Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021089 | Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wHa, complete sequence | 18 crisprs | RT,cas3 | 8 | 5 | 10 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021089_1 | 51304-51408 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_1
|
1 spacers
spacers of NC_021089_1
>1.1|51328|57|NC_021089|CRISPRCasFinder CTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_1
The CRISPR arrays of NC_021089_1 >merge|NC_021089|1|51304-51408|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGCTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG >NC_021089|1|1|51304-51408|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGG CTGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCT CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG
>NC_021089.1|WP_010962337.1|49668_51171_+|leucyl-aminopeptidase MYSLQLFATEIPAMKITISKISPDFKTIVMGLFEDNETVNDGGVLQGKQVIDNIKQFSDFNGSFGEFFSTALPEEKNVIVVGLGKKDEWNENKELNIGGKIYCELSRLKIKKAAVLIEGSAANVAYGAFLRSFKFDKYKTKKDEKITEVEEITVLVKDEQLSNAERSFEHLRQEGESIFLARSFITEPPNILYPESYADHIKKELTKLGLEIEVLDKKQMEEKKMGALLGVAQGSSKEPKLVVIKWNGASKEQKPIAFVGKGITFDTGGVSLKPSRGMESMKYDMAGSATVVGVMHALAGRKAKVNAIGVVALAENAVGGNAQRPSDVVTSMSGQTIEVLNTDAEGRLILADALWYTQDRFSPKFMIDLATLTGAIVVALGNNEYAGLFSNNDELANRLIDAGNEVNEKLWRFPMNETYDKIIDSPIADVQNIAPAGSGGDSIMAAQFLQRFVNETCWAHLDIAGTAWHEKGTDICPRGAVGFGVRLLNKLVEKYYEAND >NC_021089.1|WP_015588781.1|48930_49572_+|dioxygenase MNVKNILLAFLVQMVFSLPLFAADPVLLNCIETPEIYDLDARPKNFNSSNNLRRKPGSPNSAIGELIHIVGRITDINCLPIQNAVVSIWHANSRGVNHYDKNIEDDLNFAGSGRFVVNNLGYYNFITIAPGKIGDRAPHINFLVQHPDFPEFTTQMFFADHNCDNCADPVLEDFVSNGLASLLITPFTYSDQVIKTYTFNITLGGYNKFSNKR >NC_021089.1|WP_015588780.1|46335_47283_-|IS110-family-transposase MVTSYQNFIGIDIGKFKNVVAIHKQKNAVEFDNNASGWQQLFQEFSDILPNALVTLENTGKYELGLSHFLTDKNIAVHRANTRKVKSFILSHGALAKSDRSDARALAQYGFERHRTISLFVPTSTEQSTLAALCQRRDDITQMRTQEKCRLEAPENDHIKESCQKTIEFFDSQINELNDTIQKIIDESRELQQRQKILKTVPGIGKKLSQDFLCLMPELGYLNRKEVASLAGVAPHPKESGKAVGYRRITGGRSNVRSKLFTAAMAATRSKSILGAFYSKLVESGKKKMVAITALMRKIIVIANTRLKEAINLHT >NC_021089.1|WP_015588779.1|44725_45649_-|hypothetical-protein MVASDSVLKRYALAYIKKLGNNNNIEGFLQYCNNTPNLTWSKENFKNVYEEFTHPNSSNRHDTGSRNDQYNAGNNAQPTGSQTTHIHVYNDRGLDFWDYLLLRSLFGGHTTVINNPGFSSGSHQSREDKKKDSEDNRKLLALGMVAAVVCVAFHAGMCFWYNSSRKVARKEEKIDYLDSKFKTFRNIEFAVGAVSLAALVACAVYPVLPVWGLVILGVNSLVCFTGGLAFHMKHEEESENIEKAERAVDSYLKQGHGYGDSSRYDAPPPYFSQDPNTTPTAPPQNAFDNPYLQQKFGNCKGFTRDKN >NC_021089.1|WP_015588778.1|43380_44499_-|molecular-chaperone-DnaJ MSKKDYYDLLEVGRNANIDEIKKAYKKLALKYHPDRNPGNKEAEEKFKEVTAAYEVLSDSEKRAGYDRYGHEGASGGFQGFSSAGDFSDIFNDFFGGGFGGGASRSRAKRSTTGVSGADLRYDLEITLEDAFKGIQAPIHYVTNVKCDTCQGTGGEGAIKPVQCHTCQGSGRIRTQQGFFTIERTCTTCYGEGEIIQNKCKKCGGSGRRRDEVNISVSIPKGIEEGAKVRISGKGEAGTKGGKSGDLYVYVKIIFHKIFARNKADLHCKVPIRMTLAVLGGEIDIQSIDGAKIKVKVPEGTQTGTKLRCREKGMPYMNSHARGDLYVQVIVETLNPKNLTKKQIELLKALEEEENASVQQQSEGFFSKVKKK >NC_021089.1|WP_012673044.1|41414_43049_-|ribonuclease-J MNINKNEFLFLPLGGVGRIGMNVSLYHYQGKWIMIDLGVGFADETMPGVELLIADIDFIAQRKKDLLGIIITHAHEDHCGAVPHLWEELQCSIYTTKFTVNFLKEKLKEFRLEGIVPVKEVDINGSINLGPFTVEFINVTHSIPEANSILISTEMGSALHTGDWKFDPKPVVGLTSNMERLKEIGDKGDLLAAICDSTNILSKHHPESEGEIYNNIYNIIKRSKKLVAVSLFASNVARIETISQAAKALNRKVVLLGRSLWRIVKVAQDSGYLTDSPQFLEAKEAVNFPREELVLLCTGCQGEPLAATARLAAKSHQAFKMQQGDTMIFSSKIIPGNETRAHNMLNAFIEMGVEVITEKTEHVHASGHPTREELKEMYSLIKPKMSIPVHGEYIHTHAHVKFAKECGVAKAIMIAPGDIVNLENGEKVDSIDVDYFGIDGMLLRHPESSVIKMRKRMRDAGVIVVTAVVNKKNKLLAKPKVFVPGVFEVLEDAATIQKIVKKVESLFSLQPTKKIKNKIESSILSILKEYLLKRPIIEVQIEQV >NC_021089.1|WP_015588777.1|40146_41409_-|Tol-Pal-system-protein-TolB MKLFVHLVLFISLFIPYFTKAALYVDIKKSSVGNIGLVVSKCTCKTALESELSENIAKVIGTNLSNCGLFNVKRGAEAESKSWKSDTVVTVSLSEISGSALELSFRLFDTFTKRELLTQSVVFPAKDWRKIGHLVSDVIHDRLIGEKGHFNTKITYIAEEKDSNYKSVRKIAVMNQDGSNIKYLTNGDRFVSTPRFSPNGKGIVYISYANGKSYIILKNLKDNTESIISAFEGVVSAPRFSPDGKSLLISHSLGGETNILSLDLSSKRTKKITKGSAISTSPSFSPDQKYMAFSSDISGSQQLYVIDFTNKSKKPKRISFGSGRYATPVWSPKGDLIAFTKIQSGKFYIGVMKPDGKEERLLSEGHKIESPAWLPNGREIIFTRTESPSNSKLYLVDLVKKNQKMVSTPTNASLPDWSYF >NC_021089.1|WP_015588776.1|39751_40105_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatC MPAKSTEDVITSLIEFANKRKITITKEEMLKIAQLVRIKLSNDEIDHYSKELTMLDWIHDTLLQVNTEGVSPMRYGSIDKDIHVRDDVINSQNIKKEILSNTKPEHGYFVVPKVISD >NC_021089.1|WP_015588775.1|38835_39762_+|ribose-phosphate-diphosphokinase MKIIIGNASKELGESVVNRLDVQPSSAWISKFTDGEVNVEVANDLYNQEVYIVQSLSPPVNDNLMELLLIIDAVNRLGAKRIVVIIPYYGYSRQDRIIKNNNMQSALSAKLVANLIQTAGASSVAVIDLHSSQIEGFFDVPVTNLNCFEAFVDSINTENLAIVAPDVGAIGRARAFARALEEKYKIGLSDKIIVVDKYREKAGTSQVMNIIGEVANKNCVIVDDIVDSGGTLCNAALALKSYGAKSVTSCITHGVLSGSAVEKISSSSLDKLVITDTILHKLEKTGKIEVVSVVNILTHFIQGGRNAS >NC_021089.1|WP_015588774.1|37665_38532_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MTEETKDGYASLYVAIQEGNIEAAELLIKCGTNVNDHYERNRTPLHIAIGRKQLEIAKLLIKNGANVNAKTQNHGKDDLTPMHFAVFANTPEFIELLASHGALINERESTEGYTPLHFAALYGNKNIIQALIDKGQDIEDVDNNGRTALFLAARQCTEAEDDSRIEIIKYLIDKLKADVTKKDNNNNAVLFPAANNCPGKVVEFIIEQYIKIFELENFINHKNNDGMDALDIALNSGNEKAIEVLRSYGADIKNKVDGSIQKITAEKPSSTLDRAEGAEVAPPIKQRV >NC_021089.1|WP_015588783.1|51542_52730_+|MFS-transporter MESRAKAWFIWLISNLVVIFSNMQIIYTFISVNLEKELRLTIAQVALANSAYTWTFAILQFFSGATFNVFSSKKIYFFSLSTMILGFFVLINSDNFSHLILSQVLIATGASFGFIGAAHTSSICFSAAQFGLMFSLVQTISSLSALVIQILFSNLLAEDAYWKNLIVCIILFGVLIFVLTLFCPNTLPESSSEKRTIKSSMKTVMCSILTVLKLRDIWITSVVGAITFGTFLALNTLWAPRLLGNSELNAMESGIATAILWLGLAVGAPIADRISNLFKNRKHVISAFALLQGVSIIILLYSHLTVHVVYFCMLMFGFFAGGHMLNFTVGSEIVKRKYISTSSSIINGFMFIGSGVIVSMLALFTDHKMALFAIFAILIVAGILNYATKETYSKK >NC_021089.1|WP_006279881.1|52790_53096_+|integration-host-factor-subunit-alpha MDHVTTKDTTVTKATIAGDINQEIGLSKEDSVSIIDDILDEIKTSLVKDGIVKISSFGTFLVKKKKERPGNIPNTSEKVMIQARNSVSFRPSKIIKKSINN >NC_021089.1|WP_006279880.1|53095_53422_+|MerR-family-transcriptional-regulator MNKEKLFYTIGEVAEELHLEQHVLRFWEGQFHQIKPTKRKGRRLYDRKCIEAIKKVKYMLYDKGYTIKGVQKEFGNDIKVTKNLLQELTDLRDYLTSKINNEESNKQA >NC_021089.1|WP_006279879.1|53467_54064_+|M23-family-metallopeptidase MWHIASFLMLLAILIGCGLQKPAPVLLKGEEFYGKRDLEYTREYHLIREPSVQKESRKAIINRIYKDNNNTQNVGVNCKFVMPVKGSATSSDEMCKDGIKIAAQNGTNVVSSAPGKVIYVGKGLRWYGNLIIVEHKDNYMTVYSYLKNIHVEIGDKVKQGQVIGSAGKSSTQDKDPQMCFTIRHNGQAVDPLMHMNCN >NC_021089.1|WP_015588784.1|54076_56527_+|leucine--tRNA-ligase MKYDFKSVEKFYQDKWDFSVSKSGKQEKCYVLEMFPYPSGKIHMGHLRNYAIGDVIARYKRANGFEVLHPIGWDAFGLPAENAARDNNISPETWTKENIDNMRTQLKSIGLSYNWERELSTCEPDYYKHEQKFFLDFLKHGLAYRKESWVNWDPVDQTVLANEQVVDGKGWRSGAVVEKRKLSQWFLKITDFAEDLLKCLQSLKNWPEKVKTMQERWIGKSEGVTIDFEIVGLNKKLKIFTTSPHTWFGASFFAVAAEHPIVQDLKDKEIRDFIDGMKAKEENDEKIGVYTGLNVKHPFLDKELPLYIANFVLMEYGEGAIFGCPAHDQRDFEFAQKYDLPVIPVICEKGAQAIVTLEEAYTGGEIMCNSEFLNGLTVSEAKEVIIKKLKEKGIGEKTTNYRLHDWGISRQRYWGCPIPIIYCRDCGTVPVPEKDLPVVLPTDVEFTSGGNPLDKHPTWKFVDCPKCGKQAERETDTFDTFFESSWYFAAFCSEDKSIDKDACNRFMPVDYYIGGIEHAILHLLYSRFFCRALTKCGYFDIKEPFSTLITQGMVCHATYKDENGKWLFPAEAKELIAQGAKVQVGKVEKMSKSKKNTVDPNFIIEKYGADTARLFVLSDTPPEKDMEWSDDGVEGCSRYVNKLWRMVMQLKPVNMHYDSKSVTGGLLEYRKKIHKLLHGLTDDLENCRLNCVVAKFREMTNLIAEIDVAAGKSLINEGICILIRVIEPFMPHLAESLWQEIGGQPWPKADESLLVDDTVTIAVQINGKLRATIEVAINLPQEELKKIAIDSVSSKIDQNKVRTVYAVPNKIVNIVI >NC_021089.1|WP_015588785.1|56645_57251_+|OmpA-like-protein MKMKRLCALAVLLTSSLAGTANNSASKSEDQYYAGLNFGAGWGGGLKIKPSVVFGYHHDKNSKFELEVLTDISDMFGKEEKKMGASLLANYRYYPNLDIDPVKLYVSGGLGGYLQVIPFGFGNSGTSEPASKDIEAAGEKASVVDKILGSISYKLKVGVDYEIAPQIVGTVGITAGGQLSGFKPPVQIPDAILEVGIRYNF >NC_021089.1|WP_010082072.1|57769_57934_-|IS3-family-transposase MSNKGCCYDNSVAESFFSSLKREILIDTSQHSAQQTRTAIFEYIEIFYNKQRHY >NC_021089.1|WP_010082071.1|57926_58088_-|hypothetical-protein MSSAINKQLVMNSLLMAINRRKPVKNLLLHSDQGSQYTAQGYQYLLAVKNIDE >NC_021089.1|WP_141456787.1|58091_58526_-|IS3-family-transposase MFFYIVTAIKYRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLEAIQKIYQVSKCRYGAPKIYAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNDIRAILRRKFKIKKQQTDNRAVAPNILDQNFIVDQPNKVWDYLHQNQGGMAIFGSNNSHVW >NC_021089.1|WP_081600753.1|58510_58813_-|transposase MVREYTAEFKLEAVKLANEQRKAGQTITKIARDLGIKGGLLGKWIKKHNEKKSAADAFPGRGNMAPYDKERFDLQSKSNKGKRHLKKSPGQSKRVKYFFI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_2 | 114426-114697 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_2
|
3 spacers
spacers of NC_021089_2
>2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR GCTTATCGTCACGCCACCGCGAACCGTCATACCG >2.2|114546|40|NC_021089|PILER-CR ATTACTTAACCATCATCTACACCCTCATACCGCGATTCAT >2.3|114469|37|NC_021089|CRT GCTTATCGTCACGCCACCGCGAACCGTCATACCGTCA >2.4|114546|43|NC_021089|CRT ATTACTTAACCATCATCTACACCCTCATACCGCGATTCATTCG >2.5|114629|29|NC_021089|CRT GGTCATGCCGCCGCAAACCGTCATACCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_2
The CRISPR arrays of NC_021089_2 >merge|NC_021089|2|114426-114697|PILER-CR,CRT TCACGGTATCTCCAGATCCCGCTAACAAGTAGCGGGATGACGAGCTTATCGTCACGCCACCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTCTAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGATGACGAATTACTTAACCATCATCTACACCCTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCTAGATCCCGCTAACACGTAGGGGAATGACGAGGTCATGCCGCCGCAAACCGTCATACCGCCGCGGTATCTCTTAGCCGCTAACACGTAGCGGGATGACGG >NC_021089|2|1|114426-114628|PILER-CR TCACGGTATCTCCAGATCCCGCTAACAAGTAGCGGGATGACGA GCTTATCGTCACGCCACCGCGAACCGTCATACCG TCACGGTATCTCTAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGATGACGA ATTACTTAACCATCATCTACACCCTCATACCGCGATTCAT TCGCGGTATCTCTAGATCCCGCTAACACGTAGGGGAATGACGA >NC_021089|2|1|114429-114697|CRT CGGTATCTCCAGATCCCGCTAACAAGTAGCGGGATGACGA GCTTATCGTCACGCCACCGCGAACCGTCATACCGTCA CGGTATCTCTAGATCCCGCTAACACGTAGCGGGATGACGA ATTACTTAACCATCATCTACACCCTCATACCGCGATTCATTCG CGGTATCTCTAGATCCCGCTAACACGTAGGGGAATGACGA GGTCATGCCGCCGCAAACCGTCATACCGC CGCGGTATCTCTTAGCCGCTAACACGTAGCGGGATGACGG
>NC_021089.1|WP_081600757.1|111987_114186_-|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MEKKKFFEIINEVSKSEGLNENNLLERIGSELKDADSIVYSTYNNLKIDKMFSILDSDKIVNYMLVHLAVECNSVPIVKLLLAKEAKVNEPIYELDEAKSKLTALHIAALHGHQEIAQLLLNNNANPSLKDSQGRTPRDIVGDVKGKKAIIKMLEEGEQRYAETRATRRQPYRQGTLPQPNNKTPGDSAMGGNKITAAVQAWNARDQKENNGITPNSRKIYVQDEDEQTSSNSITNENNINKVDDTLERELAKRDAVAQKLQEAEQRLANNQKRIEHNDLHSQHPEQYTTYNGEQTFLNKSSSDDSGICFDGDGSEALGQSILENGEDIDAQDKDGVTPSHWAVADNNKELAKLLIKHGADVDARNRDKHTPLHYAAVHGYVEIAKYLIDNGANVNAQDQDEHIPLYFPVTNDNKELAKLLIKYGADRSLIKDEDLIDRLNSMCDQPSEVVPSTFSHSKTHNATETPEKAEKVEKRKAKLKELRTQLKDEQKKNELLKQKIQDLESKNTTLNSELEKTKTKTDEVPLEKAQKELTELKSYITGHGARLDTLEKLNEENESLRQEIKNLKNENTTLKGELEKTKTKKNEVPLEKAQKELTELRNCVTEHETKLEVLEKLNEENESLEQKIQDLESKNTILNSELEENENKHSKTKVLLEKAQKELAESKSCIVGHETKLKQFNKENESLTQKIKSLENENTPLEGELGKTKTNEVSLEKNFPQKLPTRALQLC >NC_021089.1|WP_041573496.1|111811_111994_-|hypothetical-protein MLAVGAALSIASGLSVLLIVAASVVSALIAGGITYTISKPIAPDTELKEVNIQGSAQRCL >NC_021089.1|WP_015588824.1|111171_111483_-|hypothetical-protein MKTFTKNFKNNEKKLEEFNKEIEDITTIAQDKFAHELENIAYDSVQKFRSLLAKELNSTFNNIHSQNVNLLKSSLVEYAISSNFINKKGETALIRSLLNIFIR >NC_021089.1|WP_015588823.1|110486_111035_-|phage-head-tail-connector-protein MSIRSTSPRISVQRKSKPESFPVTLEEVKSFLRIENNQDDKLISDLIFMATDYAEWHMEKSLVKQTWQVSYEDYVPRRIYLSYGPVSKIVLATAMMSKNQEKRTLKYYFSDVGGYVEFFNCLNAIRVDVVYEAGYDNVPEQIKLGIMRHVSALYKNRESEVSSHLSEVKKVYSPFREPKVVL >NC_021089.1|WP_015588822.1|109784_110195_-|DUF3168-domain-containing-protein MEKIQAINELYNSIYAALKANSDLRKYVTNIYDYLPKQVTIPYLRLRAVNYSNLHMLSNFATKARFSCDIYTYHIDSMFAIIRHINLILKSIEGFSSEVILESNCAMDQHDEILHSTINFDILIKGGDNEQITAKN >NC_021089.1|WP_015588821.1|109420_109810_-|hypothetical-protein MSKLQLKIKDHDNNFIVLNNIQNLRFTLRNNREEVKDISSFGWRKVLDSAGSRHITIKINGILDSVLADELLRNSAMLNSNNDYEISFKAKEKIRLRCSVELYERYYDPAAFDSFTVILASAEVVNAFH >NC_021089.1|WP_041573495.1|108578_109355_-|hypothetical-protein MNDKDLFEEDGDNIEENNDDKRERSLENENQQNQEEQHKEEDKQYIIQYTQDYLKVFEDILNQIDEGIDNLDSYERTMQIKRSIDRLIETLYSQAASEDIDTEFETTKHTRDKSESMKRVREKRRKQAIEEVLSSMFAQQQKELMNAKHLSHGHETAHDDEAKKRVKSSIRGVLFSVIAHRMDPRRRAGETADDNEKQAHIHGREAVGGALGALLKTFLTAVAAIVHEIAKPLQKQETSFAKQVEESRNADSQKGRSV >NC_021089.1|WP_010082072.1|108010_108175_+|IS3-family-transposase MSNKGCCYDNSVAESFFSSLKREILIDTSQHSAQQTRTAIFEYIEIFYNKQRHY >NC_021089.1|WP_010082071.1|107856_108018_+|hypothetical-protein MSSAINKQLVMNSLLMAINRRKPVKNLLLHSDQGSQYTAQGYQYLLAVKNIDE >NC_021089.1|WP_141456787.1|107418_107853_+|IS3-family-transposase MFFYIVTAIKYRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLEAIQKIYQVSKCRYGAPKIYAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNDIRAILRRKFKIKKQQTDNRAVAPNILDQNFIVDQPNKVWDYLHQNQGGMAIFGSNNSHVW >NC_021089.1|WP_015588825.1|115260_116553_-|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MISKTHTFVILAAGHGRRMNSDLPKVLHKIGSFSMLQHVIYNAKQLNPENIAVVVDQPLIERLKCFKDIQLITQELTLGTGDAVKTAMRNLRELPDSSIVVVQYGDTPLIKSSTITKMISYLEGKALVCLGFRTSNKEYGRLIIENGSLREIVEAKSDKNNHEEFLANAGIMVACAKNLRELVEKIECNSSTHEYYLTDIVSIAVKSNLNVGYVITGGEEATGINNRNDLIKAEFYFQENKRKVFTDSGVTLVAPETVFFSLDTQIARDSVIYPYVFFGTGVKIESGAKILPFSHLENCLIKSNAEVGPFTRIRGNTTIGNKAKIGNFVEVKTSEVGQNTRIKHLSYIGNAKVGQESNIGAGTIVCNYDGKNKHETNIGSNCFVGANSSLIAPLNIHDESVIAAGSVIVEDVPEKSLAIAREKQVTKRIK >NC_021089.1|WP_015588826.1|116553_117597_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MNKELLDDILSLEDKAVSEIENASSLQDLEKVRLLYLGKKGVVRAYFDNLKKIENAEKKRDLGAVINALRDKIDHLIMNRENVLKTEEVNFKLQNEAVDITLPVRPEKMGKVHPLSKVINEVKLIFAHMGFKAVDGPDIEDEFHVFDALNTPSHHPAREEQDTFYLKNKIDDKRMVLRTHTSSVQIRTMEKTKKFPIKIVAAGRVYRNDFDATHTPMFHQIEGLYVDENVNMGQLKFTIHHFLNKFFGDKGLKIRFRNSFFPFTEPSAEVDISYKGSKWIEVLGCGMTHPNVFQNVGIDHTKYNGFAFGIGIERLAMLKYQISDLRSFYDNKISWLDHYGFHFSSLR >NC_021089.1|WP_015588827.1|117743_119471_+|hypothetical-protein MHNSNTETKNKYKIEDLPKLFKEKSRNISKAFSSETIKISAIRSRSIESNIQKFSFELTATDKDTFNIRLFRINPLIDFFKICLSREKKFTANIKVPKESSELYNNYCKTNSYKTVEEFVNSAPPQILLQGTTITLQTDVENINLDNLYQIELFLNEKLQHAEKTENEDKKEQSETNQKNAQNKQIVPVTGSFGFDVTNNGKQVTRVSIVVAAMHENVFWFRSFFCLPNFFNTSQFFSQQLPKFSIQSNNIPFGVIPAFDQEKRNMDPSSQATRMTGGSIENPIPQEAEQNVGQTTSHTEYFKANRKKSKKQSQELPEEEKQSTIKQARNDARVAVIDNQIEHRGKKLDKIFIEVMSGYKNQDPETFCNIFSSVFNIVYFQDKQLHAILEPGEISEVLQILERPQPLSNSLLGKEYLQKQVYRKKEQLLKLVSGVYIQQPSPQHENTPHKSTNPLPIKDLSPATNEAKTLPPTNITLKSPLKTVFSSKKAYFCLFIIVASASTLCLWHFPLGKVSMLKGLVPPEKRESIGLALNIGLPILIALCILNLARFIYSEYSIESIKQVSENDPLSRAYS >NC_021089.1|WP_012673066.1|119652_120249_+|riboflavin-synthase MFKGIITDIGTITDTTTHSNSDQIFHIKTQNLSSINKGDSIACSGVCLTVVDIMSDTFTVQASQETMKVANLNTWRIGKKINLEQAMRLSDKIDGHLVQGHVDGIVKFLTINQNLDSHEIKLSCPQELIKFVAKKSSVTLDGVSLTVNSVVNQEFTVNITPYTWENTTFQYNKVNDYLNLEIDMIARYLDQLMQHKYN >NC_021089.1|WP_015588828.1|120306_120897_+|CvpA-family-protein MLFDSLIIFIVVLCVIISVTRGFIKELCALMFLFLSVFLTANHYDFFTPNYSKYFDSKVTLNILSTISVFIILNLIFMIINNWLMYILLPIRLGFIDRVTGIFLGVLKGILLSYVLFFAVHLYCYTVYDKKEGEYKIEAEDILPNWIINSHSYQALFVTAEEVIDMYVPESLILKIKEIGGEMVDQEKPKNNKKEE >NC_021089.1|WP_006279412.1|121374_121812_+|hypothetical-protein MEQTDYKKLLNSAKFQVIKKTLDVISGNGFIPHLEILFFTYFNGVTMPDRLKKSYPTQMLIILQHQFYDLKVSEDKFSVSLSFQGKQERITIPFFAISEFRDKISGDVLIFDKISIDSDKEYKSEKCTEKLSNGSIISIDQLRDE >NC_021089.1|WP_006279415.1|122017_122239_+|hypothetical-protein MANSGINIALSEETLKHLAELSEFTKQPVQELAGKLFREAVELEMEDFLVSKISDERDVEGAETVDFEDIKWD >NC_021089.1|WP_015588829.1|122229_122505_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MGLERYKVKSLKSVVEKDLPNLPKTIRLRVQKAIKERLTVDPINFGEPLHHNLKGCRRLRVGDYRVIYRVNQLDHIVTITEIGHRDDIYKK >NC_021089.1|WP_006279515.1|122676_122955_+|YggT-family-protein MHPIIYLLNTLLDLYSFILICWVVLNWLVKLNMVNIYNETVSSIMHILNQLTYPPLKIIRRYIPPFNGLDLSIMILLITIHFVKYTVAYYFR >NC_021089.1|WP_015588830.1|122955_125070_+|DNA-translocase-FtsK MLKKYLKSAIYLSLLIYIYISVFSYNYKDPSLNTATNEEVTNLGGIVSSYLADILVQFLGLTSVTIATTIVYLLIFRPSKRLLKILYLILINLGICAILPQLSLGITARYRHSGIIGNALINNCPFYIFVIVTSIGLVGSVGWKRTIYSLFFLCKKIACLFVNVPFFRSHKTTEYSIAPLVVEEKHRTKITTKQQPKARQKKATEEVLSEFKFPSIHLLSKAEESLQRKQLNEMESNKNLSLLEQVLSDFGVQGKIISVCYGPVVTLYKLEPQAGTKSARVIGLADDIARSMSALSARISIIRGQNAMGIELPNKEREIVMLRDLLESPEYQNANLNLPIALGKEISGKPVIADLTKMPHLLVAGTTGSGKSVAINTMILSLVYRLSPDECKMIMIDPKMLELSIYDAIPHLITPVVTEPKKAVVALKWIVKEMENRYRMMSYLNVRNVINYNQRITEAMNSGIELERVVQIGFNSTTGKPLFEKLPIKMETFPYIVVIVDEMADLMLVAGKEIECSIQRLAQMARAAGIHIIMATQRPSVDVITGVIKANFPTRISFAVTSKIDSRTILGEQGAEQLLGMGDMLYMASGGKIIRIHGPFVSDDEVQDIVDHLKMQGEPNYMEEITKEDENSSVESEGETEDEENDLYNQAVAIIQRDQKVSTSYIQRQLRIGYNRAANIVERMEKEGVVSAPNYSGKREILVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_3 | 358734-358817 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_3
|
1 spacers
spacers of NC_021089_3
>3.1|358757|38|NC_021089|CRISPRCasFinder TTAGCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACGAATTGCTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_3
The CRISPR arrays of NC_021089_3 >merge|NC_021089|3|358734-358817|CRISPRCasFinder ACGTCATACCGCCGCGGTATCTCTTAGCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACGAATTGCTTAACCGTCATACCGCCACGAACCGTC >NC_021089|3|2|358734-358817|CRISPRCasFinder ACGTCATACCGCCGCGGTATCTC TTAGCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACGAATTGCTTAA CCGTCATACCGCCACGAACCGTC
>NC_021089.1|WP_010962623.1|357925_358618_+|thiamine-diphosphokinase MQNLHHDHVLHCSTQQQYRSIVVLNGKIPSSSFFKRDIPIIAVDGGANKLLSIGVKPDLVVGDLDSVNLDLRANLNTIYLPDQDYCDFSKAMAHLKTVKLLPSIVTGITGGAIDHILQNINIFLSTGSIFYTPSPPMVGYTLQKGITHFFSLPKNTKISLLGIPRAQISTKGLKWELHLSNLAFPGKNSCFNRSLGNKVSVEVHSGICLAMIYLETVDDAARHHVRQVKK >NC_021089.1|WP_006280002.1|357669_357945_+|hypothetical-protein MYINIEECFGFIALIASLIGLSPQVYKAYITKVTRDVSMLMLVNYLICSLSWIGYGLYQSSIFVVLSNIAGLVISIISIIQKCYYDAKPAP >NC_021089.1|WP_041573576.1|356656_357502_+|SPFH-domain-containing-protein MDKNTINDRNLSQLRFFPVLIALGLILSLLFLAYDSTIALGVAAVSILTFLQGFFINDPNEARVIEFFGHYIGTDFKSGICVTLPFSSKYIVSLKFQNINTEKIKVNDANGSPIEISAVIVWRVNSPAKAYYNVNNYHEFVFVQSDSVIRELASNYPYDSESDEESLRKNSDKISDELRSMLQQRLDIAGIEITEARISHLAYSSEIAQAMLRRQQAHAITSARRHIVQNAIGIVEEVIAHFEKNKSLQLDGKQKVQLINNLLVALISEQDAQPKISLDNN >NC_021089.1|WP_015588956.1|355710_356649_+|M23-family-metallopeptidase MRLVIFVLLCILPAYATETSTDLAQPFQHGIRKKKATLTTESDRKLLFISSTIKSSFFATEGLAPNTVVKLINIYKDFGVDFKKDIVPESKLEVLFERLPNNQKTEEKILYASLTINKKAISLYHYKSQDGKERYFNKEGISLKNGEIFANPLNGDYRISSKFGNRKHPVRGKIAFHKGVDYAAKLGTPIYAAAEGVIEYIGKNGGYGNYIKIKHKNEYSTCYAHISRFSGDIKLGSKVKQGQVIAYVGSTGVATGPHLHYEVIYNGKHIDPLTIAHKTEVKLPDHELREFKLFVNKINKTINREGSSEKEV >NC_021089.1|WP_015588955.1|354973_355714_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MAGHSQFSNIKHRKGAQDAKRSQKFTKLIREITVAAKQGLPDHELNPRLRSAIFAARKENLPKDKIETAIKNATGNVAGENYEEIQYEGHGPSGTALIVHALTNNRNRTASEVRYIFSRKGGNLGETGSVSYLFDHVGLIVYKAEGVNFDDLFSHGIELEVLNIEENDKEGLHVITCEIKDFGKVRDAFYAKFGEPELARLSWQPKDLIEISDKELIDKLSALVEELEDNDDVQYVEGNFTFVDKL >NC_021089.1|WP_015588954.1|354205_354913_+|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamD MYKTLITCFIFLICSFTQSYADDLEKTETELYEEAVELFDQKKYKQAIRAFHKIEDLYPLSYWAMKAKLLSGVSHYNMGNYSSAASDMADYIYVYSNGEDLPYVYYLRVLSYYMQINKVQLGQQTAYKTLELATEYINLFPGSEYVDEIKEKTKLITEHISTKEYSIGKFYLRRGEYLAAIKRFQNMASYKDSKYFSKSINYLIAVHSAIGLDLEAEQYESMLLAENLQDAKPEA >NC_021089.1|WP_015588953.1|353203_354145_+|hypothetical-protein MKIPSGKFSSTKKVPGKNKKKRDFEPLEEFFWDFWPTVDKEVKRERLEQELLALKKRELYRQCVSLVTMVPFALFMAIELEKICSDQVLLGVISGALSHTILPFTVLSLICTLYLIYNNRKIAQKERELEIIENGEEVKEKEHNISDIGQCLIYIEAITTALVIVGMIMGETSSLEAAEDAILFLANAIAFLATLVSYIDKHEKNKKKETEKSDLDEKSSKKTSNISVAGLALAGSSIFLIRRIMLMALASSLNPAVGPTLGLIGIAIFMAVQILTIHSYSKTLKDPKVEGRGESRNAGSSDRSYKEEGPAIA >NC_021089.1|WP_015588952.1|352549_353092_+|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MLKKNVPNLLTISRALAVPAIILSFYIENKYAGLITISIFVFACITDFFDGYLARAWKVQSKFGKLFDPIADKLIVVSTIIMLVYKQKINDFTIVPSIIIICREILVSGLREFLIATNVSLPVSKAGKIKTFLQMVAVVALIMNDYYMIQYTGAICLWVAAIITMWSGYNYILAGIKQIG >NC_021089.1|WP_015588951.1|351092_352415_-|NADP-dependent-malic-enzyme MNDDLDSTTKQEALNYHSRGGKPGKISIMPTKPLSTQYDLSLAYSPGVAAPCLEIAKNPEVIYDYTAKSNCVAVISNGTAVLGLGNIGPLAAKPVMEGKAVLFKRFADIDAVDIEVGTENIEDFINAVRYLGPSWGGINLEDIRSPDCFIIEKRLNELMDIPVFHDDQHGTAVVVAAGIENALDIVEKKLEDVKIIMNGAGAAGIACLEILKSMGAKNIVLCDKQGVIYKGRNEDMNEWKEKYAIDTSERSLLDTIKGADVFIGLSAKDVLNEEMLKSMGKDPIIFALANPDPEVRPEFAKSVRPDAIIATGRSDYNNQVNNVMGFPYIFRGALDVHATTINDEMKIAAADAIAKLAREPVPGEISAVYGGRKMGYGREYIIPTPFDPRLISIVAPAVAKAAVDSGVARKAIQDWSKYENQLKSRLSNVLSTLNLLSSHM >NC_021089.1|WP_015588949.1|349816_350041_-|BolA/IbaG-family-iron-sulfur-metabolism-protein MTIAIHELERIIKQSFPDADIKIHDLAGDDDHYHLKINSKCFLGKTKIEQHKMVYKALEGQSIHALQLETNTLK >NC_021089.1|WP_141456678.1|359010_359340_+|transposase MPQKMRVSNCHEYNKFLQERGSIFCYINDAIENWYENCPKMQGGNYIYSDKVVILVHIIVSFFRIGLRQTVGFIKGYLQQIGRDLAVISYSQASRRFKKLNIKINDCRK >NC_021089.1|WP_174517030.1|359341_359959_+|transposase MEDIEIAIDSTGISIYNNTPGHSKENSTDRKYRGYEQTRKLHVMLNINNKKAIAVKYSNGVYSDHYGACDLLKEVDFQHAIKALYADRACDRHKFYKLCNEYDIKTKIPPINNAAEHPEIDYMSDRNAAIRLIKLYGEDGMKEWKKEVNYGKRSYIEGFFSRLKQIFGFSFRNKSEINREKELLIKCYLLNKFTDIGMAKFEIVT >NC_021089.1|WP_015588958.1|360960_362364_+|malonyl-CoA-decarboxylase MTKESLVKTDIVKVEDKKAVRSFFKILGGVADAVRSWIGNISPDLSNSRDIDSLVLKMNECLNPKGGEVSARKNAVSLGNLYLSLSEKGKIKFLQTLAEKFNPNKAEIDEKIREYKKNQDPELNYKFEQDLIKILESPRSKILKQFISLPEGLKFIVDMRSDVLKLKNQYRSLNPLESELKNILYTWVDVDLLDLRQITWDSPASLLEKLIKYEAVHKISSWGDLKNRLDSDRLCFAFFHYKIPNEPLIFVEVALVDKIADSIQHLLDESVPSNDPSNASTAIFYSISNTQAGLSGISLGNFLIKRVVEKLSQEFKSIKTYATLSPIPGFTKWLKNNLNQDVTLLGKLNIKQSSAEILESAEQLKTNVECTNETKQYMLKLCAYYLLKVNNSNGNTYDPVAHFHLSNGASIKQLNWMADTSEKGISQSAGMMVNYLYELPKIDNNHENYMVNKVISCSKKVSSMLKE >NC_021089.1|WP_015588959.1|362443_364240_+|elongation-factor-4 MNNIRNFAIIAHIDHGKSTLADRLIEECNGLEAREMTNQILDSMDIERERGITIKAQTVKLNYTANDGNQYCLNLMDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGSLLVVDSSQGVEAQTLANVYKAIDNNHEIIVVLNKVDLPAADPEKVKLQVEEVIGIDASESVLISAKTGLGIKDVLEAIVAKLPAPQGDVNAPLQAILVDSWYDTYLGVVILVRVKNGVLKKGMKIVMMSNNATYQIDNIGIFTPKKVMTGELSAGEVGFITASMKEVADCKVGDTITEEKRPCSKALPGFKEVHPVVFCSIFPHKTDDFKYLREALEKLHLNDASFTFEAETSNALGYGFRCGFLGMLHLEVIQERLEREFDLDLTATAPSVIYRVTTRSGEVLNIHNPSDMPDPTKIEIVEEPWITATIMVPDQYLGEILSLCEERRGEQEDLSYIGNTTTALLRYKLPLSEVVFDFYDRLKSISKGYASLDWEISSYLVSQIDKLSFLINGEPVDALACIVHKSRAEKRGREICARLKDLIPRQQYKIAIQAAVGGKIIARETINPYRKDVTAKLYGGDVTRRMKLLEKQKKGKKRLHSIGNVNIPQNAFIQALKISD >NC_021089.1|WP_015588960.1|364856_365612_+|hypothetical-protein MVCDNCSVIKFSGKMIMDIAYLAALISAAIIKIAAVILCAIMCISVFFILFKGIKEHLDSKGFLSLLKTVGVISIILSIISLPLIILSLTTPSPLVVGIVGGIVGAISIIPLIVAYILLSITSKGLSQQPENYQHLFLTSLLLFIGNIIAGAFIAVSGVFPICKVDSLSSLSAALESLPAVGIHALALTIATAIGVVIVIDLAKQAKEYISGKIMQAEKESVTDTHKEPDSKVDEAKEGNVKNERKVPLLP >NC_021089.1|WP_015588961.1|366338_366719_+|TrbC/VirB2-family-protein MNPTIKRIFNIFLIVLFISFSHVGSAAADTNTDTTAQVICNIIGYVWGIGGPLMTVVIIGAALLAIFGRMPWPALFALGIFCAVFFGAKTIVIKVMGGIGGTGNTSLMDQCGTGDTKKNYFFLKQT >NC_021089.1|WP_015588962.1|366694_367693_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-E1-component-subunit-beta MATLSVREALCTAIREEMQNDSDVLIMGEEVAEYDGAYKVTKGLLKEFGENRVVDTPITEHGFAGLAVGAAFAGLKPIVEFMTFNFSMQAIDQIVNSAAKTNYMSGGQLGCPIVFRGPNGAAARVAAQHSQCFAAWYSHIPGLKVIAPYFASDCRGLLKAAIRDPNPVIFLENEIAYGHEHEVSDSELSNKDYLLEIGKAAVIREGKDVTITAFSLKLMDALNAADLLSSEGIEAEVIDLRTLRPLDTQTVINSIQKTNRLVSVEEGWPFAGIGAELSAVIMEQGFDYLDAPVVRVTGKDIPLPYAANLEKKALPQVEDIVEAVHQVCFRKK >NC_021089.1|WP_015588963.1|368240_369341_-|AAA-family-ATPase MKKIEISELLKRISICLLCVATIVSIAFLFAYMHTMLLSKGYELAAHYVSEAMPCVLLVVPLFIVWFVYDQVFSKLKEVELPISIELANSDDKRITFADAIIDDSLKQRLQMICCDQMTEEMRKLFGNKSINSLRGYILYGPPGNGKTLIARAIAGESNMNFISISGPELIGVYIGHGAHAVRELFKIAKKYSPCIVFIDEIDAVAQKRSTANNSAYHCRESLTQLLTEIDGFKSRKDIIVIGATNLIGGIDPALIRPGRLGQKVYVPNPNIEVRQKILALYMRGTKTDEKLSLQDIADKTEGYSGAELEQLVNEAKISAGAQRRLIVSEEDFSYALHRLSPEQERDRIKLVSNAKTQIEETSFIR >NC_021089.1|WP_144054588.1|370413_371688_+|MFS-transporter MNLVQTRVLISTILCRIAIWYDYMLFIDLINIISREFCFAKDVYSNILQLFGIVGLGAIVRPLGAFIFGHVGDRYGRRIALIITILLISIPSSLIAFIPSHNQVGIISTILLLAIHITQGIALGGEQGSSVYLIEHLSSRKENLGMYFGMMGFGRSIGVLLSAVIVIICKKTTDFCTLGWRLPFIFSAILGLISAYSIYTLGETPAYEKNRKQRNLPDLPIIELIKRHKRALILAILISVPVNVAVGFTIFLRTLAKEIASVDVYVTTYINEIVLIITSVLMPISSIAFGMLADKVGKERTAILFIAITMALCCPALSIAYYYKNYLVIALSVMVLSIIERGIVPIGIVASELFPTNVRFSGVSLSRNISYALHGGFTPMVCIWLTVTFPQTNLAAGLYIVFCLLISVVAILQIKLQDKKFDWS >NC_021089.1|WP_015588966.1|372152_372563_-|nucleoside-deaminase MELAIEQAKLAQKNDEVPIGAVIVSGDNIISSAHNISSDPTAHAEMLAIRQAFSTPTLCDADMYVTLEPCPMCAQAISFARIKRLYFGAYNPKGGGIENGAKIFQFCSHIPEVYGGILETECSFLLKDFFEKLRNI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_4 | 515298-515408 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_4
