Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022737 | Staphylococcus pasteuri SP1, complete sequence | 6 crisprs | cas3,DEDDh,cas14j,csa3,WYL,cas2,cas1,cas9 | 1 | 9 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022737_1 | 924462-924548 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022737_1
|
1 spacers
spacers of NC_022737_1
>1.1|924486|39|NC_022737|CRISPRCasFinder TTAAGGATCACAGTAGCTTACGCTACTGCGTAAGAAGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022737_1
The CRISPR arrays of NC_022737_1 >merge|NC_022737|1|924462-924548|CRISPRCasFinder CTAACCATTAAAATGGAAGTACTTTTAAGGATCACAGTAGCTTACGCTACTGCGTAAGAAGTACTAACCATTAAAATGGAAGTACTT >NC_022737|1|1|924462-924548|CRISPRCasFinder CTAACCATTAAAATGGAAGTACTT TTAAGGATCACAGTAGCTTACGCTACTGCGTAAGAAGTA CTAACCATTAAAATGGAAGTACTT
>NC_022737.1|WP_023373878.1|923902_924247_+|DUF4889-domain-containing-protein MKSKKGLGFGLIAIMLIVCIVLVVAMMAGGKKETYYGVMKNDTTIDKMISEKDEKIEKNVKLPSDAKVSVKKEDFVMITKNEKTGKIAKVKKVDHDDVPHGLMTQIHDMGHMHM >NC_022737.1|WP_041613694.1|923117_923540_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein MDNQKATEAIENVLNHSKVGVLSTAYNNKPNSRYMVFYNDELTLYTKTNVNSIKVEEIEDNPYAYILLGYNETTNHSFVEIDATIEVVKDQKVIDWLWETQDKSFFDSNKDPELCVLKVTPKSIKLMNDKDLDTPFTIEL >NC_022737.1|WP_023373874.1|920938_923041_+|AraC-family-transcriptional-regulator-Rsp MSCHLTLFTQHQTQPCRNINQIIILFSLSHELSIKINGEIKDLDAHIAIINHGDIYEIENATHLVQLSIPIFYFYIEDTSFFQCYFDRHLLQSSDYIKTLLLQLLQQDSKNKIDQTVCSKIIQTLYKEAVVKLEDDYIPNMAVNYALFANCLQFLEEQLTQPISLKDVASNSNISESYCSNLFNRYLNMNFKDYFTSLKLCHSIQLLMTTHLSINAISETSGFTSHTNFTNQFKNYLQFSPKQYRAYINQINAMPQLNIANYDNAVFLPLIENFNFNDQITTEITKIDIDHFDPKDYSKASKAFIRLDNFNELFHFTFNDYFDIDFSFLPEPVILINDIKDLTTNQINYHLLYRCFDKLFERHIGLAMTIKSKEDFKAVNQFILMFLQGHTDYQLNKKTVKLMLIFDSATMTIHDIHLCHLKIKNKNRDIKYGVTIDGLLHQHQTLDKTYDILRRLHFDYYLLDIENIETTSLLINKRKTYNHTTSHFDNYKQFIMDSGIDSTRFVYDYLSFKCFKYTNNGANPLQLADLVCHIIALLRYGGGISYQLIANGSIYISLFNEFGNALPLIHIYKMADAFVDESIQISNNYIMSRKDGNYHFILFNKINDRYLSDTHLEFIFSNNLKANSLITVQTLNNEHGTIDNLLPQNRQQLFLDKEMIEQLDRSNHPKTELSLLEHDNQDIKIILKHDEVKYVCIKPN >NC_022737.1|WP_023373872.1|919628_920000_+|YbgA-family-protein MKERGHIEQLWREEKYRVLLHSQKQYDAIREKLKTQTSYEEIRMMIEHAITIEPSQGSVINAYDHMWGYFKKLATDEEKQSAQTLKQQFVNHDVSIHDLMSFLNILAIKYEVHYLQQSTVLKE >NC_022737.1|WP_023373870.1|917808_919248_-|PTS-sucrose-transporter-subunit-IIBC MNYKQSAEEILNAIGGEENLDSMAHCATRLRLILNDESKVDEEALSKMDVVKGTFSTGGQYQIIIGSGTVNKVFNEMEKITGKEASTTSEVKDKSTKNMNPLQRFVKMLSDIFVPIIPAIVAGGLLMGLNNLLTAKDLFYAGKSLIEVHSQFAGLADMINIFANAPFTLLPILIGFSAAKRFGGNPFLGAALGMILVHPSLMSAYDFPKAVEAGKAIPHWDVFGLHINQVGYQGQVLPMLVAAYILATIEKWLRKVVPTVLDNLLTPLLSIFITAFLTFLFVGPITRQLGYWLSDGLTWLYEFGGAIGGLIFGLLYAPIVITGMHHSFIAVETTLIADQAKTGGSFIFPIATMSNMAQGGAALASFFIIKNNKKLKGVASAAGISAVLGITEPAMFGVNLKLRYPFIGAIIGSGLGAAYISFFKVKAIALGTAGIPGFISINPNHGGWLHYLIGMVIAFVVSIVVTFILSKRKKYKEVQ >NC_022737.1|WP_023373868.1|916790_917738_+|magnesium-transporter-CorA-family-protein MITAYKHSNQMNNEIIETPIDQQPLWINVVEPDREEIEYLMDHYNLPEDFIRDPLDSEESARIEYDEDTGYSLIIIDLPLINSTNRSVLSFITIPLGIVIGNGIVMTICDAENEFLENFSRQDNINLKFHSRFALEILTTIANHYNRNLRLLNKSRIRIERELKNNITNKQLFKLMEVEKSLVYFLAALKGNDTIIKKLFRLPAIKRFEDDEELLEDLIIENNQAIETTELHQRILESITTSYASLLSNDMNTIMKTLTMFTVLLTLPTLVFSFFGMNVILPLDDHSYISWIIVVVISLILVAIVSIYLWRKQKL >NC_022737.1|WP_023373866.1|916120_916729_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MKEDRRVRKTKSAIKHAFIQLLKERGLENITVQDIADKADINRGTFYLHYEDKYLLLTDMEDECIDQISKFTQFSEIQGDNVEMIATLFIDKVLRNIIQHVYDNLDFYNTILSLERKSRLEEKIIDLIQENMKNQISVDNEIEGIPEMYFHSYVSGATISIIRYWVLDTNRISVDELVTHIFKIIYYGPLRIMAEQRYNHLN >NC_022737.1|WP_023373864.1|914680_915958_-|YhgE/Pip-domain-containing-protein MNIFKSKLLWLTPIAIILLLMLFAIAFYPAFNPKPKDMPIAIVNHDKGTSIQGKKMNIGDKLEDKLLDSDSKAIKWVKVDSEKDAKKGMENEKYYGAAIFEKDFSKHAMSKTQKVVMDSKKAEMKEKVESGEIPAQQAQMMAKKMGNQSVDVKQAQLKTIVSQGSSLQGSQMATNVLSGMGDNINKQITKQSLQTLEKQNVKVDAKDINSVTNPVKVDNEKINKVKDHQGGGNAPFLMFMPIWMGSIVISVLLFFAFRTSGNIKIAHRLIASVGQIVFTAIAAFAGSFAYVYFMGGALGFDFDHPNRVAIFVALAIMGFVGLILGTMTWLGMKSVPIFFLAMFFSMQMVMLPKQMLPKFYQHYIVDWNPFVHYATSLKEIIYMNHHIELNSTMWMLIGFMIFGAVSSLLAAAIRKHSTKRTEVPS >NC_022737.1|WP_023373863.1|914138_914564_+|lipocalin-like-domain-containing-protein MSQLQEQLIGTWALVSYQDEDENGKIFYPLGKDATGFIMYNPDGYMSAQLMQQGRPAYASGDLHTGTKDEMAEAAHGYLAYAGKYELDEENQTVYHTMNVSMNPTWLGDTQPRVFKLEGNTLSIENGNNPNQKLVWQRVNH >NC_022737.1|WP_023373861.1|913346_914102_+|3-hydroxybutyrate-dehydrogenase MNRNIIVTGSGQGIGYAIAQAFDQQGDRVFIFDMSKDAAESAAQSLEKGVAYQVDVTDETTVKNAINDVTNQYGAIDVLVNNAGIQYISKIEDFPLDKWNQVIGVIQTGTFLMTKHVLPSMKKQQKGRIVTISSAHGEMADPFKSAYVASKFAQIGFTKTIALETVNDGITANAVLPGPVRTKLIENQLAKLAEQDGTSEQEAMEKHITSKSPMNRLLEPSEIADTVVFLASDGASAITGETISVSGGSNA >NC_022737.1|WP_023373880.1|924744_926022_-|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter MALFKRKISLPVQVLIALVLGVVVGLILYGNEEAANYIKPFGDVFLNLIKMIVIPVVFCSLALSISNVGESKTVGRYGWKTILYFEIITTIAIGLGIIFGNLFKPGSGLDPSKLPKGDISKYQSSAHAAEQSTYGNHFIDTIVNIVPTNFFEALTKGELLPIIFFAVFFGLALAAIGEKAEPVKSFLSGTLEAVFWMINKILKLAPLGVFAFICTTIITFGASALLPLLKLVLVVVFAMVFFIVVVLGIVARMCGISIFSIMKILKSEILLAFSTSSSEAVLPVMMKKMEKFGSPKEITSFVIPIGYTFNLDGSALYQSIAALFVAQMYGMHLTLTEQLVLMLTLMLTSKGMAAVPGTSIVVLLTTLGAMGLPAQGLALIIGVDRLLDMVRTVVNVMGNALSTVVIAKWENLYDKKQGQEYLKSL >NC_022737.1|WP_023373882.1|926273_926639_-|DUF3139-domain-containing-protein MSRKQKLIRITIILIISLVLAFAFFFALKTYQGHKNIEMVDSYLKEHHLKDKIKKEETLYSAKKGVYYKEVIYKDEPKVTYVIQPISTRKGIFAEGFDTETKKSLKSAKHNYFNKNYKPSN >NC_022737.1|WP_023373884.1|926767_927397_-|nitroreductase-family-protein MERISKFDDVLKGRKSVKVFDTEYKISHEEMDEMIQKATKAPSSVNMQPWRLMVVDTDEGKEKILPSFGMNSRQVNTSSAMIIVFGDLKNYEKAEQIYSDAVSKKHMTEEIKDKMLSWVLPHYKGLSREGMKDIVNIDSSLMAMQFMLVAKSHGYDTNPIGGFDKANIADVLGLDSDRFVPVVAIAVGKGAQEAHESVRLPLDDVRQYL >NC_022737.1|WP_023373886.1|927561_928008_+|MarR-family-transcriptional-regulator MYVENSYLSKQLCFLFYVSSKEIIKKYSSYLKEYELTYTGYIVLMAIEEDEKLNIKTLGDRVFLDSGTLTPLLKKLEKKNYVVRTREEKDERNLQISLTDHGKSIKKPLSEVSVKVFGEFDIDVNEAKELINHLQMFVSKNFDKSTEK >NC_022737.1|WP_023373888.1|928246_928663_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MPSNDFFNNSFLKNDPTDMFRDLGKQVFNQFSTQAFPANLYNESDHYLIEAELAGVKKENISLTFDHHTLTIKANKYIEPHNGQAQLNERSNGELVRRFEFEDVNKDLIKATFEDGVLNIRLPKQQQESEDATTISIL >NC_022737.1|WP_023373890.1|928716_929868_-|NarK/NasA-family-nitrate-transporter MDKTKGGFQLTLQTLSLVVGFMAWSIISPLMPFISQDIKISAEQLSIILAIPVILGSILRVPFGYLTNIVGAKWVFFCSFIVLLFPIYFLGQAQSPKMMMLSGFFLGVGGAIFSVGVTSIPKYFPKDKVGLANGIYGMGNIGTAISSFLAPPIAGIIGWQTTVRSYLIIIAIFAVLMFIFGDHREPKVKVPLIAQMKILFKNYKLYYTSLWYFITFGAFVAFGLFLPNYLVQHFGIDKVDAGIRSGIFIALATFLRPVGGILGDKLNAVKVLMVDFVIMIIGALILGFSNHIALFTIGCLMISVCAGIGNGLIFKLVPSYFAKEAGSANGIVSMMGGLGGFFPPLVITYVTGMTGSSHLAFIFLAVFGLIALITMVHLNKKEA >NC_022737.1|WP_041613696.1|930297_930951_-|response-regulator-transcription-factor MKIVIADDHAVVRTGFSMILNYQEDMEVVATAADGVEAYQKVLEFKPDVLLMDLSMPPGESGLIATSKIHESFPETKILILTMYDDEEYLFHVLRNGAKGYILKNAPDEQLLLAIRTVYNGETYVDMKLTTSLVNEFVNSSNQEYTDTSDPFKVLSKRELEILPLIAKGYGNKEIAEKLFVSVKTVEAHKTHIMNKLELKSKPELVEYAMKKKLLEF >NC_022737.1|WP_041613697.1|930973_932005_-|sensor-histidine-kinase MTVNNKQLEVLLKRYFESTNEKIVFVNNNGKVIAMNEAAKEVISEEENYSAMTNAICRRCEGYTNEYDLQSCKDCFLDVEQPHHSQFQVFMKTKNRKIAPFTASYHTIDSVKGINAFTLQDVAPQIERQEKMNQRRMMRKTISAQENERKRISRELHDSVIQEMLNIDVQLRLLKYQEDKEKILDDVKNIEGLMSQLVDDVRHLSVELRPASLDDLGLEAAFKSYFKQFEENYGMRINYVSNIVNHRFDSEVETVVYRVVQEAVYNALKYAGVSEVEVTIQQNELTLIAEIIDRGQGFDPSSKPRGSGLGLYGMKERSELVEGNLNIETHIGKGTIITLEVPL >NC_022737.1|WP_002465468.1|932014_932467_-|GAF-domain-containing-protein MMPDSMFESQNFQENIDRIRLEQGFDFAALAFYESASTFSPIKWQYVSGNKNDRYKLIILRKGRGLAGNVMKTGKRMVIANVDMALTPDEKVKFPILLSENLTAVIAIPLWYQQQVYGVMLFGQRNHKPLPINVYDIDIYEQLGIFNEEI >NC_022737.1|WP_023373896.1|932488_933166_-|respiratory-nitrate-reductase-subunit-gamma MINQFLWVIYPYLCIAIFIIGHIARFKYDQFSWTAKSSELIEKKRLKWGSLLFHLGVIPVFFGHVVGLVIPKYWMDSLGVSEHMYHFGAVYIGSIFGIMTLIGMLLLTARRITIKNVRRLSSFSDIFVNILLLIIIFMGCYSTIVTNMMHIEFNYREIISVWFRQLFMFKPHADLMTNVPLQFKLHMLLGFTIFACWPFTRLVHVWSVPLSYTNRRYIIYRKNKL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022737_2 | 1119762-1119843 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022737_2
|
1 spacers
spacers of NC_022737_2
>2.1|1119787|32|NC_022737|CRISPRCasFinder TAGCCCAACTTGCATTGCTTGTAGAGTTTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022737_2
The CRISPR arrays of NC_022737_2 >merge|NC_022737|2|1119762-1119843|CRISPRCasFinder TTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCTAGCCCAACTTGCATTGCTTGTAGAGTTTCTGTTTGAAATTCTCTATGTTGGGTCCC >NC_022737|2|2|1119762-1119843|CRISPRCasFinder TTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCC TAGCCCAACTTGCATTGCTTGTAGAGTTTCTG TTTGAAATTCTCTATGTTGGGTCCC
>NC_022737.1|WP_023374151.1|1118307_1119363_-|PTS-transporter-subunit-IIC MTTLSKIGPKEFIFRVLSGVAVGIVAGLVPNAILGEIFKYLMQFHPIFKTLLGVVQAIQFTVPALVGALIALKFNLTPLAMAVVASASYVGSGAAQFKNGTWIIAGIGDLINTMITASIAVLLILLIEHRVGSMALIVYPTIVGGISATIGVLILPYVHMITTGIGNMINSFTELQPVLMSMLISMVFSFIIISPLSTVAIAIAIGISGIAAGSASIGIAATEAVLLIGTSQVNRAGVPISIFFGGVKMMMPNMVRYPIIMLPILITAAVSGIASGIVGIAGTKESAGFGFIGMVGPINAFKFMGIDSAWLSLLLIIVAFFIVPFFVAWILDILLRKVFKIYTNDIFKFLA >NC_022737.1|WP_023374150.1|1116785_1118210_-|polyphosphate-kinase-2 MNKKIEQLKLKAASLTRQTHDLGIPVMIVFEGVPASGKTRLSNELLLTFDAKYTQFISTKTPDDEDLRYQFLQKYWNTLPQKGNINIYFRSWYSHFLDYKQNNIKQDYYKNDDKLVNQIKHFEEMLQNDSYELIKFYIEVSEEKRQEHIQQTKDNPLMSWKVQEYEQIIPKDIYLKEMRKFTHSDKQWEVIDYTQREVAFEKMYKHIIERLEQAIQKANQSKGNKDGAFTKDFSTTKFDVTLDEVSKKEYKELIEPLQKRMREIQFALYERKIPLILTFEGMDAAGKGGNIKRIREKLDPTGYEVNGISAPTDVELAHHYLWRFAKEMPKSGHIEIFDRSWYGRVLVERVEGFANKDEWQRAYEEINHFEKMWTDEGAILLKFFLCLDKEEQLKRFKDREQDVNKQWKITDEDWRNREKWDLYLEASHDMIDKTDTIHAPWLIVPADHKKTARIEVLKYIIRQCEKVLWGVKDY >NC_022737.1|WP_023374149.1|1115570_1116326_-|transglycosylase-IsaA MKKTFIASTLALTLGAAGYAVSGHEAHASETTNVDQAHLVDLAHNHPEQLNAAPIQEGAYDIHFVSGGYEYNFTSDGSNFSWNYQEVGSTSAQTSNTAVQSADYTTSYNQEAGTQSVSSNQQSSNTNVEAVSAPTTSNNGSSHNYSTKTTSYSAPSTSSASTSSASTGGSTKAQFLANGGTEEAWNAIVMPESGGNPNAVNPAGYRGLGQTMESWGTGSVASQTKGMLNYANSRYGSLSNAIAFRNSHGWW >NC_022737.1|WP_023374148.1|1114365_1115229_-|phytoene/squalene-synthase-family-protein MTTVNESYKYCHQIMKKYSKSFSYAFDLLPESERRAVWAVYAVCRIIDDSIDEEQNPQKLQAIKEDIQLIQSQQVDSTDQFKSNQRIMLAFYDTSQNYKMEYQSFYNLIESVFEDEHFEMFVQDEDLMRYCYGVAGTVGEVLSPILTEQPSDETYEVARELGEALQLTNILRDVGEDFEKGRIYFSREMLKQYDVNIEDVYQHQPTDNYINLWEHYAQIAEKDYQFALDHLHVFKTEARLIIELAARIYKGIIDEVREHGYPLHRRAYVSRLDKLNIYRQVKAKYNK >NC_022737.1|WP_041613731.1|1112847_1114353_-|phytoene-desaturase MNIAVIGAGVTGLASAARLAAHGHQVTLYEKNEQIGGRMNQFTKDGFTFDMGPTIVMVPEVYKAVFEECGERFEDYVDMEQLPYIYDIYFDKDDKVRVPTDLAELHDTLEQIEPGTTHGFMKFLADVYGRYEIARKYFLERTYRKPSDFYNLTSLIQGYKLKTLNHADNLIGQYVQNEKVQKMLAFQMLYIGIDPKQGPSLYSIIPMIEMMFGVHFIKGGMYGMAKGLEQLNLKLGVDIQCNANIDEIIIDPKYKKADGVRVNGLVKRFDKVLCTADFPYAAQQLMPQHAPVKKYPPQKIDQLDYSCSAFLMYIGIDKDITEDVLLHNVLFSNHFRQNIDEIFNGDISEDPSLYLYVPKVGDATLAPEGQTGLYVLMPTPELKTGPLEWENPEFIDSVKQHIYRKLATIPALEHVRDHVISETIFTPKDFEQTFNAKFGTAFGLMPTLAQSNYYRPPNVSRDYKDLYFAGASTHPGAGVPIVLTSAKITVDEIIKDINNHI >NC_022737.1|WP_041613730.1|1111490_1112651_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MKMSERLAAIPESYFGKTMGRKIEYGPLPLINMAVGIPDGETPQGIINHFAKRLNVPENQKYGAFHGKSSFKQAIVDFYQRHYDVELDAEEEVCILYGTKNGLVALPTCLVNPGETVLLPDPGYTDYLAGVMLADAHPVPLNLEPPHYLPDWDKVDKNTLNNTKLIYLTYPNNPTGSTATKAVFDEAIQRFKDTNTKIIHDFAYSAFGFDAKNPSILSSDNGKDVAVEIFSLSKGYNMSGFRVGFAVGNRDMIQALKKYQTHTNAGMFGALQDAASYALNHYDEFLEQQNDTFKRRRDMFERKLSEARVPFVHSKGGIYCWLKTPPGYESESFEQFLLKEYSILVAPGIPFGENGRNYVRLSLALSDEQLETAAERLATLANLYEK >NC_022737.1|WP_023374145.1|1110470_1111469_-|D-lactate-dehydrogenase MTKIKIMSVRDEDIVYIESWAKENNVEYELTKSPLTEDNVDEVKGFDGLSLSQQLPISEAVFAQLKSFGIKQIAQRSAGFDTYDLELASKYDIIVSNVPSYSPSSIAEFAVTQAINVVRHFNAIQTKMKLHDFRWEPSILSQSISDLKVAVIGTGRIGSIVAKIFANGYGCEVVAYDPFPDAHIKDIVSYQTTLQDAIEGADIVTLHVPATKYNHHLFDQYTFNHFKKGSVFVNCARGALVDTHALLSCIDSGQIKGAALDTYEFERGLFPSDQRDKKMNDTLLQQLIDREDIIITPHIAFYTEAAVKNLIVDALDATMEVIQTGTTHLRVN >NC_022737.1|WP_023374144.1|1110219_1110426_+|copper-chaperone-CopZ MGQEIINVEGMSCDHCKNAVESALAKINGVSAAEVDLDKGQVRVDYNEDKVQLSDMKDAIEDQGYDVK >NC_022737.1|WP_023374143.1|1107740_1110125_+|copper-translocating-P-type-ATPase MDKNKRTTLDITGMTCAACSNRIEKKLNKLDDVKAQVNVTTEQATIEDFKGQYRTSDYVNEIQHLGYDVVKGSVELTISGMTCAACSNRIEKVLNKMDGVVQATVNLTTEQATVTYYRGVVNSDDFISKIQNLGYDAEVKEGQQQYSNKDKQLKKQFHKLIFSIVLSVPLLMTMLVHLFHLSLPSILMNPWFQFILATPVQFIIGWQFYKGAYKNLKNGSANMDVLVALGTSAAYFYSIYEMFKWLNHSTHMPHLYFETSAVLITLILFGKYLEAKAKTQTTNALGELLSLQAKEARIVKDGIEKMVPIKDVQVGDHIIIKPGEKIPVDGVIIKGITSIDESMLTGESIPVDKNVDDKVIGATINQNGSIIMEATQVGNDTALANIIKVVEQAQGSKAPIQRLADRISGYFVPTVVGIALLTFIVWITVVHVGEFEPALMAAISVLVIACPCSLGLATPTSIMVGTGRAAEKGILFKGGQYVEQTQHIDTIVLDKTGTITNGKPVVTDFDGETRTLQLLASAEYASEHPLAKAIVDYAKEKNLELVDTNEFNAMPGHGISATIDHSMILVGNRQLMTKHQINLNSHIDEKMTQWELDGKTVMLIAIDGIYQGMIAVADTIKDNAIESIQKLHNMNIDVVMLTGDNNNTARAIAQQVGIDHVIANVLPDEKSDNITRLQKEGRQVAMVGDGVNDAPALVTADIGIAMGTGTEVAIEAADITILGGDLSLLSQTINISQLTMRNIRQNLIWAFGYNIAGIPIAALGLLAPWIAGAAMALSSVSVVTNALRLKRIIK >NC_022737.1|WP_023374142.1|1107321_1107528_+|hypothetical-protein MKRILKAVIAVLILLGVVKTVQTHDVINEADQYYQQMKNGQLLENISNYDINQVKDINLKQFSPSDFF >NC_022737.1|WP_023374154.1|1121499_1122066_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MNTTKIDPRILRTKKLLVEAFQIVSRKKQFSQITVKNITDEATVNRATFYAHFTDKYDILEYSLSVTILKDLNDTLNISDFINEQVLSKLFITICDYMVDVQNFCELNQAIFCNQAHQRINEELEDIFTIMLENSYPNHDRDTLVNSASFLSAGLCGLCKHWLNTSQQTAKVFIKKNLPFLIHHIAHL >NC_022737.1|WP_023374155.1|1122311_1123256_+|LLM-class-oxidoreductase MTTIEDHEGFKRTFKDKHLTLGLSIPFDQSQQEHINIEEQVELAQLAENLGYSSLFVRDNPLYSKYLGHVTENYDPFVFLTYLAAHTSTISLGTASMVATLRHPLHLAKAATSLDILSHERLLLGMATGDRSFEFPAFKVNKDELAERYRTSIKSLRQLWQSNSPDISNSIFELSEESGLQILPKNKAIPMFGTGYSKQSIEWLKQNMDGWIFYAQRFQNQKQLVEQWHKDNDSFKPFINILFIDLSSNPNETVKPIKGGYRTGRKMLLEILKAYETIGTNHIILRFINKDRQLKDLIDEVGMYIVPHFPTHQI >NC_022737.1|WP_017636600.1|1123268_1123505_+|DUF896-domain-containing-protein MEILNRINELANKEKVQTLSVEEKQEQQALRQDYLKMIRGQVLNTFSTMKVVDPLGQDVTPDKVYDLRKEYGNIQENE >NC_022737.1|WP_023374156.1|1123559_1123937_-|glyoxalase MIQSMWFNLHVKDLKRSEQFYQSLGFEINHNPDMLDKMVGIKIGSTIVILIENQHFEAVTQDKIHDNANETIISLGVKTNEEVDQLIKQVETAGGRILEQPTVKQGYYGAMFADPDGHKFNFLVC >NC_022737.1|WP_023374157.1|1123968_1124784_-|NmrA/HSCARG-family-protein MKSILVIGSTGKQGNAVVKQLLSDGWHVRALTRNKNNEKLTSIESDQLEIFEGDLSDQQSLEQAMEGQYGLYSVQPIVKDDIAEELRQGKMIIQLAEKQNIEFVVYSTAGGVNRDRKGPHFEALADIENTLKVSSLNFSIIKPSFFMDNFLRIAKKENQQIVIPEFISPDVKFAMISSIDIARIAANLFKEPAQYNHQAIEIASDELTLNEVVKTFATVTGMPTEIKGEFVSGTAERSWLEEKGYVVDFDLMNQINPDKLSLAQWIEKVQF >NC_022737.1|WP_023374158.1|1124801_1125104_-|DUF2316-family-protein MSLNKEQRQITAKELQEHFDETTLSLKNIADELNISINDVSHVLQMKAPNKLFGNHLQQFIHLVWDVRDLMNENIWHTGKSPKEYTYLKGEKEDYWFLQQ >NC_022737.1|WP_041613733.1|1125229_1125781_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MRRDALENRQRIENKAIELFNQYGVQQVSMNRIAKELNIGMGTLYRHFKDKSALCATIIEHDFTEIINQMYEVKEKHHDTKVVMTKSLDIFLDFKTINSDLLHCIEETTDKNDFYHSDIYLQLFKFYSEILGNNISTTWTTFKVDMLLKSLSTKSFELQKDERGLSNETIRDYIIKLYFDKEE >NC_022737.1|WP_023374160.1|1125785_1126490_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MTKITLITGGNKGLGFETAKALINEGHKVYIGSRNESRGQEAAKEIGAQCVQLDVTDETSVQHAFDYIKDQEGRLDVLVNNAGISGQFAKPANITVEDMDKVYQTNVYGIVRMMNTFIPLLEQSEQPVVVNVTSGLGSFGMVTNPETEEFHVNSLAYCSSKSAVTMLTVQYAKGLPQMQINAADPGSTNTDLVGDFSNNSKPATEGIKPIVELATIDANGPTGTFINGDGKMPW >NC_022737.1|WP_023374161.1|1126557_1127559_+|amidohydrolase MKSITFEEHYVIDDIQKETMSQASADPNGVPMKVMLEGLEKKSGFTDADEISHHDKRIKFMDEQNVQMQVLSYGNGAPSNLEGQKAIDLCKKANDQLADYIKQYPDRFVGFATLPINEPEAAVEEFKRCVNELGFKGALIMGRTKDGFLDQDQFDGIFATAEELNVPIYLHPAPVNSDVYQAYYKGNYPEITAATFACFGYGWHIDVGIHAIHLVLSGIFDRYPNLNMIIGHWGEFIPFFLERMDETLFADHLKHPVSYYFKNNFYMTPSGMLTKPQFDLVKKEMGIDRILYAADYPYIEPERLGVFLDELGLTDEEKEKVSYRNGAKLLGLE >NC_022737.1|WP_023374162.1|1127602_1128436_+|alpha/beta-hydrolase MNTIELKGAKLRYHQIGQGPVLIFIPGANGTGDIFLPLAQQLKDHFTVVAVDRRDYGESELTEPLPESAANPDDDYRVKRDAQDIAELAQSLSDEPVYILGSSSGSIVAMHVLKEHPEVVKQIAFHEPPINTFLPDSKYWKDKNDEIVNQILTEGLEKGMKTFAQTLNIAPIDAKMMSQPAETEEAQKEQYQRVMFWSEYEIRQYTHSDITLDDFKKHEDQITLLNGTDSKGSFPQDVNFYINEQIGLPIFDIPGGHLGYVQKPEGFAEVLLKMWHK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022737_3 | 1369966-1370793 | orTypeII |
NA
Consensus repeat of NC_022737_3
|
12 spacers
spacers of NC_022737_3
>3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTGCATTTTATTAATTTCTGCCTCAG >3.2|1370068|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAACTCATCCATTGAATCAAGAACTTCTG >3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCGGTTTTGTTAGTGATAAAGCCTAATTC >3.4|1370200|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTAAATAAGTATGACCGTATTCTGCATA >3.5|1370266|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCTGAAGACGCTTTAACATTAGGTGTTTG >3.6|1370332|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGAGAAAGTCGCAAGTACGTTCTATTGTA >3.7|1370398|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTCACCGGGTCTAATATTTCTCCATCTTT >3.8|1370464|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGAACCTGTCCAACCGTTAGCGCCATACC >3.9|1370530|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTCTTCGGTACGCCAAGTTCCCTCTTTTA >3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGTATTTAAAAGTGCAAACCAAATAATTT >3.11|1370662|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTACTAATGTTAAGGGTAACCAACCACTGT >3.12|1370728|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAACACGTTGGACACAAAAAGGAAGATTAA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022737_3
The CRISPR arrays of NC_022737_3 >merge|NC_022737|3|1369966-1370793|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCTACTTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACATTGCTGCATTTTATTAATTTCTGCCTCAGGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACCTAACTCATCCATTGAATCAAGAACTTCTGGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACGTCGGTTTTGTTAGTGATAAAGCCTAATTCGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACAACTAAATAAGTATGACCGTATTCTGCATAGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACACCTGAAGACGCTTTAACATTAGGTGTTTGGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACATGAGAAAGTCGCAAGTACGTTCTATTGTAGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACATTCACCGGGTCTAATATTTCTCCATCTTTGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACGAGAACCTGTCCAACCGTTAGCGCCATACCGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACTCTCTTCGGTACGCCAAGTTCCCTCTTTTAGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACTAGTATTTAAAAGTGCAAACCAAATAATTTGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACTTACTAATGTTAAGGGTAACCAACCACTGTGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACAAACACGTTGGACACAAAAAGGAAGATTAAGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC >NC_022737|3|3|1369966-1370793|CRISPRCasFinder ATCTACTTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ATTGCTGCATTTTATTAATTTCTGCCTCAG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC CTAACTCATCCATTGAATCAAGAACTTCTG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GTCGGTTTTGTTAGTGATAAAGCCTAATTC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AACTAAATAAGTATGACCGTATTCTGCATA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ACCTGAAGACGCTTTAACATTAGGTGTTTG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ATGAGAAAGTCGCAAGTACGTTCTATTGTA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ATTCACCGGGTCTAATATTTCTCCATCTTT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GAGAACCTGTCCAACCGTTAGCGCCATACC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TCTCTTCGGTACGCCAAGTTCCCTCTTTTA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TAGTATTTAAAAGTGCAAACCAAATAATTT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TTACTAATGTTAAGGGTAACCAACCACTGT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AAACACGTTGGACACAAAAAGGAAGATTAA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC >NC_022737|3|1|1369966-1370793|CRT ATCTACTTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ATTGCTGCATTTTATTAATTTCTGCCTCAG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC CTAACTCATCCATTGAATCAAGAACTTCTG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GTCGGTTTTGTTAGTGATAAAGCCTAATTC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AACTAAATAAGTATGACCGTATTCTGCATA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ACCTGAAGACGCTTTAACATTAGGTGTTTG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ATGAGAAAGTCGCAAGTACGTTCTATTGTA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ATTCACCGGGTCTAATATTTCTCCATCTTT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GAGAACCTGTCCAACCGTTAGCGCCATACC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TCTCTTCGGTACGCCAAGTTCCCTCTTTTA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TAGTATTTAAAAGTGCAAACCAAATAATTT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TTACTAATGTTAAGGGTAACCAACCACTGT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AAACACGTTGGACACAAAAAGGAAGATTAA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC >NC_022737|3|1|1370032-1370793|PILER-CR GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC CTAACTCATCCATTGAATCAAGAACTTCTG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GTCGGTTTTGTTAGTGATAAAGCCTAATTC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AACTAAATAAGTATGACCGTATTCTGCATA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ACCTGAAGACGCTTTAACATTAGGTGTTTG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ATGAGAAAGTCGCAAGTACGTTCTATTGTA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC ATTCACCGGGTCTAATATTTCTCCATCTTT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GAGAACCTGTCCAACCGTTAGCGCCATACC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TCTCTTCGGTACGCCAAGTTCCCTCTTTTA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TAGTATTTAAAAGTGCAAACCAAATAATTT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TTACTAATGTTAAGGGTAACCAACCACTGT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AAACACGTTGGACACAAAAAGGAAGATTAA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC
>NC_022737.1|WP_023374361.1|1368221_1369955_-|DUF2075-domain-containing-protein MSSMRKPIIKNISYSNEELVNSLGEWQQSDDSKFLLRYPTVYIINDKNKSDHFNLYVGETTDIKNRTIQHLKNDVKLKDYWKSFYSSDTSSMYVIGHPFFNKSLTLDIENKFMQYLSSVDAVTSIFNSRTNQQNEYYTSEKLDEIFTNIWQQLHKENSKLFPIESVIKDSAIFKASPFHKLTNEQQSVKDEILNKIEHAILSESEENQLILVEGEAGSGKTVLMSTLFFELKQMMDLDEMKNLDIHLLVNHDQQLKVYKQIANKLGLEGKNQNIINKPTSFILNRDVKDKADVVIIDEAHLLLTQGKMSYRGEGHLKDIQKRAKVVVAVFDKKQILSKQQIWEFDTLDKLIQYSKDQNNHLLLKNQLRINSSIETMNWLRHLIDDHKIDPIPQDSKGYDIKIFDTPAELEKAILRKSKNIESGLSRMLATFDWEFKNGKSPNDGLFWEVKIGQWSRPWNLQLKCPRGEKNLAWPEQSQTINEIGSTFTIQGFDLNYAGVIIGPSVKYRNGKIIYDKSESKNIQVTQNRKLSDDTMKNFGEELLRNELNVLLTRGVNGLYIYAVDDELRNALKEASKG >NC_022737.1|WP_023374360.1|1367877_1368216_-|nucleotide-pyrophosphohydrolase MRTENSVMEKINQFRDERNWRQFHNEKDLALSITLEASELLELFQWKSSEDVVESKRERLAEELADILIYSYMFADNLDFDINEIIERKLVKNAEKYPVDKSKDNNSKYNEL >NC_022737.1|WP_023374359.1|1365899_1367759_-|BglG-family-transcription-antiterminator MIERQIKLIELLRNNRSDYLKSDDIASYLNISNRTARTDIKIINNQFMPEVIGNIKSKGYFLNTTRYSLEDIDNQLSNYLHQDGKLLIKIAYQLLMYSKSVLISELMEQFQLSKKEILDYMSRIQMWCEKYEVNIIIKRKTGIRVTGNEKDINNAILHLNQLSKQHHRVEDLILNELPKAHIQIIKQIIETNLSVHDIRTSHLQIEQLVIHLILILKRQSISEESWNINDESLVISNEIIKGINQRLGYHLNTQTVHLFSFFISYHFNKFDLGFEKVFIESYIQQLITKMEQKMHLKFGSDNVLKDNLLAHFSRTYLRIMKEVYLNNPLTGEIKILYPYVFNVLYDIIHELAKDTGINLSEDEIAFLTIHFQASIDRNEESQVNIAICCYYGLGISQLLETKISKVNQHVKVIDILRFEDIENDAFENIDILITTHDINMQLPQYLDVIKVSPLFSEDDQFKLNRIVKGKLNPISKNNGLNEIPVTIVNNDFIQTIPGVFEMAHQILNNYKAISSGYIETALNREKASSTYIGNSMTMPHGDPTKVLNSHIIIFKSNNGFYWKEHKVKLVFFLAIAKPDIHLMKQMMQNLSLLDEEDIHQLAHLEETAFQNKILKLIKG >NC_022737.1|WP_023374358.1|1363864_1365820_-|PTS-transporter-subunit-EIIA MKILAITSCPNGIAHTYMAQEKLEQAAKKMGVDIKVETQGGVGAENVLTAKEIREADGIIITADRQVDLSRFNGKRLINENVREGIHHPETLIQRIIDQDAKIYHDKNATTQSKDSDDEEDQKSGIQMVYQHLMNGVSFMVPFIVVGGLLIAIALTLGGHPTSEGLKIPDDSFWKAIENIGKLSFGFMVPILAGYIAYSIADKPGLVPGMIGGAIAADGSLYGSEAGAGFLGGIVAGFIAGYVAKWIKNIRVPKAMAPIMPIIIIPILASLVVGLIFIFLIGAPISGIFTALTGWLKGMQGANIIILALIIGAMIAFDMGGPVNKVAFLFGSALIAEGNYAVMGMVAVAVCTPPIGLGLATFVQKHKFNHAVQEMGKASFTMGLFGITEGAIPFAAQDPLRIIPSNMIGAMVAAVIAAMGGVGDRVAHGGPIVAVLGGIDHIIWFFIAVIIGSLVTMITILILKRNTPVTDVEENQVDAHLETSTNSSQESKHSESKVDESVEHNDNVFQKDVININTNVKTKEEAIDYMVKNLKEHRFINNEDVVKQAILNREAESTTAIGMNVAIPHAKSDAVKQPTVAVLQNKEGVDWISLDETLPKILFMIVVPNDSNNTHLKLLQRLSRSLMDDKTREALINAPSKDDIYDILKEI >NC_022737.1|WP_023374357.1|1362914_1363850_-|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I MVLFLKPVFQEKIWGGTALESFNYHLPSNNVGECWAISAHPNGPNVIENGDYKGKTLDEVWSIDRSLFGNDKRDKFPLLTKILDANDKLSVQVHPDDDYAQKYEGEYGKTECWYILDAKEDAEIIYGINVDNKEDLVECINNREFDRLFKKVKVKPGDFYYVPAGTVHAIGSGILILETQQSSDTTYRIYDYDRKDKHGHLRDLHLEQSKAVININQENPNMVPQKSEVQGQTVTQFVSNEFFTVEKWEINSKLNYNKPHAYCLVSVIDGTGSVIIDDERYDIQKGRHFIITNEDQDILFEGKLEMIISYS >NC_022737.1|WP_023374356.1|1361824_1362661_-|membrane-protein-insertase-YidC MKLKYLILVLLAPVFLSACNYSKPENRNGFFYNTFAKPMDLFLNWMGEHLNHNYGLAIIIIVLAIRLIMLPFMLSQTKNGQFMRKLMKIAKPELDPIQEKVRRARTQEEKMDANKEMMDVYKKYHINPMKSMLGCLPMLIQMPILFGLYASLKWPVHNHLSQYPHFLWFDLSNPDIYITLIAGILYFIQSLVSLGNMPQEQRQMGYMMMVISPIFIIYISFTSASALGLYWSINALFLIIQMYFSNQYYSKIADEYIKSFEKQNDKKSQKAKTIKKKK >NC_022737.1|WP_023374355.1|1360360_1361008_-|hypothetical-protein MVDLILGFVGGFIERRIYKAKYREWTVARALDQDYFNREIARCEAQFESDKQYILSEHKRIDSKIRNDYQSIYTHFETEAQKLETYLPSEFRSLDILSTLFAILNAGFGDSWKEIINVYRDQKNMNELKSHINDIQNTLNSMSNNQKATIQAINHQGQQQQRLLNELNVGIQQSNNNIEKLTNDINRGYDKVQRNHKAIHDELVDMNPNNPRGKY >NC_022737.1|WP_023374354.1|1359739_1360306_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKTTKILGATTLAGALLFTGVSSHNASAAESSVNANNAQSVATQVWKEDGYKPERVNFQKAEDKGDYYLLGYNNKSGVGDGAVRVYKDGTVETGEGVLATADDGKFYKNGKYQFDNSNNNEQGQQQATDNTVTTQNNNQQQAVQNNATQAQELPATGETTNNGLVASIATALLAIGSLLTFKRFSKEK >NC_022737.1|WP_023374353.1|1358523_1359054_-|hypothetical-protein MQIKNAIYQGTISGKQVVVDHERLKYNKFLILPVIVGIIFIYLAMVVMVIIINLAFLVDLVFINILGCIVGFFIPAILFKYLHNQIFMREITLIQLGWDQYELHVGNQKYIGYYKDVKKAIYVSYPGQATIFMPDAVTKIKTSDGTYRIAAVKMEQQQTVQKIKFHFEQMIDKYQS >NC_022737.1|WP_023374352.1|1356020_1357835_-|3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase MNFKNVVVAGGGVLGSQIAFQSAFHGFNVTLYDINDEALEKVKERLNILKGRYLDDLDTTEEKVEQAYQSIQFSTSIPDAAKDADIVIEAIPEVVSIKTDFYKQLGESAPEKTIFATNSSTFAPSQFKDVTGRPEKFLALHFANEIWLRNTGEVMRTEDTSDEIFNEVLDFAKAIGMVPLPIQKEQPGYILNSLLVPLVTQAGYLLGNEVADYKMIDKTWMKATNDEHGPFGMNDIVGIATHLNIRKSKMDENSPEWAKNYLKFLEGMVEEGRLGKSVGKGFYNYPNPEFKSDNFFDNPKEIKDLTHGFKNITVAGGGVLGSQIAFQTASGDFNVSLYDISDDAIEAAKGRVKQIKQDYKSDMNVDDATVDKFESNISYYTDLAEATKDADLVIEVVPENTDIKKDFYKQLSEVLNEDAYIVTNSSTLRPSDFEDLTGRPEKFAALHFSNGVWLKNTGEVMVASKTTEDTFNKILAFARDIHLVVIPIHKEQPGYILNTLLIPLLHAGLKLLVKDIANVETIDKTWMIGFHAVHGPLAIVDIIGLNTMYHILNAIYQESNDEIDGKVVDLLQSKIDKGELGRGVGKGFYDYSNGAPYLEPDFLK >NC_022737.1|WP_023374362.1|1370812_1371820_-|hypothetical-protein MTNLQWCIKTESLPTITLNIGKYTSIYNEYETIEEDLLNVINQYFKKRNSNKSHVTIAEMLNQEEISPLSYESIIIDNRAIDNEFLLSSNSIINKKLQRDFYENIESSSYIESINVLFEDLLNLINKTELPLKIKAFDIKQFIKLLSFEYSLNEDYSKLIVRIEQILPLLVEELNKQYGGKLLLIYLYPEANLSPKEQIRLKELIISLGIDIIVLTGSLHFLAEDWKYNNYIRCDNQKISSELVDNLLWNAPLNFERSEIEQSLNQFILAYQDKIEIKPIISNYQIAQIMLFSSIDLYVGVSYMQHCNHEFILNIDETKLPLSMAKYLEQFVKEN >NC_022737.1|WP_023374363.1|1371833_1372142_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRVLLMFDLPTETKKHRRIYSKFRKKLIEDGFLMMQYSIYIKSVVNKDAANQTIKRVNTFLPSEGHVRALIITEKQYEHMQILLGEENQNIEILGDNRTIIF >NC_022737.1|WP_041614063.1|1372146_1373049_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSWRIVYVSDVNHMSLNLNSLKIMKGDLETKIPLSDIFALVIEDLTTTITARLLVELSDYNILVIFCNQKHLPECTLQPVSGHFNQYTQMKEQLKWDEARKSELWKIIIENKIQNQIECMKYLSIQSERVDKMIELKNSVTLFDRNNIEGQAAKYYFNSFFEDFTRDNEEIIENAVLNYGYTILNSAIARTIVAKGLIPAIGIHHIGGRNHFNLASDLIEPFRPIVDLFLLKHPPQDFLTKEYRVKIINLLHARIEIDGKMQTVIRAIEIMIQSIIDYFKDGQLDRVKFPKLSKYSFYEL >NC_022737.1|WP_023374365.1|1373051_1376216_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKEKYILGLDLGITSVGYGIINFETKKIIDAGVRLFPEANVDNNEGRRSKRGSRRLKRRRIHRLERVKLLLTEYDLINKEQIPTSNNPYQIRVKGLSEILSKDELAIALLHLAKRRGIHNINVSSEDEDASNELSTKEQINRNNKLLKDKYVCEVQLQRLKEGQIRGEKNRFKTTDILKEIDQLLKVQKDYHNLDIDFINQYKEIVETRREYFEGPGQGSPFGWNGDLKKWYEMLMGHCTYFPQELRSVKYAYSADLFNALNDLNNLIIQRDNSEKLEYHEKYHIIENVFKQKKKPTLKQIAKEIGVNPEDIKGYRITKSGTPQFTEFKLYHDLKSIVFDKSILENEAILDQIAEILTIYQDEQSIKEELNKLPEILNEQDKAEIAKLIGYNGTHRLSLKCIHLINEELWQTSRNQMEIFNYLNIKPNKVDLSEQNKIPKDMVNDFILSPVVKRTFIQSINVINKVIEKYGIPEDIIIELARENNSDDRKKFINNLQKKNEATRKRINEIIGQTGNQNAKRIVEKIRLHDQQEGKCLYSLESIALMDLLNNPQNYEVDHIIPRSVAFDNSIHNKVLVKQIENSKKGNRTPYQYLNSSDAKLSYNQFKQHILNLSKSKDRISKKKKDYLLEERDINKFEVQKEFINRNLVDTRYATRELTSYLKAYFSANNMDVKVKTINGSFTNHLRKVWRFDKYRNHGYKHHAEDALIIANADFLFKENKKLQNTNKILEKPTIENNTKKVTVEKEEDYNNVFETPKLVEDIKQYRDYKFSHRVDKKPNRQLINDTLYSTRMKDEHDYIVQTITDIYGKDNTNLKKQFNKNPEKFLMYQNDPKTFEKLSIIMKQYSDEKNPLAKYYEETGEYLTKYSKKNNGPIVKKIKLLGNKVGNHLDVTNKYENSTKKLVKLSIKNYRFDVYLTEKGYKFVTIAYLNVFKKDNYYYIPKDKYQELKEKKKIKDTDQFIASFYKNDLIKLNGDLYKIIGVNSDDRNIIELDYYDIKYKDYCEINNIKGEPRIKKTIGKKTESIEKFTTDVLGNLYLHSTEKAPQLIFKRGL >NC_022737.1|WP_023374366.1|1377119_1378058_-|glyoxalase MTILGHHHISMYTKDAVKNKAFYTEVLGLRLVEKTVNQDNTKMYHLFYGDDAGHPGTLLTFFEIENVGKHRPGTDSIHRLTLLVPSEAALNYFKQRLDQNNVEWTSLTYVGQSAVLLKDPDELEIILLVNDDYQTPEQWSANDDTDIPKDVQILGMGPVELRSRKPEALTEFLEYILGYHQRNDLEVDDNTTIMTLDEQGLYTDFVIVNQQGHRVRPGQGYVHHVAVNLPTDIDLNDIYEKIARQPNPNSGIIDRYFFKSLYYRHNQILFEFATAEPGFTVDTPVDKLGQQLNLPDFLEDKRDEIESQLREI >NC_022737.1|WP_106913175.1|1378428_1378518_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Fst-family-toxin MYILAIINGFIVALFTHWLRNRNNKKDDR >NC_022737.1|WP_023374367.1|1378896_1380075_-|MFS-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTTIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILLINACALILYGLTGLEGYFIARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLAGPLIAVGIWHLDRISIFAIVMIAIALTTTFFGYRVTFANEEPDTRKKVEPLPFNAVTVFAQFFKNKELFNSGLIMIVVSIVFGAVSTFVPLYTVKFGFADAGIFLTIQAIAVVLARIYLRKYIPSDGMWHPVYMVSVLMLLVIASMLVAIGPHIHVMMFYSSAILIGATQALVYPTLTSYLSFVLPKAGRNMLLGLFIACADLGVSLGGSLMGPISDLVGFSWMYTICGMLVVVMILMSTLKGVRQK >NC_022737.1|WP_023374368.1|1380086_1380836_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKINHVEKHYGKRSLWGPKPKPIIKDVSLDCPVDEAIAIIGESGSGKSTLSRMILGIERPDKGTVTLNDQPMYKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVRDILFEVMCQCDKQSTDEMEGAAKTLLEEVGLSEDFLDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPTYILFDEAISALDMSIQTQILDLLKRLKHTRHLSYIFITHDIQAATYLCDRLVIFKDGQIDEQIATRDLHTTTNAYTQALIDKQLSF >NC_022737.1|WP_023374369.1|1380828_1381644_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLLTVQQLTIRDEWTDTTLVDDINFQVERGETLGIIGESGSGKSITCKALVGLNPSRLKVTGDVHFDGHNLLALSERQLRQYRGQAIAMVMQQGARAFDPSTKVGKQMIETMQVHTSLSTQEIEQTLIDYMTYMNLTEPKTILASYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTINQFDVLEAFEDIKQHFDCAMIFISHDLTVIHKVADRVIVMKEGQLVEEGTTEAVLHHPHHRYTQYLLSTKQKVNDHFQRVMRGDSHD >NC_022737.1|WP_041613789.1|1381640_1382510_-|ABC-transporter-permease MMIVKRLLQDRGAVVALVIIVTYVLLGCLAPVVTFHEPNHIDTAHKFAGISATHWLGTDHLGRDVLTRLIYAIRPSLLYVSIALVISVVIGAILGFISGYFRGYIDALIMRCCDVMLAFPSYVVTLALITLFGMGVENIILAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTSADHVKFAKTIGMSDFTIIRKHILPLTLGDIAIISSSAMCSMILQMSGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMVTTGIVIVIIVMAFNFLSDALQVAMDPRISSKEKMRAVKKGVMHE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022737_4 | 1376467-1376963 | orTypeII |
NA
Consensus repeat of NC_022737_4
|
7 spacers
spacers of NC_022737_4
>4.1|1376503|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT AATACTGGCTTAGGAATGCTTTCTTATTCA >4.2|1376569|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACTGGATGTATCCGAAAATTGTGTATAAT >4.3|1376635|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGATGGTAAGTATTAAGAATTAATAACTC >4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTGAAAACTTAAAGAAATCAGGTAGTGGT >4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACACTGATGACCATAATTCCATTTGACCA >4.6|1376833|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATCAAACAATTCGAATCATTATCCGCAAG >4.7|1376899|29|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTCTAAAATTAGAAAAATGCGTAGTATC |
cas9,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022737_4
The CRISPR arrays of NC_022737_4 >merge|NC_022737|4|1376467-1376963|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACACTTTCAATATTCAAATTACAGAGTACTAAAACAATACTGGCTTAGGAATGCTTTCTTATTCAGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACTACTGGATGTATCCGAAAATTGTGTATAATGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACTAGATGGTAAGTATTAAGAATTAATAACTCGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACGCTGAAAACTTAAAGAAATCAGGTAGTGGTGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACTACACTGATGACCATAATTCCATTTGACCAGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACAATCAAACAATTCGAATCATTATCCGCAAGGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAACAGTCTAAAATTAGAAAAATGCGTAGTATCGTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC >NC_022737|4|4|1376467-1376963|CRISPRCasFinder TACACTTTCAATATTCAAATTACAGAGTACTAAAAC AATACTGGCTTAGGAATGCTTTCTTATTCA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TACTGGATGTATCCGAAAATTGTGTATAAT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TAGATGGTAAGTATTAAGAATTAATAACTC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GCTGAAAACTTAAAGAAATCAGGTAGTGGT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TACACTGATGACCATAATTCCATTTGACCA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AATCAAACAATTCGAATCATTATCCGCAAG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AGTCTAAAATTAGAAAAATGCGTAGTATC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC >NC_022737|4|2|1376467-1376963|CRT TACACTTTCAATATTCAAATTACAGAGTACTAAAAC AATACTGGCTTAGGAATGCTTTCTTATTCA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TACTGGATGTATCCGAAAATTGTGTATAAT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TAGATGGTAAGTATTAAGAATTAATAACTC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GCTGAAAACTTAAAGAAATCAGGTAGTGGT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TACACTGATGACCATAATTCCATTTGACCA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AATCAAACAATTCGAATCATTATCCGCAAG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AGTCTAAAATTAGAAAAATGCGTAGTATC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC >NC_022737|4|2|1376533-1376963|PILER-CR GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TACTGGATGTATCCGAAAATTGTGTATAAT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TAGATGGTAAGTATTAAGAATTAATAACTC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC GCTGAAAACTTAAAGAAATCAGGTAGTGGT GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC TACACTGATGACCATAATTCCATTTGACCA GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AATCAAACAATTCGAATCATTATCCGCAAG GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC AGTCTAAAATTAGAAAAATGCGTAGTATC GTTTCACTCATACCTAAAATTACAGAGTACTAAAAC
>NC_022737.1|WP_023374365.1|1373051_1376216_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKEKYILGLDLGITSVGYGIINFETKKIIDAGVRLFPEANVDNNEGRRSKRGSRRLKRRRIHRLERVKLLLTEYDLINKEQIPTSNNPYQIRVKGLSEILSKDELAIALLHLAKRRGIHNINVSSEDEDASNELSTKEQINRNNKLLKDKYVCEVQLQRLKEGQIRGEKNRFKTTDILKEIDQLLKVQKDYHNLDIDFINQYKEIVETRREYFEGPGQGSPFGWNGDLKKWYEMLMGHCTYFPQELRSVKYAYSADLFNALNDLNNLIIQRDNSEKLEYHEKYHIIENVFKQKKKPTLKQIAKEIGVNPEDIKGYRITKSGTPQFTEFKLYHDLKSIVFDKSILENEAILDQIAEILTIYQDEQSIKEELNKLPEILNEQDKAEIAKLIGYNGTHRLSLKCIHLINEELWQTSRNQMEIFNYLNIKPNKVDLSEQNKIPKDMVNDFILSPVVKRTFIQSINVINKVIEKYGIPEDIIIELARENNSDDRKKFINNLQKKNEATRKRINEIIGQTGNQNAKRIVEKIRLHDQQEGKCLYSLESIALMDLLNNPQNYEVDHIIPRSVAFDNSIHNKVLVKQIENSKKGNRTPYQYLNSSDAKLSYNQFKQHILNLSKSKDRISKKKKDYLLEERDINKFEVQKEFINRNLVDTRYATRELTSYLKAYFSANNMDVKVKTINGSFTNHLRKVWRFDKYRNHGYKHHAEDALIIANADFLFKENKKLQNTNKILEKPTIENNTKKVTVEKEEDYNNVFETPKLVEDIKQYRDYKFSHRVDKKPNRQLINDTLYSTRMKDEHDYIVQTITDIYGKDNTNLKKQFNKNPEKFLMYQNDPKTFEKLSIIMKQYSDEKNPLAKYYEETGEYLTKYSKKNNGPIVKKIKLLGNKVGNHLDVTNKYENSTKKLVKLSIKNYRFDVYLTEKGYKFVTIAYLNVFKKDNYYYIPKDKYQELKEKKKIKDTDQFIASFYKNDLIKLNGDLYKIIGVNSDDRNIIELDYYDIKYKDYCEINNIKGEPRIKKTIGKKTESIEKFTTDVLGNLYLHSTEKAPQLIFKRGL >NC_022737.1|WP_041614063.1|1372146_1373049_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSWRIVYVSDVNHMSLNLNSLKIMKGDLETKIPLSDIFALVIEDLTTTITARLLVELSDYNILVIFCNQKHLPECTLQPVSGHFNQYTQMKEQLKWDEARKSELWKIIIENKIQNQIECMKYLSIQSERVDKMIELKNSVTLFDRNNIEGQAAKYYFNSFFEDFTRDNEEIIENAVLNYGYTILNSAIARTIVAKGLIPAIGIHHIGGRNHFNLASDLIEPFRPIVDLFLLKHPPQDFLTKEYRVKIINLLHARIEIDGKMQTVIRAIEIMIQSIIDYFKDGQLDRVKFPKLSKYSFYEL >NC_022737.1|WP_023374363.1|1371833_1372142_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRVLLMFDLPTETKKHRRIYSKFRKKLIEDGFLMMQYSIYIKSVVNKDAANQTIKRVNTFLPSEGHVRALIITEKQYEHMQILLGEENQNIEILGDNRTIIF >NC_022737.1|WP_023374362.1|1370812_1371820_-|hypothetical-protein MTNLQWCIKTESLPTITLNIGKYTSIYNEYETIEEDLLNVINQYFKKRNSNKSHVTIAEMLNQEEISPLSYESIIIDNRAIDNEFLLSSNSIINKKLQRDFYENIESSSYIESINVLFEDLLNLINKTELPLKIKAFDIKQFIKLLSFEYSLNEDYSKLIVRIEQILPLLVEELNKQYGGKLLLIYLYPEANLSPKEQIRLKELIISLGIDIIVLTGSLHFLAEDWKYNNYIRCDNQKISSELVDNLLWNAPLNFERSEIEQSLNQFILAYQDKIEIKPIISNYQIAQIMLFSSIDLYVGVSYMQHCNHEFILNIDETKLPLSMAKYLEQFVKEN >NC_022737.1|WP_023374361.1|1368221_1369955_-|DUF2075-domain-containing-protein MSSMRKPIIKNISYSNEELVNSLGEWQQSDDSKFLLRYPTVYIINDKNKSDHFNLYVGETTDIKNRTIQHLKNDVKLKDYWKSFYSSDTSSMYVIGHPFFNKSLTLDIENKFMQYLSSVDAVTSIFNSRTNQQNEYYTSEKLDEIFTNIWQQLHKENSKLFPIESVIKDSAIFKASPFHKLTNEQQSVKDEILNKIEHAILSESEENQLILVEGEAGSGKTVLMSTLFFELKQMMDLDEMKNLDIHLLVNHDQQLKVYKQIANKLGLEGKNQNIINKPTSFILNRDVKDKADVVIIDEAHLLLTQGKMSYRGEGHLKDIQKRAKVVVAVFDKKQILSKQQIWEFDTLDKLIQYSKDQNNHLLLKNQLRINSSIETMNWLRHLIDDHKIDPIPQDSKGYDIKIFDTPAELEKAILRKSKNIESGLSRMLATFDWEFKNGKSPNDGLFWEVKIGQWSRPWNLQLKCPRGEKNLAWPEQSQTINEIGSTFTIQGFDLNYAGVIIGPSVKYRNGKIIYDKSESKNIQVTQNRKLSDDTMKNFGEELLRNELNVLLTRGVNGLYIYAVDDELRNALKEASKG >NC_022737.1|WP_023374360.1|1367877_1368216_-|nucleotide-pyrophosphohydrolase MRTENSVMEKINQFRDERNWRQFHNEKDLALSITLEASELLELFQWKSSEDVVESKRERLAEELADILIYSYMFADNLDFDINEIIERKLVKNAEKYPVDKSKDNNSKYNEL >NC_022737.1|WP_023374359.1|1365899_1367759_-|BglG-family-transcription-antiterminator MIERQIKLIELLRNNRSDYLKSDDIASYLNISNRTARTDIKIINNQFMPEVIGNIKSKGYFLNTTRYSLEDIDNQLSNYLHQDGKLLIKIAYQLLMYSKSVLISELMEQFQLSKKEILDYMSRIQMWCEKYEVNIIIKRKTGIRVTGNEKDINNAILHLNQLSKQHHRVEDLILNELPKAHIQIIKQIIETNLSVHDIRTSHLQIEQLVIHLILILKRQSISEESWNINDESLVISNEIIKGINQRLGYHLNTQTVHLFSFFISYHFNKFDLGFEKVFIESYIQQLITKMEQKMHLKFGSDNVLKDNLLAHFSRTYLRIMKEVYLNNPLTGEIKILYPYVFNVLYDIIHELAKDTGINLSEDEIAFLTIHFQASIDRNEESQVNIAICCYYGLGISQLLETKISKVNQHVKVIDILRFEDIENDAFENIDILITTHDINMQLPQYLDVIKVSPLFSEDDQFKLNRIVKGKLNPISKNNGLNEIPVTIVNNDFIQTIPGVFEMAHQILNNYKAISSGYIETALNREKASSTYIGNSMTMPHGDPTKVLNSHIIIFKSNNGFYWKEHKVKLVFFLAIAKPDIHLMKQMMQNLSLLDEEDIHQLAHLEETAFQNKILKLIKG >NC_022737.1|WP_023374358.1|1363864_1365820_-|PTS-transporter-subunit-EIIA MKILAITSCPNGIAHTYMAQEKLEQAAKKMGVDIKVETQGGVGAENVLTAKEIREADGIIITADRQVDLSRFNGKRLINENVREGIHHPETLIQRIIDQDAKIYHDKNATTQSKDSDDEEDQKSGIQMVYQHLMNGVSFMVPFIVVGGLLIAIALTLGGHPTSEGLKIPDDSFWKAIENIGKLSFGFMVPILAGYIAYSIADKPGLVPGMIGGAIAADGSLYGSEAGAGFLGGIVAGFIAGYVAKWIKNIRVPKAMAPIMPIIIIPILASLVVGLIFIFLIGAPISGIFTALTGWLKGMQGANIIILALIIGAMIAFDMGGPVNKVAFLFGSALIAEGNYAVMGMVAVAVCTPPIGLGLATFVQKHKFNHAVQEMGKASFTMGLFGITEGAIPFAAQDPLRIIPSNMIGAMVAAVIAAMGGVGDRVAHGGPIVAVLGGIDHIIWFFIAVIIGSLVTMITILILKRNTPVTDVEENQVDAHLETSTNSSQESKHSESKVDESVEHNDNVFQKDVININTNVKTKEEAIDYMVKNLKEHRFINNEDVVKQAILNREAESTTAIGMNVAIPHAKSDAVKQPTVAVLQNKEGVDWISLDETLPKILFMIVVPNDSNNTHLKLLQRLSRSLMDDKTREALINAPSKDDIYDILKEI >NC_022737.1|WP_023374357.1|1362914_1363850_-|mannose-6-phosphate-isomerase,-class-I MVLFLKPVFQEKIWGGTALESFNYHLPSNNVGECWAISAHPNGPNVIENGDYKGKTLDEVWSIDRSLFGNDKRDKFPLLTKILDANDKLSVQVHPDDDYAQKYEGEYGKTECWYILDAKEDAEIIYGINVDNKEDLVECINNREFDRLFKKVKVKPGDFYYVPAGTVHAIGSGILILETQQSSDTTYRIYDYDRKDKHGHLRDLHLEQSKAVININQENPNMVPQKSEVQGQTVTQFVSNEFFTVEKWEINSKLNYNKPHAYCLVSVIDGTGSVIIDDERYDIQKGRHFIITNEDQDILFEGKLEMIISYS >NC_022737.1|WP_023374356.1|1361824_1362661_-|membrane-protein-insertase-YidC MKLKYLILVLLAPVFLSACNYSKPENRNGFFYNTFAKPMDLFLNWMGEHLNHNYGLAIIIIVLAIRLIMLPFMLSQTKNGQFMRKLMKIAKPELDPIQEKVRRARTQEEKMDANKEMMDVYKKYHINPMKSMLGCLPMLIQMPILFGLYASLKWPVHNHLSQYPHFLWFDLSNPDIYITLIAGILYFIQSLVSLGNMPQEQRQMGYMMMVISPIFIIYISFTSASALGLYWSINALFLIIQMYFSNQYYSKIADEYIKSFEKQNDKKSQKAKTIKKKK >NC_022737.1|WP_023374366.1|1377119_1378058_-|glyoxalase MTILGHHHISMYTKDAVKNKAFYTEVLGLRLVEKTVNQDNTKMYHLFYGDDAGHPGTLLTFFEIENVGKHRPGTDSIHRLTLLVPSEAALNYFKQRLDQNNVEWTSLTYVGQSAVLLKDPDELEIILLVNDDYQTPEQWSANDDTDIPKDVQILGMGPVELRSRKPEALTEFLEYILGYHQRNDLEVDDNTTIMTLDEQGLYTDFVIVNQQGHRVRPGQGYVHHVAVNLPTDIDLNDIYEKIARQPNPNSGIIDRYFFKSLYYRHNQILFEFATAEPGFTVDTPVDKLGQQLNLPDFLEDKRDEIESQLREI >NC_022737.1|WP_106913175.1|1378428_1378518_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Fst-family-toxin MYILAIINGFIVALFTHWLRNRNNKKDDR >NC_022737.1|WP_023374367.1|1378896_1380075_-|MFS-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTTIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILLINACALILYGLTGLEGYFIARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLAGPLIAVGIWHLDRISIFAIVMIAIALTTTFFGYRVTFANEEPDTRKKVEPLPFNAVTVFAQFFKNKELFNSGLIMIVVSIVFGAVSTFVPLYTVKFGFADAGIFLTIQAIAVVLARIYLRKYIPSDGMWHPVYMVSVLMLLVIASMLVAIGPHIHVMMFYSSAILIGATQALVYPTLTSYLSFVLPKAGRNMLLGLFIACADLGVSLGGSLMGPISDLVGFSWMYTICGMLVVVMILMSTLKGVRQK >NC_022737.1|WP_023374368.1|1380086_1380836_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKINHVEKHYGKRSLWGPKPKPIIKDVSLDCPVDEAIAIIGESGSGKSTLSRMILGIERPDKGTVTLNDQPMYKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVRDILFEVMCQCDKQSTDEMEGAAKTLLEEVGLSEDFLDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPTYILFDEAISALDMSIQTQILDLLKRLKHTRHLSYIFITHDIQAATYLCDRLVIFKDGQIDEQIATRDLHTTTNAYTQALIDKQLSF >NC_022737.1|WP_023374369.1|1380828_1381644_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLLTVQQLTIRDEWTDTTLVDDINFQVERGETLGIIGESGSGKSITCKALVGLNPSRLKVTGDVHFDGHNLLALSERQLRQYRGQAIAMVMQQGARAFDPSTKVGKQMIETMQVHTSLSTQEIEQTLIDYMTYMNLTEPKTILASYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTINQFDVLEAFEDIKQHFDCAMIFISHDLTVIHKVADRVIVMKEGQLVEEGTTEAVLHHPHHRYTQYLLSTKQKVNDHFQRVMRGDSHD >NC_022737.1|WP_041613789.1|1381640_1382510_-|ABC-transporter-permease MMIVKRLLQDRGAVVALVIIVTYVLLGCLAPVVTFHEPNHIDTAHKFAGISATHWLGTDHLGRDVLTRLIYAIRPSLLYVSIALVISVVIGAILGFISGYFRGYIDALIMRCCDVMLAFPSYVVTLALITLFGMGVENIILAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTSADHVKFAKTIGMSDFTIIRKHILPLTLGDIAIISSSAMCSMILQMSGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMVTTGIVIVIIVMAFNFLSDALQVAMDPRISSKEKMRAVKKGVMHE >NC_022737.1|WP_023374371.1|1382506_1383442_-|ABC-transporter-permease MFKLIIKRIALMFPLLIVVSFMTFMMTYLTNEDPAVTILHAQGTPNVTPQLITETKEKYGLDAPILVQYKDWLQQAVQFKFGTSYITGDPVSERIGPAFMNTLKLTLISSVSVMVTSICLGVVSALTRGQRTDRVIRSFAFFLTALPSYWVASMLIIYVSVKLNLLPTSGLTGPESYVLPVIVITMTYAGIYFRNVRRAMIEQLNEDYVFYLKASGVKTMTLLRHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIENVFAWPGLGQLSIKAIVEHDFPVVQTYVLIVAVLFIIFNTLADIINALLNPRLREASR >NC_022737.1|WP_023374372.1|1383454_1385053_-|nickel-ABC-transporter,-nickel/metallophore-periplasmic-binding-protein MNKLTKMSAVLLASGIILTGCGGNKGLEDKKEQKTLSYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMIYEPLVRNTKEGIKPLLAKKWDISKDGKTYTFHLRDDVKFHDGTKFNAEAVKKNIDAVQQNKKLHSWLKISTLIDDVKVKDDYTVQIHLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKHGTTKDGVKAFDGTGPFKMSEHKKDESATFNKNQHYWGERSKLNKVEAKVKPAGETAFLSMKKGENNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKETGDYNVKRSQPMNTKMIVANAGNKDSAVSDKSVRQAIGHMVDRDKIAKDILDGQEKPATQLFAKNVTDINFNMPTRQFDTKKAEKLLDQAGWKMNQDKQIRQKDGKDLTMTMYYDKGSTSQKEQAEFLEAEFKKVGVKLNINGETSDKIAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKSKTGYESATSGIKDKKKLYNDIDEAFKMKDEKARSKAYQQILKQVDDEGVFIPISHGSMTVVAPKDLKNVSFTQSQYELPFNEMQYK >NC_022737.1|WP_023374373.1|1385120_1386413_-|staphylopine-biosynthesis-dehydrogenase MSNILIIGSGPVAIQLAQLCNHVSKNHIDMVGRASTSKKSMDVYQSYQQAGTFTVTTQNDSHHQFAGQFQIRHFYQDIQQIDQSYDTIILACTADAYRLMLKQLAPTILQHVKHIILVSPTFGSHMMIEQLLADINTDVEVISFSTYLGDTRVVDMAQPHRVLTTAVKSKLFVGSNKTSSQLIPQLQIWFEALHIQLAVMDTPLHAEIHNSSLYVHPPLFMNDFALKAIFQGTEVPVYVYKLFPEGPITMTLIREMRQMWQEMMTILQKLSVPSVNLLKFMVKENYPVRSETLSESDIHQFEELSAIHQEYLLYVRYTAILIDPFSKPDKDGRYFDFSAVPFKPLYQNEQGVVHIPRMPSEDYYRTTVIQAIGKALGVSTPMIDTLLHRYTDYCERYQIEHPQQSMSSQFNLDDFEEDISLVTTYLANKL >NC_022737.1|WP_023374374.1|1386405_1387221_-|staphylopine-biosynthesis-enzyme-CntL MHSNTKIETLLQQYLEQFEARYQHVLSDPNSIDALETLVDDYSQLILNPTYQQQYDLWHDEPRKQLITQQLQDITAQCVKQVEMIRARRLLDGKASTSGYFDNIEHCIDEEFGQCHIGKNDKLLLVGSGAYPMTLIQVAKETGASVIGIDIDPQAVYLGQRVVNVLAPNEDIQISNQTVDQLPDIKEVTHIIFSSTIPVKYEILAQLFELTNDCVVVAMRYGDGMKAIFNYPSQFTASDQWQCVHQLVQPNQIFDVALYQKVSSKAGVTYV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022737_5 | 1732749-1732831 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022737_5
|
1 spacers
spacers of NC_022737_5
>5.1|1732772|37|NC_022737|CRISPRCasFinder ATTAGATTAAGGAACACCTGAGCAAGGCTCATGCATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022737_5
The CRISPR arrays of NC_022737_5 >merge|NC_022737|5|1732749-1732831|CRISPRCasFinder AGAAACTCTAAGCATTAAAATGCATTAGATTAAGGAACACCTGAGCAAGGCTCATGCATAAGAAACTCTAAGCATTAAAATGC >NC_022737|5|5|1732749-1732831|CRISPRCasFinder AGAAACTCTAAGCATTAAAATGC ATTAGATTAAGGAACACCTGAGCAAGGCTCATGCATA AGAAACTCTAAGCATTAAAATGC
>NC_022737.1|WP_002451215.1|1731835_1732531_+|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKGKKYQEAANKVDRTQYYSVEEAIKLAKETSIANFDASVEVAFRLGIDTRKNDQQIRGAVVLPNGTGKSQRVLVFAKGDKITEAEEAGADYVGESDYVQKIQQGWFDFDVVVATPDMMGEVGKLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVKKAVEEIKAGKVEYRAEKAGIVHASIGKVSFSDEKLVENFKALQDVLAKAKPSSSKGTYFKSVAVTTTMGPGVKVDTASFKL >NC_022737.1|WP_002451214.1|1731196_1731619_+|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKVVKLQIPAGKANPAPPVGPALGQAGVNIMGFCKEFNARTQEQAGLIIPVEISVYEDRSFTFITKTPPAPVLLKKAAGVEKGSGEPNKNKVASVTKDQVREIANSKMQDLNAADEEAAMRIIEGTARSMGITVE >NC_022737.1|WP_002451213.1|1730467_1731016_+|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MSEEVGAKRWYAVHTYSGYENKVKKNLEKRVESMNMTEQIFRVVIPEEEETQVKDGKAKKLVKKTFPGYVLVELVMTDESWYVVRNTPGVTGFVGSAGAGSKPNPLLPEEVRFILKQMGLKEKTIDVELDVGEQVRIKSGPFANQVGEVQEIEAEKFKLTVLVDMFGRETPVEVEFDQIEKL >NC_022737.1|WP_023374639.1|1730274_1730457_+|preprotein-translocase-subunit-SecE MAKKESFFQGVKSEMEKTSWPTKEELFKYTVIVVSTVIFFLVFFYALDLGITALKNLLLG >NC_022737.1|WP_002465546.1|1730079_1730223_+|50S-ribosomal-protein-L33 MKKVPLNCEECGNRNYHVPKKEGSAVRLTLKKYCSRCNAHTVHKESK >NC_022737.1|WP_023374638.1|1729373_1729955_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MTHKNNNLKQQLLLSKSQQLDLELKAILQQFDSFIMRRINYISQNDFEKDDLYQEVLIKIYLALERHHFQYDDSFIKYISRLIKSVKCDYYRRHYTQQKRYTNVVNDAVVEYQTNLLNRDRVEREILTCEAIKLLNAACEKLTKQEREVFEFYSKGYKPKEIAHLLSIKDKVVYNAIQRCKMKIRHHLEYRLK >NC_022737.1|WP_002465578.1|1728775_1729303_+|NYN-domain-containing-protein MKERYLIIDGYNMIGQSPTLSKIAKENLEEAREQLIDAIANYNAVIADEIVCVFDAYEQSGIEREYMYHGVKTVFTKEKETADSFIERYVYELYDKHTTHITVVTSDMSEQHAIFGSGAYRVSSREMWRDLRENQITVSKSLEDITETKPRTRIPLSEDILAEFEKIRRGNHKKD >NC_022737.1|WP_002465583.1|1728029_1728776_+|23S-rRNA-(guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase-RlmB MEDIVIVGRHAVKEAIISGHSINKILIQDGIKKQQINDILKNAKDQKLIVQTVPKSKLDFLSTAPHQGVAALVAPYEYADFDQFLKQQQEKDGLSTVIILDGLEDPHNLGSILRTADASGVDGVIIPKRRSVSLTQTVAKASTGAIQHVPVIRVTNLAKTIDELKNNGFWVAGTEANNATDYRDLEADMSLAIVIGSEGQGMSRLVSDKCDFYIKIPMVGHVNSLNASVAASLMMYEVFRKRHSNGDK >NC_022737.1|WP_023374637.1|1727635_1728025_+|Mini-ribonuclease-3 MNIKLLNPLTLAYMGDAVLDQHVRQYIVLKLRSKPNRLHQMSKLYVSAKSQAQTLETLIEEAWFTEEEMDILKRGRNAKSYTKAKNTDVQTYRKSSALEAVIGFLYLEHREERLKVLLDKIIEIVNERS >NC_022737.1|WP_023374636.1|1726233_1727634_+|cysteine--tRNA-ligase MITLYNTLTRQKETFEPIEPGKVKMYVCGPTVYNYIHIGNARPAINYDVVRRYFEYKGYEVTYVSNFTDVDDKLIKRSKELNESVPEIADKYIKAFYEDVGALNVKKATSNPRVMNHMDEIIDFIKKLVDEGYAYESNGDVYFRTRQFKDYGKLSHQSIDDLKVGARIEAGDQKEDALDFTLWKKAKPGEISWESPFGEGRPGWHIECSVMAFHELGPTIDIHAGGSDLQFPHHENEIAQSEAHNHAPFANYWMHNGFINIDNEKMSKSLGNFILVHDIIKEIDPDVLRFFMISVHYRSPINYNLELVSAAKSGLERIRNSYQLIEEREAIATNIDNQEEYINQIDQILENFETVMDDDFNTANAVTAWYDLAKLANRYVLENVTSTKVIAKFKEVYQIFSDVLGVPLKGNQQDDLLDEDIEKLIEERNEARKNKDFARADEIRDHLKEQNIILEDTPQGVRFKRG >NC_022737.1|WP_002451216.1|1733066_1733567_+|50S-ribosomal-protein-L10 MSAIIEAKKQLVDTIADQLKNSVSTVIVDYRGLTVAEVTELRKQLREAGVEYKVYKNTMVRRAAEKAGIEGLDEFLTGPTAIATSTEDVVAPAKVIAGFAKEHEALEVKSGVMEGNVISAEEVKTVGSLPSHDGLVSMLLSVLQAPVRNFAYAVKAVGEQKEESAE >NC_022737.1|WP_002451217.1|1733606_1733975_+|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MANQEQIIEAIKEMSVLELNDLVKAIEEEFGVTAAAPVAAAGAAGGGEAAAEKTEFDVELTSAGSSKIKVVKAVKEATGLGLKDAKELVDGAPKVIKEAMPKEDAEKLKEQLEEVGATVELK >NC_022737.1|WP_023374641.1|1734134_1734743_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSHYYDENPDVKSDEKHITYECYQHSINLITDNGVFSRDKVDFGSDLLIQTFLKANPPGPSKTIADVGCGYGPIGLMIAKVSPHHHITMLDVNRRALELAKKNKKKNHIENADIFESDGMTQVDDNQFDFVLTNPPIRAGKTVVHRIFEEAYQKLKSNGELFVVIQKKQGMPSAKKKMDELFNNVEVVNKSKGYYILKSVKA >NC_022737.1|WP_041613831.1|1734960_1738512_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta MAGQVVQYGRHRKRRNYARISEVLELPNLIEIQTKSYDWFLKEGLLEMFRDISPIEDFTGNLSLEFVDYRLGEPKYDLEESKNRDATYAAPLRVKVRLIIKETGEVKEQEVFMGDFPLMTDTGTFVINGAERVIVSQLVRSPSVYFNEKLDKNGRENYDATIIPNRGAWLEYETDAKDVVYVRIDRTRKLPLTVLLRALGFSSDQEIVDLLGDSEYLRNTLEKDGTENTEQALLEIYERLRPGEPPTVENAKSLLYSRFFDPKRYDLASVGRYKANKKLHLKHRLFNQKLAEPIVNSETGEIVVEEGTVLDRRKLDEIMDVLEANANSEVFELEGTVIDEPVEIQSIKVYVPNDDEGRTTTVIGNALPDSEVKCITPADIIASMSYFFNLLSGIGYTDDIDHLGNRRLRSVGELLQNQFRIGLSRMERVVRERMSIQDTDSITPQQLINIRPVIASIKEFFGSSQLSQFMDQANPLAELTHKRRLFALGPGGLTRERAQMEVRDVHYSHYGRMCPIETPEGPNIGLINSLSSYARVNEFGFIETPYRKVDLDTNAITDQIDYLTADEEDSYVVAQANSRLDENGRFLDDEVVCRFRGNNTVMAKEKMDYMDVSPKQVVSAATACIPFLENDDSNRALMGANMQRQAVPLMNPEAPFVGTGMEHVAARDSGAAITANHRGRVEHVESNEILVRRLVEQDGQEYEGELDRYPLAKFKRSNSGTCYNQRPIVATGDIVEYNEILADGPSMELGEMALGRNVVVGFMTWDGYNYEDAVIMSERLVKDDVYTSIHIEEYESEARDTKLGPEEITRDIPNVSESALKNLDERGIVYVGAEVKDGDILVGKVTPKGVTELTAEERLLHAIFGEKAREVRDTSLRVPHGAGGIVLDVKVFNREEGDDTLSPGVNQLVRVYIVQKRKIHVGDKMCGRHGNKGVISKIVPEEDMPYLPDGRPIDIMLNPLGVPSRMNIGQVLELHLGMAAKNLGIHVASPVFDGANDDDVWSTIEEAGMARDGKTVLYDGRTGEPFDNRISVGVMYMLKLAHMVDDKLHARSTGPYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEILTYKSDDTVGRVKTYESIVKGENISRPSVPESFRVLMKELQSLGLDVKVMDEQDNEIEMADIEDEDVTERKVDLQQKDAPESQKETTD >NC_022737.1|WP_023374643.1|1738675_1742272_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta' MKIGLASPEKIRSWSYGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCERIFGPTKDWECSCGKYKRVRYKGMVCDRCGVEVTKSKVRRERMGHIELAAPVSHIWYFKGIPSRMGLLLDMSPRALEEVIYFASYVVVDPGPTGLEKKTLLSEAEFRDYYDKYPGQFVAKMGAEGIRDLLSEIDLDEELKILRDELESATGQRLTRAIKRLEVVESFRNSGNDPAWMILDVLPIIPPEIRPMVQLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPGIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGRRGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIAVGPSLKMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVQREIATNIKNAKSKIERMDDEVWDVLEEVIVEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVTTAYNADFDGDQMAVHVPLSKEAQAEARMLMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNYYLTLERKDAVNTGTIYNDTNEVLKAYANGYVHLHTRIGVHASSFNNPTFTEEQNKKILATSVGKIIFNEIIPDSFAYINEPTQTNLEGTTPDKYFVDPTELGEGGLKEFFETKELIEPFNKKFLGNIIAEVFNRFSITDTSMMLDRMKDLGFKFSSKAGITVGVSDIVVLPDKKDILDEHEKLVERVTKQFNRGLITEEERYNAVVEIWTDAKDQIQGELMQSLEKTNPIFMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGLMAAPSGKIIELPITSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYLTRRLVDVAQDVIVREEDCGTDRGLLVSDIKEGTEMIEPFIERIEGRYSKETIRHPETDEIIIRPDELITAEIAKKITDAGIEQMYIRSAFTCNTRHGVCEKCYGKNLATGEKVEVGEAVGTIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGSDITQGLPRIQEIFEARNPKGQAVITEIEGVVEDIKLAKDRQQEIVVKGENETRSYLASGTSRLKVEVGQSVERGEVLTEGSIEPKNYLSVAGLNATESYLLKEVQKVYRMQGVEIDDKHVEVMVRQMLRKVRIIEAGDTKLLPGSLVDIHNFTDANRDAFKERKRPATAKPVLLGITKASLETESFLSAASFQETTRVLTDAAIKGKRDDLLGLKENVIIGKLIPAGTGMRRYSDVQYDKNVAPVASSEEEVEVTE >NC_022737.1|WP_023374644.1|1742420_1742681_+|50S-ribosomal-protein-L7ae MSNEKVARFNKQQYVVGLKETLKALNKDQVTSLIIARDVEVYLMTRVLSQINQKNIPYTLFSSKKELGEYVGINVNATIVAILNEN >NC_022737.1|WP_002451222.1|1742770_1743184_+|30S-ribosomal-protein-S12 MPTINQLVRKPRQSKSKKSDSPALNRGFNSKKKQFTELNSPQKRGVCTRVGTMTPKKPNSALRKYARVRLSNNIEINAYIPGIGHNLQEHSVVLVRGGRVKDLPGVRYHIVRGALDTSGVDGRRQGRSLYGTKKPKN >NC_022737.1|WP_002451223.1|1743255_1743726_+|30S-ribosomal-protein-S7 MPRKGSVPKRDVLPDPIHNSKLVTKLINKIMLDGKRGTAQRILYSAFDLVEERSGRQAIEVFEEAIENIMPVLEVKARRVGGSNYQVPVEVRPERRSTLGLRWLVNYARLRGEKTMEERLANEILDAANNTGGAVKKREDTHKMAEANKAFAHYRW >NC_022737.1|WP_023374645.1|1743845_1745927_+|elongation-factor-G MAREFSLKNTRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYTGRIHKIGETHEGASQMDWMEQEQDRGITITSAATTAAWDGHRVNIIDTPGHVDFTVEVERSLRVLDGAVTVLDAQSGVEPQTETVWRQATTYGVPRIVFINKMDKLGANFDYSVSTLHDRLQANAAPIQLPIGAEDEFEAIIDLVEMKCFKYTNDLGTEIDEIEIPEDHKERAEEARSTLIEAVAETNDELMEKYLGDEEISVAELKDAIRQATTDVEFYPVLCGTAFKNKGVQLMLNAVIDYLPSPLDVKPIVGHRANDPEEEVIAKPDDSAEFAALAFKVMTDPYVGKLTFFRVYSGTLSSGSYVKNSSKDKRERVGRLLQMHANSRQEIDTVYSGDIAAAVGLKETGTGDTLCGEKNDIILESMEFPEPVIHLSVEPKSKADQDKMTQALVKLQEEDPTFHAHTDEETGQVIIGGMGELHLDILVDRMKKEFNVECNVGAPMVSYRETFKQSAQVQGKFSRQSGGRGQYGDVHIEFTPNETGGGFEFENAIVGGVVPREYIPSVEAGLKDAMENGVLAGYPLIDVKAKLFDGSYHDVDSSEMAFKIAASLALKEAAKKCDPVILEPMMKVTIEMPEEYMGDIMGDVTARRGRVDGMEPRGNAQVVNAYVPLSEMFGYATSLRSNTQGRGTYTMYFDHYAEVPKSISEEIIKKNKGE >NC_022737.1|WP_002451225.1|1746158_1747343_+|elongation-factor-Tu MAKEKFDRSKEHANIGTIGHVDHGKTTLTAAIATVLAKNGDTVAQSYDMIDNAPEEKERGITINTAHIEYQTDKRHYAHVDCPGHADYVKNMITGAAQMDGGILVVSAADGPMPQTREHILLSRNVGVPALVVFLNKVDMVDDEELLELVEMEVRDLLSEYDFPGDDVPVIAGSALKALEGDEKYEEKILELMQAVDDYIPTPERDSDKPFMMPVEDVFSITGRGTVATGRVERGQIKVGEEVEIIGLHDTSKTTVTGVEMFRKLLDYAEAGDNIGALLRGVAREDVQRGQVLAAPGSITPHTKFKAEVYVLSKDEGGRHTPFFSNYRPQFYFRTTDVTGVVQLPEGTEMVMPGDNVEMTVELIAPIAIEDGTRFSIREGGRTVGSGVVTEIHE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022737_6 | 2547900-2547995 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022737_6
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1 spacers
spacers of NC_022737_6
>6.1|2547934|28|NC_022737|CRISPRCasFinder TTGCATAAGAGCCACTATTCAGTTAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022737_6
The CRISPR arrays of NC_022737_6 >merge|NC_022737|6|2547900-2547995|CRISPRCasFinder GATTCAAAAGGAATACACTCGTCTTGGCATCCGATTGCATAAGAGCCACTATTCAGTTAAAAGATTCAAAAGGAATACACCCGTCTTGGCATCCGA >NC_022737|6|6|2547900-2547995|CRISPRCasFinder GATTCAAAAGGAATACACTCGTCTTGGCATCCGA TTGCATAAGAGCCACTATTCAGTTAAAA GATTCAAAAGGAATACACCCGTCTTGGCATCCGA
>NC_022737.1|WP_002451353.1|2546074_2547676_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLQVTDVSLRFGDRKLFEDVNIKFTEGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGELDSQTGHVSLGKDERLAILKQDHFAYEDERVLDVVIKGHERLYEVMKEKDEIYMKPDFSDEDGIRAAELEGEFAEMNGWNAEADAANLLSGLGIDASLQDKKMSELENNQKVKVLLAQSLFGDPDVLLLDEPTNGLDIPAISWLEDFLINFENTVIVVSHDRHFLNNVCTHIADLDFGKIKVYVGNYDFWYQSSQLAQKMAQEQNKKKEEKIKELQDFVARFSANASKSKQATSRKKQLEKIELDDIQPSSRRYPYVKFTPEREIGNDLLTVQNLSKTIDGEKVLDNISFTMNPNDKAILIGDSEIAKTTLLKILAGEMEPDEGSYKWGVTTSLSYFPKDNSEFFDGVDMNLVDWLRQYAPEDEQTETFLRGFLGRMLFSGEEVKKKASVLSGGEKVRCMLSKMMLSSANVLLLDEPTNHLDLESITAVNDGLKSFKGSLIFTSYDFEFINTIANRVIDLNQSGAVSKEIPYEEYLKETGVLQ >NC_022737.1|WP_023375292.1|2545020_2545929_-|RNA-binding-virulence-regulatory-protein-CvfB MALEKDIVGSIEFLEVTGLQGSTYMLKGPNGEQVKLNQSEVNEEDELQIGEEYSFFIYPNRSGELFATQNMPDITKDKYDFAKVLKVDRDGARVDVGLPREVLIPWEDLPKVKTLWPEAGDQLLVTLRIDSQNQMFARLASEGIVDNMYTPVNDDSKQNEMLEARPYRVLRVGSFLLSTEGYKIFVHESERKAEPRLGELVTVRIIGHNERGELNGSFLPLAHERLDDDGQVIFDLLVEYDGELPFWDKSSPEAIKEVFNMSKGSFKRAIGHLYKQKIINIETGKISLTKKGWSRTEDEQHS >NC_022737.1|WP_023375291.1|2543699_2544680_-|PstS-family-phosphate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKWQLIGTTVLGASVLLGACGGGNNGGSGEGKDVSGKVKGDGSSTVGPIIEKLNEKFAKDYPNATVSSGTSGTGGGFEKFISGETDFSNASRPIKDEEKKKLEDKGIKYKEYKIAQDGVTVTVNKDNDFVKSLSKDQLKEIYSGKAKTWKDVNSKWPDKKIKAFSPDQSHGTFDFFTEEVMDKGDIKAEKNADTNVIVQSVEKNKEGIGYFGYNFYQQNKDKLKEVKIKDDKGKDTEPTKKTIQDNSYALSRPLFIYAKEKSLKENKAFQEFMKFTLEDKGKSAEDAGYVALPKKDYKEEIKDLKKYIKKNSKDSDKKSDKKEDK >NC_022737.1|WP_002451350.1|2542586_2543513_-|phosphate-ABC-transporter-permease-subunit-PstC MASKTNIREMIAKNNAKKGGTSDKIVPIILAIIAAISILVTLGILFTLLTETITFFTRVPITEFLFSTDWNPFSAKPSYGIWALIIGTLKITIIAALFAVPIGLGAAIYLSEYATDKVRRIIKPILEILAGIPTIVFGFFALTFVTPILRSVFPQLGSFNSISPGLVVGVMIIPLITSMSEDAMASVPNKIREGALGLGATKLEVAIKVVLPAAASGILASIVLAVSRAIGETMIVSLAAGSTPTASLNLTGSIQTMTGYIVQVATGDATFGSDVYYSIYAVGFTLFIFTLAMNLLSQWISKRFREEY >NC_022737.1|WP_023375290.1|2541655_2542585_-|phosphate-ABC-transporter-permease-PstA MATTTNTANGSSKTLIDQKQVDKNISSRMTKNKVFKGIFLACTLIGLIVLAALIIDTLIKGVGHLTPSFFTNFSSSTPSMAGVKGALVGTLWLMITIIPISIVLGVGTAIYLEEYARKNSFTNFVKVCISNLAGVPSVVFGLLGLTLFVRGMGVESLSLGKSILAGALTMSLLILPVIIVAAQEAIRAVPKSVREASYGLGANKWQTIYKVVLPAALPGILTGFILALSRALGETAPLILIGIPTILLRLPSGIMDQFQALPIQIYNWAKMPQEEFQNVASAGIIVLLVILLLMNGLAIFFRNKFSKKF >NC_022737.1|WP_023375289.1|2540695_2541571_-|phosphate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MANTKVEENKKLDQLKDNSNQGVSTIVTTQDKHDPISDSERKVVYSTQNLDLWYGDNHALQNINLDILENNVTAIIGPSGCGKSTYIKALNRMVELVPSVKTAGKILYRDQNIYDAKYSKEKLRTNVGMVFQQPNPFPKSIYDNITYGPKTHGIKNKKILDEIVEKSLRGAAIWDELKDRLHMNAYGLSGGQQQRVCIARCLAIEPDVILMDEPTSALDPISTLKIEELVQELKENYSIIMVTHNMQQAARVSDKTAFFLNGYVNEYDDTDKIFSNPTDKQTEDYISGRFG >NC_022737.1|WP_002451347.1|2540044_2540692_-|phosphate-signaling-complex-protein-PhoU MAVIRQKYEGQLEDLIKDLRRLGLRVYFNIENALVSLSDDKRTFARETIEKDKEINRLDYEINEKVIMLITKQQPIATDLRMMMAALKISTDFERMGDNAANIAHIRLRVKITDHYVLTRLKTMGKLAMLMLEDLNTAVKNEDITLIKEIIERDQDIDDLYINIVNTTYLIDNDPFVAGQAHLAARNLERVGDHISNIAESVYYFLTGEHYEAGR >NC_022737.1|WP_023375288.1|2538113_2539925_+|oligoendopeptidase-F MTQGLPNRQAIPSIETWDLKDLFQNDNDFYQILDETLASSLSFNERYNGQLTAIDTIERALKDYEALLIQIDRLGNYEELRLSVDTTDEAAQTLNAKLNTSYGKIASRLSFVESEILNLSNDTLQQLKSQTQYPHYIQQLIERKPYQLDPKVEQTLASLSPTLNQPYDLYGTTKMLDIAFESFKHNNTEYPMDYATFENEYEDHADPEFRQKSFKAFSDAIRRYQHTTAATYNMQIQQEKIEADLRGYDSVIDYLLQEQEVTRDMFDRQIDVIMSDLAPVMQKYAKLLQRVHGLDKMRFEDLKVSIDPSYEPDISIDESKSYIYGALDVLGEDYHSMIESAYQNRWIDFAQNKGKDTGAFCASPYFTHSYVFISWTGKMAETFVLAHELGHAGHFTLAQQNQNFLESEASMYFVEAPSTMNEMLMANYLFNHSEDPRFKRWVIGSILSRTYYHNMVTHLLEAAYQREVYQKVDNGESLTAPVLNDIMLNVYQQFFGNAVEMTDGTELTWMRQPHYYMGLYSYTYSAGLTIGTVMSQKIKKEGQSAVNAWLNTLKSGGSLSPVDLAKQAGVDITTEAPLKDTIRYISELVDEAIALTDEIEANS >NC_022737.1|WP_023375287.1|2537563_2537914_-|hypothetical-protein MTIFDMPNFLWISILAVIILTVFCTLVLHRWFIAAVISFVVLGVLAFLIPNFQDITYQPLLGYAAFMAIVSLIISFLLWYFTRNWRRERKKKQLEKDMRRYEQFEHEKEMNHFRRR >NC_022737.1|WP_023375286.1|2536448_2537447_-|ABC-transporter-permease MNLIKIIISKCLQMIIVLFILSTITFILMKLSPGNPVDKILHLDTAQVSNAQIKATEDKLGLNESLLAQWWHWMIQILHLDLGVSYQTNEPVSQEITTYAPPTLIITIGTLIMSVIISVPLGILAAINYHRPIDRIIRIFTSLSVSLPAFFIGILLIYIFDLKLNLLPPASDGQWVSYILPILTMSVGMCAYLIRLIRSNLLDLYQSPIVQASRLRGMSEKYILLHDLLKPALLPTIPLIGLSVGSLVGGTVVIENLFEIPGLGAFLVDSIRARDYPVIQGIVLFIGTLVIIINTCADLLSICLDPKQRLTQQSWPKSSQSRNDKEATHHEI >NC_022737.1|WP_167321444.1|2548437_2549643_+|aspartate-kinase MLNRSVLKFGGSSVSDFTKIKNIAGMLKNRVEQGEQLIVVVSAMGKTTDQLMENVSTLTSTPKEQELALLLTTGEQQTVSYLSMVLNDIGISAKAMTGYQAGIKTIGHHLKSKIAEIDPTTFETAFNKHDVLVIAGFQGINEDYELTTLGRGGSDTTAVALAASNQIPCEIYTDVDGVYATDPRILSHAKRLEYVSYEEMMEMSALGAGVLETRSVELAKNYDIPLYLGRTLSNVKGTWIMSRSDLLEKKAVTGVALDQHMMHVTITYPLPDNQLLTQLFTELEIGSVNVDMISQIVNHEGLQLSFSIKDTDAHQISAILEQLAVDFEALDYKINEAYVKISLIGSGMRDMSGVASRAFITLINAKIPFYQTTTSEISISYVIDAENGEKAVEELYGAFDI >NC_022737.1|WP_023375295.1|2549701_2550691_+|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MTKLAVVGATGLVGTKMLETLDRKEIPFDELVLFSSARSAGQKIEFQGQTYTVQELTDEAASEHFDYVLMSAGGGTSEHFAPLFEQAGAIVIDNSSQWRMTEDVDLVVPEVNEPHFTRGIIANPNCSTIQSVVPLKVLQDAFGLSRVAYTTYQAVSGSGVKGKRDLSEGANGKAPEAYPHPIYNNVLPHIDVFLENGYTKEEQKMIDETRKILNDKDLKVTATCVRVPVQDSHSVEMDVTLNQDTTVEAIQELFDKDDRVVLVDNPAKNEYPLAIHSTGKDDVFVGRIRRDDTLDNTFHVWCTSDNLLKGAALNAVQVLEQVLKLKGVL >NC_022737.1|WP_023375296.1|2550692_2551577_+|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MTHMFEGVGVALTTPFVNNEVDYDALRRHVTFLLENNAQAIIVNGTTAESPTLNDEEKEHVLETVVNLVNKQVPVIAGTGTNNTEKSIQASVRARQLGADAVMLITPYYNKTNQRGLVQHFETIANAVELPVVLYNVPARTNMTIEPETVETLSQNKYIVALKDATNDFEYFEEVKKRVNQDEFAIYSGNDDNVVDFYKRGGNGVISVIANVIPKEFQHLYDAKQDGDTMAKAFEPIGQLLDALSVDVNPIPIKALTAYEGFGSYELRLPLVPLEDNDRQTLEQAYETFKAGEK >NC_022737.1|WP_023375297.1|2551576_2552299_+|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-reductase MKILLIGYGAMNQRVARLAEEKGHEIVGVIEPTHSESTPYQQYHHIADAKEAEVAIDFSNPNLLLPLLDESFELPLVVATTGEKEKITQKLENLGKKMPVFFSANMSYGVHALTKILEAAVPLLQDFDIELTEAHHNKKVDAPSGTLVKLYDVIEGLRDKTKPVYDRHDKTEKRTPDEIGIHTVRGGTIVGEHDVLFAGTDETITISHKAQSKDIFANGAIGAAEKLINKENGFYTFDNL >NC_022737.1|WP_023375298.1|2552322_2553042_+|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-acetyltransferase MVQHLSAQEIIQYISDAKKSTPLKVYVNGTFEGVDFPESFKVFGSDYSKVIFCEADDWKPFYETHQNKLEDVEIEMDRRNSAIPLKDLTNTNARIEPGAFIREQAVIEDGAVVMMGATINIGAVVGEGTMVDMNATLGGRATTGKNVHVGAGSVLAGVIEPPSASPVVIEDNVLIGANAVILEGVRVGEGAIVAAGAIVTQDVPAGAVVAGTPAKVIKQTSEVEDSKREIVSALRKLND >NC_022737.1|WP_023375299.1|2553223_2554375_+|amidohydrolase MNELEFVTTHRRHLHQHPELSLHEYKTTQYITDFLTELDVPFERPLETGAIAYLEGNSQHTIAYRADIDALPIFEENDVEYRSQNDNVMHACGHDGHTTALMLFVQRCKVMADKGTLPHNIVFIFQPAEETGGCAHRLIKAKAFEKYPIEAVFGIHVNPFSDEGTVVIRDEEITASATEYRFYLTGLSSHVADKEQGYSCGEALQHVLTQVGQIQQFHLNGLKRNIVHMGHFEAGEAINTVPSNGYLEGTIRTYDVDDLTIVKNQMQKIAESVSLLFNVTCEVKFEEGYPPTMNSPKLREPVEQALNNANLEVIDKPTPFLFGEDFSFYGQLLAPAYFVFVGTRNKEKGYVTGLHTSHLNFDEKVLIDVANYYEQLLLNYKEV >NC_022737.1|WP_041614009.1|2554378_2555455_+|alanine-racemase MTAIWSVDTEAFYNNAKKVKNQQPIMAVVKNNAYHYGLEFAVKQFLRAGINTFSTTSLKEAVRVRELAPDVTVFLMNAVYDFDTVRDYHIHMTLPSLNFYYEHKADLRDIHVHLEFENLLHRSGFKTLEEIQEVLQDHQQNKNAERMIISGLWTHFGYADEFGVPEYDEERSAWLNVLHTLLNEGYQFDYIHSQNSASYYREGQVVLPHHTHARVGIALYGSRPYSDLDESTIQQALTVKANVIQIREVQNGDYCGYSWAFETQHDNTKLAVVDVGYGDGILRTRAQHEALINGKRYPIRALMMSHMFVEVDEHVHAQDQVVLYNDSMRIDEYTFKGVGANSEQLSAMNHDSLIKEYR >NC_022737.1|WP_023375301.1|2555457_2556723_+|diaminopimelate-decarboxylase MTVEYNEYGELTMGGTSLKTVAQSFGTPTIVYDEEQIRNQMRRYHKAFQQSGLKYNISYASKAFTCIQMVKLVQEEDLQLDVVSEGELYTALEAGFDPSRIHFHGNNKTKHEIRYALDNHIGYFVIDSLEEIDLIDRYASETVQVVLRVNPGVEAHTHEFIQTGQEDSKFGLSIRYGLANEAFDKIKQAKHLNLKGVHIHIGSQIEGTEAFIETAKIVMNWLNDQQIQVDLLNLGGGFGIKYVEGDVSFPIESGIAEITDAIKNEANQLNMETPEIGIEPGRSIVGEAGITLYEVGTIKEIPEINKYVSIDGGMSDHIRTALYDAKYQALLVNRQEEADDTVTIAGKLCESGDIIIKNAKLPSSIQRGDYLAILSTGAYHYSMASNYNQMQKPSVFFIKDGKAREVIKRQSLRQLIINDTK >NC_022737.1|WP_002433901.1|2557011_2557212_-|cold-shock-protein MKQGTVKWFNAEKGFGFIEVEGENDVFVHFSAINQDGYKSLEEGQSVEFEVVEGDRGPQAANVVKL >NC_022737.1|WP_023375302.1|2557398_2557707_-|DUF1033-family-protein MWTVAKIRADYEGWWLFEDWPEKIVKQSEFSTYEDMLAAYCKLIKDCNDYYDNCVMGKYNMYAFYNNCDLNFCEDCDEDLQIFYSFIVLKNNEVYYNLPKIV |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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1. spacer 6.1|2547934|28|NC_022737|CRISPRCasFinder matches to position: 2548056-2548083, mismatch: 2, identity: 0.929
