Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020514 | Paraglaciecola psychrophila 170, complete sequence | 2 crisprs | DEDDh,csa3,WYL,DinG,cas3,2OG_CAS | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020514_1 | 919031-919184 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020514_1
|
3 spacers
spacers of NC_020514_1
>1.1|919053|22|NC_020514|CRT TGCTTGTGTGCAAACTGCCCTT >1.2|919097|22|NC_020514|CRT CGTCAGTAAACAAACCAGCCCT >1.3|919141|22|NC_020514|CRT TGCTTATGTGCAAACTACCCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020514_1
The CRISPR arrays of NC_020514_1 >merge|NC_020514|1|919031-919184|CRT CAATTAGTTCAATAGATAAGAGTGCTTGTGTGCAAACTGCCCTTCTATTAGTTCAGTATGTAAGAGCGTCAGTAAACAAACCAGCCCTTTATTAGTTCAATAGATAAGAGTGCTTATGTGCAAACTACCCTGCTATTAGTTCAATAGATAAGGA >NC_020514|1|1|919031-919184|CRT CAATTAGTTCAATAGATAAGAG TGCTTGTGTGCAAACTGCCCTT CTATTAGTTCAGTATGTAAGAG CGTCAGTAAACAAACCAGCCCT TTATTAGTTCAATAGATAAGAG TGCTTATGTGCAAACTACCCTG CTATTAGTTCAATAGATAAGGA
>NC_020514.1|WP_007640222.1|916664_917648_-|4-hydroxythreonine-4-phosphate-dehydrogenase-PdxA MKPLKLAITPGEPAGIGPDLLIGIAQQEWPVQLVAFADGDMLRQRAKELNLAITLVPYDQDNEHTLPAGQLFLVDIKTKVPVISGKLDSENGHYVVETLRQACKKNLDGEFDAVVTGPVHKGIINEGGISFSGHTEFFAHESNTNDVVMMLATEGLRVVLATTHIPLAYVAKAITFERLHKVIHIVNTDLMLKFGIKKPHIFVCGLNPHAGENGHIGKEEILVIIPALDALRAEGLNITGPLPADTIFNPKYLEQADVVLAMYHDQGLPVLKYKGFGASVNITLGLPFIRTSVDHGTALDLAGTGHADAGSFNLAIEKAISIAAQKE >NC_020514.1|WP_007640220.1|915867_916668_-|16S-rRNA-(adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))--dimethyltransferase-RsmA MTKQHLGHTARKRFGQNFLHDNYIIDQIVTVIGPQKDQHMVEIGPGLGALTEPVCELIDSLTVIELDRDLAERLRTHPFIASKLTIIEADALKYDFSQLLSDDKPLRIFGNLPYNISTPLMFHLFSFANKVQDMHFMLQKEVVNRLAASPGNKSYGRLSVMAQYHCQIIPVLQVPPGAFNPPPKVDSAVVRLVPHQQKPVTLTNEDTLHKVCAQAFNQRRKTIRNSLKESLSEQQLIDIDINPELRAENLSLQQYAKIANAVDSLA >NC_020514.1|WP_007640218.1|915461_915836_-|Co2+/Mg2+-efflux-protein-ApaG MKQLNKVKITVETQYLKNQIPDKDKYVFAYKISVHNNGQHSVQLINRYWLITDGNGKKTEVEGPGVIGLQPHILPGDFFQYTSGAVLDTPVGTMQGYYEMQQEDGGRFEAVINVFSLAVPNVVN >NC_020514.1|WP_007640216.1|914643_915456_-|symmetrical-bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase MATYIVGDIQGCFLGLQKLLNKVHFSPINDRLIAVGDLIGRGTQPLETLDYLYSLENSFDTVLGNHDLNLLAIFAGIRKAKPNDNLDTLLASPKLNTYINWLRLKPLALLADQDTLVTHAGLYPQWSVKKALKFSLEVSEQLQAEDWKESLAYMYGNQPSIWQKSLQGSQRFRFIVNAMTRMRFIVNQNELDFSCKTPPELAPQELTPWFKVINKKFKSNQRVVFGHWASLNGDTYNSQFIGLGTGYVWEQNMTLLNLSSSEICSVNFQD >NC_020514.1|WP_007640214.1|912429_914454_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKITVATRVVGGFGIITLLLVVLGVVAVSSLSSIDTATEEVNTLALPTVSGSSQLKVSFLNMGRLTTESYYETTLDGLRNKKTAFEDSQTNFDNELRILTSVVSKEPDLRESLIETEEIYRQYIENVNAIFDNKKADLEFGNKVLDVLRNIEDNADDGSTLIVDFADLEKVQSNSQLSKAAEIANGLESSLTSLLTVGAEYVKTQTLVRADTIGNEVKLVVDQIKDKTTEVQSTAGDRDDSGTLSELYDLIADVTDSISSPNGLIQSQIKRLNSRLQAGSAYTSSEANIEDALQKLNDLLKLADAKAKYAKEDVADSVTTGKTITIIIGLISVLIAATIAYWTVQAIIKPLHKVNEMLNFVSTGDLTQRLDDSAQDEFGDLAKNCNNLIDSLKTLITGISSRAAQLAAAAEQTSTVTAQTTRSIQEQKSQVAQVAAATTEMHSTSQLVTKSAEDTLNQIKHADSEAEKVKVISEENKRTILVLAKDVEEAAAVINKLHQDSASIGGILDVIRGVADQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRTLASRTQQSTQEINSMIEVLQAGAEKAVSVMNQSKEQTTLCVEQTENATVALESITDAVHKAYDVSSQIEQSAREQNIVSLEISEKLENIVNIAEETTIGANQTSESSHEVAKLAEELQSSVQQFRV >NC_020514.1|WP_007640212.1|911243_912053_-|hypothetical-protein MRGLEKWALTAKGKLAGGRIKTSVKLGDYIEWPEDFDLTQLPAHQSPDIAVELVSSTKISKEFGISANKLNYLFSELGWINKSLKGWVVTEQGLKKGALQSEDSRSGVPYVRWPETITQSSLLLNSINDITGSNAPLLISSNDTNNVSNAMEFKEKFEAKHRATDGHYVRSKAEMMIDNWLYIAEIVHAYERKLPIEENVYCDFYIPTGKVYIEYWGYDNDPKSLARKEKKSAIYEKYGLKLIELDDTDVQNLDDILPRLLLKFGVQAY >NC_020514.1|WP_007640210.1|910468_910822_+|hypothetical-protein MKKHVKTILALVTTSTFLVGCSNINNYEHDINNFIADQNLSAIERIDSVLDYDFIVFNDQHIALIKQNNKSYLLTTPDNCQNMNFANKVILLSADKGVVHVNSDKLPELETSIQSAQ >NC_020514.1|WP_007640209.1|909927_910413_+|hypothetical-protein MNKYINTLSVVATIFLFGCSNRINYEKNINSFIADQKLAPMESIDTGGAIKYRALNDKHIALTIQNSGSYLLTVRANCQDIMNATKIVLATAAEGVVQVNSRDKIVRIGDKYSECLVSGLYKLHSGQLEQLVSWSYRRDPSWSNNLIYPLFYDVKSRGLEN >NC_020514.1|WP_007640207.1|908932_909463_+|hypothetical-protein MKYFMALLTLTLLVLVSGCTSKPDYRSAKNGSVGYSEQKITDDRYRVQFKSHSKTVADASDYALLRAAELTQQQGYDWFVVTSKETFVESEKQQPSSSIGFTQTRQIERNCGLLTCETRTRPSTEVGVNINNGINNNRKEVHSILEIRMGKGVKPNEDSYGAQDVVDNLSQKIDLD >NC_020514.1|WP_007640204.1|908174_908936_+|hypothetical-protein MNISDDMLSGFLDAELAPQDMELVRVALETDDDLVMRMAELSQVDQWVLEHAQQIDHTEVPKKLVVLAQQLDVKRNSHKTAAVNNVVQISAWEKWTADIKTPYAMAAGVALVASVAMLNLSQQTTDLGFSTDIAAVLDTEFSGETAYLEDGSTVKAQLSFENQQGQLCRQYQVASSDNRSTNIACKQISGWKLQAQHTEQSVAVTGDYQTASSSQQLEAVIDAMISGSALDRNEEQQAINNQWQFENQKRGDL >NC_020514.1|WP_007640227.1|921508_922534_+|phosphotransferase MKTPLTFKQLRQKKLHNWINQNTDFECESLEIVSGDAGFRRYFRFACYGQSIIAVDAPPTSEDTAQYIAVAQSYREKGIKVPEIYAHDLAQGFYLQQDFGNRLFSDVLTEDTCDLLYPKALANIPIIQSCLSTESGPLPDHDGAFIDIELRLFPDWLLNKYLQLRLTDSEENMLSKVFDEVKSSCLIQPKVGMHRDYHSRNLMLLEDDEIGVIDFQDAVVGPITYDAVSLLRDSYQDWPQEKVQQWLQDWHAEYYAQYPWIEFKMWFDSVGMQRHIKIAGIFARLFIRDHKSSFLADIPHTLHYLINEASQYPKYSEFAQFVSERVLPNVLQKLKSTHHDT >NC_020514.1|WP_007640231.1|923214_924045_+|co-chaperone-DjlA MIGKILGTIFGFMFGRIPGAVLGFMVGHMFDKGYSKNFNQTGGFNRFFASKDEFKTQAVFFHCLFSVMGHVAKADGKVSDVEIRMASALMDQMNLEGDVRKEAQQAFRDGKAADFALKQTVQEFKESCHGRRDIVQVYLEILIQAAYVDGKLDKAEQTILETVSQYLGFSQHDLLYLMSAFEAEMRFRQGGGGQQHTNGKKYSSQQSLDDAYKILGVKISDDGKSIKKAYRKLMSEHHPDKLVSKGLPKQALEIAKNKTQDIQSAYEMIKERRGFK >NC_020514.1|WP_007640236.1|925379_925703_-|hypothetical-protein MTANSENIKSKPLLVVKSIKSKYSSSHSTYSNPMGESYRYAEEFEKLDRLTGELKWTAIRADLIFDLNSQLRANAEDYACDDSQQKFTQDIIAAWTKVMNADRFNLK >NC_020514.1|WP_007640237.1|926028_926787_+|choice-of-anchor-H-family-protein MKNIKWLMLSSLLLSSVVLSKVVNSSENDSWSAQSTEKQFEQTSKIIYKASKDEQANELVLTSNAMSKNANTANSKKSAQAKILSVRPVAKVYNQEFWIFDAWVEFYSDNDRDGYFNHFSVEFDADTEYSSAEVYARLYLGKDEVFKEYHTTSIFSIFSDNSDDSFVVESELLNGFSSAEYEVLIELYDAYSDELVAVLDGNDDADLYLLSLESKEYETPQVIVIREHGGSVNLWGFLLLSLLLITRQYRRA >NC_020514.1|WP_007640239.1|927018_928779_-|acyl-CoA-dehydrogenase-family-protein MPQYHAPIKDMQFILHDWLNLSAHYQKLGLEDFDKDLVNEILLQGAKFAEEIIAPLNREGDEQGAKLIDGNVTTPDGFAEAHKDYVANGWNAMLGNADFGGQDLPNTVAVPVHEMLNSANLSWRLTGMLSESAILAITKHASTALQNTYLSKLVSGEWTGTMCLTEPHAGTDLSLLGTKAIPNEDGSFSITGSKIFISSGDHDWTDNIIHLVLARLPDAPVGVKGISLFLTPKFLPLSDGGIGQRNAVTVGSIEKKMGIKASPTCVMNFDGAQGFLVGEANNGLACMFTMMNDARFQVGLQGLGIVEASYQGSLEYARDRLQSRAPQGIQEPSKKADPIIHQPDVLKMLLTQKAIAEGCRALALLYAQQMDVERFGKDQEKHKAKSVISFLTPIVKGFMTDMGSEMSNLGIQVYGGHGYIREWGMEQLVRDARIAQLYEGTNGIQALDLISRKLARDKGTMLEDTFELFNSKIEQMTNADMQTQASELLAEWLATATELKQQNAVDLAGAAYDFMNYSAYCLLGVIWLSMADTAEHSDIESIKLGKANTCAFYIKRLLPRKDGFKTNLFNGADDLMVVSDAEFDYQ >NC_020514.1|WP_007640241.1|928933_929254_-|hypothetical-protein MGWDLPTHKQQKLISAQCTAHKAVWETTGLNVEVGKLLFTAPDETQYFECKLTDEFSRQLQEFPVPAWAQQKVSKISLVDPFNTEQDHWVNGINLITLREAYNQLD >NC_020514.1|WP_007640243.1|929561_930626_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MSKGLKVSPLLIAVVLCLGLVVYLYLPKEESQQVRQANATLVKVHRAAEEQFEVIVEALGTGRANESVLITTQTSDIVYKINFDDGDRVKAGQVLLTLIDLEEKARLAALDVDLQEANRQLNRIANLAKNNVASEQLLDEQQAEVNALIAEMNVLKTQMRALEVRAPFDGLLGLRQVSVGALVRPGDAITTLDDLSIIKVDFNIAEVHLPSLAIGQNIRATSIAYPDEIFEGKIVSIGSRVDPATRAIQIRANINNQDFKLRPGMLLQINLQKKMLTTLILPEASLVPVEDKHFVFVVNDAEVTRKQVKIGLRKPGKVQIISGLNEGELVVIEGALKLRDGSKVKILNIDEIEG >NC_020514.1|WP_007640248.1|930629_933743_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MFLSDISVKRPVFASVVNLLLVVFGIVSISLLSLREYPDIDPPIVSINTNYPGASASIVETRITQLIEERISGIEGIKNIESSSRNGRSSISIEFDLSRDIDAASNDVRERVSRVLNNLPDQAEPPEVSKSNSDEDVIVWYNLRSDNLSVMELTDYADRFVVDRLSVAEGVARVQLGGGRKYAMKVWLDRNAMAARDITVTDIENVIRSENVELPAGEVESIDRDFEVRVARSFLTPEDFSNLTIKASADGYLVKLKEVARVELGAEDDETEFRGGGVNMIGLGIVKQSKANTLEVARAAKAAIQLIEQTLPDNIFIVPSYDSSVFIEASINEVYETLAIAILMVVLVIYVFLGNIRATLIPAVTVPVSLVSAFIVMYALGFSINLLTLLAMVLAIGLVVDDAIVVLENISRRIEMGEPPILAAYRGAREVGFAVIATTLVLISVFVPLVFLQGNIGRLFTEFALAIAAAVAFSSVTALTLSPMMCSKLLKKRSKPSGFAHWVDNKFRKIEQGYFTGLGTTLHQPWLMSLLVIGSIVALFKLIQILPGEFVPKEDRGNFFILMQSAEGSSFESNAANLKKIESILLPYTETGEADRIIVRTPGFGGNAGIAIVGTPIGPEKKGSTFDLMDEISGKLVNIPDVTAFAVMRSGIGGRGLGRPVQFVLQGNTYEELVEWRDIVLTKARENPNLIRIDSDYKETWPQLLVNIDKNRAADLGVSISDIGRTLETMLGQRRVSTFLDKGQEYDVIMEGWEEDYRSPSSIENIYVRSSQSNQLIPLDNLLTVGENATSSRLNRYNRMRSITISANLADGYTVGEALDYLRNIVDTELPAEVAIDYKGESQQYQDSGSSILFIFVLALAITYLVLAAQFENWIQPLVIMLTVPLALVGAFIGLYFSDMTLNIYSQIGLVMLIGLAAKNGILIVEFANQLRDAGVEFEKALRQAATQRLRPIVMTGFTTIFSSLPLVLATGAGAESRTVIGMVIFAGVTVSAFLTLYVVPTAYYLLARNTGSPNARAQMIASLEKTIEYKKGDLDI >NC_020514.1|WP_007640249.1|934006_934474_-|glycine-zipper-2TM-domain-containing-protein MKALLVCFILMAGHISQATADYNRNQAVPVDKVLFGKVTSARQITETELTQDRNQGWKTFGGALIGGSIGNQFGSGSGRALSTILGAMLGSSIANDSHARVKHVTIQLVELMISIDNDGEYMVVQDFDPSMLFHTQDKIRMIYLSNGSVRIDKQL >NC_020514.1|WP_007640250.1|934530_935133_-|penicillin-binding-protein-activator-LpoB MKKLLLVSAMGLSISLLAGCANKTVVSYGDASAVETTDINFGSTDLQKIADQMTESLIQSPVVGTMTANKRPIVFVDTVKNKTSEHIDTESLTDSISTQLLRSGKFRFVDMTKVTAVREQLNYQNEGDLVNPNKAVQFGKQVGAEYMLYGNLASIVKTNNDKSDVYYKFTMRLMDLESGLVEWADETEIRKTSSKKLLGW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020514_2 | 5071917-5072024 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020514_2
|
1 spacers
spacers of NC_020514_2
>2.1|5071947|48|NC_020514|CRISPRCasFinder AATCGCCATTACAATGTTCATACATATACTGCACCAGATGTATTTTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020514_2
The CRISPR arrays of NC_020514_2 >merge|NC_020514|2|5071917-5072024|CRISPRCasFinder TTATAACAGTGGCGCTATCACTAAACTTACAATCGCCATTACAATGTTCATACATATACTGCACCAGATGTATTTTAGTTATAACAGCGGCGCTATCACTAAACTTAC >NC_020514|2|1|5071917-5072024|CRISPRCasFinder TTATAACAGTGGCGCTATCACTAAACTTAC AATCGCCATTACAATGTTCATACATATACTGCACCAGATGTATTTTAG TTATAACAGCGGCGCTATCACTAAACTTAC
>NC_020514.1|WP_007635902.1|5070883_5071858_+|class-1-fructose-bisphosphatase MKRLNSQLQEDGAPMELILLLRTLLAGCKEIAFRVSQGALAGVLGSTLSDNVQGERQKKLDVISNQILKDILSESGYVKAISSEEEDDVVPCNPEGKYLVSFDPLDGSSNTDINSLIGTIFSITHAPQWMKPDDPSAFLQPGTQIVAAGYVLYGPSAMLALTTGRGTHLYTLDKTHGGFLLTTPNVKVPEKTSEFSINTSNQRHWEAPIQAYINDLLAGTEGPREKDYNMRWVAAMVGDIHRVLSRGGIFMYPYDKRDPSKAGKLRLLYEANPMAFLVEQAGGLAETGTGRIMEVMPTEIHQRVPVLIGSKEEVETCLSYNNKN >NC_020514.1|WP_007635904.1|5069262_5070627_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase MHLHILGICGTFMGGIAAIAKELGHEVTGSDSNVYPPMSSQLESLGIELFEGYDTKQFKNEPDIVVIGNALSRGNEAVEFVLDRNLPYTSGPQWLLENVLKDRWVLAVSGTHGKTSTSSMLAWILEYAGLKPGFLIGGIPQNFDVSARLGESPFFVIEADEYDSAFFDKRSKFVHYRPRTLVMNNLEFDHADIFTDLSDIQRQFNHLLRMVPNNGLVLLPKSDNNLRKVLDMGCWTPVQFTGGDWQVQNSNPECSEFEVMFKGQVQGKVHWELMGEHNVNNALMAIAAAKHSGVKSDLAVAALSQFVNVKRRMEVKAIVNGITLYDDFAHHPTAIAFTIDGLRAKVGNGRILAVLEPRSNTMKMGVHKDTLAASWSSADQVFIFEPSNLTWSMDDLLSQSNVIAMLYKDMHMLIKSIISYAKPGDHILVMSNGSFGGIHELLTEQLAKIALNKN >NC_020514.1|WP_007635906.1|5068468_5069245_-|S1/P1-nuclease MKLNKLIMGVVAAAISFQALSWGQVGHRVTGAIAEQYLTPEAQHAIRQLLVNEDLAEASTYADEMRSNPIEFWKKTANPWHYVNVFDGKAYSDVAPPPEGNAVTALEMFAKQLKSTQTSFAEKQLALRFIVHIIGDLHQPFHAGNGLDKGGNDVKLKFFWEESNLHRVWDSGLIDRQKLSYTEWTNILSRKISEQQANQWMEVDPKVWIAESAKVRASVYPENDKLSWDYQYQNLPIVKQRLQMGGVRIAAYLNALFK >NC_020514.1|WP_007635908.1|5066543_5068460_-|alkaline-phosphatase-family-protein MQSVTEDRPTSLPKILAGPIVRRANAKQVCFWLITNKAYKFSVELFSQQPQATWFDAQLDEKQLCQVQVGTYAFVNLLTLEPNVEISSGSRVSYDISLLDKDGSRSHLCELLPSLLYSGQSYPSFLIRRQIRQMLHGSCRKPHHDSNDGLVIVDQQIELGLTGKIEPPDLLMMSGDQVYTDDVAGPTLVAIKQTIDNLGLFHEELEGATINNSREIFEHKHCFYQRPKLLPDDPSTTNTYNQFFAGKRKPIFTSVNANNHLISFAEVMAMYILTWSPEMWQRVHISDATIPEAFKQKFSKEQIIIENFVVGLDKVRRALAHVRVYMIFDDHDITDDWNLTRGWEDAVYGNLFAKRIVGNALAGYWLCQGWGNDPDKLQPLFESCRGFFTENGVIHHDLLVQNLLEWEHWHYCLGTSPKLVVLDTRTQRWRSESSLSKPSGLMDWEALCELQQELIGQEAVIMVSAAPIFGVKLIETIQRIFTFFGRALTVDAENWMAHKGTASVMLNIFRNRKTPPNFVILSGDVHYSFVYDITLRFRHNSPNITQITSSGIKNEFPDRLLKWFDRLNRIMYSKYSPLNWFTQRRNMLVRHRKPNAHTLTTLSNGSGIGLLKIDQACSKVEAQQLCASGEIVTFTKKD >NC_020514.1|WP_007635910.1|5065470_5066535_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MQPLQNDRYLRALLRQPVDITPVWMMRQAGRYLPEYKATRAEAGDFMSLCKNAELACEVTLQPLRRFDLDAAILFSDILTIPDAMGLGLYFETGEGPKFERPLTCMADIKKLPVLDPEVELGYVMNAVRTVRKNLNGTVPLIGFSGSPWTLATYMIEGGSSKAFTKIKKMAFSEPQALHLLLDKLADSVILYLNAQIAAGAQSVMVFDTWGGVLSGRDYQEFSLQYMHKIVDSLTRENDGRKVPVTLFTKNAGLWLESIAATGCDAVGLDWTVDMADAKARIGDKVALQGNMDPSMLYAPAARIEQEVQLILDGFGKGNGHVFNLGHGIHLDVPPDNAKVFIDAVHKLSKPFHQ >NC_020514.1|WP_007635912.1|5064368_5065211_+|NAD(+)-diphosphatase MIEQNISVTAETKAIWLIFSGEKIFQFTDNTGLMIETWETLSFAHAYHDQIVRIGSHRDLPCFLIDMGNEHIEHEQLSLVSMRALLMQNQTSFFGIAARAWQIALFMRTHRFCGQCGSAMQQIDWEMAMQCSRCQHRCYPRISPCIIVSIRHNDKILLAQGKPQRSRQMFSTLAGFVESGETLEQAVHREVFEEVGIQVKNLRYFSSQPWPFPHSLMIGFLADFDSGEIKVDGKEILEAYWFAPDKLPNIPPKQSIAGRLIEHTLEEIKQQKNITAPTHS >NC_020514.1|WP_051075206.1|5063727_5064201_-|transcriptional-repressor