|
1 spacers
spacers of NC_021089_4
>4.1|515328|51|NC_021089|CRISPRCasFinder TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_4
The CRISPR arrays of NC_021089_4 >merge|NC_021089|4|515298-515408|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG >NC_021089|4|3|515298-515408|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG
>NC_021089.1|WP_015589056.1|513371_515183_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIFGVVSSGDSVIPTLLTGLQKLEYRGYDSSGIAIINNEGKIEVKKSEGKVERLCEVVDDSKMSHSTVGIAHTRWATHGVPGLKNAHPIRTNNVVVAHNGIIENYNLLKKGLEERGMPFHTDTDTEIIPNMLTLYLDEGLSPVDSLFKCLNNLHGSFALVLLFTEYPDALFVAKRNLPLAIGYNCNTVFAASDSNALSAFVEKISHLEDDDIAVIKSSGVSIYNNGTQVKRSIENSSPSDFLISKNGYPSFMLKEIFEQPCALNKTINQFYKQYKEVNKKLFSELNHITIVGCGSSYFAGLIAKYWLENVAQVRVYLEISSEFRYSNVKLEEGSIGLFISQSGETADTIEALRYAKSQKQTIISITNTFSSSIEKISDIVLHTLAGPEIGVASTKTFSAQLATLACFAVELGKIKGILGGERIKQLSSAINSIPEYVEHVLNVMKIQHISGSILEHNNVILIGRGSSYGVAMEGALKIKELSYINTTGIAAGEMKHGSIALIDSTVLVIAIIPYDDLFFKTLSNIQEIIARKGKVIAFSDKQGAPFLRGVCADVVQLPDTDNFISPIIYSVAMQFLAYFTAAKKGLDADCPRNLAKSVTVE >NC_021089.1|WP_015589055.1|512919_513291_+|preprotein-translocase-subunit-YajC MLISEVFAADATSNTSSIGASFASFTPLILIFVVFYFLIIRPQQKKLKEHRKMIDQIKRGDTVITSGGIIGEVNKVDEANAQFIIEIAPKVEIKVLKSAISEVLSKETQKVAAKPIKKVKSKE >NC_021089.1|WP_015589054.1|511673_512522_-|30S-ribosomal-protein-S2 MTNLPKVTVRDLAESGVHFGHKISRWNAKMAPYIYGVHQENRIHIIDLRKTLPLLQVAMKALYDVAFQGGRILFVGTKFQAFDIIASEAIRCGQYYVNHRWLGGMLTNWGTVSSSIKTLMQYEKILNDEDSILTKKELGNIEKKKQKLDKALGGIREMGAIPDILFIIDTNKEHIAVKEAKKLGIPIVAILDTNSDPDGITYLIPGNDDSRKSIELYCKLATDSILAGIESSLAKSGVKIDDIRGDEFIQEKEDGIVQTKKRRSKVYKEEEREVVTNEDESR >NC_021089.1|WP_015589053.1|510832_511693_-|elongation-factor-Ts MKMNPDDIRELRDRTGLGLSDCKKALEECDGDIKKAVDKLRTIGLAKADKKSDRVASDGLVVMCLTENYGALVELNCETDFVARNEKFIELVSNLASIAHQERCTSVDELKNAKYESIGTVQEAIMNGTSVLGEKLELSKLCYLEAKDGVIAGYVHGDVCGLGKIGALIALQSSGDKAKLQEIGKQIAMHVVAMKPEALSIDDLDQMKLKNERSIIEEQVRGLNKPEEVAKKIVDGRMAKYYEEVVLLEQKFIKDDKMKVSDFIKSSEVSAIKLSNYKLLVLGGAN >NC_021089.1|WP_015589052.1|510078_510822_-|UMP-kinase MFPSTNEKSEIKYSRVLFKISGEALMGSQSFGYDMGIISQLCKDIADINRLGVQVCIVVGGGNIFRGTSASLSGCERASSDYIGMLATIINALILQNFLEKNLIASRVLSAIPMATVCEPYIRRKAIRHLEKGRVVIFAAGTGNPFFTTDTAAALRAVEMNCDVILKGTQVNGVYSADPKKNEDAVMYDRLSYTDLLTRDLKVMDASAISLARENSIPIIVFSLKGEKIVNIIKGQGTYTIVSDCKH >NC_021089.1|WP_015589051.1|509513_510071_-|ribosome-recycling-factor MLNEIKAKTKERMLKTIQSFHDDIKGVRTGRASASLLDGIVVNIYGGHQKLNQVAGVSVIDNKTLSIKIWDINVVGEVKNAILNANLNLNPVVEGNTIRIALPDLTQETREKLVKLLHQFAENARIAIRNIRRDIMEEIEKMKENKEISEDDFHGAKKEIQNITDNNIKKIDGELSIKEKDILNH >NC_021089.1|WP_080717616.1|509350_509437_+|hypothetical-protein MILECKIGVIPVLRHWDPGNLISNKCIR >NC_021089.1|WP_015589050.1|508542_509238_-|di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase MLNQESLPKHLAIIMDGNGRWANNQGKVKIDGYKKGSEVAYDIAKYCTDLTIPYLTLYAFSMENWLRPKNETDCLFDLFYSVLTNEDKVNFICNCNIKLNFIGNLSLLSSKILDQIKKAEEMTHKNDGLLLTVAVSYGAKQEITQAISNIIKENIAYVSEEEFEKFLYTKDLPKLDLLIRTGGEKRLSNFLLWQAAYAELYFCDTLWPDFSCQDLSKALEDYTKREKKYGR >NC_021089.1|WP_015589049.1|507926_508553_-|phosphatidate-cytidylyltransferase MVDNNFIIRMLSSIVILFIFSFATYFSDLSFYLLIFSIAVLSSFEWYNLTQGNKILYVFALLLIALPSASLIYLYNLPQGKYALVWFVLTIWGIDVTAYLFGKNFGGAKICPILSPGKTWTGLLGAILAGVVCTIFGSIFFGLFSIFYSPIIGLAIAILAQLGDFTESLVKRAYGVKDSGNMIPGHGGVLDRMDSFIFTAPLIAIYIS >NC_021089.1|WP_006279326.1|507718_507910_+|zinc-finger-domain-containing-protein MSKVRVNNRKVCCHGDENDEGSGHPLIYLDMGEEEEIACPYCEKTFVHDCTVEAVGELTRDEL >NC_021089.1|WP_015589057.1|515489_516422_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MALSKFLDPKLDLTFKKIFGTEKNKNILIHFLNDILGFTEINTIQEVEFLSTIMDPEIASDKQSIVDVLCRDSSGARYVIEMQLTRDKGFEKRAQLYAAKAYSRQADKSGKYIDLKKVFFIAISNCNLFPDKLDYISSHTIRDEKTNEHDLKDFQFVFIELPKFPKNKEEQLESIVDRWLFFFKYADETTEEDLRKIAEKAPIIKLAYDELDRFSWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLATEKGIQIGEERGIKIGKEEGKIEGKIEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSVNGY >NC_021089.1|WP_070356842.1|516536_516728_-|hypothetical-protein MVNLVELCKNLERKIAKLYQFSLLVNQISDIVELFNCGVRKKGNSMAFFPLLSIRLLCSGNWY >NC_021089.1|WP_015589058.1|516824_517712_-|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MLISLPKVRGIYRYDVLMSKATWLNVGGRADVLFKPCDIEDLTYLIKNTELPVSVIGATSNIIVRDSGIRGITVKLGKEFTYIKSKGNNSIVAGGAVLLSNLAHFAGNQQISGLEFLVGIPGTVGGGIEMNAGAYGSDIASVVQSIKAVNLEDGNLYEFSSEEMGYFYRGHSLKGNWIFVEAEFKGINSEYELILQRLKEVIERKNKSQPIRGKTAGCIFKNPKNYRAWELIDKSGCLGLNIGGARISKKHCNFLLNYDNATASDLENLGNKVKDAVKDKFNVELEWEIRVLGSY >NC_021089.1|WP_015589059.1|517702_518581_-|hydroxymethylbilane-synthase MPVKIGTRGSKLAVAQALEAKQKLLDSFPNLSIEIVKIKTSGDKYANANLAEIGGKGLFIKEIETELLENNIDMAVHSLKDMPAFFSGGLTIPCVLERLSSCDAFISHKHNSLESLPQQATIATSSIRRKVQLLNVRPDLNIVPLRGNVTTRLQNQSFDGIILAEAGLIRLEKHHLITEVLPPKVMLSAVGQGAVCIQCRRNDVKIINLLEKINNNMSFIGVKSERSFMKTVNGSCFTPLAALAEYVSENMLHLRCMLASGKNIYFTERTSFIEDAEKMGMDAGLELKSKCL >NC_021089.1|WP_015589060.1|519702_520875_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MSKIIEIRAPKTLGGESVTEGIVKIKKGIGEAVKVDDLIFEIETDKTALELTAEASGQITEFLVKEDDVISPDQLLAKLSVGEVKEEARKEDKSESAAKKDAPSARKIMEENAISAESVKGTGMGGRITKADVIGHMNKAEQPAIKQYELPKSVVSGEQREERVKMSKIRQVIAARLKASQNTAAILTTFNEIDMKNVMDLRAKYKDAFEKKYGIKLGFMSFFIKAAVQALKEIAEINAEISGDEIIYKHYYDVGVAVGTDKGLVVPVIRGADQMSFAEIELTLVALGKKAREGKLQVSEMEGATFTISNGGVYGSLLSTPIINPPQSGILGMHSIQNRPVAMGNSIEIRPMMYIALSYDHRIVDGKGAVTFLVKIKNYIEDPNRLVLEV >NC_021089.1|WP_179943641.1|523553_526160_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MSFFFIRKIFGSTNKKIIKSFRKIVQQINALETEMQSLSDEELAGKTEEFNRELKNGKTLNDLLVPAFAVVREASRRFLNMRHFDVQLIGGMVLHNGMISEMKTGEGKTLVATLAAYLNSLEGKGVHVVTVNDYLAKRDTEWMSKLYNSLGVSVAFITNNLTDEERKEAYSADIVYSTNNELAFDYLRDNMKFSQEDMVQRGFHYGIVDEVDSILIDEARTPLIISGPVEENNQIYKHINKIVTKLVDSDYEVDEKGRTVFLTEDGISRVEELLRSCNLIPENSSLYDTDSMIMTHYIDQALRAHKLFTADKDYIVKDGKVVIIDEFTGRMMEGRRYSDGLHQALEAKENLEIQHENQTLASVTFQNYFRMYNKLSGMTGTAATEAEEFSDIYRLNVVKIPTNVSVKRVDIDDEIYGTGKEKFNAVLKFIEECHKRLQPVLVGTVSIENSEKLSALLQSHSLKHSVLNARYHEQEAYIIAQAGVPGSVTIATNMAGRGTDIQLGGNAEMIAKVELKKIKNADEREKKYQEIVERVKKDKEIAIKAGGLCVVGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDPGLSKFFLSLEDDLMRIFGSDRMRSFLQKVGLKNNEAIHHPWINKALEKAQKKVEARNYDVRKSLLKFDDVINNQRKVIFKQRNNILGNEINDLLEVYSEVNESVIEGIVQSGYYEDYIEDIVKEFHTRYGITLDKEDLAKFLNKQEVLDYINDKIQEFFTEKEKYFNSQHTTDLWNTIVKQMMIMTLDHLWREHLSVLESLRQSISLRAMGQKDPLNEFKREAFLMFESMLEKWKELTIHRLAHFKLADNQEIGNRLHSARNSRLPKVSRNDKCPCNSGKKYKHCHGAVTVVN >NC_021089.1|WP_015589063.1|526163_527093_-|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MTLRLIVQEVNSSPDLSKENLIDRIKDKLQQENQLIYDEWKKNEFDINYTFIVLKCNLLLIAAENGYEKVVRYLTKNGANVNVQDEWEKTSLHYSAQHGHAQVVEVLLEEGADVNAQNEDKGTPLHYAAYSGHIEVVKHLIKKEADVNVVDRYGRSPLHYAAENGYTQVVEVLLEEGADVNAQDKDGRTPLYYAVYYTHGEHPRLNYQHPKVAKLLLNYGADPSFIHRPKAITAGITVGILAAIVAPLALIYATALPALAIVVITVASALIVGGISYGVAYKSSEHSLNSKLSEVSCSNVDGNKQTVQP >NC_021089.1|WP_015589064.1|527429_528071_-|fructose-6-phosphate-aldolase MEIFLDSVDLNEIKGLKEFIDGITTNPSLIAKSGRKDKYEDLVREICSIIKGPVSVEVVADSHEEMITEGLNLAKIADNVVIKLPLTHEGLISCKKLWTEHKIPVNITLCFSPGQALLAAKVGACFISPFVGRLDDISYDGLSLIEDICTIYSNYGFDTKVLVASVRSPAHVIEAARFGADSITVPAKVLRQLINHPLTDQGLAIFEKDWGVK >NC_021089.1|WP_041573517.1|528110_528452_-|hypothetical-protein MNLITNSIKGFYSSVKSDLDWQAKRSLIRTLVKEVNIDLDKVDVVFKIKELENPAQNGQNQKMVHCLRGLGTGMTSFFLVQITLMSQYLYSCVIGCLMFTTQEVHTVVSQAVG >NC_021089.1|WP_041573518.1|528817_529102_+|transposase MVREYTAEFKLEAVKLANEQRKVGQPVAKVARDLGIRDSVLGKWMKKYNEKKSAANAFPDVAPYDKERFDLQKELAKVTRERDILKKALASQKE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_5 | 593031-593101 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_5
|
1 spacers
spacers of NC_021089_5
>5.1|593054|25|NC_021089|CRISPRCasFinder TCCCTTGGTTTGGTGTCATTCCAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_5
The CRISPR arrays of NC_021089_5 >merge|NC_021089|5|593031-593101|CRISPRCasFinder GCTTGACACTGGAATCTGCGTTTTCCCTTGGTTTGGTGTCATTCCAGTGCTTGACACTGGAATCTGTGTTT >NC_021089|5|4|593031-593101|CRISPRCasFinder GCTTGACACTGGAATCTGCGTTT TCCCTTGGTTTGGTGTCATTCCAGT GCTTGACACTGGAATCTGTGTTT
>NC_021089.1|WP_041573589.1|591280_592153_+|hypothetical-protein MPSAEFAKDIKTASEKAFTSTKEAFISGRVTRIVKDGLKDVYGTSFEPVKSALNSFGSSLKNTCDTSIESAKGTISSVGNKLKNVYDTMPSTKIEFSWVSEKFSPYWNSVKNLMFGNKADQASGASQLSSESQGNGIVIPEGAKLELSPILFDFLFREKQKMVRQFLREQTDEKKNVATQENLKTETPSQENQMNIDNVPKQPDHLNVDAAKSYLMSLSEDQDVFYDAESGDEKGTEISSPESQPTKEENGQGWFAWSLGKVKSAMTEVVVIGADVTKPYCAKVTKALAT >NC_021089.1|WP_179943640.1|590703_590964_+|hypothetical-protein MMNKNNVPYYIAGTLAALTLLASGVFAAAPYIGFLAPVAALSVGLPFIIGGAVFSAVAIALSYAAVSKNKTISEKEAQLSDEKSRS >NC_021089.1|WP_015589094.1|589136_590588_+|replicative-DNA-helicase MNELANLLSSRSVDKEICKLPHNLEAEQMLIGAMIRDNRICDAVEDTITAENFYDPLHQSIFTQISKTRKHGIVANELSLKMFFENDQAFTECGGVEYLAKLAAKASIALDIYSLTRIIRDTYLRRCLIKLGQEIVGDSYNYDIENPAQAQIEQAMTKLFNLAVKKQGEKTYIKLASSIKDVVEKISTLKNNPEALGVTTGLQDLNQLLGGLQKSDLLILAARPSMGKTALALNIALNACKMLQKRADKQHYVAFFSLEMSAEQLTARLITIDSGISYYKALTGRISDFELHEFINTSTELSELPFIIDDTPALSISALRTRIRLLYQLYNVEVVFIDYLQLIRGTTKRSNENRVQEISEVTQGLKAIAKELNIPIVALSQLSRSVEQRDDKKPQLSDLRDSGSIEQDADIVMFLYREEYYELRKQPNEGNNKHREWQEKMEKIRNIAELIIAKQRNGPIGSVKLYFDSNRGAFKDYTERHSS >NC_021089.1|WP_015589093.1|588318_588915_-|RDD-family-protein MLHKFFNRLFSIFSSINVIQKVKKDENGICYVTGLRRYISVLLDLIIIVLFLQFCSQALNQLFMNSEDSKILSQIAAKSPMQAPLSAEEKTTQSRLIKLLILNQIVQFIMLFCYVIYMWVKFATTPGKLLFGLRVVDAQTFEKMTLKQATKRFFSFILSVAPLFLGFLWSNFNKRCQTWHDKIAGTVVVTSKSLRRQS >NC_021089.1|WP_065094818.1|587945_588125_-|hypothetical-protein MTKEDSVSATFMTPFAVFKNECSYNCASCALLNILLKNLISYYTRDKQFIDDEKLQKGA >NC_021089.1|WP_015589092.1|587296_587971_-|DNA-repair-protein-RadC MKNYKKGHRKRLREKIILDNGQSLLDYEVLEHILYSAYSRIDVKPIAKSLIENFGSLNKVFNADLEALQNVDDVSNAAISAIFCVKQAFVRSAREEIKNLPVIDNWEKLLDYLRISIGSLNKENFRVIYMNKKYRLIAEDLQNIGTVDQTSLYVREIIKRALLIGSTSIVISHNHPSGDTQPSNSDISLTRQLAEACQSIGIELIDHIIITFSSYFSFKENRLL >NC_021089.1|WP_141457347.1|587144_587240_+|hypothetical-protein MCKENWIPVSSTGMTSSRQPLRHPVTVSLSR >NC_021089.1|WP_015589091.1|583629_586890_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein MRSNAINPNFSVWVNASAGTGKTKILIDRVLRLLLENKRNILCLTFTNAAANEMENRIHSILSKWAICSDSELIMDLEQLDFFPMYPYLSSQCVTLGSRKNKDYLTRARRLFSELENLGLTIQTIHAFCYKLISSFPIEAGIAPNCTLSECKELHSIIFNKVLHNETVQDDINLIATEIDENKLRDLLYTLCVKRSMSANDSKYIKDKLSAPDGIHDLQSETIEHVGRLAEILSEGSKRDQSYSEILYSTVIPAGIQKKRTSVSYSDDTGIKWNDTKIENLAKVFLKSESHEKKSISSIATKSILEKFKDAEQIIESVQNVVFTHIRDMNSYQIFKRTSSLLGIFKVYVDLYSSEKSKNALLDYNDIIGLATNLLSNPNYKDWILFNLDQKIDHILVDEAQDNSISQWKIITNLCDEFFAGNDEKRTLFVVGDVKQSIYRFQGANPHLFNYMQQYFHTKTGGRDWISCQLEKSFRSTPEVLMLVDRIFNNFRAEISFNDNEIKHVPHRENDQGYIEIWPALPRRKEKEQRALQIPLTCKEGYTIADRLLAQTIANRIHNWLNEGRILVAKDRHIEPRDIMILVRQRNVLVDYIISELKKANVPVVGRDYFRIMDYIAVQDLIALAEFLLLQANDLALANALKSPLFNFTEDDLFNIAYDRKEHSLWERIQDYSVVIYSELNYLINLSCIESPLALFTHILRTGKKKFAARLGLECFEVLDEFMNLVLQFENPSLQAFVQWIKKNNPEIKNDMQSERNAVRIMTIHKSKGLQAPIVFLVDTNTVPRSNESIIFDGMEVPFWCGKNNNAYCDQVKREKKLEDYNEYLRLLYVALTRAEDELYILSKETVQKGSWYDLITQYGTSYEKKQACLQPIFKEKVEVLCVNANYPYIYKKRDYFDVPVISLPPNLSMSFQHVTLEPREKKPVSSYLNDKKKSTGMTDGYARGLIIHSILQYMPKIEKERRKNWVRKYLDNINTSEDKDEIYSKILAFNEKYGYLFDLGGKSEITLSGIIDGEPVLVRLDRLCITQDKAIIIDYKSHRNVSVSLLNEIKKQMLIYKTLVQEIYPNKQVECVVIWVEDLTIQSDF >NC_021089.1|WP_015589090.1|582681_583548_-|4-(cytidine-5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol-kinase MKSFCVKAPAKINLFLHVVDKKETGYHLIEGLFVFANLSNFLEIKVGEKDSRYDNSTVEFINSESRINNQYNTVMKAVNLLLRHAPVRTKVTVKVVKNIPIAAGLGSGSSDAGAVVRTLGKLWEIDRTILNEIALNVGADVPASVDSKPVFVRGIGEELCHIKKFSLPTNVVLVKPKKRFLSTPEVFSKHEGKFSEPIKWSDDAEKDLLKLLKETRNDLQEIAISFVPEIKDVISTLESQEGSILSRMSGSGVSCFGIFDSEENAKAAAVNIGKKQPEWWVCDTQLIV >NC_021089.1|WP_015589089.1|582321_582678_-|Mth938-like-domain-containing-protein MPLISENKNLINGYREGKFLVNNREYCGSIIIFPEKVIKLKESDINSKEHFKSFLTEEIEILIIGTGKTRNILSSSVKSYLMEQKGLNFEFMTTGSACRTHNVLISEDRFVVSYLIAI >NC_021089.1|WP_010082521.1|594003_594444_+|TrbC/VirB2-family-protein MIIERTMRNFLVILFIVFYAFDAHADGATDVMCNVIGYVHGIGGPMITVVIIGSSLLAIFGRMPWPALFALGMFVAVFFGAPQIVTKVTEKEVCCLFKGQTLENGKCVAAPGYERVGTGYACRSGWALTNKGYCIKAGQDPSKYWK >NC_021089.1|WP_015589098.1|594455_595631_-|multifunctional-ribose-5-phosphate-isomerase-B/3-demethylubiquinone-9-3-methyltransferase/2-octaprenyl-6-hydroxy-phenol-methylase MLGIVSIASDHAGYELKSEIKPYLEALGYRVVDQGCTAKQKCVDYPNYAVKVVEDITSKKANYGILICGTGLGMSTVANRFEGIYAALCNSVEIAKLAREHGNANVLCLGAGFTASGLAKDIVKQFLETEFSKESRHKKRLDKLSNITSKKKKTKTYNEDEISKFAKMAGQWWDENGKFKPLHMMNPVRVSYIIEKIKELKKCNLKELSLLDVGCGGGILSESMARVGINVVGIDVCEENIKVAHSHAKKVGLNIEYIHTSIEELSNDKKYDVVLLMEVVEHVDNLELFMKKAIELLKPEGLIFISTINRTIKSFCLAIIGAEYILNWLPKGTHNWNKFLKPSEIANHLRENNVTLQNMAGMEYNVIKREWNLTKGVDVNYILCGLLDLTL >NC_021089.1|WP_080717604.1|595865_595922_+|hypothetical-protein MYNKNWIPVSSTGMTPSV >NC_021089.1|WP_015589099.1|596531_598280_+|DNA-primase MDHIDIIKSKLLLSDIVGKKVRLIKRGDSFVGLCPFHNEKTPSFSVSNTKGLYYCFGCLASGDAFEFISQTEGLSFKEALEKLASVTGVELPKNLSITKEDNKLFLALDLAANWFAQKNQGVVDYLKQRKISPKIIDKFKIGYAPSSGLKEYLNSSGIEDRILIDIGLVNKNFHDYFYDRLIFPIQSIAGRVIGFGGRVLSSEQQPKYLNSPESQLFKKRENLYGLNFALSEIRKKQHILVVEGYMDAIALHQAGISNAVAPLGTAISAEQIKNLWRFAKEISICMDGDSAGRHAATRVAELALPILEPGYTLKFVTLPSNKDPYDICNELAYKKEDVLTALDHSTKLHSEYLWHHIIDSNLQNYEKLAPEKYSILEHKFMEYVNTISNSSIRRYYRDYFYNKASELRSSFKKQIFNSKTGATKGEYLHNKSPELIEAEQNQAVILRIAVEFPEILNRPIFFEQFSHFEFTNEMKRLQQRVIDVISNKSKLDKEALLQELKQFNVIKYVFEKTSVLNSQLNERKSAEIVWNNIVLLKELNALRKERTEARLSGNLDLEERLIEQIEQIESSIQEMQMEFIEK >NC_021089.1|WP_006280480.1|598517_599600_+|Fic-family-protein MNWKNFRLSTRLNLEGPVIEQVYELITAVDSVKNSWQITKKLLPQTIERLTHSVIVTSSGASNRIEGNRLTDKEVEDLYKNLRVKKFKNRDEQEIAGYLEMLTLIFHDYTDIPISESSILHINNQMLLYSEKDLYHRGKYKASSNRVEAKDQNGKVVGIIFDPTPPYLVRKEVQELIDWYHWSLNNKFKHPLIIVANFVFEYLAIHPFQDGNGRTSRLMTNLMLLQQGYDFVSIVSHEKIIETNKLDYYLALNKTQSSWKSGKEDISPWLIFFLNVLKTQANEAHYILERENTEYLLSRKQLFFWEWALSLADKEFSRKDAIEALGFPPRTVEAITKKLLGMKYLQRLGEGKATRYKVII >NC_021089.1|WP_010082072.1|600993_601158_-|IS3-family-transposase MSNKGCCYDNSVAESFFSSLKREILIDTSQHSAQQTRTAIFEYIEIFYNKQRHY >NC_021089.1|WP_010082071.1|601150_601312_-|hypothetical-protein MSSAINKQLVMNSLLMAINRRKPVKNLLLHSDQGSQYTAQGYQYLLAVKNIDE >NC_021089.1|WP_144054591.1|601315_601738_-|IS3-family-transposase MVTAIKYRNYIGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLAAIQKIYQVSKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNDIRAILRRKFKIKKQQTDNRAVAPNILDQNFIVDQPNKVWDYLHQNQGGMAIFGSNNSHVW >NC_021089.1|WP_081600778.1|601691_602045_-|transposase MVREYTAEFKLEAVKLANEQRKAGQTITKIAKDLGIKGGLLGKWIKKHNEKKSAADAFPGRGNMAPYDKERFDLQSKSNKGKRHLKKSPGQSKRVKYFFIKEHSNCYKVQELYRIFC >NC_021089.1|WP_015589100.1|602332_602647_-|septum-formation-initiator-family-protein MLISKKKQKLLCLSAALLISSLTLYFSISTITGKRGLLTLIDLKKEIEYNKLLLKDVSSEKEKLDNKVFGLYEKSLDLDLLDEQAKNALGYVNPNELMVVLDVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_6 | 724613-724713 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_6
|
1 spacers
spacers of NC_021089_6
>6.1|724639|49|NC_021089|CRISPRCasFinder AGCAGCGGGATGACGAATTACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_6
The CRISPR arrays of NC_021089_6 >merge|NC_021089|6|724613-724713|CRISPRCasFinder CGCGGTATCTCTAGATCCCGCTAACAAGCAGCGGGATGACGAATTACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGCCGCGGTATCTCTAGATCCCGCTAACA >NC_021089|6|5|724613-724713|CRISPRCasFinder CGCGGTATCTCTAGATCCCGCTAACA AGCAGCGGGATGACGAATTACTTAACCATCATCTACACCGTCATACCGC CGCGGTATCTCTAGATCCCGCTAACA