ttgcataagagccactattcagttaaaa CRISPR spacer ttgcataagagccactattcatttgaaa Protospacer ********************* **.***
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_022737_3 | 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT | 1370002-1370031 | 30 | NZ_CP053961 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed1, complete sequence | 46969-46998 | 5 | 0.833 |
NC_022737_3 | 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370134-1370163 | 30 | KT878766 | Staphylococcus phage P1105, complete genome | 22115-22144 | 5 | 0.833 |
NC_022737_3 | 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370134-1370163 | 30 | MH384261 | Staphylococcus phage SA137ruMSSAST121PVL, complete genome | 43122-43151 | 5 | 0.833 |
NC_022737_3 | 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370134-1370163 | 30 | NC_025460 | Staphylococcus phage phiSa119, complete genome | 39609-39638 | 5 | 0.833 |
NC_022737_3 | 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370134-1370163 | 30 | AY954956 | Bacteriophage 3A, complete genome | 23244-23273 | 5 | 0.833 |
NC_022737_3 | 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370134-1370163 | 30 | NC_007053 | Staphylococcus phage 3A, complete genome | 23244-23273 | 5 | 0.833 |
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NC_022737_4 | 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1376767-1376796 | 30 | JX519263 | Uncultured Mediterranean phage MEDS1 group fosmid MedDCM-OCT-S13-C2, complete sequence | 5766-5795 | 5 | 0.833 |
NC_022737_3 | 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT | 1370002-1370031 | 30 | MH992183 | Apis mellifera associated microvirus 33 isolate INH_SP_169, complete genome | 3086-3115 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP019166 | Listeria monocytogenes strain HPB5415 plasmid pLM5578, complete sequence | 50298-50327 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_KU513859 | Listeria monocytogenes strain IZSAM_Lm_15_17439_A144 plasmid pLmA144, complete sequence | 83451-83480 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP022021 | Listeria monocytogenes strain FDA709873-33 plasmid pCFSAN021445, complete sequence | 87659-87688 | 6 | 0.8 |
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NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP023753 | Listeria monocytogenes strain AT3E plasmid pLM58, complete sequence | 18401-18430 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP025439 | Listeria monocytogenes strain MF4697 plasmid pMF4697, complete sequence | 18399-18428 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NC_022045 | Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid, complete sequence | 3994-4023 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NC_022045 | Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid, complete sequence | 61547-61576 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP023053 | Listeria monocytogenes strain FDA709873-31 plasmid pCFSAN021143, complete sequence | 6095-6124 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | MK134858 | Listeria monocytogenes plasmid pLM1686, complete sequence | 85667-85696 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NC_013767 | Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578, complete sequence | 67798-67827 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP025561 | Listeria monocytogenes strain PIR00545 plasmid pPIR00545, complete sequence | 25451-25480 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP045744 | Listeria innocua strain CFSAN044836 plasmid pCFSAN044836, complete sequence | 36506-36535 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NC_014495 | Listeria monocytogenes serotype 1-2b str. SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1 complete sequence | 18860-18889 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP014251 | Listeria monocytogenes strain CFSAN010068 plasmid pCFSAN010068_01, complete sequence | 24056-24085 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NC_003383 | Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100, complete sequence | 41937-41966 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP025569 | Listeria monocytogenes strain PIR00540 plasmid pPIR00540, complete sequence | 31627-31656 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP015985 | Listeria monocytogenes strain 2015TE24968 plasmid pl2015TE24968, complete sequence | 3985-4014 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP013725 | Listeria monocytogenes strain Lm N1546 plasmid pLmN1546, complete sequence | 20901-20930 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_HG813248 | Listeria monocytogenes R479a plasmid pLMR479a, complete sequence | 83451-83480 | 6 | 0.8 |
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NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP041214 | Listeria monocytogenes strain LMP18-H8393 plasmid pCFSAN074382, complete sequence | 21637-21666 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370596-1370625 | 30 | NZ_CP045973 | Listeria monocytogenes strain AUSMDU00000224 plasmid pAUSMDU00000224_01, complete sequence | 18531-18560 | 6 | 0.8 |
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NC_022737_3 | 3.12|1370728|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370728-1370757 | 30 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 14404-14433 | 6 | 0.8 |
NC_022737_4 | 4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1376701-1376730 | 30 | NZ_CP017949 | Tenericutes bacterium MO-XQ plasmid unnamed, complete sequence | 82917-82946 | 6 | 0.8 |
NC_022737_3 | 3.2|1370068|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370068-1370097 | 30 | NZ_CP030933 | Enterococcus gilvus strain CR1 plasmid pCR1A, complete sequence | 826096-826125 | 7 | 0.767 |
NC_022737_3 | 3.12|1370728|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370728-1370757 | 30 | MK448934 | Streptococcus phage Javan422, complete genome | 4965-4994 | 7 | 0.767 |
NC_022737_4 | 4.1|1376503|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT | 1376503-1376532 | 30 | MN692980 | Marine virus AFVG_117M21, complete genome | 5260-5289 | 7 | 0.767 |
NC_022737_4 | 4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1376701-1376730 | 30 | NC_005909 | Pseudomonas alcaligenes plasmid pRA2, complete sequence | 3685-3714 | 7 | 0.767 |
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NC_022737_4 | 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1376767-1376796 | 30 | KT184316 | Enterobacteria phage XTG1, complete genome | 55930-55959 | 7 | 0.767 |
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NC_022737_3 | 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT | 1370002-1370031 | 30 | NZ_CP024097 | Bacillus cytotoxicus strain CH_39 plasmid pCh39_83, complete sequence | 78385-78414 | 8 | 0.733 |
NC_022737_3 | 3.2|1370068|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370068-1370097 | 30 | NZ_CP016898 | Acinetobacter soli strain GFJ2 plasmid pGFJ2, complete sequence | 74939-74968 | 8 | 0.733 |
NC_022737_3 | 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370134-1370163 | 30 | NZ_CP038617 | Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN5, complete sequence | 102835-102864 | 8 | 0.733 |
NC_022737_3 | 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1370134-1370163 | 30 | NZ_CP020456 | Vibrio coralliilyticus strain SNUTY-1 plasmid pSNUTY2, complete sequence | 50581-50610 | 8 | 0.733 |
NC_022737_4 | 4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1376701-1376730 | 30 | NZ_CP013615 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence | 308937-308966 | 8 | 0.733 |
NC_022737_3 | 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT | 1370002-1370031 | 30 | MN692989 | Marine virus AFVG_117M66, complete genome | 12965-12994 | 9 | 0.7 |
NC_022737_4 | 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1376767-1376796 | 30 | NZ_AP019635 | Enterobacter sp. 18A13 plasmid pECC18A13-1, complete sequence | 38640-38669 | 9 | 0.7 |
NC_022737_2 | 2.1|1119787|32|NC_022737|CRISPRCasFinder | 1119787-1119818 | 32 | MK016664 | Synechococcus phage S-B68, complete genome | 136020-136051 | 10 | 0.688 |
1. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009640 (Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
attgctgcattttattaatttc-tgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttgtatca- Protospacer *********.*********** **. ***
2. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053961 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
attgctgcattttattaatttc-tgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttgtatca- Protospacer *********.*********** **. ***
3. spacer 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT878766 (Staphylococcus phage P1105, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcggttttgttagtgataaagcctaattc CRISPR spacer atcatttttattagtgataaaacctaattc Protospacer .**. ****.***********.********
4. spacer 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH384261 (Staphylococcus phage SA137ruMSSAST121PVL, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcggttttgttagtgataaagcctaattc CRISPR spacer atcatttttattagtgataaaacctaattc Protospacer .**. ****.***********.********
5. spacer 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_025460 (Staphylococcus phage phiSa119, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcggttttgttagtgataaagcctaattc CRISPR spacer atcatttttattagtgataaaacctaattc Protospacer .**. ****.***********.********
6. spacer 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AY954956 (Bacteriophage 3A, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcggttttgttagtgataaagcctaattc CRISPR spacer atcatttttattagtgataaaacctaattc Protospacer .**. ****.***********.********
7. spacer 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007053 (Staphylococcus phage 3A, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcggttttgttagtgataaagcctaattc CRISPR spacer atcatttttattagtgataaaacctaattc Protospacer .**. ****.***********.********
8. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013811 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C15-MedDCM-OCT-S36-C173, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tacactgatgaccataattccatttgacca- CRISPR spacer agcaatgatgaccataactccattt-accac Protospacer .** ************.******* ****
9. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX519263 (Uncultured Mediterranean phage MEDS1 group fosmid MedDCM-OCT-S13-C2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tacactgatgaccataattccatttgacca- CRISPR spacer agcaatgatgaccataactccattt-accac Protospacer .** ************.******* ****
10. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH992183 (Apis mellifera associated microvirus 33 isolate INH_SP_169, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttttttcattttattgatttcttcctcag Protospacer ** .* *********.****** ******
11. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019166 (Listeria monocytogenes strain HPB5415 plasmid pLM5578, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
12. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KU513859 (Listeria monocytogenes strain IZSAM_Lm_15_17439_A144 plasmid pLmA144, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
13. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP022021 (Listeria monocytogenes strain FDA709873-33 plasmid pCFSAN021445, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
14. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP022021 (Listeria monocytogenes strain FDA709873-33 plasmid pCFSAN021445, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
15. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023753 (Listeria monocytogenes strain AT3E plasmid pLM58, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
16. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025439 (Listeria monocytogenes strain MF4697 plasmid pMF4697, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
17. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022045 (Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
18. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022045 (Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
19. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023053 (Listeria monocytogenes strain FDA709873-31 plasmid pCFSAN021143, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
20. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK134858 (Listeria monocytogenes plasmid pLM1686, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
21. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_013767 (Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
22. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025561 (Listeria monocytogenes strain PIR00545 plasmid pPIR00545, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
23. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045744 (Listeria innocua strain CFSAN044836 plasmid pCFSAN044836, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
24. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014495 (Listeria monocytogenes serotype 1-2b str. SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1 complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
25. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014251 (Listeria monocytogenes strain CFSAN010068 plasmid pCFSAN010068_01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
26. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003383 (Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
27. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025569 (Listeria monocytogenes strain PIR00540 plasmid pPIR00540, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
28. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015985 (Listeria monocytogenes strain 2015TE24968 plasmid pl2015TE24968, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
29. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013725 (Listeria monocytogenes strain Lm N1546 plasmid pLmN1546, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
30. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813248 (Listeria monocytogenes R479a plasmid pLMR479a, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
31. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025260 (Listeria monocytogenes strain MF4624 plasmid pMF4624, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
32. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032307 (Enterococcus faecium strain HY07 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
33. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025083 (Listeria monocytogenes strain MF4626 plasmid pMF4626, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
34. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023051 (Listeria monocytogenes strain FDA971911-001-001 plasmid pCFSAN059932, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
35. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021828 (Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
36. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP041214 (Listeria monocytogenes strain LMP18-H8393 plasmid pCFSAN074382, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
37. spacer 3.10|1370596|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045973 (Listeria monocytogenes strain AUSMDU00000224 plasmid pAUSMDU00000224_01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagtatttaaaagtgcaaaccaaataattt CRISPR spacer ctgtatttataagtgtaaaccaaatagtct Protospacer . ******* *****.**********.*.*
38. spacer 3.12|1370728|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaacacgttggacacaaaaaggaagattaa CRISPR spacer atactaaatggactcaaaaaggaagattaa Protospacer * ** . ***** ****************
39. spacer 3.12|1370728|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaacacgttggacacaaaaaggaagattaa CRISPR spacer atactaaatggactcaaaaaggaagattaa Protospacer * ** . ***** ****************
40. spacer 4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017949 (Tenericutes bacterium MO-XQ plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gctgaaaacttaaagaaatcaggtagtggt CRISPR spacer gctgaaaacctaaagaaattagggcttgat Protospacer *********.*********.*** **.*
41. spacer 3.2|1370068|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP030933 (Enterococcus gilvus strain CR1 plasmid pCR1A, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctaactcatccattgaatcaagaacttctg CRISPR spacer atagctcatccattgaatcaagcccatatc Protospacer **.****************** * * *
42. spacer 3.12|1370728|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448934 (Streptococcus phage Javan422, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aaacacgttggacacaaaaaggaagattaa CRISPR spacer atacctattggacacaaaaaggacgattgt Protospacer * ** ..**************** ****.
