Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021183 | Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_021182 | Clostridium pasteurianum BC1, complete sequence | 6 crisprs | RT,WYL,csa3,cas14j,PD-DExK,DinG,c2c9_V-U4,cas3,DEDDh | 0 | 3 | 16 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021182_1 | 88057-88345 | TypeV-U3 |
NA
Consensus repeat of NC_021182_1
|
4 spacers
spacers of NC_021182_1
>1.1|88087|35|NC_021182|PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTCCGGACTGTGATAATCCTGGAAGAGCTCATA >1.2|88152|34|NC_021182|PILER-CR,CRISPRCasFinder TTATACACACAACAATTAAACAAAGATCAGATAG >1.3|88216|35|NC_021182|PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAAAAGTTTTTGAAATTAAGGTGATTATCTGTAC >1.4|88281|35|NC_021182|PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTTTTGGTCTTTTAATAATGTATTAGTATCATCC >1.5|88087|38|NC_021182|CRT AATTCCGGACTGTGATAATCCTGGAAGAGCTCATAGCT >1.6|88152|37|NC_021182|CRT TTATACACACAACAATTAAACAAAGATCAGATAGGCT >1.7|88216|38|NC_021182|CRT AAAAAAGTTTTTGAAATTAAGGTGATTATCTGTACGCC >1.8|88281|38|NC_021182|CRT CGTTTTGGTCTTTTAATAATGTATTAGTATCATCCGCC |
c2c10_CAS-V-U3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021182_1
The CRISPR arrays of NC_021182_1 >merge|NC_021182|1|88057-88345|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAACAATTCCGGACTGTGATAATCCTGGAAGAGCTCATAGCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAACTTATACACACAACAATTAAACAAAGATCAGATAGGCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAACAAAAAAGTTTTTGAAATTAAGGTGATTATCTGTACGCCTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAACCGTTTTGGTCTTTTAATAATGTATTAGTATCATCCGCCTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC >NC_021182|1|1|88057-88345|PILER-CR GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC AATTCCGGACTGTGATAATCCTGGAAGAGCTCATA GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC TTATACACACAACAATTAAACAAAGATCAGATAG GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC AAAAAAGTTTTTGAAATTAAGGTGATTATCTGTAC GCCTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC CGTTTTGGTCTTTTAATAATGTATTAGTATCATCC GCCTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC >NC_021182|1|1|88057-88345|CRISPRCasFinder GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC AATTCCGGACTGTGATAATCCTGGAAGAGCTCATA GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC TTATACACACAACAATTAAACAAAGATCAGATAG GCTTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC AAAAAAGTTTTTGAAATTAAGGTGATTATCTGTAC GCCTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC CGTTTTGGTCTTTTAATAATGTATTAGTATCATCC GCCTAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC >NC_021182|1|1|88060-88345|CRT TAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC AATTCCGGACTGTGATAATCCTGGAAGAGCTCATAGCT TAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC TTATACACACAACAATTAAACAAAGATCAGATAGGCT TAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC AAAAAAGTTTTTGAAATTAAGGTGATTATCTGTACGCC TAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC CGTTTTGGTCTTTTAATAATGTATTAGTATCATCCGCC TAAACATAACCTATGTTAATAGTTAAC
>NC_021182.1|WP_172638594.1|86648_87788_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MNYKKLNGQYPIDKDLFGKTYRNVVEGYMKEIMNIVNTSNVSQTNAFVLKKWNSDKQDILNYRKSVASFKLNMPIYIYNKNYKIIQGNNGYEIDAAIFNKKQDLRHVTFNIDKLDNNKKVTLNKIISGIYKQGAAQIIQDKKGKWYFIISFSFVPDIKELDKNRILGVDLGITNTATLQIWDNNEKKWDKLLYRECILDGKESIHFRQKVEARRRSMLISCKVAGDGRSGHGTKTKIRSASNIGDKINNFRDTLNHKYSKYIVDFAVKHNCGTVQLEDLTGFNPENNFLKSWPYFDMQSKIKYKSKEKGIDIKIINPYKTSQRCSICGCIDKLNRDSKNNQSIFKCINCGYEEHADINAAKNIALPNIEKLIKNFAKIP >NC_021182.1|WP_015613516.1|85938_86652_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MSNEELVQLYKKGDKKALNELVKLNERLVYKLSNKFYVEKSNSIDKDDLIQEGFLGLILAADKYRFDIKNSCKFSTYAVYWIYQKINRFVTSKNTNEEASLNIPIGEEDGSELLDYIEGVDYSFENVEEKIYNQELRLELESIMDKALTLKEREILKLHHGWDNNKGMNHNEIGELFSVASSKINYIKKRAYGKLWRTPWGIEKAREVHVYKKKSRKYNYSSVMDDISFEQKYLKDF >NC_021182.1|WP_015613515.1|85688_85886_+|hypothetical-protein MFEKDVNNMSTEEMAAEYLKIRKADLENKEAERIQAERAQAEKSAQEKELNDTKAIMEKTMGIKF >NC_021182.1|WP_015613514.1|85064_85676_+|hypothetical-protein MSKLQFINKLNEYRNETITNKSKKSAAIKDMQKKVDDKQIEIDAKQEEYNNNPTNELFQELLVLKQELQKLKVNVKSADEIIVIPLTKTITPEEAAKDIEDFIQGLELEKAREDIGNYKQKFLDSIDVFDDKIHQMHEIKDEIRECSVSDDIKQAVLKVFENHRDVYNCVEEIKLSEQDLVIKRAGIMEKAARLYIRTYLNKF >NC_021182.1|WP_015613513.1|84639_85056_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MLSEVISQQQEDMITMIMQGRNITDISKKLKVTRSTIYSWIKKDNIKAEIESRKHEIVNEGNSYILRDLKSYIDNVKELASDKSDKRVCLAANQYLINRIYGNPTSIIDTSNGDVDNTSDTNHLEELLIQFKNKKQLK >NC_021182.1|WP_015613511.1|83816_83969_+|hypothetical-protein MIRIKASYSNEAEKKKIIAAFNGIFKIKSISKEYKKEGPYKRIHLDLLDK >NC_021182.1|WP_015613510.1|83491_83806_+|hypothetical-protein MNEILKNIIDKTMELKYYYVCDTLEREELNNSEEYKDLLKDEDKIINELKLKSPKNLQVLINKLIDIKDYQSNCYGKYYFKQGVKAGLTDLKCLGEAEEEVTML >NC_021182.1|WP_015613509.1|82818_82956_+|hypothetical-protein MRKNINEVENSDSIAELLNQKFKDIPLSMNDIIEIKKIIKEVLKS >NC_021182.1|WP_015613508.1|82418_82835_+|hypothetical-protein MNKTEMLVATNQYTGSRLFLENLRSIKKGRSRFYIDTRTKIINEQNHIYPLAITGKSVYIVCCYCGRIHSHSCARGKYEGFVAPHCLDNSKHSGYYIEPVEFKILKSDVAVKEVVNKKVVISKKNLIKGGSKNYEKKY >NC_021182.1|WP_015613507.1|79932_82140_+|phage/plasmid-primase,-P4-family,-C-terminal-domain-protein MNYSMIKSYFQIKSDHGDTCKATCPCHQDREASLSISHKQDKTLLTCHAGCTTRDILEKVGLKMSDLWDQPLQGKSNSFNNNIAAIYQYKDENGKVLYEKVRFNPKRFTQRRSIDGATVWGLDGGTYFQTYTGSNNWSKRERKNSVTREFPKQEPVIYNLPEVIKAVKNKETIFLVEGEKDSDNLVKLGFTATCNFDGASKSVQKQKWRENYNPYFKGANVVLIPDNDGAGRHHMRYIAESLKSYVSTIKMIEFQGMPDKSDISDWLDEGHTKEELLKLIENTKEYTSEDVSIKKEGELPPWYIVSTNSRGEERVSINSGILSRHLINTVHSVYAAEKFYIYDKGSYVKKSDYEAGAIVKKYIEDQYVKSRTITEVVDLWRYEILKKENELNKYQYIINLKNGLLDIEHKEFKEHTENFLSTIQLNTTYDKNAECPIFMKYIAEALEMENVTLIQEILGYLLIPETKAQKFFVLKGRGGTGKSTFLNTVSFLLGQQNISNISWQSLGDRFNTAELYGKLVNEFADLPQTPLEDTGVFKALVGEDFIKGEIKHKGIFYFKNKARLLFSCNEMPANYTDRTDGFYRRFIIIPFDKKPKVIDKDLEVKIQQEINGVFNWALKGLTRLIKNDFTFSENQYTYAALEEYKLQANNVLQFINEECDISEGKACSSSLLYSKYKGYCEDNSLKNVSQPNFKKELLKIPGIDYVQSFRTATTKFRAFTGISLSIQEVKYLNVK >NC_021182.1|WP_155241846.1|88632_88812_+|hypothetical-protein MHNELTEYDTHEINHHCRGLRVGEGYNRETLREVSTQLGHGRGNAVIRILIMWVSFLFF >NC_021182.1|WP_015613518.1|88913_89945_+|hypothetical-protein MKNKSKKIYIININGIAYFIIFSILIAVVIWFISKGMQDVNISIPLTKAYSVDQANAINALANNATGRINNTIAVSAIFFTVIVASISVFQFVKIKDFDKIKENILINTAEIEEKIKESNLEIVNLRDEYMKLDILRQNLEFRNARLQVELNDLKIDKCLSGKGYWVKELRDLLNSNIKLGDEFKNLLSKSELSELYFQLGKSYIATCDIYETYIYMKKILKKSLELIKDSNEDNQKIDTYKLMIDMEQTRGNYEEVAKILDDMGNLLEKDIEENLWLLANLNGACGWDKIDQCIKILDQLDFYYGVKCVEYIKRYDEDGSFNELKTNEKFKNKLYSIIGKNE >NC_021182.1|WP_015613519.1|90554_91025_+|SocA-family-protein MYKAKEIARWFLIRNYAEEQQDSEIEEMTNLKIQKLLYYAQGVHLAIEDYPLFSDNIVAWKHGPVVVDVYYEYKENGGNGIKYIPEPYDEGIYKKLVEDKENIDMLEFVYKEFGQYTAWKLRNMTHNEKPWKETEQGQIINNELIKEFFRNEIVEV >NC_021182.1|WP_015613520.1|91031_91472_+|hypothetical-protein MPKLKNSDKKKPSKEDIKGSYKFKRIQFNFSFLSTNSEYNFKNLTRDMKADIIDRLCELSSMDLVQIHSISKERGLEYIEDKGISIKAKCHPDFSSNEYIKSCCPKKYCIIRIYPNNNPTPSRILGRLIGHAFYIHFIVMDHKCYK >NC_021182.1|WP_015613521.1|92134_92578_+|nucleoside-deaminase MEELYIKEALIEAERAKQIKEVPVGAIIVKDNIILARAHNLKESLKDCTAHAEILAIRRAASVLKNWRLNSCEMYVTLEPCPMCAAAISASRIRKVYIGTFDPNMGAGGSVVNLLQNEYLNYNTEVKWIYSEDCSKIIKDFFKERRQ >NC_021182.1|WP_015613522.1|93022_93505_+|hypothetical-protein MAKFRTFNKIAIMLLVLTMSAFLIMGCQSKNSGSSQNSSGSNGGRTFNADAVKQRYEQDLQALVKAGTITQDQSTKILDSLTANMNNMGQGRRRPNNQGNSQNNTTQGNGKNNQTGTPRNNPLSKLVSDGVITQEQADKVMQGLRGNRQNSNNQSNQSNQ >NC_021182.1|WP_015613523.1|93652_94132_+|HD-domain-containing-protein MIEEIIESMINYFGNDVSRINHALKVHGLSQNIGNLERLDDDKQFILEISAVLHDIGIKISEKKYNSSSGKYQELEGPKVAKEILEKFNLDSKILNRILYIIGNHHTYSKIDDIDFQILVESDFLVNIFEDNVKKDSIEVIKDKYFKTTYGTRYLNSMY >NC_021182.1|WP_080648262.1|94335_95121_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MKGSDKVNPVAFTILGLSIRWYGIIIACGMLIGIIIANFTSKIKDINYDELFNIILIALPLAIIGARLYYDIFNFSYYKSNLSEIFNTRQGGLAIHGGVITGLIVAYLYTYYKKLNFWKYADVAAPSIILAQGIGRWGNFFNQEAHGGPVSAAFISHFPSFIQKGMYIDGIYYHPTFLYESIWDILVFIVLFILLKNTKKTGIAIFTYIGLYSLGRFFIEGLRTDSLMLGPVRVAQLVSLFGIGIWIVFLLILRKKGDFLK >NC_021182.1|WP_015613525.1|95333_95543_+|hypothetical-protein MNATASKQIEANNLKVIKDEIEYELLMNKKFHKYADCCNDAQLKSLCTEASNAHRENFNSLKTYLDSHQ >NC_021182.1|WP_015613526.1|95565_95844_+|spore-coat-protein MESNGNFSEKEMMQDLLATEKQVISSYSTGITETSCANLRNTLVNNFRSAQDIQYKVFDAMKQRAWYPTKDAPENEVQQLKTEVTQMVSELK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021182_2 | 366595-366672 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021182_2
|
1 spacers
spacers of NC_021182_2
>2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder CAAAATCAAAAAAAGATTTTGGTTCTCTACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021182_2
The CRISPR arrays of NC_021182_2 >merge|NC_021182|2|366595-366672|CRISPRCasFinder GCACTCTGTGAAAGTGATTCACACAAAATCAAAAAAAGATTTTGGTTCTCTACTTGCACTCTGTGAAAGCGATTCACA >NC_021182|2|2|366595-366672|CRISPRCasFinder GCACTCTGTGAAAGTGATTCACA CAAAATCAAAAAAAGATTTTGGTTCTCTACTT GCACTCTGTGAAAGCGATTCACA
>NC_021182.1|WP_155241853.1|365841_366351_-|hypothetical-protein MYEYSFRRTCVISTCSLNQIAIIRKIFTRISFSIYKELYSELPEITIADKITKLRFTHNLKREDLADLLNMHWDTIEGWEVHNIMPKPQSIRKLCDYFNLPYNYFHEYYNIYFNNPGDKIKTWKIKNKLTYGQACKLLGITHSCFGRLLNNKINLSYYIYAELKKLGAF >NC_021182.1|WP_015613749.1|365029_365791_+|hypothetical-protein MLTLLKKKSTIVGIIIIILVGVFIIGDKIINNKSISINNKKGGTAIKQNNATDTNSTVTNQSNATDTNSISAKQSNAAEINSTVTKQSNTAEINSTVTKQSNTAEINSTAVKQSNTTNTNSSITNNNNTSSTFDYKDYFGEWVIKKSVGTLPVYAIPDSKVDSYIGKKLILSANQFTDLDGSSLKTPTYKQKIVSDNDFFTDTKRNLSYFKITSNYINEIEIDNNGGMYSSIYIIDKNTIMYLVDGVFFQLQK >NC_021182.1|WP_015613748.1|363118_364639_+|VCBS-repeat-containing-protein MKIYKRVLLLLLFSTTFMLIGYNKAYADTNTNGLVWKLNTTTPLSKTDSYWSFASGDYNNDGKADIYCVKRNGANAKTEVHVLNGANNFQSFLLETATALPQATDGNWKFALGDYNNDGKPDLYCIKENGGNAKTEVHILNGADNFQSFLLQTATALPQATDGNWEFALGDYNNDGKPDLYCIKENGGNAKTEVHILNGANNFQSFLLETATALPQTDSNWAFGISDYNNDGKPDLYCIKRNGAGATEVHTLNGANNFQSFLFESATPMEPTDQNTQFVIGKGVMDVYAIKQQAPTSTEIHEFGYPDGSTGNTNGIASSRSSANIIYFIKECEGFAPSLYHDEVGVLTGGYGMTGAELNGLPSSISETTATQLLTTNVNNNYYTQVLNIIHARGVANPTQREVDAFTSFAYNEGVQAFSQSTLLKLYASGSRGADIQTQFNQWIYAGNTVLPGLVTRRNYEWGIFSASTSSIPGYNCPPSISYINTAGNPTGQVVTENNGYGANPY >NC_021182.1|WP_015613747.1|362465_362837_+|hypothetical-protein MISQTVINEIIIPIIGASVVTVLEIGRRQLKAFLDAHKELIEKQKEAVIQTIGTEKYNKDVAIVKNAVFAVEQLGKEFNWEGAIKHSKVLELITGKTGLTDDEIFNIIKGAVLEVNNFKNDIV >NC_021182.1|WP_015613746.1|361446_362406_+|peptidoglycan-binding-protein MVMKGIDIYSDTIITDWNAVKVDGVQAVYIKATEGLTYVNPLMDSQYKNAKDRGLKVGFYHFAARNAPAQEYQHFINTIGKYQQDLKPWLDYEVANPDMNFVAAFMALNPGLLLYAAHNVADASGLPKNKIVIAEPNTSPLDTRGYAGIQYTWTGRLPGTQGNMDIDLFSNDVLIDANNVVLAAAPQVAQPVQQGDPAVRIIQMQLNTLLKKGLVVDSFDGPVTTAAKKEFQGIMGLVQDAVWGPKTIAAVTEIYSKPLDGVKEIHHEYATRFIQWVVGASIDGIFGNETKIKVQNWQASHGLTPDGVVGPATWAKMLG >NC_021182.1|WP_015613745.1|361126_361441_+|hypothetical-protein MDNATIGLICTVIGAVLGVVGTITGMRKASKENEKDIENKAEKSAECNTRIETKLDYIGKDVKDIKYDIRTHEARMGSIEERVTRVEESAKSAHKRLDGIEREE >NC_021182.1|WP_015613744.1|359109_361077_+|phage-tail-protein MYRVIIINGEETTIVNEPIANQEAPKVTTGDYHNILSQPDSFDFAIPIMNPGWGKIKCLKTKVKIIDTRDNSTLFVGRVVPYKDGEDTSGIFDGQATCEGALGYLNDSLTRRWHLANKTPEEILQFLLDQHNSTMGSGNSRKIQLGTVEPTLAITVDTNFESTLNTIITKLVNILGGDIRVQERDGILYLDYLNSIGQDRNVTVMMNENMDSITRENDPSDLANRLICHGYGEGINQLDISSVNNGVIYVEDEDSIAEYGVIEGHYTNSEIQNAYTLMQAGKTALKDSKQPKVTLDTSMTDRSVLEEYNFEKYNLGDTLHIMNSILDIDVYARVTEEKFSILAPQDKDIVISTRPLGFIDQIIDLKQRTASIENAPQGNTCLISLNKAENADATHPITFDLDIPDEAININKVYINLHGRPYRAYEKGATAQQVVSTSGPSSKSTSDSGGQSTQTSTSGGASTQTSSNGGGATVTSSGGGGHTHLIGMNTGGDTKPSTYRDFLCSASQGQDTTWFKLAVSNDYLGANLYTYSTTDHTHDVSVPSHSHSVSIPGHTHNVSIPSHSHGMDHTHEITIPEQDITIKYGIYEDTYPKNVKISVNGNDVGVNYSGDAAIDEYNIDITAHVNKGNNKVEITTDQNGRVEATVYAQIFIQSK >NC_021182.1|WP_015613743.1|357618_358839_+|family-16-glycosylhydrolase MNCGKYDNKLDNPLNDKVEVIKRKLNQKVIFGITILIVIAIGTAIFVYSKSKIIESNIDPTSANASDILTDRVLVWSDEFNGKTLDTSKWRYVFGRRDLDNGTPRQYYPLDPSKNVYIENGNLVLKAIKNNPYPNYNWSAAFVETNNLFEFQYGRIEARIKYSDVPGSYATLWTLGANYDRTQKLVDGKSDENIGVPWPKSGEMDIAEFNSTGSPACNLHYGDNASTHKQIGRTSLGVNGTEWHIYAVEWTPESIKFYVDGVLKRSVNLDDLTYNNYNSFKLPYYLMINSGVAWDNKPSANVNELTTLVDWVRVYAPVGISKIVNANSISLDTNQVNLNVGDTYALCTTFTPDETCDKTLKWTSSDESVAMVYGGKITALKSGTAVITAETKNNKTATCKVTVTAP >NC_021182.1|WP_015613742.1|356317_357394_+|acyltransferase MHITLNYMVVLYISLIVILPLLLLVESKTFKFNTYNSNYLAKNNTDILKGLSVVIIIFHHLSLFLTNGGIYKTVISKVGFLAVSIFLFVSGYGLMVQFARKKNEYFKGYFKNKILKLYLVFFFSNIICTILSNVILNAQYNFVDIIKSSLLMNFADGRVLWFVAVILYFYIAFYIAFKFFKNNTAVIVIFISWILWIGLNIALHHGAWYYNSAISFPVGIIFGKYADQIFAFAKKYYLILTSGSLILFLLSMAAYIKGIDKLQFIIPILFTFVIVLLLMKVSLKSRFFNFMNGISFEFYLFQILALNIVFQTDNKTSSLYFFLAFLITVVLSKILNVFIGFIFNFIPKRLMKEDRLEV >NC_021182.1|WP_015613741.1|353896_356239_+|hypothetical-protein MISKVYVGNKSVSKIMLGNKIINFVEAFNRILNLQDVELTLTGNWLDSSLLGYDGSSTKYSTSVGDKAEWNFYVPDNSNYEVYAWFPRGTTDNASEVKYSISSLNGYWEKVINQNENYSNWVKLATVTGTGGTALKVTVQVSVSVNTRINAIRVVQTTATADDTTDINGSQDTTTIATFINQSGYDLDKTKRATITNVPDDTPFTIKKASDNSVVYNGTVTGQIVNFSDFNPSAVEEYYIECSGITSYNFKIAKYLLQRVSINPALRFMDGSRQDTWDVGGNTGYGWRDSHQFSFELNSLVLQYMANPSAYDRMTYGISHLSGTQYTELRTQNEPDIIWLVKFGAMRYYDLKTNQSKNLHAFIKGQLAYFLYLYPDISDYVSQSFYEMIRTLTVSEWSNPNCNLQWYEVSDGTDNNLFEVQSVIGDIKGQKPPGYAIVPNLLMYEVAKRDGLANYQDFFTAAYNNCEWLINNVDLDNPIYTKGQRMNEHITMEGLTYFYEMYPEDAPAGLYNKIKQWAQTMVNRSNNLWDMRKYADINDNTAYASMNQWTGGGNAYNEVGNPAGFMAVAYAVCRVLYSEDSVLKTRLQEIGIAQMDSVFGRNPFGRHFSYDAPTEIEGVDAGWFTFLNGGYGDLMSVAGVLDGSPKESAYPFNPVADPGYTEGWVAFNTCWNDSLAYSASNDVEVKIFDSTFINEISSASAGNTIGIRLKAPLNFNENVAETGEVDITLSNGTKSKLTVTEASNNDYYFTATYVVPADVTYVDVSYGYGLFKKSVRVNIV >NC_021182.1|WP_015613751.1|367041_367278_+|hypothetical-protein MEKMNVLDSIKRNIEDHLGEKVVLKANSGRKRVVVNNGIIEKTYPSIFVVRLESDTQRKVSYSYSDVLTKTVQLVFAV >NC_021182.1|WP_015613752.1|367718_369281_+|DUF3794-domain-containing-protein