Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020833 | Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183, complete sequence | 5 crisprs | RT,DEDDh,cas3,c2c9_V-U4,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,cas2,DinG,WYL,PD-DExK | 8 | 20 | 9 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020833_1 | 1086475-1087709 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_020833_1
|
18 spacers
spacers of NC_020833_1
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cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020833_1
The CRISPR arrays of NC_020833_1 >merge|NC_020833|1|1086475-1087709|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT 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>NC_020833|1|1|1086475-1087644|CRISPRCasFinder CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CCTATAACGAGCAATGGCATTTTGATCTACGGTAAA CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TTCTTGAATACCTCCGGAGTCAGTTAAGATAAGG CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CTTTTTCAAGAATCAAGATTAAGAGATCCAAACAA CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TCCGACACTTGCCCGTCTGCACTCGCCCTAGTGC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CACCGCTGCTACTTCGGTTATCGGAGTAGTTTGCAC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC GTGGCACAGTAACACGAGCAGATGCTGATAAACGC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC CAGCAGCCGTTGTTACCGTGGTGCAATGCTTGCG CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TACACTTATTGCCATAGGGTAGTAGTAATCTTTTAC CCAGCCACCTACGCGTGGCTGCGAATTGAAAC TGCGATTTTTGGATTTTTCGGGCGATAAATGATA CCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TCGTGGCTGGTTATACAAAGAAAAGCATTGTTGG GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTAAATCTAAAGCTAAAGCTATTTTATTAATTAAA GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC TTTACCGTTTACCGATTGGATTTTAATGCTAGAG GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC CCTAAATTGCCGTAAAAATCTGCCATTAGCTACGC GCAGCCACCTACGCGTGGCTGTGAATTGAAAC 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>NC_020833.2|WP_006248114.1|1085990_1086284_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLMLITYDISFDDPEGQARLRRIAKHCLDYGVRAQYSVFECDVTPAQWVTLKNKLLATYNPDCDSLRFYHLGSKWRNKVEHHGAKPSVDIFKDTLIL >NC_020833.2|WP_006248113.1|1084910_1085924_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLQNTLYITTQGSYLHKERETLVVEQDRKKVAQLPIHSIGHIFCFGNVLVSPFLMGFCGENNVNLAFFTENGRYLGRLQGRQSGNVLLRRAQYKKSETNPVPVARNIIAAKIQASKRVLQRQIRNHGENADLQSTITALNYSLQQLKTADNLDLIRGIEGDAAARYFGVFSHLIKENSGFHFDGRNRRPPRDGVNALLSFLYSIVGKDISGALQGVGLDPQIGFLHADRSGRDSLAQDILEEFRAWWVDRMVLSLINRGQVKPDDFVTEASGAVTLKPEARKLLFQTLQAKKQEKIIHPFLEEEVEIGLLPYIQAMLLARHLRGDLAEYPPFLMR >NC_020833.2|WP_006248111.1|1083593_1084514_+|hypothetical-protein MITSNLERSFHGLNIAQHNYKIFLDESGGNIGKLKHTPNDKKGSNFNRTISSHIGVPPVFVLGGIAQISNANLIAPDWRKLLHLQNKELKFSKIGKNFFNKLGSKELRKVLEWINENNLCIHFALYDWVYFYDVDIIDSALIESDVCSVWKYLSEKIGNSNRYKEIKDYQRKVGLDKQSDDIIYLFYIKELLHDFIINNLQWFLSEIYNNHYKKIDNQEKTVFLDNLYNMIKGSEKYKVLEFFLEKIDRNKYLSFIYDKLDSEMNEDKTFIMLVEDMSPPYQNYLNTFPLSEFYFDKGMEHVFIDY 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MITALTRYYYRLAAQEDRLTGEAKVPSYGFSEEKIGWVLELDSKGNLVNVISNLTEDKKPKPKLMSVPRPEKRTSGIKPNFLWDKTAYVLGIESNPDKATAKDQPINFAEKTFEAFKQYHLDLLADSNDEGLMAIRNFLQQWQPTHFAESICPREILDANVVFKLVGTSGYIHQREAAQTLWTSLLINQSDNAEKGLCLISGKLSPIQRTHPPIKGVFGGQSSGGSIISFNKESFTSFGKEQGSNAPVSEQAAFAYTTALNYLLRTEKHRLTIGDASTVFWAEADNTTQAEAAEGFFAALMTPPDDEQENQKIFEELQKISKGRPLAEISPELSENTRFYVLGLAPNAARISVRFWLDTTFGQLAKNLSEHWQDLALEPCPWKTPPSIWRLLLQTASLGKSENISPVLAGEMARAVISGHLYPMSLLSQLVTRIRADGDINGLRVALMKAVLQRKFRKGFIKEGVPMSLNKESDNQAYLLGRLFAVLERIQSQALGELNAGIADRYYGSASAVPFSVFPRLLSGAKHHLSRLRKDKGGMAVNLDKDLGEIIASLPENFPRHLSIDEQGRFAIGYYHQKQSYFAKKETTESIEN >NC_020833.2|WP_006248107.1|1079539_1080217_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MPNKIRLHIWGDYACFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGILAAVHWKPAIRWVIDKIYVLQPIQFESVRRNELGSKISASKISGAMKRKTVADLYTVIEDDRQQRAATVLKNVGYVIEAHAVLTKMAGEAETVTKHIEMFKRRAKKGQCFQQPCMGVREFAANFALIDDDEPLPECFLAENERDRDLGWMLHDIDFEHGNQPRFFRAEMKNGVIDVPPFYAEEVKS >NC_020833.2|WP_134983790.1|1077095_1077557_+|hypothetical-protein MFKPHGSLDWFMAGDVPMTSCIGKVEEPLIITPGVGKYKKGYGQPFDAHREKANEAIDSASSILCIGYGFNDDHLQTHLTGKIKSGVKTLLLTRGLSENARNVVKEAPNCKALIFDGDKAGTRVVSKQEETFIPNVHWWDVEFFVKEILENGK >NC_020833.2|WP_006253506.1|1075800_1076937_+|transposase MLLRKAFKFEIRPNGEQVRKMKQFCGCSRFVFNKALAWQNEQYEQDNHHKFSYTKLANLLPQWKKELVWLKDCHSQVLQQSLKDLESAFKNFFQKRADLPKFKKKGVKESFRFPQGCKIEQKNDRLYLPKIGWVRYRNSREIVGEVKNVTVSMKCGRFFVSIQTEFKQEIPTHKGGEIGIDMGIARFATLSNGEFFEPLNAFKTHKGKLAKLQKQLKNKVKFSKNWQKLKDKIGKLHHKIANCRKDFLHKISTQISKNHAMIYVEDLQVANMSKSAKGTAEVHGKNVKQKSGLNRVILDQSWFEFRRQLDYKTQWLGGFLLAVPPQNTSRTCPCCNYTAKENRQTQENFECVECGYTENADVVGAMNVLTRGQAIVQA >NC_020833.2|WP_006253505.1|1075337_1075754_-|IS200/IS605-family-transposase MKKETEIRRGRHVVFNLHVHLVFVTKYRREVFTQAILNDLHSIFATICADFEATLVEFDGEDDHVHLLVEYPPKVAISHLVNSLKGVSSRMIRKKNYPSIRKKLWGNQLWSPSYFAGSCGGAPISIIRQYIEQQQTPD >NC_020833.2|WP_006248118.1|1087893_1089369_+|ribonuclease-G 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>NC_020833.2|WP_006248814.1|1092443_1093127_+|DUF218-domain-containing-protein MNQTRDRLEKLPLFHKMQQFIIKALKIIAIFPLLGIAILLVVDSLTSYIVRDKIYTDSKQIPYREYAVVLGTAKFYSKDVINQYYKYRLEAAKQLVQEGKVNQLLLSGDNKTPYYNEPKTMTSDLLKMGIATSKIKQDYAGYTTFYSIIRAKKVYKLPPFTIISQKFHCERALFIAKFRDIDAICYAATYPEGAYQVRMREILARSAMVFSLLIGKEPESLEDIRSK >NC_020833.2|WP_006248815.1|1093163_1094003_-|formyltetrahydrofolate-deformylase MLQQHKILLTECPDDTGLVAKITNICYKHQLNIIKNSEFVENETKRFFMRTELNGIFNDETLLTDLKFTLPEGSSYKLLPKQRKRIVILVTKEAHCLGDLLMKNYYGGLDVEIAAVIGNHETLKSLVERFDIPFHLVSHENLTRVEHDKLLAEKIDEYSPDYIVLAKYMRVLNPEFVARYPNRVVNIHHSFLPAFIGAKPYHRAYERGVKIIGATAHFVNDELDEGPIIMQNVINVDHTYTAEAMMRAGRDVEKTVLSQALELVLADKVFVYKNKTIIL >NC_020833.2|WP_006248816.1|1094072_1094474_-|H-NS-histone-family-protein MSALKSLLNIRSLRALAKDLALEQLKSISEKLDIIIAEKEEEMKQEELEKLKQLESLNKYREMLKQDGLSIDELAELLADKVIKTRKALSPRPAKYKFVDANGNEKTWTGQGRTPKALQDALDSGKKLEDFAI >NC_020833.2|WP_006253512.1|1094910_1096443_+|Na+/H+-antiporter-NhaC-family-protein MNLVDYSTSLWSVLPALIALILAIVTRKVIISLSIGILFGAFMLTNSNFLDALTYIKNSVVSLVYKGAEEGLNSNNVNIILFLLLLGVLTSLLSISGSNQAFANWAQKKVKGKRGAKLMAAGLVFFTFIDDYFHSLAVGAIARPVTDKFRVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPISSWGAYIITLIAGLLATHSITGYSPLGAFMTMSAMNFYAIFAMIMVFFVAYFSFDIGSMARFERQAAHLAELDDEQIETKGHVRDLILPIIALIVATVSMMMKTGADALAESGASFSILGAFENTTVGISLVVGGVAGLIVATICIITSGNISFKNYVRAYGLGVKMMSGAITILFFAWTINGVVSDMQTGKYLSGLVAESIGAEFLPAILFVLAAAMAFSTGTSWGTFGIMLPIGASMAVHSDPALIIPCLSAVMAGAVCGDHCSPVSDTTILSSTGAQCNHMDHVISQLPYALLVATASIIGYLVVGFTQSAVLGFIATAVVMAILILLFKEKKH >NC_020833.2|WP_006248819.1|1096668_1097421_+|SDR-family-oxidoreductase MKIALVTGVTAGFGLAICKLLLQSGYKVIGTGRRAERLEELHLQFGDKFLPLAFDIQQPDEVEKALNSRPKAWQQIDLLVNNAGLALGLEPAQKADLNDWYQMIDTNIKGLVTMTRLVLPEMVERKSGHIINIGSIAGTYPYPGGNVYGGTKAFVKQFSLNLRADLAGTKVRVSNVEPGLCGGTEFSNVRFKGDDEKAAKVYENVQFVRPEDVANIVLWLNQQPEHVNINRVEVMPVAQTSSALNVARNI >NC_020833.2|WP_006248820.1|1097432_1098623_+|tryptophan-synthase-subunit-beta MSDTLLNPYFGEFGGMYVPEILVPVLKELEQAFVDAQQDPTFQAEFADLLKNYAGRPTALTLCRNLTKGSKTKLYLKREDLLHGGAHKTNQVLGQILLAKRMGKTRIIAETGAGQHGVATALACAMLGMPCVVYMGAKDVERQSPNVFRMRLMGAEVIPVQKGSCSLKDACCEAMRDWAANYDTTHYLIGTAAGPHPFPTMVREFQKMIGEEIKRQILAKEDRLPDAVIAAVGGGSNAIGMFADFIEEQSVKLIGVEPAGKGIETGEHGAPLKHGTTGIYFGMKSPIMQDKDGQIEESYSISAGLDFPSVGPQHAYLNATGRAEYVSITDAEALEAFQALAKNEGIIPALESSHALAYALKMIKQNPEKEQLLVVNLSGRGDKDIFTVDKILNGGE >NC_020833.2|WP_006248821.1|1098624_1099431_+|tryptophan-synthase-subunit-alpha MSRFDTLFTALKAKNEGAFVPFVTLCDPGFERSFEIIDTMIKNGADALELGFPFSDPLLDGPVIQAANKRALDGGYSTDSCFELIAKIRAKYPDIPIGLLLCANLIFVPTAEVFFQRCQQSGVDAVLIADLPVFAAQEFVPTAEKYGIQPVFICPPNADQNTIERIAQLTQGYTYLVSRAGVTSAENQAHASNLDNLVESLKQAGAAPILQGFGIAKPEQVKEALRLGADGAISGSAIVKIIERNLADQANLLKELAEFVQVMKAATK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020833_2 | 1163483-1163597 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020833_2
|
1 spacers
spacers of NC_020833_2
>2.1|1163511|59|NC_020833|CRISPRCasFinder ACCTAAAAAGCTCCCTGTTATTGTCATTAAAAGCAAAATGGATTTATTTAGTGCAACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020833_2
The CRISPR arrays of NC_020833_2 >merge|NC_020833|2|1163483-1163597|CRISPRCasFinder ACAGTGGCGAAATTATTACGATTTATCCACCTAAAAAGCTCCCTGTTATTGTCATTAAAAGCAAAATGGATTTATTTAGTGCAACAAACAGTGGCGAAATTATTACGATTTATCC >NC_020833|2|2|1163483-1163597|CRISPRCasFinder ACAGTGGCGAAATTATTACGATTTATCC ACCTAAAAAGCTCCCTGTTATTGTCATTAAAAGCAAAATGGATTTATTTAGTGCAACAA ACAGTGGCGAAATTATTACGATTTATCC
>NC_020833.2|WP_006248186.1|1162073_1162991_+|baseplate-assembly-protein MSEIVDLSKLPAPKVLEELDYETLLAERKAKFLSLYPESERAVMAARLALESEPITKLLQENCYLQLLERQRINSAAQATMLAYATGTDLDVIAANFNVERLVVQAEDLTASPPIVEELEPDDDFRQRVQLKIESVSVAGPRKAYTFHALSANGKIADVSVISPQPAYVTVTLLSRDGNGAVASEIINAAKIALNDEEVRPIADRVTVQGASIVEYEINAVLHLYRGPEKEPILKAAKANLEAYINQTKRIGRDVTHSGIHAALHVAGVQNVEILQPRTDLVLTPYQAGYCVNYTLNVEVSDEYS >NC_020833.2|WP_006248187.1|1161741_1162077_+|hypothetical-protein MNRETGEQLEDEVEHIKQSIKDILLTAKGSRVMRRTYGSNLYKLTDKPIAASLIMQLSAACVMALQQWEPRIAITRFKVEFAEDNYNKLICTLDFTLKHRKISIKGMRFTL >NC_020833.2|WP_006248188.1|1161136_1161742_+|phage-baseplate-assembly-protein-V MSEPNHAEQIRRLDNIIRLGTIAEVDLTTATARVNSGGITTDFLPWLTFRAGTSQTWSAPTVGEQCVVLSVSGEFTTGVILFGIYTQNAPSQSADEHLFRFSDGAEISYNTASGQLTVKNCKVVIVQATESITLDTPTVKATKNVVIGGNLSVKGTTSSQGAISTQGAVTAKGDVSGAGISLGSHHHIEQGDGRPTSGAKP >NC_020833.2|WP_006250779.1|1160720_1161008_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MAKITIKPQALSQFDEIVKSVIEFTGFETSGIRLQSDIFDKIEQIAFMPLSGRAREDGTRETFVRRYRIVYDYDRQADEVIILAIIHSSRLYPRP >NC_020833.2|WP_006253549.1|1160551_1160728_+|hypothetical-protein MFKEKGYDEFVNECVRKGREEHKAGLGFTLEQSRLHIKKTIEQKSQELNEFQREVVYG >NC_020833.2|WP_006248190.1|1157574_1160487_+|hypothetical-protein MSNNLKIQVVLSALDKLTAPFKSVVKQTEKLSQSLKVQRDELKALEKTQSKMQSFKKMDDSIKKSNETILKQTKHLDNLKNKISQMKNERIELKVKMDAKKREFQQITKGGSAWSARAAFLDKDFEKMQREYEKLGASISSVSRKRTEENRALKDSRHQQAKQLLYFRSLRRELRASGINIKAFAQSETNLTDKIAKANQLIDQQKAKLEKLNAVKARNEKYWATVEKVKNTSERLHNLGQRSMISGAAISAPVVGLGKGVVGMAQTAGKFEQFNAILEVTEGSAEKAKQSFDWVKQFAVDTPSNLDEAMEAFVKLRAYGLDPTNGLLQTLGDTGAAMGKPVMQAVEAIADALTGENERLKEFGIKGSVVKGTNIIEYAYTDKLGKQQVAKVNKNNRKEIEQTLTRIFNEKYAGAMEKQAKTLVGIWAKIEDYWTNFQMQVMESGAFDWIKNKLQWVLDSLDKMAENGELQKWAEDVGAVIQETVQGLWAFGEKIIEVVKWLASLARENKGLIATFVKWSAILGSSLTVLGAFAVVASFALYPVARLALGIGKFTGASTLLNKALFDSNDKFRLFNKSLYSSGTTAAFVKSKFNQLATLPNVLGSSFNKLGGGIKMLIPQLKTKVFWLNMLKGILGKLWSAIRFIFSPLKLLLGIFSPIGLAITAISVAGVALYRNWEKVRAFFGGFLQGLSKGLAPVLERFKPLGKLFETISNWVKSTFKWLSDLLTPADKTSESLDKASSAGEKFGLALAGAIDLVTSPVQWLVDQFKWISENMPSWDTIGEGVKKAATAIVPTEHAKQITKTAEMSNNMYDPNYTPPQLEQKWIGGLVGNGKGRGFATGGYTGNGGKYEPAGIVHKGEYVMTKEATARLGVANLNRLNYGKVAGLTALASSVAFAQPMPAVKIDSRPPLTASQPSPTVAPVSQNIHITINATGGQDPQAIARLVAMELEKQQRQAQARARSSLRDRG >NC_020833.2|WP_006248191.1|1157257_1157536_-|hypothetical-protein MEILFILLGLIGFGALLAIGFTTFAAIFGVVTTVFLSLLSLLANMVGLSIIVILISLYVLLPLNTFILIALIFSAILGFLCWYHSDRQSVNQ >NC_020833.2|WP_006248192.1|1156748_1157207_+|phage-virion-morphogenesis-protein MSEPIEQVKTAFDSLLNNISKPRRRLMYQQIGRELARSQRRRIKAQQNPDGSAYEPRKKPKKGVKSKIKSGKMFDKITQPRFMRLRLESEGVSLGYEGGDAVIARIHQQGLIGRVRKDWDLKVKYASRELLGFTDDDLQMIEDYMINILAGS >NC_020833.2|WP_006248193.1|1156270_1156756_+|phage-tail-protein MIKPDRLRAVLTQTIDIFQANPEKLILQYDKGKIKSKGSQSHSFEYHYDLELIVVDFPYHPDVLFVPVLNFVRNEQWELLQNPELQDKIEFEIDHNNHESYDIYIRLPLTERVIVKEQDGHLTATHADEPNLADVSPFTRLTEYEVYLKDELIYQWAEPNE >NC_020833.2|WP_006248194.1|1156052_1156274_+|TraR/DksA-family-transcriptional-regulator MSDQIDRANELAEKAREAALAKILQNQTACTSLFECEDCGEPIPEKRREMVIGCTRCIECQTIYEHKQKGYRR >NC_020833.2|WP_096864244.1|1163612_1165892_+|phage-tail-protein MEQKYKTILTHHGERVIVEALANKIPVPLKEMAIGDGNGSSITPSASQTTLVREVYRAEITDLLEDPQNRHQMIAELLIPENVGGFIVREIGLFDEQGGLVAVANCPENYKPVLEQGSGKVQYYRMILQVSSSDAVTLSINNNIVYATRTEFNEFVNNLSSPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFGAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVQILGNKTGKLVLGAGIQQAEAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFIFGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNIFRHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPFLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVYLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NC_020833.2|WP_006248181.1|1165892_1166135_+|hypothetical-protein MTKKHYCTGWRSAPANINSCCHQHDRDYGIRGTVTRADADKRLRECMIKNGNPIRAWLFWLVVRAFGWRFYKNKEIKIEK >NC_020833.2|WP_168926376.1|1166118_1166397_-|hypothetical-protein MLFIKKQAIHKRIPKTPTLFRLFRKHCTTVTTAAGKGSGACLNCATLCLLACLLACLLACLLACLLACLLACLLACLLACLLACSIIFISQS >NC_020833.2|WP_006248179.1|1166572_1167754_+|phage-tail-sheath-protein MSILDTYLHGVEVVEVNAGGVTISTAATSVIGVVCTGDQADAETFPLNTPVLITNPLNYLEKAGSTGTLRRTLNSIGSIVKTPTVIVRVAESDDSDTLTANIVGTQENGKFTGIKALLTAQSTVFVKPKLLCVPQHDNQAVATELLSVAKKLNAFAFISDNGATTKEQAYTYRQNFSQREGMMIFGDWKSYNTDKKAYDTDYAVARACALQAYIDKTVGWHKNISNVELDGVTGITKAVEFDINESSTEANYLNEKGITICLNHNGFRYWGSRTLATDTRWAFQQSVRTAQIIKETIGAGLAWAVDMPLTPLRVKTMLEAINNKLRSWASGDDPRILGARVWVAEEITADIIKSGKFVIKYDYHWIPSLESLGLEQRVNDEYVVDLVNTLKAL >NC_020833.2|WP_006248178.1|1167762_1168269_+|phage-major-tail-tube-protein MGLPAKLKNFNFSVDGTSYLGETTEVTQPKLAMQLEDYRAGGMIAPVGVNMGLEKLELEFKIGGHEEDLLKLFGGSISGNAFRFNGAYQHDDDDSVDAVELVCRGRIAEIDEGSSKAGDDTEHSYKASLTYYKKTVNGVDIIEIDTLNQIYIVDGKDRLAEIRKAMGL >NC_020833.2|WP_006248177.1|1168347_1168662_+|phage-tail-assembly-protein MKKVTLKQGILRGEKRITEIEVRKPLTKQLRGTNLTSLMQLSVDEWCIVLPRITTPKLDKADFATMSAADLLKLSGKALDLMSEDFDEADEEDSEEQGKGEILA >NC_020833.2|WP_075270712.1|1168685_1168802_+|GpE-family-phage-tail-protein MADIATVFHWTPNTFDEMTIVELGQWREKARLRNGVES >NC_020833.2|WP_006253663.1|1168865_1169213_+|hypothetical-protein MEIKTVTFSKVITAFIFHIITLFVFTQLNEQAQATFMFFWWFFISLRFILVVGIMCVGIEELKIQEYRQTKAYACFSFISNFALCLQFVYFEHLIAAILFLISYIIYHSQTVTIK >NC_020833.2|WP_006248175.1|1169214_1169652_+|phage-tail-protein MLQQFAMMSLGYFVFMRLTIPYQDTSREMNWSHVQNDVVGAMPKSQFTGKAGETMEISAELRPEITGGKMSILALEMMAEQGSAYPLISGSTFMVLGWFVIDRISEQETTFFADGTPRAISFSMSLKRVDDSLLANIIDEVAGFI >NC_020833.2|WP_006248174.1|1169651_1170890_+|phage-late-control-D-family-protein MDFLTELTNHNHRTPAVSVTVRPKPSKDNEGEKAKDISTLITHRLIQLTLTDNRGFEADQLDLELDDTDGLLALPSRGAILSVGLGWQNSPLTYKGEYTVDELTHDGPPDKVTIRARSADLRGTLTNRHERSFHRTTIGKIVKQIAEENKLKPMVGKEFENEEVKHIDQTNESSINLLQRLAEQFDAIATVKNGNLIFIKAGNATTASGKLLPLFRITRSSGDSHSFSIAEGDNYKAVKAYWHNTQTGKRGEVTWDENSQVKKVTKPTMRKKTKVKRGADGKPIKGKDGKSIKETVFVKGKGRQVNAVVQSKPIESDSEAIKTLPHTYATAQSAINACKRNFEKLQRGVATFSLTLAEGNAELIPELPVQVSGFKAEIDSNEWIISQVTHSLNKGGGFTTALEMELKPKSED |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020833_3 | 1563147-1563221 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020833_3
|
1 spacers
spacers of NC_020833_3
>3.1|1563170|29|NC_020833|CRISPRCasFinder AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA |
DinG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020833_3
The CRISPR arrays of NC_020833_3 >merge|NC_020833|3|1563147-1563221|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAAAGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGACCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA >NC_020833|3|3|1563147-1563221|CRISPRCasFinder CCTAGCGGTGGCAGGCACCAGAA AGACCTGATACTAATCTAGGGTATAAAGA CCTAGCGGTGGCAGACACCAGAA
