Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021729 | Acinetobacter baumannii BJAB0868, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 5 | 0 |
NC_021731 | Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p2BJAB0868, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
NC_021732 | Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p3BJAB0868, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_021730 | Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p1BJAB0868, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021729_1 | 1633475-1633560 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021729_1
|
1 spacers
spacers of NC_021729_1
>1.1|1633498|40|NC_021729|CRISPRCasFinder CCGTGCTGCACATGCCAGTGGTAACGCACATGAATTTACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021729_1
The CRISPR arrays of NC_021729_1 >merge|NC_021729|1|1633475-1633560|CRISPRCasFinder TCAGAAGAAGCTCGTGAAGCTGGCCGTGCTGCACATGCCAGTGGTAACGCACATGAATTTACCTCAGAAGAGGCTCGTGAAGCTGG >NC_021729|1|1|1633475-1633560|CRISPRCasFinder TCAGAAGAAGCTCGTGAAGCTGG CCGTGCTGCACATGCCAGTGGTAACGCACATGAATTTACC TCAGAAGAGGCTCGTGAAGCTGG
>NC_021729.1|WP_000983628.1|1632429_1632843_-|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NC_021729.1|WP_000432330.1|1631409_1632288_-|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NC_021729.1|WP_001990041.1|1629208_1631353_+|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NC_021729.1|WP_000482091.1|1626948_1627428_-|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NC_021729.1|WP_000108365.1|1626442_1626664_-|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NC_021729.1|WP_000132044.1|1626019_1626337_-|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NC_021729.1|WP_000498477.1|1625713_1625935_+|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NC_021729.1|WP_001136759.1|1625197_1625626_+|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NC_021729.1|WP_000251637.1|1624784_1624928_+|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS >NC_021729.1|WP_001984002.1|1623524_1623815_-|hypothetical-protein MFFLYRFVLVSLLTIGVLNLMGCRPMSKNEFNTRCVWAGHDLSACNCIYNSLEQHYSPQFVESLPKLSLQNIDAKMNFVETMNQTMQQCQLSASKH >NC_021729.1|WP_000795915.1|1633906_1634143_-|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NC_021729.1|WP_020752564.1|1634425_1635037_+|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIHLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NC_021729.1|WP_000885229.1|1635107_1635719_-|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NC_021729.1|WP_000376215.1|1635875_1636331_+|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NC_021729.1|WP_001990047.1|1636389_1638036_-|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NC_021729.1|WP_000115408.1|1638201_1641666_+|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NC_021729.1|WP_000107128.1|1641662_1642622_+|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NC_021729.1|WP_001025680.1|1642765_1643050_+|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NC_021729.1|WP_002017921.1|1643159_1643273_-|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NC_021729.1|WP_000937460.1|1643361_1643997_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
