Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009887 | Cellulophaga baltica NN016038 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,WYL,DEDDh,RT | 0 | 0 | 1 | 0 |
1. NZ_CP009887
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009887_1 | 2740659-2740801 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009887_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009887_1
>1.1|2740704|53|NZ_CP009887|CRISPRCasFinder GTTGTGAATTCTTAATATTGTGAATCTTATGCGTTTTAAAAAGAAGGGAGAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009887_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009887_1 >merge|NZ_CP009887|1|2740659-2740801|CRISPRCasFinder AGACCACAACATCTCTCTCCCTTACACACATAACCACTAACCAAAGTTGTGAATTCTTAATATTGTGAATCTTATGCGTTTTAAAAAGAAGGGAGAGGAGACCACAACATCTCTCTCCCTTACACACATAACCACTAACCAAA >NZ_CP009887|1|1|2740659-2740801|CRISPRCasFinder AGACCACAACATCTCTCTCCCTTACACACATAACCACTAACCAAA GTTGTGAATTCTTAATATTGTGAATCTTATGCGTTTTAAAAAGAAGGGAGAGG AGACCACAACATCTCTCTCCCTTACACACATAACCACTAACCAAA
>NZ_CP009887.1|WP_025614718.1|2739009_2740548_+|cellulase-family-glycosylhydrolase MAFKLNKTLYRTVIIASFIAVNALIISGIGSAWVFLNTGADRTSMLHLEVPMDEVYRPEIAWSNVDNPGRPIEEQTLGEITNDYLNAWHVRNIAFKKNDYYGIKDFYTDSARVRLYDNIDLNLKNNNWYKRTTLKHNGAIDFYSVDGTMVVFKDHNVVEYQEIYTGEELLYKEKDTTSYHVMMLLEDGFWRIRHLKEIENSRDTTTLAARDIDAELKKIENLKGINYYPKDTPWDTFGKRFDATVINEDFKIIHDMGLNGIRIFVQYEDFGKSTVKKDKIALLIKVLDLAEENKLDVILTLFDFYGDYDVSNWTLTNRHAEAIVHAVKDHPALLAWDLKNEPDLDLASRGRERVIGWLEQMMENIKLWDRNHPVTIGWSSPEAAVELVDQVDFVSYHYYRELSDFNKTYDILKKKALNKPIMLQEYGLSSYGGIWNFYRGSDKRQAEYYAEIQPLLLEKNIPFVAWTLYDFSEVPTAVVGKLPWRKSKQYHFGFLTKRGKKKAAYEHFALQK >NZ_CP009887.1|WP_025614717.1|2737823_2739020_+|hypothetical-protein MLGCSSKKEEPKKSAQINAIALTKKDRYTAGDAITMAFKTEAPIENFKLHIKNAYGTLLVAPEMVHGEMVFSFPTNFSRKSGLCRWKLINEGQTLLKGEIEIHPNEQKGTNMATYFGPRSITAGDIDYSMLVIAPTDVFDNPVARGTEVTVKSQFLASINEYKVATTELMAWYNVRSTHKSGRILVTAACNATPSKELTTIVFPSNSTSFKITAFQDHDYADGNQILKLRSDIIKDEFGNTVSDGTLVTFIIKNDKDAYLYTVGTTINGIVEGRTLHPSQAAHWNIQAFITGASESNTIDVTFRTAIEDYKVYFSKGNRNIDIGPLESFMKQLVPDGILVQMDVYSEHGDFIETKKTTTKKGVCNFYLSPEYLENGTYKLVIRAAGITKEFKKEMNGI >NZ_CP009887.1|WP_025614716.1|2734696_2737786_+|membrane-protein