>NC_020833.2|WP_006248316.1|1561788_1563030_+|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NC_020833.2|WP_006250513.1|1561585_1561789_+|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NC_020833.2|WP_006253491.1|1560261_1560777_+|single-stranded-DNA-binding-protein MAGINKVIIVGNLGNDPEMRTMPNGEAVANISVATSESWTDKNTGERREVTEWHRIVFYRRQAEVCGQYLRKGSQVYVEGRLKTRKWQDQNGQDRYTTEIQGDVLQMLGSRQGNDMGGQQGGWGNSAPAGNSYNQGNSNYGYNQTQSAAPQSKPAPQPEPAMNNFDDDIPF >NC_020833.2|WP_006253492.1|1557278_1560107_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MQHIDIRGARTHNLKNINLTLPRDKFIVITGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLSLMEKPDVDHIEGLSPAISIEQKSTSHNPRSTVGTVTEIHDYLRLLFARVGEPRCPDHDVPLAAQTISQMVDRVLEEPEGKRLMLLAPVVKERKGEHVKLLENLTASGYLRARIDGEICDLSDPPALELQKKHTIEVVVDRFKVRADLATRLAESFETALDLSGSTAIIADMDDPNAEEIVFSSSFACPHCGYSLHELEPRLFSFNNPAGACPTCDGLGVEQFFDAKKVVQNEEVSLAAGAIKGWDRRSFYYFGLLKAVAEHYGFDLETPFGQLPKKYQNIILNGTKEEIEFVYVNDRGDKVKRKHAFEGVLNNMARRYKETESNSVREELAKYINNRPCMDCEGSRLRREARYVFLDKTNLPMVSEKSIGEALTFFEELKLAGQKEKIAEKILKEIRERLQFLVNVGLNYLSLSRSAETLSGGEAQRIRLASQIGAGLVGVMYVLDEPSIGLHQRDNERLLNTLVHLRNLGNTVIVVEHDEDAIRAADHIVDIGPGAGVHGGQVIAQGTAAEIMQIEESITGQFLSGKQKIEIPAQRVPYEPTKLLTLSGASGNNLKKVKLEIPVGLFTCITGVSGSGKSTLVNDTLFPLAQNALNRAENSDVAPYESIDGLSHFDKVIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGLFTPIREIFAGTQEARARGYNVGRFSFNVRGGRCEACQGDGVIKVEMHFLPDVYVPCDHCKGKRYNRETLEIRYKGKTIHQVLEMTVEEAREFFAPMPMIARKLQTLMDVGLSYIRLGQSSTTLSGGEAQRVKLATELSKRDTGKTLYILDEPTTGLHFADIKQLLGVLHRLRDQGNTIVVIEHNLDVIKTADWIVDLGPEGGSGGGEIIATGTPEEVAKDKRSHTARFLKEILAKG >NC_020833.2|WP_006249416.1|1555453_1557187_+|C4-dicarboxylic-acid-transporter-DauA MLNKWFLTKNAFLAVKPFSALKDALNAGYGKQHLIRDIISGLTVGVIAIPLSMALAIASGVPPQHGLYTAIVAGIVIALTGGSRFNISGPTAAFVVILYPVTQQFGLSGLLMATMLSGGILVLMALLRLGRLIEYIPLPVTLGFTCGIGIVIATLQIKDFLGLSIEKMPEHYLGKLEAIFSALPTINWADTLVGVVTLLVLTRWHKLRLPIPGHLPAVFIGTLLSLLLIHFGQNVATIGSAFHYTLSDGTTGYGIPSVLPEFVLPWNLPNAEGNRIDWNLTTIQALLPAAFSMAMLGAIESLLCAVVCDNMTDTKHHSNNELLAQGLGNIASPFLGGITATAAIARSAANVRSGAVSPISSVVHALLVLFALLFLAKALSYLPLSSMAALLLVVAWNMADIPQIIQLTRRSGKNEIAVLLTCITLTVLFDMVIAITVGVLLASLLFIRTIAEMTKSFEMAHPTDLNDVLVYRISGPLFFAAADNLFADLHNKTVHTDHQIKHIVLQCDAVTVLDAGGIHALTRFVQHMLPHQQLHLCNVQFQPMRMLVRSQKTVNEIPQIQFSSDLESAFDKIRQAN >NC_020833.2|WP_006249414.1|1554279_1555212_-|ABC-transporter-permease MDSLIHFLSAFLTNITWIGALELGLIYSLVALGVLISYKILDFPDLTADGSFPLGGAVCVISILNQVDPWLATLYGTLAGAVAGMVTASLHIGFKIEKLLASILMMIALYSINLRIMGMPNIAILGETTIYDVMPIESDLQLALVRLVMALLVVIIVKGLFDLFFATEIGLAVRATGTNSRMAKAQGIAINKMTILGMAISNALIALGGALYVQSNGGVDISIGVGTIVIGLAAVIIGEAIFSVKRIIWLTFAVIIGSILYRFFIALALNNETLNGIGFGPQDLNLITALLVVIVLAVPRIKHKLLGKRG >NC_020833.2|WP_006253494.1|1553480_1554278_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELNNLFITFNKGTAIENPVLRGLSLKVEQGEFVSVIGSNGAGKSTLLNAISGDCAVDSGEILIQGNKVNQSTTWQRANQVARVFQDPMAGTCESLTIEENMALAYQRGRKRGLGFAIKRQMRELFKDKLALLGLGLENRLTDQMGRLSGGQRQAVSLLMASLQPSNILLLDEHTAALDPKTTDFVLELTNKIVREQKLTTLMVTHSMRQALDYGDRTVMLHQGQVAFDVSGEQRQKMDVPDLLQLFQQSRHEQLSDDGLLLGN >NC_020833.2|WP_006250508.1|1553172_1553394_-|hypothetical-protein MLSIFKTPVEKETLDDWAKISVDVAKVAILAIPVILFGKEPTLIKLTNLALLVLSIYVFLTLGRKLRQLKEVL >NC_020833.2|WP_006253495.1|1551064_1552990_-|ATP-dependent-DNA-helicase MTKYDDKIQHAFSENGLLSQNISGFRPRQAQLEMAQVVAKAVKFATPVVVEAGTGTGKTFAYLVPALLSGKKTILSTGSKNLQDQLFNRDLPTIQKALKYKGKIALLKGRANYLCLERLDQVTAMGVLGDKSVLTDLKKVSKWQNATKTGDLSECITIAEDSPILPQLVSTTESCLGSDCPHFKDCYVVQARRKAMEADVVVVNHHLFCADMAVKKTGFGELIPEAELVIFDEAHQLPDIASQYFGQSLSSRQLFDICKDTNIVYRTELKDLSQLGKAADHLTKVVQDFRLLMGGEGQIRGNLRELFRDKKVVDGLVKVAENIDFLSEVAKKSLGRSETLDKIFERLAEVKVQLKKLMDTSVTGYCYWYEANGRSFGLHITPLMVADKFGEQLKNQQIGWVFTSATLEVGGKFDHFCQRLGIENAEQLVLQSPFDYQHQSLLCVPRYLPDTNKSNTLTALGQLLKPVIEANKGRCFLLCTSYYMMRGLADFLREHSSLNVLLQGETSKSRLLEKFVKEDHSVLVATQSFWEGIDVRGDDLSLVIIDKLPFTSPDEPLLKARMEDCKIQGGDPFNDIQIPEAVITLKQGVGRLIRDVTDRGVVIICDSRLVMRNYGQTFLKSLPPSRRTRDLGNVIQFLKQK >NC_020833.2|WP_006250186.1|1550625_1550991_-|CidA/LrgA-family-protein MLSTLLRMVASLALLFVMLYLGKLIVYLFPIGIPDSILGMLILFGCLVIGIVKVEWVIPSAKPLTRYITLFFLPICVELIEHLELLRQNLNTFVLATALSTLVSVVAIGVFAQWIFHYKRG >NC_020833.2|WP_015587044.1|1563433_1564474_-|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NC_020833.2|WP_015484309.1|1564650_1566342_-|D-lactate-dehydrogenase MSNNSLISQLTEIVGQSYIITDPTKTEAYRSGYRFGTGSAIAVVKPTTLLEYWNVLKACVAADVIVISQAANTGLTGGSTPSGNDYDRDIVIINTMRMNGIQLINNANQVVCLPGSTLNELELLLKTHGREPHSVIGSSCIGASVIGGICNNSGGALVQRGPAYTEMALFAQLNEDGTLELKNHLGIDLGDTPEEILENLQAQRYQRKDIQQACGKGHDHAYCNHVRQIDEDSPARFNADPARHYEAAGSAGKLAVFAVRLDTFPLEKDTAVFYIGTNHTDTLNDIRRYMLANFEVLPISGEYIHRDAFDIAADYGKDTFWVIKKLGTHRLPQLFSLKAKVDRMAKKLTFLPANLSDKILQAISKMLPQHLPESLRDYRNQYEHHLIIKMGGKGVQEARDYLARYFADTQKGGYLECNPTESQAAMLHRFAVASAAIRYRAIHDKEVEDIVALDIALRRNDKAWFEVLPPEIESQITHKLYYGHFMCHVFHQDYIVKKGVDCLALEHQMLELLDKRGAQYPAEHNVGHLYEAKPTLRKFYRQLDPTNSFNPGIGQTSKKKYWK >NC_020833.2|WP_006253290.1|1566553_1567651_-|IS481-family-transposase MFYSSNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNIKNRVDESTEKAVVQFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGFCLCRWFLSLQVVFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLTALEKLVAEQGIILSEPQIQALERKKEDEIACGEIETAHPGYLGSQDTFYVGNIKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAITAADMLNDKVLPFFESQRLPMLRVLTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKQPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKRIYMDLEALQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMETLVDGKRIWAEKNLSSN >NC_020833.2|WP_006253291.1|1567980_1568697_+|DUF3800-domain-containing-protein MYLMYVDESGSTTDPTQKYFVLSGIAVFERNTHWIEKKMNVIASQFCQYSEGSDPYFYELHGSPMRSGKSEWRGIPMSERINAIQDCLKLVQSNNIRIFAAVIEQGYSSGQDTITECFEQISSRFDMYLSRLHAQGNTQRGISIFDKSSTEKSIQALARTFKNSGHTYGKLRNFSEVPLFLDSKSSRLIQLADLVSYAIFRHYEHNDSSFYDIIRNNFDYHNGRIHGLYLRNKEDIIS >NC_020833.2|WP_006248924.1|1569659_1571645_-|DNA-binding-domain-containing-protein 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MNPQSNTQPKFDLYQEVTDKIIAALEQGTAPWLKPWDSVIPYGGMPCNAISGRLYSGINVLLLWLSAAEHGYIQRKWITAKAAIEAGGHVRKGEKATLAVSYRPYDREKTDDDGNLVLDDDGNPVIEHLASIKKHCLFNIEQCEKLPQDWYETVETPEQLTDENQYAIFEEIRLMLKGMDLQVMVKPSNQAYYHPRNDHIVMPEMKQFHSPQKFHSVLLHEMTHATGHQSRLARDGIVSGKARFGNKVYAFEELVAEMGCAFLCSHLGFADVPQNASYIESWIKVLREDKRAIFRASGKAREACQYMLDALNIAQLADKYEVFEEAA >NC_020833.2|WP_006248920.1|1573512_1573668_-|hypothetical-protein MEPRTVKVIYDDGDYFFTLINADEQTIRNYYAIGSSIGFDNTRKIVAVEIL >NC_020833.2|WP_006248919.1|1573681_1574095_-|hypothetical-protein MKNEHNLEQLKYIWDNRNLENKVYQYLFHICIEPMKKGDWNRYTIWLNFHGNLINVSDVVYRVVESQKLKDDIKIWYDKQYYCRPTKVETTGFISIFLHLFYEGIARILLEQGMITETEAAEKSYNFRAANCFQRLL >NC_020833.2|WP_006248918.1|1574209_1575052_-|hypothetical-protein MSDSVLNTYFKHALVKAGFPDTLDMEYSLSHCQGDGVAFYGRLGTDDLIQLFNHLNPQKRKQKMFANLLTHIESWETHDDIGFEIIRNRFGYRYSHWNTMELYAKTADQLVFFNDSDARRNWYFPTSKVDKYKALWDGFIEDLEQYIKDISREMESVGYQIIEASPYQTETVFKFNTEKYLVELQRKPSEFYSELVDWAFGDMCDFEAAIEQICQGQLCYADFEATVTDKKSEIQLGLARLSGISYSPNDRSFSGYRQELIGEAIASARHNAARFAYLHA 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NC_020833_4 | 1787373-1787451 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020833_4
|
1 spacers
spacers of NC_020833_4
>4.1|1787398|29|NC_020833|CRISPRCasFinder AGTTTTTCTGATGCTTGCCATCTGCTAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020833_4
The CRISPR arrays of NC_020833_4 >merge|NC_020833|4|1787373-1787451|CRISPRCasFinder CCTTAAATATCCTAGATTAGTTTCAAGTTTTTCTGATGCTTGCCATCTGCTAGACCTTAAATATCCTAGATTAGTTTCA >NC_020833|4|4|1787373-1787451|CRISPRCasFinder CCTTAAATATCCTAGATTAGTTTCA AGTTTTTCTGATGCTTGCCATCTGCTAGA CCTTAAATATCCTAGATTAGTTTCA
>NC_020833.2|WP_006248322.1|1786698_1787253_-|hypothetical-protein MRKQAKLEKYIHLIEDAAKFFNSYFINKKVIYRTKTQEISIIFKRSNFMHLCGIKYTDGASEFFNAAISNNLDLAKMNVKSDGTTFLKLSLLNSVSFLLTPEMCLTEGGIYLNIRFDKSLKTKKQIFALTLINQNHVFIPNSLLNLKKMNDFPNGERVVSIKSIGLLTNEEIVFYGGCRRSDLI >NC_020833.2|WP_006248324.1|1786200_1786431_+|hypothetical-protein MSLLKKAQTFISIFNEVRAKNEAQRQSSNNLNVALKNAAEMRAEMNGFSLKPQKRSTYFADHYGCGIHAVETYDNE >NC_020833.2|WP_006248326.1|1785762_1786080_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MLSRKEVLMTRRASMNLQQIIRNVVEYTYSYESGDKLSAEIHNTLDNLSYFPRIGVIGSVENTRECFCRGYRIIYRETENQVQILAIIHCRQQYPTDYYRSAFKA >NC_020833.2|WP_006248327.1|1785611_1785770_+|hypothetical-protein MTEEYQNFLIEQVKQGLDDIENGRVISLEESRQLCQKTIYETLQELQGAVYA >NC_020833.2|WP_006248328.1|1785402_1785558_+|hypothetical-protein MLFKEKGYDEFLTQKIAKGRAELESGKGIPLEQATLLVQSTIEETAQELDD >NC_020833.2|WP_006248329.1|1785007_1785265_+|hypothetical-protein MICHADPEYVKYNYAGLWEKGSDGTFFYNYQQFMPEVEAKESLREQEPELDDGYNEEEYSEEEYSDENDASDENDNYDETYDDNF >NC_020833.2|WP_006248330.1|1784817_1784994_-|hypothetical-protein MAYVRIYQGEAYGWCAEKGEANTECPEALLVSLTGDIFEAVGGDKLKGAKKWQPYKKE >NC_020833.2|WP_006248331.1|1784655_1784814_-|hypothetical-protein MDTTQKRVALDTILQCLHFAEEKGAIPPIPEDWRYEMTGRSMGIEQIPNQKL >NC_020833.2|WP_006248332.1|1783484_1784573_+|AAA-family-ATPase MGIMSKSISIFNHKGGIAKTTTAFNVGWSLANQGYQVLLVDLDSQCNLTGLVLGYDQCKEDSDLALFYNNRHHLTMEGIVEALINGQSPDNYLSGNVGQITQTLNPNLFLLPGHLNVSELDSQISVSLKIAAGVPATRNIPGNLPTLIKKVAEQNNIDYILYDLSPNVGGLNEVILMSSDYFIVPTSPDFFCWQAVGSLAKNIRKWHNELKAFKELNGFNQSSYAIKNKPQFLGTIQQRYRPRKGQPAKSFEKWIERIRNEVITNFVPVLKTIDCAIDDTAIYAALKSTNSDLEPFDLAHIADFNSLIAISQELRVPVFSLTKEQIKNSGQFGHALNTMDESKENFDQEFQSLAERIIQLTN >NC_020833.2|WP_006248333.1|1782988_1783420_+|hypothetical-protein MKKMAIVALSAFFSMNAFANNNVVYSCTTTDNQTLKVTKEGGNYVYSHGNTTFKNPVKEALKNPASEIAGGSQFTTISLELRNAGKSYIVGHIEADPKSPFEASVQIQDIKTGNDITSFECRSDKPIRHNFDRKLMRKSGFAA >NC_020833.2|WP_020828842.1|1787570_1788161_-|hypothetical-protein MLFSSEDNYQVIINLKKADYPKNEANFITMTLNKKFGDAKFSGANHYLRCASFFNKKSTNNNEKSVLVDFTNTKTEEDNKCYFDNLLSSYKNNNVKLEPLDIKIIDELGDDKAVIAQKEIQAEIALCKRIFKQLDWSAVDFRIVKRLYRKGFSENEIAVALVRFTDFEDRHCDSHDYLTRTITKAIQNYQQCSKAC >NC_020833.2|WP_041447934.1|1788300_1789341_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSKELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NC_020833.2|WP_006252261.1|1789407_1789701_-|YfcZ/YiiS-family-protein MSKTMQQKAADAHNMCKLKGDSMLDNSDRQIAFEAVYDSEEIAVQAVEFFTQKAKSVETEPCDIQSEITPIIDGFLMKMWITFSCQAEVILFQMAVR >NC_020833.2|WP_015484369.1|1789702_1789957_-|luciferase MKAEIVPHFGPVSFQQNALYNQEKPVVRQMTACSLIGSRESIEQQLKSLKARIEIDEIMAVSYIFDEQKQHQSYTWLKEIADKV >NC_020833.2|WP_015484370.1|1789966_1790743_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MTKLSILNLVPIREGQTAKQAVDSMVKLAKHAESIGIERYWIAEHHNMKNLASSATQLLIQHALSHTEKLRVGSGGVMLPNHSPYIVAEQYGTLETLYPNRVELGLGRAPGTDMRTATALRRNAQSLPFPDEISELKGYFEGTNSVSAYPAQGLNVPFYILGSSPESAYLAAERGLPYAFASHFAPRFMDDAVRIYRTHFKPSEVLDKPYVILGVNAIAAETDQEAEQLATTQTQFFLNVVTNAQNYLQPPVESDDKV >NC_020833.2|WP_006248321.1|1790826_1791465_-|thioredoxin-domain-containing-protein MKKLALKTAFVALSALFTFNSTAIAADPTAGKEYIEVRKAPSAQKEVVEFFSFYCPHCYDFELSYKIPSQIKEKLPSDSKLVQYHVNFLGRQSEDLTRAWALAMALGAEDKVKTALFEGAQKDAFKSMDDIRSVFLANGITAEQFDSGINSFAVNGLVNKQVQLAEDFQIRGVPAFFVNGQYQLNLEGFADSSSTNDFIKRYVDAVVFLSKK >NC_020833.2|WP_006248320.1|1791528_1791798_-|DUF1040-family-protein MKCERLEELLELLGEHWRKNPDLHLIDILQQLSVEVGEPDNFKALSDEVLIYQLKMRNAGKFEPIPGIKKDYEDDFKTALLRARGILND >NC_020833.2|WP_006248319.1|1791884_1792979_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase 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>NC_020833.2|WP_006252258.1|1797378_1798152_+|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MNLSNALKLIKYNELDVLEVNHNKFKAKIALQGAQLLSWQPYNAEQDVLWLSEIEPFRIGSAIRGGIPICYPWFGSIKEPAHGTARIQEWRLVEHTCSDENVGLVFALENKAKMEMMLGETCELYFTHLDPEPAQLALHSYFNIGDIEKVEVQGLPTRCFDKLTDQEVEVPSPRKISENVDCIYPAQAVNFIQDFANQRTIKVEHINATETVLWNPWHNTVSAMTETAYQNMVCVETARINTLLQQNETLGVRVLVR |
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Consensus repeat of NC_020833_5
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1 spacers
spacers of NC_020833_5
>5.1|1799582|29|NC_020833|CRISPRCasFinder TCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020833_5
The CRISPR arrays of NC_020833_5 >merge|NC_020833|5|1799559-1799633|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTAGGTCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCTTTCTGGTGCCTGCCACCGCTAGG >NC_020833|5|5|1799559-1799633|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTAGG TCTTTATACCCTAGATTAGTATCAGGTCT TTCTGGTGCCTGCCACCGCTAGG
>NC_020833.2|WP_015587044.1|1798305_1799346_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETVHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NC_020833.2|WP_006252258.1|1797378_1798152_+|D-hexose-6-phosphate-mutarotase MNLSNALKLIKYNELDVLEVNHNKFKAKIALQGAQLLSWQPYNAEQDVLWLSEIEPFRIGSAIRGGIPICYPWFGSIKEPAHGTARIQEWRLVEHTCSDENVGLVFALENKAKMEMMLGETCELYFTHLDPEPAQLALHSYFNIGDIEKVEVQGLPTRCFDKLTDQEVEVPSPRKISENVDCIYPAQAVNFIQDFANQRTIKVEHINATETVLWNPWHNTVSAMTETAYQNMVCVETARINTLLQQNETLGVRVLVR >NC_020833.2|WP_006248318.1|1793033_1797230_-|autotransporter-domain-containing-protein MKTKTFTRSYLASFVTIVLSLPAVASVVRNDVDYQYFRDFAENKGPFSVGSMNIDIKDNNGQLVGTMLHNLPMVDFSAMVRGGYSTLIAPQYLVSVAHNTGYKNVQFGAAGYNPDSHHYTYKIVDRNDYEKVQGGLHPDYHTPRLNKLVTEVVPAAVTNAGTSIKPYLNEERFPMFLRAGSGTQALRGKESNKTTGIAGAYEYLTGGTTLQLSKSSPDHWLDYSSNLYQVSYGPLSTYALPGDSGSGSYAYDMNEKRWVLVGVLNFYNGMDNQFNRSAIIRKDFHEKKFAEDIAGTINNTVQNAQFNWTAQGKSSSLSQSNNVQKLNVDLKDSSIANQNTSLPQENHGKTINFNGKDATIVLKQDIDQGAGALNLNANLTIRPETDQTWQGAGIIVGKDKKVNWQVKNPQGDRLSKLGEGTLYVNGRGQNLGDISVGDGIVILNQQADHQGRKQAFNTVGIVSGRPTVVLGSADQVNPDNIYFGFRGGRLDLNGNSIAFKRIQNSDKHARIVNHNRDHISTLIIQGQDPLTSNDLIWGKWASNSPADIYEYTNPYQNKRKDYFRLKGNSRVYYPTNATSNDHWEFLSSNREQAIQKILDAKNLRQRYDTFNGFIGEDASNKTNGILNVVFDTKTEVNTEQDKLKNIYTMSGGFNLNGELTLKGGTLLLSGHPTPHAYDIKNKHDVVRENDWQDSHFTAKNITVNKMAQLYIGRNVNEVNSHFTATDKAKLNLGFINRSTPSCYDSEYTGTTHCEVQAVISDNIFANLATTAIKGNVKLQNHSQLNLGKANLTGSVQADQTTHITLANHSHWLNNGTSQIGHLTMEKGSILSLNDKFATTEIPVRFNKMIIQGNLKGNGRINYTANLAKGESDHLQVDGIAEGNFVLAVRNSTTEANPKSSLNLLSLKNSNQEGNKASISLENNYVDLGTYRYVLENRNHNYHLFNPLIPNSTSKEMNATSVSSIPKKESVTNVPTLDKKETEQNLTQLQKDFSAHQLENQKAKQSMINAQSELRRLNSQLNVLQKYVNSRRLGYYTQQAVLEQISIIQNKIKQTQTIFNDANATVKLTDQKLEEAKLALGSVNDLVLIKASAPAMQATNQDTSMMNIIQADWISQYANTALSELSAQANSALQISNSLDRQLFKQSDKFNVWSSVEHQKTEHKSDLYRPYKQQTNLTQLGIQMPIDNGLMFGVALSKNHANAEFNEGVNGKSNLLMASLYGKWQSQQGTFISLDGSYGKAKNQLYLFGENHFTRRISSIGANIGHQFDLAGVQIQPTIGARYYHFSGQDYTLGGAKISSPNTHFMTYQAGLKASKTFSLDDWKVEPSITTHYVDASNKRLAVNVNNNNINQRFGRYLKTEAGIRFEHNQWQFDLHAGFINGNEIKKQHFAGVKLGYSW >NC_020833.2|WP_006248319.1|1791884_1792979_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MSKTIEERISAVILAGGLARRMNGVEKGLQLFEGKPLISHILARLSPQVSDIWLNVNRSIEQYQQLYPAFSYYQDSLPDFQGPLSGMLAGFEQIESDYLLFVPCDTPFMPELLLQKLKTALRINNVQIAYAHDGERPHPTFALIHRSVQEDLKAYLGSNQQQLLAFFQSQKSVAVDFSEQKSAFTNVNTLEDLSRVSQFPVKNLAITGYSGTGKTTLLEKLIPKLTACGIRVGLIKHSHHNVDVDKKGKDSYRLREAGANPTMIVCDERWALMTETKQAVEFSQLIAKFNPQEVDLVFVEGFKHETLPKIQLHRKGIEKPLPELDQWTIATATDYPLERENWLDINNIGGIADFIKNWLENKAS >NC_020833.2|WP_006248320.1|1791528_1791798_-|DUF1040-family-protein MKCERLEELLELLGEHWRKNPDLHLIDILQQLSVEVGEPDNFKALSDEVLIYQLKMRNAGKFEPIPGIKKDYEDDFKTALLRARGILND >NC_020833.2|WP_006248321.1|1790826_1791465_-|thioredoxin-domain-containing-protein MKKLALKTAFVALSALFTFNSTAIAADPTAGKEYIEVRKAPSAQKEVVEFFSFYCPHCYDFELSYKIPSQIKEKLPSDSKLVQYHVNFLGRQSEDLTRAWALAMALGAEDKVKTALFEGAQKDAFKSMDDIRSVFLANGITAEQFDSGINSFAVNGLVNKQVQLAEDFQIRGVPAFFVNGQYQLNLEGFADSSSTNDFIKRYVDAVVFLSKK >NC_020833.2|WP_015484370.1|1789966_1790743_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MTKLSILNLVPIREGQTAKQAVDSMVKLAKHAESIGIERYWIAEHHNMKNLASSATQLLIQHALSHTEKLRVGSGGVMLPNHSPYIVAEQYGTLETLYPNRVELGLGRAPGTDMRTATALRRNAQSLPFPDEISELKGYFEGTNSVSAYPAQGLNVPFYILGSSPESAYLAAERGLPYAFASHFAPRFMDDAVRIYRTHFKPSEVLDKPYVILGVNAIAAETDQEAEQLATTQTQFFLNVVTNAQNYLQPPVESDDKV >NC_020833.2|WP_015484369.1|1789702_1789957_-|luciferase MKAEIVPHFGPVSFQQNALYNQEKPVVRQMTACSLIGSRESIEQQLKSLKARIEIDEIMAVSYIFDEQKQHQSYTWLKEIADKV >NC_020833.2|WP_006252261.1|1789407_1789701_-|YfcZ/YiiS-family-protein MSKTMQQKAADAHNMCKLKGDSMLDNSDRQIAFEAVYDSEEIAVQAVEFFTQKAKSVETEPCDIQSEITPIIDGFLMKMWITFSCQAEVILFQMAVR >NC_020833.2|WP_041447934.1|1788300_1789341_+|IS481-family-transposase MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSKELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKAAISAADMLNDKVLPFFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHSKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >NC_020833.2|WP_006248316.1|1799749_1800991_-|HipA-domain-containing-protein MMNKRIYVFADWETFSQPELVGVLSSDVVRGKENFRFSYDNEWLSSPYVQQIDPNLYLYPGEQYSTDTQNFHIFLDSCPDRWGRLLMKRREAALASQENRKPKLLIESDYLLGVHDMNRMGALRFKTELNGPFLDNNTRLAAPPLSSLRELEFAAIQLESSDNVDDPDYLKWLHMLISPGSSLGGARPKASVIDELNQLWIAKFPSRYDDYDIALWEYLAYRLAIQAKIEMATCRIERFNQEHHTFLTQRFDRHCGKRRHFTSALTQLGYYDGDYEASYLEIAQFLTESGSNTRIDLAQLWRRIVFNIAISNTDDHLRNHGFIYAQEGWILSPAYDLNPVPLSQGLHLNITDSDNRLDYQLAFDVADFFQLSKQQAVQIYDEVLKEINNWQNVAKEIGIPRQEQEQMKFAFNV >NC_020833.2|WP_006250513.1|1800990_1801194_-|hypothetical-protein MFTQTLLAQRTGLSRVTVRKIMNGDPTVAIGYYLMVLGVLGLEQDFTDVGKDDELGRKLQDIELLRK >NC_020833.2|WP_006248313.1|1801656_1802250_-|hypothetical-protein MKLKALSTLIASSMLYSQSFAVPPEKTAEEPQPFFNKTESGYDLVFNDQNYRLIETELNGEKIQFRAFERIVYVNNPIEPDYQTINLYVPEAYYNNGEINGYQADTAPIFLPNSVGGYMPAKAASYDKKRRDGSPGTILVALSKGYVVASVGARGRTLQKEGKYTGKAPSAIIDSKSAAHKACRFESDHWHHSLCKI >NC_020833.2|WP_006248311.1|1802373_1803237_-|hypothetical-protein MLQLILAILCSVTVGVLIKFARQKGIRIDQSIAVNYIVTTTMTFLLLKPDYQGQSITDIIANNPTSYIFVILSITLPTIFLVQAKALEFAGIIRTDAAQRLSLFLPILAAFTIFGEQVTQNKLIALLLAFVALGCLLWKGNQGMEKGGKIAIISLALVWVGYGVNDILFKQIAKSGSAFPVTLSIAFIGAGCFMFIYLLLKRTQWHVPSVLTGLLLGVLNFGNILFYIQAHQAMKDDPTLVFTGMNLGVICLGTFVGAFFFKEKIHKVNYLGVAIAIVAIICLFYWR >NC_020833.2|WP_006248309.1|1803408_1804158_+|alpha/beta-fold-hydrolase MEKRFEINEQGLSIRCKLFYEKELQQIENVVIVLHGFGSSKDLKSNTKFGERLSSKYKGYAALAFDFPCHGDDARKKLSVEESITYLQLVIDYAKTSLNAKNLYAYGTSFGGYLTLKYLAEKGNPFRKIALRAPAVQIYHSLMNRLSEEERQKLAKGREILWGFDRQMKISQAFFDELTDITQNDYLDYAEQILILHGTEDEMVALSTSQQFADNNVIELLPIEGADHAFSNPKLMDIAIGKIVEFFAP >NC_020833.2|WP_006248308.1|1804159_1804645_-|YbaK/prolyl-tRNA-synthetase-associated-domain-containing-protein MSEQTFHQLTALLDSHRARYRVVGHPSAGKSEEVAKIRGTEIGQGAKALVCKVKGNGVKQAVLAILPADYQADLTKIAEHLGGLRASLASPAEVAELTDCVFGAIPPFSFHPDLLLVAEPSLFERYAELAFNAGTLERSIILNTEDYQKIVNPVLVQFAKS >NC_020833.2|WP_006248307.1|1804708_1805254_-|endonuclease-SmrB MNDTLLDDEFALFREAAKGTKKLTQNTFVPKAEPRKKLQELRELKEKADTEFYFSDEYEPLLKEENEKVKYLREDVDPYILKQLRRGDFQPELFLDLHGLTREKAKKELAALILACEREKVYCASVMTGFGTRTLKDQIPRWLVQHPKVMALHQAPKEWGGDASILILVEQPENPEKMFGR >NC_020833.2|WP_006248305.1|1805346_1806291_+|50S-ribosomal-protein-L3-N(5)-glutamine-methyltransferase MFKYNTELLDEISALPIVNDLVTIQDMMRWGYSYFNASDLYYGHGYDNAWDEAQQLVLAGLYLPFDVPETLYSSRLTRVEKERIINLICERLGSRKPVAYLTNSAWFCGGEYYVDERVIVPRSPIGELIKKGFKGIIKNEPHRILDMCTGSGCIAIACAERFPEAEVDAVDLSLDALDVAQINIERHQVSHRVFPICSDLFNNLPQDKYDLIVTNPPYVDEEDLGDMPEEFHHEPALALGSGKDGLDLTKRILAQAADYLNDDGVLVCEVGNSMVHLIEQFPSVPFNWLEFEHGGLGVFSLTKEELVKHRHLFA >NC_020833.2|WP_006251360.1|1806374_1807268_-|N-acetylmuramic-acid-6-phosphate-etherase MNALGQMITEQRNPNSMNIDRLSALDIVQVINQEDKQVAIAVEQCLPQIAQAVEKIVQAFEKGGRLVYVGAGTSGRLGVLDASECPPTYGVKPEMVVGLIAGGERALRFPIEGAEDNREQGKVDLQAVNFSEKDVLVGIAASGRTPYVLGAMEYAKQLGATTVSIASNPNSAMAQIADIAIETVVGPEVLTGSSRMKSGTAQKLVLNMLTTASMILIGKCYQNLMVDVQATNEKLKARAIRIVMQATECEREVAEDTLKLAENNAKLAIMMILGNLDKQKAEDLLSQNQGRLQKALK >NC_020833.2|WP_006248303.1|1807280_1807742_-|nuclear-transport-factor-2-family-protein MRKIKLLHVILSLILGLSAAAIGSYPAIKEIGEERAKKHQDILDLNRELYSAMVNRDFSALQTLLSDDFELYSSTGEVIDKQEWIKLIQKRVLEFDKVDLLSTDFQGNQSSGLLRVNGEFFGIERDNVVVEMNIRTIVRNTERQIKCIVIKEV |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020833_1 | 1.1|1086507|36|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086507-1086542 | 36 | NC_020833.2 | 62708-62743 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.2|1086575|34|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086575-1086608 | 34 | NC_020833.2 | 68618-68651 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.3|1086641|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086641-1086675 | 35 | NC_020833.2 | 1415799-1415833 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.5|1086774|36|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086774-1086809 | 36 | NC_020833.2 | 1166644-1166679 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086842-1086876 | 35 | NC_020833.2 | 1165984-1166018 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086909-1086942 | 34 | NC_020833.2 | 1166295-1166328 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.20|1086641|36|NC_020833|PILER-CR,CRT | 1086641-1086676 | 36 | NC_020833.2 | 1415798-1415833 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.22|1086774|37|NC_020833|PILER-CR,CRT | 1086774-1086810 | 37 | NC_020833.2 | 1166644-1166680 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|1086507|36|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to position: 62708-62743, mismatch: 0, identity: 1.0
