CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NC_021552	Staphylococcus aureus CA-347 plasmid unnamed, complete sequence	0 crisprs	csa3	0	0	0	0
NC_021554	Staphylococcus aureus CA-347, complete sequence	6 crisprs	cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL	7	0	10	3

1. NC_021554

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NC_021554_1

• CRISPR_ID: NC_021554_1
• CRISPR_location: 787487-787679
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NC_021554_1

Consensus_repeat	Method
AGTTGGGGTGGGGCCCCAACA	CRT
TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA	CRISPRCasFinder

spacers of NC_021554_1

>1.1|787508|36|NC_021554|CRT
CAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA
>1.2|787565|37|NC_021554|CRT
AAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCG
>1.3|787623|36|NC_021554|CRT
CAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA
>1.4|787565|33|NC_021554|CRISPRCasFinder
AAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATG
>1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder
CAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021554_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_021554_1

>merge|NC_021554|1|787487-787679|CRT,CRISPRCasFinder
GCATATACTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA

>NC_021554|1|1|787487-787679|CRT
GCATATACTGGGGCCCCAACA	CAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA
AGTTGGGGTGGGGCCCCAACA	AAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCG
AGTTGGGGTGGGGCCCCAACA	CAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA
AGTTGGGGTGGGGCCCCAACA

>NC_021554|1|1|787540-787679|CRISPRCasFinder
TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA	AAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATG
TGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA	CAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA
TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_021554.1|WP_000930014.1|791288_791789_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF	unknown	unknown	gnl|CDD|223851
NC_021554.1|WP_000197263.1|786904_787453_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase	unknown	unknown	gnl|CDD|226895
NC_021554.1|WP_016528697.1|775378_776383_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224895
NC_021554.1|WP_000983676.1|780962_782744_+|DNA-helicase-RecQ	unknown	unknown	gnl|CDD|273594
NC_021554.1|WP_016528696.1|774385_774592_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_021554.1|WP_000589263.1|782964_783942_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224050
NC_021554.1|WP_000708692.1|774684_775395_+|allophanate-hydrolase-subunit-1	unknown	unknown	gnl|CDD|224960
NC_021554.1|WP_000098285.1|776856_778797_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS	unknown	unknown	gnl|CDD|224287
NC_021554.1|WP_000692521.1|793476_793875_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI	unknown	unknown	gnl|CDD|224694
NC_021554.1|WP_000663021.1|785688_786747_+|histidinol-phosphate-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|235106
NC_021554.1|WP_016528698.1|783934_785449_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270328
NC_021554.1|WP_031785486.1|789263_789365_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_021554.1|WP_000562500.1|796060_797032_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta	unknown	unknown	gnl|CDD|275027
NC_021554.1|WP_001068497.1|791808_792675_-|DMT-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223769
NC_021554.1|WP_000876313.1|797406_798378_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|226965
NC_021554.1|WP_001245581.1|798364_799321_+|iron-chelate-uptake-ABC-transporter-family-permease-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|226964
NC_021554.1|WP_000429016.1|788255_789173_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|224513
NC_021554.1|WP_000525111.1|779067_780951_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223562
NC_021554.1|WP_000193753.1|789442_790948_-|peptide-MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|225646
NC_021554.1|WP_000855505.1|793837_795943_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|236069

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_021554.1|WP_000930014.1|791288_791789_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF	gnl|CDD|223851	COG0780, COG0780, Enzyme related to GTP cyclohydrolase I [General function prediction only].	7.91282e-79
NC_021554.1|WP_000197263.1|786904_787453_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase	gnl|CDD|226895	COG4502, COG4502, 5'(3')-deoxyribonucleotidase [Nucleotide transport and metabolism].	5.90601e-108
NC_021554.1|WP_016528697.1|775378_776383_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein	gnl|CDD|224895	COG1984, DUR1, Allophanate hydrolase subunit 2 [Amino acid transport and metabolism].	3.98732e-144
NC_021554.1|WP_000983676.1|780962_782744_+|DNA-helicase-RecQ	gnl|CDD|273594	TIGR01389, recQ, ATP-dependent DNA helicase RecQ. The ATP-dependent DNA helicase RecQ of E. coli is about 600 residues long. This model represents bacterial proteins with a high degree of similarity in domain architecture and in primary sequence to E. coli RecQ. The model excludes eukaryotic and archaeal proteins with RecQ-like regions, as well as more distantly related bacterial helicases related to RecQ. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0
NC_021554.1|WP_000589263.1|782964_783942_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224050	COG1125, OpuBA, ABC-type proline/glycine betaine transport systems, ATPase components [Amino acid transport and metabolism].	6.84124e-155
NC_021554.1|WP_000708692.1|774684_775395_+|allophanate-hydrolase-subunit-1	gnl|CDD|224960	COG2049, DUR1, Allophanate hydrolase subunit 1 [Amino acid transport and metabolism].	1.29969e-94
NC_021554.1|WP_001245581.1|798364_799321_+|iron-chelate-uptake-ABC-transporter-family-permease-subunit	gnl|CDD|226964	COG4605, CeuC, ABC-type enterochelin transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	2.5052e-118
NC_021554.1|WP_000098285.1|776856_778797_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS	gnl|CDD|224287	COG1368, MdoB, Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NC_021554.1|WP_000692521.1|793476_793875_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI	gnl|CDD|224694	COG1780, NrdI, Protein involved in ribonucleotide reduction [Nucleotide transport and metabolism].	5.52807e-56
NC_021554.1|WP_000663021.1|785688_786747_+|histidinol-phosphate-transaminase	gnl|CDD|235106	PRK03158, PRK03158, histidinol-phosphate aminotransferase; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_016528698.1|783934_785449_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein	gnl|CDD|270328	cd13610, PBP2_ChoS, Substrate-binding domain ChoS of an osmoregulated ABC-type transporter and related proteins; type 2 periplasmic-binding protein fold. Osmoprotectant binding lipoprotein ChoS of Lactococcus lactis is predicted to be involved in uptake of compatible solutes such as choline and glycine betaine, but the relative substrate preference is not known. To counteract the efflux of water, microorganisms accumulate the compatible solutes for a sustained adjustment to high osmolarity surroundings. ChoS belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	3.44389e-151
NC_021554.1|WP_000562500.1|796060_797032_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta	gnl|CDD|275027	TIGR04171, ribonucleotide-diphosphate_reductase_subunit_beta, ribonucleoside-diphosphate reductase, class 1b, beta subunit. Members of this family are NrdF, the beta subunit of class 1b ribonucleotide reductase. This form uses a dimanganese moiety associated with a tyrosine radical to reduce the cellular requirement for iron. [Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides, 2'-Deoxyribonucleotide metabolism].	1.34879e-164
NC_021554.1|WP_001068497.1|791808_792675_-|DMT-family-transporter	gnl|CDD|223769	COG0697, RhaT, Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily [Carbohydrate transport and metabolism / Amino acid transport and metabolism / General function prediction only].	3.8323e-10
NC_021554.1|WP_000876313.1|797406_798378_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|226965	COG4606, CeuB, ABC-type enterochelin transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	4.99826e-150
NC_021554.1|WP_000429016.1|788255_789173_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase	gnl|CDD|224513	COG1597, LCB5, Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase [Lipid metabolism / General function prediction only].	5.04865e-78
NC_021554.1|WP_000525111.1|779067_780951_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|223562	COG0488, Uup, ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains [General function prediction only].	0
NC_021554.1|WP_000193753.1|789442_790948_-|peptide-MFS-transporter	gnl|CDD|225646	COG3104, PTR2, Dipeptide/tripeptide permease [Amino acid transport and metabolism].	1.95605e-172
NC_021554.1|WP_000855505.1|793837_795943_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha	gnl|CDD|236069	PRK07632, PRK07632, ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha; Validated.	0

Protein sequences

>NC_021554.1|WP_000197263.1|786904_787453_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase
MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEKEK
>NC_021554.1|WP_000663021.1|785688_786747_+|histidinol-phosphate-transaminase
MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNDDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE
>NC_021554.1|WP_016528698.1|783934_785449_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein
MINFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRFMAKLSYKKLLITLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDVYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYDQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNVRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLANKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK
>NC_021554.1|WP_000589263.1|782964_783942_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLEMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLGIMKPIDEVTSMSAYPIVYDNQQIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD
>NC_021554.1|WP_000983676.1|780962_782744_+|DNA-helicase-RecQ
MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFILDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRALFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV
>NC_021554.1|WP_000525111.1|779067_780951_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMMDAQDAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNILSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ
>NC_021554.1|WP_000098285.1|776856_778797_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS
MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK
>NC_021554.1|WP_016528697.1|775378_776383_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein
MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGVMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK
>NC_021554.1|WP_000708692.1|774684_775395_+|allophanate-hydrolase-subunit-1
MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN
>NC_021554.1|WP_016528696.1|774385_774592_+|hypothetical-protein
MIIVYIVLLLILVYVNYRFVNRLLSENRIYVVRLIATITTVISFILVYALIRELMPFVVRAMDLMYHQ
>NC_021554.1|WP_000429016.1|788255_789173_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase
MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLTIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL
>NC_021554.1|WP_031785486.1|789263_789365_+|hypothetical-protein
MIITDIDVYRVGRENIVIVVYNEHIKFLFILIS
>NC_021554.1|WP_000193753.1|789442_790948_-|peptide-MFS-transporter
MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGTSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR
>NC_021554.1|WP_000930014.1|791288_791789_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF
MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR
>NC_021554.1|WP_001068497.1|791808_792675_-|DMT-family-transporter
MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK
>NC_021554.1|WP_000692521.1|793476_793875_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI
MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY
>NC_021554.1|WP_000855505.1|793837_795943_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha
MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI
>NC_021554.1|WP_000562500.1|796060_797032_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta
MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDVWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK
>NC_021554.1|WP_000876313.1|797406_798378_+|ABC-transporter-permease
MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINVALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRVIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ
>NC_021554.1|WP_001245581.1|798364_799321_+|iron-chelate-uptake-ABC-transporter-family-permease-subunit
MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQSITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVIPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLVTMVLFALLLFQVIFKIGQFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVILVTLLIITIYLVPYLDVLLLGRAEAINLGISYEQLTRFLLVIVSILVSISTTLVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVKRRNAQ

Crispr_ID: NC_021554_2

• CRISPR_ID: NC_021554_2
• CRISPR_location: 833735-833818
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NC_021554_2

Consensus_repeat	Method
GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCT	CRISPRCasFinder

spacers of NC_021554_2

>2.1|833760|34|NC_021554|CRISPRCasFinder
TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021554_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_021554_2

>merge|NC_021554|2|833735-833818|CRISPRCasFinder
GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATCGTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT

>NC_021554|2|2|833735-833818|CRISPRCasFinder
GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCT	TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC
GTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_021554.1|WP_001074749.1|845494_846685_+|phosphoglycerate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234613
NC_021554.1|WP_000538142.1|822169_822820_+|HD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378993
NC_021554.1|WP_000229257.1|823321_825307_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	unknown	unknown	gnl|CDD|235395
NC_021554.1|WP_000816297.1|840436_841339_-|TIGR01777-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224015
NC_021554.1|WP_000513299.1|829457_830297_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|183527
NC_021554.1|WP_000070822.1|842041_842671_+|DUF4887-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|234750
NC_021554.1|WP_000675904.1|838356_839991_+|NAD-dependent-malic-enzyme	unknown	unknown	gnl|CDD|237414
NC_021554.1|WP_001224792.1|830304_830790_+|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100053
NC_021554.1|WP_000958224.1|828519_829452_+|HPr-kinase/phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|235459
NC_021554.1|WP_001248939.1|834974_835970_+|YvcK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|211689
NC_021554.1|WP_010956549.1|819636_820747_+|peptide-chain-release-factor-2	unknown	unknown	gnl|CDD|234799
NC_021554.1|WP_000279414.1|844345_845356_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|273675
NC_021554.1|WP_000654030.1|843279_844293_+|sugar-binding-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|225263
NC_021554.1|WP_000662699.1|825314_828143_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	unknown	unknown	gnl|CDD|234734
NC_021554.1|WP_000638419.1|822816_823053_+|CsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227234
NC_021554.1|WP_000369722.1|834066_834978_+|RNase-adapter-RapZ	unknown	unknown	gnl|CDD|224574
NC_021554.1|WP_000057562.1|830797_832237_+|tetratricopeptide-repeat-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276809
NC_021554.1|WP_000134963.1|832303_833239_+|thioredoxin-disulfide-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|273540
NC_021554.1|WP_001049165.1|837587_838175_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	unknown	unknown	gnl|CDD|178955
NC_021554.1|WP_000006551.1|836080_837025_+|DNA-binding-protein-WhiA	unknown	unknown	gnl|CDD|273194

