYVLKTTGERENKYQTLLDALAEKFNVVEDIKEDVKEIKNKIES >NC_018648.1|WP_012422679.1|975391_975958_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNDINFKTLINKHIPVNGSQIFIDKIDLNKLLYIYNWSSKEVQEKMTCRPIINRNRDESIKLYNSLLNSDTVYIFGLYNLNNKELLGKITLFDYNCRNKSLEIGYYLLPKFRKKGYMNEAIKIILNLLFLKTDINKVYAQTASFNNDSNALLKLNNFKLDGILREHHELNEVFYDDYIYSILKNEFIL >NC_018648.1|WP_012423358.1|976267_977311_+|phosphodiester-glycosidase-family-protein MNKKVKKKPTRKKKRKENKKKKSLSIFMGLIYVITFLVITTPLVLIYGPYEKTKKVLISTVIATRHSYLVYDFIPQKTLDSILGKSEIEEEAVEANTSIDLNKIDVKCDSGNKVTKYDIHTERYDGYMLEIENPHKVKATMTKHLGKLGQKTSEMAEEHNAIAAINGGTFLDKSSDGVTYAGTGGQPGGFVISNGKVIYPTSGYDEHSFENVIAFTKKGQLIVGDHTLAELKKLDVQEAMCFRKPNIIINGIKQIKDRFEDGVNPRTAVGQKEDGTVLFLVLDGRKLSKPGASLYDVQEIMKNRGAINAGMLDGGYSTTMYYKGDVINSPNAWDGERTVATAFYVEQ >NC_018648.1|WP_012425498.1|977329_978367_+|hypothetical-protein MKVLNKLLIFTFVAFIIQQGVFFYIENIYLSSNMDIKIEKSDDSEVSKNEQKEVELKEYVDDLKVSSNGRYVAGLQNGRLKVLDSDENKYKDIKNNVNSNIVFYKWVTNSDRIIAIQKIKEKGRSYFEPVAFNAKNGEQIELADFDLNKLRVRVENSEDKVEDIPFSIGTHSLYIKIKKSNEKSDLYYANTMNQLEKKRSNKEIGNIVIPTTGANAIMEMGTQVTILDKPDNLLIPNTKNPKLLGTDINDNVYFASEVNNKVVKIYYAISSDNYKDWKEFKLDNPVNKEDILVDYSGKVYINDNEKKTAVELTSKKTIKYKGELIQTYSKGVISKNGNKLIKNSI >NC_018648.1|WP_012424973.1|978519_979629_+|sn-glycerol-3-phosphate-ABC-transporter-ATP-binding-protein-UgpC MADLSLRHIYKIYSGDVTAVNDFNLEIEDKEFIVFVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISKGELYIGGKLVNDVEPKERDIAMVFQNYALYPHMSVYDNMAFALKLRKVPKEEIDEKVTEAARVLGIEHLLTRKPKALSGGQRQRVALGRAIVREPKVFLMDEPLSNLDAKLRVQMRTEISKLYNKLQTTFIYVTHDQVEAMTMGTRIVVMKDGIIQQVDTPQNIYNNPVNIFVAGFIGSPQMNFIDGKIIEKEGKLYCSFEENNILLPEQQAKELKTKGYVNKEVTFGIRPEHLDDNMEVVKENPSSIINGKVEVVELMGAESYIYFVASNNNMTARVNGTTNVKTGDSIKLYVESEKIHVFDKENELRII >NC_018648.1|WP_012423571.1|979650_980592_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MYGLVEYLNELYKKCEIPFELCIDNKVAFKTNPFLYTDKEIIEARFNINNKICILRTYSNFKDSLKLIKFCIENRCKDEHDVRENTIISLLKNEYVSSDKLNDIMFELNEVYLISINLEEKISETIDILKTIYIDTEVSILEYNEYIILLGTFEDIEDHISSITETIHNNLYKRCYISYYEVKDYNNISSLYKEGIYKINLAKKYNISNRIFNEKSLLFESIVDSLSEEKKVKILSKFNDGFNKLDDDTINTIEVFFNCDLNLSESAKNLYVHRNTLIYRLDKIKKCTSYDIRNFNEAILFKIAFFVWKESKV >NC_018648.1|WP_012423673.1|980753_981773_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MNIGDIARLAGVGVSTVSRVINNHPDVKESTRERIWEIIKQNNYIPNNSARILKQNNTKNIGVLVKGVFNPFFSQMINIIGNIIDKSGYTMILEQNDYNFYQDVENLMGFIKEKKLQGVICLGGNFINIKEDSFSDIETPIVLTSVNTISKKGKKHYSSIGIDNIKASYDTTKYLIEKGHKKIALILGDENDLGISWWRLKGYRNALKENNIQIDDELELIGDYSCEKAYKETINLIKNRKDVSAIFALSDIMATGVAKAVIDSGLKIGDDISIIGFDGMDASKYYNPGLTTVNQPKRLMAETSISLLFSLINGVEENKQILLDTKLIERESCKDLLKK >NC_018648.1|WP_012422949.1|981920_983408_+|4-alpha-glucanotransferase MRRSSGIIMHIASLPGEFGIGTFGKEAYEFADFLKESHQKYWQILPIGPTSYGDSPYQSFSAFAGNPYFIDFNLLKKDGLLKSKDYSNLNFGKDKEDIDYGLIFVEKMKVLRKAYERFKLNLPTDLKEFEEENQWLNDYSLYMALKSKFELKSWQKWDIDIKLRKKEVLNKYKEELKDEINLWKFIQYKFFEQWTNLKKYVNDLDIEIIGDIPIYVAEDSADIWANPKAFLLDEETLVPLKVSGCPPDNFAVTGQLWGNPIYNWDYIDKTNYKWWIDRMKQSSKLYDVIRIDHFRGFESYWSIPYGDPTAENGEWVKGPGMKLFNAIKKELGDIKIIAEDLGFLTDEVVKFREESGFPGMRVLQFAFVGDAANRDLPHNYEENCIAYTGTHDNNTFRGWLEKTGTEEEIEASIKYLGLNKEEGYNWGFIRGVWSSKAYLSIALIQDFLNLGNESRINVPSTLGQNWRWRAKEDVFTDELAEKIYEITKMYGRCEE >NC_018648.1|WP_012425120.1|983407_985768_+|glycogen/starch/alpha-glucan-phosphorylase MNKENIKQGINRYLKVKYGIKLEDAKEYQIFNALSLAILEEIVDDWNDTTKAYNEKRSANYFSAEYLMGRALGNNLINLGLYDEVKDVLKELNIDINKVEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFMESAATIDMPLNGYGIRYNNGLFKQNIDEGFQTESEDSWLKYGDPWSIRKDNEAQVVEFEDMKVKAIPYDTPIIGYGTKNINTLRLWKCEPIKEFDFYLFNEQKYDESVELKNRAEDISRVLYPNDSNDEGKILRLRQQYFLVSASLKDIIRKHIEKFGTDFEKISEYNFVQLNDTHPTLAIPEFIRILVDEEGINFNKALRYAKKFFGYTNHTILAEALEKWDVELIEKLFPRILEITEKIDKELIKELKAKKYTEKEIKKLRIIGDDQMRMANLAIFVSKAVNGVAQLHTDILKDKELNDWYKLYPAKFQNKTNGITPRRWLRLCNQELSEFITKLLGTEDWVKNLSLLKDLKKFENDDKVLEELMNIKLEKKKQLAEYIKDEEGIELDPNSIFDIQIKRLHEYKRQLLNAMYILDLYYRIKENPSLDIPKVSFIFGAKAFPGYVRAKAIVKFINEIAELVNNDKDVNGKIKVVFVHNYRVSYAQRLFPAADLSKQISTAGKEASGTGNMKFMLNATPTFGTYDGANIEIVQESGEENNYIFGLKVEDIDDIKEEYNPMTYYKKNKSIKRVLDTLIDGTFNDGNTEDFEDLYNSLLEEGDQYYLLADFESFKEAQDKVFKDYKDTKKWAKKCFANLYSAGIFSSDRTIKQYCDEIWDIKETPIK >NC_018648.1|WP_012424434.1|986284_988024_+|potassium-transporting-ATPase-subunit-KdpA MMNLVLQYGLYILILVVLAIPLGNYIGKIMNGEKVFLSKILTPCENFIYKILHIDKDEDMSWKKYSFSVLAFSIISLIVLFLLHIFQGFLPLNPEKVSGTSWDLAFNNAISFVTNTNWQGYSGESSLSYFTQMMGLTVQNFVSAAVGISVLFALIRGFIRVKQKGIGNFWIDITRTVLYILIPLSIVVSLALVSQGVVQNFKQYETVSLLEPITLEDGTLVTEEVVPLGPAASQIAIKQLGTNGGGFMGTNSAHPIENPTILSNLFEMISLLLIPVALCFTFGRNIKDRRQGIAIFVAMGIMLVVAMAIVGVNEQIGTPQMALNGQVDLSTINQAGGNMEGKEARFGIATSSTWATFTTAASNGSVNSMHDSYTPIGGMIPMLLMQLGEVVFGGVGCGLYGMIGFAILAVFMAGLMVGRTPEYLGKKIEPFEMKMAVLVCLATPIAILIGSGIASILPETVNSLNNSGAHGFSEVLYAYTSAGGNNGSAFAGFAANTPFINISIGLSMIFARFVPMMGTLAIAGSMVKKKKVAESVGTLPTHNAMFIGLLIFVVLLIGALSFFPALALGPIAEFFQMLG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018648_3 | 2143741-2144745 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NC_018648_3
|
15 spacers
spacers of NC_018648_3
>3.1|2143771|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT AAGTAAAAGGAGATTTTAATACTATTAATTTAAT >3.2|2143835|36|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT ATTTTCATAATGTTTTAATGTAGTAATTACTATTTG >3.3|2143901|35|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT GATGATAGTGGTATTGGATATACAACAATAATCGC >3.4|2143966|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT TTACATTTCCTGTCCAACTTATGGTATTTTCACC >3.5|2144030|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT TTTCCTCAGTTCTATTTTTAGTAGTTGTATTTTG >3.6|2144094|36|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT AGAAATATCAAAGACTATGTTATCTTATAATATTTC >3.7|2144160|36|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT AGATACTGTACATTGCTACAACAAAAATATTGATAT >3.8|2144226|36|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT ATTACAATTAAACTTTGATGCTCTATACCCATTTCA >3.9|2144292|35|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT GAACAGGATTGTATATTTTCGTTGCATAATATACA >3.10|2144357|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT CAGATGTGAGAGTTGAAAGGCTACAGGATATTGA >3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT CAGGCGATAATATTAAAGAAAAAGTAAGTATAAC >3.12|2144485|35|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT TCATCAATTTTCATACCATCAAATTGATTATTTGC >3.13|2144550|35|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT GACGGTAAGCCTTTTTTTGGTGTTGCAATAAATAA >3.14|2144615|35|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT AACTGGGGAGGAATTAGACCTACAGTTGTAATTTG >3.15|2144680|36|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT ATTTTTTTAATTCGTATGATATTATCACATAAATTA >3.16|2143771|36|NC_018648|PILER-CR AAGTAAAAGGAGATTTTAATACTATTAATTTAATAT >3.17|2143835|38|NC_018648|PILER-CR ATTTTCATAATGTTTTAATGTAGTAATTACTATTTGAT >3.18|2143901|37|NC_018648|PILER-CR GATGATAGTGGTATTGGATATACAACAATAATCGCAT >3.19|2143966|36|NC_018648|PILER-CR TTACATTTCCTGTCCAACTTATGGTATTTTCACCAT >3.20|2144030|36|NC_018648|PILER-CR TTTCCTCAGTTCTATTTTTAGTAGTTGTATTTTGAT >3.21|2144094|38|NC_018648|PILER-CR AGAAATATCAAAGACTATGTTATCTTATAATATTTCAT >3.22|2144160|38|NC_018648|PILER-CR AGATACTGTACATTGCTACAACAAAAATATTGATATAT >3.23|2144226|38|NC_018648|PILER-CR ATTACAATTAAACTTTGATGCTCTATACCCATTTCAAT >3.24|2144292|37|NC_018648|PILER-CR GAACAGGATTGTATATTTTCGTTGCATAATATACAAT >3.25|2144357|36|NC_018648|PILER-CR CAGATGTGAGAGTTGAAAGGCTACAGGATATTGAAT >3.26|2144421|36|NC_018648|PILER-CR CAGGCGATAATATTAAAGAAAAAGTAAGTATAACAT >3.27|2144485|37|NC_018648|PILER-CR TCATCAATTTTCATACCATCAAATTGATTATTTGCAT >3.28|2144550|37|NC_018648|PILER-CR GACGGTAAGCCTTTTTTTGGTGTTGCAATAAATAAAT >3.29|2144615|37|NC_018648|PILER-CR AACTGGGGAGGAATTAGACCTACAGTTGTAATTTGAT >3.30|2144680|38|NC_018648|PILER-CR ATTTTTTTAATTCGTATGATATTATCACATAAATTAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018648_3
The CRISPR arrays of NC_018648_3 >merge|NC_018648|3|2143741-2144745|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAAACAAGTAAAAGGAGATTTTAATACTATTAATTTAATATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCATTTTCATAATGTTTTAATGTAGTAATTACTATTTGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCGATGATAGTGGTATTGGATATACAACAATAATCGCATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCTTACATTTCCTGTCCAACTTATGGTATTTTCACCATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCTTTCCTCAGTTCTATTTTTAGTAGTTGTATTTTGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCAGAAATATCAAAGACTATGTTATCTTATAATATTTCATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCAGATACTGTACATTGCTACAACAAAAATATTGATATATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCATTACAATTAAACTTTGATGCTCTATACCCATTTCAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCGAACAGGATTGTATATTTTCGTTGCATAATATACAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCCAGATGTGAGAGTTGAAAGGCTACAGGATATTGAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCCAGGCGATAATATTAAAGAAAAAGTAAGTATAACATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCTCATCAATTTTCATACCATCAAATTGATTATTTGCATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCGACGGTAAGCCTTTTTTTGGTGTTGCAATAAATAAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCAACTGGGGAGGAATTAGACCTACAGTTGTAATTTGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATCATTTTTTTAATTCGTATGATATTATCACATAAATTAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC >NC_018648|3|3|2143741-2144745|CRISPRCasFinder AATTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAAAC AAGTAAAAGGAGATTTTAATACTATTAATTTAAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTTTCATAATGTTTTAATGTAGTAATTACTATTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GATGATAGTGGTATTGGATATACAACAATAATCGC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TTACATTTCCTGTCCAACTTATGGTATTTTCACC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TTTCCTCAGTTCTATTTTTAGTAGTTGTATTTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AGAAATATCAAAGACTATGTTATCTTATAATATTTC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AGATACTGTACATTGCTACAACAAAAATATTGATAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTACAATTAAACTTTGATGCTCTATACCCATTTCA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GAACAGGATTGTATATTTTCGTTGCATAATATACA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC CAGATGTGAGAGTTGAAAGGCTACAGGATATTGA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC CAGGCGATAATATTAAAGAAAAAGTAAGTATAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TCATCAATTTTCATACCATCAAATTGATTATTTGC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GACGGTAAGCCTTTTTTTGGTGTTGCAATAAATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AACTGGGGAGGAATTAGACCTACAGTTGTAATTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTTTTTTAATTCGTATGATATTATCACATAAATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC >NC_018648|3|1|2143741-2144745|CRT AATTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAAAC AAGTAAAAGGAGATTTTAATACTATTAATTTAAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTTTCATAATGTTTTAATGTAGTAATTACTATTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GATGATAGTGGTATTGGATATACAACAATAATCGC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TTACATTTCCTGTCCAACTTATGGTATTTTCACC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TTTCCTCAGTTCTATTTTTAGTAGTTGTATTTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AGAAATATCAAAGACTATGTTATCTTATAATATTTC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AGATACTGTACATTGCTACAACAAAAATATTGATAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTACAATTAAACTTTGATGCTCTATACCCATTTCA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GAACAGGATTGTATATTTTCGTTGCATAATATACA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC CAGATGTGAGAGTTGAAAGGCTACAGGATATTGA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC CAGGCGATAATATTAAAGAAAAAGTAAGTATAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TCATCAATTTTCATACCATCAAATTGATTATTTGC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GACGGTAAGCCTTTTTTTGGTGTTGCAATAAATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AACTGGGGAGGAATTAGACCTACAGTTGTAATTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTTTTTTAATTCGTATGATATTATCACATAAATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC >NC_018648|3|1|2143743-2144745|PILER-CR TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAAAC AAGTAAAAGGAGATTTTAATACTATTAATTTAATAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTTTCATAATGTTTTAATGTAGTAATTACTATTTGAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GATGATAGTGGTATTGGATATACAACAATAATCGCAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TTACATTTCCTGTCCAACTTATGGTATTTTCACCAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TTTCCTCAGTTCTATTTTTAGTAGTTGTATTTTGAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AGAAATATCAAAGACTATGTTATCTTATAATATTTCAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AGATACTGTACATTGCTACAACAAAAATATTGATATAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTACAATTAAACTTTGATGCTCTATACCCATTTCAAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GAACAGGATTGTATATTTTCGTTGCATAATATACAAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC CAGATGTGAGAGTTGAAAGGCTACAGGATATTGAAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC CAGGCGATAATATTAAAGAAAAAGTAAGTATAACAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC TCATCAATTTTCATACCATCAAATTGATTATTTGCAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC GACGGTAAGCCTTTTTTTGGTGTTGCAATAAATAAAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC AACTGGGGAGGAATTAGACCTACAGTTGTAATTTGAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC ATTTTTTTAATTCGTATGATATTATCACATAAATTAAT TTAAATACATCTCATGTTAAGGTTAATC
>NC_018648.1|WP_012424468.1|2142315_2143590_-|peptidase-S41 MKFNKKGKVITTILLVIAVVIGIFAFKIFHRVTNSPMIKSEDRNEKFIADIEFLKKELPKKHKNLFFSKSEEEFNDEIDSLINNVSRYSDEEINGELAKIIVSINDSHTNVDIMGSLAYPLNFFQFGNDIYLVDGDSEYKGYWGKKLISINGHSINELKEKLEPFISKDNEAISKNQFSVLLKCVEVLKLSGIVKEDNATFTFEGSPNDDVMIKPVTMEEYMNITTLSSDEEFKNRFPISKQNSNDNYWFKYIEEENTMYVKYNSCMEMKEYSFSNFTKDVFNVIDTKNATKLVVDLRDNGGGNSRVFETFLDEIKKRENINKEGNLYAIIGRRTFSSAVLNAMSLRNETNATLIGEPTGGKPNHFGEVKTIHLSNVNIDVNYSSNYFKTSDEDTDSIYPNVEINLKAESFFNGQDDFLEYVIR >NC_018648.1|WP_012425427.1|2141635_2142178_-|hypothetical-protein MDFIKVNERKFTILKLLGKGKGGYSYLVTDDKSNKYVVKQIHHEPCEYYQFGNKIESELNDYNKLYKIGLKIPKMLDVDIENERILKEFIDGDTIYNMILKDNMNENYIKQIKNMCKKLYPVNINIDYFPTNFIVQDELIWYIDYECNEYMEKWDFENWGIKYWSKTPEFIEYVNNNKGQ >NC_018648.1|WP_012425425.1|2139715_2141419_-|hydroxylamine-reductase MSMFCYQCQETAGCKGCTKVGVCGKDEHVAKAQDLLIYVTKGLAIVSNEGRKVGVIDSKVDKYITENLFTTITNANFDRDSILDRVRETLKLREILKAKVIKAGGKVGEVKVSGGFFKKIFGMQTTEMIMPDAATWTADNIIEFDVKAEKVGVLATENEDIRSLRELITYGLKGLSAYMKHAMNLKYNNEEVHGFMARALAATLDDSLTVDDLVALALEAGKFGVDGMALLDKANTESYGHPEITTVDIGVRTNPGILISGHDLKDLEMLLKQTEGTGVDVYTHGEMLAGQYYPKFKKYKHFAGNYGNAWWKQKEEFEKFNGPILMTTNCIVIPKESYKNRLFTTGATGMPGCPHIEADSKGIKDFSKVIEMAKKCNAPTEIEKGQIVGGFAHNQVLALADKVVDAVKTGAIKRFFVMAGCDGRAKSRNYYTDFAEKLPKDTVILTAGCAKYKYNKLNLGDIGGIPRVLDAGQCNDSYSLVVIALKLQEVFSLDDVNKLPISYNIAWYEQKAVIVLLSLLHLGVKNIHLGPTLPAFLSPNVAKVLIDNFGIGGITNVEDDMKMFMEA >NC_018648.1|WP_012422806.1|2139119_2139353_-|DUF2249-domain-containing-protein MSNFAATVDARKYEPRDKHPVIFKTFEGLALGEKMELINDHDPRPLHYQFIIERPETFEWEYLEEGPEVWRVAITKK >NC_018648.1|WP_012424131.1|2138760_2138922_-|rubredoxin MDSYVCTVCGYIYDPVVGDTDNGVAPGTKFEDIADDWVCPLCGVPKSDFEKVE >NC_018648.1|WP_079991389.1|2138385_2138718_+|transposase MKICNIIQKQILILVITVRNCSLFSIVHRKAASGYEAEVTVYECESCENCSHKAKCTKAKANRKMQVSKTFVEKREISYKNIITEKGASLLIKINHFATAPYKFIISLIF >NC_018648.1|WP_012424904.1|2136880_2138113_+|FprA-family-A-type-flavoprotein MEKNIMLNENIFWVGKVDDRDVPFHRLTLTKGTTYNSYLLMTEKPTVIDTVDISFGREFVENLKNVIELDKIKYIVINHTEPDHSGSLRSLATKATNAVIVCTKPAVNELKEMYKLHDREFLVVGDGDTLDIGGKTLKFIETPYLHTEETMVTYCEEDKILFPCDIFSTHVANYEYFNDMAKKDIKDDFIGYYKLIMHPHRRYVQNMIEKIRNLDIRMIAPSHGFIIRDDIKSFIDIYDNMSKNTDLDKKALILYSTMTGSTKKIATILNEKFEEQNITSEVMDVNKIPMEEVMKSINEADVIFFGSSTRYGDMIGNMEDILKNLKSLNLESKLGAAFGSYGWSGEAIEVVQDYLNETNLKVLNTSHVIKSTGMIDIELPLRIRFSPKEDILKNIERLVTYVSDLLLSTI >NC_018648.1|WP_012425258.1|2135617_2136388_-|oxidoreductase MIDNKVSSDSRWKGFKDFRVFKIVKEDEVVTSFYLKSLDGSKLPEFIAGQFITVRIKNEDNTFTKPRQYTLSMNYNEEFYRISVKREENGFLSKKLCDEIKAGDNLQITAPLGNFILKNSEKPLVLIGGGIGITPMLTMAYDAVSSDRKIHFIYSIPNSTHHSFKEETAKLNNNNFKSTVLYTRPTETEELGKDFDIKGRISREWMIDNLPKDGEFYFCGPVPFMKTIYHNLISMGIEKEYINFEMFEAGVDITKE >NC_018648.1|WP_012422907.1|2134105_2135566_-|NADP-dependent-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MFNHIKDENNTFKNLINGEWVSSRSFVEIKSPLSNSLLGRVPAMTKEEVDIAVQTAKEAQKKWNKITINERAEILYKASDILLENIDELSELMMMEIAKDRKSCRSEVSRTSDFIKFTADTAKNLSGESIPGDSFPGFKNNKVSIVKREPLGVVLAISPFNYPINLSASKIAPGLMAGNSVVLKPATQGSLCGLYLARIFEKAGVPAGVLNTITGKGSEIGDYITTHKGINFINFTGSTEVGARISKMTSMVPLLMELGGKDAAIVLEDADLELTASNIVAGGYSYSGQRCTAVKRILVVDKVADKLLEKIKEKMKKLTVGNPLEKDVDIVPLISSKAADFVIELIEDAKSKGADLIVGGNREGNLIYPTLFDNVTTDMRLAWEEPFGPVLPIIRVKDKDEAIEIANKSEYGLQSAVFTKNINDAFYVADKLEVGTVQINNKTERGPDNFPFMGVKASGIGTQGIKYSIESMSRPKATIINLSIHN >NC_018648.1|WP_012423745.1|2133597_2134014_-|flavodoxin MKIIYWSQSGNTEKMASLILEGIKSEGGKAELLEVSAVSLDDVKNEEILILGCPASGAEELEESEMEPFVKSLEGIIKGKKVALFGSWGWGNGEWMTEWEKRMESYGATLISEGLTVQEYPEGEDENKCISFGKLIVK >NC_018648.1|WP_012423143.1|2146548_2147340_-|esterase MNKSKIEKVNFYSDALGKESSMLVYLPESYSSVTPLPVLYFLHGRSGNENVIFELDIKTKADRMIKDGEIKPIIIVCPRIENSRGVNSSLIYEEISDYGNNNRIINLGMYEDYFIKEIVPLIDKTFNTIKDRKGRYIGGASAGGYAALHNTFRHQNMFSKVGGHMPALELELEDEDKTYYKDMGVWEKYDPICIARNNNISLDINVYLDAGDQDEGKFYEGCSILYEILKEKGIKSQNHVFRGNHNVEYIKSNIEKYLKFYGR >NC_018648.1|WP_012425568.1|2147582_2148452_+|AraC-family-transcriptional-regulator MKNLQTYYYKKMPNPNLGIDIFLAEGFCKGRKFNTHWHENMQLYFFTEGKALVECNKKRYYVAADSIVVINSNELHSLESLSDDLKFYTIRIDSSFLFSNQVDLCQTKFLSPLSQNQIFFQNLIEDDKQILDCVTITIQEYLSKEIGYELAVKSFIYQLIVLLLRKYISKFLTRKELILKVNNLKRFDLVFKYIDSNYSKKITTSDLSDIVHISNYHFCRTFKQMTGKTTTDYINGIRLEKAVNYLNKGDLNITEIALRCGFDSINYFSRLFKKHYNVSPTQFKKTNFK >NC_018648.1|WP_012424189.1|2148648_2149377_+|hypothetical-protein MKKLNAFQIKVFLIIMMLLDHISSAFPGVLPNWTHAITRGVSPMFAYFLVEGYFYTRSKKKYGIRLLSFAVLMYLGNTLINTLLAVKGVYVENNIFETLFAGFIGIWIFDYAKKKQGSVKVLLIILGVVCSIIGALFTEGGLSVIPFILITYFFRENTKKQIVGYLLLSIVLFFMVFTPYETVTETIDMLMFNSDFLLILAIPTILLYNGERGLNNKFSKYLFYVFYPLHLWGLAIISYLIK >NC_018648.1|WP_012422668.1|2149617_2150829_-|MFS-transporter MKNISFKLNTIRSFSMNLLFNSFGNSVVGTIYVLFLSQVKGFSDKDVSLMVGLIPIITIPSYILWGIIIDKTKKVVLTNKMVIIANIVTLILLIYVDNIYAFFIINLIRTVLLQPGGMVNDEYLLNLVKDNTGSYGSIRTFGTVGYGLGGLVCLLLMDYIEISGLLIIAIMSLASTLLFISKMPEINIDKSLKKGYHKTKFKIEQLDLLKNMKYMRLMIIYVLMNGTLASASSYAIPMIMIKLDAPQNIIGVMPFIMIVFELILLLQNKRLNFPKKRNKYLLIGLILLTIRWITMGVTESYIIIILISIIHGAVAGILLPIQNDMVEKFVPQNQQSTAIMLQTLLSSTIVPSILNIILGFLLEPWVIKSFGIVYLICNVITLFMYIINLLFNRYEEKRVVFDK >NC_018648.1|WP_012425832.1|2150933_2151824_-|ROK-family-protein MKYYIGIDIGGTNLRAAILDEKCNLVDKLKISNEVEKGPEYNLDKLILEIKERWSDKEIISVGVGCPGPLDIRSGTILVTPNLRTWEYFKLKEYLENKFDLPVFVNNDANVAGYSEAMVGAGKGAESVYYMTLSTGIGGGFIYKGEIVSGFNSIAAEIGNMIINEDTYKHSNMNYGGLEGQCSGVNIARISSEIIGGELTTKDVFEGAEKGNMELQKMLSEWVTNVSKAIANIIVTVDPEVIVLGGSVIINNPSYLNKIKEETQKRVFDGIKINIKLAEIGDDTGLIGAGLLGKLK >NC_018648.1|WP_012424859.1|2151834_2152770_-|mannose-6-phosphate-isomerase MYPIKFKNIYYEKIWGGRDLAQFRDNLPLGDIGESWDVACHSNGMSIVENGELKGKRFDELIKEYGKDLLGESFENKDFPLLVKLINSREKLSVQVHPNDEYANRVENSLGKTEAWYVVDAKPGACLIVGTKDCNKAVFEKAIKEGKTEDYLNKIQVKKGDCFLINSGLVHAICEGVIIAEIQQNSDITYRIYDYGRPREIHVDKSLDVIDFGLKAMNFSENKLDSYDGYKKGVLCSSEYFTMEKYVVNGEVEESSDINKFFIFTCVDGNGFIKSLHGHDIEVLKGDSILIPAKLGKYVIEGNLTLLKSYI >NC_018648.1|WP_012423930.1|2152947_2154549_-|alpha-glucosidase MHKKWWKESVFYEIYMPSFKDGNNDGIGDFKGITSKLEYLSDLGIRGIWLTPFYPSPKVDNGYDISDYYNIDKDYGTLEDFNEFLSKAHSLGIKIIVDIVLNHTSSEHPWFKESRKSKDNEKRDFYIWKKEKPNNWESFFGGEAWEYDELTKEYYYHAFAKEQVDLNWSNPKVYDAMKDVLKYWIDLGVDGFRFDVINFLTIKNDLAQDNPYDEKGEQIHKYDKDQEGIIEIIKTLVKDIREIKEDVFLVGEVGSEDLNELRGYSGKDLLDVVFNFNLGSINEFSAEKIYKEIKNMNDNYDSYQIPTIFFNSHDMGRSISRFNPDGNKNGIEKAMAALLLISYGVPFMYFGEEIGMKDLVCLDINKMNDIQGVTKYNIEISNGKTQEEALISANKSSRDKSRSPMQWNNSKFYGFSNTMPWINIEDKNDNELVEKQIKEEGSLINLYKDLIKIRYKNDTLLYGKYANLSFDDGVLIMERELNNETIRTVINFGDNEYIENNTEEIIYRNIKVQEKRTLGKFDFIIQRYKAITN >NC_018648.1|WP_012423012.1|2154563_2155481_-|DUF1861-family-protein MKDMKTCEILLAEYLKSESKIYGVEKINFINVGENDVYNISAPFVDNDKTIIAGRVEARDSEHSTVYFFEKNDEGWSPIDSYPTFSLQDPFFTKINNELIVGGVEIFPHPEIEGTLKWRTIFYKGKDVASLERFFVGPDGMKDLRLVQLLDKRIGVLTRPQGEKGGRGRIGFSIINTLEELNIKVIEESPLLDGLFVDEEWGGANEARPLNETTLGILGHVACFDKDGNRHYYPMTFELNINTLEVKNQKLIAVRKDFKPGQAKRPDLEDVVFSGGLEIKEDKATLYAGISDAEAQFIIIDNPFK >NC_018648.1|WP_012425824.1|2155494_2156556_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGKVTMKDIAAKLNISINAVSLALNGKPGVSEETKKLVLDVAEKIGYLDRSPKFIQSFASKNICALIKQSHFEDSTFYSKILMSIVEEARKKGYDVITCIVNEDEQNIPSCIESKKVCGIIIISAIDDDYLIKLKEFELPVVLVDHASLLENTDSILTNNKLGSFKITKLLLDKGYTKIGFFGDLEYSLSIKERFFGYQEAIKKFIKFDNKDGITDFINDYSILSDLESYIINQDSEGIQKKISQMDNIPEAFVCSNDNAAIMLITSLKELGYEIPKDISVVGFDDIILSSLVMPKVTTVRVQKELMGKNAVNRLLWRIDHKDAPNEDIVMGVDIVERDSVGIKNIMENEQKN >NC_018648.1|WP_012424962.1|2156624_2157713_-|glycosidase MNNKLNVVRSAKNPLIKPSDVKPSREDFKVDGVFNCGVCKYKDEYILLCRVAESVKVENEDEVKIPVVANENGKDAIKIISFNKKIDTEFDYSDSRSLWKLEKKGTRKIAYLTSLSHIRIARSKDGENFEIDDNAFIKPIASEEEWGIEDPRITQIDNKYYINYTSVTRNGAATSLVSTEDFKSYERHGIIFAPENKDVTIFPEKVNGKYLTFNRPVPCAIGAPDMWLAESPDLIHWGKQKHFYGGSDEESWDSGRVGGGAVPFLTEKGWLKIYHAADKEDRYCLGAFLLDKDDPMKILAKTNDPILEPEAVYEKDGFFGNVVFTCGCLFEDGIVKIYYGAADDKICRADIKIEDIFALMDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018648_4 | 3372795-3372971 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018648_4
|
2 spacers
spacers of NC_018648_4
>4.1|3372837|49|NC_018648|PILER-CR TCCAACCAGTTTTCATTGCTCCTCTAGTTCCGTCTGAAACTGGATTTAA >4.2|3372928|24|NC_018648|PILER-CR CGTTTTGCCATCCAGTTAACATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018648_4
The CRISPR arrays of NC_018648_4 >merge|NC_018648|4|3372795-3372971|PILER-CR CTCCTGATGCATTAGTGTAGTACCAAGTTCCGTTATCATTGATCCAACCAGTTTTCATTGCTCCTCTAGTTCCGTCTGAAACTGGATTTAAGTAGTACCAAGTTCCATTAACGTTTTGCCATCCAGTTAACATAACTCCTGATTCATTAGTGTAGAACCAAGTTCCATTATCATTAA >NC_018648|4|2|3372795-3372971|PILER-CR CTCCTGATGCATTAGTGTAGTACCAAGTTCCGTTATCATTGA TCCAACCAGTTTTCATTGCTCCTCTAGTTCCGTCTGAAACTGGATTTAA GTAGTACCAAGTTCCATTAACGTTTTGCCATCCAGTTAACAT AACTCCTGATTCATTAGTGTAGAA CCAAGTTCCATTATCATTAA
>NC_018648.1|WP_012425500.1|3372109_3372427_-|hypothetical-protein MELYYSGWKNLNGKWYFFKDGSMKSGWVQDGLAWYYLNDEGEMQNGWIKDGESEYFTNSRGIMQTGWISDYGILYYANKNGLIQKGKAIIGGKEYNFSKDGRLIL >NC_018648.1|WP_012423343.1|3370141_3371626_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIKRIKKIMALVLVATSVVAIAPREMFKGNVTAYAATTKEGMPTEQEIIGALQEELKKEYLGCLAVKVIPEPVKTLNITLTTSEATKIATPIAEKKAKQIVEAKGLHDGDPGYDDAVKATTKVILTQLVPVLQAACKNIPIYKYAAIGTDGQTVIGKGFVVGGGVEALLLQTGKSPIYVDATNLDNTIVNELIDKIKGAIGNISSTITDALDDIAHSVDKISNSITDLFDDLDDSTDDFFDKINKDEGWDKHDGYVYYYDEDGIKYRGVHEIKGKNYYFNRVDGAMETGWQIVDGKRCYFSPKKGYQLYSQWIKDGDKIYCLDEKGEVRKSQWAQDGANSCYLKADGTVAKGWYSVNRDERYYFNETTGYIETSKWIYDDQEWYYLKDSGVAATDWECVNGKWYCFKSTGKLYSGWFRNEGSWYYSDSTGAMQTGWVYHKNKWFYLDDSGKMKKNEWLSVNGKWYYFNLNGEMITSSRYIDGTKYHFNSDGSLQ >NC_018648.1|WP_012424053.1|3368943_3369855_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKKLKRIITMTLIIGAFSSVLPVNYKIFNNEKVYASTKDDYLLKKLGVFEAKSGDEVNLLDSEWKKTSFNKKSKENYCVKVDSDIDSIRIDTSTDAADYAIYKNDGKKNYKGKDILLSDGITKIYIKTYDSKSDADDDKNVKKEYKLTVKKSLDSNEGISSGDDNDSSSNLEQSKDNDIKNQNNSLSKFDNKVSNNAKRNQWVIVNGLWQYNNYLGDSLKYEWYHDTFNDKWYFLDSYGNMVTGWLNKGEQWYYFDSNGEMVTGWRSINGQWYYFNLLGKMMTERVLDNGEWYYFLPSGELI >NC_018648.1|WP_012424359.1|3367373_3368720_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKRLKHIIAATLVVSAFTTITPAKYINLGAVNAYASSNSMSKDEFDDLVVCKGSSSKELQLYSSSSCKDSDEIDFKFGTKTYYVKISGSTNSVTIDAEVDSDYEAHVFKGNKDKAYDLGEEVKVGSGTTTLYVRIYEDGEFDEDDVEEDVARTYKICVKNGSSSDDEDSDSDKVYLKDLTLSDGDINFSKQKTSYDINVNESVNSIMIKAVPKNDDDYTVEIDGDTVDDGDKYKKEVDLKKGKNTIKINIEDNDDNKRTYTLNITRGVTSISGNQSTSNNTNNNKQDSNTVKPSTPTDSNKKCDQWVDANGRWQYNDSNGNALKSRWHSDKSSGKWYYLDENGYMKTGWLKDGESWYYLDDNGAMKTGWLLCGSDWYYLNSNGSMHTGWLQSGSNWYFINKNTGVMKNNGWIVDNGKYYYFSSSGMMLSNVTINGYILGKDGAWIGR >NC_018648.1|WP_012425179.1|3365994_3367224_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKIFKRTMASLLTVAAFATVGPVKYTSLFTTEAHASDSKEYLTELKVERNGSKTKLYKDDDFKKKVDFESDRKKYYVDLGSKNKISIDADAGDGYTIKLFKDSVKDNNEEEFDKDIKVKKNKTKFYVNVYGTDKEKEVTQYTIWAYKDRDKDDDDDDDDDDYDDIYLDKLKVGGKTVSLKESKTTYTVDVDADTTSVKIVAEPEDDEYKVKIDGATVDDDDDYEKKVTLNKGKNEIKIRVKDDDKNERIYTLIINRGSSSDKEDSKDDDKNNSNSNNNTNVTARPNQWVTVNGNLMYNDSLGNPIKNAWFIDRNSGAWYHFEADGTMKKGWLTDKGTWYYLNEYSGQMQSGWSYINGQWYYLNPQSGAMQTGWVNDNGTWYYCDGSGKMLKNTNVGGYRLGSSGAWIR >NC_018648.1|WP_012422917.1|3363905_3365339_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MSLKKFFRNVIMSFLVIGIFVILEPSKYLNLTNKKVYAASKVYLDNIYLSDKYDIDFSKKKYSYILDVDKSLKEIVVRARPEDYNDIVKINGKVITRDDKYRELVPLEIGKNKIEIEVKDNDSAMTSTYTLYIYRGGNESNYLLDDINIDSSNIGFKKDRNSYNIEIDDDTSKVVLKAITKDKNYKVIVNGTELDYPNLIRIRFSGIGKYEIKIKVIDPETNRFKEYNLDMYVGIPISPDISNSVNSVVKPNQWVMVNGRWRYNDSLGEPIKDKWFFDKKYNNYFYFNNRGNMRTGWFSIDGEWYYASINGERQTGWLLEDNEWYYFDYDGKMRTDWIQYKDKWYFLDSIGAMQTGWICDNGNWYILNNNGEMITGWITYNNNRYFLKNNGQMAVGWFNNENEWYYFNANGSMKSGEWLFYRDNWYYINYIGTMRTGWLYKDDKYYYFNEDGTMSTTTKTIDGYTYNFNKDGSVNFN >NC_018648.1|WP_012425172.1|3361774_3363862_-|GGDEF-domain-containing-protein MKFPELQEHIEIFMNNENYIGYFRKFAVDTIEHDPHYVKNVMEYLLNISKELNYELAAHWCLIYIGWCEQLECNFEKSIKLHLMSKEYFEKIKELEGVSVTCNALLVDYLKIGQFDLAIINALRGADIARKLGDKELTIILLLNISYAYVDSYNYNEAINILKKLKTYKNEFNFKHEILMFMILAECALSINDLERTFDYATYALKIINENNTKIYKVELFSIIADVLYRKNEECKAIKLFEKSLEILKQDDNYLRAKILIRWGQCSLYNENYILAEKKFLECLNLLEETNFITLESKVYKELSTIYEKLGKYKEAFEAMKDYVKYEKRVYDLHSSSWFSIFKYRNLEEKANVYRELYNKIERISEIGKEIISILDIDKLLYTIYIEVKKLIDTDIFGIALFNEHKNELDYKLFIENGDLKNLCSISIDNRNSFGVYCFKSKKEILINNIENEYVKYVKKFDVNKYKNAPYSIMYIPIIIKNKSIGVISVQSYRKNAYTRNELNELKILSSYIAIALQNGKTFNTVEHFAKYDSLTGMFNRNVILTQGERIFNNKLETKQTFSIIMIDVDYFKQINDRYGHDIGDIVLRDISSIIKSEIRNTDSLGRYGGEEFLILLPNINLEEAKKIADRIRKSVENYKYHYLTSEKHNRVTLSLGVYEFNKNEFDFFEGVKKADKALYMAKSLGRNRAIEYSG >NC_018648.1|WP_012422602.1|3360930_3361482_-|hypothetical-protein MKKKSSYLKKILSKICLGDKCLIIFMIIIFFHVTFDLFIGGNGINSEETVNGIDIIVRTTIASIFGYFISSNFVKDKKEVLYEKESNKYCLENKNSNKAYLNDNNKVIINNNNENLEDENKKSRASEEQIVIVFIIGLVSLILLLLVRDFIQVSDLDIPIISQLRDIVCGCVGFLLGCPSNHK >NC_018648.1|WP_012424811.1|3356631_3360834_-|InlB-B-repeat-containing-protein MKNVLFKKMLASVLTATTIITFIPIKASATWTKDYSGNWNWTENGHNSIGWKNINGNWYYFDYSGAMRTGWINDWGCWYYADSNGVMQTGIVEICGKIYAFDDSGIMQKGNVSINGQSYKFNDQGYAIGDKIPESIKAFDNGNNELPYGSKPPYSNSEDSSSDSEDEIFKDVETIKVRYKVTFNTDGGSSVSAITNIKSGKTIDLPKEPTKSGYKFDGWYKDDDFDKEFTEDTKIRSNMKVYAKWVKEDSSDGSDSGDSGSTSNSIIINNIQVTVGENESDIGNVKVSARVSNYAGLTETTIDLIDKETNEVKKTQTLNIGGSGYIGFTFTGVEKGTYYAKITVGKVTSNSPQFIILSKDEIANSDVIKDMNELRLQDISLVTNDLSLPTKGSHGSAITWKSSDSNIIDDTGKVNRPDGIGTEVVKLTATLSKGSSTPVTKEFNAYVKKYDKNLGDAVKGINDAVNNGANEEEKILAITNKLTTSSMVAIGVSEYQHNKYKELRLTSTSDENQTYQLAVAKAIYDDLNSNNYISGSPNDNVYKKELENEAIGIIKVFDLSVNEQYRLKKEKENEIESDNKLKEAKEELTKIINEQYSDGSLRHTLIEEQDKNTKESWTSYISALTKAIEVEFSDTTSLSSIENAINYLEYSRKSLTGAYLVTINLYKNNVNWSDFKGTISFQKGTSSSNIDAEVAGGSSYKATLTKGQYKILVDGKYTGETINVIDNSVCENPIKLEYYTVRFEFSKPDIINGKIIAKYGNTINGYSEFNSSEAILANENNELILMADVNSDYTSEFRYLWKKTDGSPLDGAHKVDENSARIAISNIKDYGKIELVCEVNPNELIITNINGVANNDNSGNATVTAKVYEYSGQDKKVKLFKDNILCATKTGNDVEIDANGNLKTNFTGLEKGSYKIKVNIGSLERESSGSFYVNKIDQAVLESVNAINEAMKADATDSTYTKLRELFSPDNPNSRYLIAIGLNIEGYSKLIESTNKYTIEVAKSVYRSLEYSISDVNTISKAFNDAVTKQTNIKKTDDANSESEENLKNAKEALKKALDNAMESDRTTWKKKDTDYTEESWKSYASAVMSAIKVEQNSTSTLSQITSTTNTLTNAESSLKEGFEGIIKINKDGNLYDGIGTITLKKFENGSFGNIVSGDNVSLGTIKTKRIESGYYNIFVNGKDTGMKVQIGKGLSNSEVLEYYTFNFALSSTSSINAGGSTVTLTEVNNRLAEKERNKVIKSGDAVLKENNVVISITPIMVNGVPKESEFVYQWTEVTSDINTATVYNVSKKSDATCIVKPKNPVIFNLLTSADKTGKINITGQIDYGNSINKDIKVELFKNADLINPVVSKTGVGLNTEGKFNVDLNAPASGKYIAKVTIDSVTKSSNTFEVNIETTP >NC_018648.1|WP_012424475.1|3354601_3356197_-|peptide-chain-release-factor-3 MADYIKEIEKRRTFAIISHPDAGKTTLTEKFLLYGGAIRLAGSVKARKASKHAVSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFNYDGHCINILDTPGHQDFSEDTYRTLMAADSAVMVVDAAKGIEDQTRKLFHVASLREMPIFTFVNKMDREARDPFGLLEDIENELGIKTYPMNWPIGSGKDFKGVYERDNNRIIAFNGGNHGQNEVEAIEGSADDPKFREILGEALHDKLMEDIELLDIAGDDLDLEAVRSGELTPVFFGSALTNFGVEPFLEHFLKMTTSPLARNSSEGVIDPFEDKFSAFVFKIQANMNKAHRDRIAFMRICSGKFNKGEDVYHMQGGKKIKLAQPQQFMAQDREIVEEAYAGDIIGVFDPGIFSIGDTLCAPSKKFKFEGIPIFAPEHFARVRPVDTMKRKQFIKGVTQIAQEGAIQVFKEIHIGMEEIIVGVVGVLQFEVLEYRLKNEYNVDIKMDRLSYRYVRWIENKNIDMDKLNLTSDTKKVKDLRDRNLLIFQNDWGISWALDHNKDVILSDVGKSED >NC_018648.1|WP_041712289.1|3374954_3377189_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MKINFKRVISQLLILTVMVTGIQLGNIKSASAVELNLGFVVEAGGANLDINKSSSNAYYTDEIDMSVSTINIKSSDTSYYKLEGVTSSSSGVKIASSTTNGITSYKIAVTKYNDFNATIKVKDLGTQEVKSYNVTFKFKEENADTFKFNKIMIVASGSGGPMTLDLDYNSDGDDYYISGLGDDIDTAKVSIVDENGKAITSGVKITMDGKTGTFKLLGGENEILISRTVNGRTKTFKLVIAKKGSAKLKSLTGVTLSPRFDSETTDYTATVPTATDKVVLKPTAADNSSTIRINGVLVTSGANSQPISLKEGKNDITIRVTTKDGEVGVYNLEVTRTEAPRSSYLKYLKINSASLSPSFNKQTFDYTATVENKVTAVTITPTAEYATSTIKVNGKTVVSGGTTGYISLDEGSNEIEIKVTDAKGDTSTYDIVITRRYGKDNVKLSNLKSTEGTLSPKFDPETYLYTVKVDRAVGRTKIVFKAQNDKATIKVNGKEYTSAQESDYIDLKIGANLINIEVVAEDKKTTTLYRVSVIRDKIQAINEWVLSGDDWTFYDALGYQVKNKWVKYDNQWYFVNINGYMEKNGWLNESGEWYYLNGDGTMKTGWFKDNGYWYYLQGDGKMKNSGWGYYDKEWYMFGPNGMLETGWKQHKGNWYFLLDNGTMRRGWQYYDLNWYYLNDDGIMKRGWLYDGKNYYYLNNSGVMKTGWQRINSKDYYFDSSGKMKTGYIFLDGKWYNLGQDGSLN >NC_018648.1|WP_012424852.1|3377448_3379128_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKRLKRIIAIALTISAFSTIQPTKYMNLFATTAYAASSHISNLILNKTDTSNELKLYRDDEYDVSTEFRTSRSEYYAKTSLRSVNISCDTDSNYETYIFADSNKRSTAFESDEEVELGKGTTTLYVRTYKEGRFDKNNVKNDVVNEYEIHIERTSSGSSNNSSLYLSSISLDYGKISFSKTKTSYDVDVNSSVDEIEIKAKPSDKDYTVRIDGTKVKDSNGYEGTVDLKKGKNVIEVSVTDEDDNEKIYTLNVYRGGRDSSSSDSSNSGKEDNKQDPVYLDDLKLNNGDIKLDFNKKVTSYDVKVASNIDSVTIEAEPDDDEYDVTVDKKKVNSKNQRTVDLTLNKKNVIEVKVTNEDDEYRTYTLNITRGTVSSSNDNNSNNNPGTVTPGGTVTPGGGNNNNSSSNNNASTIKGKWVKTSNGNWQYYDANGIALKNQWFKDTNGKWYYLTEDGNMKTNWLKNNDKWYYLNYDGSMMTGWIKINGFWNYFNTDGAMLVGWYKIGDNWYYSNADGAMRTGWLQEGKTKYYLNDDGTMQKGQKTISGVNYNFDASGKLVE >NC_018648.1|WP_012423697.1|3379546_3381835_-|surface-protein-PspA MREFMRHIHFKPIAMILTILFIQFTFNFYLPCKDSYIAYASEVLHKDDIEKYHELSENLIGKSTELMSRENILSNNENNKDGIILKDFNESHIVKECDNTENTESKDEKIVGDSNNTIDKDDNVSEKPDEGNTGGTEQGGNSGNESSGGNNEDVPPEIDNKKQAIVPSINSFAEDMGKNYEKLTVSAANINVQGEYTFIILASDKLNVCKHSATNSTLNKWFIPLIELSKGEQKLSYSTDGKNFFKFSLDSNNKIPYYMRANITGALNYTEKERDSILYFKYSEDNDDTAIKIRIHYIPSVNANDNSNSGNISGDILKSVYIYGTERVGSTLRAKTKYNNNTDKPKVSYQWLRCKDKDGEYKEISGADKEEYKLKSNDKGYYLKVKITVSGEVSESKESDRSEIIKEKLKENSSSSNSGSSSSNNYHSGIVVDTDKTNDDQMYLNTSYSSKVDKEIFDLTKEYEYKKLILEGSNYVWNFNASDLKNVSQMDDNFDSEIQTKTQTDSEVVINFKHHGVLPGKATIQVNVGDGLNGDNRCLYYYNEGTNSLELISSNVSVKKGKAIFTITHCSKYILSANPNANSNISSGDYNTTIETSTQDNYVNNVVDSDKTFNDPNLNNTDSSSLKWRESMDGKWYLCSNSFIMTGWQKVDNNWYYFNEFGVMQKDWVNSNGKWYYLDNNGCMITGWIKSNNNWYYTNSSGEISTGWKEFNKVWCYFNIKGEMQTGWQYIDYRWYYLYPDGSMAYNVEIDGRVLNNNGAAR >NC_018648.1|WP_012424563.1|3382311_3384090_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MFNRANKMTALLVAAAAVVSLVPATGVNAAEVKRISSEDGKVYHAVAYKDGQVYIDGELNDKDEAAYYLADGKYNELEKIDSNSAAKAYGEKYVNIEDGDYFVDLTNGKVTDDNVKEDDADDAGAALRKKIKDDTEDRYDEENAKLTRDDDDLDIISGNKFGDVWYETSVEQSKDCDSNGFTSTTKGEFTIYTDAKGNYIDADHNLGTVKVRIAKTEAADATTSSAVKIENTDKVYKEDGQEIKASIKHVRTLGQDSKNIYRYAKLTITADTEIREINGKDVTPGKTKELSVIQKISKDQASGDIDGAKYAKTVYTYVISNDDTKLEKDAEKFYDLIETEKANVTVVNGKLIAYAMKGENKIIAQTASLKTKSGWYYTDCEGQSDEDVDYNKDDSAYAVDVDVDGNLWRIDGGFVYKFDNTDDWDKLYKVDGSMDRLSVYNKDNMVVWNEDDEVYSVIGAKEDKEDEKPEVEVKAGWTQAADGTWTFVKDGVKATGWFQDGANWYLADEAGIMQTGWKTVNGTWYYLASNGAMQTGWIIDNGTWYYADGSGAMQTGWINDNGTWYFCDGSGKMLANTTVNGYVLGANGAWVK >NC_018648.1|WP_041712292.1|3384559_3386035_+|DUF2334-domain-containing-protein MNKFFTYILLSLSLISLTGCNDINSSQSLIPKNTDNTIEDKIVDENLISDNLSENNNLTFIDYSNFKDLGINKDEVTLKINGHDLDFTLPVYLDKDRYYFSLNEIIHNLNGAFTKDEGSLYLNINDELYSINLLDNTVQCPNKEFNLKKDLLNSENIYYICFSDLSTMLDLYTRWDKDNKIINCKINSSQYINNTSDKISNDKNNSVTNELEDKNNSTSTSSENTQIGLIRFEDVCVTSQGYDKNYFENLRIIGQYMNKQNIPYHIAWIPRYKNPNFKIDNDPLTKNNFEIAEMVYTLDYLKNNNGIIGLHGYTHQLGNCESAAGFEFGKFEPSTDVFKEKIEKAIETASYLDIPIDFFEVPHYEITPEQNKIAEEYFKILYYPFNDYGIDKADLKKPQLSPYNNSSLYISTPLDYIAEGKEDICLDRIKNSDISNMGSVFFHPSLENAFISLNEDSDGYPSFSYDDNSILKRLVNILEEKGFKMTKVTDL >NC_018648.1|WP_012422614.1|3386281_3388321_-|M13-family-metallopeptidase MAKFKKSRLIACALAFSLFMSQAAYVKAAEVTNTVNLGNKVVADDVRLQDDFYSVTNKEWLNTAKIDAGEVSNSAFNEAEKVLTEQKKEIMKELLANEKNYSKDSDEKKMINLYKNVLNSEARNKQGIEPIKEMLDKIKNIKNLDDVRELNKYDIGNPLINVGCSVDLKDATRYAAYVGSTSLSLGNSDEYVKPTENTARVKSLSENYYKKILTLVGYTEEEAKIKVDNFYKLEYMIAPSIIGKEESIKNPNAIDDEYNVYTLDKLNDVSPNLKIKDLMKDLKIDKANKIILTEPNWLKAMNDIYTEENVPLIRDYIEIRNIAGAAGCLGDDFKKAAQEFSNAYLGSSGETPKDEEAINIVNSALAMPFGKIYVEKYFSKKTKNDVKDMTDEIIKTYEKRIENLDWMSDSTKKSAKEKLNKISVHIGYPEKWEDYSSLKIRSYEEGGSLFENLTNLGKFAEEKQLSVLNERVDKSQFACPPQMVNAFYNPTANSITVPAGILQQQFYDVNASKEHNLGAIGAVIGHEISHAFDNTGAKFDGDGNLNSWWIAEDFKKFEEKTNNVRSFYNNVKLDNGKSVNGDLTVGENIADIGGIACALDILDKMPKANYKDFFESNANVWREISTKEYGDLKLENDVHSPNKVRSNVVLSQFDKFYEIYGIKESDKMYVNPEDRLKIW >NC_018648.1|WP_012425409.1|3388706_3389882_-|phage-replisome-organizer-N-terminal-domain-containing-protein MERKIVKLRVDMYNDTKFKIIDTMEDRDLIHYIWTRLLTLAGKVNLEGALYLSKSIPYSIETLALEFNRSAKNVEIALMVFMDLEMIELGENNVYKVRNFAKHQNIKPKKKEDSNDKKEGCNDKSKNVHNNVDNRESDVNKFDESDCIVENQLIGNEGDNYILESLYNLWGSTYENTENSISNLNIEKHDEDKTTLHKSKDINITGAFESKIHTVNKENIQNLNKECIKENKSNSKEFVVNHDKENEISNLYNNVKVVDFNSDKKDSDVNIESINVRDNINKKDNIEIQNKDILDKINLNKASATENFLNNKSDVKNKIELKDKSDLDAEFVFSKANDNKKRSKPKMKNKKVSKKNDNEIISSWDDEADDFEICEFTDEPPKGKLIATFKV >NC_018648.1|WP_012424032.1|3390101_3390950_-|glycosyltransferase MKISIICPLYNAENYIYNLNKNLLSQERESNQELEILYVLTRSKDKSEEILKELNCNYCMIEPKDFSHSKTREMMVSFASGDIIVFISQDVKMKNKLWLKNLVTPIISGECEASFSRQICENNSIEKYTREKNYPEESRVASKKDIEKYGLLTFFYSDASSAVNAKIYRELNAYDGKDMPTNEDMYFAHKLIHAGYRIKYCADSEVYHSHDFTFKQLYNRYYDTGVFFKENSYLIKYKGNESGFTLAKYVFKRALKERNIKVIFSLLPNFGVRYIAMKIGQK >NC_018648.1|WP_012423554.1|3391196_3391532_-|EamA-family-transporter MNKFIFILLISVLVASISQVVLKKSANKQHKNLIKEYLNVQVVIGYSLLFLSTILTIFALKGLPYKSVPIIETVGYAFVLIMGRLFLEEKITKKKIIGNIIIVIGIIVFNL >NC_018648.1|WP_012423791.1|3391524_3391866_-|EamA-family-transporter MNKKYLSIIFLQAIIVIYTLSGICAKLASAHKLLSVEFIGFYGLEILVLGVYAILWQQVLKRFDISVAYANRSVTLIWSLIWSVLFFGEKITVPNIIGTIIVILGIVVVNLDE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018648_3 | 3.2|2143835|36|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT | 2143835-2143870 | 36 | NC_018648.1 | 1998000-1998035 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.2|2143835|36|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1998000-1998035, mismatch: 0, identity: 1.0
attttcataatgttttaatgtagtaattactatttg CRISPR spacer attttcataatgttttaatgtagtaattactatttg Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018648_3 | 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT | 2144421-2144454 | 34 | NC_015498 | Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01, complete sequence | 268855-268888 | 9 | 0.735 |
NC_018648_3 | 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT | 2144421-2144454 | 34 | NC_018492 | Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence | 25432-25465 | 9 | 0.735 |
NC_018648_3 | 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT | 2144421-2144454 | 34 | NZ_CP016317 | Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence | 224845-224878 | 9 | 0.735 |
NC_018648_3 | 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT | 2144421-2144454 | 34 | NZ_CP045274 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence | 7126-7159 | 10 | 0.706 |
NC_018648_3 | 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT | 2144421-2144454 | 34 | NZ_MK275620 | Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p2, complete sequence | 13577-13610 | 10 | 0.706 |
NC_018648_3 | 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT | 2144421-2144454 | 34 | NC_008265 | Clostridium phage phiSM101, complete genome | 19383-19416 | 10 | 0.706 |
1. spacer 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015498 (Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
caggcgataatattaaagaaaaagtaagtataac CRISPR spacer ttgcaaataatatgaaggaaaaagtaagtatgaa Protospacer . * .******* **.**************.*
2. spacer 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
caggcgataatattaaagaaaaagtaagtataac CRISPR spacer tagatgaaattattaaagaaaaagtaagtggagt Protospacer .**..** * *******************. *..