MAIELVKENIEYEQLLGENTADTVVREEYIIPDTQPDVLKILMVDAKPSILNTEVMQDKVYLEGQVEFDVVYLGKTEDGTEICGVSYSAKFSNYVEIEGAAHKMISDTDYYVEHIDCNAVNERKIAVEGIIKLKSEVYSKNELEIVKDITGLGDVQFLRNPTSIDKVAGNTSVDLVAKSHLQVPMENPQVGNILKYDVNIHKKQVKLLEGKISIEAFAEINVLYKGKDTADVFHLSDDVLLSQEVELEGVNSNMNVFGEFTVDATECNIKEDDLGENRNIDIEALVKANVKVQSKENVDVIQDAYSPDLNLKIEKKDYELNLVYGHATTENIVKENLEIKEENVVPTEVILAVGKVSITDKKLVEDKLSVEGIINISVIYKTNDEKNNLSSLNEDIPFNSTVDIPGAKIEMSSIAKGDLDSLEASIEANTIAIKAIVSVYGRVNYNSNKDFLINIVPLEGEKPKKKASVTIYTTQVGDTLWKIAKVYFTTVESIVNINGIENSDYVLPGQKLIIPGRAII >NC_021182.1|WP_015613753.1|369480_370323_+|4-(cytidine-5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol-kinase MLLKAYAKINISLDIVGKREDGYHLLKMIMQAIDLYDVMNINRTDNGIKLSCDKQYVPTDDKNIAYKAAKLFIDTYNIKSGVSIEINKNIPVAAGLAGGSTDGAAVLRAMRDIFSVDVTDEELMELGLKLGADVPYCILGGTALCEGIGEKITTLKSFKDKILILVKPNFGVSTKEVYKNFDIERVFKHPDMNSLIKAMEKDDLEFISNNMKNLLENVTIRKYNMLKNIKDSMLRYGALGSMMSGSGPSIFGFFDDMLKAQRCFEGMKEKYEEVYITRTI >NC_021182.1|WP_015613754.1|370955_371378_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKIIIKFLGLNIHKTDEENRTFRVGIVSTLLLETGIIFTLFKHRDDSSIKFILLAIIVAIICILMLISIRLYDVCIFLMANYIIYTVKKGDNLLTISEQFLPECNPWRTSEIIKNKNNIEEILHPGQKILIPSKREFFI >NC_021182.1|WP_015613755.1|371658_372360_+|stage-II-sporulation-protein-R MKKVLIFMGIMLISTMLIWNYSKNKTYFTTKVEAREANEQADQQCIAKKIIRFHVLANSDSNEDQALKLKVRDKVLAYIAPKLSNSKSIEESREILKKYDKNINAIAESVIRENGYNYSVKTELSYVDFPVKSYGTIVLPQGRYEAYRILIGSAKGHNWWCVMFPPLCFTDITKGNVEVEKTQDEMKSALTKDEYALVDNSKNNSENVNNKIIVRFKLLDEVKKLVTDIKDKI >NC_021182.1|WP_015613756.1|372431_373586_-|UDP-N-acetylglucosamine--LPS-N-acetylglucosamine-transferase MRALILSVSAGGGHKHAALALKDYILKFEPVSEVKILDTIKYINPILNKVLIGGYLNTLKITPSLFGKIYRFTENTDKDASISSFKNKLTEIMAHKILPAIERFKPDIIICTHWYPVEMVSILKEKNKLNIPIVCIITDYAPHSFWIYPQVDSYIVSNKDMLEEMVHRGINRNSIFDSGIPVGSDFFDRYNRNDTLKELKLDPNKQVILIMGGSLGMGRISGIYSQIANSTKNIQVIVVAGNNKKLYTKLMSIKKTSNVDTRILGFTKDVNKYMQCSDILITKPGGLTISEALICQIPLVLFSPIPGQEEKNEEFLLKHNLAISIGDGSNCREKIVQLLCSSETLKIMKHNCKKFSKPNCGYNIFNVINDLIKRREIAIMKNEI >NC_021182.1|WP_015613757.1|373879_375253_+|germination-protein-YpeB MNTTKKRIIYTIAVALIVVFSTTFAILMTLERIDYRNYLMGEYSKSMYQLINSVENIGSNLAKVPVLGSKDQDIVALEEIFRYSSIANDKLHSLPIDEQQLSGTSKFITQVGDFCYTLASKTTQGGELSDEDIAKVETLKKQAYTLENQLKNVQNNINNGDVKWGEIRKKASGVLLSSNENAVSTSFESIQKQIVQYPSLIYDGPFSDNNLDINPKINSSKDVTVTEAEGIVRKAIGNEKIDSVERLEDVNKQKIPCYSFNVNIKGRKSDNKVSCEVTKKGGMIYYILDNRNIDKPTIDVNKAQDIGSKYLADMGYTNMTPTYSLVYNNTAIISYIYNIGNVAVYTDQIKLKIALDNGNIIGMESAKYLTAHDTGRKIPDENSLISKDKAQEKVSKRLTVTSSRLAIVPTESNKEVLCYEFVGNYNGDSFIVYINAQTGYEVRILQIRNTPNGKLTI >NC_021182.1|WP_015613758.1|375437_376469_+|D-alanine--D-alanine-ligase MKKKIAILFGGKSTEHEVSRVSASSVLRNIDISKYDVYPIGITKDGEWFEYTGSIDKIENGQWEKDEYYKKPEGQKVLFNREVDVVFPVLHGLCGEDGTVQGLCRLIDIPCVGPNVMSSAVCMDKVYTKYVLEHFEIKQADYVVVTAVEYGISRDKIIDTIEKKLKYDVFIKPSNSGSSVGITKAHDRKELIDGIEEALKYDRKVLVEKAINAREVEVAVLGNDKPKAGVPGEILPAKEFYDYEAKYEDAESKLLIPADMNGTELEKIKKLAVKIYTALDCAGMARVDFLVDKVTSEIYLNEVNTIPGFTKISMYPKMWEAAGKAYKDLISELIEFAIERNNN >NC_021182.1|WP_015613759.1|376503_376920_+|DUF1934-domain-containing-protein MEKKAIITISSIQGDKEEDTIQVVTPGIFYLKDDFYYAIYEETEISGMQGTTTTLKIKPEELILLREGTTNANMHFLCGTNNLSMYDTPYGTLKMEVDTKEINIDVNEKGGNISVKYDMNISGQMVPATSLDINIKLQ >NC_021182.1|WP_015613760.1|377122_378721_-|CTP-synthase MKNTKYIFVTGGVVSSLGKGITAASLGRLLKNRGLKVSIQKFDPYINVDPGTMSPYQHGEVFVTDDGAETDLDLGHYERFIDENLSKNSNVTTGKVYWSVISKERKGDYLGGTVQVIPHITNELKDRVYRVAKEKDVDVVITEIGGTVGDIESLPFLEAIRQIKYEVGNGNSCFIHVTLVPYLRKAGEIKTKPTQHSVKELRGIGIQPDIIVCRTEKELSEDVRNKLGLFCNVEGKAVIQNLDAENLYEIPLLLHKEGLDDLVCEQLSLGCNEVDNTEWIEMVGKLKSLSKEVTIALVGKYVELHDAYLSVVESLSHGGLASGASVNVKWINSVDVTAENVNDILKDVDGVLVPGGFGDRGIEGKIESIRWARENKIPFLGICLGMQCAVIEYARNVLGYSDAHSSEIAPDTKHPVIDLMPDQKDIDEKGGTMRLGLYACKLSKDTNAMAAYNEQVIYERHRHRYEFNNEYRTSLIEKGLILSGTSPDERLVEIVELKDHPWFVAVQFHPEFKSRPNKPHPLFRDFIKASLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021182_3 | 1220463-1220573 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021182_3
|
1 spacers
spacers of NC_021182_3
>3.1|1220490|57|NC_021182|CRISPRCasFinder TACCCAGAAGAATGCTAATATAACTGCAAATAGTAATAATAATACTCAGAAGAACAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021182_3
The CRISPR arrays of NC_021182_3 >merge|NC_021182|3|1220463-1220573|CRISPRCasFinder TAATTCAACTACAAACAGTAATAGTAATACCCAGAAGAATGCTAATATAACTGCAAATAGTAATAATAATACTCAGAAGAACATTAATTCAACTACAAATAGTAATAGTAA >NC_021182|3|3|1220463-1220573|CRISPRCasFinder TAATTCAACTACAAACAGTAATAGTAA TACCCAGAAGAATGCTAATATAACTGCAAATAGTAATAATAATACTCAGAAGAACAT TAATTCAACTACAAATAGTAATAGTAA
>NC_021182.1|WP_015614502.1|1218533_1219346_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MSKIKMICLDIDGTLLNSKHEISERTKEVIKIASNEREIPVILVSARMPKGILFLQEELEIEQPIICYSGALILDKSSNILSKNIIPAHNLERLYKLVCNEKVHMSLYKDDEWYIEKMDYWAKQESDITNITPIIASFNELIKLWKEYETGPNKILCMAESDEINLLKGKVKDYDLNIYPSKPTYLEIMPKEASKTSAISVLKEKFGIDRDEILAMGDNYNDMDMIEYAGLGIAMGNAPDKVKRCANKIALTNDEDGVAEAIREFVLADD >NC_021182.1|WP_015614501.1|1217745_1218501_+|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MYQEERLLKILEYLKGHNNMSIHNICEMFSVSRDTARRDIIKLIEQGTAIRTHGGISLPTLRNTIEAYRERLKYYSEEKKAISKKAMEFINEKEHYFFDVSTTVSFLAEYLNKSVTVFTHSLDNIEILSEKKEIVVHSIGGKLHDKNRFFYKPGCTDYLNGIRFDAAFIGAAAINEDGIYYDDEEDTFVKQAAVKKSDKVIILTDCKKFKLSSYYKGVNWEQVDVIITDQRPPEVFMNIIEAQDIQLIICK >NC_021182.1|WP_015614500.1|1217097_1217712_+|hypothetical-protein MHQDNESKYCKQCNHSYEERLSIRSEEKKKIVEKALMFIREGKSYFFDVSTSIQFLAQSIDKKITVYTHSIDNLYILSEKKDVEVHSVGNTLNKNNRFFYSEDNKNYFEGINFDVAFLGATAITKDGIYYDDKEDADIKREAAKKAKRVILLAEHEKYKNVSCYKGLDLNEIDIIIVDPMSCNSFVDIIVSQNINIDPHSLIIM >NC_021182.1|WP_015614499.1|1215933_1216707_+|SDR-family-oxidoreductase MNDMDTVLITGASSGIGRELAKVFALHKYNIILVSRSTEKLRKLADELIDEYKIKVEIIGQDLSKVGAAKKLFDNVTDRNLQVDVLINNAGVGAVGLFHEIEIEKDMEMLKLNIITLTEITKLFSRKMIERKKGKILNVASTGSFAPGPFIAIYYATKAYVLSFSEALYKELKPYNVTVTVLCPGATRTNFAKAAGRENSSIAMEPDKVAKIAYEGLKNNKRVVIPGVANKILTRLPRNFVSDMVFRYQKKLSVKKK >NC_021182.1|WP_015614498.1|1214522_1215887_+|hypothetical-protein MAHINKDLLFFIIFVILVVLIVEATLFLHKYFSGFISLIVNLIKNRWLNKLLSKKDYKQISKKYHNLADKEKRKFERDNLLGIAALYEHDSKTAIDLFKISLKEAPRGHVRTIEDNLATAYLQDGLHIAALNLFEVHYENGGVGVIGYILALLMNDREGEANTFYEYNRNMLDNQEKHFMELILSFSLSKTEIIEELEKIIKADELWIYQPVLKGIALKWKLSVFYNSTERHNILLTQGKKLLSEFQKQPELFNNENVKYMRLLISKVIPRINTYDDVAGLWGIIDGIDELALKLPLDNELCEECYLFWNRIYFLFSKTSNIETYDFEKEQKFIKEQIPLNARSTIDCTHICDLFLSESLHFAIRLVEIYKYGFTYYYLDIVSEEFAKEILTYVKPISEIIKEVPSTEEFLEPLLYDLVCSIDSVKASDVIDVLNRISPEYREKLQPLKERVLL >NC_021182.1|WP_015614497.1|1212894_1214196_+|diaminopimelate-decarboxylase MKLFGTMEIKENELYIGGISSNELCKEFGTPLYVIDEELVRKNCRDYYENFDVDKGKNKVAYAGKAFLPTAMCQVINEESLYLDVVSGGELYTAHKADFLMKRVLFHGNNKTIDEIKMGISFNVGRFVVDNFYEMEKINEIAGKNNKVQKILLRITPGIEAHTHEYIKTGQVDSKFGFTLINNEAINAVKKAISLPNIKLKGLHCHIGSQIFEIKPYEEEVDIMLDLIKTIKDELNYEIEELDLGGGFGIYYKEGDKPREAKEFCSAILKRAEDKVKELQINLPALMIEPGRSIIGNAGTTLYTVGSIKNIPDIRKYVSVDGGMTDNIRPSLYQAEYECAIANKINNETSEEVTIAGKCCESGDILLTDTNIAQAESGDILIVSNTGAYGYSMANNYNKIPRPAVVLVKDGHARIICRRESYGDVLRNELPLL >NC_021182.1|WP_015614496.1|1211541_1212741_+|aspartate-kinase MSLIVQKYGGSSLATIDKIKKVAENIINKKEEGNNVVVVVSAMGDTTDGLINLAKKISDEPDKRELDGLLSTGEMASASLLAMAIKEMGCDAISYTAYQIGMRTIGDYGKCLIEDLDDRRINRSLRKDKIVVIAGFQGINSIGDITTLGRGGADTTAVAIAVKLNAICEIYTYADGIYNIDPREYDGAKKLEEIDYEEMLELTSLGAELLHLRAIELAQKYKVPIHVGLSFGNVEGTIIREVNTMNMESKPVTGIATSDEDVAVTIKDIYSDINILSNLFEALASKKISIDMISQTAPIDGKVNVSFTIPKESLGECLNIIDDFAERENVYVDKDIDKFSVVGIGMKTSSGVAAKMFKLFSDNGIEVKMITTSQIRITCAIKQSDKQKAVELVIKNFRH >NC_021182.1|WP_015614495.1|1209879_1210839_-|MORN-repeat-protein MEKLDTKYGVIKGISSMDYYKNGNPRDCVVTEVNELKTNYGTFIPQYENGSERRKHIKSFSFYDNGNLQSVYLEKQAKINTSIGILPAELITFYQNGNIKRIFPLNGQITAYWSELDEYKLAEDISFDLSVGKFEKKIIAVNFYEDGVVKSITFWPNNPVEITSPIGKVMARIGLAFYNSGKLKSFEPLKPTRVETPIGAITSYDTNALGIHGDLNSINFFEDGNIKSLITSSDTIEITTKAGEKKIYKPGLKVSVINDEVMEVVPMRVSFNDNKVCFNNSEDAYSIDECTFKVECIPLQTKSPCANCSGNSDCNGDCC >NC_021182.1|WP_015614494.1|1208241_1209543_+|M18-family-aminopeptidase MSTEIELAENLIDFIYESPSAFHAVTSIKKVLDKKGFIELNEGDRWELQKGGKYFVVRNDSAIISFIVGSGIIAKKGFKIIGAHTDSPSFRIKPCPEITSEKNYVKLNTEVYGGPILNTWLDRPLSLAGRVTVKGKDLLYPEAALVNIKRPIMIIPNLAIHMNRAINKGVELNRQTDVLPLLGLINNTLEKDNLLVKTIAKEFNIKADEILDFDLFLYEYDKGNIMGLNNEFVSSSRLDDLEMVHAGVIALSNSDVIEATSVLACFDNEEVGSSTKQGADSELLSSTLERIVISFGGDREDYFRALYKSFMISADAAHAVHPNRGDKSDPTNRPIINKGPVIKISSNQKYTSDSNSIAVYETICKKANIPVQKFVNRSDEPGGSTIGPISSTHVGIRSVDIGTPLLAMHSVRELCGVDDHFYVEKSFEEFYKL >NC_021182.1|WP_015614493.1|1206781_1207963_-|cation-transporter MTVKFIISHFIKNYDNINDKDVREKYGILSGIIGIIINLMLFIIEIILGIFTNSIAIIADAVHNLADVTSSLVTLIGFKLAGKPADKEHPFGHGRMEYVSALVVSFLILIVGFEFIKSSLQRILHPEPVNFNLITFIIILVAIPLKLWLSHFNKTLGKLIESSTLEATGADSLNDVAILGGVIISLLVSYFTHISIDGYVGMVVAIFILISGISFIKETLNPLLGEAPDPKLVKELRKGVLSYDYISGVHDLIIHNYGPGRTMASLHAEVPCNMPIMKIHDVIDTAEKELSEELDMFIVIHMDPICNNSAEVIKTKNSVIEILKNFPIVKSLHDFRIVGEGKNRKLIFDVVISFDNKISEEEKEILKNNIDTAVREANPFYSTIITVDQDYTH >NC_021182.1|WP_172638600.1|1221609_1222500_+|MFS-transporter MIIFLVLMNLSMSIFRSPVVALMPDITYEENRSKANSIINFMGGIGSLIAYFVGSLLWDKNPAYPFYLAAVLILISFIITFNFIKEKRDVIQYENSEDKVDLIKGLRQGLKSQNTRYLLFGICSWFIGFNGIETFFTRYGEIYLGVKVSTAAMSFTFVSLSFLVFAIPAGIIGTKLGKQRTIQIGIIGIIVGFLIVAFLHSITPIRITFLIFGFFWALININSYPYVAEMAPAGYIGTYTGLYYLFSSVANIISPPFLGAIMDLIGYKYMFFYGACFFILALFFMNKVKVKPSENL >NC_021182.1|WP_015614505.1|1222692_1231347_+|cyclic-beta-1-2-glucan-synthetase MPYIYIQISAVILILSIFIVVTFEIRHRNDSFEEFPPINLEGEGLKRHAAYISDYHKRIKTTNSKRKIMKSIDKNYRDILAGYEYIDRDTRYKRDVIPAAEWLMDNLYLIEKEYKDIKHNLPEYCYKNLPAVNKGIFKGYPRVYHIAMEMVSHTYGKIDEKTIMSFIETYQKQTVLTNSELWALPNMLRIALLQNIGSVTNKIVTAQKEKNRADRLGDGLINAVNNGKIDEELKNIIAEKPKFTAHFAGRLLKDLRDNGIDNENIYNWIENNLAAIESSSEKIMITEHQKEIGFQLSMGNCINSIREVEALNWTEGFEKLSYTDEILRQDPSGIYGKMDFNSRDYYRHNVERMAKHMGISESYLARLCIECSLNASEKSKNEYEKHVGYYIIDKGVNYLKRKISYRARGIDIFTYAFKKHKAAWYIFLNIAGTIGLLIFIIARSLADDANFILWRYIISGIAIIIPCSEIVNSILNWSINHLATPKFIPKMELSEGISSDCKTIVVIPAILSDEKTVHEIISKLEVYYLANEENNLYFAVLGDFKDSQNESEAEDNKINETALNDIKLLNEKYKRKNEDIFYFLNRARTYNKKQNSWLGWERKRGKLMEFNQLLRGGSDTSYNVISGSIVKLQDVKYVITLDSDTQLPRDTAKKLVGAMSHVLNKAIVDTKKKKVTRGYGIMQPRISIDTVSANKTFYSKIFSGETGIDTYSTAISDAYQDLFGEGIYTGKGIYDIDVFQNAIDGQIKENSVLSHDLLEGAYARCALVTDVEFIDAYPSYYNSGTKRLHRWVRGDWQLIPYMFKPSSLNVISKWKMLDNLRRSTLSLSIIILLILSLTIVPDGIDKWLSLAFIALISPWLFDVSEIVASPMRGISISGKMNSNKNVIEQVFLIFTFLTFNACLMLDAIFRTLYRITISRKKLLEWQTAADTEANSNKKFTGYLLYMWTGSAVAAIIAALGFKAQQPVGYIILPSCILWFISPIIAYFISKDRKKVDIKLSDEDRNLLRRISRKTFAYFEDFINDEENWLAPDNYQEDPAKGVAHRTSPTNMGMGITSNLAAYDLGYLTLPELVDRLDKILTSMESLEKYKGHFYNWYDTKTKQPLNPRYISTVDSGNLVGYLWLASRALQEYISEPLITIRYAKGICDILRLSNEEIENAFSVKNNYNSMISEIEAYNMDAATWKRTLTTLSGECDKFEKNNKNIILYWNSKARHQIKMGLDEIDRIFPWAELVSKRDEMINNKGNAIKNLSNNVALKDIPKEIDKIISTFTVSDDAFSFGKDITWIDKIINMFNESKTQIEKLINKVEDIRMRLDTMAEETDFKIVFDSKRQLFSIGYDMEANKISNCYYDLLASESRQASFVAIAKGDVEQSHWFKLGRAMSFMGKGKGLVSWSGTMFEYFMPMLIMKNYEDTLLNETYKSVVEGQKKYIKDRKISCWGISESAFYKFDIASNYQYKAFGVPGIGLKRGLVDELVISPYSTVLAMQQDVNNSLSNIKRIMSEGLEGKYGFYEAVDYTENRLPKNIKKAIIKCFMVHHQGMSLMALDNILNRFVLQNIFHNIPKIKATELLLQERVPKRVVYDRDKVFEAVNNEKNDRSNFIVRIYNNAKTEMPETHILSNGVYSMMISNSGSGYSKKQDMMLYRWKEDVTTEDKGLFFYIRDITDNRLWSAAYEPSKTEGDSYEAIFALDKVEFKRKDGDVETHTEIAVSSEDNTEVRKFTLKNNGNVEKLIELTSYSEITLAPLNADEVHPAFSNLFIRTEFVESPMCILANRRPRAKKQDKPWLMQTMFIDGENDDDIQYETSRVNFIGRGRDVTSPLCFDEGNDKLKNTVGNVLDPIISIRRSIKIKPGTSCSIVFVNSITDSREDALNMAIKYHQVQNIKRAFELSWSQSQVELNYLGIKPNQANLYQLMASKLLFINTMVREREYYIKGVSKSQSALWAYGISGDLPIALLIVRNESDIGLVKQMLNAHEYWSMKGLKVDLVIINMNGNSYLQELQNSLGDVIASSRSRDKQNKPAGVFLHSNATMGEEDIKLLMGISRLVIDSDKGLLVSQVKSSIKLKEDAADIQPKNINYRVSEFQYPERELAYNNGFGGFDTEANEYVITLEDYKNTPAPWINVISNKNFGFHISEAGSAYTWFRNSRENKITPWSNDYVTDELGEAIYIRDEDTGKLWSISPKPIRDKGKYIIEHGYGYSNFKHTANGIAGEMTMFASMEESVKFIEVKLKNISDIKRNLSVSYYSQIVMGVVPSHTGIHIVTNIDKEKNFMFSKNPYSQNFGNSYAYLKILGGNEESFTGNRKEFIGRGGSLTSPQALKKITLSNNIGAGLDPCMAENCKISLEAEEENSLWIIFGEDESLEKIGEVIDRYSNYHNVIKELYLTKTYWENMLGKIKVKTPDETMDIMLNGWLMYQAISCRLWSRTAFYQSGGAYGFRDQLQDVMPLSFLKPKMTRKQIIISASRQFLEGDVQHWWHPVVDSGIRTRFSDDLLWLPYVTSDYIKNTGDYSILEESVEYLEDEPLKEGEDERYSISKKSDKTGSIYEHCIKALEKGLKFGIHNIPLMGSGDWNDGMSTVGNQGKGESVWLGWFVYSILRDFKDICKIKGDEYRSQRYSELSDFVKENLEKNAWDGKWYRRAYFDDGTPLGSVKNDECRIDSLSQSWAVISKAASPERAEAAMDSLEKYLVKENERMVLLLTPPFDNSKLEPGYIKGYVPGVRENGGQYTHAATWVILAMAKLGKTDKAWKLFNMINPINHSKTKEESEIYKVEPYVMAADVYAGEHVGRGGWTWYTGTAGWMYRVGIEGILGLSLVGERGFRINPCVPKEWNEYEINYRHENCMYNIIIKRSENKSVTIDGKHVQDGIIPFMAEGAHVVEIKF >NC_021182.1|WP_015614506.1|1231423_1231615_-|hypothetical-protein MSKKIPYLPKEREYFEAPQKKVKAYSERDYTELPDNVIDPIVSNNISNVEFDYTYDPLDDYDD >NC_021182.1|WP_015614507.1|1231960_1232335_+|desulfoferrodoxin MTELKQIYKCPICGNIVEVVNKAGGTLVCCGKPMELITENTQDAALEKHVPVVEQKGEEVFVKVGEVEHPMIDTHYIQWIEVITKNKLYRKYLNPGEKPEATFKIDEEIVAVREYCNIHGLWKK >NC_021182.1|WP_041711308.1|1232542_1233547_+|tryptophan--tRNA-ligase MEQNKKVIFSGIQPSGELTLGNYLGALKNWVKLQHEYDCYFCVVDLHAITVKQEPKDLRRRTLEVMAIYIAAGIDPEKSTIFIQSHVAEHTELAWLLNCYSYVGELNRMTQFKDKSSKYGSSVSAGLLNYPVLMAADILLYQTDLVPVGIDQKQHLELTRDLAERFNNAYSPTFKIPEPYIPEKGAKIMSLQEPEKKMSKSSDNPNSFILIMDPPEVIRKKISRAVTDSLGIVKYSDNQPGVKNLMIILNTLTGESIEAIEKKYEGQGYAKFKEDVAEAIVNELKPIQDKVKNLTTDKAYLESIYKEGAKRASYIANKTLRKVQKKIGFIPVSK >NC_021182.1|WP_015614509.1|1233739_1235398_-|PAS-domain-S-box-protein MSAYSLTNKNKITKKKQKKKFSTKNIKIIYQCYDLLPDPIIIAKKDKVLYVNPEACKLFGLEKPKTVFGKSIFKLISFTSDSDRDTYMHKIKETCFKQFDCKINCTDGHTVNVYLKLRVCNINSKTYNFITIEDVSKMKILENESNTGKELYKKLLNISPDAICLHDGHNFCFPANTLVKMLKYNDSLDIMGKSIIDILPKEYHNHFNDRMKKILNSDEILPDSKYKFINSKNNLIDVECKSVRLYLNGRYVIISSIRDVTEKNKLIAENLKAEANKELLEKTLEYDKLKTEFFSNISHELRTPLNILLSSLQLLNLYLKDEIVNIKPTKKYLSVMKQNCFRLLRLINNLLDITKIDSGFYNLNLCNRNIIAVVENITLSVADYLKNKKINIIFDTDIEEKIIACDEEKIERIILNLLSNSIKFTDVNGTINVNIYDGKDYIKICIIDDGIGIPKEKLNTIFDRFIQIDKSLTRNSKGTGIGLALVKSLVELHNGKIQVESEYGKGCKFTILLPVKIIASEDQSNLYGTFIDTSSQDTKIEKMNIEFSDIYF >NC_021182.1|WP_015614510.1|1235498_1237415_-|diguanylate-cyclase