Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_021236 | Strawberry lethal yellows phytoplasma (CPA) str. NZSb11, complete sequence | 6 crisprs | RT,DEDDh,cas3 | 3 | 1 | 5 | 0 |
1. NC_021236
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_021236_1 | 208912-209181 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021236_1
|
3 spacers
spacers of NC_021236_1
>1.1|208945|51|NC_021236|PILER-CR GAATACGATCCTCAAACAGGTAAACGAACCAAAGAAACTTTCTACAGAACT >1.2|209029|42|NC_021236|PILER-CR ACCCCAGATGGTAAATTAACCAAACAAACTTTATACAGAACT >1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR GACCCCCAAACAGCCAACAAAACCAAAGAAATAAATTACTTATCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021236_1
The CRISPR arrays of NC_021236_1 >merge|NC_021236|1|208912-209181|PILER-CR GACGGAAAAACAATTGATTACATCACTAAATATGAATACGATCCTCAAACAGGTAAACGAACCAAAGAAACTTTCTACAGAACTGATGGAAAAACAATTGAATCCATCACCGAATACACCCCAGATGGTAAATTAACCAAACAAACTTTATACAGAACTGATGGCAAAACAATAGATTACATTACCGAATACGACCCCCAAACAGCCAACAAAACCAAAGAAATAAATTACTTATCCGACGGAAAAACAATTAATTACACCAACAAATAC >NC_021236|1|1|208912-209181|PILER-CR GACGGAAAAACAATTGATTACATCACTAAATAT GAATACGATCCTCAAACAGGTAAACGAACCAAAGAAACTTTCTACAGAACT GATGGAAAAACAATTGAATCCATCACCGAATAC ACCCCAGATGGTAAATTAACCAAACAAACTTTATACAGAACT GATGGCAAAACAATAGATTACATTACCGAATAC GACCCCCAAACAGCCAACAAAACCAAAGAAATAAATTACTTATCC GACGGAAAAACAATTAATTACACCAACAAATAC
>NC_021236.1|WP_015637789.1|207520_208168_+|hypothetical-protein MKTKGWFYKNKKAVYVLITVILLLVLSLTAYGTWKFMNRGKESENQTDNQNNNGKLEIDPFLDQHFVLYMQLLPSQNDYNTDLSQRKPWHPPQGAVLSQNFHPLIKNNHFQQGFFYAYDKKDVQKAKQLFQTAFAETKADIDKLPTESKNLTIYFDEEVIEKINNLQRKLGQSSPNQGQNFISIDNNNYLNVIDQIVLNVNDCFWLRLPQKSGTG >NC_021236.1|WP_081475349.1|206375_206771_+|iron-sulfur-cluster-assembly-scaffold-protein MQKHYQNPQNTTESDLKGYQTFKKNISCCGDQVIIQVKLSPSQTILDLKYEANACSICVASASLMSVFVKNLDKTTSLNKINHFCAMINKKAYDKEQLDENIQSLDIVHQLPNKTNCVLLPWQTLQAFWLN >NC_021236.1|WP_015637788.1|205183_206074_+|hypothetical-protein MKQIIKLATPFERVFNALEEIKNDFLKYNVQLEILSEKQVMEKYQISSNDALKKGLIDANISNNFHTMQAYNKLYSNDYNEFPLVMVSPLFHPKYGLYIHKNNPLGLKNLEDVKKHSKLRLLFAPFNELHIAPCDLSRSLFLLKKLGLVEIDESKITEKGFNLNLQDVKNTYDLEFIKTSHLLEISKKFQNYQKYDLAINCPGLMRDPNFIRIGSIGEGKEENIEPREKVFLSYAVILAAKKGTEKNEKINLLKEVLNNSNYKKIQFKYGGATNDYIMVPNQESLKEEIETNYKHL >NC_021236.1|WP_015637787.1|204282_205152_+|hypothetical-protein MNSVKNIKIASPMQSVLNTLNKAKVFFQKDNINIEVVKVNYQTTEPYEMVLNEKVDGLIYTNIHVLNFVNSVLKANNKELLEFVQSFYHSKYGLYINKKRNPVLNNLEEVKKHSHLKVLLATGFSYIVPCDTPRSLILLNNLGLIKIPQEVLEKKKFDLSLTDIQNTYQLEFIKSSQLPEKFLNNPQKYDLMANWPAFMNHYSDFKRIGSNIEGIEEPTDDFVVSYAIGLACKKTLKDSPKTKLIQTILNHPQTKEFHFQEGGKNHDYIMIQDPEKTGQRIKELWLKAY >NC_021236.1|WP_012358939.1|201817_203809_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MNMFKLKTDLKPNGDQPQAIKKLVQGFEKGFKEQILLGATGTGKTFTIANIIQHLQQQTLVIAHNKTLAGQLYNELKMMFPENKVEYFISYYDYYQPEAYVTSSDTYIEKDSKINDEIDQLRHNAIVSLLNRKDVIVVASVSCIYGVGDLEDYQSSTLFLQIGDRFERNLFLKKLVELKFQRNEVNFGRGTFRVRGDIVEIIPSSHKEIGIRIIFFGDEIERIQLFELLNAKVIENLKVTKIFPASLYAVNAEKIKESIKRIRQELKEQIKHFEKEKNLVAAQKIKMRTSHDLEMLAEMGHCSGIENYSRHLSLKEQGQPPSTLIDFFDKEFLTIIDESHVTVPQIKGMYFGDFSRKSNLVNYGFRLPSALDNRPLKFHEFEEKIDKIIYLSATPGDHEIERKLPIIEQIIRPTFVLDPEIEVKRTQNQMDDLYFEIKKRIQKNQRVLITTLTINMSEDLTAYLKNLGIKVTYLHSEIKSLQRLEILRDLRLGKYDCLVGVNLLREGLDLPEVSLVAILDADKQGFLRNQRSLIQTIGRAARNVDGKVIMYADNTSDAMKLAITETNRRRQIQKDYNQKNQLTPLSLKKNISESVSIQTKDKATSKKEPMFDLKNINQQIKKLTNDMKKAAEKLDFEKAASLRDLILELEKKDKKAMKKFSKR >NC_021236.1|WP_015637783.1|198862_200656_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MSSLLEKIKNLPLNPGCYLFKNKNNTIIYVGKAKKLRKRVQSYFIKGHNRKTTCMVQEISDVFYVITNNEQEALILEANLIKEHTPKYNFKLLDDKTYPYLEITQEKDPQLKISRFKKIPPGKVLFGPYPNLNSTKETLKLLHFLYPLRRCPLSAKKPCLHFHINQCLGPCALKNVDYRPNIEAITNFLKGDTKIILKKIKLLMQEASQQRFYEKAQEYRDMLIHIQNTTKKQIISHQKIKNCDILAYVYNDDQIAIQILKMQQGNIVDSHRSVFSYVGYPQENINNYLALYYQSKLKPELIITGKNTHNLTSPESNTQQQEAILFSAELLSQTLKTKVVVAKIGDKKKLYSLALKNAQNDLMQNNLLYQSKDQAIQEALDQLAIIFNKDIKRIDVFDNSQLFGQAFVSARIVFDQFDFKKSLYRVFHIKDNDPNEFTSFEEVLTRSYQKKDKEELVKPDLILVDGGLWQLKAGFQALNQLNLDIALGALQKNDKHQLECLLTSHNKIALTPKPRLFAFLKRLSEEVHRFVVKFHHKTKNKLDYQTVLSQIKGIGAKRHKIILNHFNSWEDLKKASWETFEKIGISKEIFEAIKSKL >NC_021236.1|WP_081632672.1|198274_198676_-|hypothetical-protein MQIFNSLLIPVCFKLPPLTLAFGDFDGLHLGHQKILQKLLSFQDTKSALINFVPNSKAFLQQKEDFFLTSLEQKITFYRFLKLDYLFLWHWNQKLACLKKLILFVYCKKLMSKELLSHKNPVLVIKKKGIIKL >NC_021236.1|WP_051085520.1|197762_198389_-|hypothetical-protein MLKKTDFIRLLQKINVKRVIITQESRFGYQKEGNYQTLKQAGFLVDLIDDYVKPNGCQQKISTTCIKKLLTQGKIDDANLYLSRPYKIQGKVIQGKQRGRLLGFRTANLELINFFLPRLGVYAVFVTYKKEKYAGIANLGVRPTFEQKPQKLLEIHLLNFDQNLYHQTIEVEFIAFLRNEKKFENVSQLIFQIKKDVLDAKTLLKTKM >NC_021236.1|WP_012358936.1|195866_197606_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKLYLKFFHYIKKNYLKLTKILIIVVFVFLLILGHYYVFAKANSKEQKQTQSDQKVLKVGIVNTLGLTGFDVDDKAPNGKQTINGGKISGTDVFLFEALAKKIGAKLEITVVDKDGMLTNLNIDKYDVISSGHNYTEERADNYDVEKMYKVDVAMLIKTKNKDTFKKFKVENGQMSLFDKPYPKLERKIKLTTWKNSEYSKKIEKEINEIKKIKGNNTPFEADESLLSLDNNSRGFYNIIEDLADGYIIEDNLLSLEMELHNTKTEDKDQKLEMIKLSDWDLPEMGLFFKKGTTEKPETIQKELKDELDNLSKEKKQEIYTNAIEKSEKDYRYMASKRIEQNANIFKKIIAFAPSYGKPFLVSLIISIDGLFLGFLLGLGLVKAKYFNPQLETANKFLSYIKKTAAFLIDCAFGFFQAVPVLIQGLLFYFLILIITKKHFHIDFFITNEGIFVISLTVIILNTAVFLASTMLNHIKFLDSGQIEGSVALGMKPKQVFRYIIFSQSIKRTYPSIWSQFIVNIKDTALFSSIGLAGVIWQAKRNIATNGDTITPYLTISIIYIILVLSTNLIKKMTMKYFQ >NC_021236.1|WP_041784478.1|193841_195140_-|DEAD/DEAH-box-helicase MSQLQNYVQKKIAQLKFRTLTPIQKEVFQQFEKPGNLVGIAPTGTGKTFAYLLPLLSQIDFQKNFCQAIILVPTNDLVFQVWEMFKQIEKNHFIKILYGGMDKQKTLDQFTKKQPSLIIATPDKILEYAFKLKKINLKYVSYLVLDEADMMFDQAFLTMLEPLINHLNAKILLFSATLKLEMKPFINRYFGKANFIDVLNQNDSKCNFFLLETKISRLQTLIKLTKVLNPYLALIFVSNKKEQELVFQTLNSEKLNMLNYNSSLSVQQRKKQLKLIHKLKYQYVIVSDIASRGIDFDASCVIHYNLPTQMEFFYHRSGRTARMGKKGEVIVLSDPKDNKEKEKINKLIQAGVNFQKAFLAKEGFERETQKTNLKITSKSQTQQLNHKKSNKTKSFSETKTTKKHPKKSRFVSNKNSKPKTKKQFGKKQKNKL >NC_021236.1|WP_015637792.1|209321_209954_-|hypothetical-protein MQQISNLDFNNINVFNHKSLCVNITKQIVQPIFFNKAFNQYMFDCHNILNTYLTNNQHNSQSQKSIRGKINEYLILLYLNHKGIKYLYPQSYLFFIPDIKFDLVLFTKTKRIIAFNFKTCLRERYKQSIVEGEQIKKLDTRFGFYLLTNDESETQRLNNKIKNGKVQSINKVINLFSNSANLFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVRSNDK >NC_021236.1|WP_015637796.1|211639_212107_-|DUF4065-domain-containing-protein MQPNKIDILDVATYLVKHQNKDDFTRMKIQKLVFLTYCKYLLKYNIPMFENDFEAWEEGPISLPLNLEQIKYPTKFDKTITFSQKYDENKFTKEHIQIMNSILKKHGSKPLRQLYDFIHKENGPYQISYKKKDVSQNSILDSIIKQCYLSKKHLI >NC_021236.1|WP_015637797.1|212316_212544_-|DUF2963-domain-containing-protein MNCKKNKTTYYNIDGKTIYAIHEHDPDTLNFIKTTWFHKDGKKIDFITDYDPITEEPIKETYYNSDGTIKEEKTF >NC_021236.1|WP_015637619.1|212545_213199_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MQREKLFKDFLKNKKDLEIRDQLIEMHLPLVKKIANQFKYFPKSLQREDLYQEGILGLIKALDKYKDLGYGFYGFINYAKELIKGEITELIRGLQTASTPLKLVFRKEKQTSNIPFEEWEEAKQPRWSTILNPHQLWLKQDNHELFLKKLKNILNYKEFEIIKLSFGIPLGNVNEEPQIEYSNKNIGQMLNLSSRKVAIIKNKAIKKLKKIYKKGNK >NC_021236.1|WP_015637798.1|213413_214088_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor METNEIRKQELFQEFLKNKNNTEIRNQLVELDYPLIQKIASSFKHYPQMLQREALFQEGVLSLIKVIDRYDPTGRNGGEFIEYATKNIKSDIRDLIQSCHPSSMPRKENKIKKVDFEEWEEATQPKWDKILNPHQQWLKQVHHDIFLQILTKNLTDKQFDVINWSLGVSPKDVEDNDKVIHSNQEIAEELEKKYNKNFSLRQVEQIKTQAIAKLQKIFKKGENN >NC_021236.1|WP_015637799.1|214296_214437_+|hypothetical-protein MKKIVDSCMQQALTIINENKTLLDEIVLQLMEKETLNEKDMQTLLI >NC_021236.1|WP_012358950.1|214928_215252_-|hypothetical-protein MNHDKKVVKLENIYLEVQARYLKTADGFKKEWFGHFNNQNTKYNNVIVSFAHIDQDNPEFFLQPGQVVKVLEGEMREEKKESSSQFFLDVVTFRQTDDEEKNKINHI >NC_021236.1|WP_012358951.1|215396_215738_+|hypothetical-protein MRILVGKNNVFKLLWLILKNQQKKFCQKCQKTDVMGRIWSLKMGLLNNKIVFLRTISFDPETGEEIKKIKHFYQKKDNQKIDCVQENDHRTNECKFIIYKSDCKTVSVNRLKK >NC_021236.1|WP_015637801.1|216139_216439_+|IS3-family-transposase MVQKFKQTLNLTTILKTIKINRSTYYYWVKIQLKNNHKMEIRNIQQKRIKEICKSHRYHYGHRKIAVLYRQIYKEDITTSKIYQIMKENGICCRLKTKK >NC_021236.1|WP_041784487.1|217020_217500_-|SVM-family-protein MLKLKNKFKIISVCLFTFLGLLFINNNVMAMNNLSDENSINNEINELSLEQQALTAKISYFRIHHLDDDVQLQEQLNNLNQIIKNLYQRLYDIKFLNYINEQMSRYSYERNQIANKILSRPYQDPEMQELISNHKKLVIKIKNLRQKYINLQYKLNQFN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_021236_2 | 303571-303739 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021236_2
|
2 spacers
spacers of NC_021236_2
>2.1|303593|38|NC_021236|PILER-CR GCCTTTTTGGAGTTCTTTGATGTTGCTGCCTGCATTTC >2.2|303653|68|NC_021236|PILER-CR AATGGTTTTTAAATTTTGCAGTTTGATTCCTGCGAATAAAAATTGTTCCAAAGAAAAACCTTTTTCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021236_2
The CRISPR arrays of NC_021236_2 >merge|NC_021236|2|303571-303739|PILER-CR TTAATTCTTCAAGAGTATAGCCGCCTTTTTGGAGTTCTTTGATGTTGCTGCCTGCATTTCTCAATTCTTCCAGAGTATAAATGGTTTTTAAATTTTGCAGTTTGATTCCTGCGAATAAAAATTGTTCCAAAGAAAAACCTTTTTCTTTTAATTCTTCAAGAGTATAGCC >NC_021236|2|2|303571-303739|PILER-CR TTAATTCTTCAAGAGTATAGCC GCCTTTTTGGAGTTCTTTGATGTTGCTGCCTGCATTTC TCAATTCTTCCAGAGTATAAAT GGTTTTTAAATTTTGCAGTTTGATTCCTGCGAATAAAAATTGTTCCAAAGAAAAACCTTTTTCTTTTA ATTCTTCAAGAGTATAGCC
>NC_021236.1|WP_015637866.1|300532_303031_-|preprotein-translocase-subunit-SecA MFKFLKKIFNSSKKALRKARVIANKVQNLTETMSLLKDQDFVVKTNELKQRYQKGETLNQLLPEAYALVREATKRVTGLTPYYVQILGAIILHQGNIAEMKTGEGKTLTAIMPAYLNALSGDPVHIVTVNEYLAKREFEGKIGEVFRFLGLSVGINIKDNNTEEKQKAYLCDVLYITNSELGFDYLRDNMEIDANNLVMKRPYSYAIIDEVDSILIDEARTPLIISQSAKETKNLYKEANRFVKTLKSKHYLIELESKTIELTEEGINKAESFFQIKNLYDVQHSSLLHHIKNALKAFFTMHKNKDYLVNQNQVLIIDQFTGRVLKGRQFSDGLHQALEAKEGVLIKEETSIGATITYQNFFRLYHKLSGMTGTAKTEEDEFRDIYNMEVIEIPTNLPMIRVDEPDFIFVTMQEKYDALIKTTLERHKLGQPILIGTTTVEVSEIISKKLAKNFIKHEILNAKNHFKEAEIIAKAGLKNSVTIATNMAGRGTDIRLGEGVADLGGLAVLGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGYSRFFISSEDELAQRFGGKRIEKIISLLQQINTSGKETSSKMVTNFFTKIQKKVESSNFDYRKYLLKYDDILRIQREIIYDQRKGILNSPHPEKIALNLMEKTINQAVVPFFTNTKKTNQPEELILFLEKSFFPKGTFDLKEVQAIFEQSPNTALTEFRKYLSNKMTVILEQQKDSFEKENNDIHFFDQVIRWFMLKIIDNYYKRHINDMSVLRQGVGFVGYGQQDSFIEYQKEGQILFNKMVDQIVMDITTAILRFPLSQSFQTPPQQEKMILNDNNSDNNITKRRRKVRISKKPWN >NC_021236.1|WP_015637865.1|299416_300529_-|peptide-chain-release-factor-2 MEKYEINQHLENIAQNLRDLKEAINLSESYQTLNQINELMQKKDFWDDPKKAVATSQKFNDLQEKINTLKHLETNHQDLVTFLDLESNQNNETAFLEEEIKKLIDAVLNFKIKVFLNQPYDNNNAILIFHPGAGGTESQDWCEMLFRMYQKYAQKKNFKTEILDYQSGEEAGIKSATLLVKGAYAYGYLKAEKGVHRLVRVSPFDTNAKRHTSFVSCDVLPEIKEKIKIDLRQEDLKFDFFRSSGAGGQHVNTTDSAVRITHLPTGLVVSCQNERSQNQNREKALQMLKIKLFQLADKKQKEEHAKNFQGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYKMVKDHRTNQEIFQLEQVMDGNIDVFINGYLTKIPFVKNNL >NC_021236.1|WP_012359021.1|299065_299341_-|30S-ribosomal-protein-S16 MAIKMRLQRFGVHKRPFYRVVASDSRVTRDGKFLDIVGTYDTILNIIKLDNEKVQKWLSCGAQPTQTVKKILKKNFVFQKDNQIKKPQTAK >NC_021236.1|WP_041784298.1|298295_299030_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MIIEIVTIFPLFFKSFCDNSIIKRALNQQKVQIKIHDLRKYSVNKHQQVDDCVYGGGVGMLLSFPPFFDCLQEIKTPQSKVILLSPQGKIFDQVQANNYASNTPHLIILCGNYEGVDTRILKYVDQEISIGDYVLTGGEIAATVVVDAIVRLIPGVIKHESAFSDSHQQGLLKFPQYTRPQIYQNQEVPSVLLSGNHAQIENWRQKESLKITLQKRPDLLINKKLSSKEKVILEEIKQELKNNS >NC_021236.1|WP_015637863.1|297906_298263_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSQLKGQGLIESVTQNQLKEVPFFKPGDTVKVFIKIEEGNRKRIQIFEGLVIKRQGRLMSETFTVRKIFAGIGIEFTFPLHSPSNEKIEVVRRGIVRRAKLNYVRNLSSKAARIKEKR >NC_021236.1|WP_012359018.1|296590_297838_-|tyrosine--tRNA-ligase MSFYEELKWRNLIKDSSDEKELKNLLDCKKIKFYCGFDPTSDSLTVGHLVQLTMMSLLEKQGHSPFILVGGATGLIGDPKETEERKLLSLETSLQNAKSLETQLKKILFQKKITFLNNYEWFSQLDIITFLRKYGKLFNINYMLNKQTVAKRLSSGISFTEFTYMILQSLDFHHLYKNYGVQLQLGGSDQWGNITSGLELIRKLETTSHAFGLSTPLLLNANGTKFGKSEQDVLWLDPQKTSPYKIYQYFLNLADEEVVNCLKQLTLIPKEEILELEKATLQTPQKRLAQKALANNIVNLIYSQKVLQECHKTNEVLFLNKKKESFQEADFTLLNKTLFSYETSLVSIPLSEALVKTQLTTSKREAREFIQRGSIQIFNEKIKNPDYLIDKKNTLFNKYVLLKKGKKNNSLIILN >NC_021236.1|WP_015637861.1|295357_296578_-|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MEAQIVLKNPLRSLFPIFKANPKLVYFDSAATSLKPKKVIDELTSFYYNNGMANKSFAFLSSQTNLLINETRKKTAFFLNCLPEEIIFTKGTTDSLNLLAQSLGELLEEGDEIIVSELDHNSSVLPWLKQAKRKKAKIVFVPLDSNNKITVENFSKVLTKKTKIVALTHVSNLLGYMTPIKEIIDLSHQQNTLVVIDAAQSAAHFPIDVKALNSDFLAFSAHKLYGPFGVGVLFGKISLLKKLKPTFFGGNSIQEFSLNDFVLNEPPHKFEAGTLNIAGIIAFKKALEFIQEIGFEKIQSIEKNIYQGIIKELEKIPEITIYNPQSLDIISFNFNHIHAHDVENFLAQENIYVKTGRCCAFLAAKKINQTSLVRISVGVYNNQEDIDILIKNLKKARDFFIKCAKK >NC_021236.1|WP_012359016.1|294902_295346_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MLEINKLYRDIIMKHYQEPQNWGLSQDKSFISLTHKNISCGDSIVLQIKFGGQKANQKIEDIKYKTQSCAICRASASLMSLYLKNLEINQCLNKINTFLAMINNQDLDETKIEKELLLFKHFCQFQGRRVCVALPWQALEKIIQKNR >NC_021236.1|WP_015637859.1|293414_294149_+|hypothetical-protein MGLITYNYLKTYENAKYLKYNIPILNKLTRPTHQIAPEVEANNVQSFVFLSSFCIMFLAGLLWAIGFYWYLSLLKFTTIILSVGWGYFFGAQYALFQMAFNIKSNYIALFFYIPFLGTLLVVGLMSYLYYSKKLVITPQKRYLIAICFIIFYFVSISLNLYRRPFSFWWIHIIILLWSILGLVISAFIWVLMLEQVDIFVEKQIPKKYEWLLIGLMLVSLINIFMLILTIMIRIIKLIKKIVSN >NC_021236.1|WP_158454209.1|293053_293209_+|hypothetical-protein MITLKYYKLVAETNISDSDHLLINILKTKNIFADNHSLNIYGGKLKEEGKQ >NC_021236.1|WP_081632684.1|305620_305755_+|DUF2963-domain-containing-protein MDYTIDYNPYTGNKIKLTQYKSNGTTVDYTQNYEYPLTGQIIKN >NC_021236.1|WP_012359026.1|306790_307834_-|molecular-chaperone-DnaJ MTKKDYYQVLGLNKEATPKEIKKAYLRLAKKYHPDVSQEANAEANFKEIQEAYSVLSDANKKANYDRFGHDSQTQQQGFSGFEGFEENIFNSFSDFFGTNKRSRKVNYDKKVEMTISFMDAVLGALKNIDIMVDADCQVCQGKGALSSSDIVKCRHCNGLGQVITEQRTFLGNIRSQQTCPYCRGEGEQIKNKCYSCHGSKRQKKKQSVSFQIPAGIEEGMSFQIHGKGNFPPLSNQAGDLYINFKIRPHESFVRKNQDIVLEIFINVPEAVLGTNKLIPTIYGEVNLKIPSGIQSGNKLRMKNQGIAYLNSSYRKGDQYVVVHVKIPSSPTLEEKRLYLKLLQLSN >NC_021236.1|WP_041784301.1|307902_309759_-|molecular-chaperone-DnaK MAKSNKIIGIDLGTTNSCVALMEGGEAKVIPNAEGGRTTPSVVSFKGNDIMVGEIAKRQVITNPNTISSIKRHMGEANYTVDVNGKKYTPQEISAMILTNLKKTAEDYLGAEVSDAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLNVKRIINEPTAAALAYGADKSNKEQTILVFDLGGGTFDVSILDLADGTFEVLSTSGDNALGGDDFDLRIVDFLVKEFKKDNGVDLSKDKMAMQRLKDVAEKAKKELSGVTSSQISLPFLTMSASGPLHLEYNMTRAKFNELTKDLIDRCLGPVKRALSDAKLTIEKIDQVLLVGGSTRIPAVQELVKKELQKTPNKSINPDEVVAIGAAIQGGILAGDVKDILLLDVTPLSLGIETLGNVFTKLIERNTTIPTSQKQVFSTASDNQSAVDIHVLQGERPLAADNKTLGQFRLTDIPPAPRGIPQIEVTFDIDANGIVSVKAKDLGTQKEQKITISGSGALKEEEIKRMIREAEENAEADRVKKEGIDARNEADNMIFLTKKSLDDLKAEVTPEEKEKVQKQIQELETALKGEDISLIKEKTASLSKESQGIAMKAYQKAQQQQQNQNEANPEQPNSSDKDKKDGVDEVVDADFEEKK >NC_021236.1|WP_015637872.1|309745_310414_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MLFEEKEEKNNCQACDVCDDNEKNATPTEETKKKLNSDCDCTHQDNTQTEKKPSSKTIVKLKEQINKLTLQLEEQKKAFADASLKNQAELINFKKRLQKQKIQELKYASSNLISDLLVPLEQLEKALEISTDNELLKKYLLGFQMIQQQIKNILKEEGVEEIQSLNAVFNPALHNALEKISEPEKPNKTNLKVLQKGYLYKEKILRPAMVQVNEWSNEDGKK >NC_021236.1|WP_012359029.1|310443_311466_-|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MLSDRKKIILKAVVESYSQKRQPVGSKSLIHLPELQFSSATIRYDMLKLEEEGFLKKNHTSSGRIPSFKGYTYYLTHLLTRDYDAANSFPLIDKVIQNKTFHKNKVIKEAIKLLNSLTSYTAMAIGPDVFNNSKISKIDFIPLNHKQALILIITNKGDVQHQNISLDQTKEISIYDLKDIVKIISDLLVGKYLSEAVKIIQSDFVKQTIAKYIRFQEQLIALFIEAFSSFASENTYFAGISEMTKKKEFSDLELIKKIMNLLERKELLKILLNQEGLSFKLSDELQLTPVKDYMILSIPFAIDANEKGTIAILGPSWMKYPKIIPLLEYLSIHLSKLNQE >NC_021236.1|WP_012359031.1|312701_313058_-|50S-ribosomal-protein-L17 MPFSKLGRNKSQRRALLRTLMTDLIVNEQIITTESKAKELQRLADKMITLAKKGTLHTRRQAARHLFDEKINEETTVLQKLFQKLASQYLNCQGGYTRVIKTVPRRGDAAPMAIIAFA >NC_021236.1|WP_012359032.1|313075_314068_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MKNLKFIKPFFVEELDEKLTSGKFIFYPLVKGHATSIGNSLRRTLLSSLPGTAIVNVSIEGVEHEFTTISGVYEDVMTIILNLKKIIFKVDDESNDFEEKLKISLSGPQKITAASFGLPEGVKIINPEAPIATISSDINFNMTATIKKGIGYVSAKDNKVHSENQLGVIPIDSLFTPVVNVAYQVEKKIGNKEELTMEITTNGALLAKEALATAAKILVEHFNVVSELSQQTPNVEFVSERKPEAHNYFLDLEIEQLDLSVRLFNSLKRAGINTVADLVKLSEREVVKLKSLGRKSFQELKDKFVEYGLEFNDCLKEALHNSDEEEKETN >NC_021236.1|WP_012359033.1|314096_314483_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARRKTTKRKVKKNVPFGIAHIHTTFNNTIVTITDANGNAITWSSAGALGFKGSRKSTPFAAQLAAEAVAKAAMEHGMAKIEVFIAGPGPGREAAVRSLQAAGLEITAIKDVTAVPHNGCRPPKSPRG >NC_021236.1|WP_012359034.1|314498_314864_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGIDIPSDKRVVIALTYIYGLGKKLSQKILNELNISHDIRVKNLTEQQLSSLRSEITKYSVEGDLRREVTLNIKRLMEIGVYRGLRHRKGLPVRGQKTRNNAHTVKGKPKSIAGKKK >NC_021236.1|WP_012359035.1|314876_314993_-|50S-ribosomal-protein-L36 MKVKASVKKRSEDDIIVRRKGRVYVINKKNRRHNQRQG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_021236_3 | 489632-489907 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021236_3
|
3 spacers
spacers of NC_021236_3
>3.1|489671|45|NC_021236|PILER-CR GTAATCAATTGTTTTTCCGTCGGAGTTGTAATTGGTTTTTTTTAA >3.2|489755|39|NC_021236|PILER-CR GAAGTAAATTGTTTTTCCGTCGGATAAGTAATTTATTTC >3.3|489833|42|NC_021236|PILER-CR AGAGTAAATTGTTTTGTCATCAGTGTATCTGTAGACAGTTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021236_3
The CRISPR arrays of NC_021236_3 >merge|NC_021236|3|489632-489907|PILER-CR TTTGGTTTTGTTGGGTGTTTGGGGGTTGTATTCGATGGTGTAATCAATTGTTTTTCCGTCGGAGTTGTAATTGGTTTTTTTTAATTCGTTGCCTGTTTGGGGGTTGTATTCGATGATGAAGTAAATTGTTTTTCCGTCGGATAAGTAATTTATTTCTTTGGTTTTGTTGGCTGTTTGGGGGTCGTATTCGATGATAGAGTAAATTGTTTTGTCATCAGTGTATCTGTAGACAGTTTCTTTGGTTTTGTTGCCTGTTTGGGGGTTGTATTCGGTGGT >NC_021236|3|3|489632-489907|PILER-CR TTTGGTTTTGTTGGGTGTTTGGGGGTTGTATTCGATGGT GTAATCAATTGTTTTTCCGTCGGAGTTGTAATTGGTTTTTTTTAA TTCGTTGCCTGTTTGGGGGTTGTATTCGATGATGAAGTA AATTGTTTTTCCGTCGGATAAGTAATTTATTTCTTTGGT TTTGTTGGCTGTTTGGGGGTCGTATTCGATGATAGAGTA AATTGTTTTGTCATCAGTGTATCTGTAGACAGTTTCTTTGGT TTTGTTGCCTGTTTGGGGGTTGTATTCGGTGGT
>NC_021236.1|WP_015638021.1|488302_489553_-|DUF2963-domain-containing-protein MNYQKTFYYDDGKTIDYTNEYNPQTGKITKQTLYRTDGKTKKSVVEYSPDGKITKKTYYNSDGKTIYSITEYDPQTEEEIKHTKYDDDGKTLESITEYDPQTGKLNKETLYRTDGKTIDYTIEYDPQTGKITKQTLYRTDGKTIDYTIEYDPQTGNELKKTNYNSDGETIFYITKYEYDPQTGKITKQTLYRTDGTLESITEYDPQTGKITKQTLYRTDGKTIDYTIEYDPQTEELIKHTKYDDDGKTLESIIEYDPQTGKITKQTLYRTDGKTIDYTIECDPQTGKITKQTLYRTDGKTIDYTIECDPQTGKITKQTLYRTDGKTIYSITEYDPQTSNKTKEINYLSDGKTIWYITEYDPQTGKITKKTYYNSDGKTIYSIIEYDPQTGNKTKRTYYNPDGSIKKVEENFGPAEC >NC_021236.1|WP_015638020.1|486594_488082_-|hypothetical-protein MLLIIIFNFVPSINSHSSFFHSQNKTKIKLADYETLQQEWLATQPKMKRYDIPVLSKESIPEILKYFNIKTSTYGLVKKPTYNPYAKNFIIWELKNPPAGLICAFFKARQNPFKEQYPRDDDKYTLDDLLKYEIAIEEAFVFWDVNKQPTQTNVNITFVNQDIFASDNKEKAINEYLIKNKIIQEPKLIKLGCYNITPTTGLIAPLPAGGFNGIEIAAIYFDDGIRLLPENQKTSFLKSGIEWREEMIKRYQTENEIIKELLPKQIESLQEEIKELYQEIINHQTYTIEDLLKLSDGTKNIYLFSFNTKKRIKEIKLPDAIDPYQVIRDWKRENNLYTFPPLVQEDDYEEQSENRDAYIEITSPAYKKISILFPIKIVKHTFETTDCCYYLVCKNDTLQIELAKQYRDAYVLWMKRCYIKPGISYSDQEIRNKFGRSSRDIYNEEGKKCRYRYDINTFIDDWYVDGIFCFGSNNTFYNFYDTTPPPKKPQELNIN >NC_021236.1|WP_148284454.1|484054_484603_-|site-specific-DNA-methyltransferase MPSCSFWQRSYESILCLWNNEKPKINIDQIREPYTSNFLKYDGKKRNGTLGRFGNSETLYRVNEKGVLPRDIIKVPALAGGAGFKERFFLCKTCDCKIFRSKELKNHQSPHQTIIHPTQKPQMLTNKLIDSAIMENQKGNVLIPFAGSGSECLVAKKKNLNYIGIEINPDYVMLINEALKKI >NC_021236.1|WP_015638015.1|481515_482478_-|IS3-family-transposase MSETQKMQKLNNKIILLQNMISQIKIIDKEIVFKLVKRFFKTLNLSTILRTIKINRSTYYYWLKNQEKKRLQCENYLLQQKRIQPLCSRYQYFYGYRKITHLYQKTFNEHIAKEKVYQIMKENNICCRLRIKKVKRAYKNNLKPKLSVAPNLINRDFIATKPLQKLFTDITFFPTPEGFVYFSAIIDSFNNQIIASHTSNRQDKELILNTIKKLPPLKDPCVIHSDRGTVYQSLKVQNKLIKKGFLISMSHKATPRDNAVIENFFGQMKSILFNQHPFLFQQEPHEIKKIIHHFPSFWNKRWMLAKLNNLSPLKYSQSFR >NC_021236.1|WP_015638013.1|480656_481118_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIVKDLIEEGLICQGIKDQVLRQKKVNQMIRLVDLRLSDLSRYPHEFSGGQKQRIVIARALIVTPTILIADEPISALDVSIQAQILNLLNDLKKQLGLTIIFISHDLEVVRYFCDSLAVMYQGNIVEQGTTEEIFSHTKHPYTQRLLNDSNFN >NC_021236.1|WP_041784328.1|478941_479349_-|Hsp20-family-protein MLFNLIDSEKDLFEDLFAGIQPTNLNHMMKTDIQEKDDKYLITVELPGFQKENIKVALEKGYLIVEAKTNQENEKKERNFLRKERLQGIFRRNFYLGKGFSLEDIQGRLEEGLLKLSVTKKDTKEVKEKRYLELK >NC_021236.1|WP_015638009.1|478226_478604_+|hypothetical-protein MILQKKKFKKIIASKNNVGYKIVFPNDLAVYPQNLDRGTICVNLSNKKVLISPSYKIYKINTDKISCLYLHYLVRNDNSILIYDSIINKGNSCGRVCSDMKSFLNLEFFFPSLKEQNKIAFFCLC >NC_021236.1|WP_012359177.1|477746_477932_-|50S-ribosomal-protein-L28 MKCYVTGKTTLFGNRRSHAMNATKRVWKSNLQSVRIINEQGKVQKVKIAARALKKLKLKRV >NC_021236.1|WP_012359176.1|477460_477700_-|50S-ribosomal-protein-L31 MKNNIHPKSQTVKISCPTCERQYQVETTVPSIKIETCFKCGPFYTGSQNFVVAAGPIDKFNKRYNVNTQKSVDQKEKNK >NC_021236.1|WP_012359175.1|476812_477412_-|thymidine-kinase MPKEQQGFIEVICGPMFAGKTEALIKRYQEAQKLKKNILSFKPRIDNRYSSEGFIVSHSQNKFPAILIDQSRDILPFVTPETDLIIIDEVQFLDNDIFGIVDYLANQNIQIILAGLDLDFKGKPFGPMPYLLALAEVVTKLTAICAVSGKKATKTQRLINGKPAKSNDSTILVGGQEYHEPRCRRHHELLDVDKKTINL >NC_021236.1|WP_015638023.1|490188_491022_-|hypothetical-protein MKQPNFFQKHLVTIIIILLFGIAIIIGIKQGFNDYQNEKNSLSPLGQTPEKDSLEPENPSNPSRMKRSTETSQPKIKTTSIRLEQIKTYLFVEPTDTSKLPSDLSAREQEEIKELKNSWQLSFNLLKKQKTWVDEEQKVCDEHQFQLNSLQPQIEALKPQKQKLEQQKEAKEKEMKQKQEEEKLASPDDKIRLRAEIEKLQDEVIELVGKIDKIEVQIGKLKAPQRKYQNMLSRAEMFKKDLEKRYQIKETEYKNEILKSLDSLYEITPTKFNLASK >NC_021236.1|WP_015638024.1|491114_492737_-|DNA-double-strand-break-repair-Rad50-ATPase MISTLDVLKGFINLKSYLTWFLFATTVFGLFCFIKNKFSHNQQTTTLKSYLIPFLIILTLFSFLYLSFFHKSDKSEPSSKYTGQLIGKIDEAIKKYDETINNYHGLKKDWEKELQNCEAELKELYEQKELTQEAKDKIKDVLEKTKPKIKEIKENLDKDTKNITILKGKLIQTKQQKEAKEKEMKQKQEEEKLASPDDKIRLRAEIEKLQDEVIELVGKIDKIEVQIGKLEATQRKYQDMLSRAEMLKKDLEKRFQTLSDDEKSLFNQIQSVQERHTKIQKEIDKVDKKLEEIKLEKELYKSLKLKYEEMYNRMTTYQEENKASAGKIAKWLFKGFDKVTDLIPGKLAIKALDKTISVTRKFAQGMSKATLVLHEGHRLWGMYNEVANENKEHPPMITKEALEMYTRDIDRDLAKLDADYKDCEKELRDYQLRQEEDNLKKQTEKSEELNKDIKHHFNSWINEYSTTIEELTQKHKEVSGTKNLFEQRDKVEYKVEYKRKDINVLKEQLDQENPSYDRARQLLKARRVGKIPEMVMNPNN >NC_021236.1|WP_148284439.1|492739_493834_-|AAA-family-ATPase MNLLFSSSTTFLGQSRFHHQTLSTTEEKINQHEGLLKQQEELPKDKKQTLLDNNNLPTNTNLQKEGVIFEPSDPQKFIGFDKLIGFKEELKAAQGFINYSKKPENYQGIGQVEPPLGILIYGVPGTGKTTLARALAKETNLPFFEVNSSLFSQKYKGLAPKMVKDLFTDARIVAEECNGAIIFLDECETIFTDLSMLEAGSEIANVVNAFKTEMTSMNNNPDKPIFIIGATNQYHLIDEAIKSRFTYNIEVKPGNKVERQQMLEFLMKKRKNPYSEEAKQYLFEVINEALERLPQNQQFLKANRTLENLLKTTVSNLAENRGEGENKRSEINKEDLKQAYQLIISPDTTLLDQIENNLTPKGGE >NC_021236.1|WP_015638026.1|493907_495095_+|AAA-family-ATPase MIEAERALLGALLLNPEKMDAVINLVNTNNFSNPKHRYIFETMKQLKMQNREIDYVTVGSVLDNNLYKIGGIDYLIELVEGSPASEYLETYIDLIKENSLKKDLLGLIKQLPTELSKTKNIHNYLQTVKNQVESFMQKTKSPFISTKTLIPYIRQSIVNDDKDNQLVGIKTGFKNLDELISGFKPNQLIILGARTGMGKTAFMLNLACNIAKNFTTNPENQKAVIFSLEMAAEELGIRLLSSTSQIPLKQLQHKNLTKNDKLQLLIADDEITQLNILIDDDRNNKIEDIKTKCRQMKYTKGLDIVFIDYLHLLKEDQIFNTYQAISVISRELKKLASELNIPIVALSQMNRATYVREVKSPQLTDLRDSGTIEQDADVVMLLHRVYSHWGCNRFH >NC_021236.1|WP_051085522.1|494979_495594_-|DUF2963-domain-containing-protein MNYQKTFYRKGIKTAIKFVAEYSPDGKLTKETYYNSDGKTIFHINEYDPQTHKRIKETHYYGDGKTKRFVIEYYSDGKLNKSTWFREDGKIINCIICWNPITAEIIKTINYHLDGKIGEEIMIMDDKKHTINCYQDNFKTLIYTTEYNPQTGNKTKQTQYNPDGTFFNEIYYNPNGSIRGAITSQHQRLVRLFLNLLNLLIVGF >NC_021236.1|WP_015638028.1|496530_496998_-|DUF4065-domain-containing-protein MQPNKIDILDVATYLVKHQNKDDFTRMKIQKLVFLTYCKYLLKYNIPMFENDFEAWEEGPISLSLYLEQIKYPTKFDKTITFSQKYDENKFTKEHIQIMNSILKKHGSKPLRQIYDFIHKENGPYQISYKKKDVSQNSILDSILKQCYLSKKHLI >NC_021236.1|WP_041784329.1|497209_497437_-|DUF2963-domain-containing-protein MNYQKNTTTYYNIDGKTIYAIHEHDPDTWNFIKTTWFNKNGKTIDYITEYDPETEEPIKETYYNSDGTIKEEKTF >NC_021236.1|WP_015637712.1|497870_498614_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MLRQKLFKDFLKNKELLHEINKPKAQLKEEKAAHVATKERLEEEKNYLAIRDQLIEIHFALVHKIVKDFKYFPKSLQREDLYQEGILGLIKALDNYEDLGYDFIAYATPTIKREITKLIRGLQTTSISKGVFEKEKQTRQTSNIPLEEWEEATQPRWSTILNPHQLWLKQYNHELFLKNLKNILNPQEFEIIRLSFGITLGNVNEEPQIEYSNKNIGQILNLSSRQVAIIKNQAITKLQKIYKERNK >NC_021236.1|WP_015637713.1|498735_499203_+|SocA-family-protein MQTHKIDILDVATYLINHQNKNDYTPLKLQKLVFFVYAKNLIDTNQSMFNNDFESWHYGPVSPKLYTNLPKDQKPLNYQQKIKENYDQNIFSQQEKEIMDYVIEKYGPKTATELVNITHRPNSPWERSYISQYFALNNIPDKLIQNYYSQRNRKV >NC_021236.1|WP_015637714.1|499233_499404_+|hypothetical-protein MQTHKIDILDVATYLVKHQNKDDFTRMKIQKLVFLTYCKYLLKGLDFLINELKARI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_021236_4 | 530513-530770 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021236_4
|
3 spacers
spacers of NC_021236_4
>4.1|530537|51|NC_021236|PILER-CR GATGGTGGTTTCAAGTGTTCCATCAGTTCTGTAGAAAGTTACTTTATTTAA >4.2|530612|65|NC_021236|PILER-CR ATATTTAGTGATGGAATCAATTGTTTTGCCATCTTTATGGAACCAGGTTTCTTTGGTTTCGTTGT >4.3|530701|51|NC_021236|PILER-CR GATGGTGGTTTCAAGTGTTCCATCAGTTCTGTAGAAAGTTACTTTATTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021236_4
The CRISPR arrays of NC_021236_4 >merge|NC_021236|4|530513-530770|PILER-CR TTTATCTGTTTGGGGGTTGTATTCGATGGTGGTTTCAAGTGTTCCATCAGTTCTGTAGAAAGTTACTTTATTTAATTTACCTGTTTGAGGGTCGTATTCATATTTAGTGATGGAATCAATTGTTTTGCCATCTTTATGGAACCAGGTTTCTTTGGTTTCGTTGTCTGTTTGAGGGTTGTATTCGATGGTGGTTTCAAGTGTTCCATCAGTTCTGTAGAAAGTTACTTTATTTAATTTACCTGTTTGAGGGTCGTATTC >NC_021236|4|4|530513-530770|PILER-CR TTTATCTGTTTGGGGGTTGTATTC GATGGTGGTTTCAAGTGTTCCATCAGTTCTGTAGAAAGTTACTTTATTTAA TTTACCTGTTTGAGGGTCGTATTC ATATTTAGTGATGGAATCAATTGTTTTGCCATCTTTATGGAACCAGGTTTCTTTGGTTTCGTTGT CTGTTTGAGGGTTGTATTCGATGG TGGTTTCAAGTGTTCCATCAGTTCTGTAGAAAGTTACTTTATTTAATTTAC CTGTTTGAGGGTCGTATTC
