Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021726 | Acinetobacter baumannii BJAB07104, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,RT,cas3,csa3,WYL | 0 | 0 | 7 | 0 |
NC_021728 | Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p2BJAB07104, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_021727 | Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p1BJAB07104, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021726_1 | 2404526-2404611 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021726_1
|
1 spacers
spacers of NC_021726_1
>1.1|2404549|40|NC_021726|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021726_1
The CRISPR arrays of NC_021726_1 >merge|NC_021726|1|2404526-2404611|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NC_021726|1|1|2404526-2404611|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NC_021726.1|WP_000795915.1|2403486_2403723_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NC_021726.1|WP_001124846.1|2402592_2403204_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NC_021726.1|WP_000885229.1|2401910_2402522_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NC_021726.1|WP_000376215.1|2401298_2401754_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NC_021726.1|WP_001990047.1|2399593_2401240_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NC_021726.1|WP_000115408.1|2395963_2399428_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NC_021726.1|WP_000107128.1|2395007_2395967_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NC_021726.1|WP_001025680.1|2394579_2394864_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NC_021726.1|WP_002017921.1|2394356_2394470_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NC_021726.1|WP_000937460.1|2393632_2394268_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NC_021726.1|WP_000983628.1|2405242_2405656_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NC_021726.1|WP_000432330.1|2405797_2406676_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NC_021726.1|WP_001990041.1|2406732_2408877_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NC_021726.1|WP_001145693.1|2408931_2410341_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NC_021726.1|WP_000482091.1|2410656_2411136_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NC_021726.1|WP_000108365.1|2411420_2411642_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NC_021726.1|WP_000132044.1|2411747_2412065_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NC_021726.1|WP_000498477.1|2412149_2412371_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NC_021726.1|WP_001136759.1|2412458_2412887_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NC_021726.1|WP_000251637.1|2413156_2413300_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
264504 : 292343
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021726|264504:292343|DBSCAN-SWA TATGAAAAAATTGAGTGACGAATACTTACCTGTTAGAAAAGCTCAAACTGTTTATGGGAGTATTTCGGGAAATTATGCCTTTAGAGGTGAGAAAACCATTTGGTTTGAATCGACCCTTGAGCGTGATTTCATACTTAAGCAAGAATTTAATAACAATGTGATTGATGTTATCGGTCAACCTGTAGTTATCCCCTACATCACTGAATTGGGTAATCAATCAAACTACACCCCTGACTTTTTGGTGCAGTTTTCAAGCTCGAATTGTGATGATTTTGAGGATTTCCCTGTACCTATGCTTATTGAAATTAAGCCCAAGAAAAAGCTTGCTGAGGACTGGGATAAGTTAAAACCAAAATTTAGAGCAGCTCATCGTTTTGCTGCTGATAAAGGATGGAAGTTCAAAATTATCAGTGAAACAAGATTATATGATCAGTATTGGGAAAATATTAATTTCTTAAAAAAATTTAGACGCTCTCATGTAGGTGCCGTTGATCAACAATTATTACTCGATACCCTACAAGAGTTAGGTCAATCAACAATTAATCAATTACCTGCCCATATTTTTAAAGATAAAACCAATGTTTTAAAAGGAATTCACCAAGTTTGGGCATTAGTGGCAAAGCGCATGATTGCTTGTGACTTGTATTGCCCTTTAACGGCTGAAACAGTGATATGGGTGAACCAAAATGATGCATTTGCGAGGAATATCTAAATGATTGAATCTAATGCTGTCAATATCGATCGTAGTCGTATCATTCTAAAACCCAATGTGGTTGTCGGTTATGAGGGGCAACCCTATAAAATTGTGAATGTTTTAAATGCCAATGACATTGTTATATCAAGTCTTGATTCGGTACGTAGTCTACAGGTCAATGCTAGAAGTTTGACCATTTTTAATGGGGGAAATACGCTAACTGAGCGTTTGAATAAGGGTGATCAGGATATTAGTAATGAAGCTTGGCAGATTGCTTTACAACGTTATGAGATTATTAAGCCTTTGATTGAGTATTCAACGACTGAACTGGTCGAAAATAGGGCGAATGAATATGATGTGAATCGCTCAACATTGTGGAAATGGCTTAAAGATTATCGGGAAAATAATTCTCTAATGGCATTGATTCCCAAAAAACGAGGTTGGACAACTGAAAAATCAAGGTTGTCACCTCAAGTGAGCAATATCATTAAACAAGCTATCAATGATGAATATTTGAATGCGAAGAAACCCAGTATTTCCAAAACGATTGAAATTGTAAAAGCAGAGTGTTCTCGGCTTCAGCTTGAAGCACCGCATGAAAACTCTATTCGTAGAAGAATCGAGGCTTTAAATGATTACCAAGTAACGAAAGCACGTCTTGGATCTAAAGCTGCAATAGATAAATTTAAGGCTGCTGCTGGTTCATTTCCAAATGCTGATTACCCTTTGGCATATGTGCAGATTGATCATACACCTCTAGATATTGAAATCGTGGATGACGAGTTTAGAGAAGCGATTGGAAAACCTCATTTAACCTTGGCAATCGATGTTTTCAGTCGGATGATTGTTGGATATTACCTATCACTAGAAGCACCAAGTACGACTTCAGTGGCGATGTGTATAGCATCTTGTATTTTGTCAAAAAAACGTAAGTTGATCGAACTAAATATTGATGCTGAATGGCAGGTCGAAGGTATTATGGACTCGGTGCATACAGATAATGGACCCGATTTTAGAACCAATCACATCAGTAAAGCTTGCCTAAAATATGGGATTCATTGGGAATATAGACCAATTGGTGGGGCGAGATTTGGCGGTCATATTGAACGTATGCTTGGTATTGTCAATCTTGAAATGCATGTGCTGGATGGTACAACTTTTTCAAATGTGCAGCAGCGAGGAACTTATGATTCCGCTAAACAAGCCTGTATGACATTAAAGGAACTTGAATACTATATCGTTTATTGGATTACTAAAGTTTATCATCAGAAGAAGCATTCAGCTTTAGGAACATCACCTATTGTTAAATGGGAAGAAGGTGTTTGGGGGACGAAGACGACAGCAGGTACAGGTTTGAAAGAACGTGTATCAGATGAAGATACCTTGTTTATTGATTTTCTACCTGAATTTGAAGCGACCATTCAGCGTACAGGGGTGCAGAAAGATAACTTATTCTATTTTGCAGACTGTTTAAGGCAATGGGTTAATTCTATTGATCCAGACGACAATAATCGAAAGCGCAAAAGAAAATTCTTGTTTAAACGTGATCCGAGGGATATTTCACAGATTTGGTTTTATGAGCCATATTCTAATACCTATTTTAAAGTACCTACCGCAAAGCGAGAGATACCACCGATTAGCTTATTTGAATATAAGCAGGTTCAGAACTATCTCAAAAGTGAACGTCAGGATGTTCAGAATCAGGATGAGATTTACAAGGCGATTTTGCATCTACGTGATCAACTTAATCAGGCTAGAAGCTTGACTCGAAAGCAACGTCGCTCAAACCAAAGAAAAAAGGAAAATGCAAAAGCCATTACTCAGCTTTCCGAACAGAATCAGTCTAAAAAGGCTGTAGTTTCTGAAAGTCTTCAGACAAGTGATGATTTGTGGAGTACTCCTTTAACTGCATTTGATGATTTAAGGTGATGTGATGGAAAAATATGAATATCTTGCAGAGCATGTACTTGAAATCATGCAATTAAGCGATAGTGAACGGATTGAGACATTATTCACTGATCGGTGGATTGGCTATAAGAAAGCCCACTCTATTGTAAACAAGACATTTTTATCTTTTATATTCAATGGCTTATTTTCCTGCTAATTGGTAATACCATGAAAAATACCATGCTCAGAAAAGGCTTAACAATATTTTGAAAAATTGCCTACTGAGCGCTGCCGCACAGCTCCATAGGCCGCTTTCCTGGCTTTGCTTCCAGATGTATGCTCTTCTGCTCCTGCAGCTAATGGATCACCGCAAACAGGTTACTCGCCTGGGGATTCCCTTTCGACCCGAGCATCCGTATGAGACTCATGCTCGATTATTATTATTCTCTGTACACGACAAATTTCACAGAACCCTTATCCTATCAGGGTTCTGCCTTCTTAAAATTGCCAAAATTTCCTTAAACTCTTCTTTTTTCCCAAAACCAATTAAACGCTGAATCGCCATTTGAACATAGTCTAAACCATAGCGAAATAAACTCATTGAGAGTCGTCCATGCTTCTTTATTTTTATCGCTTTTTTTTTGATCATGTTGCCATTCACCCGTTAAGTAACACCAACAGAAGCTTATAGCTAACACCGCAATCAATTTTTTCACTCGTCTAGGGTCTGTCAAGCGCGTATTTTCAAGATTAAACCCGCGTCCTTTGAGACAACTGAATAAGGTTTCAATTTCCCAGCGTAATGCATAATCCTGAATAGCATTGGCATTAAACTGAGGAGAAACGACGAGTAAAAGCTCTCCATTTTCTAACTGTAGTGCACTTATATATAGTTTCACCCGACCAACCAAAATCCGTCGTTTACGACATTCAATTTGACCAACTTTAAGATGGCGAAATAAATCACTAATTTTATGATTCTTTCCTAAATGATTGGTGACAATGAAGTTTTTTTAACACGAATGCAGAAGTTGATGTCTTGTTCAATTAACCATGTAAACCACTGCTCACCGATAAACTCTCTGTCTGCGAACACATTCACAATACGGTCTTTACCAAAAATGGCTATAAAGCGTTGAATCAAAGCAATACGCTCTTTCGTATCTGAATTTCCACGTTTATTAAGCAATGTCCAAAGGATAGGTATCGCTATTCCACGATAAACGATTGCGAGCATCAGGATATTAATATTTCGTTTTCCCCATTTCCAATTGGTTCTATCTAAAGTCAGTTGCACTTGGTCGAATGAAAACATATTGAAAATCAACTGAGAAATTTGACGATAATCAAAATACTGACCTGCAAAGAAGCGCTGCATACGTCGATAAAATGATTGTGGTAAGCACTTGATGGGCAAGGCTTTAGATGCAGAAGAAAGATTACATGTTTGCTTTAAAATAATCACAAGCATGATGAGCGCAAAGCACTTTAAATGTGACTTGTTCCATTTTAGATATTTGTTTAAGATAAGATATAACTCATTGAGATGTGTCATAGTATTCGTCGTTAGAAAACAATTATTATGACATTATTTCAATGAGTTATCTATTTTTATCGTGTACAGAGATTATTATTATAGAAGCCCCCATGAATAAATCGCTCATCATTTTCGGCATCGTCAACATAACCTCGGACAGTTTCTCCGATGGAGGCCGGTATCTGGCGCCAGACGCAGCCATTGCGCAGGCGCGTAAGCTGATGGCCGAGGGGGCAGATGTGATCGACCTCGGTCCGGCATCCAGCAATCCCGACGCCGCGCCTGTTTCGTCCGACACAGAAATCGCGCGTATCGCGCCGGTGCTGGACGCGCTCAAGGCAGATGGCATTCCCGTCTCGCTCGACAGTTATCAACCCGCGACGCAAGCCTATGCCTTGTCGCGTGGTGTGGCCTATCTCAATGATATTCGCGGTTTTCCAGACGCTGCGTTCTATCCGCAATTGGCGAAATCATCTGCCAAACTCGTCGTTATGCATTCGGTGCAAGACGGGCAGGCAGATCGGCGCGAGGCACCCGCTGGCGACATCATGGATCACATTGCGGCGTTCTTTGACGCGCGCATCGCGGCGCTGACGGGTGCCGGTATCAAACGCAACCGCCTTGTCCTTGATCCCGGCATGGGGTTTTTTCTGGGGGCTGCTCCCGAAACCTCGCTCTCGGTGCTGGCGCGGTTCGATGAATTGCGGCTGCGCTTCGATTTGCCGGTGCTTCTGTCTGTTTCGCGCAAATCCTTTCTGCGCGCGCTCACAGGCCGTGGTCCGGGGGATGTCGGGGCCGCGACACTCGCTGCAGAGCTTGCCGCCGCCGCAGGTGGAGCTGACTTCATCCGCACACACGAGCCGCGCCCCTTGCGCGACGGGC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23 | Vibriophage(60.0%) | transposase,integrase | attL 277494:277553|attR 292848:298715 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1002373 : 1010470
