Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019752 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.03, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_019728 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
NC_019751 | Calothrix sp. PCC 6303, complete sequence | 22 crisprs | cas1,cas2,WYL,cas10,cmr4gr7,cmr5gr11,csx1,Cas14c_CAS-V-F,2OG_CAS,cas14j,DinG,cas3,csa3,c2c9_V-U4,PD-DExK,c2c5_V-U5,cas10d,csc2gr7,csc1gr5,cas6,cas4,cas14k,RT | 5 | 10 | 4 | 0 |
NC_019727 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01, complete sequence | 2 crisprs | NA | 2 | 2 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019727_1 | 791-907 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019727_1
|
2 spacers
spacers of NC_019727_1
>1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder ATAATTGCGCTTCAACCAGGATTAATTGCAA >1.2|868|17|NC_019727|CRISPRCasFinder AACCTGCAATCATCGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019727_1
The CRISPR arrays of NC_019727_1 >merge|NC_019727|1|791-907|CRISPRCasFinder CCAAACCAGGATTAACTGCAACTATAATTGCGCTTCAACCAGGATTAATTGCAACTGAGCCAGGATTAAATGCAACCAACCTGCAATCATCGGTTTCAACCAGGATTATTTGCAACT >NC_019727|1|1|791-907|CRISPRCasFinder CCAAACCAGGATTAACTGCAACT ATAATTGCGCTTCAACCAGGATTAATTGCAA CTGAGCCAGGATTAAATGCAACC AACCTGCAATCATCGGT TTCAACCAGGATTATTTGCAACT
>NC_019727.1|WP_041741187.1|73_757_-|IS630-family-transposase MQVVTGTQKKGVIWKRARKSHKGKQDPKTREIKQADLDMLQLSAATGEIDLKYLDESGFCMWSEPSYTYYQRGEQKCLEQTKRRGRRLSIIGLLQPLISFVYGLVIGGVNRKSYIQMMEFEAQEAEKVGRIRVIVQDNGPIHRCKEVQQLWTKWESQGLYIFFLPKYCSEMNPIELEWQHLKKDELSGQMFDDELDLAYAVMNGVKARGETGKYSTERIKFNSPPCS >NC_019727.1|WP_015173887.1|1202_1772_+|recombinase-family-protein MLIGYARVSTEDQNLDLQMDALRQAGCEKVYTDHISGAKAARPGLLLAFEVARTGDVLVVWRLDRLGRSLKDLIETMETLDKRGIGLSSLQESITTTSGSGRLIFHLFGALAEFERNLISERTTAGLMAARKRGHRGGRPKALDPAKRQLAVKLYTERQHTIIEICKLMGISKPTLYNYVAEIETEHVT >NC_019727.1|WP_083866410.1|1776_3423_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MPTEALINLRHRLDGLPSRCQERRILIEETAALYGVSTDTLYRALRNSSRPKSINRSDSGTPRKLSMTEMERYCEVIAAMKIRTSNKKGRHISTVRAIELLEEFGMETPDGFVQPPKGALTRSTVNYYLKTWGYDTERMTRQPPAVRFQANHSNECWHFDLSPSDLKHVKQPSWVESGKGNPLLMLYSIVDDRSGVCYQEYHCVYGENVEAALRFLFNAMTLKTTDGFPFHGIPEMIYTDNGPIAKSHVFQNVMDCLKIKLVTHMPAGKDGRRVTARSKGKVERPFRTVKEAHETLYHFHEPESDVEANLWLRQYLLHYNDKPHRLEPHSRMEDWLRNTPKSPLREMCSWERFCTYAREPQRRKVGTDARVSVEGVAYEVEPDLAGETVVLWWGLFDNELYVEFNDQRYGPFYPVDGPIPLHRYRKFKKTKTEERADKIADLAKKLGLPRTALDKNADLQFLVDKYKELTPTVTPFNDPDPYQEFTYPTVLLAKLAISDYLAKPLAKLSTEQLAFIDTLLAETLIKKVIIERVRLYFHSNKGGEQNAY >NC_019727.1|WP_015173889.1|3412_4384_+|AAA-family-ATPase MLTEVMEHFRLVREFPKAGYYETEHQKQMFKDIKSAIHSGKLVAITGIIGCGKTTTLRRLFEVLEKEGKILVSKSLSVDKDRATLPTLIAALFYDLSTDKEIKIPKDGEKRERELRDLIRKGKKPVALFVDEAHDLHYSTLTGLKRLIEVVEDGGGTLSVVLAGHPKLKNDLRRPTMEEIGYRSTVFSLEGMVGSQREYIEWLVSECTMVDTPIDEILEVEAIELLATRLRTPLQIEQHLTLALEAAYRVAVKPVTTVIVESVLSKQIDDLEPTLTRHGYDVRGLAEQFNTKPSEIKLLFRGQLDPARSRELQEQMLAAGLPL >NC_019727.1|WP_015173890.1|4626_5010_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MGARLRVFLTHKQDKTLLNLRTVDVPQKVKDRAEVVRLNAHGWYVEKIAAHFNWTPQTVREVLHKWQKLGLEGLWELPGRGGKTKYKEEDIVFLEECLKKEPRTYNSLQLVQKLKSEACATTSRSQS >NC_019727.1|WP_015173891.1|5198_5972_+|ParA-family-protein MSKTRIIALFNQSGGVAKTTLTHNLGYHLAANKRRVLLVDMDPQASLTNFLGIDPETQEKTIYNAIIDEEALFIYPEKIHGMQLAPTNINLSAAELLLPAATAREYRLAEALTPIKDNYDFILIDCPPSLGILSIVSLTAATHLLVPIQCQFKSFLGTDLLLDTVARVKKKLNKNLQIAGFIPTMLDSRTAQETRTLAAVQEQLSQVATIYPAIPKSIAFADASERRIPLAMYDKNHAAVKVMKKIAKELEKLEVKP >NC_019727.1|WP_158333194.1|5976_7167_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MSKKDIAYNAKLKHTKPLDLMFGGEDSDFSEQSSVPTTSDFSEQISGNKTSNTIDREQIKLDPNQPRRYFDPKKLEKLAQSIKELGILEPLLVRPLNDGYYELIAGERRFKAAGIAGLSEVPCIVKEMDDETVKQVQLIENLQREDLNAYEETIGILELLALRLKMTQDEVISLLNRIEKANRKKADKVIRHDSKEQTDNVIHHDSKEQADNVIRHDNDESEDDVIRHNDESEDKKADNVTPSKRKKQANNVIRLEEIEIVNKVFASIGRLSAESFRANRLPLLNLPGDIQQALASGTIEYTKARAIARVKSEPERLQLLDKAINQNLSLTQIKEIILGLESSEQKEIPPEKAASQRVANIGKRLKEAKVWDDVKKRRKLEKLLGDIEKLLDEQAC >NC_019727.1|WP_015173893.1|7334_8369_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MNIILHKVNDSQIGQRREDGYINLTKMAQASNRKLNDYLRLSTAKAFIDKLSADTGIPVSGKNGLVQVHKGGNNKTTQGTWGHPQVAINCGQWCSPEFAVLVSKWVFSWIANAQNPVKENCDGQSPVFDHRSNQFSDVVKAYIESSQALNRAIHTAIHQQTDSLREALKFLDSYNDVTVTVLAAEAKLVEQTCTTSDTVCIDLITLPDEQPRRYFDGQKLEELSHSIKEFGILEPLLVRPLSGGNYELIAGERRLRASQIAGLTSVPVLVREMDDTTTRACRLIENLQREDLNVYEETIGILNLLALQLKTTEDKVISLLNRIEKANRKKADECGSFSKTGNVV >NC_019727.1|WP_015173894.1|8365_10021_-|ISKra4-like-element-ISCasp2-family-transposase MKQMHPCLSKDKNGNKYGRMQASRSNPGMFWEEARELFEEIVGWLDSDSICGLEHGEIESKLLDNGYELLRRLLQGYFDKRSQDETDSEWVGKDQAKRTHKKKLSRKLTTIFGTVIANRIGYGGRKINTLFPLDAELNLPAEQYSHGLRQRVAVEVARSGFRETVDIIEKTTAAKIGKRQAEELAYQSAVDFDDFYTYQQAEAVQVEEIGEIVVISADGKGVIVSHSTRAVPSVEVAVRTEDLRPQTQKRAQASSKKLDKRLTKGEKANAKRMATVASVYTINPFVRTVEQIVNPSDEDKKIKRPKPIGKRVWASVAKEPEVVIKEAFDEALHRDPDRQKRFCALVDGNKQQLSLMKKFAKKHHLELTIVLDIIHVIEYLWKAAFVFYSSTDKQAEAWVTKRLKSILEGKSSDVASGMRTSATKRKLTPQERKPVDNCARYLLNNREYLKYHDYLKAGLPIATGVIEGACRHLIKDRMDITGARWSLAGAEAVLRLRSLYISGDWDKYWRFHLHQEHKRNHLALYQGAIPLMKRVAKARCPITPSPLPIPV >NC_019727.1|WP_015173895.1|10658_15362_-|DEAD/DEAH-box-helicase MEERRKITKFNRISSWLSDSVSESEDKRYIHRLIKENLSQRDLILDELISIVQKAHDDARYRLRKLAGNSLAPFENSSAIDPTEGYPERLHLQSLKGYFGEIFAGIIAENFAPFGEEDWEVPVFLFRVHVVEFQHLEFLNQTGETAKKRPGRTGDDCLAFRRNSEGVIISSLACEAKCTANHKTNMISEAHEKASAVNIKPVDIPQLIEILQDYDDIVSNEWVNALRVLWLQKVKKNYERCDLVSYICGEHPSAKRQRKAWISTDKAHENYTSGRRLEAVEIHLHDVENLIKAVYVPQTSIILSTNVSAQIVQEPDDLEVTKAKSDVIVEGESLQNEMAQPSNEVIALATEVQNSLAGSTLTPAIAKLYSQHTRLRAGTDGLKGWREDEAGERLNDAIRLIEAAFIKREAGETDWRNGMLRAGEIFEWLSHPQLNPNNLPIRLLAAAIYELAGYPARAAGLLNEDAIEGIESEILRSLLKADFPNLLQLLTKHWTTALSLNVQADTSLLWDDTDTQSHKFNEYIVNQTASSLGILCAEMRWGNEPRLEKAIEKLSSIAKVLLHGHDTYSWLLGKLCAEVTSVYVETSLRKNIEALSSTITQNGGDFLERYLRQSYQNRKALAWRSQICGIERLATAESFALCTPTGSGKTRIAEIAILQSLFFKTNNSNNLSSPFPLVLYLVPSKALATEVESNLSRVLNRTTNKNVIVTGLYGGTDWGPTDAWLTSDKPTVLICTYEKAEALMKFLGPLFIRRVSLIIIDEAHAVQFDGNKDSLQKAENRALRLESLGARLFTYVEQNHSRIIALSAVASETEGALASWIENQTNASPAKTYYRSTRQLIGRLECKPGRGFEIRYDLLDGRRLEFQEGGENNTPFIPRPFQAYPPAGKLEREQSPGKRLRPYLFWAGMHLAAPNEKGQQRAVLISITQQIGGYAEDFLNLLKKDWANVQKPLFFQVPLEAKKIELWEKCLQSCEDYFGKNSREYQLLNKGIVVHHGKMPGLMARLLIDLINERIIHLVLATSTLSEGVNLPFETVLIPNLQRWSRNDEKYVDINSSEFSNLVGRAGRPGFGTEGRSLVILPATESIEQIKDNKERQKSTKIRNQYRSLVNDLTIQDNPSDKIYNPQSPLAQLLLNLEEQWRHISLPNLEDILFTLPEATFGENNFYDDNFITWLEQTAPLSYGNNLSEAESSAIETLDSLDSILLAVIVEIEQLKAKDLSPNELEEQLQKIWQRSFAHYASIEQERLGNLFIKRGKALKTEIYRDVSQRRRLYRTSLPPRDGNQLLTLYPKLKEIFNTGGDYAIWTVEQRLKYIENIVSNLATLSKFKLEESSGKISWNEILRWWLDPNTAAKKPTAKQVSKWHSYISQNFTYRFNWGLGSIIALAIDEAFGGELVESSLENWSQTGLPWIVFWMKELIVWGTLDPVAAYLLAKVEDVTTRKQAEELAQTYYQYISERELEPNEYLNAVNIRNWTEQSFSDVERHLPTPKPPKKIDVNLLKDFSKAPSKNWRVVPVEVGNEIQWFDLAGVPLAICQKPENWQPDFLNTYDFTLDAENRIVSSRVYV >NC_019727.1|WP_015173896.1|15935_16346_-|hypothetical-protein MPKNNRVRKSLSFRLQPYEGTPLAEVADYLNGLDKEEATRKIGEILVMAFLPYARLEANKPTSNKLSSTFLIARDMADKHFGVMALALGLDAVYAVATPLTIAGGSLKEVSNQVEEEDSSLIEGKVTATEIGKLFG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019727_2 | 21270-21396 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019727_2
|
1 spacers
spacers of NC_019727_2
>2.1|21304|59|NC_019727|CRISPRCasFinder GCTCAAATAGCCACCAGTTTTTTAATAACGAATTAAGTGCTGACCAGGGAAATAGCCAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019727_2
The CRISPR arrays of NC_019727_2 >merge|NC_019727|2|21270-21396|CRISPRCasFinder CAGCCAGATAAACATTACAAATTAAATACCGAGCGCTCAAATAGCCACCAGTTTTTTAATAACGAATTAAGTGCTGACCAGGGAAATAGCCAGCAGCCAGATAAACATTACAAATTAAATGCCGAGC >NC_019727|2|2|21270-21396|CRISPRCasFinder CAGCCAGATAAACATTACAAATTAAATACCGAGC GCTCAAATAGCCACCAGTTTTTTAATAACGAATTAAGTGCTGACCAGGGAAATAGCCAG CAGCCAGATAAACATTACAAATTAAATGCCGAGC
>NC_019727.1|WP_015173901.1|19199_19907_-|DUF4145-domain-containing-protein MNIVANYFLLTEPESVYEYSYYPEECGDPHTNKINIEYAVEYNPNDYDDAPNAGCDYSLLLCLACKEVTLRKSCQHDFMDSETIEMGIETLYPPQGLELSYLPSAIQKAYKAALKARSINVDAYAILLGSTLDMVCEERKAEGKDIYEKLKFLAENGEIPNNLVEVVHKIRQLRNVGAHEPFKGLTSKEIPILDDLIRAILEYLYIAPNLARKAVMHLKRIKDKKSKLEDGEIMF >NC_019727.1|WP_041741194.1|18981_19197_+|hypothetical-protein MKVVSRVGSDGILHLDVPVGMTNEELEVMVIFQPLKSSVQVETPQTLGWMPGFFEEVIGGWSGEPLERGKF >NC_019727.1|WP_015173899.1|18211_18607_+|MobC-family-plasmid-mobilization-relaxosome-protein MGSKTKRDDGVSRKITHPVRFAEDEYEQLKQKAYNARVSVTEFIRRAALRRQVVEPPPPPQINWKLYEELNAIGVNLNQIAKAVNRAVKSGRGANVDAGRLQNLVDRLNAAIRETQMQLLECGVTDDEEED >NC_019727.1|WP_015173898.1|17867_18143_-|hypothetical-protein MRVQRIKATWLAFNPRPAHPQASSKTLPRTNFSAVNVVRNNIENGKISDSDNGVDITLLNYLQIYPILIKKNLVTAQAQIKYSFSLSNKSL >NC_019727.1|WP_015173897.1|16438_17731_-|ParM/StbA-family-protein MSKACNLYLAVDVGGSQTKIIYQFSDWKSPEYLLMSPGVEQISKSDLKRYFDQLGWVGAPTPQQQAWLEWKSNIFVVGDFVSEFAPQDRIFERKYENALYKVLAAVGTILSKHNIGKKRRGNPESLKVNLNLGLLLPWNEYNDRKRFEEQLELMLKSLKFRGQSWDVNLSHFECRPEGGGLAAIRIKQNGLDWLQKHKVAVLMFGHRNVTAIYFDAGAIKRGDSPLLGFSTFLDDVCSRVSGLERDKLAAAIFEGLYQKSSQVYRDECTVHPEWGQMEAIASLATAKDESLKALEREDIAQAIQLAIPSYWNRIKKWLDKNIPHLPSEVIVGGGAAAFLEPELEEYFNCKADTKYGAPTRQSGKRASAYTSRNFRDHANLVWVEDIQKQIENLFEFNWQDRRQQSVRLIDCFGMFDQLKDMVAEAENANS >NC_019727.1|WP_015173896.1|15935_16346_-|hypothetical-protein MPKNNRVRKSLSFRLQPYEGTPLAEVADYLNGLDKEEATRKIGEILVMAFLPYARLEANKPTSNKLSSTFLIARDMADKHFGVMALALGLDAVYAVATPLTIAGGSLKEVSNQVEEEDSSLIEGKVTATEIGKLFG >NC_019727.1|WP_015173895.1|10658_15362_-|DEAD/DEAH-box-helicase MEERRKITKFNRISSWLSDSVSESEDKRYIHRLIKENLSQRDLILDELISIVQKAHDDARYRLRKLAGNSLAPFENSSAIDPTEGYPERLHLQSLKGYFGEIFAGIIAENFAPFGEEDWEVPVFLFRVHVVEFQHLEFLNQTGETAKKRPGRTGDDCLAFRRNSEGVIISSLACEAKCTANHKTNMISEAHEKASAVNIKPVDIPQLIEILQDYDDIVSNEWVNALRVLWLQKVKKNYERCDLVSYICGEHPSAKRQRKAWISTDKAHENYTSGRRLEAVEIHLHDVENLIKAVYVPQTSIILSTNVSAQIVQEPDDLEVTKAKSDVIVEGESLQNEMAQPSNEVIALATEVQNSLAGSTLTPAIAKLYSQHTRLRAGTDGLKGWREDEAGERLNDAIRLIEAAFIKREAGETDWRNGMLRAGEIFEWLSHPQLNPNNLPIRLLAAAIYELAGYPARAAGLLNEDAIEGIESEILRSLLKADFPNLLQLLTKHWTTALSLNVQADTSLLWDDTDTQSHKFNEYIVNQTASSLGILCAEMRWGNEPRLEKAIEKLSSIAKVLLHGHDTYSWLLGKLCAEVTSVYVETSLRKNIEALSSTITQNGGDFLERYLRQSYQNRKALAWRSQICGIERLATAESFALCTPTGSGKTRIAEIAILQSLFFKTNNSNNLSSPFPLVLYLVPSKALATEVESNLSRVLNRTTNKNVIVTGLYGGTDWGPTDAWLTSDKPTVLICTYEKAEALMKFLGPLFIRRVSLIIIDEAHAVQFDGNKDSLQKAENRALRLESLGARLFTYVEQNHSRIIALSAVASETEGALASWIENQTNASPAKTYYRSTRQLIGRLECKPGRGFEIRYDLLDGRRLEFQEGGENNTPFIPRPFQAYPPAGKLEREQSPGKRLRPYLFWAGMHLAAPNEKGQQRAVLISITQQIGGYAEDFLNLLKKDWANVQKPLFFQVPLEAKKIELWEKCLQSCEDYFGKNSREYQLLNKGIVVHHGKMPGLMARLLIDLINERIIHLVLATSTLSEGVNLPFETVLIPNLQRWSRNDEKYVDINSSEFSNLVGRAGRPGFGTEGRSLVILPATESIEQIKDNKERQKSTKIRNQYRSLVNDLTIQDNPSDKIYNPQSPLAQLLLNLEEQWRHISLPNLEDILFTLPEATFGENNFYDDNFITWLEQTAPLSYGNNLSEAESSAIETLDSLDSILLAVIVEIEQLKAKDLSPNELEEQLQKIWQRSFAHYASIEQERLGNLFIKRGKALKTEIYRDVSQRRRLYRTSLPPRDGNQLLTLYPKLKEIFNTGGDYAIWTVEQRLKYIENIVSNLATLSKFKLEESSGKISWNEILRWWLDPNTAAKKPTAKQVSKWHSYISQNFTYRFNWGLGSIIALAIDEAFGGELVESSLENWSQTGLPWIVFWMKELIVWGTLDPVAAYLLAKVEDVTTRKQAEELAQTYYQYISERELEPNEYLNAVNIRNWTEQSFSDVERHLPTPKPPKKIDVNLLKDFSKAPSKNWRVVPVEVGNEIQWFDLAGVPLAICQKPENWQPDFLNTYDFTLDAENRIVSSRVYV >NC_019727.1|WP_015173894.1|8365_10021_-|ISKra4-like-element-ISCasp2-family-transposase MKQMHPCLSKDKNGNKYGRMQASRSNPGMFWEEARELFEEIVGWLDSDSICGLEHGEIESKLLDNGYELLRRLLQGYFDKRSQDETDSEWVGKDQAKRTHKKKLSRKLTTIFGTVIANRIGYGGRKINTLFPLDAELNLPAEQYSHGLRQRVAVEVARSGFRETVDIIEKTTAAKIGKRQAEELAYQSAVDFDDFYTYQQAEAVQVEEIGEIVVISADGKGVIVSHSTRAVPSVEVAVRTEDLRPQTQKRAQASSKKLDKRLTKGEKANAKRMATVASVYTINPFVRTVEQIVNPSDEDKKIKRPKPIGKRVWASVAKEPEVVIKEAFDEALHRDPDRQKRFCALVDGNKQQLSLMKKFAKKHHLELTIVLDIIHVIEYLWKAAFVFYSSTDKQAEAWVTKRLKSILEGKSSDVASGMRTSATKRKLTPQERKPVDNCARYLLNNREYLKYHDYLKAGLPIATGVIEGACRHLIKDRMDITGARWSLAGAEAVLRLRSLYISGDWDKYWRFHLHQEHKRNHLALYQGAIPLMKRVAKARCPITPSPLPIPV >NC_019727.1|WP_015173893.1|7334_8369_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MNIILHKVNDSQIGQRREDGYINLTKMAQASNRKLNDYLRLSTAKAFIDKLSADTGIPVSGKNGLVQVHKGGNNKTTQGTWGHPQVAINCGQWCSPEFAVLVSKWVFSWIANAQNPVKENCDGQSPVFDHRSNQFSDVVKAYIESSQALNRAIHTAIHQQTDSLREALKFLDSYNDVTVTVLAAEAKLVEQTCTTSDTVCIDLITLPDEQPRRYFDGQKLEELSHSIKEFGILEPLLVRPLSGGNYELIAGERRLRASQIAGLTSVPVLVREMDDTTTRACRLIENLQREDLNVYEETIGILNLLALQLKTTEDKVISLLNRIEKANRKKADECGSFSKTGNVV >NC_019727.1|WP_158333194.1|5976_7167_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MSKKDIAYNAKLKHTKPLDLMFGGEDSDFSEQSSVPTTSDFSEQISGNKTSNTIDREQIKLDPNQPRRYFDPKKLEKLAQSIKELGILEPLLVRPLNDGYYELIAGERRFKAAGIAGLSEVPCIVKEMDDETVKQVQLIENLQREDLNAYEETIGILELLALRLKMTQDEVISLLNRIEKANRKKADKVIRHDSKEQTDNVIHHDSKEQADNVIRHDNDESEDDVIRHNDESEDKKADNVTPSKRKKQANNVIRLEEIEIVNKVFASIGRLSAESFRANRLPLLNLPGDIQQALASGTIEYTKARAIARVKSEPERLQLLDKAINQNLSLTQIKEIILGLESSEQKEIPPEKAASQRVANIGKRLKEAKVWDDVKKRRKLEKLLGDIEKLLDEQAC >NC_019727.1|WP_144051166.1|22016_22610_-|hypothetical-protein MELIEAEDAANGEVGCGIPSDKLSKYLDNRSININGENLRQLLREHLGHILTERDFDAIISQVSRHICSMVAEFNESISNVLQTSEVDGDIIEHISNTELKKYFQSELEEFLSKDFIEQIIQRTHSIIHQSVLQPRHSWLSPIWVFKGSEKLYIASSATLHLAIENVKAQYPHIVGELEVVKVGGILAPNQVVEVDY >NC_019727.1|WP_051036839.1|22660_22915_-|hypothetical-protein MDNTAPWNRSTINYPPIYKGVGGNLIDFAVVRSNELGYQGRIGLHALPGAIAFYKKLKIGLLDCGPDPDEPDNLVYFETLRRKL >NC_019727.1|WP_144051160.1|26387_26684_+|hypothetical-protein MEASNFCQPSNFSTTRCNAHLGRLMVLNVNRRVRSLSSVLGTRALLPSAIAIKLRVQYREGFIPDLEFFGIFPVKAVYDMGFQILGNGFDDVLMMRFR >NC_019727.1|WP_015173907.1|28271_28457_-|hypothetical-protein MPSKKPQMTIRVEEDEYQYLEEWAKEEFLSPTQLAKIIIKRAIANKKKEKAANSGRYEQSM >NC_019727.1|WP_015173908.1|28775_29900_+|hypothetical-protein MTVEYSNSENWLASVSYCASLRSLELISGKDPGAGYGKAIYGDMTVVVPAAYSLLRNRNINHHETIANSGAWVRYVEGSRSDLKEKQYFWGTAATAQADHTLLHENKALKAELALESILADLAILNVPDGSKLWISLSNHNPEKWEEDIKRKVRGGHTFQHKDPVSREIVTKTIEIAITGIYPEGFGSIAYCLFGNQSLHLDASEIAIALDIGSSTWLITIFNGSGAVIDRHLIEGGCGELHRAIAETLDKRNDGTSLLRKDVKHSPNLVNQGILAGTFTYGGNHLTGKVFKTEYEQCLQTWWDTRIEKFANFVTNSGYLDQAQYLVCWGGGASLPLTQERLTDIGFVTLTEPQFINAQGLKLLTEITLEDISK >NC_019727.1|WP_015173909.1|29896_30145_+|hypothetical-protein MSNYASRRITISYFAAEEVCKMAGLPLDVPPQALAGAVEKLIFQFESDRQASSQPKAEPPKTQVVEANKNAIAAMVKGYQSK >NC_019727.1|WP_015173911.1|30740_31034_+|hypothetical-protein MSKPIGYYTNYTPGDEGLLAQMQSVWGAQLQELNNADRLWMIYKLAEELCAEFEEALEIEDLTEGVEEAVERSNSELQQSDRLGLIEALVNQVKHSK >NC_019727.1|WP_015173912.1|31039_31477_+|hypothetical-protein MGRNKYQLQASLGLFSLFLTASPLFLKLPAQYQAFNKNSEMEVDAAIAYSKTRTSEQIERERIQQRKETADTLQRTGILPTHQKLKIRRYFDNPKRNPNPDITGYLEDETVYVYDSAGICIGRIENRQWYWKHWYKNACDNSPAQ >NC_019727.1|WP_015173913.1|31878_32580_+|hypothetical-protein MSALGEKDASQSKKEEQKKGVSEYIEIIAQWVVDIISIPFQFAGAIMSQFVQPGTSGAKILGMLMFAGGVVLSADGIWQTLFQGTPMFPWFERGWIGWFGWLTVWFNPLFWLSIVVSWCIQQAEAKTLRGKKPNLAKTEFDESKQYSLPSKPSGSIDLTKALWGDYKRAGMRERHSGGLIALLIWTLDFVTTFYSRNPFGFTDPGQVMGCIVYNFATMMAGEIGWNLWKHSKR >NC_019727.1|WP_015173914.1|33042_35280_+|hypothetical-protein MDFINHQPDSNPHFSPKPATGDGQSDNQSGVTPIKPPVPQLTTPETARLRENYPSIEHLEAGNVAAWLQERQDQLLSRATEGRASMNLAKLITLAGGAVGAVCYATSPIAPIAALIGFGSYIWTVAKDNNATHKFAPVPFIRGSFWEFLSAMGDAEAREEWFSNQDDLLDLLSHMERMERTEYAMLREFKQELTDYLSIVDSGKKFYAYRWLLDCFEQYRGSLPSAKTLKQHLEIVTVDPRTDFEQVNALIQHQSQQQQPRIIDLPPGRINDLPPGKINDSSLGNINDSASRNINDSSLGDINDLSSRKNNDLSPGNIHDLASRKTNDSSLSDINDLASRKTNELSPENIHDLQKSPHNPTTPNRDELLKLPLTARAEAIIKALTEGGFDIAKCIQDQISAIAGNQRGGKGTLMAILAILSFALNPQTKIHYFTAGDDIYPFKCDKLLCRLNWHNLDGSEADAKVAQALFKYLKKMDNATQGEYDDVILVIDEAVALSGYLTDDQKEWMVKYILTRASKKGAQIFVVLHGKHLSTWVGKNTNGMADTFKSGVSFIGCESTSIQVSALKRISVATGRYFLADPDSFDKAVKGGEIGVLPDWIKTEKHPVNGQPDPARTLLTFFPELVDNNPNFDNSSSGEDICETIKVDRSATVESLENLWKLSVPEVDFESEIDEAFLSLILELVAKASAFPVSFEAIRKHKSWERDWGLKNPGRGTLRAALSKLVIEQRLNGNEKEGYLLPNKS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019727.1 | 4495-4525 | 0 | 1.0 |
NC_019727_1 | 1.2|868|17|NC_019727|CRISPRCasFinder | 868-884 | 17 | NC_019727.1 | 4455-4471 | 1 | 0.941 |
1. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to position: 4495-4525, mismatch: 0, identity: 1.0
ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa Protospacer *******************************
2. spacer 1.2|868|17|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to position: 4455-4471, mismatch: 1, identity: 0.941
aacctgcaatcatcggt CRISPR spacer aacctgcaatcatctgt Protospacer ************** **
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019727 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01, complete sequence | 814-844 | 0 | 1.0 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019727 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01, complete sequence | 4495-4525 | 0 | 1.0 |
NC_019727_2 | 2.1|21304|59|NC_019727|CRISPRCasFinder | 21304-21362 | 59 | NC_019727 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01, complete sequence | 21304-21362 | 0 | 1.0 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019773 | Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03, complete sequence | 76281-76311 | 4 | 0.871 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019773 | Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03, complete sequence | 112477-112507 | 4 | 0.871 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019774 | Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04, complete sequence | 80646-80676 | 4 | 0.871 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NZ_CP046708 | Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_e, complete sequence | 26464-26494 | 5 | 0.839 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019773 | Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03, complete sequence | 72780-72810 | 5 | 0.839 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019773 | Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03, complete sequence | 108976-109006 | 5 | 0.839 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_019774 | Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04, complete sequence | 84147-84177 | 5 | 0.839 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NC_003273 | Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120delta, complete sequence | 45261-45291 | 5 | 0.839 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | NZ_CP016500 | Agrobacterium sp. RAC06 plasmid pBSY240_1, complete sequence | 233415-233445 | 6 | 0.806 |
NC_019727_1 | 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder | 814-844 | 31 | AP018324 | Nostoc sp. HK-01 plasmid plasmid6 DNA, complete genome | 2483-2513 | 7 | 0.774 |
1. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019727 (Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa Protospacer *******************************
2. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019727 (Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa Protospacer *******************************
3. spacer 2.1|21304|59|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019727 (Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gctcaaatagccaccagttttttaataacgaattaagtgctgaccagggaaatagccag CRISPR spacer gctcaaatagccaccagttttttaataacgaattaagtgctgaccagggaaatagccag Protospacer ***********************************************************
4. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019773 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
-ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer aatcatc-cgtttcaaccaggattaattgcaa Protospacer ** **. **.*********************
5. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019773 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
-ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer aatcatc-cgtttcaaccaggattaattgcaa Protospacer ** **. **.*********************
6. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019774 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
-ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer aatcatc-cgtttcaaccaggattaattgcaa Protospacer ** **. **.*********************
7. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046708 (Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_e, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer aatcatc-cgtttcgaccaggattaattgcaa Protospacer ** **. **.***.*****************
8. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019773 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer aatcatc-cgtttcaaccaggattatttgcaa Protospacer ** **. **.************** ******
9. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019773 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer aatcatc-cgtttcaaccaggattatttgcaa Protospacer ** **. **.************** ******
10. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_019774 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer aatcatc-cgtttcaaccaggattatttgcaa Protospacer ** **. **.************** ******
11. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NC_003273 (Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120delta, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
-ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer aatcatc-cgtttcgaccaggattaattgcaa Protospacer ** **. **.***.*****************
12. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016500 (Agrobacterium sp. RAC06 plasmid pBSY240_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
ataattgcgcttcaaccaggattaat-tgcaa CRISPR spacer agaattgcgcttcaagcaggatgaacatgcg- Protospacer * ************* ****** **. ***.
13. spacer 1.1|814|31|NC_019727|CRISPRCasFinder matches to AP018324 (Nostoc sp. HK-01 plasmid plasmid6 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
ataattgcgcttcaaccaggattaattgcaa CRISPR spacer ataattacgcttcagccaggattaagggtct Protospacer ******.*******.********** *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_1 | 316560-317384 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_019751_1
|
11 spacers
spacers of NC_019751_1
>1.1|316595|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAACTGCTTCTGCTGATTGAGTTAAAAAGGATTTT >1.2|316666|40|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTGTACCTCTCCCCTGTATCGTTGCGCATAGATTGCGA >1.3|316741|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGATATTTTCTCTATTTCACGACCATCTTTTTTAAT >1.4|316813|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAAGTTTCCGTCTGTTACAAAATCATCTAAATTG >1.5|316884|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGGATAAATTTAAAAAGAATGAAGTCGATACGATCA >1.6|316956|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATGGATAATTTTTGACCGAATACCACTTTTCT >1.7|317026|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATGATTCGCTGCTAAAGTATTTTTCAACCTTCTT >1.8|317098|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTACTCTTTCAAAATAAGAGTCAAAATTTTTT >1.9|317168|38|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTAGCACAATCCCATTCAGTAATTGCACATACTTTTC >1.10|317241|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTTTGCCACATATTCTGAAAATAAAACACGAGTT >1.11|317313|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTTAACAAATTATTTTGTCAAATCTGAAAAATCA |
cas1,cas2,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_1
The CRISPR arrays of NC_019751_1 >merge|NC_019751|1|316560-317384|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGAAACTGCTTCTGCTGATTGAGTTAAAAAGGATTTTCTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACCTCTGTACCTCTCCCCTGTATCGTTGCGCATAGATTGCGACTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTAGATATTTTCTCTATTTCACGACCATCTTTTTTAATCTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTTGAAGTTTCCGTCTGTTACAAAATCATCTAAATTGCTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGAGGATAAATTTAAAAAGAATGAAGTCGATACGATCACTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGAAATGGATAATTTTTGACCGAATACCACTTTTCTCTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTATATGATTCGCTGCTAAAGTATTTTTCAACCTTCTTCTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTTTTTACTCTTTCAAAATAAGAGTCAAAATTTTTTCTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACAGTAGCACAATCCCATTCAGTAATTGCACATACTTTTCCTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACATTGTTTGCCACATATTCTGAAAATAAAACACGAGTTCTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACACATTTAACAAATTATTTTGTCAAATCTGAAAAATCACTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC >NC_019751|1|1|316560-317384|PILER-CR CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAAACTGCTTCTGCTGATTGAGTTAAAAAGGATTTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTCTGTACCTCTCCCCTGTATCGTTGCGCATAGATTGCGA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TAGATATTTTCTCTATTTCACGACCATCTTTTTTAAT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTGAAGTTTCCGTCTGTTACAAAATCATCTAAATTG CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAGGATAAATTTAAAAAGAATGAAGTCGATACGATCA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAAATGGATAATTTTTGACCGAATACCACTTTTCT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TATATGATTCGCTGCTAAAGTATTTTTCAACCTTCTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTTTACTCTTTCAAAATAAGAGTCAAAATTTTTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AGTAGCACAATCCCATTCAGTAATTGCACATACTTTTC CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ATTGTTTGCCACATATTCTGAAAATAAAACACGAGTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ACATTTAACAAATTATTTTGTCAAATCTGAAAAATCA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC >NC_019751|1|1|316560-317384|CRISPRCasFinder CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAAACTGCTTCTGCTGATTGAGTTAAAAAGGATTTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTCTGTACCTCTCCCCTGTATCGTTGCGCATAGATTGCGA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TAGATATTTTCTCTATTTCACGACCATCTTTTTTAAT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTGAAGTTTCCGTCTGTTACAAAATCATCTAAATTG CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAGGATAAATTTAAAAAGAATGAAGTCGATACGATCA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAAATGGATAATTTTTGACCGAATACCACTTTTCT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TATATGATTCGCTGCTAAAGTATTTTTCAACCTTCTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTTTACTCTTTCAAAATAAGAGTCAAAATTTTTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AGTAGCACAATCCCATTCAGTAATTGCACATACTTTTC CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ATTGTTTGCCACATATTCTGAAAATAAAACACGAGTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ACATTTAACAAATTATTTTGTCAAATCTGAAAAATCA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC >NC_019751|1|1|316560-317384|CRT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAAACTGCTTCTGCTGATTGAGTTAAAAAGGATTTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTCTGTACCTCTCCCCTGTATCGTTGCGCATAGATTGCGA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TAGATATTTTCTCTATTTCACGACCATCTTTTTTAAT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTGAAGTTTCCGTCTGTTACAAAATCATCTAAATTG CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAGGATAAATTTAAAAAGAATGAAGTCGATACGATCA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAAATGGATAATTTTTGACCGAATACCACTTTTCT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TATATGATTCGCTGCTAAAGTATTTTTCAACCTTCTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTTTACTCTTTCAAAATAAGAGTCAAAATTTTTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AGTAGCACAATCCCATTCAGTAATTGCACATACTTTTC CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ATTGTTTGCCACATATTCTGAAAATAAAACACGAGTT CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ACATTTAACAAATTATTTTGTCAAATCTGAAAAATCA CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
>NC_019751.1|WP_158333119.1|316385_316526_+|hypothetical-protein MAETLILSFYPTNRYPGKGLMLLEYGLITKNYQLFRKNFTPHKKWR >NC_019751.1|WP_015196021.1|314349_316356_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MFTLEHLNYAWLQVRAGSKSAGVDGISIGFFESMATEQLRNLVSQLQYGTYTASPAKGFYVPKKNGGKRLIGIPTVRDRIIQRLLLDELYFPLEDTFVDCSYAYRPGRNIQQAVQHLYRYYQYQPKWIIKADIVEFFDNICLALLLNALEKLRLEPNILQLIEQQIKSGIIINGQYQNAGKGLLQGGTLSGALANLYLTDFDQKCLNQGINLVRYGDDFVIACSNFAEANRVLDKITGWLGGVYLTLKAEKTEIFSPDDEFTFLGYRFAKGEVFAPPPPEPTQQGEWVINDSGTPYFRRKPKPEKPVSRPPKACSIDKPVNFPRAAISHYWQDFMSTLYVTDQGAYLSMKNQQFQVFYQGELKIKIPVVRVSSIVMFGCCNVSHGAVSMALIRRIPIMYLSQKGRYFGHTAVQGNAKVEYLMKQVICCQNPVFTRQQAETIVAAKLHNSRILLMRLNRRRETEIATQAIDFIEILIDSLPKAESMDALRGYEGKAATIYFQALGSLFTGFFAFDKRTKRPPTDPINSLMSLGYTLLSQQVFSFVQSVGLHTHFGNLHVPRDNHPALVSDLMEEFRAQIVDSFVSYIVNKKILTPEDFTSPDERGGVYLQASALKKYLKHWEEKLQSETTHPNTGYKVAYRRCIELQVREYVACLVGEVEVYRPMTWKM >NC_019751.1|WP_015196020.1|313459_314212_-|DUF4384-domain-containing-protein 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MSEIIETITQLNREVVKLAEAGDFEASISIAKEAVKLGEKNIDEHPAFADSLNNLAELYRMQGYFVEAKPLYIKILNLRKRLLGDSHPDVAQSLNNLAAFYVSQGLFIEAENYFLAALDIWKIYLGDEHPEIATNLNNIAEVYREQGRFQESEKIHLQALNMRKRLFGDFHADIAQSLDNLAVIYENQARYSEAETTHLEALEIRREIFGDENWQIAASLNNLAALYNSQGRFVEAAENYSQALELCKNCLGNEEHPYIAITLNNLANTYKNQGHYAEAEKTHFQALSMRKNIFGDEHLEVAQSLSNLGDIYLIQGRYLDAEEVYLQADSIKKDLLNPEHPDIALSLHNLGVLYTYQGRYQQAEAKYLEALSLHEQSLGKNHPIVADNLNHLGSLYQEQGLFSDAEQKYLAALAIRKNIFGEEHPDIADSYNKIAEIYRLQGRYSQAEGLYLEAYKLNKKLLGEIHPDVAAILSNLGVLYDAQFKYSQAEPLFTEALLIVRTKFGDNHPQVASVLNNLAAIYGSMRRYLEAEEIHLQVLEIRKSIFGSEHPDIANTLNNLAEIYLAQGKYAEAEKYYSSALSVRIKFLGENHPDVALSLNNLATLYAATKRPDNALSHRIQASTIHDKLISNVFAFSSENDRLAFIDKIRGNFDLFLSLIYQYFPNSETATQEAFDFILKRKGLTAASLAAQSQAFYNDRYPQLTGKFRQLSELNTQLVRLTSFANQTQNIANYQSNLTQLRSQYDNLQKQIASQVPEIQLSTQIPNRHAVASALPTKSVLIEFVLFDVFDFQAIQANGETQWKSPHYLAFILPAGQADGVQMVDLGEADTIHNLINLFRLEASDGGEETLGWAKVKTTPQLQIKQYNPAAAVELSQIILSPILDVLTDCDQIIFAPDGNLNLVPLQILPIYPSERSFLMDKYTVSYLGVGRDIIHSQHQPTTIGDTPIIIADPDFDLAMANNNLPNLENPTKQELLDTLDIKLDIKVLPPAHGTRLLGASVAKKLKNARLYTGAKALSTCLTNSKCPSIMLIATHGLFIPDSRQSNPMMRSAVAFAGANTALLGGNLPKQAGNGFIFAQDIAGLDLRANELTVLSACDTARGDIKIGEGVFGLRRAFASSGTKILVMSLWEVPGRATALLMEQFFEHYQNGVAAVEALQNAQNYIRNITVEELRKSDLGMEILTELSQVRGLEISTNGNKKPLEHPFYWGAWICQGL >NC_019751.1|WP_015196018.1|308554_309154_-|hypothetical-protein MKSWKLSVATVVLVASVCIPKAEAKNLSNTQANQVKQTFSVLANNSQVIKEPSLIAINDTYRGPNQDFEIQMPGSVQENEERKLMSWSDTTQTVYVIIHKDMPVDVSYLSVEEVEQVLQTSMREEMASTGKIVRSTNLEIDGYPGLELLVQHTDGTTGQYRGFIVKGRMYVMGAATQGELTTEAVNFFDSFGVYPERVR >NC_019751.1|WP_015196017.1|307408_308317_-|M48-family-metalloprotease MKTSHIKSIRKIIFTTLGFSSSILLSLNTPGFAQALITLPDLSITNSSISTSQVKPKKTNLQWVYSVAEKVIRANGLDEHPWRFQVSDEYNINAYAGELNKIVIYKGLLDQIHGDDAALAFIIAHELAHHTQRHSAQQEEAEARLKDKLLKEAEAEFTSWIVAEKQKSQKPISIAEKDVIKQRILIQKKQEFDQAIQALSRQHEFQADAVGYTYMGKAGYDPNGGLRVFNLFHRLPSDYTENSTHPTTEQRIDALNQVMNKYPWRTLWADGNERLKVNSQPLKFDVIENGISLRINSKFLSE >NC_019751.1|WP_015196016.1|306437_306971_-|glycine-rich-domain-containing-protein-like MNTIWEKQLPSKTNEEFAEKITNFFRKLNQLDFRAISKKLTSNTENFQWTEEETKSAIHLYKMFLCLHFLFPNTELVPTVEIDRVWHTHILLNTAKYIEDCQELYGYILHHYSPADDDLEISHKFQKTAFDLTKHLFLEIFGIDICHNVAYHQGRCLILPQHFPQLQRSACLTIPKS >NC_019751.1|WP_015196015.1|304143_306417_+|AAA-family-ATPase MLSRNFLSQIAYEHELSPEQQQVFLMRIGDGLSYEEIAAQLNTSADACLKRMGQVYKKFNISGASRGKESKLRFFLTNRLEKVTEESSAHTQSIEEKKQETQPNSVAQNLPVREYTTFVGRDQEITRLMELLDFQHTAHLISVDGIGGVGKTTLVVEVAYRCLQASNNQLLTPNLPTFEAIIFTSAKQNHLTSIGILPRLTKERTLRDICREVARILDLSEITNLPIEEQFQPIREKLSQTRTLLIVDNLETIENQQEVLSFLYDLPPSVKVIITTREQALFVPIRLGCLPREHGLCLIQQEAQEKSINLTAEESQQLFEGVSGIPAAIIYVIGQIAAGYSLEDALSQIKEPDGDVARFCFAGSVIPLRGTPPHYLLMALSLGVKPITRETAASVAFEQADPILTSQGLAKLQQLSLVYHQQGRYSLLELTREYAASELAANRELAQQLQQRWVNWYIRFSEVYGGTNWKEWHLGYSYLEIEWENLRSVLEWCMSQGIYGDARTIWQQIKGYIHVRGYWDERLEWTAWLIETAKQAGDWKFTVEVMCDRAITLIRMRHENQLTEAEILLQEAWNLRQHQSIALQLEIATNMVILSIYQQKWQQAGEWLTEEEKLLTQTSLSELERQQQQVHILYYQGQISFKTGNYQQAQSFFLQALESATTAGWLRATTAIQNWLADIALELGNLKQARQLLEISFPMAERHKDKLSIAYHKATFAKLEKRSGNLPQAKRLAKEAAEGFESLKMVVEAKEMRSLLS >NC_019751.1|WP_015196014.1|303797_303959_+|hypothetical-protein MSTPAAGIANHEIVETEEGFILPFLAPIYLSLRRVSFYAFSVKWFFLEKYPIG >NC_019751.1|WP_015196013.1|303003_303693_-|hypothetical-protein MGKSFSSLDEVAVKAQKAVIKAENESLSDEDRQQALLEKQIALTKLMTLLMERIKVELPKPGNVGLSEYIYEETLQNIYLYICKNIGKYNSDYSVMAWVKFLLKKRKNNVFNWLNWDGKVSYIDKGLNKDGDEYERNPLESYQPPSLNPLPSEKLIEFIKEDPEGLLASKLFKKNPQASFQAILLKKNEECKTWEEITQELNLGKTHGPIYSFYSRCCDEFSPYFKKYL >NC_019751.1|WP_015196022.1|317685_318726_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSTIYITEPDASFKLQNKYLKLLQQDKQRFFIRISNISQFAIFGNIKLPKDVMQIVRLNQIPAIYFTHTGEYVGRLENPSTVQAKYLNYQRQRLHDREFNRATAESIVWAKLHNQQTFLQNWTRYCTDYTTQRASDYLTLLMDNLSLAPCVEELHQYIEEADKVYYCAVASILSLYSSNPHTTAKQINRFLNLGNQLLHQYIYNHLKTAGLHPDYSILHRDTHHELPLAWDFSAEFRAPIVDDLVLNFVRNLAKNNGNGNGNGKKPYTHLQRFLQHWEGKLKTFVLHPSAGEVSYRQCIDLQVKEYIASLLGDVEYYRPLALKFHPEQTNFINMLETQKPILTLVK >NC_019751.1|WP_015196023.1|318737_319016_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFYLVCYDIVSDTRRNKVSKLLESYGLRVQKSVFECVLDEKQYESISKLLMRLLNRREDQVRFYPMSAHNRCKVAVVGTQPEFSVDDAAFIV >NC_019751.1|WP_015196024.1|319267_319537_+|hypothetical-protein MQIQCVRFCLIFSPKAEKQLDDLPNKDRKQYDKAFKCFIQNSPAYRSLRTHRYCSKDGDIWSSSASMAKRFYWRYLEGDIIEITHIDSH >NC_019751.1|WP_015196025.1|319633_319933_+|hypothetical-protein MRKPKSLGERELHLIRVYSNWNFGMTPIEFYTKWEVSYEQIALICDRSDSTVRRWFKQGDNRRYPNRNDLLNLALIDFLLEHFEEIPEHLRRLLCAENF >NC_019751.1|WP_015196027.1|320450_320843_+|hypothetical-protein MKTTRFLTFLGTTSALLMGLSLIATTSQPAKADWWDVGKQIIEDNLNGIRGNTVGRIYDQTFIAELSSEEVGQYKQRWGGNYSAKISDWCNDTVYQAGWRNLAGNQIPFVNTTWREENGKVNCYVRHAAQ >NC_019751.1|WP_015196028.1|321419_321713_+|hypothetical-protein MNKSINRFLLVGGLITVSSVTVATLPINPPAQAGWAPWVQVYVTDYSEGNGRDQGENVRVCQNKAKESGRPDRIKRWWFNSTFRDGKCWTRVPIWEG >NC_019751.1|WP_144051089.1|322012_322243_+|hypothetical-protein MLKRGVCAVIGVNTGECASERQNSPSPNYSSPNYPQYPEQPLNNSNQADEYPQYMPPNPEVPYGYPQYTSPNPEEQ >NC_019751.1|WP_085953333.1|322570_323808_-|ISAzo13-family-transposase MVLTDSLKKLFIETASQLKGAEKRRFMASTVQSLGLGGQRLAQSELGWNRDTIRKGTRELKSGITCVDNMSGKGRYKAEEHLPNLLEDIKKIVDFYSQTDPSFKSQRLYTRLSAAEVRKQLIEKSGYSDEKLHTSETIRVKLNNLGYKLRRVKKVQPQKKFPQTDAIFEQLDVVNKDADEDKSVLRLSMDGKACVKIGSFDRGGKSRDGVKASDHDYNPKTTVTPYGIFLPELDELFLYFTESKVTSDFIVDILEDFWSCEKHRFSEVKTLLLNQDNGPQNSSRRTQFMKRIVEFAHKHQVNIRLAYYPPYHSKYNPIERTWAVLENHWNGSILDELETALNFASTMKWNGKHPVVKLVHETYENGVKLTKKAMAQIEKQIERLTDSNHEVFPNLGNWFIDICCSKTNVISF >NC_019751.1|WP_015196030.1|325819_327913_-|WYL-domain-containing-protein MSALNICHFLIGVPGSGKSTFAAALAKLGNNVIISTDEIRTTLYGDAAIQGNWNEIENQALLLIQQAQTSKKSVIYDATNFKRAFRMDFLMKIKEDGETLPLRWIAWYLKTPIETCIKWNQNRNRQVPQPIIETMSKLLANFPPLIAEGFATIEEIDVTKFPTDTAAFTAQIEKRINSLKRRITNRNNRTQHDGIIFHRYSRLLDFDRLMHLISLVIKYPGIGNLHTTNPKLLENILGEIPETTSNIDEITKIMAKLHGGIYGNPSEIIADLQWLEENGVIAGNKEQENNSLSLPSPLSFHCPHPTHSYSDTEPFQRLIGTISFILHNPFLPNIGDGNLPTLAQALQQAGITCGDNLDTLRKDIEKILKPYQILPEFAMRNGYFAGTGILSQAELIRVFETLRSQAQSLDDPLALELYETFKQRMLQTKLIDTDKKVYPVRAIVNRSIVDPRYLHSTALVNNLPKLEAAISNGEVLELNRFSGSGGYDYDPKSFFLAYPLQIVFSNLAWYLGFESVGGNEPGLLRFERLDRLFLGNQQNKTRYRSEQEKSLQKLQALLKGSAGLFLGNSEVEQSKFLSQDQKVHITACMTVELWFNNDVYKFITEGTKRFAKIKMSPPVSSTKNNLPKSIFSLKATKDKQFPHRFQVILPKWSLHDFDLWRWIVGFGGNVKVIEPIELVEKVKGIGSGIVQVYDTKK >NC_019751.1|WP_041738925.1|329011_329272_-|hypothetical-protein MYLNFWRDRISLLYYISESDRTCKYLSSGTPRVGVSYHDISRKISKSTLFLANRSGVLQVIGFWELKPLSVKAFSYFSLKGGLPNF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_2 | 324319-325428 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_019751_2