cctataacgagcaatggcattttgatctacggtaaa CRISPR spacer cctataacgagcaatggcattttgatctacggtaaa Protospacer ************************************
2. spacer 1.2|1086575|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to position: 68618-68651, mismatch: 0, identity: 1.0
ttcttgaatacctccggagtcagttaagataagg CRISPR spacer ttcttgaatacctccggagtcagttaagataagg Protospacer **********************************
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ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa Protospacer ***********************************
4. spacer 1.5|1086774|36|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to position: 1166644-1166679, mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcac Protospacer ************************************
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gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc Protospacer ***********************************
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cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
7. spacer 1.20|1086641|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to position: 1415798-1415833, mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.22|1086774|37|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to position: 1166644-1166680, mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020833_1 | 1.3|1086641|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086641-1086675 | 35 | NC_028853 | Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome | 11457-11491 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.3|1086641|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086641-1086675 | 35 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 11457-11491 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.3|1086641|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086641-1086675 | 35 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 11439-11473 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.4|1086708|34|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086708-1086741 | 34 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 3967-4000 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.5|1086774|36|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086774-1086809 | 36 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18740-18775 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.5|1086774|36|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086774-1086809 | 36 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18815-18850 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.5|1086774|36|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086774-1086809 | 36 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18780-18815 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.5|1086774|36|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086774-1086809 | 36 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18976-19011 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.5|1086774|36|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086774-1086809 | 36 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 19141-19176 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.5|1086774|36|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086774-1086809 | 36 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18740-18775 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086842-1086876 | 35 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086842-1086876 | 35 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086842-1086876 | 35 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086842-1086876 | 35 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18336-18370 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086842-1086876 | 35 | KP137438 | Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome | 18565-18599 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086842-1086876 | 35 | DQ426904 | Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome | 18136-18170 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086909-1086942 | 34 | NC_008201 | Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome | 18391-18424 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086909-1086942 | 34 | DQ426905 | Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome | 18466-18499 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086909-1086942 | 34 | KP137432 | Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome | 18431-18464 | 0 | 1.0 |
NC_020833_1 | 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086909-1086942 | 34 | JN255163 | Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome | 18627-18660 | 0 | 1.0 |
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NC_020833_1 | 1.32|1087442|38|NC_020833|PILER-CR,CRT | 1087442-1087479 | 38 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 27370-27407 | 1 | 0.974 |
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NC_020833_1 | 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1086909-1086942 | 34 | NC_028898 | Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome | 19392-19425 | 6 | 0.824 |
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NC_020833_1 | 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT | 1086909-1086943 | 35 | NC_028898 | Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome | 19392-19426 | 7 | 0.8 |
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NC_020833_4 | 4.1|1787398|29|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1787398-1787426 | 29 | NZ_CP042500 | Enterobacter sp. E76 plasmid pE76_001, complete sequence | 104085-104113 | 7 | 0.759 |
NC_020833_4 | 4.1|1787398|29|NC_020833|CRISPRCasFinder | 1787398-1787426 | 29 | NZ_CP012834 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Cerro str. CFSAN001588 plasmid pCFSAN001588_001, complete sequence | 14210-14238 | 7 | 0.759 |
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1. spacer 1.3|1086641|35|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
18. spacer 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
19. spacer 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
20. spacer 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
21. spacer 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
22. spacer 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg Protospacer **********************************
23. spacer 1.12|1087242|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag Protospacer **********************************
24. spacer 1.12|1087242|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagag Protospacer **********************************
25. spacer 1.15|1087442|37|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa Protospacer *************************************
26. spacer 1.15|1087442|37|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaa Protospacer *************************************
27. spacer 1.20|1086641|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************
28. spacer 1.20|1086641|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************
29. spacer 1.20|1086641|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************
30. spacer 1.22|1086774|37|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
31. spacer 1.22|1086774|37|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
32. spacer 1.22|1086774|37|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
33. spacer 1.22|1086774|37|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
34. spacer 1.22|1086774|37|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
35. spacer 1.22|1086774|37|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc CRISPR spacer caccgctgctacttcggttatcggagtagtttgcacc Protospacer *************************************
36. spacer 2.1|1163511|59|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa CRISPR spacer acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa Protospacer ***********************************************************
37. spacer 2.1|1163511|59|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa CRISPR spacer acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa Protospacer ***********************************************************
38. spacer 2.1|1163511|59|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa CRISPR spacer acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa Protospacer ***********************************************************
39. spacer 2.1|1163511|59|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa CRISPR spacer acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa Protospacer ***********************************************************
40. spacer 2.1|1163511|59|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa CRISPR spacer acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa Protospacer ***********************************************************
41. spacer 2.1|1163511|59|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa CRISPR spacer acctaaaaagctccctgttattgtcattaaaagcaaaatggatttatttagtgcaacaa Protospacer ***********************************************************
42. spacer 1.21|1086708|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tccgacacttgcccgtctgcactcgccctagtgcc CRISPR spacer tccgacacttgcccgtctgcactcgccctagtgct Protospacer **********************************.
43. spacer 1.23|1086842|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
44. spacer 1.23|1086842|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
45. spacer 1.23|1086842|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
46. spacer 1.23|1086842|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
47. spacer 1.23|1086842|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
48. spacer 1.23|1086842|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgcc CRISPR spacer gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgct Protospacer ***********************************.
49. spacer 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_008201 (Mannheimia phage phiMHaA1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
50. spacer 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to DQ426905 (Bacteriophage phi-MhaA1-BAA410, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
51. spacer 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to KP137432 (Mannheimia phage vB_MhM_535AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
52. spacer 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to JN255163 (Mannheimia phage vB_MhM_1152AP, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
53. spacer 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to KP137438 (Mannheimia phage vB_MhM_2256AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
54. spacer 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to DQ426904 (Bacteriophage phi-MhaA1-PHL101, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgg Protospacer **********************************
55. spacer 1.29|1087242|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagg CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagt Protospacer **********************************
56. spacer 1.29|1087242|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagg CRISPR spacer tttaccgtttaccgattggattttaatgctagagt Protospacer **********************************
57. spacer 1.32|1087442|38|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaag CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaat Protospacer *************************************
58. spacer 1.32|1087442|38|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaag CRISPR spacer aggggcgtgtaccgcaatcaattttaattataaccaat Protospacer *************************************
59. spacer 3.1|1563170|29|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
agacctgatactaatctagggtataaaga CRISPR spacer aaacctcataataatctagggtataaggc Protospacer *.**** *** ***************.*
60. spacer 5.1|1799582|29|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to MH791397 (UNVERIFIED: Enterococcus phage EfsSzw-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tctttataccctagattagtatcaggtct CRISPR spacer gccttataccctagattattatgaggttt Protospacer *.*************** *** ****.*
61. spacer 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcg Protospacer . .********.************.********
62. spacer 1.7|1086909|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcg CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcg Protospacer . .********.************.********
63. spacer 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_047750 (Mannheimia phage vB_MhM_1127AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcgg Protospacer . .********.************.********
64. spacer 1.24|1086909|35|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_028898 (Mannheimia phage vB_MhM_587AP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
cagcagccgttgttaccgtggtgcaatgcttgcgc CRISPR spacer ttctagccgttgctaccgtggtgcagtgcttgcgg Protospacer . .********.************.********
65. spacer 4.1|1787398|29|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045463 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum strain M-3851 plasmid p48k, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
agtttttctgatgcttgccatctgctaga CRISPR spacer catttatctgatgctggccatctgcgaac Protospacer .*** ********* ********* *.
66. spacer 4.1|1787398|29|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045512 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum strain M-5360 plasmid p48k, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
agtttttctgatgcttgccatctgctaga CRISPR spacer catttatctgatgctggccatctgcgaac Protospacer .*** ********* ********* *.
67. spacer 4.1|1787398|29|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042500 (Enterobacter sp. E76 plasmid pE76_001, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
agtttttctgatgcttgccatctgctaga CRISPR spacer taattttctaatgcttgctatctgctcaa Protospacer . ******.********.******* .*
68. spacer 4.1|1787398|29|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012834 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Cerro str. CFSAN001588 plasmid pCFSAN001588_001, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
agtttttctgatgcttgccatctgctaga CRISPR spacer catttatctgatgctggccatctgcgaac Protospacer .*** ********* ********* *.