>NC_021236.1|WP_015638040.1|529964_530129_-|hypothetical-protein MLLIIIFNFVPFINANSSFFHSQNKTKIKLADYETLQQEWLATQPKTKIYYTLY >NC_021236.1|WP_015638039.1|529210_529792_-|DUF4065-domain-containing-protein MLSKKEAITVVNKNNNKPNVLDVANYIIIKFKNNNENLTHMKLHKLIYYSYVKYLIEYKKRLILERPKAWKCGPVFGELYFILKDYFEKPIVKSLCDGRSQKIITDGKRKKIIDEVLLLCKNKTAIELSNISHQQTPWDETYHYYRYKKNDSTILDEDLKNFFSNHKLLETIKEDELQKNFKKKFGIFGKDWW >NC_021236.1|WP_015638038.1|527505_529002_-|hypothetical-protein MLLIIIFNFVPSINANSSFFNSQNKTKIKLADYETLKQEWLATQPKMKRYDIPVLSKESIPEILKYFNIETSTYSLDEKPTYNPYAKNIFYWELKNPPAGLICVFFKARKNPFKIKYPHDGDEYTLDDLLKYEIAIEEAFVFWDAQQKTQEEKGNMELIIINLFGDRSKEKAINDYLIQNQIIQEPKLIKLGCYNATPTTGLVVPLPLGEFNGIEIAAIYFDDGIRLLPENQKTRVLKQRIKQREGMIKEYQNNLIKTKNEITKELAPKQIESLQEQIKEIYQEIINHQTYNIEDLLKLSNGAKNIYLFSFKTKKNIEIIELPDAIDPYQAIRDWKRENNLYTFPPLVQEDDYEEQSKNREAYIEITSPAYKKISILFPIKIVEHTFETTDCCYYLVCKNDTLQIELAKQYLDAYVLWMKRCYIKPGISYSAGEIRDKFGRSSRDIYNEEGEECRYRYDINTFIDDWYVNGIECSGSNNTFYNFYDTTPPPKKPQELM >NC_021236.1|WP_015638036.1|523967_525674_-|hypothetical-protein MLLIIIFNFVPSINANSSFFHSQNKTKIKLADYETLKQEWLATQPKMKRYDIPVLSKESIPEILKYFNIKTSTPYGLDGKPTYNSYTENYMYWYFKNPPAGLICAFFKVRQNPFKEQYPTSGYKYTLDDLLKYEIAIEETFVFWDANKQPPQTNVNITFVKQDIYASDNKEKAINEYLIKNKIIQEPKLIKLGCYNATPTTGLVVPLPSINYTTHEKDNEIKNWLFQAQKYINHKTSSKEIQFPRLWSDKPFTYKIVPKIDFYETGFTENGNGYRAYNEMIERNTIQGESIQKAPGKYYCKPTINMNKIPYVTDGVELVFSEPVSVLEPPQQQQIEAIYFDDGIRFFPESSQTYTIEDLLKLSNGAKNIYLFSFNTKKRIKSIELPDAIDPYQAIRDWKRENNLYTFPPLVQEDDDEERSENRDAYIEINSAAYKKIEIIFPIKIVKHTFETTDCCYYLVCKNDTLQIKLAEQYRDAYGNWMDQCYIKPGISYSAQEIRNKFGRSSRDIYNQVGEKCRYRYVTNTFIDDWYVNGIECSGWNITFSNFYDTTPPPKKPQEMCCSFFHNI >NC_021236.1|WP_015638035.1|522978_523248_-|hypothetical-protein MVLIMQKLQKLKQKIKLLQNMIFHIQTINNQTINKKVVFQLVKQFSQDLNLTTILKTIRINRSTYYYWLKIEEKLKLKEEVKKEIKTYN >NC_021236.1|WP_041784330.1|521258_522212_-|IS3-family-transposase MQKLQKLKQKIRLLQNMIFHIQIINKKIVFKLVKQFSQDLNLTTILKTIRINRSTYYYWLKIEEKLKSKQTKYFLQQKRIKVLCLHHQYFYGHRKITDLYQKTFNEPITKKKVYLIMKENNICCKLRPKKNKYYYHKNLKSNLQVAPNLINQDFTTSQPMQKLFTDITYFQTPQGFIYFSAIIDSFNNQIIASHTSNRQDKELILNTIKKLPPLKKPCVIHSDQGLVYQSLKVQQTLTKKRFLISMSRKATPRDNAVIENFFGQMKSILFNQHPFLFQKKPNKIKKIINRFASFWNHKWLLTKLNTLSPLKYSQSFR >NC_021236.1|WP_015637740.1|519056_519689_+|hypothetical-protein MMSSFLKETKKRTKWDKKTFNEIIMYIQKILGKFCKEIGYIEPYSNIKNKEIFVTTIIKTWLEEIFGKVTTRESSNGHGKTDLILFFDDEIEHPIECKRYKGNESMEMLYKQVSRHTTVFNKTVSMIIYCEEKNFFESIKKITKWINDNVSLIKKPILNFNNYPNIFKGEFKHDYGHTVMLHCACYHLFFDKSHAKTKKQIAKQPKNNLK >NC_021236.1|WP_015637739.1|518561_519020_+|DUF4065-domain-containing-protein MKNNNQINVFDVAKYLLDNCPQKYGTGITQMQKLLYYAQAEYLIHYRQPLFEEEIQAWPLGPVVAHVYYEFVRCMAEDKDLFETKCSKNPLPDKVIKILNLVIKKHGTKTPNDLIEQTHNEDPWKNIYHPNKKFSNSVISNEQIYVFFKNRK >NC_021236.1|WP_015637738.1|517968_518526_+|SVM-family-protein MLVKNKLHLLPFFLISCLGLLFIVDNKQVMGMNNNLSQNNSNIDNNIDEYRIFQNLLSIQEGTIQQIINALRNHNSEVEINTLLNQSQQIHQQIITHQQRQHNNQHQFMINFERNITKIQLEREHLSLIQEMNTAINNIPIYASTEQINVLRNIQIRIDQNRRQINIIIQQLQNNPNPPNNNRRR >NC_021236.1|WP_015637737.1|517095_517464_+|SVM-family-protein MLAKNKLHLLPFFLISCLGLLFITSNNQVMAMENGNINNNGNINQNNRNINPIIEACRNLHDLLLEEARLINQIYNAIRNNDSEETIRILINQTNEIALQAENIRRNINNNQNQPNNNRRNQ >NC_021236.1|WP_015638044.1|531964_532825_-|hypothetical-protein MKQPNFFQKHLVTIIIILLFGIAIIIGIKQGFNDYQNEKNSLSPLGQTPEKDSLEPETPSNPSRMKRYTEETSQPKIKTNAARLEQIKTYLFTEPTDTSKLPTVLSAREQEEINKLKNSWQLSFNLLKEQKTWVDEKQKVCDEYKTQLDSIKPQIEALKPQQQKLEQQRDEKRQEVQQKKEVQKQFKYLPNQPEEVRKKRKENYDLLQAEIEKLQGEVSEIVGEIGKIEVQIGKLESKQKKYQDMLSRAEMLKKDLEKRYQIKETEYRNEILKSLDSLYEITPTEL >NC_021236.1|WP_015638045.1|532917_534561_-|DNA-double-strand-break-repair-Rad50-ATPase MISPLDVLKGFINLKSYLTWFLLATTVFGLFCFIKNKFSHNQQTTTLKSYLIPFLIILTLFSFLYLSFFRKSEPSSKYTGQLIGKIDEAIDKYNETINNYHGLKKDWEKELQNCEAELKELYEQKELTQEAKDKIKEALNNNEKKIKETKNQLSENDKNITILKGKLIQLEQQQEAKEKEIKQKQEEKNLASPNDKIRLRAEIEKLQAEISEIVGEIGKIEVQIGKLESKQKMYQDMLSRAEMLKKDLEKRYQTLSDDEKSLFNQIQSVQERRAEIQKEIDEVNIKLEKIKLEKELYQSLKEKYREMYNRMITYEKEHEASAGNIAKWVFKGFDKVADLMPSKMLFKTVGKAISVTRKFAQGMAKVTLVLHEGHRLWHMYNEVANENKEHPPMITREALEMYSKDIDRDLDKLDADHKDYEKKLDDYKLRQNQDNLKEEIKKSEKLNKDIKDDFNSWINEYSIIIDELTLKQKEVSDTKKLYEDGTILEDKLETKREDVNVLKEALKQKNPSYARAQQNLQARRVGEIPEMVMIPEDNLKEETRKNK >NC_021236.1|WP_015638046.1|534563_535757_-|ATP-binding-protein MEIKNQTPNKPLLLKVMTIIILFFLFWLATYVWIHHQTLSTTEEKINQHQGLLKQHEGLLKQQEELFKQQEELPKDKKQPLLDNEGNNLPTNTNLQKEGVFFDPSDPQKFIGFDKLIGFKEELKAVQGFMDYLKNSENYQGIGQVEPPLGILMYGCPGTGKTTLARALAKETNLPFFEVNSSLFSQKYKGLAPQMVKDLFEDARIVAEECNGAIIFLDECETIFTDLSMLEAGSEVANVVNQFKTEMTSMNNNPDKPIFIIGATNQYHLIDEAIKSRFTYNIEVKPGNKTERQQMLEFLIKKRKNPYSEEAKQYLFEVINETLERLPQNQQFLKANRTLENLLKTTVSIFAKNRGKGENKRSEINKEDLKQAYQLIISPDTTLLNQIENQLKPKGGE >NC_021236.1|WP_148284455.1|535815_536346_-|hypothetical-protein MAINNYFSRQKQEKIKLMSENNAPLFEVNKISGNNEDKTLIPLPMPNLNPNKYHHTITINHQAVLNLNGFDSDIGLYLKITPKYDTHNTFSNPETLFNLEIKTNNIIYDDTKRQQLIYKPNGKGNTNIQIKLEQNNFVKATNPLLTLVLDYELVDSNGNAFSGSGTTIENKIKNLA >NC_021236.1|WP_015638048.1|536447_536771_-|hypothetical-protein MIKKVIKKKKTNKKSTELKNKKVLNSKQTPPSEKTVVKLPTTLEKQPTQPTTNNNNKGNLFKTFIILTIILYFILHVNVIYYQNQIPWLTTGINNLIDIIKSTLGGK >NC_021236.1|WP_041784339.1|536789_537023_-|hypothetical-protein MNDLNFPIGFIVGALFTTALMFIIKKIFFNFLPLPEINKKNEPKKDNKTKSSFSIIPNPNNESKEKDDLENYKEKNN >NC_021236.1|WP_015638050.1|537015_537456_-|hypothetical-protein MFIFSIFATISNFILKYSKGFTTTEILERRMDGIQTTLFTILVVSGFKPIFKLIANTLNFFKDLILGIFFPNKKLQKLEIQNAKQEYLEKQLLKKLDKINENQEKLQSQIMVQRVKVSHWQEKKARKKQLKSQNINPIIKKEDENE >NC_021236.1|WP_041784342.1|537478_537697_-|hypothetical-protein MNNMSDGMSEAFNGTYFKSRNSQSKKKTNKYNQPKGKWLNLDRPNKTFKNKKKSFKKQRKVMKELEEEIEKL >NC_021236.1|WP_015638053.1|537849_538479_-|N-6-DNA-methylase MYRVDRNNFFKNEKKSTIYTPSWVSQFLYDILSPQIKPRLIFDPCVGEGSLLLPWKEKGFDVLGVDIEKTSFPNLINKNFLELSQKDLKKQKISLVITNPPFNLDFKNKSYVKEKYGGRPLLPELWLKKIIEIFGKDIPIVLFTPYGFRLNQSLNSKRLQKFVNQEYPEISSIISLPKDVFENVVFHSEILIFNVNNLKPHYFCRGAMI >NC_021236.1|WP_015638054.1|538694_538865_-|hypothetical-protein MPVLSSLLLNLIPKPKPDVSVSNKNQDDEIKKQLLILKLQNGKLKKTIREESRQKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_021236_5 | 816133-816313 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021236_5
|
2 spacers
spacers of NC_021236_5
>5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR GGATAAAATTGTTTCCCCATCTGAGTAGTATTCGTTCCA >5.2|816250|57|NC_021236|PILER-CR AGGATCATACTCGATAATGTAATCTATTGTTTTTCCGTCGGAGTTGTAATTTGTTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021236_5
The CRISPR arrays of NC_021236_5 >merge|NC_021236|5|816133-816313|PILER-CR CTGTTTGGGGGTTGTATTCGGTGATGGATAAAATTGTTTCCCCATCTGAGTAGTATTCGTTCCATTTGGTTTTGTTGCCTGTTTGAGGATCATACTCGATAATGTAATCTATTGTTTTTCCGTCGGAGTTGTAATTTGTTTGTTTGGTTTTGTTGCCTGTTTTGGGGTTGTATTCGGTGAT >NC_021236|5|5|816133-816313|PILER-CR CTGTTTGGGGGTTGTATTCGGTGATGGATAAAATTGTTT CCCCATCTGAGTAGTATTCGTTCCATTTGGTTTTGTTGC CTGTTTGAGGATCATACTCGATAATGTAATCTATTGTTT TTCCGTCGGAGTTGTAATTTGTTTGTTTGGTTTTGTTGCCTGTTTTGGGGTTGTATT CGGTGAT
>NC_021236.1|WP_015638266.1|814239_814557_-|HU-family-DNA-binding-protein MTKKEKFKKLTKKELIKNLAVMHNTSVTQTQDFYNSFENALIEAIKSNKAVIISPKIGKFILKSRKAHKGRNPKTGKPLRIPAKTVVNFKFSQTIKDEVKNLKLK >NC_021236.1|WP_015638265.1|813965_814217_-|hypothetical-protein MKKIKKHQIFFHIIIIFLSIFITYLLTRQIGLSQSEHLEKNFNKVSDEVNDAKKQTQERFNETHKKLDESIEKLDKKNNKENE >NC_021236.1|WP_015638263.1|813395_813836_-|hypothetical-protein MFIFSIFATISNFILNYSKGFSTTEILERRMDGIQTTLFTILVISGFKPIFKLIKNIIVFIKDLILGIFFPNKKLQNLEIQNAKQEYLEKQLLKKLDKINENQEKLQSQIEMQRVKVTHWQEKKARKKHLKSRNINPIIKKEDENE >NC_021236.1|WP_041784394.1|813172_813403_-|hypothetical-protein MNDLNFAIGFIVGALFTTSLMFIIKKIFFNFLPLPEINKKNEPKKDNKTKSSFSIIPNPNNESKEKDDLENYKEKK >NC_021236.1|WP_015638261.1|812908_813040_-|SVM-family-protein MFKLKIDFFVLNIILFSGLSLLFIDNNQVMAMENNNKTKKRGI >NC_021236.1|WP_015638260.1|812435_812906_-|DUF4065-domain-containing-protein MKNNNQINVFDVANYIIENNPHKTTHMKLHKMIYYAYAKYLMKHNSLPNFKDSFRAWVYGPVLPELYNEFKEFTYLPINKLSPKGNSTKINSTLKKNIDFIIELYGAKTGNELSDLTHQELPWELSYNGNITWDKNVILDQTIYDFFKNNLNRIQK >NC_021236.1|WP_015638259.1|811686_812316_-|N-6-DNA-methylase MYRVDRNNFFKNEKKSTIYTPSWVSQFLYDILSPQIKRGLIFDPSVGEGSLLLPWEEKGFDVLGVDIEKTSFPNLIHKNFLELSQKDLKKQKISLVITNPPFNLDFKTKSYVKEKYGGRPLLPELWLKKIIEIFGKDIPIVLFTPYGFRLNQSLNSKRLQKFVNQEYPEISSIISLPKDVFKNVVFHSEILIFNVNNLKPHYFCRGAMI >NC_021236.1|WP_015638258.1|809276_811526_-|AAA-family-ATPase MKLKNKIYLSFLALFGFILLILFIVGITKKENNIKPLINPTITQPPNNQLDSEAKEELNKLQKRLKDLEIINQQNINNNKKLIEEDNQLSQQINSNLETIKTLNLQINNLNQELAQKSKELINKETNLTDETKSQLETEIINLNQQIADLSKQRDQINETTQPLTKKRVENTKSQVRNKKIIENVQSETNKTTQFKDIYQKISDLQQAINYNNANKENIKKLIIKHQDNPQENPQNLESYDLFLDGQLIQFDKQIKQLQNEIEVIKNPNIEKIPKKEITFKDVYGMENEKEQLEDLIFYFKESNNNLVNFDKIRPKGYLLYGPPGTGKTFLLKALSNECNAYFIEFEPSKLDKTYVGEGVEEWEKIWKDAESHNKAIIFIDEISGMANREDKNTNKTSINIVNNILTKLDGFNRSDKKIVLMGATNHLDQIDKALRSRFSKEIKIDLIKDEEIEGFLKFLIEPYQISYHTYLHLKEIANKCKGKNYSNRDLTTIINDAYNKTNKFKTLNPKHEVMLPSDLDEVIDTKQGINKSITEIKARRKECEEQYESWKQGFLKYLKPSKDETKVEKLYAFYSLNGLGRGQHRECEPTDLMPFMKNPFDKWETKDSSSDYFDTFHMKHKGNDSYFGDINFINNRSNHYTELEYEGPKWLIEEDKDFFMDEVRCHIIDPKDSGFPKREKKNYYLHFNPKQSYITLYTKKFNTKKDIENTPINVSILQNNLQHLEKEKEEKEIAIKKIKEELEKGDKK >NC_021236.1|WP_041784392.1|808971_809280_-|hypothetical-protein MKLKILNKTVLISTIFFIIIFLNPLEIHASPNNNTLKRCNAFKYDENNNIVSVSTPQIIQNLNTISILNINKTKFFHFLHKIFHCGIDILSITNEIIDLQNN >NC_021236.1|WP_015638257.1|808179_808944_-|hypothetical-protein MAKKIIKTKKSKLNQPIKKNTKQIKTKLPTKKTKKITPIPKKVVSKINKTKKTSKKIIKKQIQPTKIIVETKKENWFVKLIKSIVKITLILLPFILIGGGIWLVISKFFPELAGKIGGVVDTCWQFIKHMCHNLDDKTKKALENAGIDPKYSAIASKVLWLVGGCLLAAACCLIPGIGKFLGGAVLISTIAYVGTITLTEKTNQEPPKNTSPPQQVENKVDNTNKQIEPDKLTENNRDFETQETQKKKKQNQLN >NC_021236.1|WP_015638270.1|816818_817286_-|DUF4065-domain-containing-protein MQPNKIDILDVATYLVKHQNKDDFTRMKIQKLVFLTYCKYLLKYNIPMFENDFEAWEEGPISLPLYLEQIKYPTKFDKTITFSQKYDENKFTKEHIQIMNRILKKHGSKPLRRIYDFIHKENGPWRISYKKKDVSQNSILDSTLKQCYLSKKHII >NC_021236.1|WP_015638271.1|817384_817768_-|DUF2963-domain-containing-protein MNYQKTFYYDDGKTIYAIEEYDLKTGKRIKETYYDDDGKTKRFFIEYYSDGKLNKSTWFREDGKKIDSITEYDPQTSKITKKTWFHKDGKTINCITEYDLEKEAPIKETYYNSDGTIKEEKNFFINI >NC_021236.1|WP_015638272.1|817786_818434_-|dTMP-kinase MTNKLISFEGIDGSGKTTLINELKDSFENKGYQIKVFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLGGYLVLVDRWYDSTFAYQSKGNYIDYDDKITSKIINHFLIKPKLTFYLDIDPQIGIQRKQTQANHKLDLIEKKPLNYFENVRKHYLNQHKYCNDANCNHKNCNYFMINATNSQKENLAQIMKILINKKIF >NC_021236.1|WP_015638273.1|818423_819056_-|hypothetical-protein MQQISNLDFNNINVFNHKSLCVNITKQIVQPIFFNKAFNRYMFDCHNILNAYLTNNQHNSQSQKAIRGKINEYLILLYLNHKGIKYLYPQSYLFFIPDIRFDLVLFTKTKRIIAFNFKTCLRERYKQSILEGEQIKKLDTRFDFYLLTNDESETQRLNNKIKNGKVQSINKVIDLFSNSANIFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVRSNDK >NC_021236.1|WP_015638274.1|819419_820073_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MLRQKLFKDFLKNKKNLAIRDQLIEMHLKEPFSLVKNIVKQFTYFPKSLQREDLYQEGILGLIKALDDYEDFGYDFIVYAIPTIKGEITKLIRGLQTTSMSREDFRKEKQTSNIPLEEWEEATQPKWSTILNPHQLWLNQTNHELFLKNLKNILNPQEFDIIRLSFGIPLGNVNEEPQIEYSNKNIGKMLKLSSRQVVIIKNEAITKLQKIYKERNK >NC_021236.1|WP_015638275.1|820074_820308_+|DUF2963-domain-containing-protein MNCKKNKTTYYNYNIDGKTIYAIQEHDPDTWNFIKTTWFNKDGKTIDFITEYDPITEEPIKETYYNSDGTIKEEKTF >NC_021236.1|WP_041784345.1|820409_820877_+|SocA-family-protein MQTHKIDILDVATYLINHQNKNDYTPLKLQKLVFFVYAKNLIDTNQSMFNNDFESWAYGPVSPKLYTNLPKDKKPLNYQQKIKENYDQNIFSQQEKEIMDYVIEKYDPKTATELVNITHRPNSPWERSYISQYFALNNIPDKLIQNYYSQRNRKV >NC_021236.1|WP_015638065.1|821100_822357_+|DNA-cytosine-methyltransferase MNKNTIAETFAGAGGSHLGFINNGFVSVYINEFEPNCIQTLKLNFPLLEKKCYIDPRDINDISINKISIINVDVLFGGIVCKGFSLAGQRKPTDKRNYLYLKQLEFVNHLKPTISIIENVPTFLTTKILKKELIPQFEKEIDDIWQEYAQLQAKKGSKRKKNLSHELENKRLLELKKQKNDLLKKLEKQQVLISVFDDIKNKYDKMGYKVYHQVLNSAWYGAATARNRAIIVAVKKEIKKIFTFPKITHFQKDNPLGNINGMSFCDNLLPYTTVEDVFKTIDYNNLDDLDNIPMSHNPKTIKRFGFIPEGKNISHIIDQLPNELKISSFYSRGSATRLSRHKPCGTLVPGHSALPIHPWLNRSITIREAAALSGFPLNYKFYGSHSNRCEQIGNAVPILLSNAIAKKIKKFLKEVKSE >NC_021236.1|WP_041784355.1|822417_822891_+|SocA-family-protein MKYRSNKIDILDVAIYLVKHQNKDDFTRMKIQKIVFLTYCKYLLKYNIPMFENDFEAWEEGPISLPLYLEQIKYPTKFDKTITFSQKYDENKFTKEHIQIMNSILKKHGSKTLRQIYNFIHKENGPYKISYKKKDVSQNSILDSTLKQCYLSKKHLI >NC_021236.1|WP_015638108.1|823305_824592_+|replicative-DNA-helicase MIEAERALLGTLLLKPEKMDAVINSVNTNNFSNPKHRYIFEAMKQLKIQNREIDYVTVGSVLETNNLYKTKWTDYLIELVEMTPASEYLKTYIDLITENALKRDVLGLIKQLPTALSKTKNIHNYLQAVKNQVESFMQKTKSPFVSIKMLSPYVCQSIFNDDNPNQFIGIKTGFKNLDELISGFKPKELIILGAKTGMGKTAFMLNLACNIAKNFTSNPENQKAVIFSLEMAAEQLAFRLLSSASKIPLKQLLHKKINKDEKLQLLIADDEITQLNILIDDDRNNKIKDIETKCRQMKYNEGLDIVFIDYLHLLKDDQSFNIYQAISEISRKLKNLASELNIPIVALSQFSRDIEKRVDKRPVLSDLRDSGSIEQDADIVMLLHRESYWQKPDNNPHTNLIIAKNRSGQKGECNFNFFQEIQRFEAKE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_021236_6 | 842892-842996 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021236_6