|
15 spacers
spacers of NC_019751_2
>2.1|324354|39|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGGAAGTTTTCGCTTGGGTATTGCTTAATTTAGCAGAG >2.2|324428|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTAAGGCTATATCGCTTCTAAATTGAGAGACA >2.3|324498|44|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGACAGAGATATGTCCTCAAAGAGAAATGAGTTTGTCTCAATT >2.4|324577|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATCTGCTTTTGTAAACTCTCCCCAATGCAAAG >2.5|324648|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTGGTTTGCCGCTTGAGTGGGCATAGTCAAAAAAT >2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTTGAGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTC >2.7|324790|39|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACACGATTCTGGAACGTTACTAACATCCCATCAGGA >2.8|324864|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTTGAGTTGGTACACCAGCTGACTCTCAATTTG >2.9|324934|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAGGGTCTCTGTAGATCTTAAATTCCTCAGAGTA >2.10|325005|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATGAAAAGATTTTTACATCTTTTGCTGATAAAA >2.11|325075|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTAAGTCACGGAATTTTCGGTTGAACTAACTAAT >2.12|325146|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTGATGTAAGAAAACTCATCACTAGCAAAAAAA >2.13|325216|38|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGGCTCTTAGCTCTGCCCGTAATTCGTCGCGGGACTT >2.14|325289|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTCGCTGCTTTCAACTTCTGCTGCACAAACTACG >2.15|325360|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGAATTTTGTTATTCTAACCTCCACTCCACATG |
cas2,cas1,WYL,cas10,cmr4gr7,cmr5gr11,csx1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_2
The CRISPR arrays of NC_019751_2 >merge|NC_019751|2|324319-325428|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTAGGAAGTTTTCGCTTGGGTATTGCTTAATTTAGCAGAGCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTATTTAAGGCTATATCGCTTCTAAATTGAGAGACACTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACAAGACAGAGATATGTCCTCAAAGAGAAATGAGTTTGTCTCAATTCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTTTTATCTGCTTTTGTAAACTCTCCCCAATGCAAAGCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACACTGGTTTGCCGCTTGAGTGGGCATAGTCAAAAAATCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACAGTTTGAGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTCCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTTTACACGATTCTGGAACGTTACTAACATCCCATCAGGACTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTCGTTGAGTTGGTACACCAGCTGACTCTCAATTTGCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACATTAGGGTCTCTGTAGATCTTAAATTCCTCAGAGTACTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGAATGAAAAGATTTTTACATCTTTTGCTGATAAAACTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGTGTAAGTCACGGAATTTTCGGTTGAACTAACTAATCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACCTTTGATGTAAGAAAACTCATCACTAGCAAAAAAACTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGGGGCTCTTAGCTCTGCCCGTAATTCGTCGCGGGACTTCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGTGTCGCTGCTTTCAACTTCTGCTGCACAAACTACGCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACCTGAATTTTGTTATTCTAACCTCCACTCCACATGCTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC >NC_019751|2|2|324319-325428|PILER-CR CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TAGGAAGTTTTCGCTTGGGTATTGCTTAATTTAGCAGAG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TATTTAAGGCTATATCGCTTCTAAATTGAGAGACA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AAGACAGAGATATGTCCTCAAAGAGAAATGAGTTTGTCTCAATT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTTATCTGCTTTTGTAAACTCTCCCCAATGCAAAG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ACTGGTTTGCCGCTTGAGTGGGCATAGTCAAAAAAT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AGTTTGAGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTC CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTACACGATTCTGGAACGTTACTAACATCCCATCAGGA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TCGTTGAGTTGGTACACCAGCTGACTCTCAATTTG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ATTAGGGTCTCTGTAGATCTTAAATTCCTCAGAGTA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAATGAAAAGATTTTTACATCTTTTGCTGATAAAA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GTGTAAGTCACGGAATTTTCGGTTGAACTAACTAAT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTTTGATGTAAGAAAACTCATCACTAGCAAAAAAA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GGGGCTCTTAGCTCTGCCCGTAATTCGTCGCGGGACTT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GTGTCGCTGCTTTCAACTTCTGCTGCACAAACTACG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTGAATTTTGTTATTCTAACCTCCACTCCACATG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC >NC_019751|2|2|324319-325428|CRISPRCasFinder CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TAGGAAGTTTTCGCTTGGGTATTGCTTAATTTAGCAGAG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TATTTAAGGCTATATCGCTTCTAAATTGAGAGACA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AAGACAGAGATATGTCCTCAAAGAGAAATGAGTTTGTCTCAATT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTTATCTGCTTTTGTAAACTCTCCCCAATGCAAAG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ACTGGTTTGCCGCTTGAGTGGGCATAGTCAAAAAAT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AGTTTGAGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTC CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTACACGATTCTGGAACGTTACTAACATCCCATCAGGA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TCGTTGAGTTGGTACACCAGCTGACTCTCAATTTG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ATTAGGGTCTCTGTAGATCTTAAATTCCTCAGAGTA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAATGAAAAGATTTTTACATCTTTTGCTGATAAAA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GTGTAAGTCACGGAATTTTCGGTTGAACTAACTAAT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTTTGATGTAAGAAAACTCATCACTAGCAAAAAAA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GGGGCTCTTAGCTCTGCCCGTAATTCGTCGCGGGACTT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GTGTCGCTGCTTTCAACTTCTGCTGCACAAACTACG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTGAATTTTGTTATTCTAACCTCCACTCCACATG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC >NC_019751|2|2|324319-325428|CRT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TAGGAAGTTTTCGCTTGGGTATTGCTTAATTTAGCAGAG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TATTTAAGGCTATATCGCTTCTAAATTGAGAGACA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AAGACAGAGATATGTCCTCAAAGAGAAATGAGTTTGTCTCAATT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTTATCTGCTTTTGTAAACTCTCCCCAATGCAAAG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ACTGGTTTGCCGCTTGAGTGGGCATAGTCAAAAAAT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC AGTTTGAGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTC CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TTTACACGATTCTGGAACGTTACTAACATCCCATCAGGA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC TCGTTGAGTTGGTACACCAGCTGACTCTCAATTTG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC ATTAGGGTCTCTGTAGATCTTAAATTCCTCAGAGTA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GAATGAAAAGATTTTTACATCTTTTGCTGATAAAA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GTGTAAGTCACGGAATTTTCGGTTGAACTAACTAAT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTTTGATGTAAGAAAACTCATCACTAGCAAAAAAA CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GGGGCTCTTAGCTCTGCCCGTAATTCGTCGCGGGACTT CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC GTGTCGCTGCTTTCAACTTCTGCTGCACAAACTACG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC CTGAATTTTGTTATTCTAACCTCCACTCCACATG CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
>NC_019751.1|WP_085953333.1|322570_323808_-|ISAzo13-family-transposase MVLTDSLKKLFIETASQLKGAEKRRFMASTVQSLGLGGQRLAQSELGWNRDTIRKGTRELKSGITCVDNMSGKGRYKAEEHLPNLLEDIKKIVDFYSQTDPSFKSQRLYTRLSAAEVRKQLIEKSGYSDEKLHTSETIRVKLNNLGYKLRRVKKVQPQKKFPQTDAIFEQLDVVNKDADEDKSVLRLSMDGKACVKIGSFDRGGKSRDGVKASDHDYNPKTTVTPYGIFLPELDELFLYFTESKVTSDFIVDILEDFWSCEKHRFSEVKTLLLNQDNGPQNSSRRTQFMKRIVEFAHKHQVNIRLAYYPPYHSKYNPIERTWAVLENHWNGSILDELETALNFASTMKWNGKHPVVKLVHETYENGVKLTKKAMAQIEKQIERLTDSNHEVFPNLGNWFIDICCSKTNVISF >NC_019751.1|WP_144051089.1|322012_322243_+|hypothetical-protein MLKRGVCAVIGVNTGECASERQNSPSPNYSSPNYPQYPEQPLNNSNQADEYPQYMPPNPEVPYGYPQYTSPNPEEQ >NC_019751.1|WP_015196028.1|321419_321713_+|hypothetical-protein MNKSINRFLLVGGLITVSSVTVATLPINPPAQAGWAPWVQVYVTDYSEGNGRDQGENVRVCQNKAKESGRPDRIKRWWFNSTFRDGKCWTRVPIWEG >NC_019751.1|WP_015196027.1|320450_320843_+|hypothetical-protein MKTTRFLTFLGTTSALLMGLSLIATTSQPAKADWWDVGKQIIEDNLNGIRGNTVGRIYDQTFIAELSSEEVGQYKQRWGGNYSAKISDWCNDTVYQAGWRNLAGNQIPFVNTTWREENGKVNCYVRHAAQ >NC_019751.1|WP_015196025.1|319633_319933_+|hypothetical-protein MRKPKSLGERELHLIRVYSNWNFGMTPIEFYTKWEVSYEQIALICDRSDSTVRRWFKQGDNRRYPNRNDLLNLALIDFLLEHFEEIPEHLRRLLCAENF >NC_019751.1|WP_015196024.1|319267_319537_+|hypothetical-protein MQIQCVRFCLIFSPKAEKQLDDLPNKDRKQYDKAFKCFIQNSPAYRSLRTHRYCSKDGDIWSSSASMAKRFYWRYLEGDIIEITHIDSH >NC_019751.1|WP_015196023.1|318737_319016_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFYLVCYDIVSDTRRNKVSKLLESYGLRVQKSVFECVLDEKQYESISKLLMRLLNRREDQVRFYPMSAHNRCKVAVVGTQPEFSVDDAAFIV >NC_019751.1|WP_015196022.1|317685_318726_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSTIYITEPDASFKLQNKYLKLLQQDKQRFFIRISNISQFAIFGNIKLPKDVMQIVRLNQIPAIYFTHTGEYVGRLENPSTVQAKYLNYQRQRLHDREFNRATAESIVWAKLHNQQTFLQNWTRYCTDYTTQRASDYLTLLMDNLSLAPCVEELHQYIEEADKVYYCAVASILSLYSSNPHTTAKQINRFLNLGNQLLHQYIYNHLKTAGLHPDYSILHRDTHHELPLAWDFSAEFRAPIVDDLVLNFVRNLAKNNGNGNGNGKKPYTHLQRFLQHWEGKLKTFVLHPSAGEVSYRQCIDLQVKEYIASLLGDVEYYRPLALKFHPEQTNFINMLETQKPILTLVK >NC_019751.1|WP_158333119.1|316385_316526_+|hypothetical-protein MAETLILSFYPTNRYPGKGLMLLEYGLITKNYQLFRKNFTPHKKWR >NC_019751.1|WP_015196021.1|314349_316356_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MFTLEHLNYAWLQVRAGSKSAGVDGISIGFFESMATEQLRNLVSQLQYGTYTASPAKGFYVPKKNGGKRLIGIPTVRDRIIQRLLLDELYFPLEDTFVDCSYAYRPGRNIQQAVQHLYRYYQYQPKWIIKADIVEFFDNICLALLLNALEKLRLEPNILQLIEQQIKSGIIINGQYQNAGKGLLQGGTLSGALANLYLTDFDQKCLNQGINLVRYGDDFVIACSNFAEANRVLDKITGWLGGVYLTLKAEKTEIFSPDDEFTFLGYRFAKGEVFAPPPPEPTQQGEWVINDSGTPYFRRKPKPEKPVSRPPKACSIDKPVNFPRAAISHYWQDFMSTLYVTDQGAYLSMKNQQFQVFYQGELKIKIPVVRVSSIVMFGCCNVSHGAVSMALIRRIPIMYLSQKGRYFGHTAVQGNAKVEYLMKQVICCQNPVFTRQQAETIVAAKLHNSRILLMRLNRRRETEIATQAIDFIEILIDSLPKAESMDALRGYEGKAATIYFQALGSLFTGFFAFDKRTKRPPTDPINSLMSLGYTLLSQQVFSFVQSVGLHTHFGNLHVPRDNHPALVSDLMEEFRAQIVDSFVSYIVNKKILTPEDFTSPDERGGVYLQASALKKYLKHWEEKLQSETTHPNTGYKVAYRRCIELQVREYVACLVGEVEVYRPMTWKM >NC_019751.1|WP_015196030.1|325819_327913_-|WYL-domain-containing-protein MSALNICHFLIGVPGSGKSTFAAALAKLGNNVIISTDEIRTTLYGDAAIQGNWNEIENQALLLIQQAQTSKKSVIYDATNFKRAFRMDFLMKIKEDGETLPLRWIAWYLKTPIETCIKWNQNRNRQVPQPIIETMSKLLANFPPLIAEGFATIEEIDVTKFPTDTAAFTAQIEKRINSLKRRITNRNNRTQHDGIIFHRYSRLLDFDRLMHLISLVIKYPGIGNLHTTNPKLLENILGEIPETTSNIDEITKIMAKLHGGIYGNPSEIIADLQWLEENGVIAGNKEQENNSLSLPSPLSFHCPHPTHSYSDTEPFQRLIGTISFILHNPFLPNIGDGNLPTLAQALQQAGITCGDNLDTLRKDIEKILKPYQILPEFAMRNGYFAGTGILSQAELIRVFETLRSQAQSLDDPLALELYETFKQRMLQTKLIDTDKKVYPVRAIVNRSIVDPRYLHSTALVNNLPKLEAAISNGEVLELNRFSGSGGYDYDPKSFFLAYPLQIVFSNLAWYLGFESVGGNEPGLLRFERLDRLFLGNQQNKTRYRSEQEKSLQKLQALLKGSAGLFLGNSEVEQSKFLSQDQKVHITACMTVELWFNNDVYKFITEGTKRFAKIKMSPPVSSTKNNLPKSIFSLKATKDKQFPHRFQVILPKWSLHDFDLWRWIVGFGGNVKVIEPIELVEKVKGIGSGIVQVYDTKK >NC_019751.1|WP_041738925.1|329011_329272_-|hypothetical-protein MYLNFWRDRISLLYYISESDRTCKYLSSGTPRVGVSYHDISRKISKSTLFLANRSGVLQVIGFWELKPLSVKAFSYFSLKGGLPNF >NC_019751.1|WP_015196031.1|329577_331143_+|hypothetical-protein MPKYTAITFAPVQGFIEKSRKLRDLYGSSQILSYLSQELLNEAGKTTEVVSPAIIKMQKGMPNRILLKGDFTEKQARDTLSSAWKRILFECRSWIGTKLPEKSYGTYHWEREWQNWGNYAWEVFCGSGDTISAAMEDLETKKLSRDWIGVNWIGESSSLTGTDAIAFPGLGAESRNPNNRKWSAEKEEIKTFYRRLACVLEGISLDKEPEGKYIALEEKLSIPELVKRLVTHEDIATSLGISPLGNSFSDIYRRPEKITETEKGRCTGWFMGDGDKVGDYLKDLAQKSDAEVKLFSQAMREWGRDFARDFPKEFGRVVYAGGDDFLGAIYSDKDKPKIEPEQVYQWLLELPNKWREHKQPINVSVGFIWAASSVPQRDILQHCREAEKVAKSLGRNRVTIRILFNSGQYVEWTCPWNYLNILDKYKDLDGNSNWSHIYTDLAQLEARNAFNIDKRTFNRKFALDFFDIYFPGEGEKLSKDNNLLKNIVGYTDDDEEYERVEKTIDWMRSLIKVGFQLCSNT >NC_019751.1|WP_015196032.1|332141_332951_+|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKKAFGIIETLAPLHVGATAGEESGNLNLIFRDQFTQTGIIPGSSLRGRFRAEMRSQVDEKEVSYWYGEGASSEQSEINNESMVKFEHASIVWLPVFCPGQPIVWVSSPRLLERYKRIAQIDAEIPSLYVASSNIRARESQGKKTIFFNLGFLNIIRSENLSKWFPNGKELPAVIVDDSDIAMIHDMALYRQSRVRLKDNEKVVDGGGFFNTEALPEGTILVFPIAIRDDKSNKKWQPFPNDITDEIYLGGLESIGFGHCQLKIVNRN >NC_019751.1|WP_015196033.1|333002_333431_+|hypothetical-protein MNWQPYNLDQEAQRLVLAFRNKEGVIGQSHKMRVTVAYGLERFWGEHLRLLGKNDAKEREKGKYWQSVWKEFVRIMKRTGVELPSDEISDRNTEQIEEVAKKLWSLSLDDQKICLSVLTQFCDSLVWWTQRYKKAGDREEEV >NC_019751.1|WP_015196034.1|333427_335047_+|hypothetical-protein MTNYREIPLMFQAQIKGRGQIQYIAQPEKAYRWVDEWEEGVGNDVSNFSNRVSTKEYKITWRFISNSGQDDDVIRPVIASGGFPYYPGASMKGAFLRSCTPEQAMHYCGGIASKADSTTKPGILRFHGGYPKDATWKDKELVDVVHPQADWQLKDSSSHSAFIQISLHEPTLVFGISSNIKIESSEWDTIWSIWEKALERGIGSRVSAGYGQPVKHPETKLLTVGLTGQGLASQLINKTGEFRPNMFKAALRGHTLRLFAGITDENSAEALTRELWGGFAGKDGAVVGDLGIVFNPLELEMDGYRYRGNSIPTYELNNGILHILSMRSVSEEYKTELRSLAIKLIQFSLLLGGFGKSWRRIDHRIFFPDYLKNNQKPMIGCHWEFHQGAEKLYIPTNRLENISKFFTTLDEKIHQWIIANNKKTSNNLSQWREVWHPQKVQVWARVAEDEDDSSAVHWFHGEYKEGGTIKGSTLTGQIGQIGRIWHRMYPRYSKLKDGTMRRMGDEYIELLTIFPDTSNTTTQFIDFLGKSYFKRIYPS >NC_019751.1|WP_015196035.1|335224_336832_+|hypothetical-protein MAIWIITTGNSDVRIKKENNWNTIFHTIRDNLECTDFASPIPINPNAIEEGYTLPARVLGVAYSQIIEQEPKYFDELEFPLIETFCQKLKSEKKLEKKSHKLEQIFVLTTDQNNLFPNKWDRINEKCPYWQDTIELQTLLEKYLKTQFDIPIEFISLCPNSDEGLDYWDATLKLVETEFSQKFAKLQDKIVYVSHQAGTPAISAAVQFASLGIFGKVEFLVSNQYYDASYNHQAKAKIIDSSEYWRGLQIQKAKPLIRNGFPSTALKLLDGIDRIDKNIILQLEQMVDFFNLKSQSQNTNPDSIKEDFGIPNATQRIVDGLDLIGFFFKQNNYLPGISLLAAAQETFLKVAIKSEIQKNTANYCGIPVAELVKWTTKGLISPNNDELRNILKLPNSQNIDKVRNDIFDLLKFPYSKHNDRFYLYSIKQDLEFSRTGMLEWLLILAPNFREWAHLRQSNLRNQVIHNLRGIEEEEVIAYLLGLRDYQPIPNNITTAMDAYIQKVKQPFMQAIVLLKLPCEKGKLQERLNAIADSLI >NC_019751.1|WP_144051088.1|337174_338395_+|ISL3-family-transposase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_3 | 328043-328873 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_019751_3
|
11 spacers
spacers of NC_019751_3
>3.1|328080|37|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT AAGCGGCTGAATTTAAACCCGAAACCATCCAAGAATA >3.2|328154|33|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT GATTACAAACCTTGGTGTTTCTACCCAAATTGC >3.3|328224|35|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT ATAATCAACCTAGCGGGATAAATCTTCCTTATTTA >3.4|328296|35|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT ATTGAATTCATCCACCTCATCATCTGTATCGAAGG >3.5|328368|34|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT CAAAATCAACTGGCTAGCAACGAAGCTCAGATGC >3.6|328439|35|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT TTCAGAGTTGGAAAATTTATTTGCCGTTTGTACTT >3.7|328511|36|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT TTTCTTGCCACTTAAGATGCTGATAAGTTGTGTTGT >3.8|328584|37|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT CAATATCACCCTTGGAAACTGGATCATCTACATAAAA >3.9|328658|33|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT TTATCCATGTAATGTAATAATAGGTTGCTTTGA >3.10|328728|35|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT CTTAAGGTAACGGCTAAGGATTATAAAGGAAATGA >3.11|328800|37|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT CAACAAAGCAGTTGATTATAAATTGAGCTTACCAAGG >3.12|328081|37|NC_019751|PILER-CR AAGCGGCTGAATTTAAACCCGAAACCATCCAAGAATA >3.13|328155|33|NC_019751|PILER-CR GATTACAAACCTTGGTGTTTCTACCCAAATTGC >3.14|328225|35|NC_019751|PILER-CR ATAATCAACCTAGCGGGATAAATCTTCCTTATTTA >3.15|328297|35|NC_019751|PILER-CR ATTGAATTCATCCACCTCATCATCTGTATCGAAGG >3.16|328369|34|NC_019751|PILER-CR CAAAATCAACTGGCTAGCAACGAAGCTCAGATGC >3.17|328440|35|NC_019751|PILER-CR TTCAGAGTTGGAAAATTTATTTGCCGTTTGTACTT >3.18|328512|36|NC_019751|PILER-CR TTTCTTGCCACTTAAGATGCTGATAAGTTGTGTTGT >3.19|328585|37|NC_019751|PILER-CR CAATATCACCCTTGGAAACTGGATCATCTACATAAAA >3.20|328659|33|NC_019751|PILER-CR TTATCCATGTAATGTAATAATAGGTTGCTTTGA >3.21|328729|35|NC_019751|PILER-CR CTTAAGGTAACGGCTAAGGATTATAAAGGAAATGA >3.22|328801|37|NC_019751|PILER-CR CAACAAAGCAGTTGATTATAAATTGAGCTTACCAAGG |
WYL,cas2,cas1,cas10,cmr4gr7,cmr5gr11,csx1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_3
The CRISPR arrays of NC_019751_3 >merge|NC_019751|3|328043-328873|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACAAGCGGCTGAATTTAAACCCGAAACCATCCAAGAATAGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACGATTACAAACCTTGGTGTTTCTACCCAAATTGCGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACATAATCAACCTAGCGGGATAAATCTTCCTTATTTAGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACATTGAATTCATCCACCTCATCATCTGTATCGAAGGGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACCAAAATCAACTGGCTAGCAACGAAGCTCAGATGCGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACTTCAGAGTTGGAAAATTTATTTGCCGTTTGTACTTGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACTTTCTTGCCACTTAAGATGCTGATAAGTTGTGTTGTGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACCAATATCACCCTTGGAAACTGGATCATCTACATAAAAGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACTTATCCATGTAATGTAATAATAGGTTGCTTTGAGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACCTTAAGGTAACGGCTAAGGATTATAAAGGAAATGAGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACCAACAAAGCAGTTGATTATAAATTGAGCTTACCAAGGGTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC >NC_019751|3|3|328043-328873|CRISPRCasFinder ATTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC AAGCGGCTGAATTTAAACCCGAAACCATCCAAGAATA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC GATTACAAACCTTGGTGTTTCTACCCAAATTGC GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC ATAATCAACCTAGCGGGATAAATCTTCCTTATTTA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC ATTGAATTCATCCACCTCATCATCTGTATCGAAGG GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC CAAAATCAACTGGCTAGCAACGAAGCTCAGATGC GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC TTCAGAGTTGGAAAATTTATTTGCCGTTTGTACTT GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC TTTCTTGCCACTTAAGATGCTGATAAGTTGTGTTGT GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC CAATATCACCCTTGGAAACTGGATCATCTACATAAAA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC TTATCCATGTAATGTAATAATAGGTTGCTTTGA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC CTTAAGGTAACGGCTAAGGATTATAAAGGAAATGA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC CAACAAAGCAGTTGATTATAAATTGAGCTTACCAAGG GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC >NC_019751|3|3|328043-328873|CRT ATTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC AAGCGGCTGAATTTAAACCCGAAACCATCCAAGAATA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC GATTACAAACCTTGGTGTTTCTACCCAAATTGC GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC ATAATCAACCTAGCGGGATAAATCTTCCTTATTTA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC ATTGAATTCATCCACCTCATCATCTGTATCGAAGG GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAAC CAAAATCAACTGGCTAGCAACGAAGCTCAGATGC GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC TTCAGAGTTGGAAAATTTATTTGCCGTTTGTACTT GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC TTTCTTGCCACTTAAGATGCTGATAAGTTGTGTTGT GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC CAATATCACCCTTGGAAACTGGATCATCTACATAAAA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC TTATCCATGTAATGTAATAATAGGTTGCTTTGA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC CTTAAGGTAACGGCTAAGGATTATAAAGGAAATGA GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC CAACAAAGCAGTTGATTATAAATTGAGCTTACCAAGG GTTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC >NC_019751|3|3|328044-328873|PILER-CR TTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACA AGCGGCTGAATTTAAACCCGAAACCATCCAAGAATAG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACG ATTACAAACCTTGGTGTTTCTACCCAAATTGCG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACA TAATCAACCTAGCGGGATAAATCTTCCTTATTTAG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACA TTGAATTCATCCACCTCATCATCTGTATCGAAGGG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAGAGAAGCTTTGAAACC AAAATCAACTGGCTAGCAACGAAGCTCAGATGCG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACT TCAGAGTTGGAAAATTTATTTGCCGTTTGTACTTG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACT TTCTTGCCACTTAAGATGCTGATAAGTTGTGTTGTG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACC AATATCACCCTTGGAAACTGGATCATCTACATAAAAG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACT TATCCATGTAATGTAATAATAGGTTGCTTTGAG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACC TTAAGGTAACGGCTAAGGATTATAAAGGAAATGAG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAACC AACAAAGCAGTTGATTATAAATTGAGCTTACCAAGGG TTTCCATTAATTCAGCTTCAAAAGAAGCTTTGAAAC
>NC_019751.1|WP_015196030.1|325819_327913_-|WYL-domain-containing-protein MSALNICHFLIGVPGSGKSTFAAALAKLGNNVIISTDEIRTTLYGDAAIQGNWNEIENQALLLIQQAQTSKKSVIYDATNFKRAFRMDFLMKIKEDGETLPLRWIAWYLKTPIETCIKWNQNRNRQVPQPIIETMSKLLANFPPLIAEGFATIEEIDVTKFPTDTAAFTAQIEKRINSLKRRITNRNNRTQHDGIIFHRYSRLLDFDRLMHLISLVIKYPGIGNLHTTNPKLLENILGEIPETTSNIDEITKIMAKLHGGIYGNPSEIIADLQWLEENGVIAGNKEQENNSLSLPSPLSFHCPHPTHSYSDTEPFQRLIGTISFILHNPFLPNIGDGNLPTLAQALQQAGITCGDNLDTLRKDIEKILKPYQILPEFAMRNGYFAGTGILSQAELIRVFETLRSQAQSLDDPLALELYETFKQRMLQTKLIDTDKKVYPVRAIVNRSIVDPRYLHSTALVNNLPKLEAAISNGEVLELNRFSGSGGYDYDPKSFFLAYPLQIVFSNLAWYLGFESVGGNEPGLLRFERLDRLFLGNQQNKTRYRSEQEKSLQKLQALLKGSAGLFLGNSEVEQSKFLSQDQKVHITACMTVELWFNNDVYKFITEGTKRFAKIKMSPPVSSTKNNLPKSIFSLKATKDKQFPHRFQVILPKWSLHDFDLWRWIVGFGGNVKVIEPIELVEKVKGIGSGIVQVYDTKK >NC_019751.1|WP_085953333.1|322570_323808_-|ISAzo13-family-transposase MVLTDSLKKLFIETASQLKGAEKRRFMASTVQSLGLGGQRLAQSELGWNRDTIRKGTRELKSGITCVDNMSGKGRYKAEEHLPNLLEDIKKIVDFYSQTDPSFKSQRLYTRLSAAEVRKQLIEKSGYSDEKLHTSETIRVKLNNLGYKLRRVKKVQPQKKFPQTDAIFEQLDVVNKDADEDKSVLRLSMDGKACVKIGSFDRGGKSRDGVKASDHDYNPKTTVTPYGIFLPELDELFLYFTESKVTSDFIVDILEDFWSCEKHRFSEVKTLLLNQDNGPQNSSRRTQFMKRIVEFAHKHQVNIRLAYYPPYHSKYNPIERTWAVLENHWNGSILDELETALNFASTMKWNGKHPVVKLVHETYENGVKLTKKAMAQIEKQIERLTDSNHEVFPNLGNWFIDICCSKTNVISF >NC_019751.1|WP_144051089.1|322012_322243_+|hypothetical-protein MLKRGVCAVIGVNTGECASERQNSPSPNYSSPNYPQYPEQPLNNSNQADEYPQYMPPNPEVPYGYPQYTSPNPEEQ >NC_019751.1|WP_015196028.1|321419_321713_+|hypothetical-protein MNKSINRFLLVGGLITVSSVTVATLPINPPAQAGWAPWVQVYVTDYSEGNGRDQGENVRVCQNKAKESGRPDRIKRWWFNSTFRDGKCWTRVPIWEG >NC_019751.1|WP_015196027.1|320450_320843_+|hypothetical-protein MKTTRFLTFLGTTSALLMGLSLIATTSQPAKADWWDVGKQIIEDNLNGIRGNTVGRIYDQTFIAELSSEEVGQYKQRWGGNYSAKISDWCNDTVYQAGWRNLAGNQIPFVNTTWREENGKVNCYVRHAAQ >NC_019751.1|WP_015196025.1|319633_319933_+|hypothetical-protein MRKPKSLGERELHLIRVYSNWNFGMTPIEFYTKWEVSYEQIALICDRSDSTVRRWFKQGDNRRYPNRNDLLNLALIDFLLEHFEEIPEHLRRLLCAENF >NC_019751.1|WP_015196024.1|319267_319537_+|hypothetical-protein MQIQCVRFCLIFSPKAEKQLDDLPNKDRKQYDKAFKCFIQNSPAYRSLRTHRYCSKDGDIWSSSASMAKRFYWRYLEGDIIEITHIDSH >NC_019751.1|WP_015196023.1|318737_319016_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFYLVCYDIVSDTRRNKVSKLLESYGLRVQKSVFECVLDEKQYESISKLLMRLLNRREDQVRFYPMSAHNRCKVAVVGTQPEFSVDDAAFIV >NC_019751.1|WP_015196022.1|317685_318726_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSTIYITEPDASFKLQNKYLKLLQQDKQRFFIRISNISQFAIFGNIKLPKDVMQIVRLNQIPAIYFTHTGEYVGRLENPSTVQAKYLNYQRQRLHDREFNRATAESIVWAKLHNQQTFLQNWTRYCTDYTTQRASDYLTLLMDNLSLAPCVEELHQYIEEADKVYYCAVASILSLYSSNPHTTAKQINRFLNLGNQLLHQYIYNHLKTAGLHPDYSILHRDTHHELPLAWDFSAEFRAPIVDDLVLNFVRNLAKNNGNGNGNGKKPYTHLQRFLQHWEGKLKTFVLHPSAGEVSYRQCIDLQVKEYIASLLGDVEYYRPLALKFHPEQTNFINMLETQKPILTLVK >NC_019751.1|WP_158333119.1|316385_316526_+|hypothetical-protein MAETLILSFYPTNRYPGKGLMLLEYGLITKNYQLFRKNFTPHKKWR >NC_019751.1|WP_041738925.1|329011_329272_-|hypothetical-protein MYLNFWRDRISLLYYISESDRTCKYLSSGTPRVGVSYHDISRKISKSTLFLANRSGVLQVIGFWELKPLSVKAFSYFSLKGGLPNF >NC_019751.1|WP_015196031.1|329577_331143_+|hypothetical-protein MPKYTAITFAPVQGFIEKSRKLRDLYGSSQILSYLSQELLNEAGKTTEVVSPAIIKMQKGMPNRILLKGDFTEKQARDTLSSAWKRILFECRSWIGTKLPEKSYGTYHWEREWQNWGNYAWEVFCGSGDTISAAMEDLETKKLSRDWIGVNWIGESSSLTGTDAIAFPGLGAESRNPNNRKWSAEKEEIKTFYRRLACVLEGISLDKEPEGKYIALEEKLSIPELVKRLVTHEDIATSLGISPLGNSFSDIYRRPEKITETEKGRCTGWFMGDGDKVGDYLKDLAQKSDAEVKLFSQAMREWGRDFARDFPKEFGRVVYAGGDDFLGAIYSDKDKPKIEPEQVYQWLLELPNKWREHKQPINVSVGFIWAASSVPQRDILQHCREAEKVAKSLGRNRVTIRILFNSGQYVEWTCPWNYLNILDKYKDLDGNSNWSHIYTDLAQLEARNAFNIDKRTFNRKFALDFFDIYFPGEGEKLSKDNNLLKNIVGYTDDDEEYERVEKTIDWMRSLIKVGFQLCSNT >NC_019751.1|WP_015196032.1|332141_332951_+|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKKAFGIIETLAPLHVGATAGEESGNLNLIFRDQFTQTGIIPGSSLRGRFRAEMRSQVDEKEVSYWYGEGASSEQSEINNESMVKFEHASIVWLPVFCPGQPIVWVSSPRLLERYKRIAQIDAEIPSLYVASSNIRARESQGKKTIFFNLGFLNIIRSENLSKWFPNGKELPAVIVDDSDIAMIHDMALYRQSRVRLKDNEKVVDGGGFFNTEALPEGTILVFPIAIRDDKSNKKWQPFPNDITDEIYLGGLESIGFGHCQLKIVNRN >NC_019751.1|WP_015196033.1|333002_333431_+|hypothetical-protein MNWQPYNLDQEAQRLVLAFRNKEGVIGQSHKMRVTVAYGLERFWGEHLRLLGKNDAKEREKGKYWQSVWKEFVRIMKRTGVELPSDEISDRNTEQIEEVAKKLWSLSLDDQKICLSVLTQFCDSLVWWTQRYKKAGDREEEV >NC_019751.1|WP_015196034.1|333427_335047_+|hypothetical-protein 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MAIWIITTGNSDVRIKKENNWNTIFHTIRDNLECTDFASPIPINPNAIEEGYTLPARVLGVAYSQIIEQEPKYFDELEFPLIETFCQKLKSEKKLEKKSHKLEQIFVLTTDQNNLFPNKWDRINEKCPYWQDTIELQTLLEKYLKTQFDIPIEFISLCPNSDEGLDYWDATLKLVETEFSQKFAKLQDKIVYVSHQAGTPAISAAVQFASLGIFGKVEFLVSNQYYDASYNHQAKAKIIDSSEYWRGLQIQKAKPLIRNGFPSTALKLLDGIDRIDKNIILQLEQMVDFFNLKSQSQNTNPDSIKEDFGIPNATQRIVDGLDLIGFFFKQNNYLPGISLLAAAQETFLKVAIKSEIQKNTANYCGIPVAELVKWTTKGLISPNNDELRNILKLPNSQNIDKVRNDIFDLLKFPYSKHNDRFYLYSIKQDLEFSRTGMLEWLLILAPNFREWAHLRQSNLRNQVIHNLRGIEEEEVIAYLLGLRDYQPIPNNITTAMDAYIQKVKQPFMQAIVLLKLPCEKGKLQERLNAIADSLI >NC_019751.1|WP_144051088.1|337174_338395_+|ISL3-family-transposase MKVLTELLDLKDIKVTSQRIYNGIGIILQTESTKSYSICPHCGTKSEKLHQNHSHIIKDLPFSEKPVFLEVNRRQFKCYQCQKPFSEELYYAKKKRTYTNRLAQKIIQDVLESDIHSVASKGIVTTEEIERMLKDASEELCDSKPSNLKRLGIDEIALVKGKGDYCAVLVDLDASKLLAILNGRTQDKIKEALSGWGLEVLQQIEEVSIDLWQGYKNLVMELMPNAQVVADRFHVMTQINKELDTQRKRERRSIEEQIKETKSESEKAEYEIILAGLKNSKYSLLKNEDNLTDEQVVKLREVKRVSPVLKEMHDFKEKIRKIFNLTDHWYTGVFKLGMWLSKAKKYFPRSNNTIIRWFDEIIAYFDNGTTSGTVEGINNKLKLIKRSGYGFRNFQNFKIRCLLNWT >NC_019751.1|WP_015196036.1|338483_338750_+|hypothetical-protein MNIINITFTHPFAKAPKHVFGQQVTIKSNCDRKKWAKGQITGLRLDYNSPNTWNYTVVFDYPQGFCEEFTEEDLAAVDELVCSQLLFK >NC_019751.1|WP_015196037.1|338872_339235_+|hypothetical-protein MKTPQQIEAALNQFTGSTTLYKHWLGLKYTDGIKYLAEETSCYWLLDAIFSHQTKTFLSNQNLREFQIWYLRVENNSGVLICEWDTNQEVLRQEIEYTDFSLSHIKLYLIETVLMLPSEY >NC_019751.1|WP_015196038.1|339270_339516_+|hypothetical-protein MLQAISSGQTFVTNLEQFMTKADKFIKIYYAGISEESKVREIVQELQNLLSDTDLQQLEIDYQHYCEIKDLMSDCDDSAWF |
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NC_019751_4 | 1085419-1085526 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_4
|
1 spacers
spacers of NC_019751_4
>4.1|1085445|56|NC_019751|CRISPRCasFinder AGCTTGCGCGACGTAGCTTGTCCGACGCAAGTCGTAAGTCGTTCGCTTTGTGGATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_4
The CRISPR arrays of NC_019751_4 >merge|NC_019751|4|1085419-1085526|CRISPRCasFinder TTAATGGGTTTTGTGGGGTTATGCGAAGCTTGCGCGACGTAGCTTGTCCGACGCAAGTCGTAAGTCGTTCGCTTTGTGGATTATTAATGGGTTTGTGGGGTTATGCGA >NC_019751|4|4|1085419-1085526|CRISPRCasFinder TTAATGGGTTTTGTGGGGTTATGCGA AGCTTGCGCGACGTAGCTTGTCCGACGCAAGTCGTAAGTCGTTCGCTTTGTGGATT ATTAATGGGTTTGTGGGGTTATGCGA
>NC_019751.1|WP_015196638.1|1085125_1085314_-|hypothetical-protein MEKLNIKEEARKLIDKLPDNSTWDDLMYEIYVRQVVEAGLVDSQAGNVTSVQEVRAKFGLPE >NC_019751.1|WP_015196637.1|1084838_1085129_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MKVFWTETAVENLSAIYNYISQNSPQYATRIIDRITRRSQQIVNFPLSGRIVPEFETEQIREVIEGSYRIIYYIKPEQIDVLAVIHGAQEITSGIE >NC_019751.1|WP_015196636.1|1082966_1084673_+|tetratricopeptide-repeat-protein MSSSNKPSKQPSNHNSSENQAEIGKFIATNQDEFAELVTFIDFAEKFTLGFIEINFPPDINLLIAGLQQNSQCQEIQFVILDFPEKNLRFLRDELVRQLAEITKESNKKLVLLIRNLEKSIGVFGDYPPILQDLNFVRDSYRQTVPHPLLFILPDYAISRLAKFAPDFWAWKSGLFRFKTTELTRDRAIASTLDADTNIARLPTPEQQERIDLLHSLLMEYKPTGEIPNQENLRNCGNILNELGTAYLSQHKPSQAREYLKEAWKITQEFSDYSLEIRVINQLGGSYSQQRQFATARSYHQQALNIAKKQESNHAVANCLFNLGNVSLDTRQFQQARDYYQQALEIKIELGARFESARTYHQLGRVAQQLREYEQARDYYQQALEIKIEFGARYDSASTYHGLGILARKLREYEQARVYSQQALEIKIEFGARFESAGTYHNLGIVAQQLREYEQARVYYQQALEIKIEFGARFESASTYGQLGLLAQDLREYPQARDYYQQALEIYIEYGDRYSQALTLYCLGTLAKAEENYAEARANLQTALEIYVEYQDEYMATMMQECLEDLPE >NC_019751.1|WP_015196635.1|1081663_1083010_+|AAA-family-ATPase MSQSSFQRANTLKAAFLACNVEPLEPAEMERYYVDLSSVRKTSAIDNVSTILDFQEAGDFTTILFTGHRGCGKSTELKRIQSLWENNYHVIYLEANEETDINDARYTDLYLIVIKQVEFELRKLGLTFDDKLLKSFESWFKDITQENEQSVEKSVNVDAEATLSPTAPFLAKLMVKLLAQIKGSDKQKTTIRQTLEKDLSRLKSDTNLLLSDAYVKLRQKFPECKGLLIIFDNLDRVPPVVAEHLFFDYAAQMQELNCTIIYTVPISILCSPKNPLNQFDGNPHIVPMINIYEFERHKCELNYDQKGLDIIASVIEKRVDVDAIFESRNQLLELAKASGGHVRQLMQMMRSACQTASTRKHAKIMSEDIDYAVKQQQFTFERFIPEEHYAHLAQVCLTKDVSKDEVGQLMLFNTSVLEYNGDKRWNYPNPVVKQNEFFQQALKAAQQP >NC_019751.1|WP_015196634.1|1079170_1081486_+|phosphoenolpyruvate-synthase MDKLYWLEEIELQDYAKVGDKALNLSKAIQRGYPVIPGFVVGVGVLREFLETLSSSEALVADLPHSSLRLDVGNWRQLQQVARSLRQEIIAATIPQNWLDQILAAVEDWDSKHLIFRPTFVLPTKINFGKNISGLLESQVCLRDRTLIETTLKQVWSQLFRARSLLYWQRLGIDMSQINLAVLVQPIENAIASGSLVANSEICEIHGTFGLGFPLNYGEIIPDYYKVSCRDGIILERQLGKKILGYQLDYNSLSPYLINQELNHQFSLSNDDCQQLVSLTKKIPIPDHTNFRFDWTILQHRGKDIVYLTQALFPQTAANLHLICQGLGVARGVVTAPVHVITRHQETISELTPGVILVATVIVPEWLPLLHSCSGIITERGGFTSHAAILARELGIPAVVNVSGATNIIHSGDRLLINGDSGEIFSIKKGSHGEPSMERLEPGVHSISELDVADLARDNSVVPLGNVYPTIATKLFVNLSQPSSLKTIENLPIDGVGLLRSELMTVGLLEGKSPQSWLDEGRERELIERWYQQLLLFVKAFAPRPIFYRSLDLQSNGIQLTRSHDESQHSNQGILGERGTLGYLQNSAVFEVELAALGKLQQNGYHNINLILPFVRSVEEFRFCRRRIEQAGLMDVSQFQLWIMAEVPSVLFLLSEYVKAGVQGIAIGSNDLTQLLLGIDREKSKPTRTLDERHPAVMNAIAQLIQMAQNENIPCSICGQAPSLYPEIIDSLVRWGITSISVEPNSIPQTYHAIARAEQRIILNAARRQMM >NC_019751.1|WP_015196633.1|1078612_1079083_-|MgtC/SapB-family-protein MFSIHQILSNNWLQITLRLSFALILGAIIGLERELKHKPAGLRTHMLVSLASAIFTLIPWELTGGGSNLDTNNLSRIIQGIAAGVGFLGAGEILRASSQTSQRPEVHGLTSAAAIWVSASLGIAAGCGLWELGLIGGVFTFLVLYVFKRFEKSSLK >NC_019751.1|WP_015196632.1|1078050_1078476_+|hypothetical-protein MNQLIERNEIITLGKSLREIQPQLLKQNYQEGAKRMWFQGEEPYFDVFFETQNHQITWFQFTLRGKTLSWDNSKPGWQTGISNELKINDVSFYAASKLIENDPEIDWEFIKLVKSILEIQTHEEMFVKALELFDEKTFPST >NC_019751.1|WP_015196631.1|1076456_1077578_+|DNA-replication/repair-protein-RecF MFLQSLHLRYFRNYKEQFVEFTAPKTILVGNNAQGKSNMLEAVELLATLRSHRLARDRDLVQDGQAIAQIKATLKRDTGNHDLTLTLRRNGRRTVARNSEVVRRQMDFLGILNAVEFSSLDLELVRGGPDLRRHWLDTLLLQLEPIYTHILQQYNQVLRQRNAFLKQHVETTPDPEQLALWDAQLVATGIKVIRRRDRAIQRLAPIAAMWHANISKSTEVLEIKYSPSIPFEESQPEQVQESFFDRIQQRTIAETHQGTTLVGPHRDEIELVINQTPARQYGSQGQQRTLVLALKLAELQLIEEVVGEPPLLLLDDVLAELDPSRQNQLLDTIQDRFQTIITTTHLGSFDAQWLKSSQILTINSGQILSQAIF >NC_019751.1|WP_015196630.1|1073224_1076110_+|cation-translocating-P-type-ATPase 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>NC_019751.1|WP_015196629.1|1071187_1072864_-|transglutaminase-family-protein MGSALTSFPNSQMFGQRTIRPLCAAALGGIAFIKNTLIAIDSNRGYLLQVDPVTDNTKILNPHHTSEFMDITGISLWEDTLWVTRGKSIYLCKFNSWGLEHFITLPYQADGIAVWGSTVYVSCQKMGAILIYDCETRRKITQFYAPGVGIANLAVCEETLWVADKVEQTIFALDRATGDIRFSILTPFECPTGLAVHSNSESGKETIYVAYASEEAFIRDNPNADPSQELAYRDRTFIHPLSYHYDPQTRCCLSNGYRIEMSYIEEIAPLEEVYLPEVEWRIALPSNTDRQRVVSVEAVGLPFSEEIIDGQKVAVFKFETLVPGERHLFGWKAILEVRGVKYRLTPRDVENIPELSEEFQTRYLVDDDELAMDNTIVQDAAKVAVGSETNLLRKMYSIRNYVYDQLSYSIKPHIDAPDVVLERGTGSCGEYVGVLLALCRLNGIACRTVGRYKCPPYADHQGIPLEPDFNHVWLEFYIPSIGWLPMESNPDDLGYQSAHPTRFFMGLSWYHIEIGKGISFETLMSKGERLKKEDISIGELAINHIRFKIIEELPPLNQ >NC_019751.1|WP_015196639.1|1085560_1085827_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MSYKVEILKGALKQLKKLPSELQERIQVKIDDLAIEPRPNGVKKLKGKENTYRIRVSDYRVIYDIFDDNLVVSVVEVGHRGKIYKDES >NC_019751.1|WP_015196640.1|1085823_1086063_-|hypothetical-protein MKSEQEREQLIKEINILLHQSYDSTLDDIYALLQKIEAEEEEEDLKAYNKAREASKIDDSMSWEEAKKELRTEIKKEVA >NC_019751.1|WP_015196641.1|1086083_1086521_-|hypothetical-protein MNAQLTADEINSVRDLLKEYQPANKAIATLEHHNGNLDTSFEELWIEKNGKPTMGSKNIWQTTLDVVRDELCGDEGFRARLSDYTKSPENAVLLTATITSLMALTAIPLDPSIATIIVLYILKIGLNVYCQYTEPSDGKNLPPSN >NC_019751.1|WP_015196642.1|1086555_1087881_-|cytochrome-P450 MSSTKNLPLPPGKLGLPLLGETIDFLRDRSFSQKRQNWYGNLYKTHLFGRPTIVVIGADANRFLLTNENTYFTSSFPKTTKELLGAASLAIQKGGEHLQRRKLLSQAFQPRALSGYVGGMEAITHGYLQKWEKIGDLTWYPELKKYTFDVACKLLIGTDTASDDEIGQFFEEFSEGLFSLPINLPWTKFGKALHAREQLLMKIEQIILQSQQQTASSQDALGLLLQATDEDGSKLSIKELKDQVLLLLFAGHETLTSAIASFCLLLAQHPDVMAKVRTEQQNFDFSQPLTLESLKEMTYLEQVLKEVMRVIPPVGGGFREVIQTCEFNGYQIPQGWAVLYQVNRTHRDESIYTEPDSFEPERFNPDRAEDKTKPFSYMTFGGGVRECLGKEFAKLEMKIFAALLIRKYQWELVNGDKPEMAMVPTPRPRDNLQVRFGCLSK >NC_019751.1|WP_015196643.1|1088232_1088511_+|hypothetical-protein MNRAFRKYHRTIAMIVSLPLAITVLTGMATTMVQQWSFSFGISRSIILQIHTGKIFHLEGIYPILNGLGLIGLLVTGLTMTGLFRGKAKKPS >NC_019751.1|WP_015196644.1|1088619_1088982_+|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_5 | 1591761-1591849 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_5
|
1 spacers
spacers of NC_019751_5
>5.1|1591785|41|NC_019751|CRISPRCasFinder CCTCATAACTGCGATCGCACTAATCCCACAAACCCCAATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_5
The CRISPR arrays of NC_019751_5 >merge|NC_019751|5|1591761-1591849|CRISPRCasFinder AAGCGATCGCACTCCAACCCAAACCCTCATAACTGCGATCGCACTAATCCCACAAACCCCAATAAAAGCGATCGCACTCCAACCCAAAC >NC_019751|5|5|1591761-1591849|CRISPRCasFinder AAGCGATCGCACTCCAACCCAAAC CCTCATAACTGCGATCGCACTAATCCCACAAACCCCAATAA AAGCGATCGCACTCCAACCCAAAC
