Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019683 | Leptolyngbya sp. PCC 7376, complete sequence | 7 crisprs | csa3,DinG,PD-DExK,cas3,cas6,DEDDh,RT | 0 | 1 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019683_1 | 1349326-1349422 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019683_1
|
1 spacers
spacers of NC_019683_1
>1.1|1349357|35|NC_019683|CRISPRCasFinder GCTGGGGGGGATCCTCAATAGGTTGCGAAATATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019683_1
The CRISPR arrays of NC_019683_1 >merge|NC_019683|1|1349326-1349422|CRISPRCasFinder GATCCCCCTAAATCCCCCTTAGTCAAGGGGGGCTGGGGGGGATCCTCAATAGGTTGCGAAATATTAGATCCCCCTAAATCCCCCTTATCAAGGGGGA >NC_019683|1|1|1349326-1349422|CRISPRCasFinder GATCCCCCTAAATCCCCCTTAGTCAAGGGGG GCTGGGGGGGATCCTCAATAGGTTGCGAAATATTA GATCCCCCTAAATCCCCCTTATCAAGGGGGA
>NC_019683.1|WP_015133339.1|1345017_1345395_-|endonuclease-domain-containing-protein MPKIIPYRPHLKALARELRKNMTRGEATLWQYLKGKKLLGYNFDRQRPIDDFIVDFYCKDLMLAIEVDGASHNDENAQLKDEIRQRTIESFGVKFLRFSEGDVCNHSEDVVAAITHWITQNSPFE >NC_019683.1|WP_015133338.1|1344552_1344933_-|DUF2358-domain-containing-protein MDIIEILQRDYQQFPKEQTFEIYADDVFFKDPLNEFRGVTKYKKMIGFLGRWFQNIQLELHEIQRDNATICTDWTLNMTCPLPWQPRLSISGYSLLEVNEQDLIISHIDYWNDAPLKVLGQVFKFG >NC_019683.1|WP_015133337.1|1342998_1344522_+|bifunctional-ADP-dependent-NAD(P)H-hydrate-dehydratase/NAD(P)H-hydrate-epimerase MSTINPENIVVFAEEMRQIETEIFAQEMPVPALMEKAALSIFQHIQIHYPQSEYLSVSVLVGSGHNGGDALVVARELHLAGYQVLLYCPLPKFKSLTQKHFDYAQFLGIDCAENIDNFLDCKLIIDGLFGFGLEREVTGHLAILIERINQRNKTVVSIDLPSGLHTDTGEALGIAIEATESLCLGLWKRLYVQDQAIPYLGKPTRLDFGIPTQLLEPHTKIQRIDVTIAKRFLPLRRSPLTHKYKQGNLLLIGGSDQYAGSIILAGLGARATGVGMLTIAVPKSLKPLVVARLPEALVIGCPETEDGAIAELPDLDFVKYGAIACGCGLTLQGATNIMPKLVKQEVPLILDADALNWLAQNNLSQIQNRQAPTVLTPHLGEFRRIFPMIEETGDRLTMTQQAAQLSNTITLLKGAKTIVANPNGQIYCSTASTPALARGGSGDVLLGIAGGLLSQNPTKPLEVTATAAWWHAQAGILAAKEQTLAGVDGVTLATYLTKFLTTMDTCM >NC_019683.1|WP_015133336.1|1341267_1342980_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MVKIKPLPNDVVQLIAAGEVIDSLGAVVRELAENAIDAGATRIGIEINPNLWKIRVIDNGCGMDLDDLELCATPHSTSKIGDRHDLAHIASLGFRGEALYSIAQVANLNIASCTAGDTGYLLKAYQEDISTASLHPMSVGSIVTVDRLFENFPVRRNALPSLSQQLKTIQQIIHHLALCYPHITWQVGKNNQPWFQVSAGETALDILPQLLKAIAPNDLIYRRFTSAELELLAPDCAIELVLGLPDRCHRHQPDWLKLAVNGRIVKFPVLENTIIKAFYRTLPRDRHPVCFAHLHLPPHQIDWNRHPAKSEIYLQHQDRWQETIKEAIAKALRLSEASLPKLENQRVLNLMVAAEPRAEYSVATKPKTAVETEPETKQSTTINIDLKVIGQSRNTYILVEHEAGIWLVEQHIAHERALFEQLQEQWQIIPNPTPIILGNLTAKQLEQLTENLGLSLESFGENLWKVNTIPAALQTYPDLEAALLELADGGNIDTAQAAIACRTAVKNGTPLTQEKMRDIIQQWQQTKNPHTCPHGRPIYLSLEETSLYRFFRRHWVLGKSHGITESKPPK >NC_019683.1|WP_015133335.1|1340208_1340853_-|PTPA-CTERM-sorting-domain-containing-protein MFKSNLFTTASVTALSTLSVCLGFTHSAQALSFTEVDDAGELLGTAQVIGGSGAITEISGNTDFDANDFADLFKISLDGSFFSATTETTSTDFDTALFLFDSTGDVVLSNDDIDFDNFVVESEISGNLAAGIYYLGITGSGYLPEDAFGSVINDPTDPPFGFDSVGTLAGWQDEPFEVGAYNISLTGVNAVPTPAAVLPILSGLFTAARRKKNK >NC_019683.1|WP_015133334.1|1338811_1340080_+|type-II/IV-secretion-system-protein MVNFQAKDQTGQIKQILRHALDNRASDIHLEPTTDGLKIRYRVDGMLRHIQTLPLEISRKLIVALKVMCDMDIAESRVPQDGRIGEKYFGGELIKGLDLRVSTLPCVSNTKGDVAEKAVLRLLRQQNSFKTVADLGFSRRSRSKFEGYLNQPQGLVILTGPTGSGKTSTLYTSLVGVATEEVNIITVEDPVEYLLPNITQTQVNEAAGMTFAKSLKAILRQDPDIIMLGEIRDAETVETSIRAALTGHLVLTTLHTNDAIGAIPRLKDLGPDPALISDALLGVVAQRLIRVNCPHCSEPYQPIAADWHQLDLTPKEFASKNWRKGRGCEHCFGSGYLGREAIVELLHVDDAVRQIIYEGSITQLRHYLQQSEFESFRRAAIAKVINGITTVEEICRVLPRSVLQNPQPLLKKRSPTTLINAS >NC_019683.1|WP_041763210.1|1338630_1338831_-|hypothetical-protein MAWKFTINTEAIAHKKLDKKELKNIERRKDNPAKAPGTHQVQTSLHPQQKNTPTELSQTLITNKST >NC_019683.1|WP_015133333.1|1336708_1338634_+|PhoX-family-phosphatase MPHDNKPSNFSGNRPFHDVLQKRISRRNMLKKSMILSAAGFVGAIAGENLLRQTPVTAKTSAAAKKVAKGSSPLIEFDAVPVAAGNGSVPTISADYEYQALIPWGTALTNEYDDWDGNPATRPTSAQQAKMIGIGHDGMTFFPFRGQTNHGLIAVNHEFGRNTHVLGKSAPETLEDVLLSQHAHGVSVVEVKANPQGVWEVVKNSAYNRRVHVNTPVTFSGPVAGDSLLDTPQGNSPKGTVNNCANGFTPWRTYLTCEENFNGYFGANGNWTPTAEQTRYGFSSSGFGYGWQNFDDRFDLSNSRYRNEDNRFGWVVEIDPMSPDKPPVKRTALGRFKHEGVGVTVGRGGRVVCYMGDDQRFDYIYKFVSAANWKRMIKQGKSPLDEGTLYVARFNDDGTGDWLELTINDPKLAAKFSSQAEVLTYARLAADELGATPMDRPEWTTVAPDGTVYCSLTNNSRRTTDDPTGANPIELDEFGNPLRDSDGDIVGNPDGHIMSWVDSNRHTGITFEWDIFVLSRDTRNTESVFSDPDGLWADPDGRLFIQTDGGQKDSLNNQMLVADPKTHEIRRLFTGVTSDEITGIAVTPDRKTMFINTQHPGNGDPSRTNFPVENNPANPNGPIPRDSTIVIKRKDGGIVGS >NC_019683.1|WP_160148390.1|1336069_1336588_+|hypothetical-protein MSAFYTFVSLLFLINPVDAKATQKSTFTVPIHRSMDYQDIRHQAEQLTNAYISLAFTQNLDIEALQLDVLGEKAVEIVPLFSIFITRTQWRESPHISDWVSYNQASFSLLQSDQPLIASAEENDVVSSSSRTTSINLVNFPAIDESFVIDEVDIDQLINDGFNPQVIIDDLD >NC_019683.1|WP_015133331.1|1334181_1335669_+|PAS-domain-containing-protein MAKSDKPLSQKDKAIADLEEELNQARLEIKALQQSHDEELSQARSEIKTLRQARQQESHHREQIDSELKASQQLLQLVMDTLPEAIFWKDRHSVYLGCNQNFAEDAGVGSPPNIVGKTDYDLAWKTEEADFFRECDQRVMSSNCAELGIIEPQLQGDGKQAWLETNKAPLHNSCGEVIGILGTYQDITERKQADIALQNLNKKLERQTNRLKLALELVQSEKMSALGKMVAGIAHEINNPMNFIHGNVTHLEEYTKELLQLLDSYQQQYPVPPQSLQAELEDANLSFLTQDLTKIFQSMKTGSTRIRNIVLSLRNFSRLGESGYKWVDLHEGIDSTLLFLQHRLKTPTKFTGIQVIKEYGNLPLVECCPRELNQVFLNLLTNSIDALETTAHKSTPEQQVTQPTIRISTHLTAEERVKITISDNGLGIPKMIESRIFDPFFSTKSIGKGTGLGLSISYQIVTEKHNGAIWFDSTEGSGCEFVIEIPLCHSEAVST >NC_019683.1|WP_015133341.1|1351162_1352515_-|hypothetical-protein MSFDFRGFIRRLKPDGTLNIGDPEDKRFYVDFSEVRGDQVVDEIFDGIDIFPEDHTCHLFTGHIGCGKSTELLALRHKLNQEGYFTVYFESTDYLEKADVSIVDVLLAIAICIDRSFTEAKLPPARGLKGIFEKTKEVLNIPIEVNEFAVEAGGIGASVQGDGSFSVGTGFAKITAKAKIDSALREKLNRYLGSIKTELLRDINEELVEPLVNLVREQDKKGLVVIVDNLDRVERGDNRNQHEDLFIGQAEVLQSFPCHMVYTMPLALRFGDRFGLIETRYNPQPKTLPMVRIKTKTGEDNPAGLAKMREMVLVRAFPDLKPEEWDAHITEVFEDPESLNHLCRVSGGHVRNLLQLLSDWALKDWRKDKLTQATLEEKIRQRSNNMILSMDDGEYEMLREVYQTKKIGGDRDYNKLIASRLVFEYQEAQTSWFDLNPIIMGAEKLQDLQA >NC_019683.1|WP_041763212.1|1352598_1353339_-|tryptophan-rich-sensory-protein MDSKNIVKSGVQTVMGVEEKANDDKKIATDLENPQFDGKATVNYILGTALQIGLLVALLWGMNFLLPQVTQYFSQPWMTVTAVCGFFAFFTLRSRLFSPLDNTRSGRRYDSVQRPTWSPPPLAFPIVWMSIAVLRVVSAYYIWLATSENFLSLPLIIYAIHLALGDTWNTIFTVEGRLGAAVPVVIMGPLLSSFAVAIAYWQVLPLAAWIILPSCLWLTVATVLVISIWQLNGQEPLYPLVAQSAE >NC_019683.1|WP_160148391.1|1353613_1354411_+|PEBP-family-protein MKKLTFILFTLLMLTACGEADQQGLERNETATPESSNSSESFRADAPPPPKKKGTEEINFTTNTVSNGTVSFRMDVWADNWFAAYLGETLIVEDSVPITTERSFNAESVTFKADYPLNINFILRDFKENNTGLEYIGENKQQMGDGGFIMQLIKTSTGAVVAVTNSSLNCLVIHEAPLDKSCENESNPVAGTAPCDFVETPEPDRWMSASYDDSEWTATTVHSASDVDPKRGYDQILWDDSAEFIWGPDLETDNTLLCRVTILSP >NC_019683.1|WP_015133344.1|1354714_1355599_-|mechanosensitive-ion-channel-family-protein MSSLSLLNQLVFLAQTSEVEQPLSDNLLTDITFGKVAQAATTVAIAYGSFWMIQVATEWLSERVPRRFRLTIKQALPFWKASILIVTLSYLLNLFLNLSEANLLALTGTIAVALGFAFKDYASSVIAGLLALFEAPYRMGDRIQIADHYGEVVGYGLRGIKIQTPDDNVVTIPHNTTWTEPISNANTGQLEAQVATSFYFAHHADAEKIVSILYQAAYSSKYTQLKLPIVVVMEEHYWGTQFKLRCYPMDARDEFVYKTDLIRRAKQAFQRHKLPYPEFMRIVNEEGMGGELLR >NC_019683.1|WP_015133345.1|1355600_1356818_-|MarR-family-transcriptional-regulator MHSAAQSLKQYLQSRFQKDTTVAEANDGLVMLPDVLENQIAKKLQALPSPTPYQETVKTEISAAIEAWQQNLDAPNSLVLLGNPVEPIANILNDSLRQWVDPPASIITPLRCVERPLDPWQLKRKVEGALMPYAQIEPPETKDTDQQPEPNSLDNRKTLILVPCLEQCFLRCIGGWESIEYLRDIAIHHRNCFWVMGCNHWAWNFLDFVCQVSAYFSEVKALPELDGEMLKDWLDPVVKTIIATPEKEKVSEEEEGDRPEYWDVLARKSLGVSSVAKSLWLQSLRIEAEIIEETEDLRDLKLLGQDTDQKEELNLLEVRPTLPNLPTLSGNDRYLLHSLLIHGHMTRAHLAFSLGQQEGQIQSAIQALLRKGLLERANGGLRVEATHYAKLKMELSNNNFFVGDD >NC_019683.1|WP_015133346.1|1356931_1357807_-|DMT-family-transporter MVGEISALTAAFIWSVSSIVYDKIIAKTKASATLISFYRGFFSLPFFVVSLLILEPTLPQLSSLQWWYLSLSAILGITIGDTALFLSFQDVGVRKALLLQTLTPLFGAFFAWIFLNESLSAYGLMGIPLTLLGIVWVISERAAAGRSPHLWRGIIWGLISTSSQGLGAIFVREMLDNGDISPLWSSTFRMALGTIILGIWLIYKGSMTFNLLSARQWQGIASASFGGSFVGLWLHQTAFQFAPVGIAATLLGTSPLFAVGISLYLREKVTWRSLGGVMLALMGIGLLLIRQ >NC_019683.1|WP_015133347.1|1357882_1358674_-|VOC-family-protein MGIRESYARGIFNWVDLMTADPAAAEEFYGKLFGWEFDHRPMPNGDYYAIAQKNGRDVTAIFGLPEDKKEQGIPPHWQSYINTPDLDETVVTWEAKGGKVLAPPFDVMSAGRMAVVQDPTGAVVNLWQAKEHIGAGVVNEPNTFSWAELQTWDGPTATDFYEEVFGWEIEMDEKPPHYVTAKVDGHMNCGFFDMSKTELPRTIPATWATYFNVENLDTAIATVTELGGAPLMEPIVLDVGRFTTIRDPQGAMVTLIELKVVDD >NC_019683.1|WP_015133348.1|1359201_1359702_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MSLVRFSPFSELETVHTQMNRILDELAGWQGDGKVAWRPSVELLDGDTELTLKASLPGLEKDGIDISLTRESVRISGEYNYHKEDHDKGVYHSEFSYGKFDRSIVLPVAIDHENASATFADGILTLTLPKVVPTSKKVVKLNLGEGTVSAEAPAIADSENESDVNS >NC_019683.1|WP_015133349.1|1360022_1361375_+|hypothetical-protein MFAPTFRKNKTQRSIFSPERSLGWRRRQEQTSAQQFTDMQIGFPKTAGRVVPVEEEELPDEVAEAIRDILNFFVKLSKTSSISSLLENFELFFIDHDPNSIPQNLNHSIYQLLVYNCTSDFIYLLNRCSFLIVNSCLKQKKTKHIEKLIDLFQNPSTLPSNASLATRKFRDWVDSYKSSRQYKILELFSPAAKVGNKTWHDRYIRLTLLAQTFDVETPIEQRQACQFLYQFLKNRYKFQLVMYLTKGCDEAPAKAKVSNPTLIHPSTLKLIQKIVVKRGQGYPQMAEEFMEQHEQGIYADFKKALVEHLLTSIGGDRRLKWLPKKMEQHLDTIYPEKSSVTVGHHLITKTCDETICYLLNPESFVDPTHPFTLMMIQREFLSLSIILLKLVLISPRSYGQLIQSLNDLMQHYRHKSQDECEWLTGLLETVQVILTLGVNEAQYYSFANAA >NC_019683.1|WP_015133350.1|1361475_1363167_+|dihydroxy-acid-dehydratase MSENQNRRSRVVTEGHQRSPNRAMLRAVGFGDDDFKKPIVGLANGYSTITPCNMGINDLALRAESALRDAGAMPQMFGTITISDGISMGTEGMKYSLVSRDVIADSIETACNGQSMDAVLAIGGCDKNMPGAVLAIARMNIPAIFVYGGTIKPGHLDGEDLTVVSSFEAVGQFSAGKISEEKLMAIEKNACPGAGSCGGMFTANTMSSAFEAMGISLPYSSTMAAEDEEKAISTEESAKALVNAVKNQILPMDILTRKAFENAISVIMAVGGSTNSVLHLLAIANTIGVELTLDDFEEIRQRVPVFCDLKPSGKYVTTNLHKAGGIPQVMKMLLDQGLLHGDCMTITGKTVAENLADIPSEPPADQDVIRKFDNPLYKVGHLAILKGNLAQEGSVAKISGVKKPAITGPARVFESEEECLDAILAGKISAGDVIIVRYEGPKGGPGMREMLAPTSAIIGAGLGDSVGLITDGRFSGGTYGLVVGHVAPEAYVGGNIGLVKEGDSITIDANQLLLQINVSDEELAKRREAWTPRPPRYKRGVLGKYAKIVSSSSKGAVTDIDLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019683_2 | 2612972-2613089 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019683_2
|
1 spacers
spacers of NC_019683_2
>2.1|2613011|39|NC_019683|CRISPRCasFinder CTGAGATCGTAAATTCCCCCTCCAGAAGTCGTAGCAGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019683_2
The CRISPR arrays of NC_019683_2 >merge|NC_019683|2|2612972-2613089|CRISPRCasFinder TTACCAGAGATAGTGGAATTATTGATGTTTACTATTCCACTGAGATCGTAAATTCCCCCTCCAGAAGTCGTAGCAGTATTACCAGAGATAGTGGAATTATTGATGTTTACTGTTCCAA >NC_019683|2|2|2612972-2613089|CRISPRCasFinder TTACCAGAGATAGTGGAATTATTGATGTTTACTATTCCA CTGAGATCGTAAATTCCCCCTCCAGAAGTCGTAGCAGTA TTACCAGAGATAGTGGAATTATTGATGTTTACTGTTCCAA
