Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019701 | Pseudanabaena sp. PCC 7367, complete genome | 8 crisprs | cas6,csx21,csm3gr7,csx19,csm2gr11,csx10gr5,cas10,csa3,cas4,DEDDh,cas3,cas5,cas8c,cas7,cas1,cas2,WYL | 0 | 7 | 3 | 0 |
NC_019690 | Pseudanabaena sp. PCC 7367 plasmid pPSE7367.01, complete sequence | 0 crisprs | RT,PD-DExK,cas3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019701_1 | 841798-842500 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019701_1
|
9 spacers
spacers of NC_019701_1
>1.1|841835|39|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTATCGGCCACCAGGCATACCTGATAACAGGTGCTCCG >1.2|841911|40|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATCCCATTTTCTGGGACCGTGCCCAGTGGTGCGCCGTA >1.3|841988|37|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGCAGTGACCCAGCCATCCGTGTCGGTGCTGTCGAT >1.4|842062|37|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACCATTTGACCCAGCCTCAAAACTAGGACGATGGG >1.5|842136|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAGTATAGGTCACGTTTACCGGACATGTCAAGC >1.6|842208|36|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGTTTTAGTGGTCATTTTTTGTTTAGGCTCTTG >1.7|842281|37|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCACAGTCTTTGGTGGGATGCTGTTTTCATTGGCG >1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTAAATCAGTATATTTATCTAAGTAAATCAAC >1.9|842427|37|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAACAAATTCCGCCATGTGCTTTTTGTCTATACCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019701_1
The CRISPR arrays of NC_019701_1 >merge|NC_019701|1|841798-842500|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACAGTATCGGCCACCAGGCATACCTGATAACAGGTGCTCCGATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACCGATCCCATTTTCTGGGACCGTGCCCAGTGGTGCGCCGTAATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACTGGCAGTGACCCAGCCATCCGTGTCGGTGCTGTCGATATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACACACCATTTGACCCAGCCTCAAAACTAGGACGATGGGATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACTTTAGTATAGGTCACGTTTACCGGACATGTCAAGCATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACTTTGGTTTTAGTGGTCATTTTTTGTTTAGGCTCTTGATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACCAGCACAGTCTTTGGTGGGATGCTGTTTTCATTGGCGATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACTATTTAAATCAGTATATTTATCTAAGTAAATCAACATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAACCTAACAAATTCCGCCATGTGCTTTTTGTCTATACCAAATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC >NC_019701|1|1|841798-842500|PILER-CR ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC AGTATCGGCCACCAGGCATACCTGATAACAGGTGCTCCG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CGATCCCATTTTCTGGGACCGTGCCCAGTGGTGCGCCGTA ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TGGCAGTGACCCAGCCATCCGTGTCGGTGCTGTCGAT ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC ACACCATTTGACCCAGCCTCAAAACTAGGACGATGGG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTAGTATAGGTCACGTTTACCGGACATGTCAAGC ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTGGTTTTAGTGGTCATTTTTTGTTTAGGCTCTTG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CAGCACAGTCTTTGGTGGGATGCTGTTTTCATTGGCG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TATTTAAATCAGTATATTTATCTAAGTAAATCAAC ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CTAACAAATTCCGCCATGTGCTTTTTGTCTATACCAA ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC >NC_019701|1|1|841798-842500|CRISPRCasFinder ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC AGTATCGGCCACCAGGCATACCTGATAACAGGTGCTCCG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CGATCCCATTTTCTGGGACCGTGCCCAGTGGTGCGCCGTA ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TGGCAGTGACCCAGCCATCCGTGTCGGTGCTGTCGAT ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC ACACCATTTGACCCAGCCTCAAAACTAGGACGATGGG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTAGTATAGGTCACGTTTACCGGACATGTCAAGC ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTGGTTTTAGTGGTCATTTTTTGTTTAGGCTCTTG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CAGCACAGTCTTTGGTGGGATGCTGTTTTCATTGGCG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TATTTAAATCAGTATATTTATCTAAGTAAATCAAC ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CTAACAAATTCCGCCATGTGCTTTTTGTCTATACCAA ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC >NC_019701|1|1|841798-842500|CRT ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC AGTATCGGCCACCAGGCATACCTGATAACAGGTGCTCCG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CGATCCCATTTTCTGGGACCGTGCCCAGTGGTGCGCCGTA ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TGGCAGTGACCCAGCCATCCGTGTCGGTGCTGTCGAT ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC ACACCATTTGACCCAGCCTCAAAACTAGGACGATGGG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTAGTATAGGTCACGTTTACCGGACATGTCAAGC ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTGGTTTTAGTGGTCATTTTTTGTTTAGGCTCTTG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CAGCACAGTCTTTGGTGGGATGCTGTTTTCATTGGCG ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TATTTAAATCAGTATATTTATCTAAGTAAATCAAC ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC CTAACAAATTCCGCCATGTGCTTTTTGTCTATACCAA ATTGCAACGCTCCTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC
>NC_019701.1|WP_015163928.1|840898_841513_+|(2Fe-2S)-ferredoxin-domain-containing-protein MAKKSKLLDKPKSKSVAKKSISKDSKTIEGIYLDGLRSKKGRLKWLRLETEHGEIVVKVAKDIASDLPPQIQVGDRLKLAVARKDSYLKAIQIMPIGQAINATALEFPAQVAEPQNKTQPQIKLKICRKGSCCKRGSKDVIKAMEAAIETHNLGDRVTIETTGCMDRCKKGPNIKALPEGEWYSRVNPDQAEDILRELQAIDRS >NC_019701.1|WP_015163927.1|840510_840750_+|hypothetical-protein MQIIDSSRMEHVEALVTSLKHFSKANGDRVYAVFELPSGQQCGIWSAIDNQLLINLQVGDRVVLGRSPQGRFKMIRRQT >NC_019701.1|WP_015163925.1|838930_839479_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSTATTLRQEFGTVAENPVLLETSVTEPVCEGMNVALASFQALYLQYEKHHFVVEGAEFYQLHNFFADCYGEVRGHVHDLGERLNGLGAVPATSFSKLAELCCFEPEADGAYSSRAMLEHDLVAEKAMVTLLRKLAGQAESLGDRATRYLYEKMLLETEERTYHIAHFLASDTLVALGFSNN >NC_019701.1|WP_015163924.1|837902_838586_+|pentapeptide-repeat-containing-protein MNVRTEDLLKNLKFCPYCELSSVKLPGAELDGEVLHHANLADADLSAGNLNHADLSNSDLSRANLYRCSLKHANFSAAKLSNANLKDVQLNDANLSDAILSCANLAEADLSGAILVGADLSGADLTNAELCHANLTGANLEGVLLHNANLTGANFTNANMENAQLDGADLTNANLSGTTLHNVNLANSNLQAVNLTNADLRGVNLQHTHNLETANLCDAIMPYGDRS >NC_019701.1|WP_156800450.1|837192_837513_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MGWLSVQNFYGRCAYQGTMEVSIYVANRHQGKGVGKQLLSYAIATGPQIGITCLMGMIFGHNQPSLQLFSKFGFEQWGHLPQIARLDGVKRDLVIVGLHLPNPESR >NC_019701.1|WP_015163922.1|836062_836509_-|hypothetical-protein MTNTPESTPEKEVAIVEVSPETKALVEKEMSDESDDVKERAMELIEAIKKKAMTETKEAGDFTVKAYLSAVQNAKEALEKSGEFATERKAALDKSIDVIEKEASENWEKLTEELDELGDRLAGVADAAWKLLTKPLFAANQDDDDAKS >NC_019701.1|WP_015163921.1|833840_835940_+|hypothetical-protein MEELFAHLREEPIATFAIMLAIILIIPPLFEKLKLPGLLGLLLAGLLVGPNVLHVVSIESEAMELLSDIGLVYLMFVAGLEIDIEQFNRTKDRAATFGAFTFFFPLIAGALIGRLFGFGWNASILLGSIFSSHTLLAYPIVSRLGVVGNEAVTVTIGATIITDIGALLVLAVSVGVNAGDFSLIRLITLLVSLLIYSSIVLFGFDRLGKIFFERSGDEEGNQFLFILLVVFLASLGAELIGVEKIVGAFLAGLAVNEVLGESPVKEKVVFIGSVLFIPIFFVDIGLIIDVNSFISSISSLWLSLAIAIGLIIGKFLAAYSSKLLYKYDWNQTMTMWSLSLPQVAATLAAALVGYREDLLSNSVLNSIVLLMVFTSTLGTILTKRFAAKLVLPGAGVQETSYAWVPEMYSNRFKVMVPVYNPNTEQHLVELASLLARHEEGGIFPLAVASAHMHMDANALADELTRARSLLANASEISKDIGIESETILRIDDSVYEGISRASREQRAHLIVMGWSEITGLKAKLFGTVIDRVLEATHCPVAVTRLLGSPMEIDHILVPIKSPRGHSMQMLRFAYILADANHAQVTLLNVCSPSISSERIEWRRSQFKLLADNWLPDCDVEVKIMPHRDPIAAIVAESSNHNLVILRSLRRRTVAGGIAISDVAEQLVQKLNCSMMILGEPHKQPVGILADVDSEKKAKA >NC_019701.1|WP_015163918.1|831239_832673_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MKKLSVLEIEEKLKQHEIWLKSFGANGQRFDVQNADLSGVDLQGVNLTDATLSSSDLSGANLHRAKLENTNLYFTNFSAANLSNVDFFCAAGYFANFDGANLSKAYLYQGGFFSADFSGADLCDADLSCTQLHEADFWGADLRGTELSGSNASGARFYKACLTGACIQGWTIDEETRFDQVDCEFVYLTWSGWDEEAQESIYFLDRLPKNENEFFKPGEFAVLVQQYTNTINLFFSEENGIDWQALSIALENFKAANNGQGLEIQGIEQQINGFIVKFMTQIDPTKPWISPRDCKTWTMLKEKYEEALQAIDTNYKEQLELTGDQLVFFKEQLAIERRNSTDFKGILKAMSNQQSSKYDLRGAQIGNLADTVKDNARQQTNQYNYAPAQKQTLAEAAAEIQQLLDQLAANNPTETVTDRAIVASKAIEVIEKNPTQKEKIVKALRVGGIAALKQMVKPVSEPITNVLFPMLEELTKN >NC_019701.1|WP_015163917.1|830403_831141_-|SMI1/KNR4-family-protein MSELTDALERIENWLVANAPKIAEGFEPGISREEIDRLLAKYKFIHQFPEELYEFYGWHNGAKYSVVPYYSNFFSLERALHPWSSWGFHKVQEHEEIEEDEPDIWNWKSQHLRIMDLEGDEVCAVDVVAPRCPIWRIDIESDKILYNSLTSYMQAYAECYEAGGYSYDSEEGLWEEDKEIVESIQLKYGCTDIDFESLSAEIDVDFQLQMLEQYTSLLPGMAPRLEGMRQELEKMKLERDPASDD >NC_019701.1|WP_015163916.1|829866_830385_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MPGQDTQENTQGNTQDFTIRAAIQADAEAIFNLIKALAEYEKLSHAVTGNVESLAAHLFGDRPCAEAIVVELEQAIVGFALFFTNYSTFLTKPGIYLEDLFVLPSHRGKGLGKALLLEVAAIATRRDCGRMEWSVLDWNEPAIAFYEHIGATVLPDWRICRIMGDRLGEIVS >NC_019701.1|WP_015163929.1|842547_842925_+|hypothetical-protein MLSKNSKYLILPIAALISLHHPIQAQSTTTSTTVKKAHCLYFEAKDDGPESELPLEDPGCTIEIGNHSDRVIHWSDGTTTKIQIDPDNPTVNGRSANIFETNEAERICMNWAGQVNQEAICYSFL >NC_019701.1|WP_015163930.1|842961_843612_+|hypothetical-protein MTEIGLIHGGFVGMRFWHYRDRQTKHGNFAAFSDLLENGTAALHLWAQANQSLDFWQVLDIPTIFNYYYQERAYTNSDTAHDRLGQFLAQQQPRAIACHSLGCHLLLQYLNNQNPLPDRTTAIYFAQGDFDRDYVITNPAILVRIKQGHLKIYNYYHPWDQMLLISIGANRRVAAGLTGTTEGYFIDRFFPLITTPNLHQSQLCSRQFKKEVMQGI >NC_019701.1|WP_015163931.1|843608_844481_-|metal-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSSFDKLTNQLGDRFEPKSNQSHQSNQAITTAPSPDQPVDQDISNAQNAQNASIVISHLSVRYRSVEALRDLNLVIEPGQLTGMIGPNGAGKSTMLKAMLGLIPAWGIARYRDRPLVEQLEQVAYVPQRSQIDWTYPTTVWDVVMMGRVRKTGWFKRFSNVSRRVAKEALDRVQMLDFADRRIGQLSGGQQQRVFLARSLAQEAEIFCFDEPFVGVDQKTEDIIFQIFHELAAAGKIVLVVNHDLGESITNFDRLILLNRELVASGDRDLVLQPEHMQRAYGGKVAFFAA >NC_019701.1|WP_015163932.1|844594_845659_+|zinc-ABC-transporter-solute-binding-protein MTQRSPSPSASIPVTKQLTNHISGKRPTPGFKTSFKQRLNSCAKLAAIVIAGLGLGSCAEPISQQVIDRPDKPNVVATSTMLWDLTDRVGGDEIDLVGILRPGADPHIYEPVPRDIVAIEAAELIFYNGYNLEPALIKLITASGINAEKIALGELVEPLDFDYQGKTAPDPHVWGSARNAIVMVEAIREYLTELSPEDAALFAQNADQLIAELKQLDQWITVQIATIPESQRYLVTTHDAFQYYAVAYDIPVAGTLIGISTEEQPSAQTVKNLSDTIKELGVPTIFAESTINPALIKTVAAEAGVNLAEQKLYSDSIGSLDSEANSYVMMLVVNTRTIVNGLGGNYENFEPSEQ >NC_019701.1|WP_156800332.1|845630_846224_+|hypothetical-protein MKISSRVNSSLGMLSGFSLAFVTTIIAIALADQIPIVAAQALPSETTSINKTKQNRLVPRPSVLTWQEFTAEIANGKVRFISTTYDLPPTYTNGYVYRTQGANWLGAYVIRSGLSAYPQQTENKLDQIDPELADRFMQDGNAIYFFWNRGNSARGMNRNRVEFTEAKRACLGATCVKAPGLSNAEIREILRSERNSM >NC_019701.1|WP_041698896.1|846242_847496_-|insulinase-family-protein MQRLVHHKTLANGLLVVVVENPTADIVATRCFLKGGTRIETSDRAGLVHLASSLVTRGTVSYSSQEIAEQVESIGASLGTESAADYFLLSFKTITDDFAEILALAAEILRSPTFCESELELERRLTIQAIKSQQERPFSVAYDHLQQLLYGAHPYGFPTLGTEDSIGNLGRQQLIDYHQAYFRPEQMVVSIAGKIEPAAAIAQVEAALGDWQVDMALPSYGGNHAEFTPKQTLTWQDTQQAIVMLGYPAPAVGSPDYAALKLITAYLGSGLSSRLFVELREKRGLAYEVSAFYPTRLEASQFVAYMGTAPQNALTAREGLQAECDRLAQGLLEPDELAMTKSKLIGQYALSKQTNAQIANAIGLYETLGLGADYDEIFTEQIKAVTLAEIERVAQHYFAQPAISVVGPDQAMQQLQV >NC_019701.1|WP_041698898.1|847890_849210_-|peptidase-M16 MTCPTKTASQATVKTLEHGITLIHQYVPSVSVAAVDIWIHAGTSTEPEHMLGMAHFLEHMIFKGTERILPGEFDWFIESQGGITNAATSHDYTHYNFTTAAHNFTTTLEHLAEMLLNASIPDDEFEQERLVVIEEIRQALDDPDWLSFQNLMQAAYADHPYSRSVLGTEDILSGFTPDHMRQFHRSFYRPEFMTVAVVGAVPIEEAIAAVSQSFVNSTANSANLLSPDQLGLSSTSIASRGNGDRPYIAGMQRCQHQHPRLQHSRMTMAWLGPNVDNLNDALGLELLSVVLAEGRSSRLVQELREELGWVHDVGSSFAIQKDPGLFSISAYLDAEYLEPVEHSIAQHILRISSEPITTAEIDRAKRSLRNSFAFALESPHQLANFLGYHGLLGCYELCADWSNVYSDSVSSFSASDLQDLARKYLSPRQYVLSSLVPEA >NC_019701.1|WP_041698315.1|849597_851136_-|phosphomannomutase/phosphoglucomutase MQDFDWKKLQNGSDIRGIALEGVADESVNLTSEVARKLGQAFATWLAAKVNKPIDKLLISVGRDSRLSGPDLMQATIAGINSMGAQVYDFDLASTPAMFMSTVTIGFSCEGAIMLTASHLPFNRNGMKFFTAQGGLNKQDITDILALAAANKFELANAPGKATKRDFISVYADQFVTKIRNAVNHPKHFKQPLQGLKIIVDAGNGAGGFYADKVLKTLGADTTGSQFLDPDGTFPNHVPNPENKVAMASICDAVVKHQADFGIIFDTDVDRSAAVDGQGNELNRNRLIALIAAIVINEHPGSTIVTDSITSDGLTKFIEQDLGGKHHRFKRGYKNVINEAVRLNEAGQESWLAIETSGHAAMKENYFLDDGAYLVSKLLIELAKAKLAGKSLTDLIANLKEPVESSEFRLKIGVDDFKTHGQQVIDKLTAFATEQSDWQIVPNNYEGIRVACPADNEDGWFLLRLSLHDPVIPLNIESNVAGGVNAIAARLLTFFATTDALDLAPLTKKFTG >NC_019701.1|WP_015163937.1|851747_851948_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKLKTRKSAAKRFKITGSGKIMRRHAMRNHLLEKKTTARKSRLFQKELVAEGDIQRVKDMLPYSR >NC_019701.1|WP_015163938.1|852158_852512_+|50S-ribosomal-protein-L20 MTRVKRGNVARKRRKKILKLAKGFRGSHSKLFRIANQQVMKALRNAYRDRRKRKRDFRRLWIARINAAARMQGSTYSQLMGMIKKANIEINRKMLAQLAIADPDTFNQIVEAAKSAS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019701_2 | 2206597-2212374 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NC_019701_2
|
79 spacers
spacers of NC_019701_2
>2.1|2206634|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCACATATTTGATGGCGGATTGTGATCTTCACGCG >2.2|2206706|36|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCGAGGACGACATTTTGGAGTTGTGCCGAAGTGAG >2.3|2206779|37|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGCGATCGAGCGGTAGATAGTCTGGGCACAGCCACG >2.4|2206853|39|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCACCCAGAGGAGGCGATCGCCAGCTTCGGGCGCGAG >2.5|2206929|38|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCCGGTGGGCAATCGGTTGTTACTTGTGGCTCAATTG >2.6|2207004|31|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATCTGTTGTCTGGTGATTCATCGTCACCG >2.7|2207072|37|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACCTTGCCATACGAGGATTAATCAAAGCTATGTGA >2.8|2207146|36|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCGAGCGAGCCAAACAATTTGCGCTGAACTTCCAA >2.9|2207219|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTCCCGTCCCTGGTATTTATCGAAATATTGGCT >2.10|2207291|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTCATCATCGGCTTAAGCAATGCAGCGATCGCC >2.11|2207363|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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AACTTTCATACCCTTCACCTCATTTACTACACGCCGT >2.23|2208228|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCTACGCATCAACGCCACCACTGGCAACAGCAACG >2.24|2208301|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCTATGCCCCATCTAGCTTGCGATTGCTACATCTG >2.25|2208374|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTCGTTTGCCACTTTAGTTAGTTTTGGCGATCGG >2.26|2208447|35|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATCGCCCAATATATACTGTGGCCAGAAGCCAAG >2.27|2208519|34|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGTCACCATGTCGGCGCAGGCATCGCCAACAT >2.28|2208590|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTGTAATCACCACTGACGAAATTATTGTTAGTTAAA >2.29|2208664|42|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTTCAGTTTGGTTCTGCCGGGATTGGGAAGCCGATCGCAG >2.30|2208743|35|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTATGCAACTCTTCTGATGCTTCATATCTAGCGAT >2.31|2208815|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGGAATTTTGCTCAAGCTCACCCCGAATCAACATT >2.32|2208888|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTATAACGAATTGAGGCGGTGGGAGCCTCTCAAT 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cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019701_2
The CRISPR arrays of NC_019701_2 >merge|NC_019701|2|2206597-2212374|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCCACATATTTGATGGCGGATTGTGATCTTCACGCGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACACCGAGGACGACATTTTGGAGTTGTGCCGAAGTGAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTGGCGATCGAGCGGTAGATAGTCTGGGCACAGCCACGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAATCACCCAGAGGAGGCGATCGCCAGCTTCGGGCGCGAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCTCCGGTGGGCAATCGGTTGTTACTTGTGGCTCAATTGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGAATCTGTTGTCTGGTGATTCATCGTCACCGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTAACCTTGCCATACGAGGATTAATCAAAGCTATGTGAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATCGAGCGAGCCAAACAATTTGCGCTGAACTTCCAAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAATTCCCGTCCCTGGTATTTATCGAAATATTGGCTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTAGTCATCATCGGCTTAAGCAATGCAGCGATCGCCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGTTGGCGATCGCACCTGGTAAAACCTGATCTGGCGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAATCACCCAGAGGAGGCGATCGCCAGCTTCGGGCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACACCTGAGCAGCAATTATCTTTGGTTGGCGATACCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTCTGTACAGTTCGTGGGCGATGTTACCTATGTTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAATAAACTGCCTGACGGTGTGAAGAAAAATGTAGGTGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATGGGCTGCCACTGTTAAGACTACGTGGGCTGAGTACAACTCAAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGATAATAGAGAAATCCAAAAATTACCTATTGGCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTCGGTCAGGTCATCGAACTTGATTTTGGTCAGCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACACAGTAATGAGAGCCTTTGACAGGGCGATTGCCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTAAATATCCAGCGGCTAAAGGCAATGCCGCCAATAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGTTTGACGAGAATTACCCGCAGTGCTTGTTAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAACTTTCATACCCTTCACCTCATTTACTACACGCCGTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACACCTACGCATCAACGCCACCACTGGCAACAGCAACGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATCTATGCCCCATCTAGCTTGCGATTGCTACATCTGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTTTTCGTTTGCCACTTTAGTTAGTTTTGGCGATCGGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCAATCGCCCAATATATACTGTGGCCAGAAGCCAAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATTGTCACCATGTCGGCGCAGGCATCGCCAACATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGGTGTAATCACCACTGACGAAATTATTGTTAGTTAAAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGGTTCAGTTTGGTTCTGCCGGGATTGGGAAGCCGATCGCAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCTATGCAACTCTTCTGATGCTTCATATCTAGCGATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAAGGAATTTTGCTCAAGCTCACCCCGAATCAACATTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTTCTATAACGAATTGAGGCGGTGGGAGCCTCTCAATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATGTGCTGCCCTACTTGCAGTCTGAGGCAACGGCGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTGGACTCAGGCCAACTCATGTTTATTGTGTATATGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCTTTAACTCGCATTAGGGCGATCTCTTGCGAATCGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATTCAAACTGGCCTCTGATCTGTGTAGGTTGGCAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGCTGATTAGCCATTTGCGACCAGCGGTTTTGTGTCAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGGGAAATAACGACATGGCAGTTATTGATATTGAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTGGTATGACTGGCGGCATCCCACTATGCGCCGATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACACTCCATAAACTTTATAGACATATTTCAAAGCAAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACACTGCAACGCGACGCTAATGGAAACAAGCAGCTAGCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGATCTCTGGAACAAGAAGGTTCTTGTATGTTGAAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGATCGCCAGATCTTGAGAACCAGCCGAAGTCGCGGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGTTTAGGATCTGTTGGGCAAACTGCTGTCTTGTCTGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCCAGAGGTGCGCAATTATGCCTAGTTGTTATTTGTGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTTGTCCCCGAATAAGCTTTAAAATCTAGCGTCTCTAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATTTCGGTCACTGTTTCGAGGACTTGCTGTCGAATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCCTTAGTGATCCAAATACTTGCCACTTTCTGGTGGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGCCATCCTAAGTCTTGCAAGTGCCTGGGTTTAAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACACTCGCCAGCCGCTTTGCTAATATTATCACCGCCTCAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATCTCCTCCTCCTGGGCTTGATCAGCCTGCGCAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGCGCTGTGTTTAACGCAAATGTGTTGCGCGATCCAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATCTTTATTGTTGCTGTATGGTGGGTTGCCATATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATGATGAATGCTTTTTCGTGCGCATCTCGCGTTACATTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTGATTGGAGTAGGGCTGTTCTTACGGCCTCGAATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTATTTGATGGTATGCAGGTTTGTCGTTTTTGAATAAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAAAAGAACCAAGGCAGGCCGCCTGTGACCTGCACCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAAGAGATCGGCTTTAGCGAACAAGTCGAGGTGATCGAAAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGGGCGATATGTTTGCCAGGATCGTGCAAGACGCTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAACCAGGGCATTGCAATCTCAACTATTAGATATTGACGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAACTGGGTAGCCGTCAAATGTTTCATAGGTCAACGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGACGATATTATTCATTTGTTGACCTCGACCTCTATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTCGATCTCTTAGTGCTAGCCCCGTCTCACCTTCTAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCCATGTGTTCTTTACCAATGCCAAGACCATCGCAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGGCACTCCCAGATTCAACCAACCCGCTGCAACATTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAACTTTCATACCCTTCACCTCATTTACTACACGCCGTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCCAGTAGGGGCGCTCAGTCAATTCAATAAAACCGAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGGGCAGGGATAGCTGTTATAATCAGAGCGTCAACAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGCCACACAGCCCAGGGTTAGCTCCAC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>NC_019701|2|2|2206597-2207646|PILER-CR GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CCACATATTTGATGGCGGATTGTGATCTTCACGCG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ACCGAGGACGACATTTTGGAGTTGTGCCGAAGTGAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TGGCGATCGAGCGGTAGATAGTCTGGGCACAGCCACG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AATCACCCAGAGGAGGCGATCGCCAGCTTCGGGCGCGAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CTCCGGTGGGCAATCGGTTGTTACTTGTGGCTCAATTG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GAATCTGTTGTCTGGTGATTCATCGTCACCG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TAACCTTGCCATACGAGGATTAATCAAAGCTATGTGA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ATCGAGCGAGCCAAACAATTTGCGCTGAACTTCCAA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AATTCCCGTCCCTGGTATTTATCGAAATATTGGCT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TAGTCATCATCGGCTTAAGCAATGCAGCGATCGCC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GTTGGCGATCGCACCTGGTAAAACCTGATCTGGCG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AATCACCCAGAGGAGGCGATCGCCAGCTTCGGGC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC 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GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ATTCAAACTGGCCTCTGATCTGTGTAGGTTGGCAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GCTGATTAGCCATTTGCGACCAGCGGTTTTGTGTCAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGGGAAATAACGACATGGCAGTTATTGATATTGAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TGGTATGACTGGCGGCATCCCACTATGCGCCGAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ACTCCATAAACTTTATAGACATATTTCAAAGCAAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ACTGCAACGCGACGCTAATGGAAACAAGCAGCTAGC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GATCTCTGGAACAAGAAGGTTCTTGTATGTTGAAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GATCGCCAGATCTTGAGAACCAGCCGAAGTCGCGG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GTTTAGGATCTGTTGGGCAAACTGCTGTCTTGTCTG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CCAGAGGTGCGCAATTATGCCTAGTTGTTATTTGTG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TTGTCCCCGAATAAGCTTTAAAATCTAGCGTCTCTA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ATTTCGGTCACTGTTTCGAGGACTTGCTGTCGAAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CCTTAGTGATCCAAATACTTGCCACTTTCTGGTGG 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>NC_019701.1|WP_015164994.1|2206130_2206424_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MANILVTYDVNTETKEGRRRLRKVATTCKDYGQRVQLSVFECNVNEAQYEALRAKLYNIIDPDLDSIRIYKLPAPRELSVECYGIDKYIDFNDPLII >NC_019701.1|WP_015164993.1|2205064_2206096_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKVLLNTLYVQTQGSYLRLDHETLKIEVERELTFQIPLHHLGAIVTFGNVLISPFLIHRCAEDGRALIWLSEYGRFRARANGSTSGNVLLRQAQYSALESTDAVLLIARYIVAGKLQNARLILMRSARDAKNESDRTALSAAAATHAEAIKSAEKAESVEKLRGIEGYAAKAYFAAFSHMIRLNRDAFALTERSRRPPRDPINAMLSFVYTLLVNDCVSACEGVGLDPQVGFLHAIRPGRPSLALDLMEELRAPIADRLVLTLINRGQIKPEHFLERPGGAIFMTDDARKTVLAEFQKRKKVEVNHPILATKVPLGLVNHTQARLLARHLRGDVPTYQPFILR >NC_019701.1|WP_051038115.1|2204465_2205068_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MLSALQHYVFCPRQCALIHVEQTFDENIYTLRGQRVHERVNIPEGESFEGIRVERSLTLWSHQHRLTGIADLVEFSFDHTPYPVEYKSGSRKPRRADDVQLCAQALCLEEMFGIAVPKGAIFHHASKRRREVIFDPDLRSLVIETAHQVRQMLTQSIVPPPVADQRCPDCSLLDACMPHAIQDFRKLAQSNNPFFVPLDP >NC_019701.1|WP_015164991.1|2203261_2204431_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MTKHFDPNRRHDFVLLFDVTDGNPNGDPDGGNMPRTDPETLQGLVTDVSLKRKIRNYVATYAAHEAPDDQKARLKIFVEHHGVLNEQIRLAYTEQDIPTGKPADDNIDDAEILAGLRAIAADLPEAFTFVDRDDDASDDETEPANLAYSGELSDTEKKEALEQLEEVISELAIESAIAKKTITFIKNLTKKAGKPDKSRANAEKAQVWMCNNFFDVRMFGAVMSTGLNAGQVRGPVQITFARSIDPVLPQDLAITRMAVTTEADREKLQTMGRKTLIPYGLYLAYGFYSPYLAQNTGVNKFDLQLFWQALVNMWDFDRSASRGLMAPRGLYVFTHESKLGNAPAHKLFERITVRLKNPNSTPRSFKDYELIVNTDNLPDAITLTDLLAE >NC_019701.1|WP_015164990.1|2201531_2203244_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MILSQLYEYSQRQMELPPAMYKGTKVRWVISLSTEGEFRDFIPRGGNSKADKRGTEMTAPHILRTVGVKPKLLADTGEYVLGIARPNSKPQRVKDCHQQFKDLVQQCANSTEEPTIRAIVKFLDTWNPETDRGKLPKDFDPADVITFEVGDTLPADEKAELHRIEEFWADYTLGDSDKSMPIMTCLITGERKPVVSTLPLLIKGLVGGQPSGTAMVSANAKPFTSYGLKSSLTSPISRDAAEGFAKALNHLIASPNFRLRIGSTTYVFWTRDQEDDFDALSYLDDPDPEKVKSLLSSPFTGQQSFSVDENQFYCLTLTANNARAVVRDWLETTVPEVKRNLCNWFEAQRIVAPDGEEFKSWGVYKLAASAYRDPAKEMLPAVPNALVKFALSGDRLPHDLLARVLRRNRAEQKVTYARVALIKLILTSQNKFARTEMETLNPNPDFPAIADHTAYHCGRLLAELEAIQRTALGKINATLTDRYYGAVSSTPASAFPPLLSGAKRAHLPKLRKNRPGAYQALEKRLEEIMSHLSELGFPKTLTLQQQGLFAIGYYHQKAANRAAAQTNQAS >NC_019701.1|WP_041698385.1|2200845_2201535_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MVETDSSLVVKVWGDFACFTRPEFGAERVSYEVMTPSAARGVLEAIFWKPEFSWQVQEIQVLKPIKRFSILRNEINSWQSDRSAKDPAYHYYADGDRAQRHTLCLREVAYMIKAKINLKPHASAHPAKYRDQFRRRVAKGQCHHQPYLGTREFSAFFSKPEEGDRPIKGSEGNKELGLMLMDLEFAIDSKGAITYLSHDPNGAKAVKGNASPRFFGARLENGVLRVPES >NC_019701.1|WP_015164988.1|2198497_2200720_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MQKLQYVAHTPNKLGEWHSLQEHLSDVAIKAQGYAAKIGCDELGYYAGLWHDLGKYHPKFQQYLECCHLATENGRSSSCKKFPHAIYGACLAREYLQPLAPIIWGHHAGLPDKDKLTNDLSKENHAVQNEYRAVLQHVPETLLQVRSIQKSKQAMQGLAKDSTEMLIRMLFSCLVDADYLDTEEHFDPDAPKLRGGYKTVNLLWKIFQADQQQLFDRVKGIDSKVNQIRSEVYLACVEAAAQMPGVFRLAVPTGGGKTRSGLAFALKHAMIHNLDRVIVAVPYTSIIEQTVNVYRNILGEADVLEHHSAAKEPDDEDARQSYAKARLATQNWDASLVVTTTVQLFESLFANRPSRCRKLHNLVGSVIVLDEVQTLPMFLLTPILSGLKELVDRYRVTVVLCTATQPALEGESRYLEGFTAGSVRDIVSSALAKQHFAGLARVNYEIKEQTWSWEQLVADIKEHNHDRALIILNTRKDALAVLDTLQNDDEIDADSLLHLSTLLCGEHRRQVLNQVRNRLDRHQPCLLVSTQVVEAGVDLDFPAVYRAIGPLDRIVQAAGRCNREGKMPEKGRVVVFEPEQGSKPKGDYETAAKRAEGILKSPELDLHNPDTFETYFKVLYKDVKLDQLDIQKKRTNFNYPEVAKNFKFIKDDTTPVVIQFDDRVRKHLKQIQRRDLNSGDYRKLQPYLVNLRQNDFKGTEALREEIAPGLWVWERLSYDELKGIKIGDRSIDFDPADLVQ >NC_019701.1|WP_015164987.1|2196514_2198017_-|DASH-family-cryptochrome MSPQRIIIWYRNDLRIHDHEPLWTVAKAGAIAIPIYCFDPRQFATTKYGFAKTGAFRAQFLTESVLDLRDRLRQLGSDLIVRYGEPEQILPELAQKLNANANAIYYHQEVTSEETKVEAAIAQDLAATDIKLQAFWGHTLYHRDDLPFSMERIPAIFTKFRKQVEQEATINPALPMPTELISFNDLNDLNEIDAPLDPGEIPSLAQLGLEPIAPDDRAAITFTGGEGAAIARLDQYFWQNDCLRTYKQTRNGMLGADYSSKFSPWLAHGCISPRYIFEQVQKYEQDRVANDSTYWLVFELIWRDYFRFIAAKHGDRLFYKSGLQNLDLPWKKDSTRFAQWCEGKTGFPLIDANMRELAATGFMSNRGRQNVASFLTKNLGIDWRIGAAWFESLLIDYDVCSNWGNWNYSAGVGNDARGFRFFNTTKQARDYDRQGDYAKHWLPELAKIPASKVHEPWLLSPAEQKQYGVRLGVDYPQPIVDLFKSAQANQKLYEMALSHQ >NC_019701.1|WP_015164986.1|2195773_2196328_-|DUF3122-domain-containing-protein MLKKYLHRIWSVIFAKIVTICLLCLFWIAGLLLAMPAQAKIWHTHEAPDQVVYQSRQALKDQHRNSWQAIAFNRVRADGSHGFKLRLVGFPGITSIDRDRPLVITTSLGKSFSVADNSSQIFTDATAPEPNIAQYDLMPIVPKLQAAIPIKLQLPTLGDEDIRLSIPPALIDEWQTIAARGDES >NC_019701.1|WP_015164985.1|2194888_2195416_-|OsmC-family-protein MTETVKTTITPISKEGLVGLADKAKEDPTKIGTLKVKTVCESKFRNLNYIRDLPVHVVDEPPTLLGDNTAPNPSEANLAALGSCLSVGIHANAVMRGINLTKLELELEGDINITGVWGIGDLAKKRLGFTDVRVKVNLEGDASREELEELVAHSNFWSPVANTTRNPVNMEVSLG >NC_019701.1|WP_041698386.1|2212406_2212979_-|IS630-family-transposase MQQLRADYQRWLWPQAMENLVFIDETGVNLAMTRLYARATLGERAYASKPLARGKNVTIIGAMALRGVLTNFTFTGSNNTDTFVSYLKDKLLPNLWSGAIVIMDNLSVHKVDPVRELIESVGAHLVYLPPYSPELNPIEMLWSKVKQFLRSWAARDYDDLHKAISNALAKVSLDDIMGWFLEADLCASLI >NC_019701.1|WP_041698387.1|2212995_2213361_-|hypothetical-protein MRAHSLDLRQRIVTAYENKEGSIRELATRFSVSKDSVHQLLQLYRTTGSVEPIPYKAGAKAKFNEAALAELAKLVAAKNDATLSELCEQMYERTGIRVSEPTMCRTLQRQELTRKKNFSRR >NC_019701.1|WP_015164995.1|2214660_2215803_+|LD-carboxypeptidase MDQQVSRRSLGKGFLGGLGVGLSTIWACRSAGLSGNQAIAATTDKSAKDNQKSSPSKVSKSIIKPPMLSPGDRVGMVAPASDAYEPEEIQIAKETMELYGFEVVLAKHIGDRYGYLAGKDRDRAADINEMFGREDIKGLVTFSGGYGCSRLLPLLDYDLIRQNPKVIVGHSDITALLMGIYAQTGLVTFHGSSGLTGVGEYARSHFRRAIMNKATIGEVAKPPATSAKTVKRNHRLVTISPGQATGQLIGGNLTLVTNLVGSPYFPDLKGKILFLEDVGEEPYRIDRMLTQLWLSGKLEDAAGIALGHFSNCYPKEYQASFFNTLSLEEVLRDRFEPLGIPTLYNLMFGHVGENAVLPLGTEATLDATAQTLTINENAVI >NC_019701.1|WP_015164996.1|2215917_2216208_+|DUF1232-domain-containing-protein MRSLFSLYFRLFRSSRFRWIAILASLVYILSPFDLSPDLMPILGRVDDLVVIVLMLAGLIQNLFIKSSDDEDESDRGDLGGDKDVETIDVDSVTLP >NC_019701.1|WP_015164997.1|2216274_2216586_+|hypothetical-protein MHIRFAEVDEKFIKSQIEDGFYTNETELVRDAVRKMRETQERKAQFLAAVQLGMDQADRGETVAYSDDLMDQIAQRATARVAAGKPIKNPEAIGTSPKLEMDE >NC_019701.1|WP_015164998.1|2216667_2218020_-|type-IV-pilus-twitching-motility-protein-PilT MSQSGIPPLPPPPSGNPGDRGGAPTPPPRAQVPNQQARKVASQKTSVPNPSTRLDNATQRQQTASRIPQPGGALKPPPPGPPPSMPSIPLVVNRNPGQPSLEQLVRDAFEQGCSDLHLGVNEQVRFRQRGIMMIQEQYPVTDEQTFYAWMHEVMEEKLVQQFKETMEYDGAAQYEYCRCRINIFESLRGPALVMRIIPLKILTLDQLNLPEVFRELCYTHRGLILVTGPTGSGKSTTMAAMVDFINAEMAKNIISIEDPIEFVHKSKKSLVKQREVGIHTVKFDNALKASLREDPDIILIGEMRDRETVNTALKAGQTGHLVFGTLHTNSAIKTIERILNLYEPDQQGPMRDQLAETMVAVIAQTLVRTTDGKRAAVHEIMINTDAIRDYIKRNEVDEIESIIPKSTFDGMVSMNQSLYKLYEEGRITEETAVENSPKPNEMAQYLRGRL >NC_019701.1|WP_015164999.1|2218528_2219395_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MNILSSLRSQSRQSNHKAKSSANGKSGNSKPRPTKGIELKSKREQDFMRESARIVATVLKEMYEIAAPGVTTADLDAHAEKRIREMGAVPSFKGYHNFPASICSSINNEVVHGIPNPRKVIKPGDVVKIDTGAYKNGFHGDSCITIMIPPYDEKAALLVKVAEEALYKGIEQVKPGNHLLDIAGAIEDHVKANGFSIVEDFTGHGVGRNLHEEPSVFNFRTHQLPNVKLRAGMTLAIEPIVNAGSKNVRILSDRWTAVTVDRSLSAQFEHTVLITNDGYEILTDRHKV >NC_019701.1|WP_015165000.1|2219558_2221055_-|hypothetical-protein MPQPEINDRVGSAATNHSSPPSQEANGWYGAIAQPSNEFACQALPIIAGQIPTGLRGSFYRNGPGRIGRGGIPVGHWFDGDGAILAVHFDRGGAQGTYRYVQTEGYLAEQQVGKLLFANYGMVAPIPWWQRFLNTDLKNCANTSVLALPDRLLALWEGGSPYALDLKTLATIGADDLDATLPNIPYSAHPKQDPVTGEIFNFGITYRGTTALNIFKSDRHGKIIQRKAIPLRGICPVHDFVLAGKYLLFCIPPVRLDVLPVLLKTKSYSESLRWQPQQGTQILVVDRNNLEIVSRSQVDAWYQWHFGNGYTDRDGNIMFDLVRYDDLATNQYLQEVITGNPQTKAVGELWQGRLQPETGKMLTMQRVSDRICEFPRINPHQVGQPHRHVYLAIHRRGVNTVKETFGAIGSFDYASATMHEADFGAGKYVSEPVYAPDVHNPEQGWLLITVYDATAHQSEVWVMDAQHLDNAEPVCRLALPEVVPLAFHSTWKPEQPEQ >NC_019701.1|WP_015165001.1|2221259_2221445_-|hypothetical-protein MKTEPIYLSKSEKEKLMQINDLIRECRHLLVESAQYPDAVAFLSDVRDILKQHRVKPSQAS >NC_019701.1|WP_156800489.1|2222061_2223045_+|2-carboxy-1,4-naphthoquinone-phytyltransferase MEANRSQIDQPQSLSANSTPKSQRKLWLAAIKPPMYSVAIMPIVVGTAIAFYQTQQLNWRNFLTFMFAAILVLAWENLSNDVFDSETGIDQNKAHSVVNLTGNKNLVFAIANLFLLLGISGVVAISWWQRDFVVLGIVVLTCLLGYSYQGPPLRLGYLGWGEPICFICFGPLAIMAAYYSQTNAFLINSINSSAQNLAALAAAAIIVGVGVTLVLFCSHFHQVEDDIKAGKRSPVVRLGSKRAAQLIPWAAVSIYATTIVSMISGFLPLWSGLVLLSAPFAWKLSSLLGKYHDQPAMITESKYVAVLLQFSSGLGLSVGLVIARLLN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019701_3 | 2213433-2214421 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NC_019701_3
|
13 spacers
spacers of NC_019701_3
>3.1|2213470|35|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT TTTATGGCTTCCAGATCGATTGCGATAGGTCTAAG >3.2|2213542|38|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT AGAAATCCTAATGTGGTGCTTAATTCCGAAGTTTTGAC >3.3|2213617|35|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT TTTATGGCTTCCAGATCGATTGCGATAGGTCTAAG >3.4|2213689|35|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT CAGCCAATCAGACTTTCTTCGAGAGCTTGTACCCA >3.5|2213761|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCAT >3.6|2213834|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCAT >3.7|2213907|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTCTGGGAAACGTCAAAAGTGGCTACACCTCTAAA >3.8|2213980|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCGAATCGGTTTCTTTCGCTATCAAACGAATAGG >3.9|2214054|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTACCACTGGCTATCCACTGGTTACCCATCAGA >3.10|2214128|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCATCAGATACATCGTGGCTACACTTAGGCGATCGC >3.11|2214202|34|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTCTATGTCCATGCAATAGATGGTTTGCTAGAC >3.12|2214273|38|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCGATTAAAACCGGAAGTGGCCGATTTGATCCGTACT >3.13|2214348|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGATCAAATCTCAATACTATCCAGCCTATTTAAGAT |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019701_3
The CRISPR arrays of NC_019701_3 >merge|NC_019701|3|2213433-2214421|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTTTATGGCTTCCAGATCGATTGCGATAGGTCTAAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGAAATCCTAATGTGGTGCTTAATTCCGAAGTTTTGACGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTTTATGGCTTCCAGATCGATTGCGATAGGTCTAAGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCAGCCAATCAGACTTTCTTCGAGAGCTTGTACCCAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGTCTGGGAAACGTCAAAAGTGGCTACACCTCTAAAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACCTTTCGAATCGGTTTCTTTCGCTATCAAACGAATAGGGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACTAATTTACCACTGGCTATCCACTGGTTACCCATCAGAGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACATCATCAGATACATCGTGGCTACACTTAGGCGATCGCGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACGGTCTATGTCCATGCAATAGATGGTTTGCTAGACGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACACCGATTAAAACCGGAAGTGGCCGATTTGATCCGTACTGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAACAGGATCAAATCTCAATACTATCCAGCCTATTTAAGATGTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC >NC_019701|3|3|2213433-2214421|CRISPRCasFinder GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TTTATGGCTTCCAGATCGATTGCGATAGGTCTAAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGAAATCCTAATGTGGTGCTTAATTCCGAAGTTTTGAC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TTTATGGCTTCCAGATCGATTGCGATAGGTCTAAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CAGCCAATCAGACTTTCTTCGAGAGCTTGTACCCA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGTCTGGGAAACGTCAAAAGTGGCTACACCTCTAAA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CTTTCGAATCGGTTTCTTTCGCTATCAAACGAATAGG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TAATTTACCACTGGCTATCCACTGGTTACCCATCAGA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ATCATCAGATACATCGTGGCTACACTTAGGCGATCGC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GGTCTATGTCCATGCAATAGATGGTTTGCTAGAC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ACCGATTAAAACCGGAAGTGGCCGATTTGATCCGTACT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGGATCAAATCTCAATACTATCCAGCCTATTTAAGAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC >NC_019701|3|3|2213433-2214421|CRT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TTTATGGCTTCCAGATCGATTGCGATAGGTCTAAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGAAATCCTAATGTGGTGCTTAATTCCGAAGTTTTGAC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TTTATGGCTTCCAGATCGATTGCGATAGGTCTAAG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CAGCCAATCAGACTTTCTTCGAGAGCTTGTACCCA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGTCTGGGAAACGTCAAAAGTGGCTACACCTCTAAA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CTTTCGAATCGGTTTCTTTCGCTATCAAACGAATAGG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TAATTTACCACTGGCTATCCACTGGTTACCCATCAGA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ATCATCAGATACATCGTGGCTACACTTAGGCGATCGC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GGTCTATGTCCATGCAATAGATGGTTTGCTAGAC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ACCGATTAAAACCGGAAGTGGCCGATTTGATCCGTACT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGGATCAAATCTCAATACTATCCAGCCTATTTAAGAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC >NC_019701|3|4|2213724-2214421|PILER-CR GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AAGTATTGAGGGTGGGATCACGTTAACATTTCGCAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGTCTGGGAAACGTCAAAAGTGGCTACACCTCTAAA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC CTTTCGAATCGGTTTCTTTCGCTATCAAACGAATAGG GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC TAATTTACCACTGGCTATCCACTGGTTACCCATCAGA GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ATCATCAGATACATCGTGGCTACACTTAGGCGATCGC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC GGTCTATGTCCATGCAATAGATGGTTTGCTAGAC GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC ACCGATTAAAACCGGAAGTGGCCGATTTGATCCGTACT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC AGGATCAAATCTCAATACTATCCAGCCTATTTAAGAT GTTGCACCTGGCCTTCGGGCTGGGTGAGGATTGGAAC