>NC_019751.1|WP_015197072.1|1591116_1591683_+|hypothetical-protein MAEDIYLPKREIISNKEINKGDEILPRLGFVEPYECESISHYLGRVRRFKANSLPSGYSLGKIAGIGAVTTRWEKLYLNPFPSETELEALAKVIEVEVERLRQMLPPKGMTMKPRPIRLCAACYAESPHHRIEWQFKDVMVCDRHQLPLSTKCKNCGTPFPIPADWVRGECPHCCLSFTKMAKRQKSG >NC_019751.1|WP_015197071.1|1590308_1591160_+|AAA-family-ATPase MARSQLAIQSSVEVLVPQLDLNAQLAKVVEVEEIFSNYFIPTDRSSEYLRWLDELRILRQCGRVIGPRDVGKSRASLHYQGQDQKRISYVRAWSASSSKRLFSQILKDIKHAAPMGKRDDLRPRLAGSLEVFGFEQVIIDNAENLQKEALLDLKQLFDECHVPIVLIGGQELDTILDEFDLLTCFPTLYEFDGLDENDFKKTLNTIEFDILALPEASNLSEGIIFELLAESTGARIGLLVKILTKAVLHSLKNGFSKIDQNILEKIANRYGRRYIPPEKRNNK >NC_019751.1|WP_041740314.1|1588436_1590305_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MADKKFELTEKFTQLPEAVFLGENNFVIDPSQIILETSDKHKLTFNLMQWLAESPNRTIKSQRKQAIASTLGVSTRQVERLLKQYDEDRLSETSGLQRSDKGKYRVSDYWQEFIKTTYEKSLKDKHPISPASIVREVKRHAIVDLKLEQGNYPHPATVYRILNPLIEQQERKKKVRNPGSGSWMTVETRDGKQLKVDFSNQIIQCDHTKLDIRIVDSDGILLTERPWLTTVVDTFSSCVNGFHLWIKQPGSAEVAIALRHAILPKQYPDDYELGKPWKIYGHPFQYFFTDGGKDFRSKHLKAIGKKLGFQCELRDRPIQGGIVERIFNTINTQVLKDLPGYTGPNVQERPENAEKEACLSIHDLDKILASFFCDIYNHEPYPKDTRITRFERWFKGMGEKLPEPLNERELDICLMKEAQRVVQAHGSIQFENLVYRGESLNAHKGEYVTLRYDPDHILTLYVYSYDVNDELENFLGYVHAINMDTQDLSLEELKSLNKERSKARREHSNYDALLALSKRKELVEERKQGKKEKRQAEQKRLRAASKKNSNVVELRQNRASSSSNKDEKDEKIELLPERVSREELKVEKIEPQLEILDKAETPPQERHKLVISSRKQHLKKIW >NC_019751.1|WP_041740313.1|1586727_1588110_-|Rieske-2Fe-2S-domain-containing-protein MMTNFSWTKQWYPVTPISYLEPSHPTAITLLGKNLVIWRDKQQKWVAMDDVCPHKLAQLSLGSIDKNGNIMCRHHGWCFDGTGTCTNIPMLSDEKALETACKSERSQITTYPTQVLQGLLWIWADNSPTAFEDSNLKQPALMPEFQLDSSATDWFMSEVPVGYTVSFESSFDPSHAQFLHNGIAGFSPERAIPMEHFEVSGEISAENGFTLKHSGYNIFNKDMDATRQFTPPCCNTTIYKYSNGKSALFQLYFVPTEPGYCKHIGKFITDTFSQKRNFWFELLPKYLQTGLRHSSSYKLSNQDLSMMHSQAMNESLEDKPWQKSYFMPSLADIGIVTFRKWLDEFAGGKPAWQGMKEVPFQELSDEQLYDIWHRHTKHCPSCRQSLVLIDKVKDYCQNFTAVLAILGLLLIVVNLPIKIVLLPVLLSILSLGCSYKLGLMRERFISSVPRKGLPVVDLYK >NC_019751.1|WP_041740312.1|1585888_1586623_-|DUF3598-family-protein MEAQNESWSNFCKYHVGDWHGNWTTFSSEGQLTNSIQCIRSFRLNEDGTEIQHHNHYTYEDGKKESKLYGNYNKSTLRSLFLKNCFSWGLKQVDSGTKFFFETGFRYEQRRISVVGIYKNGISIDSVLVISEHIADFPDKPTSTVKQITGINWNGISKTITDDYQVSSSEEKIWTALESLGIDYFTMHFSDGISISCPQVIEKGQHFLTVIDWQVLPTFWQRGIRKYDQSGFSSLTLEEFHKPQ >NC_019751.1|WP_015197067.1|1584462_1585527_+|trypsin-like-peptidase-domain-containing-protein MLSKIQNQFKSALVISALLSATLPIAPAKSQTSQPLQTNFSQTQQLTQANLVAEDVKPSVVRVVVGCKAKVYSPNTGKIYELEKITGHGSGFFVNPNGYAATNAHVTNPEDCQQILRADLAAKLEADGETLENVEAELKWIETKPIQLVYLPNQEQLPFEIINFGAVAGEGKDVSIIKVNLINAPVLKLAESNQVKLLDSVTVVGYPGLVETIPVFNEESFYEASFTRGQISAKKNLKDGTPILQITAPVPKGNSGGPVLNDNGEVIGLVTFGPDDNFTFIFTSDTIQEFLDSANISNQQGLVNQTYREGLQLYSRGEYSQALRKFELVKRLFPQHSEVENYLDKCQQVVANGN >NC_019751.1|WP_015197066.1|1583663_1584137_+|hypothetical-protein MLHKKLQATLFGTVAGITAIYGSLFVAVTPVRADDAEYSGQVRTQLMAAAIRVGLEGYSLTHDPFIDVLDHGRSDYITLNLRAGTSYGIVGVCDSDCRDLDISLYDSRGNRVASDLGNDDIPTITINPSRSGTYRIRVDMASCDTRNCYYGIGAFGQ >NC_019751.1|WP_015197065.1|1582162_1583515_+|hypothetical-protein MPRGIRVRPDCITLVKQRTLQKGFTRQIDLAERINRGQSTAYSFLNGKPVDYLNFLEFCNLLNFDIQEIADFEALADIYTEKTQIEKPQKTNNSPPSSSPLPELEYPEGQVPLNSPFYVERSPIEQRCYEEIKKPGSLIRIKAPQHMGKSSLLARILQEAENQGNRTVEIDFQLVEEEFFSDFNKFIHWFCDTVAEGVAGNNRELLEKLLQQLDEHWKTGQRFGYMKTCKNYFERYLFPEINQPLVLGLEAVDRLFAYPKIYKDFFGLLRAVHEEAKRRDIWKQLRLVLAYSTEVYAYGPVDINQSPFNVGLALDLPEFTHEQVKDLTQRHQLNWSDTEVEKLMGLVSGHPFLVRLALYKIARQEINLAEFLQTAATAQGIYSRHLQHLEEILQQQPELQTAMQEVASSDNPVNLPTAIRFKLHSMGLVHLHGNEVTPRCQLYRQYFCSH >NC_019751.1|WP_015197064.1|1577457_1581840_-|CHAT-domain-containing-protein MTGDYEYKVGGSLEEDAPSYVRRQADSDLYYGLKAGELCYVFNSRQMGKTSLLVRTMKRLQADGFACAVIDISGLGSQDITLEQWYGSIVDSLLTELNFVEPEDLAVWWEKSIEITPVRRLGKLFDELLLPNVNQNIVIFLDEIDSILRLDFPADDFFALIRSCYQRRSFKAEYKRLTFALFGVATPADLIKDEERTPFNIGTAIQLDGFRLDEIAPLAQGLEGKVENPQAVMREVLAWTGGQPLLTQKVCNLLIQDLRNPTPTLARRGEIGGNEWVEGVVRSGIIENWESQDEQEHLKTIRDRLLVNEQIAVALLGLYQQILQKGEIAVDGSFEQMRSRLTGLVVQQQGKLRVYNQIYGNVFDLIWVENELGKLRFYADKLRAWVESNYQDNTCLLWGEDLEKSRVWADGRKLSDVDYRFLSASLEAELNQKVAEAEGKQNQAFEEERKANKRLAEVERKTNQKIRNGLIVLTLSVFGVITALIFASSAEQRRSVATSQFNSTNSELDSKKIELSKAKESIKTLTRQQEEREKLIAIANSEKKQAETAKKQLEIKSKQANYKLNATNTKLQTANQQVKAAQQLFSEANNKVQSAEEEAKNAKGEQKNANNLAQQARNELASAKKGLEEAQKKQQEAEKQAQIAEKQQKEAQQLLAKAKVDLEIASRGVEKLNIAVVDIQQKIGESRALARNLTNTGEVYNSIGETEQALKLFNEALPIQREIRDYIGQGRTLSKIGTIYSYIGEPKKALEFFNQALPLQRTALDRAGEATTLDNIGAVYQTLGERQKALEFFNKALSLRREVGDKAGEATTLDNVGSVYQALGESQKALQFFNQALPLRREVGDKAGEATTLDNIGTVYQTLGNPQKALEFFNQALSLRRAASNRVGEANTLKNIANLERSRGNLNKSLTQLKTAININEDLSKNFINPELRAYYFSSVQDNYELYTDLLMQMHVQQPSKGYDAQALSANERSRAMSFMEFLTESNSNIRQGANPELLARERSLQQEISALETQRLELSSRRDTEKQVTETSQKITSLLEDYKQLQTKIRISSPRYAALKYPKTLSLQEIQQQVLDNNTLLVAYSLGKERSYLWAVSKTSITSYQLPKRSDIEVATSNFRYSLGQPNTAANFAQEDGKKLSSIILSPVANQLQQKRLLITADGILQTIPFAALPIPNNNEQDFTPLLVQNEIVNAPSASSIAVLRNQLKGRIPAPKTVAVIADPVFTSDDPRLTGKRPEIAPQLDLQFTGKRPEIAPQLDLQFTHSGFARLPFTREEAEEILRLVPENKRFSAFDFAANYETVTSPKLAKYQIMHFATHAFVDSQNLELSGLVLSQFDSKGNPKPSYLRLFDIFNLNLSAELVVLSSSDTGLGKEVKGQGIVGLTRGFMYAGSPRVISSLWQVSDQGTSVLMARFYRKMLVDGLKPSAALRAAQLDMLKEEKWRNPFYWAAFTMQGEWR >NC_019751.1|WP_015197063.1|1576717_1577116_+|PIN-domain-containing-protein MKYVIDTHALIWFLEGNPRLGTNAKAILSHPDSRLIIPATALAEAVWIVERGRTCIPSAKDVISAVEADSRVIIYPLDKDVIEITINLSAINEMHDRQIVATVIFLANKGEEVQLLSCDKNIVESGLVPITW >NC_019751.1|WP_083866295.1|1591936_1594270_-|hypothetical-protein MISSPHYSVDSGFSGKLDQRNQEVAQRRQQVETLKKSVESLKKSATRSQGDREKAQQAAQQAQTKLKEAEKSLEIAVNQLEETKQEQQVALRERQVALQERKIAIEQSQQAKQQNQEAKKQAQTAETQREEAEQQRKNALTATRLEQVGIRTLRQFYVGGQIENLLEIMRAGRELKGLVKSKQSLADYPAYSPVFSLQEILLNIREWNQLEGHNKVNSVAFSPDRKMLAVGSDGSIKLWNLTTGKEIASLTTGNKSEINSVMFSPDGTTLASASEDTTIKLWNVAKGKEITSLTGHEESVQSVVFSPDGTTLASGSKDTTIKLWNVAKGKEITSLTGHEESVQSVVFSPDGKTLASASWDKTIKLWNVATGKKIASLTGHQINVDSVAFSLDGTTLASASSDGSIKLWNLATGKEIASLTGHEESVQSVVFSPDGKTLASASWDKTIKLWNVLTGKDIPSLTGHQDYVYSVAFSPDGKMLASGSGDSTIKLWNVLTGKEITSLIGHQTRVESVVFSPDGKTLASASLDNSIKLWNVATGKETVSLTGHRQTVESVVFSPDGKTLASASSDKTIKLWNVATGKETASLTGHQETVGSVVFSPDGKTLASASVDKTIKLWNVTTGKETASLAGHQGYVYSVAFSPDGKTLASGSRDKTIKLWNVTTGKEIYSLTGHQEGGRSVTFSPDGKTLASASWDKTIKLWNVATGKEIASLTGHQDWVSSVVFSPDGKTLASGSGDKTIKLWSLDLDDLLAQGCNYLKDYLATRDELRQEICPNK >NC_019751.1|WP_083866360.1|1594404_1594620_-|hypothetical-protein MNNHLKATKLNIGGTNISSPHKKPRNRELTAEQKDENKVFSSNRVFVEHIIRVIKIFRVASERFRLHSNTY >NC_019751.1|WP_144051010.1|1594866_1595103_-|hypothetical-protein MLPHQGFYIPLHSLNIYSQLCSKCDRIISVILSDRLTSYCQRGMTPKNCYAKWEVNHEAIADENGITGKELFDQLVQF >NC_019751.1|WP_015173935.1|1596394_1598062_-|IS1634-family-transposase MSPTSIAEIKNIDHLGIVAGLIDEIGIVETINSKLGVDSREKITAGVLVKAVLINGLGFVSRPLYLFKQFFDDKAIELLLGEGVESNYLNDDKIGRVMDDLYKYGLNNLFIEIVLSVIKKFKIDTKYSHLDATSFHLHGKYKREMNQEKEEEITKERPIFITKGYSRDHRPDLKQCVLDLITSSDGDIPLLMRAGDGNEADKAVFGKILIEFKKQIVFDSIMVCDSALYSQENLKLIENLKWISRVPMTIKKAQELVQSVNTEEMEEIEEIETEEKEIETEEKKKKTYQDLDGYKWKEEIVNYGGIKQIWLIVESQKRKDSDLEKLDKKLIKEKDKVEKLLKELKREDFETPEQARYKLKGINKKLKFHEIKEANFIESKSKNNKTIYKMEGVSYEKPEEIEIQRKEAGRFILATNLVNDDDKLKPEEIITTYKNQQSCERGFRFLKDPLFFADSFFLENPERIETMLFLMSLCLLVYNLGQRELRNSLKRIKIGIKNQLGKLTLSPTLRWVFQCFQGIHFLMLDGLNQIVNLTSERHFILSCLPSSCQKYYLLS >NC_019751.1|WP_015197074.1|1600749_1601781_+|CHAT-domain-containing-protein MKKILILSANPKNTPNLRLDEEVREIKNTLQLSPNRDGFQIITESAVRVDDLTRFLSHHQPTIVHFSGHGSGTDGLALEDNSGHMQLVSTQALAKLFDLFQLQVECVLLNACYSESQATAIHQYIDCVVGMNQAIGDKAAIEFSVGFYTALAAGRNYEDCFHMGCTSIDLQGIPEYLTPMRKIRQRRYQTVQAANPVTSNKDDSINNDNKGWQNRSVSIVGNVPGSAIQTGDSNTANINFQQVSLPAPASVNIETELNALREILAKLETSDRRKIDNAIADAEEEINKPQPDKNEVGKALERAFDYAKKAEGFASVIEKLKPHLTKTVGWLGENWHKLLSLVN >NC_019751.1|WP_015197075.1|1601871_1603350_-|SAM-dependent-DNA-methyltransferase MANESSTIVQKLWNYCNVLRDDGVSYSDYVEQLTYLLFLKMVEEQNQLPPPLGKRSTIPTEYSWEALRSQDGDALEIQYRHTLENLGKEKGLLGVIFRKSQNKIQDPAKLKRLVELINSETWIGLDIDVKGEIYEGLLQKNAEDVKGGAGQYFTPRALIKAIVEVMEPQPGQRICDPACGTGGFFLVANDTIIKNYKLDKAQKLFLKNQTFKGFDVADGVVRLCAMNLYLHGIAGDESPVEAKDSLMADPGDRFELVLTNPPFGKKSSITVFNDDGKADKEKIVYRRDDFWATTSNKQLNFLQHVKTLLQINGKAAVVVPDNVLFEGGAGETIRKKLLHECDVHTLLRLPTGIFYAQGVKANVLFFDRKPASADPWTKKLWIYDFRTNQHFTLKTNPIRYENLQDFIQCYSAEKRQERQETERFRAFSYEELMQRDKVSLDIFWLRDESLEDSDNLPAPDVLALEIAEDLGAALELFQSITENLEAKTVIEV >NC_019751.1|WP_015197076.1|1603673_1608128_+|NACHT-domain-containing-protein MSLINLDLVFNAITSIANPLIKEKLLRSETVIKLLQQFNLDPEHPPADFSGVYAYALVEYGVGKPKPLLELFRQEAIKQAFRTALDHNNPSILLSEVDVFLDAYTLGDDIRGLGLDVRREVAEFATVFIEVAKRTRTPADVLLNQKIGSLHKRIATIQEQLERLPTLEGIRTEIARLAVENYPALPGSVTENQCRAIALAQQMRGWFETLGYDFEKYEIWAEEYFEWIIQIPVRRSYDRILIRGVAGEIGLSDVMALRSSVEAQKTDEGWLVTTRRISRAARDEVKKEENHRLDCFTFDELIDLDADFNAYLDWLEAEIKRRKIDTKYVPLACTKEEIHPVTKQRIGVSRYEEEDGWIDGYIDLWLDDPAKEHISILGEFGTGKTWFVFHYAWIALQRYRDAQKRGVERPRLPLVITLRDFAKALNVENVLAGFFFTQHNIRINSEVFDQLNRMGKLLLIFDGFDEMAAKVDRQQMINNFWELAKVVVPGAKVILTCRTEHFPEAKEGRALLNAELQASTKKLTGETPQFEVLELEKFNDEQIRQVLSYQAEAATVEQVMGNEQLLDLARRPVMTDLILEALPDIEAGKPVDMSRVYLYAVRRKMERDIKAERTFTSLADKLYFLCELSWEMLSNDQMSLNYRLFPERIRRLFGSSVQEEKDLDHWHYDMMAQTMLVRNADGDYTPAHRSLLEFFVAYKFAAELGALASDFTELAQARSLVDKTVAPADYTWSGYFSQQGSGEAMPAANPLGNASLREFKSESLDKLRETFGKVPLTKAVMDLLLPMLGNNELLISVIKETRDKNEDEVGYIGGNAATLAVKIDKAVLEGRDLSRAVIKAADFSNASLRDVNFTEANLIDSGFVKDFGAVFSVAYSSDGQFLATGDGNGIVRLWKVSTSREILTCKGHTSGILSVNFSSDAYTFASGGYDGTIKLWNSQNGKCLKTLEGHNYSVNSVVFCSEGKILASGSSDNTIRLWDITTGQCLQILEGHTDSILSIALSTDDKILASGASDNTVRLWNTQTGKCLKILQGHTNSVSSVVFSPDGQLLASAGYDATLKLWEIQTGQCKSTLETPNNPIFAITFSPDSKILASSSNQIIKLWDISTNKCIQILEGHFNIVRSIAFSPKGNNLVSGSYDKTVRFWNISTGECFKILQGYSNWVNSITFSLDSQKLASGDDLAIVIWDVSSGKSLRTLQGHTHWVQSIALNQDGTILASGSADNTVRLWDFQTGECLKLLQGHSDWVQSVAFSPDNQLLASGSADGTVRLWEVPVGRCWKILRSNYSIRSVAFSLDGEILASGLSDGTLQLWNIHTSECLKTLQVGNNIGTRSIAFSPDSKVLASGISNASVGLWNISTGEFLRSLQAHTDSVLAVAFSPDSKILASSGDDQTVILWDINSGECLKILRGHSLWIRSVAFSSDGNIIASCSCDSTIKLWNVETGECLKTLINKRPYENMTITGVRGLTEAEKASLKALGAVEDGE >NC_019751.1|WP_015197077.1|1608237_1609512_-|hypothetical-protein MIKRLFPVPNHLGEQLPILTEDKKQVLQQQTITQNSPGTILRDFQTILEFLQPDGVEVSSTYHQFSLKYLQELNSRLSYPIETNLKRPQQKSYPYIYGLYFVLRTSGLSQVITQGKKTKLVLDEQLLKIWQGFNPTEQYFTLLESWLIWGESEVLGEPRDPFGLLFRCCQFWREIPDEGLNINSYSEQDKLVYYPGLHSLSLFHLFGFLELIPGKPEPAKGWRIAAVKRRPWGDAMIALISEIYDEIEPDREEEEITLNFRIAFEKLKPSLQIYFPEWEQTLVIAKGEFTDAIYTFKVTLLDAWRRIAIPSNFNFDQVAAAFVQAFDFDFEHLYRFIYKDHLGRTFEFSHPFVDIPPNTSDFRLGELPLKTGNHLQFIFDLLDEWEFDLLLEKIEPANAKMKQPKILEIHGEAPTQYGEEEEVY >NC_019751.1|WP_051036615.1|1609504_1610074_-|hypothetical-protein MGDFIFGKIGTLGKPVKISQPFNYTLSANVVLVQPDINFLNPEFAITYMASPLIETLLKKESRATTQSAFGIQKVRIIPFPLPPSQEQLAIAEEIELIFSVTDKLEKTINVNLKRAEKLRQTILKQAFEGKLVPQDPNDEPAEKLLERIKAEKAQREADKKPKRQSTIKSKQPRKSKTTATQLELKLDD >NC_019751.1|WP_015197078.1|1611664_1612666_-|restriction-endonuclease-subunit-S MGEELYELPKGWAYSELRDVAEIIMGQSPPGDSYNQDGIGVPLINGPVEFGPRPFSKTIRSKFTTQPTRMCKKDDLILCVRGSTTGRINIAGFDASIGRGVAAIRSLLYQEYLNIFIHAIREQIYNRGTGSTFPNVSNEAVSSIIVPLPPLPEQHRIVAKIEELFTQLDTGVELLKKVKAKLKRYRQAVLKAAVEGNLTKEWREANQGELEPASVLLERILKQRREKWEAEQLAKMKAQGKTPKDDSWKLKYQEPVAPDTSELRELPDEWVWTTLELVANAVDPQPSHRTPPTVDGGVPYIGMGDIKDGKIDFENSRKVSIEVLKEHQGTSKE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_6 | 1621155-1621703 | TypeV-U5 |
V-U5
Consensus repeat of NC_019751_6
|
7 spacers
spacers of NC_019751_6
>6.1|1621192|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATCAAATTCGACTCTAATGGTTATCAAGTGATTG >6.2|1621265|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTAAGTCTGGGCGGGTTGATATTCCTACTGATT >6.3|1621336|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAACGTTGGATATATTGGAGATTTTTGCACTGCCGT >6.4|1621410|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTCTTTAATTTTTTCTAGGGAAACTTGAAACTC >6.5|1621482|40|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCCTAGCTTTGTAGGAGCAAAAAATGAACCAACATGAA >6.6|1621559|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCAACCGCAAATATTCGTCCTCATATAACACTA >6.7|1621631|36|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT ACGGTTAGACTTGCTTGGATACGTTAGCGATCGCAT |
c2c5_V-U5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_6
The CRISPR arrays of NC_019751_6 >merge|NC_019751|6|1621155-1621703|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAGGTATCAAATTCGACTCTAATGGTTATCAAGTGATTGGTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAGCCTAAGTCTGGGCGGGTTGATATTCCTACTGATTGTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAGTTAACGTTGGATATATTGGAGATTTTTGCACTGCCGTGTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAGTCGTCTTTAATTTTTTCTAGGGAAACTTGAAACTCGTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAGAAGCCTAGCTTTGTAGGAGCAAAAAATGAACCAACATGAAGTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAGCTGCAACCGCAAATATTCGTCCTCATATAACACTAGTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAGACGGTTAGACTTGCTTGGATACGTTAGCGATCGCATGTTTCGACAGCCATTCCGTCTAGGGATGGGTTGAAAG >NC_019751|6|4|1621155-1621630|PILER-CR GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG GTATCAAATTCGACTCTAATGGTTATCAAGTGATTG GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG CCTAAGTCTGGGCGGGTTGATATTCCTACTGATT GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG TTAACGTTGGATATATTGGAGATTTTTGCACTGCCGT GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG TCGTCTTTAATTTTTTCTAGGGAAACTTGAAACTC GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG AAGCCTAGCTTTGTAGGAGCAAAAAATGAACCAACATGAA GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG CTGCAACCGCAAATATTCGTCCTCATATAACACTA GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG >NC_019751|6|6|1621155-1621703|CRISPRCasFinder GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG GTATCAAATTCGACTCTAATGGTTATCAAGTGATTG GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG CCTAAGTCTGGGCGGGTTGATATTCCTACTGATT GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG TTAACGTTGGATATATTGGAGATTTTTGCACTGCCGT GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG TCGTCTTTAATTTTTTCTAGGGAAACTTGAAACTC GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG AAGCCTAGCTTTGTAGGAGCAAAAAATGAACCAACATGAA GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG CTGCAACCGCAAATATTCGTCCTCATATAACACTA GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG ACGGTTAGACTTGCTTGGATACGTTAGCGATCGCAT GTTTCGACAGCCATTCCGTCTAGGGATGGGTTGAAAG >NC_019751|6|4|1621155-1621703|CRT GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG GTATCAAATTCGACTCTAATGGTTATCAAGTGATTG GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG CCTAAGTCTGGGCGGGTTGATATTCCTACTGATT GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG TTAACGTTGGATATATTGGAGATTTTTGCACTGCCGT GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG TCGTCTTTAATTTTTTCTAGGGAAACTTGAAACTC GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG AAGCCTAGCTTTGTAGGAGCAAAAAATGAACCAACATGAA GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG CTGCAACCGCAAATATTCGTCCTCATATAACACTA GTTTCAACTACCATCCCGACTAGGGGTGGGTTGAAAG ACGGTTAGACTTGCTTGGATACGTTAGCGATCGCAT GTTTCGACAGCCATTCCGTCTAGGGATGGGTTGAAAG
>NC_019751.1|WP_158333134.1|1620870_1621035_+|hypothetical-protein MQIWSRFITVGITSAVVTESPPSSGEPSQIFFWRVEAGAKSLDSRQNLKTLALY >NC_019751.1|WP_015197084.1|1618647_1620567_+|hypothetical-protein MSVITIQCRLVADEETLRHLWTLMAEKNTPFANEILEQLAQHAEFESWVKNSRVPATVIKELCDSLKNQELFAGQPGRFYTSATTLVTYIYKSWLAVNKRLQRKIEGKKQWLDMLRSDTELEQESNSNLEKIRAKATEILDSFATRQINQVNSKSKTSKNNKNKQEKEVKSLSIQSNILFETYRQTEDNLTKCAIVYLLKNNCEVNDVEEDIEEYEKNKRKKEIQIKRLEDQLKSRVPKGRDLTGEKWVEVLEKAVNSVPESENEAKSWQASLLRKSSQIPFPVVYETNEDIKWSINEKGRIFVSFNGLGKLKFEIFCDKRHLHYFQRFLEDQDIKRQGKNQHSSSLFTLRSGRISWLEQPGKGKPWNINRLLLFCSIDTRMLTAEGTQQVIEEKIADTQNKIAKAQEKCEGELNPNQQAHINRKKSTLARINTPFPRPSKPLYQGKSHIVVGVSLGLKATATIAVFDAMNNQVLAYRSTKQLLGDNYKLLNRQQQQKQRLSQQRHKSQKQFASNSFGESELGQYVDRLLAKEIVAVAKNFGAGSIVLPKLGDMREIIQSEVQAKAEKKIPGFIELQKNYAKEYRKSAHNWSYGRLIENIQSQATKEGIEIETGKQPTRGIPQEQARDLALFAYQCRIA >NC_019751.1|WP_015197083.1|1618338_1618557_-|hypothetical-protein MLVYYARINPGRAFGAGMTEETREVRGRIPKELKITFEIACARLEVTQTAALEEAIKDWLKKQESTSSDKSV >NC_019751.1|WP_015197082.1|1616465_1618334_+|DUF262-domain-containing-protein MIVTAEPPMDSISTFDITKYPLFDVMKDIKIGRIQLPDFQRDWVWDDTHVRRLLASISLAYPIGAVMMLQQGIQRQQFKPRLVDGVTNKAAQTPNLLVLDGQQRLTTLFMVLLSKQPVIIKDPRSQKLVKKWYYLNIEKSLEPEVDRKSTIIALPETKVMRTRNGDCIDCSTPENEYEALLFPLSKVFFFSEWRSKFSKYWQYDPQKLQLIDTLELEVLKKFEHYQIPVIQLRDSLPKEAVCQVFEDTNTAGCDLNFFDLMSSSYCVNDFSLRDDWKQRETRFQSFKVLRKVRNTDFIQSVTLVAGYARRREAIKQGWNLDKLPAVSCGRSEVLKLTKEEYQTWADPVHRGFEEAARFLHGQKIFDADDIAYPIQLVALSAILTIVGERSRSFQVRSKLERWLWCGMFGEIYTHWHDGQAGRDAVEVPAWINGGAVPFSITQANFSYERLLSVRKRLGAVYQGFAALLRREGAVDWITGEEINDVVYFEEQIDSHHIFPVAWCRKQGIDPTMYNCLVNRTPLSAKTNKRIGSKPPSVYLKEFEQYGTAVANLEEIMRSHCIELSILQCDNFETFFQARATALMELIGKAMGKDLSIKLHGNSDRDYLNHNGCKLHPETITTS >NC_019751.1|WP_015197081.1|1616053_1616368_+|hypothetical-protein MQTGSKSQQNKHRIDSLCQLPLEPMEYCRRWVVHEPGRNYRKSCINAIAQVTGTSPKTVKDWGKDFRYRPKYVTRILRQADLINQFKQLVAQGIINLPPDSLQE >NC_019751.1|WP_041739172.1|1615603_1615897_+|hypothetical-protein MDSDRKTPQYRIDALGNLPLEPLEYCRKWVDMSPDERGYRKACVIALAEATGLSERTIGNWGTNFEKRPNYVAHILRMADKLNQIKKIVLPPDFPQE >NC_019751.1|WP_015197079.1|1612665_1615401_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MKPEEKTRIEIDKLLTAAGWIVQDHKDINLGAGIGIAVREYPLKLGVADYLLFINRNAAGVIEAKAEGSTLSGVEIQSDKYIFNLPSNLRCHRKPLPFAYESTGKETFFRDSRESDYRSRRIFAFHKPETLQEWLQESDTLRERLKQLPEIDTEDLRDCQKDAIAGLFNSFAQNRPRALIQMATGVGKTYTAVSFIYWLIKLARARRVLFLVDRKNLGEQTQKEFQQYITPDDGRKFTELYNVQLLTSNNFDPVSKVCITTIQRVYSMLRGEAEFDVAEEEESLFDRDEENQQPKEVVYSSRIPIETFDFIITDECHRSIYNVWRQTLEYFDAFLVGLTATPSLQTFGFFNQNLVMEYRHEDAVADGVNVGYEVYRIRTQITEQGSTVEAGYHIDRRNRKTRAVRWQELDNDLTYTSNQLDRSVVAIDQIRTVIRTFRDRLFTEIFPGRREVPKTLIFAKDDSHAEDIVRIVREEFGKGNEFCKKITYRTTGEKTENLIASFRNSYNPRIAVTVDMISTGTDIKPLECLLFMRNVKSRTYFEQMKGRGTRTINYTDFQAVTPDAGVKEQFIIVDAVGVCEADKTDSRPLERKRSVTFDKLLQAIALDQRDEDTLMSLAGRLARLDQKLTPSDRTQLESFTGGKSMRQITKDILTALDLDNQIAKAEETFKTENPTEQQQEAAAEELINQACEPFDNPQFRQLLDEIYESKKDNDQIIDVVSQDKVLQAGFDTTARDKVMGTVESFQEFVAAKKDEITALQILYNQPYGQRRLTYEQIKQLANALERPPCNLTTEKLWQAYAQLQADKVRGAGVQKLLTDIISLVRFAMGETETLEPYAVTVEEKFQQWLATKEFTSQQVGWLEKIKEHIATSMRIEPEDLQEMPQEAFQGYQLFGNDLMDILDELNEALAA >NC_019751.1|WP_015197078.1|1611664_1612666_-|restriction-endonuclease-subunit-S 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MIKRLFPVPNHLGEQLPILTEDKKQVLQQQTITQNSPGTILRDFQTILEFLQPDGVEVSSTYHQFSLKYLQELNSRLSYPIETNLKRPQQKSYPYIYGLYFVLRTSGLSQVITQGKKTKLVLDEQLLKIWQGFNPTEQYFTLLESWLIWGESEVLGEPRDPFGLLFRCCQFWREIPDEGLNINSYSEQDKLVYYPGLHSLSLFHLFGFLELIPGKPEPAKGWRIAAVKRRPWGDAMIALISEIYDEIEPDREEEEITLNFRIAFEKLKPSLQIYFPEWEQTLVIAKGEFTDAIYTFKVTLLDAWRRIAIPSNFNFDQVAAAFVQAFDFDFEHLYRFIYKDHLGRTFEFSHPFVDIPPNTSDFRLGELPLKTGNHLQFIFDLLDEWEFDLLLEKIEPANAKMKQPKILEIHGEAPTQYGEEEEVY >NC_019751.1|WP_015197086.1|1622561_1624004_+|neutral-invertase MPRDESIDNMMEQQAWDALEKSIVYYKGRPVGTLAAYDPSVDALNYDQVFVRDFVSSGLIFLSKGKPEIVRNFLKETLKLQPKERQLDAYKPARGLMPASFKVISIDGEEFLEADFGEHAIARVTPVDSCLWWIILLRAYVVSTKDICFAHHPEFQNGIKLILELCLANRFDMYPTLLVPDGACMIDRRMGIFGHPLEIQSLFYAALRAAKELLVCQANPNIIEAIDNRLPLLCAHIRQHYWIDIHRLNAIYRFKSEEYGKTAVNLFNIYADSLPYYELDKWLPVKGGYLAGNVGPSQLDTRFFSLGNLMAIISELATEEQSQAIMNLIEERWDNLVGDMPMKICFPALQGEEYRIVTGCDPKNIPWSYHNAGSWPVLMWMLAAAAMKTNRVHLAEKAINIAESRLQEDEYPEYYDGKKGRLMGKQARKYQTWTITGYLLAKELVKNPSHLPLVSFEKLPQELVSRACEFEIDTVDVTLY >NC_019751.1|WP_015197087.1|1624384_1625818_+|hypothetical-protein MEKIESRTEQVVQEDLVMFINACYSCTGQREFYDEANGQKLSISFLHDYILGNYRLLYARTLAIGINHFNQAQIILKLLATGKNINPEYRQEEGGLIAEALNKLPPQRAWGLLQELQNKRINNRRTRAIVRDFIATRRDVNFDAVKYRTKVKAAISHTHLKLNNELPIFLFDYQQQKAFTTDLFENFRKAHYSQDAIYKLPFTIAEGFATKHKIKREIFLSRIQSQMTIGEKMRYQGAAERSDININVDWEHLPLTKLALYILSLPMETRIQTWEKFHRVLEELAKKVLKKSPLKLKLGRVAAVLDNSYSSSGSLEKRRRPLGIALATHYLLKAAATDYRAFWTLQPKNSLLVEPRGQTDLATPLLAALGCGAETVIIVSDGCENDPPKGATEVLRIYCTKLDRLRKTSIIHCNPVFNAEDYTLRSLSSHIPTVGLRDAEDLPTVLGFAKFAEGSLNLSELESYLAERVSSFLKHGF >NC_019751.1|WP_015197088.1|1625927_1627082_+|hypothetical-protein MLIKNILLKGLQIAPSQVCGSIRIVPLVRHKTRGDLHLQNRKYNDDLSIVSIDKNTNYYSYIPHGMVMSWSDDGSSVANMGINITKKDGKSFNNKYANVRLMHRMAKRESKNTLRFLPLHLAMEGFLSLYFNAPKIAWDEYSTYAKSYGLGCRTEYSVSGRAIFGLEEALRVFEIHEGQVGVLVYVAEALASAFVVPNPQDYRALHYNLLEDFYGDLIYRYALMYDQTYSMDLSIDASKISNLADLRSAVVQMRKDWASFNQGMMLDGLLDRQIHSRLVYTAGCFELQRFVTQVSLSDEENHIGEAIIRDNGELEYLHTYRLTAAQSRRVYYLRILDENNWNLKETATALACTQEEFVRKMEKEGFGYLFQQQIRDKARKANKR >NC_019751.1|WP_015197090.1|1627258_1628605_+|16S-rRNA-(cytosine(967)-C(5))-methyltransferase MLNPRQVAFFALRDVHKGAFVDVAIDRILNKSNLANLDRRLVTELVYGSVRRQRTLDAIIDKIAKKKSQQQPKDLRTILHLGLYQLRYQERIPDSAAVNTTVDLAKEHGFPGLTGLINGILRQYLRLIDAGDEIITSSNPVERLGILYSFPDWIIQVWVEQFGLEETEKLCQWMNQTPTIDLRVNLLRTTVEKVEAAFTAAGVKYQRLQYLPCGLRLLGHNGRIQDLPGFLDGWWTVQDSSAQLVGYLLDPKLNEVIIDTCAAPGGKTTHIAELMEDQGTIWACDRTASRMGKLKENIQRLQIQSIRTCVGDSRDLPQFTGIADKVLLDAPCSGLGTLHRHADARWRQTSANVQELAKLQTELISQTSKFVKPGGILVYATCTLHPQENEAVIASFLENHPNCQIEAPNPESPLAVHATPSGFIKVLPHNQDMDGFFMVRLRKTNNSG >NC_019751.1|WP_015197091.1|1628665_1629091_+|TerB-family-tellurite-resistance-protein MKSQSSSTKNLVKILIGAAWIDGKIQPEERQYLRHIAQEKGVATDPEIKPWLYELVSVQPNECYNWVREYLGEHPTNEDYQNLIQAISGLIYSDGEVAVEEAKLLTKLQQLSDENDVSQAGLNVILKQIQKLYRRWLEVQN >NC_019751.1|WP_041739177.1|1629290_1629830_-|hypothetical-protein MNADELNRFVAYCKRIQPQSQEDIRRFFEGVVGFPYDKELLLQAYLFLNIKDLFPCCSELLLFEKSPIADYTDLGKCDFVYLSSVGNLLLIETKFIDTEATGATERKRRNKHRNKVFEQVMTLKSRFSEYWDIRLEHLNCGVFTTDSEVEWRGSSVNVLTKAISIENLEQWRRSYKYGK >NC_019751.1|WP_015197093.1|1630681_1632076_+|hypothetical-protein MINQAAKKSLTNNFISIVELFNLLAANRQHIILNFHNLQENYQYQHIRQVIGTRDIDGNLIQPWLKAEDIDKNEYVQITSFSLNRHTASLNMLIQRQVRLINTQDATPITEVAGLLTNQLNRFNNYTVVSDGKFNIREIKVKISSKKTFELLHQSDIITDSEFDFRREYTINLDKFPIVDLEQPYQTIDGVFQKLAEAKVLVSIISAHLKQESDVFLAEQLDSLAQHHLSKQVYLNFPKTKESSESIQMRTIHKIDIGNKDILNLSKFHSANKFLNRMYCGYDIETGEVLKKLDFGMAILTNVAFQCKPISSRMKITEVDQFMKLIFDDFLGFSNCGIVTEILTRVGDRYLIQLLQEKRQGKHASKSEMVAALTAANTMLGQYIESIYREIISPLVFYIGSTGLLPKNMETTAMNSQQLAEKYPNLQFSPNEKHGKFFEVGDSIVSIYSQTELYSQKTDMTVLK >NC_019751.1|WP_015197094.1|1632614_1633688_+|HEAT-domain-containing-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_7 | 2021864-2022765 | TypeI-D |
I-D,II-B
Consensus repeat of NC_019751_7
|
12 spacers
spacers of NC_019751_7
>7.1|2021901|33|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTGCTTTTCCTGATAAAGATTGCCCGGAAAA >7.2|2021971|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTACTCAGCAGGAAGATATCAGCAACTGAATGAC >7.3|2022043|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAACCCCTAAGAGTGAGCGCCAAAGAATTCTAGC >7.4|2022114|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACGAAAATCTAGATGATTTTAGGGCTAATTTTGCT >7.5|2022187|42|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTAGCGCAGAAACCAGGCAGCAAGCAATCAGGCAATTCTT >7.6|2022266|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTGGGCTATGACGAGTTAACTCATTTCACGAA >7.7|2022337|33|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATAACGGTGCAACTTGGGGGATAAATAATGA >7.8|2022407|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAGTATAAGTCTGAATAAGTCTGAATATCCCT >7.9|2022480|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTTGATTAGCTATCAACCTGGCGACAAGGCTGTAG >7.10|2022554|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATAATAGTATTCTGAATACTCTGGTGTAATT >7.11|2022625|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTAACCATTCGTTCGCGGAATCTTTACCCATACT >7.12|2022697|32|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT CCAGCACGAGTGCGATCGCCGATTGCGATCGC |
cas3,PD-DExK,cas10d,csc2gr7,csc1gr5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_7
The CRISPR arrays of NC_019751_7 >merge|NC_019751|7|2021864-2022765|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAGTTGCTTTTCCTGATAAAGATTGCCCGGAAAAGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTTACTCAGCAGGAAGATATCAGCAACTGAATGACGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCAACCCCTAAGAGTGAGCGCCAAAGAATTCTAGCGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAACGAAAATCTAGATGATTTTAGGGCTAATTTTGCTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAGTTAGCGCAGAAACCAGGCAGCAAGCAATCAGGCAATTCTTGTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACATCTGGGCTATGACGAGTTAACTCATTTCACGAAGTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTCATAACGGTGCAACTTGGGGGATAAATAATGAGTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAAAGAAGTATAAGTCTGAATAAGTCTGAATATCCCTGTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCCTTTGATTAGCTATCAACCTGGCGACAAGGCTGTAGGTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTGATAATAGTATTCTGAATACTCTGGTGTAATTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAGTAACCATTCGTTCGCGGAATCTTTACCCATACTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCCAGCACGAGTGCGATCGCCGATTGCGATCGCGTTCCTATAAAGTAAAATTCCTAAGCCATATCGTATA >NC_019751|7|5|2021864-2022696|PILER-CR GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTTGCTTTTCCTGATAAAGATTGCCCGGAAAA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTTACTCAGCAGGAAGATATCAGCAACTGAATGAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAACCCCTAAGAGTGAGCGCCAAAGAATTCTAGC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AACGAAAATCTAGATGATTTTAGGGCTAATTTTGCT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTTAGCGCAGAAACCAGGCAGCAAGCAATCAGGCAATTCTT GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATCTGGGCTATGACGAGTTAACTCATTTCACGAA GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TCATAACGGTGCAACTTGGGGGATAAATAATGA GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AAAGAAGTATAAGTCTGAATAAGTCTGAATATCCCT GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CCTTTGATTAGCTATCAACCTGGCGACAAGGCTGTAG GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TTGATAATAGTATTCTGAATACTCTGGTGTAATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTAACCATTCGTTCGCGGAATCTTTACCCATACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC >NC_019751|7|7|2021864-2022765|CRISPRCasFinder GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTTGCTTTTCCTGATAAAGATTGCCCGGAAAA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTTACTCAGCAGGAAGATATCAGCAACTGAATGAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAACCCCTAAGAGTGAGCGCCAAAGAATTCTAGC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AACGAAAATCTAGATGATTTTAGGGCTAATTTTGCT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTTAGCGCAGAAACCAGGCAGCAAGCAATCAGGCAATTCTT GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATCTGGGCTATGACGAGTTAACTCATTTCACGAA GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TCATAACGGTGCAACTTGGGGGATAAATAATGA GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AAAGAAGTATAAGTCTGAATAAGTCTGAATATCCCT GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CCTTTGATTAGCTATCAACCTGGCGACAAGGCTGTAG GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TTGATAATAGTATTCTGAATACTCTGGTGTAATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTAACCATTCGTTCGCGGAATCTTTACCCATACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CCAGCACGAGTGCGATCGCCGATTGCGATCGC GTTCCTATAAAGTAAAATTCCTAAGCCATATCGTATA >NC_019751|7|5|2021864-2022765|CRT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTTGCTTTTCCTGATAAAGATTGCCCGGAAAA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTTACTCAGCAGGAAGATATCAGCAACTGAATGAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAACCCCTAAGAGTGAGCGCCAAAGAATTCTAGC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AACGAAAATCTAGATGATTTTAGGGCTAATTTTGCT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTTAGCGCAGAAACCAGGCAGCAAGCAATCAGGCAATTCTT GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATCTGGGCTATGACGAGTTAACTCATTTCACGAA GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TCATAACGGTGCAACTTGGGGGATAAATAATGA GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AAAGAAGTATAAGTCTGAATAAGTCTGAATATCCCT GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CCTTTGATTAGCTATCAACCTGGCGACAAGGCTGTAG GTTCCTATAAACCAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TTGATAATAGTATTCTGAATACTCTGGTGTAATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGTAACCATTCGTTCGCGGAATCTTTACCCATACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CCAGCACGAGTGCGATCGCCGATTGCGATCGC GTTCCTATAAAGTAAAATTCCTAAGCCATATCGTATA
>NC_019751.1|WP_015197381.1|2017108_2018581_+|recombinase-family-protein MRDLSRAIGYCRVSTQRQVTDGHGLERYIFRLKEFGLTDDNIYYDIESGDSETRAGYNRVLDLVRCRAVDTIIVPCFDRFTRSALGWEKARAELQEYNVELQFLDGGSLDLETPEGLFTSRILAAMAAQLRDKNKYNALQGAKYFREKKKIYQAIFGFVKVGETVEPNREEYRSTGKSHAAIAVEAIQIFISTGEIGGTIRKLVEKYGVERVSHLNYKDFPRDISAFKRWLLNPQLWGGICYYPTDSRRKIIVKSEHEGIISQSDHEEVLRLLKKPVGQRKKKRKNPLANIAICGVCGNRLEFHSYDRIVDDVKKSHQHLRCLGAYNKPGKPQVCDNRKYYRLEDAIAFACKHIQLASVEIAKRLDVESSPRRETIEILELKQQISQLKALNDPDLDPVIRSKEFKLSSAYGRLEIENQVQVGNVNYLEAIKGLFSLDKDWIFDIEIEELCVLFPELIESFVCSPPPEGKSPGGKYSKDSPGVFEVRLRT >NC_019751.1|WP_015197380.1|2011944_2017071_-|acyltransferase-domain-containing-protein MGKLARGKQLAMPLAARLEYPVWEKVLRTSGLSEEDTQKIIAKFKTAYVKWDENAFPGMLANVVAGRIANRLNFGGTNCVVDAACASSIAALKMAISELLEHRADIMLTGGVDTDNSIMAYISFSKTPAVTPGDNVKPFDAKSDGMMLGEGIGMIVLKRLADAERDGDKIYAVIKGIGTSSDGRYKSIYAPRQEGQVKALQRAYEDAGFSPATIGLVEAHGTGTMAGDPTEFASLREYFSVDNPRKQYIALGSVKSQIGHTKAAAGAASLIKTALALHHKVLPPTINVTEPNPKLNIKNSAFYINTETRPWIRAEGEAPRRAAVSSFGFGGTNYHVVLEEYTQETGKNSYRINNAPFEVLLSALNPGLLLTRCQEVLANLQSGNSEKQYVELVEESKTKNIPLNNARVGFIAESPQEAIKFLKMTVDLLHKQPNSPAWEHPQGIFYRESGLELGGKVVSLFSGQGSQYLEMGRELVMNFPALRNLYGYMDSLLLKDNMQPLSEIVFPHPVFEDAEKNAQIAALQRTEYAQPAIGMLSAGMYKILQQAGFKTDFVAGHSFGEITALWAAGVFNDEDYCKLVKARGQAMAPPQDPDYDAGAMLAVKEDLHKVEAVLRHFPRVMIANYNSQKQVVLAGPTAEINRVKQALQDQSYSAVSLPVSAAFHTPLIAFAQKSFAIALKSVQFQTPKLPVYSNTTGNQYANEPQTIQHILESHLSSSVLFKQEIEHIYAAGGSCFVEFGPRKILSNLVKEILGERPHLTIALNSNSQKNSDRTLREAVVQLRVAGMNLQNLDPFQQPLTVPPVTAGNKTLTIKLNGANFISEKTRKGWEETLNSTDKVQLMGTSDTVVTSTQEIQPVISAKELETVINSPVSSNGHHLPTVSNGKQPKFSIPQPDSTVSKVICSEVSQNEDFSGNSVVNPQYSELPQLTSSTNQPVRESKMQTIPNNPGDYQQILGSLEYVLTQFQQNQTENLQVHGLYLNNQKEYAQTFFQLMQQQNGLFAKNGNSDIKPVVMESLERSMMQFHSQQGETLRIHEQYLQNQIEYTQSFLKLIQQEYKQLIAGEVTVSSTILTESKSTPVFASVPTPTQVTPVVEGVPTPTQIQPVVESVAAPTQIKPVVESVPTPTQIQPVVETTPAPTQVTPVVESIPAPTQIQPVVESIPAPTQIQPVVESVPTPTQIQSVAANIPTVTIDLSDLGDKLLAITSEKTGYPVEMLEMDMDMEADLGIDSIKRVEILGGLQEIYPNLPEPNLEDLAELRTIGQIVEYLQTNNAPAKPVAPVEMMISAVQKATDIPIPELEITPTIPVITPDNTPTPVVSTTPTVSSTVSSDFANLDKSLLEITSEKTGYPVEMLELDMDMEADLGIDSIKRVEILGALQEAYPDLPKPDNMEELAELRTIGQIVTYLQNLAGGEKKKPESDSLEVESREQGEMRQGEQGSRGAGGDEELLQVSSLPITEFGEIHTPVNCNIKRLPARLLELGKPDFLDFTLPEGYVAIVTDDGTLTTTSVVQSLCDRGWKVVVLNFPASLVPEKSPLPQGVNRVALNDLSEEHLQQQLSAIADYFGTVAAFIHLHPHFPNNSPGILYHPDEKAIVKHVFFIAKYLKKPLVEAANHTRSCFLTVAHLDGSFGLKHQNNFGAIGAGLFGLSKTMLWEWANVYCRAVDLSPELTSNEAANSIIAEIHDANRYLIEVGYSKQGRVTLIAD >NC_019751.1|WP_015197379.1|2011069_2011588_-|carboxypeptidase-regulatory-like-domain-containing-protein MAKQTAISYIGRVIDYRKQAPISGAKVSFTAENNSLVTYTDLEGIYRFIVKPGDKKVLQGQIVVDAKGYPEYSSLIRLSTERKDLGDIRLGSRSKSSPSNYRSTSGSKEENSNLTVVIAIIVISFFTILAISLKSNPRREPINQQDDREFLNRYQRYQNKVPDRQRLNDFTF >NC_019751.1|WP_041740352.1|2009215_2010940_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MPTPIFIKPTSIFVVSGGAKGITAACTIRLAQQYPCTFILLGRSELSDNEPEFARDCVDDATLKKRIMEQLIAQGEKPTPNSVQKIFNQITSNREIKATLAAIIKTGGKAEYLSVDITDSEKLKIKLAEISQRLGKITGIIHGAGNLADKLIEKKTSEDFEKVYTAKVQGLENLFNSIPSNQIEQLVLFSSVTGFYGNIGQSDYAIANEILNKSAHLVKTQHPNCHVVAINWGGWDSGMVTPQLKKEFARRGIEIIPVEAGTQMLVNELSPIHHNTAQVVIGSPMILPPAPLGTELRSHRVRRSLIGGDNPFLYDHKIAGNLILPATCAMSWIADTCERLYPGYRFFCATNFRVLKGISVSETDSTEYTVELQEISKIDGVEIQLQAKISSKLPNGKTTYHFASEPKLLVEIPQSPTYENLNLQTDNTITLQGSQFYQQNPSSLFHGKTFQQINRILNISPEKITAECHWASIGTKQQGQYPVDWMNPYATDLSTHPLWIWLYHYHQQICLPGQMEKYEQFERTPINTDYYVSCEIQQKTATGISANFIVHNQQGKIYSQLLGTKGVILPKLLE >NC_019751.1|WP_041739263.1|2004385_2009074_-|PfaB-family-protein 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>NC_019751.1|WP_015197376.1|2002464_2004132_-|PfaD-family-polyunsaturated-fatty-acid/polyketide-biosynthesis-protein MKTVDTVTNPRDNGLKFNTFSFYQNQVWKGSTDCISFDQNSIKEKLLNLNQPCYVVRVDGRIGIANGGYAAPQDDAKTGEVELITAVPPIKIQNLGDPNFLSFYGTKYAYMTGAMAGGIASAEMIIALGKAKLMGSFGAGGLTPSRLEAAINQIQSALINEPYCFNLIHSPNDLAIERRAVDLYLKYGVRVVEASAFLDLTPNIVYYRAAGLGLNSANEIEIRNKVIAKVSRREVATKFLQPAPIKILQDLVNQGLISELQANLAARLPVADDITVEADSGGHTDNRPLVCLLPSMLALRDEIQAKYQYEKPIRIGVAGGISNPQSALAGLMMGAAYIVTGSVNQSCVESGSCEHTKKLLAQAEMADMMMAPAADMFEMGVKLQVLKRGTMFPMRAQKLYELYRTYDSIDDIPMAEREKLEKQIFRQSLSEVWEGTVSYLSQTNPEKLAKAVNNPKLKMAAIFKWYLGLSSRWSSSGEKGREVDYQIWCGPAMGSFNEWVKGTYLEEANNRLVVDVANQIMSGAAYLYRVQSLRVQGLQIGDCYGQFYPQVSSLE >NC_019751.1|WP_015197375.1|2000751_2002263_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MVSPKKSMTAEEIQVWMAGKLAELLKVEVDEVDVNLPLEDYGLDSARAMVLVGQVEKKLGVELSPVLLWHYPTIAALSVRLAEDSEDVSDAKSTGVSVVKPLDISVDLGAEVVLDPSIYPAKNSFRFNGEPENVFVTGATGFLGGFIIYELLKQTSCDVYCLVRAANTEAGKIKLKKNLEQYAIWDDEFEPRIIPILGDLSQPLLGISQEGFEMLAANMDAIYHSAATLNYVYPYSALKTANVLGTQEVLRMACMIRVKPVHYVSSVAVFESSAYAGKIVKEDDAFEHWQGIFLGYSQTKWVAEKLVKAASDRGLPVTIHRPPLIGGDSQTGVCNGDDFINLMIKGCIQMGAFPDVDYKMDFSPVDYVSKAIVHLSRQKESLGKAFHLQHPQPVPLKELVEWISSFGFSVKSIPYKEWQQKLTEITDNSNPLYTLRPFLLERWSKEQLTIPDLYLQTQRPIISCQATLHALSGSGVSCPPIDSRLFMTYSAYLIQSGFLSFGS >NC_019751.1|WP_041740351.1|1999606_2000350_+|4'-phosphopantetheinyl-transferase-superfamily-protein MQNSKLRSLTIDSDRQWLVAPNDVKLLPDDIHVWRIELERSESQIKQFAKILSEDERGRAEKLYFQQHRQRFVVGRGILRTILGRYLDVAPQEVKFDYEAFGKPVLSAEFSDRKIWFNLSHCQSLALCAVSRDRPIGVDLEYARPITDVLVLAQQFFSASESALMRSLPPHQKQQAFFRIWTCKEAYLKATGAGISQLQKIEITLTPGESAKLNVPDWRLLEISAGRNSIAAVAVPGTAANLRYWQY >NC_019751.1|WP_015197373.1|1997880_1998786_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MYTKTALICLGVMFSSVISLPANAETVMAKINRTGVLTAGTSKDAIPFAYADSKGKLTGYSVDMLVLMKEQLEKQLGKKIQLKLVSLSPAERIPKILKNEVDIVCDASSFTWERDKQVDFSVSYAVTGTQLLVKKNSNLDSAESFVAKQVGVLSKTTNEQAMKRFQPQAKLVYFPTRNQAYSALQQGKIDAFASDGILSEGWLRTQKNPDAFKIVPSLPLSREGVACMVPENNSKFLDTVNYSLIKFMQGFVSGNPRNVTIFDRSFGAKGAVFINKDIRDLTIETMQLVIESRQEIGERDF >NC_019751.1|WP_015197372.1|1996772_1997747_+|quinolinate-synthase-NadA MFTTALPQREKEQLGTFPLDLFTAITELKKELNAVILAHYYQEPDIQDIADYIGDSLQLARAAAETNADVIVFAGVHFMAETAKILNPDKLVLLPDLDAGCSLADTCPPQEFAAFKAAHPGHLVISYINCTAEIKAMSDIICTSSNAVKIVQQIPKEQPIIFAPDRNLGRYVMEQTGRDMVLWQGSCIVHETFSEKKIVQLKIANPEAEIIAHPECEASVLRHADYIGSTAALLKYCQDSKSSKFIVATEPGIIHQMQKVASEKQFIPAPPENNCNCNECPFMRLNTMDKLYLAMKNRTPEITMSEEIRSAALLPMQRMLEMSK >NC_019751.1|WP_015197383.1|2023763_2024024_+|DUF433-domain-containing-protein MTSENLLARISIDPNICFGKPCIKGHRIWVSMILDYLAGGETIEGILEAYPSIEREDILACIAYGAEMSRGAFVEIPLTKKKEATA >NC_019751.1|WP_015197384.1|2024020_2024386_+|DUF5615-family-PIN-like-protein 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>NC_019751.1|WP_015197386.1|2026795_2027065_+|hypothetical-protein MLSHNADPHLLNLLMNADLEQINQALILRLVTENCGFKHRIDTLESQNEEILQKLDNLENIYNEIPYLRHLVDQNEELQNLVDFYCPPD >NC_019751.1|WP_015197387.1|2027326_2027773_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MNTPTIEKLKQLAQQIPEKIPYLKMLVLFGSRATGETHVNSDWDFAVLIDKAQQEIYTKDNAWGAFGLSMFIGEILNINPDKIDIVELNHCSWLIAHFVARDGILIFEKESSGFEYFRLTSLRPESELKKFRKEQHQLIEMQLKQWSI >NC_019751.1|WP_015197388.1|2027769_2028213_+|DUF86-domain-containing-protein MSKIDPEIVLARLRLITKYKNTLEEFRSININEFLAEFRQQLIVERLLQLMIQAAIDINDHILSRLNPGNSATNFEAFIELGKYEVITSELAKQLAPSGSLRNRLVHEYDDIDPNQVYQAIKFALQQYPLYVQQINAYLISLDTESS >NC_019751.1|WP_015197389.1|2028231_2029251_+|DUF1016-domain-containing-protein 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MAKKTKKSEESKQLSLFESGLDLNSEITDEADDNWLEGDFGFDGDSDRTIETKSELLTLKLLREAIKAQNPDDQVMADFGEYVLPNLLSIAIGVTAKGGKFFDEIDEKREAEGKAKVRRDNAADQSLNTHLLNGLFPANLIERRLHKLDTTVQRVVRERERRLVIAGFILHDFEKFPDVPNDCRKLPLEEHRQIIDEKVRQLGLDKFIDSENTEAYKEYIDDLLCMAYNAQRRWDTNWNFSEFGLNPLLKDRTLRSLSDLTCLADSLASIIKHPQDAENPRLNEIIHSLSDGKLKFTYHRISENRGVLTNVVNNALIQVHTKLNTDENIYYEPLLYLPTGVIYLARRDAPEISLDDVPNQVIENIKSLCSGQLKLRQTGFGRDGKGMKYAEYYNLFFDEIGLMKVALDATLRILNPNKDSVAKSRSDNLVKFQQQKVLSVDYDFKFTDDIRIDQIAEFGDLICRKIWDESANRIEVACKKDKNLPKLTQLDLTYKVAEFWELAEYLPQIREIQRINESLKENKLKGNTGGVPYEWYYLAAKFLEKHPGIENVRESCQQVIEYINNLISPIISQYELPDGWNDLRLWVKQVVMLPGNQETQTPDNFLNELANYNAAKKSGRGRQLICSISHSAYTVTEQMESAVLFTPQVYTNKQMLNGSNAKRNISSIAGLEMMLRQILMNQTQAVGKRFEDGKYRYLYFYPTYYFTPETNKFLQKAYTGISQTRFDTRIRNHFISKDLQANFDKDTYQNVDAFLIDENLDSDKDRTFKLSYPDDQPLTFYFMAMPPGRDSSDTESWVMPTWLAFAFPMILDVKTVVSESPIPPFNDGAEFEESVFLDSAPHAFRTLVGRDRFRLDYILEGWTENNKSYPAPLNVLTAAYAIHIDVNAKSGKSGYDANWGRFTELAKDFETTPLYVFAYLNRWVRSQGVETARIEKIRLYAHKFYPCFDPYAQYDFESKEWKLMPESQLNHPKKLTDLYRKFYRANKRYNPKSNAVLKPIDIAAETILKAEVSVFSGETLVAAVAAEVFKLMDRVHANTADGRWVMSKREEERQAVLDFARYFVMDVFENSFSSDRARLAGRQLNLIKDTCEFLYRLEDDKENANKDVKEEENDKNED >NC_019751.1|WP_015197391.1|2032745_2033771_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csc2 MSFLKTVDAKFFHSEIPYKPMGKYVHFLTVRVTESYPLFQTDSELNKARVRAGIVDKTTISRLSMFKRKQSTPERLVGRELLRNYGLMTAEECEYNVKFAMNNPDCIIYGFAIGDSGSEKSKVVVDTAFSIKSFDESHETFTLNAPFENGTMASKGENGSKVGEVTSRINQQDHIKPQVFFPSIVTLKDPTEASFLYVFNNILRTRHYGAQTTRTGRVRNELIGVIFADGEIVSNLRWTQAIYDQMKSNNTLNSPDPLNEDEVFVSAKVSISTLMEDEFIVHEDFLGDKFAALLKEVKAITANEEELKKMLKKADDEAKAYAKVHIKGKDKEKDKDKAAAK >NC_019751.1|WP_015197392.1|2033776_2034484_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas5/Csc1 MTIIYRCQIELHDSVYYATREIGRLYETEPIIHNYALCYALGLVDSEKYATTVSEEHSYRYFCPEQVPKYEEHLTPLNKQGIYVTPACSISHTSILNTWKYANNNYHVEMEKTQKNIPSFGRAKEIAPESVFEFLIISQNELKLPKWIRLGKWMSKAEVTVEKLPEPKTKTDLFICTHPLNPLDVMFTNQVISYDVINMPPVSLIQNVQMRGQYYYFENVKDVRLPVNISYRFRN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_8 | 2026580-2026681 | TypeI-D |