>NC_019683.1|WP_015134346.1|2610197_2610524_-|(2Fe-2S)-binding-protein MPKIIFGDQIITCDVGENLRKVLLKHNAALYNGKANIINCMGIGSCGTCAVEIEGELPERNWKEKARLSFPPHNPEKQRRLACQITVENDLTITKYDGFWGQGDRRLF >NC_019683.1|WP_041765501.1|2607652_2609884_+|hypothetical-protein MTSCFDLDATNDGTNDFGCDIETFVSSSSDQAAFEAASYVIAKNNGQPTIGTVPRGEAFQNLNMQEYGFAIHAVAKKTVAADSELGASLKMDIKSRLIPMFQFAAFYANDLEILPGPTMNLRGPVHTNGSLYLGAGGTLFVHNQVTLTGELYNSRKNKNSTYSEGKVQIKDAAGNWQNLLSGGTGSTSQTNSAMNPELVDSTWGTQVQTDLEPVIIPSPSFIDATGAYYTNGDLRIEYKPADTATNNTDYLATVPFEIQVPDSSTGTHEQLTEGQLRSLRQPVMVGRDVEQAGYCNAVSEPSISALTSDNEVKRYIVEALQTAIASQVEPLQFTTLDTSMSDAEFANLKASFDTALTARLDAQLNFTSILSSGDTAQIASLNSIVDSTQLNILDNLSPEQIAAISYQGTDPDDGSTIELGERCFVAAPLRDIGRDSSSHQSPYRYYNDREGREMRLLQMNIESLTVWNRDGVYVEFNSGAVQNLNSGQGFSSDESLFERIEPDGNAVANSFQSLGLASSDTSEGGLVFHATVDQTTYPDAAGVDSPYGFVLTKGEQLMGLAGTASNPENTGLTFVSDHGVYVQGDYNIVNKQPASVLADSLNVLSNACRNQDGMINKKSGKNCNPDINNEDTKSNGATTEINSAFLAGTDITVPNGGNGGYNGGLENYPRFAESWSGKTLRYRGSFVSLGTSQHVSGKWSSQKYNPPGRDWEYDLDFNNADNLPPLSPRFVHVKQSSFERYLD >NC_019683.1|WP_015134343.1|2606164_2607298_+|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MKRQFIQWKPSTQISNKLSFYLKLLDYQRKTKNNSSELGFTLVELLVSLAIGLLVISLAFFGSVLNRQIFVQDRARSEIAQTLRLPLDTVGNDIKQAGEGIGTSDPNFPVVLLTQNPTQLTIRRQLVPTSIPVCRDIAVGSSDPVVVLDQNGGTPLVGCEITVLSDADSDGWPDQWDNAEKFRDYRLNNGSAIRAFIYNGNGEGEFFDYQNERAFDIDDNEIPNPLATVNPVEYTTLDSNSNVWTNNYLGDSSSRIYLLEERRYQLDETSNTLQLITDNSQTLSITNNIDILEVAVIVEQDNVEHTCTVLPPTTATDCDPVLTNSYSWSQIKAIDVMLQVAADSSPALALQENCPDPNDCEALQLRRQFVPRNVFNF >NC_019683.1|WP_015134342.1|2605758_2606214_+|type-II-secretion-system-protein MLFYINNFLFRDIDKKEDNGGFSLIESIVSLLIFVITFSLAAPLFVAQQKSNINNEIRTGAVSLSQQVLDNLRLETSLTLGETNESSISSLGKEYSYNQFVCSDKPSFNADSSVSCNTTVDLSNPMRYILLQVEYNEETIYTVETIYTDIQ >NC_019683.1|WP_015134341.1|2604427_2605732_+|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MNNNQDQGFTLLELLVALAIIGILSAITTPLVLWANKPLQNATYQAAGIFSQGRSRAIATTSSIRIQPDPSDPDHSLIVEASDTRSCDPNTTQLTGAVPTTGNQLTVVSTNGFAAGDRLKVGDDETENVVLTTDSSTSVLTLGQPLGTSQASGEAVEIISTWTSDKTFFQEDMTLPDTVTIASNLNNWVLCFDSRGIASVSDDTGITTDDLEITLISEQSAKEGKITVFQGGLIDSVVIQPKPEVVVASASDTGTSTSDDSSSGTGSDSSSTGGGSDSATSSEDDASTEADDTSTDPEASTETETSTEPDDTSTEPEAIAEETEYELDNGVVVTVDDSSPIPPDPDPEPATTDPEPAATDPEPAATDITPPDNTSPDDEEPQTYEEKLVVYREWLDDNEYYQSLVEGTQTVDRDSEPYKNFITELIEKLTWLYS >NC_019683.1|WP_015134340.1|2603682_2604276_+|hypothetical-protein MNTTSFQKASKARKTQQTVNVKPPELVPSSWINGFGVVSLVTCSTIIASGYSSQHQAQAALHDAQSHGIAEAGVARIFSKLIQQQNRGLLTKNFDTTASVDEWSTGSLSCGATMTAPGSVPTDLFGGTVQNGSYRLVAYKYDANLQQGTFVVEGTVNGSTSRLEVTRNINLAGAGQGNACPSIARNLRDSVATNMAS >NC_019683.1|WP_015134339.1|2602373_2603180_-|methyltransferase-domain-containing-protein MSEYIHGYDPEEQQRLVEQAQYWSDRLFLPNLDLEPDAHILDIGCGVGAVLGIISQKYPDLIFAGVDLQPRQIAFATQYLTDLGLNFDLRAGDAYQLPWADNTFDFALTVWLLEHVPDTAGVLQEALRVLKSGGQICLMETDYQSLLVHPTHPDFEYFREALCELFFAANGNAYVGRSLGAYLVQAGFAEVNNEAIAFHYWQTPENEELRGLVNHIDTWLKLMIPQMVEKLGKDGDRLKNGLEHFRNVPNDPLGSITLNIYRATGTKL >NC_019683.1|WP_015134338.1|2601718_2602318_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MIPTVIESSGRGERAFDIYSRLLRERIVFLGQQVNDEIANLIVAQLLFLEADDPEKDIYLYINSPGGSVSAGMGIFDTMNQVRPDVCTICIGLAASMGAFLLSAGEKGKRMSLPNSRIMIHQPLGGAQGQATDIEIQAKEILYLKGKLNQHLADHTGQPLDKIEVDTDRDFFMSAAEAMDYGLIDQVIDKSPSATNPPV >NC_019683.1|WP_015134337.1|2601073_2601628_+|guanylate-kinase MTSPGKLIVLTGPSGVGKGTLVRELLPRHEQLFLSISATTRQPRTGEVDGKDYFFKSRAEFEAMIAAKELLEWAEYAGNYYGTPLPPVKAQMKKGNSALLEIEVVGANSVKNIFPEALRIFILPPSFEVLEERLRGRGTDADEVIAKRLTRAKEELELSTEFDYQIINDDLEQAIADIEAAIFS >NC_019683.1|WP_015134336.1|2600763_2601036_+|DUF370-domain-containing-protein MEIQLINIGFGNIVSANRVIAIVSPESAPIKRIISDARDRGQLIDATYGRRTRAVIITDSSHVVLSAIQPETVAHRFVVQKDGAIANAKV >NC_019683.1|WP_015134348.1|2615616_2617569_-|Rieske-2Fe-2S-domain-containing-protein MANTSTQWFKVLAPDELPEGRVKTVIAGHKGLALTHYDGQYGALDNRCPHQGGPLGEGSIENGLLRCPWHGWDYCPLTGQSPGAFDDDDALETFPVEVREDGVYVGLPVEDPHTRTVSDVMAETMVNWGVTHVFGMVGHSNLGLADALRRQEEQGNITFFGIRHEGAAAFAAAAYGKLTGRPAACLTIAGPGATNLLTGMWDAKVDRSPILALTGQVNSQVLGTGNFQECDLGAAFSGVAAWSQTVLSHSKHAELMTLAVKNALLQRDVSHLIFPDEVQVQAAVDVPASSPTGRITPLQIAPPPDALQKAIARLKQSRRPVIIVGHGSRFNMPAIIELAELLGAPILTTFKAKGQISDRHPLGCGVLGRSGTPIASWFMNESDLLLVFGASFSNHTGISAKKPIIQVDFDPLALGKFHPVEVPVWGEISIVVEQLKTALTGQVNTENRREEIADRWAIWREEKIRREADDRGQGLGSAAIFAAMTRQIPANAVISVDVGNNTYSFGRYFECEAQSVLMSGYLGSIGFSFPAAMGAWAAAGHERPIVSVSGDGGFGQYLAEFTTAVKYDMNITHFLVNNSQLGKISKEQRAGEWDVWQTSLHNPDFSKYAEICGGLGIRVTKKEELDDAMQRALEYKGPALVEMIADAELI >NC_019683.1|WP_015134349.1|2617666_2619280_-|alpha-hydroxy-acid-oxidizing-protein 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NC_019683_3 | 2613200-2613547 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019683_3
|
4 spacers
spacers of NC_019683_3
>3.1|2613239|42|NC_019683|CRISPRCasFinder GTTCCAGCATTATAAATTCCTCCTCCGAAGAAACTAGATGTA >3.2|2613320|36|NC_019683|CRISPRCasFinder TCATTACTAATTCCTCCACCTAAATTAGAGGCAGAA >3.3|2613395|39|NC_019683|CRISPRCasFinder AAGCTATTTTGAATACCTCCTCCATTAAGGGAAGCCATA >3.4|2613473|36|NC_019683|CRISPRCasFinder ATATTAGTGTAAATGCCAGCACCAGTACTTGCTGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019683_3
The CRISPR arrays of NC_019683_3 >merge|NC_019683|3|2613200-2613547|CRISPRCasFinder TTATTAGAGATATTAGAATCATTAACATCTATTATTCCTGTTCCAGCATTATAAATTCCTCCTCCGAAGAAACTAGATGTATTACCAGAGATAGTGGAACTATTAATATTTACTGTTCCATCATTACTAATTCCTCCACCTAAATTAGAGGCAGAATTATTCTCAATAGTGGAATTATTAATATTTACTGTTCCCAAGCTATTTTGAATACCTCCTCCATTAAGGGAAGCCATATTGCCAGAAACAGTAGAACTATTGATATTTACCGTTGCAATATTAGTGTAAATGCCAGCACCAGTACTTGCTGTATTACCAGAAATAATAGAGTTATTAATGTTTACTATTCCT >NC_019683|3|3|2613200-2613547|CRISPRCasFinder TTATTAGAGATATTAGAATCATTAACATCTATTATTCCT GTTCCAGCATTATAAATTCCTCCTCCGAAGAAACTAGATGTA TTACCAGAGATAGTGGAACTATTAATATTTACTGTTCCA TCATTACTAATTCCTCCACCTAAATTAGAGGCAGAA TTATTCTCAATAGTGGAATTATTAATATTTACTGTTCCC AAGCTATTTTGAATACCTCCTCCATTAAGGGAAGCCATA TTGCCAGAAACAGTAGAACTATTGATATTTACCGTTGCA ATATTAGTGTAAATGCCAGCACCAGTACTTGCTGTA TTACCAGAAATAATAGAGTTATTAATGTTTACTATTCCT
>NC_019683.1|WP_015134346.1|2610197_2610524_-|(2Fe-2S)-binding-protein MPKIIFGDQIITCDVGENLRKVLLKHNAALYNGKANIINCMGIGSCGTCAVEIEGELPERNWKEKARLSFPPHNPEKQRRLACQITVENDLTITKYDGFWGQGDRRLF >NC_019683.1|WP_041765501.1|2607652_2609884_+|hypothetical-protein MTSCFDLDATNDGTNDFGCDIETFVSSSSDQAAFEAASYVIAKNNGQPTIGTVPRGEAFQNLNMQEYGFAIHAVAKKTVAADSELGASLKMDIKSRLIPMFQFAAFYANDLEILPGPTMNLRGPVHTNGSLYLGAGGTLFVHNQVTLTGELYNSRKNKNSTYSEGKVQIKDAAGNWQNLLSGGTGSTSQTNSAMNPELVDSTWGTQVQTDLEPVIIPSPSFIDATGAYYTNGDLRIEYKPADTATNNTDYLATVPFEIQVPDSSTGTHEQLTEGQLRSLRQPVMVGRDVEQAGYCNAVSEPSISALTSDNEVKRYIVEALQTAIASQVEPLQFTTLDTSMSDAEFANLKASFDTALTARLDAQLNFTSILSSGDTAQIASLNSIVDSTQLNILDNLSPEQIAAISYQGTDPDDGSTIELGERCFVAAPLRDIGRDSSSHQSPYRYYNDREGREMRLLQMNIESLTVWNRDGVYVEFNSGAVQNLNSGQGFSSDESLFERIEPDGNAVANSFQSLGLASSDTSEGGLVFHATVDQTTYPDAAGVDSPYGFVLTKGEQLMGLAGTASNPENTGLTFVSDHGVYVQGDYNIVNKQPASVLADSLNVLSNACRNQDGMINKKSGKNCNPDINNEDTKSNGATTEINSAFLAGTDITVPNGGNGGYNGGLENYPRFAESWSGKTLRYRGSFVSLGTSQHVSGKWSSQKYNPPGRDWEYDLDFNNADNLPPLSPRFVHVKQSSFERYLD 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>NC_019683.1|WP_015134348.1|2615616_2617569_-|Rieske-2Fe-2S-domain-containing-protein MANTSTQWFKVLAPDELPEGRVKTVIAGHKGLALTHYDGQYGALDNRCPHQGGPLGEGSIENGLLRCPWHGWDYCPLTGQSPGAFDDDDALETFPVEVREDGVYVGLPVEDPHTRTVSDVMAETMVNWGVTHVFGMVGHSNLGLADALRRQEEQGNITFFGIRHEGAAAFAAAAYGKLTGRPAACLTIAGPGATNLLTGMWDAKVDRSPILALTGQVNSQVLGTGNFQECDLGAAFSGVAAWSQTVLSHSKHAELMTLAVKNALLQRDVSHLIFPDEVQVQAAVDVPASSPTGRITPLQIAPPPDALQKAIARLKQSRRPVIIVGHGSRFNMPAIIELAELLGAPILTTFKAKGQISDRHPLGCGVLGRSGTPIASWFMNESDLLLVFGASFSNHTGISAKKPIIQVDFDPLALGKFHPVEVPVWGEISIVVEQLKTALTGQVNTENRREEIADRWAIWREEKIRREADDRGQGLGSAAIFAAMTRQIPANAVISVDVGNNTYSFGRYFECEAQSVLMSGYLGSIGFSFPAAMGAWAAAGHERPIVSVSGDGGFGQYLAEFTTAVKYDMNITHFLVNNSQLGKISKEQRAGEWDVWQTSLHNPDFSKYAEICGGLGIRVTKKEELDDAMQRALEYKGPALVEMIADAELI >NC_019683.1|WP_015134349.1|2617666_2619280_-|alpha-hydroxy-acid-oxidizing-protein 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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NC_019683_4 | 2967108-2967209 | Orphan |
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019683_4
The CRISPR arrays of NC_019683_4 >merge|NC_019683|4|2967108-2967209|CRISPRCasFinder CTGTTGTTCTAGGGTTTTTTCGAGACGCTCATATTCTGCTTTGAGAGCTGCAACTTCTTCAGACTCATCAGTAGTCTGTTGTTCTAGGGTTTTTTCGAGACG >NC_019683|4|4|2967108-2967209|CRISPRCasFinder CTGTTGTTCTAGGGTTTTTTCGAGACG CTCATATTCTGCTTTGAGAGCTGCAACTTCTTCAGACTCATCAGTAGT CTGTTGTTCTAGGGTTTTTTCGAGACG
>NC_019683.1|WP_015134680.1|2966346_2966706_-|hypothetical-protein MPANTCIISNNSEQKAKLAQCFERNALLSTSFPRNLQNIFELAQQSPLLLIVIALKQDPTLSKKICHSLKKNPLTKNTPLILIKKQGLSEDQQLADAYLPDDFSMRDLEQLVRQLTIGY >NC_019683.1|WP_015134679.1|2965638_2966148_-|allophycocyanin-subunit-beta MQDAVTSLIRNYDTTGRYLDSNAIDNLKSYFATGADRITTAAIVNGNSAEIVKFAANQLFEAVPELLLAGGNAYTTRRYSACLRDMDYYLRYGTYAIIAGNNDILNERVLQGLRETYNSLSVPIGPTVRGIQFIKEAIKSAAAEAGIADTSFIDEPFEHMIREFSEVDI >NC_019683.1|WP_015134678.1|2964571_2965492_+|LysR-family-transcriptional-regulator MRLEQLEAFLAIAATGNFGQAAKQCRVTQSTVSRQIQSLEGIVGTPLFHRNAQVKLTLAGERFLPYARRICSSWNNAKQEIDELISGKQSELCVAAIHSVCAYHLPPVLKRFYRMYPQTQLRITALGSDRALKVLRDNLIDVAIVMNNRFLTASPDMIVQPLYRESIEVLVSHEHPLASHKSLSWRDLANYPQVVFKDGYGMQRYVQEQLNKQGLTTGTTVELNSLDAFRGVVRQGDMLALLPQSALIEARRDPDLVVVPLADAKDFREVVLVTTSDRLEIPPIQYFCSQVMQCIAKAPNNSQLIA >NC_019683.1|WP_160148622.1|2962283_2964356_-|S-layer-homology-domain-containing-protein MQQKLYVNPEIGDDENSGSQENPLRTISTAIKRSTSDCVIHIAAGNYTRKRGELFPLILPSGVQLIGDVASQGHSVTIRGSGIYNSDRLKTQNVAIAMLSGSALKGVTVINLERKGTGVWIEEGRVEIENNCFQHCRREAIFAAGTSKALIFDNLFLDNKGNGIFMANNAKGEICHNQFQGNQYAIALNEQAAPFIAHNRIAQNQIGIFIAKQTQPVLRRNLIENNHDFGVVISGNAQPDLGLTQDPAGNIIRQNLEADLRNKTDDVIVSVGNDLNPVTTAGMVEFAAATVPITKMGMTPFRDVLSHWAEPFIQVLVENRYLQGFPDGTFRPDAPLTRAEYAALLARCFDLPRPLGVQDAEFADIASDFWGKNAVTKAVTMGFLVGYPDDTFRPQAPLTRLQAIISLAKGLGLKDGNPKVLQAYGDRPLIPSYALNSVAVATQNRLVVSYPKTDRLQPLHDITRGEIAALLHQALVINQKLPLLNSEHIVEPLPYLPTFSDVTYHWAKPFVTAIANLGLVQGYKDGSFRPDAPLKRAEFAALLSDIFAPNPVRPAKNFFDIPADFWAATAIQQAYRGGFLSGFPDQTFHPHQGLRRVHVILALANGLNLPSAPQSVSLNQYLDVNEIPEYANEAVAASTQAGLIVNYPDPKILNPNGEATRAEVIALCYQALVYLQRAAPVDSTAIVNVT >NC_019683.1|WP_173391207.1|2960956_2962234_-|insulinase-family-protein MVAVSSLPYSPQPNPAEIFTLDNGLQVIHQYLPASSVVVSDIWVKAGAIAEPPEWEGMAHFLEHMVFKGSDQVCPGEFDHIIENRGGTSNAATSYDYAHFFITTARDQLSETLPYLGDILLNATIPDEEFIRERLVVLEEINSSNDDPDWLGFQALNQTLYQQHPYGRSILGHEEQLCDYTPNQMRCFHRTYYQPHNMSISLIGNIQAEPAIELLETVFAKFPVPAECPAFNVEAEPPLISPRRSDVRFPNIEVSRLMMGWLCDGIENFDDAVGLDVLSVILAGTMSSWLVQELREQRHWVLDISSGFSLQRDSSLFTLQAWLNEEHISDVESVIGDRLTYLQNHTVSETELNRAKSILCNDHIFSMETPSQLAGLYGYYHTLGQLNYAHIYPQLVRRLTVNDLQRLVRQYLSPERCAVVTVNPC >NC_019683.1|WP_015134675.1|2960192_2960960_+|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MFYVSQAHLQKFQDCPPSFQNAYLDQLATPLNPVQQQKQEWGIRFHLAMQQLHSGFPLEQITDDEQLKKSVQSLLAEIPYFQIQSGDRHSVAEYRQTLLKQDFLLTIICDWVLFRGDGLEIHDWKTYRQPKQPDRLKNHWQTKLYLYLMAEKTDYNPDDLSMTYWFIEAGKPPQSSTFKYSYIWHQKIESELNQLLEMLTKSLDNYFEKNIFFQHFEPTDCWYCLSQKSSRRSPQSLLSEVGLEQLLETSEIIEI >NC_019683.1|WP_015134674.1|2957746_2960062_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MSPTTWQLPANFDIPQTFIEQVQTLTDGRGDRHLTQLLWQRGFTEENQAELLGFLTPDHYQPTSPFDFGQEMKRAMRRLVQAINQGEKIAIWGDFDADGVTATSVLWEGLGQFFEQKTQLTYYVPNRLTESHGLNNAGIEQLKNQGITLIVTCDTGSTNLAEIAYAKELGLDIIVTDHHTLPNDRPDVLAIINPRYFAENHPLYHLSGVAVAYKLVEALYETLPDIPTQPVTNLLDLVAIGLIADLVALKGDCRYLAQRGIRQLQKQLNPQTVVHPGIKFLLEACRKNGDRPTDISFGIGPRINAVSRIHGDASFCVELLTSRDLNRCRRLAEQAESANTRRKEIQNVVVQQAKKQAATFDLSTTGVLVLGDRQWQGGVLGLVANQVAQEFGRPTILLTYDRDQDLWKGSARSVQGIDLYELVHSQGHLLHRFGGHPFAAGLSLKPENLELFKLGINQKARQLLGDRAGQTGKQIKVDLVVNVGELGAGLFRELKCLEPCGMGNPVPKILVQNCGLEITKFHKLRDKFNRKLNYYKVDFLLWDDTGELEGICWGKHPDEIPQGNGYDLVVELDMVSINPREQKSIVRLEAIAPSTNVMQQDSSFNNLVDFRQETALKLTKKQYVIQQDCPITWQDLHDNYHRARQKSKPLALAYNSPKIVDAEEAFKVLIGIAKYLVQHKKIIPLDAVREKIGCGDRLLKLALEALINFGFSYEFTDDKLNIKAIDKQFKPEKITRFQTTFAEEKFQQQYFCDVPLPVIQQTLELSPTDLS >NC_019683.1|WP_015134673.1|2956779_2957715_-|AEC-family-transporter MSIILIQLAAIYGKLGLGIGAGWIFGKFSSEAIAKKIGQWLFWVGVPISVFAFVRQIDLSGSIWLAPAVAWLAMGLCLGCAWLWLRYTPHDLDKPAQGSFLLSSTIGNTGYLGFPISLAIAGESMFGWALFYDLLGSLLWGYGIGVMVAAYYGEKEKTSVAKIIGKMFTQAAINPAIWSLILGLVFRGIAFPNLLEQTLHYIAWTVIALAIALIGMRLSHLKNNANITQIRSSLSIKMLLIPLIFALLLPLFDVPRNICLALLLPMAMPPAFATLIVSETYQLDQELSVCSLATGTCLLPFTLPIWVILFS >NC_019683.1|WP_015134672.1|2955778_2956636_+|IS982-family-transposase MSSLEALFCHVDDFCQVFEPLWHQALLSSGKKYRRRQRSLSLSEVMTILIAFHQSYYRNFKHFYLIKVKCDWQQEFPLAVSYQRFVTWIPSSLIPLCTYLRRCFGQCTGISFIDATSIKVCHNRRISQHRVFEGCAARGKTSVGWFFDFKLHLVINERGELLNVQVTPGNTDDRQPIVELWQDLWGKVFADKGYVSQSLAQHLQEEHEVTLMAKPRRNMKHHLMVYQDKLFARKRALIETVIDQLKNISQIEHSRHRSPTNFCVNLLCGLIAYCHQPKKPSLQLD >NC_019683.1|WP_015134671.1|2955180_2955699_+|PTPA-CTERM-sorting-domain-containing-protein MLPVGVSKAFTEGGLTVDVSTIPTSRLGRDNRGLFVQKPGIFNDIPNQVDAAANPNEFIDFDFGSELVQSISVVFSRVGFNDDFSFSVDGNVILPDTDILGVGNNRVFSFDSSVPLGSVLRFRASNFNDDFTISKLTVYAVQQVPTPAAVLPVISGLFAAAGRRKDEESEEA >NC_019683.1|WP_015134682.1|2967758_2968532_+|ABC-transporter-permease MNLKRIWAIATNCFREVIRDRILYFLGFYALAFGIAVQILPDISATAGDKIVVDFGLGMIGILSVLVAIFVGTGLVNKEIEKRTILVLIPKPISRAELIIGKHIGLSAVIGVMLAAMVVIYFGFLNWAERPFFTVPILVSICYLFLELMLIVAVAIAFGVFTSSLLATLCSFGIYLMGHFSTDLVKLGELSKNANVQWLTENLYTILPDLSRLNFRNEVVYGVIPEPNILITSAIYGIVYVILLQAIAIFVLSRRQF >NC_019683.1|WP_015134683.1|2968621_2969032_+|hypothetical-protein MAKLEQLIQMAEDELTEYSSDARKIEKLRRKFALGLNARQIEALKAELIEDMPKGFFASLIEDNRQSIALPFWGIAGLGLLFGISLRQPLDFIAPVIAIPAAIQVQRWGWQLEAKRLVLKTFEQLEERMKNPEKIK >NC_019683.1|WP_015134684.1|2969068_2970790_+|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase MTLNFNNLNSLWASVMVETLARLGLRNAIICPGSRSTPLTVALARHPKIEAIPILDERSAGFWALGLAKTSGIPTVLVCTSGTAGANFYPAVIEARYSYVPLLILTGDRPPELRQCASGQTINQLNLFGEFAQFFSEMATPVASLNMLQYARQTMVQAWQKSLFPQKGVVHLNCPFRDPLPPNILDDSVTFFADEINPKTFFQGIQSPIPLSFSPSRLPLEHWQGKKGIIIAGVDQPENPETYTKAIATLSKNLGFPVLAEALSPLRNFADFELITIYDFILRNDGQAEALLPEIVIQIGALPTSKILRAWLRTHHIPTWMITPYHDNLDPLHRPTQTLFSSVEQLVKLLPARSQSDTEYPQKWHFYQQQTTTAITQAFNSEADFIEAKVVRLLSQYLPEKSAIFFANSMTVRYAEFFWQQNQRQIQPYFNRGANGIDGTLSTAIAIAHNYSPCVLLTGDLALLHDTNGFLTLSQCRGSLTIIVINNGGGGIFEMLPIAQVDDVFKEYFITPQSPDLKQLAATYGVTYQKITNPDALIAAVSNLPKKGVRLLEVLGDRHRDTQWLQSLLCTFS >NC_019683.1|WP_015134685.1|2970808_2972245_-|glycogen-synthase-GlgA MRILFVAAEAAPIAKAGGMGDVVGALPKALRQLGHDVRIFLPYYGFLNNTMDLPSEPVWRGTAMFNDFAVYETTLPETDVPLYLFGHPAFDKREIYGGIDEFWRFTFFSNGAAEFIWNHWKPDVVHCHDWHTGMIPVWMHQSPDISTVFTIHNLAYQGPGRAFLEQTTWCPWYMDGDNAMASALMFANQINTVSPTYAQQIKTEQYGEKLEGLLSWVSGKSQGIVNGIDAERYNPSTDKFIPKTFSSKTLEDRTANKIALQQETGLEVNKKAFLMAMVSRLVEQKGIDLLMNILDQFMSYTDAQLIVLGTGDRQYETQLWQMAYRYKGRMSVQLLYNDGLSRRIYAGSDVYLMPSRFEPCGISQMMAMRYGSIPIVRRTGGLVDTVSFHDPIEQSGTGFAFDRYEPLDMYTCMVRAWESFRYKDEWTKLQQRAMQTDFSWYEPAAKYLKMYRQSIGDEAVLTADEADKIEHFGKLYQV >NC_019683.1|WP_015134686.1|2972326_2973160_-|alpha/beta-hydrolase MPNISVRGIPHYFEWIRVDQSANKPIMLFVHGWGGSSQYWRQTAHQFSSQFDCLIYDLKGFGQSQLTPDYQGDFALEDYALDLAELIHNLDISTSFVLNAHSMGASIAALFTEQYPQKVERLILNCNGVFEYDERAFAIFQKIGSAIVQLRYPWLISVPFMDRVAIARFLNRPINKQDRQQFLADYLAADSAAAGGTLIASVNKDMVTRLPAALKTIQCPTLFLSGEKDKIIPAVQAQAAIALNPNFQYAEIPQVGHFPMLESPDIYKAQIQKFLDS >NC_019683.1|WP_015134687.1|2973176_2974517_-|ATP-dependent-protease-ATP-binding-subunit-ClpX MSKYDSHLKCSFCGKSQEQVRKLIAGPGVYICDECVELCNEILDEELMENAAGMAPTVARSPEKNPEKSPPAKIKFEDIPKPREIKEYLDEHVIGQNDAKKVLSVAVYNHYKRLSLLPDEEEPDPAADGIELHKSNILLIGPTGCGKTLLAQTLAKILDVPFAVADATTLTEAGYVGEDVENILLRLLQVADLDVEEAQRGIIYIDEIDKIARKSENPSITRDVSGEGVQQALLKMLEGTVANVPPQGGRKHPYQDCIQIDTKNILFICGGAFVGLDKVIERRVGKKSMGFVRPGEEGSNKDQRTAKLLQHLSSEDLVKYGMIPEFTGRIPVMASLNSLDEDTLIEILTQPKNALVKQYRKLLKMDNVELEFEPAAVRAIAQEAYRRKTGARALRGIVEELMLDVMYEIPSRADLQRCKITQEMVEKRSTAELLLHPSSLPKPESA >NC_019683.1|WP_015134688.1|2974560_2975217_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MVQSQTSYQNLLSQSAPYTFSMGGAVVPMVVEQSGMGERAFDLYSRLLRERIIFLGSAIDDTVADSIVAQLLFLDAEDAEKDIQIYVNSPGGSVYAGMAIYDTMQQIRPDVVTICYGIAASMGAFLLSGGTKGKRMALPSSRVMIHQPLGGAQGQAVDIEIQAKEILYIKEKLNSLIADHTGQAFDKVAEDTERDFYMSAEEACAYGLIDKVITPEAA >NC_019683.1|WP_015134689.1|2975361_2976342_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MTIIAVDQLSKTYPVALKEPGLKGTIRHFFKRRYRQVKAVENISFQIKAGEMVGFLGPNGAGKTTTLKMLTGLIHPSAGKVHVAGATPFNRKASFLRQISLVMGQKQQLLWDLPALDSLRINAAIYDIPESVFQERLAELSDMLSLGNKLTQPIRKLSLGERMKAELLAALLHHPRVLFLDEPTLGLDVNAQVAVRDFLREYNRLYGATILLTSHYMADITALCERVLLIHQGSLIYDGGLDELLADFSPYREVRVELATPYNESQLVVFGEVESINGQEVRFLVKREQLTQRIAKILERLPVLDLSVNDPPIEEIIGRVFSLGAV >NC_019683.1|WP_160148623.1|2976460_2977597_-|septal-ring-lytic-transglycosylase-RlpA-family-protein MVAIAEASQPKHHTRIGKQPNVDFVATLQPLTQTKNSVSQAEDSTVLAAAELMSQRQSLAQNPLCQLVSETAETPLAIAEAKVAAPTPSKFSNFVSSFVQKFLRVIGLDHLMRTKPIKKSPVAVVSKTIQVNEKPSQTASNQQSSARFVSDRPQTTRPSLAQDYELWVKGSLIATVRSQEKADLLAQRLERLVETTNFNATAITPKLHQEQPAIAMGDQILFVIDESITREDIKNYEILAIRWANNLRLAFGVPALDLITAQTQMYQVEETGQSLEGLASWYGPYFHGRLTANGEIYDQYAFTAAHPSMPLDTYLKITNLDNEKSVIIRLNDRGPYIPPRSLDLSLGAARCLNSVETGVIPYKATIMERRPTLATEAI >NC_019683.1|WP_015134691.1|2978076_2980326_+|ATP-dependent-helicase MDHLSSSQQGYLRDLSAGLRPGQVELAQWQSGAMAISAVPGSGKSHALAIAAVLTLARQQLHQQKQLLVVTFTRSAASSIKQKICDHLKEARLPVLGFTVQTLHGLALQIANRHPDVSGLDLERVTLTHTHANHPVVREAVEIWIQDNEALFQRLLEGDRREDEETERLRRQFALRTEILPQLAQTVIHEAKSSNLQPADLWYLGEKLGDRYSVMDIAAGLFEQYQGLMSIRNLIDYDDMILGALRVLEVEELQELWQTQIYGVFEDEAQDSSPLQERLLTLLAGDRQTEKTNLVRVGDPNQAINSTFTPADPFYFNRFCEQVNCAEIQQAGRSSPPIIEAANQLLNWAGQESSPQRRAYRLQNIAPVAADDPQPNANPEPVGQGVEILQPEDIYETVDLIGDRLKALLTENPEHNAAILVRRHRQGKFIADILKERFRQSSFQVYEARDGNNNSQIPAEIYQILRFLDRPHSPDCLQDALKVLGDRQQIATQDLSRLATYPEKFLYPSPLDPLPDQPQILEARALCDRLLKARWELPHHQLIPFLAMTLDYSGTELATVQKLSERIAQEVTDKKSLQQTLSILQNLMRDGFKDIDEDTDSAYTRKNQVTILTMHKAKGLDWDYVFVPFLHEDEISGEAWVPNAAKFLGDYTLAEVARAQIRQFVHRQEKDSSDETAFLDPKGAWNEAQLLKQEEEYRLLYVAMTRAKRLLWLSAAQETAFSWSVFQPNKSSLKAKEMSRALQHIRTHC |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019683_5 | 3648990-3649162 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019683_5
|
2 spacers
spacers of NC_019683_5
>5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR AATACCTCCCTTACATCAATAACAATTCCCG >5.2|3649103|39|NC_019683|PILER-CR GTAACGCGTTTCAAGATTCGGCTCTCACATCCGTTGTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019683_5
The CRISPR arrays of NC_019683_5 >merge|NC_019683|5|3648990-3649162|PILER-CR TCGGGAATTCTGTCACTTCGATTGGCAATTATGCCTTTAACAATACCTCCCTTACATCAATAACAATTCCCGATTCTGTCACCTCGATTGGCAGTAACGCGTTTCAAGATTCGGCTCTCACATCCGTTGTACTCGGGAATTCTGTCATCTCGATTGATGATTATGCCTTCAAC >NC_019683|5|1|3648990-3649162|PILER-CR TCGGGAATTCTGTCACTTCGATTGGCAATTATGCCTTTAAC AATACCTCCCTTACATCAATAACAATTCCCG ATTCTGTCACCTCGATTGGCAGTAACGCGTTTCAAGATTCG GCTCTCACATCCGTTGTACTCGGGAATTCTGTCATCTCG ATTGATGATTATGCCTTCAAC
>NC_019683.1|WP_015135276.1|3648301_3648538_-|hypothetical-protein MTYDGFTVSFTIAKINGRKNTGLVMFSHVFWGKKVIESNVGDASLFGVVTAIAKSLFSPKLFKQAGIYGGGDRLNFPK >NC_019683.1|WP_015135275.1|3647556_3648132_-|PTPA-CTERM-sorting-domain-containing-protein MKSLIGKLGLGSAVIGLAMMTAPAAEAFVITTTNFGSYDVDVIFGNFNSNEDILADQDWWGNQGLADEIGAALFVDWEKFHRSQQWSDPGDVELHGAMLAFELNLSSRGDRAGTVLIESEEVRLSSPLSQVNFNSRGDRGILGNSGFYYLTGTSVPTPTTVVPTPAAVLPGLFGMGLSAMRKRRDSSSENI >NC_019683.1|WP_015135274.1|3647013_3647349_+|photosystem-II-reaction-center-protein-Psb28 MAVIQFSQGIDEPEIPDIRVTRAQDGSTGTAVFTFEDPAALAQDSTDEITGMYLIDEEGEIITREVKGKFYDGKARVIEARLIMRSPEEWERFLRFMERYGKQNGLEFTKS >NC_019683.1|WP_015135273.1|3646576_3646930_+|hypothetical-protein MARYTCSYHVGLPEKEMIASLKEIIDECDLNLTYETGGYIMAKEKPGNVAFPKLVEVEILYDRTKPDQDSIQVDFVAKNEELPLQTQNHCYHIFNGIQSIINTKKPWEPESENPQDD >NC_019683.1|WP_015135272.1|3645562_3646507_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MISLDQVIGQQQAITLLRRAIATDQIAPAYLFAGTAGIGRSLAARGFSTELMTQGVDSEAQRLIRYKLHKNNHPDLLWVEPTYQHQGKLYTPAQASEAGLKRKAPPQIRIEQIRQISSFLARPALEAPRCLVVIEEAQTMAEAPANALLKTLEEPGNATLVLLAPSADSILPTLVSRCQKIPFYRLSQENVAHILTEKGYQHILDDETILAIAQGSPGEAIAIYELLGNVPQDLLGKLKKMPTNPLQSLTLAKELTAALETEVQMRLIDYLQYHYWQLTGQRDAIEKLEEVRKYLRRYVQPRLVWETFFLGNCS >NC_019683.1|WP_015135271.1|3644687_3645512_+|carbohydrate-ABC-transporter-permease MSKTFKLIGTYLFLGAIALVMLFPLLWLLSTALKSPSENIFSFPPQLIPETPTLQNFVTVWQNHPFGKYLFNSTLIAVLTVVFNLLFCALAAYPLARLDFRGRDIIFATVVSTIMIPFQIVMIPLYVLTVQLGLRNTYLGIIFPSLASAFGIFLLRQAFQGVPKELEEAGRIDGCSELGIWWHIMIPAVRPALITLAIFVFIGSWSDFLWPLIVIDRPEFYTLPLGVATLAGQFSLDWRLVAAGSIISLLPVMILFGFLQRYIIPTDSGSGVKG >NC_019683.1|WP_051188879.1|3644399_3644582_-|hypothetical-protein MPELIWEKLNCKNQPFGGLGIWRAKVPGGWLVAVRSGGSKGGGVTFYPDPKHQWDGGSLK >NC_019683.1|WP_015135269.1|3643400_3644393_+|thiamine-phosphate-kinase MKQIKHLSDLREPEILKVLQRFCPAEIIGDDGAVLAWQNNKDLVVTTDVLVDTVHFSDRTTPAKMAGWRAVAANLSDLAAMGATPVSITVGLSLPPKTELRWLEDLYAGIGACLQTYDTPLVGGDITRSPVKTIAITALGAVSKKNVIRRNTAQVGDVIIATGFHGDSRAGLELLLNPETGRNLTVGDRQYLILAHQKPLPRLDVSAYLNDIETDRNFAGMDSSDGLADAVLQLCEMSQAGAVLNETKIPISHALSRYQSLDKALQWTLYGGEDFELVLCMRRSPAEMLVQKFGKGCSIIGEITADKTVRLIRKDGRSQTLSRQNSFQHF >NC_019683.1|WP_015135268.1|3642655_3643276_-|hypothetical-protein MDYEIMGTKNKAVTAYLPADIEIRLAEYCLEHGLSRQGKKSGKEKPALGTGIIEVLRTFFGTEMNGNVAGTVIDKKEIQKIISKTLPSNVPTEDWVKAEIQQAIAALKSELATDETVTEEKTDNTDKSEADVTPEASEPAPKAETKLILNQADLSRRLSSNPSTLSRHQKKGESHFAQWSKAKDPEKLAWQFDGIKNNSKMFTPIK >NC_019683.1|WP_015135267.1|3641576_3642578_+|DnaJ-domain-containing-protein