|
1 spacers
spacers of NC_021236_6
>6.1|842919|51|NC_021236|CRISPRCasFinder CAACCTATTACAACTCCGATGGAAAAACAATTAATAACATCCTCGAATACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021236_6
The CRISPR arrays of NC_021236_6 >merge|NC_021236|6|842892-842996|CRISPRCasFinder ACCCTCAAACAGGCAACAAAACCAAAACAACCTATTACAACTCCGATGGAAAAACAATTAATAACATCCTCGAATACAACCCTCAAACAGGCAACATAACCAAAA >NC_021236|6|1|842892-842996|CRISPRCasFinder ACCCTCAAACAGGCAACAAAACCAAAA CAACCTATTACAACTCCGATGGAAAAACAATTAATAACATCCTCGAATACA ACCCTCAAACAGGCAACATAACCAAAA
>NC_021236.1|WP_015638284.1|841830_842508_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MLRQKLFKDFLKNKKNLAIRDQLIEMHLKEPFSLVKNIVKQFTYFPKSLKREDLFQEGVLGLIKALNNYKDLGYDFIAYAKPTIKSEITKLIRGLQTASIPKEVFEKEKQTSNIPIPLEEWEEATQPRWSTILNPHQLWLKQVNHELFLKKLKNILNPQEFEIIRLSFGISLENVNEEPQQIEYSNKNIGQMFNLSLRQVEKIKTRAITKLRESDYFAMDKKGNK >NC_021236.1|WP_015638283.1|839266_840955_+|hypothetical-protein MLLIIIFNFVPCINANSSFFNSQNKTKIKLADYETLKQEWLATQPKMKRYDIPVLSKESIHEILKYFNIETSTYGLNKKPTYNSYANNSLIWYFKNPPAGLICVFFKARQNPFKEQYPQACDKYTLDDFLKYEIAIEEAFVFWDANKQPTQTNVNITFVKQNIYASDNKEKAINEYLIKNKIIKEPKLTKLGCYNATPTTGLVVPLPSINYTTYEKDNEIKNWLLQAQKEYNHKTSSKEIQFPRFWNDKPFTYKIVPKIDFYKTGFRESGSGYRAYSEMIERNTIQGESIQKAPGKYYCTPSIDMHKIRYDTYGVGLVFSEPVSELEPPQQQQIEAIYFDDGIRFFPESSQTYTIKDLLKLSNGAKNIYLFSFTTKKRIKEIKLPDAIDPYQAIRDWKRENNLYTFPPLVQEDDYVERSENRDAGFEITSPAYKKISIPYLIKLVKHTFETTDCCYYLVCKNDTLQLQLAKQYRDAYAEWFKQCYIKAGGSYSAGEIRDKFGRSSRDIYNEEGKECRYYYVTNTFIDDWFVNGSYCSGSNNTFNNFYDTTPPPKKPQELNIN >NC_021236.1|WP_015638119.1|838360_838960_+|hypothetical-protein MKNLNKDNFEEIIKTIHSVCVSISRTKNLRKNNNSNPQDTEAIYRDNIFVQLNSYPSSFENFVNCEANNNHGKTDIIIPFKNEKKYIAECATLKEKDRGYKIEKKYEQLIYNTTEKDNKISLIFFVLKREFKPNQILEEIEKIIKKQSDNNNFHNKQIKYKNSDWIIKTRVKRFPEIDFYIHIGVYNFFYDEKYSKIQK >NC_021236.1|WP_015638282.1|837866_838337_+|DUF4065-domain-containing-protein MKNNNQINVFDVANYLISQTDTNKYKISNMKINKLLYYIQGHYIAQTGKTLFPEKIEAWLFGPVILNIYSEFFNFVDNSIPNDYVCKGASKNELTTEAKKIIDKVINKYSPFSARELSVKTHEELPWKEAYNPRKKWQNNIITHQLLEKFFKDNII >NC_021236.1|WP_015637738.1|837273_837831_+|SVM-family-protein MLVKNKLHLLPFFLISCLGLLFIVDNKQVMGMNNNLSQNNSNIDNNIDEYRIFQNLLSIQEGTIQQIINALRNHNSEVEINTLLNQSQQIHQQIITHQQRQHNNQHQFMINFERNITKIQLEREHLSLIQEMNTAINNIPIYASTEQINVLRNIQIRIDQNRRQINIIIQQLQNNPNPPNNNRRR >NC_021236.1|WP_015638281.1|836418_837249_+|hypothetical-protein MKQPNFFQKHLITIIIILLFGIAIIIGLFQGFNDYQNEKNSLSPLGQTPEKDSLEPENTPNSSRMKLSTEETPQPKIKTTSARLEKIKTYLFTEPTDTYKLPSDLSEREQEEINKLKNSWKLSLELLENRKTRPTGINKSQKECEELKTQLDSIQPKIEALKPQQQKLEQQKEAKEKEIKQKQEEKNLASPDDKIRLRAEIEKLQSEKQKIIEEISEVKLQIKKLESKQKYYQDMLSRAEKFKNDLVESYERQEKEYKNEILKSLNSLYEIIKVEE >NC_021236.1|WP_015638280.1|834682_836326_+|DNA-double-strand-break-repair-Rad50-ATPase MISPLDVLKGFINLKSYLTWFLLATTVFGLFCFIKNKFSHNQQTTTLKSYLIPFLIILTLFSFLYLSFFHKSEPSSKYTGQLIGKIDEAIKKYDETINNYHGLKKDWEKELEKCEAELKELRDEKELTQEAKGKIKDVLEKNEVKIKEIKENLDKNTENITILKGKLIQLEQQKEAKEKEIKQKQEEEKLASPDDKIRLQAEIEKLQSEKQKIIEEISEVKLQIKKLESKQKYYQDMLSRAEKFKNDLEETYQTLSDDEKTLFNKIKSVKERHAEIQKEIDKVDKKLEEIKLKKELYEDLKLKYQEMHNRLTTYQEENKASAGNIAKWVFKGFDKVTDLIPGKFALKVIGKTISVTRKFAQGMSKATLVLHEGHRLWGMYNEVANENKEKPLMITQAALEKYTKDINDDLAKLDADYKDGKEDLAGYKLRQKQDNLKKELDESQKLAEGIKERRRNVVDGYANIINELEEKRDEVSDTVPLLNKEDSLEDKLENINKAINTNKEQLDQENPSYARAQQRIKARRVGKIPEMVMDPEDNLKEETRKNK >NC_021236.1|WP_015638279.1|833534_834680_+|ATP-binding-protein MKTKNKSRSQPLLSKVMTIIILFFLFWLATYVWIHHQTLSTTEEKINQHKGLLKQQEEQPKDKKQTLLNNNNLPTNTNLQKEGVFFDPSDPQKFIGLDKLIGFKEELKAVQGFMDYLKNPENYQGIGQVEPPLGILMYGCPGTGKTTLARALAKETNLPFFEVNSSLFSQKYKGLAPKMVKDLFEDARIVAEESNGAIIFLDECETIFTDLSMLEAGSEIANVVNQFKTEMTSMNNNPDKPIFIIGATNQYHLIDEAIKSRFDFNIEVTPGGKAERQQMLEFLTKKRKNPYSEEAKQYLFEVINEALERLPQNQQFLKANRTLENLFKTTVSIFAKNRGKGENKRSEINKEDLKQAYQLIISPDTSLLDQIENNLTPKGGE >NC_021236.1|WP_148284455.1|832945_833476_+|hypothetical-protein MAINNYFSRQKQEKIKLMSENNAPLFEVNKISGNNEDKTLIPLPMPNLNPNKYHHTITINHQAVLNLNGFDSDIGLYLKITPKYDTHNTFSNPETLFNLEIKTNNIIYDDTKRQQLIYKPNGKGNTNIQIKLEQNNFVKATNPLLTLVLDYELVDSNGNAFSGSGTTIENKIKNLA >NC_021236.1|WP_015638115.1|832520_832844_+|hypothetical-protein MIKKVIKKKKTNKKSTELKNKKVLNSKQTPPSEKTVVKLPTTPEKQPTQTTTNNNNKGNLFKTFINLTIILYFILRVNVIYYQNQIPWLTTGTNNLIDIIKSTLGGK >NC_021236.1|WP_015638286.1|843121_844435_+|replicative-DNA-helicase MIVAERALLKPIEAERALLGTLLLKPEKKDYVINSVNTNNFNDSKHRYIFEAMKQLKMQNREIDYVTVGSVLDNNLYKIGGIDYLIELVEATPASEYLETYIDLIKENALKRDVLGLFKQFPIGLSGTKNIHNYLQAVKNQLESFMQKTKSPFISTKTLSPCICQSILNDDEDNQFVGIQTGFKNLDELISGFKPNQLIILGARTAMGKTTFMLNLACNIAKNFTSNNKNQKAVIFSLEMAAEELVIRLLSSASQIPLKQLQHKNLNKDEKSQLLIADNEITRLNILIDDDRDNKIEDIETKCRQMKSTEGLDIVFIDYLHLLIDDQNLNIYQAISKISRALKKLASELNIPIMALSQTNRANNLREDKTPQLTDLSGSGTIEQDADVVMFLHRESYYKKPDIDPHTNLIIAKNRSGEVGECSFNFYKQIQRFEEKE >NC_021236.1|WP_015638287.1|844450_845083_+|hypothetical-protein MNQLSNLDFENINVFNHKSLCVNITKQIVQPIFFNKVFNQYMFDCHNILNTYLTNNQHNSQSQKSIRGKINEYLILLYLNHKGIKYLYPQSYLFFIPDIKFDLVLFTKTKRIIAFNFKTCLRDRYKQSIVEGEQIKKLDTRFGFYLLTNDESETQRLNNKIKNGKVQSINKVINLFSNSANLFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVHSNDK >NC_021236.1|WP_015638288.1|845072_845720_+|dTMP-kinase MTNKLISFEGVDGSGKTTLINELKASFENKGYQIKVFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLGGYLVIVDRWYDSTFAYQSKGNYMDYDDKITSKIINHFLIKPKLTFYLDIDPKIGIQRKQAQANHKLDLIEKKPLNYFENVRKHYLNRHKYCNDANCNHKNCNHFMINATNSQKENLAQIMKILISKKIF >NC_021236.1|WP_148284463.1|845743_845824_+|DUF2963-domain-containing-protein MIKENFYDDDGKTIEFINEYNAKKSK >NC_021236.1|WP_041784269.1|846118_846322_+|hypothetical-protein MILTPKHILILLSITYLGFIITNLMTLFFDFNLGIKANTAISLVSDVVFLIYIWVKEFNNENTMDRQ >NC_021236.1|WP_015638289.1|846296_847109_+|Dam-family-site-specific-DNA-(adenine-N6)-methyltransferase MKIPWIGSKKKMLPQLLKYIPTNYNNYYEPFLGSGALFQSLTPSTVTLNDNDINLIQLWKDMLAQPELFCDYVRKFKDKIYVNKDQKTQKESFKHLVEKFNKSNLGAYKSALFYVLLKYAFRGIFRYRSDGTIYLGYSFSSRFKNPIIDLLEIQRIKTNVKNIKLLNGDFESVINQTQSNDFIFVDPPYWREGIKDKVFYQKPFTFEDHKRLYKSLEMANYRKVKWLYTNYNSSKITELFKKFHIQPIQTTTKHNLTSKGISQEVIIKNY >NC_021236.1|WP_015638290.1|847173_847689_+|DUF2963-domain-containing-protein MNYQKTFYCKGIQTAIKFVAEYSPDGKLTKQTQYYSDGKTIYVIQEYDLKTGKRIKETHYNSDGKTKRFFIEYYSDGKLNKSTWFREDGKTINCIICWNPETAEIIKTINYHLDGTIGEEIIDDKKHTINCYQDDFKTLIYTNEYNPQTGTRTKQTQYNPDGTVFNENFNQ >NC_021236.1|WP_015638291.1|847721_848483_+|DUF2963-domain-containing-protein MNYQKTFYYDDGKTIDFTNEYDPQTGKLTKQTLYRTDGKRKKSVVEWTPDGKLTKKTYYKSDGKTILDIIEYDPITEEPIKETFEYDPQTGNKTKEINYLSDGKTIVSITEYNPQTGNKTKKTFYYDDGKTIIDIIEYDPQTEEVIKETYYNSDGKLTTEIFYAGDGETIDYIRKYNPQISKLIKFTNYREDGETIDYTTEFKYHPKTNKLIKTTGFSFDRKRIAFIYKHHPNGKLFKKTYYNSDGTINKKYK >NC_021236.1|WP_041784398.1|848502_848796_+|DNA-binding-protein MTKKELITTLAKVTKNSVTQTEEFYNSFENTLIEAITSNEEVVLSPQLGRFVLKTRQARLWKHPKTGKKLKIPAKTAVTFKLSSSLKNKVKKTVKLN >NC_021236.1|WP_015638293.1|848819_849449_+|N-6-DNA-methylase MYRVDRNNFFKNEKKSTIYTPSWVSQFLYDILSPQIKPRLIFDPCVGEGSLLLPWKEKGFDVLGVDIEKTSFPNLIHKNFLELSQKDLKKQKISLVITNPPFNLDFKTKSYVKEKYGGRPLLPELWLKKIIEIFGKDIPIVLFTPYGFRLNQSLNSKRLQKFVIQEYPEISSIISLPKDVFENVVFHSEILIFNVNNLKPHYFCRGAMI |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_021236_5 | 5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR | 816172-816210 | 39 | NC_021236.1 | 814936-814974 | 0 | 1.0 |
| NC_021236_5 | 5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR | 816172-816210 | 39 | NC_021236.1 | 540274-540312 | 1 | 0.974 |
| NC_021236_5 | 5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR | 816172-816210 | 39 | NC_021236.1 | 597566-597604 | 1 | 0.974 |
| NC_021236_5 | 5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR | 816172-816210 | 39 | NC_021236.1 | 828987-829025 | 1 | 0.974 |
| NC_021236_1 | 1.2|209029|42|NC_021236|PILER-CR | 209029-209070 | 42 | NC_021236.1 | 842816-842857 | 2 | 0.952 |
| NC_021236_1 | 1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR | 209104-209148 | 45 | NC_021236.1 | 143874-143918 | 2 | 0.956 |
| NC_021236_1 | 1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR | 209104-209148 | 45 | NC_021236.1 | 488510-488554 | 2 | 0.956 |
| NC_021236_1 | 1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR | 209104-209148 | 45 | NC_021236.1 | 507372-507416 | 2 | 0.956 |
| NC_021236_1 | 1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR | 209104-209148 | 45 | NC_021236.1 | 847980-848024 | 2 | 0.956 |
1. spacer 5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR matches to position: 814936-814974, mismatch: 0, identity: 1.0
ggataaaattgtttccccatctgagtagtattcgttcca CRISPR spacer ggataaaattgtttccccatctgagtagtattcgttcca Protospacer ***************************************
2. spacer 5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR matches to position: 540274-540312, mismatch: 1, identity: 0.974
ggataaaattgtttccccatctgagtagtattcgttcca CRISPR spacer ggataaaattgtttcaccatctgagtagtattcgttcca Protospacer *************** ***********************
3. spacer 5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR matches to position: 597566-597604, mismatch: 1, identity: 0.974
ggataaaattgtttccccatctgagtagtattcgttcca CRISPR spacer ggataaaattgtttcaccatctgagtagtattcgttcca Protospacer *************** ***********************
4. spacer 5.1|816172|39|NC_021236|PILER-CR matches to position: 828987-829025, mismatch: 1, identity: 0.974
ggataaaattgtttccccatctgagtagtattcgttcca CRISPR spacer ggataaaattgtttcaccatctgagtagtattcgttcca Protospacer *************** ***********************
5. spacer 1.2|209029|42|NC_021236|PILER-CR matches to position: 842816-842857, mismatch: 2, identity: 0.952
accccagatggtaaattaaccaaacaaactttatacagaact CRISPR spacer accccagatggtaaattaaccaaacgaactttatacagagct Protospacer *************************.*************.**
6. spacer 1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR matches to position: 143874-143918, mismatch: 2, identity: 0.956
gacccccaaacagccaacaaaaccaaagaaataaattacttatcc CRISPR spacer gaccctcaaacaggcaacaaaaccaaagaaataaattacttatcc Protospacer *****.******* *******************************
7. spacer 1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR matches to position: 488510-488554, mismatch: 2, identity: 0.956
gacccccaaacagccaacaaaaccaaagaaataaattacttatcc CRISPR spacer gaccctcaaacatccaacaaaaccaaagaaataaattacttatcc Protospacer *****.****** ********************************
8. spacer 1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR matches to position: 507372-507416, mismatch: 2, identity: 0.956
gacccccaaacagccaacaaaaccaaagaaataaattacttatcc CRISPR spacer gaccctcaaacaggcaacaaaaccaaagaaataaattacttatcc Protospacer *****.******* *******************************
9. spacer 1.3|209104|45|NC_021236|PILER-CR matches to position: 847980-848024, mismatch: 2, identity: 0.956
gacccccaaacagccaacaaaaccaaagaaataaattacttatcc CRISPR spacer gaccctcaaacaggcaacaaaaccaaagaaataaattacttatcc Protospacer *****.******* *******************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_021236_3 | 3.2|489755|39|NC_021236|PILER-CR | 489755-489793 | 39 | NC_010856 | Candidatus Phytoplasma australiense plasmid pPASb11, complete sequence | 1493-1531 | 9 | 0.769 |
1. spacer 3.2|489755|39|NC_021236|PILER-CR matches to NC_010856 (Candidatus Phytoplasma australiense plasmid pPASb11, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.769
gaagtaaattgtttttccgtcggataagtaatttatttc CRISPR spacer ataataaattgtttttccgtcggatttgtaattggttcg Protospacer . *.********************* ****** .**.