I-D,II-B
Consensus repeat of NC_019751_8
|
1 spacers
spacers of NC_019751_8
>8.1|2026603|56|NC_019751|CRISPRCasFinder GAGACTTGTGTTTTATGCAAGCAAGGGAGAAGCCAATCATTATAAGGATAGCTCGT |
cas3,PD-DExK,cas10d,csc2gr7,csc1gr5,cas6,cas4,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_8
The CRISPR arrays of NC_019751_8 >merge|NC_019751|8|2026580-2026681|CRISPRCasFinder GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGAGACTTGTGTTTTATGCAAGCAAGGGAGAAGCCAATCATTATAAGGATAGCTCGTGTTTCAATCCCTGATAGGGATTA >NC_019751|8|8|2026580-2026681|CRISPRCasFinder GTTTCAATCCCTAATAGGGATTA GAGACTTGTGTTTTATGCAAGCAAGGGAGAAGCCAATCATTATAAGGATAGCTCGT GTTTCAATCCCTGATAGGGATTA
>NC_019751.1|WP_041740355.1|2024394_2026578_+|type-I-D-CRISPR-associated-helicase-Cas3' MNESIYQVNLKSVYSSPVESELQDVTLPKNWRLSWHQAETLKALRNPNIDVIINTAMTGDGKSLAAYLEVLQGEFSAIGLYPTNELARDQEIQIKGYIDTFKPANNPRVARLSSAELEIYAENEGLKKSAAISTLTNQREVILTNPDILHYLHRGAYLIPGDSPDKLWGRIDKDFNLFIFDEFHIFAAPQIAGVINTMLLMNCTNRHKKFLFLSATPDKDFIDKLKLAGFRCQEINPLDNQKYQFPDNLEQEQELQLQNWRQVSRSINLNFISLEPSFKASETWIKENSNLILEYFQNNPGSKGAIILNSIAAVKRLVSFFQEIFQTHGLIVGENTGLSGKITKEKSLLADLVFGTSTIDVGVDFKINLLIFESSDAGNFIQRLGRLGRHDGYNKDGEDIKFEKYTAYALVPNFLVERLFLGDNPPLKNTENYNRAFLNATIKDKYRQINDFRGYYKRWGAVQSFYLFHKLSDRTIQQPYAQSREKFQKACESVFNTSLKSIAGRVSGWAKDWKNASGKSGNPIAEDASSFRGASSLQCGLYDLTEENPADRFKTYDLPGILGNLEIEMWTETGFMRTLKETAQVTGQPIPKGKYEYCLGFMKLRSYREERLNWKFVYPGDLQPVADAWKVQVLTGIEVWQPDNNYVREINKRLKKQALVCYVLRRPIAEVRNRLRLPMHFQLYPICDELSLHDSSAPYAIAFGQSALLLDTLAYTFKSKGDESWII >NC_019751.1|WP_015197384.1|2024020_2024386_+|DUF5615-family-PIN-like-protein MNLKLDENIDARVITLLRLAGHDVATVPEKGLMSAPDEEVIEVCRREERCLVTCDRGFGNRVKYNPSNYAGIVIIRLPSRYTFADCQQAIEILIQGLESAEVTGKLWIIQRGNIQEYQAIE >NC_019751.1|WP_015197383.1|2023763_2024024_+|DUF433-domain-containing-protein MTSENLLARISIDPNICFGKPCIKGHRIWVSMILDYLAGGETIEGILEAYPSIEREDILACIAYGAEMSRGAFVEIPLTKKKEATA >NC_019751.1|WP_015197381.1|2017108_2018581_+|recombinase-family-protein MRDLSRAIGYCRVSTQRQVTDGHGLERYIFRLKEFGLTDDNIYYDIESGDSETRAGYNRVLDLVRCRAVDTIIVPCFDRFTRSALGWEKARAELQEYNVELQFLDGGSLDLETPEGLFTSRILAAMAAQLRDKNKYNALQGAKYFREKKKIYQAIFGFVKVGETVEPNREEYRSTGKSHAAIAVEAIQIFISTGEIGGTIRKLVEKYGVERVSHLNYKDFPRDISAFKRWLLNPQLWGGICYYPTDSRRKIIVKSEHEGIISQSDHEEVLRLLKKPVGQRKKKRKNPLANIAICGVCGNRLEFHSYDRIVDDVKKSHQHLRCLGAYNKPGKPQVCDNRKYYRLEDAIAFACKHIQLASVEIAKRLDVESSPRRETIEILELKQQISQLKALNDPDLDPVIRSKEFKLSSAYGRLEIENQVQVGNVNYLEAIKGLFSLDKDWIFDIEIEELCVLFPELIESFVCSPPPEGKSPGGKYSKDSPGVFEVRLRT >NC_019751.1|WP_015197380.1|2011944_2017071_-|acyltransferase-domain-containing-protein MGKLARGKQLAMPLAARLEYPVWEKVLRTSGLSEEDTQKIIAKFKTAYVKWDENAFPGMLANVVAGRIANRLNFGGTNCVVDAACASSIAALKMAISELLEHRADIMLTGGVDTDNSIMAYISFSKTPAVTPGDNVKPFDAKSDGMMLGEGIGMIVLKRLADAERDGDKIYAVIKGIGTSSDGRYKSIYAPRQEGQVKALQRAYEDAGFSPATIGLVEAHGTGTMAGDPTEFASLREYFSVDNPRKQYIALGSVKSQIGHTKAAAGAASLIKTALALHHKVLPPTINVTEPNPKLNIKNSAFYINTETRPWIRAEGEAPRRAAVSSFGFGGTNYHVVLEEYTQETGKNSYRINNAPFEVLLSALNPGLLLTRCQEVLANLQSGNSEKQYVELVEESKTKNIPLNNARVGFIAESPQEAIKFLKMTVDLLHKQPNSPAWEHPQGIFYRESGLELGGKVVSLFSGQGSQYLEMGRELVMNFPALRNLYGYMDSLLLKDNMQPLSEIVFPHPVFEDAEKNAQIAALQRTEYAQPAIGMLSAGMYKILQQAGFKTDFVAGHSFGEITALWAAGVFNDEDYCKLVKARGQAMAPPQDPDYDAGAMLAVKEDLHKVEAVLRHFPRVMIANYNSQKQVVLAGPTAEINRVKQALQDQSYSAVSLPVSAAFHTPLIAFAQKSFAIALKSVQFQTPKLPVYSNTTGNQYANEPQTIQHILESHLSSSVLFKQEIEHIYAAGGSCFVEFGPRKILSNLVKEILGERPHLTIALNSNSQKNSDRTLREAVVQLRVAGMNLQNLDPFQQPLTVPPVTAGNKTLTIKLNGANFISEKTRKGWEETLNSTDKVQLMGTSDTVVTSTQEIQPVISAKELETVINSPVSSNGHHLPTVSNGKQPKFSIPQPDSTVSKVICSEVSQNEDFSGNSVVNPQYSELPQLTSSTNQPVRESKMQTIPNNPGDYQQILGSLEYVLTQFQQNQTENLQVHGLYLNNQKEYAQTFFQLMQQQNGLFAKNGNSDIKPVVMESLERSMMQFHSQQGETLRIHEQYLQNQIEYTQSFLKLIQQEYKQLIAGEVTVSSTILTESKSTPVFASVPTPTQVTPVVEGVPTPTQIQPVVESVAAPTQIKPVVESVPTPTQIQPVVETTPAPTQVTPVVESIPAPTQIQPVVESIPAPTQIQPVVESVPTPTQIQSVAANIPTVTIDLSDLGDKLLAITSEKTGYPVEMLEMDMDMEADLGIDSIKRVEILGGLQEIYPNLPEPNLEDLAELRTIGQIVEYLQTNNAPAKPVAPVEMMISAVQKATDIPIPELEITPTIPVITPDNTPTPVVSTTPTVSSTVSSDFANLDKSLLEITSEKTGYPVEMLELDMDMEADLGIDSIKRVEILGALQEAYPDLPKPDNMEELAELRTIGQIVTYLQNLAGGEKKKPESDSLEVESREQGEMRQGEQGSRGAGGDEELLQVSSLPITEFGEIHTPVNCNIKRLPARLLELGKPDFLDFTLPEGYVAIVTDDGTLTTTSVVQSLCDRGWKVVVLNFPASLVPEKSPLPQGVNRVALNDLSEEHLQQQLSAIADYFGTVAAFIHLHPHFPNNSPGILYHPDEKAIVKHVFFIAKYLKKPLVEAANHTRSCFLTVAHLDGSFGLKHQNNFGAIGAGLFGLSKTMLWEWANVYCRAVDLSPELTSNEAANSIIAEIHDANRYLIEVGYSKQGRVTLIAD >NC_019751.1|WP_015197379.1|2011069_2011588_-|carboxypeptidase-regulatory-like-domain-containing-protein MAKQTAISYIGRVIDYRKQAPISGAKVSFTAENNSLVTYTDLEGIYRFIVKPGDKKVLQGQIVVDAKGYPEYSSLIRLSTERKDLGDIRLGSRSKSSPSNYRSTSGSKEENSNLTVVIAIIVISFFTILAISLKSNPRREPINQQDDREFLNRYQRYQNKVPDRQRLNDFTF >NC_019751.1|WP_041740352.1|2009215_2010940_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MPTPIFIKPTSIFVVSGGAKGITAACTIRLAQQYPCTFILLGRSELSDNEPEFARDCVDDATLKKRIMEQLIAQGEKPTPNSVQKIFNQITSNREIKATLAAIIKTGGKAEYLSVDITDSEKLKIKLAEISQRLGKITGIIHGAGNLADKLIEKKTSEDFEKVYTAKVQGLENLFNSIPSNQIEQLVLFSSVTGFYGNIGQSDYAIANEILNKSAHLVKTQHPNCHVVAINWGGWDSGMVTPQLKKEFARRGIEIIPVEAGTQMLVNELSPIHHNTAQVVIGSPMILPPAPLGTELRSHRVRRSLIGGDNPFLYDHKIAGNLILPATCAMSWIADTCERLYPGYRFFCATNFRVLKGISVSETDSTEYTVELQEISKIDGVEIQLQAKISSKLPNGKTTYHFASEPKLLVEIPQSPTYENLNLQTDNTITLQGSQFYQQNPSSLFHGKTFQQINRILNISPEKITAECHWASIGTKQQGQYPVDWMNPYATDLSTHPLWIWLYHYHQQICLPGQMEKYEQFERTPINTDYYVSCEIQQKTATGISANFIVHNQQGKIYSQLLGTKGVILPKLLE >NC_019751.1|WP_041739263.1|2004385_2009074_-|PfaB-family-protein MEKIAIIGYSCLLPDAKNPEEFWQNLIAQKDSTSPITTEELGIDPQTHYHPTKGKPDKYYSLKGTHIRDFKFDPKGYKLPPQLLNSLDNTSKWSLYAAKNALQHSGYLNNDPLLAHCGVILGTLSLPTRTSNQLLAPIYQQILNPAIRQLLETENFQLPAPSETSHHNAMISGMPAAIIAQALSLSSTHFCIDAACSSPQYAIRLASHYLWTHKADMMLAGGVSAADPLFLRMLFSGLQAYPEDNDISRPLDKTSRGLMTGEGTGMFVLKRYSDAVRDGDRIYATITGNGLSNDGKGKHLLSPNSKGQVLAFERAYAEAGINPKDIDYLECHATGTLLGDTTEFNSVETFFGQHQASPLVGSAKANVGHLLVGAGSVGLLKVILSMGKGVIPATINIGEPIGNETNVISPKKIVRSTTNWQKNGNIKRAAISAFGFGGTNAHMIVEEGGNQASHAEAPLEVAKIAVVGMDAYFGNCKNLDEFERSIYDGIQHFIPLPEKRWRGVEKETDLLKQYGLSEGKAPMGAYIQDFEFDMISSKIPPNELDKLNPQQLLLLKVAERALKDAEIQPGGKVAVIIAAETELSVHQLQQRWNLSWQVKDGLDVELAETSQLETILKDSIHNPVELGEFVSYISNIMASRISALWDFNAPTFTMTAGENSTFKALEVAQHLLTTGEAESVLVGAVDLAGGLENVLLRSQQTPMNTGTQTLSFDAKVHGLTVGEGAGAVVLQKYDPKATKKVYAVVDAIAFAQKHALGVADAGTIKQVSNHAFAVAGIKPDAVNYLEVSASGISQADTAEIQGLVQAYPGSENRLSCAVGSVKSNIGHTFTASGIASFIKTALCLYHRYIPGTPQWSGVKEQEQWHGSPFYVAPTSRPWLLSKHTTRRVAAINGIGADGSYAHLIVSEAEQQGERQSRYLQQMPLYLFPLAGDSKEELLTQLDALKSTVQNSTHLQNSASLSFTQFQQKATAKYTLVILGRNHKELLREMESAAKGVTNAFEKGEPWQTPIGSYFTPKPLGKTGEIAYVYPAAINAYVGIAQNIGRLYPQVHDDAMITSLYTAVDDIEKFLYPRSLNKLSTRQLENLEKELLDNSLAMFETEICIARLLTTIIRDRFQAKPKFAFGYSLGETSMMFAQGVWSDFNEGIKKFHASPLFGDRVSGQKNALREYWKLPSFAESPADDFWSTHVLIAKPEQVREAIKNETRVYLTQISTPEEVVIAGEPGGCQRVIKALGCNAFAAPFNHLIHCEAMQSEYNEIVRVNNLPAQPVGDIAFYSSAEYTPVALEGNAIAQSIGKCLTTPLDFPRLVNQIYSQGARIFIEAGAGNVCSRWIDKILENQEHVTVSLNRRGTDDHSSIVRALAKLTSHRVNLDLSSLYNCETATTKKTSYKTITLGGASITGAILTEDNKKLFQDVLKKQHSQAVIPQLPAKSLIPVSEVVNLPEITSQKTNEGDIFSTTKKPEQKLEKVTMKHDINNSYAAKEQLQFCELDVKQHQTPQLIPQSQQSHYPSTTLHFQKLSQNNSRVHKTHATFLQSRQDFSHSISEIIQLQIACAENLLNE >NC_019751.1|WP_015197376.1|2002464_2004132_-|PfaD-family-polyunsaturated-fatty-acid/polyketide-biosynthesis-protein MKTVDTVTNPRDNGLKFNTFSFYQNQVWKGSTDCISFDQNSIKEKLLNLNQPCYVVRVDGRIGIANGGYAAPQDDAKTGEVELITAVPPIKIQNLGDPNFLSFYGTKYAYMTGAMAGGIASAEMIIALGKAKLMGSFGAGGLTPSRLEAAINQIQSALINEPYCFNLIHSPNDLAIERRAVDLYLKYGVRVVEASAFLDLTPNIVYYRAAGLGLNSANEIEIRNKVIAKVSRREVATKFLQPAPIKILQDLVNQGLISELQANLAARLPVADDITVEADSGGHTDNRPLVCLLPSMLALRDEIQAKYQYEKPIRIGVAGGISNPQSALAGLMMGAAYIVTGSVNQSCVESGSCEHTKKLLAQAEMADMMMAPAADMFEMGVKLQVLKRGTMFPMRAQKLYELYRTYDSIDDIPMAEREKLEKQIFRQSLSEVWEGTVSYLSQTNPEKLAKAVNNPKLKMAAIFKWYLGLSSRWSSSGEKGREVDYQIWCGPAMGSFNEWVKGTYLEEANNRLVVDVANQIMSGAAYLYRVQSLRVQGLQIGDCYGQFYPQVSSLE >NC_019751.1|WP_015197375.1|2000751_2002263_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MVSPKKSMTAEEIQVWMAGKLAELLKVEVDEVDVNLPLEDYGLDSARAMVLVGQVEKKLGVELSPVLLWHYPTIAALSVRLAEDSEDVSDAKSTGVSVVKPLDISVDLGAEVVLDPSIYPAKNSFRFNGEPENVFVTGATGFLGGFIIYELLKQTSCDVYCLVRAANTEAGKIKLKKNLEQYAIWDDEFEPRIIPILGDLSQPLLGISQEGFEMLAANMDAIYHSAATLNYVYPYSALKTANVLGTQEVLRMACMIRVKPVHYVSSVAVFESSAYAGKIVKEDDAFEHWQGIFLGYSQTKWVAEKLVKAASDRGLPVTIHRPPLIGGDSQTGVCNGDDFINLMIKGCIQMGAFPDVDYKMDFSPVDYVSKAIVHLSRQKESLGKAFHLQHPQPVPLKELVEWISSFGFSVKSIPYKEWQQKLTEITDNSNPLYTLRPFLLERWSKEQLTIPDLYLQTQRPIISCQATLHALSGSGVSCPPIDSRLFMTYSAYLIQSGFLSFGS >NC_019751.1|WP_015197386.1|2026795_2027065_+|hypothetical-protein MLSHNADPHLLNLLMNADLEQINQALILRLVTENCGFKHRIDTLESQNEEILQKLDNLENIYNEIPYLRHLVDQNEELQNLVDFYCPPD >NC_019751.1|WP_015197387.1|2027326_2027773_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MNTPTIEKLKQLAQQIPEKIPYLKMLVLFGSRATGETHVNSDWDFAVLIDKAQQEIYTKDNAWGAFGLSMFIGEILNINPDKIDIVELNHCSWLIAHFVARDGILIFEKESSGFEYFRLTSLRPESELKKFRKEQHQLIEMQLKQWSI >NC_019751.1|WP_015197388.1|2027769_2028213_+|DUF86-domain-containing-protein MSKIDPEIVLARLRLITKYKNTLEEFRSININEFLAEFRQQLIVERLLQLMIQAAIDINDHILSRLNPGNSATNFEAFIELGKYEVITSELAKQLAPSGSLRNRLVHEYDDIDPNQVYQAIKFALQQYPLYVQQINAYLISLDTESS >NC_019751.1|WP_015197389.1|2028231_2029251_+|DUF1016-domain-containing-protein MNKPTSEEYINLLVEVKQRIRSAQYEALKAVNKELIALYWDIGKMIVTRQEGATWGKSVVEQLAKDLQNEFPGISGFSTANLWRMRLFYDTFANNEKLAPMVREIGWTHNLVILEKCKDDLEREFYIRMTRKFGWTKNVLIHQIENQTYEKTLLNQTNFNQTVSEEIRNQAKLAVKDEYTFDFLELADEHSERQLEQAILTRVEPFLKEMGGMFAFIGSQYRLEIDDEEYFIDILLYHRILKCLIAVELKIGKFLPEYIGKMQFYLAALDDKVRQPDENPSIGIILCKSKNKTIVEYALRESNKPIGVATYQIVSTVPQELINQLPEPEQVAKLLQGIE >NC_019751.1|WP_015197390.1|2029275_2032632_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas10d/Csc3 MAKKTKKSEESKQLSLFESGLDLNSEITDEADDNWLEGDFGFDGDSDRTIETKSELLTLKLLREAIKAQNPDDQVMADFGEYVLPNLLSIAIGVTAKGGKFFDEIDEKREAEGKAKVRRDNAADQSLNTHLLNGLFPANLIERRLHKLDTTVQRVVRERERRLVIAGFILHDFEKFPDVPNDCRKLPLEEHRQIIDEKVRQLGLDKFIDSENTEAYKEYIDDLLCMAYNAQRRWDTNWNFSEFGLNPLLKDRTLRSLSDLTCLADSLASIIKHPQDAENPRLNEIIHSLSDGKLKFTYHRISENRGVLTNVVNNALIQVHTKLNTDENIYYEPLLYLPTGVIYLARRDAPEISLDDVPNQVIENIKSLCSGQLKLRQTGFGRDGKGMKYAEYYNLFFDEIGLMKVALDATLRILNPNKDSVAKSRSDNLVKFQQQKVLSVDYDFKFTDDIRIDQIAEFGDLICRKIWDESANRIEVACKKDKNLPKLTQLDLTYKVAEFWELAEYLPQIREIQRINESLKENKLKGNTGGVPYEWYYLAAKFLEKHPGIENVRESCQQVIEYINNLISPIISQYELPDGWNDLRLWVKQVVMLPGNQETQTPDNFLNELANYNAAKKSGRGRQLICSISHSAYTVTEQMESAVLFTPQVYTNKQMLNGSNAKRNISSIAGLEMMLRQILMNQTQAVGKRFEDGKYRYLYFYPTYYFTPETNKFLQKAYTGISQTRFDTRIRNHFISKDLQANFDKDTYQNVDAFLIDENLDSDKDRTFKLSYPDDQPLTFYFMAMPPGRDSSDTESWVMPTWLAFAFPMILDVKTVVSESPIPPFNDGAEFEESVFLDSAPHAFRTLVGRDRFRLDYILEGWTENNKSYPAPLNVLTAAYAIHIDVNAKSGKSGYDANWGRFTELAKDFETTPLYVFAYLNRWVRSQGVETARIEKIRLYAHKFYPCFDPYAQYDFESKEWKLMPESQLNHPKKLTDLYRKFYRANKRYNPKSNAVLKPIDIAAETILKAEVSVFSGETLVAAVAAEVFKLMDRVHANTADGRWVMSKREEERQAVLDFARYFVMDVFENSFSSDRARLAGRQLNLIKDTCEFLYRLEDDKENANKDVKEEENDKNED >NC_019751.1|WP_015197391.1|2032745_2033771_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csc2 MSFLKTVDAKFFHSEIPYKPMGKYVHFLTVRVTESYPLFQTDSELNKARVRAGIVDKTTISRLSMFKRKQSTPERLVGRELLRNYGLMTAEECEYNVKFAMNNPDCIIYGFAIGDSGSEKSKVVVDTAFSIKSFDESHETFTLNAPFENGTMASKGENGSKVGEVTSRINQQDHIKPQVFFPSIVTLKDPTEASFLYVFNNILRTRHYGAQTTRTGRVRNELIGVIFADGEIVSNLRWTQAIYDQMKSNNTLNSPDPLNEDEVFVSAKVSISTLMEDEFIVHEDFLGDKFAALLKEVKAITANEEELKKMLKKADDEAKAYAKVHIKGKDKEKDKDKAAAK >NC_019751.1|WP_015197392.1|2033776_2034484_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas5/Csc1 MTIIYRCQIELHDSVYYATREIGRLYETEPIIHNYALCYALGLVDSEKYATTVSEEHSYRYFCPEQVPKYEEHLTPLNKQGIYVTPACSISHTSILNTWKYANNNYHVEMEKTQKNIPSFGRAKEIAPESVFEFLIISQNELKLPKWIRLGKWMSKAEVTVEKLPEPKTKTDLFICTHPLNPLDVMFTNQVISYDVINMPPVSLIQNVQMRGQYYYFENVKDVRLPVNISYRFRN >NC_019751.1|WP_015197393.1|2034943_2035783_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MPYSLILNILPQSTIYPNYLTGRHYHALFLSLISSVDRSLGDKLHDSTADKAFTLSPLQVSDRIHHNYPKKTPRSNLLQVNQNEPIPPGTPCWWRISLLDDTLFSKLTPLWLDINPKQPWLLGSADLFITSILATLRQTQPWANACSYHQLYEQASESDRILNFLFSTPVCFRQGSYDSCLPTRESVFNSLLRSWNKYAGLEFLESKLDTIFPNFFNIKTDIVSDSRSKFIGCIGEISYRIMGDIEPIEIKQLNTLADFAIYAGIGRKTTMGMGMVRRI >NC_019751.1|WP_015197394.1|2035825_2036416_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKNEEYIPIAALNQYTYCPHRCWRIHCAGEFTDNQYTIEGTSLHDRVHTVGEGNRDEIWQVRAIWLKSEQYKLIGKSDLIELENSGWLPVEYKRGKKGEWDNDELQVCAQALCLEEMTGKHIQTGYVYYAQTHQRQLIEINPELRRQTINTITDVTRLLVTGAMPQAIYSNRCKGCSLYEQCLPKATEKVGKYCED >NC_019751.1|WP_015197395.1|2036526_2037531_+|type-I-D-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGTVYVTQDDAFIGKVDERLHVRIEKKTILDVPLIKIDGLVVMGRASISPMAIMELIQNKIPLTFLTINGKYIARLEPEMSKNIFLRNAQWKAAGDSSQAIHVTKAFVRGKLKNYRYALLRLQRSYLEHDLSQSLIQLKQSIESLEKVNNIDSIRGYEGAGSAVYFGCFDKFIRVDNFSFKNRNRRPPVDPVNSLLSLGYSLLRHDIQSALNIVGFDPYLGYLHVERYGRPSLALDLMEEFRPLIVDAVVINSINKKILKPSDFITEPVSNAVSLTKEGLHTFLKLYQEKKQAKFKHPVLGIQKTYQESFEVQARLLGKYLMGEIDKYPPLIMK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_9 | 2038085-2039287 | TypeI-D |
I-D,II-B
Consensus repeat of NC_019751_9
|
16 spacers
spacers of NC_019751_9
>9.1|2038122|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATATACGCTCAATCATCATCATAATTTCCTTTT >9.2|2038194|40|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTTAAAGCAGGCGCTAGAATTAGCAGAAGCAAAATCAC >9.3|2038271|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAACCTTAAATCGGTTGCTATCAGCATATATT >9.4|2038342|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGTAGGAACTACCAACGAGTCGGAAATTTTAAA >9.5|2038414|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGCGAATGTGACCGAAGAATTGAGCGACGAACT >9.6|2038486|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAACTAAATCCCCAATCATCCTGTTTTGTTGTTGGGT >9.7|2038560|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGTCCTCAATAACTTTTGTAAATGCGGCTTTTT >9.8|2038631|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTGGTCGCTACCTGGCGCTGCGCGCCAGGTCA >9.9|2038702|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAAACCTTTTTAGGTCAAGCCGTTACAGGACTTA >9.10|2038775|38|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATGCGATCGCGCCAAATCTCAAAGTAGGATCTTCAC >9.11|2038850|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGCTTTGTACAACTTCAAGAAAAATCAAATAGTT >9.12|2038923|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGACGAAGGCAGCTTCGACGGATTACTAAGTGCATT >9.13|2038996|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCAGTTACTGTTCCCCTGCGAAAAGTCAACGTGGA >9.14|2039069|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAATATCTTGATCACATCCTCCACCAATAGCAG >9.15|2039140|39|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAGGTATGCAGCTATAGACCCGCTGCGTCCTCTGTTCC >9.16|2039216|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTATTCGATGAAATTTTCTGGGCTGAAGGTACT |
cas2,cas1,cas4,cas6,csc1gr5,csc2gr7,cas10d,PD-DExK |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_9
The CRISPR arrays of NC_019751_9 >merge|NC_019751|9|2038085-2039287|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACAGATATACGCTCAATCATCATCATAATTTCCTTTTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACATTTTAAAGCAGGCGCTAGAATTAGCAGAAGCAAAATCACGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTCAAACCTTAAATCGGTTGCTATCAGCATATATTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTAGTAGGAACTACCAACGAGTCGGAAATTTTAAAGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACTTAGCGAATGTGACCGAAGAATTGAGCGACGAACTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCAACTAAATCCCCAATCATCCTGTTTTGTTGTTGGGTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACGCGTCCTCAATAACTTTTGTAAATGCGGCTTTTTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTCTGGTCGCTACCTGGCGCTGCGCGCCAGGTCAGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTAAAACCTTTTTAGGTCAAGCCGTTACAGGACTTAGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACATATGCGATCGCGCCAAATCTCAAAGTAGGATCTTCACGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCAAGCTTTGTACAACTTCAAGAAAAATCAAATAGTTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACGGACGAAGGCAGCTTCGACGGATTACTAAGTGCATTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCGCAGTTACTGTTCCCCTGCGAAAAGTCAACGTGGAGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTAATATCTTGATCACATCCTCCACCAATAGCAGGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCGAGGTATGCAGCTATAGACCCGCTGCGTCCTCTGTTCCGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAACCTTTATTCGATGAAATTTTCTGGGCTGAAGGTACTGTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC >NC_019751|9|6|2038085-2039287|PILER-CR GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGATATACGCTCAATCATCATCATAATTTCCTTTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATTTTAAAGCAGGCGCTAGAATTAGCAGAAGCAAAATCAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TCAAACCTTAAATCGGTTGCTATCAGCATATATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAGTAGGAACTACCAACGAGTCGGAAATTTTAAA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TTAGCGAATGTGACCGAAGAATTGAGCGACGAACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAACTAAATCCCCAATCATCCTGTTTTGTTGTTGGGT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC GCGTCCTCAATAACTTTTGTAAATGCGGCTTTTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTCTGGTCGCTACCTGGCGCTGCGCGCCAGGTCA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAAAACCTTTTTAGGTCAAGCCGTTACAGGACTTA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATATGCGATCGCGCCAAATCTCAAAGTAGGATCTTCAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAAGCTTTGTACAACTTCAAGAAAAATCAAATAGTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC GGACGAAGGCAGCTTCGACGGATTACTAAGTGCATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CGCAGTTACTGTTCCCCTGCGAAAAGTCAACGTGGA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAATATCTTGATCACATCCTCCACCAATAGCAG GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CGAGGTATGCAGCTATAGACCCGCTGCGTCCTCTGTTCC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTTTATTCGATGAAATTTTCTGGGCTGAAGGTACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC >NC_019751|9|9|2038085-2039287|CRISPRCasFinder GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGATATACGCTCAATCATCATCATAATTTCCTTTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATTTTAAAGCAGGCGCTAGAATTAGCAGAAGCAAAATCAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TCAAACCTTAAATCGGTTGCTATCAGCATATATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAGTAGGAACTACCAACGAGTCGGAAATTTTAAA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TTAGCGAATGTGACCGAAGAATTGAGCGACGAACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAACTAAATCCCCAATCATCCTGTTTTGTTGTTGGGT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC GCGTCCTCAATAACTTTTGTAAATGCGGCTTTTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTCTGGTCGCTACCTGGCGCTGCGCGCCAGGTCA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAAAACCTTTTTAGGTCAAGCCGTTACAGGACTTA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATATGCGATCGCGCCAAATCTCAAAGTAGGATCTTCAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAAGCTTTGTACAACTTCAAGAAAAATCAAATAGTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC GGACGAAGGCAGCTTCGACGGATTACTAAGTGCATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CGCAGTTACTGTTCCCCTGCGAAAAGTCAACGTGGA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAATATCTTGATCACATCCTCCACCAATAGCAG GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CGAGGTATGCAGCTATAGACCCGCTGCGTCCTCTGTTCC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTTTATTCGATGAAATTTTCTGGGCTGAAGGTACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC >NC_019751|9|6|2038085-2039287|CRT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC AGATATACGCTCAATCATCATCATAATTTCCTTTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATTTTAAAGCAGGCGCTAGAATTAGCAGAAGCAAAATCAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TCAAACCTTAAATCGGTTGCTATCAGCATATATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAGTAGGAACTACCAACGAGTCGGAAATTTTAAA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC TTAGCGAATGTGACCGAAGAATTGAGCGACGAACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAACTAAATCCCCAATCATCCTGTTTTGTTGTTGGGT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC GCGTCCTCAATAACTTTTGTAAATGCGGCTTTTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTCTGGTCGCTACCTGGCGCTGCGCGCCAGGTCA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAAAACCTTTTTAGGTCAAGCCGTTACAGGACTTA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC ATATGCGATCGCGCCAAATCTCAAAGTAGGATCTTCAC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CAAGCTTTGTACAACTTCAAGAAAAATCAAATAGTT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC GGACGAAGGCAGCTTCGACGGATTACTAAGTGCATT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CGCAGTTACTGTTCCCCTGCGAAAAGTCAACGTGGA GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTAATATCTTGATCACATCCTCCACCAATAGCAG GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CGAGGTATGCAGCTATAGACCCGCTGCGTCCTCTGTTCC GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC CTTTATTCGATGAAATTTTCTGGGCTGAAGGTACT GTTCCTATAAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
>NC_019751.1|WP_015197396.1|2037552_2037825_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVVVSYDIPEDKRRTKIHNTLKSYGQWMQYSLFECDLTDTQYAKLRSRLSKLIKPQEDSVRFYFLCACCKGKVERIGGEMPRNDTMFFI >NC_019751.1|WP_015197395.1|2036526_2037531_+|type-I-D-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGTVYVTQDDAFIGKVDERLHVRIEKKTILDVPLIKIDGLVVMGRASISPMAIMELIQNKIPLTFLTINGKYIARLEPEMSKNIFLRNAQWKAAGDSSQAIHVTKAFVRGKLKNYRYALLRLQRSYLEHDLSQSLIQLKQSIESLEKVNNIDSIRGYEGAGSAVYFGCFDKFIRVDNFSFKNRNRRPPVDPVNSLLSLGYSLLRHDIQSALNIVGFDPYLGYLHVERYGRPSLALDLMEEFRPLIVDAVVINSINKKILKPSDFITEPVSNAVSLTKEGLHTFLKLYQEKKQAKFKHPVLGIQKTYQESFEVQARLLGKYLMGEIDKYPPLIMK >NC_019751.1|WP_015197394.1|2035825_2036416_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKNEEYIPIAALNQYTYCPHRCWRIHCAGEFTDNQYTIEGTSLHDRVHTVGEGNRDEIWQVRAIWLKSEQYKLIGKSDLIELENSGWLPVEYKRGKKGEWDNDELQVCAQALCLEEMTGKHIQTGYVYYAQTHQRQLIEINPELRRQTINTITDVTRLLVTGAMPQAIYSNRCKGCSLYEQCLPKATEKVGKYCED >NC_019751.1|WP_015197393.1|2034943_2035783_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MPYSLILNILPQSTIYPNYLTGRHYHALFLSLISSVDRSLGDKLHDSTADKAFTLSPLQVSDRIHHNYPKKTPRSNLLQVNQNEPIPPGTPCWWRISLLDDTLFSKLTPLWLDINPKQPWLLGSADLFITSILATLRQTQPWANACSYHQLYEQASESDRILNFLFSTPVCFRQGSYDSCLPTRESVFNSLLRSWNKYAGLEFLESKLDTIFPNFFNIKTDIVSDSRSKFIGCIGEISYRIMGDIEPIEIKQLNTLADFAIYAGIGRKTTMGMGMVRRI >NC_019751.1|WP_015197392.1|2033776_2034484_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas5/Csc1 MTIIYRCQIELHDSVYYATREIGRLYETEPIIHNYALCYALGLVDSEKYATTVSEEHSYRYFCPEQVPKYEEHLTPLNKQGIYVTPACSISHTSILNTWKYANNNYHVEMEKTQKNIPSFGRAKEIAPESVFEFLIISQNELKLPKWIRLGKWMSKAEVTVEKLPEPKTKTDLFICTHPLNPLDVMFTNQVISYDVINMPPVSLIQNVQMRGQYYYFENVKDVRLPVNISYRFRN >NC_019751.1|WP_015197391.1|2032745_2033771_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csc2 MSFLKTVDAKFFHSEIPYKPMGKYVHFLTVRVTESYPLFQTDSELNKARVRAGIVDKTTISRLSMFKRKQSTPERLVGRELLRNYGLMTAEECEYNVKFAMNNPDCIIYGFAIGDSGSEKSKVVVDTAFSIKSFDESHETFTLNAPFENGTMASKGENGSKVGEVTSRINQQDHIKPQVFFPSIVTLKDPTEASFLYVFNNILRTRHYGAQTTRTGRVRNELIGVIFADGEIVSNLRWTQAIYDQMKSNNTLNSPDPLNEDEVFVSAKVSISTLMEDEFIVHEDFLGDKFAALLKEVKAITANEEELKKMLKKADDEAKAYAKVHIKGKDKEKDKDKAAAK >NC_019751.1|WP_015197390.1|2029275_2032632_+|type-I-D-CRISPR-associated-protein-Cas10d/Csc3 MAKKTKKSEESKQLSLFESGLDLNSEITDEADDNWLEGDFGFDGDSDRTIETKSELLTLKLLREAIKAQNPDDQVMADFGEYVLPNLLSIAIGVTAKGGKFFDEIDEKREAEGKAKVRRDNAADQSLNTHLLNGLFPANLIERRLHKLDTTVQRVVRERERRLVIAGFILHDFEKFPDVPNDCRKLPLEEHRQIIDEKVRQLGLDKFIDSENTEAYKEYIDDLLCMAYNAQRRWDTNWNFSEFGLNPLLKDRTLRSLSDLTCLADSLASIIKHPQDAENPRLNEIIHSLSDGKLKFTYHRISENRGVLTNVVNNALIQVHTKLNTDENIYYEPLLYLPTGVIYLARRDAPEISLDDVPNQVIENIKSLCSGQLKLRQTGFGRDGKGMKYAEYYNLFFDEIGLMKVALDATLRILNPNKDSVAKSRSDNLVKFQQQKVLSVDYDFKFTDDIRIDQIAEFGDLICRKIWDESANRIEVACKKDKNLPKLTQLDLTYKVAEFWELAEYLPQIREIQRINESLKENKLKGNTGGVPYEWYYLAAKFLEKHPGIENVRESCQQVIEYINNLISPIISQYELPDGWNDLRLWVKQVVMLPGNQETQTPDNFLNELANYNAAKKSGRGRQLICSISHSAYTVTEQMESAVLFTPQVYTNKQMLNGSNAKRNISSIAGLEMMLRQILMNQTQAVGKRFEDGKYRYLYFYPTYYFTPETNKFLQKAYTGISQTRFDTRIRNHFISKDLQANFDKDTYQNVDAFLIDENLDSDKDRTFKLSYPDDQPLTFYFMAMPPGRDSSDTESWVMPTWLAFAFPMILDVKTVVSESPIPPFNDGAEFEESVFLDSAPHAFRTLVGRDRFRLDYILEGWTENNKSYPAPLNVLTAAYAIHIDVNAKSGKSGYDANWGRFTELAKDFETTPLYVFAYLNRWVRSQGVETARIEKIRLYAHKFYPCFDPYAQYDFESKEWKLMPESQLNHPKKLTDLYRKFYRANKRYNPKSNAVLKPIDIAAETILKAEVSVFSGETLVAAVAAEVFKLMDRVHANTADGRWVMSKREEERQAVLDFARYFVMDVFENSFSSDRARLAGRQLNLIKDTCEFLYRLEDDKENANKDVKEEENDKNED >NC_019751.1|WP_015197389.1|2028231_2029251_+|DUF1016-domain-containing-protein MNKPTSEEYINLLVEVKQRIRSAQYEALKAVNKELIALYWDIGKMIVTRQEGATWGKSVVEQLAKDLQNEFPGISGFSTANLWRMRLFYDTFANNEKLAPMVREIGWTHNLVILEKCKDDLEREFYIRMTRKFGWTKNVLIHQIENQTYEKTLLNQTNFNQTVSEEIRNQAKLAVKDEYTFDFLELADEHSERQLEQAILTRVEPFLKEMGGMFAFIGSQYRLEIDDEEYFIDILLYHRILKCLIAVELKIGKFLPEYIGKMQFYLAALDDKVRQPDENPSIGIILCKSKNKTIVEYALRESNKPIGVATYQIVSTVPQELINQLPEPEQVAKLLQGIE >NC_019751.1|WP_015197388.1|2027769_2028213_+|DUF86-domain-containing-protein MSKIDPEIVLARLRLITKYKNTLEEFRSININEFLAEFRQQLIVERLLQLMIQAAIDINDHILSRLNPGNSATNFEAFIELGKYEVITSELAKQLAPSGSLRNRLVHEYDDIDPNQVYQAIKFALQQYPLYVQQINAYLISLDTESS >NC_019751.1|WP_015197387.1|2027326_2027773_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MNTPTIEKLKQLAQQIPEKIPYLKMLVLFGSRATGETHVNSDWDFAVLIDKAQQEIYTKDNAWGAFGLSMFIGEILNINPDKIDIVELNHCSWLIAHFVARDGILIFEKESSGFEYFRLTSLRPESELKKFRKEQHQLIEMQLKQWSI >NC_019751.1|WP_015197397.1|2039319_2039853_-|beta-ketoacyl-synthase MSASWLNNALAQLEEHINNCEQAVIKHIEEKKRMSDKSVPVNPMNTKLQHNPIAIVGMASLLPQSRNMREYWENIIKKIDCITDIPDSHWNVDEYYDPNPRTPEDKTYCKRGGFIPYVDFNPMEFGLPPNILEVTDVSQLLSLVVAKEAMEDAGYGQNNEFNREKVGVVLGVASGKP >NC_019751.1|WP_015197398.1|2040308_2040587_-|hypothetical-protein MSFIKIQNIIINTSYIAAIKLDNITSSGENSVSVLIATPRFPLFQLESTSQNLYHQEWVEFTGQAAQALENYFTSFNNVIDLLPAHQQSTTI >NC_019751.1|WP_015197399.1|2041247_2042540_-|ParB-N-terminal-domain-containing-protein MSKVVALDIEQIRIGENRRPIKDAKVAELIQSIQANGLLNPITVDQKFNLVAGLHRLTACKLLGSKEIECNVINCSDADGARLAEIDENFVRSELEPLERYELWLERDRILERMGLRAKPGDNQYSRSGGEFISPPPKTTLELAQSLGYSERSFQQGKQIAKDIHPEVKREIVGSSLAKSRTIQLQIARAAAAERMAAEIAEKALELAIQAENHQEAEEQAQLATQARERQKQIQIETLQGAISRKGRRGEGKRGGGEEEGEGEEWVLGRHLVYCGDTASGDFIKKLPGHAALAIATLTQSPWRHDYLVKEARIVAVLRSAGNIYEFFNCQKMPFQYEFIIDDVYVGIFSQQSIPKPQGKINIGGVEGIISYLLGTYTQPNNYVIAPFMGNGEVLLGCDRMSRICFTGDKNPQLVKGGIERYQKFGNKRE >NC_019751.1|WP_015197400.1|2043480_2044689_+|ABC-exporter-membrane-fusion-protein MTLDSDRPFFKHKPLFPWHLLIAIPIVLGGIVSSSYGIYKYQFYIQKQSTEPIKITPTKIAVIALGKIVPQGEVTRLSPPSSLSGVRAEKILVKEGQIVKAGQVLAWLEGYKKTAAAVQQSVENVKVARAKLAQIQAGAKIGDINAQKAVISSLQAQLEGEISTQSATITRLAAQVENADAENQRYQMLLQQGAVSVSVADSKRLQMQTVEQELVEGRARLNRSTNILQDQLREARAKLASLSEVRPVDVQLAEAEVKSAIASLQQSQAEHELTYVTTPIAGKLLKVHSKTGEVIGSEGVAQIGKTSQMYVVAEVYQTDLEKVHIAQKAIITSTAFKGKIIGTVSDIGLQVERQSIVSINPSPDSDRRVVKVKIRIDNPQDSQRVSGLTNLQVDVAIQISNQ >NC_019751.1|WP_015197401.1|2044914_2045898_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MTTILITEIDGCIGLRAAEIAVAKGMKVKGILSNSDKVKDFDKSKIDIIVGNITKPDIAKQACQGVDIVLHTAEMAKEGGAIKAFREINVEGTKNIANAAKQAGVKTFVHLSTVLVYGFEYSDRITEAAPLNTQKNPYCQSKIEAEKAIIEYNHPPEFGVIVIRAGDVYGPESIPWIVRPVTLMRQNTFAYANEGKGVMNHLYVDNLIDAIFLAIEKQAYGETFNITDGQETSWKEYFTKLAEIAELTAPFSLPKDEMKLFLQIRHQGQKLFRKEADILPESVDFMTRPHAYSIIKAKDLLDYKPKVSLEEGLQLTKKWLQANVLNN >NC_019751.1|WP_015197403.1|2046000_2046999_+|glycosyltransferase-family-2-protein MKNKPRLSIGLPVYNGEKFLRPALDSLLNQTFQDFELIISDNASTDATEAICQEYADKDSRIRYYRNPDNVGCARNFNYVLELASCEYFKWVAYDDLHDSTFIEKCINILDQDPNLILCHSQVQFIDETGRYIQDYNIHIKANLPKAHQRFSELITKHLCYQCYGVIRTKILKNAPRMGSYGAADAIFLLRLALFGRFYEIPEYLFFARHHSQQSLSMFFPEYMSCVDKKPQKIANKLPDFYAYAEWFDTNNKGKLLFPHWRILGEYLRSAWMGKMEWYERLICYFNIIKKLSGTETLLIKDLIVAIGLIWQHIPRVSVSVKVEIRRPSVSI >NC_019751.1|WP_015197404.1|2047159_2049097_+|glycosyltransferase MQTTKPLKIVICTDYLGYGAVEGSFSGFQKVITDWISKSTSDPNIQIIVYCLGTEEKVYRAFNSVLFKQYKPHLSNRTILPLVSPHIFPFLLDIFPIHSKIIKDIIHEKPDVIHTFQTFGVTELAGFIAAKIMKMRKQQVTLINTVMCEIDTYAANYMRRVVISFYKIIDSSPFFKIVADSVDGGSYLVKSTNPSRQVRSVLYTISAASAYYLFLNLSLLGQIQDFLVKAVRFIYKLILQKKYPKFESEVKLAMNSIREPFILSRYREKNFSLFKLIAKPFQLVFDFLRRGDELGKQPGLAGILGNTLGVALKQQISLFVNQCDRVTISRHEDIGRYSIKSNIWEVPLGYDTAKFKVYQPNIDELIFKVEKSVAIGNLSAVNAKKLIDFISHPMRINQRCFIYVGRLSDEKNISLLLNACERLLHQDNLQNQVHFLFIGTGFAASEIASTLGSSATIIDFVPNYLLPDIYNFLRQNSGFFISASDTETYGITHGEAAACGLPLIGMERGSRGHFFCPGDKVGKLVIEDEEKIAKSITEIVIESGNNNLMVALNGLYVSDTSYGLGLSRLPVFDLSRILAQESLFVAMYMMALLPDSIYLSMSDCSANLSIHNQFSSDESWELMKYVYVNDWISYNFKLQQKKHIF >NC_019751.1|WP_015197405.1|2049304_2049766_+|DUF2141-domain-containing-protein MRFNLLPLLCLTFATTNAFYNPVLAQSTSNMTVVVNGIKSESGRVCFRVYSSDQGFPFSNKSEVQSGCVEKTGSVVKKQFVGLKPGNYAVTVIDDSNRDGKLNTDFLGIPQEGFGVSNNPTVSITTGTPKFSKASFSLNKNTVINIRMKYSLD >NC_019751.1|WP_015197406.1|2049900_2051154_+|glycosyltransferase MQKQPLRIAIITSLYAPFLTGVSVAVHQRVNWLLKQGHEVFLIHPEINDKFPQKVSNRPMPSIEENQAFPNFYSFAFPTEPLIFYKSLPQPLNHRHWSDTKLLENFKPDIIIVEEAPQLRGFYSLFLQGYGRPVGIDYARKTGTPIISLFHTDIVAYIRYYLGNQIFNLISLILPGIIKKFSEEYDANFFPSREELKKYQDLKSQRSEYLPYQGVDCQKFQPKNICYNPIPEDKRPTLLFVGRITAEKNVTQLIDIYPLVAAKIPDVHLVIIGSGPLDAEMRTRAEKYVPGITIWGESHGNELLGWYTRADLFVNPSLTENFCTANNEALASGTPVVAAKAPSTAEQVIVGKNGFLAEANDIVDFANKIVEILGNPQLKAEMSKQARLSILPFDWAACSQKFEDKLYEVVEAKKGSE >NC_019751.1|WP_015197407.1|2051629_2053012_+|amino-acid-permease MNKRKNYAVVQEATTTINSATAPKQSLAFLDAVALIVGIVIGAGIFQTPAFVAANAGSGINLLILWLLGGAISLVGALCYAELATTYPDVGGTYYYLKLAFGRSVAFLFAWARMTVIQSGSIVLLAFVFGDYFSALWQLGTYSPSIYAAIAIVLLTGLNILGLYPGKWTQNWLTVAKIVGLLLVVVIGVCSNAPLNPATLPTPSTSTNWGLAMVFVLLSFGGWNEAAYISADIKDGKRNIVRSLVWSIGIITVIYLLINFAYLRGLGLTTMAKSEAVAATLMDQTVGKTGSLFLSVLVAICTLGAINATILTGARSNYALGKDFSLFSFMGGWQQQKETPTQALLIQGVIALSLVFLGTITRNGFETMVEYTAPVFWFFFLLSAISLFILRRRDPHIPRPFRVPLYPWTPLLFCIICGYLLYSSLAYTSIGAIVGILVVGAGIPLWVWNGYRGKKYNLRS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_10 | 2237603-2237729 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_10
|
1 spacers
spacers of NC_019751_10
>10.1|2237643|47|NC_019751|CRISPRCasFinder TCCCCCAGAATTAGGTGTTTTAGTAGAACCACCAGCAGGTTTTGCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_10
The CRISPR arrays of NC_019751_10 >merge|NC_019751|10|2237603-2237729|CRISPRCasFinder TAACTGGTGTCACTACTGGTGTAACAGTGGGTGGTACTGTTCCCCCAGAATTAGGTGTTTTAGTAGAACCACCAGCAGGTTTTGCCATAACTGGTGTCACTACTGGTGTAACAGTGGGTGGTACTGT >NC_019751|10|10|2237603-2237729|CRISPRCasFinder TAACTGGTGTCACTACTGGTGTAACAGTGGGTGGTACTGT TCCCCCAGAATTAGGTGTTTTAGTAGAACCACCAGCAGGTTTTGCCA TAACTGGTGTCACTACTGGTGTAACAGTGGGTGGTACTGT