>NC_021089.1|WP_015589166.1|721816_722866_+|SAM-dependent-methyltransferase MLTYIHELIDKSQGSISISDFMNAVLYHEKYGYYTSKLPLGKDGDFTTAPEISQLFGEVIAVWIMHTWEKLGKPSKFSLVELGPGKGTLIHDIIRVTKKYSSFFNSMLIHLVEISPTLRKIQKEKLKSLDVNWHKNIDNLPEQPTIFLANEFFDALPVDQFVYRDGQWYENMVTKQDDGSLLVSCQCVTLESRKKESWIPVSATQMTNGKFFNGAVVEICSVGVEILKKLEKKIYNNKGAALIVDYGYVYPAYKSTLQSIKQHKYANFLENVGNSDITALVNFQALRDSLKHVDCEILTQREFLYLFGIKERTQALMKSASDEQKNRIFSEFLRLTENMGTLFKAMLLI >NC_021089.1|WP_015589165.1|721343_721736_-|hypothetical-protein MSNSASVMDDKNTDYVVLIAQDDSIEYKFEEAVNFIENKVINADGLTLAEVFQVLVQMLDGDLALVKKVLAYANIMAKHGMKVAKESQLSRADVRRALEGRESVVNRQDFIKKPPLPPAIKSTKKKSRGL >NC_021089.1|WP_010962783.1|721058_721343_-|DUF2610-domain-containing-protein MAESIKKFTVQCDFKGQSSPFAIYIGNPKSDAHPIHHQDSWLVKERGGNIPNKVKESLQKLYKLSQENGVSFSELCAYAITVVSNNDKKSDDKE >NC_021089.1|WP_015589164.1|720221_721052_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MEGLQLKKTQSEIEDIWKNREKFNDCNLKKTARIAIKEVIELLDSGKIRVAEKLSSGEWVVHKWIKQAILLHFLTEENKIIDNTNCWFDKIGNKFSEWNEEKFRQLKIRAVPGCFVRRSAYIGTNVVLMPSFINVGAYVDSGTMIDTWSTIGSCAQIGKNCHISGGVGIGGVLEPIQASPVIIEDNCFIGARSEVAEGVVVREGSVLGIGVFIGASTKIIDRETSKVFYGEVPPYSVVVPGSIPSKNNISTYCAVIVKKVDEKTRSKISINEILRD >NC_021089.1|WP_010962781.1|719719_720148_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MKIQCNSCTKTYLVSPKQIGASGRKVKCTNCNHIWHEYLEEVSNKSHSANIQEKKVSGRNFLQNLAFTTLAFATATGLCVVIANGIFPREMNKAYKTISLYKDSISYKLGYKKEQTESPNVKKLAVNKFYQDYLFLSNLRSS >NC_021089.1|WP_015589163.1|718936_719617_-|ribulose-phosphate-3-epimerase MSIKIAPSILSADFAKLGEEVRKISDLGVDYIHIDVMDGNFVPNITIGPSVVSAIRKYSNLPFDVHLMVKSPGNHIESFINAGADIITVHAEAEIHLERLIRKIKSYKNVNDAKKPIQAGVSIVPSTSPSVLEYIIHELDIVLIMTVNPGFGGQEFIHSQLNKISTIKKMIQERNLKTQISVDGGINFSNAADIIKAGADILVAGSAIFKAEDIKKAVNDLKNPSL >NC_021089.1|WP_015589162.1|716259_717342_+|bifunctional-diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil-reductase-RibD MTDDHFMSIALRLAEKNLGNVAPNPAVGCVIVKDGTIVSEGYTGIGGRPHAEVVALQNAKDSTHGATIYITLEPCCHHGVTGPCTAKIIKASIKRVVIATIDPDSRVSGRGMKALKEAGIEVEQGIMQKEAKELNVGFFTTKELHRPFIACKVATTLDGKIATFTGDSKWITSENTRNWVHELRAKYDAIMIGSNTLINDDPLLTCRLPGLGSRSPIRLIIDSQGRLKEEHNIAKTADKVITWVITNKEVEKKIKNINYLVVNSSNAGKVCLKDMALKLVSEIGITRLLVEGGGVLITELLKCNLIDRLIICRSGKILGNDATPFVGDLGIQFINNCYQFKKTKIIEFSEDIVEVWDRSS >NC_021089.1|WP_015589161.1|715060_716260_+|deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase MSNNNFLLNYACFPSKTKGRYFKEPEDENRSCFQRDRDRIIHSNAFRKLEYKTQVFINYEHDYYRTRLTHSLEVAQIARSIARRLGLNEDITECIALAHDLGHPPFGHAGEDALKKSVQDLNLDNEKYEFDHNVQAIRILTYLEQKHADFDGMNLSWEVIEGVVKHNGPLLGQNEESSTSNQLLLEYNKKYDLKLEEFSSIEAQVASIADDIAYSVHDLDDALRANLVTIEDLLNVPLIEKMFKDIRSRYSELPQSKLIHESLSGTIGTMISDVVSQTERNIEDHKIKSVEDVRSLNKMLVTFSPEVANATKEMKRFNMEKIYRSYKLSRTMNKAKRIIQELFQCFYENPGLLPTEWSKLACESQRSVIICDYISGMTDRFAIHEHRRIFDTSYEMTSF >NC_021089.1|WP_015589160.1|714584_715013_-|HesB/YadR/YfhF-family-protein MSTNYNINLTDNALKKIHSLAEQEGDKSSILRVAVSGGGCSGFKYNFLMDQMNKNLSLDDEDEDDDYEESEDYRSHSSFSKKGKDIVINDENGNPVLMVDNCSAKFLNNSVIDYTEDLSGSGFQIKNAFAKSQCGCGNSFSV >NC_021089.1|WP_015589159.1|713870_714545_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MGGNVALELTSVDKSFKDNSAVVKDINLSVTRGQVVALIGNSGAGKTTILQIAGLLDKPTSGIVTIDGINCTQASNKHKTHVRRNFLSFVYQFHYLLQELSVLENIMLPQLIAGKSKAEAKKNSQAMLEKFGLENKASSMVSEVSGGERQRVAIARSIVNSPKLLLADEPTGNLDPTNSFKVFLLLHSYVKENNSSMLIVTHNHLLAEKADCIFQLRDRSLVKL >NC_021089.1|WP_015589167.1|725292_726867_-|penicillin-binding-protein MWTKNKVFNRRAFILGGIQLTISAVFSCRLYNLQIRNRQKYEALSNSNRIRVATIMPKRGKILDRNSIELAVNKISYVVLFDGSGKEVDLQTLSEVESKIAKSSEKITALYKRYYPFGSMCSHVIGYTKRQQGISEVGISGIEYTYDHILKGKSGKSEQEINSKKRVIKELSSIPQQDGQDVQLTIEINLQEKTAEVFKDHQGSAVVIDVNNGEILALYNSPSYDNNLFASRLSNETWENLNAPSLPLVNRALSYQIPPGSIFKVIVALAGLKDGIITPEEKFSCKGYMKIGERKFRCLKSKVHGYVSLNEAMALSCNTYFYNIGKKISVDSLVEMARKFGIGSGPLIGTFKEEAPGLLPDRDWRTRKLYSQWYLGDTINLVIGQGYMLTTPLQLAVLAARIATGKEVIPHIEMSKTIQDFPDIDVDCEHLSIVRKAMFDVVNSKTGTYKKGLSGIQIAGKTGTPEINSKGESHKLFIAYGPYHNPRYAISVFIEHGKAPRQDVAIANEIFQYMLETMSIKLLA >NC_021089.1|WP_015589168.1|726821_727661_-|polysaccharide-deacetylase-family-protein MFIRIITFFLLYSSTAFCSDCNFNLPYCGLSCNLDLSYRNLSNIKKLLNNDDKFVALTFDDGPSNNRINDIINVLESYEAKATFFVLGERINEKTSEIVKKIHESGHELGNHSWSHRKLTSLSSEEQLQELEKTNTAIKNAIKQDVKWFRPPYGCYDDNLIENTDQLNMYSILWTVDSLDWQGDKPETLVERVLSNVHNGAVILFHDHNNRSNTIEALPHIIKILKKSDYKFVTLSEWEKRVCNTVKARSVTIKEGKKVCFEGMLCGQKTKSLTAEHSY >NC_021089.1|WP_015589169.1|727783_729292_+|YifB-family-Mg-chelatase-like-AAA-ATPase MIANINTVALQGISTVNVNAQIHMANGIPAFNIVGLPDKTVAESRERIRAALNSINLLLPPKRITVNLSPADLLKEGSHYDLAIAIGLLVVMNVIPVEKVQSYIIMGELALDSRVIPVSGVLPTAINAKKDNKGVICPRGNGVEAVWVKNVSILAIEKLTDIIRHFKGEQLIQPVIFNYSDAPKEKRLVPDMKDIKGQVVAKRAAEIAAAGGHNMLLVGPPGTGKSMLAKRFIGLLPDLTEQEIIDVNIISSITKTGNEIFKVTRPFREPHHSCSMPAMIGGGKNAKPGEITMAHNGVLFLDELPEFPRLVLDSLRQPLEDRKVTVARANAHITYPANFQLIAAMNPCSCGYLGDASRSCNKAPKCGTDYKNKISGPLLDRIDICIEMPNVSILSPEISVEGESTKIIRERVIAARKVQTERYSELNIRCNSEVSGEAFNKFTEPDQAGLELLKYVLKENYISNRGYTRVLKVARTIADLAKSEEVKRAHIAEALNYRIKVY >NC_021089.1|WP_015589170.1|729375_729840_+|hypothetical-protein MALTNYEYRKGDGIFHAISEGYIRAEKYWGIPGAAGGAGQYAMHNKGRTALFPLAVASVVFTAMHMKAGFVSAAEASGFLAKTASYFVGTNQAIAASLPGFIGTGVAGQIVAGAIMAIAAAAVLYGTYQIASKLKDVAVEALKGEEKDKEANNL >NC_021089.1|WP_010962790.1|730078_731275_+|cell-division-protein-FtsZ MSIDLSLPELPILHPRITVVGVGGAGGNAVNNMIQSNLQGVNFVVANTDAQALEKSLCDKKIQLGINLTKGLGAGALPDVGKGAAEESIDEIMEHIKDSHMLFITAGMGGGTGTGAAPVIAKAAREARAAVKDRAPKEKKILTVGVVTKPFGFEGVRRMRIAELGLEELQKYVDTLIVIPNQNLFRIANEKTTFSDAFKLADNVLHIGIRGVTDLMVMPGLINLDFADIETVMSEMGKAMIGTGEAEGEDRAISAAEAAISNPLLDNVSMKGAQGILINITGGGDMTLFEVDAAANRVREEVDENANIIFGATFDQAMEGRVRVSVLATGIDGRNNKSETSPISQSEDSEKEKFKWPYSQSESTQDKTLETKPAEQVSEGAKWGSNIYDIPAYLRRKK >NC_021089.1|WP_007549395.1|731274_731673_+|EVE-domain-containing-protein MQFWLLKSEPSEYSWQKMEKEQVVEWDGVRNYQAQNYMKIMKASDLAFFYHTGKEKAILGIVEVFKEYYHVNDPKFGLVNVKFLKPLNNQVTLNNIKQNPLLKNMTILKQPRLSIAPVSEIEWNEIIRMSDV >NC_021089.1|WP_179943634.1|731728_732064_+|hypothetical-protein MNICLEGSALNVIADFASNTKVSFQFLTLESSLNATTLKPLCFNIRLATFIFTNLMSNQNSWIPVPRHWDDILLVYNIRTVVYMTQGSITLLFWIPVSAICMTPLLMCHSC >NC_021089.1|WP_010082473.1|732057_732510_+|rRNA-maturation-RNase-YbeY MLEVNILDKKWCSIIENPKNFVLGVINASLKELKIDHYKPNISIALADDDLLHQLNLKFREMDKPTNVLSFPYEQLSNECDLGDIAISIDTIKRESHEYYIPILAHIAHMLVHGLLHLLGYDHQKKDEEIIMKNLEREILASLGYNMCAI >NC_021089.1|WP_010082472.1|732596_733385_+|succinate-dehydrogenase-iron-sulfur-subunit MVQFSLPKNSKINQKGKIYPIPARAKNIRRFQIYRWSADDEKNPRIDTFFIDMDSCGPMVLDALIKIKDEIDSTLTFRRSCREGICGSCAMNIDGTNTLACTRSIHDIKGDVKIYPLPHMYVIKDLVSDLSQFYEQYKSIKPWLQADKPALPNKEYSQSSEDRKKLDGLSDCILCACCSTGCPSYWWNSDKFLGPAILLQAYRWIADSRDNKTGERLDVLNDPFKLYRCHTIMNCTKTCPKGLNPARAIAKVKQLMVEREGV >NC_021089.1|WP_010962793.1|733388_734525_-|hypothetical-protein MFFLYEVVLILILILFFLSYSKLKISNKIKNLQHQNVIINNLIDTVNDGFYIWDAKKRIEKFSPNLLILLNTVFYSFNEFVNFFEQSESLIKNFVEAKEINKSFTLDLKSKDSEVYCICYGRSIIDDSNNVIGVLLWIRNVSDCKIKANGLELENSKLTQEVESYKNVFNSLPFPILRYNKSRKVEFYNLFYDKYVDGSKKFAITGSAHSTKPGRHVITYKNEPKVFDFVKIPIQGSGSIVMYGKDVSDAEKLYTELNSYLATQKNLLERLPVAIVIYSKNQKLKFYNNAFIKTFQFDPKFLASYPTYHEVMLYLFESKKLLEKEDFQTISNQRHELFKKLFESYDDTMHFTNGKAFRVLTIPYASEGLLFSYEECKR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021089_7 | 763657-763761 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_7
|
1 spacers
spacers of NC_021089_7
>7.1|763681|57|NC_021089|CRISPRCasFinder AGGTTATCGTCATGCCACCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_7
The CRISPR arrays of NC_021089_7 >merge|NC_021089|7|763657-763761|CRISPRCasFinder CCGCTAACAAGTAGCGGGATGACGAGGTTATCGTCATGCCACCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCGGCCGCTAACACGTAGCGGGATGACG >NC_021089|7|6|763657-763761|CRISPRCasFinder CCGCTAACAAGTAGCGGGATGACG AGGTTATCGTCATGCCACCGCGAACCGTCATACCGCGATTCATTCGCGGTATCTCGG CCGCTAACACGTAGCGGGATGACG
>NC_021089.1|WP_012673206.1|762837_763437_-|peroxiredoxin MNLVTKSAIDFTASSVLSDGEIVDDFCLSKRIKNKYAVLFFYPLDFTFVCPTELISLNNRINEFAKRGVEVIGISVDSKFSHYKWRNTPVNDGGIGEISYTLVSDIKKSISRDYGVLYDDSIALRATFVIDDKFIVRHQSINDLPLGRNIDEFVRIVDAIKHNEEHGEVCPAGWKKGKPAMQASDEGVADYLNSYSEEL >NC_021089.1|WP_015589186.1|761912_762851_-|thioredoxin-disulfide-reductase MKNYKFSTKVLIIGSGAAGYAAAIYAARANLEPIVVTGMQPGGQLTITTDVENYPGFVSIQGPELMEQMRLHAEKVGAKIIDDEIKSVEQLEDSNEYRFRSSGNINDYYSDAIIIASGAQAKWLGLESEKKFQGYGVSACATCDGAFFRNKVVAVIGGGNTAVEEAIFLTRFAKEVILIHRRDKLRAEKVMQDRLFKNDKIKVMWNHTVEQILGEENPKRVAGIAIKSAETQELKVDGVFIAIGHAPNTGIFKGFVEMDEQGYIITKPGTTLTSRAGVFAAGDVQDKVYRQAVVAAGTGCMAALDAEKFLES >NC_021089.1|WP_015589184.1|759389_760310_+|tyrosine-recombinase-XerC MDLGSIIEKWYEWLRCNRSYSPNTLESYMRDLKDLISFLNTHIGGEVNVGTLKNLSIPELRSWLTSRYARGVNARSNTRALSVIRNFFKYIKNNHNIDNEAVFSLSRPIQRRTLPKALSIPNIKTLLKEMKLSDLGEPWVVKREIAIIVLLYGTGLRISEALNLRVSDISSENLIITGKGDKQRQVFILPVVKKCIQEYIKACPYLDEAQHLFLGVRGKKLGRTYVANRLQKIRRMLNLPEILSPHAFRHSFATHLLQEDIDIRSIQQLLGHSSLETTQIYTHLNYQDVFNMYKNFQQGLEKKSKL >NC_021089.1|WP_015589183.1|758007_759387_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MTDYDLIVIGGGPGGYKCAIAAAKLGLKVACIDKNSIFGGTCLRVGCIPSKALLHSSYQYAHTKNDLSKLGIKIKDASFDLKEMLGYKDARVQELGKGIEYLFNLHKITKINGLASFDQGNLEVSVEGKVLKTKNIVIATGSDVISLPGINIDEKDIISSTGALSLTEVPKKLVVIGAGAIGLEMSSVWRRLGSEVTVVEFFDRIAAAMDGELSKSLLSSLQKQGIKFLLSTKVEEIKQSSNSLSVKVCSVKDNQTNVIEADKVLVAAGRKPCTENLGIDEKIEKDNRGFVQVNNRYETNVKGIFAIGDVIGGAMLAHKAEEEGVAVAEIIAGQVPHVDYEIIPSVIYTHPAVSSIGKTEEELKSVGRKYKVGKCQFAANGRAKITDDAEGFVKVLTCSRADTILGVHIIGAYADTLINEAAVAMAYGAAAEDIYRICHSHPDINEAFRDACIDAFFKK >NC_021089.1|WP_015589182.1|756905_758015_+|PQQ-like-beta-propeller-repeat-protein MKVIIVMIMLLCSSYTMASERISLVDKKLSQGYVAPVLIENSVILSDKHGALYSFDIDNSKAMNWKLHLSHRKKIGNMSLSHYEKNVFFIVDNTLHAIGAKTGKIEWEKELRAPVRGKAAVINNKLVVLTIDNYLYVFDIKDGSFVWTYQNGINEVRGLYSISPAISNDKIIAPFSNGELIAFNEDGKKLWSQKLATNLLDTQLTDVTTTPRVLGDTLIATNNSYIYSIDVKSGNILWSKSLQVKSVSDIESYYSPLIPAEKQKEGGRIFIVTKDDKIIGLDIKNGETVWTSDLIENTQLFAPIMHAHTLWVTSNKGSMFAFPGSESAGKVVKVPGNVFHTPVFTRNKIYVTTEGKGVYSLENRFVFYD >NC_021089.1|WP_044471264.1|756254_756536_-|transposase MRVSNCHEYNKFLEKRGNIFRYIDKAIENWYENSPKMQGGNYIYSDKVVILVHIIVNLFRIGLRQTVGFIKGYLQQIGRDLAVISYSQASKKT >NC_021089.1|WP_022626339.1|755621_755873_-|hypothetical-protein MAERNAAIRLIKSYSEDGMKRWKRQTNYGKRSYVESFFSRLKQTFGFNFRNKSEINRGKELLLKCYLLNQFTDIGMAKFEMAT >NC_021089.1|WP_015589181.1|754590_755397_+|DUF2163-domain-containing-protein MQTTLKNHLAGELLTTATCWKLTLAGGEVMGFTDYDEDLNIDNILYKSSSGFAASSIILNSDLKTDNLEIEGILNSVDIKEKDVLSGKYDFANIEIFLVNYKDLTQGTMNLHSGIFGKVTLSSGRFIVEIRGLSAKLERSIAELYSPACRAQFCDDKCKADTKKFSKISTITKVIDERRFEDTNLTESDEYYKHGVVKFFGSIAFEGVVKEYKNKVVTLFTSPPYQIFAGDKYSILAGCDKTFPTCRSKFNNTVNFRGEPYIPGFYIV >NC_021089.1|WP_012673252.1|752174_754154_+|porin MKKSMYTRTALVSLLTLCSFSSFAADFPDESMKEIKKQESTKTSGKTEVMKTSNKKLKEKMDRICNADPRKKAEELKKKEELRLAAEQKKKEEIRLANEKKAKLIEDSKAKALNAKNSNIEKGKVSKTKRSKTKNAKVEAKDVKKDIKVVNKNTEEKGKASPVVSVGGVDIIDTNQGQSNLRITFGGVVDAQGYGKAGPSGADYKRYNVMPNRSTEYYNATPDITKGANPIFYEGIGNIGDYSNDMGMIADAILHLRAENKNEDLGLLYGADVQFHVPVTEGKGASQGVYAAKGRSAHVFVNSKYGDVKLGYQFGPEALMRLDATRIATVDGAADSDWFRKVNLEGSAASFPFYVTPRLYTESFSSESEKFSFRMAGKYNKGVMTTLPFRVAYYSPNYMGARFGISYSPRYDSGLFTVKETVSEDKGGKIEHKETIKHVGPDYEHIVSAGASYEYDFDKHNIKVKTSAVGEYGFPKQPSKDKHLYKEFVEYNDLMGVNFGVSADYKINEDQGVKFAASFAYLGKSGQPKGIKKLIGDTYTEIDSKDATDGKRVEGLKAQFGKDSIDTMYWTVGAGYQHENIYTSLTYFGSRMNDKDMLHDGALGVQYDLSPACSKNKFVPYAALHYFMTNETGKLKDESDADVPSNQGILLLTGVKFSF >NC_021089.1|WP_015589180.1|751145_751967_+|3'-5'-exonuclease MLNSLLVFDIETIPDVNSCKNLLNISDDSSVEEKRDALTKYHLEITNGQNSFLRQPFHLVVVISFLLCNISYQSGYEVFTLQEIRSGGTLNSSEKELVKGFFNYISEKKPRLVSFNGRTFDIPVLKYRAMVHGIQAEYFHKAGDKWNSYNQRYSSDWHCDLLESLSDFGASARVKMNEVCAAFNLPGKIGVDGSQVMDLYDSGKIQEIRDYCETDVINTYLIYLRFMHHQGRITTESYNKSAEELLLECEKKEYLKKFKEEWQITCGGKILLP >NC_021089.1|WP_007550039.1|764375_765248_-|hypothetical-protein MTKNISIISRNLISIELVNKQDLENFIKIFTVLDKHIAAKTLFTEEVRIEYKQHNGIEVVELLKDTDFTYHEVENVLNHLSKHGMKVPSSVIAHTLFAAYNHALEFKDVAFSFSEGSPQFNIRVSKNTFIITPMSEENLELNSQSSKKLIESLQSEKNIYDCIVEENTIKVIVHSEIHQAINLIIKSLIKSRLLAKEEEGKFKEKLRQLAFKDQAFVEYSSIKTISRYPHNHPLRKHESVTKDIENILCDFIANENSEFAIERLNRLSSAVSPDTPRIITKTIDKLVKFH >NC_021089.1|WP_007550037.1|765363_765702_-|glutaredoxin-3 MKNVVIYVKKGCPYCIRAKDLLDKKGVKYEEIDVLKNSDLFNDIKSKYNVRTVPQIFINDKHIGGCDKLMDLEKEGKLDDMLNNNDNHTDVTTYTNSNDECGECVIPHDDFM >NC_021089.1|WP_010082493.1|765762_766695_+|riboflavin-biosynthesis-protein-RibF MKIIYNCEQGIENNIALTFGNFDGIHLGHEFAISTLKKVAQERGLPSAVLTFEPHPSTVLFGRNNFRLIDQEQKKELISSYGIDYLYIINFNRGFSEVSCDDFISEILIDKYGAKHIIVGENCTFGHKRLGNILTLEKYSEIYGYSLTKLEPLTIDGKICSSSSIREYVQRGEIEIANKLLGRPYQVSGVVTKGACRGREIGFPTINIPIEDCMIKPKFGTYYARVTFPDSNPNWLYGVVNIGMRPTFKDLKKPIIEMHIFDFDEDVYSHKVNIQLLKFIRSEKKFHSIEELTKQINYDILKVYRLKANL >NC_021089.1|WP_006279329.1|766691_767168_+|signal-peptidase-II MKKLCLVVILIIVLIDQTSKLYINSLIDEGESIEIASFIKLVEVWNSGISFGMCSALPHGGFFFSAFSILIIGILAYLIYKSDDQSTYLGFSLMIGGAIGNVVDRIYWGAVYDFIYFHIDDWYWPAFNLADLSIVCGMFTLLYKWYIYDMLISKQNEE >NC_021089.1|WP_015589188.1|768607_769927_+|insulinase-family-protein MRISKFVLLFFFCLSFNLQASGSLNIEEVTTRKGFKFLFVENCALPKVSLNISFKDAGYVYENAEKQGLTWFTSLIIQEGAGKNDAKDFAKKLEDKGISLNFIADLEAFRVSLNTLSDNLEEAISLLSDTIMRPKVDPEGLNRVFEKAKVNFNNLEKSPYFVAGKELDTLLFKKHPYSKSVYGTLDTIMNITRDDVLTYIKRNFAKDNIVISVAGCAKKEEIITLLDKYLSKLPSKRSKVRKIPVKNNFGSAESKNIFMDIPQSVILFAQKGIAYEDPNYYNAGVLIDALGGMRLNSILMTELRQNLGITYGVYASIISNKHGNIISGFISTDSSTAGKAISAVKDTFSRIKKQGIDEQLFKDAKIGLVNNLVLFLSNNTNTATLLDNMQINDRDVNRINNYANIINDVKLEEVNELASSLLEPENLFFVEVGKNAQGQ >NC_021089.1|WP_015589189.1|769936_770497_-|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MKKIKLGILISGRGSNMQALIEACQDQNFSAEVACVITNNSEAAGLKIAEQAGISAFIVKDKPLDAGKIHEILVQHKVDLICLAGFMRILKADFLSKWHNKVINIHPSLLPSFKGLNAQEQALKAGVKITGCTVHYVTPEVDAGAIIAQVVVPVLPADDIQSLSERILAKEHKCYVEAVRSIAEDI >NC_021089.1|WP_006279382.1|770801_771218_+|hypothetical-protein MSKLPNNAKIGKSQVTQWEVIKNCEYADNCLSKIVTLYVIRITQLSDFYTSDEPEINTVLARISVTSENVFLNKATTIEVMEGIFPYKFNSKKRNNILRLEDLYNYLCSIVNNSLPKEMLESLVREYKDAVNLFKAIT >NC_021089.1|WP_010962821.1|771210_771741_-|Na+/H+-antiporter-subunit-E MKNLNFRKEIKFFSLSFIILFVLWTVLSGYFEPFFIFCGVFSSIFTSFIFRRLINAERALSQILNSTSRLSFYKLVSYIPWLMYQIILSSVYVTKKVLQLKSKLEPIIILRKCKGHNDESIALFANSVTITPGTLTINVESKQKTYFSTMYLIDKDLESGISEIENKILKILRSVK >NC_021089.1|WP_015589190.1|771809_773852_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MLKDITTKLCILSEEVMKYGKFMEILNKINDLSDLSKDNIVEKIKAKLQEEDPDLCQEWEKSKPDNDSGSGINYIFTISCGQNSKKVKLLHLASYWNYANVAKALIENGADINAEHDNKITPLHIAAHYGHEDVVTILTGKGAIVDAKNGDGWTSLHFAVEKNHKNVVNTLIGKGANVNAENDKGWAPLHLAITNGHKEIVQVLSKAEGINVDAKNSDGWTSLHLAAANGRKDIVETLIEKGADVNAKDHYKWTPLTFASQKGHEVVKGALLKAQENIKALHSAVKHNNEEEVKNLLNKGVNVNAKDDDGCTPLHLAAREGHKDVVDILIAKGAKVNAENDDRCTALHLAAENNHIEVVKILVEKADVNAEGIVDETPLHLAAREGHEDIVKTLIKKGAKVNAENDDRCTALHLAAENNHIEVVKILVEKADVNIKDADRWTPLHVAAENGHEDIVKTLIAKGAKVNAKNGDRRTPLHLAAKNGHEDVLKTLIAKGAEVNANNGDRRTPLHLAAENGKIKVVEVLLHTEADPSLKDVDGKTPRDLTKYQGIIQLLEEAEKKQTLKNENKKTPKDLTENKDVMQLPEKKEEKQIGKNAIVKEKEQSAKNAIVKGIIVCFVTAVIVGVALAFATALSVPAIIGLAAGSALIVGAGQYIMSKPKTEMKEVKELVPRETEKALT >NC_021089.1|WP_007548863.1|773972_774422_+|SsrA-binding-protein-SmpB MEVIAENRKARFEYFILEEFEAGMVLLSSEVKSLRERKVNISDAYVVEKNSEVWLHNMHIAEYKAANRKNHKPKRERKLLLHKKEINKLIGQIKTAGITVVPLSVYFNDKGFAKTKIAIVKGKKLYDKRATIKQREWDREKSRLSKNNL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_8 | 767116-767225 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_8
|
1 spacers
spacers of NC_021089_8
>8.1|767142|58|NC_021089|CRISPRCasFinder CTTATTTCTAAACAAAATGAGGAATAAAATAATTATATTCACATAATGTTGACATCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_8
The CRISPR arrays of NC_021089_8 >merge|NC_021089|8|767116-767225|CRISPRCasFinder TATATAAGTGGTATATATACGATATGCTTATTTCTAAACAAAATGAGGAATAAAATAATTATATTCACATAATGTTGACATCGCTATATAAGTGGTATACATACGATATG >NC_021089|8|7|767116-767225|CRISPRCasFinder TATATAAGTGGTATATATACGATATG CTTATTTCTAAACAAAATGAGGAATAAAATAATTATATTCACATAATGTTGACATCGC TATATAAGTGGTATACATACGATATG
>NC_021089.1|WP_010082493.1|765762_766695_+|riboflavin-biosynthesis-protein-RibF MKIIYNCEQGIENNIALTFGNFDGIHLGHEFAISTLKKVAQERGLPSAVLTFEPHPSTVLFGRNNFRLIDQEQKKELISSYGIDYLYIINFNRGFSEVSCDDFISEILIDKYGAKHIIVGENCTFGHKRLGNILTLEKYSEIYGYSLTKLEPLTIDGKICSSSSIREYVQRGEIEIANKLLGRPYQVSGVVTKGACRGREIGFPTINIPIEDCMIKPKFGTYYARVTFPDSNPNWLYGVVNIGMRPTFKDLKKPIIEMHIFDFDEDVYSHKVNIQLLKFIRSEKKFHSIEELTKQINYDILKVYRLKANL >NC_021089.1|WP_007550037.1|765363_765702_-|glutaredoxin-3 MKNVVIYVKKGCPYCIRAKDLLDKKGVKYEEIDVLKNSDLFNDIKSKYNVRTVPQIFINDKHIGGCDKLMDLEKEGKLDDMLNNNDNHTDVTTYTNSNDECGECVIPHDDFM >NC_021089.1|WP_007550039.1|764375_765248_-|hypothetical-protein MTKNISIISRNLISIELVNKQDLENFIKIFTVLDKHIAAKTLFTEEVRIEYKQHNGIEVVELLKDTDFTYHEVENVLNHLSKHGMKVPSSVIAHTLFAAYNHALEFKDVAFSFSEGSPQFNIRVSKNTFIITPMSEENLELNSQSSKKLIESLQSEKNIYDCIVEENTIKVIVHSEIHQAINLIIKSLIKSRLLAKEEEGKFKEKLRQLAFKDQAFVEYSSIKTISRYPHNHPLRKHESVTKDIENILCDFIANENSEFAIERLNRLSSAVSPDTPRIITKTIDKLVKFH >NC_021089.1|WP_012673206.1|762837_763437_-|peroxiredoxin MNLVTKSAIDFTASSVLSDGEIVDDFCLSKRIKNKYAVLFFYPLDFTFVCPTELISLNNRINEFAKRGVEVIGISVDSKFSHYKWRNTPVNDGGIGEISYTLVSDIKKSISRDYGVLYDDSIALRATFVIDDKFIVRHQSINDLPLGRNIDEFVRIVDAIKHNEEHGEVCPAGWKKGKPAMQASDEGVADYLNSYSEEL >NC_021089.1|WP_015589186.1|761912_762851_-|thioredoxin-disulfide-reductase MKNYKFSTKVLIIGSGAAGYAAAIYAARANLEPIVVTGMQPGGQLTITTDVENYPGFVSIQGPELMEQMRLHAEKVGAKIIDDEIKSVEQLEDSNEYRFRSSGNINDYYSDAIIIASGAQAKWLGLESEKKFQGYGVSACATCDGAFFRNKVVAVIGGGNTAVEEAIFLTRFAKEVILIHRRDKLRAEKVMQDRLFKNDKIKVMWNHTVEQILGEENPKRVAGIAIKSAETQELKVDGVFIAIGHAPNTGIFKGFVEMDEQGYIITKPGTTLTSRAGVFAAGDVQDKVYRQAVVAAGTGCMAALDAEKFLES >NC_021089.1|WP_015589184.1|759389_760310_+|tyrosine-recombinase-XerC MDLGSIIEKWYEWLRCNRSYSPNTLESYMRDLKDLISFLNTHIGGEVNVGTLKNLSIPELRSWLTSRYARGVNARSNTRALSVIRNFFKYIKNNHNIDNEAVFSLSRPIQRRTLPKALSIPNIKTLLKEMKLSDLGEPWVVKREIAIIVLLYGTGLRISEALNLRVSDISSENLIITGKGDKQRQVFILPVVKKCIQEYIKACPYLDEAQHLFLGVRGKKLGRTYVANRLQKIRRMLNLPEILSPHAFRHSFATHLLQEDIDIRSIQQLLGHSSLETTQIYTHLNYQDVFNMYKNFQQGLEKKSKL >NC_021089.1|WP_015589183.1|758007_759387_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MTDYDLIVIGGGPGGYKCAIAAAKLGLKVACIDKNSIFGGTCLRVGCIPSKALLHSSYQYAHTKNDLSKLGIKIKDASFDLKEMLGYKDARVQELGKGIEYLFNLHKITKINGLASFDQGNLEVSVEGKVLKTKNIVIATGSDVISLPGINIDEKDIISSTGALSLTEVPKKLVVIGAGAIGLEMSSVWRRLGSEVTVVEFFDRIAAAMDGELSKSLLSSLQKQGIKFLLSTKVEEIKQSSNSLSVKVCSVKDNQTNVIEADKVLVAAGRKPCTENLGIDEKIEKDNRGFVQVNNRYETNVKGIFAIGDVIGGAMLAHKAEEEGVAVAEIIAGQVPHVDYEIIPSVIYTHPAVSSIGKTEEELKSVGRKYKVGKCQFAANGRAKITDDAEGFVKVLTCSRADTILGVHIIGAYADTLINEAAVAMAYGAAAEDIYRICHSHPDINEAFRDACIDAFFKK >NC_021089.1|WP_015589182.1|756905_758015_+|PQQ-like-beta-propeller-repeat-protein MKVIIVMIMLLCSSYTMASERISLVDKKLSQGYVAPVLIENSVILSDKHGALYSFDIDNSKAMNWKLHLSHRKKIGNMSLSHYEKNVFFIVDNTLHAIGAKTGKIEWEKELRAPVRGKAAVINNKLVVLTIDNYLYVFDIKDGSFVWTYQNGINEVRGLYSISPAISNDKIIAPFSNGELIAFNEDGKKLWSQKLATNLLDTQLTDVTTTPRVLGDTLIATNNSYIYSIDVKSGNILWSKSLQVKSVSDIESYYSPLIPAEKQKEGGRIFIVTKDDKIIGLDIKNGETVWTSDLIENTQLFAPIMHAHTLWVTSNKGSMFAFPGSESAGKVVKVPGNVFHTPVFTRNKIYVTTEGKGVYSLENRFVFYD >NC_021089.1|WP_044471264.1|756254_756536_-|transposase MRVSNCHEYNKFLEKRGNIFRYIDKAIENWYENSPKMQGGNYIYSDKVVILVHIIVNLFRIGLRQTVGFIKGYLQQIGRDLAVISYSQASKKT >NC_021089.1|WP_022626339.1|755621_755873_-|hypothetical-protein MAERNAAIRLIKSYSEDGMKRWKRQTNYGKRSYVESFFSRLKQTFGFNFRNKSEINRGKELLLKCYLLNQFTDIGMAKFEMAT >NC_021089.1|WP_015589188.1|768607_769927_+|insulinase-family-protein MRISKFVLLFFFCLSFNLQASGSLNIEEVTTRKGFKFLFVENCALPKVSLNISFKDAGYVYENAEKQGLTWFTSLIIQEGAGKNDAKDFAKKLEDKGISLNFIADLEAFRVSLNTLSDNLEEAISLLSDTIMRPKVDPEGLNRVFEKAKVNFNNLEKSPYFVAGKELDTLLFKKHPYSKSVYGTLDTIMNITRDDVLTYIKRNFAKDNIVISVAGCAKKEEIITLLDKYLSKLPSKRSKVRKIPVKNNFGSAESKNIFMDIPQSVILFAQKGIAYEDPNYYNAGVLIDALGGMRLNSILMTELRQNLGITYGVYASIISNKHGNIISGFISTDSSTAGKAISAVKDTFSRIKKQGIDEQLFKDAKIGLVNNLVLFLSNNTNTATLLDNMQINDRDVNRINNYANIINDVKLEEVNELASSLLEPENLFFVEVGKNAQGQ >NC_021089.1|WP_015589189.1|769936_770497_-|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MKKIKLGILISGRGSNMQALIEACQDQNFSAEVACVITNNSEAAGLKIAEQAGISAFIVKDKPLDAGKIHEILVQHKVDLICLAGFMRILKADFLSKWHNKVINIHPSLLPSFKGLNAQEQALKAGVKITGCTVHYVTPEVDAGAIIAQVVVPVLPADDIQSLSERILAKEHKCYVEAVRSIAEDI >NC_021089.1|WP_006279382.1|770801_771218_+|hypothetical-protein MSKLPNNAKIGKSQVTQWEVIKNCEYADNCLSKIVTLYVIRITQLSDFYTSDEPEINTVLARISVTSENVFLNKATTIEVMEGIFPYKFNSKKRNNILRLEDLYNYLCSIVNNSLPKEMLESLVREYKDAVNLFKAIT >NC_021089.1|WP_010962821.1|771210_771741_-|Na+/H+-antiporter-subunit-E MKNLNFRKEIKFFSLSFIILFVLWTVLSGYFEPFFIFCGVFSSIFTSFIFRRLINAERALSQILNSTSRLSFYKLVSYIPWLMYQIILSSVYVTKKVLQLKSKLEPIIILRKCKGHNDESIALFANSVTITPGTLTINVESKQKTYFSTMYLIDKDLESGISEIENKILKILRSVK >NC_021089.1|WP_015589190.1|771809_773852_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MLKDITTKLCILSEEVMKYGKFMEILNKINDLSDLSKDNIVEKIKAKLQEEDPDLCQEWEKSKPDNDSGSGINYIFTISCGQNSKKVKLLHLASYWNYANVAKALIENGADINAEHDNKITPLHIAAHYGHEDVVTILTGKGAIVDAKNGDGWTSLHFAVEKNHKNVVNTLIGKGANVNAENDKGWAPLHLAITNGHKEIVQVLSKAEGINVDAKNSDGWTSLHLAAANGRKDIVETLIEKGADVNAKDHYKWTPLTFASQKGHEVVKGALLKAQENIKALHSAVKHNNEEEVKNLLNKGVNVNAKDDDGCTPLHLAAREGHKDVVDILIAKGAKVNAENDDRCTALHLAAENNHIEVVKILVEKADVNAEGIVDETPLHLAAREGHEDIVKTLIKKGAKVNAENDDRCTALHLAAENNHIEVVKILVEKADVNIKDADRWTPLHVAAENGHEDIVKTLIAKGAKVNAKNGDRRTPLHLAAKNGHEDVLKTLIAKGAEVNANNGDRRTPLHLAAENGKIKVVEVLLHTEADPSLKDVDGKTPRDLTKYQGIIQLLEEAEKKQTLKNENKKTPKDLTENKDVMQLPEKKEEKQIGKNAIVKEKEQSAKNAIVKGIIVCFVTAVIVGVALAFATALSVPAIIGLAAGSALIVGAGQYIMSKPKTEMKEVKELVPRETEKALT >NC_021089.1|WP_007548863.1|773972_774422_+|SsrA-binding-protein-SmpB MEVIAENRKARFEYFILEEFEAGMVLLSSEVKSLRERKVNISDAYVVEKNSEVWLHNMHIAEYKAANRKNHKPKRERKLLLHKKEINKLIGQIKTAGITVVPLSVYFNDKGFAKTKIAIVKGKKLYDKRATIKQREWDREKSRLSKNNL >NC_021089.1|WP_015589191.1|774428_775220_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MSLNPVIFSIGPVSIYWYSLAYVLGIVFAYWYLHRLDDQKIFTKNFYDSLLTATIIGIILGGRLGYVLIYDPVLYISNPIEILKTWEGGMSFHGGAIGVLLAVIISCRRHNIPIFYALDLVSCGVPIGLFLGRIGNFINGELFGRVTTMPWGMVFPESGDNLLHHPSQLYEALFEGLLLFAVANSLFFLTRIRLYHGALTGIAVMWYGIARFFVEFFREPDYQIGYLWLDLTMGQLLSIPMVLLGMLVYLGALNLKFNTKSVT >NC_021089.1|WP_015589192.1|775910_777656_+|type-I-secretion-system-permease/ATPase MEITPSIKKELKQSTLYVCLEKCKSAFWFIFWFSAGINLLMLFLPLYTSQVLDRVISSESVSTLTMLTIITLSAFACSAMLETCRYLAMAKIGDWIDKTATPDLIVRSIRLTSVQSSTSSGEAIRDLGVIKNFITGNGIFSLFDTPWSLIYLVVIFMIHTSTGFIAITGIIILVSMAIWNELATKRILQETNEETIRNINAIDVATRNAEVVEAMGMSEFIVSDWCKRNDQNRAMQIKAQNRSNVITGITKFLRSTLQISVIGTGALLAITAHKTAGSIIAASILMGRVLAPFDAAVHTWKFLNQARMSYGRLQRLILTSPKREQTMALPEPEGKLEFDRVFFTPYGSNKPTVKGISFIIDPGDVVGVIGASASGKSTIAKLTVGVWKPISGVVRLDGADVYTWNRENFGNYVGYLPQDIELFNTSVKANIARMRPDPNPEEIIKAAKIAGIHELILSLPNGYDTTIGGPGGVTLSGGQKQLLGLARAFYGHTKLLVLDEPNANLDSNGEACLINAIGIARKQNTTTVIITHKLPLLSVVDKVILMSDGVIYAMGPKDEILSKLVAPSSSTTEDERSSANG >NC_021089.1|WP_015589193.1|778121_779561_+|hypothetical-protein MFSSKSKSKFMLSIGEEGIMLLYFKNNTLNKRYFVKGKNDKAVSDLISCLSSDKKAPLYLVLNHADQNYSLQFITRANKISAYLSAKTKMEHFSRNNDISSVFLVEKPNKFNQNWCYLLVSSKAKHLVEYWLNVFIEIGSNFKGILMFPIEISNITKKILHKDPNNWKIIVAATKTGGYRQVVLKENKMVFTRLTSFTNDNLPGIIAGGIYQEVQDTIRSLTKFGFEKNNPIDLCIIVSEDIKASLSVINFSENSVNILTPYELGKLLGAELAISEKDNFCDTIILFHSFKNKLAAIFNTKETKEFYLFNYLYLNSPRIFLYFALVLVITNTLCLLNLYSNFNVADNLSAKQNTLNNQLTKLSQSYNVKKIDEIYDFININNILSKIEYSPLTQVKYVEKLKIPGIELRSFEWNYNEAKSYITTTLKFNFQSGKNISHQYEKLRKNLNDNFRTYDINISSLPAAKEQNLSIDVEIGEAM >NC_021089.1|WP_015589194.1|779565_780174_+|hypothetical-protein MTISQLKRKATIQFISYLLLSVGLIGLLTYVVIYNEKIYNKNQIAIDKIRSINLQITGIQKKEVVLNKNLDLWKKISSSNLHSSRYIANLNFELSKLYKKHYILEPEISISIPEEVELHNKSERTKVIKSEVVLNLSSISDKHIFLFLQSIPNLPGYVMIKSLILNKQRNIDAATMNQILNGNMIEIVRANIVFDWYTILSR |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_9 | 825573-825677 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_021089_9
|
1 spacers
spacers of NC_021089_9
>9.1|825598|55|NC_021089|CRISPRCasFinder CTAAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTGTAATGACGGTTAAGTAAT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_9
