Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022270 | Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome II, complete sequence | 2 crisprs | RT,csa3,cas6f,cas7f,cas5f,cas3 | 0 | 5 | 17 | 0 |
NC_022269 | Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome I, complete sequence | 2 crisprs | RT,DEDDh,WYL,DinG,csx1,cas3,PrimPol,csa3 | 0 | 0 | 15 | 1 |
NC_022271 | Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid unnamed, complete sequence | 2 crisprs | csa3,RT | 1 | 2 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022270_1 | 474031-474113 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022270_1
|
1 spacers
spacers of NC_022270_1
>1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder GGACGCGGGTCAAACTCGCTGGATGGCGGTG |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022270_1
The CRISPR arrays of NC_022270_1 >merge|NC_022270|1|474031-474113|CRISPRCasFinder AAGGTAACGACACGTTAACGGTCAGCGGACGCGGGTCAAACTCGCTGGATGGCGGTGAAGGTGACGACACGTTAACGGTCAGC >NC_022270|1|1|474031-474113|CRISPRCasFinder AAGGTAACGACACGTTAACGGTCAGC GGACGCGGGTCAAACTCGCTGGATGGCGGTG AAGGTGACGACACGTTAACGGTCAGC
>NC_022270.1|WP_144080944.1|470802_471264_+|hypothetical-protein MVMIILGIWFIVFVLSIKPLVSKSRQFYRTRTKNSSYGIKTIILSISAHIGFTYLIYTDVGESWLDWFLPLANIMFVVQVLLVLNLALDNYDVVDKARVRNDAIFGFSLAYLGAVAMLYYSVYINDVILKGICVTAASVGLAGRLITYRNRKV >NC_022270.1|WP_012129891.1|467361_468735_+|HlyD-family-type-I-secretion-periplasmic-adaptor-subunit MFPIIAKVIRAKQGQTHRNRRNAHDYEFLPAYLEIIEKPPSPWSRRIAFTIATFLLLVLIWSIVGRLDIHASAQGKVMVSSHSKVIQALEQGEVVEINVRNGQFVRQGDVLIQLNPAGANAESTRLSEQHVRYQLNKARLLALLSPNPMQSFTPPREATPAQITASQQHLQSEYQETQQMLERLNAERDVNRAELEANQQGIQALNKLKQNIVTRLHARRALMESNAIARVDLLEQEKEWLDVERDISNMQAQQAILKAKASSLVEQRETLLAQKRLEYYDELNQIDGQIAEIEQELIKAKERQRIQALRSPVDGVVQQLAIHTLGGVASPAEPLMVIVPQNADLEAEVNILNKDVGFVMAGQPVEIKIDSFPFTKYGTIPGELLYVSKDAVEDERLGPVFPARIRLERDQILVDDTWVTLGAGMSLNAEIKTGSRRIIEYLLSPLQQYQSEAMRER >NC_022270.1|WP_144080972.1|465325_467377_+|type-I-secretion-system-permease/ATPase MPTEHPGGDLKGWLKKASGQTDGQLRLKRLSENTLTASHLPLAYQQHDGEFVVLARLSDDQALIQRHHEQTPQVISRTTLEEAWAGQVIQYHESGRQFDIRWFIPEFIRHRGLLGEILFFSLLLQMLALVLPLFFQVIMDKVLVHNALSTLDVLVVALVVVGLFEVILKGLREYLLAHTTTRIDIRLGTKLFKHLLGLPLLYFKNRHVGAIVTRVRELDSIRNLLTGAALTLLVDVSFTFVFLGVMVYLSAPLTALVIATLPLYALLAWATSEPLKRRIEHQFACGAKNTAFLTESLNGVETVKSLALEPRFERRWEGQTQELVAANFSRQSFQAQVSQCVTLLQKVTSVGVLWLGAQMVMSLELTIGQLIAFNMMVNHVSQPLAKLVELWQQFIQTRVAVDNLSEMLNLPAEQEMGEFQPNAPIQGHIEFQQVWFRYQPQLAPVLHGLSLTIKPGESIGLVGPSGSGKSTVTRLIQKLYLAEKGQVLIDGTPLNQWSAAALRQGIGVVLQENYLFHRTVRENIAIRQPTASFEAVVEAAKLAGAHEFIIKMPKGYDTLLAEGGASLSGGQKQRIAIARALMTQPRILIFDEATSALDEESQRIVNQNMAKIARGRTVITVAHRLSAVQGCDRIAVIEQGEVTELGNHQHLLAQQGCYARLWHIQQNKQVESVGEEVLPCSQS >NC_022270.1|WP_041853608.1|463773_464340_-|reverse-transcriptase-N-terminal-domain-containing-protein MMISKEISASPDSAQWQSINWKAVESHVLKLQMRIAKATREGKHGKAKALQWILTHSRSAKLLAVKRVSQNKGSKTPGIDGVIWNTDTRRMKAVNQLSRKAYLAKPLKRIYIPKKNGKLRPLGIPCMVDRAQQALHLLALEPVSETLADPNSYGFRPNRSTADAIAQCFKCLALKKSAQWVLEGDIKA >NC_022270.1|WP_011999348.1|462467_463661_-|IS4-family-transposase MNLSTILNTFFLMSSFSAIKDKRRITAVLDCINALNEKDTLTLTGLGRGMKNTKTKVKHCIKRVCRLLGNPHLHRERTGVYAYITDFLLKNVKHPIIIVDWSPVNHVDKQILRATIPIGGRAFTLYEEVHPECKLGSLAVHKAFIRRLATMVPKGVIPIVTTDAGFKVPWFKPIEQQGWYWLGRVRGNSKLRVNDRWCSADEVFVQAQYKPQHLGTAELTKQHQYPCQVCLYRKKSKGRKAKNWSGSLQRNTVSLSHAKGEREPWLLVSNLPGETWFAERVVALYTQRMSIEEGFRDTKNERYGLALNFSGSASPKRIEILLMIGMLTQFALLVVGKVAYLKGYYKDFQANTIRTRRVLSYFFLGKELIGREAYSFSVKDLALAVGGLKAISAAEFR >NC_022270.1|WP_011998890.1|461414_461612_+|hypothetical-protein MSSRRHLLPSAVPLRTQRATFTALGSSLHEGTYWHPATYKAARAGSCQELRHCLFDFLFAKYSWY >NC_022270.1|WP_012129897.1|460624_461344_+|beta-ketoacyl-ACP-reductase MKAEKVAVVTGAARGIGQAICEQLLEDGFHVVGLDISPVEWSQSAQLSNYQVNLCDAAAVSEVVDSIVRQHGRIDALVNNAGITRDALLPDMLEQDWDSVIDVNLKAVFLLTQRVAPVMLEQGTGSIVSISSIVGTDGNIGQSNYGASKGGVISMSKGWAKELSRKGAQIRVNCVAPGFIATDMTKNLPEKVIQMMEGKTPLGRMGSVQDIANGVSFLTSDKSAYITGHVLKIDGGLVL >NC_022270.1|WP_012129898.1|458701_460186_-|DUF1800-family-protein MNQAYIDAARTLQQCTFGPSQRDINDLVQSGSIENWVAQQTLITPSSWLKHFEQDELNVPDLGQSLYYASSWTRMTVEGDDILRQRIAYTLSQLFVVSVKDPAFKAASKRRYMCNYFDGLLDNAFGNFRDVIRFVSKSPIMGEYLTFVNNVSNDLTAPDENYARELLQLFTLGPVKLRNNGEVRLDAEGNEVASYTQEDIEQLARVFTGWKFIDIRGNDKYSQPMEPRGEHDMGEKPILGKTFPGGVGAEEELEAVIEHLMNQNTLYTFVTKFFINKLVTSNPRAGYIRRVRRAFKRSDGDMQALIIAILTDKDALRSGSTVGKLRDPLSVFTHAMRALQVKRRDGVLMWPKQFNWYNRTLPLSAPSVFYYYQPDDAPNHPDFNGLVAPEFNVYQWHDIYQYGIQFRELVARFEEEAKDWYMDEVLFTRYLAFDDEGVVDYLNEHLFAYQMSEQARQCYLDYLAQCPSRQSKWRKEIKNLVMNALLSPEFITQG >NC_022270.1|WP_012129899.1|457349_458696_-|DUF1501-domain-containing-protein MNLTRRRFLQAGSAGVGVSALNLAAFPAFADSFNQCKNGYRAVVGIDLAGGNDGYNMLIPTAAPANSQYRALRGSLALDETSCIHLDAVNDDAKLALNPAMAALKTYWDNANLVPVVNLGPLTQRVNNVIYGESTRPAHLFSHSHQSTMVQSHATKSLSKEGFGAKTSTELGTMLRSLNELSPMFDIGGTQVWTNCIEAQSNSVGSQPPSDIFNDQRSRDLFDQLQNTGSYGNVFQSHYAGIAVDSTRMYQEFSAILNAEITEVFPETRIGNQLKAVFKLLLHKDQFQHPAQYFSCKLGGFDTHSAQISRQTGLLQELAEAMAAFQLALENNGLFDQVTTFTHSEFGRTLIPNGTDGTDHGWASHALVMGGGVAGKAIVGEYPDLSETSPYLLSRGRVIPTISSDQLHASLMAWLGLSETGINQLFPALDNTLTDSIQPQTLPLFKSC >NC_022270.1|WP_012129900.1|456430_457225_+|metal-ABC-transporter-permease MTEYAWLLPAVLCGLIALVGNVVLGQQVLKRQIIFIDLAVAQVAALGAALSHYWLNQYALFSGSFFGEMVGPWVMSLLLCGLNALMEKRYQQHLEPMIGSLFVVSASLAILLVSKDPHGADFIQGILNGQLLWSTWDDVWPLALITAAMLLLVWLKPAFMQGSGFYLIFAILMPITVKLTGIYLEFALLVIPALCAAALKGTRFFIASISIGFVGILSGISASARYDLPSGASIVITLFIAGMLFNLLVQPWLHKSPSINEETA >NC_022270.1|WP_021018133.1|474855_475566_+|hypothetical-protein MNWIKCFTFLSLFACFNISSCELYLYNLERSNLIYAYGDDIFSEKHKLSGNFDDDLIVSLKYRYGLGLNKDLEKSSDILLSYSDSQIGNDKGDLGMKYYLLGTYNYSCKNPVKGLEYLKKSNEYGYVKSNFLYGYISYYGLREKITTEDYFSILKKGMQNADGYSIFQYIYLSFTTGEITGVTDWIDIIEKMNLFSTCDLYNFHKFGVGVGGLISDWESKKLIIRKLWPEYNLKCE >NC_022270.1|WP_021018134.1|475579_478747_+|calcium-binding-protein MSKKLDLVRDVISANQHTNDINKLDSELMSLCDDAMSNPTIDNLNKVRDKIEQRKETEQLRGTDAFGALGLLGELLDSFIGEMVDKGDAIQDHWEPAIFDDIEEYMQGDKARRNELKELCNKDGKHLQGPRLRELPKSPTAPGSPLILDLDGDGIETTDLESGVYFDHDGDGKRERSAFVGPDDGLLVLDVDGDGAITSGNELFGNNTKLGDGTFASNGFTALSQYDENGDGLIDSKDPIFSQLKVFRDLNQDGISQSEELRSLNHHGVTSLKVTYNDSPYVDENGNEHRQQSSYTKSDGRKNDLNDVWFQMEKSDFIYPEIDIPKDILKLPNINGIGSLPSLHYAMAKDGSGRLKSLIESYQAGTTDQSSAELLTEIMFTWAGVTGDYSPYYQSKIDARKIRTLEAFYGYKIDKPRGSGVQYTALFSGIFKNLSREIGLRLSGTESILFREVKWIQEEKTGNWYGDFSEVADKVIELVSKGTAGAWKETIHFFNTLKLSDDEYSTNQKNLYSYLFESAHSSTADNLPEGFDKLIHMSISQESRVGDEFDNDLFGSSSDDFVYGNKGDDSITVGAGNDFVYGGEGNDTLHGGTGNDRVSGGEGDDHLTVAYSGSNTLDGGAGDDVLTVETPTSSGRYSSYYKTANNARNTLIGGAGNDRLVGGLGAERYEFNRGDGQDTIRDRDVYGSSVDQIVFGEGIVRDELSLRREGNHLVIMIGGPDSGDSITIEEGYVNSQHQIEEIVLSDGSTVSPQSLPILSSAEADELRGGYFADVIDGREGDDRLYGEGGDDTLEGGQGDDVLDGGAGNDTLNAGAGNDTVTAGAGNDVVAGGLGNDTLHGGTGNDQVSGGEGDDHLTVAYSGSNTLDGGAGDDVLTVETPTSSGRYSSYYKTANNARNTLIGGAGNDRLVGGLGAERYEFNRGDGQDTIRDRDVYGSSVDQIVFGEGIVRDELSLRREGNHLVIMIGGPDSGDSITIEEGYVNSQYQIEEIVLSDGSTVSPFDLPDYVEPVIETDLLVQAMSAFDAQENVANNAVIDSVTSSMSPNVVVSGRSPL >NC_022270.1|WP_021017836.1|479087_479399_+|IS66-family-insertion-sequence-hypothetical-protein MGKRHTNQEWQTLIEQSESSSLSTLAFCKLNELNPSTFYAKRQQFKKANSSQGFLRAEVVEKTTKYQAQIATANMTLLINDVELSIPQGTPAAYLAELIGALS >NC_022270.1|WP_012127165.1|479395_479749_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MKHMLSAPEIYLYRESVDFRKSINGLAAIIESDTDLPLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPAKEQNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVKINDFTMT >NC_022270.1|WP_012129880.1|479808_481341_+|IS66-family-transposase MKKTPVINPESQDVAELQAMVKALMVSESQWKQERQSLLEQLKLAFDRQFAKRSEALKPYDESQGDLFNEVECEAAKEEEVEVVTTTTTTKKRGKRKPLPKTLPREVIELDLDDHEKQCACCQHSLHKIGEDRSEKLEFSPAVLKVLEYVRPKYACRQCEQTEDNSHIVQKPAPQSIIPKSFATESLLANIILGKYQYAMPLYRQESLFTQSGIELSRTTMARWVIQVSEKFKPLYAALKEHLLQQVVVQADETPLNVLKEDKKCYMWLYCSGADSPDAALPNVKNIALYDYQNSRARACPVAFLGDYSGYLQTDGYGAYDGLHHVTNVGCLAHARRKFMDAKKLQGKGKSGKADKALAKIQKLYGIESCLKGATVETRKAERQLHAKPILDELHDWMTSQQVLASSSLGKAIKYTLGQWPKLIRYIDDGHLSIDNNRAERAIKPLVIGRKNWLFSNTPNGADASAMLYSIVETAKANGLILYDYMVKCMKELAKAEPDIDALLPWNFKY >NC_022270.1|WP_041853519.1|482416_483622_-|DUF3103-domain-containing-protein MRPSFSISMALATTVVGFHSYADSINTTTSSLTSVHVAEQKQSLALQISASYADLESSLKAQITEKSLSMPIDKLNSAQPYSTFSSEMQKADLSYRKMKGINNFSDSVLEIRMADETMIDAWKDGKSPLFAFEPSGDDADWQYIEAYDVYGQVHELDVYQMPDVPVFVIDSDGAKELKAGLMAMQAELNQLGMTTQINADGKNSADNTQKQPLISKARHSISESEPEELNTTRLTKIRLAVDREPWISGKAEIYAIVTGVDASRLEPQIDLVEMPYLDYDKQTYYPNQTIIFWPRYRWGAADIILMEHDDGTNYKDLAKLLVKAAEEVLKMIPDPEVQGYVIIPQITSKIIELIPNNILVNDDDFVDVYYTLLQKTPYVDRPGAGGNAVASFTPVTILPTE >NC_022270.1|WP_012129878.1|483878_484523_-|HAD-IA-family-hydrolase MIECKKFIFDVDATLVDTQAVIDNIWKKWCETVGVSYVDMSQYIHGRKIEETLHCISPSYACDVQVEKVKSIALSEMTKAQAISNAHSFISNLSPNAWGIATSGPKKVATTSLLASGFDLPKVMIWAEDVLKGKPDPEPFIKAAHALNVIPSECVAFEDSPSGVLSAKRAGCFTVALLTSHREDELKDADLIVQGFGHLTVIKNHNGSYCLAAS >NC_022270.1|WP_012129877.1|484587_484995_-|DUF2007-domain-containing-protein MIVVARFSFPHEAHIAKANLESAGIQSFIADEHTVNTQWLYSNAIIGGVRLMVSEEDFEEATELLSCDFSESLETHSVVAGEKKDLCPHCGSSDLSAHTKGKRPAFLVFILLGFPLFFYKQGYKCNQCGEFSEQL >NC_022270.1|WP_012129876.1|485234_485762_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MEITFRQINMDDDFELCVASRKDAYFCSFGHYDGFEDFISGYRERVLERLSTSGWFYIHIFVDGEFAGQLEFRSFSPEQDTGYVHLIYLKPNFRGLGLAPKVQEYIVRTLSQAGCLRAVLSVSRTNTRALAFYKRNGWEFARRNPKHDETDFYQLWIGHTVYVESGSNGLSGAKR >NC_022270.1|WP_012129873.1|486309_487170_+|glutathione-dependent-disulfide-bond-oxidoreductase MTNEYIPPKVWTNDNENGGQWASINRPDSGARHEQELPVGEHPFQLYSMGTPNGQKVTIMFEELLAAGVTEAEYDAYLIKIGDGDQFGSGFVSVNPNSKIPALVDRSGAEPVNVFESGNILFYLAEKFGHLLPTEGAKRAEVMNWLFWLQGSAPYLGGGFGHFYSYAPEKFEYPINRFTMETKRQLDVLDKRLANNEYLGGDEYSIADIATWPWYGNLVLGRAYDAAEFLDVASYKNVVRWARAIDEREAVQRGRIVNRAWGEEWEQVAERHSAADIDAALAKKPE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022270_2 | 677185-677393 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_022270_2
|
3 spacers
spacers of NC_022270_2
>2.1|677213|32|NC_022270|CRISPRCasFinder TTTGAGTCTTGATTGCACCCACTACACCGTTG >2.2|677273|32|NC_022270|CRISPRCasFinder GATAACGAAAGGATGCAAGCCACGACCTATTT >2.3|677333|32|NC_022270|CRISPRCasFinder TCATACCGCGATGAGCGCAAGCGGTCGCAACC >2.4|677214|31|NC_022270|CRT TTGAGTCTTGATTGCACCCACTACACCGTTG >2.5|677274|31|NC_022270|CRT,PILER-CR ATAACGAAAGGATGCAAGCCACGACCTATTT >2.6|677334|31|NC_022270|CRT,PILER-CR CATACCGCGATGAGCGCAAGCGGTCGCAACC |
cas6f,cas7f,cas5f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022270_2
The CRISPR arrays of NC_022270_2 >merge|NC_022270|2|677185-677393|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATGTACTCTAACTACTCGGCAGTTCAATTTGAGTCTTGATTGCACCCACTACACCGTTGATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACGATAACGAAAGGATGCAAGCCACGACCTATTTATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACTCATACCGCGATGAGCGCAAGCGGTCGCAACCATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACT >NC_022270|2|2|677185-677392|CRISPRCasFinder AATGTACTCTAACTACTCGGCAGTTCAA TTTGAGTCTTGATTGCACCCACTACACCGTTG ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTAC GATAACGAAAGGATGCAAGCCACGACCTATTT ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTAC TCATACCGCGATGAGCGCAAGCGGTCGCAACC ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTAC >NC_022270|2|1|677185-677393|CRT AATGTACTCTAACTACTCGGCAGTTCAAT TTGAGTCTTGATTGCACCCACTACACCGTTG ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACG ATAACGAAAGGATGCAAGCCACGACCTATTT ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACT CATACCGCGATGAGCGCAAGCGGTCGCAACC ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACT >NC_022270|2|1|677245-677393|PILER-CR ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACG ATAACGAAAGGATGCAAGCCACGACCTATTT ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACT CATACCGCGATGAGCGCAAGCGGTCGCAACC ATTATCAGCTACCTACTCGGCAGTTTACT
>NC_022270.1|WP_012129697.1|676819_677026_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNDLAKAFGNNLRLMRKSKSISQDKLALLADIDRSYIGRIERGEVNITLEKAYQLARVLGCDVIDLLP >NC_022270.1|WP_012129698.1|676179_676728_-|hypothetical-protein MTKKVQVNRDIYEIISLPSVSEFRVTQIRNLITKKSGHYSNKNTARLYVARQLESLEKQGVLKSQGLRHNKTYRKTDMFADANFILKDKRVSKKRPDNSGPLNSASVKSMLMDEKKDIESNLTIALAEINEYKLLMSRSKSLHNLLLSSHLDAVNKAAVLVAKLNVWTDAIKLVTKQDVKSC >NC_022270.1|WP_012129699.1|674791_676186_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MLRKWQAECISLALSKYRRGHAHFLAQATPGAGKTIMAATLAKQMFDSREIDFVLCFSPSKAVADGIKSTFSQLLECSFNGALGETGCSVTYQSLRFVTKRFWDTLSKYKVLCIFDEIHHCGGDNELNSNSWGYQLLSDVQHAATFTLALTGTPWRSDKTPITLASYTDPEGKIVCDYQYSLAQAVQDGVCRKPKIALIDCEEVKVTESEGLRSYNTIDELLNEGDVTYALILKDQQALLHLIGEAVSRLISIQAESPNAGGLIVASSIQEANKIASILTHSYAQSSVVVSYRDTSSHEKIKEFKETHSKNWIVSVGMVSEGTDIPRLQVCCYLTKIKTELYFRQVLGRILRVTESPNQEAWLYTFAESNMIRCAEEIETDIPDTCLYLNYECPDSQRSRVDESNKTQALDAQLLPASVAEISFNWNDDLSASEPPNGKNSDLFESSIQLARFNQRVIEAFRGV >NC_022270.1|WP_012129700.1|673720_674701_+|AAA-family-ATPase MECQKVEITANKVKQIFIQNPQITYIIDDISDCREFSDGIHEPDCMIVVGDTGAGKTTIIDKYLAKNPRSETNDGSIIPILSTSLPPNATPITASEQLLSDLGDPLAFSRGNDPVKIAKEMSDLMKLCGVELIIIDEFQHMIDRKNKQILHSAADWLKMLIVGSKIPVVLFGMPYSVLILEANNQLAGRFELQHTLEPFRLNNKENRILYKTFLAMLDEALPFHESSDLASPDMMKRIYAFSQGNLRRIRKLINRSSRLALRDNSNKILLKHFAKAAPKVSRAACEKQNPFRVNVNELTIKQPPKDIGWENYLSQQEKDISPRDLF >NC_022270.1|WP_012129701.1|672697_673699_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MWGALRVWPCYGLPEHLIVDNGAEFNSLDFKIACKELKIKVKKNPTKKPWLKGSVERYFRTINNRLLSRIPGKSFTNIFERKDYDPLKNAVIDSLLLQEMIHIWIVDMYQNGKNGLENNIPNLSWVDAVNSSIPPRPFKGSREELKFNLGKNREVALDRNGVRLGTTVRYSSDRLAKYFGEATCKDMKGVRVRIKYDPSCLGRVYVLDEKKEEFFAVEAIDADYAYSVSEWLHKTCCNYARRYIRKNYNHRDVVEAWRKILEIIDKAFDKTGQNQTRNSLGTITTSRVQRVKEHTERASSVAKTQQQDKSIKSELDDEFDWDIEVNTKGWSIE >NC_022270.1|WP_012129703.1|671404_672598_-|IS4-family-transposase MNLSTILNTFFLMSSFSAIKDKRRITAVLDCINALNEKDTLTLTGLGRGMKNTKTKVKHCIKRVCRLLGNPHLHRERTGVYAYITDFLLKNVKHPIIIVDWSPVNHVDKQILRATIPIGGRAFTLYEEVHPECKLGSLAVHKAFIRRLATMVPKGVVPIVTTDAGFKVPWFKPIEQQGWYWLGRVRGNSKLRVNDRWCSADEVFVQAQYKPQHLGTAELTKQHQYPCQVCLYRKKSKGRKAKNWSGSLQRNTVSLSHAKGEREPWLLVSNLPGETWFAERVVALYTQRMSIEEGFRDTKNERYGLALNFSGSASPKRIEILLMIGMLTQFALLVVGKVAYLKGYYKDFQANTIRTRRVLSYFFLGKELIGREAYSFSVKDLALAVGGLKAISAAEFR >NC_022270.1|WP_012129704.1|670484_671387_+|hypothetical-protein MSDEDTERFGDLFPRSRSGIASKPKETLSLPLWKEIDLVFKDVFGVSEERRDEAIHRYNVLELLIERYGKNFSKKEIDDAFPFLKEKFGSTTPSASSIYRYWRTFKKSDFQLSSLIPKVTAGNTSKNVPEELEPLIQEAIKDYFSAEEQTAVSAYLTLETEVSRYNETNNTQHSLFSIQSFRNRLRKHSEYEKIVLRKGKSAADATFRKVGQRPATTRALERVEADHTRLDLFVIDERYGIPLGRPWLTLLYDTHTKSIIGFYLGFEPPSYLSVSLALENSILPKDYVKELYPSVEGVWP >NC_022270.1|WP_012129705.1|669861_670482_+|TnsA-endonuclease-N-terminal-domain-containing-protein MKKRILRNSSVKNISRFVSLKTDSIHTVESDLEFDACFHFEFSAKILTFEAQPLGFEYHLDGKRRKYTPDFLVTYNDTYQPFYEIKPKRITETEEFKETFSVKKEQALSMGNDLKVLTEDDIQIYPLLDNLKIIHRYACDDRLNSLQHQILGLLRKYGELRIEQIVKYSSVHSSISLPALYDLIARQLLKIDMHQPIDWQTPIWSS >NC_022270.1|WP_012129706.1|668673_669717_+|GMP-reductase MRIEQELKLGFKDVLFRPKRSTLKSRSQVNLTRDFTFKHSGRQWSGVPVIAANMDSVGSFAMAKALAEHGVMTAVHKHYTVEDWAEFANTADKATLNNVMVSTGTSEADFQKTKDIMAISDEFIFICIDIANGYSEHLVEYVQRVRAAFPDKVISAGNVVTGDMCEELILAGADIVKVGIGPGSVCTTRVKTGVGYPQLSAIIECGDAAHGLGGMIIGDGGCSCAGDVAKAFGGGADFVMLGGMLAGHEESGGEVIEQDGKQFMKFYGMSSKSAMDKHSGGVAGYRAAEGKTVLLPFRGSVHGTIQDILGGVRSTCTYVGAAKLKELTKRTTFIRVQEQENNVFGKE >NC_022270.1|WP_012129708.1|666687_668226_+|bifunctional-ADP-dependent-NAD(P)H-hydrate-dehydratase/NAD(P)H-hydrate-epimerase MDFNLALKLYTAEQVRNGEVIAAQMAGVSMYSLMQRAGMAVYEQFLHLYPKARTVLVVCGKGNNGGDGYVFATLAKQAQLNVRVFQLGDTTALKGDALRAFEDWQTIDGENSSWSDWHTALLEADVIIDAMLGTGLSGEVRHEYRRYIDQVNQIHCPVISIDIPSGLSADTGAVLGDAIQADHTVTFIGVKQGLCTGQARDYVGELHFSGLGVNVEFESIEEESALGIDHRIIKRLLPKRKATAHKGNNGKLLCIGGNQGMSGAIRLCASAAARTGAGLTAALTHPSSLLPLQVGAPEVMSQAITFDELKEVDNALIKRTRWADTLAFGPGFGEDEWAHQAYQLLSQQHKPKVVDADGLNILAMLSQRNDVVVLRDEQRVMTPHPGEAARLLNVSTKEIEQDRFAAARQLHERYGGVVVLKGAGTLIYDGVRMYICLAGNPGMASGGMGDVLSGVIAALLAKGLPIAVAARLGVMLHSHAADINVQQKGEIGLLASDVIESLRDAINLKNDD >NC_022270.1|WP_021018164.1|677520_678120_-|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MNWYYRTVTFLPERCNNESLAAKCLRVLHGFNYRYETRNTGVSFPLWCNETVGKKVSFVSTNKMELDLLLKQEYFVQMEKLQYFSISKTVLVPEGCRYVSFKRCQSIDKATTAGHERKIRRLEKRAKSRGEPFDPSSFTPKEHTVLSHYHSLEEFSSKTNNNFRLNVRMFSEQHNEGDSVFSSYGLSNSEHFLQPVPLI >NC_022270.1|WP_012129695.1|678122_679181_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MKLPSSLAYERSIDPSDVCFFVVWPDDKKTPLTYTSRTLLGQMETASLAYDTSGQPKKSVTAEALAQGNPHQVDFCHVPYGASHVECCFSVSFSSELRKPYKCNSSSVKQTLVKLVGLYEKKIGWTELATRYLINICDGTWLWKNTRKAYCWNIELTPWPWNGENVKFEDIRNNYISRKDFENHKDWSGMTEMIKTAFSSSNGLAILEVKATVHLPTNAMVRPSQAFTEKENGSKNKSKSQNSRVFQHTVIDGERSPILGAFKTGAAIATIDDWYPEATETLRVGRFGVHREDVTCYRHPSTGKDLFSLLQKADHYIEVLSSNEAPDQEAINDMHFVMANLIKGGLFQHKGD >NC_022270.1|WP_012129694.1|679152_681075_-|hypothetical-protein MQTLKELIASNPDDLKATLKRVFRPLTPHIAIDGKELDALTILVNLTDKTDDQKDLLDRAKCKQKLRDEKWWASCLNGVNYRQSHNPKFPDIRSEGIIRTEALSELPSFLLSSSKIPPYHWSYAHDSKYVNKSAFLTNEFCWNGGISCLAELLRDVDHPLWKTLAKLGCYQKTRKAIAKQLASIAHMTISVPLAPNYLTQISLPDSNTSYISLSPVTSLSMQSHFYQGLQDEYLHTATTRYSRSTNMGVTAMTCDGAFRMLKSNTKISTTPHHRLNSKRSWLTSEHVQSLTKYQRLNKRLMPENARKALRRKCKIEVLNLVNAWLAMQDCTLDSTILVQHLNHDLSCIGATKRFAYDPAMTKLFTELLKRALSNSINNGTQHTNGSYLVLPNIRVCGATALSSPVTVGVPSLTAFFGYVHAFERKLNSIYTAFRIESFAICIHQLHVEKRGLTAEFVAKGNGTISAPATHDDWQCDAVFSLILNTNFAQRIDQKTLITALPKRLARGSAKIAIDDFKYLNSFTTIETAIQSLPIKVGRWISLHTQPNNNLGDLLAAIKEDSQLMASCVGYHLLEEPKDKPNSLRGYKHAFAESIVGLIKSITFGSTTDANTILWSLNSHKNYLVVQPRSISDETTLESSL >NC_022270.1|WP_012129693.1|681075_682260_-|TniQ-family-protein MFLQRPKPYSDESLESFFIRVANKNGYSDVHRFLEATKRFLQDIDHTGYQTFPTDIAKINPCSAKDSSGARTASLLKLAQLTFNEPTELLGLAINRTNLKYSPSTSAVIRGSEVFPRSLLRTRSIPCCPLCLQENGYASYLWHLEGYDHCHIHNAPLITSCSCGNEFDYRVSELKGVCSNCKEPIATKSRGREPKQAYNVANWLAGNGSEELPNLPKSYRWGLIHWWTHLNDDKFDHGSFTHFFANWPSAFHSMIDAEIEFNLEHAFVNISELRLKDLLGRLFFSSIRLPERNLRHNIILSELLSHLEKRLWQDKGLIANLKMNALEATVLLNCSLDQIASIVAQRILKPNRRTKPNSPLEHTDYLFHFGDIFCLWLAEFQTDEFNRSFYVSRW >NC_022270.1|WP_012129691.1|682465_687223_-|hypothetical-protein MGFQFDQEVYLFGAYFERKETDEGNFFPNWHQESDLTEKTELDGKIRPIPQTPIMVNAIAGMDSQLWGTTLEGKIVELGMGEPLSKSAAQPLNGEKVDGEETVTEDKENFMILHPGARKEDIQKDIDYELSFPPISWLSQMIAPPDYKDGGASDVATLAENIKHFATTIDGVVDGKRQTGVKFKLTKIKPSQLAAKYEEETDGKLSEEQKAYNSWYDKQQKKPYLQGFIVPRVHTCAVLFTDPFYAGAEVTLVQPLKQIKPGESESAGETIIATQTVIQRKPRWDDRIENNVLPSALLHLDPIDAKDGFYLIRVAFREQEWLEFEKELYQRLKLPESVIRANVKKSKAFIGNTDEVQDVYTYELHERLIFKETAGIGKMACVCGDMITLEETLIQQFPSQLPEYSVYASKGVTYHNQSKPGLASLSLSSAIMKTYDSLSSDFLSIEGAKVYGTFGDMAKTIGQALWENAEAGNLPDFIMSGLSLKAAFAACKDAQQTIDISKTLVALPLSVKDYRKLILKKTVINIPYIKQAFKDNGQTKIFRGLGRLSKDFLSGTNQALPVIQLGLSAMETKEQYDKHIDALEDADQAHGSLKAYAQQYLSAIAYLRRSDEKERWETKATEVQGFLGNEAKIYTDAMGVVVRINFKFNSAEFENEVKALNSNYEELCKKLRNLLVENPDYQIALIGHGGPISSQEKNLIVSQRRIDTIKDRILNGTQGDERIKLERRLVTQAKGKAELLPKEGGYHDHGDRSDTADIAINRRVEVRLVIPDFSISLPPSRTGTLALNRAHQYWEGFKITAKEAQKEAFFSAIDVLATVALWTPASPIAAYYLAGSTAGKLLGAATDFYGDLFGDQTFKKLKDTYNTKSMLKTLSMINQELIVLYEEVDTKLEQKELKPSEIAGFLESQVNHDELLKRFLLRAYALNSLVELLAILSSMDGVLRSFDNLIEQYEVDLFIEQYVMSDNWSIPVNMGNTLALNWINRKKAFNSSLSHTVSSLAFDQGRQVHGSFNTGFPVQSQLYLNDKTADMIDINLAKKEGLKAFCNDFNLTKVELEEKDIGFSRLLVKEGNNWQPYVDWVREESGRKLRPQTRVMLQVILTGEGEHHSKSMFLREVSYSTEVIGFNTNCPAFDVLFTKKNAQELQDPDGAVAKYFEQQPQLQEEELELHSLEFEPTYTFGHVYIHGLKPLCPYVKGIDSLKALIKGQSVFEHVLDNDGFDQMEYTFSLAKHDLALGVRMVGTNNQFRLEYLTAKYGTSKASSPQKSHFDGQIEVLSQFEDTDFLIEDFVMSESSSARDNTPQVIGDQLTVLQGIEIDGQLKWGEDWTEQALASEFDWNKETSFAVCFALFGDELASQEYETMRLNWRELMMKLKLKDGPTIHSAMHYCGEMSIATHTTVVPSNNNYNGMQNEIVFKLAHDKTQSTHNHDDLAQSAIDFLQDNTAQYSQSLKSSDRKHVYIVRFKFTYVSPTGTLVDGMRPYGDIIAGKNLKPLTVTFESLQQSALNEGYPLPGIDVRLPPIKDYMDKPWTRILNEKEPSSISVRNHWGNLESPEQKREFVNKWITEQGLSLKAPQVELLQIKEI >NC_022270.1|WP_012129690.1|687222_688305_-|hypothetical-protein MKKLLSLCLAVLTLTACTDDGRTYVGEHNYYTMEPTEIAESPSSTYQAGKFPRYHVFRAKEWPREDLNDASSYDLPRVQFTWANLSERGVLEKGAPAYTDYEGRVKVWSMKTDGTDLRLVTDLPYEGRSRDIVRDKTSRSPNNRYVAMDAGTQVKVFDIKEQKMIDLPHKLHGPSGYIWAEDSSYLYYRTGQVGRVVYKWDVKTGQVEKTDIHISQTGLIKDGKRYKVTSVYTVVYDENTGEKLQSVRWGEGLKSWQSNADYTSISPEGTVSWGSNRSYGNFSVDITSNTVKPAIGAMQFAIGLNSKFALTNYNAMRMTVKNNQTKQSWKWRALSNNGTRDPAIVYNVSANNGDWFKEAK >NC_022270.1|WP_012127146.1|688950_690144_+|IS4-family-transposase MNLSTILNTFFLMSSFSAIKDKRRITAVLDCINALNEKDTLTLTGLGRGMKNTKTKVKHCIKRVCRLLGNPHLHRERTGVYAYITDFLLKNVKHPIIIVDWSPVNHVDKQILRATIPIGGRAFTLYEEVHPECKLGSLAVHKAFIRRLATMVPKGVIPIVTTDAGFKVPWFKPIEQQGWYWLGRVRGNSKLRVNDRWCSADEVFVQAQYKPQHLGTAELTKQHQYPCQVCLYRKKSKGRKAKNWSGSLQRNTVSLSHAKGEREPWLLVSNLPGETWFAERVVALYTQRMSIEEGFRDTKNERYGLALNFSGSACPKRIEILLMIGMLTQFALLVVGKVAYLKGYYKDFQANTIRTRRVLSYFFLGKELIGREAYSFSVKDLALAVGGLKAISAAEFR >NC_022270.1|WP_012129686.1|692095_694105_+|AAA-family-ATPase MKLSKVRISNFQCFGKLTEIEFEEDLTALIGLNGSGKTSTLHALSRMFGVTESSRKVLVDDFHCPSSNTFRAEKLFIEAWFEFPELQGGDDLTAVASTFNQMCFSSEGNGKTEGGVKTLLRVRLEAELTVDDVSPEGIVNETVYFILSDKDDFDASEKRVLRRSDRNNIQVHYIPASRNPFKEISSSTKILLGRLLDAIQWSKGPEGELQKAVEYTEKASDEISKNAAVSLIQGHLENSWDQMYAGDLFSKAKLNFLPLQSEDLLKTISLSFESASGAVASMERLSDGQRSLLHISIIQAVHEMESKTLQDMENRRHFDQKRLKRPIYTMLALEEPENHLAPHYLGRIVKSMVKLAKKTNAQVAVTTHSPSLVGRIEPKQIRHFRQEKQSHTTIVSKIDLPSPEDEQYKFVSGAVKAYPEIYFARLVVLGEGESEQIVIPKLLSHCGVDIDDSFISVAPLGGRHVNHFWRLLEGLNIPYVTLLDLDYGRHGGGWGRVKYVLEQQELLGKEPEIRPHNNFDDPLCNPMTSTYEINDEDKTALEILGEQGVFFSTPLDLDYSMQVAFPEQYNVRHAGERGPRPKAWDDLKPVVLKSSYSKAIAESFYSAEKDELPFNWYSYRFLGSKGKPVSHIRALEEIDFESGENKDKIPESFQEMIKHIIREVSSLPE >NC_022270.1|WP_012129685.1|694110_694602_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein MNEAWVPKDNLVFDDKSLEIIHCNANLAVWAGPGAGKTELLAQKACFLLETERCEWPFSILSISRKRASASNLKERVQMRSGDELSERFHSFTIEAFTKSIVDRFMCVLPKHRQPSPDYQVTNGGSNFPKSLSFDHITSIALEICNTSSDLMASLRVLRAPHN >NC_022270.1|WP_011999348.1|694697_695891_+|IS4-family-transposase MNLSTILNTFFLMSSFSAIKDKRRITAVLDCINALNEKDTLTLTGLGRGMKNTKTKVKHCIKRVCRLLGNPHLHRERTGVYAYITDFLLKNVKHPIIIVDWSPVNHVDKQILRATIPIGGRAFTLYEEVHPECKLGSLAVHKAFIRRLATMVPKGVIPIVTTDAGFKVPWFKPIEQQGWYWLGRVRGNSKLRVNDRWCSADEVFVQAQYKPQHLGTAELTKQHQYPCQVCLYRKKSKGRKAKNWSGSLQRNTVSLSHAKGEREPWLLVSNLPGETWFAERVVALYTQRMSIEEGFRDTKNERYGLALNFSGSASPKRIEILLMIGMLTQFALLVVGKVAYLKGYYKDFQANTIRTRRVLSYFFLGKELIGREAYSFSVKDLALAVGGLKAISAAEFR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022270_1 | 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder | 474057-474087 | 31 | NZ_CP053542 | Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence | 48673-48703 | 1 | 0.968 |
NC_022270_1 | 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder | 474057-474087 | 31 | NZ_CP053542 | Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence | 51981-52011 | 1 | 0.968 |
NC_022270_2 | 2.2|677273|32|NC_022270|CRISPRCasFinder | 677273-677304 | 32 | NZ_CP053818 | Vibrio cholerae strain SA7G plasmid pSA7G1, complete sequence | 78825-78856 | 1 | 0.969 |
NC_022270_2 | 2.5|677274|31|NC_022270|CRT,PILER-CR | 677274-677304 | 31 | NZ_CP053818 | Vibrio cholerae strain SA7G plasmid pSA7G1, complete sequence | 78825-78855 | 1 | 0.968 |
NC_022270_1 | 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder | 474057-474087 | 31 | NZ_CP053542 | Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence | 49324-49354 | 2 | 0.935 |
NC_022270_1 | 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder | 474057-474087 | 31 | NZ_CP053542 | Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence | 49974-50004 | 2 | 0.935 |
NC_022270_1 | 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder | 474057-474087 | 31 | NZ_CP053542 | Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence | 50679-50709 | 2 | 0.935 |
NC_022270_1 | 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder | 474057-474087 | 31 | NZ_CP053542 | Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence | 51330-51360 | 2 | 0.935 |
NC_022270_2 | 2.6|677334|31|NC_022270|CRT,PILER-CR | 677334-677364 | 31 | NZ_CP032520 | Cupriavidus oxalaticus strain T2 plasmid unnamed1, complete sequence | 108990-109020 | 5 | 0.839 |
NC_022270_2 | 2.3|677333|32|NC_022270|CRISPRCasFinder | 677333-677364 | 32 | NZ_CP032520 | Cupriavidus oxalaticus strain T2 plasmid unnamed1, complete sequence | 108989-109020 | 6 | 0.812 |
NC_022270_1 | 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder | 474057-474087 | 31 | NZ_CP045419 | Pseudoalteromonas sp. THAF3 plasmid pTHAF3_a, complete sequence | 148753-148783 | 7 | 0.774 |
1. spacer 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053542 (Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggtg CRISPR spacer ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggcg Protospacer *****************************.*
2. spacer 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053542 (Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggtg CRISPR spacer ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggcg Protospacer *****************************.*
3. spacer 2.2|677273|32|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053818 (Vibrio cholerae strain SA7G plasmid pSA7G1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
gataacgaaaggatgcaagccacgacctattt CRISPR spacer gataacgaaaggatgcaagccacgacccattt Protospacer ***************************.****
4. spacer 2.5|677274|31|NC_022270|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053818 (Vibrio cholerae strain SA7G plasmid pSA7G1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.968
ataacgaaaggatgcaagccacgacctattt CRISPR spacer ataacgaaaggatgcaagccacgacccattt Protospacer **************************.****
5. spacer 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053542 (Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935
ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggtg CRISPR spacer ggacgcgggtcgaactcgctggatggcggcg Protospacer ***********.*****************.*
6. spacer 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053542 (Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935
ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggtg CRISPR spacer ggacgcgggtcgaactcgctggatggcggcg Protospacer ***********.*****************.*
7. spacer 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053542 (Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935
ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggtg CRISPR spacer ggacgcgggtcgaactcgctggatggcggcg Protospacer ***********.*****************.*
8. spacer 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053542 (Vibrio europaeus strain NPI-1 plasmid pVEu, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935
ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggtg CRISPR spacer ggacgcgggtcgaactcgctggatggcggcg Protospacer ***********.*****************.*
9. spacer 2.6|677334|31|NC_022270|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032520 (Cupriavidus oxalaticus strain T2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
cataccgcgatgagcgcaagcggtcgcaacc CRISPR spacer catagcgcgatgcgcgcaagcggtcgcgata Protospacer **** ******* **************.*.
10. spacer 2.3|677333|32|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032520 (Cupriavidus oxalaticus strain T2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tcataccgcgatgagcgcaagcggtcgcaacc CRISPR spacer gcatagcgcgatgcgcgcaagcggtcgcgata Protospacer **** ******* **************.*.
11. spacer 1.1|474057|31|NC_022270|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045419 (Pseudoalteromonas sp. THAF3 plasmid pTHAF3_a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
ggacgcgggtcaaactcgctggatggcggtg CRISPR spacer gtagacgcgtcaaactcgctagatggcgata Protospacer * * .** ************.*******.*.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
7914 : 74207
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022270|7914:74207|DBSCAN-SWA 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54 | Enterobacteria_phage(21.43%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
80506 : 212758
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022270|80506:212758|DBSCAN-SWA 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117 | Leptospira_phage(11.11%) | transposase,tRNA,protease,integrase | attL 80428:80446|attR 175760:175774 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
437008 : 506654
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022270|437008:506654|DBSCAN-SWA 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57 | Leptospira_phage(21.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
514080 : 573684
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_022270|514080:573684|DBSCAN-SWA 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44 | Enterobacteria_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
607492 : 673699
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_022270|607492:673699|DBSCAN-SWA 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54 | Enterobacteria_phage(12.5%) | transposase,integrase | attL 633923:633937|attR 678547:678561 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
688950 : 746763
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_022270|688950:746763|DBSCAN-SWA 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47 | Enterobacteria_phage(30.0%) | transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
820091 : 848092
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_022270|820091:848092|DBSCAN-SWA 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24 | Enterobacteria_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
851816 : 917041
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_022270|851816:917041|DBSCAN-SWA 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54 | Vibrio_phage(21.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
971291 : 997640
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_022270|971291:997640|DBSCAN-SWA 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16 | Leptospira_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1023501 : 1070718
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_022270|1023501:1070718|DBSCAN-SWA 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34 | Vibrio_phage(25.0%) | transposase,protease,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1104576 : 1111359