MYFLSLLSLICSIIYLYIGVNIFRLKKDSILTRLFILSCVGMFIWSSSYGLFYITADNTQIVFSKIASLGWCFCPALLLHLCLIFTKNKFSKKRILAYAIYIPGSIFFFIRLFLIGSDTSTSPILLNLFYKFNFIYNLTFTSACYLLLFISYKKSITIKEKKQTRMIILTGTFSYISNIAMQYTLSIYGLKNIPQIDQILNIVIFLGIYYSIINYSLFEISPNLIINNLISQMLGVVIIISPAGEILNINKFMEKLTGYKADSLIGKSIYELIDSKDILDSISKNNYDTGNYIEINCKTKNNEIIPMNISPFPIVNKKINEISGILLVGYDIKNIKKLQQEVEDHRKNEEELKESEEKFKIMFYKHTSIMCLFDPETLRILDVNDAAIKFYGYSYEQLKNMKITEVSKLKEDSLRNIINKIIYSNDTTPYKTKHILSDCNLRDVEIHATPITFKNKKIIFSIINDITERNKNDEHISFLAYHDSLTGLPNRKLFYLKLEQTLYQAQLNNAVFAVLYIDFDGFKAINDTYGHQIGDFVLRTSSQKLKHCIRKEDTLARIGGDEFTILLNDIQNYENAQLVVKKLLSILNDPIIINNHKLFINASIGISLYPLNGDTIDSLIQNADHHMYTIKRQKKKIL >NC_021182.1|WP_015614511.1|1237674_1238481_-|sugar-phosphatase MYKLIAIDMDGTLLKNDKTISKENFDAVQNARKNNVKVVLATGRPVKGIERYLKELNLVGEDEYAVTFNGALVQTTNSKHIIGKALLTLEDFHYLYNLSKELKVNIHAHTEEECITPKSSKYSILEAELNSISLKETDFNNLDKNTIIVKVMFIDEEEILDRVIKSLPKELYEKYTIVRSAPYFLEFLNKESNKGTGVKLLSEKLGIKQDEIICVGDADNDKHMIEYAGLGVAMGNADDKIKELANFVTKSNEDNGIAYIIDKFIFNK >NC_021182.1|WP_015614512.1|1239289_1240879_+|peptide-chain-release-factor-3 MSDFINEIERRRTFAIISHPDAGKTTLTEKLLLYGGAIRMAGSVKARKAAKHAVSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFNYEDYCINILDTPGHQDFSEDTYRTLMAADSAVMVVDAAKGIEAQTRKLFNVCSLRGIPIFTFINKMDRESKDPFELMQQLEEELGIKTYPVNWPIGSGKDFKGVYEREKKVIQVFDGGNHGQTEVETVEGNVEDDVFRDLLGDGLHDKLIEDIELLDIAGDEFNIEKLKKGEITPVFFGSALTNFGVKPFLEEFLKLTPPPLARDSDQGEIDVFRKDFSAFIFKIQANMNKAHRDRIAFMRICSGEFKKGMEVFHVQNGNKVRLTQPQQFLAQDREIIDEAYAGDIIGVFDPGIFNIGDTLCESADKFKFEGIPTFAPEHFARVRTVDTMKRKQFIKGITQISQEGAIQVFKEINIGVEELIVGVVGVLQFEVLEYRLKNEYNVDIKMDRLGFKNIRWIENKDIDPKTLVITSDSKLVKDLDDRNLLLFQSDWSISWALEHNKGLVLSDISKS >NC_021182.1|WP_015614513.1|1241833_1242802_+|porphobilinogen-synthase MFRRHRRLRENSTIRSLVRETVLTPNDFIYPIFVTEGENIKKEIESMPDNYHWSVDRLHELVQQISKAGVKGVMVFGLPDHKDEIGTSAFEEDGIVQKAVREIKELAPDLLVITDVCMCEYTSHGHCGILKNKRVDNDETIKYIAEIALSHAKAGADMVAPSDMMDGRVQAIRNTLDENGYKDVSIMAYSAKYASAFFGPFREAADSAPQFGDRKGYQMDPANIREAMLEIEDDINEGADIIMVKPAMSYLDVIRWARDKFNYPVAAYSVSGEYAMIKAAGKLGVIDEKATAMEVLVSLKRAGADIIITYFALDACHWLRGE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021182_4 | 2220738-2220865 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021182_4
|
1 spacers
spacers of NC_021182_4
>4.1|2220774|56|NC_021182|CRISPRCasFinder ATGATATAATTGGACAAAATAATTTTTTGCCAATATGATGTATATTAAAATTGTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021182_4
The CRISPR arrays of NC_021182_4 >merge|NC_021182|4|2220738-2220865|CRISPRCasFinder AAAAATGAAAAGTGTTATACAATTAAAATGAATTAAATGATATAATTGGACAAAATAATTTTTTGCCAATATGATGTATATTAAAATTGTGCAAAAATGAAAAGTGCTATACAATTAAAATGAATTAA >NC_021182|4|4|2220738-2220865|CRISPRCasFinder AAAAATGAAAAGTGTTATACAATTAAAATGAATTAA ATGATATAATTGGACAAAATAATTTTTTGCCAATATGATGTATATTAAAATTGTGC AAAAATGAAAAGTGCTATACAATTAAAATGAATTAA
>NC_021182.1|WP_015615393.1|2220033_2220636_+|DUF4342-domain-containing-protein MAEITLEKIDIVRERTGVSYTEAKAALEATDGNVVDALIYIEKNAKTTKEQIYTSKEEFIEWIKGIIRKGNVTRIVVRKDEKILVDIPVNAGVAAGVAIMAALPALLAVIFLTAVITKVTVEITKEDGSVEVVNKIIKDAVSNVKDKATEVKDKFTKDQSNGNKSDDSNSYQYTVKFEDVDKEDKEDKEDKEDKEDKEDK >NC_021182.1|WP_015615392.1|2219285_2220032_+|DNA-repair-protein-RecO MSIFNSRGVVIKSQGIKENDKILWIFTEKFGKITVIAKGSKKNKSKLMPISLLFCFANYTLFKGKSMFNINEGEIIDSFQEFLSDLDTLTYTSYLCELIDLSMTEGESNRALFKTFVTAFYLIKNKVGDIETLTRAFEIKLLTLTGYGFNLDYCVKCRKKLSVSNYFSYQYYGGICNQCEKDNGKNISFAAFKALNYLSKLSMDKVYRVNLDSKIKDEIYKILSDLILQSYGKKPKSLEILNSLRGSD >NC_021182.1|WP_015615391.1|2218345_2219239_+|GTPase-Era MHKSGFVTIIGRPNVGKSTLLNYIMGEKLSIVSSKPQTTRNNIQTILTDKNSQLIFVDTPGIHKPKHMLGEYMVKVATDSFKDVDLIVFVTTPDVTMGRGDEFILEQLKEINIPVFLVLNKIDETTQERVAETLKNYSEKFNFKEIIPISAAKGKNVDKLLEIMIENMPEGPQYYPEDMLTDVQERFVISEIIREKALRLLTEEVPHGVAVEIMSMKLNDNNKYNIEATLFCEKNSHKGIIIGKNGSMLKKITKYSREDIGEFLKIKANLKIWVKVKKEWRDNPFLLNELGYKKIKK >NC_021182.1|WP_015615390.1|2217729_2218125_+|cytidine-deaminase MDYKKLILEALKYRERAYAPYSKFKVGAAVIMEDGKIYSGCNIENASYGATNCAERTAIFKAVSEGGKTIKAIAIVGDLHNYTYPCGICRQVIEEFSDYSTDIVLAKNENDYIVKNFGEILPGAFSKKDLN >NC_021182.1|WP_015615389.1|2217004_2217703_+|diacylglycerol-kinase MKVKKVVDSFNYAIDGILYAVRTQRNMRIDMISALLVLTACFFTDLSKVEVLIVTITITMVISAEMINTAVECTVDMSANYYHPLAKIAKNVAAGAVLVTAVNAAIVGYIIFGDKLRPVSFVLIAKIKNSNPYMIFVILVIVSITTLIIKAVFGEGTPLRGGMPSGHSAIAFAVATTITLIAQEPTVIILSYFLAFIVAQSRVDSEVHSILEVLVGGVFGTLLTILLFRLFE >NC_021182.1|WP_015615388.1|2216477_2216981_+|rRNA-maturation-RNase-YbeY MIFIDNRQDKIDFSSENEKTIKDIIDYSLKEEGVNMPYEISVILIDNREIEEINGEMRGIHKITDVLSFPMLEYPEGKVYKQVYGENKFEEIFLDEGMIVLGDIALSLEKAKAQSIEFDHSFIRECAYLTIHSVLHLMGYDHIKEEDKVVMRKREEEILNKFNINRI >NC_021182.1|WP_015615387.1|2214408_2216463_+|HD-family-phosphohydrolase MKLLSLIKGKNARKVYIFFITFAIIYGIMLTSLVTQKYDLKEGDIAKVDIKASREVEDKLATDARRKQATDSVGQQYNKKTEVEGTSEVDLNTNFDKINNIRNSNADINQKASNIKNSIPYNLSDIEINNLISMSKDDFNSFQALIIKNIKGIYSNDIREGNSDDVKKAQDYINLQFSNSKFNKDIIDLGTIISNSYIKPNLFLDEDRTLEMRDSAEKKVSPVIIKKDQIIAKEGEPVTKEQLQMLQDLGLLDNNNSSNWFIYINLAVLIFIILLIEVFYLYRYHERLFEDNSKLILIFLLNVISLILARSIYIISPFLIPLACMPMLLILLIDDRVSLFISILNCILISVVVEFNTQITLISITSALLPAIVLRKMQMRNDILYSSIYIAVINAIITFSVGFLISNNVIDVLTITGFSFLGACISAILTVGFLPFLESVFDIVTTVKLLELSNPNQPLLRRLLMEAPGTYHHSILVANIAEVAAENIGGNPVLTRVCAYYHDIGKIMRPYFFKENQIGNDNPHDKISPNLSALVIISHVKEGLELAREYKLPKTIQDTIAEHHGTTLVKYFYITMKNSSENPKDVNEENFKYPGPIPKTKENAVIMLADCVEASVRSISNPTKGKIEEMVNNIIRDRLNEGQLDNCDLTLKDIDIIRKSFLKTLNGIYHQRIEYPIDKSQIKK >NC_021182.1|WP_015615386.1|2213215_2214358_+|sporulation-protein-YqfD MGNKFNFKEYKNGTITVQLQSKEIERIINVMWSHGIVIKNIKRNSINVITFDTSFNNYYKVKELATRTKSKIKIINRRGMIFLKMKLKNRIAMVLGIFIFIGIISYLSNYIWGIDITTEKNIAPYEIRDELKNIGIAPGINKKNINVYDIEEKLKTNNENIMWVRVRIQGSKLKVTATERQSPPEVINDDSPCNLVAKKDGQIVRIYTKAGTAVVKQGDIVRKGQLIVKGEQGNEGSTYQVHASGSVIAKIYYEETREVPLSRTEKNRTGNKIVNYYISIFGKKFYLKNSLNKFAKYDKIEENDNFIKKEIYCEVKEKNIKTDPKVAVNQTADAIYQNLVINFNKSVNIIDKVVESSVQGNMCKVRVLVTTEEDIAETAK >NC_021182.1|WP_015615385.1|2212932_2213214_+|sporulation-protein-YqfC MQNKISKVKKNLAEKLDIPRDVVLNIPKIIIVGNDEITIENHHGILQFSDNFIRIKSSLGNIGVQGSGFEILFISGTTIVLSGIFKSVEYEGK >NC_021182.1|WP_015615384.1|2212371_2212815_+|GatB/YqeY-domain-containing-protein MSLKEKLQQDWKDALKGRDKFKVNVISMAKAAILQIEKTKAVKLNDEEVIEVLAKEVKSRRDALLEFEKGKRQDLVDTANAEIEILMSYLPQQLTEDELKDIIKGAASEVGANSIKDMGKIMAAIMPKTKGRADNSMISSLVKEYLK >NC_021182.1|WP_172638645.1|2220910_2221543_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKLSQRQKEIIDLVKEKQPITSEQLAGKLNLTRAALRPDLAILTMTGILEAKPKVGYIYSKKPSYSILYDYIRNIKAKDIMSKPVVMDEETKVYDAIVYLFLNDVGTLFIENKGYLVGAVSRKDFLKTAIGGTDMHQVPTGVIMTRMPNIIWVEAGDSAYLAAKKIIEHEVDSLPVVEKVIEGSKELYKIVGKISKTNITKLFVKLGNDV >NC_021182.1|WP_015615395.1|2221617_2224248_+|pyruvate,-phosphate-dikinase MENKKYVYLFSEGNARMRNLLGGKGANLAEMTNLGIPVPQGFTISTEACIKYYEDEKNVSDDIIIQINKAIQEIEKITCKRFGNSDNPLLLSVRSGARVSMPGMMDTILNLGLNDITVEKIVKLTNNIRFAYDSYRRFIQMFSDVVMGIEKRKFEDLIDKAKEEKKVKFDTELDENDLKKLVVQYKKLYAEEIGKPFPEDPKDQLIESVTAVFRSWNNPRAIVYRRLNDIPGEWGTAVNVQTMVFGNMGNTSGTGVAFTRNPATGENKIFGEYLINAQGEDVVAGIRTPQPITKLKEDSPQCYEEFINIAHSLENHYKDMQDMEFTIEQGKLYFLQTRNGKRTAQAALKIAVDMVNEGSLTKEEAILKVEPKQLETLLHPAFDTDEIKKATCIAKGLPASPGAACGKVYFTAEDAKEQHEKGEKVVLVRLETSPEDIEGMVAAEGILTVRGGMTSHAAVVARGMGTCCVAGCGKINIDEEKKVFQVGGKQYSEGDYISLDGSTGNVYGEAIKTTLPEISGDFEIFMKWADDIKKLQVRTNADTPKEAAEAVKFGAKGIGLCRTEHMFFEEDRIPAVREMIVATTVEQRKKALDKLLPMQKKDFIGIYEAMEGKPVTIRFLDPPLHEFLPSEEEDIRALSKEMGISFDELKITVASLHEFNPMMGHRGCRLTVSYPEIAQMQTTAIIEAALEVNKRKGFNIVPEIMIPLVGEIKELKFVKDIVLKTANEIIDKSGEKLKYSVGTMIEIPRAALTADEIAKEAEFFSFGTNDLTQMTFGFSRDDAGKFLDDYYENKIYEFDPFEKLDQIGVGKLVKIAAELGKKTRPDIHLGICGEHGGDPSSVEFCHNVGLDYVSCSPFRVPLARLAAAQAQVKNPR >NC_021182.1|WP_015615396.1|2224359_2225412_-|CotS-family-spore-coat-protein MPQPAVKYILLSEDKLRKFILSKYNLQDASICQVKFKDTDKQRAVYKIESNSKAYCLKKVYYTKEELLFVYSSIEWLYRFQLNVPRILPTESGGRFVIYNDMIFILTSWIEGEKCDYDNTTHIIESARTLAEMHKATENFFPIAGSNMRLGYEDISSSMNRHFHQLLSYSNLAFEYEDVFSSIFVKNFNICINLAKISNDVASHINSDNMRKSLCHLDFVNKNIIFDIDNKVWIIDFDKCKIDYCAHDISYFLRRFLKRENTNWDLKLLVNCLYEYENTLPLTIDDYRYILSYISFPQKYWKLARDYYNNIDKCNKAAFISLLEKTVKHTEKQLEMIYGFKNFIEKNYLL >NC_021182.1|WP_015615397.1|2225727_2226756_+|deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase MSIREIIEEKEKKSMNICGTISVKTIGREIKEEPDEIRTSFMVDRDRIVHSKSFRRLKHKTQVFIKPFGDHYRTRLTHTVEVSQIARTIGKGIGLNEDLIEAISLGHDIGHVAFAHNGEEILNELLPNGFSHNINSIRVLTKLENQGKGLNLTKEVLDGILNHSGFSNKNKRAFTLEGQVVKYSDKIAYVNHDIDDSIRAGILHEEELPKDYIEILGTNCSNRVDTLVKDCIYNTLKNIEEGKIEVSLSKDIESALLGLRSFMFKNVYSGSKLKVERNKAKFILEQVFFYFLKNEKELPQFYRGIVNREGLYQGVADYISGMSDDYCLLTFNEKYVPKLVVY >NC_021182.1|WP_015615398.1|2227072_2228845_+|DNA-primase MIPEDVIEKIKYENDIVDVISDTVKLKRSGRNYMGLCPFHSEKSPSFSVSVDKQIYKCFGCGEAGNVITFVMKTKNLSFIEAVKTLAERIHMDLDYLEKGNSKKKNENDKLFKLNVDAARFFFSNLNSNKMAKNYFIGRGILESTIRSFGLGYALNDWHGIMNFLKKKGYSDLDLLNAGLIIKNEKGNKYDRFRNRVIFPVFDYKGKVIGFGGRVLDDSKPKYLNSPETALFKKGINLYGLNFALKRDNKRTFIIVEGYMDCITLHQYGITNTVASLGTALTVNQAKLLKRYADNIIISYDADTAGQTATLRGLKILRDVGLVVKVLKVPEGKDPDEFIRNNGKEAFEVLINNAMPIIDYRIKMAGDNINFKNNEEIPAYIKQIADILIDLDPIEKDVYIKKVSENTDIKEQAIYDLLSEEMHKNTNDLQNVNNMDNYGQKLYLEPAYIKAERLLLKLMNFNREAYDYITEKLSSDDLNLESHKKIFNLIIENRSLDEEHRKKAIEMKCTDPESSSEWINICEEKFNNNNCDMEELIDDYIINVKKFKLEESKKEIMKEIKYYETKGMVEKSLEKVKELNMIQEEINNLL >NC_021182.1|WP_015615399.1|2228866_2229988_+|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoD MKEKKQSEAEVKGVEQEANLKTQSEKMEFVKKLVDKGKKKGNLTYKEIMDELENIDLSPEQIEKVYEVLETMGIDIIGDIQDIEVEEEELDLSVPEGIAIDDPVRMYLKEIGKVPLLSPDEEINLAQRIEDGDQVAKKKLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMQFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYRKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGREPQAEEIAKIMEMPVDKVREIMKIAQEPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAFTMLKEQLINVLDTLTPREEKVLRLRFGLDDGRARTLEEVGKEFNVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLKDYLD >NC_021182.1|WP_015615400.1|2230092_2230983_+|DUF2679-domain-containing-protein MEYFKPLDRRKGMEFIILITLLFDILIGLGSIYLNDYVLNIFLRAFLIAFNIYQFYHVALFVTLNYAVDNEAFYIITFGGIKKTILPFKEMERYCKSSGSIEAVKLSGYGKKNFVIGKCFFKKFGFVNMYVTSSKNIFYLKNNQEVYGVSPESFKSFEDKLISENIAIGDWHVKLNKPMNLYRDKHFMIPLIVSIIIITFFTLHPAILYYKNLLPSSMPLSFNIKFQPTIIGTSRDFLFKQMSYSAFNTAILLCMYFAAHFSAKHNRKSAYKYIYVSLIIALIFLLIQQRIISRVI >NC_021182.1|WP_015615401.1|2231207_2231897_+|SAM-dependent-methyltransferase MDISNRLKSIANMVEKCECIADVGTDHAYLPIYLVEQGICNRAIASDINKGPVEKAKRNIYFSHRSEQIQCRLGAGLTTILPQEVNCAVIAGMGGNLIRDILEESIDVFKSLDYVILQPVQNVDVLRKYILENGYNIIDEELCVDENKYYEIIKIAYDSKLEKFDNIYCEISKKLLEKKHPLLKKYIFFKIRKYDKILTDINYTSKLAMSRKCELEGKVIKLKELLKCL >NC_021182.1|WP_015615402.1|2231887_2232703_+|Nif3-like-dinuclear-metal-center-hexameric-protein MSLRVKDICSIMEKVAPKKLSQNYDNVGLMVGNFEKNISSILVALDCTLTVIEEAKRKKCNFIFTHHPLLFKRPNSITTGTLLGEKIIKLIKDDIDLYSSHTNLDSVKGGLNDILVEILGFSNASVIEPSTAEGFNDGNSGIGRVVVLDKRIKLSELCELVKEKLELTHLTYTGEEESFIEKIALINGSGTSYMDMSRKLGVDCIITGDVTYHYASDYAEMGIAVIDAGHFGTEWLALKKVASVLKNEINKLGYNNSVLLSEVTRNPYKTK >NC_021182.1|WP_015615403.1|2232817_2233552_+|DNA-binding-protein MGNSKLLLELQRCYQDIEESKKVLNDGSYLYLLKKMKKEFENMKDKYNGKRKALGDLKIEYTSIGKDLRNLKNKIDKNEHDLYNNADNDVKSINALQNNIEINKEKLKALEDKAIELLEVEEKLKLDIESLKMDLINVKNNFYNYKKVTSEKINDAKDKLKESEDRVEELKKIIPENELKVFYSMIDKRKVAVVKLKNEICEGCKMRVSSVTLDNIYKGKDIVYCDNCGRILIYDNGKKLKEAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021182_5 | 4416526-4416624 | Orphan |
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Consensus repeat of NC_021182_5
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spacers of NC_021182_5
>5.1|4416563|25|NC_021182|CRISPRCasFinder AAATTAACTTAACTTGAATACATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021182_5
The CRISPR arrays of NC_021182_5 >merge|NC_021182|5|4416526-4416624|CRISPRCasFinder TATAACAAAATCGTGTAGATAAAATAAAGATTTTGTTAAATTAACTTAACTTGAATACATTATATAACAAAATTGTGTAGATAAAATAAAGATTTTGTT >NC_021182|5|5|4416526-4416624|CRISPRCasFinder TATAACAAAATCGTGTAGATAAAATAAAGATTTTGTT AAATTAACTTAACTTGAATACATTA TATAACAAAATTGTGTAGATAAAATAAAGATTTTGTT