The CRISPR arrays of NC_021089_9 >merge|NC_021089|9|825573-825677|CRISPRCasFinder TCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGCTAAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTGTAATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG >NC_021089|9|8|825573-825677|CRISPRCasFinder TCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGG CTAAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTGTAATGACGGTTAAGTAAT TCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG
>NC_021089.1|WP_015589220.1|822956_824978_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MSNQIFLNSRLENIPKFHSAILPKLCGGDKVVDLLFYKPLSYVDRSKLLSDARVGEFTTFIAKVYEHQSPTFRGRPYKIVVESESQYIFIVFFNYSVKYLYKLFPIGANVIISGKLEKFAEHWQITHPDYVSLDINQFKKIACIEPVYQLCRGITNKRIGNIISSNLKELPDLPEWIDDTLIKQKKWLSWRESIIKLHRPSSLVEAEVCRKRLAYDELFAYQLALKLARKNHVKERGREFIILSKYKEQVLNELSFQLTNDQTRAIDEISERQKSKYRMISLLQGDVGSGKTVVALFAMINVVENNMQAALMAPTTILAEQHYNWIEEVLSCTDIKVALLTGKTSRKERKIIMNELASGVLNIVIGTHALFQANVTFKNLGLAVIDEQQRFGVMQRNRLVGKGENADILFVTATPIPRTLQQAMYGDVECSILKEKPKSRLPIKTVTMNISRVPDVIEKLKGAINRGEKAYWICPYIEENEETNIAAAEMRFQELQKTFLDKVGIIHGKLTQEQKDQVMFSFKRNEFSLLVATTVIEVGIDVPDATIMIIENAEQFGLSQLHQLRGRVGRGNKPSFCVLLYDNLSKSSSSKLKIMCESQDGFYIAERDMMLRGSGDILGTKQSGCMEFKFADLYQDKELLNLAYNNAKGAMADFELLLDIFEYRSRLHFSKFQ >NC_021089.1|WP_015589219.1|821829_822660_-|hypothetical-protein MSSSISEEKENPVVTLRAQAEKFGFSKLRAGKDNAEANSGNTAFLDFQRMDFVINGKSISRDLIAELYKEHDSLLPKSEGKNEDYRPFARKVFKEMFKYAKAEVPSDSILEELVINCNQAGYEAGVHIEFQGALSQHSFIIERPEKVISIDCVSQNNVSVKSDMTLPIFFQRSDGTFGDKVCDLSSSLEFTLKSQDDKNVTYTNGNLSLTVPERLKDYNIGDKSLFDIIKEYFQKLCERLGFFKIKIEHGLGDPLEVSDHLENMEPPIRSNEHGLN >NC_021089.1|WP_015589218.1|820948_821833_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MKNNIVIITGITASGKSELCDNLIEKYGNISIINCDSKQVYEEIPIITAQPPKQEVFYKLYGYVSAKENYSVGLWLEDLEKEVNHALENAQIPIITGGSGLYISSLIKGLSSMPQISQKVRKNVSELRKNLSKEEFYKLALSKDPRIQGKVFMNDSHRLSRTLEVITETGKSIFVWQENRQPPLFNNFKIYTILPKREDVYRKINSRFITMIENGAIDEVKKLLSMNLAPHLPAMKAHGVPEIIKYLKGEITLDEAIQIAQTNTRHYAKRQYTWFKKQFLNAEVIDCANKLKIF >NC_021089.1|WP_015589217.1|820402_820873_-|hypothetical-protein MAENNDNNSFTKRFTNRTPGGTGEGFSSKYSSQNTKERALGEKGKISELAGKKTESKEAFSESGGIKSKSRTVNERSFADATKRSRSDLVYLVRGKDRGKSAWHYVLVDKEKREMFLAKSRTGSIDVADYGEILYSGWGEDPPQAIIDKVNEEFGL >NC_021089.1|WP_015589216.1|819696_820284_-|threonylcarbamoyl-AMP-synthase MVSKIINAIQNNLLVCFPTETVYALACNALDNESIGKIYQIKKRSQNKPLSIFVSDIYNLTKIAKVKERYIDLINHFSPGPITYILPLKNNNILPNEFFKDSIGIRIPEHPIAILILNKLKVPIVATSINISGEKSVCKADDIPQSIKQHLSAVIEDDELVSGIESTIIDLTEDKIKVLREGAILLQTVNNAFSN >NC_021089.1|WP_015589215.1|818857_819679_-|DNA-polymerase-III,-delta'-subunit MKKVIGHNQAKKKLMNNLSVQSWLICGKKGIGKATLAKSFSNWLLIKSYNEVALDLHIVEGDTIGIEKVREMKNFLHLSPIQSEHKIAIIDSLEAMTNNAKNAILKILEEPPKNSKIFIISHKPYDIQTTILCRCFQLNLLPLTYDETKQVVSSQCKFDDQIFDEIITLFPGMPGMIINAISSDAYEAYKYFYKFLHDLKNPNMINKVINSEIELELASYIIQAFILESIKREVNDVEILLSQWKKIDELFVVAKQLHLDKKHVLANVVNIMT >NC_021089.1|WP_015589214.1|817989_818784_-|hypothetical-protein MTDNKLTVWQSIEVLTKAILNMQKELSSIKNIALDQDVTLEKGKELLSGIYEANFKLNKAINIATLPKIGYHMLNGEFVVRNHITEEEVRIPRDFHYLKVVKSDHDNYKLTFCNFLGNEFFEYKKYDPQYSGVSDEYKFVDFGSVKKTHNLKFKEYVGHAPKFFAAEGPIEPGSQNHVIDLFELVKSGKGRKVGTFADEFGYFDDQNKLHYYNYHKSVESNTYDPENFSVKMINIDVSKIDKFYLIAEQGDIIIHPIWENLDIF >NC_021089.1|WP_015589213.1|817267_817921_-|type-IV-secretion-system-protein-VirB8 MEDKLLESVKNKSYFSKAVEWYCHRYLFCVAERSWMALIVSLLLVCLCLLTLNIYLLFPVKKDLNFVKYMNHTEDEFSAMHKLSFSKKEDEYTSTARYLISKYIEVYESIKTVEPKYQENFIRNNSIHKIHQGFQEKTNNEAVSSKRKITNINVITLSIDRSTKDLVTFAGNATVVFTTEQNKEDTVEISFTLSNIKATLAGIIPFKFIVNGYKYRF >NC_021089.1|WP_041573531.1|815774_817271_+|cation:proton-antiporter MDYILMYLSLPFSITENYLLITALIPLLSALVIFFTGKWPGVNNSITVTSSVLLFTYTCLCTLYWVYGDHSQFILMDFGNNLHISLKLESTGVIFSLLISFLWVLTSIYAICYMQNNYADSNHSSFLCFFSISISCAMFIAFSGDLLTTFVFYELLTISTYPLVTYNSTNESMIAGRYYFGVLFFSSLVLFFPAIGLLYNEFHTLDFVSGGIFKFDTSLITFIAVCFAMLIYGIGKAALMPMHFWLPKAMVAPTPVSALLHAVAVVKSGVFIIIKVILYTFGIGNMQRFAQQSWFAGGWLPYAAGFTIITASLIALKQKELKKLLAYSTISQLSYIILFASIFSELSMRVAIFQLVCHAFAKITLFFVAGAIITRAGEKYIDKIYGIGRSMPISMTAFAIGALSMIGVPPAPTFWGKFLIFQAVFNSGNVILSVFVTLVLIVSTILNALYFLPIIYNAFFLKPSQNYFIKKTPILLVLPPVITATCTLVIFFSYQVIF >NC_021089.1|WP_007549151.1|815057_815414_+|holo-[acyl-carrier-protein]-synthase MIHGIGTDIVYIPRVSRILQKYGEKFLNRIYTEKEIELSRKYNSQEMRARYFAKRFAAKEAFVKARGSGQGIIMKDIEIYNDVRGKPYLTVSKDFISKIHLSLSDDGDYATAFVVICV >NC_021089.1|WP_007549783.1|825831_826119_+|hypothetical-protein MSNNFNFKEFFNHYETNSTSDDIQRYYLLWKSVIAQAMIDAASHCKKTESLVEKRKAISWLSDFSQDFVHTCILADCDPVYVKNKIQPTLKSLTR >NC_021089.1|WP_010962863.1|826134_826710_-|hypothetical-protein MISLFYKLRLLNYILGSLKDIIVKLFLFTMYLYTFSIVLMFLSNGFWYAVEFCSFKNAFYRLFQYCKWYYENREDLGYGISIRILVAFLTPHFLYKLLLGTGWKSFLKEKIIQILNTRRKKGSEFSNSSKPSGSSYSDKNNYSNNSGNNERQAQDAKRKVNMIKQLLIKDIEATIDRRLNYIFFGKRSKPH >NC_021089.1|WP_015589221.1|826793_827129_-|divalent-cation-tolerance-protein-CutA MSSLVLIYTTFSNFEEAKTISEELLNEKLIVCVNIFPEVNSLYLWEGKISNSCEVVAIMKSKNDQVDKIVEKIEAMHSYDQPAIAVMPIEKANKSFTNWANSVIDVSSIGV >NC_021089.1|WP_174517030.1|827456_828074_-|transposase MEDIEIAIDSTGISIYNNTPGHSKENSTDRKYRGYEQTRKLHVMLNINNKKAIAVKYSNGVYSDHYGACDLLKEVDFQHAIKALYADRACDRHKFYKLCNEYDIKTKIPPINNAAEHPEIDYMSDRNAAIRLIKLYGEDGMKEWKKEVNYGKRSYIEGFFSRLKQIFGFSFRNKSEINREKELLIKCYLLNKFTDIGMAKFEIVT >NC_021089.1|WP_141456678.1|828075_828405_-|transposase MPQKMRVSNCHEYNKFLQERGSIFCYINDAIENWYENCPKMQGGNYIYSDKVVILVHIIVSFFRIGLRQTVGFIKGYLQQIGRDLAVISYSQASRRFKKLNIKINDCRK >NC_021089.1|WP_015589223.1|830735_830951_+|hypothetical-protein MKYRKRTLIFLAVITLIIIALLFRYNSHFHKDVVHLKSDNKEFKKKPENSIESTILHREKEVYNHVFHPDD >NC_021089.1|WP_006279849.1|831033_832068_+|FtsH-protease-activity-modulator-HflK MFDDNNPWNLGKKPVGNKTPNNEDILSKAVSDIRFFLNGLTRNRGKKPYFIIFIILLFYACTGFYIVHPSEESIELTFGKYSNTETPGLRYHFPYPIGKVFKVNVKEVNREEIGVSSSYGRDTDRGEGVMLTGDENIVNVNFEVQWRVRDAKDYLFKVRDYKPGFSVKNAAESAMREIIGKNTISFALGQGRPEISRDTRILLQQILDGYQMGIEILSVQMKKIDPPEKVISSFRDVQSARADKERTINEAYAYNNDIIPRAKGEAIKIKLDAQAYENEVINEAKGNANRFLSLYEEYRQNPSLVKNRIYLETMENIFSKVDKVVVTDDLKGMFSYLPLTNLGK >NC_021089.1|WP_015589224.1|832070_832943_+|protease-modulator-HflC MSSNIKIVFVSVFVVLLIALSNSIFVVQETKQAIVIQLGKVVRDVRESGLYFKLPFINSVEFLDKRVLDLSPDKTPREVITADQKRIIVDAYAKYKITNPITFYQAVRNESGLVRRLYPVIEAHIRENIGRFSLISLLNEKRSEVMQLIQRGVYSEAEKFGIEIIDVRIKRADLPEENSSAIFRRMQTEREKEAKEIRAEGEQAGQEVRSKADKLKREIISSAVKESYEIRGRGYAEATRIYNEAFKVDEEFFNFYRSMSAYSKSFAENNTKFVLSPNNNFLDILNKGWK >NC_021089.1|WP_015589225.1|832946_834440_+|DegQ-family-serine-endoprotease MKSKAFILSIFAYFLIAFSSYANMFDWNAKKVVDASTTACNCNQGLADLVEELIPAVVNISSEQIIKQENNSRTRVPSMPGNNFFDDFREFFEHFDQFFMDRGPSVNKEVVLLGSGFIIDKGGTIVTNYHVIKNAKDITVTMNDNTYFKAEVLGYDARTDLAVLKINSDKDLSSVAFGDSDKARVGDTVMAIGNPFGLGGSVSTGIISARSRDISIGTMNEFIQTDAAINRGNSGGPLFDLNGKVIGINTAIYSPSESGGNVGIGFAIPSNLAMSIIDTLKSGKKIKHGWLGVQVQPITKEFAESLGLKDIKGALVASIVKDSPAEKGGIKVGDILLEFDGKKIDRMTQLPQMVSRAGPEKKVQVKLLRKSKEVNIKVVIGESTNDGQDNNQEENKSTSDYVTGLTVSNLPKESKESKNNVPTKGVIVTNVDSNSNATLRGIKKGDIIIQLDGTDIENTNDFQKQVDSAVKKNGKDSIMLLIYRNGNQFFASIKLKK >NC_021089.1|WP_081600785.1|834566_834671_+|hypothetical-protein MPVPRHWKLHCNEHIEQLYNKNWIPVSATCMTPS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_10 | 850891-851004 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_10
|
1 spacers
spacers of NC_021089_10
>10.1|850920|56|NC_021089|CRISPRCasFinder GGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGGATCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_10
The CRISPR arrays of NC_021089_10 >merge|NC_021089|10|850891-851004|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGAC >NC_021089|10|9|850891-851004|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGAC GGTTCGCGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGGATCTA GAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGAC
>NC_021089.1|WP_179943635.1|848749_848968_+|transposase MTPRQYSSGEVDRHGSISKMGPPECRSMLYEAAQTMLTVTKRTFKLKNWGCEEKRNEKSNCSSSKKISCNYA >NC_021089.1|WP_081600786.1|847480_847777_-|transposase MVESAKENLSEVKNILVDAGYTGENFATKIKTIIGATVEVIKRSELHSFAVLPQRWVVERSFAWLEKCRRLWKNCERKLNTSLQMVVLSFISLLLRRF >NC_021089.1|WP_015589232.1|845177_847085_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MEFQIATHFQPAGDQPQAIDSLIAGLNSNKRDQVLLGVTGSGKTFTMANVIARTNRPALIMAHNKTLAAQLYEEMKGLFPHNAVEYFISYYDYYQPEAYLPQTDTYIEKDSAINERIEMLRYSTVCSLLERRDTIVVASVSCIYGLGSPESYRSMIIPLSVGNKIRINDFLSNLTDLQYKRSDARFERGYFRVRGDIIDIFPSHYENKAWRLSLFGDEIEEISEVDAITGNVTKGVNKITIFPNSYYITPREALLQAIELVKKELHERLDYYYSQNKIVEAKRLEQRTNFDIEMMRTTGICKGIENYSRYLYGMEAGDPLPTLFEYLPKDVILFVDESHVTVPQVGAMYSGNEARKKKLIDYGFRLPSAFDNRPLKFEEWEGVRPQTVYISATPGKYELAKTNNVFIEQVIRPTGLTDPICIVKPIESQIDDVIHEAQVTIGKGFCVLITTLTKKMAENLAEYMSELNMRVSYLHSDIAALERIEIIYKLRSKEIDVLVGVNLLREGLDIPECGLVAILDADKEGFLRSETSLIQTIGRAARNAEGRVILYADKITGSLDRALRETERRRKKQEEHNILHNIIPKTIIKPISNTLQERAIAEPKVNTNKDDLRKQMIEHAKNLEFEEAARIKKLL >NC_021089.1|WP_179943633.1|843212_844997_+|hypothetical-protein MPEDSYFLPSTLTSFPRVITPPVHYTISTKPILLTTKNDQKSSSLEFSARSPCLKDVNILGMKSEEHDKSEQGACSQVGVRALEGDQADDESMLIKIQGQQVSYRPSLTPFPTAWNDSMSLNSVASNEEPEKQQVTDESDLESNDECSKAKPQSESPSSRKGSESNSFSGSSTPSKVRQSSILESLENTSFGGIPEHLPQDAVSKPNVPGYRSSKISVDSGLGSLERPQSNSSITTSTVPGISESRKDLNPPVDNKRPQSLPLADFSTCASNETVKAFLCFLDYFSSSEGKKQLPLLLSSEAGKQLSSISDPREQENLLDFLFSTEGNKQLCSLFSSENKQQLHSLFSPKGKELLFSPSPEGQKTIPLVLSPEGKERLPLLLSPEGERISKPFSPEAGNIISLLIYSRVEPKNMSHRSFRDKLAKWLHRNSSLSKVASPQEKPLTNDEKKELRPFLCPKLQKKLDSNSLEDAQLKYLLYTPGGKEKLNLLLSSPEKEGKQLHPGLPSEAEKGLLFKFFDEQEISGNTSTNSKDSGYSGSSSQKSTSDTGSDEDGLEASGGSSVSSNSSTSTVRTKMDATKIEQYLQEKKVNSCT >NC_021089.1|WP_015589227.1|841660_841888_+|hypothetical-protein MDKKQQASSSSQGDPRFKVGSGGYDSAAWLKANPREGGGPDMHEGRSRFDDCGKYPYTRMSGTKADKAGSKNKEK >NC_021089.1|WP_015589228.1|838515_839862_-|hypothetical-protein MVESFSGNNKGSNFIEEAKIMENFSDNNGNGSSIFQGKIREQDFSAEQKLNELKAAIEELTRQDLLRRLECERQASSCIDEISSQAELHIGQGDDEDYFTGEKGRVLGDFWNFFESLFTLFEVDVDDPKIYQMLKEKKEKNLIAAIMKFLRDKLKELIKKIFARDLSFNQRLDKEIKELQEKLGSGELSEEEFARALERLTALQDLKLRLQMAVVGWIVTMFAEMFGVELAAAVEASTEKEDKKAEKTSLKEENKEVCENVEMKVDEREKPKVPVFLFEISPGFVRPVVLSKPELEIVSDPLKHLLRLTELERKSHENSQKQKVDKEEKKAKPEEQKKEVCPQKPAEKGPIFVEKTGRSSEKSEKKSMNISGQTPTVGSTGEQNMRNSGNASKETVGSIGGQKSSNTGKETIDIDKICGELLAEQDQISPESELNSINVQPKGGYKGK >NC_021089.1|WP_015589227.1|838194_838422_-|hypothetical-protein MDKKQQASSSSQGDPRFKVGSGGYDSAAWLKANPREGGGPDMHEGRSRFDDCGKYPYTRMSGTKADKAGSKNKEK >NC_021089.1|WP_081600785.1|834566_834671_+|hypothetical-protein MPVPRHWKLHCNEHIEQLYNKNWIPVSATCMTPS >NC_021089.1|WP_015589225.1|832946_834440_+|DegQ-family-serine-endoprotease MKSKAFILSIFAYFLIAFSSYANMFDWNAKKVVDASTTACNCNQGLADLVEELIPAVVNISSEQIIKQENNSRTRVPSMPGNNFFDDFREFFEHFDQFFMDRGPSVNKEVVLLGSGFIIDKGGTIVTNYHVIKNAKDITVTMNDNTYFKAEVLGYDARTDLAVLKINSDKDLSSVAFGDSDKARVGDTVMAIGNPFGLGGSVSTGIISARSRDISIGTMNEFIQTDAAINRGNSGGPLFDLNGKVIGINTAIYSPSESGGNVGIGFAIPSNLAMSIIDTLKSGKKIKHGWLGVQVQPITKEFAESLGLKDIKGALVASIVKDSPAEKGGIKVGDILLEFDGKKIDRMTQLPQMVSRAGPEKKVQVKLLRKSKEVNIKVVIGESTNDGQDNNQEENKSTSDYVTGLTVSNLPKESKESKNNVPTKGVIVTNVDSNSNATLRGIKKGDIIIQLDGTDIENTNDFQKQVDSAVKKNGKDSIMLLIYRNGNQFFASIKLKK >NC_021089.1|WP_015589224.1|832070_832943_+|protease-modulator-HflC MSSNIKIVFVSVFVVLLIALSNSIFVVQETKQAIVIQLGKVVRDVRESGLYFKLPFINSVEFLDKRVLDLSPDKTPREVITADQKRIIVDAYAKYKITNPITFYQAVRNESGLVRRLYPVIEAHIRENIGRFSLISLLNEKRSEVMQLIQRGVYSEAEKFGIEIIDVRIKRADLPEENSSAIFRRMQTEREKEAKEIRAEGEQAGQEVRSKADKLKREIISSAVKESYEIRGRGYAEATRIYNEAFKVDEEFFNFYRSMSAYSKSFAENNTKFVLSPNNNFLDILNKGWK >NC_021089.1|WP_015589233.1|851094_852438_+|DNA-repair-protein-RadA MKTVYVCQSCGHSTGRWVGKCIACDNWDTIVEEIAVKTGKRSISAPILIKTLSGSEIITPSRFLTGIEELDRVFGGGIVQGASILIGGEPGIGKSTLLLRIAANVVQLSSFECLYVSGEESLEQVSLRAKRLKINEPKIKLLSTVSLTDVVATIKENKSIKFLVIDSIQTMYDSRITSAPGTVTQVRTCAHELTILAKQYGVSLLIVGHITKDGQIAGPKTLEHMVDTVLYFEGENSNQCRILRTIKNRFGPANEIGVFEMSEAGLVPVDNPSSLFLMAHDREVVGSAVFAGIEGSRPILMEVQALIAGTNMATPRRAVVGWDINRLAMIIAVLNARCKMFLHDKEVYLNIAGGLKIQEPSADLAVAASLISSVVNLPLPTSSIICGEVALSGEIRNVSHADLRLKEAQKLGFKKAIMPKNGNYSSHDIEIIKLGHVRELREVFNYN >NC_021089.1|WP_015589234.1|852424_853336_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSLFSNLYKGLLKTSSRFSDGVKSIFSGKKKLDQSLLDELEELLISMDIGHKTSKLIIDRLTSIKFDKEVEHNIISQQLMNEIEAILSPVVQPLILNKKPHIIMVCGVNGNGKTTTIGKLAYKYKEMGKSVMLVACDTFRAAASEQLNIWAERSDCLIVTGEYGSDSASVAYRAVSQAIKDNVDVVLIDTAGRLQNNVNLMEELSKIYRTIKKLDDTAPHDVILVLDATTGQNAYSQLEAFSKMVHVTGLIVTKLDGTAKGGVVIGLAEAYKVKLHAIGIGENIEDLREFTSKEFAEALFNCN >NC_021089.1|WP_015589235.1|853539_853923_+|Fe-S-cluster-assembly-scaffold-IscU MSYNEKILDHYENPRNVGSLDKNDPNVGTGLVGAPSCGDVMKLQIKVNDKGVIEDAKFKTFGCGSAIASSSLLTEMIKGRTISDLTQIKNTQIVEELSLPPVKIHCSVLAEDAIKAAIHDYQSKQKN >NC_021089.1|WP_015589236.1|853928_854342_+|iron-sulfur-cluster-assembly-accessory-protein MSEYQEVGGGETVKKNRKLITITAEAVERIRYLLDQKKHTNLEKPEEAIGIRVLIKQKGCSGLKYDIEYAYDTRPLESIIEENCSDDQKVKVLIDPKSVMFILGSEMDYVEEKFSSGFVFKNPNEKGKCGCGESFHV >NC_021089.1|WP_015589237.1|854334_854793_+|hypothetical-protein MSSSYFTLFEIEPTFNISFDELEKKYIELSKTDINERQSQNMENINRAYQILKSPLKRAEHLLDFFDVKSQKDHLNSEILSESMEIREYLLDCDDLQFASRMIDEKIKDCVKNLINTFAIKNFDGAATQVLRLKYLYKSFEEVKKNATNSNF >NC_021089.1|WP_015589238.1|854770_856519_+|Fe-S-protein-assembly-chaperone-HscA MQPIQISEPNSSEVIFGIDLGTTNSLIAMVNKAGNVEIFEDEQGRELLPSALSYENNTLKTGYDVGQNAIYSIKRLMGKSVEELNKEGVNFEIDHESEKVIRIKCAEEKYLTPVEISAEILKALCERVKKSKGLEVKKAVITVPAYFDDSARNATKYAAKLAGIEVLRLVNEPTAAALSYSIEKNNSSRIYAVYDLGGGTFDISILKLHQGVFQVLAVGGDTKLGGDDFDHLLSSIVIDKYREKTAKQLNSLLIESRSVKEYLSKNTSGIFEFSINGKPFECEITREEFEQAISSLVNKTINIVTRTISDIDLKIDNIKGVILVGGATRTPLVQNSLVKLFGNKVLNDVDPDKAVAIGAALQAHDLTSSSKDRNILLDVLPLSLGIETMGGIVEKIIPRNTPLPVSETKEFTTYFDGQTAMKIHVCQGEREMIEDNKSLAQFELKGIPPLPAGSARVEIEFTVNVDGILTVTAREKTTGIEQTVEVNSSFGLSEADVQNMVNQSINSFDEDMKARSLAGAKINGNKLIHLVENNNNLSTDQKLKNLLQNAKNALQGNDLNEINNTIAELENSSLELCELTNR >NC_021089.1|WP_010962911.1|856526_857273_-|signal-peptidase-I MEELSKNWVIRTGRFLSSLFFLLLIALSIRSFLFEPFHIPSGSMKSTLLEGDYIFTSKYSYGYSKHSFPFSPNIFSGRIFYTPPKRGDIVVFKPTRNDSIRFVKRVIGTPGDKVQMIEGELYLNDQKVERRQIESFFDYESNRNIPRYIETLLSGKEHEILVDDISNKLSYNTPVYYVPNDQFFVMGDNRNNSLDSRFPEVGFVPMENIIGRVSIVGLSFKLGKVDWLPFNFRLPVALRLNRVLHKVV >NC_021089.1|WP_015589239.1|858213_859101_-|aspartate-carbamoyltransferase-catalytic-subunit MNKRRNLLNISDLTVDDVENITKLANQYLKKEVANSHILENKTVINLFFEDSTRTLASFEIAAKSLGANVVTLPIRSSSINKGEDLKDMIKTLNAMNPDYIIIRHKSSGIINTLAKYVNCSLINAGDGSSEHPTQALADYLVISNHKKQIKDLKVVICGDILHSRVARSNIRLLKMFGAEINLVAPPTLICKHFPEVDSVHYSLIEGIKDADVIMLLRLQKERMNNSSSEKEYFHLYGLDLQKLSYAKPDAIVMHPGPINRGIEISSDVADCVILQQVEFGLAIRKAVLHYYRPC >NC_021089.1|WP_015589240.1|859321_860347_-|extracellular-solute-binding-protein MKKAFIFTSLIAIILIVITYLYRNDGTNDSQVVNVYSSRKEELVRTLFDEFTKNTGIKVRYIIDDYSQLLSRMENGGEADLFLTADAINLILAKKRGLLSQVDSEVLKSVIPARFRDSEDYWFGLTKRARILVYNKESVDPKDLSTYEDLANEKWKGKILVRSSTSPYNRSLIAFMIANNGFEKTKEWVSGIVSNMARKPSGGDTDQIYAVAAGEGDVAIVNSYYFARILSSENKKNVADKLGAFFPNRNDHGVMVNISGAAVTKNAKNRENAIVLLEFLVSKQAQELYAKKNQEYPIIEGVETSDILKSWGNYSQSDLPLSELEKHLFEAVMIADECKCK >NC_021089.1|WP_007548764.1|863127_863535_-|transposase MLKEVDFQYVIKVLYADRAYDREKLYKLCNQYGIKTKIPPKNNAAEHPKLDYMAERNSAVKLIKSYDEDGIKKWKKEMSYGKRSYIESFFSRLKQTFGFSFRNKSETNREKELLVKCYLLNKFTDIGMAKFEIAS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_11 | 945764-945859 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_11
|
1 spacers
spacers of NC_021089_11
>11.1|945790|44|NC_021089|CRISPRCasFinder CCCTTTCTCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCATTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_11
The CRISPR arrays of NC_021089_11 >merge|NC_021089|11|945764-945859|CRISPRCasFinder CTTTATGAGGGTGTCATCCGAGTAGCCCCTTTCTCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCATTTCACTTTATGAGGGTGTCATCCGAATAGC >NC_021089|11|10|945764-945859|CRISPRCasFinder CTTTATGAGGGTGTCATCCGAGTAGC CCCTTTCTCGTCATCCCGCTACGTGTTAGCGGGATCTCATTTCA CTTTATGAGGGTGTCATCCGAATAGC
>NC_021089.1|WP_012673308.1|945100_945595_+|Smr/MutS-family-protein MSDDELDWQKNVKPIKCGKVTLKVDHKVNIKSMVDKGTSDLQGNFLNTNNGNSSFCLDQNTKSKVDRGKYFISDKLDLHGYNIEDAYCKLIDFIIKNYRAGNRCLLVITGYGSATNKTDTIKNNLNKWLNDTKIQHMVLYYQQATKKHGGKGAFYVLLRRLRSY >NC_021089.1|WP_015589288.1|944243_945008_-|23S-rRNA-(guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase-RlmB MKSSKTNENFWLYGKHTCMSALKNKNRRCIELLVTENFYREHEKEIKQCANSKGIKVRLVENKILNDVLPKGANHQGIALKVAPILHNLSIEEVAESSNDSSTIVILDQVTDTHNIGSILRTSACFNVNALVLPHNHSPSENASIAKAASGALDIVPLIYVTNIVKTMEYLKKVGYWCYGFDCNAKENIDEIKSFEKKRVIIFGSEEKGVRRLVKENCDYLLKIPISNVIDSLNVSNAAAIGLYSIYIKTNASA >NC_021089.1|WP_015589287.1|943441_944164_-|Bax-inhibitor-1/YccA-family-protein MSYMRNEQDIRSQGAYYSAGLRSYLTKVYNYMALALGVTGLVAFLTVFSGLFQVIHSNPVLSLVVMLSPVALVFYMSYRIQHLSAQSAVTIFFSFSVLMGLSLSYIFIVYTAENIARAFFITSIMFGSMALYGNTTKRDLTSMGSFLIMGIWGLIIASIVNLFLGSSPLYFAISFISVIVFTLMTAYDAQRIKDVYYKHNDGSEVATTKLAILGATNLYFDFINIFLNLLRLLNLFNNRD >NC_021089.1|WP_015589286.1|942904_943441_-|cytochrome-c-oxidase-assembly-protein MFSFLRKGSKNSIVFFLISLVVLMLCLAYASVPLYSIFCKATGYGGTIRKVTNTTTNITNQKIRVHFNADIMSDLPWEFKSETNYVDVNIGEQSLAFYYAKNLSDQPSFGMAVYNVTPFKAGKYFNKVACFCFEEQMLLAKQKAAMPVSFYIDPEIMLDSNTKDLSEITLSYTFFKLK >NC_021089.1|WP_015589285.1|941952_942651_+|hypothetical-protein MDRENLLYSVLYNVLYKVDKDNGLDTSNIIKKIKERLESGMRTSSKENYYEYLYASWEKKGFDINHKFDLKDYDGFPVDSLFSIAINNKPHALPNLAQVLIKAGTNVQNEKGYLHACALTRSPDVLKALIEAGVSDSPHEHYGGNTALDCVTELYDAEKSIECKDCCKILIKHTLEKKPHEKMPDSVKNNKELAQYWNACEAKNEGWELITPSTETQVVGAQKANKNSCSIQ >NC_021089.1|WP_015589284.1|940856_941834_-|quinone-oxidoreductase MVRAIQIKKTGGPEVLEFVDKNIGEPKGEEVLVRHTTIGLNRYDLEHRKGTRKIKNLPSVLGVEAVGVIEKLGKKISDGLKVGDRVGYCTAPPGAYCEKRIIHQKYLIKIPDDISDEVAAAVLFKGMTAHYLVNQSYKIRPGAFVLVHGANGGLGQIICQWAKDKKGVVIGSVSSDEKMKIALQSGCTYAINYNDKDFVSKIMEITQNRGVGAVYDPIGYATSKLSFESLGRFGIYVSYGQISGNAPISFSLLSSRSLFATGTLIYHYKHDRFTLVLTTMEIFEMIRKKLLTVRINKKYKFDEIIQAHRDMENRKASGLNIIKIS >NC_021089.1|WP_174517030.1|939890_940508_+|transposase MEDIEIAIDSTGISIYNNTPGHSKENSTDRKYRGYEQTRKLHVMLNINNKKAIAVKYSNGVYSDHYGACDLLKEVDFQHAIKALYADRACDRHKFYKLCNEYDIKTKIPPINNAAEHPEIDYMSDRNAAIRLIKLYGEDGMKEWKKEVNYGKRSYIEGFFSRLKQIFGFSFRNKSEINREKELLIKCYLLNKFTDIGMAKFEIVT >NC_021089.1|WP_141456678.1|939559_939889_+|transposase MPQKMRVSNCHEYNKFLQERGSIFCYINDAIENWYENCPKMQGGNYIYSDKVVILVHIIVSFFRIGLRQTVGFIKGYLQQIGRDLAVISYSQASRRFKKLNIKINDCRK >NC_021089.1|WP_179943636.1|939437_939575_+|hypothetical-protein MTPSQGETGFQWALLHRSSEKNWQLLTKFIINSHLTVEEKICHKK >NC_021089.1|WP_015589283.1|936160_937774_-|hypothetical-protein MNNPFKSENYKKNLDSLIKAVKLGNAEKQYNKTLRDLSHELEGFTGEAKGIAEFVIYTDLNNYVEQPLGLFKTLMNRILGKNFPTKNSSISNFVNDELSSFTLETAAKYTRILKKIDLLEQLEKDFRKNNILKDSLNLEQSEKSQGKDRSHEVSLEGRKQKEGTFELRKEEQPKEKLGGNRMRQIKRPTTAPPAAPDSRKVRFKSEISSDGESKAKSTSSLLKGANSFSMPDAKENPSEDSGYESSLDQGSEYEDISNYQEKKQKENPLYEQREDSGYGSSLNEESVYKEISNYQEKKSKILIENSQSSKSPKEEPIYATVPKEHIEAKRERKQKQQPQSLVPPKPPQVPKKMFTTGQEVRQESKVVIKDKPAVPPKPKNLSRANQKVSTEPKVVGVILKKSAERVPLESENQDNRKSAQKAAGKAIPKVAAATMKGGANREMGSKVKALKEKFEQNQAKGNANVQLAESKTTPAAQADIGVKKKQSHSFLTENKRSATKHVTAKSDPKSHISKNSLLTHANVKEMVAQIEKGKGGR >NC_021089.1|WP_010962945.1|946478_947513_-|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MRYKIAVIGATGRVGREVLSTLAEFQDEAIDCVIALASKKSEGKKVSFGDKELTVLCLEDYDFVGTNVAIFCAGSHVSEEYVPIATQAGCIVIDNSSHFRMKEGVPLIIPEINKEKIMEYKNHNIISNPNCTTIQMLLVLHLLHQKAKIKRIVASTYQSTSGAGKAAMDELYDQTKKIFMNEAKKPKIFSKQIAFNCIPHVGEFMENGSTEEEWKMQEETKKILEEDIKVTATCVRVPVFIGHAMAVNVEFDQHITEEQAREVLSEAEDSGVLVYNRREDSEYITQIDVVQENAVYVSRIRRDNTVEHGLNMWIVADNLRKGAALNIVQILEILIREHLSIKCI >NC_021089.1|WP_015589289.1|947653_948106_+|hypothetical-protein MSKEYDETKVKPAMSTPQGPEGTNGSKAQSVLSNKRKPTINFDDKKYGVKTSKIDQQSLNKRQESSKLRDLLRSIPIIRRFLARIFTPEKIEIISNPIYDNMEAYKKSQEDYPSKIKDETSIDDEHTKEVDSKLEKGNVEQVDNKKSRSS >NC_021089.1|WP_007552972.1|948426_948696_+|IS110-family-transposase MQVNAILGVDISKKKFDVCLLVDSKKRHKVFQNNQDGFAKLVVWCNGHGANLTHLCLEATSWYGEDLATFMHDLGHNVSIVNPESFWQK >NC_021089.1|WP_007549647.1|948815_949142_+|transposase MQSLKDDKVQQTNRLENKNMHSSCKEAISKVILAIEEQIIVLEKEINEHINNYPHLKNMVENLKTIKGIGYLTAVAVVAEMPSVDNFDNAKQFTAFAARTLSIGIVSK >NC_021089.1|WP_081600779.1|949080_949371_+|transposase MLNNLQLLLPGHYQSGSSVSKRSCICKIGSERIRKALYMPAIVVKNHNNHFQKFCQRLASKGKCPKVIVLALMRKLMHVFFGILKKNQPFNCNFVG >NC_021089.1|WP_015589290.1|949584_950859_-|amino-acid-permease MSNKIGFWAIFALVISSQIGSGIFMLPISLAPYGMYSLISWIISGLGAISLALVFASLCAKFPETGGSHVYVKHAFGPAAAFFVGWTYWVISWVSTTAVIVVGVGYLTPFFHEDIQNVHLFLEMLLLTIITLINFRGVATAGRVEFLLTVIKISVLLVIPIAALFFFDRNNFIISEEISNLTTSQILARSTLITLWGFIGVELATAPAGSVDNPARTIPRAVVLGTISVAVVYFINNLAIMGLINGNDLASSRAPYVDAIKIMASGNWHLIISITAFIFCVGTLNAWVLASGQVALGLAKDKLMPQFFAQRNKHGSPFWGITISSVGTSVLLILTSSNNFAKQITSIIDFSVVSFLFVYLACSLAFLKVIVQEKSCYKFLIGSIATTFCCWVIFETSVNTLLIASLFTASGVPLYLFWYRRVSV >NC_021089.1|WP_015589291.1|950994_952440_+|hypothetical-protein MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYLSTSTSSPALAFLATGFIVIAAFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKGPTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALRGFLIFNFGLLLLNYALLIPVALLELIKYPLVRLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTSSFEHSILQCAQELKQKFGAQPNVLNKEFEDYINNSDELTTEQKEQLKLYLNFNGSNEAAWQESKTGLTLTQAANLVSTAAKNQKSDVNSLLLMNLKDGLGLCTLGMFDRIIYSLSCLEAKNNFLVQINGAVNVLTPKFTERFLKEYCNYKKLKILVDKFEDFYSEDYADKNNISDEVKSNINQSIIEIREFVFKELYIKFYEEYGKSIQRGAIKQKLRELVTDDSIKEAVYYSMYNIEIPAEPPTYLERVKAFFGGHARSSAA >NC_021089.1|WP_015589292.1|952640_953807_+|aspartate-kinase MDKIIIKKFGGTSLTDLNRVANLIKNDIEKGCNVIVVVSAVAGFTDQMVFQARQISNLSYRQELSEYDVMLSAGEQISCGLLAITLQSIGVNAKSWLAWQLPIATDDFYSESKIKTIKIERVKRSFAEGYTAAIIAGFQGINDDRITTFGRGGSDISAVAFAVAFGVRTCEIFTDIDGIYTADPRIVPKARKLKFISYDEMLEMSSSGAKILHNRSVQLAMKHNIKVQVLSTFKEVEGTTVLHKRDVLERYLITGITYSTNEALVTFTNLANNLRTLRDIAGANVKIDMIHGSSFVISKFDIDSMEKLLNKNENYAINDNVAKISIIGIGVMSNTEVMHRTLKVLSEKKIEILAITTSEIKISIIVQKECAVALVKDLHTEYELDMQH >NC_021089.1|WP_007549940.1|953898_954102_+|IS5-family-transposase MYPSDISDKEWEILEPHVAQGKIGRPRKHNIRTIINAIRYIMRGGCQWRMLPKDFPPWKTVYDYFLR >NC_021089.1|WP_022626388.1|954295_954517_+|hypothetical-protein MGLIIAADVHSASVQDRDGALNLFTQAKYKAPTLRKFFADQGYIAKPLFIGDRIRLPRKLLMLQDFSTIWTTI |