3. spacer 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
caggcgataatattaaagaaaaagtaagtataac CRISPR spacer tagatgaaattattaaagaaaaagtaagtggagt Protospacer .**..** * *******************. *..
4. spacer 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
caggcgataatattaaagaaaaagtaagtataac CRISPR spacer ataaagataatattaaagaaataataagtcaatc Protospacer .. **************** *.***** * *
5. spacer 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK275620 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
caggcgataatattaaagaaaaagtaagtataac CRISPR spacer cttttaaaaattttaaagaaaaagtaagaatagt Protospacer * ..* *** **************** ***..
6. spacer 3.11|2144421|34|NC_018648|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008265 (Clostridium phage phiSM101, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
caggcgataatattaaagaaaaagtaagtataac CRISPR spacer cttataaaaattttaaagaaaaagtaagaatagt Protospacer * ...* *** **************** ***..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
17535 : 45420
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018648|17535:45420|DBSCAN-SWA AATGTTAGATTTAAAGAGAATAAGAAATAATCCAGAAGAAATAAAGAAATTATTATCAAATAGAGGAGAAGATTTTGACGTAGCAGTTATAGATGAAATTGTAACTTTAGATGAAGAAAGAAGAAAAATATTAGTTGAAGTTGAAAGCTTAAAGAGTAAAAGAAATCAAGTTTCAGCAGAAATACCTAAGTTAAAAAAAGCTGGCGAAGATGTTACTGAAATAATGAATGATATGAGAAAACTAGGAGAAGAAATTAAAAACTTCGATACTAGAGTAAATGAGATAAATGAAAGAATAGAATACATAATGCTTAGAATCCCTAACATTCCAAATCCAGAAGTTCCAGATGGAGAAACTGATGAAGATAATGTTGAAATTAAAAAATGGGGAGAACCTACTAAATTTAATTTTGAACCTAAAGCTCACTGGGATTTAGGAACTGATCTTAATATCTTAGACTTTGAAAGAGGTGGAAAGGTAGCTGGATCTAGATTCACAGTATACAAGGGATTAGGAGCTAGATTAGAAAGATCAATAATAAACTACTTCCTAGATAAACATACTACTGAAAATGGATATACTGAAATATTACCACCTTACATGGTTAATAGAGATAGTATGACAGGAACTGGTCAATTACCTAAATTTGAAGAAGATGCATTTAAAGTAGAAAATAATGGATACTTCTTAATACCAACAGCAGAAGTACCAGTTACAAATATGTATAGAAATGAAGTTTTAAGTGGTGATATTTTACCAATAAAACATGCAGCATATTCAGCTTGTTTTAGAGCTGAAGCAGGATCAGCTGGTAGAGATACTAGAGGTCTTGTAAGACAACATCAATTCAATAAAGTAGAATTAGTTAAGTTCTGTAAACCAGAAGATTCTTATGCTGAATTAGATAAATTAGTAGAAGATGCTGAATCAGTTTTACAAGGATTAGGATTACCTTATAGAATAGTTAGAATATGCAAAGGTGATTTAGGATTTACTGCAGCATTAAAATACGATATAGAAGTTTGGATGCCAAGTTACAATAGATATGTAGAAATTTCAAGTTGTTCTAATTTTGAAGATTTCCAAGCTAGAAGAGCTAATATTAAATATAGAGAAACACCAAAAGATAAGCCTAAATTTATCCATACTTTAAATGGATCAGGTGTTGCAATAGGTAGAACTGTAGCAGCAGTATTAGAAAATTATCAAAAAGAAGATGGAACAGTTGAAATTCCAGAAGCAATAAAAAGATTTATGAACGTAGATTTTATAAAATAATTAGTTTTAATATATAAATAATAGTCTACATTAACATATTAAGTTGATGTAGACTATTATTATTTATAAAATTTTTTATTATATAAATATAGTGAAATGCAGTAAAACAGCTACTTTAAAAAGAAGTTTAACTATAAAAGTTATAATTTACATAAAAATATAAGATTTTTTAACAAATTATGTTGACAGACTATATATATGTTGATATAATAACTCATGTAGTCACGGAGAGATGGTCGAGTTGGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCGTGTGAGCGTACCTAGGGTTCGAATCCCTATCTCTCCGCCACTTTTTTTTTATATAGAATTATTTAGAAGGCACATGGAGAATTACTCAAGTGGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGCGTAGGTCGGGCAACTGGCGCCCGGGTTCAAATCCCGGATTCTCCGCCAAAACATCTAGTATTTTTACTAGATGTTTTTTTATTCTTCAGAAAATTATATTTAAAAAAATTTGTGATAACCCAAATTATAATCTTGTTTAAGGGTTAAGAAATAAAACCTAAAAAATAATAATATATCGCACAATTATTCATATACTACGTTGGAAAAGGTGCATGGCTAAAAAATCGATTACGTTAAATTAGATATAGCTATACTTAATTAAAAAATTGTAACGAAATTCTTTTAATTATATTGACATATTAGATATTAGTTGTTATAATAAATTTCGTAAGTTGTGGAGAGATGGTCGAGTTGGTTTAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGTGCGTGTGAGCGTACCTAGGGTTCGAATCCCTATCTCTCCGCCATTAATTTTTTATATAAAATTAATTAGAAGGCACATGGAGAATTACTCAAGTGGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGCGTAGGTCGGGCAACTGGCGCCCGGGTTCAAATCCCGGATTCTCCGCCAAAACACCTAGTATTTTTACTAGGTGTTTTTTTGTTATATAAAATTATAGAATTTATATAACTTGTAGAATTAATTAATTTTCTAATTTTAAATTAGAAATAGGTTATGATAATTAGAATAATAAATTTTATAATTAGTATTTGCTTTAAAGATACATTTTTGAGCTTAATTAGGTAATTAAACTTTACCACTTTCCATAAAAGCTAAATATTTTTCTTAACTCAAATAGTAATATTTGCAAATATGATGCAGCATTTTTATTAGAGATAGTATAATAATAATATAAGTAATTGTTAAGAAGGTGAACTATGCTTAAAGGGGAAAAAGTTTATTTAAGATTAATGCAAGTTAGCGATATTAAACGTTTATATGATTTATCTAACGATTATGAAGTAAAAAAATATAATGATAAGATGTTAGATATTGATGAAAAAATTCATATTGATGAAGATTCAAGTAATGTTAGCATATATGAAAGAAAAGCAGTAAGTATAATTAATAAAAAGAATGTTTTAGTAGGATTTATGACTTATAAACCAAATGATTATTGCAACAATGTTTATTCAATAGGTATTACTATAGGAAAAAAATATTGGAACAGAGGGTATGGTCAAGATTCTATAAAAACATTAATTAAATATTTGTTTGATGATTTAAATGCAAAAAAAATACAATTAGAGGTTGCGGCAGAAAATATAAGAGCTATAAAATGTTATAAGAAGTGTGGTTTTGTTGAAGAGAAAATAAGGAAAGCCATATATTATATAGATGGAAAGTATATGGACATAATAATTATGGGCATTCTAAAAAAAGAGATGGCTTTATAAATTATTAAATAAAAATATAGGAGTAATTATGAGTATAAGGTTTATTTATGGAAGAGCAGGTAGTGGAAAGAGTTTATTTTGTATAAATCAGATAAAAAAGTTAATAGATTCAGATAAAGAAAAGAAGATAATATTATTAGTTCCAGAGCAGTATACTTTTACTACTGAAAATAAGGTTTTAAATCACATAGGTGAGAGAGCAGCTTTAAATACTCATGTATTGAGCTTTAGAACTATGTGTCAAAAGGTATTTGAAGAATGTGGTGGAAGAGTAAAACAAATTATAAAAGACACTGGTAAGCACATGTTAATTAACAAAGTATTAAATGAAAAAATAGATGATTTAAGCTATTTTAAAAAAATGTCTAGAGAGCAAGGTTTTAATAATATAATATCTGAATTAATTACTGAATTTAAAAAATATAATATAGACATAGATGCTTTAAGAGATTTAACAGATAAAATAGATGATAATGAATTAGTTGAAAAGATAAGAGAATTATCTTTAATATATGAGGAGTTTAATGTAAAAATGCACAGCTCTTATATAGATACTGATGATGAGCTTACTTTGTTAGCTAAAAAGTTGTTAGCTAATAATATTTATGCAAATAGCGAGATTTGGATAGATGAATTTACAACATTTACTCCTCAACAATTAGAGATCATAAGGATAATTTCTAAGACATCAGTAGTTAACATAACTCTTTGCATGGATAAGATAGAAAATAGTGATGCTGAAGACATAACTAATGTATTTAGTAGTATTGAGAATACAGAAAACAGGATATTAAAGTTAATGGAAGAAAATAATATAGGTTATTTAAATCCTATTAATTTAAATTCTAAGTTACCATATAGATTTAAAAATAGTGAGGAATTAGCTCATATAGAGAAGTATTGCATAACATATCCATTTAAATCTTATAAGGGAAAAAATAAGGATGTAAGATTATACAAAGCAAATAATACCTATGATGAAATTGAAAAAGTAGCTCAGGATATAATTAGATTAGTAAGGGATAGAAATTATAGGTTTAGGGATATATCTGTAGTGTGCAGAAATATAGAGGACTATAATAAGATAATTTCTGTTATTTTTAATGATTATGAAATACCATTCTTTATGGATAAAAAAATAAAATTATTAAATAACCCATTAATTATTTTAATAACTTCTGCATTTGAAGTTTTATTAAAAAATTGGTCATACGAAAGTGTATTTAAATACTTAAAGAGCGGACTAACAGGCTTTAATACTTATGATATTGATAGATTAGAAAACTTTGTATTAGAACATGGAATAAAGAGTTATAAATGGAATGAAGAAGAGATTAAAAAGCTTAAAAATATAAGCATAGAAAATGGTGCTACCGAAGAAGAACTCACTATATTCAATGTGATGGAAGAGGTGAGAAATTCACTTATATCATTCCATAAATTAATAGAAGGTAAACACAATGTTAGAGATATATGTAAAGCTCTATACGAATTTTTATTAAGTATTAAAGCTTTTGAAAGAATAGATGAATGGATTATTAAGTTTGAAGAATTAAAGCTAGAAGATAAAGTAAAAGAGTATAAACAAGTAGAATCTATTGTAATAGATATGTTAGATCAAGCTGTAGAAGTTATGGGATCTGATGTAGTAGATACATTTGAATTTTTTAAAATATTAAATTCTGGTTTTGAAAATGAAGAAATAGGTGTTATACCAGTAGCTTTAGACCAAGTTAATGTTGGAGATATAGCTAGGATAAAAGGTAGAGAAGTAAAGGCATTATATATAGTTGGAATTAATGATGGGATATTACCAGCTGCACATAAAGATGAGGGAATTCTATCAGATAGAGATAGAATTGAACTTAAAGAGTTTGGAGTAGTATTAGCAGCTGATGGTAGAAGTAAAGCTTTTGAGGAACAGTTTGTAGTGTATACGGCATTAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018648|17535:45420|20616_24075_+|WP_012423101.1|DBSCAN-SWA 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>NC_018648|17535:45420|40285_41512_+|WP_012423878.1|capsid|DBSCAN-SWA MKFKTISEAFNYYRNHNTGDIEKRAAEIGNLINTDPNVDMESLNIELEGLKQAKTNIEERSQQQEQFNPVAGMNFNNNSTEVPKGDIFASNEYRSAFFKNMLGQRLTDMEQRTFKRAMEIVDTEKRADAFSTTTSAAAVLPTQTLNEVISKARTMGGLISSCRNFNIPTNLSVPIGTPSTKAAWHVEGAAVETKEPAISSVSFAAYEIIKVMSLSAAAKKMSIQAFESYVTEELTNCVMETIADSLVNGTGSAQGTGILTGITWNISNSFTFAKAGVPVYTDFTKMVAMLKRGYGAGAKFAMNNSTLYNLVYSLVDLNGRPIFIADPKNEEIGYILGKPVVIDDNIADDVVLLGNFNYMGYNIPQGIIIETSRDSSFKSGLIDYRALAIADTKPLVDETFVKLSRASS >NC_018648|17535:45420|33016_34171_-|WP_012422737.1|integrase|DBSCAN-SWA MASYEQLTKYNWKATVSLGYENGKQVKTRKQGFKTKKDAEIWVTDTLGKKHKGYIALTNSNILFKDYINKWFNEYKVLNVSINTKNDYIYRINAHVVPMIGNYKLSELSTSIIQDFYNKLISEKGMKPVSAKKVYDIVNGCLKYAKKSKLIYDLPTDIEKQKLVKPEIEFWTKKEIDFFLDKINDLYLYSPVFLDVLTGLRVGELCGLRWCDVNLESGYIEVNSQVIQDRINKELIFSSILKTSTSHRNISIPPVLIDFLKAMKEDNNALENDFVILSREGLMCNPRNLSMNFTKTVAKYKKSIDDIEKENKEVPKDYMQLKQISFHGLRHTHATLLIFNGENIKVVSDRLGHRDISITLNTYTHIMDDMKSNTATLLNNLFKK 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>NC_018648|17535:45420|29420_30230_+|WP_012424208.1|DBSCAN-SWA MNKTDNFFKKFINCIYNLKALITYPKYGIWKAILYVLLMSIILGGIRGITIGYKIDRELSNLSTMLQEDKYKFNIVDGVLHTENSPLKIEETSSLIYIDENKSLNEIDDLRDITVHNDNNILFLKDGVSLEAGMYKQQAHYKELIGDSKLDNSILFGELSYVLKIIVAIVILYTILFTFINTLINCLFVTAFASFSLIIMKVFMKYSILYSLSLYACTLPFIFQIILQSIFPNINLDTMFIVGTLVYVIFILKYIKDGMTKTKLNKDGM >NC_018648|17535:45420|45102_45420_+|WP_012424770.1|head|DBSCAN-SWA MRKDKKITILEYVNGVDEDNLPLEEYVPVKGAENIWAYYRHLSGKEFYAAATTNSKVDVIFQINWRQGIDTTMKVLYNNKEYYITQIDDFEGKKTDLKIYAYKIN >NC_018648|17535:45420|39726_40284_+|WP_012423118.1|head,protease|DBSCAN-SWA MKEIRNSQIQSNSDLELIGTPIVYDEPTIINDPLGNYTEIIKRGALDTADLSDIRLLYNHDTSKIPLARVPKTMGFNVDDKGLHMRATLPNTEEAKAVHTAVCRGDLTGMSFAFKVPKDGSFYDSKTNTRTITKIEKVYECSVVPYPAYQNTSIEARNQITEVQKLESQKDQAKIKINQILKGSI >NC_018648|17535:45420|41952_42495_+|WP_012425794.1|integrase|DBSCAN-SWA 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24 | Clostridium_phage(33.33%) | tRNA,protease,head,terminase,tail,integrase,portal,capsid | attL 35638:35656|attR 52063:52081 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
585662 : 594017
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018648|585662:594017|DBSCAN-SWA TTTAATCCTGTCTTCTTCTTCTTTTTTTCAATTGATCATCTTGAATTTTTGGTATAGAAGTTGTAATTTCTAATAGTCTTTTTTTTCGATTCTTTTTCTTATTATATTCTATTGCTAATGTTAATATAATAAGCAATGTAACTCCAGAAATAATAGCCCCTATAATCAAATTCCTTTTATTCTTCTCTATAAAAGAATAAATATCTTCTTTTATAGAATAATTTCTAGAAATACCTGCACATAAATCTAATTTACATAATTCTTTATCGTTTAAATATACAGTACCTTTTAATATAACATCGCCTTCATTAAAAGATAATCTATTTAGATTTTTATTTTCAAATTTAATATAAGTATTAAGTTTGTCTTTATCTTCATTTGGAACAACGCAATTTACATCTTTTGAAGCAATAAGAGGAACTGTTAGACCATTATGTAACTTAATAGAATCTATTTCCTGTCCTTTTTTATAGATATTAGAAAAATAAAAATTATTAAATCCATAATTAAAAACAGTTCTCATATCTTCAAAATTTTTATCTTTATCTAAAGCATTAAGATACGATGCTACTAAAATATGCCCATTGTTTTCTGCAGCTACTGTATATGTATGATTTGATTTAGTTGTATAGCCATTTTTACCTGTAAGGGTATATTGATAATAATACATTGAATTCTTATTTATCATATGATTTTTATTATTAATCCATATTGTTCTAGATGAATCATTTTTTATTGGTATTTCATATGTCATAACTTTAGATAATTCTAAGAATTTATCATTTTTAATAGCTTCATTCATAATTAGGGCTAAATCATGAGCAGTAGTTAAATGCTCTGGATCAGGTAATCCACTTGGATTTTTAAAATGGGTATTAACGGCTCCAATTTCAGTAGCTTTTTTATTCATAAGCACTGCAAATTTATCAATAGAAGAAGAAACATGGCAAGCTAAAGCGTTAGCTGCATCATTCCCAGATTCTAATAGAAGCCCAAGTAATAAATCTTTTACAGTAACAATATCACCTTTTAAAAGACCTATAGTTGTACCATCAATCTTTGTAAAATCTTCAGTAACTACAACTTCTTCATTTAAATCACAATTTTCTAAAGTTAATATAGCAGTCATTACCTTAGTCGTTGAGGCCGGCTCCAAAACTTTATCGGGATTTTTACTAAATAATATTTCTCCAGTTGATGCATCCATTAAAACAGAACCTTCTGCATTTATCTCAGGAGGGGATGACACTGCCATTACATTAATGGATGAAACAAGAAATATAAATAGGAAAAAAATAAGTGTTTTTAAATGTGATTTCATAACATTCTCCATAATATTAAAATTTTTTATTACAACAGTTTTATTTTACCAAAGAAAAATATATTATGCTATAAAAATATGAATTTTGATAATAAAATTGCATTATTATGTATATAATTTAAATAAATGGATGAAAAACTGTTGAAAAATTTAAAAATAAACTTATTATTATACTAAAATGTAAATATTAGTTTAAGAAATAAAGGAGGTTTCAATTTGATTAATAAAGCTAATAAAAAAATTGGAATAATAGCAATTTTAGTTATAATTCTAGTAGTATGTTTATCTACATATATTAAAAGCGGAAAAGACAAATTAGTAAAAAATGATAATACTTCAATTTTTGTTGAAGAAGAAAACCCAAATATTAATGAAGATGAAAAAATAGAAAAATTAAAAGATAAAAATATAGTAGTTGAAATAAAAGGAGAAGTAAAAAAACCTGATGTATATCAATTAAATGATGAGAGTATAGTTAAAGATGTTATTGAAATAGCGGGTGGATTAACAGAAGAAGCAGATATATCCAATATAAATAGAGCTCAAAAACTTAAAAATCATGAATTAATATATATACATAATAAAAGTGAAGTAAAAGATAATGTAAGTTATGCACAAAATACTGTTACTACATCTAATAATAGTGGAAAAATAAATATAAATTGTGCACAACTTGAAGAATTAAAAAATCTTAATGGAATAGGTGAAGCAAAAGCTAAAAGAATTATAGAATATAGAGAAAACATAGGTGCATTTAATTCAATAGAGGATATTAAAAACATTGATGGAATAGGTGAAAAAAGTTTTGAAAAATTAAAAGACCAGATAGATGTTTAGAACGGAAATATATTATATATTTAAAAATAATTGTTACATTTTTTGTGATTGACACATATTTGAAATATAATAATGATACAATAATTTATTGTATTGTGGTATTCTAATAAGTAGTATTAATCTAAAAATATAATATAAATTTATATAAATATAATGAAAAATAAAAACTAGGGGGATTTTTAATGTCCAAAAAAATTTGCACTATAATAATGACTTTAATGATTACAACATCATTAATTGGATGCATTAGTATAGATAGTAATAAAGCAGAAGATAAGAATAATGCTAGTACTGCAACAGAAGTAAAGAATTCAGACGAAAATTTACAAGGATCATGGGCAGAAGATTATAGTTTAGAAAAAACAAAAGGATATTTTAAAGACTATTTATCTAAGATGGAAAAAGTTACAGAAGAACTTGGAATGAAGTATTCTAAAGAAGATGTAGTAAAAGAAAATGATGGAAGCACCATAAGTGTTAATTCAATATACTTTGACAATGAAAAACCAGATCCAAACAAAATAGAAAGTATGTATTTTGGAATGAAGATATTTGGAGAAGATTTATCATCAGGAGAAATTGAATTAAAGTTAAGCTTAAACTTTGATAGTGCAGAAGTAATAAAATCAGGAAACTTTGATTTAGGAAATACATCATTTAGTAAATACATAGCTGCATTTACAGGACAAAGTAGCAGAGATTATTCAGAAATAAATAAAAAAATAATAGATGGATTAAAAAGTGAAAAAGCTGAAGGCATTATAGAGAATTCAATAGATGGATTAAAGGAAGAAATAAGATTTAATAAAAATTATATAGTATATAAATTAAGTACTAAAACGTATGATTTTAAAAATCCAAATCCAACTTTAGAAAATAATAATTAATATAATTAATAAGGGGGAAAATACCTTGAGTAAAGAAGAAAATAATATTAATGAAAAAGAAGACACTATATTGAATGACACAAAAGCGAAAGAAGAAACTAACAATGAAACAAAAGAATTGTTAATGGGAGAGACGAATGAAAATAATAGTAATGAAGAAGAAAAACCATCATTGCTAAAAAAAATATTTGCGAGTGTTATAGATCAGTTGGTTACAATTTCTATTTCAGGAATAGCATTAATTATATTTGATTTTATTATAGGATTTATGGGATATAAGGTATCTATGCCAATAGGAATTTTAATTATATTCTATTTTATAGTAAATGCATTATATATTCCATTAATGGAGAAAACTAAATTAAGAAAAAGCATAGGAAGAAAAGTTATTAATATAAAGTAATTATAGGAGAACATATATGAAAAGAGGAAGCGAAGTAAAGGTTAAAATCGAAAAAACACAATTTCCATCGACAGGGATAGGATATTTAGAAGATAAGCCAGTATACGTGAAAAACACATATCCAGGTCAAGTAGTAACTGGTAGAGTTAAAAAGAATAGAAAAGAATACGCTGAATTAAAATTAACAGGTGTAGAGGAAAGAGCAGATTATGAAATAGATGCAATATGTCCTCATTTTGGATCTTGTGGAGGATGTTCATCTCAAACATTATCTTATGAAAAGCAGTTACAAGTTTTAGAAGATGAAATAAAAGATTTATTCAAAGAAGCTGATGTAACTACTGGAGAGTTTTTAGGGGTACTTGGAAGCTCAGAACAATGGGAATATAGAAATAAGATGGAATTCACATTTGGCGATGAAGAAAAAGGTGGAGATCTTTCAATTGGAATGCATATGAGAGGTAAATCTTTTGGAATAATGACAGTTGATCATTGTAAGATAGTTGATGAAGATTATAGAAGAATAATAAGATTAACTGCAGATTATTTTGGAAAACAAGACTTACCATATTATAGAGTTATGAAAAGAGAAGGATATTTAAGACATCTTGTGATAAGAAAAGCTCAAAATACAGGTGAAATATTAGTAAATCTTGTTACAACAACTCAAATAGATTTTGATTTAAGTGAATATGTTGAATTATTAAAATCTCAAGATTATAAGGGTACATTAGTATCAATACTTCACACTGAAAATAACTCATTTTCAGATGCAGTAATACCAGAAAAGGTAAATGTACTATATGGAAGAGATTATATACAAGAAAAATTATTAGGACTTGATTTTAAAATTTCACCATTCTCATTCTTTCAAACTAACACAAAAGGTGCAGAAAGTCTTTATTCATTAGTTAGAGATTTTATGGGAAGTTCAGAAAATAAAGTTGTATTTGATCTTTATTGTGGAACAGGAACAATAGGTCAAATAGTTGCTCCTAATGCTAAAAAAGTTGTAGGAATAGAACTTATAGAAGAAGCAGTTGAAGCAGCAAAAGAAAATGCTAAATTAAATGGATTAAATAACTGCGAATTTTTGGCAGGAGATGTAGCGGAAATAATAAAAACAGTAAAAGATAAACCAGATATAATTATATTAGATCCGCCAAGAAGTGGTGTCCATCCTAAAGCTTTAGATTACGTAATAAAATTTAATGCACCAGAAATAGTATATGTGTCATGTAATCCAAAGACTTTAGTAACAGACCTTAAAGTATTAATTGAAAGAGGTTATAAAATAATCCAAACACAAGTGAAAGATATGTTCCCGAACACGCCTCACGCTGAAACTATAGTTAAGCTAATCAAGTAATAGAGCCATTTAGGATAATAAAATAAGTGAAAAAACTTCTAACTTCCACCATTCTTCCACCCTAAGTATTAAGATGGTGGAAGTTTTTTTATTGCTTCTTCAAATAATCTAACACTATCTTGAGACATTTTTTTAGTGACATGAGAATAAACATCCATAGTAGTGGCTAATTTACTATGTCCTAGTCTTTGCTGAATATCTTTTATATTAGCTCCAGCTTCTAAGAGCATGGTAGCATGAGTATGTCTTAAGGAATGAAATTTAAAATCTATGCCTAACTCATAATTTACAACTTTACTTAGATATTTAAGACTATCAGTTGTTAACAATTCACCATTTTCTTTTAAACATACAAAATCATAATCATGTTTAACATAAAATGGTCCATATCTTAATTTATTTTCTTTTTGATCTTTATGGAATTTTTTTAATAATGAGAGAAGCGTATTACCTATTTTTATAGTTCGATAGCTACTATGCGTTTTGGGAGAACCAAATACCCATTTTTTGAATTCATTTCTATAAAGAATTTTTTCAACTCTTAAAGTCTGATTTTCAAAATCTATACAATCCCAAGTTAATGACATAACCTCAGCAGCTCTTAGTCCTGTATTAAAACTAATTTGAAGTGGTATATACATATTACTTCCATAAGGAAACCGTTTTAATATATTGTTGTAATCTTCAAGTGTAATAATTTTTAAATCATCAGGATTATTTATGAGTTTTGTATTGTATTTAGGCATTTTTACGAAAGTCATAGGATTTTCTTTAATAAAATTACTAGGGTATACAGCATATTTAAATGCTCCACTAAGAACTCCATATAAATTACCTAAATAATTTTTACTAAATCCATTTCTATATTTTAAATTAATTAGTTCTTGCAAACGAGAGGATGTTATTTTTTTCAATTGATATATACCTAGACTAGGTTTTAGATGATTTTTTATTAAACGTTTGTATGAAACTTGGGTGCTATATTTACAGTTTATTAAAACATATTCGTTAAACCAATAATCAAAATAGTCACTAACACTAATATTACTTTCAGTAATTATAGTACCTACATTGTCATATTCCGATAAAGCTTTTCTTAAAGCTTCTAATGCTTCTTTTTTTGTGTTACCACCAGCTCTTTCAATTTTTTTTCTTTTTCCATCTGATTTTGCAACATCAAAATAGTAATACCATTTATTACCTCTCTTTCTAACACTTCCTTGCATGTTTCAACACCTCCATATTTAGTGTTTTGCATTTTGAAGTATTTTTTTCATTAAAATTAGTTTTTGTATTCTGTATACAGATAGATTTTTTATATAAACTTTTTTCATAAACAATCTTATTACCAAATGTTATCTTTAAAACATTATTCCATATCATAATAAAATCCCCCTTATTTTATGCAGAACAAATGTTCTAGTGTAAATTATATCATTTTAATAAATATTTTTCCAATAAATCTAAATATTTTTTAAAAAATTAAAAATACCACATAAAAATTAAAAATTAGATAATTATTTACAAAAAAAAAATCATAGATAAATCTATGATTATAATATACAGATTATTTGTTTTTTGAATTATTAATTAACTTTTCAATATCTAGTCCAACTGCATCCAATTGTTTAAGCATATTATCAACGTCTTTTGGAGTTAACTTATAAGGATAATCTTTATCTATTTCTAGTTCTACAGTTTTATCATGTAATTTTCCTAAATAAATTTTTGCACATGGATTATCAGTTCTTCCTAAAATATAGTCTATACTACAATCAAAATAATCAGCTATTTTAATTAAAACATCATCTTTAGGAAATCTATTACCCTTCTCCCAATTTGTAATGGTAGCAGGCTCAACATTCATAATTTTAGCAAAATCTTTACTTAATAAATCTTTACTTTCACGTAGCTCCTTAAGTCTTTCTGGAAACTTACTCATATTGTATCACCTCTAAATAGATTATAAACTATTTGTTAATAATTTAATCTTAAATTAACTAAATGAAAATTAAATTTTGAAAAACTGTAAAATTACTATTGAAATTATCGTTTAGTTAATCTATAATATAATAAAATTAACTAAATGAAAATAAAATAAAAATTAATTAGCAAAAGGTTAATTGAATAGGAGATGTAAAATGTATAGCAGATTAAAAGGACTTATGGTAGAAAATTCTATTACACAACAAAATTTAGCTAAGATACTTGATATATCAATAAGCACTTTAAATTTTAAGATAAATGGAAAATCTGATTTTACCATAATGGAAGCTAAGAAAGTTTCAAGAATTTTAAATAAGAGTATTGAAGAAGTATTTAATATATAAGTAAATATTAAATTATTAGTATTTTAAGTTATAGATAGTGGAGGAGATAAGATGACAAGAGTACTAAAAACAAAAGAATTTAGAGAATTAAAAAATTTAACAGTATCTAAGCTTTCATATAAAAGTGGTGTTGCAATTGGATATATAACAGAACTTGAAAATGGTAAATATAAAAATCCTAGTTTGCAGATTATATGTAAGTTAAGTAAAGCATTAAATATAACACCTAATGATTTAATAGATAAGAATTTATGGAATTAAAAAGGGGCGAGAGATTATGGAAGCAGTTTTGTATACGGTATCAGAAGCGGCAGAATTATTAAAAATTAATAGAAATTCAGTTTATGATTTGTTAAAACATAATGTTATCAAGGGTTTAAAACTTGGAAGTTTAAAGATAACAAGAAATGAATTATTAAAATTTTTAGAAGAGAATAATGGGAAAGATCTATCAAATCTAAAGGAAATTAAAGAATTAAATTTTGATAAAGTAGATTAGAAATTACATGAAGATTATTTCTTCATGTAATTATTTATATAGATTTAAATGATTTTGTTTATAGGAGTGTGAAAATAGTGTCAGATGTTAAATGGATTAAAATAACTACTAATATGTTTGAGGATGAAAAAATTAGATTAATAGATGCTATGCCAGAAAGAGATACAATTCACTATATATGGATTAGATTATTAGTACAAGCGGGAAAAAATAATGCTAATGGATTTATATTTTTAAGTGAAAGCATTCCATATACTGATGAAATGTTGTCCACAATATTTTGCAGGCCATTAACATCTATTAGGCTTGCCCTAAAAACATTAAAAGATTTTGGCATGATAGAAGTAGATGAAGACAACCTTATTAAGATTACAAATTGGGAAAAGCATCAAAATGTTGAAGGATTAGATAAGGTTAGGGAGCAAAATAGAATAAGAGCTAAAAACTATAGAGATAAGAAAAAACAACTTAAAGCAGCTGATGAAAATGAGGATATTGAAGATATAAGTAGTTCGGAAAATGAAGAAGAGATTGTCCAAAATTTGAATGAAATTGAGGGTAACGTTACGAAAAAAAAACGTAACGTTATGCAAAATGAAAATAACGTTACAGTAACGGAACAGAATAAGAGGAAGAGTAAGAATAAGAATCAGAAGAAGAATAAGAACTCTATCATAGATAGAGAGAAAGAGAGTAATGATACTAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018648|585662:594017|588001_588706_+|WP_012424544.1|DBSCAN-SWA