>NC_021182.1|WP_015617340.1|4415243_4416470_-|O-acetylhomoserine-aminocarboxypropyltransferase/cysteine-synthase MNFNTKLIHGNRKKDEIGATNTPIYLSNAYAHDSAEKLESILMGNSMGYAYTRISNPTVTAFERRIASIEGGMVATSAASGMSAIYLAITNIVETGDEIIASSGLFGGTYTLMRNLKSFGVSVKFLDSINEETLKENITDNTKLVFAETIGNPKLDILDIDSVSKVCKDNNVILIVDSTVTTPYLIKPLEHGADIVIHSTSKYINGTSNSIGGIIVDGGSNKYSDEKFKNFKDFSKKFGKMAFTAKLRATVGRDLGAALSPVNAFLNLTGIETLSLRMKEHCKNAMAVAEYLSGNKKVVSVNYPKLKGSEYYSLAEKYYERGASGVLTFRLGTKENAFKFVNNLKLISNLTNIGDTKTLVIHPSSTICAGNTEEEKLQMGVYDDLLRMSVGIEDIEDIIADIENALSI >NC_021182.1|WP_015617339.1|4414573_4415164_-|adenylyl-sulfate-kinase MGIKATNIVWQQTNVSRQDREKLLRQKGILIWFTGLSGSGKSTVATMLEKKLHDMGKLTYLLDGDNVRHGLNSDLGFSIEDRIENIRRIAELSKLFVDSGVITITTFISPFIKDREAVKELLKDDFIEVYVDCPIEVCEKRDPKGIYKKARKGEIKNFTGIDSPYEPPVNPEITVKTHIDSLEECVSKIIDYLELK >NC_021182.1|WP_015617338.1|4412811_4414497_-|adenylyl-sulfate-reductase-subunit-alpha MRLEPRISTTDILIIGGGAAGCFAAITAAKSNIKVTIAEKANIKRSGCLAAGVNALNAYITRDETPESFVEYVKKEFNGVIREDLVYSIAKRLNKVTKDIEDAGLTILKDEAGEYITRGKRSIKINGENIKPILAVAVKNIENIEVINKLNIIDYIEKDGKIIGAYGFSLDTDEFYVIHAKSVICTTGGAAGVYKPNNPTFSRHKMWYSPFDTGAGYAMGIRAGAEMTTFEMRFIALRCKDTIAPTGTIAQGVRTPQVNGSKELYVNKYGKPTTINRLYATVMENLNGEGPCYLKTTGITEEQNEELLKAYLNMAPAQTLKWIENGTSPATEDVEIEGTEPYIVGGHTASGYWVDTNRKTTLKGLYAAGDVAGGSPKKYVTGCFAEAEIAAQEAVKYIQSVQLQEVLEADIKDKLKEINSFFENKFSLYSIEEVEEAMQKVMDEYSGGISQNYRYSARKLSIAAKRIEELIEITEKLNAKDTHELLFIYEILDRLYVAKVLICHLSARHETRWKCYQENEDYTQRDDENWLRYVNSTYRDGKVKIIFRDLVGRDEIYEHKN >NC_021182.1|WP_015617337.1|4412513_4412828_-|ferredoxin-family-protein MSIKIDKDKCVGCGKCIDVCPGTLIYKDKENKAYIKYEKNCWGCTACLKECKVAAIKYYLGADIGGNGASLYVEQDKDILNWNITDKNGEKVVISTNRKEANRY >NC_021182.1|WP_015617336.1|4411333_4412389_-|aliphatic-sulfonate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKGKKILFSLVAMLTIGVLAGCSSANNTSGSSNTTGSKPLDTVRIAYFPNITHSQALVGMQNGQFQKDLGSTKIEWKQFNAGPSEIEAFLSGAVDIGYIGPGPAINGYTKSKGDLQIIAGATDAGAVLIGKKDSAIKSVKDLSGKKVAIPQFGNTQDLCLRFLLQENGLKDTTKGGTVQIVQADNPDIVSLLDKGSIDAALVPEPWGATIQAKSGASIILDYNQIWKQGKYSTAVVVARKEFIKDHPDVVEKFLKTHVELTDYLNKSQTEASTKVNDELNTLTKKPLDKSVLDTAFKRLTVTVNPETEATKEMIDMSVKAGFIKEKPDDKGLFDLTILNKVLKAKGEKTIN >NC_021182.1|WP_015617335.1|4410275_4411115_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSLVIDGVSKKFITKSKETFTLDNINLSFKKGEFICLLGPSGCGKSTLLNIIAGLEKPTSGKVTLKDKEVKEVGPDKAFMFQEAALFPWLSVIENVEFGMKMADVSKEQRREKALKYLKMVHLTKFQNSFPHELSGGMRQRVSLARALTLDSEVLLMDEPFSALDSQTKSILQLELQKIWWETKKTIVFVTHNVEEAVLLGDRVIVMSANPGRVKREFKIELARPREAQSIDLTYVVSEVMKELKEEVEKVAKAEYDSDWSIEENNILYNSDNDMGNGL >NC_021182.1|WP_155242018.1|4409566_4410319_-|ABC-transporter-permease-subunit MFYIILIMIWEMVYKIGVDALGIWKPYSFPSPIDVFKTLKSLIGDNSLFIATVVSLRRLLIGYLISLVIGLPLGLIVVRYKYLDENLSSLILGLQTLPSVCWLPFAILWYGLNESSILFVVTIGSVFAVCMATESGIKNVNPIHIKAGKIMGAKGIKLYWNVVVPSALPDIIGGMKQGWSFAWRALIAGEMLSATKGLGQILMVGRDLADISQVVAVMIVIIVLGLIIDKLIFGALENSVRNKRGLGRVL >NC_021182.1|WP_015617332.1|4408643_4409444_-|sulfate-adenylyltransferase-subunit-2 MDHLDRLEAESIYILREAYKHFGKLGMLWSVGKDSTVMLWLAEKAFFGNCPFPLIHVDTTFKIPEMIKFRDKVAKDYNLNLIVNTNWKALEEGMGPQKGRLVCCKALKTDGLQEVVSKYEFEGLIVGVRRDEEGSRSKERVFSERNAESEWDYTDQPPELWDQFKTDFKKGNHIRIHPLLGWREIDIWEYIKRENIPVVDLYFAKNGKRYRSLGCAPCTNPIESSASNVDEIIEELKNTKETERSGRAQDQEDAHALEKLRKHGYM >NC_021182.1|WP_015617331.1|4406795_4408628_-|adenylyl-sulfate-kinase MKSERENLNIVVVGHVDHGKSTLIGRLLYDTDSLPAGAIEKVKKISAEKGKSFEYAYLLDAFEEEQKQGITIDITMIQFFTKKRDYVIIDAPGHKEFLKNMISGAASAEAAFLLIDAKEGIQEQSKRHGYILSLLGIKKVYVLVNKMDLVDYSEERFNEIQVQFNEFLNNLNVYPEKYIPISAFNGQNITSKPSEMPWYKGDYVLECMDKIEKAKGIEEKPLRFPIQDVYKFDDRRIIAGRIEAGTLKNGDEIVIYPGGKTTRIKSIEAWQGKDKTDVISAGMSVGITVEDEFFNKRGEVICHKEDHVATANIFNANVFWMGKNNLERGKKYKLKIATQEVEFEVFSINKIIDAASLKTNSELNYIKKNDVAEVTIKTKTPICFDAFGNIQALGRFVIIDDYNTAGGGIISNVEDSLNREVTNVKSKNITIRKRLVSRKDREEALGQKGKVIWLTGLPGCGKNEIAVKLEKKLFELGKKVYYIDSANVRFGLSSDLDFSPKDSYEQTRRISEVSNLFADSGTITIVTSVSRFKEAREYSRKVIGKDNYVEILVEASNEICKKRNPNAFTEDCDNVFDYEKSEYPVISLNIDEAEFNSDKKAEAIIDLLNL >NC_021182.1|WP_015617330.1|4405319_4406396_-|glutamyl-tRNA-reductase MYYLVMAGVDYKNSKLTTREKVNFTSSAIKRAFERIKSEGILKEAVILSTCNRSEIYGILEKENGEEYLRSFYCSFFNIDTEEIKDNVVCRSGFQVIDHLFQVTNGFKSMVLGEDQILGQVKNAYSEALTNKASGKILNRLFLSAITNAKKVKTITNISQTSISVSSIGIKLIHKHFGKLKGKKVLVVGLGKMSKIAIKYLLSEGVEKIYVTNRTKNKIMDMEIIADNIQGIDFDNKYEAVKDVDIIISCTGAPHFVIHKEEFLNNYSGNSMCILDLAVPRDVEPDIGNIENVSLYVIDDIEKIAKENENKRRIEFNRGMILVREDISKYLEWIVNENIDIYQCDSSSRITLEKDVAL >NC_021182.1|WP_015617341.1|4416646_4418950_-|sulfurtransferase-TusA-family-protein MIQITEDNFKAIEDFKEKADQYKNGDIDPLRFKAFRVSMGVYEQREKETYMVRTRVPGGVITLQQLQTINDIAKEYANGRMHITSRQDLQFHNVKLEDVYDIMKQLIEVGIITKGTGGNTVRNVQCAALSGVSTDDVFDVTPYVREVTNHLIKDPSNMNLPRKYKLAFSNSPVDEADATISDLGFIAKVQDGKKGFEVYGGGGFGGNPRVSLKLADFIEDKDVIYYVQGMKELFEKEGDRSNKNKARIRYIVARLGKEKFIQRFEEELARVRKENNLEINIDEPYEKYDTDNIETIDKPLKNIIFPQKQKGLYSVYVHPQSGNLASENLDKVINFINTLDYGTSIRVTNTQAFFVRDLKEKDVAKLSDIILQFTSRFNIDNSITCAGASTCQLGLCLSQNLLKGIKEEFKDASDDIKYALPRIYISGCPNSCAVHEKGKIGLSGRAKRTEDGLIPMYTIFLGGKVGAGGAKMGEVYGDILAKKVPKYLYKLAELKSKSSYENFDEFLDNSKEEIKKLVKEYSTLESFAENADLYYDFGACNKFTLEGRGAGECSTGVVDVIKLDLANAEGALEKYKTTKENADLYSSAVSSARALLVLNGVDTNKDREIFKAFKKDFVDTGYVKAEIGDLFDTLIDFKLGDIKNIADKAEDISYLYNKVRAMYDSLDGQLHITLPKEVEKEETKKNLEDKQENSYEVIDFRGVKCPINFVKVKVELAKIKSGEKRGFYLDDGAPIDNVPKSVEKEGHRIVDIDTNYDGYNLLIVEKK >NC_021182.1|WP_041711019.1|4418981_4419389_-|M67-family-metallopeptidase MIYIEKKEYEKIIEQAKKEFPNECCGFLAGNKKDQDLFIKTAYAMTNIDASSEHFSMDPKDQFKAVKAIREENMELIGNYHSHPYTPSRPSEEDKRLAYDPKAIYGILSLEKEVPVFNLFKIEKGNVEKIQYEII >NC_021182.1|WP_015617343.1|4419451_4420282_-|HesA/MoeB/ThiF-family-protein MDFSEEQIERYSRHIILSEVGVEGQEKLLNSKVLIIGTGGLGAPAAMYLAAAGIGTIGLVDGDAVDLSNLQRQIIHQTADVGKLKAESGKETINAINPDVKVITYNEFATSENIMDIIKDQDYDFILDGTDNFPAKFLINDACVLAKKPFSHAGIIRFQGQLTTYIPDNGTPCYRCIFQSPPPEGVVPTCREAGVIGAMGGIIGTLQAMEAIKYLLGLGETLAGYLLTYDALKMEFKKIKINYNKRCGVCGDNPTIDTLIDYAKPACDLKTGNLGM >NC_021182.1|WP_015617344.1|4420271_4420487_-|sulfur-carrier-protein-ThiS MKIKVNGEVKEIKDAVTVTEILKIENVEMPDMVSVQLNGEFAERDKFDTTVLKENDEIEFLYFMGGGSCGF >NC_021182.1|WP_015617345.1|4420568_4421771_-|ROK-family-transcriptional-regulator MTKVIDTLKNMNRDGKNIFSILQKNGPLTKAQIMDLTKLKLTTLNRIIKPIIDEKLIVEASIGESTGGRRPSLYDVNMTDYAFIGIDISRIYTQVIFADFKLNIIHKERFSMDSSYSPEKTVDRITDICKNAIHMAELMNKELIAVGLGTVGPMDIYKGIMKSPANFMSKGWTGTPIKEMLQKNLNLEVYMDNGANAAVTVEYLFGYGKNLKNIAYFNFGIGIRTGAISDGNIVRTINDAEDAFAHMVIDVDGEKCICGNYGCVECYSSIKSITKNFKKRIAMGESTKIQKSIDDINYIDISLAAQNGDNVSEEVIKKAAEIFGTGLSNFINLLNPELIILSGPLIMVSELFYKISVATAKQKCYLSKHSNIFFNRGGYFKENAISAGAAAMAIENLLRE >NC_021182.1|WP_015617346.1|4422010_4422664_-|bifunctional-precorrin-2-dehydrogenase/sirohydrochlorin-ferrochelatase MNEYYPIMLNVKSKKCGVIGGGKVAYRKITALLECGAEVLVISREIIQDIEILVNENKVIYLEDNYDFKYISDLYLVYAATNEKNINNKIYKQCNEKNILVNVVDEPDICNFIVPSKIRRGDLTIAVSTNGKSPMLAKKIREDLEEIYDDRYEIFLDIMGQIRKEAFAILKDSKRRSEFYRHVIYSNFINRLSYDNKESIQKEIMDILIEYKSNGKL >NC_021182.1|WP_041711021.1|4422982_4423414_+|HAD-hydrolase-like-protein MKKVEGCIFHLDYILNYSKNSIGLKDLKRFLINLRMSDMKLAVISNNNNLLDIVKILKIEDFFDVISDNNLDSDFKPLLLKAAENLNIAPENCVVFDSEIDGLNEAKLLNMTAIGIGINIETNMADRIIPNLSDVNSSILNFS >NC_021182.1|WP_080648354.1|4423516_4424533_-|peptide-chain-release-factor-2 MQVKIEELENIMQEPGFWDDMKRAQEIAQEAKGLKDRVELVNSLEQKLDDVKVLIEMCQEEEDEAVLDEIVSEIKELNLSIDKFRIEILLSGEYDRNNAILDLHTGAGGTDAQDWTEMLLRMYTRWAESKNFKVETLDLLPGDEAGIKSVTLKITGEFAYGYLKAEKGIHRLVRISPFNANGKRQTSFASVEVLPELTESQDIDIKTDDLRIDTYRSSGAGGQHVNKTESAIRITHIPTGIVVQCQNERSQHSNKESAMTMLKAKLVELKERAHKEKIEDLTGELKDNGFGSQIRSYVFQPYTMVKDHRTGVEMGNIDSVMDGDIDNFITEYLKKNSL >NC_021182.1|WP_015617348.1|4424640_4427148_-|preprotein-translocase-subunit-SecA MGILGKIFGSYSEREVKRIIPIVDKIESFDEKTSVLDDNELKEKTEEFKNRLNNGETLDDILPEAFAVVREASYRVLGMKHFREQLIGGIVLHQGRISEMKTGEGKTLVATLPSYLNALSGKGVHIVTVNDYLAKRDKEWMGKVYEFLGLSVGVILHNLNQDERKEAYCSDITYGTNNEFGFDYLRDNMVIYKEERVQRPLNYSIVDEVDSILIDESRTPLIISGEGDKSTEFYKVADGFAKTLKKEDYTVDEKSNSVILNDSGVEKAEKFFDLENYADSENMEIQHHLSQALKANYMMKKDKDYMVKDGEVIIVDEFTGRLMEGRRYSDGLHQAIEAKESVKVQKESKTLATITFQNYFRLYNKLSGMTGTALTEEVEFREIYGLDVIVVPTHRGIARKDFPDLVYKTEMGKFNAIVDEIVETNKNGQPVLVGTVSIEKSEVLSELLKRKGIRHQVLNAKYHEKEAEIISRAGEKGSITIATNMAGRGTDIKLGDDVVEFGGLKIIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGSSRFYVSLEDDLMRIFGSDKLSGMVDRLGLQDDEAIESKMVSNAIENAQKKVEGNNFDIRKTLLKYDDVMNQQREIMYKQRAQVLEGEDMKSQIQAMIKDLVYTSVDSHLTDIEENIEEDLSHLIEFLEDIYLPKSKITVDELKVMSNEEIKEKLLQTAMDIYTEKEENFGSEQMRDIERVILLRVVDTKWMDHIDNMDHLKQGMGLRAYRQQDPVQAYQFEGSQMFDEMIYNIKVETVKYLYRVQVERAPERLRVIRPTTTNHGDTEEVREPIRRKEEKVGRNDPCPCGSGKKYKNCCGRRA >NC_021182.1|WP_015617349.1|4427467_4428004_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MRITISGKNVEVTNGLRSALEKKLTKLDRYFNPDVTAHATLSVENYRQIVEVTILFGGAILRGEESNTDMYAAIDLVADKMERQVRKQKTKLEKRKYGASLRFQSIPDFEQDNKDEVKEPSIVKTKRFAIKPMSEEEAVLQMELLAHSFFVFQNADSSEVNVVYKRKDGNYGLIEPEF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021182_6 | 4648580-4648672 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_021182_6
|
1 spacers
spacers of NC_021182_6
>6.1|4648606|41|NC_021182|CRISPRCasFinder AAATAGAATCCCTACTTTATTTTAATATTAAATCTAATGAT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021182_6
The CRISPR arrays of NC_021182_6 >merge|NC_021182|6|4648580-4648672|CRISPRCasFinder TTTTCCATTTCTAATTACTTTACATGAAATAGAATCCCTACTTTATTTTAATATTAAATCTAATGATTTTTCCATTTCTAATTACTTTACATG >NC_021182|6|6|4648580-4648672|CRISPRCasFinder TTTTCCATTTCTAATTACTTTACATG AAATAGAATCCCTACTTTATTTTAATATTAAATCTAATGAT TTTTCCATTTCTAATTACTTTACATG
>NC_021182.1|WP_015617550.1|4647557_4648121_-|aminoacyl-tRNA-hydrolase MYLIVGLGNPGKEYEKTRHNVGFDILDLMCDKYNINMNRTKFKGVYGEGKIEQEKVIFLKPTTFMNLSGESVKEVCDFYKIQSENVIIIYDDISLDVGRMRIRKSGSAGGHNGIKNIIFNLSTEVFPRIKVGVGISKGDLISHVLGRFNQDDRVEVEKVFSAVIDAVDCIITKGICEAMNNFNGLKV >NC_021182.1|WP_015617549.1|4644020_4647539_-|transcription-repair-coupling-factor MRFRGLIQPLRESREFINILYNINKNKFPIGISGLSESARSYFVYSLYEEINAPFVVVTDNDVEAKKLYEDLSLYLSNVYYFPTKDVVFYNVDAISGDLRWERIKIIKEMLLKGRKIIVTSIEAFSSYYSPVELYKKYTFNIGLGDAINLDKFSKELILSGYERVETVDSKGQFSIRGGIFDIFPPISNMPYRIEFFGDEIESIRTFNTGSQRSIEKVTKVDIFPAKEIILEESNIERGYNLIKEELSVVVENLKEKKDKEAKGKISGIINRNLEALRESSTFETIDSFLPFFYDKPSTFFDFIQDSIIIIADDLRCKGKLSSVFFEFQENYKAFLERGDILPGQGELLFPEKEIYEVLNSSKIINITGIEKSKGFLKNTYDESFREITLSNFGGVLEVLINEIKDKKDKGYKTVILCGSKPRGERLVNTLRDRGIESNYRDEIQSIQFGEIVITFGSLNKSFEYPDLKLCVISDKEIFGESKRKSKKKIQKGVSKIKSFAELKPGDYIVHVNHGIGVYKGIKQLEVEGHKKDYLELTYTGDDKLFVPVEQLDLVQKYIGSDGNSPKVSKLGGNEWTKAKNKVKKSINEIAEELVKLYAVRSTLNGYTYSKDTIWQKQFEDEFPYDETPDQLSAIEDIKHDMEIGKVMDRLLCGDVGYGKTEVAVRTAFKAVMDGKQVAFLVPTTILAEQHYTNLKKRFSDFPVKIDMISRFRTSAQQKVTIKALKEGNVDVLIGTHRILQKDVQFKDLGLLIVDEEQRFGVTHKEKIKNLKKNIDVLTLTATPIPRTLHMSLTGVRDISVMETPPEERYPVQTYVVEYNDQLIRDAVMRELNRDGQVFFVYNRVETINDMAAKLTKLIPEAKVAVAHGQMTERELETEMLGFMNKEYDILLCTTIIETGIDIQNVNTMIIYDADKMGLSQLYQLRGRVGRTNRIAYAYFTYRKDKVLTEIAEKRLKAIKEFTELGSGFKIAMRDLEIRGAGNMMGSAQHGHMASIGYDLYCRMLEDAIKQYKGDVEKEPIETSIELKIDAYIPNSYIENEVQKIEIYKKIASIESKEEFFDIQEELEDRYSDIPISVANLMHIAYIKSLAKKVGIIDIKDKKDFVNFKFYDKNRITDKLVKSLIKDYNRSIVFRLEDKPIIVYNLRNSKRENLLINLTELLEYIISIVETK >NC_021182.1|WP_015617548.1|4642932_4643940_-|peptidylprolyl-isomerase MRNVKKIVSFAIVGMLAVAISGCNMIAKTQQGILNSTVAQVNNEKITRGQLEDSWQMKSLISQIKQQYGNNYTSNDQAIAALKQQKQTILDQMVTETLFLQKAKELKLIPSDSELQSEVTKQYDSAKSQYKTDAEWKTALSQNGFTEQSLKDEIKRELTLNKVNDYITKNVKVTDKQIQDYYNANQTQFTTQPNKIHLAHILVATEAEANQVKTRIDKGEDFAKVAKEVSTDTGSKDNGGDLGDVEEANSGLDPTFLKAGMALKPGEVSQPVHTQFGWHVIKCITKTEYPVKKLDEVKSDIQTNLLNTAKQSEVQKTTDTWKKAAQIKQYPNNLQ >NC_021182.1|WP_015617547.1|4642053_4642608_-|stage-V-sporulation-protein-T MKATGIVRRIDDLGRVVIPKEIRRTLRIREGDPLEIFTDREGGVILKKYSPIGELSDFSKEYAESLNASSGHIVLISDKDNIISVSGGVKKEYLEKRVSDELEKVMDDRKLVNINDNDNKAIPLIEDEDTEGKYSAQIISPIIAEGDSIGAVIIMSKEDGVTFSQIEEKLGETASLFLGKQMEQ >NC_021182.1|WP_015617546.1|4640328_4641870_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MKKQSLIRGTVILGMAGIVAKFLGIFFRWPLIMLIGDEGIGYYQMSYPMYMFFIATASGIPVAISKLVSERNAVGDRDGANLVLRKALVLMIIIGGGFTAFILIFSNKLIIFLNWDRKSYYSLIAIAFAPLFISIVSAFRGFFQGMQNMNPTAISQIFEQLGRVMVGVGLAYILLPRGIEYSAGGAAFGAVAGAVAAGIYLIGKYINVRKEFKIVKHKKNYEIMSKLLYIAIPISLGSAVSSIMGLLDSIIVPQKLIMAGFNYKEATILYGQLTGKAFVLVNVPLTLSIALCASLVPIISEAYILNRRQEVIHKLHLAIKVSMVIAIPSLCGLFFMARPILNLIFPGHGDGYLILKYLSICIPFIVLAQTCTAVLQGVGKYFYPVINLFFGCIVKVTITLYLVQMPEINIYGAVIGTIFGYMTAAMLNIRLVKKYLNVKINFYESIIKPAYASIIMVIAVVFIYLNVYNNTMSNSIACFVAIFLGVIIYLILILLFGIFSYSQIKRRIGRRKL >NC_021182.1|WP_015617545.1|4638848_4640300_-|nucleoside-triphosphate-pyrophosphohydrolase MINIVGLGPGSLESLTMGAIQIIKQNSNIFLRTIKHPTVKFLKDEGLDFLTYDGKYEQAENFDEVYSSIAEDLLKQHELLGNIVYAVPGHPLVAEKSVNILLKLCKDRKIQVNILPAVSFIDAVMEALEIDPIEGIKVIDAFDINNQIMDKRIGTIITQVYNNFIASEVKLALLNYYRDDTEIYFVRSAGIKNDESIRKILLYELDRQQDIDYLTSIYIPKDLNNNKDFYDLVNIMDILRGENGCPWDKKQNHDSIKRGLIEESYEVLEAIDKKDENMIVEELGDVLFQIIFHSQIGKEDGYFNVNDVIEGICNKMVDRHPHIFGNEIADTSEAVIDRWDQIKMKEQKLTNHADELKHIAKNLPALIRAEKVQKKAAKIGFDWDKVEEAMDKVLEELNEVKDVYKGSNRDKILEEVGDLAFSVVNVSRFLDIDPENALNYTIDKFIRRFEFIELKAKEMNIILEDMTLGEMDKLWNEAKSLKI >NC_021182.1|WP_172638658.1|4638470_4638845_-|HU-family-DNA-binding-protein MYVNYLLKRRNFVIYEEYAIKLMYILNFKEVTKVNKAELITSIAEKSNLTKKDAEIALKGFIESIEEALEKGEKVQLVGFGTFETRERAERKGRNPRSKEEITIPASTVPVFKAGKEFKDRVNK >NC_021182.1|WP_015617543.1|4638115_4638373_-|RNA-binding-S4-domain-containing-protein MRLDKYLKISRIIKRRTVAKEACESGRVFINGKLAKPSSEVNEEDIIEIKYSEKVLKAKIMNISNHVLKENANQMYEIISDKKDN >NC_021182.1|WP_015617542.1|4637746_4638028_-|sporulation-protein-YabP MEVKVEDKKSNLVLENRKKLSITGVNEVVSFNDEIIILNTNLGALTIKGNELKMNKLDVENGDMKITGSINSFAYTGNQSRKNNESIIARLFR >NC_021182.1|WP_015617541.1|4637336_4637741_-|spore-cortex-biosynthesis-protein-YabQ MVLSNFIQFNLLFYSFIAGIFTGILFDIYRVIRGLELPNKVLGFIEDLLFWILTAIIIFVFLLYSNDAIMGIYVYLFIALGVYIYIKLLSEKLIYGEVKLLRFFVRFIRITFNLIIYPIRLLFNYFLGKDKNKG >NC_021182.1|WP_015617552.1|4649845_4651267_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKKGLFSQMIATYTIIIAVSFIIVSGLLSVWFESYYFQQREDELYRGAALIKPVAINYMQGGMSYDFLNDTLQNLERYFNANILLVGKYGYVYAVSDETNVKLLDKQIILSGDIEQLRKGNIIARKDVYGDTFNMPVHTYIVPISDNSNGFEGAIMMNTSLSEIKRPLIKVYYIIWVLATFAIIIACIVIYHLSQKIIVKPLGKINYAARKIANGDIEKRVEIKSEDEIGELANSFNYMADSITKIEKNRREFISNVSHEIRSPITSIKGFIGGILDGVIPPEKEKYYLSLAYDETQRLTRLVNDLLDLSAIESGQLTLNITKLNINEIIRRTVIKFEPKINEKKLVVDVYFDKDDSYAMGDMDRIMQVVTNLIDNAIKYVVNEGKVSIGTKIKGDKIFISIYNESNPLSEDALKHIWDRFYKKDKSRTSKVSTGLGLPIVQSILTQHGEDIWVKNVKDTGVEFTFTLTKANN >NC_021182.1|WP_015617553.1|4651270_4651957_-|response-regulator-transcription-factor MEGTLGTILIIDDDENIADIIKIYLESSGYSTRLCYDGKEAIDAFIECKPDLVLLDIMLPHVDGIDVLKAIRKEYETPVIMLTAKGETFDKVLGLELGADDYIVKPFEAKELIARVKAVLRRYNTDNRGKEKLSFDGLLIDINSYSVVYNGEEIKMPPKEFELLHYLANNRNRVFTREQLLCEVWGYDYPGDSRTVDVHVKRLREKLQGGSNWQIQTVWGVGYKFEVK >NC_021182.1|WP_015617554.1|4652131_4653106_-|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MICHGKNIKIFTGNSNPDLVKSIADILGIKLGDSKVSKFSNGETYVDINETVRGADVFVVQTLCEPVNDSLMELLIMLDALKRASAGRITAVIPHYAYARQDRKAKARQPITAKLVADLIHTAGADRVLTMDLHAAQIQGFFDIPVDHLEGAPILAKYFKELNFNKDELVAVSPDIGGVKRTRKFAERLEVPIAIVDKRRPKPNVSEVLSVIGNIDGKKVILVDDMIDTAGSITNAADALTKLGAKEIYACCTHGVLSGPAMERIEKSTLKEVVVLDTIPVDEKNCSNKIKILSVANIFAEAIRRIYEDVSVSKIFDEAIDNKN >NC_021182.1|WP_015617555.1|4653128_4654499_-|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MDKCVLILAGGKGKRMKSDLPKVLHKVCGKEMLNHVIDVMRKSDFESINIIIGKGADQVKIATKEKNVTYSFQSEQLGTGHAVMCAKEFLKDKDGIVAIFAGDAPLISEDTVKKFIKFHEQGGYKATLLTSILEHPDGYGRIIRNSQDGVERIVEHKDCSADELKVKEVNAAMYCFDIKILLNGLEKIKNDNAQKEYYLTDMIEILRKAGEKIGAMAIDFEETLGVNSRVQLSEVERIMRNRINKKHMENGVTIIDPNCTYIGEDVQIEKDTIVYPGNVIEGNSIIKEGCILYPNSRIVSSIISENVTIQSSVILESKIGSNTTVGPFAYIRPETSIGSHARIGDFVEIKKSKIGNNTKVSHLTYIGDAEVGKNCNFGCGTVVVNYDGKEKHKTIIGDNSFIGCNTNLVSPVEVEDNTYIAAGSTITEKVPEGSLAIARSRQVNKKDWVSKNNLKK >NC_021182.1|WP_015617556.1|4654656_4654944_-|septation-regulator-SpoVG MQITDVRIRKITTEGKMKAIVSVTFDNEFVVHDIKVIEGQNGLFIAMPSRKTPDGEFKDIAHPINTTTREKIQTAILDEYEKVKNEEETKAESEE >NC_021182.1|WP_015617557.1|4655048_4655864_-|pur-operon-repressor MEKFSRNQRIAAITKILVEKPNKVINLNNFTEIFNAAKSTISEDIVIIRDILNKLKIGNIETISGASGGIKYACNVSEVEKEKFANELCFILKEKNRIIPGNFIYMTDVMYNPEMVHKAAAILSLNFNKLSIDYVVTVETKGIPLAYEVAKLLGVQLIIVRRDSKVTEGPTVSINYLSGSSKRIQNMSLSKRSMKRGSKCVFIDDFMKVGGTALGIIDLLREFDSEVLGIGVLIDSVENKRKLVNDYISILKFNGISEDGTAVLIPSENKK >NC_021182.1|WP_015617558.1|4656130_4657507_+|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MSFNLNMDFKKKVHFIGIGGISMSGLAQILLKRGYTVSGSDMNASPLTKKLSDLGAEIYIGHDKNNLKNVDLVIYTAAIPDTNPELAEAKLLNIPLLTRAEFLGLIMKGHKYNVAISGTHGKTTTTSMISHITLEENLDPTILVGGELDIIDGNVRTGKSEYFITEACEYKASFLKFYPYIGIILNVDADHLDYYKDIDDIQNTFEKFTNLIPEDGYLIANADDVRASEIASKANCNVLTFGIDNGTIAAKNISFDTNGCASFNVYNSNDFLFNIKLNVPGKHNILNALASISCALILNINKSSILNGLSSFGGTHRRFEYKGKKNGVTVIDDYAHHPTEIKATLSAAKNYPHKRILCIFQPHTYSRTLSLFDEFSKAFSGTDELILADIYAAREKDTGVVSSNTLADSIRKNNVKCENIHSFEEIVTYLNNNLKEGDLLLTVGAGNIFEVGEMYLNN >NC_021182.1|WP_015617560.1|4657908_4659645_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKRVLKYLSKYHFLILIPSTAMLLGIGLDMLNPYLVQIMIDKVIILKKYELLTKLLIYIGLISTLRAILGYVKEYCFDYMSTKVTTDIKKDLFDHIQNLSFSYFDSMNTGELMSRIGEDVENVWKALGFAINLIIENLLYFIIASVILFKLNWILAIICLTTMPLLIYITAKLKNETVSQFDKISDQIAILNTTAQENIAGVRLVKAFAREKYEILKFLKLNKTNYDLNMGVNYIWSKYNPLQDFLGNISTVLVVCAGGILVIKGNMSIGTLVAFNSYVWMLIWPIRMIGTFTNVISQSSASAKKIDAIFNIKPQIVSPKNSISLNNIKGDIEFKNVSFKYNSETVLNNISLKIPAKSTVAIMGTTGSGKSSLINLIGRYYDVASGSVLIDGVDVRNLDTELLRSQMSIVPQDVFLFSDTIANNVKFSNADASYNEIIKACSDSCALNFIKKLENGFDTVIGERGMGLSGGQKQRLAIARALVKKSKILILDDSTSALDMDTEYNLLKNLYHRPEKMTTFIIAHRISAVKNADIIVFLDNGSIIEIGTHSELLKKKGYYYDIYCEQFKSLDENETEVI >NC_021182.1|WP_015617561.1|4659644_4661429_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAKNSVRQDENTNSISNKDLIFRLFDYLKPYKLKVFFILVLLIYVMICGLLNPYLMKLAIDKYISQKNLQGLVIIAIVMFILNFLSMIASAASIRMMAKVTNTVLLEIRQQLYKHIQKLSFSFFDNRPVGKILARVIGDVNSLQELFSTSITSFIPEILTLICVTFIMFYMNFQLALVSILVLPFLAITLFSIETISRKRWQIYRKKRSNLNAYTHEDFSGIRVIKGFAEEEKTSSNFLLFTKDMMNSFVKAVRLNDSFWPIVTLSSGVGTVLVFGYGVSLIKWGSMTIGTMVAFISYVSMFWRPIINISNFYNTLITNFAAGERIFEILDIEPDIIDIKNHIMPKIKGTVQFKNLTFSYDNHTNTLNNINFKINPGETIALVGSTGSGKTTIVNLISRFYDATKGEVLIDGKDVKNFTIESLRSQMGIMLQDTFLFSSTIRENIRYGKLDATDEEVIAAAKSANAHNFIINLEKGYDTEVNERGSRLSVGQRQLISFARALLANPRILILDEATSNIDTYTEKLVQEGIQKLLIGRTSFVIAHRLSTIRNADKIMVIDNGNIAEAGTHKELMKLKGLYHDLFMSQYKFLNEAN >NC_021182.1|WP_015617562.1|4661599_4661920_+|hypothetical-protein MRNFIISAGMDLVLILISYFLFRGIISGPTRHRFYEKFMSSFAKFVIYIFVASILITGITALIVYKTRYVVYINIIAPALVSILIGFIVSVVPTKGAGDKRHKSSH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021182_5 | 5.1|4416563|25|NC_021182|CRISPRCasFinder | 4416563-4416587 | 25 | NZ_CP006906 | Clostridium baratii str. Sullivan plasmid pCBJ, complete sequence | 9596-9620 | 3 | 0.88 |
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NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | NC_018272 | Persicivirga phage P12024L, complete genome | 31470-31501 | 6 | 0.812 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | MN693342 | Marine virus AFVG_25M9, complete genome | 4874-4905 | 8 | 0.75 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | NC_015420 | Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01, complete sequence | 52446-52477 | 8 | 0.75 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | NC_018611 | Lactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 plasmid pCD034-3, complete sequence | 20859-20890 | 8 | 0.75 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | NZ_KX785328 | Streptococcus suis strain 3366 plasmid unnamed3, complete sequence | 17399-17430 | 9 | 0.719 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | NC_012923 | Streptococcus suis BM407 plasmid pBM407, complete sequence | 13396-13427 | 9 | 0.719 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | NZ_CP029399 | Streptococcus suis strain HN105 plasmid unnamed1, complete sequence | 2970-3001 | 9 | 0.719 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | MT074137 | Bacteroides phage DAC16, complete genome | 142852-142883 | 9 | 0.719 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | MT074142 | Bacteroides phage DAC23, complete genome | 144883-144914 | 9 | 0.719 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | MT074141 | Bacteroides phage DAC22, complete genome | 145327-145358 | 9 | 0.719 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | MT074139 | Bacteroides phage DAC19, complete genome | 144964-144995 | 9 | 0.719 |
NC_021182_2 | 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder | 366618-366649 | 32 | MT074140 | Bacteroides phage DAC20, complete genome | 144963-144994 | 9 | 0.719 |
NC_021182_1 | 1.2|88152|34|NC_021182|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 88152-88185 | 34 | MT520979 | Enterococcus phage vB_EfaS-271, complete genome | 25641-25674 | 11 | 0.676 |
1. spacer 5.1|4416563|25|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006906 (Clostridium baratii str. Sullivan plasmid pCBJ, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
aaattaacttaacttgaatacatta CRISPR spacer atattaaataaacttgaatacatta Protospacer * ***** * ***************
2. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to JQ823122 (Persicivirga phage P12024S, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer taaaatcattaaaagattttggttctcaaata Protospacer .******* ***************** * *
3. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to NC_018272 (Persicivirga phage P12024L, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer taaaatcattaaaagattttggttctcaaata Protospacer .******* ***************** * *
4. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to MN693342 (Marine virus AFVG_25M9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer attgatcaaaaatagcttttggttctctacca Protospacer .******** ** **************.
5. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to NC_015420 (Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer taaattcaaaaaaatattttggttgtttctat Protospacer .*** ********* ********* *.* . *
6. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to NC_018611 (Lactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 plasmid pCD034-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer taaattcaaaaaaatattttggttgtttctat Protospacer .*** ********* ********* *.* . *
7. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX785328 (Streptococcus suis strain 3366 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer aacaatcaaaaaaagatttttattctaacaat Protospacer * ***************** .**** *
8. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to NC_012923 (Streptococcus suis BM407 plasmid pBM407, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer aacaatcaaaaaaagatttttattctaacaat Protospacer * ***************** .**** *
9. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029399 (Streptococcus suis strain HN105 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer aacaatcaaaaaaagatttttattctaacaat Protospacer * ***************** .**** *
10. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to MT074137 (Bacteroides phage DAC16, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer caaaatcaaaagaagaatttggtaaattatca Protospacer ***********.**** ****** .**..
11. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to MT074142 (Bacteroides phage DAC23, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer caaaatcaaaagaagaatttggtaaattatca Protospacer ***********.**** ****** .**..
12. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to MT074141 (Bacteroides phage DAC22, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer caaaatcaaaagaagaatttggtaaattatca Protospacer ***********.**** ****** .**..
13. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to MT074139 (Bacteroides phage DAC19, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer caaaatcaaaagaagaatttggtaaattatca Protospacer ***********.**** ****** .**..
14. spacer 2.1|366618|32|NC_021182|CRISPRCasFinder matches to MT074140 (Bacteroides phage DAC20, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
caaaatcaaaaaaagattttggttctctactt CRISPR spacer caaaatcaaaagaagaatttggtaaattatca Protospacer ***********.**** ****** .**..
15. spacer 1.2|88152|34|NC_021182|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT520979 (Enterococcus phage vB_EfaS-271, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttatacacacaacaattaaacaaagatcagatag CRISPR spacer gcgtacaaacaacaattcaacaaagatactgaaa Protospacer ..**** ********* ********* . *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
276400 : 361077
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021182|276400:361077|DBSCAN-SWA 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80 | Clostridium_phage(29.17%) | terminase,integrase,portal,tail,protease,tRNA,capsid,coat | attL 294638:294664|attR 369306:369332 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
555153 : 593426
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021182|555153:593426|DBSCAN-SWA 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42 | Clostridium_phage(63.33%) | terminase,integrase,portal,holin,capsid,plate | attL 554981:554997|attR 595389:595405 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
998057 : 1031258
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021182|998057:1031258|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021182|998057:1031258|1006676_1007564_-|WP_015614315.1|DBSCAN-SWA MCRLIHAEIYKLFRMRGFKILCIIALILGISMAGLSKLSSSEDFLKSSLKSFPPEQQQTYIEQLKKANAESYSKVTIGSMGFFVHSKDIFHPTGKDVFRASFGIGVIEILASVLIGSMIAIEYSSGTIKNILAYGKKREYYYIAKIVAAFVGFTIILGLMVTSTTIISSFTFGWGAPFAINDALYILKIFAAALAVGLGTISFLIFISTLVKSNGGTILIGIILFSISPMFIAFLYGKYTWFDKLYKCILPYNWALATSAAVTNNELLRASSLGIITLLITAAAGIAVFKNQDIK >NC_021182|998057:1031258|1002784_1003543_+|WP_015614312.1|DBSCAN-SWA MKTSVIKANNLCKSFVTGKTALNVIKNLNLDIYEGDFTVIMGSSGSGKSTLLYTLSGMDSATSGTVQLLDNEITSMKEEELSFIRKKDISFVFQSINLLPDITVFENIAYCGYGVNKNKKDINEKTLKLLETFGLTEAKDKYPSEISGGMQQRVAMARAIITSPEILFGDEPTGALNSTAGEEVLDILTDLNNKGQTVVMVTHDLKAASRASRLIYLKDGRIDGELSLGKFSKEDYKNRDILIFEFLKERGW >NC_021182|998057:1031258|1007556_1008480_-|WP_015614316.1|DBSCAN-SWA 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35 | Bacillus_phage(37.5%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1588141 : 1639544
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021182|1588141:1639544|DBSCAN-SWA TATGGAAAGAGTTGAACCTATAAGATCAGAGAAAAAAATTAAGGATCTAAAGAAGTATCCTTTAGGAGCAGGAAATATGAGAAACTATGCTTTAATTGTGCTGGGGCTTAATACAGCACTAAGGATTTCAGATATACTGCAGCTGACATGGGAGGATGTATATGACTTTGAAGAAAAGACCTTCAAAACTCATGTATACATAAAGGAACAAAGGACCGGTAAGGATAAAAAATTCTTACTTAATAAAAATACCATAGAAGGTCTTTTAAAGCATAAAAGAAAGCTTGGGCATATAAATCATCAAGACTATATTTTCAGCAGCCGCAACGGTGAGAATAAAGCTATAACCCGACATATGGCCATAAGAATAATAAAAGAGAGCTGCGCAGCAGTGGGAATAAAAGAACATGTTGGCTGCCATTCATTAAGAAAGACCTTTGGATATCACTCCTGGAAGAAGGGAGTACCAGTGCCAGTGCTTATGGAGCTGTTTAATCATTCTACTCAGGCCATAACTAAATTGTATTTGGGTATTTCCCAAGATGATATTGATGATGTTTATCGTCTTGTAGAACTTTAATGTATAGACTTTCTCATCTTAAAATAGGTTATTAAATAAATTTTGTTAATTTAATAACCTATTTTATTTACATTTAACCTACTATGTAATACAATATAGTAAAGCTAACTTGTATTACATAATAGAGAGGCGATGTTATTGAATGATAAATCTCAATTCTTAAAGGGAACTTTAGAAGGATGTATACTGAAGATTATTAATGATGATGAAGTTTATGGATATGAAATAGCTGAAAAATTGAAGAATTATGGATTAAGTGAAGTGAGTGAAGGTACTATATACCCGCTGCTTTTAAGACTTGAAAAAGCAGGACTTCTAAATTCTACGAAAAAAGAATCTCCTTATGGTCCTAAAAGAAAATATTATAAGTTATCCATTGGAGGAAAAGAAGCATTAAATAATTTCTATGAAAACTGGATGAAGCTTAAAGAAAGCATTGATAAAATATTTATTGATTATAGAGAGGAGACTGAAAATGAATGAAGCAAATAAAATGATAAAGGAAAATCATGAAATAAGTAAAAAACTTAATAAAGAAAATCAAGCAATATATACGGATATTGTTTGCTATATTAGAGTAAGCTCAATAAATGAAAAAGAAGAAATTATTTCTGATATTTTAGATATGTTTTTAAGGTGCCAGGAAGCTGGAAAACCAATTGAAGAAGCTATAGAAAATGATTATAAGGGATTTTGTGATTCAATTATAGGATCTGTAAGTCAAAAGAGAATTTCATTTAATAATCTAAAAGAATATCTAGGAATAATTATAAATGGGATATTTATTCTTTTAACTATAGATTTTGTGTTTAACTATATACCAAAATTAATTGCAAGTAAATCTTTAATCAGTTACCAGTTTAATGTATCATTTTTTATAACAACTATAATAATTATTATTATATCTATTGCTATAGTAAAATACATTGGCAAAAATAGCTTCAAATTTTCAAATAGGAAGTCATCGAAAAAAGAAAACTTTCTATTTGGTTCAGGATTTGCATCGTTTATTATTTTAATGGGTATTTTTCAATATGTATTAAGGAATTATGTATTGTTTTCTTTAAGTGGATACTACGTATTTTTTGTATTAGGAATCTATTGGATATACAAACTTATAAGTAAAATAAAAGATAAATTTTAATACAGATAACAATACCATGATATTTAATGCATGACACGGATACTTCTATTATCTCTCATAAGGGTAATATTACCATATGTGTCATGTATTAAAAAACTGGATTAAATTAATTATAAGAGACATTTGTAGAAAATTACCTTTCTACAAATGTCTCTTATAAATTTTTATTTAATCTTTCTTCAGCTTCATCGTAAACTTCATTATCAGATCGTTTTCCAATAACGATAATATCAATAATATCGATATCGTCAGATGAGATTCCCTGTTTAAATATAATTCTTAAACCCTTCTTCTTATTCTTTAATTTACGACAATTATGAAGCTTACCGTGTAATTGTTCACCAGCTTGCATACCGAAAATTTTTATTCTATCTAAACCTTTATCTACAAAAGTAATTTGATCACCATCAAGATTAAAATAGTCTTCTTTTGCTTTGTCAAACCAATTTAGTGCATGATTATCGTTTCCTTTTAATTGATTAATAGCGTCATAATGATTTTTTATACTCTTATTCCCAGCCATCATTTTCATTCAATATTAGTGGTTTATTTGATTTGATTCCACGAACCTCATAATCTGATAACTTTTGTACTTTACCTTTTGACTCTTCAAGAATACGAATATAAGCTTCAGCTTCAATCAATTTATCATTTAAATTTTCAAATCTATCAATTTGTTTATTATAATCTTCAATAGAAATAATAATTTTAAATGGACGATTATTTTTCATTACAAAGATCTCTTTTTTTCTATCAAGAACTTTAGAGGTATATCTTTGTAAATCCGTAGTAGATACAAATTGATCATTGTCAATTTTTTCTTTTATCATGATACAACCTCCTTATATATTGCTTTATAATTATATTATCATAATTAACTGTATAATTCAACATATAATTAACTGTATGATGAAATTTACTCATTTAGATAATATATTTTAATGTGATTAAATGTATGTGAAATTTATAATCAAAATATTTTGGACTTAATATAAGAAATAGAAGTTAGCCTATTCAAACAATAAGCTTACTTAGTTTTTTCCACACTTTTCCTACAAAAGTTTCAGATAGCTGTAGTTTTGTTTAGAAAGTAGAAGTAAGTAAAGCTAGCAATACCAACACTTATAGGAAAGTATAGAAAGATAAAAAGATATTAAAACAAATCTGAAGGTCGAGGGTTCGACTCCCCCTGGGTGCACCAAAACATTGATACAAGCCAGTTCACGGATAATGTGAATTTGCTTGTATTTTTATTTTCCCACAAAAGTTTTAGAAACATTTAGTTCCTTTTAGAAGAGAATAGTTCATAAATTTAGTAAGATTAATAGTTATAGCGAATTTTAGAAATATATAATTTGATAGTAAATAAGCAAATTGGTCGGGGGGGCGGATCCTCTCTGACGCACCATGAAAAGCCTTGATAACACTATGATTCAAGGCTTTTTACAGTGAGCCTATAGGCGCAATTTAATAGGTAAAAGTCCCAAGCTCGGGTTGATAGTGCCAATTGCATAGCTTAAGACGAGGGTGTCCACTGTGAGGTGGGATCTGAAGGAAGCCAGCGGCAAGACTCTGGTCTGACGAAAAGAAACTACATATAAGGCACATGTCTGTGGGTAAGTTTGCTACACAAAACAAAGCCCTAAACTATCCGAAACAAGCGGTGTAAATGTAGTAGAAAGATGGAGTGAAAGGTTGTGCTCTTACCTGTGAAATTCTGGAAGGTAAGTTATAGATATGAAATTAGAAATAACAACCCATACAGTGATGTGTGGCTGGAATGTCATAAGTCAGGGATGTACTATAGATACGCTGACACTGGTTCCATGGATACTACCTCCACCCCAACTAAAAAGGAACTAGCCGAAAGATGAAAAGTATCTGAAAGGACCATAGACCAATACAAGGAAAACTGCATAATTATCTCTATCAAAGATTTGCCATGTATAAGATTTAATGTACATTACATTGAAAAAATTGAGGGACGCATCTCTGAAAAAGTTACTTTGAGGGAAAGAAAACTTGAAAGAGAAATTGAATATGCAGTTTCAAAAGCTAATGTGATACTTTCAGAAGTTTTATATAATACGCTAAAGAAATTTAGTATTGAACTATTTACAATTAGTATTCAATATTGTCATAGAATTGCCATAAACAAAAATTAGTATATAAATATAGACTAAAATATGGATAAGTATTTGGTTGATTCCAGGTGCTATTTTTCATATATGTATAAAGCAAGTGACATGATGGCAGGAATAAATAGTATAAGAGATGGGATATATAGATAGCAATTTAGCAAAGGGGTGAATATATGATTACTGTGAAAAATATTTACAATACATTTATAAATAATGAAAAATATAAACATATTATAAGATTTGGATGTGTAGGGTGCTTAAATACTACGTTTGACTTTGGAATATTTTCTCTCTTAAATAGTGTATTTGGTATTAATTATATCATAAGCCAGATAGCATCCTATTCTAGTGGTACGTTAAATAGCTATCTTTTAAATAAATTTTGGAGCTTTAATGATACGAAAATTAGTAAGAAGACAACAATGGAAGTTGTTCAATTTATTGTTGTTAATTCAGCATCCCTAGGAGTAAGTTTAATAGGTTTACGTATATTAATGAGAGATAATTCCATGAATCCTTTCTTTGCAAAAATTATTTCAATGGTACTAGCTCAAGTAGTTAATTTTGTAGGATATAGATTTTGGGTTTTTGGCACAATTGCAAAGTTAGTACCTCGTACTAAAAAAACATAGCGTGAACCTCATATGGTTTTTAAAAATAACAAAATATGCATATATTCAGATGGTAATACTTTATACGTTAATTGTATAAAGTTATTTAATCAATTTAAAATAATAATGAGGTGAGAGATAAATGTATAATGAGATAGTTTATTCTGTAATAGTACCATTGTATAATGAAGAGCTTGTTATTGATGAGAGTTACAAAAGATTGAAAGAAGTCATGGATTCTTTAAAGAAAATTATGAAATTATGTTTGTGAATGATGGGAGTCGTGATGCCACAAGAGATAAAGTTGAAAAGATATGTGAAAAGGATGAAAAAATTAAACTTATAAATTTTTCAAGAAATTTTGGACATCAGTGTGCAATAACGGCGGGCATGGATCTAGCAGCAGGGGATGCTATTGTTGTAATAGATGCGGATCTCCAGGACCCTCCAGAAGTTATTCCAAAGATGATTGAAAAATGGAAAGAAGGATATGAAGTTGTCTATGCAAAAAGAATTAAGAGACA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50 | Clostridium_phage(28.57%) | terminase,integrase,transposase,protease | attL 1583027:1583043|attR 1629582:1629598 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1881694 : 1938724
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021182|1881694:1938724|DBSCAN-SWA AATGCCACAGCATTCTTTGTCAAGGACAGAGCTTCTAATTGGAAAAGAAGCCTTAGATAAATTAAAAGATAGTAAGGTAGTAGTATTTGGTATAGGTGGGGTAGGAAGCTTTACAGTGGAGGCCTTAGTTAGAGGCGGAGTAGGAAGACTTGTACTTGTAGACGATGATACCGTTTGTTTAACTAATATTAATAGACAGATCCACGCTACCTTTAAAAGCATAAGTAAGCCTAAAGTTGAAGTTATGAGGGATAGAATACTAAGTATAAATCCTAAATGTGAGGTTATAATCTATCAAACTTTTGTAAAGGAAGATAATATAGGTGATATTATAGGAGAAGATACGGATTATGTAGTAGATGTGATAGATACTGTATCCTCCAAGATAGCTTTAATATTATGGTGTAAAGAGCATAACATTGAAATTATAAGCTGTATGGGTACAGGAAATAAATTGGATCCAACTAAATTTCAAATTGCAGATATATATAAAACAAAAATATGCCCCCTAGCAAAGGTAATGAGATGTGAACTTAGAAAAAGAGGAGTAAAGTCTTTAAAGGTTCTCTATTCTGAGGAAATGCCTTTAAAGCCAAAGGAAGATGAAGTTATAACCTGTAAAGAAGGTTGCGTTTGTACAGGAGGAACTAAGAAATGTCTTGCTAAAAGACAAATACCAGGAAGTATATCCTTTGTACCACCAGTAGCAGGTATGATAATAGGTGGGGAAGTTATAAAGGATATAATTGGAATTCACTAGATTATGTAATCAATAGCTGCATATAATTGTTTATACAATTGCTAGTATTTTTAAAGATTTCATAGGAAGCAATGTAAATATGATAAATTCATCCATTGACTTGAAGTACATATGTTAATGGATGAATTTAGTTTTTACAGTTTCTACTTAATAAAAATAACATCTAAAAGAATGTTTATTATAGATGTTATTTTTAAAATCCATCTACTGATTTTTTCTATGATTTTTATAGTTTTTAAGTTTATCGTCTATAATTAGTCCGCCTTTCTTCTCATCTATTCTCACTACTGTTATTACTCTCTCACTGCCGGCTTCAAAAGGAATCCTGTGAACTTTTTTTATAAGTTCAAAAACCTCATCATATTCACCTTCTACAGTAGTACTCATAGCGCCTATCTCATATTTTAAACCACTGTTTTTTATATAATCAATAGCTGCATCTACCTGTTTATATAGCTCTTCTTCTGAAACAGATGGAATTAGAGGCATAACAGCTATGTCAGCAATAACCATATATACACATCTCCCTTGTTAATTAATTTTGTTTAACGGAATAAGTAACTTTTGTTGACATGTCTATTGACGATATAATAATTAGGAATATACAGATTATACGATTTTAATATGTTTCAATAAATTATAGTACAAGAAAGAGAGTGTTACAATATTATTTCAAAAGATTGTGCCTATGATAAGGCTCTGCATGAATTAATATATATGAATTAGGAAATATAATTTTTATGTCCTTTTCTATTGAACTACATAGATTATGAGCTTCCACCAAGGACTGATTTGAGTCTAACAATAGGTGGATATCTATTTCTCTTGTATCACCACTTTTCCGAGTTCTCAATTTGTGATAGGATTTTACATCAGAATATTTATGGATAATATTTAAAATTCTATTGATATCTTCAGAAGACAGGCTGCTGTCTACCAGATCCTTCATGGATTTTTTTATAAGAACTATAGAAGTTCTTATAATTAACAAAGCTACTATAATAGCTGCAATTGAATCAAATATCTTTAAACCTGTAAGCTTTAAAAGTATAAGTCCTATAAAAACTCCTAAGGAGGTGAATACATCAGTTAATAAATGCATGGCGTCTGCTTCTAAAGCAATAGATTCTGTTTTTTTAGATATTTTTAAAATATTAAGTGAAGTTATAAGATTTACTCCTGTAGAAATAAGCATTACTACTATTCCAGAATAGATATTTCCAACATTATTTTCAGAAAATATTTTTACTATGGATTCGTATATTATTATAATCCCTGCAAATAAAATTAACAGAGCTTCCACAAAACCTGAAACATTTTCGTATTTTCCGTGACCAAAGGGATGGTCTTCGTCTTCAGCTTTGCTGGCTTCTTTTATAGAAAAAAATGCAATAAGACTAGCAATTAAATCTATGGAGGAGTGAATACCTTCAGATATAACGCTTATAGAATTCATAGATATTCCGGCTATAATTTTAAATATAATTAATATGATATTTGATGCTATGGATAAAAAAGCACCATTTTCTTTATTCATTTTTACCTCTCCAGTGACAATTATTTCAATTGATAATAGAAATTAAACTATTATTGTATTATTATATGTAGATGTATAAATAACTGTGAAGAAAAAAGTAACAGAAGATATTGGTATTGATTATCATTTGATAATGAAAAATCGAAATGACTTTATATTGAGCTAAATTTCATAAGCGATGCTTATCTGATGACTATCCATTCTAATACTCCCATCTTTCTTAAAGCGAGAGTAAAAGAGTGGTTACGTTCTTGGATAAGGATTTACCCTAAAGGGCAACGATTTCTAAGTATCATAAATACCGATATTAAGAAATCTGCTTGTGAGTACAGTGGGCTGCAGGATTACTGGAGTAAAAGATTACTTATGCAGATAAATTTGTTATAATGAGATTAGAATATGCAATATAATATGTAATTCGTAATATGAAGAAAAGACTAAATAAAAACCTTCATGCTAGTTAGAACTATTCTTAATAGTTAATTAGTAGACATACAGGAAAGGAAGACAATTATGAATTTAATATCCCTTGAAAATATAAAAAAGAGTTATGGAGAGAAAATATTATTTGATGATATATCTCTTGGAATAAATGAAGGACAGAAAATCGGATTAATAGGTATAAATGGTACTGGTAAATCTACACTTTTAAAAATTATAACAGGTATTGATAGCGCAGATGAAGGGAAAATTATAACGAAAAACAAAATTAAAATTGAATACTTATCTCAAAATACCAGTTTTACAAAAGATGATACAGTAATGGAAGCTATTTTTAAAGGAAATTCACCTGTAATGATATTATTAAGAGAATATGAAAAAGTAGTAAGCCAATTATCCAAAAATCCTCAAGATGAAACTATTCAAAATAAGTTTAATAATTTATCAGAAAAAATGGATGCATTAGATGCCTGGAATGTGGAAAGTGATGCAAAGGCTATTTTAACAAAGCTTGGAATAAAAGACTTTGAGGCTAAGGTAGAAACTTTATCTGGTGGTCAGAAAAAGAGAATAGCTCTAGCTAGTGCACTTATAGCTCCTTCAGATCTTCTTATATTAGATGAACCTACAAACCATATAGATGATGCCACTGTTAATTGGCTGGAGTCCTACCTTAATAGTAGAAAGGGTTCTTTAATTATGATAACTCATGATAGATATTTTCTTGATAGAATCGTAACTGAGATATTGGAGCTTTATAAGGGAAAACTCTATAGTTATGAAGGAAATTACAGTAAATATCTGGAGCAGAAAATAGAGAGACTAAGTCAAATGGAGGCACAGGAGCAAAAGAGGCAAAGTTTAATTAAAAGTGAGCTTAAATGGATAAGAAGAGGTGCAAAGGCAAGATCTACGAAGCAAAAGGCTAGAATAGATAGATTTGAGATATTGCAAAATGAAAATATGGATTTAACTGATGGAAAAGTTGAAATATCCGTGGGAAACACACGACTTGGCAAGAAAATAATTGAAATCAATGATATAAGTATAAACTTTGGAGACAAAACTTTAATAGATGATTTTAGCTATATAATAAACAGGGAAGACAGAATAGGAATAGTAGGGCCTAATGGTATGGGTAAAAGTACCCTTCTGAATATAATTTCTGGAAAACTTAGGCCAACTGCAGGTGAGGTTGAAATTGGAGAAACAGTGAAGCTTGGATATTTTTCACAGGAGTATAGAGACATAGATGAAACTTTAAGAGTAATAGATTATATAAAAGAAACGGCAGAATATATGAGTACAGCGGATGGAAGTTTAATAAGTGCTTCTCAAATGCTTGAAAAATTTTTGTTTCCAGGAGTACTTCAGTATACTCCAATATCTAGACTTTCTGGGGGAGAAAAGAGAAGACTATATCTTTTAAAGGTATTGATGGAAGCACCTAATGTATTACTGTTAGATGAGCCTACTAATGACCTGGATATAGAAACACTAAATATATTGGAAGAATATATAGAAGAATTCACTGGAACCGTAGTGGCAGTGTCTCATGACAGATATTTTTTAGATAAGGTAAGTAATAAAATTTTTGCCTTTGAAGGTGAAGGGAAAATTATAGAGCATACAGGTAATTACACAGATTATCTGGAGTTTCATAATGATATTGTTGAAGAAGAAAATGATCTACAAAAAATAAAAAATAAAGGTAATCAGGAAAAGCAGGTTAGAAATAATAAAAGAGAAAAAACATTAAAATTTACTTTTAAGGAACAAAAAGAATATGAAGAAATAGAGTCAAATATAAATGAAACTGAAAATTCTTTAGAAGAAATAAATAATGAAATAAGCAATTCTTCCAGCGATTATGTAACTCTACAGGAATTAATGGATAAAAAAGAGAAAACAGAGGAGCATTTGAATTATCTTTTAGAGAGATGGATGTATCTTAGTGAGCTGGCAGAAAAAATAAATAATCAAAAGTCTTAAATTAGTTTATTTCTGGGTAGAATAAAGATGTAAATGTATTTTAACCTGGATTGGATATATAATCCTAGATGGCATTGATAATTCATATAAAATTTTTTATGAATCAAATTAAAACTTATGTAAGATTTACTGGATTACCTGCCCCATTGAGTCTTATGATTTCTAAGGAAAAAAATAATATATAGTTTAAAGTGGTGATGAACTTTGGATAAAAAAAATAAAAAACTGGCGAATTTAATTCTCTTAATATTTGCTGTTGGATTTTTCATT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67 | Bacillus_phage(15.79%) | terminase,integrase,portal,tail,protease,tRNA,capsid,head | attL 1878385:1878401|attR 1920351:1920367 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2062400 : 2073063
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_021182|2062400:2073063|DBSCAN-SWA 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TAATATTCATGATGCCTACGTTCGTGCCTTTGAATGTGATCCTACCTCTATTTTTGGTGGTATAGTTGCTGTTAATAGAAAATTAGATGTAGCAACAGCAGAGGAACTTGTGAAGATTTTCCTTGAAATAGTAATAGCTCCTGATTTTGAAGACGCTGCACTGGAAATATTAAAGACAAAGAAAAACTTAAGAGTTATAAAAGCAGAGCACAAACCACAGGATCATAGAGAATATGCAAAGGTAGACGGTGGAATTCTAGTACAGAGTTCAGATGATAAACTTGTAGATGAACTTAAATTTGTAACAGAAAAGAAGCCGACAGAAGAGGAATTAAAGCAGCTTCTATTCGGTATGAAGGTAGTAAAATATGTTAAATCCAATGCAATACTGGTGGTTAAAGATGGAATGGCTAAGGGAATTGGCGGCGGACAGGTAAACAGAATATGGCCGACAATTGAAGCACTTGATAGAGCAAAGGATGGTACTCTTCTTGTATCAGATGCTTTCTTCCCATTTAACGATGTAGTGGAAGAAGCAGCTAAGCACAATATAAAGGCAATAATACAGCCTGGTGGCTCTATAAGAGACCAAGATTCCATTGATGCCTGCAATAAACATGGCATAGCAATGGTGATTTCAGGAATAAGACATTTTAAACACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_021182|2062400:2073063|2069573_2070569_+|WP_015615248.1|DBSCAN-SWA MVTYKDAGVNIEEGYETVSKIKDYAKKTYTKDVLNNLGSFAGMFALGNYKNPVLVSGTDGVGTKLAIAFKLKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYMACGKLSAETASQIVKGVSEGCLQAESALIGGETAEMPGFYKDGDYDLAGFSVGIVEKDEIIDGSKIEDKDVLIGIASSGVHSNGFSLVRKLVPDIEIDFHGKKIGEVLLEPTKIYVKPILKLMEKFEIRGMAHVTGGGFYENIPRMFKGDFTAIINKDSYEVPEIFKYLMSLGVKGNDMYNTFNMGIGFVLCVKQEDKAAVIDTLKEFGEEAFEIGYVEAGGKGVCLK >NC_021182|2062400:2073063|2070556_2071174_+|WP_015615249.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLISGGGTNLQSIIDKVKSGYLNCKIEIVISDSEKAYGIERAKENNIYAIALSKKQYGDKLSDEVLKIVEEKGVDLIVTAGFLSILKGDLLKKFKNRIINIHPSLIPSFCGKGMYGLNVHKAAISYGVKASGCTVHFLDEGTDTGPIIIQKTVPVFAEDTAELLQKRVLEKEHEALPEAIRLIAENKVEVQERKVFIENN >NC_021182|2062400:2073063|2066928_2067408_+|WP_015615245.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDVDKMRGAAKALKEFGIEYRVHILSAHRVPEKLAQVIEDLEAEDFDCIIAGAGLAAHLPGVIASHTTLPVIGVPINAALNGLDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSLKYPGLKEKLIQYRKDMKSKFISENEEGVEL >NC_021182|2062400:2073063|2067407_2068118_+|WP_015615246.1|DBSCAN-SWA MTKKELLYEGKAKKVYATDKEDEVIVYYKDDATAFNGVKKGQIEDKGELNNSITSMLFELVEKHGVKTHFIEKLNDREQLCKKVNIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGVEEGSPLKTTVFEICYKNDDYDDPLINDTHAVALGFSTFEELKTIYAMTDKVNEILKEFFLKQNIKLIDFKLEFGKTTNGEILLADEISPDTCRLWDATTNEKLDKDRFRRDMGNVKEAYVEILKRIAGK >NC_021182|2062400:2073063|2071560_2073063_+|WP_015615250.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVYNKDKVLDLAKFLIKKDVEIISTGGTYKYLKENHIAVTEVEEVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGILAIRDNAQHMKAIEDKGIKPIDLVVVNLYPFFDKVQEDLTFEEKIEFIDIGGPTMIRAAAKNFQDVVVLTDVKDYEDVIDQIDKNGEVDFESRKKFAGKVFNLMAAYDAAVSRFLLGDEVYPEYLNMSYKKSMDLRYGENPHQSAAYYVSTATKGAMKDFQQLNGKELSYNNIKDMDIAWKVASEFEEPMCCALKHNSPCGAAIADNIHDAYVRAFECDPTSIFGGIVAVNRKLDVATAEELVKIFLEIVIAPDFEDAALEILKTKKNLRVIKAEHKPQDHREYAKVDGGILVQSSDDKLVDELKFVTEKKPTEEELKQLLFGMKVVKYVKSNAILVVKDGMAKGIGGGQVNRIWPTIEALDRAKDGTLLVSDAFFPFNDVVEEAAKHNIKAIIQPGGSIRDQDSIDACNKHGIAMVISGIRHFKH >NC_021182|2062400:2073063|2068143_2069553_+|WP_015615247.1|DBSCAN-SWA MIDLEQDKLKEECGVFGIFSNRNIDVSHLTYYGLYALQHRGQESAGIAVCNNGKIDVHKGMGLVTDVFDNDSLDKMVGNSAIGHVRYSTTGGSCANNAQPIVNEFELGSIALAHNGNLVNTDIIRELLQYGGTSFETSIDTEVVLKLIAKNAKKGIENAVADAIQAIKGSFAIVILTEDKLIGVRDPNGIRPLCIGKFDDNSYVMCSETCALDAVGAEFVRDVNPGEIVIIDKEGIKSINFAEKTKCETCVFEYIYFARPDSVIDGISVYNSRELAGEELYREAPVEADMVIGVPDSGLAAATGYAKASGIPYGIGLIKNRYVGRTFISPTQELREKAVAVKLNPLKVNIEGKRIVIIDDSIVRGTTSKKLVDILRKAGAKEIHFRVSSPIIKYPCYFGINIASRNELIGGNKTVEEIRDFIGADSLAYLSIDSLLKSLGKKNNFCLGCLKGVYPVSAPMEVEKERFEV >NC_021182|2062400:2073063|2062400_2066162_+|WP_015615244.1|DBSCAN-SWA MDNKVRRIFVEKRQGFNVEALELLNDVKENLNISQLSNIKIVNRYDISGISDEEFEKAKKIIFSEPVTDNVFEENINTKDNDSIFAVEYLPGQYDQRADSADQCIKILSQNEASKVATAKLYILEGELNEVEVERIKKYCINPVDSREASMEKPETLETEVELPADVKILEYFTDLPEEKLEQFRLDEGLAMSLADLKFCQEYFKNTEKRNPTYTEIKVIDTYWSDHCRHTTFATKLNNVEFEKGKFNKPVKEAFEEYNNSKTKLKREDKVTCLMDVALMAMRELKEDGKLQDLDVSDEINACSIEKEVDIDGKKEKWLIMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGCIRDPLSGRVYVYQAMRVTGSGDPRTKIEDTLQGKLPQRKITVGAAKGYSSYGNQIGLATGQVTEVYHEGYVAKRLEVGAVIGAAPKENVVRKEPKAGDIIILLGGRTGRDGCGGATGSSKEHDEKSILTCGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNPEVSKLIKRCNDFGAGGVSVAIGELSDGLDINLNLVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVVEEKDADKFIELSLKENLEAVKVAVVTEDRRLKLRWRNDYVVNISRDFLDTNGVRQEIDVYVKKPKKSLNYFAKTEKVKDIKKKWLSVLEDLNVCSQKGLVERFDSTIGAGSVFLPFAGKYQMTPTEAMIAKVPVLKGETNTATVMAHGYNPNLSSWSPFHGAVYSVVEAVAKVVACGGKYDSIRLTLQEYFERLGTEPERWGKPLAALLGAYHAQKMFEIPAIGGKDSMSGTFKDMDVPPTLVAFAVDVVDANKVVSQEFKNSGNTVVLVEAVRDENELPDFKVLKKNYKKINKLIEKGRVLSSYTVKQGGVCEAITKMCLGNKIGFGFNKNVDEELLFEPSYGSIILEIDKEENVKKIMDGVNYVVLGKTTNEAAISYEKFNLDIDELLKQWTKTLEGVFPTKTEVSSKDIEKGVFDNRNTKSPTIKYARPRVFIPVFPGTNCEYDSARAFERAGAETSVKVFKNLTPDFIKESVDFIANEIDKAQMIMLPGGFSAGDEPDGSGKFIASVLRNPKIAESIMKLLKERDGLMLGICNGFQALTKLGLVPFGEIREIDEECPTLTYNNIGRHVSKMVDTRIVSTLSPWFNQVNCNEVYTIPVSHGEGRFVGKEDVIKKLFENGQVATQYVDFKGNPTYDIDFNPNGSMQAIEGITSPDGRILGKMGHSERIGSNIAKNIPGNKDQKIFESGVKYFK |
7 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2344890 : 2358257
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_021182|2344890:2358257|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_021182|2344890:2358257|2346826_2346964_+|WP_010233516.1|DBSCAN-SWA MKHIKSINKSNIKESLKKPGCKECANSCQSACKTSCTVANLACEK >NC_021182|2344890:2358257|2349873_2350770_+|WP_015615497.1|DBSCAN-SWA MLKVVEKRKIWFTISIIIIVIGIGFMCYRGLNFGIDFRGGTLMQININKDFNKQDTDKIIEKYVKSNEFESTKANNKELTIRINSEAISDANTTKLFNDIKDKYKLKDSDLISRDRIGATIGNDLVRNAVTALSISIILMLFFIAYRFEFKFGLAAIIALLHDVLITLSVYAIGNLQINTPFIAAILTIIGYSIADTIVIFDRIRENQKKLRGKELIEIADTSISQTVGRSICTVTTTVVTITCLHIFVPGVREFTIPILVGIISGCYSSIFIASPIWYLFKKRSSDKKRTDKKELIK >NC_021182|2344890:2358257|2351911_2352430_+|WP_015615499.1|DBSCAN-SWA MNLESKIRIIEDFPKKGISFKDITTLLEDKAAFKYTIDSFSELLKDKDIDIVVGPEARGFMFGTPLAYALGAGFVPARKKGKLPCDTLSIEYGLEYGKDVIEIHKDAIKPGQKVAIIDDLLATGGTIEAVTKLVEEMGGEVVSINFLIELTGLNGREKLEKYDINSLVTYEF >NC_021182|2344890:2358257|2354949_2355549_+|WP_015615501.1|DBSCAN-SWA 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13 | uncultured_Mediterranean_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2536605 : 2547982