>NC_019751.1|WP_144051017.1|2235997_2236093_+|cytochrome-B6 MLGAILFVLFIGAFIGLAIGLLFGLRAVKLI >NC_019751.1|WP_015197560.1|2234771_2235869_-|3-dehydroquinate-synthase MASTITVSLPQQSYEIAIAPGSLSLLGGHLAKLNLGKKILVVSNPTVFPLYGESAIASLQEAGFDVFTCILPDGERYKNLEVLQKIYDVCLQNRLERSSTMVALGGGVIGDMTGFAAATWLRGINFVQVPTTLLAMVDSSIGGKTGVNHPQGKNLIGAFYQPQFVLIDPDVLKTLPVREFRAGMAEVIKYGVIWDRDFFAQMEASSHLDAMDNISPELMELILKRSCQAKADVVSQDEKESGIRAILNYGHTIGHAVESLTGYTEVVHGEGVGIGMVAAGKIAAELGMWTQAEVERQDSLIVKAGLPRKLPPGLDISQIVEALQIDKKVKAGKVRFILPTQIGNVTITDEVPADIILRVLAEMGN >NC_019751.1|WP_015197559.1|2234440_2234623_+|hypothetical-protein MLDGASVAIHPQAIEPWGIPQVWLKNKEPQPINRLRLKFNQGASTIYLSKAVPDISGKNS >NC_019751.1|WP_015197558.1|2232989_2233862_+|lipid-kinase MNERALLLINHHSRQGKQRSDEVVAYLQNLGLELFIESTDEPHHMTEMIHQYKHRVDLVIVGGGDGTLNAAIEGLLETKLPLGVLPLGTANDLARTLNIPNSLPAACNAIASGKIRYIDLGWVNGKHFFNVASLGLSVKITQRLTKQAKRRWGVLAYAATALKVIWESRPFSADIILQGRTISVKTVQIAVGNGRYYGGGMAVVFDANIDDQRLDLYSLEMKHWWQIIPLLPAMRDGKHIHWRNVRALEGQEFEVYTRKPRPINTDGEITTYTPAHFRVIPKAIAVFVPN >NC_019751.1|WP_015197557.1|2231181_2232912_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MVLHRVTDFVGEGFAVPDLLPGYYYEGVCPQTGVLLRLPRTALVESVARGLMADLAVDEGYAQKGKMFGVLLVELPSGEQRVLKAFSGLLNGCNLVEGWVPPIPGRESVVVDETETLVMLDAIKQELIRLRELPERLEYENLAREWEVTLQQMSVVHSDRKSQRSQERQAFAEDITVLTRLDYESRKDGTERRLLKRKIRGVLEPLELVIKAADARIQELKSQRRQLSRQLQVKMHAAYSVMNFYGMSQSLQKFMPHGLPTGTGDCCAPKLLNYAASNGFKPLAMAEFWWGAGTFTGKVSGEFYGACVERCQPMMGFLLSGLNEGRSQEAEGSHDEQIFSPVKNVRDFSTTPYSLLPTHLQVRKLEIAEISVIYEDEWLMVVNKPAGLLSVPGRYYDTQDSVVSRLQNVLPDGNKIASVHRLDGETSGILLLAKDTQTHRQLSGQFQGRKVKKVYEALLSGLLSSDRGTVELPLWGNPENRPYQQVNWEYGKPSVTNFEVIKREGNYTRINFYPLTGRTHQLRVHAADKAGLNIPILGDSLYGCDDGRRLHLHAKELCFGHPQSGENLCLQVETPF >NC_019751.1|WP_015197556.1|2229281_2230973_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-M MMADQFPWLTAIILLPLVGAFLIPLLPDKDGKYVRWYALGVGIADFILMCLAFWLNYDPNSTTFQMAESYSWLPQIGLSWSVSVDGLSFPLVLLAGFVTTLAIFSAWQVDRRPKLFYSLMLVLYAAQIGVFVAQDLLLFFIMWEVELIPVYLLICIWGGQKRRYAATKFLIYTAAASIFIIVAAIAMALYGGNDVTFDIVALKLKDYPLGLELFLYAGLLIAFGVKLAVFPLHTWLPDAHGEASSPVSMILAGVLLKMGGYGIIRLNLEMLPNAHIYFAPVLAILGVVNIIYGALNSFAQNNMKRRLAYSSISHMGFVLLGIASFTDLGINGAMLQMISHGLIASVLFFLAGITYDRTHTMMMEEMGGVGQAMPKVFALFTIGAMASLALPGMSGFAGELSVFLGITTSDIYSSTFCTVTIFLAAVGVILTPIYLLNLLRQVFYGNGKSLICDINNTTSTNLTDEEVACFGTDCLLPSQSIYRDASPREIFIAACFIVLIVGIGLYPKAAMGMYDAKTVAINTQVRQSYTQIAQTNPRVYANGFLNPQIIESEMPSVLGTLNQ >NC_019751.1|WP_015197555.1|2227984_2228791_+|dienelactone-hydrolase-family-protein MKRRDLLITSAAVASTSLIAKFGTDKTIAAQAVKGKTVTLAEGLEGYYVYPQGKKSAPAVMVFMEAFGLNSYIKEVCDRLARAGYAALAPDFYHGATYNYTDIQNAIAKLKTLNDDTVMSEVGKGLEFLAKRKEVTANKVGVMGFCMGGRYTFLANAVHADKFKGAVAFYGGGIDNPKDQLGRKSLLDQVAGMKAPIMLIYGAEDNLIPPDEHGRIATALSSAKKRYTLTVFPAAGHGFFSDRRDSYVAPAAKEAWQLTMSFFSENLK >NC_019751.1|WP_015197554.1|2227503_2227977_+|hypothetical-protein MLQRFAITSGLILTNILIVTPATWAESTEVQIHFSGVVPERTSVRISPTPNSELLSSLKIIKSPQGQRSTTLHFDSTQPSNIIVSPPEFVSGSHPEPRGTVHTSLLKFEQDSSDTSGKNFTTIPAGKVDLQLQTLVKAPQDLPPGIYNYRATLTIVP >NC_019751.1|WP_015197553.1|2226866_2227142_+|MoaD/ThiS-family-protein MTIKVLVPTALQKFTNNQATLECSGTNIDEMINSLEDVCPGIKARLCDEAGKPRRFLNLYVNSEDIRFLDGTSTPLKDGDEVSIVPAVAGG >NC_019751.1|WP_015197552.1|2225480_2226785_+|threonine-synthase MTQAIAKQAHVNTGNFKALKCKECGAEYEPKALHVCELCFGPLEVKYDYSNLRLSVTRESIQAGPNSIWRYRDFLPVATDNYIDVGTGMTPLVKSNRLARRLGLKNLYIKNDAVNMPTLSFKDRVVSVALSRARELGFTTVSCASTGNLANSTAAIAAYAGLDCCVFIPSDLEAGKVLGSLVYSPTLMAVKGNYDQVNRLCSEVANTHGWGFVNINLRPYYSEGSKTLGFEVAEQLGWKLPDHVVAPLASGSLFTKIYKGFQEFVEVGLVEDKKVRFSGAQAEGCSPIAEAFKEGRDFIKPVKPNTIAKSLAIGNPADGVYAVELAQKTGGNIESVTDAEIIEAIKLLAETEGIFTETAGGTTVAVLKKLVEAGKIDPDETTVVYITGNGLKTQEAVQGYIGEPFTIDAKLDSFESALERSRTLDRLEWQQVLV >NC_019751.1|WP_015197562.1|2238496_2240071_-|circadian-clock-protein-KaiC MSDNDLPSQQNTNLPSPKVGGVEKIRTMIEGFDDISHGGLPIGRTTLVSGTSGTGKTLFSLQFLYNGIHEFNEAGVFVTFEESPSDIIKNAYIFGWDLQRLIEEGKLFIVDASPDPEGQDIIGSFDLSALIERLQYAIRKYKATRVSIDSITAVFQQYEAVGVVRREIFRLVARLKQLYVTTIITTERSEEYGPVASFGVEEFVSDNVVIVRNVLEGERRRRTIEILKLRGTTHMKGEYPFTITNDGVNIFPLGAMRLTQRSSNIRVSSGVEALDVMCGGGFFKDSIILATGATGTGKTLLVSKFIQTGCTGSERAILFAYEESRAQLSRNASSWGINFEELEEQGLLKIICTYPESTGLEDHLQIIKSEIAEFKPSRIAIDSLSALARGVGNNAFRQFVIGVTGYAKQEEITGFFTNTSDQFMGSHSITDSHISTITDTIIMLQYVEIRGEMSRAINVFKMRGSWHDKGIREYNITAEGPEIKDSFRNYERIVSGAPTRVAVDEKAELSRIVQGIQEKSDTNS >NC_019751.1|WP_015197563.1|2240366_2240690_-|circadian-clock-protein-KaiB MDKVRKTYVLKLYVAGNTANSVRALKTLKNILETEFQGVYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEELSDDNYFEENT >NC_019751.1|WP_015197564.1|2240797_2241130_-|KaiA-family-protein MTSAEQQVLLKQIKLDYRQILIIYFAPDKTLQDRIDKLVETLFRANIPVPRIIEIHMELIDEFSIQLKLEGRTNETLLDYRLTLIDLLANLCEAYRRSVSQSSQIQHNLQ >NC_019751.1|WP_158333136.1|2242493_2242640_+|hypothetical-protein MELKHQNNVGITTSKLVKHKVGVFPQAGSDGWELPLRGQLDCEHQLVY >NC_019751.1|WP_015197565.1|2242908_2246325_+|response-regulator MLHYSLYEFILSLPSCQGTLRLATILEMFEQTQCDRIIVLNEENIPIGLLNSACLLRKLLLLPEVDLQQQLGNLLNGSLNGEFIEPIQVISAKTKFEDFCQILKQEHSDHKNHHDLNWIVVDDADNRLLGVLDSLRILKYISQQTITKQQPQRKKQLSTAKSSPSQRQKAKLPTPALNVPSKVSSSHQSPHQHPLIQLLERLPWPLMLQTTSGEVVTQNPAWWQQLGMLKDPEGIRQEVEMVLSPFSRQQQEYTPDLVPQASQSVGSSTKVAPSSSPQVSRTKRATKSQKVKPVEVNAPGRCFLDNELGTCTCVVEVQSGQERVWQFAKIPLDSPESKAYGIDYETTFTPAEAILHANLWLMLATDVTEKQQLCKELAAKNADLIQLNRLKDEFLACISHELKTPLTSVLGLSRLLVEQQLGELNERQARYAGLIHQSGRHLMTVVNDILDLTRMETGQMELTPATVNIQVVCDRAIAEAKTIHQQSSKAPIGSSSNSPTHQFTLNIQPGLEEIVADELRLRQMLVHLFSNALKFTETGGKIGLKISRWEGWIAFTIWDTGIGIPEHQQHLIFQKFQQLENPLTRQFEGTGLGLVLTRALARLHGGDVSFLSREGKGSQFTLLLPPTPAKNSFTDQQVRRWSAFNDSNISNQNNTVNSSKNAGLFRETSKPSQNNNDVFWDENEDLILHGKVPLSQSVPNSNSSQRLVLVVEAVGRYIEDLTEQLTGLGYRVVIARSGCEAVEKARRLQPKAIFLNPLLPLLSGWDVLTLLKSDSATRGIKVIVTATAAEKEQAFTNRADSFLSLPVQHQMLAPTLEALQSLSEPKKSGKDQRETITTNNPLRILRLVEPDMESNSQPFLCEHRIIEVDDFEQADVLSKVWEFDVILLDAENQTALNFLEKIAKRPRLSGIPLVTCTVETTQAASQIEGLSVFPCLASSENEHISDVGKTEALLSVLQIAAGVCCPPSILVVDLTVLPDLPKAKRGNLRKNVELELFPGLQPLTVSHGCEWFQALIQYLQTAGLKSSMARSWAELLQQIRHRSIDLLLVCLSESTDEKQIHSAITALSKLPFKLPPVLVLDRRVSDEEPLTLSESMQVAISSLTSKDDNPFDSQTQVLPRSTSMEELLNRINLGLKGY >NC_019751.1|WP_015197566.1|2246381_2248151_-|glycosyltransferase-family-39-protein MKNRGFEQFFRELDKRPVLAVMLSVLWLAVFGGIGFFLNLGSVGLVDETEPLFAEASRQMLVRGDWITPFFNNQTRFDKPALIYWCQAIAYSILGVNEWAVRLPSAIAAMVVVGLSFYVLQWYQLQRDNLTGISSPTKRWVTAAFCGAVICFTPEMIIWGRTGVSDMLLTGCIASGLFCFFLGYATSPEENRKKTNWYMFFYIFVAGAILTKGPVGIVLPGLIIAAFLLYVGKLREVMGEMHLILGTLTILVLAAPWYILVTWRNGWSFINSFFLYHNVERFTSVVNRHSAPWYFYFLVVLLLFAPYSVYLPIAIARLKFWRRSWWSSQTRSHQLPLFAVFWFLGVFGFFTVSITKLPSYVLPLMPAAAILIALLWAELLPNSSDAPNYFWLRVSGWVNVAFIITLGVVLFYVPQMLGSDPALPNFGEALQKSNLTTIGGVIWLVCGLILAFFVIRRQWVTILGVNLAAFSLFLLIVITPALFLLDEQRQLPLRQLSAIALQNKQPQDELVMVGFKKPSVVFYTGRSVNYIRTTPGGKDYINSKTTNQLASLLLITQSPKIPQMGLQPKDYTSLGKSGVYELVRLGKKQ >NC_019751.1|WP_015197567.1|2248409_2248916_-|DUF29-domain-containing-protein MQIPETNPQMANIPMSAPSLYETDFYGWTQQQVDLIRKQQWNQIEWQNVIEEIESLGKQQRQELRNRLSVLVGHLLKWQFQPQCRSRSWLATLRIQRRDTLRLLQDNPSLKSYLDDGLVEAYENARDLAMGETDLPEETFPLECPYDLEDIFSNSFYPGEPSELVNRQ >NC_019751.1|WP_015197568.1|2249078_2249255_+|hypothetical-protein MTTNKLPKKKDEKTPIPQHPLAKLAGKFEGEFWEDTILEIQKFRELEKQDINNILDSK >NC_019751.1|WP_015197569.1|2249406_2250147_+|creatininase-family-protein MRLHLSTWQEVETYLETSKGIIIPIGSTEQHGPTGLIGTDAICAEAVAYGVGEATHAIVAPTINVGMALHHIAFPGTISLRPSTMIKVISEQITCLAKVGFNKFYFINGHGGNIATLKAAFSETYAELEDLQIANATQVECQVANWFMCGSVYKLAKELYGDEEGSHATPSEVALTQYIYPEAIKKAPLSEEVGKGHNIYGAKNFRQRYPDGRMGSNPALATPEHGKMFYDAAVKELSQGYLEFVG >NC_019751.1|WP_015197570.1|2250157_2251117_+|LD-carboxypeptidase MQAKISNCEPQIKSQIMIPPALQPGDLLRVIAPSGALRELDTFSRGVEVWRSRGYTIEVIPQIDDRWGYLAGTDDKRRFHLQTAWEDPECKGILCARGGFGCTRILEDWDWNRLKNPSSTPTLTPKWLIGFSDITALLWSLHQVGISGVHGAVLTTLAAEAEWSQQRLFDWVEGKEIPPLQGNGWGGGIVDGVLLPGNLTVATHLLGTKYQPNFDDVILAIEDVSEAPYRIDRMLTQWRMSGVLAKVRGIAIGRFSQCEPPANIPSFNVMEVLRDRLSDLNIPIVSDLPFGHDGNNAALPVGVMAKLDANQGTLAIQKN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_11 | 2712338-2712432 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_11
|
1 spacers
spacers of NC_019751_11
>11.1|2712361|49|NC_019751|CRISPRCasFinder CCAACAAACCCAGTAAAATAAGCTATCTGTCACCACAAGCGAACGACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_11
The CRISPR arrays of NC_019751_11 >merge|NC_019751|11|2712338-2712432|CRISPRCasFinder TCGTCGCGCAAGCTTCGCACTCTCCAACAAACCCAGTAAAATAAGCTATCTGTCACCACAAGCGAACGACTTACGTCGCGCAAGCTTCGCACTCT >NC_019751|11|11|2712338-2712432|CRISPRCasFinder TCGTCGCGCAAGCTTCGCACTCT CCAACAAACCCAGTAAAATAAGCTATCTGTCACCACAAGCGAACGACTT ACGTCGCGCAAGCTTCGCACTCT
>NC_019751.1|WP_015197931.1|2712079_2712304_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MTRIRRMGADEVERILQSYGFELISQKGSHRKWRNDDRQLQVIVPYHKGRDLPIGTLRNIMIGADIPELEWKTD >NC_019751.1|WP_015197930.1|2711879_2712083_+|HicB-family-protein MKWRVVLEPDPETGEWAVWCPELPGCTSAGDTEEEALENIREAIQLYLETDSIKLAPGAIFREVMVG >NC_019751.1|WP_144051032.1|2711368_2711635_+|hypothetical-protein MRSHYVVQARTSFSNKRSHSKPKHQKPSFSPTSERLTSRKLRITTQTTKNRHSHQQTINLWFLSAIALSNQPSKPHFTPNSKTLSVIA >NC_019751.1|WP_015197929.1|2710906_2711257_-|hypothetical-protein MPVSEDLFVIVERIINHHESAEDLETLRRLIGTNSSQESLQIGKYGVNVGQGQDIHIGDKIYQGTDAETIREIIAPLIRELQLRESVPSQKAANAVKYSNIYPIQVSVILLDAAKN >NC_019751.1|WP_083866307.1|2708573_2711003_-|tetratricopeptide-repeat-protein MSTESKSCKCSQIFKYIPHTGVSHFVGRSKELTKIHEKLHQQNAVVISAVAGMGGVGKTELVIKYALEHEADYPGGICWLSARDANLAAGIIQFVQLHMGLKVPQKDFHENPLTLNQQVGWCWQNWQPLLGLVLVVFDDVTNLENLSELLPTNNRFRVLMTTRLRNLNPKIEEIPLDVLSPNESLEFLINLVGKKKVNKELATAKELSQWLGYLPLGIELVGRHLVKKPPHWTLAQILEQLQQQRIHYRATIPQEKVLSPVQTAVLAAFELSWVELNPTTQKIAVLLSLFAGDIFVWKWVESTAKLLNWHQADVELAIEQLYQRHLVQCVEEKNTCYYKIHPLIREFLQIKSIEISENSELKQAFSSTFVEIARSIPYPLTLNIINSVKNAIPHLTEVAENLIDAVGNENLYWTFTGLARFYGEQGLYGLAETWYQRCVSAIKSRLGEKHPDFAGSLNNLARIYISQGKYETAESLCLEALELRKQLLGENHPYFATSLSSLAELYKSQGKYEAAEPLFIQVLDLLKKQNHPCFAASLSSLAGLYKSQGKYELAEILYLKVLDLEKHQWDRNDRNVVASLDSLAELYRSQERYTEAEPIYIESLELGRRLLGEQHPINAIVLNNLALLKYDQGYYEEAEKFALQSLELDKLLLGEEHPDFATDIHNLALIYRAQNRYREAEELFLKSLEIKTNTLVKGHPLIADTIYALGFMYRLQERYIEAEPLCLRALELDKYIWGENHLNVVRSLDNLAELYCQLQRYEEAEFLYQQALGIIDRILEPNHPKTIAIREKLESLRTQQQENQNRHQN >NC_019751.1|WP_015197927.1|2708211_2708457_-|hypothetical-protein MTLIKKSEQQLLLKIKKIEDEEQNIQPDAKDISEVREEQTQVNIESNYIPARDNPIVQSIGNSGWQISDIWRDIRVDNFSD >NC_019751.1|WP_015197926.1|2707819_2708185_+|hypothetical-protein MQCREKEIHIKKIPRWFAKFILRSQYNPNNQQIFFTLLEPMTPQEWCLIWIPVIHPGIELPCDGERNPTGYMKACLTTLSTLTGYHERTVEGWFYGKPYHYSVEILLRCFHLIFTLQQYLN >NC_019751.1|WP_015197925.1|2706310_2707723_+|hypothetical-protein MNATAPFSLAYSFDYDRFTKPDLQAKAKSTLGNFFGFVRQTFDGLIEIGRSLQDFYFDCLAFCPNGKKVFSEWLASPDFGASRYIASSAMDIYAWFDKLPVRSQKLIRQNVQNWSVSALRQLTKVSHDLVKELVLEGKKTAAQVKHEGGSERAREKEEKQASSEEISRTPSVPTPELARGMRIVVKEENTGWNGHSGIIMSKREDDFWVLLDHTVSQGMEIKHLLKTHQIQLEAQQSVTKPASKELFTDAQVEQKITDALAQREREKAESEQGRFVEIRDAALQAAKREIQAAQEYANALEQAKHKLIEQLASKDLEVRSLHVLQTRNQQLEQRVAELEKALENSSANNWGNTFNNQAAKAVNSELEKTIQPLMSEVERLQNLVRSQQQELAQIQTSDTPEGSGYRQRSASDAVLAEFGEIGERFGWSGWSRRGYRAASGMLSTGISAIAAFIADLKQSSPSYQQQEITF >NC_019751.1|WP_015197923.1|2703533_2705702_+|S8-family-serine-peptidase MKRLLSSLVLAGCFLTSTSLPLIPHQYRELAQAQTADELFYTFYGQKIPLNLKRDRVAVSFKPTTNSRSSRSTQPLYLQLQQDLRRGGGNSRSVSSGNGFDIDVKPLGDNIALVNLPTGSRSSLNSIQQRIQNQSYVKETLPILTRKSGEASKEKESEQVIVLPNEIAIAFDRDMSESQRQMVLLRHNLEVVRPLRFSKNRYLVRSKSVSGTEILNLANQLAQVTGVQSATPNFIQATSYQQSQLLANLANLPETPNAAQRLEQQLAQLPQPKDTPVSAKLLPLQWHLNSTPKRGQLLARTDVRATEAWKHSNGGRGTVVAVIDSLIQWDHPDLVKNIYKSGNHPDKLPGEEYGWDFSSSGQGDADTRLSSQELSQIQAEWQNTFKLPSDQLLKKYQQFADVFKKRNPKASPGEIAHQIRNLIRNQISSEFHGTWSAGVIAANSPDKAGVLGVAPNTQILPVRVFALGGAINSASLGEAIGYAASRNVDVINMSLGGLLPDEGLTEQIFDVLDNNRNLVIIASAGNENLDGVAFPAGIPGVLSVGATNMTGNRTFYSSYGGGLDLVAPGGEIQNGMSGGILTTGGTWLDGFWQGISVPDNSWGVALDPVGKYVQVQGTSFSAPIVSGVVALMKGEDPKRRLSREEMVSILKKTATYDGLNLSSSDVNRYRLQKEVGFGTVIDAPISRPSGIFAKAKPVSAQEYFFGKGLVNADAAVESVRKR >NC_019751.1|WP_015197922.1|2701903_2703304_-|hypothetical-protein MGNASRYWKLVRIDGGGNRKILEIPTARSFFTQLFGELTDDAPDGDIQRQLMDLYRDSSGESTLLAERCLLCFISGILEQGCLKLTRRFGEKYNFHCNELLPFVLEDDGKLLPAINYQCFSRQILQSFDATQGSLTTWASIKVKQHPELNHFLLERGVYLISNWAILNDTQPQQLQRILKDFHTLGELEIQEAQYLLQGYHTIYRVQRLENIRNKIRSKCIEPTYQQLEDIAIYIKNQTGRLFDNETVRVKLTKLANQLREYRIYVRGGSLPIDSLDASFTDKSNSLLDNVSAPASENSEISDEQSEFLDFYRHQIQVSLQSALTKVTESRVKKLKKKGDKARIFLTALELSQCQKLAMNEIAEQLGMRAQYTVTKLLKLKELRTDVQQEMLIILKDSVKEQAKKYAGVEALNKLDEQLTIFLSSEISKIIENAESQSRTAKNYLKTDIFAQRLCEYLDMRKQVNN >NC_019751.1|WP_144051111.1|2712853_2714986_-|tetratricopeptide-repeat-protein MIERILSHQHTEADLVLLRQAISASSSQGTLQIGKYNVNIGEGKDVHIGDKVYHGADAEAIREIIKEILPSQKAATAVKYIPYTGVRNFVGRSDELVKIHEKLYQQQNTVAISAVSGMGGIGKTELAVKYAREHENYYPGGICWFSVRDRNLAAEIIQFTQLYLNLEVPQKDARENPLDIHQQVAWCWQNWQPPEGLVLVVLDDVTDLKDIKEFLPKTNNRFRILITTRQRRLDINYAEISLDVLSPEEALSLLKGILGENDRRVDREIEIANSLCKWLGYLPLGLELIGRYLVEDPDLSITEMLQALREERLKNEAISPSFEDLENTEITAKLGVRDAFNLTWEKLDPKTKRVGELLSLFSPDEIAWEYVESVSKSLSWEKKEVNEAKKQLYKRHLIERLESVEANYKIHPLIREFLRDKLGELEEVNEFKQAFTSTFMEIAQTIPQSPTLEFIDSVKTAIPHLTEVAENLLDAVSDENLIWAFTGLAWYYNGQGLYALAAPWYQGCVSAVRLRLGENHPHVAQSLNNLAYLYSSQGRCEAAEPLYIQALELYKQLLGENHPDVATSLNNLAGLYRSQGRYEAAEPLYIQALELRKQLLGENHPDVAQSLNNLALLYNSQGRYEAAEPLYIQALELYKQLLGENHPSYATSLNNLALLYCSQGRYEAAEPLYIQALEIAERVLDVNHPNTLTCRGNLEYLRTQQRESGG >NC_019751.1|WP_015197933.1|2715183_2716182_+|IS630-family-transposase MFFIKEINPLSLKLLERIYRQSRHHQVRQRAHFLILASQGVKVDELMRIFSVSYKTIYNWQNRWESEGMVGLYNKPGRGSKKIFERSQEEEIREWARLEPRQIKRVLQKVKEEWDVVVSAETIKRILKRLSMSWHRMRRDVFGKPDPLEYKDKKEKLSELKRLEDEGKINLYYLDEAGFCLIPTVPYGWQNIGEYLKIKSRRSPRLNVLGIMSRKNHLETYVSSQTINSDVVVACIDTFFPTVNKPTYIVADRASIHTSDIVLDKIEEWKERGITIFELPSYSPDLNLIEILWRFIKYQWIEIDAYSSWQTFVTSLEKILREFGQNYVINFD >NC_019751.1|WP_083866366.1|2716543_2718955_+|NACHT-domain-containing-protein MLSEQQRLTTNPLTSGEGISHRTTQVYVPLGLVERKKQTRRKEDVSPEQGSELYRETEITQTFEYQQFLQQVLKQRQSPKSQGKRIAIIGEPGAGKTTLLQQIASWVSGEIPDAIVIWISLADLQGQELEVYLFDKWLQAVARKVGQAEASTQVKDDFVAQFNRGLVWLLLDGVDEMQATQGNPLGECDRQLRAGSLLQQARIVLSCRLNLWDGGSNSLDSFDNYRTLEFSYPQQVEQFIGNWFASLPSAETQIGERLCAALAESGKERIRDLAKNPLRLTLLCFNWYLGEGKLPETKAGLYEQFVADFYEWKKGQFATTGEQRKRLNTALGELAREAIEKEATRFRLRQDFVCEYLGEPDDADSLFGLALRLGWLNKVGVDGDNPRKGVYGFFHPTFQEYFAALAIDDWHYFLNHIPDNPSHPNASYRIFEQQCREIFFLWIGFPQNNFLPAIEALMSFEDACKSWNISVKSFYEHQAYMIVIYCLMEIGIRKQYKEIFKEIVNYILNLFGEQKQHNYWLFLSDAVFPILDDLYTKNILQELFNLVNDQKTIGKTKQIILICREKQLREQNKIILKQNNVLDIITEIDKLIIKSNPGESITYRLSQLIELISKNNVLLIQALIKILNYEHPRHIKLKTIIALGLASHENLDAIAALNKEIESSPDLIYLFYTTKTLVAINPRNREAILLLRELMPTLHIYMQIEACELLMNDEEIAYDLFIKLIELIQSDPDDEVYYRACQTLKANINTDILYYSLLISKLRDCLTNKIYEDEFFRFRDCYELLWCYSQELSYKAFYEAWFQ >NC_019751.1|WP_015197935.1|2719104_2720304_-|IS4-family-transposase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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NC_019751_12 | 2712512-2712723 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_12
|
2 spacers
spacers of NC_019751_12
>12.1|2712560|45|NC_019751|PILER-CR TTACGTCGCGCAAGCTAGAACTTCGTTCAGCTACGCTAACGCACT >12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR ACGACTTTCGTCGCGCAAGCTTCGCATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_12
The CRISPR arrays of NC_019751_12 >merge|NC_019751|12|2712512-2712723|PILER-CR CCATCCCAAAGTAGCTAAAATCGTCATTCTCAGCAACAAGCGATCGCATTACGTCGCGCAAGCTAGAACTTCGTTCAGCTACGCTAACGCACTCCAATTCAAAACACCAAAAACCGTCATTCTCAGTAATAAGCGAACGACTTTCGTCGCGCAAGCTTCGCATCTCAACCCAAAACACCAAAAACCGTCATTCTCAGCAACAAGCGATCGCA >NC_019751|12|7|2712512-2712723|PILER-CR CCATCCCAAAGTAGCTAAAATCGTCATTCTCAGCAACAAGCGATCGCA TTACGTCGCGCAAGCTAGAACTTCGTTCAGCTACGCTAACGCACT CCAATTCAAAACACCAAAAACCGTCATTCTCAGTAATAAGCGAACGAC TTTCGTCGCGCAAGCTTCGCATCTCAAC CCAAAACACCAAAAACCGTCATTCTCAGCAACAAGCGATCGCA
>NC_019751.1|WP_015197931.1|2712079_2712304_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MTRIRRMGADEVERILQSYGFELISQKGSHRKWRNDDRQLQVIVPYHKGRDLPIGTLRNIMIGADIPELEWKTD >NC_019751.1|WP_015197930.1|2711879_2712083_+|HicB-family-protein MKWRVVLEPDPETGEWAVWCPELPGCTSAGDTEEEALENIREAIQLYLETDSIKLAPGAIFREVMVG >NC_019751.1|WP_144051032.1|2711368_2711635_+|hypothetical-protein MRSHYVVQARTSFSNKRSHSKPKHQKPSFSPTSERLTSRKLRITTQTTKNRHSHQQTINLWFLSAIALSNQPSKPHFTPNSKTLSVIA >NC_019751.1|WP_015197929.1|2710906_2711257_-|hypothetical-protein MPVSEDLFVIVERIINHHESAEDLETLRRLIGTNSSQESLQIGKYGVNVGQGQDIHIGDKIYQGTDAETIREIIAPLIRELQLRESVPSQKAANAVKYSNIYPIQVSVILLDAAKN >NC_019751.1|WP_083866307.1|2708573_2711003_-|tetratricopeptide-repeat-protein MSTESKSCKCSQIFKYIPHTGVSHFVGRSKELTKIHEKLHQQNAVVISAVAGMGGVGKTELVIKYALEHEADYPGGICWLSARDANLAAGIIQFVQLHMGLKVPQKDFHENPLTLNQQVGWCWQNWQPLLGLVLVVFDDVTNLENLSELLPTNNRFRVLMTTRLRNLNPKIEEIPLDVLSPNESLEFLINLVGKKKVNKELATAKELSQWLGYLPLGIELVGRHLVKKPPHWTLAQILEQLQQQRIHYRATIPQEKVLSPVQTAVLAAFELSWVELNPTTQKIAVLLSLFAGDIFVWKWVESTAKLLNWHQADVELAIEQLYQRHLVQCVEEKNTCYYKIHPLIREFLQIKSIEISENSELKQAFSSTFVEIARSIPYPLTLNIINSVKNAIPHLTEVAENLIDAVGNENLYWTFTGLARFYGEQGLYGLAETWYQRCVSAIKSRLGEKHPDFAGSLNNLARIYISQGKYETAESLCLEALELRKQLLGENHPYFATSLSSLAELYKSQGKYEAAEPLFIQVLDLLKKQNHPCFAASLSSLAGLYKSQGKYELAEILYLKVLDLEKHQWDRNDRNVVASLDSLAELYRSQERYTEAEPIYIESLELGRRLLGEQHPINAIVLNNLALLKYDQGYYEEAEKFALQSLELDKLLLGEEHPDFATDIHNLALIYRAQNRYREAEELFLKSLEIKTNTLVKGHPLIADTIYALGFMYRLQERYIEAEPLCLRALELDKYIWGENHLNVVRSLDNLAELYCQLQRYEEAEFLYQQALGIIDRILEPNHPKTIAIREKLESLRTQQQENQNRHQN >NC_019751.1|WP_015197927.1|2708211_2708457_-|hypothetical-protein MTLIKKSEQQLLLKIKKIEDEEQNIQPDAKDISEVREEQTQVNIESNYIPARDNPIVQSIGNSGWQISDIWRDIRVDNFSD >NC_019751.1|WP_015197926.1|2707819_2708185_+|hypothetical-protein MQCREKEIHIKKIPRWFAKFILRSQYNPNNQQIFFTLLEPMTPQEWCLIWIPVIHPGIELPCDGERNPTGYMKACLTTLSTLTGYHERTVEGWFYGKPYHYSVEILLRCFHLIFTLQQYLN >NC_019751.1|WP_015197925.1|2706310_2707723_+|hypothetical-protein MNATAPFSLAYSFDYDRFTKPDLQAKAKSTLGNFFGFVRQTFDGLIEIGRSLQDFYFDCLAFCPNGKKVFSEWLASPDFGASRYIASSAMDIYAWFDKLPVRSQKLIRQNVQNWSVSALRQLTKVSHDLVKELVLEGKKTAAQVKHEGGSERAREKEEKQASSEEISRTPSVPTPELARGMRIVVKEENTGWNGHSGIIMSKREDDFWVLLDHTVSQGMEIKHLLKTHQIQLEAQQSVTKPASKELFTDAQVEQKITDALAQREREKAESEQGRFVEIRDAALQAAKREIQAAQEYANALEQAKHKLIEQLASKDLEVRSLHVLQTRNQQLEQRVAELEKALENSSANNWGNTFNNQAAKAVNSELEKTIQPLMSEVERLQNLVRSQQQELAQIQTSDTPEGSGYRQRSASDAVLAEFGEIGERFGWSGWSRRGYRAASGMLSTGISAIAAFIADLKQSSPSYQQQEITF >NC_019751.1|WP_015197923.1|2703533_2705702_+|S8-family-serine-peptidase 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MGNASRYWKLVRIDGGGNRKILEIPTARSFFTQLFGELTDDAPDGDIQRQLMDLYRDSSGESTLLAERCLLCFISGILEQGCLKLTRRFGEKYNFHCNELLPFVLEDDGKLLPAINYQCFSRQILQSFDATQGSLTTWASIKVKQHPELNHFLLERGVYLISNWAILNDTQPQQLQRILKDFHTLGELEIQEAQYLLQGYHTIYRVQRLENIRNKIRSKCIEPTYQQLEDIAIYIKNQTGRLFDNETVRVKLTKLANQLREYRIYVRGGSLPIDSLDASFTDKSNSLLDNVSAPASENSEISDEQSEFLDFYRHQIQVSLQSALTKVTESRVKKLKKKGDKARIFLTALELSQCQKLAMNEIAEQLGMRAQYTVTKLLKLKELRTDVQQEMLIILKDSVKEQAKKYAGVEALNKLDEQLTIFLSSEISKIIENAESQSRTAKNYLKTDIFAQRLCEYLDMRKQVNN >NC_019751.1|WP_144051111.1|2712853_2714986_-|tetratricopeptide-repeat-protein 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_13 | 2924934-2925044 | Orphan |
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|
1 spacers
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_13
The CRISPR arrays of NC_019751_13 >merge|NC_019751|13|2924934-2925044|CRISPRCasFinder ACTCGCGCCGACTGCGTTAAGTCGGATTAGTTGGAAACCAGATTTTAAGATAAACAGTATATTCTCTCTCTAACTCGCGCCGACTGCGTTAAGTCGGATTAGTTGGAAACC >NC_019751|13|12|2924934-2925044|CRISPRCasFinder ACTCGCGCCGACTGCGTTAAGTCGGATTAGTTGGAAACC AGATTTTAAGATAAACAGTATATTCTCTCTCTA ACTCGCGCCGACTGCGTTAAGTCGGATTAGTTGGAAACC
>NC_019751.1|WP_015198100.1|2922779_2924519_-|HEAT-domain-containing-protein MNPRIYFALSLLAVLTSSITKVSAAISHTKVAPIPSVISQSLPPTKKPIIVSELVEKLRIADMEERSKIIQQLSDSQENSPENIIPELIKALSDPDPLVKSAVAEVLGNFTDRAVAAIPALIEMMGSSQRAIIPSPYLVFPRISQAIAPIIPPPISASNTPRIPPTPPKNPENLLRITAIAALGKIGLPARTAATQPLTQALQDPDPWVKLNATWALAEIGASTPILNYWLEAIQHPNPELRRNAAIIIQDSRSLLRKSFGAEANTNIAIVLVSALKDDDYAVRDAAKSALEMLGTKALPGLIQGLSAPEPLVRLEAVKLLGNTEGTAQPAVSTLVKLLKDTGRYVPPKSDISNVFLLPDVQLPSFSRKYPLPPDNPEKMVRINAAIALGQIGDSQAIPALTTVLKDNNPWMQLASNWALIRLGQNQGLPVIGKLVQHPQAKVQRDALYQLKYYGSQSAPYLLPYYKAQLDSNDDEKRNNAIIGIGDMGATALNLVPKLRTILMGNRKNSSGYAATILGQVAQDTATAWHKGNLSPQQRQQAITEFAKVLQIMEAPKAKFNRQPRDRVRNALTTLRNSK >NC_019751.1|WP_015198099.1|2922517_2922757_+|hypothetical-protein MHSYQIKLKGESISDVREKLNEKKRGRDWAGINWQGESSTLSGADAIAIASLCKNHKYRKPSTLDDGRVIFFDGNCVNK >NC_019751.1|WP_015198098.1|2921725_2922334_-|hypothetical-protein MNKESMPKSQIFSGLVAAEAGIYEQLVSLVGEDAKKAVETIRQHSYISATCDVLVVAPGADLLAFVANTWTMYARINSALGISLSKNILKSVASAIGTNILSIIPGMILSSVGGSILKIVPGLGTAGGMAITGTTFYALSTVMGWTYLKAIMFLVSSDVPINEKNLKVATKQVTKDKDFIREIYDSAKSNFQQDQQDSANND >NC_019751.1|WP_015198096.1|2920654_2921551_+|DUF4351-domain-containing-protein MTRFPHDEFAKGFLESLLSPFGKVQTSFKIGSEVREVDIYFQPNPQVESDLALGLLGKLAKNSLIFEPFRNPVKTQQIRFCMGKLYDLHADLFRESKRNKQPEPKDSELPCLWILTPTLSEAILDGYGAKLAPEFTPAGVYLVNPSYKFGIVVIHQLQKTPETLWFRLLGKGNVQSEAIVEVAKLPENHPCRQNALDWLGNLKVILESREVLEPEERDLMMQLSPLYLEKIRAAESLGRQEGQCELLLRLLNRRVGSLSPEMQDQVKALTLARLEELGEALLDFTSLTDLETWLNQLH >NC_019751.1|WP_015198095.1|2917497_2918529_+|M48-family-metalloprotease MKFRNAKGNLAVITIMMLFCLSVFSYGIYASYYGLQLFQQGAFNFIIGLFFLGCVGVPSIYWVVSTIYRYFAAVPSYINQRQIRVINPHLLHEKGLYFETEKSLCAAVKELAKAEGLPTTPVVGIELCDDNPNAYAVGATRSYAMVVATTGLINQLNQREVAAVMAHELGHIANLDTMAKTLLSAALDGVMLILFTPMMMIVWYFGRFAALLMLAAGLIYGLLGNWQHATGFFVGVLVWIILMMLPMITKFLVTLLTFWHSRWREYHADAVAARLTSVDDMVSALATLDRLPFQPPKKNREQMSTLWIRVAMNEETGTFHWLKHTHPPIHKRIEALRRGLYLR >NC_019751.1|WP_015198094.1|2915808_2917272_+|ThiF-family-adenylyltransferase MKKSTAISLHIPPKMWSEFRESMLKSRMFNEEVIGFLFCQRHQVSKSKIRYIPKTWVVPASDCYEHQSTSGLVLKQHFHSYLLENHLQVGLDVVHIHTHTGQGIPDFSHTDDRYESEYARFISSNFPKKPYLISGVFDENLQSGQFRIWDRKGQKFEYLNFCNSLFEVSKFEDVINHDDSIFARQKIFGKGNQKALNQLKVLLIGCGGIGSIFAELLGRLGVKNWVLVDPDRLETTNLNRMPSATQEMVEQQWHKVHYVKHLIKKIYSEGSSVKTIVTTVESELAKQEIATCDLIVVATDNHFSRKTAQELALQYMRPLVCLGTHIDMKSDNTPRMYCRVTVPPLGGAWCLMCGNIINLQRAALESAPLAINQIAANAGYLEGVNDPAVFWLNSICASTGVGVIHGMVSGFLNVDSGIDWIYEFPDGNWRKTNTEYLQNDDCYFCGMGSLEEVVEDSDFEDSDFEDSDFLGSDVEDSDFDNSDFFVW >NC_019751.1|WP_015198093.1|2915172_2915658_+|hypothetical-protein MAVTISQEKAGFKPSQRIIEELKLLEKVARNVIVGSKTVGDIKYIAVLIKGMPLSSKKFTVSNTDVLFLLPPDYPRLPPIGCYLNYPWNTLGEGDHHFTRQSYYGAPFLSEEGWYWYCVGLGGGFNHDVWLNSWRPSNNPENGHNLATLFVTARHAINSDD >NC_019751.1|WP_015198092.1|2914866_2915064_+|hypothetical-protein MRAIVNGKLVDLPEGTTVEQLRKKLPEIGQDDVMEEGFSGTRPLKNNEALKEGSKVWTVPKIVKG >NC_019751.1|WP_015198091.1|2914410_2914794_+|hypothetical-protein MGTVNGKLINQKINHFDELTQKTERINQRCEDLESQVIAITKHNYTQHLQKLNQEINSHKSYLQKLEQKIGFLEDVASRQAKQLFFLKISGVIALVSLWLIFGMNNQPEQSKTKPHRKAESLEFTQS >NC_019751.1|WP_015198005.1|2912464_2913805_-|IS4-family-transposase MFDILSLLQCFLPQINATTMKQLNQIILAMLAMSGRVTMLGISRWTGSGGSYRTMLRFFHTVIPWATLFWLFFRKHLFRANEVYLLAGDEVVVSKSGKKTYGLDRFFSSLVSKPISGLSFFTLSLVSVEQRHSFPIQIEQVIKNDIEKSSVSPRPEIKAKEKRGRGRPKGSKNKNKTEVILTSELLRIKKMINELVKLVANFIPLTYLVLDGHFGNNNALQMARQVNLHIISKLRHDSALYIPYQNPDPNHRSRRKYGDKLDWRNISDEYLRQSSIEEDIQTDSYQATLLHKEFAQSLNVVILVKTNLKTNARSHVILFSSDLKLSSEKIIDYYKLRFQIEFNFRDAKQFWGLEDFMNIGQTAVTNAANLAFFMVNLSHHLLADFRILNPDSGIIDLKAHYRGFRYVHEILKMLPEIPEPILLTRIFAKLTSLGRIHHVSTGVESS >NC_019751.1|WP_015198101.1|2925688_2926363_+|nucleotidyl-transferase-AbiEii/AbiGii-toxin-family-protein MSRKQIRNVPASIRSQLLHLSKQRGEDFNYLLMHYGSDRLLYRLSQSPYQKQFILKGATLFRVWNGEPHRATKDLDLLSFGANDVSSLMEIFKEICRQQYDQDGISFHEETVRGEKIKEEQEYEGVRINLQAKLDSTKISIQVDIGFGDAVTPLPEEALLPSILDLPAPRLQIYPRETVVAEKFQAMVALGISNSRLKDFYDIWFLCQSFEFQGNLLVYRDTSY >NC_019751.1|WP_144051116.1|2926331_2926976_+|hypothetical-protein MYLFTETQVTENTRQALLNFWRDSIIKLCTPHSYLNFYTREQTVSIWWLHWLLDSITSEKTGKAWFGQQITEWLANLPGDRGNLGGEYGVLCLLTKDLSDILYQGKCPYPKFYEVVVAPSQQSTPDDTSRRKYLQEYAPLDLWERVMDYWRANLHNFVPKPEMSQNSDYSTNAAWMSALKELSPQSYQRLLSEWKVNHQRRRNLWKAMGSLGLM >NC_019751.1|WP_015198103.1|2927055_2928300_+|hypothetical-protein MTLKTTILAIVGSLTLAIPQTYQYTFAETPSKLSQAQPSLKASGIPKSVVLQVRQDMAKQLNFKLTDVRFTRIESKIFDACLNLPAKNEKCKEIGYKGWAIRVGTGKQSWLYHAVSPQNISNNFRINWLQSLPKDVKQTVISNVTRFSKLPLGKIKVVSVEPRIWKNNCLELAKTDQRCDSTKTPGWLIKLKSDTYGGKLRLNEEKPSQWVYRSDLDGKIVELDLVSSMGNLSQKVNANILSDAAKRSQTQPSAWRVDKIQNLQWSTRSGDGPSRPITGAVPVENYTFGWKVLVSSPQQKWVYYATKNGFEFDAPKSVPSYLVEEAIKAASVQTGKPASNFRLHWAELLTWDDTCLGVTINKPACEKTPVLGWRISLMESNSTLFTFHSRFDRDVRFAGSSPWFFPPSANPGGR >NC_019751.1|WP_015198104.1|2928776_2929883_-|peptidase-C14-caspase-catalytic-subunit-p20 MGKYALLIGIDTYGEGLQPLPAASKDVAALREVLLNPQMGGFDEAKPMINPTQSEMAREIELWFQDRQPEDLVLLFFSGHGVKDDRRDLYFAAANTEKQRDRLLVSTAIPARFIHDCIRSCKAKYQVLILDCCFSGAFGDSIPRDDGEIPLKEQLGAEGRVVLTSTSAVDYSFEEKGADLSIYTRYLVEGIATGAADENEDGVITVDELHRYAGRKVKETSPVMSPTLITLKDEGFRIRVARSPQDAPSLKYRKEVEQIAAEDEGEADSILSRHKNVRLRIRMNGGMAWNVFRIPRYVYLDHHILILKTKEISFTVNAETNIGTHTLCIGESSYMHSRRLHFPEAGYYEVYCRSDFIKGLIISDPEKL >NC_019751.1|WP_015198105.1|2929907_2930327_-|hypothetical-protein MSEPCSVLIDFSEAGLDLDRSDLESYLLTIADEMESGDLVQSARLARDEDIPEAAKSGVAAFLIGILTTEINRKNLGKLMDYLGNLRYGKTLTLSGEIDGMTYNIEYRNKQELDQAADTIERLTNLRVKIREQQTKPEN >NC_019751.1|WP_041739473.1|2932991_2933228_-|hypothetical-protein MAGDGQRYEFQTTCDRSYLLSEIPAAIQYLEQDQVMRIDSNVRRYMVRKFPDEILLISLFGCYMKNFWISAINRLKSL >NC_019751.1|WP_015198106.1|2933314_2933806_-|ATP-binding-protein MYSKGTLIFFCGKMGAGKSTLSRQISQELNAILLSEDDWLSTLYPEEIKNFDDYLKYANRLKPLLISHIRNILNSGVSVVMDFPANTKNQRAWFKNIFLTENIPHRLIYLEIDDKTCIEQIAKRRETNPERSVFDTEEVFRHVTTFFQPPSADEGFSIEVVKR >NC_019751.1|WP_015198107.1|2933828_2934680_-|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MNQQLPDFIHDVVERLQSIEGIASVALGGSRARGNHTPKSDVDLGIYYQPDNPIDVIALNKLACELDDNHRPNLITPIGGWGKWINGGGWLKIKNMPVDFLYRDVAQVDRVIDDCRLGKITIDYQPGHPHGFVSSIYMGEVAISLSLCDSHGVLAALQAKTQPYPIELQKATIDTFAWEISFSLLVGKKSIARGDIAHAAGCCFRSIACINQVLFALNHEYLLNEKGAVAMANNFAVCPHNYQQRVESAFALLATKSIAEAVAILEEIELELSQWYGERRLEM >NC_019751.1|WP_015198108.1|2934776_2935289_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKQSDRSQDLREYINSQIAIRLFEERDAEQIALLFHDTVREINIRDYSSNQVRAWAPDNIYFRDWVKMCSSRFTYIADDMGIIAGFGELEANGHIDCFYCHKNYQGCGVGKQIYRAIEAKAIELSLSRLFVEVSITAKPFFQRMGFSIVQKQEVTCRGESFVNYVMEKSL >NC_019751.1|WP_015198109.1|2935504_2935969_-|HXXEE-domain-containing-protein MALQNLSVWLLAFALILHTVAEVWLPAYEKVKPDWRLVLFDTGLFLENIPVFLFAFVTAFAGWQWQILGMILPAVGLTHPLLDHLFLSWKYQQLRPGTLSGLFLLFPLSIWVYYLGYTRQLLSLQAGLISGVIGLAISVRLLWEVRKVPGSQTS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_14 | 3151872-3151960 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_14
|
1 spacers
spacers of NC_019751_14
>14.1|3151895|43|NC_019751|CRISPRCasFinder AAGCCCATTAATACTAGAAATATCGTGATTATGAATCGTTGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_14
The CRISPR arrays of NC_019751_14 >merge|NC_019751|14|3151872-3151960|CRISPRCasFinder GCTTTTTGCTCTAAAGCACTTTCAAGCCCATTAATACTAGAAATATCGTGATTATGAATCGTTGGAGCCTTTTGCTCTAAAGCACTTTC >NC_019751|14|13|3151872-3151960|CRISPRCasFinder GCTTTTTGCTCTAAAGCACTTTC AAGCCCATTAATACTAGAAATATCGTGATTATGAATCGTTGGA GCCTTTTGCTCTAAAGCACTTTC
>NC_019751.1|WP_015198261.1|3149726_3150851_-|hypothetical-protein MPLFVDWARDVLENILQAIPSSENPALIKGIRSKFRDDFSGGTLNADNWEVIQLGSGQAITVSNSELQINTGTSTGSTIIRSKKSFSIPVRLSFVFYLSQRIANQNFIIEIVDSAGENYARWSFNGTNPNNSIPSVANFGIAGSAIAVNTANATSTYALYEIDIGLNEVIFATRNLEAGNARASSYSRNRKIPDPNLEYFIQVRVENSGVVSNTTVFVDSFSYQIPELLSAEITGGRGSTVGSEAIPVIGVGGNFSINGAIAVSTIGTITALDNVVYSTETIATLLANATFTGASKDTAGRKNLTVFVNSDQTGTLFVDWSADALTFFPFPGQACAANTSVVYQQETPLRYYRIRFVNGATAATPKIYTLLRFL >NC_019751.1|WP_015198260.1|3149196_3149730_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKIAIDPGHKCPPDTGAEGFLIEQDLNQDIYNELSWLLIDAGVEVVNCRPTTRVKSVTESLSRRCAIANAAKADYFISIHHNAGGGTGSEIFAISPEGKKLAASVLAPLCALGFRNRGVKERGFLVLRKTNMPAILIEVCFIDNAADCQLWEKLKAKQIASAIFKGLDDCLQITSQS >NC_019751.1|WP_158333150.1|3148632_3148953_-|hypothetical-protein MATLLEKIQELQAGQAVSNEKIQALVAASTEEREQVGGLVTLSVAQQETITQLNEKVEELTALLDGSNQETTAAIEAVESLLESTMQQSENISGAIEEIKAIYNPE >NC_019751.1|WP_158333149.1|3148384_3148552_+|hypothetical-protein MIENGDSFFCEECGYVGYIPEVDLDINDPDFHDHYEDGTPVIEPTDKTPNINSEH >NC_019751.1|WP_015198257.1|3145850_3148334_+|AAA-family-ATPase MVAIPYKADVLDFTPTPNELPPRNEQAEDAILGGILLDPTAIFRIWGRLKPEHFQVTANREIYKACCKLARQNKPTDLLSLSSYLNDKKLLAEIGGRNKLANLVEGTVSAVNIDELAALVIEKAVRKDLIKLGNETIRLGYDTQVDIEEVLESFKRRVETVVELETVKTEEELIKSRHDRLIDKLKRIYTTVAEPSLKHMRLKALADDTRTSIGFLESLYLKSLVGTCTKLMDYEDLKQAAGSSVRRWLQQGLVPLATTILLAADGGIGKTKLVYSLAKNLIEGTQFGDFLATGEKRRILFYQGDEQEGDMLQSLQMLGYEQGDLTKYIRIRFGWSFENMATLTQDLNEFKPDFVVFDSLSFGSRFSTVRESDSEFARPLLEASGLAAQHNCTFLFIHHANKGGEVRGTTAIRNAVSEVWRLTKSNQPEDTQYDRVLEIDKSRSRSSGKRYKLYFDPDTLAFKFLGEEVAPNADVSSRGTRGKILEYFRQHPNTRFTAEEISQFANISSGNCRRTLNEITSDGLLSVERKPGKTNCYYLEFTNGYNLNGSQIIYSTENQGLQPLSVPLIDDHTKYPDHPADHPADHPLKLDGISDSGDGDRVIGKNDPEKKGTPKNDGDQNRSPDHHRLEDLQNIGSRGDRVPDPLTDHPITSDHPSNAPLKSELIHVEAKPSTLEKTATTELSEPIQQPLFPGQETQVQTKQLEQIRKIYNTCLGQVKAMAEEIDPKNWRFTIITPDGIKAVEKTEKLGAYKPDNKLKNVLDNWLKSLTFEVIKTDCSPTQWVSGCKWVESIDHHNAMQKRHKFITPDGTLIDAFGFGCDRIRVMS >NC_019751.1|WP_015198255.1|3145145_3145382_+|hypothetical-protein MNKQQINLTPSGVAQAEALAELTVYLEREFNLSFDEARWMSAGIIHNLTCAIKANPESHRGLSEIAGEIKNQKHSLNN >NC_019751.1|WP_158333148.1|3144766_3145078_-|hypothetical-protein MENRIVLEDGDVVNVSPNQNPTGSATAKVGDIKKSIGSKLGNDQMSWGFNGVHGEALIQIGGGGWMKGRMVLQIMFYPSQSLPSQQKTQVSSPLDDLRKELNI >NC_019751.1|WP_015198253.1|3144358_3144709_+|hypothetical-protein MGNVNGSENKNSCTRAEEKRSLNNADSRQSGLFRRSSCNTGHKQKRVSRKDDSRTKNFGGDSTAGGMLRHLISNYREQVAQKDLEIQVALEEKIKLETKIKELESLRIELETASPE >NC_019751.1|WP_015198252.1|3143719_3144058_-|hypothetical-protein MTQQLINLVTDIEPIMDYLDFQPGEDPFIDGLVERHGNHLQTLTQREKLYMVAFLANSLSLEADGDIGNRIIQLSQDCFSQLGGTDLLALIAALSDQLRGGYYAESNNKTGQ >NC_019751.1|WP_015198251.1|3143170_3143629_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MAAKQTPKSTKTTPEVAQEIGVAESTVRSWLSRYTCFVEGHHYIKEESGRTLWLEAGVEFLKTKSGEFSTATETVTINPGEEIIEPILEATAQQLAYIYFEKLPQRVVERIQQMLSNPSPQDAEVLQRAMQRSIAAGATHLIANSTTRRLQG >NC_019751.1|WP_015198263.1|3152355_3152814_-|hypothetical-protein MSLNSSLWQQNYQQNFTVATNGIRFVPLPAIDIPVTFDKSLVAISTSSFNSPPKWVTGGWVSQKIYTGLTIENNNDATLTNQRVFLNKLNLFKFSLDLASSYTLNYAFPRWIKDISIAIWEYQGDISSYDPNDIPATLQRLEDKIDDLAGGF >NC_019751.1|WP_015198264.1|3152816_3153221_-|hypothetical-protein MQIVIPAKPNLDVLVDSAYSDWKSKHSSVVAAREEADSQAMAILQADFQKSLNEVLALDIQALLNIQFNQSLNKGVFAIFSFLNKQWSIYRFVHDDGTHWNLINDEIDLVCFPDCFQKQLLIELGKVKARTISP >NC_019751.1|WP_015198265.1|3153340_3153595_-|hypothetical-protein MLIETEEGLILPGHPDFNYYLQSKLPPDWREFANKHSDFAFVVRADGSGLLEIVNEDELEEYCEDGELDAREAEMEDDDLIFVP >NC_019751.1|WP_015198266.1|3153595_3154279_-|hypothetical-protein MAVYTRGKKRDILTYVAVYPTLLYGFKTKDFNNLAGITTANLVAQLGHLLGDFTPPAGSIRVIGANTPKPNRVTKRIANAGVGSQQSVSTFCSSETLTNAMSGGWNVTKQRRGVNLRPETSSKNTLTAIATLSDGSLYCYPMNKADYTTYAEPLGLTNSAGLGSISPAERGKLVSGSTIPRPGKAAIEVSGGGIFSTFYSTANKDALATAGFSILTDESVFALAVTP >NC_019751.1|WP_015198267.1|3154512_3154686_+|hypothetical-protein MLSPFSRMVQYENLLEDFAMPYSVFGSIDRENLLEKYKKLSNKPTHYLETRYQHWQW >NC_019751.1|WP_015198268.1|3154679_3156584_+|hypothetical-protein MVKQRFTLPFQLPFPFQRPPTSPPSFPGMGIYGVRLPTPDNIRQGIFDAGVVGYKVDIVADNCNTAISVAPRYLSVRFPPVQIVHRNPYCRERQYPPVQLPIPDDKEEPGEMDEGCGVGMYFVYENYRLSYGDGGLERNAAFTRYVRGEVFRDLVELNFRRDINNDFVEIGEFNGEGYHIAATLNVRTFVKFNTSNARDNNITVEDWAASGGIPGNPNELNSIWSKEQQGNVTYFFRAGGRFIGGAGGIETDSSYTPLIVNENLDDFRLDDFRANFATANRQSSTKQDQTFIQYDKPFTETIISDYAPRKPELVEQGTTVFGTRFFVYSCYELSFDAERVRARELCVKSPPPPPDMSCNCCPNIQQNDELLRLILKRIGTPVSVQIFDENLEREGSQQATKTPETLFKASKLAVERTEISNRLIGIENFPVKVPDTMIEPFKEGIFENIFGFFEGEKERSLKSVTELIAWMAEQDSAVLGQFHQVVEFEQDFDGDGNIQKETVVLPNVAETLKEVILLLVQLANNEGTKVHALAKILIEISNIKANLFKTMNTVVDIQDYLDYPTLTKTVEVPLAVDLTLDKETQDFVDFFKESKGKITYEDWDGTNSLHDNMLDLMQMATMLRAILYQRTEQE >NC_019751.1|WP_015198269.1|3156583_3156910_+|hypothetical-protein MADPKPNPQAEKISRRMKAKVDKLEKISDVLTDKQLPEGKIGEKLRRQRELERDTKKGAAARNKKFKEFDDWLDRQELINNSRQGAGDEVPYVKITRLVATTKDGRLL >NC_019751.1|WP_015198270.1|3156911_3157970_+|hypothetical-protein MPLPLVLGKAAMWGAKAAVGLAVSYACEKAVDKATGQENNPVGLACYLVGGGALGKAGKKGITKLVVKQPTVSRAITKNFFGQAVTGLIKLPFRGLGRVGRLVGGLTRRVLRNHLVQAGIFVGILSATINTTNFIVNFNINASDEELLKQIEARINSFYGLFGAAVGSSLGYLMCGALPGTVAFAFNPAVGALIMRDLDEEARSDIYAQAGAIGRLSFQTLVNAELTRQFMNARRYLKRDPNHPVTKILKNIMGKKTFENWGKSNQPSFTISENVINKSIDDNIKDKGLKQFTEELLENFTEACIESGFLIAQNLDSAIAANVLAQRQIIGKPVEVSIQLNAPQPPTPRRRN >NC_019751.1|WP_015198271.1|3157966_3158692_-|hypothetical-protein MEEIIVSGSEETVKPIITMLMGISQMLNNRDIGQFVGEPLEENIKAVPSLLTMKIVWYSAKEPPFQAPVGKRFIKAECNIPDVYKSKLKWETIKQLAGGANGYEWGEYLALAKLDNNRQMHVRGATKAIASKQLDNMLELTKAKVTSISVIQLTKAGRRASGQTLEIKPARIYPANFIIVNSKKIDATQQRIYRDEIATRKLSTLRGDYAKRGSQRIPLWTDKPPKDYKQILNNAFNIDVV >NC_019751.1|WP_015198272.1|3158760_3159264_+|hypothetical-protein MTAITPGSGASISAATLEGQLLELAVFLKIAEQSPSKNPNSRNFIGITFNLSTLIASITFSLPASPGVNSSGQLLTTATPYLQNTGFTPGSGGTFLSVNPEAYFMELVTALQINEANAAKNPALANNVSAVYDSDEQLFDGTATLPIEVSLQLDGSIKTIADEYLLD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_15 | 3493010-3493138 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NC_019751_15
|
1 spacers
spacers of NC_019751_15
>15.1|3493048|53|NC_019751|CRISPRCasFinder GGTTTGTAAGAAGCGCAAACATTTGGGAGGAAAAGCCCCTCAAATAGTTTGTA |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_15
The CRISPR arrays of NC_019751_15 >merge|NC_019751|15|3493010-3493138|CRISPRCasFinder AGAAGCGCAAACAGGATGTGTAGCTGTGCTTCCGTCCTGGTTTGTAAGAAGCGCAAACATTTGGGAGGAAAAGCCCCTCAAATAGTTTGTAAGAAGCGCAAACAGGACGTGTAGCTGTGCTTCCGTCCT >NC_019751|15|14|3493010-3493138|CRISPRCasFinder AGAAGCGCAAACAGGATGTGTAGCTGTGCTTCCGTCCT GGTTTGTAAGAAGCGCAAACATTTGGGAGGAAAAGCCCCTCAAATAGTTTGTA AGAAGCGCAAACAGGACGTGTAGCTGTGCTTCCGTCCT
