Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022759 | Campylobacter fetus subsp. testudinum 03-427, complete genome | 4 crisprs | cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,WYL,DEDDh,csx23,cas10,csm3gr7,csx10gr5,csx19 | 0 | 8 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022759_1 | 43156-43270 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022759_1
|
1 spacers
spacers of NC_022759_1
>1.1|43186|55|NC_022759|CRISPRCasFinder TAATTTAAAAGAATATAAATTTCTAAAGCGTGAGCAAAAGCGAACGGACTTTAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022759_1
The CRISPR arrays of NC_022759_1 >merge|NC_022759|1|43156-43270|CRISPRCasFinder ATTTAGTTCTTTAGTACGAATTTATTCGTATAATTTAAAAGAATATAAATTTCTAAAGCGTGAGCAAAAGCGAACGGACTTTAGTATTTGGTTCTTTAGTACGAATTTATTCGTA >NC_022759|1|1|43156-43270|CRISPRCasFinder ATTTAGTTCTTTAGTACGAATTTATTCGTA TAATTTAAAAGAATATAAATTTCTAAAGCGTGAGCAAAAGCGAACGGACTTTAGT ATTTGGTTCTTTAGTACGAATTTATTCGTA
>NC_022759.1|WP_023384004.1|42250_43009_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MAISIKNAKDLEQLRAANQIVANTLDYLHNYIKPGVSLLEIDKICEDMIRSAGAKPAFKGLYGFPNAACISVNEVVIHGIPNEYKLKEGDIVSVDIGSNLKGYFGDSARTYPVGKISANDEALISCSKDALYFAIEYIKSGMHFKEVCYEIENFILNRGFVPLKGFCGHGIGKRPHEEPEIPNYLEGNNPKSGPKIRNGMVFCIEPMICQKDGTPVIADDKWTVRSKDGLRTSHYEHCLAIIDGKAEVLSQI >NC_022759.1|WP_023384002.1|40986_42249_+|preprotein-translocase-subunit-SecY MNKTLINKILITLGFLFAYRVLAYVPVPGVNVDVIKEFFTSNSSNALGLFNMFSGRAAERLSIISLGIMPYITSSIIMELLAATFPTLGKMKKERDGMQKYMQIIRYATIVITIVQAIGVSIGLQSLTGRGGEQAIMIDINLFIAISCISMLSGTMLLMWIGEQITQRGIGNGISLIIFAGIVSGIPSAIGGTINLVNTGEMNFLVVIGIALVILITVGIVIFVEMGERRVPISYSRKTVMQNQNKRIMNYIPIKVNLSGVIPPIFASAILMFPGTILQASTNEFILAINDFLNPNSYFFNFLTFLFILFFAYFYASITFNAKDISENLKRQGGFIPGVRPGESTATYLNEVASRLTLTGSVYLGLISTLPWILVKFMGVPFYFGGTSVLIVVSVALDTMRKIEAQIYMNKYQTLSAVGL >NC_022759.1|WP_023384000.1|40585_40987_+|50S-ribosomal-protein-L15 MGLENLQKANGSTRNTKRIGRGQGSGWGKTATKGGKGQTARKGYNEKRGFEGGQQPLQRRLPKVGFASKFVKPYAINVEKNEGVKTLSEITLDSLKTVHKFSNSIKKVKLIGAGAKDLASKIKDENITVTGIN >NC_022759.1|WP_023383999.1|40132_40576_+|30S-ribosomal-protein-S5 MEKYNREEFEEVIVDIGRVTKVVKGGRRFRFTALVVVGDKKGHVGFGFGKAKEVPDAMKKAVDDAFKNIVEVKLKGSTIPHDIEVKFNASRILLKPASEGTGVIAGGGARPVVELAGIKNILTKSLGSNNSANVVRATIKALSMLKG >NC_022759.1|WP_023383997.1|39761_40118_+|50S-ribosomal-protein-L18 MVANVLKRKISLRIKRKRRIRAKINGTASCPRISIFKSNRTIYVQAIEDINATTLCASDGRKLGIKANKSGAAVLAKDIAGKLSAKGINEAVFDRNGYLYHGVVAAFAEALRENGIKL >NC_022759.1|WP_023383996.1|39215_39752_+|50S-ribosomal-protein-L6 MSRIGKQPISIPNGLDVSLKGSVLVFKKGNNTKELDTKGNVNIEVKDGNIIFTSKGDDRQSRAYWGTYRALANNVVVGLTTGFTRQLEINGVGYKAAAKGKVLELALGFSHPINYELPEGIEISVEKNIITIKGSDKQVVGQVAAEVRGFRPPEPYKGKGVKYVEERIIRKAGKTSKK >NC_022759.1|WP_002847989.1|38697_39093_+|30S-ribosomal-protein-S8 MINDLISDGLTRIRNASMRRLDTTKLLHSNVVEATLKILANKSYIESYNVVEEGNKKFINVVLKYDERGRSVINELKRVSKPGRRVYQGRDEIKRFKNGYGTIIVSTSKGVLSNDEAHKAGVGGEVLCTVW >NC_022759.1|WP_002847988.1|38501_38687_+|30S-ribosomal-protein-S14-type-Z MAKKSMIAKAARKPKFSARGYTRCQICGRPHSVYKDFGICRVCLRKMANEGLIPGLKKASW >NC_022759.1|WP_023383995.1|37957_38500_+|50S-ribosomal-protein-L5 MRLKAKYNESIKPALAKEFDIKNPMLIPAIEKIVISVGAGEGAKDQKLLQNMADTISLIAGQKAVITNAKKSVAGFKVREGYPVGIKVTLRKEQMYTFLDKLVSVALPRVKDFRGLPRDGFDGRGNYNFGLNEQLMFPEVVYDQILRTHGMNITIVTTAGDDKQAFKLLELFGIPFAKGK >NC_022759.1|WP_023383994.1|37721_37955_+|50S-ribosomal-protein-L24 MAVKYKIKKGDEVKVIAGDDKGKVAKVIAVLPKKGQVIVEGVKVAKKAVKPTDKNPNGGFISKEMPIDISNVAKVEG >NC_022759.1|WP_002848031.1|43305_43524_+|translation-initiation-factor-IF-1 MAKDDVIEIDGNVVEALPNATFKVELDNKHIILCHIAGKMRMHYIKIMPGDRVKVELTPYSLDKGRITYRYK >NC_022759.1|WP_023384005.1|44033_44318_+|hypothetical-protein MQLKKLISNTINDILSIVEHLPSIDYDFIISQSEDDLKAFAQKDPSSNKDEIYILKSYLTYFATISYRVANYLHLKNEKINARKISENAKNNFV >NC_022759.1|WP_023384007.1|44412_45276_+|EamA/RhaT-family-transporter MHNLRQNQTKFIALMLLAISFLAFGGIFVKLSELPPINTGFYRILFAVPFLFPFVYKDLKKLSKKEVGLLLLSGVFLAFDLILWHISFSYTTVANANLLANLVPFTIIPVSYFLFKEKINLYFFIGLVVTLVGIVILVSGKLNPTPDNFIGDLMAFSTSIFYALFMITIYKMRDKIKTTTVIFVSAFGSLPVLAIAMGINEGIYIPMSFDELWPLLALALLCHIGGQGLMAFCLGKVSANLSSVLVLAQPVIAGIYAFILFEEVLSIFEVFGMFVVLVGIYFAKKNA >NC_022759.1|WP_002848032.1|45446_45560_+|50S-ribosomal-protein-L36 MKVRPSVKKMCDKCKIVKRKGIVHVICENPKHKQRQG >NC_022759.1|WP_002848033.1|45563_45932_+|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDLPKKKRVEYGLTYIYGIGLFTSRKILNAVGISYDKRVYELSEDEAAAIRKEIQEHYMVEGDLRKSVAMDIKALMDLGSYRGLRHRKGLPVRGQKTKTNARTRKGRRKTVGAATK >NC_022759.1|WP_002848034.1|45941_46334_+|30S-ribosomal-protein-S11 MAKRKVIKKKIVRKNIAKGIVYISATFNNTMVTVTDEMGNAIAWSSAGGLGFKGSKKSTPYAAQQAVEDAMNKAKEHGIKEVGIKVQGPGSGRETAVKSIGGVEGIKVLYLKDITPLAHNGCRPPKRRRV >NC_022759.1|WP_023384009.1|46361_46988_+|30S-ribosomal-protein-S4 MARYRGPVEKLERRLGVSLALKGERRLAGKSALDKRPYAPGQHGQRKTKISEYGLQLREKQKAKFMYGVSEKQFRRLFAEAARREGNTGALLIGLLEQRLDNVVYRMGFATTRRFARQLVTHGHILVNGKKVDIPSYRVASGEKIEVAEKSKTNPQIVRAIELTNQTGIAAWVDVEKDKKYGIFTRIPEREEVVIPVEERYIVELYSK >NC_022759.1|WP_023384011.1|47000_47999_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MKKITTSAYMPTEIEVVNVSENVAKIIAYPFETGYAVTLAHPLRRLLYTSTVGFAPTAVKIDGVAHEFDSMRGMLEDVTLFIINLKNLRFKLKNDSKREVIEYSFKGPKEITGSDLNNDIVDIVNPDSYLATINEDAELKFSLIVEKGIGYVPSEEIRDYIDSEYIALDAFFTPVKKAVYEIENVLVEDNPDYEKIVLTVTTDGQVSPIEAFKHSIEAMYKQMSIFNNVLNIDVNMALTSSQSSNEHSKLLESVENLNLSARSFNCLDKADIRYIGELALMEESELKDLKNLGKKSLDEIKAVMAEIGYPFGENTLGDSKEALRKKISELKS >NC_022759.1|WP_023384013.1|48017_48374_+|50S-ribosomal-protein-L17 MRHNHGYRKLGRTSSHRAALLKNLTIAIVKAGKIETTLPKAKELRGYVEKLITRARKGDFNAHKFVFAHLQDKEATNKLVTEIAPKYATRNGGYTRIIKTRVRKGDAAEMAYIELVAQ >NC_022759.1|WP_002848038.1|48600_48867_+|NifU-family-protein MIPFSDEELLEPVKESLKVIMPMLEQDGGGMELLGIKNGVVYVRLTGHCHGCAASSQTLKYGVERQLKVDIHPELSVVNIPIGEEFEL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022759_2 | 657961-659566 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_022759_2