MKKKTNTLLILALIVGLAFHGSAIFFTLESTYDALIHLFFADHYADSWFDPWEYRWYTGFTVQSYPPLVHQVIGILSYIGGLKFGMYTVALLAIVLFITGVYRYTLLMTGSRRIAGYGAVLAVFSSTFVETLHIFGQLPSITALSILLHSMTEIYLWIKTGKIRYFLTSVTMLAVTVTSHHVTPIFGMVFFIAPLIGMAVMDASRERVNSYKELTFKIFWNTTLKHFWRIAKFGGTSLFLIVFCIFPYWYNSKRNPITQVAIPHGSRDNFLEITSSGLVFFVIPWGIFLFVLPYFFYRYFSKRYIFFGLSFALLTILGTGGTTPIPLMMLGETAFNILTLDRFTLWATIMALPIFAEFAYRMVEGDLKVLVQEKFGEVYHRVIGGLIAGGMLFMVLFTMTLGYFRPSQPAKINMLPIVNFLGADSHDSWRYLPLGFGDQMAWLSAQTTAMTVDGNYHSARRLPELTTRAIERIENSKFRGVEGIGSLQQFLTVPEKYNLKYIFSNDKFYDPILYYCGWQRLQQLENGIMVWEKLNVPPIPQIIPKEDVPTIMKIMWGIIPLTTVLLAFIINIQLIWVRLLKSKKLEPPSFMKLELPYNKFSYKLLIFSHFWAFIVLICLGYGIYLFYVKNVAQLSANNVVEAYYDALDFKEFNRAHSYLDPDSNIDIAQYMLEVSVTDGILSSYAKMDSLHVEIYDETPTSAKAKVHTRWITPLENLYSSDYHELVKRKSKWYIKPSKFDNDIPPDQLFTANGTTFYNHGRRKITTQETYHEDVLKQPVLEILSAKLVKNRGQFSIIGEIQNVDNVPADVVIKATLYNDANKELANYNAKYHMKHKLMPKETTVFKINFEGIAWSSTKDTLPPTFDPDQFTPMNFEDQPTNFNLQSAGNVANTDLYKGVALQDMEYTDQGFNGVLFNAGVQEVTIPQLIISYYNKENELLWVDHSFVPEGVRIQRKQFFNYKPLELDSLEVIRSDLKNCFVNGMPNASIAEKVFPNRNYSHGASQTQPFSGVGFEFIKFEINSYIGNPK >NZ_CP009887.1|WP_025614715.1|2733252_2734392_-|response-regulator MKILAIDDQLLILMSLEKRLIELGYQVKTADSGEKGIDIFKTFQPDLVIVDINMPGLSGLDVVKHIRLEEKSKTPIVVMSGNTDEKIIVDGFDLGIDDYMKKPVSLSEVAARVKRIIGTPAESNTEGAKSEGQMLQQYCVGVVIPCYNEEERLSGEAFKNFVYNNLGYHLCFVNDGSTDSTLEVLEELRKGNENKISVYNCEKNGGKAEAVRQGMLHLAKDPQLDYIGYLDADLSTDFRDFDDLVKTMETSDFKIVSGSRMSRMGANITKESARKIISMTINLIIRSILKMPFNDTQCGAKIMDKELVELVFQKKFITRWLFDVEIFMRMRKHYGKEKVQSMICEQPLKRWIHADGSKLSMKDSIQIVGQLAKIAIHYK >NZ_CP009887.1|WP_025614714.1|2732170_2733079_-|J-domain-containing-protein MEFIDYYKVLGISKNATEGDIKKAYRKLARKHHPDLNPDNEEAEKNFKKINEANEVLSNKEKRKKYDQYGKDWQHADEFEKQKQQQRQHSRQNPGGAGGFNGGQSNEDFSDFFESMFGGQQGNFNSSRQNARFRGQDYNASLTLNLTDTLTTEKQTLTVNNKKIRITIPAGIEDEQTIKIAGYGGLGVNNGPAGNLFIKFTVQNNTDFTREGANLYKTIEVPLTKAILGGDITIDTLTGKVKLKVKPETQNGTKVKLSGKGLPKYKKENQFGDLYITYQVKIPTHLTKEQKELFEALAATNL >NZ_CP009887.1|WP_024480207.1|2731866_2732160_-|chaperone-modulator-CbpM MDTQLIHLNDFCTSYEIEITFITELYNYDIIELKSVDDHQFIPLEELPKVEKMVRLHQDLNINIEGLEAVHQLLERNSAMQEELRLLKQKLNRLDAI >NZ_CP009887.1|WP_025614713.1|2731644_2731860_+|hypothetical-protein MKKVHQVLTAISQLIKTIETDYPELYQFLDENPVTIPSEKHPDLDKDTLEGYLADLNSLLEHHIKNHTKAK >NZ_CP009887.1|WP_025614712.1|2730951_2731629_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDLVLETKKINKHFLKPKDFHVLKDISFGIEKGEFTSIMGKSGSGKSTLLYILSTMDTEYTGELYLNNELITGKNQKELSQIRNKYVGFVFQFHYLLSEFTVLENVMLPAKKLAEKSHQEIEYIAMEKLKMLDIEKLALQRASRISGGEKQRVAIARALINNPVLLMGDEPTGNLDSRNADNVFNIFKQLKEEEDLSLLIVTHDEDFAHKTDRIIQMEDGRIITS >NZ_CP009887.1|WP_025614711.1|2729680_2730943_+|ABC-transporter-permease MTNWPVILNIAKTHLLTKLKSTLTAALGVTFGIGAYITLVSFMTGLNAMLDDLILNQTPHIHLYNEIKPSEKQPVALYDEFQQSFQFVHSIKPKQHQKKLHNALPILSYLKKDKKIKGVTPQARAQIFYISGSIEIGGSLIGVSIMDEIRLSNIRDNIIQGLPEDLENNDTGILLGSGLAKKMSLKIGDRVQVSTVKGDLFPLKIVGLYQSGVAEVDNSQSFVNLKTVQRILGETQNYITDINIKLNDIEDASAYSKQLASLFSITATSINEANAQFETGTNIRNLITYAVSITLLIVAGFGIYNILNMLIYEKMKDIAILKALGFSGTDVQLIFMSQAMIIGLVGGLLGLLVGFGFSVLIDHTSFKTEALPTIDTYPVDFSLSYYVIGIVFALLSTFIAGYLPANKARKIDPVKIIRGT >NZ_CP009887.1|WP_025614710.1|2728604_2729681_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKIVFLLSTLLCISCGSKQERTLPIVKKLTESVYASVTIQPDSLYEAYAIVNGILERNFVEEGALVHKNTPLAHITNSSSALNAENARLSLQLTASNYQGNSTVLKELQEDIETARLTFTNDSINYKRQENLWRQHIGSKIAYETRKLAYQRSKNQLNVLDNKFNRTKKELQTQVKQAQNTYKNSQITTGEYTVTSKINGKVYALYKNRGEIVTTMEALALVGSTSNFVIELLVDEVDIVKIEKGQKALVSLDAYADRVFEAVVTKIYPQKDSRSQTFKVEALFIKTPEKLYPGLSGEGNIVIYEKSDALIVPKEYIVNGNSVVTDDGLKTVEIGLQNLNEVEITKGITTTTELLKPE >NZ_CP009887.1|WP_025614719.1|2740894_2742106_-|glycosyltransferase MKLAIVTAYPPSKVTLTEYGYHLVKHFRLQDQVTELVLICDKTEGKKDLAFTENGCKITVKECWSFNSYGNIFSINKALNQTKPDAVLFNLQFLKFGDKKIPAALGLLLPAICKFKGIPTISLLHNILEQVDLESAGFTENKVLQKIYNFIGTTLTRFVLASDVVAVTISKYVTILEKKYKAKNIALIPHGAFETPPTPTYDLPAGPKQVMAFGKFGTYKKVEVLIEAVELIRKRTQEDIEIVIAGTDSPNTPGYLDSMKEKYNTVPQIRFTGYVAEEDVEKIFKDSAVVVFPYTSTTGSSGVLHQAGSYGNAVALPDLGDLSILVKEEGYRGEFFDADNTGSLADAIQNIITNDTYRRSLGHTNYTAACSLPMSTIAAMYLDHFNTIIEKKSPVPKLQEEQA >NZ_CP009887.1|WP_025614720.1|2742235_2743474_-|sugar-isomerase MLTIKLLLKKITPEQLFMGSVLLVNGGNYIYNLLLGRLLGPAAFAEAALLITLLLVLSFVGMTFQLATAKFAVLFSGDQWSSFKNRSYKHATIFGIIAGILIILFSKNLQELFHTKSHWMFILFGIGVPLYFFMSVNRGNYQGNQDFKNLSITYQTEMWSRLLITLALLLFVPLESSFLVALGIGISFIFGLIPSDLKGLSFSSKTKLLPENAKRVTKFMVLTACYEFTQIIINNSDILLVKHYFDALDAGLYASLALIGRVVYFVAWMFVMLLLPTVVQKQKDGEPTAPILFKYVGYIGLLSAVIVTACYLMPEFIITVMFGDAYISMAGLLWQYALATSLFAIGNIFAYYFLSLDHYVPVILSGLLGMSQIALVVFYHDTLEVVVHVQIIAMALLLAVQIIYFLLKKSKL >NZ_CP009887.1|WP_025614721.1|2743819_2745889_+|tetratricopeptide-repeat-protein MRKFILFIYLFSAHLIWAQEDNITQGFQLLETGKFEEAETFFKSYLESNPDNKTAKLCYGRAVGLSGEPKLANTIFKGLLEEYPGDFEIQINYNESFLWDREFVAAKPLYKKLVAENPDNFGAVLGYANTLSNLKEYPQALEMVNRAIAIQPENGSAKVSRKFIKLGYANTFVNNQEYKKGIAYLNEIFTDFPEDKDALLNLANIYLIIKETANAKAIYARLATSEKDSITALNGIALAEHIGENDKEALRIAGQAKEKVASIDDEALKETTYDRYVQALIWNNKYKDAKEEITLLEEQYPEKNWIAALKATRGMYTADFKTSLSNYDMILSRDRTSFDGNLGKANALFASDRIIPAYNAAFQTLKIFDKQKDALGFIEKLNLKFTPSVEEHIAYTFDNGNNEAFSSTTNFHVPINTKLITTLNYQYRTTDNSVTMHEASSHVLMAGIEYKLMPKTNLKASLGINSSNFTADSYTQPVFDIKLQTQPFRLQSLDLGYKREVQSFNAELIEREIVMNHYGLNYNMGTNFKLGWYTQLMHTRQTDDNIRNLLFTSLYYNVFKKPAFKVGVNFQYITFQDQLPTIYFSPETYQAFELFGDLRGNFSEKTTYMISAASGLQKVEDDAQTVIFRAEVGVKHQFNTRWSAEVYGKYSNIASATAAGFEFTEIGLKVKWLFLKEPFYFKKLKKSNE >NZ_CP009887.1|WP_025614722.1|2746064_2746778_-|response-regulator-transcription-factor MNCIIVDDEGAARMIVEQLCSKIPELDVIDSFSNAMDAMKFLNQQTVDVVFLDIHMPGFTGIDFVQTLKNPPRIVLTTSDTNFAIEAYEYEAIVDYLVKPITQDRFEKSIVKIKTALEKSKAPAPVTTKAASNAEDDIYINIDRRLIKLKLNEILVVEAKGDYIEVKTTTKNYRVHNTLKSIKDKLPENMFLQIHRSYIINFTKIIDIEDNSVLIEKSVIPISRSNRPELMRRLNLL >NZ_CP009887.1|WP_024480217.1|2746781_2747102_-|hypothetical-protein MEQQPNLNYIKDLSGDDSAFEEKFIAVLKEEIPLEKEEYIRCITAENYKDTASIVHKLKHKLNILSLTEDYKLAVIYEEDLKKGDSSLNDKFLIILNKIDVYIKNL >NZ_CP009887.1|WP_025614723.1|2747103_2748165_-|GHKL-domain-containing-protein MHSLLKRQIRKHLPENLKDSEDLAAFLDAINNSYKDYDDKAEMVQRAMSISSIELTQANKDLRAESGSQRKILNILEKAIRVLNDAGNTEPEENSSMEFLEVDALELAAKIEKQAKDIVKMTAEKNTMMKNLERQNASLNDYAHMVSHDLKSPIRNINALMCWIMEDEKEKFTSNSVNNCNLVSQNLQKMDALIDGILRHAVIDSLEEEQIHLNLNHLIDEITKTVFIPEHIKVRIVGQLPTFLTEKYKIEQLFKNLITNSITATEQVVHGEIIIKHLEDTNFWKFSVSDNGKGIAKKHQESIFNMFKKLENDSNASGIGLALVKKVVNIYEGDIWLESEEGKGTTIYFTLKK >NZ_CP009887.1|WP_024480219.1|2748164_2749295_-|FIST-C-terminal-domain-containing-protein MKTIQAIKHKDQAWKFMSEKTTFKNPLVLVFGNRFLLESPSLYEEINTMFPDGNIVFGSTSGEILGENVFDDSIVITAIEFENSTYVIHSENITNFNSDSEQLGAKLSRKFTKEGLKHLFIVSEGSLINGSALIKGLEQHTGTSTITGGLCGDGALFEKTLASHNENPKKGEVIAIGLYGAQLEVTCANYGGWSAFGPERIISKSKDNVLYELDGQPALDLYKKYLGDKANELPQAALLYPLSLRVKDSTEVVVRTILNIDEKANTMILAGDVPEGSTVQLMMSTVDDIAEGAAKAGMYAMRSRTKKPDLALLVSCIGRKLVMNQRTEEEIEEVIEAIGKQAVVAGFYSYGELSPFSNQLGCKLHNQTMTLTLISE >NZ_CP009887.1|WP_025614724.1|2749299_2751651_-|PAS-domain-containing-sensor-histidine-kinase MDNKEITLLKRALDRQVKARKQAESILEAKSKELYDTTRHLQEVNSRLENLLSEKSSELNEIFVNIVDPYVVMDLMGNIIKMNDAAREFLGCGPDEEVDLSSYVHKDYIEYTYNSFKSLVEVGTIKNYRPKLVLKDGTIRTVEVNGSIIYDENRVPVGAQGIIRDISQESEIKELLGNQRKQLDIIVENSPLGIILTDNEHIIKANNAIVNLLGYSIEELKKQSLDAISSSEHTTESQKLMQKMDDGELENFSVVRTFIKKNGKQLFTKTAVSAVKNQQGEIDYKVIILEDITKELEAEEQLKASENRLSSLIANLHTGILVEDEDRNVVLANKMFCALFEIEAPPHRLVGINCENAMSGNEHLFKNPDFEVSRINKIIQKKDLVLSDEVEMADGKTLQRDFIPIFNKGVYNGHLWTYTDVTISKNYKRNLEVQKEKYSSIIANMNLGLLEVNLDEIIQTVNQSFCSMSGYTEKELLGNKATDLIKITDTNTLNSKSEKRLKGESDSYEVEVLQKDGTTRHWLISGAPRYNDSGKVIGSLGIHLDITAQKQLELQKEALVKELEKSNVGLQEYAHIVSHDLKSPLRSISALCTWLNEDYQDKLDDNGKYNLSMMQEKVEAMDSLIDGILKYSTINSDNIENSSVDVNEVIKEITDIIYIPEHVKVVVTSTLPTIYADRTKVHQLIQNFLSNAVVHIEREKGLVEIGCIETKTHWQFSVKDNGVGIPKEYHEKIFKIFQSVGNKERSTGIGLSIVKKIIDLYEGQVWLESEIGEGTTFFFTLKK >NZ_CP009887.1|WP_024480221.1|2751643_2752186_-|heme-NO-binding-domain-containing-protein MKGVVFTEFLEMVELKFGLEVVDTIIENSNLPSEGIYTSVGTYSFNEMVSLITSLSDEVKAPMGDLIYAFGLYLFKGLGSSHPEVIENYSNPISLLYAIEDHIHVHVKKLYPDAELPTFKILDKSDNSISMVYSSSRGLYRLAHGLIEKTFEHFNGTATITYELLKEDGTEVKFDIVQNG >NZ_CP009887.1|WP_024480222.1|2752265_2752667_-|response-regulator MDVLFIEDDTIETMKLQRTVSKLQLKHNIIEAKNGEQALEILKSSTKLPDIILLDLNMPRMSGIEFLEIIKADANYKYLPTIVLTTSENRADLLECYRIGIAGYVIKPLKYEDYETKLKTVFEYWQTNELVKA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009887_2 | 3401855-3402005 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009887_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009887_2
>2.1|3401908|45|NZ_CP009887|CRISPRCasFinder GTTTTTTAGAGTAGGGGATTCACTTCGTGCATCCTTAGGTTTCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009887_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009887_2 >merge|NZ_CP009887|2|3401855-3402005|CRISPRCasFinder CACCTGACAATAAAGCTCAAATTGCTAGCGCAATATACGGGCTTTTTTATTTTGTTTTTTAGAGTAGGGGATTCACTTCGTGCATCCTTAGGTTTCCGCACCTGACAATAAAGCTCAAATTGCTAGCGCAATTTACGGGCTTTTTTATTTT >NZ_CP009887|2|2|3401855-3402005|CRISPRCasFinder CACCTGACAATAAAGCTCAAATTGCTAGCGCAATATACGGGCTTTTTTATTTT GTTTTTTAGAGTAGGGGATTCACTTCGTGCATCCTTAGGTTTCCG CACCTGACAATAAAGCTCAAATTGCTAGCGCAATTTACGGGCTTTTTTATTTT