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021726|1002373:1010470|DBSCAN-SWA TATGCTATCGGATGCCCAAGTAAAGTCATTAAAACCTAAAGAATCTAGATATTCAGTAGCAGATGGGGAAGGATTAAACATTTCCGTTTTTCCTAATGGAAAAAAGAAATGGGTTTTGTCTTATCGCCAAAATGGAAAGCAAAATCAAAAGATGTTGGGTGAATATCCTATTATGGGATGTAAAGAAGCACGCCAACTAGCAAGACAATTAAAATTAGAATATCAGGGCAAGGTCGCCAATTCTCCACCAGTCCATAAGGTGGTTGAGGAATGGTTGAGTATCATGAAATCACAATGGACCAGCAAAAAATACTATGACACAGTCGAATATCGACTTGCATATCTAACCGAGGATTTTAAAAATCTTCCAATTAATGAAGTTGAAAGAAAGCACATCTCGAAGAAAATTAAAGAAATTGTTGCAAAGGGTACTTTAGAAACAGCAAGCCGAGCATTAAGACTTGGAAAGCAAGTATTTGATTTTGCAATTGCCTCAGATTATACAGATCGTAATCCATGTACATTAGTAGAGGATGTAATACCTGAATATGAATCTGACAGCCATCCTTGTTTACCTGTGAGTGAAATGCCAGAATTCTTTAAACGCATGAAAGCGAGTCATTCTAGCTCAATAGTAAAAATGGCCATGCTTTTAGTTTGTTATACCGGAACCCGAATAACAGAATTGTTAAAAGCTAGGTGGGATACTGGAGAGATAGATTTTGAAAACAAAGTCTGGATAATTCCTGCAGAGCGAATGAAAAAAAGAAAAGAATTAATGGTCCCACTGGTACCGCAAATCTATGCTTTGTTTAAGGAACTCGAAAGCGTCAAAACAGATGATGGGTACATATTTAAAAAACGTGGAAAACCTTATGAGCACATGACATCTGAGTCGGTTCTCACAATGATAAAAAGAATGGGCTACACAGATAAAATGGTTACTCATGGTTTTCGTTCATTGTTTTCGACTCATGCTAATGAAAGTAAATTGTTCCGTGGTGAGGTTATCGATTATCAAATTGCCCACGTGAACAAAACAACAAAAGCAGATAAGACAAGTAAAATTTATAACCGTGCCGAATATTGGGATGAGCGAGTAGAGCTTATGACTTGGTATGCGAATGAAGTAGAAAATTGGATTGGTACTAACTCATGAACCAAAGTTTATTTGTCGGTTTTTGGAATATAAATTTATCTCCTCCTATAGGAAATAGATGGAATAAATCAAAAGTTGATAAAAAAATAAAAGTTTCTAGGGTAATTCAAGGGCTCTTGAAACTCGATTTTGATTTTTTATGTCTTTGTGAGGTTTCACCTGAGGATATGGAGTTTATAGATAATAGTATTCAACTTATTGGGATGGGCTATGATTACAATATTTATCGAAAAAATTATGGAGGCTTATATTTTGATACATGTGTAATATTTAAAAATACTTTTGATTTTGTTCAATCAAAAGTAGAAGTCGATGGTGAAGAAAAGAATAAGCTTAAAGTCTTTCAAAAATATGAATTTCTAAGTGGGCACTTAGAAGAAAGAATTATATTTTATGTTACTCATTGGTTATCTCAATTAAATGATAATAAGGAAAAAAGAAGAACAGTCGCATCATTTATTAAAAAAGATACTAATGATGAAAAAAAATTTTTCAATAAAACGAAGTTTGTTGTTTTAGGGGATTTTAATGTTGAACCTTATGATTCGGCAATATTAGAGGGGTTAAGAAGTACTAGGGATCAAAAAGTTATCTCTAATAATTCTTCACTGTTTTACAATCCTTTTTGGAAATTTTTACAAATTAAGGAAGATCAACCCTCAGGTACCCATCACTGTACTAAAAATGAGTTCCATCACTGGCACATTTATGATCAAATCTTAGTTTCAGGAAACTTTTTCCGTGATGGATGGAATTTGGATGATAATCTAGTTCTTGTCTTTGATGATAAGATGATTAGTTCTTTACATAATGATTCATTTAGTAACCCTTCAGATCATTTGCCTATCTGTCTAAAGTTGGAGAAAACAAAATGCATTTAGATTTAAGTTTAGCAGTTGAAGAGGGTATGCAATCCTCTGTAACCAGAGACAAAAGTATTGAAGAAATTGATAATGTATTATTTGAAGTAGACCAAGCAGTTAAGAAAGCAACAAATAATAAAGTTGAATTTGGTTGGAGAAAAAAAGGGTTTAATACGTTAGGTTTATTAACGGGTCTTACTTCACTTCCAATTACAGATGTAAAAATTGAATCTCAAGAGCCTGAGTCGCGTGTTCTCTATGTTTCTGCAACAGATGACAAAACACAAAGATTTGATATAACAATATTAGTGATAAGTCCTGATGGCTTCCCATGTGAAATGAATGTTAACGGCAACAAGCTTATATCACATGATGCTGAATCCTTATTAGAGCAATTTAAACCCTTACTTTCTAGTGCTTTTGTTGGAGATAAAATAAGAAAATTAATGAAAAAAGGCGCTTAATTAGCGCCTTAAATTTTGAATCTAATCATAGCAAGTAATTATGAAAGCAATTTTTTGTAGGTTTTAAATTGAACGAATTTCTAATGTATAAAATTGATAAATGGGTAAATCAAAATGGGTAATAAATACTACGATCAATTAGTAAATAATGATTCTCATTTTGAAATTACGTTTAATGATTTTGAGGAGTTTATAACTTTTATTCGTCCAGATAAATTACATGTAAAAGATCTTATGACTCAATTAAGATTGGAATTTAACCCATCAGCTGTTAATTTTCCTTTTTTTAAGATAAAAGATTTTAAAGGGTATAGTACATTAGACAAATCGATCATTTATCGGGGACATGGAGAAAGTGATTGGGATTTAAAACCAACCTTTTATCGTAATAAAAAAAATATTGGGTGGGTTAAGACAAATTGGAGTGTAGATCAAAATTATGAGTCAGAAATTTTATTGAAATTCCAAGATTCCTGTGATTTAGCTGGTGTTCAATTACCATCAGATAATGATCAATTGAGAAGAAGACAAAAAAATAAGTTAAGTAAATATAGGAAATCGTTTGGAAGAGATCAGCTAGATTGGTTTGATGATGATTTTTTTGAGTTAGCTGTATATGCACAACATTATGGAGTTGAAACTAGATTGCTGGATTGGACCAAAAATCCGTTTGTAGCTAGTTATTTCGCTTGTTCTCATGCACTCAAAATGAATTATGATCCAAATTCAAAATTTTGCATTTGGGTATTAAATTCTGAAAGTATTACAAATGAATTGAATCAAGTACTCGAAGTGCTAGATCCACCTAAAGGCCTTAATCAGCATATTTCTCATCAACAAGGTGTCTTAACTTACACAAAAAATCACATCAAAATCTTTAATAAATTTGGAACTCGACCATGCTTAAAAGATATTCTAAAGTATTATGAAAGTGGTTACAGGTTATTAAAAATAACTTTAGGATATGAATTAATCGTTGAATTATTTAATTATTGTAATATTCATAATTTCAATGCATGTCACTTATTTCGTGGTGCCAACGGTGCTGCAATGCACACCACTGATTTATTAAATTTTGATGACTATAAATATCCTATAGAAGATTAAAGGCGCTTATTTAGCGCCTTGAATCTCAACTTTAATCTTTGCTACTGATTGAGATGTCCAACCCTTATAAGTTTTGGATTCTCGATCAGGCGGGAATTTCTCCAAATAATATTTTTTAAAAGTATTTGGAGCCATTCCGAGTTCTTTAGCTAATTGTCTTAAAGAATACCAAGACATTTAAATCTCCTGACTTTCCGCTTTAACTTCTTTCAGTGATTCAATTGACTTAATCCAACTTAAAATGTGTGGCTTAGTTATTTCATCCTGACCGTGAAACCAGTAGAACTTTTTTTCTTTTTCAAGAACGTAATAAGGTTCACCAGATCCATTAGGCACAAGAAAATAATGGGTAGCATCTTTGGGTGCTGATTCAAGTATTTCTAATTCACTCATCCCTCAGCTCCCGATTCAATATCCAACTTCATTGCACCTTCTTCTGGATATTCGGTCATCCAAAAGTAATAGCCTTTTCCACTGTGGCCATCTTCAAAGAATTTAATTGTTAGTTCAGTATCAAGTTGATCTAAATCTTTCTCACCATCTGGATTTACAAATTCGAGAAGGCTTTTTAGTTGATGACCGCTAAGTGTTATGCTCATTGTTCAGCTCCCGATACGTTTGGCACACTATGAAAATGCATCCAGTGAGAAGGTGGGTCATTATAATAATTTGCCCATACACTATTTAGATCTTCATCAATAGTTATATAGTCTTGTTCTGGAGTAACATCTGGCGCATCATCCCAACAAATAAGTACCATTATGTCTGTAGGTGGCTCTTCATCTTTTACGCTGATCCAAGTGGGCCCAGCTTGGGCTTTTGCTGCAGCCCAAGCTTTTGCACTTGTATAAAAGTCAGCTTCATATTCAGGGCTTCCATCTTTGGCCCATTTATATGCAATTGGGTCATCATTTTTATACCAATCAGCATGAGCTTGCATTTCCTTTTTCCAAAGTAACCAAGCTTTATTTGTCACTATATTAAAATAGCCATTCATGGTTTCACTAAATACAAGAATGTCATTTTTTCGAATATTGCTTTCTTGCTTGAAAGTTTCAGTTTTTTTGAAATTTTCTTCAAAAAAAGCACGGTCATAAAAAATCATGAATTAGCTCCCATTCTGCTTGAATAAAGAGCTTTATTACTTTCGACAATTTCTTCACATTCTTTTTGACTACCAACGAAGAAATAATCTTTTTTCAGTTCACCAGCCTCAAATTTAGCTACCCAAGTACCGTAGACCTTTTCGGCTGAGATATATGCATAGCGTTGCTTTGTGATTGAAATGATATCTTCAATGTCTAAACAATCACCCAAACAATTAAAGTCTTTTTCTTTATTTACGCAATTTTCAGGCTCTTCATTGTCTTGCCACATAGTTTTAATTTGGTCTTCAACAATTAGAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021726|1002373:1010470|1009247_1009928_-|WP_000643997.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NC_021726|1002373:1010470|1006560_1007070_-|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ >NC_021726|1002373:1010470|1007066_1007603_-|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NC_021726|1002373:1010470|1010098_1010470_-|WP_001260065.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR >NC_021726|1002373:1010470|1006354_1006564_-|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NC_021726|1002373:1010470|1003527_1004412_+|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NC_021726|1002373:1010470|1005971_1006142_-|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK >NC_021726|1002373:1010470|1004972_1005965_+|WP_000527288.1|DBSCAN-SWA MGNKYYDQLVNNDSHFEITFNDFEEFITFIRPDKLHVKDLMTQLRLEFNPSAVNFPFFKIKDFKGYSTLDKSIIYRGHGESDWDLKPTFYRNKKNIGWVKTNWSVDQNYESEILLKFQDSCDLAGVQLPSDNDQLRRRQKNKLSKYRKSFGRDQLDWFDDDFFELAVYAQHYGVETRLLDWTKNPFVASYFACSHALKMNYDPNSKFCIWVLNSESITNELNQVLEVLDPPKGLNQHISHQQGVLTYTKNHIKIFNKFGTRPCLKDILKYYESGYRLLKITLGYELIVELFNYCNIHNFNACHLFRGANGAAMHTTDLLNFDDYKYPIED >NC_021726|1002373:1010470|1007775_1008066_-|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA >NC_021726|1002373:1010470|1008206_1009235_-|WP_000805204.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWEKDNAGTDSPIFVVQEKKIVWGLDPASDSVEITNIVDADDESTYKSIDDFFESLKATDKHALNGLAIEEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NC_021726|1002373:1010470|1007595_1007775_-|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND >NC_021726|1002373:1010470|1004402_1004858_+|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NC_021726|1002373:1010470|1002373_1003531_+|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NC_021726|1002373:1010470|1006142_1006358_-|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI |
14 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 997700:997714|attR 1009612:1009626 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1230762 : 1243110