>NC_019701.1|WP_041698387.1|2212995_2213361_-|hypothetical-protein MRAHSLDLRQRIVTAYENKEGSIRELATRFSVSKDSVHQLLQLYRTTGSVEPIPYKAGAKAKFNEAALAELAKLVAAKNDATLSELCEQMYERTGIRVSEPTMCRTLQRQELTRKKNFSRR >NC_019701.1|WP_041698386.1|2212406_2212979_-|IS630-family-transposase MQQLRADYQRWLWPQAMENLVFIDETGVNLAMTRLYARATLGERAYASKPLARGKNVTIIGAMALRGVLTNFTFTGSNNTDTFVSYLKDKLLPNLWSGAIVIMDNLSVHKVDPVRELIESVGAHLVYLPPYSPELNPIEMLWSKVKQFLRSWAARDYDDLHKAISNALAKVSLDDIMGWFLEADLCASLI >NC_019701.1|WP_015164994.1|2206130_2206424_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MANILVTYDVNTETKEGRRRLRKVATTCKDYGQRVQLSVFECNVNEAQYEALRAKLYNIIDPDLDSIRIYKLPAPRELSVECYGIDKYIDFNDPLII >NC_019701.1|WP_015164993.1|2205064_2206096_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKVLLNTLYVQTQGSYLRLDHETLKIEVERELTFQIPLHHLGAIVTFGNVLISPFLIHRCAEDGRALIWLSEYGRFRARANGSTSGNVLLRQAQYSALESTDAVLLIARYIVAGKLQNARLILMRSARDAKNESDRTALSAAAATHAEAIKSAEKAESVEKLRGIEGYAAKAYFAAFSHMIRLNRDAFALTERSRRPPRDPINAMLSFVYTLLVNDCVSACEGVGLDPQVGFLHAIRPGRPSLALDLMEELRAPIADRLVLTLINRGQIKPEHFLERPGGAIFMTDDARKTVLAEFQKRKKVEVNHPILATKVPLGLVNHTQARLLARHLRGDVPTYQPFILR >NC_019701.1|WP_051038115.1|2204465_2205068_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MLSALQHYVFCPRQCALIHVEQTFDENIYTLRGQRVHERVNIPEGESFEGIRVERSLTLWSHQHRLTGIADLVEFSFDHTPYPVEYKSGSRKPRRADDVQLCAQALCLEEMFGIAVPKGAIFHHASKRRREVIFDPDLRSLVIETAHQVRQMLTQSIVPPPVADQRCPDCSLLDACMPHAIQDFRKLAQSNNPFFVPLDP >NC_019701.1|WP_015164991.1|2203261_2204431_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MTKHFDPNRRHDFVLLFDVTDGNPNGDPDGGNMPRTDPETLQGLVTDVSLKRKIRNYVATYAAHEAPDDQKARLKIFVEHHGVLNEQIRLAYTEQDIPTGKPADDNIDDAEILAGLRAIAADLPEAFTFVDRDDDASDDETEPANLAYSGELSDTEKKEALEQLEEVISELAIESAIAKKTITFIKNLTKKAGKPDKSRANAEKAQVWMCNNFFDVRMFGAVMSTGLNAGQVRGPVQITFARSIDPVLPQDLAITRMAVTTEADREKLQTMGRKTLIPYGLYLAYGFYSPYLAQNTGVNKFDLQLFWQALVNMWDFDRSASRGLMAPRGLYVFTHESKLGNAPAHKLFERITVRLKNPNSTPRSFKDYELIVNTDNLPDAITLTDLLAE >NC_019701.1|WP_015164990.1|2201531_2203244_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MILSQLYEYSQRQMELPPAMYKGTKVRWVISLSTEGEFRDFIPRGGNSKADKRGTEMTAPHILRTVGVKPKLLADTGEYVLGIARPNSKPQRVKDCHQQFKDLVQQCANSTEEPTIRAIVKFLDTWNPETDRGKLPKDFDPADVITFEVGDTLPADEKAELHRIEEFWADYTLGDSDKSMPIMTCLITGERKPVVSTLPLLIKGLVGGQPSGTAMVSANAKPFTSYGLKSSLTSPISRDAAEGFAKALNHLIASPNFRLRIGSTTYVFWTRDQEDDFDALSYLDDPDPEKVKSLLSSPFTGQQSFSVDENQFYCLTLTANNARAVVRDWLETTVPEVKRNLCNWFEAQRIVAPDGEEFKSWGVYKLAASAYRDPAKEMLPAVPNALVKFALSGDRLPHDLLARVLRRNRAEQKVTYARVALIKLILTSQNKFARTEMETLNPNPDFPAIADHTAYHCGRLLAELEAIQRTALGKINATLTDRYYGAVSSTPASAFPPLLSGAKRAHLPKLRKNRPGAYQALEKRLEEIMSHLSELGFPKTLTLQQQGLFAIGYYHQKAANRAAAQTNQAS >NC_019701.1|WP_041698385.1|2200845_2201535_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MVETDSSLVVKVWGDFACFTRPEFGAERVSYEVMTPSAARGVLEAIFWKPEFSWQVQEIQVLKPIKRFSILRNEINSWQSDRSAKDPAYHYYADGDRAQRHTLCLREVAYMIKAKINLKPHASAHPAKYRDQFRRRVAKGQCHHQPYLGTREFSAFFSKPEEGDRPIKGSEGNKELGLMLMDLEFAIDSKGAITYLSHDPNGAKAVKGNASPRFFGARLENGVLRVPES >NC_019701.1|WP_015164988.1|2198497_2200720_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MQKLQYVAHTPNKLGEWHSLQEHLSDVAIKAQGYAAKIGCDELGYYAGLWHDLGKYHPKFQQYLECCHLATENGRSSSCKKFPHAIYGACLAREYLQPLAPIIWGHHAGLPDKDKLTNDLSKENHAVQNEYRAVLQHVPETLLQVRSIQKSKQAMQGLAKDSTEMLIRMLFSCLVDADYLDTEEHFDPDAPKLRGGYKTVNLLWKIFQADQQQLFDRVKGIDSKVNQIRSEVYLACVEAAAQMPGVFRLAVPTGGGKTRSGLAFALKHAMIHNLDRVIVAVPYTSIIEQTVNVYRNILGEADVLEHHSAAKEPDDEDARQSYAKARLATQNWDASLVVTTTVQLFESLFANRPSRCRKLHNLVGSVIVLDEVQTLPMFLLTPILSGLKELVDRYRVTVVLCTATQPALEGESRYLEGFTAGSVRDIVSSALAKQHFAGLARVNYEIKEQTWSWEQLVADIKEHNHDRALIILNTRKDALAVLDTLQNDDEIDADSLLHLSTLLCGEHRRQVLNQVRNRLDRHQPCLLVSTQVVEAGVDLDFPAVYRAIGPLDRIVQAAGRCNREGKMPEKGRVVVFEPEQGSKPKGDYETAAKRAEGILKSPELDLHNPDTFETYFKVLYKDVKLDQLDIQKKRTNFNYPEVAKNFKFIKDDTTPVVIQFDDRVRKHLKQIQRRDLNSGDYRKLQPYLVNLRQNDFKGTEALREEIAPGLWVWERLSYDELKGIKIGDRSIDFDPADLVQ >NC_019701.1|WP_015164987.1|2196514_2198017_-|DASH-family-cryptochrome MSPQRIIIWYRNDLRIHDHEPLWTVAKAGAIAIPIYCFDPRQFATTKYGFAKTGAFRAQFLTESVLDLRDRLRQLGSDLIVRYGEPEQILPELAQKLNANANAIYYHQEVTSEETKVEAAIAQDLAATDIKLQAFWGHTLYHRDDLPFSMERIPAIFTKFRKQVEQEATINPALPMPTELISFNDLNDLNEIDAPLDPGEIPSLAQLGLEPIAPDDRAAITFTGGEGAAIARLDQYFWQNDCLRTYKQTRNGMLGADYSSKFSPWLAHGCISPRYIFEQVQKYEQDRVANDSTYWLVFELIWRDYFRFIAAKHGDRLFYKSGLQNLDLPWKKDSTRFAQWCEGKTGFPLIDANMRELAATGFMSNRGRQNVASFLTKNLGIDWRIGAAWFESLLIDYDVCSNWGNWNYSAGVGNDARGFRFFNTTKQARDYDRQGDYAKHWLPELAKIPASKVHEPWLLSPAEQKQYGVRLGVDYPQPIVDLFKSAQANQKLYEMALSHQ >NC_019701.1|WP_015164995.1|2214660_2215803_+|LD-carboxypeptidase MDQQVSRRSLGKGFLGGLGVGLSTIWACRSAGLSGNQAIAATTDKSAKDNQKSSPSKVSKSIIKPPMLSPGDRVGMVAPASDAYEPEEIQIAKETMELYGFEVVLAKHIGDRYGYLAGKDRDRAADINEMFGREDIKGLVTFSGGYGCSRLLPLLDYDLIRQNPKVIVGHSDITALLMGIYAQTGLVTFHGSSGLTGVGEYARSHFRRAIMNKATIGEVAKPPATSAKTVKRNHRLVTISPGQATGQLIGGNLTLVTNLVGSPYFPDLKGKILFLEDVGEEPYRIDRMLTQLWLSGKLEDAAGIALGHFSNCYPKEYQASFFNTLSLEEVLRDRFEPLGIPTLYNLMFGHVGENAVLPLGTEATLDATAQTLTINENAVI >NC_019701.1|WP_015164996.1|2215917_2216208_+|DUF1232-domain-containing-protein MRSLFSLYFRLFRSSRFRWIAILASLVYILSPFDLSPDLMPILGRVDDLVVIVLMLAGLIQNLFIKSSDDEDESDRGDLGGDKDVETIDVDSVTLP >NC_019701.1|WP_015164997.1|2216274_2216586_+|hypothetical-protein MHIRFAEVDEKFIKSQIEDGFYTNETELVRDAVRKMRETQERKAQFLAAVQLGMDQADRGETVAYSDDLMDQIAQRATARVAAGKPIKNPEAIGTSPKLEMDE >NC_019701.1|WP_015164998.1|2216667_2218020_-|type-IV-pilus-twitching-motility-protein-PilT MSQSGIPPLPPPPSGNPGDRGGAPTPPPRAQVPNQQARKVASQKTSVPNPSTRLDNATQRQQTASRIPQPGGALKPPPPGPPPSMPSIPLVVNRNPGQPSLEQLVRDAFEQGCSDLHLGVNEQVRFRQRGIMMIQEQYPVTDEQTFYAWMHEVMEEKLVQQFKETMEYDGAAQYEYCRCRINIFESLRGPALVMRIIPLKILTLDQLNLPEVFRELCYTHRGLILVTGPTGSGKSTTMAAMVDFINAEMAKNIISIEDPIEFVHKSKKSLVKQREVGIHTVKFDNALKASLREDPDIILIGEMRDRETVNTALKAGQTGHLVFGTLHTNSAIKTIERILNLYEPDQQGPMRDQLAETMVAVIAQTLVRTTDGKRAAVHEIMINTDAIRDYIKRNEVDEIESIIPKSTFDGMVSMNQSLYKLYEEGRITEETAVENSPKPNEMAQYLRGRL >NC_019701.1|WP_015164999.1|2218528_2219395_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MNILSSLRSQSRQSNHKAKSSANGKSGNSKPRPTKGIELKSKREQDFMRESARIVATVLKEMYEIAAPGVTTADLDAHAEKRIREMGAVPSFKGYHNFPASICSSINNEVVHGIPNPRKVIKPGDVVKIDTGAYKNGFHGDSCITIMIPPYDEKAALLVKVAEEALYKGIEQVKPGNHLLDIAGAIEDHVKANGFSIVEDFTGHGVGRNLHEEPSVFNFRTHQLPNVKLRAGMTLAIEPIVNAGSKNVRILSDRWTAVTVDRSLSAQFEHTVLITNDGYEILTDRHKV >NC_019701.1|WP_015165000.1|2219558_2221055_-|hypothetical-protein MPQPEINDRVGSAATNHSSPPSQEANGWYGAIAQPSNEFACQALPIIAGQIPTGLRGSFYRNGPGRIGRGGIPVGHWFDGDGAILAVHFDRGGAQGTYRYVQTEGYLAEQQVGKLLFANYGMVAPIPWWQRFLNTDLKNCANTSVLALPDRLLALWEGGSPYALDLKTLATIGADDLDATLPNIPYSAHPKQDPVTGEIFNFGITYRGTTALNIFKSDRHGKIIQRKAIPLRGICPVHDFVLAGKYLLFCIPPVRLDVLPVLLKTKSYSESLRWQPQQGTQILVVDRNNLEIVSRSQVDAWYQWHFGNGYTDRDGNIMFDLVRYDDLATNQYLQEVITGNPQTKAVGELWQGRLQPETGKMLTMQRVSDRICEFPRINPHQVGQPHRHVYLAIHRRGVNTVKETFGAIGSFDYASATMHEADFGAGKYVSEPVYAPDVHNPEQGWLLITVYDATAHQSEVWVMDAQHLDNAEPVCRLALPEVVPLAFHSTWKPEQPEQ >NC_019701.1|WP_015165001.1|2221259_2221445_-|hypothetical-protein MKTEPIYLSKSEKEKLMQINDLIRECRHLLVESAQYPDAVAFLSDVRDILKQHRVKPSQAS >NC_019701.1|WP_156800489.1|2222061_2223045_+|2-carboxy-1,4-naphthoquinone-phytyltransferase MEANRSQIDQPQSLSANSTPKSQRKLWLAAIKPPMYSVAIMPIVVGTAIAFYQTQQLNWRNFLTFMFAAILVLAWENLSNDVFDSETGIDQNKAHSVVNLTGNKNLVFAIANLFLLLGISGVVAISWWQRDFVVLGIVVLTCLLGYSYQGPPLRLGYLGWGEPICFICFGPLAIMAAYYSQTNAFLINSINSSAQNLAALAAAAIIVGVGVTLVLFCSHFHQVEDDIKAGKRSPVVRLGSKRAAQLIPWAAVSIYATTIVSMISGFLPLWSGLVLLSAPFAWKLSSLLGKYHDQPAMITESKYVAVLLQFSSGLGLSVGLVIARLLN >NC_019701.1|WP_015165003.1|2223225_2226540_-|translation-initiation-factor-IF-2 MSISRVRVYELKRELDLETKEILGICDRLGIPVKSHSSTITEAEADRIRNFAQNRDQSAKLDKSEPEVAEPVSSANKESSTASASKQEILINTVSRPATIKQLQKPTAAEPPAPSRPVVVEPSPQEQAEPAVAATKPSKKNSKATTNTKGTAQNTDNGAIAKAPTSSSSAQLKQPPARPAESAGEVVEISEIAPANDQPELAKPPAAKAKSKAAQEAAPAANTASNAASKAEQNKAEQKPEATLAKKPELIKPVPRSTAIEQPAQTAAIAGNSSSSTSSTSSANPVSPTSSGKKASKTSKPGKSAEPDKTTISVGSAPKNNREQPARPQLHRPKPVKDAVLIERGITAPTEPKPQQILQPPVRPTAKPVAKDDEATETDGAEIAAKPPGLELAAPPERPIKLSRVAAKVNKRGKTKREEEEEEDTEVRAKKPNRLKRYKVIEDDIDDIDDDLENGDLDDASNLSTARPTARPPKPKQARSTGAENKPIPAKPSRKPARDRRSSQPEKQIEKPELIELSDSVTVQELADQMLVSETEVIRTLFMKGVMVNINQTLDVPTARMVAEELGYEVEEIETDAPARKITEMIDLEDIESLVRRPPVVTIMGHVDHGKTTLLDSIRESKVAQGEAGGITQHIGAYHVDVEHEDGVKQVVFLDTPGHEAFTAMRARGARVTDIAILVVAADDGVQPQTIEAISHAKAANVPIVVAINKVDKPEAQPDRIRQELTEYGLVDEEWGGETIMVPVSAIEGSNLDTLLEMILLVAEIEDLQANPDRTARGTIIEAHLDKARGPVATFLVQNGTLRVGDVFVAGSVFGKVRAMIDDRGERVDAADPSFAVEVLGLNEVPAAGDEFQVYLEEKKARSLASDRAEQQRQSRLQQTMSSRRVTLGTVSAQAQEGELKELNLILKADVQGSVEAILGSLEQLPQEEVQIRVLLSAPGEITENDVELAAASDAVIIGFNTSMATGARQAADNLGVDVRDYDVIYKLLEDIRDAMEGLLEPELVEEHLGQAEVRALFTVGKGVVAGCYVQSGKLIRNCKVRVLRKGEVITTGSLDSLKRMREDAKEVASGFECGVGIDRFASWQEGDIVDAYRMVTKRRTLKS >NC_019701.1|WP_015165004.1|2227197_2229012_+|elongation-factor-4 MTEVPASRIRNFSIIAHIDHGKSTLADRLLQVTGTVADREMKEQFLDTLDLERERGITIKLQAARMNYTAKDGQEYVLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDASQGVEAQTMANVYLALENDLEIIPVLNKIDLPGAEPDRVAEEIEQVIGLDCSEAILASAKEGIGVNEILEAIVAQVPPPADTTEEPLRALIFDSYYDPYRGVIVYFRVMDGNLKKGDRVKFMASGQEYDIDEIGVLSPVQIQVDQLHAGEVGYLAAAIKTVEHARVGDTITLANHPATKPLPGYVEAKPMVFCGMFPIDADQFEDLREALEKFKLNDAALNYEPETSSAMGFGFRCGFLGLLHMEIVQERLEREYNLNLIITAPSVVYQVTTNKDEVLLIDNPSELPPPMLREKIEEPYVRLDMMTPQEHIGALMELCETRRGDFKDMKYITQDRASLIYEIPLAEIVTDFFNQMKSRTKGYASMEYHIIGYRPNDLVKLDILVNEEPVDSLACIVHRDKAYQMGRGLVSKLKQLIPRQQFKIPVQAAIGSKVLSRENIPALRKNVLSKCYGGDISRKKKLLEKQKEGKKRMKAIGTVEVPQEAFMAILKLNQDS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019701_4 | 3090389-3091347 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019701_4
|
12 spacers
spacers of NC_019701_4
>4.1|3090424|39|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT CTCGTTTCAGCCCTCGTACATTGCAACAGATGTTCCCCA >4.2|3090498|40|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCCGACGAACACCCTATGGCCGTCAAAGCGGTTAACAAG >4.3|3090573|46|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGCTGAACAGGGCTGGTGTGTTGTTGGTGACCAGAACGACGGTG >4.4|3090654|39|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGAAGCAATATCATCATTAACAGACATTGATGCATATA >4.5|3090728|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCCACCCCTCAGGTGGAGTTGGTTAGCTTCAGGCCA >4.6|3090800|49|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCACATGGCAGCTAATTTTGCTATTGAGCTTGCAACTCCAGCAGGCAA >4.7|3090884|40|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTTTGCTTTAAAATTTTACTCACCGATCTTGTTTTTCG >4.8|3090959|46|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCAAAGCGAATGGAACAAGCTGCGCAACACGTGGCTCGACCATGT >4.9|3091040|44|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGACCGAATTGGCCCATCTGCTTCTAGCGCAGTTGATCAGACAA >4.10|3091119|40|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAGTCTTGGTCTGTCCAAATCTGAGATACAGGCCGAAAA >4.11|3091194|39|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCTATCAAGATGCTTTCTGGATCGAACTGACTGGTCGT >4.12|3091268|45|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTGACGATGACCAATATCATGTAAAACATTCCAACAGAGACGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019701_4
The CRISPR arrays of NC_019701_4 >merge|NC_019701|4|3090389-3091347|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGGTTGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGCTCGTTTCAGCCCTCGTACATTGCAACAGATGTTCCCCAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGACCCGACGAACACCCTATGGCCGTCAAAGCGGTTAACAAGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGCTTGCTGAACAGGGCTGGTGTGTTGTTGGTGACCAGAACGACGGTGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGTTGAAGCAATATCATCATTAACAGACATTGATGCATATAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGCCCCACCCCTCAGGTGGAGTTGGTTAGCTTCAGGCCAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGTCCACATGGCAGCTAATTTTGCTATTGAGCTTGCAACTCCAGCAGGCAAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGTCTTTTGCTTTAAAATTTTACTCACCGATCTTGTTTTTCGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAGTTCAAAGCGAATGGAACAAGCTGCGCAACACGTGGCTCGACCATGTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAGAGACCGAATTGGCCCATCTGCTTCTAGCGCAGTTGATCAGACAAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAGCCAGTCTTGGTCTGTCCAAATCTGAGATACAGGCCGAAAAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAGAGCTATCAAGATGCTTTCTGGATCGAACTGACTGGTCGTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAGTCTGACGATGACCAATATCATGTAAAACATTCCAACAGAGACGGTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG >NC_019701|4|4|3090389-3091347|CRISPRCasFinder GTGGTTGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CTCGTTTCAGCCCTCGTACATTGCAACAGATGTTCCCCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG ACCCGACGAACACCCTATGGCCGTCAAAGCGGTTAACAAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CTTGCTGAACAGGGCTGGTGTGTTGTTGGTGACCAGAACGACGGTG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTGAAGCAATATCATCATTAACAGACATTGATGCATATA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CCCCACCCCTCAGGTGGAGTTGGTTAGCTTCAGGCCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TCCACATGGCAGCTAATTTTGCTATTGAGCTTGCAACTCCAGCAGGCAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TCTTTTGCTTTAAAATTTTACTCACCGATCTTGTTTTTCG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG TTCAAAGCGAATGGAACAAGCTGCGCAACACGTGGCTCGACCATGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG AGACCGAATTGGCCCATCTGCTTCTAGCGCAGTTGATCAGACAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG CCAGTCTTGGTCTGTCCAAATCTGAGATACAGGCCGAAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG AGCTATCAAGATGCTTTCTGGATCGAACTGACTGGTCGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG TCTGACGATGACCAATATCATGTAAAACATTCCAACAGAGACGGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG >NC_019701|4|4|3090389-3091347|CRT GTGGTTGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CTCGTTTCAGCCCTCGTACATTGCAACAGATGTTCCCCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG ACCCGACGAACACCCTATGGCCGTCAAAGCGGTTAACAAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CTTGCTGAACAGGGCTGGTGTGTTGTTGGTGACCAGAACGACGGTG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTGAAGCAATATCATCATTAACAGACATTGATGCATATA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CCCCACCCCTCAGGTGGAGTTGGTTAGCTTCAGGCCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TCCACATGGCAGCTAATTTTGCTATTGAGCTTGCAACTCCAGCAGGCAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TCTTTTGCTTTAAAATTTTACTCACCGATCTTGTTTTTCG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG TTCAAAGCGAATGGAACAAGCTGCGCAACACGTGGCTCGACCATGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG AGACCGAATTGGCCCATCTGCTTCTAGCGCAGTTGATCAGACAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG CCAGTCTTGGTCTGTCCAAATCTGAGATACAGGCCGAAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG AGCTATCAAGATGCTTTCTGGATCGAACTGACTGGTCGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG TCTGACGATGACCAATATCATGTAAAACATTCCAACAGAGACGGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG >NC_019701|4|5|3090463-3091347|PILER-CR GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG ACCCGACGAACACCCTATGGCCGTCAAAGCGGTTAACAAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CTTGCTGAACAGGGCTGGTGTGTTGTTGGTGACCAGAACGACGGTG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTGAAGCAATATCATCATTAACAGACATTGATGCATATA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CCCCACCCCTCAGGTGGAGTTGGTTAGCTTCAGGCCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TCCACATGGCAGCTAATTTTGCTATTGAGCTTGCAACTCCAGCAGGCAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TCTTTTGCTTTAAAATTTTACTCACCGATCTTGTTTTTCG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG TTCAAAGCGAATGGAACAAGCTGCGCAACACGTGGCTCGACCATGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG AGACCGAATTGGCCCATCTGCTTCTAGCGCAGTTGATCAGACAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG CCAGTCTTGGTCTGTCCAAATCTGAGATACAGGCCGAAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG AGCTATCAAGATGCTTTCTGGATCGAACTGACTGGTCGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG TCTGACGATGACCAATATCATGTAAAACATTCCAACAGAGACGGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGGTTTGAAAG
>NC_019701.1|WP_015165669.1|3089278_3090346_-|M20/M25/M40-family-metallo-hydrolase MEELLRPDRLYDLISELVMCHSPSGAEAEIDRYLLAQFANLELEHWQDAAGNIVAKIPGPKNNPASNSAIAITAHKDEIGAIVKSINQYGQIEIGKLDGSFPWVYGEGIVDLLGDRETISAVLSFGSRHISHRSPQKELQTSKALSWDDAWLETKASPQKLAAAGIRPGTRMVISKHRKQPFRLSEDYVASYTLDNKASLAILLTLAEVIGQTNGQPKTDVYLLASANEEVGAIGAMYFSNQRSLDALIALEIIPLSCEYPIEDNDAPVLLSQDAYGVYDENLNRGIAQIAQDHKLALQFAVLNSFGSDGSIAMKFGHVPRAACLGFPTENTHGYEIAHLGAIANCIRLLYAYLK >NC_019701.1|WP_015165668.1|3088471_3089185_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MPAINYEIPKPQSSPDWEKLIAATRKRFDKEYKQESFDLPDEIEAMPLFREWVGHTLSSRTSSPFWEIAQFKKNLHCLDIGCGVSFLIYPWNDWNVYFHGLEISTVARDALNSRGSQLNSKLFKGVELGNAHQLPYENDSFDRAVATGFSCYYPIEYWQMVLQEAKRVLKPGGVLVFDAIDPNSEIAENWAILETYLGAEVFLTPLKEFEAIAANIGRISTQREGELFKMYRLTMPK >NC_019701.1|WP_015165667.1|3087622_3088423_+|3',5'-cyclic-AMP-phosphodiesterase MTGTPQITIAQITDIHLFDDSGLTLKGIDTNSSFQAVLAAIANLEQQPDLLLVTGDLTQDGLNHSYQRLHHELSHLSIPAYCIPGNHDSAELVQNFLADMAAIDRRLVLGNWQILLLNSAVPGQVHGHLADATLQWLECQLEANPDLNTLIALHHPALAIDSEWMDMISLQNRDQFWQICDRYPQIKAVIAGHAHQDIDAFWQGKGSQQIRHLVTPSTCVQFAPQKNCFALDYERSPGFRLLYLYGDGRVETEVKRLPQGKFVPTR >NC_019701.1|WP_015165666.1|3086910_3087147_+|hypothetical-protein MEEKAGKCRHCGEIEVRRSRRRYIYDYPLSWVGIYPYRCAFCVVRCYKLGRDRYVAESIKSSVQLVKPNQPVSQAVDG >NC_019701.1|WP_015165665.1|3085603_3086611_-|phosphate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MAQKNNETIVLVASLAVTVGLLGAGYWFVRGRDGGDSIVVESSDPTEPTTSEPSSNSNNNQSNGDAPASASLASIEATLPNPNLLQIDGSTTMVALMQNLNNAYAQANPSIPAIYGQPANNPNGSSGGIRNLINGTVDLAASSRPLKPEEATANLQVVAIAKDAVAVVVSASNPYRGGLTMSQLRQIYEGRITNWSEVGGPNVPIKVINRAQASGTRDLFQNVVLLSQSFAPDSANFITWPQDETTAIIRELGNNGISYATVSQVANQSTVRIMPIDDSLPTDINAIRNNTYPISRNIFLITTKQTSPAVKEFIELALSPQGQQLATNNGFIPIN >NC_019701.1|WP_015165664.1|3084516_3085476_-|aldo/keto-reductase MQKVKLGNSNVEVSAIGVGTWAWGDTLFWKYGSDYGEVEVKKAFSASLDAGVTLFDTAEVYGLGKSEELLGQFMKAIAPRVPRSQIKIATKYMPVPWRLGKQAVKDAVAKSLERLQVESIDLYQIHQPFTFLMGQETLLNALADEVKAGRIKALGVSNFSADQMRKAHETLAKRKIPLTVNQVQYSLIAKKVETNGTLDAAEELGVTILAYSPLAQGVLSGKYTSTNPPKGARQLDPKFGSDGITKVQPLLRVLADLAEVYDATMAQVAINWLAAQQNVIPIPGAKNAKQAQENAAALEFKLVPEEITQLDRVSDECTR >NC_019701.1|WP_156800515.1|3083029_3084409_-|chloride-channel-protein MQDISHAKTTDDHDQHRQLNFNHTQLVLCAAAIGIFGGLVATIYYFVLETMMDQVWHVLPELIEPYFPPWLPTNNYVWIATTIGGVAVGIAIYLLGCPGEMAQVVDRIHQPGKIDISKTPAMVIASLLAITAGGSAGPEAPLVQVNGSFGSWLGDRLKLSIGSVRVLTFCGMSAALGAFFGAPIGAALFALEIPHRRGLEYYEAIAPAVISAIFSFAIFRISTGITIGGIYHFESVPSLTPMNLLEGLLLGIVGAAIAVLFIYIFRAVGYLFQFIEHDQILSATLGGLAIGLIALFLPQTLFFSEAQIHDVIETGMTLGVSMLLLIAVAKMLAISFTLHSGFLGGFIFPLFFIGANVGLAIALAVPQIHPTVGMICLMAAMNVAVTKTPISSSIILSVLSDTAMLPVIVIASFVSFLLTAQIAMISTQRSRGSDEQAIPVWLHNSTVDTISAVDNEGIG >NC_019701.1|WP_015165662.1|3082158_3082896_+|7-cyano-7-deazaguanine-synthase-QueC MSSNNLHVDRSELNEPKVAKPKAVVLLSGGLDSATAAAQAIAAGYEPIALSFNYGQRHKRELQSAQVVAKQLGITEHHVIDVNLSLWGSSSLTDKSMHLPIEGLQDNVIPSTYVPGRNTVFIAIALSLAEARSAKAIYLGINAVDYSGYPDCRPDYLEAYQNLAALSSKAALEGNGIELVAPLVMDSKVDIVKKAIALGVPIAATWSCYQGGTEPCGVCDSCRIRDQALSEAGYPELASAVSKGN >NC_019701.1|WP_015165661.1|3081352_3082015_+|7-carboxy-7-deazaguanine-synthase-QueE MPRIKNLQLTQSNQSPQLTASTATTYPIVETFHSIQGEGAWFGSSAYFIRLGGCDVKCWFCDTKESWDASSHPRQTVTDLVRQVEKAKPAIVVITGGEPLMHDLRPITKALQKLDVRVHLETSGAHPLSGEFDWITLSPKTFKPPVANIYIHIHELKVVVAKQQDLGWAERQADLVPTTAIKYLQPEWNSVNANKLIFDYVRQNSQWRMSLQTHKLLGVR >NC_019701.1|WP_015165660.1|3080191_3080911_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MANPEQLDIIAQGVQIWNLWRNDHPDTKIDLSAADLGAINLQQAILAKANLAGINLSGANLSGSDLQGSALDGANLVGAKIKDAKLVGASLGEADLGKADLGGADLKGADLRKARLFDADLSGSSLRMANLWQAHLHQVNLTDANLSDAYLGEADLTRANLERANLSNADLNGANLLAAILCGAKLNQANFVGANLTNADLEKAIALATNFQGANLTNASCKNWSINSDTLLDNIDLAP >NC_019701.1|WP_041698452.1|3091562_3091751_-|hypothetical-protein MSFQLKPLGAMLRLNLINLTGLSYWAIAAGWAGLCAALWDGIVGCKFKLSWGRSLDFCGGFQ >NC_019701.1|WP_015165670.1|3091774_3093238_+|MFS-transporter MSQGTTSQSTASEQLAKPLSFSTKLAYGAGDLGTAITANILAFFLLYFFTNVAGMRPDLAGSVLLIAKVSDAINDPIVGVLSDRTNSRWGRRHPWMVAGALPFGVFFVMQWLVPTSNQWGLFFYYVAIAVLFNLFYTVVNLPYTAMTPELTQDYNERTSLNSFRFAFSIGGSIVSLLVAGMLLDRNRIPDQRLAYMLLGLFCAVVSVIAILWCVIGTRKRMALAEGERSSFKTVTPIPIRQQLKIVLSNRPFLYVIGIYFCSWLALQITASIIPFFVVNWMKMPEKQISLVSIGVQGTALLMLFVWSFVSNRYGKKAAYFMGMVLWIIAQAGLFLLQPGQVILLYILAIVAGIGVSVAYLIPWSMVPDVIELDELNTGQRREGIFYAFMVFLQKMGLAVGLWFLGIGLQLAGFQKQIPDEAVQPDSALMAIRIAIGPLPTIALILGLVLAYFYPITKEFHAQIMLQLHEKRLAEAGETIEGLEREDS >NC_019701.1|WP_015165671.1|3093256_3094219_-|prephenate-dehydratase MTTVAYLGPAGTYTEAAAISFLKLRGWPQDYVHLQPYATISKAMAAVATGESLVAVVPVENSIQGSVTMTLDSLWQWEQLQIQQALVLPIRHALITQAPEKAAIKTVYSHPQALAQCQNWVGENLPQVQQIPAHSTADGLRLVAEDGTGTAAAIASQRAAAMYNLPIMACPINDYPDNYTRFLVLSLDRSANTGTNQTKQSELTGDSGDLDQVNNDLSKQDPIANNEHISLAFSVKANMPGVLVRPLSVFANRNINLSRIESRPTKKSLGDYIFFADIEASIAEKHVQEAIAELESLCETLKIFGSYGIEKVAIDNIEDI >NC_019701.1|WP_041698453.1|3094313_3096200_-|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MNKSLNGSRYKSLGRRLQTLLIGVLACQGAIALAPSTLAAQEGEPKQMEYSEFVQQVQNDQVESVDIDSDQLRIEAELKGDRQVIVDLPTQDTKIIQQLRENDVDINVLEPSQDAAFRQFAGSFIFIGALILLLIIAMRRVSNSPGGPSQALSFGKSRARFSPEAKTGVIFDDVAGVESAKEELQEVVTFLKYPEKFTAVGAKIPKGVLLVGPPGTGKTLLARAIAGEAGVPFFSLSGSEFVEMFVGVGASRVRDLFHRAKENAPCIVFIDEIDAVGRQRGTGIGGGNDEREQTLNQLLSEMDGFQGNTGVIIIAATNRPDVLDRALLRPGRFDRQIIVDYPTYQGRLDILKVHARNKRIDEAVSLEATARRTPGFAGADLANLLNEAAILTARRRKEAITQNEILDAIDRVRSGLTLKPLLNNAKKIQIAYHEIGHALLFTLLEHSYPLDKVTVIPRSTGAAGFAAPIPPEELGLETRAEMLDLVTVTLGGRAIEEVVFGDAQVSIGARSDFQMVAKRVRAMVTRFGMSDLGLVALEGQDSQVFLGRDSMPKAEYSEEVASRIDREIRHIVKQCYDRAKKIISENRQLCDYLVDTLIELETIEGDEFRQIVSQYTEVPEKQVETVKL >NC_019701.1|WP_015165673.1|3096419_3097310_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MTANNPSQSFSANEFLEALDQHNYEFGVGQIISGKIISHARDGVYVDVGGKSPAFLPADEAMLESDTDLVTSLPLDSEHEFLIISEQNAEGEVKLSIRRMLIQKAWQQMQAYQAEETIFDCVVLHTNKGGVVVNAAGLRGFIPRSHLTVKDNLESLIGKTLPVSVIEINEPTNRLVLSNTNAVRTSVMGNLAKGQLVAGTVSGIRPFGVFLNFDGVSGLLHIKEISQARVNDINAVFAIGDPVPAVIIDIDESRNRISLSTKLLENHSGELLENTAQVFAEAPERLEKNIQKLWNT >NC_019701.1|WP_015165674.1|3097355_3098588_+|hypothetical-protein MEILCISNGHGEDIVAARICIELEKLGVSAMALPLVGNGHAYQPQIPIVTEAMGGAIQKMPSGGFVRMDNKQLRRDLQNGLAQLTWKQLQVVWQWSRRRSGDRRLILAVGDIVPLLFAWLPTWWWGCDYVFVATAKSEYYWRDRQGKLPGLKPPFGGSFFYPWERWLMGSRHCRANFVRDTLTEKWLNQKYRLPALYLGNPMMDGLEPKGLDFGLREDDWAIAILPGSRAPEAYENWSTLMVAAEITAKVMPHRATFLAAITSSLELDKFIEIAIQRGWQRIDELNYRFSQARLRLVQGGFGDCIHRAHLGLAMAGTATEQMVGLGKPVITFVGRGPQFTAKFAREQVRLLGSSVICLEKPNQIEVVLQKILNDPDYFQEVHDNAIERMGKAGASARIAKYLAEQVLSQS >NC_019701.1|WP_015165675.1|3098625_3099243_-|Uma2-family-endonuclease MKAEIFPAQSHLNPIAEQRLILPKIYSWQQFETLEQLTKATGLRLSYLDGWIEFMTVGEEHEYLKTMLGFLLESYLVAIGIDFVPAGSATRRDQALGVSFEPDESYYLTEAKGQPDLAIEIIISSGSPAKLDKYAKFAIPEVWFWQNSQIMVYQWQGENADDGYELSDRSGLLPELDLNLLTSCMQMDSRIRAVQTLLAGVEGKS >NC_019701.1|WP_015165676.1|3099546_3100101_+|Uma2-family-endonuclease MVQAKPRLSLTEFLALPQTDVPCELVSGVVVPKMSPKYFHSALTTALWSLISQSCADKGRVAVEWAVVLTRQGEDWVPVPDLLYVSYDHLAADWLRDEPCPVAPELVIEIISQGQAFRQLLEKAADYLNAGVDRVWIVDPASRSISVLFGDRPPQTYMGVEMVSDPLLADVQLSCDRLFQLAGI >NC_019701.1|WP_015165677.1|3100107_3101220_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MKTTTLAVSILSMFFGFVGFGLTAGAENIEDVRQFIQTKKCPGCALSFFFSNGDHTQNYRWYEPSLITYAYNFLEPASYVVKFRDSVDDTSDIDIDFSQANLSKADLYGATLLFNFTNANLSNADLRAAHLRGRFEGADFSGADLRNALLSGNLKGANFNNANLSRAKFILRSLVEVIDLRGANLRNADLSYVSISHADLRGADLRGANVDFMKVSIPFVHPEKGFVAIGMLTIDENTLLPPKLSILYEIAREGGVGKDLSNLDLSNSYLGMLDLRGADLSGSNLSNSILHSSDLGGANLQNANLSGANLVDANFKDANLDSAILDGVVWCAPEIVTFVPASEELALALATGKAQPELISINECTKTNIK >NC_019701.1|WP_083883834.1|3101414_3102728_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MVLNMPETQPPCRDCHWRSLIVAIASSPHHNLLFLLGLVFQSRACFVELAKQMKTTTLAVSILSMFFGFVGFGTAGAENIEDVRQFIQTKKCPGCDLSGFSPPEDLMFSWMSNQPFYYTMGGDKPYAKEFMEMAQISVSHAIDFGGADLRDANLNGAILRLNFESAKFTSAFLRAAHLKGNFNQADFRNADLSVAVIHGMFREANFSHANLNGVLVYVWTDFSKANLRGANLSFANLSSTDLSGADLRDAEIDGVILHSPKRDEIGASYMAKIDEATQMPPKLRQIYTIVKDGAVGRDLSNLDLSGAYLAGVDFSGANLSGTNLRNANLFGANFEGADLQNADFTRAILTKTNLQYANMVGANFNGAITYDANIKNSQVDYSAKINSYFWSDHSMTRSIWFDGCNVMLMPYEAIEFPCPPTSGESTVWTMPDDWESK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019701_5 | 3106132-3107207 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019701_5