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_021554.1|WP_001074749.1|845494_846685_+|phosphoglycerate-kinase	gnl|CDD|234613	PRK00073, pgk, phosphoglycerate kinase; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_000538142.1|822169_822820_+|HD-domain-containing-protein	gnl|CDD|378993	pfam12917, HD_2, HD containing hydrolase-like enzyme. This is a family of bacterial and archaeal hydrolases.	2.8293e-58
NC_021554.1|WP_000229257.1|823321_825307_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	gnl|CDD|235395	PRK05298, PRK05298, excinuclease ABC subunit UvrB.	0
NC_021554.1|WP_000816297.1|840436_841339_-|TIGR01777-family-protein	gnl|CDD|224015	COG1090, COG1090, Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase [General function prediction only].	3.55253e-152
NC_021554.1|WP_000513299.1|829457_830297_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	gnl|CDD|183527	PRK12437, PRK12437, prolipoprotein diacylglyceryl transferase; Reviewed.	4.44091e-119
NC_021554.1|WP_000070822.1|842041_842671_+|DUF4887-domain-containing-protein	gnl|CDD|234750	PRK00409, PRK00409, recombination and DNA strand exchange inhibitor protein; Reviewed.	0.000190559
NC_021554.1|WP_000675904.1|838356_839991_+|NAD-dependent-malic-enzyme	gnl|CDD|237414	PRK13529, PRK13529, oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase.	0
NC_021554.1|WP_001224792.1|830304_830790_+|acetyltransferase	gnl|CDD|100053	cd04647, LbH_MAT_like, Maltose O-acyltransferase (MAT)-like: This family is composed of maltose O-acetyltransferase, galactoside O-acetyltransferase (GAT), xenobiotic acyltransferase (XAT) and similar proteins. MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively while GAT specifically acetylates galactopyranosides. XAT catalyzes the CoA-dependent acetylation of a variety of hydroxyl-bearing acceptors such as chloramphenicol and streptogramin, among others. XATs are implicated in inactivating xenobiotics leading to xenobiotic resistance in patients. Members of this family contain a a left-handed parallel beta-helix (LbH) domain with at least 5 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X). They are trimeric in their active form.	3.25151e-30
NC_021554.1|WP_000958224.1|828519_829452_+|HPr-kinase/phosphorylase	gnl|CDD|235459	PRK05428, PRK05428, HPr kinase/phosphorylase; Provisional.	1.22623e-170
NC_021554.1|WP_001248939.1|834974_835970_+|YvcK-family-protein	gnl|CDD|211689	TIGR01826, Putative_gluconeogenesis_factor, conserved hypothetical protein, cofD-related. This model represents a subfamily of conserved hypothetical proteins that forms a sister group to the family of CofD, (TIGR01819), LPPG:Fo 2-phospho-L-lactate transferase, an enzyme of cytochrome F420 biosynthesis. Both this family and TIGR01819 are within the scope of the pfam01933. [Hypothetical proteins, Conserved].	5.06652e-172
NC_021554.1|WP_010956549.1|819636_820747_+|peptide-chain-release-factor-2	gnl|CDD|234799	PRK00578, prfB, peptide chain release factor 2; Validated.	0
NC_021554.1|WP_000279414.1|844345_845356_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	gnl|CDD|273675	TIGR01534, Glyceraldehyde-3-phosphate_dehydrogenase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I. This model represents glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), the enzyme responsible for the interconversion of 1,3-diphosphoglycerate and glyceraldehyde-3-phosphate, a central step in glycolysis and gluconeogenesis. Forms exist which utilize NAD (EC 1.2.1.12), NADP (EC 1.2.1.13) or either (1.2.1.59). In some species, NAD- and NADP- utilizing forms exist, generally being responsible for reactions in the anabolic and catabolic directions respectively. Two Pfam models cover the two functional domains of this protein; pfam00044 represents the N-terminal NAD(P)-binding domain and pfam02800 represents the C-terminal catalytic domain. An additional form of gap gene is found in gamma proteobacteria and is responsible for the conversion of erythrose-4-phosphate (E4P) to 4-phospho-erythronate in the biosynthesis of pyridoxine. This pathway of pyridoxine biosynthesis appears to be limited, however, to a relatively small number of bacterial species although it is prevalent among the gamma-proteobacteria. This enzyme is described by TIGR001532. These sequences generally score between trusted and noise to this GAPDH model due to the close evolutionary relationship. There exists the possiblity that some forms of GAPDH may be bifunctional and act on E4P in species which make pyridoxine and via hydroxythreonine and lack a separate E4PDH enzyme (for instance, the GAPDH from Bacillus stearothermophilus has been shown to posess a limited E4PD activity as well as a robust GAPDH activity). There are a great number of sequences in the databases which score between trusted and noise to this model, nearly all of them due to fragmentary sequences. It seems that study of this gene has been carried out in many species utilizing PCR probes which exclude the extreme ends of the consenses used to define this model. The noise level is set relative not to E4PD, but the next closest outliers, the class II GAPDH's (found in archaea, TIGR01546) and aspartate semialdehyde dehydrogenase (ASADH, TIGR01296) both of which have highest-scoring hits around -225 to the prior model. [Energy metabolism, Glycolysis/gluconeogenesis].	0
NC_021554.1|WP_000654030.1|843279_844293_+|sugar-binding-transcriptional-regulator	gnl|CDD|225263	COG2390, DeoR, Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain [Transcription].	1.39665e-92
NC_021554.1|WP_000662699.1|825314_828143_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	gnl|CDD|234734	PRK00349, uvrA, excinuclease ABC subunit UvrA.	0
NC_021554.1|WP_000638419.1|822816_823053_+|CsbA-family-protein	gnl|CDD|227234	COG4897, CsbA, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	4.73465e-34
NC_021554.1|WP_000369722.1|834066_834978_+|RNase-adapter-RapZ	gnl|CDD|224574	COG1660, COG1660, Predicted P-loop-containing kinase [General function prediction only].	4.97899e-170
NC_021554.1|WP_000057562.1|830797_832237_+|tetratricopeptide-repeat-protein	gnl|CDD|276809	sd00006, TPR, Tetratricopeptide repeat. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. The number of TPR motifs varies among proteins. Those containing 5-6 tandem repeats generate a right-handed helical structure with an amphipathic channel that is thought to accommodate an alpha-helix of a target protein. It has been proposed that TPR proteins preferentially interact with WD-40 repeat proteins, but in many instances several TPR-proteins seem to aggregate to multi-protein complexes.	7.78879e-06
NC_021554.1|WP_000134963.1|832303_833239_+|thioredoxin-disulfide-reductase	gnl|CDD|273540	TIGR01292, Thioredoxin_reductase, thioredoxin-disulfide reductase. This model describes thioredoxin-disulfide reductase, a member of the pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases (pfam00070). [Energy metabolism, Electron transport].	4.19425e-154
NC_021554.1|WP_001049165.1|837587_838175_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	gnl|CDD|178955	PRK00277, clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit; Reviewed.	4.59321e-148
NC_021554.1|WP_000006551.1|836080_837025_+|DNA-binding-protein-WhiA	gnl|CDD|273194	TIGR00647, DNA_bind_WhiA, DNA-binding protein WhiA. This family describes a DNA-binding protein widely conserved in Gram-positive bacteria, and occasionally occurring elsewhere, such as in Thermotoga. It is associated with cell division, and in sporulating organisms with sporulation. [Cellular processes, Cell division].	7.40812e-153

Protein sequences

>NC_021554.1|WP_000134963.1|832303_833239_+|thioredoxin-disulfide-reductase
MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA
>NC_021554.1|WP_000057562.1|830797_832237_+|tetratricopeptide-repeat-protein
MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI
>NC_021554.1|WP_001224792.1|830304_830790_+|acetyltransferase
MRKFLSKTHHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNISIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR
>NC_021554.1|WP_000513299.1|829457_830297_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase
MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSFGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIIYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK
>NC_021554.1|WP_000958224.1|828519_829452_+|HPr-kinase/phosphorylase
MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE
>NC_021554.1|WP_000662699.1|825314_828143_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA
MKEPSIVVKGARAHNLKNIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHHIEIESQTVQQMVDRIMELETRTKIQLLAPVISHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNEVPELDKNKNHTIEVVVDRLVVKEGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGQRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDK
>NC_021554.1|WP_000229257.1|823321_825307_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB
MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKMKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDRGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG
>NC_021554.1|WP_000638419.1|822816_823053_+|CsbA-family-protein
MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR
>NC_021554.1|WP_000538142.1|822169_822820_+|HD-domain-containing-protein
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>NC_021554.1|WP_000816297.1|840436_841339_-|TIGR01777-family-protein
MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINKESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK
>NC_021554.1|WP_000070822.1|842041_842671_+|DUF4887-domain-containing-protein
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>NC_021554.1|WP_000654030.1|843279_844293_+|sugar-binding-transcriptional-regulator
MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE
>NC_021554.1|WP_000279414.1|844345_845356_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase
MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK
>NC_021554.1|WP_001074749.1|845494_846685_+|phosphoglycerate-kinase
MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK

Crispr_ID: NC_021554_3

• CRISPR_ID: NC_021554_3
• CRISPR_location: 840207-840286
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NC_021554_3

Consensus_repeat	Method
CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC	CRISPRCasFinder

spacers of NC_021554_3

>3.1|840231|32|NC_021554|CRISPRCasFinder
AACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021554_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_021554_3

>merge|NC_021554|3|840207-840286|CRISPRCasFinder
CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC

>NC_021554|3|3|840207-840286|CRISPRCasFinder
CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC	AACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGC
CAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_021554.1|WP_001074749.1|845494_846685_+|phosphoglycerate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234613
NC_021554.1|WP_001260089.1|846806_847568_+|triose-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|234589
NC_021554.1|WP_000816297.1|840436_841339_-|TIGR01777-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224015
NC_021554.1|WP_000513299.1|829457_830297_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|183527
NC_021554.1|WP_001121760.1|849217_850522_+|phosphopyruvate-hydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|234617
NC_021554.1|WP_000070822.1|842041_842671_+|DUF4887-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|234750
NC_021554.1|WP_001224792.1|830304_830790_+|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100053
NC_021554.1|WP_000958224.1|828519_829452_+|HPr-kinase/phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|235459
NC_021554.1|WP_001248939.1|834974_835970_+|YvcK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|211689
NC_021554.1|WP_016528700.1|851385_851619_+|preprotein-translocase-subunit-SecG	unknown	unknown	gnl|CDD|224233
NC_021554.1|WP_001622492.1|850860_851319_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_021554.1|WP_000279414.1|844345_845356_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|273675
NC_021554.1|WP_000654030.1|843279_844293_+|sugar-binding-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|225263
NC_021554.1|WP_000675904.1|838356_839991_+|NAD-dependent-malic-enzyme	unknown	unknown	gnl|CDD|237414
NC_021554.1|WP_000369722.1|834066_834978_+|RNase-adapter-RapZ	unknown	unknown	gnl|CDD|224574
NC_021554.1|WP_000057562.1|830797_832237_+|tetratricopeptide-repeat-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276809
NC_021554.1|WP_000134963.1|832303_833239_+|thioredoxin-disulfide-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|273540
NC_021554.1|WP_001049165.1|837587_838175_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	unknown	unknown	gnl|CDD|178955
NC_021554.1|WP_000006551.1|836080_837025_+|DNA-binding-protein-WhiA	unknown	unknown	gnl|CDD|273194
NC_021554.1|WP_001085498.1|847570_849088_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase	unknown	unknown	gnl|CDD|235463

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_021554.1|WP_001074749.1|845494_846685_+|phosphoglycerate-kinase	gnl|CDD|234613	PRK00073, pgk, phosphoglycerate kinase; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_001260089.1|846806_847568_+|triose-phosphate-isomerase	gnl|CDD|234589	PRK00042, tpiA, triosephosphate isomerase; Provisional.	2.84083e-146
NC_021554.1|WP_000816297.1|840436_841339_-|TIGR01777-family-protein	gnl|CDD|224015	COG1090, COG1090, Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase [General function prediction only].	3.55253e-152
NC_021554.1|WP_000513299.1|829457_830297_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	gnl|CDD|183527	PRK12437, PRK12437, prolipoprotein diacylglyceryl transferase; Reviewed.	4.44091e-119
NC_021554.1|WP_001121760.1|849217_850522_+|phosphopyruvate-hydratase	gnl|CDD|234617	PRK00077, eno, enolase; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_000070822.1|842041_842671_+|DUF4887-domain-containing-protein	gnl|CDD|234750	PRK00409, PRK00409, recombination and DNA strand exchange inhibitor protein; Reviewed.	0.000190559
NC_021554.1|WP_001224792.1|830304_830790_+|acetyltransferase	gnl|CDD|100053	cd04647, LbH_MAT_like, Maltose O-acyltransferase (MAT)-like: This family is composed of maltose O-acetyltransferase, galactoside O-acetyltransferase (GAT), xenobiotic acyltransferase (XAT) and similar proteins. MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively while GAT specifically acetylates galactopyranosides. XAT catalyzes the CoA-dependent acetylation of a variety of hydroxyl-bearing acceptors such as chloramphenicol and streptogramin, among others. XATs are implicated in inactivating xenobiotics leading to xenobiotic resistance in patients. Members of this family contain a a left-handed parallel beta-helix (LbH) domain with at least 5 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X). They are trimeric in their active form.	3.25151e-30
NC_021554.1|WP_000958224.1|828519_829452_+|HPr-kinase/phosphorylase	gnl|CDD|235459	PRK05428, PRK05428, HPr kinase/phosphorylase; Provisional.	1.22623e-170
NC_021554.1|WP_001248939.1|834974_835970_+|YvcK-family-protein	gnl|CDD|211689	TIGR01826, Putative_gluconeogenesis_factor, conserved hypothetical protein, cofD-related. This model represents a subfamily of conserved hypothetical proteins that forms a sister group to the family of CofD, (TIGR01819), LPPG:Fo 2-phospho-L-lactate transferase, an enzyme of cytochrome F420 biosynthesis. Both this family and TIGR01819 are within the scope of the pfam01933. [Hypothetical proteins, Conserved].	5.06652e-172
NC_021554.1|WP_016528700.1|851385_851619_+|preprotein-translocase-subunit-SecG	gnl|CDD|224233	COG1314, SecG, Preprotein translocase subunit SecG [Intracellular trafficking and secretion].	2.91291e-14
NC_021554.1|WP_000279414.1|844345_845356_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	gnl|CDD|273675	TIGR01534, Glyceraldehyde-3-phosphate_dehydrogenase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I. This model represents glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), the enzyme responsible for the interconversion of 1,3-diphosphoglycerate and glyceraldehyde-3-phosphate, a central step in glycolysis and gluconeogenesis. Forms exist which utilize NAD (EC 1.2.1.12), NADP (EC 1.2.1.13) or either (1.2.1.59). In some species, NAD- and NADP- utilizing forms exist, generally being responsible for reactions in the anabolic and catabolic directions respectively. Two Pfam models cover the two functional domains of this protein; pfam00044 represents the N-terminal NAD(P)-binding domain and pfam02800 represents the C-terminal catalytic domain. An additional form of gap gene is found in gamma proteobacteria and is responsible for the conversion of erythrose-4-phosphate (E4P) to 4-phospho-erythronate in the biosynthesis of pyridoxine. This pathway of pyridoxine biosynthesis appears to be limited, however, to a relatively small number of bacterial species although it is prevalent among the gamma-proteobacteria. This enzyme is described by TIGR001532. These sequences generally score between trusted and noise to this GAPDH model due to the close evolutionary relationship. There exists the possiblity that some forms of GAPDH may be bifunctional and act on E4P in species which make pyridoxine and via hydroxythreonine and lack a separate E4PDH enzyme (for instance, the GAPDH from Bacillus stearothermophilus has been shown to posess a limited E4PD activity as well as a robust GAPDH activity). There are a great number of sequences in the databases which score between trusted and noise to this model, nearly all of them due to fragmentary sequences. It seems that study of this gene has been carried out in many species utilizing PCR probes which exclude the extreme ends of the consenses used to define this model. The noise level is set relative not to E4PD, but the next closest outliers, the class II GAPDH's (found in archaea, TIGR01546) and aspartate semialdehyde dehydrogenase (ASADH, TIGR01296) both of which have highest-scoring hits around -225 to the prior model. [Energy metabolism, Glycolysis/gluconeogenesis].	0
NC_021554.1|WP_000654030.1|843279_844293_+|sugar-binding-transcriptional-regulator	gnl|CDD|225263	COG2390, DeoR, Transcriptional regulator, contains sigma factor-related N-terminal domain [Transcription].	1.39665e-92
NC_021554.1|WP_000675904.1|838356_839991_+|NAD-dependent-malic-enzyme	gnl|CDD|237414	PRK13529, PRK13529, oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase.	0
NC_021554.1|WP_000369722.1|834066_834978_+|RNase-adapter-RapZ	gnl|CDD|224574	COG1660, COG1660, Predicted P-loop-containing kinase [General function prediction only].	4.97899e-170
NC_021554.1|WP_000057562.1|830797_832237_+|tetratricopeptide-repeat-protein	gnl|CDD|276809	sd00006, TPR, Tetratricopeptide repeat. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. The number of TPR motifs varies among proteins. Those containing 5-6 tandem repeats generate a right-handed helical structure with an amphipathic channel that is thought to accommodate an alpha-helix of a target protein. It has been proposed that TPR proteins preferentially interact with WD-40 repeat proteins, but in many instances several TPR-proteins seem to aggregate to multi-protein complexes.	7.78879e-06
NC_021554.1|WP_000134963.1|832303_833239_+|thioredoxin-disulfide-reductase	gnl|CDD|273540	TIGR01292, Thioredoxin_reductase, thioredoxin-disulfide reductase. This model describes thioredoxin-disulfide reductase, a member of the pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases (pfam00070). [Energy metabolism, Electron transport].	4.19425e-154
NC_021554.1|WP_001049165.1|837587_838175_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	gnl|CDD|178955	PRK00277, clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit; Reviewed.	4.59321e-148
NC_021554.1|WP_000006551.1|836080_837025_+|DNA-binding-protein-WhiA	gnl|CDD|273194	TIGR00647, DNA_bind_WhiA, DNA-binding protein WhiA. This family describes a DNA-binding protein widely conserved in Gram-positive bacteria, and occasionally occurring elsewhere, such as in Thermotoga. It is associated with cell division, and in sporulating organisms with sporulation. [Cellular processes, Cell division].	7.40812e-153
NC_021554.1|WP_001085498.1|847570_849088_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase	gnl|CDD|235463	PRK05434, PRK05434, 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase.	0