261449 : 286186
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021729|261449:286186|DBSCAN-SWA TATGAAAAAATTGAGTGACGAATACTTACCTGTTAGAAAAGCTCAAACTGTTTATGGGAGTATTTCGGGAAATTATGCCTTTAGAGGTGAGAAAACCATTTGGTTTGAATCGACCCTTGAGCGTGATTTCATACTTAAGCAAGAATTTAATAACAATGTGATTGATGTTATCGGTCAACCTGTAGTTATCCCCTACATCACTGAATTGGGTAACCAATCAACCTACACTCCTGACTTTTTAGTGCAGTTTTCAAGCTCGAATTGTGATGATTTTGAGGATTTTCCTGTACCAATGCTCATCGAAATTAAGCCTAAGAAAAAGCTTGTTGAGGACTGGGATAAGTTAAAACCAAAATTCAGAGCAGCCCATCGTTTTGCTGCTGATAAAGGATGGAAGTTCAAAATTATCAGTGAAACAAGATTATATGATCAGTATTGGGAAAATATTAATTTCTTAAAAAAATTTAGACGCTCTCATGTAGGTGCCGTTGATCAACAACTATTACTCGATACCCTACAAGAGTTAGGTCAATCAACAATTAATCAATTACCTGCCCATATTTTTAAAGATAAAACCAATGTTTTAAAAGGAATTCACCAAGTTTGGGCATTAGTGGCAAAGCGAATGATTGCTTGTGACTTGTATTGCCCTTTAACGGCTGAAACAGTGATATGGGTGAACCAAAATGATGCATTTGCGAGGAATATCTAAATGATTGAATCTAATGCTGTCAATATCGATCGTAGTCGTATCATTCTAAAACCCAATGTGGTTGTCGGTTATGAGGGGCAACCCTATAAAATTGTGAATGTTTTAAATGCCAATGACATTGTTATATCAAGTCTTGATTCGGTACGTAGTCTACAGGTCAATGCTAGAAGTTTGACCATTTTTAATGGGGGAAATACGCTAACTGAGCGTTTGAATAAGGGTGATCAGGATATTAGTAATGAAGCTTGGCAGATTGCTTTACAACGTTATGAGATTATTAAGCCTTTGATTGAGTATTCAACGACTGAACTGGTCGAAAATAGGGCGAATGAATATGATGTGAATCGCTCAACATTGTGGAAATGGCTTAAAGATTATCGGGAAAATAATTCTCTAATGGCATTGATTCCCAAAAAACGAGGTTGGACAACTGAAAAATCAAGGTTGTCACCTCAAGTGAGCAATATCATTAAACAAGCTATCAATGATGAATATTTGAATGCGAAGAAACCCAGTATTTCCAAAACGATTGAAATTGTAAAAGCAGAGTGTTCTCGGCTTCAGCTTGAAGCACCGCATGAAAACTCTATTCGTAGAAGAATCGAGGCTTTAAATGATTACCAAGTAACGAAAGCACGTCTTGGATCTAAAGCTGCAATAGATAAATTTAAGGCTGCTGCTGGTTCATTTCCAAATGCTGATTACCCTTTGGCATATGTGCAGATTGATCATACACCTCTAGATATTGAAATCGTGGATGACGAGTTTAGAGAAGCGATTGGAAAACCTCATTTAACCTTGGCAATCGATGTTTTCAGTCGGATGATCGTAGGGTATTACCTATCACTAGAAGCGCCAAGTACGACTTCAGTGGCGATGTGTATCGCATCTTGTATTTTGTCAAAAAAACGTAAGTTGATCGAACTCGATATTGATGCTGAATGGCAGGTCGAAGGGATTATGGACTCGGTGCATACAGATAATGGCCCCGATTTTAGAACCAATCACATCAGTAAAGCTTGTCTAAAGTATGGGATTCATTGGGAATACCGACCAATTGGTGGGGCAAGATTTGGCGGTCATATCGAGCGTATGCTTGGTATCGTCAATCTTGAAATGCATGTCTTGGATGGTACAACTTTTTCAAATGTACAGCAGCGTGGGACTTATGATTCCGCTAAACAAGCCTGTATGACATTAAAAGAGCTTGAATACTATATCGTGTATTGGATTACTAAAGTTTATCACCAGAAGAAACATTCCGCTTTAGGAACATCCCCAATCGTTAAATGGGAAGAAGGTGTTTGGGGGACGAAGACGACAGCAGGTACAGGTTTGAAAGAACGTGTATCAGATGAAGATACCTTGTTTATTGATTTTCTACCTGAATTTGAAGCGACTATTCAGCGTACAGGGGTGCAAAAAGATAACTTATTCTATTTTGCCGACTGTTTAAGACAATGGGTTAATTCTATTGATCCAGAGGACAATAATCGAAAGCGCAAAAGAAAATTCTTGTTTAAACGTGATCCGAGGGATATTTCACAGATTTGGTTTTATGAGCCATATTCTAATACCTATTTTAAAGTACCTACCGCAAAGCGAGAGATACCACCGATTAGCTTATTTGAATATAAGCAGGTTCAGAACTATCTCAAAAGTGAACGTCAGGATGTTCAGAATCAGGATGAGATTTACAAGGCGATTTTGCATCTACGTGATCAACTTAATCAGGCTAGAAGCTTGACTCGAAAGCAACGTCGCTCAAACCAAAGAAAAAAGGAAAATGCAAAAGCCATTACTCAGCTTTCCGAACAGAATCAGTCTAAAAAGGCTGTAGTTTCTGAAAGTCTTCAGACAAGTGATGATTTGTGGAGTACTCCTTTAACTGCATTTGACGATTTAAGGTGATGTGATGGAAAAATATGAATATCTTGCAGAGCATGTACTTGAAATCATGCAATTAAGCGATAGTGAACGGATTGAGACATTATTCACTGATCGGTGGATTGGCTATAAGAAAGCCCACTCTATTGTAAACAAGACATTTTTATCTTTTATATTCAATGGCTTATTTTCCTGCTAATTGGTAATACCATGAAAAATACCATGCTCAGAAAAGGCTTAACAATATTTTGAAAAATTGCCTACTGAGCGCTGCCGCACAGCTCCATAGGCCGCTTTCCTGGCTTTGCTTCCAGATGTATGCTCTTCTGCTCCTGCAGCTAATGGATCACCGCAAACAGGTTACTCGCCTGGGGATTCCCTTTCGACCCGAGCATCCGTATGAGACTCATGCTCGATTATTATTATTCTCTGTACACGACAAATTTCACAGAACCCTTATCCTATCAGGGTTCTGCCTTCTTAAAATTGCCAAAATTTCCTTAAACTCTTCTTTTTTCCCAAAACCAATTAAACGCTGAATCGCCATTTGAACATAGTCTAAACCATAGCGAAATAAACTCATTGAGAGTCGTCCATGCTTCTTTATTTTTATCGCTTTTTTTTTGATCATGTTGCCATTCACCCGTTAAGTAACACCAACAGAAGCTTATAGCTAACACCGCAATCAATTTTTTCACTCGTCTAGGGTCTGTCAAGCGCGTATTTTCAAGATTAAACCCGCGTCCTTTGAGACAACTGAATAAGGTTTCAATTTCCCAGCGTAATGCATAATCCTGAATAGCATTGGCATTAAACTGAGGAGAAACGACGAGTAAAAGCTCTCCATTTTCTAACTGTAGTGCACTTATATATAGTTTCACCCGACCAACCAAAATCCGTCGTTTACGACATTCAATTTGACCAACTTTAAGATGGCGAAATAAATCACTAATTTTATGATTCTTTCCTAAATGATTGGTGACAATGAAGTTTTTTTAACACGAATGCAGAAGTTGATGTCTTGTTCAATTAACCATGTAAACCACTGCTCACCGATAAACTCTCTGTCTGCGAACACATTCACAATACGGTCTTTACCAAAAATGGCTATAAAGCGTTGAATCAAAGCAATACGCTCTTTCGTATCTGAATTTCCACGTTTATTAAGCAATGTCCAAAGGATAGGTATCGCTATTCCACGATAAACGATTGCGAGCATCAGGATATTAATATTTCGTTTTCCCCATTTCCAATTGGTTCTATCTAAAGTCAGTTGCACTTGGTCGAATGAAAACATATTGAAAATCAACTGAGAAATTTGACGATAATCAAAATACTGACCTGCAAAGAAGCGCTGCATACGTCGATAAAATGATTGTGGTAAGCACTTGATGGGCAAGGCTTTAGATGCAGAAGAAAGATTACATGTTTGCTTTAAAATAATCACAAGCATGATGAGCGCAAAGCACTTTAAATGTGACTTGTTCCATTTTAGATATTTGTTTAAGATAAGATATAACTCATTGAGATGTGTCATAGTATTCGTCGTTAGAAAACAATTATTATGACATTATTTCAATGAGTTATCTATTTTTATCGTGTACAGAGATTATTATTATAGAAGCCCCCATGAATAAATCGCTCATCATTTTCGGCATCGTCAACATAACCTCGGACAGTTTCTCCGATGGAGGCCGGTATCTGGCGCCAGACGCAGCCATTGCGCAGGCGCGTAAGCTGATGGCCGAGGGGGCAGATGTGATCGACCTCGGTCCGGCATCCAGCAATCCCGACGCCGCGCCTGTTTCGTCCGACACAGAAATCGCGCGTATCGCGCCGGTGCTGGACGCGCTCAAGGCAGATGGCATTCCCGTCTCGCTCGACAGTTATCAACCCGCGACGCAAGCCTATGCCTTGTCGCGTGGTGTGGCCTATCTCAATGATATTCGCGGTTTTCCAGACGCTGCGTTCTATCCGCAATTGGCGAAATCATCTGCCAAACTCGTCGTTATGCATTCGGTGCAAGACGGGCAGGCAGATCGGCGCGAGGCACCCGCTGGCGACATCATGGATCACATTGCGGCGTTCTTTGACGCGCGCATCGCGGCGCTGACGGGTGCCGGTATCAAACGCAACCGCCTTGTCCTTGATCCCGGCATGGGGTTTTTTCTGGGGGCTGCTCCCGAAACCTCGCTCTCGGTGCTGGCGCGGTTCGATGAATTGCGGCTGCGCTTCGATTTGCCGGTGCTTCTGTCTGTTTCGCGCAAATCCTTTCTGCGCGCGCTCACAGGCCGTGGTCCGGGGGATGTCGGGGCCGCGACACTCGCTGCAGAGCTTGCCGCCGCCGCAGGTGGAGCTGACTTCATCCGCACACACGAGCCGCGCCCCTTGCGCGACGAGC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24 | Vibriophage(50.0%) | transposase,integrase | attL 273249:273308|attR 288602:294469 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1004203 : 1016987