MLFLEGINVTDICQHSIADQVYKARQFCEDKGARFTLLREKVYALLLEQQGAVGAYELLDALKLTESNAKPATVYRTLDFLLEFGLIHKIESTNAFVACHHFDCNHPVQFLICDTCGDVKEIQSEGLKDTLDKQAQTVGFNIVNQTIEAHGTCAACQ >NC_020514.1|WP_007635915.1|5063196_5063661_-|chemotaxis-protein-CheX MNAEFINPFIAALINVMQTMAQIELLPGKPKKKSDNTAGGQISGLIGMVGEKVQGSMSISFDEGLVLEIMHKMLGEKPASIDADVQDMVGEITNMICGGAKNELGQKGYDFGMATPIVVSGENHTINHQVDGKKMVMPFSHASGNLYLEMCFNK >NC_020514.1|WP_007635919.1|5061548_5062742_-|OmpA-family-protein MKGRIKMKKLLILSAVAASLSVNAQTQTEDSEKWVAGFIEYYSTDKSGSGFPDYLDNGVGLGAEFGFKFSPEWATRLEVAHLNIDATPTDKSGNRVGVDALYFLPDDLMYVFGGVKITNFNDTDLMGNFGLGKHWDVGNDFKIITEVAVYQLIDGGDTHMGYKVGLAYTFGGSTVSTTSKDSDNDGVFDSIDQCANTPIGTQVDNVGCALDSDGDGVLNDVDMCPDTPAGTKVGAKGCSLILDADQDGILDEQDQCADTPMTDKVDANGCSVFTEEQVSIDIKVLFGNNSSVINNPDDAQFQEFTDFMNRYPATDTLIEGHASAPGDADYNMTVSQKRAEAVKTLLINTYGIDSVRIKAKGFGENQLLDTSNTAAANKVNRRITAKVTASKRMKVER >NC_020514.1|WP_034898795.1|5060087_5061485_+|replicative-DNA-helicase MPVKAVPQKNSDAKVEKLKVPPHSIEAEQSVLGSMLIAPDSWDKVAEVVVETDFYNRSHQIIFRAIVRLLTKSHPIDLITVSEDLEGMDELESAGGFAYLGELAKNTPSSANVSAYAQIIKERAVIRELIGVAHVIADTGYNPEGRNSGEILDMAESKVFEIAEKRTGKDEGPKNVEAVLTKTIDRLEILVKSNKEVTGVSTGYTDLDKKTSGLQPSDLIIVAARPSMGKTTFAMNLCENAMLLEEKPVLVFSLEMPAEQIMMRMLASLSRVDQTKIRTAQLDDEDWARMSNTMAMLKDKDNLFIDDSSGLTPMDVRTRARKLAREKGGISLIMIDYLQLMQVPGLSDNRTLEIAEISRSLKSLAKELEVPVVALSQLNRSLEQRSDKRPINSDLRESGSIEQDADLIMFIYRDEVYNEQSTDQGVAEIIIGKQRNGPIGTSRLTFQGQFSRFDNYSGPAVEDKY >NC_020514.1|WP_007635898.1|5074302_5074851_+|inorganic-diphosphatase MSLNAVPAGKNLPDEINVIIEIPAHSDPVKYEVDKESGAIFVDRFMATCMHYPTNYGYVPHTLSEDGDPADVLVMTPFPLLAGSVIKCRPVGVLKMTDESGIDAKILAVPADKLSTIYRGITDIDHIPELTKHQIQHFFEHYKDLEPNKWVKIEGWGDAAAAKAELINSVKLYEAEEQKPAF >NC_020514.1|WP_007635895.1|5074943_5075921_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MIKLAVIGTNWITDNFIQGALQTGRFELCAVYSRSFGQAQNFGLKYNVKYFFDDLELFASSTEFEAVYIASPNSFHKYQSIRMLKSSKHVICEKPLASDYTSAQDMYKTAEENDVVLFEAFMTPYLPNFAVLKQNIKDIGTLRKVMFNYCQYSSRYPKFLRGENPNTFNPSFSNGSVMDIGYYCLGAAIELFGEPKSVYATADILESGVDGNGSIILGYNGFDAVLMHSKTSNSFLPSEIQGEQACLQIEMISTCNKVSRIDRNGHITDLSVGQKENRMFYEANAFADQVIINKINTKSKTRSLTLAKVLTDVRIQTGVIFPTDP >NC_020514.1|WP_007635887.1|5076037_5076511_+|DUF3299-domain-containing-protein MIKMINATCLILFLFSQIIFAKEPLELFWEDMVPPDYQTPDTPLSHDGNMLQMGLDAPIVESLNGKLVKIPGFVVPLEGDNETTTEFLLVPYFGACIHVPPPPANQIVYVKFLDAVPIDNLYDAVWVTGTLSTKGWEGDLATVGYSLVGISVSPYDG >NC_020514.1|WP_007635885.1|5077259_5077655_-|acyl-CoA-thioesterase MFSEEFNVRFYETDALAHVSNTVLVGWFESGREPIFKLFNPELDLQNWSLILASYKVDFLEQIFYGQKVQVRTFISRIGRSSFDVYQELWQQQKKCATGTTTMVHFDYQSKQAVAINKSIKAELLANSYSG >NC_020514.1|WP_007635884.1|5077661_5080496_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1504873 : 1514021
