Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_019425 | Carnobacterium maltaromaticum LMA28, complete genome | 5 crisprs | cas3,WYL,csa3,DinG,DEDDh | 0 | 1 | 10 | 0 |
1. NC_019425
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_019425_1 | 1087784-1087884 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019425_1
|
1 spacers
spacers of NC_019425_1
>1.1|1087808|53|NC_019425|CRISPRCasFinder CCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGAGCCCGTTAACCCCCACCATGAGTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019425_1
The CRISPR arrays of NC_019425_1 >merge|NC_019425|1|1087784-1087884|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGAGCCCGTTAACCCCCACCATGAGTCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG >NC_019425|1|1|1087784-1087884|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTG CCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGAGCCCGTTAACCCCCACCATGAGTCA TTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTG
>NC_019425.2|WP_015075876.1|1081419_1081950_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MGNKVVLHQAKTSDLGLIEGMLYETASWLKSIGSKQWNGVLEGKDNHNTPQAIERGEVFYCTINDEPVGMFILWSNQSEWDAQLWGAEDSSQYFYLHRLNLVRKFSGQGIANEILAEIKAYSQKKGKSGVRLDCISSNAVLNKLYQSVNFAFLKTIYDHDAGEQVADFNLYEYDCK >NC_019425.2|WP_010051195.1|1079798_1081145_+|glucose-6-phosphate-isomerase MPHIQFDYSKIDKFLQPHEVAYLQQQVTTADEMLRKGTGQGNDFLGWIDLPKNYDKDEFARIKAAAKKIQSDSEVLIVIGIGGSYLGAKAALDFLNHSFYNLQDSKDRKAPQIFFAGNSISSSYLHDLIDIIGDRDFSVNIISKSGTTTEPAIAFRVFKELLVKKYGAEEAKKRIYATTDKAQGALKNEANAEGYESFIIPDDVGGRFSVLTPVGLLPIAASGADIDSLMKGAADASEAYSNPKLEENEAYQYAAVRNALYRKGKVTELLINYEPSLQYFSEWWKQLFGESEGKDQKGIYPSSANFSTDLHSLGQYIQEGRRNIFETVIKVDKARHDIKIPVTEADLDGLGYLQGKEIDFVNTKAFQGTLLAHTDGDVPNLLVTIPETDAYTLGYLMYFFEIAVGISGYLNGVNPFDQPGVEAYKKNMFALLGKPGFEELAKELNERL >NC_019425.2|WP_010051193.1|1079270_1079663_+|hypothetical-protein MIEKQWVAGTVMTMDQEGRSVFLVSNKTGETANFSFPSAKIAENRTGLASILEDLKHKLTIDVSSLHLFELTNAIVADVRIPLFVFELTENLDDLESLLKVSKDDTLSWQHTDAIRGALSTWEISGVPQF >NC_019425.2|WP_010051191.1|1078799_1079177_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MTYKIGMIVKGKVTGIQPYGAFVSLDKDTQGLVHISECKHGFVKNLNEVLQVGEEIEVMVIDIDEYTKKISLSMRSLEQKSTMHYHYKKRKYRPDKADKVGFESLRQMMPKWIEEAKNDEKKRQK >NC_019425.2|WP_015075875.1|1077433_1078606_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MQANFDEIINRKGTNSVKWDMLTEKFGSEDVLPMWVADMDFATPKTILSALKKSLDVQILGYSIPSDGLYDAIIDWQSNHHQLNLNKSDILFSPGVVPSLALMVTALTEPGDSVMIHDPVYPPFTEVVRSNQRQLVRSSLIIENKQFKMDFVDIEEKLKNHSVKLFILCNPHNPGGRVWSTTELKQLAELCKKYKVILVSDEIHGDLVFAPHSFTSVVTLDPSYQEFVVTLTAATKTFNMAGVKHSMIFVKNKELKAKIAMEQHKSEQDGINTFGYVATEAAYNTGEVWLEELLDYLSENLDYACKFLEKELPQVKFLKPEATYLIWLDCSYLGLSDSALRKQLVNMGRLGLNPGISFGPNGSQFMRMNIATSRATLKEGLERLKVALTK >NC_019425.2|WP_010051189.1|1076521_1077385_+|ROK-family-protein MMYGAIEAGGTKFVCAISDENFEIKERVSIPTTTPEETLSHVFEFFDQFKLDSIGIGSFGPIDVNKKSATYGYVTTTPKVAWTNFDFLGAVKKRYEIPVGWTTDVNAAALGELKKGAAIGLDSCVYLTVGTGIGGGAVVNGKLLAGYGHPEMGHMLVRLHPDESYGGFCPYHGNCLEGIAAGPAIEGRYGVKGHELADKIEVWQMEAYYLAQALMNYTLILSPERIVLGGGVMKQNQLYTLVREEFKKLMAGYVAVPPLEEYIVAPGLGDNAGVTGCLLLAADELTK >NC_019425.2|WP_010051188.1|1075748_1076342_+|peptidylprolyl-isomerase MTQFPQLSTEVAANEKLVTMKTTMGDIKLKLFPDLAPKTVENFLGLAAKGYYDGIIFHRVIPDFMIQGGDPTGTGMGGESLWGEEFNDEFSKQAFNLNGALSMANAGPNTNGSQFFIVSNTEVPQNMLTQLEGAGYEKEVIDAYAKNGGTPWLDFRHTVFGHVIEGMDVVYDIQNVKRGAQDKPVNGVRIESIEIAD >NC_019425.2|WP_010051187.1|1075082_1075574_-|divergent-PAP2-family-protein MQILTNYPLIAALSAICFSQFIKVPIAFLLKKNTTWALAVSTGGMPSSHSAGVTALITALILNYGWESPYVAIAVTFGVIVMFDAMGVRRQSGEQGLVLNQLIIDLQNLKIKSNESGESPKRKQRDKHIKEYLGHKPLEVLFGIFTGIAMAYLVRAILNYFNY >NC_019425.2|WP_010051185.1|1073912_1074905_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MDSIDDVFDITIIGGGPVGMFAAFYGGMRNAKVKIIESLPKLGGQLATLYPEKKIYDIAGFPEVKAQELVDNLEKQMSRFETTICLEEEVLSVEKDAEGLFVLETTKHTHYSKAIIITAGNGAFQPRRLELDNAIRYEGTSLHYFVDNLERFKNRKVAICGGGDSAVDWALMLEPVAKEVFLIHRRNQFRAHEHSVSLLDKSTVQLKTPFIPAKINGSKEALDSITLKEVRGDQVEELVVDDFLINYGFVSSIGAIKNWGLDIEKNAIVVNSKMETTIPGIYAAGDICTYNGKVKLIAAGFGEAPTAINNAMSYIYPDKKVQPMHSTSLF >NC_019425.2|WP_010051184.1|1073511_1073748_+|YuzB-family-protein MDPIVEFCVNNAANGTQPIIEQLEKDGKVEVVSYDCLNECVVCAKDFFALAEGKLVRADTPEELLTKIYSSLEEEGWL >NC_019425.2|WP_015075877.1|1089788_1090583_-|hypothetical-protein MFQSIKNNLFYHPLFLIFINPISAILFGTLYALQFTKIHWLNFFFFYLFILATQFIETILSNYVKKQQPIRLFPLILFELLAIILSIYFIFQLNYLVFLLMIVYLFAIHFQFFPYNLTETLYGLILNSFFKGGIITYLSYFIQAKFISQNLYYWSISLILLALLVSFTKDVVLSNKTPEVNKQNHLIFIAILTLLYLSNLVIFFIFKTTYPYLWLQLLTLPIALRLIVIMKPNRAKYSTSIKFKTLLLFQLTYILIASLTILLK >NC_019425.2|WP_010050173.1|1090841_1092032_+|methionine-adenosyltransferase MMERRLFTSESVSEGHPDKIADQISDGILDAILAKDPDARVACETTVTTGLVLVVGEISTSTYVDIQKVVRNTIRGIGYTRAKYGFDADTCAVMVAIDEQSSDIAQGVDDSVEFKADEEDKLNQIGAGDQGLMFGFAIDETPELMPLPIALSHRLTKRLATVRKTGLVSYLRPDAKAQVTVEYDELGKPFRVDTIVISTQHHPDTEISELKKDILDLVINEVIPSELLDAETKYFINPTGRFVIGGPQGDSGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGAFSGKDPTKVDRSASYAARYIAKNIVAAGFATKCEVQLAYAIGVAQPVSIAIDTFGTGTVSESELIKAVRANFDLRPAGIIKMLDLQRPIYQQTAAYGHFGRTDIDLTWEATDKVEALKASIGK >NC_019425.2|WP_010050171.1|1092220_1093705_+|MFS-transporter METKKKQTNVLLVTIAIFVGTFMTAVEGTIVSTAMPTIVGSLEGMAIMNWVFSIYLLTNAMMTPVYGKLSDMIGRKPIFIIGAIIFVIGSSLCGLAQTMDQLILFRAIQGIGAGAIMPVSFTIIADIYPYEKRAKVMGMNGAAWGIAGIFGPLLGGFIVDQLSWHWIFYINVPVGIITIILIALFLHEDFSFEKKPIDFLGCFSLMAALLFLLYGFQIVGDTGEFSASMAGVFALAVGMFALFIFAEKRAIDPIIPLSLFNNRTFVIQNIVAALVSGFLIGIDVYIPMWMQGLLGMKAAMGGFAITPMSLTWIIGSFIAGRVILKHPVKSILSSSLVIVGISGLMMVLAPMTTPFAFFLLVTAIIGIGMGITITTTTVTAQSVVPQDQIGVATSSNTLFRILGQTVMVSVYGIVLNSSIAKHIAAQTVDGVNEKMMNKLINPLTAVDLDPKIVQPLREILYDGLHSVFILALVVVVLAFVINQFDKKNAPKISV >NC_019425.2|WP_010050168.1|1093748_1094312_-|methyltransferase-domain-containing-protein MLERAMHYSHTLLKQAITNGDSVIDATVGNGGDTVFLASLVGPFGKVFGFDIQKEAIETTQQKLLLTGLTEQVELFQQGHETIDSVLPKNSQIAAAIFNLGYLPTSDKSIITQADTTLLAIEHILPRLRKTGLVVIVVYYGHDGGLAEKDAVLNYCQTLPQEEFNVLQYGFINQRNQPPFLLAIEKK >NC_019425.2|WP_015075878.1|1094441_1095398_-|TIGR01212-family-radical-SAM-protein MNQFKFTNDPNKRYHTWNYALREQFGEKVFKVPLDGGFDCPNRDGTVAHSGCTFCSVSGSGDFAGDRIDPLPIQFQKEVQMMHNKWPNVTKYIAYFQNFTNTHAPVAELRHKFEQVVNEKGVVGIQIATRPDCLPDDVVDYLAELNQRYYLWVELGLQTIHEKTSQLINRAHDYQTYLDGVEKLRKHNINVCTHLINGLPGETTEMMLESNKRMILDSDIQGVKLHLLHLMRNTKMVRDYHEGRLEFMDMETYVNLICDQVEQIPPEIIIHRLTGDAPRDTIIGPLWSLKKWEVLNAIDRELKQRNTFQGSKNIRLHG >NC_019425.2|WP_015075879.1|1095557_1096772_+|MFS-transporter MQMNKKERLPRDLWIVAIGMVLLYTGLSFIWPFNMLYMTENLGMSDTAAGTALLVNSGIGIIGSVIGGIIFDRVSGYVSLAIGTGILVLTTGSLFLFHGHPAFIYNIWAVSVAMGMVFAGLYTAAGLTHPSGGRTGFNTIYVAQNIGVAVGPFLAGFLAKDGLGNVYTGSFAFALIYALFFFVYFRKIDWHSNKVTSETKHKQKGTVRGKATKIGLISFGLLLLTYLFCQLPHVQWQSNLSTYMTSQKGVTTAQYGNLWSINGTLILIGQVLIIPLVARFKEKLSLQIYIGIGLFFCSFLFAMQAESYGGFLLGMILLTLGEMFAWPAIPAIAYKLAPVGQAGLYQGLVNGTATAARMIAPIFGAVVVANLGGITSLFIAIFILLGLAIVSLFLQQKTQKMMDI >NC_019425.2|WP_010050217.1|1096828_1097497_-|phosphatase-PAP2-family-protein MNHYQKKWVFASLLALLGFGFVASSVMLKATWVLTFDQNLTTLIRDPITTGKSNFYLPITQFGSVKLIIFMGFIFCLFLIFRKKDWGNACWFVVNLAIGAGLLNLTMKNIFRRPRPIIEHLVNENTFSFPSGHAMGSMVFYFSVAFILCQFIRSNKLQIIVCLIASFMIVSIGMSRIYAGVHFPSDILGGYLLAFSWMALALAYYEKWSQWFQSKALQLLAK >NC_019425.2|WP_015075880.1|1097637_1098597_-|DUF4097-family-beta-strand-repeat-protein MKTKLIKRMVILSLSMLAIGAVGSIVTYPMAHKKVTLDLNKTVDATSVKQVSVKGTSMDITLADSPDNKIHVSVNGETQSADKFDIKTKQNGDTLEVTFDEPKLIEMNFVLFFNYNNRSATVSLPKSVKQATVKTNFGEIYTNNFVGESLELKTDAGDINLSGLKLTDLNAKTNAGSISLSQSAITNTDLKASAGALYVNNLVSSKTKLNTSAGNIDLNQVTGDLVATSNAGEIDLTNKTIDQNIDLQTNFGSINVQSESKPTNLTVIAATDLGEMDIFDQNNREQTFGAGKYKMNLKTNAGDIEVNHSAYENDDEDFD >NC_019425.2|WP_010050221.1|1098586_1099231_-|DUF1700-domain-containing-protein MNKEHFMIELKLSLRDLDESERQDVMRDYLEHFENGLAEGKTEEQIAKELGSPSQIAKEILTTLGVKPQVKGPEYSQGDWVSFENEKNPYQEPSYQPRRHNPNSPLMTVFKFIGLGFFNLVFVLGPAVALLGCLFAGWITSIAFTLTPLGGIFMIVTAFSTASLFQFFFTILLCGVGLLLLTLLYPITILIFKLVKRYVLWNVRTIFGGPYYEN >NC_019425.2|WP_015075881.1|1099235_1099553_-|PadR-family-transcriptional-regulator MNTQFKKGVLELCVLVILEKKDCYGYELIETISKHIEISEGTIYPLLRKLTKEGLCTTYLQESNEGPSRKYYQVTEDGVAYLGKQLIEWKEFIKSVDTIIEIGDE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_019425_2 | 2352075-2352183 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019425_2
|
1 spacers
spacers of NC_019425_2
>2.1|2352115|29|NC_019425|CRISPRCasFinder GTGAGTTTTTTTTTTGACCTTCAGTTCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019425_2
The CRISPR arrays of NC_019425_2 >merge|NC_019425|2|2352075-2352183|CRISPRCasFinder CCCTCTTTCAAGTTTTGTGAGAGAGGGGGGGTAGGGGGGTGTGAGTTTTTTTTTTGACCTTCAGTTCCCCCCTCTTTCAAGTTCTGTGAGAGAGGGGGGGTAGGGGGGT >NC_019425|2|2|2352075-2352183|CRISPRCasFinder CCCTCTTTCAAGTTTTGTGAGAGAGGGGGGGTAGGGGGGT GTGAGTTTTTTTTTTGACCTTCAGTTCCC CCCTCTTTCAAGTTCTGTGAGAGAGGGGGGGTAGGGGGGT