43. spacer 4.1|1376503|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN692980 (Marine virus AFVG_117M21, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatactggcttaggaatgctttcttattca CRISPR spacer cctacgggctttggaatgctttcttttata Protospacer *** ***** ************* * .*
44. spacer 4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_005909 (Pseudomonas alcaligenes plasmid pRA2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gctgaaaacttaaagaaatcaggtagtggt CRISPR spacer tcgaaaaacttaatgaaatcaggaagtgcg Protospacer * .********* ********* ****
45. spacer 4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH617606 (Microviridae sp. isolate ctgi760, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gctgaaaacttaaagaaatcaggtagtggt CRISPR spacer gttgaagacttaaagaaagcaggtataaat Protospacer *.****.*********** ****** ..*
46. spacer 4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK064565 (Sulfolobales Beppu rod-shaped virus 1 clone D, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gctgaaaacttaaagaaatcaggtagtggt CRISPR spacer agtgaaaacttaaagaaattagctaaagct Protospacer . *****************.** **. * *
47. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT833282 (Escherichia coli phage vB_EcoM_Shy, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
48. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC473039 (Escherichia phage L27 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataagtccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
49. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_005282 (Enterobacteria phage Felix 01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataagtccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
50. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JF461087 (Salmonella phage FO1a, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataagtccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
51. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK482690 (Escherichia phage vB_EcoM_LMP34, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
52. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK482689 (Escherichia phage vB_EcoM_LMP33, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
53. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN994499 (Phage NBEco005, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
54. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC139638 (Salmonella phage FSL SP-107 thymidylate synthase, dihydrofolate reductase, hypothetical proteins, putative transcriptional regulatory protein, hypothetical proteins, ATP-dependent DNA ligase, hypothetical proteins, putative DNA polymerase, endonuclease, putative DNA polymerase, hypothetical proteins, putative deoxynucleotide monophosphate kinase, hypothetical protein, putative phage DNA primase/helicase, hypothetical proteins, putative exodeoxyribonuclease, NAD synthetase, hypothetical proteins, ribonucleoside triphosphate reductase, alpha chain, hypothetical protein, ribonucleoside triphosphate reductase, beta chain, putative glutaredoxin, hypothetical protein, ribonucleotide reductase of class III, hypothetical proteins, ribonucleotide reductase of class III, hypothetical proteins, putative ribose-phosphate pyrophosphokinase, nicotinamide phosphoribosyl transferase, hypothetical proteins, rIIA protein, rIIB protein, hypothetical protein, putative PseT polynucleotide 5'-kinase/3'-phosphatase, and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
55. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG646671 (Salmonella phage BPS17S6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatttgtcca Protospacer * * ********** ******** ***
56. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG065668 (UNVERIFIED: Campylobacter phage A126, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
57. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN994503 (Phage NBSal004, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
58. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH571750 (Escherichia phage vB_EcoM-Ro111lw, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
59. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR699048 (Escherichia phage VpaE1_ev035 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
60. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK965970 (Salmonella phage DaR-2019b isolate 6717_4FA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
61. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR597663 (Escherichia phage VpaE1_ev78 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
62. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT446388 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH10, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
63. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850637 (Escherichia phage warpig, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
64. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850635 (Escherichia phage bumzen, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
65. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850564 (Escherichia phage humlepung, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
66. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK524176 (Escherichia phage PHB11, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatttgtcca Protospacer * * ********** ******** ***
67. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AF320576 (Bacteriophage Felix 01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataagtccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
68. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX560968 (Escherichia phage EC6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
69. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028872 (Escherichia phage HY02, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
70. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN882542 (Escherichia phage JN01,complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
71. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG065664 (UNVERIFIED: Campylobacter phage A132, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
72. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK965969 (Salmonella phage DaR-2019a isolate 6712_28b, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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73. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_031939 (Salmonella phage BPS15Q2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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74. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG646670 (Salmonella phage BPS15S6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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75. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU169904 (Staphylococcus phage SA1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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76. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850566 (Escherichia phage garuso, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
77. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR597658 (Escherichia phage VpaE1_ev108 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
78. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP010413 (Salmonella phage vB_SPuM_SP116, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatttgtcca Protospacer * * ********** ******** ***
79. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT184316 (Enterobacteria phage XTG1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
80. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_027337 (Escherichia phage vB_EcoM-VpaE1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
81. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850644 (Escherichia phage ekra, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
82. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850636 (Escherichia phage dune, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
83. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN655999 (Shigella phage Z31, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
84. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850577 (Escherichia phage heid, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
85. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850585 (Escherichia phage skuden, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
86. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT322327 (UNVERIFIED: Escherichia phage SSBS18_WS_10_728, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
87. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850631 (Escherichia phage mio, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
88. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850639 (Escherichia phage radambza, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
89. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG646669 (Salmonella phage BPS17W1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatttgtcca Protospacer * * ********** ******** ***
90. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK482688 (Escherichia phage vB_EcoM_LMP25, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
91. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF055347 (Escherichia phage JH2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatttgtcca Protospacer * * ********** ******** ***
92. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_042096 (Salmonella phage BPS17L1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
93. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_027360 (Enterobacteriaphage UAB_Phi87, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
94. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN227145 (Salmonella phage BPSELC-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatttgtcca Protospacer * * ********** ******** ***
95. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850633 (Escherichia phage allfine, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaaacatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
96. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850619 (Escherichia phage finno, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
97. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT184313 (Enterobacteria phage KhF1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
98. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT184315 (Enterobacteria phage KhF3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
99. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN481367 (Salmonella phage D1-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatttgtcca Protospacer * * ********** ******** ***
100. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH586731 (Salmonella phage Meda, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
101. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT184314 (Enterobacteria phage KhF2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
102. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN850647 (Escherichia phage tootiki, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer ttgaagcatgaccataaatccatctgacca Protospacer * * ********** *****.******
103. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024110 (Bacillus cytotoxicus strain CH_13 plasmid pCh13_79, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
104. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020005 (Bacillus thuringiensis strain Bacillus thuringiensis L-7601 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
105. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024106 (Bacillus cytotoxicus strain CH_23 plasmid pCh23_67, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
106. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024118 (Bacillus cytotoxicus strain CH_2 plasmid pCh2_83, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
107. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024103 (Bacillus cytotoxicus strain CH_25 plasmid pCh25_67, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
108. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024108 (Bacillus cytotoxicus strain CH_15 plasmid pCh15_83, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
109. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024100 (Bacillus cytotoxicus strain CH_38 plasmid pCh38_83, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
110. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024122 (Bacillus cytotoxicus strain CH_1 plasmid pCh1_67, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
111. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024115 (Bacillus cytotoxicus strain CH_3 plasmid pCh3_83, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
112. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024097 (Bacillus cytotoxicus strain CH_39 plasmid pCh39_83, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer cttgctgcatcttattaatttcttctatca Protospacer *********.************ *. . .
113. spacer 3.2|1370068|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016898 (Acinetobacter soli strain GFJ2 plasmid pGFJ2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaactcatccattgaatcaagaacttctg CRISPR spacer ctaactcatccattaaatcaattaatgtat Protospacer **************.****** * * .
114. spacer 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP038617 (Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcggttttgttagtgataaagcctaattc CRISPR spacer tcgggttttggtagtgataaaacctataac Protospacer . ******* **********.**** *
115. spacer 3.3|1370134|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020456 (Vibrio coralliilyticus strain SNUTY-1 plasmid pSNUTY2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcggttttgttagtgataaagcctaattc CRISPR spacer gtcggtgttgttagtgataaataaaaacat Protospacer ****** ************** **. .
116. spacer 4.4|1376701|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013615 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gctgaaaacttaaagaaatcaggtagtggt CRISPR spacer gatgaaaatttaaagaattcaggtaaaatc Protospacer * ******.******** *******. . .
117. spacer 3.1|1370002|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN692989 (Marine virus AFVG_117M66, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
attgctgcattttattaatttctgcctcag CRISPR spacer agccctgcatattattaatttctgcaattc Protospacer * . ****** ************** .
118. spacer 4.5|1376767|30|NC_022737|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP019635 (Enterobacter sp. 18A13 plasmid pECC18A13-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tacactgatgaccataattccatttgacca CRISPR spacer tacgctgatgaccataataccatccattag Protospacer ***.************** ****... . .
119. spacer 2.1|1119787|32|NC_022737|CRISPRCasFinder matches to MK016664 (Synechococcus phage S-B68, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tagcccaacttgcattgcttgtagagtttctg CRISPR spacer acgttgcgcttggagtgcttgtagagtttctc Protospacer *.. .**** * ****************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
233685 : 242710
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022737|233685:242710|DBSCAN-SWA ACTATTCATCATAAGAAATTAAACTCATCACATCATAGTCTTTTATCTTTTCAATACCATTTAAATATTTTAATTCAATAATAAAAGCAATCCCTACAACGATACCGCCTAACTTTTCAACAAGTTTAATAGCCGCTTCAATTGTACCACCTGTCGCTAATAAATCGTCCGTGATTAATACACGTTGACCAGGTTTAATAGCATCTTTATGCATTGTTAAAACATTAGTGCCATATTCTAAATTATACTCGTATCTAATAACTTCACGAGGTAATTTACCTTCTTTACGTACAGGTGCAAACCCTATACCCATAGAATAAGCTACTGGGCAACCAATAATAAATCCTCGTGCTTCTGGTCCTACAACCACGTCGACATCTTTTTCTCTTGCATATTCAACAATTTGGTCTGTAGCATAGCCGTATGCTTCACCATTGTCCATAATTGTAGTGATATCTTTGAAGCTAACCCCTGGTTTTGGCCAGTCTTGTACCTCAGAAACGTATTGTTTTAAATCCATCTTATTATTTCCTCCTAATTACTATATCCCAATTGAGTTTTAATCCATAATTTTAAATGATTGAAATCATCATATAATAAAAGTTTTTCGACCTCTATTCTGGACAACCTAGCCTGATACAATTGACTTGTTTCAATATCTTGTTTACTTGGTTGACTCGCAATCGTTATTATACCATCATCTTCGTTAATAAATCCTAATTCTAAAAATACTTTTAGCATAAATTTTAATGAATTAGCTTTAATATTGAGAAAGTCACACAACATCATACCTTCAGTAGCTAAATTCATTTCCTTTTTATTAATTAATGCTTTATAACATTGTTTAAATAAATTGATACTTGGCATTCCTTCAAAATATATAGACATTTTATGTTGAAACACAAGATAAATTTGAGATATTTCTGTTTGTTGTAATGTACTTTTTAATTCATCAAGTGTATTCGGTAAATCTCTAAAAACAATTTTATCATATTCAGCAGGTATAACTTCTCCATAGTAGAACTCGTTTTCATTTGATTTTTGAACTTTAGAATGAATGACAAAAGCTGTTGTATGGTCATTATTTAAGAAATGTGTATTCTTACTTTTACTTCGATAATCTAATATCTGCATTGTATCCATAGCTATATCTTGAACAATGAACTGAGGTGTTTGATTGCCATTCCATTCATTTATTTGCAAGTTACCTATTAAGTTGACCGGTTGACCGTTATCTAATTGTGTTGCATATGCACCATTTTGCCAAAATAAAGCTGGTAAATTAGAATCACCTAATGTCATCTTCAAATGATTTTGTTCTTTACCTATGGCCTTTAATGAATTAATAGTCATATTTTGAATTTCGAATAATGGTGAATTAAAATCTGTGCCGAATGGTCGTAATTTATGAATATCTTTAATATTTTTAATCGTAATATCAGCTTCATTCAATAACACATCTATTTTTTTACTAGGATCAAGTGAGGTCGTTTCACTTAGTCTTGCCATCCATTCATTTAATCCATCTCGTAATGCCTCAACATTATCAATATCCATAGTCATTCCAGCTGCCATATGGTGCCCACCGAATTTACTAATTAAATCTTGATGTGCATTTAAAATTTCAAACATAGAAACTTGTTCAATTGATCTAGCAGAACCTTTAGCATGATTTTGTTCATAATCAATATTTAAAATTAATGTTGGTAAACTATATGTCTCCACGATTTTCGATGCTACAATTCCCAATACTCCTTCATGCCAATCTTCTTTGGCTAATAATAGAAATTGATGTCCTTGAGAAACATAATCCTCAGCCATTGCTAATGCTTCTTCTGTAATTTGAGCTACGATATCTTTACGCTCTTGGTTGAAATGCCCAACCTGTTCTGCTAAAAATTCAGCTTCATCTACACTATCAGACATTAATAATTCAGCAGCTAAAGATGCATCTTCTAATCGTCCAACTGCATTTAATCTAGGACCTATAATAAAACCTATTGTTTCTTCAGTAATTTCATCGTTATAACTAGCTTGATTTAGTAAAGCTTTAACGGCAACTGGACAACTGTCATTCATGACTTTTAAACCTTGTTGTACAATTGAACGATTTTCATCAGTTAAAGATACTAAGTCTGCAATCGTTCCTATAGCTGCATATGCTTTAAAATAATTTGGCACATTTTCTAATAATGCTTGCGCTAATTTATAGGCTACACCAGCACCACATAAATATTTAAAAGGATAATCAAATTCTGGATGCATGGGGTGTACAATTGCATACGCTTCAGGTAACGTTCTGCCAATTTCGTGGTGATCAGTGACAATAACATCTACACCTAAATCTTGAGCCATTTTAATTTCAGCATGCCCTTGTATACCATTATCTACAGTAATGATTAATGAAATTCCTTCATCATAAGCATTTTGAAATGCCAATTCATTCGGCCCATACCCTTCTGTAAAACGGTTCGGTATATACCATCCAACTTGAGCCCCTAATTTTTGTAAAGTATGTACTAATATTGTCGTTGATGTCACACCATCAGCATCGTAATCACCATATACTAATATACGTTCGTTTTTATCTATAGCTTGATTTATACGTTCTATCGTCTTATCAATGTCGCTAAGTAAAGAACAATCATGATTGATATCAACGCCATTTAAAATACGTTGTATGTCTTCTTCTTCAATAATATGTTTACTTTCTAATATCTTTTTGATGATAGGAGATAGTTTTAAGCGTTGAGCTATACTATCTGATATATATTCAGTTGGGTTATTTAAATTCCAATTATATTTAGATTTAATCATAAGTAACCTTCCTCATTTCCAAATGCCATTATATCGAAAATCGAAAAAAATAAAAAGGTTGAGCACTTTGTTGCAAAATCTTTTAAAGATATTACAACATCAATGCTCAACCTTATATTGATTAAACTACGATTTTTTCGTCATTTGATTTTTTCTCTTTGAATACAACTAATTTATGATTAGATGATTTTTTCAATTGACGTTTCTTCATAATTCCCCATAATGGGACAGCTATAAAGACTGAAGAGAACACGCCTGAAATTAATCCGATTAATAAAGCTAATGAGAAGTTGAAAATTGTTGGTGCACCAAATAATAGGATTGCAACAACTACGACAACAACTGTTAAAACTGTATTAATAGAACGTGTCATTGTTTGTCTAATTGATCTGTTAACGATGTCATCAATTTGTTCAGTTGATGTAATCACTTTAATCTTATGCAAGTTTTCTCGAACACGGTCAAATGTAACGATGGTATCGTTAATAGAATAACCAACAATCGTTAAGATTGCAGCGATAAATGTTAAATCAACTTCTAAACGAAGTAAACTGAACACAGCGACTATAATGAATACGTCGTGTAATAAAGCTAAGACAGAGGATAATCCCATTCTCCATTCGAAACGTAATGATACGTAGATAATAATACCTAATGCTGCATATACTAACGCAAGCATTGCGTTTTTAGCTAATTCTTGTCCAATTAATGGTGAAACTGTATTAATTTGTGGTGAGTTACCAAATTCAGATTTCATTTTATCACTTAGTTGATTATCTTTAGCTTGTGATAAATCTTGTTTAAATTGAACAGTAGCGTTTTTATTACCTGAACCATTTATTTGAATTTGATCTGGTTCTAATCCAACATCTTTCACTACTTTTTCAACTTTAGATTGAGAAAGTGCTTCTTTAGATTGTAAGTCTACTCGCGTACCAGCAGAGAAATCTATACCTAAATTCAATTTGAAAATGTAAAGAATGACTAGTCCTACTACAACAATTAAAATACTCAATGAAATTAATGGTTTAGCTAATTTAACGAAATTCCATTTTTCAAATGATGTTTTTAAGTCATGGACGTCCTTACCTTCGCTAATATCATGTCTATCTGCTTTTTTAACACCAAATAACCAATATTTTTTCTTAAATAAATTAGAATAAACTAGTAATGATAATAATAATCTAGATAAGAACACTGCAGTTACAAATATCATTAAAATACCTAATAACAACATTGTTGCGAAACCTTTTACTGAGCTTTCACCAAAGAAGAACAGTACTGCAGCAGCGATCACGGTTGTTAAGTTGGAGTCAAAGATTGTTAAGAATGAACTTTTATTGGCTTTAGAATAAGCCTGTTTAAGCGTCCTACCAATTCTCAACTCATCTTTAATCCGTTCATACATTATGATGTTGGCATCTACTGCCATACCTACACCTAATACTAAGGCAGCTAAACCAGGTAATGTAAGTACACCTGAAATAAAGTTAAAGGCTACAAGCGTTATATATATATATGTTGTTAATGCGATGATGGCTACAAGTCCTGGTAATCTGTAGAAACCTAACATAAATAGATAGATTACAGCTACACCTAGAACTGATGCAAAGATTGTTTTATCTAGTGCATCTTGACCAAATTCAGCACCAACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTAAGATCTACCGGTAAAGAACCAGCGTTTAATAATTCAGCAATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGACCATGGAATCCACCAGAAATTTCTACACTATCTGAATTGATTGGTTGATCAACGTTTGCTGCAGAAACGAACTTAGGATCTTTTTTGTTTGCTTCTTTCTTATAGCTGTCGCCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATTACGTTATTTTGCTTTTTAGATATTTCTTCAGTTACTTTTTTAAATTTATTTTTATCTTTTACTTTAAATGTAACTGTTGGATCATTCGTATTTTGTTTAAATTCTTGCTTCGCTGATCCTTGTTTAATATCTGCACCACTTAATTTAACTTTGTCGTCCGCATCACGAATAGTTAAATTAGCTTGTGATGATAAAATCTTTCTTGCCTCTTTCTGATCTTTAACACCAGCAAGTTGAACCCTAATTCTATTTGGATCTTCAACTTGTATTTTAGGTTCAGAAACACCTAATACGTTAACACGATTTTCTAGTGTTTGCGCTGTAGATTGCAACGCATTTTTATCAATTTTATCACCTTTATGTAATGGGTCAACTTGATAAAGCACTTCGAATCCGCCCTGTAAATCAAGGCCTAAGTTAACATTCTTAATCACATTCTTATATGTAAGACCCATACCTGCGAACAGAAGGATCACCAGTAGTAAGAATGCAATCAATCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACTTATGATACTAGAATACTCGATTAATCCTTATATTTGCAAGTCAGAGTAAAATGAATAACTCCTACGACCTATCTATATTAACATACTACACTTTATAGTGAAATTATTGAAAACTTTTTTCAATTAAATTAATGCATATCCATAACTAAAAATAGTGATATTAAGTCATCTCTAGCATCATTTATTTATATAAAACGGTCTTTATAATGATAAAGAACATAAAATTAAACTTAAAGTCAAATAGTCACGTGAATTAATCTTCATGTAAATATAAATGAAGCCTGAGACATTAATGCCCCAGGCTTCAATAACATACTATTATGAAGGATCTACTTGTTTAATAGCTGGTTTTTCAAAAGTCATTTCTGTACCGTGTCCATTAACAGTCACAACTACTGTTGTTTCATCAACGGCTTTAACTGTACCTTTAATACCACCAATTGTAGTAATTTTTTGTCCAGCTTCTACACGACTTATCATTTCACGATGCTCTTTGGCACGTTTTTGTTGTGGTCTAATTAAGAAGAAATACATTAGAACCAACAATAAGATCGGTAATATCAATGATGTAAATTGCATGTTACATTCTCCTCTTTAAAAGTTTTTAGGGTTATCTACATTTAATCCATACTGTTCGAAGAATTCAGCTTTAAAATCTAAAAGTCTATCTTCTCGAATGGCTTGTCTAATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGGATACCAAAGGTTTCTTCTGCTTTGATCAAGTGTCTAATGTATGCTCTAGAATAATTTTTACATGTATAGCAATCACAATTTTCATCTAATGGTCTTAAATCATCAGCGAACTTGGCGTTTTTGATTACTAAACGTCCATTAGAAGTCATACATGTACCATTTCTAGCAATACGAGTAGGTAATACACAATCAAACATATCCATACCTCGGATGCTACATTCGATTAATGCATCAGGAGATCCAACACCCATTAAATATCTAGGTTTATCTTTCGGCATAAATTGTTCTGTATGTTCTACCATTTCGTACATTACCGGTTTAGGCTCTCCTACTGAAAGTCCACCAATTGCATATCCAGGAAAATCTAATTCAACAAGCTCTTTCGCACTTTGTTCACGTAAATCTTTATATTCGCCACCTTGAATAATACCAAACAACGCTTGATCTTCAGGACGGGCATGTGCTTTTAAACATCTTTCTGCCCAACGAGTTGTTCTATCAATTGAATCTTTGACATACTTATATTCAGAAGGCATAGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATGTCTGAACCTAAATCATTTTGTATTTCCATTGATTTCTCTGGACTCAAAAATAATTTTGAACCATTCGTATGATGTCTAAATTCGACACCTTCTTCTGAGATTTTACGTAGATTACTTAAACTAAAAACTTGGAACCCTCCTGAATCGGTAAGAATAGGTCCGTTCCAATTCATGAATTTATGCAGTCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCAGGTTGTAACCACAAATGATACGTATTTCCCAAAATGATCTTAGCCTCAATCTGACGCAATTCTTCAGGACTCATTGTTTTAACTGTTGCTTTAGTTCCAACTGGCATAAACATTGGTGTTTCAAATGAACCATGTGGTGTATGTACAATTCCTAAACGTGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATATGTTCATATGTTACTGCAGGCATATTTAAAATCCTCACATTCTTTTATATAATTAACATCGCATCTCCAAAACTAAAGAATCTATACTCCATTTCAACAGCTTTTTGATATGCATTTAAAATATATTCTCTACTACTAAACGCTGACACTAACATTACTAAGGTTGATTTAGGAAGATGGAAGTTAGTAATCAAACCATCGATAGCTTTATATTCAAAACCTGGATAGATAAAGATATCTGTCCATCCACTTTTCTCAACAAATTCAGAATGATCTCTGCGTATTGTTTCAAGTGTTCTAGTTGATGTCGTACCCACTGAAATAATTCGATGACCTTTTTTTCTAGTTTCATTTAATAAATCTGCAGTTTCTTGCGTCATCTGATAGTATTCACTATGCATCTCATGATCATCAATATTATCTACACTTACTGGTCTAAATGTACCAAGACCAACATGCAATGTAATAAAGGCGATATTCACACCTTTAGCTTTAATTGACTCTAGAAGTTCATCTGTAAAATGTAGTCCTGCAGTTGGTGCGGCAGCAGATCCGCTTTCTTTAGCATAAACAGTTTGATAACGATCAGGGTCATCTAGTCTTTCTTTAATATATGGTGGTAACGGCATCTCACCTAGTTCATCAAGACGTTCTTGGAGTATACCCTCATAGTGCAAGCGCATAATTCTACCGCCTTGATCTAACTCCTCAATACATTCAGCGATTATTTTTCCATCACCGAAATTCAATTGATTCCCTACTTTAATACGTTTAGCCGGCTTTAACAATACTTCCCAGTCATTGCCTTCAATTTGAGTCAACATAAGCATCTCAACTTTAGCACCAGTTTCTTCTTTTAATCCAAAAAGTCTTGCTGGCATTACTCTAGTATCGTTTAAAACTAACGTATCACCAGGATTAAAATAATTAATAACATCTTTAAAATGTAGATGTTCCATATTTCCGTTTTTTCTATTTAATACTAACAATCTACTTTGGTCTCTATTTTTTAAAGGTGTTTGAGCTATTAGAGATTCAGGTAAATCATAGTCAAAATCTTCAATATTCAACTTACTCCCTCATTTCATTAGAATTGCTAAAATGTTTATGCGCTAATGGTGTTGCTTTTCTACCTCTAGGTGTACGTTCTAAGAAACCTTTTTGAATCAAGAAGGGTTCGTAAACGTCTTCAATAGTTATACGTTCTTCACCAATAGACACCGCAATTGTATCAAGCCCAACAGGTCCACCTTTATATTGATTCAATATACAATTCATCATTTTATGATCAATATAATCTAAACCATAATCGTCAACTTGTAATAGTTTTAATGCACGTTTCGTAGTTTCAATATAGATTTGATCATCTTCATTAACTTGTTGAAAATCTCTCACTCTCTTTAATAAACGATTCGCAACACGCGGCGTTCCTCTAGAACGTTTTGCTAATTCTATAGCACTTTCTTCATCTATATCTGTTCCTAGTACTTCCGCAGTTCTTATTATAATTTCTTTTAAATCTGCTTCATTATAATATTCAAGTCGCAAGTGGACGCCAAATCGATCTCTTAAAGGGCCAGTTAAACTACCTGCACGTGTTGTAGCACCAACAAGTGTAAAAGGTGGTAAATCAATACGAATGCTTCGTGCTTCATCACCTTTACCTATAATGATATCTAAGAAAAAATCTTCCATCGCAGGATATAATACTTCTTCAACAACACTACTTAAACGATGTATTTCATCAATAAACAACACATCTCCTGGTTGTAATCCTGATAAAATGGCTGCTAAATCTCCAGGGCGCTCTAATGAAGGTCCAGATACTGTTCTAATATTAACATCCATTTCATTAGCTATAATATTAGACAAAGTTGTTTTACCTAATCCAGGGGGACCATATAAGAGAACGTGATCTAAAGGTTCTTCTCTTAATTTAGCTGCTTTAATGAATACTTCTAAATTGCTTTTAATGGAAGATTGACCAATGTACTGTTTTAATTTAGTAGGTCGTAATGATAATTCGAAGTCAGATTCTTCATTATGTGCAGATTGATCTACCATTCTTTCATCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022737|233685:242710|234218_236501_-|WP_023372788.1|DBSCAN-SWA MIKSKYNWNLNNPTEYISDSIAQRLKLSPIIKKILESKHIIEEEDIQRILNGVDINHDCSLLSDIDKTIERINQAIDKNERILVYGDYDADGVTSTTILVHTLQKLGAQVGWYIPNRFTEGYGPNELAFQNAYDEGISLIITVDNGIQGHAEIKMAQDLGVDVIVTDHHEIGRTLPEAYAIVHPMHPEFDYPFKYLCGAGVAYKLAQALLENVPNYFKAYAAIGTIADLVSLTDENRSIVQQGLKVMNDSCPVAVKALLNQASYNDEITEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMSDSVDEAEFLAEQVGHFNQERKDIVAQITEEALAMAEDYVSQGHQFLLLAKEDWHEGVLGIVASKIVETYSLPTLILNIDYEQNHAKGSARSIEQVSMFEILNAHQDLISKFGGHHMAAGMTMDIDNVEALRDGLNEWMARLSETTSLDPSKKIDVLLNEADITIKNIKDIHKLRPFGTDFNSPLFEIQNMTINSLKAIGKEQNHLKMTLGDSNLPALFWQNGAYATQLDNGQPVNLIGNLQINEWNGNQTPQFIVQDIAMDTMQILDYRSKSKNTHFLNNDHTTAFVIHSKVQKSNENEFYYGEVIPAEYDKIVFRDLPNTLDELKSTLQQTEISQIYLVFQHKMSIYFEGMPSINLFKQCYKALINKKEMNLATEGMMLCDFLNIKANSLKFMLKVFLELGFINEDDGIITIASQPSKQDIETSQLYQARLSRIEVEKLLLYDDFNHLKLWIKTQLGYSN >NC_022737|233685:242710|239517_240657_-|WP_023372792.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYKYVKDSIDRTTRWAERCLKAHARPEDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYEMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSNGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKAEFFEQYGLNVDNPKNF >NC_022737|233685:242710|241705_242710_-|WP_023372796.1|DBSCAN-SWA MDERMVDQSAHNEESDFELSLRPTKLKQYIGQSSIKSNLEVFIKAAKLREEPLDHVLLYGPPGLGKTTLSNIIANEMDVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNEADLKEIIIRTAEVLGTDIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDDQIYIETTKRALKLLQVDDYGLDYIDHKMMNCILNQYKGGPVGLDTIAVSIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAHKHFSNSNEMRE >NC_022737|233685:242710|239241_239502_-|WP_002451803.1|DBSCAN-SWA MQFTSLILPILLLVLMYFFLIRPQQKRAKEHREMISRVEAGQKITTIGGIKGTVKAVDETTVVVTVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS >NC_022737|233685:242710|233685_234204_-|WP_002467522.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVEYAREKDVDVVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYNLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NC_022737|233685:242710|236622_238902_-|WP_023372790.1|DBSCAN-SWA MKKSSRLIAFLLLVILLFAGMGLTYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLHKGDKIDKNALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEDPNRIRVQLAGVKDQKEARKILSSQANLTIRDADDKVKLSGADIKQGSAKQEFKQNTNDPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKQNNVMVVWLDFKKGDSYKKEANKKDPKFVSAANVDQPINSDSVEISGGFHGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAEFGQDALDKTIFASVLGVAVIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYITLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRLLLSLLVYSNLFKKKYWLFGVKKADRHDISEGKDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLISLSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSAGTRVDLQSKEALSQSKVEKVVKDVGLEPDQIQINGSGNKNATVQFKQDLSQAKDNQLSDKMKSEFGNSPQINTVSPLIGQELAKNAMLALVYAALGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAVFSLLRLEVDLTFIAAILTIVGYSINDTIVTFDRVRENLHKIKVITSTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVVVVVVAILLFGAPTIFNFSLALLIGLISGVFSSVFIAVPLWGIMKKRQLKKSSNHKLVVFKEKKSNDEKIVV >NC_022737|233685:242710|240678_241704_-|WP_023372794.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEDFDYDLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLNRKNGNMEHLHFKDVINYFNPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNQLNFGDGKIIAECIEELDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLESIKAKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMTQETADLLNETRKKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHSEFVEKSGWTDIFIYPGFEYKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSSREYILNAYQKAVEMEYRFFSFGDAMLII |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
367682 : 404016
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022737|367682:404016|DBSCAN-SWA TTTAATTATCTTTTTTTCTGCGTTTTAGACTGCTTGCAAATATTGCTATTCCAAATGTAAACATAATAGGAACTATTGGATGTTGATAATTAGTTAGACCTGTATTAGGCAACTCTTGAGTCGATGCTTCTTTCAATATACAACTATCCTTTGTTTCTTTTTCAATAACAACAGTTTTATCTCTAGTTACACAAACTAAAGCTGGTTCATTTTCTTTTTCTACAATTTTTTCTACTTGAGTTTCCTCTGTAGGTAATTGAATTGCTTTTAGTTTTTCAATTGTTTCTTTAACAATTTGTGCTACTTCAGCATTTGTTTTTGCTTCTTTGATAAACGTATTAGCTTCGTTTAAAATATCCTCTATTCTATCTAAAGCATTTTTTATTGCTATAGGATTAACATTTTTAAGTTGATTTATTTTTTCTTTGACTTCATTTGCAACAAGATTGATGTCATCTTTTGCAGTAGGTTTTACTTCTATTACTGGTTGAATATGTTCAATGAGTTGCACTTCTTTAAGTTTAACTTGCGCCACTTCTGCATTTGTTAATGCTTTCATTACTAATATTTTGGCTATTTCCAATTCTTTATGCACCTTCGCAATGGCTTCATCTTTCTCTTCTTGCGTAGCTTCAGATATACGTTCAAAATCTTGAATAACTTGTTGAGCTATTGAAGCTAAGGCTTCGTTTGCTTCTGGTTTCACTTTAATAAGTGGCTTAAAACTTTTGATTAAAGTTTCCCATTCTATTTTAGCTTTAGCGACTTCTGCATTAGTTAATGATTGGTCTACAGTATTAATGCTATTTTTTAACGCTTCTTCCAATTGATTGATAGCTTCATCTTTTTCTTCTTGAGTTGCCTCATTAGTCTCATTAATTTGAGTCTTAATTTGACTTGATAATTCTTGTAATGCGTCTATCGCAGCAGGTTTCACTTCTATATTAGGCATAATCTGTTCAATTTCTTTTAATGCTTTTGATAGTACATCTGCAACATTTTGGTTTGTTTGTGCATTAGATACTTCTTTAGTGTATTGATTTACAGCTTCTTTTAATTGCTGTAATGCTATTTCTTTTTCTTCAATTGTTGCTTCATTTGTTATATTAATCACTTGGTCTTGTTTTGTAGAAGCTTGGTTAATTGCATTTATAGCTTCGGGTTTTTTTACAATATTAAGTTTTACTTTATTTATTTCGTCAATTGATTGAGTTTCAGTTTGATCAACTTGTTGGTTAGTTTGATCTGACTGTAAAGCTTTTAATGCATTTTGAAGTATTGTCTTTAATTGTTGAATCGCTGCATCTTTTTCTTCAGTTGTTGCTTCACCATTATTATTAAACAACTGGCTTTTATTTGCTTCAGCGCTAGTGATTGATCTTCTTGCATCATTCTTTTTAACTACATTAACCTGAACATCATTAATTGCTTTAACACCTTGTTGTTCTGTTAGATTCACTTGATTCGTAGTTTTATCTTCATTAATTTGAGTCAAAGCTTGATTTAATAATTTTTCAACTAACGATTTAGCCACATTGATTTCCTCATTGGTAGCATCAGGCGTTAACGATAAATCTTTCAATTTTGCTTCTGTTGTTTGATTTAAGGATCCTCTAGCATCTGTTTTTACTTTAGTAGAAGGTAAAATTTGTTCAATATCATTAATTGCTTTATTTTTAGTATTTTCTACTTCAGTATCATCTGTTAATCGATTAATATCATTTTTAGCTTTATTAGCAATAATATTTACTTCTTTAACAGCTGTATCCTTTTCCTCAACTGTTGCATCAGCAACGCCATTAATTACCTTATCTTGATTACCTACGGTTTGATTTATCATTGTTCTTGCATTTTCTTTAACAACTATATGAGGTAATATGTTAGGAATCAACGCATCGCTTTTTGTTTGAATTTGATTTACTTGTGCATTCGTAGTTGCGTTATTAATATCTGCTAATAATTGATTTGCAGCATTTTGCAATCTATCTAATGCTTTATTTTTCTCTTCATTAGTAGCATCGTTAGCTTGATTAATTAAGTCTTGTTGATGTTCTAAAAGTTTTTGTATAGCATCTCTAGCATTTTGTTTAACAGTCGGCTTGAACACTATCTGATTAATGTTTTCTAATCCATTGTCTTTTGTAGTTGCAACTTCTTGATTGGTATTATCAGCTGTTATTTGTTTATTTAAATCATTTAATTCATTGTTTAAATTATTAATAAAAATATCTTTTTCATCTTGAGTTGCTTCTTTATTTTCAATTGCCTCTTGTTTTTTATTATTTATAGCATTAAGTAACGTTTCTCTTGCAGTTGTTTTAACAATCGTCTCTGGAACAATTTGTTGAATTTCTTGATTTCCATTTGCTTCAGCATTATTAACTTCTTGATTAGTTTGTGCTTGAGCAATATTCTTTAGCGCTTCATTTTTAGCTTGATCAACCAATTGTTTTGCAACATCTTTTTCCTCAACTGTCGATTCAATATTATTATCGATTATATTATCGCGTTGCTTAGCATCTGTTTCTATATTATTTCTAGCAGTATTTTTAATGATTGTTTCAGGTAAAGTCGCATTGATTTGGTCAATTGCTTGTTGACGTACTTCTTCTACCTTTTGATTAGTTTGTGCTTGGTTGATTGAAGCATTTGCTTGATTAAATATTTGTTCCAACTTTTGTAAAGCTTCATTTTTTTCTTCTACTGTAGCATCTTGTGTAGCATTAATGACACGTTCTTGATCAGTTTTAGCATCTATTAAGGCTTGTCTTGCGTCAGGCTTAGTTACGACATTTACTTGAATTGCATCTATATTTTGAATAGCTTGGTCTTTAGCTTGATCAACTTCTTGATTAGTTTGTGCTTGATTGATCGCTTCCAATGCTTGTTGCTTATTTTGATCTAATTGTTGAATAGCAGTATTTTTCTCTTCAATTGTTGCGTCAGGTGTCTGATTAATTTGAGCTAATTTATTATTATATTGATGATTGACGTCATTTAGTGCTTCAGTTTTTTTTACAACATGCACTTGTATTTGATTAATATTATTATCACCATTTTGTTGTGCTTGATCTACTTGAGCATTAGTATCAGCTTGGTTCACCTGTTCAATAGCTTGATTAAGTGCTTGATTCACTTGTGTAATGGCCGCCTCTTTTTCTTCTGTTGTCGCATCAGGTGTTTGATTTATATTTTGTTTTTTAGTTGTAGCATTATTATTTAATATGCCAATAGCTTCTTGCTTTTTCGTTACAGTTGGTTGTACATTACCGATATCATTAAGTGCTGTATTTTTTATTGCTTCTACCATTGCTGTTGTATTAACAGTATTAATATCATTCAAAGCGCGATTCAATAAATTATTAACTCTATCAACTGCCTCTTGTTTTTCCTCTCTAGTAGCACCAGGTGTTGCATTAATATTAGTAATAGCTTCATTCGCTTTATTGGTAACCGCATTTCTAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGACGGTTGGACATTACCAATTTCTTGCAGCCCATTATTTTTAGCATCTGATACTTGTTGATTGGTATCCGCATTATTAATATTTTGTATTGCCGTGTTTAATGTTTGATCCAATATAAGTTGAGCTGCTTGTTGTTCTTCTACAGTGGCCTCATTGTTAGTAAAAATAATATTGTGTTGTTCTTGTGCTTTTTGATTTAATGCATTTTTAGCGTTTGTTTTAACGATAGTAGCAGGTGTAATCGCTTGTATTTGATTTAATGCATTATTCTTAACTACATCAACATCGTTATTAGTATTAGCTTTTAATATATTATCATTTGCTGTCGTAACTGCTTGATTCACTGACTGAATAGCTGCTTCTCGTTCCTCAAAAGTCGCTTCATGATTCGTATTTATATCTGCAATTTTTTGTTGCGCATTATTAGCGACTGCCTCTCTCGCTGCTTGTTTTACAATTGTGGCAGGTGCAATGTCTAAAATGGCATCAATACCTTTTTCTTTAGCATCATCGACGTCACTATTTGATATGCCTTTATTTATATTTTGAATCGCTTGCTCAGATGCTTGGTTAAGTTCATTAAGTGCATTGTCGCGTTCTTCTTGAGTTGCTTCATGATTTTGATTGATTTGCTCACGTTGCTTGACTACTGCTTGATTAATAGCTGCTATTGCGTTTGCACGATACGTATTGGCAGGTACATCAGAATTAATTTCGTTTATACCATTACTTTTAGCTTCGTTTACAGCATCATTTGTATGTGCCTGATTAATGTTATTCATTGCATTTGCAACATGATTATCTACTTGTGCATTAGCTGCTTCTTTTTCTTCTTTTGTTGCTATAGGGTCTTGTTGAATTCTTTGTCTTTGCTCATTTGCTTTGTCATTTATAGCTTGTCTCGCATTAGGTTTTATTACAGGAACTATATTGACTTGATCAATCTTGTTAATTCCCGCTTCTTTCTCTCTTGTTACACCATCGTCCGTAGTTTGATCATCTATATGGTTTAATGCATCATTTTTTAAATTAGTAATTTGCCCTCTATAAGCATCGTTTTCATCGTCTGTTAAATCATTAACAGTATCTACTTCATCAGATCTATCATCTGCTTTTTGTCCAAGTTCACGTGCAGCGTCTACACGAGAAATAAGCGTATGTTGCATTTGATGTAATAAATCATCAATTGTAGCTTGTGAGACTTGTTGATTCAAAGGGACATTGTTACGATCTTCATTTAATATCGTTTGCGCTTGTTGTTTTAGACGATTATATTCTTGGTATGAGGCATACGTATAATCTGATGGTACTACGCCCCAATTATATTGTGCTTGTAAATCATCTTTGTTCATGACTATATTCACTTGATATGGAACACCATTCACTGTGCTTTGTGGTGGTTCTCCATTCAAATAAGTTTGTGTATAAGTCTTAGATTTAATTGCATCTGAAAAAGTCACTTGTTTTGGAGTAGCTACGTTATTAACTCTTAAATTAAATGTTACATTTAATGTC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32 | Staphylococcus_phage(96.3%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
524890 : 536546
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022737|524890:536546|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022737|524890:536546|525793_526252_-|WP_002497253.1|DBSCAN-SWA MQEHTNESYQQSKISEYELLTKYNPKYINSKIKTAQSHIDEMYHLSTSITTCDDIMGVISVSYPVDNLVIWISETKDNLKRFKDDSAMRLYLLKQILNTYSQEEQRQVVRYMQSHGRIKSHELIERLQVDLYNINHDKPLTKASEPQHTMVV >NC_022737|524890:536546|525449_525791_-|WP_002497254.1|DBSCAN-SWA MFVGDKEALKDFILNYHNNVDDDYKDVSVNDFFTLNDDVDEYSYQTINADEHIFMNDLDILVDRIADFREYNIFMLLCNGRTFGDIAQILEITQSRVQQLFDGLLNKIIKQGA >NC_022737|524890:536546|529606_531223_-|WP_023373215.1|DBSCAN-SWA MDEVSLYKKHFEFHSKLDYVSTINLSRIKEISKRINFASISTDKQVFNNKGNVYHREKDDVAGDYISNLTLDYTIKPKEIGLVYGTVNIKTIDKNGEEEKQSTFKTSHFHNYARFIADLISDKVIYSKQLDCFIIVKNNQYEVIDNTNFALTYPVDNKYYIDDFLDVMLELYREHLNVVHNYKIYPYCFAGNNWKYDCKELQLQKWELKKNELYAIKYDVDFKDINLEIPKNFFRLVTDNEKSRNNLMLVHAYTMYRKMKLIQAEKWMLLKDFGRSGKGLFMATFEKLMKVNKVNFDSLISGGFESANEWMNFYGADIAHANETGEITKQMMRILRKIATGETISGRGIGRNAFTFKNNAVLILDTNESVDTGEITANTTRTVKISLKDRPTNETDEERYQIFKPYWDYIQPNGNISIGASVSFLIASLEYLKENGREFKFQNVILKHYFNEDELTETQITMIRLLSKQGFILAGDETLQRLIEQDYSSLRYKNAKEDMRKIGISINNQKKINGVNTKVHKVGNIELFNMALELISKN >NC_022737|524890:536546|528368_528641_-|WP_023373212.1|DBSCAN-SWA MQAVKEDYNLDEQAQSIGLITGISNEVYYCSISYVSTVYLEYIDNNWTAWRESYIPKSNKRTSYKVIATGSFELVLARLKNYLNYIKRSK >NC_022737|524890:536546|527725_528367_-|WP_023373210.1|DBSCAN-SWA MNIEIIANQFETRAATLLRYYTGLLESSRDNHFAFKIYNDPFDIVYVMMNGKLFGHVYIKDCKVRKSFELASSKHTEGLIRSIEGYYNGFEIHDDMRLSISDMMASQLFENEYFMYGLQTFSESNNTDMFTYIEGGLNVEELEGVQSSNADVIGNIEILYQLATGINEPAPELVEGLKLVTSFVQDENATQDDYKALERKLSELKESYYSVSK >NC_022737|524890:536546|531643_531853_-|WP_023373218.1|DBSCAN-SWA MEQKQKGVIQDIYTTLGTTFWDKATEYEHHFKEGHNEWTEIVNREEHLQAIIEWAIQQIENNFDFEEEK >NC_022737|524890:536546|526338_527022_-|WP_002497252.1|DBSCAN-SWA MTMKTGSAYDVLFNDRKYKDLLDKVDQFLEETFIMYQRGYRMDIIDEQQKPKVTQIENEFKQFASDKLKRIEARMDEIEEELTRDDVEDPQSELIKRQNLEARLSFYSNSEIMDYIREADAEKIDVFELSLLQKAFDQRLSESEQSQVSFSLTALKQAVLYPFENNEEHDNLAYQFNVLRQIGMANNGSVITKDDEGYVVIKPLADRYNNQLKYAKAKKDGARQQAQ >NC_022737|524890:536546|533338_534514_+|WP_023373226.1|integrase|DBSCAN-SWA MASYDQIAKNNWRYRISLGKNSETGKYEYISKTGFKRKSDAKHQAEMIERQLRNGDYIAPSSSTFKQVADDWLKQYANDVKVSSVRAREKAIQHAIERFNTKPIQTIKKHDYQRFVDDMSTQYSKNYVDSIVASTNMIFEYANDMRLIKAMPSEGIKRPKKKVSVEELEDIEIHKKFLEKDELFQFLEVAKYHHSPQNSFEVFTTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNIISITKTYYNPNNNKKHYQILTPKTESSIGKISVDPHVIQLLKDYKVNVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLSTWIQAIMKKTDITNKHISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYARITNSYKKDASHKFSQLMENVSKELF >NC_022737|524890:536546|536258_536546_-|WP_023373230.1|DBSCAN-SWA MLKPLGNRVIIERKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGIVKAVGKGRLLDDGSRVAPEVKEGDTIVFQQYAGTEVKRGDETFIVLNEDDILAIIEA >NC_022737|524890:536546|532703_533327_+|WP_023373224.1|DBSCAN-SWA MIQSRLSVLMAERGLKISDLYEETGISKTTLMAIAENTGKGVQYDTVDKLCNFLGVTPCEFFEYSPYLVSFRMDKIKSDRNIPIDYTITIKNQNYEKLFYLYVFIYLGNSYDIPVRKDEFKAYIDINLESSEHYNDEEFYNFISDLTISFRTDFINKIIGSITSLLLDFEEVRTIDSKNISFKKGDYIALGLFRESKYETLKKITLK >NC_022737|524890:536546|534582_536205_-|WP_023373228.1|DBSCAN-SWA MAKDLKFSEDARQAMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEYTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVQVAVEALHEISQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGKYISEAMEKVGNDGVITIEESSGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMIAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKDASIDMLGSANKVEVTKDNTTVVDGDGDENNIDARVNQIKAQIEETDSDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYKKVSEIDATGDVETGVNIVLKALQAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKNADAGVGFNAATNEWVNMLEEGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVATIPEKDQSEQAGMSGGMPGMM >NC_022737|524890:536546|524890_525445_-|WP_023373206.1|terminase|DBSCAN-SWA MDKLTPKQERFANEYIKTLNVTQSAIKAGYSPNSAHVTGSRLLRKDKVDEYIKSKKDEIMDDTILSAKELLYLLTQAAVGDETETKEAVVKKGTFERNPDSGRMNLVYNEHVETVKVPIKPSDRLKARDLLGRYHSLFTEKVDLNVATPVFIDSVGEDDEKNERELEKLSEQYPNAEFHIDDIS >NC_022737|524890:536546|531297_531639_-|WP_023373216.1|DBSCAN-SWA MSNLKQNIKQMKNEVIEAELNTKINTVITMIGEHMDSNERFRSHLDAQGKVMESYMLKEYYQNYYVLMAVLNSILKDVNFMNDEITTFYDRALDELDKTNASSENFGEESLNA >NC_022737|524890:536546|531856_532000_-|WP_002470330.1|DBSCAN-SWA MVKFTLQLLLISLMTLLASSFIAFHVGLAIYLLGSTIALLNYENVEA >NC_022737|524890:536546|531992_532313_-|WP_023373220.1|DBSCAN-SWA MFNINIDEKEARALLEQAINQRVDELAREKFFMTYKELAEYLNLSKPTIEELLINNGLKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEKITSQMDIHNNDFKQINVKKLMEVQNG >NC_022737|524890:536546|528627_529431_-|WP_023373214.1|DBSCAN-SWA MTGYHVAKQLLKKNIEVIPLNNHKKPTVSFADKDITDEFIEYHYNIYHQTNVLGVLTRGVWCIDIDVDHEDGKNGFDSLRQIPYYDELVTNAQNTLVQTTASGGKHIIFKKHDNIEYGQKIGYLPSVDIKAHPNNYFVLAGSQTAKGIYTHNGVNVTEYQGEFEKRIFSKAGNYTQQVLEPYSIRRALPNYSFSHVRGGKGGEGKRAYQRIIDGQSEYRNNDLFKAVSYAIQCNVDIEPLRVLIGDNKNGDVFTEKDWEATVRSASR >NC_022737|524890:536546|532316_532532_-|WP_023373222.1|DBSCAN-SWA MKNEFRVLIAINKSSIAKVHEGTGIAKTTLYGLYYEKTQNPSLSVILKLCNYLKVTPNEFLGIESLNKKEA >NC_022737|524890:536546|527048_527387_-|WP_023373208.1|DBSCAN-SWA MIDTLNKNQSVPTEYLRIFDTIQNSKDKYITKSKILNLMGYEYNSSNERWLRNAISKLIDDYSYPIGCSYKKHERGYYIITTDEEKQQAMLSIKRLADGSMKRYEALKRIKL |