MAADFKDYYSILGVSKSASADEIKKKFRKLALKYHPDRNPGDTVAEEKFKEISEAYEVLSDAEKRKKYDQFGQYWQQAARPGGGGNPYGAGAGVNVDFNNFDFGDFGSFEEFISELLGRGGGRTSSSYSSSSSSSSSYYSDFGFNTGTAGARSTAGANREANIKLTFGEAFRGVEKRLSLGSENINVKIPAGVTTGKKIRVKGKGMPSNTGGQPGDLYLIVQVTPHSFFQFDGDNLVCTVPITPDEAVLGTSIDVPTPDGSVTMRLPAGIKAGQSLRLRGKGWVKPKGDRTDQLVKIEIAVPKNPTAAEKECYQKLQSIGDFKPRKNLANIRL >NC_019683.1|WP_015135278.1|3652718_3655997_+|hemolysin-type-calcium-binding-protein MSTDHRHNPEIQAYLDLNKEIEETIESDLFSESNTGYFNGANFALTTLLTYAPGFLRLSTIQSYAAYYAIMFAGEFISAMLERYGEDEIAGYFGNDYGIDFDSGLDTLEANAYESLVQAAYDVLQGINTSIDLFFEFNIGSSLGQTLKDAINGTRPTLMYDETQEKEGFIFNYTEYIFREGDGNDYLDFEDRRHNSRSTSQIIVYAGKGKDYIANVKKAYGENGDDQIKDVKYAWGGTGDDYITNVKYEAYGENDNDYISSAKKAYGGNHDDYITDSDEAYGEDGQDILVDNKKADGGEGNDTLLGNGDSYGREGDDYIIGSHSRGNGNILNGGADDDTVIGQDKNDVLKGGTGSDILIGGGGNDLIDGGEDSLYDNDLASDVAIFRNDANFTFTKQSGTWEYRVSGQGIDEFKNIESVVVEAGDSDNTIDASALEISSNLDGRAGNDIIKGGGNNDILVGGLGNDRLIAGLGFDYLDGGQGNDILIGSGTSDVGRYSETELAVARGELPESALRSPLVTIYQHDSYGGKSKAFYDLGNFTDHQLGIGNDALSSLKVADGYRVTLYQHHNRTGNSLTHDFSTTYIGDWFNDETSSIVIEKAPPVTIYRDGSYRGRRQELSVGSYNVGGLSYIGNEQLSSLKVAEGYEVTLYEHANFSGDSISFTSNTSYVGNGFDNETSSIKVEKLLEVDDVLVGGAGNDLLDGGDGHDYLTGGTGADKFVLRNPNSYDVITDFNASQGDEIWLDRDAFPGMASYNIPTQTLSMGGKKIFALENAVGFNAHEHIKFVSAEQLDAHTSLPGTERAIGEYGTVDNLTHVWQTIELDGNYIDPVVIASDPTFNGSDFSGIRLRNVDSDSFEIRIQEADYLNDIHTFGETVSFFVVEAGEWELADGTRIAAGLHRTDNLITAQNDFDTIDFTDNGLTDFVSAPTVLSQIQTNGTNEGGSQWVTTRLKGQSSTGFSLGMQEEDSLNTGNHVEETIGWLAIEQGVSHDADGDLLLQGGTTGASVDENWETISFGEGFDVTPTLIAKLGSTRGLDPSVLRLDSGSISTTGFDAFVQEDQSLTPEIGHNHESVSYLAFNGNSGTLTGFEL >NC_019683.1|WP_160148490.1|3656145_3656310_-|hypothetical-protein MTYCSSAVVSTIAKFFGRKNTYLVIFGHVFSSQKIIKSHSGDIDLCWFVTAIAT >NC_019683.1|WP_015135279.1|3656330_3657173_+|PTPA-CTERM-sorting-domain-containing-protein MSMNYGFIYDGKQDDKYVCNSDEYIFREECISSFSKMLAGIGLIAASMIALMAVPAQALVITAQENTPFSTVERAQTITFDDAPLRDLSLRTQRGGVEYIDKSGISYTGIGGDIVQGHGGGRYAAPPSQGDYNNTNNPYLSVGSFGNESSDIVTINLDVESDYFGFYFGSIDNHNNLYFYNGETLITSLTGEDILTLANGAHNINNALFLNIFAEEGENFDRVVFQSNNIAFETDNHAYRISEPVPTPAAILPILSGLCAAAKRRNQAKITEKNHQLDSL >NC_019683.1|WP_083891135.1|3657592_3657748_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MASRRSRAQNKRQNYLWRAVDKEGQTLDILLQSKRHRTAAEKFFKRLLKGE >NC_019683.1|WP_041763826.1|3658861_3659143_+|transposase MKKQNQTSRADELIDELLQDCPDSESILRESGLLQQLSKRLIERALQGELSHHLNQAKEAGKQNSRNGYSKKTIKSTQGEMDISILRGCLKRV >NC_019683.1|WP_160148491.1|3660328_3660970_+|IS256-family-transposase MSEVTSAVMEEIKAWQHRPLEEIYPILWLDGMRIKIREEGRDTNQTLYLALGVKQSGHKEVLGMWLSSGGEGAKFWLSVLNEIHHRGVEHICIACVDGLKGFPAAIEAVFPKTRVQLCIVHLIRNSLKFVSWKDRKSVVSDLKPIYQAATVSEAESALTAFAERWDGIYPTISQIWLNHWDNIIPLFDYPAPIRRIIYTTNAIEAVNRSLRKV >NC_019683.1|WP_160148492.1|3663585_3663759_-|hypothetical-protein MRQELARLKPEQIIYCDESGMDERDGQYDYGYGPEEERVYDLKSGSRRGRVKRMFEK >NC_019683.1|WP_041763834.1|3663775_3664138_-|hypothetical-protein MPAADSDDLRCQALAAIALGILKKDVCEMFGLGLNSLYLWIQQTRANRKFYRAKTGYQKGSGHKITDWEAFKSFVQQHPDKTQAEMAELWSDDVSRRTISRMLKKIGFTRKKDLWVSGKG >NC_019683.1|WP_015135282.1|3664537_3666706_+|DUF3769-domain-containing-protein MSAIAAFCALNCAVASIPADVTAQSPQPIAQIPADVEPQEFPAEEPIFNGVQIEDRTNESQQQFSLEDPPITPTTEDGTETEASVEVAEEELRVLEVIGDRQEYDELTNIVTAVGDVVVRFNESVLTADRLQINLNTKLAIAEGNVALQRGQQLLRGDRFDYFFVQNRGYIRQAQGEVSQQDLSQDLSAQPTPSISNISDPAILLNERLLLDQPISNVNQTNDGFNIVVGSSRGIENRPPLENNIGTVNRIRYYAEEVEFFEDRWEAKNIRLTNDPFNPPELQVIADTATYRDIDEFTSELVTTDTRLVIDDNVSLPIYPRTYRFDSSDDEGIFSLVSIGFDDEDRGGFFIQRRFTLFKNQQGKWTVTPQYLVQKVLFPDNEFGGTEGDDSAIISPDVFGLTTDFNYNFNPRVFVIAKGSIPNLSFENLEDDLKVNFRFEQLLGNLANPFRLSQEFNYRDRLFNGSLGFQRVQRSLGIVLRSPRYVLGRSGFVLDYQASIQNIVANTDRRELLGIDNPLSQDEVNLTRYQATASLNHSLPLWSGQALPSTPDEGLRFSARPVVPYLSLQTGVRGVSSLYSNGDQQITGTARIGLQGQIGHFSHNFFDYTGFNVAYSFGSRGESPFLFDRLADSKTLSFGLTQQIYGPIRAGFQTAINLDNNDAISTDYFLEYSRRTHSILIRYNPVLEIGSFNFRINDFDWSGSTDPFVNQDVRPVIDGVIP >NC_019683.1|WP_015135283.1|3666755_3667157_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MALDYPDDLRYLDSHEYIRLDGEIATIGLSAFALDELGDIVFLELPDEGDALEVGSTFGSIESVKAVEDLYAPISGTVIDRNQMVIDNPEAIAEDPYLEGWFLKVRVDNLDDEMLAETMTADEYRLRVAGDDS |
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NC_019683_6 | 3807005-3807087 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019683_6
|
1 spacers
spacers of NC_019683_6
>6.1|3807029|35|NC_019683|CRISPRCasFinder TAGGGGCGTCATCGAGATATGCCCACCAAGGTATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019683_6
The CRISPR arrays of NC_019683_6 >merge|NC_019683|6|3807005-3807087|CRISPRCasFinder GAACCTAAGAAAAGGTTAGTAATGTAGGGGCGTCATCGAGATATGCCCACCAAGGTATCGAACCTAAGAAAAGGTTAGTACTG >NC_019683|6|5|3807005-3807087|CRISPRCasFinder GAACCTAAGAAAAGGTTAGTAATG TAGGGGCGTCATCGAGATATGCCCACCAAGGTATC GAACCTAAGAAAAGGTTAGTACTG
>NC_019683.1|WP_015135400.1|3806398_3806911_+|phosphate-starvation-inducible-PsiE-family-protein MQQTINPPKTRQQPPISLYEINRGRIVRLLESVQDLIVVSLCIGLFSFMVLQMRDMFLSMLPPVHFHMVTADILFLLILVELFRLLIIYLQEQRISIGVAVEVSIVSVLREIIVSGVLETDWTKILAACAFLIVLGVLLVVRVWIPPTFEGIDPEKAISKRHSQSVSEKG >NC_019683.1|WP_015135399.1|3804607_3806335_+|flavin-reductase MVTLVQSTQEKNRQRLTIQTAELAENTTAIRSLDWDRDRFDIEFGLRNGTTYNSFLIRGDKTALVDTSHRKFEQLYLEALAGLVDIKTIDYLVVSHTEPDHSALIADLLVIAPHIVIVGAKVAIKFLENMVHYPFESQIVKSGDLLDLGKGHELEFVSAPNLHWPDTIFSFDHGTGILYTCDVFGMHYCDDQIYDTNPQILEADFRYYYDCLMAPNARSVLAALKRIAKLDIKLVATGHGPLLKESIPHWLEQYQSWSAAQTKTDTFVALFYCQDYGHSDHLARAIAHGVNRNGVQVELIDLQQTSPQELREWVEAAKGLIVGMPPQSCPISQTALSTVLAAAHKKQAVGLFETGGSEDEPIYPLRNKFRDIGLTEAFPPISVKEAPQAAMDQLCDEAGTDMGQWLTRDRTQKKIQAIDATLEQALGRISTGLYLITAKKGDLSSAMLASWVTQASGSPLGVAIAVAKDRAIESFMQGGDRFVLNVLEESNYQPLMKHFLKRFPPGGDRFAGVKTYPASNGCPILADALAYIECEVSSRMDCCDHWVIYSTVHTGRVADVHGLTAVHHRKLGSHY >NC_019683.1|WP_015135398.1|3803262_3804222_-|DUF362-domain-containing-protein MSSVSLIAAKSYELDQLRQSLETLLEPLGGMAAFVKPGDRVLLKPNMLTGARPTKECTTRKEIVYCVAQMVMDAGGKPFIGDSPAFGSAHGVAKQNGYLELLEELNIPLIEFHGKRYETESDNYKNLRLSKEAMEADVVINLPKVKSHIQLTMTLGVKNLFGCVPGKMKAWWHMEAGKEPETFADMLIETAKAIAPDLTIIDGIIGHEGNGPSGGEPKDLGVLGASADVFALDRAMVDILGVDPELVPTVALSMKKGLCSTTEAIDFPLEEPKTLAIADWKLPEALMPIDFALPRILKSTFRHLYIRFIKEPISSYSDK >NC_019683.1|WP_015135397.1|3801894_3803022_-|glycosyltransferase MTRYAFVHEWLTPHATGGSELVVKEILQHLDADLFALIDFESSNPKSYLYDRNIGTSFLQGFPRAKYGLQNYLPLMPIAIEQLNLENYDVILSSSHAVAKGVITRPQQLHICYCHTPMRYAWDLTFDYLNNSGLGKGVKGLVARYFLHRLRQWDVISANQVDYFIANSKWTAQRIWRCYRREAEVIYPPVNIERFPFVEQKEDFYVTVSRLVPYKKVSLIVEAFNELGKNLVVIGGGKELEYLRAIAKPNIKILGRQPDDVVEKYMSEAKAYVYAGCEDFGIVLVEAQACGTPVIAFGQGGATETVRDIRNSSFGTGILFSEQSTQSLVAAVNSFEQHQTQISAEACLQQAKRFTSDIFWQSYVEFVNNCQEKSE >NC_019683.1|WP_015135396.1|3801063_3801798_-|sugar-transferase MTVYRQFDALKLLTALARQGSAIALPEAREYPNALQKLLNGAFAKRTFDICFSLGVLLFLSPLYLTLALIIKLSSPGPVFYVQRRVGKNYRPFGCIKFRTMVLNADLVLEDMLRRSPELRAEFEQDFKLKKDPRITAIGNFLRLTSLDEFPQFWNVLVGDMSIVGPRPLVPREIYKYGRHMDKVLTIRPGLTGLWQVSGRNDIPYATRVRMDSYYVHHRHWFMDLWIVCKTVFVMLVPKNNGAY >NC_019683.1|WP_015135395.1|3800700_3800985_-|TatA/E-family-twin-arginine-targeting-protein-translocase MNVFGIGLPEMALIFVIALLVFGPKKLPEIGRTLGKTLKSFQAASNEFQEEIKKETDKIEKSVTMQARLEESEAEKAEKVEVEEANAETSSTEA >NC_019683.1|WP_015135394.1|3799888_3800605_+|SIMPL-domain-containing-protein MSRKKFWLPIFTGLICLGCTTSVIADDQATLLRTITVTGQGQEAIATSLSQVRLGVEVKGKTAEQVQADMANRSQQVVEFLKGKNVEKLTTTGINLQPQYDWSGDERRLIGYIATNTVSFEVPTESAGSIMDEAVKAGATRIDGISFRATDEAIAAAETIALGEASQDAKTQAEVVLESLGLNSQEIIQIQVNGSQPATPMPLLMRQQVSLEASDAAITPVEGGEQKVNASVTLTIRY >NC_019683.1|WP_015135393.1|3798812_3799700_-|RnfABCDGE-type-electron-transport-complex-subunit-D MPFSDVRDFQIAILSGFLLLGVYTRDWTLHLDWVAFTVVACVLTQWLFSLYLGKRNATKEKPFKVRPALVSGLRSSLITALGLSLLLRTNHVGILMLAGCLAIASKFLLKYEKKHFFNPANFGIISVLLLTNDAWVSPGQWGTDWWYLILFFSAAGLVLNKVGRWDTSIAFLAAYGGLEILRNFWLGWTWDVVFLQLSSGSLLLFAFFMLTDPRSIPNAKKGRIFWAISIALLTFILQNGVYSSSAIFWALFALAPSTIVIDKIWKGKRFNWKQSESKVQDLKPINLSTQAMNLV >NC_019683.1|WP_015135392.1|3797470_3798802_-|DUF2330-domain-containing-protein MFLRYLKGLFISLVSLLLLSQPAWAFCGFYVAKADTELYNQASQVIIARDGDRTVLTMANDYQGDVDDFAMVVPVPVVLKEDQVHVGESRIIKRLDDFSAPRLVEYFDENPCQVHAFDDFGGGMLRSQTTSAPVPAAALESAADLGVTIEEEFSVGEYDILILSAKESDGLETWLRQNEYQLPDGASDLLKPYIRSKMKFFVAKVNLEEFDSNGVNELRPLMMAYESPKYMLPIRLGMMNANQAQDLLVYILSPKGQAEVTNYRTVKIPSNVEVPEFVEDEFGDFYTTMFENDYQRQGRNDIFLEYAWDMSSCDPCSAPNLSKQELKDAGVFWDKDSYIPQVFITRLHVRYTRDKFPQDLKFHETSNRQFFQGRYVIRHPFRDKEQLTCDAASDYLDRTYRRQEEEIHTLAKLTGWDKSEIRDKVDFVDTATPPKGDWWDSIW >NC_019683.1|WP_015135391.1|3796563_3797274_+|abortive-infection-family-protein 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>NC_019683.1|WP_015135405.1|3813138_3814968_-|iron-uptake-porin MFFPTDLAYDFSEDPSSKIVLIESDSSQQIENSLDQKQTFDASQTSPYFLGQLEQEERYIPVRYFKDVEPSDWAYEAIRNLVDKYQCLSPETDTLFRGDEAISRYEFAVSLNTCLEAIYLIIDADTSMSGDEELVGTLNQLTTEFNSELASISQDVDELEEAVSGLESSLFSKYTKLDGEAIFALAKAYGDNFVEGSENLSFLPGVSVNLDPNLVAAFDARNRPIPRVDALVDNEQVAVFGYRIHLDLDTSFTGKDSLLIRLAATNLRPFTANSRGRFKAPAIPPFLPRPLDARFVGNTGETFQSLNINESKLIYSFPVGGTRFNVAAAGAAWHDFAPTSNPFFFDHDGGLGGISTLSSHSPIYRIGGGTGLVINAPLAWKKETNKGIDLTLGYLAGADVADPFSGFAKASYGVLAQTSFEMGNFDWGLTYVHAYNRENDALFNHGFRNRDGFVGTQLANLPGTTLQRLTEPLVGLSPTGVVSNSYGVQGAWKISDAVSLSGYFSYTDLKILGQGDGDLWTYGVGFALPNFGKENNLLGVFFGAQPYISNLDLPNITYRNETTPFHLEAFYRHQIMEDISLTPGVIWLMAPNGFDSDVVIGSLRTTFHF >NC_019683.1|WP_015135406.1|3815416_3815746_+|PqqD-family-protein MSKGNRLEQQKTNSATFYERTIPLHAPNVEVHALEPDLLLYHADDEVAVSLNASAKEIWQLCRGVHSIKDISQELADSLPEIELEDIFGDVVATITRLEQVGFLELSTR >NC_019683.1|WP_015135407.1|3816039_3816702_+|KilA-N-domain-containing-protein 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>NC_019683.1|WP_160148497.1|3818855_3819656_+|hypothetical-protein MQLEFQHQALLIETNNLSIEQFVLSIFDHLLSDSQSNPIAKFSAIQSQSEYELSQLIQGDSKLVFSTSQLDVFTTQLKYHLVTTLLENTSQFLWFHAAAAAKNNEAIWLLAPPGGGKSSIVLLLVQEGWQYLSDDVVALDLVTNQLIGFPQTPRPRKSINKWIQDKNQINSIAKEIVTIPIEKVQASPCEVKGIVFLKYHSESTIALEKLSSSQAVIKLLEQTINFPLHKQSAMNALVDLSAQTQAYQLDYDNRNAAFLALIQCFD >NC_019683.1|WP_015135410.1|3819744_3820212_-|DUF1348-family-protein MTTPLVPPFTREIAIAKVRMAENAWNGRNPDKVCMAYTEDSFWRNRAEVFQGREKIREFLRRKWDKELNYRLVKELWAYGDDRIAVRFQYEWQDDAGQWYRAYGNENWEFDEAGLMRRREASINDKPIAESERRFFWDAPGDRPSDHPGLINSPE >NC_019683.1|WP_015135412.1|3820630_3821380_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MTESNYEIIIPENIEDLVIQEEFFYLLQDGKKRKIRLHDYKELYSIPRLYQSIMEQQQEQSHIVLPSLLKEYIVSSGKKMEDLTILEVGAGSGAVGKTLSDFGVKSIVGIDIVPEAKEAVDRDYPDVYSSYYIEDLNNLSPKTKEALIQQKFDCIVCGSALGFNHIPAKTWAKAFNVIAPNSWIAFNVQNERWENEGTDSFVAWHPWVSDENILNITKTHKYRHRFYLDGRPLYYVAIIGTKVGNIPNS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019683_7 | 4416052-4416143 | Orphan |