>NC_019425.2|WP_015076914.1|2351592_2351961_-|replication-relaxation-family-protein MKALLANYYVEFKPKVNTDWIILCILHELRIVSYKQISSLINLAFPIAEKNLRKQISHLKEQGLIEFIVDDKLGNAHYYFLTREGHNSIGGYYPYPKVPEYNLFHHLMVTNSLFCSLLLLEL >NC_019425.2|WP_015076912.1|2350380_2351076_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDIEKLTVENLSYSYKNDLNNPELKNVSFELDKGSILGLLGNNGAGKTTLLNCLYNIYDYSGIVINPASKIILISSDIELYNNLTVYETLYFIVKVHDSKRKVSRNSIMKYLELFDLTEKEFYLIKDLSYGMLNKVKLIAGLIIDCDLLLLDEPMLGFDVKSIKNTQEILVSEVRRTNKTIVISSHNMSIIQEMCNQILVLEKGKVLFTGTCKDFLENFSNLETAFMEALN >NC_019425.2|WP_015076911.1|2349850_2350384_-|stage-II-sporulation-protein-M MKKIIISLTLIYILFFIIGIVLHSENIFGKIRETALIVENKNFFYYFAHNINVLKNSLVGIFSFGIFSILQLTINGIFLGVGMAEMTANVGWMKSLLFIFPHGFFEIPALILSTMLGIYPVYLFCLLIFKNKNYKWKVVIFKQIKNIFWIFMIILILIIIAALLEAYLTPWLIKNYV >NC_019425.2|WP_016356534.1|2349403_2349736_-|hypothetical-protein MNIEKYSISKLKKKINNFNLFLSISLSNALAGMLLVYLKSPQIIEDLFPNKFSVETSIGMEFLFGVFGFLTGAFMPFISCFFITFILKILFLIAKIEISFNNISQVQTPV >NC_019425.2|WP_000195429.1|2348204_2349377_+|IS256-like-element-IS256-family-transposase MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >NC_019425.2|WP_015076909.1|2347331_2347550_-|circular-bacteriocin,-circularin-A/uberolysin-family MSDLIMEIASSMGISWGVASKVIDLVLAGSSAWAIVAAIVSGGGIIAIGAVAIKALIQSKLKQMGRAAVITW >NC_019425.2|WP_015076908.1|2346578_2347031_-|hypothetical-protein MNKNFLKSTKLCTLLLAIILTIISISMIFSSFGMLVLQSGALNNIEGVNQADMNQITQSVSFFDSFLVYFQTVLYLILTVFMYIFNSKLKKGVLVSKVPYFIIIFLQVYGMVISFLNYTSFALIGILFSIVIILLALFPIINLFKLEPND >NC_019425.2|WP_041555024.1|2345345_2346548_-|hypothetical-protein MNSISKKKKIIGSILISFVIVLILIGVALYSVSSNKKKDTQSFHAITLKENDPLLFKGMAIPQKETKTYLDPTLGNLNELYVTEGQSIDIGTPLISYQDDKIQEQINEQARGIERVKTSIANTQERNGEAQKKKETAISNITTTKAMINQLEQSSEPEDLAKVQQYTQEIAKYEGIVEGQEAQIETLETALQDAQADLTERQAAVDQLQQKVTSNVTAEIAGQVHINEEGKVSSTIPLVTIVSPTILIQGQVSEYDYTKLAVGQAVNLNIPSTGDKISGKIEEVDSLPQRTGATDSVGTTSSNQVLYNFKVIPEHEIQYGYSVQIELPQNEINVPAKAVKNDKDELYVFVFQKGRVKKQDIKAIKKENFYVVQEGIVKGEKIIENPSKELKDNQEVAVDE >NC_019425.2|WP_015076906.1|2344665_2345349_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKDINKYYLSGEETFHVLRNIQLSIEEREFLAIMGPSGSGKSTLINLLGFIDRKFDGTYLFEGESLKNTSDNNLSKIRNQTVGFVFQNFSLIENNTVFENVELPLLYNGYTSRNTKEKVHSILEKVGILDKAQKYPKQLSGGQQQRVAIARALVNNPKFIIADEPTGALDSITSEEILNLFKELNEKEGVTIILVTHDLESVQYCQRLVKILDGKIIEDVELIS >NC_019425.2|WP_016356532.1|2343472_2344669_-|ABC-transporter-permease MKFSIIWRTSVKALVKNKRRSILTMIGIIIGISSVITIMSLGRGFQKETIKNLSSNDKDEITVNVNFIPEEVNLGANNLVYFQEQDLRNIKEIEGVKKVSIAEDTSDTQQVELMIKGKKKNEQLKLVKGKSTNVDYGRSLKASDSQTTNKVAVIDSILAKELYTTEKSALNSAVDIQGELFTIVGIVSVSDTDNLFSMNPNIEIPKQSYEFYFPKSSNGESIQVTVEPTSTPDKVTTKVLKELRKSGSMRERGEYQVFDMAALTEGIGKILSGLTLFISAIAGISLFIAGVGVMNMMYISVSERTKEIGIRRALGATEKVIQVQFLLEGVTITLIGGLIGYLLGIVSAFIISLFLPFSISVDVFTVLLATGISVLIGIVFSVMPASAAARKDLIDILR >NC_019425.2|WP_015076916.1|2352635_2354765_-|DUF853-family-protein MDDNLLNGIFGQSKKGKSENDKSKSSKIIYFLIAFFLLVYPFAIAGIVPYLVVKNIDRKQRNEHIGEMDYKSIIPRSSKLFGMLIPLGFIINIIFFLFVIPRGYLSTYYFFPLNTIKNDIVINYQTIIALILGGLGMSPIMLFATSFSEKRKIVSKKSQINKIKESKEYKKRLENKFIESQKFVEEYEEKYEIAKAEGDFKELEKQKQVILLGTDENGKPYIINLKELNQHGILPATTGGGKTVVLQIIVEHCIKFGIPCLVVDGKGAKDTRDAIAAIAKKYNKKVKEFTDTGTVSYNPVKYGNSVVIRDKLVSLAETESVFYSSASKSLLMSTVQLIDAYGIHRSLENMSNYFLPRNVLALFIEELLQVDPDLLVVEVVPDKKKNGKKIVDNEPKSEKTPKKVDDEFDQFSQLDEDVMVTEYVETMKLDIQTISLEDMYTVVRESIDLLTKRSKELFNQLFVRYEHKENPFYLYATSESLQTNFNMLLDSELGHLFNTEDNKNELDLQEATRNGEIVYVALDGLIYKEFIKTLAQFLISDVNYLCSEKYEISDDFPFFTIFDEPSAYLTETFIDTANKTRGAGNHAIFAPQTLADIEAIDPILLKQLIGNVNTYIVGQTNEQSEVDYWSNHFGSYDDIEITSVTQQEDGFSDLNKTDWVGDKGTQREVENYTIHPNTIKGLRTGEFIIGRKANNVHEQIRKVYMRKPI >NC_019425.2|WP_051120435.1|2354790_2357121_-|hypothetical-protein MKLNKLILVFICCLFFIILPGTKALADIPPNYNPNDPNSTDVSSVEPEVAVNRVDPTDDTNTIYERYKDNSFELMTKEYESLNGFKKMFVNSTGLLKNFSWGGVFYTGLFNTELVKFMYSLDVISPLKNGLKSMTATIAGSMLSIAGTVAITFVSFVMAFKFMAEQKMKSVFRIFFMTIAIFTCLVLLKDINANGSIIDKALNLDSAIEREFLKINPVFDGSSIPVKEDDTSEETISSTGDLIATKIFRSNIYEPYLLFQYGTTDMEAIRSKEVEYKGNSYDRIGILLDNDVRDDSGTALIDAVTKYEANTLKNRTIMYTSNFGNAIFGVFYFCLNLIQMVVFFILAMLRLMIQFLQAILFPMAPIILLVGLFNFENNVFKNYIKAFLITVLAKAMCGFATIFFATYISLGYASSSLVDNPFQKILTIIVYAVVPFAVYLFRHFLGAVFAGRLTVGDAMQYMMSPRRMNKMYKQAEKTRKDDKKARKNDAKNKKKEEQEKNNKKDGGSNKNGLNEQKNRNNKDKSDSRKPKENENKDNNHAPDLNKRNKNDTNKPNSNENKKDNKAEGKGNRQSPNRSAKRNAPVIVPLVDKKAKAQTSQSGNTQLGKNNKFNAKPYSNARKASTGADRSGRMSSKVNSNTEAIQRIKSKARANKGVKPKNEKVSQSVNVIANQKLKQGRSRRVTPNAQPTIRSPRTGKTIPTQSGRNRNQKGRPSTRGKVTRTVNKEIAVQRKTGRGGSSRNSKKMSNVLKESNRNSQQSRQINKSARVPRKRSH >NC_019425.2|WP_015076918.1|2357124_2359632_-|ATP-binding-protein MKLKSTKYKKATFPIEDYYQNFIFTEDEKIWVGYRLSKQDFPLNDIDFFKEYIEDGKGILSHYDLEYHFINISRDFDMNEQIQTTNNELVTGEFADIGKKYFERSGDILSDEVQMDEYVTYLFIQLDAIVEVVNPIEFWYLFKEKVGKKIRKMTGQESSTQVLLSSFIEKEKLLYLDLLDFKSVERTTEQDLERITYQQFHRSDSKVPTTSIHPIEMTEGIVSDEKGYLTIEQLEKTHYIASIPLIEVPTSIQGSAFIQDLQDMVSFPIDTHIRLRYKHEESDQKKVRRMRKRIFEQDKESDDIDAILDDDEVVLFGEERLHDLSVGLKNKSRRVCRTTIQFVISADSSDELDSRVRQMEQILDGTDYKIYRPLVDQLTLFNQSLIGSKYAYKNYELVLTTGYVADLGLDLNKSVGNGYGMPLGRVITSKKFKTVQEAISYSTNIVWFYPNLTKRFIPGSTHTNGNTLITGPPGMGKSVLVKYIFMWLTFLGQKILYVDPKNETQLFFKKALEKFGHIPEFVEMYKRINFMSLSDSEEFRGMLDPLIFLPREDAIQTARSVLNGLAETSKDVSTVADKKTIIIECIDEIMDSNQPKNLTRVIDLIQTKDNSLGAILKSFNIGLSKVLIGNDDSTAIGFENPINVLGIQGLKLPTKKERENTEVGLTSEQVSSTVIMDVITKLTNVFSTDKEEDAAIIYDEAKGLEDTPQGETSIDDNMRKGRANGTDIYQVTQAFVDADREDRKELISYKFSFRPKQLEARKKILQFFGMAESKKNLELIDSLVPGTCLFQDHKGRNQAIAIDVLFEEWLEAISSTKNDDAITKKALAMEKEKGV >NC_019425.2|WP_041555025.1|2359628_2360039_-|hypothetical-protein 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MQEDYSQKIDIELKWEKYKNEKLNLNKKGNNLAIVVLISIIISCIVLILFYFFISKEFVRSTWLIFITIGGLIGVYVFESIFVSNEDEIKKIFFKHHREEIMPLVVSKTMKLEPIKKNDLKPIYIVVSSPYGVEKQIVDCAIKTEKGIELKKYIKDNASKFYFQDIKISEDDKPRVEMKNRRFASENLKNIFREYSLMDLYYLEYTFYLPEENMETFFEKICYKGESL >NC_019425.2|WP_016356536.1|2362537_2362726_-|hypothetical-protein MNNKGTKTEFLASVIFLMLNIMGYFFLYQVIEKLHEKIRRKEDKINTTYIDPKKSCHKGVTT >NC_019425.2|WP_015076925.1|2362789_2363395_-|hypothetical-protein MKKKELTIGLFFVVLSLFAIGSAFYFKASELDLQREVTRWEKQFKVAEQDKKDLKADNELLSSIDVENNKNIIEYVGNESEVKKIHNQFVEATFSYDKASQRNKQMIPFIPEEQVKDLGLDKELDGAEVDIFARLAQQTDYIRHIDDNEIEIMSRITIDYNQTQGNKQYVLFTVNYRKNGNNQWKVYNIRFQDDRYNQEIK |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_019425_3 | 2526079-2526230 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019425_3
|
1 spacers
spacers of NC_019425_3
>3.1|2526127|56|NC_019425|CRISPRCasFinder GAATTCATTTAATAATAAAAATAGAAAAGGCGACTGATGGGAATCGAACCCACGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019425_3
The CRISPR arrays of NC_019425_3 >merge|NC_019425|3|2526079-2526230|CRISPRCasFinder TGGCGGAACCACAATCCGCTGTGTTAACCACTTCACCACAATCGCCATGAATTCATTTAATAATAAAAATAGAAAAGGCGACTGATGGGAATCGAACCCACGCGTGGCGGAACCACAATCCGCTGTGTTAACCACTTCACCACAATCGCCAT >NC_019425|3|3|2526079-2526230|CRISPRCasFinder TGGCGGAACCACAATCCGCTGTGTTAACCACTTCACCACAATCGCCAT GAATTCATTTAATAATAAAAATAGAAAAGGCGACTGATGGGAATCGAACCCACGCG TGGCGGAACCACAATCCGCTGTGTTAACCACTTCACCACAATCGCCAT
>NC_019425.2|WP_015075518.1|2522880_2524200_+|IS1380-like-element-IS1678-family-transposase MTSLHKNQVKFNSNITISHTGGQLSSDSGLVLVKELMNTFGFSELAKQHIHIEDERAYFTHDNLSILEQFIMQLIAGYSADSAANLLRQDPVFKAVLDRKELASQSSLSRFLDRLSEENIHELQALNQELIDKARLIRNDTELIIDLDSTHSDTFGHQEQTDYNTHYQTYGYHPLVAFDGLTGDFLKAELRSGNQYTSKGVKEFLTPLLEHYNHSLPNTDILVRGDSGFATPGVYDSCESKKSHYVIRLKNNRRLGQIAEKSVLYGDNQKWEEREVQYFSTTYQAQSWSQSRRVCIRSTREAGELLFRHEFIVTNLSENVSPDTIFSLYAKRGTMENFIKEAKAGFYFDKTDSPRFLENHVRMMLSLIAYNLVNFLRTIGFEEVQKGMTIHSIRLKFLKVAGKLVQTGRRVYLKLSSYHVYQNEFYRVFARLRRASQWI >NC_019425.2|WP_015077036.1|2522619_2522757_-|hypothetical-protein MVLIKSMNYSGDMCYYSSIKNNNMENLKRTDVPYHWADDLFASRG >NC_019425.2|WP_015077035.1|2522246_2522597_-|bacteriocin-immunity-protein MDKVDKVKENIHELYNNLIKRSGSASSLLDITDVLLQVYIKIDTTENPEALVNRLVNYIYSVGLKGRIKLSPVEENLLSELGVFAQRAGLNGLYRAGFSDKSQFYSYFDKNQMPRH >NC_019425.2|WP_015077034.1|2520294_2522073_-|Cna-B-type-domain-containing-protein MNKIKKFYSISMLVVLIFSILGSFQFVSADNTKTMENKQVISDIVTNINMTRNDGSDIGTIDQWTDILVTIDFTLPNNKISAGDTTTISLPKELELQNDSIFEVKDDAGNVVATAYANQDDKTVKLIYTDYAEKNSNISGKLWFSVQVDSYTITETGKIPLEFDIDGQTIIKEIEYEKGTGDQDEVLYKSGVFDPNGDPQVINYSLRVNVSSKDLTDVVVSDLLGQQDILINQDSIKIQEIDYTWNNVDEDWNMVPNSLRDVTDAFSNKITMSNGNKGFSIGLGNINRPYLITYDGIIGHIPAQGESFDNKAVITANEIETTTSEKNFVYSDEGGSAAGNTYQIHLIKQDKENATLLNGAEFDVIRVSTNRKVGTIATVNGEGQIKGLLQDSYQLIETKAPVGYTLDPTPILVTPADFKESNSLFVATITATNEKEKTEISGIKMWDDFNNKYNTRPESITVILLQNGQMFEKQEVKADDQGKWTFNFTNLPKSDTNGVAYTYTLDEVEVAKYKKSIDNTTITNTLTELPENPVIPVVPEEPSRPELPSKPVAPQAKTESFPKTGEEETVFAMLLGLLFVTGAAFSFIKKLN >NC_019425.2|WP_016356552.1|2519568_2520123_-|hypothetical-protein MKTIYILLTRSNTYISKLIQLVTTDDYTHVSLAFDEELSECFSFGRKNPYFALPAGLIQENLTNCFFNYHKDTPCTLYELKVSESVFMQARREVQQMVIEKKQYRYNIIGLVCYKLSILYQREKYYFCSQFVAEILEKSQAVILPKPAELIRPIDCISLIPGNCVFTGKISELVASVNSQVRAS >NC_019425.2|WP_010054684.1|2519168_2519522_-|GntR-family-transcriptional-regulator 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>NC_019425.2|WP_015077028.1|2516477_2517116_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MEHFKNNRSIIDYLNSFESSTLNCQQLALTQDEYIITRYEKSEYLYLLTNGLASVEILEDSNNYISAFIFENDFFGLDSFSSFPTKNHAIKVISSSAEIVKIKKDFLLNALNQKPELYKLLLTNFADIFQRHYYFFNFLSLPPVERVKTTLLYLSDFISVPNETSHLEIPREITQQIVARFCRTSQSRVSICLRKLHETGFLLTKTAPFIIN >NC_019425.2|WP_015077039.1|2532988_2534617_-|alpha-glucosidase MEKWWQSSVVYQIYPRSFQDSNGDGVGDIAGITSRLEYLEKLGIDVIWLSPVYKSPNDDNGYDISDYEAILPEFGTMADMDELIREAKQRGIQIIMDLVVNHTSDEHPWFKEAKKSKTNPYRDYYIWRDSVNGGPPNDLQSIFSGSAWEFDKETNQYYFHLFSKRQPDLNWENPAVQEEVWKLMNFWLAKGIGGFRMDVIDLIGKIPDKGITGNGPKLHEYLKKMHKETFGKYDVLTVGETWGATPEIAKLYSNPDREELSMVFQFEHISLDELPGKSKWDLQPLDFIQLKAILSKWQTALGDEGWNSLFWNNHDLPRIISRWGNDSPKYRVKSGKMLATILHLMKGTPYIYQGEEIGMVNTPVSSIEELDDIESLNMYRERLAAGYDKADILASINKKGRDNARRPMQWSNHEHGGFTTGTPWLELSPRYSEINVENELADSESLFYHYQRLIQLRKNNPLVVWGTYQELIPNDTQLFVYERSYENETWLIVANFYEEEADFSHESHKVKEIILSNYSDSSVDLANLHLRAYETVVYRLEK >NC_019425.2|WP_015077042.1|2535363_2537634_-|glycoside-hydrolase-family-65-protein MIQRLFDIDSWKVATTKLDKEHKRLQESLTAIGNGYMGMRGNFEEGYSGDSHVGTYLAGVWYPDKTRVGWWKNGYPDYFGKVINATNFIGVDIFVNQHKVDTFVDEIKDFHLELDLQTGILHRHYTWVSGEIEIKFSFKRFVSVAQKELCIVEVAAEVLKGEASIQFNAKLDGNVTNEDSNYDEKFWLEMDRGLGEYSYLTTKTIPNDFEIPQFTVTIMMKNRVSDEKKGHTTDQEMLVQEQFDYQLKAGEKAKLTKLIAVVTSRDIEPNQQVAKAEELLRVAEDAGISKLEREHKIVWGKRWHKADVVIAGDPESQQGIRFNIFQLFSTYYGEDARLNVGPKGFTGEKYGGATYWDTEAYIVPMYLSVTEPEVSQQLLKYRHDQLPGALHNARQQGLKGALYPMVTFTGVECHNEWEITFEEIHRNAAIAYAIYNYTNYTGDEAYLLSDGIDVLTEISRFWADRVHYSKRNEAYMLHGVTGPNEYENNVNNNWYTNTMATWVLRYTLESLKKVSKEKLVDLQITETEKDQWQDIIAKMYYPKNQELGIFVQHDTFLDKDLRAVETLAATERPLNQHWSWDKILRSCFIKQADVLQGLYFLNNEYTIEEKKKNFEFYEPMTVHESSLSACIHAILAAEVGLEDKAVELYARTARLDLDNYNNDTEDGLHITSMSGSWLAIVQGFAGMRTYENQLQFKPFCPKGWDGYEFKISYRGRLLKIIVTKTTASVILVEGEALDLTLCGENVRVTDQVQQAI >NC_019425.2|WP_010052149.1|2537630_2538473_-|DUF1189-family-protein MKKMPFPLNYFNSIATPKRVFKGRKNLSWIQNIVIFIFLNALLMFPVSLYFSQSTNFQLQEIMPHTLRLVTDEFATKLQAVEFENGKLISGEPFTIVEDTGVVGVEIPKSVKKSEKNLISFEKDHLLLKDESGYQFEVRYTENFSLKNSQTKSALKEQIKEQWFKQNKAFVSFTMMLMTGIIISFSNVLVMFIAAFFIWMTKRSALSSIRTYKESFNLILNASGIGTLLAVLIGLVHFDMTIMIGFQSLGLVIMLTAVFAVTHFSDTPIKNKRKRNEEIK >NC_019425.2|WP_010052148.1|2538521_2539373_-|sugar-ABC-transporter-permease MKNLAKSQKNSRLISRFLTYLFMIVLSIIIIYPILITISSAFKSGNIAAFNLDFNSKWTLLNFSRLFNETLYGSWYKNTLIIAISTMIVQVTVITLAGYTYSRYRFVGRKNSLLFFLIIQMVPTMAALTAFYVMALLLGALDQYWFLTLIYIGGGIPMNTWLMKGYFDTVPIDLDESAKLDGAGHFRIFAQIVLPLVRPMIAVQALWAFMGPFGDYMLAKFLLRSPENLTVAVGLQTFINDSQNQKVSLFAAGAVLIALPISILFFMLQKNFVSGLLAGGTKG >NC_019425.2|WP_015077045.1|2539374_2540679_-|sugar-ABC-transporter-permease MDSEKRENQNVKKAMLLSIIPGLGQFYNGQKFKGFIFLGLAIIFVVEMILFGFSAFNGLITLGSTPMEDHSLFLMIEGTLQLIITILFIFFYVININDAKRVAKIWRSGGKVNQTAKEIIANMLDNGFPYLLTFPAYIAMIFTIIFPVLVTVFMAFTNYDFYHIPPASLIDWVGFKNFFSIFFLSAYRDTFVSVFSWTLIWTLCASTLAIVLGVFTAVIANQDFIKGKRFFGVIFLLPWAVPAFITIMSFSNMFNDSIGAINSQVIPMLNHLPFVEIGAVAWKTDPFWTKVAIIMIQGWLGFPYIYVMTTGILQSIPGELYEAAKIDGANAIQRFTQITMPMILFVAAPIFVTQYTGNFNNFSMIYLFNAGGPGSVGGGAGSTDILISWIFKLTTGTSPQYSMAAAVTLIISTVIITVSLIIFKKTNAFNMEEL >NC_019425.2|WP_015077046.1|2540972_2542241_-|extracellular-solute-binding-protein MNKRNLKKIGLGFLSAGVILSLAACGGGSDSKKDAAKEDNKSLTISVAEGYVDYVNDIKADFEKENDVKIKVVEKDMFDQLEALSLDGPAGKAPDVMMSAYDRIGPLGQQGHLAEVKLGNDSDYDETDKAQVKIDGKIFGEPAVIETLVLYYNKDLITEAPKTFKDAEALAKDPRFEFAAEAGKNTGFLAKWTDFYYSYGLLAGYGGYVFGKDGTDPSQVGLNNKGAVEGITYATKWFQDVWPKGMQDTTGAGDFVTNQFTTNKTAAIIDGPWQAQAYKEAGVNFGVSEIPTLDNGEPYQPFGGGKAWVVSNYSKNKEVAQKWLDYVTNKDNQVKFYEATNEIPANQAAREVAKGKNDELTNAVIAQYANAQPMPNIPEMAEIWSGAENLMFDAASGKKTPQETADAAVKQIKENIEQKYQK >NC_019425.2|WP_016356555.1|2542680_2544459_-|alpha-glycosidase METAAILHRPDSEYAYLYEADNFHIRLRTKKDEVSQVGLIGGDPYLFDVDEWYKNEEPMKLLASTDVHDYWLIETTAPYRRLQYAFHVVGKDGTEVFYGDRGIFPYTAETLATPGYFFRMPYFQEIDRFKSPDWVKETVWYQIFPERFANGNPAITPENALPWGSKEHPGREDFFGGDLQGVIDHLDYLVDLGINGIYFCPIFKASSNHKYDTIDYYEIDPDFGDKETFKKLVDEAHKRGIRIMLDAVFNHTGDISPLWQDVVKNQEKSKYVDWFHVHSFPVDIGKNGNFEGERTVSYDTFAFTPHMPKLNTANPEVQKYLLDIATYWIREFDIDAWRLDVANEVDHHFWKEFFKATTDLKKDFYILGEIWHSSQSWLQGDEFHAVMNYAYTETIEDFFVKKKIDVSKMVAGLNEQLMLYRQQTNEVQFNMLDSHDTARLLTICGDDKELAKATLAFTFLQHGSPCIYYGTEIGMTGDNDPDCRKCMIWDQEKQDLTMFDFTKKLISLRKEKQEVLSYGSLEWSLVADQEKCVGFKRVGQNEVLTCYFNQGSQETTIDKIETEEVLLSNLTTNNPTSITIEPNGFIILSSKI >NC_019425.2|WP_015077048.1|2544471_2546169_-|alpha-glucosidase MSRTNWWQSAIVYQIYPRSFQDTNNDGIGDIKGIIQRLDYIKSLGVNTIWLNPIFISPQIDNGYDISNYYGIDPIFGTLKDVQELIYEAHQRELKIIFDFVLNHTSDQHPWFQEALKGPDNLYRDYYLWADGKKNGAEPPNNWASFFGGSTWEKDLHSQQYYFHLFAKEMPDLNWENPEVHVALLDIAKFWLNEGIDGFRLDAFIHMAKEKGYPALPNPTNEKYVIAEEYYANLPKVQEYLAKFIQALREVKPDVFIVGEAASAEVKQAVEYTDPTKNQCDTVITFRYFPEREELKDSRLPLGMQPGTLDRQQFKQVMAEWQKEMASVGGPTLYWNNHDMPRVVSRFGDDGLYRETSSKMLATLMYLQKGLPFLLNGEEIGMKNRIIQSIKDYEDPGAEAFYHQALALGYTEIEVLELLNASSKDASRGGMQWTKEPYSGFSTVKPWSSVNQEENYTVEAEEADEGSILHYYRRLLLLKKRELFTKGSFSLLETGDETFCYVRNWDNEEAVVLTNMTNEPVQLTCLEETLFNGKILLSAGDHELTKKQVTLAPYSCVVIQTKMKK >NC_019425.2|WP_010050042.1|2546442_2547405_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MATLNDVAKKANVSKMTVSRVINHPEQVTDELKELVFKAMKELDYRPNVAAKALANNRTQIIKFFILEEMDTTEPYYMNLLTGIAKELDKHHYTLQLVTKNNFDIGACDGYIITGMRESDYAWIERATKPVVLFGENHHGHDFVDTDNKSGTKKATEHAIAQGYESIIYIGIDVKEPFEYSREAGYINTMQQAGRVPEIKRFSNRSRYSAQFILENWSDFPTNTVFICSSDRLAIGIERSILKLGGQIPKEYGIIGFDGVFLDQIASPPLTTVKQQVIEMGVACARMLLNKIDQSGAPQGNLLFEPELIIRESTVERKDS >NC_019425.2|WP_010050040.1|2547553_2548018_-|transcriptional-repressor MKNSMVAHSIEKLKASNIRITPQRYAILEYLIESESHPTADEIYRALAERFPNMSVATVYNNLRLFTKIGFVQEMVYGDSSSRFDFTSTQHYHAICEECGKIVDIYYPGLDDVEVVASNLTGFEVSHHRMEMYGTCPDCLAKRQAETKEKTEAI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_019425_4 | 2542482-2542603 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019425_4
|
1 spacers
spacers of NC_019425_4
>4.1|2542522|42|NC_019425|CRISPRCasFinder TTTCTAAGTTACTAAAGCAACAAGAACCTCAACAAACCAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019425_4
The CRISPR arrays of NC_019425_4 >merge|NC_019425|4|2542482-2542603|CRISPRCasFinder TTTAAGGACCACAGTCCATCTTTGATGGATGTGTATCATGTTTCTAAGTTACTAAAGCAACAAGAACCTCAACAAACCAACGTTTAAGGATCACAGTCCATCTTTGATGGATGTGTATCATG >NC_019425|4|4|2542482-2542603|CRISPRCasFinder TTTAAGGACCACAGTCCATCTTTGATGGATGTGTATCATG TTTCTAAGTTACTAAAGCAACAAGAACCTCAACAAACCAACG TTTAAGGATCACAGTCCATCTTTGATGGATGTGTATCATG
>NC_019425.2|WP_015077046.1|2540972_2542241_-|extracellular-solute-binding-protein MNKRNLKKIGLGFLSAGVILSLAACGGGSDSKKDAAKEDNKSLTISVAEGYVDYVNDIKADFEKENDVKIKVVEKDMFDQLEALSLDGPAGKAPDVMMSAYDRIGPLGQQGHLAEVKLGNDSDYDETDKAQVKIDGKIFGEPAVIETLVLYYNKDLITEAPKTFKDAEALAKDPRFEFAAEAGKNTGFLAKWTDFYYSYGLLAGYGGYVFGKDGTDPSQVGLNNKGAVEGITYATKWFQDVWPKGMQDTTGAGDFVTNQFTTNKTAAIIDGPWQAQAYKEAGVNFGVSEIPTLDNGEPYQPFGGGKAWVVSNYSKNKEVAQKWLDYVTNKDNQVKFYEATNEIPANQAAREVAKGKNDELTNAVIAQYANAQPMPNIPEMAEIWSGAENLMFDAASGKKTPQETADAAVKQIKENIEQKYQK >NC_019425.2|WP_015077045.1|2539374_2540679_-|sugar-ABC-transporter-permease MDSEKRENQNVKKAMLLSIIPGLGQFYNGQKFKGFIFLGLAIIFVVEMILFGFSAFNGLITLGSTPMEDHSLFLMIEGTLQLIITILFIFFYVININDAKRVAKIWRSGGKVNQTAKEIIANMLDNGFPYLLTFPAYIAMIFTIIFPVLVTVFMAFTNYDFYHIPPASLIDWVGFKNFFSIFFLSAYRDTFVSVFSWTLIWTLCASTLAIVLGVFTAVIANQDFIKGKRFFGVIFLLPWAVPAFITIMSFSNMFNDSIGAINSQVIPMLNHLPFVEIGAVAWKTDPFWTKVAIIMIQGWLGFPYIYVMTTGILQSIPGELYEAAKIDGANAIQRFTQITMPMILFVAAPIFVTQYTGNFNNFSMIYLFNAGGPGSVGGGAGSTDILISWIFKLTTGTSPQYSMAAAVTLIISTVIITVSLIIFKKTNAFNMEEL >NC_019425.2|WP_010052148.1|2538521_2539373_-|sugar-ABC-transporter-permease MKNLAKSQKNSRLISRFLTYLFMIVLSIIIIYPILITISSAFKSGNIAAFNLDFNSKWTLLNFSRLFNETLYGSWYKNTLIIAISTMIVQVTVITLAGYTYSRYRFVGRKNSLLFFLIIQMVPTMAALTAFYVMALLLGALDQYWFLTLIYIGGGIPMNTWLMKGYFDTVPIDLDESAKLDGAGHFRIFAQIVLPLVRPMIAVQALWAFMGPFGDYMLAKFLLRSPENLTVAVGLQTFINDSQNQKVSLFAAGAVLIALPISILFFMLQKNFVSGLLAGGTKG >NC_019425.2|WP_010052149.1|2537630_2538473_-|DUF1189-family-protein MKKMPFPLNYFNSIATPKRVFKGRKNLSWIQNIVIFIFLNALLMFPVSLYFSQSTNFQLQEIMPHTLRLVTDEFATKLQAVEFENGKLISGEPFTIVEDTGVVGVEIPKSVKKSEKNLISFEKDHLLLKDESGYQFEVRYTENFSLKNSQTKSALKEQIKEQWFKQNKAFVSFTMMLMTGIIISFSNVLVMFIAAFFIWMTKRSALSSIRTYKESFNLILNASGIGTLLAVLIGLVHFDMTIMIGFQSLGLVIMLTAVFAVTHFSDTPIKNKRKRNEEIK >NC_019425.2|WP_015077042.1|2535363_2537634_-|glycoside-hydrolase-family-65-protein MIQRLFDIDSWKVATTKLDKEHKRLQESLTAIGNGYMGMRGNFEEGYSGDSHVGTYLAGVWYPDKTRVGWWKNGYPDYFGKVINATNFIGVDIFVNQHKVDTFVDEIKDFHLELDLQTGILHRHYTWVSGEIEIKFSFKRFVSVAQKELCIVEVAAEVLKGEASIQFNAKLDGNVTNEDSNYDEKFWLEMDRGLGEYSYLTTKTIPNDFEIPQFTVTIMMKNRVSDEKKGHTTDQEMLVQEQFDYQLKAGEKAKLTKLIAVVTSRDIEPNQQVAKAEELLRVAEDAGISKLEREHKIVWGKRWHKADVVIAGDPESQQGIRFNIFQLFSTYYGEDARLNVGPKGFTGEKYGGATYWDTEAYIVPMYLSVTEPEVSQQLLKYRHDQLPGALHNARQQGLKGALYPMVTFTGVECHNEWEITFEEIHRNAAIAYAIYNYTNYTGDEAYLLSDGIDVLTEISRFWADRVHYSKRNEAYMLHGVTGPNEYENNVNNNWYTNTMATWVLRYTLESLKKVSKEKLVDLQITETEKDQWQDIIAKMYYPKNQELGIFVQHDTFLDKDLRAVETLAATERPLNQHWSWDKILRSCFIKQADVLQGLYFLNNEYTIEEKKKNFEFYEPMTVHESSLSACIHAILAAEVGLEDKAVELYARTARLDLDNYNNDTEDGLHITSMSGSWLAIVQGFAGMRTYENQLQFKPFCPKGWDGYEFKISYRGRLLKIIVTKTTASVILVEGEALDLTLCGENVRVTDQVQQAI >NC_019425.2|WP_015077039.1|2532988_2534617_-|alpha-glucosidase MEKWWQSSVVYQIYPRSFQDSNGDGVGDIAGITSRLEYLEKLGIDVIWLSPVYKSPNDDNGYDISDYEAILPEFGTMADMDELIREAKQRGIQIIMDLVVNHTSDEHPWFKEAKKSKTNPYRDYYIWRDSVNGGPPNDLQSIFSGSAWEFDKETNQYYFHLFSKRQPDLNWENPAVQEEVWKLMNFWLAKGIGGFRMDVIDLIGKIPDKGITGNGPKLHEYLKKMHKETFGKYDVLTVGETWGATPEIAKLYSNPDREELSMVFQFEHISLDELPGKSKWDLQPLDFIQLKAILSKWQTALGDEGWNSLFWNNHDLPRIISRWGNDSPKYRVKSGKMLATILHLMKGTPYIYQGEEIGMVNTPVSSIEELDDIESLNMYRERLAAGYDKADILASINKKGRDNARRPMQWSNHEHGGFTTGTPWLELSPRYSEINVENELADSESLFYHYQRLIQLRKNNPLVVWGTYQELIPNDTQLFVYERSYENETWLIVANFYEEEADFSHESHKVKEIILSNYSDSSVDLANLHLRAYETVVYRLEK >NC_019425.2|WP_015075518.1|2522880_2524200_+|IS1380-like-element-IS1678-family-transposase MTSLHKNQVKFNSNITISHTGGQLSSDSGLVLVKELMNTFGFSELAKQHIHIEDERAYFTHDNLSILEQFIMQLIAGYSADSAANLLRQDPVFKAVLDRKELASQSSLSRFLDRLSEENIHELQALNQELIDKARLIRNDTELIIDLDSTHSDTFGHQEQTDYNTHYQTYGYHPLVAFDGLTGDFLKAELRSGNQYTSKGVKEFLTPLLEHYNHSLPNTDILVRGDSGFATPGVYDSCESKKSHYVIRLKNNRRLGQIAEKSVLYGDNQKWEEREVQYFSTTYQAQSWSQSRRVCIRSTREAGELLFRHEFIVTNLSENVSPDTIFSLYAKRGTMENFIKEAKAGFYFDKTDSPRFLENHVRMMLSLIAYNLVNFLRTIGFEEVQKGMTIHSIRLKFLKVAGKLVQTGRRVYLKLSSYHVYQNEFYRVFARLRRASQWI >NC_019425.2|WP_015077036.1|2522619_2522757_-|hypothetical-protein MVLIKSMNYSGDMCYYSSIKNNNMENLKRTDVPYHWADDLFASRG >NC_019425.2|WP_015077035.1|2522246_2522597_-|bacteriocin-immunity-protein MDKVDKVKENIHELYNNLIKRSGSASSLLDITDVLLQVYIKIDTTENPEALVNRLVNYIYSVGLKGRIKLSPVEENLLSELGVFAQRAGLNGLYRAGFSDKSQFYSYFDKNQMPRH >NC_019425.2|WP_015077034.1|2520294_2522073_-|Cna-B-type-domain-containing-protein MNKIKKFYSISMLVVLIFSILGSFQFVSADNTKTMENKQVISDIVTNINMTRNDGSDIGTIDQWTDILVTIDFTLPNNKISAGDTTTISLPKELELQNDSIFEVKDDAGNVVATAYANQDDKTVKLIYTDYAEKNSNISGKLWFSVQVDSYTITETGKIPLEFDIDGQTIIKEIEYEKGTGDQDEVLYKSGVFDPNGDPQVINYSLRVNVSSKDLTDVVVSDLLGQQDILINQDSIKIQEIDYTWNNVDEDWNMVPNSLRDVTDAFSNKITMSNGNKGFSIGLGNINRPYLITYDGIIGHIPAQGESFDNKAVITANEIETTTSEKNFVYSDEGGSAAGNTYQIHLIKQDKENATLLNGAEFDVIRVSTNRKVGTIATVNGEGQIKGLLQDSYQLIETKAPVGYTLDPTPILVTPADFKESNSLFVATITATNEKEKTEISGIKMWDDFNNKYNTRPESITVILLQNGQMFEKQEVKADDQGKWTFNFTNLPKSDTNGVAYTYTLDEVEVAKYKKSIDNTTITNTLTELPENPVIPVVPEEPSRPELPSKPVAPQAKTESFPKTGEEETVFAMLLGLLFVTGAAFSFIKKLN >NC_019425.2|WP_016356555.1|2542680_2544459_-|alpha-glycosidase METAAILHRPDSEYAYLYEADNFHIRLRTKKDEVSQVGLIGGDPYLFDVDEWYKNEEPMKLLASTDVHDYWLIETTAPYRRLQYAFHVVGKDGTEVFYGDRGIFPYTAETLATPGYFFRMPYFQEIDRFKSPDWVKETVWYQIFPERFANGNPAITPENALPWGSKEHPGREDFFGGDLQGVIDHLDYLVDLGINGIYFCPIFKASSNHKYDTIDYYEIDPDFGDKETFKKLVDEAHKRGIRIMLDAVFNHTGDISPLWQDVVKNQEKSKYVDWFHVHSFPVDIGKNGNFEGERTVSYDTFAFTPHMPKLNTANPEVQKYLLDIATYWIREFDIDAWRLDVANEVDHHFWKEFFKATTDLKKDFYILGEIWHSSQSWLQGDEFHAVMNYAYTETIEDFFVKKKIDVSKMVAGLNEQLMLYRQQTNEVQFNMLDSHDTARLLTICGDDKELAKATLAFTFLQHGSPCIYYGTEIGMTGDNDPDCRKCMIWDQEKQDLTMFDFTKKLISLRKEKQEVLSYGSLEWSLVADQEKCVGFKRVGQNEVLTCYFNQGSQETTIDKIETEEVLLSNLTTNNPTSITIEPNGFIILSSKI >NC_019425.2|WP_015077048.1|2544471_2546169_-|alpha-glucosidase MSRTNWWQSAIVYQIYPRSFQDTNNDGIGDIKGIIQRLDYIKSLGVNTIWLNPIFISPQIDNGYDISNYYGIDPIFGTLKDVQELIYEAHQRELKIIFDFVLNHTSDQHPWFQEALKGPDNLYRDYYLWADGKKNGAEPPNNWASFFGGSTWEKDLHSQQYYFHLFAKEMPDLNWENPEVHVALLDIAKFWLNEGIDGFRLDAFIHMAKEKGYPALPNPTNEKYVIAEEYYANLPKVQEYLAKFIQALREVKPDVFIVGEAASAEVKQAVEYTDPTKNQCDTVITFRYFPEREELKDSRLPLGMQPGTLDRQQFKQVMAEWQKEMASVGGPTLYWNNHDMPRVVSRFGDDGLYRETSSKMLATLMYLQKGLPFLLNGEEIGMKNRIIQSIKDYEDPGAEAFYHQALALGYTEIEVLELLNASSKDASRGGMQWTKEPYSGFSTVKPWSSVNQEENYTVEAEEADEGSILHYYRRLLLLKKRELFTKGSFSLLETGDETFCYVRNWDNEEAVVLTNMTNEPVQLTCLEETLFNGKILLSAGDHELTKKQVTLAPYSCVVIQTKMKK >NC_019425.2|WP_010050042.1|2546442_2547405_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MATLNDVAKKANVSKMTVSRVINHPEQVTDELKELVFKAMKELDYRPNVAAKALANNRTQIIKFFILEEMDTTEPYYMNLLTGIAKELDKHHYTLQLVTKNNFDIGACDGYIITGMRESDYAWIERATKPVVLFGENHHGHDFVDTDNKSGTKKATEHAIAQGYESIIYIGIDVKEPFEYSREAGYINTMQQAGRVPEIKRFSNRSRYSAQFILENWSDFPTNTVFICSSDRLAIGIERSILKLGGQIPKEYGIIGFDGVFLDQIASPPLTTVKQQVIEMGVACARMLLNKIDQSGAPQGNLLFEPELIIRESTVERKDS >NC_019425.2|WP_010050040.1|2547553_2548018_-|transcriptional-repressor MKNSMVAHSIEKLKASNIRITPQRYAILEYLIESESHPTADEIYRALAERFPNMSVATVYNNLRLFTKIGFVQEMVYGDSSSRFDFTSTQHYHAICEECGKIVDIYYPGLDDVEVVASNLTGFEVSHHRMEMYGTCPDCLAKRQAETKEKTEAI >NC_019425.2|WP_010050037.1|2548321_2549614_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MLDHTESNRLAEQAKKVIVGGVNSPSRSFKGVGGGNPVTMVKGDGCYLYDVDGNKYIDYLAAFGPIITGFNHPHIVKAIKKAADTGVLFGTPTEHEITFAKMLTDAIPSMDKVRFTNSGTEAVMSTIRIARAFTNRELVVKFSGAYHGHFDLVLVEAGSGPSTLGASDSAGVTNGTAQEVITVPFNQIEPYKAVMEKWGHKVAAVLVEPIIGNFGMVAPVPGFLEAVNEITHEHGALVIYDEVITNFRFHYGAAQDMLGVIPDLTAFGKSIGGGLPIGAYGGPKHIMDTVAPLGPAYQAGTMSGNPLSMQAGIACLEVLQEPGIYERMAGFAEQLRDALLSAGKKNNIPTVVNQIGGSLTVYFSERPIFNYDDAKNTDSIRFGKFFKLMLDEGINLAPSKFEAWFLTIMHTQADIDATIEAINRVFAKLD >NC_019425.2|WP_010050034.1|2549851_2550943_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MKLGARTLKTGLAVAIALYVSKWVGIPSVTFAAISAIFAMQPSVKRSLNTLRDQTIGNILGAGVAIITVLTLGKQYVLIGFAAIILIAILHQLELDQVIGLATVTLIVVMTTTGDDFMLYAILRFSSTMVGILTAFVINSVFFPPKYEEKLYHVVDFATSEILKWIRASVRNNTEYPFLKKDLQWVRNQMMKMDFYYSLFKEEGSYSKKKRFQNLRKIVVYRQMISTTKASYNLLKTMHKNENSFSNFPKELRVLIRERLETLLSAHEQILLKFNGRVPPNSVNFIANNRSLRKEFMDSFFEAANTDENFKDGYLQSNSVIHILSSILNYEEYLEHLNTLVTSYKGNNWNPTTDISNIENVEH >NC_019425.2|WP_015077049.1|2550996_2551863_-|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MNKKSLILLFIGLILTGAIIFLGKNYSITKKNELLRQGEAQESLVQGQEEKRTMNEKNDLEAKTTEFQSNRANLSINDYLVLINAKNSKATLAFYGDNVESEQWTKNIKTATIEKTGLANLEMNRYYFPGYDSLRLTNENTSEKLVDLKPDVVFFFIPVVGNQAVDISLDASSQAILASYLALKEQLPDSLIVAVTPVPSSSLMNKFNSRTLDYTSYVTDAVTVLTENEVPLLDLHSLYLSELETTNQLLASTLEADGIQLNAQGVTLATTLFLNQLASPRDTTSGID >NC_019425.2|WP_010051756.1|2552032_2552566_-|DUF402-domain-containing-protein MRIPKEGEYITIQSYKHDGSLHRTWRDTMVLKTSEQSVIGCNDHTLVTEADGRRWLTREPAIVYFHKHYWFNIIAMIRENGVSYYCNLASPYTMDEEALKYIDYDLDIKVFPDGEKRLLDVDEYEAHRKKWQYPNDIDHILKENVKILVEWINEEKGPFSEEYVKLWYERYQQLSRK >NC_019425.2|WP_016356556.1|2552713_2554216_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNYFLDKLQTRKIKLIKLLKNEYPNRSIAEISKELDCSNQTLMTTIESLIEDLKSFEINTARIRIVSKRIEADFDVNFSVDCLIHEYVRKSFEYQVILDCFFNTTKSISDYAKDFFLSQASTYRKINGVKNILKNFNIELQQSTTLQIVGEEKMIRYFYFSFFWETHSNINWSFEFSKEFIASFKKVIHSNAIKADHTLVNQNKIDLWFGIILTRIASGYSVGVIPQIKNIGDFNVNYLEKITESQAFFNQINPKLSRTKSLDELNFCYSIEIINTHYRVYNPTMEGLLNKIKANDQIYKVASQQFIESLDKYLSQALDKEAQAILLANLFSVHLSVFLFDNVLSPFSEKLKLHRFDRIYPSVYKMLNKAYQDFIRHKAIAKVYHDKELLFPSYLLILYLSVDVKNYTEPIIIYLYSANSTLLEFLLKKELQKMSQYNLIFTETVTAETDLVISDTFNTPFCLSQESTLIWESVPSDSDWMNLRNKLNEIKKEKEFSRLE >NC_019425.2|WP_016356558.1|2554914_2556111_-|A/G-specific-adenine-glycosylase MTEEKLRVDTQKTEITMWSEKKITDFRSHFLSWYDLEKRTLPWRENNDPYRIWVSEIMLQQTRVDTVIPYYLNFMKLFPTTADLAAAEEDTLLKVWEGLGYYSRVRNLQKAAIQIMNEFSGEMPTNPEDIATLKGIGPYTTGAISSMAFQLPVPAVDGNVMRVVSRLFEISEDIAKPASRKTFEAIMNQIIDPYKPGDFNQAMMDLGSSTCTPTTPTCNLCPINEFCQAFEAGTMTQYPVKSKKKKAKPVYYAGLLIQNERGEFLIEKRPAEGLLANMWTFPLLPEELLTVGTGLKIGKLNDKLPETIETQVLNNLSVESRQRYQIEPIWLKKPFGEVVHLFSHLKWFITSYYGKMSSEMLTEAPENCLWVHPSDFENYTFPGPQQKMWKSYLTKFEK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_019425_5 | 3350263-3350363 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019425_5
|
1 spacers
spacers of NC_019425_5
>5.1|3350287|53|NC_019425|CRISPRCasFinder TGACTCATGGTGGGGGTTAACGGGCTCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019425_5
The CRISPR arrays of NC_019425_5 >merge|NC_019425|5|3350263-3350363|CRISPRCasFinder CAGATGCTCTACCAACTGAGCTAATGACTCATGGTGGGGGTTAACGGGCTCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAACTGAGCTAA >NC_019425|5|5|3350263-3350363|CRISPRCasFinder CAGATGCTCTACCAACTGAGCTAA TGACTCATGGTGGGGGTTAACGGGCTCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGG CAGATGCTCTCCCAACTGAGCTAA
>NC_019425.2|WP_010049704.1|3348864_3349326_-|CtsR-family-transcriptional-regulator MQNQNMSDIIEAYLKQVLTAHEQIEIRRSEMANQFNCVPSQINYVINTRFTIQQGYLVESKRGGGGYIRIIKVKLLDKAEMLDAMIQIIGDKISQKDAYSIVQKLYEDDMLTKREATLILSAMEKPVLTLCGKLENELRAQILIAFLNNLRYE >NC_019425.2|WP_016356668.1|3346341_3348834_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MDELFTEKAKLVLILAQEEAKNFRHHSVGTEHILLALVVEQDGMAGKTLRQFAVNEQDVREEIEHFTGYGTMKNVPKNALLPYSPRAKQVITFATDEARRLGAPLVGTEHLLLGLLREEEILSSKILSNLDVSLNKTRQLLLKKIGVSDVNGTKGARRGRQSPKQATGGTPTLDSLARDLTALAKEGKMDPVVGRHKEVHRLIQVLSRRTKNNPVLVGEPGVGKTAIAEGLAQKIINGEVPKDMAKKRLMMLDMGSMVAGTKYRGEFEDRMKKVIEEIYQDGQVILFIDELHTLIGAGGAEGAIDASNILKPALARGELQTIGATTLDEYQKYIEKDAALERRFAPITVDEPTPEEAEEILLGLRSRYEEHHGVEVTDEAIHAAVQFSTRYITSRQLPDKAIDLIDESAAKVRLDVSDKPTPVAVAVAELDQLVNDKELAIQMQDFEKAAAIRTKEMRQKKKIETLIVKEGKQHSASKLQVTEFDVAEVVSLWTGIPVQQMEQKESERLLNLEKVLHSRVVGQEDAVSAVSRAMRRARSGLKDPNRPIGSFMFLGPTGVGKTELAKALAESMFGSEDALIRVDMSEYMEKYSTSRLIGSPPGYVGYDEGGQLTEKIRQKPYSVVLLDEVEKAHPDVFNILLQVLDDGHLTDAKGRKVDFKNTILIMTSNLGATSLRDEKSVGFSTKDTKKDHKAMEKRILEELKNTFRPEFINRIDETIVFHSLEKNELNEIVKLMAAIIVKRLKDLDIHVKITPAAIEVIAKAGFDPEYGARPLRRALQKEVEDRLSEELLNKTVKIGDHVTIGAAKGKINIQVKELKKKAKPETVEVK >NC_019425.2|WP_010049709.1|3345888_3346239_-|hypothetical-protein MKNATKGLLIGLGATVVVGTIIVSSSEKAVKKIESFMNRKRAKDFIKEKLNGNNDALEVVDHLSDEEITNLLQIVDKVNSLKGRINVYGDNLKDAAEEFKSTLHGYKDTVKEKFEN >NC_019425.2|WP_010049713.1|3344947_3345814_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MDFQQLKTIYPTAKLSDTRQLDTALLNFPYSNQWIQIESQDLSTSEIKLLNQLFKYSETAANSLNTHFWYQFLWENKQISTTKHGDYRVIQFEIVHPSQNENATSWLEAFQNIFEGCEDAFFISENYGIIIEEKQKTELSTKEIVGVLQALEDDFSIKSICYIGQYWTITPSFPSLFNEEYTIFQKQKGQNKGLAVLSLSQLALSHYIKSALEESELLSELKKIFSDQAEWRELVKALWETQGNISMAAKSLYVHRNTLQYRIDRFNEATGFSLKDKDDLMLCYLLLL >NC_019425.2|WP_015077725.1|3344284_3344806_-|tRNA-adenosine(34)-deaminase-TadA MYTHVEKEKFMREAIVEAKKAGDKLEVPIGAVIVLDGKIIARGHNRREETNDATTHAEMIAIREANQVMESWRLEEASLFVTLEPCPMCSGALIMSRMKAVYYGAADPKGGTAGTLLNLLTDTRFNHQVAVEKGILEEECGKLLSDFFRELRKRKKIEKIKQKIAIDEINTTK >NC_019425.2|WP_015077724.1|3343397_3344210_+|pyrroline-5-carboxylate-reductase MKIGFIGTGNMARAIIKGIIESKQLPNENIFVFNRDSDKTTSFAIETNTHPCTSSQKLAESVDVLVLAVKPGVIPTVLKELHTTFLKHQPLLVSIAAGTTIASLEDTLGSIQKHPIIRVMPNLNALIGKGMAAVCSNQFASKQQISFVLDLFNSIGIAIELEEHHFSTFTAIAGSSPAYTFLFIDSLARGAVKNGMPKDLATKIATQAVLGSAEMLLASDKSPWDLIDQVSSPGGTTVAGLVALEDEAFISTVIKGVDATIKRDHELMND >NC_019425.2|WP_015077723.1|3341897_3343040_+|site-specific-integrase