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NC_021235_1 | 1348092-1352667 | TypeV,TypeI-E |
NA
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cas14j,DEDDh,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021235_1
The CRISPR arrays of NC_021235_1 >merge|NC_021235|1|1348092-1352667|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_021235.1|WP_015639197.1|1345634_1346798_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MTKLIKGVKLRLYPNKQQQAQLWQMFGNDRRVWNLMLDMAKQRYQNNPSSHFVNEYGMNYLLKQLKQEYPYLKDSDATSFLVVNHNLVQAFKMLFKHRGGYPRFKSRHAAKQSYTGRSVCTVIAKRRMKLPKLGSIRTSKTSQAVNGKIKRYTVSYGPTGRYYLSLQVETVAPEVLPKTGKTVGLDVGIADLAISSDGEKFGTFNAKWLEKQATKWQSNYSRRKYQATVAVRQWNHNHKDVKMDLNDYQNWQRAQKQKARYQQRIANQRQDYLHKLTTALVKKYDVIVIEDLKAKNLQKNHHLAKAIANASWYQFRTMLKYKCDWYGKQLITVNPNYTSQICSTCGYHSGKKPLEIREWTCPKCGTHHDRDINAAVNILHRGLKAVG >NC_021235.1|WP_015639195.1|1343762_1344728_-|aspartate-carbamoyltransferase-catalytic-subunit MTTQLVEQLVSLPHFVSVEDLTTDQVNALIARAEEFKNGAPAPELSQPVYVTNMFFENSTRTHTSFAMAEKKLGLTEIPFDASHSSIKKGETLYDTCLTLDALGVDLTVIRASENDYYLPLINPGAGHYLGLGIVSGGDGSGQHPSQCMLDIMTIHEHFGHFKGLKVAIVGDITHSRVARSNMEILNKLGAEVYFSGPEYWYDHAFDKYGKFLPIDELVEEVDVMMLLRVQHERHAGDAHEGDFSAADYHKQYGINEERYALLKPDTIIMHPGPINRGVELADSLVEAPKSAFVAQMENGVFMRMAMLEAVLRGRKLGGLE >NC_021235.1|WP_004563240.1|1342473_1343763_-|dihydroorotase 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>NC_021235.1|WP_012391418.1|1337280_1338198_-|dihydroorotate-dehydrogenase MTNRLAVSLPGLNMTNPLMPASGTFGFGDAWGADQVNFNDLGALVIKTTTPEARTGNPQPQIAKLTDGVMNAVGLTNPGVDAVIKEKLPNLAKQYPDLPVVGSIGGSTETDYVLVAEKLAKSGLVSALELNVSCPNVAHGGMAFGTDAKVLESLTNQVKRVVGDVPLYVKLTPNVTDITEVARGAEAGGADGLSLINTVLGLHIDIRTGQPVLGNGMGGYSGTAVKPLAVRMVYQVARATKLPIIGMGGIETAADVLEFMMAGASAVAVGAAHFKDIAACPHIAAQLPALMDELGIKTLAELKRI >NC_021235.1|WP_015639192.1|1336242_1337049_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDQHLIALDMDGTTLNNQSKLTDHTVSTLRRLANDGHLVVIVTGRPWLISVHLYDQIGLKSPIINFNGALAHLPYQNWKHEYAIKVTRELTLDMLESRRKLGVQTLIAEDKHHVWADHPSNELPEFLPAQLSDDQILNERNLTDDPIALTIQFDPAKKDAIINRVNERYGDFVEPRVWGGGYSIMELIHRGTHKETALSYLAHHFQIDRQHIVAFGDEQNDLEMIDFAGHGVAMKNAIPELKAVAKDVTNLDNEHDGVADYLEKYFQL >NC_021235.1|WP_035431171.1|1334740_1336114_-|RsmB/NOP-family-class-I-SAM-dependent-RNA-methyltransferase 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>NC_021235.1|WP_041813941.1|1355870_1356971_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MMKNLYLDINVLQTVPSSNINRDDTGTPKTAIYGGVTRSRVSSQSWKRVMRQAFMTDSEGAEWLNSHRTKHAAKLLAGRIKKLSDGLSDEEALEKALEAFNTTKVKPKKDKKTGEYLTGALLQLSNGQLDKLAHYVLSHDELDIKEIKETLMEKSSLDLALFGRMVADDPELNVDAASQVAHAISTHAIVPEYDFYTAIDDDKEDSQAGSAMMGTLAYNSSTLYRYANVNINELMHNLGSTELTIEGVKLFVKEFMLTMPTGKENTFANKTLPQYVMITLREDTPVNLVSAFEEPVKSNHGYVEESIERLEKEYSDTLKLVEQPIYTGVLTTKQSNLNQVANTEELLDQVAKFVSEKVVDDENVNG >NC_021235.1|WP_015639207.1|1356979_1357564_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MSHISKTVAKIIHQLYNDGDLDKGTLAKLRTANSLLSRDATAIWPLLFENIEDKQDLSQTGEPSFAETAIFTALRAYAIYQQGTEESVFKHSDNWRENRSLFQAFGRLRSDPDFTDSLDKRVSNVLTSLNFQSAENSITQLVRILKSKGQGGQIDFAQLGEDLYRFQFSSESARQVTLKWGQDYYWNNLKDNQE >NC_021235.1|WP_015639208.1|1357580_1359245_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA 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MKELSKQVKALWGKKSNVDGQELWQPLVVHLLDTKNVINWLYSHWLTDGQRKVIQGNLSEEAGQQLAEFLGAVHDLGKATPVFQIKKSYNGDQDLDDQLMEQLIQVGFDHLGDLILASPRESPHALAGEALLEQFGIDKTVGAIIGGHHGKPQSKVPRTEIDDHTKNYWQVDNLVKAREGNWLKVQRELFNFCLQECGYQSVADVPANLTQPQAILLEGLLIMADWLASTEYLGDDRSKPLFPLIPLHNSMEDLDLGARFQRAILTWWVEDQWFPEQITDIDEQFQKWWGFKPRPVQRQMDQVIQDATDPGIIIIELEPGAGKTEIALEAVEQLAYTNGEQGLFFGLPTQATSNAMFDRVTDWLAKVAKDDDAKLGIKLMHSKAEFNPTYADLKIPQAHNVEGEGSVTVNSWFSGKKSILEEFSIGTIDHLLLMGLKQKHLFLRHLGMSGKVVVIDEVHAYDAYMDSYLTKALEWLGAYHVPVIALSATLPIATRSALIEAYCKGKYGKKKVEGAPSWDKNQAYPLISVLDGKRLVQKSDFMRNTEKRVVEVERLSVEEEGLIKAVLEAVEDGGVAGVIVNTVKRAQMIASQIPKGIPKLILHSAFLAPDRAEIETKLQGLIGKYGKRPKKMIIIGTQVLEQSLDIDFDIMFTDIAPMDLLIQRIGRLHRHDIQRPSKLVTPQVKIMGINDYGDYGSANEAIYSKYLLMKTDQYLPEQLTIPDDISPLVQATYRDDGEMEPDLREAKRVFDVKHKEELDKAEKFQIKSPKQRKSLHGWLDSELVDANKDEVRAQAAVRDIQETLEVLMVKQVKGDYYLLDGQQLEEVDSKTIAQQLIRIPAAVTPRIDKSIELLETQTAKNFPDWQADPWLKGALVVVLDEQNSVELGNWRIHYSRKFGLSYEKADDDEKQAF >NC_021235.1|WP_003683897.1|1362197_1362557_-|50S-ribosomal-protein-L19 MRQNQLIEKVTAGQLRSDIPAFRAGDTVRVHALIVEGTRERVQIFEGVVIKRHGAGISATYTVRKISNGIGVERTFPLHSPRVEKIEVVRYGRVRRAKLYYLRERTGKSARIAERRRDK >NC_021235.1|WP_015639210.1|1362677_1364105_-|amino-acid-permease MKKLIARLLKQEDPSVYQLKDGQLEPTLRTIDLIGLGTGMVVGTAIFTLPGIVAAEHTGPAVPLAFIVAAIGAGLSALAYAETASVLPFAGSAFSWMNVLFGEFFGWIAGWALLAEYFISVAFVASGWSAYMQGFLASFGIKLPTALTGGFNPASGSYVDIFAAIAILAVGWLLSHGVHQVARIENTIVAIKLLVIILFIVVGATAIHIQNYHPFISAHRPGTTFGGWTGIMAGASQIFIAYVGFDAIAANTAETKNPQKTMPRGLIGTLVLGTSFFIVVSLVLVGMFKYSRYANNAEPAAWALRESGHYLTANLLSVVALIGIFSALIAILLASSRLIYAFGRDGLLPSFLGHVDAKRVPNRALWTITVLAMILGSIFPFTFLATLVSAGTLVAFIFVSLGIYALRRREGKDLPEAQFKMPGYPILPAVSVIFSAVIFWNLNVDAKWMMVGWFAIGLLVYFLYGIRHSTLAKKG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021235_1 | 1.18|1349157|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349157-1349189 | 33 | MN830252 | Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome | 27234-27266 | 0 | 1.0 |
NC_021235_1 | 1.18|1349157|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349157-1349189 | 33 | HQ141410 | Lactobacillus phage LF1, complete genome | 22566-22598 | 0 | 1.0 |
NC_021235_1 | 1.24|1349523|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349523-1349555 | 33 | MN830253 | Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome | 53466-53498 | 0 | 1.0 |
NC_021235_1 | 1.26|1349646|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349646-1349678 | 33 | MN830253 | Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome | 26115-26147 | 0 | 1.0 |
NC_021235_1 | 1.62|1351875|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1351875-1351907 | 33 | KP054477 | Lactobacillus phage LfeInf, complete genome | 68278-68310 | 0 | 1.0 |
NC_021235_1 | 1.70|1352363|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1352363-1352395 | 33 | MK504445 | Lactobacillus phage ATCCB, complete genome | 49730-49762 | 0 | 1.0 |
NC_021235_1 | 1.15|1348974|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1348974-1349006 | 33 | MN830253 | Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome | 26403-26435 | 1 | 0.97 |
NC_021235_1 | 1.18|1349157|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349157-1349189 | 33 | GU323708 | Lactobacillus phage phiPYB5, complete genome | 20676-20708 | 1 | 0.97 |
NC_021235_1 | 1.19|1349218|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349218-1349250 | 33 | MN830253 | Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome | 21250-21282 | 1 | 0.97 |
NC_021235_1 | 1.53|1351294|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1351294-1351326 | 33 | NC_029068 | Lactobacillus phage LfeSau, complete genome | 13504-13536 | 1 | 0.97 |
NC_021235_1 | 1.59|1351692|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1351692-1351724 | 33 | MN830253 | Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome | 26403-26435 | 1 | 0.97 |
NC_021235_1 | 1.68|1352241|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1352241-1352273 | 33 | NC_029068 | Lactobacillus phage LfeSau, complete genome | 16935-16967 | 1 | 0.97 |
NC_021235_1 | 1.16|1349035|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349035-1349067 | 33 | MN830252 | Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome | 26136-26168 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.42|1350623|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350623-1350655 | 33 | GU323708 | Lactobacillus phage phiPYB5, complete genome | 18449-18481 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.48|1350989|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350989-1351021 | 33 | KP054477 | Lactobacillus phage LfeInf, complete genome | 36546-36578 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.52|1351233|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1351233-1351265 | 33 | NC_029068 | Lactobacillus phage LfeSau, complete genome | 14183-14215 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.60|1351753|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1351753-1351785 | 33 | MN830252 | Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome | 26136-26168 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.66|1352119|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1352119-1352151 | 33 | KP054477 | Lactobacillus phage LfeInf, complete genome | 29181-29213 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.82|1351873|33|NC_021235|CRT | 1351873-1351905 | 33 | KP054477 | Lactobacillus phage LfeInf, complete genome | 68280-68312 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.88|1352239|33|NC_021235|CRT | 1352239-1352271 | 33 | NC_029068 | Lactobacillus phage LfeSau, complete genome | 16937-16969 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.90|1352361|33|NC_021235|CRT | 1352361-1352393 | 33 | MK504445 | Lactobacillus phage ATCCB, complete genome | 49728-49760 | 2 | 0.939 |
NC_021235_1 | 1.79|1351690|33|NC_021235|CRT | 1351690-1351722 | 33 | MN830253 | Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome | 26405-26437 | 3 | 0.909 |
NC_021235_1 | 1.27|1349707|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349707-1349739 | 33 | MN830253 | Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome | 27237-27269 | 4 | 0.879 |
NC_021235_1 | 1.80|1351751|33|NC_021235|CRT | 1351751-1351783 | 33 | MN830252 | Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome | 26134-26166 | 4 | 0.879 |
NC_021235_1 | 1.86|1352117|33|NC_021235|CRT | 1352117-1352149 | 33 | KP054477 | Lactobacillus phage LfeInf, complete genome | 29179-29211 | 4 | 0.879 |
NC_021235_1 | 1.48|1350989|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350989-1351021 | 33 | MT774376 | CrAssphage cr55_1, complete genome | 58297-58329 | 6 | 0.818 |
NC_021235_1 | 1.48|1350989|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350989-1351021 | 33 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 61884-61916 | 6 | 0.818 |
NC_021235_1 | 1.4|1348303|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1348303-1348335 | 33 | AP014341 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S37-C76, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 25950-25982 | 7 | 0.788 |
NC_021235_1 | 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350256-1350288 | 33 | MT778837 | Rhizobium phage AF3, complete genome | 137419-137451 | 7 | 0.788 |
NC_021235_1 | 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350256-1350288 | 33 | MN549361 | Rhizobium phage RL2RES, complete genome | 74441-74473 | 7 | 0.788 |
NC_021235_1 | 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350256-1350288 | 33 | NC_025429 | Rhizobium phage vB_RleM_P10VF, complete genome | 126023-126055 | 7 | 0.788 |
NC_021235_1 | 1.54|1351355|34|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1351355-1351388 | 34 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 1061631-1061664 | 7 | 0.794 |
NC_021235_1 | 1.63|1351936|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1351936-1351968 | 33 | NZ_CP039965 | Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence | 1345267-1345299 | 7 | 0.788 |
NC_021235_1 | 1.90|1352361|33|NC_021235|CRT | 1352361-1352393 | 33 | MK504442 | Lactobacillus phage 3-SAC12, complete genome | 21034-21066 | 7 | 0.788 |
NC_021235_1 | 1.32|1350012|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350012-1350044 | 33 | NZ_CP031836 | Lactobacillus amylolyticus strain L5 plasmid p1, complete sequence | 195842-195874 | 8 | 0.758 |
NC_021235_1 | 1.32|1350012|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350012-1350044 | 33 | NZ_CP020458 | Lactobacillus amylolyticus strain L6 plasmid pL6-1, complete sequence | 209041-209073 | 8 | 0.758 |
NC_021235_1 | 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350256-1350288 | 33 | MN734438 | Sphingomonas phage Lucius, complete genome | 5466-5498 | 8 | 0.758 |
NC_021235_1 | 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350256-1350288 | 33 | MT778839 | Rhizobium phage P9VFCI, complete genome | 46369-46401 | 8 | 0.758 |