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_022270|1104576:1111359|DBSCAN-SWA TTTAACATAATATACATAATGCGCACTGAATTGAGGATTCCACTGGGCTTGAAAACGCTACGGCAAATCCTGCACAAGCCATTGAAATACTTGGTAATCCAAGCCCGTTAAACTTTTTTGCAATGTTCGCCCAAGCTTGTTGAGCTTCGAACGTTTTCGCTTTATCAGCTGCTAGATAAACAAGGACAGATTCTGTATCTGCTCCAATCTCTTTTGCCAGAAAAAGTGCTTCATTTTCCGATAGATACCTTTGCCCGTTTCTTATCGCACTAATCTTTTGACGACTTAAACCTAAATCATGGGCAACTTGCTTATCTTGGATATAGTTCTTCGCCTTTTTGTAGGCATCTAACAGTTCATTTGTGTACATAGGAATCCTCCAGTCCTGATTATTGTATACCCACAGTCCACAAAAAGCGGGCTTTACAGTCCTGATTTTTGTGTCTTATAGTCCACACAAATCAGGACTCATGTACTTCAGTCTTTAATTTTAGGCCACCTTGGTTTGGGCGTTTGCCCTTGACGCTTTCGTCTGGCCTTGGTGGTCTCTCTCTCAACTAGTCAAGGTGGTTGTTATGTCAAACGTTCACGGTTCTAAGGTTCTTGTGATTAAAACGCAAAGCGGTGACAGATTCTTCACTCGTTTTGGAAAAGGCGGTTCGGTTCAAACTGCTTGGTCGCTTGCTGGTGCTTGTCACTTCCTTTTAAGTGCTGACTTGATTTCTGTTACAGAAAAGCTTGACGCAAAGAAAAAACAATACGCAGTTCATGAGGTTGTTTGCTCAACAGTTCCTTCTGCTTCACTTCTTCGCGGTGGTAGTCATGTCAAAATTCTCTAGCTTAATCGAGGTTAATCCTCATAACCCTTCAATACGTTCTATAGATTTCGGAAATCTTCGTCTTACTCATTTTGGTAATCAAAACGCCTATAGAATCCGAATTTCATTTTGTGATATCGGTGTTCACTACTCACAAGAAACGTATGTGTTACCGAGTCAACTTGAGCATGTTGTTGAAATTGACCAACACGGTGAAGTTTGGGTAGTCCTTCGAGATGTAGACAACCGTCAAATTTTTCTATCTGTAGCCTGTCAGCATGCCTATGCATCAATCTGTGAACTTTTCTCAATGCCTGTCAGTGATGCGGTTATTCGCGCATTTGAGATTGAGGAGCAACTTGCAGTGAAGCGTGACGCCGTAACCGAGTCTAACTCAGAGGCATAACCCATGAACGAAGCCCAAACCATCTATTACGATTTGTTGCCTGATTACACGGTTTCCGTGTTGGTCAAAGGCTGTGAAGAATGGGATTTGCTCAAGTCTATGTCTCATCTCGAATCTTGGGCTTCGTCTGAATTTGTCTCTTACGAGTTGGTATCTATCACCAACACCACTTACCAAGAACGCGTTGATTTAGGGGTCTTCGATGACTACTGCAACTAACATCCTTAAGAAATTCGATGAGCAGTCTGTTCATATTGACTACCTATGTTTTACATTTGCAGTCAAGGACTTACGCCATTGTCACAACGCGATTCAACGTCTTCACAAGCATGAGGAATACAAAGGTTTAGCGCCTAAATCGTTGTTACAGCGTAACTGCAAAGCACCCAAGTTCCCTGCTCCACCTCAGTTTAATGCGACAATTGCGGGCACTGCTGAAGAGATTGAAGCGTACAACAACGCCTTTGATATCTGTTACCGCAATTACCTAGAAGATTGTTTGCGCATCTTCACCAATCAGGTGCTTGGATTGTCTCTTTCTGCACCTCGTGGCCTTGGCTTTCAGTTCTATTCTGAGTCTATGAAGTTGACCTCACCAGACGGTGAAGACTTCTGTGGTTTCGTGGGTATTGGCGGCAACAATGACACGGTGCATTTCCAAATTAATGGCACTGGTTGTAAGCATGTGTTTGCTCGTCGTGCGCCTTGGTCGCTGCATGATTGGCTAACAAACGTTCTTGGTGTTCAAACACTCGCGCGTGTCGATCTCGCTTACGATGATTACGACGGTATCTTTGATTGTGAATACGCGCGTAAAGCTTGGAACGACAACGCATTTCGAACGGCTGAACGTGGTCGTAATCCGGTTCTGCATGTTGACCATACGATTGCGGGCTTTCGTGATGGCCGTCCTGATTACACCAAAGAGCAATACTCGATTGGCTCTCGTACTTCTCGTATTTACTGGCGTATCTACAACAAGGCTCTTGAGCAGAAACTCGCGAACACGGGTCTTGTTTGGTACCGCTCAGAAGTTGAACTTAAAAAATGGAACATCGATGTGCTGTTGAATCCTGCTGGCGCATTCGCGGCCATCAACGACTTCGCAGCGTCGATTTCTACTGCAAAACAATTCAATACAAAACCTGTCCCGACTAAACGTGCGGCGCTAGACCTGTTGGCTTCGGCTCACTGGATGCGTCGCCAGTACGGGAAAATCCTGAACTCTTTAATCGAATTCCATGAGGGCGACATTGAAACCGTTGTCGGCTCGCTCGTCCGTGATGGAACCAAATTCACCTTCCCCGATACCTACGGCAAGTTGGTGACTCACATATTGGAGACCTAACAAATGGCTAAATCTGTTTTTGTCCTAGGCATGGACATCACTTGGAACTCGGCACGTGGTGACAGTGCTCAACTGAACATCTCACGTCCACTACGAGAAATTAACTCGGAGAAATTCAAGCGTCGCACCATCGGCGAATCTGGTGACGTAAACCCGCAATGGGATCAACCTTTGATGATTGATCATGAATACGCCCTGCTCCTTGAGCGCACCGGTGCTTTGGTTCCTCGTCGTGAGTACCAATTGCAACTTGAAATCAACCCAGAAGATCCATTGGCGGGTGCCATCGTGACAGCGCTTATTCCTGTCGACGCAGAAATTAAGAAGCACTTCGAAGCTTCAATGAAATCAGTTCAAGGTTAGAAAAAATGTCTCTATGCGTCACCGTTGTTAACCAGTACGGCAATTTAAAAGCGACGAAAACTCACGTCGACAATTGCGAAGGCTACGTACTGATTTCAGCGGTGGAGTATCAAGAATATAAGGATCCAGTCCTATTCAATGGTGACTTGTTCCTATATGTCAGTGGCGTGCTCTTGATCAACATGGTTGTTGGTCACGGAGTGGGTCGTGTTGTTCGCCTTATGAGTAAAAGGTAATTCAAATGAAAAAACTAGAACTTGTTGTAAATAACGTAAAACACGCAGTCGTAAACAAGAAAACAGCCGTAGGCTCTGCGCTTATGCTTGCTTCCGTTTCTCCGGCTTTTGCTGAAACACCAGACATTACGGGCGCTATCAACGCCGCTGTTACTGGCGGTCAAAGCAACGTATCACTTGTTGTTGCGGGGCTTATTGGTATGGCTGCACTGGGCTTTGGTGTGACCATGGTTGTTGGCTTCTTGCGTCGCTAACGGTAAACCTCAATGCCTCCTATATCTGGTAACTTACTTGGGGATGTTCTCGCTATCGTTCTGGGTATTTCCTTTGCGGGGGCATTTCTCCACGGCTTTGTGAGTGGCATCAATACTCACTAATCAGTTAATCAAGGGGGCTTCGGCTCCCTTTTTTATTGGTTTCAGACAATGATTCATTTTCTGCGCTTTTCTATTGTCCTTTTTGTTATATGTTTCAGTAATTTAACGTTCGCTTTAGAAGCTTATGTTAGTTATAGGCAAATGACGGGCTGCAGCTCTACGGGCGAATGGGTTGATCCTAATCAGGTGAACGCTTGTTTTATGAAGCATGATTATATTCGTTCATGCACATTTCAGAAGGTAACCTATGCTAACGCTCGCTATCCTTATCAGACAGTTTGTGACAATTCACTTGCTCTTTCTTATTCAGAGGTTCGTTGCCCTGCAAACAGTGAATTCGACCCTTCAACATTGAGGTGTAAATCTCAATGCGAATACGGCGCAAATCCAGACGGTTCATGTATGGATGCTTGCCAATTCAAACAGTCAACGGGGGACGAAAGACGCCTTCAGTGGCTGGCTTATGTTTACGGCGAACAAGTCACGGGGGCTTGTTATGGTGACTTTGGCGCGACTCGTTGCGAACTCTCTCGTATTCCAAACGACAGCACCCTTTGCACTGATGTTTCTTCTGGCGAGTTTACGCAAAACACCTTATGTCACGGTAACTTCCAATTCACAGGAAACCAGTGTGATGGCGGTACTTTATTCTGGGGAACAAACGGCCCTGATGAGCCGATTATCCCAACGGATCCAACCCATGACCCCGATGACCCAACAGGCCCTATAGAAGATCCTAGTGTCTTGCCTGATGACTCGACCAATACATTCAACAAACCTGACGTAGAAGATGAGCCGGATGTGGAAGAACCCGACACAGATGAATCGACAGACACGGCAGTTGTGAGCGCCATTACAGGACTTAATAAAGATATTAACACTGCCCTTCATGATTTGAATTCAGACATCAATGAAACTCAAGGCGCTATCGTTAATGAGTTGATTGCAGTCAAAGGCTCGCTTGTCGATAACACGCAAGCGACACAAGAACAGCAAATCAATGACAACAAGATATACAACAACACCAAAGCGCTTATCCAACAAGCCAATGGCGACATTACAACAGCGGTCAATAAGAGCACCAATGCAACTAAGGGTGTCCGTGAAGACTTACAAGGATTAGGTGATTCGATTGGCGAATTGGGTAATAGCCTTGATGGTATCGAAGAACTGCTTAAAGGCTCTGGTTTCAATTCCCCTTACGGTGATGATGTGCCTGAGCAAATCTTCGCCTCGTCTGATTTCATCGCTATCAATGAAACCATCGCAGAGAAAACCCGCTCAATTGAAGACTACGTTGATGAAATCAAAGGTCTGGTTTCTATCGGTACCAACTTCAATAACGGCTCGTTAAGCGATCGGTCTTTCACCGTTAAAGGCACCAAGGTTGATTCTGGCCTACAGCGTTTTGATGAGGTTTCGCCTTACGTTCGCCCTGTCATCCTCTTTATCTGCGCGCTCATTGCGCTCTACATCTTGTTTGGTCAACGGAGTAAATAACGTGGATTTCATTTATTCAGCGCTCAATTTTATCGCCAACGTCGGCCAAACCATGGTCGAGTTCATCCAGTACATACCGGATTGGATCATCAATTGCTTTGAGTATGGCGCCCTTTGGTGTGTGTCTCTTTGGCTTGATCTTAAGATTGCATCGATTCAGGTAGCACTAAAAATCGCTCAGACTTTGCTATCAGAGTATGGCGTTTACACGCTGGTTGAATCTCATTTCAATGCGCTCCCTTCTGATGTTCGTTACATCCTCATTCAATACAACGTGACAGGAGGACTACGCATAATTTTCGATGCGTTTGCAACGTCCTTAGTCATGCGTTTCTTTAACTGGTGATTCAATGGCAACTTCATTTAGATATGGTCACGGCGGCTCATATAAATCAGCGTGTGCAGTATGGTTCGACTTACTGCCAGCCCTTCGTGAAGGTCGAGTTTGCATCACCAATATTCATGGTATGCAGCCGCTCGACATTATCGAGAAACGACTGGGTGAAAAGTTTCCGGACAGTGCTCGCCTCATTCGTATCAGCTCGCGTAATCCTGAAGGCTTTGAGCTTTGGAAATACTTCTTCTGTTGGGCGCCAATTGGGGCGTTCATCCTCATTGATGAGTGTCAGCAAATCTACTCCACCAATGCAGGCTTTAAAATGGCGAACATACACAAGCGCCCTTTTGCTGACTTTCAGCCGCATCTACCCGAAGGATTCTCTGAGTTGTTTCAGTCTCGTTGGCTGACTGTTGATACATCCAGTTTGGACAATGGCGAGATAGACGATTGCCAACGCACACGTTTCGACGAGCAAGGCCGAATCATCTATCCGGAGAACTTCAACAATGCCTTTATGGAGCACCGGCACTACAACTGGGACATTGTCCTGCTCACGCCCGACTTTGCTCAAATCCCTAAAGAGTTAAAAGGTGTGGCTGAGTTGGCCAAGCAGCACAAAGGGAAAGACGGGATCTTCTTTTCCAACCGTAAACCTCGAATCCTAGAACATGACCCAACAAGAACGGTCACCAAACCAAGCAAAGACGATGTGGTGTACAACCTCAAAGTCCCGCTTGATGTTCACCTACTCTACGCCTCCACTGTTACGGGGCAAATCACTAAAGCGGGACTTGGAAAGAACATCTTTCTTAATCCTAAATTCTTAGCAGCTATGGCACTGATGGTGCTTTCATTTGGGTATGTCATTTATGCGCTTATTGGTCTTTTTTCTGATCCTGAGACGGCAGCTTCGCAAGGAACGCAGCCTCATCAAACTACGCAGCAAAGTTCTGTTTCGTCTTCGCAAAGTAAATCGAGCCCTGGGCAAACTTCTGCGGATAATTCTGTCGTGGGTTCTGGTCGTTCTGACTGTACGGGTACTGATTGCGGGACTCGGCCTTATCATGACATAGGCACCGTTCCGGCTTGGTTTCCACTGGCCAACTCAGAAAGTATCTATGTGTCAGCCGTTGAACGTTGGCACAAACCCAACTCAATTCGAGTGAGTGTCCATTTTGAGGTAATAACACCGAGAGGTGTTAGCTACCTCGATGACTCGTTTCTAAAAAAGCTAGGTATTCAAATGGATTATCTAGACGACTGCCTTGTCCAGCTGTCTAGCGGTGAATCGAACTTTTACGTGACCTGCTCCCCTTACGAGCAATTCGCACAAGTACAAGAGCAAGACATAGAACTTAAGCCAGTTGGCGGTATCTTTGGCGGGGACGAAACCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_022270|1104576:1111359|1108525_1109623_+|WP_012129361.1|DBSCAN-SWA MDACQFKQSTGDERRLQWLAYVYGEQVTGACYGDFGATRCELSRIPNDSTLCTDVSSGEFTQNTLCHGNFQFTGNQCDGGTLFWGTNGPDEPIIPTDPTHDPDDPTGPIEDPSVLPDDSTNTFNKPDVEDEPDVEEPDTDESTDTAVVSAITGLNKDINTALHDLNSDINETQGAIVNELIAVKGSLVDNTQATQEQQINDNKIYNNTKALIQQANGDITTAVNKSTNATKGVREDLQGLGDSIGELGNSLDGIEELLKGSGFNSPYGDDVPEQIFASSDFIAINETIAEKTRSIEDYVDEIKGLVSIGTNFNNGSLSDRSFTVKGTKVDSGLQRFDEVSPYVRPVILFICALIALYILFGQRSK >NC_022270|1104576:1111359|1104576_1104945_-|WP_012129368.1|DBSCAN-SWA MYTNELLDAYKKAKNYIQDKQVAHDLGLSRQKISAIRNGQRYLSENEALFLAKEIGADTESVLVYLAADKAKTFEAQQAWANIAKKFNGLGLPSISMACAGFAVAFSSPVESSIQCALCILC >NC_022270|1104576:1111359|1107150_1107510_+|WP_012127988.1|DBSCAN-SWA MAKSVFVLGMDITWNSARGDSAQLNISRPLREINSEKFKRRTIGESGDVNPQWDQPLMIDHEYALLLERTGALVPRREYQLQLEINPEDPLAGAIVTALIPVDAEIKKHFEASMKSVQG >NC_022270|1104576:1111359|1107751_1108000_+|WP_012129363.1|DBSCAN-SWA MKKLELVVNNVKHAVVNKKTAVGSALMLASVSPAFAETPDITGAINAAVTGGQSNVSLVVAGLIGMAALGFGVTMVVGFLRR >NC_022270|1104576:1111359|1109973_1111359_+|WP_021018230.1|DBSCAN-SWA MATSFRYGHGGSYKSACAVWFDLLPALREGRVCITNIHGMQPLDIIEKRLGEKFPDSARLIRISSRNPEGFELWKYFFCWAPIGAFILIDECQQIYSTNAGFKMANIHKRPFADFQPHLPEGFSELFQSRWLTVDTSSLDNGEIDDCQRTRFDEQGRIIYPENFNNAFMEHRHYNWDIVLLTPDFAQIPKELKGVAELAKQHKGKDGIFFSNRKPRILEHDPTRTVTKPSKDDVVYNLKVPLDVHLLYASTVTGQITKAGLGKNIFLNPKFLAAMALMVLSFGYVIYALIGLFSDPETAASQGTQPHQTTQQSSVSSSQSKSSPGQTSADNSVVGSGRSDCTGTDCGTRPYHDIGTVPAWFPLANSESIYVSAVERWHKPNSIRVSVHFEVITPRGVSYLDDSFLKKLGIQMDYLDDCLVQLSSGESNFYVTCSPYEQFAQVQEQDIELKPVGGIFGGDET >NC_022270|1104576:1111359|1105397_1105799_+|WP_012129366.1|DBSCAN-SWA MSKFSSLIEVNPHNPSIRSIDFGNLRLTHFGNQNAYRIRISFCDIGVHYSQETYVLPSQLEHVVEIDQHGEVWVVLRDVDNRQIFLSVACQHAYASICELFSMPVSDAVIRAFEIEEQLAVKRDAVTESNSEA >NC_022270|1104576:1111359|1105150_1105414_+|WP_021018226.1|DBSCAN-SWA MSNVHGSKVLVIKTQSGDRFFTRFGKGGSVQTAWSLAGACHFLLSADLISVTEKLDAKKKQYAVHEVVCSTVPSASLLRGGSHVKIL >NC_022270|1104576:1111359|1109624_1109969_+|WP_021018229.1|DBSCAN-SWA MDFIYSALNFIANVGQTMVEFIQYIPDWIINCFEYGALWCVSLWLDLKIASIQVALKIAQTLLSEYGVYTLVESHFNALPSDVRYILIQYNVTGGLRIIFDAFATSLVMRFFNW >NC_022270|1104576:1111359|1106001_1107147_+|WP_012129365.1|DBSCAN-SWA MTTATNILKKFDEQSVHIDYLCFTFAVKDLRHCHNAIQRLHKHEEYKGLAPKSLLQRNCKAPKFPAPPQFNATIAGTAEEIEAYNNAFDICYRNYLEDCLRIFTNQVLGLSLSAPRGLGFQFYSESMKLTSPDGEDFCGFVGIGGNNDTVHFQINGTGCKHVFARRAPWSLHDWLTNVLGVQTLARVDLAYDDYDGIFDCEYARKAWNDNAFRTAERGRNPVLHVDHTIAGFRDGRPDYTKEQYSIGSRTSRIYWRIYNKALEQKLANTGLVWYRSEVELKKWNIDVLLNPAGAFAAINDFAASISTAKQFNTKPVPTKRAALDLLASAHWMRRQYGKILNSLIEFHEGDIETVVGSLVRDGTKFTFPDTYGKLVTHILET >NC_022270|1104576:1111359|1107515_1107746_+|WP_012129364.1|DBSCAN-SWA MSLCVTVVNQYGNLKATKTHVDNCEGYVLISAVEYQEYKDPVLFNGDLFLYVSGVLLINMVVGHGVGRVVRLMSKR >NC_022270|1104576:1111359|1105802_1106018_+|WP_005531344.1|DBSCAN-SWA MNEAQTIYYDLLPDYTVSVLVKGCEEWDLLKSMSHLESWASSEFVSYELVSITNTTYQERVDLGVFDDYCN |
11 | Vibrio_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1119843 : 1153180
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_022270|1119843:1153180|DBSCAN-SWA 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27 | Bacillus_phage(55.56%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1169123 : 1218702
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_022270|1169123:1218702|DBSCAN-SWA 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39 | uncultured_Caudovirales_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1230616 : 1308896
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_022270|1230616:1308896|DBSCAN-SWA 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52 | Enterobacteria_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1703968 : 1799172
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_022270|1703968:1799172|DBSCAN-SWA 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83 | Vibrio_phage(46.15%) | plate,terminase,tail,portal,transposase,capsid,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1802257 : 1806987
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NC_022270|1802257:1806987|DBSCAN-SWA TATGAGAGTAATTTGCCAGGAGTGTGGCGAGAAAGCCCGCATACAAAAAACAAACCGTATTTCAGCGGGTTATAGCGATTTATATTGTAGTTGTAGTGACCCTGAGTGCGGCCATACCTTCGTGATGAACCTTTCCTTCAGCCATACTCTTAGCCCCTCTGCAAAAACAACTTCGCAAATGGCCTTTAGCCTGGTTAAAGCACTAGGCCCAGAACAACAGAAAGAGCTGAAGCAACAGCTCTCGATGCTATAGCTTAAATTCAGGGCTATCCGCCTCATCGGCCATTTGAATGATCATTTCGATGGCTTCCACCTTATCGTTATCAAGCTTGCCTTGATTATCTGCGACAACCAATCCCATCAAATACGCCCCGATCTGCGCTCGGCTTTCAGTTTCTGTACCCAATGCTACCCCGTCTATGATTAGCTCTAATGCTTGTTGAAATACTTGATTTTTATCAGACATATCGAGATCCCTAGTAATGACATAAGAAATATACTGTATATACATACAGCATTCTAGTGTGGCATATCTCTTTTTTAGGCTCTCTCACACGTAAATTAATGTGGACTTGATATCGTTTCCGCCTTCATGAAGCGTTCCCATTCGGGATCACTCCTATCTAATTCCATTTCTAGGAAAAATTTATCGATGATTTGTTGGCCTTTGGGTGAAATTCTACAGTTATTGCCACTGGACCAAGGTCGGTCGCTCCCGCTCCCTTCAGAAGCCTCCGACAAGTCGGAGTCTTTCTTAACGAGTTTCCATTCCGTTTCCCGTGTATAAACAACCAAACCGGACCCTTTCACCCCATCAGTTACCTCGACAATTTCACCGTACTTGTTTTCTCTTTCCTTTTTAACCAACTGGATCGGTCGCTCAGATGAACGAAGCCGGTGCCCGCCCATGTAATCCATATAAGCCGAGAAAAAGCCGTTGTCGGCCGCCCTTCTTGCTTTCTCAAAAAGGCAGTATTCTTGTTCTTCATCGATGCGGCGAAGCTCGCGCCAAATCGTGACTGGTGGGGTTTTCTGGAATTGGAATTGACGAAAACAAAATGTACGCGACCAGGCGGTCACGTTTTTCACGGTCTCTTGAAGCTTCGCTCTTTTGTTGTCTAGATCGGTTTCACCTTCAAGCGCATAACCATCAACGTTCTTTGATATATATTTGGCCAGATAAGCAACGGCACCGCCTGCCGACTTATCGATCAGTTTTGCCTCGAATCGCGCCTTAATAGCTTTTGTTCTTGGGGAGCCATCCTCGAAATAAAGCTCTCCGCTTTCCCTGAACTGATAAGACTGAAGCCCTGCAACAAACGGTTTTACGTGCTCAAGAGGCATGAAAAATACACCATGCCAGTGTGGTGTTCCGTCTTGATGAGGCTCAACAACCCTCATACCGTAGTAAGTTAATTCACGATAATCCGCCCAGGCTCTAAACAAGTTCCAACCTTTGCTTAACCAAGCATGCGCGTCTTTTGGATTGCCGCCATCGAACTTAGGATTTTCTACCCAGTATTTACCGTGCTTTTTAAGTCTATGAAAACGACTAGGTGCCGTCATCGTGACAAAAACAGCTACATGATCATTGCTCTCTGCATATTCCTGACAACCAGCAATACGAGTCATCAGTTCATGTCTTCGATTAGCCGGGTTACTTTGGGACGAATCAATGACGGTTTTAAGATCAACCACATCGCCACTCTCAGATTCAATGGCCATGAGCTCAATCCACTCTCTTTGTCGGTCCTGCCGAATGGTTAACCACTCACAAGCCGCATTGGACGCATAAGGAGAGCTGTGTGGCGAAACCATACCTGCAGCACGGCGAGCATTTTCAAATACGGCCACTGTGATACGGCCAATAGCTCTGCGCCAAAATGCTTCGTCCATCAGTCGACATGCCATTGCGAATGCCTCATGAAAGTTTTCCGCATGAGTAAAACCTGGGAACCATAAAGAAGCACCGGTGTATTCGTTAATGAACTCGATACTTTGCTCTGGCGACATCCCATGCTCAGAAGCCAATCTGATTCTATTACCGCAGCGCCCAGCCATTTCTATGGCCAGCTTAGCGATTTTGATTTCGCTATCGACTTTCCACCATGGTTCGGGCAATACAGAGAACGCCGCCGCAACCGCGCTACTTCGCTTTTCAATGAAGTCTAACGCACGCTTAAAACCGTACTTCTTCAACCTACTGGCAGAAGCTTTGTCGATATAGTTTCGGATGTCATATGGCAATTTAAGTCTGTTCGCTGTAGTCGACGCAAACTCAAAGACCCTTTCTCTTGGCGTCAGTTTGCCATCATGAACCCACTCGCCATTGATATAAGAAAGTTGGGATGTACCTTTTTGGTTATCCAGATAAGAAAGCAACTCCCGATGCAGATTGCTCGGGAGTCGGTTGAGAGGATTAGACGAGTTGATTTTGTGTCTTATCATGGTGTTTAGCGGTGCGTTATTTCACGATTCGGGAGACGCAAAGACTTTTGCTTTAACTTCTCAAGCCATAGTCTTTTGCGTCGTTCTCGTGGCGTTTCGTTTGCTTGCCTTATCGCAGCAAACTCTTTGCGCAATCTTTCTAAACAAATAAGGCCTCGCTCTTTGTCTTCCTTAGTTAACGAGTAATGTTCTAAGTCAGGGCAAGGCAAGTGGCATGGTGGGGTAACAGTTTTAGCACTCATATCTCAACAAACTCCTGAGTATTAACGACGATAAAACCGCCCTCGCCTTCACCTTCACTCAATAAACCGTGGCGAACGTGATTACATTTGAGTTGCTCGCAAGCCTGCTGTATCGCCTCATCCATACATTCAAAATCCCCGAGAGTGGTAGCTTCCAGCTCTTGAGTATGTTTGTGGCGCTTCATTGCGCCATCACCAAATAAACGAATCGCAACGTACTCCATCAGGCAACATCCCTCGCTGCGGCAAACTTCTCAATATGCTTGATTGCTTGATCACGAATGTCTTTCCAAATACGAACATTGGCGATTTGCTGGCACTCATGGTCCTTAATAATATTGTTTTGGTATTTATGAGCATTGATAGCCGCGATGTTATGAATATGAATCGCTTCCTCAAGGGTATTTAATTCAATCTTTATCATGGTAAAACTTCCTTTGTTCGTTAATGAGTTAGGCAAGTCCGGGGATGGCGGCACCATTGGCGACCAAATCCACACTCATGGCTAAGAATGGGGAAACGCCTTTTGTGCGGCTTTCGATATCGTTGATAAGAAGCACAAGGTTGCTGATGCCTGCCTGTGCCTTTTGGATAATGACGTGTTTATTGGTGCGGCTTAGGCGATCATTCCCTGCATGTTCTAAAGCCATGCGGGATAAATCCCCCGAGTGCACCGCGTTTTCTAATGCGCGTTTAATAAAAGTCTCTTCACTCGCATCATTGGGGATTTGTGCCGTAACCACACCGAGGCCAAGCAAAAGGCTATTAAGAATGGTGAAGTTGCCACTGGCCTTGGTGATAAGCACAAGCTCTACATTGGTAAGGATGTGCGGTTGCTCTGGGTTGAGCTTGTTACGCAGCATGGTCGCATTCATGCCCACGGCTTTCGCTAACTTGGTCATGTTCTCCGAGTTCGCAAATGCACAGCACGCTTCGTTAAATGCTTTTTGTTTAGAGCCACGGAATTCGCACATTGAGTCAATTTCGTTCATAACCAATACTCAATTGAAGACAAACGGGATGAAAACGAGACCCCAACCAAGAATATTGAGCCAAAGCGGACAGTACTCTTTGGTTGGAATCAGGGATGATAAGCGCATGGATATCAACCTAGGTTTTGCATGGCTTCACGTGTCGCGATTTCCAGTAAAGCCACCATATTGATCAACGGTGTTTCTTTACCTTTTGCTTTGGTTTTAATAGGTAAGCGACCGTCTGCAACCCAATCCATGATGGTGCGTTTTGGCATACCAGAGAACTGAGAGTATTGGTCGTACGTCATGAAAGGCGTATTTAGAACTACTTGATATGAGAGCATAGTGATATCCTATCTAGCTATTGAGTGTTTCATTTCGGACAATAGGGTCTCACCCCGCACTGTCCAGTAATCATTTGAGTGAAATATAGACTTCTTATGAGTGAATTACAAGAGAAAATACCACCTTTTGAATACATTGGTGGCCGAGAAGTTACAGAAAGGATGAAGGAAGTCACGAAAACGAAAGACTTTAAGTCCCTTGGTGACGTACTTGGCATTTCAAAAGGGACGATATCTACGTGGCACCAAAGAGAGCTAACTCCTTTTGAAGTGATTTTGAGACTTCATTTGAAGACTGGCGCATCAATCAAATACTTAGCTTTGGGAGAAGGCGAGGCTTTCCCTGATCACGCAGTACAAGAACATACGTCTAAGAAAAACGAAGCGAAGACACTGTTTGACATCGATTACTTCGCCTTAGTGAACGGAAAGCTCATAGGGAATGAAACGCTAGCGTTTGATAAAAGCTATTTAGTTAAGCTTGGAGTTCTGAATGTAATGGGCCTAGAGCACGATGGGAGTACATTCATTGTCGACAAAGAAGTTCGCCAAGCAGTAAGCGGCACTTACTTAGTAGATATGGACGGCCTACTCTCACTGAATGAGATTCAGCGCTTACCAGGTAAGAAACTAGCGATTAGCTTCAATGGATCGACATTAACCGTCGAGGAAGATGAAGTGAGAGTTGTAGGGCGCGTCGCGTTGGTTATGGAAAAGAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_16 >NC_022270|1802257:1806987|1805169_1805370_-|WP_010645271.1|DBSCAN-SWA MIKIELNTLEEAIHIHNIAAINAHKYQNNIIKDHECQQIANVRIWKDIRDQAIKHIEKFAAARDVA >NC_022270|1802257:1806987|1805398_1805938_-|WP_011999291.1|DBSCAN-SWA MNEIDSMCEFRGSKQKAFNEACCAFANSENMTKLAKAVGMNATMLRNKLNPEQPHILTNVELVLITKASGNFTILNSLLLGLGVVTAQIPNDASEETFIKRALENAVHSGDLSRMALEHAGNDRLSRTNKHVIIQKAQAGISNLVLLINDIESRTKGVSPFLAMSVDLVANGAAIPGLA >NC_022270|1802257:1806987|1804709_1804946_-|WP_011999293.1|DBSCAN-SWA MSAKTVTPPCHLPCPDLEHYSLTKEDKERGLICLERLRKEFAAIRQANETPRERRKRLWLEKLKQKSLRLPNREITHR >NC_022270|1802257:1806987|1802503_1802767_-|WP_011999295.1|DBSCAN-SWA MYIQYISYVITRDLDMSDKNQVFQQALELIIDGVALGTETESRAQIGAYLMGLVVADNQGKLDNDKVEAIEMIIQMADEADSPEFKL >NC_022270|1802257:1806987|1804942_1805170_-|WP_011999292.1|DBSCAN-SWA MEYVAIRLFGDGAMKRHKHTQELEATTLGDFECMDEAIQQACEQLKCNHVRHGLLSEGEGEGGFIVVNTQEFVEI >NC_022270|1802257:1806987|1806360_1806987_+|WP_011999289.1|DBSCAN-SWA MSELQEKIPPFEYIGGREVTERMKEVTKTKDFKSLGDVLGISKGTISTWHQRELTPFEVILRLHLKTGASIKYLALGEGEAFPDHAVQEHTSKKNEAKTLFDIDYFALVNGKLIGNETLAFDKSYLVKLGVLNVMGLEHDGSTFIVDKEVRQAVSGTYLVDMDGLLSLNEIQRLPGKKLAISFNGSTLTVEEDEVRVVGRVALVMEKK >NC_022270|1802257:1806987|1802817_1804704_-|WP_011999294.1|DBSCAN-SWA MIRHKINSSNPLNRLPSNLHRELLSYLDNQKGTSQLSYINGEWVHDGKLTPRERVFEFASTTANRLKLPYDIRNYIDKASASRLKKYGFKRALDFIEKRSSAVAAAFSVLPEPWWKVDSEIKIAKLAIEMAGRCGNRIRLASEHGMSPEQSIEFINEYTGASLWFPGFTHAENFHEAFAMACRLMDEAFWRRAIGRITVAVFENARRAAGMVSPHSSPYASNAACEWLTIRQDRQREWIELMAIESESGDVVDLKTVIDSSQSNPANRRHELMTRIAGCQEYAESNDHVAVFVTMTAPSRFHRLKKHGKYWVENPKFDGGNPKDAHAWLSKGWNLFRAWADYRELTYYGMRVVEPHQDGTPHWHGVFFMPLEHVKPFVAGLQSYQFRESGELYFEDGSPRTKAIKARFEAKLIDKSAGGAVAYLAKYISKNVDGYALEGETDLDNKRAKLQETVKNVTAWSRTFCFRQFQFQKTPPVTIWRELRRIDEEQEYCLFEKARRAADNGFFSAYMDYMGGHRLRSSERPIQLVKKERENKYGEIVEVTDGVKGSGLVVYTRETEWKLVKKDSDLSEASEGSGSDRPWSSGNNCRISPKGQQIIDKFFLEMELDRSDPEWERFMKAETISSPH >NC_022270|1802257:1806987|1802257_1802509_+|WP_011999296.1|DBSCAN-SWA MRVICQECGEKARIQKTNRISAGYSDLYCSCSDPECGHTFVMNLSFSHTLSPSAKTTSQMAFSLVKALGPEQQKELKQQLSML >NC_022270|1802257:1806987|1806051_1806264_-|WP_005530092.1|DBSCAN-SWA MLSYQVVLNTPFMTYDQYSQFSGMPKRTIMDWVADGRLPIKTKAKGKETPLINMVALLEIATREAMQNLG |