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NC_021089_12 | 982229-982339 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_12
|
1 spacers
spacers of NC_021089_12
>12.1|982259|51|NC_021089|CRISPRCasFinder TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_12
The CRISPR arrays of NC_021089_12 >merge|NC_021089|12|982229-982339|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGGTGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTAGAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG >NC_021089|12|11|982229-982339|CRISPRCasFinder GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG TGGTATGACGGTTAAGTAATTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTA GAGATACCGCGGCGGTATGACGGTTCGCGG
>NC_021089.1|WP_015589315.1|980972_982136_+|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-reductoisomerase MKKVSVLGSTGSVGKKTVDLLSKRKEEYQVEALSAHSNFALLAHQAKLLNAKYVAISDERLYKDLKENLLGTDVKIAIGATNIATIPVDLSVVAIVGIAGLEPVMEVIESGTKVIALANKESIVCGGKLLLKKAKEKNVQIISIDSEHNAIFQILQNDDKCIEKIILTASGGPFLNYSSEQLRNVIVDQALSHPTWNMGKKISIDSATMMNKALEIIEAHNLFNISPDKIEAIVHPESIVHGIVTYKDGFNFAVLAETDMAIPISYALSWPERSALNRKLDLTKQGKLTFQEPDHKRFPALKLSMAVLNSSAPQTNSIVLNAANEIAVNEFLKSRIGFLKIVEVVESTMESFDSYTDINSLSDIINIDCESRIIAHKIVESKVVAYS >NC_021089.1|WP_007548965.1|980392_980890_+|hypothetical-protein MSEAQGPNIAEWQAQQQHQEAAGEKSGFGLGHSDSVSTVVDGMKWLFNFHEGAIAAYSNVFEGLVSGSSLVTLFGKSGNMFGIKFLEGLAEYFSGGGGEDMPSEGMDMAHGDDGHHSDDYPHANNEIAHNADGLQDMHDAGDHHGQSFSPGPSPSVGDDHGHELG >NC_021089.1|WP_015589314.1|979370_980072_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MRNPIISILNLSLSFDDRTVLKDLNFDILKGESLVILGGSGSGKSVLTKTIIGLLAPDSGSVKINSKSKNKFGGLFQNSALFDYVTVWENISFNYKKRFNISKKEAKQLAIEKLNDVGLEESIADMFPIELSGGMKKRVALARAIAHNPEIIILDEPTSGLDPIMSDIVNEIIIKLSRDLNPTIITITHDIHSAFKIADKIAVLYEGEIISHGTVQEIQNTNNEYIKKFIHYI >NC_021089.1|WP_015589313.1|978595_979378_+|ABC-transporter-permease MSFFDINSVRIIGRYFINFLLRLGSAFIFFIQSLYHCLVPPYYFSNIARQIIEIGFFSLPIVGLTGVFIGAAIVLQSSLSDPLINQEQIIPKLVTITIIKELGPVLISLIMVGKVGSSVAAEIGTMRITEQIDALTTLNINPFKYLIAPRILASIIVFPILTVCADLIGIFGGCITAVFEFNHNLNIYIKHTAQFFNTYDFITGLIKATVFGAIISVSSCYYGYHCKEGARGVGVATTSTVVLSSILIILANYMITLIHA >NC_021089.1|WP_041573607.1|978073_978256_-|50S-ribosomal-protein-L32 MAVPKRKKSKSRRNMHRSHHAIEPKNIVVCSTTGEFMLPHNVAVDGSYKGKRVFIKQQAE >NC_021089.1|WP_015589311.1|977025_978063_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MLPTVNNNIVIALDAMGGDFAPLSVIHGAGFFLDNLVDPGIKVFFHIYGDKEEVSPLLSKYKKVSNNSEFTHCSDNVLANDKPSFALRHRKDSSMKAAIEAVKKGKAFGVVSSGNTGALMAISRFILGTLPNIYRPAIASICPTKTKSFALLDLGANVDCNADSLFQFALMGSIFAKIALKIDNPEVALLNIGTEEVKGNDSVRGAFELLKNAPGINFKGYIEASEFLEGSIDVIVADGFVGNVMLKTAEATASTFINLIKQEVFNSWIAKMLVGILLKSKLNKALTRFNPKIRSGAMFLGLNGIIIKSHGNSDAISFAHAIKFAVNAISENLNQKIINGVSHIE >NC_021089.1|WP_015589310.1|976076_977033_-|ketoacyl-ACP-synthase-III MNKSFILSTGSYLPRKMLSNNEIASIVETSDEWIRQRTGIVQRHIADEGELTSDLAVNAAKSAIEKAKISVDEIDLIIVATTTPDKTFPSCATIVQSKLKCKNAFAFDVQAACSGFIYAVTVADSLIKSNNRIKYALVIGAEIMSRIVDWEDRSTCVLFGDGAGAVVMKSEMGRSGIISTNLYSDGNVDILCTNGGVSSTGDSGKICMNGREVFKHAVDKLTASVEETLKCNNLKITDIDWLIPHQANIRIIEAVVKKLDFPIEKVINTVDKHANTSAASIPLALDYAIQESKIKSGNLVLLISIGAGLTWGSMLLHY >NC_021089.1|WP_015589309.1|974324_975341_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MKTDIVIIGAGPVGIFTAFQAGMLDMKCHIIDVLDQAGGQCTALYPEKPIYDIPGYPVITAQKLIEQLMEQASPFKPIYHLSQKVEKISNNCDQSFIIITNTGTEVKCKAVIVAAGNGMFEPNRPPLNGILEYENKSVFYSVNKISDFQDKTIVIAGGGDSAADWTVELSKVAKKIYVIHRRKEFRCTPETRNKLESLESDGKIELVVPYQLHELAGGNGQLSTVIVKNIASKEEKEISADFLLPFFGLSMNLGPINNWGIQLEHSRIVVDPAILKTSRDRIYAIGDIAIYSGKLKLILSGFAESAMACHDIYKVIHNSPVNFQYSTSKGIHGKEKLP >NC_021089.1|WP_015589308.1|972692_974021_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MTNTNETIFALSTVFGKSGVAVIRISGNYALKALNHFHIKKEIKPRFATLVDLYDDFNQLIDNGIIIYFPAPNSFTGENVIELQVHGSKAVIKIILEELSKIFVMARPGEFSLRAFLNGKFDLTQIEGIADLIDAETKMQAKQAIKQISGELERLYSNWRQRLITIQSKIEAYIDFPEDIWAEKSELEKINNEVQSLVRLIQEHLNDNRRGERLREGLHIVITGKPNVGKSTLFNFLAKRDIAIVSEYAGTTRDILEAHIDIGGYPIILSDTAGIRESSDPIESEGISRAKKRSFEADLRIELFPFEQRHNINCNVVNSDTIYVLSKADDVINNHNIKINGIDLLPISILKEIGTNKLISLIKEKAEEKFGHDRDTPVITRQRHRNHMKKALEHLQRFNIDNPIELISEDLRLAAFELGAVIGIIDVEEILSSVFSNFCVGK >NC_021089.1|WP_041573606.1|971987_972470_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoI MLKKLAWYWSFAELIKGFAITLKYMFKPKVTLRYPMEKGPLSPRFRGEHALRRYPNGEERCIACKLCEVICPAQAIVIEAEEREDGSRRTTRYDIDMTKCIYCGLCQEACPVDAIVEGPNFEFATETREELMYNKEKLLRNGEIWEDAIALRLKKNRPYY >NC_021089.1|WP_015589316.1|982426_983326_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MALSKFLDPKLDLTFKRIFGTEKNKNILIHFLNDILGFTEINTIQEVEFLSTIMDPEIASDKQSIVDVLCRDSSGTRYVIEMQLTRDKGFEKRAQLYAAKAYSRQLDKSGNYIDLKKVFFIAISNCNLLPEEVDYISNHTIRDEKTNEHDLKDFQFIFIELPKFPKNKEEQLESIVDRWLFFFKYADETTEEDLRKIAEKAPIIKLAYDELDRFSWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLATEKGKKIGKEEGKIEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSVNGTE >NC_021089.1|WP_015589317.1|983360_984608_-|IscS-subfamily-cysteine-desulfurase MNVESKKIHDAKIKLPIFLDYQSTTKVDPRVLEVMIPYFGEFSNAHSRSHSFGWTAEEAVEKARKHIADLVNADSKEIIFTSGATESNNTAIKGVAHFYKNKGNHIITVCTEHKCVLDSCRHLENEGFKVTYLPVKQNGIIDLLKLEEAITDKTILVSVMMVNNEIGVIQPVKEIGEICRKRNIFFHTDAAQSFGKVPIDVNEMCIDLMSLSSHKIYGPMGIGALYVRRKNPRVRLIPLISGGGQERGMRSGTVPTPLAVGFGEAARIAKEEMKKETTRVEELRDILYNKIKEAFPDIVLNGDYENRIPGNLNLSFPYVEGESLIMAIKDLAVSSGSACTSASLEPSYVVRSLNNGHDLEHSSIRFGLGRFTTKEEVLYAADLVAKNVGRLREMSPLWEMVQEGVDLNTVKWDSH >NC_021089.1|WP_015589318.1|984894_986313_-|metalloprotease-TldD MPNLDQIFFAQNDVNINNVYKIVNNALSNSDGGELFLEFCQSESLVFEDNILKHMDLNTRRGFGLRSFCEDSTSFVCSSEISEKEISNAASMVKSSVSLNKTNSINLNEETKSLYSRINPINEMDLNSKIKLLNEVNEYVRSKNNCVKQVKITLSGEWQVVQIIKGDHRLSDIRPLVRFNVLVIVEKDGRTERGSAGHGGRDSYSKFISEKKWKEVANQALEQALVNLEAIPTPAGEMTVVLGPGWPGILLHEAVGHGLEGDFNRKKVSAFSNSVGKQVAASDITVVDDGTLPNLRGSISVDDEGTPPSYNILIEDGILKGYMQDHMNAKLMGVSPTGNGRRESYKEVIMPRMTNTYMLPGKYTPKEIISSVKKGLYAVNFGGGQVDITSGKFVFSSSEAYLIENGKITQPVKGATLIGDGQTVLKKVSMVGNDLKLDPGVGTCSKDGQNVPVGVGQPTLKVDAITVGGTEI >NC_021089.1|WP_015589319.1|986530_987022_+|hypothetical-protein MYSEKNKLACRKKVRTYSKRLVTTLSTISFIGYIAALVLNIPVLSLYFSIACTILSVLSSTLNIWSLADHFRQRDLNKQLGVENTPGQEKLTKICLDITSNVLFLIGGITPILPFESPIIPFVSTAFFILGCAFMATNIVRTRISEPQAKKPTDDHSLTAKAA >NC_021089.1|WP_015589320.1|987266_987974_+|uroporphyrinogen-III-synthase MKSIFLTRPLLDSFNTRNILRKYGYKVFIEPVFTIKYLNPDISAYEFDVVISTSKNSVKALSQICKEDDFPIITVGNSTMQAAKNLGFSDIISADSNVDGLISFIKAHYSNAIKFLYIRGQEVSCDLKKRLSEEDFNIREVVLYKTIIKRSLTNRCKNLLLDGKIDSVAFFSSQTARVFCSLVLKSGLSHVMSNITAYTMSKNIADSLKLIKWKKIITSRLPTGESLIDIINKDC >NC_021089.1|WP_015589321.1|987973_988753_+|exodeoxyribonuclease-III MLKIATWNVNSIRKRVNQLCSFIVDSQVDIILLQEIKCTEEQFPYAEIEKLGYEYAIYGQVARNGVCVLSKYPILEKFKIDIVESHQEARYIECVIKHTNHKIRVGSVYVPNGQSPDSQAFEYKLKFFDNLYERMSTLLKNEELTIIAGDYNVAPDEIDVFDSNLLNGQVCFHIREREKLRAILNLGFKDAFRISHPNLQQFTWWHYQGNSLRNNQGMRIDYMLLSPQAVDKLETCYIDDRLRKLENPSDHTPVVCAIE >NC_021089.1|WP_015589322.1|988789_989812_-|hypothetical-protein MTKILTPQTKNLEPSNQVTNKDEKIFEKEEHQVIYDYFVKVLEGKAELKENKEITDYFISAYKDILLNNVNPKDIKPLSEENFSQFLLSVFEKIREKKLANEENLKNGKIKEVVDDCVADIRGTEAKDSSIKFVLEMLLLLIGGIKIDPKNISGSFMDGMKEKIPFLGKDKKEEDEPPLSDEEMVTTFLSKIFFPVLLSTIPMLIFGPTTLGVVLTAIGTIFAIKGGVEVLFSNNKKGTLYDPSSQDKDDTEKRAKLNGKILEGIDDILKTPVTEVEKGTSVSEQISQGKEKSEQQPVPEQISQENNRGNEESKQQDQPWTRKENKRREENTSNKQAGIT >NC_021089.1|WP_015589323.1|989862_992439_-|DNA-polymerase-I MKEKTFTIIDGYGFLFRAYYVLPHLITTTGMPIGGVYGFLNMVLKYIAHSDYLTIALDAGKKNFRHDLYPEYKANRVTPPEDLTPQFTILREAVEAFNLSYEEIEGYEADDIIATLAAKYANHQDFKVVVVSSDKDLFQLLNHNILIFDPIKNIYIDEKQVIEKFGVNSHKLLDLFSLTGDASDNIPGVPGIGPKTAAKLLDEFDSLNNIIENIDNIEQTRIRNILTEHKEKALISRELLSLCEKVDLQHDIAKYEVHSPNMEKLLSFLKKYEFNSLIGKMEKLFSYNGSSTKEKIEYSSEELEKFLEHCRYEGRIAIHCHFEDNLLNKISLSYSESNIFYIEQDSIQDALITINSTLLSNGVLKIIHNIKEIRKIFPAIEKMLDSVDDLMIMSYSLDTGKHDHSIPNIVAHNLSGDVEIFSAKTLIAIREKLKQRLFQEKLFTIYERFDKPLMKVIFDMEKNGILLNIQKLQELSDKFQQVIAVLEDEIYNLAGERFNIASPKQLSDVLFNKMGLNKKKKSKKSGSYSTNYEVLEALEEEGVEIASKILNWRHLSKLKGTYTDALIKQVDSIDGRIHTSFSTTATATGRLSSSNPNLQNIPIRSEEGNLIRQAFIAPKGHKIISADYSQIELRLLAHVANVAAFKEAFANGQDIHEITARQVFGVQEIDEQLRRKAKSINFGIIYGISPFGLAKRLGITIAEAAEYINYYFSCYPEIKAYMEKAVSIARLHGYVETLFGRRCFVRDINNTIPYIRQFAERAAINAPLQGTAADIIKRATIQLFDQLKVGKIILQVHDELLVEVEDEKVQETAKLVKNIMEGVVEISIPLEVEIKVGDNWALNYDLNMADSKSIDYLN >NC_021089.1|WP_081600771.1|992653_992818_-|IS3-family-transposase MSHKGCCYNNSVVESFFSSLKREILIDTSQHSAQQTRTAIFEYIEIFYNKQRHY >NC_021089.1|WP_095866567.1|993056_993398_-|IS3-family-transposase MVNTIKCRNYVGFSASGYYKWTTRKISSRESANKELLADIQKIYQASKCRYGAPKIHAELKALGKSCNLKTVQSIMQKNGIQAILRRKFKIKKQQTDSSSQYIRPKLYCRSTK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_13 | 1063946-1064054 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_13
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1 spacers
spacers of NC_021089_13
>13.1|1063975|51|NC_021089|CRISPRCasFinder CTTGTTAGCGCCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_13
The CRISPR arrays of NC_021089_13 >merge|NC_021089|13|1063946-1064054|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCGCCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCT >NC_021089|13|12|1063946-1064054|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCT CTTGTTAGCGCCGCGGCGGTATGACGGTTCGTGGCGGCGTGACGATAAGCT CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCT
>NC_021089.1|WP_015589369.1|1062707_1063460_-|5'/3'-nucleotidase-SurE MIILITNDDGFGSEGIKLLKEIARNFASEIWIVAPDTDRSGAARSLDYPVKQSIGINQHSEREFSVSGTPADCVIIALNKVMNKKPDLILSGVNIGSNVGDDICYSGTIGAVMEGAARSIPSIALSQVYHDKIDWHNTKVFAPKVIAKLVKVGWPKNIVMSVNFPATEKVKGVEFAEQGEYNIDGDLIFTENSNGSFSLNWSREHSGSGSINKIKEGFITITPVKLDFTDYDTLNAMKNSCADEFSSIAD >NC_021089.1|WP_015589368.1|1061459_1062683_+|histidine--tRNA-ligase MTNQTVRGTKDLLFDEWYKFKYIQQTANRISSLYGFLPAQTPIFEYTEVFTKTLGDSSDIITKEMYSFNDKGGKSITLRPEFTAAIVRLLIEKKLQTPIKLFSTGPAFRYERPQKGRQRQFHQINFEVFGIEDPKADVELISLAQHLLTEFGINKNVKLEINSLGDGETITKYREALILYFTKYQNDLSEDSKNRLIKNPLRILDSKDEKDRLIISDAPKISNYYTKESSDFFEQILNGLTILDIPYTVNNKLVRGLDYYCHTVFEFVTEDLGAQGAVFAGGRYDNLVSSVGGKHTPAIGFAGGIERIMELINYSPKEERPIYLIPIGREAEKHALTLANELRRNSLYVSYEHSGTVKNRMKKASQANAKIVLIFGNDELNNNTVKVKNMDTGEEKIIARDNTIENI >NC_021089.1|WP_015589367.1|1060890_1061463_+|NifU-family-protein MFIQIEETPNPNTLKFLPGFAILNEGETADFSNANEIKNSKLAANLFQIEHVVRVFFGHDFISVTKLGEINWDTLKVEILTTIMDHFTSGGKALNKEGVNDNNIPNEEFFDESDIEIVNRIKELMESYIKPAVAQDGGDIKFRGYKDGIVYVELQGACSGCPSAAITLKQGVQNMLSYHIPEVAGIETTL >NC_021089.1|WP_015589366.1|1060469_1060829_-|DnaJ-domain-containing-protein MSFIFFLFWIFIVVTFVLPSVVIFFLFLTKKNNMSFMMNSILSKFLNEFSSSRSYTENYTGDNMSKDEALKILGLNPEASQNEINKAYQNLMKLVHPDKGGSEYFAQKLNAARDKLLKK >NC_021089.1|WP_006280242.1|1057348_1058578_-|cytochrome-b/b6 MQEDNKKETIKEEKGILGWIEYRLPIFSFLRHTASYQVPKNLNYAWNFGSLAGIALILQIITGIFLAMHYTPHVDYAFNSVERIMRDVNYGWLIRYTHAVGASLFFMVVYVHIMRGLYYGSYKRPREMVWFIGIFIFFAMMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLFSAIPLIGNKIVIWLWGGFSVDNPTLNRFFALHYLLPFVIIALAMLHVIALHRFGSGNPSGVEVKSDKDTIPLYPYYIVKDCITFGLFFVVLFAFVFYAPNYLGHPDNYIEADSMVTPVHIVPEWYFLPFYAMLRSIPDKLTGVLTMFASILVWFLLPWLDKSKVKSGAYRPVFKKFFWVFAINFVLLAWLGGQEVKEPYITMSRLSTLYYFAYFVIVLPLLSKYEKPKEPPKTLSDSVPEMR >NC_021089.1|WP_010963022.1|1056242_1057001_-|cytochrome-c1 MGSNVFAIFCMLFLSSLISAEEFKSSPNKKIDWKFDGIVGSFDRESIQRGYKVYKEVCAACHSMNRVAFRNLQDVGFSEEDVKQIAASYQVKDGPNDLGEMFDRPGVPSDYFIAPFDTKEAAAASNNGAVPPDLSLIIKARHDGANYVYSLLTGYQNGEHDENDLYFNSYFPTGRLAMAPPLSEGMVEYDGARQATVENMAYDVINFLQWAAEPELERRHKLGLKVVAYFIILTVFFVLTNNKVWSKLYKKK >NC_021089.1|WP_007550541.1|1055805_1055958_-|transposase MPAAYSYDLRKKAMEALDEGESREAVAARFKIGRTTLWEWQHCRLDHKLC >NC_021089.1|WP_015589365.1|1055026_1055764_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRYKITVEYNGSSFSGWQKQQHSANSIQEKIENAIFNFSGEKIALYCGGRTDAGVHALGQVAHFDMEKECELYRIRNAINYHLKSIPIVVLNAEVVDDAFHARFSAKKRYYEYRIVNRYAPAALETGYVWQVFNPLDVNIMREAAKHLLGKHDLSSFRSKDCHAANPIRTIDDIDIVQNGNHIHIKISAISFLHNQVRIIAGTLVEFGKNRTNPQEMLHILSQCKRSAAGVTAPPFGLYLVKIDY >NC_021089.1|WP_041573541.1|1053780_1054938_+|DNA-polymerase-III-subunit-beta MSEVAGVDTEIKKQNSVCEQMRFSVSRTSLLNTLSRVSGVVERRNAIDVLACINIKAQHGSIKLMATDLDISMFASLAATVLTEGEVKISAHTLHDIVKKLPADLDVNFEVNNQGKLLMSCGNANFSLPNVVSSSFPALEEDNYKYDFTLLNTDLIDLLTKTKFAVSLDDTRYNLNGIYLHTDEQFLYCVATDGHRLSCIKRPKPGNINGEFGVIIPRKTVMELLKILDDCNEIKVKLSDRKIKFTCGEYILISKLIDGTFPNYKAVIPASQDKHMIIESKKLSDVIDRVSVVVSDKVKSIKFSLQEKLLTLHSNSQECSDATESIEVDYNEAPIEIGFNSRYLLDVLSCIKNKCKFSLADGNSATIITDEDDSNVLYVVMPMRT >NC_021089.1|WP_015589363.1|1053167_1053665_+|hypothetical-protein MRSFFIFLIFFSIGAFASVSDVQLKEKYKDWLVYTALEDGEKVCYIVSYPKKKSEHYTTNRKPYVMVSYVDKKADEVSVTSGFQYDKEPVALNIDKKIKYTLPIIQGSFAWAEHTKIDQDLILKMKQGLSMVVNGKTKTVTIDDTYSLLGFQKAYQKMHDSCHTK >NC_021089.1|WP_015589370.1|1064757_1066101_-|signal-recognition-particle-protein MFKSLTESLNSVFSKLRGKSIISEDDFNLAMREIRIALIEADVSLEVAKKFINDIKDKVIGEKVIKSVSPAQMIIKIVQDNLVAVLGSEKSDLNLAVKPPAVIMMVGLQGAGKTTTSGKLALKLKKQKKKVMLASLDIYRPAAQKQLEVLGKQIDVQTLPVVIDEKPITITKRALATAKNDNCDVLILDTAGRLHIDNNMMNELKAVKEIASPAEVILVADAMIGQDAVNIAKSFNEVIDVTGIILTRVDGDARGGAALSMKMIADCPIKFIACGEKLSDLDDFYPDRIAKRILSMGDVVSLVEKAAEIVGQEEIDKLQKKVKKGKFDLNDLVGMLKTLSKMDGISNIMKFIPSSFTKKLSSSVPDDNKVKKYIAIINSMTEKERQNPDILNGKRRLRISKGSGTTVTDINLLIKQYNQMSSMVNKFSKVDHSKLKESDLMDMLSRK >NC_021089.1|WP_015589371.1|1066085_1067645_-|oxidoreductase MQLYKSSLLLLLTVLIVIVLKLPENLSIAVNWSLPILDFDLSFRTILISFLSVAFLAVLPAQNLTFSEMLSFAAYTISSLYAVLSEHMILVIIFCELMTISAFFIIAASCRDSGPAIRYACVHFFVGVILIAGLALQSTNLIILGLLINCACFPFSFWVVDAYPAASLHGTTYLSLFTTKVSFLVMLLHTYNLWQDCTEILALVGTITAIYSIIFASLEQNIRRFLCYNVVGQMGLLIIAGGLLSPSEKAIPILILHIIFSLVYQSLLFVVSNSIISRTKTISFNGVGKLMSVEGMCAIIAILTMAAFPGTAGFISKSYITAEIEASGANLEVYKNLYKILNLLLYLSVGLKFLYYIFIAKSKSKPLAERGGKMTMIILAFICVIAGNPYLPIYNKPSIFDFVYNTKNILSQFNLLLCTTLLFILLRKLFYPRINFKMDVDWIFRAFIPYIILLFNQLVFKVREMSANVLQNLTNSLTSLYFDNITKLKEVLGYNSVSFVSASSLFLMSILLMLLCLSR >NC_021089.1|WP_015589372.1|1067948_1070810_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKLNFKISFSNLYTRNGLIKLDETFLNYIKSCDESLFCSLIEAREKAASSSMSSQCHPPSSQCLTLGSRKQEGRSATWMTDSQLIVDLSYLLDEFIAKLFNVEKEIEELKKKHNDFAVIYKCKRLFVQRYALKKYTNVANIDITNKLSHFLTLPTTEKNFAEQVMHWFEDKENHKEEIELAAQYAVWRVKNKQSILFSIHKKIDHENLIPFSKKEVDKVEVLYSNEVKRRYGFDLTSKKVSLNKALDNAHYCIFCHKQSKDSCSKGLINNDNTFKQSPLKVELHGCPLEQKISEMNLVKSEGYSIASLAIVMIDNPLCAATGHRICNDCMNSCIYQKQEPVNVPAIETRILDDVLSLPYGFEIYSLLSRWNPLNFQRSLPRGNTGKNVLVVGLGPAGFNLAHHLLNDGHNVIAIDGLKIEPLIDNFQLIKDFKHEKLSERMAGGFGGVAEYGITSRWDKNYLKIIRLLLERRENFVLYGGIRFGGTINADDAFNLGFDHIALALGSGKPRMIKIKNILARGVRMASDFLMSLQLTGALKFDSIANLQVRMPIVVIGAGLTAIDTATEALAYYPIQVEKFLLRYEILVDKYGKDCVEKDWTEEEREIANEFISHAQLIREKQKLAKKENREIKILELMQSLGGVKVIYRKELKDSPSYRLNSEEVQNALSEGIYFIENLEPVEVVTDKYNHAELIKLIDTKSGEIKRIKARSIFIAAGTEPNTVIATEDKKHFKLSNGYFTQLNSLGKEIDPIFSPKMQNKDRILVYKQGNKTISFFGDLHPSYSGSVVKAMASAKNGYPIISQLLNRVNSFVSVIPVCDVVGQKKNAWPSVEDLANKELFNRIKEQFTAKVIKVQYLTDKVVEIVIKAPLAAKNFKPGQFFRLQNFETNGRKANNTNLAMEGIAVTGTEVDKKKGIISTIVLEIGGSTNLCRHLREGEQIILMGPTGRPTEVY >NC_021089.1|WP_006279640.1|1070855_1071287_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MQFNISDIIKILPHSYPFLLVDRVIECDPGKSIKAIKNVTFNEPFFIGHFPGHPIMPGVLIIESLAQASAICVLGKETIENKVVYLRSIENAKFRKPVTPGDTLILQANIQSVCLGVHKFRCIASVSEEKVAEATISAVLQNK >NC_021089.1|WP_015589373.1|1071291_1071843_-|OmpH-family-outer-membrane-protein MKYIQLFISVIALIISLFVGYKFVGYQPQNTKAAIIDSDKVINESLALQNIQQQIKEQNSRLQQEFESELEKLKTSKEEFELLSEEAKKEKTEQFNKHTVNTRDNYAKKMLHLEESYRDAVESVFNKIKEVAKKTAEKNNIDLVLFISKKNQVLYSMDEVDLSDVVLNNINKKIPEFALKGIE >NC_021089.1|WP_015589374.1|1071843_1074180_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamA MKKLFYILVVVFISFPALLVALGTAEKVQVKDVKCIGNERVSNQTIGFYIKLKSGDYINDDDIDSIIKDLYKTKLFASVNAYIDDKKNLVIKIQENPLINKIILKGNKLFNSKELLNNVIQSKSLTIFTETKLQNDLMNLITTYRNNGKVGVKIEYELEKLDSNRVNLIFKIKEGKTSKIKDIRFIGNKNFSENELEQVIKRHSNDIFSKLFRAIFKGENHYSPQYLLINTELLDRFYSSKGYIQNNIQPIVEVDNNNQTELTFLIDEGQQYLFGNNEVNIETEIQDLSLKEEILDFITEENDKIFNRVKINNTVEKINKYLNEKGYIFAKVNPEYAQRDNVVDVTYRVLPGKKIYINQITIDGNDRTLDKVIRSKLSVAEGDAYNISEIQKSRKKLMSSDFFETVKVNSYAVNDNTVNLDLNVKEKNTTSLYLGGGVSLPGGALIKIDLKDRNLFGTGKELSFALEKSQYVFSTDLEFVENNFNDSDTSLGVDVFYEKQDKPNTTFDSCDMGFFTKLSYKVTENLTNSLRYSYKYNHIHMDNKGGQDTDISEIILDRKGEHQISSVGYTLAHNKLDNLYTPKEGYLLRLSQDISGLGGNVNFLKSEFLSFYTHPILSKIDDDITLRFKMAAGHIFSYTDENLNIGQHFFKGGNEIRGFDLSGIGPRAEDKNKSSLGGKTYFNLTQQVDFPLPKLYDYAGIKGSLFVDYATLFGLDDKNKKYEGKYYDSKLVRVSPGFGFSMLSPFGRLRLDFGFPLVKESYDIIPSPNVKFSIEAGI >NC_021089.1|WP_012673365.1|1074188_1075307_-|RIP-metalloprotease-RseP MELISNLIHQFSDGIYYFLSFSLIISVIVFVHEYGHYVVAKACKVKVESFSIGFGPEIFGFNDKSGTRWKLSAVPLGGYVKMLGDTNAASVPADQQELTEEEKLYSFHTKPRHKKAAVVFAGPFANMVFAVIAFTIFFSIAGYYRTPPVIENVIEGSAAKQAGLLPGDTITQINEHKIKYFEDISRVIMSNPKTRMEIEYSRNNEKHRTSLTPLIIKDKDVFGNTIERETIGIISVNTLKQSSFLGAVSLSVSETYHTMCLTIKALFHIIVGKRSINEIGGPIKIAKYSGQSAKKGFIMVLYFMAIISANLAAINLLPIPLLDGGHLFHYIIEAVIRRDLSLKCQKYAAIFGALVLFLLMATGMSNDIRDLF >NC_021089.1|WP_006279484.1|1075406_1075685_+|succinate-dehydrogenase-assembly-factor-2 MTDTSLLRRKLIYRSWHRGCKETDILLGHFALKYLDKFSLSELIEYEKIVDLDDYELYCYITRKTNLPPGLNSQIVNLIACFIEANPLCTQD >NC_021089.1|WP_010082086.1|1075659_1075986_-|cell-division-protein-ZapA MQVVEIVIRNNTYKISCESGKGNHLLRLANSFDKLVSSVSQKTGGKGSDALNFLLAALILEDKILELTKRLDEVNQEREKYRNEKRIEYTEVLDKVNKIITNLECIKD >NC_021089.1|WP_010963035.1|1076058_1076337_-|integration-host-factor-subunit-beta MATKSDIIARVAKRHPFLDKIVIAAIVDRFFGILSSTLKHHNRVEIRGFGSFSVRSYNLKETSHLMLQKFTKNQYFKTYFRSSKKLSDLINE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_14 | 1079019-1079117 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_14
|
1 spacers
spacers of NC_021089_14
>14.1|1079042|53|NC_021089|CRISPRCasFinder TGAGGCTTATCGTCATGCCACCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTCTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_14
The CRISPR arrays of NC_021089_14 >merge|NC_021089|14|1079019-1079117|CRISPRCasFinder GGCGCTAACAAGTAGCGGGATGATGAGGCTTATCGTCATGCCACCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTCTTAGCCGCTAACAAGTAGCGGGATGA >NC_021089|14|13|1079019-1079117|CRISPRCasFinder GGCGCTAACAAGTAGCGGGATGA TGAGGCTTATCGTCATGCCACCGCGAACCGTCATACCGTCACGGTATCTCTTA GCCGCTAACAAGTAGCGGGATGA