Protein sequences

>NC_021554.1|WP_000675904.1|838356_839991_+|NAD-dependent-malic-enzyme
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>NC_021554.1|WP_001049165.1|837587_838175_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP
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>NC_021554.1|WP_001248939.1|834974_835970_+|YvcK-family-protein
MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK
>NC_021554.1|WP_000369722.1|834066_834978_+|RNase-adapter-RapZ
MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK
>NC_021554.1|WP_000134963.1|832303_833239_+|thioredoxin-disulfide-reductase
MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA
>NC_021554.1|WP_000057562.1|830797_832237_+|tetratricopeptide-repeat-protein
MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI
>NC_021554.1|WP_001224792.1|830304_830790_+|acetyltransferase
MRKFLSKTHHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNISIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR
>NC_021554.1|WP_000513299.1|829457_830297_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase
MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSFGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIIYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK
>NC_021554.1|WP_000958224.1|828519_829452_+|HPr-kinase/phosphorylase
MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE
>NC_021554.1|WP_000816297.1|840436_841339_-|TIGR01777-family-protein
MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINKESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK
>NC_021554.1|WP_000070822.1|842041_842671_+|DUF4887-domain-containing-protein
MSNQNYDYKTNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQTNQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQASQQNSQSTTNKQNNANDK
>NC_021554.1|WP_000654030.1|843279_844293_+|sugar-binding-transcriptional-regulator
MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE
>NC_021554.1|WP_000279414.1|844345_845356_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase
MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK
>NC_021554.1|WP_001074749.1|845494_846685_+|phosphoglycerate-kinase
MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK
>NC_021554.1|WP_001260089.1|846806_847568_+|triose-phosphate-isomerase
MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK
>NC_021554.1|WP_001085498.1|847570_849088_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase
MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVEDQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH
>NC_021554.1|WP_001121760.1|849217_850522_+|phosphopyruvate-hydratase
MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK
>NC_021554.1|WP_001622492.1|850860_851319_+|hypothetical-protein
MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGILYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR
>NC_021554.1|WP_016528700.1|851385_851619_+|preprotein-translocase-subunit-SecG
MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISFLGM

Crispr_ID: NC_021554_4

• CRISPR_ID: NC_021554_4
• CRISPR_location: 927532-927677
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NC_021554_4

Consensus_repeat	Method
CAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAAGCCAG	PILER-CR

spacers of NC_021554_4

>4.1|927576|29|NC_021554|PILER-CR
GAAATTTAGGAGCCAATTTCTACAGACAA
>4.2|927649|14|NC_021554|PILER-CR
CTTACAATAATGTG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021554_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_021554_4

>merge|NC_021554|4|927532-927677|PILER-CR
CGGGGCCCCAACACAGAGAAATTTAGGAGCCAATTTCTACAGACAATACAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGGAAAGCCAG

>NC_021554|4|1|927532-927677|PILER-CR
CGGGGCCCCAACACAGAGAAATTTAGGAGCCAATTTCTACAGAC	AATACAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGA
AGCTGGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGG	CCCCAACACAGAAG
CTGGTGGAAAGCCAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_021554.1|WP_000066054.1|929082_930462_-|argininosuccinate-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|179143
NC_021554.1|WP_000007965.1|934266_934842_+|TVP38/TMEM64-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223475
NC_021554.1|WP_000711897.1|935386_935962_+|signal-peptidase-I	unknown	unknown	gnl|CDD|274044
NC_021554.1|WP_000185324.1|927911_928841_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|176543
NC_021554.1|WP_001067294.1|922690_923068_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224023
NC_021554.1|WP_000838022.1|923428_924556_+|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|240086
NC_021554.1|WP_000758209.1|934846_935371_+|signal-peptidase-I	unknown	unknown	gnl|CDD|274044
NC_021554.1|WP_000138487.1|926162_927407_+|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|223411
NC_021554.1|WP_000035064.1|921681_922275_+|peptidylprolyl-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|238908
NC_021554.1|WP_000660057.1|930451_931657_-|argininosuccinate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234785
NC_021554.1|WP_000154909.1|939598_943252_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA	unknown	unknown	gnl|CDD|274299
NC_021554.1|WP_000573077.1|916447_917944_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-D	unknown	unknown	gnl|CDD|181085
NC_021554.1|WP_000167314.1|924863_926054_+|ornithine--oxo-acid-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|179736
NC_021554.1|WP_000781162.1|921234_921618_-|kinase-associated-lipoprotein-B	unknown	unknown	gnl|CDD|378054
NC_021554.1|WP_000172361.1|936121_939598_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB	unknown	unknown	gnl|CDD|213736
NC_021554.1|WP_000148855.1|932007_933339_+|glucose-6-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|184504
NC_021554.1|WP_000402803.1|917936_918278_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-C	unknown	unknown	gnl|CDD|181497
NC_021554.1|WP_000670752.1|943417_944320_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223257
NC_021554.1|WP_000054618.1|918698_921104_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-A	unknown	unknown	gnl|CDD|237155
NC_021554.1|WP_001081626.1|918277_918706_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|183602

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_021554.1|WP_000066054.1|929082_930462_-|argininosuccinate-lyase	gnl|CDD|179143	PRK00855, PRK00855, argininosuccinate lyase; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_000007965.1|934266_934842_+|TVP38/TMEM64-family-protein	gnl|CDD|223475	COG0398, COG0398, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.15479e-40
NC_021554.1|WP_000711897.1|935386_935962_+|signal-peptidase-I	gnl|CDD|274044	TIGR02227, Inactive_signal_peptidase_IA., signal peptidase I, bacterial type. This model represents signal peptidase I from most bacteria. Eukaryotic sequences are likely organellar. Several bacteria have multiple paralogs, but these represent isozymes of signal peptidase I. Virtually all known bacteria may be presumed to A related model finds a simlar protein in many archaea and a few bacteria, as well as a microsomal (endoplasmic reticulum) protein in eukaryotes. [Protein fate, Protein and peptide secretion and trafficking].	1.63465e-53
NC_021554.1|WP_000185324.1|927911_928841_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase	gnl|CDD|176543	cd08601, GDPD_SaGlpQ_like, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain of Staphylococcus aureus and similar proteins. This subfamily corresponds to the glycerophosphodiester phosphodiesterase domain (GDPD) present in uncharacterized glycerophosphodiester phosphodiesterase (GP-GDE, EC 3.1.4.46) from Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis and similar proteins. Members in this family show very high sequence similarity to Escherichia coli periplasmic phosphodiesterase GlpQ, which catalyzes the Ca2+-dependent degradation of periplasmic glycerophosphodiesters to produce sn-glycerol-3-phosphate (G3P) and the corresponding alcohols.	7.97991e-151
NC_021554.1|WP_001067294.1|922690_923068_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|224023	COG1098, VacB, Predicted RNA binding protein (contains ribosomal protein S1 domain) [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	3.22125e-44
NC_021554.1|WP_000838022.1|923428_924556_+|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase	gnl|CDD|240086	cd04735, OYE_like_4_FMN, Old yellow enzyme (OYE)-related FMN binding domain, group 4. Each monomer of OYE contains FMN as a non-covalently bound cofactor, uses NADPH as a reducing agent with oxygens, quinones, and alpha,beta-unsaturated aldehydes and ketones, and can act as electron acceptors in the catalytic reaction. Other members of OYE family include trimethylamine dehydrogenase, 2,4-dienoyl-CoA reductase, enoate reductase, pentaerythriol tetranitrate reductase, xenobiotic reductase, and morphinone reductase.	0
NC_021554.1|WP_000758209.1|934846_935371_+|signal-peptidase-I	gnl|CDD|274044	TIGR02227, Inactive_signal_peptidase_IA., signal peptidase I, bacterial type. This model represents signal peptidase I from most bacteria. Eukaryotic sequences are likely organellar. Several bacteria have multiple paralogs, but these represent isozymes of signal peptidase I. Virtually all known bacteria may be presumed to A related model finds a simlar protein in many archaea and a few bacteria, as well as a microsomal (endoplasmic reticulum) protein in eukaryotes. [Protein fate, Protein and peptide secretion and trafficking].	1.81012e-49
NC_021554.1|WP_000138487.1|926162_927407_+|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase	gnl|CDD|223411	COG0334, GdhA, Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase [Amino acid transport and metabolism].	0
NC_021554.1|WP_000035064.1|921681_922275_+|peptidylprolyl-isomerase	gnl|CDD|238908	cd01927, cyclophilin_WD40, cyclophilin_WD40: cyclophilin-type peptidylprolyl cis- trans isomerases (cyclophilins) having a WD40 domain. This group consists of several hypothetical and putative eukaryotic and bacterial proteins which have a cyclophilin domain and a WD40 domain. Function of the protein is not known.	2.08824e-65
NC_021554.1|WP_000660057.1|930451_931657_-|argininosuccinate-synthase	gnl|CDD|234785	PRK00509, PRK00509, argininosuccinate synthase; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_000154909.1|939598_943252_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA	gnl|CDD|274299	TIGR02785, ATP-dependent_helicase/nuclease_subunit_A, helicase-exonuclease AddAB, AddA subunit, Firmicutes type. AddAB, also called RexAB, substitutes for RecBCD in several bacterial lineages. These DNA recombination proteins act before synapse and are particularly important for DNA repair of double-stranded breaks by homologous recombination. The term AddAB is used broadly, with AddA homologous between the Firmicutes (as modeled here) and the alphaproteobacteria, while the partner AddB proteins show no strong homology across the two groups of species. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0
NC_021554.1|WP_000573077.1|916447_917944_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-D	gnl|CDD|181085	PRK07691, PRK07691, putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D; Reviewed.	0
NC_021554.1|WP_000167314.1|924863_926054_+|ornithine--oxo-acid-transaminase	gnl|CDD|179736	PRK04073, rocD, ornithine--oxo-acid transaminase; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_000781162.1|921234_921618_-|kinase-associated-lipoprotein-B	gnl|CDD|378054	pfam08810, KapB, Kinase associated protein B. This bacterial protein forms an anti-parallel beta sheet with an extending alpha helical region.	8.96507e-53
NC_021554.1|WP_000172361.1|936121_939598_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB	gnl|CDD|213736	TIGR02773, ATP-dependent_helicase/deoxyribonuclease_subunit_B, helicase-exonuclease AddAB, AddB subunit. DNA repair is accomplished by several different systems in prokaryotes. Recombinational repair of double-stranded DNA breaks involves the RecBCD pathway in some lineages, and AddAB (also called RexAB) in other. The AddA protein is conserved between the firmicutes and the alphaproteobacteria, while the partner protein is not. Nevertheless, the partner is designated AddB in both systems. This model describes the AddB protein as found Bacillus subtilis and related species. Although the RexB protein of Streptococcus and Lactococcus is considered to be orthologous, functionally equivalent, and merely named differently, all members of this protein family have a P-loop nucleotide binding motif GxxGxGK[ST] at the N-terminus, unlike RexB proteins, and a CxxCxxxxxC motif at the C-terminus, both of which may be relevant to function. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0
NC_021554.1|WP_000148855.1|932007_933339_+|glucose-6-phosphate-isomerase	gnl|CDD|184504	PRK14097, pgi, glucose-6-phosphate isomerase; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_000402803.1|917936_918278_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-C	gnl|CDD|181497	PRK08600, PRK08600, putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C; Reviewed.	9.82501e-64
NC_021554.1|WP_000670752.1|943417_944320_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein	gnl|CDD|223257	COG0179, MhpD, 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	1.0042e-87
NC_021554.1|WP_000054618.1|918698_921104_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-A	gnl|CDD|237155	PRK12645, PRK12645, monovalent cation/H+ antiporter subunit A; Reviewed.	0
NC_021554.1|WP_001081626.1|918277_918706_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-B	gnl|CDD|183602	PRK12573, PRK12573, Na(+)/H(+) antiporter subunit B.	9.17513e-61