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021726|1230762:1243110|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021726|1230762:1243110|1232142_1233075_-|WP_000698529.1|DBSCAN-SWA MKILNKVEAKLAWANGELLLVNNTERNGWEPFNPYDFGFDVFDKFEFQLKPRTIFIGEFEVPEPLRVAPEKGSTCSYPSPTVELGVQQFKWNGSKGQLRMLQHGQVHSSFDNAFAHCCAIIKISGGEFAEDILKLLNKPTEEVEEEKPSESHAESLKVKNSKPEVVEKAQTAEPAIESETADSEYQKKLDTLLQRVKDSKTPDEVNAVYRYTRTWSDKQMEPLLLATHKRLEELEKSKAQATEPPSLMVQIQNAPDLTTLDALEIDVAARDPQIQSRLMDFVKKRRFELENPTSTPLQEAEPDYLLGDGF >NC_021726|1230762:1243110|1234204_1234528_-|WP_000064463.1|DBSCAN-SWA MSNFKKHPDGYKSFLGRDDKGLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGFKTPLNVFRFQTDYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKTKRGFTGSR >NC_021726|1230762:1243110|1242235_1242637_+|WP_020752364.1|DBSCAN-SWA MSSVSIAEYRKLFPIKKNKKRRSAKQVARQPSVGEVVLATHLRACKIGFEQEYKFHPKRKWRADFLIIGTKILIEVEGGIWSGGRHTRGKGYIGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVGEK >NC_021726|1230762:1243110|1238689_1238878_+|WP_000703023.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1247069 : 1275743
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021726|1247069:1275743|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1281358 : 1318810
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021726|1281358:1318810|DBSCAN-SWA 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54 | Acinetobacter_phage(45.45%) | terminase,portal,capsid,head,integrase,tail,protease | attL 1282884:1282937|attR 1318971:1319024 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1606686 : 1657446
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_021726|1606686:1657446|DBSCAN-SWA 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71 | Acinetobacter_phage(89.66%) | terminase,integrase,capsid,transposase | attL 1603868:1603884|attR 1650567:1650583 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2815287 : 2830084
Sequences of DBSCAN-SWA_7
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MLVKPSFKKRLLLTTLLSLSATQIFASNNSEQIPIGKLPEWVVPESYDLDFKIDPAQKGYTGKTTIHLKLAQATDHIWIHGKSLTVKDVNITSAEGVKTKAKYEQASEIDGVSKIKFAKTLPAGQYQLVLDFNAAYDQQLDGIYKIEFEGKPYVMTQMEAISARQSFPSFDEPRFKTPFNIRLTIPSKYSGFANTQQTSEQIEKSGWKTLSFAQTKPLPTYLLALAVGPWQLQKGPDIGATSWRKQPIQLRGIAPDTKAEKMQQALSETPAILKTLEDYFAFGYPFDKLDLLAAPDFAAGAMENPGLITFRDYLMLLDKDSPVFFVQNSFNVNAHELAHQWFGDVVTMPWWDDLWLNESFATWMQSKITQKLHPEFNADLERITDTADAMKSDSLVSVRRIRQPILSNADIQTAFDGITYQKGAAVLNMFESYLGEEKFKQGVRNYINKHQYGNATANDLISALAEQSGQGERFTRAMKSFLDQPGVPLINTALQQEGNKVFLNVKQSRYLPVGSKGDARSLWGVPLCVRYEVPNAGSKVQCELVDQAEAKIELKGASLGSWYIPNADAAGYYQFSLPQKEFTRLTAATEKLSNTEQLAYAYAISAAFNHGDINLLAVVDAAKKFANSNSRQISTALFSQLSTIHRHVLKTEAERERFRKVLANLYLPKLNQLGYVSKTDESAEDSLWRSELVRFLALDIQVPEVRTQLLKQSDALFAQKQLNFAQVTPELLPTILAVRVQEKGQPAFDRLSGELQRVTQPTQRLAILTALGSANQEATRQQARQLILNPRVKVGEVRTVVNSINSYGDEQGGLWSWFKVNHDAVFDRLGKSSAGRFPAMFSGAACTQQQAAQLNDFFAPRTKELVGVERGLKQTKERIQLCESLVAKQDGSIVQQLKL >NC_021726|2815287:2830084|2822884_2823691_+|WP_000608304.1|DBSCAN-SWA MINIQNTILGKIVDRKHEELAARLKQRNLQDVEELAKAATPVRGFANALQHKRPGVIAEIKKASPSKGIIRADFNPAEIAEQYEQAGAACLSVLTDVDFFQGADENIAIARNHCALPALRKDFLVDPYNVVEARALHADCILLIVACLSDQQLEEMSKTAFEHQLDVLVEVHDEEELERALKLSEQCLLGVNNRNLKTFDVDLNTTIRLKKLLPASRLLITESGIATPDDVRMMQEHDIHSFLVGESFMKQPRPDQAFTALFGQPQTV >NC_021726|2815287:2830084|2823700_2824396_+|WP_000066126.1|DBSCAN-SWA MSNKDSSLSKEQQKLLKQFKKQISNPHSSKIANQPESKKSQAESEELEDTHLFKQAVAGVKPINNSNIADVKTPRAKKVDAQTLAKRAAAEGGRDTEHAELSDTQAALNPVASQATLSYRIATLQHKVFEDLKAGKMRWFEAVDLHGCTIEQARDAVLQIIQMAKDENQNVIKIVHGKGPEAVLKTYVNGWLRQHRDVLAFVSAPENQGGTGAVLVLLKRAEKNPKFEQKK >NC_021726|2815287:2830084|2815287_2815863_+|WP_000566784.1|DBSCAN-SWA MIDNYDSFTYNIVQYFGELNQEVKVVRNDQVTLEDIERWQPKYLVIGPGPCSPSEAGISIPAINHFAGKIPLLGVCLGHQSIGQAFGGKIVRAKTVMHGRLSDMYHSNKGIFSNLPSPFSATRYHSLVIDQETLPDCLEVTCWTNEADGSMEEIMGVKHKTLPVEGVQFHPESILSQHGHQIFKNFLDIYA >NC_021726|2815287:2830084|2824406_2825390_-|WP_001164226.1|DBSCAN-SWA MQHLQWWTDFVAWQADALPMVLVTVVRADGSTPREVGATMLLRFNLQQQWQQSDTIGGGHLEFQAIDIAKAMLKESETCVRRIERFNLSARLGQCCGGVMWLLFEKILPAEIASDLSGSLQAWRAGKHIWRNASYQYASTWQTMDMEQQPSFEFHSGSSEEWQFSQQIQPNTMQVLICGAGHVAEAIVRCLLPIGVRVKWIDPRDDIFPSDLLEQAYCITTDTLDAEIEHFDRSGAVLILTHDHQLDLQLCFTALKPTAKPFAYVGMIGSKSKRAIFEKRMQVRGYTSETLQRLVCPIGIEGISSKQPAMIAIAVVAQLLQVFDVKK |
10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021727_1 | 58447-58537 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021727_1