MSKKICTIIMTLMITTSLIGCISIDSNKAEDKNNASTATEVKNSDENLQGSWAEDYSLEKTKGYFKDYLSKMEKVTEELGMKYSKEDVVKENDGSTISVNSIYFDNEKPDPNKIESMYFGMKIFGEDLSSGEIELKLSLNFDSAEVIKSGNFDLGNTSFSKYIAAFTGQSSRDYSEINKKIIDGLKSEKAEGIIENSIDGLKEEIRFNKNYIVYKLSTKTYDFKNPNPTLENNN >NC_018648|585662:594017|592859_593069_+|WP_012423366.1|DBSCAN-SWA MTRVLKTKEFRELKNLTVSKLSYKSGVAIGYITELENGKYKNPSLQIICKLSKALNITPNDLIDKNLWN >NC_018648|585662:594017|591687_591861_-|WP_012425763.1|DBSCAN-SWA MIWNNVLKITFGNKIVYEKSLYKKSICIQNTKTNFNEKNTSKCKTLNMEVLKHARKC >NC_018648|585662:594017|585662_586982_-|WP_041712129.1|DBSCAN-SWA MKSHLKTLIFFLFIFLVSSINVMAVSSPPEINAEGSVLMDASTGEILFSKNPDKVLEPASTTKVMTAILTLENCDLNEEVVVTEDFTKIDGTTIGLLKGDIVTVKDLLLGLLLESGNDAANALACHVSSSIDKFAVLMNKKATEIGAVNTHFKNPSGLPDPEHLTTAHDLALIMNEAIKNDKFLELSKVMTYEIPIKNDSSRTIWINNKNHMINKNSMYYYQYTLTGKNGYTTKSNHTYTVAAENNGHILVASYLNALDKDKNFEDMRTVFNYGFNNFYFSNIYKKGQEIDSIKLHNGLTVPLIASKDVNCVVPNEDKDKLNTYIKFENKNLNRLSFNEGDVILKGTVYLNDKELCKLDLCAGISRNYSIKEDIYSFIEKNKRNLIIGAIISGVTLLIILTLAIEYNKKKNRKKRLLEITTSIPKIQDDQLKKRRRRQD >NC_018648|585662:594017|588731_589109_+|WP_012423953.1|DBSCAN-SWA MSKEENNINEKEDTILNDTKAKEETNNETKELLMGETNENNSNEEEKPSLLKKIFASVIDQLVTISISGIALIIFDFIIGFMGYKVSMPIGILIIFYFIVNALYIPLMEKTKLRKSIGRKVINIK >NC_018648|585662:594017|589125_590478_+|WP_012422699.1|DBSCAN-SWA MKRGSEVKVKIEKTQFPSTGIGYLEDKPVYVKNTYPGQVVTGRVKKNRKEYAELKLTGVEERADYEIDAICPHFGSCGGCSSQTLSYEKQLQVLEDEIKDLFKEADVTTGEFLGVLGSSEQWEYRNKMEFTFGDEEKGGDLSIGMHMRGKSFGIMTVDHCKIVDEDYRRIIRLTADYFGKQDLPYYRVMKREGYLRHLVIRKAQNTGEILVNLVTTTQIDFDLSEYVELLKSQDYKGTLVSILHTENNSFSDAVIPEKVNVLYGRDYIQEKLLGLDFKISPFSFFQTNTKGAESLYSLVRDFMGSSENKVVFDLYCGTGTIGQIVAPNAKKVVGIELIEEAVEAAKENAKLNGLNNCEFLAGDVAEIIKTVKDKPDIIILDPPRSGVHPKALDYVIKFNAPEIVYVSCNPKTLVTDLKVLIERGYKIIQTQVKDMFPNTPHAETIVKLIK >NC_018648|585662:594017|592045_592420_-|WP_012423607.1|DBSCAN-SWA MSKFPERLKELRESKDLLSKDFAKIMNVEPATITNWEKGNRFPKDDVLIKIADYFDCSIDYILGRTDNPCAKIYLGKLHDKTVELEIDKDYPYKLTPKDVDNMLKQLDAVGLDIEKLINNSKNK >NC_018648|585662:594017|593384_594017_+|WP_079991382.1|DBSCAN-SWA MSDVKWIKITTNMFEDEKIRLIDAMPERDTIHYIWIRLLVQAGKNNANGFIFLSESIPYTDEMLSTIFCRPLTSIRLALKTLKDFGMIEVDEDNLIKITNWEKHQNVEGLDKVREQNRIRAKNYRDKKKQLKAADENEDIEDISSSENEEEIVQNLNEIEGNVTKKKRNVMQNENNVTVTEQNKRKSKNKNQKKNKNSIIDREKESNDTN >NC_018648|585662:594017|590546_591704_-|WP_012425469.1|integrase|DBSCAN-SWA MQGSVRKRGNKWYYYFDVAKSDGKRKKIERAGGNTKKEALEALRKALSEYDNVGTIITESNISVSDYFDYWFNEYVLINCKYSTQVSYKRLIKNHLKPSLGIYQLKKITSSRLQELINLKYRNGFSKNYLGNLYGVLSGAFKYAVYPSNFIKENPMTFVKMPKYNTKLINNPDDLKIITLEDYNNILKRFPYGSNMYIPLQISFNTGLRAAEVMSLTWDCIDFENQTLRVEKILYRNEFKKWVFGSPKTHSSYRTIKIGNTLLSLLKKFHKDQKENKLRYGPFYVKHDYDFVCLKENGELLTTDSLKYLSKVVNYELGIDFKFHSLRHTHATMLLEAGANIKDIQQRLGHSKLATTMDVYSHVTKKMSQDSVRLFEEAIKKLPPS >NC_018648|585662:594017|593085_593307_+|WP_012423488.1|DBSCAN-SWA MEAVLYTVSEAAELLKINRNSVYDLLKHNVIKGLKLGSLKITRNELLKFLEENNGKDLSNLKEIKELNFDKVD >NC_018648|585662:594017|592619_592808_+|WP_012423892.1|DBSCAN-SWA MYSRLKGLMVENSITQQNLAKILDISISTLNFKINGKSDFTIMEAKKVSRILNKSIEEVFNI >NC_018648|585662:594017|587198_587819_+|WP_012425312.1|DBSCAN-SWA MINKANKKIGIIAILVIILVVCLSTYIKSGKDKLVKNDNTSIFVEEENPNINEDEKIEKLKDKNIVVEIKGEVKKPDVYQLNDESIVKDVIEIAGGLTEEADISNINRAQKLKNHELIYIHNKSEVKDNVSYAQNTVTTSNNSGKININCAQLEELKNLNGIGEAKAKRIIEYRENIGAFNSIEDIKNIDGIGEKSFEKLKDQIDV |
12 | Clostridium_phage(33.33%) | integrase | attL 589647:589663|attR 601737:601753 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
916608 : 967917
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018648|916608:967917|DBSCAN-SWA AATGAGAATGAGAAAAAAGCCATGGGCAAGACCAGAACTTGAAAGTTGTAACTTTTTTATTGTAAATCCTAAAGAAAACAAAGGTAAGTGGAATGAATCATTTAATAATGAAAATCCTATTTACTTAGAACTTGGATGCGGTAAAGGTGTGTTTGTAGCTGTACATGGTTCTGATAATGAAAATATTAATTATATTGCAATTGATATAAAAGACGAAGTGCTAGGTTTAGCTAAAAGAAATATAGAAAAAGCATATAACGAGAAAAACAAAGAATTAAATAATATTAAATTGATGGCTCAAGAGATTGGTCTTATTAATGAAATATTAGATGAAAATGATAAAATAAGTAGAATTTATATTAATTTCTGTAATCCTTGGCCTAAAAAGAAACATAAGAAGAGAAGATTAACTCATACAAGACAGTTAATTCAATATAGAAACTTTTTAAAGGAAAACGGAGAGATTTGGTTTAAGACAGATGATGATGAATTATTTGAAGAATCTCTTGAATATTTTAAAGAAGGTAAGTTTAGAATTGAATATATAACTTATGATTTACATACTAGTGGCTTTGAAGGAAATATTCAAACTGAACATGAAAGAATGTTTACTGAACAAGGAATAAAAACTAAGTTTTTAATAGCAATAAAAGAAGACTAGAAAATTAACATAATATCTATTATAGGTTATGTTTTAAAATTGTATTAATACCATAGTGTAAAGTATTGGCTAGAGCATGGTATTTTTACTGAAGTGTTATTTGCTGAAATATTAATAATTATTTAAAACATAGCTATTATTAAAATAAGTGTAGGAGTGATTTAATATGAACGGAGTATGGATAGAAGTTAGAGTAATAACAAGTTGCGAAGCAATAGAACCTATATCAGGAATATTTTATGGATTAAACAGTCAAGGTGTTGCAGTAGAAGATCCAAACGATTTATTAACAAGAGATCAAGGACCATTAACTTGGGATTTTGCAGATATAAATGTATTAGAGCATAAAGGTGAATTTGCAGTGGTTAAAGCTTATTTCTCTGGGGATGATGATTTAGAGAAGATAGTTTCAATTACAAAGGAAAAAGTTAAAGAAATTCAAGAAATGGGAATTGATATAGGAAAAGGTATAGTTGAATGTGACAAGATAAAAGAAGAAGATTGGGCAAACAACTGGAAAAAGTACTACAAACCATCAAATATTACAGATAGAATAGTCGTAAAACCTATGTGGGAAGAGTATTCACCTAAAAATGAAGAGTTAGTTATTGAATTAGATCCAGGAATGGCATTTGGTACAGGAACACATGAAACTACAAGAATGTGTGTCAAAGCATTAGAAAAGTATGTAGAACATGATTCGACTGTGTTTGATGTTGGTTGTGGTTCTGGTATTTTAGCTATAGCAGCAGCAAAGCTTGGAGCAAAATTGGCTTTAGGAGTTGATTTAGATCCAGTAGCAGTTGAATCAGCTAAAGAAAATGTAGGGTTAAATGATTTAGATAATATTGAAATATTAGAAGGAAATCTTCTTGATGTAATTGATGGAAAAGCTGACATAGTAGTTGCGAATATAATAGCAGAAATTATTTGTATCTTAACAGATGATGTTAGTAAAGCTCTAAATAAAGGTGGATTATTTATTACTTCAGGAATAATACATGAAAGAGTAGATATGGTTACTTCAAAACTTGATGAATGTGGATTTGAAGTTATGGAAGTAAACAAAGATGGAGAATGGAATTGTATAGTTGCTAAATTAAAATAATCTTATTTATTTTAAATTTTTTGATAATGCAATATAAAAAAACATTATCAAACATTGTAGTTAAAAAAATTTAATTTAAGAGGGAGATTTTTATGCATAAGTTTTTTACTTCAGCATGCAATATAACAGGATCAGAGGGGAAAATACTTGGTGATGATGTAAAACATATATATAAGGTTTTACGTTTAAATGAAGGTGAAAAAGTAGTTTTAAATAACTGTGAAGGTAAAGAATACTTAGGAGAAATTCAATCTGTTGGAAAACAAGAAGTAATAGTAAATATATTAGAAGAATTAAGTACTAATAATGAAAGTAGAGTAAATATAACTTTATTTCAAGGATTACCTAAAGGACAAAAGATGGATTTAATAGTTCAAAAAGGAACAGAACTTGGTATAAAAGAATTTGTGCCGATAATAACAGATAGAGTAGATGTTAAATTAAAGGGCGAATTTAAAAAGCTTGAAAGACTAAATAGAATTGCGTTAGAGGCAGCTAAGCAATCAAAAAGAAGTATTATACCAAATGTAAGAGAAGTTGTTGAATTTGATGAAGCTTTAAATGAACTACAAGGATTAGATCTAATTTTAGTCCCTTATGAAAACGCAGAAAATTTTGGTTTCAAAAGTCTTGTGAAAGAACTAAGTGATAAAAATGTAGATTTAAATTCTATAGAAAATATAGGAATTGTAATAGGACCAGAAGGTGGATTTGAAGAGAGTGAAATTGAAACTTTAAAACACAAAGGTGCTTATATAATAACTTTAGGCAATAGAATTTTACGTACAGAAACAGCAGGATTTGTAGCTACTTCTTTAATACAATATGAATTAGCAGATTTAGGAGGAATTGTTTAATGAAAGTTGCATTTGCTACATTAGGATGTAGAGTTAATCAATATGAAACTGAAGCGATGACAGAAAAGTTTATAAGAGAAGGTTATAGTGTTACTGACTTTGACGATTTTGCTGATGTTTATGTTATAAATACATGTACAGTTACAAACATGGGCGATAAAAAATCAAGACAAATAATAAGTAAGGCTAGAAGAACTAATAGTGATGCTATAATTGCAGTAGTTGGATGTTATTCTCAAATAGCACCAGAAGAAGTCTCTAAAATTGAAGGTGTAGATGTTGTTTTAGGAACAAGAAATAAAGGAGATATAGTATATTTTGTTAATAAAGCTAGAGATGAAAAAGCAATACAAGTAAGTGTCAATGAAGTTCTTAGAAATAAAGAATTTGAAGAACTTAATATAGAAGAATATCAAGATAAAACTAGGGCTTTTTTAAAGATACAAGATGGATGTAATAGATTTTGTACATTTTGTTTAATACCATATGCAAGAGGGGCTACTTGTTCTAAGAAACCAGAAAAAGTTCTTGAAGAAGTAAAGAAGCTAGCAGAGCATGGATTTAAAGAGGTTATTCTATCTGGTATACATACAGCTTCTTATGGTGTGGATTTAGGCACAGGAGTGACGCTAATAAGCTTGCTTGAAGATATAGAGAAGATAGAGGGAATAGATAGAGTTAGAATTGGCTCTATAGAACCAGCATTCTTTACTGATGAAGTTATAAATAAAATAAAGAATATGAAAAAATTATGTCCTCATTTTCATTTATCACTTCAAAGTGGTTCTGATGCTACTTTAAAGAGAATGAATAGAAGATATACAGCAGATGAATATGCTAAAACAGTTCAAACATTAAGGGATAATATTCAAGATGTATCAATTACAACTGATTTAATAGTAGGGTTCCCAGGTGAAACTGAAGAAGAATTTAATGAAACATATGAATATTTAAAAAAATTAAAATTAACTAAAGTTCATTTATTTAAATATAGTCCTAGAAAAGGAACTAAAGCAGCAGAAATGCCAAATCAAATAGATGGTAATATTAAAGATAAGAGAAGTAAAATATTATCAGAGTTAAATAAAGAAAATGAAGTAGACTTTGTTAAGAAATTAGTTGGTAGAGAAATGGGTGTTTTAATAGAAAGAGAATGCTCAAATAAACCGGGAATTTTTGAAGGATATACAAAAAACTATGTAAAAGCTGAAATTTCTGATGCGAGTGAAGAAATGATCGGTAAAATTATGAATTGTAATATAGAAGATTACGAGGATAATTATATTATTGGGAAAATAAATTAGAGATTTGGTATAATAAATGTATGAAAATAAGAAAATATAATTATCTATAAAGTTATATTTTCTTATAGGCTATGTTTTAAATATATATTGATATATACAACAGATAAAGTGGTGCTATAATTAGAATTTTAGAATGCTGACTAGAACCTTATTTAAATATATATCGATATTGTATTAAAGCAGAATCTTTTGATAATATTTTTAGGAGGTGAATTTATGGGAGATTGTATATTTTGTAAAATTATAAAAGGTGATATTCCAAGCAAAAAGTTATACGAAGATGAACTTGTATATGCTTTTTACGATATAAATCCAGAAGCACCAGTTCATTTTTTAGTTATTCCTAAAGAACATATAAAAAGTGTAAATGAGTTAAATGAAAAAAATATTAATGTAGTTTCACACATCTTTAAAGTAATTAATAAATTAGTAGTAGAGCTTGGTATTGCTGATAGTGGATATAGAATAGTTAATAATTGTGGAGAAGATGGTGGCCAAACGGTGAATCATATGCATTTTCACATTTTAGCTGGTAGAAACTTGCAATGGCCACCGGGTTAAAATTTATAATATAATTAGTTAGACATTTTATTCTAAGTTGTTGACATTAATCAGTTTAATATTGTATAATATACCGTGTGTTATAAAGCCCATAGCTGAGTTAATTAATTTAAGCTAGCGGAGGGAGGGATAGTAAATGTCAGAAATTAAAGTTGGAGAAAACGAGACACTTGAAAGTGCTTTAAGAAGATTTAAAAAGAAGTGTGCTAGAGCTGGGGTTCTTTCAGAAGTAAGAAAGAGAGAACATTATGAAAAGCCAAGCGTTAAGAAAAAGAAAAAATCAGAAGCTGCTAGAAAGAGAAAGTTTAAATAAAATGGTTTCTTTTGAAAGAAGGTATAACAATGCCAACAATTAAGGAAAAACTTCAAGAAGACTGGAAAGCCGCTTTAAAGGCTAAAGATAAATTTAAAGCTAATACAATTAGTACAGCTAGATCTGCTATATTATTAGTTGAGAAAACTGATAATGTTAAGCTTGAGGATGATGAAGTTATCAATATTTTAGCAAA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|
60 | Clostridium_phage(63.33%) | tRNA,coat,terminase,head,protease,tail,integrase,portal,capsid | attL 920170:920185|attR 955359:955374 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1127458 : 1137693
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018648|1127458:1137693|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018648|1127458:1137693|1131696_1132176_+|WP_003371243.1|DBSCAN-SWA MKVAIFFGSKSDTEIMKGAANALKEFNVDYKAYILSAHRVPEKLEETIKMVESKGCEVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPINAALDGLDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLALQMIALKDDELRERLIEFRENMKKNFIDENGEGVEL >NC_018648|1127458:1137693|1134435_1135437_+|WP_012422618.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYRSVKLIKEYAAKTMSEYVLNGLGSFTGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGRLEAEVASDLVKGISDGCIQSDCALIGGETAEMPGFYDEGEYDMAGFAVGIVDKEKIINGSRIKEGDKLIGIASSGIHSNGYSLVRKIFTDLNEDFKGEEVWKTLITPTKIYVKPILNLLENFDIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGRELTAVINKDSYPLPAIFERIIEKGVDKDHMYNTFNMGIGFVLAVNEKDVEPIIKALIAMGEKAYEIGYVTSGGEGVCLK >NC_018648|1127458:1137693|1136187_1137693_+|WP_012424513.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFNKDGVLDFAKFLVSKDIEIVSTGGTYKYLKENGIDVIEINEVTNFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNKEHMKVLEEREIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLTFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISNINDYEVVKSEIKNDGQVSLKTKKKLSGKVFNLMSAYDGAIANFMLGDEEEYPEYLSVSYKKMQNLRYGENSHQSAAVYSSTMVDGAMNTFETLNGKELSYNNFKDVDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVATGENSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAQEMVKIFLEVIAAPDYDEDALEVLKTKKNLRVLKFHNTPKAEKCMVTVDGAILVQDEDNKLIDEIKVVTEKKPSDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALRRGKGATILASDAFFPFRDVVDKAAEGGIKAIIQPGGSMRDQESIDACNEHGIAMVFTGFRHFKH >NC_018648|1127458:1137693|1132175_1132883_+|WP_012424889.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKQIYATDKADEVVIYYKDDATAFNGEKKGQITDKGVMNNKITSILFEQLEKQGIKTHFIKKLNDREQLCKKVSIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGTKLKTTVFEFSYKDDELGDPLINSYHAVAIGAATFEEIDTILEMTAKINNILKEAFAKENINLIDFKIEFGKCADGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVEDAYIEILKRISK >NC_018648|1127458:1137693|1135424_1136039_+|WP_012425200.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTDLQSIIDAVENKEIECSIEMVIGSKEGIYALERAKNHNIPTYVVSKKEYKDKSSDKILHLIKGKVDLIVLAGYLAILDGEILKEFNNKIINIHPSLIPAFCGSGMYGLKVHEAVIKSGVKFSGCTVHYVNSEVDGGAILLQDIVPVYFEDDAKSLQKRILEKEHMLLPKAIKLISEGKVEIVDGKTKVIEI >NC_018648|1127458:1137693|1127458_1131205_+|WP_012424797.1|DBSCAN-SWA MLNIKSIFVEKKSGFDVEAQGLLRDFKENLGVTNLESVRLINKYIISDISEDYYNKALHTIFSELTVDNVYESELPINEDEIAFSVEFLPGQYDQRADSASECISLLTEEDKSYIKSAKIIALKGNITKKEIDKIKLYYINPVDSREVDINSKDITSTSNIPKDVLILSGFIDKNLEELQEFHSDYGLAMSVEDLVMIKDYFKKENRNPSITEIRVIDTYWSDHCRHTTFSTILENIEFEDNKYTSPIKKSYENYIKSREYVYGEKQKNKTLMDIAVIGMKELRKRGKLDDLDISEEINACSINVKVETDKGLEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRITGSGDPTLPIEKTLKGKLPQRTITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVQEIYHPNYIAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKLGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTIDSLNECGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNPKVAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVTKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKENADEFIRLSNEENLEATLVAHVTDTDKLRLFWRGKKIVDLDRSFLDTNGASQKVSVKVKCPVQYPYEIYDVNVKDTWINNLKDLNIASQKGLVERFDSTIGAGTVIMPFGGKYANTPAEGMAAKIPVLGGESKDATIMTFGFNPYLGTWSQYHMAYYSVIESITKLSAMGGDYRKARLTFQEYFEKLGKDEIRWGKPFAALLGAYEAQMQLGIAAIGGKDSMSGSFGELDVPPTLVSFAVGVEKASKIISPEFKGVNSKLVLLKTEKLEDGTIDMNKFKKNLEVLYKLIGEEKVISASAVKFGGVSECLTKMSLGNKIGIEFNNLTKDELFGFNYGSLLLEVKNEIDINEEFKDCLYKEVGKTISPSTIISKEYDLELDIENLEEIYEKKLNSVFKIKTEDVSQKIETVLYEKKEISSPAIKLAKPRVVIPVFPGNNCEYDCRRAFEKEGAEVSEVVFRNITKEALVESIERLKSEIDKSQIIMIPGGFSAGDEPDGSGKFIATVLRNEKIKESVMELLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPCGEIVDIREEMPTLTYNNINRHMSSIVRTKVVSNKSPWFNEVNVGDIHSIAISHGEGRFVAPEDLIKELINNGQVATQYVDLQGDVALNMPYNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGENLYRNIPGNFDQKIFKSGVNYFK >NC_018648|1127458:1137693|1132998_1134426_+|WP_012424148.1|DBSCAN-SWA MTNSEFELIMDPSLDKFKDECGVFGVYTNKPLDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIEMHKGLGLITDAFKHEDLEKLKGHIAIGHVRYSTAGGKGIENAQPILTTSKIGSIAMAHNGNLVNDDVIRELLEDAGQIFHTSSDSEVIACLIARSAKKGLTRAVVDAISAIRGSFALTIMSTDKLIGARDPHGIRPLSLGKIDEGYILTSESCALDAIGAELVRDIEPGEIVIIDEDGIHSYRYSENTLCHTCAFEYIYFARPDSKIDGLEVHTSRVRAGEQLYKEHPIDADLVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKVNIEGKRVILIDDSIVRGTTSKHLIESLKSAGVKEINFLIASPGVKYPCHFGIDTPYRSELIAANNSVEEIRDIIGADYLGYLSEDGVKESCRGKKGFCMGCFNGIYPVATPIETPNQFER |
7 | Prochlorococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1988427 : 1996564