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020514|1504873:1514021|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020514|1504873:1514021|1511172_1511658_+|WP_007634852.1|DBSCAN-SWA MTEDITQLAQRLGNTLSTKGWQISCAESCTGGGIGYAITSISGSSAWFKKGFITYSNDAKQELLGVSEDTLIQYGAVSAQTVEEMAEGAAKNANAEVAIAISGVAGPDGGTPDKPVGTVWFGFYINGQSISQKLLITGNRQDVRIKAIEFALFNTLMLLQK >NC_020514|1504873:1514021|1512947_1514021_-|WP_007634856.1|DBSCAN-SWA MLVSKSRYVELEQKLAHIEAEKNRYKTENEDLIAELSSVKAASVIQEESSFDKQIWPNLLDCIAQVTSIRESVLSSYEVIQNEAQSIDELNLVLDSGQKSITDIACGMEQITEKMQNMSQSMANLEAIADSINSFVVTISKISDQTNLLALNAAIEAARAGDAGRGFSVVADEVRSLASNTSKSAEEVGGLIARIKQDTESGVKFATALEESNIELSNTIAGLNNSYSGINNTVGAMKSSILGVTDRSFIQTVKLDHIVWKGEVYEVALGRSLKSVDSFVDHKQCRLGQWYNSEQSRQYQKSSSFKAIDRPHSEVHQNGITALKQLQDGNIKGSLLSFEKMEQASMQLMNILDDLTN >NC_020514|1504873:1514021|1508472_1511091_-|WP_034898537.1|DBSCAN-SWA MPSNNFSEQTPISPALQTHTPMMQQYLKIKAEHPDILLFYRMGDFYELFFDDAKKASELLDISLTARGKSGGNAIPMAGVPYHAVENYLARLVKMGQSVAIVEQIGDPATSKGPVDRKVQRIVTPGTVSDEALLEDKQDNILAAVVSVKQQSSVYFGYATLDVTTGRFTLCEPKDAEALAAEIQRTNPVELLYPEDFAFQHIIEQRKGLRRRPQWEFDFDTATKQLNQQFGTKELTGFGVTANKIGLCAAGCVMQYVKDTQRSALPHIRNIVLETESDTVLMDAATRRNLELTQNLSGGKEHTLASVLDNAATPMGSRLLQRWLHRPLTNVSILKQRQLNIKSLLNSDYPQLQSNLKQVGDMQRVLARLALRSARPRDFVRLRQAFMLLPDIQGFITDQSAESANKGLMQLANDISQFPSFADLLNNAIEEAPPVLIRDGGVIKTGYNPELDELRALSKGATDYLDELEQREKDRTGISTLKVGYNRVHGYFIEVSRSYADKVPADYVRRQTLKNNERYIIQELKEHEDKVLTSQSKSLALEKRLYDELFDILMPELANLMQSADAIAELDVLTNLAERAETLNYHCPELSEKSGIHFEQGRHPVVEHVMKTPFIANPIAVNPHRRMLVITGPNMGGKSTYMRQTALIVLMAYMGSFIPAENAQIGPIDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILNNATANSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWACAEYLALKIQSYTLFATHYFELTQLAEDLPELANVHLDAVEHEETIRFMHAVQEGAANKSYGLQVAQLAGVPRSVIQKAKHKLAELENQPVSNNQPQVRQEQQLNLLNLVDDLRLCLKQINPDDLTPKQALEYLYQLKTLAAQD >NC_020514|1504873:1514021|1511805_1512843_+|WP_034898551.1|DBSCAN-SWA MLMDDNKTRALTAALGQIEKQFGKGSIMRLGDNKTMDVETISTGSLGLDIALGAGGLPLGRIVEIYGPESSGKTTLTLEVIAEAQRNGKVCAFIDAEHALDPIYAKKLGVDVNELLVSQPDTGEQALEICDMLTRSGAVDVIVVDSVAALTPKAEIEGDIGDSHMGLAARMMSQAMRKLTGNLKHSNTMLIFINQIRMKIGVMFGSPETTTGGNALKFYASVRLDIRRIGAVKSGDEIVGNETRVKVVKNKIAPPFKQAEFQIMYGEGINSLGELIDLGVTHKMVEKAGAWYSCNGERIGQGKANSIGYLKEHPDMAKDLDKRLRELLLSKPVEADETVKKADTE >NC_020514|1504873:1514021|1504873_1506166_-|WP_007634843.1|DBSCAN-SWA