|
24 spacers
spacers of NC_022759_2
>2.1|657991|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGCCTCGTAAAACATCTTGTCGCTCTCTTTTTTG >2.2|658056|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT >2.3|658122|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATATTTACAACTCGATTTATTAAATTTGTTGAT >2.4|658188|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCATAGATTGCGGCTAATTTGTCCGTGGGATAGT >2.5|658254|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTCTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTT >2.6|658320|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAAAGAACTAACAGCTCTCTAGTTTCTGCTGATA >2.7|658386|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGCTA >2.8|658451|34|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAGCGTACGTGCATTCCGCACCTACTTTAA >2.9|658515|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGGAAATTTCGTTGAAAGTCTTTGAAGTTTTAACG >2.10|658581|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTT >2.11|658647|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTATTGCAATGTATGCGTCTTGCAGACACTCC >2.12|658713|37|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAATTACTGCTTTTATGTTAGGGTCTATTTGGTGT >2.13|658780|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGATAAGATTTTTGAAGAAAATGTAGCAAATGAT >2.14|658846|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTT >2.15|658912|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTT >2.16|658978|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGTACTCTCCTAACTCTTCAAATAAATTTCTTGTT >2.17|659044|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTCAATAGCTGTTTTTATCGGTAGCGCTATGGC >2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTTACTATACGCTTCTTTAGCATTCTGTTTGGCT >2.19|659175|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTCGATTATTAGATCGCCCTCTACGTCTGCAAAA >2.20|659240|34|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTATCTCTGCTGGGAACACCCTTAATATTTT >2.21|659304|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAAGTTTTATTGCTGGTTTTAACTTAAGATTATTG >2.22|659370|37|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACCCAAAAACGCTAAATTTGAGTGTGCAAAATAG >2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAACTATGTTGATGAAGCTTTAAAAAGAATAG >2.24|659502|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCCACCACAATCGGCCTCGTGTTCTCTTATTTT |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022759_2
The CRISPR arrays of NC_022759_2 >merge|NC_022759|2|657961-659566|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAGCCTCGTAAAACATCTTGTCGCTCTCTTTTTTGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAAATATTTACAACTCGATTTATTAAATTTGTTGATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAGCATAGATTGCGGCTAATTTGTCCGTGGGATAGTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTCTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTATAAAGAACTAACAGCTCTCTAGTTTCTGCTGATAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGCTAGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAATAAAGAAGCGTACGTGCATTCCGCACCTACTTTAAGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACACGGAAATTTCGTTGAAAGTCTTTGAAGTTTTAACGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTTTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGTTTGTATTGCAATGTATGCGTCTTGCAGACACTCCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGGAATTACTGCTTTTATGTTAGGGTCTATTTGGTGTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGATGATAAGATTTTTGAAGAAAATGTAGCAAATGATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGCGTACTCTCCTAACTCTTCAAATAAATTTCTTGTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAGTCAATAGCTGTTTTTATCGGTAGCGCTATGGCGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACATTTTACTATACGCTTCTTTAGCATTCTGTTTGGCTGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACTCTCGATTATTAGATCGCCCTCTACGTCTGCAAAAGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACAATTTATCTCTGCTGGGAACACCCTTAATATTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGTAAGTTTTATTGCTGGTTTTAACTTAAGATTATTGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAAACCCAAAAACGCTAAATTTGAGTGTGCAAAATAGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAAAAACTATGTTGATGAAGCTTTAAAAAGAATAGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGTTCCACCACAATCGGCCTCGTGTTCTCTTATTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC >NC_022759|2|1|657961-659566|PILER-CR GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAGCCTCGTAAAACATCTTGTCGCTCTCTTTTTTG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAATATTTACAACTCGATTTATTAAATTTGTTGAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGCATAGATTGCGGCTAATTTGTCCGTGGGATAGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTCTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TATAAAGAACTAACAGCTCTCTAGTTTCTGCTGATA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGCTA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAT AAAGAAGCGTACGTGCATTCCGCACCTACTTTAA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ACGGAAATTTCGTTGAAAGTCTTTGAAGTTTTAACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTTTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GTTTGTATTGCAATGTATGCGTCTTGCAGACACTCC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGGAATTACTGCTTTTATGTTAGGGTCTATTTGGTGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GATGATAAGATTTTTGAAGAAAATGTAGCAAATGAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GCGTACTCTCCTAACTCTTCAAATAAATTTCTTGTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGTCAATAGCTGTTTTTATCGGTAGCGCTATGGC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ATTTTACTATACGCTTCTTTAGCATTCTGTTTGGCT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC TCTCGATTATTAGATCGCCCTCTACGTCTGCAAAA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AATTTATCTCTGCTGGGAACACCCTTAATATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GTAAGTTTTATTGCTGGTTTTAACTTAAGATTATTG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAAACCCAAAAACGCTAAATTTGAGTGTGCAAAATAG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAAAACTATGTTGATGAAGCTTTAAAAAGAATAG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GTTCCACCACAATCGGCCTCGTGTTCTCTTATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC >NC_022759|2|2|657961-659566|CRISPRCasFinder GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAGCCTCGTAAAACATCTTGTCGCTCTCTTTTTTG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAATATTTACAACTCGATTTATTAAATTTGTTGAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC 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AAAGAAGCGTACGTGCATTCCGCACCTACTTTAA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ACGGAAATTTCGTTGAAAGTCTTTGAAGTTTTAACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTTTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GTTTGTATTGCAATGTATGCGTCTTGCAGACACTCC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGGAATTACTGCTTTTATGTTAGGGTCTATTTGGTGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GATGATAAGATTTTTGAAGAAAATGTAGCAAATGAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GCGTACTCTCCTAACTCTTCAAATAAATTTCTTGTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGTCAATAGCTGTTTTTATCGGTAGCGCTATGGC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ATTTTACTATACGCTTCTTTAGCATTCTGTTTGGCT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC TCTCGATTATTAGATCGCCCTCTACGTCTGCAAAA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AATTTATCTCTGCTGGGAACACCCTTAATATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GTAAGTTTTATTGCTGGTTTTAACTTAAGATTATTG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAAACCCAAAAACGCTAAATTTGAGTGTGCAAAATAG 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>NC_022759.1|WP_023384766.1|656569_657307_+|peroxide-stress-protein-YaaA MKILFSPSESKMSGGSMDTPINFSWVFPNLNDKRLEILEIYNGFLKKANKNELQTLFGLKKENELEYYSSDLFSRPLMKAILRYNGVAYEHLNYRNLDESSRKIIDENTIIFSNLYGAILAKDMICDYKLKQGETIGGFRTEVFYKKYFSSVLDDFLDFDILDLRAGFYEKFYSITKPHTTIKFLKNGKVVSHFAKAYRGIVLRYIALNQISSLDEFYNMQIPNLKINKIIKNRLKTEIIVDIIG >NC_022759.1|WP_023384765.1|656069_656573_+|HIT-domain-containing-protein MKHEFSPWRAEYFKTRKDGVMEHNCVFCDIAQNSQNDEENFVLFRAKNCFAVMNRYPYTLGEFMIIPYIHTDNIENLDKNIWFEMSDLVQLGVGVLKESLNANGVNIGMNLGSAAGAGIAEHIHYHVVPRWSRDTNFITTIAYTRVHGVPFLDQYHALKQAFQKVLK >NC_022759.1|WP_023384764.1|655293_656070_+|indole-3-glycerol-phosphate-synthase-TrpC MILDEIISKTKINLENIKEKLPLCKLENALTSSYVPRDVKQVLKQKNSINIIAEIKKASPSKGVIREDFDPLEIAFEYEKAGVSAFSILTEPFYFQGSLEYMALVRRYTNTPILRKDFIVDIYQIAEARLYGADFILLIAKALDKFYLKTLFEYAKSLNLEVLMEIHDEIDLEKALFVDADIIGINHRNLQTFDMDMELCVKLMPLIPGGKIIVAESGLYSNSDLVNLKKQGADAFLIGEHFMRQKSIYNAVKDMKGE >NC_022759.1|WP_039362186.1|654136_655297_+|hypothetical-protein MKGFYLLGDAKSKDALEVFYTLYKTTKKPIFLKESLKIAFVIKDERLDELITDARSVLNGDYDAIRIEIGYYILKSQIKEAKELALNLIQKESGNSINHSILATIYLFNDEPIRALKEFKKAYEIDDSEENLLKLVDMLDNKLDRTNEAIRYLNNWIEENGCSKPVCFTLLNIYSAKGELDLMTEMYIKLYEAYEESDFLNRALEILLYKKDVVTAKELLEKYGFNEPILMGIYAELKEFQKAYDVAQDLYSRSQNPEYMARMAIYKYEQSSKNISKFELDMVVKLFEGSVYALNSPLYFNYYGYLLIDYGIDVKKGLDIVKKAYILDPNSPYIIDSIAWGYFKLGECKEAKMWMDKIQSDTKFMKEDEAKAHKTAIDKCFNKGTK >NC_022759.1|WP_023384762.1|653654_654026_+|YkgJ-family-cysteine-cluster-protein MLKKPGFDYCFDSSKCEVCGARCCTGDSGYIWINEAEMESLSSHLKLSLSEFKKLFTYRVGVRFSLKEKEYNGAYACLFFDENNKNCSVYEFRPKQCRTFPFWDYFKKHFNELEKECIGVERL >NC_022759.1|WP_023384761.1|652965_653661_+|methyltransferase-domain-containing-protein MKLFQLKDGYRYNSDSLFLYDFISKNKIFGNLLDVGCGCGILGLLLKRDFVNLNLSSIDIQEINSTITQLNADVNSLVATVICDDFSKFKSEMKFDFIVSNPPFYSDQITKSQKEHINISRYSSSLDPLSFFKCVNANLKPQGTLYFCYDARRVGEILPILSSFKLKLTKLRFVHSKVSESSKLVLFEAKKSSKSMCEIYPPLIVFDGNEFSDEAKEIFKKSDTKSEIYEC >NC_022759.1|WP_023384760.1|651046_652969_+|hypothetical-protein MKFRKFAKILFVVGTAFFILGCETKDEKALNQDKLKFSDLPMAEQDRYISKDELDKLGSYLTLLDNRNIDINSDEIPAKSVDELRDKIADLMQKNRLLFADNEELAKKNLEIITKLREQTSLRESENKLISAKYIDSMNEVEKQHYKNINDLTKKINEVQKENIQSIKSYEQKIIGLENKIDELEKELSKKDTNFNEKVSSATKDQLAKNKELSQKNSYLLEQTEILKKQADALSKELDSKLADKKTQIDTLKQTILTKDNKINDLLAAHTNEIIELQNKHSKALDDLKNELDRQKNDYFGELNLKNSELAKLNTDFKEYKLKKDEELKNAENRVLANYKNIETQRLNAIKSDYERIIFEQNRTIAAFEGKMINLELKFKKELETKDANYANTLENLKQKALFLKNDEDRLRVEFDKNITSLKSQIALKNAQISDLDSKLKELENEKNDIKKIQNYEILNNMITKLNAQNEELKNYAKNALDEAKKMVLEAESRAKEQNDKLKNYYEELIKNIKNQDNQLILSDINVNSKKFLAEVSCLSLDKSAKLNKDCETKLNDMIKKYGKERIYEIKAAISDFKFLGDDKAGELKNVNLLNLKSTKDMLNAASKAISSRIKDPMLAYSKDVLLEQGGYGFVIKVYE >NC_022759.1|WP_023384758.1|650083_651037_+|NADPH-oxidoreductase-flavodoxin-quinone-reductase-FqrB MENIYDVVVIGGGPFGIATVVEAKYNGFKNVLLLEKGDNHSQTIRKFYKDGKRVDKVYKGLDSQTHGNVEFFDGTKESTLNYFDNLLDSGKIDAVFNIEVESVKKDGDIFSIVTSKNTYKSKNVMIGIGRMGKPNKPEYKIPPSLTQIVNFNLNSCNCGENILVIGGGNSAAEYAIELSKCNTVTLCYRKEKFTRLNEINEAQVFEYFNDKKLNLKLGIDVISLDNENGKVKVNFSSNSSEIYDRIIYAIGGSTPVDFLQKCGIELNKDGEPIVDEHLQTNTPRLFVGGDIASKNGGSIVVALNDAHTVIDYIIKSK >NC_022759.1|WP_080669813.1|648781_650029_-|glutamate-5-semialdehyde-dehydrogenase MLLKEQAKMEKLLNNLKNSSKSLSIITQTQRENLIINISNEIMNAKDEILSANKLDLDLAQDLSSALKDRLKLTSKSIENLCDSIKNIANLKEVIGVIKDGWQTKSGLKIEKITVPLGNIATIYESRPNVTAEVAALCIKSANGCALKGGKEARNTNLAIIKAIHKALQKCDLDKNCVVYLDIDRSEVEKLIKMDKYLDLIVPRGGENLVKFVSQNATIPVLKHDKGLCHIYVDEFADLDKALNICVNAKCSRPGVCNAAETILVHEAVANEFIPNLKKSLDQFNVIIFGCKKIAKIIDCELANEQNYSTEYLDFKLNLKIVKNLEESLEHISEFSSGHSEAVISENYSICEMFLNLVNSACVYANASTRFSDGGEFGFGAEIGISTNKLHARGPVGLNELTTYKYIIRANGQIR >NC_022759.1|WP_023384755.1|647278_648622_+|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase-class-II MSKWNRDSWRDYNILQQPQYPDKNELKNAEDKLKSLPPLVFAGEVRNLKDELKNVTLGKSFLLQGGDCAESFSNFSANGIRDMFKIMLQMAIVLTFAGGCPVVKVGRVAGQFAKPRSSDFEDIDGVKLPSYRGDIINGFDFTKEARIPDPKRMIDAYYQSASTLNLLRAFSRGGLANLNEVHRWNLGFIKKAELDDKFEKLADELTGALKFMEACGVTTQNTPTLSETKLYTSHEALLLPYEEALTRVDSLTNEWYDCSAHMLWIGERTRGINDAHVHFLSGIKNPIGCKIGPDGKSSDIISLAQKLNPSNEPGRLNIIIRMGANKIEDRLPAILSDVKKEGLNILWSIDPMHGNTIKASSGFKTREFNNVMKEVKSFFEIHKSCGTIAGGVHLEMTGQDVTECVGGAFNVTEDSLGNRYETQCDPRLNADQALELAFLIADLVKKR >NC_022759.1|WP_023384767.1|659766_660027_+|ribbon-helix-helix-protein,-CopG-family MKSYCLKLDDDTFAQLNQIVKNSKTTMAEFIRNALEQKLKETKGSLSYRLTTLSYCDKKESDEILDSLKHLNDDELKIAKKETINL >NC_022759.1|WP_023384768.1|660023_660293_+|hypothetical-protein MKLEINYTKVSIKFFDKHKDIKDKFITNIGKFISGESVDIKALKGIEEPKLYRMRVGKFRVVFWINDKGELVIINVINADSRGGIYKGV >NC_022759.1|WP_023384769.1|660593_660869_+|hypothetical-protein MVNPTLTFGVDLSALGSALKEIDKRTDKLSQNLNQGLKDAQKSYNNLQYIKNPLKIEETIAKLNKLKADIKKATIAKFDLKIDNAKKARRA >NC_022759.1|WP_051349863.1|660986_663500_+|hypothetical-protein MDIEKELSNELNLPQMQIRASLQYLWDNHANDGMFKNKRDIYNTIKMLIGYQDYAGNSFKNPNMAYIATKTNDKRMSDMVISRDSAGVTHLNKDKKMSETDKNIFDSKSVVETPKSQRKQQVLGVQMNTSKEHYSPTNNRIIPQNSKQVKPTSEAGDDMIAITKLKNEIDELKATKQGGKYLSSQVKAEVIDKSNELGKLIDERISQGKSINQTLVSEYKAQIQRARYQASKEAKPTSAPVKTEVKTEPTTNKYLSGIKELEKVDYDSLNAHQKDIYDVFAGKKSSTILKVSDIDDLATLEQGSRNAGARKIMIKHAGVEKTGGLNGDELVDIEQTLLKGKIDNNSFETGDDFIRYSYAYNKNGTTLQVVINEFNNGKKIFDYYSDRNFIDYNKKPQVSGNTLTKNGATNGIIPQNIDNINPASEAQNFFKTLSEYNNLRDNIAKNNKKIDNEHFTLSKSIHNEINGNLSKIFNLVKERDIAAKSRLKKLETMFKFKGVTGNEALKDYLDDLTLIHFNSFSKEELDFIKLTKDKIIKSQGDILAGANKARSFRYGNLDTADDLKNKVFKLFSDLNIKANNFFELEPLLLSHSAKENELRHIVSLDTVSNARLAMEKEANITPIKEFGTNYAEFYHDGSNAIKKLLIEKQGQVAGAFEKEGLGDIDLVWGIEGTSHSDGYGLSKIAKYHPEAVDNLDNIISKGEFYKDEKGRLNIKYNDDIVGLRENWLGNETVPWIISSYTKKAETSKGFNSASSITPSKENYSFTTQHNNIIPQNTKFDNTPTFLNKYPKLIDDLKWDKTLKFSSAPKSKEELKARQAFLNEFKILSSKEKIDIKI >NC_022759.1|WP_023384775.1|666394_666709_+|hypothetical-protein MENRKFTIEFYEIEWFIDLQSHIDNGDSQLDIIQPITKTRDKRIARIFDIFAPETEYIDKAKEYKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NC_022759.1|WP_002850371.1|666895_667111_+|hypothetical-protein MSPAEFGLSEYESMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSVFKRYANVLNRVED >NC_022759.1|WP_080669814.1|667575_668298_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MDVKIYQLKVFLKLNQNVDFINSPEFLSTNLHKAMLGDEALRSIHMQRYLKPYSIGFLYSMKGKKDTFVSGEDMYFYVRSIDESFISKLRICLENSKNLGFNVYLSKFENLDIKQIDRLYTMSPATIVLKEGDKTIPWRRENSDITVLKEALISNLKNKYEYFLDKKIEIKDDIIELIEIKTNRAFAFRYKNGKIYAYRYQIHFSQNRLAQEFANIAMILGVGVKNTLGFGFCMRSNNAV >NC_022759.1|WP_023384778.1|668287_669979_+|hypothetical-protein MLFELLDEFKKQLEKNKHIVTQNHILKDGVYARISDEKCEIFYVKTITEKIGKTAQKRTILYKQNGDIALNDDMQWFEQADYLSFLWDMNKAVLPNKKFHSINFLSLFFKLEESEYVKENLEEYFDIFRDYSAFNKAKDKEILSFYMDYIKDENRQNLITNSVVLSKKYFNDINDFAVQNNFKKCYIKFFIDKDFEIYEKESQIYIDLKIYNSNEHNIKYNNEIFGLSNFNMGMNSKKPFLEHKNRLFKIPYAISQKDALASKMLFDWLGSQNKRIIRDFNSIFISKFNKQSKAVVSDFEYVPVDKNKFKFDKFKLKNFMNIENGEKEILSFDDFKQVIDEQLYHKCLFGNLYNDEIRVSKRISEDMQNLLYQTRCSMVEYFDKFNNNEFYYVIQKYSNDFIKIAMQDSEFGRLNGKKSINLLLSIKEIKGEKVDIDGIKNRVISALTDDNVTKLSGNEYYFLVGNLAMYLVSKSKTWKKTFALTDPYTKARNTKKLKMALFIDFDRYNYDIFLENGILKKAFSLAQNCEDIVMSNNDQQMVLIGMMTKNIIKKPGEKDEISE >NC_022759.1|WP_023384780.1|669962_670904_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-superfamily-protein-Cas7 MKLANRIYGIIGIKSTMANWNADFSGRPKSTGNGDIFASDKALKYPMKKMWESYGKNILFVKSLKQGKSKDGNDKLVPNTLGERYGLLFGDIKKAKSTKEVLSNLFNCIDVKNFGATFPEDGYNLSITGAVQIGQGFNKFGDINIEVQNILSPFADSRAKEKNENGEDASQSTLGTKIVTDEAHYFYGFCINPLAYNDYKEILGDDFGYDEDDYAEFKKAARFCATYFNSNSKFGCENEFAMFIETAVDAYLPDLSSYMDFICKDKNRSVNLEKIEKMIESSDVKKVEIYYNPLSLDVETKFDKFDIYSGNKI >NC_022759.1|WP_039363197.1|670903_671665_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAISFKLSGKFAHFKKPDVNEYVYFTYNNIPKPTLLGLLGAIIGLKGYAQKTYNNKKDKKSLLNNENRSNEPEFYERLKHLKICIIPLVKYGKFSKKIQVFNNSVGYASTEEGGNLIVREQWLENPSWQILIEDDGSVEFETISQYLFDKKAKFIPYLGKNDHFADISEVEKIDLAESKKDKIVIKSLFFDNLAKQVDDPDDEISYLFNEFYPIGFNELMFYKLEKTTFTNQICQAMDGKWYEFKDGTICFF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022759_3 | 664068-665873 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_022759_3
|
27 spacers
spacers of NC_022759_3