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Consensus repeat of NC_019683_7
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1 spacers
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>7.1|4416075|46|NC_019683|CRISPRCasFinder GAAAGGAATCACCGAATTAAACAATCTACAAAAGCTTTGTCTTAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019683_7
The CRISPR arrays of NC_019683_7 >merge|NC_019683|7|4416052-4416143|CRISPRCasFinder AACAACAAAATCAAAGAAATCCCGAAAGGAATCACCGAATTAAACAATCTACAAAAGCTTTGTCTTAGTAACAATAAAATCAAAGAAATCCC >NC_019683|7|6|4416052-4416143|CRISPRCasFinder AACAACAAAATCAAAGAAATCCC GAAAGGAATCACCGAATTAAACAATCTACAAAAGCTTTGTCTTAGT AACAATAAAATCAAAGAAATCCC
>NC_019683.1|WP_015135855.1|4412845_4415563_+|cation-transporting-P-type-ATPase MTQRPSSQHSFHDLSTQKVLDDFGSNLEQGLSAEQVAQRYETYGWNELTFKSGKPAWLRFLLQFHQPLLYILLFAGVVKAFLGSWTNAAVIWGVTVVNAVIGYLQEAKAEGAIASLAKAVTTEASVLRDQQPLRIPSKDLVPGDLVMLASGDKVPADLRLVATRNLQIDESALTGEAVPVEKNPESLPLDTPLAERNNMAYAGSFVTFGQGRGIVVATANATEMGQISQSMERQVSLQTPLTRKFSKFSRTLLYAILTLATLTFAIGLGQGESWVYMFEAAIALAVSAIPEGLPAVVTITLAIGVNRMASRHAIIRKLPAVEALGSATVVCSDKTGTLTENQMTVQAIYAGQEHYSVSGGGYSAKGEICRQDDRRANCHLDGELPSTLAECLLAGLLCNDSQLKQTGEDWSVVGDPTEGALISSAAKAGFSQTGFAATKPRLDVIPFESEYQYMATLHDGEARTIYVKGSVESILSRCGQMFDEQGQSIPVEQDTITQVVNDMAAQGLRVLAFAKKEVKEHQHSVDHEDIVANLMFLGLQGMIDPPRPEAIAAVHACQKAGIRVKMITGDHIKTAQAIAQRMGINTAGEVTAFEGRQLVEMDKTQLARTAETGSVFARVAPAQKLQLVEALQLKGDIVAMTGDGVNDAPALKQADIGIAMGKGGTEVARESADMLLTDDNFASIEAAVEEGRTVYQNLRKAIAFLLPVNGGESMTILISALLARDLPILSLQVLWLNMINSITMTVPLAFEAKSPDIMQSVPRNPNEPLITKLLLRRILAVSAFNWILIFGMFEWAKSTTGDVTIARTMAIQALVAARVIYLLSISQLGRSLLLYLRGKTQTITNAPFLLVGILVAIVLQIVFSQWSVMNRLFDTAPLTFSQGLICLIPMLPMIPLAIFANRIDP >NC_019683.1|WP_015135854.1|4410544_4412230_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter MSVVNKISFRNFKGDFYGGLTAAVVALPMALAFGIASGAGAAAGIWGAILIGFFASLFGGTPSLISEPTGPMTVILTAVITELVANNPENGLAMGFTVVVLAGVFQILFGVFRLGKYITMLPYNVISGFMTGIGVILIFLQIAPFLGQATPKGGVLGVLRSLPSLLSNASPVEAGLGVLTLAILFFYPNKLKTILPPQLTALVIGTIISILFLGNIEIRTIATIGEITPGLPSLQIPYFSMADARLIVVNALILATVGCIDCLLTCLVADSLTRTEHNSNKELIGQGVANIITGLFGGVAGSGATTATVVSVQAGGRTAMAGIVRAFVLLIIALWAAPLTSGIPLAVLAGIVLKVGIDIIDWGFLKRVHKISWKAAGIVYSVILLTVFVDLMIAVGVGVFIANILTIDRLSSVQKDAVKAITDVDDQIILGSEEKRILDLANGKLLLFHLNGPMIFGVAKAIAREHSAIDSYDVLIVDLEEVPVVGVTSALAIENAIQEALDVGREVVVVGATGKVRDRLEKLGIAGMIPEEHWMKDRLMALEEGLRMIEDRQGMPMGTLA >NC_019683.1|WP_160148530.1|4410249_4410426_-|hypothetical-protein MGQFIASTTQSMGYRHLFRRSPSTDFRLLLIPEFLTYQNAGIFVKDCNSLWSYTIFGM >NC_019683.1|WP_015135853.1|4409436_4409745_-|hypothetical-protein MMYRKFLFIGIISASTLVVFHNAAQANEVNQAKGKLRHLSESHVMLSRSARQAQVEASEKTGKLGHLYGSSYVCLNNPRPECANPEHAEERTAELPNRLKVI >NC_019683.1|WP_160148529.1|4409080_4409281_-|hypothetical-protein MESTSRLLKCSPDDGEKSLPKFTKPNCYHWFNKFLVDRSLTLRAIAIAVDCLLIRLDGKKNFYATI >NC_019683.1|WP_015135852.1|4407894_4409094_-|trypsin-like-peptidase-domain-containing-protein MRRSKFLQRFSTHIVALVFGCAITFGAIQGSAEPTNQTLADTQTPQQVAAVPITGESSFVADAVARTGSAVVRLDTEKTVVRRFEDPFMNDPFFREFFGDRFGVEIPSEQEQVLTGQGSGFITDRNGIILTNAHVVSGADKVTVTLKDGRSFEGEVKGTDEITDLAVVKINPGNESIPVAPLGNSGAVQVGDWAIAVGNPVGLNNTVTLGIISTLERSSAQAGIPDKRVDFLQTDAAINPGNSGGPLLNAKGEVIGINTAIRRDAMGIGFAIPINKAKSLQDTLASGKEVPHPFIGIRMVTITPEDAKQNNDDPNSLVTLPEVDGVLVIGVVPNSPAQDAGLRRGDVITKIDGKRITDAQQLQEVVEDSGINATLKVELSRGDRQLQMNIRTAQLSEMS >NC_019683.1|WP_015135851.1|4407324_4407798_-|HXXEE-domain-containing-protein MMATPILIMWLLAIALILHVFEEVWVSEYKKGQVTWGTVILNYAPIVENIPIFIFAIVLAVIGWRSPMISGILLSVCLTHPLLDHVGLSIKTQSIRAGSLTAIFLMLPLSIWAYAVGYNNALFQAPALVISGMTGLGISIWLFWEVEKELQQKSRSS >NC_019683.1|WP_015135850.1|4406641_4407271_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MGTADMNSIIKATFSDADLIAETLGEAFDDDPVISYLLGASGNAYDFFRSLFQHIYLPFNCSFYLANDQGEMMGCALWSKPGQDPNALSLGFFKVLWQNRRNLTFSSLQRLFSTSNLSMRYHPKEPHYYLCAIGVNLSFRRQGAASRLLASVLTMADQEQVSVYLENSKEQNLAFYQKNGFKVVHKHILANDGPPIWFMQRSPQNPPQA >NC_019683.1|WP_015135849.1|4405982_4406606_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAQSTKFWDKIAAKYSKQPIEDEASYQKKLEVTRTYFQPDTEVLEIGCGTGSTALLHAPYVKHIRATDFSKEMLAIAREKAAAQNVENVTFEQSSIDDLNVAAESLGVVMGMSILHLLEDKEAAIAKVYKMLKPGGLFVTSTVCLGDTMGWFKLIAPIGKLLGFFPLVKVFKVEALVNSLTQAGFSIDYQWQPGKKKAVFIVAKKAT >NC_019683.1|WP_015135848.1|4405246_4405963_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MCSALSQQNSFSSTHEIATEFDKWAEIGRGDSMAEGHLHATQTLLKDFAIAENSVVLDAGCGIGWILNDLIGSQITEGVGIDLAPEMISIASARCKRPHLKFLTADSAKTPFGNDQFSHIISVESLYYNAEPLDTLQEWLRISMPGGRLGLVLDLYQDNPAAHHWVNALSVTAHNFSVAEWETLLASAGWTNIKHRRVTLPAKISASDFTPSAYFPTYDIYQAYCAAGSLLLSAEKAK >NC_019683.1|WP_015135857.1|4418624_4419005_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MSNSKHEQKVLAAVSQASERWKNAFNTGDAAGCAANYEDDATMHARPFGTFTGTEAIKTFWQGLIDGGYSDVEYIEPKVEVLSETEAILTSGWRMNKASGVIHKELWVIQENGAAKLREDDFEVIA >NC_019683.1|WP_041766123.1|4419028_4420006_+|alpha/beta-hydrolase MPISMQLLLLIPTIFFQAIATWLEDQESPPGQLIDIGDYQLHLCISGEAKAHPTIIFDHSLGGIEGYFLIEELSRLTRVCIYDRAGYGWSDHSPNPRTSEQIANELDTLLTQAKIEPPYILIGDSFGTYNVRMYTHLFPEKVLGIVLTDGLHEIGMLNMPLALKLLKLFFISGFFMSTLGSMLGIIRLLNVLKIFELLKPELRKFPQHSLKLVKRSFCRPKHWITMSREMINLEESARQVSVAKNFGEMPIMSIKASSFFKPSFLTLFIPLKKANKLRDRMHQELCKLSTNCTQIEANQSGHFVWVDEPHIIINAVKKLLAQIPE >NC_019683.1|WP_015135860.1|4421541_4421721_+|hypothetical-protein MTAVACRQRNLENRQISYLIATGLLTILATSAGGLVPLFYLVAKDTQKKSKKSGKTKKK >NC_019683.1|WP_015135861.1|4421748_4423554_-|proline--tRNA-ligase MRLSQSLFVTLREVPADAEISSHQLLLRAGYIRRIGRGIYAYLPMMWRVLQKVSAIVREEMNATGAQETLLPQLQPSELWKDSGRWDTYTKAEGIMFSLTDRVDGELGLGPTHEEVITTVAKDMIRSYRQLPQHLYQIQTKFRDEIRPRFGLMRGREFIMKDGYSFHANEESLKETYADMDQAYRNMLRRCGLEFRAVEADSGAIGGSGSQEFMVLAEAGEDEILYTDDEKYAANTEKAVSLPADLVESPFSSFEKRETPDTATIATLCKAVDCDPTNTVKNVLYQVVYDNGQTVLVLISIRGDQDVNEVKLTNELTKLAPDYDANTIIALTVPDADAQKKWAAKPLPLGYISPDLADDYIEGSKTVAAKFLRMVDQTAVELKNFVTGADESGYHVLGANWGSKFKLPKLQVDIRLAMAGDRAVHDPSQILQTARGIEAGHIFQLGTKYSEAMGATFMDENGKPQPLVMGCYGVGVSRLAQAAVEQSYDKNGIIWPVAIAPYHAVVVVPNIKDADQMAAAEKLYTELNSAGVETILDDRKERAGVKFKDSELIGIPFRIVTGKSLKDGKVEVVKRKDGDRQDIAIEDVVATVKGWVEEATA >NC_019683.1|WP_015135862.1|4423738_4425403_+|DUF262-domain-containing-protein MSLPQPQTRTFTSLITDILEGQIQIPQFQRDFVWTMQKSAGLIDSIVKGYPIGTFIFWRTQERLRSIKKLGQQSLPEPDENQLIDYVLDGQQRLTSLFASLRGIKLYREGKKEDDFSKIFIDLEASKFEQIVVVNAEGKEKDQLISILTLLEGDFTSLGLYKSIYHPKIKEYQDRIRSYQFSIIQVQDVPIDIATEIFTRINVGGKPLSLFEIMVAKTYDHEKKFDLSEKFQELLDVLKPLNYETISDAIILQTVSMILAKECNRKTILKLDKNKFIEVWEKAKDAIERCIEYFRSYYRIPVSQLLPYNGLIVQFSYFFFHHPDKPTGDKQKFLEDFFWRCSLSGRYSSSLESKLAQDIKRIDQILNDQLPTYDYAVDTSPDFIINNGWFSAGRSYIKAILSIYAYFQPQSFVDSSLVNISNYWLKQANSKNYHHFFPKAYLLKRQEDSFRINHILNITIVDDFLNKRLIRTKAPSLYMNDFKNKNKDIESAMKSHLIDIDGFGIWDDDYDVFFEERAKKVSEELSKRIIRQDGDLQDQSDLKDDYEEEPTITE >NC_019683.1|WP_015135863.1|4425668_4427345_+|DUF3352-domain-containing-protein MKSRSFFVYLGLLAVLLLSVGAASWYGIFAQSPLPWLKGGVATNPAAALFVPRQAPLMLSMVVNPEKLAALGLVQSPYGKRRETLQELQQAKTSLMSATGLDYTKQIEPWLGNEISLAVTTLDVDRNPENGVTPGYLLVVEARDQELAKEFLQLAYTEQALSPDSALSYETYKGVNLVIPDVKTKQFASAIVGNYVLFASEGKVLRSAINTVQVPDLNLSHDPQYNEALETIDRDHIGIAVANLPALSAWIANDINPEEPTLKQRLAIALSLQTDGLIAETALIGDTEPALNRPMLTEPVEALNYIPPQALLAVAGRDLNQLWTDATTGLNPSSPLSQVLQQSVVAVQEPLGIDLPADIFEWIADDYALAIVPTEDPRKVDWLFVAARDEETNIDPIIDHFDELAQAKGLSVGRLPLDDRKVTAWTAIDTSDRDDLVQLNAEVQGAHISVENYELFASSVKVLSRAIKASKKQSLLDNKNFKTSLQKLPSKNGGYLYADWRRGSSLFKTQVPILRVVDYVAKPFFNHLNSLSLTSSGNTEDIRRSTLFFTLSPESIQN >NC_019683.1|WP_015135864.1|4427442_4427832_+|SET-domain-containing-protein-lysine-N-methyltransferase MIKVKIIPPKGRGVVATTLIAKGTLIEASPVSSFPKEQWDMIRQTSIFKYCFVRLSEYRIQKKVDGYLVFGTSTLCNHSEKPNSYIEWVENELGLWAHLIAKEDIQPNEEVSIFYANINEYSLASKFVT >NC_019683.1|WP_015135865.1|4427877_4428615_+|hypothetical-protein MEPEVKRIAMWASPRCLSTVLLRSWSSRPDTFVQDEPLYPHYLFISDRQDPEQAEILAQYETDWRKIITQVTTRTSPNKSIYYYKFMVYRLLPHIETHWVHQLTNCFLIRDPREMILSYLKLWGTTPTLESLGTLRLKKLFNQVCEFNSQIPPVVDAKDLLENPKRTLSLLCAALEIDFDKAMLSWPNGNPTNDVWSKYHWYDTVRNSTTFHPDKPKTEVIPPELHDLLKQCNQVYQELYQHRLV >NC_019683.1|WP_015135866.1|4428809_4431074_+|serine/threonine-protein-kinase MTLPTGQTTLNGRYRISQELAQGGFGATFLAEDLHLPEHPACVVKQLKPQMDDPQSLKTARRLFETEAQILYELGKYDAIPQLFAYFEEQHEFYLVQEYIRGQDLRQEIRQQGRLSQDQVVDILKEILEILVFVHGSNVIHRDLNPSNLIRRASDRRLCLIDFGAVKRVTTQFQQATGRATVAIGTQGYIPSEQAQGRPQFGSDIYAAGMIAIEALTGQFPHTLATDPHTAELIWRDTIIHLDPEFADIIDKMVRHDFRERYFSAQAALDALNEMGKEEESNTVVLRPQVPDPANVPANNVQAAPVPVATSSFYTQVPQGAGRAFTINPKDRTAMAVVIGLGLAAVVSLGATLNIGMQWLSSRQERIEQYEQGQVYQELGEAENALASYQEVLNQDASHQGALLGKAQVLQQLQRYDEALATYDELLQLSPNDWEAWWGRGKIYSDRQQYGQAITSLNRAIQGNGNNLEIWQTKAQIHLAQDDRENALRSLEAVLKLDSRQAWAWYEKGWIHHQQEQYKEAIAAYDRALRINNSDPNIWYQKGNSYFKLANYQEAKNAYGRVVKLKPDHAPAWYSQGIAFENLEKFRDAQQSFTKVVELEPENDRAWYHLAWNAQQANNRDTAIMAYRRTVSIKGNDHSSWVNLGNLFYEAKNYPEAIAAYERALALKTQDGNSWELKGNSHLLIGDYAEAIAAYDQALQYKPGDEEILANREQAEAELERRRLKEELKEELKEELEETAEDIKSGLDSLLPWL >NC_019683.1|WP_015135867.1|4432253_4432724_-|SET-domain-containing-protein-lysine-N-methyltransferase MHNGYELRTVGNKDEGVFSLRHFKTAEIVMVGKIKEILSSNDSHASQIAKGIFARHTGDIPKVNHSCGPNCGVKLNESGAHDFVARRDITVGEEITFDYAMRNYIIEHFPLQCACGADNCRGQVTGWKDLSVEQKKHYDGFAAPYLHELDTELKTR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019683_5 | 5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR | 3649031-3649061 | 31 | NZ_CP010587 | Bacillus megaterium Q3 plasmid p1, complete sequence | 8373-8403 | 8 | 0.742 |
NC_019683_5 | 5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR | 3649031-3649061 | 31 | NZ_CP023319 | Bacillus megaterium strain A plasmid p2, complete sequence | 6858-6888 | 8 | 0.742 |
NC_019683_5 | 5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR | 3649031-3649061 | 31 | NZ_CP024037 | Bacillus aryabhattai strain K13 plasmid unnamed2 | 2914-2944 | 8 | 0.742 |
NC_019683_5 | 5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR | 3649031-3649061 | 31 | NZ_CP026740 | Bacillus megaterium strain YC4-R4 plasmid unnamed4 | 63258-63288 | 8 | 0.742 |
1. spacer 5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR matches to NZ_CP010587 (Bacillus megaterium Q3 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
aatacctcccttacatcaataacaattcccg CRISPR spacer ttcatgtcacttacatcaataacaattccgc Protospacer .*. ** ********************
2. spacer 5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR matches to NZ_CP023319 (Bacillus megaterium strain A plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