MSKISKIIAREIMDSRGNPTVEADVYLESGAMGRAAAPSGASTGSREALELRDGDKSRYLGKGVLKAVAAINNDIQTALLGKDAVDQAALDKIMIDLDGTENKEKFGANAILAVSLAAAKAAAIHKKIPLYQHISELNGTPGVYSMPVPMMNIINGGEHADNNVDIQEFMVQPVGAKSFKEALRTGAEIFHSLKKVLNEKGLNTAVGDEGGFAPNLGSNEEALTVIIEAVEKAGYVMDKDITLAMDCAASEFYVDGKYDLKGEGKVFDSEGFGDFLADLSRKYPIISIEDGLDESDWDGWASLTRKIGDKVQLVGDDLFVTNTKILKRGIDNGIGNSILIKFNQIGTLTETLEAIRMAQAAGFTVVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVAKYNQLLRIEQELGDRVTYNGRKEIKGQ >NC_020514|1504873:1514021|1508055_1508397_-|WP_187292408.1|DBSCAN-SWA MVFAFKVGFSRKKYNVIAPAVSGNLVWEKLYRVQQNTLEQLIVFIPALWIFSYLVSPSIAAAIGILFIIGRPTYYVSYVKDPRSRALGFAMGFFANIALMLGGLGAAIFSLMA >NC_020514|1504873:1514021|1506181_1507813_-|WP_007634845.1|DBSCAN-SWA MTHYIFVTGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLNVTMLKLDPYINVDPGTMSPIQHGEVFVTDDGAETDLDLGHYERFIRTRMTKRNNFTTGRVYEEVLKRERRGDYLGATIQVIPHITNEIKRRIIDGSEGVDVAIVEIGGTVGDIESQPFIEAIRQLGVEVGRNRAMFMHLTLVPYLAVSAEVKTKPTQHSVKELRSVGVQPDILVCRSEVPLPSNERQKIALFTNVIDKAVISLRDADSIYKIPAMLKAQGLDELVVERFGLDCPEADLTEWEQVLYAESNPTGEVTIGMVGKYVELPDAYKSVNEALKHAGLKNRLTVNIRYIDSQDIESKGEHILEGLDAVLVPGGFGERGIEGKIAAAKYARENQIPYLGICLGMQVALIEYARNVAGMENANSTEFAPDTPFPVVGLITEWLDAAGTTESRDESSDLGGTMRLGSQLCHLLPDSKVHDMYGASEIYERHRHRYEVNNNLRGKVEAAGLKVTGLSADKRLVEVIEIAEHPWFVAGQFHPEFNSTPRDGHPLFTGFVKAAGEYFKNHN |
7 | Streptococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2053753 : 2133933
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_020514|2053753:2133933|DBSCAN-SWA 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57 | Leptospira_phage(40.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2254036 : 2286939
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_020514|2254036:2286939|DBSCAN-SWA 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51 | Vibrio_phage(35.29%) | integrase,portal,head,terminase,tail,transposase | attL 2253987:2254002|attR 2254687:2254702 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3266630 : 3316160
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_020514|3266630:3316160|DBSCAN-SWA 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MSGDNDIPINKRGSGVKRLVLISFFRAEAERRQLEAGLPSVVYAIEEPETSQHPDHQRALIDALVALSGVPRTQIILTSHSPEIIKRLKFENILLITGQDSASIRQVQEHELPYPSLNEVNYVAFDEPSSEYHNELYGYIESRGALAAYKAGKSTVAYNRLNRDGTTTQQQILSTEYVRHQIHHPENTSNPRFTAAQLNQFIEDMRAHIQANP |
29 | Leptospira_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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