NC_021235_1 | 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350256-1350288 | 33 | MN549360 | Rhizobium phage RL38J1, complete genome | 121054-121086 | 8 | 0.758 |
NC_021235_1 | 1.40|1350501|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350501-1350533 | 33 | MN694638 | Marine virus AFVG_250M1093, complete genome | 38666-38698 | 8 | 0.758 |
NC_021235_1 | 1.17|1349096|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1349096-1349128 | 33 | MN694029 | Marine virus AFVG_250M395, complete genome | 9619-9651 | 9 | 0.727 |
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NC_021235_1 | 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350256-1350288 | 33 | MN734439 | Sphingomonas phage Kharn, complete genome | 5465-5497 | 9 | 0.727 |
NC_021235_1 | 1.40|1350501|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350501-1350533 | 33 | NZ_CP017949 | Tenericutes bacterium MO-XQ plasmid unnamed, complete sequence | 34848-34880 | 9 | 0.727 |
NC_021235_1 | 1.53|1351294|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1351294-1351326 | 33 | NZ_CP054616 | Azospirillum oryzae strain KACC 14407 plasmid unnamed2, complete sequence | 158072-158104 | 9 | 0.727 |
NC_021235_1 | 1.54|1351355|34|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1351355-1351388 | 34 | NZ_CP033927 | Chryseobacterium joostei strain DSM 16927 plasmid unnamed, complete sequence | 21847-21880 | 9 | 0.735 |
NC_021235_1 | 1.61|1351814|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1351814-1351846 | 33 | MN694029 | Marine virus AFVG_250M395, complete genome | 9619-9651 | 9 | 0.727 |
NC_021235_1 | 1.83|1351934|33|NC_021235|CRT | 1351934-1351966 | 33 | NZ_CP039965 | Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence | 1345265-1345297 | 9 | 0.727 |
NC_021235_1 | 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1350256-1350288 | 33 | NZ_CP007015 | Pseudomonas syringae CC1557 plasmid pCC1557, complete sequence | 42214-42246 | 10 | 0.697 |
NC_021235_1 | 1.53|1351294|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1351294-1351326 | 33 | NZ_CP029831 | Azospirillum ramasamyi strain M2T2B2 plasmid unnamed7, complete sequence | 406216-406248 | 10 | 0.697 |
NC_021235_1 | 1.53|1351294|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1351294-1351326 | 33 | NC_013857 | Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510c, complete sequence | 624607-624639 | 10 | 0.697 |
NC_021235_1 | 1.54|1351355|34|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT | 1351355-1351388 | 34 | NZ_CP039845 | Acetobacter pasteurianus strain CICC 22518 plasmid pAP22518-1, complete sequence | 214375-214408 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.18|1349157|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830252 (Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cggccccgcgcttgatcatcttcatcttttgca CRISPR spacer cggccccgcgcttgatcatcttcatcttttgca Protospacer *********************************
2. spacer 1.18|1349157|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ141410 (Lactobacillus phage LF1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cggccccgcgcttgatcatcttcatcttttgca CRISPR spacer cggccccgcgcttgatcatcttcatcttttgca Protospacer *********************************
3. spacer 1.24|1349523|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830253 (Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagcgattgctaatggcttgatgtggttgctag CRISPR spacer tagcgattgctaatggcttgatgtggttgctag Protospacer *********************************
4. spacer 1.26|1349646|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830253 (Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagtgctgttaaagcacccgattgaatcaacca CRISPR spacer gagtgctgttaaagcacccgattgaatcaacca Protospacer *********************************
5. spacer 1.62|1351875|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KP054477 (Lactobacillus phage LfeInf, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atggtgccatcttcaatgttatccccagaaaag CRISPR spacer atggtgccatcttcaatgttatccccagaaaag Protospacer *********************************
6. spacer 1.70|1352363|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK504445 (Lactobacillus phage ATCCB, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatccattgtttaaatcagtaacagtaacgtag CRISPR spacer aatccattgtttaaatcagtaacagtaacgtag Protospacer *********************************
7. spacer 1.15|1348974|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830253 (Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gcctggcacaaccgttggcgtcagtgggctatg CRISPR spacer gcctggcacaaccgttggcgtcagtggactatg Protospacer ***************************.*****
8. spacer 1.18|1349157|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to GU323708 (Lactobacillus phage phiPYB5, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
cggccccgcgcttgatcatcttcatcttttgca CRISPR spacer cggccccgcgcttaatcatcttcatcttttgca Protospacer *************.*******************
9. spacer 1.19|1349218|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830253 (Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
agatgtctaccaggatctaggcaatcagcattg CRISPR spacer agatgtataccaggatctaggcaatcagcattg Protospacer ****** **************************
10. spacer 1.53|1351294|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_029068 (Lactobacillus phage LfeSau, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
attcggccgcaagaccggcccgcttcgtatatg CRISPR spacer attcggccgcaagaccggcctgcttcgtatatg Protospacer ********************.************
11. spacer 1.59|1351692|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN830253 (Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gcctggcacaaccgttggcgtcagtgggctatg CRISPR spacer gcctggcacaaccgttggcgtcagtggactatg Protospacer ***************************.*****
12. spacer 1.68|1352241|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_029068 (Lactobacillus phage LfeSau, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
ttgcggtaggcttccacgttattaaccgttgta CRISPR spacer ttgcggtaggcttccacgttattaaccgttgtg Protospacer ********************************.
13. spacer 1.16|1349035|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830252 (Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tcggtgctaactggttactacacgtccgctcag CRISPR spacer tcagtgctaactggctactacacgtccgctcag Protospacer **.***********.******************
14. spacer 1.42|1350623|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to GU323708 (Lactobacillus phage phiPYB5, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
cagccatacagccaaggactctaacagagctga CRISPR spacer cagccatacagctaaggattctaacagagctga Protospacer ************.*****.**************
15. spacer 1.48|1350989|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to KP054477 (Lactobacillus phage LfeInf, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
ttaaataagactgttgatgagcttaatagtaag CRISPR spacer ttaaacaagactgttgatgaacttaatagtaag Protospacer *****.**************.************
16. spacer 1.52|1351233|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_029068 (Lactobacillus phage LfeSau, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taggtgacaccgtggcaatcattcgccacgata CRISPR spacer taggtgataccgtggcaattattcgccacgata Protospacer *******.***********.*************
17. spacer 1.60|1351753|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN830252 (Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tcggtgctaactggttactacacgtccgctcag CRISPR spacer tcagtgctaactggctactacacgtccgctcag Protospacer **.***********.******************
18. spacer 1.66|1352119|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KP054477 (Lactobacillus phage LfeInf, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
cgcccttttcttcggtgtacatttcataataca CRISPR spacer cgcccttttcttcggtgtacatctcgtaataca Protospacer **********************.**.*******
19. spacer 1.82|1351873|33|NC_021235|CRT matches to KP054477 (Lactobacillus phage LfeInf, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
acatggtgccatcttcaatgttatccccagaaa CRISPR spacer caatggtgccatcttcaatgttatccccagaaa Protospacer *******************************
20. spacer 1.88|1352239|33|NC_021235|CRT matches to NC_029068 (Lactobacillus phage LfeSau, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
acttgcggtaggcttccacgttattaaccgttg CRISPR spacer ttttgcggtaggcttccacgttattaaccgttg Protospacer .*******************************
21. spacer 1.90|1352361|33|NC_021235|CRT matches to MK504445 (Lactobacillus phage ATCCB, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
acaatccattgtttaaatcagtaacagtaacgt CRISPR spacer ttaatccattgtttaaatcagtaacagtaacgt Protospacer .*******************************
22. spacer 1.79|1351690|33|NC_021235|CRT matches to MN830253 (Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
acgcctggcacaaccgttggcgtcagtgggcta CRISPR spacer ttgcctggcacaaccgttggcgtcagtggacta Protospacer .***************************.***
23. spacer 1.27|1349707|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830253 (Lactobacillus phage JNU_P5, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
taggatcgccaatcccgttgatggcggatagag CRISPR spacer ttggatcaccaatcccgttgatagcggatagaa Protospacer * *****.**************.*********.
24. spacer 1.80|1351751|33|NC_021235|CRT matches to MN830252 (Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
actcggtgctaactggttactacacgtccgctc CRISPR spacer cttcagtgctaactggctactacacgtccgctc Protospacer .**.***********.****************
25. spacer 1.86|1352117|33|NC_021235|CRT matches to KP054477 (Lactobacillus phage LfeInf, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
accgcccttttcttcggtgtacatttcataata CRISPR spacer tgcgcccttttcttcggtgtacatctcgtaata Protospacer **********************.**.*****
26. spacer 1.48|1350989|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttaaataagactgttgatgagcttaatagtaag CRISPR spacer ataaagaagactattgatgagcttaattctatg Protospacer **** ******.************** ** *
27. spacer 1.48|1350989|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttaaataagactgttgatgagcttaatagtaag CRISPR spacer ataaagaagactattgatgagcttaattctatg Protospacer **** ******.************** ** *
28. spacer 1.4|1348303|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014341 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S37-C76, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aagcaaaataataaaactagaatagaccgccaa CRISPR spacer attgaaaatactaaatctagaatagaccgagaa Protospacer * ****** **** ************* **
29. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT778837 (Rhizobium phage AF3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
-agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer ccgaac-tcgaagaagtcgtacagcgtttcgcca Protospacer **.* ************* ** ******* .*
30. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN549361 (Rhizobium phage RL2RES, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
-agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer ccgaac-tcgaagaagtcgtacagcgtttcgcca Protospacer **.* ************* ** ******* .*
31. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025429 (Rhizobium phage vB_RleM_P10VF, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
-agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer ctgaac-tcgaagaagtcgtacagcgtttcgcca Protospacer **.* ************* ** ******* .*
32. spacer 1.54|1351355|34|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
-aacattttcgttagcaatgctattgatcgattta CRISPR spacer caata-tttcgtaaacaatgctattgatcgaaaaa Protospacer **.* ****** *.**************** *
33. spacer 1.63|1351936|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP039965 (Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aggcgaccaagacattgtcaaactcgtcgaacg- CRISPR spacer ttgcgaccaagaccttgtcaaactcg-cggctgc Protospacer *********** ************ **. .*
34. spacer 1.90|1352361|33|NC_021235|CRT matches to MK504442 (Lactobacillus phage 3-SAC12, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
acaatccattgtttaaatcagtaacagtaacgt CRISPR spacer tcaatccattgtttaaatcagtaactttagttg Protospacer ************************ **..