9 | Vibrio_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
2007870 : 2082079
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NC_022270|2007870:2082079|DBSCAN-SWA 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>NC_022270|2007870:2082079|2042316_2042775_+|WP_021018343.1|DBSCAN-SWA MSQCYTDNTMTDDDKLLLENQVCFPLYSAANAVIRAYRPLLDELDLTYSQYLVMMVLWEKDGASVKELGSQLHLDSGTLTPLLKRLEAKGYVERGRSETDERVRVLNLTEQGRNLKEQAKSVPNAMMCKITLELDEMIMLKKLCGKVLDNLS >NC_022270|2007870:2082079|2062607_2063150_+|WP_048814466.1|DBSCAN-SWA MSNVDNLGKSERYDGFSKILHWVMAVLIIYATIAGYGMLLVQDDPELFHILSTLNMSGATIATVLFVFRWSWSFFRETPKLPSSISSFQQNVAKLIHSFAYLLMFIVFVSGYLMLKHDYEFFWLFTISQPISNNEVNDFFFIVHRISCVMLGCFIGLHVAAALKHHIILKNDVLKSMTFS >NC_022270|2007870:2082079|2048061_2048481_+|WP_011999070.1|DBSCAN-SWA MIQLEHVNLVVKDIPEMLKFYQVAFPHWYVRDEGEGTWGGKHRNWLHFGDEYQYIALSDHGEGNNRDLDGHQVGLAHFAYVTNNVDAVTKRLVEAGYPIAQSGADEPYRKNVYFVDPAGFEIEFVEYLTDDPKLRNSTN >NC_022270|2007870:2082079|2039140_2039407_+|WP_004746427.1|DBSCAN-SWA MNPIIALLKENNISDEQINEIFQTLTQNPLAAMATISQLGLPQDKLQMLMAQVMQNPALIKEAVDELGLDFSKVEEAKEKLQSQNQGN >NC_022270|2007870:2082079|2065022_2066556_+|WP_086028385.1|transposase|DBSCAN-SWA MNRIPTERKEAILKKLLPPYSMSVSQVAKEEGISTATLYHWRRQLRRSGGAVPNSNTSSEQWSAQTKLAIVAETYSMTENELSQYCREKGLFPEQVQGWRSECMQGFMSAKEREAEAKKQAKADKLEIKELKKELRFKEKALAETAALLVLRKKLRGLLRGRARGRLTSTDERHYLVTLIHDAKQSGCRLEHACHEVQIDLRTYRRWYQQGEIQADKRPTCVRPVPANKLSQQERDAIIEVCNRPEYASLPPTQIVPTLLDNGEYIASESSYYRVLKAEGQLHTRGRQRSRPRQAKPTSYTATGPNQVYTWDITYLPSRVRGQHYYLYVIEDIYSRKIVGYDVYECECGELASQLLQRTLMREQCFNQPLVLHSDSGAPMKSLTFRAKMDELGITSSYSRPRVSDDNPYVESLFRTVKYMPNWPTKGFEQLDASRSWVEAFVRWYNTEHKHSKLNYVTPSERHSGKDSEILRRRSDVLSVARERHPERWSGKIRNCDPVGEVHLNPERKAA |
58 | Vibrio_phage(23.53%) | transposase,integrase | attL 1995330:1995345|attR 2052416:2052431 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022269_1 | 1322510-1322662 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022269_1
|
1 spacers
spacers of NC_022269_1
>1.1|1322561|51|NC_022269|CRISPRCasFinder ACAACCCCTCTAACTCCCCTTGGAAATAGGGAGGACCGGACTGAGAGCGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022269_1
The CRISPR arrays of NC_022269_1 >merge|NC_022269|1|1322510-1322662|CRISPRCasFinder TTTTGGTTCGCTGACTTGTTCAAATACCGAAACTAGATTTAGTTCGGAGCAACAACCCCTCTAACTCCCCTTGGAAATAGGGAGGACCGGACTGAGAGCGCTTTTTGGTTCGCTGACTTGTTCAAATACCGAAACTGGATTTAGTTCGGAGCA >NC_022269|1|1|1322510-1322662|CRISPRCasFinder TTTTGGTTCGCTGACTTGTTCAAATACCGAAACTAGATTTAGTTCGGAGCA ACAACCCCTCTAACTCCCCTTGGAAATAGGGAGGACCGGACTGAGAGCGCT TTTTGGTTCGCTGACTTGTTCAAATACCGAAACTGGATTTAGTTCGGAGCA
>NC_022269.1|WP_005430847.1|1321545_1322406_+|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase-FolD MTAQNIDGTLISQTVRSEVAARVKARVEAGLRAPGLAVVLVGEDPASQVYVGSKRRACEEVGFVSKSFDLPATTSEEELLALIDELNNDAEIDGILVQLPLPAGIDATHVLERIHPEKDVDGFHPYNVGRLAQRIPKLRSCTPKGIITLLDRYNIELRGKHAVVVGASNIVGRPMTLELLLAGCTTTTCHRFTKDLEGHVRQADLVVVAVGKPNFIPGEWIKKGAVVVDVGINRLESGKLVGDVEYDKARENASFITPVPGGVGPMTVASLIENTMLACEQFHTKK >NC_022269.1|WP_021017868.1|1318902_1319319_-|hypothetical-protein MVNLTVDALVLAALSTASWDGVYHCEVGLGQTNSGLNAWVEYQLSIDDESCTLGILGFQTEENIKCATSRQDLTIDILFTSYSNGRVTNRYGVQLYQVEEPLLRLTQREDSVVTEWKTIQPNSDVQQTTYCFDRKEKS >NC_022269.1|WP_012127289.1|1318048_1318771_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein MFSHCGFIVKTVSKRLYKLLKITKLKHKKDKVFSFPNSLMRKNQKVVNTLSPLSLFPNKNDVSCSGFSSSPVDALAWGNRVSPEFKSKVSDISQELNIDPNHLMACMAFETAETFSPSIKNGSGSGATGLIQFMPSTAEALGSSTKKLAKMSAIEQLDYVKAYFLPYRGRMDSLEDVYMAILYPAAIGKPHSHVLFKQGSIAYRQNAGIDRNNAGKITLGDVSYKVRRKLEKGRHPKFYG >NC_022269.1|WP_041853223.1|1317237_1318029_+|2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate-dehydrogenase MSENRSEFNGKLCLVTGAGQGIGLACAKSLLAQGARVIACDVTQLALDVFQQSLPKCQQSNTLLIPFDLADSNAIQTACHNLEQDQLIPDYIVTCAGTLQLESVLDLPLEALTKTLDVNLKGTMLLTQQLAKILVKHSKQGAIVAVGSNAADTPRVKMSAYCTSKAGLHMWMQCLGLELAEHGIRCNIVSPGSTRTPMQEQMWNEAYGERETIQGNLASHRMGIPLNKIAETKDITNAIEFLLSDKSGHITMHDLRVDGGATF >NC_022269.1|WP_041853222.1|1316038_1317136_-|hypothetical-protein MNKFGWKIKPWLLAVGLVGMAGCEYLPHSAEVDLPKQKIEQVVNQAQPANAAILKAFEQHNFVGIGDYHWNDAFLNYATELVTTEAFSDHVTHIVVEFGNAKYQPVLDEYLAGGEVTQAQLEEVLRGSIYFMAWMPDAYRNFFEAIRTRNATLPEGKKIQVHLAEAPFDWQGLQDEKVWKLAAKNKTDHFYQIAAERMAKQEKALLIFGAFHLVNAPKDYVAKTQDSAWPLATRLEQAFPDSTYLIWPMTEPEVVETFHGVSAPALLDVKQSPIAELRFIDLLPKARYKLAAMDKMDAQVGELFDAFLYLGANQRTTVFPRDVMADRNWVNEMQRRVDLIGGKMQDRFNEIRTLSDEKYGFNDQG >NC_022269.1|WP_012127292.1|1314526_1315747_-|isochorismate-synthase MIMLRNSMGSSTMLTEFLNAHTDDASFFFSSPTVTLLTQGITAEFSQQVKFSELDTHISQLLESAKDAGNQNPIAVGVIPFSEHNPVHFIVPDRLITTSPIRPDKVSDVDGVADCPPSSIQPIPTPEEYMRSVELAATSCCREDIDLDKVVLSRTMQVDTEEEIDRARLLKTLLKQNPGGYTFSTRIGGSQSDAYLMGSSPELLVSRKGPHVCSNPLAGSRRRSDNECINQQQGELMMESAKDLHEHAVVVDAVEKALQPWCHNLYVPMVPSVIETKAMLHLSTRIEGTVSDANTSVLKLASALHPTPAVCGYPTTQAYDFISHVEPFDRGYFTGLVGWVDARGNGEWVVVIRCAEVEKKRLKVYAGAGIVAGSEPQSELEETGNKMRTVLNALGIEIRENMEVVQ >NC_022269.1|WP_012127293.1|1312910_1314530_-|(2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate-synthase MSHESMQASGFTPWPEARAEQYRQAGYWTDQTIPQMLQASAIRLPQQLALVDGEREWTYQSLAQQVDQLAAGFQTKLSLKPGDKAVLHLPNIGEFYLSLFALLKIGVQPVLSLPAHRYSEIRYFCHFTEAKVLITAPQRGVNTADIAQQVAAELPSLTSIVWAGEVSEMPTGSLTLDSLYLNDAELHEEQGEGFAFFQLSGGTTGTPKLIPRTHSDYLYSVRASNEVCQFSDRTRYICVLPAAHNFPLSSPGALGCFMAGGTVVLTPDASPQTAFSLIEKYQITVAALVPPLALLWLDEAARTEHDITSLEVLQVGGARFSEEAAKRVRPELGCTLQQVFGMAEGLVNYTRLDDPESEIISTQGRPMSSADELLVLDEMGNPVEQGTEGILFVRGPYTIQGYYRAPEHNQRSFTQQGYYRTGDIVVLTEAGNLQVVGRDKDQINRGGEKIAAEEVENHLLAHDSVHDAAVIAIPDDYLGERSCAALVCPEQNPRVIEIKRFLRDRGLADFKIPDRVIFVDVLPKTPVGKINKNKLLELV >NC_022269.1|WP_012127294.1|1311955_1312846_-|isochorismatase-family-protein MAIPSLSGYPLPKAIPENRVNWSVDPQRAVLLIHDMQQYFLNFYDVDSELIQTLTRNIQAIKQTCIDAGIPAVYTAQPGDQKQEDRALLTDFWGPGLKADESITRIFPALAPTDQDIVYTKWRYSAFQRTPLKSMMDETGRDQLIIVGVYAHIGCLQTAAEAFMTDIQAFMVSDAVADFSSDDHDMALNYVAGRCGYVLDKQQLLSQINRADELVGGDFSIPQSQPHLTQQLAALLEVPVDEMTPEDSLLDFGLDSVRMMSLVSDWQQAGLDVSFMELAANPSLQDWWQLIEKKRT >NC_022269.1|WP_041853220.1|1307974_1311922_-|enterobactin-synthase-subunit-F MYDLPYTAEQLLPLTDAQAGIWFAQLRDPENPIYKTGEYLVIDGKVDEPCFVEAVKTAIDEVDSLHAKFVTTTEGPRMVIDRQNWQVERIDFSQQDAPLDAAVDWMKSELKQPVDLEQGPLFVMALLKLSEDQFVWFLSLHHIAIDGYSMSLVAGRVAHIYGQLAQGKPFDKIEFVDQQALLKEDDDYKASEKYQKDRAFYLQRYADHSDTVNLAGKPTVTSDRFLRLKGAMEVDDFQRMESLAKQCRTHWYSVLIASIAAYVHRMTRSNEVVLGVPLMGRLGSVAIQTPAMRVNILPVRVSFEQGLDIKMLVKQVNQEFSSVRRHQSYRYEELHRELNLVKDNRNLFGPLVNIMPFEYEHKFGELNSKAHNLSAGPVDDISFYCYELDGQLHIDMDANPELYSEKDIHEHQQRLFHFMSDFFAIAQAQDPALCQVSDINILLAGEREKVIETWNDTDHEVPETTLAALLARQRILTPHSPAIIFEGQKLSYEELAKKVYSLTNWLTAEGVTLGDRIAVCVPRSEELIVVQQAILAAGAVYVPVDPDYPEGRIHYMLESSAPKFVFSTSALQDKLPHGVEVKLVDDDTLPTIYKRVEPLPPQVKPEPHSPAYMIYTSGSTGKPKGVVVTHDAIVNRLLWMHDQYPITAKDRVLQKTPAGFDVSVWEFFWPMMVGSCLVIAKPDGHKDPIYLQDLIHREKITTLHFVPSMLQIFVQQADPDLCQSLRQVFCSGEALPIELVNHYYQAFNAPLHNLYGPTEAAVDVTYWPSEANTEGTSIPIGRPVWNTQIYILDDALNPVPPGVVGHLYIAGRQLAQGYHGQPELTAERFIENPFGPQGSRMYLSGDLARWREDGAIEYCGRSDFQVKIRGFRIELEEIENALANHPSVAQVAVLAQEYNDGDKRLVAYVTAENTEQGIDSNALQTYLAEPLPEYMVPSYFVELEAFPLTPNGKLDRSALPKPDLSGQVGTKGPSNLVEERLCKLFCQLLDLPAVGVDDNFFELGGHSLLAAQLIAHVKEIMGIELSLAAVFESPTVSGIAAKLNGSESDDALSILLPLRQREGKAAIFCVHPAGGLSWCYAALTPIIPSNVPLYGVQARNLGDPSAPLPKSMKEMAEDYVAAIREEQPFGPYHLLGWSIGGMIVHLMAGILQEQGQEVGLVTLLDSYPTEQWQTIHPPGEEQALGALIRMAGVEFDEAAHSSITKPEVIDILQDAGSSMAHLSTETITAMIEVVINNNQRVRDAVDYHYQGDVLFFNAEKPPEESFLDRNGWFKYMEGDLKVVDVACLHRDMMRPEMLRLIGTHMVKELRERFDV >NC_022269.1|WP_012127296.1|1307040_1307982_-|hypothetical-protein MFDSSTQSRSNAQLEGMISPLTFFKAKLESGAILAIGEAHWYGELFEKMTDVLLDAELDGMFSHLFIEFGNAKHQALLNNYLMGETITDAELAAVWLDSVAFPAWLHPCYGQFFQRLRAANEQRKVPINVVLTEPSFQWQDIAHAGELAKINAQRDQALVDGVEKQVVKSDRGVVVLVGARHILKRSPTLGFMAKHKTFGDLAQQKFAQRYVSVWPHILTSEFSHTEHGIYATTQPKLSQKSFLDLIPKKPPVNPYAFISLDKLVDAYWYLGPQSRQLDAHGVNVPLMWKSRLEQRLPLVNERQQMVIKKVIE >NC_022269.1|WP_005536160.1|1322830_1324030_-|NupC/NupG-family-nucleoside-CNT-transporter MNSILGIVVILFVAWLLSTNRKNIRLRTVSLAFALQVIFALLVLYVPAGKEALNAVTGAVSNLINYGQEGIAFLFGNLATGGFTFAINVLGIIVFFSALISGLYHIGLMPKVINLIGGGLQRLLGTGRAESLSATANIFVGMIEAPLVVKPYLKHMSDSQFFAVMTGGLASVAGGTLVGYASLGVDLNFLIAAAFMSAPAGLLMAKIMMPETDSAAQDMDLDQVEMPRATNVVEAMADGAMSGLRIAVAVGATLLAFVSVIAMLNGILGWFGGLFGMELSFELVLGYLFAPIAWLLGIPWNEAIVAGSLIGNKIVVNEFVAFIQLMEVKSQLSAHSQAIVTFALCGFANISTMAMLIGGLGSLVPEKRSFISKYGFRAIAAGVMANLMSASIAGVILSL >NC_022269.1|WP_017188388.1|1324266_1325211_-|LysR-family-transcriptional-regulator MLSERAAQMVIFSALIKHKNFTAAAKSLGVSVSHVSKQLSQLEASLGIKLVQRTTRSFTPTEAGQTFYHHCEQVVQAVSSATLEMESQRDEVAGLVRLGLSQSFGTLHIIPAIQELREKYPQLQVEVHLFDYKVDMLEEGLDLWITNNEHLPEGYIAQRLADCQFVVAASPDYLLKFDTPTEPNDLSQHNCLIYRSWERDYTSWAFTNREQELNVKVSGNYSVDLAEAVRDAAIAGWGIAYLATYLLGDEFRSGKLIQLLPDWKASQSMPFYAVYPSRQHMPKKISAVIEFIKQKIGSPCHWDQRLAPYISIPK >NC_022269.1|WP_005430863.1|1325282_1326254_-|lytic-murein-transglycosylase MKKILAAMLSVGMCTSAFASSDGFDEYLNKLRAEARDKGISEQVISAAFADVEYKPRAVKADRNQPEKKLTLDEYIPRAVPEWKVKQAKQLYKEHYAELKRIGDEFGVQPRFIVALWGVESNFGKFTGNFRVIDALSTMAFEGRREEFFRKETMAALQILDEGHIELENFKGSWAGAMGQCQFMPSSFLRFAADGNGDGKKDIWQSEADVFASTANYLSKSGWDDKFTWGRQVKVPHGIDHNLQGREAEKGKYLQEWSKLGITKYDGSPLPKLDEDIKAWLIMPDDENGRTYLVYNNYNVLMKWNRSYYFALAVSHLADRITF >NC_022269.1|WP_012127285.1|1326302_1326584_-|YcgL-domain-containing-protein MLCSIYKSSRKEGTYLYIPKKDDFSQVPDTLMQMFGKPMPVMTIKLDGRTLAQVDVEKVKASLINDGFFLQVPPPPENLLEKYKEQKAQQKGE >NC_022269.1|WP_005437686.1|1326781_1327444_+|septum-site-determining-protein-MinC MTHSPDLKGSSFTLSVLHLSDNEIAKTVEFLQEKVSQAPSFFASAPLVINIAKVEGDIDFTALKQGIADAGFIPVGVTGCKDKRVQNLASEAGFAIMSASKSPTQAPAKMAPTKIVRTPVRSGQQIYAKDGDLVVLAHVSAGAEVIADGSIHIHGTLRGRAIAGASGQQEARIICHDLQAELVSIAGDYWLSDQIESEYWQKKVMISKAEESLHLETLTI >NC_022269.1|WP_005437688.1|1327461_1328274_+|septum-site-determining-protein-MinD MARIIVVTSGKGGVGKTTSSAAIASGLALKGKKTAVIDFDIGLRNLDLIMGCERRVVYDFVNVINGEATLNQAMIKDKRTDNLFILPASQTRDKDALTKDGVQRVFTELDEMGFDFIICDSPAGIEQGALMALYYADEAIVTTNPEVSSVRDSDRILGILDSKSLRAEQGLEPVKQHLLLTRYNPSRVTQGEMLSVEDVEEILHISLLGVIPESQAVLNASNKGVPVIFDENTDAGMAYSDTVDRLLGNQVEFRFLTEEKKGLFKRLFGG >NC_022269.1|WP_012127283.1|1328276_1328540_+|cell-division-topological-specificity-factor-MinE MSLLEFFRPQKKTSANLAKERLQIIVAERRSQNDPAPSYLPQLKEDILKVISKYVAIDPNMVDLTFEHKDDDIAVLELNVKLPEDEK >NC_022269.1|WP_041853224.1|1330308_1331427_-|ribonuclease-D MNYQIITKNKDLEEVCALAREADVVMLDTEFVRIRTYYPQLGLIQLFDGKQLSLIDPTELTDMTSFVELLKDTSVLKVLHACGEDLEVFQNAFGCTPFPMVDTQLMAAFLGHGLSTGFATLVEEYLGVELDKSESRTDWMARPLTQKQLDYAAADVHYLMPLYEKLLDKVNEAGWWEAVQQESDLLVSKRIRNVNEENAYLDIKGAWQLRPTELAILKPLATWRYREAIKRDLALNFIFKEGDLLTVARLGLTGFKKMEAEGIDIRAINRHGARIAGIVKQAKQTPADDYPAKIERLMDYPGYKQIFKNMKDVVKVASQKSGLATEFLASKKQINQIISWVWKKDRDPARLPDVMQGWRLELLGEKMNKVLK >NC_022269.1|WP_012127281.1|1331514_1333206_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase-FadD MDKPWLSRYPSDVPETINPEQYESLVEMFEQSVQKYADQPAFMNMGSVMTFRKLEERSRAFAAYLQNELKLKKGDRVALMMPNLLQYPVALFGILRAGCIAVNVNPLYTPRELEHQLNDAGATAIVIVSNFANTLEQIVENTPVKHVVLTSLGQMLPRAKGTLVDFVVKYVKGMVPKYDLPGAISMRKALHKGRRLQYVKPFMSGDDIAFLQYTGGTTGVAKGAILTHRNMIANVMQAKGAYGPVLAPGRELVVTALPLYHVFALTVNCLLFVEMGGNNLLITNPRDIPGFVKELQKYQFTAITGVNTLFNALVNNEDFHELDFSNLRLAVGGGMAVQRAVAEKWQKTTGCYLLEGYGLTECSPLVAAYPHDLVEYNGSIGLPVPSTEVRIVDEEGNALANTETGELQVRGPQVMQGYWQRPEATKEVINEDGWLSTGDIVKFDDEGFLHIVDRKKDMILVSGFNVYPNEIEDVVALHGKVLEVAAIGQPHEVSGELVKIYVVKRDPSLTKDEVIAHCRQHLTGYKVPKLVEFREDLPKTNVGKILRRVLREENDAELAKKSA >NC_022269.1|WP_012127280.1|1333312_1334167_-|alpha/beta-hydrolase MNERRFALPNGSMAALEIGNEKTTACSVVFLHGWMDNAGSFKTLMNAIHQCNPDLHLLAIDLFGHGLSSHKSSDNYYPFHDYIADLHQLLDELSPNRLVLVGHSLGALIASCYSAAFPEQVEALVQIEGAGPLAEQPSNSVKRLRDGVLSRQRQRNKPERSIASFDLALKLRMQANHLTAEQLMPIVERGTECRENQWFWRHDAKLKCDSLYRMAQDHANSITSQIRCPHLIILGDKGFQHLQSNQVDWGENPPNVVSVAGGHHCHLEQTLEVAKRILGVVNKI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022269_2 | 2477448-2477580 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022269_2
|
1 spacers
spacers of NC_022269_2
>2.1|2477491|47|NC_022269|CRISPRCasFinder AGAACTGAAACAGCAAGTGCGNTGGAGGCTANCATACANCACCCAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022269_2
The CRISPR arrays of NC_022269_2 >merge|NC_022269|2|2477448-2477580|CRISPRCasFinder GGGGTTTTGATGGACTCAAAGCAAGAACAGAATTGAATGTGTAAGAACTGAAACAGCAAGTGCGNTGGAGGCTANCATACANCACCCAAGGGGGTTTTGATGGACTCAAAGCAAGAACGAATTGAATGTGTAC >NC_022269|2|2|2477448-2477580|CRISPRCasFinder GGGGTTTTGATGGACTCAAAGCAAGAACAGAATTGAATGTGTA AGAACTGAAACAGCAAGTGCGNTGGAGGCTANCATACANCACCCAAG GGGGTTTTGATGGACTCAAAGCAAGAACGAATTGAATGTGTAC
>NC_022269.1|WP_038890960.1|2471317_2471773_-|RNA-binding-protein MTSKKNLTLCAGLAVIGGIIFSQLPVPPALSFVIGVIATAFLFSLSSKTPVLQSSDSDPSTKTLYVGNLPYKANESHVRDLFAEYGQVYAVRLMKDKRTGKRRGFGFVVMAAADAKPAIAKLNEKEYMERTLKVRIANDPKHPEGGKPEQD >NC_022269.1|WP_012126558.1|2470548_2471355_+|glutamate-racemase MRASSKKKVLVFDSGVGGLSVFQEIHRLLPHMDYLYLFDNEAYPYGELDQDVLITRVNKLVAALVEEHQADIVVIACNTASTIVLPSLRANLSIPVVGVVPAIKPASLLASQGVGLIATPATVTRQYTHELIRDFAQGKPVELLGSTRLVDMAEEKLRGESISLSELESILLPLRNKVDVAVLGCTHFPLIKEEIHQALGGEVTLVDSGEAIARRVKALLLNAMKQESREEGSKKIYASAPPWQEDALNTCLANLGFNPVQVYRLPGV >NC_022269.1|WP_021017947.1|2469853_2470039_+|hypothetical-protein MGDTASKAHGDEEWLALTPQTNHAMPTKWFEELGLYSLRDGYESLKVYSEPPYATHACTAV >NC_022269.1|WP_012126562.1|2467491_2469345_+|TonB-dependent-receptor MRKTFLAITCASLLSPTFYSQAQEVSADETVVVTANRFKQIDGAVLAQTVTVTKEDIKRLQANSLFDVFRTLPSVEVAQYGGRGQSASIYVRGGSSSQVLVLVDGVRMPRAIMGGIDFNQFPINSVERIDYIRGARASIYGSEAISGVINIITRAPINDDSGRVSAGYGSNNHKKGTFVVSKPVGEGKHFKGVLGYEKTDGFNVKPQPGLNDGDEHGFETLNLKLGYQQNFSDNLSGYVGVSAYNNEYDYDNSSIWSGHEKKTGEVEYVGTDLSLEYNKDVYSSELKLAYGQQDNYDHKSGQNKSTGDHVAIEQFNAIWLNSYSVNEELSIGGGLDYRTEKLAKGYIAPSDRGPAKDYDPEKNPRTNFGVSAIAQYAYDVWTLEASVRNDDNNQFGNNTTWQTAAGWSFYEGYELTLSHGTAFRAPSFVDLYYPGYEMPNLKPEESENTELSLSGAVSIVDWTVTGYYNEIENMLIWEGAGMQNVGEAEIKGVELEVKLDTDIVSHEFYLDYKDPVDKSGAEDTQLAYRSKRGAKWNAYATFDQWTLGSQYLYQGERFNGSTRLPSYSLWNFTASYAVNQNWDINAKLSNAFDKDYEMYVGYVTPGRQYFVSADYRF >NC_022269.1|WP_005451984.1|2465938_2467048_-|tRNA-(uridine(54)-C5)-methyltransferase-TrmA MATLDVNPQRYQEQLAEKVERLNDMFAPYNVPELEVFESPEQHYRMRAEFRVWHEGEDLYYIMFNQETREKYRVDQFPAASRLINDLMPLLVEAMKDNESLRRKLFQVDFLSTLSGEILVSLLYHRQLDEEWIENAKALKQRLNDEGFNLNIIGRARKMKIVLDRDYVIEKLDVNGQSYIYQQVENSFTQPNGKVAEKMLEWAVDCTQESTGDLLELYCGNGNFSLALAQNFDRVLATELAKPSVVSAQYNIAANEIDNVQILRLSAEEFTQAIEGKREFRRLQDAGVDLKSYNCNTIFVDPPRSGMDVDTCKMVQGYERIMYISCNPETLKENLDILCETHNVTRFALFDQFPYTHHMEAGVLLERKA >NC_022269.1|WP_005430908.1|2465508_2465874_+|YijD-family-membrane-protein MSNGNKSEKKTLILALVAGMCGDALLSWLTMSEVSFSIFPLIALVLAVQALYQEYLNNPVSEDIPLVGLACFFVGAFGHSAFIKAQYPEAGSNFFAILVSMILLAWIGKKLGFMEKKTTAE >NC_022269.1|WP_005430912.1|2464867_2465509_+|HTH-type-transcriptional-repressor-FabR MKSMGIRAQQKEKTRRSLIDAAFNQLSADRSFSNLSLREVAREAGIAPTSFYRHFKDMDELGLTMVDEGGLLLRQLMRQARQRIVKEGSVIRTSVETFMEFIESSPNVFRLLLRERSGTSSEFRTAVAREIQHFAAELTEYLMSTGMTKEEAFTQAEASVTLVFSSGAEALDLDRRERDELAERLIMQLRMIAKGAYWYRKERERNRLKGGIE >NC_022269.1|WP_012126563.1|2463175_2464606_-|Si-specific-NAD(P)(+)-transhydrogenase MLSKYNKEDIMAHANHYDVIVIGSGPGGEGAAMGLTKAGLNVAIVEKESSVGGGCTHWGTIPSKALRHAVSRIIEFNSNPLFCRNNTSLHATFSDILGHAKSVIDKQTRLRQGFYDRNSCTLLFGTARFIDNYSIAVMQSDGTEEVYSADKFVIATGSRPYQPNDVDFLHERIYDSDSILSLKHDPRHIIIYGAGVIGCEYASIFRGLGVKTDLINTRDRLLSFLDNEVSDALSYHFWNSGVVIRNDETFEKIEGTEDGVIVHLQSGKKMKADCLLYANGRTGNTDKLNLPAVGLEGDSRGQLKVDGNYRTEVEHIYAVGDVIGYPSLASAAYDQGRFVAQAITKGQADGNLIDDIPTGIYTIPEISSVGKTEQELTAAKVPYEVGRSSFKHLARAQIAGKDIGSLKILFHRETKEILGIHCFGERAAEIIHIGQAIMEQKGEANTIEYFVNTTFNYPTMAEAYRVAALNGLNRLF >NC_022269.1|WP_021017946.1|2461763_2463107_+|MATE-family-efflux-transporter-DinF MTNSIFSPLSNPQVHRQVLALAIPMVLSNITVPLLGLVDAAVIGHLEHAWYLGGVALGSTMISVTFWLLGFLRMSTTGLAAQSYGGEDRKQLALVFMQGSLMALLFALVFLIAHNPIADLIFGWSDASAEVKHYGMQYFSIRVWSAPAALMNFVLLGWLLGTQNSKAPMWMVIITNVTNIALDLLFVIGLGWKVEGAALASVIADYSGMAFGLMCVWRTWCARLLPSPKSLLTDTQHGLGRFVKLNRDIFLRSLCLQATFSFMTFQGASFGDDVVAANAVLMSFLMMISYGMDGFAYAMEAMVGKAIGAKDRAQLNASLIGTFFWSLIICLGLTAVFGLAGSHLIAMITSIEAVQQQAAVYLPWLVVMPLASMWCFLFDGIFVGATKGKDMRNSMFVATCCFFAIFFLFSGWQNHALWFAMTSFMAMRGIGLGAIFFYQWRKGSFLA >NC_022269.1|WP_009695929.1|2460913_2461708_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKPQHHVPNHLLKPLFLRSRESLVDNGLVYDPIAAKACLSCKMAPDCISGDVDQKQLLHVTLTQLCDQQVSHFLQQHSDAWIINVGAGLDTRFYRLDNGRCHWIELDVTENLVWRQRLFHKNERYEHRCGSVEDMNWLDELRIPEKAPVLILCEMALLDCDESRVATFIQTLGRHFVSAEVCMVLAGDLTESKWGQKLGSDTYAHGFEAPAQQVLHWLPWAQWVKAFSPFDRFCSRWKAWQRWLNKIPMLKHRLTPVLVHIKW >NC_022269.1|WP_012126556.1|2478575_2479769_+|IS4-family-transposase MNLSTILNTFFLMSSFSAIKDKRRITAVLDCINALNEKDTLTLTGLGRGMKNTKTKVKHCIKRVCRLLGNPHLHRERTGVYAYITDFLLKNVKHPIIIVDWSPVNHVDKQILRATIPIGGRAFTLYEEVHPECKLGSLAVHKAFIRRLATMVPKGVIPIVTTDAGFKVPWFKPIEQQGWYWLGRVRGNSKLRVNDRWCSADEVFVQAQYKPQYLGTAELTKQHQYPCQVCLYRKKSKGRKAKNWSGSLQRNTVSLSHAKGEREPWLLVSNLPGETWFAERVVALYTQRMSIEEGFRDTKNERYGLALNFSGSACPKRIEILLMIGMLTQFALLVVGKVAYLKGYYKDFQANTIRTRRVLSYFFLGKELIGREAYSFSVKDLALAVGGLKAISAAEFR >NC_022269.1|WP_012126555.1|2479946_2481287_-|CDP-diacylglycerol--serine-O-phosphatidyltransferase MIVSRNPFEQLPSLAVKPEDFEVLHAADTFRTRLLEAISKATSRIYLVALYLEDDEAGREIFTALYEAKQRNPGLDINICVDWHRAQRGLIGAESSEGNAALYKAFAKKYQHSIPVYGIPVRGREVFGVLHLKGFIVDDTVIYSGASLNNVYLQYNDRYRFDRYHVIQHKTLADSMVRFIQDEMIAHPAVNDLAGKDKPETKEIKADIRQLRSSLARANYEFEPEIASEEEVKVTPLVGLGKRRNLLNQQIVKLLAAAQNEIFICTPYFNFPKAINREVKRAMKRGVKVTIVVGDKTANDFYISPEEEFKTIGGLPYLYELNLRRFAKANEASIAARKLSIHLWKHDNNSFHLKGIWVDKRYMLMTGNNLNPRAWSLDLENGLLVQDNYAKMTDKFEQEVANILEHTQLICTYKQLEKVEDYPVSVQKLVRKITRIKADGVLKRIL >NC_022269.1|WP_012126553.1|2481892_2482936_+|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MEIKKHASLKAFHTFGIEQTCAYLAIVESVEDVRQLFQDQAYQDIPKLFLGKGSNMLFTQPYEGMVIINRLMGKTVTETDEHYLLHIEGGEDWPSLVAWSVEQGMGGMENLALIPGCAGSAPIQNIGAYGLELQSICEYVDILDLHSFETRRMTANECQFGYRDSIFKHELYEKCFITAVGLKLPKQWKAINQYGPLQSIPEDELTPLAIFERVCQVRMEKLPDPAKVGNAGSFFKNPVISQDHYDRIIQQHSNMVAYPAQGGMKVAAGWLIDQCGLKGISVNGAQVNPLQALVLTNVDNCSADDVVDLASLVKKTVWDKYQIELEHEVRFMNNKGETNLAEIEAKQ >NC_022269.1|WP_012126552.1|2482932_2483898_+|bifunctional-biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-ligase/biotin-operon-repressor-BirA MRKEHSVKLHILKSLSDGGFHSGEDLGQELGISRAAIAKHIKGLNDWGVDIYRIQGRGYQLAQPLQLLDEERLQAQLDTPLELISVIDSTNQYLLDRVNDSVKGRVCLAEYQAKGRGRRGRQWISPFGTNLYLSMYWRLDAGMAAAMGLSLVVGIAAVEAIEELGIQGVKLKWPNDIYYQDKKLAGILVEMSGQAGGAAHLVIGMGLNIGMPDLQPDIDQPWTTLNQVSDGFSIDRNDLALKFIKHWKMALEEYEMTGLAGFVERWNRLDNFIGRPVKLLMGPREVHGVVKGIDQQGGVVLETENGLETYIGGEISLRKTE >NC_022269.1|WP_038893024.1|2483914_2484838_-|type-I-pantothenate-kinase MSPFLSFDRAEWAELRNSVPMTLSEDDLTALQGINENLTMEEAVEIYLPLSRLLNLYVQARQSRNSVLQQFLNTEEHAPPFVIGIAGSVAVGKSTTARLLEALLSRWENHPKVALVTTDGFLYPKKVLEEKGIMHRKGFPESYDIKRLVEFVSDVKAGQPNLEVPVYSHITYDITEERKKVDRPDVLIIEGLNVLQSGMDYPHDPHRVFVSDFLDFSIYVDAETETIEQWYVERFLKFRRGAFTKPGSYFSHYTQLSVEEAKSKAKQIWHDINGLNLEHNILPTRERAHLILHKGPSHLVDKVSLRK >NC_022269.1|WP_012126548.1|2487012_2487393_+|preprotein-translocase-subunit-SecE MKANNAENPDSSNAADTFKWIAAFVLAAAAVVGNYLYGEMSVVVRAAGVVVLIAAALGVAATTTKGKAAISFAKESRMEVRKVVWPTRQETMQTTLIVLAVSIVMALALWGIDGIMVRLVALATGV >NC_022269.1|WP_005451123.1|2487406_2487955_+|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MSEAPKKRWYVVQAFSGFEGRVAQSLREHIKMHSMEELFGEVLVPTEEVVEMRAGQRRKSERKFFPGYVLVQMIMNDESWHLVRSVPRVMGFIGGTSDRPAPITDKEADAILNRLEKASEAPRPRTMYEAGEVVRVNEGPFADFNGTVEEVDYEKSRLKVSVSIFGRATPVELEFGQVEKLD >NC_022269.1|WP_005451125.1|2488096_2488525_+|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEAYIKLQVAAGMANPSPPVGPALGQHGVNIMEFCKAFNAKTESLEKGLPTPVVITVYNDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAGVKSGSGRPNTEKVGTVTDAQIQEIAETKAADMTGADIEAMKRSIAGTARSMGLVVEG >NC_022269.1|WP_005384683.1|2488529_2489231_+|50S-ribosomal-protein-L1 MAKLTKRMRVIREKVDVTKEYEINEAVALLQELATAKFVESVDVAVNLGIDARKSDQNVRGATVLPHGTGREIRVAVFTQGANAEAAKEAGADIVGMEDLAEQVKKGEMNFDVVVASPDAMRVVGQLGTILGPRGLMPNPKVGTVTPNVAEAVKNAKAGQVRYRNDKNGIIHTTIGKANFSAEQIKENLEALLVALKKAKPSSAKGTFLKKVSISTTMGAGVAVDQASLNTQA >NC_022269.1|WP_005533792.1|2489524_2490019_+|50S-ribosomal-protein-L10 MALNLQDKKAIVAEVNEAASGALSAVVADSRGVEVGAMTSLRKQAREAGVYMKVVRNTLARRAVQGTDYECLTDTFTGPTLIAFSNEHPGAAARLFKDFAKENKDFEIKAAAFEGAVTDAEVLATLPTYDEAIARLMMCMKEASAGKLVRTIAAIRDQKEEAAA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
68914 : 120389
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022269|68914:120389|DBSCAN-SWA GTTAATGTTTGAAGTTCCAAGGTAGGAGCGCATCGATATCAGGCTCAGCTTTCGCGAGCTCTTTCATGCACTTGACCATGTAGTCGTAGAGGATAAGGCCGTTGGCTTTCGCTGTCTCGACGATGCTGTAAAGCATCGCGCTCGCATCAGCACCATTTGGTGTGTTTGAGAACAGCCAATTTTTTCTGCCAATGACCAGCGGTTTAATGGCGCGTTCAGCACGATTATTATCGATAGATAAATGACCGTCATCGATATAGCGGATGAGCTTGGGCCATTGGCCGAGCGTATACTTAATCGCTTTTCCTAATGGACTAGAGCTTATTACTTGTTGAGACGTCATCCAGTCGTGCAGCTCATCCAGTATCGGCTTGGCATGCTGTTGACGTTCTGCTTTTCGTGTTTCGACAGTCGCACCTTTTAAGCGCGATTCTATCCCATAGAGCTTCTGGATTTTGGCCAGCGCTTTATCTGCTTTGCCTGACTTACCTTTACCTTGAAGCTTCTTAGCATCCATGAACTTACGCCGTGCATGCGCCAAGCAACCCACATTGGTTACGTGATGAAGACCATCATAGGCACCATAGCCATCGGTTTGCAGATAACCACTGTAATCCCCCAAGAAGGCAACAGGGCATACCCTCGCGCGACTGTTTTGATAGTCGTACAAGGCGATATTCTTTACATTCGGCAGTGCAGCGTCGGGCGAGTCTGCGCCCGAGCAGTAGAGCCACATATAACACTTTTTATCTTCTTTAAGGACATTGAGCGGCGTTTCATCCGCCTGAACCACCACTTGTTGAAGTAGATGCTCTTTTAAGGCGGCATAGAGGGGTTTGAACTTCTCACTGACTTGGATAACCCACCTTGCCATGGTAGTTCGCGATAGCTCAATACCCGACTGAGTAAACAGCGACTCTTGGCGGTAAAGGGGCATTGCGTATTGATATTTACCAAGGATGATATTGGCCAGCAAGCTTTCTGTCGCGAAGCTTTTAGGGATGATGCTCTGGGGCGCTGGTTTTTGAACGATGTGGCTGTTGTCTTCAGTTTGCTCGCACTGACGACAAGCATACTTAGGACGAACATATTCCAGCACTTTGAGCACAGCTGGTGAGAACTCAAGTTTCTCACTGCGGTCTTCACCGATTTTATGCAGACTATGTTGGCAGCAGGCACACTGTTTTTCATGGTCGTCTAAATCGAGTTCGATAACCTCACGAGGCAAAGTCTTTGGAAGGGGCTTGCGTTTACCACGCTTCTTCGTTGTAGTGGTCGTCGTGACCACTTCAACCTCTTCTTCCTTAGCGGCTTCACATTCCACTTCGTTGAAGAGGTCACCTTGAGATTCATCGTAAGGCTTTAGCGCCTCGGAGCGTTTCGCGAACTGACGGTCGAAGGCCAGCTTGAGCTGTTCGAGTAAGGATTGACGCTCTTGTTTCCATTGAGACTCCTTCCGCTCCTGAGAGAGCAGAAGGGCTTTCACCATCGCTTGTAGCTTGGCAACATCTTGGCTTTCTGGGTTGATAACTGGCGTTTTTTTCATGGCATTTATTATACTAAAAATCATGCCGTTAACGCTTGGTAGATAAGGCTTTATTATCGATTAAGTCATTGTAAAATCGTTTATTTGAACGGGTTTATGGCCGATAATCGTGAAGCCAGAAAGCAGTCTATCAAGCTCGAATTGAGTCAGGGTAAACACTTCATTTTGCTCTTTTGCAGGCCATTTATACTTGGCTTTTTCAAGGCGTTTATACCAAAGCGCAAAGCCAGTTTTATCCCAGTACAGCACTTTGATTTTGTCGCGCTGTTTATTGGTGAACAGGAACAGTGCGCCGCTTCCTAGAGGTAAATCGGTGTCACTTTCGATAATCGCCGCGAGGCCATTGATGGACTTTCTAAAATCGACACTCTCACGATACAGATAAATCTCTGGTGCGCTGAGCATATGTTTCATGACAAGGCTCCAATGAGTTCTGCCAGGTAGGCAGCGGGCGTGCCTTGAGGAATGCTCAACTCCACATCATTGATGAGAAGTGTCATGTTAGCGGTGGCTATTTGAGCTTGATATTTCGTTGTCTTTTCGACGACCTCTGCTCGTACAAAGCCTTGAGAGACATCTGCTTTTTTGAGTTGCTGGCGCTTAGCATAAAACGTCGAGGGATTGAGTTCATTAAACTTACAAAATGCAAGCGTTGACAATGAACTCGATTCAGACTGCTCGATGAGCGTTTGCCATTCTTGATTAGTGTGTCGTTTTCCCATTTCAAATCTCCTCATGGTTGGAGACTTGATCTTATTCTTCGCGCTAGGCGATTAGAATGCGGGTTTTATGGAGCGCTTACGTTTCAACCACAGGAGCTTCCAAGCTTTTTGGCCCAATACCTTTTCACAACTTTCTTTCGTTAGCTCATCAACTTCTTTCATGAAGCGTAATGCCAATAAACGCGTAGCAACAAAGGCATAGATGACACTTAATCTCTCTAAGTTATCTTTACTTTGTAGCCTGAGTGACTCCACATCTGTCCCTTCACTTTTCCAGACTTTATGGAAATCTTCAATCAACCATCGGCGCTCGTAATAACCGATAATTCTCATGGCATCGTCAACGTTGTTTATTGGCTCCGACGTCAAGAGATGCCATGCTAACTTGTCTTTTGATGTCCCTTGCTCAAGCAACCAACATAATAAACAGGTATGCCTGCGTGCTCTTTTTGTTGCCGGAGCTTTATGTCACCTGACCATATTTACATCAAGCTTACATCTCTCGCTTTCTCCTCTTTTGGGGATGTAGCGCTTTGTCTCGACGCTGGTACGCTGCGCATAGTCGTAAGCTTTGAGCATGCTCTCTAGACACGACTTTGCATGAGCGACGACAAACGCTGCTGATGTTGACGCTTATAAGTTAAGTATTCGAATAGGTCAGCTTCTCGGTCACAGACCGAGATAACATCTAACATTTTATCCCCTAGGCGTTCAACGACACGGCGAGAGGCTTGCTCCCACTTGTAACTCTCTTTCTCCTTATAAGGACGAGTCGCGTGTTGGTGCTTTTGCCCACGCTTGGTAATATCTCGGCTCCATCGTTGCTGCTCTATCAGACCAACAATGGTTTGGCTTTGTGGTGCAAAAAGTAACGTCGAATGTACGTGGAGAGCTCGAGTTCTATCGCCTTGATTAGTATGCCCGAGTTCTTCTTTGATACTTCGATGCGGAAAGCTGAGCGTTGTTGTATCTTCAAGCGCGAGTAATTCCTTATGCTCGTTAGCTCGAGATACCGTTGATTGAAAACCTGCTTCAGCGATGTCTTCTGCATTGATGTTTTCATTGCGGATAAAGCGATATGCACCTTCCATATCGGCGGGAGAAAAAGGAAGTTTAGCCACGGAGACTCCTGGTTGATTAGCAATAGAAGTCGCTAAACTGATGAGGCGTTGTGTTCTTCGAGGGTCTTTAAGTTGTGCTTGTCCAAATTGTTCTTGTGCCCAAAGTTTAGCGTCTGAGTGTGTCATCTTAGTGTTTCAGTAATGATTGCTAAGTGATCAGATCACACACACTTGAAAGAGTTCAAAAAAAATCCCCAAGCTACAAGCTTGGGGATTTGTGTATAAGAGACAGCCCGACTGGGAGGCTTTTATGTATCTTTAGGTTGGCGAAGTTTGCTAAGCACAATACAAAGCTCATCCAAAGGGGAGCTCAAATGACAGGCGAAAAAAAGCCCAGACTAAAAAATGTCTGGGCGGATACAAACATAGGAGTTAATAAGAAAAAGCAGCAATGTAGCAACTAGATAGAAACAAGTTTGACGGCCTGAAAAACTTTGAATGCCCTAGTTGTTACAGTAATTCGGACCGGGCTAATTCCAAACAGTTCCATTTTTTTTAGAAGTTTTTTTCACAAAATAATATTCGCTTTAAATTCATTCTCTTAAAGCGCTACTTTTCTTTCTGGTCAGACCAATGCGTGAAAGTGTGATGTTAATCATTTGTTAATCTCAGGTTTCGGGAGTATATTTTCAAACAGTTGTTTAATACGAGTGATTGAAATGGCCCCGAGAAGTACAACAAAAGAAAAAATACTCGATGTAGCAGAAGGACTATTTGCAGAATACGGCTTCAATGACACATCACTACGAACCATTACTGGTAAGGCAAACGTAAATCTGGCTTCGGTTAACTACCACTTTGGCGACAAGAAAACGCTTGTAAGGGCAGTACTAGACCGTTACCTAGAAGCGCTAATGCCAAGCATTAAGACGTCGTTAATCGAGCTAAACACACGTGATAGCTACAACATGGATGAAGTGTTTGAATCGTTGCGTTTACCGCTAAGATCGTTGAATGAGGTGAGACCGAACGGTACGGCATTGTTTATGTTACTGATTGGTAGAGGCTACACCGACGTACAAGGTCATTTACGCTGGTTTATCAGTACAAGATATGAAGAAGTGATGAACTTGTTCATGTTCTCCATCATGAAAGCGAACCCAGAATTAACCGAAGAACAATTGTTCTGGCGATTACATTTCACATTAGGCACTTGCGTTTTCACTATGGCATCAAGCCAAGCGTTAACAGAAATTGCAGAAAGTAAGTTTGAAAAAGAGGTTGATGTTAAGTCTGTCGTCGACCTTTTGATTCCATATTTGTCGGCTGGTATGTCGGCAAAGTAAAGCATATTAAATCAATAATAAAGATAAGTTAAAGCCGCTAGCGGTGACGTGAACAAAAGGATCTGAACTATGAGCTCTCTACGAAGAAAATGGATTAGTGACCCAGCATTTAAAATGTTTAAGAAAGTATTGCCTCCATTGTCGAGTACTGAAAAAGAAGCAATGGAAGCGGGCAATGTATGGTGGGACGCTGAGCTATTCTCAGGCAAGCCAAACTTTACAACGCTACATCATTATCCGAAGCCTGCTCTAACGTCTGAAGAGCAAACCTTCATGGACAATGAGCTAGAAACGTTACTAGAAATGTTGGATGACCAAAAGATCG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39 | Leptospira_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
217790 : 277602
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022269|217790:277602|DBSCAN-SWA 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49 | Enterobacteria_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
417891 : 427315
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022269|417891:427315|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022269|417891:427315|417891_418077_-|WP_005531371.1|DBSCAN-SWA MSRNKKYEEKMKSQGFKKVTIWVPADRESDLKQAASEMCEHENLTVGVLKDLNTGRMVSMH >NC_022269|417891:427315|422298_422529_-|WP_012127989.1|DBSCAN-SWA MSVCVTVVNQYGNLKATKTHVDNCQEYILISAVEYQEYKDPVLFNGDLFLYVSGVLLINMFVGHWVGRVVRLMSKR >NC_022269|417891:427315|422897_424043_-|WP_012127987.1|DBSCAN-SWA MTTATNILKKFDEQSVHIDYLCFTFAVKDLRHCHNAIQRLHKHEEYKGLAPKSLLQRHCKAPKFPAPPQFNATIAGTAEEIEAYNNAFDICYRNYLEDCLRIFTNQVLGLSLSAPRGLGFQFYSESMKLTSPDGEDFCGFVGIGGNNDTVHFQINGTGCKHVFARRAPWSLHDWLTNVLGVQTLARVDLAYDDYDGIFDCEYARKAWNDDAFRTAERGRNPVLHEDMTIASIKDGKPVYTKEQYSVGSRTSRIYWRIYNKALEQKLANTGLVWYRSEVELKKWNIDVLLNPAGAFAAINDFAASISTAKQFNTKPVPTKRAALDLLASAHWMRRQYGKILNSLIEFHEGDIETVVGSLVRDGTKFTFPDTYGKLVTHILET >NC_022269|417891:427315|424026_424242_-|WP_005531344.1|DBSCAN-SWA MNEAQTIYYDLLPDYTVSVLVKGCEEWDLLKSMSHLESWASSEFVSYELVSITNTTYQERVDLGVFDDYCN >NC_022269|417891:427315|418685_420071_-|WP_021017732.1|DBSCAN-SWA MATSFRYGHGGSYKSACAVWFDLLPALREGRVCITNIHGMQPLDIIEKRLGEKFPDSARLIRISSRNPEGFELWKYFFCWAPIGAFILIDECQQIFSTNAGFKMANIHKRPFTDFESHLPEGFSELFHSRWLTVDTSTLDNGEIDDCQRTRFDEQGRIIYPENFNNAFMEHRHYNWDIVLLTPDFAQVPKELKGVAELAKQHKGKDGIFFSNRKPRILEHDPTRTVTKPSKDDVVYNLKVPLDVHLLYASTVTGQITKAGLGKNIFLNPKFLAAMALIVLSFGYITYAIINMVSGSEASIETGTQPYQATQQNPVSSPQGQAHHHQGSAGHPVVGSGRSNCKGTDCGTRPYHDIGNVPAWFPLSNSESIYVSAVERWHKPNSIRVSVHFEVITPRGVSYLDDSFLKKLGIQMDYLDDCLVQLSSGESNFYVTCSPYEQFAQVQEQDIELKPVGGIFGGDET >NC_022269|417891:427315|422044_422293_-|WP_012127990.1|DBSCAN-SWA MKKLELVVNNVKHAVVNKKTAVGSALMLASVSPAFADTPDLTGSINTAVSGGQSNVALVVAGLIGMAALGFGVNMIVGFLRK >NC_022269|417891:427315|425046_425415_+|WP_012127985.1|DBSCAN-SWA MYANELLDAYKKAQNYVQDKQIAHDLNLQPNKISKMRKGIRYVSDEEAVFLAQGAGIDPEMALLGCHADRNENPAIRGMWENIAKKYNGLGFTGISMACGGLAMVISSPSESLLQCALYVLC >NC_022269|417891:427315|422534_422894_-|WP_012127988.1|DBSCAN-SWA MAKSVFVLGMDITWNSARGDSAQLNISRPLREINSEKFKRRTIGESGDVNPQWDQPLMIDHEYALLLERTGALVPRREYQLQLEINPEDPLAGAIVTALIPVDAEIKKHFEASMKSVQG >NC_022269|417891:427315|420075_420420_-|WP_021017733.1|DBSCAN-SWA MDFIYSALDFIANVGQTMVEFIQYIPDWIINCFDYAQLWFLSLWLELKISSIQLALKIAQTLLSEYGVYTLVESHFNALPSDVRYILIQYNVTGGLRIIFDAFATSLVMRFFNW >NC_022269|417891:427315|420421_421519_-|WP_012127993.1|DBSCAN-SWA MDACQFKQSTGDERRLQWLAYVYGEQVTGACYGDFGATRCELSRIPSDSTLCTDVDSGEFTQNTLCHGNFEFTGNQCDGGTLFWGTNGPDEPIIPTDPTHDPDDPTGPIEDPSVLPDDSTNTFNKPDVEDEPDVEEPDTDESTDTAVVSAITGLNKDINTALHDLNSDINETQGAIVNELIAVKGSLVDNTQATQEQQINDNKIYNNTKALIQQANGDITTAVNKSTNATKGVREDLQGLGDSIGELGNSLDGIEELLKGSGFNSPYGDDVPEQIFASSDFIAINETIAEKTRSIEDYVDEIKGLVSIGTNFNNGSLSDRSFTVKGTKVDSGLQRFDDVSPYVRPVILFICALIALYILFGQRSK >NC_022269|417891:427315|424245_424869_-|WP_021017735.1|DBSCAN-SWA MKKLSTENAIIIDTETTGLGSDTEIIEFTAICADSGKVIVNELVKPTCSIPAEATAIHGITDEDVKDAPDFHLVFSNYFLPLLNGRPIIIYNSDFDTRLIIQSLDKHCNAAYVQSVHDLFFKFCVPQCAMLWYAEFFGVLNEHHEDYKWQSLTNACAQQQVDVSDLTAHRALADCEMTRRLIHAVNSQIENQNNQSCDGVTKYSSKA >NC_022269|417891:427315|425584_427315_-|WP_012127984.1|DBSCAN-SWA MKDKYLEIYQQEALQEALVELKEARQREKLLADENKAILSAISAMSEARNRHEIFSGLNSVLKKYIDFDDFIVITRDCNQQNFKTLLSTNSVFDRASWLPGNASERALNGECILLFEPMRLKEFEGLNSFIKSQVNSMLLTGIRSEVTQTIIILVGAQKGHFSIENKETLRRFRPLIERAVIDIETKEKLQRIVEVRTSQLAKAREEAERANQSKPEFLAMMSHEIRTPLNSVLGMLDILRQSTLTESQSEVLNQMECSADLLLAIISDILDLSKIESVSFRLSEQWTNLRDAVTLVISQQKQVAISKNLSFEYQCNLDNNKQYWIDSTRLSQVLFNLIGNASKFTDFGGINVSVIERDGELVISVVDTGIGIPQSKIGHLFTAFHQGDSSITRRFGGTGLGLAITKHLVEMMRGTISVKSEENVGSHFEIKIPVLTRNNQDRPVKIEPNHPSKAVNLLVVEDTESNQLVIKLILNKLGHNVFIASHGAEAIAFLEEQRQNIDIILMDVSMPIMDGITATRLIRQKGINIPIIALTAHALESDKTTCMKAGMDGFVSKPVRRQEIYEAIQSLVETA |
12 | Vibrio_phage(91.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
545624 : 776562
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_022269|545624:776562|DBSCAN-SWA 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200 | Vibrio_phage(28.77%) | tail,plate,tRNA,head,terminase,lysis,integrase,portal,transposase,capsid | attL 720260:720282|attR 779483:779505 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
782358 : 833990