69. spacer 1.6|1086842|35|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to HM144385 (Brochothrix phage NF5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gtggcacagtaacacgagcagatgctgataaacgc CRISPR spacer atcgaccagtaacacgaccagatgttgataattat Protospacer .* * *********** ******.****** ...
70. spacer 1.9|1087043|34|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgcgatttttggatttttcgggcgataaatgata CRISPR spacer ttttattgttggattttttgggcgataagcttgt Protospacer * . *** **********.*********..
71. spacer 1.11|1087175|35|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_014534 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ttaaatctaaagctaaagctattttattaattaaa CRISPR spacer cccgatctaaagctaaaattattttattagattgg Protospacer .. .*************..**********. * ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4938 : 12398
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020833|4938:12398|DBSCAN-SWA TTTAAACTAAAGAGTGTCCGATGTGGACTACCTGCCCGATGATTTGGAGGTTTTGAGCTTCTTCGGCGGTAATCTGTATTGGGCGGTAGGACTCGTTATCGCTAATTAATTCAATATAGTCCCATTCTTTTCTAATCCGTTTAACCCATACGCTTTCCCCATTCTGCACAAGATAAATCTTATCATCACCACGAGGCTCTCGTTTGCTGAAATCTACCAGCATTTGGTCACTGTCTGCAATGGTAGGGTGCATTGATGTTCCATTTGCCCAAAACACGCCGCAGTTGTGGGCTTTTACGCCGAGGCTTTGCAGCAGGCTGTCGGCGTAAGGTTCTTGCCCGTCTGGCTTCGTTACGCCCTCGTTAAAGCTGCCAAAGCCTGCTGAAACGTTGATTGTTCTGAAGCTGTTAATCATTGAAACAATATCATCAGCCATTTTTTCTAGTCGCTCAAACTCTCTTGCCACAATACTGGTATTCTCTGATTGTGGTTTGCTTTCCTTACCTGTTGCCAGCCATTCAAGGCTCACATTTGACACCTCTGCTATTTTTACAAGATTTGAACGAGATGGATCTGCCTCTCCTTTTACCCACCTAGATAGTGATGCTTGGGCTACCCCCACTGCTCTTGCAAACTCACTGTAATTGTCCTTAAAGCTATTTTTTGCAATCCATTTCATTCTTTCTGAGAAGCTCTCATCGTAAATGTTTGGTTTACTCATCTTTTACGTTTCCATTAATAAAGTTTTACTCGTAAAACATACTCATAAACCATTGATTTTTAAGTTATTTATGAATAAAGCAAAAATATTTTAGATGTTTTTATGTTTTACGGTTGATTTGTTTAAAGTTTTACGGTTAAATACACGCATCAAATAGATAAAAAGAGGTGTATCGAATGAGTGTATTAAACGATGTTAAAAAAACCGCACAGAGAGATTGGCATAAAGCCGATATTCTTGCGGAACTTCGTAAAAAAGGTTGGTCACTTCGTTCTTTGGCTAAAGCAGGCAATGTTAGCCATAACACGCTGAAGTCTGTTTTAGACAAGCCTTACCCCAAAATGGAACGCTTAGTTGCAAATGCCATAGGGGTTGCCCCTGAAGTGATTTGGGCTGGGCGAACAGCAGAACGCATTGAACGTAATCGGCGACCAACTTTAACTAATAAGTTTTAATCATAAATGATCTTTAACGTAAAAGATATAGGAGAAGAACATTTATGAGCGAATTAAGTTTAAAAACGCACTATTCAGTGGCTGAATTGTTAAGTTTTAAGTTATCTAGCCTACCAAGTGCTCATAAAAATGTGCTTGAGAAAGCAATAAGGGAAAACTGGCAATCTCAAAAACGCAAAGGCAGAGGCGGCGGGGTTGAATATGAATTAATCAGTTTACCCACCGAAGTCCAACAGGAAATCCGCACCAAGTTACTCAAACTTCTTCCTGCTGAAATCAGCAAAGGCGAATTGAGTGTAGTGCGACAAAACATTGATTTGGAGCAGATAACCGATAAACAACTTTCTACGGCAGATGCTCGCATTATGGTGGTGCGGTGGTTCTTGATGCAGGAAGTGCAGTTGGGGCTAAGCCGCACAAAAACGCTAGACCAAGTCATTGCAGCGGTGGCAAGCAGTGAAATTCCTGCTGAAATTTGCAAAGCGATTATGGCGGGCAATAGTAAAGCCGGTGGAAAGTTAAAGCTATCTAAACGCACCTTGCATAGTTGGGTGCTGGCGTATGAGGCAGGCGAAAATTCAGCGGAACGGTTAAAACAGATGATACCGCTGAAAACACAAAAACGTGCCGTGCCCGAGCGGTGTGGTTGGTTGCAAGCCTTTCTGCCGTTTTATCAAACCTTTAGCAATGTGGCACTCACACAGGCTTATGCTCAATTTGCAATGCAGTATGAGGGCGAAGATTTACCTACAGAGAGCCAAGTTCGGTATGCCTTGAAGCAGTTGCCCGATTATGTGGTGCAACAAGGGCGGAAATTGCCGGTGAAGAAGATCCGGCTCGCCCGTTAAATACCCTTGAAGTTAAAGGCTTAACGGTCGTAGATGACTCGCAGAAACCGTTATTTAGCGAAGTAAACCAAGCGTTATATCACGGTTTAAGCCCGATTGAGGTGGTGGCAAGCCGTGTGCAGATTACCCGTGCGATTACTACATACACCAAAAACGTGACGAATACTGATGACCCAAGCTATTTGGATTTAACCACCATTCGTACGCTTGACTATGTGCGTAAGGCAATCCAAACCCGTCAGCGTTTGCGTTTCCCTCGTGCGAAAAACTCCCACCGTATTGTGGCAAAAGTACGCTCGGAGATTTTAGATGTGCTTTATCAGCTTGAGGGCGAAGAGGTAATCGAAAATGTGGAAGCGTGGAAAAATCGCTTATTAGTGGTGCGTAATCAAGACCCGACTTACTTGGATTTAGAAATCCCTGCGGATGTGGTTAATGGCTTGCACGTTATTCGTAACAAAATTACGTTAATTTTATAGGGGGTGCTAGATGTCAATTGTTTATGAAGGCTCTTGCGTGCTTGAGGTAGATGGCGTTGAGATTGAAATTACCAAACTTGATGTAAAAACCGTAACCGGTCGCAAGCTGGTTAAAACGATGAACAGTTCCGGACGTGCAAGAGGTTATTCGCAAGGCATTGCGGAATATACTCTCTCGGTGACTGCAGTTGAGCCTCAAGACGGTTCGGTAATTGATTGGGATAACATTAAAAATGCGAAGCTCACTAAATACCCGTTAGACAATAGCGAAAAACGCACCTCTTATTTAGGCTGTTTTACTACCGATGTGAGCGAGTCTTACACCGTTGATGGTGAGTCGGTGCGTGATATTCAACTCAACGCATTGCGTAAGGTGAATGAATAATGAAAATCACTTTAAATCTTGGCATTGAATATAACGGGAAAATTCGCCGTGATTGTACGGTGCGATTGCTGACGATGGGCGGTCAATGCACGGCTCAAGAAATGATTGCGGATTTAGGGTTTGAGGAAAACTCGGAAGCCCTATCAAAGCGTGAACAAACCTTGGTCGATATGGCTTACCTTTCGCAGCAAGTTACCTTTGATGGTATTTATCAAGGTAATGTGACGGCTCAATTTTTATTTGACAATTTAGCTACCGAAGACTACTGGCAGTTGATTGAGGCAACGCTCACACTCCGAAAAAAGCGGTTAGAAAATGGGGTGAGCCAAAGCGAGAGCGAAAGCCCGGCAAATCCCGATTTGGCGTAGCAGAAGCCTTTAAGCAGTACCGACAAGCGGTGATTTTACTCTCAAAATTTGCAATTACCGCCGAGCAGGTATGGCAAATGCCGTTGCTTGAGGTATTTGCGTGGATTGAGAGCTACTTGGAGAGTGAGGGCGTAAAAACACCGCATAGCCCAATGGGTGCGAATAGCGAAGTGAAACGCGAAAGCTATGTCTTTACTCGGTGTGGCAAAATTGAATAGGGGCGAAAGCCCCTTTTTTGTACTTTAAAATTAGTTTAAAGAGACTTTAAAAATGGCAAAAAATATGAAAGTGCAACTGGAATTGACGGCAAAAGATACTGCCTCCCCAGTTTTAAACCAAGCCGCTAAAACCGCCGAAAAAGCCTTTAAAAATACAGAGCGAGCGGCACAAAAAAGTGGCAATGCTCAAACGCAAGCAGCACAGAAAGCAGCGAATGCTACAGAAAGCTCAAATCGGAAAATAGAACAGAGTTACCGTAATGCCCGCCGAGTGGCTGCCGATGTGAGCCGAGCCCGTGAAACATTAGGTGTTCGGGCGGAAAATGCAATCCAACGCGAAATTGAACAAACTCGTGCAGCCTATGACCGCTTAAAACGCTCAGGTGTTGCCTCTCAAAATGAGCTACGCCGTGCCTCAGAAGCCACTAAGCAACGGGTGCGAGAGCTGAATGCAGAATTGGGTAAGACAAGCTTTGGGGATAAGGCTAAAGGATTTGGGCGTGGTTTGATGAGTGCCGGTGTCGGTATTGCAGCAGGTGCTGCAATGGCTCGTCAGCCAGCCAAGAACCAAATGGAGTTTGACCGACAGTTAGCGATGGCATCAAACACTGCCTTTTCCGACCGTGATGTTAAAGGGCGTATTGAGGGCAAGAAAGAGTTATTAGCAGCGGTGCAAGAGGCGGTTAAGGTTGGGGGTGGAACAAAAGAAGATGCTCTTTTAACTCTTGATACGCTAATTGCCTCAGGAACGATGAAGGCTGAAACTGCAATGAGCCTATTACCAACCTTGCAGAAAGGTGCTGTAGCAACAGGTGCAAGCTCCGAGGATATGGCAAAAATTGCGATCTCCTCAATGCAACAATTTGGGATTAAAGAAGAGGATATTGGGCGGGCATTGGATATGGCAGTTGCAGCCGGGCAAGCAGGTAACTTTGAGCTTGCAGATATGGCTCGCTGGCTACCACAACAAATGGCCGCAGGTAACACGGCAAGGCATTGGGCGGTTTATTACCGCCTGTATCGTATGACCCAAACGGCAGATGGCTAGCGTTATCCCTTGAAGTTGAGGGGAGAGAGCTAGACCGCATTGATGCGAGAGCCAAGACTTTAATCGATGCCGTTGATGTATCAACAGGCATTTTTATTGATGATTGGGAGCGGGTTTGTGGCTTAACGGCGAATAGCTCACTACCGCTTGAAACCCGAATTGAGCGTGTGATTGCAAAGCTGAATCAGTTGGGTGGATTGTCGATAGGCTATATCACTCAAGTGGCCAAAGAGCTTGGATATTGCATCAAAATTAGTGAGCCACAACCCTTTATTGCTGGGCTAAGCCGAGCTGGGGATATGTTATGGCATAAAGACATTATGTGGACATTTTTTGTGGATGTTTGCAACCCCACAGATGATTACAAGCGTTTTAGAGCAAGCGTGTCAATGGCTGGCGATGCGTTAATGGGACGATACAAAGACCCAATTTTAGAAAGTCTACTTGAAGAGGTAAAACCTGCATTTAGCCGTGTGTGGGTAAGATATTTAGGAGATATTGAATGAAACAAGTGATGAATCCGATTAATACCCCAACACAGCGTTTTAAAGATGGCAACCCTGCCACTGGTGAATATGGCACGATTGTGACTGCTGAATTTTTGAATAACGTCCAAGATTCGGTCATTAACACCCAACAAGAATTGCACAGTGTACTTGCTGAAGCAGGAATCGAAGCAAATGACGAACAAGTTAATCAGGTGGCTAAAGCAATCAAGAAAATTGCGGGCGATGCTACTCGTGATAATTTTAACGCATTAGCCAACCCTGATGGTTACAAACACATCGGTCGCTGCAAATCGGTTGCGGAGTTACGTACTATCCGCCCAACGGAACACGGTCAGCGTATTTTGGTGGATGCTTACTATGAGGACGGCACAACAGGCGGTGGGGAGTTTGTGGCTGATTTGCAGGATTTAGTTACGCCTGATGATGGTGGGGTTTGTTTTGTTGTGAATAATAATGGGGGGCGGTGGAAGCGTGTTGACCTTTCACATCTTACATTATTTGATTTTTGGGCCGTCGGTGACGGGGTAACAAATGATGAATCAGCATTTGTAAATGCTATGAGATATTCTCAATTTTTTATCGAAAACGGTACATTTCGTATCAACAATGCCGTTAATTCTGTTCGCGATAATGTGAAAATTTTGGGCAATAAGACCGGCAAATTAGTATTAGGTGCAGGTATCCAGCAAGCAGGGGCCGAAGTTTTTAATATTAATCACAGCAATTATTTTATCTCGGGTTTTTGTATTGAAACACCGAACAAAGCAATTGGTATTCGATTTAAGTCTTTGGATGATGCTGGTGTTAAAAATCTCCATATTGACAATGTTGTGTTTAATGGCACCTTCTACGGGGTCAGGGCAGGTGAAAGTATTCAGGCGGATACTAATTACCCAACTGATAATGTGATTGTACAAAACTGCCAATCGTATTGTGGTTCAGGTAATGCGGGACATTATCTCTGCACCAAAGTTAAAGGTGTGCGATTTTTTAACAATATAGCAATTGGAGGTCGCAATGTATCAGCTTACGGTGCAACATCTTGCTCTGATATTTTCATTTTTGGTAATCGTGAACAGGGGATGGCAGTGACGACAGTCGATGTGGAAGCGGGCGTACAAGTGGAAGATGTACAAACTGGCGAATGTGTGGTAGCGAATAATATTTTCAGACACGATATTTGGATGTCTGGTGCTAAAAATGCCATTATCAACAGTAACCTCTGCCGTCGCTTGCGTGTCACATCAGGTAATCCGACTGACACAGGCAGCAACAATGTAGAATTTTCAAATAATCAAGCAAAATCTATTGCAATATCGAAATATGGTTCTTTCGATAATCCTTCATTGTTTATTGATAATATCAATTTTATTAATAACATTTTGGAGCCCAGTGAATTTAATCAAGATGTGTATATTGACGGGACAATTTTAAAACAGTGCCAATTTATTAATAATCGTTGTATTAGCAAGTCTAAGCAATATTCTGTCAGACTTGCTCGCAATAATCCGTTCTTAAATTTAACATTTAAGAGTAATAAATTATCGGACAATCCTGCGATTATATCAGGTAAGCAAGGTGTTATTTTCTGCGATGATTTGAGCTTAGGAGTAAATAAGCACAGATTAAGATTGCGATTTTCATCGCCGATTAATTTTACTGTTAATCAAGAATGGCAAAAAATGCCGTTTGACAGAGTGTTAAATGATATCAATGGTCATGTTGATATTGTCAGTGGTCAATTTATTGCAAGGACAGGCGGGACTTTTCATTTAAAAGGTAAAATAACGGTTACAAATTCATCGGAAGATGTGCTGAATTTATATCAACTCAGGCTGTTAATAAATAACGAAGAGAAAGAAAGACTGATTAATCAAAGTGTTTCACCTAAAAACAGCAAATCAAATACAAATGGTATGACAACAATCAATTTTGATACTGTAGTTGATTTAAAAGTAGGTGACATTGTTGATTTGCAGTATAAAACAACGCATGAGTTGACATTACTGTCAGACTCATTTTTATCTCAAATTTATGTGACTCAGGAGTTTTAAGTGACTAAAAAACACTACTGCACAGGCTGGCGTAATGCGCCAGCCAATATCAATAGTTGCTGTCATCAGCATGACCGAGACTACGGTATCAAGGGCACAGTCAGCCGAGCCGAAGCCGACAAGCGGTTAAGACATTGCTTAATTTCGCAAGGGAATCCGATTAAGGCGTGGGTGTTTTGGGTTGTGGTGAGGTTGTTTGGGTGGATTTATTACAAGGAGAAAAATATCAATGGAAAGTCATAAAACAGGAAATATCATTACTGAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAAGTGTAGCTCAATTTAAACAAGCTCCGCTACCTTTTACAGGTCAAAAGCGGATGTTTTTAAAACACTTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020833|4938:12398|9961_12022_+|WP_015483985.1|tail|DBSCAN-SWA MKQVMNPINTPTQRFKDGNPATGEYGTIVTAEFLNNVQDSVINTQQELHSVLAEAGIEANDEQVNQVAKAIKKIAGDATRDNFNALANPDGYKHIGRCKSVAELRTIRPTEHGQRILVDAYYEDGTTGGGEFVADLQDLVTPDDGGVCFVVNNNGGRWKRVDLSHLTLFDFWAVGDGVTNDESAFVNAMRYSQFFIENGTFRINNAVNSVRDNVKILGNKTGKLVLGAGIQQAGAEVFNINHSNYFISGFCIETPNKAIGIRFKSLDDAGVKNLHIDNVVFNGTFYGVRAGESIQADTNYPTDNVIVQNCQSYCGSGNAGHYLCTKVKGVRFFNNIAIGGRNVSAYGATSCSDIFIFGNREQGMAVTTVDVEAGVQVEDVQTGECVVANNIFRHDIWMSGAKNAIINSNLCRRLRVTSGNPTDTGSNNVEFSNNQAKSIAISKYGSFDNPSLFIDNINFINNILEPSEFNQDVYIDGTILKQCQFINNRCISKSKQYSVRLARNNPFLNLTFKSNKLSDNPAIISGKQGVIFCDDLSLGVNKHRLRLRFSSPINFTVNQEWQKMPFDRVLNDINGHVDIVSGQFIARTGGTFHLKGKITVTNSSEDVLNLYQLRLLINNEEKERLINQSVSPKNSKSNTNGMTTINFDTVVDLKVGDIVDLQYKTTHELTLLSDSFLSQIYVTQEF >NC_020833|4938:12398|12022_12265_+|WP_006248673.1|DBSCAN-SWA MTKKHYCTGWRNAPANINSCCHQHDRDYGIKGTVSRAEADKRLRHCLISQGNPIKAWVFWVVVRLFGWIYYKEKNINGKS >NC_020833|4938:12398|6157_6961_+|WP_006253446.1|transposase|DBSCAN-SWA MSELSLKTHYSVAELLSFKLSSLPSAHKNVLEKAIRENWQSQKRKGRGGGVEYELISLPTEVQQEIRTKLLKLLPAEISKGELSVVRQNIDLEQITDKQLSTADARIMVVRWFLMQEVQLGLSRTKTLDQVIAAVASSEIPAEICKAIMAGNSKAGGKLKLSKRTLHSWVLAYEAGENSAERLKQMIPLKTQKRAVPERCGWLQAFLPFYQTFSNVALTQAYAQFAMQYEGEDLPTESQVRYALKQLPDYVVQQGRKLPVKKIRLAR >NC_020833|4938:12398|4938_5658_-|WP_006248970.1|DBSCAN-SWA MSKPNIYDESFSERMKWIAKNSFKDNYSEFARAVGVAQASLSRWVKGEADPSRSNLVKIAEVSNVSLEWLATGKESKPQSENTSIVAREFERLEKMADDIVSMINSFRTINVSAGFGSFNEGVTKPDGQEPYADSLLQSLGVKAHNCGVFWANGTSMHPTIADSDQMLVDFSKREPRGDDKIYLVQNGESVWVKRIRKEWDYIELISDNESYRPIQITAEEAQNLQIIGQVVHIGHSLV >NC_020833|4938:12398|8222_8411_+|WP_006251296.1|DBSCAN-SWA MILLSKFAITAEQVWQMPLLEVFAWIESYLESEGVKTPHSPMGANSEVKRESYVFTRCGKIE >NC_020833|4938:12398|7824_8193_+|WP_006253443.1|DBSCAN-SWA MKITLNLGIEYNGKIRRDCTVRLLTMGGQCTAQEMIADLGFEENSEALSKREQTLVDMAYLSQQVTFDGIYQGNVTAQFLFDNLATEDYWQLIEATLTLRKKRLENGVSQSESESPANPDLA >NC_020833|4938:12398|7450_7825_+|WP_006253444.1|DBSCAN-SWA MSIVYEGSCVLEVDGVEIEITKLDVKTVTGRKLVKTMNSSGRARGYSQGIAEYTLSVTAVEPQDGSVIDWDNIKNAKLTKYPLDNSEKRTSYLGCFTTDVSESYTVDGESVRDIQLNALRKVNE >NC_020833|4938:12398|9407_9965_+|WP_006253441.1|DBSCAN-SWA MGGLLPPVSYDPNGRWLALSLEVEGRELDRIDARAKTLIDAVDVSTGIFIDDWERVCGLTANSSLPLETRIERVIAKLNQLGGLSIGYITQVAKELGYCIKISEPQPFIAGLSRAGDMLWHKDIMWTFFVDVCNPTDDYKRFRASVSMAGDALMGRYKDPILESLLEEVKPAFSRVWVRYLGDIE >NC_020833|4938:12398|12251_12398_+|WP_015483986.1|DBSCAN-SWA MESHKTGNIITEQASKQASKQASKQSVAQFKQAPLPFTGQKRMFLKHF >NC_020833|4938:12398|8463_9459_+|WP_006253442.1|tail|DBSCAN-SWA MAKNMKVQLELTAKDTASPVLNQAAKTAEKAFKNTERAAQKSGNAQTQAAQKAANATESSNRKIEQSYRNARRVAADVSRARETLGVRAENAIQREIEQTRAAYDRLKRSGVASQNELRRASEATKQRVRELNAELGKTSFGDKAKGFGRGLMSAGVGIAAGAAMARQPAKNQMEFDRQLAMASNTAFSDRDVKGRIEGKKELLAAVQEAVKVGGGTKEDALLTLDTLIASGTMKAETAMSLLPTLQKGAVATGASSEDMAKIAISSMQQFGIKEEDIGRALDMAVAAGQAGNFELADMARWLPQQMAAGNTARHWAVYYRLYRMTQTADG >NC_020833|4938:12398|5834_6113_+|WP_006248972.1|DBSCAN-SWA MSVLNDVKKTAQRDWHKADILAELRKKGWSLRSLAKAGNVSHNTLKSVLDKPYPKMERLVANAIGVAPEVIWAGRTAERIERNRRPTLTNKF |
11 | Mannheimia_phage(81.82%) | transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
435651 : 443806