MWIEKTDNGKFKYFERYIDPYTEKAKRVSVTLNSESNQAKNQAQRILNEKINSKLETKNKSKLTVGELLDEWWEQYIKTVRKSSINSNAKVMKYIYANIELDTLIANADVKFFQKFINSLNQGYAYRKKFKSILNMSFNYALDMEYLTNNPLTRVTVPKPPKTLSNMSLIEDKYLEKEEVDKLLKVYYSAFQSYRTGQLAEFMYLTGLRVGEAISLTVDNFKEDEAMLEVHGTLDYSGGFKHAKKEIPKTQASYRVINLSNRAMYILKEAIEDNKIRFNDYSSDSYIFIGKTGKPIQTNSFNNSLKHTNEKLGKDKINKAISSHIFRHSHISLLAELNVPIKAIMERVGHSDEKTTLQIYTHVTKKQKNDVANKLNELGM >NC_019425.2|WP_080639181.1|3341037_3341778_+|Ltp-family-lipoprotein MLGYVYIHGNFIGKGKITVTDGYGEDIDSTNADSNGNFYLRVNGFANKQILYVKAGNLKEKVNILPLNADLLAKQKQRADEEQRSLAETRAKKEAEDKLAAEAKAEEDRIKKEAEDKRKAEEERLKKEAEDKRVAEEQAKEAIANLPTEYKSALNKAYAYSEKMSMSKMGLYDQLTSEYGEKFSAEAAQYAIDNVKADWNANALTKARNYQESMSMSPEAIREQLTSEYGEKFTPEEADYAIQNLN >NC_019425.2|WP_015077721.1|3340321_3340786_+|hypothetical-protein MNSYEVLLDEICSNINVVEAELFKATGLLGVYKEGKGIIIDKNMETDLKKTTLMEEYMHSKYTVGNILDQSSIENRKQELLARKYAYIELVPLDALIEAYSLGLTQYYEVADFLEVDIEFLWDATNYYKSTYGTMFQYKGVLIHFSNTITMEFK >NC_019425.2|WP_016356666.1|3339970_3340309_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MHLNEFVGNKIKTFREARGMTQDMLADKLKTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELSVIFGVKVDDFFPSRDNISEESPLATIAAHMANSEKKLTKSDIDKINDYIDLILDSKK >NC_019425.2|WP_015077728.1|3356652_3356859_-|hypothetical-protein MKNMDQKKVFSMLSSIYSTLIILFLVLYFFTRDTNSLLIDICLIGLLVIAIIFAVILFINYRKQKSTK >NC_019425.2|WP_015077729.1|3356950_3357724_-|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MLFLDKTVELNDTEMEIYHYISGNIDKVIFMRIRDLADEVHYSTTTILRFCRKFDCQGFAEFRIKLRMFRKNQKQIPIDTTDETTYIDFLNRTAQPEFQRSVQEVVTILAESELVIFVGVGSSKLMAEYGALYFSSLFLMSIHIDDLFNHPLYYLSNQVSKKSCLFIVSVDGENKEIIKNIHHLKMQNIKVISITNSAKSTIARLSDANISYYINKEQFQEANITSQLPALYTIELVGKEMRKQLNRTKDSIGNDLF >NC_019425.2|WP_016356671.1|3357923_3359303_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MQGLMNWLEKYIIPIAAKIGNEKHLVALRDGFIGTMPATMAGSIAVLLNAFLRDFPTTWGWTGFVTAMEPIIGINGYVWLGSLAIVAVIFAVALGYNLAKVYHVDPLSGAVVALAAFFMGLTQTATTNLALSEKIPGNMVKLINEAGGSVTDGNTIVTSAWGFFNFDAHMGGSGLFTAIIFGFISVVIFSKLMLANITIKMPDSVPPAVAKAFAAIIPACVALYTCGLINYGFSKLTGMPMIDWITSTIQEPLLNLSQGFGAVLLIVFLVHLLWFFGIHGDNVMAPVLSTIWGNTMNQNMNAFQNGQDIPYKWVSGTFQAFVWPGGSGATLMLIVAIFVFSKRPDSRAVANLSIGPGIFNINEPVMFGMPIVLNPLYMIPVILAPCVMAGVAYFATMTGLVAPVVVSVIWVMPPIVNGFLATGGDWRAIILSIVNLAIAFVIWAPFVIAANKIKLEDVD >NC_019425.2|WP_010052137.1|3359370_3360333_-|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta 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>NC_019425.2|WP_010052133.1|3362937_3363171_-|glutaredoxin-like-protein-NrdH MNKIHLYSKPNCPQCDMTKFLLKNENIEFHEKNIMEDESHLNYLKDLGYMSVPVVMVEGIEPIVGFQPERLKELKAI >NC_019425.2|WP_015077732.1|3363483_3364314_-|hypothetical-protein MEKIIISALLIFSLSLFVLSLCLHIQLKKKIKRLMTKKPNTRQRKAQLRWNQTQKMLKKRLAKRLIFVICFGLVSLMVGLTLPFYSENRFKASSESTFKTEVNADQNQLILNTPEQSIEKDEVPEKTGTQENPQPFSQPVRVAANFLDLNTMTFFPAELEVTVLNSIRGEEAWRLLVGENQFNPVAPAGKEYILNRLKCKIVAPENSTAIAKFSEFDFSYYSKEGNPYERVTVIAPDRLGSELEVNVEKEGYLYALIDSGDVPVINYQNNLFLATE >NC_019425.2|WP_015077733.1|3364404_3364959_-|DUF5067-domain-containing-protein MKKWRKINIFALMLGLLLLVGCGMRKEAEHDVSKDFTYDKKVEMDQVVEGEEYSVRVTGYKVIRDSENMPALMMYYEFVNSSEEEISPYDLYMDAYQTSKIADGDTELYEADIYDGLLDEEDLTLLNNTFELVEPESQLKCATVWKLRNNKYPLEVEVYSYEEEYLGIIQIDMQKGIVEGSTEI >NC_019425.2|WP_010052128.1|3365169_3365367_-|hypothetical-protein MTLISKKNNILSYPKFIIQADADLKEQGVKTHNKSLYQILVEANILNQSGEPTEWIMENGHLKEA |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_019425_2 | 2.1|2352115|29|NC_019425|CRISPRCasFinder | 2352115-2352143 | 29 | NZ_CP016845 | Carnobacterium maltaromaticum strain TMW 2.1581 plasmid pL21581-1, complete sequence | 42727-42755 | 0 | 1.0 |
1. spacer 2.1|2352115|29|NC_019425|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016845 (Carnobacterium maltaromaticum strain TMW 2.1581 plasmid pL21581-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgagttttttttttgaccttcagttccc CRISPR spacer gtgagttttttttttgaccttcagttccc Protospacer *****************************
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1601529 : 1706708
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019425|1601529:1706708|DBSCAN-SWA 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101 | Staphylococcus_phage(17.86%) | integrase,transposase,tRNA,holin,protease | attL 1611054:1611071|attR 1686996:1687017 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1841254 : 1894719
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019425|1841254:1894719|DBSCAN-SWA 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59 | Listeria_phage(44.44%) | tail,plate,integrase,terminase,transposase,tRNA,holin | attL 1846402:1846418|attR 1878660:1878676 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1900260 : 1920208
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_019425|1900260:1920208|DBSCAN-SWA 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29 | Listeria_phage(25.0%) | integrase,transposase | attL 1898033:1898053|attR 1920611:1920631 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2017860 : 2069007
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_019425|2017860:2069007|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(16.67%) | tRNA,tail,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2098717 : 2179424
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_019425|2098717:2179424|DBSCAN-SWA 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89 | Lactococcus_phage(25.71%) | portal,tail,terminase,capsid,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2569073 : 2629242
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_019425|2569073:2629242|DBSCAN-SWA 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MADKLVYQVRIEEDIKMIELLLDRIYDVARVDELWIHDKLEDIRKEINELKIYV |
72 | Bacillus_phage(23.53%) | portal,tail,terminase,transposase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2633020 : 2641236
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_019425|2633020:2641236|DBSCAN-SWA TTTGAAAATTGATTCCACAGTTACTCTTTCTATAATTCTTGCAATAGTAGCCTTATTTGCACCTATCTTTACTACAATGATTAATAATAGGTATAAGATTAAAATGAAACAAATTGATTTATTGAATGAAAAATATACAAACGAAACTTTACATGTGAAAAAACTTTTTGAATCATTTTTACAAGACTACGGAATTTATCAAGGAGATCAGAAAACAGTTGCGTTAGAAAATTTAAAAGGTTCATATTATAAATGTTTACCTTATGTTCCTAAAAAGCATTCAGCCGAATTTATAAACTTTTACAATACTCTTGTAGATAGGCATGCTTATGATTCGAAACAAATAATGAACGAGAAGCTTATCTTTGTGATAAAAGATATATTAGATGGATTGTAAAAATAAAAGTCACAATTATTGTATAAATCTTTCCTTCTTTTGATCCTAATTTGTCCCAATATATATAAGCAACAACCATTAAAACGTAAGTGATAACAACTAATAATACTGTAATATCCATGTTCCCCTCCTAAGCTAGTTGTAGTTGTTCAATATCCATTAACGGATATACATTTATTTCTTTCAATGACTCGTAAATGAACAATCTGCCTTTTTGAGTCCACTTCGTGTTCATCACAACTTTTTCTGTTCCATCTGCTTTTGGAACTCGAGTAGTATGTGATTTGGTGTAGCCTTCACGTTGATGTCTTGTATATAAAATCCATTGACCGCCAACTTTGTGCTGTATTTTCAATTCATTTAATCGCTTGTTCATTGCAACTGCTGATAGACCGTAATCCGCTGCTATCTGAGTGATCGTTACAGTATCAGTTGATTCTAAAATGCTATCTAAATAGCTAATCTTAGGCTCATACTCTGCTACTCTCTGTTCAGCTACAAGCCGCAAGGTGCGTTCTTCTTTTAACTTGGTTGCAACTTCTATTAATAAATCTGGATTGTCTAGCAGCTCGTCTGTGGCATACATTCCGTTTTTTCGTATAGATGGTAATACCTCTTTAGTAACCCATCGCTTGAATTTTTTTGCTGTCGGAAGTTTGCTCCCGATTACTAATGAATACAACCCAGATTCGTTGATTCCTATAAGTCCTCTGTTAGGGATGTTTTCTAAAGTAACGATTTGTGACGTTAGAACTAATTTGTCCTCAGGATCAACATGGTCACTCAAAGCTTTTCTTGAATTTGAGTAACCAAGAATTGTTGATATTTCTTTTCCGATGAAATATAACTCTTCATTAATCAGAACTGTTTGTACTTCGTTTTGTTCAAAGTTGAATTTTTGTAAGTTTGACATATTAACACTCCTTTATCTTTTTTAGTTAAATCTGTTATAATTAATTTGAAACGAGGTGATAAAATGAAATTAAAGATACAATTAGAGATAACAAAGTTTGGACTGATACTAAAAAAGTAACCTCAAAATTTTCAAGTGTTTCTATTACTATGGTTGAAACCGTTGCTTCAAATGTTCTGACAAACATAATTTCTAAGCAAATGGGACTTTCTTAATTTATTTTTTTAAATTGCTTTATCCAAAAATAAAACACTGTTATCCAGAAAATGAATATTATACCTAGCACTGCAGCTAATAGCAGTGCTAGTTTCACCTGCCAAATTAGATATACTGCTAACGCTATTAAAAGCAATACAATCGATGCTGTAATCCAAAACATCAATACAGTTCCTTCTTGAATTTTCTTTTTGCTCGGCATCTCTTTCCTCCTTTATGCTGAATGAAAACAACTTGTCCGAAATGCAACAAAACTTTTGATGTAACCTTTTGGTCTTGATTCGATTAACGCTGTAATCAAGTCGGTTTATAACACTCTTCAAGATTTACCTGAGGAGAAATAACAAAAGAGACATTAACTTCGTACTTTTCAGAAAGGGCTTCTATCTCAAGTAGAAGCTCTTTTGCTTGTTCTACGTTTTCTAAAGATGCTGATACTGTGATTGTTTGTTTTTCCATCGTTTACACCTCCTTCACTGTCACGTTGTTAATCCCGTGTTTGATAAACGCTTCTGCTATTTCTCCGATGGTCATATTCGTTTCATCTTTAAGTTGTTTTAATTGCTCGTGTATTTCCGAGCTGACGAAAATTGGTTTTGTTTCTGCTTTAAGCTCTCGTTTAGTTAAAATTAACTCGCTCATTTTATTTCCTCCTTAAACTAATTGTAATTGTTCTTTTTCGGGAACGTTTTTTGTAAAAAAAATACCTAGCTCTTCACTTGAGTATCCTAAAATTTCAGCAAACTTAGCTAGTTCATCTGCTCCTATTGAAACAATTCCATTTTCACGCTTAGCGTAAGGTGTCCGAGTTTCCCAACCAGCAAGTCTAGCCATTTCATCTTGTGTGTACCCTTTTGCTATTCTTTCAGCTTTCAACCTTTTTAAATTAAGAGTCATCTTTTCCACACCTCCCTTCGTTCTCTTTCGGGAACAACACCAATATACCACCTTCGTTCCCGACTGTCAACATTAAATATTAATAAAAGCGCAAATATATTTTTTTGGGTTATCTATTGTATCCAAACGGGAACGATGTTATAATGATGAAGTAATAAGAAGGAGGTGTTAATAGTGAGAAATAACGATGAAATCATCGATATACTAAACAAATTAAAAGAAGAAAAAGGCTTATCTTTAAGCGAGTTAGCAAGAAGAGTAAATATGGCAAAGTCTGCTTTATCGAGATACTTTAACAAAACTAGACAATTTCCTCTAAATAGAGTTGAAGATTTTGCAGATGTTTTAGGCGTTAGTTCTGAATTCATTTTAGGATTTGACTCAAACTCTAAAGCAATTGACATTACTACTATATATAACGAATTAGAACCGCCTAGACAAAAAGTCGTTTATAAATTCGCTGAAAGACAACTTCAAGAACAAAACGAAAAACCTAAAGTTGTTCAACTTCCTATTATAGAAGATGACAAAGAAATCGAGATACTTAGCGGTCATGAATCAGCGGCAGGATTTGCGATACTCGGTGATGATTCTAACATGACTAGTACAGTCATGAAAGCTTCTAAAGTGCCTAACGGAGCAGACGAGGTAGTAGAAATCAAAGGTAATTCTATGGAACCACTGATTATGAATGGCGAACAAGTTTTCATTAGACATCAACCTTCAGTTGAAAATGGTGAAATAGCAATTGTAGCTATTATTGATGATGGTATAACTTGTAAAAAAGTGTACTATGATGATGCAGAAGGAACTGTTACACTAGAGTCTGTTAATGATGATTATGAGGATATGGTGTTTCCTGTTGAGGATATACGAATTATCGGTAAAGTTTTAGGTAAATAAAAATACCCTAGTAAGCGCTGATACACTTCTAGGGTTTGATACTCACATATTAGGATATGTTATAAAAATATTATAACACAAAGGAGATTTAAAATGAAAAAAATTATTAGTTTAGGTTTTATTAGTTTATGTGTTGTTGCGTTATCAGCTTGTGGTGCGCCAGAGAAAAAAAGCGAAAAGACTTCTGAACAAAAAAGTTCTCAGGTTCAAAAAGAAAGTGTTTCAGAAAAGAAAAAAACAGATGACGTCACTTATTCTGATAAAACTATCGAAAATAAAGATGGAAAAGTTAAAATCACTAGCATTGAAAAAGGTGTAGACTTTAATGACGAACCTGCTATGATTGTTCATTTTGAGCTAACTAACAAAAAAACAGAACCCGAAAATGTTCAAATAGCTTATATGAGTTTTATTAAAGCTGAACAAAATACAGGCGATACAACAGAAAATCTACAATATGCAATAATGACTGAAAATCCTTATCAAGATAAAACAGACATGTTGCAAAAAGACATCAATCCAAACGCTACTATCGAGGGTGTTTATATGTATGAGTTAGCAGACGAAACTAAACCAGTTACTCTTAAATTTTTAGATGGAATGTTTGGTAAAGAAGTAGCCACTGAAGAAATAACAGTTCAATAAAAAAAAGAACATCCTACTCAACTTGGCGGCTGAAGGATGTTCAGTAAAAAAATCACCTTACAATAAGGCTTCTTTTCTATGCCTATTGTACCATAAAATAGGAGTGGTTAAAATGGAAATCAATAAATTAAAAGCAGCTTTATATGTTCGTGTATCAACAACTGAACAAGCTAATGAAGGTTATTCAATCCAAGCTCAAACAGAACGTTTAAAAAACTACGCTAAAGCTAAAGATTATTTTATTATCAAAACCTACACTGATCCAGGCTTCTCAGGTGCTAAACTAGATAGACCTGCCTTACAAGAAATGATAAAGGATATAGAAAATAATCAAATTGACATCGTTTTAGTTTATAAATTAGATAGGCTCTCACGTTCACAAAAAAATACTTTATTCTTAATAGAAGACGTCTTTTTGAAAAACAATGTAGATTTCGTTTCCATGCAAGAATCTTTTGATACTACCAGCGCATTTGGTCGAGCAATGATAGGTATACTATCTGTATTCGCTCAGTTGGAACGAGACACTATAACGGAGCGTATGGGCATGGGGAGGACTGAACGAGCTAAAGAAGGTTACTTTCATGGAGGCGGCTCTGCTAGAATACCTGTAGGGTATGACTATATAGATGGACTGCTACAAGTAAATGAATATGAAGCGGAAATTGTTCGTTCCATATTTGAATTGTATAACTCTGGAAAAGGCGTGAATTCTATTTCTAACGAAATAAGAGATAAGTTTCCAAGCAAACGAAAGTTTGGGGTATCTCTCATAAGGTCTATTCTAACGAATAATCTTTATGTAGGATTAATTAAATTTAACGATGGAGTCTATGAAGGTAAACACGAACCTATTATATCTAAAGATATTTTTGATAAGGCTCAGAACGAATTTAAACGGCGTACAACTGGTAAGTTAAAGTTATTCACATCGAAGTATTTGCTGACTGGTATAACTTATTGTGGACATTGTGGTGCACGAGTAAAAGGTACTGGGTCATCTAAACTAAAAGATGGCACTAGATTATCTTATTATAGCTGCTATTCAAGAGCTGGATCACCTTCACACATGGTTAAGGACCTGAATTGCCCTTCTAAAATTAATAGAACCGAAATATTAGATGAATACGTTATTTCTCAAATGAAAGAAATAACTAAAACAGATATTAGTATAGAGATTGATAGTGAATTCACTGATGATAGCGACACTGACAATACAGTTATACAAAACGAAATCAAGTCAATTGAAGATCGAATTAACAAGCTCCTAGAACTATATCAATTCGGCAATGTTCCTCTAGACGTATTGAATAGTAAGATTAATTCTTTAAACAGTGAAAAATCAAAATTAAACGAGATAATAAACGAAAGCGCAACAGAAATAATAGACGATACCATAGACAAAGTAGAAATATTTAATAACTTAAAAAAAGTAGATTGGAATACAATTACTCATGAAGAAACTAAGACTATCATTTCGAAATCAATTGAGAAAATTACAATTTTTAACGAAAAAATAGAGATAGAATGGAAGTTTTAACCACTCTATCTCCTTTATTTACAACGTTTTTAAGCTTCTATTCTTGTTAACAAACTACAAGATTCCACATGGCTTGTTTGAGGGAATAAATCAACTGGTTGAACTTTCTCAACTTTATACCCACCATCAGCTAGTAAAGCTAAATCTCTTGCCAATGTTGCTGGATTACAACTTACATAAATTATTTTATTAGGTTTCATTGTAAGTGCTGCTTCAATAAAGCTACCTTCCAACCCTTTACGAGGAGGATCCACAACTAACAAATCAACTGCTAATTCTTTCTCAGCCCACTCAACCATTACCTCTTCAGCTAAACCAGCTTCAAAAGTTACATTTTCAATGCCATTTAGTTTTGCGTTGTTTTTAGCATTCTCAACAGCTGCTTCAACTACTTCAATACCATAAACTTCTTTCGCTTCTTTAGCTAATGAAAGAGAAATTGTTCCAATTCCACAATACGCATCAATAACTGTTTCTTTTCCAGTTAGCTCAGCATATTCTAAAACTGTTTGATATAATTTTTCTGTTTGAGTTGGATTTACTTGGTAAAAAGCAGATGCTGAAATTTGGAAAGTATTGCCTAATAGCGTATCAGTAAAATAATCTTGACCCCATAAAACAATATTTTCAGGTCCTAATATTTTATTTGTACGACTTGGATTTACATTTTGAATGATACTAACCACTTCTGGTAATGCCTCTGTAATAGCAGGTAAAATTTTACTTGTTGGAAATAGTTTATTTGTTCTAGTAACTAAAACAATCATGATTTCGCCTGTATGATAACCACGGCGCACAACAATATGGCGTAAATTCCCAGTATTTTCTGCTTCGTTATAAGGTTTCACATTAAATTCGCGCATAATATCGCGTACAATCACAACAGCTTGATCAATTTTTGGATCTTGAATGACAAAATCTTCCATTGCAATTAAATCATGACTATTTTTACGGAAAAAGCCAGTTGTTAGTTTATCATTTTGTTTACGAACTGGGATTTGAGCTTTATTACGATAACCCCAAGGTTCTGCCATTCCGATTGTTTCAAAAACAGGAACTTCTGGCATTTTAGCAATTCGTTCCATAACATTTCGTAATTGTTGGCGTTTAAAAACTAATTGAGAGGCATAAGTCATATGTTGTAGAGGCGTAATTCCCACTCTAGTATAATTTTCATCTTTAATTTCTACTCGACTTTGGCTTGAAGTCAAACGTTTCATCATTTTTCCGTAACCAAAAGATTTACCTGTTTTATGGATTTTAATTTCCATTTGTTCCCCAGGTAAAGCATTTTCGATAAAAATTGGGTAACCTTCTATTTTAGCAACCCCCATACCTTCATGAGTTAAATCCTCAACCTTAACTGTATGTTTTTCATTTTTTTTAACGGGTATAATTCTTTCTTCTTTCATTAAAAAGCTCCTTTCGCTTGACAATGTCTATTCAACAGTAATAAGCAGTGTTTTATGTCCTACAATTTTCAAGGTTCTAACTTTATTTAAATAGGATGTATGTTTTTATTTTAAGGACAATCACAAAATTGAATCACAAGTAACAAAAGACTAAGTTCCGCTAATCCTCGTCACTTTTCCATTCAAAAAGTTTGCTGTCCTTTTAGAGTATCTCACAAAAGGACAGCAAACTCAAAATAATTTGTCGTTTAATTCGTAATTTCTACTTTTTATCAGGTTTTGAAATAACTCCATCCCCGTCAATATCTTCATTCGTTAAGTGTTCCATTTCTTTAATGAAGGCTTCTTCAGCGGCTTCTATCTCTTCTTCACCAATAACAGCATCATCAGGAATAGCATCTAAATCACCAAACATTTCAATATGTTGATGTAAATTTGTAAAAGTCATCGGTGCATCTCCACCATATTCACCATCTAAATTAATCATCATTCTTGATCCATCCATTGGCTCAGCTTTTACTTTACTCGATTTTACATAGAGAAGTTTTGGATGATCAATATGTTTTCCACCATTTAACATTAAAGCCACAAGATGTAGAATTTCCACAACATTAGAAGTTTTAATGATCATTAGCGAAAATAAACCGTCATCTAAATGGGCGTCTGGTGCAATTTGCTCAAAACCGCCAACTGAATTTGTTAATCCTAATAAGAACATCGAAGCTTTTCCTTCATAGACACCTTCATCATATTCAATCCGCATTGGAATCGGTTTGACTCTCGGTAGCATTTCAGCCCCTTTGACTAAATAAGCTAAATAGCCAAAAATCGATTTTAATTGAGATGGAACATCATAAGTTAATTCAGTTAAATTCCCACCGCCAGCAATATTTATAAAATAAGTTTCATTGGCTTTACCGATATCCATTTTAATGGTTTGGCGCTTCTGAATAACTTTTGCTGCAGCAACAACATCATTTCGTGGAACATGAAGTGCTCTTGCATAATCATTAGTTGTTCCAGCAGGAATAATGGCCATTTTCGGACGATTTTCTAAATGCGCAATGCCGTTAACAACTTCATTAATCGTTCCATCCCCACCAGCTGCTACTATTAATTCAAAACCATCTAAAGCAGCTCGTTCGGCTTCTTTCTTGGCTGAATTTGGTTCTGCAGTTGTAGCGAATGCGCTGGTTTCATAACCCTCTGCTTCAAGAATCTCTAAAATGTCGACTAAACTTTTTTTAAGAACTTCTCTTCCTGAAGTTGGATTATATATGACTCTTGCTCTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_019425|2633020:2641236|2638559_2639942_-|WP_016356574.1|DBSCAN-SWA MKEERIIPVKKNEKHTVKVEDLTHEGMGVAKIEGYPIFIENALPGEQMEIKIHKTGKSFGYGKMMKRLTSSQSRVEIKDENYTRVGITPLQHMTYASQLVFKRQQLRNVMERIAKMPEVPVFETIGMAEPWGYRNKAQIPVRKQNDKLTTGFFRKNSHDLIAMEDFVIQDPKIDQAVVIVRDIMREFNVKPYNEAENTGNLRHIVVRRGYHTGEIMIVLVTRTNKLFPTSKILPAITEALPEVVSIIQNVNPSRTNKILGPENIVLWGQDYFTDTLLGNTFQISASAFYQVNPTQTEKLYQTVLEYAELTGKETVIDAYCGIGTISLSLAKEAKEVYGIEVVEAAVENAKNNAKLNGIENVTFEAGLAEEVMVEWAEKELAVDLLVVDPPRKGLEGSFIEAALTMKPNKIIYVSCNPATLARDLALLADGGYKVEKVQPVDLFPQTSHVESCSLLTRIEA >NC_019425|2633020:2641236|2637102_2638530_+|WP_015077159.1|DBSCAN-SWA MEINKLKAALYVRVSTTEQANEGYSIQAQTERLKNYAKAKDYFIIKTYTDPGFSGAKLDRPALQEMIKDIENNQIDIVLVYKLDRLSRSQKNTLFLIEDVFLKNNVDFVSMQESFDTTSAFGRAMIGILSVFAQLERDTITERMGMGRTERAKEGYFHGGGSARIPVGYDYIDGLLQVNEYEAEIVRSIFELYNSGKGVNSISNEIRDKFPSKRKFGVSLIRSILTNNLYVGLIKFNDGVYEGKHEPIISKDIFDKAQNEFKRRTTGKLKLFTSKYLLTGITYCGHCGARVKGTGSSKLKDGTRLSYYSCYSRAGSPSHMVKDLNCPSKINRTEILDEYVISQMKEITKTDISIEIDSEFTDDSDTDNTVIQNEIKSIEDRINKLLELYQFGNVPLDVLNSKINSLNSEKSKLNEIINESATEIIDDTIDKVEIFNNLKKVDWNTITHEETKTIISKSIEKITIFNEKIEIEWKF >NC_019425|2633020:2641236|2634842_2635004_-|WP_015077154.1|DBSCAN-SWA MEKQTITVSASLENVEQAKELLLEIEALSEKYEVNVSFVISPQVNLEECYKPT >NC_019425|2633020:2641236|2635616_2636345_+|WP_015077157.1|DBSCAN-SWA MRNNDEIIDILNKLKEEKGLSLSELARRVNMAKSALSRYFNKTRQFPLNRVEDFADVLGVSSEFILGFDSNSKAIDITTIYNELEPPRQKVVYKFAERQLQEQNEKPKVVQLPIIEDDKEIEILSGHESAAGFAILGDDSNMTSTVMKASKVPNGADEVVEIKGNSMEPLIMNGEQVFIRHQPSVENGEIAIVAIIDDGITCKKVYYDDAEGTVTLESVNDDYEDMVFPVEDIRIIGKVLGK >NC_019425|2633020:2641236|2633020_2633416_+|WP_015077150.1|DBSCAN-SWA MKIDSTVTLSIILAIVALFAPIFTTMINNRYKIKMKQIDLLNEKYTNETLHVKKLFESFLQDYGIYQGDQKTVALENLKGSYYKCLPYVPKKHSAEFINFYNTLVDRHAYDSKQIMNEKLIFVIKDILDGL >NC_019425|2633020:2641236|2636438_2636990_+|WP_015077158.1|DBSCAN-SWA MKKIISLGFISLCVVALSACGAPEKKSEKTSEQKSSQVQKESVSEKKKTDDVTYSDKTIENKDGKVKITSIEKGVDFNDEPAMIVHFELTNKKTEPENVQIAYMSFIKAEQNTGDTTENLQYAIMTENPYQDKTDMLQKDINPNATIEGVYMYELADETKPVTLKFLDGMFGKEVATEEITVQ >NC_019425|2633020:2641236|2634540_2634747_-|WP_035065584.1|DBSCAN-SWA MPSKKKIQEGTVLMFWITASIVLLLIALAVYLIWQVKLALLLAAVLGIIFIFWITVFYFWIKQFKKIN >NC_019425|2633020:2641236|2640204_2641236_-|WP_015077161.1|DBSCAN-SWA MRARVIYNPTSGREVLKKSLVDILEILEAEGYETSAFATTAEPNSAKKEAERAALDGFELIVAAGGDGTINEVVNGIAHLENRPKMAIIPAGTTNDYARALHVPRNDVVAAAKVIQKRQTIKMDIGKANETYFINIAGGGNLTELTYDVPSQLKSIFGYLAYLVKGAEMLPRVKPIPMRIEYDEGVYEGKASMFLLGLTNSVGGFEQIAPDAHLDDGLFSLMIIKTSNVVEILHLVALMLNGGKHIDHPKLLYVKSSKVKAEPMDGSRMMINLDGEYGGDAPMTFTNLHQHIEMFGDLDAIPDDAVIGEEEIEAAEEAFIKEMEHLTNEDIDGDGVISKPDKK >NC_019425|2633020:2641236|2635007_2635187_-|WP_015077155.1|DBSCAN-SWA MSELILTKRELKAETKPIFVSSEIHEQLKQLKDETNMTIGEIAEAFIKHGINNVTVKEV >NC_019425|2633020:2641236|2633546_2634329_-|WP_016356573.1|DBSCAN-SWA MSNLQKFNFEQNEVQTVLINEELYFIGKEISTILGYSNSRKALSDHVDPEDKLVLTSQIVTLENIPNRGLIGINESGLYSLVIGSKLPTAKKFKRWVTKEVLPSIRKNGMYATDELLDNPDLLIEVATKLKEERTLRLVAEQRVAEYEPKISYLDSILESTDTVTITQIAADYGLSAVAMNKRLNELKIQHKVGGQWILYTRHQREGYTKSHTTRVPKADGTEKVVMNTKWTQKGRLFIYESLKEINVYPLMDIEQLQLA >NC_019425|2633020:2641236|2635199_2635442_-|WP_015077156.1|DBSCAN-SWA MTLNLKRLKAERIAKGYTQDEMARLAGWETRTPYAKRENGIVSIGADELAKFAEILGYSSEELGIFFTKNVPEKEQLQLV |
11 | Staphylococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2655241 : 2664084