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_022269|782358:833990|DBSCAN-SWA CGTGGGTTCATGGGGCGTTTACACAGCGAAAGCCAACGGCCTTATCCTCTACGACTACATGGTCAAGTGCATGAAAGAGCTCGCGAAAGCGGAGCCTGATATCGATGCGCTCCTACCTTGGAACTTCAAATATTAACAACATCGCCCCGTGGGTTCATGGGGCGTTTACTTTACAGAAGTTGCGCCAGTCAGATAAGGAGGCGCTGGAACTTGTATTTCAAGTAAAAGAAGGTTCATCAGATACAAGTGCCGGGGGCTGGGACTTTTTGAACAAAGTTACAGAGAGTTTAGAGAGCTTATCAAACGGTATGGATAGTATGGAAAAGCTATTGTTAGTAATTATCATCGGAGGTCTGCTTAGCGGAACCTTCTGCTACTACCTAAGAAATAGTAGAAAGCTTGAAAATGAACAGTTTTTGGAGCAACAAAAAACAACTCGCGCTGCTCTTGAATCAGGTGAAAAGAGCACTAGGGAAGTATCCACTCTACTTCAAAATATATTGTTACAGCACCCTAATCTAAACGGTGAGCACCTGCGAGCGATGGATTACACGGATCAAGCGCATACTAATTTTATGCGTAGAGTTCCTGATGCTACTTACGTAAGAACAGGTAACAATGAGTATCGAGGAGCAGAAATTCATGAGTTTAGTCGTCGTCAACGAAGCGAAAACGGTCAAAGAAATGAACGAACTGACGACTTCTATATCGACGGTATTGAGCGCTCTGATAGCGAATACCTAGTAATAAAGACAACTAAAGCCAGCAACGATGCTCAAATTAGAATGAAGGCGCTAGAGTCCATTGTTGGCAGTGATCTTGAGGTTCTTACAGCTGCATTTCTTGAAGGAAGGACTGCTAAAATCCGTTATATATCTTCAGTTCGCGGTGGGGATGAGTATTCAGCTCAATTTAACTACGTTGTCAAGGAAGAAGTCGACATAGAAGTCGAACAAGATATACAGCGAGGTTAGTTTTAAAAGGGGCTTATAGCAGCCCCTTAATTTTTTGGTTAGATTTCTTGAAACTAATTTTATCCAAAGACTAGCTGACGCCAATCTCGGCAAACACGTCTTTGCCCCAAAATTGGTTTCGCCAAAAAGTCTAAATTCACATGAGAGAGGGTTTTGAGCAAATAGAACTAATCTGAAACCCAATACTCACAAAGAACAAAAATGGGTGTTAGAGTGCGGTTCTTAGCTCAAATGAATTTGCTAATTTTTGCCTGTAAATCGCTTTGAAAGCGTCACAAACTTACAAGTCGTTATGGCAGTAACTAGCCTTGAACAAGTATCTAAAATCTTCGCCATGAGCGCTTGAGGTGGTCTGAGGGCTTTTTTTTGATAGCAAAATCAGACATTTACCACAATAGGAATAATAAACACCTAAAAATCAGCCTATACTCCTCGTTTTAAGATGCTAGGTTGAAAGCTATGGTTAATAAAATCACTGAAATTTGGGAGAGTGAGCGTGAGTTACAAGACGATATAGAACTTGTAAGAAAGCCTTTTGTTATGTGGAAATCTCAAAAGCAAAATAACGAAAATGACATTGAAATACTCCCAGAAGATGCAGCTTTCGAAGCTCTTTGTGAACTATATGGAGTAGAGTTGGCCTCTAAGAAATTAGACATCATTTTTGAAAGTTGTTTTGATAAGCCGATATATGAAGGTGGTGGTTGGGTGAAAGGTTGAATACATCGTATGCGCCCCATGAACCCACGGGGCGGTGTTGTTAATGTTTGAAGTTCCAAGGTAGGAGCGCATCGATATCAGGCTCAGCTTTCGCGAGCTCTTTCATGCACTTGACCATGTAGTCGTAGAGGATAAGGCCGTTGGCTTTCGCTGTCTCGACGATGCTGTAAAGCATCGCGCTCGCATCAGCACCATTTGGTGTGTTTGAGAACAGCCAATTTTTTCTGCCAATGACCAGCGGTTTAATGGCGCGTTCAGCACGATTATTATCGATAGATAAATGACCGTCATCGATATAGCGGATGAGCTTGGGCCATTGGCCGAGCATATACTTAATCGCTTTTCCTAATGGACTAGAGCTTATTACTTGTTGAGACGTCATCCAGTCGTGCAGCTCATCCAGTATCGGCTTGGCATGCTGTTGACGTTCTGCTTTTCGTGTTTCGACAGTCGCACCTTTTAAGCGCGATTCTATCCCATAGAGCTTCTGGATTTTGGCCAGCGCTTTATCTGCTTTGCCTGACTTACCTTTACCTTGAAGCTTCTTAGCATCCATGAACTTACGCCGTGCATGCGCCAAGCAACCAACATTGGTTACGTGATGAAGACCATCATAGGCACCATAGCCATCGGTTTGCAGATAACCACTGTAATTCCCCAAGAAGGCAACAGGGCATGCCCTCGCGCGACTGTTTTGATAGTCGTACAAGGCGATATTCTTCACATTCGGCAGTGCAGCGTCGGGCGAGTCTGCGCCCGAGCAGTAGAGCCACATATAACACTGTTTATCTTCTTTAAGGACATTGAGCGGCGTTTCATCCGCCTGAACCACCACTTGTTGAAGTAGATGCTCTTTTAAGGCGGCATAGAGGGGTTTGAACTTCTCACTGACTTGGATAACCCACCTTGCCATGGTAGTTCGCGATAGCTCAATACCCGACTGAGTAAACAGCGACTCTTGGCGGTAAAGGGGCATTGCGTATTGATATTTACCAAGGATGATATTGGCCAGCAAGCTTTCTGTCGCGAAGCTTTTAGGGATGATGCTCTGGGGCGCTGGTTTTTGAACGATGTGGCTTTTGTCTTCAGTTTGCTCGCACTGACGACAAGCATACTTAGGACGAACATATTCCAGCACTTTGAGCACAGCTGGTGAGAACTCAAGTTTCTCACTACGGTCTTCACCGATTTTATGCAGACTATGTTGGCAGCAGGCACACTGTTTTTCATGGTCGTCTAAATCGAGTTCGATAACCTCACGAGGCAAAGTCTTTGGAAGGGGCTTGCGTTTACCACGCTTCTTCGTTGTAGTGGTCGTCGTGACCACTTCAACCTCTTCTTCCTTAGCGGCTTCACATTCCACTTCGTTGAAGAGGTCACCTTGAGATTCATCGTAAGGCTTTAGCGCCTCGGAGCGTTTCGCGAACTGACGGTCGAAGGCCAGCTTGAGCTGTTCGAGTAAGGATTGACGCTCTTGTTTCCATTGAGACTCCTTCCGCTCCTGAGAGAGCAGAAGGGCTTTCACCATCGCTTGTAGCTTGGCAACATCTTGGCTTTCTGGGTTGATAACTGGCGTTTTTTTCATGGCATTTATTATACTAAAATCATGCCATTCACGCTTGGTAGATAAGGCTTTATTATCAATTAAGTCATTGTAAAATCGTTTATTTGAACGGGTTTATGGCCGATAATCGTGAAGCCAGAAAGCAGTCTATCAAGCTCGAATTGAGTCAGGGTAAACACTTCATTTTGCTCTTTTGCAGGCCATTTATACTTGGCTTTTTCAAGGCGTTTATACCAAAGCGCAAAGCCAGTTTTATCCCAGTACAGCACTTTGATTTTGTCGCGCTGTTTATTGGTGAACAGGAACAGTGCGCCGCTTCCCAAGGGTAAATCGGTGTCACTTTCGATAATCGCCGCGAGGCCATTGATGGACTTTCTAAAATCGACACTCTCACGATACAGATAAATCTCTGGTGCGCTGAGCATATGTTTCATGACAAGGCTCCAATGAGTTCTGCCAGGTAGGCAGCGGGCGTGCCTTGAGGAATGCTCAACTCCACATCATTGATGAGAAGTGTCATGTTAGCGGTGGCTATTTGAGCTTGATATTTCGTTGTCTTTTCGACGACCTCTGCTCGTACAAAGCCTTGAGAGACATCTGCTTTTTTGAGTTGCTGGCGCTTAGCATAAAACGTCGAGGGATTGAGTTCATTAAGCTTACAAAAAATACATCTATCAGAGATAGTGCTCTAATCGAAAGCAATGCTACTTACAGTGAGCTCAGATTTAGACATAAGAACGGCTCCCGATTGGGAGCCGTTCTTATGTTTATGTGTTTAAGTTTTATAATGTAACACGAGTGATATTTGATCGACCTTTGAGTTTGAATGAGACTTCGTTTTTGTCTTTGTCGTAGGTTAAATTGGTTTTGTCCTCCTGACGCCAACGCCCCCACTTGTTTGAATCATTAAGCCACGCAGCCCAGACTATTTGGTCATTTGATATGTCACAAACATAGCTCCAACGTGTTGAGTCAGAGCTTCTTGTGTATCTGACGTATGTCAGGCCATCTTCATTCTTATAGTTTTGGATGATTCCTATTGGTTTGCTGAAAATTTGACCTATGTAAGATTTGCAAATTTTTGATTTTTCGACATCTAAATACTCTTTCCCTGAATTGTTTTTAGATGAAACTATTGCTGTAATAATAAGCGCAATTACCAGTAATGTTTTTTTCATAGCTTCGTTTGTACTTAAATTATTTTTGGCTAGATAGAGAGTATCACCTCAGTTAATGTAACGTACACTTAGTACGCACCTAAACATAAACCAATACTTTTGCTAGTGCGATGTTACTCATCGCACTAGATCTTCACAAGTAAATTTGCCACACCTGTAGTTATTGATGATTTACTAATTTAGAAAATCCTTGGCAAACAATTGTCCAGAACCTTCACAGTTGGCACTTCGTAACACAGAAGTGCCCCATTCCTTCTCAGCGCGAAAATTCACTCACAATCTGTGATAGTACGTTTGCCTTACCTGTAGTTATCCGAAAGAGTCTCGAATTAAGCTTTTTAAAAATTATGCGCCATTTTGCAATCTAATACTTAACACTTCTCATTAACCTATTGATTATAAATTGAACTGCGACTGGAAAGGCTGCACAATAGGAATATGAAAGGCGGCTAAAAGCCGTATAAAAAGCGTTATGTGTATGATGATTCGGAGATAGAATGACGTATATCTATGACTGGTTTAGCTTCCCACAATATTTTTCGGTCTCTTGTCCTAAATGCGGCG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48 | Leptospira_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
898131 : 978081
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_022269|898131:978081|DBSCAN-SWA 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58 | Leptospira_phage(13.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1001389 : 1117186
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_022269|1001389:1117186|DBSCAN-SWA 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97 | Leptospira_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1221043 : 1243539
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_022269|1221043:1243539|DBSCAN-SWA 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17 | Leptospira_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1495799 : 1625264
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_022269|1495799:1625264|DBSCAN-SWA 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102 | Staphylococcus_phage(22.58%) | integrase,transposase,tRNA | attL 1571431:1571445|attR 1598344:1598358 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1885808 : 1894240
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_022269|1885808:1894240|DBSCAN-SWA ATTACGCGATTGGTGTTAGTTGATCGATCGGCCAACGTGGGCGAGCTTCAACTGACATATCAGCCACCTCGCCGTTCTTCAAACGTTGCATACCTGCGTAAGCGATCATCGCACCGTTATCGGTACAAAACTCAGTGCGTGGGTAGTAAACTTCGCCGCCAACTTTCTTCGCCAGCTTCTCAAGCTCTGCACGCAGACGGCGGTTCGCACTTACACCACCAGCAATAACAATGCGTTTCATACCCGTTTGCTCAAGTGCGCGCTTACATTTGATAGCCAGCGTAGCACATACCGCTTCTTCGAATGCTAAAGCGATATCTGCACGTGTTTGCTCATCATCACCGTTGGCAGCAATCGTGTTAGCCGTAAAGGTTTTTAGACCAGAGAAACTCATGTCCAAGCCTGGTACATTCGTCATTGGACGTGGGAATTTAAAGCGACCCGGTGTGCCTTTTTCAGCTAGCTTAGAAAGCAGCGGACCACCTGGGTAATCTAAGCCCATTAGCTTCGCCGTCTTATCGAATGCCTCACCCGCCGCATCGTCAATTGATTCGCCTAGGATTTTGTACTCGCCGATGCCTTTTACTTCCACCATCATTGAGTGACCACCCGATACCAATACCGCCACAAATGGGAACGGTGGTGGATTATCTTCTAGCATAGGCGCCAGTAGGTGACCTTCCATGTGGTGAACAGGCACCGCTGGTACACCCCAAGCGTAAGCAATACTGCGACCGATGGTAGCACCAACAAGGAGTGCGCCCACCAAACCTGGACCTGCCGTGTATGCTACACCGTCAATGTCTTTAGAAGTCAGATTTGCTTCTTTCAGTGCCTCTTTAATAAGAGGGATGGTTTTCTTAACATGGTCACGTGAAGCCAACTCAGGCACCACGCCGCCGTAATCTGCGTGAAGTTTTACTTGGCTGTAAAGCTTGTGTGATAGCAGACCTTTTTTATCGTCATAAATCGCGATGCCAGTCTCGTCACAAGAGGTTTCAATACCAATAATGCGCATGGTTTTCTCAGTATGCTTTCTATATAGAGGAAATTTGGGCGTCATATTACCCTGCCTTGGTGCTTCAAACAAATTTTGTACAGACAATAAGCGATAAAAGGCTTTACAAAGCTGTGTTGATCGGATTAAAATTCCACACCATTTTTGATCAAGCTGGTAACTGACCAAACAATTGTGGTTTGGTTCATTAAATTCCAGCGTTAACGAATAACCCCTGAGGTGAAAGGCATATGCCAGTAGTTAAAGTACGTGAAAACGAACCGTTCGACGTTGCTCTACGTCGTTTCAAGCGCTCTTGCGAAAAAGCAGGTATCCTTTCTGAAGTGCGTCGTCGTGAGCACTACGAAAAACCAACTACAGTTCGCAAACGCGCTAAAGCAGCAGCTCAAAAGCGTCACGCTAAGAAGCTAGCTCGCGAAAACGCTCGTCGCGTTCGCCTGTACTAATAACTGAGCTCCGGAAAGGAATTTAGTTATGGCTCTGATTGATAAACTCAAAGAAGAGCAAAAATTAGCGATGAAAGCCAAGGACAAATTGCGCCTTGGTACTATTCGTTTAGCTCTATCAGCAGTTAAGCAGCGTGAAGTTGACGAACAGATTATTCTGGGCGATGACGACATCCTTGCTGTACTGACCAAGATGGTTAAACAACGTCGCGACTCTGTATCGCAATTTGAAGCAGCAGGTCGTCAAGATCTTGCTGATGCGGAACAAGCTGAAATTACCGTTCTTGAGGACTTTATGCCTCAACCACTGACAGACGAAGAAGTTGCTGCTCTTATCGATAACGCAATTGCTGAATCTGGCGCAGCTGGCATGCAAGACATGGGCAAAGTAATGGGCGTTCTGAAACCGCAAATTCAAGGGCGTGCAGATATGGGTAAAGTGAGCGGTTTAGTTCGCGCTAAATTGGCTTAATACCCCACCCAATTGCAGCAAGCCGTGCTATCCTTTGGAACGCACGGCTTGTTTGTATCTGGCAGAATGGAATAACAAAAAGCCTCACATATGCTTTTCTTTGTAACCCATTCACACCAATCATGATTTTCTTTTTTTGTTAGGTTTTATGGCTGGACACATCCCTCGCAGTTTTATTGATGACCTCCTAGCTCGACTCGATATTGTCGATATCATCGACGCACGCGTGAAACTTAAGAAAAAAGGCAAAAACTACGGTGCTTGCTGCCCTTTCCATAACGAAAAGACCCCTTCATTCAGCGTCAGCCAAGAGAAACAGTTTTACCACTGTTTTGGTTGCGGCGTTCACGGCAATGCCATCGACTTCATCATGGAGTTCGAACGGTTAGAGTTTGTCGAAGCCATTGAAGAGCTGGCGTCTTACCTCGGTTTGGATGTACCGCGTGAACAACGCAGTGGCGGCGGTGGACAGTTTAATTCTGGTCCTCAAGCAAGCAGCAGTGAAAAACGCAATCTGTACGATTTGATGGGCAGCATTGCTCAGTTCTATCGTAACCAACTCAAACAGCCAGCCAGCAAGGTGGCGATTGAGTACCTGAAAGATCGCGGTCTATCTGGCGAAATCGTCCAGAAGTTTGGGATCGGCTACGTAGCTGATGAATGGGACTTAGTCCGTAAAAACTTCGGCCAGAATAAAGACAACCAAGACATGCTGGTAACTGGTGGCATGTTGATTGAAAACGATAAAGGCAACCGCTATGACCGCTTCCGTGGTCGTATCATGTTCCCGATTCGTGACCGTCGTGGTCGAGTTATCGGCTTTGGTGGCCGTGTACTTGGTGATGGCACACCGAAATACCTCAACTCACCAGAGACGCCTATCTTCCATAAAGGTAAAGAACTTTACGGCCTTTATGAAGTTTTGCAGGCATATCGTGAACCGCCACGAGTTTTGGTCGTTGAAGGCTATATGGATGTGGTGGCTTTAGCGCAATATGGCGTAGATTACTCTGTCGCATCATTGGGCACATCCACCACGGGTGACCATATTCAAATGCTGTTCCGTCAAACCAACACGGTAGTGTGTTGTTACGATGGTGACCGCGCAGGTAAAGAAGCCGCATGGCGCGCGCTCGAGAATGCACTTCAGTACCTAAAAACGGGTAACACGCTGAAGTTCTTATTCTTACCTGATGGCGAAGATCCAGACAGCTACGTTCGTAAATATGGCAAACAAGCCTTCGAACAACAAATTGAACAAGCGACACCGCTTTCGAGCTATCTGTTTGATAACTTGATTGAATTGCACCAAATCAACTTGGGCAACAATGAAGGTAAATCCGCACTACGCGCCTACGCAAGTGCGTTGATCGACAAGATACCTGATCCCTACTTTCAGGAATTACTCGAAAAGCTGCTTGATGAACGCACGGGCTTTGATAACCGCTTACGCCAACCGCGTAAAAAGACGAGTGAAACTCGACCTCAGCCGCACAAAGAGATCAAACGAACTCCTATGCGCGAGGTAATCGCTCTACTTATTCAAAATCCGAGCTATGCTCAAATGGTACCTGATTTGTCTTCGGTAAGAGAATTATCAATACCGGGGCTAAGTTTATTTGTTGATGTACTTGATAAATGCCAGGCACATCCCCATATAAGCACAGGCCAATTATTAGAGCATTGGCGAAATAGCCAAAATGAGACCCTTCTGTCTCGTCTAGCGAGCTGGGACATTCCCCTCGATGAAGACAACCAAGAAGAAATATTTTTAGACTCACTGGATAAAATTATTGCCCAGTGCGTAGAAAAGCAAATTGAAAACCTGCAGGCCAAAGCAAGAAGTGTCGGTTTATCAGCCGAAGAGAAAAGGGAGCTGCTAGCTTTGATGCTAGATTTAAAAGCGTAACCCTGTTTAATTAGTCAGCAACAATTTAATTTGTTATAGTAAGTGGTTTGCATTTCGCATACTGATTCCTTCACCAGATTACGAAGTTGGATACCGTCTATGGATCAAAATCCGCAGTCACAGCTAAAGTTACTTGTTATTAAAGGCAAGGAACAAGGCTATCTGACCTACGCCGAAGTAAATGACCACCTACCTGCTGAAATCGTAGATTCAGAACAGGTAGAAGACATCATTCAGATGATCAACGACATGGGTATCAAGGTAGTAGAAACTGCTCCTGATGCCGATGATCTAGCGCTGAACGATGACACAAACATTACCGATGAAGATGCAGCTGAAGCTGCAGCAGCAGCACTTTCTAGCGTAGAAAGTGAAATTGGTCGTACAACAGACCCAGTGCGCATGTACATGCGTGAAATGGGTACTGTGGAGCTGCTGACTCGCGAAGGCGAAATCGACATCGCAAAACGTATTGAAGAAGGTATTAACCAAGTTCAATCGTCTGTTGCTGAATACCCTGGCACTATCCCATACATTCTTGAGCAGTTTGATAAAGTTCAAGCAGAAGAACTTCGTCTAACAGACCTAATCTCTGGATTTGTTGACCCTGATGCAGACGATACAGCTGCACCAACAGCAACGCACATCGGTTCTGAGCTGACTGAATCTCAGCTAGAAGAAGAAGATGAAGAAGACGTTGATGACGACGAAGAAAGCGATGACGATTCAGATGATTCTGAAGAAGATGTTGGTATCGACCCAGAGCTAGCGCTTGAGAAATTCAACCAGCTACGCAGCACATACCAAAACCTTCAGCTTGCAATCAACGAACACGGTTACGAGAGCCCTAAAGCGACCGTAGCTAACGAGTTGATGCTAGACGTATTCAAAGAATTCCGTCTAACGCCAAAACAGTTCGATCACCTAGTGAATGAACTGCGCACAGCAATGGATCGCGTTCGTACTCAAGAACGTCTGATCATGAAGTCTGCAGTTGAATACGGCAAAATGCCGAAGAAATCATTCATCGCGCTGTTCACAGGCAACGAATCAAGCGAAGCATGGCTAGATGAGATCCTAGCATCTGACAAGCCATACGCTGAAAAGATCAAACGTAACGAAGAAGAAATCCGTCGTTCAATCGCTAAACTAAAAATGATTGAAGAAGAGACTTCTCTAAACGTTCAAAACATTAAAGACATCAGCCGTCGCATGTCTATCGGTGAAGCAAAAGCTCGCCGTGCGAAGAAAGAGATGGTTGAAGCGAACTTACGTCTAGTAATTTCTATCGCGAAGAAATACACCAACCGTGGTCTACAGTTCTTGGATCTAATCCAAGAAGGTAACATCGGTCTGATGAAAGCGGTAGATAAGTTCGAATACCGTCGTGGTTACAAGTTCTCGACTTACGCAACGTGGTGGATCCGTCAGGCCATCACTCGTTCAATCGCGGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCGGTACACATGATCGAAACGATCAACAAGCTAAACCGTATCTCTCGTCAAATGCTGCAAGAGATGGGGCGTGAGCCATTACCGGAAGAACTGGCAGAGCGTATGCAAATGCCAGAAGACAAGATTCGTAAAGTACTGAAAATCGCTAAAGAGCCAATCTCTATGGAGACACCAATTGGTGACGACGAAGATTCGCATCTAGGTGATTTCATCGAAGATACTACGCTAGAACTACCGCTAGATTCTGCTACGGCAACGAGCCTGAAAATGGCAACGAAAGACGTACTTGCAGGTCTAACGCCACGTGAAGCAAAAGTACTTCGTATGCGCTTTGGTATCGACATGAACACTGACCACACTCTAGAAGAAGTTGGTAAGCAGTTCGACGTTACTCGTGAACGTATCCGTCAGATCGAAGCGAAAGCACTACGTAAACTTCGTCACCCAAGCCGCTCAGAAACACTGCGCAGCTTCCTAGACGAGTAATCGCAGCGATTAAAAACAAAAAAAGGTGACCGAGTGTCACCTTTTTTATTATCTGTGAAGCTAAATGAATAAAAACTAAGCGAAATTGCCCTACCTAGTGGCTAGACACCTTGCAACGCTTCCCCTATAATCGTTGACCTATTAAGGCCCCTTAGCTCAGTGGTTAGAGCAGTCGACTCATAATCGATTGGTCCGCAGTTCAAGTCTGCGAGGGGCCACCATATTTCGAAAGGCGTAGCAGGTTAGTACCTACTACGCCTTTTTTGCATTTGATGATTTGTAAGCGCTCCATAAAACCCGCATTCTAATCGCCTAGCGCGAAGAATAAGATCAAGTCTCCAACCATGAGGAGATTTGAAATGGGAAAACGACACACTAATCAAGAATGGCAAACGCTCATCGAGCAGTCTGACTCGAGTTCATTGTCAACGCTTGCATTTTGTAAGCTTAATGAACTCAATCCCTCGACGTTTTATGCTAAGCGCCAGCAACTCAAAAAAGCAGATGTCTCTCAAGGCTTTGTACGAGCAGAGGTCGTCGAAAAGACAACGAAATATCAAGCTCAAATAGCCACCGCTAACATGACACTTCTCATCAATGATGTGGAGTTGAGCATTCCTCAAGGCACGCCCGCTGCCTACCTGGCAGAACTCATTGGAGCCTTGTCATGAAACATATGCTCAGCGCACCAGAGATTTATCTGTATCGTGAGAGTGTCGATTTTAGAAAGTTCATCAATGGCCTCGCGGCGATTATCGAAAGTGACACCGATTTACCTCTAGGAAGCGGCGCACTGTTCCTGTTCACCAATAAACAGCGCGACAAAATCAAAGTGCTGTACTGGGATAAAACTGGCTTTGCGCTTTGGTATAAACGCCTTGAAAAAGCCAAGTATAAATGGCCTACAAAAGAGCGAAATGAAGTGTTTACCCTGACTCAATTCGAGCTTGATAGACTGCTTTCTGGCTTCACGATTATCGGCCATAAACCCGTTCAAATAAACGATTTTACAATGACTTAATTGATAATAAAGCCTTATCTACCAAGCGTTAACGGCATGATTTTTAGTATAATAAATGCCATGAAAAAGACGCCAAATATTAACCCAGAAAGCCAAGATGTTGCCAAGCTACAAGCGATGGTGAAAGCCCTTCTGCTCTCTCAGGAGCGGAAGGAGTCTCAATGGAAACAAGAGCGTCAATCCTTACTCGAACAGCTCAAGCTGGCCTTCGACCGTCAGTTCGCGAAACGCTCCGAGGCGCTAAAGCCTTACGATGAATCTCAAGGTGACCTCTTCAACGAAGTGGAATGTGAAGCCGCTAAGGAAGAAGAGGTTGAAGTGGTCACGACGACCACTACAACGAAGAAGCGTGGTAAACGCAAGCCCCTTCCAAAGACTTTGCCTCGTGAGGTTATCGAACTCGATTTAGACGACCATGAAAAACAGTGTGCCTGCTGCCAACATAGTCTGCATAAAATCGGTGAAGACCGCAGTGAGAAACTTGAGTTCTCACCAGCAGTGCTCAAAGTGCTGGAATATGTTCGTCCTAAATATGCTTGTCGTCAGTGTGAGCAAACTGAAGACAACAGCCACATCGTTCAAAAGCCAGCGCCTCAGAGCATCATCCCTAAAAGCTTCGCGACAGAAAGCTTGCTGGCCAATATCATCCTTGGTAAATATCAATACGCAATGCCCCTTTACCGCCAAGAGTCGCTGTTTACTCAGTCGGGTATTGAGCTATCGCGAACTACCATGGCAAGGTGGGTTATCCAAGTCAGTGAGAAGTTCACACCGCTGTATGCGGCCTTAAAAGCGCATCTACTTCAACAAGTGGTGGTTCAGGCGGATGAAACGCCGCTCAATGTCCTTAAAGAAGATAAAAAGTGTTATATGTGGCTCTACTGCTCGGGCGCAGACTCGCCCGACGCTGCACTGCCGAATGTAAAGAATATCGCCTTGTACGACTATCAAAACAGTCGCGCGAGGGCATGCCCTGTTGCCTTCTTGGGGAATTACAGTGGTTATCTGCAAACCGATGGCTATGGTGCCTATGATGGTCTTCATCACGTAACCAATGTTGGTTGCTTGGCGCATGCACGGCGTAAGTTCATGGATGCTAAGAAGCTTCAAGGTAAAGGTAAGTCAGGCAAAGCAGATAAAGCGCTGGCCAAAATCCAGAAGCTCTATGGGATAGAATCGCGCTTAAAAGGTGCGACTGTCGAAACACGAAAAGCAGAACGTCAACAGCATGCCAAGCCGATACTGGATGAGCTGCACGACTGGATGACGTCTCAACAAGTAATAAGCTCTAGTCCATTAGGAAAAGCGATTAAGTATACGCTCGGCCAATGGCCCAAGCTCATCCGCTATATCGATGACGGTCATTTATCTATCGATAATAATCGTGCTGAACGCGCCATTAAACCGCTGGTCATTGGCAGAAAAAATTGGCTGTTCTCAAACACACCAAATGGTGCTGATGCGAGCGCGATGCTTTACAGCATCGTCGAGACAGCGAAAGCCAACGGCCTTATCCTCTACGACTACATGGTCAAGTGCATGAAAGAGCTCGCGAAAGCTGAGCCTGATATCGATGCGCTCCTACCTTGGAACTTCAAACATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_022269|1885808:1894240|1885808_1886825_-|WP_041853246.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRIIGIETSCDETGIAIYDDKKGLLSHKLYSQVKLHADYGGVVPELASRDHVKKTIPLIKEALKEANLTSKDIDGVAYTAGPGLVGALLVGATIGRSIAYAWGVPAVPVHHMEGHLLAPMLEDNPPPFPFVAVLVSGGHSMMVEVKGIGEYKILGESIDDAAGEAFDKTAKLMGLDYPGGPLLSKLAEKGTPGRFKFPRPMTNVPGLDMSFSGLKTFTANTIAANGDDEQTRADIALAFEEAVCATLAIKCKRALEQTGMKRIVIAGGVSANRRLRAELEKLAKKVGGEVYYPRTEFCTDNGAMIAYAGMQRLKNGEVADMSVEARPRWPIDQLTPIA >NC_022269|1885808:1894240|1889751_1891614_+|WP_005528793.1|DBSCAN-SWA MDQNPQSQLKLLVIKGKEQGYLTYAEVNDHLPAEIVDSEQVEDIIQMINDMGIKVVETAPDADDLALNDDTNITDEDAAEAAAAALSSVESEIGRTTDPVRMYMREMGTVELLTREGEIDIAKRIEEGINQVQSSVAEYPGTIPYILEQFDKVQAEELRLTDLISGFVDPDADDTAAPTATHIGSELTESQLEEEDEEDVDDDEESDDDSDDSEEDVGIDPELALEKFNQLRSTYQNLQLAINEHGYESPKATVANELMLDVFKEFRLTPKQFDHLVNELRTAMDRVRTQERLIMKSAVEYGKMPKKSFIALFTGNESSEAWLDEILASDKPYAEKIKRNEEEIRRSIAKLKMIEEETSLNVQNIKDISRRMSIGEAKARRAKKEMVEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDLIQEGNIGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRISRQMLQEMGREPLPEELAERMQMPEDKIRKVLKIAKEPISMETPIGDDEDSHLGDFIEDTTLELPLDSATATSLKMATKDVLAGLTPREAKVLRMRFGIDMNTDHTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSETLRSFLDE >NC_022269|1885808:1894240|1891973_1892285_+|WP_021017902.1|DBSCAN-SWA MGKRHTNQEWQTLIEQSDSSSLSTLAFCKLNELNPSTFYAKRQQLKKADVSQGFVRAEVVEKTTKYQAQIATANMTLLINDVELSIPQGTPAAYLAELIGALS >NC_022269|1885808:1894240|1892695_1894240_+|WP_021017903.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKTPNINPESQDVAKLQAMVKALLLSQERKESQWKQERQSLLEQLKLAFDRQFAKRSEALKPYDESQGDLFNEVECEAAKEEEVEVVTTTTTTKKRGKRKPLPKTLPREVIELDLDDHEKQCACCQHSLHKIGEDRSEKLEFSPAVLKVLEYVRPKYACRQCEQTEDNSHIVQKPAPQSIIPKSFATESLLANIILGKYQYAMPLYRQESLFTQSGIELSRTTMARWVIQVSEKFTPLYAALKAHLLQQVVVQADETPLNVLKEDKKCYMWLYCSGADSPDAALPNVKNIALYDYQNSRARACPVAFLGNYSGYLQTDGYGAYDGLHHVTNVGCLAHARRKFMDAKKLQGKGKSGKADKALAKIQKLYGIESRLKGATVETRKAERQQHAKPILDELHDWMTSQQVISSSPLGKAIKYTLGQWPKLIRYIDDGHLSIDNNRAERAIKPLVIGRKNWLFSNTPNGADASAMLYSIVETAKANGLILYDYMVKCMKELAKAEPDIDALLPWNFKH >NC_022269|1885808:1894240|1892281_1892635_+|WP_012126950.1|DBSCAN-SWA MKHMLSAPEIYLYRESVDFRKFINGLAAIIESDTDLPLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPTKERNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVQINDFTMT >NC_022269|1885808:1894240|1887299_1887743_+|WP_012126953.1|DBSCAN-SWA MALIDKLKEEQKLAMKAKDKLRLGTIRLALSAVKQREVDEQIILGDDDILAVLTKMVKQRRDSVSQFEAAGRQDLADAEQAEITVLEDFMPQPLTDEEVAALIDNAIAESGAAGMQDMGKVMGVLKPQIQGRADMGKVSGLVRAKLA >NC_022269|1885808:1894240|1887891_1889652_+|WP_012126952.1|DBSCAN-SWA MAGHIPRSFIDDLLARLDIVDIIDARVKLKKKGKNYGACCPFHNEKTPSFSVSQEKQFYHCFGCGVHGNAIDFIMEFERLEFVEAIEELASYLGLDVPREQRSGGGGQFNSGPQASSSEKRNLYDLMGSIAQFYRNQLKQPASKVAIEYLKDRGLSGEIVQKFGIGYVADEWDLVRKNFGQNKDNQDMLVTGGMLIENDKGNRYDRFRGRIMFPIRDRRGRVIGFGGRVLGDGTPKYLNSPETPIFHKGKELYGLYEVLQAYREPPRVLVVEGYMDVVALAQYGVDYSVASLGTSTTGDHIQMLFRQTNTVVCCYDGDRAGKEAAWRALENALQYLKTGNTLKFLFLPDGEDPDSYVRKYGKQAFEQQIEQATPLSSYLFDNLIELHQINLGNNEGKSALRAYASALIDKIPDPYFQELLEKLLDERTGFDNRLRQPRKKTSETRPQPHKEIKRTPMREVIALLIQNPSYAQMVPDLSSVRELSIPGLSLFVDVLDKCQAHPHISTGQLLEHWRNSQNETLLSRLASWDIPLDEDNQEEIFLDSLDKIIAQCVEKQIENLQAKARSVGLSAEEKRELLALMLDLKA >NC_022269|1885808:1894240|1887055_1887271_+|WP_001145625.1|DBSCAN-SWA MPVVKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGILSEVRRREHYEKPTTVRKRAKAAAQKRHAKKLARENARRVRLY |