>NZ_CP009887.1|WP_025615125.1|3401357_3401675_+|hypothetical-protein MKKFFKIFLVIHILLLSLSCEKEEEIKPTVNFTIFFQAECMSEMVFICVSEDEFMRIKKLHALDEGVDKSCFSITVTDLDGKKYEGILRGYSSTSEDIPCDQSVF >NZ_CP009887.1|WP_025615124.1|3398328_3401331_+|type-I-restriction-endonuclease-subunit-R MSLNEHTAQNAAIVWLQELGYNRIPGNALERDLKKVVLENELKKFLKTTYPNVPETARNEAFAQFTQHEGMEVAYRNQDFHRKLTQGIDIAWKDADGNEKAKHLYPIDYTHPENNSFIVSDEVSIVGKNSRRTDLIIFINGLPLIVFEFKNPFDSTVGVENAHRQLHNYVLDIPQLFDYNAICVASDGLEALHGMYSSALEWFAPWKSLDGDDTEQKAELQLETLLHGLFPKKTLLDYLQHFIFHEDHNGKIIKKGAKYHQYWGISRAVESSLENIKPNGDGRLGVIWHTQGSGKSISMAILTGILRQRTELKNPTIVIQVDRSDLDQQLYENFVLANDLVGGVQHAESTDDLRRLLSSDGGGVIFTTIEKFRLKDLENGKETQHPILSERYNLIVMADEAHRTQYGFESGGFAQNIRRALPNASFIGFTGTPVDGKDADTEQVFGPTIHTYDIKQAVEDGATVPIYYEPKMVPLNIKAKYTQELEEVEEQAEDTTVGVWAAVEDAAGSEDRVKTVAKDILTHFKERTKTLDGKAMVVCMSRRNCVKMYDALSTLDDCPEIAVIMTSSPGKDPVSWNTHMRTKDAMEAVKSRFKNPEDPLKMVIVRDMWLTGFDAPCAHTMYVDKIMKGHNLMQAIARVNRVFEGKPNGLVVDFIGISGFLAEATKKYTGSGGAGKPTLDLDAAVELCLEQLSIVKSLVGGFELDVINEMPATEKMKWTTSVLNGLLKDDATTEGYLKEERKLSELMAMTNSDERIWEIQEDVAIIQKFREQIRKIKYPPGAQRTKNDRIKDLISKSLESQAIVDLAAMYNLDKIDISIVDDSFQAIVKDKGGENIKIELLRRIINDELKVRMSKNIKKGRKLKDELEKVLGKYHKNSLDSIAAIKQLLDIANEMKEDDKRTKELGLTEDELAFYDLLSANSAILNEAGPVQDLVHTVVASVKKNLQLDWTKKENARAAIRLAVKKELRGKVPFSELDKLLKEVIEQAEGQYKDWPMLGA >NZ_CP009887.1|WP_025615123.1|3397057_3398332_+|restriction-endonuclease-subunit-S MPNNSKTYKLSELTTKIGSGATPRGGKDAYKDSGISLIRSQNVLDFSFSDNGLAFIDEQQAKKLKNVEIESRDILLNITGDSVARVCQVPDKWIPARVNQHVAIIRANKNILNSEFLLYSLLTNQNKDKLLTLSSAGATRNAITKSMIEDFEISIPALPEQHAIASILSAIDDKIENNLAMNKTLEEMAMALYKHWFVDFGPFQEGKFIDSELGEIPEGWEVKSLDEEFSITIGRTPPRKEPNWFSKISGIKWISIKDMGNSGTYIFNSSEYLTEEAIKKKNVPIIPSETVILSFKLTVGRVAITTEEMASNEAIAHLNRNKHTRIPNTYSYLYLKSFDYNSLASTSSIATAVNSKTIKGMKIIVPENHINESFDKEVLPLFNQIKNNSLETETLTKLRDTLLPKLISGEVRLKEFEKEITAAL >NZ_CP009887.1|WP_025615122.1|3396565_3397057_+|DUF2971-domain-containing-protein MCLTNNSHSHAYWNIYSPEGHGVRLRLRTSELFKLVSAKKEKSWFGRLNYEFEKDIKNHLKSTIGLQKSLDNKDPDNLFLNVFHKKRMPFMYENESRISILTNNEGKDGIYKLNFTPQKLISQLYLDPHMGNNEVKAWKEYLLKFNIPVTRSLLLKDQIHKIK >NZ_CP009887.1|WP_025615121.1|3394469_3396131_+|putative-DNA-binding-domain-containing-protein MDSFEHSQIDYKSLKKVMGKTADFSSLAETCVAFANAQGGEIIIGIEDKDSEPYKDQKVDVEIINKTVLRLRSLTDSVGIVNPEIITHSNGGQYFKFSIFPSSRTIATTSTGRVFVRVTDNSVPVSGEELTNLAAEKNAFQWELVSVAKIKINDADISQVTYFLEQIQNSKLVSDFIKEKSNEEILEHYQLISPEGHLTNLGVIWLGKSSQRARLSYPITVQYIVYNDLEEKIRKKDWHFHLHNPKELLLEIEKEAVELNYSIEIASGLYRKQLRNYPKEVIRELLINAIAHKRFTISGDIFIEVYPDRMVISNPGGLPLGVSANNILHERHRRNPHFIQTLHDLGLMEGEGSGYDLIFEKLVREIKPLPTIESTLNKTSVTIYSGITNKEALEILDYVSNHFSLSQKEYIVLGIVASHKKILSTQLSQKLQLNNEDRLRTWLGNLLDKNVLTSRGIKKGTEYLLNPALFSQSKINIAPSLKTIDKEQLKHLILEYLKYNGERSKQEIHQHIQDVEIDDVQKCLYSLVQEDKLAISGANRNRKYTVIKKINRK >NZ_CP009887.1|WP_158399890.1|3393974_3394142_+|hypothetical-protein MNEVVIYESSEIQIQVEVVFDGETAWSTQNQLSNLLIKPSKTSACTLTTVLEKEN >NZ_CP009887.1|WP_025615120.1|3392323_3393913_+|SAM-dependent-DNA-methyltransferase MAKPTIKGDIDFEKELWDAANELRGAVSENNYKNYILPLVFLKHLSERFEVVQEEITNQFSEPSSSYYTKDEDEKKYVLSDPDEFRSRNTFMIPETASWQYFKDNAEQDNIKVIIDDAFDVIQELLTAYNPQLNNLLPRIFVKSELSAKQTGGIINLLSHPKFSEKENPESDILGRIYEYYIGRFAMAEGSGAGQFFTPGSIVRLLVEILEPYKGRIFDPACGSGGMFVQSLKFIKEHGGNKSDISIYGQEMTSQTLRLCLMNLLLRDLSFDIKLGNSLLDDKFPSLKADYVIANPPFNVSNWHSEDLPENDPRLFGPREEFTTDGSANYMWMQTFWNHLSDTGTAGIVMANGAMTSNTKGEKNVRQYMVDEGMIDCIVRMPDKLFLTTGIPACLFILSKNRDGKDGEHRKRMKEVLFIDAAKMGTMASRKLRVFEDADIDKIADTYHNWRTVDKTYEDVDGFCKAATLEEVQKQDYKLTPGIYVGTEAEEDDGIPFEVKMEELKATLLEQFEKGETLKKQILANFDKL >NZ_CP009887.1|WP_025615119.1|3391402_3391816_+|virulence-RhuM-family-protein MNKGEIILYNDKPNVEIRLENNTIWLNQKQMAELFDKDSDTIGLHLKNIYTTKELNKNATTEKYSVVQIEGKREVNRKVLFYNLDAIISVGYRVNSKRGTQFRIWANSILKDYLVQGYAIMYSLYNMLTMNRLKYAF >NZ_CP009887.1|WP_025615118.1|3390654_3390852_+|hypothetical-protein MERVDRKIIQLLSKGYRTPEISNHFIEKGIAPSSVSSVEKRIKAIKKVYGAKTLFHLAVLVTKSK >NZ_CP009887.1|WP_025615117.1|3389780_3390290_-|RNA-polymerase-sigma-factor 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
2892616 : 2923805