|
1 spacers
spacers of NC_021727_1
>1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder AGTACTTTCTGTGGATCTTGAGCTACTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021727_1
The CRISPR arrays of NC_021727_1 >merge|NC_021727|1|58447-58537|CRISPRCasFinder AGGCTGATCCAGTTGATTATCTCTCGTCTGTAGTACTTTCTGTGGATCTTGAGCTACTTCAGGCTGATCCAGTTGATTATCTCTCGTCTGT >NC_021727|1|1|58447-58537|CRISPRCasFinder AGGCTGATCCAGTTGATTATCTCTCGTCTGT AGTACTTTCTGTGGATCTTGAGCTACTTC AGGCTGATCCAGTTGATTATCTCTCGTCTGT
>NC_021727.1|WP_000218962.1|55904_56339_-|hypothetical-protein MTVTENATMKNVSNRIYEDREAIQLLINPTYKYLLTVYSRKKELPFNYVLSYLVGNAVNDPDLLSEIKRIQPQFKGVKGKNTPFRLDTEIAKRFKEVAKTQKGDLYSSFVNAAIYYFLKHGDFEKMPELQALINNEINTEEKPS >NC_021727.1|WP_000210503.1|54844_55861_-|hypothetical-protein MTTNKTIVFVFLSIFALIISIALLVALSIYIRSSYIVLSAAVLSLIGSSLFLIRFLYRTFINETSTYKEKYTFWVMSYSMFIVVVFTIPLGYFINVYDQKRYTKNFLDLLNSVEFKSILKLGTENDVYVQLGNTNTGWSKTRLVLPESSNASMYLNNGYCGLNYDDDSSTSMKKSISKYLDKDRLKNNQIDLAKLSIMVHEFGHCLDMKRDFISFNTKLIPEKNTLIIGKNAIVPKMRSKAKDIESYLLLAQDSTLWKEVFADVYASGYMFVNHPNEAFQITKGLQEYRLKNKKDDPEHNSSCYLNVVLTSTKPKSNEELIKWSDKIREDKKCNSGFY >NC_021727.1|WP_020752480.1|54110_54617_+|hypothetical-protein MSFNNHNNHPQVLELKTIFQAIPLLLIVILVLSFMIYKGRQLNKSLTDVDIINYTNSLGSKNDCYFDNVTVKKDGNGKIAILTINDNGSIIKGTPIFDRTTKQVLGFKVYPSQIMYCTKGRFNYKSPIITTDRVLAQLPESQVKEKTSKFNKELSNKYIDKIGNYLTK >NC_021727.1|WP_000172709.1|53476_54094_+|hypothetical-protein MTLKDDDLKIINSTDLVEWDVKVSSIPWIPNLYNGNIKVWAKRNAEQNEVFDIAFRKLTNQAFPNTDLSMWVFENASCVTVQDSNKVNLQIKVQKMRDITRKILALNLFDVLNIEVGDTNHWDDPDHITLLKNAYAQVVLRISNQGQDSNLYTVSLEIDEYDSYGDIYLNDEFWFLFGNEESIISDIKLKQWNPIDLQPYAFHFK >NC_021727.1|WP_001084693.1|52776_53493_+|DNA-adenine-methylase MNSILNNYLGAKSGSGVYQAIINLIPPHDTYIELFLGTGSILSKKAKSSRQIGIDLNIDCIESFISPENDVELYHTDSLNFLNEFDFSQSGRTVLYCDPPYLLETRSSKKRYKYEFNDEDHLKLIQLLKKLPENCFVLLSGYRNRIYDELIADWWSIDFQAMTRGGVRTETVWCNFFPNTIHYHTYAGKDFTDRQRIKRKAERWANNFKDLPCAERQAILASILSVSNAEDYLNDIKG >NC_021727.1|WP_001193276.1|51925_52483_+|hypothetical-protein MQTIEMLDIRISNYKPISKEQYQSAFSNFDFITNVIIHAFILSQFLFCFYGFYLCWIFSFNLRINFLVAISFSSIMILSIRILYKYLSKRNSRFLNQQNLNFLSTTFLFNEISEIDYLTLKEIIDRNETVKLKVKEIMEFRKGTITCFDFQQLLIPEYLKSYQPSNKDINLCTIKKNFISLVNKV >NC_021727.1|WP_000462439.1|51623_51848_+|hypothetical-protein MFELKTGNKEYHESQLRKTKIFIIIQVTILILVNLYTIILKGKIDLGLSTIILFSIGLGLLGLKKVLTALQKFK >NC_021727.1|WP_000180530.1|51105_51609_+|hypothetical-protein MTNEIYDATKLLTAFKFPNKASGEHTFIMGCTNKNKGKSLFQEELKDHPNIIFIEATEDDIAKQKESQRLKNLKDEQRLLSIKECYWSHSKDESFFLDTLKYSLINHFEFFENVDPTIDQLKTLFMYFDDYLIGQIISWGYSDTEVSTYIDEYIDENRDELETMLFK >NC_021727.1|WP_014702631.1|50636_51116_+|hypothetical-protein MLSHSELVQIAAKWVKSYLKFPIIETELKCIGSREIPDILAFRSNTSLIVECKTSLADFRKDFKKPERNGQLMGVGNYRIYCAPKGLIEINKVPDSWGLIEVSSNGKVTIERFRTGNIYSSNNSQDIYKQRDPFFHLSDIEKERSFLYSILLRRMSNDK >NC_021727.1|WP_020752479.1|49823_50429_+|hypothetical-protein MNEIVKTQEVIDLCIKEIKEYKPLTQKQYIPIYRKSERYTIIIRLLLILMIIFFVIAFISLMDLLIPEVPVFNYGKMIFLTSLTFFIISAFSTRKMFSVNDNLLNKNNLISLCSIDSFDEIDSDSYQMISDVSNTIPEFKNKVKEILKNRDGIITGFDFINLNVIKLLSLLKEQESINESNKKRDLILTDLFNDNGDKNND >NC_021727.1|WP_020752482.1|59550_61263_-|type-IV-secretion-system-DNA-binding-domain-containing-protein MADEQIRGSELKSNQELINKIRDNGGFSPYKLTGVPLKKNTEGTNIGVIGSPGSGKSQVFRDVISQVRSRQRKAIIYDPSGEFTQEFYRPGVDIILNPFDARMPFWSPYLEVEHEEHFDSIAKAFIPVVSKEPYFESAAQAVFSEIMRELYNQGDKTNRSIYDTVSLSTVSEIHSLLEGTPAAKHVDPKNEKTVLGVLSTVQTKLAVFRYLPDSGEPFSIRQWVKKSEEDSCIFLSIREEQKTTIEPLIALWFSVFIKSVMNLPAIHKELLWLFCDEIPTLPRMDDIPMSLTNTRKYGLCHMLGFQDLPQLDSKYGDKIAQSMLSALQTKIFMRVNENNTAKRMSEILGQMEVAEKNQSRSMGIESSRDGDSFITQRRERFIVMPSEIMRLPDLKGYLRIPGDFPVTLVQQTYHPHTKNQPPLVLRESLSAMAILTSNDDVEEEIDHSSNGIYDQVLSQNNDFLAQDSSYDHRQEADYLEPESQDVYQETSNEQNVSQSVHDDKTGEYEDQNYHDELDEKKKDTSRLASFKKYENEDSSSQVDTSSQSTSESTNNSNGDLFSNYFGDNNN >NC_021727.1|WP_000030955.1|61701_62172_-|hypothetical-protein MSKDELVPMGTRVPPGIKKAYIEAARNSGLTPAEFHRNVLINNLSLERVKLLTDELSHQISSMMEYMDNSFKTHLEKIDQRLEVYESSIKQTVIDNASSEHSEVILTCLFLLAATHYRNLDTVLDFNKRQVAGQTLFDSIHSEAKQTVKKKTKTAA >NC_021727.1|WP_001099194.1|62749_63103_+|hypothetical-protein MNTVTATNPQDSQNSVSQSADNATSNIEENKTSNKQDEAEKIEHSYLSPKAQKLLNKKQSLVKEIELLEQALEEEIKEARKKTVDSVVSILEKNGLLDVSPKVWKSKISEVVKIFKQ >NC_021727.1|WP_000052061.1|63145_63454_-|hypothetical-protein MSLGTSMTEIKALFQKFTNSTLNDEEKIYLNTTDKKVIFTASKIITLQISKNRIAYTEYDISNKEKMRIVAKETLSFSTSLSFLVKFHFAKVHAETIIQAAQ >NC_021727.1|WP_000800373.1|63598_64096_-|hypothetical-protein MKNWFSTAVKSLDDLKKEYRKLCFKHHPDMGGTTEDMQAINSEYEQLLKKLINQKADSNYSDKSTFSNREEEIEAEIKLREVLEKIEILEGLEIEKIGLWLYVSGNTKAHKDKLKEAGLKWNHTRKLWVYVGTEARGRGTKDMDELRAKYGNEKFKTRSKIKKIA >NC_021727.1|WP_001099722.1|64131_64443_-|hypothetical-protein MNTYTKIAINYFKNLLSVSEQNNGLKYSESMQNPKHIACNETTFFITQIENSIVIIDCDHESFLPYSIDACLDFTSNSVKEAAEKAIDYYCQIRDHYFELINQ >NC_021727.1|WP_000787564.1|65103_65301_-|hypothetical-protein MKNEYSDSELEKLWCELSKIAIAVNENFIEQDFIFFEAGTDIIEIWIWFDQLHSKGVKWLQDNID >NC_021727.1|WP_000790397.1|65362_66415_-|hypothetical-protein MKNITDSIIQKLGLITFEELEKGDLEIFTNFDTCKVIIKEIKKNWSEEKVFKILFDALNGDFIYCNSQQELQAFIKYFKTTNKQSNKAEQHFFVQPTKPYMVDPKKRYFIANLAVPNLQIENLKDVDNLTSREVEFINKVKDGFANPDIDKSFLNFLEDYKKIVAAEYQRKTNQNKKAMDEIEWFIGNGFFIPEQILKYEDKNKILDIIVYCNIAALNWLLIPSNLSKYENIHQNDLLALTKYLYLMQTILAETEITKLRSGDVEEYCFRKKGYYFLDELSSEEIDHYCEGEDYEVWIVKSKDNEIEPETAEKAYDAYGNSYAYDLKELKDTLQKFISLNEVQFLLYKKI >NC_021727.1|WP_000786837.1|66477_66921_-|hypothetical-protein MKNDLVLSYTLSNGETHFYGYFIHRNDGSLTSGFNQTPEEVIEGLKQRYGERLVSTSLDDEIEYFKKELEFLIPKQIDEEEYKSKFNILPPAKMYKSESVEAFMCTEPLAINLYTHFVNFPKHKKAFQIVAFGNTPITDVIKQAEHF >NC_021727.1|WP_020752484.1|67142_67349_+|hypothetical-protein MEDALSLDSKFNQQRQLNETMHYAKGLVTGLGLANVIDLNEYKMYIEDISDQHSALLEKIASNVLGKV |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_CP018144 | Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence | 68613-68641 | 0 | 1.0 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_MK386682 | Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence | 6236-6264 | 0 | 1.0 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NC_021727 | Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p1BJAB07104, complete sequence | 58478-58506 | 0 | 1.0 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_CP018422 | Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence | 17316-17344 | 0 | 1.0 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NC_017848 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence | 50506-50534 | 0 | 1.0 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_KM922672 | Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence | 58478-58506 | 0 | 1.0 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NC_021731 | Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p2BJAB0868, complete sequence | 58476-58504 | 0 | 1.0 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_CP018144 | Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence | 68493-68521 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_CP018144 | Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence | 68553-68581 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_MK386682 | Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence | 6116-6144 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_MK386682 | Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence | 6176-6204 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_CP018422 | Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence | 17376-17404 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_CP018422 | Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence | 17436-17464 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NC_017848 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence | 50566-50594 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NC_017848 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence | 50626-50654 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_KM922672 | Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence | 58538-58566 | 1 | 0.966 |
NC_021727_1 | 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder | 58478-58506 | 29 | NZ_KM922672 | Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence | 58598-58626 | 1 | 0.966 |
1. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018144 (Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer agtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer *****************************
2. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK386682 (Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer agtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer *****************************
3. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NC_021727 (Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p1BJAB07104, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer agtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer *****************************
4. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018422 (Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer agtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer *****************************
5. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NC_017848 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer agtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer *****************************
6. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_KM922672 (Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer agtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer *****************************
7. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NC_021731 (Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p2BJAB0868, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer agtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer *****************************
8. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018144 (Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer ggtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer .****************************
9. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018144 (Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer ggtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer .****************************
10. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK386682 (Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer ggtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer .****************************
11. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK386682 (Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer ggtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer .****************************
12. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018422 (Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer ggtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer .****************************
13. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018422 (Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer ggtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer .****************************
14. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NC_017848 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer ggtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer .****************************
15. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NC_017848 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
agtactttctgtggatcttgagctacttc CRISPR spacer ggtactttctgtggatcttgagctacttc Protospacer .****************************
16. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_KM922672 (Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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17. spacer 1.1|58478|29|NC_021727|CRISPRCasFinder matches to NZ_KM922672 (Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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