8 | Leptospira_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2145584 : 2208456
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_022269|2145584:2208456|DBSCAN-SWA 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45 | Enterobacteria_phage(18.18%) | bacteriocin,transposase,tRNA,integrase | attL 2158477:2158493|attR 2215465:2215481 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2452384 : 2534871
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_022269|2452384:2534871|DBSCAN-SWA 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52 | Enterobacteria_phage(20.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2903396 : 2922113
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_022269|2903396:2922113|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_022269|2903396:2922113|2906820_2907102_+|WP_005452106.1|DBSCAN-SWA MRIFVIALTLLFGWLQYTLWFGKNGVSDYYTVEDEIEVQQQVNSKLQARNNEMFAEIDDLRQGLDAIEERARHELGLVKDGETFYRIVDEEEH >NC_022269|2903396:2922113|2908350_2909394_+|WP_012128911.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSDILSSLAYLTGKPVASAKIKAQPEHFQVREDLGFAFTGEGEHLLVRIRKTGENTSFVANELAKACGVKSKDVSWAGLKDRHAVTEQWLSVHLPKGETPDFSAFLAQHPSIEILATDRHNKKLRPGDLVGNEFVVTLSEVTDVADVEQRLEKVKQVGVPNYFGSQRFGNDGNNLEEASRWGRENVRTRNQNKRSMYLSAARSWIFNRIVSARLENGVFDKFIDGDVAQTASGTQLVDASNMAALQAQFAQGEVAITAALAGDNALPTQADALTLEQPFLDEEPDLMALIRGNRMRHDRRDIALKPQDLAWTVDGNNITMTFSLDAGSFATSIVRELVIEEKVEREY >NC_022269|2903396:2922113|2912937_2914260_+|WP_041853460.1|transposase|DBSCAN-SWA 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16 | uncultured_Mediterranean_phage(18.18%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
3423776 : 3472428
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_022269|3423776:3472428|DBSCAN-SWA 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41 | Vibrio_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
3520251 : 3651610
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_022269|3520251:3651610|DBSCAN-SWA 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MKNTLYISITSSLLALSSSAIASPLAEIDGATLQGLINSPADYSAQVDAFLGVKYASAERFSAPQRHHFITGEHYDATVTGDICPQVPHTMEANGVVQEAQSEDCLNANIWRPSDIANDEKLPVYVFIHGGAFELGSSTVEQFDGAKLVAKNADEGNPFILVSINYRLGILGSFYSSEHSGNYGIQDQKSALSWIHDNIGNFGGDAENITLFGESAGAMSIGIQLMDEKQNAHLYQRAIMESNPYGVKYKDAKSAQWLAEQVKDKLSNDQDIQTVPFEEIINIQSQMKAATTQMNNLMTITPSTSGLLAWAPYVDGETIPYQPIDLQKVDGVDVTLGFNKDESNIFVAPFDVILNAPGSYNLLVDAFFGSDKGEQLRNLPAFHLNWWNSTPEKRKNNARKLMNQVLFMCSSQHVAQNLSSNQTTTSLYQFNYQPDFALWPDYYVESFTKTCSPSETSCHGAELSFIFGNEVNAVSGPTVFSEKDHQAKDVLMSNWLKSKTFEPYSQETDNITVFNEEAYFNVSGDWDNTKNGNVCSQVNEIMNSNTKLY >NC_022269|3520251:3651610|3613530_3614250_+|WP_012128411.1|DBSCAN-SWA MEYDAQYDKHYEDDIALIQKHITAMGVRSLLDVCCGTGIVTIPVAKKLDNAVGIDIAEGMLKQAKRKAQGLDNLSFLQQDATQFSLDKHFDMAIMTGNAFQAFLSDEMLFGVLNSISNHLNRGGRFIFDTRLPTPDNLEIDAEMSLWQTYELPDKGEVKYMGMRERYDAESAILYLKKERYYQDGSTTHSSIDLKYRKLSEIEAFLAQAGLSTTEKYSSWAEEKFSENSNNLICVAEKL >NC_022269|3520251:3651610|3600812_3601514_+|WP_010645640.1|DBSCAN-SWA MIDQKVIVALDYDNQADALAFVDRIDPASCRLKVGKEMFTLFGPDFVRELHKRGFSVFLDLKFHDIPNTCSKAVRAAAELGVWMVNVHASGGERMMTASREILEPYGKDRPLLIGVTVLTSMEQSDLAGIGLDVAPQEQVIRLATLTKNSGLDGVVCSAQESSLLKNELGKEFKLVTPGIRPAGSEQGDQRRIMTPVDAIQAGSDYLVIGRPITQAADPASVLKSINDSLASM >NC_022269|3520251:3651610|3585110_3585455_-|WP_021018037.1|DBSCAN-SWA MLSAPEIYLYRESVDFRKSINGLAAIIESDTDLPLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPAKEQNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVQINDFTMT >NC_022269|3520251:3651610|3616116_3616887_+|WP_086028387.1|DBSCAN-SWA MFHCKKLGLFMAFLSTVAADVCAEEKRFSAHEDNYLLPFYTESKVNQARFTPTNPNAHDAKDVLVQFQISMKYKLLVFGDDGLFVAYTQRSNWEAYDDSAYFRDDQYNPAIFYRWNLNPWRISLGFEHQSNGAGGSDEVSWNRVYLDNKWRFESGFVRFKTWFDVGSNHYNPDIVDFLGYGELEAAWISENDHKLNLTVSNLFTEGWEKGFYRASWNFPVYQGLRGYMKAETGYGLTISNYNFDESAFGVGFAFDF >NC_022269|3520251:3651610|3560228_3561689_-|WP_012128446.1|DBSCAN-SWA MKREQWGSRAGFILAAVGSAIGLGNIWRFPYMAYENGGGAFFIPYLFAMITAGIPFMILEFSMGQKYRGSAPKTLAKIHSKFEWLGWFQVGVAAVIAVYYVAVIGWAISYFGMSFTQSWGSDTNAFFFSEYLKLGDNSPTDLGSIQWKIAVSMLIAWAITYTAIVSGVKSGIERASKIMMPILFFMVIFLIGRMIFLPGALDGVNYMFEPDFSKIWDVKVWAAAYGQIFFTLSIGFAIMLAYSSYLPEKSDITNNAFMTVLINCGFSILSGIMLFSVLGYMAQEQGKPLTEVVSAGVGLAFVTLPAAINLLPAPYILGPLFFFALVVAGLSSHISIMEAVTSAVIDKLKWSRKKAANVVIGTGFVVSMAFATNGGLLLLDLVDHFANNVGIMVGGLVEILLMAWLLKQVPEVRRYVNERSDFSVGQWFELCLRFITPIMLAIILATKLYALLTEGYGGYDLTLGWAMIAALFVFGVLINVASKEKA >NC_022269|3520251:3651610|3520251_3521211_-|WP_012128474.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRVVLGPMEGVLDHLMRQILTEINDYDLCVTEFVRVIDQLLPDHVFHRLCPELLQGSQTASGVPVHVQLLGQEPNWMAENAVKAAELGARGIDLNFGCPAKLVNKSKGGAALLQHPEFIHNIVKACRDAVPSNIPVTAKIRLGWENPEDCFEIVDAIQSAGANELTVHARTKQGGYKASEIKWEYITQIRDRFSIPLIANGEIWNYEDGQRCIETTGVDSLMVCRGAFNIPNLGNMVKHNQQPMAWPEVVELLIYYSQFEMKGDKGLYYPNRVKQWFSYLRQAYPEANELFREIRTFNKAAPIVEHIQRYRDELLSRVA >NC_022269|3520251:3651610|3599553_3600729_+|WP_012128423.1|DBSCAN-SWA MLELLFLLLPIAAAYGWYMGHRSAQQDKQKQSHQISRQYVTGLNLLLSDQSDKAVDHFIELLQVDNETIDTHLALGNLFRSRGEVDRAIRIHQNLISRSGLTLDQKNLALQQLAKDYMASGFLDRAEKIFEQLVEEPDHRESALQQLVTIYQQTREWEKAIHYANQLAKMGKKRTRIRANIAHFWCELAMLDQADGNTSKAIQHFKKALSEDPKCVRASIALGRVYLESEYYKHTIKYLTGVLEQDKDFISDVLPTIAECYHHLGQEDELVEFLRACIDKKAGVSSELMLAQLVAHHESVGAAQELLTKQLLKNPTMKGFYRLIDYHIAEAEDGRAKDSLSTLQAMVGEQLKVKPHYRCRKCGFSTHSLYWHCPSCKGWGTIKPIRGLDGE |
105 | Enterobacteria_phage(17.39%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022269.1|WP_021017851.1|1224072_1224264_+|hypothetical-protein |
1224072_1224264_+
Protein sequences of NC_022269.1|WP_021017851.1|1224072_1224264_+|hypothetical-protein>NC_022269.1|WP_021017851.1|1224072_1224264_+|hypothetical-protein MIKRPFALVQILAVAFVLTKVTQNSSFAQEHQIVVTISIALISVAWAALSGMIWDMLKGSLYR |
63 aa aa | NA | NA | NA | 1221043-1243539 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to NC_022269 position: 1223434-1223408, mismatch: 0 aaaccagcacctaaaaaagaatctagc CRISPR spacer aaaccagcacctaaaaaagaatctagc Protospacer *************************** |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022271_1 | 28092-28166 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022271_1
|
1 spacers
spacers of NC_022271_1
>1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder AAACCAGCACCTAAAAAAGAATCTAGC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022271_1
The CRISPR arrays of NC_022271_1 >merge|NC_022271|1|28092-28166|CRISPRCasFinder TGTGGTACTTCTTGTGGTGACTCTAAACCAGCACCTAAAAAAGAATCTAGCTGTGGTACTTCTTGTGGTGACTCT >NC_022271|1|1|28092-28166|CRISPRCasFinder TGTGGTACTTCTTGTGGTGACTCT AAACCAGCACCTAAAAAAGAATCTAGC TGTGGTACTTCTTGTGGTGACTCT
>NC_022271.1|WP_011998818.1|27279_27477_-|hypothetical-protein MIKRPFALVQILAVAFVLTKVTQNSSFAQEHQIVVTISIALISVAWAALSGMIWDMLKGSLYVEK >NC_022271.1|WP_011998817.1|26996_27293_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MLKSKLTNISMVFNALGNETRLLIIHYLINQNEDSIRVGKIKDALGIPSSTLSHHLIVLSQTGALKQHKKGREIYCSVNQKCLRDAIMVFDKECCLNL >NC_022271.1|WP_011998815.1|25446_26271_+|DUF2971-domain-containing-protein MYHYTDLNGFLSIIQNNSLWLTDARAMNDSLEISWFGKLFAKELERSIEGLHLSLSQKEILDDFINSSLNSNLTPHICCFSKEGDLLSQWRAYADDGFGVSIFFDESAFNKVSLSQLPERLVDSTFYSDIIYSQEEQEVASKNLVDRTVNAINKISGNTRNDAYKTLPIREFWDIKANIELQSYFSKNPAFSEEKELRFIKLVELDKLKYKEKLRFRVTGGTIASYFELEFSKPSIKRVILGPKCKADGNTIRLFLDANGFEHVEVLKSKASYR >NC_022271.1|WP_011998813.1|23466_24666_-|IS4-family-transposase MRDIQILQQAIENQCPDIHKKRLRSLMLATKAVLDGSALTLTKIGRALDTDTTVKHAIKRIDRLLGNRNLHREKESIYRWHASFITRANPFPVVLVDWSDVREQLRYMTLRASVSVKGRAVTLYEQAFEYKNYNSPKSHQLFLDKLQSLLPQGCTPIIVSDAGFRNTWFRQVANKGWFWLGRVRGEVSIKCGEGAWLWNKTFYPQATDKPLFLGESQLARRSPLRCFAYLYKGQPKGRKAHRHSRTCQKHSAGKVFHKGAKEPWLLVTNIPNHVLNGVKITRLYAKRMQIEESFRDLKSPAYGLALRHNRTRCTKRIDILLLMALMAEIIMWWNGLIAMQAKWHYDFQANTIKHRRVLSIPRLGKEVRSHRRYRIKESQYHWAMVEYQRLTHTCGLGEL >NC_022271.1|WP_011998812.1|22339_23356_-|IS110-family-transposase MTQHKIIGIDLAKNIFFLVEINHKGKNLSRKKLQRSRLLNYVANQSPCIIAMEACSGAHYWAREFEKFGHDVLLYPPQHVKNQRRKQKNDYNDAEAIAELALYQRVYPVQHKSIEQQDIQSLIRMRRLCVTERTRLINQVRGLVAEYGIVIPKGKAAFRQAIPEILEEVENQLSPILRELLSRQYERYLYIDEQILWFEEKLSQTVKQFDNAKRLMSIPGFGPLTSQAVAVWLGSGLQFKTGRDASAAMGLVPKQDTTGGNVILLGITKRGNTYIRSLLVHGARAALRRAKFKSDKLSKWMLELQERRGSNRAAVALANKLMRIAWAVIAKNEEYQPA >NC_022271.1|WP_080514194.1|22003_22135_+|DUF3265-domain-containing-protein MCSRGILNAWHFHYALILVIKVVCGGFGIALLTYMVSPCFASQ >NC_022271.1|WP_011998811.1|20879_21923_-|IS110-family-transposase MRFYNNQHNYYCGIDLHARLLYVCILDSLGNKVLHKKIDADPDALLELITPCQDNIVIGVECMHCWYWVSDLCLDYAFDFVLGHALYMKAIHGGKTKNDRIDSFKIASLLRGGNFPIAYVYPRAMRATRDLLRRRTKIMRHGADLKAHVANTFSQYNQQSHNVQLRYPCAREQVRNQFDEPSINRSIDMDLNVIAFYTKELASVEHFIEKTAKQHNAQDYSLIQTVPGIGRILALTILYEIGNIERFPSVQNFASYSRLVKCKAESAGKQKGTNGNKIGNAYLKWAFSEAAVLYLRGNEPAKKYIQRLQKRMSKAKALSALAHKLGRCVYFMLRNKTVFDEKRFLPQ >NC_022271.1|WP_011998809.1|20136_20421_+|hypothetical-protein MEWSVLIVFVVLLIFIGHREISAMKYKHKLLERKIDFLLERSGLSLDKHFGVPAQVLDAVKSGNKLKALRLYREETGASLVDAQKVIEELWSDT >NC_022271.1|WP_021018373.1|19317_19977_-|IS110-family-transposase MNNDSIIFIGLDTHKSFIQVAVLQGHRGAQPQHLGRIKSNKSALVKLALQLQSKYPKATLHFVYEAGPCGYWTYRLLTSIGHCCYVVAPSLIPKKPGDRVKTDKRDAAKLAKLFKAEELTPIYVPEAEDEAIRDLSRARETAMKDLKDAKFQLKGFLLRNNVQATVNDNWSKKHLRWLTDLILPHYSQQIVLQEMIITINALLRCEARNTEASASHLNH >NC_022271.1|WP_011998807.1|18832_19264_+|hypothetical-protein MAKQIWEMTPQDIQDHAVWQFPSWKDDSHDETVICQASQDDALDPNSNIIVRAKFFDANGNEFIGFIHYGLAEVEYSQPNMFVNGKTVGFWFGITKPNHNDLIRLNFPIVITSESVFGLEQITVTVEGYSYVNEASATCVMSC >NC_022271.1|WP_011998820.1|29123_31328_-|DNA-topoisomerase-III MIVYIAEKPSLAKAIFEGLGGNPQTQRGEGFYQHKEHVVTYCVGHLLETYDPDDYDEKYAKWTFDDLPISTVYPPTLKPIPDTKSQLQTVLNFIKKADTIVHAGDPDDEGQLLVDEVLNYAGNTKPVQRLLVADLNLAPVQKALANMESNEKYVPLGMSALARSISDKSFGYNLTRGCTLKGREKGFQGVLNVGRVKSAVMGLVNERTLANQNHQKSFYYDVYAQFECGENRIKAKYNTKESDQVDDKKRLISASNASFIQDSVTNRPGLVTLVVTKPEKKHAPQPLNLSALQQLCAKSYGYSAKKTLDIAQSLYETHKLLTYPRTDNRFISDEHYYQSSDILVAIGATCPSLTDSITNTNVDMTRKHKAFNTDKIEAHHAIIPTTKHGSQASLNKEERQVYELVSRYFIGLFYPESIRDKTKAMFEVEGYQFSATQSVLVEQGWEVLHSEEKETQSDHDGFDLATLKSNTATTCVESEVEQKETKPPKLFTESTLLAAMTRAASFIDDPELRAKLEAKDKDSNDQGSIGTEATRASILSQLAANTELISISEEKGYKEKVWRTTKQGQELCAALPNEIIKPDISAIWAEKQAFVKAGEMSVEDFIADVDSYITERIDDLDKNGINITSNTVPCPSCGKPLYRRKGRNGWFWSCSGYPECDKAYPDLQGKPDFRPRVKPVVSAHKCPTCSKGLIRRKSPKGKGKYFWACSGYPDCITTLFDRKGRPNYESAKSS >NC_022271.1|WP_011998821.1|31336_31873_-|hypothetical-protein MKHKLFMAAITAAFLLPVQPAFAASDDECAIWLCLPTGFPSGCSGAKKAFVKRIKKFKPPLPSFTSCLFSGDVPIGTPSNDTDMFARDGRAAYIPPRVECVKWETGKDWSRCSKTEVRPSQIIKNQSCHVNHKEGTSSPKYCSHTISYVETFQDGEQYGETYYFDNAGNTYIEGSTEH >NC_022271.1|WP_021018375.1|31883_33623_-|type-IV-secretory-system-conjugative-DNA-transfer-family-protein MFLFFTLLCLIGGLYGGGAAYYKLTNISLEHLTYHSLFDQWQAYSHNPDIKKFLVIGVAVSIAITLFPTLMAIVIAIASQEREEIHGSAKFATDMDLANSGLFPNPKAKNKKPSILLGKMPKGRFKGRFIELESSQFVEVPAPTRSGKGVGIVIPNCVTYPDSLVCVDIKFENLVKSGGFRQQCGQAVFLFAPDGYAIDEQAREREELRTHQWNPYDYVRRSPVFRVSDVLNIANSLYPISGDKGDIWNELAGKLFKGLSCWMLDTESITGITPSLPYVLKLGGIDGGLRAWMRREIKNDYVSDDARFEFNNCLSMAEETYSSVESNLLSPLAIFSDRVTAAAVSGSDFDFRELRKKRMTIYVGCQPANLKNFGKLFNLFFEQLISENTRTLPEHDDTLKYQCLGLLDEFTALGRVKQIEKAISYTAGYNLRFLTIYQDEGQLEEVYGRENAKNIRKNHGVKVVYPPKEVDDNVRRLSDTLGTKTVKKRKVSRSTGKGSSRTTSEDELKRPLMMPHEIVELGFEKHPIAKELGIKTLILKENQRPFIAEKIIYFEEPVFAERVKYSEANIPEIPRLKLH >NC_022271.1|WP_011998823.1|33665_34682_-|P-type-DNA-transfer-ATPase-VirB11 MNTIDKAATVNQLLSMTGLRHYLDLEGLTEIAINRPNEVWFDRGNGWERDALPNLSLNMCSNLAKALATFAGLTIPLGEANPVASVIFPDGERGQIAIPPATENGIVSMTIRKPSLTRFALSSYQESGRFSDFREMDVNRVELTPVQEQLLTLKQNGDMSQFFSMAVKSKLNILLVGGTGSGKTTVMKAMVDEYPTDKRLFTIEDVHELDLPNHPNHLHLFYKQGGLTPKQIIESCMRMKPDHVLLAELRGDEAWTYLEMLNTGHEGSITTIHANDCYSTPARLAGLVKQSEVGQTLDYHHIMRTIRTSIDVIAFFKHTHLVELFYDPVEKNRLLSEG >NC_022271.1|WP_011998825.1|35032_36226_-|type-IV-secretion-system-protein-VirB10 MSDDNTIPSAYESANLDRGELTVSGRKKKNKAVIVIALVILSLVVVAVGVLFAINQFREAEVETKPLQPESTAEVIGVEKGTVGNDSAWFEKAKRDHEKDKAQQERAAQWKRKQELKQAKAQATQQQPVTVPKTDVPEPNVAKQPSATSKRGKKAPPTPQERRLMGSLMVNVESGNAASSQSTTEPASYDNSYDAPTFAMGHAAKRKQGGLDFLLKHGSIIPCALYSQVISDYQGIVMCRVTQDVYSANGKALLVERGSMLTGSQNVQLEAGKNRVFTTWADIETPNGIAIRIDSLGAGRLGASGNEAWVDNHFKERFGGAILLSFLDDAFGALAEKAASSDGDITFDSSTENASNMAEKALESSINISPTGYTQIGQRINIIVARDIDMSSVYAFE >NC_022271.1|WP_011998826.1|36218_36986_-|TrbG/VirB9-family-P-type-conjugative-transfer-protein MMKQLIVSLACLMAFSTHALTLPKHQGKDRRIVYAEYDPSDVIAIRTKVGVATLIQLDKNETIVGEHSGLGMGDAAAWGFNVRGNNVFFKPQAKQPNTNLTIVSDLGRTYSFELFTNKQPFYVVKMRYPKPKKANTTPLKAPCTDGKYNFRYVKWGDEELAPAYAWDDGRFTCMKFTKNAELPVIYQINADSKESLVNYHIEQDTIVIHSVANEYRLRLGERVLGVLSHFVEFAGHNQKASSIKATRVIKEDEHE >NC_022271.1|WP_011998827.1|36982_37738_-|conjugal-transfer-protein-TraG MSTTIDSALEHNHTKAEKKPTAKHQKQADAYLEEIKQFEQDRIEIAKKNAKTAWKVATGSCVLALVLGITIVVMMPLKTVDYRLLYIDPQTGMTQIIQPLADAREITYGEALDKHWLNRYVITRGSYQWQTVQDAFDYVKLTSRHDVFSAYSTQLRAKNSPVEVFKDYKKIRLEDVAISFLPTRQDQMLAQVSFTKVVLNSDDTPDTAYLPTKWSATVTFDYLKEIKTESERQLNPLGFRVTSYQENRVIQ >NC_022271.1|WP_021018376.1|37734_37887_-|hypothetical-protein MKTFTLLLVACLTVGCSSTPPPPPEPKGDITPVNPSKVNLADLYTQGDMQ >NC_022271.1|WP_011998829.1|37961_38912_-|type-IV-secretion-system-protein MFDRLFDFVHLITQENIASFVGIFTATITPLIGACVVLYAIYLAFQALYDAENMMIMESLKFIASLALCTTVAFNTSWYLNSIVPMVYYSGDDIANAMLGSTGSGSLQTMFDTMLKQFADTWGEVSFGMSDSWGQSIYFMLLAFLILIGYLPFIVVATAYLLIAKVMVSFLLILGPLFIMFAFFPSTRDMFKTWTGQCLNYVLLVVVYPIAFNLFTRTLEHVIFGGSATAIGLSTVIMTIILFGCCILISVQIPVFCSSLSGGVGINGLVSNMGMGMRSLSNAAKGGAGAAKRAGQGTYNGAKSLGDKFKNRIRPG >NC_022271.1|WP_005430722.1|38921_39155_-|EexN-family-lipoprotein MKQIISLIAFSFLLTACSSEETKTIEYYSAHLDEAKTVKIECEKKTATLSENCKNAIKAVLDDSYKKSMFGDGITYE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022271_2 | 52213-52312 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022271_2
|
1 spacers
spacers of NC_022271_2
>2.1|52236|54|NC_022271|CRISPRCasFinder GGGGGAGTGGGAAGGGCAATTCAACAACATCAGTGGATTAGAGCTGTATATCGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022271_2
The CRISPR arrays of NC_022271_2 >merge|NC_022271|2|52213-52312|CRISPRCasFinder TTTTCAATTGTGCAATTTAGTTAGGGGGAGTGGGAAGGGCAATTCAACAACATCAGTGGATTAGAGCTGTATATCGTTTTTCAATTGTGCAATTTAGTTA >NC_022271|2|2|52213-52312|CRISPRCasFinder TTTTCAATTGTGCAATTTAGTTA GGGGGAGTGGGAAGGGCAATTCAACAACATCAGTGGATTAGAGCTGTATATCGT TTTTCAATTGTGCAATTTAGTTA