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
135237 : 143260
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021236|135237:143260|DBSCAN-SWA TATGCAAACTCATAAAATAGATATTCTAGATGTAGCTACTTACTTAATAAACCACCAAAATAAAAATGATTATACACCTTTAAAACTTCAAAAATTAGTTTTTTTTGTATATGCTAAAAATTTAATAGATACTAACCAATCTATGTTTAATAATGATTTTGAATCTTGGCATTATGGTCCAGTTTCACCTAAATTATATACTAATTTACCAAAAGACCAAAAACCATTAAATTATCAACAAAAAATTAAAGAAAATTACGATCAAAACATTTTTTCCCAACAAGAAAAAGAAATTATGGATTATGTTATAGAAAAATATGGTCCTAAAACAGCTACCGAATTAGTAAATATAACACATAGACCAAATTCTCCTTGGGAAAGAAGTTATATATCGCAATATTTTGCTTTAAATAATATTCCTGATAAACTTATTCAAAATTATTATTCTCAAAGAAATAGAAAAGTATAATTTTATAACACAATAAAGGAGCAAATAACTATGCAAACTCATAAAATAGATATTCTAGATGTTGCAACTTATTTAGTAAAACACCAAAACAAAGATGATTTTACTCGTATGAAAATCCAAAAATTAGTATTTTTGACATATTGTAAATATTTACTTAAAGGTTTAGATTTTTTAATTAATGAATTAAAAGCGAGAATATAATATGAATAAAAATACTATTGCTGAAACTTTTGCTGGTGCTGGCGGTTCTCATTTAGGGTTTATTAATAATGGTTTCGTAAGCGTTTATATTAATGAATTTGAACCCAATTGTATTCAAACTTTGAAATTAAATTTTCCTTTATTAGAAAAAAAATGTTATATAGACCCAAGAGATATTAATGATATCTCAATTAATAAAATCTCAATTATAAATGTTGATGTTTTATTTGGTGGTATTGTTTGCAAAGGATTTAGTTTAGCAGGTCAAAGAAAACCCACCGATAAAAGAAATTATTTATATTTAAAACAATTAGAATTTGTTAACCATTTAAAACCTACAATTTCTATTATTGAAAATGTTCCTACTTTTTTAACTACTAAAATCTTAAAAAAGGAATTGATTCCTCAATTTGAAAAAGAAATTGATGATATTTGGCAAGAATACGCTCAACTTCAAGCCAAAAAAGGTAGCAAAAGAAAAAAGAATTTATCTCATGAATTAGAAAATAAACGTCTTTTGGAATTAAAAAACCTAAAAAACGATTTATTAAAAAAATTAGAAAAACAACAAGTTTTAATTTCTGTATTTGATGATATTAAAAATAAATACGATAAAATGGGTTATAAAGTTTACCATCAAGTATTAAATTCAGCTTGGTATGGTGCAGCTACTGCTAGAAATAGAGCTATTATAGTAGCAGTTAAAAAAGAAATAAAAAAAATTTTTACCTTTCCTAAAATCACTCATTTTCAAAAAGATAATCCATTAGGGAATATTAATGGAATGAGTTTTTGTGATAATTTACTCCCTTATACTACTGTAGAAGATGTTTTCAAAACCATTGATTATAATAATTTAGATGATTTAGATAATATACCGATGTCACACAATCCCAAAACTATTAAAAGATTTGGTTTTATCCCTGAGGGAAAAAATATTTCTCATATTATTGACCAATTACCAAATGAACTTAAAATTAGTAGTTTTTATTCTCGTGGAAGTGCTACTAGATTATCTAGACACAAACCATGCGGCACTTTGGTTCCAGGACATAGTGCTTTACCTATCCATCCTTGGTTGAATAGAAGCATCACAATAAGAGAAGCCGCTGCTTTAAGTGGATTTCCATTAAATTATAAATTTTATGGGAGCCATTCAAATAGGTGTGAACAAATAGGTAACGCAGTACCTATTTTACTATCTAATGCTATTGCTAAAAAAATAAAAAAATTTTTAAAAGAGGTAAAAAGTGAATGAAAACAAATTAACGGATTTAATTCTAAAAGATGATAATTTTAAAAAAAATTTTGCTCGTTTATTAAATATCGATGATTTTATAATTCAAAAAGAAGAAAAATTTATTAATAACATAAAAGCTGATTTTTGCTTTTATAATCATAAAAATAAAATTATAGCTATTTTAGAATGCAAAGGACAAGTGGGCATAACAGAATACATAAGAGGAGTTGGTCAAATTTTACAGTATCAAGGTTTTAAAGAAAATAATATTTTTGATAAATTTTTAAATGAAACAAAAGTAATTTTGGTAGTTCCTAGTTCTGTTTTCGGTAAGAAAAGTCACTTTAACCCAGCTAAAGTTTTTTATCCTAAAGAAACTGAATTAATACAACATTCCTATGTTTGAAAATGATTTTGAGGCTTGGGAAGAAGGTCCTATTTCATTGCCTTTATATTTAGAACAAATTAAATATCCCACCAAATTTGATAAAACAATAACATTTTCTCAAAAATACGATGAAAATAAATTTACCAAAGAACATATCCAAATAATGAATAGCATTTTAAAAAAACATGGTTCTAAACCATTAAGACAAATATATGATTTTATTCATAAAGAAAATGGTCCTTATAAAATAAGTTATAAAAAGAAAGATGTTTCACAAAACTCTATTTTAGATTCAACATTAAAACAGTGTTATTTATCTAAAAAGCATCTAATATAACAAAAATATAGGACAAATGTTAAATTTATCTTCAAGGCAAGTAGAAATTATCAAAACCAAAGCAATTGCTAAATTAAAAAAAATATATAAAAAAGGAAATAAATAATATGAATTGTAAAAAAAATACAACTACTTACTACAATATTGATGGTAAAACAATTTACGCCATTCACGAACATGATCCCGATACATTGAATTTTATTAAAACAACTTGGTTTAATAAAAATGGCAAAACAATTGACTTTATTACTGAATATGATCCTGAAACAGAAGAACCAATCAAAGAAACCTGGTACAACCCCGACAGGGAAACAATTGATTACATCAGAAAATACAACCCTCAAACAGGCAAAGAAACCAAACGAACTATTTACAACGACGACGAAAAAACAATTTACTCCATCACCGAATACGACCCTCAAACAGGGAATGAAACCAAAAAAACCTATTACAACTCCGATGGAACAATTAAAGAAGAAAAAACTTTTTAATTAAGATATAAACTAAACCCCTTTTTTGAAGGGGTATTTTTTATACCCAAATCACAAAAAAAAGGAGTTTGAAAGATGATTGAAGCCGAACGCGCATTATTAGGAGCACTATTATTAAATCCAGAAAAAATGGATGTTGTTATAAATTTAGTTAACACAAATGATTTTTCCAACCCCAAGCATCGTTATATCTTTGAGACAATGAAGCAATTAAAAATGCAAAATCGCGAAATTGATTATGTTACGGTTAGTTCCGTTTTAGATAACAATTTATACAAAATAGGAGGAACTGATTATTTAATTGAATTAGGAGGAGTGGAGGCGTCCCCTGCAATTGAATATTTAGAAACTTACATTGATTTAATCAAAGAAAATTCCCTTAAAAGAGATTTTTTAGGATTCATCAAACAACAACAAACCGCATTATCAAAAAGTAAAAATATTCACAATTTTTTTCAAGCAGTCAAAGACCAAGTAGAAAGTTTTATGCAAAAAACCAAATCTCCTTTTATTTCTACAAAAACATTAATTCCTGATATTCGCCAAAGTATTCTCAATGATGACAACCCCAACCAATTTATAGGAATAAAAACAGGCTTTAAAAATCTAGATGAATTAATTTCTGGTTTCAAGCCAAACCAATTAATTATCTTAGGAGCAAGAACTGCGATGGGAAAAACTGCTTTTATGCTTAATTTGGCTTGTAATATTGCAAAAAACTTTACTAGCAACAACAAAAACCAAAAAGCAGTTATTTTTAGTTTAGAAATGGCAGCGGAAGAATTAGGAATTAGGCTACTTTCTTCTGCTTCTCAAATCCCTTTAAAACAACTCCAACACAAAAACTTAACTAAAAATGAAAAATTACAGTTATTTATCGCTGATGACAAAATTACACAATTAAACATTTTAATTGATGATGATAGAAATAACAAAATGAAAGACATTGAAACCAAATGCCGTCAAATGAAATATGCTAAAGGACTTGATATTGTTTTTATTGATTACCTCCATTTATTAAGAAAAGAACAAAATGTTAATATATATCAAGAAATATCTGAAATTTCACGCAAATTAAAAAACCTAGCAAGTGAACTTAATATTCCAATTGTAGCTTTATCTCAATTATCAAGGGATCTTGAAAAAAGAGTAGACAAAAGGCCTGTTTTATCCGATTTAAGTAACTCAGGATCGATAGAACAAGACGCTGATGTTGTGATGTTATTGCACCGCGAAAGTTATTACCAAAAAGATGATAACAACCCACATACAAATTTAATTATTGCCAAAAACCGTAGCGGTCAATTAGGTGAATGTAGTTTTAATTTTTATAAACAAATCCAAAGATTTGAACAAAAAGAATAAAATAGGAGTAAAAAATGCAACAATTATCTAATTTAGATTTTAATAATATTAACGTTTTTAATCATAAATCTTTGTGCGTTAACATAACCAAACAAATAGTTCAACCAATTTTTTTCAACAAAGCTTTTAATCAGTATATGTTTGATTGCCATAATATACTCAATGAATATTTAACCAACAACCAACACAACTCTCAAAGTCAAAAATCAATTCGCGGAAAAATTAACGAATACTTAATTTTGCTTTATCTAAATCACAAAGGAATTAAATATTTATATCCTCAATCATATTTATTTTTCATCCCTGATATTAAATTTGATTTAGTATTGTTTAATAAAACAAAACGCATCATTGCCTTCAATTTCAAAACTTGCCTTAGAGATAGATACAAACAATCAATAGTAGAAGGGGAACAAATCAAAAAACTAGACACTCGTTTTGAATATTACTTATTAACAAATGATGAAGTCGAAACTCAAAGATTAAATAATAAAATTAAAAATGGTAAAGTACAATCAATTAACAAAGTAATCAATTTATTTTCCAATTCAGCTAATCTCTTCTTACAAAACTTACTAACCAACCAATTTATCCCTTTTTCACCTATTAATTTAATTAAAAAGATGGTTCGCTCTAATGACAAATAAATTAATTAGTTTTGAAGGTGTTGACGGAAGTGGTAAAACTACTTTAATTAACGAATTAAAAGCTTCTTTTGAAAATAAAGGCTATCAAATCAAAGTTTTTCAAGGTTTAGGCAGTTCCATTGTTGGAAAAGAAATCAGAAATTTATTTTTACATCAATCCAAAATAAGCCCTAAAACTAAATATTTACTTAGTCTTGCCAATATGATGCAAACCCAAGATGAATTAATAATCCCTGCTTTGTTGGGTGGTTATCTTGTTATAGTTGACCGTTGGTATGATTCTACTTTTGCTTATCAAAGCAAAGGCAATTACATGGATTATGATGATAAAATTACTTCAAAAATCATTAATCATTTCTTAATTAAACCTAAATTAACTTTTTACCTAGATATTGACCCTAAAATTGGGCTAAAACGAAAACAAACTCAACCAAATCATAAATTAGACCTCATTGAACAAAAACCCTTAAATTATTTTGAAAATGTCCGCAAACATTATTTAAACCAACATAAATACTATAAATACTGTAATGATGCAAATTGCAACCACAAAAATTGTAATCATTTTATGATTAACGCAACCAACTCGCAAAAAGAAAATTTAGCCCAAATAATGAAAATTTTAATCAACAAACAAATATTTTAATTAAAGGAGAAAAATAATTATGAATTATCAAAAAACTTTATATAGCCCAGATGGTAAAATAACCAAACAAATCCAATACTATTCCGACGGAAAAACAATAGATTACATTACCGAGTATGATCCCATAACAGAGGAACCAATCAAAGAAACTTTTTATTACCTTGACGGCAAAACAAAGAAATCTGTTGTTGAATATAGCCCAGATGGTAAAAAAACCAAATGGAACGAATACTACTCAGATGGGGAAACAATATATTACATCACTGAATATCACCCTGAAACAGAAGAAGTAATTAAACAAACAAATTATAATTCTGATGGTAAATTAACCACAGAAATTTTTTATAACGTCGATGGTGAAACAATTGATTACATCAGAAAATACAACCCCCAAATAAGTAAATTAATTAAATTTACTAAATACCGAGAAGATGGTGAAACAATTGACTATATTACAGAATTTAAGTACCATCCCAAAACAAACAAATTAATTAAAACAACTGGTTTTTCCTTCGATCGCAAAAGAATAGCTTTTATATACAAACACCATCCTAATGGTAAATTGTTTAAAAGAACTTACTACAACTCCGATGGAACAATCAATAAAAAAATAATTCAAATAAATAAAGGAGAATGAAAATGATTTTAACTCCCAAACACATTTTAATATTGTTAAGTATAACATATTTAGGATTTATCATAACAAATCTAATGACCTTATTTTTTGATTTTAATTTAGGAATTAAGGCTAATACTGCTATTAGTCTTGTTTCTGATGTTGTCTTTTTAATTTATATTTGGGTAAAGGAGTTTAATAATGAAAATACCATGGATAGGCAGTAAAAAGAAAATGTTACCCCAATTATTAAAATATATTCCAACAAATTATAACAATTATTATGAACCTTTTTTAGGAAGCGGGGCTTTATTCCAATCTCTTACTCCCTCAACTGTCACTTTGAACGATAATGATATCAATTTAATACAACTTTGGAAAGATATGTTGGCACAACCAGAATTGTTTTGCGATTATGTGCGTAAATTTAAAGACAAAATATATGTAAATAAAGATCAAAAGACGCAAAAAAAATCATTTAAACATTTGGTAGAAAAATTTAATAAAAGTAATTTGGGTGCTTATAAAAGTGCCCTTTTTTACGTTTTATTGAAATATGCTTTTCGGGGTATTTTCCGATATCGATCCGATGGAACTATTTATTTAGGATACAGTTTTTCATCTTGTTTCAAAAACCCTATAATTGTTTTATCAGAAATCCAAAGAATAAAAACCAATGTTAAGAATATAAAATTGTTAAATGGCGATTTTGAAAATGTCATTAACCAAGCCCAAAGCAACGATTTTATATTTGTTGATCCTCCGTATTGGCGTGAAGGGATTAAAGATAAATATTTTTATCAAAAACCTTTCACATTTGAAGATCACAAAAGACTTTATAAAAGTTTAGAAATGGCAAATTATCGCAAGGTAAAGTGGTTGTATACAAATTATAATTCGTCAAAAATAACTGAATTGTTTAAAAAATTTCACATTCAACCCATTCAAACCACTACAAAACACAATTTAACTTCAAAAGGGATATCGCAAGAAGTTATTATTAAAAATTATTAAAAAGAACAAATAATCAAAATTTTAATCAACAAATAAATATTTTAATTAAAGGAGAAAAATAATTATGAAAAAAGAATCTATTAATGTTTTTGATGTTGCAAATTATATTATTATAAAATTTAAAAACAACAACCAAAATTTAACTCACATGAAGCTACACAAATTAATTTATTTTTCTTATGTAAAATATTTAATTGAATACAAAAAAAGATTAATTTTAGAGCATCCAAAAGCCTGGAAATATGGACCTATTTTTGGAGAATTATATGTTGTTTTAAAAGATTATTTTGAAAAATCGATTGTAAAACCATTATGTGATGGGAGAAGTCAAAAAATAATAACCGACGAAAAAAGAAAGAAAAACATTGATGAAGTTTTGTTGTTATGCAAAGATAAAACTGGGAAGGAATTAGCTAATATTTCTCACCAACAATCCCCACAGGACGAAACATACCATTATTATCGTTACAAAAACAACAACAGCACAATTTCAGATGAAGATTTAAAAAACTTTTTTTCAAATCATAAACTTTTAGAAACAATCCACCAAGATGAATTAAAACAAAATTTTAATAAAAAATTTGGTATTTTCGGTAAAGACTGGTGGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021236|135237:143260|135907_137164_+|WP_015637715.1|DBSCAN-SWA MNKNTIAETFAGAGGSHLGFINNGFVSVYINEFEPNCIQTLKLNFPLLEKKCYIDPRDINDISINKISIINVDVLFGGIVCKGFSLAGQRKPTDKRNYLYLKQLEFVNHLKPTISIIENVPTFLTTKILKKELIPQFEKEIDDIWQEYAQLQAKKGSKRKKNLSHELENKRLLELKNLKNDLLKKLEKQQVLISVFDDIKNKYDKMGYKVYHQVLNSAWYGAATARNRAIIVAVKKEIKKIFTFPKITHFQKDNPLGNINGMSFCDNLLPYTTVEDVFKTIDYNNLDDLDNIPMSHNPKTIKRFGFIPEGKNISHIIDQLPNELKISSFYSRGSATRLSRHKPCGTLVPGHSALPIHPWLNRSITIREAAALSGFPLNYKFYGSHSNRCEQIGNAVPILLSNAIAKKIKKFLKEVKSE >NC_021236|135237:143260|142714_143260_+|WP_015637724.1|DBSCAN-SWA MKKESINVFDVANYIIIKFKNNNQNLTHMKLHKLIYFSYVKYLIEYKKRLILEHPKAWKYGPIFGELYVVLKDYFEKSIVKPLCDGRSQKIITDEKRKKNIDEVLLLCKDKTGKELANISHQQSPQDETYHYYRYKNNNSTISDEDLKNFFSNHKLLETIHQDELKQNFNKKFGIFGKDWW >NC_021236|135237:143260|141659_141863_+|WP_041784269.1|DBSCAN-SWA MILTPKHILILLSITYLGFIITNLMTLFFDFNLGIKANTAISLVSDVVFLIYIWVKEFNNENTMDRQ >NC_021236|135237:143260|141837_142650_+|WP_015637723.1|DBSCAN-SWA MKIPWIGSKKKMLPQLLKYIPTNYNNYYEPFLGSGALFQSLTPSTVTLNDNDINLIQLWKDMLAQPELFCDYVRKFKDKIYVNKDQKTQKKSFKHLVEKFNKSNLGAYKSALFYVLLKYAFRGIFRYRSDGTIYLGYSFSSCFKNPIIVLSEIQRIKTNVKNIKLLNGDFENVINQAQSNDFIFVDPPYWREGIKDKYFYQKPFTFEDHKRLYKSLEMANYRKVKWLYTNYNSSKITELFKKFHIQPIQTTTKHNLTSKGISQEVIIKNY >NC_021236|135237:143260|135735_135906_+|WP_015637714.1|DBSCAN-SWA MQTHKIDILDVATYLVKHQNKDDFTRMKIQKLVFLTYCKYLLKGLDFLINELKARI >NC_021236|135237:143260|135237_135705_+|WP_015637713.1|DBSCAN-SWA MQTHKIDILDVATYLINHQNKNDYTPLKLQKLVFFVYAKNLIDTNQSMFNNDFESWHYGPVSPKLYTNLPKDQKPLNYQQKIKENYDQNIFSQQEKEIMDYVIEKYGPKTATELVNITHRPNSPWERSYISQYFALNNIPDKLIQNYYSQRNRKV >NC_021236|135237:143260|139741_140374_+|WP_015637720.1|DBSCAN-SWA MQQLSNLDFNNINVFNHKSLCVNITKQIVQPIFFNKAFNQYMFDCHNILNEYLTNNQHNSQSQKSIRGKINEYLILLYLNHKGIKYLYPQSYLFFIPDIKFDLVLFNKTKRIIAFNFKTCLRDRYKQSIVEGEQIKKLDTRFEYYLLTNDEVETQRLNNKIKNGKVQSINKVINLFSNSANLFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVRSNDK >NC_021236|135237:143260|137544_137871_+|WP_015637717.1|DBSCAN-SWA MFENDFEAWEEGPISLPLYLEQIKYPTKFDKTITFSQKYDENKFTKEHIQIMNSILKKHGSKPLRQIYDFIHKENGPYKISYKKKDVSQNSILDSTLKQCYLSKKHLI >NC_021236|135237:143260|138437_139727_+|WP_015637719.1|DBSCAN-SWA MIEAERALLGALLLNPEKMDVVINLVNTNDFSNPKHRYIFETMKQLKMQNREIDYVTVSSVLDNNLYKIGGTDYLIELGGVEASPAIEYLETYIDLIKENSLKRDFLGFIKQQQTALSKSKNIHNFFQAVKDQVESFMQKTKSPFISTKTLIPDIRQSILNDDNPNQFIGIKTGFKNLDELISGFKPNQLIILGARTAMGKTAFMLNLACNIAKNFTSNNKNQKAVIFSLEMAAEELGIRLLSSASQIPLKQLQHKNLTKNEKLQLFIADDKITQLNILIDDDRNNKMKDIETKCRQMKYAKGLDIVFIDYLHLLRKEQNVNIYQEISEISRKLKNLASELNIPIVALSQLSRDLEKRVDKRPVLSDLSNSGSIEQDADVVMLLHRESYYQKDDNNPHTNLIIAKNRSGQLGECSFNFYKQIQRFEQKE >NC_021236|135237:143260|137978_138362_+|WP_015637718.1|DBSCAN-SWA MNCKKNTTTYYNIDGKTIYAIHEHDPDTLNFIKTTWFNKNGKTIDFITEYDPETEEPIKETWYNPDRETIDYIRKYNPQTGKETKRTIYNDDEKTIYSITEYDPQTGNETKKTYYNSDGTIKEEKTF >NC_021236|135237:143260|141039_141657_+|WP_015637722.1|DBSCAN-SWA MNYQKTLYSPDGKITKQIQYYSDGKTIDYITEYDPITEEPIKETFYYLDGKTKKSVVEYSPDGKKTKWNEYYSDGETIYYITEYHPETEEVIKQTNYNSDGKLTTEIFYNVDGETIDYIRKYNPQISKLIKFTKYREDGETIDYITEFKYHPKTNKLIKTTGFSFDRKRIAFIYKHHPNGKLFKRTYYNSDGTINKKIIQINKGE >NC_021236|135237:143260|140363_141020_+|WP_015637721.1|DBSCAN-SWA MTNKLISFEGVDGSGKTTLINELKASFENKGYQIKVFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLGGYLVIVDRWYDSTFAYQSKGNYMDYDDKITSKIINHFLIKPKLTFYLDIDPKIGLKRKQTQPNHKLDLIEQKPLNYFENVRKHYLNQHKYYKYCNDANCNHKNCNHFMINATNSQKENLAQIMKILINKQIF |
12 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
498735 : 506758