35. spacer 1.32|1350012|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031836 (Lactobacillus amylolyticus strain L5 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tgtaactcagtaaatttaatcttttccatgttg CRISPR spacer gctgaatcagtgaatttaatctttgccatgatt Protospacer *.* *****.************ ***** *
36. spacer 1.32|1350012|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020458 (Lactobacillus amylolyticus strain L6 plasmid pL6-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tgtaactcagtaaatttaatcttttccatgttg CRISPR spacer gctgaatcagtgaatttaatctttgccatgatt Protospacer *.* *****.************ ***** *
37. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN734438 (Sphingomonas phage Lucius, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer acattctggaagaagtcgtcgttcgtttcgatg Protospacer * * . * ************ **********.
38. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT778839 (Rhizobium phage P9VFCI, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
-agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer ccgaac-tcgaagaagtcgtacagcgtttcgccg Protospacer **.* ************* ** ******* ..
39. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN549360 (Rhizobium phage RL38J1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
-agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer ccgaac-tcgaagaagtcgtacagcgtttcgccg Protospacer **.* ************* ** ******* ..
40. spacer 1.40|1350501|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694638 (Marine virus AFVG_250M1093, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tggttggtttcagatagttcatcttcaggtata CRISPR spacer tattcttcttctgatagttcatcttcaggtatt Protospacer *. *. .*** ********************
41. spacer 1.17|1349096|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694029 (Marine virus AFVG_250M395, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtaaaatgaaaataaccattaacgccaaccaag CRISPR spacer actcgaataaaataaccattaaagacaaccaag Protospacer .. .* ************** * ********
42. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007015 (Pseudomonas syringae CC1557 plasmid pCC1557, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer cgcgcgtcgaggaagtagtccatcgttgccggg Protospacer * *******.***** ********** * . .
43. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN734439 (Sphingomonas phage Kharn, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer acgttctggaagaagtcgtcgttcgtttcgatg Protospacer * . . * ************ **********.
44. spacer 1.40|1350501|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017949 (Tenericutes bacterium MO-XQ plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tggttggtttcagatagttcatcttcaggtata CRISPR spacer aatatgaattcagataatttatcttcaggtatg Protospacer . **. ********.**.************.
45. spacer 1.53|1351294|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054616 (Azospirillum oryzae strain KACC 14407 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
attcggccgcaagaccggcccgcttcgtatatg CRISPR spacer cagcgtccgcaagaccggcccgcttcgcttcaa Protospacer ** *********************. * .
46. spacer 1.54|1351355|34|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033927 (Chryseobacterium joostei strain DSM 16927 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aacattttcgttagcaatgctattgatcgattta CRISPR spacer tttattttctatagcaatgctattgatttatatg Protospacer .****** ****************. ** *.
47. spacer 1.61|1351814|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN694029 (Marine virus AFVG_250M395, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtaaaatgaaaataaccattaacgccaaccaag CRISPR spacer actcgaataaaataaccattaaagacaaccaag Protospacer .. .* ************** * ********
48. spacer 1.83|1351934|33|NC_021235|CRT matches to NZ_CP039965 (Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
acaggcgaccaagacattgtcaaactcgtcgaa CRISPR spacer cgttgcgaccaagaccttgtcaaactcgcggct Protospacer *********** ************. *
49. spacer 1.36|1350256|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007015 (Pseudomonas syringae CC1557 plasmid pCC1557, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
agagcgtcgaagaagtcgtccatcgtttcgata CRISPR spacer ctcgcgtcgaggaagtagtccatcgttgccggg Protospacer *******.***** ********** * . .
50. spacer 1.53|1351294|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029831 (Azospirillum ramasamyi strain M2T2B2 plasmid unnamed7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attcggccgcaagaccggcccgcttcgtatatg CRISPR spacer cagcgtccgcaagaccggcccgctgcgcttcaa Protospacer ** ****************** **. * .
51. spacer 1.53|1351294|33|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013857 (Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510c, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attcggccgcaagaccggcccgcttcgtatatg CRISPR spacer cagcgtccgcaagaccggcccgctgcgcttcaa Protospacer ** ****************** **. * .
52. spacer 1.54|1351355|34|NC_021235|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039845 (Acetobacter pasteurianus strain CICC 22518 plasmid pAP22518-1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
aacattttcgttagcaatgctattgatcgattta CRISPR spacer gacattttcgatagcaatgcaattggctgcacct Protospacer .********* ********* ****...* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
205014 : 281068
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021235|205014:281068|DBSCAN-SWA AATGGAAGCACACCAAGCACTCGAACGCCGTCGTAGCACCCGTTGGTTTTTGGACCGCCCGGTCGATCCGGACGATTTAAAGACGATTGTGGTCCAGGGACTGCACGCCCCTTCCTGGGTCAACTCCCAGCCCTACCACGCCCACATTGTGACCGGAGAGACCCTCCAAAGGATCAAAGACGACTACCTTGAGGCCAGCAGGAATGGTAAGGAAAGCAAGCCGGAACTGCCCCCGACGCCACTGGAAGATTGGTCGCCCTTGGCCCAGCAAAACATGACCCACTGGAGGGAAGGGGTGGAACACACCCTTGGTGACATGAAGGCCATGGAAGAGGCTGCGAGCCATTTGTACAACGCCCCGGCGATCGTTTATTTAACCCTGCCCAAGAACTTCTCGCCGTGGTCATTATATGACCTAGGGGGCTTTGGCATGGGGATGATCATCGCCGCTACCGACCAGGGGATTGCGAGCTTACCGGCCTACCGCTTCGTGATCTATCCGGACATCATTCGCCAACACGTTGAGATTCCGGAAGACGAGGTGCTGGTGCTCGGGATTGGCTTGGGCTACCGTGATTCCTACGCCCCGGTGAACCGGATTATTGCGGCCCGCGAACCGCTGACCGAACTTTTAGACTATAAGGAGTAATTGTAAGCCATGGCTGACCAAGAATTGTTCATGCAAAACATGTTGACCGAACTAACCACCTCGCAACGCTTTACGGAGGGGAACGCGCCCGCCTTCTCCCCCGACCGGGTTAATTACGACCCGGCTTCGCCTTTAAATGGGCGCCGGGTGGCCTTTTTGGGTTCTTCAATCACCTACGGGCTCTTCGCCAAGGGGGTTTCCTTCGTCGATTACCTGCAGGCCAAGGACGGTTTGGTCGCCACCAAGGCGGCCGTTTCTGGGACCACCTTGGCCGGTACCGACGTCAACGGCTACTTAAAGCGGATGAAACGGCGCTTCAACGGTCAAAAAGCGTACGACCTCTTTGTCTGCCAGCTATCGACTAACGACACTCGGCACGGGGCGACCCTGGGTGAGCGAACCGGCAACGAACAGCGGGAGGGCTTTGACCTGTCAACCACGCTGGGGGCGATCGAAGAAATCTGCGCGTACGTCAAGCAGACCCTCGACTGCCCAGTCCTCTTTTACACTTGCGTTAACCAAAAAGACGACGGCACCTACGCCCAGCTAGTTGATGAACTCAAGTTGTTACAAGCCAAGTGGGACTTTGCCATCCTCGACCTGTTTAACGACGCCGGCTTAAACGCCGCGACCGCTGCCCGCCCCAACGCCATGTATGACGAGGTCCACCCGACTCAGGCGGGCTATTTGAAGCTGTGGTTACCGGTCTTTGAACAAAAGCTCGGCGCCCTGCTTGGTTAGGGGGGCAGCCATGGAATACGAAGACTTATTTAATCAATATTAGCCGGAAATCCCGTGACTTTAGTCATGGGATGGATAGGCCACTATTGAGCTCCTTTATGGGACTTTTTGTTTGTTTCTGTATATTTTTGGTCATTGATATATTTCTCGACAACTTCTTTGCTCATATTGCCCAATGTACTCATATAGTAACTCGGCGACCAAAGATGACCGCCCCAATATTGGCTACATCGTATTTCTGGATGATTCTGTAAAAAAATATAGGCACTACGTCCTTTGAGCGCCTTAATGGCACTAGCCGGAGCTTTGCTTGGCGGAAAACTGATCAGCATATGAATGTGATCCGGCATGACTTCCATCTTTTCGATTACGATGTCATTGTCATCTGCAACTTGCTGCAAGATAGCTTTCATTTCGTTAGATAAGACCTCGGTTGTAAAAGTCTGATTGCGATACTTAGTTACCCAGATCAAATGATAATGGAAATTATAGATATAACGACGAGTATAAATGGCATCTTTGATTTTTTCTTTAGTCATAATATGCTCTCCTTTGTTAATACATTGACATCATGATATAATGTTATCATATCAATAAAGGAGGTGAAATAAAATTAAGTCAATGGCAAAAATGAAATATCATTATGGCCTAAAAATGCGCTGCTATCCTAGTGACCAACAAAAGCAGTTGATTAAAATCAACAGTGACGCTAGTCGCTTTATCTATAACGAAATGGTTGCGATCAATAAGGAACTGATGCAGCTTCGCAGAGTTAAGCTACCGATTGACATAGTTCAGGATCGTATTAAGCAACTAACTATGCGCCAAAACGCTAAGCAAATGTCTAATCACTATCAATTCTTAGAAGATAAACGAATTGATAGTTTGACGAAAGCTAATGCCATTCAGAACTATCGAAAAGCTTGGAATGCTTTTCGGAAGGTTCACGCCACTGGCGTTCCCAAATTTCATCGAAAGAGTTATCACTGGCGGTATCAAACCAATTGTCAATACCCGGGGCAAAAAACTGCGTTGCTAACTAACGGTACAGTCTGTTTTCTAGATAATAGTCATGTCAAAGTACCTAAAATAGGACTGTTACGTGTTGCCGGTTCGCAAGCACGGCTTTTGAAAAGAATATGCGAGACTAGAATTGGTACCGTGACGTTGACTAAAGATTCAGCGGATCGCTTCTTTTTATCAATGCAGTTAGCTTCAGATGAATCTTTTGTTAAAGTGTCCAAAGCTACTCATGGACATGTTGGAATTGATCTTAATACTGATAACTTCTTAACCGACAGTGAAGGCAACATAGTTCCTAATCCACGATATTACCGCACTATTAAAGGTAAATTAGCCAAAGAACAGCGCATTTTATCTAGACGGCAACAACGTGCAAAAAAAGAACATCGTTCTTTACGAGATAGTAAAAATTATCAAAAACAGCGCTTGTTAGTCGCTAAACTCCATGCCAAGGTAATGAACCAAAGGCATAATTTTCTCCAACAAATTTCTACCGCATTAATCAAGAACCACGATTTAGTAGTAGCCGAGGAGTTGCGTAGCAAGAATTTGCTTAAAAATCATGCTTTGGCACTTAGTATTTCTGACGTTGGCTGGCGAACATTTCTTGGCATGTTGGCTTATAAAGCAAAGCTTTATGGGCGTCAATTTATCACAATCAACCCAAGAAATACTACCCAAACATGTCGCGATTGTGGCTTTGTAATGGGCACTAATGGGACGGACAAACTAACATTAGATGATAGAAACTGGACTTGTCCTAACTGTGGTATTCACCATATTCGTGACTGGAACGCAGCTAAAAACATTCTTGATAAGGGAATAGCTAAACTAGCCTAGCTTATCTGTCCCTATGGCAACCTGGGGACATAAAAGGCGTTGGTAATTAGACGACCGCTGTTTGATTACAATTTCAGTTGGTCAAATAAGTTGTCCCTATCTACGCAAATTGTGGTTCGAAATCCGTGATGATATTCGGCTCACAAGCCACTGACTTTAGTCAGTGGTGGTTGACAAAGATCACTGCGTGGGCCCACGACCGCGGCATCGACCAGGCTGACCCGCGGGTTGAATTCATGAAGATGGCCGAGGAACTCGGCGAATTATCGGCGGCTTATAACAAAGAGCACCACGCTAAGATGGTGGATAGCATCGGTGACCTGCAAGTGGCGCTGTTGATCTTTTGCCAGTTGGTCGGCGTCGACCACAAGGAAGCGATTGAAGCGGCCTACAACCAAATTAAGGACCGGACCGGTAAGACGACCACCGCGGGGGTGTTCATTAAGCAGAGCGACCTGCACGATTAAAAGAAGGTATCGGCGAATTGCTTGTTTAATCTTGGCCTAGCGGGGTATGATTAATAACGTAAATGATTAAGTGAGCAAGAAGGGAGCGCATTAACCGATGAAAAGTGCAATGTTTATGAAAAGGGGGCTCGTTGAAGTCCAAGACGTTGACAAGCCGACCGTTAAGAACCCAGACGATGTCGTGATTAAGGTTTTACGGGCCTGCGTTTGTGGTTCCGACCTCTGGGCTTACCGGGGCTTAGATGACAAGCCGGCCAACTCAATCAACAGTGGTCACGAAGCCATTGGGATCGTGGAAGAAGTCGGCACAGACATCACCACGGTTAAGCCGGGCGACTTTGTGATCGCTCCGTTCACGCACGGCTGTGGCCACTGTCCAGCCTGCTTAGCTGGTTTTGACGGGGTTTGCCAAGACCACAGTGATAACTTCTCCAACGGGACCCAGGCTGAATACTACCTGGCCCAACACGCACAGTGGAGCTTGGTGAAGGTACCAGGTAAGCCGGAAGACTACAGCGAAGCCATGCTCAAGTCCTTTTTGACCCTGGCCGACGTAATGGCTACTGGTTACCACGCCGCACGCGTTGCCGACGTTAAGCCGGGCGACACGGTGGTGGTAATGGGTGACGGGGCCGTTGGTTTGAGCGCCATCATCGCCGCTAAGCTACGCGGCGCCAAGCGGATCATCTCAACTTCTCGTCACAATGACCGCCGCGAGTTAGCCGCTGAATTTGGTGCTACCGACAACGTGGCCGAACGTGGCGACGAAGCGGTGGAAAAGATCCTCGCCATGACTAACGGCGGGGCCGACGCCGTCCTCGAATGCGTGGGGACCGCTCAATCGACCGACACCGCCATGAAGGTGGGTCGTCCGGGCGCCATCGTTGGCCGGGTTGGTTTGCCACACGACGCTACCATGGACATGGCCACGCCGTTCTACCGCAACACCGCCGTTGCTGGGGGCCCAGCCTCCGTTACCACCTACGACAAGGATCTGCTGTTAAAGGCCGTCTTGGACGGTAAGATCAACCCGGGGAAGGTCTTCACCAAGACCTTCACCCTGGATGAAATCAACGACGCCTACCAAGCCATGGCTGATCGTCAGGTCATCAAGAGCTACGTGAAGGTTAGCGATTAAAAAGAAGTGCGACCAACCTCCTCGGTAAGCCGTATGACTAGGCTGGGGACGAAGGTTGATGTGGCACGCATCGTTCTTCGTCCTGCTTAGGCACTAGGCTTACGGTTGGGAGCACGTTAGCTGAATAATCGTTGAGAAACAT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62 | Tupanvirus(15.38%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
338120 : 346592
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021235|338120:346592|DBSCAN-SWA CTTAAATTACGCAAGATTCACATTGGTTGGCGCCGACTTCTTCGTTATCATCCGTGAAGGTCCGGATGTAGTAAATCGACTTAATGCCCTTTTGGTGGGCGTAGTGACGAAGGATGTTTAGGTCGCGGGTGGTCATCTTTTCCGTCCGCCCGTCCTTCCATTCGTACATGCCGGCTGGAATGGTCGAGCGCATGAACAGGGTCATCGACAGGGACTGGTCGACGTGTTCCTGGGCGGCGGCGTAGGTATCAATGACGCTACGCATGTCCGTATCGTAAGCGGAGCGGTAGTACGGCATCGTGTCGTTGGATAGGTATGGGGCCGGGTAGTAGACCTTACCAATCATCTTTTCTTGCCGTTCTTCGATCCGGTTGATGATGGGGTGTAGGCTAGACGTGGAGTCCCCAATGTAAGAGGTCGAGCCGTTCGGTGCCACGGCGAGGCGGTAGGCATTGTAGAGACCGGATTCTTGAACCCGTTGCTTGAGTTCTTGCCAGTCGTCTGGGGTTGGGATAAAGAAGCCGGCAAAGAGTTCCTTAACGGCGGCGGATTTTGGCCCCCAGTCCTTAGTCAGGTACTTGTCAAAGTAGGAACCGTCAGCGTAGGCAGACCGTTCGAAGTTGGCAAAGCTTTCACCCTTTTCCTGGGCGATTTCGTTAGAAGCCACTAAGGTCCAGTAGTTTAAAAGCATGAAGTAAACGCTGGTGAACTCAAGGGCAACCGGAGAACCGTACATGATGTGGTGCTTAGCTAAGAAGCCGTGTAGCCCCATCGCTCCTAACCCAACCGAGTGGGAAAGGTCGTTGCCGTGCTTGATGGATGGGACTACGGTTAAGCTTTCAGCATCGGAAATGTGGGTCAGACCACGCATCATCGCCCGAACGGAGCGTCCGAGGTCTGGTGTTTCCATCAGGTTAGCGATGTTTGTGGAACCGAGGTTACAAGAAACGTCGGTGCCGAGGGTTTCGTAGGTTTGGTCATCGTTGACCCGGGACGGAATCTGAACTTGGGCAATTTCGGAACAGAGGTTGGACATTACGATTGTTCCTTCAATTGGGTTGGCCTTGTTAACCGTATCGACGTTAACAATGTATGGGTAGCCAGATTCTTGTTGTAACTTGGAGATTTCGTCTTCCAACTCACGGGCGTTGACCTTCTTCTTGGTGATTTCAGGGTTAGCAACCAGGTTGTCGTATTCCTTGGTGATGTCAACGTAAGAGAAGGGCTTACCGTAGATTCGTTCCACGTCGTACGGGGAGAAGAGGTACATTGGGGCGTCTTCTTCCACTAACTGGTAGAACTTGTCCGGCACCGTTACCCCCAGGGAAAGGGTCTTTAAGCGAACCTTTTCGTCGGCGTTTTCCTTTTTGGCCCCCAAAAAGTCAATGATGTCGGGGTGGAAGACGGAGAGGTAAACAACCCCCGCTCCTTGGCGCTGCCCCAGTTGGTTGGAGTATGAAAAGGCGTCTTCTAAGAGCTTCATGACCGGGACAACCCCGGAAGCGGCCCCCTTGATCTTCTTGATTGGGGCGCCGGCTTCGCGGAGGTTATTTAAGTTGATGCCGACCCCGCCACCGATCTTGGATAGTTGCAAAGCGGAGTTGATCGTCCGCCCGATCGTGTTCATGTCATCGGTAGCTTGGATTTCAAAGCAGGAAACGAATTCCCCGCGCCGCTTGCGACCAACGTTTAAGAAGGTTGGCGTGGCCGGTTGGTAGCGTTGGTGGATTAACTCATCAGCCAGGTCCATGGCCAGTTGTTCGTCCCCGTTAGCTAGGTACAAGGCGTTCATAGCCACCCGGTCGATGTAGTTTTCCAGGTAGTATTCCTTGTCGTTGGTCCGCATGGCGTATTGGGCGTAAAATTTGTAGGCGGCCATAAAGGAGTGGAAGTGGAAGTCTTGTTCCTTTAAGTATTGGTAGAGTCGATCTAAAAAGGCGGGCGTATATTGGCGAATAAAGTCTTCTTCGAGGTAGTCGTTTTCGATTAACCAGTTTAGCCGTTCCATTACGGAGGAGAACTTCTTGGTGTTTGGTTCCACGTTTTCCTTAATAAAGTCGTCTAGGGCTTCTTGATCGAGGTTCAACTGGATTTGACCATCCTTGGGGATGTTGATCTCGTTGTTTAGGTCGAAGTACTTCACCTTGGTCATATCAATTTCTGAAAGAGCCATTGATCACGTTCCTACTTTCTTTTATACCTGAGTTAATAACAATAAAAAGGGCGGGCACCTAGAACAGGTGTCGCCGCCCGTAAAATTTTTGCAGCGCCCTTAGGCCAAGGCTGAAAGGCGATCCGGTCGAAAACCGGTGAAGGCATTACCGTCGGGAAGTTTAACGACGGGGGTTGCCAAAAAGCCTTCTGCCTTTAAGTTTTCGATGAATTCAGGTTGTTCATCGATGTTGTGTTCAATGAACGCTACGTTGTGTTCCTCTAAGAAACGCTTGGTCATTTTGCATTGAATGCAATTATTCTTGGAAAAGACGGTTACCATGAGCATTTCCTCCCTTACCGATATTTGATGTTTTCTAGTATAGCCGATCAATCATAAAAAGACCACCATATCTCGTGCTGGTCGAAAACGATAACACAAGATATGGTGGTTGATGGGACGCGGTTAGGACCGAATCAAAAAAAGTTGAAAATTTTTTAGCCGATGATTGAACAGTCATATCGACAGATTTGAAAGTAACTAAGAGCGTATTGTACACTGAAGAGCGATAAAAAACTAGCCAAAAGGGGGGCAAAGAATGGAAGAAAAAATAACGGAGCGTGGTTATATGAAGGAGGCCTTCAAGGAGGCTAACCAAGCGGCCTTGCTGGGCGAAGTTCCAATTGGGGCGGTCGTCGTTTATAAGGGGAAAATTATCGGACGAGGACACAACATGCGGGAAAAATTCCAAGATGCCACCTACCACGCCGAAGTATTAGCAATCATGGAGGCCTGCCAAGCGTTGGGTTCGTGGCGACTAGAAGAATGTGATCTTTACGTCACCCTTGAACCGTGCATCATGTGTTCTGGGGCGATCATCAATTCACGGATTAAACGAGTCTTTTTTGCGGCCCCGGATGAAAAGGCGGGGGCGGTATCCTCCCTTTACCACCTATTAGAAGATACCCGCTTGAACCACCAAGTTGAAGTTCACCAGGGTCTAATGCAAGAAGAAGCCAGTCAAATGCTCAAGGAGTTCTTTCGGGCGATCCGTAAGCGGCAAAAGACGGCGAAGAAAAAACGGCGCCAGGAAGAAAATGCGGCTCAAAAGGCTGGTCAGTGACCGAAAAATAGTGTATAATTATTTTTGCCGTTAGGCCTTAGGGCAAGGGCGTCCTTACGAATCGTGTCAGGCCTGGAAGGGAGCAGCACTAAGTTTGCGATTCCTTGTGCCCTAAGTTTGAATGAAATTAACCAGGAGGCTGGGAGAAACATTGTTTTCTCCCAGCCTCTTTGAATTTTGAGATATCTCTTTTGGTAGATGATTAAAAGCTAGTATAATGGATAAAGATATCTTCAAAAGCAGGGAGGAACAGAGATGAGTTATCAGGCGCTCTACCGGGTTTGGCGACCCCAGCGGTTTAGTGACCTCGTTGGTCAGCAGATCGTTTCGACCACCTTAAAAAACGCCATCATCACCAAAAAAATTAGTCACGCCTACCTCTTTGCCGGTCCACGGGGAACGGGGAAGACATCGGCGGCGAAAATTTTTGCCAAGGCGGTAAACTGCCACCACCAAACGGATGGGGAACCCTGCAACAAGTGCGAACTCTGCCAAGCAATCACGGCGGGGCAACTAAATGACGTAATTGAAATCGACGCCGCTTCCAATAACGGGGTTGAGCAGATCCGTGACATTAGAGATAAGGTCAAGTACGCCCCCACTCAGGCTGACTATAAGGTTTATATCATTGACGAAGTCCACATGTTATCGACCGGGGCCTTCAACGCCCTCTTGAAAACCTTGGAGGAACCGCCAGCCAACGTGATCTTTATTTTGGCTACTACGGAACCGCACAAGATCCCGCTGACGATCATTTCCCGGGTTCAGCGCTTTGATTTTAGACGAATTAGCGCAAAGGACGCCTTTGAGCGGATGAAATACATCCTGGATCAAAAAAAGGTCGCCTACCAAGAGGACGCCCTATGGGTGATTGCCAACGCCGCTGAGGGGGGGATGCGGGACGCCTTAAGTATTCTCGACCAGGCACTGTCCTTTGGCGATGAGCAGGTGACCATTGATGACGCCTTATTGGTGACCGGGAGTGTGACCAAGCAGCTGGTGCAGGAATATTTCCTGCAAGTAGCCAAGGGTGATAGCGCCCCGGCCTTAGAGACCCTTACTAAGATCACCGGGGCGGGCAAGGACGGTCAGCGTTTCATTGAGGACCTGATCTCCTTTATTCGCGACGTCCTCTTGTACCAGGAATCACCAAGTTTGATTGACCTGCCGGCGACGGGCCTGCGTAAGGAAGATTTTGATCAACTGAGCGGCGCCGCAAGTTCGACGGCTCTGTATCAAATGATCGATACCCTAAACGATATCCAACAGGAGATGCGCTTTACGACGCACCCGGACGTCTACCTAGAAGTGTTAACCGTCCGGTTGTGCCAGATTAGAGGGGACGAAAGAACCCAGCCAGGTGCTGACCAAGCGGAACTTACGCAGCTTCGCCAGGCGGTAGCTGCCTTACAACAAGAGGTTAATCAGCTACGCCAAACCCCACCAGCAGAGGTGAAAACACCGGCGCCAAGGCCGAGCCGGTCGACTAGCAATAAACAGGCGTTGCGGATTAACTTAGCCCAGGTTAACTTGATCTTGACCAACGCAACCCGGCCTGAGTTAGAGAAATTACAGGGCCTGTGGGGAGACATGCTTTCCTTATTAGATAACGCTCAGAGCTCGTTGATCAATAATTCTGAGCCGGTGGCTGCCAGTCCGGCGGGGGTCGTGGTATCCTTTGATAATAACTTCCTCTTTGAACAGGCCAACGGGGGCAACCTAGGTAACGCAATGGGGGCGGCCCTACAACAGTTGACCGGTAGCGAACGCCAAGTGGTCTTCGTGCCTAAGGACAAGTGGCCCCAAATGCGCCAAGACTTCTTAGTGGAAAATGGTTACTTAAAAAAGGGAACCGCTAAAAAGGAGGCCCCCAAGGCAACTGATCCGGTAGTCAGTCAGGCCGAAAAGTTGTTTGGCCCGGACGCAATTGAAGTAAAAAACGATTAACAATAAAGGATGGTAATGAATTATGATGCGCGGAATGAACATGCAAAAGATGATGAAGCAAGCCCAAAAAATGCAAAAGCAAATGATGGCCGAACAAGAAGAATTAGCGGCCATGGAATTTGTTGGCCAAGCGCCGGACGAAATGGTAACGGCGACTTTAACCGGGGACAAGAAGCTCAAGGATTTGAAGATTAACCCAGAGGCGGTGGACCCAGATGACGTGGATATGTTAAGCGACTTAATCGTAGCGGCGGTTAACGATGGCTTAGACAAGGTTGAACAGGCCACCCAAGCTAAGATGGGTAAGTACACCCGCGGGTTAGGAATGTAAGGTTTAGGTGAGCAAATGCAGTACCCAGAACCGATTGCCCGTTTAATCGATAGCTACATGAAGCTGCCGGGAATCGGGGAGAAATCTGCCACCCGGCTCGCCTTTTACACCTTGGGCATGTCCGATGCGGACGTGGATAACTTTGCCAAGTCGTTAAGGGCCGTTAAGCGCGACTTGCACTACTGTAGCGTGTGCGGGAACATTACCGAAGACGACCCGTGTCCCATTTGTAAGGATAAGACCCGTGACCAAAGCCGGGTCTTGGTGGTGGAACGGTCCAGAGACATTATGGCCATGGAACGGATGAAGGAATACCACGGCCTTTACCACGTCTTACACGGGACGATATCGCCAAGCGAAGGGACGGGCCCCCAAGACATTAACTTGGAGAGCCTCTTAAAGCGCCTTGAAGCGCATAAGGAAATCCAAGAGGTGATCGTGGCCACCAACGCTTCTTTAGACGGGGAAACCACCGCCCAGTACTTGGCCCACTTGATTAAGCCAGCTGGGATCAAAGTAACCCGCTTAGCCCATGGTTTATCAGCGGGGGCGGACATTGATTACACTGATGAAGTGACCCTCTTCCGGGCGGTTCAAGGGCGAACGGAGATGTAAGATGTTTTTCAAACGACCACAACATCAAGTTGAACAGGAAGGTAACCAACGCTTGTTAAACTTGATTTACCAAACCAAGGCCAGCTGGGATCACGCAAAGGAAACGGAGCAAGCTGTTTACGAAAGCCATGTTAATAACGAGCTCAAGGAGCGAACTAAGCTGCAAGAGCGTAAGTACTTATACTTGTACGAACGGGCACGTAAGCGAGGCTTGCACGGTAAGACCAACGCTGGTGTAATTATGCAATAAGATAGGGGCGCACCAAGAGATGAGCGGACGATTTATTAGTTTTGAGGGGCCAGACGGGGCCGGGAAGACAAGTGTCTTAACCGCGATCCGGACGGGCCTAGTTAACCAGTTGGGTGATCAAGTTGTCTATACCCGTGAACCCGGGGGAAACCCAATCGCCGAACAAGTACGGGCGGTCTTGTTAGATAAGCAAAACGGGGCGATGGATGACTGGACGGAGGCCTTATTATACGCGGCTTCCCGGCGCCAACACGTGGTTGAAACCCTTAAACCGGCACTTGAAGCGGGGAAGCTAATTTTGTGCGACCGCTACTTGGATAGTTCAATTGCCTACCAGGGTGGGGGACGTGAGTTAGGGATCGACCGAATCTGGGAGTTAAACCAGTACGCCATTGACGGTCTCTTGCCGGACCTAACCATTTTTTTGGACCTCCCCGTGGAAACCGGGTTAGCCCGGATTGAAAAGGGACGGGCGGAGACAATTAACCGCTTGGATGAGCAAACCACCAACTTCCACCGGCGGGTCCGTCAGGCCTACTTAACCCTGGCCGAGCGCTTCCCAGAACGAATTGTGAAGGTAAACGCCGATCAGGAATTAGCGCGGGTAATTGAAGACGTACGAAGCGCAATTCACGCACGTTACGCAGACCTATTTACCAACTAAGGAGGAACCGTCATGAAGATGATTATGGCCATTGTGCAACCAAAAGACAGCAACCGCCTTCGCGACGCCTTTAACGACGCCAAGATTGGCGCCACCAAACTTTCGAGTACCGGGGGCTTTTTGCGGGAAGGGAACACGACCTTTTTGATTGGGGTCGCCGACGATCGTGTTGACGATGTCTTAGAGATCATCAAGAAAAACGCCGAGTCCCGGGAGCAATACATGACGCCGCCTACTCACATGGATAACGGGGCGGGCGCCATGCCAATTAACGTGCAAGTCGGGGGCGCGACCGTCTTCGTCTTACCGGTTGAGCAGTTCTTACACTTCTAGGACGGAGGGAAGAGAACATGGAGCGTGAGCTAACCGCTATCGCACTACAACCTGAAATCACGGCGCGCTTTGCCAGCCTAATTGAGCGGGGGACGCTGGCTCACGCCTACCTCCTAGTGGGCAACGTCAACATGGGAACGGTCGCGTTAGCAACGGAGGTCGCATTACGCTTGTTTTGCCCCCATCAAGACGACCAGGGGCATCCCGATCGGACGTGCCCAGAGTGCCAGCGGGTTCTTTCGGGGAACCACCCGGACGTGGTGGTCGCCCGTCCCGAGGGGCGTCAGATTAAGGTTGATCAGGTCCGCTATCTAAAGGCTGAATTTTCCAAAACCGGGGTTGAAGGGGAGAAAAAGGTGTTCATCATCGAGGGGGCCGAAACCTTAACCGGCTCGGCTGCTAACTCCTTATTGAAATTTATCGAAGAACCCGGACCGGGGGTCTACATCTTTTTGTTAACTCCTAACAAAAATGCCGTTTTGCAGACGGTTCAATCCCGGTGCCAAGTAATCGAATTACGCCCCTTGCCAAGTGAAATGGTTAAAGAGCAGCTGCAAGAGGCGGGGGTACCAGAATACCTGGGCCCCCTGGCCGCGGGGCTGGGACTAAGCGCCAAGCAGGGGGCCTCTTTGATGGAAGACGACTGGCTCCCCACCAGCGTGAAACTAGTTTTTGACTGGTTTAAGGAGGTAGCTAGTGGCGATCCGCTCAGCTTTGTGGACGTCCAAACTGGTTTTTTAAAGCAGGGTAGCGACCGGGCAAAGCAACTAGTCTTGTTGGACCTAGTGACGATGGTTTGGCGCGACGCCCTCTTGTTAAAGAACCGGGTGACCGAACCAGAGCGGCTTCACTTTCGTCAGTGGCAAGCAGAAGTGGCCCAACTGATCATGCCAAGTTCGGCCCAGCAAGTTCTCGTGGCCAGTGAACTAACCTTAGAGGGGCGCCACTTGCTTGATCAAAACATAAGCTTTCAAAACGTGGTGGAGCAATTAACGCTCCGCCTCCTCTTGGTGATGAAGGGTGACTTTAGTGAGGAAAGGGGCAGCAACCGTGAGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021235|338120:346592|340869_341394_+|WP_004562759.1|DBSCAN-SWA MEEKITERGYMKEAFKEANQAALLGEVPIGAVVVYKGKIIGRGHNMREKFQDATYHAEVLAIMEACQALGSWRLEECDLYVTLEPCIMCSGAIINSRIKRVFFAAPDEKAGAVSSLYHLLEDTRLNHQVEVHQGLMQEEASQMLKEFFRAIRKRQKTAKKKRRQEENAAQKAGQ >NC_021235|338120:346592|341649_343341_+|WP_015638599.1|DBSCAN-SWA MSYQALYRVWRPQRFSDLVGQQIVSTTLKNAIITKKISHAYLFAGPRGTGKTSAAKIFAKAVNCHHQTDGEPCNKCELCQAITAGQLNDVIEIDAASNNGVEQIRDIRDKVKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRVQRFDFRRISAKDAFERMKYILDQKKVAYQEDALWVIANAAEGGMRDALSILDQALSFGDEQVTIDDALLVTGSVTKQLVQEYFLQVAKGDSAPALETLTKITGAGKDGQRFIEDLISFIRDVLLYQESPSLIDLPATGLRKEDFDQLSGAASSTALYQMIDTLNDIQQEMRFTTHPDVYLEVLTVRLCQIRGDERTQPGADQAELTQLRQAVAALQQEVNQLRQTPPAEVKTPAPRPSRSTSNKQALRINLAQVNLILTNATRPELEKLQGLWGDMLSLLDNAQSSLINNSEPVAASPAGVVVSFDNNFLFEQANGGNLGNAMGAALQQLTGSERQVVFVPKDKWPQMRQDFLVENGYLKKGTAKKEAPKATDPVVSQAEKLFGPDAIEVKND >NC_021235|338120:346592|345551_346592_+|WP_015638600.1|DBSCAN-SWA MERELTAIALQPEITARFASLIERGTLAHAYLLVGNVNMGTVALATEVALRLFCPHQDDQGHPDRTCPECQRVLSGNHPDVVVARPEGRQIKVDQVRYLKAEFSKTGVEGEKKVFIIEGAETLTGSAANSLLKFIEEPGPGVYIFLLTPNKNAVLQTVQSRCQVIELRPLPSEMVKEQLQEAGVPEYLGPLAAGLGLSAKQGASLMEDDWLPTSVKLVFDWFKEVASGDPLSFVDVQTGFLKQGSDRAKQLVLLDLVTMVWRDALLLKNRVTEPERLHFRQWQAEVAQLIMPSSAQQVLVASELTLEGRHLLDQNISFQNVVEQLTLRLLLVMKGDFSEERGSNRE >NC_021235|338120:346592|340391_340613_-|WP_004563324.1|DBSCAN-SWA MVTVFSKNNCIQCKMTKRFLEEHNVAFIEHNIDEQPEFIENLKAEGFLATPVVKLPDGNAFTGFRPDRLSALA >NC_021235|338120:346592|343687_344287_+|WP_004562762.