aatacctcccttacatcaataacaattcccg CRISPR spacer ttcatgtcacttacatcaataacaattccgc Protospacer .*. ** ********************
3. spacer 5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR matches to NZ_CP024037 (Bacillus aryabhattai strain K13 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
aatacctcccttacatcaataacaattcccg CRISPR spacer ttcatgtcacttacatcaataacaattccgc Protospacer .*. ** ********************
4. spacer 5.1|3649031|31|NC_019683|PILER-CR matches to NZ_CP026740 (Bacillus megaterium strain YC4-R4 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
aatacctcccttacatcaataacaattcccg CRISPR spacer ttcatgtcacttacatcaataacaattccgc Protospacer .*. ** ********************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
154227 : 163792
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019683|154227:163792|DBSCAN-SWA CATGTTTGAACGCTTCACAGAAAAAGCAATTAAGGTGATTATGCTTGCCCAAGAGGAAGCGCGTCGCCTTGGCCATAACTTCGTTGGCACGGAGCAAATCCTCCTCGGTCTCATTGGTGAGGGGACTGGTGTCGCCGCAAAGGTGCTCCGGTCTATGGGAGTTAATCTTAAGGATGCTCGCATCGAAGTTGAAAAAATAATTGGACGGGGATCTGGCTTTGTTGCCGTAGAAATTCCTTTCACACCTAGAGCAAAAAGAGTTTTAGAGCTCTCCCTTGAAGAAGCCCGTCAGCTCGGCCATAATTACATCGGCACTGAGCACTTATTGTTAGGCCTTATTCGTGAGGGTGAAGGTGTTGCCGCTAGAGTTCTAGAGAATTTAGGGGTTGATCTTTCGAAGGTAAGAACCCAAGTTATCCGTATGTTGGGTGAAACTGCCGAGGTCGCGGCTGGCAGTGGCGGCTCTCGTAGTAATAAGACACCAACCCTTGATGAGTTTGGCTCCAACCTTACTCAGTTAGCCAAAGACAGTAAACTTGATCCCGTTGTCGGTCGTCAAAAGGAAATTGAGCGGGTTATCCAAATTCTTGGTCGTCGGACAAAGAATAATCCTGTTCTAATTGGTGAACCGGGTGTTGGTAAAACGGCGATCGCCGAAGGTTTGGCACAGCGTATTTCTACTGGTGATGTACCAGATATTCTCGAAGAAAAGCGTGTCGTTACCCTTGATATTGGTCTGCTCGTTGCGGGTACAAAATATCGCGGTGAATTTGAAGAACGCCTTAAAAAGATCATGGATGAAGTCCGCCAAGCGGGTAATGTAATCCTTGTGATTGACGAGGTTCATACCCTTATTGGCGCTGGTGCAGCAGAAGGGGCGATCGACGCAGCGAATATCCTCAAGCCTGCTCTCGCTCGTGGTGAACTGCAATGTATTGGTGCTACCACTCTCGATGAGTACCGCAAGCATATTGAGCGAGACGCGGCTCTCGAACGTCGTTTCCAGCCTGTAATGGTTGGTGAGCCTTCCGTTGAAGAAACCATCGAAATTCTCTTCGGTCTTCGCGAACGTTATGAGCAACACCACAAGCTTAAAATTCTTGATGAAGCTCTCGATGCGGCAGCAAAATTGGCAGATCGTTATATCAGTGATCGCTTCCTTCCTGACAAGGCGATTGACTTGATTGATGAAGCTGGTTCTCGCGTCCGTCTAATCAATTCTCAACTTCCTGCTGAAGCAAAAGAACTTGATAAGGAACTCCGCGGTGTCCTTAAAGAGAAGGACGAAGCAGTTCGTTCCCAAGAGTTTGATAAAGCCGGTGAACTCCGTGATCGTGAAATGTCGATCAAGGCAGAAATTCGGGCGATCGCCGCAAGCCAGAAAGAGAAAAAGACTGACATCGATGCCGTGGTTGACGCTGAAGAAATCGCCCATATCGTTGCATCTTGGACAGGTGTTCCCCTCAACAAACTTACTGAGAGTGAATCCACCAAACTCCTCAATATGGAAGATACCTTGCACCAGCGTTTGATTGGTCAAGAGGAAGCAGTAAGAGCTGTATCCCGCGCCATCCGCCGTGCCCGTGTTGGCCTGAAGAACCCCAACCGTCCTATTGCAAGTTTTGTTTTCTCTGGTCCTACCGGTGTTGGTAAAACTGAGCTAACCAAATCTTTAGCAGCCTACTTCTTCGGTTCTGAAGATGCCATGATTCGCCTGGATATGTCCGAATTCATGGAGCGTCACACCGTATCCAAGTTGATCGGTTCTCCTCCAGGATATGTTGGCTATAACGAAGGTGGTCAATTGACTGAAGCCGTTCGTCGTCGCCCTTACACTGTCATTCTCTTTGATGAGATTGAGAAGGCACACCCCGATATCTTCAATATGCTTCTGCAAATCCTTGAAGATGGTCGTCTAACCGATGCGAAAGGTCGTACCGTTGACTTCAAAAACACCCTCATTATCTTGACTTCGAACATTGGTTCTAAGGTCATTGAGAAAGGTGGTGGTGGTCTCGGTTTTGAATTCGGTGATGATGCAGCTGAATCTCAATACAACCGCATTCGTTCTCTTGTGAATGAGGAATTGAAACAATACTTCCGTCCTGAATTCTTGAATCGTCTTGACGAAATCATTGTCTTCCGTCAACTCACTAAGGATGAGGTTAAAGAGATTTCTGAAATTCTTCTCAAGGATGTTTTCCAACGTCTTACTGAACAGGAAATCGAGCTGCAAGTTACTGAGAAGTTCAAAGAACGTCTTGTGGAAGAAGGTTACAATCCTGCTTACGGTGCACGTCCATTACGCCGAGCAATTATGCGTCTCTTAGAGGATGTCCTTGCTGAAGAAATTCTCTCTGGTCGTGTTAGCTCTGGCGATACGGCTCTCGTTGATATCAACGAAGAAGGCAAAGTTGCTGTCAGTAAAGAAGAGCGTAAACCTGAACTCGTAGAGCAAGTTTAGTGACACTCATTATTCGGTTCAGACAAGTCATCTAACACAATTTTATAAACTTCTAAAGAAGCCTCCGGGCTTCTTTTTTTGTGGGGATCAAGATAATTGAGAATATAAAGTTTTCCTGATATTTCAGATAAGTAAAATTTAATTGTGTAACAATGATTACAGAAAGAGTTATGAGATTTTGAAGAGGCAAAATATGAAATTGACATATCGTGGTGTTTCTTATGATCGCGCTCCCGCCTCATTAGAAGTGACTGAAGGAAATATTCTTGGAAAGTACCGTGGCCAAGTGACTCGTCGCCGTTGTGTTGTGAGTTCTGTTGAGCGTCCTGATGTTGAGTCTGTATTGCTCCACTATCGTGGTGGATCATACGCAACAATGCAGCCAGCGATTCCAGCCTCTTTGCGAGAGCGTCGTGTCAATCAAGCGCCTGCTCCGTCTTGTCCTGTAAGACTGCCTCAATTATCAAGATTGATGAGTCAGGATGTACGACAGGTTCATCTTGAAAATATGCGCCGCAGTTTAGAGAGTCGGATTCAGTCGGCACAAGCCAGAGGTGATCAGCATCTCGTTAGCTTATTGCGCCAAGAATCAAGCAATTTATGGTTATCTCATTAGGCGATCGCCTGTGGTATTGGCCAAGATGAAAGATTAATTCAACTTTGATTCTCCATTTCATTGTTTTAGAGAAAGCCTTCGTGGCTTTCTTTTTTTGTGGGTGTCCGAAAAAAAAATTCTTCATGGGGTCAAAGGCTTGATTCATAATGGAGTTATGCAGTTGTGGTGTGGTATTTGTAAACGGCGATTATGATTGGGCAACTTCTTGACGGACGATACAAAATTACAGAGTCCCTTGCAGCTGGGGGCTTTGGCCAGACTTTTTTGGCAGAGGATATAAAGCAGTTCAACAAGATCTGTGTCGTAAAGCAGCTCAAGCCGAGTTTTAGTAATCCAGAGGCCTTGCTTGTGGCGCGACGATTATTTGAAGCTGAAGCTCAGTTACTGAATCGTCTGGGAGATCACGATCAGATTCCTCATCTTTTGGCCTATTTTGAGCTCAATCAAGAGTTTTTCTTAGTTCAAGATTTTGTGGAAGGCCACAGTCTCGAAAAGGAAATTACGGTTGGAAAAAAGCACAGTGAAGCTTATGCGATCGCCCTCATCGAAAGTATGTTGGAGCCACTGGCTTTTATCCACGAGCAAAATGTGATTCACCGCGATATTAAACCAGCGAATTTAATTCGGCGGCAACAGGATGGCAAAGTTGTACTGATTGATTTTGGCGCGGTAAAAGAGCTCGCTGCGACACAGGTGAATGCCCAAGGCCAAACGCAAATTGGCACAATTATCGGAACCCCAGGCTATATGTCTAGTGAGCAGGGGCGCGGCAAACCTAAACTCAGTAGTGATATTTATGCGGCAGGCATGATCGTGGTGCAAGCTCTCACTGGAAAAATTCCACCAGTGGGTTACAACACGGCTGATGAGCTTTACGAAGACCCGAATACCGCCGAAATTATTTGGCATCAGGATGCCAGTGTTTCACCAGAGTTTGCGGGCATTCTCGACAAAATGATTTGCTATGATTTTCGCCAACGGTATCGTTCTGCAATGGAAGTCAAACAGGCGATCGCCCAACTCTCCACAAATTCCCGCACCATTGCCACTACATCCGATAAAGGCGGGATCGCTACCGTTTTTCAAGAAGAAATTCCCGCCACTTCTATTAATATCCCCAAACCACCCATCAATCTTGCGAAGTCTCCACAGGGTGTAGGTGTACCTGCTCCGATTAAAAGACATTGGGCAAGGGTTGCATTTCGTGGGTTTCAGCGGTTCATTGCCGTGTGCTTTCTGATTTTAGGTTTACCGATCAGCATCTACGCCGTTTTCGAAGTGAATAATATGTCAGTCCCGAAAAATGAGCGAGACGACGCGATGGCTGCCCTCGTGATTTTAGGGTTGCCTCTGACAGGTTCCGGAAGCTGGATGCTTTGGAGTTTGCATCAGCGGGTGCGTAAAGAAAAATTTGACTCAGATTGGTTGCGGCACAATTTTTATCAAGTGATTGAGGCTAATCAAGGTGAAATATCATTGTTGAAATTTGCCCAAACGTCTAGATTATCAGGCAAAGAATCCCAGCGTTACCTCGAAGCGAGGGTAAAAGAGTTTAATGGCGATGTGCGTCAGATGCCCGATGGTGAGACCATCTATCGGTTCAAGTTGTAGCGAGAAAGGGAGAGGGAATACTGAAAAGGTTATGATCGCTGGATACGAAACCAGTTTTCTGCCTTTATGTCATCCCCCCTAAAACGTTTATTTACCTATAGCGATCGCCATCGCACTCAGATTAATCAAGCGATCGCCTGCTCTGTCCTAAACAAGATTTTTGATCTCGCACCTCCAGCACTGATTGGGATGGCAGTAGACACCGTCATCGAAAAAGAAGACTCGTTTGTGGCGCAGTTTGGGGTGACTAGTTTAATCGGGCAACTATTTGTGATTTGTACGATTTCACTCATTATTTGGGGGGCTGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019683|154227:163792|156883_157306_+|WP_015132375.1|DBSCAN-SWA MKLTYRGVSYDRAPASLEVTEGNILGKYRGQVTRRRCVVSSVERPDVESVLLHYRGGSYATMQPAIPASLRERRVNQAPAPSCPVRLPQLSRLMSQDVRQVHLENMRRSLESRIQSAQARGDQHLVSLLRQESSNLWLSH >NC_019683|154227:163792|160903_161389_-|WP_015132378.1|DBSCAN-SWA MIRQQFQKNSRFFSRSAAKIALSLGLIVIAPSMALAMPAGDSINAYLFGTTPEAGQIGHDYIVMQKGEGDNIQGAFYQINSEYACFSGEVAEGKLNLAVIDPYEEVAYDYQMDYTDSALIANSEEQTQTQIVPEGFHLIDIVTDLASTILAQCSADNSLAI >NC_019683|154227:163792|158983_160753_+|WP_015132377.1|DBSCAN-SWA MSSPLKRLFTYSDRHRTQINQAIACSVLNKIFDLAPPALIGMAVDTVIEKEDSFVAQFGVTSLIGQLFVICTISLIIWGAESVFEYLYQRLWRNLAQKMQHELRLDGYSHLQDLELAYFEERSTGELLALLNDDINQLERFLDVGANEILQVLTTVVLIGGVFIYFTPSVAWMALAPIPVIIWGSIAFQKKLAPLYGDVREKVSLLSTRLSNNLSGITTIKSFTTEHFELDRLRFDSLAYLKSNNRAIAFSAAFVPLIRIAILAGFTAILFFGGLQVENGTLAVGTYSVLVFMTQRLLWPLTRLGQTLDLYQRAMASTKRVFNLLDTSIQIRSGEKELPTHTVKGAINLANVQFAYKDRPAVLENFSLSVPAGQTIAVVGATGSGKSTIVKLLLRFYEIEQGKITLDGLDIRDIYLKDLRRAIGLVSQDVFLFHGTVAENISYGSADVSLTEIMQAAKQAEAHEFIEALPDKYDTIVGERGQRLSGGQRQRLAIARAILKDPPILILDEATSAVDNETEAAIARSLEKITQHRTTVAIAHRLSTIRHSDCIYVMDQGKIVEFGTHEELLENRGIYNNLWQVQTGAKITA >NC_019683|154227:163792|163024_163792_-|WP_015132381.1|DBSCAN-SWA MNRRSQFSEDLALFKRYAQQPTVCLRNRLVKSNLGLVRKVAYQMSRTCAETYEDLEQVASFGLIRAVERFNPERGVAFSSFAMPYIRGEILHYLRDRGSVIKIPRVWQELHSKGQKLRRKLRTQLGRSPYDYELAEALGVSTKDWQDCQLAWKNRLLISLDVSFGSSADDTVTLGETLPDTHNLEQQQREEIKLQLQDVFTHLEERTQKAIQLVCLEELPRTEAAKLIGISPMTVSRHLKKGMQQMNQLLEPQAA >NC_019683|154227:163792|157495_158917_+|WP_015132376.1|DBSCAN-SWA MIGQLLDGRYKITESLAAGGFGQTFLAEDIKQFNKICVVKQLKPSFSNPEALLVARRLFEAEAQLLNRLGDHDQIPHLLAYFELNQEFFLVQDFVEGHSLEKEITVGKKHSEAYAIALIESMLEPLAFIHEQNVIHRDIKPANLIRRQQDGKVVLIDFGAVKELAATQVNAQGQTQIGTIIGTPGYMSSEQGRGKPKLSSDIYAAGMIVVQALTGKIPPVGYNTADELYEDPNTAEIIWHQDASVSPEFAGILDKMICYDFRQRYRSAMEVKQAIAQLSTNSRTIATTSDKGGIATVFQEEIPATSINIPKPPINLAKSPQGVGVPAPIKRHWARVAFRGFQRFIAVCFLILGLPISIYAVFEVNNMSVPKNERDDAMAALVILGLPLTGSGSWMLWSLHQRVRKEKFDSDWLRHNFYQVIEANQGEISLLKFAQTSRLSGKESQRYLEARVKEFNGDVRQMPDGETIYRFKL >NC_019683|154227:163792|161699_162023_-|WP_015132379.1|DBSCAN-SWA MAVKKQFASFQEMLENSQKPVLIDFYATWCGPCQVMSQVLEQVSVQMLDEIQIVKIDGDRYNTLASQHGVHAYPTIVLYKDNQIVFRVEGAVPAPQLMQQLRQAIRK >NC_019683|154227:163792|154227_156690_+|WP_015132374.1|protease|DBSCAN-SWA MFERFTEKAIKVIMLAQEEARRLGHNFVGTEQILLGLIGEGTGVAAKVLRSMGVNLKDARIEVEKIIGRGSGFVAVEIPFTPRAKRVLELSLEEARQLGHNYIGTEHLLLGLIREGEGVAARVLENLGVDLSKVRTQVIRMLGETAEVAAGSGGSRSNKTPTLDEFGSNLTQLAKDSKLDPVVGRQKEIERVIQILGRRTKNNPVLIGEPGVGKTAIAEGLAQRISTGDVPDILEEKRVVTLDIGLLVAGTKYRGEFEERLKKIMDEVRQAGNVILVIDEVHTLIGAGAAEGAIDAANILKPALARGELQCIGATTLDEYRKHIERDAALERRFQPVMVGEPSVEETIEILFGLRERYEQHHKLKILDEALDAAAKLADRYISDRFLPDKAIDLIDEAGSRVRLINSQLPAEAKELDKELRGVLKEKDEAVRSQEFDKAGELRDREMSIKAEIRAIAASQKEKKTDIDAVVDAEEIAHIVASWTGVPLNKLTESESTKLLNMEDTLHQRLIGQEEAVRAVSRAIRRARVGLKNPNRPIASFVFSGPTGVGKTELTKSLAAYFFGSEDAMIRLDMSEFMERHTVSKLIGSPPGYVGYNEGGQLTEAVRRRPYTVILFDEIEKAHPDIFNMLLQILEDGRLTDAKGRTVDFKNTLIILTSNIGSKVIEKGGGGLGFEFGDDAAESQYNRIRSLVNEELKQYFRPEFLNRLDEIIVFRQLTKDEVKEISEILLKDVFQRLTEQEIELQVTEKFKERLVEEGYNPAYGARPLRRAIMRLLEDVLAEEILSGRVSSGDTALVDINEEGKVAVSKEERKPELVEQV >NC_019683|154227:163792|162133_162898_+|WP_015132380.1|DBSCAN-SWA MELLPVPQQRLKDQVAIVTGASRGIGKATAIALATEGAKVVINYARSSDAAEALVAEITDAGGEAIALQADVSQADQVDALIKNTLEKWGQIDILVNNAGITKDTLLMRMKPDAWQAVIDINLTGVFLCTKAVTRTMMKKRYGRIINITSVSGLMGNPGQANYSAAKAGVIGFTKTVAKELSSRNVTVNAVAPGFIATDMTEGLDNEDILKYIPMGRFGKPEDIAGMIRFLAADPAAAYITGQTFNVDGGMVMQ |
8 | Agrobacterium_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
592930 : 601310