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_021182|2536605:2547982|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_021182|2536605:2547982|2546433_2546706_+|WP_155241906.1|DBSCAN-SWA MSSLKKMLEHEEKCWYNPQNRTCITCKFGELIDDSCDHDELPGCPTEHWRYRICHEYHGEDIEFPKRKATGETVIPIEHCEYWKIKESIK >NC_021182|2536605:2547982|2538478_2538715_+|WP_015615668.1|DBSCAN-SWA MLIKKQANFKLKGLRASCNLKQSDIAKELGISESTYNRKENGYADFSETEMWQISKILNKEPESIFFSNIFFDNKVAK >NC_021182|2536605:2547982|2539447_2539657_+|WP_015615671.1|DBSCAN-SWA MFDTKNIKGYYKLNCIDKTVFDSFLKRFYEAWEYPEEHKPVSVKVQKEFIRVDLNDGSWLHVKPNGEWY >NC_021182|2536605:2547982|2547334_2547982_+|WP_015615684.1|DBSCAN-SWA MPKIKIIDETTGEVTDIECVGYNLQFVESTGNGVIQKIRALNNGKYGYKHWIKNDFYRPIAQKIKDKYKEKFEEFTMINLDKILFIEDTEYIGDELKRSDEIMWIKKANKQLEEVTGYKFIIESREFWVERISNEQVVALIYSCLRQIENGYKIREPDLVGWKEVIGTLGYGWETTKSEIPNLLDGFNMNDFKMLRKADKQVGFFDSKEKYYEQG >NC_021182|2536605:2547982|2539281_2539455_+|WP_015615670.1|DBSCAN-SWA MGKLVRVETEHVKVGRFEAFVTKKFYDGPEEREAQVRALKRIKSLIGREPQEGAKDV >NC_021182|2536605:2547982|2537419_2537866_-|WP_015615666.1|DBSCAN-SWA 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21 | Bacillus_phage(27.27%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2552094 : 2577497
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_021182|2552094:2577497|DBSCAN-SWA 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28 | Brevibacillus_phage(16.67%) | terminase,portal,tail,capsid,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2701307 : 2748503
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_021182|2701307:2748503|DBSCAN-SWA 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52 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | protease,terminase,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2752703 : 2782459
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_021182|2752703:2782459|DBSCAN-SWA 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40 | uncultured_Caudovirales_phage(25.0%) | integrase,portal,holin,tail,capsid,plate,head | attL 2756506:2756521|attR 2765772:2765787 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3079866 : 3139987
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_021182|3079866:3139987|DBSCAN-SWA 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52 | Tupanvirus(25.0%) | portal,coat,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
3152310 : 3163166
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_021182|3152310:3163166|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_021182|3152310:3163166|3157245_3157455_-|WP_015616267.1|DBSCAN-SWA MNNTIREIIKNKNLKTIEVIRKVGVAKSYFYDVMNGASIPSLQIARRISDELEVPLDELFPEETFETRN >NC_021182|3152310:3163166|3155042_3155222_-|WP_015616260.1|DBSCAN-SWA MIRKLLEKQGLKMSDQEFNEVMQETQNDIRENHLRFGVRTSRKYLLKVAIIYYGISKSI >NC_021182|3152310:3163166|3159822_3161004_-|WP_015616271.1|DBSCAN-SWA MKVNPVTLIIIISFCYPILKGLLLGFSSYSAKRDMENIIGSISFILAVYIGIKYVRNIFIGNENGVVNKMISYLPDNIAYYFQSKPMIIYLIVIPIAIYIIYKIISVILIFINNITIYHLIDGIESLVRNKSYVFRRIMGALVQIPRSICYLLVVLLMLNFASMFSVNSQFNKYLSSSNTYKYLCQQFVIPATNSNVAKKLPKIIDDSVSIVVKQNNLQNLPNGKISDTSPGRTIVYYNGVTLDEGIKSNQQINNFARNLVEREGNTTSKAKKLYDWEGQNIAYDYNKANLVLNNNFDIQSGAIPTFESRKGICFDYACLYVAMARADNMKVRLVTGEGFNGVSWVSHAWNMVYIPETDKWINVDTTFSKGGNYFNSRIFDLDHRNAKIIGEW >NC_021182|3152310:3163166|3161903_3163166_-|WP_015616273.1|DBSCAN-SWA MDRGIINFKETELSNGLKLITIKKSTDLFSVHAGIKIGSIYERKDEKGIAHFVEHMLFKGTKTKSNEVLNDEFEGIGGEYNAYTDYNCTVVHAAGLKEELTKSLSLISDMLINCNFPEEEIEKEREVILAEIRTSIDDVEDYSFKRAHAAAYKNSPLKYETIGEEGTVKKFTRKDIYNFYHKYYVPNNCCISIVSSLEHEDLIKLAENYFEKWLRKDFRVKDIIVENNIPIKKITFKDNIEQSSIIYIFTFHGLDEKSELALKILNHKLGESANSILFRELREKRGLAYDVYSELDTSSFVKSLYIYTAVGKENIENTIACINSCIEKIKSEEFLFDVDTINLMKKVLKTAVILTIEDTSELCNYVLHQIIEKEDIYKFLTDMKDLKDIKKEDIYEAARTVLKDPTIHILLPKESDIFEG >NC_021182|3152310:3163166|3156779_3156989_-|WP_015616265.1|DBSCAN-SWA MFEAKNIKNYNRLGPNAKKAFDNFLRKFYNAWEYPEDHKPVAVNMCKGFLKVDLNDGSWLHVTPSGEWY >NC_021182|3152310:3163166|3155236_3155785_-|WP_015616261.1|DBSCAN-SWA MIDVQDHLGLAKLQAGRIYKKFQLSYRYDFDDILQMCHVGLIKAAQKFDKTKGYTFSTYALSLMYGYVLNTILRDKYYPSAERNGSLNSHVLSLDINVNNSMDKEVTYKDAIMDKQEFYTEFTGILVRTALEKLPSKHREVIKLRYFQGKTQMQIAKLFGTSQTTIGRFEKEGLTKLRRYVS >NC_021182|3152310:3163166|3157684_3158152_+|WP_015616268.1|DBSCAN-SWA MDANNNVKKIGNKIREIRKSKKLSIMDIKEITGLSKSTISEIENNNSNPTAETLQKLANALKVPVSDFFADKNEPPMDQASEEYYESEKGKYKSMLLKDGFEFKTPQEAMKFVLSQPAIMGFGGFDANKMSDEEIMDFANELLNQLKLLGYKYKK >NC_021182|3152310:3163166|3158174_3158621_+|WP_015616269.1|DBSCAN-SWA MNWIDSIILGLIEECGSNDIYEVCDYLGIDIVKLEPNNAILLGNESVYNRNFFNREVIFIRNDFAVKYARFVISHEVCHAVVHTSIGSAAFNGDLINKGKLERQANYFAFKFNNIKFDEIQLYEMTMEQISSCLELPEKALKQLFNEI >NC_021182|3152310:3163166|3161065_3161914_-|WP_015616272.1|DBSCAN-SWA MKDKITKIELQKKRKDRVNIYINNEYSLSCSAELVFLHSLKKDMDIDKDYLEKIIDEENYIKCKNDALKAIERSYKTEKEISTKLVQKEHSEKNINKAIEFLRQYKFVDDYRYVDLYLKEKMKKQGKKKIKYELLKKGIEENIINDKLGSISNESEVFNMDILARKKYSILIKSEDNSFKIYSKLFNYLSRLGYNNSMIKDVIKNIMDVITEKDNYRQSIKKTTEENYQELHSIAEKRYNIILKHESNSVKIYGKLWRFLTAKGYSSDDVKQELKKLINTDI >NC_021182|3152310:3163166|3157063_3157231_-|WP_015616266.1|DBSCAN-SWA MSSFYRVEDITKILDISTSKAYKIIQQLNKELKDKGYVTIAGRIPIKYFKEKYYC >NC_021182|3152310:3163166|3152310_3153267_-|WP_015616259.1|DBSCAN-SWA MRNDNTDVLAMGRVEYEVNGTPIKLTSTIVKKYLVSGDPTRVTDEEVGVFLQLCKGQKLNPFLREAYLVKFGNKPAAMIVGKDTFTKRELRNQDSEGHEAGIIVVNLKKEVEQRSGTFYLKGQEMLVGGWAKAYRKNKKFPTEITVTLDEYIGKKADGTTNSNWTQRPATMIRKVALVQALREAYPEEFEGLYVAEEMNVDDKDLNTEPVDPEKEIEKENEVPEQPKPVQREQKEYLMQLGAQKGLVIGEGKEADVSKLEALANEHKISLRGLTYESANTLLKLVEEYTEVVDVEVTPVNDDPGPDAPPEDESDTEPF >NC_021182|3152310:3163166|3155989_3156187_-|WP_015616263.1|DBSCAN-SWA MPRKVNVDVNRAKQLYEKYGTLSRAALSLDCSPTHLKKVLVNAGVEINPYKAEKWNMKSGGWNNG >NC_021182|3152310:3163166|3156186_3156549_-|WP_015616264.1|DBSCAN-SWA MKINENYKIEAIDERNVCIMERKVPKEEPGKEPKKHYWKTEGYYPNIEFALKSLVTKEINGTGIKGLKTITDKIKELHELMEELNYKTAMELLEYKKKNKELEATIEEMSERILDLEACE >NC_021182|3152310:3163166|3155790_3155997_-|WP_015616262.1|DBSCAN-SWA MAKKFLPGLKYVFTKKNFIKRFGKEEYRKSKTWVNKANGNNVKVTGICSGDVRGFLVIPEWCKCIGKE >NC_021182|3152310:3163166|3156561_3156765_-|WP_041710913.1|DBSCAN-SWA MNKYQKVINQIVKDHLQKTFIPLSFTCVRKVIRKKFKRVTNGYGYKSLRFSTLLKIKQYGKDHEFRA >NC_021182|3152310:3163166|3158699_3159749_+|WP_041711518.1|integrase|DBSCAN-SWA MPTYKNEEKGTWYCSFYYTDWTGAKKKKKKEGFKKESEAKAFERKFLEKQQNNCDINFGALADLYMEDAATRIRATTLQCKKYIVDLKIKPYFGKMRTSDITANHVRKWQNEMIKKDYSQTYLKNINNQLSAIFNFAIKYYNLSSNPDIKAGTIGKKNADGMKFWTLDEFKKFIEYSSKPMATLAFKILFWTGIRSGELMALTWKDIDLENKILHITKTYARINKIDYINNPKTPKSKRDVSLSDFLCRDIEIYKNKVYETGSNERIFTFTKDFICREIKRICKKSEVKQIRIHDLRHSHASLLIELGFTPLLIAERLGHENPQTTIDTYSHLYPNKDSAVANKLDDLY |
16 | Clostridium_phage(50.0%) | integrase | attL 3151804:3151819|attR 3161546:3161561 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
3325601 : 3360581
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_021182|3325601:3360581|DBSCAN-SWA 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34 | Streptococcus_phage(28.57%) | holin,tail,protease,tRNA,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
3373722 : 3381344
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_021182|3373722:3381344|DBSCAN-SWA ACTAAAACGGTATGTCTCCATCATCTATCGGAGTAATATCTCCGTACTCAGTATCAATATTCTTTACTGGTTCAAGGACTTTGCCGCCTTGATTATTTATCTCTCCATCAACTGGCTTCTTATCCCATTCAAGGAACTGGACTTCATCAGCTACAACCTCAGTAATATAAACTCTATGACCGTCTTTAGCTTCATAATTTCTTGTCTGTATTCTCCCCGAAATTCCGGCAAGCTTTCCTTTTGTCAGGTAGTTTGCAGCTGACTCACCTATCTTATTCCATACCACTATAGGTACAAAATCAGCTTCTCTTTTTCCTGTATTTTTGTCGGTGAAATTCCTATCTACAGCTAAGGTAAAAGTACATACTGCATTACCACTTCCCGGGGTAAATTTCAAGTCTGGATCCTTTGTGAGCCTACCTATTAAAACAACTCTATTCATTTATTTCACCTCATTGTTTAAATTTAACTTGGTTACTATCTTCACCTGGTTCAAAGTGATCTTCTAATATATAACTAGACTCTAAATCTGCTGTATGAAGAGCAACACCAGCTTTATACATATTCCATGCATTACTTATAGTATTTAAATTCTCCTTGGCTTCATAGCCACCCATATGCCAACGGATAAGGATAACTTCTTCTTTAGTTAGTTTTATAAATTGTTGAAGCAATATAACACTCTTATCGCCATGTCCTATAGGCATTAAATCATTAACCCCATATGCTGGTGTTTTAATCCATTTTGGTTTTTCTCCTGCTTTTGCGATATTAACATTCTTATCGTAAACTGTGTAAAAATTTACTTTGCAAATATCATGGAGCAGTGAAGAAATTGTAACCGTGTCATAGCTTAGTCCAAAATCATATATTTCATTTTTTCTTTTGAATAATTCGTAGACATTAAGACTATGTTCTGCAAGTCCTCCTGAAAAATTTCCATGGAATCTGGTTGAAGCGGGGGCGGTAAAAAAATCGCCCTCTACCAAATATTTAGCAACCTTATCTATATTTTCTCTTTTGACATTACTCAAAAGATTTATTATTTGTTCTTTAACTACCTTTATGTCTTTCATGCTTGCCTCCTTATAGATAGCTTTGTTCGTAAATAATCATTTTCTTCCTGAAGCTTATCTGCTTTTGTTTCTACTTCTGATAATCTATCCTGTAATGATATATAGGTTTCTTTTTCTTCGTGCAGCATTTCATCTATTGTGTGAAAAAGTTTATTAAATGCATCCCATGTGCCAGTTATCCATGTTCCATCTGAAAACTTAAATATAATGGTGTCACTATTGCGGTCTAATGGCTTGAATGAATACTTGTCATTTTCTTCTAAAAATATATTTGCATTTGAAATCATGAGATTACCTCTTAAAATGGATCTGCGTCATCAATGTCTTCGGGTGGTGCGTCAGTACCAGGATCATCATTTACAGGAGTTACTTCTACATCTACAACCTCAGTGTATTCTTCAACTAACTTTAGAAGAGTGTTTGCACTATCGTAGGTTAGACCTCTAAGACTTATTTTGTGTTCATTTGCCAGTGCTTCAAGCTTAGACACATCTGCTTCCTTGCCTTCGCCTGTTACTAATCCTTTTTGAGCTCCTAGCTGCATTAAATATTGTTTCTGTTCTTTCTGAACTGGTTTTGGCTGCTCTGGGGCCTCATTTTCTTTTTCAATTTCCTTTTCTACGTCTACTGGATCTGTACTTAAATCTTTATCATCAACATTCATTTCCTCAGCTACATATAAGCCTTCAAATTCTTCCGGATAAGCTTCTCTAAGAGCCTGTACTAATGCAACCTTTCTTATCATCGTTGCCGGTCTTTGGGTCCAGTTAGAATTTATCGTGCCATCTGCTTTTTTTCCTATATATTCATCTAATGTAACTGTAATTTCAGTAGGAAATTTTTTATTTTTTCTATAAGCTTTGGCCCATCCACCAACTAGTGTTTCTTGGCCTTTAAGATAGAATGTTCCGCTTCTCTGCTCAACCTCTTTTTTTAGATTAACAACTATTATTCCTGCCTCATGGCCTTCACTATCTTGATTTCTTAATTCTCTCTTGGTAAAAGTATCTTTGCCAACTATCATGGCTGCTGGCTTATTGCCGAATTTTACTAGATATGCTTCTCTTAAGAATGGATTTAATTTTTGACCTTTGCATAATTGAAGGAAAACTCCTACTTCTTCATCTGTAACTCGTGTTGGATCACCACTTACTAAATACTTTTTTACTATAGTAGAAGTTAACTTTATTTGAGTTCCATTAACTTCATACTCAACTCTGCCCATTGCTAAAACATCAGTATTATCATTTCTCATTATTTAAGCACCTCAACTTTCAATTCTTGGCCTTCAACTACTTTAGCCATAATCATTTGTGTATCTAATTCCTGTATAACTGTAATGCTCTCTGCATTATCAATGAACACTGGAAAATGTAAATCCATCATATTTGAAACAAAGTTACTCATTTCAAGGCCAGCCTTTATTTTTTCTGCATTAGATAACTTATTGAATTCTCTACCTTCATATAGGATTTTAAAATCATCTTTAAGCTCTCCATCTTTGGTTAATTTTTCAAATTGCAACTCTACTTTATCTAGGTACTTACCTATAATCTCAGTTTGCTTTTTAAGTTTTATAGAGTTGTACTGCTTACCGGCATCTATAGCAACTTTTAATTCTGCTATTTTTAGCTTGGAGTTTTCAATTTCTCTCTTGGATTTTTCTATATCATGCTTGATTTTTTCATTCTGCTTTTCAAGAGCTTCTATATTTGAGTTATGAGCAAAAATTCTTCTCTCTTCCTCATCAAGCTCTAATACTTTTGCTTTTATTGATGTGATTTTCTCTTTTCTGGATTCTTCCTCTTTTGATTTTTCTGCTGCAAGGTTACTTATTTCTTTTTGAATAGTCTCTATTTGATATTTAAGACCTATTTCCCATTCCTGGACTACTTTCATATTCTCTGCTTTTGTAATTTCATTTTCTTTTTCAAGTTCATCTATCTCTTTTTTCTTGGCTATGCCCTCAGCCTTTACCTCGTTTAATTCTTTTTCTAAACTAACCTTTAGAGTTGCATTAAGATCTATTTCATTACCACAGTTATCACAAGTAACCACGTTTTTACCAATATTAGATGTTTTGGCTTCAATATCTCTAAATCTTTTAAGTAAACTGTCTTTCTCTGCTCTCAGCCACTTAGTACCCTCTATAGGCTTTATATCAAGGTAACCTTTTAAAAGTTCTAATTCTAAATCTCTTTTTTTTCTTTCCAGTCTATCAAAATTAGGATCTTTAGATACTGATTCTAAACTTTTAAGCTGCTCTCTAAGATTCTTTAATTCTGTATCAGCAAAACTTTTTCTTTCAGGAATATCTATAGGTTTAGCCCCTTCGATGACCCCCTCTAGGAAGATGATATTTTCCTCCTGGTCTTTTAATTCTGCTCTCTTATCTGTAAGAAAAGTTTCAGGAGTTCTAAACTTATTCTTTTCTAATTTCTCCTTTAAGAAGTCTCCAAGCTCTGCAAATATGTCTTCCTTGCTTATTGGCTTTAAGATACTGGATAAAAGATTCTTTGCATCTTTTGGAGCTAAATTAGGAAAGTAATAAGGATTTAATATACTGAGGAAAACATCTTTGCTCTTATACAAGTCCCTTGAGATATCATTGTTGGCCACTTTAACGTCATTCAAGTAAATCTCATTACTGGAACCTTTCTTTCTTCTGATTAAAGTTTGTGGTGTTCCATCTATCTCAAGATCAAGTACCACCTCAGTCAACTTAGGCTTTTTATCATTAACAAGCCTTGCTGTAGCCTTTTCATTTCCGTTAATATCACAACCAGTTATAGCCCACGCTATAGCTTCACCTATGCTAGACTTTCCTAGACCGTTATCGCCACTTACCAGTGTTCTTTTACCTAAGACAAATTCGCATTCGTCTACGTAGCCCTTAAAGCCTTTTATGGCTATCTTATTTATATTTACCTGCATTTATATTTCCTCCTATTTGACTTTTACCCTCATTCCATAGTAGAATAGGGATACACTATTTTATTTATTGGCTCTTTTTCTAAGAGCTCTTTTTTTATATACTCTTTGAAATTCCATAATAAATAATTGCCACCTTTAACAGATAATCCTTTGAAGTCCTAACCCCTAACCTAAGATGATTTTCTCTAATGTCGTTTTGAGTTTCTGTCATGACCTCTTTAAATTTTGTATCCGACATCTTAAGACCGTTTTGCTCTAACAATTTTCTTATCAACTTTATTCTTCCTCCTTGTTATAACTGCATGGCATACGCCACTGGCAGTAGTCCCATAATAACTACCTATTTCGCTCCAACTAAGGCCTTCTTCTCTGAATTTAAGAACATCTTTTACATCCTTCTCAATCCAATCAAAGTTTGGAGATCTTTTACGTTCAAGCCATGCAAGATTATCTATATATTTAAAAGCTATTTCAGGCGGACAATTTCGCCTTATAGCAACATGGAGAGCCATTAGATTTTCAAATACCATTACTTAACACCTGCCTCCTTAATTATTTTTCTTGCATTTTCAAATCTAACTCTAGCTATCAGAAATATGTCTTTATAAGACTTGCCTTCTTTCTTAAGATTAATTACCTGCTTCTTCTTCTTGGCTGTTATTTTCATTACTTACATGCCTCCAAATCTAAAATCCTCTCTGACATTTCCTCAAGCTGTGCTTCAAGCTCCTTATTCTTTTTCTCATATTCCAGTAGCTCCATGGCTGTTTTATAATTAAGTCCCCCAATAAGTTCATGCAACTCTTTAATCTTATCTGTAATCGTCTTTAAACCTTTTATTCCAGTACCATTAATCTCTTTTGTAACTAAACTCTTAAGAGCAAATTCTATGTTGGGATAATAGCCTTCTGTTTTCCAATAAGGTTTCTTTGGTTCTTTTCCTGGTTCTGCTTTTGGAATTTTACGCTCCATGATGCAAACATTTCTTTCATCAATGGCTTCAATTTTGTAGTTTTCATTAATCTTCAATGGTTTCGCCTCCTATGCTCTAAATTCATGATCCTTGCCATACTGTTTGATTTTTAGTAACGTTGAAAATCTAAGGCTCTTATAGCCATATTCATTAGTTACTCTTTTAAATTTTTTGCGGATTGCTTTTCTTGTGGTAACAAATGGTATTGGCATAAAAGTTTTCTCTAAATGGTCTTTAGTTATTTGATTGATTACTTTTTGATATTTATTCAAGTCCTCCTTACCTCACTTTTTTTCGCATCATGACATATTTTATAGCCACAGCTCCTAATCATGTCATGGTTCTTTTTATCCACTCTTACTTTTTAGCCATTGCGGCACTATAGATATGATTAGTTATTGAAATGCTGATATTTGGTTTTGAAATGATTAAACTACTTTCTTTTCTTGGAAAGATATTATCTTACTGCTTTCCGCTAAAACAGTTTGTAAAATCCCTTTAAAGCAATCTCTTTCTTTTTTTACTTCTTCTAATTCCTTTTCAAGTTTTCTTTCCCTTAAAGTAGCTCTTTCCGGAATACAACCTTCAATCTTTTCAATGTATTGTAAATTGTATCTGATGCAAGGGATTCCTTTTACGGGAACAATGATTCTATTCTCTCTGTACTGGTCTATTGTTCTTTCTGAAACTTGCCACCTTTCTGCTAAATCCTTTTTAGTTAATAACTTATCCACAACTCTTGACCCCCTCATAAAATATTTCAGGCACTGTTTTCCCTAAAGCGCTTGATATTTTTTCCATTACCAATTTTGTTGGATTAGTCTCATTCATATTGTCATTTTCTATATCACTTATATACCCCACGGCCACACCAGATGCTAATGATAATTCCTTTACTGTCATCCCTATAGACTGTCTAAATTCTTTTATTCTGTTCATCTTCTCACCCCCTGTTTGCTATATTTAAATTATATGTTTTTCTCTGGTAGAGAACAAAGTTTATATTATTTCACTACAGGCGAAGAAAGCAAACTGTTGTTCGTTTTCAGCGAAATACTTTATTTTTCTTAATATTTCGTTGACATTGAAATATTTTAAGTATAAAATATTCGTTATGGGAGAATAATTACAAATGAGGTGATATTAATGAATGGATATAATATAAAAAAAATTAGAGAAGAAAAGCATATTACTATTAATAAACTAGCTGAATTAGCTGGCATGTCTGTAGGATATCTGAGTGACATAGAAAATAATAAGAAAAAGAATCCAACGATAGATAAAATTGAAAAAATTGCAGATGCGCTTGGAATTACAATAAAAGAATTGTTAACTACTGAGGAACAGTTGAACTATACTATTGATACTATAAAGAACATACATAATATTGTTAAAGAAGGTTTAGAAAATAGTTCATATGTAGTGGATAATAAAAACAATTTAATACTAGAACCTTTTTATGATGTAGAATTTACCGAAACTGAAAGGTCCGAAATAGTTCAATATATGAAGTACTTATTGTCGAAAAGAAAACGATAGGAGGTAATTTTTATGCAATACAATATAACCTATAGAAAGAAAGACAATGGATGGCAATACATTATCAGTTACAAAGATAATTTGGGAAAATGGAAACAGAAATCGAAACAAGGCTTCCCTTTGAACAAAGAGGGAAAACAGGCTGCAAAAGATGCCGCTCTAGTAACAGTAGACGAACTAAAATTAAAGAGTTGTATTGTTGAACATAATGAATGTGACAAAATGAGTTTTAAAGAATTTGGGGAAAAGTTCATTAAGCATGAAACTTTATATAAAACAGCTAATACAATAAGTTCTCACTACAGTTCTTTGAAAAAATTCTCTTCTCTCTATGATCTTTCTTTACCAGAAATTACGAATCTAGATGTTCAAAACTGCATTGACTTGCTTGTAAACAAAAAATTAAAAGCTTCCACTATAAAATGGCATTTATCCAATATAAAACTTATATTCGCCTATGCAAAAGAAAAATATAAGCTTATACAGGAAAATCCAGCATCCAATATTGATATACCTGTAGACGAAAATACAAGTGAGAAAACTGCATTGACTATAACTCAATTAGAAGATTTGTTAAAAAAAATACAATATAAACCTTTTTTCTTAATGTCTCTTTTGGCTGCAAAATGTGGCTTAAGGATAGGAGAAATTGTTGGTCTGAGATGGTCAGATATTGACGAACCAAGGTCTATTCTACAAGTATCGCTTCAATGGAAGAAAATTGATAGCAATAAATATGGATTAGGAAAATTAAAAACTAATAATTCTAAAAGGGAAGTCCCTATTCCTGTAGTGGTTATGGATGAACTTATGAAATTTAAAAAAGAAAATCCTATTAATTTTGATAATAGAATTTTTAAAAATAAATCACTTGTAGGGATATCGTCTGACTTGAGTAGAAATTATAAAAAAGCTGGGTATAGTATAACAGTGCACGAATTAAGACATACTTATGCTACCATGTTGATAAGTCATGGTGTTGACTTTAAAACCGCCGCAAAGCTGCTAGGACATGATATTAAACAAACCATGAATACTTATTCTCACGTAACATCTGACATGATAGAAAATGCGTCAAAAAAAATCAATACAATATTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_021182|3373722:3381344|3373722_3374163_-|WP_015616472.1|DBSCAN-SWA