Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_022660 | Campylobacter coli 15-537360, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas14j,csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
| NC_022656 | Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
1. NC_022660
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
1086473 : 1100301
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022660|1086473:1100301|DBSCAN-SWA TTTAATCCTTATTCTTTAAAAACATTAATTCTTTTAATTTGCTTTTCTCTATAAAAGGATACATATCTTCTATAGGTTTTCCTACAATCAACTTAGGCTCTACATTGGTTAATTTATTATTTAAAAGAATATTAACAACTTCAGGTTGATTATTTGAAAAAATTTCATCACTAATTTGGTCAAAAATATTTAAATTCTCTATTGTTCTAGATTGAATCCCATAAGCTTTTGCAACAGACTCGAAATTAGGAGCACTATAATCTTTAATAGTTCCGATATAATTTTTGTCAAAATATATTTCTTGAAATTGTCTTACCATTCCTAAATTTTCATTATTAAAAATAAAAATTTTAATGGGTAAATTGCGTCTTTTAATTACTTCCAATTCTTGAATATTCATTTGAAATCCGCCATCTCCAACGATCACAACAACAGGCTGGTTACTAGCAATACAAGCACCTATTGCACAAGGCAAGGAAAAACCCATTGCTCCCATACCTCCAGAAAAAAGTATTCTAGTATTCTTTAATACACTTAGTGCTTGAGCTGCCCACATTTGGTGCTGACCAACATCGATACAGAAAATTGGAGCTTTAGTTTTTTTAGATATTATTGAAATTAAAAAATTTTCTATTTTAATATTGCCATAAATATCTTTATTATTTGGCAATGTTTTAATTATATTTTTAACCCAATTCCTCCATTGAATACATTTGCATTGGATTTTTTGTTTAATAAGCTCATCTAAAAATAATTTAATATCGCTAGAAATTTGTATTTTTGTTAAAATTTTTTTTCCCAATTCATTATTATCAATATCTACTTGTATAATCTCAGAATTTTTAGCAAATAACTTCAAATCAGTACCAGTTTGCCTAGTGTCCAAACGTGAACCTAGCACCAAAATAACATCACTATTAGCTAAGGCTAAATTAGCACAACGATTTCCATAGGAACCAATTAGCCCCAAGTTTAATTCGAATCCACTTTCAATTGCATCCTTACCCATCAAAGAATGAACAACAGGTAAATTATATTTTTTCAAAAAGAAATCTAATATTTCACAAGCATTAGAATTTCTAACACCGCCACCAACCAAAACTATAGGGCTTTTAGCTTTACTAATCTTTGAAGCAATATGCTTTATTTGTTTTATGGATAAATTATTACTTGTAATATAATAATTTTGCATATTTAAATATTCTTTTGTTTTAAAGAAACTTTTAGCCTGATCAAAGTCAAACTCCGATCTTTGAATATTCATGGGTATATCGACTAATACGGGTCCCTTTCTTTGAAAGTGAGAAATATAATATGCTTTTTCTAGCTCATATCGTAAATCTTCGATTTTATTTACCATTACTGCATATTTTGTAATAGGTTTTACAATCTCGACAATATCAGTTTCTTGAAAACCAATTTGCCTTGAAATTTTATTATAATTAAATTCATATGTGTTTACTTGTCCTGTAATACACAATAAAGGAATAGAATCAAAATAACAACTTCCAATGGTGGTAATTAAATTTGTAGCACCAGGACCACTGGTAGCAATCACAACCCCAGATTTTCCAGTGACTCTTGCATAACCTTCAGCAGCAAACGCACTGCCTTGCTCATGAATTCCATTTATTATTTCAAGATTAGGATTTTTTGAAATAGAATCATAAATATGAGCTACAGCTCCACCAATATAGCCAAAAACTTTATCGATTTTATTCAATATAAGAAAATTAACTAAAAAATCACTTGCTTTCATCAAATTAGCAAACTTTCTAAATTATATTTTTGATAAAACTATCCAATTGAGGAATACTAATAACATTCTTTTCATTATAAAAACTTTTATACCATTCTATTGTCATTTTAATACCCTCCTCGCTTGTCAAAATAGGTCTCCAAGATAACATTTTTTTTGCTTTAGATGTATCTAGCATTAATAAATTTGCCTCATGAAGAGCATCTAGATCTATTTTGTATTCATAAGAAATTTTATGCCAAAAACCCTTTGCGATTTGTAACACTTCTTCAACTTTTAAATGTCCGTTAGCTTCTGGTCCGAAATTAAAACTCGTTGCAAATTCTTTTTGCTCCAATAATAATCTTTCTCCAAGCATCAAATAACCTCTTAGTGGCTCTAAAACATGCTGCCAAGGTCTCGTTGATTTAGGATTGCGAATAATGGCTGAAAAATTATCGTTAGCAGCTTTAACAATATCCGGCATAAGTCTATCTTCATTCCAATCACCTCCGCCTATTACATTACCTGCTCTTGCAGAAGCTATTAAAACATTGTGAGATTTTTTAAATTTATCTACATTAAAAAAACTTTGTCTCATAGAATTTGTGATAATTTCAGCACAAGCTTTACTTGCGCTATATGGATCATATCCACCTAATGGATCTAATTCCTTGTATCCCCGATACCATTCTTTATTTTCATATACCTTATCTGTCGTAATAATAACTATTGCTTTTAAATTCTTAAGATTTCTAGCAATGTTTAAAATATTCAATGTCCCCATTGCATTAGTTTGAAAGGTCTCTAAAGGATTTCTATAGCCATATCTTACTAAAGGTTGAGCAGCTAAATGAAAGATAATTTCTGGCTGGCATTCAAGTAAAGCATTTTCAAGCTTTATATAATCATTAATATCTTCAAAATAACTTTTTTCAAAAATTTTTTGCATAGATAAGATATCAAAGTGATTAGGAGTAGTATTTGGCTTAAGTGAGTAACCATAAATTTTTGCACCTATATAGTGCAACCACAATGAAAGCCATGAACCCTTAAAACCGCTATGTCCCGTTATAAAAACTTTCTTATTTTTATAAATATCAAATAACACCAATCACCCCTCCCCATGGCTTTTATCAAGCCATAAAGCCCACGGAGCTTTGTTTTCTATCCACATTTTTGTTAGATCATTTTTATCTTTCAAAGTATCCATACATTTCCAAAAACCATGATGTTGATAACTATAAAGCTCGCCATTTTGTGCTAAATTTCTTAGTGGGGCTTGTTCAAAAACTGTCATATCACCTTCTTTAATATAATCAAACACTTTAGGTTCACACACAAAAAAACCACCATTTATCCAACCAGCATTATTTAAACTAGCATCACCCTTTGGCTTTTCCGTAAAGCTTTTAACACAATTTGTAGTATCATCAATATCTAAAGCACCAAATTTTCCCTCAGGAAGCACAGAGGTCATCGTAATGGCTTTGCCATGCTGTTTGTGAAATTTTAATAACTCATTAATATTTACATCACTCACACCATCACCATAAGTAAGCATAAAAGTTTCATTACCCACATAATCTTTAGCATGCAAGATTCTACCACCCGTCATAGAATCTTGTCCAGTATAAAGCATGGTTACTTTCCATGGTTCGTGTCTAGTGTTATGAATTTGAACAGAATTATCTAACATATCTACTGTTATATCGCTGTATTGCGTATAGTAATTTATAAAATAATCTTTTATAATATGCCCTTTATAGCCTGTTAAAATAATAAAATCATTAAATCCATAATGACTATATATTTTCATTATATGCCATAAAATAGGTTTTCCACCTATCTCTACCATAGGTTTTGGCTTTAAACCTGTTTCTTCTGAGAGCCTTGTTCCAAGACCACCTGCTAAAATTAAAACTTTCATGATCCATCTCTTGTAATTAAAAATTTTCTTAATAATATTTGACGAATGTAATAGTAAATTTTTACTAAAATTTTATATTTTATTTTTTTTACTTTGGAAATTGAAAAATCAGTATTACTCTTGGGTTCAAAATTTATCATCATAATATTATGCATAGAAAAAAGCATAGAATTATATTTAGGTGTTATAAATAAGGTTTCTTCTTGAGATAAAAGTTTAGCACCAAAACCCATGCTACCGTGTGAACCTATTATAATTTTGCATAGTGAAAGAAAATAGAGATCTAAATAGCCTTGTTCCGGAGTACTTATATCAGAAACAACACAATCTATTCCTTTAATACATGGCACAATATTTTCCTTAACCCATTTATTATCATCACTAAAAAAATAAAGTTTAATATTTTTATGCATTAACATCACTATATTAATACATCTTAGAAAATAATCTATATCTGTTGGCTTTCCATAGGCAACATGCTCTTTACTCAAATCTCCTCTTCTAATATGAACTCCACAGCTTTTGTTTCTTTTAATCTCTTCACCTAAAAATTTTATCTTGTCATTAGTCAACAAATCTAAGGGAGTAAAAAAATTACGAATTTCTCTGCAAATTTCTACTATATTTAAATTTACGCTATAATTATAACCAACGATATACAGAGGGGGTTTACATTCTAAAAATAATTCACTATCTGTAGCAAATTTTTTATATCGATTAATTTCCAATTTGCTTGCAATTTCAATATGAAGATTTGGAAATATTTTAGGAATATCCCAATTTACATTGTAAACTTGATTATAACCTTTATCAACACTATAAAATCCTCTTCCTTCTTGCTCAAACCAAGTAATATCGTATTTTACTCTATATCCTTTTTTTTCAAAAAGCTTTCCCGCTGCAAAAAAGTATAGCTGGCTTACAATTCCCCCGTCTACTTTAATTATCACTAACTTTGGATCTAGCATTAAGTTTGTATCCTCAACCATTTAAAACAAACAATTCTTCATAAAGATGATTTTCGCAATTAAGATATTTTAATGCCTTAAAATAATTTTCTTTGATAGCCTCCAAACGATCTTTATAGTTTTGTTCATTACATTGCTTTAAAATAAGTTCTATCCTATCAACATCTTTTGGGAAAATTTGAATAATTCCATCCAAATTAAAAAAATCACCTATTCTAGTTGCACCTATATATATAGGTACACACATTGATATAAAACAGTCTAAAATTTTTTCAGTAAAATAATAAGCTGAAATTTCATTTTCAACTACAATTTGATAGCGATACTTATCTAAAGACTCCGACTTAAAGCAAATAGGTTTATC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TGTTTAAAAGCATTTTTGTGTGCTTCTAGACAAAAATCATAAATTTCTTTTGCATAAATTTGCATTTGCTCTAAGAAAAATCCAACTTTAAACATAAACATGCCGGAATTCCATAGATAATTTCCATCTTCCAAAAATTCTTTAGCCTTTTTTAAATCCGGTTTTTCTACAAAAGCTTCGACATTATAAATATTTTTGGATTTGATATAGCCATATCCAGTATGCGGACTATCAGGTTTTATACCAAAAGTAACAAGATAATCATCATTGGCAAATTCTAAAGCCTTTGTTATCGCTTCCTGATATGCTTTTTCATTTTTAATCAAATGATCACTTGGTGTGATTAAGACTATTTCTTCTTTAGGTAAAGATAGACACGCTAAAGTAATAGCACCTGCTGTATTTCTAGCTAGGGGTTCTAAGATAAATTGGGCTTTATTTGCATTTGAAATTTGATCAAGGGCTAAAAAATATTGCTCCTCATTGCAAACTATTAAAATACTAGAACACACTTTAGAATTTCTTCGCAAAGCCAATTCAAATAAAGATTTATCATCAAATAATTTTATAAATTGTTTTGGTGTAAGTGTTCTACTGAGCGGCCAAAGCCTTGTCCCGCTACCACCACAAAGAAGGATGTTAGTCATCTAAAAATCCATAAATAAAGTTTTAACTAAATGGAATTATATTCAATTTCTCTTTAAATATCTTAAAAACAAATTCTTTTCCTCTTTCTCCAAAACCTCAAGCAATCTTTTACAAATTTCATCGTTTTTTAATTCCAAAGAAAGCTTTTTTATAAGCTCATTGCTTCTTTTTTTATCCTTGTAATTTTGCCACAAAATTTCTTTATTTTTGTTTTCATATCTACCCTTTTCATTAAATTCATAATGATAAATACACTCTTTAAAAACACCCATTTTATCGCATTCTAAAAAATTCATATAGCAAAAAAGCACATCTTCTCCATAGCTCAAACGCTCGTATAAATTTATCCTTTCAAAGCTTTTCAAAATCAAATCTTTCCTAAAAAGCTTCGCCCAAACCGACCAGCAAAAATGTTTTTGTTTGCCTAAAAATTCGAAAAATTCTTTTTGATTAAAAACTTCATCTTGTTTAAAACGATAAAATTGTTTGGTTTTGACTCTATGCACAAAAGCATCAAAGCAAATCAAATCAAAGCCTTGTTTTATTTTGGTTAAGGCCAGTTCACAAGCATTTAAAGCTAAAAAATCATCACTATCTAAAAACATGATAAATTCAGCTCTAGATTTTAAAACTCCTAAATTTCTAGTCGCAAAAGTGCCTAAATTTTCATCATTTTGAAAGATTTTTACTCTCTCATCTTTTTTAGCCAATTCTAAGGCTATTTTTACACTCTCATCTTCGCTTTTATCATCAACAACTAAAATTTCAATATCTCTTAAAGTCTGATTTATACAGCTTTGCAAGGCTCTTGTGATAAATTCACAAGAATTAAAAAGCGGGATTATGATCGAAAGTTGTGGCATATTTTTCCTAAATTTTGTTAAAATAATAAAAAGAATTTTATCAAACTTTTAGGAAATCTATGAAAATTTTTATCCATCTTCCCACTTGGCTAGGCGATGCAGTCATGGCCTCACCTGCTTTATATGGAGTTTATCATCATTTTAAAAATGCTGAATTTATCCTTTATGGATCTTTTGTATCTACAGCGCTTTTTAAGGAATTTCCTAATGCTAAAATCATTGTAGAAAATAAAAAATCACGCTACAAACAAACCCTTTCTTTACGCAAAAAACTTGGAAAAATCGATCTAGCCCTTTCTTTTAGATCAGCTCTTTCCTCTAAGATCATTTTGCATATCCTTAAGGCAAAAAAAAGATATTTTTTTAACAAGTATAATTTCAAAGAAGAACATCAGGTTTTAAAATATCTTTATTTTATAGAAAATTCACTAGATATCAAAGCTCATTCTAAGGATTTAAAACTCCCTTTTAGATTAAAATTTCAAAATCCTATTGTTTTAAAAAATGGCAAAAAAATCCTAGGATTAAACCCTGGAGCGAGTTTTGGAAGTGCTAAAAGATGGGATGCGAGCTATTTTGCACAAGTTGCTTTAAATTTTAGCAAAACTCATGAAATTTTGATTTTTGGAGCAGGTAAAGCAGAACAAGAACTTTGCGATGAAATTTTTCATATACTAAAAGAAAAAAATGTCAAAGTAAAAAATCTTTGCAATAAAACCACTATCAAAACCCTTTGTCAAAATATCGTTTTTTGTGATATTTTCATCACAAACGATAGCGGCCCTATGCACATAGCTGCCGCTTATAAAACAAAAACCATAGCTATTTTTGGGCCTACTAAATTTACCCAAACCTCACCTTGGCAAAATCAAAATGCAAAATTAGTACATCTAAATTTATCTTGCATGCCTTGCATGCAAAAAACCTGTCCTTTAAAACATCATCGGTGCATGAAAGATTTAAAACCGGAAAAAATTTTAGAAGCAATCCAAAATTTTACTTAAGATTTAATTTTTTCTTAATATAAAAAACATAGAGCAATCTTGAAATATCTCTATAAAGTCTAAAAATTTCTCTTACAATTTTTCTATGAATTTTAAGTTTTTTATTTGTACGTCCAAGATTAGAAATTTCGCTTTCTAATTTACAATTATGTTTTAATAATAAAGGTTTTTTTACGATATTTAATACCTTATGTTTATAAAACATATCCATATAATCATCCACGGGTGTATAAATAAATTTTGCCTTTGATATAAATTTGTTTGCAGCACTAGGTTTTAATACGTAACCTTGAGTTCCTGCAAGTTTTTCAAAACTTAGAATATAATTTTCATTTAAAGGATAAAATTTCTTATCAAACAAATAACAAAATCTTACATATTCATACTCACTCTTTGATAATTCTTCTATGTATTCTTCCCCATTATTTAAAAATTCATCACTAAATTCAACATCATCTTCTAGGATGATTATAGGTTTATCAAGTTTTATACATTCTTGCCAAAGTTTATAATGACTCGCAAAACAAGCCTTTTCTCCATCACTAAGCTCTCTACCTAAAACCCAAGAAGCCCACCAAGGAAAATGTTGTTTAAATTCTAAATATTCTTTATTTTTAGCATCAACGGCTTTAAAGAAAATAAATTCTAGCTTATTTTTTAGACTAGGGTTCTTTTCAAAAAGTTTTTGATTTTGCCTTTGCATGTACTCTTTTCTATCTAAAGAACGCTCTAAATTAATGATAAATGCCTTCATCAAAAGCTCTCATCTACTATCTGACAAAGCGTGTGTATGATTAAGATATGCATTTCTTGAATTCTAGCCGTATCATCGCTTGGCACAACAAGATTATGATCGCAAAGCTCATTCATCTTTCCACCTCCTTTGCCACTAAGCCCCAAGCAAAGCATGTTTAATTCTTTAGCTTTTTTAAATGCTTCTAAGACATTAGGACTTTTTCCACTGGTTGAAATGCCTATTAAAATATCATTTTCACTTCCCAAAGCTTCTACTTGCCTTGAAAAAACAAACTCAAATCCATAATCATTGCCTATAGCACTAAGTGCTGAAGTGTCTGTTGTCAAAGCTATACCCGCTAAAGCTTTGCGTTCTTTTTTATATCTGCCGCTAAGCTCCGCTGCAAAATGTTGAGAATCCGCGGCACTCCCACCATTTCCACAAATTAAAATTTTTCCACCTTTTTTTAAACACTCACACAAAAGCTCGCCTACTTTTGCGATTTGCCCTTTTAAAATTTCACTTTCCTCGGCAACTTTTTGATGTTCTTGCCATTCTTTTTCTACTAAATTTATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022660|1086473:1100301|1094611_1095751_-|WP_002844800.1|DBSCAN-SWA MKKVALITGVTGQDGAYLSEFLLNKGYEVHGIKRRSSLFNTDRIDHLFEGHHNKKNDFYLHYGDMTDSMNLTRIIAEIKPDEIYNLAAMSHVHVSFETPEYTANADGIGTLRILDAVRFLNLTQKTKIYQASTSELFGKVQEIPQNEKTPFYPRSPYAVAKMYAYWITVNYREAYDMFACNGILFNHESPVRGETFVTRKITRATAKIALNLDDMLYLGNLDAKRDWGHAKDYVRMMWMILQHEKADDWVIATGKTTTVRDFVKLAFEYCGIKLNFKGVGVDEEGFIEDLDQQRAKELSLSFNHLQKGQVVVKVNPRYFRPTEVDLLLGDPSKAEKELGWNREYDLKNLVDDMMENDLKLMTKDVYLKQGGYKIMRYYE >NC_022660|1086473:1100301|1098042_1098987_+|WP_023362005.1|DBSCAN-SWA MKIFIHLPTWLGDAVMASPALYGVYHHFKNAEFILYGSFVSTALFKEFPNAKIIVENKKSRYKQTLSLRKKLGKIDLALSFRSALSSKIILHILKAKKRYFFNKYNFKEEHQVLKYLYFIENSLDIKAHSKDLKLPFRLKFQNPIVLKNGKKILGLNPGASFGSAKRWDASYFAQVALNFSKTHEILIFGAGKAEQELCDEIFHILKEKNVKVKNLCNKTTIKTLCQNIVFCDIFITNDSGPMHIAAAYKTKTIAIFGPTKFTQTSPWQNQNAKLVHLNLSCMPCMQKTCPLKHHRCMKDLKPEKILEAIQNFT >NC_022660|1086473:1100301|1098979_1099741_-|WP_002826801.1|DBSCAN-SWA 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13 | Synechococcus_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
1392393 : 1403623