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018648|1988427:1996564|DBSCAN-SWA 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ATCTAGTGTAGTTTCTTTAGAATTATAAATTAAACTTACAGATATATTTAAAAGTAATTCTTCTACAGAAACTACAGTTACAGTTGCTCCTATAGGTCTTACTTCTTCTATATGCTGCTTAACTTTATCAATTAATTCTTTACTAGCAGCTCTTTTATTACTATTAGAAATAACACATTTTACAGTGCCATTTCCATTCCAAAGTGGATATACTTTTGCACTTCCACAGCCTTCTGTTTCCAGACACCATTGTTTGTAATGATAGTCGTTTCCTGATGTCACTGGAGTTTGTACCTTTAACAAGTATCTAGCGTATAAATCTTCATCTGTTTCTTGGGCATAACCATTAGTTGCTGCTTCTTTATTGGCAATACTAGTTATCCCATTATATTTTATCGGTAAATAATTTATCTCTCCAACCTTCGCATTGTATTTACTACCTGGGTTCTCTGCTTTTATAATAACTTTTCCATGGCCATCTTGATCTAATACTAAATCATTTTGTGTTAAATATAATCTGTTATCTTTAATTCCTACAATACTATTTGCCTTTAAATTTGCATTTGGAGAACCATTTACATCAATTTTAGTGCTGGCATAAGTTGGTTGTTTTCTTTCTATTCCAACTTCTTTTATTCTCATTTCTAGATAATTAGAATATCCACTTTCTAAAGCAGAACTAGCAAATACTTTTTTTGTAGCTTCATCTAAATCCAATAAAGCAGTTGATAATTTAATACATACTGGCATACAAGAGTTATAAATCAAACTGCCTTCACTTGTATCAGTTTCTGTATATCCTAAGAACATTTCTTCATATATGTCCTCAGCGCTTCTGTAATAAACCATAAAATCACCTCCTAATCTATATCTACATAAAAACTATCATCTTTATTTCCATAGATACTTTCTATAGTATAATTTATCTTATAACAGCTCTTTTCTAATTCTGTTAAAAAATTACTTATTCCAGTTACATAAGTTCCATCCACTAGGCAATCGTGAAGCATTTGATATGCATAAATATCACCATTGCTCTTACTTTTTCCTATAAGCTTATGAAGTTTACTTCCAAAATTCTTACCATAGATTAAATAACCTTCACCTGCTAATGGATCTATTTTCTTTGTGTGTATTTTCCTCCATGCCTGTACTATTACTGCATCTAATCCTTCTACAATTATTGCATTCTTATTTTTATCAAGTAATATCTCGCCTGTATCAAGATTTATTGCATAATCCTTTAACAAAGGTATTTCCTTTTTCTTTTTTATATTTGTTTTAGTATTATAAAAATCTTCTGGGAAAAATCCCATTATTCAAGCACCTCCAATACACAATACTTTTGATATGTTTTCACTTGTTCATCATAATTAATGCCATAACAAGCAACGTTTAATCCAAGCTTTAGCTTTGAACGATGGTGTATAGTTGTGATAGTGTGACTATGTTTATCATTCATACTGGTTGTAATATTAACTTCTTCATCCCATGCTAGTAAGTGAGGATTGATATATAAATTTTTTTTATATAAAGGAAGACCCTCCAGCTCTACAACCAAAGGGTCTATTGAAGTAACTTTTCCTATTTCAAAAGGTTCATCAATTGTGTTATTTTTTTGTTGTAAATCTATAGAGTTCCAAAATTCATCAAATGATGAAGACATCATATCACCTCTTTTTACTTTAATGCATTTTTAGTTTTTAATATATTGTAGGCTTTTAATACTTTTGAAGCATAATATTTCTTTTCATTAGCATCCCAAGTAGGATTATGAGATTTAACATAGCTATATAGTGCATCTCCTAATTGCTTAACTGTTACAGTTGATGTATTATATCCATTTTGCTTACAGGAATTCAGAACAGTACCTTCACCACTGTTATAAGCTGAAAAAATTACATGAGATTGAATGCCAACAGCACTCATTTTTTGCTTATATTCTTTTAATCCCTGCTCTATATTATTAGCTGGGTCTGATGAACCTCCACTTACTTGCATTAATCCGTAATACGAACCTCCACAATAAGGATTTCCTTCACTTTCTATTGCAATAATTGCAGCAGTAACATAAGCATCTATTTTATATACATTAGATTTATTTATAATAATATCTTTAAAATTATATTTGCTCATATTAGAAATAAATGTATTACAATTACCTTCAACAGCAGTTAAATTACTCACATATTCATCTGGAACACCTTCAATATTAATGTCTGCATATCCAGTCTTACTTACTGGTATTACTCTTTTAACAGAATAAATATCTGTTCTTGTAACATCTACAGTTTTTACTACATCTCCAGTTCTTGGGGCATGAAGCATTTTATTATCACCAATATAAACACTAACATGAGCTGGTGCTGGATAACTACCATTACCAATCCAAAATAATAAATCTCCTGGTTCCCAACTCTCTTTACTATTTTTATCAACCTCAGTTCCTTGTTTACATTGCTCATAAGTAGTCCAACCAAGTGTTAGTCCTAATTCTGCTTTGTATTGGTTGTAACAATATTCTACTAGACCACTACAGTCAAATGTATCTGGTCCATGTGCACCCCAAACATATGATTTGCCTTCTTGTTGTTTTAAAACAGAATAAATTTTTTCCCATAAAGCAGAACTTGAAGCTGAACTTCCTTCTTCATCTTCATCATCATATAAATCTGTCCATTCCATTTCATCCATAACACGTGATGGTGTTAATGTAAGCTTACTTATAAATAAATTATTAGATTTCCATTCGTGTTCTACTTCTTTAATATACATAAAACAATCTTCGTAACCTTGCAAAAATGGCGCAACTAAATGAACTCCAAAACCTACTCTATAGTCTATATCTCCAATACATTCTACTTCTATAGTTTGCTTAGGCTTGCAGTTCTCATTTAATATTCTTTTTGCTTTTAAAGTTGGATCTTCTTTTTTAGATTTAAAAATAATATCCTGTATAAGTCCATATTTTTTAATAATACCACTAGGAGCTGTTAAAGTATTATTAATTGCCTTAGCTTCTTCTCCAGTTGTTTGATCTGTTAAATTCTTTAATCCTAATAATTCATTTACTTTTTTAGTTCCTAGTGTTTGTGCTTTTCCAATACTCATATGTTCAAGTTCAGGAGATTTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018648|1988427:1996564|1995106_1996564_-|WP_012425660.1|DBSCAN-SWA MAKSPELEHMSIGKAQTLGTKKVNELLGLKNLTDQTTGEEAKAINNTLTAPSGIIKKYGLIQDIIFKSKKEDPTLKAKRILNENCKPKQTIEVECIGDIDYRVGFGVHLVAPFLQGYEDCFMYIKEVEHEWKSNNLFISKLTLTPSRVMDEMEWTDLYDDEDEEGSSASSSALWEKIYSVLKQQEGKSYVWGAHGPDTFDCSGLVEYCYNQYKAELGLTLGWTTYEQCKQGTEVDKNSKESWEPGDLLFWIGNGSYPAPAHVSVYIGDNKMLHAPRTGDVVKTVDVTRTDIYSVKRVIPVSKTGYADINIEGVPDEYVSNLTAVEGNCNTFISNMSKYNFKDIIINKSNVYKIDAYVTAAIIAIESEGNPYCGGSYYGLMQVSGGSSDPANNIEQGLKEYKQKMSAVGIQSHVIFSAYNSGEGTVLNSCKQNGYNTSTVTVKQLGDALYSYVKSHNPTWDANEKKYYASKVLKAYNILKTKNALK >NC_018648|1988427:1996564|1990338_1990548_-|WP_012425395.1|DBSCAN-SWA MFNKKIFEVHFKQEGEDCNVHVKINTEVDTDGLITKDELEKIKNITLNIYKRVNIKNGDDKYKLTREFN >NC_018648|1988427:1996564|1994286_1994742_-|WP_012423346.1|DBSCAN-SWA MGFFPEDFYNTKTNIKKKKEIPLLKDYAINLDTGEILLDKNKNAIIVEGLDAVIVQAWRKIHTKKIDPLAGEGYLIYGKNFGSKLHKLIGKSKSNGDIYAYQMLHDCLVDGTYVTGISNFLTELEKSCYKINYTIESIYGNKDDSFYVDID >NC_018648|1988427:1996564|1994741_1995092_-|WP_041712207.1|DBSCAN-SWA MSSSFDEFWNSIDLQQKNNTIDEPFEIGKVTSIDPLVVELEGLPLYKKNLYINPHLLAWDEEVNITTSMNDKHSHTITTIHHRSKLKLGLNVACYGINYDEQVKTYQKYCVLEVLE >NC_018648|1988427:1996564|1990643_1990841_-|WP_012425575.1|DBSCAN-SWA MFETCKKQYERKIERGLLTNEYVEKQKVYIGIFLMNELLIQEQYQEILELLTVNVKAEDKEVVSQ >NC_018648|1988427:1996564|1990853_1991192_-|WP_012424871.1|DBSCAN-SWA MKILTVYNSKGQLIFTQTNAIEQYSCLVEEVAENKEVIGVDLETNKFILTDRLATNEEKEQLKRELEAKNLELEKKNKELEIKNQNLENKELESLKLTDKVIELTAKNLINQ >NC_018648|1988427:1996564|1992600_1993218_-|WP_012424817.1|DBSCAN-SWA MQLKDYVPSFLSGDKILSKVYEEQQKQIDSTNADIQDLINQCFVETATWGLDTWEKELGIQSNIGDSYSIRRSRILAKLRGQGTTTIEAIKNICKSFVEDVEVIEHNSEYYFQINLLSHSGFSKGFDTLYDSIREVKPSHLNTNYILRAITETDFRVVMVGLQGEIIKTFPWTPNNLAYKADVKIPLMQPKSFENIRTYPVEEGL >NC_018648|1988427:1996564|1989702_1990257_-|WP_012422817.1|DBSCAN-SWA MNLQKIKELENLKEELRQYGSKYENLSNERRHNYIVAAHNDFISFFKAKGFTINDRSKEIEAVYGSAKIKIDKYDEEEWYVGCYAVWNMSCKINKSKYRILLNKLGKYPTLSATYGGSKELSEDEKLDKDIELTKESIIKKKKDIEEFDTVKLGYGLINENEQNTDSKYPQFESMKKLLENIFE >NC_018648|1988427:1996564|1988692_1989478_-|WP_012425097.1|DBSCAN-SWA MKNCFKKILVMFVMVLTIMGIGAIQNRNIVNAATVGEQLLQPEEGWRRYDDNDGNISYIGDGWYYGTNIESQNGMLHANIGYGEARFNFTGSKIRIISNADQETGFSDNIKITIDNKIIDTYSQNIKAKSEGMILLYENTSLKNGTHTVKISKEDDSKYIEIDTIDIDGVLLPYEEIEQPEEPYKPDEDDSNKTGAILIINLVDGETKVYDVTTSEAKKFIDWYDKHDKETYRFDKDVNEKISVNEYVVHDKITFFEIRRY >NC_018648|1988427:1996564|1988427_1988628_-|WP_012423300.1|DBSCAN-SWA MDELIRVALGQGLGYGMFACLLVYVLKTTGERELKYQELLDKMADKFNVVEDIKEDVKEIKLKIEK >NC_018648|1988427:1996564|1993207_1994275_-|WP_012424061.1|plate|DBSCAN-SWA MVYYRSAEDIYEEMFLGYTETDTSEGSLIYNSCMPVCIKLSTALLDLDEATKKVFASSALESGYSNYLEMRIKEVGIERKQPTYASTKIDVNGSPNANLKANSIVGIKDNRLYLTQNDLVLDQDGHGKVIIKAENPGSKYNAKVGEINYLPIKYNGITSIANKEAATNGYAQETDEDLYARYLLKVQTPVTSGNDYHYKQWCLETEGCGSAKVYPLWNGNGTVKCVISNSNKRAASKELIDKVKQHIEEVRPIGATVTVVSVEELLLNISVSLIYNSKETTLDKIKENIRNSIEEYLKKVALNINYISIAKIGALILSSDGVEDYNNLTINSSATNVTVNDNQIAVLGEVVCNAT >NC_018648|1988427:1996564|1991209_1992601_-|WP_012425528.1|tail|DBSCAN-SWA MAEKFYSILTNIGKAKVANSIGLGTKVNFSKMKVGDGGGSYYEPTESQTDLKNVVWEGNINHVTVDEENPNWIHIEVMIPSTVGGFTIREYGAFDDENNLIGICKCAETYKPVIADGSTKELLLDLILCVVNTDTVELKVDPTIIFAKKGEVEQLRTDINIQLKDIANDSYPIVEATGTNIYVGSTARITKLSKGTRCTLFVNTDSNGNCSLNLNNYGVKNIKDSFGNIVTNLKSNIPYNLCYNGSDFILQGKGGGGNLIPKYLLQGYYGDGDNGRVDGSMVNRGAPVVNLNCGGTFNLQEGYYSGGQAIANNLASQTSANATASQILSGFSAWVNGNKINGSATIESLGGKKFKSGTLNISNLQTKSYNVVNLENNTLTNSTRNVNEISLELDFVAKFLIIHSNSYTNSISVKFNDICIAIYDESSSGYDRVNCYRVNQNNNTIPIDLSTYAKTFTYYAFGD |
12 | Clostridium_phage(71.43%) | tail,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2001172 : 2025187
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018648|2001172:2025187|DBSCAN-SWA 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40 | Clostridium_phage(50.0%) | portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2325825 : 2363952
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018648|2325825:2363952|DBSCAN-SWA 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59 | Clostridium_phage(41.38%) | tRNA,head,protease,terminase,coat,tail,portal,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2811614 : 2874243
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_018648|2811614:2874243|DBSCAN-SWA 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Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3398034 : 3408384
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_018648|3398034:3408384|DBSCAN-SWA CTTACCTTAAAGAAAAATCTTCCCTATCCAATGTTAAATTAACATTATAATAATGATCTCCATCTTTAAGTTCCTTCTTCCATCGTTCTTGAAATCTTCTAACTTCACCATTAAATCTAGCTTTTCTCTCTGGTGTATCTTCAGTTCCTCTTGAGATTGATTCATAATGATAAGCTTCAGCATAAGGAGTCCATACAATTAAATACCCAGCTTTTCTAATTCTCATACATAAATCCACATCATTAAAAGCAACTTCAAAAGTTTCATCAAATCCATTAATTTCATTAAATATACTTTTTTTCATCATAATGCAAGCTGCTGTTACTCCTGATACATTTCTAGTAAAAAATAAATTTCCCATGTACCCAGTAGCATCTCTATTAAAATGTCTAAAATAATGTCCAGCTAATGTTAATATTCCTAGACCCAATCCTGCATGTTGAATAGTATCATTAGGATAATACAACTTCGCACCAATTGCTCCTACATCTTCTCTTTGAGAATACATTAACATTTCTTCTAACCAATTCTCACTTATAATTTCTATATCATTATTTAAAAACAATAATTGATTTCCCTTTGCATATCTAACTCCAAAGTTATTAATAGCAGAATAATTAAATTTACCCTTACTTTCATACGTAACAACTTTAATATTTTTATATTTTTCTAAAGTTTTATAATACTCAAAAGTTTTTTGTTCTGTACTGTTATTTTCTATTATTATTATTTCTATATTTTTATAAGTTGATTTTTCTAATATAGAATTTATACATCTAGAAAGATCTATAATATGATCTTTATTAGGTATCAATATTGAAATTAATTGGTTATCTATTATAGAATATTTTATTCTATAAATATTAGGATGTACTGTAGAACTTTCTACTGTAGCCTTTAAATCACATCTAGACAAATGTTCCTTTACAGCATTAATTCCTGCTTCAATAGTATATGGTTTTGCGTATGGATCAGATGCAACTGAATTTGAACTTACTCTCCAGTGATATAATATTTTAGGTATATGCACAATATTTTTTGATTTTTCTGTTAATCTCAAAATCATATCATGATCTTGGGATCCATCAAATTCTTTTCTAAATAAACCCGTTTCTTGAATTAAAGTCTTTTTAAAAACAGTAAAATGACAAATATAATTATTAGCTCTTAAATTATCAATGGAAAAATCTGGTTTGAAATGAGGATCAAATCTCATATTAACATCTGTATCAAACTTATCCTCATCACAATAAATAAAATCAGCATTTTTTTCACAAATAACTTTCATATATTCAAATAATGCTGATTGATGTAATACATCATCATGATCAAAAAGTGCTATATATTCTCCTATAGCCATTTTGATACATTCATTTGTATTTTCCGAAATTCCTCTATTTGCTTCTAATATTTTATATTTTATACGCTTATCTTTCTTTATATAATCTTCAACTACTTTACTAACATAGCTATGTTCTTTATCACTTCCATCTGCAAGACATAGCTCCCAATTACCATATGTTTGATTTATACAAGAATTAATCATCTCACATAAAAAGTTTTTTGGAGTATTATATAATGGTACAACTATACTAAATTTAATATCTTCAGAAAATTTAGTATTAATTTGAATTTGCTTTTCTTCATCAGTTAAAATAGTTTGTTTTACATATTCATTGTAACCTTCAAAATTTATAGATTTTTGTGTTATCTTTCTTAGAGTATACTTTATACCATTTTGTTTTAAGCACTTTATTCCCTTACAAGTTAAATGTGTATATTTATTAGATTTTAAAATCTTCTTCATTAAATCTAAAATAATTCTAATTGGCTTTGTTATTTTCCAACAAGTAGAGTTTAAAATTTGATTATAACTATTCTCTATATGTTGTAATCTATTTTTAAACTCTTCTCTTTGTAATATAGCAGTATGATAATGTAGTTTGTAATATTCTAATTCATTCTTTAACTCTTTTATATTATTTTCTTTTTGAGTTAAATTATCACTTAACTCTTTTATAATATTTTCTTTCTCTAATACAGTATCTTTTACCATTATACTATTTTCATTTTCTTCATTTATTAATCGTAATTTATTTAAAATACCAATAGATGAACTATAATCAAAAGTAGATATATTAGCTTGTATCTTCAACCATTGTATTGGTTTTTCTGAACAATTAATCATTATTTGAGGATCATCATTATCAAAAACGATATAATTATCAATACAATATCCATTAAATATTTCATAATTTAAAGTTCCAATATTTGATACTATATTCATTCCACTTAGCACCACAGTTTTTCCTTCGATTGGATCAAATCTAATATTTTTCACATTTGTAGGAATATTAATTAATAAATCTATGTTTCCTGAAGATTTATTTACTTTGTATGAATAACTAATTTTTGATTCTTCATTAAAACCATTTCCAGTATCTAAATAAAGTGTAGTCTTTTCATTTTTTTCTAATTTTTCTTTCTTCATTGGAAGCTGAGCAATGGATCTCATATCTTGAATATTTTTATGTATAAAGTCTATATATTTTTGTGATAAATTTTCACTAAAAAGATTCTTTACGTTATTATCTAAATAATTATTTAATTTCAAATCATTTGTTATAACAATAAACTTTCTATAGTTATTTTCGCCACTATCATGAATAAAAATATTTTTTTTATAAAAATCATCAATCCTATCTTGAAAAGATATTAGTTCAGGAGTAGTATAGCTATAAAATGTTGATTTAGTCATTTGTTCCCACAATAAAATATCACCATGTTCAAACATTAAATAGTTCCTATTCATATTTTCAAGAATATTTTTAACTTCATCAATATTAGGTAATCCATTATCAATGTGTTCACTTAACCAAATATGATTTTGTCCAAATATAGCTTTATAATATTCATTTGCACGTATTTCAGCACTTTCAACGGCTTCACTCTTAAATGGGAAACAATTTAAATTTAATAATTTAGCAACCCTACTTGTTTCATTTAAAAACTTAATTCTTTTATCTTTAGATATATGTTCAAATACATCTGATGAAATAACAATGTCGAATTCACCATCATTAATATTCTTTAAACTTGTAGCATCGGCTTCTATAAATTTAACCTTACTATCTATCTTCTTAGGAATAGTTAAATCTGAATAAGTAATATTTTCATTAGGTAAAAATTTTTCTAAATTTAATTGTTCATTAGAACCAACCTCTAAAATATTTAATTTATCAATATTATAATATTTCTTTACAGCTTCAACTATAATTTGTATAGTCTTATATCTTTGATATTGATCAAAAGTAATTCCCATTATTTAATTACCTCCCATTTATGTTCCATAAAAAATTGACCTTCTGAAAAGTATTTATTGGTTATTAAAAAGTTGCATACATCCGACTTATAGTCTATACACACTATTCCTTCATTATTAAATATACCTACATCTATATTATAACTTCCCCCTAATAAACTCACGGATGGTATAACATATTTCACCTTATGTCTTCCATATGTATTCAGTACTTTAATCTTATCTAGATGTGTATTAGGCCCAAATATGTAATCTCTATCTGGCGTGTACAATGCAACACCTAATAAAAATCCTGATATTTCATTATCATATATCTCATATTCAACAATAACTTCTATCTTATCAAAAGTTTCAATATTAGATTTAGAGCAAGTAACTTTTGTTATAATTGCAACTATATCCTCTGAAGGTCTAATAAGATTTTTTTCTTTTATTTGTTCTTTTTCTATGATAACTTCTTCAACTATATCTTCTTTTATTTTCCCACCTTGTAACATAAAAGCTTCATATTTATCTACTATTTCACTTGATTCTCCACTATCAATAATTTCACCTTTGTTTATCCATATTGCTTTAGTACAAAATCTTTTTACTTGTTCTGTTGCATGAGAAACAAATAAAATAGTAGTTCCATTCTCTTTAAGTTCTTTCATTTTGTTGATGCATTTAGTTTGAAATCTCACATCTCCTACAGATAAAGCTTCATCTACTATAAGTATTTCCGGTTCAACATTTATAGCAACAGCAAATGCCAATCTTGCAAACATACCACTTGAATAAGTTTTTACTGGCTGATTTATAAATTCACCTATATCAGCAAACTCAATTATTGAACCTAATCTTTGTTCCATTTGTTCTCTTGTATACCCCATCATTGTTCCGTTAAGATATATATTTTCTAATCCTGTATACTCTGGATTAAATCCTGCTCCAAGCTCTAATAATGCTGATATCTTTCCATTAACTTGAACCATTCCTGAAGAAGGAGTTAATACACCTGTAATTATTTTTAATAATGTAGATTTACCAGATCCATTTGTCCCTAGTATGCCTAATGTTTCACCCCTTTTAACTTCAAATGATATATTTTTTAACGCATAATGTTCTCTGCTATATTTCTTTTTTGATATACTTAAAGCTTCTTTCATTCTATCTAGAGGCTTATCATATAATTTATATAGTTTACTTAAATTTTCTATTTTTATAGCTATATCTGACATATATATATCTCCTTACCTATAATACATCTGCAAAATGTGGTTTAAGTTTCTTAAATATAACTGTTCCTAAAATAAATAATCCTAAAATTATAACCCAAAAATACACAGTTTGAAAATATCTTTGAAAAAACCAAGCTTTATTTATAAATGTATCTCTATATCCTTCTACTATATAATACATAGGGTTTAATTTGACTATCCACTGAAAATTTTTTGGTACAATAGTATAACTCCACATTATAGGAGTCATCCACATTCCAACTTGTAAAAATATATTTATTATTTGTCCTAAATCTTTAAAAAATATTACTATTGCACTAGTTGCATATGATATTGCAAGCACCATAAAAAATGTACAAAATGAATAATATATTAACTGTATACTATATTTAGATGGATAAAATCCATATATACCTGCAACAATGAATAAAAAGCCTATGAATACAAAATGTACAAATAATGCAGAGATAACTTTTACTATAGGAAGTATACTTATTTTAAATACTACTTTTTTTACTAGGTAACTATACTCTAACATGCAATTTGTAGCATTAAGTAATGCTTCTTGGAAAAAGAACCATGGTATTATTCCAGATACTAGCCATACCACAAAAGGTACACCTTCCATTGGTGACCCAGCTTTTAATCCAAATTCAAATACAAACCAATAAACTAATATTGTAACTATTGGTTGAACAAAAGCCCATGTTATTCCTAAATAAGAACCTGCATATTTAGTTTTAAAATCATTTTTAGATAAATTCCATATTAGTGTTTTATTATTTTTTAATTCTTGAAATAATCCTAAAATACTTTTGGATTTTTTCATAAATAATAATACAAGTATATCAATAGCTATACAGATAACTAATTTCAATATATTGTTTAATATATTAATATGCTCATTAAAACTTGATACTAAATTTGAGTCTAGTTTGTATACTATATATGGATCATTACCTTCTATTTTTATATCAAAATAACCCAATTCTTCTTTTAATTGTGTAATTTGATTTTGATTGTTTTTATCTAATAATTGATTACTATCTATTTCTACTGATTTACCCTTACTTGATAATTTTATGTTACATATTTTTACATTAGAAGGTTGGTTTCCCAAATCTAATCTTAATTCTTTAGTATCCTTAGGAATTGTATATTTTATAGTTTCTTCTTTATTAATGTTTCTGTAGTTAACTTTTTGTGATTGTTCTTCATTCCATACCGTATCATTTCCATAGAAAACTTGATATATATCCTGCTTATCAGATATTATTTTATAACTCAAAGTTATATTTTTATTGTCTAAGTTACAATAATTAAATACCACTATATTTGATATAACCACTAAAAATATCAATATTACATATTTTATATACTTCCTTTTATTCATATTAAACTTATCCTCTTAATTCTGTTAAATATCTTTCCAAAGCATTTTTCCACTCAGGCATTAATTCAAATCCATTATCAACTAATGATTTCTTAGACAATCTAGAATTAAATGGTCTAACTGCCTTTGTTGGGTATTCACTTGTTTGAATGTAATTAATTTTACAATTTAATCCTGCCATTTTCATAATTTCTTCTGCAAATTCTGCCCAAGAGCATGTCCTTTCATTGGTTGCATGATAAACTCCATATTTTTCTGATATAACCATATCACATAAAAGTGGTGCTAAATCAGCTGTATACGTTGGACTCCCAATTTGATCAGAAACTACATTTAAACTTTCTTTTTCTGCTCCCAATCTAAGCATTATATTAATGAAATTATTTCCATTAATACCAAATACCCATGAAATTCTAACTATAAAATATTTATCTAAAATTTCTTTTACTTTTAGTTCACCTTTATATTTAGTTTTTCCATAAACTGATAACGGATTAATATTTCCATCTACCTCAAATGGTTTATCACCTAATCCATCAAATACATAATCAGTCGATATGTAAACCATCTTTGTATCTATTTCTTTACATGCCTTTGCTATATTTTCTGTTCCATATACATTCACTTTAGTACAAATTTCTTCTTCATCTTCTGCCTTATCAACAGCTGTATATGCAGCACAATGTATAACACATTCTGGCTTTAAATTTAAAATATATTCATTAACAGCTTTATCATCTGTTATGTCTAAATCTTTTATATCTATTCCTAAACATTCAATATCTCTTTTATTTAATTCTTTTACAACATCATATCCTAGTTGACCATTTACTCCAGTAACTAAAATCATATTTTTCCTCCTTTATAGTAAACCCTTCTTAGTCATATTAATAATATATTTAAATATAGTATTAGGTATAAACGGTAAAAAGGTTTCTATTAATATAGAAATCTTGTGAAATCTTCTATACTTTATCATTATCTTTAAGTCCTTAAGTGACAATTTTTTTGCATAATTCTTTCTTGCTTTTAACCATTCTAATGTCTCACTTATACAATTAGTTAATTCTTTTCTATAGCCTAATCTTTTTTGTAATTCAATATAACGCTCTAAAAAAATATTTATTCGCATTTTATAATATGTTTGCTTATCATAAATTCCTGTTAATATCCCTGTTTGATTAAAACTATGCTGTCTATATCTAACTAATGGTTTATTTATGAATTCTATCTTTCCTTCAATAGCTGCTATTATAGCAATCCATTGATCATGAATTAACATATCCTCAAAAGGTACAGCTTTTTTAGCAATATCTCTTTTAACCATCATTGCACATCCAGTTACAAAATTAACCATCAATAATTCTTTAGCTAAATTATAACCACTTTTATATACAATTCTTTTTCTTATATCGGTTATACTATTATGAGTTTTTATACTGTTTTCATCAATTATGCAAAGATCACTACAAACAAGTGTTACATCCTTATTTAATAGCTTTTCAACCATTAAATATATTTTTCTATCTTCCCAAATATCATCTTGATCACAATAAGCAAAAAACTCTCCATTGCCTAGCTTTGTAAGCTTTTCAAAAGCCTTATTAGACCCTTGATTTTTTTCACCCCTGATTAAAGTATACGAAAAGTTTGTAATATACTTTTTAAATAAATTTTCATCAACCGGAAATTCTGGGCAATCATCATAAATAAGTAGTTCTAAATTACCATAAGTTTGACTATTTAATGAAATGAGCTGTTCTATAAGCCAGTTTTCATTTGGCTTATAGACAGCTAATAATATAGATACTAAGCACTTATCTGTTTGCATACATATTCTCATAGTAGTTTGAATATTCACCACTTAATATATTTTCCCACCAAGTTCTATTATCTAAATACCATTTTATAGTCTTTTTAATTCCTTCATCAAAACTTGTAGTTGGAAGCCATCCAAGTTCACTATGAATCTTGCTAGGATCTATTGCATATCTCATATCATGACCTTTTCTATCACCTACAAATTTAATTAACTCTTCAGACTTTCCTAATTCATGAATAATTGTTTTAACTACATCTAAATTACTTCTTTCATTATGTCCACCAATATTATAAACTTCTCCTATTGTTCCGTTATGAATAATAATATCAATAGCTCTACAGTGATCTTCAACATAAAGCCAATCTCTGATATTTTCTCCACTTCCGTATACAGGTAATTCTTTATCATTTAATGCATTTGCTATCATTAATGGAATCAACTTTTCTGGAAAATGGTATGGTCCATAGTTATTTGAACATCTTGAAATTGTAGTTTGTAATCCATAAGTTCTGTTATATGCTCCAACTAAAAGATCTGCTGATGCCTTACTTGAAGAATATGGGCTTGATGTATGTATTGGTGTTTCTTCTGTAAAGAATAAATCTGGTCTGTCAATTGGTAAATCCCCATATACTTCATCTGTTGATACTTGATGATATCTTTTTATTCCGTATTTTATACAAGCATCCATTAAAACAGCAGTACCCATAATATTAGTTTTTAAAAATATTTCTGGATTTTCTATTGATCTATCCACATGACTCTCTGCTGCAAAATTAACTACTATATCTGGATTTTCTTTTTTAAACATATCATATACAGCTTTTCTATCTGCTATATCTATTTTATGAAAACTAAAGTTTTTACTATCTTTAACACTTTCTAATGTTTCCATATTTCCAGCATAAGTTAAAGCATCAACACAAATTATTTTATAATCATTATATTTATTAAGCATATAATGAACAAAATTTCCACCAATAAATCCTGCTCCACCAGTTACTACTATTTTCATATATTTATCTCCTCTAACCATTTATCTAAAACTCTATAATAAATTTAACAAATTCTATTTGTCTGAACTTAATCTTAGTAATATGCATAGATATTACTTAAAAATTTAGACTATCATTAAAAAATACAATCACTATCCTTTAAAAGTGGTGCTTTTTTATCTTTTTCTGAAAGAATAGGATTTTTTATTCCCCATTCAACTCCTATTTCTGGATCATTAAATCTAATGCTTCTATCACTTTCGTGATTATAATAATTATCTGTTTTATATACAAATTCAACATCATCAGTTAATGTTACAAATCCATGTCCAAAACCTCTTGGTATAAATAATTGCTTTTTATTTTCTGCTGAAAGCTCTACAGCTACCCATTGTTTATATGTAGGCGAATTTTTTCTTAGATCCACAGCTACATCTAATACAGCTCCCCTTACACATCTTACTAGTTTTGCTTGTGCATGTTTTCCATTTTGAAAATGAATTCCTCTAAGAATTCCCTTTTCTTTTGAATATGATTGATTATCTTGTATAAAATCACAAGCTATTTCTGGTGTTTTAATTTTTGAGTAAGTTTCCATAAACCAGCCTCTTTCATCTCCAAAAACTTGTGGTTCTACTATATAAACACCATCTAATTTAGTTTTAATTAAATTCATTGTTATACGCACCTCTCTTGCAATAGACAATTGATTATTGTCATTTAATAAATAACTTTATTATTTGCTACATTATATAAGTGCTTCCCATATGGACTTTTACCATATTGTTTAGCACTTTCAAGTAAAGTTTCTTTATCTATCCAACCATTTTTATATGAAATTTCTTCTAAACATGCAATCTTAAGACCTTGTCTAGTTTCAATAACTTTTACATATTCAGTTGCTTCAGTTAAACTATCAACTGTTCCTGTATCAAGCCATCCATAACCTCTTCCAAGTGTTATTACATCAAGTTTACCTTGTTCAAGATATATTCTATTTAAATCTGTAATTTCTAATTCACCTCTAGCTGATGGCTTTAAGTTCTTAGCATATTCACATACTTTATTATCATAAAAATAAAGTCCTGTAACAGCATAATTAGATTTTGGAACTTCTGGCTTTTCTTCTAATGATATTGCTTTTCCTTTATCATCAAATTCTACTACTCCAAAACGTTCTGGATCATCTACATAATATCCAAATACTGTTGCACGTCCTTCATTTTCAACTGCTCTTTTTAAATGTGCTGTTAAACCATTTCCATGGAATATATTATCTCCAAGTATCATTGCACAACTATCATTTCCTATAAACTCTTCTCCTAATGTAAAAGCTTGAGCTAAACCATCTGGAGATGGCTGAACTTTATAAGATAAATTCATTCCATATCTTGATCCATCTCCTAATAACTTTTGAAAATTAGGTAAATCATTAGGCGTTGAAATTATTAATATATCTTTAATTCCTGCTAACATTAAAGTTGATAGTGGATAATAAATCATCGGTTTGTCATATACCGGTAAAAGTTGTTTTGATGTAACCATTGTTAGTGGATAAAGTCTTGTCCCACTTCCACCTGCAAGTATTATGCCCTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_018648|3398034:3408384|3398034_3401355_-|WP_012425464.1|DBSCAN-SWA MGITFDQYQRYKTIQIIVEAVKKYYNIDKLNILEVGSNEQLNLEKFLPNENITYSDLTIPKKIDSKVKFIEADATSLKNINDGEFDIVISSDVFEHISKDKRIKFLNETSRVAKLLNLNCFPFKSEAVESAEIRANEYYKAIFGQNHIWLSEHIDNGLPNIDEVKNILENMNRNYLMFEHGDILLWEQMTKSTFYSYTTPELISFQDRIDDFYKKNIFIHDSGENNYRKFIVITNDLKLNNYLDNNVKNLFSENLSQKYIDFIHKNIQDMRSIAQLPMKKEKLEKNEKTTLYLDTGNGFNEESKISYSYKVNKSSGNIDLLINIPTNVKNIRFDPIEGKTVVLSGMNIVSNIGTLNYEIFNGYCIDNYIVFDNDDPQIMINCSEKPIQWLKIQANISTFDYSSSIGILNKLRLINEENENSIMVKDTVLEKENIIKELSDNLTQKENNIKELKNELEYYKLHYHTAILQREEFKNRLQHIENSYNQILNSTCWKITKPIRIILDLMKKILKSNKYTHLTCKGIKCLKQNGIKYTLRKITQKSINFEGYNEYVKQTILTDEEKQIQINTKFSEDIKFSIVVPLYNTPKNFLCEMINSCINQTYGNWELCLADGSDKEHSYVSKVVEDYIKKDKRIKYKILEANRGISENTNECIKMAIGEYIALFDHDDVLHQSALFEYMKVICEKNADFIYCDEDKFDTDVNMRFDPHFKPDFSIDNLRANNYICHFTVFKKTLIQETGLFRKEFDGSQDHDMILRLTEKSKNIVHIPKILYHWRVSSNSVASDPYAKPYTIEAGINAVKEHLSRCDLKATVESSTVHPNIYRIKYSIIDNQLISILIPNKDHIIDLSRCINSILEKSTYKNIEIIIIENNSTEQKTFEYYKTLEKYKNIKVVTYESKGKFNYSAINNFGVRYAKGNQLLFLNNDIEIISENWLEEMLMYSQREDVGAIGAKLYYPNDTIQHAGLGLGILTLAGHYFRHFNRDATGYMGNLFFTRNVSGVTAACIMMKKSIFNEINGFDETFEVAFNDVDLCMRIRKAGYLIVWTPYAEAYHYESISRGTEDTPERKARFNGEVRRFQERWKKELKDGDHYYNVNLTLDREDFSLR >NC_018648|3398034:3408384|3407505_3408384_-|WP_012425432.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPLTMVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKDILIISTPNDLPNFQKLLGDGSRYGMNLSYKVQPSPDGLAQAFTLGEEFIGNDSCAMILGDNIFHGNGLTAHLKRAVENEGRATVFGYYVDDPERFGVVEFDDKGKAISLEEKPEVPKSNYAVTGLYFYDNKVCEYAKNLKPSARGELEITDLNRIYLEQGKLDVITLGRGYGWLDTGTVDSLTEATEYVKVIETRQGLKIACLEEISYKNGWIDKETLLESAKQYGKSPYGKHLYNVANNKVIY >NC_018648|3398034:3408384|3402591_3403968_-|WP_041712297.1|DBSCAN-SWA MNKRKYIKYVILIFLVVISNIVVFNYCNLDNKNITLSYKIISDKQDIYQVFYGNDTVWNEEQSQKVNYRNINKEETIKYTIPKDTKELRLDLGNQPSNVKICNIKLSSKGKSVEIDSNQLLDKNNQNQITQLKEELGYFDIKIEGNDPYIVYKLDSNLVSSFNEHINILNNILKLVICIAIDILVLLFMKKSKSILGLFQELKNNKTLIWNLSKNDFKTKYAGSYLGITWAFVQPIVTILVYWFVFEFGLKAGSPMEGVPFVVWLVSGIIPWFFFQEALLNATNCMLEYSYLVKKVVFKISILPIVKVISALFVHFVFIGFLFIVAGIYGFYPSKYSIQLIYYSFCTFFMVLAISYATSAIVIFFKDLGQIINIFLQVGMWMTPIMWSYTIVPKNFQWIVKLNPMYYIVEGYRDTFINKAWFFQRYFQTVYFWVIILGLFILGTVIFKKLKPHFADVL >NC_018648|3398034:3408384|3401354_3402575_-|WP_012424548.1|DBSCAN-SWA MSDIAIKIENLSKLYKLYDKPLDRMKEALSISKKKYSREHYALKNISFEVKRGETLGILGTNGSGKSTLLKIITGVLTPSSGMVQVNGKISALLELGAGFNPEYTGLENIYLNGTMMGYTREQMEQRLGSIIEFADIGEFINQPVKTYSSGMFARLAFAVAINVEPEILIVDEALSVGDVRFQTKCINKMKELKENGTTILFVSHATEQVKRFCTKAIWINKGEIIDSGESSEIVDKYEAFMLQGGKIKEDIVEEVIIEKEQIKEKNLIRPSEDIVAIITKVTCSKSNIETFDKIEVIVEYEIYDNEISGFLLGVALYTPDRDYIFGPNTHLDKIKVLNTYGRHKVKYVIPSVSLLGGSYNIDVGIFNNEGIVCIDYKSDVCNFLITNKYFSEGQFFMEHKWEVIK >NC_018648|3398034:3408384|3404830_3405799_-|WP_012423850.1|DBSCAN-SWA MQTDKCLVSILLAVYKPNENWLIEQLISLNSQTYGNLELLIYDDCPEFPVDENLFKKYITNFSYTLIRGEKNQGSNKAFEKLTKLGNGEFFAYCDQDDIWEDRKIYLMVEKLLNKDVTLVCSDLCIIDENSIKTHNSITDIRKRIVYKSGYNLAKELLMVNFVTGCAMMVKRDIAKKAVPFEDMLIHDQWIAIIAAIEGKIEFINKPLVRYRQHSFNQTGILTGIYDKQTYYKMRINIFLERYIELQKRLGYRKELTNCISETLEWLKARKNYAKKLSLKDLKIMIKYRRFHKISILIETFLPFIPNTIFKYIINMTKKGLL >NC_018648|3398034:3408384|3406921_3407461_-|WP_012425702.1|DBSCAN-SWA MNLIKTKLDGVYIVEPQVFGDERGWFMETYSKIKTPEIACDFIQDNQSYSKEKGILRGIHFQNGKHAQAKLVRCVRGAVLDVAVDLRKNSPTYKQWVAVELSAENKKQLFIPRGFGHGFVTLTDDVEFVYKTDNYYNHESDRSIRFNDPEIGVEWGIKNPILSEKDKKAPLLKDSDCIF >NC_018648|3398034:3408384|3403975_3404818_-|WP_012424446.1|DBSCAN-SWA MILVTGVNGQLGYDVVKELNKRDIECLGIDIKDLDITDDKAVNEYILNLKPECVIHCAAYTAVDKAEDEEEICTKVNVYGTENIAKACKEIDTKMVYISTDYVFDGLGDKPFEVDGNINPLSVYGKTKYKGELKVKEILDKYFIVRISWVFGINGNNFINIMLRLGAEKESLNVVSDQIGSPTYTADLAPLLCDMVISEKYGVYHATNERTCSWAEFAEEIMKMAGLNCKINYIQTSEYPTKAVRPFNSRLSKKSLVDNGFELMPEWKNALERYLTELRG >NC_018648|3398034:3408384|3405785_3406805_-|WP_012424996.1|DBSCAN-SWA MKIVVTGGAGFIGGNFVHYMLNKYNDYKIICVDALTYAGNMETLESVKDSKNFSFHKIDIADRKAVYDMFKKENPDIVVNFAAESHVDRSIENPEIFLKTNIMGTAVLMDACIKYGIKRYHQVSTDEVYGDLPIDRPDLFFTEETPIHTSSPYSSSKASADLLVGAYNRTYGLQTTISRCSNNYGPYHFPEKLIPLMIANALNDKELPVYGSGENIRDWLYVEDHCRAIDIIIHNGTIGEVYNIGGHNERSNLDVVKTIIHELGKSEELIKFVGDRKGHDMRYAIDPSKIHSELGWLPTTSFDEGIKKTIKWYLDNRTWWENILSGEYSNYYENMYANR |
8 | Enterobacteria_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018653_1 | 12964-13339 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018653_1
|
3 spacers
spacers of NC_018653_1
>1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder ATTTTGATTCATTTGGAGTAATGCAAACAGGATGGCAATGTATAGATAATGAATGGTATTACTTAAATCCTGTTGCTGGACAAGGGTTA >1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder TCTGTAATGATAGTGGAAAAATGCTTAATGGTTGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATTTCTGTAATGATAGT >1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder ATCTAAACCCTAAATCAGACGGAACTAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018653_1
The CRISPR arrays of NC_018653_1 >merge|NC_018653|1|12964-13339|CRISPRCasFinder GGAAAAGTTAAAACTGGTTGGGTTAACGATAATGGAAATTGGTATTATTTTGATTCATTTGGAGTAATGCAAACAGGATGGCAATGTATAGATAATGAATGGTATTACTTAAATCCTGTTGCTGGACAAGGGTTAGGAGCTATGCAAACAAAATGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATTTCTGTAATGATAGTGGAAAAATGCTTAATGGTTGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATTTCTGTAATGATAGTGGAAAAATGCTTAATGGTTGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATTATCTAAACCCTAAATCAGACGGAACTAAAGGAAAAATGCTTAATGGTTGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATT >NC_018653|1|1|12964-13339|CRISPRCasFinder GGAAAAGTTAAAACTGGTTGGGTTAACGATAATGGAAATTGGTATT ATTTTGATTCATTTGGAGTAATGCAAACAGGATGGCAATGTATAGATAATGAATGGTATTACTTAAATCCTGTTGCTGGACAAGGGTTA GGAGCTATGCAAACAAAATGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATT TCTGTAATGATAGTGGAAAAATGCTTAATGGTTGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATTTCTGTAATGATAGT GGAAAAATGCTTAATGGTTGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATT ATCTAAACCCTAAATCAGACGGAACTAAA GGAAAAATGCTTAATGGTTGGATTAATGATAATGGCAACTGGTATT
>NC_018653.1|WP_012431102.1|8317_8830_+|hypothetical-protein MKKKLIAGVLATATVVGGVIPTTAFADVKEADNQIIIEEVQNVLPVIESESTTGSAIKIENDDKNLENEDIDEIQDLNQNEEIIVDEQQEIGISEVKELKATIDENITIGEKVNVKVIGFNATGEEIKLDKEKISYKWFADKEIVGNNDYLNITDDMANREISCRVDYRN >NC_018653.1|WP_162137538.1|8032_8221_+|hypothetical-protein MNLMFFKDIKVKHGIYVGIAPKGEQVIFNKFNRNNQGNSLTIGVPGRGSEFNMTTKFINTND >NC_018653.1|WP_012431107.1|7635_7998_+|hypothetical-protein MLDKKKVRLDKKEVKNLFVAGYIASEIADILKAKVDTVKKCIDRNFKIEEVLSIHKEKRRIKKDIKRVISNTSNRYMGTEQLIKYNRSSFNMNKNGVLVYNNDHGLAPVDLPQRFKPVLG >NC_018653.1|WP_012431109.1|7326_7563_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSSQFKKNRKNKLIDLRVKNNLSRSYVADKIGTSEDCIARIENSKQKIILDEHAVRLAKVYRVSLDDIYVASIQKSEL >NC_018653.1|WP_012431108.1|6458_7166_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKGNVLIFSKNLKKLRTFNKMKQEDLAVKIGVARSNISYYETQKSEPTLTPLINIANIFNVTINELVTVELTDDIIQEKNQQQDNITKVFSSSEIFSKNLKELRIGKNMYQIELAKEVKTSKSNISFYESGRSEPTLGVLMRICDFFNIKLSELVSKDLKPTEWIKSESDFIKKISYDLESVENKDENFLKFLYELKEYYLNQSKRLEELVQIKIPAKLKEIDNIIEFVKEKRNE >NC_018653.1|WP_012431070.1|6149_6404_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNLIKKQRIKNKISQVELANLCKVKQSQISRIETNKELPSAKLIVKLATNLNLCPSDVFSFFYENNKCDFSENDKCNSNKNEKV >NC_018653.1|WP_035784561.1|5722_5944_-|hypothetical-protein MLKDFTNIITSNEAYLELDKNIFNVLNLIKKHIPDEKIFLLEKLENLYNMQEGIGEELIYRQGILDGAKLSKQ >NC_018653.1|WP_012431065.1|5319_5679_+|hypothetical-protein MTNNQNSAKEKKRDLKPVSFNYDNERDVKLLEYAQKAGMKFGTYVKFLIEKEMNGSNNNNLDINSIANAINQLTKVIESKSFVTNSISSDNIDDKPKKLSDKDKETKNIISGILNMNSK >NC_018653.1|WP_012431085.1|4433_5327_+|ParM/StbA-family-protein MNIGIDLGNGYTKFKGKKFASKVKMGRLANFGEKNKEVHEVKYNNASYVVGEGQFFITDDRYFTNEYKICLLTAIALASNEIVIEANICVGLPVMKYMSDVKRRLEDHLNTIGAEKITVNGEEKIIHIKSVTVFVESALVVKDRSQGNEITIDIGAGTENIIQWENGVPVNFDTKNKSFYNLYNKISKYLKDVGKGDVSTEYIEKTLGQDEIIINQELVDIRDTHNIIEQHVRELASKIISEFDISRARRIRLMGGGGLPTYKYWKNIIEKVELADNAQFINSEIYETVLEMSGIND >NC_018653.1|WP_012431074.1|3416_4187_+|transglutaminase-domain-containing-protein MKSKLLKTIALTLISVNTIVYPIYAAEVPKFSNLNDVEENIYTHLINRDSNINFIYTGSTREFKDNIVKTIKAAYSKDDYTERSWLEIKPNVNISDGKINTSINFEYLTNKEQEEFIDIEIKKITDKLINDKMSDFEKVKAINDYLANRYEYDYTLSSSNVYSALITNYTVCQGYSLTAYKMLKNAGIESRIGVGTNKGASHSWNIVKIEDSWYHLDITNNDSTRSNKYFLVSDKFLEDNNYKWNRTEYPEALNNK >NC_018653.1|WP_052295166.1|13471_13801_+|hypothetical-protein MGKKKKLTGMLIVSLLMISGLSTVASAEELYIPTFCNVVTGVTDTTNEISTTSWKYIDGYWYYLKPSGEKVTGWINDNGNWYFCDSLGRMLHDTVINNFKLGSNGAWIY >NC_018653.1|WP_012431095.1|13862_14051_+|hypothetical-protein MSENSIYDFELDENFNPKKRLVIYCPTDLIEKLDKTGKKNKLSKNKFGLEIIKNYFKEQPSM >NC_018653.1|WP_157860583.1|14073_14235_+|hypothetical-protein MAKSKIDNESKELAITILKTKDIDPEEWLNEKYKEVITQNSKILIDCLKNSQI >NC_018653.1|WP_012431104.1|14247_14484_+|hypothetical-protein MDVINQLVQLGNEVVKWIQTLGVPSCAIALGVGGIQQIFGGAEGARKARPWYTGAGLGLLVILGASAIAAFLSTKITF >NC_018653.1|WP_012431094.1|14547_16767_+|type-IV-secretory-system-conjugative-DNA-transfer-family-protein MKYIRNLKMLMKNDNESNKEMKLLQFLANQKLILLSTLIVFFLVTVLANLLSNAVMYLIGGSKSFSFLVSAFKFKLLSFPIFYIVMYSFTAILLWKVFFNFKASFRTINDGQKGTSRFTTIEELKAQYRSIPEKTEEFDGKGGVPISRYKNKIFIDDSPVNNIIIGTTRSGKGEMFIFPTIDIYSRAKEKASLIINDPKGELIAASQDTLKKRGYRIELLNLLKPMNSMSYNPLQLIIDAYKKKNYSEAQSLCSTLTYTLYYDPNPKDPFWMNSAMGLVNALILAVIDECFKKSDEIEKEMEKLDKNHKEFKVLEERKDKELSKMTLYTVANMLSELGSKEDEFQRNELDNYFSKLDPSSAAKMQYATSNFSKGTTRGGIFSTAMSKLQIFTLDEIAKMTSMNSINLKDIGFKNNDNEKPTALFIVTPDYDVSNHVIASIFIRQLYYVLAKESSLNDSGKCDREVIFLLDEFGNMPPIEGMANIITVCLSRGIRFNCVIQAYSQLKKLYGDDKETILGNCGNQIYILTNENETAEEFSKLIGEETIVTYSRSGEILDSTKHQTESVDSRRLLRAEELRSLNEGETVVVRALKRRDLKNNKITPRPIFNSIKTTTDMKYRYEYLSDEIDNSKSFSTVKVESLHESVDLKELLLFNNNNKSESLENSNNDTDNNKNIIISEVFDVDEISEIRNIIRKYLSTAFEIELDTPFDLFRKFCENENNEQLMKFAEKGINRITEMG >NC_018653.1|WP_012431077.1|16771_18907_+|hypothetical-protein MNGLLLSIEGTARLLHDNNITQIADVISIGFRWIGWRIIEFLSRIINTLEASATKLCTLNGFFNSTEVNTLINRYKPLVWMILGISIAIIGMKIIFNRVKNRGDLAPNLMFSVCVLILLPVMMLKIDTMSTLAIQDLNSYNISSANTIVKNNLHDIYYLDSVNYNLTGNKNNISANDILSIDINEKLDTDNISISHRKIFKNKIIKDSNGSSVMTKLKQGWFLYEQFYRYNLDFVVTLISLGAIGITLICISLKSVRLIFEIAVNKFLATLFAFADIESGKKLKAILKHIGSMFAVLVTMSVMLKFYVLFNSYLSRIESTNPFDDFTKVIVILGVSVAVIDGPNIIEQVFGIDAGLKSGLGVMVGGYGAARVVGGIGKGIAGEFKRMLSNPAEKLKNKVKSGISEKFAGNKDKSGAGNNNLANEMKSNNDKSSNKDKNLPTLQEQMNNKKNNNNEEKGSMKDLNDRNKPIDKAINNISNKDIDKPINDAIKNLNNKDNGKPIGEAMNNLNSKDNGKPMAEAMNNVNSKDNGKPIGEAMNNVNGKDNGKPIGEAMNNVNSKDNGKPISEAMNNVNSKGNGKPMAEAMNNVNSKDNVRPMVGAMNNVNNKDNGKPMAESMNNVNNKDNGNLINESTKKLENNKENTKSMNESMKKLENNKEKNNLINESINVSGSSKNSQVINSKKNESRMNQSVKNKNSAIANEFKENGGKK >NC_018653.1|WP_012431073.1|18907_19183_+|hypothetical-protein MDQYTIPKEISSEMKFSRKFYLFDIVILISSLSIAWLFSSMVYTKIIFFYYIFIFFGTVFLLMRNKFNPKKRNFQTVYFALKRDRTVYTRI >NC_018653.1|WP_012431082.1|19294_19933_+|hypothetical-protein MKKFLDITIKNEEPKKIKLNKEEKKELKEKRKKEKFEIKELKNEEKKVFKSTKELNPIADVNENDIFLTKDGYIDIYQVESKDIYAFNQYEADLHVYNFIAFLRNYLNDFKLISMNFPVNTSRQQEYIRNKLEQSTNEINNKFLQEKLDEFMFLEQYRNNKEFFIMFFAKNKQDITSSILKNQTRIFILKEISLEKKIKILFKLNNLNTKLI >NC_018653.1|WP_012431093.1|19988_21902_+|hypothetical-protein MGLKFWDNEVKNINHNPYLLSKIQPVGGIAFNPSSIRKGDGYEACIHLYEYQTTVNTFWLEQLLNFDDVVVTVDVSTANKQDALEQINRSISENLTRIDEVANNIDKIEASNTVDNLTSLVYDITSKDEIIKIVTIRYFISARTIDELDKKAKTILERLEGLGYRGAIFLNEQEYEWKSLFLSSTEQSKLPNKRNEKGIPSISFGGGYPFHFTELNDPTGMYLGTTKTGGNVIFDLFTKDDIRKSYNALVIGLMGSGKSTLLKKILNNNGIVNNTIRIFDIAGEFKTLVRILGGEVIALDGSDGIINPLQIFATIIDEDTNEILEEQSYMQHLSKVSMMYQFLAPNANSNEIREFEKSLSNFYSSFGIDTRKATQYETNEYPIMEELIEFLLNELYENVQKGILKANITNNRQERLENIILTLEGTVRDYGKLFNGHTTIKDITNKQIVSFEVRNLVQFDKRIFNAQTFNILTMLWNNALLQGLVEKKAFDEGRKTTMEAIKYLVLMDEAHKFINSNNIMAVDYLINFEREARKYFGGLIFATQSIRDVVPDNTSSEALEKIRTLFELTQYKFIMQQDNNSKKSLAEIFDGQLTESEIETVPFMGTGDCILSINGGKNIRFHIEASDKELELFKGGA >NC_018653.1|WP_012431088.1|21903_22584_+|hypothetical-protein MNKKNIIIVALLISFIFSFIYIGSKIFKKNDTNNDIATTNNVNEVKKNNINKEDIDEKESTESDLDKKIPVESGFKTTITGGDNEQEVIENNILLDNNSTSIQNKLEAKRVAENFVQAIVSFDINDKDGTVEKATKYVCKNKIDEVRSLYTNIGKSQDMKKTIITDLYSEEENKQENNEYLYFYVAVDVDLIDNYDQQVKGTGETYLVKLLKEDGQYKIIEYYFDE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018653_2 | 27618-27744 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018653_2
|
2 spacers
spacers of NC_018653_2
>2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder ACAAGGAATGAAATTCTTAA >2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder TAAAAATGCAGATTTAAGAGATTGTGTTATAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018653_2
The CRISPR arrays of NC_018653_2 >merge|NC_018653|2|27618-27744|CRISPRCasFinder AATTAGATTTAAGCAATAAGGATTTACAAGGAATGAAATTCTTAAATGTAGATTTAAGAAATGCAAATTTTAAAAATGCAGATTTAAGAGATTGTGTTATATATGCAGATTTAAGAAATGCAAATTT >NC_018653|2|2|27618-27744|CRISPRCasFinder AATTAGATTTAAGCAATAAGGATTT ACAAGGAATGAAATTCTTAA ATGTAGATTTAAGAAATGCAAATTT TAAAAATGCAGATTTAAGAGATTGTGTTATAT ATGCAGATTTAAGAAATGCAAATTT