>NC_019751.1|WP_015198545.1|3492218_3492488_-|30S-ribosomal-protein-S15 MALNQQQKQEIFAKYQIHETDTGSADVQVAMLTERISLLSKHLQANKKDHSSRRGLLKLIGQRKSLLAYIQKGSREHYQGLISRLGIRG >NC_019751.1|WP_015198544.1|3491724_3492207_-|PAM68-family-protein MSAESNPKNNLPFEPKTKRQKPAKANNQPPVVKQGLAKKEQNQQLPFSKEEMAIPKVVSQRMIRRVAAFCGIPTFLGITTLVVSYLLVSFAHIKLPPIAVLLVNMGFFGLGVLGITYGTLSASWDEDRTGTWLGWNEFTTNWGRMVSEWRTTKQNKQKKA >NC_019751.1|WP_015198543.1|3490028_3491084_-|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MIVVMKIGTPEAEINRIDQELSGWGLSPEKIVGRHKVVIGLVGETIDLDPRQIQDVSPWIEQVLRVEQPYKRASREYRQGDASDVVIHTPDGNVTIGEHHPVVVVAGPCSVENEQMIVETAKRVKAAGAKFLRGGAYKPRTSPYAFQGHGESALELLATASRESGLGIITEVMDAADLDKIVEVADVIQVGARNMQNFSLLKKVGAQPKPVLLKRGMAATIEDWLMAAEYILAAGNPNVILCERGIRTFDRQFTRNTLDVSVVPVLRKLTHLPIMIDPSHGTGWSEFVPSMAMASIAAGTDSLMIEVHPNPKKALSDGPQSLTPDAFDVLMRELSVVGKAMKRWEQVPAIV >NC_019751.1|WP_015198542.1|3489690_3489936_+|HNH-endonuclease MPKTPRIPIPKEVRKYVFQRDKFQCQSCGKTDTETKLSIDHIIPLASGGSNDMSNLHTLCITCNRQKSDQNDPRFRRYFET >NC_019751.1|WP_015198541.1|3489171_3489627_+|KGK-family-protein MENQFKILECHDDDVISFDQELLKYKDFKNKLKNKFLCQIDYLFEKDSNDQSTTERLFNLILTPFGKLNLSINLNSPLEGEKAEILRLGSNKWEKGKIRTKLVIEFLPEGDTVYEGSEIRMSIEFSPDEPETICQSASPLDDLRRQIQEIT >NC_019751.1|WP_015198540.1|3488653_3489067_+|KGK-family-protein MENSFQKIECNDNDVISFLGDYTYKVAKIKRAFVQVRNTSIGNLFHHELKNKGIILNLEKLHPKGYHSACEQWLNEGIDCEILNVGASAWKKGKMKIKISVEFVIEEDNTTINNETNFNHTPPESPLDDLRQMMIDN >NC_019751.1|WP_015198539.1|3485942_3488369_+|dynamin-like-GTPase-family-protein MTKILPQCENLQSQVEAILELLQQESNLRSYDTTAVKTSLSKAIAPKFEIVFAGAFSAGKSMLINALLERELLYSAEGHATGTECKIEYAPLAEERVVLTFLSEVEIREQAIFLCQELGFDTVGNINQTEIIDLLTQGCQTIIQKEGGEGKSVRAKQAKALLLLLEGYVNNRGHIQTVTNATYSMEQFNFTNLKEAASYARRGINSAVLRRIEYYCYHPLLEDGNVIIDTPGIDAPVEKDAQLTYQKIQNPDTSAVVCVLKPAAAGDMTKEETQLLEMMRGNWGIRDRVFYIFNRIDETWYNTQLRQRLDDLISSQFRESSRVYKTSGLLGFYGSQLKQTSGRDRFGLDSVFAESVKGLDGVEETPQFVNEFLRYCANSGKLSPNQFRISVNSYETPNQNYTRILAEQGQPLIQKLIQDSGIEDFHTAITRYLTEEKRSQLFKTLADDLEDVCILLKKNYQQLQRDLDSQPREIEAMKTQELQRLNQQLQQLGKDFSQHITDEVNKIITNNCDAFETDFRHLQVKMIRRLDELLNTFSVADAYRRATLSHPRNATAPLLAILVEAFYYLANQLEDILVVSCEEIVASLFQRLLDGIHKADFYRQLYRLLGNDSSIEQKLKILEKDVLDGLVSNARVECDRFVRESPRFYDEGTFSIYQFRQTLIQTSQGYDCESMVEAEPAIRQLLKLDFEPKVNETIRKNFRQTVNQILKTQLLPMADQQADEILQQYAHARTYLEATLQQEAEDKISQNQQLLGTVEQKIAAYNSAINNINNCLRGMSLHEHLLPEIADSDVLTVEDKFLKTVVEV >NC_019751.1|WP_051036677.1|3484671_3485625_+|hypothetical-protein MGYLFDKWLAPLGDVKKDEIKETQGLQNHEIALLNLAPDYTGFICNFIPYLCNRETQNNSHQNGLRLVVELQTTPSIPKITDRELAAVKQVIEKRIQRLDISQATVQIQGKNQILIILPKVRDPSQVTRILGKSGKLEFKEQKSGTKNQLYTLLATRYQLTEKQQKLRKNSNPDQNAIAKNAQALQQNNLAISQVFKITKPPLTGKNITDAFSQSTQDKYRWEIAIRFDEEGSRTFAKVTKNLAGTGRAIGIFIDDKLVSSPVIGVEFAKSGITGGSAVISGSFTAEDAQDIALKLQSGAFPLPLKIIESTSIKQSK >NC_019751.1|WP_015198537.1|3483636_3484536_+|hypothetical-protein MLMTILRKFTAVFLAASLCLTTVACGGGNQTSSPTNSPAQNVSQKSVSTKLADGQYDVQQASFDDGNGEYMLMLLGATPPTFKTDKLQMARLTDEEIKAGKKTYLKVEGGQPALYLTEDFKIEYVHNVTETKTNPQTGQQETVVVRRENGFWAPFAGSVAGSIAGQAIGSLLFRPQYYVPPAYQPGGVIRGYGGYGSSYGDAVSSYRTRYNEAPAVERNRTAFRTTGSIRRNSPNTTNTRTTTKTTSGSRASGSGFGGSTLRPSGNSSTVRRSPSNNSFGSGRSAAPRRSSGSFGSRRR >NC_019751.1|WP_015198536.1|3482973_3483567_+|DUF1517-domain-containing-protein MRDGFNKMMGKTRYVVSRVFVHLGGADVAPILGILNSIARDAIDGDGDMETLGQGLVELCESLLQYDEYWVSAANEGDVFWNEGEAGDFVNELFTDSAQRYGAEFDIGYTNDSNQALSIPVTNNVLVMITAAAEGEVPELETDLSNISALKQGLKGLINLHYKHKLRAVQVHFSPAQFGEELTNDQLLQYYPELIPL >NC_019751.1|WP_015198547.1|3493182_3494187_+|transaldolase MSSNLLEQLRKMTVVVADTGDIQAIAQFKPQDATTNPSLITAAAQMPEYQEIVDQTLLKAKSDLGAGASQEDILTRAFDRLAVAFGLKILEIIPGRVSTEVDARLSYDTEGTIKKAHELIAQYEAAGIAKERILIKIASTWEGIRAAEVLEKEGIHCNLTLLFGIHQAIACAEAGITLISPFVGRILDWYKKDTGRDSYPAAEDPGVLSVTKIYNYYKKFGYKTEVMGASFRNIGEITELAGCDLLTISPQLLTELQGSTTELPRKLDPAKATAMTIEKIAVDKASYDKMHASDRMASEKLDEGIKGFTKALETLEQLLAERLKKLEEKAAVGV >NC_019751.1|WP_015198548.1|3494598_3495363_+|CHAT-domain-containing-protein MKKNILLLAANPKNTANLRLQEEEREIKERLRLNGYGKTPIFSTGATRIRDIQLAMLDFNPHIVHFCGHGTGERGLVFEDNNSREQIVTSEAIATIFKLFAQQEQLECVVLNACYSEEQAKEICKYVPYVVGMSESIGDDAAIEFAIGFYTTVGAGKSYQFAHEMGCNAIELADLTENNIPILLTNPDLIIKSQIPIATEEDLKYEAELKAIELQMLKNTQSYEREIRLLEYEQKKSKAYHRGFMSAFESKHDE >NC_019751.1|WP_015198549.1|3495458_3496457_-|radical-SAM/Cys-rich-domain-protein MQIQINNSQITSFSEKLKSPLLKQTISVLQVNLGKRCNLACNHCHVEASPKRTEELSPQICQQIIELIARFPQIQIIDLTGGAPEMNYGFNLLVEAANKYQKQVIVRSNLTIFFEPGFEYLPEYFAKNKIRVVASLPCYLADNVDKMRGIGVFNNSIRALQLLNQLGYASDENLILDLVYNPQLPKSENFALTPEQNKLEADYKHFLNTNFGINFNHLFTITNIPIGRTKLYLERQKLHTPYLKFLEKNFNPQTTEHLMCRNELSIDYLGNIYDCDFNQMMDLPARTSDGKTLTVAKLLEIGNLDLVSEVQTANYCYGCTAGSGSSCGGALV >NC_019751.1|WP_015198550.1|3496493_3496817_-|hypothetical-protein MNLNQINPNLINLVKVVSTTVMFSAVGLELGNIYALTNSIRVPSNLDIVFVVERIAVTSHFIEAIIAGFFAPAKNKQPIQYAVYTFFTGTIGLLELLQIDKVEEKPN >NC_019751.1|WP_015198551.1|3496940_3497135_+|hypothetical-protein MIAQDLDSKAVAEDISMKQIKIKQTQLKIARESNMTFVAEVLQHQLEELQDESNFQAMMSLLDD >NC_019751.1|WP_015198552.1|3497243_3498638_-|histidine-kinase MNGSLARDLSIYQQIVSAGTTSQAQAFSPATLLSMMRSHIDILIERKISATLWVKLPPGDVWQSELQRYQQQVYDCGKIYSFQIGEGIKIQTEDEINLSHPCHFPIYFPPKSRLRREYFLLILSPQFSSLIVAYRPLRSLKKTNPKKPNSGKIPVLVAINTFEGKIIKPVVDNIQAAFTQLEIFKLVLPETPEPSIISQLLLRQFYNQEKINRQITNIRLNKLRRQNQKMYQSLQLKDDYLSTVCQELRTPLTHMKTALSLLNSPVLKMPQRQRYLQMLSTECDRQNSLIMGITELVELERSLKSPTFEAVQLADIVPGVVSTYQPLAQERDIMLAYTVPQSLPNAWFISGGVKQIVINLLSNSIKFTPNGGEVWVKAKHQGDYIQMEIRDTGIGIAESEIPKIFNSFYHLRPANSDELAGVGLGLTIVQQMLQRCGGSISVKSKQNEGTTFTVQLAIAKQHRK >NC_019751.1|WP_015198553.1|3498786_3500274_-|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,-6-diaminopimelate-ligase MKLRELLAAVDGIVALPEHPAMDMEIEGLTTNSHATNVGELFVGMPGTRVDGGEFWQSALAAGAVAAIISTAAAAKVPPTADVCVITTSDMTKACAKISAAFYGYPGHALKLIGVTGTNGKTTTTHLIEFLLDKASLKTALMGTLYTRWQGFSQTAVHTTPFAVELQQQLAAAVDAGNEYGVMEISSHALAQGRVLGCKFEVGVFSNLTQDHLDYHKDMEDYFNAKALLFSPNYLQGRAIINIDDSYGQRLIQALGDEKVWSYSVNNTQANLWMSDLNYQQNGISGTLHTPKGNVKFHSPLVGQYNLENLLAAVGAVLHFDVDLDLVADAISEFPGVPGRMERVQLSENQDISVIVDYAHTPDSLENLLKASRPFIPGKIICVFGCGGDRDKTKRPKMGKIAAELADVAVVTSDNPRTEDAEQILKDILVGIPENTNPIVICDRAQAIRTAILSAKPGDGILLAGKGHEDYQILGTEKIHFDDREHAKDALKARV >NC_019751.1|WP_015198554.1|3500400_3500676_-|glutaredoxin-family-protein MRLILYSKPGCHLCEGLQQKLEQITTIQFELEIRDITTQDNWFAMYQYEIPVLMVQNYGNSDDTTTREQSIPRPSPRATVAQLEKLLQKYL >NC_019751.1|WP_015198555.1|3501138_3502350_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MQKAFKIALIPSHNQEVLINKTIGCARFVYNRFLALRKELYATEQKTLNYNTCSQELTLLKKEIEWLKEVDKFALQNSLKNLEAAYKNFFTDLKKSKKKKGVGFPKFKKKYGCKQSYKTNLTNGNIQIIENRLKLPKLGWIKFYKSQDITGKLVNVTVTRTSSGKYIASILCETEIEKYPIGTQNIGLDLGIKSYLVTSEGEVIENPKYYRLQLKKLRKANKKLSRSTKGSSNRVKAKIKLARIYERITNLRDDFLHKLSTRLIKENSIICIEDLRVVNMVKNHKLALSISDASWSKFVTMLEYKALWHDRVVQKVGTFYPSSQTCNCCGLINPLVKDLKLREWSCPSCNSYNLRDKNASLNILSEGLRLLTAVGTPEVIKNACGELVSPELFQAEIVEAGIA >NC_019751.1|WP_015198556.1|3502638_3505350_+|hypothetical-protein MTQQHLLKLAMQGNTEAIETLINELLQPQGITAKVGSQQSSLYVALAAANVPKQQLLVPLIYQKILHWHVEYFQTAKIYAAAWGESSPAWQEEVLLSDAKSKNNDFVETNSDMLKDGGEKIDDSPDIKSMERTSGNLRIGDNVLQIGLPNGNVVKQGVSAPPCRWQPRPTPILSLPKTFPLLIGRLPQIKSAIAFSKEKHSVEFFGSPGLGKSSLLWHLGYYFQSQSRFSDGVVGFNTHYESVSDILQGLFDIFYESEKGCKPTLSEIQQALRNKQILVFLDDQNLSSDEVGDLIKTLPNITFIIASTEQRLSQTGQSLRLPGLTNRDGLTLVSHELKRSLTPEERTAFDALYLRFEGHPWLLQLTAIAMRQGVGTLAEILIKLQLADSNNWLVKQILASLSSPQLAVVAALASVGGAGLLIPQIAALSGVRETADVLASLAELKLVQAENDTFTGNGYYRYSVTSSLIDALPPEWDLETLRLRSFNYFIGWAQKSRNINSINTINTINNLLFSETDAIMTTLAWGVKSQQWAQVLSMVQTVETPIALARRWGLWEQLLKWGLQASEKLSDDATTAYILHQLGTRSFCLNDYTSAQEYLNRSLKIRQSLADTQGMEITSYTLGLIPKPETSAVVTPPKNSIPQTFKLQTSKLIYPKIRISSATLIPLTMVGAVGLTGYYLILQPKSSTTSQIPVKSTSPIPPTSKSVAVKPVSFSREKFNFGNQSIDIKNQQLFLTIINPNTTSLEVGKIKPIGKQADFEVNLDDCSNPITSNEICKLAIIFNPLTTGKHQATLPVTDSQGKIIKQIPIEGVATAPTLPFIPETNLPAPTSEVEEVLPTPKAKEFPRIRRTKIQPQVIPRESTSTTPESSPQVTPTESPTPLPTETPGLQPTPETTPEVMDTP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_16 | 3544526-3544629 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_16
|
1 spacers
spacers of NC_019751_16
>16.1|3544552|52|NC_019751|CRISPRCasFinder CAATAACCCAGTTACCTAGGTGAAAGATGAAAATTGTCATTGCGACGCAAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_16
The CRISPR arrays of NC_019751_16 >merge|NC_019751|16|3544526-3544629|CRISPRCasFinder AAGCAATCTCGAAATCTTCTTTTCACCAATAACCCAGTTACCTAGGTGAAAGATGAAAATTGTCATTGCGACGCAAGGAAGCAATCTCAAAATCTTCTTTTCAC >NC_019751|16|15|3544526-3544629|CRISPRCasFinder AAGCAATCTCGAAATCTTCTTTTCAC CAATAACCCAGTTACCTAGGTGAAAGATGAAAATTGTCATTGCGACGCAAGG AAGCAATCTCAAAATCTTCTTTTCAC
>NC_019751.1|WP_015198585.1|3543548_3544451_-|trypsin-like-serine-protease MNKQSFALLFTGIIGAATLTLSVQAQTKQSITPKFISAKTGGFKFDANVKPFIPDGLGRSAKPDEGDSRGIVSDIDNRIPMLSKKYPWSAIGRVKGTTTNAESYHCTGTLIGEDLVLTNAHCVIDPETKEKSAKIQFMPNVIDGKYQDVAEVVDVIYGTDFKQGDQISPNDWAIMTINKPLGRKYGFLGMKPIPTSTLINNPRSLFFVGYSKDFPTENYQKYLTAGKGWTASYEKGCSITKEEAGFLFHDCATAGGSSGGALIGIIGGEPYILALNNAELGNITNFAVKISTIQEDLSQK >NC_019751.1|WP_015198584.1|3541951_3543457_+|NAD(P)-binding-protein MFDVIVIGSGIGGLTAAGLLARYGKRVVVYESHTVFGGAAHSFKRQGFEFDSGPSFYCGLTGAESLNPVKQVLDILGESLQTVTYDPLGHYHFPEGSFPVYSNLQRYQDEVAKITPQGSAELQRFYQRMLPLYAAMKEIPTVTLRSDWQLIPVLLGNYGLSLLKMLPHLPILQGSVGDVMDSTIKDSWVRRLIDLECFLLSGLKANGTVAPEVAFMLGERSRAGVEYPIGGTGAIIDAFVRGIERFGGVMRSRSHVNQVLISNNSVTGVQLQNGEVISAPVVISNATLWDTYTELLQPNDLPETYRRDALDTGYVDSFMHLHLGIRSDGLENLTGHHVVVQDSHEDITVPGNTCMISIPSVWDANLAPAGHHVVHAYTLEPYAGWQRDDGYEQKKRQKADVLYQALAKVIPDIRERVTLELIGTPLTHAHYLRRYKGTYGAAIPANQGMFPSTHTPISGLYRVGDSTIPGIGVPAVAASGILCANTLVSPQVVKEICSKLN >NC_019751.1|WP_015198583.1|3541330_3541555_-|hypothetical-protein MNNIRNSDFDNHAEDALLPEYDFDYTQVRPNRFANQQNKTQINIALDPDVAEIFTTSEAVNNALRAILSAIPKQ >NC_019751.1|WP_015198582.1|3540429_3541212_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MTEPLIELKGISKTFGNNKVLDNVDLTINRGEALGIIGPSGTGKSTILRIIAGLTPPDTGEIHVQGVKRRGLIEDSADPVGISMVFQQAALFDSLTVEENVGFLLYQHSKLGRRRIRDLVNEKLEMVGLGGISDRYPSELSGGMRKRVSFARAIISNPEHPEDAPEVLLYDEPTAGLDPIASTVIEDLIRQLQASQGVCSTYAIVTHQDSTIRRTSDRIIFLYQGKVQWQGHVNEVDRTENPLIRQFMSGSIAGPIQVGG >NC_019751.1|WP_015198581.1|3538910_3540356_-|MCE-family-protein MRSLRTIREGSVGLLVLAGLGIFGLIFLWLNRFTASQNSYKAIVEFKDAGGLQKGAVVRYRGVKVGRTISVKPGLNAVEVEIEINQPELIIPSNVTVEASQSGLISEGIVDIIPRLKIPEGAIAGKPLEATCDSNQIICNNSRLKGQIGISIDQVLRSTNDLAVVYSNPKFYANLNQALEQSTLAASGVATLSKNLSSLSLSAKNQLSDFSGVGNSVQRAVNQASSSTTQLSANANQTLDKFAATAGEFGITAKELRTTNSQAGKLLANLDNLVVNNRSSLVSTLNNLSVSSSQLRTTVSSLSPTVNRLTQGELIKNFEILSANAAEASTNLRDATKTLNDPKNAILLQQTLDSARVTFENTQKLTSDLDELTGDPKFRTNLRQLVNGLSNLVSSTQEIEQQVQVAQTLDSMKAGTFSKNTPVVNFDSELSQIPPTSASTKRNQAIKRLTKILQQNNQAAKASLDKSRDVSNQESKAINSP >NC_019751.1|WP_015198580.1|3538020_3538611_-|L-threonylcarbamoyladenylate-synthase MDHVSLINLVSNARQGKLVSFPTDTVPALATVPEFAELIFTAKQRSQDKPLILMAATTEELWNYVVGSPEECQEWQSMMDKYLPGALTLVLPASKNVPKNLNPQQPNTIGVRIPKSAIAQTILSQTGALATTSANLSGQPALLTMEEIAVQFPDVATLDPREFASEELNTKGVPSTVIKWTGKDWQILRQGAVILE >NC_019751.1|WP_015198579.1|3536808_3537741_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MNWSNWIYLAVGVGLGAALRSLFTRPQASVSAFAPLTPVSEAEDKPPLSKPIEQTQLAYQMAREMEQFKAGFLARVTHELRSPLNGLIGLHQLILSDLCENPEEEREFIGQAHERALQLLKIIDEVLNVARTEYGSNRLDMRSHSVAEVLKEVHTLTHMLAKNRNYPFQVTFPDVSLTVTTDHRWLRQIILSLVETSIACIDAEVQEGSIYLSAASCPTGVTQIWLDIPIYALPKSEAIDLLTLTNQPSNTTMTVGMKLLLNQTLVEAIGGKMEILPHPEKEASNQDLIRLQISISPGIPEAELQLQEAS >NC_019751.1|WP_015198578.1|3536390_3536861_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MDNTQIQFSDRKSEINLEQLQQLFTLSAFWAKERNLEDLEIAIANSEPVITVWNREKLIGFARATSDGIYRATIWDVAIHPDYQKQGLGSKLVETVLSHPRMCRVERVYLMTTHQQRFYERIGFQTNSTTTMVLYNQEPTSLLPEAEVLLQESLGK >NC_019751.1|WP_015198577.1|3535157_3536225_+|hypothetical-protein MNTTSLDSFKKEINQVREYIKHIQDVDNIVNYTVSEADNEEIKALLNTLKEHHRIFRTDKKIFEYKASIISLYGLLEKYVENWIKEYLTALSGLVLEYDKIHEKIRNNHFELSVKLISSIVSREIAKYQHLTKEQVLKELNECIVNTANYKFNTEAFVLSSGNLKHKQIVKLFELINVSLNEVLKKNETLIQYFKDDRGITNISNTNTDILYNTINDLVERRNQIAHGSEILDILNISELESYIQFLEKYCQAVFEILAEEFIKQESIYTFQKIEKVIKIFGNRILAFEIENYKIKIGDILIIETIEGKFYKKPILTIELNNESHAEIIIMEKQNIAVSVEPSIKENQTFYIVKQ >NC_019751.1|WP_015198576.1|3533948_3535142_+|DUF262-domain-containing-protein MTTKNHLIPGETFFYSDKSDISQVSLSDDEINEKYKKGEIRIVTEQARYPLDSIETMLDSQKYILNPEYQRRKRWNNTRKSRLMESFIMNVPIPPIFLYEVSYSIYEVMDGLQRLTAIYDFYKGKYNLEGLEYWRELNGRNYQNLPEQIKRGIDRRYLSSIVLLQETAKSAEEADFLKQIVFERLNSGGEQLTAQETRNALHNGKFNQLCIKLAENDFFRKMWKLPLESEGEEKLLESEPYRKMEDVELVLRFFAYRHIANFKSPLDKFLDDYLKHANAYSDETINNLENLFNETINLVYSIFGDSAFIPPKEKRDNKTPIRIVYDSMMQVFANNIPHKEILLNHSKSIKSALYSDKQLLHLKEEKNRLLFDARYNNKKDVEARIKYFQNFLQSYIP >NC_019751.1|WP_015198586.1|3544718_3548399_-|DUF2225-domain-containing-protein MAQCKKNRVNLSYFLAKFTRYSLIGLLSVVLVSESVGASVTLAQSQIAQQTVPNPSVPLSGEKQKRYQEQVKLYQEGEELQKKGTREGYLQAIEKYQQALKIAQKIGLRGEEAEILMQIGLVNVFLSEYQQALDLYNQSLKIWQELNQPLFEAIVLSMIGDTYNNMGKTQESLDYLKRAESSFRTQKQFRYLAINLSSISRVYMRLGQTKNALHFLNQALEIYRTTYKDQVKEAHTLNSLAFINSLIGQSEVAFKYYNQAVEIYRERKDFLGQAEMLKSIGSLHGKLGKHDLALEYLNKALEIQSTKGTLVDRGLTINDIASIYSSRGDYEKAVEYYQKAKLLFHEAGWTTLETLSIGSIVSIYRNFLGNNQQALKYTEEVLKLNRKTGEKDEEASTLNQKGDIYIQQGDYQLALDAYNQALEIERSITKNPKAAARTLGNIALLYNSLGDSKLSIRTYNQALDIYRKLDNKAQQARILLYMGGVYQKNEKLDDALVSYNQAIKLLNEENYNLEISIHYGLARIYRDKEDYTKAFKSANLALELSKKHENSFQEIASLGIIGSIYLAQGDYTNALDSYNEVLDRCRKSDLKIKEAETLSTISIAYGFQQQHQKAINTLNEELKLRQTLKDKIGEAQVNYQIAINQRKLGKLETALTNIDEAIKIVESIRSNVKNPDLRTSYFATVQNYYKFKIDLLMELHKKQPSKGYDALALNTSEASRARGLVDLLTEAGANIRKGANPQLLAEEQRLQQLLNGKEKARIDILSTSKGNDVAKTTADKLGDEIADIINQQQQLKTQILTKSPEYAALKYPQPLELKGIQQQLDKDTILLQYSLGKERSYLWLVTPDSVQAYELAKGEVIEKAVENFRDVILTANTPYGKDHPDDINQPASQLSQMILAPVANKLGKKRLVIVADGALQNIPFAALADPGTPPPTPRLQGGEESKPLSLQERGLERGSYQPLLVNHEIVNLPSITAIQTQRKHLNNRLLSPKTLAVLADPFFTTEQAQGKLEALGPEISDNPQEVIKNSEKLPPLPGTRIEAEAMLKSLSSDQKTHAFGADANYNFATNPTLKQYRHLFFATHGFVNTERPELSGIALAQVDKDGKPVDEKKGYLRLGDIFNMDWAAELVVLSACETGLGKDTKGEGLVGLTRGLMYAGSKRAVVSLWKVSDKGTSELMPIFYKSVLAGKSPAVALREAQLQMWQGKEWRNPYYWAAFTLQGEWR >NC_019751.1|WP_041740600.1|3548926_3549337_+|hypothetical-protein MTEETRGEIARRLAIELSLRTEIYQKREGQGFKTFGEFKRTIGVAGAGQAWHHIVGQTTANLQKFGAEAIHNTGNLIRIEHGKGSIHQEITNFYNSVQPEITGSSNITVREWLGNQSFEEQQDFGIRVIKIFGGSL >NC_019751.1|WP_015198588.1|3549336_3549633_+|hypothetical-protein MLTIDLQSILNSIPNEVNWQNIVEFEKLDERVSIANEVCANLVGVNDGFIEWCPNEEPASHLETLLWWWVVRPDLGAAIAREAPQELKEIISQYILNN >NC_019751.1|WP_015198589.1|3549917_3551606_+|dihydroxy-acid-dehydratase MPENLKSQVVTQGVQRSPNRAMLRAVGFGDEDFNKAIVGIANSYSTITPCNMGINQLAQRAEIGVRAAGAMPQMFGTITISDGISMGTEGMKYSLVSREVIADSIETACTGQSMDGVLAIGGCDKNMPGAMIAIARMNIPAIFVYGGTIKPGHYDGKDLTVVSSFEAVGQYSAGKIDDAELTEVERNACPGAGSCGGMFTANTMSSAFEAMGMSLPYSSTMAAEDAEKADSTEESGRVLVEAIRKQILPRQIITRKSIENALAVIMAVGGSTNAVLHFLAIAHTAGVKLVLDDIETIRARVPVLCDLKPSGKYVATDLHKAGGIPQVMKMLLAHGLIHGDCLTITGQTIAESLADIPETPSPNQDVIRPWENPMYKEGHLAILKGNLASEGSVAKITGVKVPKISGPARVFESEEDCLAAILAKKINPGDILIIRYEGPKGGPGMREMLAPTSAIIGAGLGDSVGLITDGRFSGGTYGMVVGHVAPEAAVGGNIALVEEGDTITIDAHSRSLNLHVDDAELSRRRANWQPKPPRYTTGILGKYAKLVSSSSLGAVTDLDLFS >NC_019751.1|WP_015198590.1|3552033_3553896_+|NAD(P)H-quinone-oxidoreductase-subunit-F MTNFLLETVWLVPCYALIGGLLALPWSPGIIKRTGPRPAGYINLVLTFLAFVHSACVLPITWNHLPHEISIPWLNIAGLNLSIDLEISSLSVGAMVVITGLNLLAQIFAIGYMEMDWGWARFYSLLGLFEAGLCSLTLCNSLFFSYVVLEVLTLGTYLLVGLWFSQPLVVTGARDAFLTKRVGDLFLLMGVLALWSQAGTWNYTDLAEWATTANVNPTLITLTCLALIAGPMGKCAQFPLHLWLDEAMEGPVPSTILRNSVVVASGAWVLIKLQPVFSLSPMASSAMVAIGVVTAVGGSLIAIAQIDIKRCLSYSVSAYMGLVFIAVGTQQDEAALLLVLTHALGSALLVMSTGAIVWNSITQDVSLLGGLWSRRPVSGIAYIVGTLGLIGVPPLGGFWALLQLASGLWTTQPWLVGVIIVVNALTAFSLTREFSLIFGGQSKQMSDRSPEVSWQMALPMMILLGFTLHLPLVLQSLSLLPTWATVNKDVALLLIWSSIFGCSISSVIYLGNVIPKPIRFPSKPIQNLLAYDFYTPKLYKMSIVLGVDMISKLTDMIDRFIIDGIVNLVGLVSILSGESLKYSTSGRTQFYTFTLLIGVSVLGMLVTWQYWGDNLFNLIF >NC_019751.1|WP_015198591.1|3554042_3555545_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-M MLSTLIWLPIIGAAIISLLPRAIPAINIRLTAITIAGLVLAWNIYLLFQFDISLPGMQLQESLPWNDTLGLNYKLGVDGLSILMLFLNSLLTWIAIYSSNQQTERPRLFYSLILLVSGGVAGAFVAQNLLLFFLFYELELIPFYLLISIWGGEKRSYAAMKFLIYTAVSGALILATFLGTVWLTGATDFDYNTISTQALSTTLQIVLLVGIILGFGIKIPLVPLHTWLPDAYVEASAPVAILLGGVLAKLGTYGLLRFGMAMFPDAWSILAPSLATWGAISAIYGAVTAIAQKDIKRMVAYSSIGHMGYILLAAAASTSLALIGAIAQMFSHGIILAILFHLVGVIEAKVGTRELDKLNGLMSPIRGLPLTSALLILGGMASTGIPGMTGFIAEFIVFQGSFSVFPIPTLLCVVASGLTAVYFVILLNRTCFGKLDNKLAYYPKVLLSEQIPALILAIMIVFLGVQPGFLVRWSEPTTTAIVAAIPPMEKTITAQVALNN >NC_019751.1|WP_015198592.1|3555665_3556979_+|CO2-hydration-protein MVQTPNKTEAKLPPSTHEFAEVIHRLEAGGAMLPDTPENLMQIIGLYKAYAVPMDFYWRDLLYIAERVFLNPFAFFKYFISPEYLERHNHYAGDDADLRVWRGEATAHPELLEFMEKGETFKMPKILHHLFHDRINMEFAEACMRAMLWHRGMGGKFDPYLDTEEYKANADRAIKAYFQGNPFMLGLYKLFPDMFLEQCRQMSYYSNLGLFWEVMAPVFFEMSDLYDEGKITSVPEAMNFLVNGIFAVANRPIYHHVYIRGECYEIIPKSKGFVWLHEAALPYVEAVFYRTAPFRGTKSYNAQAGQVPTDQKDFHYGILYADVFPVGTAGIPPTLLMQDMLHFLPPYLIDYYKQYCRGEEDTLIQLGISFQRSMYCVTSAVIQALRTVLCHPLDDPDPEHLQANRDFFESQLNRFTRPEYGIRDAARLNDIQRQDYR >NC_019751.1|WP_015198594.1|3557246_3558380_-|S-layer-family-protein MRDNNSTTKRPTSSSSSSYFGEGIVNTQDLIVRDGAVVSAETFAVGKGGNLTVNASKNIELVGTSVDGSVFSGLISAANQGSSGNAGDLTIKTQNLLVRDRAGVFVNSLGTGNAGILTINSDRIRLDNKASLNANTRSPNKDTNREQATINLNTDALILRRNSNITTNAQGQNVIGGNINIDAGVIAAFENSDINANSTDFRGGRVKINAEGIFGTQARNSPTPESDITATGANPSLNGTTEINLPDVDPSKGLIELPEGLKDQSDQIDQLCGRGKKPLGRFVVTGKDGSIPSNPVVNTMSGYLDLTTIASFGEVNSNVPVNPIPDSLMAQKPPENRIVEAQAIVRGADGDLYLVAEAPSVIPNSRPAVSACVGLRR >NC_019751.1|WP_015198005.1|3558411_3559752_+|IS4-family-transposase MFDILSLLQCFLPQINATTMKQLNQIILAMLAMSGRVTMLGISRWTGSGGSYRTMLRFFHTVIPWATLFWLFFRKHLFRANEVYLLAGDEVVVSKSGKKTYGLDRFFSSLVSKPISGLSFFTLSLVSVEQRHSFPIQIEQVIKNDIEKSSVSPRPEIKAKEKRGRGRPKGSKNKNKTEVILTSELLRIKKMINELVKLVANFIPLTYLVLDGHFGNNNALQMARQVNLHIISKLRHDSALYIPYQNPDPNHRSRRKYGDKLDWRNISDEYLRQSSIEEDIQTDSYQATLLHKEFAQSLNVVILVKTNLKTNARSHVILFSSDLKLSSEKIIDYYKLRFQIEFNFRDAKQFWGLEDFMNIGQTAVTNAANLAFFMVNLSHHLLADFRILNPDSGIIDLKAHYRGFRYVHEILKMLPEIPEPILLTRIFAKLTSLGRIHHVSTGVESS >NC_019751.1|WP_015198595.1|3559729_3561943_-|filamentous-hemagglutinin-N-terminal-domain-containing-protein MNKIKLLFASLFLYNFALIKNLPTQAQIIPDSTLANESSQINSNVLIKGSNAEQINGGATRGSNLFHSFSEFNIKDGQRVYFANPSGVFNILTRVTGGNASSIFGTLGVDGSANLFLMNPNGILFGQNASLDIRGSFVGTTANGLQFGNQGVFSATNPEAPGLLTINPSVLWFNQLNQNATIKNNALTTGLVVDEGKSLLLVGGNISIDGGILFAPGGRVELGGLAEPGSVGIQQDGNILSLNFPVQVERADVLLNNRAGVSVISGGGGSVTINARNIDILEGSLILAGIGRGLGTDDSKAGDITLNATREIKVEQGSYIRNAVSSNATGNGGNLTINAQNLFVQSGGRIQVSTLGKGKGGNLTVNVSDKIELVGTSDDGLIPSGLFALTLKPSTRNAGNITINTQDLFVRDGAQLSAATFGAGKGGDLTVNASRQVELVGTSKNVSLISGLFASAQSGSIGDAGDLTINTQNLFIRDGAQVNTGTFGAGKAGNLTVNASEKVELVGQEGVRNLLTGLSSSSELGSTGDAGDLTINTQNVFVQDRAQIATSTSGSGKGGNLIVNASKRVQLGGIVTASAEPFSTGNAGNLTINTPDLLVRDGGRVLAATAGTGKGGNLSVNASGSVQVIGTSADGLLSSGLGTSAESDATGNAGDLTINTPDLLVRDGAQVGVGTFGAGDGGKLTVNASNRVQIIGESADGLLTSGLYASAQRNSTGNAGNLTINQYLCQIKRIQRP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_17 | 3976837-3976932 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_17
|
1 spacers
spacers of NC_019751_17
>17.1|3976861|48|NC_019751|CRISPRCasFinder GTATCCCAAGTTGTGGAAACCTCAGATAGTTCAGATGGAGTTGTACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_17
The CRISPR arrays of NC_019751_17 >merge|NC_019751|17|3976837-3976932|CRISPRCasFinder GAAATCAGTAAACTTCCTCAACAAGTATCCCAAGTTGTGGAAACCTCAGATAGTTCAGATGGAGTTGTACTTGAAATCAGTAAACTTCCTCAAAAA >NC_019751|17|16|3976837-3976932|CRISPRCasFinder GAAATCAGTAAACTTCCTCAACAA GTATCCCAAGTTGTGGAAACCTCAGATAGTTCAGATGGAGTTGTACTT GAAATCAGTAAACTTCCTCAAAAA
>NC_019751.1|WP_015198922.1|3974278_3976543_-|hypothetical-protein MANPPHQPNPNARIIKRVIKKTGKKYQRQNSLVSWLAIAFLLGTGSLVVGFAWISFLYIFNPQKVSWLNKVLPTWARISMQGENPLSLKQIQTAITKQGLIPGETLTLKNKGFLLPVYKKRANCQDDCQEIIELRLYQQGIDGDSQVTRKYQLISQTTVTGPEESFVAAPLSNAINESPGTSVALPLTEIGQMEAAPSPGMWFYLRGQRQDSAYTAAYGHIIYYNPERDRIQQMLSWTSPTGQLPQWQKQGLVINQTVGLEPQLLVYQVKSVKLFLNPVELVEITLKPAAWKNDNYEKALSLARSGLWTPAYTWLQSIQKQNKNIPVSAQAQIEVIRLHSQLTQAQAAKSWASPSQEILANLIDGRWSQALEVFKQGSPEKAQEIAAFLKTDDGRLWNRLEAALEVNQNRPEVQLWGGLIVAAREGNAKATSWLQKRKATSQTLSDSKVLFAKLRGEVVTKSPVIPNHPSRIIGSVQAITKVNPSEWLQPEEKLDVVTHQKWYQVEVAGFHDGKRWLYPPFNNLNLPKTSADKYLWSNLGINSDPLLQIAIWLPNGEQKATTATIKAVKLAGGSLRLLALPTENIIEANRALAVSNSALEWVEPLPISVSELAQQNLQQLKVILPKLWKSLQASGQIPKSDVPSLPQIQQKVGNWLVQRLDLTGNSKAETVFTISPEALATLNPGAKKPKGKESPRTVIFSDGGSIIYTDFAEKPQQNLSAIAKLAEVDSLALLVVNGKGYSLKRWSGKNQRFE >NC_019751.1|WP_015198921.1|3974065_3974251_+|hypothetical-protein MTTSSVTTRDLHSTFVSKTNKAYYREDQQDKFMHLQAEVDYLLQQLQNLKQEKSGTDTCEN >NC_019751.1|WP_015198920.1|3973364_3973652_-|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MLDLREIYPLSDFQRNARQFIEQLQENQKPIVLTVNGKASVVLQDAASYQKLLDDLELAKSAATIRQSIAEVAAGQEQDAIEALEALRAKHDIPR >NC_019751.1|WP_083866321.1|3973036_3973318_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MGEYSKENAAKWFNGLFNVVETLTSMPQRCPIAPERDLVGQDIRCLFYRKNYRILYTVEGEAVTIYHIRHTSQSVMTREEFLREPYREEILPE >NC_019751.1|WP_015198919.1|3972519_3972882_+|hypothetical-protein MIEGNFDDIGHIFFEIDLITTDGLNLPVDAMLDTGFTGFLVINKQDLEVLEWVYRGDEQMLTARGEAIFEKYLGKVFLDEQEYEIPVYAGDEITEVLIGSAWLKILPLVVNYQAGILTLG >NC_019751.1|WP_015198918.1|3972205_3972523_+|hypothetical-protein MTESVFKPKERRSRISLNSSLSPEELAKRKAEHEIFAQRCREIFDGVRPQIIDTYYGWYIAIEPESGDYFIDANIEIAHDRALQKYPHNHHCVFCLNETGATGTI >NC_019751.1|WP_015198917.1|3970777_3971869_-|threonine-synthase MTVSLSPATSYRQPWAGLIETYRPYLPVSESTPVVTLLEGNTPLIPAPSLARYIGRGVKVLVKYDGLNPTGSFKDRGMTMAITKAKEAGAKAVICASTGNTSAAAAAYARRGGMKAFVLIPDGYVALGKLAQALLYGAEVLAIQGNFDRALEIVREMSEQYPVTLVNSVNPYRIEGQKTAAFEIVDTLGDAPDWLCIPVGNAGNITAYWMGFCEYHQMGKCDRLPKMMGFQAAGAAPLVYGQPVAHPETIATAIRIGNPASWDKAVAAKSASMGEFNAVTDEEILNAYRILASEEGVFCEPASAASVAGMLKVKDQIPTGATVVCVLTGNGLKDPDTAIKHSGNQFKQGIAPDVLDVAKAMGF >NC_019751.1|WP_041740688.1|3970238_3970679_+|hypothetical-protein MGKDLTQEWLGEIQGLKQQLAELQNARNEAWESAEKWRKLYNTEAEQRRTDNQLAQQAIASLNGQLQKIKGIDDKTLPDADTSSAIHAEVIQLQSVEELQTKLIAATKERDRLLLALKTEQEEHAKTRTNLTTALGDAIDGMKQRS >NC_019751.1|WP_015198915.1|3969169_3969865_-|sugar-transferase MSAFIFSADGSAAEKITNHPDSIKYLQNSIHPSISSNTKRLLDIFGAVIGLLITACLFIPIACITVISDPGPIFYSQIRCGLNGKTFRIWKFRSMVVNADRLKHLVKNEAQGHIFKCVDDPRITPMGKFLRRTSLDELPQFWNVLKGDMSLVGTRPPTLDEVAKYKPHHWERLRIKPGMTGEWQVNGRSSIKDFETIVKMDINYQQKWSNAYDLMLIFKTIWVVVGKSNAY >NC_019751.1|WP_015198914.1|3966383_3968354_-|acetate--CoA-ligase MSQPTIESILQEKRIFPPSLEFSQNANIKSLEDYQQIYDFAKANPERFWAELAEKELHWFQKWDTVLDWQPPFAKWFVNGKINISYNCLDRHLTTACKNKAAIIWEGEPGDSRTITYAQLHREVCQFANVLKSLGVKKGDRIGIYMPMIPEAAVAMLACARIGAPHSVVFGGFSAEALRDRLNDAQAKLVITADGGWRKDAIVPLKPQVDKALADGACPSVENVLVVKRTAQDVTMTAGRDHWWHDLQKTVSADCPAEPMDSEDMLFILYTSGSTGKPKGVVHSTGGYNLYTHMTTKWIFDLKETDVYWCTADVGWITGHSYIVYGPLSNAATTVMYEGAPRASNPGCTWDIIEKHGVTIFYTAPTAIRAFIKMGDQHPNTRNLSSLRLLGTVGEPINPEAWIWYHKVIGGERCPIVDTWWQTETGGIMITPLPGAIPTKPGSATRPFPGILADVVDLDGNPANDNDGGYLVVRYPWPSMMRTVYGDDERFRRTYWEHIAPIDGQYLYFAGDGARRDEDGYYWVMGRVDDVLNVSGHRLGTMEIESALVSHPAVAEAAVVGKPDDLKGEEVVAFVTLEGTHTASDELSKELKSHVVKEIGAIARPGEIRFTEALPKTRSGKIMRRLLRNLAAGEEVSGDTSTLEDRGVLDKLRAGN >NC_019751.1|WP_083866374.1|3976974_3978483_+|iron-uptake-porin MSQVTSVSQLKDVQPTDWAFQALQSLVERYGCIAGYPDGTYRGNRSLTRYEFAAGLNACLNRVNELIATGTENITTREDLEKLKKLQEDFSAELVALRGRVDNLETRSAEVAANQFSTTTKLSGVSIIGVQGRSNNRADINPRDGIRDTKDPGTNTNLITLNQLFLTTQTSPTSYLVTGLLAGQGSTNPRNSNDITLGYEFNTNSSFVLSDLHYHQLLSPKLAVMIGTSNVNTITAFRGPNRVENAAIGPLSYFAQRNPILDIGYVGQAGIAVDWQFSKRASLQGIYSSVSANNPSQRNGLFDGNTTAGGQLLVTPTDSIDVSLYYLNNYAANGCLLTFIGDDCLTATDPMTNKRAPIQTNAIGSTINWQLSPKFTIGAWGGYTNSHIPGKSGKVETTNWMVYLNFPDLFGKGNLGGIYVGQPPKITNSDLPLGSNVPDFISGGSGKSGGQPGTTTHIEAFYRFQVTDNISVTPGIIHLIEPGNTPDSDSVTIGVLRTTFLF >NC_019751.1|WP_015198924.1|3978820_3979015_-|hypothetical-protein MSKEENIEKILLATAIVVQPKVVPVVTAYIAAKEAEETSKTLYKYSKKASKIAYKGFKKAKKFF >NC_019751.1|WP_015198925.1|3979411_3979777_+|DUF2237-domain-containing-protein MTNAKNVLGGELEICCTSPMTGFTRNGKCETGINDMGVHVVCAQVTEEFLKFTKLQGNDLSTPAPEYGFPGLKPGDGWCLCATRWQDALKAGVAPPIVLAATHEKLLEYLPLEVLKEHALD >NC_019751.1|WP_015198927.1|3980043_3980994_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MHISIFLQQLLNGLSIGSTYAIFALGYTLVYSILGIINLAHGAVFTLGAYFTYALMGGTFGSSGLLANTTLPFKLPFATALIIGGILSGLVGVAIERFAFLPLRKQGSDALLTVVSSLGVALIVVNLILYMVGAENYTFPSDTYGNLPVSINFGTVENPIPIRTVQIIIFIVSVVIVAMMTWFINRTKYGKAMQAIAEDAMTASLLGINSDRLIVLTFFISSFLAGIAGTLLASSVSIAGPYFGITFGLRGLAVIVLGGLGSIPGAVLGGFVIGIIEAFVPGEYSGYKDAVAFGILFIMLLVRPQGLLGKRFIQKV >NC_019751.1|WP_015198928.1|3981355_3982537_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MSKTPTFKTILFTALSITITACTNSTKTSQTIPIGIAFAQTSNVALLGQEGSNGAKIAEKYFNDQGGINGTPIKLIFQDTGGEEQGAINAFQTLINKDKVVGIIGPTLSQQGFSAHPVADRAKVPVVAASNTAKGIPEIGDYVARVSSPASIVAPNSVKAALKQNPNIKKVAVFYAQNDAFNKIETEIFQKTVKDLGLEVVTVQKFQTTDTDFQSQATNGINAKPDLIIVSGLAADGGNLVRQLRELGYKGLIIGGNGLNSSNVLKVCKASCDGLIIAQAYSPQHPGKINKAFRDMYFQQYKVEPPQFSAQAFTAVQVYVEALNELDKKTKISTLQLPKIREDLNKQMLAGKYDTPIGEISFTPIGEIVQKDFYVAQIKMEKDGSAGKFEFIK >NC_019751.1|WP_051036686.1|3982797_3983505_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKIAVVGGGAGGVELTLAIQAGLQQLGSRKLEMHLFHSGRELMSNSSTSLRKLLKKILQQRGVELHLGKLSQIEKVFPEQGYKKITNCPDLFQHVFWVTQASAAPWIQKTGLAVDAEGFILIDETLQSISHPHVFATGDIATMVNHPRPKAGVFAVRQGKPLFRNLRQAVWGKPLKPYIPQQNYLSLIGTGDGNAISTISYAYASRGKLTLPPHKLLWYWKDYIDRQFMRQFERL >NC_019751.1|WP_041739691.1|3984786_3985125_-|hypothetical-protein MINLVMIGGGHSHTIALRFFATNPVPGLHLTLISDAEDTPYSGMLPGHIAGFYSRSQCHINLRRLTISAQAEFYVERVVNLDLEKKLVICENILPIAFDIVSIDIGSKLKRI >NC_019751.1|WP_015198929.1|3985249_3985861_+|pentapeptide-repeat-containing-protein MLKQTLQRQIKQLNSQEIQERLLAINQLEQITKTHPSHHWYIMEALSNFLRQSAPIDNLDIICIDIQTALHVICNRNVQHDPKNQILDLSFTNIPNVNLDNTNLQQINFYQSNLTNASLKNANLHQAILAAANLKGANLERANLSSANLGAANLTNANLRAANLHRANLYLANLEGAIVQEANLWEANLREANFKGVRQPLNS >NC_019751.1|WP_015198930.1|3986142_3986790_-|J-domain-containing-protein MDLGDCYRILGLRTGASFADVKSSYRRLAQLYHPDINPEDRKAKDKFIALTEAYKLLLQVLPATDVVMPQSKATRQATTQQRTATTRKPSGTSPAAAEATTGVAKERVQTKPPNLAEIEQRLKWKTYEQLQRFLQERRFPQAIALAEALAERLPDDAEVRQWQAVAYQVWARALITEKQWLKARIYLKKAMKTDPHNKSLLYEVQCDFQKLEQIF >NC_019751.1|WP_015198931.1|3987351_3987948_-|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MPIGVPKVPYRLPGGQQTQWIDIYNRLFLERIIFLGREVDDDIANKIIAEMLYLDSEDPGKDIILYINSPGGSVSAGLAIFDTMQHIKSDVATICVGLAASMGSFLLTAGTKGKRLALPHSRIMIHQPSGGTRGQATDIEIEAREIIRIRHQLNNIYANTTGQTLQKIEKDMDRDFFMSAAEAKEYGLVDRVIEEKPF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_18 | 4624382-4624475 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_18
|
1 spacers
spacers of NC_019751_18
>18.1|4624405|48|NC_019751|CRISPRCasFinder TTCAAGACTCTTTACTTCGGTAAAACAAAGCTTAACCCCAAGAGCGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_18
The CRISPR arrays of NC_019751_18 >merge|NC_019751|18|4624382-4624475|CRISPRCasFinder GTTCACCACCGTAGGTATCGCACTTCAAGACTCTTTACTTCGGTAAAACAAAGCTTAACCCCAAGAGCGTGGTTTACCACCGTAGGTATCGCAC >NC_019751|18|17|4624382-4624475|CRISPRCasFinder GTTCACCACCGTAGGTATCGCAC TTCAAGACTCTTTACTTCGGTAAAACAAAGCTTAACCCCAAGAGCGTG GTTTACCACCGTAGGTATCGCAC
>NC_019751.1|WP_015199421.1|4623815_4624298_-|hypothetical-protein MILHISIDAHNPLQVATTLAEVLNGKIYKFFIPGSYLVMPFDNYGTHIVVFKEGDVWVPGNDVKAAQVLSAEPSKLVANHTAMVVPTTQEQIQQIGKREGWRVLTRKQGEGVPFSAIEFWVENRILFEFLTPEFVPQYLQTMQPEIIEKMFGLPIQLVPA >NC_019751.1|WP_015199420.1|4623238_4623715_-|hypothetical-protein MIHHISVAAHNPQHVSQVLAEILQGQSVPFPSHSGSYVALAFDSQGTMIEVHPLGTTLFPSNEVNEAVELRHNSASSNHTAIHAAISVPVSQDQIQAIADREDWRMVRCHRGDYFDVIEFWVENELLLEFLPPEIIQQYLSFMEPRSLQQQVAQSAAK >NC_019751.1|WP_015199419.1|4621129_4622917_-|serine/threonine-protein-kinase MCVRAVVSHGNKSAIHCINPDCKRPFPQPWGNRFCNSCGAPLQLNDRYVPLQTLGSGGFAQIYTVWDLQTQTEKVLKILVETSVKALELFEQEAAVLRHLRHPGVPKVESDGLFKLELCHPQPRQLHCLVMEKIDGMTLEEIQKKYPQGCPQGLVLNWLIQSVEILKHLHECKIIHRDIKPSNMMLRTAAFSRGAAQGDQLVLIDFGGVKQFNSNMRRPPNSTRLFSSGYSPPEQLIGGNVSPATDFYALGRTMVELLTGKNPADLEDSATGELQWRHLVTVKPQLGDLLDEMIKPDARSRPATTAMIQRRLTQMSQISVANGSISQLQQSISNVTQQITTAVKVSPPLFFSQVSAGVIQAARFVTQMVSTAILFVLQTVTTTVLACLSTIWAMLLTGSGAALGTMIGALLTYQTGWGEEFATLVSNQLMLVLPNNSPLTASDILLFASAGLGTACGFTTSGVFNQQRRYAIASITSIIGYCLSWFVLQGIATRSLPEAITGLILVAVTFLTLGLGFRSHHIVYSIITAFGTALSFAFLINLNLFPIDIFDPQTVTVSNLVLKTFFFTFVGVLISFFVAISHYTIIPWLRLLGWK >NC_019751.1|WP_015199418.1|4617450_4620522_+|filamentous-hemagglutinin-N-terminal-domain-containing-protein MDWIIARKIVFTFAVSLTLTQPVKAQIIPDQTLPQNSKISQPGCNNCDITGGTQVGNNLFHSFEQFSIPKNGSANFNNSVSIVNIINRVTGVSPSTIDGLIKTSGNANLFILNPNGILFGDGAKLEIGGSFFATTANSLQFGNLGFYSAVNPNSPSELLTINPSVFFFNQMKQQVQVNNSNLSVPANQSIFLVGGDVNLNNSKLQTPGGKIELAGIENNGSIGLAVENNKFSLIPNNSERANISLTNNAKIDVTGNGSGTVALTGRNLQITTGSVIAAGITQQLTGVPSPGDININVTDKFQISGDSIVANMANFRSNGKAGNINVNANSVEVTGGIIRTRTSGNGDAGDINIIGDNIYINNPAYKMPGRDTRLEDKPALDASNYTNDALNSGRGRSGNVSLNANNSITLIGLGIDEENKVISTYNRSGGNGGGGISLIANGAILFDNAYVVTSSFSRNGAGNVTLRGNGSISLINNSAINSISFVSGNSGDISLSSQGPILLRTGKINTQVANDIAVNQPSLGNAGSITISGQSVMIQDGTEIKSSSFAGGNSGEIKIIAPEFVEVSGNGIFPIPRGYRPRNYIYSSVTSSNEEKAIGNGGNIYISTNTLRLADGAHIRANTRGPGKGGDITVDAKVLELIGGGQIITTTSGKGDAGNITLNIKDQANISGFNPDYDQDFKQVVAKILADSSGNKVPKTATQLKNEALIKIGSINSASGIFADASDSSIGQGGDLTINTNSLEVRDHAKLTVTSDGLGSAGNANINAGTFILDRSSLTADTGSRNSDLNSEQATINIQSQNLFLFRGAKITTNASGSNVVGGNININTEVLAALQNSDISANSANFRGGKVFINAEGIIGTQFRNSLTDESDITATGASPELSGKVEIISPDTDPSRGFIQLREGLKDQSDQIDQLCGRGKKPLGRFVVTGRNGTIPSNPIINLMQGEIDYSELATLDESNATTKLSSIPDGLMVKNPEPNRIVEAQAIVRGADGILYLVDKAPTVRPNSRPTVSACADVGK >NC_019751.1|WP_015199417.1|4616121_4616730_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MNFRILTTVAALLYFGLAGQAQAENQQDLEQLKATGNCPRCDLSGVNLSGANLGGVILRDANLKGVNFTGANLRGADLTGANLEGAVLNNANLYGASLTGATLKAASFENANLSFASLMGTNLEGTNFKGSTQQMTNYRGAYFRLTTTPSSVVTSDKPYGWSLQRDIKRDCNKFKLDGASGSVCATDQAPGSSMQPPQQVKN >NC_019751.1|WP_015199416.1|4614484_4615963_+|carotenoid-oxygenase-family-protein MQAYQASSTTEKSYSLESWQGGYKSLKQEYDYWIEDIEGEIPPDLSGTLFRNGPGLLDINEQQIHHPFDGDGMISKITFTDGRAHFRNRFVQTEAYIKEQKAGKILYRGVFGTQKPGGMLTNIFNFKLKNIANTNVIYWGGKLLALWEGAEPHILDPITLETLGKEYFNNVLSEGEAFSAHPHFDPSCAMDGGNPCMVNFSITPGLSTTIKVFELDLSGKVIRKHAHFVPGFCFIHDFVITENYCVFFQNPVKFNPIPFALGMRGAGECIKFDPNQPTRAIVIPRNPKNQEIKILEMQSGFVFHHANAFEKAGEIVIDSICYANLPEVEPGSDFRQTDFDALSPGQLWRFHLNLEQQTVQGKLLEARSCEFPSLHPELVTRSHRYLYLGAAHSETGNAPLQAFIKVDVETGEKLLWSAAPQGFTGEPIFVPRPNATNEDDGWVLGLVYDSQHHRSDVVILDAKNLTVIAKLHLQHHIPYGLHGNFVNQVFLG >NC_019751.1|WP_015199415.1|4612910_4614356_+|folate/biopterin-family-MFS-transporter MLVSSSGFSKVKELVKEKILFGNEPSAELIAILTVYFVQGILGLARLAVSFFLKDELRLSPAQVSALLGIVALPWIIKPLFGFISDGLPIFGYRRRPYLILSGLLGTISWICLATVVHSPVSATIAIALGSLSVAVADVIVDSLVVERARGESQADAGSLQSLCWGASAVGGLITAYFSGMLLQYFSDRTIFLITATFPLIVSGVAWLIAETPINKDQTQSENTAIDIKQQIKQLRQAITQKSIWLPTAFVFIWQATPTADSAFFFFTTNELHFEPEFLGRVRLVTSLASLVGIWIFQRFLKTVSFRVIFGWSILLSSALGMTMLLLVTHTNRSLGIDDHWFSLGDSLVLTVMGQIAYMPVLVLAARLCPPGVEATFFALLMSVSNLASLVSYELGAGLMHWMGINESNFDNLAVLVIITNLSTLLPLPFLNWLPGSDIEENPANLPPAAVHCHEQSLIPEFVPELILRQPKPRKKEEGGF >NC_019751.1|WP_015199414.1|4611218_4612376_-|hypothetical-protein MFKVATGHSIDPDSASAIAEVIKQCKLTLEGELPQAGILFAAIDFDHALILSQIQDAFPGIELIGGTTNGEISSSMGFQQDSLTLMVFASDEVEIKAGLGKGVSKNPISITKQAIEMAKAKISAPPQLCLTFPDSLSNNGVLILEGLKQSLGEEVPIIGGMTADDYTFSQTYQFFQNQVLSDAVPILLFSGNLQFSFGVASGWTPIGKPSCVTKVDGNVVYEIDGQRALDFYQYYLGAEKFAANYAIHALAVFEDSDRFYMRAPNGYDNESGSVTFFSAIPEGAMVQITDASRENILQASETSLKEALTNFPGKNITAAFLVSCAARRRILGTLTSEEYQLLKKHLPQVLPCCGFYAYGEIAPLTSKGQTQFHNKTFVTLLIGTN >NC_019751.1|WP_015199413.1|4610152_4611211_-|two-component-sensor-histidine-kinase MNSGNDSERVKELEKANRILEKQIARCQRDRKQLETDIAAKEFLLKQVISELQDSQSALASRSEELEITLQNLHNMQSQMLQSEKMSALGQMVAGVAHEINNPVNFIYGNLGYLESYNQDMLRLIQLYRCFFPNAPKEIEKLQNEIEIEFLQEDVTKILNSMNLGTNRIREIVLSLRNFSRLDEAEFKAVDIHQGIDNTLLILQHRLKATSTRLEIFVVRDYAILPDVECYPGQLNQVFMNLLANAIDALEEVDFQQNFAQIKIITSVVNSHWIEIAIADNGNGIPESIQSQIFNPFFTTKPVGKGTGMGLSISYQIICEKHGGKFNCSSSIGKGTEFTIQIPIKQPSHNAS >NC_019751.1|WP_015199412.1|4607714_4610066_+|DNA-helicase-PcrA MTTTIDFLSHLNPCQRRAVEHYCGPLLVVAGAGSGKTRALTYRIANLILQHRVDPENILAVTFTNKAAREMKERIQKLFAEQMAMREFGEKFDLLPEYDQVKLRSRVYRTVIKDMWCGTFHSLFSRILRMDIEKYQDENGRKWQKNFSIFDDSDAQSLVKEIVTKQLNLDDKKFDPRSVRYAIGNAKNKGLSPKEFELDQPNYRGRVISQVYSAYQDKLAENNALDFDDLILVPTRLFQQNSQLLNYWHGKFRHILVDEYQDTNKTQYELIRLLSTNNQSKNDWNWNNRSTFVVGDADQSIYSFRQADFTILLGFQDDFGDGLADDDTSTMVKLEENYRSCENILEAANHLIENNTQRIDKVLKPTRGAGEQIYLFKADDEVVEADFVINQIRRMETEHPNLNWGSFSILYRTNAQSRPFEDLLVKYQIPYTVVGGFRFYDRKEIKDILAYLKAIQNPADSVNLLRIINTPRRGIGKSTTDNLTRAAQELGTNLWEILSDETSVATLAGRAAKSINSFAGIIKKWQTQIETLPVAELVQGVIEDSGYVQDLHTQGTDEASDRIENIQALYNAVLEFQEENEGEENVNLQSFLEKTSLSSDLDNLKEGESAVSLMTLHASKGLEFPVVFLVGLEQGLFPNYRSMQDPASLEEERRLCYVGITRAQERLFISHARERRLYGSREPAMRSQFLDELPTELIATPGGKRQGYTKTSTGSTKQAKAKPSSEGETLTWQVGEQVLHRSFGIGEITHVFDSGSKTSVAVKFAALGTKIIDPRVAQLQRVE >NC_019751.1|WP_015199423.1|4625521_4626178_-|glutathione-S-transferase-family-protein MLKFYYNPVSTNARRVWVALLEKEIPFEAILVNLDGEQLGDEFTAINPLQRIPVIIDNQLRVVESLAILDYLEAKYPTRSLMPNQAEDIATVRMVETIAVNELQLATIPFTCQLVGLEVDDRKIENARQRIIAVMEFYENLLDGNTYFVNNKLTLADIVAGTLVPSLPHFGFSLNTYPNLTAWSQKLLERDSWQQTDLKADAIASAIPSIRAILERRS >NC_019751.1|WP_015199424.1|4626295_4627519_-|PQQ-dependent-sugar-dehydrogenase MKLTKTITGKLLISILCLEIISCTSPTSESANANNQQAETTKQVSQQTNNNQACTLVEDGFGTEGKVNIKVEEVVTGLEVPWGIAFLPNQDMLVTERPGRVRLVRDSKLVEKPVATINVTESGEDGLLGIATHPDVAKNRLFYVYYTTDINGSQVNRVERWRLSENGLSASSDRVILDNIPVAQFHNGGRIRFGADRMLYIGTGDARNPQSSQDVNSLSGKILRVTPDGQVPQDNPFAKNPVYITGIRNTQGFDWSDKSTLWVTDHGPSGELGRSGHDKVSVARAGDNLGWPTTYRCESGKGLVTPSIVWRNALPPGGAAIYTGNSIPEWKGNLIISTLRSQHLQRVVFNPQSPEQVQLHEVYLQGKYGRLREAIMGSDGELYITTSNCDGRGNCPSQKDKILRITR >NC_019751.1|WP_041739768.1|4627954_4629247_-|glycoside-hydrolase-family-10-protein MTIKFHHNNMRWLNWVKNSFLKPAKFNFIVPWWERTIHILPTSLKSIAPLLFILSLISVLLLNSFTPVIAQQSRPEIRGVWMTNNDFDILRDRAKVQDAVTKLRQMNFNTVYPVVWNSGYAMYPSAVAQKAEIQPFVYKGTDGHDIIADLTNQAHRQGLLVIPWFEFGFMAPPTSELALNHPEWLTRKRDGTDTSISAGGEVVWLNPFHPEVQEFISNLVLEIVTQYDADGIQFDDHMSLPYEFGYDPYTIALYTQETGNPPPSNPQDQMWMRWRADKITTFMVHLNQEVKARKPNLIFSVSPNYYDFAYKFHLQDWLTWLRLNIIDELIVQVYNPNLQSFTNNISRPEMQEALQSIPTGVGIMTGLRNSPVPIQQIQSQVRLVQERGLGAVFFYYESLWDSGLESASERKSAFQALFPNPAFRSANRQQ >NC_019751.1|WP_015199426.1|4629619_4635496_-|AAA-family-ATPase MLTTQVNIPGYQVDKQIYNGCKTIVYRGYRESDSLPVAIKLLKNPYPTFSELVQFRNQYTIAKNINSSLILQTYSLETYKNSYILIMEDFGGISLNQWEGKEKISANLVDFLQIAIALTDALDILYRHNIIHKDIKPANILINPDTKKIKLIDFSIASLLPRETQIPTNPHGLEGTLEYLSPEQTGRMNRGIDYRTDFYSLGVTFYELLTGGLPFQSDDPLQLVHCHIAKQPPHTAHNGEIPQVLWDIIMKLMAKNAEDRYQSALGLKCDLENCLSQIKEAGKIEDFKIAQWDLCDRFIISDKLYGREAEIATLLTAFERVTCGATEIMLVAGFSGIGKTAIVNEIHKPIIQQQGYFVQGKFDQFNHNIPLSAFVQALRDLMRQLLSESDSKIEYWKSQILSAIGNNGQVIIEVIPELEQIIGSQPIVPQLSTNAAQNRLNLLFQKLIAIFTRKEHPLTIFFDDLQWADSTSLNLIKLLTTEITPGYLFIIGAFRNNEVSSNHPLICTLNEIKNAGITINTITLLPLSVSDNNRLIADALKCTLEESLDLTKFIYQKTQGNPFFNNQFLKSLKENGSITFNMDAKAWEFDINQIYTLDLNDDVVDLIVTQLKNLPQSTQNSLKLAACIGTSFKLKILSIITEKSQIDTANDLWQALKEGFILPRNEASKFSQSNIVQDNNKLDNIFIFEDCEYKFLYDRVQQAAYSLIPEEEKPATHLKIGQLIIENNSPENCQENIFEIVNQLNIGRALINQESEREQLIILNLTAVRKAKAATAYSAASNYLAICIELLPFDSWNSHYDLTLKLYEEAVEIAYLNADYQLMEEMIEIVLSQAKTLIDKIKVYETKILAIKAKSQLRESIEVGLELLKLLDVEFSKQPTSEDIGEALTETLLAWKEISIPSLLGAKEMSDPIKLAAMRILTQLTPSAYQAFPSLMPLLIFKQIIFIIAEGNCPISAFSYADYGLVLCGIVGDLDAGYKFGELALNIIDRFQGDFYKCRTYFIVYSHIHHWKSPLSASLPFFLEAYQVGLAHGDLESSALNAQMYCCHAYFVGKELVALASEMDIYRQAVEELKQQGALTSLEICQQTVLNLLGHSDDPCQLVGDIYDENESLPLLKTLHNRAAIYHLYYHKTVISYLLGKYQQAAFYASLVESYADIMPAAFTIPLFNFYNSLLSLQLYTYAETKQEKNNYLKKVVTNQRQLKQWSNSAPMNHLHKFYLVEAEYHQLLANYQEAIEYYDRAIRLAQENKYIQDEALANELAAKFYLTWGKERIAQSYIIDAYYCYVHWGAKVKIEDLEQRYPQLLAPILQKQQQSLNANEIIPIASFHSSKAATLGINSISETLDLATIIKASQTLSREIELDKLLIALLEVLLENAGADKCVLLLPKNEQWVIEGICQLGQSPIVLQSIPMQLGQYLPISLINSVKHSLKASVIFNAVAHANLAVDPYVLHQRPKSVLCTPILNQGKLVGILYLENSLTTGAFTSDRLELLNLICTQAAIALENARTYQQAQNYGKQLEQSLEALNASEARFQKLADNIPGVIYQLRLNQNGSFSMSYISSGCYELYEVTAEELISTGRSIRSFEHPEDVTKIDEAILNSAQNLTPFQYQWRIITPSGQIKWIQALSQPERQENNELIWDGVILDISQRQAALQERKRAETERQKKAEALETALQELQQTQIQLVQNEKMSALGNLVAGVAHEINNPIAFLGGNIQPALEHIQDLFGLVDLYQEKYPHPEAEIENEIIAIDLDYIREDLPNLVGSMREGVKRICEISNSLRTFSRKDSNCPVACNLHDGIDSTIMILKHRLKASDSRPEIQIIKQYGEIPSIECFAGQLNQVFMNLLANAIDALEESNIGYTYAQIKANPNLIIITTQIADNPRQIIISIKDNGKGMTPEVKQKIFDHLFTTKSVGKGTGLGLAIARQIVVEKHHGAIDVNSTLGEGSEFLIRLPF >NC_019751.1|WP_015199427.1|4635634_4636210_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MPKIVDHKQYRKELLAKSFNIFAERGYGAVTMRHLSQGLGVSTGTLYHYFPSKRALFEQLVEEETTRDILIVSAEFKEIEGIENKLNFVGRYLTENQDYQVKWMYIMVDFFQTQDAEEVRQNDFWERLLQRFVLLVYDLLGVEDLILANFVISFIDGIIIEKILANEMVDFNEQCQLLGKMLSLYVNNLKK >NC_019751.1|WP_015199428.1|4636247_4637642_+|biotin/lipoyl-binding-protein MTLNLFTKPGNKQMIALIIGAIVITGGVIYYGVSQFGIIGKATSPKAETLPEIKKVTALGRLEPEMKVIQLSAPSNLDGDRVLAVMVAEGDKVSKGQIIAVLDSRDRLRDAALVAEKQVAMAKAKLAQVKAGAKTGDIRAQQAAVGRFQAQTQGDKIGQQETIARLQAQWQGDRVGQQEVIDRLAAQLVGDRDAQLATIGKLSAELKNAEAEYERYRQLSQQGAISASLFDSKGLSVETARQQLSEAKAILTRIEATGNKQISEARTVLTRIDATNSKQISEAKIALSRINATGGKQVTEAKATLSSIAEVRNVDITVAQAEIENATASWQQAKTEAEEAYIRAPMAGQILKIHSRPGEKISDDGIAEMAQNQQMLAVAEVYQSDIAKVKLGQKAIITGQAFTGEVKGTVSQIGLQVNRQNTFANQPGENMDRRVIEVKILINQEDVNRVSGLTNLQVQTAIEL >NC_019751.1|WP_015199429.1|4637701_4638037_+|DUF2834-domain-containing-protein MLQLTYFLLCLLGFTLPISQFIPFLVEHGLNLELFIHQLFINRISTFFGMDVFVSAVVVIVMIFAEGTRIQMRNLWIPILCLVVGISFSLPVFLLMRQKHLHHQQSIITPI >NC_019751.1|WP_015199430.1|4638061_4639219_+|FtsX-like-permease-family-protein MPPKIFKKTPLAWRQLMKEKTRLLVAVAGIAFADILMLLQMGFESALYDASILPHRQLNADLVLIDPYMQTLFAVKSFPRERLYQTLASEGVVSTTPVYIASGQWRNPETRLERTILVWGVDPLLKTFKMPEVNQNLGQIKQLNTVLFDIAGRPDYGVTKENFLTFETELNSKSVNVEGLFINGASFAADGNIITSDSTFLNLFADRKSEKIELGLINLQPGSDVKRIQKQLIANLPKDVSVLTTEEFAQIEKTYWANSTAIGFIFGIGVGVGFIVGIVIVYQILYSDVSDHLPEYATLKAMGYTDGYLFGVLMQEALLLAVLGYIPSFFVVSGLYVLAANATMLPIVMTAERAVTVFVMTIVMCSISGFVAMGKLRSADPADIF >NC_019751.1|WP_015199431.1|4639404_4640106_+|DevA-family-ABC-transporter-ATP-binding-protein MAVISISNLNHYFGEGGLRKQALSDINLQIQAGEIIIMTGPSGSGKTTLLTLMGGLRSAQEGSLNILGQEICGANKRELTQLRRNIGYIFQAHNLMMFLTAKENVRMSLELHEEFLHQDLNAVAVEILEHVGLGERVDYYPENLSGGQRQRVAIARALVSRPKIVLADEPTAALDKKSGRDVVELMQKLAKEQGCTILLVTHDNRILDIADRIVYMEDGRLVSNDVDLMTKMS >NC_019751.1|WP_015199432.1|4640250_4641423_+|VCBS-repeat-containing-protein MFESNKSSELSTDARQSAYVQSSGGFTDKLDTTSSISKSSLFSANPNPNPYVTSAAINPDFNGDGKTDKIWFNTQTGETAIWLMDGGNPNGVMLPQSAAEWDMKIADVNGDNKTDLFWRNKNSGELVVWVMDGANIVSQTSVATLDKAWDFSIADTNGDRKTDLVWNNKQTGDNAVWLMDGGTITSAEMLTKTDSNWTSRAGDFNRDGKTDLLWHNKSTGENAIWYMDGTKVNGAGLQSFGAGWDLTSGDFDGDLKTDVLWHNNQTGENKLWTFDITGAAVQSDLATMGAGSKYSIADFDGNGKTDIIWRDESTGTNKVWLMNGATVTEQDVPQLGSNWKYSVGDFDGNGRADIFWNNADTGENMIWSVDDQGNPISTNTVTTPKGWITY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_19 | 4750254-4750354 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_19