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIARLIDSYMKLPGIGEKSATRLAFYTLGMSDADVDNFAKSLRAVKRDLHYCSVCGNITEDDPCPICKDKTRDQSRVLVVERSRDIMAMERMKEYHGLYHVLHGTISPSEGTGPQDINLESLLKRLEAHKEIQEVIVATNASLDGETTAQYLAHLIKPAGIKVTRLAHGLSAGADIDYTDEVTLFRAVQGRTEM >NC_021235|338120:346592|345213_345534_+|WP_004562765.1|DBSCAN-SWA MKMIMAIVQPKDSNRLRDAFNDAKIGATKLSSTGGFLREGNTTFLIGVADDRVDDVLEIIKKNAESREQYMTPPTHMDNGAGAMPINVQVGGATVFVLPVEQFLHF >NC_021235|338120:346592|338120_340292_-|WP_015638598.1|DBSCAN-SWA MALSEIDMTKVKYFDLNNEINIPKDGQIQLNLDQEALDDFIKENVEPNTKKFSSVMERLNWLIENDYLEEDFIRQYTPAFLDRLYQYLKEQDFHFHSFMAAYKFYAQYAMRTNDKEYYLENYIDRVAMNALYLANGDEQLAMDLADELIHQRYQPATPTFLNVGRKRRGEFVSCFEIQATDDMNTIGRTINSALQLSKIGGGVGINLNNLREAGAPIKKIKGAASGVVPVMKLLEDAFSYSNQLGQRQGAGVVYLSVFHPDIIDFLGAKKENADEKVRLKTLSLGVTVPDKFYQLVEEDAPMYLFSPYDVERIYGKPFSYVDITKEYDNLVANPEITKKKVNARELEDEISKLQQESGYPYIVNVDTVNKANPIEGTIVMSNLCSEIAQVQIPSRVNDDQTYETLGTDVSCNLGSTNIANLMETPDLGRSVRAMMRGLTHISDAESLTVVPSIKHGNDLSHSVGLGAMGLHGFLAKHHIMYGSPVALEFTSVYFMLLNYWTLVASNEIAQEKGESFANFERSAYADGSYFDKYLTKDWGPKSAAVKELFAGFFIPTPDDWQELKQRVQESGLYNAYRLAVAPNGSTSYIGDSTSSLHPIINRIEERQEKMIGKVYYPAPYLSNDTMPYYRSAYDTDMRSVIDTYAAAQEHVDQSLSMTLFMRSTIPAGMYEWKDGRTEKMTTRDLNILRHYAHQKGIKSIYYIRTFTDDNEEVGANQCESCVI >NC_021235|338120:346592|344288_344537_+|WP_004562763.1|DBSCAN-SWA MFFKRPQHQVEQEGNQRLLNLIYQTKASWDHAKETEQAVYESHVNNELKERTKLQERKYLYLYERARKRGLHGKTNAGVIMQ >NC_021235|338120:346592|343363_343672_+|WP_004562761.1|DBSCAN-SWA MMRGMNMQKMMKQAQKMQKQMMAEQEELAAMEFVGQAPDEMVTATLTGDKKLKDLKINPEAVDPDDVDMLSDLIVAAVNDGLDKVEQATQAKMGKYTRGLGM >NC_021235|338120:346592|344556_345201_+|WP_004562764.1|DBSCAN-SWA MSGRFISFEGPDGAGKTSVLTAIRTGLVNQLGDQVVYTREPGGNPIAEQVRAVLLDKQNGAMDDWTEALLYAASRRQHVVETLKPALEAGKLILCDRYLDSSIAYQGGGRELGIDRIWELNQYAIDGLLPDLTIFLDLPVETGLARIEKGRAETINRLDEQTTNFHRRVRQAYLTLAERFPERIVKVNADQELARVIEDVRSAIHARYADLFTN |
10 | Enterococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
393703 : 453543
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021235|393703:453543|DBSCAN-SWA AGTGGGCTTTTTAAAAAACATCATTATCGATGCCATCCTATTTGTGGCCCTAGCTGGTCTGTTTGCTAACACCGGCTGGTTTTACATCACGAGCGTTTGGACGGCTCTAGTAGCGGCCATCGTGTTAGCAATCTTAAACGCCCTGATTAAACCGATTCTAGTATTCCTATCGTTACCAATTACCATTTTGACCCTCGGTTTGTTTTCGATCGTCATCAATGGCTTGATGCTACAGTTGACGGCGAGTTTCGTCGGCCCGGGGATTCATTTCTCTTCGTTTTGGGCAGCGATGTTGATCGCCCTGATTATGTCAATTTGCAACACCATTATTAGCAATCACTTCGCTAATCAATAAGGAGGAGAAACAACATGCCCAATGTTGATTCAGTTACCGTCGCCGACTTGGCCCAAAACGTGCGCCTAACGGTTTTACAGGGGGAAGATTACCTGAACCGCCAGATTACCACGAGTGACATTTGTCGCCCGTCCTTAGAGTTTGCCGGTTACTTTAAGCACTACCCGGCCATGCGAATTCAGCTGCTCGGAATCACCGAAACTTCCTTTGCTAAGGAAGTGCCGGCGGACAAGCGACGCGAGTACATTGAAAGAATGTGCACCCCGCAAACGCCGTGCTTTGTGGTCTCCACCGACCTGCCGGTGATGGACGAACTCAAAACGGCCGCCGAAAAGGCCCACATCCCAATCCTGGGGACCCCGCTAACGTCCTCGCGAATTTTGGGGAACATGACTTCCTATTTGGTCGGTCGACTGGCCCCACGTGAATCCTTACACGGGGTCTTGGTCGACATTAGCGGGGTGGGGGTGTTAATCACCGGTGACTCCGGAGTCGGCAAGTCCGAAACGGCATTGGAATTAGTGCGTCGGGGCCACCGGCTGGTCGCCGATGACCGGGTTGAAGTATACGCCCGCGATGAACAGACCCTGGTTGGGGCGGCGCCGACGATCCTCCAGTACCTAATGGAAATTCGGGGGATTGGGATCATCGACGTTATGACCTTGTACGGATCGGGGGCCGTCTTGCCGCAGGATACGATCGACTTCATTGTCCACCTAGAAATCTGGACGCCCGATTCCCAGTTTGACCGCTTAGGCGATCAGGGCGATACTCAGTTCATCCAAGACGTGGCCATTCCGAAGGTGTCAGTACCGGTGAAGACCGGGCGCAACCTCGCCATCATTATCGAATCGGCGGCAATGAACTTCCGTGCCCAGACGATGGGGTACGATGCCACTAAGACCTTTGACGAAAACCTTAACCGCCTGATCCAGCAAAACTCAGAACGTGACCGAAAGGAAGCGGAGAATGACTAAGCTTGTGCTGAGGGCCCTAAATCCAATTGCCCTCCAGTTTGGCCCTTTTACCGTCCACTGGTACGGGGTGATCATTGCCAGCGGGGTGGTGTTGGCCCTGTGGCTATCAATTAGGGAGGGGGCCCGCCTGGGGTTAAACGAAGACGTCTTTTATGACTACTTATTGTGCGCCCTGCCGGTTGCCATTATTTGTGCCCGGACCTATTACGTGACCTTTGAGTGGCAGTATTATTCCGCCCACCCGAGTGAGATTATCGCTATTTGGGACGGGGGAATTGCCATCTACGGGGCCATCATCGGGGGCTTTTTGACGATGGCGATCTTTTGCCATTACCGTCACGTTAACATGTGGACCCTATTAGACGTGGTTGCCCCGACCGTAATCATGGCCCAGGGGATTGGGCGGTGGGGTAACTTCATGAACCAAGAGGCCTTCGGGGTGATTACCACGCGGGCTGCCTTGGTCGCCCAACACCTTCCCAACTGGATCATCCAACAAATGTACATTGGTGGCCACTACCGGGTCCCCACCTTTTTATACGAGTCGTTGGGTGACCTAGTGGGCTTCGCCTTGTTAATGTTACTTCGCCACCGCCGCCACCTTTTTAAACGGGGGGAGGTCTTCTTAGCCTACGTATCCTGGTACGCGTGCGTCCGGATGGTGGTTGAGGGGATGCGGACCGATAGTTTGATGCTCGGGGGCCTCCGGGTTTCCCAGTGGCTATCGGTAATTTTCTTAGTTGTAGCTGTTTGCACCTTTATCTACCGTCGGCGCCACCAAGCCGACTTGCCTTGGTACACGAGTTTATTCGTACCAGAAGGGAGTCAGAAATCATGAAAAAAGTAGCCGTCCTCGGGGCCGGATCCTGGGGGAGCGTTTTGGCCAACCTCCTCGTCGAAAATGGGCACCAAGTAATGCTGTGGTCCCGCAACCAAGCCCAAGTTGACCAGTTAAACCAAGAACACAAGAACCCACACTACATGAAGGATTTTACCTACAACGAAGGGTTAGTAGCCACTAGCGACATGCAAGCGGCCGTGAGTGGGGCAGCGGTCATCTTGATGGTGATCCCCACCAAGGGGGTTCGTCAGGTTGCCGGTCAATTGGCTGAACTACTAAACGGCGTCACGCCGGCACCATTGTTAGTTCACGCCACTAAGGGCTTAGAACAAAATACCTACAAGCGGGTTTCGGAAATGCTAGCCGAAGAAATCCCGGCGGCTTCTCGCCGCGGGATCGTGGTATTGTCCGGGCCGAGTCACGCCGAAGACGTTGCCATCAAGGACGTGACGGCGGTTACCGCAGCCTGTGGTGACTTAGCGTGCGCAAAAGAGATCCAAGAACTCTTTTCAAACCACTACTTCCGGGTTTACACTAATGACGACGTAATTGGCGCCGAGTTCGGGGCCGCCTTAAAGAACATCATCGCCCTGGGATCCGGGGCCTTAAGCGGGTTAGGTTACCACGATAACGCCCGGGCCGCTTTGATTACCCGGGGCTTAGCGGAAATCCGTCGGCTCGGGGTGGCCTTTGGCGCTGACCCGATGACCTTTATTGGCCTCTCTGGGGTTGGGGACCTAGTGGTGACCGCCACTTCCAAGAACTCGCGGAACTGGCGGGCCGGCTACCAACTCGGTCAGGGCCAGAAACTCGCCGACGTGGTGGAAAACATGGGGATGGTCATCGAAGGGGTAGCGACTACCAAAGCTGCTTACGAGTTGGCCCAAAAGCGTCACGTTCAGATGCCAATTACCGCCGCTTTGTACCGGGTCCTCTATGAAGACGAAGACATTAAGTCCGCCATTGACGGCTTGATGGAACGGGAAGTTACTTCGGAAAAAGAATAAATTTGTGGTAAAATGAGAGCGGCTCCATATTGAGAATTTAACATGGAAGGATTTAAGTTAGTATGAAACAAGTAAGAAAAGCAATTATTCCGGCAGCCGGCTTAGGGACGCGCTTTTTGCCAGCCACCAAGGCCTTAGCAAAGGAAATGTTACCAATCGTCGACAAGCCAACCATTCAATTCATCGTTGAAGAAGCCCGTAAGTCCGGGATTGAAGACATCGTGGTGGTTGATGGGAAGAACAAGCGCTCCATCGAAGACCACTTCGACTCTAACCCAGAACTGGAAGATAACCTGCGCGATAAGCACAAGGATGAGATGCTCAAGCTGGTTCAAGAAACCACTGACATTAACATCTACTTCATCCGCCAATCCCACCCACGTGGTTTGGGGGACGCCGTGTTGACCGCCCGTGACTTCATTGGCGACGAACCGTTCGTGGTAATGCTTGGTGACGACTTGAACAACATTAACGGCGATGCCGAACCGTTGACCAAGGAATTAATCAACTCTTACGAAGAAACCGGTGCATCAACCTTAGCAGTTATGCGGGTGCCGCACGAAGACACCGCCAAGTACGGGGTCATCAACCCAAGCAAGGAAGTAATGCCGGGTCTTTACAACGTTACCTCCTTCGTGGAAAAGCCGGAACCAAAGGATGCGCCAAGTGACTTGGCCATCATCGGCCGCTACGTCTTCACGCCAGAAATTTTTGATGTACTGGCCAAGACCAAGCCGGGTAAGGGTAACGAAATTCAACTGACTGATGCCATCAACACCTTAAACAAGACGCAACGGGTCTTTGCCCACGAATACAAGGGTCACCGTTACGACGTCGGCAACAAGTTTGGCTGGATTGAAACTAACATTGAATACGGCCTCAAGCACCCGGAAACCAAGGATGAACTCCGTGAGTACATCAAGGATTTGGGCGTTAAGTTCGCCGCTGAAGACAAGAAGAAGCCAGCAAAATAAACGATCATGAGGAAGTGGAGCCAAGTTTGGTTCGCACTTCCTTTTTGGGTGCACCAATTTCAACCACAGGCCTAGTGACTAAGTACGGGCAAAGAACAGTGCGTGGGTACTAACTGAGGCCCTAGCTTAGCCCACGGCCTGTCGAGGAAGGTTGGTTCACACTTCTCTTTTATTTTCCATCAAGGGTTGACACTAGATTAAAAAGCAATTAATATCTAACCAACAAATGATAAAATAATTAAGAGCAAATGTGATGATGAGTAAAGCGGTACGCCACTACGCCAGAGATTTCCCGGTGGCTGGAAGGGAAAAGGGCCCCGCTTGAAGATGGTCACCACCAGCCCCAGGGTGAGGGAACAAGCCTTGGGCGGTGCGGCGCCGTTACCGGCCGGTAGGTCATTGACCCATTGAGGTGCTCCCTGTGAGGGGGGCGTGAAAAAAGGTGGTACCACGGGATCGTCAGCCCGTCCTTTGCGTCGAAAACGACGGAAGGGGCGGGCTTTTAATTTTAGGAGGTGTTCAAATGAGGGTGGCAATTGATCAATTAGACGTGGCGTTGGCAAGGCCAGACCAAAACTTTGCTCAGGTAGCAGCTGACGTTAAAGAGGCGGCTAAGGCGGGAGCGGACGTAATCGTGATTCCGGAAATGTGGAATACCGGTTACGCCCTTGACCAACTGGGGGACTTAGCCGACCTTGATGGTCAACGCACTAAGCAGACCCTAGCAAGGTTAGCCAGGGACAATCAAATTAACATCGTTGGCGGTTCGGTGGCGATTAAGCGGGGGAAACGGTTCTACAACACGACCTACGTTTATGATCGAACCGGTCAATTGGTTGGCGATTA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41 | Streptococcus_phage(38.46%) | holin,integrase,transposase,protease | attL 392299:392314|attR 441693:441708 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
467688 : 505915
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021235|467688:505915|DBSCAN-SWA 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38 | Streptococcus_phage(26.67%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
660810 : 773716