>NC_018653.1|WP_012431069.1|25632_26772_+|hypothetical-protein MVGIVHKVRFVTSSSKKFKSYINYIARDEATRNNNFDKFSLYNDYMSNPEKSGSLFTSTKDWLDKKGTEQLKEVFEKSQENNSIMWQDVFSFDNEWLEKNGLYDSKTHTVDETKVRNAVRAAMEELKKNENLDGLVWSASLHYNTDNIHVHIASVEINPSRERGKRKPKTLINMKSKLLNNLIDRQAEYSKINDIIRKNIIEQRRDTDFFKDKEIKKMLKDIIKDLPEDHSLWKYNNNCMNDIRPKLDKLTKYYIENYKKDDYEELIKELNKGEKFLKESYGEGEKFRYKDYKENKINDLYTRMGNSILSELRINAKEKERLEARKKFVNNLRKNTNTNTLNIRNKDVNRIKNAMRDNVNHAKNQSIHRQLESEYEYFN >NC_018653.1|WP_012431064.1|25208_25619_+|hypothetical-protein MARKSKHFQLSEKNYAYLEELKEERQLKYLSDALDLVINEHRCKGDITTDYIIKLIVDKVSERIEEKFRGIKTASNSSDRNTKILLEMINGMFFKAKYGEIVTIAEDKSPALIIAENSVQKSIEGSRIKKLDSNFK >NC_018653.1|WP_012431092.1|24927_25203_+|hypothetical-protein MEIKVRDISKEAVIKIDGLAKKKGLSRNEYLKRHLENLSIMDKINDNEAKYTILIEKLTKILDYNTLALNKFLEENLFTLDELVQENSLKG >NC_018653.1|WP_012431068.1|23832_24645_+|hypothetical-protein MNEIERIVQRLQRNKLILHYFITGFLIVGLILFLNSNRLLNKKYNIINTDVNTNLVNQNLNVHLSKKEYNPNNRLIKFNIKVKLQIANQEIPIRTELVEKSNLGYKIPNNLVKVDKENYVIYATLPEKWTTVSLKVIEDIKDSNNPKFVKIYADSRDINIKNDLIEKKESELEIETIENEIESINQKINEKQSVIEEKKLLIEKEQCNLADMEKDKKYQTENEINETNTEIDNKRSTIEFTRLQIGKLEDESNELRNKISKLEVKKNDLR >NC_018653.1|WP_012431084.1|22644_23814_+|C40-family-peptidase MGFIKKFFKKILIAAIGFIFNFFLIVVTLMGACALLEHGGSSSNKHYYANLSGGGCPQEFVSYFNSTAQFFNIPNWVLAGVAKQESGFNPNDAYGGAYGIMQTQKYDFDGSDLWDGLMNCGLGNVYRSLGYNFNSSEDMWELFLTDPQVQIIAGAYEVRYYTNYVLYKKGMVSKLDYNNNENMALINWNADENDSQFREVLRRVFACYNGGPGYGMRVKLDKAQNDYPNKVFSYCMQFRGNGIPSGGGEGGLVGDNETIEKAINSGMSFVGNSPYCWGGGRTKDDIQAGIFDCSSFVHYCYSQAGIELGDYTSVTTYSLIGLGQKVDSSEMRRGDVIFFNTTGVNGHVAIYLGDNKFLHDGSSKGVSIGDLNNDYYKSTFNGEVRRIIQ >NC_018653.1|WP_012431088.1|21903_22584_+|hypothetical-protein MNKKNIIIVALLISFIFSFIYIGSKIFKKNDTNNDIATTNNVNEVKKNNINKEDIDEKESTESDLDKKIPVESGFKTTITGGDNEQEVIENNILLDNNSTSIQNKLEAKRVAENFVQAIVSFDINDKDGTVEKATKYVCKNKIDEVRSLYTNIGKSQDMKKTIITDLYSEEENKQENNEYLYFYVAVDVDLIDNYDQQVKGTGETYLVKLLKEDGQYKIIEYYFDE >NC_018653.1|WP_012431093.1|19988_21902_+|hypothetical-protein MGLKFWDNEVKNINHNPYLLSKIQPVGGIAFNPSSIRKGDGYEACIHLYEYQTTVNTFWLEQLLNFDDVVVTVDVSTANKQDALEQINRSISENLTRIDEVANNIDKIEASNTVDNLTSLVYDITSKDEIIKIVTIRYFISARTIDELDKKAKTILERLEGLGYRGAIFLNEQEYEWKSLFLSSTEQSKLPNKRNEKGIPSISFGGGYPFHFTELNDPTGMYLGTTKTGGNVIFDLFTKDDIRKSYNALVIGLMGSGKSTLLKKILNNNGIVNNTIRIFDIAGEFKTLVRILGGEVIALDGSDGIINPLQIFATIIDEDTNEILEEQSYMQHLSKVSMMYQFLAPNANSNEIREFEKSLSNFYSSFGIDTRKATQYETNEYPIMEELIEFLLNELYENVQKGILKANITNNRQERLENIILTLEGTVRDYGKLFNGHTTIKDITNKQIVSFEVRNLVQFDKRIFNAQTFNILTMLWNNALLQGLVEKKAFDEGRKTTMEAIKYLVLMDEAHKFINSNNIMAVDYLINFEREARKYFGGLIFATQSIRDVVPDNTSSEALEKIRTLFELTQYKFIMQQDNNSKKSLAEIFDGQLTESEIETVPFMGTGDCILSINGGKNIRFHIEASDKELELFKGGA >NC_018653.1|WP_012431082.1|19294_19933_+|hypothetical-protein MKKFLDITIKNEEPKKIKLNKEEKKELKEKRKKEKFEIKELKNEEKKVFKSTKELNPIADVNENDIFLTKDGYIDIYQVESKDIYAFNQYEADLHVYNFIAFLRNYLNDFKLISMNFPVNTSRQQEYIRNKLEQSTNEINNKFLQEKLDEFMFLEQYRNNKEFFIMFFAKNKQDITSSILKNQTRIFILKEISLEKKIKILFKLNNLNTKLI >NC_018653.1|WP_012431073.1|18907_19183_+|hypothetical-protein MDQYTIPKEISSEMKFSRKFYLFDIVILISSLSIAWLFSSMVYTKIIFFYYIFIFFGTVFLLMRNKFNPKKRNFQTVYFALKRDRTVYTRI >NC_018653.1|WP_012431077.1|16771_18907_+|hypothetical-protein MNGLLLSIEGTARLLHDNNITQIADVISIGFRWIGWRIIEFLSRIINTLEASATKLCTLNGFFNSTEVNTLINRYKPLVWMILGISIAIIGMKIIFNRVKNRGDLAPNLMFSVCVLILLPVMMLKIDTMSTLAIQDLNSYNISSANTIVKNNLHDIYYLDSVNYNLTGNKNNISANDILSIDINEKLDTDNISISHRKIFKNKIIKDSNGSSVMTKLKQGWFLYEQFYRYNLDFVVTLISLGAIGITLICISLKSVRLIFEIAVNKFLATLFAFADIESGKKLKAILKHIGSMFAVLVTMSVMLKFYVLFNSYLSRIESTNPFDDFTKVIVILGVSVAVIDGPNIIEQVFGIDAGLKSGLGVMVGGYGAARVVGGIGKGIAGEFKRMLSNPAEKLKNKVKSGISEKFAGNKDKSGAGNNNLANEMKSNNDKSSNKDKNLPTLQEQMNNKKNNNNEEKGSMKDLNDRNKPIDKAINNISNKDIDKPINDAIKNLNNKDNGKPIGEAMNNLNSKDNGKPMAEAMNNVNSKDNGKPIGEAMNNVNGKDNGKPIGEAMNNVNSKDNGKPISEAMNNVNSKGNGKPMAEAMNNVNSKDNVRPMVGAMNNVNNKDNGKPMAESMNNVNNKDNGNLINESTKKLENNKENTKSMNESMKKLENNKEKNNLINESINVSGSSKNSQVINSKKNESRMNQSVKNKNSAIANEFKENGGKK >NC_018653.1|WP_041712655.1|27983_28499_+|hypothetical-protein MKFLNNLNKDKKIIIVLSFLLLLVFAGYQTNSTIKNIKIKNLENEINELSLNIENSNRKVYAASNFTPNENIETENKEQKEVINIESNENDITPYRTIKERFIDIAKDIKKEYDESINDTEAISFETMDLSTLTDNQIKKTLEKLPNKKFNIKIEENKLGNNNFYKIILLQ >NC_018653.1|WP_012431105.1|28521_28872_+|hypothetical-protein MKKEDVYKFSQKVKLLLRSLEGVKIEGEDYKIEKIKSLYEELEIEIEKFSPTIKEEYSLRTKILYNQMLKSKKEYENIKKSNASKKLVQVALEDFKMSTLKYENSKKIRDSIKNIN >NC_018653.1|WP_012431079.1|28885_29236_+|single-stranded-DNA-binding-protein MNKVVLIGRLTKDPEVKFTQENGKAVTKITLAVDKYNSKSGQKEADFVPIVVWDKQAESIGNYMKKGSQIAISGRIQTRNYEEKDGTKRYVTEVIASEVQFLSRVNNVNSEDNESK >NC_018653.1|WP_012431087.1|29437_29848_+|hypothetical-protein MQMEEIKKLLTINKNWKEKFKGDLLDNLLEKCVDIEKYIDLITNEWMNIWISVTKDKEIRKIYYDFNKQIKELDIRRLKVEYEVIYNIYKYSKELEDSNNESTNNIENIIKWINIIDVNSLEELENALDEQIRYSL >NC_018653.1|WP_012431089.1|29928_30087_+|hypothetical-protein MNMPTIQELTQIGEVIIIWIKYMLMHLAVAMPIMFIVMKFLNVNKKFAKLLK >NC_018653.1|WP_012431072.1|30102_30414_+|hypothetical-protein MKILIDEKQYLEIMELLNMINREKATLLASFNLYLNDNERCLYENVKRENKKYLSLMKQLDKNKKNNIRKRLIAAVEKWIECEVTGDEAMTQIIELLEIKLTN >NC_018653.1|WP_012431106.1|30706_31021_+|hypothetical-protein MSIILISELMTKLNSNSFNREQLNIIEKYNNKDKKLFLTTICIVFASSIFDSIFRINLIFDIIDIVIIILSMLILIRYLYFKITMKKSLLIELQEIENKKMKIV >NC_018653.1|WP_012431112.1|31579_31816_+|hypothetical-protein MLIIIVIILYIGISLYSKHLLYIQSYARFKRELLYNREQNVKRVCNKSVKKIEWICFVPGINLITVLALSIMILIDKY >NC_018653.1|WP_012431081.1|31912_32128_+|hypothetical-protein MYNLINSLSNGDQKMFWLIFDLIVIATFHLIWFSYLFFKRKDSELQSIRKPLYYRSLQYILCICLGLLIAA >NC_018653.1|WP_012431076.1|32201_32489_+|hypothetical-protein MNKIIRVKVSKEIRNIIDLLSREKNKSKSQMLREILKIYKENNTTRNKNEVEDYSIIIHIPEKEGFTKEKYQKYADKITNDDIMIIINDLYNIQA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NZ_KJ776576 | Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence | 13282-13310 | 0 | 1.0 |
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NC_018653 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence | 13265-13293 | 0 | 1.0 |
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NC_010680 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence | 47376-47404 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27643-27662 | 20 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 30644-30663 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27643-27662 | 20 | NZ_KJ776576 | Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence | 27660-27679 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27643-27662 | 20 | NZ_KJ776581 | Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence | 33675-33694 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27643-27662 | 20 | NC_018653 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence | 27643-27662 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27643-27662 | 20 | NC_010680 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence | 14112-14131 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 39023-39054 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_KJ776576 | Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence | 27705-27736 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NC_018653 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence | 27688-27719 | 0 | 1.0 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NC_010680 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence | 14157-14188 | 0 | 1.0 |
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NZ_KJ776585 | Clostridium botulinum strain DB2 plasmid pDB2, complete sequence | 13042-13070 | 1 | 0.966 |
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NZ_KJ776583 | Clostridium botulinum strain KapchunkaB3 plasmid pKAPB3, complete sequence | 13051-13079 | 1 | 0.966 |
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NZ_KJ776581 | Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence | 19123-19151 | 1 | 0.966 |
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NZ_KJ776579 | Clostridium botulinum strain KapchunkaB2 plasmid pKAPB2, complete sequence | 13051-13079 | 1 | 0.966 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_KJ776581 | Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence | 33720-33751 | 1 | 0.969 |
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 16240-16268 | 2 | 0.931 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 30689-30720 | 2 | 0.938 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_KJ776585 | Clostridium botulinum strain DB2 plasmid pDB2, complete sequence | 27461-27492 | 2 | 0.938 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_KJ776583 | Clostridium botulinum strain KapchunkaB3 plasmid pKAPB3, complete sequence | 27470-27501 | 2 | 0.938 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_KJ776579 | Clostridium botulinum strain KapchunkaB2 plasmid pKAPB2, complete sequence | 27470-27501 | 2 | 0.938 |
NC_018653_1 | 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13265-13293 | 29 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 16165-16193 | 3 | 0.897 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_CP024873 | Leptospira mayottensis 200901116 plasmid p1_L200901116, complete sequence | 92245-92276 | 8 | 0.75 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | LR214957 | Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 3 | 13692-13723 | 9 | 0.719 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | NZ_LR215006 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 10 | 8258-8289 | 9 | 0.719 |
NC_018653_2 | 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder | 27688-27719 | 32 | MH598801 | Pelagibacter phage HTVC200P, complete genome | 27397-27428 | 9 | 0.719 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NZ_KJ776576 | Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence | 13162-13235 | 14 | 0.811 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NZ_KJ776576 | Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence | 13222-13295 | 14 | 0.811 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NC_018653 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence | 13145-13218 | 14 | 0.811 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NC_018653 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence | 13205-13278 | 14 | 0.811 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NC_010680 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence | 47256-47329 | 14 | 0.811 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NC_010680 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence | 47316-47389 | 14 | 0.811 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NZ_KJ776576 | Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence | 13297-13370 | 26 | 0.649 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NC_018653 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence | 13280-13353 | 26 | 0.649 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NC_010680 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence | 47391-47464 | 26 | 0.649 |
NC_018653_1 | 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13145-13218 | 74 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 16255-16328 | 26 | 0.649 |
NC_018653_1 | 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13010-13098 | 89 | NZ_KT901798 | Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence | 15970-16058 | 29 | 0.674 |
NC_018653_1 | 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13010-13098 | 89 | NZ_KJ776576 | Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence | 13027-13115 | 29 | 0.674 |
NC_018653_1 | 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13010-13098 | 89 | NC_018653 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence | 13010-13098 | 29 | 0.674 |
NC_018653_1 | 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13010-13098 | 89 | NC_010680 | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence | 47121-47209 | 29 | 0.674 |
NC_018653_1 | 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder | 13010-13098 | 89 | NZ_KJ776581 | Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence | 18853-18941 | 30 | 0.663 |
1. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atctaaaccctaaatcagacggaactaaa Protospacer *****************************
2. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atctaaaccctaaatcagacggaactaaa Protospacer *****************************
3. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atctaaaccctaaatcagacggaactaaa Protospacer *****************************
4. spacer 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acaaggaatgaaattcttaa CRISPR spacer acaaggaatgaaattcttaa Protospacer ********************
5. spacer 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acaaggaatgaaattcttaa CRISPR spacer acaaggaatgaaattcttaa Protospacer ********************
6. spacer 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776581 (Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acaaggaatgaaattcttaa CRISPR spacer acaaggaatgaaattcttaa Protospacer ********************
7. spacer 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acaaggaatgaaattcttaa CRISPR spacer acaaggaatgaaattcttaa Protospacer ********************
8. spacer 2.1|27643|20|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acaaggaatgaaattcttaa CRISPR spacer acaaggaatgaaattcttaa Protospacer ********************
9. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat Protospacer ********************************
10. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat Protospacer ********************************
11. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat Protospacer ********************************
12. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat Protospacer ********************************
13. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776585 (Clostridium botulinum strain DB2 plasmid pDB2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atctaaatcctaaatcagacggaactaaa Protospacer *******.*********************
14. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776583 (Clostridium botulinum strain KapchunkaB3 plasmid pKAPB3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atctaaatcctaaatcagacggaactaaa Protospacer *******.*********************
15. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776581 (Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atctaaatcctaaatcagacggaactaaa Protospacer *******.*********************
16. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776579 (Clostridium botulinum strain KapchunkaB2 plasmid pKAPB2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atctaaatcctaaatcagacggaactaaa Protospacer *******.*********************
17. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776581 (Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer caaaaatgcagatttaagagattgtgttatat Protospacer .*******************************
18. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atttaaatcctaaatcagacggaactaaa Protospacer **.****.*********************
19. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer caaaaatgcagatttaagagattgtgtcatat Protospacer .**************************.****
20. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776585 (Clostridium botulinum strain DB2 plasmid pDB2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer cagaaatgcagatttaagagattgtgttatat Protospacer .*.*****************************
21. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776583 (Clostridium botulinum strain KapchunkaB3 plasmid pKAPB3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer cagaaatgcagatttaagagattgtgttatat Protospacer .*.*****************************
22. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776579 (Clostridium botulinum strain KapchunkaB2 plasmid pKAPB2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer cagaaatgcagatttaagagattgtgttatat Protospacer .*.*****************************
23. spacer 1.3|13265|29|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.897
atctaaaccctaaatcagacggaactaaa CRISPR spacer atctaaaccctgaatcagatggaactaga Protospacer ***********.*******.*******.*
24. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024873 (Leptospira mayottensis 200901116 plasmid p1_L200901116, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taaaaatgcagatttaagagatt------gtgttatat CRISPR spacer taaaaatgcagatttaggatatttaaggggtg------ Protospacer ****************.** *** ***
25. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to LR214957 (Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 3) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer tgaaaatgcagaattaagagatggtaaattca Protospacer *.********** ********* **. *
26. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR215006 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 10) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer tgaaaatgcagaattaagagatggtaaattca Protospacer *.********** ********* **. *
27. spacer 2.2|27688|32|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to MH598801 (Pelagibacter phage HTVC200P, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taaaaatgcagatttaagagattgtgttatat CRISPR spacer taaaattgtagatttaagagattttaaaaata Protospacer ***** **.************** *. *
28. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.811
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer ************************************************************
29. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.811
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer ************************************************************
30. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.811
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer ************************************************************
31. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.811
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer ************************************************************
32. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.811
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer ************************************************************
33. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 14, identity: 0.811
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer ************************************************************
34. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 26, identity: 0.649
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer cagacggaactaaaggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer . .... . **. **********************************************
35. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 26, identity: 0.649
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer cagacggaactaaaggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer . .... . **. **********************************************
36. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 26, identity: 0.649
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer cagacggaactaaaggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer . .... . **. **********************************************
37. spacer 1.2|13145|74|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 26, identity: 0.649
tctgtaatgatagtggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt CRISPR spacer cagacggaactaaaggaaaaatgcttaatggttggattaatgataatggcaactggtatt Protospacer . .... . **. **********************************************
38. spacer 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT901798 (Clostridium botulinum strain GA0702E1CS plasmid pGA0702E1CS, complete sequence) position: , mismatch: 29, identity: 0.674
attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt CRISPR spacer attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt Protospacer ************************************************************
39. spacer 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776576 (Clostridium botulinum strain Eklund2B plasmid pEklund2B, complete sequence) position: , mismatch: 29, identity: 0.674
attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt CRISPR spacer attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt Protospacer ************************************************************
40. spacer 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_018653 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid p17BNRP, complete sequence) position: , mismatch: 29, identity: 0.674
attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt CRISPR spacer attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt Protospacer ************************************************************
41. spacer 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NC_010680 (Clostridium botulinum B str. Eklund 17B (NRP) plasmid pCLL, complete sequence) position: , mismatch: 29, identity: 0.674
attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt CRISPR spacer attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt Protospacer ************************************************************
42. spacer 1.1|13010|89|NC_018653|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ776581 (Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence) position: , mismatch: 30, identity: 0.663
attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatgtatagataatgaatggtatt CRISPR spacer attttgattcatttggagtaatgcaaacaggatggcaatatatagataatgaatggtatt Protospacer ***************************************.********************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
33436 : 46087
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018653|33436:46087|DBSCAN-SWA TATGTTGAAGGAAAATGATAGGCTTGGATTATTGACATTGATTAGAAAGGAAAATCATAAGTGGAGAACATATTGGTATTACAAATGTGATTGTGGTAATGAAAAATGGATAAGAGCAGATGCATTAAATAGAACGAAGAAACCAACTGGAAGTTGTGGGTGTTTGGCTGAAAATACACAGTTTAAAAAAGAGGATATTACAAATGAGAGATTTGGAAAACTTCAAGCTATTCGTCCAACAGAGCAGAAGAGGGGTAACAGTACAGTTTATTGATAACAATATTTCAGAAACGGTTATTAGAGAAAAAGTATTGATTGAAAATTTGACGGAAGAAATAACTAATATAAAAAAACTTAAGTAAAGAGTTTATAAATTTATCAAATGACTGGAAAAATTTAATTAATGATAAAGTTAAGTTACCTAAGGACAAGTTTACTAAAAGTGATGGAATTAAAATAAAAAATTCAAGAAATAACTATGTAAAGAATCTAGGATTATATGAATATTCAAGTACAATTAATATTGATAGAATAGAAATATCAGACGATAAATTAATCCCATTAATAAATGGATTTGATATGAAATTTGATTCTTCAGCTAGTGATAATATAAGAGCTATATGGGCTTTTACCTTTGCATTAATGCAAGCATCCTTTTATGATAATGGAAATCATCCCAAAATGTTAATAGAGAACTTCAAACTATAATTGGAATAACAATAGATAGTGATGAAATTATTAATTCAATGGAAAAATTGAATAAAGAAGAATATAAACTAATTATGTTTGAAGACAGAGTTATAACCCGTATGTAGGTTTAATAAAATAATAATATTTTAATCAAACTTTATTTAAAATATCATTATTTTATTTTTTTGCCACAAAAATGAACCTCCCCTAATCTAGATTTTTGTCTAAACTTTGGGGGGGCACTTCATAAGCTGATGGACTCTTATTTAATAATAAATCGTAATATATTAATTAGTAATATCTATATGCAATCTTATATTATAGTTATTTAATTCTGTAACTTCTACTTTTAATATATAAATTGCACCATTTAATAAACGTATTGACTTGGTGCTATTTAAGAGATGTAAATTATGTTGTATATCAATTAAATCATAGCCGTCAATAGTTTCAGTAACTCTAAATAAAGTACCTATTCCTTGGTTATTACTAGTATAAAGTCTAATGTTAGATGTATCTTTATTATTAAAGTTACCAGGTACTGTAAATTCATATGAAATATAGTTACCAACATCAGGACTTTGTCTCGTATAGTAATGTTCACCTGTTGAATTAAGATTATCTATTATATTAACTGAAGAATTTGCTAAAATTCGGATGTTACCTTCTTCTCTCTTAAATTTTATTTGATTTTCTATATTAGAAGAAGTTTGTGGTACTCTAATGTAGTAATTTTTATTCTTATTAAGTAAAACAACTAAATAACTTTTAGCATTAGAGCTGTCAAACCCAGTAATATAATTTATTGCTTTAATATGATCATCACATAAATTTCCAGATTGCAAATTTCTATTACCAGAACCTATCGCTTCATATATTTTTAATGGTGGTAGATTATTTTGAGCATTAATTTTATAAATTCCTGTAGTATTTACTGTAAATAATATATAAAATGGATTATTATCTACAATATCTGGAATGCTATATGTGTAATTATCTGAAATAGCAGTATTTATTTCTTGTATATTTTCAGATGGGTCTATGACACCTACTACGATTTCTTCCTCGGGGCCATTCTGTACAAATCCATCTTCAGCCACTTGCGTTTTAACTACTTCAGATTCAGGTGAAGGAGCATTAGTTACTTCACAATATCCTAAGGAAGGAAGGTAATACTCAGCTGTATTAATAATACTTCCATTTTGATAGTCTATTAATTCATACTTTTCATAGGTATTATAAGCCTTTATGCATATATTTTTATTTGAAGGAGCTTCTTCTACAAATTTAAATAACGATGTTGATGTATTAAATAATTGTACATTGAAAGCGTCTTTAAGTCTTTCTTCAGTATATTGTTGTGAGAATTTTGTATTATTACTTGTGGTGAATAATGGTCTAGTTGTATTTCTTAATCGAGGTTGTATAATACTTCCTGATGAACCTGCTTCGATTAATAATGTACCTATCAAATCTTTATCATTTGTTCTTATATATCCATCACCCTTATTAATAACATATAGTCCATTACTATAAGGCAATACTCGTTGTGTGCTACTAACTTTAGAATTAAAAATATTGTTAGTTGGTATATTTTTGGTAGTTTCTAAAATTTTTTTATATAGAAATTGTTCATTTAAAATGCACTTATCATTAGTTAAAAAGTAAAAATCTTTATTTATTTTTTCCCCTAGATTAAATTCTATAGACTTAACATATCCAAGAGATGGAACATATAGAACTGCTCTTTCTATAATTTCATGTTGTAAGACTTTTATTATTTCATATCTAATGTAGGTATATTGTAAATACATATATAAGTTTTTATTTGAGGGAGCGGTTTTACTAAATTCAAATCCTATAGGAATTTGATTAGCTTCAGTAAAGTTAGTAAATACAGTTTGTATATTATTTTTTATATATTCTTCATTGAAGGATGGTGTTGGATAATAATATGGTATCGCATTATCATTTACACGTAGGTCCCCAACTATTCCTGTTGATCCATTACTAATTACACTTCCACCTAGTATTTGATTTTGTCTAGATAATATCCATCCATCTCCTCTGCTAACTACATAATTACCATCAGCTAAATCAATAGTATCACTATAGTTTATAACTTTTTCTTGTATATGATTATAAATTTTTTTTATAGATGAATTCATACATTTTTCTCCTTTATATTTTTTCAAGTTTTAACATTTGATTTGAATTGTATATATCAAAATTAGGTAGTAGGAGTAGTGGTTGGCTTAAAATATTTTCATTAGTATCATAAATGTCCCAGGCATAATCTAATTCATTCACTTTATTTAAATTTAACATAATATAAGTATTTACAGCAATTTTAATAGGAAACCAGTAGCATTTATTGGATAATGAATCTAAAGAAATAAATCCAAAGTTATCGTAACTTAAATACTTATTTGGTTCTGCTACATTAGAGATTTTAAAGCATCTATTTTTAGCCATATATTCTACATTCCATTTTTGATTATTTGCAGAAGATTCACTTGAAAATGTTAATGATCCTGATACAGGATTTAAATATAAAGAACCAGAAAATATAGATTTTATATTATAATTACCATCAGGTAGAAAAGTTCTTTCAACTGACATATAATTCACCTCTTTATAAATTAGATGATAGTACTCATATTAAGTCTTTGTTGATATTAATTTTATGGGTTCCTAATAAACCATTTCTGATTATCATCTCCATGATAATTAAATACTTGAATAGTAGTTCCGTTTGCTGTTTGGCTGTTATATAAATCTAGAGCTTTAGTTGTATCGTGTAAATTAGTAATTGTATATGTTTCATAAGCATTTGAAACAGGATTTATAAGCCAATATTGGGCATCATTATTTTGTGCAATAGAAGAAACTCTTACAGTATTACCATTTGAAGAAATCCATGTTAGAACTCCATTTGAAAGTATTGTATTAAAAAACTGGTATGCTGATTTTTCTTTATTATATTTAATTGTCCATTTTTGATTTCTACCATAGTCCCAAGTATATAAATTAACACTTAGATCTGTCATAGCCACTTGTTGTACAACTTTACTAGAATCTAATATTGGACTTATTTTACATGTGAAATTGTTAAAATCTGATATCATATAATCTTCTATGATAAATTTTATATAACTTGAATTATTAAGTGTGCTAAGCTTCAAATTACGAGCTACGGTATCAGCATATAATACTAAGTTAGGGTTTTTATAACTTGCAATAATAAATGAATTGCTACCAATATCTTTTAATAATAACCAATATTGATTATCTGCATTTGAATCTTGTTGTGCTGATATATTATGTGTTGGTGCATTCCATGTTAAAACTAAATTAGTATTATGGCTATCCATACTTTTTATTTTATAAGCAGCTTTATTAGCATCATATATAAGTCTCCATCTTTCAAGGTAATTTCTAGTTTGTTGAAATAAGCTAACGTTACCGACAGTTTGATAAAAAAATAAATTAGTATCGGCCTTACAGGAGATGGTAACAATTTCGTCATTTAATGAATTTTGGATTACTGAATAGTGCTCCATTATGATTCCTCCTTTATTTAAGAATTAATCTTACATATAATATATAACATGATCAAATTATTTTTTGTAAACCTAAAATTTAAATATATAAAGTTTTTATTAGTATGTTTACATAATTGATTATGGATATTTCGTAAAAATGGCTTATTTAAAATTTAAAAGTAATTAATTCCTATATATTATAATAAAGTAATATTATATATATTATGGAAGGACAGTGGTAAATATGAATAAATTGTTTTTACAAATTAAAAGATTGAAAAATGACAATAGAGAGTTTCAAGAAATTTTTAAGAATTTTGAAAAAACTATAGATATATTTACTAGAAAATATAATATATATGATAATTACAATGATATTTTGTACCATTTATGGTATACACTTAAAAAAGTTGATTTGAGTAATTTCAATACGCAAAATGATTTAGAGAGATATATTAGTAGGACTTTAAAAAGATATTGCTTAGACATTTGCAATAAAAGAAAGATTGATAAGAAAATAATATATAATTCAGAAATTGTAGGTGAAAAATTAAGATTAATAGCAAATAGTTATTCAAGTTATTCAGAAGTTGAATTTAATGATTTAATATCCATATTACCTGATGATCAAAAGAAAATTATATATATGAAATTTGTTGAAGATATTAAGGAGATAGATATAGCTAAAAAACTTAATATAAGTCGTCAATCTGTATATAAAAATAAAATAATGGCTTTAGGAAGATTAAAACCTATATTAGTTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018653|33436:46087|34412_36293_-|WP_012431098.1|DBSCAN-SWA MNSSIKKIYNHIQEKVINYSDTIDLADGNYVVSRGDGWILSRQNQILGGSVISNGSTGIVGDLRVNDNAIPYYYPTPSFNEEYIKNNIQTVFTNFTEANQIPIGFEFSKTAPSNKNLYMYLQYTYIRYEIIKVLQHEIIERAVLYVPSLGYVKSIEFNLGEKINKDFYFLTNDKCILNEQFLYKKILETTKNIPTNNIFNSKVSSTQRVLPYSNGLYVINKGDGYIRTNDKDLIGTLLIEAGSSGSIIQPRLRNTTRPLFTTSNNTKFSQQYTEERLKDAFNVQLFNTSTSLFKFVEEAPSNKNICIKAYNTYEKYELIDYQNGSIINTAEYYLPSLGYCEVTNAPSPESEVVKTQVAEDGFVQNGPEEEIVVGVIDPSENIQEINTAISDNYTYSIPDIVDNNPFYILFTVNTTGIYKINAQNNLPPLKIYEAIGSGNRNLQSGNLCDDHIKAINYITGFDSSNAKSYLVVLLNKNKNYYIRVPQTSSNIENQIKFKREEGNIRILANSSVNIIDNLNSTGEHYYTRQSPDVGNYISYEFTVPGNFNNKDTSNIRLYTSNNQGIGTLFRVTETIDGYDLIDIQHNLHLLNSTKSIRLLNGAIYILKVEVTELNNYNIRLHIDITN >NC_018653|33436:46087|42211_46087_+|WP_012431101.1|DBSCAN-SWA MPVTINNFNYNDPIDNDNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVEQKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDTIQAEELYTFGGQDPSIISPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFNKLYKSLMFGFTEINIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKNMGKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVKVPGICIDVDNENLFFIADKNSFSDDLSKNERVEYNTQNNYIGNDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKVFTDENTIFQYLYSQTFPLNIRDISLTSSFDDALLVSSKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVDDFVIEANKSSTMDKIADISLIVPYIGLALNVGDETAKGNFESAFEIAGSSILLEFIPELLIPVVGVFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRVEKWIDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYKYNIYSEEEKSNININFNDINSKLNDGINQAMDNINDFINECSVSYLMKKMIPLAVKKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSVEDEKSKVDKYLKTIIPFDLSTYTNNEILIKIFNKYNSEILNNIILNLRYRDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVKLNDKNQFKLTSSADSKIRVTQNQNIIFNSMFLDFSVSFWIRIPKYRNDDIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLDNAKIYINGTLESNMDIKDIGEVIVNGEITFKLDGDVDRTQFIWMKYFSIFNTQLNQSNIKEIYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLVKDSSVGEILIRSKYNQNSNYINYRNLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIHLDFVNSNEEWRVYAYKNFKEQEQKLFLSIIYDSNEFYKTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDDIGLIGIHRFYESGVLRKKYKDYFCISKWYLKEVKRKPYKSNLGCNWQFIPKDEGWTE >NC_018653|33436:46087|37914_38454_+|WP_012431103.1|DBSCAN-SWA MNKLFLQIKRLKNDNREFQEIFKNFEKTIDIFTRKYNIYDNYNDILYHLWYTLKKVDLSNFNTQNDLERYISRTLKRYCLDICNKRKIDKKIIYNSEIVGEKLRLIANSYSSYSEVEFNDLISILPDDQKKIIYMKFVEDIKEIDIAKKLNISRQSVYKNKIMALGRLKPILVYIFKKF >NC_018653|33436:46087|36809_37688_-|WP_012431090.1|DBSCAN-SWA MEHYSVIQNSLNDEIVTISCKADTNLFFYQTVGNVSLFQQTRNYLERWRLIYDANKAAYKIKSMDSHNTNLVLTWNAPTHNISAQQDSNADNQYWLLLKDIGSNSFIIASYKNPNLVLYADTVARNLKLSTLNNSSYIKFIIEDYMISDFNNFTCKISPILDSSKVVQQVAMTDLSVNLYTWDYGRNQKWTIKYNKEKSAYQFFNTILSNGVLTWISSNGNTVRVSSIAQNNDAQYWLINPVSNAYETYTITNLHDTTKALDLYNSQTANGTTIQVFNYHGDDNQKWFIRNP >NC_018653|33436:46087|38592_42186_+|WP_012431075.1|DBSCAN-SWA MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTIFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGGGYYAPNMITFGSAPKSNKKLNSLISSTIPFPYAGYRETNYLSSEDNKNFYASNIVIFGPGSNIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDQFYIDPAIELMKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVVPYRLRNELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFIDNYFSNAKKVFEDHRNIYKTEVEGNNAIGNDIKLRLKQKFRINTNDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLFLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRAYEYHFNNSNDSSLDNVNTGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNERFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKEYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVAWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGPSSLINKKENLSMPIIEIDEIPNYMLGLPLNDLNEKLFNIYLKNILYFKKVYFNFLDQWWTEYYSQYFDLICMAKQSILAQEKLIKQIIQNKLQDLSKADISMDKLNLMNLATGKTFIDLSNESQIAIDNINDFLNKSAICFFDTNIYPKFISFMEQCINSVNSNVTTFIQKCTNITEDEKLQLIKLNTFMNIDFEFFDIQNIKDLITSETDLIKEEKESDYNLFLLTLQEDNNKVIEDISGKNTLVKYSDSISLVYGVNGDALYLKEPNESVSFSNKVFENGLTNSFSICFWLRNLGEDIITSKLIENKADNCGWEIYFENNGLVFSIVDCNGNEENIYLSDVISKNWYYISISIDRLRNQLLIFINDKLIANQSIEQILNIYSSSTISLVNENNPIYVEGLSILNRSITSEEVVNNYFSYLNNSYIRDISGERLEYNKIYELYNYVFPENSLYEVTENNNIYLSIKDTNDLNIQGAKFKLINIDTNKQYVQKWDEGVVCLLGDEEKYVDISSENNRIQLVSSRDTAKKIIFNNDIFKPNCLTFAYNNKYLSLSFRDRNYNWMIYNNNDNIPKAAHLWTLKGI >NC_018653|33436:46087|36306_36747_-|WP_012431100.1|DBSCAN-SWA MSVERTFLPDGNYNIKSIFSGSLYLNPVSGSLTFSSESSANNQKWNVEYMAKNRCFKISNVAEPNKYLSYDNFGFISLDSLSNKCYWFPIKIAVNTYIMLNLNKVNELDYAWDIYDTNENILSQPLLLLPNFDIYNSNQMLKLEKI >NC_018653|33436:46087|33436_33709_+|WP_012431066.1|DBSCAN-SWA MLKENDRLGLLTLIRKENHKWRTYWYYKCDCGNEKWIRADALNRTKKPTGSCGCLAENTQFKKEDITNERFGKLQAIRPTEQKRGNSTVY |
7 | Clostridium_botulinum_D_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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