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022660|1392393:1403623|DBSCAN-SWA AATGATTAAATTTTTAGATTTAGAAAAAATAAATAATCGCTTCAGAAATGAAATAAATACAAAGATTGAACAAATTTTGGATAGTGGTTGGTATCTGCAAGGACAATATAATGCAGAATTTGCTAGAGAATTTGCAAATTTTTGCGGAACAAAATATGCGCTTGGTGTAGCAAATGGACTCGATGCACTAAAGCTTATTATAAAGGCATATGGATTCAAAGACGGTGACGAAATTATAGTTCCAGCAAATACATACATTGCAAGCATACTAGCCATAAGTGATAACAACTGTGTACCAATTTTGATTGAGCCAGATATAAATACCTATTGCATAAATCCAGATTTAATAGAAGAAAGAATTACAAAAAAAACGAAAGCTATTATGGCAGTGCATCTATATGGTCAGGTTTGCGATATGGATAAAATTAATTCTATTGCAAATAGATACAATCTTAAAGTAATAGAAGATTCAGCTCAAGCGCATGGAGCATATTATAAAAATAAAAGAGTAGGAAATCTCGGAGACGCATCTGGGTTTTCATTTTATCCTGGAAAAAATTTAGGTTGCATTGGAGATGGAGGCGGCATAACAACCAATGATGAAAAATTATATCTCAAAATTAAAGCCTTAGCTAATTACGGTTCTCATAAAAAATACTGTCATGTCTATAAAGGGCTTAACTCAAGGCTCGATGAGATTCAAGCAGCTATTTTAAATATTAAGTTAAAATATCTTGATGAAGATAATGCAATCAGAAGAAAAATAGCAAAATATTACCTAAAACATATCACAAATAACCTAATAACTCTACAAAGCATAGATGATGAAAAGTCGCACGTATGGCATATTTTTACCATAAGAGTTAAAAAAAATAGAGATAAATTTGCAAACTATCTTAAAGCTCATGGTATAGAAAGCATAATTCACTATCCAACTCCTCCGCATAAGCAAAAGGCATACAAAGAGCTTAATCATTTATCATATCCAATTACGGAACAAATCCATAAAGAAATAATAAGTCTGCCAATATCTCCTGTAATGACCGAAAAAGAAATTATGCAAGTTGTAAAAGTGGTAAATAATTGGAGTTAAAAATGTATCTCAATTATACTCAAAAGGAACAAGCATATCTTTTTATATTAGAAATAATTACAAATGAAAAAACGAACTCTATTAAGCTTGATATAATCAGTAAGTTGTTAAGAAGTAAGATTATTTATGGTAATAAATATTTTAGCTCCGAAAAATTAGAATGTATTTTGATAAATAATTCCAATACATTACAAACTAAAATACCAACAAAGTATCAAAAAAATAATATACTACATATTCTTACTTATTCTTATTCGAATGGTGGGCATACAAGAATTATAGAAAGATGGGTAGAGCATGATAAAAATTCCAAAATACATTCAATATTACTTACAGAACAACAAAAAATACAAATCAATCCAGAATTACACAATATCATCAAAAAGCAAAATGGTAATATATTTTCTATATCTAACATTAAAGATATTCAAAAAAAAGCCTTATTACTAAGAAGAATAGCCTCTAGATATGAAATAATTATATTGCATATTCATAACTACGACATTACACCCTTATTAGCATTTGGAACTTTAGATTTCAAAAGGCCAATTTTCTTTTACAATCACTCAGATCATTTATTTTGGATTGGAGCAAGTATTGCAGATTTAATTTTAGAAATAAGAACTTATGGAATTAAAATATCAGATATGTATAGAGGTACAAATAAAAGCTATTTATTAGGAATCCCTATAGGAAAAAATATAAAACATCTAAATCATAATAAACAAGCAATAAAACACAAATTATCAATTCCATTAAATAAAAAAATTATTTTATCAGTTGCAAGTTCTTATAAATTTACACCTACTAAAGATATTAATTTTATTAAGCTAGTTGAACAAGTAATTAATATAAATTCTGAAATTTTATTTATCATTATAGGAGCTGATATTAAAAAATTAAATTGGAGTAAGACAGTTAGAAAATCATGTAATCGAATAATAACAATACCTAAAATACCACATAATCAATTATTAGATTATATTTCAATTACAGACTTATACATAGATTCAGCACCACTAGGCGGAGGTGTAGCAGTTATAGATATGATTTATTCCAATATTCCAATTTTAAGTTTGAAATCTATTATTCCGAATTTTGACTATCTGCTTAATTCAGAAGCACTATGCAATGATTTAAACGAACTATTGCAAAAAACAAATCTGATACTGTATAACAAAAATTTCAGAAAAAAACATATCAAAGAAACATACAATCTCTTAAATCAATTCACAAATAGACGATTATGGAATAGCAAGATTAAAGGTATTTATAATATTGCTCAAAATATGGAACATAACATTTATAGCATCTATAGCAAAAAATACAATGATGCCAACCTAAATAATTTTTTATGTATATTACATAAAGCTTATTTGTTAGATATTATAAAAATAATAGGAATAAAACGATTTTTAAAATATCTATTTAAAAAGATAAAACTATCTAATCGCAACGCTACCAAAAGCTAATATTTATATAAGTGAAAAAATAATCTAAAAAATACAGATAATCTAACAAAAAATCTCTTTTTTAGTAAATTAAATTTAATTAAATTTATATATAAGTTAATTTTATTACCCTTTAATTCCAAATATGAGAGATATGCTGTTAAAATTATTTTATCTTGGCTATTCACCCGATTTACTAGTTTTTTAAGAAAAACTTTTCTTGTTGTATTATGATTAGGTAAATATGCTAATTTATTTCTAGTTAAACCTTGAAAAAAAATATTTTTTTTATTACTAGTATTTAACATATGTATTCTATATTTTATCAATGCTTTATTTATACTAACTCGTATTCCAAAAAATTCACAATTTACCGCTATCCAATAATCATGGGAATCTAACATTTCTGGGAATGGCAAAACAATTGATTTTAATTTTTTATTCATAAAAATAGTATTACCCATAACACCACAAGGTCCCAATATTACACCCACATCTTTATTGGGACTAAACTTATATCCTCTAGCATCAAAATATGAACTAAATATTTTATGCAAACTAGAATCAACAACCTCTAAATCATGATGGATCATCATGGCCTTATCTTTAAATATTGTTTCTTTCTCTTTAAGCGCAGAATATTGTAAAAATATTTTATCTTTATCCCAAACATCATCTTGATCACTAAAGGCTATATAATCTTCTTTTGTATTTTGCAAAAGTTTTTCAAAATTCTTAACAAAACCTATATTTGTTTCATTTTGATAATATATAATTTTATCAGGATATAAGTTTTTATAGGCTCTGATAATATCAATAGTACCGTCTTTTGAACAGTCATCGCCTATATAAATCTTAATATTTTTATATGTCTGATCAAGTATTGACTCAATCTGCTGTTTTAAATATTTTTCACCATTATAAGTAGCCAATATAACAGCTATAGTATCATTCATATTTATTTAAATACCATTCTATTGTTTTAATTATACCTGTATCAAAATTTTCATCAGCTTTCCAACCAAGTTCATTCTCAATTTTACTAGCATCGATAGCATAACGCCTGTCGTGTCCTGCTCTATCCTCCACAAAAGTGATTTGCTCTTTATAGCTAGTATCTTTTGGTTTGTATTGATCTAATAATTCACAAATTTTATAAGCAATTTGTAAATTTGTTCTTTCATTTCTCCCACCAATATTGTAAGTTTGTCCTGATTTCCCATTATGATATGCAAGATCAATACCTTTGCAATGATCTAATACATACAACCAATCGCGGATATTTTTACCATCTCCATAAATTGGAATTTTATTACCTGCTAATGCGTTTCTTATAATTGTAGGAATTAATTTTTCATCATGCTGTTTTGGCCCATAATTATTAGAACAATTAGTTATGATTGTATTTAATCCATAAGTTTCATGATAAGATCTTACAAGCATATCAGATCCAGCCTTGCTAGCAGAATAAGGCGAATTTGGAGCATAAGGAGTATTTTCGGTAAAAAACCCGTTTTCCCCTAAAGTCCCATAAACCTCATCCGTACTTATATGATGGAATCTACAATTTTGATATTTCTCTTTATATACAAATGGTTTCTCCATCCAATGCTTGTATGCTACCTCTAGTAGATTAAATGTCCCATTTATATTTGTTTGAATAAAAATTTCAGGATTCTTGATAGAGTTATCAACATGCGACTCTGCCGCAAAATGAATAACACCTTGGATATTATACTCAACAAAAAGAAATTGAACCAATTCTTGATTGCAAATATTCCCTTTTACAAATTTAAATCTAGTGTTATTTTGACATTCTTTTAAATTTTCCAACTTGCCTGCATATGTTAAAAGATCAAGATTAATTAAAGTATAATCCTTGTATTTTTCTAAAAAATACGGTACAAAATTTGAACCAATAAAACCTGCTGCTCCTGTTAATAATAAATTTTTCATAAAACACCATCCTTCTGCAATATGCTGATACATCTTTCTAAGCTATCTTTCCAATATGGAATTTCAATGTGAAATTTTTCTTTAATTTTTTGTTTATTTAAAACAGAATAATAAGGTCTCGGAGCTAATGTTGGAAAATCTTTGCTTTCTATAGGTTTGATATTGCAATCTAATTGTGATAATTTCATTATCTCTTTTGCAAAATCATACCAACTTGCAACACCCTCATTAGAATAATGATAAATTTCAGGCTTTTCATTTTGGATTGCAGGTAAGATATTTACAATAACCTCGGCTAAATCTCTTGCATAGGTAGGAGTTCCTATTTGATCAAAAACAACATCAATCTCATCCCTTTTTTTGCCAAGATTTCGTATAGTATGGACAAAATTTCCTTTGTAATTACTATACAACCATGATGTTCTTAAAATAATTGTATTTTTAGGCTTAATATCTATAATTGCTCGCTCGCCTCTTAACTTTGACTCACCATAAATATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022660|1392393:1403623|1397762_1398338_-|WP_023362156.1|DBSCAN-SWA MCIVDTDFNEVKLIKKKLFFDNRGYFVENFHQEKIEKLLCKQFIFVQENESCSKKNTIRGLHYQIHPFAQTKLINVTSGGILDVIVDLRKNSPTFLEHIKIAVRAEDNTLLFIPRGFAHGFIALEDFTKVSYMVDNFYNPKSERGILYNDPQLKIDWGINDSDVLISDKDLYLPTLEQIRDFFDYNVDYYE >NC_022660|1392393:1403623|1393487_1394957_+|WP_023362148.1|DBSCAN-SWA MYLNYTQKEQAYLFILEIITNEKTNSIKLDIISKLLRSKIIYGNKYFSSEKLECILINNSNTLQTKIPTKYQKNNILHILTYSYSNGGHTRIIERWVEHDKNSKIHSILLTEQQKIQINPELHNIIKKQNGNIFSISNIKDIQKKALLLRRIASRYEIIILHIHNYDITPLLAFGTLDFKRPIFFYNHSDHLFWIGASIADLILEIRTYGIKISDMYRGTNKSYLLGIPIGKNIKHLNHNKQAIKHKLSIPLNKKIILSVASSYKFTPTKDINFIKLVEQVININSEILFIIIGADIKKLNWSKTVRKSCNRIITIPKIPHNQLLDYISITDLYIDSAPLGGGVAVIDMIYSNIPILSLKSIIPNFDYLLNSEALCNDLNELLQKTNLILYNKNFRKKHIKETYNLLNQFTNRRLWNSKIKGIYNIAQNMEHNIYSIYSKKYNDANLNNFLCILHKAYLLDIIKIIGIKRFLKYLFKKIKLSNRNATKS >NC_022660|1392393:1403623|1400212_1401844_-|WP_023362162.1|DBSCAN-SWA MKKILILFLSCIFCFGAIDVSQISASGNSSTTSSSQNIENNISKSTPVQIPVFGAELFNGNFKNYTQRVYNPDYKIAVGDQISLKIWGAVEFEQILVVDSQGNIFIPKVGAVNLLGVKNSALVSVIKAQVNKIYKNNVFVYADMNAYQNVSVFVTGSVNAPGLYQGLSSDSVIQYLDKAGGINLEYGSFRDIQILRNNAVIKKIDLYDFLLKGQIDLFPFRSGDVVLVGNVQSYVFVNGDVQRPFRFELANDIKTLFDLARVAGAKPIVTNAILRSYGNDHKLEVSAYNKMQFSKVLLKTGDEVQFNPEYISQNISITVNGEHSGLKTLVVQKGTTLEDVSRLIVANGQSDMNALQVFRKSVAKTQKDLINAQLKELETLALTSPSVTSQGAAIKAEQAKLILEFIQRARELEPKGQIVIDKPKSYGEVILEEGDTINVPSKNNLIIVQGEVTLPGAFVYNKGEDLKYYINLAGGYGERADTSKVLVIRNNGKAQRYSGSVDMMPGDSVLVLPKVESENLQIFSMLTQILYQIAVATNVVLNI >NC_022660|1392393:1403623|1399255_1400203_-|WP_023362160.1|DBSCAN-SWA MDALKIAKEVFATEAKAIEDLALNLDENFSKAIELMLHTKGRCIVSGMGKSGHIGAKIAATLASTGTPSFFIHPGEALHGDLGMLTPDDVLIAISNSGETEEILKIIPAIKKRKIPLIAMCGKKNSTLVKQGDIFLNISVKEEACPLQLAPMSSTTATLVMGDALAAALMKARNFRPDDFALFHPGGSLGRKLLTRVSDLMVSKNLPIVHPDTEFNDLVDVMTSGKLGLCLVLENEKLVGIITDGDLRRALKANDKPRFDFKAKEIMSINPKVVDADAMASEAEEIMLKYKIKEIVVSKEDKVVGIIQLYAIGNV >NC_022660|1392393:1403623|1401845_1402961_-|WP_023362164.1|DBSCAN-SWA MTKINTFFNKIKDLSIFDSFKIVWILMIFVIIYYILIAADRYVSTITMSVKSTTGSTQASGVLSLLTATSNTSEDIKFLQGYIESLDMLKILDEKIHLKKLYNEQYIDLFFSLSSSSSIESYLKYYQSRVKVHVDDKTGLLNVEVEGFTPESAHLIAKTIMQESEKFINEISHKAAREQMAFAEEELVKYKERYQKAQNDLIAFQNKYGVFDPLKQAEAKAGLVTQLESDIAQREAKLLTMQSYMNDHAPEIVTLKAEITALKKQLVKERSKISADNSSQKLNDLAAKFQDLTIEAGFAQSAYEAALKAYESARIEALRKIKQLVIVQTPDVPQSAKYPEKIYNILTAFIVLSLIFGVIKFVKMIIEEHKY >NC_022660|1392393:1403623|1394953_1395892_-|WP_023362150.1|DBSCAN-SWA MNDTIAVILATYNGEKYLKQQIESILDQTYKNIKIYIGDDCSKDGTIDIIRAYKNLYPDKIIYYQNETNIGFVKNFEKLLQNTKEDYIAFSDQDDVWDKDKIFLQYSALKEKETIFKDKAMMIHHDLEVVDSSLHKIFSSYFDARGYKFSPNKDVGVILGPCGVMGNTIFMNKKLKSIVLPFPEMLDSHDYWIAVNCEFFGIRVSINKALIKYRIHMLNTSNKKNIFFQGLTRNKLAYLPNHNTTRKVFLKKLVNRVNSQDKIILTAYLSYLELKGNKINLYINLIKFNLLKKRFFVRLSVFFRLFFHLYKY >NC_022660|1392393:1403623|1402960_1403623_-|WP_002785623.1|DBSCAN-SWA MIKVLNLTKSYPLFNGGRHYVFKDFTFEFPENCSIGLMGRNGAGKSTLMKLLSGSELPDRGKIITNKKFSWPLGLSGAFQGSLTARDNAKFVARVYGYKGEELHEKVKFVEDFAELGKFFDEPMNTYSSGMSARIAFGLSMAFDFDYYLIDEAGAVGDPKFREKSHKLYKERLSQSKVIMVSHNVAEIKEWCDKIIFMENGKATVYDDVDEGIAVYQGKK >NC_022660|1392393:1403623|1395884_1396892_-|WP_023362152.1|DBSCAN-SWA MKNLLLTGAAGFIGSNFVPYFLEKYKDYTLINLDLLTYAGKLENLKECQNNTRFKFVKGNICNQELVQFLFVEYNIQGVIHFAAESHVDNSIKNPEIFIQTNINGTFNLLEVAYKHWMEKPFVYKEKYQNCRFHHISTDEVYGTLGENGFFTENTPYAPNSPYSASKAGSDMLVRSYHETYGLNTIITNCSNNYGPKQHDEKLIPTIIRNALAGNKIPIYGDGKNIRDWLYVLDHCKGIDLAYHNGKSGQTYNIGGRNERTNLQIAYKICELLDQYKPKDTSYKEQITFVEDRAGHDRRYAIDASKIENELGWKADENFDTGIIKTIEWYLNKYE >NC_022660|1392393:1403623|1398344_1399232_-|WP_023362158.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITKGISKQLLPIYDKPMIYYPLSVLMLSGIKEILIISTPKDLPRFQELLGDGSDFGVKLYYKEQPSPDGLAQAFLIGESFIEDKDVCLILGDNIFYGHSLAQLMQNAIKNAKDYSKATVFGYYVNDPERYGVVEFDQQNKAISIEEKPIVPKSNYAVTGLYFYPNDVISKAKLVKPSSRGELEITTLNQMYLEEDRLNVELMGRGFAWLDTGTHESLIQASLFIQTIEERQSLKIACLEEIAYNKGYINKEQLLQLAKPLLKNQYGHYLVKIAEKDFFK >NC_022660|1392393:1403623|1392393_1393485_+|WP_002792363.1|DBSCAN-SWA MIKFLDLEKINNRFRNEINTKIEQILDSGWYLQGQYNAEFAREFANFCGTKYALGVANGLDALKLIIKAYGFKDGDEIIVPANTYIASILAISDNNCVPILIEPDINTYCINPDLIEERITKKTKAIMAVHLYGQVCDMDKINSIANRYNLKVIEDSAQAHGAYYKNKRVGNLGDASGFSFYPGKNLGCIGDGGGITTNDEKLYLKIKALANYGSHKKYCHVYKGLNSRLDEIQAAILNIKLKYLDEDNAIRRKIAKYYLKHITNNLITLQSIDDEKSHVWHIFTIRVKKNRDKFANYLKAHGIESIIHYPTPPHKQKAYKELNHLSYPITEQIHKEIISLPISPVMTEKEIMQVVKVVNNWS >NC_022660|1392393:1403623|1396888_1397770_-|WP_023362154.1|DBSCAN-SWA MNKNIAILGSNGQLGKTFRELFSLFEKKYNVYFFDKTQLNIQDKNLLEYFIDKYKFDYIINCAAYTDVNLAEVEQEKAYILNHNSVKNIADLAKKYNLTFIHISTDYVFDGKSCIPYKEDDKTKPLNIYGESKLRGERAIIDIKPKNTIILRTSWLYSNYKGNFVHTIRNLGKKRDEIDVVFDQIGTPTYARDLAEVIVNILPAIQNEKPEIYHYSNEGVASWYDFAKEIMKLSQLDCNIKPIESKDFPTLAPRPYYSVLNKQKIKEKFHIEIPYWKDSLERCISILQKDGVL |
11 | Escherichia_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
2. NC_022656
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_022656_1 | 2554-2662 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022656_1
|
1 spacers
spacers of NC_022656_1
>1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder TAAACATTCAAATGTTAAAAATGTATCATATTTTGAGACAAAAGCAAAAAATCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022656_1
The CRISPR arrays of NC_022656_1 >merge|NC_022656|1|2554-2662|CRISPRCasFinder TATTTTGTATCAAGAAAATGAAAAAAATAAACATTCAAATGTTAAAAATGTATCATATTTTGAGACAAAAGCAAAAAATCTATATTTTGTCTCAAGAAAATGAAAAAAA >NC_022656|1|1|2554-2662|CRISPRCasFinder TATTTTGTATCAAGAAAATGAAAAAAA TAAACATTCAAATGTTAAAAATGTATCATATTTTGAGACAAAAGCAAAAAATCTA TATTTTGTCTCAAGAAAATGAAAAAAA
>NC_022656.1|WP_023361546.1|2076_2490_+|PIN-domain-containing-protein MKKVFLDTNIFIDFFEETRENNQQAKQLIYFLISNDIKIIFSEDMISTVAYILKKENLGKFTHFIKTISLEKEFEIVSFGASVINMACDYYDKYQGDFEDYLQYFCAEKENCCAIYTMDKKFPNLKIPVKRYGEIDI >NC_022656.1|WP_023361544.1|1234_2080_+|hypothetical-protein MKEIVDLENKPVTRLYSKVEEKVDNITGEVTTIVSSFLQKEKTKDDFIKLFVENINYLTDNLSNSALRVVLMMFKNLNYQNIFHYNSDFVSYFTNKKILGKSSVYRAIKELEDKNVIFKITKEQQEEYDIISPNSYIMNPQIIGKGSFKDLKKLRQTTIKEFDFEKLEMIQKVEVESEYEGLDEVKENPENYYIEDIKQIAYPNTIENQIIISKKEAEADNQTLIANDTQPSLFNENQKEQEARLFIEKFGGMFSGAYHPTKSAKELKREKLDQDLKEGKI >NC_022656.1|WP_041161631.1|920_1211_+|hypothetical-protein MQMSVSEICCKKFFVFKSRLRRKRLKKNAFKYRYNSALIRFLIFPPVGQIFPPVGQKLLVVGKLFLEKIMFPNKLGKNCFFYLNMFHFLGKNDIIL >NC_022656.1|WP_023361540.1|200_524_+|hypothetical-protein MKRGFAKIEFFANLEYLKQEYNKGYVVSKILYEKAKQDKNISMVYSQFNKYFNEVFKNKIEKKEITQENNQSLALENKEPIKLKINTKSKKVFDAKFGKDIKENDLL >NC_022656.1|WP_023361549.1|2988_3927_+|P-type-conjugative-transfer-ATPase-TrbB MSNIEFQARINEKIKREFGDILFYLEDRETIELMLNSDGKLWLEKLGQDMICLGEFSEAKAKSIITAVSTLLDTTTNAENPILECELPLDGSRFEALLPPIVAKPTFTIRKKAVKIFTLDDYVESKILTPKQKEVLINAIKERQNILVVGGTGSGKTTFSNAIIDGISKITPEHRIVIIEDTAELQCASENKVILRATDKVDMLRLLKATMRLRPDRIIVGETRGKEALDLLKAWNTGHPGGIATIHANSANGGLTRMEQLISEATNAKMSKLIAEAVNLIVFISKSKEGRKVKEIIKVIGYENDKYITQAI >NC_022656.1|WP_002784998.1|3936_4233_+|conjugal-transfer-protein-TrbC MKKFLILFLALGLGYALASTTGAGLPWEGPLEQIKASLSGPVAFIMSILAIIGAGAGLIWGNEFSGFIKTLFYIVIVIALIVGANSFMSLFSTSGALI >NC_022656.1|WP_002779817.1|4232_4520_+|conjugal-transfer-protein-TrbD MEELQRIDIYSALNKPNLIFGADRELILMVGVISFALIFTGATLLTSIIGIFLFFFCNMLLRLMAKSDPLMRQIFLRQIKYKKFYYAQSTPFSKD >NC_022656.1|WP_002790710.1|4523_6989_+|conjugal-transfer-protein-TrbE MLALKEFRSKAKAFPDILNYASFIDEGILLNKDGSLTAGFYYRAGDISSMTINERNTLSARINSVLKTLGNGWAVHIDCSRIKTENYIDGDTFYKSNIAQILENERKHYFDNVEHFENLFTMIFTYLPPHKSINKITDLMIIDETKNKNQGDKILEYFKNTLQKLEDSLSNYIKIERMLPRIAIDEYNNEYILDDMLEYINFCICGERQKIILPNAPMFLDCLLGGRHFETGMHPRIDNQYIGIIAIEGFPSESYPNILNALTELNFDYRFNTRFIFLDDFEAQNSLNKYRKKWQQKTKGWLDQLLDRPARKQDDHAVLMVQELDSALSESKSGMIGYGYYTANIVVFDRDYESLEYKLKDIRKVLENLGFLSRTETINSVEAYLGTLPGFVYPNLRRPILNTLNLTHLIPLASIWAGDKYNSSERFPPNSPPLMQVVTSGNTPFRLNLHVSDLGHTLIFGPPGSGKSTLLANIFLAWQKYPNAKIYAFDKGQSLLAPTLATGGIHYDVAGDHSSLAFAPLANIKTDAEIAWAEFWIETCLKLQNVNITPKQKKLIHEALISHINTNSTSLTEFVSALQDSDLRDALNYYTISGTGGFLFDSEEDKLSLSSITTFEIEELMNLGDQYIIPALLYIFNRIEKGLDGSPTLLIIDEAWIALKHPAFKDKIVNWLKVLRKANVAVIMATQSLSDSAKSGILDILQEYCPTKIFLPNPEAYKKGSENVLAPYDFYKIFGLNDVQISIINNAIQKREYYYTSPLGTRLFNLALGKTNLAFTTISDKVSVKRVRQLYEKHKENWAYKWLEEKEINYKRFDNSQKEQI >NC_022656.1|WP_002779815.1|6985_7657_+|TrbM-protein MKNFIFGVKKITLALSATLLISSNAFADDILTGDTKLACEAILCLSSGTRPSECSSSLARYFSIKFKKPWKTINARRAFLNLCPIQNDANIEDLVLNNLVDDVLPVSDPRQCTPNYLNTQVETKRSYSTFGIMSYRINPNMPNFCHALINHAYTDYKTPKYKCTGEFYNSLEWKLSAKLQLITQQAYESLSDDQRYMISRTCGDRNCYDYYQKIPFTKECWTY >NC_022656.1|WP_023361551.1|7668_8253_+|phage-Rha-protein MSNTSIININNQEVIFENKDEQVFCTSLDVAKVFGKEHKNILRDIKNILNDLREIGDVQCKSNFELSFKVRKIQGFKGRERKYPYYNLTRDGFSLLAMGFTGKEALQWKILFIDAFNEMERIIKNQYTPKLKNYNKYKIPNTPYKENIIKAIMQTEQNRNCEFEELIAYEIKEIYKDNKSHIEQKINFRAKGLI >NC_022656.1|WP_023361553.1|8840_9635_+|P-type-conjugative-transfer-protein-TrbJ MKKSLFGVKKATSTIIATLIIGTNNAFAGGIPVIDLSAIANQVKDYAMQLQQYEQMYSQLQQQIQMVQMQKQNLERLTKEDWDNLGTVLYQTRNVMNKVNGISYDIGNVSRKFEDTYKNFEGYSNDLENATNESERNKIYSDRYKQIAETNQNTFNGTLQQLELRYQDLESEDALIAKLKQNSQNSNGNLQAVQATNDLLAYQIDEIRKLRSVIMDQSNMLTNYLASQNNQRIMQQAKIDKFIEDTGYIEKTWGKSNPDALKWK >NC_022656.1|WP_079278985.1|9836_11123_+|P-type-conjugative-transfer-protein-TrbL MKLNKGIVLMQNGRLKQKIQVILKKLGVNQTQTLLNGNKLAIIFLIFLAPNLAFGAESAEGVLSIIRNGLLSWTPLIKTACLWVFWTLVIIDLVWTFGLKALSGFEFGDFIATLIKKVMYIGIFLLLFNIDQWLQIIFNSFSQLATSVNNGTAVSPNNIIIQALSIVRKIIQSMDFWSPGDSILKVIAGVIILIAFVLMAIDLLIVYLKFFLMNVIVFFALALGGLSHFKQIGLNPITTAIKVGVELFMIQGLMALCINMIDTINNEITQNSSVEIILTILTTALIFCMITKMVPGIIEAVFNGSIGESAGASAGFRAVATMAAGAATGAAVGAVGVTRAMNAAKALHLAEGGAGGMDLVKGVAKNLASAGGEHLRDNLTRGRMPNQMANRLQEKLRDIQGKASEGGISAGTPKEESYQSGINPNITK >NC_022656.1|WP_002790743.1|11142_11838_+|conjugal-transfer-protein-TrbF MNIFRQKQKIEKNEFDTSSNPYLNAKTEWLERYGDYITRAKNWQMVAIISLAMCFVCVLFIGYIGSQNKLIPYVIEVDKLGNTAKVGMVQNIDLKNPNVIKYSLNTFIYSWRSVWGNAETQRKFIFDAYAYVEPRSKAFNYLNSEFQKNNPFTRSTKENVRVKIKNIVPQNIDTWQVEWEETTTNLNEDILSKETYRGLIRIKQIIPNTEEQILKNPLGIFITDINFAKIL >NC_022656.1|WP_041161634.1|12037_13003_+|P-type-conjugative-transfer-protein-TrbG MANTPKNYTQKLKKLSLIASLLLFIGSSAYANNLNERDFANLTPKEKKDLAIAQKWINSKTTTIQGNNGEVIFLYGEAMPSIVTAPLRLTDISLEPGEVIKDVQIGDSIRWAISLSISGEEPYLVSHIIVKPTDKNLQTTMNIMTNKRVYRLNLISEAKKFMPAVSFNYTNQIIHTLEDYKNQMKAKSESKNFYKTKDDEIPSNIENLDFGYSVEGNAPFKPLRIYNDGIKTYIQMPKNLKFYEAPALMILDSSNEKQIVNYRLKYDTFIVDRLFNKAILLSNVGSKQEKIKITKHSNKANQDIVNNVLYDLSLQNKKENK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_022656_1 | 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder | 2581-2635 | 55 | NZ_CP017876 | Campylobacter coli strain ZV1224 plasmid pCCDM224S, complete sequence | 10967-11021 | 0 | 1.0 |
| NC_022656_1 | 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder | 2581-2635 | 55 | NZ_CP040242 | Campylobacter coli strain S9 plasmid pCcS9_3, complete sequence | 11797-11851 | 0 | 1.0 |
| NC_022656_1 | 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder | 2581-2635 | 55 | NC_022656 | Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr, complete sequence | 2581-2635 | 0 | 1.0 |
| NC_022656_1 | 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder | 2581-2635 | 55 | NZ_CP011016 | Campylobacter coli strain FB1 plasmid pCC42, complete sequence | 12284-12338 | 1 | 0.982 |
| NC_022656_1 | 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder | 2581-2635 | 55 | CP013736 | Campylobacter coli strain OR12 plasmid pOR12CC42, complete sequence | 18107-18161 | 1 | 0.982 |
1. spacer 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017876 (Campylobacter coli strain ZV1224 plasmid pCCDM224S, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaacattcaaatgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta CRISPR spacer taaacattcaaatgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta Protospacer *******************************************************
2. spacer 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040242 (Campylobacter coli strain S9 plasmid pCcS9_3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaacattcaaatgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta CRISPR spacer taaacattcaaatgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta Protospacer *******************************************************
3. spacer 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder matches to NC_022656 (Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaacattcaaatgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta CRISPR spacer taaacattcaaatgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta Protospacer *******************************************************
4. spacer 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011016 (Campylobacter coli strain FB1 plasmid pCC42, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.982
taaacattcaaatgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta CRISPR spacer taaacattcaattgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta Protospacer *********** *******************************************
5. spacer 1.1|2581|55|NC_022656|CRISPRCasFinder matches to CP013736 (Campylobacter coli strain OR12 plasmid pOR12CC42, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.982
taaacattcaaatgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta CRISPR spacer taaacattcaattgttaaaaatgtatcatattttgagacaaaagcaaaaaatcta Protospacer *********** *******************************************
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
|---|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|