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_020833|435651:443806|DBSCAN-SWA CTTAAGGTTCGGCTAGAATATCAGGGCAAGCACTTTGGCGGATTGCATTTTTTAGGAAGCGTTTATATCTAGGCGTTACTGATTTTGACGATAGTACGCCTTTTAGTATTTGTTGATAGGCTTCATCATTAATTAGGGCTTTTTGAATGAAATAACCGGCTTCTATATTTGCCTTAATCTCATCTAACGAATCGATTCTTATATGGCGGTAGAAAATAAAGCTGTCCCGTGTGATAAATTCGTGTGTTCCTGCCTTTAAAATACAAGTTTCATCAAGTGCTTTCCCGTCTTTAATGCTTGAGCAGTTTACACTTAAAATCATATCTCCTTTACCGGTTTCACCATCAAAGCACGGATCGGTAACCTGCTTATCCAGCCCTAGCAACTTCGCTTTGCCCATTGTGGCTTGAGTCATTGCGTTAGGGTTTTCTTTCTCTCTCGCCAGTATACGAGCCTCTTCCAGCTCCTTTAAAAGGTCATCAACGGTTAATTTATGGCGTTCTGCGTGTTCGGCTTTCAGTTCCTCAATCCTTGCCGTAATCTTGCCGTTATCCATTAGCTCTTTAGCTTTTCGGTGGACGGTTTCGGACTTCATATCTTCGGTTTCATAGGCTTGGCGGTAGGCTTCGCTAGCATTGCCGGTTTCAATATAAGCAAAGCAAAAAGCCTCTTGTTTTGGTGTGAGTTCGGTCATTCTTTCCCCTCCGCCATTCGCTTTTCAGCAAAGGCATAATCGATTTTTTCTCGGTATTCTTTGCTCATCTGCTCCCGTGTAATTTCGTTGCCGTGTCGGTCAATAAATGGGTTTGTTCGTTGTGGGTGGGGGAGCTTGTTGATTTCACTCAATAAGTCATCATTCACTAATAGCGGCGTGGCGGTTAGCTGTTGATGATAGGCAATAATCGCTAGAGCCTCTAAAAAGCCCGTAGCCCCTGCCATTTCAATATTGATATGATCTTCAAGGTCAAGAGAAAGCACACCGATAAAAAACGGTCTGCCGTTATCGTGGTGCAGTCGTTCAATTCGGATATGCGGAAAATCTAAAAAGCTCAAGGTTGCTTTGATAGGTTCATTCATTAAAGCAGTAATACCCGCTAAATTAAGCTCGTGTTTCATTTTGGTTTATTCCTTTATTCTTTCCGCCACTTTTAACAGTTGGCTAAGTTGTTTTCTTAAAATGCCGAGTGTGATTGAATCGGTTTCGCTTGGCATTGCGTTATGTTGTTGTTCCAGCTTCGCTATTCGGTTGCCTAGCACAATTAAAAGCTCGGGCAATGGGTAAGCTCGGTTTCAGAATAGAGGCTTAAAAACGTGAATAGTCTGCTAAATAATCAGGTGTTATCTCAGAAAAATCGAGCTTTTTCCCTAGTGCTGCTTCTAATTCTTGTTTATTTAAAAGTAAATTTTGGAAATCATTTAAATTCATTGCTGCCACCTAGAACGGAATATCATCATCAAAATTAAAGCTGCTTGATTGTTTTTCATATCCGTTATTAATTGCTACAAAATCAAAGGCTGCTTTTAAATTAGTATTATCTTTATCAATGCTTGGACTTATTCCGCCATATTGTCGATAAAGCTGTATATTTTTATCTTTGAGTAAGCGGTTTAAATCGTTAGCTGTTTCACTAAGACTTGAGTAATGTTTACTTGCCCATTCTATGAAGTCATAAACAGAAATATAATCATTTTGAATTTGGCTAATCTCTGATTGTGTTTGCTTGGTGGTTAATTTATCTAACAAGGTTGGCGATTGTGTTTTAATCAGCTGTGTTATTTCTCTTGCTGTTACGTAATAAGCATTTAAATGTTCAACATCAATAGAATTTTGAGCAATAACATCACTTAAAACGCCTTTAGGCTGATCGAAAGCGTCTTTGAAATGTAGTGTTTTGGGCTCAATAGCATAGCTTTCACCATCTTCAAAGAGAGTGCAATTTACAAAAGCATTCGTATATATTCCATTTTGCTGAAAGGAAAAAATGAGGCTTTTCAATTTATCCGCTATATGTGAAAAAGGTTTATTTGTATAGTTTGATAATTCTTGTATCAGTTCTTGAAAGCTGATTTTGGGCTCAATACGATTTTCAAGCCTAGAAATAAATTGACTGTGATCTGCCATAAGCGCCCCTTTAACGTATCCCTTTACTGTGAGAGCGTGGAAAGAGAAATAAAGGGCTTTCTCCTTTCGTGCCGGTTAATTACTCCGCCACTATCCACGCTAATTTGAATAAATCCGTATAGTTACGGATTGAACTTGATAGGTTGTATTTTGCTAATTATTCAGATAAATTACAAGTAATAAGCTGTGTTTTATTACAGTAAATCAAAATAGGCTAAAGATGGGTTTCCGGACGCTATAAAAAAGAGCATTCAAGCGGTCATATTTCATTAAGGTTTTGCGAATAGTGCGGAATTTTCGGAGCAGTACGCACGCAAGGAGCAAATAAAAAGCCGTCAATATCCATCAACGGCTATTTAAAAGTGAGGTTTTGACAGGTAGCAAGTGATAAGTTTTAGCCATTTTTGACTTGTGGAATAAGCACTAAATTGAATGCCCCTAGAATTTTTTGAATAGTGTCAAAGCGTGGTTTGCTGCCTTTGGCTAGGGTTTTATATAGGCTCTCTCTGCCTAGCCCTGTTTGCTTGGCCAGCTCCGCCATTCCTCTTGCTCTTGCTACATCGTTCAAGGCTTCTAAAAATTCGTCTTGGTCGCCCTCTTTTAACACTTCCGCTAAATAGGCTTGAATAGTTGCCTCATCGGTTAAAAACTCCGCCACGTCAAAAGGGCGTAAACCGTGCTTTTCTGCTGCCTGTTCATTGATTTGTATTGTTTCCATTGCTTTCTCCTGTAGTTTTTAATTCAGCCCATAATGCTTTCGCTTTCTCTATATCGGCTTGCTGTGTTGATTTATCGCCGCCGTGTAACAAGATATAAATTACATTTCCTTGTTATGCGTAATAAATTCTATATCCGGCTCCTGTTGCTATCCGCATTTCATAAAGTCCGCCTGTACCGGCTAAAGATTTATGATCGCCAAAGTTGCCATTAATCGCATTTTTTATCCGTCTTGCTACCGTTGCTTTTGCGATAGGGTTCTTTAAATTCTCAAGCCATTTTGAAAAATTATCGGTAATAATAATTTGATTAGTGGTTTGCTCTCTCATCATTGCCGGCTTCTTATTCTATTTATTGCTTATTGTATCCATTAAGATACAGTGAGCAAGGGTTTTTGCCATTTACCCACTTTTAACCCACTTTACCCACTGTCATTTTTTCTTTATTTTTCAGTTAGTTATAAAAAAATAATAGTGAAAAGTGGGTAAAGTGGGTAAAAATCGAAAAGTTTACAGAATTTTCATCAAGGGGAATTACGGGCATAAAAAAGCCGTCAGGCGGTTTACCTAACGGCATTACAAGCGGTCATTTTTGGCGGAAAATTTACTAGGCTATTTTCAAATGATATTGCGGTAAGCTACCTTGCGAACATTCCTCTACAAAATCCGCCCACACTTGGAGCAGTTTAAAACGTTGCTCTAGGCGTTCGCCTCTATCATAGGCGGCTTTGATTCGGTCGCTGTTTAAATGCGATAAGGCAACCTCGATTAAATCGCTATTGTAGCCTTTCTCATTAAGATAAGTGGAGGCGATGGCCCGCAAGCCGTGAGCCACTAATTTGCCCTTGTAGCCCATTCGTTTGATCGCACCGTTGGCGGTTTGAGTATTGACGTGCGTTTGTGGGTTCTTCACGCTAGGGAATAAATACGTTTTACCGCCACTTAGCTTTTTAATCTCTCGCAAAAGTGCGATTGCTTGGCGTGAGAGTGTGATTTTATGCTCAATGCCTCGCTTCATATTTTCCGCCGGTATCGTCCACAGTTTGGCTTTTTCGTCTATATCCGCCCATTTTGCCTTAGCCGCTTCATTCGGGCGGGTCATTGTGAGTAACTGCCACAGAATTAAATAGCGTGTCTGTAAATGAATTTGGGCGTTTTGTAAGGTGTATAAAAACTCGCCTAAATCTTCCGGCTTAATGGTTTTGAAATGTTCAACCGTTGGGCTATCAAACTCTTTCGCAATATTGGCGGTAGGGTTAAACGGTATCATTTCACGGTGTACGGCAAACATCATAATTTCATTATGTTTTTGAATTGCCCGTTTTAACTTCTCTAGTTTGCCCTCGTCTTGGTATTGCTTGAATGCCTTGATTGCCATTGGTGCGGTTATTTGTGTGATAGGCATTCTTCCAAAGTGCGGCAAGAGGTTATTTTTAATTAAGGCGATTACATCTTTTTGGTAGTTGTCTGAAAAATTCTTCTTGGTCTTGCGGTGTTCCAGCCACGCCCACGCTACATTTTCATAAGTGTTGCTGATTTCGTTGGCCTTTGCCTGTTCCTGTTGTTGGCGGTGGGTTTGAGGGTCGATATTTTGAGCCAATAATGCCCTATATTCTTCTCTAATTTCTCTCGCTTGTGCTAAAGAAATATCAGGGTAAGCCCCAATGCTTAAATCATTCCGCTTTTTTGTGAACGGTCTTTCATACCTAAACCGCCACAATTTAGAATTTGAGGTAATAACAAGTAGTAAGCCGTTACCGTCTCTTAATGGGCTGTCTTCCGGTTTCGCTTTTCTTATTTGGGTATCGTTTAACGGTGTGATTTTTCTAGCCATAGTAAACCTTTAGGAGTATAAAGCCTAAATCTTAGGAGTATGATTTTTTGTTTGGGAGTACAAAACTAAAAGCGATAAAGCCTTATTTGAAAAGGCTCTAAAGTGGTTTTAGGAGTACGAATTTTTGGGGGTATTCCGGCGTACTCCTAAATATACTCCTAAAATCTTCGGATTTGATTGTATCGTATAGGTACGCAACGGACAATAAAAAAGCCTTGAAACATTGATTTTCAAGGCTTTTTAGGTATCGGTTGAACCGTATAGGATTATAATTTGGTGGAGCTGGGGGGATTTGAACCCCCGTCCGAAATTTCTCTACCTTCAGTACTACATGTTTAGTCTAGTCTTTAATTTCGCTTATTCACAGCGGACAGACACGCAATGAATAAACTAGCTTTATTTAATTTAGTGTTTCGATCCTAAAGCGGCGGCGTCCACACGATCTCGTTTTGGGTGACTTATCTTTGCCCTCGTCTTACGAGCGGAAGCTGAGGAGATAAGGCTTTAAAGCAGGTTATTAAGCTGCTAAAGCGTATTGTTCGTCGTTTGCGACTATTATTTTGCGGTTTGTTTACGAGGCCTACCGCACCTCGACATGCACCTTGGGCTTCGCCAATCCCGTCGAATCCAAAATCAGCCCCAAAAGTAGCGGTATTCTAAAGGAAAGCGGTCGAATTTGCAAAAAGTTTTGCAAGTGGCGGAACTTAGCGGTATTGAATAGCTCGAAATAAAATCATACAAATCCCACACCAGATAGATTTAACTCTGTTATAATGTAAACCTTGCTGAGAGTGAAGAGAAATAGAATGAAAAAATTTAACGAGAACGAGATTGAAGATGCTGAAATTATAGATGCCGAGCCGATTGATGTTGATGAGATAGACGAAGAAGAAACATCGGTAGAAGCAATGCATCCGGCTTTGGTTTCCGGCTCAATGCCTGTGCCGCAGGGCAATTTGGATAGCTACATCCGAATGGCAAATCAGTATCCGATTCTCACCGCCGAGCAAGAAAAAGAACTGGCGGAGCGTTATTATTATGATGAAGACGTTGAGGCGGCAAAACAGCTGATCCTTTCCCATATGCGGTTTGTGATCCATATTGCTCGTGGCTATTTGGGCTATGGTTTACCGCTGGCAGATCTGATCCAAGAGGGTAATATCGGCTTGATGAAAGCGGTAAAACGGTTTGACCCGAATGTCGGCGTGCGGTTGGTTTCTTTTGCGGTTCATTGGGTGAAAGCGGAAATTCACGAATATGTGCTGAAAAACTGGCGAATTGTGAAAGTGGCAACCACCAAAGCTCAACGTAAATTATTCTTTAATTTACGCAAAAATAAAAACCGCTTGGCGTGGTTTAATGAAGAAGAGATCAAAAAAGTTGCCGATGATTTAGGGGTTTCAGTGGAAGAAGTACGAGAAATGGAATCTCGAATGACCGGACAAGATTTAGGTTTTGACCTGCCTGCCGGTGATGACGATGAAGACAGCTACGCTCCTTCTATGTATATTGAAGATAGCAGCTCCAATTTCGCCGATGACTTGGAAGACGAACAACATAATGGGCAGGCAACCGCTCAACTTGCCTATGCGTTAGCCACCCTTGATGAACGTAGCCAAGACATCATCAAAACCCGCTGGTTAGATGACAATAAAGCCACACTGCAAGATTTAGCCGATAAATATAACATCTCGGCAGAGCGGGTAAGACAGCTTGAAAATGCCGCATTGAAGAAAATCAAGGAAGCGATTTCATTAGACGGCTAGAAATGCCTACAAGCGGTGATTTTTTTACTCGCTACGCTCGCACTTCGTGCCGTCGGCAGAGCCAACGTTCAAACGCAAGCGTTTGTGCAAAATTTTACGCAAAAAGCACCGCTTGTATTTTGACTAAAAATGAGGATACTATGATTAACATTACCGATAAACAAATTGACCCAACTTTCTACCAGCGTCTACCAGCGAGCAGACGGCTTTATTAACGTTGCCAACGCTCATTTAAAAAACATTGCCCCAAACCAAGTCAGCAATGCGATGTTGTTTGGTTGTGCCAGATTTAACGCCTATGTTGCGGCAAGCAAGGCGGAATATAAACAGCAGTTGGCCGATTCCAGAGAAGAAGTTATTCAATATTTTGTGGAGCAATACAAAGAAATGCTCACTGCAAATTTAGATGAATATATCCAAAACTTCGAGCGATATATTGAAGGGAAAAAGGCGGATTAACCGCCTTTGTTTTGTGGTCAAACTTGTTTTACAAAATCACTTAAAACTTGATTAATTCTACTTTGCCAACCTTTACCTGAAGCTCTAAAGGCTTCAAGAACGCTTTTATCAAGACGTAACGAAACCAATTCTTTCTTTGAACCAGCTGGTCTGCCACGTTTTTTCATTGCAATTGAAAACTCTGATGGCGTAACCGGGCGTTCATCGTCATCTTTTCCGTCCCAAATAAAATCTTGGCTTGCCGGAATAGCTTGAATAGCCATAAGTAGCTGTTTTTTCTCTAAATTTTTATTATTCAAAGTATTGTTGTAAGTATTCATAATATGCCTCTCTTTCTGCTTTAGATGCTCGCCGAAAGCTAATTACTCTGATGTAATCTTCCCTTTCTGTATATGCAAGTGATAATACGAGTAAACGTCCAAATGAATATGCAAAAGATTGTATTCTAAATTCATTGTTACGAATAACTTCAACATCAAATCGATAGGGCGATGAGAGAACTTCATCTGCATCGGCAAAATCTAATCCGTGCTTGGCTAAATTGATTTTGCGTTTAGTTTCGTCCCAAGTATAAATTTTCATAATTATTGTATATACATAAAATAAATCTAACAAGAACTAAATTTAATTTAGCAAACAGTAATTTGAAAATCAGATTAGAAATACATTTTTTCGATGCAGATCGCAAAAATAAAATGAAATTTAACTGCTTGAAGAGTCTACTGAGCCATTTTCCCCGCTACCGTTAAAAAACCATCTGCGGTTTTAAAAATTTCACCGAATCCTTGAGCCTCCAAAATTTGGTCGGAGACTTCACGAAACGCCCCTTCACCACCGGCTTTTTGCAATACCCAATCTGCTTTTTCTTTGATGTAATCGAGGGCGTTACGGGTTGCAATCGCAATGCCACACACTTCAAAAGCCGGTAAATCTAAGGTGTCATCACCAATGTAAGCCGTTTGCTCAGGGGTAACACCGGCTTGCTGCATTAGCTCAAAGCAGGCGGAGCGTTTTTCCATTTTGCCTAACAAAGCGAGATCAATTTTCAGCACCTCTAACCGTTTGCGGAGCAAAGCCGTATCGCCGCCCGAGAGTACTGCCACTTTAATGCCACAACTTTGTAACATCTTAACGCCTAAACCATCGTGAACGTGGAAACGTTTCATTACTTCGCCTTGGTCGGTGTAGTACATTCCGCCATCGGTTAGCACGCCGTCCACATCGGTAATCACTAATTTAATCTTGGTGAGATCTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_020833|435651:443806|438166_438490_-|WP_006250284.1|DBSCAN-SWA METIQINEQAAEKHGLRPFDVAEFLTDEATIQAYLAEVLKEGDQDEFLEALNDVARARGMAELAKQTGLGRESLYKTLAKGSKPRFDTIQKILGAFNLVLIPQVKNG >NC_020833|435651:443806|436340_436766_-|WP_006250289.1|DBSCAN-SWA MKHELNLAGITALMNEPIKATLSFLDFPHIRIERLHHDNGRPFFIGVLSLDLEDHINIEMAGATGFLEALAIIAYHQQLTATPLLVNDDLLSEINKLPHPQRTNPFIDRHGNEITREQMSKEYREKIDYAFAEKRMAEGKE >NC_020833|435651:443806|436772_436925_-|WP_015484065.1|DBSCAN-SWA MPELLIVLGNRIAKLEQQHNAMPSETDSITLGILRKQLSQLLKVAERIKE >NC_020833|435651:443806|435651_436344_-|WP_006250290.1|terminase|DBSCAN-SWA MTELTPKQEAFCFAYIETGNASEAYRQAYETEDMKSETVHRKAKELMDNGKITARIEELKAEHAERHKLTVDDLLKELEEARILAREKENPNAMTQATMGKAKLLGLDKQVTDPCFDGETGKGDMILSVNCSSIKDGKALDETCILKAGTHEFITRDSFIFYRHIRIDSLDEIKANIEAGYFIQKALINDEAYQQILKGVLSSKSVTPRYKRFLKNAIRQSACPDILAEP >NC_020833|435651:443806|442564_442867_-|WP_006250278.1|DBSCAN-SWA MNTYNNTLNNKNLEKKQLLMAIQAIPASQDFIWDGKDDDERPVTPSEFSIAMKKRGRPAGSKKELVSLRLDKSVLEAFRASGKGWQSRINQVLSDFVKQV >NC_020833|435651:443806|443266_443806_-|WP_006250276.1|DBSCAN-SWA MLDLTKIKLVITDVDGVLTDGGMYYTDQGEVMKRFHVHDGLGVKMLQSCGIKVAVLSGGDTALLRKRLEVLKIDLALLGKMEKRSACFELMQQAGVTPEQTAYIGDDTLDLPAFEVCGIAIATRNALDYIKEKADWVLQKAGGEGAFREVSDQILEAQGFGEIFKTADGFLTVAGKMAQ >NC_020833|435651:443806|437085_437772_-|WP_006250286.1|DBSCAN-SWA MADHSQFISRLENRIEPKISFQELIQELSNYTNKPFSHIADKLKSLIFSFQQNGIYTNAFVNCTLFEDGESYAIEPKTLHFKDAFDQPKGVLSDVIAQNSIDVEHLNAYYVTAREITQLIKTQSPTLLDKLTTKQTQSEISQIQNDYISVYDFIEWASKHYSSLSETANDLNRLLKDKNIQLYRQYGGISPSIDKDNTNLKAAFDFVAINNGYEKQSSSFNFDDDIPF >NC_020833|435651:443806|439095_440322_-|WP_006250282.1|integrase|DBSCAN-SWA MARKITPLNDTQIRKAKPEDSPLRDGNGLLLVITSNSKLWRFRYERPFTKKRNDLSIGAYPDISLAQAREIREEYRALLAQNIDPQTHRQQQEQAKANEISNTYENVAWAWLEHRKTKKNFSDNYQKDVIALIKNNLLPHFGRMPITQITAPMAIKAFKQYQDEGKLEKLKRAIQKHNEIMMFAVHREMIPFNPTANIAKEFDSPTVEHFKTIKPEDLGEFLYTLQNAQIHLQTRYLILWQLLTMTRPNEAAKAKWADIDEKAKLWTIPAENMKRGIEHKITLSRQAIALLREIKKLSGGKTYLFPSVKNPQTHVNTQTANGAIKRMGYKGKLVAHGLRAIASTYLNEKGYNSDLIEVALSHLNSDRIKAAYDRGERLEQRFKLLQVWADFVEECSQGSLPQYHLKIA >NC_020833|435651:443806|438602_438821_-|WP_006253767.1|DBSCAN-SWA MMREQTTNQIIITDNFSKWLENLKNPIAKATVARRIKNAINGNFGDHKSLAGTGGLYEMRIATGAGYRIYYA >NC_020833|435651:443806|442253_442547_+|WP_006253765.1|DBSCAN-SWA MTQLSTSVYQRADGFINVANAHLKNIAPNQVSNAMLFGCARFNAYVAASKAEYKQQLADSREEVIQYFVEQYKEMLTANLDEYIQNFERYIEGKKAD >NC_020833|435651:443806|442838_443129_-|WP_006250894.1|DBSCAN-SWA MKIYTWDETKRKINLAKHGLDFADADEVLSSPYRFDVEVIRNNEFRIQSFAYSFGRLLVLSLAYTEREDYIRVISFRRASKAEREAYYEYLQQYFE >NC_020833|435651:443806|441128_442088_+|WP_006250280.1|DBSCAN-SWA MKKFNENEIEDAEIIDAEPIDVDEIDEEETSVEAMHPALVSGSMPVPQGNLDSYIRMANQYPILTAEQEKELAERYYYDEDVEAAKQLILSHMRFVIHIARGYLGYGLPLADLIQEGNIGLMKAVKRFDPNVGVRLVSFAVHWVKAEIHEYVLKNWRIVKVATTKAQRKLFFNLRKNKNRLAWFNEEEIKKVADDLGVSVEEVREMESRMTGQDLGFDLPAGDDDEDSYAPSMYIEDSSSNFADDLEDEQHNGQATAQLAYALATLDERSQDIIKTRWLDDNKATLQDLADKYNISAERVRQLENAALKKIKEAISLDG |
12 | Acinetobacter_phage(16.67%) | integrase,terminase | attL 435163:435222|attR 440528:440601 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
877101 : 884045