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021236|498735:506758|DBSCAN-SWA TATGCAAACTCATAAAATAGATATTCTAGATGTAGCTACTTACTTAATAAACCACCAAAATAAAAATGATTATACACCTTTAAAACTTCAAAAATTAGTTTTTTTTGTATATGCTAAAAATTTAATAGATACTAACCAATCTATGTTTAATAATGATTTTGAATCTTGGCATTATGGTCCAGTTTCACCTAAATTATATACTAATTTACCAAAAGACCAAAAACCATTAAATTATCAACAAAAAATTAAAGAAAATTACGATCAAAACATTTTTTCCCAACAAGAAAAAGAAATTATGGATTATGTTATAGAAAAATATGGTCCTAAAACAGCTACCGAATTAGTAAATATAACACATAGACCAAATTCTCCTTGGGAAAGAAGTTATATATCGCAATATTTTGCTTTAAATAATATTCCTGATAAACTTATTCAAAATTATTATTCTCAAAGAAATAGAAAAGTATAATTTTATAACACAATAAAGGAGCAAATAACTATGCAAACTCATAAAATAGATATTCTAGATGTTGCAACTTATTTAGTAAAACACCAAAACAAAGATGATTTTACTCGTATGAAAATCCAAAAATTAGTATTTTTGACATATTGTAAATATTTACTTAAAGGTTTAGATTTTTTAATTAATGAATTAAAAGCGAGAATATAATATGAATAAAAATACTATTGCTGAAACTTTTGCTGGTGCTGGCGGTTCTCATTTAGGGTTTATTAATAATGGTTTCGTAAGCGTTTATATTAATGAATTTGAACCCAATTGTATTCAAACTTTGAAATTAAATTTTCCTTTATTAGAAAAAAAATGTTATATAGACCCAAGAGATATTAATGATATCTCAATTAATAAAATCTCAATTATAAATGTTGATGTTTTATTTGGTGGTATTGTTTGCAAAGGATTTAGTTTAGCAGGTCAAAGAAAACCCACCGATAAAAGAAATTATTTATATTTAAAACAATTAGAATTTGTTAACCATTTAAAACCTACAATTTCTATTATTGAAAATGTTCCTACTTTTTTAACTACTAAAATCTTAAAAAAGGAATTGATTCCTCAATTTGAAAAAGAAATTGATGATATTTGGCAAGAATACGCTCAACTTCAAGCCAAAAAAGGTAGCAAAAGAAAAAAGAATTTATCTCATGAATTAGAAAATAAACGTCTTTTGGAATTAAAAAACCTAAAAAACGATTTATTAAAAAAATTAGAAAAACAACAAGTTTTAATTTCTGTATTTGATGATATTAAAAATAAATACGATAAAATGGGTTATAAAGTTTACCATCAAGTATTAAATTCAGCTTGGTATGGTGCAGCTACTGCTAGAAATAGAGCTATTATAGTAGCAGTTAAAAAAGAAATAAAAAAAATTTTTACCTTTCCTAAAATCACTCATTTTCAAAAAGATAATCCATTAGGGAATATTAATGGAATGAGTTTTTGTGATAATTTACTCCCTTATACTACTGTAGAAGATGTTTTCAAAACCATTGATTATAATAATTTAGATGATTTAGATAATATACCGATGTCACACAATCCCAAAACTATTAAAAGATTTGGTTTTATCCCTGAGGGAAAAAATATTTCTCATATTATTGACCAATTACCAAATGAACTTAAAATTAGTAGTTTTTATTCTCGTGGAAGTGCTACTAGATTATCTAGACACAAACCATGCGGCACTTTGGTTCCAGGACATAGTGCTTTACCTATCCATCCTTGGTTGAATAGAAGCATCACAATAAGAGAAGCCGCTGCTTTAAGTGGATTTCCATTAAATTATAAATTTTATGGGAGCCATTCAAATAGGTGTGAACAAATAGGTAACGCAGTACCTATTTTACTATCTAATGCTATTGCTAAAAAAATAAAAAAATTTTTAAAAGAGGTAAAAAGTGAATGAAAACAAATTAACGGATTTAATTCTAAAAGATGATAATTTTAAAAAAAATTTTGCTCGTTTATTAAATATCGATGATTTTATAATTCAAAAAGAAGAAAAATTTATTAATAACATAAAAGCTGATTTTTGCTTTTATAATCATAAAAATAAAATTATAGCTATTTTAGAATGCAAAGGACAAGTGGGCATAACAGAATACATAAGAGGAGTTGGTCAAATTTTACAGTATCAAGGTTTTAAAGAAAATAATATTTTTGATAAATTTTTAAATGAAACAAAAGTAATTTTGGTAGTTCCTAGTTCTGTTTTCGGTAAGAAAAGTCACTTTAACCCAGCTAAAGTTTTTTATCCTAAAGAAACTGAATTAATACAACATTCCTATGTTTGAAAATGATTTTGAGGCTTGGGAAGAAGGTCCTATTTCATTGCCTTTATATTTAGAACAAATTAAATATCCCACCAAATTTGATAAAACAATAACATTTTCTCAAAAATACGATGAAAATAAATTTACCAAAGAACATATCCAAATAATGAATAGCATTTTAAAAAAACATGGTTCTAAACCATTAAGACAAATATATGATTTTATTCATAAAGAAAATGGTCCTTATAAAATAAGTTATAAAAAGAAAGATGTTTCACAAAACTCTATTTTAGATTCAACATTAAAACAGTGTTATTTATCTAAAAAGCATCTAATATAACAAAAATATAGGACAAATGTTAAATTTATCTTCAAGGCAAGTAGAAATTATCAAAACCAAAGCAATTGCTAAATTAAAAAAAATATATAAAAAAGGAAATAAATAATATGAATTGTAAAAAAAATACAACTACTTACTACAATATTGATGGTAAAACAATTTACGCCATTCACGAACATGATCCCGATACATTGAATTTTATTAAAACAACTTGGTTTAATAAAAATGGCAAAACAATTGACTTTATTACTGAATATGATCCTGAAACAGAAGAACCAATCAAAGAAACCTGGTACAACCCCGACAGGGAAACAATTGATTACATCAGAAAATACAACCCTCAAACAGGCAAAGAAACCAAACGAACTATTTACAACGACGACGAAAAAACAATTTACTCCATCACCGAATACGACCCTCAAACAGGGAATGAAACCAAAAAAACCTATTACAACTCCGATGGAACAATTAAAGAAGAAAAAACTTTTTAATTAAGATATAAACTAAACCCCTTTTTTGAAGGGGTATTTTTTATACCCAAATCACAAAAAAAAGGAGTTTGAAAGATGATTGAAGCCGAACGCGCATTATTAGGAGCACTATTATTAAATCCAGAAAAAATGGATGTTGTTATAAATTTAGTTAACACAAATGATTTTTCCAACCCCAAGCATCGTTATATCTTTGAGACAATGAAGCAATTAAAAATGCAAAATCGCGAAATTGATTATGTTACGGTTAGTTCCGTTTTAGATAACAATTTATACAAAATAGGAGGAACTGATTATTTAATTGAATTAGGAGGAGTGGAGGCGTCCCCTGCAATTGAATATTTAGAAACTTACATTGATTTAATCAAAGAAAATTCCCTTAAAAGAGATTTTTTAGGATTCATCAAACAACAACAAACCGCATTATCAAAAAGTAAAAATATTCACAATTTTTTTCAAGCAGTCAAAGACCAAGTAGAAAGTTTTATGCAAAAAACCAAATCTCCTTTTATTTCTACAAAAACATTAATTCCTGATATTCGCCAAAGTATTCTCAATGATGACAACCCCAACCAATTTATAGGAATAAAAACAGGCTTTAAAAATCTAGATGAATTAATTTCTGGTTTCAAGCCAAACCAATTAATTATCTTAGGAGCAAGAACTGCGATGGGAAAAACTGCTTTTATGCTTAATTTGGCTTGTAATATTGCAAAAAACTTTACTAGCAACAACAAAAACCAAAAAGCAGTTATTTTTAGTTTAGAAATGGCAGCGGAAGAATTAGGAATTAGGCTACTTTCTTCTGCTTCTCAAATCCCTTTAAAACAACTCCAACACAAAAACTTAACTAAAAATGAAAAATTACAGTTATTTATCGCTGATGACAAAATTACACAATTAAACATTTTAATTGATGATGATAGAAATAACAAAATGAAAGACATTGAAACCAAATGCCGTCAAATGAAATATGCTAAAGGACTTGATATTGTTTTTATTGATTACCTCCATTTATTAAGAAAAGAACAAAATGTTAATATATATCAAGAAATATCTGAAATTTCACGCAAATTAAAAAACCTAGCAAGTGAACTTAATATTCCAATTGTAGCTTTATCTCAATTATCAAGGGATCTTGAAAAAAGAGTAGACAAAAGGCCTGTTTTATCCGATTTAAGTAACTCAGGATCGATAGAACAAGACGCTGATGTTGTGATGTTATTGCACCGCGAAAGTTATTACCAAAAAGATGATAACAACCCACATACAAATTTAATTATTGCCAAAAACCGTAGCGGTCAATTAGGTGAATGTAGTTTTAATTTTTATAAACAAATCCAAAGATTTGAACAAAAAGAATAAAATAGGAGTAAAAAATGCAACAATTATCTAATTTAGATTTTAATAATATTAACGTTTTTAATCATAAATCTTTGTGCGTTAACATAACCAAACAAATAGTTCAACCAATTTTTTTCAACAAAGCTTTTAATCAGTATATGTTTGATTGCCATAATATACTCAATGAATATTTAACCAACAACCAACACAACTCTCAAAGTCAAAAATCAATTCGCGGAAAAATTAACGAATACTTAATTTTGCTTTATCTAAATCACAAAGGAATTAAATATTTATATCCTCAATCATATTTATTTTTCATCCCTGATATTAAATTTGATTTAGTATTGTTTAATAAAACAAAACGCATCATTGCCTTCAATTTCAAAACTTGCCTTAGAGATAGATACAAACAATCAATAGTAGAAGGGGAACAAATCAAAAAACTAGACACTCGTTTTGAATATTACTTATTAACAAATGATGAAGTCGAAACTCAAAGATTAAATAATAAAATTAAAAATGGTAAAGTACAATCAATTAACAAAGTAATCAATTTATTTTCCAATTCAGCTAATCTCTTCTTACAAAACTTACTAACCAACCAATTTATCCCTTTTTCACCTATTAATTTAATTAAAAAGATGGTTCGCTCTAATGACAAATAAATTAATTAGTTTTGAAGGTGTTGACGGAAGTGGTAAAACTACTTTAATTAACGAATTAAAAGCTTCTTTTGAAAATAAAGGCTATCAAATCAAAGTTTTTCAAGGTTTAGGCAGTTCCATTGTTGGAAAAGAAATCAGAAATTTATTTTTACATCAATCCAAAATAAGCCCTAAAACTAAATATTTACTTAGTCTTGCCAATATGATGCAAACCCAAGATGAATTAATAATCCCTGCTTTGTTGGGTGGTTATCTTGTTATAGTTGACCGTTGGTATGATTCTACTTTTGCTTATCAAAGCAAAGGCAATTACATGGATTATGATGATAAAATTACTTCAAAAATCATTAATCATTTCTTAATTAAACCTAAATTAACTTTTTACCTAGATATTGACCCTAAAATTGGGCTAAAACGAAAACAAACTCAACCAAATCATAAATTAGACCTCATTGAACAAAAACCCTTAAATTATTTTGAAAATGTCCGCAAACATTATTTAAACCAACATAAATACTATAAATACTGTAATGATGCAAATTGCAACCACAAAAATTGTAATCATTTTATGATTAACGCAACCAACTCGCAAAAAGAAAATTTAGCCCAAATAATGAAAATTTTAATCAACAAACAAATATTTTAATTAAAGGAGAAAAATAATTATGAATTATCAAAAAACTTTATATAGCCCAGATGGTAAAATAACCAAACAAATCCAATACTATTCCGACGGAAAAACAATAGATTACATTACCGAGTATGATCCCATAACAGAGGAACCAATCAAAGAAACTTTTTATTACCTTGACGGCAAAACAAAGAAATCTGTTGTTGAATATAGCCCAGATGGTAAAAAAACCAAATGGAACGAATACTACTCAGATGGGGAAACAATATATTACATCACTGAATATCACCCTGAAACAGAAGAAGTAATTAAACAAACAAATTATAATTCTGATGGTAAATTAACCACAGAAATTTTTTATAACGTCGATGGTGAAACAATTGATTACATCAGAAAATACAACCCCCAAATAAGTAAATTAATTAAATTTACTAAATACCGAGAAGATGGTGAAACAATTGACTATATTACAGAATTTAAGTACCATCCCAAAACAAACAAATTAATTAAAACAACTGGTTTTTCCTTCGATCGCAAAAGAATAGCTTTTATATACAAACACCATCCTAATGGTAAATTGTTTAAAAGAACTTACTACAACTCCGATGGAACAATCAATAAAAAAATAATTCAAATAAATAAAGGAGAATGAAAATGATTTTAACTCCCAAACACATTTTAATATTGTTAAGTATAACATATTTAGGATTTATCATAACAAATCTAATGACCTTATTTTTTGATTTTAATTTAGGAATTAAGGCTAATACTGCTATTAGTCTTGTTTCTGATGTTGTCTTTTTAATTTATATTTGGGTAAAGGAGTTTAATAATGAAAATACCATGGATAGGCAGTAAAAAGAAAATGTTACCCCAATTATTAAAATATATTCCAACAAATTATAACAATTATTATGAACCTTTTTTAGGAAGCGGGGCTTTATTCCAATCTCTTACTCCCTCAACTGTCACTTTGAACGATAATGATATCAATTTAATACAACTTTGGAAAGATATGTTGGCACAACCAGAATTGTTTTGCGATTATGTGCGTAAATTTAAAGACAAAATATATGTAAATAAAGATCAAAAGACGCAAAAAAAATCATTTAAACATTTGGTAGAAAAATTTAATAAAAGTAATTTGGGTGCTTATAAAAGTGCCCTTTTTTACGTTTTATTGAAATATGCTTTTCGGGGTATTTTCCGATATCGATCCGATGGAACTATTTATTTAGGATACAGTTTTTCATCTTGTTTCAAAAACCCTATAATTGTTTTATCAGAAATCCAAAGAATAAAAACCAATGTTAAGAATATAAAATTGTTAAATGGCGATTTTGAAAATGTCATTAACCAAGCCCAAAGCAACGATTTTATATTTGTTGATCCTCCGTATTGGCGTGAAGGGATTAAAGATAAATATTTTTATCAAAAACCTTTCACATTTGAAGATCACAAAAGACTTTATAAAAGTTTAGAAATGGCAAATTATCGCAAGGTAAAGTGGTTGTATACAAATTATAATTCGTCAAAAATAACTGAATTGTTTAAAAAATTTCACATTCAACCCATTCAAACCACTACAAAACACAATTTAACTTCAAAAGGGATATCGCAAGAAGTTATTATTAAAAATTATTAAAAAGAACAAATAATCAAAATTTTAATCAACAAATAAATATTTTAATTAAAGGAGAAAAATAATTATGAAAAAAGAATCTATTAATGTTTTTGATGTTGCAAATTATATTATTATAAAATTTAAAAACAACAACCAAAATTTAACTCACATGAAGCTACACAAATTAATTTATTTTTCTTATGTAAAATATTTAATTGAATACAAAAAAAGATTAATTTTAGAGCATCCAAAAGCCTGGAAATATGGACCTATTTTTGGAGAATTATATGTTGTTTTAAAAGATTATTTTGAAAAATCGATTGTAAAACCATTATGTGATGGGAGAAGTCAAAAAATAATAACCGACGAAAAAAGAAAGAAAAACATTGATGAAGTTTTGTTGTTATGCAAAGATAAAACTGGGAAGGAATTAGCTAATATTTCTCACCAACAATCCCCACAGGACGAAACATACCATTATTATCGTTACAAAAACAACAACAGCACAATTTCAGATGAAGATTTAAAAAACTTTTTTTCAAATCATAAACTTTTAGAAACAATCCACCAAGATGAATTAAAACAAAATTTTAATAAAAAATTTGGTATTTTCGGTAAAGACTGGTGGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021236|498735:506758|501935_503225_+|WP_015637719.1|DBSCAN-SWA MIEAERALLGALLLNPEKMDVVINLVNTNDFSNPKHRYIFETMKQLKMQNREIDYVTVSSVLDNNLYKIGGTDYLIELGGVEASPAIEYLETYIDLIKENSLKRDFLGFIKQQQTALSKSKNIHNFFQAVKDQVESFMQKTKSPFISTKTLIPDIRQSILNDDNPNQFIGIKTGFKNLDELISGFKPNQLIILGARTAMGKTAFMLNLACNIAKNFTSNNKNQKAVIFSLEMAAEELGIRLLSSASQIPLKQLQHKNLTKNEKLQLFIADDKITQLNILIDDDRNNKMKDIETKCRQMKYAKGLDIVFIDYLHLLRKEQNVNIYQEISEISRKLKNLASELNIPIVALSQLSRDLEKRVDKRPVLSDLSNSGSIEQDADVVMLLHRESYYQKDDNNPHTNLIIAKNRSGQLGECSFNFYKQIQRFEQKE >NC_021236|498735:506758|505157_505361_+|WP_041784269.1|DBSCAN-SWA MILTPKHILILLSITYLGFIITNLMTLFFDFNLGIKANTAISLVSDVVFLIYIWVKEFNNENTMDRQ >NC_021236|498735:506758|499405_500662_+|WP_015637715.1|DBSCAN-SWA MNKNTIAETFAGAGGSHLGFINNGFVSVYINEFEPNCIQTLKLNFPLLEKKCYIDPRDINDISINKISIINVDVLFGGIVCKGFSLAGQRKPTDKRNYLYLKQLEFVNHLKPTISIIENVPTFLTTKILKKELIPQFEKEIDDIWQEYAQLQAKKGSKRKKNLSHELENKRLLELKNLKNDLLKKLEKQQVLISVFDDIKNKYDKMGYKVYHQVLNSAWYGAATARNRAIIVAVKKEIKKIFTFPKITHFQKDNPLGNINGMSFCDNLLPYTTVEDVFKTIDYNNLDDLDNIPMSHNPKTIKRFGFIPEGKNISHIIDQLPNELKISSFYSRGSATRLSRHKPCGTLVPGHSALPIHPWLNRSITIREAAALSGFPLNYKFYGSHSNRCEQIGNAVPILLSNAIAKKIKKFLKEVKSE >NC_021236|498735:506758|499233_499404_+|WP_015637714.1|DBSCAN-SWA MQTHKIDILDVATYLVKHQNKDDFTRMKIQKLVFLTYCKYLLKGLDFLINELKARI >NC_021236|498735:506758|506212_506758_+|WP_015637724.1|DBSCAN-SWA MKKESINVFDVANYIIIKFKNNNQNLTHMKLHKLIYFSYVKYLIEYKKRLILEHPKAWKYGPIFGELYVVLKDYFEKSIVKPLCDGRSQKIITDEKRKKNIDEVLLLCKDKTGKELANISHQQSPQDETYHYYRYKNNNSTISDEDLKNFFSNHKLLETIHQDELKQNFNKKFGIFGKDWW >NC_021236|498735:506758|505335_506148_+|WP_015637723.1|DBSCAN-SWA MKIPWIGSKKKMLPQLLKYIPTNYNNYYEPFLGSGALFQSLTPSTVTLNDNDINLIQLWKDMLAQPELFCDYVRKFKDKIYVNKDQKTQKKSFKHLVEKFNKSNLGAYKSALFYVLLKYAFRGIFRYRSDGTIYLGYSFSSCFKNPIIVLSEIQRIKTNVKNIKLLNGDFENVINQAQSNDFIFVDPPYWREGIKDKYFYQKPFTFEDHKRLYKSLEMANYRKVKWLYTNYNSSKITELFKKFHIQPIQTTTKHNLTSKGISQEVIIKNY >NC_021236|498735:506758|504537_505155_+|WP_015637722.1|DBSCAN-SWA MNYQKTLYSPDGKITKQIQYYSDGKTIDYITEYDPITEEPIKETFYYLDGKTKKSVVEYSPDGKKTKWNEYYSDGETIYYITEYHPETEEVIKQTNYNSDGKLTTEIFYNVDGETIDYIRKYNPQISKLIKFTKYREDGETIDYITEFKYHPKTNKLIKTTGFSFDRKRIAFIYKHHPNGKLFKRTYYNSDGTINKKIIQINKGE >NC_021236|498735:506758|501476_501860_+|WP_015637718.1|DBSCAN-SWA MNCKKNTTTYYNIDGKTIYAIHEHDPDTLNFIKTTWFNKNGKTIDFITEYDPETEEPIKETWYNPDRETIDYIRKYNPQTGKETKRTIYNDDEKTIYSITEYDPQTGNETKKTYYNSDGTIKEEKTF >NC_021236|498735:506758|498735_499203_+|WP_015637713.1|DBSCAN-SWA MQTHKIDILDVATYLINHQNKNDYTPLKLQKLVFFVYAKNLIDTNQSMFNNDFESWHYGPVSPKLYTNLPKDQKPLNYQQKIKENYDQNIFSQQEKEIMDYVIEKYGPKTATELVNITHRPNSPWERSYISQYFALNNIPDKLIQNYYSQRNRKV >NC_021236|498735:506758|503239_503872_+|WP_015637720.1|DBSCAN-SWA MQQLSNLDFNNINVFNHKSLCVNITKQIVQPIFFNKAFNQYMFDCHNILNEYLTNNQHNSQSQKSIRGKINEYLILLYLNHKGIKYLYPQSYLFFIPDIKFDLVLFNKTKRIIAFNFKTCLRDRYKQSIVEGEQIKKLDTRFEYYLLTNDEVETQRLNNKIKNGKVQSINKVINLFSNSANLFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVRSNDK >NC_021236|498735:506758|501042_501369_+|WP_015637717.1|DBSCAN-SWA MFENDFEAWEEGPISLPLYLEQIKYPTKFDKTITFSQKYDENKFTKEHIQIMNSILKKHGSKPLRQIYDFIHKENGPYKISYKKKDVSQNSILDSTLKQCYLSKKHLI >NC_021236|498735:506758|503861_504518_+|WP_015637721.1|DBSCAN-SWA MTNKLISFEGVDGSGKTTLINELKASFENKGYQIKVFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLGGYLVIVDRWYDSTFAYQSKGNYMDYDDKITSKIINHFLIKPKLTFYLDIDPKIGLKRKQTQPNHKLDLIEQKPLNYFENVRKHYLNQHKYYKYCNDANCNHKNCNHFMINATNSQKENLAQIMKILINKQIF |
12 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
588988 : 596894
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021236|588988:596894|DBSCAN-SWA TATGCAAACTCATAAAATAGATATTCTAGATGTAGCTACTTACTTAATAAACCACCAAAATAAAAATGATTATACACCTTTAAAACTTCAAAAATTAGTTTTTTTTGTATATGCTAAAAATTTAATAGATACTAACCAATCTATGTTTAATAATGATTTTGAATCTTGGGCTTATGGTCCAGTTTCACCTAAATTATATACTAATTTACCAAAAGACAAAAAACCATTAAATTATCAACAAAAAATTAAAGAAAATTATGATCAAAACATTTTTTCCCAACAAGAAAAAGAAATTATGGATTATGTTATAGAAAAATATGGTCCTAAAACAGCTACCGAATTAGTAAATATAACACATAGACCAAATTCTCCTTGGGAAAGAAGTTATATATCGCAATATTTTGCTTTAAATAATATTCCTGATAAACTTATTCAAAATTATTATTCTCAAAGAAATAGAAAAGTATAATTTTATAACACAATAAAGGAGCAAATAACTATGCAACCTAATAGGAGCAAAACCGATTTTATGTTAAAATTCATATTTTAATTTGTAAAAAAATAATATAATAATTAAAAAAAGAAAGTAGTTTAAAAAATGAAAAATGCAACTTCTTTTGATACATTTTTAAACATCAAAAATGTCAAAGGTTTAGATTTTTTAATTAATGAATTAAAAGCGAGAATATAATATGAATAAAAATACTATTGCTGAAACTTTTGCTGGTGCTGGCGGTTCTCATTTAGGGTTTATTAATAATGGTTTCGTAAGCGTTTATATTAATGAATTTGAACCCAATTGTATTCAAACTTTGAAATTAAATTTTCCTTTATTAGAAAAAAAATGTTATATAGACCCAAGAGATATTAATGATATCTCAATTAATAAAATCTCAATTATAAATGTTGATGTTTTATTTGGTGGTATTGTTTGCAAAGGATTTAGTTTAGCAGGTCAAAGAAAACCCACCGATAAAAGAAATTATTTATATTTAAAACAATTAGAATTTGTTAACCATTTAAAACCTACAATTTCTATTATTGAAAATGTTCCTACTTTTTTAACTACTAAAATCTTAAAAAAGGAATTGATTCCTCAATTTGAAAAAGAAATTGATGATATTTGGCAAGAATACGCTCAACTTCAAGCCAAAAAAGGTAGCAAAAGAAAAAAGAATTTATCTCATGAATTAGAAAATAAACGTCTTTTGGAATTAAAAAAACAAAAAAATGATTTATTAAAAAAATTAGAAAAACAACAAGTTTTAATTTCTGTATTTGATGATATTAAAAATAAATACGATAAAATGGGTTATAAAGTTTACCATCAAGTATTAAATTCAGCTTGGTATGGTGCAGCTACTGCTAGAAATAGAGCTATTATAGTAGCAGTTAAAAAAGAAATAAAAAAAATTTTTACCTTTCCTAAAATCACTCATTTTCAAAAAGATAATCCATTAGGGAATATTAATGGAATGAGTTTTTGTGATAATTTACTCCCTTATACTACTGTAGAAGATGTTTTCAAAACCATTGATTATAATAATTTAGATGATTTAGATAATATACCGATGTCACACAATCCCAAAACTATTAAAAGATTTGGTTTTATCCCTGAGGGAAAAAATATTTCTCATATTATTGACCAATTACCAAATGAACTTAAAATTAGTAGTTTTTATTCTCGTGGAAGTGCTACTAGATTATCTAGACACAAACCATGCGGCACTTTGGTTCCAGGACATAGTGCTTTACCTATCCATCCTTGGTTGAATAGAAGCATCACAATAAGAGAAGCCGCTGCTTTAAGTGGATTTCCATTAAATTATAAATTTTATGGGAGCCATTCAAATAGGTGTGAACAAATAGGTAACGCAGTACCTATTTTACTATCTAATGCTATTGCTAAAAAAATAAAAAAATTTTTAAAAGAGGTAAAAAGTGAATGAAAACAAATTAACGGATTTAATTCTAAAAGATGATAATTTTAAAAAAAATTTTGCTCGTTTATTAAATATCGATCTAATAAAATAGATATTCTAGATGTTGCAATTTATTTAGTAAAACACCAAAACAAAGATGATTTTACTCGTATGAAAATCCAAAAAATAGTATTTTTGACATATTGTAAATATTTACTTAAATACAACATTCCTATGTTTGAAAATGATTTTGAGGCTTGGGAAGAAGGTCCTATTTCATTGCCTTTATATTTAGAACAAATTAAATATCCCACCAAATTTGATAAAACAATAACATTTTCTCAAAAATACGATGAAAATAAATTTACCAAAGAACATATCCAAATAATGAATAGCATTTTAAAAAAACATGGTTCTAAAACATTAAGACAAATATATAATTTTATTCATAAAGAAAATGGTCCTTATAAAATAAGTTATAAAAAGAAAGATGTTTCACAAAACTCTATTTTAGATTCAACATTAAAACAATGTTATTTATCTAAAAAACATCTAATATAACAAAAATAATAAAAGAAATGTCAACTCAAAAAGTTATATTTCAATTTTGCGAAACAAAAAACATTATTTTATATTTATCTAAAACAAGAAATTTAACTTGTAATTACCAACAAATTTTAAATGATTTAGAACAAAAATTATTTTTGTAATTTTATAGGAATTGGTAATCCTAAAGAATAGATTTTAAAATAATATTTTAACTATTATTTATTCTTTTTTATCTCTTAAACCATTAAATTAACAAGTAAAAATTAACTAAAATATTCTTTCTTGCAACCCTTAGACTCTTCTAATCGAGAGTCTTTTTTTATGCAAAAAATCTAAAATCAAAAAGGATTTAAAAATACAAAAACAAAGCAAATATAATAACATAAATGAATAAATAACCCAAATCAAAAAAAAGGAGTTTGAAAGATGATTGAAGCCGAACGCGCATTATTAGGGACACTATTATTAAAACCAGAAAAAATGGATGCTGTTATAAATTCAGTCAACACAAACAATTTTTCCAACCCCAAACATCGTTATATCTTTGAGGCAATGAAACAACTAAAAATACAAAATCGCGAAATTGATTATGTTACGGTGGGTTCTGTTTTAGAAACTAACAATTTATACAAAACTAAATGGACTGATTATTTAATTGAATTAGTGGAGATGACCCCTGCAAGTGAATATTTAAAAACATACATTGATTTAATTACAGAAAATGCCCTTAAAAGAGATGTGTTAGGATTAATCAAACAATTACCAACCGCATTATCAAAAACTAAAAATATTCACAATTATTTGCAAGCAGTCAAAAACCAAGTAGAAAGTTTTATGCAAAAAACTAAATCTCCCTTCGTGTCTATAAAAATGTTAAGTCCTTATGTTTGCCAAAGTATTTTTAATGATGACAACCCCAACCAATTTATAGGAATAAAAACAGGCTTTAAAAATCTAGATGAATTAATTTCTGGTTTCAAACCAAAGGAATTAATTATCTTAGGAGCAAAAACTGGGATGGGAAAAACTGCTTTTATGTTAAATTTGGCTTGTAATATTGCAAAAAACTTTACTAGCAACCCAGAAAACCAAAAAGCAGTTATTTTTAGTTTAGAGATGGCAGCGGAACAATTAGCATTTAGGCTACTTTCTTCTGCTTCTAAAATCCCTTTAAAACAACTCCTACACAAAAAAATAAATAAAGATGAAAAATTACAGTTACTTATCGCTGATGACGAAATCACGCAATTAAACATTTTAATCGATGATGATAGAAATAACAAAATTAAAGATATTGAAACCAAATGCCGTCAAATGAAATATAATGAAGGACTTGATATTGTCTTTATTGATTATCTCCATTTATTAAAAGACGACCAAAGTTTTAATATATACCAAGCAATATCTGAAATTTCACGCAAATTAAAAAACCTAGCAAGTGAACTTAATATTCCAATTGTAGCTTTATCTCAATTTTCAAGGGATATTGAAAAAAGAGTAGACAAAAGGCCTGTTTTATCCGATTTAAGAGACTCAGGATCGATAGAACAAGACGCTGATATTGTGATGTTATTACACCGCGAAAGTTATTGGCAAAAACCTGATAACAACCCACATACGAATTTAATTATTGCCAAAAACCGTAGCGGTCAAAAGGGCGAATGTAATTTTAATTTTTTTCAAGAAATCCAAAGATTTGAAGCAAAAGAATAAGAATAAAAAAAGGAAAGAAAAAAATGAAAAAATTAACTAATCTAGATTTTGAAAATATTAACGTTTTTAATCATAAATCTTTGTGCGTTAACATCACCAAACAAATAGTTCAACCAATTTTTTTCAACAAAGTTTTTAATCAGTATATGTTTGATTGTCATAATATACTCAATGCATATTTAACCAACAACCAACACAACTCCCAAAGTCAAAAATCAATTAGAGGTAAAATTAACGAATACTTAATTTTGCTTTATCTAAATCAAAAAGGAATTAAATATTTATACCCTCAATCATGTTTATTTTTCATCCCCGATATCAAATTTGATTTAGTGTTGTTTACCAAAACTAAACGCATCATTGCTTTCAATTTCAAAACTTGCCTTAGAGATAGATACAAACAATCAATAGTAGAAGGACAACAACTAAAAAAACTAGACACTCGTTTTGGGTTTTATTTGTTAACAAATGATGAATCCGAAACTCAAAGATTAAATAATAAAATTAAAAATGGTAAAGTACAATCAATTAACAAAGTAATCAATTTATTTTCCAATTCAGCTAATCTCTTTTTACAAAACTTACTAACCAACCAATTCATTCCCTTTTCACCTATTAATTTAATTAAAAAGATGGTTCACCCTAATGACAAATAAATTAATTAGTTTTGAAGGTGTTGACGGAAGTGGCAAAACTACTTTAATTAATGAATTAAAAAAATATTTTGAAAATAAAGGCTATCAAATCAAAGTTTTTCAAGGTTTAGGCAGTTCCATCGTTGGAAAAGAAATCAGAAATTTATTTTTACATCAATCCAAAATAAGCCCTAAAACTAAATATTTATTAAGCCTTGCCAATATGATGCAAACTCAAGATGAATTAATAATCCCTGCTTTATTAAGTGGTTATCTTGTTATAGTTGACCGTTGGTATGATTCCACTTTCGCATATCAAAGCAAAGGCAATTACATAGATTATGATGATAAAATTACTTCAAAAATTATCAATCATTTCTTAATTAAACCTAAATTAACTTTTTACCTAGATATTGACCCTCAAATTGGGATACAACGAAAACAAACCCAAACAAATCATAAATTAGACCTCATTGAACAAAAACCCTTAAATTATTTTGAAAATGTCCGCAAACATTATTTAAACCAACATAAATACTGTAATGATGCAAATTGCAACCACAAAAATTGTAATTATTTTATGATTAACGCAACCAACTCGCAAAAAGAAAATTTAGCCCAAATAATGAAAATTTTAATCAACAAATAAATATTTTAATTAAAGGAGAAAAATAATTATGAATTATCAAAAAACTTTTTACGACGACGATGGTAAAACAATTGAATTTATTAATGAATATAACGCTAAAAAAAGTAAATGAAACAAATACATTGAAAATTAGAAAGGAGAAAGTGTTATGAGTGTCATATTTTGGACTTGTTTATTTGTCATTTTTTATCTCTCATTTTGTGGATAAAATAATTGATTATATTTTTTCAGATGAATTTATTTTATTGATTCTTAGGATATCAACAACATTTTTATAAAATTATTAAAACTTTAATTAGTAAAAAAATAATTCAAATAAATAAAGGAGAATAAAAATGATTTTAACTCCCAAACACATTTTAATATTGTTAAGTATAACATATTTAGGATTTATCATAACAAATCTAATGACCTTATTTTTTGATTTTAATTTAGGAATCAAAGCAAATACAGCTATTAGTCTTGTTTCTGATGTTGTCTTTTTGATTTATATTTGGGTAAAGGAGTTTAATAATGAAAATACCATGGATAGGCAGTAAAAAGAAAATGTTGCCTCAATTATTAAAATATATTCCAACAAATTATAACAATTATTATGAACCCTTTTTAGGAAGTGGGGCTTTATTCCAATCTCTTACTCCCTCAACTGTCACCTTGAACGATAATGATATCAATTTAATACAACTTTGGAAAGATATGTTGGCACAACCAGAATTGTTTTGCGATTATGTGCGTAAATTTAAAGACAAAATATATGTAAATAAAGATCAAAAGACGCAAAAAGAATCATTTAAACATTTGGTAGAAAAATTTAATAAAAGTAATTTGGGTGCTTATAAAAGTGCCCTTTTTTACGTTTTATTGAAATATGCTTTTCGGGGCATTTTCCGATATCGATCCGACGGAACTATTTATTTAGGATACCGTTTTTCATCTCGTTTCAAAAACCCTATAATTGATTTATTAGAAATACAAAGAATAAAAACCAATGTTAAGAATATAAAATTGTTAAATGGCGATTTTGAAAGTGTCATTAACCAAACCCAAAGCAACGATTTTATATTTGTTGATCCTCCGTATTGGCGTGAAGGGATTAAAGATAAAGTCTTTTATCAAAAACCTTTCACATTTGAAGATCACAAAAGACTTTATAAAAGTTTAGAGATGGCAAATTATCGCAAGGTAAAGTGGTTGTATACAAATTATAATTCGTCAAAAATAACTGAATTGTTTAAAAAATTTCACATTCAACCCATTCAAACCACTACAAAACACAATTTAACTTCAAAAGGGATATCGCAAGAAGTTATTATTAAAAATTATTAAAAAGAACAAATAATCAAAATTTTAATCAACAAATAAATATTTTAATTAAAGGAGAAAAATAATTATGAAAAAAGAATCTATTAATGTTTTTGATGTTGCAAATTATATTATTATAAAATTTAAAAACAACAACCAAAATTTAACTCACATGAAGCTACACAAATTAATTTATTTTTCTTATGTAAAATATTTAATTGAATACAAAAAAAGATTAATTTTAGAGCATCCAAAAGCCTGGAAATATGGACCTATTTTTGGAGAATTATATGTTGTTTTAAAAGATTATTTTGAAAAATCGATTGTAAAACCATTATGTGATGGGAGAAGTCAAAAAATAATAACCGACGAAAAAAGAAAGAAAAACATTGATGAAGTTTTGTTGTTATGCAAAGATAAAACTGGGAAGGAATTAGCTAATATTTCTCACCAACAATCCCCACAGGACGAAACATACCATTATTATCGTTACAAAAACAACAACAGCACAATTTCAGATGAAGATTTAAAAAACTTTTTTTCAAATCATAAACTTTTAGAAACAATCCACCAAGATGAATTAAAACAAAATTTTAATAAAAAATTTGGTATTTTCGGTAAAGACTGGTGGTAAAAAAATCAAAAAGGAAAATAAATAAAATGAACCAAACAAAACAAATTAACGTTTTTGACGTTGCCCTTTATATCGTCAAAAACAACCCTTCTTCAACTACTAAAATGAAACTGAATAAAATGATTTATTACGCTCATGCCAAACATCTAGTACAAACCAAAAAACCTCTTTTAAAAGAGCAAATACAAGCCTGGATTTATGGTCCTGTCTTTCCTGAATTATGCAAGCAATTAAAAGATTTTACTTATCAACCAATAAATCCCGAAGTTTTAGCAATGGGAGATATAACTAAAATAAATGCAACTCAAAAACAAATCCTTGATTTTATGATTTGGTTATACGGCGATGCATCACCTAATGATTTATCTTCTCAAACTCACATGGAGCACCCATGGATAAAAAGTTATTACAAAGATTATGATTCTGGTTGGTCTAAAAAGATTATTAAAAACAAAGACATTTTAGAATATTTCTCTGAAAACAATAAAAATATAGGAGCATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021236|588988:596894|593194_593827_+|WP_015638109.1|DBSCAN-SWA MKKLTNLDFENINVFNHKSLCVNITKQIVQPIFFNKVFNQYMFDCHNILNAYLTNNQHNSQSQKSIRGKINEYLILLYLNQKGIKYLYPQSCLFFIPDIKFDLVLFTKTKRIIAFNFKTCLRDRYKQSIVEGQQLKKLDTRFGFYLLTNDESETQRLNNKIKNGKVQSINKVINLFSNSANLFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVHPNDK >NC_021236|588988:596894|589679_590936_+|WP_015638065.1|DBSCAN-SWA MNKNTIAETFAGAGGSHLGFINNGFVSVYINEFEPNCIQTLKLNFPLLEKKCYIDPRDINDISINKISIINVDVLFGGIVCKGFSLAGQRKPTDKRNYLYLKQLEFVNHLKPTISIIENVPTFLTTKILKKELIPQFEKEIDDIWQEYAQLQAKKGSKRKKNLSHELENKRLLELKKQKNDLLKKLEKQQVLISVFDDIKNKYDKMGYKVYHQVLNSAWYGAATARNRAIIVAVKKEIKKIFTFPKITHFQKDNPLGNINGMSFCDNLLPYTTVEDVFKTIDYNNLDDLDNIPMSHNPKTIKRFGFIPEGKNISHIIDQLPNELKISSFYSRGSATRLSRHKPCGTLVPGHSALPIHPWLNRSITIREAAALSGFPLNYKFYGSHSNRCEQIGNAVPILLSNAIAKKIKKFLKEVKSE >NC_021236|588988:596894|594968_595781_+|WP_015638110.1|DBSCAN-SWA MKIPWIGSKKKMLPQLLKYIPTNYNNYYEPFLGSGALFQSLTPSTVTLNDNDINLIQLWKDMLAQPELFCDYVRKFKDKIYVNKDQKTQKESFKHLVEKFNKSNLGAYKSALFYVLLKYAFRGIFRYRSDGTIYLGYRFSSRFKNPIIDLLEIQRIKTNVKNIKLLNGDFESVINQTQSNDFIFVDPPYWREGIKDKVFYQKPFTFEDHKRLYKSLEMANYRKVKWLYTNYNSSKITELFKKFHIQPIQTTTKHNLTSKGISQEVIIKNY >NC_021236|588988:596894|596417_596894_+|WP_041784358.1|DBSCAN-SWA MNQTKQINVFDVALYIVKNNPSSTTKMKLNKMIYYAHAKHLVQTKKPLLKEQIQAWIYGPVFPELCKQLKDFTYQPINPEVLAMGDITKINATQKQILDFMIWLYGDASPNDLSSQTHMEHPWIKSYYKDYDSGWSKKIIKNKDILEYFSENNKNIGA >NC_021236|588988:596894|594483_594567_+|WP_148284457.1|DBSCAN-SWA MNYQKTFYDDDGKTIEFINEYNAKKSK >NC_021236|588988:596894|594790_594994_+|WP_041784269.1|DBSCAN-SWA MILTPKHILILLSITYLGFIITNLMTLFFDFNLGIKANTAISLVSDVVFLIYIWVKEFNNENTMDRQ >NC_021236|588988:596894|595845_596391_+|WP_015637724.1|DBSCAN-SWA MKKESINVFDVANYIIIKFKNNNQNLTHMKLHKLIYFSYVKYLIEYKKRLILEHPKAWKYGPIFGELYVVLKDYFEKSIVKPLCDGRSQKIITDEKRKKNIDEVLLLCKDKTGKELANISHQQSPQDETYHYYRYKNNNSTISDEDLKNFFSNHKLLETIHQDELKQNFNKKFGIFGKDWW >NC_021236|588988:596894|590996_591470_+|WP_041784355.1|DBSCAN-SWA MKYRSNKIDILDVAIYLVKHQNKDDFTRMKIQKIVFLTYCKYLLKYNIPMFENDFEAWEEGPISLPLYLEQIKYPTKFDKTITFSQKYDENKFTKEHIQIMNSILKKHGSKTLRQIYNFIHKENGPYKISYKKKDVSQNSILDSTLKQCYLSKKHLI >NC_021236|588988:596894|588988_589456_+|WP_041784353.1|DBSCAN-SWA MQTHKIDILDVATYLINHQNKNDYTPLKLQKLVFFVYAKNLIDTNQSMFNNDFESWAYGPVSPKLYTNLPKDKKPLNYQQKIKENYDQNIFSQQEKEIMDYVIEKYGPKTATELVNITHRPNSPWERSYISQYFALNNIPDKLIQNYYSQRNRKV >NC_021236|588988:596894|591884_593171_+|WP_015638108.1|DBSCAN-SWA MIEAERALLGTLLLKPEKMDAVINSVNTNNFSNPKHRYIFEAMKQLKIQNREIDYVTVGSVLETNNLYKTKWTDYLIELVEMTPASEYLKTYIDLITENALKRDVLGLIKQLPTALSKTKNIHNYLQAVKNQVESFMQKTKSPFVSIKMLSPYVCQSIFNDDNPNQFIGIKTGFKNLDELISGFKPKELIILGAKTGMGKTAFMLNLACNIAKNFTSNPENQKAVIFSLEMAAEQLAFRLLSSASKIPLKQLLHKKINKDEKLQLLIADDEITQLNILIDDDRNNKIKDIETKCRQMKYNEGLDIVFIDYLHLLKDDQSFNIYQAISEISRKLKNLASELNIPIVALSQFSRDIEKRVDKRPVLSDLRDSGSIEQDADIVMLLHRESYWQKPDNNPHTNLIIAKNRSGQKGECNFNFFQEIQRFEAKE >NC_021236|588988:596894|593816_594455_+|WP_015638061.1|DBSCAN-SWA MTNKLISFEGVDGSGKTTLINELKKYFENKGYQIKVFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLSGYLVIVDRWYDSTFAYQSKGNYIDYDDKITSKIINHFLIKPKLTFYLDIDPQIGIQRKQTQTNHKLDLIEQKPLNYFENVRKHYLNQHKYCNDANCNHKNCNYFMINATNSQKENLAQIMKILINK |
11 | Salmonella_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
820409 : 828315
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021236|820409:828315|DBSCAN-SWA TATGCAAACTCATAAAATAGATATTCTAGATGTAGCTACTTACTTAATAAACCACCAAAATAAAAATGATTATACACCTTTAAAACTTCAAAAATTAGTTTTTTTTGTATATGCTAAAAATTTAATAGATACTAACCAATCTATGTTTAATAATGATTTTGAATCTTGGGCTTATGGTCCAGTTTCACCTAAATTATATACTAATTTACCAAAAGACAAAAAACCATTAAATTATCAACAAAAAATTAAAGAAAATTATGATCAAAACATTTTTTCCCAACAAGAAAAAGAAATTATGGATTATGTTATAGAAAAATATGATCCTAAAACAGCTACCGAATTAGTAAATATAACACATAGACCAAATTCTCCTTGGGAAAGAAGTTATATATCGCAATATTTTGCTTTAAATAATATTCCTGATAAACTTATTCAAAATTATTATTCTCAAAGAAATAGAAAAGTATAATTTTATAACACAATAAAGGAGCAAATAACTATGCAACCTAATAGGAGCAAAACCGATTTTATGTTAAAATTCATATTTTAATTTGTAAAAAAATAATATAATAATTAAAAAAAGAAAGTAGTTTAAAAAATGAAAAATGCAACTTCTTTTGATACATTTTTAAACATCAAAAATGTCAAAGGTTTAGATTTTTTAATTAATGAATTAAAAGCGAGAATATAATATGAATAAAAATACTATTGCTGAAACTTTTGCTGGTGCTGGCGGTTCTCATTTAGGGTTTATTAATAATGGTTTCGTAAGCGTTTATATTAATGAATTTGAACCCAATTGTATTCAAACTTTGAAATTAAATTTTCCTTTATTAGAAAAAAAATGTTATATAGACCCAAGAGATATTAATGATATCTCAATTAATAAAATCTCAATTATAAATGTTGATGTTTTATTTGGTGGTATTGTTTGCAAAGGATTTAGTTTAGCAGGTCAAAGAAAACCCACCGATAAAAGAAATTATTTATATTTAAAACAATTAGAATTTGTTAACCATTTAAAACCTACAATTTCTATTATTGAAAATGTTCCTACTTTTTTAACTACTAAAATCTTAAAAAAGGAATTGATTCCTCAATTTGAAAAAGAAATTGATGATATTTGGCAAGAATACGCTCAACTTCAAGCCAAAAAAGGTAGCAAAAGAAAAAAGAATTTATCTCATGAATTAGAAAATAAACGTCTTTTGGAATTAAAAAAACAAAAAAATGATTTATTAAAAAAATTAGAAAAACAACAAGTTTTAATTTCTGTATTTGATGATATTAAAAATAAATACGATAAAATGGGTTATAAAGTTTACCATCAAGTATTAAATTCAGCTTGGTATGGTGCAGCTACTGCTAGAAATAGAGCTATTATAGTAGCAGTTAAAAAAGAAATAAAAAAAATTTTTACCTTTCCTAAAATCACTCATTTTCAAAAAGATAATCCATTAGGGAATATTAATGGAATGAGTTTTTGTGATAATTTACTCCCTTATACTACTGTAGAAGATGTTTTCAAAACCATTGATTATAATAATTTAGATGATTTAGATAATATACCGATGTCACACAATCCCAAAACTATTAAAAGATTTGGTTTTATCCCTGAGGGAAAAAATATTTCTCATATTATTGACCAATTACCAAATGAACTTAAAATTAGTAGTTTTTATTCTCGTGGAAGTGCTACTAGATTATCTAGACACAAACCATGCGGCACTTTGGTTCCAGGACATAGTGCTTTACCTATCCATCCTTGGTTGAATAGAAGCATCACAATAAGAGAAGCCGCTGCTTTAAGTGGATTTCCATTAAATTATAAATTTTATGGGAGCCATTCAAATAGGTGTGAACAAATAGGTAACGCAGTACCTATTTTACTATCTAATGCTATTGCTAAAAAAATAAAAAAATTTTTAAAAGAGGTAAAAAGTGAATGAAAACAAATTAACGGATTTAATTCTAAAAGATGATAATTTTAAAAAAAATTTTGCTCGTTTATTAAATATCGATCTAATAAAATAGATATTCTAGATGTTGCAATTTATTTAGTAAAACACCAAAACAAAGATGATTTTACTCGTATGAAAATCCAAAAAATAGTATTTTTGACATATTGTAAATATTTACTTAAATACAACATTCCTATGTTTGAAAATGATTTTGAGGCTTGGGAAGAAGGTCCTATTTCATTGCCTTTATATTTAGAACAAATTAAATATCCCACCAAATTTGATAAAACAATAACATTTTCTCAAAAATACGATGAAAATAAATTTACCAAAGAACATATCCAAATAATGAATAGCATTTTAAAAAAACATGGTTCTAAAACATTAAGACAAATATATAATTTTATTCATAAAGAAAATGGTCCTTATAAAATAAGTTATAAAAAGAAAGATGTTTCACAAAACTCTATTTTAGATTCAACATTAAAACAATGTTATTTATCTAAAAAACATCTAATATAACAAAAATAATAAAAGAAATGTCAACTCAAAAAGTTATATTTCAATTTTGCGAAACAAAAAACATTATTTTATATTTATCTAAAACAAGAAATTTAACTTGTAATTACCAACAAATTTTAAATGATTTAGAACAAAAATTATTTTTGTAATTTTATAGGAATTGGTAATCCTAAAGAATAGATTTTAAAATAATATTTTAACTATTATTTATTCTTTTTTATCTCTTAAACCATTAAATTAACAAGTAAAAATTAACTAAAATATTCTTTCTTGCAACCCTTAGACTCTTCTAATCGAGAGTCTTTTTTTATGCAAAAAATCTAAAATCAAAAAGGATTTAAAAATACAAAAACAAAGCAAATATAATAACATAAATGAATAAATAACCCAAATCAAAAAAAAGGAGTTTGAAAGATGATTGAAGCCGAACGCGCATTATTAGGGACACTATTATTAAAACCAGAAAAAATGGATGCTGTTATAAATTCAGTCAACACAAACAATTTTTCCAACCCCAAACATCGTTATATCTTTGAGGCAATGAAACAACTAAAAATACAAAATCGCGAAATTGATTATGTTACGGTGGGTTCTGTTTTAGAAACTAACAATTTATACAAAACTAAATGGACTGATTATTTAATTGAATTAGTGGAGATGACCCCTGCAAGTGAATATTTAAAAACATACATTGATTTAATTACAGAAAATGCCCTTAAAAGAGATGTGTTAGGATTAATCAAACAATTACCAACCGCATTATCAAAAACTAAAAATATTCACAATTATTTGCAAGCAGTCAAAAACCAAGTAGAAAGTTTTATGCAAAAAACTAAATCTCCCTTCGTGTCTATAAAAATGTTAAGTCCTTATGTTTGCCAAAGTATTTTTAATGATGACAACCCCAACCAATTTATAGGAATAAAAACAGGCTTTAAAAATCTAGATGAATTAATTTCTGGTTTCAAACCAAAGGAATTAATTATCTTAGGAGCAAAAACTGGGATGGGAAAAACTGCTTTTATGTTAAATTTGGCTTGTAATATTGCAAAAAACTTTACTAGCAACCCAGAAAACCAAAAAGCAGTTATTTTTAGTTTAGAGATGGCAGCGGAACAATTAGCATTTAGGCTACTTTCTTCTGCTTCTAAAATCCCTTTAAAACAACTCCTACACAAAAAAATAAATAAAGATGAAAAATTACAGTTACTTATCGCTGATGACGAAATCACGCAATTAAACATTTTAATCGATGATGATAGAAATAACAAAATTAAAGATATTGAAACCAAATGCCGTCAAATGAAATATAATGAAGGACTTGATATTGTCTTTATTGATTATCTCCATTTATTAAAAGACGACCAAAGTTTTAATATATACCAAGCAATATCTGAAATTTCACGCAAATTAAAAAACCTAGCAAGTGAACTTAATATTCCAATTGTAGCTTTATCTCAATTTTCAAGGGATATTGAAAAAAGAGTAGACAAAAGGCCTGTTTTATCCGATTTAAGAGACTCAGGATCGATAGAACAAGACGCTGATATTGTGATGTTATTACACCGCGAAAGTTATTGGCAAAAACCTGATAACAACCCACATACGAATTTAATTATTGCCAAAAACCGTAGCGGTCAAAAGGGCGAATGTAATTTTAATTTTTTTCAAGAAATCCAAAGATTTGAAGCAAAAGAATAAGAATAAAAAAAGAAAAGAAAAAAATGAAAAAATTAACTAATCTAGATTTTGAAAATATTAACGTTTTTAATCATAAATCTTTGTGCGTTAACATCACCAAACAAATAGTTCAACCAATTTTTTTCAACAAAGTTTTTAATCAGTATATGTTTGATTGTCATAATATACTCAATGCATATTTAACCAACAACCAACACAACTCCCAAAGTCAAAAATCAATTAGAGGTAAAATTAACGAATACTTAATTTTGCTTTATCTAAATCAAAAAGGAATTAAATATTTATACCCTCAATCATGTTTATTTTTCATCCCCGATATCAAATTTGATTTAGTGTTGTTTACCAAAACTAAACGCATCATTGCTTTCAATTTCAAAACTTGCCTTAGAGATAGATACAAACAATCAATAGTAGAAGGACAACAACTAAAAAAACTAGACACTCGTTTTGGGTTTTATTTGTTAACAAATGATGAATCCGAAACTCAAAGATTAAATAATAAAATTAAAAATGGTAAAGTACAATCAATTAACAAAGTAATCAATTTATTTTCCAATTCAGCTAATCTCTTTTTACAAAACTTACTAACCAACCAATTCATTCCCTTTTCACCTATTAATTTAATTAAAAAGATGGTTCACCCTAATGACAAATAAATTAATTAGTTTTGAAGGTGTTGACGGAAGTGGCAAAACTACTTTAATTAATGAATTAAAAAAATATTTTGAAAATAAAGGCTATCAAATCAAAGTTTTTCAAGGTTTAGGCAGTTCCATCGTTGGAAAAGAAATCAGAAATTTATTTTTACATCAATCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021236|820409:828315|824615_825248_+|WP_015638109.1|DBSCAN-SWA