Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022351 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,WYL,cas14j,cas2,cas1,cas9,csa3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022351_1 | 1417454-1417533 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022351_1
|
1 spacers
spacers of NC_022351_1
>1.1|1417477|34|NC_022351|CRISPRCasFinder TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTGCTCATATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022351_1
The CRISPR arrays of NC_022351_1 >merge|NC_022351|1|1417454-1417533|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTCTTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTGCTCATATAATCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC >NC_022351|1|1|1417454-1417533|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTC TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTGCTCATATAA TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC
>NC_022351.2|WP_002858238.1|1417052_1417379_+|ribosome-silencing-factor MQERIDLIVKILDEKKAENIKTIDMSEQEYFVKYVIIAATLGERHALSLIDELKTRLKAKGEEFLNIDSSEEWSVIDLGDILIHLLTPEHRGIYNIEELLENLKKGRV >NC_022351.2|WP_002780449.1|1416479_1417025_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKIALFGGSFDPPHNGHNSVVLEALEKLDIDKLIIMPTYINPFKQSFSADEKQRFLWVKKLWGHLPKVEICDFEIRQKRPVPSIESVKYLYKLYNPSKFYLLIGADHLEKLHLWHDFEKLNSLVEFVIANRNDIGIPKNFKDLKTNKKIASSFIRDTLNTNEVCEEIKDEVKKYYEKLQKN >NC_022351.2|WP_002780453.1|1415421_1416420_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRCVARIILERNDIELVAINDTTDIELTKYLFKYDTVHGEFKGSVDSEGDDLVVNGKKIKVFKSRNVKDLDFAKHGAQIVLECTGAHLTMAKCQEFIDMGVQKVIMSAPAKDDTPTYVLGVNSELYKGESIISNASCTTNCLGPVCRVLQDNFGIEKGLMTTIHAYTNGQSIIDAKAKDKRRSRAAAQNIIPTSTGAAKAMKLVMPELNGKLHGQSMRVPVIDVSSVDLTAQLSRKVSKDEINEAFRKAAATNLKGILMVDDDERVSSDFITCSYGAIVASDLTQVIADDFIKVIAWYDNEWGYSSRLVDMAVYIANKA >NC_022351.2|WP_002855324.1|1414216_1415419_-|phosphoglycerate-kinase MSDIISIKDIDLAKKKVFIRCDFNVPQDDFLNITDDRRIRSAIPTIRYCLDNGCSVILASHLGRPKEISSKYSLEPVAKRLARLLDKEIVMAKDVIGEDAKTKAMNLKAGEILLLENLRFEKGETKNDENLAKELASMVQVYINDAFGVCHRAHSSVEAITKFFDEKHKGAGFLLQKEIDFASNLIKHPARPFVAVVGGSKVSGKLQALTNLLPKVDKLIIGGGMAFTFLKALGYDIGNSLLEEELLEEANKILTKGKNLGVKIYLPVDVVAAPACSQDAPMKFVPAQEIPNGWMGLDIGPASVRLFKEVISDAQTIWWNGPMGVFEIDKFSKGSIKMSHYISEGHATSVVGGGDTADVVARAGDADEMTFISTGGGASLELIEGKELPGVKALRSKENE >NC_022351.2|WP_002855528.1|1413548_1414220_-|triose-phosphate-isomerase MIFAANLKCNHTRASFKIYAKILNKTMGVKCDDIIVFPPSIAFLENENNFIQGAQNFYPCVNGAFTGELGKEHLDEFGIKCVLIGHSERRALGDEEFIKAKFDFAKEHGYKIVFCIGENLDTKNSGKTLEFLKKQLEIIDLNYEKLIIAYEPIYSIGTGVSAQSTDIAKVLEFLASLTKVPLLYGGSVNENNIKEILSVNHCGGVLIGSAALKVENFIKLIKG >NC_022351.2|WP_002780456.1|1412720_1413545_-|enoyl-ACP-reductase-FabI