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_020833|877101:884045|DBSCAN-SWA TATGGGTAAAAGTGTTGCTATTCTTGGCGCTCAGTGGGGCGATGAGGGAAAAGGCAAAATTGTTGATTTATTAACAGATCGTGTGAAATATGTAGTACGTTATCAAGGTGGACATAATGCAGGGCATACCTTAATCATTAATGGTGAAAAAACCGTTCTGCGTTTAATTCCATCGGGTATTTTGCGTGATAACGTGACTTGTTTAATCGGTAATGGTGTAGTGCTTTCTCCAGAGGCATTAATGAAAGAGATGGGGGAGCTAGAAGAACGAGGCATTAATGTGCGTGAGCGTTTAAAAATTTCTGAAGCTTGCCCGTTAATTCTGCCTTATCACGTTGCGATGGATCACGCTCGAGAAGCGGCACTTGGTAAAAACAAAATTGGTACAACAGGACGTGGTATTGGCCCAGCTTATGAAGATAAAGTCGCTCGCCGTGGTTTACGTGTCAGCGATTTATTCGACAAAGAACATTTTGCCGCAAAATTAAAAGATATTTTAGATTACTACAACTTCCAATTAGTCAATTATTACAAAGTTGAAGCGGTAGATTATCAAAAAACCTTAGATGATGTGTTTGCGATTGCGGATGTGATTACCGGAATGGTTGCCGATGTGACAACTTTACTTCACGAAGCACGTGAAAACGGCGACAATATTTTATTTGAAGGGGCTCAAGGCACGATGTTAGATATCGACCACGGTACTTACCCGTTCGTAACCAGCTCGAATACGACAGCAGGCGGTGTGGCAACCGGATCAGGCTACGGTCCTCGTCATTTAGATTATGTATTAGGGATTATCAAAGCCTACTGTACCCGTGTAGGTAGTGGACCGTTCACCACCGAACTATTTGACGATGTAGGTGCTGAAATTGCTCGCAAAGGTAATGAGTTCGGAGCGGTAACCGGTCGCCCTCGCCGTTGTGGCTGGTTTGATGCCGTAGCCGTTCGCCGAGCAGTGCAAATCAACTCCATTTCAGGCTTCTGTATGACTAAACTCGATGTTTTAGACGGATTCAAAGAGCTAAAAATCTGCGTTGCCTACAAAATGCCAAACGGAAAAATTGTCGAATATGCCCCTCTTGCAGCAAAAGACTGGGAAGGTGTTGAACCAATTTATGAAACAATGCCGGGTTGGTCTGAAAATACTTTCCGTGTGACAAAACGTGAAGATTTACCACAAGCCGCATTAGATTACATTAAACGTATCGAAGAGCTGGTCGGTGTGCCGGTAGATATTCTTTCTACAGGTCCGGATCGTGTCGAAACGATGATTTTGCGTGATCCTTTTGCAGCTTAATAAAAGATAAAATAAAGCCATTTAGTGAGATAGAGCTAGATGGCTTTTTTGTTTGAACCAGTAAACTTTACTTTGGCACAATTTTGTCACAATACAGAAAATAGTTCTTTAGCGTGAGTTTTTGAGGCTGTGTAAGTATTTGAATTTAAAAGAATTTAATGGCACGCCCTAAAGGATTCGAACCTTTGACCCACGCCTTAGAAGGGCGATAGGTATTTTATAAAAGGCGTTTATTTTAACTAATAAAAACAAAGACTTATAGAGATAACCCCTCTATATTACCTACCATTATTTCACATCTTTTTACATTAAATAACACCATTTACGGTACATTTATGGAACACGTTGGTGATGAGCTAGTCTTCAAAAGTTACTAAATTAAACTACAATCTGCCCCGTCTCTTTTAAGTACTTATAGATACGCCCTAACATAATCTGCGTTGGCGTTTTGCCAATATCCTCTTTTGTTAGCGGTGCATCAGTAATCTCCTTGGCGGACTGTGCATCAATGTATTTGTACTCACTTGTGATGATTACAAAGTTTGTTACTTCTCCATCGGTATCATCGCCTGTACCGACCACATATTTAGCATTGAGCGAGCCGTCATCTTGCGTTGAGTAGCTTGCGATGGTGGAATACATTGGGTTTAAGATTTTGTTAAAAGTTGTCATAATTTTTCCTTTTGTGGATTGTTGATAAAAAAAGACCGCTTGTAGTCATACAAACGGCTTAGTAGGAAGAGTAAATTGCTTTACATAATATAACCTTTTATTTATACTTCATTTATAAATAGTAAGTTATAAAAGGTTCAAAAATGGCAGACCCTATAGAATGGTCTATTATCACGACTGACTGCTTTGATGAATGGTTCGGTCAACAAGATGAAAGTACTCAAGAACGTGTCTTGGCTTGTTTAATCTATCTGCGGAAATTCGGTTATAGTCTAGGCAGACCTTATGCTGATACAGTTTATCAGTCTAAATTCCCTAATATGAAAGAGTTACGCATTCAAAACAAAGGTAAGCCAATTCGAGCATTTTATGCTTTTGACCCTTTACGCCAAGCGATAGTACTTTGTGCTGGCGAGAAAGGTAAAGACAAAAGATTCTATGAAAAAATGATCGCTCTTGCTGATGCGGAATTTACCTCCTATTTAAATAATTTAGAGAAAGAAAATGAAAACGTTAGATCAAATGCTCAATGAACTCTCTCCTGAACGCCGCCAAAAAGTGGAAGATATGGCTCAAGAAATGATTAGAGAGATACAACTTTCAAAACTAAGAGAAGAGCTAAATCTCTCTCAACAACAATTAGCTACAGCTCTCGGTATTTCACAGCCTGCTATTGCTAAACTTGAACAGAAAGATAACGATCCAAGATTATCCACGCTCAAACGCTATATTGAAGCAATGGGCGGTAAGTTAAAACTTGCCGTTGAATTGCCTACAGGCGATGAGCGTGTAATTAGGATTTAATTACTTTGTTAACCTGAATGCCCTCCTGAGCCAATACAGTTTTTCCCCGGTAATTGCTCTTGAGGGGCTAGTTGATAACAAAAGGTTGGTTTTGTTGTATAGTCTTGCTTATATTGAGTTGTACAAGCTGAAACCATAATTGTTGTAAGTAGTATAATTTTTTTCATATTTGCCTCCTATAATTGATAAGATGAACCATTTGTAGATGATATAATTGCTCGAAAATTCACTTTAGCACTTCTCCCACGCCCTGCACACCACGCACGACACGTTACTACATATTGAGTATTAGCAATGAGTATTGCCCCAGAATCATTAAATGGGTTAGATACATTAGGTGAAATAGTATTGCTAATATCAATTACAGACGGTAATGTAATTGTTGTCGGTGTCCGATTACTACCACTACCATAAAAAGTTTCGCTTTTACTCTCTCCTGTTGGAGTGTGGACAACATACAATGTTCTCGTCGCTTTTGTAGCAGGTAGTACAAATTGACATACATACTCATAATATGTATCACTTAATGCAAAACTGTTTTTCGTTTCTGAATATGTTTTACTTTTCCCTGTTGCTTTTGATGTCCAAGTTTTAGCCTCATAGATATTACCTCCGATCAATTGGTTGATTTCAAGTTCTCCAGTAAATTTACCTGTTAATCCCTCAATTCTTGCTCCTTTAATTATTCCCCCTGTAATTGTTGTACCTGAAATTGTCCCACCACTAATTGTCGTCCCTGTAATTGTACCAGCAGTTACCTTACCAAGATTTGCCGATATTGCCGCTAAATTGTTTACATTTAGCTTATCCGCAGTGATCGAACTCCCCACAATATGACTTGCATTAATCGAGTTTGCTGCCATATTTCGAGCTGCAATCGTGCCGGCTGCGATTTCGTTGGCGGTAATGGTATTTGCTGCAATTTGTTGAGCAGTAACGGTATTAGTAACTATTGAGCCACCGTGGATAGCGGTTACACCGGCATTTTGCCAAGGGCTATTTTAGGTCTGTTTAATAGGCTGGCTATAACAGGTATTGTTGCTAACCGTTGATTAGCCCCATCAGCACGCATCAAGAATACATAGTTGAGCCCCGTTTTTTGTATGCCGGCTGTACCCTGTACATTCAGGCTAAGTGTGTACTCTTGACCCTGTCTGATATTACTTACTTGAGCGGCTGGTGCTTGTACAATACCGGCCACACCTGCGCCACCAAGCATTCCGAGTCGTATCAACATATTGCCGCGATAGACTGTGCGTGTGATTGATGACATTTTTGTATTGTAGTTGATGTGTTGGTTGTAAGTACTGTCTATCAGTAAGTTCCTTGCACCGATAGAAAGTGAATCAACGGCAGATTTTGCATCAGCTTTCCAAACTGCCTGCAACGAACTTTGTGCAAGGCTCGCAACCTCACTTTTATTCGCTTTGGTTGATTGGAAATTGGTAATAGTTGATTCCGCATTTGCAACACGGCTTGTTATGTCTGTGAGTTTATCTGCATTCACTTTATCTGCATCAACACGAGCTTTTTTTTCTTCCGTGATTTTGGCATTTAAATTGCTCTCTGCTTTGGTCAAGTTCACAGATAACTGATTAAGTTGCTGTGCTTGTGCTGAATCGGTAATTATCCCTTATTTTCTAAAGCCTGTTTTCTTGTTGCTTGCCGGTTGGTTTTCTTTAATGGTGATCGTCTCAACTCCCTGCGATATCACAAGCGAGCCGGTCCGAATTAAGCCATAAGCCAACGGCACAGGTTTGCCTTGAGTCACCAAGTTATTTAAATTTGAAAAAGCCGTTGAGCTTTCTTTTTCTGTTTCATTACCCATTGTGGGGGCTTTTGGCATTTTGGTGAGCATTTGGGAAACTCCTCCTAGTAACATCGAAGCCCCTAACATACCCATCATTTTTGCTCCAGCTCCCCAAGCCGCAATAGAAGCACCGCCAGTAAAAAATGCGGCTCCGATCAAGGCTGCACCTAAAACAAAATTAAACACGCCACCGCTTTTCGCTCCTTTGATAACAGGGGTAAAATGAATGGTTTGCCCTTTCTTCAGACAATAAAAAAGCCCTTTTTCAAGGGCTGACGGGTCTAAATACTGTTTGCCGATACGGACTTTATAAACACCGTCTCGTAATGCCTCACGCAATCCGCTAATCTGTGTACATAAGGCTCGGATAGCTTCGGCAGTATCTTTAACTTCTAAGCTAAATTCACTACCAAATTTTTTTAAATTGCCGTAAAATTTAATTTTAGTCATGACTCACCATTACAATTATAGCCAAAATAAAGGGGATTTATGTTCTTTATTTTTCTTAACTCTATAAGCATATTATTACTTATTTGTTTATATGCAATTACTAGTTATTTTTTTATTTTCGAGAAACAAATTAAATACACCATAAAATCAGCAATCTATATTGGAATACTTATTTTTTTATTTAAAATAATATTGCCAATTGTTTTATATTACTATCATAATTAAGGTGTTATTTTTATCTTCTTGTCTATCGAAAATCGTACCGATTTTATCCAGCTATCTTGAATAATATAAGGTGTTCCATTTGGGTTCCATTCTCCTTTAGTAAAATTGAATGTATCAAATGGGTCAGTGAATCTGTCCCTGATACTATAATGGATATTTCCCCTAGCAATACCACCGGGAAAAATTTGTATATCTTTCAATTCTCCACTAATGGTAGCTGTTCCTAACGCCCATAACGGATCTGCAATACCCGATGCTTCTTTTGTAAAATCATAAGCATTGGAGAAAGATGTGCGTCCTTCATTTTTATATTGCGAAATAAATCGGCTTTCTATACTTCCATTGGATTTACCAAATGCTTTATCTTTATTCACTAGAGGACGAATTTTATTACTTAATCCAACGGATGAAAGATTTAATGCCTCTCCATTACCATAAGAATAATGCTGATATAAGTCAAAAGAATCAAATGGAACTCCCTGATAAATAGGAGGTATACGATTTTTCTCTAAATTCTTTTCCATTTCATGACCAAAAGATTTAGAAAACTGTGAAAACTTCGTATTGTATATTTTATCTGCTTTATCAACATCCCCTTTTTCTAAAGCATCCAAAAAGTCTTTGTAGTCTTTACTCTTTTTCATTTGTGGACAATCTTTTTTACCACAAATAAAGCAGATCTTATTAACTAATAATTGATATTTACTAAATTTCATATTGTTCTCCTATATCATTAAATATGCCGTCAAAATCCAATCTATCCGCCAGTTTATGCCGCCAAATACTGTGGGTATGGCGTAACCAATAACCGTCATATAAATCACGCTTAGATAATCGGTTCGGGCTATGGTGGATTACCATTTGTTCACCAATATAAATCGCTGCGTGATTCGGCACATCAGAACCGACCTGTATTAAAATCACATCGCCGATTTGGGGTGTATCCACTCTCTCAAAACCTTGCCCTTGAATGTTATCCAAGTAAAGATTTTGCCCGGTATACCGCTGCTTTAAATTCTGCCATTGTCATTCCCAAACCTTTTGCCATTGCTTGAATAATGGTTGGGGTTTGAGTAATGAGCGAGTTAAATTCTTGGGCTTTCATTTTGCCCATTAAAAGTGATTGACCAAATTGGGTTAGGGCATTACTTGCTGCAGAACTGCTTGCGCCGCTTGCAGCAACGGCTTGAGAGACCGTTTTAGTTAATTCTGCTACATCTTTTTGAGCCAGTCCGAGAGATTGGGCATTTTGAGCAAATGTTTGATAGACACCTGAAACAGCCTCTGTACTTTGGCTTGTTTTAGTCGCAATATCAAACACATCAGTTAATCGTTTAGCTGCCTCTGCTGAACTACCGCTTACTAATTTCATTTTATTTTGAATATCAGTATAGGCTTTTGCCGCACTCAATATGCCACTAGACATTGATTGATAATGTCCACCAATAGTCGATAAAAATGAAAATTCAGAATTTTTATTGAGGTTCTTTGCCGCTTGCTCAATGTTTTTTAAATATTGGGTTGAGCGATCGGCAAATTCTTTGGCGTGATTTCTAGCTCTATCCATATTTTGGATAAAGTTCTTGGCAAATTTTTGTGCCTCATAATCAGATTTCGTCATTGCGGACTGAAATTTTGCATTTTCAAGCTCTAAGGTAACGGTTAATTTTCCTAAGCCACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_020833|877101:884045|881509_882136_-|WP_006247807.1|tail|DBSCAN-SWA MTKIKFYGNLKKFGSEFSLEVKDTAEAIRALCTQISGLREALRDGVYKVRIGKQYLDPSALEKGLFYCLKKGQTIHFTPVIKGAKSGGVFNFVLGAALIGAAFFTGGASIAAWGAGAKMMGMLGASMLLGGVSQMLTKMPKAPTMGNETEKESSTAFSNLNNLVTQGKPVPLAYGLIRTGSLVISQGVETITIKENQPASNKKTGFRK >NC_020833|877101:884045|883334_884045_-|WP_006253312.1|DBSCAN-SWA MSGLGKLTVTLELENAKFQSAMTKSDYEAQKFAKNFIQNMDRARNHAKEFADRSTQYLKNIEQAAKNLNKNSEFSFLSTIGGHYQSMSSGILSAAKAYTDIQNKMKLVSGSSAEAAKRLTDVFDIATKTSQSTEAVSGVYQTFAQNAQSLGLAQKDVAELTKTVSQAVAASGASSSAASNALTQFGQSLLMGKMKAQEFNSLITQTPTIIQAMAKGLGMTMAEFKAAVYRAKSLLG >NC_020833|877101:884045|879884_880043_-|WP_006247809.1|DBSCAN-SWA MKKIILLTTIMVSACTTQYKQDYTTKPTFCYQLAPQEQLPGKNCIGSGGHSG >NC_020833|877101:884045|882357_883077_-|WP_006247806.1|DBSCAN-SWA MKFSKYQLLVNKICFICGKKDCPQMKKSKDYKDFLDALEKGDVDKADKIYNTKFSQFSKSFGHEMEKNLEKNRIPPIYQGVPFDSFDLYQHYSYGNGEALNLSSVGLSNKIRPLVNKDKAFGKSNGSIESRFISQYKNEGRTSFSNAYDFTKEASGIADPLWALGTATISGELKDIQIFPGGIARGNIHYSIRDRFTDPFDTFNFTKGEWNPNGTPYIIQDSWIKSVRFSIDKKIKITP >NC_020833|877101:884045|879215_879605_+|WP_006247811.1|DBSCAN-SWA MADPIEWSIITTDCFDEWFGQQDESTQERVLACLIYLRKFGYSLGRPYADTVYQSKFPNMKELRIQNKGKPIRAFYAFDPLRQAIVLCAGEKGKDKRFYEKMIALADAEFTSYLNNLEKENENVRSNAQ >NC_020833|877101:884045|878778_879072_-|WP_006250050.1|DBSCAN-SWA MTTFNKILNPMYSTIASYSTQDDGSLNAKYVVGTGDDTDGEVTNFVIITSEYKYIDAQSAKEITDAPLTKEDIGKTPTQIMLGRIYKYLKETGQIVV >NC_020833|877101:884045|880849_881461_-|WP_006253310.1|DBSCAN-SWA MNLTKAESNLNAKITEEKKARVDADKVNADKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASLAQSSLQAVWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLLNRPKIALGKMPV >NC_020833|877101:884045|880052_880739_-|WP_006247808.1|DBSCAN-SWA MAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTISGGTISGTTITGGIIKGARIEGLTGKFTGELEINQLIGGNIYEAKTWTSKATGKSKTYSETKNSFALSDTYYEYVCQFVLPATKATRTLYVVHTPTGESKSETFYGSGSNRTPTTITLPSVIDISNTISPNVSNPFNDSGAILIANTQYVVTCRAWCAGRGRSAKVNFRAIISSTNGSSYQL >NC_020833|877101:884045|879576_879876_+|WP_006247810.1|DBSCAN-SWA MKTLDQMLNELSPERRQKVEDMAQEMIREIQLSKLREELNLSQQQLATALGISQPAIAKLEQKDNDPRLSTLKRYIEAMGGKLKLAVELPTGDERVIRI >NC_020833|877101:884045|877101_878400_+|WP_006250049.1|DBSCAN-SWA MGKSVAILGAQWGDEGKGKIVDLLTDRVKYVVRYQGGHNAGHTLIINGEKTVLRLIPSGILRDNVTCLIGNGVVLSPEALMKEMGELEERGINVRERLKISEACPLILPYHVAMDHAREAALGKNKIGTTGRGIGPAYEDKVARRGLRVSDLFDKEHFAAKLKDILDYYNFQLVNYYKVEAVDYQKTLDDVFAIADVITGMVADVTTLLHEARENGDNILFEGAQGTMLDIDHGTYPFVTSSNTTAGGVATGSGYGPRHLDYVLGIIKAYCTRVGSGPFTTELFDDVGAEIARKGNEFGAVTGRPRRCGWFDAVAVRRAVQINSISGFCMTKLDVLDGFKELKICVAYKMPNGKIVEYAPLAAKDWEGVEPIYETMPGWSENTFRVTKREDLPQAALDYIKRIEELVGVPVDILSTGPDRVETMILRDPFAA |
10 | Mannheimia_phage(60.0%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
887278 : 897595
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_020833|887278:897595|DBSCAN-SWA AATGCACATAGAAGACAAAATCGCTTGGTGGCTTGCCAATGGAGAGACAGGGGTAAGCAGTAAAACAATGGCTTTTTACCTTGGTTACGGAATAAGACCAAAAATAGAAGGCTACCCACACGATGTATCGGATTTCAGGCGTTGCTTTCTGTTGTTGGAGACAGTCCCTTTTTTGCGAAATAGGATTGAAAAAATGGCTGAACTTGGGAAAGTTTGGGCTGCACTTGCAAAAGAATGGCACACATTAGAGGCTCTCTACAACGAAGAGGAATGTCAAATAAGATGCCCCAAAACCTATGCTAAGTTGAGAGAAATCCTAGAAGCCAACGAAGAAAATGTTGTCCGTATTGGGAATTTGAGTATTTCGATAGGATAGGTAAAAAATGCAATTCACCTACGGCTCAATTTGTAGCGGTATCGAAGCTACAAGTATAGCGTGGCACGGTTTAGGTAAGCCTTTGTGGTTCTCTGAAATTGAGCCATTCCCCTGTGCGGTATTAGCTCACCGTTTCCCCAATGTGCCAAATGGAAACGGTATGGCTGTGCCTTGATGCAGTGGATAAGGCAAAGACTTAACGATTATTTAGTACAATCCCTCGTTTAGAGGGATTTATTTTGGAGAAAGTAATGAATGGAACATCTTACTATTAATCAAGTGGCAAAAGAATTAAATTGCCATCCAAATACAGTCCGCCAACATTTGGCGGATTGGGGATTTTTTAAAATGGTAGGCTCGGAAGTTTGGCGGATCAACCGAGAAGATTTGGAAAGAGCAAAAAAGAGAGCCGGTATTGACCCAATAAGAAAACGATCTGATAATGACCGAGGGTTATCTCTGTCGGTCGAGGAGAATGAAAAATGTCGATCTACAGACGAAAAGCAAACGGTCCGTGGTGGGTTGATATCACAACCCCAAACGGCAAGAGAATTAAGAGAAGCACTCGCACGCTTGTAAAACGTGAAGCTCAGCAGTATCACGATAAACTCAAGCAAGAAATGTGGGCAGAGGATAAACTCGAGGAAAAGAGAAAATATATCTTTGAAGATGCTTTGCTCCATTACGTTCGTGCGGCCGAAGAATTAAAAGATAAAGCCACAAAAAAGCGACATGCTGAATACTGGTTATCCAAATTTGCCGGTCGTGAACTCAGCTCTTTAACAGCTCAGGAGATTATCCTAAATATCCCGAAAAAGAATGCAAATACGAAAAAGCCTCTATCTCATAGTACGCAAAATAAGTATGTGAAATCTTTATCGAGAGTATTAAATATCGCTCATAAACTTGGTATGTTGGATGCAGTCCCACACATACCGAAAAAGAAAGAGCCGCCAATTCGTGTACGCTGGATCACCAAAGAACAAGCAAAACAGCTAATAGATAAATTAAGTTCAGACTGGATGAAATCTATCTGTAAGTTTGCTTTGATGACTGGAGCCAGACGGACAGAAATTTTGACAATGACTTGGGATAAGATAGATCTTGTAAGAAAGGTAGCAATCGTGACTAATGATGTCGCTAAATCAGGTAAGGCACGATCGCTATTACTGAATCAAGAGGCAATTAAGCTGTAGAAGATCAGACTTGATCTGACAATTCACTCTAAAAAGTGAGAGTTTCCCGTTTAGAATATGAGTGTCAAAAATCAATCTAAACAAAAAGGAAACTCTCATGTTTTATTCTAACAACCCTCTCATTAAACACAAGACCGGTTTATTAAATTTAGCAGAAGAACTGGGTAATATTTCTCAAGCCTGCAAAGTAATGGGAATGAGCCGAGATACATTCTATCGTTATCAACAAGCGGTTGAGCAAGGTGGTGTTGAAGCATTGCTGAATCAAAATAGACGCGTTCCCAACTTAAAAAATCGTGTTGATGAGGCAATAGAGCAAGCTGTTGTGAAGTTTGCTCTTGATAACCCGGCATTTGGACAGGTAAGAGTGAGTAAGGAACTCCGTAAACAAGGCATCTTTGTTTCAGCAGGAGGTGTACGTTCGATTTGGTTACGTCATCATCTTGCCAATTTTAAGCAAAGATTAATCGCCCTGGAAAAACTGGTTGCAGAACAAGGTATTATACTCAGTGAAACACAGGTACAAGCCTTAGAGCGTAAGAAAGAAGATGAGATTGCCTGTGGTGAAATTGAAACGGTACACCCTGGCTATCTTGGCTCACAAGATACTTTCTATGTGGGCAACCTCAAAGGAGTGGGTCGTATTTATCAACAAACGTTTATTGATACTTACAGTAAAGTGGCGTTTGCAAAACTTTATACAATGAAGACCGCTATCAGTGCTGCGGATATTACTTTCTTTGCTCACACCGCTATTATTCAGTGGTGGATAGCCGAGAAACTGCTGTAATGCCTTGCTGTCTAATTCATCAAGCAAACCTTTGATACTCGCAAACAACACTAAGTCCGCAAATTCAATAGCGGTAGATTGCGTTTTGCGTAAGGTTAAGCGGATTTGTTGGGCGATAAATTTTTCCCAGTTTTCATCCGCTAGTGCTTCTAATTTTTCATTCGGGATTTCACCGTCCATTCGCATTTTGTCGTGATGCCAACAAAGCTGTACCGCACCGTTTTTATTCTCTACCAGCACTTTTTCCGTGTGGCAATATTTGCCATCTCGGCATTGGCACGTCTGAATTGACTTTACAAACCGGATATAAGGCAAATCATTACTATATTTGTCACGCTGATTTAGCGTTGAACGAACTTTTGCCGATTTAGCAAACACCGCCAGCTCTTTACAAGCGGTCGAATTTGCCGAAAAATTTGCAACCTTGCCTGATTTAACCGTCGCTAAATCGGTCGGTGCAGGTTGCAACAAAGTTCGCTCACCGAAAGCAGCAGGAGAAACATCTTTAGGCACTTTGTAAAACACAATACCCACTTCGGTTTGAAAGTAAGGGGTAAGTAGCAAACCTTCCGCCATTATTGCCCCCATTTCTCGGTTTCATCATAGGCTTTCACGAATAGCATAAATACGCCAATACAGATTAAAAAAATCAGTACGCCAATTACTGCACCAATACCAATAAATAGTTCCCAATAATCCATTTTATTTACCCCATTCCTTGATTTTATCTAGTGGCATCTGACGAGTTACAATGCCCTCAATAAATGGGTCAAACACAACAATCATCGAGCCTTTATTATTACCTTGTGCCGGTTTACCTGTTACCGGGTTGATAAATTGAATCCGCCCTGTCCGCCAAGTGCCTTTTTCATCGTGATAGCCAATAATATCAATTACCTCATTAGCGTGTTGTTGAATGATGGTGTACCATTCTGTTGTTTTATCCGCTGGTAATAACATCACAACCAAATGACCTGCTTTTTTCAATTCTGCCGCTCGTTGAACAAAAGGCAGTGGATCAGAATATGGCGGATTAACGAAAATACGCAGTAATTCTCCCCAGTCTGAAACTTTATCTAGTAGCACATCAAATAAATCATCGGCTAAAAAATCATCGGCAATTTGGCAACTTAATTTATCATCATCTAAACCGTCTGCCGCTCTACCAATCCAATAGGTGTACAACGTATTTTGTCCGTTAGAGCAACCGTCAATATGAAACCAAGCATAACGATGATTTAGCCAATTACGCACATAATTAGGTGTTTGGTAAGTGTTTTTATCAAAATCTGTCATTGTCTAATCCTTACGAAAATGTTGGTACTCTCAAACGGTCGATACGCTCAACCGCATTTTTAATTTCTTGGCTGATAATCATCGGCAAATCACGTTCAAGTGGTCGCTTGTTTCTGGTGTTGATTGTGGCGTGGTACATCACTAAATTTCGTTTGTTGGTAAAGTCCAATGCCTTAAACGGATTGCCACTGAGTGATTTCTGGAACAAGGCTCGTACTTCGTCCACCGTTGGCATAATCAAGCGTTTTTCCAGCTCCGCCGGTGTAACCCACTTACCATTTACGCAAACAGGCTTTCCGTTATTAGCCCAAGCGGTCGATTTTGGAAAATAATCTGCAAAATTCGATTGGCGGAAAATCGTTTTCGGGCAGAGGTATTCACGCATTTTTTCATCTCGTCCCCATTTAGCGACAAGGTAATCCACCACTTGGCAACAGTCCGCCACCGAACTTTCACGAATGCGAGCAGTAATATTTTTTGCCCACGGCTTGAGCGAATACCCCACAGGCTTACGCTCACCAAGCTGTACCGCCAACGTTACCAAAGCCGAATTGAGATAATTCAACACAACTTCAGCCGGGGCAGGTTCCCCCGCTGGGGGATTAAGGGGGGTAGTATGATCATTATTATTTTTATAATTAGTATTATTATCTGTCGGATTTTTTTCCGAGCTTTCTCGGAAATTTTTCCGAGTTTGTTCGGAGTTATTTCCGATACTCGGATTTTTTTCCGACTCACGGATCGGCTCGAATTTATTCCATTCACAACCTTTTTCGGTTAAACGGACATAATCTTTACCGTCCATTTTGAAGTGGTCGATAATGCCTTTTTCTTTCAACACCTTATATTGGCGGTAAACTGTATCTTCTTTGCTAAAAACCGCAGGTAACTCTTCGCAAACCTTGCTAAATGACATCCAGTAATAGGTTATGCCGTCAATAACCACCGCTTTCGCCCAACTGGAGGCTTGATTGATTAAATCGACCAATGCCCCTTGTGTAATATTGATTTCCCATTCCACTAAGCGGACATTGTTTATGGTTGATGTAAATCTCATTGTCCTAACTCCGATGCGTAACGTTGAGCAATCCATTCAATCCCTTTGGCGGTTACTCTCGTTTGGGTAAAATTATGACCGTGTTCTGCCGTGCCGGTTTTTACTGCAAAAAGCTGTTTAGCTTGTTTATCTTGATAAGGGAGTAGGTTTCCTGATTGGCGATAAAGAACTCGATATCGTTCTAAACATTCAATCAACCGCTTTTCTGGAAAATTGAGTATCTTGGCGGTTTCTCGCAATGATTTAGTCGTTCCCACCTCAACATAATGCTCCACAAATGCGACT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TTACTTAATGATGATGCAATTGAATTATTACAAAAGCAGAGAGGGAAAAATCCTAAATATGTTTTTGTAGGAAGCAAAGGGCAGGCATTACAAGATATTAACCGCAAAATATTTAACAAAGCGACTGAAAAATGTTTATTGGTTGATTTCCATTTCCATGATTTAAGGCATACTTGGGCCAGTTGGCACGTTCAGGCCGGCACACCATTATTTACCTTAAAAGAATTGGGTGGCTGGGAAACATTAGAGATGGTAAAGAAATATGCCCATCTTAATGCAGACCATTTACTCAACCACGCTAACTCAGTTAAATTCTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_020833|887278:897595|893042_893699_+|WP_006247791.1|DBSCAN-SWA MNTQTLGDRIKSRRKELKLTQKDLATALKGVSHVAVSQWESSTTKPNSENILDLSTVLQCDISWLLRGNGESNVLPASLGMTKVPLISYIQAGQWTGIDDFRETCGDYEYILTDLEVSEDAFALEIKGDSMEPDFIEGDRVIIDPDVQPHAGEFVAAINGDYEATFKKYRPLEDLDEYGRQHFELIALNPDYHKLSTLKQEIRIIGTMVEHRIYRRKR >NC_020833|887278:897595|895009_895606_-|WP_006253352.1|DBSCAN-SWA MKKLLMTLCCLPAFALANETGESCSKIEDSAKRLECYDSVFVKKDTGKDEATDEKSNWEYEQKKDELRNATTYFAKIRSTNTIDFGFPYNSSSMNLMLRKDPKYGNDVIFSVHGQFNGCMIESCKITVKFDDGKLESYRMIGADGGSNDTLFIENAKAMKTFVDKLKKSKKLIVEASFYNYGKGQFTFDTQGLEWKHF >NC_020833|887278:897595|893710_894085_+|WP_006247790.1|DBSCAN-SWA MTEFKDVKQAIVEAQLASTPKDKVVNDIMKGSAELLSANDIINRLGIGADEFQELVNLPNHYLRINGGLGAAVYNTRRMFDTHVELVNQELEKNISFPKPDLYILGKARWKKETFKKWLEEQCR >NC_020833|887278:897595|890341_890935_-|WP_006247795.1|DBSCAN-SWA MTDFDKNTYQTPNYVRNWLNHRYAWFHIDGCSNGQNTLYTYWIGRAADGLDDDKLSCQIADDFLADDLFDVLLDKVSDWGELLRIFVNPPYSDPLPFVQRAAELKKAGHLVVMLLPADKTTEWYTIIQQHANEVIDIIGYHDEKGTWRTGRIQFINPVTGKPAQGNNKGSMIVVFDPFIEGIVTRQMPLDKIKEWGK >NC_020833|887278:897595|896620_897595_+|WP_006249218.1|DBSCAN-SWA MAGINKVIIVGRLGNDPELRTMPNGDSVAKISVATSTEWTDKTSGEKKQATEWHSIIAFRNLADIIGKYLKKGSQVYVEGKLRTRKWQAQDGTDRWTTEIIADQLQMLGSSNSGNSNNNWATEPAGNPPPTNPYNHVMTDSESRDFDDDIRVRWITKEQAKQFINNISTDWMKTICSFALLTGARRTEILSMTWDKIDFIRKVAIVSNDIAKSEKARSLLLNDDAIELLQKQRGKNPKYVFVGSKGQALQDINRKIFNKATEKCLLVDFHFHDLRHTWASWHVQAGTPLFTLKELGGWETLEMVKKYAHLNADHLLNHANSVKF >NC_020833|887278:897595|892729_892918_-|WP_006247792.1|DBSCAN-SWA MKKDDVLEHFGTLEKVAATLGISVSAVSQWGEIIPEKNAYRLQEITAGKLKVKHSLYRNRSK >NC_020833|887278:897595|891988_892672_-|WP_006247793.1|DBSCAN-SWA MNQLLNISAPKASITMSSREIAELCEKEHRHVTRDIEAMFSQLDIPAEGYAHFWTHPQNGQTYREFRLPYDLTLTLISGYSVILRKKIIDRWQELESRQGIPQSFSQALRLAAEQQEVIEQQNHQLAIQAPKVAFVEHYVEVGTTKSLRETAKILNFPEKRLIECLERYRVLYRQSGNLLPYQDKQAKQLFAVKTGTAEHGHNFTQTRVTAKGIEWIAQRYASELGQ >NC_020833|887278:897595|887278_887653_+|WP_006247798.1|DBSCAN-SWA MHIEDKIAWWLANGETGVSSKTMAFYLGYGIRPKIEGYPHDVSDFRRCFLLLETVPFLRNRIEKMAELGKVWAALAKEWHTLEALYNEEECQIRCPKTYAKLREILEANEENVVRIGNLSISIG >NC_020833|887278:897595|894236_894974_+|WP_006247789.1|DBSCAN-SWA MLSKQVLSISESRLSTYLFCFFRNDPTKQKEAIAIYTALQHRTGIYFSLIQEIEVALRNEVSQLLRFAAPNHNLYEFFHFLANDSNAPLNAESKRQLQKAISECGRNYNENDIISHISFGFWVNLFNYDIKRNQYVAYWQSVLKPIFGHRFSNFKDLYNTLKQIMRFRNRLYHQEVVWNKRIAKKPTHALENLEKTYKQFELALQKIAPERFAFRQLSQALIWQRQIFFDQQIFEAEIVILPQHI >NC_020833|887278:897595|896420_896618_+|WP_006249219.1|DBSCAN-SWA MARKIDAGVEIVEVDKRFIAKFFYDGKLQHTTYPQYNRQNAIMLINRKIERFNIGRDKPIKLYKE >NC_020833|887278:897595|887908_888232_+|WP_006253316.1|DBSCAN-SWA MEHLTINQVAKELNCHPNTVRQHLADWGFFKMVGSEVWRINREDLERAKKRAGIDPIRKRSDNDRGLSLSVEENEKCRSTDEKQTVRGGLISQPQTARELREALARL >NC_020833|887278:897595|890945_891992_-|WP_006247794.1|DBSCAN-SWA MRFTSTINNVRLVEWEINITQGALVDLINQASSWAKAVVIDGITYYWMSFSKVCEELPAVFSKEDTVYRQYKVLKEKGIIDHFKMDGKDYVRLTEKGCEWNKFEPIRESEKNPSIGNNSEQTRKNFRESSEKNPTDNNTNYKNNNDHTTPLNPPAGEPAPAEVVLNYLNSALVTLAVQLGERKPVGYSLKPWAKNITARIRESSVADCCQVVDYLVAKWGRDEKMREYLCPKTIFRQSNFADYFPKSTAWANNGKPVCVNGKWVTPAELEKRLIMPTVDEVRALFQKSLSGNPFKALDFTNKRNLVMYHATINTRNKRPLERDLPMIISQEIKNAVERIDRLRVPTFS >NC_020833|887278:897595|896251_896437_+|WP_006249220.1|DBSCAN-SWA MNKMKQLAPFALLILLLGIVGRMDYDDHIQMQRYKCERNQGFWQMESNGNQYCGGKYGTKN >NC_020833|887278:897595|887660_887828_+|WP_006253314.1|DBSCAN-SWA MQFTYGSICSGIEATSIAWHGLGKPLWFSEIEPFPCAVLAHRFPNVPNGNGMAVP |
14 | Mannheimia_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
971325 : 1076937
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_020833|971325:1076937|DBSCAN-SWA 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103 | Mannheimia_phage(43.86%) | integrase,transposase,tail,tRNA,terminase,holin,portal | attL 961670:961729|attR 1061882:1062043 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1102097 : 1191422
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_020833|1102097:1191422|DBSCAN-SWA 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107 | Mannheimia_phage(84.62%) | integrase,plate,tail,tRNA,terminase,holin,capsid,portal,head | attL 1090859:1090877|attR 1193979:1193997 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1355632 : 1493828
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_020833|1355632:1493828|DBSCAN-SWA 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MSLSVLDQLEEKIKQAVETIQLLQLEVEELKGKNDAAKQENDTLRSEYEQLKVEQQNFQDRLRSLLGQIDNV |
163 | Mannheimia_phage(78.72%) | integrase,protease,transposase,tail,tRNA,terminase,capsid | attL 1355574:1355633|attR 1490450:1490540 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1637943 : 1644728
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_020833|1637943:1644728|DBSCAN-SWA ATTAATCATCAATACTAAATACATCACCACCGTGCATATCGATCATTTCTAATGCTTTACCACCACCACGAGCTACACAAGTTAATGGATCTTCTGCTACTACGACTTGCACGCCAGTTGAATCAGAAAGTAAACGATCTAAATTATGTAATAATGCACCACCTCCTGTTAACACCATACCGCGCTCAAAAATGTCTGCTGCCAATTCAGGTGGGCATTGCTCTAAGACTGATTTAACTGCCTCTACAATACCATTTAATGGTTGTTCAATTGCTTCTAATACATGTCTTGAGTTAAGCTCGAAAGTACGAGGAGCGCCTTCAGCTAAATTGTGTCCGTGTACTTCCATTGTTTTAACATCATCATCGGATTCAATCTTAGCACTAGCAATTTCTTGTTTAATTCGCTCTGCCGTTGCTTCACCAATAGCAGAACCAAAATGACGACGTACATAAGCAATAATAGCTTCATCTAACTTATCACCACCAATACGCACAGAAGTTGAATACACAATGCCGTTTAAAGAAAGCACTGCCACTTCGGTTGTACCGCCACCAATGTCAATTACCATTGACCCCATTGCTTCGTGAACCGGCAAACCTGCACCGATTGCAGCCGCCATTGGCTCTTCAATTAAATAGACTTCACGCGCTCCTGCTCCAATTGCAGATTCTTTAATTGCACGGCGTTCCACTTGTGTTGCACCTGCTGGCACGCACACTAATACACGAGGGCTTGGGCGCATAAAGTTATTACTATGTACTTGTTTAATAAAGTGTTGCAACATTTTTTCTGTTACAAAAAAATCCGCAATGACACCATCTTTCATTGGACGAATCGCCATTATGCTTTTTGGTGTACGGCCTAGCATTAATTTTGCATGTGAGCCTACCGCCGCAATACTTTTTAGCGATCCCATACGATCTTGACGTACAGCAACCACTGAGGGTTCATCTAGCACAATACCTTGACCTTTAACATAAACCAGTGTATTTGCTGTCCCGAGATCGATAGAAAGATCGTTTGAAAATAATCCTAAAAATTTTTTAAACATAAAAGAATCCGTTAAAATAAAATTATTCAAAAATAAGCACATTTTATAGTGCGAACATTGCTACTAATATAGCAAAAAAGCCCGTCATTCATCAATGAAAAAATTTAAACTCCACTAGAAAATTTGCAGAGCAAGTTGATAAGTATAAATCAGTAAACTAAAAGCGATAAAGTACATAATTAGCCCGGTAACAGCATCTAAAATTTGCCAAGTTCTTCGCTTTGCAAAATAAGGGGAAAGTAAGCTTGCTCCATAACCTATGCCAAAAAACCAAATAAATGAGCAAAGTAATGCACCTGCTAAAAAGTATATTTTACCGTTAAAATCTAATTTCCCACCGATACTGCCTACAATCACAACCGTATCAATATAAACGTGAGGATTTAAGAATGTAATCGCAAAGGTAATCAGTAAAGCCTTTTTTAAGCTCGTTGCATTCTCTCCACTTGCCACAAGGTATTCACCACTTTTAAATACGCTGATAAATGAACGGCTACCGTAGCTTAATAGAAAAATGGCCCCTAAAAGCGAAATAATGAAACTTACAACAGGCAATTCCGCAATTAACGTGCCTAAGCCTAGCACACCTATCGTCATTAAAAATACATCACCTAAAAAACAGAGCAATGCAATCCAAAATATGTGTTGTTTTAAAATCCCTTGCTTTAATAAAAAGGCATTTTGTGCGCCAATAGAGACAATTAAGCCAAAACACACTATAAATCCTTGAATGAAAATATCCATTTTTTCTCCAAAATCGCATAACAAGCGGTCAATTATACAAAAAATTTTGCAAAACTTCGGTATAATTTATCGAATACTCTTTTGACTGAATAGGAAATTTTTTATGACTGATACTAGCCAGACTTCATCTTGCGTTGTCATTGCGATTGCCGGCGCATCTGCCTCAGGTAAGAGCCTGATTGCCTCAACCATCTATAAAGAACTCAAAAATGAATTGGGAACAGATAATATCGGTATTATTTCCGAAGATGCTTATTATAGAGATCAATCTCATCTAACAATGGAAGAACGGATTAAAACCAATTACGATCACCCTAATTCAATGGATCATCATTTATTGGTTGAACATTTACGCCAATTAAAACAAGGTAATGCGATTGAAATTCCAGAATATGACTATACCGAACATAATCGTAAAACGACCACGAAGCACTTTGAACCAAAGAAAATCATTATTTTAGAAGGTATTTTATTGCTGACAGATGAGAATATTCGCAATGAAATTAATGTTTCTATTTTCGTAGATGCTCCTCTGGACATCTGCTTTATCCGCCGCTTACAACGTGATATGGTGGAACGTGGACGTTCGATGGAATCAGTGATTAGTCAATATCGCAAAACCGTTCGCCCAATGTTCTTACAATTTATCGAACCCTCTAAACAATATGCTGATATTATTGTGCCAAAAGGTGGCAAAAACCGTATTGCCATTGATATTCTTAAAGCACAAATTAAGCAATTACTAAAATAAAATAGGAGCTAAATATGCGTTTATGTGATACAGATATTAAACGTTACTTAGATGAAGGTATTATTGCCATAACGCCTCGACCTTCAGACGATAAAATTTCTGGCGCCACTGCAGATGTGCGTTTAGGTAATTCGTTTCGTGTATTTCGTGAACATAAAACGCCCTATATTGATTTAAGTGGCCCTAGAGAAGAAGTTGCCGCTCAGTTAAATAAAGTGATGAGTGATGAAATTATCATCGGTGATGATGAAGCATTTTTCCTTCATCCCGGTGACCTTGCACTCGCAACAACCCTTGAATCGGTTTCCTTACCAGCCAATATCGTTGGATGGTTAGATGGTCGTTCGTCACTTGCTAGATTAGGCTTAATGGTACACGTTACCGCCCACAGAATCGATCCGGGTTGGGAAGGCAAAATTGTATTGGAATTTTTTAATGCTGGAAAATTACCCCTAGCTTTACGCCCTAATATGGCAATTGGCGCATTAAGCTTTGAGATTTTAAGTGGTGATGCTGCAAAACCCTATAATGCGCGAAAAGATGCAAAATATAAGAACCAGCAAAGTGCCATTTCAAGTCGGATTAATCAAGATTAATATAGTACATGCCTTGCAATCATACATTAACTATGTTAGTTTTTTAATCAGTTTATTACACAGTAAGGAGTATAACTATGTTACATTATGCAGTCGTATTTTTTGTCATCGCTATAATCGCAGCGCTATTAGGATTTGGTGGTATTGCTGGAAGTGCTACTGAAATTGCCAAAATTCTCTTTTTTGTCTTTTTAATACTTACTGTTATTTCGTTCTTCTTCAAGAAAAAGTGACACAGTTAAACCTAATTTTTTAAGTTAAAATATAGTTCAAAAAAACAGTTGGTAATGGATATTTATAATTATTCTTACCAACTGTTTTGCTATTATATCTTTTTAAGATGAAATGCTCGTCTTTTGTTTCACTTTTTATACTGCTTTTTATTTTTATACCATTTCCAGCCTAAAAATAGAATAACAATGCCTAAAATGGCAAAAATGAGGTGCTGCCCATTAGCTACTTGTTCTTTTAGCCAATCCAAATTAGATGCCCCATAGTCGCCTAAATAAACCCAAATTGGCACAGAGATAATAGCGGCACAGAAATCAACTAATAAAAATTTTACGAAGCTGACTTTTCTGGTAATACCTGAAACTAAGTAAACCACCGCGCGCAAGCCAGGTAAAAAACGAGCCATAAAAAGTAGTTTCCATCCTTGTTTTTCAAAACGTTCTTGCACGGTTGCAAAACGTTCAGGTGTCGCAACATTCCTGATTAATGGAAATTTGAGAATTTTTTCGCCATAGATTCTACCTAGCCAGTACATTGTGCTATCGCCAACTAATACTCCTAACATACTAACAACCAGCATCCAATGCACATTGGTGTAGCCTAATCCTGAAATAACACCACCGGATACTAACGTAATATCTTCAGGAATCGGCACACCGAAACCACAGGCAAGTAGCACAAGAAAAACAGCCCAATAACCATAGCTACTAAAAAATTCAATCAATGTTTCCATATTACTCCTTAATGTTTAAATTCCGAACCGATTTACGTTTGACCAATTCAGGAAAGAACTCTAATACTTTAGGCTCTTTTGCGTTTTCGTTATCTTCAATACGTTCTAATAATAATTCTAATGCTGCCGAGCCTAAGCGAGATTTTGACTGATGGATTGTCGTAAGAGGCGGTGCATAAAAGCGTGAGCTATGCACGTTATCATACCCGATCACTGAAATATCTTGCGGCACATTCAGCCCTTTTTCGGTAATAGCTGAAATTGCCCCTAGTGCCATTGAGTCATTAAAACAAAAAACCGCGGTTGGTAATTTTTCACTGCTCTTAAGCAAATTATTCATACACTCATACCCCCCCTCAGGTTCAAAATCGCCTTCTTGAATCCATTCTTCACGAATAGACAAACCCGCCTCAGATAGCGCTTTTTTAAAACCTTCAAAACGGGTTCTTGCAATTTCTTTATCTCTATTGCCGGTAATTACAGCAATATCTTGATGCCCGTTTTCAATTAAATGCTGAGTCGCAATATAGCCACCTTCAACACCGTGATCTAAAATAATATCACTGCGTTCATCACTTCGTCCCCAATCCATAATCACCATTGGGATATTGCTGTTTTCAAAGATATCAAATGAATTAGCTGTATATTCGGAGCACATCACCAAAATGCCATCAACCCGTTTTTTGATGAGCATATCTAAATGATTTTGAATTTTCTCAAGTTTGTTTTGAGTATTGCACAAAAATAGTGAATACCCTTTGCTATAGCAAAATTCCTCTACCGCTAACACAATTTCAGCGAAAAACGGTGATTCGCTGGTTGTAATGATCATACCGATAGATTTAGTCGTATTAATTTTCAAACTCCGCGCTACAGCACTAGGAGAATAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_020833|1637943:1644728|1641164_1641320_+|WP_006248951.1|DBSCAN-SWA MLHYAVVFFVIAIIAALLGFGGIAGSATEIAKILFFVFLILTVISFFFKKK >NC_020833|1637943:1644728|1639110_1639740_-|WP_006248954.1|DBSCAN-SWA MDIFIQGFIVCFGLIVSIGAQNAFLLKQGILKQHIFWIALLCFLGDVFLMTIGVLGLGTLIAELPVVSFIISLLGAIFLLSYGSRSFISVFKSGEYLVASGENATSLKKALLITFAITFLNPHVYIDTVVIVGSIGGKLDFNGKIYFLAGALLCSFIWFFGIGYGASLLSPYFAKRRTWQILDAVTGLIMYFIAFSLLIYTYQLALQIF >NC_020833|1637943:1644728|1641448_1642051_-|WP_006248950.1|DBSCAN-SWA METLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGVPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLVVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILKFPLIRNVATPERFATVQERFEKQGWKLLFMARFLPGLRAVVYLVSGITRKVSFVKFLLVDFCAAIISVPIWVYLGDYGASNLDWLKEQVANGQHLIFAILGIVILFLGWKWYKNKKQYKK >NC_020833|1637943:1644728|1637943_1638996_-|WP_006248955.1|DBSCAN-SWA MFKKFLGLFSNDLSIDLGTANTLVYVKGQGIVLDEPSVVAVRQDRMGSLKSIAAVGSHAKLMLGRTPKSIMAIRPMKDGVIADFFVTEKMLQHFIKQVHSNNFMRPSPRVLVCVPAGATQVERRAIKESAIGAGAREVYLIEEPMAAAIGAGLPVHEAMGSMVIDIGGGTTEVAVLSLNGIVYSTSVRIGGDKLDEAIIAYVRRHFGSAIGEATAERIKQEIASAKIESDDDVKTMEVHGHNLAEGAPRTFELNSRHVLEAIEQPLNGIVEAVKSVLEQCPPELAADIFERGMVLTGGGALLHNLDRLLSDSTGVQVVVAEDPLTCVARGGGKALEMIDMHGGDVFSIDD >NC_020833|1637943:1644728|1639843_1640491_+|WP_006248953.1|DBSCAN-SWA MTDTSQTSSCVVIAIAGASASGKSLIASTIYKELKNELGTDNIGIISEDAYYRDQSHLTMEERIKTNYDHPNSMDHHLLVEHLRQLKQGNAIEIPEYDYTEHNRKTTTKHFEPKKIIILEGILLLTDENIRNEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMVERGRSMESVISQYRKTVRPMFLQFIEPSKQYADIIVPKGGKNRIAIDILKAQIKQLLK >NC_020833|1637943:1644728|1643945_1644728_-|WP_006253612.1|DBSCAN-SWA MTEKSQLNFNYQPSNNHANAQTMIFLHGLFGDLNNLGAIAKPFAERYSILMVDLRNHGRSFHSDEMNYALIAQDLAQLLTELNIQNAIVVGHSMGGKSAMALAAFAPELVEKLVVIDIAPVTYTQNRHQQVMAALFAVKEAKPQNRQQAKAIMAEYIRDEGVQQFMLKSFDAQSEQSFRFNLQALKDNYQNVMGWQQVFVDKPTLFIKGALSDYIQAEHTQTILAQFPQAKSFIVANADHWVHAEKTGTVVRAINKFLEK >NC_020833|1637943:1644728|1640505_1641087_+|WP_006248952.1|DBSCAN-SWA MRLCDTDIKRYLDEGIIAITPRPSDDKISGATADVRLGNSFRVFREHKTPYIDLSGPREEVAAQLNKVMSDEIIIGDDEAFFLHPGDLALATTLESVSLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGDAAKPYNARKDAKYKNQQSAISSRINQD >NC_020833|1637943:1644728|1642052_1643072_-|WP_006248949.1|DBSCAN-SWA MATIKDVAKYAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWEAIKALNYSPSAVARSLKINTTKSIGMIITTSESPFFAEIVLAVEEFCYSKGYSLFLCNTQNKLEKIQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTANSFDIFENSNIPMVIMDWGRSDERSDIILDHGVEGGYIATQHLIENGHQDIAVITGNRDKEIARTRFEGFKKALSEAGLSIREEWIQEGDFEPEGGYECMNNLLKSSEKLPTAVFCFNDSMALGAISAITEKGLNVPQDISVIGYDNVHSSRFYAPPLTTIHQSKSRLGSAALELLLERIEDNENAKEPKVLEFFPELVKRKSVRNLNIKE >NC_020833|1637943:1644728|1643207_1643936_-|WP_006248948.1|DBSCAN-SWA MQRDTLFSAPIEKLGDFTFDESVAEVFPDMIQRSVPGYSNIITAIGMLAERFVTDNSNVYDLGCSRGAGILSIRRNVNAKNVQIIGVDNSQPMVERCKTHLSAYHSEIPVTILLDDIRHIEIKNASMVVLNFTLQFLPREDRLALLQKIYQGLNSNGILVLSEKFTFESEEMNELLIDLHHTFKRANGYSELEVSQKRNALENVMRTDSIETHKKRLQEAGFTQVELWFQCFNFGSMIAIKA |
9 | Organic_Lake_phycodnavirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2056643 : 2140605
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_020833|2056643:2140605|DBSCAN-SWA AATGGCATTTGAAAAAGAACCCCACTGTAGTTTTTGCGGTAAAAAACGTACCGAAGTCGATCAATTAGTCGAAGGCACGGAAGGCTATATTTGTAATGAATGTATCGAGGAATCCTACGCCTTATTACACGGTGAAGAAGAGCCGTTAATTGATGAAAACCAAGACGATGAAGGCAGTTTTTTCACCAATGTGCCGACACCTCACGAATTACACGCTCATTTAGATGATTATGTCATCGGTCAAGAACACGCGAAAAAAGTGCTTTCGGTGGCCGTTTATAACCACTACAAACGCTTAAGAAGTGCATTGTCAAACCATCAAGCCACTAATGGCGTAGAGTTAGGTAAAAGTAATATTTTATTAATCGGGCCGACCGGTAGCGGTAAAACCTTGTTGGCAGAAACCCTTGCCCGCCGTTTAAACGTACCTTTTGCGGTAGCTGATGCTACTACCCTTACCCAAGCAGGCTATGTGGGAGAAGATGTCGAAAACGTGATTCAAAAATTATTAATGAAATGCGATTTTGAAGCCGAACAAGCGGAACGAGGCATTGTTTTTATTGATGAAATCGACAAAATCACCCGTAAATCGGAAAGTGCATCCATTACCCGTGATGTATCGGGCGAAGGTGTTCAACAAGCCTTATTAAAACTACTTGAAGGCACGGTGGCGAACATTAACCCACAAGGCGGTCGCAAACACCCGAAAGGCGAAACCATTCCGGTGGACACCTCCAAAATTCTCTTTATTTGCGGCGGTGCTTTTGCCGGTTTAGATAAAATCGTGGAAGCCCGTACCAACACTCAAGGTGGTATCGGTTTTGCAGCGGCATTGAAAAAAGATAAAGATCGCCAAGATTTAACCGAGCTATTCAAACAAGTTGAACCGGAAGATTTAGTCAAATTCGGCTTAATTCCTGAATTAATCGGGCGTTTACCGGTGGTGACTCCGCTGCAAGAATTGGACGAAGAAGCTCTGATTCAAATCTTAACCGAGCCGAAAAATGCGATCATCAAGCAATATCAAGCCTTATTCGAAATGGAAGGCGTTGAATTGCACTTCACCAAAGATGCATTAATTTCAATTGCCCAAAAAGCGATTAGCCGCAAAACCGGGGCTCGTGGGTTACGTTCTATTGTCGAGAACTTATTACTTGACACAATGTACGATCTCCCAACCCTCAATGCGAAAAAAGTCACCATCGGCAAAGGCTGTGTTGAAAACGGCGATAAGCCGAAGGTGGAGTAACAATGACAAGCGGTTTAATTTTTTAGGATTATTGCAAAATGGCTTATAAACCACCTTTTACAGTTACCACTAAAATGCTGAATCTGGTTGTAGAAATTTCTCATAAATTGGGAACGCTACAATTGGATTTTGAGCGTAATTTACATCTTAGAAAAAATAACCGCTTGAGATCAATTCAAGCCTCTTTAGCTATTGAGGCAAATTCATTAACGATTGAGCAAGTTACCGCAATCATTAAGGGCAAAAAGGTTCTCGGACACCCCAAAGATATTCGTGAAGTCAAAAATGCCTATGACGCTTACGATGAAATGATGCACTATAATCCTTACTCGATTAAAGATTTTCTCAAAGCACATAAGTTTCTTACTGCTGACTTAGTAAATGACGCAGGGGCTTTTCGTTCAAAAGATGTCGGCATTTATAATTTCAGTGGGCAACTTGTGCATATGGGGGCTCGTCCTCAATTCGTAGAGAATTTGATTAATGAGTTGTTCTCTTGGGCTAAACAAGATGATACACCTGCACTCATTAAAAGCTCGGTTATGCACTATGAAATAGAAATGATTCACCCCTTTAGTGATGGAAACGGCAGAATGGGTCGATTATGGCAAAATGTCCTTTTAGCACAATGGAACCCACTTTTCGCTTGGTTGCCGATTGAAACAATGGTTTACGAAAATCAACAACGTTATTATCAAATGCTTTCTCTCGCAGACAGCCAAAATGATTCTACCGGCTTTATTGAGTTTATGTTGGAGATGATTTTAGAGACATTATTAAAATTAAAATAACACCACTTAATTCCAAAGTGGTGTTACTCATAAAATTACTGTATGTATTTAGCACAATTTTGTAATATTTCACGAGGTAAATTAGACATAATCTCAATCCGTCTATCACGGGTTAAATATTGCGGCTTAGTGTTTGCCAAAGGGTAGTCTTTGACTTCATCTCGAGTCAGTTGTTTAGCAAACATTCTACCAGTGCACATAGCATAATCATACGGTGTATTTCTATCACTTCTTACTGTTTCTTCTGCAAAATGTTTTGCGATAAATTCTCTTCGCTCTTTATCTGAAGCTGAGTACCACTCATCTAAATTAGGATAAGCAACATTACTTAATGTCATAAAAGCAAAAAATAAATATTTTTTCATAATCTATCCAAATAAATACATAAGTCCACGAACAATACCTAACGGGAAAATAATTATATCCATAAGAGATAACATATTCTCCCCAAATTGATAGTCTTTATATGCTGCATAAAGAGGCAAAATTACTGATGCAGCTGACGCTAAAATACCTAGCATTCCATATAATGGATTATATTGATTATTCATGAATGTTTCTTCTCCTGTGAGCTTAAGATAAAATTTACTCTATTCTAAATTGCTCAATAAACTGCTACAATCCACAAAATTTATCCTTTACCACATCAAGTTATATCCCAACTCCCACAATCTATAGGTGTTATATGAAAGTACACGAAAAAATCAAATTACTGCGAGAAAATAATCATTGGACACAAGATGAAATGGCTCAAAAATTAAGTATGACAACCAAAGGTTATGCAAAAATAGAACGTGGTGAAACTATCTCTAATTTACCGAAAATAGAACAAATCGCAGAAGTATTTAATATGGATATTTGCGAATTATTATCCTATGGGGAAGAAGGAAAAATTTACATAAATAATACAGATAATAATCTCACTAATTCATTTATCTCATTAGGAAATGGAGTAGAAGAAATTCAACGTTTACAACTTATTATCTCCCACAAAGATGAATTATTAGCCCATAAAGAAGAAATTATCGAAAACCAAAAACGTGAATTAGCCTTATTACGAGATTTAGTTGAAACACTTAAAAATAAATAATATGAAAATCTGGCAAACAAAATCCCTTATCACTTGGCTGCTTTCGCCGCTTTCGTTGCTGTTTTGGCTGATTAGTCAAGCTCGCAAGCGGTTATATTCTCTGAATATTTTGCAATCGTACCGTTCGCCTTTGCCTATGCTGGTAGTCGGTAATATCTCGGTTGGAGGCAACGGCAAAACGCCAGTGGTCGTTTGGCTGGTGGAACAACTGCAACAGCGTGGCGTAAAAGTAGGCGTGATTTCTCGAGGCTATGGCGGTAAAGCGAAAACGTTTCCGCAATTAGTTACCCGAGAAAGTTCTGCTGAAATGGTGGGTGATGAACCGGTTCTGATTGTTCAGCGAACCAATGTGCCTTTGGCTATTTCTCCAAACCGCCAACAAAGCATTGAATTACTATTAAATCAGTTTGAGCCGGACATCATCATCACCGATGATGGCTTGCAACACTATGCCCTACAGCGAGATATGGAATGGGTGGTGGTTGATGGCGTAAGGCGTTTCGGTAACGGTTTTGTGCTGCCGGCGGGCGGATTGCGTGAATTACCGAGCCGTTTAAACTCCGTGCAAGCGGTTATTTGCAACGGCGGCACACCGCAAGCTAACGAGCATTTAATGACGCTTGAACCGTCTGATGCAATTAATTTAGTCACCAATCAACGCAAGCCATTAAGCGAATTTACCCAACCCTGTGTGGCGATTGCCGGTATCGGTCACCCACCACGCTTTTTTACGATGTTAGAAAAATTAGGCATTCCGCTTGCCAAAACTCAAGGCTTTGCCGATCATCAAGCCTTTGATAAGGCTCAGCTGGCTCAATTTGCTGATAGCCAAACGCCGTTATTAATGACCGAGAAAGATGCGGTAAAATGCCACGATTTTGCACAGCCAAATTGGTGGTATGTACCGGTTTCTGCAACATTTTCAGAAAAATCGACCGCTTGTTTGTTAGCCCCGATTCTACAAAAACTAGGAAAAGAAGATGAACGAAACACTACTCAATAACCTCGTCTGCCCTGTCTCTAATGAAAAATTAGAATGGGACAAAGAGAACAACCGATTAATTAACCCTAAGCTCAATATTGCTTACCCGATTAAAAACGGCATTCCGGAATTACTGCCGGAAGCCGGAGTGGCATTATAAACTGAATAAATATTAGCAAGCCTGATTAAATCGGGTAAAATAGCAACAATAACCTTGGTTCGTATTAATTTTATAGAGGAACATAAAATGGCAATTTTAGTTACAGGTGGTGCAGGCTACATCGGTTCACATACATTAGTTGAATTATTAAACGAAAATCGTGAAATCGTGGTGTTAGATAATCTTTCTAATTCCTCTGAAGTATCACTTGAGCGTGTGAAGCAGATCACCGGCAAGAGCGTAAAATTCTATCAAGGCGATATTTTAGATCGTGATATTTTACGCAAAATTTTTGCGGAAAATCAGATTGAATCGGTAATTCACTTTGCCGGTTTAAAAGCTGTAGGCGAAAGCGTCAGAGAACCGCTACGTTACTATCAAAACAATGTAACCGGCTCGATTGTATTGGTAGAAGAGATGCTAAAAGCCAATGTGAATACCATTGTGTTTAGTTCATCGGCGACCGTTTATGGTGATCCGCAGATTATCCCGATTGTGGAATCTTGCCCTGTCGGTGGCACAACCAACCCTTACGGTACGTCCAAATATATGGTTGAACGCATTCTTGAAGATACCGTTAAAGCCTTCCCACAATTAAGTGCGGTAGTATTGCGTTACTTCAACCCGGTAGGGGCTCACGAAAGCGGTTTAATCGGTGAAGATCCAAACGGTATCCCAAATAACTTAATGCCGTTTATCAGCCAAGTGGCTGTGGGCAAATTACCTCA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MPNHNQDLKKEWFNKARIDYHSPFLMLWLSCNSWYNFHYSLGKDRTHIDRIKSDTSNQNKLYKEFERIFTSGKIKEKTNLWNNIEQLHFALVQAELKYSGSNIPSEYSKFNLENVLIDFPNKTNSVAYQNLVIHNAKTRAGKLKTQYANAHDLGNLVLVEDIQKIFSGLLEIIYQVRCHLVHGSLSPTPENHEVVKYCYLILWDCLKGFCD >NC_020833|2056643:2140605|2122562_2123678_-|WP_006249654.1|DBSCAN-SWA MTQIEIFKAGKRYDANGTLIDITPEMLQQTVAAYNPEFHEAPLVIGHPKSNNPAWGWVKALSLEGDVLKAEVDQLDAEFSEMVASGKFKKVSAAFYLPDSPNNPHKGVLSLRHVGFLGAMPPAVKGLKQVEFAEDDDFVVFSEWGVASLFSRFRDWLVSEFGLEKADKALPPHEIDWLKEEAMRSQISKQVHAEQATPEPIFNEPAQPEGEPEMSAEEKEELERLKAENEQLKAEKAQAEAEKMEAELEAEKAGNAEFCEGLVKQGKLAPVAKAAFVQALNNLSVLKAGREPEFNEGEDVVSQFKSAMSQSPQIIQFGEYATADKANPQEAEAVEYAEGTDPVSIEADQKVRAYMKAHNVGYAAAFNAIYR |
93 | Mannheimia_phage(18.75%) | plate,protease,transposase,tail,tRNA,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020833.2|WP_006250250.1|1439734_1439965_+|hypothetical-protein |
1439734_1439965_+
Protein sequences of NC_020833.2|WP_006250250.1|1439734_1439965_+|hypothetical-protein>NC_020833.2|WP_006250250.1|1439734_1439965_+|hypothetical-protein MNAQATLNNHKDYILCGRKEKRTSDFINVFEVFENEATQEFVIERAMFRNGKLIDWNQSDKMNAEQAQQLWQAYIH |
76 aa aa | NA | NA | NA | 1355632-1493828 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.3|1086641|35|NC_020833|CRISPRCasFinder matches to NC_020833 position: 1415833-1415799, mismatch: 0 ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaa Protospacer *********************************** 2. spacer 1.20|1086641|36|NC_020833|PILER-CR,CRT matches to NC_020833 position: 1415833-1415798, mismatch: 0 ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac CRISPR spacer ctttttcaagaatcaagattaagagatccaaacaac Protospacer ************************************ |