Protein sequences

>NC_021554.1|WP_000138487.1|926162_927407_+|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase
MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA
>NC_021554.1|WP_000167314.1|924863_926054_+|ornithine--oxo-acid-transaminase
MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ
>NC_021554.1|WP_000838022.1|923428_924556_+|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase
MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDIELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTAQEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPIAVIEEVLKAKEMYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK
>NC_021554.1|WP_001067294.1|922690_923068_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein
MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND
>NC_021554.1|WP_000035064.1|921681_922275_+|peptidylprolyl-isomerase
MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYNGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE
>NC_021554.1|WP_000781162.1|921234_921618_-|kinase-associated-lipoprotein-B
MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK
>NC_021554.1|WP_000054618.1|918698_921104_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-A
MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLALPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWIWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDILGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPDKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTVFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE
>NC_021554.1|WP_001081626.1|918277_918706_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-B
MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE
>NC_021554.1|WP_000402803.1|917936_918278_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-C
MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD
>NC_021554.1|WP_000573077.1|916447_917944_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-D
MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK
>NC_021554.1|WP_000185324.1|927911_928841_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase
MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKRHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK
>NC_021554.1|WP_000066054.1|929082_930462_-|argininosuccinate-lyase
MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDSDIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ
>NC_021554.1|WP_000660057.1|930451_931657_-|argininosuccinate-synthase
MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYQKALDMGAIECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFVKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGNSNEQ
>NC_021554.1|WP_000148855.1|932007_933339_+|glucose-6-phosphate-isomerase
MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL
>NC_021554.1|WP_000007965.1|934266_934842_+|TVP38/TMEM64-family-protein
MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE
>NC_021554.1|WP_000758209.1|934846_935371_+|signal-peptidase-I
MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS
>NC_021554.1|WP_000711897.1|935386_935962_+|signal-peptidase-I
MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN
>NC_021554.1|WP_000172361.1|936121_939598_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB
MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKELIKYAKSVTIILTTDGNNDQFSLFRKPSEVLQHIEEIANELNISIERQYFNQFYRFNNQDLKHLEQEFDAFQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILYFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMDRFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLTQIQALFNRLEITNIPRYHEVAPLSLMQHVKQTKIALFEALRSWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVQLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSAILDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQAVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ
>NC_021554.1|WP_000154909.1|939598_943252_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA
MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPDPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLATTNYIFKHMMDEQVGEVNYDESAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELALIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSKQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL
>NC_021554.1|WP_000670752.1|943417_944320_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein
MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK

Crispr_ID: NC_021554_5

• CRISPR_ID: NC_021554_5
• CRISPR_location: 2336721-2336856
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NC_021554_5

Consensus_repeat	Method
TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTC	CRISPRCasFinder

spacers of NC_021554_5

>5.1|2336769|40|NC_021554|CRISPRCasFinder
AAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021554_5

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_021554_5

>merge|NC_021554|5|2336721-2336856|CRISPRCasFinder
TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCAAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGATTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTC

>NC_021554|5|4|2336721-2336856|CRISPRCasFinder
TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTC	AAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA
TTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_021554.1|WP_000655242.1|2335576_2335759_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_021554.1|WP_000791632.1|2340531_2341338_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT	unknown	unknown	gnl|CDD|223692
NC_021554.1|WP_000389669.1|2342184_2342994_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|184207
NC_021554.1|WP_000027572.1|2341327_2342188_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|184205
NC_021554.1|WP_000569649.1|2343916_2344861_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|235359
NC_021554.1|WP_000101625.1|2344935_2345325_-|30S-ribosomal-protein-S11	unknown	unknown	gnl|CDD|180007
NC_021554.1|WP_000222277.1|2324412_2326833_+|polysaccharide-lyase-8-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238517
NC_021554.1|WP_000214774.1|2329048_2330566_+|glycosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|340855
NC_021554.1|WP_000143638.1|2328760_2329039_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_021554.1|WP_001622005.1|2335394_2335595_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_021554.1|WP_000769707.1|2331899_2332325_+|MAP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367591
NC_021554.1|WP_001250038.1|2339046_2339484_-|50S-ribosomal-protein-L13	unknown	unknown	gnl|CDD|181703
NC_021554.1|WP_001044440.1|2327031_2327886_-|M23-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|223810
NC_021554.1|WP_000130128.1|2333441_2335106_-|acetolactate-synthase-AlsS	unknown	unknown	gnl|CDD|236312
NC_021554.1|WP_000542274.1|2343531_2343900_-|50S-ribosomal-protein-L17	unknown	unknown	gnl|CDD|235522
NC_021554.1|WP_000170975.1|2338634_2339033_-|30S-ribosomal-protein-S9	unknown	unknown	gnl|CDD|178888
NC_021554.1|WP_001221849.1|2339723_2340527_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA	unknown	unknown	gnl|CDD|234577
NC_021554.1|WP_000044372.1|2330790_2331606_-|HAD-IIB-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|319792
NC_021554.1|WP_000090796.1|2345348_2345714_-|30S-ribosomal-protein-S13	unknown	unknown	gnl|CDD|235358
NC_021554.1|WP_000186132.1|2332700_2333405_-|acetolactate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|226058

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_021554.1|WP_000791632.1|2340531_2341338_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT	gnl|CDD|223692	COG0619, CbiQ, ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters [Inorganic ion transport and metabolism].	5.04502e-49
NC_021554.1|WP_000389669.1|2342184_2342994_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase	gnl|CDD|184207	PRK13648, cbiO, cobalt transporter ATP-binding subunit; Provisional.	0
NC_021554.1|WP_000027572.1|2341327_2342188_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase	gnl|CDD|184205	PRK13646, cbiO, energy-coupling factor transporter ATPase.	0
NC_021554.1|WP_000569649.1|2343916_2344861_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha	gnl|CDD|235359	PRK05182, PRK05182, DNA-directed RNA polymerase subunit alpha; Provisional.	1.89947e-175
NC_021554.1|WP_000101625.1|2344935_2345325_-|30S-ribosomal-protein-S11	gnl|CDD|180007	PRK05309, PRK05309, 30S ribosomal protein S11; Validated.	2.01588e-89
NC_021554.1|WP_000222277.1|2324412_2326833_+|polysaccharide-lyase-8-family-protein	gnl|CDD|238517	cd01083, GAG_Lyase, Glycosaminoglycan (GAG) polysaccharide lyase family. This family consists of a group of secreted bacterial lyase enzymes capable of acting on glycosaminoglycans, such as hyaluronan and chondroitin, in the extracellular matrix of host tissues, contributing to the invasive capacity of the pathogen. These are broad-specificity glycosaminoglycan lyases which recognize uronyl residues in polysaccharides and cleave their glycosidic bonds via a beta-elimination reaction to form a double bond between C-4 and C-5 of the non-reducing terminal uronyl residues of released products. Substrates include chondroitin, chondroitin 4-sulfate, chondroitin 6-sulfate, and hyaluronic acid. Family members include chondroitin AC lyase, chondroitin abc lyase, xanthan lyase, and hyalurate lyase.	0
NC_021554.1|WP_000214774.1|2329048_2330566_+|glycosyltransferase	gnl|CDD|340855	cd04949, GT4_GtfA-like, accessory Sec system glycosyltransferase GtfA and similar proteins. This family is most closely related to the GT4 family of glycosyltransferases and is named after gtfA in Streptococcus gordonii, where it plays a role in the O-linked glycosylation of GspB, a cell surface glycoprotein involved in platelet binding. In general glycosyltransferases catalyze the transfer of sugar moieties from activated donor molecules to specific acceptor molecules, forming glycosidic bonds. The acceptor molecule can be a lipid, a protein, a heterocyclic compound, or another carbohydrate residue. This group of glycosyltransferases is most closely related to the previously defined glycosyltransferase family 1 (GT1). The members of this family may transfer UDP, ADP, GDP, or CMP linked sugars. The diverse enzymatic activities among members of this family reflect a wide range of biological functions. The protein structure available for this family has the GTB topology, one of the two protein topologies observed for nucleotide-sugar-dependent glycosyltransferases. GTB proteins have distinct N- and C- terminal domains each containing a typical Rossmann fold. The two domains have high structural homology despite minimal sequence homology. The large cleft that separates the two domains includes the catalytic center and permits a high degree of flexibility. The members of this family are found in bacteria.	2.16153e-60
NC_021554.1|WP_000769707.1|2331899_2332325_+|MAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|367591	pfam03642, MAP, MAP domain. This presumed 110 amino acid residue domain is found in multiple copies in MAP (MHC class II analogue protein). The protein has been found in a wide range of extracellular matrix proteins.	6.70728e-35
NC_021554.1|WP_001221849.1|2339723_2340527_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA	gnl|CDD|234577	PRK00021, truA, tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA.	3.32017e-120
NC_021554.1|WP_001250038.1|2339046_2339484_-|50S-ribosomal-protein-L13	gnl|CDD|181703	PRK09216, rplM, 50S ribosomal protein L13; Reviewed.	4.91074e-100
NC_021554.1|WP_001044440.1|2327031_2327886_-|M23-family-metallopeptidase	gnl|CDD|223810	COG0739, NlpD, Membrane proteins related to metalloendopeptidases [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	7.53812e-24
NC_021554.1|WP_000130128.1|2333441_2335106_-|acetolactate-synthase-AlsS	gnl|CDD|236312	PRK08617, PRK08617, acetolactate synthase AlsS.	0
NC_021554.1|WP_000542274.1|2343531_2343900_-|50S-ribosomal-protein-L17	gnl|CDD|235522	PRK05591, rplQ, 50S ribosomal protein L17; Validated.	2.70058e-62
NC_021554.1|WP_000170975.1|2338634_2339033_-|30S-ribosomal-protein-S9	gnl|CDD|178888	PRK00132, rpsI, 30S ribosomal protein S9; Reviewed.	2.2295e-82
NC_021554.1|WP_000044372.1|2330790_2331606_-|HAD-IIB-family-hydrolase	gnl|CDD|319792	cd02605, HAD_SPP, sucrose-phosphatase, similar to Synechocystis sp PCC 6803 SPP. Sucrose-phosphatase (SPP; EC 3.1.3.24) catalyzes the dephosphorylation of sucrose-6(F)-phosphate (Suc6P)-the final step in the pathway of sucrose biosynthesis in plants and cyanobacteria. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	2.68683e-98
NC_021554.1|WP_000090796.1|2345348_2345714_-|30S-ribosomal-protein-S13	gnl|CDD|235358	PRK05179, rpsM, 30S ribosomal protein S13; Validated.	2.16257e-78
NC_021554.1|WP_000186132.1|2332700_2333405_-|acetolactate-decarboxylase	gnl|CDD|226058	COG3527, AlsD, Alpha-acetolactate decarboxylase [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	1.05414e-118

Protein sequences

>NC_021554.1|WP_000655242.1|2335576_2335759_-|hypothetical-protein
MKDSIFWKKAFIPVYFIVAMLVFLLFRFYIKTDNFSIYLMIIFLICLGTASIIYNYKTNR
>NC_021554.1|WP_001622005.1|2335394_2335595_+|hypothetical-protein
MSLSLVFSRWRFEIVVLWWNEFVVLWRYKNAVLWQFQNGVSIKKSQQDLELTVTYTFHTYIYRLVL
>NC_021554.1|WP_000130128.1|2333441_2335106_-|acetolactate-synthase-AlsS
MTDKKYTAADIVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGIVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELETQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN
>NC_021554.1|WP_000186132.1|2332700_2333405_-|acetolactate-decarboxylase
MTNVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHIRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE
>NC_021554.1|WP_000769707.1|2331899_2332325_+|MAP-domain-containing-protein
MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNLIDPSTIKQIQIVVK
>NC_021554.1|WP_000044372.1|2330790_2331606_-|HAD-IIB-family-hydrolase
MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVMTAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSIGNHNKDRRILESLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY
>NC_021554.1|WP_000214774.1|2329048_2330566_+|glycosyltransferase
MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKEVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNNYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRIKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKMFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYPKVENMQNNDVKKIFTIHTNHFLSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAVSFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRGLYTKASLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSK
>NC_021554.1|WP_000143638.1|2328760_2329039_+|hypothetical-protein
MTFNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK
>NC_021554.1|WP_001044440.1|2327031_2327886_-|M23-family-metallopeptidase
MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDDTMEQIWIDKAKQFGVSVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKKQGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFLNNRELIKGDVVCGLQGE
>NC_021554.1|WP_000222277.1|2324412_2326833_+|polysaccharide-lyase-8-family-protein
MTYRMKKWQKLSTITLLMAGVITLSDGEFRSVDKHQIAVADTNTQTPNYEKLKNTWLDVNYGYDKYDESNPDMKKKFEATENEAKKLLSEMKTESGRTYLWESSKDIDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMNHPKTTLKNDENKKKLKDALEWLHKNAYGKDPDKKVADLKTNFSKSAPQKNTNLNWWDYEIGTPKSLTNTLILLNGDISSDEKKKYTAPIKTFAPKSDEILSSVGKAEPAKGGNLVDIAKVKLLESIIEEDKDMTKNSIDSFNKVFTYVQSNSTGKERNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETPFKETSQNDTILKSWIDDGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHSASVTVMKSLLRLSDAMDESTKAKYKKIVKTSVKSDSSYKQNDYLSSYSDISKMKALMEDSTLSTNDLTQQLKIYNDMDRVTYHNKDLDFAFGLSMTSKNVARYESINNENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMKRLAGTTTLDNEEPKENKNSDKTFVGGTKFDDQHASIGMEFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKNTDSSMNPVTTIENRKANGYTLYTDDKQTTNSDNQETNSVFLESTDTKKNIGYHFLNKSKINVKKESHTGKWSEINKSQKTEDKKDEYYEVTQKHSNSDNKYGYVLYPSLSKDVFKSKASQVTVVKQDDDFHVVKDNESVWAGVNYSDSAKTFEINGTKVEVKAKGMFILKKKDDKTYECSFYNPESTNTASDIESKISMTGYSITNKNASTTNESGVRFELTK
>NC_021554.1|WP_000170975.1|2338634_2339033_-|30S-ribosomal-protein-S9
MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR
>NC_021554.1|WP_001250038.1|2339046_2339484_-|50S-ribosomal-protein-L13
MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG
>NC_021554.1|WP_001221849.1|2339723_2340527_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA
MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNKAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEISDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND
>NC_021554.1|WP_000791632.1|2340531_2341338_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT
MKNKLIIGRYLPNDSYVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFVCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV
>NC_021554.1|WP_000027572.1|2341327_2342188_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase
MSIRFNDVSYTYQQGTPYEHQAIHDINTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALIKPTSGTVTIDDVTVTHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMDLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSVLAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKTIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKEKEKLAGWHIGLPDIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK
>NC_021554.1|WP_000389669.1|2342184_2342994_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase
MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIENVKSGEIFYNNQTITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRIVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGHQTSFLTYEGLVNQL
>NC_021554.1|WP_000542274.1|2343531_2343900_-|50S-ribosomal-protein-L17
MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV
>NC_021554.1|WP_000569649.1|2343916_2344861_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha
MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED
>NC_021554.1|WP_000101625.1|2344935_2345325_-|30S-ribosomal-protein-S11
MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV
>NC_021554.1|WP_000090796.1|2345348_2345714_-|30S-ribosomal-protein-S13
MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK

Crispr_ID: NC_021554_6

• CRISPR_ID: NC_021554_6
• CRISPR_location: 2527875-2527968
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NC_021554_6

Consensus_repeat	Method
TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG	CRISPRCasFinder

spacers of NC_021554_6

>6.1|2527901|42|NC_021554|CRISPRCasFinder
CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021554_6

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_021554_6

>merge|NC_021554|6|2527875-2527968|CRISPRCasFinder
TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG

>NC_021554|6|5|2527875-2527968|CRISPRCasFinder
TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG	CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTC
TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_021554.1|WP_000200952.1|2533692_2534160_-|QueT-transporter-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377623
NC_021554.1|WP_001125208.1|2525854_2526541_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase	unknown	unknown	gnl|CDD|184518
NC_021554.1|WP_001012230.1|2520308_2521559_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA	unknown	unknown	gnl|CDD|367067
NC_021554.1|WP_000971558.1|2534873_2535989_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223234
NC_021554.1|WP_000019132.1|2526867_2527734_-|cation-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223131
NC_021554.1|WP_001056918.1|2532656_2533634_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|273388
NC_021554.1|WP_001110067.1|2536975_2538334_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|273109
NC_021554.1|WP_001046647.1|2535966_2536974_-|biotin-synthase-BioB	unknown	unknown	gnl|CDD|235755
NC_021554.1|WP_000727759.1|2517234_2518782_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-lipoprotein-AdcA	unknown	unknown	gnl|CDD|370371
NC_021554.1|WP_000615468.1|2521655_2522387_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224051
NC_021554.1|WP_000916696.1|2531707_2532655_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C	unknown	unknown	gnl|CDD|369625
NC_021554.1|WP_000286884.1|2534170_2534863_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|224342
NC_021554.1|WP_000594516.1|2530210_2531140_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A	unknown	unknown	gnl|CDD|369625
NC_021554.1|WP_000038955.1|2523983_2525423_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NC_021554.1|WP_000162809.1|2519073_2519673_-|DsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224565
NC_021554.1|WP_000819842.1|2519691_2520054_-|DUF4467-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|291399
NC_021554.1|WP_000762708.1|2525596_2525701_+|putative-metal-homeostasis-protein	unknown	unknown	unknown
NC_021554.1|WP_000479573.1|2522383_2523103_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223836
NC_021554.1|WP_001791249.1|2528162_2528267_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_021554.1|WP_000792549.1|2528361_2529675_+|B-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|288473

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_021554.1|WP_001125208.1|2525854_2526541_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase	gnl|CDD|184518	PRK14119, gpmA, phosphoglyceromutase; Provisional.	3.52864e-167
NC_021554.1|WP_001012230.1|2520308_2521559_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA	gnl|CDD|367067	pfam02388, FemAB, FemAB family. The femAB operon codes for two nearly identical approximately 50-kDa proteins involved in the formation of the Staphylococcal pentaglycine interpeptide bridge in peptidoglycan. These proteins are also considered as a factor influencing the level of methicillin resistance.	0
NC_021554.1|WP_000971558.1|2534873_2535989_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein	gnl|CDD|223234	COG0156, BioF, 7-keto-8-aminopelargonate synthetase and related enzymes [Coenzyme metabolism].	5.99985e-138
NC_021554.1|WP_000019132.1|2526867_2527734_-|cation-transporter	gnl|CDD|223131	COG0053, MMT1, Predicted Co/Zn/Cd cation transporters [Inorganic ion transport and metabolism].	1.98386e-90
NC_021554.1|WP_001056918.1|2532656_2533634_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	4.68948e-128
NC_021554.1|WP_001110067.1|2536975_2538334_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase	gnl|CDD|273109	TIGR00508, hypothetical_protein_DESPIG_00326, adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate transaminase. All members of the seed alignment have been demonstrated experimentally to act as EC 2.6.1.62, an enzyme in the biotin biosynthetic pathway. Alternate names include 7,8-diaminopelargonic acid aminotransferase, DAPA aminotransferase, and adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase. The gene symbol is bioA in E. coli and BIO3 in S. cerevisiae. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Biotin].	0
NC_021554.1|WP_001046647.1|2535966_2536974_-|biotin-synthase-BioB	gnl|CDD|235755	PRK06256, PRK06256, biotin synthase; Validated.	0
NC_021554.1|WP_000727759.1|2517234_2518782_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-lipoprotein-AdcA	gnl|CDD|370371	pfam09223, ZinT, ZinT (YodA) periplasmic lipocalin-like zinc-recruitment. ZinT plays a critical role in recruiting periplasmic zinc to the bacterial zinc-uptake complex ZnuABC, consisting of families pfam01297,pfam00950, pfam00005, regulated by the transcription-regulator FUR, pfam01475. ZinT acts as a Zn2+-buffering protein that delivers Zn2+ to ZnuA (TroA), pfam01297. Members of this family of prokaryotic domains were first identified as part of the response of bacteria to a challenge with the toxic heavy metal cadmium. They are able to bind to cadmium, and ensure its subsequent elimination.	4.89631e-101
NC_021554.1|WP_000615468.1|2521655_2522387_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224051	COG1126, GlnQ, ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component [Amino acid transport and metabolism].	1.59267e-145
NC_021554.1|WP_000916696.1|2531707_2532655_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C	gnl|CDD|369625	pfam07968, Leukocidin, Leukocidin/Hemolysin toxin family.	1.96123e-92
NC_021554.1|WP_000286884.1|2534170_2534863_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase	gnl|CDD|224342	COG1424, BioW, Pimeloyl-CoA synthetase [Coenzyme metabolism].	4.99039e-130
NC_021554.1|WP_000200952.1|2533692_2534160_-|QueT-transporter-family-protein	gnl|CDD|377623	pfam06177, QueT, QueT transporter. This family includes the queT gene encoding a hypothetical integral membrane protein with 5 predicted transmembrane regions. The queT genes in Firmicutes are often preceded by the PreQ1 (7-aminomethyl-7-deazaguanine) riboswitches of two distinct classes, suggesting involvement of the QueT transporters in uptake of a queuosine biosynthetic intermediate.	0.00103624
NC_021554.1|WP_000038955.1|2523983_2525423_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	7.17835e-92
NC_021554.1|WP_000162809.1|2519073_2519673_-|DsbA-family-protein	gnl|CDD|224565	COG1651, DsbG, Protein-disulfide isomerase [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	7.90499e-30
NC_021554.1|WP_000819842.1|2519691_2520054_-|DUF4467-domain-containing-protein	gnl|CDD|291399	pfam14729, DUF4467, Domain of unknown function with cystatin-like fold (DUF4467). Large family of predicted lipoproteins from Gram-positive bacteria Experimentally determined structure shows a cystatitin-like fold, allowing us to classify this family in the NFT2 clan, despite lack of any detectable sequence similarity between members of this family and other families in this clan.	1.83927e-31
NC_021554.1|WP_000479573.1|2522383_2523103_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223836	COG0765, HisM, ABC-type amino acid transport system, permease component [Amino acid transport and metabolism].	8.38308e-78
NC_021554.1|WP_000594516.1|2530210_2531140_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A	gnl|CDD|369625	pfam07968, Leukocidin, Leukocidin/Hemolysin toxin family.	2.15607e-97
NC_021554.1|WP_000792549.1|2528361_2529675_+|B-domain-containing-protein	gnl|CDD|288473	pfam11621, Sbi-IV, C3 binding domain 4 of IgG-bind protein SBI. This family of proteins represents Sbi domain IV which binds the central complement protein C3. Sbi-IV interacts with Sbi-III to induce a consumption of complement via alternative pathway activation. When not interacting with Sbi-III, Sbi-IV inhibits the alternative pathway without complement consumption. The structure of Sbi-IV consists of a three-helix bundle fold.	7.22146e-28

Protein sequences

>NC_021554.1|WP_000019132.1|2526867_2527734_-|cation-transporter
MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNEITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL
>NC_021554.1|WP_001125208.1|2525854_2526541_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase
MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL
>NC_021554.1|WP_000762708.1|2525596_2525701_+|putative-metal-homeostasis-protein
MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK
>NC_021554.1|WP_000038955.1|2523983_2525423_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA
MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIEMMNQIKIDTMLHGYHAGFLFALLITVISFFCSFMLQGKKKEVDSHQ
>NC_021554.1|WP_000479573.1|2522383_2523103_-|amino-acid-ABC-transporter-permease
MFLNLNSEQLHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKVLRSIARVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYRQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS
>NC_021554.1|WP_000615468.1|2521655_2522387_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein
MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVGKGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEIFNNPKTEELKRFLNVINEE
>NC_021554.1|WP_001012230.1|2520308_2521559_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA
MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLIDPYLIENLRNAEGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESAEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMLYKLQTYLKHKRR
>NC_021554.1|WP_000819842.1|2519691_2520054_-|DUF4467-domain-containing-protein
MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDERVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN
>NC_021554.1|WP_000162809.1|2519073_2519673_-|DsbA-family-protein
MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAEDHHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK
>NC_021554.1|WP_000727759.1|2517234_2518782_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-lipoprotein-AdcA
MKKKLGMLLLVPAVTLSLAACGNDDGKDKDGKVTIKTTVYPLQSFAEQIGGKHVKVSSIYPAGTDLHSYEPTQKDILSASKSDLFMYTGDNLDPVAKKVASTIKDKDKKLSLEDKLDKAKLLTDQHEHGEEHEHEGHDHEKEEHHHHGGYDPHVWLDPKINQTFAKEIKDELVKKDPKHKDDYEKNYKKLNDDLKKIDNDMKQVTKDKQGNAVFISHESIGYLADRYGFVQKGIQNMNAEDPSQKELTKIVKEIRDSNAKYILYEDNVANKVTETIRKETDAKPLKFYNMESLNKEQQKKDNITYQSLMKSNIENIGKALDSGVKVKDDKAESKHDKAISDGYFKDEQVKDRELSDYAGEWQSVYPYLKDGTLDEVMEHKAENDPKKSAKDLKAYYDKGYKTDITNIDIKGNEITFTKDGKKHTGKYEYNGKKTLKYPKGNRGVRFMFKLVDGNDKDLPKFIQFSDHYIAPKKAEHFHIFMGNDNDALLKEMDNWPTYYPSKLNKDQIKEEMLAH
>NC_021554.1|WP_001791249.1|2528162_2528267_-|hypothetical-protein
MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKKVLYGEMQ
>NC_021554.1|WP_000792549.1|2528361_2529675_+|B-domain-containing-protein
MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQSSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNKYYQYKGLIDKTVLTTIGSGYGSYIKPLEVSKESGNLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYAFYQKPELVKTAIKAQETATTFKNALTGIFKSFWK
>NC_021554.1|WP_000594516.1|2530210_2531140_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A
MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHEKGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK
>NC_021554.1|WP_000916696.1|2531707_2532655_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C
MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLEKAKAANDTEDIGKGNDVEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDPNVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFVTASGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSGDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFKNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN
>NC_021554.1|WP_001056918.1|2532656_2533634_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B
MNMNKLVKSSVATSMALLLLSNTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYERPNPKDYDFSKIYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNYKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETEINK
>NC_021554.1|WP_000200952.1|2533692_2534160_-|QueT-transporter-family-protein
MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLILSVILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR
>NC_021554.1|WP_000286884.1|2534170_2534863_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase
MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQNLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV
>NC_021554.1|WP_000971558.1|2534873_2535989_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein
MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKTVGYIDRQYIEVENQRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKNDFEKFMRKYSYHLSSSRLISGSSAAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLTLFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKSLNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQILLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED
>NC_021554.1|WP_001046647.1|2535966_2536974_-|biotin-synthase-BioB
MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYGTCENKENKNDVSRAN
>NC_021554.1|WP_001110067.1|2536975_2538334_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase
MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKCKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPLLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC

Self-targeting detection

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NC_021554_3	3.1|840231|32|NC_021554|CRISPRCasFinder	840231-840262	32	NC_021554.1	2568518-2568549	0	1.0
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NC_021554_1	1.1|787508|36|NC_021554|CRT	787508-787543	36	NC_021554.1	430349-430384	2	0.944
NC_021554_1	1.3|787623|36|NC_021554|CRT	787623-787658	36	NC_021554.1	90092-90127	2	0.944
NC_021554_1	1.3|787623|36|NC_021554|CRT	787623-787658	36	NC_021554.1	430349-430384	2	0.944
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NC_021554_1	1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder	787623-787654	32	NC_021554.1	2409712-2409743	2	0.938
NC_021554_3	3.1|840231|32|NC_021554|CRISPRCasFinder	840231-840262	32	NC_021554.1	1942208-1942239	2	0.938