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_019425|2655241:2664084|DBSCAN-SWA ATTAGTTTTTACTCATTTCCAACTCTTCAATAAACTGTTGAATGACAATTGGATACAAACGATGCTCAACTTGATGAATTTTTCTCTCCAAAGATTCCAATGTTTCTCCTACTTCTAACGAAACAGCTTCTTGAGCTATAATCGGCCCTGTATCCACTCCATCATCTACTAAATGAATGGTTACACCGGTTTGACTTACTTGGGCTTCAAATGCATCACGAATCCCATGAAGTCCGGGGAAATCAGGCAATAATGCTGGATGGATATTCAGGATTTTCTGCTGATAAGCCATTAACAAAGTGGTACCAATTAAACGCATATAACCTGCTAAAACAATTAACTCAATTTGATTTTCTTGTAAAAGAGCCAAAATAGCTTCTTCGTATTCGGTTTTACTAGTAAAATCAGCTGGACTAAATGAATAACTGGGTATGCCTAATTGGCGACTTCGTTCTATAACAAATGCTTGCTTTCTATCACAAAATAAAAGGACCAGTTCTGCTTCATTATTTTCTGCTCGAATCTGATTCGCAATCGCTTCAAAATTACTGCCATTCCCTGACGCAAAGACTGCTATTTTCATTCCTACACCTCAGCTTTAAAAATGATAGACTCTTCTTGTTTTTCCGTAACCTTCCCAATCACAGATGCTCCTTCTCCAGCTTCATGAAATAAAGCCAACGCTTCATCTACGTTTTCTGCCGAAACAGCTACAACCATTCCAATTCCCATATTAAAAATTTCATACATTTCAGTAGTTGGAACTTGCCCATATTTTTCTAAAGCTTTAAATATTGGCAACACTTCCCAAGTGCCTAACTGGATTTCAGCAGCTAAATGCTCTGGCAACATCCGCGGAATATTCTCGACAAATCCGCCACCAGTAATATGCGAAATGCCATGGACTAAATCAGCTTGAAGTGCTTTTAACAAGGGTTTTACATAAATTTTAGTTGGAGTTAAAAGCTCTGAACCTAAGGATTTACCAGAAATTTCAGCGAGCTGACTGTCATAAGTGAAGTTGTTTTGTTGGAAGAATATTTTTCGAACTAATGAGTATCCATTGGAATGAATACCACTTGAAGCCAATCCAATCAAACAATCTCCTGCTTGAATATCATTTGAATTTAATAAATTCTTTTTCTCCACGACCCCTACCGCAAAACCAGCTAAATCATAGTCATCTTCCTCATACATTCCTGGCATCTCAGCCGTTTCTCCACCAATTAAAGCGGCTCCTGCTTCAATACATCCCTCAGCGACACCAGCGACAACTTGTTCCAATCTAGCTGGCTTATTTTTTCCTGTTGCAATATAATCTAAAAAATAAAGTGGCTCTGCTCCTTGCGCGATAATATCGTTGACGCACATTGCCACACAATCGATTCCAATCGTCTGATGTTGATTCATAGCAATAGCAATCATCAATTTTGTTCCGACACCATCTGTTCCAGAAACCAAAACTGGTTCTTTTACACCTGTAATAGATAAATCAAAGCAACCTCCAAAACCACCCAGAGCACCCATTACACCCAGACGTTCTGTTCGTTTCACGTGCTTTTTAATTCGTTCAACAGTTTCATATCCTGCTGCTACATCTACACCTGCTTTTGCATATGCATTTGTCATTTTTAGGAATCCCTCCACCTGTTCTTTTAGATTTTAGTTATTGCTGGTTCCTCTTCTAAAGAAGCTAAATATTCAGCTTCATAATCATATAAAGACGTTGGAAAATCACCATTGAAATACGCCATACATAATCCAGTATAGGGAGCATCATAATTTAAACCAATCGAGTCAATTAGCCCATCCTGGCTCAAATATGCTAAACTATCTGCCCCAATCAGTGTTTCAATTTCAGAAACCGAATGATTGGCTGCAATCAACTCTTGTCTTGTTTGAATATCAATCCCATAGAAACACGGATAACGCAGCGGTGGCGAAGCAATTCTTACATGAACTTCAGCAGCACCAGCTTCTTTTAATAATTTTACAATTCGGCGACTCGTTGTCCCACGAACAATTGAGTCATCCACCATCACAACTTTTTTGCCTGCAACAACACCACGAACTGCGGAAAGCTTCATTCTGACACCTTGCTCTCTCAATTCTTGCGTCGGTTGAATAAACGTACGAGCAATATATTGATTTTTAACTAAGCCCATTTCATAAGGAATACCACTCATTTCTGCATAACCACTGGCTGCTGACAAAGATGAATTTGGCACGCCAATCACAATATCCGCCTCAATTGGCGCTTCCTCAGCTAGGCGACGTCCCATATTTTTACGAGCTGTATGAACATTTACCCCAGCAATATCTGAATCCGGTCTCGCAAAATAAATATATTCCATCGAACAAATTGACATAGTCGTTTCATCTGTATATGTTTCAATTCGATACCCCGAGTCATCAATAATGACAATTTCACCAGGCATTACCTGACGAACAAACTTGGCTCCAACTACATCAATTGCACAGGTTTCACTGGCTAAAATATAGGCTCCATTCTGCATTTGGCCAATCGATAACGGTCTAAAACCATTGGGATCTAAAGCTCCAATTAGTGCTTCTGGTGTTAAAATTAAATAGGCAAATCCGCCTTTTACAGTGTTTAAACTTTCTTTCAACTTATCTAAAAAAGTGGCTTCTTTACTTCGTCTAATCAAATGCATTAACACTTCTGTATCTGAATTAGAATGAAAAATAGCTCCTTCACGTTCCAATTCAAAACGTAAACTTTTAGCATTAATTAAATTGCCATTATGCGCTAAAGCCATCTCTTCATCATAAAATTTAAAGAGAAAGGGTTGAATATTATTGATTCCATCGCTTCCGGCTGTTCCATAACGAACATGTCCAATCGCAGCATGCCCTTCTAGACGTTGCAAATCAGCCTCATCCTTAAAAACCTCTGCAATTAATCCAACATTTCGATGGCCTTTTAATTTTCCAGCTTGATTGGCAACGATGCCGGCTCCTTCTTGTCCCCGATGTTGCAAACTATGAAGACCAAAATAACTCAATCTAGCTGCATCGTGATGTCCCCAAACACCAAAAACGCCACATTCTTCATTTAAACTTCTGACTTCAGTAAGCACGGAATCGCATCCTCCCATAATTCTCTTAGTTGCTTCGTTTCTAATTGTAAATTTCCATCTTTCGCAGTCAAATTAAACTTTCCGTCATTTGTTACTTTTCCAATTTCTGTTGCAGCATCATCAAAAAGTTGTTTAAATGCAGATGTTTTTTCAGTTTTGACTGAAATTACATAACGAGATTGTGTCTCGCTAAATAACCAGTTTAATGGCATATCAACTGCCACTTCGATACCTAAGTCATTTCCAAAAGCGGATTCTGCTAAAGCTACAGCCAAACCACCTTCAGCTAAATCATGAGCACTAGTAACTAAACCAGCTTTGATTGCTGCTAAAACTTTATCTTGATGCGCCTTTTCAACTACTAAATCAAAATCCATTAATTTACCTTCTATGCGACCTAGCTCCATTTTTTGTAATTCAGAACCATTAAAATCAGCTTTTGTTGTTCCCACTACAAAAATATGATCCCCTGCTTGCTTAAATTCTTGTGTTGTAACATGTGCTAAATCTTCAATTAAACCAACCATACCAATCATCGGAGTAGGGTAAATGGCTTGGCCATTAAATTCATTGTACAAAGAAACATTACCGGAGATAACCGGAGTATCCAGGACTTCACAGGCTTTTGCAATACCATCAGCTGAGGTCCATAGTTCCCAAAAAATTTCTGGCTTATCTGGATTCCCATAATTCAAACAATCCGTTATCGCTAATGGTTTACCACCACTACAAACAATATTTCGAGCTGCTTCCGCAACTGCAATTTGTCCGCCTTTTTCAGGATTTAAATAGAGGTACCGTGCATTACAATCTGTCGTTAAAGCTAAAGCTTTTTTAGTTCCTCTAATGCGCACTACAGCGGCATCACTACCTGGTCCAACAACAGTATTCGTACGCACCATTGAATCATACTTTTCAAAAATAGAACGTTTAGAAGCAATTGTCGGTTGTTGTAAAAGTTTTTTTAATGTCTCAGCTGGATTAGTAGTCTTTGGTTGATACTTTTCTAAAGCACTAAATGCTTGGATTCTTGCCGGCTCCTCATACTTTTTATAATAGGTTGGTGCATCTTCTGCCAAAGCATCAACAGGTAAATCAGCAACTAAATTCCCTTCATGATATAAACGATACATGCCATCGTCTGTTACATGTCCAATAGTTACTGCCTCAAGTTCATAGCGTTGAAAAAGTTCCTCGACTCTTTTTTCAGAACCTTTTTTCACACAAATCAACATGCGCTCTTGCGATTCCGAAAGCATCATTTCATAAGGAGTCATTTCTGTTTCCCGTTGTGGAACATCATCTAAATTCAGAACTAAACCACTTCCAGCTTTAGAAGCCATTTCTGAACTTGAAGAAACTAAACCAGCTGCTCCCATATCTTGGATACCGACTAATATATCTTGATAATCATAAATTAATTCTAAACAAGCTTCTAGTAAGAGTTTTTCCATAAATGGATCGCCAACTTGTACAGCTGAACGTTGTGCTTCTTCCTCATCGTTAAATTCCTCAGAAGCAAATGTTGCGCCATGAATTCCATCACGCCCTGTTTTTGCTCCCACATACATAATGGAATTCCCAGTTCCTTTAGCTTGACCTTTTTGAATATCTTTATGATCAATTAAACCTACACACATAGCGTTTACTAATGGATTTCCAGCGTAACAAGAATCAAAAGCAATTTCTCCACCAACTGTCGGAATCCCAATACAATTCCCATAACCCGCAATCCCAGCAACAACTTCTTCGACTAAATACTTGGTTCTTTCATTGTCTAATTCACCAAAACGAAGCGAATCCAAAATCGCAATCGGTCGAGCTCCCATGCTGAAAATGTCACGAATAATGCCTCCAACTCCAGTTGCTGCCCCTTCATAAGGTTCAACTGCGGAAGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_019425|2655241:2664084|2656895_2658341_-|WP_010051642.1|DBSCAN-SWA MLTEVRSLNEECGVFGVWGHHDAARLSYFGLHSLQHRGQEGAGIVANQAGKLKGHRNVGLIAEVFKDEADLQRLEGHAAIGHVRYGTAGSDGINNIQPFLFKFYDEEMALAHNGNLINAKSLRFELEREGAIFHSNSDTEVLMHLIRRSKEATFLDKLKESLNTVKGGFAYLILTPEALIGALDPNGFRPLSIGQMQNGAYILASETCAIDVVGAKFVRQVMPGEIVIIDDSGYRIETYTDETTMSICSMEYIYFARPDSDIAGVNVHTARKNMGRRLAEEAPIEADIVIGVPNSSLSAASGYAEMSGIPYEMGLVKNQYIARTFIQPTQELREQGVRMKLSAVRGVVAGKKVVMVDDSIVRGTTSRRIVKLLKEAGAAEVHVRIASPPLRYPCFYGIDIQTRQELIAANHSVSEIETLIGADSLAYLSQDGLIDSIGLNYDAPYTGLCMAYFNGDFPTSLYDYEAEYLASLEEEPAITKI >NC_019425|2655241:2664084|2660544_2661225_-|WP_010051639.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDMDMLSAVTDILGEKAEYVQHYETSLAGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSAIMSEVIRFANEGKPVFGTCNGFQILLEAGLLPGALRRNESLHFVCKTVGLKVVTNKTNFTSEYAKGEVIQIPIAHGEGNYYCDAETLEGLKANNQIIFTYESENPNGSLANIAGITNQAGNVLGMMPHPERAVEELLGSNDGLRFFKSIVANYGKVTNT >NC_019425|2655241:2664084|2661489_2662203_-|WP_010051637.1|DBSCAN-SWA MEKKALIYEGKAKMLFETDHEKHIWVSYLNQATALNGAKKDQISGKGQLNNQITSIIFEKLKKKGIESHFIQQLSATDQLIERVTMFPLEIVIRNVAAGSFSKRLGIVEGTPLTFPILEIYFKEDKLDDPLINDDHVAVLGLAKKDQLVVIKEKAHQINLELLDLFQEIGIRLVDFKLEFGQRDDGTILLADEISPDTCRLWDKETNEHLDKDIYRRDLGDLVPVYEEVLQRLKNKK >NC_019425|2655241:2664084|2655825_2656869_-|WP_015077171.1|DBSCAN-SWA MTNAYAKAGVDVAAGYETVERIKKHVKRTERLGVMGALGGFGGCFDLSITGVKEPVLVSGTDGVGTKLMIAIAMNQHQTIGIDCVAMCVNDIIAQGAEPLYFLDYIATGKNKPARLEQVVAGVAEGCIEAGAALIGGETAEMPGMYEEDDYDLAGFAVGVVEKKNLLNSNDIQAGDCLIGLASSGIHSNGYSLVRKIFFQQNNFTYDSQLAEISGKSLGSELLTPTKIYVKPLLKALQADLVHGISHITGGGFVENIPRMLPEHLAAEIQLGTWEVLPIFKALEKYGQVPTTEMYEIFNMGIGMVVAVSAENVDEALALFHEAGEGASVIGKVTEKQEESIIFKAEV >NC_019425|2655241:2664084|2655241_2655823_-|WP_015077170.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFEAIANQIRAENNEAELVLLFCDRKQAFVIERSRQLGIPSYSFSPADFTSKTEYEEAILALLQENQIELIVLAGYMRLIGTTLLMAYQQKILNIHPALLPDFPGLHGIRDAFEAQVSQTGVTIHLVDDGVDTGPIIAQEAVSLEVGETLESLERKIHQVEHRLYPIVIQQFIEELEMSKN >NC_019425|2655241:2664084|2661225_2661474_-|WP_010051638.1|DBSCAN-SWA MYLVKVYVMYKQSVLDPQGEAVKGAVHRLGYSEIEDIRIGKYFEIKVAKSETKIETTIEEICDKLLANVVMESYHYEIQEVS >NC_019425|2655241:2664084|2662462_2662843_+|WP_015077173.1|DBSCAN-SWA MSKKMLHTCVRVQNLEKSMDFYTKALNLKEMRRKDFPDYQFTLVYLAFEKGGYELELTYNYDQAEPYEIGNGYGHIAIGVDDLKATHVAHKSANYEVTDLKGLPGSEPSYYFIQDPDGYKIEVIQN >NC_019425|2655241:2664084|2658316_2660548_-|WP_015077172.1|DBSCAN-SWA MIMVHEPTPEEIKNERIYLEWGLTDEEYQLISVDILKRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTSGPQVLQGPGEGAGIVDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIAILDSLRFGELDNERTKYLVEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEIAFDSCYAGNPLVNAMCVGLIDHKDIQKGQAKGTGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFNDEEEAQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELIYDYQDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGSGLVLNLDDVPQRETEMTPYEMMLSESQERMLICVKKGSEKRVEELFQRYELEAVTIGHVTDDGMYRLYHEGNLVADLPVDALAEDAPTYYKKYEEPARIQAFSALEKYQPKTTNPAETLKKLLQQPTIASKRSIFEKYDSMVRTNTVVGPGSDAAVVRIRGTKKALALTTDCNARYLYLNPEKGGQIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDCLNYGNPDKPEIFWELWTSADGIAKACEVLDTPVISGNVSLYNEFNGQAIYPTPMIGMVGLIEDLAHVTTQEFKQAGDHIFVVGTTKADFNGSELQKMELGRIEGKLMDFDLVVEKAHQDKVLAAIKAGLVTSAHDLAEGGLAVALAESAFGNDLGIEVAVDMPLNWLFSETQSRYVISVKTEKTSAFKQLFDDAATEIGKVTNDGKFNLTAKDGNLQLETKQLRELWEDAIPCLLKSEV >NC_019425|2655241:2664084|2662896_2664084_-|WP_010051635.1|DBSCAN-SWA MSKQHYERTKEHVNIGTIGHVDHGKTTLTAAITSVLAKKGLANPQDYASIDAAPEERERGITINTSHVEYETEKRHYAHIDAPGHADYVKNMITGAAQMDGAILVVSATDGPMPQTREHILLSRQVGVNDLIVFMNKVDLVDDEELLDLVEMEIRELLSEYNYPGDDIPVIRGSALKALEGDEKAEAAILELMDTVDSYIPTPKREMDKPFLMPIEDVFTITGRGTVASGRIDRGVVKVGDEVELVGLFPETKKTVVTGIEMFRKILDVGEAGDNVGILLRGIGREDIERGQVIAKPGSITPHTKFKGEVYILSKEEGGRHTPFFTNYRPQFYFRTTDVTGVIDLPSGTEMVMPGDNVTIDVELIAPIAVEVGTKFSIREGGRTVGAGVITEIEK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2676530 : 2687790