>NC_022271.1|WP_021018379.1|51454_51700_-|prevent-host-death-protein MRTETVSFLKKHAADLPLDDAMTITQNGKPIYVVESYEERQRRDQAIALMKLVSFGREDMTAGRTTSSDKFKERLAARKSK >NC_022271.1|WP_011998849.1|51105_51444_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MSTNIVYTEAFENMTDDQINYLSLWSEEDVVVERIENLVEKFESNITDNPEMYPPCHELTTLGVYNIRQFSFGGFKLLYEYHEHIDTAAALALVRDRQDLQSMLVDYCLIHK >NC_022271.1|WP_011998846.1|50456_50753_+|hypothetical-protein MAKLKARGAITIASSTEQKNEKSQAITTVKKKVTTSYKVPPLTLRMSLKDKESIAGWVDDLQKLSERNVSAAKLFRALALYRDNIDDDELIKLIDKMN >NC_022271.1|WP_011998845.1|49668_50436_+|ParA-family-protein MKTKVISAANQKGGVGKTTTLVNLGAELARKRKVLVVDLDPQGNCTKTLTGQRHFQFEETVAAMFDKPKVVSIVDLIRPALLDGESIQNLDVVPADFQLSRIIETSLTKINRERILEKQLAKLGETYDFILLDTPPNLSLTTLNAIQASDLILIPVDSGAFSLDGISPLLEAVSEIKDDEANYLILRNEVDVRNTVINEFIEEELEVAKDKVLSVTIRRSEHVSQANAVSAPVRFYKSGSLVNNDYRKLASLIAG >NC_022271.1|WP_011998844.1|49157_49556_+|GIY-YIG-nuclease-family-protein MIESKSDYNSRKKQVIDSIKIELDSMGVIYEPPSYIYTLELEDGKYYVGFSDRILARLSMHFMSGGAAWVKKYKPVKILDVRRGSIELESLRTLEVMREFGVSNVRGGKWCELRDFTPAELLELNKRIRSLG >NC_022271.1|WP_144080979.1|47657_48458_+|hypothetical-protein MYRANRKARVRECIEIHHDAVAAEKARLKAKGKAFTNLEIGFTKRRVLRDKKNPKVINLPLEFATILKGCEEFIDNPSRFPALDIWVSEMRNRQARELVAKVLACLLSNTDMISGRVGKPTEAGMKTLSYYQLQEDYALRFGEYIAPKSFGKAIKYLKQAGYFHSEAINIRMEDGEGAVRSAPAYKQFSERFFSDLKVVRYSNVAESIVATRKRQMKEGLRHTWVSFREIANGVRQIFLNANKFESIAESTGRVFEAYLPLHPNPH >NC_022271.1|WP_011998841.1|46474_46954_-|hypothetical-protein MKLKILFLSFLSFGLAGWGVAITKPDKLDHLSSFMTYNYVKSVVWYHSRGKLKELESIILNDDLSDEEAIKRKIQNMLKHRTSVYLREFNSLDAPIQNVGNHYEEMFEFAPFLNDVYEVVFSDKDVHLKLSLIADIMEAYQTRANNQLLDLMNNKEARL >NC_022271.1|WP_011998840.1|45830_46478_-|isoprenoid-biosynthesis-glyoxalase-ElbB MKKIAVVLSGCGVFDGAEINEAVLTLLALEERGIAYQCFAPDKPQLHTINHLKGEDKEQARNVLEESARIVRGSVSALSELDEQDFSALIIPGGFGVAKNLSTFATDGADFSIDVEFQQVMTAFASKKKPVGYMCIAPVLLPKVYNGVRCTIGYDEETASVINSLGGLHVDCTVDNIVVDNDYNVVTTPAYMLAGSIADAKKGIDKLVEQVASLI >NC_022271.1|WP_021018378.1|45392_45818_-|hypothetical-protein MENTYDILCTIGVSAFLGVGLWLALELLPFQSNGNVTIATTLEEKESPKAGLLFDASQNAVLRGEDEILRIKQGSTNHRFISYLFEHEGQDIPIEQLYQDLRLPEDTYLKKLIANTKLPKEIRSQAFVVSKSTIRFQTTLD >NC_022271.1|WP_011998838.1|44780_45371_+|LexA-family-transcriptional-regulator MKTLGQRLEELRVNNRLTKKDVGHVAGVTGTTVDKWEKDLIIPRDAKLKRLAEHYNVSFEWLRVGVDGAKVTPVPESFAVSIQSYKEGDESVFFDARLLPSGHSERLVYVQVEGHSMGDILPDGSKLIVDLEDRHYKDDKLYVFKTQDFMSIRRLSFTSTGVRLQSLGSQKDEVLTFQQLSKVDVLGRVISSICPR >NC_022271.1|WP_011998851.1|52572_53025_-|hypothetical-protein MKAVRLEEVESIMRWRDRSSAKDGHLQREMFDKYITLMVAWERLKRGIATERDQLICYQIHKGLMKGLCQGDKVPLMHLGARVESMVEPDKRITLRKPMKIHQAIAWVADMDGRSHEAVRKQWNKWRNATQDEKDDVTRKFMSCKDADFT >NC_022271.1|WP_011998852.1|53221_54208_+|hypothetical-protein MARERAFSDQQVIEAANALLVEGKNINGTSLRNKIGTGRPSALMSAFKALEDSGEILAPMLPDSTEQTITHQELPPEIAERLSVMLGDVEQLVHQINDHAHYTVEQRLNQAIAEANERAANAAKREAESIQEQDKAFEQLEDALESNADLQEQLKQEHKESSRLNAALNVAQSETKAALDTVSERDERLAEMQKQIASMQKQLNTAESDKAKAEGQAEQLGKQLEEKSEEMAKLNASLKTSEKELGSLQGQVVSLTEQIANQKATNEQLQGKFDEEKAAHIRAESRIESLSSELNKKNIALLETQASLGEAEKLSAKLEGQLMQYQEN >NC_022271.1|WP_011998853.1|54295_54691_+|hypothetical-protein MFLSHGVNEQGDLVSILEVSAGRVPLSCPFCGQGLIAKKGAQKEHHFAHDGQTCADAKAILQMTALPLFDMDMGLSKTEITLLEKLSRWRSFSRTWLSSKQRAVFDELVVSGLVDFQEGDDKPRLSNVRRQ >NC_022271.1|WP_012127359.1|54893_56447_-|IS66-family-transposase MKKTPVINPESQDVAKLQAMVKALLLSQERKESQWKQERQSLLEQLKLAFDRQFAKRSEALKPYDESQGDLFNEVECEAAKEEEEEEVEVVTTTTTTKKRGKRKPLPKTLPREVIELDLDDNEKQCACCQHSLHKIGEDLSEKLEFSPAVLKVLEYVRPKYACRQCEQTEDKSHIVQKPAPQSIIPKSFATESLLANIILGKYQYAMPLYRQESLFTQSGIELSRTTMARWVIQVSEKFKPLYAALKEHLLQQVVVQADETPLNVLKEDKQCYMWLYCSGADSPDAALPNVKNIALYDYQNSRARACPVAFLGNYSGYLQTDGYGAYDGLHHVTNVGCLAHARRKFMDAKKLQGKGKSGKADKALAKIQKLYGIESRLKGATVETRKAERQQHAKPILDELHDWMTSQQVISSSPLGKAIKYTLGQWPKLIRYIDDGHLSIDNNRAERAIKPLVIGRKNWLFSNTPNGADASAMLYSIVETAKANGLILYDYMVKCMKELAKAEPDIDALLPWNFKH >NC_022271.1|WP_011998799.1|56506_56860_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MKHMLSAPEIYLYRESVDFRKSINGLAAIIESDTDLPLGSGALFLFTNKQRDKIKVLYWDKTGFALWYKRLEKAKYKWPAKEQNEVFTLTQFELDRLLSGFTIIGHKPVQINDFTMT >NC_022271.1|WP_011999494.1|56856_57168_-|IS66-family-insertion-sequence-hypothetical-protein MGKRHTNQEWQTLIEQSESSSLSTLAFCKLNELNPSTFYAKRQQLKKADVSQGFVRAEVVEKTTKYQAQIATANMTLLINDVELSIPQGTPAAYLAELIGALS >NC_022271.1|WP_041853714.1|57408_57882_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVRKAIKQDSGKLLELIGHKAEFDRSMKGFDGEISTTKEKIERTLFGDYPFAHALLLEVDGEVQGFALFHYRYSSFRGEPSIWLDDLLVIGKYRSKGYGAELMHALKSEAQKSLTTHISWTASPHNTKAHEFYKKLGAEVERMDGQRPYFRWEMYG >NC_022271.1|WP_011998856.1|58621_59386_+|hypothetical-protein MLIFNCTKAAANFLSPHKSKESKPLIQAVPDFDIEDVGSPQAPISQWLVQHTKQLGQDILYVCHVQHRFTMVFTGVEKGNWLQFMQCFWERLVNHFCWLIEELSLNINSSPQNWVDNIRTLHSQNGERPIFCLRYSPSVNASAARFRSTFETALYEIGCLPNDEEAGEFEFHENSRIHFSGCKENMFYPAHELLCNGLEMYMDVSGNDLDAFKSLSFNYFEQTLSDMFNVSTITPEDVAMVLNTLTTEKGTNNR >NC_022271.1|WP_011998859.1|59905_60127_-|hypothetical-protein MVWLQDSLGVLLVAAVFFYGGLKFLHWGRTGVLDRRDIKDNPRYMKLATACGYFSIGFSVFIVCLMFFLKWPM >NC_022271.1|WP_011998860.1|60134_61337_-|hypothetical-protein MPFYSSAGATVPPPQRVYVDKVTSPDGRDLEWAQGERLASVDFTDLAAKIRVSRFTNTYYFEDEPGTIKSSSRTGLFFEFKNSEDFTLGDEAIFEVKFLTPDRSRFVTHRSCHTKVVFGGPSQETCETKFVKHSIKITRDSKGALRLKSDSDDFLSYGYKKSGGREYFEVFSTIDLMTHWNLKDKDAVPYIVLTAFNANSNSSKSVEAPAVLAKYTGVQNAAKVWDVYKPTVESYIRASNMPDIRPVVQVGVSVQVRQVEVVGTVTSDFKDIDVAFSGGVAISNTDLEINASVMGFATDSLESVTSGTSTTVSGELGSAVNVGGALSYNSNNELIGAGISVGFGSAIDVDLSVTESTVVYTTRTSSNESERGDGNRRDGYNEREGRTSRVDGEGGRSIEH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022271_1 | 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder | 28116-28142 | 27 | NC_022269.1 | 131672-131698 | 0 | 1.0 |
NC_022271_1 | 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder | 28116-28142 | 27 | NC_022269.1 | 1223408-1223434 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to position: 131672-131698, mismatch: 0, identity: 1.0
aaaccagcacctaaaaaagaatctagc CRISPR spacer aaaccagcacctaaaaaagaatctagc Protospacer ***************************
2. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to position: 1223408-1223434, mismatch: 0, identity: 1.0
aaaccagcacctaaaaaagaatctagc CRISPR spacer aaaccagcacctaaaaaagaatctagc Protospacer ***************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022271_1 | 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder | 28116-28142 | 27 | NC_022271 | Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid unnamed, complete sequence | 28116-28142 | 0 | 1.0 |
NC_022271_1 | 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder | 28116-28142 | 27 | NC_009777 | Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR, complete sequence | 28672-28698 | 0 | 1.0 |
NC_022271_2 | 2.1|52236|54|NC_022271|CRISPRCasFinder | 52236-52289 | 54 | NC_022271 | Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid unnamed, complete sequence | 52236-52289 | 0 | 1.0 |
NC_022271_2 | 2.1|52236|54|NC_022271|CRISPRCasFinder | 52236-52289 | 54 | NC_009777 | Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR, complete sequence | 52792-52845 | 0 | 1.0 |
NC_022271_1 | 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder | 28116-28142 | 27 | KU737346 | Bacillus phage Vinny, complete genome | 40975-41001 | 5 | 0.815 |
NC_022271_1 | 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder | 28116-28142 | 27 | NC_024207 | Bacillus phage Evoli, complete genome | 40370-40396 | 5 | 0.815 |
NC_022271_1 | 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder | 28116-28142 | 27 | NC_018856 | Bacillus phage Bastille, complete genome | 14622-14648 | 5 | 0.815 |
NC_022271_1 | 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder | 28116-28142 | 27 | MK448855 | Streptococcus phage Javan150, complete genome | 7605-7631 | 6 | 0.778 |
1. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to NC_022271 (Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaccagcacctaaaaaagaatctagc CRISPR spacer aaaccagcacctaaaaaagaatctagc Protospacer ***************************
2. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to NC_009777 (Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaccagcacctaaaaaagaatctagc CRISPR spacer aaaccagcacctaaaaaagaatctagc Protospacer ***************************
3. spacer 2.1|52236|54|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to NC_022271 (Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gggggagtgggaagggcaattcaacaacatcagtggattagagctgtatatcgt CRISPR spacer gggggagtgggaagggcaattcaacaacatcagtggattagagctgtatatcgt Protospacer ******************************************************
4. spacer 2.1|52236|54|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to NC_009777 (Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid pVIBHAR, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gggggagtgggaagggcaattcaacaacatcagtggattagagctgtatatcgt CRISPR spacer gggggagtgggaagggcaattcaacaacatcagtggattagagctgtatatcgt Protospacer ******************************************************
5. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to KU737346 (Bacillus phage Vinny, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
aaaccagcacctaaaaaag-aatctagc CRISPR spacer aaaccagcacctaaaaaagcggagtag- Protospacer ******************* .. ***
6. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to NC_024207 (Bacillus phage Evoli, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
aaaccagcacctaaaaaag-aatctagc CRISPR spacer aaaccagcacctaaaaaagcggagtag- Protospacer ******************* .. ***
7. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to NC_018856 (Bacillus phage Bastille, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
aaaccagcacctaaaaaag-aatctagc CRISPR spacer aaaccagcacctaaaaaagcggagtag- Protospacer ******************* .. ***
8. spacer 1.1|28116|27|NC_022271|CRISPRCasFinder matches to MK448855 (Streptococcus phage Javan150, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
aaaccagcacctaaaaaagaatctagc CRISPR spacer aagccagcacctaaaaaagaagcagct Protospacer **.****************** * . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
12306 : 56447
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022271|12306:56447|DBSCAN-SWA GTTAATGTTTGAAGTTCCAAGGTAGGAGCGCATCGATATCAGGCTCAGCTTTCGCGAGCTCTTTCATGCACTTGACCATGTAGTCGTAGAGGATAAGGCCGTTGGCTTTCGCTGTCTCGACGATGCTGTAAAGCATCGCGCTCGCATCAGCACCATTTGGTGTGTTTGAGAACAGCCAATTTTTTCTGCCAATGACCAGCGGTTTAATGGCGCGTTCAGCACGATTATTATCGATAGATAAATGACCGTCATCGATATAGCGGATGAGCTTGGGCCATTGGCCGAGCGTATACTTAATCGCTTTTCCTAATGGACTAGAGCTTATTACTTGTTGAGACGTCATCCAGTCGTGCAGCTCATCCAGTATCGGCTTGGCATGCTGTTGACGTTCTGCTTTTCGCGTTTCGACAGTCGCACCTTTTAAGCGCGATTCTATCCCATAGAGCTTCTGGATTTTGGCCAGCGCTTTATCTGCTTTGCCTGACTTACCTTTACCTTGAAGCTTCTTAGCATCCATGAACTTACGCCGTGCATGCGCCAAGCAACCCACATTGGTTACGTGATGAAGACCATCATAGGCACCATAGCCATCGGTTTGCAGATAACCACTGTAATCCCCCAAGAAGGCAACAGGGCATACCCTCGCGCGACTGTTTTGATAGTCGTACAAGGCGATATTCTTTACATTCGGCAGTGCAGCGTCGGGCGAGTCTGCGCCCGAGCAGTAGAGCCACATATAACACTTTTTATCTTCTTTAAGGACATTGAGCGGCGTTTCATCCGCCTGAACCACCACTTGTTGAAGTAGATGCGCTTTTAAGGCCGCATACAGCGGTGTGAACTTCTCACTGACTTGGATAACCCACCTTGCCATGGTAGTTCGCGATAGCTCAATACCCGACTGAGTAAACAGCGACTCTTGGCGGTAAAGGGGCATTGCGTATTGATATTTACCAAGGATGATATTGGCCAGCAAGCTTTCTGTCGCGAAGCTTTTAGGGATGATGCTCTGAGGCGCTGGCTTTTGAACGATGTGGCTGTTGTCTTCAGTTTGCTCACACTGACGACAAGCATATTTAGGACGAACATATTCCAGCACTTTGAGCACTGCTGGTGAGAACTCAAGTTTCTCACTGCGGTCTTCACCGATTTTATGCAGACTATGTTGGCAGCAGGCACACTGTTTTTCATGGTCGTCTAAATCGAGTTCGATAACCTCACGAGGCAAAGTCTTTGGAAGTGGCTTGCGTTTACCACGCTTCTTCGTTGTAGTGGTCGTCGTGACCACTTCAACCTCTTCTTCCTTAGCGGCTTCACATTCCACTTCGTTGAAGAGGTCACCTTGAGATTCATCGTAAGGCTTTAGCGCCTCGGAGCGTTTCGCGAACTGACGGTCGAAGGCCAGCTTGAGCTGTTCGAGTAAGGATTGACGCTCTTGTTTCCATTGAGACTCCTTCCGCTCCTGAGAGAGCAGAAGGGCTTTCACCATCGCTTGTAGCTTGGCAACATCTTGGCTTTCTGGGTTAATATTTGGCGTCTTTTTCATGGCATTTATTATACTAAAAATCATGCCGTTAACGCTTGGTAGATAAGGCTTTATTATCGATTAAGTCATTGTAAAATCGTTTATTTGAACGGGTTTATGGCCGATAATCGTGAAGCCAGAAAGCAGTCTATCAAGCTCGAATTGAGTCAGGGTAAACACTTCATTTTGCTCTTTTGCAGGCCATTTATACTTGGCTTTTTCAAGGCGTTTATACCAAAGCGCAAAGCCAGTTTTATCCCAGTACAGCACTTTGATTTTGTCGCGCTGTTTATTGGTGAACAAGAACAGTGCGCCGCTTCCTAGAGGTAAATCGGTGTCACTTTCGATAATCGCCGCGAGGCCATTGATGGACTTTCTAAAATCGACACTCTCACGATACAGATAAATCTCTGGTGCGCTGAGCATATGTTTCATGACAAGGCTCCAATGAGTTCTGCCAGGTAGGCAGCGGGCGTGCCTTGAGGAATGCTCAACTCCACATCATTGATGAGAAGTGTCATGTTAGCGGTGGCTATTTGAGCTTGATATTTCGTTGTCTTTTCGACGACCTCTGCTCGTACAAAGCCTTGAGAGACATCTGCTTTTTTGAGTTGCTGGCGCTTAGCATAAAACGTCGAGGGATTGAGTTCATTAAGCTTACAAAATGCAAGCGTTGACAATGAACTCGATTCAGACTGCTCGATGAGCGTTTGCCATTCTTGATTAGTGTGTCGTTTTCCCATTTCAAATCTCCTCATGGTTGGAGACTTGATCTTATTCTTCGCGCTAGGCGATTAGAATGCGGGTTTTATGGAGCGCTTACCATATTTCAGGCTTCTCCATAATCGCTCTATGAAAACATTGTCGACCCAGCGTCCTTTCCCATCCATACTTATCCTGACTCCATGGTCGAGTAGCTTCTGTGTGAATTCGGTGCTGGTAAACTGACTGCCTTGATCTGAGTTGAAGATATCTGGCGGGCCATAATGTTTAAGCGCGTCTTCAAGGGCTTCGATACAAAAGCTCGTGTCCATGGTGTTGGATAGCCGCCAAGACAGCACCTTTCGGCTATACCAGTCGATAATGGCGACTAAATACAGGAACCCCTTAGCCATCGGGATATACGTGATGTCAATCGCCCAAGCTTGGTTCGGGTAAGTGACTTCGATATCACGCAAAAGGTAGGGATAAACCTTGTGTGCTTTGTTCGCTAGGGTCGTTCTAGGCTTGGGGTAAATAGCCCCAATGCCCATGTCTCGCATGAGCCGAACGACACGTTTACGATTAACGTTATGGCCTTTTTTAGCCATCTCATTTCGAATGCGTCTGCTCCCCATGAACGGATACCGAAGGTGAATTTCGTCAATCATGCGCCGTAGTACAATCTCTTCAGCAGAGAGTCCTATGGGTTGATAGTAAGCAGTAGAGCGAGCAATACTGAGAAGCTCACACTGGCGTTTTATTGGCAATTGGGTAGATTTAACCAGCGATCTCTTTCGCTGGGCTCGGTCTAACGACCGAGCACTTTGGCCAAAAAATCATTTTCCATGGTCAATTGACCAATCTTGGCGTGCAGTTTGTCCACTTCTTCAGAGTTGTCCTTGCCTGACTGGCTTTCAGAGGCAAAAATCATGGCTGCATTTTCGAGCAGCTCTTTTTTCCATGTAGAAATTTGGTTAGCGTGAAGATTGTATTTCTGAGCTAACTCAGCGACAGTTTTATCACCTCTAGCAGCATCAAGCGCCACCTTAGCTTTAAATTCGGGTGAGTGGTTTCTACGTTTTCTAGTCATAATCTGTTCCAGTATTTTTAGGTACTATACAAACAGATCAATCACTTAAAGTCATGTCCGAAAATTGGGGGCCATTTCTTTTTTTGTTCACAGCTCAACGCCAAGGCGACAATCGCGGCCTATTTTGAAAAAACAGGCGTTAGCTCGATCAAAAAAGGCCCAAAAAAGGGCCTTTGCTTTTATTACATTACATTACATTACTCGATAGTAATCGCTCTAACAGCCGCATACTTATTTGCCGAATTTTTAATCAAGTGATTCTCTTATCATGACATAGTGTGGCTTCTCAGAAGCCGTATAGCGCTTTATGTCACTGCATTTTTTAAGATTGTAATATTGCATCATCAGTGGCTTTTGAGTTGTCACAGCAGTCAAAGCCATTGAAACCCACGATTTGCACGTATCAGGCGTGATACCATTTTTAGTTTTACTGACGCTACACAAACCGACAAACGATGCCCACGAGGTATTAATAATTAGTGAGCCATCACTTTGTATCCAAGCATCAGTGACAGTGCCTTTACAGTGTATGGAATCCGCACAAAAAGCAGGTACTGAAAAAAACCACAGCAGTAAAAACCATTTTGTTTTCATATTGAACCTTTCTATTTAGGGAAGGCAAAAATACCTTCGATGGAGCAATGCCACCAACCTTTATGATTGGTTTCTTGATAACGAATATTCCCTTTAAAATTTTTGGTAGCCATCATTGTCAGTAGGAGTGAATAAAGCTCCTTGTAATTAGGGTTAGATTTACTGAGTCGTCCGCCCTTATTACCGCTACAGTTAGGCATAGCGCCCTGTTGAAACTCAATATAAAGGCCATCACCAGCGTCATGATAAAATGAAACTGGGTATAATTTTTCAATCGGTGGCCCTGTTTTAATTTCAGCTTGAGAAGAAAAAGAGCCAAGTATTGCGGCCACAAGTAAACATTTTTTCATTATTAATCCCCTATTAACCTATTGGATCAACTTGGTTGATTACGCAAAATGAAGAGCCATTTTGCATGTCCGATGTATAAACGGTTACCCGTCGTTTGTCTGCAATCCAAAGGGCCAGTGTGGTTGACGTCATTGCACTGTAAGAAGTGGACCCCAATGGTTGGACACATAAGCTAACTTCTTAAGTGGTTGATCCAGCTCATGCAGCGTATCTCTGCCTACCAAAGTAGGCTTCATCAGGAGTGAGGTCATTGAGTCCCTGATGGTTACGCTCCTCATTATAAAACACCATGTAGTGGCCGATTTCAAGCTCTGCTTCTCGGGGCGTGGTGTAAGCTTTTAAGTAAACCTCCTCATATTTCAGGCTTCTCCATAATCGCTCTATGAAAACATTGTCGACCCAGCGTCCTTTCCCATCCATACTTATCCTGACTCCATGGTCGAGTAGCTTCTGTGTGAATTCGGTGCTGGTAAACTGACTGCCTTGATCTGAGTTGAAGATATCTGGCGGGCCATAATGTTTAAGCGCGTCTTCAAGGGCTTCGATACAAAAGCTCGTGTCCATGGTGTTGGATAGCCGCCAAGACAGCACCTTTCGGCTATACCAGTCGATAATGGCGACTAAATACAGGAACCCCTTAGCCATCGGGATATACGTGATGTCAATCGCCCAAGCTTGGTTCGGGTAAGTGACTTCGATATCACGCAAAAGGTAGGGATAAACCTTGTGTGCTTTGTT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>NC_022271|12306:56447|53221_54208_+|WP_011998852.1|DBSCAN-SWA MARERAFSDQQVIEAANALLVEGKNINGTSLRNKIGTGRPSALMSAFKALEDSGEILAPMLPDSTEQTITHQELPPEIAERLSVMLGDVEQLVHQINDHAHYTVEQRLNQAIAEANERAANAAKREAESIQEQDKAFEQLEDALESNADLQEQLKQEHKESSRLNAALNVAQSETKAALDTVSERDERLAEMQKQIASMQKQLNTAESDKAKAEGQAEQLGKQLEEKSEEMAKLNASLKTSEKELGSLQGQVVSLTEQIANQKATNEQLQGKFDEEKAAHIRAESRIESLSSELNKKNIALLETQASLGEAEKLSAKLEGQLMQYQEN |
49 | Leptospira_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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