MKKLTNLDFENINVFNHKSLCVNITKQIVQPIFFNKVFNQYMFDCHNILNAYLTNNQHNSQSQKSIRGKINEYLILLYLNQKGIKYLYPQSCLFFIPDIKFDLVLFTKTKRIIAFNFKTCLRDRYKQSIVEGQQLKKLDTRFGFYLLTNDESETQRLNNKIKNGKVQSINKVINLFSNSANLFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVHPNDK >NC_021236|820409:828315|827266_827812_+|WP_015637724.1|DBSCAN-SWA MKKESINVFDVANYIIIKFKNNNQNLTHMKLHKLIYFSYVKYLIEYKKRLILEHPKAWKYGPIFGELYVVLKDYFEKSIVKPLCDGRSQKIITDEKRKKNIDEVLLLCKDKTGKELANISHQQSPQDETYHYYRYKNNNSTISDEDLKNFFSNHKLLETIHQDELKQNFNKKFGIFGKDWW >NC_021236|820409:828315|826211_826415_+|WP_041784269.1|DBSCAN-SWA MILTPKHILILLSITYLGFIITNLMTLFFDFNLGIKANTAISLVSDVVFLIYIWVKEFNNENTMDRQ >NC_021236|820409:828315|822417_822891_+|WP_041784355.1|DBSCAN-SWA MKYRSNKIDILDVAIYLVKHQNKDDFTRMKIQKIVFLTYCKYLLKYNIPMFENDFEAWEEGPISLPLYLEQIKYPTKFDKTITFSQKYDENKFTKEHIQIMNSILKKHGSKTLRQIYNFIHKENGPYKISYKKKDVSQNSILDSTLKQCYLSKKHLI >NC_021236|820409:828315|825904_825988_+|WP_148284457.1|DBSCAN-SWA MNYQKTFYDDDGKTIEFINEYNAKKSK >NC_021236|820409:828315|826389_827202_+|WP_015638276.1|DBSCAN-SWA MKIPWIGSKKKMLPQLLKYIPTNYNNYYEPFLGSGALFQSLTPSTVTLNDNDINLIQLWKDMLAQPELFCDYVRKFKDKIYVNKDQKTQKESFKHLVEKFNKSNLGAYKSALFYVLLKYAFRGIFRYRSDGTIYLGYNFSSRFKNPIIDLLEIQRIKTNVKNIKLLNGDFESVINQTQSNDFIFVDPPYWREGIKDKVFYQKPFTFEDHKRLYKSLEMANYRKVKWLYTNYNSSKITELFKKFHIQPIQTTTKHNLTSKGISQEVIIKNY >NC_021236|820409:828315|825237_825876_+|WP_015638061.1|DBSCAN-SWA MTNKLISFEGVDGSGKTTLINELKKYFENKGYQIKVFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLSGYLVIVDRWYDSTFAYQSKGNYIDYDDKITSKIINHFLIKPKLTFYLDIDPQIGIQRKQTQTNHKLDLIEQKPLNYFENVRKHYLNQHKYCNDANCNHKNCNYFMINATNSQKENLAQIMKILINK >NC_021236|820409:828315|820409_820877_+|WP_041784345.1|DBSCAN-SWA MQTHKIDILDVATYLINHQNKNDYTPLKLQKLVFFVYAKNLIDTNQSMFNNDFESWAYGPVSPKLYTNLPKDKKPLNYQQKIKENYDQNIFSQQEKEIMDYVIEKYDPKTATELVNITHRPNSPWERSYISQYFALNNIPDKLIQNYYSQRNRKV >NC_021236|820409:828315|827838_828315_+|WP_041784358.1|DBSCAN-SWA MNQTKQINVFDVALYIVKNNPSSTTKMKLNKMIYYAHAKHLVQTKKPLLKEQIQAWIYGPVFPELCKQLKDFTYQPINPEVLAMGDITKINATQKQILDFMIWLYGDASPNDLSSQTHMEHPWIKSYYKDYDSGWSKKIIKNKDILEYFSENNKNIGA >NC_021236|820409:828315|821100_822357_+|WP_015638065.1|DBSCAN-SWA MNKNTIAETFAGAGGSHLGFINNGFVSVYINEFEPNCIQTLKLNFPLLEKKCYIDPRDINDISINKISIINVDVLFGGIVCKGFSLAGQRKPTDKRNYLYLKQLEFVNHLKPTISIIENVPTFLTTKILKKELIPQFEKEIDDIWQEYAQLQAKKGSKRKKNLSHELENKRLLELKKQKNDLLKKLEKQQVLISVFDDIKNKYDKMGYKVYHQVLNSAWYGAATARNRAIIVAVKKEIKKIFTFPKITHFQKDNPLGNINGMSFCDNLLPYTTVEDVFKTIDYNNLDDLDNIPMSHNPKTIKRFGFIPEGKNISHIIDQLPNELKISSFYSRGSATRLSRHKPCGTLVPGHSALPIHPWLNRSITIREAAALSGFPLNYKFYGSHSNRCEQIGNAVPILLSNAIAKKIKKFLKEVKSE >NC_021236|820409:828315|823305_824592_+|WP_015638108.1|DBSCAN-SWA MIEAERALLGTLLLKPEKMDAVINSVNTNNFSNPKHRYIFEAMKQLKIQNREIDYVTVGSVLETNNLYKTKWTDYLIELVEMTPASEYLKTYIDLITENALKRDVLGLIKQLPTALSKTKNIHNYLQAVKNQVESFMQKTKSPFVSIKMLSPYVCQSIFNDDNPNQFIGIKTGFKNLDELISGFKPKELIILGAKTGMGKTAFMLNLACNIAKNFTSNPENQKAVIFSLEMAAEQLAFRLLSSASKIPLKQLLHKKINKDEKLQLLIADDEITQLNILIDDDRNNKIKDIETKCRQMKYNEGLDIVFIDYLHLLKDDQSFNIYQAISEISRKLKNLASELNIPIVALSQFSRDIEKRVDKRPVLSDLRDSGSIEQDADIVMLLHRESYWQKPDNNPHTNLIIAKNRSGQKGECNFNFFQEIQRFEAKE |
11 | Salmonella_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
918667 : 926350
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021236|918667:926350|DBSCAN-SWA AATGACAAATAAATTAATTAGTTTTGAAGGTGTTGACGGAAGCGGCAAAACTACTTTAATTAACGAATTAAAAGATTCTTTTGAAAATAAAGGCTATCAAATCAAAGTTTTTCAAGGGTTAGGTAGTTCCATTGTTGGAAAAGAAATCAGAAATTTATTTTTACATCAATCCAAAATAAGCCCTAAAACTAAATATTTATTAAGCCTTGCCAACATGATGCAAACCCAAGATGAATTAATAATCCCTGCTTTGTTGGGTGGTTATCTTGTTATAGTTGACCGTTGGTATGATTCCACTTTCGCATATCAAAGCAAAGGCAATTACATGGATTATGATGATAAAATTACTTCAAAAATTATCAATCATTTCTTAATTAAACCTAAATTAACTTTTTACCTAGATATTGACCCTAAAATTGGGCTAAAACGAAAACAAACTCAATCAAATCATAAATTAGACCTCATTGAGCAAAAACCCTTAAATTATTTTGAAAATGTCCGCAAACATTATTTAAACCAACATAAATACTGTAATGATGCAAATTGTAAACACCAAAATTGCCATCATTTTTTAATTAATGCAACAAAATCCCAAAAAGATAATTTAGAACAAGTAATTAAAACTTTAATTAGTAAAAAAATAATTCAAATAAATAAAGGAGAATAAAAATGATTTTAACTCCCAAACACATTTTAATATTGTTAAGTATAACATATTTAGGATTTATCATAACAAATCTAATGACCCTATTTTTTGATTTTAATTTAGGAATGAAGGCTAATACTGCTATTAGTCTTGTTTCTGATGTTGTCTTTTTATTTATATTTGGGTAAAGGAGTTTAATAATGAAAATACCATGGATAGGCAGTAAAAAGAAAATGTTACCTAAATTATTAAAATATATTCCAACAAATTATAACAATTATTATGAACCTTTTTTAGGAAGCGGGGCTTTATTCCAATCTCTTACCCCCTCAACTGTCACTTTGAACGATAATGATATCAATTTAATACAACTTTGGAAAGATATGTTGGCACAACCAGAATTGTTTTGTGATTATGTGCGTAAATTTGAAGACAAAATATATGAAAATAAAGATCAAAAGACGCAAAAAGAATCATTTAAACATTTGGTAGAAAAATTTAATAAAAGTAATTTGGGTACTTATAAAAGTGCCCTTTTTTACGTTTTATTGAAATATGCTTTTAGGGGCATTTTCGGATATCGATCCGATGGAACTATTTATTTAGGATACGGGTTTTCATCTCGTTTCAAAAACCCTATAATTGTTTTATCAGAAATCCAAAGAATAAAAACCAATGTTAAGAATATAAAATTGTTAAATGGCGATTTTGAAAGTCTCATTAACCAAACCCAAAGCAACGATTTTATATTTGTTGATCCTCCGTATTGGCGTGAAGGGATTAAAGATAAATATTTTTATCAAAAACCTTTCACATTTGAAGATCACAAAAGACTTTATAAAAGTTTAGAAATGGCAAATTATCGCAAGGTAAAGTGGTTGTATACAAATTATAATTCGTCAAAAATAACTGAATTGTTTAAAAAATTTCACATTCAACCCATTCAAACCACTACAAAACACAATTTAACTTCAAAAGGGATATCGCAAGAAGTTATTATTAAAAATTATTAAAAAGAACAAATAATGAAAATTTTAATCAACAAACAAATATTTTAATTAAAGGAGAAAAATAATTATGAAAAAAGAATCTATTAATGTCTTTGATGTTGCTCTTTATATTGTTAAAAATAATCCTCATTCAACTACTAAAATGAAACTAAATAAAATGATTTATTATGCTCATGCAAAACATCTAGTAAAAACAAAAAAACCTCTTGTAAAAGAACAAATCCAAGCTTGGATTCATGGTCCTGTCTTTCCTGAATTATGCAAGCAATTAAAAGATTTTACTTATCAACCAATAAATCCCGAAGTTTTAGCAATGGGAGATATAACTAAAATAAATGCAACTCAAAAACAAATCCTTGATTTTATGATTTTGTTATACGGCGATGCATCACCTAATGATTTATCTTCTCAAACTCACATGGAGCACCCATGGATAAAAAGTTATTACAAAGATTATGATTCTGGTTGGTCTAAAAAGATTATTAAAAACAAAGACATTTTAGAATATTTCTCTGAAAACAATAAACATATAGGAGCATAAATAATATGAATTATCAAAAAACTTTTTATCGCAAAGGAATAAAAACAGGCTTTAAAAATCTAGATGAATTAATTTCTGGTTTCAAACCAAAGGAATTAATTATCTTAGGAGCAAGAACTGGGATGGGAAAAACTGCTTTTATGCTTAATTTGGCTTGTAATATTGCAAAAAACTTTACTACCAACCCCGAAACCCAAAAAGCAGTTATTTTTAGTTTAGAAATGGCAGCGGAAGAATTAGGAATTAGGTTACTTTCTTCTGCTTCTAAAATCCCTTTAAAACAACTCCAACACAAAAACTTAAATAAAAATGAAAAATTACAGTTACTTATCCCTGAAGACGAAACCACGCAATTAAACATTTTAATTGATGATGATAGAAATAACAAAATTGAAGACATTGAAACCAAATGCCGTCAAATGAAATATACTAAAGGACTTGATATTGTTTTTATTGATTACCTCCATTTATTAAAAGAAGACCAAAATTTTAATACATATCAAGCAATATCTGTGATTTCACGCAAATTAAAAAAACTAGCAAGTGAACTTAATATTCCAATTGTAGCTTTGAGTCAAATGAACCGTGCAACCTATGTAAGAGAAGTCAAAAGGCCACAATTAACAGATTTAAGAGATTCGGGAACAATCGAACAAGACGCTGATGTTGTGATGTTATTACACCGCGAAAGTTATTATCAAAAACCTGATATTAACCCACATACCAATTTAATTATTGCCAAAAACCGTAGCGGTCAAAAGGGCGAATGTAGTTTTAATTTTTATAAACAAATCCAAAGATTTGAAGCAAAATAATAAAAGGAAATAAATAAAATGCAACAAATATCTAATTTAGATTTTAATAATATTAACGTTTTTAATCATAAATCTTTGTGCGTTAACATAACCAAACAAATAATTCAACCAATTTTTTTCAACAAAGCTTTTAATCAGTATATGTTTGATTGCCATAATATACTCAATGAATATTTAACCAACAACCAATACAACTCTCAAAGCCAAAAATCAATTCGCGGAAAAATTAACGAATACTTAATTTTGCTTTATTTATCCCACAAAGGAATTAAATATTTATATCCTCAATCATATTTATTTTTCATCCCCGATATTAAATTTGATTTAGTATTGTTTACCAAAACAAAACGCATTATTGCCTTCAATTTCAAAACATGCCTTAGAGATAGATACAAACAATCAATAGTAGAAGGGGAACAAATCAAAAAACTAGACACTCGTTTTGGGTTTTATTTGTTAACAAATGATGAATCCGAAACTCAAAGATTAAATAATAAAATTAAAAATGGTAAAGTACAATCAATTAACAAAGTAATCAATTTATTTTCCAATTCAGCCAATCTCTTCTTACAAAACTTACTAACCAACCAATTCATTCCCTTTTCACCCATTAATTTAATTAAAAAGATGGTTCACCCTAATGACAAATAAATTAATTAGTTTTGAAGGTGTTGACGGAAGCGACAAAACTACTTTAATTAACGAATTAAAAGATTCTTTTGAAAATAAAGGCTATCAAATTAAATTTTTTCAAGGTTTAGGCAGTTCCATTGTTGGAAAAGAAATCAGAAATTTATTTTTACATCAATCCAAAATAAGCCCTAAAACTAAATATTTACTTAGCCTTGCCAACATGATGCAAACCCAAGATGAATTAATAATCCCTGCTTTATTGGGTGGTTATATTGTTCTAGTTGACCGTTGGTATGATTCCACTTTTGCATATCAAAGCAAAGGCAATTACATGGATTATGATGATAAAATTACTTCAAAAATTATCAATCATTTCTTAATTAAACCTAAATTAACTTATTACCTAGATATTGACCCTAAAATTGGGCTAAAACGAAAACAAACTCAATCAAATCATAAATTAGACCTCATTGAACAAAAACCCTTAAATTATTTTGAAAATGTCCGCAAACATTATTTAAACCGTCATAAATACTGTAATGATACAAATTGTAAACACCAAAATTGTAATCATTTTATGATTAACGCAACCAACTCGCAAAAAGAAAATTTAGCCCAAATAATGAAAATTTTAATCAACAAAAAAATATTTTAATTAAAGGAGAAAAATAATTATGAATTATCAAAAAACTTTTTATCGCAAAGGAATAAAAACAGGCTTTAAAAATCTAGATGAATTAATTTCTGGTTTCAAACCAAAGGAATTAATTATCTTAGGAGCAAGAACTGGGATGGGAAAAACTGCTTTTATGCTTAATTTGGCTTGTAATATTGCAAAAAACTTTAATACCAATCCCAAAAACCAAAAAGCAGTTATTTTTAGTTTAGAAATGGCAGCGGAAGAATTAGGAATTAGGTTATTTTCTTCTGCTTCTAAAATCCCTTTAAAACAACTCCAACACAAAAACTTAAATAAAAATGAAAAATTACAGTTACTTATCCCTGAAGACGAAACCACGCAATTAAACATTTTAATTGATGATGATAGAAATAACAAAATTGAAGACATTGAAACCAAATGCCGTCAAATGAAATATACTAAAGGACTTGATATTGTTTTTATTGATTACCTCCATTTATTAAAAGAAGACCAAAATTTTAATACATATCAAGCAATATCTGTGATTTCACGCAAATTAAAAAAACTAGCAAGTGAACTTAATATTCCAATTGTAGCTTTGAGTCAAATGAACCGTGCAACCTATGTAAGAGAAGTCAAAAGGCCACAATTAACAGATTTAAGAGATTCGGGAACAATCGAACAAGACGCTGATGTTGTGATGTTATTACACCGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021236|918667:926350|924435_925083_+|WP_015638370.1|DBSCAN-SWA MTNKLISFEGVDGSGKTTLINELKDSFENKSYQIKFFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLGGYIVLVDRWYDSTFAYQSKGNYMDYDDKITSKIINYFLIKPKLTFYLDIDPKIGLKRKQTQSNHKLDLIEQKPLNYFENVRKHYLNRHKYCNDTNCKHQNCNHFMINATNSQKENLAQIMKILINKKIF >NC_021236|918667:926350|921696_922329_+|WP_015638367.1|DBSCAN-SWA MQQISNLDFNNINVFNHKSLCVNITKQIIQPIFFNKAFNQYMFDCHNILNEYLTNNQYNSQSQKSIRGKINEYLILLYLSHKGIKYLYPQSYLFFIPDIKFDLVLFTKTKRIIAFNFKTCLRDRYKQSIVEGEQIKKLDTRFGFYLLTNDESETQRLNNKIKNGKVQSINKVINLFSNSANLFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVHPNDK >NC_021236|918667:926350|922318_922966_+|WP_015638368.1|DBSCAN-SWA MTNKLISFEGVDGSDKTTLINELKDSFENKGYQIKFFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLGGYIVLVDRWYDSTFAYQSKGNYMDYDDKITSKIINHFLIKPKLTYYLDIDPKIGLKRKQTQSNHKLDLIEQKPLNYFENVRKHYLNRHKYCNDTNCKHQNCNHFMINATNSQKENLAQIMKILINKKIF >NC_021236|918667:926350|920389_920863_+|WP_015637680.1|DBSCAN-SWA MKKESINVFDVALYIVKNNPHSTTKMKLNKMIYYAHAKHLVKTKKPLVKEQIQAWIHGPVFPELCKQLKDFTYQPINPEVLAMGDITKINATQKQILDFMILLYGDASPNDLSSQTHMEHPWIKSYYKDYDSGWSKKIIKNKDILEYFSENNKHIGA >NC_021236|918667:926350|925359_925563_+|WP_041784421.1|DBSCAN-SWA MILTPKHILILLSITYLGFIITNLMTLFFDFSLGIKANTAISLVSDVVFLIYIWVKEFNNENTMDRQ >NC_021236|918667:926350|923813_924446_+|WP_015638367.1|DBSCAN-SWA MQQISNLDFNNINVFNHKSLCVNITKQIIQPIFFNKAFNQYMFDCHNILNEYLTNNQYNSQSQKSIRGKINEYLILLYLSHKGIKYLYPQSYLFFIPDIKFDLVLFTKTKRIIAFNFKTCLRDRYKQSIVEGEQIKKLDTRFGFYLLTNDESETQRLNNKIKNGKVQSINKVINLFSNSANLFLQNLLTNQFIPFSPINLIKKMVHPNDK >NC_021236|918667:926350|925537_926350_+|WP_015638372.1|DBSCAN-SWA MKIPWIGSKKKMLPQLLKYIPTNYNNYYEPFLGSGALFQSLTPSTVTLNDNDINLIQLWKDMLAQPELFCDYVRKFEDKIYVNKDQKTQKESFKHLVEKFNKSNLVAYKSALFYVLLKYAFRGIFRYRPDGTIYLGYGFSSRFKNPIIVLSEIQRIKTNVKNIKLLNGDFESVINQTQSNDFIFVDPPYWREGIKDKYFYQKPFTFEDHKRLYKSLEMANYRKVKWLYTNYNSSKITELFKKFHIQPIQTTTKYSLTSKGISQEVIIKNY >NC_021236|918667:926350|919512_920325_+|WP_015638365.1|DBSCAN-SWA MKIPWIGSKKKMLPKLLKYIPTNYNNYYEPFLGSGALFQSLTPSTVTLNDNDINLIQLWKDMLAQPELFCDYVRKFEDKIYENKDQKTQKESFKHLVEKFNKSNLGTYKSALFYVLLKYAFRGIFGYRSDGTIYLGYGFSSRFKNPIIVLSEIQRIKTNVKNIKLLNGDFESLINQTQSNDFIFVDPPYWREGIKDKYFYQKPFTFEDHKRLYKSLEMANYRKVKWLYTNYNSSKITELFKKFHIQPIQTTTKHNLTSKGISQEVIIKNY >NC_021236|918667:926350|925102_925357_+|WP_015638371.1|DBSCAN-SWA MNYQKTYYYLDGKTKKSVVEYGPDGKLTKYTEYYSDGKTIDYINELNQKEEVIKTTCYYPDGNIKEVQYSKEYYKKIIQINKGE >NC_021236|918667:926350|918667_919333_+|WP_015638364.1|DBSCAN-SWA MTNKLISFEGVDGSGKTTLINELKDSFENKGYQIKVFQGLGSSIVGKEIRNLFLHQSKISPKTKYLLSLANMMQTQDELIIPALLGGYLVIVDRWYDSTFAYQSKGNYMDYDDKITSKIINHFLIKPKLTFYLDIDPKIGLKRKQTQSNHKLDLIEQKPLNYFENVRKHYLNQHKYCNDANCKHQNCHHFLINATKSQKDNLEQVIKTLISKKIIQINKGE |
10 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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