|
14 spacers
spacers of NC_019701_5
>5.1|3106167|39|NC_019701|CRISPRCasFinder CTACCCAACCTTATTCATCCTGGCTTACCAAAGGTTCTT >5.2|3106241|38|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR TCCTCGAAGGTTTTACCCAAAACTCAGGAGCAAAAAGA >5.3|3106314|42|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR AATGCTATTTCTATTCACGCATTTAATTCAGTACAAAGAATT >5.4|3106391|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAACTAACGCGTGCAATGCATGTATCGGTTCTTGGGA >5.5|3106463|40|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAACTGGAAAAACTGTTGTTGTCCCAGAGGATTATTTGCA >5.6|3106538|39|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATGCACCAATTAATTTTGCTGTGTTGGATGAAACCGCCA >5.7|3106612|44|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTCCGCTATTTGTATAGCTGCGGTCTTTTTGGGGGCATGTTCA >5.8|3106691|39|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR CAGTATTTATAGAGGATCCAAAACAAGGAAGGAAAGAGG >5.9|3106765|38|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATACTCTGATTTATATGATCTCTATTTACATTACAAGT >5.10|3106838|35|NC_019701|CRISPRCasFinder,PILER-CR GCTTTGAAGTAGTTGGCGAATCCCTCAAAGGGATC >5.11|3106908|39|NC_019701|CRISPRCasFinder CTCAGTTTATACTTGGCCTTAAAGCTAAGGTAGCTGCAT >5.12|3106982|39|NC_019701|CRISPRCasFinder GGTCTACCCTGATGGTTGCTGGAGTACATGAGTGCTTCA >5.13|3107056|40|NC_019701|CRISPRCasFinder GTTTAGAAAGTGTTGCGAACACTTCTAACTCATCTACTTG >5.14|3107131|41|NC_019701|CRISPRCasFinder GGCTGCATGAGTGCGTTTAGCTACTTATATTATTAACCCCG >5.15|3106166|40|NC_019701|CRT GCTACCCAACCTTATTCATCCTGGCTTACCAAAGGTTCTT >5.16|3106240|39|NC_019701|CRT GTCCTCGAAGGTTTTACCCAAAACTCAGGAGCAAAAAGA >5.17|3106313|43|NC_019701|CRT GAATGCTATTTCTATTCACGCATTTAATTCAGTACAAAGAATT >5.18|3106390|38|NC_019701|CRT GGAACTAACGCGTGCAATGCATGTATCGGTTCTTGGGA >5.19|3106462|41|NC_019701|CRT GAAACTGGAAAAACTGTTGTTGTCCCAGAGGATTATTTGCA >5.20|3106537|40|NC_019701|CRT GATGCACCAATTAATTTTGCTGTGTTGGATGAAACCGCCA >5.21|3106611|45|NC_019701|CRT GTTTCCGCTATTTGTATAGCTGCGGTCTTTTTGGGGGCATGTTCA >5.22|3106690|40|NC_019701|CRT GCAGTATTTATAGAGGATCCAAAACAAGGAAGGAAAGAGG >5.23|3106764|39|NC_019701|CRT GATACTCTGATTTATATGATCTCTATTTACATTACAAGT >5.24|3106837|36|NC_019701|CRT GGCTTTGAAGTAGTTGGCGAATCCCTCAAAGGGATC >5.25|3106907|40|NC_019701|CRT GCTCAGTTTATACTTGGCCTTAAAGCTAAGGTAGCTGCAT >5.26|3106981|40|NC_019701|CRT AGGTCTACCCTGATGGTTGCTGGAGTACATGAGTGCTTCA >5.27|3107055|41|NC_019701|CRT AGTTTAGAAAGTGTTGCGAACACTTCTAACTCATCTACTTG >5.28|3107130|42|NC_019701|CRT AGGCTGCATGAGTGCGTTTAGCTACTTATATTATTAACCCCG >5.29|3106983|38|NC_019701|PILER-CR GTCTACCCTGATGGTTGCTGGAGTACATGAGTGCTTCA >5.30|3107057|39|NC_019701|PILER-CR TTTAGAAAGTGTTGCGAACACTTCTAACTCATCTACTTG >5.31|3107132|40|NC_019701|PILER-CR GCTGCATGAGTGCGTTTAGCTACTTATATTATTAACCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019701_5
The CRISPR arrays of NC_019701_5 >merge|NC_019701|5|3106132-3107207|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR TTTTTTGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGCTACCCAACCTTATTCATCCTGGCTTACCAAAGGTTCTTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGTCCTCGAAGGTTTTACCCAAAACTCAGGAGCAAAAAGAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGAATGCTATTTCTATTCACGCATTTAATTCAGTACAAAGAATTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGGAACTAACGCGTGCAATGCATGTATCGGTTCTTGGGAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGAAACTGGAAAAACTGTTGTTGTCCCAGAGGATTATTTGCAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGATGCACCAATTAATTTTGCTGTGTTGGATGAAACCGCCAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGTTTCCGCTATTTGTATAGCTGCGGTCTTTTTGGGGGCATGTTCAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGCAGTATTTATAGAGGATCCAAAACAAGGAAGGAAAGAGGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGATACTCTGATTTATATGATCTCTATTTACATTACAAGTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGGCTTTGAAGTAGTTGGCGAATCCCTCAAAGGGATCGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAGCTCAGTTTATACTTGGCCTTAAAGCTAAGGTAGCTGCATGTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAAGGTCTACCCTGATGGTTGCTGGAGTACATGAGTGCTTCAGTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAAGTTTAGAAAGTGTTGCGAACACTTCTAACTCATCTACTTGGTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAAGGCTGCATGAGTGCGTTTAGCTACTTATATTATTAACCCCGGTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAAG >NC_019701|5|5|3106132-3107206|CRISPRCasFinder TTTTTTGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG CTACCCAACCTTATTCATCCTGGCTTACCAAAGGTTCTT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG TCCTCGAAGGTTTTACCCAAAACTCAGGAGCAAAAAGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG AATGCTATTTCTATTCACGCATTTAATTCAGTACAAAGAATT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG GAACTAACGCGTGCAATGCATGTATCGGTTCTTGGGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG AAACTGGAAAAACTGTTGTTGTCCCAGAGGATTATTTGCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG ATGCACCAATTAATTTTGCTGTGTTGGATGAAACCGCCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG TTTCCGCTATTTGTATAGCTGCGGTCTTTTTGGGGGCATGTTCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG CAGTATTTATAGAGGATCCAAAACAAGGAAGGAAAGAGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG ATACTCTGATTTATATGATCTCTATTTACATTACAAGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG GCTTTGAAGTAGTTGGCGAATCCCTCAAAGGGATC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAAG CTCAGTTTATACTTGGCCTTAAAGCTAAGGTAGCTGCAT GTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAA GGTCTACCCTGATGGTTGCTGGAGTACATGAGTGCTTCA GTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAA GTTTAGAAAGTGTTGCGAACACTTCTAACTCATCTACTTG GTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAA GGCTGCATGAGTGCGTTTAGCTACTTATATTATTAACCCCG GTTTCAGTCCCCTTTCGGGGTAGTTGGGATGTCAA >NC_019701|5|5|3106132-3107205|CRT TTTTTTGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GCTACCCAACCTTATTCATCCTGGCTTACCAAAGGTTCTT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GTCCTCGAAGGTTTTACCCAAAACTCAGGAGCAAAAAGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GAATGCTATTTCTATTCACGCATTTAATTCAGTACAAAGAATT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GGAACTAACGCGTGCAATGCATGTATCGGTTCTTGGGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GAAACTGGAAAAACTGTTGTTGTCCCAGAGGATTATTTGCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GATGCACCAATTAATTTTGCTGTGTTGGATGAAACCGCCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GTTTCCGCTATTTGTATAGCTGCGGTCTTTTTGGGGGCATGTTCA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GCAGTATTTATAGAGGATCCAAAACAAGGAAGGAAAGAGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GATACTCTGATTTATATGATCTCTATTTACATTACAAGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA GGCTTTGAAGTAGTTGGCGAATCCCTCAAAGGGATC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAGTGGGTTTGAAA 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>NC_019701.1|WP_041699658.1|3104829_3105975_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLWLKENLFSSWHNTALTLISISFIAIAGTASINWVFNLADWEIIEVNFRLFLVGRYPSELYWRIWTVLGMVCFLGGASWGIWGRFSRNFAILTAVVAIGLAFIVPVEDFAPRVWTVVSGVMVFAGFFAGQALKGFKNISLALSITWFLSFFVTLWLVGGGLGLEQVRIDRWNGLLLTLIVAVVGIVLSFPFGVLFALGRQSKTMPIVKWFCTIYIEVIRGLPLIGILFFAKTMMPLIVPKEISIDAIVQVTIGFIVFTSAYLAENVRGGLQGTPRGQEEAARALGLNVPLSISLIVLPQALKAVIPAIVGQFISLFKDTALLGVLRILDFYGMARSILAQPEFTRNSPEGFIFIGLVYWVFCYAMSMGSQKLEKTLQTGR >NC_019701.1|WP_156800395.1|3104301_3104484_-|hypothetical-protein MLTKPVKPQLPTPRGHQDTDKDGIPDRHDPRPYGPWWQDPHRHLWPQPNGRTVRNPFTRW >NC_019701.1|WP_015165680.1|3103260_3104238_+|histone-deacetylase MDLPIVYHPNYVAPLPAGHRFPMPKFGLLRDQLIADRVATIDQFHAPEPPPQDWFELVHDPDYVDAYCNGTLDTKAQRRIGLPWSAGLALRTQTAIAGSILTTKLAIEHGLACNTAGGTHHAFPSFGSGFCIFNDLAIATKLVQQQNLAQRVLIVDLDVHQGDGTAFIFNAINQAQASLTNETNNWVKDARKTEVFTFSMHCQDNFPHRKQTSHLDVPLPVGMEDEDYLRTLASYLPDLLDQFKPDLVLYDAGVDTHIGDRLGKLALTNTGLFRREMQVLSTCVGQGYPVACVIGGGYAEDMRALVYRHTLLHRAASEVYHQYRL >NC_019701.1|WP_015165679.1|3102652_3103243_+|RdgB/HAM1-family-non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase MQSQQLVIASGNRGKVAEFRAYLAPLGWEILPKPEAIDVAETGETFIANAYLKAKQIAKATGTWALADDSGLEVNALGGAPGIYSARYGNSDQARIDRLLQELEGKADRSAQFVCAIAVADPSGKVVSEAIGICKGEIITEQRGDHGFGYDPVFYVPEQQRTFAEMTKPEKGKISHRAIALEILIPQLKQIWQQDH >NC_019701.1|WP_083883834.1|3101414_3102728_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MVLNMPETQPPCRDCHWRSLIVAIASSPHHNLLFLLGLVFQSRACFVELAKQMKTTTLAVSILSMFFGFVGFGTAGAENIEDVRQFIQTKKCPGCDLSGFSPPEDLMFSWMSNQPFYYTMGGDKPYAKEFMEMAQISVSHAIDFGGADLRDANLNGAILRLNFESAKFTSAFLRAAHLKGNFNQADFRNADLSVAVIHGMFREANFSHANLNGVLVYVWTDFSKANLRGANLSFANLSSTDLSGADLRDAEIDGVILHSPKRDEIGASYMAKIDEATQMPPKLRQIYTIVKDGAVGRDLSNLDLSGAYLAGVDFSGANLSGTNLRNANLFGANFEGADLQNADFTRAILTKTNLQYANMVGANFNGAITYDANIKNSQVDYSAKINSYFWSDHSMTRSIWFDGCNVMLMPYEAIEFPCPPTSGESTVWTMPDDWESK >NC_019701.1|WP_015165677.1|3100107_3101220_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MKTTTLAVSILSMFFGFVGFGLTAGAENIEDVRQFIQTKKCPGCALSFFFSNGDHTQNYRWYEPSLITYAYNFLEPASYVVKFRDSVDDTSDIDIDFSQANLSKADLYGATLLFNFTNANLSNADLRAAHLRGRFEGADFSGADLRNALLSGNLKGANFNNANLSRAKFILRSLVEVIDLRGANLRNADLSYVSISHADLRGADLRGANVDFMKVSIPFVHPEKGFVAIGMLTIDENTLLPPKLSILYEIAREGGVGKDLSNLDLSNSYLGMLDLRGADLSGSNLSNSILHSSDLGGANLQNANLSGANLVDANFKDANLDSAILDGVVWCAPEIVTFVPASEELALALATGKAQPELISINECTKTNIK >NC_019701.1|WP_015165676.1|3099546_3100101_+|Uma2-family-endonuclease MVQAKPRLSLTEFLALPQTDVPCELVSGVVVPKMSPKYFHSALTTALWSLISQSCADKGRVAVEWAVVLTRQGEDWVPVPDLLYVSYDHLAADWLRDEPCPVAPELVIEIISQGQAFRQLLEKAADYLNAGVDRVWIVDPASRSISVLFGDRPPQTYMGVEMVSDPLLADVQLSCDRLFQLAGI >NC_019701.1|WP_015165675.1|3098625_3099243_-|Uma2-family-endonuclease MKAEIFPAQSHLNPIAEQRLILPKIYSWQQFETLEQLTKATGLRLSYLDGWIEFMTVGEEHEYLKTMLGFLLESYLVAIGIDFVPAGSATRRDQALGVSFEPDESYYLTEAKGQPDLAIEIIISSGSPAKLDKYAKFAIPEVWFWQNSQIMVYQWQGENADDGYELSDRSGLLPELDLNLLTSCMQMDSRIRAVQTLLAGVEGKS >NC_019701.1|WP_015165674.1|3097355_3098588_+|hypothetical-protein MEILCISNGHGEDIVAARICIELEKLGVSAMALPLVGNGHAYQPQIPIVTEAMGGAIQKMPSGGFVRMDNKQLRRDLQNGLAQLTWKQLQVVWQWSRRRSGDRRLILAVGDIVPLLFAWLPTWWWGCDYVFVATAKSEYYWRDRQGKLPGLKPPFGGSFFYPWERWLMGSRHCRANFVRDTLTEKWLNQKYRLPALYLGNPMMDGLEPKGLDFGLREDDWAIAILPGSRAPEAYENWSTLMVAAEITAKVMPHRATFLAAITSSLELDKFIEIAIQRGWQRIDELNYRFSQARLRLVQGGFGDCIHRAHLGLAMAGTATEQMVGLGKPVITFVGRGPQFTAKFAREQVRLLGSSVICLEKPNQIEVVLQKILNDPDYFQEVHDNAIERMGKAGASARIAKYLAEQVLSQS >NC_019701.1|WP_015165673.1|3096419_3097310_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MTANNPSQSFSANEFLEALDQHNYEFGVGQIISGKIISHARDGVYVDVGGKSPAFLPADEAMLESDTDLVTSLPLDSEHEFLIISEQNAEGEVKLSIRRMLIQKAWQQMQAYQAEETIFDCVVLHTNKGGVVVNAAGLRGFIPRSHLTVKDNLESLIGKTLPVSVIEINEPTNRLVLSNTNAVRTSVMGNLAKGQLVAGTVSGIRPFGVFLNFDGVSGLLHIKEISQARVNDINAVFAIGDPVPAVIIDIDESRNRISLSTKLLENHSGELLENTAQVFAEAPERLEKNIQKLWNT >NC_019701.1|WP_015165683.1|3107489_3108551_-|ArsA-family-ATPase MSLILTFLGKGGVGKTTTAIATARAYASQGKRVLLVGQQVGNSLAQMLETELDCDPKQVQANLMAVNLVSTTLIERYWEQMRSLENQYLRTPFFKEVYGQELGILPGMDAALGLAWLRDREAEGNYDLIIYDGMGDMYALRMLGMPEILSWYLRRFRDAISVSSLGKALSPFVEPVLRSVLHVSSTEDFNKQAGEATDILSQGREAVKDADRVAAYLVTTADPIAVDVAKYLWGSAQQVGLTVAGVFGRGEFDATEFAPLPVETLADRPGELIIPDHMSPRLATPSFSIDVAAKLVKLYLPTFDKKQVKLIQSGPEITIEAGDQRHNLFLPPELAGKQATGAKFQDSHLLIYF >NC_019701.1|WP_015165684.1|3108757_3109132_-|HU-family-DNA-binding-protein MADLNRQDLIKGMMAEVDGLTYSMAAASLEAFLTCVSRALGDRQSVVIKNFGKFTVRDRKARRGMHPHSHKPIEIPAVSIPHFAPSPTLKQLVNQDRQQSKSGGKLLKPSSHSNISDRYPQDQL >NC_019701.1|WP_015165685.1|3109255_3109465_-|DUF2862-domain-containing-protein MQSSNSFKIGQRVRIQGFREGVNQDMASKQGEVGTIAEPKIVDGGMGYVVEFNDSQSAWFFAEELEVAG >NC_019701.1|WP_015165686.1|3109684_3110464_+|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MTVTTANLQTFKERGQPITALTATEYAIAKLIDRAGVDLILVGDSLAMVALGHKNTLPVTLDQMIHHAQAVGRAVENALLVVDLPFMSYQESDEQALRSAGRVIKETQAQALKLEGGYPDMVDRVSRIVQVGIPVMGHIGLTPQAVHRLGFRKQGIDEAAAAEIFKQAEALVEVGVFALLLEHMPVELAGKITQAVPIPTIGIGAGDACDGQILVTHDLLGLSAWQPPFAPKYIDLSTIITTILQKYCQDVQDHNFPTN >NC_019701.1|WP_156800396.1|3110460_3110709_-|hypothetical-protein MSELETFICCDGSNVTKVYLGVIRIKIYWLGIFTYTWGVATKNNCCSLYGLWVCYDRWDQPAARDLADVVAIALWLKPCLPN >NC_019701.1|WP_015165687.1|3110810_3111314_+|Orange-carotenoid-binding-protein MANISNYNSTIFPAIAVGNDVELATAQYKTLSTDDKLGLLWIAYTEIGRSITPAAPGAARLELAAGLLDQIKQMSYDEQLQTMRDLVEKRNTPVTRAYGVFTTNTKLGFWYVLAQLMDQKIVVPVPAGYQLSRDAKKAFETITLLEMSQQITVLRNAAAEMGVDPLF >NC_019701.1|WP_041699662.1|3111559_3111964_+|nuclear-transport-factor-2 MQTRQISIAGIDEPNVIAYFQTLANQDFEATASLFAPDGELCPPFEDGVVGKVAIANYLAQEAIGIKPNPKEGFAEYFADGTVHLKITGRVELPWCAVNVAWRFALDRNRQITCVAIDLLATMQELLKFRNNRG >NC_019701.1|WP_015165689.1|3112350_3113640_+|hypothetical-protein MAVLQPKSRQLERSQQRIYDYLMRVVRRWPPEKVLMAFGDLFINYECVGDSAAWQALGEVIDANNEQEFIYTLQRSCFILINFWNVTSNYCYGQRLVTLLADTAVYQHTNLPKLTTLRRWVQRFVVSGNYLKLKTLATRHIAVRARWCDRYSAYLLTSQYANLNNPLEQRQIAGMLSHSIKSQFRFDLAMYTVRVNRPIGGKYAPPANPTCLGDDVLSLIRLVLGSHYGFNYRNRANIFMRLNSGITFGQFKANFEQFLKFSYDDSDAVTAYWRVVEMLYNSFPSCDDRRVDADLMRRTCDRVVRAMILGEDYNTPSDLIKVLLQHGHPLAMVIPLLKIVLISPDSRTCIETCLAELIKHYSQFAEDECRPLIDFLEILRVTLTIYTEDTNYNLLKMNSNGNGSSSNGHSISGSADYRIFSQARLPSKA >NC_019701.1|WP_041699666.1|3113664_3114633_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MENLDPFSQIIGQTSAVDLLKAAIKRDRIAPAYLFAGTPGIGRALTATAFATILIQDHKSTHRIHDRNHPDLLWVEPTYLDRGKLLTASQAAEQGLKRRAAPQIRLEQVRSIAEFLSKPPLESQRSIVVIEDAHTMAEAAANGLLKTLEEPGHGTIILIAPAAGNLLPTIVSRCQLIPFYRLSVAQVQLVLGKLGYSDLQLQILDLAQGSPGTALMAIDKLAEIPDEILEALEQIPAQPIAALTTAKQIAKDLDIETQLWLIEYLQNYFWRLYQGRSLHLPQIIQCLEQAHKLLNGYVQPRLVWEVTFLKMTDLRSGRLAIV >NC_019701.1|WP_015165691.1|3114872_3115085_+|hypothetical-protein MTTRRTDSAFPLSHNKESEEIINGLTKRELFSVMLMQSLTSSDIQFEDIYQKARMAVMEADALIAILDSE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019701_6 | 3411179-3412685 | Orphan |
N:A
Consensus repeat of NC_019701_6
|
20 spacers
spacers of NC_019701_6
>6.1|3411216|36|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCACCCAGGGATTTATACTGGCCGTGCGGAACGAC >6.2|3411289|40|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCTGGACAAAGAGAATGATGCAGTAACAAGCTATATCAG >6.3|3411366|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTTGATTATGGGCAGCTTGATGCAGAGACCAGG >6.4|3411438|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGGGCGAAGGGCAGATTGCTCCAGGAGCTACGC >6.5|3411510|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCGCATCAAGAAGCGAACTTCGCCAGGGTATGT >6.6|3411582|38|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCAGCGCACACCACTTTTGTTTGACCCGACACTAAGG >6.7|3411657|42|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACAGACAACTTGTGGTGGGTTAAAACGATCGAGGCCACATT >6.8|3411736|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAACTATCAGAAATAAGTCTTTGCTTGTTTTGCC >6.9|3411808|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCAGAATTTGACGCGGAATTGGGGGAGGTGAAT >6.10|3411879|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATGCCTGTAAGTCGCTTAAGGTAAAAGCCATAT >6.11|3411951|36|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGATTCGCAAGAGATCGCCCTAATGCGAGTTAAAG >6.12|3412024|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGCTGCCAATTCTTATCCTTATTGGCCTGGATT >6.13|3412095|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGCCACCGCCAGATTGGAGCCAAACAGCTTAAT >6.14|3412167|38|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGATCGCCTTGCGCAACGCCTTAACTATGTTTTGCCT >6.15|3412242|36|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGACTGATGCCTTACACAATAACTCAACCACACTGA >6.16|3412315|39|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGATCGAGGCATGATTAACTACCCTCCTTTGGTGTTT >6.17|3412391|37|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCCAGGGCTGGGAGCGGTGCGGGTAGAGTTGTAAAA >6.18|3412465|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTACAAGCCAACTGCACGAACTGCACAAAATTAT >6.19|3412537|37|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGAGGCATGTGGGGCAAGTTACAGCGGATGCCCTGG >6.20|3412611|38|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAGCCCATGCCTGCATACCTAGGACAATCAATGCATG |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019701_6