>NC_021089.1|WP_012673367.1|1078158_1078824_+|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MLFKNSKWIRSFSRRSRLKPDVDEILEKYSIQNSKESIEKIVNSQKRIWVEIGFGNGENMLYQVLNEPDLLFIGCEPYLKGVSRLLTNIEIQNIKNILMWTEDARELIANFPDNSVERFFILFPDPWPKRSHNKRRLINTEFLNLLAKKILITGEIFIATDHQDYAEWIASHIKQCNSLIYREDDFTSYTLTKYHRRALKDQRKVRFFKVSVINNLQTMDQ >NC_021089.1|WP_015589375.1|1076366_1078019_-|30S-ribosomal-protein-S1 MNNNNPVVNLPVTIRKLSSNKFIEEICQGQFEDQDNTLFEDSFVNKIKEGDVVEGVITRINPNDVVVDIGLKSDGRILIKELGCNDEVIIGSKIRVYVERIEDYHGNVVLSREKAIRDEKWNKLEEDTVTRAEVSGVIKRSIKCGFIVDLGDGISAFLPLSHVDLKQVKDAKHLIETEQKFIVLKMDKKQGNIVVSRKLVLEKLHAGEKIKFLESLNEGDIIEGKIKSITHYGVFVGIHESDVVGVIDGLLHITDISWSRVSHPSAVFTCGQTIKVKIIKIDKENAKISLGVKQLEDSPWQDAESKYPVDSVNKGYVTSIEDYGLFVELRPGIEGLVHSSEITWVKSNLPVSSLVTRGQEVYVKILSIDIAKSRMSLSMKRCVDNPWQVFINKYPPGSIVSGEVKNNTGSYVSVAFGDSEIDENVEGTIYVKDFSWSKNGSDEIKKYNVGDKIEAKVIRANVNRARTYLGIKQIEYDPLEELIKKVKVGDKIQVIVGKREDNGLVVEVENDVTLLIDQEHLPENKKFSISEKIEVEVLGVEEYNIALSAK >NC_021089.1|WP_010963035.1|1076058_1076337_-|integration-host-factor-subunit-beta MATKSDIIARVAKRHPFLDKIVIAAIVDRFFGILSSTLKHHNRVEIRGFGSFSVRSYNLKETSHLMLQKFTKNQYFKTYFRSSKKLSDLINE >NC_021089.1|WP_010082086.1|1075659_1075986_-|cell-division-protein-ZapA MQVVEIVIRNNTYKISCESGKGNHLLRLANSFDKLVSSVSQKTGGKGSDALNFLLAALILEDKILELTKRLDEVNQEREKYRNEKRIEYTEVLDKVNKIITNLECIKD >NC_021089.1|WP_006279484.1|1075406_1075685_+|succinate-dehydrogenase-assembly-factor-2 MTDTSLLRRKLIYRSWHRGCKETDILLGHFALKYLDKFSLSELIEYEKIVDLDDYELYCYITRKTNLPPGLNSQIVNLIACFIEANPLCTQD >NC_021089.1|WP_012673365.1|1074188_1075307_-|RIP-metalloprotease-RseP MELISNLIHQFSDGIYYFLSFSLIISVIVFVHEYGHYVVAKACKVKVESFSIGFGPEIFGFNDKSGTRWKLSAVPLGGYVKMLGDTNAASVPADQQELTEEEKLYSFHTKPRHKKAAVVFAGPFANMVFAVIAFTIFFSIAGYYRTPPVIENVIEGSAAKQAGLLPGDTITQINEHKIKYFEDISRVIMSNPKTRMEIEYSRNNEKHRTSLTPLIIKDKDVFGNTIERETIGIISVNTLKQSSFLGAVSLSVSETYHTMCLTIKALFHIIVGKRSINEIGGPIKIAKYSGQSAKKGFIMVLYFMAIISANLAAINLLPIPLLDGGHLFHYIIEAVIRRDLSLKCQKYAAIFGALVLFLLMATGMSNDIRDLF >NC_021089.1|WP_015589374.1|1071843_1074180_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamA MKKLFYILVVVFISFPALLVALGTAEKVQVKDVKCIGNERVSNQTIGFYIKLKSGDYINDDDIDSIIKDLYKTKLFASVNAYIDDKKNLVIKIQENPLINKIILKGNKLFNSKELLNNVIQSKSLTIFTETKLQNDLMNLITTYRNNGKVGVKIEYELEKLDSNRVNLIFKIKEGKTSKIKDIRFIGNKNFSENELEQVIKRHSNDIFSKLFRAIFKGENHYSPQYLLINTELLDRFYSSKGYIQNNIQPIVEVDNNNQTELTFLIDEGQQYLFGNNEVNIETEIQDLSLKEEILDFITEENDKIFNRVKINNTVEKINKYLNEKGYIFAKVNPEYAQRDNVVDVTYRVLPGKKIYINQITIDGNDRTLDKVIRSKLSVAEGDAYNISEIQKSRKKLMSSDFFETVKVNSYAVNDNTVNLDLNVKEKNTTSLYLGGGVSLPGGALIKIDLKDRNLFGTGKELSFALEKSQYVFSTDLEFVENNFNDSDTSLGVDVFYEKQDKPNTTFDSCDMGFFTKLSYKVTENLTNSLRYSYKYNHIHMDNKGGQDTDISEIILDRKGEHQISSVGYTLAHNKLDNLYTPKEGYLLRLSQDISGLGGNVNFLKSEFLSFYTHPILSKIDDDITLRFKMAAGHIFSYTDENLNIGQHFFKGGNEIRGFDLSGIGPRAEDKNKSSLGGKTYFNLTQQVDFPLPKLYDYAGIKGSLFVDYATLFGLDDKNKKYEGKYYDSKLVRVSPGFGFSMLSPFGRLRLDFGFPLVKESYDIIPSPNVKFSIEAGI >NC_021089.1|WP_015589373.1|1071291_1071843_-|OmpH-family-outer-membrane-protein 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MKLNFKISFSNLYTRNGLIKLDETFLNYIKSCDESLFCSLIEAREKAASSSMSSQCHPPSSQCLTLGSRKQEGRSATWMTDSQLIVDLSYLLDEFIAKLFNVEKEIEELKKKHNDFAVIYKCKRLFVQRYALKKYTNVANIDITNKLSHFLTLPTTEKNFAEQVMHWFEDKENHKEEIELAAQYAVWRVKNKQSILFSIHKKIDHENLIPFSKKEVDKVEVLYSNEVKRRYGFDLTSKKVSLNKALDNAHYCIFCHKQSKDSCSKGLINNDNTFKQSPLKVELHGCPLEQKISEMNLVKSEGYSIASLAIVMIDNPLCAATGHRICNDCMNSCIYQKQEPVNVPAIETRILDDVLSLPYGFEIYSLLSRWNPLNFQRSLPRGNTGKNVLVVGLGPAGFNLAHHLLNDGHNVIAIDGLKIEPLIDNFQLIKDFKHEKLSERMAGGFGGVAEYGITSRWDKNYLKIIRLLLERRENFVLYGGIRFGGTINADDAFNLGFDHIALALGSGKPRMIKIKNILARGVRMASDFLMSLQLTGALKFDSIANLQVRMPIVVIGAGLTAIDTATEALAYYPIQVEKFLLRYEILVDKYGKDCVEKDWTEEEREIANEFISHAQLIREKQKLAKKENREIKILELMQSLGGVKVIYRKELKDSPSYRLNSEEVQNALSEGIYFIENLEPVEVVTDKYNHAELIKLIDTKSGEIKRIKARSIFIAAGTEPNTVIATEDKKHFKLSNGYFTQLNSLGKEIDPIFSPKMQNKDRILVYKQGNKTISFFGDLHPSYSGSVVKAMASAKNGYPIISQLLNRVNSFVSVIPVCDVVGQKKNAWPSVEDLANKELFNRIKEQFTAKVIKVQYLTDKVVEIVIKAPLAAKNFKPGQFFRLQNFETNGRKANNTNLAMEGIAVTGTEVDKKKGIISTIVLEIGGSTNLCRHLREGEQIILMGPTGRPTEVY >NC_021089.1|WP_015589376.1|1079300_1079948_-|heme-exporter-protein-CcmB MIDSVKKLVIDDKNFTYIVCIFIIMLSLSSFTLKNNNKQEVMLTLTWICATFVLQISTNNLFTSDYHDGILEQIFVQPLSSRLIVAYKIFAHWLLFGLPISVISSIFSFAILGNSIEHSIAVGVSLLFNTLIITNISATGNALMIGQNNLASGVSQILVLPMIMPTFVYFKMLTQFENLSLNIYTLLITILVFVILIVNSTVTTHMALKFAVEQD >NC_021089.1|WP_010963040.1|1080054_1080447_+|TraR/DksA-C4-type-zinc-finger-protein MEKLPKIKSPEDYTPSEDEEYMSVKQLEYFSLKLQSILAELEKQELEDNSIDTYYSDEDSGNEELIKRRKDRKEKIKEALEKIKLGTYGYCDGTGEEIGVERLKANPLAIYCIEEQERVEKEKNVYNIND >NC_021089.1|WP_015589377.1|1081896_1082106_-|hypothetical-protein MLVSEQIESVDREELKQQNHIHKDTECSEETTIYGHINQHMEKNISNTLHEIYDALMSYNESEQSMTST >NC_021089.1|WP_015589378.1|1082237_1083563_+|ribosome-biogenesis-GTPase-Der MLKIAIVGLPNAGKSTLFNRLVGRKAAVVSNIPGVTRDRREGMGRISDLEFKIIDTGGWNDQTNFSLQVIEQIEFSLSNSNIIFFLVDAKVQNERNEEFAKWLKRKINKPVILVANKCESHKSENVDYLQFFDFLGPVYISAEHNLGMVDLYDALAGVIENFNENTELPNNELSRLRIAIIGRPNVGKSTFLNGLLAENRLITSSEPGTTRDSVDITYDHDGELITLIDTAGIRRKANVVDGLESRFVEKSMESIKRSHVVVLMLDSLVGIEQQDLSIGEAAIKGGKGIIVVLNKWDLIGKDDRSRLIKFVKQQEVTRLFLEVPTITISALKGMRCGDVIDKCLEVSESLNKKISTAKLNKWLIDAVGKHSHPLVKGKAVKMKYIAQIGTKPPAFSLICNIPESVDESYKRYLINDLRKNFFADGVPVRLLLKKNKNPYVK >NC_021089.1|WP_015589379.1|1083559_1084081_+|disulfide-bond-formation-protein-B MNTLLYTFRDNLLKVMCNNSRIPAIFLLSSAAALIFAYVLEYFFNMLPCKLCTYERIVYYIAGLLAVACMLKDNKILIYAMFCSYLIGAVISFYHIGLELHLFHDVLGCTEQASGNVSIEELRNNLLNPNYSPSCDRPHYVLGVSLATWNLIYLIVALFVSGKVYCGERKKSK >NC_021089.1|WP_015589380.1|1084055_1084598_+|demethoxyubiquinone-hydroxylase-family-protein MEKERNLNNLRYSNNQFLQQAIRIDHAGEYGAICIYSGQKFILKKSSIINEIIEMEEQEKKHFHYFNEKIKEQKVRPTVLLPVWRVLGVSLGVATAIMGKKAAMACTAAVEEVIGEHYKEQVSHLEDGELRETISKFRDEELEHKDIAIQHNAESAFGYNILSSFIKTGCKTAIYLSKLI >NC_021089.1|WP_081600794.1|1085096_1085732_-|transposase MIAENNMEDIEIAIDSTGISIYNNTPGHSKENSTDRKYRGYEQTRKLHVMLNINNKKAIAVKYSNGVYSDHYGACDLLKEVDFQHAIKALYADRACDRHKFYKLCNEYDIKTKIPPINNAAEHPETDYMSDRNAAIRLIKLYGEDGMKEWKKEVNYGKRSYIEGFFSRLKQIFGFSFRNKSEINREKELLIKCYLLNKFTDIGMAKFEIVT >NC_021089.1|WP_141456678.1|1085715_1086045_-|transposase MPQKMRVSNCHEYNKFLQERGSIFCYINDAIENWYENCPKMQGGNYIYSDKVVILVHIIVSFFRIGLRQTVGFIKGYLQQIGRDLAVISYSQASRRFKKLNIKINDCRK >NC_021089.1|WP_007548592.1|1086267_1087248_+|phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide--transferase MILATKVFFTSFVFGFILFPYFIKLLKKISKDGQPIRSCGPESHLITKKNVPPMGGIIILTSSLLPILLWVQLTPEILLLILITLFFALLGFIDDYLKLKTNHYRGLSAKTKILIQFIVALVGVFILKLYSAECFTKTSLFKGVIIDFGYLYVPFAAFVIVGSSNAVNLTDGLDGLAATQVITSFAFLGLIAYITQADMNITLFCIAFIGAILSFLWFNTHPAKIFMGDVGSLSVGAALGLTSVLIKREMLFAVIGIIFVIETLSVIIQISYFKYTKFKYGEGKRVFLMAPMHHHFEKKGWSENVIVMKFWIISIICSVFTITFLL >NC_021089.1|WP_015589381.1|1087254_1087851_+|ribonuclease-HII MKYPDFTLENKLSGVIAGVDEVGRGPLAGPVISAAVVFIDRNTIIDGINDSKKLTPQCRQVLYEKIISVAKFGIGMASVEEINSYNILQATKLSMKRALIDLDLELDYVLVDGNQPPEVKWQVKSIVNGDNLSTSIAAASIVAKVTRDRLMQELHNKHPEYNWYKNKGYGTKEHLNAIGLYGITEHHRKNFAPISRAL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_15 | 1111956-1112095 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_15
|
1 spacers
spacers of NC_021089_15
>15.1|1111999|54|NC_021089|CRISPRCasFinder GTTCGCGGCAGCATGACGGTAAGCTCGTCATCCCACTACTTGTTAGCGGGATCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_15
The CRISPR arrays of NC_021089_15 >merge|NC_021089|15|1111956-1112095|CRISPRCasFinder CTTGTTAGCTGATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCAGCATGACGGTAAGCTCGTCATCCCACTACTTGTTAGCGGGATCTCTTGTTAGCGGATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACG >NC_021089|15|14|1111956-1112095|CRISPRCasFinder CTTGTTAGCTGATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACG GTTCGCGGCAGCATGACGGTAAGCTCGTCATCCCACTACTTGTTAGCGGGATCT CTTGTTAGCGGATGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACG
>NC_021089.1|WP_015589398.1|1110394_1111846_+|phage-terminase-large-subunit MNFLKFIELCFQTVVPGCEYNDYQYIKVIADRLEAASAGEVKRIIFNMPPRSMKSMCISVAWPAWILGNQPTARIIVASYSQRLSEKHSLDTRCVMQSSWYRALFPEIELSKDQNTKYKFQTVQRGYRIATSVGGTLTGEGGDFIIVDDPLSSAQALSETLRKRATNWFDQTLVTRLNDRKKGVIVLVMHRLHQEDLTGHLLSKPKNIWHHICLPMISENKQVIYSIKKPIPPVPIIRVAQHCATRRLYNKPASPVRILYSREEGQLLYPLDGGKEEVEIIKAELGSYAFAAQYQQNPLPLSSGIIKPEWLKRYKKFPDNLSHITQSWDTAVSTSNMSNFSVCTTWAKIDNKFYLLDVYRAKLEYPKLKEQVLSLAARWTPHAILIEAKTSGQQLVQELKTNSDLPIIEIVPHDDKLTRFHQIVPIIESGKVFLPHQAVWLNDFEYEILMFPETRHDDQVDSTVQYLQWVRNSTSRVAVIRAL >NC_021089.1|WP_015589397.1|1108395_1109346_+|complex-I-NDUFA9-subunit-family-protein MTKRVIIFGGTGFIGKHIVRRLAAEGYLIKIFTRNQEKAACLKLCGNLGQISIFKGDFFDEKSVLDGMEECDVAINLVGILYEAKKHDFYAVHVKIAERIAKAAKMKNVPMMIHFSAMGIENSKLSKYAKSKLEGEKAVTSAFQEAIIIRPSLVFGKEDNFFNKFARLATILPFLPLIGNGTTKFQPICVTDLAEVVYRIISFNKQDKKIYNMGGPKVYSFKSLLKFILNVTNRKCLLVNVSFPMAKLIAFFLENKIISMLLKPITGDTNPMLTQDQVKVMMNSSIEKSVDLETMKVRPLAIENVVPEYLKIYRKY >NC_021089.1|WP_015589396.1|1106815_1108345_+|UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D--alanine-ligase MFKWNTNNIIDATGGRDVNGCNWIHSSNISTDTRSIKKGDLFIALKGRNFDGHNFLHEAFLKGAVAAIVSEGKYKNFPLIIVQDTLKALHDMASYYIRNVLIDAKVIAVTGSVGKTTTKDMLHTVLSQYGVSHANEGNLNNNIGLPLTILKAPKNCQYLILEMGMNKAGEIKELSKISNPNIAVITNIEPAHTENFSSLFDVAQAKLEILYGMKNNGTLVLSRDNKYYDYLSSHANRNVISFGKDKNAEVCLLNLIRNDESSVISALSSVIPVLDYLDPGSSIANEHIRRLYNKDWIPASRAGMTSNRVANRLSLKIRLSDNQIINCNLRVQGEHFAYSLLAVAAVVQSLGLDLSKLPLALKNFSVAKGRGNIHKIKYNRKYIHLIDDSYNASPASMKTAIKTLSTYSNQRKVALLGDMLELGDESIEFHTDLVKIITENNIDKVYTVGKFMLELHELLPDNIRGTHFNDSNQLKSDLANIIQNNDAILVKGSRGMKMDLIVREFVIKY >NC_021089.1|WP_015589395.1|1105852_1106632_-|hypothetical-protein MLTRENEKSTSILAKVGNAASGVGSFLGRGVKVLVKGAIYPIWPKNWFKSWDEMRHDIKNGGRSIIGNPHEEYDPPIKTTQASKDLGVQITEQKKGTGKVSFLASRTLTGDIPYLSPEQLDKIKKDLPNVTIFREENKIVIEVDVKKIIEDIKTDSKNKGKSPEEIKKLALQGIADSINGDLKKLAGITGGEFKIHTDLKLLNGIAEKLYKEYDNQKQSSDKVVKSDVGQPSETIASGEKKWAQEAIKPGKSQSCGMQK >NC_021089.1|WP_006279579.1|1105578_1105836_-|hypothetical-protein MSEAKKIEERHHSLTVPGDMYHLQPGVITGKRVSGIEPFLKEQQDMVKVRELVSSLNLEDASGEAIKPLSTPNVEKNEERGKGRS >NC_021089.1|WP_015589394.1|1105206_1105575_-|HIT-domain-containing-protein MSNEVYDSDNIFAQILRGELPCEKVHENENVLAFHDKYPDAPVHILVIPKNQYISYDDFILKAPEEEIADFFKTVREIAHKYNLEKTGYRLVTNYGENGEQVVPHFHVHILGGKKLGKHVNS >NC_021089.1|WP_006279576.1|1104834_1105188_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-A MSEYLTIVIFICVSIVVSFALGILPMFLAVSKPDGEKLSTYECGFNPLSSARKNFDIKFYLVSILFIIFDLEIAFLFPWAVSLSKISYGGFWSMMVFLAILTIGFIYEWCKGALEWE >NC_021089.1|WP_006279574.1|1104324_1104831_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-B MTNQILSNDDWGRYKKEGFLVTKFGDLTDYVMNWARSGSLWPMTFGLACCAVEMMHTASSRYDLDRYGIMFRASPRQSDVMIVAGTLTNKMAAALRKVYDQMADPKYVISMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDRIVPVDVYVPGCPPTAEALLYGMLCLQNKIKRTRNG >NC_021089.1|WP_007548576.1|1103759_1104332_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-C MDKTAKYIQKKTKCECIQKDDGIIVIYSTLDEIEKHLFFLRDDEKCRFELLVDIFGVDYPNREKRFELIYNLLSIVHNIRVHIKLQLCESDMPPSVAKIFSTALWFEREVFDMYGIEFSDHPDLRRILTDYGFKGHPMLKDFPLTGYEEVRYDIETKKVVYNPIDLPQDFRMFDSLSPWEGKTIKVNTKE >NC_021089.1|WP_007548577.1|1102805_1103756_-|malate-dehydrogenase MTVQRKKISLIGAGNIGGTLTHMIALRELGDVVLLDISDGIPQGKALDIAESSPIDGFNVNITGTNRYEDIKNSDAIIITAGIARKPGMSRDDLLQTNAKVMKEVGENIKKYSPNAFVIVVTNPLDAMVSVVHKFSNLPTNMIVGMAGVLDSSRFRYFLASELNISVEDISAFVLGGHGDTMVPLINCASVAGVPLTQIIDMGLITQKKVDEIVERTRNGGKEIVDLLKSGSAYYAPASSAICMLESYLKDKRRILPCAAYLNGEYGVEELFIGVPVIIGKNGIEKILEVKMNDSEQEMFNKSVNSVRELVKSLGS >NC_021089.1|WP_015589399.1|1112237_1114688_+|type-I-DNA-topoisomerase MALLIVESPAKAKTIGKYLSKEFKVAASFGHVRDLPAKNGSVDPDNDFAIKYETIEKAEKYIKELVKAASKTSDIYLATDPDREGEAMAWHVIETLKEKKAISNENNIYRVVFNEITKRAVQEAIKNPREINMDLVRAQQARRALDYLVGFSLSPLLWTKLSGSKSAGRVQSVALKIICEREDEISKFITQEYWSIKAEMQNSKDEAFFAMLSHYDNKKLEKFDIKNEEEAKNLVREIESRQYAVSTVERKQVKRNPLPPFITSSLQQDAVNKLYFNVKSVMRIAQNLYEGIDIGGETVGLITYMRTDGFHIADEAINSIRGSIKSLYGDKYLPQSPRKYVKKVKNAQEAHEAIRPTDINRTPGSIKDYLTPEQFKLYDLIWKRTIASQMESAIFDQVVVEISSTDQKVILRASGSSIFFDGFYRVYQDNIEAENEGLLPAMKEGEACKLISVEPKQHFTQPPPRYSEASIVKKMEEIGIGRPSTYATIISVLQDREYVSLDSKRFIPSSRGKIVTIFLETFFQRCVEYDFTAQMEEKLDLISNGHADWKKELGHFWVPFFGHVNSVKQMTHDEVFSGIHDLVIDWFCSEEGKKEVNTKCPACSDGILKLNFGKAGVFLGCSNYPECNHTKEITGSNDNSEYPKSLGIDDITNQEVMIKKGPFGLYLEFNNELKKKKTVSIPKDINVNEIDLSTATQLLSLPKVIGEHPETGKEVKIGLGRFGYYIFYDGRYFSLKKSSKEVLNRELSEVVQIIANSPCKELKSLGVNEKGKEVFICNGRYGFYIKCGKTNVALGKSADIESIDLEKALELIKNKK >NC_021089.1|WP_015589400.1|1114745_1115804_+|hypothetical-protein MIFYTQGDTPALCRLDYTDVSKLVGIPNITRLDLTECKISVEVARELAKLINLTSLHLGKCKISVEVARELAKLINLTSLHLAGCKISVGVAKELTKLTNLTSLHLGQCKISVGVAKELTKLTNLTSLHLGQCKISVGVAKELTKLTNLTSLHLAGCEISVEIVKELAKLKNLTSLHLAGCEISVEIVKELAKLKNLTSLHLAGCNIGVEVAKELTKLTNLTSLNLIGCKISNEVAKELDKLKKNLPSLNIIGYKISGKGANVKLQDEVSNSQEKLKSSSKYYICGATVGLVIGLVAAYCLGAAALTPVGVSVAAFIASAVVGALLGAGVGYAVSTYLESTELNNMQPRRSC >NC_021089.1|WP_015589401.1|1115845_1116652_-|rhodanese-related-sulfurtransferase MSFVIATFYHFVELSNYYDMKDEIKATCNNVELKGTILLAEEGVNATISGERNAIDKIFDFLRSDYRLRDLTWKESAAEYQPFSKMKVKLKREIVNLGVSNLDISLKGKYVDPEHWDDFTSQPDVLVIDTRNEYEVKLGKFKNAINPHTQCFREFPQWTESFSESKDLKVAMYCTGGIRCEKSTAYMKNLGFNDVYHLKGGILSYLEKTHNKNDNWEGECFVFDDRIAVDNSLTPSNTIKCILCSNQVSTDKLKSVPRGQVVCFNCKL >NC_021089.1|WP_015589402.1|1116781_1118380_+|iron-ABC-transporter-permease MFLRVFKNIFLFLVSILFVCPILSLISILFTDTANSGWVISTLFPEYILSTLILMIGVGGISFIFGVIPAWLTTFFSFPGSKIFEIALFFPISIPGYIVAFVYVNTLEFSGPVQSSLRDILEWSKGDYWFPEIKSLGGGILVMGFSLYPYVYMLVRSSLKNVSNSVTIASTLGFSSLKSLFSVIIPSIRPSIIAGLSLVLMEVITDFGTPQFLAIDTFTTGIYRTWFLLHDKYSTTVLAVAELIFVVILIAIEKKLQKKGISYSSINTNSDYHNKRSISGAIPLIFAYLMCVLPILIGFILPMIPLIYWSIEKGFFIYEARFYNIIANSISLSFITALISISIAIMIGYTARKNKVINNIARLISLGYAIPNAIIAISIIIFLSRISSFITQYVVEISLVGTIGALVYSYLFRFFAISFKAVESGLKKTPNEIEWTAYTMGHGPISTCLNVHIPLIKKSILSGFLLVFMDTIKELTATLIIRPFNFETISTRIYELVSDERYREAAPFSLIIVIIGLISTITLFTLDDKDKK >NC_021089.1|WP_015589403.1|1118390_1119284_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MALSKFLDPRNDLCFKKIFGTEKNKNILTHFLNDILGFTEINAIQEVEFLSTIMDPEVASDKQSIVDVLCKDSHGNRYIAEMQLARDKGFEKRAQLYAAKAYSRQLDKSGNYIDLKKVFFIAISNCNLLPEEVDYISTHNIRDIKTNGHYLKDFQFVFIELPKFAKNKVEQLESIVERWCFFFKYAEETTEEDLKEIAEKAPIIKLAYDELDKFRWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLAEEKGIQKGIEKGKIEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSGNL >NC_021089.1|WP_174516854.1|1119518_1119920_-|Co2+/Mg2+-efflux-protein-ApaG MLEYTLTTNFVEVTVLPIYIEEQSIPYENCYVWMYNVKIKNKSQSTIQLLSRHWQIIDYKGKVNEIAGVGVIGEQPVIKSGEVFKYTSGTYLNAPSGIMQGKYEFLNEESIKIFEVMIPPFSLDSPYVKTRPH >NC_021089.1|WP_015589405.1|1120019_1121084_+|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-synthase MNEPDALSKKVIGIIGGGQLGKMTAIAATKLGQKTHVFASAKDDPACSVADDFTIADFSDKKALESFAQSVDLVTIESENIPCSAINIDVNFYPGKKALHIAQNRLREKDFIRSLSIKTAEYKSIQNYNELLESSRAFGYPTRLKTTEMGYDGKGQYVLENDSEVKQFASFDWNTEYILEASVDLLKEVSIVVARDKNGKVAFFPIAENYHVDGILDTSTVPAKIDSKLTQEVQRAAKKIANALDVIGILAIEFFVTKDNELLVNELAPRPHNSCHWSLDACNVSQFEQLVRIICGLPMQEVVLRFPCMTKNTIGNDIYDSHKYLSNEKASLTIYGKKEVRDKRKMGHVNIDLS >NC_021089.1|WP_015589406.1|1121823_1123017_-|2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate-cytidylyltransferase MCAKKYKIAALIVAAGVGSRCNSTIPKQYIKLAGKSVLFHTIKRFLANQYIDYIRIAINRDHESFYEKAISLITDTKLLSPVYGGENRQSSVKLGLESLQKVNPDFVVIHDACRPFVSDVLIDNLVESMINDQYTGVVPAIEVEDTMSLVSNSFIESTISRGKLRAIQTPQIFNFKELLSCHQSVKEFTDDSSLMVEHKKHVAIIKGEKSNFKLTTKEDINMAKLLFEEPKFRVGAGYDIHKFIKVQNGAESFIKICGVKIEHNMAIEAHSDGDVAIHAIVDAILGALGYGDIGEHFPPSSSEWKDCNSSHFLDFAAKKAKEKGYSVSNLDITIVCEEPKISPYKVEMKKFISKALEIDDEFVNIKATTAEKLGSLGRNEGIAVHASVLLHTNFYWK >NC_021089.1|WP_015589407.1|1123280_1124345_+|AI-2E-family-transporter MQKRHITICFILLFIIGMLFLMRPMIFPCLISIIIAYLFNPLVVKFEKYRIPRSCSVIFIILILLIAFILVITFVLPIIYVQITSILNFLVSKVPSLKLKVIPSVLEFLNIKIEDSLFDHLSKNLAENYSNYVSYFMNALDIASNFIIQVLSSSFNTVPLMVITPVVFFYILRDWPLIIEKANKLIPIPYRGKIADYFSKVDFIISNYLKGQVNVCIVMMVFYSVSLSIIGLEHSIVIGILSGMLTFIPYVGPLLYTIIGFLSAITQFSGWFESAAVLLLFGVGQLIDSNILVPLLIGKKVHIHPTVIILGITICASYFGFTGILLFIPIIAMFNVSVEYAINKYFKSELYKNG >NC_021089.1|WP_006280257.1|1124474_1125110_+|chromosomal-DNA-replication-initiator-DnaA MQLNLFNNNQADYSRQNYIILDENKHVYNSVVNDLSWKCLILFGPKSSGKTHLAHIWQSINDAIFINVNNFVSEIRYSDAFILEDVQNIKDEAMLLHCYNYMKENDKRLLITSSISPKKLNFKLRDLSSRILSTISVKILPASEELLRIMLIKRFSDKQLKIDLKVINYILARIERSFYSIDKIIEKIDNESIGSNVTVPFISTLLKKDAI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021089_16 | 1121186-1121292 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_16
|
1 spacers
spacers of NC_021089_16
>16.1|1121223|33|NC_021089|CRISPRCasFinder GGGTGTCATCCGAGTAGCCCCTTTCTCGTCATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_16
The CRISPR arrays of NC_021089_16 >merge|NC_021089|16|1121186-1121292|CRISPRCasFinder CCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCATTTTACTTTATGAGGGTGTCATCCGAGTAGCCCCTTTCTCGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCATTTCACTTTATGA >NC_021089|16|15|1121186-1121292|CRISPRCasFinder CCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCATTTTACTTTATGA GGGTGTCATCCGAGTAGCCCCTTTCTCGTCATC CCGCTGCTTGTTAGCGGGATCTCATTTCACTTTATGA
>NC_021089.1|WP_015589405.1|1120019_1121084_+|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-synthase MNEPDALSKKVIGIIGGGQLGKMTAIAATKLGQKTHVFASAKDDPACSVADDFTIADFSDKKALESFAQSVDLVTIESENIPCSAINIDVNFYPGKKALHIAQNRLREKDFIRSLSIKTAEYKSIQNYNELLESSRAFGYPTRLKTTEMGYDGKGQYVLENDSEVKQFASFDWNTEYILEASVDLLKEVSIVVARDKNGKVAFFPIAENYHVDGILDTSTVPAKIDSKLTQEVQRAAKKIANALDVIGILAIEFFVTKDNELLVNELAPRPHNSCHWSLDACNVSQFEQLVRIICGLPMQEVVLRFPCMTKNTIGNDIYDSHKYLSNEKASLTIYGKKEVRDKRKMGHVNIDLS >NC_021089.1|WP_174516854.1|1119518_1119920_-|Co2+/Mg2+-efflux-protein-ApaG MLEYTLTTNFVEVTVLPIYIEEQSIPYENCYVWMYNVKIKNKSQSTIQLLSRHWQIIDYKGKVNEIAGVGVIGEQPVIKSGEVFKYTSGTYLNAPSGIMQGKYEFLNEESIKIFEVMIPPFSLDSPYVKTRPH >NC_021089.1|WP_015589403.1|1118390_1119284_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MALSKFLDPRNDLCFKKIFGTEKNKNILTHFLNDILGFTEINAIQEVEFLSTIMDPEVASDKQSIVDVLCKDSHGNRYIAEMQLARDKGFEKRAQLYAAKAYSRQLDKSGNYIDLKKVFFIAISNCNLLPEEVDYISTHNIRDIKTNGHYLKDFQFVFIELPKFAKNKVEQLESIVERWCFFFKYAEETTEEDLKEIAEKAPIIKLAYDELDKFRWNEKDLVAYEERIMDLRKEEAILEYRLDLAEEKGIQKGIEKGKIEGKIEVAKAMLANNVDVNTIVKFTGLSISEIEELSGNL >NC_021089.1|WP_015589402.1|1116781_1118380_+|iron-ABC-transporter-permease MFLRVFKNIFLFLVSILFVCPILSLISILFTDTANSGWVISTLFPEYILSTLILMIGVGGISFIFGVIPAWLTTFFSFPGSKIFEIALFFPISIPGYIVAFVYVNTLEFSGPVQSSLRDILEWSKGDYWFPEIKSLGGGILVMGFSLYPYVYMLVRSSLKNVSNSVTIASTLGFSSLKSLFSVIIPSIRPSIIAGLSLVLMEVITDFGTPQFLAIDTFTTGIYRTWFLLHDKYSTTVLAVAELIFVVILIAIEKKLQKKGISYSSINTNSDYHNKRSISGAIPLIFAYLMCVLPILIGFILPMIPLIYWSIEKGFFIYEARFYNIIANSISLSFITALISISIAIMIGYTARKNKVINNIARLISLGYAIPNAIIAISIIIFLSRISSFITQYVVEISLVGTIGALVYSYLFRFFAISFKAVESGLKKTPNEIEWTAYTMGHGPISTCLNVHIPLIKKSILSGFLLVFMDTIKELTATLIIRPFNFETISTRIYELVSDERYREAAPFSLIIVIIGLISTITLFTLDDKDKK >NC_021089.1|WP_015589401.1|1115845_1116652_-|rhodanese-related-sulfurtransferase MSFVIATFYHFVELSNYYDMKDEIKATCNNVELKGTILLAEEGVNATISGERNAIDKIFDFLRSDYRLRDLTWKESAAEYQPFSKMKVKLKREIVNLGVSNLDISLKGKYVDPEHWDDFTSQPDVLVIDTRNEYEVKLGKFKNAINPHTQCFREFPQWTESFSESKDLKVAMYCTGGIRCEKSTAYMKNLGFNDVYHLKGGILSYLEKTHNKNDNWEGECFVFDDRIAVDNSLTPSNTIKCILCSNQVSTDKLKSVPRGQVVCFNCKL >NC_021089.1|WP_015589400.1|1114745_1115804_+|hypothetical-protein MIFYTQGDTPALCRLDYTDVSKLVGIPNITRLDLTECKISVEVARELAKLINLTSLHLGKCKISVEVARELAKLINLTSLHLAGCKISVGVAKELTKLTNLTSLHLGQCKISVGVAKELTKLTNLTSLHLGQCKISVGVAKELTKLTNLTSLHLAGCEISVEIVKELAKLKNLTSLHLAGCEISVEIVKELAKLKNLTSLHLAGCNIGVEVAKELTKLTNLTSLNLIGCKISNEVAKELDKLKKNLPSLNIIGYKISGKGANVKLQDEVSNSQEKLKSSSKYYICGATVGLVIGLVAAYCLGAAALTPVGVSVAAFIASAVVGALLGAGVGYAVSTYLESTELNNMQPRRSC >NC_021089.1|WP_015589399.1|1112237_1114688_+|type-I-DNA-topoisomerase MALLIVESPAKAKTIGKYLSKEFKVAASFGHVRDLPAKNGSVDPDNDFAIKYETIEKAEKYIKELVKAASKTSDIYLATDPDREGEAMAWHVIETLKEKKAISNENNIYRVVFNEITKRAVQEAIKNPREINMDLVRAQQARRALDYLVGFSLSPLLWTKLSGSKSAGRVQSVALKIICEREDEISKFITQEYWSIKAEMQNSKDEAFFAMLSHYDNKKLEKFDIKNEEEAKNLVREIESRQYAVSTVERKQVKRNPLPPFITSSLQQDAVNKLYFNVKSVMRIAQNLYEGIDIGGETVGLITYMRTDGFHIADEAINSIRGSIKSLYGDKYLPQSPRKYVKKVKNAQEAHEAIRPTDINRTPGSIKDYLTPEQFKLYDLIWKRTIASQMESAIFDQVVVEISSTDQKVILRASGSSIFFDGFYRVYQDNIEAENEGLLPAMKEGEACKLISVEPKQHFTQPPPRYSEASIVKKMEEIGIGRPSTYATIISVLQDREYVSLDSKRFIPSSRGKIVTIFLETFFQRCVEYDFTAQMEEKLDLISNGHADWKKELGHFWVPFFGHVNSVKQMTHDEVFSGIHDLVIDWFCSEEGKKEVNTKCPACSDGILKLNFGKAGVFLGCSNYPECNHTKEITGSNDNSEYPKSLGIDDITNQEVMIKKGPFGLYLEFNNELKKKKTVSIPKDINVNEIDLSTATQLLSLPKVIGEHPETGKEVKIGLGRFGYYIFYDGRYFSLKKSSKEVLNRELSEVVQIIANSPCKELKSLGVNEKGKEVFICNGRYGFYIKCGKTNVALGKSADIESIDLEKALELIKNKK >NC_021089.1|WP_015589398.1|1110394_1111846_+|phage-terminase-large-subunit MNFLKFIELCFQTVVPGCEYNDYQYIKVIADRLEAASAGEVKRIIFNMPPRSMKSMCISVAWPAWILGNQPTARIIVASYSQRLSEKHSLDTRCVMQSSWYRALFPEIELSKDQNTKYKFQTVQRGYRIATSVGGTLTGEGGDFIIVDDPLSSAQALSETLRKRATNWFDQTLVTRLNDRKKGVIVLVMHRLHQEDLTGHLLSKPKNIWHHICLPMISENKQVIYSIKKPIPPVPIIRVAQHCATRRLYNKPASPVRILYSREEGQLLYPLDGGKEEVEIIKAELGSYAFAAQYQQNPLPLSSGIIKPEWLKRYKKFPDNLSHITQSWDTAVSTSNMSNFSVCTTWAKIDNKFYLLDVYRAKLEYPKLKEQVLSLAARWTPHAILIEAKTSGQQLVQELKTNSDLPIIEIVPHDDKLTRFHQIVPIIESGKVFLPHQAVWLNDFEYEILMFPETRHDDQVDSTVQYLQWVRNSTSRVAVIRAL >NC_021089.1|WP_015589397.1|1108395_1109346_+|complex-I-NDUFA9-subunit-family-protein MTKRVIIFGGTGFIGKHIVRRLAAEGYLIKIFTRNQEKAACLKLCGNLGQISIFKGDFFDEKSVLDGMEECDVAINLVGILYEAKKHDFYAVHVKIAERIAKAAKMKNVPMMIHFSAMGIENSKLSKYAKSKLEGEKAVTSAFQEAIIIRPSLVFGKEDNFFNKFARLATILPFLPLIGNGTTKFQPICVTDLAEVVYRIISFNKQDKKIYNMGGPKVYSFKSLLKFILNVTNRKCLLVNVSFPMAKLIAFFLENKIISMLLKPITGDTNPMLTQDQVKVMMNSSIEKSVDLETMKVRPLAIENVVPEYLKIYRKY >NC_021089.1|WP_015589396.1|1106815_1108345_+|UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D--alanine-ligase MFKWNTNNIIDATGGRDVNGCNWIHSSNISTDTRSIKKGDLFIALKGRNFDGHNFLHEAFLKGAVAAIVSEGKYKNFPLIIVQDTLKALHDMASYYIRNVLIDAKVIAVTGSVGKTTTKDMLHTVLSQYGVSHANEGNLNNNIGLPLTILKAPKNCQYLILEMGMNKAGEIKELSKISNPNIAVITNIEPAHTENFSSLFDVAQAKLEILYGMKNNGTLVLSRDNKYYDYLSSHANRNVISFGKDKNAEVCLLNLIRNDESSVISALSSVIPVLDYLDPGSSIANEHIRRLYNKDWIPASRAGMTSNRVANRLSLKIRLSDNQIINCNLRVQGEHFAYSLLAVAAVVQSLGLDLSKLPLALKNFSVAKGRGNIHKIKYNRKYIHLIDDSYNASPASMKTAIKTLSTYSNQRKVALLGDMLELGDESIEFHTDLVKIITENNIDKVYTVGKFMLELHELLPDNIRGTHFNDSNQLKSDLANIIQNNDAILVKGSRGMKMDLIVREFVIKY >NC_021089.1|WP_015589406.1|1121823_1123017_-|2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate-cytidylyltransferase MCAKKYKIAALIVAAGVGSRCNSTIPKQYIKLAGKSVLFHTIKRFLANQYIDYIRIAINRDHESFYEKAISLITDTKLLSPVYGGENRQSSVKLGLESLQKVNPDFVVIHDACRPFVSDVLIDNLVESMINDQYTGVVPAIEVEDTMSLVSNSFIESTISRGKLRAIQTPQIFNFKELLSCHQSVKEFTDDSSLMVEHKKHVAIIKGEKSNFKLTTKEDINMAKLLFEEPKFRVGAGYDIHKFIKVQNGAESFIKICGVKIEHNMAIEAHSDGDVAIHAIVDAILGALGYGDIGEHFPPSSSEWKDCNSSHFLDFAAKKAKEKGYSVSNLDITIVCEEPKISPYKVEMKKFISKALEIDDEFVNIKATTAEKLGSLGRNEGIAVHASVLLHTNFYWK >NC_021089.1|WP_015589407.1|1123280_1124345_+|AI-2E-family-transporter MQKRHITICFILLFIIGMLFLMRPMIFPCLISIIIAYLFNPLVVKFEKYRIPRSCSVIFIILILLIAFILVITFVLPIIYVQITSILNFLVSKVPSLKLKVIPSVLEFLNIKIEDSLFDHLSKNLAENYSNYVSYFMNALDIASNFIIQVLSSSFNTVPLMVITPVVFFYILRDWPLIIEKANKLIPIPYRGKIADYFSKVDFIISNYLKGQVNVCIVMMVFYSVSLSIIGLEHSIVIGILSGMLTFIPYVGPLLYTIIGFLSAITQFSGWFESAAVLLLFGVGQLIDSNILVPLLIGKKVHIHPTVIILGITICASYFGFTGILLFIPIIAMFNVSVEYAINKYFKSELYKNG >NC_021089.1|WP_006280257.1|1124474_1125110_+|chromosomal-DNA-replication-initiator-DnaA MQLNLFNNNQADYSRQNYIILDENKHVYNSVVNDLSWKCLILFGPKSSGKTHLAHIWQSINDAIFINVNNFVSEIRYSDAFILEDVQNIKDEAMLLHCYNYMKENDKRLLITSSISPKKLNFKLRDLSSRILSTISVKILPASEELLRIMLIKRFSDKQLKIDLKVINYILARIERSFYSIDKIIEKIDNESIGSNVTVPFISTLLKKDAI >NC_021089.1|WP_007549057.1|1125315_1125486_+|hypothetical-protein MIRVRLNLRKRLKQKFVMFTLLINALFVSYFLIRNTGNTSNQIIAKEINIGTDNEK >NC_021089.1|WP_015589408.1|1125475_1126462_+|tyrosine-recombinase MKNKQSQNKKENLYITYYIDALASERFAAQNTLESYRSDLHQFEEFLLESGTTLVGVNKTNIKDYVKSLCTQKKYKSSSISRKISAMKNFYKCLFNDGIIDFNPAPANDAELKNPKVSRPLPKYLSVEEIFLLMDTVRKSASESNKEISSKRLCAILDILYSSGMRVSELISMKLCEVSHLINSNNKECYIIIKGKSGRERQILFNEQALQSLRNYLSVRDNLISKEKESDWLFPGDKPNKPITRQRLGQLMKELARKCNIDENEISPHVIRHSFATHLLNSGANIVLIQKVLGHTNLSTTQIYTHIANEKLKDKLADSHPITQMINN >NC_021089.1|WP_010963063.1|1126517_1127243_+|1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate-acyltransferase MISSLLFNFFLILWEVFYTFITLPVIFFSECVITIFLVCSVRVVLFMLRLLCGIKYEVRGMENIPKQPFIIASKHQSPFETFIFILLFRKAVFILKRELKWIPFIGLHLIALKMIFINRSDGISSIRHIIKLAKMRIKENRSIIIFPEGTRTTINQNIKYQPGIAALYSVLSVPVLPVALNTGLFWPKSILSLRKNPGKAVIEILPPIYPGLNKNEFLQSLEKIIEERSSRLTIGKTDIAN >NC_021089.1|WP_012673338.1|1127294_1127564_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANHKSAKKMIKVIAKRTLINKMRKSKTRTSIRKLVDIIKSGDKENVVLAFRNAESNLHKCVNKGVIHRNTAARKISRLNAKVKALMTA >NC_021089.1|WP_015589409.1|1127644_1128895_+|citrate-synthase MDKKVLLELSNGLKIELPVLSGTTGPDVLNIKDLYKMTGLFTYDPGFVSTASCSSTITFIDGDEGVLKYRGHNIADLAENNNFTAVIYLLLYGELPSSEQHKKFLLKIQESSKVSEQVTNVIKAFPKTAHPMSILVACFASLSASYHEKHGNNVNGEDLDFGISAIAQVSTIIAMIYRHINNQEFINANNELSYSENFLKMIFGDAVDNDKSALFAKALDKIFTLHADHEQNASTAAVRLVGSAGSNLFASLSAGVATLWGPAHGGANEAVINMLKEIEQSGDIDKFIEKAKDDKDPFKLMGFGHRVYKNYDPRARILKGACHEVLSKLEQNNELLKIAKKLEEIALKDEYFIVRKLYPNVDFYSGIIMNAIDIPSNMFTPIFALARTTGWVTQWYEMINDKETKICRPRQLYFGK >NC_021089.1|WP_015589410.1|1131340_1132867_+|acyl-CoA-carboxylase-subunit-beta MQDFKILENLKTKALEAEKGGGSDRITKQHEKGKLTARERLSILLDESSFAEYDKFVKHHANDFGMQNANFLGDGVVIGHGTIYGRKVFVYSQDFTVFGGSLGASHAKKICKIMDMAINARVPIIGLNDSGGARIQEGVNSLAGYGEIFQRNVNASGVIPQISLIMGPCAGGAVYSPALTDFTFMVKNSSYMFITGPDVVKKVTYEDVSFEDLGGAKIHTSKTGVADFAFNNDVEMLLKMREFFTFLPANNQESPKSAPICNDVDDIDESLNTLIPTNPNTPYDMYELIEKVCDERNFFELKPDFARNIITGFGRIGGNTVGIVANQPMHLAGCLDIDSSRKAARFVRFCDAFNIPIITLIDVPGFLPGTNQEYNNIIQHGAKLLYAYAEATVPKISLITRKAYGGAYIVMNSKHLKGDINYAWPTAEIAVMGPESAVEIIFRHEKDQQTLIKEYKEKFANPFFAASYGYIDDIIVPSKTRYHFCKALELLKNKKVERIWKKHDNLPL >NC_021089.1|WP_015589411.1|1133240_1134056_+|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVEVISNFLLDKIKNKQISNVIVNNWNLRAPITKNIDDMLKGKVIRNIKRRGKYTIWNTDGSVAVIIHLGMSGKLIYADHDQMRNKHDHVVFLFSDNTSIIFNDPRRFGLVIVLNKEQETDFFSDFGIEPLTDEFSGDYLQELLKNKKVNIKSALMDNKSIVGVGNIYASESLFRACISPLRSAKNLTYRECEKLAAEIKNTLSDAIAAGGSTLKDYAQPSGSAGYFQNNFYVYGKVQKPCKICNNIITLIRQNGRSTYFCNACQN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021089_17 | 1232689-1232796 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_17