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3. spacer 3.1|840231|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 280703-280734, mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 4.2|927649|14|NC_021554|PILER-CR matches to position: 1361648-1361661, mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 4.2|927649|14|NC_021554|PILER-CR matches to position: 2409847-2409860, mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 4.2|927649|14|NC_021554|PILER-CR matches to position: 2409903-2409916, mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 4.2|927649|14|NC_021554|PILER-CR matches to position: 2409959-2409972, mismatch: 0, identity: 1.0

cttacaataatgtg	CRISPR spacer
cttacaataatgtg	Protospacer
**************

24. spacer 4.2|927649|14|NC_021554|PILER-CR matches to position: 2410015-2410028, mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 4.2|927649|14|NC_021554|PILER-CR matches to position: 2568530-2568543, mismatch: 0, identity: 1.0

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cttacaataatgtg	Protospacer
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26. spacer 1.1|787508|36|NC_021554|CRT matches to position: 948021-948056, mismatch: 1, identity: 0.972

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27. spacer 1.3|787623|36|NC_021554|CRT matches to position: 948021-948056, mismatch: 1, identity: 0.972

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****************************.*******

28. spacer 1.4|787565|33|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 1066896-1066928, mismatch: 1, identity: 0.97

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**************************.******

29. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 948025-948056, mismatch: 1, identity: 0.969

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****************************.***

30. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 1361594-1361625, mismatch: 1, identity: 0.969

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***********************.********

31. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 2129815-2129846, mismatch: 1, identity: 0.969

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**************************.*****

32. spacer 1.1|787508|36|NC_021554|CRT matches to position: 90092-90127, mismatch: 2, identity: 0.944

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***************************..*******

33. spacer 1.1|787508|36|NC_021554|CRT matches to position: 430349-430384, mismatch: 2, identity: 0.944

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cagaggatttcgaaaagaaattctacagacaatgca	Protospacer
*****.*********************.********

34. spacer 1.3|787623|36|NC_021554|CRT matches to position: 90092-90127, mismatch: 2, identity: 0.944

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***************************..*******

35. spacer 1.3|787623|36|NC_021554|CRT matches to position: 430349-430384, mismatch: 2, identity: 0.944

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*****.*********************.********

36. spacer 1.4|787565|33|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 833728-833760, mismatch: 2, identity: 0.939

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********.*** ********************

37. spacer 1.4|787565|33|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 1066955-1066987, mismatch: 2, identity: 0.939

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** ***********************.******

38. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 90096-90127, mismatch: 2, identity: 0.938

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***************************..***

39. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 280580-280611, mismatch: 2, identity: 0.938

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***************************..***

40. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 430349-430380, mismatch: 2, identity: 0.938

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*****.*********************.****

41. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 833671-833702, mismatch: 2, identity: 0.938

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***************************..***

42. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 1668095-1668126, mismatch: 2, identity: 0.938

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***************************..***

43. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 1884965-1884996, mismatch: 2, identity: 0.938

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************* **************.***

44. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 2409712-2409743, mismatch: 2, identity: 0.938

cagagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa	CRISPR spacer
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***************************..***

45. spacer 3.1|840231|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to position: 1942208-1942239, mismatch: 2, identity: 0.938

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*********.****** ***************

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	765893 : 773712	10	Hokovirus(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	785688 : 800079	13	uncultured_Caudovirales_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	1042207 : 1050680	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	1306167 : 1320676	25	Staphylococcus_phage(57.14%)	integrase,portal,capsid,terminase	attL 1299990:1300007|attR 1324479:1324496
DBSCAN-SWA_5	1498502 : 1584594	105	Staphylococcus_phage(71.25%)	protease,portal,integrase,capsid,tRNA,tail,head,terminase,holin,plate	attL 1536504:1536521|attR 1583111:1583128
DBSCAN-SWA_6	1639713 : 1648025	7	Staphylococcus_phage(16.67%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	1717338 : 1726382	7	uncultured_Mediterranean_phage(50.0%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	1856290 : 1903845	43	Staphylococcus_phage(88.89%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_9	1943523 : 2016910	86	Staphylococcus_phage(81.54%)	portal,integrase,capsid,tRNA,tail,head,terminase,holin,plate	attL 1976941:1976957|attR 2024443:2024459
DBSCAN-SWA_10	2038030 : 2134692	114	Staphylococcus_phage(85.71%)	protease,transposase,integrase,capsid,tRNA,tail,head,terminase,holin	attL 2100316:2100333|attR 2125890:2125907

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NC_021554|765893:773712|DBSCAN-SWA
ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTACGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCATTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCATAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCATAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAAGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAGCAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACGCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATAAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGATATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTTATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGCGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGACTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACAATTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATAACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGGTGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGTCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAATTGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCCTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCACCAGGGCCGGGTAATCCTGATGATTATCCAATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGGTTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTACATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAGGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTATTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATCTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCCACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTTTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTAAAAAAGCGGAAAACATAAATTCAATATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAACATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGCGAAACGTATCAGGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACTGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTCATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGAATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NC_021554|765893:773712|770964_771633_-|WP_000446726.1|DBSCAN-SWA
MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKQFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL
>NC_021554|765893:773712|770543_770963_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA
MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV
>NC_021554|765893:773712|768423_768864_-|WP_001093554.1|DBSCAN-SWA
MNTKYFLAVGAAAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK
>NC_021554|765893:773712|767609_768083_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA
MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG
>NC_021554|765893:773712|772560_773712_+|WP_001217805.1|DBSCAN-SWA
MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFKKAENINSIYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML
>NC_021554|765893:773712|769143_769728_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA
MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF
>NC_021554|765893:773712|766948_767635_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA
MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR
>NC_021554|765893:773712|765893_766949_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA
MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS
>NC_021554|765893:773712|771983_772577_+|WP_000604517.1|DBSCAN-SWA
MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKVTAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI
>NC_021554|765893:773712|769826_770540_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA
MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000244415.1|765893_766949_-	two-component system sensor histidine kinase SaeS	A0A1V0SGX0	Hokovirus	3.6e-14	29.8
WP_000149344.1|766948_767635_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_001037807.1|767609_768083_-	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001093554.1|768423_768864_-	DM13 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000637683.1|769143_769728_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001062976.1|769826_770540_-	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	A0A1U9WRB6	Streptococcus_virus	6.5e-52	43.5
WP_000941336.1|770543_770963_-	6-carboxytetrahydropterin synthase QueD	S4U060	uncultured_phage	6.3e-07	28.7
WP_000446726.1|770964_771633_-	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	7.4e-66	57.5
WP_000604517.1|771983_772577_+	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	8.9e-39	44.0
WP_001217805.1|772560_773712_+	anthranilate synthase component I family protein	S4VNU7	Pandoravirus	2.1e-23	36.1

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDVWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK
>NC_021554|785688:800079|789442_790948_-|WP_000193753.1|DBSCAN-SWA
MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGTSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR
>NC_021554|785688:800079|791808_792675_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA
MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000663021.1|785688_786747_+	histidinol-phosphate transaminase	A0A0H3TLT9	Faustovirus	2.6e-20	26.9
WP_000197263.1|786904_787453_+	5'-3'-deoxyribonucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_000429016.1|788255_789173_-	diacylglycerol kinase family lipid kinase	A0A1V0SBJ0	Catovirus	2.1e-07	22.4
WP_031785486.1|789263_789365_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000193753.1|789442_790948_-	peptide MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	2.6e-58	32.2
WP_000930014.1|791288_791789_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	E7DN65	Pneumococcus_phage	5.9e-52	71.5
WP_001068497.1|791808_792675_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_000692521.1|793476_793875_+	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	A0A2H4J545	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-52	72.0
WP_000855505.1|793837_795943_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4J2N6	uncultured_Caudovirales_phage	0.0e+00	91.7
WP_000562500.1|796060_797032_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A2H4J4P3	uncultured_Caudovirales_phage	3.2e-171	91.3
WP_000876313.1|797406_798378_+	ABC transporter permease	A0A2H4IY97	uncultured_Caudovirales_phage	1.0e-140	79.9
WP_001245581.1|798364_799321_+	iron chelate uptake ABC transporter family permease subunit	A0A2H4J116	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-05	57.8
WP_000616861.1|799317_800079_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	Q9EMR9	Amsacta_moorei_entomopoxvirus	2.7e-16	30.6

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NC_021554|1042207:1050680|DBSCAN-SWA
AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACAACGCTACCAGTTATTGGAGTACCAATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTCTAGATTCTTTATTATCTATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAATGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAATCCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAATATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGCTGTATTGGATCCTACTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAAGTTGTCCCATTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAGACAACAATCAAATCACTTATTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAAGCGTGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAACAGAAAAATGGGTCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGTGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAGCAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGCGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCATTAAATGATCCTTTGATTACAGATGATCACATCAAATTACTGAATATTGCGACAGATAAAGATATTGAAACATTAAAAACGAAAGCGCTAGAAATTAATCAAGTATTAAAACAATTAATGGATGCGATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGATCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGATTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTGTTAGATGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCTGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATTGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCATTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAACTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTGTGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGTTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGTCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATCGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAATCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATACCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAGCAAAACCAACGATTACTTAAAGGTGTTGTTAAAGGGATAGGTGGCTACGGCAACTGTATTGGTATACCAACAACAGCTGGTGAAATTGAATTTGATGAACGATACGATGGCAATCCACTAGTTAATGCAATGTGCGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCTTCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGTTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTACGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGAAGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAAATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAACATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTTCGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGTAATTTAATTGCGGTTGGAGCCACACCATTAGCAATGACTGACTGCTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATTTATCAACAGCTGATAGATTCAACGAAGGGTATGGCAGAAGCATGCGAAATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGTAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGAAAAGTTAATTTATGGCAAAGTTAATCATGAATATGAGCCATTAGATTTGAGTTCAGAAGTTGAAAAAGGTGAATCAATCAAGACCGCTATTCGTGAAGGACTATTATCACATGTTCAAACAGTTGGTAAAGGTGGCTTACTGATTACCTTAGCTAAACTAAGTGCGCATTACGGTTTAGGATTAAAGTCTTCAATAGATATAACAAATGCACAATTGTTTAGTGAGACACAAGGCCGATATGTTGTTTCTGTTAAATCAGGTAAAACTTTAAATATTGATAATGCAATAGAAATTGGACTTTTAACAGATAGTGATAATTTCAAAGTAACAACACCATATACAGAGATTAGTGAAAATGTTTCAGATATTAAACAAATATGGGAAGGGGCAATTGCTCAATGTTTAACTACTCAGGATTAAACGAAGAATGTGGCGTGTTTGGTATTTGGAATCATCCTGAAGCAGCGCAACTAACATATATGGGACTTCATAGTTTGCAACATCGTGGTCAAGAAGGTGCAGGTATAGTTGTTTCTGATCAAAATGAATTAAAAGGCGAGCGAGGATTAGGCTTACTAACTGAAGCGATTAAAGATGACCAAATGGAACGATTAAAAGGATATCAACATGCAATTGGTCACGTCCGTTATGCTACTTCAGGTAATAAAGGTATTGAAAATATTCAACCGTTTCTGTATCACTTTTATGATATGAGTGTAGGTATTTGTCATAATGGTAACCTCATTAATGCTAAATCATTGCGTCAGAATTTAGAAAAACAAGGTGCTATCTTCCATTCGTCTTCTGATACTGAAGTCATTATGCATTTGATACGTCGAAGTAAAGCTCCTACTTTTGAGGAAGCGTTGAAAGAAAGTTTGCGAAAAGTTAAAGGCGGTTTTACATTTGCGATTTTAACTAAAGATGCGTTATATGGCGCAGTAGATCCAAATGCTATCAGACCTCTTGTTGTAGGTAAAATGAAAGATGGTACATACATCCTTGCAAGTGAAACATGTGCAATAGATGTGTTAGGTGCAGAATTTGTTCAAGATATTCATGCAGGTGAATATGTCGTGATTAACGATAAAGGTATTACAGTTAAATCCTATACACATCATACGACAACTGCAATTTCTGCGATGGAATATATTTATTTTGCGAGACCAGACTCAACAATAGCTGGTAAAAATGTCCATGCAGTACGTAAAGCTTCTGGTAAAAAATTAGCCCAAGAAAGCCCTGTAAACGCTGATATGGTCATCGGTGTACCTAATTCATCATTATCTGCAGCGAGCGGTTATGCTGAAGAAATCGGTTTGCCATATGAAATGGGACTAGTTAAAAATCAATATGTTGCAAGAACATTTATTCAACCAACGCAAGAGTTACGTGAACAAGGTGTAAGGGTGAAGCTATCTGCAGTGAAAGATATTGTAGACGGTAAAAATATTATTCTTGTTGATGATTCTATTGTTCGCGGTACGACAATTCGACGCATTGTGAAAATGTTAAAAGATTCTGGTGCAAATAAAGTGCATGTGCGTATAGCATCGCCGGAATTTATGTTCCCGAGTTTTTATGGAATCGATGTTTCAACAACGGCAGAATTAATTTCTGCAAGCAAATCACCTGAAGAAATTAAAGATTATATTGGCGCTGATTCGTTAGCATATCTATCTGTAGATGGGTTAATTGAATCAATTGGTTTAGATTATGACGCGCCTTATAGTGGCTTATGTGTAGAAAGTTTCACTGGAGATTATCCTGCAGGGTTATATGATTATGAAGCAAATTATAAAGCACATTTAAGTCATCGACAAAAGCAATATATTTCTAAAAACAAACACTTTTTTGATAGCGAGGGAAATTTAAATGTCTAAAGCATATGAACAATCTGGTGTTAATATTCATGCTGGTTATGAATCTGTAGAAAGAATGTCTAGTCATGTTAAACGTACGATGCGTAAAGAAGTTATTGGTGGTTTAGGTGGATTCGGTGCTACATTTGATTTATCACAATTAAATATGACAGCGCCAGTTTTAGTTTCTGGAACAGACGGAGTAGGTACGAAATTAAAACTAGCTATCGACTATGGTAAACATGATTCGATAGGTATCGATGCAGTTGCAATGTGTGTTAATGATATTTTAACGACAGGTGCAGAACCATTGTATTTTTTAGATTATATCGCTACAAATAAAGTTGTTCCTGAAGTTATTGAACAAATTGTTAAAGGTATTAGTGATGCATGTGTTGAAACGAATACTGCACTTATCGGTGGAGAGACTGCTGAAATGGGTGAAATGTATCACGAAGGCGAATATGATGTAGCTGGATTTGCTGTTGGAGTAGTTGAAAAGGATGACTATGTAGATGGTTCAGAAGTAAAAGAGAGACAAGTTGTTATAGGGCTTGCGTCAAGTGGCATTCATTCAAATGGATACAGTTTAGTGCGTAAATTAATTAATGAATCAGGCATTGATTTGGCATCAAACTTCGATAATCGTCCATTTATAGATGTCTTTTTAGAACCAACTAAATTATATGTCAAACCTGTACTTGCTTTGAAAAAAGAAGTTTCTATTAAGGCAATGAATCATATTACTGGTGGAGGTTTTTATGAAAATATTCCACGTGCATTGCCAGCCGGATATGCTGCTAGAATTGATACTACATCATTTCCAACGCCAAAAATATTTGATTGGTTACAACAGCAAGGCAATATTGACACAAATGAAATGTATAACATTTTTAATATGGGTATTGGCTATACAGTTATCGTTGATGAAAAAGATGCATCACGCGCATTGAAGATTTTAGCCGAACAAGATGTGGAAGCCTATCAGATTGGTCATATTGTGAAAAATGAGTCAACTGCAATTGAATTGTTGGGGGTATAACAATGGTTAAAATTGCGATTTTTGCATCTGGTTCAGGAAGTAACTTTGAAAATATAGTTGATCATGTTGAATCAGGAAAACTTGAAAATATTGAAGTTACGGCGCTATATACGGATCATCAAAATGCGTTTTGTATAGATAGAGCAAAAAAGCACGATATACCTGTGTATATTAATGAACCAAAACAATTTGATTCAAAAGCAGCGTATGAACAACATTTAGTAACTTTATTAAATAAAGATAAGGTAGAGTGGATTATTTTAGCTGGCTACATGCGTCTAATTGGTCCAGACTTATTAGCTTCATTTGAAGGTAAAATATTGAATATACATCCATCTCTATTGCCGAAATATAAGGGGATTGACGCAATAGGCCAAGCATATCATAGTGGCGATACTATTACTGGTTCGACAGTACATTATGTTGATAGTGGTATGGATACGGGAGAAATTATTGAACAGAGACAATGTGATATTAGACCGGACGATTCAAAAGAACAATTAGAAGAGAAAGTAAAAAAATTGGAATATGAGTTATATCCAAGTGTTATTGCTAAAATTGTAAAATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NC_021554|1042207:1050680|1043804_1044509_+|WP_000174048.1|DBSCAN-SWA
MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETDQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK
>NC_021554|1042207:1050680|1049082_1050111_+|WP_000030827.1|DBSCAN-SWA
MSKAYEQSGVNIHAGYESVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGVVEKDDYVDGSEVKERQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQDVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV
>NC_021554|1042207:1050680|1042676_1043801_+|WP_001010404.1|DBSCAN-SWA
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>NC_021554|1042207:1050680|1044508_1044772_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA
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>NC_021554|1042207:1050680|1047605_1049090_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA
MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV
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MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACEILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEYEPLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD
>NC_021554|1042207:1050680|1050113_1050680_+|WP_000238657.1|DBSCAN-SWA
MVKIAIFASGSGSNFENIVDHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK
>NC_021554|1042207:1050680|1042207_1042690_+|WP_001622461.1|DBSCAN-SWA
MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001622461.1|1042207_1042690_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	8.0e-22	44.7
WP_001010404.1|1042676_1043801_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_000174048.1|1043804_1044509_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4R1E8	Synechococcus_phage	4.0e-46	41.2
WP_000848350.1|1044508_1044772_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_000666803.1|1044773_1045445_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase I	NA	NA	NA	NA
WP_000032752.1|1045437_1047627_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	3.5e-141	39.8
WP_000483713.1|1047605_1049090_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	3.2e-45	31.7
WP_000030827.1|1049082_1050111_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.2e-62	41.7
WP_000238657.1|1050113_1050680_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	8.0e-29	39.6