MNRVVLIGRLTKDPDLKFTPGSGNAVCTFTLAVDRNFTDKNTGKREADFVPIVVWNKIGESAANYLTKGKLAGISGRIQTRNYEAKDGHRVYITEVVADEVQFLEWDKKPVDGEINNQGGKVLEPVKNIDTEYGDITPIDDGDIPF >NC_021182|3373722:3381344|3376051_3377731_-|WP_015616476.1|DBSCAN-SWA MQVNINKIAIKGFKGYVDECEFVLGKRTLVSGDNGLGKSSIGEAIAWAITGCDINGNEKATARLVNDKKPKLTEVVLDLEIDGTPQTLIRRKKGSSNEIYLNDVKVANNDISRDLYKSKDVFLSILNPYYFPNLAPKDAKNLLSSILKPISKEDIFAELGDFLKEKLEKNKFRTPETFLTDKRAELKDQEENIIFLEGVIEGAKPIDIPERKSFADTELKNLREQLKSLESVSKDPNFDRLERKKRDLELELLKGYLDIKPIEGTKWLRAEKDSLLKRFRDIEAKTSNIGKNVVTCDNCGNEIDLNATLKVSLEKELNEVKAEGIAKKKEIDELEKENEITKAENMKVVQEWEIGLKYQIETIQKEISNLAAEKSKEEESRKEKITSIKAKVLELDEEERRIFAHNSNIEALEKQNEKIKHDIEKSKREIENSKLKIAELKVAIDAGKQYNSIKLKKQTEIIGKYLDKVELQFEKLTKDGELKDDFKILYEGREFNKLSNAEKIKAGLEMSNFVSNMMDLHFPVFIDNAESITVIQELDTQMIMAKVVEGQELKVEVLK >NC_021182|3373722:3381344|3379132_3379438_-|WP_015616482.1|DBSCAN-SWA MDKLLTKKDLAERWQVSERTIDQYRENRIIVPVKGIPCIRYNLQYIEKIEGCIPERATLRERKLEKELEEVKKERDCFKGILQTVLAESSKIISFQEKKVV >NC_021182|3373722:3381344|3377825_3378005_-|WP_015616477.1|DBSCAN-SWA MIRKLLEQNGLKMSDTKFKEVMTETQNDIRENHLRLGVRTSKDYLLKVAIIYYGISKSI >NC_021182|3373722:3381344|3379841_3380243_+|WP_155241928.1|DBSCAN-SWA MILMNGYNIKKIREEKHITINKLAELAGMSVGYLSDIENNKKKNPTIDKIEKIADALGITIKELLTTEEQLNYTIDTIKNIHNIVKEGLENSSYVVDNKNNLILEPFYDVEFTETERSEIVQYMKYLLSKRKR >NC_021182|3373722:3381344|3379430_3379643_-|WP_015616483.1|DBSCAN-SWA MNRIKEFRQSIGMTVKELSLASGVAVGYISDIENDNMNETNPTKLVMEKISSALGKTVPEIFYEGVKSCG >NC_021182|3373722:3381344|3378260_3378398_-|WP_015616479.1|DBSCAN-SWA MKITAKKKKQVINLKKEGKSYKDIFLIARVRFENARKIIKEAGVK >NC_021182|3373722:3381344|3380255_3381344_+|WP_015616485.1|integrase|DBSCAN-SWA MQYNITYRKKDNGWQYIISYKDNLGKWKQKSKQGFPLNKEGKQAAKDAALVTVDELKLKSCIVEHNECDKMSFKEFGEKFIKHETLYKTANTISSHYSSLKKFSSLYDLSLPEITNLDVQNCIDLLVNKKLKASTIKWHLSNIKLIFAYAKEKYKLIQENPASNIDIPVDENTSEKTALTITQLEDLLKKIQYKPFFLMSLLAAKCGLRIGEIVGLRWSDIDEPRSILQVSLQWKKIDSNKYGLGKLKTNNSKREVPIPVVVMDELMKFKKENPINFDNRIFKNKSLVGISSDLSRNYKKAGYSITVHELRHTYATMLISHGVDFKTAAKLLGHDIKQTMNTYSHVTSDMIENASKKINTIF >NC_021182|3373722:3381344|3378772_3378976_-|WP_015616481.1|DBSCAN-SWA MNKYQKVINQITKDHLEKTFMPIPFVTTRKAIRKKFKRVTNEYGYKSLRFSTLLKIKQYGKDHEFRA >NC_021182|3373722:3381344|3374793_3375084_-|WP_015616474.1|DBSCAN-SWA MISNANIFLEENDKYSFKPLDRNSDTIIFKFSDGTWITGTWDAFNKLFHTIDEMLHEEKETYISLQDRLSEVETKADKLQEENDYLRTKLSIRRQA >NC_021182|3373722:3381344|3375095_3376052_-|WP_015616475.1|DBSCAN-SWA MRNDNTDVLAMGRVEYEVNGTQIKLTSTIVKKYLVSGDPTRVTDEEVGVFLQLCKGQKLNPFLREAYLVKFGNKPAAMIVGKDTFTKRELRNQDSEGHEAGIIVVNLKKEVEQRSGTFYLKGQETLVGGWAKAYRKNKKFPTEITVTLDEYIGKKADGTINSNWTQRPATMIRKVALVQALREAYPEEFEGLYVAEEMNVDDKDLSTDPVDVEKEIEKENEAPEQPKPVQKEQKQYLMQLGAQKGLVTGEGKEADVSKLEALANEHKISLRGLTYDSANTLLKLVEEYTEVVDVEVTPVNDDPGTDAPPEDIDDADPF >NC_021182|3373722:3381344|3377970_3378243_-|WP_155241927.1|DBSCAN-SWA MALHVAIRRNCPPEIAFKYIDNLAWLERKRSPNFDWIEKDVKDVLKFREEGLSWSEIGSYYGTTASGVCHAVITRRKNKVDKKIVRAKRS >NC_021182|3373722:3381344|3374173_3374797_-|WP_015616473.1|DBSCAN-SWA MKDIKVVKEQIINLLSNVKRENIDKVAKYLVEGDFFTAPASTRFHGNFSGGLAEHSLNVYELFKRKNEIYDFGLSYDTVTISSLLHDICKVNFYTVYDKNVNIAKAGEKPKWIKTPAYGVNDLMPIGHGDKSVILLQQFIKLTKEEVILIRWHMGGYEAKENLNTISNAWNMYKAGVALHTADLESSYILEDHFEPGEDSNQVKFKQ >NC_021182|3373722:3381344|3378397_3378760_-|WP_015616480.1|DBSCAN-SWA MKINENYKIEAIDERNVCIMERKIPKAEPGKEPKKPYWKTEGYYPNIEFALKSLVTKEINGTGIKGLKTITDKIKELHELIGGLNYKTAMELLEYEKKNKELEAQLEEMSERILDLEACK |
14 | Listeria_phage(16.67%) | integrase | attL 3371761:3371775|attR 3382757:3382771 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
4377832 : 4383620
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NC_021182|4377832:4383620|DBSCAN-SWA ATCACTCATAGCTTTCCGCCTCTGGGCTTATATCCATATCCAATTCCTTTAAAAAGTTTCTAACACTATAGTAAAGTTTCCTGTAAATCTCAAATCCTGAGTTAACTCTTTCAGTAAATATGGTGTCATATAAATATAAATCCTGTATGCTTGATAATCTTCCTAAGAGTGCTTTTGGAGTATATAAACTCCTGTAATTACCTGTCTTTATGTTCTCCATACCGTTCTTATCTTCAATTATGAGATAAATCTTAATGCCTTTTGTCTTTGCCCTTTGTAACTCACGTATAAGCCTTACATCATCATGAGTGTCGGTTTCTTCTGCTAAGTTTCCGGCAATTTCATCTATAGAATTTTTCCTTTCTACTGCTACTGGAAAATATAAATCTCTGTAGATTCCCATATCCGGGCGCTTAGTGATTATTGCAGTGTAGTCTCCTTCATCAATCTTTTTCTTCTTATATGAGACCTTCTTTTTATCTAAATAATCCAATATGTGCAAATTGGCTTGCTCTCTGGTGTCATATAATATTTGAAAATTTTCCTTTAGAAGTTTTTTGATTTCTGTTTCTGAAAATTTGTAATGCATATATTCACCTTCTTTTATCAATTGATTGTCATTTGATAATATCTAATTACAACAATGTTTAAAATCGTTCTTAGTTCTCAATATTATTGAATTACGTACTATTCTTGCTTGTTTATAAAGTAATATTCTATATTATTTTTCGCACAAGTCTCACAATGTTTTGGATTACCATGACCTGCTTCTATAGATTTTTTACAAGACTTGCATCCACATTCAATAAGTCCTTTAATATTTATTTCATCAGATATATTCTCTAACATTATCCTAATCATATTTTAATAAATTCTCCTTCGTCATATAAATATTAATCATATTAAAATTTTCACGATAAATACTGTTTGCCCTTTTGTTTAAGCAGCTTGACTAACTGCTATCTTAAAAGGTATATCACCATCATCTATAGGCGTTATATCCGCTTTTAAATATTCATCATTATTTTTCACAGGTTCAAGAACCTTGCTACCTTGATTATTTATTTCTCCATCAACTGCTTTCTTATCCCATTCAAGGAATTGGACTTCATCAGCAATTATTTCAGTAACATAAACTCTGTGACCGTCTTTAGCCTCATAATTCCTGGTTTGTATTCTTCCTGAGATTCCAGCTAGCTTACCTTTATTTAAATAATTTGCTGACGACTCTGCTGTTTTGCCCCATACTACTATAGGAATAAAATCAGCTTCTCTTTTTCCCGTATTTTTGTCTGTAAAATTTCTTTCTACAGCTAAATTGAAAGTACATACTGCATTCCCTGAACCAGGAGTAAATTTCAAATCCGGATCCTTCGTCAGTCTGCCTATTAAAACAACTCTGTTCATCTATTTCACCTCACTAAACTTCACTTGATTACTATCTTGCCCTGGTTCTATATGCTGTTCCAATAAATAACTAGCTTCCATATCCGCTGTATGGAGTGCTACTGCCGCCGGGAACAACTCCCAAGCATTGTTAAGATTCATCTGCATTTCCTTAGGCTCCGTATTTCCCATGTGCCATCTTATGAGCAATATTTCTTGCTTAGTTAACCTTATAAAGTTCTGAATCATGATTACTGATTTTTCACCATGGCCCACTGGAAAATCGTCCTGGACCTTATAACCTTCGTAACTTTCCCATCTATTGCTGTCATTCTTTTTCCAACACGTTTGCTTATTATAAAAATTAATCTTACAGAAGTCATGTAATAGAGCTGTCACAACTACAGTATCCTCTGATAATCCCAGTTGGAATCTTTCATTTTTCTCTTTTAAGAGTTCATAGACATTAAGGCTGTGTTCTGCCAGCCCTCCATCATAGTTGCCATGATATTTAGTGGAAGCAGGAGCAACAAAGAAGTCGCTCGCTACTAAATACATAATTAATTTGTCCATGCCAGGCTTTTGAACATTACTTAAGAGATTCAATATTTGTTCTTTAACTACTTTTATATCTTTCATTTTTGCCTCCTTAATTCTAACTGCTCCCTTAAATATTCATTTTCTTCCTGAAGCTTATCTGCTCTTGTTTCTGATTCTAGTAATCTATCCTGTAATAATGCATGAGTTTCTTTTTCTTCGTGCAGCATCTCATCTATAATTGCAAATAGTTTGTTAAATGCGTCCCATGAGCCAATTATCCATGTTGCTTCTGGGCATTTAAGGATAAAAGTATCTTTATTTTCAGGGTTGAATGAATAATTATCATCAGATTTTATAAAAATATTTACACTTGTGACCATAAAATCACCTCTTAAAATGGATCTGCGTCATCAATATCATCAGGTGGAGCATCCGGGCCAGGATCATCATTTACTGGAGTTACCTCAACATCTACAACCTCAGTGTATTCTTCAACTAATTTTAGAAGAGTATTTGCACTTTCATAAGTTAACCCTCTAAGACTTATTTTGTGCTCATTTGCTAGTGCTTCAAGCTTACTTACATCTGCTTCTTTACCTTCACCAATTACAAGTCCCTTTTGAGCTCCTAGCTGCATCAAATATTCTTTTTGCTCTCTCTGTACTGGCTTTGGCTGCTCTGGTACCTCATTTTCTTTTTCTATTTCCTTTTCAGGATCTACTGGCTCTGTATTTAAATCTTTATCGTCAACATTCATTTCTTCAGCTACATATAAGCCCTCAAATTCTTCTGGATAAGCTTCTCTGAGAGCCTGTACCAATGCAACCTTTCTTATCATAGTTGCTGGTCTTTGTGTCCAGTTAGAATTTATCGTGCCATCTGCTTTTTTCCCTATATATTCATCTAATGTAACTGTAATTTCAGTAGGAAATTTTTTATTTTTTCTATAAGCTTTGGCCCATCCGCCAACTAATTTTTCCTCGCCTTTAAGATAGAATGTTCCGCTTCTCTGCTCAACCTCTTTTTTTAGATTAACAACTATTATTCCTGCCTCATGTCCTTCACTATCTTGATTTCTTAATTCTCTCTTGGTAAAAGTATCTTTGCCAACTATCATGGCTGCTGGCTTATTGCCGAATTTTACTAGATATGCTTCTCTTAAGAATGGATTTAATTTTTGACCTTTGCATAATTGAAGGAAAACTCCTACTTCTTCATCTGTAACTCGTGTTGGATCACCACTTACTAAATACTTTTTTACTATAGTAGAAGTTAACTTTATTTGAGTTCCATTAACCTCGTATTCAACTCTACCCATTGCTAAAACATCAGTATTATCATTTCTCATTATTTAAGCACCTCAACTTTCAATTCTTGACCTTCAACTACTTTGGCCATAATCATTTGTGTATCTAGTTCCTGTATAACTGTAATACTTTCAGCATTATCTATGAAAACTGGAAAATGTAAATCCATCATATTTGAAACAAAGTTACTCATTTCAAGGCCAGCCTTTATTTTTTCTGCATTGGATAACTTATTAAATTCTCTACCTTCATATAGGATTTTAAAATCATCTTTAAGCTCTCCATCTTTAGTCAATTTCTCAAACTGCAATTCTACTTTATCCAGGTACTTACCTATAATGTCAGTTTGCTTTTTAAGTTTTATAGAGTTGTACTGCTTACCGGCATCTATAGCAACTTTTAATTCTGCTATTTTTAGCTTGGAGTTTTCAATTTCTCTCTTGGATTTTTCTATATCATGTTTGATTTTTTCATTCTCCTTTTCAAGAGCCTCTATATTTGAGTTATGAGCAAAAACTTTTCTCTCTTCCTCATCAAGCTCTAATACTTTTGCTTTTATTGATGTGATTTTCTCTTTTCTGGATTCTTCCTCTTTTGATTTTTCTGCTGCAAGTTCACTTATTTCTTTTTGAATGGCTTCTATTTGATATTTAAGTCCTATCTCCCATTCCTGAACTGCTTTCGCATTTTCAGCCTTGGTAATTTCATTTTCTTTCTCCCATTCTTCTATTTCTTTTTTCTTGGCAACACCTTTAATTTGTATATCCTTTAATTCTTTTTCTAAATTAGCTTTTAGAGTCGCATTAAGGTCAATTTCATTGCCGCAGTTATCGCAAGTAACTACATTCTTACCAAGATTAGATATTTTGACTTTAATCTCTTTAAATCTCTTAAGTAAACTGTCCTTCTCTGCTTTATGCCACTTAGTATCATTTATAGGCTTTACATCAAAATATCCTTTAGAAAATTCTAATTGTAATTTTCTCTTTTTATTTTCTAATTCATCAAACTTAGGATCTTTAATTACTGATTCCAAAGTTTTGAGTTGTTCTTTGAGATTCTTCAGCTCTGTATTATCAAAACTCTTTCTTTCAGAAATATCTATAGGTTTGGCACCTTCAATGACCCCCTCTAAGAATATAATGTTTTCCTCTTGATCCTTTAATTCTGCCCTCTTATCTGTTAAGAAAGTTTCAGGAGTTCTAAATTTATTCTTCTCTAATTTTTCCTTTAAGAAGTCCCCGAGCTCTGCAAATATTTCTTCCTTGCTTATTGGCTTTAAGATACTAGATAAAAGATTCTTTGCATCTTTTGGAGCTAGATTAGGAAAGTAATAAGGATTCAATATACTGAGGAAAACATCTTTGCTCTTATACAAGTCCCTTGAGATATCATTGTTGGCCACTTTAACGTCATTCAAGTAAATCTCATTACTGGAGCCTTTCTTTCTTCTAATTAAAGTTTGCGGCGTTCCATCTATCTCAAAATCAAGTACTACCTCGGTAAGCTTTGGTTTCTTATCATTAACAAGTCTTGCTGTAGCTTTCTCATTTCCGTTGATGTCGCAACCAGTTATGGCCCACGCTATAGCTTCACCTATACTAGACTTTCCTAGACCGTTGTCGCCACTTACCAGTGTTCTTTTACCTAAGACAAATTCACATTCGTCTACGTAGCCCTTAAAGCCTTTTATGGCTATCTTATTTATATTTACCTGCATTTATATTTCCTCCTATTTGACTTTTACCCTCATTCCATAGTAGAATAGGGATACACTATTTTATTTATTGGCTCTTTTTCTAAGAGCTCTTTTTTATATACTCTTTGAAATTCCATAATAAATAATTGCCACCCTTAACAAATAATCCTTTGAAGTCCTAACCCCTAACTTAATGTGATTCTCTCTAATATCGTTTTGAGTTTCTTCCATGACTTCATTAAACTCTTGGTCTGACATTTTGATACCTTGCTGCTCTAGTAATTTTCTTATCATTGCTTTTGCCACTCCTAACTTACATATCGCCTTAGTTTAGTAAGTGCTTCTTTTTCAAACCGTCCAATTGTAGTTTGGCTAGTTCCAAATAGTTTTGCTATTTGCATTTGAGTTTTCCCTTGAAAGTATTTTAGTTTTATAATTTCTTTATGTTTACCGGACAATTTCCCCAAGGCAGTTCTTACTAAAATACCAGTAAATTCAGTATCAAGTTCCTGTTTGTCCATAATGGCATCTTTATAAGTAACTTCTTTATCATCAGAATTATTAACATTAACATCTAAGCTAAGGACATGTGAATTTAAACTTCCATTTCTCTCAGCAGAGGGGTAAAATTTATCTCTTAAAATAATATTTAATGTATAGCCATACATTAAGCTTAAAGCATAGGTACTAAATTTATATCCTTTAGTTTCATCAAATTTTTGTGCAGCTTTTATTAGCCCTACATGGCATATTTGAAGAATATCGTCAAAGTCATATCTATAAGACAATTGAAATTTTTTATATACCCTACCTGCCTGAAGTTTTGCAAGCCCTAAATGTTCTTGAACATCAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_16 >NC_021182|4377832:4383620|4379238_4379856_-|WP_015617298.1|DBSCAN-SWA MKDIKVVKEQILNLLSNVQKPGMDKLIMYLVASDFFVAPASTKYHGNYDGGLAEHSLNVYELLKEKNERFQLGLSEDTVVVTALLHDFCKINFYNKQTCWKKNDSNRWESYEGYKVQDDFPVGHGEKSVIMIQNFIRLTKQEILLIRWHMGNTEPKEMQMNLNNAWELFPAAVALHTADMEASYLLEQHIEPGQDSNQVKFSEVK >NC_021182|4377832:4383620|4378770_4379238_-|WP_015617297.1|DBSCAN-SWA MNRVVLIGRLTKDPDLKFTPGSGNAVCTFNLAVERNFTDKNTGKREADFIPIVVWGKTAESSANYLNKGKLAGISGRIQTRNYEAKDGHRVYVTEIIADEVQFLEWDKKAVDGEINNQGSKVLEPVKNNDEYLKADITPIDDGDIPFKIAVSQAA >NC_021182|4377832:4383620|4380148_4381105_-|WP_015617300.1|DBSCAN-SWA MRNDNTDVLAMGRVEYEVNGTQIKLTSTIVKKYLVSGDPTRVTDEEVGVFLQLCKGQKLNPFLREAYLVKFGNKPAAMIVGKDTFTKRELRNQDSEGHEAGIIVVNLKKEVEQRSGTFYLKGEEKLVGGWAKAYRKNKKFPTEITVTLDEYIGKKADGTINSNWTQRPATMIRKVALVQALREAYPEEFEGLYVAEEMNVDDKDLNTEPVDPEKEIEKENEVPEQPKPVQREQKEYLMQLGAQKGLVIGEGKEADVSKLEALANEHKISLRGLTYESANTLLKLVEEYTEVVDVEVTPVNDDPGPDAPPDDIDDADPF >NC_021182|4377832:4383620|4377832_4378420_-|WP_015617295.1|DBSCAN-SWA MHYKFSETEIKKLLKENFQILYDTREQANLHILDYLDKKKVSYKKKKIDEGDYTAIITKRPDMGIYRDLYFPVAVERKNSIDEIAGNLAEETDTHDDVRLIRELQRAKTKGIKIYLIIEDKNGMENIKTGNYRSLYTPKALLGRLSSIQDLYLYDTIFTERVNSGFEIYRKLYYSVRNFLKELDMDISPEAESYE >NC_021182|4377832:4383620|4378518_4378692_-|WP_015617296.1|DBSCAN-SWA MIRIMLENISDEINIKGLIECGCKSCKKSIEAGHGNPKHCETCAKNNIEYYFINKQE >NC_021182|4377832:4383620|4382877_4383057_-|WP_015617302.1|DBSCAN-SWA MIRKLLEQQGIKMSDQEFNEVMEETQNDIRENHIKLGVRTSKDYLLRVAIIYYGISKSI >NC_021182|4377832:4383620|4379852_4380137_-|WP_015617299.1|DBSCAN-SWA MVTSVNIFIKSDDNYSFNPENKDTFILKCPEATWIIGSWDAFNKLFAIIDEMLHEEKETHALLQDRLLESETRADKLQEENEYLREQLELRRQK >NC_021182|4377832:4383620|4383071_4383620_-|WP_015617303.1|DBSCAN-SWA MIDVQEHLGLAKLQAGRVYKKFQLSYRYDFDDILQICHVGLIKAAQKFDETKGYKFSTYALSLMYGYTLNIILRDKFYPSAERNGSLNSHVLSLDVNVNNSDDKEVTYKDAIMDKQELDTEFTGILVRTALGKLSGKHKEIIKLKYFQGKTQMQIAKLFGTSQTTIGRFEKEALTKLRRYVS >NC_021182|4377832:4383620|4381104_4382784_-|WP_015617301.1|DBSCAN-SWA MQVNINKIAIKGFKGYVDECEFVLGKRTLVSGDNGLGKSSIGEAIAWAITGCDINGNEKATARLVNDKKPKLTEVVLDFEIDGTPQTLIRRKKGSSNEIYLNDVKVANNDISRDLYKSKDVFLSILNPYYFPNLAPKDAKNLLSSILKPISKEEIFAELGDFLKEKLEKNKFRTPETFLTDKRAELKDQEENIIFLEGVIEGAKPIDISERKSFDNTELKNLKEQLKTLESVIKDPKFDELENKKRKLQLEFSKGYFDVKPINDTKWHKAEKDSLLKRFKEIKVKISNLGKNVVTCDNCGNEIDLNATLKANLEKELKDIQIKGVAKKKEIEEWEKENEITKAENAKAVQEWEIGLKYQIEAIQKEISELAAEKSKEEESRKEKITSIKAKVLELDEEERKVFAHNSNIEALEKENEKIKHDIEKSKREIENSKLKIAELKVAIDAGKQYNSIKLKKQTDIIGKYLDKVELQFEKLTKDGELKDDFKILYEGREFNKLSNAEKIKAGLEMSNFVSNMMDLHFPVFIDNAESITVIQELDTQMIMAKVVEGQELKVEVLK |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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