|
1 spacers
spacers of NC_021089_17
>17.1|1232713|60|NC_021089|CRISPRCasFinder CTAAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCATAAAGATAAGTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_17
The CRISPR arrays of NC_021089_17 >merge|NC_021089|17|1232689-1232796|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGGCTAAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCATAAAGATAAGTCTCGTCATCCCGCTGCGTGTTAGCGG >NC_021089|17|16|1232689-1232796|CRISPRCasFinder CGTCATCCCGCTGCTTGTTAGCGG CTAAGAGATACCGCGAATGAATCGCGGTATGACGGTTCGCGGCGGCATAAAGATAAGTCT CGTCATCCCGCTGCGTGTTAGCGG
>NC_021089.1|WP_015589473.1|1231035_1232139_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MLKEFEIEPLLKDKAPHQTKAVVAMSGGVDSSVAAALLYNFGYQVIGVTLQLYGTDGARKGACCAGQDIYDAKRVAESVGFPHYILNYEEIFKKEVIEDFASTYMRGETPIPCVRCNQTVKFRDLLQVTKNLGADVLVTGHYVRRLEKNGEVKLCRSIDKSKDQSYFLFATTQEQLKLLRFPLGGFYKSDIRKLAKYFGLQISEKPDSQDICFVSESYSKTIAKLAPQSVQKGKIVDVNGKVLGEHSGIVNFTVGQRKGLGIAHNEPLYVIKINTENNEVIVGPINVLMQKKILIKELNWLEQPKEGMEVTVKLRSSHAGSLATIHSTDEKNKACVILNDDYFGISPGQACVAYKDEQVIGGGWICS >NC_021089.1|WP_015589472.1|1229756_1230833_+|rod-shape-determining-protein MNFVRKLTEKFCSLFTFKGLFASDIAIDLGTANTLVYQKNQGIVLDEPSVVARIKEKGSYVPYAFGKKAKMMLGKTPGEIEAIRPLKDGVIADFKSAEEMLKYFIRSANTKFTVNKPNIIICVPSGSTPVERRAIQDAAESAGANEVFLIEEPMGAAIGAGLPVTEPEGSMIVDIGGGTTEVAIISLGGIVYSRSARVGGDIMDEAIKSYIRENHKLLIGETTAEKIKKSIGSANLPGENNKEGMIIKGRDLVSGMPKEMLLSEYQVAESLIEPVHQIISAIRTALESTPPELSSDIVDKGIILSGGGGLLRNLGKVISETTKLPVRVADDPLCCVALGSGKVLENMDYFGHVLFKQD >NC_021089.1|WP_015589471.1|1228311_1229733_+|Thermostable-carboxypeptidase-1 MKSYKFLEEVLYRVKNIENTLKVLNQSQLNAEDKVEQMSLLEEIRHEIISHDVIKESLADALDNKKSADAWQLKLIERIHKSNSAVPIDLVKSLSKAKVECQSLWRLNNSEASNLEKLKERFTDLITLIREVASIKSQQLKCSKYDSLLADYDSDITEKNIREVFPKVGKFFSGNVDKIIEKQKKDKVTNIQKVATQKQIELGSSCLQQMGVALHEVRTSYYYPIDYDESDFCYGLFSLLRHSGYAIYQKCLAQNSISSPITRHVMYETQGLFMERMIGTSREFIEFIQPHIKEKFAIKGKTNEKVSSVENLYLIFNEINLSSFLKNADEFSLLAHIMLRTRLEQDIINGTLEVKDLHDAWLEGMKHYKIPVKAENELNTYFQDEYWASGVMGYFPIKIIALIAAVQIFSCVKKNHYESLSAIIKGDFSLLISWLSQNIYSAKCGLELLKKVTGKGLDVECCISYLSGKYNLS >NC_021089.1|WP_010081889.1|1227556_1228036_-|OmpA-family-protein MWSRLVIMCCFCLLLTGVSSCPKKGANTTNKINSVVKQIGDKRVFFGYDESSIAEVSADALLDVMEVLQDNPDAKVTLTGHTDNRGSHEYNLALGARRADAAKKFMVSCTPYIENRIKTASKGETEPLVNVKDDSRNSKYEKEHAKNRRVEFSFSGIKK >NC_021089.1|WP_015589470.1|1226083_1227379_-|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MELELLFQNVVNSFAFYNNQVAVAVSGGVDSIILLHLMNNWAKKNKLPLPIALTVNHGLRSESQKEADFVVSYAKELGAKESFILNWEKQNIKGNIQLQARKARYKLLAEWCKNNNVKYLLVAHHKDDQAETFLLRLERGSGVDGLSSMDYKSFLNGIYIFRPLLNFSRSEIEKYAKLHRLKWIEDRSNYDLKYRRTLYRNLLKASDNQEILTERICLTALHMKRAAKALMHYTRLAFNDCVNVHDLGYIEIKLSEFYQLPEEIALRLLLYSIMAIASKHYKPRYNSLIVIFNKILQKDSNVNCTLSGCKIRKHGENILIIRESSKIQEITLNLPLNEPTQWDNRFSCTILGNQECSVIIAPLKKTQKVPEFLKDYNCCPEVFYSLPVVLKDGKVLAYPDVNYNGKNTNDDKVQCIINSTIKQNLVSLISI >NC_021089.1|WP_012673393.1|1224232_1226071_-|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MKKFLEGLLIWLVIIVLISVAYIQFSGNVGKSKTIIPFSEFLTRLEDNDVENIVIKNQSIEGKFRDGSSFNSSGVIYSDLIKNLHDRKVRFSFSTGDSAMNVIGGLLISWVPTFIFIGFLLFFLKQTQAGGNRTISFGKSRARLMTSGKKVTFDDVAGIDEAKEELVEIVDFLKQRQKFQILGGKIPKGCLLIGSPGTGKTLLARAIAGEANVPFFSISGSDFVEMFVGVGASRVRDMFDQGKKNAPCIIFIDEIDAVGRHRGIGLGGGNDEREQTLNQLLVEMDGFESNEGVIIIAATNRPDVLDPALLRPGRFDRQITISLPDINGREKILNTHIKKISIAPDVNVKTVARGTPGFSGADLANLVNESALIAARRNKKIVTMDDFEYARDKVMMGVERRSLIMTEEEKRLTAYHEAGHAMIAVNMPASDPIHKATIIPRGRALGLVMRLPETDRVSLTREKMLADITVAMGGRVAEELIFGYDKVTSGASSDIKQASDLSRAMVTKWGMSDKIGPIYHNREQTIHGSEIISEDTLKLIDEEVKKVVSSCYEKAKDILTKHKKGLDLIAENLLEFETLTGDEIKDILNGKKIVREENEKNEKIKKSSLYES >NC_021089.1|WP_007548786.1|1223409_1224078_-|hypothetical-protein MIDIASIGVSTVIDQNYRRKAQLCLSGLFVTVSIATVTWFIFPASQNVLAPFLLPAMFLLFTLSMGYYMFIFSCEEKSLVKNVLGMVEPAESVKRVHCQENIKSLLAEVRSTTKDRFRNVLVNLCFEDRSKAHKLALYVKEIDNIVSSIKNKDLLDHFDQFFTITEVSNKKNRSELMNLARAYKMISEEDPDKIQDFLATQTKSYSYEIMLPEIDNFLSQAR >NC_021089.1|WP_015589469.1|1222826_1223417_+|dTMP-kinase MFITFEGIDGSGKTTQSKLLANHFKQIHGENNVVLTREPGGTNFAEKIRGVLLTNNIDPISELLLLISMRREHMKKLILPALAEGKIVICDRFIDSTIAYQGYGLSVDLGLIRDLHKLVEIKCPDITFILDIDVKVGLNRAKDKNKYEEMDVNFYNKVRKGFQEIAIKEPVRCSVITGIETKNDNHVHNEIIDKIT >NC_021089.1|WP_015589468.1|1222145_1222718_-|thioredoxin-family-protein MVALNTPKVDFSFTAKDFNLLGVDNKYYTLSDCCGKNGLIVMFICNHCPYVQSIISNLVSDVDQLKKDYQVNTIAIMPNDVNEYPEDSFENMINFAKENKFTFPYLIDSTQKIAKEYGAVCTPDFFGFNSNLNLCYRGRFNNAKKEKVQSYEVGSSDLFQAMKFIAETGNSPIDQKSSIGCSIKWSNSTG >NC_021089.1|WP_015589467.1|1220421_1222140_-|cation:proton-antiporter MHSGSQHLFDIIILLSAAVFIVIAFWKMNISPVLGYFVAGAVIGSHGFNLIHSAEAMDNLAEFGVVFLLFIIGLELTFERLIAMRIHVFGFGSLQVIVTMVAIWCIALAFGVNTNIATVIGGGLALSSTAIVLQVLQEKGSQASQVGRLSIAVLLMQDFAVVPLIVLVPLLTGNSEHSLISSLAGSLVQAAIALVLIFITGRLLLRPLFSVIAKMESNEIFISTTLLIVLGAAFITEQFHLSLALGAFVAGLLVAETEYRHSVEHAVLPFKDLFLGLFFMTVGMSINTELLLNKLPLITLLSIILIVLKTSIIYILCRFFGFKSAPAIQAGLLLSQGGEFAFILFRLADELNVLPSEIAQVLMMVTTVTMAFTPLLSGLGDWIANSFSTEKTILDDEAVETDTQDLHNHVIVAGFGRVGYMVTKMLTAEHLSYVVVDIQSKIVKEGKSDSFPIYLGDVTRCEILKSVGIERAQALVISIKNEVTIKKVVSLVAANFPHVNIVIRLPDLSNVEVYRDLGASKIIPETSEIGLQLGGAALSLSGISESGVMSLKSRFRKGNYSMLKDLGSDKDE >NC_021089.1|WP_015589474.1|1232934_1234158_+|hypothetical-protein MIKEIEELIKIVGKGNLLETLFIFLGSFQHADLGRFMDHRNHFGLSEFIRKKEEPLDKYFNLKFSLQGLFLIYAQAYQILSENNNLNTKDVIDKIYEVIKGSELNEYINEVVDGRKLDLLNILANPKREPIFKTEEDFENKVLIGLRKLLSEGNTLNKYDREFALNKCVIGCYYSIHNIKVDKDIALLFSIGSYYKELSPSNKTVRREVLEICENQLIENYIVHLASKLHMIGLSSRDKYTIDHENVDRQEKALKMDGLTCPINTKNTLEQLLKNQNSDEFEQLVMSPENIYYSVLPEENEYRPNLITSKKKEKDYKNTVCKLILGMFILSVGLSVADYFLMEQKLLNSIKNVLPQDNLTNLIIGAVLTIVIVYALFQLLKPPQEPPLSTVNKMMNENLGPLHAKQA >NC_021089.1|WP_012673395.1|1234220_1234736_+|inorganic-diphosphatase MDLSKITAGPNAVNVVIEISANAEPVKYEFNKEFGLLQVDRFLSTSMTYPCNYGFIPNTCAGDGDPVDVLVLTQFPLASSVLISVRPIGALLTKDEKGEDEKILAVPVSSVDSYYDNIKDYSDLSKSLLDKITHFFSHYKDLEKGKTVAVGEWVGVEEAKQIVASSIKSGN >NC_021089.1|WP_015589475.1|1235392_1236538_+|SurA-N-terminal-domain-containing-protein MHKILILLLIVLPLRLLAIEIEIVADVNGEPISNLDIEKRINFINSLFGTQSVDQKGAKPQILRELIDEIIIINEAQRLNIKLSNEELDNAIMLFLTQSFKLKANEVDQYIEKHNIDLGILRKQIKCQLLWSKIIEVRIVPFINISDKEVNDVKRQTEKPDYLITFQEFIIPDQKGKDVYGIAEDLVKKLRNSNNPESPIKMRKATVNLSQLKGKLKNVLEGLETSDIAGPFSFSEGYSVIKVIDKVQLNHALLESTLKLKQIVVEGSESLLDNLKEQKVNCLNFDKLADNFKLPNAKEFEIKMRDLNPDLQILFSKTSVNEIVELRENGTAKLMMLCDIKSNVAGIEAIKQKMYQQKIMIQSNLLLDDMRKNAAISYRYS >NC_021089.1|WP_015589476.1|1236641_1237262_+|hypothetical-protein MKNIMLIGGGVGNAVLFSIGKACLENNNKVLYFAGYKKLSDVFKRALIERASNAVVWACEEGLIETSRDQDKSFHGNIVDAIVSYQQGRLGINLNVIDKIITIGSDKMMKAVNEARKTILKPYLKSSHIAISSVNSPMQCMMKEICAQCVQQHINKETGERSFVYSCSNQDQDMEFIDFDFLSERLKQNSLQEKLTAKWIDHVQRY >NC_021089.1|WP_015589477.1|1237245_1237797_+|5-formyltetrahydrofolate-cyclo-ligase MFKDIKQHKKEIREQYRAIRKDIDESYSSYAANSLINLFNQNLSYVKGKTIAAYIPMDGEINVVPLMHSLLDLDYKVAIPNKNKLLKFEEWNKTNEDVIPDTIITPVIAFDDHFNRLGFGGGWYDTMIEKLRPLGKIFIGVAYEKQYCKDLPVEKHDQKLDIIITEMCVRCGSGLLKKVDKKE >NC_021089.1|WP_015589478.1|1237841_1238876_-|hypothetical-protein MESSNSMFFDTDYPELRKAISDIIESIAQSSQEGKKELFTTLSEQVKGMNLKDLGLAINDQGLQKEVNKELFIKLIEEALKDLTSENVNSKIIEEALKSVNQQAISNVINNNKGPLDNLVNYFKSASANEKIGIASAGMVLGVAFSPLIVLATLIALVAIGARYVGIGIGKAGEKIKEGAIDAGKAVKSLSKNLGDKLPEVGPKKDNFSKLYNSLAQEIIGYNMSEEGEKIKNAQSKAKVIGMLQNEGQRSAIQELVKNGTIQNFSEDDMKKLREKGTSTYESDKEALEELMEKFQSKIMAIGEGKIEEVEKIVDEKVAAMKPSSHLGISSAARVSEGGITGPS >NC_021089.1|WP_041573547.1|1239012_1239720_+|isoprenoid-biosynthesis-glyoxalase-ElbB MGKKKLKAAVVLSGCGHLDGAEVREAVLSLLVLDQQEVDVKCFAPDINITQVMNHRTKEATKEKRNVLVEAARIARGEIYDLKEAKAENFDMLVVPGGYGVAKNLSDLAESKDMVTVMPEFERLVSEFFVTKKPIGAICISPAIIVSILSSKIGKEESKVKVTIGDDREQLIERLGGEHIKCDTELSIEDEEHNVFSCSAYMRSDESTYSVYQGIKHMIDSMVKKINKKTKQPFL >NC_021089.1|WP_041573548.1|1239895_1240204_+|hypothetical-protein MSDLFYIETTCCVDGQCDVYTGEVSFNDVMLGKFSLNSCSGKEAMINLDIITFDINIAIDGQNGKTIKKDLKGLEFVTKDDGSWYINKDFGNDKFEIIVNQS >NC_021089.1|WP_015589481.1|1240206_1242042_-|penicillin-binding-protein-2 MQALLKNKLRSLCFIVPLFIFYIIIIFRIFSLTFDQPTTSENFRKDNIVHKQPDILDRNGVVIATNVPTTSLYIDATKVKNPDSIAAQLCSTLHDLEYKNLYRVLTSEKKFAWIKRHLTPKELLAIKNAGVPGVNFYDDIKRIYPHSNLFSHVLGYTDIDGNGIAGVEAYISKNKQHSVIQVPDIQLYECCNLKAIPAQQFPTQQIQCVTLGSRYKNTDKLRDEQRIPETYVKNNVCDEIAHKTGFQCQCTGMTPDQASAQSSVIRQGWSRSADQYVQLSLDTRVQSIVHEELTKAVSRYQALGGVGIVLNVRNSEVISMVSLPDFNPNLQNKAEDVQKFNRASLGVYEMGSVLKYFTIAAALDANATKTSDLYDVSTPITIGKYKIQDFHKSKIPKITVQDIFVKSSNIGAAKIAVKLGIEKQVEYFKAMKLFSPLKIEIPEKSTPIIPDKWSENTLITASYGYGIAVTPIHLAQTAAALINNGIFHNATLMLNKRSIGEQMISRRTSREMRKLLRAAVTDGTGRKAKIKAYSIGGKTGSAEKVVDGKYSKDANIASFIGVLTMLDPRYIVLIAIDEPQGMHHTGGVIAAPIVRNIINRVAPILNVTPEM >NC_021089.1|WP_015589482.1|1242062_1242992_+|4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate-reductase MEIILAEPRGFCAGVKRAVDILAITLEKYKNERQVYVLHEIVHNKYIVEDFKKQGVVFVSSIEEIEDNEGILIFSAHGVSKNIEDEAKRKGIQVIDATCPLVSKVHKEAKRYENSGKELILIGHENHPEVKGIRGRVNNPITLVQTLQDVYDLKVKDPDNLSYVTQTTLSIDDTHEIIVALKLRFPSITGPDLKDICYATQNRQNAVKKLAEIVDMVLVVGSKNSSNSNRLLDLCTAREKRAYLIDNYRCVNKSWFQGVEKIGITAGASAPDILVDELMDYLKVNLSVKISVMPGGIIENVQFKIPNLV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021089_18 | 1279828-1279946 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021089_18
|
1 spacers
spacers of NC_021089_18
>18.1|1279860|55|NC_021089|CRISPRCasFinder GCTGGCATTAATTCCTTCTTGTCGTGTTTTTTGCTCTAGTTGATGAGAAAAAGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021089_18
The CRISPR arrays of NC_021089_18 >merge|NC_021089|18|1279828-1279946|CRISPRCasFinder ATTTCTCTATCCGTATAAACAGTCGCACTAGCGCTGGCATTAATTCCTTCTTGTCGTGTTTTTTGCTCTAGTTGATGAGAAAAAGGGATTTCTTTATCCGTATAAACAGTCGCACTAGC >NC_021089|18|17|1279828-1279946|CRISPRCasFinder ATTTCTCTATCCGTATAAACAGTCGCACTAGC GCTGGCATTAATTCCTTCTTGTCGTGTTTTTTGCTCTAGTTGATGAGAAAAAGGG ATTTCTTTATCCGTATAAACAGTCGCACTAGC
>NC_021089.1|WP_015589503.1|1278726_1279323_-|TIGR02217-family-protein MSFTEIRFPENISYGSAGGPEFSTDVVTTHNGCEQRNINWSHARTRYNIAYGVRSNEQLLELITFFHARKGKAIGFRFKDWSDFIAINQEIGIGDNKKTTFQLIKTYVSGEDKHIRMIKKPVHGTVKIYLNGKEESEYSVNYSTGEITFMKPPVKDAIITASFEFDVPVHFDTDYLNASIDDYGSNSWNNIPLIEVKF >NC_021089.1|WP_015589502.1|1277807_1278596_+|hypothetical-protein MNTKIFEMLIRRTGLRRDSKAEIIQLNRNEKAFVDEDKKSIELAEAIFEENNMFHFRKPGPAMDYILHKLINDRKLFEEMKDRGTSIIRLFSLLSMYHGRLNCCVIRKGGCITECGILDYAGTYPELVPLEDFILIEPCSYLEYTVLDNDNIRNRLARDLTEDKTKLDIFLNGILATKNSDLVLSCINKIEVLNEEDRYFVNRLQKNNMLDYILNKDDTTLAKSTLKELLKLSILQEGESTKLESPQASSVNVSKAQQHCSI >NC_021089.1|WP_015589501.1|1274908_1277563_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component MSSLSCLYGDNAEFVEEMYSRYLQGDKSIGEDWYRIFSSNLEVNKAETCGAQHVTKVDDSVSSLANFFRSYGHFFADLNPLSPNVNKEVDYQKYSNLYPASDAGIYRDIYCKNIGFEFMHISSYEERMWLQEKIENQNYTLSSQDKKEILRHLIESEMFEQFLHMKFPGYKRFSIEGGESAIVAIERIISDSAAFSIEEIVLGMAHRGRLNILTKVMGKEYAAMLSEFQGNLAYPGGLEVSGDVKYHLGYSSDQTLASGKKIHLSLCPNPSHLEAVNPVLAGRIRAKQNIRSVLGISIHGDAAFIGQGVVAETLTLSNIEGYKVDGIVHIVINNQVGFTANPCCARSSFYCTDVAKSIEAPVFHVNGDNPEAVSFATSLAMEYRQKFKKDVVIDIICYRKYGHNEGDEPNFTQPLMYKVISKHKTPGTLYEEKLIAEKVLSGDEVNKLRSEFRAKLDKSLAESAAYTPKKADWFGGVWSKLRRAKLNDLSEYYTDSDVPPDELKKLGVHINSNIPSSFNINNKVRKILDGRIDSINSGSNIDWATAESLAFASLLTEGIGVRLSGQDSGRGTFSHRHSRLVDQVTEEAFIPLNNINEKQAHFEVIDSALSEYAVMGFEYGYSLDSPYSLVLWEGQFGDFANGAQIMIDQFIASAETKWLRSSGLVLLLPHGYEGQGPEHSSARIERFLQLCAEDNMQVVNCSTPANYFHVLRRQMHRDFRKPLVVFTPKSLLRHKRAVSNLSDFEGKFLTVIPECRKGLVSSDKVRKVVICSGKVYYDIIEMLETQKINDIAVIRLEQFYPFPADKLSNELEKYKNAEIIWCQEEPKNMGGWFFVNPLIEEVLSNLDIQAKRPKCIARPAAASPACGYASVHAQQQEEILRQIA >NC_021089.1|WP_015589500.1|1272098_1273916_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MAIILLDTKTINRIAAGEVIERPASVVKELVENAIDAGSLEIEIKIESGGRNLIIVTDDGNGVEKNDLELAFMRHATSKLSDNELIEIKHLGFRGEALPSIAAVSRIKLSSKAREANEAWSISYEGGEKIGEQTPYSLSQGTHIEVRDLFFATPNRLKFLKTERAETQSIVDIVNNLAMINYHIGFTFNSGNKKLLKYAKQTSLFHRLCEVEEEFQGSSLEINEEEDGIKLTGHICKPTVNRGKSTQIYTFVNGRPIKDNLLIGAVRYAYHDFIPSDRYPFAALHLEIPYDQVDVNVHPNKSEVRFQNKKLIYEIVTRGLIKALSRRIGTFLAHDKKMDSTLPDPFDKPNVQNERRPSPFENQLIKEFASPNERVKSLSEQSKSFDYTGIQKLPSQAETMVLEKKVLEQVDLIESHPLGFARCQVYNTYIIAEVRDKLIIVDQHAAHERLVYECLKQKSSIKRQKLLLPETVEIKNQAGMEMIEIYKDKLFEMGFDIEIKSENKVIVKEIPAILGAIDVKEMLINIIDRLTEIEDTLPVEDKVNKILATIACHGSIRAGRKMRLDEMNELLRQMEKTPYSGQCNHGRPTYIEMKLSDIEKLFERR >NC_021089.1|WP_015589499.1|1271599_1272091_+|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-mutase MTKIKKDIAVIMGSESDYTTMVHTVDMLKALEVSHDIFIISAHRTPERLFNFAKSAQEEGFKVIIAGAGGAAHLPGMVASLTCLPVIGVPVHSKQLNGLDSLLSIVQMPKGVPVATMSIGENGAYNAAITAVSILSISNSEIAGRLKKWREKQTKEVKEKPVS >NC_021089.1|WP_012673420.1|1270866_1271163_-|XRE-family-transcriptional-regulator MEIISLNNLDSAGIKTKLLYIINKIVEKNAWTQAFAAEKLGIDQPKVSQIKNGKIDGFSLERLLGFLKKLDHEITITMTESQEIKSEAEKVKHEVESQ >NC_021089.1|WP_007548528.1|1270398_1270806_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-omega MAESIVEKCIERVSNRFKLVLLASQRTHDLNTGASNPIQAAKFKGHKNTIVSLHEIAGKQVDTHELFSLLVGRCKEYMKGNMNNVYSSNTSKLANLLNFSDNTDLDASQESQDYEVDGEIDDEINDQDGDEEVSV >NC_021089.1|WP_015589498.1|1270124_1270370_-|Multiple-resistance-and-pH-regulation-protein-F MICIAIYTLLSCMSVMLCCIVSKSNDVYNKVLAFNNFSTQVVVLITAISIILNNFFLIDIALLYASVSFISTIALMRLMLF >NC_021089.1|WP_006279703.1|1269830_1270118_-|monovalent-cation/H(+)-antiporter-subunit-G MIGSIFIFLGICLIIISNIGVIRFPDFYTRLHAAGITDSSGATLLLIGFALQNGFSINTVKIVLLIFIIWVANSTNSYILARTHYKVKKKTVKEG >NC_021089.1|WP_015589497.1|1269301_1269829_-|DUF4040-domain-containing-protein MLEILNVVLLLLLLTVTVFIVFSRHLVVSAVLMCVFSSLIALIYLIMNAPDVAITEASVGAGLSTVFTFAALSLIKNHKVNLSHNPITLFFMLFLAVCLSYFMIQLPDFGSHNAPIHLHVAPYYVENTEKATGIPNIVTAILASFRGYDTFGETIVVFTAALCITLILKEEKEND >NC_021089.1|WP_015589505.1|1280964_1281723_-|DsbA-family-protein MSRISFLLILILAVASLPVINNWLSHRGQTLTDDQISTRLDDYISRNFDKIVKTLKEESIKSSYAARDNATKGKILQYKNEIFDSAYPYSGNENSSVIAVGFFDYSCGYCKAMKNDIKQLINDGKIKYIFRDAPILGNDSLRAAKSALAVYFIDKEKYFDFHYSALSHKGGFSDESILDIVKSIGIDEDDFNDSIKDNADKIEQMINNSRLLVRDLGVGGTPFLIIGDSLFVGATDLNILRKKVDELSHKQG >NC_021089.1|WP_007548541.1|1282054_1282207_+|hypothetical-protein MSEPIIGREKEIAILQDKLLSQSAEFIAVYGRRRVNVVLSAFYQHNIEVM >NC_021089.1|WP_015589506.1|1282217_1283297_+|Fic-family-protein MPMPNYTITSKIANCLMRIEAAKEKVLHLPLTVSMLSSLRETARLYTTHYSTMIEGNRLEPKQIEEVLSGKSHFPKYRRDENEVKGYYAALTQVEQWAARTIPITEKAIQTLHALVMASGKSKVKPTSYRDGQNVIRDSRTRAIIYMPPEAKDVPKLMSSMIDWIRDSEQVPCPIIAGIAHYQFVTIHPYYDGNGRTARLLTTLILHLGGYDLKGLYSLEEYYAKNLGAYYEAISVGPSHNYYMGRAEADITKWVEYFVEGMANSFENVLQRINEEEYHTDQTDLIRKLDPKQRKALELFQGFSAITASQVGELFNFKPRTSAQLCKKWVEMGFIKIVDFSNRGRKYKLSKQYEDLISN >NC_021089.1|WP_015589507.1|1283384_1284863_+|UbiD-family-decarboxylase MYNNLRDFIKALEEKKDLIRIKEEVSTVLEMTEIHRRVLSSKGPAIIFENVITENGKNSIPVLVNLFGTIKRIALGLNINPDELRDLGKLLAFLQSPEPPKNFKDAIKMFPLLKVVLSMRSKVVSKAPCQEVVLTGDEVDLSLLPIQTCWPNEPAPLITWPIVVTKGPTKEKQDNFNLGIYRMQVIDKKTTLMRWLAQRGGATHHKRWKEKEQNMKFPAAAVIGSDPATIIAAVTPVPETLSEYQFAGLLRKKPLELVNCRTIPLQVPAHAEIVLEGYVSLDRYQDEGPYGDHTGYYNSVEQFPEFNITAITMRKNPIYLSTFTGKPPDEPSILGEALNEIFVPILINQFPEIVDFYLPPEGCSYRIAVVSIKKSYPGQAKRIVMGILSFLKQFLYTKFIIVVDDDINIRDWKEVMWAMSTRMDPVRDTIMIENAPIDYLDFASPESGLGGKMGFDATNKIPPETKREWGKKIEMSEEIVRKVTEKWEEYMD >NC_021089.1|WP_015589508.1|1285648_1286506_-|4-hydroxybenzoate-octaprenyltransferase MHFNRYFSLMRLHSLTGLWLVLFPSLSGILLASTSLSYQVLFLLVLFTIGAFLMRPAGCIINDIFDRKIDAHVERTKYRPLASGALNIKQALALLSLLLSIDLVILLLTNKTTLILGIISMCMIATYPLLKRYVWWPQLFLGFTFNMGSLMGSAAITNQISIESLLFYIGCVFWTLSYDTIYAHQDKKDDEKLGMKSTALYFGDTTKSWLKRFYLISLMTWLYAGILSSLNNIFYIALLAVGFIFHRQYKNFNPDDPSQCMSIFKNNSYVGLLLFFGILLDRIIT >NC_021089.1|WP_015589509.1|1286509_1286908_-|ribosome-binding-factor-A MKKEIRNLKIASVLHRAISRILMEGKVFNKNVAVSDVKLSKDLKKADVYIVLSSLNIQVADYLDPEKRRTGDPSENNCDLNTVVNEMNQSAWSIRKSILCYVDLRFIPELVFKPDLAFDNFVNVSKILHNHT >NC_021089.1|WP_015589510.1|1286917_1289242_-|translation-initiation-factor-IF-2 MNNEDISDKKLTLQGLSKLKLDLNLNSSASPSTGATVVKKRRKKSHDAEEHNLFDESKLGSLTEKEQIFRINAVQNAALLKERNQREEKEKTAKEDSNKEIDEKNEADALSKEINKQVLSNTHLVEPKEDSIDHEDNDKKSFKVNKDIYSKHSKLVIAQAIDEKTEQPPVFKQRFGIRGRKSKFTKGKNISREVIIPDKITIRELSIRMAEDSKSVLKMFKEEVGESYRVDDLVDPDIACEIVEKFNHTAKRVSDTNREKDLFFIEGRESLPKKPKPPIVTFMGHVDHGKTSLLDAFRESNVAERESGGITQHIGAYQIITKDKQKITFIDTPGHEAFTAMRACGANITNIVVIVVAADDGIMKQTVEAINHAKAANVSIIVAINKIDKSEPGDVEKVMSSLPQYDLIPEELGGDVMIVPVSAKKKTNLDKLEETILLIAELMKLEAIEDCRALGWVIESKIDKAKGISATLIVEEGTLKVGDILVVGTTYSKVRSMVNHLGQREKAALPSAPIEITGLNGVPNAGDKFVVVNSEKQAREIVEYRLELIKKKKEDLGDNNLDIFSRNNSETEELSVVLKCDVTGSIEAISSSIDKLGKDQVKLNILHKAVGGITDSDVLLAEASSAVILAFNVKVDSKIRDLAKQKGIEIHTYNIIYELIDDMRMYLTKMLKPVTREVRVGSASVRQIFNVSKAGNIIGCYVSDGVIKKDSLIKVVRGGKLVHEGKLKAIRRFKDDVKEVGVNFECGVSLEGNIDIKVGDILEAYQLVQEERVL >NC_021089.1|WP_015589511.1|1289251_1290814_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusA MIANRKSSVKQKSNKNNIVGSLDVIKTAGELSLQKGLDFDVVIKALESAIEAVAHQKYGSKSKIVVDIDRNTGKVTSYRKLKVIDDESNEKENTECESITLTQAKLIKGDAKVGDTVSELLSLNTDLASARIAQQKIAQIIKDEESKKQYEEFKDKVGEIRYGIVKQVEYSDLIIDINGTRAYLPLRNLTGGESFREGDKVKAYIQTVKRSDDGRQIILSRTHEGFLEALLNQEIPEIADGLVTIKGIARDAGSRSKVAVFSPDKNIDPVGACVGVKGDRIKTIIHELNGEKIDVINYSSDLGQFVIKAITPAEVSKVIIDENENCIELIVAEDQLSLAIGKKGQNVRLASELVGWKIEILSTQQESERRSKELSQCSALFAEALNLEEIMGQLLVTEGFSSVEDISSASIKELASIEGFNEDIANELHNRANKYLKAENDRKIEELKSLGMEDDVINLTLSIDNKIALSKHDIKTLEDIADLSSYEFCSILSSSSDSKEDLKDTVDSIIIEARKKLGLI >NC_021089.1|WP_015589512.1|1290902_1293977_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MQSLLIERNRAVVLLLIVIFIFGSYVYVKMPRESNPDIQIPIISVFVGLPGISAQDSEKLLVLPIENELRSIEGVRELRAFATNDGAHMILEFGTEYDNKEVLDNVRSKLSNIKSKLPVEAESPIINEINLSLFPILNVGLIGNLPERALTEIARKLKKEIESLPNVLKVEVAGMRKETVEVIIEPTVLTKYNIQSNEIFQAISSNNRLVGAGSLENDTGKYSIKISGLLKDIEDIMNIPIRSQGDAVLRIKDIAKVYPRFEDHQGFARINGLPSVVLEISKRNGKNIIDTVNQVKYLMDKAKDQLPENLKVVYLNDQSKNVRDVLDDLENGIIFAVLLILIIMMLSMGTRIAILVALSIPGSFLIGIIALYFMGITLNIVVLFSLIMAVGMLVDDAIVISEYADRKMICGMGKVEAFHTSVRDMFYPVLSSTLTKLAVFFPLLLWPDTVGKFMQYIPITIILTLTGSLIMALVFIPTLGAIFGKPSVTSKEEIEKMNAIESGEIKNAGPIIRAYVRMLEKVLDHPKKFVCATVFVLFSFSVLYFTFGPGVKFFPKVDSDNILISVKAKESLSAKARDLILKEVEERILSIEKKIHVSYARSGAFSDNVIARIQLELMDWRFRRKAKHILNDIRSSVQDMKGIIINVQEEKPGPSADKPIQINLSGSASSLNLAAEKILEIMNQPSSGFINIQDSRSAPEIEWNMSVDKNKATSSEVSVATIGDFIKMVTNGVLIGKYRPNNTDEEIDIVLRFPGKDRNMKTIDNLFINTVNGPYPMSNIVKYAPEKKVNKLNRIDGLRTVTISADVDTSYLVDERVKFIQNSIAQDWDKGVKIDFKGDKEDQQKSGAFLLKAFILAITLMILVLVTQFNNVYHTFIVMTAVFLSTTCVFFVFFLIQQVFVVVMCGVGIIALAGIIVNNNILLLDAFHHQIKVHKNDIKRCVINAAISRVRPILLTVATTVLGLIPMITRLNINFFTLQITYDAPSSQWWVDISTTIASGILAATVLTLFFTPALLVIQKHEKT >NC_021089.1|WP_015589513.1|1294152_1294893_+|hypothetical-protein MVAILNITKGKNKVIVSGLAGALSALIFLTAIHIAAKIAIIVSAAAVTYLLLSLIHKIRTKKEQPEITGVSGEKVSEDEGYSSVDEGEEKDTAKEPEKTETELEEEIIRKRAQERMEKGSLGGPINAFGEPIHVTIDAENSNPVDYTKTMVVPEEIILSMLNDKTLTQNNSSSIKNQMKPLPEHMDVPGNPLPGQVLSNLELESKSTQKLSALDLLLQCKNVDNDVKKMLKQPITQKGFNGLGFDR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021089_1 | 1.1|51328|57|NC_021089|CRISPRCasFinder | 51328-51384 | 57 | NC_021089.1 | 786208-786264 | 0 | 1.0 |