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NC_021554|1498502:1584594|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MMQTYKVCLCIKFFASKCDYKLKKHYFVKSTNEEKATNMVLKLIRKKLPFETASIEVEKVEAI

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000005212.1|1508380_1508956_-	YpiB family protein	G3MAV7	Bacillus_virus	2.1e-08	27.2
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WP_001269939.1|1512618_1513785_-	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	2.6e-34	32.3
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WP_000442481.1|1514602_1515052_-	nucleoside-diphosphate kinase	D2E8E1	Anguillid_herpesvirus	5.4e-28	43.8
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WP_000450565.1|1516832_1517405_-	heptaprenyl diphosphate synthase component 1	NA	NA	NA	NA
WP_001043863.1|1517835_1518108_-	HU family DNA-binding protein	A7KV42	Bacillus_phage	4.2e-28	73.3
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1536504:1536521	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_000152769.1|1567787_1567943_-	hypothetical protein	A0A2I6PDP0	Staphylococcus_phage	3.5e-19	94.1
WP_076050776.1|1567954_1569907_-	DNA polymerase	A0A2I6PE86	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.7
WP_016528725.1|1569974_1570532_-	DUF2815 family protein	A0A2K9VBT2	Staphylococcus_phage	3.9e-97	99.5
WP_015581855.1|1570557_1571724_-	DUF2800 domain-containing protein	A7TWG4	Staphylococcus_phage	1.8e-221	100.0
WP_000985986.1|1571720_1572083_-	hypothetical protein	Q4ZCP8	Staphylococcus_virus	2.2e-56	100.0
WP_000175000.1|1572097_1572421_-	hypothetical protein	A0A2I6PDL5	Staphylococcus_phage	1.3e-52	100.0
WP_001285954.1|1572499_1572661_-	DUF1270 domain-containing protein	A7TWM3	Staphylococcus_phage	8.6e-21	100.0
WP_001124160.1|1572673_1572937_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A7TWG0	Staphylococcus_phage	5.7e-46	100.0
WP_001097552.1|1572961_1573177_-	hypothetical protein	A0A2I6PF01	Staphylococcus_phage	1.9e-31	100.0
WP_001128433.1|1573231_1573597_+	hypothetical protein	A0A2I6PF07	Staphylococcus_phage	2.4e-63	100.0
WP_001025401.1|1573565_1573811_-	DUF2829 domain-containing protein	A0A2I6PF15	Staphylococcus_phage	5.1e-41	100.0
WP_000773059.1|1573877_1574258_+	DUF2513 domain-containing protein	Q4ZCQ5	Staphylococcus_virus	5.8e-68	100.0
WP_001148860.1|1574244_1574442_-	hypothetical protein	A7TWF5	Staphylococcus_phage	4.6e-24	100.0
WP_000362644.1|1574511_1574724_+	hypothetical protein	D2JGJ1	Staphylococcus_phage	7.6e-33	100.0
WP_000771849.1|1574764_1574914_-	hypothetical protein	D2JGJ0	Staphylococcus_phage	1.4e-20	100.0
WP_000435357.1|1574928_1575372_-	hypothetical protein	A7TWF2	Staphylococcus_phage	8.9e-76	100.0
WP_000213811.1|1575419_1575632_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A7TWF1	Staphylococcus_phage	1.6e-30	100.0
WP_000511090.1|1575783_1576515_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	S4SVC5	Staphylococcus_phage	1.3e-132	99.2
WP_000705240.1|1576585_1576768_+	hypothetical protein	A0A2I6PDR4	Staphylococcus_phage	5.3e-27	100.0
WP_001794606.1|1576804_1576951_+	hypothetical protein	A0A2I6PEK8	Staphylococcus_phage	2.6e-16	97.9
WP_000191459.1|1576947_1577562_-	hypothetical protein	A7TW88	Staphylococcus_phage	7.9e-107	100.0
WP_000264751.1|1577687_1578893_+|integrase	site-specific integrase	A0A2I6PEN0	Staphylococcus_phage	7.7e-223	100.0
WP_001827592.1|1578935_1580963_-	hypothetical protein	B5WZK7	Staphylococcus_phage	4.2e-56	56.3
WP_001622322.1|1580955_1581885_-	DUF1672 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000987760.1|1582136_1583888_-	two-component system sensor histidine kinase SrrB	A0A1V0SGX0	Hokovirus	1.3e-21	33.3
1583111:1583128	attR	NA	NA	NA	NA
WP_000064074.1|1583868_1584594_-	two-component system response regulator SrrA	W8CYM9	Bacillus_phage	6.0e-45	43.0

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NC_021554|1639713:1648025|DBSCAN-SWA
ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGCTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAGCCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAGCATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAATCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTCAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTATATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAATGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTAACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCCTTACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGCTGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAGCCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCTTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGCAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAACTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTCTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAACAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGTACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAACAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAATTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACATATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTCGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATTCGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAATACCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATGGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAACTATATTGTTCTAGGCTAATTAATGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAATGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAAATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGGCCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCATTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTAGTAAGTATGTTAATGCTTTTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCGATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NC_021554|1639713:1648025|1644087_1644765_-|WP_000624564.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTESLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSAQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINEEIAVIERVL
>NC_021554|1639713:1648025|1641524_1642871_-|WP_001062169.1|DBSCAN-SWA
MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHISQFKAGVSVEVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG
>NC_021554|1639713:1648025|1640624_1641515_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA
MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ
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MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD
>NC_021554|1639713:1648025|1642984_1644085_-|WP_000683915.1|DBSCAN-SWA
MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTALKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESKGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKLRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI
>NC_021554|1639713:1648025|1646225_1648025_-|WP_001217237.1|DBSCAN-SWA
MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEKALTYLLERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISFMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM
>NC_021554|1639713:1648025|1639713_1640499_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA
MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001213908.1|1639713_1640499_-	metal ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	8.0e-19	28.3
WP_000924214.1|1640624_1641515_-	deoxyribonuclease IV	A0A2H4UU70	Bodo_saltans_virus	2.0e-26	33.1
WP_001062169.1|1641524_1642871_-	DEAD/DEAH box helicase	A0A1V0SIR5	Klosneuvirus	5.3e-55	33.7
WP_000683915.1|1642984_1644085_-	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	A0A1S5V250	Saudi_moumouvirus	3.0e-08	30.6
WP_000624564.1|1644087_1644765_-|tRNA	tRNA (adenine-N(1))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_001283055.1|1644895_1646002_-	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	1.1e-37	38.1
WP_001217237.1|1646225_1648025_-	DNA primase	A0A0K1LMQ9	Caulobacter_phage	1.3e-53	36.0

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NC_021554|1717338:1726382|DBSCAN-SWA
TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTCGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATTGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTTATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGTTCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGTATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCCACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATTATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAAGGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCGAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCCGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCACTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGCCTTGGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGATATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACAATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATAATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCAAAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGATCCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTAAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCTGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACGCCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCACTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATCCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAATACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII
>NC_021554|1717338:1726382|1717878_1720152_-|WP_000594988.1|DBSCAN-SWA
MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKAIERIKRAIVNDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNNQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGTVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDKNIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIEKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS
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MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE
>NC_021554|1717338:1726382|1720355_1722635_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA
MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV
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MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF
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MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG
>NC_021554|1717338:1726382|1722909_1723170_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA
MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_000594988.1|1717878_1720152_-	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	7.3e-65	29.5
WP_000749795.1|1720355_1722635_-	protein translocase subunit SecDF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-31	35.8
WP_001160682.1|1722909_1723170_-	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	8.2e-05	35.3
WP_001112045.1|1723188_1724328_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-85	44.7
WP_001019178.1|1724350_1725376_-|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_001005768.1|1725377_1726382_-	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.7e-05	29.1

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NC_021554|1856290:1903845|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001622206.1|1863505_1865923_-|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	98.7
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WP_000764418.1|1868452_1869016_+	class I SAM-dependent methyltransferase	A0A2H4PQV0	Staphylococcus_phage	4.1e-102	98.4
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WP_000933821.1|1889995_1891189_-	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	4.3e-218	99.5
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WP_000672013.1|1894283_1894757_-	nucleoside triphosphatase YtkD	A0A2H4PQM4	Staphylococcus_phage	7.2e-84	98.7
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WP_000778530.1|1895076_1896078_-	o-succinylbenzoate synthase	A0A2H4PQM0	Staphylococcus_phage	3.1e-185	97.6
WP_001622194.1|1896082_1897561_-	o-succinylbenzoate--CoA ligase	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	3.9e-277	94.9
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WP_001796416.1|1899703_1900354_+	excalibur calcium-binding domain-containing protein	A0A2H4PQM8	Staphylococcus_phage	1.3e-30	70.4
WP_000070666.1|1900434_1901430_+	DUF4352 domain-containing protein	A0A2H4PQN2	Staphylococcus_phage	1.9e-73	97.2
WP_000669031.1|1901505_1902132_+	hypothetical protein	A0A2H4PQM7	Staphylococcus_phage	3.9e-85	84.1
WP_000627532.1|1902172_1902514_+	DUF3969 family protein	A0A2H4PQN6	Staphylococcus_phage	4.8e-53	91.2
WP_098686295.1|1902715_1903845_-|transposase	IS3 family transposase	A0A2I7SC85	Paenibacillus_phage	5.2e-80	54.3

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NC_021554|1943523:2016910|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000379990.1|1943998_1945126_-|tRNA	tRNA epoxyqueuosine(34) reductase QueG	NA	NA	NA	NA
WP_000590809.1|1945276_1945999_-	amino acid ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.3e-36	42.7
WP_000649917.1|1945991_1947449_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_000063547.1|1947707_1948769_-	PTS transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_000110011.1|1957597_1958044_-	peroxide-responsive transcriptional repressor PerR	NA	NA	NA	NA
WP_000869466.1|1958140_1959091_-	phosphoglycerate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_000939524.1|1959096_1959552_-	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_001011611.1|1959632_1960922_+	glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase	NA	NA	NA	NA
WP_001796444.1|1961214_1962309_+	aromatic acid exporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016528740.1|1962499_1964236_-	SAV1866 family putative multidrug efflux ABC transporter	W8CYL7	Bacillus_phage	1.7e-53	30.4
WP_000251252.1|1964525_1965068_-	DUF402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001622168.1|1965370_1966408_-	A/G-specific adenine glycosylase	NA	NA	NA	NA
WP_000379095.1|1966559_1967537_+	metal-dependent hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_000886472.1|1967797_1968634_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000535840.1|1968642_1970160_-	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NC_021554|2038030:2134692|DBSCAN-SWA
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MKFKTTKECKSNNIFKRSQEINNRESEKGCLWGISMLILLFLLILFGITACSSSIHFIN
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MTKNYKDMTQEEIKDLLSEKTAELYELAKEIKGESKFDILLFSSIGVIDGDYLAGSSSVIGHTFDLAYLLDSTKSYKDIVNVLQMCKSQKILGIDDDKED