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021729|1004203:1016987|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021729|1004203:1016987|1009878_1010829_+|WP_001110396.1|DBSCAN-SWA MNYYQHHIGDFNNATRHLSLIERAIYRDLLDMYYDTEKAIDASSIDRLARRLQCTTEEQKEALKYVLDEFFILEEGVYRNNRCEREIAEYHGKKKQASEAGKASAAKRAAKKKGSSNSDSSKDDQASNENSTVVENPLNEEQTDVQPTNNHKPLTINQEPIIDSSSNAREENSQFTPIQFAQYQIDDHKRYSMREFISEYSEFQYDFISLAQQRFVSVPEIDLRTMIQNFGDWYFANESSSLNTPSIWLVKWFSWVQNNEKQVAANRKKQEQINSAGQKPQESGYFANLFEEQSESQIVDVTPAKKFPMIEEVGHA >NC_021729|1004203:1016987|1014781_1015546_+|WP_000994866.1|DBSCAN-SWA MNAVPQKLEYKISHTNQICKIHKEQMINVHGRIVCQSCVEKIMKQSNEKYESDKNNRILNLKMARAGIPKRHVNSGFSNYAVTHKGQDKARKTCEKFTMDFNSGVFRNLLLVGRTGTGKTHLGSSILKNIIIKNWEAIYITSADLAEDIAGAYRRSGDSEDEALKRYVKKDLLIIDEYGLHDRAEKRPQLLESVHKVLLTRYDELKPTVVISNLSLSEVREDLGDRLWSRFQHDGLDIVECDWDDARIGGGKAQ >NC_021729|1004203:1016987|1012160_1012523_+|WP_139162307.1|DBSCAN-SWA MSASMEMLRARLIELLTPHLSDRYVKWREAYFTRFTKCGGDSGWMFCVGPHEFHIDGALRRYYSGSIDITYNQKDRYFLVGEKKKVKCKACKGFGFIRDDGWGHIDKCETCDAEKGASHE 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19 | Acinetobacter_phage(53.85%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1237992 : 1270028
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021729|1237992:1270028|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(43.33%) | terminase,protease,capsid,portal,head,integrase,tail | attL 1234103:1234156|attR 1270189:1270242 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2723842 : 2738639
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021729|2723842:2738639|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3175264 : 3227163
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021729|3175264:3227163|DBSCAN-SWA 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MSKTTFKFIQWYESKYPEFVNRYGALKRLYDSDLDSFFIEEIDELYKEFKQGGVV >NC_021729|3175264:3227163|3193212_3193671_-|WP_000274931.1|DBSCAN-SWA MYHYEECGLSNIWLRNGFTIENDEDYGELVSIESVHELHNAIGLFLITQKPDLNGEEIRFLRKELNLSQKNLAGLLGVSETSIRHWEADRGLIGKPTELLLRALYKEHVQGDGKLRSMIESLNHQERTLVPSEISFSYGNNHSWHQTNCEIA >NC_021729|3175264:3227163|3183180_3183687_-|WP_000368384.1|DBSCAN-SWA MDNEYAKFFFNRKVDVYQLECIELSHPSFMNTYRVVRNDDRGVYVQHKEGSGQVYYEFLPASIQRSGMLGDLDQTLTVSISGLGDVMPDEFERVIEGQYPDVKPTVNYRIYSSDNLNSPMFYLLGLQLSSVAMNHKAVTFKAESPRLNTAKTGDIFSLDRFSGLKGAI |
75 | Acinetobacter_phage(90.16%) | terminase,capsid,integrase | attL 3175076:3175096|attR 3227902:3227922 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021731_1 | 58445-58535 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021731_1
|
1 spacers
spacers of NC_021731_1
>1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder AGTACTTTCTGTGGATCTTGAGCTACTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021731_1