NC_021089_6 | 6.1|724639|49|NC_021089|CRISPRCasFinder | 724639-724687 | 49 | NC_021089.1 | 1110114-1110162 | 0 | 1.0 |
NC_021089_6 | 6.1|724639|49|NC_021089|CRISPRCasFinder | 724639-724687 | 49 | NC_021089.1 | 1274742-1274790 | 0 | 1.0 |
NC_021089_2 | 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR | 114469-114502 | 34 | NC_021089.1 | 342586-342619 | 1 | 0.971 |
NC_021089_2 | 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR | 114469-114502 | 34 | NC_021089.1 | 342750-342783 | 1 | 0.971 |
NC_021089_2 | 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR | 114469-114502 | 34 | NC_021089.1 | 815537-815570 | 1 | 0.971 |
NC_021089_2 | 2.2|114546|40|NC_021089|PILER-CR | 114546-114585 | 40 | NC_021089.1 | 1010097-1010136 | 1 | 0.975 |
NC_021089_2 | 2.2|114546|40|NC_021089|PILER-CR | 114546-114585 | 40 | NC_021089.1 | 1110107-1110146 | 1 | 0.975 |
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ctgagataccgcgaatgaatcgcggtatgacggttcgtggcggcgtgacgataagct CRISPR spacer ctgagataccgcgaatgaatcgcggtatgacggttcgtggcggcgtgacgataagct Protospacer *********************************************************
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agcagcgggatgacgaattacttaaccatcatctacaccgtcataccgc CRISPR spacer agcagcgggatgacgaattacttaaccatcatctacaccgtcataccgc Protospacer *************************************************
3. spacer 6.1|724639|49|NC_021089|CRISPRCasFinder matches to position: 1274742-1274790, mismatch: 0, identity: 1.0
agcagcgggatgacgaattacttaaccatcatctacaccgtcataccgc CRISPR spacer agcagcgggatgacgaattacttaaccatcatctacaccgtcataccgc Protospacer *************************************************
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gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccg CRISPR spacer gcttatcgtcacgccaccgctaaccgtcataccg Protospacer ******************** *************
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gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccg CRISPR spacer gcttatcgtcatgccaccgcgaaccgtcataccg Protospacer ***********.**********************
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attacttaaccatcatctacaccctcataccgcgattcattcg CRISPR spacer attacttaaccatcatctacaccgtcataccgcgattcattcg Protospacer *********************** *******************
15. spacer 3.1|358757|38|NC_021089|CRISPRCasFinder matches to position: 1274766-1274803, mismatch: 1, identity: 0.974
ttagccgctaacaagcagcgggatgacgaattgcttaa CRISPR spacer ttagccgctaacaagcagcgggatgacgaattacttaa Protospacer ********************************.*****
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gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccg CRISPR spacer gcttatcgtcacgccgccacgaaccgtcataccg Protospacer ***************.**.***************
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gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccg CRISPR spacer gcttatcgtcacgccgccacgaaccgtcataccg Protospacer ***************.**.***************
18. spacer 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR matches to position: 623184-623217, mismatch: 2, identity: 0.941
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19. spacer 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR matches to position: 623267-623300, mismatch: 2, identity: 0.941
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20. spacer 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR matches to position: 623352-623385, mismatch: 2, identity: 0.941
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gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccg CRISPR spacer gcttatcgtcacgccgccacgaaccgtcataccg Protospacer ***************.**.***************
24. spacer 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR matches to position: 786209-786242, mismatch: 2, identity: 0.941
gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccg CRISPR spacer gcttatcgtcacgccgccacgaaccgtcataccg Protospacer ***************.**.***************
25. spacer 2.5|114629|29|NC_021089|CRT matches to position: 850752-850780, mismatch: 2, identity: 0.931
ggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgc CRISPR spacer ggtcatgccgccacgaaccgtcataccgc Protospacer ************.*.**************
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ggttcgcggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctacttgttagcgggatcta CRISPR spacer ggttcgtggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctgcttgttagcgggatcta Protospacer ******.*******************************.*****************
27. spacer 10.1|850920|56|NC_021089|CRISPRCasFinder matches to position: 786178-786233, mismatch: 2, identity: 0.964
ggttcgcggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctacttgttagcgggatcta CRISPR spacer ggttcgtggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctacgtgttagcgggatcta Protospacer ******.********************************* ***************
28. spacer 10.1|850920|56|NC_021089|CRISPRCasFinder matches to position: 1064000-1064055, mismatch: 2, identity: 0.964
ggttcgcggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctacttgttagcgggatcta CRISPR spacer ggttcgtggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctgcttgttagcgggatcta Protospacer ******.*******************************.*****************
29. spacer 10.1|850920|56|NC_021089|CRISPRCasFinder matches to position: 1274517-1274572, mismatch: 2, identity: 0.964
ggttcgcggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctacttgttagcgggatcta CRISPR spacer ggttcgtggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctgcttgttagcgggatcta Protospacer ******.*******************************.*****************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021089_14 | 14.1|1079042|53|NC_021089|CRISPRCasFinder | 1079042-1079094 | 53 | MN180249 | UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence | 19779-19831 | 0 | 1.0 |
NC_021089_2 | 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR | 114469-114502 | 34 | MN180249 | UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence | 19794-19827 | 1 | 0.971 |
NC_021089_2 | 2.3|114469|37|NC_021089|CRT | 114469-114505 | 37 | MN180249 | UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence | 19791-19827 | 1 | 0.973 |
NC_021089_2 | 2.5|114629|29|NC_021089|CRT | 114629-114657 | 29 | MN180249 | UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence | 19793-19821 | 4 | 0.862 |
NC_021089_2 | 2.5|114629|29|NC_021089|CRT | 114629-114657 | 29 | NZ_CP021032 | Rhizobium sp. NXC14 plasmid pRspNXC14b, complete sequence | 332714-332742 | 7 | 0.759 |
NC_021089_2 | 2.5|114629|29|NC_021089|CRT | 114629-114657 | 29 | NZ_CP030074 | Streptomyces sp. ZFG47 plasmid unnamed1, complete sequence | 957600-957628 | 8 | 0.724 |
NC_021089_2 | 2.5|114629|29|NC_021089|CRT | 114629-114657 | 29 | NZ_CP030074 | Streptomyces sp. ZFG47 plasmid unnamed1, complete sequence | 12275-12303 | 8 | 0.724 |
NC_021089_3 | 3.1|358757|38|NC_021089|CRISPRCasFinder | 358757-358794 | 38 | MN180249 | UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence | 19744-19781 | 8 | 0.789 |
NC_021089_2 | 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR | 114469-114502 | 34 | NZ_CP007129 | Gemmatirosa kalamazoonesis strain KBS708 plasmid 1, complete sequence | 859162-859195 | 9 | 0.735 |
1. spacer 14.1|1079042|53|NC_021089|CRISPRCasFinder matches to MN180249 (UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgaggcttatcgtcatgccaccgcgaaccgtcataccgtcacggtatctctta CRISPR spacer tgaggcttatcgtcatgccaccgcgaaccgtcataccgtcacggtatctctta Protospacer *****************************************************
2. spacer 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR matches to MN180249 (UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccg CRISPR spacer gcttatcgtcatgccaccgcgaaccgtcataccg Protospacer ***********.**********************
3. spacer 2.3|114469|37|NC_021089|CRT matches to MN180249 (UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccgtca CRISPR spacer gcttatcgtcatgccaccgcgaaccgtcataccgtca Protospacer ***********.*************************
4. spacer 2.5|114629|29|NC_021089|CRT matches to MN180249 (UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.862
ggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgc CRISPR spacer cgtcatgccaccgcgaaccgtcataccgt Protospacer ********.****.*************.
5. spacer 2.5|114629|29|NC_021089|CRT matches to NZ_CP021032 (Rhizobium sp. NXC14 plasmid pRspNXC14b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgc CRISPR spacer cgatctgccgccggcaaccgtcataccgg Protospacer * . ******** *************
6. spacer 2.5|114629|29|NC_021089|CRT matches to NZ_CP030074 (Streptomyces sp. ZFG47 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
ggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgc CRISPR spacer cccgatgccgccccaaaccgtcatccccg Protospacer . ******** *********** **
7. spacer 2.5|114629|29|NC_021089|CRT matches to NZ_CP030074 (Streptomyces sp. ZFG47 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
ggtcatgccgccgcaaaccgtcataccgc CRISPR spacer cccgatgccgccccaaaccgtcatccccg Protospacer . ******** *********** **
8. spacer 3.1|358757|38|NC_021089|CRISPRCasFinder matches to MN180249 (UNVERIFIED: Wolbachia phage WO isolate Seq2WORi_AMD2 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.789
ttagccgctaacaagcagcgggatgacgaattgcttaa- CRISPR spacer ttagccgctaacaagtagcgggatgacg-gttgtcaggt Protospacer ***************.************ .***.. ..
9. spacer 2.1|114469|34|NC_021089|PILER-CR matches to NZ_CP007129 (Gemmatirosa kalamazoonesis strain KBS708 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
-gcttatcgtcacgccaccgcgaaccgtcataccg CRISPR spacer cgcctgct-cgacggcaccgcgaaccgtcagaccg Protospacer **.*... . *** *************** ****
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
46335 : 233911
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021089|46335:233911|DBSCAN-SWA TTTAAGTATGCAAATTAATTGCTTCTTTAAGTCTTGTATTAGCAATTACTATAATTTTACGCATTAGGGCTGTTATAGCCACCATCTTCTTCTTACCACTTTCAACAAGCTTAGAATAAAAGGCGCCAAGTATAGATTTTGACCTTGTAGCAGCCATAGCGGCTGTAAAGAGCTTTGAACGAACGTTACTTCTACCACCTGTAATCCTTCGGTAACCAACAGCTTTACCACTTTCTTTTGGATGCGGTGCAACTCCGGCAAGACTTGCTACTTCTTTTCTGTTTAAGTAACCAAGCTCTGGCATTAAACACAAAAAATCTTGTGATAACTTTTTACCTATTCCAGGAACTGTTTTAAGAATTTTTTGGCGTTGTTGTAATTCGCGGCTTTCATCAATAATCTTTTGTATAGTATCATTGAGTTCGTTTATTTGACTATCGAAAAACTCAATGGTCTTTTGACAGCTTTCTTTTATATGATCATTTTCCGGTGCTTCAAGTCTGCATTTTTCTTGAGTTCTCATTTGCGTAATATCATCACGACGTTGACAAAGTGCAGCCAAAGTTGATTGTTCTGTAGAGGTAGGTACAAATAGAGAGATAGTTCTATGGCGTTCAAATCCATATTGAGCAAGAGCTCTTGCATCTGATCTATCAGACTTTGCTAAAGCTCCGTGAGATAAAATAAAGCTTTTTACTTTACGAGTATTAGCTCGATGCACGGCAATATTTTTGTCGGTAAGAAAATGTGATAAGCCAAGCTCATATTTCCCTGTATTTTCTAAAGTCACTAAAGCATTAGGTAGAATATCTGAAAACTCTTGAAATAATTGTTGCCAACCAGAAGCATTATTATCAAATTCGACAGCATTCTTCTGTTTGTGAATTGCAACGACATTTTTAAATTTTCCGATGTCAATGCCAATAAAATTTTGATAAGATGTAACCATAATAAACCTCGATAGTTTTAGTTAATTTAAGATTGTAAACGGGTGCATATATATGTCCCAAGCAACTATTCAAACGTATCGAGAGATAGGGCTAGCGTACCTTGATACCAACGGTTGTAATACCAATTTCCTTTCGGTCGCGCACGCCCGCTATTCCTAGTGAGCAGGGTTATCTTTCTCTCTTATCTCTTTTATATCACGTTTTTAACTTACAATTTCCTTAGATGGAAAATAGAGATATTACATAAAATTTTAAATCCGGTCTCAAAGTTGAGGAATGTAGACTTGGAACAGCAGAAAGATTAATGAGGTATTTAACAGTCATGAGCATTATTGCTTGGAGAATTTTCTTTATTACATCAATTGCAAGAACTAACCCAACATTACCATGTACTGCCTTATTAGCTGAGGAAGAATGGAAAGTTTTATATGTTAAAATACACAGGAAACCATGTCCAAATATAGCCCCTACTATAAAAGAAGCCGTTTCGTGAACTTGGAGGTCATTTAGCAAGAAAAAGCGACCCAAAACCAGGACCAATTACTCTTTGGAAAGGGTGGAGACGTCTCTTTGATCTAGCAGAAGGATGGCGACTTGCTCACGAACCTCATATTTGTGGGTAATAGTAAGATTTGATATGCTGCCAACACTTATGTTCAAATTAAAAATGTCATTTATGATACTAGCCACTTCATGCTTTGAGTTTTTGTAAAATCCGCTGAGTGCTGCAATTATAGACTTAACCCTTGGACCAAATGTATCTGGCGTAACACCTTCTGGTAACTTGCTACTTTTTCTTTTTCTGCATCTCCAACAACGACCATGTTCCAATTACTACATAAGGCCTAATTTCCGGAAGATCAACTTTTTGGTGAACATAAGGTTTTTCGCATATTACAAGCTCTCCTCCGCATTCGCAAATATTAGGCAACTCTATTTTTACTACTTTATCCGCTTCCATTGTAGCATGAAAATTTCCTTTATGCTCAACCTGATCGCCAACATTCCTTTCGCTTTTTGGCTTGTCCTTTTTTGTTTTGTACAATTCTTTAGAGCTCGGTAGAGATGAATTTTTCGAGTTTAAACCAAGCCTTTCCTTTAATTCAGCGTTCTCTATCTTTAAAGCTTTATTTTCTGCTTTTAAGTTTTCTATCTCTGCTTTCAGTTTTTCTATTTTTTGCTGTAAATTTTTGCAAAGTTCTAAAAGGTTTACCACATTACCTCACTTTTGCTCTATGATTATCTTTTTAGATCACTTTGTCTACCTTATTCTACCACTCCGCTGAACGGATACAATTTACTAAACAGAAAAAAAGGCAAAAGAAACCCCGTGTTAGCTAGTTGTCACTCTCTAATCCTGCAAATTGGCGTACTATACTGTCTTGAACGACTTATAAGCGCGTTTCAGCTTGTGTAGGTAAAAACCTAGAAATATTGTGAAGACATAAGGTGCACATAGTGCAAAAAATTAAAAATAAGACGCCAACTACGTTGTTTTCTTGCTGTTTAATCTGCACAGATGAAGATAACTGAATACCTTCAGTTTTATGATAAGAGGGCTGGCGGAGTTTGTAAAGTAATTTTTTCGTTTCTATTCCCAATAAAAGTTTGTTATATGGTTATGCAAGAAGTCTATTATAAATGAAATGAATGTGAAAAATATCTTATTAGCGTTTTTAGTACAAATGGTATTCAGTTTGCCGCTATTTGCAGCTGATCCTGTTTTGCTCAACTGCATTGAAACTCCAGAAATATATGACCTTGATGCAAGGCCAAAAAATTTTAACTCTTCAAACAATTTAAGAAGAAAACCTGGTTCTCCAAATAGTGCAATAGGGGAATTAATACACATAGTGGGTAGAATTACTGATATAAACTGCTTACCAATACAAAATGCTGTAGTTTCTATATGGCACGCGAATTCACGCGGCGTGAACCATTACGATAAGAATATAGAGGATGATCTGAATTTTGCTGGATCAGGAAGGTTTGTAGTGAATAATCTTGGCTATTATAATTTTATTACGATAGCACCTGGTAAAATTGGTGATAGAGCTCCACATATCAACTTTCTAGTTCAACATCCGGATTTTCCAGAATTCACAACGCAAATGTTTTTTGCTGACCATAATTGCGATAATTGCGCTGATCCTGTTCTTGAAGATTTTGTTAGTAATGGGCTTGCAAGCCTTCTCATAACACCATTTACTTACAGTGATCAGGTCATAAAAACCTATACGTTTAACATTACCTTGGGCGGATATAATAAGTTCTCTAATAAAAGATAAAAAACCTTGCATGTAAGGGAGTCCATAGTAAACTTAAGTGTTATTGTACTTAGGATGTATATGAAAAATATCTTACTGATGTTTTTGCTATGTTTTATGTACAGTTTACAATTATTTGCAACGGAGATACCAGCAATGAAAATAACAATTTCTAAAATTTCGCCCGATTTTAAAACAATAGTAATGGGTTTATTTGAAGACAACGAAACCGTAAATGATGGCGGAGTTTTGCAAGGAAAACAGGTCATAGATAATATAAAGCAATTTAGCGATTTCAATGGAAGTTTTGGTGAATTTTTCTCTACTGCTTTGCCAGAAGAAAAAAATGTTATAGTTGTTGGACTGGGTAAGAAGGATGAATGGAATGAAAATAAAGAATTAAATATTGGTGGTAAAATATATTGTGAGCTAAGCAGATTAAAAATTAAAAAAGCAGCGGTTTTAATCGAAGGTAGTGCAGCAAATGTTGCATATGGTGCGTTTCTGCGTAGTTTTAAGTTTGATAAGTATAAAACTAAAAAGGATGAGAAAATTACAGAGGTAGAGGAGATTACCGTATTAGTAAAAGATGAACAATTAAGTAATGCTGAAAGATCATTTGAGCACTTAAGGCAAGAAGGTGAGAGTATATTTCTTGCGCGCTCTTTTATAACAGAGCCTCCTAACATTCTATATCCAGAATCCTATGCTGATCATATAAAAAAAGAACTTACTAAGCTTGGCCTTGAAATCGAGGTGCTTGATAAAAAGCAGATGGAAGAGAAAAAAATGGGAGCCTTGCTTGGAGTTGCACAAGGAAGTAGTAAAGAACCAAAATTAGTAGTGATAAAATGGAATGGAGCTTCTAAAGAACAAAAGCCTATAGCTTTTGTTGGTAAAGGTATAACGTTTGACACTGGTGGAGTATCACTCAAACCTTCACGTGGTATGGAGTCGATGAAATATGACATGGCAGGCTCTGCTACTGTGGTTGGGGTGATGCATGCTTTAGCAGGACGAAAAGCAAAAGTAAATGCAATTGGCGTGGTCGCACTTGCAGAAAATGCAGTGGGTGGTAATGCTCAAAGACCAAGTGATGTAGTAACTTCAATGTCTGGACAAACAATAGAAGTGTTGAACACCGATGCAGAAGGAAGGCTCATACTTGCAGATGCTTTATGGTATACGCAAGATAGATTCTCACCAAAATTTATGATTGATCTTGCAACTTTAACTGGTGCTATAGTGGTTGCACTTGGAAATAACGAATATGCTGGTCTTTTTTCAAATAATGATGAATTAGCAAACCGTCTGATTGATGCAGGAAATGAAGTAAATGAGAAGTTATGGCGTTTTCCTATGAATGAAACTTATGACAAAATTATTGATTCACCGATTGCTGATGTTCAAAACATCGCTCCTGCAGGCTCTGGTGGAGATAGCATAATGGCTGCACAGTTTTTACAGCGTTTTGTGAATGAAACTTGCTGGGCACATTTAGATATCGCAGGCACTGCTTGGCACGAGAAAGGTACTGACATTTGTCCAAGAGGAGCAGTAGGTTTTGGTGTAAGGTTACTTAATAAGTTGGTTGAGAAGTACTACGAAGCCAATGATTAAAGGTCTTTATACTGGATTTATGGCTTAGCTACATGAACGTTTATTTTCGAGGCGCAGCAAATGAAAGTAGCTGATACATATTTCTTTTTTTCTGGATTCCAGTGTCAGCTACTTTCATGACACCCTGACAACCGTCATCCCGCTACTTGTTAGCGGCTGAGAT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176 | Shigella_phage(24.0%) | protease,tRNA,integrase,head,transposase,tail | attL 37482:37536|attR 230959:231137 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
258941 : 326735
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021089|258941:326735|DBSCAN-SWA 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47 | Wolbachia_phage(71.88%) | plate,terminase,head,transposase,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
331681 : 393654
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021089|331681:393654|DBSCAN-SWA 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57 | Tupanvirus(15.38%) | transposase,tRNA,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
405775 : 473904
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021089|405775:473904|DBSCAN-SWA 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52 | Wolbachia_phage(88.64%) | plate,terminase,tRNA,head,portal,transposase,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
482114 : 533592
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021089|482114:533592|DBSCAN-SWA 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44 | Wolbachia_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
541585 : 674881
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_021089|541585:674881|DBSCAN-SWA 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117 | Bacillus_phage(17.95%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
784754 : 834440
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_021089|784754:834440|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_021089|784754:834440|827456_828074_-|WP_174517030.1|transposase|DBSCAN-SWA MEDIEIAIDSTGISIYNNTPGHSKENSTDRKYRGYEQTRKLHVMLNINNKKAIAVKYSNGVYSDHYGACDLLKEVDFQHAIKALYADRACDRHKFYKLCNEYDIKTKIPPINNAAEHPEIDYMSDRNAAIRLIKLYGEDGMKEWKKEVNYGKRSYIEGFFSRLKQIFGFSFRNKSEINREKELLIKCYLLNKFTDIGMAKFEIVT >NC_021089|784754:834440|813792_815061_+|WP_015589211.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRLSKYYLPTLKEKPAHAKIISHQYSLRAGLIKQIASGIYSWLPLGLLVLKNIEDIIRDEMNKSGAIEVLMPCVQPANLWRESGRYDDYGKEMLRIRDRHEEDMLFGPTHEEVATDLIRDMVKSYKDLPLCLYQIQWKFRDEVRPRYGVMRGREFLMKDAYSFDVDYEGALNSYNLMYKTYIKIFKRMGLTPIGVRADTGPIGGNLSHEFHILANTGESTLYYDNKFSELLESEDVESLKSIYAVADDMHDPETCPISQEQLNVSKGIEIGHIFYFGDKYSKPMKASVTSQDGKNVNIHMGSYGIGVSRLVGAIIEAFHDDKGIIWPESVAPFRIGLINLQTKVTEAADKIYKALKSDEVLYDDTEGSVGVKFSRMDLIGLPWQIIVGKKAIDEKIVEVKNRATGEVKEMQIEEAINHFSTK >NC_021089|784754:834440|802267_804076_+|WP_015589207.1|DBSCAN-SWA 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42 | Tupanvirus(12.5%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
882869 : 1009981
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_021089|882869:1009981|DBSCAN-SWA 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114 | Bacillus_virus(13.64%) | protease,terminase,tRNA,portal,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1049932 : 1086045
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_021089|1049932:1086045|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_021089|1049932:1086045|1075659_1075986_-|WP_010082086.1|DBSCAN-SWA MQVVEIVIRNNTYKISCESGKGNHLLRLANSFDKLVSSVSQKTGGKGSDALNFLLAALILEDKILELTKRLDEVNQEREKYRNEKRIEYTEVLDKVNKIITNLECIKD >NC_021089|1049932:1086045|1078158_1078824_+|WP_012673367.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLFKNSKWIRSFSRRSRLKPDVDEILEKYSIQNSKESIEKIVNSQKRIWVEIGFGNGENMLYQVLNEPDLLFIGCEPYLKGVSRLLTNIEIQNIKNILMWTEDARELIANFPDNSVERFFILFPDPWPKRSHNKRRLINTEFLNLLAKKILITGEIFIATDHQDYAEWIASHIKQCNSLIYREDDFTSYTLTKYHRRALKDQRKVRFFKVSVINNLQTMDQ >NC_021089|1049932:1086045|1061459_1062683_+|WP_015589368.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTNQTVRGTKDLLFDEWYKFKYIQQTANRISSLYGFLPAQTPIFEYTEVFTKTLGDSSDIITKEMYSFNDKGGKSITLRPEFTAAIVRLLIEKKLQTPIKLFSTGPAFRYERPQKGRQRQFHQINFEVFGIEDPKADVELISLAQHLLTEFGINKNVKLEINSLGDGETITKYREALILYFTKYQNDLSEDSKNRLIKNPLRILDSKDEKDRLIISDAPKISNYYTKESSDFFEQILNGLTILDIPYTVNNKLVRGLDYYCHTVFEFVTEDLGAQGAVFAGGRYDNLVSSVGGKHTPAIGFAGGIERIMELINYSPKEERPIYLIPIGREAEKHALTLANELRRNSLYVSYEHSGTVKNRMKKASQANAKIVLIFGNDELNNNTVKVKNMDTGEEKIIARDNTIENI 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>NC_021089|1049932:1086045|1085715_1086045_-|WP_141456678.1|transposase|DBSCAN-SWA MPQKMRVSNCHEYNKFLQERGSIFCYINDAIENWYENCPKMQGGNYIYSDKVVILVHIIVSFFRIGLRQTVGFIKGYLQQIGRDLAVISYSQASRRFKKLNIKINDCRK |
34 | Salicola_phage(20.0%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1162726 : 1226071
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_021089|1162726:1226071|DBSCAN-SWA 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56 | Hokovirus(13.33%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021089.1|WP_015589377.1|1081896_1082106_-|hypothetical-protein |
1081896_1082106_-
Protein sequences of NC_021089.1|WP_015589377.1|1081896_1082106_-|hypothetical-protein>NC_021089.1|WP_015589377.1|1081896_1082106_-|hypothetical-protein MLVSEQIESVDREELKQQNHIHKDTECSEETTIYGHINQHMEKNISNTLHEIYDALMSYNESEQSMTST |
69 aa aa | NA | NA | NA | 1049932-1086045 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 10.1|850920|56|NC_021089|CRISPRCasFinder matches to NC_021089 position: 1064000-1064055, mismatch: 2 ggttcgcggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctacttgttagcgggatcta CRISPR spacer ggttcgtggcggcgtgacgataagctcgtcatcccgctgcttgttagcgggatcta Protospacer ******.*******************************.***************** |