The CRISPR arrays of NC_019701_6 >merge|NC_019701|6|3411179-3412685|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATATCACCCAGGGATTTATACTGGCCGTGCGGAACGACGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCCCTGGACAAAGAGAATGATGCAGTAACAAGCTATATCAGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCCTTTGATTATGGGCAGCTTGATGCAGAGACCAGGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCAGGGGCGAAGGGCAGATTGCTCCAGGAGCTACGCGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATTGTCGCATCAAGAAGCGAACTTCGCCAGGGTATGTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCCCAGCGCACACCACTTTTGTTTGACCCGACACTAAGGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCACAGACAACTTGTGGTGGGTTAAAACGATCGAGGCCACATTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCCAACTATCAGAAATAAGTCTTTGCTTGTTTTGCCGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATTCCAGAATTTGACGCGGAATTGGGGGAGGTGAATGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATAAATGCCTGTAAGTCGCTTAAGGTAAAAGCCATATGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATACGATTCGCAAGAGATCGCCCTAATGCGAGTTAAAGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATTCGCTGCCAATTCTTATCCTTATTGGCCTGGATTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATTTTGCCACCGCCAGATTGGAGCCAAACAGCTTAATGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCCGATCGCCTTGCGCAACGCCTTAACTATGTTTTGCCTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCGACTGATGCCTTACACAATAACTCAACCACACTGAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATAATGATCGAGGCATGATTAACTACCCTCCTTTGGTGTTTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATATCCAGGGCTGGGAGCGGTGCGGGTAGAGTTGTAAAAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATGTTACAAGCCAACTGCACGAACTGCACAAAATTATGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATTAGAGGCATGTGGGGCAAGTTACAGCGGATGCCCTGGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAATCCAGCCCATGCCTGCATACCTAGGACAATCAATGCATGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT >NC_019701|6|8|3411179-3412685|PILER-CR GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ATCACCCAGGGATTTATACTGGCCGTGCGGAACGAC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCCTGGACAAAGAGAATGATGCAGTAACAAGCTATATCAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCTTTGATTATGGGCAGCTTGATGCAGAGACCAGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CAGGGGCGAAGGGCAGATTGCTCCAGGAGCTACGC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TGTCGCATCAAGAAGCGAACTTCGCCAGGGTATGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCCAGCGCACACCACTTTTGTTTGACCCGACACTAAGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CACAGACAACTTGTGGTGGGTTAAAACGATCGAGGCCACATT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCAACTATCAGAAATAAGTCTTTGCTTGTTTTGCC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TCCAGAATTTGACGCGGAATTGGGGGAGGTGAAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT AAATGCCTGTAAGTCGCTTAAGGTAAAAGCCATAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ACGATTCGCAAGAGATCGCCCTAATGCGAGTTAAAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TCGCTGCCAATTCTTATCCTTATTGGCCTGGATT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TTTGCCACCGCCAGATTGGAGCCAAACAGCTTAAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCGATCGCCTTGCGCAACGCCTTAACTATGTTTTGCCT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CGACTGATGCCTTACACAATAACTCAACCACACTGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT AATGATCGAGGCATGATTAACTACCCTCCTTTGGTGTTT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ATCCAGGGCTGGGAGCGGTGCGGGTAGAGTTGTAAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT GTTACAAGCCAACTGCACGAACTGCACAAAATTAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TAGAGGCATGTGGGGCAAGTTACAGCGGATGCCCTGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCAGCCCATGCCTGCATACCTAGGACAATCAATGCATG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT >NC_019701|6|6|3411179-3412685|CRISPRCasFinder GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ATCACCCAGGGATTTATACTGGCCGTGCGGAACGAC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCCTGGACAAAGAGAATGATGCAGTAACAAGCTATATCAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCTTTGATTATGGGCAGCTTGATGCAGAGACCAGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CAGGGGCGAAGGGCAGATTGCTCCAGGAGCTACGC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TGTCGCATCAAGAAGCGAACTTCGCCAGGGTATGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCCAGCGCACACCACTTTTGTTTGACCCGACACTAAGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CACAGACAACTTGTGGTGGGTTAAAACGATCGAGGCCACATT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCAACTATCAGAAATAAGTCTTTGCTTGTTTTGCC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TCCAGAATTTGACGCGGAATTGGGGGAGGTGAAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT AAATGCCTGTAAGTCGCTTAAGGTAAAAGCCATAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ACGATTCGCAAGAGATCGCCCTAATGCGAGTTAAAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TCGCTGCCAATTCTTATCCTTATTGGCCTGGATT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TTTGCCACCGCCAGATTGGAGCCAAACAGCTTAAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCGATCGCCTTGCGCAACGCCTTAACTATGTTTTGCCT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CGACTGATGCCTTACACAATAACTCAACCACACTGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT AATGATCGAGGCATGATTAACTACCCTCCTTTGGTGTTT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ATCCAGGGCTGGGAGCGGTGCGGGTAGAGTTGTAAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT GTTACAAGCCAACTGCACGAACTGCACAAAATTAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TAGAGGCATGTGGGGCAAGTTACAGCGGATGCCCTGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCAGCCCATGCCTGCATACCTAGGACAATCAATGCATG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT >NC_019701|6|6|3411179-3412685|CRT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ATCACCCAGGGATTTATACTGGCCGTGCGGAACGAC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCCTGGACAAAGAGAATGATGCAGTAACAAGCTATATCAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCTTTGATTATGGGCAGCTTGATGCAGAGACCAGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CAGGGGCGAAGGGCAGATTGCTCCAGGAGCTACGC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TGTCGCATCAAGAAGCGAACTTCGCCAGGGTATGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCCAGCGCACACCACTTTTGTTTGACCCGACACTAAGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CACAGACAACTTGTGGTGGGTTAAAACGATCGAGGCCACATT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCAACTATCAGAAATAAGTCTTTGCTTGTTTTGCC GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TCCAGAATTTGACGCGGAATTGGGGGAGGTGAAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT AAATGCCTGTAAGTCGCTTAAGGTAAAAGCCATAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ACGATTCGCAAGAGATCGCCCTAATGCGAGTTAAAG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TCGCTGCCAATTCTTATCCTTATTGGCCTGGATT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TTTGCCACCGCCAGATTGGAGCCAAACAGCTTAAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCGATCGCCTTGCGCAACGCCTTAACTATGTTTTGCCT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CGACTGATGCCTTACACAATAACTCAACCACACTGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT AATGATCGAGGCATGATTAACTACCCTCCTTTGGTGTTT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT ATCCAGGGCTGGGAGCGGTGCGGGTAGAGTTGTAAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT GTTACAAGCCAACTGCACGAACTGCACAAAATTAT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT TAGAGGCATGTGGGGCAAGTTACAGCGGATGCCCTGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT CCAGCCCATGCCTGCATACCTAGGACAATCAATGCATG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAAAGGAGCGTTGCAAT
>NC_019701.1|WP_015165919.1|3410891_3411065_-|hypothetical-protein MALDKEKIDEFDGFEIGFQTKEQVDEYLRLARQQAEELKEQIRSGKVRPIPRRQSES >NC_019701.1|WP_015165918.1|3410092_3410770_-|hypothetical-protein MVTPPPIEPDDSPADSIAISDRPLPKIGLVFLVLWVIANIFTTSISGQNSIAVGKLFSEPIGVFISYGFIGAIVGAGQWLLLRKVVKRSKWWIPLTALAETAVAPFSLTIAFKLSLATGALIDLIAVSAIIRGASVGLFQWTMLYGQFPRAATWIVAVAASRCISALIGTSAIVTQSIDYKTVYILTNAISGLLSGLILVWLLQARSPQPKVADDIKGDRQDLNA >NC_019701.1|WP_015165917.1|3409156_3410059_+|M56-family-metallopeptidase MHLVMILSAIAFAWGLRQATPLWLGSNRQISNQNVTHDWHQRWWRSLFLLTFPPLLVLTTSLAVLCMGHHGLMVGLPASKSGCAIAVGICIYLVLIGLQLFISIRNSTRQIATYNKIELDGKSARVLEVPTLFAAQVGLWQPELVISRGMLTEFTPDRLQAVLCHEQAHYHYHDTFWFFWLGWLRQATFWLPNTEALWQELLLLRELRADRWAAQQVDPLLLAESLLMTVTSAIAPDNFSELDYGVGLNQWKEGEQGDRLAERIDALLAEAEPIPRPKPWYLTWLIAVLLPFLSLPLHLS >NC_019701.1|WP_015165916.1|3408737_3409157_+|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MSPLPDRTPKKLSLGRLEAEILGIIWDLGSATAKDIHDRILSDPDRELAYASVSTVLNRLANKGWLSMSKKGRAILWHPLVSRQEARSLQAYEHLNNFLQVGNADIVAAFADQLDRASLDKIDAIAQRLQQARQDREAE >NC_019701.1|WP_015165915.1|3408090_3408432_-|c-type-cytochrome MRKLLLSALGVLICLFTCSIVFVQPSYAADAANGAKLFSVNCASCHAKGRNLVIKNKTLQKDALETYGMYSIEKIVYQIGHGKNAMPAFRKLSDQQMEDIATYVLQQADNGWS >NC_019701.1|WP_015165914.1|3406762_3407875_+|glycosyltransferase-family-4-protein MKHILYVLPYLEKAGTERQALSLIKHFQQSQQATLLAPDDTGTELFAAAGVKHYKFDRLERNLWQGLTKFRRHIKQIHQEKPIDLVHVHAAHELMLLVRLFLPGVPIVFTVHGYHGDQAQVSYWLASKFINLFADRAIAVCKADLENLLQLKTNPHKLSLIHNGVAEPKVDPIAAQALATQYGLDPEQHLIIGTAARLNPAKGLEFLIAAFAQLAQEHDQLRLAIAGEGYLEAELKQMAIDLGVGDRVVFTGFVDNLADLVSLFDVFALPSLQEAFSLAFLEAMALQKPIVGTKVGGIPEQVIDGHNGFVVVAGDAAAVAEKLAILINDPLLRKEFSHNSYQRYQTNFTTEIMIAKTDRVYADLLGNPVR >NC_019701.1|WP_015165913.1|3405798_3406677_+|hypothetical-protein MLNTTEILINAFVEKLKAGYRRTYGGLKTNYEDIIGWAGNMALENIANSDALYHNVEHTILVTLVGQEILRGKHIREGGISPEDWLHYIISLVCHDIGYVKGVCRQDRDGKYATGLDGSQVELPPGASDAGLTPYHVDRAKLFVAERFGGHGLIQAEVICHNIELTRFPVPKTGDHQDTIAPPGLVRAADLIGQLSDPRYLKKIGALYYEFEETGVNKALGYNNPGDLRRNYPKFYWTSVYPYVKDALYYLSLTQQGQQVIAHLYSNVFVVEHEKPDFDASIRAIPTAANYQ >NC_019701.1|WP_015165912.1|3405003_3405408_-|hypothetical-protein MKPVHRWKKNIYQTIEEIASKEYQEKAWLGKLEGVMSSPDELMLNLLEDFYFDEFLDSEEIGLNDQQKQAGKYLLKKVDEYYDNSPIFPIPEEVLSDPGWHEIRNMAKNVLHICQVQGHYFSISDYVAHKKDIS >NC_019701.1|WP_015165911.1|3403660_3404938_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MKIIVIGSGGREHALAWQFAQSAQVKQIFCIPGNAGTATIEKCRNVALNQDDFEGILRFAQVQGVQLTVVGPEAPLADGVVDFFQAGEMPIFGPTKQGAQIEASKSWAKDLMVEAGIPTAASEVFTDPIAAREYVQAQGVPIVIKADGLASGKGVTVATTFAEANQAIDEALGGKFGDAGETLLIEECLQGQEASVLAITDGKTIRALLPAQDHKRIGVGDTGPNTGGMGAYAPAPIVTPEIQRKIQTQVLEPAIAALQKRKIDYCGCLYAGLMITPAGEPKVIEFNCRFGDPETQVILPLLETPLADLMLACIEKRLEQMPAIEWKDGAAVCVVLASGGYPGKYETGKPITGIGKAKEHGAIVFHAGTKLKTSTLVTAGGRVLGVTAIGESIQAAIDNAYVSLAYINFEGATYRHDIGHRAIAN >NC_019701.1|WP_156800528.1|3402965_3403526_+|chorismate-binding-protein MTGDYSNWDQAIANPPLFAHIRVCIRPLPNQLSDHGIWLYSEQAYDFQIDRPYRIAVLHLVLAADRIEIENHKLNDEESFYGAARQPERLAAITAASVVKLPGCNILVDRTPTGSFVGKIEPGKKCNVHRKNQDTYLVHEFELNQTNLTTLDRGYDPETDERVWGTIAGPFEFVKQASFADEVKAI >NC_019701.1|WP_015165920.1|3413070_3414144_+|magnesium-chelatase-ATPase-subunit-I MTVTQAKPLTQKRPVFPFSAIVGQEEMKLALILNVIDPKIGGVMIMGDRGTGKSTTIRALANLLPEIQIVADDPFSSDPVDADLQSDEVRQRLAQGEQLPIAAKQVLMVDLPLGATEDRVCGTIDIEKALTEGVKAFEPGLLAKANRGILYIDEVNLLDDHLVDVLLDSAASGWNTVEREGISIRHPARFVLVGSGNPEEGELRPQLLDRFGMHAEIRTVKEPELRVKIVEQRTEFDREPHEFIDHYQTEQVDLQKKIVTAQENLNAVGIPHELRLHISQVCAQLDVDGLRGDIVTNRAAKALAAFEGKSEVDVDEIKRVITLCLRHRLRKDPLESIDSGYKVQKVFAEVFGLAEAE >NC_019701.1|WP_015165921.1|3414145_3415096_+|methionyl-tRNA-formyltransferase MRVVFFGTPDFAVPTLQHLLNAADFEVLGVVTQPDARRGRGKKMTPSPVKQVAIEHALKVWQPNRLKRDQATLAELEALQADVFVVVAYGQILSQQILDMPKYGCINVHGSLLPKYRGCAPVQWAIANGEQVTGITTMQMDKGIDTGDMLLIADLAIEAADNAETLSPKLAELGANLLIDTLQQIETIKPQPQDHSQNSYAPMIGKEDWQIDWQSAAIEIHNKVRGFYPNCFTDYQGQRLKILETQLLKPAELNEQAKVEIGAIAQLVKKSGFAIQTSTEPLLITKLQPAGKRPQSGWDFANGARLEVGQLLFPPA >NC_019701.1|WP_015165922.1|3415142_3415688_-|DUF937-domain-containing-protein 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MTNLALNSSQIDRNALTPMLQHYMGVKDRYSHAVLLYRMGDFFETFFEDAQLVSRELELVLTGRDGGKTLGRIPMAGIPHHALDRYARQLVAKGFSIAICDQVETAAQAQGLVKREVTRVLTPGTVIEAGMLAAKQNNFLAAIVAADPSHQKSNGNSKGNKKWGLAFADISTGEFMTTQLANTEQLVQELLRLQPAEVLFPTDAPNPNLFDSYSNYDDKKRSPQLDAIPPELPDFLCYTLRSQTSFLLVEAKQKIMTTYKVRSLEGFGCASLSLAIRAAGGLLEYLDSTQKDLKAPLHNLTTYTVTDYLILDHQTRRNLEITQTVRDGTLAGSLLWALDCTSTSMGSRALRRWLLQPLKDTQQISDRADTVAELFQHHNLRKNLRALLHEIYDIERLCSRIGAGTANARDLVALADSLSKLTDVADLLAKAESPYLKTLQSPPLELAELANFLSDTLIDSPPIYLTEGNIIRDGVSPQIDQIRQQSAADVEWLATLEKTERERTGINTLKVGYNKAFGYYLSISRGKSDQAPDDYIRKQTLTNEERFITPELKEREARILNAKAEINQLEYDLFVQLRSQAATHITAMRSVARDLAAADALASLAEVANKYDYCRPEITSDRTINIQNGRHPVVEQSLPSGFFVPNSARLGCTQAPDLIILTGPNMSGKSIYLRQVGLIQLMAQVGSFVPAQSATLGISDRIFTRVGAVDDLATGQSTFMVEMNETANILNHAQDHSLVLLDEIGRGTSTFDGMAIAWSVAEHIAKQIQARAIFATHYHELNELASLLTNVTNFQVTVKELEDEIIFLHQVQPGGADRSYGIEVGRLAGLPPAVIARAKQVLEQIARNSHIATGLRRGSSAKATKGKKNQAKSQLSIFETSMEGSASHNQANPDLDLDSATDPDN >NC_019701.1|WP_156800405.1|3418983_3419217_-|2-oxoisovalerate-dehydrogenase MAIVFTITEKIRGGYTASAIGEAIATEGKDIDELYNNIRTSTIDYFGAELAPNTARLYFLREEVLYIFPDRFDASNN >NC_019701.1|WP_015165925.1|3420014_3421301_+|WYL-domain-containing-protein MASQDQKHAYRDRTAFERLLLLIAVLLKHPGIGSNEPELSGGADLKSLKSLKSVSGQSSLPKQQQAKQFSKQSAKHHDALMPVANKMQELATQLHIDLPNCSIAALRKDLRTLRQYGILAADQKFRWGYYLGTGVLQQEELKIALQTFYSLAEYQKDPKISEIYQRLRRRLQAQKWEEGKELYHSRVLFNRVITHTKTEETIEQGVFSKNLNLYHQIDRVERAIRQGECLRLTRHSNPYQTDQVGDLEIYPLQFIYYNIAWYLLFEHSDSGLLAIERVDRFADQFQVIAAQSRSLTIQRQRLKSAHKLLDLGWDLHLGNSKKEQEDELSGKLKPIKVTVRFSAQVAPFISEGDLRHPSQQVKEVKENGILTYVEYTVYLPRRSYGEFRRWVHRFMADAIIVEPTELATQHFKDAQALYKKLAALKENT >NC_019701.1|WP_015165926.1|3421530_3422796_+|family-10-glycosylhydrolase MFPFKLRKPKSKTVRFLWATCIAIGLFLLSAYAPFALQTTSAQSGLQPIAPPEQIRGVWLTNVASGIFFVPWGIKRSLQQLAQLNFNTIYPVVWNRGYTLYPSAIAAPLTGKKQMPWLGLMHLGQDVLAQTINQAHQYGLRVLPWFEYGFIVPTVSQIAQQHPEWLTHTLAESQQQQGNRHVQAALVAADFPEAVDQPLIPQSWLNPFHPQVQEFMLNLILEVVNNYDIDGIQFDDHFSLPVAYGYDSYTIELYQQEHQGQLPPEDASDEQWVSWRSQKISEFMQRIATAVREVKPELIISLSPNSYNFAYKYHLQDWLTWVESGWVDELILQVYRSDLASFSAELGQSALQTARQRIPVAIGILTGTLGKPIAIEQVQQQVQTVQDLQFNGISFFYWETMWGYFTPESPYQRREGFAQLF >NC_019701.1|WP_015165927.1|3422933_3423563_+|hypothetical-protein MKTVKLGCGFWLLWTILTLVGFGASLYWVEVGESPYLGAKAGLIGGLAIGTCQAIALRPLVPRFWVWIMINALVWVILGISDIGAIGWIAPRTGSLAVRLIYGLVYGSITGLFLGGCQWVGLRMEMRQQAPALFAWLVGNGVIWSVALAVGWLVGGWLRAFSNLFLGEVLGLVMTWAIVAGLSGWWLVWCINVKSGDQAALAISIDQNS >NC_019701.1|WP_015165928.1|3423601_3424351_+|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MSNQPATQPEKSEPTNLQERIIVAIDVPTIDAALALCDRLPQVGFWKVGLELFVSTGAEILTELKQRQKKIFLDLKLHDIPNTVAAATRAAVKYEVDFLTVHAVGGRNMLKAAQAEVVDSNTRLLAITLLTSLSSRELAFDLKIPLELPEYALQMALMAQDCGLYGAVCSPLEVSGLRSLLPPNPTGAEFGLVTPGIRPAGSEQGDQRRTMTPAQAIAAGASYLVIGRPITQAEDPAAAWQEICAQLSN >NC_019701.1|WP_015165929.1|3424535_3425150_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MGIYSRYIFPALMDWSMSSPEISKYRQQVLAEVSGDVLEIGFGTGLNLPHYPAQVNKLVVVDPNPGMNARAKKRVEAAKIAVESQILNSEVLPMPDRSFDAVVSTWTLCSIVNLEQALSEIARVLKPGGKFYFIEHGLSPEPEVQKWQNRFNPIQKVIGDGCNLNRNISELISRHLRIEKLEEFYMPNTPKIAGYFYQGVAVKD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019701_7 | 3694549-3695104 | Orphan |
N:A
Consensus repeat of NC_019701_7
|
7 spacers
spacers of NC_019701_7
>7.1|3694584|40|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT ATTTACACCACTCCAGTAACACTAAGAACTACAAAAACTA >7.2|3694659|38|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATCTATGCATCGAGATTGTGTCATACCAAGACTGGG >7.3|3694732|45|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGCATGTATTTTTTTGTTTAACCCTAGGAGGGTGATGGAAAAGA >7.4|3694812|40|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCTCACAGGAGCCCCCCACCGATGGAGAGAATGTTCTT >7.5|3694887|36|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATCTGGCTGCGCGGGCAGGGGATGTAGAGATAAA >7.6|3694958|39|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCCATACAAGAACCTATGCTGCTTTCTGTGATGAAATG >7.7|3695032|38|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGCACGACTTTATGGTTGCGATGGAGAAGGATGAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019701_7
The CRISPR arrays of NC_019701_7 >merge|NC_019701|7|3694549-3695104|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTGTAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGATTTACACCACTCCAGTAACACTAAGAACTACAAAAACTAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGTAATCTATGCATCGAGATTGTGTCATACCAAGACTGGGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGAGGCATGTATTTTTTTGTTTAACCCTAGGAGGGTGATGGAAAAGAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGTTTCTCACAGGAGCCCCCCACCGATGGAGAGAATGTTCTTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGCAATCTGGCTGCGCGGGCAGGGGATGTAGAGATAAAGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGTTCCATACAAGAACCTATGCTGCTTTCTGTGATGAAATGGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAGACGCACGACTTTATGGTTGCGATGGAGAAGGATGAAGTGTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG >NC_019701|7|7|3694549-3695104|CRISPRCasFinder TGTGTAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG ATTTACACCACTCCAGTAACACTAAGAACTACAAAAACTA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TAATCTATGCATCGAGATTGTGTCATACCAAGACTGGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG AGGCATGTATTTTTTTGTTTAACCCTAGGAGGGTGATGGAAAAGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTTCTCACAGGAGCCCCCCACCGATGGAGAGAATGTTCTT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CAATCTGGCTGCGCGGGCAGGGGATGTAGAGATAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTCCATACAAGAACCTATGCTGCTTTCTGTGATGAAATG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG ACGCACGACTTTATGGTTGCGATGGAGAAGGATGAAGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG >NC_019701|7|7|3694549-3695104|CRT TGTGTAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG ATTTACACCACTCCAGTAACACTAAGAACTACAAAAACTA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TAATCTATGCATCGAGATTGTGTCATACCAAGACTGGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG AGGCATGTATTTTTTTGTTTAACCCTAGGAGGGTGATGGAAAAGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTTCTCACAGGAGCCCCCCACCGATGGAGAGAATGTTCTT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CAATCTGGCTGCGCGGGCAGGGGATGTAGAGATAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTCCATACAAGAACCTATGCTGCTTTCTGTGATGAAATG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG ACGCACGACTTTATGGTTGCGATGGAGAAGGATGAAGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG >NC_019701|7|9|3694624-3695104|PILER-CR GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TAATCTATGCATCGAGATTGTGTCATACCAAGACTGGG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG AGGCATGTATTTTTTTGTTTAACCCTAGGAGGGTGATGGAAAAGA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTTCTCACAGGAGCCCCCCACCGATGGAGAGAATGTTCTT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG CAATCTGGCTGCGCGGGCAGGGGATGTAGAGATAAA GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG TTCCATACAAGAACCTATGCTGCTTTCTGTGATGAAATG GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG ACGCACGACTTTATGGTTGCGATGGAGAAGGATGAAGT GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGTAATGGGTTTGAAAG
>NC_019701.1|WP_015166142.1|3692898_3694482_+|B12-binding-domain-containing-radical-SAM-protein MSAVDRILYVRLPCNPIFPIGVVYLADHIHKIAPQVEQSIFDMGTVAPLDFHKALDQSIDRFKPDLLVFSWRDIQIYAPVGGRGGNPLQNAFEFYYGKSPLTRLRGAFNGLRLFGAYYSELWRNSLLIRQGVKRAQRYSPRARAVIGGGAVSVFYEQLAGMMPQNTIISVGEGETLLQKLVFDQSIANERCYTVGVTTPRDRLIHEAPEPIEKSACDYDYIESIWDKFNYYFRDNDFYIGVQTKRGCPHNCCYCIYTTIEGKQVRINPADEVVAEMRQLYDRGIRNFWFTDAQFIPAKRFIPDAIELLQKILASGMDDISWAAYIRADNLTPELCDLMVATGMNYFEIGITSGSQELIRKMRMGYNLRSVLQNCRDLKAAGFNELVSVNYSFNVIDENFDTIRQTIAYHRELEAIFGRDKVEPAIFFIGLQPHTHLEEYAIKNEILKPDYDPMSMMPWNAKKLLWNPEPLGSYFGEVCLEAWQRDETDFGRAVMDILEERLGRAPLEEALTAPISLSAPEKKMTAAV >NC_019701.1|WP_041698515.1|3691864_3692209_-|DUF1830-domain-containing-protein MSQLLDPVPAGNQKIVCCYTNTTSKIQVVRITNVPDWYFERVAFPGQHLIFEALPSGQLEIHTGMMASSILSDTIACVQLQVENDSTTLPEWLPLKTSTGAAQETEQFKTEVAN >NC_019701.1|WP_015166140.1|3690413_3691862_-|MBOAT-family-protein MDFLSVEYGAFLICIAVIYWLTPHLQARLGILLTASLLFYMLLQRQAVALLIASTLVNFGLGFAIKRSRQRNYRIALLSLGIGFNVLLLLGFKYISFLMGNIGILASWQGGIELANWADQNVIAPIAISFFSFEMIAFLIDVYRGTAPTQDFWGFFTYKSFFPKLLSGPIVRYQDFAKQLVSPTHPKLADISEGLWLIAAGAIKKGLVADNLGRFVDISLANIERAGSVDLWLALVGFGLQIYFDFSGYIDIARGSALLLGIELPQNFDFPYLAASISEFWRRWNITLGHWLRDFVYIPLGGSRRGLIITCLNLLIVMLVAGIWHGAQWGFILWGGLHGLYLIAHRLFMVVGTRFNGFVEFWRSQWGKILGILITQLAVLVSWIPFRLPKWADMQVMLNRLWGQAADPQFGLKIYVETLQVTPAQIGLLCLAIVMAMIFAYRCDRAKWQLTWQAKLFLVPISLYLVAMFGPQSNLPFIYFDF >NC_019701.1|WP_015166139.1|3689967_3690318_+|DUF1257-domain-containing-protein MSHFSTLRTKITDAEILKSSLRDLGISVNANADVRGYNGQRVRAEIVATLEGDYDLGWSRNGDGSFDLIADLWGVAKKHNQTELINSINQKYAVTKTLSEVKRPGLSNANVRLVVQ >NC_019701.1|WP_015166138.1|3688311_3689820_+|AAA-family-ATPase MREELSILIQAQYPLIYLNTSEEERAEQAIAAIAQIKPARALFTWTVTRGMVEYGQVNATQHNTISPQAAIEWAIRHKDPAIFVFKDIHPFVENPEVCRWLRDAVASFKGTLKSIIMMSSVQSVPIELEKEVVVLDFPLPDIQEIEAVLAEQLGQSRYHKMQPDTKEKLVRAAQGLTRDEAEKVYRKAQVTTGKLTENEVQIVLTEKQQLVRRNGILEYLDCEEGMGSVGGLEELKHWLTERTTAFSSKAREYGLPQPKGMLIIGVPGCGKSLIAKTTSKLWSLPLVRLDMGRVYDGSTVGRSEANLRNALKVAESIAPVILFIDELDKAFAGGAGSADSDGGTSSRIFGSFLTWMQEKTSPVFVMATANRVDRLPSEFLRKGRFDELFFIDLPNQDERRAIFQIHLNKRRSDLSRFDIDQLAKEITEGFSGAEIEQALIAAMYTAFSQGREFTQLDIISAIKSTTPLSRTMTEQVAALRDWARLRARPAATTDAEYQRMEF >NC_019701.1|WP_015166137.1|3687629_3687950_+|hypothetical-protein MHDKQKVTLYLSADLHRQLKIRSAIDQESMSELAAKAISFYLSHAEVVERAGVGYTHQVHNCPACEQTLVIKEGELLAVGGDRSDRNGSVQTPALTGHDEELVTVR >NC_019701.1|WP_015166136.1|3686772_3687261_-|hypothetical-protein MDKTLRKGLSLIGALVVASGSIAVLAGSVTAQTKSLSLARNFRPDPIELAGSAGGGKSIPSLAGMQGRCRGFSNQNPNHVVQLTEDFPLVDMLVHTPNINADLTLLVKGDNGLVICADDEYRGRNPQITRRLSQGNYQIWVGTGNANQSVNYTLSISEIAQK >NC_019701.1|WP_156800411.1|3686221_3686749_-|hypothetical-protein MNQTALAPIVANQAKRSIGMRAKLGLKKITQAAIAVAVLTAFSGWPGIASSQNMFSPIAPRFSPDPITYAGKASGAMQLQAIAGSNAVGDCQGLTQSKPNHVLQLINPFGQLSIKAEGISKNISLLVKGPDGVFCQTGRSPEISGAWALGEYQIWIASIDGSATDYRLSISETNH >NC_019701.1|WP_156800410.1|3684582_3685761_+|hypothetical-protein MRAQVRITAIQYLEQYLDQYLAQYPVSLGFQQHDRAKIVTHWQTQEILIKPCYPNYQAHYSCPVAFQLAHDLNQYLNRFNSPAIDQLPSTKEQSSNQSQPNRSPHLEIAPLNPEQIAQALSDRLQHLNHRLTISTISAPEIELLATSSQFYAVAAIGGHLNFRLSDRYLADCLSAYLSYFKNLNVNCDDAPSDQIDQRNKQNDLNAPVNRSIHSIDRARSLNKPNSAYPSQQSKFPGYTYVQYAYATCEAMLQLAQQEGLANASAADFNWSFLSHPEKSNQFNQFDRALQSPASPSRLIFQTEPELQLIVEILKIGDYFLSSNIPDGQPPPNVRQWQKAAYGLALSCLIFYEHCPMFGVSPAIAIARVGLFALTQQLIKLLVGNLIDLPTQL >NC_019701.1|WP_015166133.1|3683034_3684069_-|polysaccharide-pyruvyl-transferase-CsaB