MIMKGKKGLIVGVANNKSIAYGIAKACFDQGAELAFTFLNDALKKRVEPIAQEFNSNFVYELDVNNNEHLDSIAEKIKKDLGEIDFVVHAVAFAPKEALENSFLETSKEAFDIAMQTSVYSLLSLTRAVLPILKDKGSILTLSYLGGVKYVPHYNVMGVAKAALESSVRYLARDLGVKGIRVNAISAGPIKTLAASGIGDFRMILKYNEINSPLKRNVSIEDVGNSAMYLLSDLANGVTGEIHYVDAGYNIMGMGDVEKNEEGQTVLCWDNQKG >NC_022351.2|WP_002858455.1|1411223_1412717_-|hydrogenase-small-subunit MAKLSNEELKNILEDRIKKLENSTLKEDKVINEESVKILARHLSLGNEIPALAQRFFQIAPKTKLVWLHLCECTGCSESLLRSELPSFDELIFDFFSLEYHETLMAANGTKAEELLEYVLEEDFILAVEGGVAAIDTFFLTIGAQGESGYEILEKLAAKAKAIFAVGTCSSYGGIQAAYPNPSKTCGISEVLSQKVVNIPGCPPSDINIIATLSFFALFGVLPELDEQNRPVWAYGKCLHDMCERKAKFESGIFAEHFDDEAAKNGACLFKIGCKGPYTYNNCPKVKFNAKTSWPVAAGHGCIACSEKNFWDEFGNYEKPMANIFSYAKLCNEELKQEFFLEEQIKILEQIDFEFESNIKLILQNIAKNKLGALLVENYKKSFEKNYAFIEQNFDENPMPSKDFWKYLEISFILVKGAFLKDKNDFLIVAKNYAFKHASPYDFKLNMNAEKPKLDVSKSFRMTLIYLCGGLDFEGVAYSILKAFEDNIAKISSLKAS >NC_022351.2|WP_002779147.1|1409165_1409390_+|ferrous-iron-transport-protein-A MTLNELKDGQKAIIVNLNAHKELKNRLLSFGFIKNKNLKKIHSSLKNATIMVELDTSCVILRSDEAKTIEVNLI >NC_022351.2|WP_002857989.1|1406367_1407735_+|adenylosuccinate-lyase MTGISVFDHRLLADSWSTQEMRAIFCEQNRIQKWLDVEAALAKAQAKLKIIPKKAADEIAKKAHYKFMDMDFIFAEFKKTKHPLVPTVRGLEKACDNNLGEYVHFRVTTQDIIDTGLVLQFKEAMTLVKSELKAIAKALAKLAKTHKNTAMMGRTLALQALPITFGHKVAIWLSELDRHFERILELEKRLYVGSIVGAVGTKASLSDECNEVEKLTLENLGLEVPNISWQSTRDRFIELGFVLGNINATFNKIAHQLLILSHNEIDEVAEPFGKGQVGSSTMPHKRNPAVSENAVTVSNAFKANLAILSDIERHEHERDGQVWKMEWKLLPEMFLMLSVVLANMKFALSDLEVKKDKMLKNLDTLKGFVLAERVMFALSDHYGKQHAHEIVYENAMLGIEQQKTFKEVLLADTRVSQVLKEKDIDALLDATSYVGYAPKLVDEFLAKIKNSAILK >NC_022351.2|WP_002852401.1|1403377_1403740_+|RidA-family-protein MSNYPKAIGPYSAYREVNGLLFISGQLPINPASGEIESSDIKEQTKQSLKNIGAILEENGISYDKVIKTTCFLADINDFVAFNEIYAEFFKAPYPARSAFAVKDLPKKAKVEIEIIAQKG >NC_022351.2|WP_010891933.1|1417834_1419223_-|phosphoglucosamine-mutase-PgmL MNLKEKMLDVIFREYDIRGLYDKELNEKSVKAIGFCLGQTMLNRGCKNVSVGYDARYSANELFNYLVSGLNKAGIKIYDIGLVPTPLGYFSLYEGLKFDANVMITGSHNPKDYNGFKITINKESFFGVELKEFSKEVYKHLDDDIEENLEVEKYDILNLYVKFMCEQFSFLKDFNYKFGVDCTNGAAGVVIKPLIKALNLKAHVMFAEPDGQFPNHAPDPTEEENLSAIREFLNQNQDYSLAFAFDGDADRMVALSKTHVFCGDELCYLFAKDIPNPRILGEVKCSKNLFDEVAKFGTIFMGKTGHSNIKKMMKEKDIDLAAEVSGHIFFKHRYFGYDDGIYAFLRALELVYKGFDLESMIKALPKLYTTPEIKIPVNEEEKFKLVEEFQKEIEKGALKGVKSLCEIDGARIDFGDGWALLRASNTSPYLITRFEATSLERAKELESMVFTLFNDIKARFKN >NC_022351.2|WP_002780442.1|1419325_1419862_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL MDEELENEETKKKKGGSLVIIIVILLFVLLLSIMGVIAWLISSSSSDESEVKEAPKEEAKADKPKVSAPAQRGSDFANIGPMYPLDPFTLNLLSDSGSRYVKCTIELEQNSELLKPELDKKVPVIRDIIIRTLTAKTFEEVSTQKGKERLKDELVGKINEILTDGFIKNVYFTDFVVS >NC_022351.2|WP_002857939.1|1419861_1420209_+|holo-ACP-synthase MRVGCDIIAISRIEKIHSRHGKNFLDKFLNPKEQILIKNPATLAGLWAAKEAASKALGVGICELCSFFDIEISKDEKNAPKLKYSQKITKDFNITQTSLSISHDNGFAIAIVAVV >NC_022351.2|WP_002780440.1|1420209_1420629_-|hypothetical-protein MKRVRTKIRANFRRRVKRTLKGSLKEKLAGTILLCAIVPLAVLGYLFIVIIGIFFNTARARQGVRALDHFVNASLFNGYAWESVSSHAWRERNRKKWARIVIKITDFFQKDHCKRANKREQPVVDFILSRNLDKQTIGK >NC_022351.2|WP_002780438.1|1420625_1421987_-|cytochrome-P450 MSECPFFPKPYKNKASTLLTFLLKRRSWLDGLYERSYKMQTGYVKMPNFDLYVINDTKEVKRMMVDEVREFPKSAFLHELLSPLLGESIFTTNGEVWKKQRELLRPSFEMTRINKVFNLMSEAVADMMDRFSKYPNHAVIEVDEAMTFITADVIFRTIMSSKLDEEKGKKILNAFVTFQEQSVHTAMRRMFRFPKWLSYVLGDCKRAKAGDVIRQVLSDIIKPRYDMADNAEFEDILGSLLLVVDADTNKRFSFEEILDQVAMLFLAGHETTASSLTWTLYLLSLYPKEQEKAYEEITQVLQGGVIEISHLRQFKYLTNIFKESLRLYPPVGFFAREAKKDTQVRDKLIKKGSGVVIAPWLIHRHEEFWTNPHGFNPSRFEGEYKKDAYLPFGVGERICIGQGFAMQEAILILANILKTYKLELEEGFVPDVVGRLTVRSANGMRIKFSKRKL >NC_022351.2|WP_002858304.1|1421983_1423105_-|membrane-protein MDREVFYIAGYDPKSYRFYYDLFKKNLKDYSHAFNIKADLSKIEKNEQFPFFQISCEGVQTKYHFLTWNDIVKKNWSENYKDALADCYSFFRIYTITGLFIKFGKESIYQLITGYYPFFYVLFSLLFSLVLAFGSFAFLQNYMHFSLAIIIGCFLGFLLNHFLFKLGKKLAVFWIARICAFCATWQDKKTGTMQERIKLFANTIVDKLKQNENKQDYELVLVAHSVGTIVCIEVLECILRQNLDLSLLHKLKILTLGECIPLVSYQKKADEFRKKLEFVSRFDLKWYDYTSIIDGACFPQVDFFRTSGVNAKFTPPFLSAKFHTLYEKHEYKKIKRDKNKAHFLYLYSISVKGDYDFFSFIIMPKFLEEKVKI >NC_022351.2|WP_002857981.1|1423177_1424362_-|capsule-polysaccharide-modification-protein-KpsS MRFSTKIKKEFSGKNVLLLQGPVGNFFHHLAVKMRKNQTKVFKLNFNGGDFFFYPSGTRCKCDEKDLENFYRDFFQNKKIDAILMYNDCRIIHAKAIKVAKELGIEIWIFEEGYLRPYCITLEKDGVNANSSLPRDKNFYLSQNIFTKESIKEIPGGFKFMAFDAFLYWLFAFILAPFFNNKLHHRTLYPFEFLFWFRSLYRKYLYKITEKKLNEKIYNLEKKYFLAILQVYSDTQIKYHYKKSIEHFIEETILSFANHARAKSYLVFKHHPMDRGYKNYFKLINDLSRKYHVEGRVLYVHDTHLPVLLRKALGCITINSTVGLSAILEGCPTKVCGNAFYNFEGLSYPKKLQFFWREAHAYKPNPVLVCNFKKYLLQTNQFNGNFYKNFFLDK >NC_022351.2|WP_002857891.1|1424358_1426428_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MKYYSISKKLIANVRNFYTISLYKKNLKIKKDDLFFGWGRKKSGLKAMNLAKKYKAKFILLEDGFIRSLNLGVENSPSFSMVKDDIGIYYDATMPSKLENLLNTCEFKDEEIKQAKKAIELIKKYKISKYNNNLDIPDNYFQKDEKRVLIITQTANDASLEFGLAKDFKTLDMIKDAIKENPKSTIYIKIHPDVLSGKKQSDLDLNSLPKECILITENFNPIALLEFFDKVYTKTSGMGFEALMQECECICYGMPFYAGWGLTKDKLECKRRMQKRSLEEVFYAAYILYAEYFNPYLNQKSNIFDTIQTLAKYKDIEKVNSNKLFMLGFTLWKRHFIKPFFKAKDNEIIFLNSLKSLARYKLKENDKFFIWGKRIDYNALKTTLIKKAQDENLLHFTPKISLVEDGFIRSISLGSDLTRPFSLIVDDKGLYIDPNKASKLEELLQNEIFDENMLNRAKNIIKILLENRFSKYNGLKHEDLKINAKIGQKIILIPAQVEDDASMILGGFGLSTLDLLKEVRAKNQDAYIIFKPHPDVLSGNRVGLKDETLILEFCDEIVKDCSIDSAIKIADEIHTITSTSGFDALLRAKKVFTYGMPFYAGWGLTKDKYRCERRIRKLSLEELVAGALIIYPRYINPKTKTLCEIEVCLDIMLNLQKAYFSKKYIKLAIDFKTFMLRKIRRFYEFLAKK >NC_022351.2|WP_002858462.1|1426424_1426937_-|adenylyl-sulfate-kinase MKNNPYIIWLTGLAGSGKTTIGQALYEKLKLKYKNLIYLDGDELREILGHYAYDRQGRIDMALKRAKFAKFLNDQGMMVIVTTISMFNEIYDYNRKQLKNYYEIYIECDMHELIQRDQKGLYTKALNKEIDNVVGVDIEFDKPEADLVINNSCRNNLEEKVELIIKKLAL >NC_022351.2|WP_002858404.1|1426926_1427688_-|CTP:phosphoglutamine-cytidylyltransferase MNAIILAAGFGSRLMPLTKDQPKCMVEYKNKKIIDYEIEALKSAGINEIAVVGGYLNDVLKNYLNKYDIEHFFINSKYDKTNMVHTFFCAKDFMLKCIEEKQDLIISYADIVYFQDCVQKLINAKEELAIVVDKSWCKLWSKRFANPLEDAETLKMTNGYIIELGKKANAYDEIEAQYIGLFKFSYQFLSEVIAFYEMLDRDILYDNKNFENMYMTSFLQALIEKYNNAKAVEIDGNWCEIDFMSDLEVQIEK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
