Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NC_019537 | Francisella tularensis subsp. holarctica F92, complete sequence | 0 crisprs | csa3,DEDDh,RT,cas4,cas2 | 0 | 0 | 2 | 0 |
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---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
67521 : 75336
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019537|67521:75336|DBSCAN-SWA 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TCTATTGTGAGAGTTTACAAATGCCTCACAATATACTGGTTGTGTTTCTATATCAACGTTTCTAAGAGCAGCTAGCTTTTCAGGATTATTAGATATTAATCGGCAGCGGTTGACATTGTTATATTTTAGGACTTGTATAGCTAGATCGTATTTTCTTGCGTCAGCGGGTAAGCCAAGAGCTAAATTAGCTTCAAGAGTGTCCATATTTTCATTCATCTGCAAATTATAGGCTTTAAGCTTATTTGTTAAACCAATACCTCTACCTTCTTGGTCAAGATATATAAAAAAGCCACCCTCTTCGCTAATCATTTCAATTCCTTTATGTAATTGATCTTGGCAGTCACAGCGTAGCGAGCCAAAAATATCTCCTGTTATGCAAGATGAATGCATTCTTACTAAAGGATTATTACCAGAATAAGGTTTAGATAAAACAACAACTTCATCACCACTAAAGTTATCTTTATACACACTCATTTCCAATTCGCCAATTTTCTTGAATGGTATAGTAGAGCTTGCCATTTTCGTGACAAAAATTTCAGTTGCTAAACGATATTGGTAAAGCTCTGCAATAGTTAAAAGAGGCAGATCGTGCTTTTTAGCAAATGCTTCTAGTTCAGCAGCTTTCATCATGGTGCCATCTTTATTCATTAGCTCACATAGAACTCCAGCGCTATTAAAACCACTTAGTTTCATAAGATCAACAGTTGCCTCAGTATGACCATTTCTACCAAGTACGCCTTTATCATTGGCTATAAGAGGGAATATATGTCCAGGTCTAGCTAATTCTTCTGCTTTAGCATCAGCTTTTGATGCAACTTGAATAGTATGTGCTCTATCCTTTGCTGATACTCCTGTAGTTACCCCTTCTTTAGCCTCTATAGTTACAGTAAAAGGAGTTGTAAAAGTACTATTGTTTTGGTCAGCAGCTACCATTGGCGTTAGATTTAATTCTCGTGCTTTCTTTGAGTCCATTGCCAAACAAATGATGCCACTTGTATGCTCAAGCATAAATGTGATATTTTCTTCTGTGGCTTTTTGACCCGGTAGAATTAGATCACCCTCATTTTCTCTATCATAATCATCAAGTACAACTACGGGTTTGCCTTGCTTAAGAGCTTCTATGGCATTCTCAACATTATTTTTTATTTGCTCAAACATTTTCTTTAAATCCTTGTATATATTTATAGATATATTTACCTGTTGCATCAGCTTCAAGATTTACCATAGAACCATTACTATAGTTTTTTGCGATAGTAACTTCAATGGTGTGAGGTATCAAAGTTACAGTAAATGAATCTTTGAGTACATTTATTACAGTTATACTCATACCATCTATGGTTACAAAACCTTTCTTTATTAAGTATTTTAGAAATTCTCTAGAAGCAGAAATTTCAATTAACCATGCACCACCGACATTTTGAATACTTTTGATTTGCCCTGGTTCATCAATATGACCTTGTACCATATGCCCACCAATATGATCACCATAGCGCATTGCAAGTTCGATATTTACTAGTTGGTTCTCCTTAAGAGTATCAAGATTAGTTTTTTTAAGTGTCTCTGGTACTGCATCAAAATTAGCTGTTAAGTTTTGCTTATCAAGTTTTGTAACAGTAAGACAGGTACCATTAATCGCAACACTATCACCAATGCTACATTGAAGACTATTATCAAATTTGATACAAAAAGTTTTTAGACTATCTTTAGTTGTTATTTTTTTAATTGTTCCTAGTTGCTGAACTATGCCACTAAACATTAGAATTTTCCTTAAAACAAGAGTTTATTATTATATCCTCTCTTACAGAGATTTGATTGAAGCTTAGCTGCTGTTTGGGGTTATAATCAGCTATTATTACCGGAGCTAAGTATGTATAAAATTCATTAACAAGTTTTTGATTAATAAAACTATTTAGGGTTTTATTACCACCTTCAACAAGAAGACTAGTTATTCCAATCTTACCCATCTTCTCAAGTAAGGTATCTAAACAAACCTGATGTTGACTTTGTGGTAATAGCCAATATTCAATGCCAAGTTGGTTAAGCTTGGTTGCTACTCGTGCAGAGATCTTTGAACAAACAAAAATCGTTTTGGCATGCCTTTGATCTAAAACTCGCCAATTATGATTTATTGTTGTCAGATGATTAGCAAGTATAAATCTAGTTGAATGTTTTATTTTATTGATATTTATTCTTACATCAAGACTTGGATTGTCATCAATTAGAGTTTGCTTGCCAATTAAGATAGCGTCACAAATATTGCGCAATTCATGAGTATTTACGAATGCTTGATGTGAGCTTATTTTTTTTGAGTCACCATCATTAACAGCTATTTTACCATCTAATGACATAGCCCATTTTGCATAAACAAAAGGTTTTTTGGTTGTTTGATAATGAAAAAATATTTTATTTAACTCTTGTGCTTGTTTCTCTAGTAAGCCTACTTCGACTGTTATACCAGCATTTTTGAGTCTTTCGACGCCTTTGCCAGCAACTTTAGGGTTTGGATCAAGAGTAGCAATAATTACTTTTTTTATCCCAGCTTTGATTATGGTATCAGTACAGGGAGGAGTTCTTCCACAGTGACAGCATGGTTCTAGTGTTACGTATGCTGTAGCTCCTTTTGCTTTATCAACCGCTTTTGTCAGTGCGTGAACCTCTGCATGCGCTTCTCCTACAGTTTCATGCCAACCTTCCGAGATAATTGCACCATTTTTTACTATTATGCAACCAACCATTGGATTAGGTGATACTGTAAGTCTACCTCTATTTGCTAGAGTAAGTGCTTGTTGCATATAATATTTATCGATATTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019537|67521:75336|70418_71411_-|WP_003014029.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVYFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSISTIAKKPINQESSGSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >NC_019537|67521:75336|73670_74276_-|WP_003014040.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLIKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >NC_019537|67521:75336|69319_70399_+|WP_010032231.1|tRNA|DBSCAN-SWA MENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFTAEYWDNVFEHFLIEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >NC_019537|67521:75336|72466_73678_-|WP_003014037.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENITFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADAKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATEIFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >NC_019537|67521:75336|74268_75336_-|WP_003014043.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHSTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >NC_019537|67521:75336|67521_69306_+|WP_003014022.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPFAEPDRVAQEIEEIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >NC_019537|67521:75336|71492_72011_-|WP_003014032.1|DBSCAN-SWA MSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >NC_019537|67521:75336|72013_72457_-|WP_003014034.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVTGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1525427 : 1602547
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019537|1525427:1602547|DBSCAN-SWA 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59 | Phaeocystis_globosa_virus(22.22%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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