|
1 spacers
spacers of NC_019751_19
>19.1|4750277|55|NC_019751|CRISPRCasFinder GGCTTTTTGAAGGTTTGCTTGGACTTCTTCTAATTGTGCCTGTGCTTGGGCAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_19
The CRISPR arrays of NC_019751_19 >merge|NC_019751|19|4750254-4750354|CRISPRCasFinder TCTTGGGGACGATTCCCCGCTTGGGCTTTTTGAAGGTTTGCTTGGACTTCTTCTAATTGTGCCTGTGCTTGGGCAATGTCTTGGGGACGGTTCCCCGCTTG >NC_019751|19|18|4750254-4750354|CRISPRCasFinder TCTTGGGGACGATTCCCCGCTTG GGCTTTTTGAAGGTTTGCTTGGACTTCTTCTAATTGTGCCTGTGCTTGGGCAATG TCTTGGGGACGGTTCCCCGCTTG
>NC_019751.1|WP_015199514.1|4747967_4749260_-|FtsX-like-permease-family-protein MIKLKPINKKTPKPIDTRTVPLLEILSMAIETLWSNKLRTGLTMLGVIIGISSVIAITSVGQGVQKGVEQQIQSLGTNVLQVLAGAARSGNNISQGLGSSSTLTWEDSKAIAKQAPSAEIVSAYLQRSAQVVYEGQNTSTIIYGTDLNYPEARNTFTQQGRFFTQEELDTAAQVAVIGPTVQKTLFSQGANPIGERIRIRGEAYEVIGITEAKGSQGPMDRDDQIFIPLTSMSARLVGNNALAGISVNGILIKASDQQKLEAAQFQVTNILRLRHNIYPPQPDDFRITNQADIISTFTNVVGLFTVMVVAIAGISLVVGGIGIANIMLVSVVERTREIGIRKAVGATNSAILNQFLTEAIVISSLGGGIGIAIGIIIAFAAATVFKFPFVISLLSIIVGFLLSLIVGLIAGVIPARNAAKLDPINALRSD >NC_019751.1|WP_015199513.1|4747190_4747862_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MPTMIWMESITKTYQLGEVSVPILKGIELAIEEGEYVSIMGASGSGKSTLMNILGCLDRPTGGDYIFEGRNLTTFNDDELAYIRNQRIGFVFQQFNLLARATALDNVMLPMVYANLPKPKRRERALAALERVGLAERTTNRPSQLSGGQQQRVAIARALVNRPALVLADEPTGALDTETSHDVMKLLTELNEQGITIVIVTHEPDIAAQTKRIIRVQDGLIVN >NC_019751.1|WP_015199512.1|4746449_4747037_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTWETLSENGEYKVSDFKVLQTADIQHFLPLFKELTEFNERFLLSMLRWCGYGRKRNREVPVWSVYVAFHLNKPIGVTGVYCEQEDPSERCWLGWFGIIPDYRRKRVGSYLFNTTCKISRSKGFSSLYIYTGGSNEKAISFYESIGCNKLGFGYEVFPNSCFDNFSKSNMILAFDLTSTDKVNSKSFPLLPLADS >NC_019751.1|WP_015199511.1|4745615_4746218_-|hypothetical-protein MKYRSILWLNGLCLLIVITLLAYTKYINPLAGALFMPPHFPNSLTEGLLTNIFQLLCAVPPLICAFSFIVLKKIAPQNKNNRFIFYSALVTLGFLMNEKYRIHIIFLADFGIPKFLTIVVYALIGLYYGITFRREIIKSTPYVLLLIGLGLLISGIFVDLLHLGSSSSSPLEGIPKLFSGINVALYYWLICYKEVVNSFK >NC_019751.1|WP_015199510.1|4743902_4745399_-|HlyD-family-efflux-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MRNSLAANAAQARQTKQVFARPEDQLSYELGKAVQELPPLYTRVLAGTLSAVVFSAIAWAYFSQIDEVATAPGELIASTQVRPVTSIGNGSIVAVRVKEGDRVTKNQVLVERDPEYQQLDVTRLSQSAKLIKEDISRLNAERTGNKDAGSQMQDELLSARLKDFESRQAAAEAEAKRQTALIDQAKVRLARLQENLTNARTSQENSKANYENSLLLRTKVEENLALAQKREESMRKLVASSAVPRLDYLEAQDRLNRAKAELTRAGDEIINSQNKITEATDKATSLEKDIAAQVQEVRQAQQAYQSAKNQSDRVASERQSEVLTQMNKRREELTDVSGKLDQARKQSDYETIKSPVSGTIYSIKATKGPVQSGEELLSILPDGEEILLEVKVLNRDIGFIRQGMKAKVKMATFPFQEFGTIDGEVVKISPNAIVDKELGLVFPTRIKLKKDRLTVRGEEVVFTPGMSASGEIVTRKKSVLTFIMEPITRRFSEAFSVR >NC_019751.1|WP_015199509.1|4743400_4743661_+|hypothetical-protein MDSQPQQPGTQFLTSEESAKVDAALLSSSEKFLTRITISSLRLLKHVAEENNVPIEDLTVQQVIQWFENDARIRREEGAEAAFLKW >NC_019751.1|WP_015199508.1|4743162_4743339_-|hypothetical-protein MKEAGGKRQRAEGTIGRGFRPQWDLKPLLPLVTAEDRKQYSLLPSAFPDNATDGLVGV >NC_019751.1|WP_015199507.1|4742718_4743066_+|hypothetical-protein MARYTCSFIVSVAIDHLQPLMIELLESSGLDVQYYTPDYIMAREAPGSIDFPKLVTVEILIDKTTATDLETRMTLVGKSAELPLKLDNHCRQVFDFIKQEIEHSRHWHLIQSLAG >NC_019751.1|WP_015199506.1|4741507_4742413_-|TIGR01777-family-protein MKVAIAGATGFVGSRLVERLHKQGMSVVVLSRNTTHAERVFPNTAFPNVEIVNCDSWQNAIASCDGVVNLAGEPIAEGRWTPERKQEILNSRKQTTQTIVQAISNSSQKPQVLVNASAIGYYGTSEAATFDENSPAGQDFLAEVCQTWENEAKKVTNSGVRLVILRLGIVLGNGGAMGKMITPFKLFAGGPIGSGKQWFSWIHIDDVVGLIVEALTKPEMQGVYNATAPQPVKMTEFCQVMGKVMNRPSWLPVPSFALEALLGDGAIVVLEGQQVLPTRTLASGFGYKYDKLQSALVEIIK >NC_019751.1|WP_015199505.1|4741177_4741423_+|hypothetical-protein MKEKLLNWLNLVLVADVFLVLLGFIWFAIAIVGEATGINLGLDLWHQLWQPLFNPAIGILMGGALLSGIISWFSKKFLSNH >NC_019751.1|WP_015199516.1|4751992_4753450_+|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MQLQVKPITKSQNELDNFWQENIQPLFTEESLCFQVKTTDGKEVRYVNLDNGATTAPFAPVKRYVEEMLDCYGSVHRGSGQKSLISTREYDNSRDVIRNFVGASQNNYVIFAKNTTEAINAAATLWAKIPGKILVSDIEHSSNLLPWVVNNEVVQYRTEADGSVDIAKIEAILVAHKDLPVTEQIKLLTITGASTITGYKPPIYEIAALAHRYGIKIFADLCQLVQHDRVDMLPDNDPCHLDFVAFSGHKMYAPYGTGILVGSKNFFDQFHPYQIGGGNLPYITRNLEIKRFYTERAHDPGTPNAMGAVAIAKSIQIIESLGREEIAHYEHSLVEYTFKQLSSIPGVRIHIAGDGIAHVIPFDIDGFDGRLVAEILAQEYGIGVRAGAFCTYEYIRKLKGISDEQDEVIAAEVDQGITRNIPTIIRASFALSNNFEDCQRFIDAIAQITENGFAHYLPKYSQDNTTGVWTALAASEYTHSGYRLT >NC_019751.1|WP_085953345.1|4753575_4754196_-|tetratricopeptide-repeat-protein MPTLAQAQTLVAQRTTQEVKQMLEEGKRLVDAGDYGGAIAIYKEAAAADPRNATIQSGIGYLYAQQGNLPSALIAYRRAVALNPNNDDYQYALGYVSGNLGDNRAAKDAYRKAIQINRNNANAYLGLATILLRLGETNNAMWATEQAMNLEPNNPQVFELRGTFLMKQGKSKDAIALFRKARDLYEKQGKQDNANRVEATIRKIRS >NC_019751.1|WP_015199518.1|4754586_4754916_+|YbjQ-family-protein MILTTTDVLQGAVVDSYLGIVTAEVVYGSNFLRDFVASIRDIIGGRTVSYERLFEQGQQKALAELQERAKRLGANAVIGIAVDTGTINVDQSGVLMLITATGTAVKIRQ >NC_019751.1|WP_015199519.1|4755116_4755746_+|hypothetical-protein MSYVNRMDEGDVISEPAVVARVADYHDRVRWGPIISGLLVALATQLVLSAMFAAIGAGNIEASGRPRTIAGDVAGGVGIWSIIALLISLFTGGWVTARACGPMNRNTAILNGAILWATTLAVSSWLLASGVSGAFGVAASNAGEVVNQIQGRALDVPQTNVSAQQARELASGVRQSLWWFVFGSILGLVTSIAGAVTGARSPRRNGNYS >NC_019751.1|WP_041739778.1|4755951_4756560_+|CAP-domain-containing-protein MKTVTHPWLSPLEEQVVVEMNKARSCSNYEGASHSRSYIEILESYKQRFDGKRVWLSSDVYLQTQEGVKAVDEAIKYLKKVTPAPPLTVSRGMSLAAQDHVKNQGIKGITGHNGSDGSNPFLRMERYGKWLVTAGENISYGSYMPEDIIMQLIIDDGVPDRGHRVNIFNPAFKLAGVAFGIHAKYRQMCVITYAGGYRENMI >NC_019751.1|WP_015199521.1|4756671_4757880_-|DUF1624-domain-containing-protein MRLTSLDVFRGATIAGMILVNMVSLAEPNVYPALLHADWHGCTLADLVFPFFLFIVGVAMSFSFAKYTDVIPKVEKEKDAIGALQQFLAKESSAAGGAKPPYKKIFRRGAILFALGLFLNLFWNSKNLPYFDFSTLRIMGVLQRIALTYLFASLIVLKLPKKAQWIVAGVLLVGYWLLMMYVPIPEYGAGEIGTRTGNFAAYIDRFIIPKAHLYKGDGFNNFGDPEGLFSTIPAIVSVLGGYFSGQWIRSQPVKTRTSLGLALAGIGCLIIAWLFALDFPINKKLWTSSYVIFTTGWALLLLAGCYELIEVQKIRSWAKPFEVLGMNAIAIFTASVLFIKILAKTVIGTGDTATNLYTVIYKNLFASWAGGLNGSFLFAFVTVLLWLGVAWMMYRQRLFIKI >NC_019751.1|WP_015199522.1|4758100_4758547_+|peroxiredoxin MAIKTGDAAPDFSLPSQNGTSVSLQDFRGKSVVLYFYPKDDTPGCTAESCAFRDQYEVFKSAGAEVIGISGDSPASHQKFAEKYQLPFTLLSDQGDKVRNAYGAKSLFGLFPGRITYIIDGNGVVKHVFDSMLNFQGHVEESLKILNS >NC_019751.1|WP_015199523.1|4758858_4759986_+|AI-2E-family-transporter MKLGQWIGLLAIVLSSYILWQIREALLLAFAAVVLATTLNRLSRRFQRLGLKRGISVIISVLIFIALVVGFFWLIVPPFVDQFQELTRKVPQGLQRVNFWLLEQKTHIPPQLITYIPDINRLVQEAQRFISPVLGSSFAFLSGSLEALLKILLVLVLTGMFLADPKAYRKVFVRLFPSFYRRRIDGILDKCEESLEGWVTGAFIAMSAVGIMSVVGLSILGVPAALALGILAGFLNLIPNLGPTMSVIPAMAIALLDAPWKSLAVFIVYLVIQQIESNFLTPYVMARQVSLLPAVTLISQLFFVTFFGFLGLFLALPLTVVAKIWVQEILIKDILDQWNSDAERETEFVMISEVQNVINVQQPPPNDVPTKKEEE >NC_019751.1|WP_015199524.1|4760293_4760722_+|peptidylprolyl-isomerase MTQAKIGDTVTVHYTGKLSDGTVFDSSNGGDPLEFTLGEGELIAGFENAVVGMNTGETKTAEIPVEQAYGLYNPDMVIEVDREQMPAELEPEVGQQLQLEQPTGEMIPVVITKVEESLVTLDANHPLAGEDLVFDIELVAIA >NC_019751.1|WP_015199525.1|4760787_4761195_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MATSQNEFKIQKTDQEWKESLTPEQFQVLRKHGTERPHTSPLNKEYGEGTYVCAACGTPVFTSTTKFDSGTGWPSFYQPIEEGIDTTVDRSFFMTRVEVHCKNCGGHLGHVFNDGPAPTGKRYCINGVSLKFDQQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_20 | 4840951-4841096 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_20
|
1 spacers
spacers of NC_019751_20
>20.1|4841000|48|NC_019751|CRISPRCasFinder GTGATAAGGGTTGGTTTGGAAGTGCGATCGCTGTTTGTTAGGAGTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_20
The CRISPR arrays of NC_019751_20 >merge|NC_019751|20|4840951-4841096|CRISPRCasFinder TTTGGGAGTGCGATTTTGTTAGGTTCGTTGGAGAATGCGATCGCCCTTTGTGATAAGGGTTGGTTTGGAAGTGCGATCGCTGTTTGTTAGGAGTTGCTTTGGGAGTGCGATTTTGTTAGGTTCGTTGGAGAATGCGATCGCCCTTT >NC_019751|20|19|4840951-4841096|CRISPRCasFinder TTTGGGAGTGCGATTTTGTTAGGTTCGTTGGAGAATGCGATCGCCCTTT GTGATAAGGGTTGGTTTGGAAGTGCGATCGCTGTTTGTTAGGAGTTGC TTTGGGAGTGCGATTTTGTTAGGTTCGTTGGAGAATGCGATCGCCCTTT
>NC_019751.1|WP_015199593.1|4840229_4840721_-|hypothetical-protein MESALEQTIALQKKFNIVFREIIFLESKINEKRGFWFFETHVYSKETLFNSEHHSKIDSITEKIGSDVISWNKFGKLTEEGRSVYENMKKEVNDKLEEVGKIIANREPTWWEGIESFFVEFIHKVVINNMPEILIENLAFPLFSKIPILSGVFKRIPKLLGGR >NC_019751.1|WP_015199592.1|4838796_4840074_+|adenosylhomocysteinase MTATSPRLKHEVKDLALAPLGRQRIEWAGREMPVLKQIRDRFEKEKPFAGIRISACCHVTTETAHLAIALKAGGADAILIASNPLSTQDDVAASLVVDYGIPVFAIKGEDEATYSRHVQVALDHRPNIIIDDGCDVVATLIQQRPHQIADLIGTTEETTTGIVRLQAMLKDGVLTFPAMNVNDADTKHFFDNRYGTGQSTLDGIIRATNVLLAGKTVVVAGYGWCGKGTAMRASGMGASVIVTEIDPVKGIEAVMDGFRVMPMAQAAALGDIFITVTGNKHVIRSEHFDVMKDGAMVCNSGHFDIEIDLKSLASKASEVKDVRPFTQEYKLKSGKSVVVLGEGRLINLSAAEGHPSAVMDMSFANQAMGAEFLVKNKGKLAAGIHSIPADVDKEIARLKLQAMGITVDTLTQDQIDYSNSWTSGT >NC_019751.1|WP_015199591.1|4838108_4838372_-|hypothetical-protein MMKHYILSLNPTAKHEWDRCILRDPLTAKRPDIAKMVAEAIGTNGGSYLVSVNIEIKVLEEASMPQFDQLSLNITEVMEKPQLREAA >NC_019751.1|WP_015199590.1|4837432_4837978_+|hypothetical-protein MQNTKFIASLLASAVILPLFTIGGENTATAQRPVSLLRAKCVNSGLGSAREEDMNVSIGRGVYSSRFYLGPGYRSAAITCKIQPDNNQPIFQTLNLGFGMRDNDNRSASVNVVIYVDGKQVETRTISPSKQADVTIDVTNAANVAIEANCSSEKEYCDRVYFYNASLQRPAKQQPAPAEKK >NC_019751.1|WP_015199589.1|4836702_4837308_+|Uma2-family-endonuclease MTTQLPIEIEITPIELKFHPVISINDDQLFDFCQLNRDCRIERKANGEIIIMSPTGSETDQRNFDLIVQLGIWTKQDGTGVGFGSSGGFTLPSGAVRSPDAAWIKKTNWEAIPLEKRQKFAPICPEFVIELRSASDSLKVLKNKMEEYIENGTLLGWLIDRVQRKVYVYRPHTVVEELENPTTLSGEDILPGFALDLNPIW >NC_019751.1|WP_085953346.1|4834809_4836618_+|hypothetical-protein MFAAPQVAGIGFNQENKVLAQTQLSCPAGTIPATFNWTPSNNLADFLRQSLNAEGVGVRFEFTESTSGVIDTEESRILNSVYGGLPAPNLFFNIGPQKTPAPGGATLNITFSQPVTLASPLILMDIDRNGERDLGFIYQDRVTVTAFNNGSPVSVNTRTLGSPSTVRLTGNLAEGINENSFPDRSDGNIEVVPSGAVSQIRILYEPGQEYGTPTQDESIGVAKITICAPAGSIGDTVYNDTNSNSTQDNAEVGIGNVPVTLVGAGSDGQFGTGDDFTRTTTTDSNGKYSFTELPGGNYRVTVNTPPSGFTPTQVPNNPVTLTPGQKIDTVDFGFNQRQVGSIGDFVFSDRNRNGVADNGEVGIPNVTLILRNSSNQEIARTTTNSNGIYGFPGIPLGEYTVEAIRPGNNFNPTTRTTLPANLTQNNPNTDTIDFGFQSTGVGAEDSPNIRLLKRITGASRNGQTVTGVNFNTFTSDPNSNNDDSLNDAQRQLIRGVPNLSTPLTSGDEAEYTIYFITEGGENLQNIRFCDLIPQGTTFTNNSLTVNGAGNGGDNGRYLSPLTPVDNFSNICPANNTNGAVLVNLGVLPGGNVGFVRFRVTIN >NC_019751.1|WP_015199587.1|4832265_4834590_+|OmpA-family-protein MSRLRKKQKSLPKISSHDQLTLAKGRLGKGFQNWHYYFLPLNISLGFCFVAAAIAQQPTVTPIAIPNIKVVVNSNQDGEVQADNQLTLREAVELVNGTLKPEQLSPAEQAQIQPQTVSGSQIEFNLPSGATVIQLQKQLPDLISPGLTIDGTTQPGYDGTKSATAEIPIPVPVVTITTDKDVLRGLTVTADNITIRGLNIYGFNPEPIKQQLGNLLIYDSNPKPVTLTTPPGDIVIAHRFPPPDVSKQQPPNGNFPFGKKDVPPKNITIENNWLGLTVDEKMPEKTSAFGVYVFNSQGATIRRNRISYNDGSAIITSVRSENTIVTENIIVGNGLAGMPDALRFEGVITKSQVTGNLICANDGAGVYLFKPDGDLLLQNNKITYNGRRLRRAAVYLMGSNHQVLGNEIDNQAGPGVVVSAFPRNDVGKSNVGANNVIRDNKFASLEGLSIDLNTQRNLGVSDFQRGDGANPKRNSQNRRLDTGNGAVNAPEFTTRAFAPSGSTVTIEGKADPGAEVTIYRLSDYQRGKSAIYDIGYGALNQPIVTVNTDKSGNFSTQINNIKVGDAVSAIATDPKYGTSEPAIAAVIGEKGTITSLSATVPSIPIKPPECTSKPPEIPPPEIPPPEVPPEVPPPPITLRVPKNIHFALDKSFVSPASAKVLDQIAEVLQQYPFIVIEIQGHTDPRASDAYNLALGRRRALATRNYLLRKGVKPERMTIRSFGESQLKVPNSTDIVDYARNRRAEIVFKDIRGVEIIIEEQEGDLQIEQRRGGRR >NC_019751.1|WP_015199585.1|4827119_4828046_+|DUF11-domain-containing-protein MTSMFLWLRHKSLLFPFFFLSVITYTLSPSFAQTDIRNTARVGADNLPGGRVVDSNPVTLRAGQAALETIKTGDRAAAEPGDTVVYRLAIRNTGNVVARNVSVTDRLPIGLTLINKSVKGSIGNQSIDLTISPASNRSVTITTQQELQPNQILNVVYAVEVTPDAVRGNGINLAQARAGNLGSNQASYRLQIRKGIVSDCATLIGRVFIDKNFDGEQQRNEPGVPNAVIYMDDGNRIITDANGLYSLSNVISGYRSATLDLTSLPGYALAPNKYFIEKNSFSRMVRLAPGSMGRVNFAVTPAFSEERR >NC_019751.1|WP_015199584.1|4825032_4825680_+|hypothetical-protein MSESMAFIGGVAVAGLAALVLLRGNPSPIAQSGFTLPSQLPPQVVTPPVIQPGQYGVGQTSPNLLPGDPNSTQLRIDNERVKMQMDNLMRENDRIKAENQQLQFQLQNYNNQAQLNAIRDQSQNQLLQSQQPQTPWWSSGIIWAVGGMALTVGGGIVVAGVSALFSPKQRQSRTVQVIHPYTGPTPPLVPTRRTEFLPPRNEVRRVESPEYDDIY >NC_019751.1|WP_015199583.1|4823886_4824687_+|tryptophan-synthase-subunit-alpha MTPISECFANLAQRRECALIPFITAGDPDLETTAKALRLLDDSGADIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALQRGTTLDRVLEMLTSTIPDVRSPIILFTYYNPILNRGIEQFLEQVKQAGVSGLVVPDLPLEEARGLLEPAAAIGIDVTLLVAPTSSAERIEAIARASQGFIYLVSVTGVTGMRTQIETRVSDILKQIRGYTDKPIGVGFGISQPEHATQVREWGADAVIVGSAVVKRLAEGTPAQGLDAVGEFCHQIKNAIALA >NC_019751.1|WP_015199594.1|4841185_4841410_+|hypothetical-protein MNVEKLSISLPASLVGFIENYKLEKGCKSRSQVVEKALELLRNQELEGAYRLASQEVDSAWDVTIVDGLTDETW >NC_019751.1|WP_015199595.1|4841396_4841735_+|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MKRGDIFYANLSPAMGSEMDKQRPVLIVSNNANNRASTTITILPLTSNVTRVYPFEVLINSEDSGLSKVSKVQAQQIRTISKERIKSEVVGSLSAELMIAIDTALKLHLGLD >NC_019751.1|WP_015199596.1|4841945_4842752_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKTDTIFYTLLQNLPSVLFELLEQPSTLALRYDFSSVEIKELARRIDGVFLPKSDFLEEPIYFVEVQFQPDEDLYWRLITEAAVYLNQYKPNRTCQVVVLWAKRSFDPGVPLVYQPLFPAGYIRIIYLDELAEVSGSSIGLGIIKLVVAPENEAVQQARSLIEEVKQVDAGNRRNLLELVERMLVYKFSSYSRQELEAMFGLSEWKQTRFYQEVREETRQELKEEVKEETQMENIPRLLKIGLTIEQIAQALELDIEVVQEVVNKQNK >NC_019751.1|WP_015199597.1|4843036_4844437_-|amidohydrolase MNFIIQNALVATNDNYTTQDIQIVDKNISVSFASQLETPETVVNGENKLLLPGFINAHTHSSEMWQRGIMSMFPLELWLAELYDFAPLTTEEVYLSALGTAVETLLSGGTTVVDHLVLIPGKELETIATAVRAYKEVGIRAFIAPLIQDESIAAGIPAGDTQQTYEPYFRSTQQTLDIIEDAVKQFHNSDAGINIVVAPTGIQLCSDALFQGCAELSNKYNLCRHSHLLETKAQEKLALEKYGCTAVEHLQRIGYLDYRTSLAHCVHLNDADIEILAETKSTVVHNPLSNLRLGSGIAPVIKYRQAGVNVSFGCDGASSNDSQDLLEAIKIGSILHNVTDLDYQHWITPRDSVKMAALGGAIGLNIGDVLGSLDVGKKADLVLYDLTSLSLLPRTDPIGLLVLGRPTNIVNSAWVDGKQVVADGKVTTIDVDNLRQELFQRSHWQSQRKSKTAKELESHYRAVMGI >NC_019751.1|WP_015199598.1|4844694_4845471_+|cysteine-hydrolase-family-protein MDLPLKKLGIAPNAWTVNSEIADITRPPLNPQPVILATETKTLRIDLAKSALLIIDMQNDFCHPDGWLSHIGVDITPARQPIAPLKHLLPLLREVNIPIIWINWGNRPDLLNISAAASHVYNPTGEGIGLGDALPKNGAKVLMKDSWAANVVDELEQLPEDICIDKYRMSGFWDTALDSILKNLGRTTLFFTGVNADQCVMTSLQDAHFLGYDCILLQDCTATTSPEYCWQATLYNVKQCFGFVSDSQAMLKAIDNIY >NC_019751.1|WP_015199599.1|4845490_4845937_+|cupin-domain-containing-protein MQIKSCVIPIIKSPQDYQVFRISPDDTNRLAIVFDTANANTSLTCCIEIFDVGGKTPPNRHQWAVEMFFILKGEGVALCDGKSVVIKAGDSLLVPPTGTHMIQNTGSSRLYTLTVMVPNEDFSELIRSGIPVELDAEDLEVLNRGLIV >NC_019751.1|WP_015199600.1|4845944_4847354_-|1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate-acyltransferase MPEKIRSTQPPLKFLPPKFNPFIHQLTKLAFPLLLRFRFRPWLPSGISNFETENVVELVKLYQQFQAGKVRFLMAFRHPEVDDPLSMFYLLSRAVPKAAKQHSIFLQKLTHSHFIYDRGMTVWAGDWLGWYFSKLGGMPIRRGKRIDKRALQVARQLFTNSNMPLSIAPEGATNGHSGIVSPLEPGVSQLAFWCIEDLIKENRSEEVFILPITIKYSYPKPPWRKLDWLLTKLERESGLVTISSNNLTNQNKEEIYYQRILKLAEHLVVQMEDFYQRFYHINFEPIEIDSEFEPNTEFIKRLQRLLDKALTVAEQYFSVPPQGTLIDRCRRLEDVGWSYIYREDLADLNTLAPLTKGLADWVAIEADQRMKHMRLVESFIAVSGNYITEKPTFERFAEMTLLMFDLISRLKDNTLPGRPRLGWRQSHISVGKPISVTQRWNKYSESRHSAREEVSNLTQEIYQELKNMI >NC_019751.1|WP_015199601.1|4847560_4849627_-|S9-family-peptidase MSPNPNFISPIAKKKPEILELHGDKRIDNYFWMRDIENPEVTAYLEAENDYANAVMKPTEVLQTQLYEEMLSRIKETDLSVPIRKDDYYYYSRTEEGKAYAIHCRKKGSLDAPEEVLIDENQLAEGEDFFSLGIFAVSPNHQILAYSVDTNGSERYQLYFVNLVDHKFYPETIPDTYYSFAWANDNRTVFYTKIDDANRPFQILSHQLGSSAETDILIHHEPDNSYFLSIGKTRSDAYILLNCGSQITSEVYYLDANQPQETFKLFHPRIHGIEYEIDHHGDCFYIVTNEDAINFKLMKTLVSKSAKENWQLVIPHREDVMLSGISIFANHLVIYERKFGLPRARIQNITTGVENDIQFPEPTYAFFEGANPEFHTNILRFTYTSLITPASVFDYNMDTQERELKKETEVVGGYDKTQYRSEMLTATAEDGSQIPISIVYKQNIQKNGINPLFLTGYGSYGYPYPVSFSSSNLPLLERGIVYAIAHIRGGGEIGRKWYENGKFLNKKNTFTDFITCAEYLIEQNWTSPQNLAISGGSAGGLLMGAVINMRPDLFQAVVADVPFVDVISTIIDTSLPLSAIEWEEWGNPNDKIYYDYIKSYSPYDNVEAKAYPHLLITAGLNDPRVKYWEPAKWTAKLRELKTDNNILLLKTNMGAGHGGASGRYESLKELAFEYAFVFQRLGIEIGEQ >NC_019751.1|WP_015199602.1|4849912_4850638_-|hypothetical-protein MQTESHDPINAECTIYLIPRSHRRKFFIQFTVMTALGWVVGGVVSIVFDKLVTDKLLSTFTPQLLNLWSNWGSYASLGLFAVIFAADQAIILRKYVSGWLWILTTSCGWLIATQVSTAWINYISSLAESLQRNLLPKEILIIGIVCTGAYIVSGVWMGFTQWIVIRRYTIEAWWWNFLPSIAFFVISLLVWLLSLAYDLFPTIYRDQILGYGEQGLTALTLGIVPAIALCRLKTKGKPTTT >NC_019751.1|WP_015199603.1|4850938_4851994_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MGISANEPLLLRAARGEVVDRPPVWMMRQAGRYMKAYRDLREKYPSFRERSEIPDVAIEVSLQPWKAFQPDGVILFSDIVTPFPGLGIDMDIAEGKGPIIHAPIRTQAQVDSLIPLNPEESLPFIKTILQALRQEVGNKSTVLGFVGAPWTLAAYVVEGKGSKTYSVIKNMAFSDPTILHQLLTKFADAIATYIRYQIDSGAQVVQMFDSWAGQLSPQDYDTFALPYQKMVFDKVKQTHPDTPLILLVSGSAGVLERMAKSGADIATVDWSVDMADARIRLGKQMKVQGNLDPGVLFGSKEFIRDRIYDTVRKAGDTGHILNLGHGVLPQTPEENVAFFFETAKQLKLATV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019751_21 | 5480533-5480634 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_21
|
1 spacers
spacers of NC_019751_21
>21.1|5480556|56|NC_019751|CRISPRCasFinder TAGACGCAAAGCGCCTTGTCCCAGACTACCAATCTCACGATCTCTACTAAAACCAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_21
The CRISPR arrays of NC_019751_21 >merge|NC_019751|21|5480533-5480634|CRISPRCasFinder AGTTTTGTCATTGCAACGAAAGGTAGACGCAAAGCGCCTTGTCCCAGACTACCAATCTCACGATCTCTACTAAAACCAGAGTTTTGTCATTGCAACGAAAGG >NC_019751|21|20|5480533-5480634|CRISPRCasFinder AGTTTTGTCATTGCAACGAAAGG TAGACGCAAAGCGCCTTGTCCCAGACTACCAATCTCACGATCTCTACTAAAACCAG AGTTTTGTCATTGCAACGAAAGG
>NC_019751.1|WP_015200070.1|5480046_5480358_+|DUF3181-family-protein MAATNTTETIEALAAEIGDNIYIDIAKWHLYLRDAKIHTSVAQQLYPLIASNKTINEDDVTKIIKSVTVKIGGGRNEISLIDLLPLQCQVSIVDILEKFQRDM >NC_019751.1|WP_015200069.1|5479681_5479936_+|Pr2TM-family-membrane-protein MPPRWSRIPTREDPEYRKLDDRMTFAVHVAGFAAVNSGMWFFHIFLKTDWQWLPWVTLSWLGILVSHLIYISAIADYSETPKST >NC_019751.1|WP_015200068.1|5479130_5479637_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MQDNFSQSSQSLTHLDIQGQAQMVDVSQKATSIRTAVAVANVRMSQETFTTIEAGNAPKGDVLGTARIAGIMAAKQTANLIPLCHPLPLQKVEVQIIPQPELPGYQIEATVKIKAETGVEMEALTAVSVAALTLYDMAKALEKSIQIESIHLVSKTGGKSGDYLLGKS >NC_019751.1|WP_015200067.1|5477697_5478927_+|MFS-transporter MSAFNDIDPRLRQNLLTLFTAGLFFWSSMASLLPTLPLYVEDIGASKQQIGVVMGSFAIGLLLCRPQLGQLADKRSRKLVLIIGALVAAIAPLGYAVVKSIPLLMALRAFHGISLAAFTTGYSTLVTDLAPSEKRGEIVGYMSLVNPIGMAIGPALGGYLQSEYGYLPLFLFSTISALLCLTCVYQVFCPVVAKKTYATGEDISLWKILLSPRIRIPTLVMFLVGLAFGTLSTFVPLFIKSIKIDLNAGLFYSTAAITSFSSRLVMGRISDRIGRGLFVTIGIVCYSISMFLLWQADSKASFLLAALIEGVGGGLMIPSIVTMMADRSQPQERGRVFALCVGGFDVGIAIAGPILGSVAEKLGYRDMFGFASFLTFVAIFIFMTQSSKSIRTSFNFALGRGKDVYAITE >NC_019751.1|WP_015200066.1|5476642_5477656_+|glycosyltransferase-family-2-protein MGSGLISERIEGMDNIISLPIPDVSVVVPIKDEVESLPHLLDAIASTLQGCNLSYEIICVDDGSVDGSPQLLKEKAENRSDLKSVILRRNYGQTAAMAAGFNHATGKVIVTLDADLQNDPADIPMLLSKLDEGYDMVSGWRQKRQDKALTRLLPSKIANWLIRRITGVRIHDYGCSLKAYRAELVADMNLYGELHRFLPALAYIEGARIAEMPVRHHARKFGQSKYGLSRTFRVMMDLLTIAFMKTFLTRPMHVFGLLGLSSIFSGGAIGLYLTFVKLVFHEDIGDRPLLILAVLLLVTGVQLFCFGLLAEVLMRTYHESQGKPIYRVREVITKNIN >NC_019751.1|WP_041739856.1|5475934_5476639_+|C40-family-peptidase MSSNIPSQIQNLTSGEYECLANLNIYDSPECNRLATQAAMGRHLTVTSNDADTAVEVCLCEDNYSGWVSHQDFSLLKLTLHPYRGTLSPKLTDTVSQAQRERAIAFTHDAMKQANYYLWGGTVAPNYDCSGLIQAAFVSVGIWLPRDAYQQEDFTESISISQLNPGDLVFFGTPQKATHVGLYLGDDRYIHSSGKEMGRNGIGIDVLSEHGDAVSRSYYQILRGAGRIIKGLEV >NC_019751.1|WP_015200064.1|5474952_5475912_-|hypothetical-protein MNFFSQNEQLEQVGNRVLEATWAEFPTLKSNQIALTWIVYDPPVLVNTGGALTPDAFWNHPVRGFNYRGDERVYPASVVKLFYLVAIHEWVEKGMTQPFPELDRAIRDMIFDSSNDATSLVVDILSGTTSGPELSPAPFETWKYQRNIVNRYYQSLGWKELAQINVCQKTWGDGPYGREMSFYGKMFENRNMLTTNAAARLLHSIIGGVAVSSMRSQTMMKTLKRTLNPQALPQDVEEDQITGFLGAGIPQTSQIWSKAGWTNQVRHDVAYIEIPDLRPYLLAVFTEGKENAKNRQILPFISQQITTAVRHFDVSKEAG >NC_019751.1|WP_015200063.1|5473455_5474772_+|lipopolysaccharide-biosynthesis-protein MDVIKQLISKIQKELSSQFVRNLGWLGLAEIIYRIFRVGVVVIFSRFLTRRDYGLGAILFTVRDYALTFTNVGIGAKIIQADEAELDALCDSAYWLNWVVFTALFVIQTALSFPVAWLTNSPEIVLPIVVAGIPYLIWPIVGVQKTLLQRENKFKVIALTDSLQFCVASVISAIFAVSGMGVWVFALPGVLVAPLELIVYLNQHPWRPQRKFTTENWDKIFIFGRNIFGVGLLRTSINNLDNIIIATFLGVESLGNYSWAFNSGLGISLSIIKAINSAILPHLCAVSSELEALKQRYFKSLKTISLLIIPLVLFQATLAPFYIPLIFGQQWADAVPLYVLICLSAIPRPFGDAASQLLVAIGKPNLDLRWNGIFTVIFAICLVIGVRWRDIGVATAVFGAHAVFIPIFVVVATGYVFRQVGGGGKGVGSRKQGAREKG >NC_019751.1|WP_015200062.1|5470850_5473175_+|polysaccharide-biosynthesis-tyrosine-autokinase MPIKEESLQHSHNQNPLPNPLMRDATWWKRKSDVDEESSASLSPIFGILRRRIGVIAGIAMVTATTAAIWAASQTAKYEGRFQILVEPLKTSDSELLKLLSQTLQQNVNEITKQNTTALDYNALMEVLKSPKLIDPVVQELLPKYPNTTYDHMVGGDVPSGKVAPGRLGTLYITRLTKGKDESRVIEVRYRDLDPEKVEIVLDRVSQAYRKYSIEQQQTNLRQGMRFIEQQIPKIQLRVNTLQGQMQLFQQHYGLYNPQLQSEQLLKRLDDAKTQRLEVERKLAEARSLYGSLQNQLGMQQNAAIAASALSESPQYQQILTRIREVEAKIATESVKYNEASPIMQDLREQREKLLPLLNQEQRLALGNNNNGEPLPSQVGTYQNSIRRELTQQLANTTNQVQSLTANLQTLVQSEAQMSEQIRQYPVVARQHTNLQRDLQVSTDTLNQLLAKQEALRVDNAQQDVPWELIMPPTLPRDKKGDVVPITPSPTSTAMMGGIGGLLLGALAAFAIENRQNVFYDPEDAKRAGKLPLLGSIPYYRDIHKPAIATNVARLQEQLEQGSKSQVKFSAQAEKEALFAQSFCSIYNRIQAYSVESQVRSITVTSTAGKEGKSTVALQLALIAAQAGQRVLLVDANFRHPQLHESVGLVNTKGLSEILGDGLDLNDVIGQVPREENLFIVTAGQLTQNSSKLLASEKMREFIERSHNEFNLVIYDAPNILGRVDTNILTTHTDGIVLVVGLGKTLRPNLKKLVEELKATRTTVLGMVTNTLVS >NC_019751.1|WP_015200061.1|5468444_5469767_-|O-antigen-ligase-family-protein MPGFLILLEKVFVVISLFLSTSALIPILVETEESAIAAADPYTPILFMGVYAVTGVLIFQHWKNFLWIARKDIWLWLLMGIAIASIAWTIAPDITPRRSLLLLGTSLFGAYMAVRYSIRQQLQLLGWAFALLIGLSFVFAIALPNYGLMTFQEGGIHAGAWRGVFSHKNLLGRSMVLSSMIFMFIIASKSVTPKYRWLPWLGYTLSFALIVLSSSKTAIVSFFMLGIIFQLYRSWRLNYSRLIPFAIAFILIFGTTITLIIDNLPLITSAVGRDLTLTGRTDIWMAMLDKISERPFLGYGLNGFWRDWDNEATAFMWRILGWECPYGHNGFMDLFAELGIFGLVSFMISYGTTFFRSISWLRKTKSAEGIWSAMYLTFLLIYNISESTLLTNNSIFWILYTSATFSIFAEYERLQDEQYMNAVYEAQLMELEIFNEQNLN >NC_019751.1|WP_015200071.1|5480980_5481199_+|hypothetical-protein MLLQVKETGHLVKISEVVQLIDPTVEEIHGREQAGEEEQDVAAYHKKNLVFPSGETLPRCWVDANYRDTEVN >NC_019751.1|WP_015200072.1|5481333_5482050_-|heme-oxygenase-(biliverdin-producing) MSSNLASKLRIGTKKAHTMAENVGFVKCFLKGVVEKTSYRKLVANFYFVYSAMEEEMDKHKNHPIVGKINFPQLNRKQSLEEDLTYYYGANWRDQIKVSPAGAAYVERIRKISATAPELLISHSYTRYMGDLSGGQILKGIAQNAMNLSDGDGTAFYEFPEISDEKAFKANYRAALDEMPLDEATCDRIVEEANDAFGVNMKMFQELEGNLVKAIGQMLFNTLTRRRTRGSTELATAE >NC_019751.1|WP_015200073.1|5482647_5484099_+|phosphoglucosamine-mutase MVSFATRTQNGISGVSTIEKATELMVGGVSLPATALFGTDGIRGKVGEILTAPLALQIGFWTGIVLTNHATNLGPVILGQDSRNSSDMLAMALSAGLTAAGVEVWYLGLCPTPCVAHLTSISQAVGGVMISASHNPPEDNGIKVFGANGNKLPQALQLEIEAGLRGISPLGIIQANPGRHYTRPELVADYADSLKKPLQNRLNLQGMKVVLDLAWGAAVGLAPSVFKSMGAEVICLHNKANGDRINVNCGSTHLELLQTTVLENDADFGFGFDGDADRVLAVDNLGRKVDGDYILYLWGSDLKAKQQLPEDLIISTVMANLGFERAWKQIGGNLTRTAVGDQYVQAEMMKTGATLGGEQSGHILCSHYGITGDGLLTALHIAALVKESGVSLGELIDSSFQTYPQILKNVRVEDRNRRLAWEKCEPVMNAIALAEKAMGEAGRILVRASGTEPVIRVMVEAEEIDMVNEWTNTLVAVVQKHLA >NC_019751.1|WP_015200074.1|5484881_5485229_+|DUF760-domain-containing-protein MSNHPNRVSEFFNSDSETGNLLWQYVKSLSPETVTQLSKPTSNEVFQVMERNIVGLLGHLPSEHFGVTITTNRENLGRLLASAMISGYFLRNAEQRMDFEVALQGSESEEDTQEL >NC_019751.1|WP_015200075.1|5485333_5485771_+|8-oxo-dGTP-diphosphatase-MutT MNQNIDNIPHKIIGVAVIWNDQKQVLIDRRLPKGDMAGLWEFPGGKIEAGETIKDCIQREIKEELGIEIEVRKHLVTIDHTYPNFRITLTVHHCCHLAGIPQTIECEEVRWVDLEDLDNFEFPAANQEIIKALRDGEFRGTYEKN >NC_019751.1|WP_085953347.1|5485887_5486292_+|TMEM165/GDT1-family-protein MGLPQSQSHSELNPQAVNLTSSVVATQEHSSSVVSGVSRKSESIFVTFGTTFVTIFLAEIGDKTQLSTLLMSAQSHNPWVVFLGSAAALITTSFLGVVLGSWVSTKLSPKTVEKSAGVMLLLISIMLFWDVINN >NC_019751.1|WP_015200077.1|5486367_5486853_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MQTQASNVNIGIDDANRAKIAEGLSRMLADTYTLYLKTHNFHWNVTGPMFQTLHLMFETQYNELALAVDLIAERIRSLGYPAPGTYSEYAKLSSIPETAGVPKAKEMIRLLVEGQEAVVRTARSIFPILEEVNDEPTADLLTQRMQVHEKTAWMLRSLLEE >NC_019751.1|WP_015200078.1|5487111_5488098_+|ADP-ribosylation/crystallin-J1 MRRASGCLFGLAFGDALGAKTEFLSVEEIIRRFPPQGPKELEDNPALVTDDTQMTLAVGEALIAVASGEYTANTLEPVLRKAFVDWCNSPDNNRAPGMTCLSACEKLETGIPWYEATVAESKGCGANMRVAPVAFLGVEQQGAIAQFQAALTHGHPTALVGSDLTARAIHFLIQGCQIKELPAQLRNYAYEQRTVYHHDWLGNLWERPYTKTPEEFISRGWDECLGILDRLDAALINPDYDTDPCLATGAGWIAEEAFGTGLLCFLLYPEEPVKALQRAAVTSGDSDSIACLTGAFAGTYLGMSVWSEDWISKIEYRDRLERLSKFWD >NC_019751.1|WP_015200079.1|5488192_5489209_+|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MLSPTLQTRLSTPLKIGTLQLKSRVFQSPLSGVTDLVFRRLVRRYAPESMLYTEMVHASNLQYVKEIPKIMEVDPNERPISIQLFDCRPHFLAEAAQKAVEEGADTVDINMGCPVNKITKKGGGSSLLRQPELAETIVREVVKAVDVPVTIKTRIGWDDEEITILDFAKRMEDAGAKMITVHARTRAQGYNGSARWEWIGKVKKILEIPVIANGDIFSVESAVDCLEVTGADGVMCSRGTLGYPFLVGEIDYFLKHGEYLPPPTAIERLTCAKEHLQALYEYKGDRGIQQARKHMAWYAKGFVGAAELRGDLSKVENVQQGVEMIDLVIEKLETGIAF >NC_019751.1|WP_015200080.1|5489936_5492141_+|transketolase MTATTPKPTSAYPDFCEGIQYFGESLPEFAKYGKESAISGVAVNSSDDAAVYQTILYADALRYLTLQVTGSKASGHPGGFASQAEAYAALVMLGYKNIITEVGHHAPGFYSAMFLDRSLEDMGITNVQQLRDRFREQHGLLGHLSGYIPGILAPAGPLGQGQHFAMSAALLHRDKLFPFTVGDGGLGEPYIMSSMGHFHTAYPEVTNFLPVLVWNGFSQEHHSMVSTKTNAEMIQYWQGNGFDEVILVDAKDFDDQNQPGDYVDGTAFSFTKRMEFTKAILTEVDRAAKSALGGKLTVFIIKQLKGAGVHARGAKSHNLYPKDTLDAPHIADTLKAIALSPEAWQLVRSNLEKAGGGSASKTAVTEFELAIADIGTLPLEEYAVGGEAKVATTAMGRLVGIVGQKDKQFIVTNADGNEASGIANINQALKINHPVKDDLYNQAPGGQVYEPLSEDACAGLAAGLALMGARTLWCSYESFAINGLPIWQTVIQAMAELRRQTPSTITLYTAGALEQGRNGWTHQRPEIEAYFAAMMRNGNVFPLFPCDANSIQVCYDWALTTKNKGIVITASKSPLAIRTTFAQTKEGLENGAVVLQETPGNKMVVFAVIGDITLLPAYEAAKKLQEQGVGSRIVSIINPRRLYRADDVAWSTCSEADGGFLDDAKFNQIFGGDALIGVTGGAAAMLEPIMLRSTSPRDTFAWKRGETTASAGELMAFNGITADALVKRGISLVG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_22 | 6352584-6352690 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019751_22
|
1 spacers
spacers of NC_019751_22
>22.1|6352613|49|NC_019751|CRISPRCasFinder CCAAGTGCGATCGCGTTTAGCCCAAACTGAGGCACAATTGGCAGCAGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019751_22
The CRISPR arrays of NC_019751_22 >merge|NC_019751|22|6352584-6352690|CRISPRCasFinder CGTGCGGGAAATCGTCCCCAGGAAATTGCCCAAGTGCGATCGCGTTTAGCCCAAACTGAGGCACAATTGGCAGCAGCGCGTGCGGGAAATCGTCCCCAAGAAATTGC >NC_019751|22|21|6352584-6352690|CRISPRCasFinder CGTGCGGGAAATCGTCCCCAGGAAATTGC CCAAGTGCGATCGCGTTTAGCCCAAACTGAGGCACAATTGGCAGCAGCG CGTGCGGGAAATCGTCCCCAAGAAATTGC
>NC_019751.1|WP_041740932.1|6350432_6351542_+|S-(hydroxymethyl)glutathione-dehydrogenase/class-III-alcohol-dehydrogenase MKVKAAIAYQAGKPLTIETVDLAPPRSREVLVEIKASGVCHTDAYTLSGKDPEGLFPAILGHEGAGVVVEVGKDVRSLRVGDRVIPLYTPECRECAYCLSFKTNLCQAIRVTQGRGVMPDGTSRFSLNGEMIHHYMGTSTFANYTILPEIALAKIRDDAPFEKVCYIGCGVTTGIGAVINTAKVEPGANVVVFGLGGIGLNVIQAAKMVGANMIIGVDINPGKKVLAEKFGMTHFVNPQEVEGDLVPYLVDLTKGGADYSFECIGNVKLMRQALECCHKGWGQSIIIGVAAAGEEISTRPFQLVTGRVWKGSAFGGARGRTDVPKIVDWYMEGKINIDDLITHVMPIEKINDAFDLMHRGESIRSVVTF >NC_019751.1|WP_015200765.1|6349729_6350233_-|hypothetical-protein MNQKLITIATFPNSVEAALSKQLLEGVGIPAFVINADIADVAWYYTIMVGWIKLKVRECDVENAVDILTATSVELDEDISQEMPISSEESEFNYISKPDKIIDFAFRASIIGLFSIPFLLHLYSLALLIYLLFTGWHVSANTQLKALATFLINISVMRFTWLIFSNS >NC_019751.1|WP_015200763.1|6349253_6349655_+|biopolymer-transporter-ExbD MRLPDEPDIPAQINIVPMIDVIFAILTFFIMSTLFLTRQEGLPVNLPKASTSQQSQVATKITVTVDAEGQVSLNKNPTTVDVIAEQVRRLMGTNSEAVVIINADEAVGHGKVVAVMDQVRQVEGAKLAIATQK >NC_019751.1|WP_015200762.1|6348613_6349270_+|MotA/TolQ/ExbB-proton-channel-family-protein MAISKLFADGGVVMYPLLAFSVVAIALIIERVSFWYRINTRQSKVAREVLNLYRLENVVGALDKLQKNVDLPIARVFLSALELEEATPEEFRLALESEAQAEIPILKRFNNIFETIISLAPLLGLLGTVLGLIASFESIDLSNGAGAGAARVTGGISEALVSTASGLVVAIFVLMFANTFRGFYQRQIAFLQEYGGQLELLYRRRYERGGEKSYAATR >NC_019751.1|WP_015200761.1|6346561_6348298_-|TonB-family-protein MSFSSIAIGQREKEVKALKTFLVGSTVSSLVLHIVVLAVGVGSFWVRNPQIEDEKPVELTFVEPEIKETSIPEDNKLGASKVLTSGGGGNEGGSSGGSEGGSSTQISSQVQSQQKIAVQTPPKLSAPIPQNIEKPVTPEKFTPAQKPAENPQRQSSRSIQPQKDDPVTSKEPKQVVNNTPVNPATDNQESSNNLRGLLSQFRDSRVIQATSGNSSTVTESGGTGNSSTGSGIGNGNGTGTGNGNGTGFGSGNGTGTGNGNGVGFGSGNGTGTGNGNGVGFGSGNGTGTGKTERRKREIAVAPTEPKIPTQKPENNGGSGGSADGRAACSDCKVKYSEGARRRKAEGRIQVAVDTDKDGNITNIRLASSSGDRELDEEHLRQAQNWKLKPSQAGRQGVNIATEYSIQGSRRNRQVRERQQQREERERQRQVAAASSNSQETPRRRRRNTESSSQTASGNEESRSTRLNQRLRRRTETSVSRNDNETQQSTRRERSSEDSSVGSRLRRRSSENNASEVTPRRRVQVTSENYQRTQQAPTRRKKREFNRSNQSSDSGSRLRSVLRRSRESAPAPSTGKEAE >NC_019751.1|WP_015200760.1|6345427_6346141_-|rubrerythrin-family-protein MNLENSNTAKNLEDAFGGESMANRKYLFFSEVVKQLGMADLAKLFRETANQETEHAFAHFRLMHPELVVGDATKLTDSEKKAIASRCLELAIEGETYEYQVMYPGFAEQARGDRDDGAVAEFEVQEKESREHAQIFRKAAHNFGLLTHIENHHAQQYGEALKALDGTAPVVKMQTGNPATQKWICRQCSMIYDPVVGDVDSGIAAGTAFADIPEDWRCPICGATKKTFVVYEEAAAA >NC_019751.1|WP_041740929.1|6342751_6345133_+|endonuclease-MutS2 MIQSETLELLEWSRLCQHLANFAATKLGAIASRNLQIPTSQAQSENLLAQTQEIYKLESRISPGLSFEGIQDIGDAIERAALQGILAGEELLAIATTLAGTRNLRRIIDNQEDLPILLDLVADLRTYPEIEQEIHRCVDERGQIADRASQKLGDIRAELRKSRSQIIQKLQNILQVKSNAVQENVITQRGDRYVIPVKASHKDVIHGIVHDTSTSGVTLYIEPNSVVPMGNQLRQLIRKEEIEEEVIRRQLTAQVADIKDDLERLLAIVTTLDLATAKSRYSFWLKANPPRFVDREANETITLRKLRHPLLEWQHQHEQGHEVIPVDLVIQPETRVVTITGPNTGGKTVTLKTLALAALMAKVGLFVPAREPVELPWFEQVLADIGDEQSLQQSLSTFSGHIRRISRILNAITGDTVTPSLVLLDEVGAGTDPVEGSALAIALLHHLANHVLLTMASTHFGELKALKYQDERFENASVEFDDATLSPTYKLLWGIPGRSNALAIAQRLGLSVDVIEAAKQQMGGANDEVNEVIAGLEAQRRRQETKASEAQNLLHQAEKLYKEVSAKATNLEEREQALKASQEVAVQNAIAQAKGEIAKVIKGLQKGKPTAQEAQQATNTLNQISTQFIPKAAPKAPIGFIPKTGDRIRITKIGQTAEVITPPNSDGELNVRFGIMKMTVKLEDIESLDGKKPEPIAKPQNRTPPPPVTPPPPAIRTSQNTIDLRGKRVADSEIILDQAISTAAGQIWIIHGHGTGKLREGVHAYLKQHPRISHTEPAAQADGGTGVTIAHIK >NC_019751.1|WP_015200758.1|6341017_6342181_-|GuaB3-family-IMP-dehydrogenase-related-protein MDIQIGRGKTARRAYGIDEIALVPGNRTLDPSLADTKWSIGNIEREIPIIASAMDGVVDVRMAVRLSELGALGVLNLEGIQTRYDNPEPILDRIAAVGKTEFVSLMQELYAEPIKPELIELRIQEIKQQGGIAAVSATPAAASKFGGVIAKAGADMIFIQATVVSTAHLSPESIVPLDLAKFCEEMPMPVILGNCVTYDVTLNLMKAGAAAVMVGIGPGAACTSRGVLGVGVPQATAIADCSAARDDFFRETGKYVPIVADGGLITGGDICKCIACGADGVMIGSPFARAAEAPGRGFHWGMATPSPVLPRGTRINVGTTGTVEQILRGPAGLDDGTHNLLGSLKTSMGTLGAKNIKEMQQVEVVIAPSLLTEGKVYQKAQQLGMGK >NC_019751.1|WP_015200757.1|6339617_6339941_-|thioredoxin MSAAEQVTDSSFKEQVIDSEVPVLVDFWAPWCGPCRMVAPVVDEIASQYEGQIKVVKINTDENPNVASQYGIRSIPTLMIFKDGQKVDMVVGAVPKTTLANTLEKYL >NC_019751.1|WP_015200756.1|6338280_6339396_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MTNQGVIGIAIIGTGFGQKVHIPGFQAHHRTKVVAVYHRDINKAKQIATANQIPHSCDNLDDILNLPEVQAVSISTPPFLHYEIAKQVLAAGKHLLLEKPVTLNVKEAKELYQLAQQKGVIATVDFEFRYVPGWQLFSQLLSQEYVGKKRLIKIDWLGASRADATRPWNWYSQQSQGGGVLGSLGSHAFDYINWLFGAVNKLSAHFTTAIPQRPDPQTGELKVVDSDDTCMLMLELADGTPCQVSISAVVHAPRPHSLEVYGDAGTLILESENQKDYIHGFRVKGSKIGQPVAEIEIPQHLLFPKNYSDGRISAFLRVVDQWIQGIDQGEAVIPSLKEGVYSQLLMDLATESHHNFRWVDVPNLEDFILIP >NC_019751.1|WP_015200769.1|6353716_6354934_+|FtsX-like-permease-family-protein MNIIESMTMAGKTLLSNRLRSALTMLGIVIGNASVIAMIGVGEAGQKYVAKQLESLGPNVLFVLPGNQETQQISFEVPKNLVLADADAIASQVPTIAGVAPELNRRQRVAFKNRNSDENIIGTTPSFLIVRDFDTAKGRFFSDVDMKRSNQVVVLGSKFATKFFGTNNPIGQQIRIKDSRFEVIGVLREKGSSFGADYDKVLVIPITTSANRLIGRNSPYGLGVDYIVASARDAKSVDGAVFQITNLLRLRHKINGEDDFSIQTQKDALKTVGQITSALTIMLAAIAAISLFVGGIGIMNIMLVSVTERTHEIGLRKAIGATQQDILLQFTIEAVIVSAAGGLIGAIVGVSGVLLVAALTPLEAAISPIAIASAVGISGAIGLFFGVVPARRAAKLDPIVALRSA >NC_019751.1|WP_015200770.1|6354998_6355814_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNQEQAINLNSSATVFNSATKEDVEASQVLNPSHLKPIIRLENIFKIYGIGETEVRALNDVNLIIEEGEYCAIMGPSGSGKSTAMNIIGCLDQPTSGHYYLDSLDVAQMEDKQLAHIRNKKLGFVFQQFHLLQQLTALENVMLPMVYASIPNNERKERATEALIKVGLEKRMHNKPSQLSGGQQQRVAIARSIVNRPVVLLADEPTGALDSRTTQEVLDIFTELNSSGITVVMVTHEPEVARQTRRIVWFRDGEVIHSNLTPADLNQVAMS >NC_019751.1|WP_015200771.1|6355915_6356455_+|SH3-domain-containing-protein MSLRTKATAGLLALGTLMTGILPAIARPATVTTTSNLRTDASLRAPVEQILPPSSNIEVLNIRVGNDGNYWYYVQPKVKGILSGWIRSDLVSFNPSNKRYATLAGSRGSKINVRAAATLNSKAIHYGLVGDLVTVEDSYKAPGQFRWYRVRFPSNASGWVRGDLLSIWQQGCIITCPEH >NC_019751.1|WP_015200772.1|6356563_6358093_-|protein-kinase MNLCINNKCHKPQNSDNNTFCSNCGSELLIAGKYRVLNQISQDGYSRTYEAQEIADSQSKPHKILQVFSITDSGEIELLQKIVTALQIIDHPGITQITTDSYFTYLPRNSTSPLHCLIIDKISGITLDEYMYKQDYHPVDEYLVLKWLKESVNILQLLHQQSILHLRINPQNILLKDDGNLALVDIIAVNRTKSSDGIAYSPYIPPEQFNNSPIPQSDLFALGMTFAYLLTGKEATKDPDAYQSDETKLKWQSFVPNMNKVSQLPILLDSMMAHAPIQRPQNCQVVLDSLDSFAKSQISSPHAETIISQPPKSQNSKLVKLLFLINWILATITGVTLGGVIGLIAGWCVSFLLGAAIRNVSTGIILGGVVFGLTTGLVTGIMQSWVFWQCGYKIKYWILLTTLGFAIEGALGIAIGNYNYGEKIMIVPGIVVGISQFLLLKNHINYSFLWIFINILGGGLAILVHWQMRDILIGKYQFFSYILGLMAFGLVTGISFIKLQIDKPLLEVS >NC_019751.1|WP_015200773.1|6358230_6359058_+|deoxyribodipyrimidine-photo-lyase MANDMKRDFANREELISYLREQFPQAAERDDHISEIVGGRKAAEKTLQKVDPSKYGKTRNFFSGAVTRLSPYLRYGIFSLREVRDFSLAKVNNRDDVTKLINEFGWRDYWQRLYFKLGDRIWENQEDFKTGYSIGEYVAELPEDIKEGTTGMVCMDSFSGDLRTTGYLHNHARMWMAAYIVHWRRIRWQTGAKWFLEHLLDGDPASNNMSWQWVASTFSHKPYFFNRENLEKYTEGIYCQVCPLRGKCVLEGSYEEIQAKLFPKGEFSKSGGKSR >NC_019751.1|WP_015200774.1|6359206_6361645_-|penicillin-binding-protein-1A MIKFTSWFKDKSTKLTDAKTSAETPEGEASPDELEDEKPPQGKAKQLLNRVGKVPSAILSKLPGSPKPLYRRYWFWAGAILTGGFVGVTSTISSIDKTLPSSSQLNSVAREQTLTIKAADGTILQQSGPATREQLSVDEIPEKLKQAFIASEDRRFLKHDGVDGQGIVRAVVNNLRSQNLVEGGSTITQQLARILFLKQEKTLLRKVREVRLAQKMERELSKDKILERYLNLVYLGSGAYGVADAAETYFSKPAKELTLAQMATIAGLAPAPSVYAPDRNPEAAKQRRNLVLQRMLEDGVITPEQKQEAISEPLTVTASQPKRMQVVAPYFTSFIQKELPNYVSQEVIEAGGLTVETTINPAWQELAENAVAKTLRNQGRWENFKQAALVAVDPRSGEIKVMVGGKDFGKNQFNRATQAKRQPGSTFKGFVYATAIATGMSPYQEFLDSPLIVDGYEPKNFDEGYRGSMDLRTAITKSINIVAVRILLKVGFDPIIQLAKKMGIKSELKPTYSLALGSSEVNLLEITSAYGSFATQGIHNEVHGITRVVNRQGEEVWKANFTPERALDEDSAKIMTWMLRNVVQNGTGSPAQLSDRAVAGKTGTTDEARDLWFIGYIPQLVTGVWLGNDNNNPTYGSSASAAYTWNQFMAKAVKGMPVEKFPERPKLEGRKASIKAEPVRGRRVVNRAIPDRDNKDNGNGEETPRRRRNRQETSSDSNTEQRSSRRRRRNSEETQETPRRRSRRSRSEESNSNSSSSESRSRRRVDSNSSSESRSRRSSGSSTNNGSGKSNSSGSSQSSGSSWRERLRPDAQ >NC_019751.1|WP_015200775.1|6361975_6362473_+|2-amino-4-hydroxy-6--hydroxymethyldihydropteridine-diphosphokinase MDKEINKSAIALGSNLGNSLEILESAIASLVEIPGIRLNRKSSWYRTKAIGPPQPDYINGCVILEVEMTPELLLATLLKIETDFGRVRQERWGARTLDLDILLYADRIIDLPTLQIPHPRMCDRAFVLVPLNEIAPDWIVPVSGFAIKDVIKAVDCSDVSLLMGN >NC_019751.1|WP_041739983.1|6362560_6363112_+|NUDIX-hydrolase MPLGRELPQLLKQRLFYKGRKFDFEVNRLRLPNRVEGDWECIRHPGGALVIPVTNEGKLVLVRQYRFAVGGRVLEFPAGTIEPMEEPLETVKREIQEETGFSANKWQKLGEFILAPGYSDEIIYAFLAQDLTKLEMPPQQDDDEDIEVLCWTPQELEKAILEGQPVDAKSISSFFLARPFLGL >NC_019751.1|WP_015200777.1|6363262_6367126_-|hypothetical-protein MSSDFEQQRKISVLLPAIHPELLTGLDKLLSLGLISDSQVRKICEGSLTCKLPIQEEVESDPFGELTIPFFSAEVPEVEEIPPVSKKVPVVAGMLQSLVAELSVRWLLFLGMFLVVVSSGVLAATQWERFPVAGQYGILFGYTLSFWGISFWTVKQQNLELTTQALLTVTLLLVPVNFWAMDGFRLWQNPLNWVVIAFAAVILTGVTILISGSLVFAANSEKKNLRLANILGLSFLHWGWSLGSFPLISIYVAMVGTSFLSVSQSVLGSRRQNPRLGINLPISIIIYALVLLLSRGIFVVGVDVSKLGLAIGICGWLIAWLAMKQEKLTEEGVNSDFSPPWELIGGFLLLLGWLVTITTQPAQALAVSGLGLWFGLRRLQLYSLVIDYLGIFVVGLQANWLIWRLVPLPIQGQILQFLNQVTYSQNQNWVFLSLGLFPFLLVMVLLGETLHHQGESKLAKFSEKTNLGFGILLATISIVNPATRSLNLFLSCFTLATVYKGRNFQVSQSFIFFLHTTAVITLLSFINWVFPTLQVEYWGIILLTLMVGEWLYSVGEGFWRQSAWYIGFGLATISFYLLWGYQTQGASLAPSNISSYISTYPIQDNWNLAWLVTPITLTVIASRGEANKRRLNYVSSFISLGVLQFLTFPLDKVRLIGLGTAAALMLVNTNYVDELEFAVITVGFILTFIAACCWEFLNLSISAWHVIGAMMVLGLWLTRQFLVSRESDREENSIYIEALNKWAVALCIGELFLLTIHSVLVYQGIAKAETLYLLAIVITLAAIVFRTWKYPTNRGFYAIGLSLELLVAEALAFSGRSGVKIAIANIILAIATQVVGEFWLRKHRLQRLPKSFHVLPLIYGIFSVILRLDIFTNYTGVLSLGVALIMITVGRRGRELKPILFLGIVGISVSAYETLIYHMLQSSGGAYGDGLIAMSALGAFIMYAYRLLSPWLTSYLRLSTAEVEIIAHCHWILSSFLLVSGIFAPIGINRFVGLGTGLFLARYAIFQARHSEKNIADETWVYLGLMEAGVVSYLLKDIAIGRIFTQQLLPWNAAIACIGAFILYILPWQRFGWSKTPWRNAAYVIPLLILYTTWLEVNSITLILVAGFYLFIAKANQQIRFTYISIALINWALWNSFRDFNLTDGLWYITTVSLSILYIAQIDPSLQQPQMKENRHLLRILGTSLICGYALILHQDSAWIPGIFSLIGIFAGLALRVRAFLYIGTVTFLGTSIYQLIIFSLRYPFLKWVVGLLLGIALISIAANFETRKEQLNSIFRSSNSGIQEWE >NC_019751.1|WP_015200778.1|6367277_6367865_+|Uma2-family-endonuclease MISQTLEQPIPLPEQRFLLPGYYSWSEFETIDAVVGDCRSLRITYLDGCIELMTVGEKHEMLKKVLAILLETYLFATGINFTPIGSGTRRSKEKDVSFEPDESYYIGEKKEHPDLAIEVNITSGSIDKLQKYQRLQITEVWFWEDCTLALYRLRDEGYVKVDSSELLPDLNISLLIDCILKPSVIEARQEFLKGI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_1 | 1.1|316595|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 316595-316630 | 36 | NC_019751.1 | 193339-193374 | 0 | 1.0 |