The CRISPR arrays of NC_021731_1 >merge|NC_021731|1|58445-58535|CRISPRCasFinder AGGCTGATCCAGTTGATTATCTCTCGTCTGTAGTACTTTCTGTGGATCTTGAGCTACTTCAGGCTGATCCAGTTGATTATCTCTCGTCTGT >NC_021731|1|1|58445-58535|CRISPRCasFinder AGGCTGATCCAGTTGATTATCTCTCGTCTGT AGTACTTTCTGTGGATCTTGAGCTACTTC AGGCTGATCCAGTTGATTATCTCTCGTCTGT
>NC_021731.1|WP_000218962.1|55902_56337_-|hypothetical-protein MTVTENATMKNVSNRIYEDREAIQLLINPTYKYLLTVYSRKKELPFNYVLSYLVGNAVNDPDLLSEIKRIQPQFKGVKGKNTPFRLDTEIAKRFKEVAKTQKGDLYSSFVNAAIYYFLKHGDFEKMPELQALINNEINTEEKPS >NC_021731.1|WP_000210503.1|54842_55859_-|hypothetical-protein MTTNKTIVFVFLSIFALIISIALLVALSIYIRSSYIVLSAAVLSLIGSSLFLIRFLYRTFINETSTYKEKYTFWVMSYSMFIVVVFTIPLGYFINVYDQKRYTKNFLDLLNSVEFKSILKLGTENDVYVQLGNTNTGWSKTRLVLPESSNASMYLNNGYCGLNYDDDSSTSMKKSISKYLDKDRLKNNQIDLAKLSIMVHEFGHCLDMKRDFISFNTKLIPEKNTLIIGKNAIVPKMRSKAKDIESYLLLAQDSTLWKEVFADVYASGYMFVNHPNEAFQITKGLQEYRLKNKKDDPEHNSSCYLNVVLTSTKPKSNEELIKWSDKIREDKKCNSGFY >NC_021731.1|WP_000172709.1|53476_54094_+|hypothetical-protein MTLKDDDLKIINSTDLVEWDVKVSSIPWIPNLYNGNIKVWAKRNAEQNEVFDIAFRKLTNQAFPNTDLSMWVFENASCVTVQDSNKVNLQIKVQKMRDITRKILALNLFDVLNIEVGDTNHWDDPDHITLLKNAYAQVVLRISNQGQDSNLYTVSLEIDEYDSYGDIYLNDEFWFLFGNEESIISDIKLKQWNPIDLQPYAFHFK >NC_021731.1|WP_001084693.1|52776_53493_+|DNA-adenine-methylase MNSILNNYLGAKSGSGVYQAIINLIPPHDTYIELFLGTGSILSKKAKSSRQIGIDLNIDCIESFISPENDVELYHTDSLNFLNEFDFSQSGRTVLYCDPPYLLETRSSKKRYKYEFNDEDHLKLIQLLKKLPENCFVLLSGYRNRIYDELIADWWSIDFQAMTRGGVRTETVWCNFFPNTIHYHTYAGKDFTDRQRIKRKAERWANNFKDLPCAERQAILASILSVSNAEDYLNDIKG >NC_021731.1|WP_001193276.1|51925_52483_+|hypothetical-protein MQTIEMLDIRISNYKPISKEQYQSAFSNFDFITNVIIHAFILSQFLFCFYGFYLCWIFSFNLRINFLVAISFSSIMILSIRILYKYLSKRNSRFLNQQNLNFLSTTFLFNEISEIDYLTLKEIIDRNETVKLKVKEIMEFRKGTITCFDFQQLLIPEYLKSYQPSNKDINLCTIKKNFISLVNKV >NC_021731.1|WP_000462439.1|51623_51848_+|hypothetical-protein MFELKTGNKEYHESQLRKTKIFIIIQVTILILVNLYTIILKGKIDLGLSTIILFSIGLGLLGLKKVLTALQKFK >NC_021731.1|WP_000180530.1|51105_51609_+|hypothetical-protein MTNEIYDATKLLTAFKFPNKASGEHTFIMGCTNKNKGKSLFQEELKDHPNIIFIEATEDDIAKQKESQRLKNLKDEQRLLSIKECYWSHSKDESFFLDTLKYSLINHFEFFENVDPTIDQLKTLFMYFDDYLIGQIISWGYSDTEVSTYIDEYIDENRDELETMLFK >NC_021731.1|WP_014702631.1|50636_51116_+|hypothetical-protein MLSHSELVQIAAKWVKSYLKFPIIETELKCIGSREIPDILAFRSNTSLIVECKTSLADFRKDFKKPERNGQLMGVGNYRIYCAPKGLIEINKVPDSWGLIEVSSNGKVTIERFRTGNIYSSNNSQDIYKQRDPFFHLSDIEKERSFLYSILLRRMSNDK >NC_021731.1|WP_020752479.1|49823_50429_+|hypothetical-protein MNEIVKTQEVIDLCIKEIKEYKPLTQKQYIPIYRKSERYTIIIRLLLILMIIFFVIAFISLMDLLIPEVPVFNYGKMIFLTSLTFFIISAFSTRKMFSVNDNLLNKNNLISLCSIDSFDEIDSDSYQMISDVSNTIPEFKNKVKEILKNRDGIITGFDFINLNVIKLLSLLKEQESINESNKKRDLILTDLFNDNGDKNND >NC_021731.1|WP_014702630.1|48984_49623_-|recombinase-family-protein MTIAKVARVYLRVSTDSQSLERQEKVISDARSAGYYIAAVYKEKASGATIDRPELQRMINDLQSGEVVIAEKLDRISRLPLKEAENLIESIRSKGARLAIPGLVDLSEISKDLSGMSKIIVDTIQELLLKIALQMAHEDYELRRERQRQGQKILKDKRLYKGRKPNEKVNLEIIKLRKKGLSISETAKGAKCSIAQVKKIWREYNDQLSEDD >NC_021731.1|WP_020752482.1|59548_61261_-|type-IV-secretion-system-DNA-binding-domain-containing-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NC_021731_1 | 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder | 58476-58504 | 29 | NC_017848 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence | 50506-50534 | 0 | 1.0 |
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NC_021731_1 | 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder | 58476-58504 | 29 | NC_017848 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence | 50626-50654 | 1 | 0.966 |
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1. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018144 (Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK386682 (Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NC_021727 (Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p1BJAB07104, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_KM922672 (Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NC_021731 (Acinetobacter baumannii BJAB0868 plasmid p2BJAB0868, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018144 (Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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9. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018144 (Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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10. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK386682 (Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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11. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK386682 (Acinetobacter baumannii strain ABAY10001 plasmid pABAY10001_1C, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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12. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018422 (Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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13. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018422 (Acinetobacter baumannii strain XDR-BJ83 isolate male patient plasmid pBJ83, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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14. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NC_017848 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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15. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NC_017848 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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17. spacer 1.1|58476|29|NC_021731|CRISPRCasFinder matches to NZ_KM922672 (Acinetobacter baumannii strain A221 plasmid pAZJ221, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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