>3.1|664098|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTAACTACGCTCTTGATAGCTTTAAGGCTCTAGG >3.2|664164|37|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTT >3.3|664231|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCT >3.4|664296|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCT >3.5|664361|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTCAGAGCATTTATAAAAGCCTAAATTAGGCTT >3.6|664426|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCAAAAAAATGCTAAAGCTTTCACTACTTGGAAAA >3.7|664492|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCAATCCACTTTAAAACTCTATTTTTAAAAAACT >3.8|664558|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGCAGACTGCTGTCGTCCAGCTCTGAAATTTTTC >3.9|664624|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTAAGTCCCAAAAATCCGGACTTTTAGTAATAC >3.10|664690|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAAATTCGCCGTATCTTTGGAGTTTGGCGGTTCT >3.11|664756|37|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTAGCAGGTTTTATAGGACATTGCGTTGTGGAA >3.12|664823|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATGAAAATGGCGAGAGACTTTTAACAAAGGCGG >3.13|664889|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATGAAAATGGAGAGAGACTTTTAACAAAGGCGG >3.14|664955|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTGGCTTCCATTCCAAAAGACCACATTAGCCAT >3.15|665020|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGCTTAATACAACTTTTAGCAATATTATTATAAA >3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTAAATCAATATTCTTATTTTTAATTTCGCTT >3.17|665150|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGGCATCTTTAATGGCTTTTTTATATGTGTCTAAA >3.18|665216|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAATTCTCTAGAAATAGAAAATCTTTTTCTACTC >3.19|665282|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTGAGCATTAGTAATACTCTTAGAAGTAGTAAGA >3.20|665348|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGTTTTCATCTTGTCTCCTTTTTTTCTTAAAAT >3.21|665413|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGATACAAAGCGTGGTTGGTAGATATTATATTTC >3.22|665478|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATAGAATGTGTTTTTATTGTACTTTCTAGCAGGT >3.23|665544|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGCAAACGCACTTTTAAAGGCTGGAGACGCTATA >3.24|665609|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTTAGATTTGCGTTCTATTTTATAGATAGTAACG >3.25|665675|37|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATATCTAAAATCATCGCTTAAATGACGTTTATC >3.26|665742|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGAAGTTTCGAAATCGACTTCTGTTTTAGCGTCG >3.27|665808|36|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT CCTTGATTTTTGTATAGAGTTGGTTTTATGTCAATC |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022759_3
The CRISPR arrays of NC_022759_3 >merge|NC_022759|3|664068-665873|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAGTAACTACGCTCTTGATAGCTTTAAGGCTCTAGGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATGTCAGAGCATTTATAAAAGCCTAAATTAGGCTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCCAAAAAAATGCTAAAGCTTTCACTACTTGGAAAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTCAATCCACTTTAAAACTCTATTTTTAAAAAACTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTGCAGACTGCTGTCGTCCAGCTCTGAAATTTTTCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTGTTAAGTCCCAAAAATCCGGACTTTTAGTAATACGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCAAAATTCGCCGTATCTTTGGAGTTTGGCGGTTCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAATTTAGCAGGTTTTATAGGACATTGCGTTGTGGAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTGATGAAAATGGCGAGAGACTTTTAACAAAGGCGGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTGATGAAAATGGAGAGAGACTTTTAACAAAGGCGGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTTGGCTTCCATTCCAAAAGACCACATTAGCCATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGGCTTAATACAACTTTTAGCAATATTATTATAAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTTTAAATCAATATTCTTATTTTTAATTTCGCTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGCGGCATCTTTAATGGCTTTTTTATATGTGTCTAAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGCAAATTCTCTAGAAATAGAAAATCTTTTTCTACTCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCTTTGAGCATTAGTAATACTCTTAGAAGTAGTAAGAGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACGCTGTTTTCATCTTGTCTCCTTTTTTTCTTAAAATGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACATGATACAAAGCGTGGTTGGTAGATATTATATTTCGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACTCATAGAATGTGTTTTTATTGTACTTTCTAGCAGGTGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACTAGCAAACGCACTTTTAAAGGCTGGAGACGCTATAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAGTTAGATTTGCGTTCTATTTTATAGATAGTAACGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTTAAACTTTTATATCTAAAATCATCGCTTAAATGACGTTTATCGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACAGAGAAGTTTCGAAATCGACTTCTGTTTTAGCGTCGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCCTTGATTTTTGTATAGAGTTGGTTTTATGTCAATCGTTTGCTAATCACAAAGCTCGTATTAAAAT >NC_022759|3|2|664068-665807|PILER-CR GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGTAACTACGCTCTTGATAGCTTTAAGGCTCTAGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATGTCAGAGCATTTATAAAAGCCTAAATTAGGCTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCCAAAAAAATGCTAAAGCTTTCACTACTTGGAAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTCAATCCACTTTAAAACTCTATTTTTAAAAAACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTGCAGACTGCTGTCGTCCAGCTCTGAAATTTTTC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTGTTAAGTCCCAAAAATCCGGACTTTTAGTAATAC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCAAAATTCGCCGTATCTTTGGAGTTTGGCGGTTCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAATTTAGCAGGTTTTATAGGACATTGCGTTGTGGAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTGATGAAAATGGCGAGAGACTTTTAACAAAGGCGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTGATGAAAATGGAGAGAGACTTTTAACAAAGGCGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTTGGCTTCCATTCCAAAAGACCACATTAGCCAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGGCTTAATACAACTTTTAGCAATATTATTATAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTTTAAATCAATATTCTTATTTTTAATTTCGCTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GCGGCATCTTTAATGGCTTTTTTATATGTGTCTAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GCAAATTCTCTAGAAATAGAAAATCTTTTTCTACTC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTTTGAGCATTAGTAATACTCTTAGAAGTAGTAAGA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC GCTGTTTTCATCTTGTCTCCTTTTTTTCTTAAAAT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ATGATACAAAGCGTGGTTGGTAGATATTATATTTC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC TCATAGAATGTGTTTTTATTGTACTTTCTAGCAGGT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC TAGCAAACGCACTTTTAAAGGCTGGAGACGCTATA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAGTTAGATTTGCGTTCTATTTTATAGATAGTAACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTTAAAC TTTTATATCTAAAATCATCGCTTAAATGACGTTTATC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AGAGAAGTTTCGAAATCGACTTCTGTTTTAGCGTCG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC >NC_022759|3|3|664068-665873|CRISPRCasFinder GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGTAACTACGCTCTTGATAGCTTTAAGGCTCTAGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC 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GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GCGGCATCTTTAATGGCTTTTTTATATGTGTCTAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GCAAATTCTCTAGAAATAGAAAATCTTTTTCTACTC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTTTGAGCATTAGTAATACTCTTAGAAGTAGTAAGA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC GCTGTTTTCATCTTGTCTCCTTTTTTTCTTAAAAT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ATGATACAAAGCGTGGTTGGTAGATATTATATTTC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC TCATAGAATGTGTTTTTATTGTACTTTCTAGCAGGT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC TAGCAAACGCACTTTTAAAGGCTGGAGACGCTATA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAGTTAGATTTGCGTTCTATTTTATAGATAGTAACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTTAAAC TTTTATATCTAAAATCATCGCTTAAATGACGTTTATC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AGAGAAGTTTCGAAATCGACTTCTGTTTTAGCGTCG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CCTTGATTTTTGTATAGAGTTGGTTTTATGTCAATC GTTTGCTAATCACAAAGCTCGTATTAAAAT >NC_022759|3|2|664068-665873|CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGTAACTACGCTCTTGATAGCTTTAAGGCTCTAGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC 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GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GCAAATTCTCTAGAAATAGAAAATCTTTTTCTACTC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTTTGAGCATTAGTAATACTCTTAGAAGTAGTAAGA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC GCTGTTTTCATCTTGTCTCCTTTTTTTCTTAAAAT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ATGATACAAAGCGTGGTTGGTAGATATTATATTTC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC TCATAGAATGTGTTTTTATTGTACTTTCTAGCAGGT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC TAGCAAACGCACTTTTAAAGGCTGGAGACGCTATA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAGTTAGATTTGCGTTCTATTTTATAGATAGTAACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTTAAAC TTTTATATCTAAAATCATCGCTTAAATGACGTTTATC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AGAGAAGTTTCGAAATCGACTTCTGTTTTAGCGTCG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CCTTGATTTTTGTATAGAGTTGGTTTTATGTCAATC GTTTGCTAATCACAAAGCTCGTATTAAAAT
>NC_022759.1|WP_051349863.1|660986_663500_+|hypothetical-protein MDIEKELSNELNLPQMQIRASLQYLWDNHANDGMFKNKRDIYNTIKMLIGYQDYAGNSFKNPNMAYIATKTNDKRMSDMVISRDSAGVTHLNKDKKMSETDKNIFDSKSVVETPKSQRKQQVLGVQMNTSKEHYSPTNNRIIPQNSKQVKPTSEAGDDMIAITKLKNEIDELKATKQGGKYLSSQVKAEVIDKSNELGKLIDERISQGKSINQTLVSEYKAQIQRARYQASKEAKPTSAPVKTEVKTEPTTNKYLSGIKELEKVDYDSLNAHQKDIYDVFAGKKSSTILKVSDIDDLATLEQGSRNAGARKIMIKHAGVEKTGGLNGDELVDIEQTLLKGKIDNNSFETGDDFIRYSYAYNKNGTTLQVVINEFNNGKKIFDYYSDRNFIDYNKKPQVSGNTLTKNGATNGIIPQNIDNINPASEAQNFFKTLSEYNNLRDNIAKNNKKIDNEHFTLSKSIHNEINGNLSKIFNLVKERDIAAKSRLKKLETMFKFKGVTGNEALKDYLDDLTLIHFNSFSKEELDFIKLTKDKIIKSQGDILAGANKARSFRYGNLDTADDLKNKVFKLFSDLNIKANNFFELEPLLLSHSAKENELRHIVSLDTVSNARLAMEKEANITPIKEFGTNYAEFYHDGSNAIKKLLIEKQGQVAGAFEKEGLGDIDLVWGIEGTSHSDGYGLSKIAKYHPEAVDNLDNIISKGEFYKDEKGRLNIKYNDDIVGLRENWLGNETVPWIISSYTKKAETSKGFNSASSITPSKENYSFTTQHNNIIPQNTKFDNTPTFLNKYPKLIDDLKWDKTLKFSSAPKSKEELKARQAFLNEFKILSSKEKIDIKI >NC_022759.1|WP_023384769.1|660593_660869_+|hypothetical-protein MVNPTLTFGVDLSALGSALKEIDKRTDKLSQNLNQGLKDAQKSYNNLQYIKNPLKIEETIAKLNKLKADIKKATIAKFDLKIDNAKKARRA >NC_022759.1|WP_023384768.1|660023_660293_+|hypothetical-protein MKLEINYTKVSIKFFDKHKDIKDKFITNIGKFISGESVDIKALKGIEEPKLYRMRVGKFRVVFWINDKGELVIINVINADSRGGIYKGV >NC_022759.1|WP_023384767.1|659766_660027_+|ribbon-helix-helix-protein,-CopG-family MKSYCLKLDDDTFAQLNQIVKNSKTTMAEFIRNALEQKLKETKGSLSYRLTTLSYCDKKESDEILDSLKHLNDDELKIAKKETINL >NC_022759.1|WP_023384766.1|656569_657307_+|peroxide-stress-protein-YaaA MKILFSPSESKMSGGSMDTPINFSWVFPNLNDKRLEILEIYNGFLKKANKNELQTLFGLKKENELEYYSSDLFSRPLMKAILRYNGVAYEHLNYRNLDESSRKIIDENTIIFSNLYGAILAKDMICDYKLKQGETIGGFRTEVFYKKYFSSVLDDFLDFDILDLRAGFYEKFYSITKPHTTIKFLKNGKVVSHFAKAYRGIVLRYIALNQISSLDEFYNMQIPNLKINKIIKNRLKTEIIVDIIG >NC_022759.1|WP_023384765.1|656069_656573_+|HIT-domain-containing-protein MKHEFSPWRAEYFKTRKDGVMEHNCVFCDIAQNSQNDEENFVLFRAKNCFAVMNRYPYTLGEFMIIPYIHTDNIENLDKNIWFEMSDLVQLGVGVLKESLNANGVNIGMNLGSAAGAGIAEHIHYHVVPRWSRDTNFITTIAYTRVHGVPFLDQYHALKQAFQKVLK >NC_022759.1|WP_023384764.1|655293_656070_+|indole-3-glycerol-phosphate-synthase-TrpC MILDEIISKTKINLENIKEKLPLCKLENALTSSYVPRDVKQVLKQKNSINIIAEIKKASPSKGVIREDFDPLEIAFEYEKAGVSAFSILTEPFYFQGSLEYMALVRRYTNTPILRKDFIVDIYQIAEARLYGADFILLIAKALDKFYLKTLFEYAKSLNLEVLMEIHDEIDLEKALFVDADIIGINHRNLQTFDMDMELCVKLMPLIPGGKIIVAESGLYSNSDLVNLKKQGADAFLIGEHFMRQKSIYNAVKDMKGE >NC_022759.1|WP_039362186.1|654136_655297_+|hypothetical-protein MKGFYLLGDAKSKDALEVFYTLYKTTKKPIFLKESLKIAFVIKDERLDELITDARSVLNGDYDAIRIEIGYYILKSQIKEAKELALNLIQKESGNSINHSILATIYLFNDEPIRALKEFKKAYEIDDSEENLLKLVDMLDNKLDRTNEAIRYLNNWIEENGCSKPVCFTLLNIYSAKGELDLMTEMYIKLYEAYEESDFLNRALEILLYKKDVVTAKELLEKYGFNEPILMGIYAELKEFQKAYDVAQDLYSRSQNPEYMARMAIYKYEQSSKNISKFELDMVVKLFEGSVYALNSPLYFNYYGYLLIDYGIDVKKGLDIVKKAYILDPNSPYIIDSIAWGYFKLGECKEAKMWMDKIQSDTKFMKEDEAKAHKTAIDKCFNKGTK >NC_022759.1|WP_023384762.1|653654_654026_+|YkgJ-family-cysteine-cluster-protein MLKKPGFDYCFDSSKCEVCGARCCTGDSGYIWINEAEMESLSSHLKLSLSEFKKLFTYRVGVRFSLKEKEYNGAYACLFFDENNKNCSVYEFRPKQCRTFPFWDYFKKHFNELEKECIGVERL >NC_022759.1|WP_023384761.1|652965_653661_+|methyltransferase-domain-containing-protein MKLFQLKDGYRYNSDSLFLYDFISKNKIFGNLLDVGCGCGILGLLLKRDFVNLNLSSIDIQEINSTITQLNADVNSLVATVICDDFSKFKSEMKFDFIVSNPPFYSDQITKSQKEHINISRYSSSLDPLSFFKCVNANLKPQGTLYFCYDARRVGEILPILSSFKLKLTKLRFVHSKVSESSKLVLFEAKKSSKSMCEIYPPLIVFDGNEFSDEAKEIFKKSDTKSEIYEC >NC_022759.1|WP_023384775.1|666394_666709_+|hypothetical-protein MENRKFTIEFYEIEWFIDLQSHIDNGDSQLDIIQPITKTRDKRIARIFDIFAPETEYIDKAKEYKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NC_022759.1|WP_002850371.1|666895_667111_+|hypothetical-protein MSPAEFGLSEYESMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSVFKRYANVLNRVED >NC_022759.1|WP_080669814.1|667575_668298_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MDVKIYQLKVFLKLNQNVDFINSPEFLSTNLHKAMLGDEALRSIHMQRYLKPYSIGFLYSMKGKKDTFVSGEDMYFYVRSIDESFISKLRICLENSKNLGFNVYLSKFENLDIKQIDRLYTMSPATIVLKEGDKTIPWRRENSDITVLKEALISNLKNKYEYFLDKKIEIKDDIIELIEIKTNRAFAFRYKNGKIYAYRYQIHFSQNRLAQEFANIAMILGVGVKNTLGFGFCMRSNNAV >NC_022759.1|WP_023384778.1|668287_669979_+|hypothetical-protein MLFELLDEFKKQLEKNKHIVTQNHILKDGVYARISDEKCEIFYVKTITEKIGKTAQKRTILYKQNGDIALNDDMQWFEQADYLSFLWDMNKAVLPNKKFHSINFLSLFFKLEESEYVKENLEEYFDIFRDYSAFNKAKDKEILSFYMDYIKDENRQNLITNSVVLSKKYFNDINDFAVQNNFKKCYIKFFIDKDFEIYEKESQIYIDLKIYNSNEHNIKYNNEIFGLSNFNMGMNSKKPFLEHKNRLFKIPYAISQKDALASKMLFDWLGSQNKRIIRDFNSIFISKFNKQSKAVVSDFEYVPVDKNKFKFDKFKLKNFMNIENGEKEILSFDDFKQVIDEQLYHKCLFGNLYNDEIRVSKRISEDMQNLLYQTRCSMVEYFDKFNNNEFYYVIQKYSNDFIKIAMQDSEFGRLNGKKSINLLLSIKEIKGEKVDIDGIKNRVISALTDDNVTKLSGNEYYFLVGNLAMYLVSKSKTWKKTFALTDPYTKARNTKKLKMALFIDFDRYNYDIFLENGILKKAFSLAQNCEDIVMSNNDQQMVLIGMMTKNIIKKPGEKDEISE >NC_022759.1|WP_023384780.1|669962_670904_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-superfamily-protein-Cas7 MKLANRIYGIIGIKSTMANWNADFSGRPKSTGNGDIFASDKALKYPMKKMWESYGKNILFVKSLKQGKSKDGNDKLVPNTLGERYGLLFGDIKKAKSTKEVLSNLFNCIDVKNFGATFPEDGYNLSITGAVQIGQGFNKFGDINIEVQNILSPFADSRAKEKNENGEDASQSTLGTKIVTDEAHYFYGFCINPLAYNDYKEILGDDFGYDEDDYAEFKKAARFCATYFNSNSKFGCENEFAMFIETAVDAYLPDLSSYMDFICKDKNRSVNLEKIEKMIESSDVKKVEIYYNPLSLDVETKFDKFDIYSGNKI >NC_022759.1|WP_039363197.1|670903_671665_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAISFKLSGKFAHFKKPDVNEYVYFTYNNIPKPTLLGLLGAIIGLKGYAQKTYNNKKDKKSLLNNENRSNEPEFYERLKHLKICIIPLVKYGKFSKKIQVFNNSVGYASTEEGGNLIVREQWLENPSWQILIEDDGSVEFETISQYLFDKKAKFIPYLGKNDHFADISEVEKIDLAESKKDKIVIKSLFFDNLAKQVDDPDDEISYLFNEFYPIGFNELMFYKLEKTTFTNQICQAMDGKWYEFKDGTICFF >NC_022759.1|WP_051349890.1|671817_674043_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MILEFFDDFIINHDLGKMNPAFQRFKMENKEFNEASGESTHSNHSFNKLKDKYRDFFSNSTDQDIDKIICVFYYLLSNVLNHHGHLKDGFDDKYLKISDKEEDFDTLDKKFYNSKKRTDFDFELFILIKLHFSLLIASDFYATSEYMNDIKIDDFGVFDKDKKEIIYSKFREFYSSLKPRSDIDILRSDIFQKSSKTLYDNLDKNIFYLEAPTGSGKTLTSLNLALNLLNLNSNLNKIFYVFPFNTLISQSKSIFESIFGDEFDISVINSITPPKFNKGNDQENSESKYDKTYINRVFYNHPFILTSHVALFKTLFGISKEENYGLFSLANSVIILDEIQSYRSNLWEFMALFFDSFAKHLNIKFIIMSATLPKISNLLKNNDDKWCDLLANSNYFQNTLFKDRVKVDFSLLEIGQDELFETIVSKIKEHKKDKILVEFIKKSSARDFYNFIRFKFDGYDIFELSGDDNKLYQKIVIAKLKNSNTKAIVVATQVIEAGVDIDMDIGFKDIATFESEEQFLGRINRSALKPGSLAYFFDYDNASMIYKNDSRIKFSLKDDGLKKCLIDKNFNPYYEKLLYELKCENSRVNGGFNSVRENFQKYISSINFIKISENMQLINDDRVRIFLPFKIDVSDFDMSEYGDVEHFMDGNFLDGKKIWEAIICLNEVKEYGKRKIEALSLNSLADIFSFNVFMVDDLLSISSQMRYGYIYIEDCDGFIDENGKFDRTAFAKKFNNEDLLL >NC_022759.1|WP_023384785.1|674039_674525_+|Dna2/Cas4-domain-containing-protein MKITGTLINYFFHCKRQCYLFYNRINLEDNSEDVKIGKVLHEIKFEDEIKFENIALDKITDEYVIEFKKSDSDETASMWQLLFYLKKLKEIGILRKGLLEFGENRNLPTKRLKVELTTHKELELEQIYSQISELMSLKTPPDPLKSSLKCKKCAYFNYCFI >NC_022759.1|WP_023384787.1|674533_675535_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MPKLHTRYIFSMGELSRKDNSLAFKNEKGTTYIPIVGIREIYCMNEVSMNSKLFDFLAKNGITIHFFNYYGNYSGSFYPKKHLISGRIITSQVEALATRNIIAKSIVKGIALNMHEVLYHYYRHGKTELKPLLDYLKLKVPNMLINANTIPQIMFIEGQIWSKFYDSFELFLDESFSLAKRVKRPPDNPMNAMISFGNSLLYTKTISAIYQTHLEQSISYLHESSDARFSLSLDLSEVFKPIIVFKTVFELINLKKINIKKHFEKKVEFCLLNEAGRKIFVESFEERLNESFLHSKLGRKVSYKTALKLEGYKLIKFICEAREFIPFSLKDKR >NC_022759.1|WP_023384789.1|675531_675831_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MTNYNYAYVFYDISDKESEAGKRRVAKVFKLCKKYFLHHQKSVFKGEITPSNFIKFKSAVEKLIDKNIDVITILRLIRKDDIDEMTLGGLDFVKNEMFL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022759_4 | 676333-677478 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_022759_4