NC_019751_2 | 2.1|324354|39|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324354-324392 | 39 | NC_019751.1 | 6107853-6107891 | 0 | 1.0 |
NC_019751_2 | 2.2|324428|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324428-324462 | 35 | NC_019751.1 | 4731866-4731900 | 0 | 1.0 |
NC_019751_7 | 7.12|2022697|32|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT | 2022697-2022728 | 32 | NC_019751.1 | 6375759-6375790 | 2 | 0.938 |
NC_019751_12 | 12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR | 2712653-2712680 | 28 | NC_019751.1 | 2470424-2470451 | 1 | 0.964 |
1. spacer 1.1|316595|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 193339-193374, mismatch: 0, identity: 1.0
gaaactgcttctgctgattgagttaaaaaggatttt CRISPR spacer gaaactgcttctgctgattgagttaaaaaggatttt Protospacer ************************************
2. spacer 2.1|324354|39|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 6107853-6107891, mismatch: 0, identity: 1.0
taggaagttttcgcttgggtattgcttaatttagcagag CRISPR spacer taggaagttttcgcttgggtattgcttaatttagcagag Protospacer ***************************************
3. spacer 2.2|324428|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 4731866-4731900, mismatch: 0, identity: 1.0
tatttaaggctatatcgcttctaaattgagagaca CRISPR spacer tatttaaggctatatcgcttctaaattgagagaca Protospacer ***********************************
4. spacer 7.12|2022697|32|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 6375759-6375790, mismatch: 2, identity: 0.938
ccagcacgagtgcgatcgccgattgcgatcgc CRISPR spacer ccaggacgaatgcgatcgccgattgcgatcgc Protospacer **** ****.**********************
5. spacer 12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR matches to position: 2470424-2470451, mismatch: 1, identity: 0.964
acgactttcgtcgcgcaagcttcgcatc CRISPR spacer acgacttgcgtcgcgcaagcttcgcatc Protospacer ******* ********************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019751_12 | 12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR | 2712653-2712680 | 28 | AP018277 | Calothrix sp. NIES-4101 plasmid plasmid4 DNA, complete genome | 69511-69538 | 3 | 0.893 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP025013 | Rhizobium leguminosarum strain Norway plasmid pRLN1, complete sequence | 336395-336430 | 4 | 0.889 |
NC_019751_12 | 12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR | 2712653-2712680 | 28 | NC_019728 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02, complete sequence | 48794-48821 | 4 | 0.857 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP025013 | Rhizobium leguminosarum strain Norway plasmid pRLN1, complete sequence | 336401-336436 | 6 | 0.833 |
NC_019751_13 | 13.1|2924973|33|NC_019751|CRISPRCasFinder | 2924973-2925005 | 33 | NZ_CP014853 | Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120345, complete sequence | 104222-104254 | 6 | 0.818 |
NC_019751_1 | 1.9|317168|38|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 317168-317205 | 38 | MN694186 | Marine virus AFVG_250M615, complete genome | 50697-50734 | 7 | 0.816 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NC_008269 | Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence | 509802-509837 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | MH509446 | Gordonia phage DelRio, complete genome | 6233-6268 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | MN539018 | Salmonella sp. strain OYZ4 plasmid pOYZ4, complete sequence | 121304-121339 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP044306 | Escherichia coli strain C27A plasmid pC27A-CTX-M-55, complete sequence | 130749-130784 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP027411 | Salmonella enterica strain FDAARGOS_319 plasmid unnamed, complete sequence | 73177-73212 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP028537 | Enterobacter hormaechei strain SCEH020042 plasmid pQnrB4_020042, complete sequence | 45648-45683 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_AP023191 | Escherichia coli strain TUM18530 plasmid pMTY18530-1_lncHI2, complete sequence | 47039-47074 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | MN539017 | Salmonella sp. strain PJM1 plasmid pPJM1, complete sequence | 71641-71676 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | MT077888 | Escherichia coli plasmid p65, complete sequence | 47133-47168 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NC_009838 | Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R, complete sequence | 46537-46572 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP039170 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Goldcoast strain Sal-5364 plasmid pSal-5364, complete sequence | 69624-69659 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | CP048299 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund strain WAPHL_SAL-A00527 plasmid pN1566-2, complete sequence | 195981-196016 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | CP048303 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund strain WAPHL-SAL-A00375 plasmid p28945-2, complete sequence | 41269-41304 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP037959 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Goldcoast strain R18.0877 plasmid pR18.0877_278k, complete sequence | 45080-45115 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP039861 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar 1,4,[5],12:i:- strain PNCS014880 plasmid p16-6773.1, complete sequence | 239714-239749 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP048776 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona strain SG17-135 plasmid pSG17-135-HI2, complete sequence | 45080-45115 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NC_019114 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg plasmid pSH111_227, complete sequence | 43330-43365 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_AP023198 | Escherichia coli strain TUM18780 plasmid pMTY18780-1_lncHI2, complete sequence | 47039-47074 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP043223 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bredeney strain SA20114778WT plasmid pET1.1-IncH, complete sequence | 5930-5965 | 7 | 0.806 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP043223 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bredeney strain SA20114778WT plasmid pET1.1-IncH, complete sequence | 240151-240186 | 7 | 0.806 |
NC_019751_12 | 12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR | 2712653-2712680 | 28 | NZ_CP030828 | Neorhizobium sp. NCHU2750 plasmid pNCHU2750a, complete sequence | 631683-631710 | 7 | 0.75 |
NC_019751_1 | 1.11|317313|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 317313-317349 | 37 | NZ_CP044488 | Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-5, complete sequence | 1616-1652 | 8 | 0.784 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP035001 | Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23c, complete sequence | 325884-325919 | 8 | 0.778 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | MH509446 | Gordonia phage DelRio, complete genome | 6227-6262 | 8 | 0.778 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | MT758688 | Mycobacterium phage CELFI, complete genome | 74676-74711 | 8 | 0.778 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NZ_CP029452 | Sinorhizobium fredii CCBAU 25509 plasmid pSF25509b, complete sequence | 619935-619970 | 8 | 0.778 |
NC_019751_2 | 2.10|325005|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 325005-325039 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 170929-170963 | 8 | 0.771 |
NC_019751_7 | 7.10|2022554|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2022554-2022587 | 34 | CP011076 | Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence | 1012108-1012141 | 8 | 0.765 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NC_008269 | Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence | 509808-509843 | 9 | 0.75 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NC_019201 | Streptomyces sp. x4(2010) plasmid pTSC1, complete sequence | 240-275 | 9 | 0.75 |
NC_019751_2 | 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 324719-324754 | 36 | NC_008269 | Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence | 509814-509849 | 10 | 0.722 |
NC_019751_9 | 9.11|2038850|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2038850-2038885 | 36 | MN013189 | Microcystis phage Mic1, complete genome | 65035-65070 | 10 | 0.722 |
NC_019751_2 | 2.12|325146|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 325146-325180 | 35 | MN693352 | Marine virus AFVG_25M558, complete genome | 46200-46234 | 11 | 0.686 |
NC_019751_7 | 7.12|2022697|32|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT | 2022697-2022728 | 32 | NZ_CP007257 | Rhodococcus erythropolis R138 plasmid pLRE138, complete sequence | 69014-69045 | 11 | 0.656 |
1. spacer 12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR matches to AP018277 (Calothrix sp. NIES-4101 plasmid plasmid4 DNA, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
acgactttcgtcgcgcaagcttcgcatc CRISPR spacer acgactttcgtcgcgcaagcttcgcggt Protospacer *************************. .
2. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025013 (Rhizobium leguminosarum strain Norway plasmid pRLN1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer tgtctcggtctcggtctcggtctcggtctcggtctc Protospacer **.* .*****************************
3. spacer 12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR matches to NC_019728 (Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
acgactttcgtcgcgcaagcttcgcatc CRISPR spacer acgactgtcgtcgcgcaagcttcgcggt Protospacer ****** ******************. .
4. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025013 (Rhizobium leguminosarum strain Norway plasmid pRLN1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer gggcactgtctcggtctcggtctcggtctcggtctc Protospacer .* . *****************************
5. spacer 13.1|2924973|33|NC_019751|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014853 (Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120345, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
-agattttaagataaacagtatattctctctcta CRISPR spacer cacataat-agagaaacagtatattctctttcta Protospacer * ** * *** ****************.****
6. spacer 1.9|317168|38|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694186 (Marine virus AFVG_250M615, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.816
agtagcacaatcccattcagtaattgca-catacttttc CRISPR spacer actagcacaatcccattccgtaattccaccatattgct- Protospacer * **************** ****** ** ****.* .*
7. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008269 (Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcg---gtctcggtctc CRISPR spacer ggtctgggtctcggtctcggtctcggttgtctgggt--- Protospacer .**.**.****************** **** ***
8. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH509446 (Gordonia phage DelRio, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer cgactccgtctcggtttcggtctcggtcgcggtctc Protospacer * .* ********.************ *******
9. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN539018 (Salmonella sp. strain OYZ4 plasmid pOYZ4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
10. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044306 (Escherichia coli strain C27A plasmid pC27A-CTX-M-55, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
11. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027411 (Salmonella enterica strain FDAARGOS_319 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
12. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028537 (Enterobacter hormaechei strain SCEH020042 plasmid pQnrB4_020042, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
13. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP023191 (Escherichia coli strain TUM18530 plasmid pMTY18530-1_lncHI2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
14. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN539017 (Salmonella sp. strain PJM1 plasmid pPJM1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
15. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT077888 (Escherichia coli plasmid p65, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
16. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009838 (Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
17. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039170 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Goldcoast strain Sal-5364 plasmid pSal-5364, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
18. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP048299 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund strain WAPHL_SAL-A00527 plasmid pN1566-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
19. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP048303 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund strain WAPHL-SAL-A00375 plasmid p28945-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
20. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP037959 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Goldcoast strain R18.0877 plasmid pR18.0877_278k, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
21. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039861 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar 1,4,[5],12:i:- strain PNCS014880 plasmid p16-6773.1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
22. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048776 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona strain SG17-135 plasmid pSG17-135-HI2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
23. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019114 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg plasmid pSH111_227, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
24. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP023198 (Escherichia coli strain TUM18780 plasmid pMTY18780-1_lncHI2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
25. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043223 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bredeney strain SA20114778WT plasmid pET1.1-IncH, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
26. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043223 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bredeney strain SA20114778WT plasmid pET1.1-IncH, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer atcttctgattcggtatcggtctcggtctcggtctc Protospacer * .** * .***** ********************
27. spacer 12.2|2712653|28|NC_019751|PILER-CR matches to NZ_CP030828 (Neorhizobium sp. NCHU2750 plasmid pNCHU2750a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
acgactttcgtcgcgcaagcttcgcatc CRISPR spacer tgaacttgcgtcgcgcaagcttcgatta Protospacer .**** **************** *
28. spacer 1.11|317313|37|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044488 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
acatttaacaaattattttgtcaaatctgaa---aaatca CRISPR spacer agctttaacaaattattttgttaaagctgtactcaaa--- Protospacer * ******************.*** *** * ***
29. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035001 (Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23c, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer ctcttccatcgcggtctcggtctcggtctcggtctt Protospacer .** .** ************************.
30. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH509446 (Gordonia phage DelRio, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer cgtctcggtttcggtctcggtcgcggtctcggtgcc Protospacer **.* .**.************ ********** .*
31. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT758688 (Mycobacterium phage CELFI, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer ggtacccgtctcggtcccggtcccggtctcggtccc Protospacer .** . *********.*****.***********.*
32. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029452 (Sinorhizobium fredii CCBAU 25509 plasmid pSF25509b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer ggtaccggcctcggtctcggcctcggcctcggtctc Protospacer .** . .*.***********.*****.*********
33. spacer 2.10|325005|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gaatgaaaagatttttacatcttttgctgataaaa CRISPR spacer agatgaaaagaattttaaatcttttgcataaaaca Protospacer ..********* ***** ********* * ** *
34. spacer 7.10|2022554|34|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011076 (Brevibacillus laterosporus strain B9 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgataatagtattctgaatactctg-gtgtaatt CRISPR spacer ctgataatagtattcggaatattctgcttgttgc- Protospacer .************** *****.**** *** ..
35. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008269 (Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer caactgggtctgggtctcggtctcggtctcggttgt Protospacer . .**.**** *********************. .
36. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019201 (Streptomyces sp. x4(2010) plasmid pTSC1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer tccctggtgctcggtctcagtctcggtctcagtctc Protospacer ..**. *********.***********.*****
37. spacer 2.6|324719|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008269 (Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
agtttgagtctcggtctcggtctcggtctcggtctc CRISPR spacer gaacggcaactgggtctgggtctcggtctcggtctc Protospacer .. . * . ** ***** ******************
38. spacer 9.11|2038850|36|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN013189 (Microcystis phage Mic1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
----caagctttgtacaacttcaagaaaaatcaaatagtt CRISPR spacer gtgctagg----gtacaaattcaagaaaaatcaaagagcc Protospacer .*.* ****** **************** **..
39. spacer 2.12|325146|35|NC_019751|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693352 (Marine virus AFVG_25M558, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ctttgatgtaagaaaactcatcactagcaaaaaaa CRISPR spacer agaaagaataagaaaactctttactagcaaaaaga Protospacer .. .*********** *.***********.*
40. spacer 7.12|2022697|32|NC_019751|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007257 (Rhodococcus erythropolis R138 plasmid pLRE138, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ccagcacgagtgcgatcgccgattgcgatcgc CRISPR spacer gggaaacgagcgcaatcgccgattgcgaagat Protospacer .. *****.**.************** ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
249445 : 282790
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019751|249445:282790|DBSCAN-SWA 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28 | uncultured_Caudovirales_phage(20.0%) | transposase,integrase,protease | attL 248527:248543|attR 296427:296443 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
291354 : 360224
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019751|291354:360224|DBSCAN-SWA 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50 | Lysinibacillus_phage(20.0%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2803324 : 2918529
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_019751|2803324:2918529|DBSCAN-SWA 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96 | Liberibacter_phage(16.67%) | transposase,tail,protease,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3927849 : 3988730
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_019751|3927849:3988730|DBSCAN-SWA 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MLQNIHEIQDIPGEKYRFNGNEPILLDDPRAIWVVQSGSFALFAINVKNGTPEGTRRFLFTVKAGEAMFSTPHDTKEEGIRQILAVSLEESELTRVSKTDFETSLASQKRTVINLVERWIHQLGEILESIRTERPSVPDAAIQYMSLAMGEIFQSYPHTVCWIRMQVGRLRWMGIPQLGLEPGDEIMPLGANMWVIAEEIVEFERLHTDTIDDADILLAGVDQVQNYFLRCIDLLEEVEKQQERQRFQERDRLNRQMMTETLGELVEVVRSQPMPVTPDSTAEVTDNYEAVLIAAGAVGKMLGIKIRPPAKSEDMRRVQEPLDAIARASQMRMRRIQLTDDWWQKDCGPMLGYTAEDDRPVALLPTSSTSYEMFDPILRKRLKLTAKRARTLSKCAYVFYRPLPDKENLTTFDLLQFAVRGHYREIFVVLATGVIVTLLGMLTPQVTAILIDDAIPSTNRDLLIQIAGVLIAATFGSTLFQLAQGLAVMRLETYADASTQAAVWDRLLKLKASFFRKYAIGDLQSRVQSISQIRQMLGTTVIKSIFSSVFSLLNLGLLFYYSPTLAFVALLVAFINIAVTVVSGIITLKKVRPQLELQGQIFGVMVQLINGVTKLRVAGAEARAFAYWGKQYTQQLKLTLSTQGVEDIVIVINKILPSLTTAVLFFVATTSIQEAAATGGKGFTTGTFLAFNAAFGIFIGGATSLSTTVIDVLQIVPLWQRAQPILKAEPEVDSNKADPGRLTGRLNVEHAIFRYRDDGPLTLDDVSVYANPGEFIAFVGTSGSGKSTLFRLLLGFDVPESGSIYYDGQDLAGLDINAVRRQLGVVMQNSRLTSASIYENIACGALVSMEECWEAAKMAGFAEDVQSMPMQMHTVISEGGGNISGGQRQRLLIARALVLKPRILLFDEATSALDNRTQAIVSESLERLQVTRIAIAHRLSTIRKADRIYVFENGRITQHGSFEELAQQKGLFAQLMARQSL >NC_019751|3927849:3988730|3984786_3985125_-|WP_041739691.1|DBSCAN-SWA MINLVMIGGGHSHTIALRFFATNPVPGLHLTLISDAEDTPYSGMLPGHIAGFYSRSQCHINLRRLTISAQAEFYVERVVNLDLEKKLVICENILPIAFDIVSIDIGSKLKRI >NC_019751|3927849:3988730|3985249_3985861_+|WP_015198929.1|DBSCAN-SWA MLKQTLQRQIKQLNSQEIQERLLAINQLEQITKTHPSHHWYIMEALSNFLRQSAPIDNLDIICIDIQTALHVICNRNVQHDPKNQILDLSFTNIPNVNLDNTNLQQINFYQSNLTNASLKNANLHQAILAAANLKGANLERANLSSANLGAANLTNANLRAANLHRANLYLANLEGAIVQEANLWEANLREANFKGVRQPLNS >NC_019751|3927849:3988730|3947091_3948117_+|WP_015198904.1|DBSCAN-SWA MNTPPQLDFQFQKIILEKSHNFTNCEFIFTAINDFLHKYNRGYFTIIGSPGSGKSAILAQFASFNPHSNINIIYYNAQIENKNIAEEFLKYVCSQLIEKFHNSLITPPQPSPLAGREQDSNFLPYKEKQRGQDSNFPPYTGGQRGVLPDNATEGSWFLSLLLQQISDELAPNQKLIIAIDALDTINPNNQPPGTNLLYLPRYLPPGIYFLLTRRPFKTEKSGLLIEAPSQILDLSQHDLKNWDDEQAFTQHWQQMQGEGFSDIAMKILQVLATPENEGISASTILQRIHQTNPPTLDADIFDVEEVLENWFEFLQQHQVNKEIRYSLYHPNFRNWLAEKLS >NC_019751|3927849:3988730|3973364_3973652_-|WP_015198920.1|DBSCAN-SWA MLDLREIYPLSDFQRNARQFIEQLQENQKPIVLTVNGKASVVLQDAASYQKLLDDLELAKSAATIRQSIAEVAAGQEQDAIEALEALRAKHDIPR >NC_019751|3927849:3988730|3956398_3957745_-|WP_015198908.1|DBSCAN-SWA MAIDLRRFFEATDPSKTLVVNQPEDRKYYIDFSSVRGGDVITKLKQKITYFKPNDPTCQLFTGHIGCGKSTELLRLLVELEKDGFHVIYFESSEDLEMTDVDIGDVLLAIARRVSQSLEKINIAEPRKLKELLQGAWNVLNSEVTGVKLKVPHVGDVGFSAEKEKYSLSLGIGEITSKAKSDSTLRERLNQYLAPQKVKLLAAINQELLEPAIIQLKQQGKKGLVVIVDNLDRIDNRVKPWGRTQQEYLFVDQAESLNKLSCHVVYTMPLSLKFSNDYGMLTQRFDDPKVLPMVPVKLPDGSIHEQGMALMRDMVMARAFPDLNSVDRLSKISEIFDNEMTLDRLCIASGGHVRDLLKLLNTCIQEEMTLPLTRGTLETVIVGRRNEMVLPISDEEWELLHRVKEKKKVSDDMGYQKLIRSRFVFEYRDNGEFWFDVNPILAEARELQ >NC_019751|3927849:3988730|3972519_3972882_+|WP_015198919.1|DBSCAN-SWA MIEGNFDDIGHIFFEIDLITTDGLNLPVDAMLDTGFTGFLVINKQDLEVLEWVYRGDEQMLTARGEAIFEKYLGKVFLDEQEYEIPVYAGDEITEVLIGSAWLKILPLVVNYQAGILTLG >NC_019751|3927849:3988730|3935217_3936405_-|WP_015198895.1|DBSCAN-SWA MQLIKKNNIWKKIIYFCLPIILIGLFFANFTSPSVEIVGADFIGEAVLKTGTLFQNTQVGGLSGITYDASNQVYYAISDDRGDKAPARFYTLKIDLSKGKLQQGGVVPVGVTLLLDAQGKNFASTTTDTEGIALTQKGDIYVSSEGDVGKSINPFIKEFTLASGKEVKTLPVPEKFLPTSSKRGIRNNLGFESLTVTPDHQFLYTATENALVQDGSEAKPNTSSPCRILQYNLATNQAEKEFLYPTEAAPATIKIINKYANGLPDLVALDNQGNLLSLERAFTGFGFSVKLFKVSLEGATDIRNIDSLLATDIANIQPVRKQLLLDLGKENVLLDNIEGLTLGSQLADGQPSLILISDNNFNKLQRTQILALRLKTESSSPILRFFRQLVPNSNK >NC_019751|3927849:3988730|3950563_3951610_+|WP_015198906.1|DBSCAN-SWA MADKLSLMDSYDEFLRELKERIRSAQIKAALSVNRELVLLYWQIGREIIIRQQQQGWGAKVIERLAQDLKAAFPDMKGFSARNLKYMRAFTEAYPDEQIVQQVVALIPWGHNVRILDAVKDFSVRLWYVQKTIENGWSRNILVHQMESGLYHRQGKATTNFENTLPKPQSELAQQLLKDPYNFDFLSLGKEAQERDLEKALIEHIRDFLLELGVGFAFVGSQYHLEVGNQDFYIDLLFYHLHLRCYVVIDLKIEDFKPEFSGKMSFYVSAVDDLLRHPDDKPTIGMILCKTKNQTIVEYALREMNKPIGVSTYQLRDILPEQLQGSLPTIKQLEAELEALSVDVEDEE >NC_019751|3927849:3988730|3937335_3937530_-|WP_015198897.1|DBSCAN-SWA MKVLRYILAILIPPLGIFLTYGIGQTLIISVLLTLLGWVPGSIHAVWAISKRDEAISLGQRETT >NC_019751|3927849:3988730|3960194_3961838_+|WP_015198911.1|DBSCAN-SWA MGQSLRVIQVMASFWGALTAVLLCGLNTSVQAAETVVIRFGEFAESISLAELQTMATTGKFPDGYGIYTKRLSEQQRTQIIGALRTEIPVGVVTMNRLLNTPVGTTILNDLSKAIIRKDASGVQAIRAGLVLGATAPQGLSVLNFIAAYPGKRLEIDLTQAFQVGKNLNVAFWQTQRFMEALAPRLQPRKIDLSLPFDPSQPGTSQVKVININFDDTKRQRRIPIDLYWSDAVTPNRPVILFTHGLGSVRTELRYLAEHLASHGYAVAAFEHPGSNGVNLEEALAGKTRLMKPAEFLERPKDISAVLNQLEILNQTPSSPIKGKLATNKALVLGYSFGGSTALVSGGAEYQLEYLKQRCKENLATASLGEGIQCIAQELPENTYQLRDERVKSIIALSPTTSLLFGNTGLSKITIPTLMWSASVDKTTPALTEQIISFSRMQQPKLLAGVIGATHLSVKDPSATMDQRGKINTPLSGGEVVDTQAADIRKYLKAIVVAFAAQLTPEAEKYSIFLTSDYAQYASTNDFPIRLIREIPPDAMKVLEEMK >NC_019751|3927849:3988730|3974065_3974251_+|WP_015198921.1|DBSCAN-SWA MTTSSVTTRDLHSTFVSKTNKAYYREDQQDKFMHLQAEVDYLLQQLQNLKQEKSGTDTCEN |
44 | Bacillus_virus(16.67%) | transposase,holin,tRNA,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019728_1 | 12168-12275 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019728_1
|
1 spacers
spacers of NC_019728_1
>1.1|12192|60|NC_019728|CRISPRCasFinder GCTTTTGCTGATCTTGCAATTTTTTTAGCTCATTTTCATCTACAGAATTTTTATTCTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019728_1
The CRISPR arrays of NC_019728_1 >merge|NC_019728|1|12168-12275|CRISPRCasFinder AATTTTCAATCTCCACTTTAAAATGCTTTTGCTGATCTTGCAATTTTTTTAGCTCATTTTCATCTACAGAATTTTTATTCTTTAAATTTTCAATCTCTACTTTAAAAT >NC_019728|1|1|12168-12275|CRISPRCasFinder AATTTTCAATCTCCACTTTAAAAT GCTTTTGCTGATCTTGCAATTTTTTTAGCTCATTTTCATCTACAGAATTTTTATTCTTTA AATTTTCAATCTCTACTTTAAAAT
>NC_019728.1|WP_041741245.1|11147_11762_-|radical-SAM-protein MSLLNIAEICTATQTLGPGQRFAIWVQGCCFNCQNCISPDWIPMITGNLMEPKLLANMVLSTPNTEGITVSGGEPMLQAEALFELFTFLRQEQDISIICFTGFTLEQLRSKCDRNIEQVLNMIDVLIDGQYVSELNDNKGWRGSSNQVVHFLTSRYLSQANLFLERERNVEIHLRNEAALMIGIPPHNFQRAFEETIENLRGCL >NC_019728.1|WP_015173947.1|9193_10678_-|hypothetical-protein MSGEKRRYVNVEEQELRRLRKQDSRLRSLNQDLPERLNAIREEANRELQQRLAPMEHRALQQEQEAKKLKSNLAILELQTHQRLQQQRKEFQKVIRDSESKQQQALEVEVKRLEDAMREGFAEQRSLFLQITAEQRQEYLALNQHLDQKFTELIDEERQAREQLQQQLEQEKQDKATLAQNILDDVQTIWEQIDCNYQHQRFAPGKLNDLKREINLARDNIQNGVLEAAIATSQQTYFKLADLRLELELKQQEWELLYNSALEDLKSLIAEVQANREYEIEIGQGDESQKFRLEVDYWTNGSLKKYEQELQEIETSLQKSESSLTTEQIREIVQQIEELQPCLEEIVEQAQREILSSQLRAEIADKVAHVLARMGYVLIDPNADSIYEEDDQRKAYVLKLKDANGGEVVTIVSPDKEFGKNLVSINSFGRILRDENAQKENAEAIFDALESQGIETQGSTECVEQPRDDIETLFEDALQQQVKKTEQVNKTSQK >NC_019728.1|WP_015173946.1|6630_9177_-|AAA-family-ATPase MTVERVTAGLNLEAGDRFIILYGANTSDQFCTPELLLRDIEWVLHRYLKSQGYQRILFFDGHRKLYFLDRESRDRCLPRRASTNPLPPKNSEMMVKPGPLGRKKRLLPNRSEPVAPTPAVSVASPPQAPSLMRDITVIPYFHTAMVEMEQLSAIVFSYAEGLANFANQQELFGRIIEWSRLPANNRNRCIFIFHYENRNGLEEFCRRHRFTYLENLLLNREQAGQSLNICRLGAPIADEIEYLIHYFRLDKEKPVDWGTIQLLSRWIAAENRQLNYWYDCFAIAKEISLAEARKQKWLSGNVSSKPGLERLQKMIGLQSVKEVVKQRAEVLKVENIRQQQGLFTEPPRLHLVFKGNPGTGKTTVARLIGEIYRDLGLLRRGHVVEVARQDLVAGYLGQTAMKTDSVIDSAVDGVLFIDEAYNLNQGPNDSFGLETINTLLKRMEDDKHRLAVIIAGYPDRISEFINSNPGLERRFRKEVLFEDYKPEELMEIFHQQISQIQGVIAPQLETALINLFTRLYEERDDKFGNAGLVQNLFQSMDELRAQRIAQNNLDFLHEPLQLDDLPAKEREISQQGVKDKDNLQQLRQKLDNMIGLLNVKQRVNELINTERANQRLKAEGYDSFSTLETRHLLFLGNPGTGKTTVARIVGEIFKALGLLKKGHFVEVGYSDLVAEYVGQTAPKIKKVIESALDGVLFIDEAYSLAESSFGLEAIDTLVPMMENQRHRLVVILAGYSLEMENFLNANSGISSRINDQIEFPDYNGTELFRIFMELCTQNKIKCPDNVANKLRETFNRMYATRNRKFGNGREVRNFYERMVRQWKNRISREHLTGEAMLTFAISDIPSLN >NC_019728.1|WP_015173945.1|5808_6627_-|hypothetical-protein MNNCPVCNSEYTQGEVICPICSWDLTPYPLTFAGQIPDEYISKEKTKLNWAREIWIKLHHLPSLSQAEIVELQNEKIRLEKSLQQLQSQFAQEKSHLESQINILNNDKRDLSTKVLSLEQEKSQFQSQAETISKEKIKIEQERSHLQSQVAQITQENECLLQRIATYEQERSQFQSNLESLKQQQNNLLDNIKKLENEKSELQHQANRLQIQLKAELSQAEVKLINVEQERNQLQGQLQEVQAELDKANEDRERLRQRLSSSKPGKDDVWDL >NC_019728.1|WP_015173944.1|4312_5773_+|hypothetical-protein MFEETSDIVLDTQTPVSKWAPIVYGRTYAVDFRFLVIPDNFDDNLKDLLWQYIKVTTREAENLSGNPRWIFIRGKKRCVVGVTCMVRDLIGFQADNTPEDLTRDKLGRPLYTFVGYVSQDPMITAVPAMNLELFAEPYKEFVPKKWQEIYADLGSNQAATQELKSQYEREFNLEEVATEDLEAKKISIENLLTSGQNSIIFWNISNTRNIWFTASTNREPLSICFGNFNKRDLINSVYMNAAIDEKEGREEVEKVKKVSKTQLNSQFENSTYTQSPSQRFNEQVHSSSQSDEQWDSEYLGIEDDIYQTDKEEMSFIVSISKPGYEFTRKALGEGIANGLSFINRNTVGKIAEIRYGKENVNKMHEQIIGVDELVTELKKTIEKLEKLQKQRETLIAENREAELHKLNESIESLKKQKKDLKQELDDIEENSRSRRTNQSIQPRQTEKRAKTNPNLGFQDKEIMENKQIDSDTNAKKSSQSKDIWEL >NC_019728.1|WP_015173943.1|3321_4320_+|hypothetical-protein MVAEAKITMLGLEGSGKTCYMLGLYATMQMGLQGFTLTATDMDEDLRLTSLWERMVDEEGENRWPFPTGVESHQYEFDFSYGMRPLIKFDWLDYRGGDMKGFSTQEGVQILTKRLLESSCVFLCISGEYLKQEVSSDMELMSLAKKTGVDRMNKFLMDISKNLKECQRPFPIVIVITKFDQCYERAKDKVSKEKLFDDIKKMFNALFLPNKDWLVMLCPVTLGKGLENDGVTGEIQPKNLHLPLLFALYAKFREYAMTEQARVNETQIRLDILRSGNWFQRFFTGDDQRVAESSLENYQNHLQEIQQRMALLAQELTNAQIFLGGKEQQVDV >NC_019728.1|WP_015173941.1|1025_2153_+|hypothetical-protein MSRWAAIVYGRTYEVDFRFLALPHDFNGAEQNWAMMHIQTMTRLPEDLPGKPRWAVFTNDKLCVIGVACMARELGGQANTNNEDITRDQRKRPLYTFVGYATRLNDQDVVEIPNYLGQDLSLFSLPYHQYVYPNWRVKSYDERSSVAIATTYQPLSYPTIVIPADLEKRDFSLNLAEDDAIYLWRDDDEKRHYLWASAAKQISEVNNNVSLCLGLMRSSATNGAFLNVTIADVAHKEKIIRVLESTSAPSVDSTSVAVLSQPTPKLRNVGDVRDKTSLILQQVSALLIGAITGFLVARLLKLGAAKVVIYTFVGGIVTWILLLIALGVNLLIKRTSSQKLKNNESSVLSKQDRMFGFRDKTEQDETKDDDFMGWR >NC_019728.1|WP_015173940.1|102_987_+|GTPase-domain-containing-protein MRIVEIGHEGVGKTTFMASMYGTLQKSIEGFSLRASHVNDHNRLIKLSTDIKQKKYPTPTDQRQEYKFYLQYQNKDIFPFTWADYRGGAIRETQDSEQATLLQKDLQQADGILIFCDCQALVQRDSRKNQIGRMTALITNALKNIERPIGLAVVLTKADLVNELNEDDFKIFEGLSKAIKASTYIASMMIPVACGPEPINVELPLLFVLYIGVFIQANYLTKEINEHKQMAEYYEKQTYGFGGFVQELWDIFQGNTTYREMSQESLEKATTKYKELEPLIEPVEALKKYLSISE >NC_019728.1|WP_015173951.1|15770_17330_-|Hsp70-family-protein MSSHKVGLDFGTANSVVSYFENGTLHLFEYEFKNGQKHIPSLIVYDGDGIVIGDAARSKIIRDPNVEGYGRFQKQLLFHTSKYLNSDQEQRARITVTADFLRELLFSKEVQSSSFSQQKGNIKNLVISIPETYYRDIANQEKVCLNRLIMNELGIGANNFQLISESVAAATYWIWEKQRQNLETHGNLLVCNMGSSSFNLSLCSISTTEKVKVLYSDNYGDAGFDFDRQCVQLAYTEKHGHFLAEESREFIRLLKDFELKKVNSHQESTSRLITYLKMPEAMAEYNLYCFGGGYAVKCQHISEAFAPIQKGIQEVIQHLYIWMQSHQQSFDFLFIIGDLCQFILTQNTILQALDIQESDPRFDPSFNNAYSSFAISHGACLIANSLIDPVERCVYTLGIVAENLNANAERERQLIPIIQGGTDLDDLLETQFLDQPLLTAFTGNFSTITVWVDAHLQGDIFREVKLDAIKLPNYSCRNHWRVGMRVNHSHIFYLVIEDCKNKQRLEYELGILSNIVAQL >NC_019728.1|WP_144051170.1|17825_18773_-|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MVSDPPEVIATSEALTPTQLNSVVEDKSAGIGEGETLPIAKIKLPASQPRRYFDPKKLEELSRSIKQFGVLEPLLVRPLNNDNFELIAGERRLRASELAGLMEVPVVVKEMDDYTTQQVRLVENLQREDLNPLEETEGILELLGIQLQQPINDVVSLLYRMQNEAKGKITQNVLGKHETLAVQSVFDVLGTITWESFVNSRLPLLKLPEDVLSVLRQGKLEYTKAVAIARVKDDEQRAELLDKAVIENLSLSQVKELIQQLQANGTQEILPEKALSQRYADIGKQLKQAKVWDDAKKLIKVEKLLSDIEKILSGG >NC_019728.1|WP_015173953.1|19144_19909_-|ParA-family-protein MSQTHIIALFNQSGGVAKTTLTQNLGYHLSQKKNTRVLLVDMDPQASLTMFMGLEPDELETSIYNAIVNNKPLPIYPESINGLSLVPADINLAAAEMQLSGAMSREYRLKNALAPVLDDYDFILIDCPPSLGLLSIISLTAATHILVPIQCQFKSFKGTELLLNTVAQVRSHTNPNLQFAGFVPTMYDGRTAQESRTVKAVQEQLSPLATVFPPVPKSIAFADASERRVPLALLDKSHSAVAILKKIALQLEKL >NC_019728.1|WP_015173954.1|22321_24562_-|hypothetical-protein MENLNEIKNRMMSQQSVDSEKNKVESAKREYSDSNTLNVEYIDNQTTNWIVISQFKKFFNAYHDVEPYIKIDETTKSHIENKNGWISRLEQEEFPVAFLGSFSAGKSTIINAIFKREILPEAVNSTTAFPTIIRKGEKDIANIYYIDEDAKNQLCNELCTQIRKKIDKDIFNENIVLTSQEIRNKLLEKLKKDISEYENKIGNKIESKPLETLQKLFDGWGKYQSATKIIAIDALTHYVEGHEEALFIDRIEVAIKNINIPDHVVLVDLPGLAVANERHIKFTKEYVQHKAKAFVVCMKPKSLLEGEEIKFLEEINRVNPTILQRSFWVINQWETLNDHQKKEEDANFYKKIKDYSFNITDNRFFKFTALNYFYLSCMADETLSETKKLKEQKSSYLRSLTSNGLDDLSKEEIKNLLNYDEIKSFLNFVDSLFNYLGTVAQDEFIKNAKSELLQEVLRLQKLLIPDYTMYGKKDNFEIEIQSVEVDKQVNAFIGNLEGKVERFGIQMRNVGKIDFWKESNTIQIEQEISRIILQLSRDVTNKLRSGYDNDGLLSRLPSEVIDKLELTFLMRDKLVVAVEEFFLNSLGRLLLELKEVNKDYLPESLLKLLEDKLGKRDIEMRLKGLADALFFQYGDEIERISFSLNECQGATFEERVGSALEKYKNELKKFIRSLVDDLNKYVRRSVKNHTQYVEQELLKLFVDERERIVIQIANKINLSEVTVFEQQKKSIISNSYNILTDLKRQL >NC_019728.1|WP_015173955.1|24680_25298_-|VWA-domain-containing-protein MLENRDYTLIIDKSGSMSKKDQEGNKSRWNLMEESTFALASKCEEFDPDGITIYTFSRNFKRYDNVNSSKVEQIFSENEPKGNTALAEVLQDALQNYLQRKIKPENKRDGETILVVTDGKPDDQEKVAKVIIQATQDIEKEKELAICFIQIGNEKEAADFLNFLDDELKSMGAKYDIVTTVSLLDIENEELTFKEVLLRAIDPNS >NC_019728.1|WP_083866414.1|25885_26290_-|site-specific-integrase MADRNRGYYTIKFRGKGGKYREIGLDHETSRAFKKYRGMAGDRMPVFANVSRNPTKRGLPLSDRAIKRMIQDISEAAKVKFSCHWLRHSHATRAIEHKNVFEVQNQLGHSKSDTTKAYVRAKKDAGTGTVLPRF >NC_019728.1|WP_041741238.1|27235_27460_+|hypothetical-protein MNLQEIINSINSLPTEERDYLFEFLRNKKEESRGDNFWQGLQKFRKVIQNEGIIFTDEDFADLRDTSVGREIDL >NC_019728.1|WP_015173959.1|28207_28810_+|hypothetical-protein MSDENKPSQMLRVPTPLIDAVRELSRLHRQGKTSEVLSGLDDLIFTLEFSSASPKNSAPQAILEICSRLDNLESQFSGSSNNNEVSSTKRLNDLEQKIDSINNRLTQFAEAIMLLQSNINNQPRRSKSYNSNSYYKGQSVKFQPITEESLASRLGVTPESLRKERESQPAPLFFAWSKRKDTSGIGWEFNDKTNLYHPIT >NC_019728.1|WP_041741257.1|28823_29084_+|hypothetical-protein MKTDQERQELIQDIIVLLYQAYDSTLDNIHALLKRIDDMEDEEDLQAIQEAREDIRINGTVSWNEIKEEIRNESKKSDLISTSISI >NC_019728.1|WP_015173961.1|29259_29706_+|hypothetical-protein MIPEFDSNGNLPPGVYFCEWQEFKERFGKTRRRVLLMAGLEMAMQELKTAGCRVIYINGSFVTSEPNPGDFDACYDDETVDIENLRINAPRLLNHYDRAGQKAKYKGEIFPSNQPVGSYGDNSFNFFQCDRRGNKKGIIAIDLMRWEP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019728_1 | 1.1|12192|60|NC_019728|CRISPRCasFinder | 12192-12251 | 60 | NC_019728 | Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02, complete sequence | 12192-12251 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|12192|60|NC_019728|CRISPRCasFinder matches to NC_019728 (Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcttttgctgatcttgcaatttttttagctcattttcatctacagaatttttattcttta CRISPR spacer gcttttgctgatcttgcaatttttttagctcattttcatctacagaatttttattcttta Protospacer ************************************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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