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009887|2892616:2923805|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009887|2892616:2923805|2913997_2915416_-|WP_148307514.1|DBSCAN-SWA MKKDLAVFKEIRQKVNSGLYKYRTKEQIDSIYNWAENEIENLITYREFYNLIITLTDFEGSSHNGTSIPDKKWQNLRKEKSGYFPLPIKWIDEKWVVNFKNDEIPLGAEIISVNDIPMSNLIPELGKYYTTDGINLTGKRLGIRSHFPRYFRLKYGLQNDFKIVYSKHNSNKNEEIILKSVSYAKYYSNFKKIHSLPIDRIYYTTLKENQKYSFKQIDSLSGILKIHSFGMGNEASEEHIKYTKFLDSVFTQINKSNLKNLIVDVRQNGGGDDPNDLITYSYLTQRKFQENKKAWINFEKIPLLKYYNIGIPKFIRPLVVGKYNKELQEIFPLEKNGKYYQDENSDDHKIRLPNEKAFNGKIYLLISPAVGSAGSLFASMVAGNKNTTVIGEETTGGYYGHNGHTPLEYKLPKSKIVTQFSIVNLEQDVPEKANQFYNRGIIPDIEINQTYDDFLSNKDTQLNYILNLITSE >NZ_CP009887|2892616:2923805|2896701_2897298_-|WP_025614813.1|DBSCAN-SWA MGLKFDYKDGQTALDEEEKEGLKIKSITTQGELDEFEQLNIEKVVEWTIHTKFKPENILTEKFIKNLHKRMYGDVWKWAGEFRRTEKNIGISWIQIGVELKNLLDDTKYWIENKTYVPEEVAIRFKHRIVSIHCFPNGNGRHSRMMADIIIESIFQKEIFSWHQSNMVKSDEIRKEYINALKKADDGNVAPLIKFAKN >NZ_CP009887|2892616:2923805|2902673_2903573_-|WP_025614819.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP009887|2892616:2923805|2907171_2907870_-|WP_025614822.1|DBSCAN-SWA MIDLSHAEHQIRCVTNFDDLISMPFMGKINAACWTRELVGDFSEIIQQLELHENIAEIGQEELRELELSNQGQLAREILLNDLQALKNHGASPILNLIKCYERDDAYPFFPTDVYSFHVDRSPIPTDTFLCTYHGDSSDIIPNSQAIQKVLVPEIREELRKLYGGADEGFEAFLSEYFFDLHYHPKPKAPIINLGIGHLWKLAVDHPESKSLPCIHRAPNELTGQHRLLLIC >NZ_CP009887|2892616:2923805|2912329_2913907_+|WP_038508141.1|transposase|DBSCAN-SWA MQGKKTYQEKLFNSFRLSERVPQDNFYRLLKGVLDLNFLYVQTKSYYGDSGQKSIDPVVFFKLCLVGYLENIISDRKLIQHCSMRLDLLFFIGYDIDDELPWHSTISRTRQLFPESVFEEVFTKVLSMCIEKGMVSGHTQAIDSAPIKANASMDTLELKVPEEDLQAHLRKIRVFSSMDKETPHRKSKDDKSDRGQRIVTASKKELGAIQSRNKKWSTDQDQRPGSGNKGSKYTSNKTHYSPTYPDARISVKPGKARKLNYLSQLSVDTASHVITDIRAYHADGKDNQQLPDIVERLHKRLWQQGLFWENCVADTGYSSGENYAYLEQKGLRSFIPPHGTYKGGPDGFIYNREEDYYQCPQGKIIPFTKAFNDYRTGTKKKEYRARKHVCVACPMRSSCLGKSAQEKKFSVTYYREEYERNNARVHSPQGRYMKGKRQSTVEPVFGTLTQFMGLRKINTLGLKQANKVMHLSAIAYNLKKYLKFTQKHVKSGAGMGSLFILLKKTLYALKNSHLTTLKITNYLTN >NZ_CP009887|2892616:2923805|2897288_2897750_-|WP_025614814.1|DBSCAN-SWA 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30 | Leptospira_phage(25.0%) | transposase,protease,integrase | attL 2884525:2884540|attR 2922811:2922826 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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