18 | Staphylococcus_phage(70.59%) | terminase,integrase | attL 520820:520839|attR 534520:534539 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
695005 : 736780
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_022737|695005:736780|DBSCAN-SWA 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|
68 | Staphylococcus_phage(68.75%) | head,holin,tail,portal,terminase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1563448 : 1581093
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_022737|1563448:1581093|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_022737|1563448:1581093|1578993_1579704_+|WP_023374542.1|DBSCAN-SWA MTMKTGSAYDVLFNDRKYKDLLDKVDQFLEETFIMYQRGYRMDIIDEQQKPKVTQIENEFKQFASDKLKRIEARMDEIEEELTKDDVADPQSELIRRQNLEARLSFYSNSEIMDYIRGADAEKTDVFELSLLQKAFDQRLSESEQSQVSFSLTALKQAVLYPFENNEEHDNLAYQFNVLRQIGMANNGSVITKDDEGYVVIKPLADRYNDQLKYAKAKKDGARQQAQYKKQYVYNK >NC_022737|1563448:1581093|1567069_1567891_-|WP_023374529.1|DBSCAN-SWA MLKKLSYSMFAATMLTTISGINLSYADENSNNTNDTQSKKGTMGYGYQQYMKKHPEKAKNDTQNRSTFSTKSSAATTNSGERVLDISEWQGNLTDAQVKQLKKNYDFIIIRGQYGSEYVDKCLEHNSALLDKNNMKFGVYSYSMYENADDARYEARMLYNRAPKAEFYINDYEQQTVTSGDANTATVAWADQMKKLAGNKKVLFYSYENFMVNNVANAVSSYDGYWLASYQSQEPTREKVLWQYTDSFYSSELNQNVDANYVDSNVSTNWFTS >NC_022737|1563448:1581093|1570704_1571928_-|WP_023374531.1|integrase|DBSCAN-SWA MWHEKFTNKHGDVQFRYYEKYKDPLTNKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQKRLNERIEAKLNDKTSTTLKSLTFHAACDEWLEYYKNHSGSKATTIKEKLSNTNTVKNAIDKEVLINNITHTYLQDIINEWASIHSKGHVQSLVIIIRSVFKYTFKYYDLQDISVLDKIDIPKKAKTRDELQAKRNNYLEDSEVKELLNCFDYLIKHKKHSTRKRNYKMVKAIVQFQIANGMRIGELLAIKRENINYEDKTLEIDGTINWVTDKETGAFGVKETTKTSKSYRTIGLTTQSINLLKTLILDNKKENQWNEDFIDRGYIFTNTAGSPIDLNKVNSIIKEATEISSIKKRVTTHTLRHTHISTLAQLGINLKAIQERVGHSDYKTTLEIYTHVTDRMAKDMMNKLNKVNFKN >NC_022737|1563448:1581093|1569570_1570542_-|WP_023374530.1|DBSCAN-SWA MKPFKTHRQQLRILRDRGLTISKDGEGSKVMRVLEKENYYNVINGYKDPFLKKTPNKLNKIPEEFEDNKSFDEIYSLYVMDRRLRSLILEYLLLLETHLKSAISYKFCEKFPEQNSYLDIQNYSSDNEKIIDKVSVIANLSGVIKRNIKKESFSNNQTLNSIEHYLKNHQGVPLWVLVNYLTIGNIYYFYKALDNDLADDIAKVFKDRYKRSRNRHISLNKKDLTTLIHFIKTYRNVCAHEERLFDLQIGPPNISKYINAYNRENRINVTSDELSKGDMFCLLFVLRFYLSKEEYLNLIRDTEEIIKEHKPDFSEENYRYIYI >NC_022737|1563448:1581093|1573748_1574108_+|WP_023374535.1|DBSCAN-SWA MNKLTREDYKNIDGKLNYEHIVNNKKQNRKISKLLRKRRNRDISIIKNEYPNLSKSEITKVLDDYRNYKEFVKSSNILIDFPINYEDSNIHKFITKDDVEELKWAIEEMTSFIGKLEEY >NC_022737|1563448:1581093|1566816_1567008_-|WP_002451523.1|DBSCAN-SWA MNLNLDWNKDFQEFQDILNCGLHPEWLYNAKANMILVPAYTGEGKQFFRTTDILKASEVIPFF >NC_022737|1563448:1581093|1574544_1575417_+|WP_023374537.1|DBSCAN-SWA MDFQKVKLNNNFNIHIVQYKNLYSNSCNGSDLYNWSDWLNKLQIPMINENKYKRGLCVYGDFEDIEKDNQNISKYRSDATLINRSAITLDYDEIKDFRGLYEVLKAKLEHVSWAFHTTYSYTAEKPRIRLIVPLNEPVSASDYRKYSNGLARYIGYPVDEASFVPSQAMALPVKKSKDSIYIFKYNDAPAITTEELNKMVVKNAPITVDYSNHFHKHNSSYWREIAFGVGEGERNQTLASLTGYLLRRYVDANLVYGLVSAWAMTCRPPIEQKEVNRTFKSILKKDSKNK >NC_022737|1563448:1581093|1577573_1578215_+|WP_023374540.1|DBSCAN-SWA MNIEIIANQFETRAGTLLRYYTGLLESSKKTPFGFKIYNDPFDMVYVVMEGNLYGHIYIKDCNVRKAFELASPKHTEGLIRSIEGHYAGYDVDDDRHISISDMMASRLFEDEYFLYGLQTFAESNNSDVFEYMEKGFDAGSVEGVQSSNADVIGNIELMYQLATGINEPATELIEGLKLVTEFVQDENATQDDYKALERKLSELKATYYSLNK >NC_022737|1563448:1581093|1575429_1576899_+|WP_023374538.1|DBSCAN-SWA 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MQEHTNESYQQSKISEYELLTKYNPKYINSKIKTAQSHIDEMYHLSTSITTCDDIMGVISVSYPVDKLVIWISETKGNLKRFKDDSAIRLYLLKQVLNTYTKEEQQQVVKYMQSHGRIKEHKLIERLQVDLYNISHDKPLTKASEPQHTMVV >NC_022737|1563448:1581093|1574109_1574445_+|WP_023374536.1|DBSCAN-SWA MKDLKFHVSELKNSFVDAELNSKLNTVITLIGEEMARGEEYKSLLDKQNKPMESYIVKEHINHNYVLMAVLNSILKDIDAIEEEIKNEFSSAMEQIEKASSVKSANGTDNA >NC_022737|1563448:1581093|1568584_1569100_+|WP_002466536.1|DBSCAN-SWA MLNRVVLVGRLTKDPEYRTTPSGVSVATFTLAVNRTFTNAQGEREADFINCVVFRRQAENVNNYLSKGSLAGVDGRIQSRSYENQEGRRIFVTEVVCDSVQFLEPKNSQNGGGQRSQNNEFQDYGQGFGGQQSGQNTSYNNNSSKPNSNQSDNPFANANGPIDISDDDLPF >NC_022737|1563448:1581093|1563448_1564291_+|WP_023374528.1|DBSCAN-SWA MAHREDQRLQLNKDEQVHSVSLDLIKANPYQPRKTFDEYRLNDLAQSIKQHGILQPIVVRKTVQGYYIVVGERRFRASKKAGLTEIPAIIKELSDEDMMELAIIENLQREDLNAIEEAESYKKLMEDLNITQQEVAERLSKSRPYIANMLRLLKLPSDVAKMVRGGELSGAHGRTLLGLKSPQKMKSIAKKAVKESWSVRYLENYINDYLEKTSPTKTSVDEQTFNKPKFIQKQERQLKEQYGSKVDISTHKNIGKIAFEFKSEEEFKSLIKKLNQNYDM 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>NC_022737|1563448:1581093|1577209_1577572_+|WP_023374539.1|DBSCAN-SWA MNKNHLKSEILEYIKSHDGTTFVEIESVFEENNFNYKGDGAYTSGQHPNIVFWIGWNQEAFNIIAELKRDGLIEMDICPPIIYLVDGKGLDLPIVKSKYIKTDHWLPVAFNICKKEMGCV >NC_022737|1563448:1581093|1578625_1578973_+|WP_023374541.1|DBSCAN-SWA MIKTIEKQVAQPPTEYLRVYDIIQNSNEKYVTKTKILNQLGYTLNKVNDRWLTQVITSLIINYQYPVGYSYKKDARGYYIIRSKEDKQQAIYSVKRQVLGAQTRLKALEEIEIQN >NC_022737|1563448:1581093|1569143_1569386_+|WP_002451519.1|DBSCAN-SWA MAGGPRRGGRRRKKVCYFTANGITHIDYKDTELLKRFISERGKILPRRVTGTSAKYQRMLTAAIKRARHMALLPYVKEEQ >NC_022737|1563448:1581093|1564438_1565317_+|WP_002466537.1|DBSCAN-SWA MNQVKHILSSLIEPLTKVETYETLAIKIIMILIYIIAAIIVISILNKVIEQAFKIQNKSRKGNKKRSKTLISLVQNVVKYIVWFIVITTILSKFGISVEGIIASAGVVGLAVGFGAQTIVKDIITGFFIIFENQFDVGDYVKINSGGTTVAEGTVKSIGLRSTRINTISGELTILPNGSMGEITNFSITNGTSIVAIPVSIEENLDHVEKELNKLFTSLRSKYYLFVSDPVVEGIDSIDNNKVTIRISAETIPGEGAAGGRIIRKEVQRLFVRENIKMPKPIFAPYDEQKRG >NC_022737|1563448:1581093|1573266_1573539_+|WP_023374534.1|transposase|DBSCAN-SWA MSRTKLQDIPTKENTITEPKQVVVKPMFAKPNTLACIFGISYSSVNRILKEWEKDSKGIDDLYYSLSSTMTVISIPRFEEYMKKRHKKWM >NC_022737|1563448:1581093|1568266_1568563_+|WP_002451521.1|DBSCAN-SWA MRTYEIMYIVRPNIEEDAKKAVVERFNGILASEGSEVLEEKDWGKRRLAYEINDFKEGFYNIVRIKSDNNKATDEFQRLAKINDDIIRYIVIREDQDK >NC_022737|1563448:1581093|1580225_1580567_+|WP_023374544.1|DBSCAN-SWA MFVGDKETLKDFILNYHNNLNDDYKDVSANEFFTLNDDVEEYSYQTINADEHIFMNELYSLVDQIATDKEYFIFDMLLSGRSYKEISQVLKCSIESIRKWFDNLLDEIIENKE |
25 | Staphylococcus_phage(76.47%) | terminase,transposase,integrase | attL 1570050:1570064|attR 1580497:1580511 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1910585 : 1917529
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_022737|1910585:1917529|DBSCAN-SWA AATGAATATTAATGATACACAATATTTGAATAATGGTTATCCTATGCCATCTATTGGCTTAGGTGTTTATAAAATAACAGATGATGAAATGAATGAAGTGATTAATACCGCTATTGAAGCAGGTTATCGTGCATTTGATACGGCATATTTTTATGGTAATGAACAGTCACTAGGACAAGCGTTAAAGCAAACAAACGTTGATAGAGAAGACTTATTTATTACATCCAAATTATGGAATGATTATCAAGGATATGACAGCACGATTCAATATTTCAATCAATCTTTAGAAAATTTAGGTCTTGAGTATCTAGACTTGTTTTTAATTCATTGGCCTTGTGAAGAAAATGGCTTATTTATAGAAAGTTATAAGGCATTAGAAACGCTTTATCACGAAGGTAAAGTCAAAGCCATAGGCGTTTGTAATTTTAAACAACATCATCTAGAGAAACTAATGCAAGAAACAGAAATCGTTCCTCAAATCAATCAAATAGAGTTACATCCATACTTTAATCAACAAGAATTACAAGATTATTGTGATCATCATGATATTAAAGTCACTGCATGGATGCCATTAATGAGAAATAAGGGGTTATTAGATGACCCGGTTATTACGGACATGGCTAAACGATATCATAAAACACCAGCACAAATTGTTTTACGTTGGCATTTAGCTCATAATCGTATTATTATTCCTAAATCTAAAACACCTAGTCGAATTTACGAAAACTATAATATTTTAGATTTCAATCTTGAACTTACAGATGTAGCACAAATTGATAGTTTAAATCGAAATGATAGACAAGGTAAAGATCCAGATGAAGTAGCGATAGGTGATTTAAAATAAATGAGTTGAAGTAATGCGACGTAATATTAATCATCGTATGAATGAAAGATTCCATTTATATTACTTTTGAGTTCATTTAAATTTACAAAAGTAGTGATTTTCAATAAATATTGCTATAAACATTAATGGAATATTAAGATTTTGTAAATACAAAGGCTCTAAGTAGAATACACTATTAAGTAATTGATAAAATAATATTAAATCAATTACTAGAAAAGGATGTCATTGAATGAATATAAGAGTCATCATTCCTTGTTATAATGAAGGAGAAGTCGTATTAAAAACATATGAAAAGCTGACTGAGATATTAAAGCAAGATAGCATCAATAAACAATATGAATACGATTTACTATTCATAGATGATGGCAGTAAAGATTCAACTATTGATCATCTACAAAATTTAGCATTAGCTGACCACCACGTAAAATATATTTCATTTAGTAGAAATTTTGGTAAAGAGGCTGCTATGGTGGCAGGCTATCAACATAGTGAACATTGTGACGCTGTAGTTATGATAGATGCTGATCTACAACATCCGCCAGAATTTATTCCGCAAATGGTTGAAGGGTATAATGAAGGTTATGATCAAGTTATAGCAAAACGTGATCGTAAAGGAGAAAATGTCGCTAGAAAATCGATGACACGTGCTTATTATAAATTGATTAATGCCTTTGTAGAAGATGTGCAGTTTGAAGATGGCGTAGGTGATTTTAGATTACTAAGCAAACGTGCAGTACAAGCACTGACATCTATGGATGAATATAACCGATTTTCAAAAGGATTATTTGAATGGATAGGTTATAATACGAAAGTATTCACCTATGAAAATGTAGAACGTGAAGCAGGAGAATCGAAATGGTCATTTGCCAAATTATTAAATTATGGTATTGATGGCTTAATTTCGTTTAATAATAAACCATTAAGAATGATGATTTATCTAGGTATGATTACATTTTCACTTAGTGTACTATATCTCGTATATCTTTTAATTAATATCATGATTTCAGGTGTGAACATTCCCGGTTACTTCACAACAATAGCTGCGATCACACTTTTAGGTGGTATTCAGTTAATGTCTATAGGAGTCATTGGTGAGTATATTGGTCGTATCTATTATGAAGTGAAAAAGCGACCTAAATATATTGTTCAGGCCACGAATATTGAACCTGAACAAACATCTGAAAGATCACAGGAGTCAAAAGACTCAGACAAGGCACAATCTAGAAAAAATCAATCTGAACACTATCATCAAATTAGAAGATTTGATGCACATAGACATCAACCGACATATCAAGCAACACAAAATAGTGATGAATATAAAGAACGTGTTCATTAAACAAAAAGCTTACAGATTATATATTTTTCCATAACCTGTAAGCTTTTTATAAATTGATTTTTTGACAACGATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTTTCACTCATGAATTCCTATTTTAAAGTACACATTAGCTGTGGCTAATGCGTAAGAACCACTACATCATAAATGATTAGTGGTTCTTTATTATTTCTGTCCCTCTCCCTTAAATATACGTTGCCATATGATAAATAATATGAATAGTACATATATGATAGCAAACACGTACCAAAAAGGTGTGAGTATCATCATAGCTATAAATGAGATGATAATTAATATCGTACCAATCATCATAGGGTGTTTGATTGTTTTTAAAATAGGTAGACGATTAAGTTCTGACAAATTAAATGTACCTATAAATAATAATACTGCACCGATAATGAAAATAGCTGGAGCTAAGTATGGTAACGACATATAGACAGATTGTTCACTGGAAATATCTGTTATAAATTGCGCTAAACTTATGACAATGGCAAATATCACTGCAATGAACTTTTGGTCTTTTATCATGAAAGGATTAATTTTTTTATTTAAATAGAGTTGTAATAATGCCCATACAATGAATAAAATCATCGTATAGATTGAAATAAAATTATATTTTGAGACTACGATTAAATCGATAATAGCATTTAATGAAATAGCTATTAGTATTGAACTAAACCGAAGTTGTTCAAATTGGTGCAAATATAAATCTATTCCTATAATGAGCAATACTACGGCAATATTAATTAATATATATAGAATCATGGTGTACTCCTATCCGTAATACTTCATTCAATTATTATATCAATTAACATAAACTTAATCATTATATAACACTCGAAATTGTTAAAGTTATATTAAATGAGTTTAAACACCCTTCATATTACTCCATAACAATGTGTGTAATTGGGGCAATACATATACATTATTCATATCGCTACTAGTCATGACACGTTCGACTAATTGTTCATAACGTTGTAATAGTTTAGCAGTATGGTTGTCGACCTCATCATCTAAATAAGGATTACCCACTTGTAAATAAAATGGAATTGTTGGATAACGATGATGAATCATTTTAGCAAATTCGAAGTCACCCTCATCAAAAATGACGACTTTTAAATTTAGTGATTCAGGTACACACTGTTCAATAACACTATCTAAAATTTCCAAATTAGGTTTCATATTTGAGCTTGGCGGTTTGGGACTAATTGTTAAGTCATCGATTTGAGTCATCCATGGTTGAAATTTACTGCCTTGTGTTTCAAGGGCAGTTTGAATATGATGTTCTTCAAATAAATTTACTAAATCTTGGATACCTTTAATAAGTGCCGGATTTCCACCAGAAATTGTGACGTGATTAAAATTGTCGCCACCTACTTCACGCAATTTGTCATATATTTCTTCTGCAGACATTAATTGAATATCCTCTTTAGCACTACCATCCCATGTAAAGGCAGAATCACACCAACTACAGCGATAATCACAACCTGCAGTTCTAACAAACATTGTTTTTCTACCAATGACGCGTCCTTCTCCTTGAATTGTTGGACCAAACACTTCTAATACAGGTATTTTAGCCATTATTGATCACCCTTAGGACGATAAACGACATAGCTTGTAGGTGTTTCACGTAAATAAACTTGGACACATTTTGGTTGATTCTTTTGATCTTTAAGATATGATTGCACCATTTGATATATAGTTTGAGCAACAATTTCTGTAGAAGGGCTTTTACCTTTGAATTGAACTAAATCATTTAATAAATAATGATCGAATTGGTCATGAATTAATTTTTTTAAATCACTAAAATTCACTAAAAAACCATTGTGATCTAATTCATCTCCAGCTATGGTAATATTTACGAAATAAGTATGTCCGTGAGTACGCATACATTTTCCAGCGTCTTCACTTGGAATATAATGTGCTGCTGAAAAGTTAAAGTCTTTATTAAGTTCGAATTGATAGGGATGATTGACACTAGGATAGATTTGTTGAATCATCTTATTGTACTCCTTTCTTCGCAAGATATCGGTCGAGTCCGCGTGATCTTAATTGGCAAGCAGGGCATTCACCACAACCATCTCCAATAATACCGTTATAACAAGTTAGCGTATTTTCACGAATATAGTTTAATACCCCAAGATCGTCAGCAAGTTCCCATGTTTGTGCTTTATCTAACCACATTAATGGCGTGTGAATCACAAAATCTCGATCCATAGACAGATTTAATGTTACGTTCATTGATTTAATGAAACTATCACGACAGTCAGGATAACCTGAAAAGTCAGTTTCACAAACACCAGTAATGATATGTTTAGCTTTAATTTGGTAAGCTAATGCACCAGCGAATGATAAGAACAGTAGATTACGAGCAGGTACGAATGTATTTGGAATACCATCTTCTGTATCTTCAATTTTTAAGTCATGTTGTGTTAATGCATTAGGTGTCAGTTGGGATAACAACGACATATCTAATATGTGGTGTTCTACGTTTTGTTCTTGAGCAATTTTTTTAGCTACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGTCCATAATTAAAAGTAACGAGAATAACATCTTTAAAATGCTTTTTAGCATAAAACAAACATGTTGTACTGTCTTGACCTCCGCTAAAGACGACTATGGCTTTGTTTGGATCTAGAGTGTGTTGTACCATGATTTTTTCCTCCTATAAATCATTAGTCACTAAAACCGAAAATTAAGGCATAAAAAAAGCCTATCTCTATAAAAAAGATAGACGACAGATTGTGAATACACATATAATTTTAAAGAAAGCATTAAAATGATATGTCTATTTGCAAACAGAAATTAAATTCAGTGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCGGCTAGGAACCTCTGATAACTATATATTTTGTACGCAACATAGAATAAACCAATTCATATGTAAAATCAAGTGAATATTTGTGATAATAGTGTTAAAGACGTATCGAATAACGAATATTAATGTAATGGAGCGTAATCATGTTAGTAGTGATAGATAATAAAGATTCATTTACTTATAATTTAATTAATTATTTTAAAATGGCTACACAAGATATAGTGAATGTTATTGATGTAGAGGAGATTAATATCGAGGAATTAAAGGCGCTAAAGCCTAAAGCTATCGTTATCTCTCCTGGTCCCGGGAGACCTAGTGATTATTCTATTTTATTTAAGGTGATGGATGACTTTTATCAGCACATACCTATTTTTGGGGTCTGTTTAGGATTTCAAATGATTTACCAATATTTTGGAGGAAAAATTATACATAGAGATAGACCTATACATGGTCATACGACATTATTAAGCCACTATGGTGAAGGTATGTTTCAAGGATTGCCAGAAAAATTTAATGTAATGTTATATCATTCTTTACAAGCAGATGAAAGTAGCATTCCAAGCGATTTGAAAATTACGGCTAAGGGAGAAGATGATGTCATTATGGGGATAGAGCATGATAAATATCCTATTTATGGTTTACAGTATCACCCAGAATCCATTTTAAGCGAACAAGGCCAAAACCAGATTCAAAACTTTATCGACATTGTAGGTGAAAATAATGACTATCAAATTTAACTATCGCTATTACATAGACGACAATCAATTCGAAACCTATCATATTGAATTGGATCAATTGATTGAAAAGAAGATAGCTAAACATATAGATGAAGTGGGGCGTGTTATACGTTTTGCAGAATTACAACAACAACAAGGTCGTTATGTCACGTTATATATAACATATGAAGCGGCACGTTATTTTAACCCACAAATGGCTGTGTGCCATGTAGAAGAAGATGGTATCTTAGCAATAGCATATAGCTTTAAAGTAGCCAATCACATAAATGAATCTACAAAATTGAATGATGTATCATATAATTCGAAACATCACTTTAAATTTATAGAATCAAATCAACAAATGAAAGAAAAAATTAAAAGCATTCAACATGCAATTGTCGAAGGAGACACCTATCAAGTGAACTATACTACCCGATTAACTGATAACATCCATTTTCCTATTCATCAGTTATATCGACAATTAACCACTGCGGCGAATGGTAATTACACGGCCTTATTAGATACAGATGAGGTTAAAGTCGCATCTATTTCTCCTGAATTATTTTTTCAGAAAGGAATATTTAATGGTGAACCGAACGTGTTAGTTAGTAAGCCAATGAAAGGTACAATGCCGAGAGGTGTAACGAACGAAGAAGATCTACAAAACTACCATCAACTTCAACAGTCTGAGAAAGATAAAGCTGAAAATGTAATGATTGTAGATTTATTGCGTAATGATATTTCTAGAATAGCAATGACAGGAAGTATTATTGTTTATAAATTATTTTTTATAGAAACGTATCATACGGTACATCAAATGACGAGTATGGTCACAGGAAAACTATCATCAGATGTGACACTTGAAATGATTTTAAGTGCTATATTTCCGTGTGGTTCTATTACTGGTGCACCTAAAATCAATACTATGAAATTAATTCATTCTTTAGAACAAGTTCCAAGATACATATATTGTGGAACGATTGGATTATTACTGCCTAACGGTAAAATGATATTTAATATACCTATACGTACGATTGAGTATCGACATCAGCAAGCGATTTATGGCGTTGGTGCTGGGATTACGATTAACTCTAACCCAGATAATGAAGTCCAAGAATTTTATGATAAGACGAGGATACTGGAGAGGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_022737|1910585:1917529|1914806_1915478_-|WP_023374791.1|DBSCAN-SWA MVQHTLDPNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKDVILVTFNYGQRHDTEIEVAKKIAQEQNVEHHILDMSLLSQLTPNALTQHDLKIEDTEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIKAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLNLSMDRDFVIHTPLMWLDKAQTWELADDLGVLNYIRENTLTCYNGIIGDGCGECPACQLRSRGLDRYLAKKGVQ >NC_022737|1910585:1917529|1915803_1916397_+|WP_023374792.1|DBSCAN-SWA MLVVIDNKDSFTYNLINYFKMATQDIVNVIDVEEINIEELKALKPKAIVISPGPGRPSDYSILFKVMDDFYQHIPIFGVCLGFQMIYQYFGGKIIHRDRPIHGHTTLLSHYGEGMFQGLPEKFNVMLYHSLQADESSIPSDLKITAKGEDDVIMGIEHDKYPIYGLQYHPESILSEQGQNQIQNFIDIVGENNDYQI >NC_022737|1910585:1917529|1911657_1912764_+|WP_023374787.1|DBSCAN-SWA MNIRVIIPCYNEGEVVLKTYEKLTEILKQDSINKQYEYDLLFIDDGSKDSTIDHLQNLALADHHVKYISFSRNFGKEAAMVAGYQHSEHCDAVVMIDADLQHPPEFIPQMVEGYNEGYDQVIAKRDRKGENVARKSMTRAYYKLINAFVEDVQFEDGVGDFRLLSKRAVQALTSMDEYNRFSKGLFEWIGYNTKVFTYENVEREAGESKWSFAKLLNYGIDGLISFNNKPLRMMIYLGMITFSLSVLYLVYLLINIMISGVNIPGYFTTIAAITLLGGIQLMSIGVIGEYIGRIYYEVKKRPKYIVQATNIEPEQTSERSQESKDSDKAQSRKNQSEHYHQIRRFDAHRHQPTYQATQNSDEYKERVH >NC_022737|1910585:1917529|1913672_1914386_-|WP_023374789.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEVFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKEDIQLMSAEEIYDKLREVGGDNFNHVTISGGNPALIKGIQDLVNLFEEHHIQTALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSNMKPNLEILDSVIEQCVPESLNLKVVIFDEGDFEFAKMIHHRYPTIPFYLQVGNPYLDDEVDNHTAKLLQRYEQLVERVMTSSDMNNVYVLPQLHTLLWSNMKGV >NC_022737|1910585:1917529|1910585_1911428_+|WP_023374786.1|DBSCAN-SWA MNINDTQYLNNGYPMPSIGLGVYKITDDEMNEVINTAIEAGYRAFDTAYFYGNEQSLGQALKQTNVDREDLFITSKLWNDYQGYDSTIQYFNQSLENLGLEYLDLFLIHWPCEENGLFIESYKALETLYHEGKVKAIGVCNFKQHHLEKLMQETEIVPQINQIELHPYFNQQELQDYCDHHDIKVTAWMPLMRNKGLLDDPVITDMAKRYHKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSKTPSRIYENYNILDFNLELTDVAQIDSLNRNDRQGKDPDEVAIGDLK >NC_022737|1910585:1917529|1914385_1914805_-|WP_023374790.1|DBSCAN-SWA MIQQIYPSVNHPYQFELNKDFNFSAAHYIPSEDAGKCMRTHGHTYFVNITIAGDELDHNGFLVNFSDLKKLIHDQFDHYLLNDLVQFKGKSPSTEIVAQTIYQMVQSYLKDQKNQPKCVQVYLRETPTSYVVYRPKGDQ >NC_022737|1910585:1917529|1912970_1913570_-|WP_023374788.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAVVLLIIGIDLYLHQFEQLRFSSILIAISLNAIIDLIVVSKYNFISIYTMILFIVWALLQLYLNKKINPFMIKDQKFIAVIFAIVISLAQFITDISSEQSVYMSLPYLAPAIFIIGAVLLFIGTFNLSELNRLPILKTIKHPMMIGTILIIISFIAMMILTPFWYVFAIIYVLFILFIIWQRIFKGEGQK >NC_022737|1910585:1917529|1916380_1917529_+|WP_023374793.1|DBSCAN-SWA MTIKFNYRYYIDDNQFETYHIELDQLIEKKIAKHIDEVGRVIRFAELQQQQGRYVTLYITYEAARYFNPQMAVCHVEEDGILAIAYSFKVANHINESTKLNDVSYNSKHHFKFIESNQQMKEKIKSIQHAIVEGDTYQVNYTTRLTDNIHFPIHQLYRQLTTAANGNYTALLDTDEVKVASISPELFFQKGIFNGEPNVLVSKPMKGTMPRGVTNEEDLQNYHQLQQSEKDKAENVMIVDLLRNDISRIAMTGSIIVYKLFFIETYHTVHQMTSMVTGKLSSDVTLEMILSAIFPCGSITGAPKINTMKLIHSLEQVPRYIYCGTIGLLLPNGKMIFNIPIRTIEYRHQQAIYGVGAGITINSNPDNEVQEFYDKTRILERL |
8 | Staphylococcus_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1930541 : 1939882
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_022737|1930541:1939882|DBSCAN-SWA TATGAAAAAACAACTCGAACAATTATCTGCATATCAACCAGGACTATCACCTAGAGCACTCAAAGAAGCATATGGAATTGAAGAAGAGTTATATAAATTAGCATCCAATGAAAACTTATATGGTCCTTCTCCTAAAGCTAAAGAAGCAATAACAAATCATTTAGATGAATTATATTATTATCCTGAAACAGGATCGCCACTACTTAGAGAGGCGATTAGTCAACATTTAGATGTGGACGCATCTCGAATTTTATTTGGCGCAGGTTTGGATGAAGTCATCTTAATGATTTCAAGAGCAGTATTAACACCAGGGGATAAAATCGTAACGAGCGAGGCAACATTTGGACAATATTATCATAATGCTATTGTAGAGTCTGCTCACGTTGTTCAAGTGCCATTAAAGAATGGTGGATTTGATTTAGAAGGTATTTTAAATGAAGTCGATGACGATACATCGCTAGTGTGGTTATGTAACCCTAATAATCCTACTGGTACATATTTTAATCATGATGAACTTAAAGGATTTTTAGAACGTGTACCAAGTCATGTACCTGTACTCATTGATGAAGCATATTTTGAATTTGTTACTGCAGACGATTATCCTGATACGTTAAAGTTACAAGAAACATTTGATAATGCATTTTTACTAAGAACTTTTTCAAAAGCCTATGGATTAGCAGGATTACGCGTAGGTTATGTGGTTGCCACTAATGAAGCTATTGAAAAATGGAATATCATTAGACCACCATTCAATGTTACACGTTTATCTGAATATGCTGCAGTAGCTGCATTGGAAGATCAAGACTACTTAAAACAGATTACTTCAAAAAATGCTAAAGAACGTGAAAAATTTTATCAAATACCTCAAAGTAAACATTTCTTACCAAGTCAAACTAACTTTGTATTTGTACAAACAGATAAAAGTAAAGAACTGTATGAGGCACTCTTAAAAGTAGGTTGTATTACACGACCATTTCCTACAGGCGTTAGGATTACGGTAGGTTTTCCAGAACAAAATGATAAGATGATTGACGTATTACAACATTTTGAATTTTAAAGTGTTATATTAGGTAAGTTAAATCTTTTGTCTGAATCGTCCTTTTGCTATACTTTAGAAATACATTACATTTGAGGAGTAGATTTAATGTCTCGTAAGAAAATTGCTATAGATATGGATGAAGTACTCGCTGATACACTAGGCGCGATCATTGATGGTGTAAATGAAAGAGCTAATTTAGGAATTACAGTAGAATCACTAAATGGACAAAAATTAAAGCATGTTATTCCAGAACATGACGGATTAGTCACTGAAATACTTAGAGAGCCTGGGTTCTTTAGACATTTAAAGGTTATGCCAAATGCACAAGAAGTTGTAGAGAAGTTAAATGAACATTATGATGTTTATATAGCAACAGCTGCAATGGATGTACCAACGTCATTCCATGATAAGTATGAATGGTTATTAGAACATTTTCCTTTTTTAGATCCACAACATTTTGTTTTTTGTGGTCGTAAAAATATTATTAATGCGGACTATTTAATTGATGACAATCCACGTCAGCTTGCTATTTTTGAAGGTGAATCTATTATGTATACTGCAGTGCATAATATGAATCATCAAGAATATAAACGTGTAAATGGTTGGAAAGATGTAGAAGCATTATTCTTAAATGATAAATAAAAACAGGAGCTAGCCCTTATCCTAAAATTGTCGTATGGATGAGTGGTTGAGCTCCTGTTTTTGCGAGTTAGCGCATTGTTATTATTGGTTATTATTTTGATCAGGAAATGTGAGTAATTTGATGGCATTTGGTAATACTTCAACATTTATAGGTGTCTCTAAAGCAATTTCACCATCAATGTCAATTTTCATGTTAGGTTCAGTAGTAAGCTTGATTTGTTTACCAGAGATGTGATCAATACCTTGTGTAATTTCATTCCAATTCATACTGTCACGCTTTTTAAAGATATCATTAAGGATACTGAAACTTTGATCATCAAAGATAAAGGTATTTAATTGACCATCTTGTGGAGATAAATCAGTTAAAGGAATTCTACTGCCACCAATATTAGGACCATTTGCGATAAGTATCATAGATGTATTACCGGATTTTTCTTGGCCATCAATTGATAATGTGAAATCAAACTTGCTAGGGTCCATTAATGTTTTAACAGTGGAACCAATATAGCTTAGCTTACCAAAGATGTCTTTAGAACCGTCTTGTACATTTTCAGCATTTTGTACAATCAGGCCTAATCCAACGAAATTAAGTGCAAACATATCATTAATTTTTATTACATCATATGTTTGTATATGTGAAGATAATAATTGCTGACTAGCTAATGTATGATTTGGATTGAGGTTTAATGTTTTAGTAAAGTCATTAAACGTACCTCCTGGGATAATACCAATAGGTAAATCTAAGTCGTTCTCCATTACGCCATTAATCAATTCATTAACGGTACCATCGCCACCTAAAATGAATAATACATCTATATCGTCTCCATATTGTCCATTTTTAATAGATTGGCAATAACCTTTGATATCTCCTTCATTCTCACTTAATTGAATGGAGAAGTGTTTACACATAGAACTTAGAGACTTTGTCACTTCACCTAGACCTTGGTAGATATCTTTTAAGCCACTGTGTTCATGATAGAATAGCACACCATGATTATATTTTTTTGTCATCGTCTATACCTACTTTCCTTAAGTTCTTGTTTAATATATTTCAATACCCATTTTTATAGGTAATCAATGAAATTTTAGAGTGATTTTTATTATAAACTAAAAAAGCAGTAAGCCGAATTATTTCGACTTACTGCTTACTTTGTCATCTATTATCTAATACCTCTCATTGCTTTCACGATTTTTGGTGAGAAGGCTAAAATGACTAAAGTAATGACGATTACTGTAGTACCTAAGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAATGGATCGATTAATTTAACTAATGTACCGTTAAATGCTTGAGCTGATGCATTAGTTAATAACCATAAACTCATCATTTGAGCGTTGAATGCTTTTGGTGCTAATTTAACTGCAGCACTGTTACCAGTAGGTGATAAACATAATTCACCAACTACACAAATGATGTATGAAAGAATAACCCAGTTTACTGAGAAATGCGCACTTCCATAAATGTTACCGATTAATCCCATTAAGATATAAGAGATACCAGCCAAACCAGCACCAATCACGAATTTAATAGGTAAACTTGGTTGGCGTTTGCCTAATTTTTGCCAAATAAATGAAACAACAGGTGCAAATAATAGGATGAAAAGTGGGTTAATAGATTGGAAAATTGTTTCACCGAAATTCGTTTTCCATCCTAATAGATTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATACCATAAATGTTAAGTACATTTGAACCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATACCTAAAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACTCTTGAACGTTCTACATCCGTAACATCTTTACTTCTAATCATAATTGTAAAGTATGAAACTGGTAATACGATACCAAGTACTAAAACAGTATTACTTACTAAGTTAAATGATAATGTATTCGTTAAGTATGTAACGATAAGTACAACGATAATAATGGCTACTATACCACTAATAATTGCAGTGTATTTTTTCTTTTCAGCGGGTGAAAGTGGGTTTGTTGGTGTCATACCAACACGACCTAAATTTTTACGATTGAATAATACGTACCAAACTAAACCTAATGCCATACCAATAGCTGCAATTAAGAATCCGCCATGGAAGTTTTTGACGTCTAAAAATTGTTGCAAAATGATAGGTGAAATTAATGCACCAAAGTTTACTGACATATAGAAAATAACGAAACCTGCATCCATACGTGTATCATCTTTAGTATATAATCTACCAACAATATTAGAAATGTTTGGTTTCATCATCCCAGAGCCAATAATAATAAAGAACATTGATGCGAACAAACCAACCATTGCGAACGGCAAACTTAAACAAATATGGCCAATAATGATGAGTACTGCACCAATTAAAGTAGCACCTCTTGTGCCTGTAATTCTGTCAGCAATCCAACCACCTGGAATACATGACATATAGATTAATGCCCCATATACTGACATGATTGACATTGCCGTGGTTCTATCGATACCTAAACCATGATTTGCAATGGAGTAGTACATATAGAATATCAACATCGCACGCATGCCATAATAACTGAATCTCTCCCAAAATTCTACGAAGAATAAAACACCTAAACCTCTTGGATGTCCAAAAAATCCTGTTTGTGGAATTTCTTGAACTGCCTGTTCATGGGAATTATTTGCTTTCATATAATCATCCCAACCTTTCTGTTCCCTTAACACTAACGTTATATTGTTTTTTAAAAATTGTACTATTGAAATTAAAAAGTTGCAATAATATTCTAAAAATTATAAATAAGAAAATTCTGTCAATTCCTTCGAATTAATTATATGAAATATTCATATAAAATTGAGACTCATTAATTTAATGAACTATAGTACTAATATATATAAAAATACGCTTTAACTTAATAAAGTGCAAGAGTTTTTTGAAAATTAAATAAAAAAACTTTAGCACAATTTGAAATTATCTTTGTAAGATGTTTTCAATGTACTAAAGTTTATATTTGAAATTCATTGTAAGATTAGCGATTGTCTATATTTTCAGGATACATATCATGATTCATCATTCTATGCTCCGCCATTTTTTCATATTTTGAATTAGGGCGGCCGTAATTTGTATATGGATCAATGGAGATGCCACCACGTGGTGTGAATTTACCCCATACTTCAATGTAATGAGGATCCATTAAGTCGATTAAATCATTCATAATGATATTCATACAATCTTCATGGAAGTCACCGTGGTTTCTAAAGCTAAATAAATATAATTTTAATGATTTAGATTCAACCATTTTAATGTTAGGGATGTATGAAATATAAATTGTTGCAAAATCCGGTTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_022737|1930541:1939882|1937776_1939882_+|WP_023374810.1|DBSCAN-SWA MKTMDEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFNLEKDQEALKVYLEEIHDKTIYFDSEIERLHYLVDNNFYFNVFEKYSDSDLVEITEYAKSINFQFASYMSASKFYKDYALKTNDKQQYLEDYNQHVAIVSMYLANGDKDQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSDIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGTEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESQKFRDSVHTGMDALTVVSDEANIQNAPGVKKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNYYSIERSMQIAKERGEKYLDFDKSDYANGKYFEFYTSQEFEPQFEKVRELFEGFEIPTAEDWKALQKDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLVSTIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >NC_022737|1930541:1939882|1933381_1934887_-|WP_041613870.1|DBSCAN-SWA MKANNSHEQAVQEIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYYSIANHGLGIDRTTAMSIMSVYGALIYMSCIPGGWIADRITGTRGATLIGAVLIIIGHICLSLPFAMVGLFASMFFIIIGSGMMKPNISNIVGRLYTKDDTRMDAGFVIFYMSVNFGALISPIILQQFLDVKNFHGGFLIAAIGMALGLVWYVLFNRKNLGRVGMTPTNPLSPAEKKKYTAIISGIVAIIIVVLIVTYLTNTLSFNLVSNTVLVLGIVLPVSYFTIMIRSKDVTDVERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLLGWKTNFGETIFQSINPLFILLFAPVVSFIWQKLGKRQPSLPIKFVIGAGLAGISYILMGLIGNIYGSAHFSVNWVILSYIICVVGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSLWLLTNASAQAFNGTLVKLIDPLGQTNYFIFLGTTVIVITLVILAFSPKIVKAMRGIR >NC_022737|1930541:1939882|1935746_1936616_-|WP_041613872.1|DBSCAN-SWA MNPKIKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLSGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIFKYKQPMFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYALDHMVLSDADTLMKLNPFWTILLCFIFLHEKVRKYQISAMIVAILGMLLIVKPEFSSSFIPAFIGLLSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFSIVTFEPMSKLQVLYLFGAGLSAAVGQIGITLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAIFGFILFGETPDLLSTIGYVVIISASYYMFEKARRESSTQQQN >NC_022737|1930541:1939882|1937415_1937814_+|WP_002467572.1|DBSCAN-SWA MKVVYFSFSGNVRRFIKRAEIENVMEITSDNCTDPINEPYILVTGTIGFGEVPQQVQSFLDVNHSYLRAVAASGNRNWGQNFAKAGRSISEDYNVPLLMKFEVQGTNKDVIEFKNKVGNFNENYGREEVQSH >NC_022737|1930541:1939882|1932302_1933232_-|WP_023374806.1|DBSCAN-SWA MTKKYNHGVLFYHEHSGLKDIYQGLGEVTKSLSSMCKHFSIQLSENEGDIKGYCQSIKNGQYGDDIDVLFILGGDGTVNELINGVMENDLDLPIGIIPGGTFNDFTKTLNLNPNHTLASQQLLSSHIQTYDVIKINDMFALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLMDPSKFDFTLSIDGQEKSGNTSMILIANGPNIGGSRIPLTDLSPQDGQLNTFIFDDQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIDHISGKQIKLTTEPNMKIDIDGEIALETPINVEVLPNAIKLLTFPDQNNNQ >NC_022737|1930541:1939882|1930541_1931597_+|WP_023374804.1|DBSCAN-SWA MKKQLEQLSAYQPGLSPRALKEAYGIEEELYKLASNENLYGPSPKAKEAITNHLDELYYYPETGSPLLREAISQHLDVDASRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSEATFGQYYHNAIVESAHVVQVPLKNGGFDLEGILNEVDDDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHDELKGFLERVPSHVPVLIDEAYFEFVTADDYPDTLKLQETFDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVATNEAIEKWNIIRPPFNVTRLSEYAAVAALEDQDYLKQITSKNAKEREKFYQIPQSKHFLPSQTNFVFVQTDKSKELYEALLKVGCITRPFPTGVRITVGFPEQNDKMIDVLQHFEF >NC_022737|1930541:1939882|1935222_1935723_-|WP_015365282.1|DBSCAN-SWA MAQGRQNDELQDITLLGNQNNTYNFDYRPDVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIDLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRMMNHDMYPENIDNR >NC_022737|1930541:1939882|1931684_1932221_+|WP_023374805.1|DBSCAN-SWA MSRKKIAIDMDEVLADTLGAIIDGVNERANLGITVESLNGQKLKHVIPEHDGLVTEILREPGFFRHLKVMPNAQEVVEKLNEHYDVYIATAAMDVPTSFHDKYEWLLEHFPFLDPQHFVFCGRKNIINADYLIDDNPRQLAIFEGESIMYTAVHNMNHQEYKRVNGWKDVEALFLNDK |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1990479 : 2006919
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_022737|1990479:2006919|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_022737|1990479:2006919|2005545_2006004_+|WP_023374858.1|DBSCAN-SWA MQEHTNESYQQTKISEYELLTKYNPKYINSKIKTAQSHIDEMYHLSTSITTCDDIMGVISVSYPVDKLVIWISETKDNLKRFKGDSAIRLYLLKQVLNTYTKEEQQIVVRYMQSHGRIKTHELIERLQVDLYKVSHDKPLTKANELQQAMVV >NC_022737|1990479:2006919|2004403_2004745_+|WP_023374856.1|DBSCAN-SWA MIKTIEKQVAQPPTEYLRVYDIIQNSNEKYVTKTKILNQLGYTLNKVNDRWLTQVITSLIINYQYPVGYSYKKDARGYYIIRSKEDKQQAIYSVKRQVLGAQTRLKALEEIEV >NC_022737|1990479:2006919|1999686_2000046_+|WP_041614105.1|DBSCAN-SWA MNKLTREDYKNIDGKLNYEHIVNNKKQNRKTSKLLRKRRNRDISIIKNEYPNLSKSEITKVLDDYRNYKEFVKSSNILIDFPINYEDSNIHKFITKDDVEDLKLAIEEMTSFVEKLEEY >NC_022737|1990479:2006919|1996067_1996532_+|WP_002466079.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKRGEIYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDRTREIGYSIIPLKLYLKHGQCKVLLGIARGKKKYDKRQALKEKAVKRDMDRAVKARY >NC_022737|1990479:2006919|2000482_2002735_+|WP_023374853.1|DBSCAN-SWA 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>NC_022737|1990479:2006919|2004774_2005485_+|WP_023374857.1|DBSCAN-SWA MTMKTGSAYDVLFNDRKYKDLLDKVDQFLEETFIMYQRGYRMDIIDEQQKPKVTQIENEFKQFASDKLKRIESRMDEIEEELTKDDVADPQSELIKRQNLEARLSFYSNSEIMDYIREADAEKTDVFELSLLQKAFDQRLSESEQSQVSFSLTALKKSVLYPFENNEEHDNLAYQFNVLRQIGMANNGSVITKDDEGYVVIKPLSDRYNDQLKYAKAKKDGARQQAQYKKQYVYNK >NC_022737|1990479:2006919|1999045_1999270_+|WP_023374849.1|DBSCAN-SWA MKNKLSVLLGQKKESVMYLSEKTGISPTTLYSLYHEKNKNPDTKTIMVLCKYFDITPNDFFGIDRLEDKNYAKN >NC_022737|1990479:2006919|1998299_1998881_-|WP_023374848.1|DBSCAN-SWA MIITSNLKVKMAEYNYSIKDVHEKTKLSRTTISNLYNNYSDGIKIDTLEKLCDLFNCTPNDLFKLTYLEIENIQYEKLNQVYGLNEDSTFDKSEKLSFYKANVQLKLNNIPYSIELRLIIEPSNSYSDSGLEIGILKLEEYENTFIGESLNATGLVSVPLSNKIEETVLNDFIKNNASISDYDVIEDIEYTFK >NC_022737|1990479:2006919|1999490_1999628_+|WP_167321432.1|DBSCAN-SWA MKNCLTYIGTISFITLAVALVANVFIAFALYILASAYGIKLLEVE >NC_022737|1990479:2006919|2006352_2006919_+|WP_023374860.1|terminase|DBSCAN-SWA 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21 | Staphylococcus_phage(53.33%) | terminase,integrase | attL 1981470:1981484|attR 2001358:2001372 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2038255 : 2073739
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_022737|2038255:2073739|DBSCAN-SWA AGTGGCCGAACAATCATTTGACGTTAATGAAGTTATTAAAGATTTTCCGATTTTAGAGCAACAAGTTAATGGCAAACGTTTAGCTTATCTTGATTCAACTGCGACAAGCCAAACACCAGTTCAAGTATTAAATGTATTAGATGATTATTATAAACGCTATAACTCTAATGTACACAGAGGAGTTCACACATTAGGTTCTTTAGCTACAGATGGATATGAGAGTGCTCGTGAAACAGTAAGACGTTTCATCAATGCAAAATATTTTGAAGAAATCATCTTTACAAGAGGAACAACAGCGTCCATTAACATTGTTGCACATAGCTATGGTGATGCTAATGTTGAAGAAGGCGATGAAATTGTAGTTACTGAAATGGAGCATCACGCTAATATTGTGCCATGGCAACAACTTGCCAAACGTAAAAAAGCATCATTAAAATTCATTCCAATGACAGACCAAGGCGAACTAAATATTGATGACATTAAAGCGACAATTAATGATAATACTAAGATTGTTGCTATCGCACATGTTTCTAATGTATTAGGGACAATCAATGATGTGAAAACAATAGCAGAAATTGCGCATCAACATGGTGCTATTATTAGTGTTGATGGTGCACAAGCAGCACCACATATGGCATTAGATATGCAAGATATTGATGCAGACTTTTACAGTTTTAGTGGTCATAAAATGTTAGGACCTACAGGTATTGGTGTGTTATATGGTAAGCGTGAACTACTTAAAGACATGGAACCTGTTGAATTTGGTGGCGATATGATTGACTTTGTAAGTAAATATGATGCTACTTGGGCAGACTTACCAACTAAATTCGAAGCAGGCACACCTTTAATTGCACAAGCAATCGGTTTAGCTGAAGCAATCCGTTATATTGAAAAACTAGGATTTGATGCTATTCACCAACATGAAAAAGAATTAACAGAGTATGCATACGAGCAATTATCAGAAATTGAAGGTTTAGACATTTACGGCCCACCTAAAGATAGACGTGCAGGTGTTATTACATTTAATTTAGCTGATATTCACCCGCATGATGTTGCAACTGCTGTTGATACGGAAGGTGTTGCGGTCAGAGCAGGACATCATTGTGCACAACCATTAATGAAATGGTTAGGCGTATCTTCAACTGCTAGAGCAAGCTTTTATGTATACAATAATAAGCAAGACATCGACCAATTTGTATATGCATTGAAACAAACGAAGGAGTTTTTCTCTTATGAATTTTAATAATTTAGATCAACTTTATCGATCTGTAATTATGGATCATTATAAAAATCCTAGAAACAAGGGCGTACTAGACAATGGCTCGATGACAGTTGATATGAATAACCCAACATGTGGTGACCGTATTCGACTTACCTTTGATATAGAAGATGGCGTTATTAATGACGCTAAATTTGAAGGTGAAGGTTGTTCAATCTCTATGTCCAGTGCTTCAATGATGACCGAAGCAGTAAAAGGTCACACATTAGCTGAAGCAATGCAAATGAGTCAAGAATTCACAAAAATGATGTTAGGTGAAGACTACGAAATCACTGAAGAAATGGGAGACATTGAAGCATTACAAGGTGTTTCTCAATTCCCTGCACGTATTAAATGTGCCACTTTAGCTTGGAAAGCGCTCGAAAAAGGAACAGTTGAAAAAGAAGGTAAATCAGAAGGAACTACAGAAGAATAAGACTGGAGATGTTTCTAACTGACATAACGGGTAAACATGAAATAGACAATGAATGTTATCATTCATGTTGGCTTTTTACTTTCCTTAATCGTTGTTATAATATAACAACAATTTAATACTTGTAATTAAAAATCTCACGCATGACGTTTAAATATATATAAGGAGTGATTGAAATGGCTAAAAAAGCACCTGATGTTGGGGATTACAAATATGGTTTCCACGACGAAGATGTTTCCATTTTCAGATCAGAACGAGGTCTAACTGAAAATATAGTTAGAGAAATTTCAAAAATGAAAGATGAACCTGAATGGATGCTAGATTTCCGTTTGAAAGCTTTAAAACTATTCTATAAAATGCCAATGCCTCAATGGGGTGGCGACTTATCAGAATTAGACTTTGATGACATTACTTACTATGTAAAACCATCAGAACATACTGAACGTTCATGGGATGAAGTACCTGAAGAAATCAAACGTACATTTGATAAATTAGGTATTCCTGAAGCTGAACAAAAATATTTAGCAGGTGTATCTGCTCAATATGAATCAGAAGTTGTTTATCACAATATGGAAAAAGAATTAGAAGAAAAAGGTATCATCTTCAAAGATACAGATAGTGCATTACGTGAAAATGAAGATTTATTCCGTGAATATTTCGCAACTGTTATTCCAGCAGCTGACAACAAATTTGCGGCATTAAACTCAGCTGTTTGGTCAGGTGGATCATTCATTTACGTACCTAAAAACGTTAAATTAGATACGCCATTACAAGCTTATTTCCGTATTAACTCTGAAAACATGGGACAATTTGAACGTACATTAATCATTGCTGATGAAGGCGCTTCTGTAAACTATGTAGAAGGTTGTACTGCACCAGTGTACACAACAAGCTCTCTACACTCAGCAGTAGTTGAAATTATTGTTCATAAAGATGCACACGTGCGTTATACTACAATTCAAAACTGGGCAAATAATGTTTATAACTTAGTTACTAAACGTACATTTGTTCATGAGAACGGTAATATGGAATGGGTTGACGGTAACTTAGGTTCTAAATTAACGATGAAATATCCTAACTGTGTATTACTAGGTGAAGGTGCGAAAGGTAGCACATTATCAATTGCATTTGCAGGTAAAGGACAAGTTCAAGATGCAGGTGCTAAAATGATTCATAAAGCACCGAATACGTCTTCGACTATTGTTTCTAAATCAATTTCTAAAAATGGTGGTAAAGTTATCTATCGTGGTATTGTTCATTTTGGACGTAAAGCAAAAGGTGCACGTTCAAATATCGAATGTGACACATTAATTTTAGATAATGAATCAACTTCAGATACTATTCCTTATAATGAAGTATTTAATGATAATATTTCATTGGAACACGAAGCTAAAGTTTCTAAAGTATCAGAAGAACAATTATTCTATTTAATGAGTCGTGGTATTTCTGAAGAAGAAGCGACTGAAATGATTGTTATGGGCTTCATTGAACCATTTACAAAAGAATTACCGATGGAATATGCAGTAGAAATGAATAGATTAATCAAATTTGAAATGGAAGGTAGTATTGGATAGCCTTCAAGCCCGTGGTTGAGCCATTCTTGATTGGGAAAATAGGCTATTGATACCATTTTGATACCATTTACTCATCAAAAATAGATATTGCATCATGCTTTTTCTGAGTGTATAAATGACTGTAAGTTCCCATCGTTTCAGTGATTTGAGCATGTCTCATTAACGATTGTAAAACGAAAATATCTACGCCATTATTTGCAAGATAAGATGCATAAGAATGTCTTAACGCATGTATGTTATAATTGGGGAAAGCTTTTTGAAATTTCTTATGAACATGATTATAATGTTTAGGAGCTATTCCTCCGAAAATAAAATAACTACGTTCATCAAAATATTTATTAATCGATTTTTCACGTTGGTAGCGTTCGGTTAACATATCAGTGATGAATTTAGGTAAAGGAACGATGTCCTCGGAACTTTCAGTTTTAGGTCGTGGATATATTGTTCGATTAGAGATGTCCATTGTTTTACTAATGGATATCTCTTTTTTATATTTATTAAAATCTGCCCAAACTAATGCCATTGCCTCACCTACACGTAAACCTGTATAAAACATTAATGTAAATAGTTCTCTATAATCTTGCTCTTCTACATCTTTTACTCTATCCTCAAATTCTTCTCTCATCATAAATTTAGGTTTTGGTTTAACTCTTGGTATAGGCTTAATAGATATAGTCGGATCAATACGTAACCCGAAATATTTTTTAGCATAATTAATTACCACTTTGAAACCAGACCAAATTGTACGTGCAGTATTAGTTGAAGGTATATTATCCATTAAGTATTTACGGAATTCTTGGCATTGATTTTGAGTTATCTTATTCATGTTGATGTGACCGAACTTGTCTTGAAAATGCTTTGTGTATTCATTTTGTTTACGACGTTTAGTTTTCGGGCGTAAATCACTGTTCTCTAAATAATGATTGAATACGTAATCGAACGTTCTTGAATCACTATAACCTTCATTAACATCATTCAAAAAACTAGCCTCGGCGTTTTTAGCTTCTCTTTTTGTTGAGAAACCACGCTTCATTTTTCGTTTGTTATTACCATAAACATCTTTATATCTGGTAGAAAAATACCATTTGTTTGTACTTTCGTCTTTATATACTGGCATTTTCTTTCAATCCTCCTCAAAAAAGGTAAAAAATAATAAGGGTACGGTGGTGTACCCAGAACTTCAAATTTTATAAAAATATGATATACTAAATAAAAATGGTGGTGATGATAATGATTGGTTTAATTAAAGATAAAATTAAACAAACTGAAATAGAACGGAAAAGCATGTCTAAAAATCATCGTGAAAACTTTAATAAAACAAAAAAAAGAATTGAATTGCATAGAAATAAAACTAAAAAAAGCGATGTTCAAAATCATGTAAAAAAAGAATTATCTAGACACTTTTGAGTATTCTAACCCAATTGGTTGGAAAATATCGAAAGTGTCTTTTTCTTTTAGCCCTAAAATTGATGATAAAAAGATCATAAGCATACTTTGAGTTCCTTTTGACAGAAATTCATCATTATTAAATTCGACATTTTGAAAATCAGTAATAGTTGAAAGAACTTTTGTCTTGGTGATTTTTCTTCCGAAACCATTTATATTAACTGCATTAGCTAATGATAAGGTTTCTCCAGGAATTCTTAAATGGTGTCTGTCTCCAATTAATATCGTATTCCCTCTATACAAAATTATTTTGTTTCCAAATATAGCTGAAAGATGTTTAGACATTTCA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>NC_022737|2038255:2073739|2047490_2047976_+|WP_023374910.1|DBSCAN-SWA MSNIYQINDKFLSVLNMADEDVDPQIIQDTLDSIELELNEKVDNIVGLKRSVDSDVDAIDKELKRLQELKKSKIKFSDRLKGYLSDMLEQRQLDNYRTSKNYIYKRKNGASKDVVDESKIPKEYWVSQAPKLNSKMLTDDLKAGKEIPGACLKQTVSLVVK |
55 | uncultured_Caudovirales_phage(52.0%) | tail,capsid,integrase,portal,terminase,protease | attL 2041004:2041019|attR 2056864:2056879 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2077235 : 2082495
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_022737|2077235:2082495|DBSCAN-SWA 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TTCTCCCACAATTTATTAAATATGCAAGAATTAAACACATGAAATCATTAGGGTACAGATATGAAGGTGAAAAACTTGTCAGAATACAAGAAAAAAATAATTGAATTGATCGAGAGTGATATAACAGGGTATCAAGTTTTCAAAGATACAGGGTTAAGCCAAACGGTTATGTCGTCCTTAAGAACTGGTAAGCGTGATGTTGATAATTTAAGGTTGGGAACAACCGAAAAGCTATACGAGTACGCATGTAAAGTGTTATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_022737|2077235:2082495|2078156_2078558_+|WP_041613901.1|DBSCAN-SWA MSENDEKYVLRHEWERNTGKIYERINENDRKHTEAISSLNNKVDKQTVIQEQTYESQKKQESHLEKISDKMTDFVSEVNDLRYEVKGHDEQIKSFSQILTKKQTFNVGIATAIVGGIFSLLTAAVGLAPILFK >NC_022737|2077235:2082495|2079887_2080469_+|WP_023374955.1|DBSCAN-SWA MGIRNMIGVKKGVYTLIEPIKGKPQGIFYCHICGKKHVGNLYSWYHNGRRKCGHQQVDHRLYHRYKKMIERCHNPKNQRYNYYGGKGIHVCERWINSFENFLEDMEDSFEEGLELDRIDNSKGYSPENCRWVNHSENMLNRNGFKNSTGFPGVRRYYNKYYGRFQNNKKNYRTNSFNTPQEAYRELQKLKRSL >NC_022737|2077235:2082495|2078608_2078860_+|WP_015365107.1|DBSCAN-SWA MTADKLKQYIGLFGGMLGALYLALKASGIEVPFLMPDKLDAWQNFATSIVPFVIAIYGVYKNTYVIHSHSKAQEEYLKENNLK >NC_022737|2077235:2082495|2082309_2082495_+|WP_023374957.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESDITGYQVFKDTGLSQTVMSSLRTGKRDVDNLRLGTTEKLYEYACKVL >NC_022737|2077235:2082495|2077798_2078173_+|WP_106913125.1|DBSCAN-SWA MGFGLLMFERGFFWAKEQEDILDDSQFYVALHNIMPIWVWGILGMIFSLMLIVAPFFLPKREMNNTFNYLIMLGGAGNALFYFLMTSASIFHAINWLTPLQFSTLAVLNILICVLGVIGIVRKR >NC_022737|2077235:2082495|2077235_2077382_+|WP_041613899.1|DBSCAN-SWA MKDNNNNQLQANPQLTIDFLTQEAARLTQENAMLKAIIQEQNESAEEE >NC_022737|2077235:2082495|2077425_2077713_+|WP_023374951.1|DBSCAN-SWA MANEVVNKKENYILVQVDEKGVETALSIDYRGQFFPSVNTSSAYKVVEKDKADKLASRLNALNELNHEFGIVQELMTIKVAKEIIDINYTEEPQV |
7 | Staphylococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2223083 : 2231553
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_022737|2223083:2231553|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_022737|2223083:2231553|2228478_2229963_+|WP_023375057.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPDAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVAANYEELVGERGLGLLTEAIKDDQLSRLQDYHNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAICHNGNLINAQSLRQNLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALNESLRQIKGGFTFAVLTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMQDNTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVIINDEGVQVKSYTRHTNTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKRLAQESPVEAGMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQQLREQGVRVKLSAVKDIVEGQNIILVDDSIVRGTTSKRIVKMLKDSGANEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICEYIGADSLAYLSVNGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLFDYEENYKKHLSDRQKAYINENKHYFDSEGNINV >NC_022737|2223083:2231553|2223083_2223566_+|WP_041613927.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWEIMSESCTMLEQFEIPYEKKVVSAHRTPHLMVDFASHASNNGYDLIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKAGAKNAGILAARILGISHSSVRENLENYEKSLVQKVEEMQNELQ >NC_022737|2223083:2231553|2223513_2224680_+|WP_081698203.1|DBSCAN-SWA MKNHWYKKWRKCKMNFNKLSFGSTIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVIVLDPSSDCPCRYVAHEFIEANYDDERALQHLGESSDVITYEFENISAKQLKTLTEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKQTLEQAGAKIVPYTSIKHKDDLSKATKTLGYPYIVKTRFGGYDGKGQILVQSEEDIKEAEILASNQECVAEQFLNIKKEVSLTVTIGNHQQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARCNQIENAKREVEKIIKAVHFIGTFTVEFFIDSNDQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQTLPDKIEILKPAIMMNLLGKDLDLLEDEFGEHPEWHVHIYGKSERKPNRKMGHMTILTNQIDETEQDMLKRFEGRGQ >NC_022737|2223083:2231553|2226310_2228500_+|WP_023375056.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKLYQDMGLSDKEYAKVCEILGREPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTNKQNQRLLKGVVSGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMVQKGTAKGIGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEQGTEQKFLDLFEKHELVSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVFADIPVQPLSDEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYSHIDIENVFDQLLKHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQSSVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDVLKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIDDVNYLADFKPQAGEKLYLVGDTRDDYGGSQLEKLLYGTVNHEFESIDLSDEVAKGEAVKSAIRNGAASHVQTVGKGGLLITLAKISAHYDLGLEANIDVSNAQLFSESQGRYIISVKENELLNIENAIEIGQFNEGNQFKVSNNQTTIIKNVADIKDVWEGAISQCLTTQD >NC_022737|2223083:2231553|2229955_2230984_+|WP_023375058.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDHNKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATHKVVPEIIEQIVKGISDACEETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKDEYIDGSDVKAGQVIIGLASNGIHSNGYSLVRQLIKKSGINLNDTFDRHTYLETFLAPTQLYVKPILELKKHVSIKAMNHITGGGFYENIPRSLPDGLSADINANAFPTPAIFDWLQEQGNISTDEMYNIFNMGIGFTVIVDEIEKDKTLDILKQQNVNAYEIGRIVEDSHNPIHIQGV >NC_022737|2223083:2231553|2225384_2225645_+|WP_002450716.1|DBSCAN-SWA MKTIELHVTLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYKQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVIDEKENA >NC_022737|2223083:2231553|2225646_2226318_+|WP_023375055.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKSGDEAEYVDYRTTTLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVINEVKRLAKEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFVSRNESLRIVNNQTPFTNLYEENEEVVYPVAHGEGHYYCNEDIYNELMSNNQIILKYTDNPNGSYADIAGIVNKEGNVCGMMPHPERAMESLLGTDSGVKLFEAMVNSWREQNV >NC_022737|2223083:2231553|2230986_2231553_+|WP_023375059.1|DBSCAN-SWA MIKVAIFASGSGSNFENIVRHVQQGHIEDIEITALYTDHHDAYCIKRAEQLGVSVHINEPKRFESKSHYEQHLLSLLSAEGVQWIVLAGYMRLIGEDILTAYPHKILNIHPSLLPKFKGIDAIGQAFRSEDSITGSTVHYVDNGMDTGEIIEQRQCDIRTDDTIETLEERVKQLEYELYPSVIAKIIR >NC_022737|2223083:2231553|2224680_2225385_+|WP_023375054.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRIYTTDKPNELRVEYKDEVTAGNGAKKDAMSGKGKLNNRITSIIFEYLEKNGLKSHFIKQLSETDQLVESVKIIPLEVVVRNIAAGSITQRLGFEKGYLFDVPLVEFFYKNDELNDPLITEDHIKLLHIAYDDQISTLKSMALDINKVLIQLMNEMELRLVDFKIEFGITDEGEILLADEISPDTCRIWDKYSDANFDKDVYRNDTGSLIETYQSFLNKLEDLK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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