MRRAILCGYYGMGNGGDEALLATLLQLLPKDIVPIVLSGDPAMTEELHQVQACDRKNVWNLIDVIKQADIFIWGGGSLIQDATSWRNPIYYAGLMGLAKQMNLVTVAWAQGVGPLHQKFSQKIAKRAYQACDLVSVRDSNSAHLLADWQIPCLLAPDPVWALRSQLVLNLSSLPAPRVAVVLRDHPLLTSKRLQNLGIALCNLQKATGAHLLILPFQPAQDMQIAQQIYDLSPANATIMVQEDPRSLKGIFKGVEMTIAMRLHGLIMAAAEGSRCWGISYDPKVNNLMQELEIPGWDLANLPDQPNVICQKWLEHYANGDPLSSAKIQSMGDRALIHQQLLANL >NC_019701.1|WP_015166143.1|3695418_3697263_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MALIKPLPTQLVHLIAAGEVIDSLAAVVRELVENAIDAQATRISLAIKTENLANLSVQITDNGIGIDLANLRQAAAPHTTSKIARAADLQAIESLGFRGEALHSLAQLAELQICSRTETADAGWQVTYDRNGQVIDAPKTVAIAPGTIVQAQQIFKFYPARLEALPSISQQLRQVQLIIQLAAIAHPYITWQASLNQKNWFNIWSGKYTHDILPQIVRSLQPQNLVTGIISGAAVLNEIAPNNIDIKGDRDDLAEQQQITENQKFTYAKAEQHQKQSELEHLKNKQTDRLEPEIAITLGLPDRASRHRLDWVKVALNGRMIDCPEISQTIIAAFARTLPRHRYPICVVHLQLPPEQIDWNRSIAKTEVYIRQIEHYQAKISDLIGEILRQPQRFILPRPIEVNPLQDAAAGLLRENSIGYNPKSDNQTNPIAENTPLAQGVKVVAQVQNTYILVEHDRGLWLIEQHVAHERVLFEQLQQQWQVVALEQPIVLANLTRLQIERLQEIPLQVETFGDGLMAVRSLPQILLEQKDRKEILIELSHQKDLPQAMATLACRSAVRNGTKLEMRRSQEIFRQWQRTRNPHTCPHGRPICLSLDANDLARYFKRNWIVGKG >NC_019701.1|WP_015166144.1|3697391_3699236_+|protein-kinase MGTLPDLPDLTKHGYQVTDEFDQDDKGMWRSYRASRLKTKRPVIIKLIPLQRDDDLAAYKPQIQALLKLKHPGIARYIHAFRIAEGLCLVRQYIEGAILDGMEWDDPKQIRAIAINLMETLVFLQAQQPTIFHLNIKPANIIVGMELKTYLLDFALTTGKSSGTKPSAFAAPEIKRRRPPKPNTDLYGVGLALVCLITGTTGDRVSELFDATGGLRFRRSINGEISDHFLDWLDKMTNRLNSDRYADPSVALEALQEIDFERKPELKIEPEFIQLKAKNIGDLLRSNIIVSNTVADTLLEGRWEVMPHRSDPNQASGHAWIRFEPPSFAENRTVCQVCVDTNKIVAGKTYRRTLMLHANSAAETHTVELEVKTAPLPSLTIPYQKLAILIVLATVGSFLVTSAIHALTPLVPVPENFNEAIAYFGSLDKFPPNVDLAMLKDIIQEENSTQIYSAWGGLLIGLGSGVAAGAYAESSDIYAVRNSFGAAAIASISLRLIRMFVRLFWAIAMVGIIVGLVLGIVVGYLSASSHKEHLKLGFPKGFAFAVPALAAIFSLTTGIAFKLSFTEDYIQLPWLPWLAAISAIGLVGTAGMHILRQKTFLENYQRRSRRLIKP >NC_019701.1|WP_015166145.1|3699411_3700878_-|transcriptional-regulator MNKDDETLKSLLLELVALAQETEWVEFKENNSDPQEIGEYFSALSNSALIVGRQYGYLVWGVKDGNHEIVGTDFCPREKRIKGQELENWLSTKLKPRINFKMHEFLFNNKKIVIAEIPCADHIPVKFKSEEFVRIGSYKKKLSEHPEKEREIWMLLSRLTFEGRLTYQNLPIPELLELIDFSRYFELIDQRQPEEATEIISRMVAEKFIQAEFPRSYSITNLGAILLARRLDKFETLSRKRVRVITYKGCNKIETIREIQGGRGYAIGFQGLISYITSQLPQNEVISQALRKEVPMYPEIAIRELVANALIHQDFNMSGTGPMIEIFSDRIEITNPGIPLIDTLRFIDCPPQSRNESLAAFMRRIKICEERGSGIDKVIREVEIFQLPAPEFEVTGNNHTRAILYAHKDLAEMDNQDKIRACYQHACLRYVSRDVMTNSSLRERFSIEDKNQSIASRIIAETLNADLIKRYDPSNKSKKLYRYVPFWA >NC_019701.1|WP_015166146.1|3701131_3701818_-|response-regulator-transcription-factor MRILVVEDDEPIAEAISLALTSSNNIVDTAYDGQAGWDLLEAYDYDLVLLDVILPKLDGVGLCQKLRNKGSKIPVLMMTAKGKLNDKVLGLDSGADDYLVKPFELAELEARIRALMRRRDAQFSFVLRWEKLELDPNGCTASFDMKPLPLTPKEYGLLEIFLRAGSRVLSRTKILELLWSADADAPSEEAVKMHIRSLRQKLKSNGAPDDLIQTVYGLGYKLRKTEQS >NC_019701.1|WP_015166147.1|3702823_3704245_+|9,9'-di-cis-zeta-carotene-desaturase MRAAIIGAGLAGLSTAVELCDRGYAVEIFESRPFVGGKVGSWIDQDGNHIEMGLHVFFGCYYNLFSLMQKVGAFEHLLRKEHTHTFINRGGRTGELDFRNFGGAPFHGLKAFFTTSQLSLKDKLQNAIALGTSPIVRALVDPKGALDDIHKLDHISFADWFRSHGGSQASIEQMWNAIAYGLGFIDCENISARCMLTIFQFFATRTEASVLRMLEGSPQEFLHNPIVKYIESKGGKIHLRQGIREILFEGEGDATSVTGLVVGKEDSEEIITADTYICATDVPGVKRLLPEKWRQWDQFANIYKLAAVPVVTVQLRFDGWVSDLDNLLYAVGVDFSTFADLAVTSPTDYYKEGEGSLLQLVLTPGDPFIKESNEAIVEHVLAQVHEVLPNSRDLNVLWSSVVKLAKSLYREAPGMDVYRPDQKTPIANFFLAGSYTMQDYIDSMEGATISGRRCAGAVLGESKVVPTWPQIGI >NC_019701.1|WP_015166148.1|3704268_3704667_+|6-carboxytetrahydropterin-synthase-QueD MPEWIVYKEFRFEAAHLLPDHDGKCRRLHGHSWVCLVYVKVGQLIADGPKQGMAIDFADIKKYMQPILDNYLDHYYLNETLGLENPTCEAIARWLYEQLEQAKLPGLHAVEIKETCTSGVWYSADGSLMLPS >NC_019701.1|WP_041698516.1|3704809_3705262_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MDAPPDSFLLTHEPLDLAIAYAAADAAQNGAVVLMSGMVRNQTGDRQVNYLDYQAYAPMALRVFAQIATEIRNRYPAITRVVIHHRLGKLTVGEISVIIAVGSPHRAEAFDACQSAIDTLKDHAPIWKKEHWRDGASTWVNIEKIGQSMM >NC_019701.1|WP_015166150.1|3705444_3706275_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MQKQSIEKAGFNIRNLRPSDIASLSKILASSFYLEPNRANGFAPVVRWLYPFICWGIAADLLSRLSDYKFRHVCLVATCAGYSERDDRSPVVDHERSKPQDCANYAPPNYKPHQPSYYPNLNQKLTHNLNTNFAPSSQLWLSKSFNQARSGTDRSHHASTPANEAIATVELGLQKISLPAHKFNLFKHQKQYPYISNLAVHPGWRRRGMAQALLRSTEQFAIRWGHRQIFLHVLENNLPARSLYHQLGYELYKVETDLSVWLLGYPRRLLLRKQLK >NC_019701.1|WP_015166151.1|3706609_3706789_+|hypothetical-protein MSKSIEAASNTQGNNSAKSSLYTENISAELLHLQSDIDVLLQKLQSLSSRRLQSTASGD >NC_019701.1|WP_015166152.1|3707608_3709294_+|NAD(P)H-oxidase MDTLIQRDPFASGFSFNDFPRLDGTGHDPSDPTLGGVGTRYRQLNPIDYADGLFAPAGETRPGAREISNRLMSQTTSIPDPRGLTAMSWIFGQFLNHDIDDARLGTIPFPIEVPPDDPQINNPAFVAQLGRFTRNAIDPDTGPPFNATPAAQINQATSWVDASVVYGTSEERSNAIRSFTGGRLDTSPGNLAPLDDTNLPNATVPFIPKEEFFLFGDVRGNQQLGLMAMQTVWLREHNYWADKLAEAHPDWTDEQLFQRARAIVIAEFQAVSYNEYLPAILGVENVEAYDGFDSTAVAQTSLTFATGAFRVPHSAVNETFALVTEDGTVTGEVSLFDGSFDPFFFRQGPDLVESVLRGAATTVREKNDPKYVNGLRNSFSDLGAEDIQRGRDHGLPTYNVLRNVLDRLQPTGRPFPEFTSFSQLTSDPEVIVALQDLYGDINNIDMITGMLAEELPVDQFGQATSSVGEVTGEILRLTFQRLRDGDPFYYQNPIETGGIFTDAEIQELNGTTLADIIRRTSGISNIADNVFVTDTLPLPDPNPSAIGANDFMAGADSMLLG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019701_8 | 3888351-3888836 | Orphan |
N:A
Consensus repeat of NC_019701_8
|
5 spacers
spacers of NC_019701_8
>8.1|3888386|46|NC_019701|CRISPRCasFinder ATTTTTTCCTGGTTTCCCATGCACAGGGAACATCCTGAGTTTTCAA >8.2|3888467|34|NC_019701|CRT GGCTGTGTGCCATCGTCCTGTCCTGTGTCAATTC >8.3|3888539|34|NC_019701|CRT ACTAGCCCCTAATTAGGGGGAGTGGGAACAGGCT >8.4|3888611|36|NC_019701|CRT TTTTATATCCATCTGGACAATCGTCGTCTTCGTCTG >8.5|3888685|37|NC_019701|CRT GAGACAGAGTCTGAGAAGGTGCACTTTCAAGCTCAGT >8.6|3888760|39|NC_019701|CRT TCAATTTCCAGCCAAGGATGGCCTTGAGTAGGATTCTAG >8.7|3888611|39|NC_019701|CRISPRCasFinder TTTTATATCCATCTGGACAATCGTCGTCTTCGTCTGCAT >8.8|3888685|40|NC_019701|CRISPRCasFinder GAGACAGAGTCTGAGAAGGTGCACTTTCAAGCTCAGTAGA >8.9|3888760|42|NC_019701|CRISPRCasFinder TCAATTTCCAGCCAAGGATGGCCTTGAGTAGGATTCTAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019701_8
The CRISPR arrays of NC_019701_8 >merge|NC_019701|8|3888351-3888836|CRISPRCasFinder,CRT,CRISPRCasFinder TCCTCCAATTTTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAATATTTTTTCCTGGTTTCCCATGCACAGGGAACATCCTGAGTTTTCAACCTTTAAGCCCACTACCCCATAAGGGGACTGAAACGGCTGTGTGCCATCGTCCTGTCCTGTGTCAATTCCATTGCATTGCTCTATTACCCCGTAAGGGGACTGAAACACTAGCCCCTAATTAGGGGGAGTGGGAACAGGCTCATCTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAACTTTTATATCCATCTGGACAATCGTCGTCTTCGTCTGCATCTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAACGAGACAGAGTCTGAGAAGGTGCACTTTCAAGCTCAGTAGACTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAACTCAATTTCCAGCCAAGGATGGCCTTGAGTAGGATTCTAGCTTCTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACAAACTG >NC_019701|8|8|3888351-3888467|CRISPRCasFinder TCCTCCAATTTTTTACCCCGCAAGGGGACTGAAAT ATTTTTTCCTGGTTTCCCATGCACAGGGAACATCCTGAGTTTTCAA CCTTTAAGCCCACTACCCCATAAGGGGACTGAAACGGCTGTGTGCCATCGTCCTGTCCTGTGTCAATTCCATTGCATTGCTCTATTACCCCGTAAGGGGACTGAAACACTAGCCCCTAATTAGGGGGAGTGGGAACAGGCTCATCTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTTATATCCATCTGGACAATCGTCGTCTTCGTCTGCAT CTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC GAGACAGAGTCTGAGAAGGTGCACTTTCAAGCTCAGTAGA CTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TCAATTTCCAGCCAAGGATGGCCTTGAGTAGGATTCTAGCTT >NC_019701|8|8|3888429-3888836|CRT CAACCTTTAAGCCCACTACCCCATAAGGGGACTGAAAC GGCTGTGTGCCATCGTCCTGTCCTGTGTCAATTC CATTGCATTGCTCTATTACCCCGTAAGGGGACTGAAAC ACTAGCCCCTAATTAGGGGGAGTGGGAACAGGCT CATCTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTTATATCCATCTGGACAATCGTCGTCTTCGTCTG CATCTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC GAGACAGAGTCTGAGAAGGTGCACTTTCAAGCTCAGT AGACTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TCAATTTCCAGCCAAGGATGGCCTTGAGTAGGATTCTAG CTTCTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACAAACTG >NC_019701|8|9|3888576-3888836|CRISPRCasFinder ATTTTTTCCTGGTTTCCCATGCACAGGGAACATCCTGAGTTTTCAA CCTTTAAGCCCACTACCCCATAAGGGGACTGAAACGGCTGTGTGCCATCGTCCTGTCCTGTGTCAATTCCATTGCATTGCTCTATTACCCCGTAAGGGGACTGAAACACTAGCCCCTAATTAGGGGGAGTGGGAACAGGCTCATCTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TTTTATATCCATCTGGACAATCGTCGTCTTCGTCTGCAT CTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC GAGACAGAGTCTGAGAAGGTGCACTTTCAAGCTCAGTAGA CTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACTGAAAC TCAATTTCCAGCCAAGGATGGCCTTGAGTAGGATTCTAGCTT CTTTCAAACCCACTACCCCGCAAGGGGACAAACTG
>NC_019701.1|WP_015166311.1|3886912_3888175_+|SufS-family-cysteine-desulfurase MTSTAPKIQTLTIADRTRADFPILNQEVNGQPLIYFDNAASSQKPIAVLDAWRYYYEHDNANVHRGAHTLSARATDAYELAREKVAKFINARSSQEIVYTRNASEAINLVAYSWGMANLNKGDEVILSAMEHHSNLVPWQMVAQKTGAVLRHVQITDSGELDLEHYKTLLSDRTKLVSIVHVSNTLGCINPIAEIISLAHDRGIKVLLDACQSVPHMPIDVQAIDCDWLVASGHKMCAPTGIGFLYGKLDLLREMPPFLGGGEMIAEVYLDHSTYADLPHKFEAGTPAIGEAIALGAAIDYLQNIGMDKIYAYEQELAGYLLKRMLEIPEIQIYGPLDHRAALVAFAPKAGFHANDVAEILDQSGVAIRSGHHCTQPLHSHFGITGTARASLYFYNTVAEIDAFMGHLREAIAFFKNIMG >NC_019701.1|WP_015166310.1|3885601_3886258_-|hypothetical-protein MTVAVENLLAQCALKSTGSGLVIDCPSISVANLLWEQRQEWIGITRLFHHSGKIKLVVKGQDFASPFNPFPEQGLPNFSDRVRQSMDDNLLRAPQKLDYRDILDFVRDAGDPVCVTNHLTNTCLLLNDRFSADRITWMPAQYIGINFLWLWRDSMDDYEVLQRELRQNGRVDNFTFRLRRVDGSMAEYTKDFFIADDFLGYPARISISKDWRPLSVAH >NC_019701.1|WP_015166309.1|3884776_3885529_-|SDR-family-oxidoreductase MERTRNKDRVALVTGSTSGIGLAIAKQLAIDGFTIAFHSKASIETGQALAQSYENASYNQADLADQDQASELIAEVLAHHDRLDVLVNNAGITAEIPHHELKQATPEIWRQLHEVNVIAPWTLIAEAETALREASGQDYTSCIINISSHAGIRPKGASIPYAASKAALNHITRLLAVSLAPEIRINGIAPGLVDTSMSKNWTDAQNLWRQRSPMGRGAQPAEIAQIASMLIASSYLTGEIVIADGGLNLT >NC_019701.1|WP_015166308.1|3883983_3884670_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKSLVSQALDRTMFEFKISGAQLSRQSGVSQSQLSQFRTGKVDISTSNFVKIVRALPDEARRYYLSLVFNVGWESALLQGMPAEVASNRLASSGMNEGRPESASALVQFIRAWLERNQVTMMEFELAIQQRTNLTLAKLKEIVAGRMPTETELGYLGMVLRDDRNQPFEFEYLKAICEQNSIPSANSTNSSNPGNASSGQSRNSPNSPNSPNSKENDPQNGDCSPQPN >NC_019701.1|WP_015166307.1|3881521_3883117_+|peptide-chain-release-factor-3 MNQLQQEVDKRRTFAIISHPDAGKTTLTEKLLLYGGAIHLAGAVKARASQRHVTSDWMELEQQRGISITSTVLQFNYQNFCLNLLDTPGHKDFSEDTYRTLAAADNAVMLEDAGKGLEPQTRKLFEVCRMRSLPIFTFMNKLDRPTRDPLELLDEIEQELGLTPYAMNWPIGTGDRFRGVYDRQSGTIHLFNRVKHGQQAAEVEIMLPDDPRLADLIEPDLYEQMLEEIDVLDSIGAEWDQAALHSGKMTPVFFGSAMNNFGVELFLKSFLQYALKPTNHDSTAGNVAPTDQDFSGFVFKLQANMDPRHRDRIAFVRVCSGKFEKDMTVTHVRSGKNVRLSHAQKLFAQGREALDEAYAGDVIGLNNPGVFTIGDTICTGKKLQFAGIPQFSPEMFAYLRNPNPSKFKQFRKGVSELQEEGAIQIMYSSNEAVRDPILGAVGQLQFEVVQHRLQSEYGVDSRLESLPYSVARWVEGGWEAIEDAGRLFNTMTVKDMLNRPVLLFKNSWNLDQIRSDHPDLKLSASAPVLTL >NC_019701.1|WP_015166306.1|3880696_3881191_+|hypothetical-protein MQFIDAKQAYPLVLGVALALIGVAIWQRFSPPPTPQTIEPRVVIPPLPSSIPRPSPASGISEGLLRVGNRSDFSVRVVLLASRGNEVDWNQVEPLNWDFAPNEGGSEGLILSLPGEQVKIAEGDIVFAFATDGSRTYWGPNVVGETDAPFWDSDRQEWSMILQP >NC_019701.1|WP_015166305.1|3878582_3879965_+|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MLAVAILAAGKGTRMKSDLPKVLQDLAGKSLIERVIDTAEQLNPDRILLIVGYKSDLVRTALQDKIAANPKIEFVEQAEQLGTGHAIQQLLEPLADFSGDLVVLTGDSPLLRSTTLHELVTIHRDRQVPATVLTAILPDPTGYGRVFCDDQNQIERIIEHRDCTPEQRQNQRVSSGMYCYNWPELAAVLPKLSTNNDQKEYYLTEVFDYLSPVLAVDVADYEESFGINDRVQLSHAYGVLQERTKTKWLRAGVTMLMPETISIDETVEIEPNAIIEPQTHLRGSTRIASGAHIGPGSMIVDSTIAAGARVQFSVITNSKVGTNCRVGPYAHLRDQTVIGDHCRIGNFVELKQAKIGQKTNAAHLSYIGNAKLGDKVNIGAGTITANYDGFQKHETIIGDRAKTGSNTVLVAPVTLGNNVNVGAGSVVTEDVEPNALVIGRARQVVRPDYYDQSGRKRTKP >NC_019701.1|WP_015166304.1|3877911_3878250_-|YbaB/EbfC-family-nucleoid-associated-protein MPQGQGFGFGLGKMKEAFQKAKQIQEGAKQLQEELEEMRLTAESGGGLVKITLTGNQEPCAVEIDPKALEESPEMLSDLVLTAMKEAYALSTATMKERMEELTGGLGLPGAF >NC_019701.1|WP_015166303.1|3876148_3877345_-|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MKLLRIFPFFDSSVSRWAAEARIIRWLTFLWLFVGLVVLFSASFPNADGLGDGFYYFKQQLIWAALALIIFNITVHFPLRLTIKIGSIGLFVVLLLLFATYIPGIGEARNDSTRWLKLGSFLLQPSEFIKPFLVLQAANLFGRWKQTGLLAKLFWLLVFAISLLGILMQPSLSMTALSGMSLWLMAMAAGIPWYQLTGTAVMGVAAGVFSIATKEYQRRRLMSFLNPWVDQAGDGYQLSQSLMAIGSGGTWGTGFGLSNQKMFLPFQYTDFIFSVFAEEFGLVGCIALIAMLLIFASLGFRVALMCKDAVVRLVAIGSTVFLVGQAFLNIGVASGVLPTTGITFPFFSYGGSSLLSSLAIAALLVRAAREMSAAEIISIDRFNVQERRDRLREKRYRS >NC_019701.1|WP_015166302.1|3875417_3875801_+|photosystem-II-oxygen-evolving-complex-protein-PsbU MKKLFSFLIAIAAIFTICLSSLYVPATSSYAWAEDLPETNFYTRSSKKIDLNNANVYAFRSIRGMYPNLAKKIVANAPYDKVDDVLNIADLSETQKQTLKDNMDQFDVRQPDPSLNRERINNSSYRL >NC_019701.1|WP_015166313.1|3888953_3889178_+|hypothetical-protein MANLFETNFPNIVIWVESYGYIEIGDIEDSDSYVRAMKEGDPIWEGGNSYASLDEALQDLEEGITEWLEEHGEL >NC_019701.1|WP_156800542.1|3889432_3890794_+|FAD-binding-protein MLKKRINNSIAPTSGETGASADRPDHSICCVVYPQSQVQLSEAIALAHENKWRVIPCGNGSKIDWGGLASGAEVVVSTSRLNHLVEHAIGDLTVTVEAGINFIELQSVLAEANQFLAIDPAYARRSTLGGIVATGNSGSLRHRYNSVRDMCIGISFVRYDGEIAKAGGQVVKNVAGYDLMKLLTGSYGTLGIISQLTFRLYPLPEASGTVIVKGSNEAIARLRTELLSATLTPTVVDILSNQAMEHLGYGKSLGLVIRFQTIPASIKEQSDRVQELAKSVQLAKPMEVDVIAETAEADTWQAIDNLYWHGDRENYTRSNTALPQAIVAKIGVLTDQACLLITEIEAIVAQRLPNFTAYVRVHASSGLGILRLQPNENTGEDYDYQAIVAIKEAIDKIRYLVSRKEGFLSILEAPVALKQEIDIWDYSADTLTLMKKLKQEFDPQGMFSADRLV >NC_019701.1|WP_015166315.1|3890862_3891519_+|glutathione-S-transferase-family-protein MQLKLVIGNKNYSSWSLRPWLVLKQLGVEFEEILIPLFVGDWRQQIGQYTPAGKVPVLICDHFAIWESLAIMEFLVEQFPEANLLPTDPAARAMNRSIAAEMHAGFINVRTHMPMNGRARYPGMGRTIDVLKEINRITTIWRDCRNRYGSGGDLLFGHFTIADAMYAPVVLRFVTYGVELDPVCQAYLEAVLNLPAMQEWLAAGAIEPYTIANYEYQV >NC_019701.1|WP_015166316.1|3891574_3892030_-|acyl-CoA-thioesterase MYIHQRQIYFKDTDAAGVVYFANALSICHESYEAALRDFGVDVREFFSDRGGYAVPIVHAEIDFYQPVFCGDRLVIQVLPEQRSLYSFQINYQIFANCEADLVAQDIQLNAKQKPCAKAITQHVCISTSDRRKTELPDQLTQWLANYSPTD >NC_019701.1|WP_015166317.1|3892614_3893847_+|coproporphyrinogen-III-oxidase MPVFTNQATTKSIYLHIPFCDRKCFYCDFAITTGGENLKREYVEAICAEIKLTAAQERSASNAINQGSCIKGDRPPLQTVFFGGGTPSLLTVAQLAMILAAIRTSFGIAENAEISIEANPGTVSIESLSGYKSLGVNRISLGVQAFQAHLLNICGRAHGVAEIFSAIAAIKAAGINNFSLDLISGLPEQTIADWQESLDLAIELQPTHMSVYDLTIEPGTAFGKRYVPGDQPLPTEATTVEMYLIARQKLIAAGFEHYEISNYAKPGYQCQHNLTYWHNQPFWGMGMGATSYVGQRRIDRPRKMRDYLNLVKNWQEQDIAPTAPMITPEEELLDTLMQGLRLAEGIGLSDLEQKYGQGLIEKVMATLQPHFDRGWARIINKPNPHLILTAPEGWLMSDQVIGDLYRSLID >NC_019701.1|WP_015166318.1|3893988_3894288_-|DUF2288-domain-containing-protein MEEKDLKTQLTEMIDVAEWEWLEPHAQKGNLFLVNANLSVLEVGLAVAEDNTEVVQRWLDDGMLQRPSQSQMDYWQSADAPKFESLIVHPFILSKEQPA >NC_019701.1|WP_015166319.1|3894542_3895262_-|uracil-DNA-glycosylase MSDPEQISLFNLGDDQESPPKTTTDTAKSSSTAIYANLEELRQEASGCQKCGLAETRNKVVVDRGNPKALIMIIGEGPGEEEDKTGLPFVGRAGQLLDKIIASVDLDREQDIYVCNVVKCRPPGNRNPTPDEMAACKPYLLEQIRLIDPKIILLTGATAVKAVLGDKTGITKLRGKWRDWEGRLVMPILHPAYLLRNPRREEGSPKWLMWQDIKAIKAKLLEFKAELANGNGDQDDDDF >NC_019701.1|WP_015166320.1|3895503_3896484_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MATPDHLNFAQQDLRNRCFRQHYLRDANFEGADIRGCDFRGATLVNASFEHVKAGLSQRQVLIMLVYGAFLTVMIFEAIFFALIGQTATAIALITGMAAAVALVLEIPGSLLVVVLITAIATISDRASFSLAIAISLVFLTLVAASWQRLLYFLAATAAGFLVVALSGFAGNLAEAIASPHVMITAIVFAGVVVALIERDLPKKNARYVPTGMIAIMAIFGLLAFLGAIFMQAGFVAVAQLQLTLALMHFALMLMAIAGAAVFGLEIPKTINQSIGTSFRDADLTDANFNHANLANTDLSYARTNGTNWGSAQFRKCVAYKFSSRT >NC_019701.1|WP_015166321.1|3896549_3897458_-|vitamin-K-epoxide-reductase-family-protein MLRRRSSPWIHRKSRLLIAGVASLGAVITAYIAIPVLFGGKVTCPVEGCDKVLESSYAELFGLPLALFGFLAYAGMIAISVAPLFINAETNLPLRKKLEEFTWPLLFLGGASMAIFSGYLMYVMAAEIKAFCIFCVVSAACSFSLLVLAFIGKEWKEISQLIFAFVIIAMVTLVGTNAAYQISNGGNTRSDIRTASAPANVVLAEHLTASNVKMYGAFWCKFCKDQKEMFGREAFSKVDYVECDPQGKNPRVEMCQAAGIQRYPTWEVNGQLSPGVFALEELAAMSGYEGDVSFGNPAPSSS >NC_019701.1|WP_041699886.1|3897700_3899368_-|citramalate-synthase MQTTNQPIVIYDTTLRDGAQTEGLSMSLEDKIRIAHKLDSLGVAFIEGGWPGANPKDGEFFQRLQAEPLVNAEVVAFCSTRRPGTKANEDPMLVPIVAAGTKWITLFGKSWDLHVTEGLRTSLDENLAMITDTIAYLRGRDRHVIYDAEHWFDGYKANPDYALQTLGAAIDAGAAWLVLCDTNGGTLPDEVAEITDAVIAHFGDRLTLSNLGNQPGRENQSNQVRLGIHTHNDAGVAVANALAAIKHGAMMVQGTINGYGERCGNANLCTVIPNLQLKMGYPCLAETQLQQLTDVSRQVSELVNLAPYEHAPFVGLSAFAHKGGIHVSAVKRNPKTYEHIEPETIGNRRRIVISEQSGLSNVLSKAETFGIKLDKNDATCRHILQQMKELEQNGYQFEAAEASFELLMRQAMGDRPKFFALSGFRVDSDSDPDGNVHVVAIIKVLVKGEEKLIASEGNGPISALDAALRKALVEFYPAIAQFHLTDYKVRILNSNDGTNAKTRVLIESSNGEERWTTLGVSSNIIAASYQALVEGLEYGLILAQAKEPIAAGLSQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019701_2 | 2.14|2207577|33|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2207577-2207609 | 33 | MN694106 | Marine virus AFVG_250M510, complete genome | 9123-9155 | 5 | 0.848 |
NC_019701_2 | 2.12|2207435|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2207435-2207468 | 34 | NC_017791 | Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P2, complete sequence | 72708-72741 | 8 | 0.765 |
NC_019701_1 | 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 842355-842389 | 35 | NC_021727 | Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p1BJAB07104, complete sequence | 47674-47708 | 9 | 0.743 |
NC_019701_1 | 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 842355-842389 | 35 | NZ_CP018422 | Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence | 6528-6562 | 9 | 0.743 |
NC_019701_1 | 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 842355-842389 | 35 | NZ_CP018144 | Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence | 1897-1931 | 9 | 0.743 |
NC_019701_1 | 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 842355-842389 | 35 | NC_017848 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence | 39702-39736 | 9 | 0.743 |
NC_019701_1 | 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 842355-842389 | 35 | NZ_KM922672 | Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence | 47674-47708 | 9 | 0.743 |
NC_019701_1 | 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 842355-842389 | 35 | NC_021731 | Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p2BJAB0868, complete sequence | 47674-47708 | 9 | 0.743 |
NC_019701_1 | 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 842355-842389 | 35 | NZ_MK386682 | Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence | 17034-17068 | 9 | 0.743 |
NC_019701_2 | 2.12|2207435|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2207435-2207468 | 34 | NZ_CP029356 | Azospirillum sp. CFH 70021 plasmid unnamed1 | 252773-252806 | 9 | 0.735 |
NC_019701_2 | 2.17|2207802|33|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT | 2207802-2207834 | 33 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 206742-206774 | 9 | 0.727 |
NC_019701_2 | 2.12|2207435|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2207435-2207468 | 34 | NC_012811 | Methylorubrum extorquens AM1 megaplasmid, complete sequence | 705732-705765 | 10 | 0.706 |
NC_019701_2 | 2.12|2207435|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2207435-2207468 | 34 | NC_017078 | Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1, complete sequence | 20387-20420 | 10 | 0.706 |
NC_019701_6 | 6.13|3412095|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3412095-3412129 | 35 | LN878149 | Cronobacter phage Dev-CD-23823 complete sequence | 24432-24466 | 10 | 0.714 |
NC_019701_2 | 2.22|2208154|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2208154-2208190 | 37 | MT074467 | Salmonella phage falkor, complete genome | 11652-11688 | 11 | 0.703 |
NC_019701_2 | 2.22|2208154|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2208154-2208190 | 37 | MN197465 | Salmonella phage 2-3, complete genome | 97791-97827 | 11 | 0.703 |
NC_019701_2 | 2.66|2211352|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2211352-2211388 | 37 | MT074467 | Salmonella phage falkor, complete genome | 11652-11688 | 11 | 0.703 |
NC_019701_2 | 2.66|2211352|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2211352-2211388 | 37 | MN197465 | Salmonella phage 2-3, complete genome | 97791-97827 | 11 | 0.703 |
1. spacer 2.14|2207577|33|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694106 (Marine virus AFVG_250M510, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
-tctgtacagttcgtgggcgatgttacctatgtt CRISPR spacer ctctaccca-ttcgtgggtgatgttacctatgtt Protospacer ***.. ** ********.***************
2. spacer 2.12|2207435|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017791 (Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aatcacccagaggaggcgatcgccagcttcgggc-- CRISPR spacer aatctcccagaggaggcgctcgcc--ctcacggtcg Protospacer **** ************* ***** **. **.