252161 : 322079
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022351|252161:322079|DBSCAN-SWA AATGCCTAGAAAATGTAGTTTTTGCAATGAAGTGGAGAATCCACAAAGAAGAATTTTAGCAAATGAAAATGATGATGCTTTTATTTGTGAATATTGCGTTGAAGGTGCTTATAGTATTATTTATGGAGAAGAAAAAGAATTTAAAGAACCTAAACAAAGTCATAATACAGAATTTAAAGATATCACTCCAAAAGAATTAAAAGCTTATTTAGATCGTTATGTCATAGGACAAGATAGAGCTAAAAAAGTTTTTAGTGTTGGAGTATACAATCATTATAAAAGACTTTTTAAAGCTGAGCTTCAAGATGATGGTACAGAGCTTTTTAAGTCAAATATTTTACTTGTTGGGCCAACAGGAAGTGGAAAAACTTTATTGGCGCAAACTTTAGCTAAATTTTTAGATGTACCTATAGCAATTTGTGATGCAACTTCTTTAACTGAAGCAGGATATGTAGGTGAGGATGTAGAAAATATTTTAACACGTCTTTTACAAGCTGCAGATGGAGATGTGCAAAGAGCTCAAAAAGGTATAGTTTTTATTGATGAGATTGATAAAATTGCCAGAATGAGTGAAAATCGTTCTATTACTCGTGATGTAAGTGGAGAGGGTGTGCAACAAGCTTTACTTAAGATTATCGAAGGAAGTTTGGTAAATATTCCACCAAAAGGGGGGAGAAAACATCCAAATCAAGAGTTTATACAAATTGACACTTCAAATATTTTATTTGTTTGTGGTGGAGCTTTTGATGGTTTGGAAACTATCTTAAAAAGAAAACTTGGAGATAAAGTTGTAGGTTTTTTTGATGATGCAAAAGAAGAAAATAAAGCTTTACTTGAGAAAATTGAACCTGATGATTTGGTTCATTTTGGTTTGATTCCTGAGCTTATAGGTCGTTTGCATGTGATTGCATCTTTAAATGAGCTTAATGAAGAAGATATGGTAAGAATTTTAACTGAACCTAAAAATGCCATTATTAAGCAATATCAAAAGCTTTTTGCTATTGATGGGGTAAATTTAAAATTTGAAGAAGATGCTCTAAGAGCTATCGCACAGCTTGCATTGGAGAGAAAAACAGGGGCTAGGGGGCTTAGAAGTATTATAGAAGAAATGATGGTAGATTTAATGTTTGAGTTACCAGAGTATAAAAACTATGATATTGTAATAACCAAAGAAGTTGTTAAAGACAATGCAAAGGCATTATTAATAAAAAGAAAAATAAGTTAAAAAGGATAGAAATGATATTAGATCAACTTATAGGATTTTTTTCTAGTGATATGGGGATTGATTTAGGAACAGCTAATACGCTAGTTTTGGTAAAAGATAAGGGTATAGTGATAAATGAGCCTTCTGTTGTGGCAGTTGAAAGAGAAAGGTATGGTTCCAAAGCAAAAATTTTAGCCGTAGGTAAAGAAGCTAAAGATATGGTGGGAAAAACTCCAGGTAACATCGAAGCTATTCGTCCTATGAAAGATGGCGTGATTGCAGATTTTGATATGACTGAAAAAATGATCCGCTATTTTATAGAAAAAACACATCGTAGAAAAAGTTTTTTACGCCCTAGAATTATTATTTCTGTTCCTTATGGTTTAACTCAAGTAGAAAGAAAAGCGGTAAGAGAAAGTGCTTTAAGTGCAGGTGCAAGAGAGGTATTTTTGATCGAAGAGCCTATGGCAGCAGCTATTGGCGCAAGTTTACCTATACAAGAACCTAAAGGAAATTTGGTAGTAGATATAGGGGGTGGAACTACTGAGATCGGAGTGATTTCTTTGGGTGGACTTGTGATTTCAAAGTCTATTCGTACGGCTGGAGATAAGCTTGATATGAGTATAGTTAATTATGTAAAAGAAAAATACAATCTTATCATAGGTGAAAGAACAGGCGAAGAGATCAAAATCACCATAGGTTCAGCAATACAACTTCCAAAAGAACTTTCTATGGTGGTAAAAGGACGCGATCAAGTAAGTGGACTTTTAAGTCGTATTGAACTTACAAGTGAAGATGTAAGAGAAGCAATGCGTGAGTATTTAAAAGAAATTGCTGATGCTTTAAAAATGGTTCTTGAAATGATGCCGCCTGATTTAGCAAGTGATATAGTAGAAAATGGTGTAGTTTTAACAGGTGGTGGAGCATTGATTCGTGGTTTTGATAAATACTTAAGTGAAATTGTACGTTTGCCAGTTTATATCGCAGATGAACCGCTTTTAGCTGTAGCAAAAGGAACGGGTAAAGCTTTAGAGGAAATTTCATTATTGCAACAATTAACCAATGAAGAATAAGATTTTTTATGTTCTTGTCTTAGCCTTTTTGGTTTTTATATCTTTTTATTATGGAGGACTTATCAAGCAAAATGTTCTCCGTGTTAATGATTTTGTTATAGGTAATTTTTATAATATTAAAGATTATTTGGGAAAAAAAATTTCAGAACACTTTAATCAAGCAAATCAAATTCAGCAACTAAAAGCTAGAAATAAAGAATTAGAAGATATTGCTGTAAAGGTAACTAGTTTTGCAAATCAATTAAATCGTATTTTAGAGGATCAAAATTCTACAAAATATTTACCTCAAGTTTCTTTAACTAGAGTTATTTCTTACGTTCAATTGAATGATTATAAAAAATTATGGTTAGATTGGAGCAAAATTCCAGTTGGTAAAAATCGTGGTTTAATATATCAAGGATATACTGCAGGTATAGCTATTAATAAAAATGGTAGAGCAATGGCTCTTTTACAAGGTGATGATCAGTGTGTTTTTTCTGTTTATATAGGAAAATCCAAAGCTCCAGGTTTAATTCAGGGTGAAGATGGCAGGATTGTGGTTAAATTTATTCCAAAATGGGCAAAAATTAATACCGGAGATGAAATTTTAACAAGTGGACTTGATAATATTTTCTTTTCAGATATACCTGTCGGTATTGTGAATAGAGTTAATGATGAAGATATGTATCAAAGTGTAGAAGTAAAGCCTTATGTTAAGATTAGTATTCCTGCTTATTTATATGTAGTAGATAATTTATAAGTCAAGGATTAGACTTTTTAAAAATTTTCTATATTTTTGCTAATTATTATCACTTTGTTTAATGCTAAAAATTTTGTTAAATTATCAAATAAATGTTTATAATTGAATGAGAATTTTATAAAAAATCTTAAATTTCTTTATGTATTATTTCCTAGATTAAAAGCAGAGTGTTTATTTTTTAAAATTATATCGATAATTTCAAAGTTTATAAAACTAATTTTTGTTATAATCGGCCCAAATTTATGCTCTTAGGAAAATTTATGCCAAAACGAACAGATATTAAAAGCATTTTACTTATAGGAAGTGGTCCTATTGTGATAGGACAAGCTTGTGAATTTGATTATTCTGGAACTCAAGCCGCAAAGACTTTAAAAGAATTAGGATATCGTGTAGTATTAATCAACTCAAATCCTGCAACCATCATGACAGATCCCGAATTTGCAGATGCGACTTATATAGAACCCATAACAAAAGAAAGTATTTTAAGTATTATTAAAAAAGAAAAAATTGATGCAATTTTGCCAACTATGGGTGGACAAGTAGCGTTAAATGTTGCTATGGAAGTTTATGAAAGCGGACTTTTAGGAGATGTGAAATTTTTAGGCGCAAATCCTGAGGCGATTAAAAAAGGCGAAGATCGTCAGGTTTTTAAAGAATGTATGAAAAAAATTGGCATGGATTTGCCAAAATCGATGTATGCGTATAATTATGACGAAGCTTTAAAAGCCGTAGATGAAATCGGCTTTCCTTTGATGATCCGTGCTTCTTATACTTTAGGGGGTGCTGGAAGTGGCGTGGTTTACAATATGGACGAATTTAAAGAACTTGCCAATACTGCTTTAGCTTTATCACCTATCCATGAAATTTTGATTGAAGAAAGTTTGTTAGGTTGGAAAGAATATGAAATGGAAGTTATACGCGATAGAGCGGATAATTGTATCATAGTTTGTAGCATAGAAAATATCGATCCTATGGGAGTTCATACAGGAGATAGTATTACAATAGCTCCAGCATTAACTTTGACGGATAAAGAATATCAAGTTATGCGTAATGCTTCTTTTGCTATTTTGCGTGAAATTGGTGTAGATACAGGCGGAAGTAATGTGCAATTTGCTATCAACTCAAAAAATGGAAGAATGATAGTTATAGAAATGAATCCAAGAGTTTCAAGATCAAGTGCTTTAGCTTCTAAGGCAACGGGTTATCCTATAGCAAAGGTTGCGACACTTTTGGCAGTAGGTTTTAGCTTAGATGAGATTAAAAATGATATTACAGGAACTCCTGCATCTTTCGAGCCTGTGATTGATTATATTGTAACAAAAATTCCTCGCTTTACCTTTGAAAAATTTCCAGGAGCAAATACAACTTTAGGTACAGCTATGAAAAGTGTGGGTGAGGTAATGGCTATAGGACGCACTTTTAAAGAAAGTATACAAAAAGCACTTTGTTCGCTTGAGCGTTCTTTAAGTGGTTTTGATAGGGTAAAATTTGAAGATAGAAATGATCTTGTTTTTAAAATTCGTAATGCCAATGAAAAGCGTTTACTTTATGTTGCTCAAGCTTTTAGGGAAGGTTTTAGCGTAGAAGAACTTTATGAGCTTTGTAAAATAGATCCTTGGTTTTTAACACAGATTAAAGAAATTGTAGATTTTGAAGAACAAATTGATATGGATATTTTAAACAATAAGGCTCTTTTGAGAAAAGCAAAAACTATGGGCTTTTCAGATAAAATGATAGCCTTGCTTGTAAATTTGAAAGATAATTTAGAATTAAGCCAAAATGATATTTATTATGCAAGAATGAAGCAAAAAATCATCGCAGAATTTAGTGAAGTGGATACTTGTGCGGGTGAATTTGAAGCCTTAACTCCTTATCTTTATTCAAGTATCAATGTAAGCGAACTCACTCAAAGTAAAAACGATGCTAAGGATAAAAAAGAAAAAAAAGTGATGATTATAGGTGGGGGGCCAAACCGTATAGGACA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88 | Campylobacter_phage(46.15%) | protease,terminase,integrase,tRNA,capsid,plate,transposase,tail | attL 266807:266826|attR 295369:295388 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1246733 : 1294731