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000284429.1|2055705_2057175_-	nicotinate phosphoribosyltransferase	G3MA18	Bacillus_virus	2.5e-106	44.3
WP_001622122.1|2057358_2058435_+	nitric oxide synthase oxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_031785526.1|2059320_2059428_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_001140871.1|2063287_2064217_+	manganese-dependent inorganic pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_001790680.1|2064409_2064583_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000181320.1|2066133_2067162_-	lactonase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000205103.1|2067431_2067833_+	YolD-like family protein	U3PG23	Staphylococcus_phage	1.3e-22	42.9
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WP_000713063.1|2069610_2070453_-	DUF4097 family beta strand repeat protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000966286.1|2071066_2071591_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_000182842.1|2071711_2072275_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001221648.1|2072340_2073081_-	phenol-soluble modulin export ABC transporter permease subunit PmtD	NA	NA	NA	NA
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WP_000645721.1|2073949_2074630_-	phenol-soluble modulin export ABC transporter permease subunit PmtB	NA	NA	NA	NA
WP_000991300.1|2074630_2075527_-	phenol-soluble modulin export ABC transporter ATP-binding protein PmtA	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.1e-16	30.2
WP_000691584.1|2075523_2075904_-	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_000681966.1|2076161_2076338_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000990056.1|2076579_2076678_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001068518.1|2076877_2078164_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_000669710.1|2078434_2080504_-	extracellular adherence protein Eap/Map	NA	NA	NA	NA
WP_000669789.1|2081461_2081641_+	hypothetical protein	A0A1W6JQ29	Staphylococcus_phage	2.2e-25	100.0
WP_001791826.1|2081951_2082212_+	hypothetical protein	M9NS66	Staphylococcus_phage	2.3e-23	100.0
WP_000702263.1|2082264_2082615_-	complement inhibitor SCIN-A	A0A1P8L6B0	Staphylococcus_phage	7.5e-54	100.0
WP_000727649.1|2083298_2083748_+	chemotaxis-inhibiting protein CHIPS	A0A1P8L6A8	Staphylococcus_phage	1.1e-78	100.0
WP_000919350.1|2084827_2085319_-	staphylokinase	A0A1X9H028	Staphylococcus_phage	9.5e-87	100.0
WP_000861038.1|2085509_2086265_-	CHAP domain-containing protein	D2JLG5	Staphylococcus_phage	3.4e-152	100.0
WP_000611509.1|2086276_2086531_-|holin	phage holin	D2JLG4	Staphylococcus_phage	3.4e-40	98.8
WP_001791821.1|2086582_2086690_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011447039.1|2086742_2086919_-|holin	putative holin-like toxin	D2JLG3	Staphylococcus_phage	2.2e-22	98.3
WP_001040261.1|2087422_2087710_-	hypothetical protein	D2JLG1	Staphylococcus_phage	1.3e-43	100.0
WP_001153681.1|2087756_2087909_-	hypothetical protein	D2JLG0	Staphylococcus_phage	5.2e-20	100.0
WP_000582165.1|2087898_2091684_-	hypothetical protein	A0A1X9H0H3	Staphylococcus_phage	0.0e+00	98.5
WP_000567408.1|2091699_2093184_-|tail	phage tail family protein	A0A2I6PDJ0	Staphylococcus_phage	1.2e-297	100.0
WP_001796452.1|2093180_2097710_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A2I6PDK2	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.8
WP_001549167.1|2097766_2097904_-	hypothetical protein	A0A2I6PDX7	Staphylococcus_phage	3.4e-18	100.0
WP_001096355.1|2097954_2098305_-	hypothetical protein	G4KNQ8	Staphylococcus_phage	7.8e-59	100.0
WP_071621395.1|2098354_2098579_-	Ig-like domain-containing protein	A0A075LYE8	Staphylococcus_phage	3.0e-32	100.0
WP_000268733.1|2098620_2099265_-|tail	phage tail protein	A0A1X9H0J2	Staphylococcus_phage	1.5e-119	100.0
WP_000565498.1|2099265_2099673_-	hypothetical protein	G4KNQ6	Staphylococcus_phage	7.1e-72	100.0
WP_000114227.1|2099669_2100074_-	HK97 gp10 family phage protein	G4KNQ5	Staphylococcus_phage	2.1e-68	99.3
WP_001622118.1|2100070_2100433_-|head,tail	head-tail adaptor protein	G4KNQ4	Staphylococcus_phage	4.9e-64	99.2
2100316:2100333	attL	NA	NA	NA	NA
WP_000150936.1|2100416_2100701_-|head,tail	phage head-tail adapter protein	A0A2I6PDJ5	Staphylococcus_phage	2.3e-45	100.0
WP_000238236.1|2100690_2100975_-	hypothetical protein	A0A2I6PDJ3	Staphylococcus_phage	1.8e-45	100.0
WP_000154559.1|2100994_2102140_-|capsid	phage major capsid protein	G4KNQ3	Staphylococcus_phage	9.6e-215	100.0
WP_000642728.1|2102163_2102901_-|protease	Clp protease ClpP	G4KNQ2	Staphylococcus_phage	1.8e-129	100.0
WP_098686295.1|2103690_2104820_-|transposase	IS3 family transposase	A0A2I7SC85	Paenibacillus_phage	5.2e-80	54.3
WP_001622115.1|2105314_2106976_-|terminase	terminase large subunit	A0A2I6PDJ8	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.8
WP_000402904.1|2106972_2107317_-	hypothetical protein	G4KNP9	Staphylococcus_phage	9.4e-57	100.0
WP_000988336.1|2107447_2107747_-	HNH endonuclease	A0EWY8	Staphylococcus_phage	4.6e-52	100.0
WP_000590122.1|2107978_2108395_-	hypothetical protein	G4KNP7	Staphylococcus_phage	1.3e-76	100.0
WP_001622114.1|2108422_2108623_-	DUF1514 family protein	A0A2I6PDV9	Staphylococcus_phage	4.0e-28	98.5
WP_000595265.1|2108622_2108772_-	transcriptional activator RinB	A0A1W6JPZ2	Staphylococcus_phage	4.8e-18	100.0
WP_000592207.1|2108768_2109155_-	hypothetical protein	W5R986	Staphylococcus_phage	3.0e-64	100.0
WP_000195803.1|2109151_2109358_-	DUF1381 domain-containing protein	A0A0H3U2R7	Staphylococcus_phage	1.3e-29	100.0
WP_001282074.1|2109354_2109600_-	hypothetical protein	A0A2I6PDW7	Staphylococcus_phage	5.0e-36	100.0
WP_001066447.1|2109636_2110173_-	dUTP diphosphatase	A0A0H3U2Z8	Staphylococcus_phage	7.2e-96	100.0
WP_000714403.1|2110165_2110336_-	hypothetical protein	A0A0H3U4U6	Staphylococcus_phage	8.2e-22	100.0
WP_001065097.1|2110322_2110577_-	DUF1024 family protein	A0A0H3U469	Staphylococcus_phage	5.0e-39	100.0
WP_000131370.1|2110591_2110834_-	hypothetical protein	Q4ZDP7	Staphylococcus_virus	2.1e-39	95.0
WP_000101288.1|2110837_2111206_-	hypothetical protein	A0A0H3U2T3	Staphylococcus_phage	2.0e-49	100.0
WP_000401960.1|2111218_2111623_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	A0EWX6	Staphylococcus_phage	1.9e-72	100.0
WP_000338530.1|2111631_2111850_-	hypothetical protein	A0A2I6PDG4	Staphylococcus_phage	1.0e-37	100.0
WP_000148321.1|2111856_2112750_-	DnaD domain-containing protein	A0A2I6PDG7	Staphylococcus_phage	5.5e-141	99.3
WP_000610648.1|2112779_2113250_-	single-stranded DNA-binding protein	A0EWX3	Staphylococcus_phage	1.3e-80	98.7
WP_073394849.1|2113250_2113868_-	MBL fold metallo-hydrolase	A0A2I6PDI9	Staphylococcus_phage	9.1e-87	100.0
WP_000138472.1|2113948_2114869_-	recombinase RecT	S4SUN6	Staphylococcus_phage	2.3e-166	100.0
WP_016528759.1|2114870_2116814_-	AAA family ATPase	A0A1P8L6F1	Staphylococcus_phage	0.0e+00	94.3
WP_001205732.1|2116822_2117086_-	hypothetical protein	A0A2I6PDG2	Staphylococcus_phage	7.7e-43	100.0
WP_000291510.1|2117094_2117355_-	DUF1108 family protein	A0A1P8L6F5	Staphylococcus_phage	5.2e-44	100.0
WP_000165371.1|2117359_2117662_-	DUF2482 family protein	A0A1P8L6F8	Staphylococcus_phage	7.0e-48	100.0
WP_000048129.1|2117756_2117918_-	DUF1270 family protein	A0A1P8L6G0	Staphylococcus_phage	1.9e-20	100.0
WP_001120201.1|2117914_2118238_-	DUF771 domain-containing protein	A0A075LYF5	Staphylococcus_phage	3.0e-57	100.0
WP_000762519.1|2118292_2118673_+	DUF2513 domain-containing protein	Q9T1Z5	Staphylococcus_phage	3.4e-68	99.2
WP_001148862.1|2118659_2118857_-	hypothetical protein	O80075	Staphylococcus_phage	3.5e-24	87.7
WP_001148605.1|2118872_2119625_-	phage antirepressor KilAC domain-containing protein	M9NTH5	Staphylococcus_phage	1.1e-139	100.0
WP_001622080.1|2119675_2120005_+	hypothetical protein	M9NS98	Staphylococcus_phage	4.6e-53	99.1
WP_001025404.1|2119993_2120209_-	DUF2829 domain-containing protein	A0A0H3U4C7	Staphylococcus_phage	4.8e-35	100.0
WP_000854073.1|2120224_2120488_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2I6PF09	Staphylococcus_phage	2.1e-40	98.9
WP_001801500.1|2120484_2120658_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001031454.1|2120620_2121334_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	M9NUL0	Staphylococcus_phage	1.2e-130	100.0
WP_000759682.1|2121349_2122282_+	ATP-dependent helicase	A0A2I6PEZ7	Staphylococcus_phage	5.7e-173	100.0
WP_000591749.1|2122287_2122629_+	hypothetical protein	A0A2I6PF04	Staphylococcus_phage	4.6e-56	100.0
WP_000705248.1|2122832_2123015_+	hypothetical protein	M9NSW6	Staphylococcus_phage	4.1e-27	100.0
WP_000825947.1|2123114_2123579_+	hypothetical protein	A0EWV3	Staphylococcus_phage	1.1e-28	100.0
WP_000857191.1|2123637_2124675_+|integrase	site-specific integrase	A0EWV2	Staphylococcus_phage	9.1e-180	100.0
WP_000595616.1|2125812_2126832_-	leukocidin/hemolysin toxin family protein	A0A2I6PEU3	Staphylococcus_phage	2.6e-54	39.8
2125890:2125907	attR	NA	NA	NA	NA
WP_000791399.1|2126853_2127909_-	leukocidin family pore-forming toxin	A0A2I6PER8	Staphylococcus_phage	6.0e-38	34.6
WP_000206615.1|2128339_2129563_+	ArgE/DapE family deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_001045070.1|2129958_2131266_+	TrkH family potassium uptake protein	NA	NA	NA	NA
WP_000240642.1|2131797_2133414_-	chaperonin GroEL	A0A240F779	uncultured_virus	3.4e-157	54.7
WP_000917289.1|2133489_2133774_-	co-chaperone GroES	A0A221S386	uncultured_virus	4.7e-14	46.2
WP_000197627.1|2133948_2134692_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NC_021554.1|WP_000384171.1|1881088_1881313_-|hypothetical-protein	1881088_1881313_-	74 aa aa	NA	NA	NA	1856290-1903845	yes
NC_021554.1|WP_000681966.1|2076161_2076338_-|hypothetical-protein	2076161_2076338_-	58 aa aa	NA	NA	NA	2038030-2134692	yes
NC_021554.1|WP_000990056.1|2076579_2076678_-|hypothetical-protein	2076579_2076678_-	32 aa aa	NA	NA	NA	2038030-2134692	yes

Protein sequences of NC_021554.1|WP_000384171.1|1881088_1881313_-|hypothetical-protein

>NC_021554.1|WP_000384171.1|1881088_1881313_-|hypothetical-protein
MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NC_021554_1	Orphan	1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder	787623-787654	32	1884965-1884996	2

1. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to NC_021554 position: 1884965-1884996, mismatch: 2

cagagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa	CRISPR spacer
cagagaatttcgacaagaaattctacaagcaa	Protospacer
************* **************.***

Protein sequences of NC_021554.1|WP_000681966.1|2076161_2076338_-|hypothetical-protein

>NC_021554.1|WP_000681966.1|2076161_2076338_-|hypothetical-protein
MKHLTKIFVALAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NC_021554_1	Orphan	1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder	787623-787654	32	2129846-2129815	1

1. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to NC_021554 position: 2129846-2129815, mismatch: 1

cagagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa	CRISPR spacer
cagagaatttcgaaaagaaattctacgaacaa	Protospacer
**************************.*****

Protein sequences of NC_021554.1|WP_000990056.1|2076579_2076678_-|hypothetical-protein

>NC_021554.1|WP_000990056.1|2076579_2076678_-|hypothetical-protein
MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NC_021554_1	Orphan	1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder	787623-787654	32	2129846-2129815	1

1. spacer 1.5|787623|32|NC_021554|CRISPRCasFinder matches to NC_021554 position: 2129846-2129815, mismatch: 1

cagagaatttcgaaaagaaattctacaaacaa	CRISPR spacer
cagagaatttcgaaaagaaattctacgaacaa	Protospacer
**************************.*****