3. spacer 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021727 (Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p1BJAB07104, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tatttaaatcagtatatttatctaagtaaatcaac CRISPR spacer cagacagatctgtatatttctctaagtaaatcatt Protospacer .* .*.*** ******** ************* .
4. spacer 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018422 (Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tatttaaatcagtatatttatctaagtaaatcaac CRISPR spacer cagacagatctgtatatttctctaagtaaatcatt Protospacer .* .*.*** ******** ************* .
5. spacer 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018144 (Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tatttaaatcagtatatttatctaagtaaatcaac CRISPR spacer cagacagatctgtatatttctctaagtaaatcatt Protospacer .* .*.*** ******** ************* .
6. spacer 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017848 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tatttaaatcagtatatttatctaagtaaatcaac CRISPR spacer cagacagatctgtatatttctctaagtaaatcatt Protospacer .* .*.*** ******** ************* .
7. spacer 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KM922672 (Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tatttaaatcagtatatttatctaagtaaatcaac CRISPR spacer cagacagatctgtatatttctctaagtaaatcatt Protospacer .* .*.*** ******** ************* .
8. spacer 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021731 (Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p2BJAB0868, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tatttaaatcagtatatttatctaagtaaatcaac CRISPR spacer cagacagatctgtatatttctctaagtaaatcatt Protospacer .* .*.*** ******** ************* .
9. spacer 1.8|842355|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK386682 (Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tatttaaatcagtatatttatctaagtaaatcaac CRISPR spacer cagacagatctgtatatttctctaagtaaatcatt Protospacer .* .*.*** ******** ************* .
10. spacer 2.12|2207435|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029356 (Azospirillum sp. CFH 70021 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aatcacccagaggaggcgatcgccagcttcgggc CRISPR spacer ctgcggacggaggaggcgatcgccagctaccggc Protospacer *. *.******************* * ***
11. spacer 2.17|2207802|33|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gataatagagaaatccaaaaatt-----acctattggc CRISPR spacer gataatagtgaaatcctaaaattagtaaaacca----- Protospacer ******** ******* ****** * *.*
12. spacer 2.12|2207435|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012811 (Methylorubrum extorquens AM1 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aatcacccagaggaggcgatcgccagcttcgggc CRISPR spacer gccaccccggaggaggcgatcgcccgcttcgccg Protospacer . . ***.*************** ******
13. spacer 2.12|2207435|34|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017078 (Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aatcacccagaggaggcgatcgccagcttcgggc CRISPR spacer gaaaaattcaaggaggccatcgccagctacgggc Protospacer .* * .. .******* ********** *****
14. spacer 6.13|3412095|35|NC_019701|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN878149 (Cronobacter phage Dev-CD-23823 complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttgccaccgccagattggagccaaacagcttaat CRISPR spacer agcacgcccgccagattgcagccaaccagcttgag Protospacer ..* *********** ****** ******.*
15. spacer 2.22|2208154|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT074467 (Salmonella phage falkor, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aactttcatacccttcacctcatttactacacgccgt CRISPR spacer aactttcatacacttcacctcttttattctttttcac Protospacer *********** ********* ****.* . . .*..
16. spacer 2.22|2208154|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN197465 (Salmonella phage 2-3, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aactttcatacccttcacctcatttactacacgccgt CRISPR spacer aactttcatacacttcacctcttttattctttcttct Protospacer *********** ********* ****.* . . .. *
17. spacer 2.66|2211352|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT074467 (Salmonella phage falkor, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aactttcatacccttcacctcatttactacacgccgt CRISPR spacer aactttcatacacttcacctcttttattctttttcac Protospacer *********** ********* ****.* . . .*..
18. spacer 2.66|2211352|37|NC_019701|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN197465 (Salmonella phage 2-3, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aactttcatacccttcacctcatttactacacgccgt CRISPR spacer aactttcatacacttcacctcttttattctttcttct Protospacer *********** ********* ****.* . . .. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1480082 : 1490865
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019701|1480082:1490865|DBSCAN-SWA CTTAGGCGCGCCCAGCCCCGGACTTATCTGATTCAACTCGGAAACGTTCCACCGATTCTTGCAAGCCACGGGCAACCCCCACCAGATTTTGGAGTGAGGCCGACACCCGTTGTGATTCTTGCGATGTTTCTTGGGCGGTCAACTCAACCGATTGCATAACCTGTGCCACAGTACGGGACGTTTCGGTTTGCCGGATCGTATCTTCCGTAATCGATCGCACCAGTTCGTCAATCCGCTGCGATACCTGAATAATATCATTTAGCGACTGTCTGGCCTGTTCAGCCCGTTTGGTACCATCGATTACCTGCTGCGTACCCAAGTCCATTGCTTGCTGCACCGTACCAGTCTCACTCTGGATTTGCAACACAATTTGTTCAATTTCCTTGGATGCTTTGGCGGCACGATCGGCTAGCTGCCGCACCTCATCAGCCACGATCGCAAAGCCCCGTCCGGCATCTCCTGCCCTGGCCGCCTCAATACTAGCATTAAGCGCCAGCAAGTTGGTACGGGAGGCAATCTGGGAAATCAAACCCACAATCTTAGAAATTTCCTGCGATGATTCACCCAGCCGTTTCACCTTACGGGTAGTTTCTGCCACTGTTTCTCGAATGTCCAGAATCCCAGCCATCGTCAGTTCCACTGCCTCGCCGCCTTTAAGGGCAGTTTGCGAAGCCAGTTGAGCTACATCCTCAGCTTCACGGGCGCTATCTGCCACCCGCTGAATCGATTCGGTCATCATTTGCACCGAGTTTAGAGTCACACTCAGTTCTTCTGCTTGTCTGAGCGCATCAGACGACAAACTACGGGCAAAACTTTCATTTTCTTTGGCCGCCTCACTCACCTGCTTGGCAGCGGTTTTCACCTGTTGCACAATCTCGCGCAGGTTTTGAATGGTGAGATTAAACGAGTCAGCTACGGCTCCTAGTACATCAGCGGTCACCTCGGCCTGCACGGTCAAGTCACCTCGCGCCGCACCTTCTACATCATCCAGGAGGCGGATCACCTGGCGTTGGAGGTCTTCCTTGGCTTGTTCTTGCTCTTCTGCTTTGCGCTGTGCTTCGGTGGTGCTGGCAATGATCGTTTGAATCATTTGGTTAAACGTCGAAGACAGCTTGCCAAATTCATCATCGGCATAAACCGCAGCCCTGGGATTCATCTCCCCATGCATCACCGACTCAAACTGGGCTTGCAAGTTATCGCTCGATCGCTTCACCTGACGGGTAGTCCGCGAGCCTGCAAACAAGGCCATTCCCGCTCCACCAAGAAAGGCCGCCCCTGCCATGGCAACTCCGCCAAGTTGAATACTTTGCTTGGCTTCCTTCTCAACAGGGATGCGTGCCACTGAAATGTTAAACACAAAAGCTGCAGCGATCGCTGCCACACCACCGGAAACAATTGCTGTAATCACATTTTTCTGGGGCAGTGACATGTTATCGAAGAACGAAAGCATGCCCTGATCGCTTGCTTCTATGCTGCTGCTGGAGGATTCACTCACCGATGGCTTAGAAGTACCCAGCGGTGCACCACTACTAAGCCCAAACAACTCAGCTTCTGAATCTGGCAACGATTGGCCAAACCCACCACTCGGATCGCCCTGCCCCATCAATGGCTCCGCCCCCAGGGAGCCAGACATGCCAAAGTCAACCGCTGAGGCTGAGGTATTAAAACCACTGGACTCACCACCAGTCACCATTTGGGTCGCATCAGATTCATCGAATGAGCCAGGGAAGGTTGCGGCTAGATCGCCAATTTCGTCAAAGTCATCAAATTCATCAATAAATTCATCACCGCCAATGCCTGTGCCTGGATCAAACATCTCAGCGGCGTTATTACCAGCCATCTGTGTGTCAGCGGCATAGTCAAAGTTTTCCATATCATCGGCGATATTGATGTCATCAAAGTTGAAATCATCACCATCACCAAGTTGGTCAAATTCAGCTACATCATTAAAGTCGCTGGGGGGCGAGGCATTGTCTGGCGGAGCCATGCCACCCGCTTGTAGGTTAGTGCCCCGATTGGCCTGGAGGTTGGTGGCCACCTGGGGCATTTGCTGGGCATTATCGAAGGCAAACGTATCATCAAAGTCCATGCCGCTGAAGTTGAAGTCATCGCCAGGTGTGGCAAATGGACTGCTGTACTCCTCGTCTGGTTGGGACTGGTCTTCGCTGGCTAAGTTATATTCGTTGTTGTCGTCACCATAATCAGCATTTACTTCGCCTGTTGCCGATTGATTGAGCCGCTCGCTGGCTGTGGACATACAAATGCTAGCGTTTTCAACTAGCTGCGTATCTTCAGTTAGATTCAGCACAGCTTGATACTCTGCGATCGCATCTTGATATTGTTCCAACACCAGATTGACATGGCCATGCAGCAATCGATAGGTGGGCTCATCTGGACATGCGCCGACTAGCTGCTGTGACAGATCCATGGCACGCTCATAGTCACCTTGCATATATGCTAGTGAGGCTCGATCGTAGTCCTTCTGTTGTTGAGTGCTAGATGCCATTTGTTTCTCCTAATCCATAATCTGCTGCCGCGGTTTAGTCCGTGCAAACTACTACTTAACTAGCTAAGATGCCCAACGCGCCGATCGTGATATGTTTACATGATCTAAAAGTCTCAATGACATCTCGTCTGGCTCGATCAGCCACTCACCTTTCAAAAAAGGAGCCATACTGTCAGGACTATTTCTGGAAACTTTTAATTTATCAGGATCTAGCCAGGCCATTACACCAATCTTTTCAATTGCCAGCCCCAATAGTAGCCCCTGGTCTTCGATCGCAATAATAGAAACTTCTGAGCGATCGGTATTGACTGGTGCTGATTCACCTAAAAACTGACCGAGATCGCCAACCCAAACCACCCTGCCTCTTATATTAATAGTACCCAATATTAGCGGGGAAACATTGGGCATTGGATTTATGCGATCGGGTGGATATTCGATCACCTCTTTGATCCCCGTTGCTGGCAGGGCAAATTCCAGCCCTGAGGCCGTAAAGAACCGTAAGTGCAACTCACCCTCAGGTGCACCAATTTCCTCTTGGAACTCAGGGTCTTGGCCTGGGCTATTCCCAAGTAAAAAGTCTGGATTTCCGACCATGGCTTAAAACAAACTCATAAATCATGTAAAAATTCGGGAAAATCAGTTTAATCGCTCTAGAAATCAGTAAGACAGATAGTACAGCTAGTTAAGTCGTTGCAGTAATTGAAGATAGCAGAAAAGTCAAAATAAAAACTATTTAAATACACCAGTTACTAATTATTACTAATTATTACTAATTAATTACTAATTATTTGATTGCTTAGGCTGCTTTTGTACTTTCCTTTCATCTAAATCATCTATATTTATCTATGAAACATGGCTAGATGTTAACGAACAGATGGTAAATAATCAACTCTAATTAGTTTTTGGCTGCAATTACTGCAGTTAATTAGCTGTTTGGCCAGATTTAAGTAAATTAGCGAGGTTATTAATCCAGGTTATTAATCTGAATGATTAACTAATCCGATCGCCAAACCTAAACCAGATAAAATGCGTCCCCCTTCTTTGCCACCGTGATATTTACTTGATTTACTAAACCTTTTTGTTTACTAAAGTCTTTAGCCTACTTGGTTTGTCAATCACCTAATTCAATATTCAATTAATTCAACTAAGCCAATCGCTTAAAGCGAATTAACTTACCCGTTATTTATTGCTATTGATTGCGCAAGAGTTGCTTTACCGTTCCGACCAGTTCTTGGGGTTGAAATGGCTTGGCAATATAAGCATCAGCGCCTTGGCGCATCCCCCAATAGCGATCGAATTCTTCACCCTTGGAAGAACACATCACCACAGGCACCAGTTGGGTTTCAGGATCTTGTTTGAGTCTGCGGCATACCTCATAACCATTCATGCGTGGCATCACAATATCGAGCACCACCAGATCTGGTCGATCGTTGGCTACTTGCGATAATGCTTCAACTCCATCCCCAGCACTGACCACCCTTAAACCGCTATCGCGGAGTAGGTTGGTGATCATTTGCCGCTGCGTAATACTATCTTCAACTACCAGAACCATATTCATTCCAGTTTCCTTAAGCCTTGTTCATTGTGGCAATTAAGCCTGACTGCAAACGATCGGAATTTTTAACCACCCTGAACTACTAACATATAACTAACATATGGAAGTCAGCAGGATTGATTTAGCAACTTTAATCGATCGACCCTTGCGATTAAGCTAAGCCTTAAGCGGCTAATTTAACCAATTAAATCATCGATTTAGAGACTTAATCACAGCTAACTACTTAACTATATATAATCTCACACCTGCCCCTATAGCTTATATGAATTAGCCCAGCTTATACCCTTGCCAAATTGCCTATTTAACCCCATTTTTTGCAAACTAGAACCCCGACAGGCGATCAACAGGCCTATCTGCAACAAAAATTAACAATAATCTAGGTTTTGCGCAGGAGTTGTTTGACCGTGCCCACCAGCTCTTGGGGTTGAAATGGCTTAGCAATATATGCATCAGCACCTTGGCGCATCCCCCAATAGCGATCGAATTCTTCGCCCTTAGTCGAGCACATTACCACCGGCACTTCCTGGGTCTTGGGATCAGTTTTGAGGCGGCGGCATAACTCATAGCCATTCATGCGCGGCATCACAATATCGAGCACTACCAAGTCAGGGCAGCTCCCCGATATTTGCTCTAGGGCTTCAACCCCATCGATCGCTGCACTCACACTTAAACCGCTATCTCTAAGTAAAGCCGTTATCATTTCCCGTTGCGGGGGGCTATCCTCAACAACCAAAACTTTATTCATAGCAAATCCCTTTAGAACCTCAGCAAGCTGCTCACTACAATTACGATCTAACTCCTAGCTACTGCTAATTCCTAGTATGTCCAGGTTGCTCCCATCATTTTCGTGGTAGGACTCAAAAGCAGCGATCCCCTCTGAATTGATATGGCTATTGGCCAAATATTTTTCCACCATCATCAATAACTCCTTCTCACCAAAGGGCTTAGTTAAATACTCAGTTGCACCAACCATGCGCGCCTTTACTCGATCGATAAAGCCATCCTTGCCTGTTAGCATAATAATCGGCTTTCGGGCAAAGTAGCTAGACTTTCTAAACATGCCGCATAATTCGTAGCCATCTAAATCGGGCATAGCAATGTCGCAAAGGATTAAATCTGGTTTGAGCTGAAATACTAAGCTAAGCGCCTTAATCGGGTTGGAGATCGCCGTTACCTGGTAGCCATTGTTATGAAGAATATACTCTACCGCCCGGCAAATTGTGACACTATCATCGATACAAATTATCCGCAATGCTTCATGTCTGGGTTTGGTAGTTACTGGCAAAGCGAGAGGAGCCATTGCTACCGCCCCACTTAAGATCCCTGTATACATATTTTTGGCGATCGCAAAGATACTCTGGTTACCATAACGCGCCAGTTGGCGGAGCGAGGTCTTGCCATTCACCCATTGATTCAGTTTGGGCAAGGCACCATCAATGGCGATCGCTGGGCATTGATCGGGCGATTGGATGTAGGGATAGAACCGATACCAAGCCTGTAGCTCGATCGTAATTTGCTTGAGCAGGGGTGAAAGCTTGATGGTGGTGAGCTGTGGCGCTAAGGAAGCACCGAGTTCAAACACAAAATTACCCTCATGTAAGCTGAGAATATCAAAGAGCACCTCAACAATCATGGCTCGGATAATTGCTTTGGCCTGCTTGGGGGAAAGCACCTGAGACTCTAGTAAAGCCCAAATCTGGCCATATTCAATCACATTGATGCCCAATTTGGCCGTTAAAACCTGTTCCAGGGCGCTGTCGAGATTAAGTCCATGCAGGTAATCACGCAGGCGATTTAAGTTACTGGTTGGGTCGGTTGCATAGGTGATTTCGCCATTCACAAAAAACACAAACCACGATCGCCCCGTGTTGGATTCGATCAATAATTCACCAGTACGCTGCCCCAGCTCAATTAGCCTGAGAATACTGGTCACATCTATTTCCTTCAGCGTCCCCTGCATATTAAGTGGTCTTGCTTGCCCCTTAAGCTCTGGTAGTTTTGACTGTCGTTAACTTAAAATATCTCAATATCTGAAATATTAATTATCTCAACATCTCAATTATTGGCGATCGAGACTTAACTTTCTTGGCGATCTTAGTAGTAGGTATTGTTCCAGCCTACTTAAATGCGATCAATCCCAATAAATTAGTTACATCATAGTTAACTGTGTATGTAGTGTAAGATCTTTGGCGGTAATTTAGGGCTTTTAGCTAACATTTTATTGTTTGATCTGGTTGGATTTAACCCAGTGATGCGATCGCGGTGAATTATTTGTCAGGTTTTAGCTCCTTGTCTAAGCTATGTTAAATATGTCTCAAACCTAAACATATTATTAGATATTAGCCATCGTAATCCCGGTTAATTCTACCTGGCTGATTCCCAATAGCCCAAACCTGCCTATGTAGTGATATTTAGCTATTAAGAGCAAGAATAACTCAAAATCCCTTAAATAGAAATCTGTACTTCTAAGTAATTCTAAATTACGCCACAAAATAGCAATAGTCCTGGCTGTTAATTCATTATGCCCGTATTTAAATACAAACAACCCAACTCGGCAATGGTATAGGTTATTTAGATTAATTTGTCTCAGCAGTTTTTGATGTATCTGATTTCAGGTTGATTTTGAACAAGCCAAATTTTGAACCGTTCTGGCAATTTGAGTGCGATCGCCATCCTGTTGCCGGTGTAGACGAGGTGGGTCGGGGTGCTTTATTTGGTGCAGTGGTGGCGGCGGCGGTGATTTTACCAGTTGAGCCTGTCGATCGCCTTGCGCTTGCTGAGCATAATCATACTGGCTGTTATGGGCAGTTAGTATCGGCGGGAGTCAGGGACAGTAAGCAACTTAGCGCTACCCAACGCGATGAATTGGATTCTTTAATTCGTTCTGTAGCGATCGATTGCCAGATTGGCACTGCCTCGGTGGCGGAAATTGCCGAGCTAAATATTTTGAATGCTAGTTTGCTGGCAATGGAACGGGCGATCGCCCAACTGCAACCCCGGCCAAACCATTGTTTGATTGATGGCAATCGGCAAATTAAATTTAAAATCATTGCCCCAATTGACCAAACCACAGTGGTGAAGGGAGATCAAAAGTCCCTCTCGATCGCCGCAGCCAGCATTATTGCCAAGGTGTGGCGCGATCGCTATGTGATTGATCTGGCAGAGAAATATCCTGACTATGACTTAGTGAATAACAAAGGCTATGCCACCGCCAAGCACCGCCAGGCAATCAAAGAACTTGGTTTTAGCGATCTACATCGCCGTAGTTTTAAGCTCCAGGAGTTGGCAGGTAATGAAAATCTTAGTTCTCAACTGCCTGACCAACAATTAGATTTACTTAATAACTGAAACTGAACAAGGCTAGCTAAATGAATTAAAAGCGAGCATTAAACGAACATTATCTGAGCATTAACGGAGCAATAGGATTTTTAGGCGATTCCCAACCATAAAAAGCTCAAGGATCTAAAGGTTATGCCCCTAGATCCCAGCAAAAATAAATATGCTTGTGAACTTACAATGCCAAGACTAAGGCAACTTTATGCGCCGATCGCTCATCACTCACAATCGATCGCAGCATTGCCACATAAACTACTTCAGCCGTTAGATTATTAAACTATTAGACTGTTTAAAACACTAAAAAAGCCCTAAATATGTGGCTGCAAACGCTCATATAGCTGATCGGCAGTAACAGCACCCTCAAAGCGATCGACCGGCTTACCATCCTTGAAAATCATCATCGTGGGCAGGCCATGAATGCCATATTGCGAGGCCAGCCCTTGGTAAATATCCGTATTGATCTTTACTATTTGCGCCTTATCTTTGACTTGGGGGCTGACCTGTTCTAGAACCCTGGCCATAATCTGACAAGGGCCACACCAGGGAGCATAGAAGTCAACTAAAATTGGCAACTCCGAACTTTTCAAAAGATCTTCAAAGCTATCAAACTGCTTCTTTACGGCCATATTTCATTACCTCCAATTGTGGATATATGATTAAGTTAGCGATCTCACATAGCTGCTTTGAGATCTATGGGCAGCCTAATTAATGATCAAGCTAGCCCACTCAATTGAGATTAATTTAGGTCATTGAAACTACGGGATGCTGATTTAGACTCTACTAAAACCGAATTAGAACCAAATAACCACAAATAGCTAGGATTACATCAATTCTTTTCAATCTATCTACTAGTGTACTTAGTTTTGCTTGGGCTTTGCTTGGGTTTTGCTTGGGCTTTGTTTAACAAAATCAGGCTGATCTAACTTGTTTAAGTTAACTTGTTTGAGTAATGCTAACCGTAACTAAAAAAGGAGCATTATCGCCCGATCGAAAGCATTTTTTTAGATCTAAGTAGTTTGCAATATCCAACTCTGCCCCAGAAATCACCCATAGAATGATTAAAACCCTGATTCATAATTGAGCTGTAAACAAAATTAATAGAGCAAGAGTTGAGTTAAATCACCCGATCGCTGGCAAATTCCACTAAATCCAGCCACATTGCGTAAATAGATCCAGATAATTCGATCGAGAATATGTATTAACTACCAATGTGTTTTTATGTGCCGCTAGGCGCTCTTGGCACGACATATCATGCAAAAAGTGGGCAACTAACAAACTAAGCGATCGAATATTTAATCATTTAATACCGATTAATTAAGACAAAGCTTGAGCACCGCGAGGCAAAATCTGGGGATGGACAAACAACCAAGACAATGGCAAAAACTCTGGCGTTGGTTCCTCAAACCAGAAGGAATCGGCTATCTGCTAGTGAGCTTTTGGGCGATCGGTGGTGGTCTGGCAACAGCCTATTTACCCGTGGCCAGGTTGATGGAAAAGCAAACCCAATCTACTTTTTTTAGCTGGCGCGGCGCGATCGAACCACCGGCAGAAATTGTAATTCTGGCGATCGATGAACAATCATTGTCCCAGGGTGAGTTTTATGATCCAGAGCAAAGAGCATTTTTAGAACCACTCCAATCCTGGCCCTGGCAACGTGCCGCCTATGCCCAGGTAATCGAGCAACTGATGGCAGCAGGCGCAAAGGTGGTGGCGATCGATATTTTGCTGGATACTCCCAGTATCTATGGGTTTGAGGATGATGATAGGTTACAGGCCACTTTAGACAATTATGGCGATCGGGTGGTGTTGGCCGCTTCCCTCGATTTCACCGACACCCAGGAAGCCTTGATTATGCAATTGCTCACCCCCGAAGAGACCTACTTCTTGGACTACAGCAGCATTGGCATGGTGAATTTTGATAAGGAAATCAATCAAAAAATCCATCGCCTGGGGGATGGCTATGATCTGCCGATCTTTGTGGATGAATCGGCTGAGAGTGAAGATTTAGCTAATAGCCCTGACAGTGTGCGCATTCTCTCATTTGCGGAAGCGACCCTCAGCCAGGCTGGGATCGACTATGTTCCTCCTAGCGCGAATAACTACATTTATTTCTTTGGCCCTGGTAATACATGGTTCGAGGCGGGTCAACAGGTGCCGTTTTTCTATGTGATCGATCCGCAAAATTGGCAAAACGACATTATCCGCAATGGCGAGTTTTTCCGCGACAAAATTGTGTTAATTGGGGCTACGGCCAGTTCCCTGCAAGATATTCAATTCTCAGCCTATGGGGATATGCCAGGGGTAGAAGTGCATGCCAATGCGATCGCTACGCTGATGAGCAATCGAGCAATCGCCGAAGTGGTGCCCAATCGCTTCCAGAAAGGGATCGCGGTTCTATTTCTATTGATGCTGGTGGGGATTGGCCTGAGCCAACTCAAACGCCCAGTAATTCAATTTTTGGTGGCCCTGGCGATCGCACTTGCCTGGGGAATATTTGGCTTTACCAGCCTGGTCTATGGCAACTTGATCATTGCTACGGCAATGCCTGTTACAGCCATTACATTAATTGGCCTATCGTTGATGGCAACTGGGGCGATCGCTTCGCAGCTAGAGCGATTGCAACTGCGGCGTACCCTCTCGCGGTATATGGCCGAGCCGATCGTGCAGGAGATTATGAACCAGCCGGACGACTATCGGGCGCTGCTGATCGGTCGCAGTCAAACTGCGGTAGTGTTTTTTACAGATATTCGTGGCTTTACTACCCTGCTGAGCAAGTTACCCGCCCGCGATATCGTGCAACAACTCAATCAATACCTGGAAGTCATGGTAGACATTATTCTCGAAAACCAGGGCACGGTAGATAAGTTCATCGGTGATGCGATCATGGCGGAATTTGGTTCCCCAGTCAGTCAGGGCGAAAAAACAGATGTGATGAACTCGCTCAAGGCAGCTCTGGAAATGCGATCGGCCCTGGCAAACTTGCGCCAGGAATGGAAAGACAATGGCAAGTTACCTTTTTTCAATGGCATTGGCATCAACTGGGGTGAGGTGGTGGTGGGTGATATTGGTTCGCCTCGCCGCAAGGAATACGCAGTAATTGGTGACACAGTGAATGTGGCCAGCAGAGTTGAGGGGCTAACCAAAGAGCTGGGGACTGATATTTTAATCACTGACTCCGTCTATGAACTGGTCAAGGATGAGATCGAAGTAGTAGACATGGGCGATCACCTGCTGCGGGGTCGGGCTGGCTCGATCAAGCTCTATGGTTTGGTCAGCCTGAAAGGTGAAGATGATCAACTCTTCAAGCAGGTACAACAAGAACTCAAACGCCATTTGAGTGTATTAAGTTTGCTCAGAAGCGGCAAATTCAGAACTCCATACAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019701|1480082:1490865|1486764_1487490_+|WP_015164436.1|DBSCAN-SWA