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022351|1246733:1294731|DBSCAN-SWA 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64 | Campylobacter_phage(94.64%) | head,protease,terminase,integrase,tRNA,portal,capsid,tail | attL 1256360:1256377|attR 1271459:1271476 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1436111 : 1442747
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022351|1436111:1442747|DBSCAN-SWA TTCAATTATTGATTAGAAAATGATAATAATCCTCAGGCACACCAATATCTATAAAATAATCATCAAAAATACAAGCCCTAGCCTTTAGTTTTTTATAATTTTCTTGTAAAAACTCTTCAAAAGAAAATTTTTCCTGCAAAGCAAAATCATTAAAAATATCTTTAGTTAAAAGATAAATTCCACCATTGATTAAACCTTGCTTTTTAAATACCTTTTCCTCAAAAGAAATTACAAGATCTTGTTCATCAACATTTACTGTGCCGTATCTATCAAAATCATTCATTTGTTTTAAAGCAAGACAAATTTTACTTTCATTTAGCTTTAATTTACTTAAATCTATGTCAAAAAAAGTATCACCATTTAAAACATAAGCTTCATTTTTTACAAATTTCAAAGTCTCTTTTATGGCTCCGCCTGTTCCTAGAGGCTCTTTTTCGATGCTGTATTTTATTTTTATACCTAAAAACTCATCTTTAAAATACTCTTTTATCACTTCATATTTGTATGATACTGCTAAAATTACTTCTTTTATACCTTGCTTTTTAAGATACTCAAAAATAAATTCTAAAAAAGGCTTATCATTTATCGGTGCCATAGGCTTTGGAATGTCTTTTATAATACTTTTAAGTCTTGTTCCTAAGCCGCCACAAAGTATTATTGCTTGCAAGAAAAACCTTTACCAAAAAGCTCTTCTTCGACAATAGCACAAATAATATGTCCTATTAAAATATGCGCTTCTTGAATTCTTGGCGTGCAAGTTGAAGGCACTTTTATACAATAATCACAAAGTTCATTCATAGCCCCGCCACTAGCTCCACTTAAGCCTATACTTATGATTTCTTTTTGTTTGCAAAACTCTAAAGCTTTTAAGATATTTTTACTATTTCCACTTGTTGAAATGCCTATAAAAACATCTCCCTTAACACCTTGAGCTTGCACTTGTCTAGCAAACAAATTTTCATAACCATAGTCATTACCAATAGCTGTTAATATGCTAGTATCTGTAGTAAGTGCAATACTTGCGATACCGGGTCTATCAAAATAAAACCTACTTACAAATTCCCCTGCAATATGCTGTGCATCTGCAGCACTGCCACCATTTCCTGCTAATAAAGTTTTGTTACCATTTTTATAAGCTTTTATGACTTCTAATGAAGCATTTTTAATAAGAGTTATCAAATTCTCATCTTTTAAAATTTGTTCTTTTACTAAAATAGAATCTGCAAAATGTCCTTTTATATAGGAATTTAAATTCTCCATGATTTAACCCCCTCTTTTGTAAATGAAAAATCTTGCACATAACCTTGCTCTTTTCTTAAAGCTTTGATTAAGTTGTATTTTTTAGTAGGATCTACGAAGAAAAACATAAATCCACCAGCTCCTGCTCCGCTGGTTTTGCCACTATAGGCTCCGTTATCTATAGCAAGTTTATAAATTCTTTCAAGCTCATCATTACTAACGATTTCTGAAATGATTTTTTTTGACCGCCAAGATTTTCCTAAAATTTGCGCCAAAGTACCAAAATCGGCTCTAAATAAAGCTTCTTTCATCTTTATAGCATCTTGTTTTATCGCGTGCATGGCTTCTAAAGATTTTTCATCTCCAAGCTTTCCTTTTTTATGCTCTTCTATATCTTTTGCTTCTCTTGTGATATTTGTAAAATAAAGCACAGTTCTAGCTTCAAGCTCACTAGCTATCCAGTTTTTAATACGCAAAGGATTAACAATGACTCTTTTATTGTTATAAAATTCCATAAAATTAAAACCACCAAAAGTTGCGGCGTATTGATCTTGTGCTCCACCTACTATGCCTAAATCTTCTCTTTCTATCTCGTAAGCAAGTTTAGCGATTTCATATTCTCCTAAAGGTAGATTAAGCCATTCTGCAAAGGCTTTTATAACCCCTACAACCAAAGTTGAGCTTCCGCCCAAGCCACTACCACTTGGTACATCCGAATAGGTATGCAAAGAAAAACTCAAAGGTTTTTTTGTAAAATCTTTTACAATGCGATTATAAATACTTTTAAAAATATCTAATTTTCCATCATTTCCTAAGAATTCTTTACTTTCGTACTCACAGTAAGAATTTGTATCAGGAGAATCAAAAATGATTTTTCCATCTTCTCTTTTGATCAAAGTACAATGTATGTATAAAGATATAGTCGCATTTAAAACATAACCTGTATATTTATCACAATATAAATTTATATCAGTCCCACCACCTGCTAGACCGAGACGAAGAGGAGTTTGTGTGCGTATGGTTTTCATAAATCTCCTAATTTATTTATCATATCCAATCAAGTAAAATATTTTGAATATTACATTTATTAATCAATTGCTTTAACTCCCCTATCTTTTTCTCTGAATCATCAAACATATATTCATGTGTTTCACAAGCAATATAATCAATTTTTTTATATATTTTTTTTTCAATAATTTTTTTCATTATCTCAAACTCCATTCCTTCAATATCAAGTTTTAGAAAATAAATCCTTTTATGTTGTGTTAAAATTTCATTTTCGATAAACTCGCATAAATCAATTACTTGAACTTTATATGTTTTTTCCGTCTGACTGTCTTGTACACTTTCAACTATACGATTGCCTTGAGATAGTATCCTATTTCCAAACATAATAAAATCTGTTTCATAATTTCTGTCCGATACTGCTTTTTGAAAAAGTTTTACATTTATATTATTTTCATATTTTTTTCTTAAAAAATAATTTAAATAAATATTTGGCTCAAAGATATAACTTTGCCCGCCACAATGTAAAATAATATCAGTAATTAAGCCTGCATGTCCACCACAATCAATACATACTGGACGATATCCATCCCCCCCCCCATATTTATCGACATAAAGCATCTTGTAAAAAATATCATAATATTGTTTTGGAATTCTGGCATTATCTAATAACAAATTTAATCTACCAAGCCCTTGTGGATCGGCTATAGCACCCTGAATTAAATGCAATGCATTATAAACATTTTCTTGCTTATTCCAATGGTTTAATACTTGCAACTCTGAAATTATCCTTTCTACATCAGCTATTGGTTTCCTAGCTTGCTGATGATTATCAATTTGATAAATCAAGCCATTTAGAGCCTCTTTTAATACTTCCAATTGTTCTTTTTTCATTATTTATCTCCTTTAATTTTAATTAAAATTTGCAAAGCGATTAACTTTCATCATTTTAAACGCTCTTAAAAGCTCTTTAATACCATCTTCTAAAGTATTATCTGGTTTCCAACCTGTAGCCTCTAATTTAGTATTTGAAACCAAATAATCTCTTTTATCTGGATCTTCACCTATGTTGGCTGAATGGATATAAAAATCAGGAATATACTTTTTAATTGTTTCAGCAAGCTGTCTTTTGGTCAAATTTGCAGAACTTAATCCCATGTTATAAGCCTGACCCTTCATCTTATCATAATTCTCAATTCCATGAATAAATCCTTTAACCACATCGCGAACATGAATATAATTGCGTCTAAAATGCTCTTCAAAAAGCACTATAAATTTATCTCTATATGCACGATAAGTAAAATCATTAACAAGTAAATCAAGTCTCATTCTAGGTGAAATTCCAAAAACAGTAGCTAAACGAAAAGTCACACAATTTCCTTTATCGAGCAAATATTGCTCCGCATGCACTTTATCGATCCCATATTCTGAGATAGGACGCAAGGGAGATTCTTCAGTACACATTGCATCTTTTTCTCCTATACCATAACCGCTGTTTGTATTGGGATAAATAAATATTTGAGAAGGACTTGCAAAATCACTTATCATTTTTACGGCTTCATAATTGATCATTTTAGCTAATTTTGGATTTCTTTTACAAAGTGGAGCTCCAACTAAAGCAGCTAGAGGAATAATAATATCAGCTTTTGCTACCTCTTGCCTAATAAGATTTTCATCCATAGCATCACCATTTATAAAAGTAAAATTTTTATTATGAAAACAAGATAAAAGAGAAATTTGATCAAACATCAAATTATCAATCACACAAACTTCATAACCTTTTTCAAGTAAAATCGGCGTTAAAACCGAACCTATATAACCTGCACCACCTGTAATTAAAACTTTTTTTGACATACTTTTCCTTTCGTCTTTGAAAATCAATTTTGTGTTTTATACCATTCATACATCATTTTAATACCATCTTTAAGTTCAATTTTATGCTTCCAACCTAAAGAATGAATTTTTGAGCAATCCATAAGTCTATCCATTGTGCTATCCGGTCTAGAAGTATTGAAAACTAGTTCTCCGCTAAACCCAACTATATTTTTTACCATCAAAGCAACTTCTTTGATTGAATAGTCAATACCTGTCCCTATATTAATATGGGTATTTTTACTTTTTCTATCTTTAATAAGATCTTTAAAATCAATATTTTGCATCGTATAGATAGCTACATCGGCTAGATCGTCACTATGAATAAATTCTCTCCTAACTTTTCCAGTGCCCCAAATTTCTACACTTTTTTTACTAATTCCAAAATTATGCAAATATTCTTTTGCTTCTTCAAAATTATTCATTTTCAAATCTTGAAGGATTTGAGTTATATTACCCTCGCTTAACAATTTTGCTAAATGAAATTTTCTAAGCAATGCGGGTAAGACTCTTGATTTTCCAAAATCAAAATTTGCTTTAGTTCCGTAAAGATTATTTAAAACAAGAGTAATGAAATTAGTACCATATTGAATATTATAACTTTCACACATTATAGCTCCAGCTATTTTGGCTGCACCAAAAGAATAAGCGCCATATTCTAAATCACCTTGAAATAAATATTCCTCTTTCAATGGGTTTTTAGCATTCTCAGGATACATATACCCAGAACCAAAAAATACCAATTTTTTAACATTATTAAGAAATGAATTGTGAATAACATTGTTTTGAATCATCAAATTTTCATAAATAAAATCAGCCCTTTGAGCGACATTTGCAGCACCACAAGGTAAGACTGCAGTCAAAAAAACATATTCTGGCTTTTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022351|1436111:1442747|1436764_1437370_-|WP_002857991.1|DBSCAN-SWA MENLNSYIKGHFADSILVKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSKNILKALEFCKQKEIISIGLSGASGGAMNELCDYCIKVPSTCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFSCKQ >NC_022351|1436111:1442747|1440231_1441272_-|WP_002864205.1|DBSCAN-SWA MQTNSKIYIAGHKGTAGTALVENLQKRGFNNLVLKTRQELDLVNQQAVAKFFKEEKPEYVFLTAVLPCGAANVAQRADFIYENLMIQNNVIHNSFLNNVKKLVFFGSGYMYPENAKNPLKEEYLFQGDLEYGAYSFGAAKIAGAIMCESYNIQYGTNFITLVLNNLYGTKANFDFGKSRVLPALLRKFHLAKLLSEGNITQILQDLKMNNFEEAKEYLHNFGISKKSVEIWGTGKVRREFIHSDDLADVAIYTMQNIDFKDLIKDRKSKNTHINIGTGIDYSIKEVALMVKNIVGFSGELVFNTSRPDSTMDRLMDCSKIHSLGWKHKIELKDGIKMMYEWYKTQN >NC_022351|1436111:1442747|1439266_1440208_-|WP_002858299.1|DBSCAN-SWA MSKKVLITGGAGYIGSVLTPILLEKGYEVCVIDNLMFDQISLLSCFHNKNFTFINGDAMDENLIRQEVAKADIIIPLAALVGAPLCKRNPKLAKMINYEAVKMISDFASPSQIFIYPNTNSGYGIGEKDAMCTEESPLRPISEYGIDKVHAEQYLLDKGNCVTFRLATVFGISPRMRLDLLVNDFTYRAYRDKFIVLFEEHFRRNYIHVRDVVKGFIHGIENYDKMKGQAYNMGLSSANLTKRQLAETIKKYIPDFYIHSANIGEDPDKRDYLVSNTKLEATGWKPDNTLEDGIKELLRAFKMMKVNRFANFN >NC_022351|1436111:1442747|1436111_1436777_-|WP_002857908.1|DBSCAN-SWA MQAIILCGGLGTRLKSIIKDIPKPMAPINDKPFLEFIFEYLKKQGIKEVILAVSYKYEVIKEYFKDEFLGIKIKYSIEKEPLGTGGAIKETLKFVKNEAYVLNGDTFFDIDLSKLKLNESKICLALKQMNDFDRYGTVNVDEQDLVISFEEKVFKKQGLINGGIYLLTKDIFNDFALQEKFSFEEFLQENYKKLKARACIFDDYFIDIGVPEDYYHFLINN >NC_022351|1436111:1442747|1442201_1442747_-|WP_002858190.1|DBSCAN-SWA MAIEFDIQESKILKGVYIITPNKFRDLRGEIWTAFTDEYLSKLVPDGIKFKHDKFINSHFNVLRGIHGDVKTYKLVTCVYGEVHQVVVDCRKDSPTYLKWEKFIISYKNQQLILLPPNMGNSHYVSSKEAVYYYKLAYEGEYMDAPDQFTYAWNDERIGIDWPTNTPILSDRDILATKNKG >NC_022351|1436111:1442747|1437357_1438377_-|WP_002858413.1|DBSCAN-SWA MKTIRTQTPLRLGLAGGGTDINLYCDKYTGYVLNATISLYIHCTLIKREDGKIIFDSPDTNSYCEYESKEFLGNDGKLDIFKSIYNRIVKDFTKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGVIKAFAEWLNLPLGEYEIAKLAYEIEREDLGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYNNKRVIVNPLRIKNWIASELEARTVLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLEAMHAIKQDAIKMKEALFRADFGTLAQILGKSWRSKKIISEIVSNDELERIYKLAIDNGAYSGKTSGAGAGGFMFFFVDPTKKYNLIKALRKEQGYVQDFSFTKEGVKSWRI >NC_022351|1436111:1442747|1441271_1442198_-|WP_002864204.1|DBSCAN-SWA MEKLLKELNNNIKLSNQLSYQILMSNIISNLDIDKKDKEILLLLLQARDRNYIRINNNEQCYQNIINYLNLIRPLELPLCDLLRIGGNGDGGYVMYNGGGDMSDINAKALSLGVSDSSPWDLEMAQRGFKVIEYDASIEKCPYDHENIVFHKKFIGNVNNENTITLVQALKDNNLDENKPNILQCDIENCEWDMLENIDISILNKYFSQVIFEFHGCNPEEQDGVEKRISLLKKLNEYFVPMHTHFHNHGKIFYSQGLFFSTTLEVSYLRKNLINLDIMKYRDVAGGFKNLDFPWISNPEIPIRFRGY >NC_022351|1436111:1442747|1438396_1439248_-|WP_002857889.1|DBSCAN-SWA MKKEQLEVLKEALNGLIYQIDNHQQARKPIADVERIISELQVLNHWNKQENVYNALHLIQGAIADPQGLGRLNLLLDNARIPKQYYDIFYKMLYVDKYGGGDGYRPVCIDCGGHAGLITDIILHCGGQSYIFEPNIYLNYFLRKKYENNINVKLFQKAVSDRNYETDFIMFGNRILSQGNRIVESVQDSQTEKTYKVQVIDLCEFIENEILTQHKRIYFLKLDIEGMEFEIMKKIIEKKIYKKIDYIACETHEYMFDDSEKKIGELKQLINKCNIQNILLDWI |
8 | Tupanvirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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