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021235|660810:773716|DBSCAN-SWA 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112 | Streptococcus_phage(14.29%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
778992 : 898719
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_021235|778992:898719|DBSCAN-SWA 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103 | Streptococcus_phage(27.59%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
921824 : 989620
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_021235|921824:989620|DBSCAN-SWA CATGCGCTACCAACGGCCAAAAGGGACGGCCGACATCTTGCCAGGGGATAGTCAAACCTGGCAATACGTTGAAGGCCAAGCCCGCCAAATTTTTAAAACTTATGGCTACCAAGAAATTCGAACACCGCTCTTTGAATCCTACGACATCTTCTCCCGTTCGGCCGGTGACACGTCCGACGTGGTGACCAAGGAAATGTACGACTTCAAGGATAAGGGGGATCGCCACATCGCACTGCGCCCGGAAGGAACGGCCGGCGTCGTGCGGGCCTTTGTCGAAAATAAGTTGTACGGCCCGGAATTTAATAAGCCTTACAAGGTCTACTACATCGGACCAATGTTTCGTTACGAACGGCCGCAATCGGGGCGCCAACGTGAATTCCACCAGATTGGGGTGGAAGCCTTTGGGGCCGACAACCCGGCCGTGGACGTGGAAGTCATCACGATGGCCCTGCGGTTCTTTAAAAAGCTTGGCCTCTCTGATTTGCGGGTGGCCGTTAACTCCTTGGGGGACCAGGAAAGCCGGGCCAACTACCGCCAGGCGTTGATCGACTACTTAAAGCCTCACTACGATGAATTAAGCGAAGACTCCAAGGAACGGCTGGAAAAGAACCCGCTGCGGGTGCTCGATTCTAAGGACGAACGCGACCAGCAATTCGTTGAAAACGCCCCGTCAATCCTTGATTACTTGACCCCGGCGGCCGCAGAACGGTTTGACCAAGTTAAGGAAATGTTAGACAGCCTGGGGATCGACTACGTGGTTGACGCTACGATGGTCCGGGGCTTGGATTACTACAACCACACCATCTTTGAAGTAATGGTTAAGGCCAAGTCACTGGGCCACGGCTACACCACCATCTGCGGTGGGGGCCGATACTCAGGACTGGTGGAAGAACTCGGGGGCCCGGACGAACCCGGCGTCGGCTTCGGGATTGGTCTGGAACGGCTGATCTTGCTGTTGGGCGACGAAGGGGTCGAACTGCCAACGGAAGACGGCTTAGACGTTTACGTGGTCGGGATCGGCGAAGCGACTAACCTGGAGAGCTTCCGGCTGGTAACCGCCGCCCGGGATGCCGGGCTGGTGGCCGAACGCGACTACCTAAACCGTAAGCCAAAGGCCCAGTTCAAGACGGCGGCCAAGGAAGGCGCCAAGGTAACGTTGACGGTCGGCCAACGCGAAATCGAAGAGGGGACGGTCCACTTTAAGGTGATGGCAACCGGTAAGGAAGTCTCCGTTCCCCTGGCAGATTGCTTAGCCGACTTTGGTAAGGTTTATCAAGAACACGTGGAGGAAGGTTAACTCATGAAGCGAACCAATTACGCTGGCCGCACGAGCGAAGAACAAATCGGCCAAGAAGTTGTTGTTAAGGGGTGGGTGGCTAAGCGCCGTAACCTCGGGGGCTTGATCTTTATCGACCTGTGGGACCGGGAAGGGATTGTCCAACTGGTCTTTAACGAAGAAGAAGACCAGGCGGCCTTTGAAGTGGCTAACCAGGCCCGTAACCAATACATTTTAGAGGCCCGCGGGCTGGTCCGCGCCCGGGCCGAAGTCAACCCGGACATTGCGACCGGGAAGATTGAAATTGAGGTTAAGGAAGCTAAGATCCTGGCCAAGTCCCAGACCCCGCCGTTTGAAGTCCAAGACGACGTCGACGCCTCCGAAGACCTGCGCTTGAAGTACCGCTACGTCGACTTGCGCCGGCCAAAGATGATGAACTACTTGAAGTTACGTTCCAAGGTAACCTCAATTGTTCACAACTACTTTGATAATAACGACTTTTTGGACGTGGAAACGCCGGAACTGACCCGCTCGACGCCGGAAGGGGCCCGCGATTACATCGTGCCGTCCCGGGTTTACCCGGGTCACTTCTACGCCCTGCCACAGTCGCCGCAACTCTTCAAGCAACTCTTGATGGCCGCCGGGGTGGACAAGTACTACCAAATCGCTAAGTGCTTCCGCGACGAAGACCTGCGTGGTGACCGCCAACCGGAATTCACCCAGATCGACACCGAAATGTCCTTTGCCGAACCAGAAGAAATTCAAGCAATGGCCGAAGGGTTGATCAAGCGGGTGATGAAAGAAGCCGTTGGCGTGGACGTGCCGACCCCGTTCCCGCGCATGGAATGGCAAGAGGCGATGGATAAGTACGGTTCCGACAAGCCGGATACCCGCTTTGACATGCTGATTCAAGACGTCTCCGACCTGGTTAAGGACTCCTCGTTTAAGGTCTTTTCGGCAACGGTGGCGGACGGCAACTTTGTCCGGGCGATCGTGGTCCCGGGGGGCGCCGACAAGTACTCCCGCAAGGACATCACCAAAAAAGAAGATTACATCAAGCGTTACGGCGCTAAGGGCTTAGCCTGGGTGAAGGTGACCGAAGAGGGTTACAACGGTCCGGTAGCCAAGTTCTTAAATGACGACGCCAACGCCCTTAATGAACGTTTAAGTGCCAAGGTAGGGGACCTGGTCCTCTTCGTGGCCGGCTCCTTCCACGTGGTCTGCGACTCCTTGGGTTACCTGCGTGAAAGCATCGCCAAGGAACTGGACTTGATTGACGAAAACAAGTTCAACTACCTCTGGGTAATTAACTGGCCGATGTTTGAATACGACGAAGGCTTTGGTAAGTGGATCGCCGCTCACCACCCGTTCACGATGTTAAACGAAGACGACCTCAAGTACTTAGAAGAGGGCGAGGACCCGCACCAGGCCCACGCCCAATCCTACGACATCGTCTTAAACGGGAACGAAATCGGTGGTGGCTCAATCCGTATCCACGACCCAGAAGTGCAAGAAAAGGTCTTCAAGGCCCTCGGTTACACCAAGGAAGCCGCCCAGGCCCGCTTTGGCTTCTTGATTAAGGCCTTAGAAAACGGGATGCCGCCAGAAGGTGGGATGGCCTTTGGGCTCGACCGTTGGGTAATGCTGTTGGCCCACGCCGACTCGATCCGCGACGTGATCGCCTTCCCAAAGAACTCCAAGGCCGTTGAACCGCTGACCGCCGCCCCGGGCACGGTTGACGATGAACAACTGGAGGTCTTGCACCTAAACGTTGAAGAGGCGCCAAAGGAAGCCGAATAACCAAACTAGTAATAGTAGAAATAGCCGCGGGTGACGTTTGAAACGACGCCTGACGGCTATTTTTTGGCTGGTCCGCACTTCCATCTCAAACCGCACAGGACAAATCTATCAATTTGGCGTGTCTCAAATGAGGGATTATGAAAAGATTGACGTTGGGCAGCAACTCCTTTTGCTCTGTGTTCGAACCTTACTACGGCCTGCTTGATGGTTGGTCCGCACTTCCGATAACGTGGAAAATGACCGCAGGCCTAGTGCCTAAGTACGGGCGAAGAACGGTGCCAAGGCACCAATCTTCCCCCTAGCTTAGTCATACGGTCTATCGAGAAGGTCATTTCCCACTTCCGAGATAACGTGCTCCCAACCGCAGGCCTAGTGGCTAAGTCTGGTCACAGAACACCGCTGGCGCGCTAACTTGTGACCTATCCTTAGCCCACGGCCTGCTTGATGGTTGGTCCGCACTTCGTTCTTTTAGTTAATTCCCTAGTGGCACCGTGACGGGGCGGTGAGTATAATGGAGAAAACCTTATCCGGAGGAACGCACATGCGACTTAACGTTTTACAACACGTCAGTGACGAAGGACCGGGGGCTATCTTAAATTGGGCCAACGACCACCAAGCGACCGTTACCATCTACCACCCCAACGACTTTGGCCTGTTGCCAACCGTTGATGAAACCGACCTGTTAGTTGTTTTGGGCAGCCCGGCTAGCCCCAACGATGACGACCAATGGATCAAAGACGAACGGGCCCTGATCAAGGGAATGCTAACGGCGAAGAAGCCGGTCTTCGGGGCCTGCTTTGGCGCCCAACAAATCTCGCTAATTTTGGGCGGGCGGGTTCAAGACGCCCCGGCTAAAGAAGTCGGTTGGCTAGAAGTGACCCGCCAAAGCGACCGGATCGCCGGTCTGCCGGAGGTTGCCACGCCACTGCACTGGCACCAGCAGATGTTCACGATCCCAGAAGGGGCGGACCTGCTTTATTCGTCCAAGTACCTGCAGGAACAGGGCTTTGTCTACCAGGACCTGGCGATTGGCCTGCAGTTTCACTTGGAGCCCTTAGAATTGAACGTACGGGAAATGTGCGCTAACGACGGGGCCTACGCTAACGGGTCAGTTTTAAACCAGACTGCGGAAGAAATCGTCAACCACGGGGTTCCGGCGGACAACCAGGCCGTCATGAACCGGCTGTTGGACTACTTGATGAAAGAAAATCCTGAAAACGCCTAAAAAATTGATTGACGGTGAATTAGTGCTTGTTTATAATGGTCATTGTAGTGGAAAGGCCAGGAGAACTTGGTCATGACAGTACGATCTTAAGCTCGGAGGGAGGGAATTTTACAATGTCAAAAACTATCGTTCGTAAGAATGAATCGTTAGACGATGCTCTTCGGCGCTTTAAGCGTACCGTTTCACGTAACGGGACTCTGCAAGAATACCGCAAGCGTGAATTTTACGAAAAGCCAAGTGTTAAGCGTAAGTTAAAGTCTGAAGCGGCACGGAAGCGCAAGAACAAGCGCCGTCGTTACTAGTCGCGAAAAGCTCCCGCCGGTTTCTGGTGGGAGTTTTTTCTTACATAAAATGGGGGTATTGATGATGAGCTTATTACAACAACTTTCCAAGGACATGGTCACCGCCATGAAGGAAAAGGATAAGGCGACCCTGTCGGTGGTCCGGATGTTAAAGGCGGCCGTGCAAAACGAACAGATCGCCGTGGGCCACGATTTGACGCCGGACGAAGAAAACGCCGTCTTGGCCCGGGAATACAAGCAACGCAAGGAATCGCTGGAAGAATTTACCAGCGCCGGGCGCCAGGACTTGATTGACCAAACCAACCACGAATTAGCGGTGGTCGCTAAGTACATGCCGGAACAAATGTCGGCTGACGAAGTGGCTAAGGTCGTTAACGAAACGATCGCCCAGGTCGGG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66 | Tupanvirus(10.53%) | tRNA,transposase,integrase | attL 965330:965345|attR 981928:981943 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
996416 : 1059768
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_021235|996416:1059768|DBSCAN-SWA 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55 | Lactobacillus_phage(23.08%) | capsid,integrase,transposase | attL 990854:990868|attR 999435:999449 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1265633 : 1270290
