Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_019904 | Echinicola vietnamensis DSM 17526, complete sequence | 0 crisprs | RT,cas3,DEDDh,csa3,Cas9_archaeal,cas6,WYL,PrimPol | 0 | 0 | 1 | 0 |
1. NC_019904
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
2970184 : 3028209
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019904|2970184:3028209|DBSCAN-SWA ATTACCTGAATTCCCCCTTAGGCATGATGAGGAGGATATCATCCCAATGTGGATGCTCGATATTATGGGCTTCGATATTTTGACGGGTCTTTTTGCGAAAATTCCAAACCGTGTTTTTACGTAAATCCAATAACTCCGCTAATTGCTCCAATGTGCGTTTTTCGGTGTTGGCAATCAGCTCGTAGGCGATGTAAAAAGCCTTTTCAAGCGGGAATTTGACACCGTGAAAAATGGTCCCAGCGGTGACCGAATCGATATGGCCACATTTGGAGCACCTACGGGTGAAGAGTTTGGGGCCTTTGGAGCTTTTGGTGTTTCCACAATGCCTGCATTCATAACCTTGGCCCCATTTGAATTCTTCCAAATAACGTAAACAGGCTGATTGATCTGGAAAGATCCTCTGAAATTCCTCGAACGAAAGCAGTTTATTGCTCAGTCGTGCCTGGAAAGACTCCTTGATGCTGCTTTTAAGCTTCCAGTTGTCCCGGTCCAAAAGGGAGTTGATGCGCTTGATTTCTTCGTCTTTTTCGGTCAGCTGTTGGTTGTAATCTTCCAAAAGCTTGTTTTTATGTGCCAATTCCTTGGTTCGTTCGCTTACTTTCAGTTCCAGTTCTTTGTTCACTTTTTCTTTGAGGGCAAAATTATCCTCCATCTGCCGAATGGTCCTGCGCATTGCCCGGTCTCTATTGTCCTTCAGGATTTGGATGCGGTCTCCTAACGCAAAGGTCAATAGCAGCATTTCCACCAAAAAGGCCAGGTGAAGGCTGTAATAGACCAGTGTCATATGGGGTATTATGGCGGCATTGACCAGTACTTTGACCACTACACCGATAAAGAGCACGCCATAGGCGATCACGAAAAATCGCGCTACCTTGTATCCCCTGGACCAAATGTAAACACTGGCGATAAAGATGAAGAAGAAGGGGATAATGTCATAATACTTGATCTCAAAAAGTTTGGGGTCCCAGAAAAGGCCGATGAGAAAGATAATCGACTTTATGATCAATATGACGATTAAGGCCTGATGGATTTTTGGTGATCGAAAGCGGGTGTTCAGAAATTTGATCGAGAACAATATGGCCCATAGGACGATGGAGTAGCTGAAGACGCCATTGGCGATCTGGTTCCATTTGGGAAAGTTTGGCCATAGGTATTGAAATGCGATGCCATCCACGCTTAGTGCGTAAATGCCCACACTGATGAGATAGAAGGTGTAATAAAGGTATTTAATCTCCCGGATTACCGTGTAGACCAAGAGGTTGTAAAGACCAATGATCAAAATCATTCCGTAAAAGACCCCGTAGGCAAAATACTCGTTTAACGCATAATAAATAAAGCGATTGACAGAACGAATGGCGATCCGGATGTCTGCTTTTTGGTGGGATTGGATCTTTACATAATAGTTGCTGATCCCTTCACTGTTATTATGAATAAACAGTTCAAAGTTCTTATGGCTAAAATTCCTGGAGTCAAAAGGGATGGCATCTCCCATGATAATTTCCTCAAATCCTCCCTCTCCATCTGGCGCATAAACCTCCACGACGTCGATCGTCTGGTCATAAAACTCCATTAACCACTTCTTGGAGCTTTCAGGGGTCTTATCGATGGAAAGCTTGACCCAATACGTATGGTTGATATCGAATTTATTCTTGTTAAAAGACGGCCGGATTTTAAAATTTTCTTGAAAGTCTGGCTGAATGATGTCGTCAAACACCAGGGCGTTGGTGGTGTCTTCGAAAAATTCCAACTGGCCGATGGAAAATATGCGCTCGTCCAAATTGTCATCTATCTTCAAGGTAGAGCTTCCTGAAATCCTCTGTGCCTGGGTGACCTGAGTGTTCATCATCATGAACCACATCAGTAAGGACAGCATTAAAAGTATTCGCTTCATCTGGGCTGGAATAAGGTTATTTTATTTAAGGCTATCTTTCATTAAATTAAACTTTGATAACCATTCTGGCTTGCCAAAGTTACGGGTTTCTACTTTATGACCGGTAGTTTGGAAAGTACTGATCAAAATTCATACTATAAATATGATAAAAACAATCTCTCCCAAAGAAGTTCCCACCGCTACCTTTCATCGTTATATGTTAGGAGCCATTGCTCCGCGACCAATCGCTTTTGTGAGCAGCATCGATCGTGTCGGACAGATCAATTTGAGCCCGTTTAGTTTTTTTAATGCCTTCGGGTCCAATCCTCCCGTTTTAGTGTTTTCTCCTTCTCGGCGAGTTCGCGACAACACCACCAAACACACCTTGGAAAATGTCTCGGAAGTGCCCGAAGTGGTGGTTAACATCGTGAATTATGAAATGGTCCAACAAATGTCTTTGGCCAGTACGGAGTATGAGCGGGGGATCAATGAATTTGTAAAAGCAGGATTGACAGAAGAACGGTCGGTTTTCGTAAAGCCTCCGCGGGTGAAGGAAGCTCCAGTGGCCTTTGAATGTAAGGTGCTGGAAATACGGCCCATAGGAGAAGAAGGCGGAGCGGCCAATTTGGTGATTTGTGAGATTCTTTTGATACATATTGACGAGACAATTCTAACTGAAGGAGGGGAGATTGCCCCAGATAAATTGGATGCGGTGGCCAGAATGGGGGGAGACTGGTATTGCAGGGCCAATGGAAATGCTCTTTTTAAAGTGAAGAAGCCGATTAAGACCAAGGGAATCGGCATTGATCAACTACCGGAGAAGGTAAGGCACAGTGTGGTGCTGACGGGCAATGACCTGGGCAAGCTGGGGAATGTAGAAGCTCTTCCCGATGAAGGGGCAGTCCAAGATTACGCTATGCGGCCAGAAATTGAGGAGATGCTGGTACGCTTCCAAAATGATGAAGAGAGCTTGCTTTTTAACCTCCATGAGTATGCCAAGGATCTGCTGGCAGCGGATAGGGTAGAAGAGGCCTGGCTGGTGTTGTTACAAGGGTGAGAAATGGGCAATTTGAGCAAAACAGGGCATTTAGCCCTACTAAACCCTATTTATCGGCAATAGAGCATGACCTCATCCTCCAGCACCAAGAGCATTACAAATGCCTCGCTCGGAAAGCTGCTCGTTGTAAACGAGGGCTTATTGGGGAAGTGCAGAAGGTAGGGATGGTTCAGGTGGTTGCTTCCTTAAACGCCCAATTCAGCATAATCCAAGCCATTTCATACTTCGTGCCGTGCACTTAATATTTTTTTACTTGATGATTTCTGTGGTCTTGGAGTCCAGCAGTTTTCCTTTTTCACATTTAAGAATCCTGTAGGGGTACTTGTTGAGCAAATCATGGTTATGAGTGGCCATGAGTACTGCCGTTCCCTGTTTGTTGATTTCCTGAAAAAGTTTGAAGATGCCATCGGCTACTTCTGGATCAAGGTTTCCTGTGGGCTCATCGGCCAATAGGATAGAGGGATGGTTTAACAAGGCCCTGGCAATGACCACACGCTGCTGTTCACCGCCGGAGAGCTGGTGGGGCATTTTGGTGGCTGCTCCGCCAAGTCCTACCCGCATGAGGACCTCAACCATCCTCGTTTTCATTTTGGCTTTGTCCTTCCAGCCCGTCGCACGCATCACAAAGTAGAGGTTTTCGGCTACGGTCCTGTCCGTGAACAGCTGAAAATCCTGAAAGACAATGCCGAGCTTTCGGCGAAGGAAAGGGACATCCTTGGTTTTGATTTCTTTCAGGTCATACCCTGAGATTTTACCGTAGCCCATTTTTAGGGGGAGGTCGGCATAAAGGGTTTTCAGCAAAGAGCTTTTTCCGCTTCCGGTCCTGCCGATGAGGAATACGAATTCGTCTTTTTCGATATCAAAGGTGACATCCTGCAGGATCGCAGTAATGCCTTGGAAGATGCAAGCCTTGTCAAGGCGGACCACCGGTTCACTGGAAAATACCATAGTGCGCGTTACAGTTCTAGTTTTTGTAATTTACCAAATGGAAGGGCTTTGATCAAGCGCTCCATTTCTTCTTCTTTCCCTTCCAAACCAAATTTTTCCAGGTTCTTTAGCGGACGATCAGCTCTAAAATAAGCCACAAGCACAAAGTTTTCGTCCCTGATTTGAATGTAATCCGGTATTTTGGCTTTGCCCTTGACCTTGATGATGTACATAAGAATAATTGGCTGTGATTTGAAAGCGAAATTTAAATGATAACGCTATGAGATAAAAATATTATGCCAATTTAAAATGGGTTATTATAAAAAACCACCACCCTAAACATCAAATGATGAAAGGATGGTGGAAAAATATAAAATTTAGTGGTTTTATTTTCCAGCTGCTTTGGCGTGATCGGCCAAGAATTTGGCAAGACCAGCGTCTGTAAGCGGATGGTTTAACAAACCAGTGATGACGTTAAGTGGACAGGTAACGACATCCGCGCCGATTTCAGCACATTTGATCAAGTGCATGGTGTGTCGGACAGAAGCGGCCAGCACCTGAGTGTCATAGCCGTAATTGGCGTAGATATGAACGATTTGCTCGATCAGTTCCAGTCCATCAAAGGCGATATCATCCAATCTTCCGATGAAGGGAGACAAATAAGTAGCTCCGGCTTTGGCCGCTAAAATGGCTTGGCCTGGTGAAAATACCAATGTGCAATTGGTACGGATACCTTCTTCACTAAAGTACTTGATTGCTTTCACACCGTCTTTGATCATAGGGACTTTTACGACGATTTTGTCGTCGATTTTGGCAAGTTCCTTACCTTCTTTGATGATGCCTTCAAAATCAGTGGAAATTACTTCCGCACTTACTTTGTCATCCACGATGTCACAAATGGCTTTGTAATGAGCCCTTACATTTTCGTCTCCTGTGATGCCTTCTTTGGCCATCAAGGAAGGGTTAGTGGTTACACCATCCAGTACACCTAGGTCATAGGCTTCTTTGATTTCATCTAGATTGGCGGTGTCAATAAAGAATTTCATTTGTAAAACGGTTTTTTGGTTTTGATGAATATGGTTGGCCATTGTTTGTTAATGGACAATGGCTGTAAATACAATTCTTCAGGTATTAACGTAAGTTGTT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52 | Acinetobacter_phage(30.0%) | integrase,transposase,protease | attL 3022063:3022091|attR 3025526:3025554 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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