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019683|592930:601310|DBSCAN-SWA GTTATTTGAGATATTTTTCTAACATTAACCGTAAGGATTGATGCCAATGTGGTGGGTATTCGCCTAGGAGATTGGAAATTTTTTTAGTTGATAGCACTGAGTAATGAGGTCGTTGTGCTGGAGTTGGATATTCTGAGGTTGTTATTGGCTTAAGCTGTGTCAATTTCAAAGGATAGCCAAGGCTTTTTGATTCCATAAAAATGGCAGAGGCGAAATCATACCAGCTACAAACACCGCTGTTGGTGAAATGGTAAATACCAGAATTTTCTTGGGAGAGCTGTTTACATATTTGCAACAGTGCCATTGCGAGATCTTTCGTCCATGTTGGACTCCCGATTTGATCAGAAACAATACCAAGATTCTCTCTAGCTTGACCAAGTTTCAACATGGTTTTGACAAAATTTCCTTTGCCATATATGCCATAAACCCACGCTGTTCGCACAATGATGTATTTGTCAGTTTGCTTAATAATGGCTTGCTCTCCAGCTAATTTTGATTTGCCATATGTACTACGGGGATTTGTTAAATCTTCTTCGCTATATGGTAAGTAGTTTTGACCATCGAAAACGTAATCAGTCGAAATATGAATTAGATAACTGCCGATTTGTTTCGTTGCTTTGGCGATCGCCTCTACAACCAAATGATTAATCAAAAACGCTTGCTCAACTTCTTCCTCCGCACGATCAACAGCTGTATATGCAGAACAGTTGATGACGATATCGGGCTGAACATTATAGATATAACTTTCGATGAGACTAATATTGCTTAGGTTAAGGGAGCCACGATCACAAGAAATATAATCTTCACCCTTGAACTCCAACAGCTTTTGCACCTCCTGACCTAATTGGCCAGAGCTACCGATCAGTAATATCTTTGCCATAAGACGATACAGAAAATTACGAGTAGAACAAACCAAACACTCAGTAACTGTAGCTCAACTCGGTCAATGACAACTTTCAAAATAAACTCATCTATGAGATATTAGCGCTACGGATCTTTCTGAAAATGCTTCTATGCCAAGTCTTTCATCACCGACTTACCTTATTACAGGTGGTTGTGGCTTTATCGGCTCGAATTTTACTTTAATGGCTCGCCAACAAAATTGGAGCCGCATCATTAATCTCGATGCTATTACCTATGCTGCAAATCCAGCTAATCTGAGTGCCCTAGCAAATGATGAAGACTATGTTTTTGTCAAAGGTAGTATCGGTGATCGCCACTTAGTAGAGCAACTTTTTGAGAAATATAAACCAGATGGCATCATCAATTTTGCCGCGGAGAGTCATGTAGATCGCTCCATTTTACATCCAGACTCATTTATTAACACCAATATTCTGGGGACCCATAATCTACTCGAAGAAACACTGAATTACTGGAATAATATAGATTCATCCAAGCAAAAAGAATTCCGTTTTCTTCATGTCTCAACCGATGAAGTTTATGGTTCCCTGGATGCGAATGATCCACCGTTCGAAGAAACAACCCCTTACGATCCGAGAAGTCCTTATTCCGCATCAAAAGCAGCTTCAGATCATTTAGTCAATGCCTATCACCACACCTATGGGCTACCAAGCCTAATCACCAACTGCTCAAATAACTACGGCCCTTACCAATTTCCCGAGAAACTAATTCCACTAATTATCCTCAATTGCTTAAACCTCAAGCCATTACCAATTTATGGAGACGGTCAGAATATTCGCGATTGGCTCTACGTTGAAGATCACTGCCAAGGCATCTATAACGTTATGACCAATGCCAACATCGGAGAAACTTACAATATTGGTGGCCAGACTGAACGAACAAACATTGAAGTCGTACACACTATTTGCAACATTCTCGATGAATTGAAACCCAAACCTGATTTTTCATATTCATCTCTCATCACCTTCGTCAAAGACCGACTTGGCCATGATCGCCGCTATGCCATTAACTGCAACAAAATCAAAAAAGATTTAAATTGGCAAGCACAAGAAAGCTTCCCAACCGGTATCAGAAAGACAATTCAGTGGTATCTAGAGCATCCAACTTGGATTGAGCAAGTTTGTTCCGGCGAATACCAAAACTGGATCCAAACTAACTACAAGAAATCAGAAGGATCAATTAACTAATGAAAGGGATTATTCTTGCAGGTGGCTTTGGAACAAGACTAGCTCCAATGACCAATATTTTAAGTAAACAACTTCTTCCCGTTTACGACAAACCGATGATTTATTATCCCTTGTCCGTGCTAATGCTTGCCGGAATTAGGGAAATCTTAGTTATTTCCACCCCTCAACATTTACCACTCTTTCAAAGTCTATTATCCGATGGAACACAATGGGGAATTAGCCTAAGTTATCTAGAACAAGCATACCCAAATGGTTTAGCCGAAGCTTTTATCCTCGGGGAAGAATTCATTGATACATCATCCGTATGTTTAATATTAGGCGATAACCTTCTCTATGGTCATGGACTAACAGAAGTACTGAAAAAAGCAACTCAAATCAACGAAGGAGCCTTAGTATTTGGATACCAAGTTAAAGATCCAGAGCGCTATGGTGTAATTGAATTTGACGACGCTGGTAATGTAATTAGCTTTGAAGAAAAGCCAAAAATTCCTAAAACAAACTTTGCAGTGCCAGGGATTTATTTCTATGACAATCAAGTAACCAAACTTGCTAAAAAAGTTCAACCTTCCAAGAGAGGGGAACTCGAAATAACAAGCCTAAATACTTTATATTTAGGCCGAAAACAGCTCAAAGTAGAGATATTAGGTAGAGGCTATGCTTGGCTTGATACCGGCACACCCGAATCTCTGCATCAAGCATCTAGCTATATTGAAACTATTGAGCAAAGACAAGGAACAAAGATTGCTTGCTTAGAAGAGATTGCCTACAACCAAGGATACATCGACTCAACACAATTGTTGAATCTATCCAATGCCTTACAAAAAAGCACCTATGGGCAATATTTAAAAAAGCTCATAAATAATTAGTTCCAAAATACTAGAGATAGATATTCCGATGAAGATAATTCCAACTAATCTGCCAGATGTACTACTTCTAGAACCCAAATGTTATAAAGATGATCGAGGTTTTTTCTTGGTTTCATATCAGACTGATTTTTTTCAGAAAGAATTGAATCTCAATATATCTTTTGTGCAAGACAATCATTCTCGCTCTTGTAAAAATGTTTTAAGAGGTTTGCACTTCCAAACTCAACACCCTCAAGGAAAGTTAGTTCGTGTTGTATCAGGCGAAGTATATGATGTAGCTGTGGATATCAGAGAAAATTCTAGGACTTTCGGCCAATGGTTTGGTACATATCTCAGCGCTAAAAATCAAAGAATGTTATGGGTTCCTCCAGGCTTTGCTCATGGATTTCTTGTCACATCAGAATATGCAGATTTCCTCTACAAAGTTACCGACATTTATTCCCCGAAGCATGAACAAACTATTCACTGGAGTGATCCTGAGATAGGCATAGAATGGCCACTAAATAACGAAGAACTAATTATCTCAGAAAAGGATTCTCAGGGCATGAATTTATCTGATTTGTAGAATAATACGGGACCTTAAATATTGGGTATATGACTTATAGCAATTTCTAGTCGAGTGAGGTGCAATAGCAGCAATGTGTAAACCAGCATCGAATATCATCAAGGGTAATCTTGGAAAAAGCTACCTCAATTGCCTTGTCTAGAGCTAGATAAGTTCTTGCCCCGATACTTTTCAAGGTACTTTTCAACTTTGACCAGCAATTTTCAATGGGTGAAAAATCTGGAGAATAGGGAGGAAGGTAAATCAACTTAGCTCCCACGGCCTCAATCATTGTGCGTACTGACTCTCCTAAATGAATCGAACAGTTATCCATCACCACACATGCTCCCGCCCATAAGTTTGGTATTAACTTCTGGCTGATGAATGCTTCAAAGGTTAATCCATCCGTACTTCCCCAGCAGATGATAATTAGCGACCATTCCCTTGAAGCCTAATGCTCCAATCAAAGAAACATTCTTGCCTCGTTTACTGGATTTCGGACTATAAGCTCGTTTCCCTTTCTCAGAACGTGCCCTCAGTCTTGTCATGGCTAAGTTCACGCCCGATTCATCGATAAAAATCAAGTTTTTCGCTAGAGTCGCTTGCATTTTCTGCCAAAAATCATATCTGGCTTGTTGCACTCGTTTTGTCGCCTTAAGGTCTGGATAGAATGTTTTTTTGAGGCTATATCCCATTCTTCTTAAGGTGCGATGCATGGTGCTATTGGCCACACGGAGACCAGTGCGTTTTCTCCCATCTCATCACATAGTTCCGCTAGCGTCGCATCGTTTTTCTTGGTGAGCAACTGGCGCAATATGTTTGATGCTCTTCGTTTAATTTGGGAGGTGTTTGTTGGCTCGTTTTTTCGGAGCAATCGACCCTGTCAGTCGTTTTTGGTCGAGGAGCTTTTGTACAAAACTTTTTCGCCACTCCAAATTGTCGGGCAAGACTACTTTGACTCACACCACCCCTTTCGTAGGCATCCACTATTTTCTGTCTTAAGTCTAATGAGTAGGCTTTCGGCAAGATGCTACTTTCTTCCTCACCAGTCAACTCACCTATACTACTTCATACACCTTGCTAGGCTGAAATTTGCTGTATTGTTTTACGTATCCCTTCCTCGAGACTATATTGGGGTCTAAAACCAATTTTGTTATTAAGGATTGAAGTATTGGCAAGAATAAAAGAATGTTCATCTTTGCTTGCTTCTATCATCCCTAGACCTATTAGCTCAGGAAGACCCATTTGTTTACCAATTTCAGTAACTATATCTTTTATGGCAATTGCTTTTCCTGAGGCAATATTAATATTGCCTGCTACATCACTATTTAGTAACTCGACGAATGCTCGTGCAACATCTTCTACATACATGAAATCTCTAACCTGATTTCCATGACTACATTTTGCAACTTGCTTAGCCGTTAAATTTTGGATAACAGAAGAGACAAGACGCCCAGAAGCTTCATTTACACCATATAGCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019683|592930:601310|598438_598969_-|WP_015132743.1|DBSCAN-SWA MIFQETQLQGCYLVELEKIVDERGGFSRSFCTEEFKSHGLQPTILQCNISFNQHKGTVRGMHFQKAPKSEAKLVRCTKGAIYDVALDLRAESPTYCQWIGIELREDNGKMLYIPEGFAHGFQSLEDDTEVFYQMSESYSPEHSTGVKWNDSCFGIELPLEITCISDKDLNYSDFSP >NC_019683|592930:601310|598968_600198_-|WP_015132744.1|DBSCAN-SWA MSSKCRFCQTPLSQTFVDLGMSPLANSYLKFESLSSAEKFYPLHTYVCSSCYLVQLEEFESPTHIFGDYAYFSSFSDSWLKHCENYANKIVRELSLDQGSKVVEIASNDGYLLQYFQRQAIPVLGIEPAANVAEVAREKGVNTRVCFFGKDEAQRVLANESGADLLIANNVLAHVPDINDFVAGMKTILKPTGVITVEFPHLLNLINYNQFDTIYHEHFSYLSLFTVEQIFDHHGLRIFDVDELRTHGGSLRIYACHHENQHRLQEEKVIQVKQRELDKGLDKTATYNAFSEQVKETKRKILDFAIKAKRKSKKIVAYGAPAKGNTLLNYCGIRSDFIDFTVDRSVYKQGLYLPGTHIPILEPEKIREAKPDYLMILPWNLQEEIISQMSYIREWGGQFVIPIPQLEIK >NC_019683|592930:601310|600242_601310_-|WP_015132745.1|DBSCAN-SWA MQSSFWESKKVLVTGHTGFKGSWLSLLLSHWGADVIGYALKPPSEPSLFYSVQLDELVNSIEGDVRNYDYLKKIIQEHKPDVIFHMAAQSLVLPSYQDPITTYSTNVMGTVNLLEAVRKVGTVKVVVNVTSDKCYKNKEWFWGYRENEEMGGYDPYSNSKGCAELITSAFRDSFFYQSDSVALASVRAGNVIGGGDWATNRLVPDIVRALVQNEVVTIRSPNAIRPWQHVLEPISGYITLAEKMWSDSQKFSQGWNFGPNDNDVKPVKWITQYLTNAWPTKGAWKLDEEAQLHEANYLKLDCSKARKILQWKPVMNLEQSLEWIISWYSLYYQREDVREITLEQIQQYCQLVSNA >NC_019683|592930:601310|595931_596468_+|WP_015132741.1|DBSCAN-SWA MKIIPTNLPDVLLLEPKCYKDDRGFFLVSYQTDFFQKELNLNISFVQDNHSRSCKNVLRGLHFQTQHPQGKLVRVVSGEVYDVAVDIRENSRTFGQWFGTYLSAKNQRMLWVPPGFAHGFLVTSEYADFLYKVTDIYSPKHEQTIHWSDPEIGIEWPLNNEELIISEKDSQGMNLSDL >NC_019683|592930:601310|597527_598442_-|WP_015132742.1|DBSCAN-SWA MKSILVTGSTGFIGQHTLSVLRKYGYDVHISVRTRLKIHSLKPEISSQVSIHYCDLFDYNQQVELFESIKPSHLLHFAWDATPGKFWTSENNLQWLECSMQLLRNFAKHHGERAVFAGTCAEYDWSYGYCTENLTPTNPSTLYGVCKNSLRQVSEQFCKDREISFAWGRIFWLYGVNEASGRLVSSVIQNLTAKQVAKCSHGNQVRDFMYVEDVARAFVELLNSDVAGNINIASGKAIAIKDIVTEIGKQMGLPELIGLGMIEASKDEHSFILANTSILNNKIGFRPQYSLEEGIRKTIQQISA >NC_019683|592930:601310|593942_595037_+|WP_015132739.1|DBSCAN-SWA MPSLSSPTYLITGGCGFIGSNFTLMARQQNWSRIINLDAITYAANPANLSALANDEDYVFVKGSIGDRHLVEQLFEKYKPDGIINFAAESHVDRSILHPDSFINTNILGTHNLLEETLNYWNNIDSSKQKEFRFLHVSTDEVYGSLDANDPPFEETTPYDPRSPYSASKAASDHLVNAYHHTYGLPSLITNCSNNYGPYQFPEKLIPLIILNCLNLKPLPIYGDGQNIRDWLYVEDHCQGIYNVMTNANIGETYNIGGQTERTNIEVVHTICNILDELKPKPDFSYSSLITFVKDRLGHDRRYAINCNKIKKDLNWQAQESFPTGIRKTIQWYLEHPTWIEQVCSGEYQNWIQTNYKKSEGSIN >NC_019683|592930:601310|592930_593809_-|WP_015132738.1|DBSCAN-SWA MAKILLIGSSGQLGQEVQKLLEFKGEDYISCDRGSLNLSNISLIESYIYNVQPDIVINCSAYTAVDRAEEEVEQAFLINHLVVEAIAKATKQIGSYLIHISTDYVFDGQNYLPYSEEDLTNPRSTYGKSKLAGEQAIIKQTDKYIIVRTAWVYGIYGKGNFVKTMLKLGQARENLGIVSDQIGSPTWTKDLAMALLQICKQLSQENSGIYHFTNSGVCSWYDFASAIFMESKSLGYPLKLTQLKPITTSEYPTPAQRPHYSVLSTKKISNLLGEYPPHWHQSLRLMLEKYLK >NC_019683|592930:601310|595036_595903_+|WP_015132740.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGFGTRLAPMTNILSKQLLPVYDKPMIYYPLSVLMLAGIREILVISTPQHLPLFQSLLSDGTQWGISLSYLEQAYPNGLAEAFILGEEFIDTSSVCLILGDNLLYGHGLTEVLKKATQINEGALVFGYQVKDPERYGVIEFDDAGNVISFEEKPKIPKTNFAVPGIYFYDNQVTKLAKKVQPSKRGELEITSLNTLYLGRKQLKVEILGRGYAWLDTGTPESLHQASSYIETIEQRQGTKIACLEEIAYNQGYIDSTQLLNLSNALQKSTYGQYLKKLINN |
8 | Enterobacteria_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
654343 : 761112
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_019683|654343:761112|DBSCAN-SWA ATTGAGTCATCATCTGAATCAAGTCAAAGAAGCAGGAAAGCAGAATAGTAGAAACGGCTATTCCAAGAAAACAATCAAATCAACCCAAGGGGAAATGGATATCAGCATCCCAAGGGATAGGAAAAGTGAATTTGAGCCGCTGTTAGTGCCCAAAGGTCAAAGGCGTATTCAAGGGCTAGAAGAGAAGATACTGGCTTTGTACAGTCGAGGTATGAGTACCAGAGATATTCAGGCACAAATGCAAGAACTGTATGGGGTGGAGATTTCAGCTGGGCTAGTGAGTGAAGTGACCTCGGCAGTGATGGAGGAAATCAAAGCATGGCAGCATCGTCCTCTGGAGGAGATATATCCGATATTGTGGCTGGATGGCATGAGAATAAAAATCAGAGAGGAAGGACGGGATACGAATCAGACTCTCTATCTAGCACTGGGAGTGAAGCAGTCCGGTCACAAGGAGGTCTTAGGAATGTGGCTATCCTCGGGAGGAGAGGGGGCAAAATTTTGGTTGTCAGTGCTGAATGAAATCCACCATCGGGGGGTCGAACATATCTGCATAGCTTGTGTGGATGGGTTGAAGGGATTTCCCGCTGCCATTGAAGCGGTGTTCCCAAAAACGAGAGTGCAATTATGTATCGTTCATCTGATACGAAATAGCCTGAAATTCGTTTCTTGGAAAGACCGTAAGTCCGTGGTGTCAGACCTCAAGCCTATTTACCAGGCCGCCACAGTTTCCGAGGCAGAATCCGCCTTAACTGCTTTTGCGGAGCGTTGGGACGGTATAGCAATTTCTAGTCGAGTGAGGTGCAATAGCAGCAATGTGTAAACCAGCATCGAATATCATCAAGGGTAATCTTGGAAAAAGCTACCTCAATTGCCTTGTCTAGAGCTAGATAAGTTCTTGCCCCGATACTTTTCAAGGTACTTTTCAACTTTGACCAGCAATTTTCAATGGGTGAAAAATCTGGAGAATAGGGAGGAAGGTAAATCAACTTAGCTCCCACGGCCTCAATCATTGTGCGTACTGACTCTCCTAAATGAATCGAACAGTTATCCATCACCACACATGCTCCCGCCCATAAGTTTGGTATTAACTTCTGGCTGATGAATGCTTCAAAGGTTAATCCATCCGTACTCCCCAGCAGATGATAATTAGCGACCATTCCCTTGAAGCCTAATGCTCCAATCAAAGAAACATTCTTGCCTCGTTTACTGGATTTCGGACTATAAGCTCGTTTCCCTTTCTCAGAACGTGCCCTCAGTCTTGTCATGGCTAAGTTCACGCCCGATTCATCGATAAAAATCAAGTTTTTCGCTAGAGTCGCTTGCATTTTCTGCCAAAAATCATATCTGGCTTGTTGCACTCGTTTTGTCGCCTTAAGGTCTGGATAGAATGTTTTTTTTGAGGCTATATCCCATTCTTCTTAAGGTGCGATGCATTGTGCTATTGGCCACACGGAGACCAGTGCGTTTCTCCATCTCATCACATAGTTCCGCTAGCGTCGCATCGTTTTTCTTGGTGAGCAACTGGCGCAATATTGTTTGATGCTCTTCGTTTAATTTGGGAGGTGTTTGTTGGCTTCGTTTTTTCGGAGCAATCGACCCTGTCAGTCGTTTTTGGTCGAGGAGCTTTTGTACAAAACTTTTCGCCACTCCAAATTGTCGGGCAAGACTACTTTGACTCACACCACCCCTTTCGTAGGCATCCACTATTTTCTGTCTTAAGTCTAATGAGTAGGCTTTCGGCAAGATGCTACTTTCTTCCTCACCAGTCAACTCACCTATACTACTTCATACACCTTGCTAGGCTGAAATTTGCTGTATCTACCCCACTATTTCCCAAATATGGCTGAATCATTGGGAAAACATCATTCCATTATTTGATTATCCAGCTCCCATCCGTCGCATCATTTACACCACCAATGCCATTGAGGCGGTCAATCGCTCTTTGGGCAGAGTTGTCCCTGCTGAAAATGCACTCTACTCTTTTTGAGTAGTTTGAAGTCATGGGTGCTACCTTTCTCACAGTCACAACAGATAATCTGTGCCCACTGCCAAGCAATAACTATTTGAGCTTTAAGGGAATGATGCTTCTTTTTCCCTGAGTAGTAAAGACGTTGTTTTTTTGGGCTTTTCAATCGCCTGTTCTGTGGCATCCATCAACCACTACTGTTAGAGATAACTCTTCTGAACCATGGAGCTGTTTCATGCCGGGTAAGTGGAAATCGGTTTCTTTGATGAGTTTATTCTCTGTTTTTTGCACCATGCGACAAACTGTTGATTCATGAATGCCCCATGATTGAGCGATATGAAAATAAGTGCGATATTCCCTCAGATATTCCAAGGTGAGGAGTAACTGATTTTCCAGGGATACAATACTGGGACGACCGGGTTTTTGCTTTGCTTTAGCTTCTGCGAGGACCTCTACCAGACGATTGAAAGTCTGAAGTTTAACTCCACAGGCTCTCCTGAATTGTTCTGGAGATAAATGTTGGAGCTGTTCGTAAGTTGGCATTTTTATCGCTATGGCTCTGTTACTTTCCTCTTTTTTCCCTACTCTCACCCCTTTTGCAAGAGGTCAAATATCCAACCAACTGAAGAACATTTCTCAGATTGAGCACTCTAGACATCGTAGTCCAGCGAACTTCTGCGTCTATTTGCTCTGTGGCTTGATTGCCTCTTGTCATCAGCCTAAGACACCTTCTCTCCAACTCAATTAGAGTCTCTTTTCCTTATCCAGAACTCACGTTAATATTAGTAAAAAAAAGGTTAAAAATTCGTTATTCTACTGAATCTCGGAGCATATTTTGAATGATCTGGCCAATAGATTTTGGTGATGAAGCTTATGCAATATTACGGAAACGATAGTGCTGGATACGAATGAATACTGTCTACAATGAGGAGATTATTTGCGGACTAAGCGGTCAATGCGTTCTTGGAGTAGGAGTTTGAGGAGCGATCGCCCAGTCAAGAATCCTAGGAAAAGGGCAATGCAAAAAACGGCGATCGCATAGTTGGGATAGCTGAGGAGTAACACGCCGACAATGGTTGCAAAGCCACTGAGAGTGCCGTACATAATGGTTTTGACGGCGAGATAAATGCGACGGAGTTGGCGATCGCTCTCCAGAGATTTAACGCGGAACTGAATTTCACCGAGCTCGATGCGGGATTCGAGGCGTTTAATCGCCATCTCGGTGCGGGTCGGTTTTTTGATTTGGTAGAGAACGAATTCTTTTGCTTGTTTCGCTAGGGAGGTAATACGGCTTTCGTTTTCTTCTTTGCTAATGGCAATGCTTCGGACAAAGGGTTGGGCTGCGGCGAGCAGGTTGTACTGGGGATCAAGGGCGCGGGCAATGCCATCAAGGGTTGTAATTGCTTTGATGATGAACGTCATTTGAGGAGGCAACCGGAATGGCTGCTGTTCAAACATCAAATAGATTTCGCCGCTAATCTGCTCAAATTCTTTTAAATCAACGGGGCGATCGCGGAATTTATCGAGTAGAAATGCAATCATCCGTTTAATGGGAGTCATGTCGGCCATCGGTTCGACTAAACCCATATAGACTAAGGTGTCTACCACTTCATCAGTATCTTTGCGGAGGATGGCGAAAAAAGTACGCATCATCTGCGTCTTTTCCATCGATTTGACTTCGGTCATGGTGCCAAAGTCGTAGAAAATTAGTTTGCCATCTTCATCAACCGCCATATTGCCCGGATGGGGATCAGATTGGAAAAATCCGTCTTGCAGTAATTGCTTGAGGTATGCGGAAATGCCAAGGCTAATGACGTTATCGGGATTGATATTGACTGCTTCGAGAGCAGCACGGTCATCGATTTTTATGCCGGGGAGATATTCGAGGGTAAGGACACGCTCAGTGGTGTATTGCCAATAGACTTTTGGGACAAGGATATGGTTTTGGCCAGCGAAGTTACTGCGGAAATGATCGCCATTTTTTCCTTCCTGCACATAGTCAATTTCTTGGTATAGCAGGTCAAAAAATTCACGGCAGACTTGGGTCAGATTATATTTATGGAGATCTTTTGCAAAGCGTCCGGCGATCGCCATTAATCTTTCAATGACTTGGATATCGACGTGAAACAGATTTTTAAGGCCGGGGCGCTGCACTTTAACGGCAACTTCTTCGCCAGTATATAGAATTGCTTTATGAACCTGTCCTAAACTTGCTGAGGCAAGGGGTTCTTGATCAAAGTCTTTAAAAACTGAGTAGAGAGATTTCTCAAATGATTTCTCGATGACGGCGATCGCCTCTGTGCTGTTGAAGGGAGGCACACGATCTTGCAGCTGACTCAGTTCTTCGATGTATTCGATCGGAAAAAGGTCGGGACGGGTGGACATCGCCTGACCAATTTTGATAAAAGTTGGCCCGAGATCGAGGAGATGGTTGACTAGCCAGCGAGCTTGACGACGACGGTTACTGGATTCATTTTTGCCCCCAAAGAATTTATCTTTGCCAAGACGCGCGACAAATTGCGAAGCGACAGCAAAAATTTCTAGTTGCCGCTGCCATAGATTGATATTCTGTCGTTGCCAACGTGGGGATTTCAATACTGAACTAGGCTATCGTTTCGACCACCCCTCATCATACAGAAAGCTTTCGCTAAAAACCTAAAAACGAGTCTAAATATAAGGCAATTAGGCGATCGCCAAAAAATAAACTCCCCATCGCACCCATCGCTAGAAAAGGGCCAAAGGGTAAATGCTGTTTTTTGCCATGTTTGCCGAGCTTCATTGCTGTACCGATAATCGCGGTGCCAAGGGCGCAGGACAAAAAGATTGTGAGGATAACATTTTGCCAACCGAGCCAAACACCAATCATCGCCAATAATTTTGGGTCACCGCCGCCCATCGCTTGTTGTTTGAGGGCAATCGTCCCGAGAAATCCGACAATATCTAATAACCATATCCCCAAAACCATCGCGCCAATGCCTCCAATAAAATATTGGATTGCGCCAGTCAAGCTATTGGCCTGAAAGCCGAGCAT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86 | Synechococcus_phage(18.18%) | integrase,tail,plate,transposase | attL 641802:641836|attR 684663:684697 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1007936 : 1083763
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_019683|1007936:1083763|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(14.29%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1984728 : 2056507
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_019683|1984728:2056507|DBSCAN-SWA 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54 | Synechococcus_phage(10.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3602438 : 3659143
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_019683|3602438:3659143|DBSCAN-SWA 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48 | Hokovirus(25.0%) | protease,transposase,integrase | attL 3640702:3640724|attR 3663389:3663411 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3841300 : 3992384
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_019683|3841300:3992384|DBSCAN-SWA 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>NC_019683|3841300:3992384|3935203_3935491_-|WP_015135484.1|protease|DBSCAN-SWA MSTGVIEKRSAATVRKPAPRYRVLLHNDDFNPMEHVVQTLIQTVAGLTQPQAVSIMMEAHTNGLALVITCVQEHAEFYCETLKSHGLSSTIEPDD |
114 | Escherichia_phage(12.5%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
4073809 : 4125206
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_019683|4073809:4125206|DBSCAN-SWA 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60 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 4077685:4077728|attR 4111374:4111417 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
4130815 : 4181978
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_019683|4130815:4181978|DBSCAN-SWA 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28 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | integrase,transposase | attL 4171219:4171234|attR 4190232:4190247 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4238681 : 4300353
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_019683|4238681:4300353|DBSCAN-SWA 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42 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
4313202 : 4374345
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_019683|4313202:4374345|DBSCAN-SWA 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57 | Prochlorococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
5016827 : 5072134
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_019683|5016827:5072134|DBSCAN-SWA AATGGTTTTCGATCCGTATCTCTGGCTCCACTTGGTCGGTTTGGCGATGCTCCCTCTCACTTTAGCGCTGGTAGTGATCGCCTTAGCATGGGGCATTCCGCTACCTTTTTCAACGGCAGAGTTGATCACAATCGTTTTAGTGGGTGGTGTACCTGTCTGGGTTCTACAGATTTTGCGCCCTTGGCAGCCCTTTGGCTTTTTCATTTTCCAGATTCCACCAGAAAGAATGGATGAACGCCAAAAACAGATTTTGCGGCTTATTCAGGGGACACGTCAGCCTTTACTCAATGCCCTTGGTGCGGTTGTCATGGTGATTCTCCTCTGGCAAATCGCCCATTATTCTCCCCTCGCCACAGGCATTAGTGCAGGGTTCTGGCAGTGGCGCGTGATAGGGATTACATTAGCGATCGTCGGTTTTTTTCTAAGCAATGTCATTGTGCAAATGTCATTAACCCTTTTACCGACCCTATTCCTTTCAGAAAATACGGTCATCGCAATCGACCCTCATCCAAATGTCAGCATTCGCCGCGACTTTGCCTGTTGGGGAATTCCCATGGGACAAATTTTTCCGAGTGTTCGACTCTAACGAAAGCTAATTCCCACTAATCTTCAGCTTCGCCTAAAGTTTTCACGGTGATCACTTGAGGGGGTGTTGCATCGGGAGGATAAAAGAAATCAATACGCGCTTCTACAGTCTTCTTTGAGGGAATATCAAGGGTTACTAGGGGTTGTCCTTGTTCTCCTCGTCGTTGCACAAGATGGTAATACTGGGTGACTTCATCGCCCCAACTATCAGGATAGCGAACTCGCACAGTGCCCCGATAGAAAACTCGATCCGGGGGCGTTTCAAAGAAAGTAAGGCGATCACTAAACTGATTTTGCTTAATCGGCGTTTGGAAAATCAGAGAAACCTGTTGCGGCTCACGGGTAGGATTATGCAACGGAAATTTCAGATCATAATGCACTAAATAATTGCCATGACCCTGTAGTGCCGTGTCGGGATAACGTGCCAACATCGCCGCACTTTGGACTTGAGATGTATCAAAGGTGCCAGTACTTGTGGTGCTGATGGGTAAAGAGACAGCTTCACCAACCTCTGGAATCGTAAAACGATTTTTCTTTTTGGGATCAGTGACAGTCGCCTGCCATTGGGCACCCATTGAAACACCAGCGACCCGACCATAAATGACTTGATTACTATCAGAGTCTGGAATCGGGGCACGATCACGCGGTTCCACTAATTTCCCTGTCGTCAATAAGGTGCGCCATTCATCTACAGACGGCGATCGCACAAAAGATTCCCTAATAATTTTTGTCGGAATACGAGGTAATGGCTCAGACGAAAATGTTTCTCGTTCCTCACCAAAATCAATCTCAAATCCCTTTGTTGTAGGATCAGACTCCTCTAAATCCTCAGTCTCTTCGGGCGATCGCCGCAGTTCTTCCTCTAATCGCTCTACCGCTTCCTCATCCACCACTTCCCGCTCAATAAAATCAGTCACTTCATACTTAGCGAGATTAGCGAGGTAGAGACCACCATCACTTTCAAGCTGTAAATAAGTGGAGCGCGAGCTACTAGGAGGAATGGGTAAACTCAATAGAATTTCAGTGCTGTAGGGCGGCACTTCTACAAACTCTGGAATAAAATCTTGCTCTTTACCCCGCAACAAATCTCCCACGAGCCGTGAACCAGGGCCAGAATAAACATGGCCATCAGGATCTTCAATAAAGGGAGGTAACTCACGAAATGGAGCATCCTGGCTATTGAGATAGCTCAGCCCTTGCAGGATACGAATACGACGAGGTTTTCCAGTCGGATTATTGACAATCAGGCCTTGATAAAGGGTTTTCGGTTTGTCAGCGGGACGGGAAATATGGTGAGTAAAAATATCAAACCGGCCTTCCAGTGGCGTTTCTAAATGAGCTTCAGGATTAGCTTTTACGCTCTTCGGGAAGGTGGATAGCAAAATACCTTCCTGGGTAATGATCTCAGGGCTATTGCTATTGAAAACGGGTACTTGGTTCAATTCACCAGGTAACGGAAGAATTGTTTGATAATCTACCAAGACTACAGGTAAAGGCTCCAATTCCGGAATATCTTCAAGTTCAGGAATATCATCAAATTCAGGGACGTCGTCAGCTTCTATCTCGGGTGACAATGGTTCTTTGTCATCGGGCTCATCTGATTCATCTTCTTTCGTTTGAGTGGATGCTTGAGCCTGCAAAAAAACTGAGGTTTCACTGGTCAAAGGCGTGTCAGCCGATACAGACGTAATGTCAGTAGAAGATGGATCAGAAAGGTGGGAAGGCTGAGTCAGTAGGAAAGGTAAAAAAAGATCAAACATTAATGTCTCAAACTATCCGAAACAATATTTTTTTAGATCACCACTGGAAAAATTGCGGCATCAATGACTGTTTATTCTTCAAGTCATGGCGCAAATCATCACTATTTTTAAGCGTTTTATTTGTAATATTCTATGCGGTTGTTGAATATTTTGGGTTCTATTGGCCAAATACTGACAAATGAGGCGATCACCATTTGCGTAAGATCTGACATAATTATGCGTTCTTTGGCATTATGGTGATTGGAGTTCTCCGGTGAGAATTTCAAGCGAAGTTTGGCATAACGTTGAGATCTTTTCCTCTATTTTCATTGGTTGACCGCTACATCATGGCGCAGTTGGTGCTGCCCTTTCTTTTTGGTTTAGGTGTGTTCACTAGTCTGGGTTTATCAATTGGTGTGCTCTTCGATGTAATGCGTAAAGTCGTCGCAAATGACATCACTTGGGCGATCGCCGGGCAAGTTTTATTACTACGCTTACCAGAATACTTAGTATTGGGCTTACCGATGGCTGTGTTACTCGGCAGCCTAACCGCCTACAGCCGTCTCTCTACCTTCAGCGAAATTATTGCCCTGCGTAGTGCTGGATTTAATCCAATTCGACTAATGGTGCCTTGTATTTTCGGAGGACTACTCATCAGTGGTTTAACATTTTATTTGAATGACTGGGTTGTCCCCCAAACGACCCGCCAAGCAGCCATCATGATTAAACAGGTCGAAGATACTGAGCTCAGAGATTTCAAGAAAAAAAATATTATTTATCCCGAATATCATCGCATCACAGAAGAAACAGGCGATCGCCGCGAAGTCCTCAAGACTCTGTTTTATGCCGAAGAATTTGACGGCGAGACCATGAGTAAACTCACGGTGCTTGACCGTGCCGAAGTCGATACCAGTCGCATCATCACCGCTGACTCAGCCCAATGGCAAACAGAAGCCCAAGGTTGGCAAATCCAGCAGGGCAGCATCTATCAAATTGATATGAATGGCTCCTTTAACAACATTCGACAGTTTGAAACAGAATTTTTAGACATATCTGATGCCCCACTCATTTTGGCAACCCAATGCCAGCGGGTTAATGAGATGACCTTATCCGTCGTTGATCTCTGCTTAGACAGTCTCAAACTCAGCCGTAATGAAAAAAGAATTCGGACATTACAGGTTAAAAAACAAGAAAAATTTGCAGTGCCATTTGTTTGTGTGGTCTTTGGCATTGTTGGGGCTGCAATTGGATTACGACCCCAAAATTCCAGCACAGGTGCGAGTGTCGGATTATCTGTTGCAATCGTCTTTGCTTATTACCTGCTCTCAGTAATCTCTAGCTCAATGGGCGTCTGGGGCACAGTCACGCCCTTTGTCGGCACATGGCTACCAAATGCACTGGGATTAGGAGCCGCAGCATTAATCGTTTGGCGTACCGGTTAATTTATGATTGCAGCTTGCTAGAAAGCTAAGAGGACACAGAAGCTTTCCCAAATCGCCGCTCTCGTTTCTGGAAGGCCAAAAGAGCTTGGTGAAATTCATGTTTATCAAAGTCAGGCCACAGAGTTGGTGTAACATAAATTTCGCTGTAAGCCATCTGCCACAACAAAAAATTACTGAGTCGCATCTCGCCACTGGTTCGAATTAACAGATCAGGGTCAGGGATACCGTGGGTATATAAATGGTTATTGATAATATTTTCGTCAATATCCATGGGTTTCAGCTCCCCAGCAGCAACCTTTGAGGCGATCGCCTGACAAGCTTGCACCAGTTCCTGTCGCCCCCCATAATTCGTCGCAACAGTAAATTGAATGCCAGTATTATCCTTCGTCTGCAGAACTGATCGTTGGATCTCTTCCTGAAGCGAATAAGGTAACGAAGTGAGATCTCCAACAAATCGAATCTGAATCCCTTTTTGCGCCCAAATTTTAATTTCACGGCGGAGTACTTTTTCAAATAATGTCATCAGAAACTCCACTTCAGCTGGAGGACGCCGCCAATTCTCAGTCGAAAAAGCATAAACCGTTAATGCTCCCACACCCCAATCCTGGCAATAAGTCAAAATATTGCGAATGGTATCTACTCCTCGTTGGTGCCCCATAATCCGCGGCAGCCCCCGTTGCTTACCCCAGCGACCATTACCGTCCATAATAACGGCGATATGTTGGGGCAATTTTGATGGATCGAGATCGATGGGTAGAGGATGAGCCATAATGCGAGCAAGCTTCTAAATACAGACAAAAATAATCTACAAGCAGAGAAAAGTAGTCTACAGAATCGAGGTTAAATCATTTCAAATTAATCTTTATCCGCCGAAGAGGAAGAGAGTCGCAAAAAACGATCTAGCAAAACTTTACCTTGAAAACCTAACTGACGGCTGAGTCGTCCAAAATCAGGGGTTACAGATTCATGATCGCTAGGCGTAAAATATTCAGCAAGTAGTTCTTTTAACTTACTGCTGGTGAGGGGACGATTGAGGTTGCCTTGCTCCGCGAGGGAAATGGATCCTGTTTCCTCTGAAACGACTACACACACACAATGTTCCACTCGCTCAGTAATACCCATGGCAGCCCGGTGCCTTGTACCCAGTTGACGTGATGCGGTTTTTTCAGAGAGAGGTAAGATAACGCCAGCCGCCACAATGCGAGAGCCACTAATAAACACGGCCCCATCATGG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50 | Flavobacterium_phage(20.0%) | integrase,tail,transposase | attL 5034220:5034271|attR 5062192:5062243 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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