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_021235|1265633:1270290|DBSCAN-SWA GGTGCGGACCTCTAGCCTTAACAGATGGATTAAACAATTTTTAACGGCTGGTTTGGCTGGATTGATTCGCCCTGAACACAATCACAGGTACACACTTCAAACCAAGCGATCAGCCGTTAAAGCTTACCTTTCAGGTACCCTGTCAGGCCAAGCAATTCTCAATAGATATCAAATTCGTAGTCTTTCCCAACTACATCAATGGATTGTCCGGTACAATAGTGGACAATTAAGTGTTACTTACGCAACAAGAAAGCGAGCTAGGAAAGTGGGCCGAAAAGTTACTTTTGAGGAGAAACGGCAAATTACTCAATGGACAATTGATCACGAGTATAACTATCAAGCTGCGGCAGAAAAATTTAATGTCAGCTATCAACGGGTCTATTCATGGGTACGAAAGTACCAAAGAACTCACGATTGGGAATCCCTTCAGGATAACCGGGGTCGCCATAAAGGCAAAACACCAACCAATGAAGTGGAAAGATTACGACAAGAAGTAAGGCAGCTGAAAGCTAAAGAGAAGGAACGGGAGGTACAGATTGCCTTCGCAAAAAAATTGGTCGAAATACACAATCGGGAGGTGGAACGGCCGGACGATATCAAGCGATTCAGGAAATGAGCCAAAGTGGGTATAAGGTATCTGATCTAGTTAAAGCAGCCGGGGTAAGTCGGCAGGCTTACTACAAGTGGCTTACCCATGAACCGACGGTTCATGATATTCAAGATCAAGAAATTTTAAAGCTCGTTAAACAGTTAGAAGCACAACATAAACACTGCGTTGGTTATGACAAGATGACCCGTTTGATAAAGCAGGAAAGATTATCATACACAGTTAACAAGAAGCGCGTCATGCGCATTATGAAGGAGCACAGTATTAAAGCGGACTATCGTCAGCCTAAGAGAAAACGTGTGCAGGAGCAGGAAACTTATGAAGCACAGAATACCCTGAACCACCAGTTTGAACAAGCTGCCGCAAATCAGGTGTGGGTGACGGACACGACGGAAATTGCCTACAACATTCGTAAGTACAAAGTCCGTCTACACGTTGTCCTGGATCTATACGGTCAATACCCACTTAGCTGGATTATTACGCCTACAGAAACGAGTACTGGGGCTATTAAAGTGTTTCAAATGGCCAAGCAGAAAGCCGGAGGTCTGGCACCGCTAATCCACACTGATCGCGGAGCAGCATATACTTCCAAAGCATTCAACCACTACTTGGCTAGTAATAACAGCCAACATAGTTACTCAGCCCCAGGAACGCCAGCTGATAATGCGGTGATGGAGCACTGGTGGGCTGATTTTAAATCTATCTGGTTAGCACACTCACCACAACCACAAACGTTTGAAGACTTAGAACAGCTGGTGACAGAAGGTATCGATTACTTTACGCATTCCTTTATTTCAGGCAAAAGAAATGACCTTACCGCAGCAGAATACCGCTTTGGCAAGGCCAACTAGTTTTTATTATTTAATGTGTCAACTTGACAGGGTACAGTACCAGACACCCTCCCTCCATAATTTATTTGGTACCGATATGGTACGATTTTTATATTAATACCTTTTTGGTACTTTTGCAACCTTTTTTCCCAAAAGATTCAAAAAAGGTTCCATTCTGGTATATAATAGGGCCACGAGGTGATCAGAATGGAACTTAGTAAGTTTATAGGTAAAAAGATTAAAGAACGGCGGGAACATCTCAATATCACACAAGATGAGCTTGCTGAGATGATGAACACTTCTCGGGTGACGATCACCAGGTACGAGAATGGAACACGTAAAGCAAACCAGGACGCCCTTTTTAAGCTGGCTCGGTTACTTAAGGTAAATGTAGCTTATTTCTATCCTGACCAAAATTACCCATCACAATCACAGGCCAACGATGATCTCACCGAAAACCAAAGGCTAATAGCCTACTCGATCGATCCGGATATTACTGATGAGGAACGCCAGGACATCATTAACCTGGTTAAGATTGCCATGAAGAACCGCCGTCGGATTTAGGGGGTGGTCATATGACCGATTTGGAGAAGTTGGAGGATCAGTACCCAGAACTGCGGTTTTGGTCAATCGATGTACCTAACCCACACTTTCACGGATTAATCAAAGGTACAGACATCTATATCAATGCCAACGACGATAATTTAACTCAACTTATGACAGCGTTGCATGAGGTCTTCCACCATGAAATAGACTGTGGCGATCTCTCAGACATCAACCGTGTGGAAGTAATAAAAGAAGAGGGACAGGCTATCCGGTTTGCCACCCGCCTGGTCAAAGACTTTATCCAACCATGATTAACAATAAATATAAAAATATAATTTATATCGGCTACGATATCACAATGGCAGTACTATCGATCGCTTCGATTTTTATGATCGTATTGGATTATGCTAAGAGTATTGATATTACCGCCTATCCATACAACGTGTTTGACAACTTAATACTGGCTATCTTTACAATTGATTATTTTGGTAGATTAATTGCATCAAAAAATAAACGAAAATTTATTACTGGCAACATTTGGGATCTACTTTCCATTATCCCTGTTAACCAGGCCTTCTATTTTTTCCGGGCCGCCAGGATTTTTCGTATCTTTATACTTTTAAAGCTGCTAAGACTGGTTCGGTTAGTTGGTCTTATCGGTAAGCTACGCAAGTTTATTAATACCAATGGTTTAATTTATTACATCTACGTAAGCATTGCAGTATTAATCATTGGCGCTTCTATGTATAGCATTTCAGAAAAGGTCGATTTTGCTACCGCTCTGTGGTGGTCAATTACTACTGCTACAACCGTTGGCTATGGTGATATTTCACCAACCACCTCTATGGGTAAGTTAGCTGCAGTTATGGTAATGATCATTGGAATTGGCTTTATAGGTATGCTAACCAGTTCGATTAGTAATTTCTTTATTTCCAACGATGAAGTTAACTTAAAGGAAGAATTAGCTAAACTACATAATGAGAATGTCCAGTTGAACGATAAATTAGATAGACTAGAGCAGATCATCAAGAAGAAAAACTAGGATTACAATTCCTAAAATATTAGCTACCCAGTACCTTAATACTGGATTGTTAACGTCCAAACCTGATTGACGTTAAAAGCTGAAGAGGAGGACTTCAAAATGAAGTTAAAAATCAATATGTGGACAGCAATTTTCGACATTGTTAATTGCATTTTGTTTGTTGTTTCTTGGTTTGTAATTGCCGGAACGGCTGTTATGGACGCCACGTCTGGCACAAATGCTACCGGTGGTACAGGATTATTTTTCTATATAATGGCCTGGATCGGAGTTGCACTTAATATTTGGGCTCTGGTTGCATCAAAAAAGAATGATATTTCTATTGTTGGCCCGGTGCTTGGTATTATTGGAAGTGCCATGTTTGGAGTAACTGCTGCTATGGCTTTCCCTGCACTTGTTGTCTTAATCATCGCAACGGTCTTTACTTTCCTTCAGCGTCCCGCTAAAGGCACTCAACAAAGCAATTAGGATTAGCGTCGCCGGTCGTTTGACCGGCTTTTATTTTTAAAGAGGTAGATTAATGGCACAAATTATTAAGCGTGGACCATCATATATGGTTCGGATAACCTGGCGGGACGTGGACGGTAAACAGCATAAGAAGTCTAAATCAGGATTCAAGACTAAGGTGGAGGCTCGTAAAGCGGCTGCCGAAATGGAAAACGCAAAGTATAGCTGCCAAGTGGCCGTTGGCGATCCCACGTTTGTTGGCTACTTCGAGGATTGGTATCAGACTTATAAAGCTAACAAGGTGTCGCATTCAACTAGTAAAGCCTATCAACAAGCGATTAACCTTGTTCGCCGGGAATTCGGCACGATGAAGTTATCCAAGGTGACCAGGCGCCACTACCAGTTATTCATCAATCGATTTGGCGCTACTCACTCCAAGAACACGGTCATGCAAGACCATACCTTCATCCGGACGTGCGTTAAGGATGCAGTGAGTGAAGGCCTAATCCAAAAGGACTTCACCGACCGGATCGAGCTGGTGTGGGATAAGCGTAAAGGCCGGGAGATTAAGTATCTATCAGTCAAAGAGATTAACCGGCTAGTTGATTATGCTCTCTCTCATCCAACCGTTGAGAACCGACTGATTGTGGCTGGGTTATATACCGGTGCCCGCTTAGGTGAGTTGTCCGCTCTCGCTTGGCAAGACGTCAACGAGCTGTTTAAAACAGTCACGATCAGCAAGTCGATGGAAGCCCACACTCGAAAGATTAAGGAACCGAAGAATAAGTACTCTAATCGCACCATCCGGGTTAACCAGGCGTTCTTTGATCTAATCAAACCGCTAAAAGGGACTAGTGAACTAATCTTCGGTCCGATAGTCCCTAACTCGGTCCAAGTCAACAAGCAACTGCGAGCGGATTTAACCGCCCTCAACATTGGTGACGGGAGCTATCACTTCCACAGCCTTCGTCACTCACACGTGGCGCTACTGCTTGCTCACGGCGTACCTCTGTTTGCCATCTCCCAACGTTTGGGCCACTCAAGTATGACCATCACTGCGAACACTTACGCTTACATGATCGATGAATTCAAGAACCAATCTGACCGGCAAATCACCCAGGCACTCGACACGCTAGGTGTCCCAAAAAGTGTCCCAACCTCATCATTATCTATTGTTTCTGATGATTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_021235|1265633:1270290|1268756_1269122_+|WP_041813931.1|DBSCAN-SWA MKLKINMWTAIFDIVNCILFVVSWFVIAGTAVMDATSGTNATGGTGLFFYIMAWIGVALNIWALVASKKNDISIVGPVLGIIGSAMFGVTAAMAFPALVVLIIATVFTFLQRPAKGTQQSN >NC_021235|1265633:1270290|1266184_1267090_+|WP_155819458.1|transposase|DBSCAN-SWA MGRNTQSGGGTAGRYQAIQEMSQSGYKVSDLVKAAGVSRQAYYKWLTHEPTVHDIQDQEILKLVKQLEAQHKHCVGYDKMTRLIKQERLSYTVNKKRVMRIMKEHSIKADYRQPKRKRVQEQETYEAQNTLNHQFEQAAANQVWVTDTTEIAYNIRKYKVRLHVVLDLYGQYPLSWIITPTETSTGAIKVFQMAKQKAGGLAPLIHTDRGAAYTSKAFNHYLASNNSQHSYSAPGTPADNAVMEHWWADFKSIWLAHSPQPQTFEDLEQLVTEGIDYFTHSFISGKRNDLTAAEYRFGKAN >NC_021235|1265633:1270290|1267644_1267926_+|WP_015639148.1|DBSCAN-SWA MTDLEKLEDQYPELRFWSIDVPNPHFHGLIKGTDIYINANDDNLTQLMTALHEVFHHEIDCGDLSDINRVEVIKEEGQAIRFATRLVKDFIQP >NC_021235|1265633:1270290|1269174_1270290_+|WP_015639150.1|integrase|DBSCAN-SWA MAQIIKRGPSYMVRITWRDVDGKQHKKSKSGFKTKVEARKAAAEMENAKYSCQVAVGDPTFVGYFEDWYQTYKANKVSHSTSKAYQQAINLVRREFGTMKLSKVTRRHYQLFINRFGATHSKNTVMQDHTFIRTCVKDAVSEGLIQKDFTDRIELVWDKRKGREIKYLSVKEINRLVDYALSHPTVENRLIVAGLYTGARLGELSALAWQDVNELFKTVTISKSMEAHTRKIKEPKNKYSNRTIRVNQAFFDLIKPLKGTSELIFGPIVPNSVQVNKQLRADLTALNIGDGSYHFHSLRHSHVALLLAHGVPLFAISQRLGHSSMTITANTYAYMIDEFKNQSDRQITQALDTLGVPKSVPTSSLSIVSDD >NC_021235|1265633:1270290|1265633_1266248_+|WP_015639145.1|DBSCAN-SWA MRTSSLNRWIKQFLTAGLAGLIRPEHNHRYTLQTKRSAVKAYLSGTLSGQAILNRYQIRSLSQLHQWIVRYNSGQLSVTYATRKRARKVGRKVTFEEKRQITQWTIDHEYNYQAAAEKFNVSYQRVYSWVRKYQRTHDWESLQDNRGRHKGKTPTNEVERLRQEVRQLKAKEKEREVQIAFAKKLVEIHNREVERPDDIKRFRK >NC_021235|1265633:1270290|1267922_1268657_+|WP_015639149.1|DBSCAN-SWA MINNKYKNIIYIGYDITMAVLSIASIFMIVLDYAKSIDITAYPYNVFDNLILAIFTIDYFGRLIASKNKRKFITGNIWDLLSIIPVNQAFYFFRAARIFRIFILLKLLRLVRLVGLIGKLRKFINTNGLIYYIYVSIAVLIIGASMYSISEKVDFATALWWSITTATTVGYGDISPTTSMGKLAAVMVMIIGIGFIGMLTSSISNFFISNDEVNLKEELAKLHNENVQLNDKLDRLEQIIKKKN >NC_021235|1265633:1270290|1267276_1267633_+|WP_041813930.1|DBSCAN-SWA MELSKFIGKKIKERREHLNITQDELAEMMNTSRVTITRYENGTRKANQDALFKLARLLKVNVAYFYPDQNYPSQSQANDDLTENQRLIAYSIDPDITDEERQDIINLVKIAMKNRRRI |
7 | Lactobacillus_phage(57.14%) | integrase,transposase | attL 1268408:1268421|attR 1270332:1270345 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1487187 : 1615425
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_021235|1487187:1615425|DBSCAN-SWA 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114 | Streptococcus_phage(18.75%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1686291 : 1726583
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_021235|1686291:1726583|DBSCAN-SWA 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MELDRNQHSVYLLNYHLVMVVKYRRKVINDEISEYLKHRFVVVGQSYGINLQEWNHDIDHVHVLFRATPHTEMAKFLNAYKSSSSRMVKKLFPEIKRQLWKSAFWTQSYCLISTGGAPLEVVKKYIESQGRK |
41 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1793541 : 1863045
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_021235|1793541:1863045|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(18.75%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1928501 : 2061623
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_021235|1928501:2061623|DBSCAN-SWA 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118 | Bacillus_phage(16.13%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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