Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020510 | Blattabacterium cuenoti BPAA, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
59087 : 69901
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020510|59087:69901|DBSCAN-SWA 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TTTTTATCTACGTAAGTGAAAAATATTTCTTTTTTCATCGGTTCTTCTTCTATTTTATTCATTTTAAAATTTCTTGTTCCTTTAGGGATAGATGAAAAATATTTTTTAATCAGCATTCTAGCTTCATTCATATCGAAATCACCTGATACTACTAAAACCGCATTGTTCGGAACATAGTAAGTCTTATAAAATTCTTTATAATCAGCTTCTGTTGCAGTATCTAAATCTTGATATAATCCAATAATTGGATATTTATATGGATGTTTTTTGAATAATAAAGAAGGAATAATCTCAGAAATGGCTTTTACATATGGCTGATTCTCTACACGCATTTTTTTTTCTTCTTTCACCACTTCTCTTTGAATATTAATACTTTCTTCATCGACTTTAGCATGAAGCATTCTTTCCGATTCTAACCACAAAGCTAATGGAAGACGATCAGATGGTAAAATTTCGTAATAACAAGTTTCATCATGATTTGTATAAGCATTATTTTTTCCTCCATTATAGGCAATGTACTTAAAATATTCTCCTTTTTTAATATTTTTGGATCCTTCAAACATAAGATGTTCGAAAAAGTGAGCAAAACCCGATTTTCCAGGAGTTTCGTTTTTACTTCCTACATGATACAAAACAGAAATAGAAACTAAAGGGGTTGTCTTATCTTGATGTAAAACAACATGCAATCCATTTGATAGTTTCTCTTCGAAAAACTTAATTTGATACAACTCTTTAGAACGGTTAAAATTTTTTGGACTCAAATGATTCAGTATCATAGTTATAAACATTAAGAAAAAAATGAAAATCCTATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020510|59087:69901|65480_65831_-|WP_015429675.1|DBSCAN-SWA MEIIGIVKKLFDIQKFDSGFQKREIVLTTEEPYSQNILIEFIQDKVDLLENIKPKDKIKIFINIRGREWKNPEGVIRYFNSIQGWKIEHYSTGKTSNKMTSTSPPLSSDDFDDLPF >NC_020510|59087:69901|62719_64831_+|WP_015429673.1|protease|DBSCAN-SWA MIYHYSSNSIKKIFLSSPYSDEDIENDSSSSSYGSGGSGTGSGYYGGIKSKTPVLDNFGRDLNSIAMEGKLDPVVGRDKEVERVSQILSRRKKNNPLLIGEPGVGKSAIAEGLALRIVQKKVSRVLYNKRVVVLDLASLVAGTKYRGQFEERMKAIINESEKNKGLILFIDEIHTMIGAGGTTGSLDASNIFKPALARGDIQCIGATTLNEYRQYIEKDGALERRFQKIIVHPSSEEETIEILRKIKGKYESHHNVIYTEKAIKACVYLTGRYIIDRFLPDKAIDALDEAGSRVHIKNIKVPQEIVFLEKELESIRKEKSKVVKSQKYEEAARLRDTEKRIEKQLMKAQKEWEESSKKNKEIVSEENVEEVVSMMSGVPINKIAQAEMKKLSKMIDILREKIVGQDEAVEKIVRAVQRNRTGLKDPNSPIGSFIFLGQTGVGKTYLAKIFAKELFDSEESLIRIDMSEYMEKFSVSRLIGAPPGYVGYEEGGQLTEIIRRRPYSVILLDEIEKAHHEVFNVLLQMLDYGCVTDSIGRKINFKNTVIIFTSNTGTQQLKEFGQGIGFHTQARKLNNYIQNVLEQALKRTFSPEFLNRIDDIIIFNSLTRENISKITRIELNKIIFHVSNLGYELVLLPEVIDFIQKKGFDQEYGARPLKRVIERFIKNPISEYIISEKLKKGDKISLKMDKNNDNVEVFIHQKK >NC_020510|59087:69901|67104_68571_-|WP_041178654.1|DBSCAN-SWA MFQITRTQINKFIIKIILAVIIFFHTIIMFAHIFNRNVPPPSLKRNTTINIEKPKFFQMKNGLKVLIVENHKLPLVRIGLELDYQPFLEKDKTGIKKILGQMLRSGTKNHTKEKLDDMIDYMGCSLYTSFSETSIFTMKKYLNQSVFIMSDILMNSKFDNSKELDKIIKQRIIDISLSEKDPNAILQRVRNVLYFGKDHPYGEYETHDTIKNITLYDLKKLYEKYYIPNISYLSFIGDISQKEAEKLCDLYFSKWEKKSYIDDPVLKQYVIPSKIEIDIVDIPTLTQSTICFGGPVCLKKNDPEYFSSMLANGILGGGPQSRLFLNLREKKAYTYGAYSILKSDRNIGYFSVYTQVRNEVTEKTIKDLIKEIFEITEKKISLEELNIKKKEISGQFILDFEDPNRISDLFICELKNDLPSGFYKNYLKKIESVTIDDVYQSCQKFFFTKNGRIIIVGKAHDILPNIKKLGYSIRFFDQFGSLIKKEEK >NC_020510|59087:69901|64827_65463_+|WP_015429674.1|DBSCAN-SWA MNFISKKIKIIENILDFLYPNPTPTLYYINEYTLLISIMLSSRSQEKKVNEITKILFRKINNPIDTICTPIENIKNIIKHIGLYNTKSKNIYDLSVILIKKYNGVIPKNISELKFLPGIGHKTASVFLSHVSNESVFPVDTHIHRMMFRWKLSNGKNVKQTEQDAKRFFKKKNWKKLHLQIISYAKKYSPSRKWNLKKDIIYQELLNKNLL >NC_020510|59087:69901|66790_67108_-|WP_015429677.1|DBSCAN-SWA MNPSYSLEDRIISVLKSIYDPEISVDIYELGLIYDVQISGKNKVKIVMTLTTPNCPVAESLPLEVKEKVQSMIQEIKEVDVILTFDPPWSREFMSDEARLELGLL >NC_020510|59087:69901|59850_61050_+|WP_015429671.1|DBSCAN-SWA MNLHEYQGREILNFFSIQVPDGMIASSPEEAVKVAKIIFKKTEKNSLVIKAQIHAGGRGKAGGIQIVKNLDEVYEKSKNILGKFLITPQTSKKGELVRKILLSEDVYFYESAPPIEYYLSILLNRDIEKNIILYSKEGGVNIEDISKKNPNQIYTEVIDPILGLQLFQTKKIGFNLGIHDNESLKNFSLFLLSLYKAYITFDTLLLEINPLIKTFDQKLIPVDIKMILDDNALFRHKKYNLIRDDIIDEIEREAYEAKLNFLKLEGNVGCMVNGAGLAMATMDMIKFCGGVPANFLDIGGSADLERVEKAFYLILKDKSVKTILINIFGGIVRCDTVAKGIINSFSKIHQDIKVPVVVRLQGTNDKLAKKLIQKSLFPIYSTDTLEEAADKIQEILYLK >NC_020510|59087:69901|68539_69901_-|WP_041178655.1|DBSCAN-SWA MNRIFIFFLMFITMILNHLSPKNFNRSKELYQIKFFEEKLSNGLHVVLHQDKTTPLVSISVLYHVGSKNETPGKSGFAHFFEHLMFEGSKNIKKGEYFKYIAYNGGKNNAYTNHDETCYYEILPSDRLPLALWLESERMLHAKVDEESINIQREVVKEEKKMRVENQPYVKAISEIIPSLLFKKHPYKYPIIGLYQDLDTATEADYKEFYKTYYVPNNAVLVVSGDFDMNEARMLIKKYFSSIPKGTRNFKMNKIEEEPMKKEIFFTYVDKNTKVPGVFLSYRVPKLTDEDSYVLKIIDHVLSSGESSRIMKNIVNTKQVASYAGSSLDTMEDYGIFMIYGLINPGITIDQLTKIIDEEIDLLKEKGITEYELEKQKNCFEKKFISDNYSMSGITANLSHYYLYYHNADLINTDIERYRKITTGDIKQVANKYLNKNNRVRLYNVPDNENTDK >NC_020510|59087:69901|59087_59756_-|WP_015429670.1|DBSCAN-SWA MIQAKNIYKSFGKDKILKGVNIMVKEGSIVCILGESGAGKSTLLHILGTLEKPTINKKIKPIIKINKKEILSLTDKELSILRNQKIGFIFQTPQLFPEFTVLENICLPGFINKKNVKKKAINLLKELNLYKYENSKIEELSGGQKQRVSVARALINDPKIIFADEPSGNLDIKNAEKLHNFFSFLNFKLKQTFLIVTHNLQLANMADEKLKIENGILYKIDK >NC_020510|59087:69901|61062_62604_+|WP_015429672.1|DBSCAN-SWA MNKVFSVLSEKYKPIKWNEVIGQKDIILILKKAIQENRLSQILFFFGPEGVGKNTCARILSNELNSFSELKYYSLNRFEINGLLNDSLEHIYKIINQFRFFPKLGKYNTFIINNVHMVPQCFFNFFIRFIEEKHPHVLFIFCGTEEKKIPKLILSRCQVFEFKRISTKEIFLHLRMIAEKENIEVENEALLILSKHVKGSISKAIYLFDRLILYNKNSEKKISKEFLIQKLGIIDVKYYFKIVDYLLDKKIHKIFILLDKILQNKVNSYDLIIGLTKHFRNLFLSKNYETISILKLKKEIIFSYIAQSKKMSYFFLMNALSICLRLKKEYEKFNQSYRLTIEIYIIQLAYLFDNHKNEKSFLIEEEKKNEKSFLIEEEKKNEKFSDFKEDEKIQCLQKNWIKFLQKYSGKINPIYLFFLKNEIQFQIEKNKIFLVFPSKLGNYNFLLIQTHFFKYFKEKFNYPHLEFEIVKKNSSTIEQYNLLYHKNKLIETLIERLNLKISSYEIQGKKKFL >NC_020510|59087:69901|65843_66779_-|WP_015429676.1|DBSCAN-SWA MSIFSLLFYGILALLILSIFSSFIFIVNQETAAILERMGKFHSIRYAGLNFKVPIMDNIIGKLTLKIQQLDVLVDTKTKDNVFVKVKVSVQFKVIKDKVYEAFYKLDNSHAQITSYIFDVVRAEVPKMRLDDVFERKDHIALAVKGELEGSMLNYGYSIIKALVTDLDPDEQVKQAMNRINTAEREKVAAEYQAEADRIKIVAKAKAEAESKKLQGIGTADQRREIARGILESVEVLNNVGINSQEASALIVVTQHYDTLQSMGESGNTNLILLPNSPGSASEMLNNMITSFNVSNQIGETLKKKNNSKKK |
10 | Planktothrix_phage(14.29%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
157509 : 179126
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_020510|157509:179126|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Mediterranean_phage(15.38%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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