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_019425|2676530:2687790|DBSCAN-SWA ATTAAATCTGCTTGAGCGAGTTGAGAACGAAATTAAAGCATTCTTGAAAGAGAGCAGCGGTATGAGGAGTGGCTCGAAGACGGTTCAACCTACAGTAACTCACAACTTCATGATGAGCCAACCACATCATCCGAATACTATCGGTCATCATTCGTTCGATTTTGCGACCTGGAAATTGATTTTGAGTATAGGAATATAAAAGAACCTTAAGCATCAGTTTAGGGATGATACCGAGCCCTCCAGTTTTTGTTTCTAGTTGATATATGTACGAATTCAACTAACCACATTCACAGCACGAACAAAATCCGTTTCTGGAATGTTCATCTCTAAATTTAATGGTAGAATAAATTGGTTCATGGTATAATTTTGATACATCAACAGCACTCCCTTTTGGTTTAGTCACTTTAATATTAACAGGAAGTGCCGTTTTTGTGTAACTAAAAATAGTGGTCCACTAGGAAAACTAGTGGACCACTATTTTTAGTTTAGAAGAGAGTTTTGTCCCAGCCTCTTTTTTTAGTTAACTAACTGGATATTGTCACGATCTGCAAACCCAGCTGTCATTCCATTTTTCACTAAACGGTAAGGCGCTTTTTTGCCTCCATCTAGATACTGTGCGACCCAGTAGGTTTGATAGCCCGTTGGATTTAATGGTGTACGATCAGCTGATACTGAATTTCTATAACAAGTAACATTACTTCCTTCTGGAATTGAGTTAGCAGGTAATTGATTTACTCGAGAGATATTCGCTCGAGCAGTATAACCCGCTACTTTTCCATCTCTAGAAATCTCATACGGTGATGGTCGACCAGGTATAAAATCAGTTACCCAAGCTGAATTAACTGGTCCAATTGGGCCTGGAGACGGTTTTACTGATGAATCTACTAATGAACCAAAATTCGCATAAATATTGGTTCCCACTGAAATTCCACCAACCGGAATAATAGTTTCTGGCTTAATTAACCCCATATAATGAGCTACTCTAGAAATAAAATAATCTTTAACTGCATTTAACTCTTTTCCATGTAAATCCCAAGAACGATGCGGACATGCAGTATTAAAGAATTCTTTATGAAGTCGGACAGTATCTCTATTGGGTGTAATAGCATACAGTTTGAAATCTTTTGCTACTTGTTGAAAAACAGCTTCTTCATTTGCTAAAAAATCAGTATCAGATGCTGAAAAACTTTCGCATACTTCGTAGCTCAATAAATTTCCATTCCCCCATGAATTTCCACAGTGCCATGCAACACGATTTGTTTCCATCGCTTGATAATTTTCATTCCGATTGATATAAAAATGTGCAAAACCTAATTCTAAATCTCGTCCTTTTAACCACTCGATATACTGAAATGGCGTCATGCTTCCCGCATCGTTATGGATAACCGCACCCAGTGGCTTTAAACTGTTTGTCTGTGCATTAACGATATCAATTTTATAGTTCATACTTTTATTCCCCTTTCTTTTTGTATATTCATAATAACAATAATCAATAACAGAAGACTTGTTAATTCCTTACATATATTCTATAAATTCTATCCAAATACTTCACGATTTGAAGATCAGTTTTATTTGTATAAATCATTATTAAACTGTTTTTTTTATAAACCATAAGCTAGGTATGGTTCCATCAACCTAAGTAACAGTCCTATATGTTTGATATTTTATTTACTTGCAAGATACCAAACAACATTCCACTATAAATATTTAATAAAGTTGAAAAAGTATAAGAACAATATTTTCGTTAACTTTTTGTCTATGTACTAATACGAATTACTTTAAGGAATAATCATTAAAATCACATGCTAAAATAAATTACATTTGTTTAAAGAATCTTTATATCTTCAGAAGAAAGGTTTTATTAACTTATAGCATAGTTAAAAAAGCAGTTTGAGAATTTTCCTCAAAACTGCCTGAATGCTTCTGGCTTTCATTCTTTTGAAAAATCCAGCAATATACTATCTGATAAACAGCCATAGGTAGACTAACGACTATTTAGCTAGTTCAGCTTCAATTAGTTCAGTTAATTCAGCTGTTGTACTATGTTCATCAAAGATGTGCTCTCCGATAATAACTGTTGGTACAAAGAATATATTGGCAGCTTCTGCTTCAGCAATAATTCCTTTTATTTCTTTTTCGTTAGGTTGATCTGCTAATCCAAGTGTTTTTTCCACGTAGTTAGCAACTTCAGTGTTTTCTAAATCGCCCCAATCATCTTGATGATCGTAAAGATAATCAATTGTAGTGACTGCTTTTTGTTGGTCAGAATAATCAATATGGTGATGTGCAACGTTGCCTTTTTGTAGAGAAGGTTTCTCTTTATCAAAATGTTTTACAATGCGCTGTATTTTTCCATCAGCAACATATTTAGCTAAAACATCTTTCGATAAGTCATGCCATTTCCGGCAATACGGGCAACGTAAATTGATAAATTCAATGACTTTAACAGGAGCTTTATCTTCTCCAATTTTAATTCCAAATGTGGTTCCAACTTCAGAAGCTTTAATTTTACTAATATCCATATTTAATTCCTCCTTAAATTTTACTCTTTCATTGTACCTTGAATACACAGAGTATACACGTTTTTAGCCTATAAAAAACTAGAAAGGCGAATTTACCTTTCTAGTCTCTGCGATTTATTTAGGTAAAGATTTACTATTTACCATGATTTCATCAATTAAACCATAGGCTTTGGCTTCATCAGCACTCATAAAGTTATCGCGATCTGTATCTTTTTCAATTACTTCAATTGGTTGCCCAGTTTGATCAGCTAAAATTTTATTTAAACGTTCGCGTGTTTTTAAAATATGACGAGCGGCAATTTCAATTTCAGTTGCTTGTCCTTGAGCCCCACCAAGTGGTTGGTGAATCATAATTTCAGCATTTGGTAAAGCAAAGCGTTTGCCTTTAGTTCCAGCTGTTAATAAGAAGCTTCCCATTGAAGCTGCAATTCCCATTGCAATAGTTTGAACATCGGCTTTAATGAAGTTCATTGTATCGTAGATGGCTAAGCCAGATGTTACACTTCCACCGGGAGAATTGATGTAGATGTAAATATCTTTTTCTGAATCTTGAGCATCTAAAAATAAAAGTTGGGCAATAACAGCATTTGCGACGTTGTCGTCAATAGCTCCGCTTAGCATAATAATACGATCTTTTAAAAGACGAGAATAAATGTCGTAAGCGCGTTCCCCTCTAGATGATTGTTCAATGACTGTAGGTACTAAGTTCATATGTTATTTCCTCCTTCATAGGTTTCACTTCATTAGTTATTGTAACATAAATAATAGAACTGTTACTAATTGTATTTTAACCTAATGGTCAATAAAGGTCAATTTTTTTTACTTATAATTAAGCGAGAAAATCGATTTAGTTACTAATATGAAGAAAAGTGTCTATTTATACAATAAATGGTTAAAAGAGATGAAAAATAATAATTTCTTATTTTGCATTACTTGTAAGTTCTTCTTGTCTTTTTTATAAAATTCAGCTAAAATGTAGTAGTTGAGCTTTTCTGAAAAGTCTCCTTAGTGTAATGGATATCACGTAAGATTCCGGTTCTTGAGATGGGGGTTCGATTCCCTCAGGAGACATAGTTATAAAAATATGAGGAAAACCATTAATGCATCTGTAAATAAAAAAAATAGAAAAGCGAGAAATATATGTTTATTTTCCAACATACATTTCTCGCTTTTTTATTAAACTTTATTAACTAGCTCTTTCCCTCTTAAATCATCTGCAATTTCATTTAATTTTCGTAGACGATGATTAATACCAGATTTACTAATTGCCCCGCTTGGAACAATCTCACCCAATTCTTTTAAGCTGATATCCGGATTTTCTACGCGAGCAACAGCAATCTCTCGTAATTTTTCTGGTAATTTATCCAACCCTAACATTTCATCAATGTACATTATATTGTCGATTTGCTTGCCTGCTGCATTAATCACCTTATTTAAATTGGCATTTTCACAATTCACTAAGCGATTAACTGAGTTTCGCATATCTCTTACAATACGAACATCTTCAAATTTTAACATTCCTGTTGAAGCCCCGATTAATGCTAAAAAATCAGCAATCTTTTCAGCTTCTTTTAAATACGTAATGTAGCCATTTCGACGCTCAAGTGTTCTCGCATTTAAACCAAAATGATTCATCATTTGGCAAATATCATTATTATGTTCTTCATAAATTGAATAAATTTCTAAGTGATACCGGCTTGTTTCGGGATTATTAACTGAACCCCCAGCTAAAAATGCACCTCTTAGATAAGAGCGAATTTTTTGTGGATTGTATAATACTTCGTCTGCAACATGGGCATGAAAAAGTAAACCATCCATAATCGATAAATCAGATAAAACTTCTTTTGTCCCTTGTTTCAAACGCACAATATACACATTGTTTTTCTTTAATTTCATTTTACGACGCACAAGCAATTCACTTTCAACTTCATAATGATCTTTTAATAAGACATAAATACGTCTAGCAATTGCTGCATTTTCAGTTTGAACATTTAAAATAAATTTTTGATTCAATAAGCTTACAGCACCATTCATTCGAATTAATGCAGCTAACTCAGCTTTTGCATGTTCTTTATGAACTTCTAAAGTCGTTAATTCTTTTTTCACATCTGAAGCATATGACATACTAAGCTCCCCCTTTCCACTACTAGCCTCGGCACGTAGTACTTTTATACTTTAGCACCAAATGCTAGGCGAAAGAGCTCTTCAACTACTTTATCGCCATCATGAAAGACACCATCATCTCTCAACTCTAAAAAGTCTGCCGAAACGACTTTACAGCCTTCATTTCTTAAGCCTTCAAAATCATGGGAAACCTGAACTAGATATTCATCATAGCGTTCTTTATCCAAATATCCTTCTGGAACATGCTCCGTATTTACCAAAACTGTGCTAATAAATTTAGCCTCAAGATGCTCATGCAACACACGAATATGTTCTGCATCAGAAAAATTCTCTGTTTCTCCTAGTTGAGTCATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_019425|2676530:2687790|2680227_2681175_-|WP_010051612.1|DBSCAN-SWA MSYASDVKKELTTLEVHKEHAKAELAALIRMNGAVSLLNQKFILNVQTENAAIARRIYVLLKDHYEVESELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKQGTKEVLSDLSIMDGLLFHAHVADEVLYNPQKIRSYLRGAFLAGGSVNNPETSRYHLEIYSIYEEHNNDICQMMNHFGLNARTLERRNGYITYLKEAEKIADFLALIGASTGMLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCENANLNKVINAAGKQIDNIMYIDEMLGLDKLPEKLREIAVARVENPDISLKELGEIVPSGAISKSGINHRLRKLNEIADDLRGKELVNKV >NC_019425|2676530:2687790|2677045_2677975_-|WP_015077180.1|DBSCAN-SWA MNYKIDIVNAQTNSLKPLGAVIHNDAGSMTPFQYIEWLKGRDLELGFAHFYINRNENYQAMETNRVAWHCGNSWGNGNLLSYEVCESFSASDTDFLANEEAVFQQVAKDFKLYAITPNRDTVRLHKEFFNTACPHRSWDLHGKELNAVKDYFISRVAHYMGLIKPETIIPVGGISVGTNIYANFGSLVDSSVKPSPGPIGPVNSAWVTDFIPGRPSPYEISRDGKVAGYTARANISRVNQLPANSIPEGSNVTCYRNSVSADRTPLNPTGYQTYWVAQYLDGGKKAPYRLVKNGMTAGFADRDNIQLVN >NC_019425|2676530:2687790|2686282_2686714_-|WP_010051605.1|DBSCAN-SWA MSDIEQNRAPIINFFPSSDYYFNLGIEAFQKNDMKRAKKYLSRAVTLCKTEEEKIFALCQLAICHQHVGEFQESILILTDLIAESGDIFSEAYYFQANNYAFLEDLPKALELVETYLKLDPLGDFSEEAKELLETIQSELNEF >NC_019425|2676530:2687790|2678520_2679051_-|WP_015077181.1|DBSCAN-SWA MDISKIKASEVGTTFGIKIGEDKAPVKVIEFINLRCPYCRKWHDLSKDVLAKYVADGKIQRIVKHFDKEKPSLQKGNVAHHHIDYSDQQKAVTTIDYLYDHQDDWGDLENTEVANYVEKTLGLADQPNEKEIKGIIAEAEAANIFFVPTVIIGEHIFDEHSTTAELTELIEAELAK >NC_019425|2676530:2687790|2679165_2679762_-|WP_015077182.1|DBSCAN-SWA MNLVPTVIEQSSRGERAYDIYSRLLKDRIIMLSGAIDDNVANAVIAQLLFLDAQDSEKDIYIYINSPGGSVTSGLAIYDTMNFIKADVQTIAMGIAASMGSFLLTAGTKGKRFALPNAEIMIHQPLGGAQGQATEIEIAARHILKTRERLNKILADQTGQPIEVIEKDTDRDNFMSADEAKAYGLIDEIMVNSKSLPK >NC_019425|2676530:2687790|2681219_2682215_-|WP_015077183.1|DBSCAN-SWA MTTIKRNRKPKMVVIGGGTGLPVILKGLKAQNADITAIVTVADDGGSSGTLRNYVNVVPPGDIRNVLLSLSDIPEMQQEIFQYRFDTEDDFLAGHAIGNLIIAAISEMRGNVFEAIQVLSQMMRVEGHVYPAAEEALILHAIFEDGTQVSGESKIALDRKKIKRVFVTPTENNHEAKASREVIAAIMDADMVVLGPGSLFTSILPNLMISDLGKAVVETKAEVVHICNIMTQLGETENFSDAEHIRVLHEHLEAKFISTVLVNTEHVPEGYLDKERYDEYLVQVSHDFEGLRNEGCKVVSADFLELRDDGVFHDGDKVVEELFRLAFGAKV >NC_019425|2676530:2687790|2686866_2687790_-|WP_015077186.1|DBSCAN-SWA MKKVKKAVIPAAGLGTRFLPATKAMAKEMLPIVDKPTIQFIVEEAINSGIEDILIVTGKSKRPIEDHFDSNPELEANLREKDKLDLLKLVEETTGLNLYFVRQSYPKGLGHAVLQAKAFIGNEPFVVMLGDDIMEDKVPLTKQLMDRYEKTHASNIAVMKVPHEETSKYGIIDPEGQVDKGLYNVRNFVEKPKPEDAPSDLAIIGRYLLTPEIFDILENQEPGAGNEIQLTDAIDTLNKTQRVFAHEFTGIRYDVGDKFGFLKTSIQYGLKHPEIKDSLRQYIVKLGAELALADKKVVEKKATPEKK >NC_019425|2676530:2687790|2683326_2685054_-|WP_015077184.1|DBSCAN-SWA MTWKTTYETWGNFEDLETNLKEELVSLAENEKMLEDAFYAPLEFGTAGMRGVLGVGVNRMNIYTVRQATEGLARFMDSLGEETKKRGVAIAFDSRHQSPEFAMEAAKTLGAHGIPSYVFESLRPTPELSFAVRFKNAYAGIMITASHNPAEYNGYKVYGEDGGQMPPKEADALTEYVRGIKNSLTIDVLSEEDLKKSNLLTILGEDVDAPYLELVKTVTVNSDLVKDMSKEMKLVFTPLHGTGQMLGERALKNAGFASISVVPEQAIPDPNFPTIKSPNPEEHSAFEYAIRLGEKENADVLVATDPDADRLGIAVKVPAGHYEVLSGNQIASLMLHYLLTAQKEAGTLPSNGVVLKSIVSSELATAIAKSFSIKMVDVLTGFKFIAEKIKQYEMDHTQTFLFGFEESYGYLVKPFVRDKDAIQALVLVAEVAAFYKKQGKTMYDGLQDIYATYGYYEEKTISVTLAGIEGSAKIKALMAKFREEAPIEFAGISVASMEDFDASQRIYSDGKVEIIDMPAANVLKYSLADGSWIAIRPSGTEPKIKFYIAAVASSAVEVDKKVAEFEKTIQTLINA >NC_019425|2676530:2687790|2685239_2686187_-|WP_010051606.1|DBSCAN-SWA MEVIEKIYDVIIIGSGPAGMTAALYASRSNLSTLMLERGVPGGQMINTAEIENYPGFLSILGPELSDKMFEGAKQFGAEYAYGDVKEVIDGVAYKTIIAGNKEYRTRAIIIASGAEHRKLGVAGENEYNGRGVSYCAVCDGAFFRNKELIVIGGGDSAVEEGVYLTQFASKVTIVHRREELRAQKILQDRAFKNEKVDFAWNSVVEEIHGDDMKVTGAVLVDTKDGSKREISADGAFIYVGILPQTKAFLNLGITDDEGWIVTNEEMETKLPGIFAVGDVRQKSLRQVTTAVGDGGQAGQAVFKYIEELMETLEK >NC_019425|2676530:2687790|2676530_2676806_-|WP_080732560.1|transposase|DBSCAN-SWA MNSYIYQLETKTGGLGIIPKLMLKVLLYSYTQNQFPGRKIERMMTDSIRMMWLAHHEVVSYCRLNRLRATPHTAALFQECFNFVLNSLKQI >NC_019425|2676530:2687790|2682211_2683099_-|WP_010051608.1|DBSCAN-SWA MVDSLQLVIITGMSGAGKTVAMQSFEDMGYFCVDNMPPSLLPKFWELVKESGKLTKIALVIDLRSRAFFEEIMSAIGTMDNTSFITTKILFLEASDEELVSRYKETRRTHPLAMDGRIMDGIRTERALLADIKGRAQMVIDTSDVTPRQLREKIMSSFKTDDTQLFRVEVVSFGFKYGLPIDADVVMDVRFLPNPHYIDNLRPLTGMDKPVYDYVMQQPETELFYRKFIDLLEYVLPGYKKEGKNNVTIAIGCTGGQHRSVALSERIGRQLIADDYKVNISHRDKGKRKETVNRS |
11 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
3280361 : 3348834
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_019425|3280361:3348834|DBSCAN-SWA 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95 | Streptococcus_phage(17.5%) | portal,tail,head,terminase,integrase,capsid,tRNA,holin,protease | attL 3341367:3341382|attR 3344845:3344860 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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