MNKPNFEPFWQFECDRHPVAGVDEVGRGALFGAVVAAAVILPVEPVDRLALAEHNHTGCYGQLVSAGVRDSKQLSATQRDELDSLIRSVAIDCQIGTASVAEIAELNILNASLLAMERAIAQLQPRPNHCLIDGNRQIKFKIIAPIDQTTVVKGDQKSLSIAAASIIAKVWRDRYVIDLAEKYPDYDLVNNKGYATAKHRQAIKELGFSDLHRRSFKLQELAGNENLSSQLPDQQLDLLNN >NC_019701|1480082:1490865|1484941_1486102_-|WP_015164435.1|DBSCAN-SWA MQGTLKEIDVTSILRLIELGQRTGELLIESNTGRSWFVFFVNGEITYATDPTSNLNRLRDYLHGLNLDSALEQVLTAKLGINVIEYGQIWALLESQVLSPKQAKAIIRAMIVEVLFDILSLHEGNFVFELGASLAPQLTTIKLSPLLKQITIELQAWYRFYPYIQSPDQCPAIAIDGALPKLNQWVNGKTSLRQLARYGNQSIFAIAKNMYTGILSGAVAMAPLALPVTTKPRHEALRIICIDDSVTICRAVEYILHNNGYQVTAISNPIKALSLVFQLKPDLILCDIAMPDLDGYELCGMFRKSSYFARKPIIMLTGKDGFIDRVKARMVGATEYLTKPFGEKELLMMVEKYLANSHINSEGIAAFESYHENDGSNLDILGISSS >NC_019701|1480082:1490865|1487786_1488104_-|WP_015164437.1|DBSCAN-SWA MAVKKQFDSFEDLLKSSELPILVDFYAPWCGPCQIMARVLEQVSPQVKDKAQIVKINTDIYQGLASQYGIHGLPTMMIFKDGKPVDRFEGAVTADQLYERLQPHI >NC_019701|1480082:1490865|1483776_1484145_-|WP_015164433.1|DBSCAN-SWA MNMVLVVEDSITQRQMITNLLRDSGLRVVSAGDGVEALSQVANDRPDLVVLDIVMPRMNGYEVCRRLKQDPETQLVPVVMCSSKGEEFDRYWGMRQGADAYIAKPFQPQELVGTVKQLLRNQ >NC_019701|1480082:1490865|1482650_1483181_-|WP_015164432.1|DBSCAN-SWA MVGNPDFLLGNSPGQDPEFQEEIGAPEGELHLRFFTASGLEFALPATGIKEVIEYPPDRINPMPNVSPLILGTINIRGRVVWVGDLGQFLGESAPVNTDRSEVSIIAIEDQGLLLGLAIEKIGVMAWLDPDKLKVSRNSPDSMAPFLKGEWLIEPDEMSLRLLDHVNISRSARWAS >NC_019701|1480082:1490865|1484518_1484887_-|WP_015164434.1|DBSCAN-SWA MNKVLVVEDSPPQREMITALLRDSGLSVSAAIDGVEALEQISGSCPDLVVLDIVMPRMNGYELCRRLKTDPKTQEVPVVMCSTKGEEFDRYWGMRQGADAYIAKPFQPQELVGTVKQLLRKT >NC_019701|1480082:1490865|1480082_1482587_-|WP_015164431.1|DBSCAN-SWA MASSTQQQKDYDRASLAYMQGDYERAMDLSQQLVGACPDEPTYRLLHGHVNLVLEQYQDAIAEYQAVLNLTEDTQLVENASICMSTASERLNQSATGEVNADYGDDNNEYNLASEDQSQPDEEYSSPFATPGDDFNFSGMDFDDTFAFDNAQQMPQVATNLQANRGTNLQAGGMAPPDNASPPSDFNDVAEFDQLGDGDDFNFDDINIADDMENFDYAADTQMAGNNAAEMFDPGTGIGGDEFIDEFDDFDEIGDLAATFPGSFDESDATQMVTGGESSGFNTSASAVDFGMSGSLGAEPLMGQGDPSGGFGQSLPDSEAELFGLSSGAPLGTSKPSVSESSSSSIEASDQGMLSFFDNMSLPQKNVITAIVSGGVAAIAAAFVFNISVARIPVEKEAKQSIQLGGVAMAGAAFLGGAGMALFAGSRTTRQVKRSSDNLQAQFESVMHGEMNPRAAVYADDEFGKLSSTFNQMIQTIIASTTEAQRKAEEQEQAKEDLQRQVIRLLDDVEGAARGDLTVQAEVTADVLGAVADSFNLTIQNLREIVQQVKTAAKQVSEAAKENESFARSLSSDALRQAEELSVTLNSVQMMTESIQRVADSAREAEDVAQLASQTALKGGEAVELTMAGILDIRETVAETTRKVKRLGESSQEISKIVGLISQIASRTNLLALNASIEAARAGDAGRGFAIVADEVRQLADRAAKASKEIEQIVLQIQSETGTVQQAMDLGTQQVIDGTKRAEQARQSLNDIIQVSQRIDELVRSITEDTIRQTETSRTVAQVMQSVELTAQETSQESQRVSASLQNLVGVARGLQESVERFRVESDKSGAGRA >NC_019701|1480082:1490865|1488831_1490865_+|WP_015164438.1|DBSCAN-SWA MDKQPRQWQKLWRWFLKPEGIGYLLVSFWAIGGGLATAYLPVARLMEKQTQSTFFSWRGAIEPPAEIVILAIDEQSLSQGEFYDPEQRAFLEPLQSWPWQRAAYAQVIEQLMAAGAKVVAIDILLDTPSIYGFEDDDRLQATLDNYGDRVVLAASLDFTDTQEALIMQLLTPEETYFLDYSSIGMVNFDKEINQKIHRLGDGYDLPIFVDESAESEDLANSPDSVRILSFAEATLSQAGIDYVPPSANNYIYFFGPGNTWFEAGQQVPFFYVIDPQNWQNDIIRNGEFFRDKIVLIGATASSLQDIQFSAYGDMPGVEVHANAIATLMSNRAIAEVVPNRFQKGIAVLFLLMLVGIGLSQLKRPVIQFLVALAIALAWGIFGFTSLVYGNLIIATAMPVTAITLIGLSLMATGAIASQLERLQLRRTLSRYMAEPIVQEIMNQPDDYRALLIGRSQTAVVFFTDIRGFTTLLSKLPARDIVQQLNQYLEVMVDIILENQGTVDKFIGDAIMAEFGSPVSQGEKTDVMNSLKAALEMRSALANLRQEWKDNGKLPFFNGIGINWGEVVVGDIGSPRRKEYAVIGDTVNVASRVEGLTKELGTDILITDSVYELVKDEIEVVDMGDHLLRGRAGSIKLYGLVSLKGEDDQLFKQVQQELKRHLSVLSLLRSGKFRTPYK |
8 | Bacillus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1981015 : 1987252
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019701|1981015:1987252|DBSCAN-SWA GCTAGTCAATAATTTTGATCTTGCCAGTGTGAATATAGCTGAACACTAAATTAAGTTGATTATATTCCTGCTCAGTCAGGGTGCGTTTGGCAAAGGTGGCATTAAAAATAGCTCTACTTAAGTGGCTATAACCCTTACGACTCATCTTGCCAGAGCGAATCAGACGCGAGACCACCTCTTCAATGCTCATCGCTTCGGTGGCTGGTTTACTGCTGGGGCGCAGTGATGGATTAGTTGGTTGTCTAGTTCTTGGCGTGGTTGATGATGATTGCAGAGTCGTTTTTTGGCCACCCATCTGCTGGGGCTTGGCTAGCGGTGCGGCTGGAATTTCTGGTGCGGTAGTGGCTCTGGGTGGGTTTTTACTCAGACTACGGGCGATCGCTGCTTTTAGTAATACCGGATCAAAGGGTTTGGTTAAATAATCCTCTGCCCCCATTTCCATGCAACGCATCACGCTATCTAGTTCCTCTAGAGCGGAAATCATAATTACCGGCATATGCTGGAGGGTCTCGCTGGCCTTGACTTTGCCCAGCACCGTATAGCCATCTACCTCCGGCATCATAATGTCGAGCAGAATCAGGTCAAATAGCTGCTTACTGAGTATTTTGAGGGCTTCTTTGCCATCTGCGGCCATGGTTATTTTGCACCCTTGCTGCCGGAGACGACGCGCCAGGGTATCTCGGTTCATTTCGCTATCATCTACAATCAGTACGCTATAGCCTCGCTCCACCATGAATCATCCTTTATTGCAATTTCTAGATATAGCCGACCAATAATCTAGTTAGTTTCTATTCCTTGCTAGTCTCATTATGCTGTACGGAATTAATAATTACTGTGATTTATTTGCTGTTTGGGCAAACCAGAAGTTATTTTTATTTTGCGATCGGTGGTAATCCCAAAATCGCCCCAAACACTGCTTCCTGCTTTAGCGATCGTTTTGATCGCCCTCATGTTCTAAAAATTAGCAGTATTCTTGACATCTGCAGTATTCTTGACATCTGCAGTATTCTTGACATCTGCAGTATTCTTGACATCTAGGTAATTAGGCCAGCACTAAGACCATCATGCCAAACTTGCACCTGGTTCTTACCCTGCTGCTTAGCCAAAAAGAGCGCTTTATCAGCATTGGCAATTATTTCCGAATAACCACGATCGCCACCAGCCAGCACTGCCGTAACCCCTAAGCTGATGGTGACATACATACTGGCAGCCGAATATGCATGATTAATCTGCAAGTTCTCCACATCCTGCCGTAGCTCTCTTGCCAATTTCTCCGCCCCGCTCAAAGGCGTATTGGGTAAAATAACCACAAATTCTTCACCGCCATATCTGGCCACAACATCATGGGGGCGCTTGATCGTGCGCTGGGCAACTCTGGCAACTTGTTTTAAGCATTCATCACCAGCCTGATGGCCATAGGCATCATTAAATTGTTTAAAGAAGTCAATATCAAAAATGATCAGCGCGATCGTTTGCTTCTCGGCGACTGCGATCGACCAGGCCTTAGCGATCGCATCATCAAAATAGCGGCGATTGGCAATCCCAGTTAAACCATCCAATTTAGAGAGTTGCTCTAGCTGCTGATTAACTTCCGCCAATTTTTTATTGGCTTCTTCTAGTTGCTGTCGGTAAATTTCTTCTTGATCGCGGAGGCGTTTTTTCTCTAGGCAGGCACTGGTGCGCGCCTTCAGCAACACCCGATTAAAGGGCTTGTGTAAATAATCCTCTGCCCCCATTTCAATGCATCTGACCACACTATCAATCTCGTCTACAGCGGAGATCATAATCACTGGGATGTGGCTCAGTTTAAGATCTGCTTTCAAATATGCCAGCAATTCATAGCCATTCATCTGGGGCATTTGAATATCTAGGAGGATTAGGTCAAAATTATGCCCACTAAGCATTTCGAGCGCTTCTTTACCATTTTCCGCCGCGAGTATTTGTTGATATCCCTGACGTACCAAATGTCGCCGCAACACGTCACGGTTCATTTCATTATCGTCAACGATTAATAGGTTAAAATCTTCATGATTTGGCATTTTGGTTTAGCAATGCTTGGATTTTACCTAAAAGACGCTTAAATTCGATCGGTTTGGTGTCGTAGTCATTACAACCTGCGGCCATGCCCTTTTCACGATCGCCAGTCATGGCATGGGCCGATAGCCCAATCACCGGAATATGCTGAGTAATGGTATTTGTTTTGAGCTGTCTAGTGGCCTCCCAGCCATCCAGTACGGGCAAACTCATATCCATTAAAATCAGGTCTGGGGGGTCTGCTTGGGCGATCGCCAACCCTTGCTTACCATCGGTGGCGATTTCAACCTTAAACCCCTTGCGGATCAGCCGCCGCGATAGCATATCCCGATTCATTTCATTATCTTCAACCAGCAGAATCCTAGTCATATTGGGTCTATCTGAACTATATCAATATGAAATGAATAACAACAACACGAATTGGGTTCAAACTTGGTTTAACCCAGATTTTAAAGATCATAGCAGCGCAACTAGGTTAGCGATCTAAACCACTTATGGAGCTTTACTAGGAGAATGCTTAATCTATTGCTGCTCTTTACTTAATTGATGCAAGGATAAGGATAATATTTGATTAAAACTTGCGCATGGTTTATTTATAGCTAGTAGCTAGCAATCTGCCCAACCATGCCAGCAAACCAATTGTTTAATATTTCAGTCTAATTAATTATCCCCCGATTTAATACCACCATGCTACTCAGAAAGTTTGAGTAAAATTTAAGTAAAAATAGACAACAGACAATTAGTCCACTTAGTCCCGCTGAAAAAGATGTGCCAGTAATGTATGTAAGTTTAATATACTCATTATTAGAACCTGTAGCCATAATTACTGCTGCGATCCTGGTTAAGAATGCGTTAGCTTTATATTGGCAGAATATGGCTGTTGCCAAAATATGGCTAAGCACTTAATCATTGAGCGTTTTTACCGACAGAAAACCAGGCCAAGCTTTTTGGCTTAAACCAGCAAACCATAGAAATTAATGATTACTCTGCATAGAATATTCGCTATGGTAGTAATATATTAATACTTAAAAACATTATAAGTGCAGATCAAGCTTAGGCGGCTCCTTTGAAGCAAGCAACTCTACATCAGTTAAAGGTATTTGAAGTAGCAGCTCGTCATGGCAGTTTTACTCGCGCTGCTGAAGAGTTATTTCTAACTCAGCCGACAGTATCCATGCAAATCAAGCAGCTCACCAAAGCCGTTGGTTTACCTCTGTTTGAGCAAGTAGGCAAGCGGTTATATCTAACTGAGGCTGGGAAAGAATTATTTAGCACCTGCCAGAATATCTTTGGTCTCTTGTCACAGTTTGAAATGACAGTGGCGAATATGAAGGGGATGAAACAGGGTAGCCTGAGTCTGGCTGTAGTAACTACCGCAAAATATGTAATTCCCCGGCTATTAGGGCCATTCTGCCAACGATTTCCTGGGATTGATGTATCGCTCAAGGTTACCAATCATGAGCGTCTTCTAGAGCGATTGGGAAATAATAAGGATGATTTGTATATCCTCAGTAAACCGCCCACTAATACTGATATTTCCTCATATCCATTCCTAGAGAATCCACTGGTGGTACTTGCGCCTAGCAATCATCCGTTGGTAAATGAATCAAATATTCCGATCGAGCGGTTGGCCCAAGAGCCGTTTATAATGCGTGAGCCTGGTTCAAATACGCGTAGAACTGTAGAGAAACTGTTTGCCGAGCATGATGTATCGGCGCAAATCCGCTTGGAGTTATCCAGTAATGAGGCGATCAAACAGGCGATCGCTGGTGGTTTGGGCATATCAGTGCTTTCATTGCACACCCTGGCACTTGAAGGAGCTAGCAATCAAATTAAAATTCTTGATGTTGAGCATTTCCCGATTATGAGCCACTGGTATGTGATCAACCTGTCTAGTAAGCAATTATCGGTGGTGGCAGAAACCTTCCTGGACTACCTTAAGAACGAAGGCAAAGAGATTGCCGACCAAAGTGTAGTGCCATTGCAAAAGAATATGAAGGATGCCAGTAAAGCGGCTGTATCCCTCTAAATCAAGCTAAATCAATTTAAATTAAGCTAAATCAAATTGAATAATTCAAGGGAAAAGCTCGCACGCCACGTGGCCGGACATAGACCGTTTGGCGTGGTTGGAGATTGAGATCATGAAAGCGATCGCGGGTGAGATGAGCAGTTAATACCTGACCATCATCAAGCACCACCTCTGCTTGCACTTCCCAGCCCAGATGGATAATCCGATTAATCCGGGCAGGAAGCGTCGAGCCATTGGCAGCAGTTTCGATCAAAATATCCTGGGGACGAATATAAACATGCTCATGTTCATCAAAGGCATGGCCGCTGCTGGAAAAAGCCGATAGATTATTTGGTACCACATTCACCGGACCAATGAAACTCATTACAAAAGGCGTGGCCGGATGATCATAGATTTGCTCTGGTGTGCCCACTTGTTCAATCAAGCCCTTATTCATCACCACGATCGAATCGGCCACCTCCATTGCTTCTTCTTGATCGTGGGTCACAAACACACTGGTCACATGCACCTCATCATGCAAACGGCGTAACCAGGCGCGGAGTTCTTTGCGGACTTTGGCATCGAGCGCCCCAAATGGCTCATCTAGCAATAAAACCTTGGGCTCCACAGCCAGAGCTCTGGCCAGGGCGACCCGCTGACGTTGACCGCCGGAAAGCTGAGAGGGGAAGCGATTGCCCAACCCAGCCAACTGCACCAATTTTAGGAGTTCATCTACTTTAGGCTTGATTTCGGCTTTGGGGCGTTTGCGAATCTCTAGGCCAAAGGCAATATTCTGGCGCACGGTCATGTGGCGAAACAGGGCATAGTGCTGAAACACAAAGCCAATATTACGATCGCGCACATCCTGGTGGGTGGCATTCTCACCGGTCAGAAAAACCTCGCCCGTGTCGGGAATTTCCAGGCCAGCGATCAGGCGCAAAAGAGTCGATTTCCCCGAACCCGAAGGCCCCAACAAGGCCACCAGCGATCCCGATTCGACCTCCAGATTAATATTATCAACGGCTTTAAAGTCTCCATAGTATTTCGATACATTCTGAACCACTATGCCCACTTGTAAAAACCTCTAGCCTAAATTAATAGAGAACACTTTGCTTGTTTGATTTGGCGCTTATTTGGCAATCATGTTGTTGCGCCGATCGCTCTAAGAAAAACGTTTGATCAAATCCACACCTTGCCGATCGGTTTACCGATGATTAGATCTTCTATGTATCATATCCTACATTTAATTATTTTATGGTTCTTTGGTGATGATGCCCAAATCTATGTATAGGTTCCCCCGATCATGAGTATATACCTAGATATTCCAGCTAACTGTGATGCGGATCTAGATTAGCAATCTGAAGTATATAGCTTTTACAAATTGGCGATCGCATTACCAGCCAGCCATGCCGTAGTCCAGGCGCTTTGAAAATTAAACCCACCCGTAACACCATCAATATCCAGCACCTCGCCCGCAAAAAATAAATCAGGGCAAATGCGACTCTGCATTGTCTTAAAGTCTACTTCTTTTAAACTCACACCGCCACAGGTGACAAATTCCTCCTTAAAAACGCCCTTGCCAGCGATCGTTTGTTCACAACTATTTAATTGGGTAATTAATTGATTAATCTGCGTTTTGGCTAAATCTGCCCAACGCAAGTCTGCGGCGATCGCCACCCCCATTAGTAAATATTGCCATAGTCGCTTGGGTAAATTAAACGGGCAATAGCTACTTATCTGACGTTTGGGAAATTGTTGCTTGGTGGTTAATAATTGCTGGCGAATTTGATCTGAATTTAAATTGGGCAACCAGTTGATCTGAAGCTGAGCTTGATAGTGGCGATCGCTTAGGAATCTGGCTCCCCAGGCCGATAGTTTCAATACCGCAGGGCCACTCATGCCCCAATGGGTAATTAACAGCGGGCCAGATTGAGTGAGGTCGGCTGGTTTCTTTTTATTTGTTGTTTTCTTGTTCCGCGTCGGTTGAGGCTGTTTATTGATTTGATTTGTTGCTTGGGTAAGGGCGATCGTTGATGAATTATTATGTATGGCATGTATGGCATGTATGGCTGAATTATCAATAGTTCCTAAGGCTTTAATGCTTGCCTGCACCTGCTCAACACTCACACCAGCCAGTTGATGCAGCTTTGGATCATTAATATTGAAGGTAAACAACGAAGGCACTGGTGCAATGAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019701|1981015:1987252|1983039_1983417_-|WP_015164831.1|DBSCAN-SWA MTRILLVEDNEMNRDMLSRRLIRKGFKVEIATDGKQGLAIAQADPPDLILMDMSLPVLDGWEATRQLKTNTITQHIPVIGLSAHAMTGDREKGMAAGCNDYDTKPIEFKRLLGKIQALLNQNAKS >NC_019701|1981015:1987252|1982048_1983053_-|WP_015164830.1|DBSCAN-SWA MPNHEDFNLLIVDDNEMNRDVLRRHLVRQGYQQILAAENGKEALEMLSGHNFDLILLDIQMPQMNGYELLAYLKADLKLSHIPVIMISAVDEIDSVVRCIEMGAEDYLHKPFNRVLLKARTSACLEKKRLRDQEEIYRQQLEEANKKLAEVNQQLEQLSKLDGLTGIANRRYFDDAIAKAWSIAVAEKQTIALIIFDIDFFKQFNDAYGHQAGDECLKQVARVAQRTIKRPHDVVARYGGEEFVVILPNTPLSGAEKLARELRQDVENLQINHAYSAASMYVTISLGVTAVLAGGDRGYSEIIANADKALFLAKQQGKNQVQVWHDGLSAGLIT >NC_019701|1981015:1987252|1986430_1987252_-|WP_156800480.1|DBSCAN-SWA MIAPVPSLFTFNINDPKLHQLAGVSVEQVQASIKALGTIDNSAIHAIHAIHNNSSTIALTQATNQINKQPQPTRNKKTTNKKKPADLTQSGPLLITHWGMSGPAVLKLSAWGARFLSDRHYQAQLQINWLPNLNSDQIRQQLLTTKQQFPKRQISSYCPFNLPKRLWQYLLMGVAIAADLRWADLAKTQINQLITQLNSCEQTIAGKGVFKEEFVTCGGVSLKEVDFKTMQSRICPDLFFAGEVLDIDGVTGGFNFQSAWTTAWLAGNAIANL >NC_019701|1981015:1987252|1985108_1986128_-|WP_015164833.1|DBSCAN-SWA MGIVVQNVSKYYGDFKAVDNINLEVESGSLVALLGPSGSGKSTLLRLIAGLEIPDTGEVFLTGENATHQDVRDRNIGFVFQHYALFRHMTVRQNIAFGLEIRKRPKAEIKPKVDELLKLVQLAGLGNRFPSQLSGGQRQRVALARALAVEPKVLLLDEPFGALDAKVRKELRAWLRRLHDEVHVTSVFVTHDQEEAMEVADSIVVMNKGLIEQVGTPEQIYDHPATPFVMSFIGPVNVVPNNLSAFSSSGHAFDEHEHVYIRPQDILIETAANGSTLPARINRIIHLGWEVQAEVVLDDGQVLTAHLTRDRFHDLNLQPRQTVYVRPRGVRAFPLNYSI >NC_019701|1981015:1987252|1981015_1981747_-|WP_015164829.1|DBSCAN-SWA MVERGYSVLIVDDSEMNRDTLARRLRQQGCKITMAADGKEALKILSKQLFDLILLDIMMPEVDGYTVLGKVKASETLQHMPVIMISALEELDSVMRCMEMGAEDYLTKPFDPVLLKAAIARSLSKNPPRATTAPEIPAAPLAKPQQMGGQKTTLQSSSTTPRTRQPTNPSLRPSSKPATEAMSIEEVVSRLIRSGKMSRKGYSHLSRAIFNATFAKRTLTEQEYNQLNLVFSYIHTGKIKIID >NC_019701|1981015:1987252|1984114_1985077_+|WP_015164832.1|DBSCAN-SWA MKQATLHQLKVFEVAARHGSFTRAAEELFLTQPTVSMQIKQLTKAVGLPLFEQVGKRLYLTEAGKELFSTCQNIFGLLSQFEMTVANMKGMKQGSLSLAVVTTAKYVIPRLLGPFCQRFPGIDVSLKVTNHERLLERLGNNKDDLYILSKPPTNTDISSYPFLENPLVVLAPSNHPLVNESNIPIERLAQEPFIMREPGSNTRRTVEKLFAEHDVSAQIRLELSSNEAIKQAIAGGLGISVLSLHTLALEGASNQIKILDVEHFPIMSHWYVINLSSKQLSVVAETFLDYLKNEGKEIADQSVVPLQKNMKDASKAAVSL |
6 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2566474 : 2621490
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_019701|2566474:2621490|DBSCAN-SWA 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42 | uncultured_virus(20.0%) | tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
15850 : 82759
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019690|15850:82759|DBSCAN-SWA 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49 | Enterobacteria_phage(27.78%) | integrase,transposase | attL 38675:38734|attR 59862:62441 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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