|
17 spacers
spacers of NC_022759_4
>4.1|676363|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGAAGCAAGGCTTAAAAATGTTCGCAGATGGTG >4.2|676428|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT >4.3|676494|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA >4.4|676560|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT >4.5|676625|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT >4.6|676690|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA >4.7|676756|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG >4.8|676822|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT >4.9|676888|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG >4.10|676954|41|NC_022759|PILER-CR GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCCAGTTTG >4.11|677025|37|NC_022759|PILER-CR TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT >4.12|677092|35|NC_022759|PILER-CR TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT >4.13|677157|36|NC_022759|PILER-CR AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA >4.14|677223|37|NC_022759|PILER-CR TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT >4.15|677290|36|NC_022759|PILER-CR TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG >4.16|676954|35|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCC >4.17|677019|37|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT >4.18|677086|35|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT >4.19|677151|36|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA >4.20|677217|37|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT >4.21|677284|36|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG >4.22|677350|36|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT AAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTAT >4.23|677416|33|NC_022759|CRISPRCasFinder,CRT CCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022759_4
The CRISPR arrays of NC_022759_4 >merge|NC_022759|4|676333-677478|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGAGAAGCAAGGCTTAAAAATGTTCGCAGATGGTGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCCAGTTTGTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCTGTTTACTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACGGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACAAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAATCCCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTAGTTTACTAATCACAAAGTTTATATTAAAAT >NC_022759|4|3|676333-677349|PILER-CR GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAGAAGCAAGGCTTAAAAATGTTCGCAGATGGTG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCCAGTTTG TAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTAAT TTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCTGTTTAC TAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTGCC ATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCATGTTTGC TAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTGGG GGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACAGTTTGC TAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTTTG CTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGTGTTTGC TAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAAGTA ATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACGGTTTGC TAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC >NC_022759|4|4|676333-677478|CRISPRCasFinder GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAGAAGCAAGGCTTAAAAATGTTCGCAGATGGTG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCC AGTTTGTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT GTTTACTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAATC CCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTA GTTTACTAATCACAAAGTTTATATTAAAAT >NC_022759|4|3|676333-677478|CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAGAAGCAAGGCTTAAAAATGTTCGCAGATGGTG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCC AGTTTGTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT GTTTACTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAATC CCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTA GTTTACTAATCACAAAGTTTATATTAAAAT
>NC_022759.1|WP_023384789.1|675531_675831_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MTNYNYAYVFYDISDKESEAGKRRVAKVFKLCKKYFLHHQKSVFKGEITPSNFIKFKSAVEKLIDKNIDVITILRLIRKDDIDEMTLGGLDFVKNEMFL >NC_022759.1|WP_023384787.1|674533_675535_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MPKLHTRYIFSMGELSRKDNSLAFKNEKGTTYIPIVGIREIYCMNEVSMNSKLFDFLAKNGITIHFFNYYGNYSGSFYPKKHLISGRIITSQVEALATRNIIAKSIVKGIALNMHEVLYHYYRHGKTELKPLLDYLKLKVPNMLINANTIPQIMFIEGQIWSKFYDSFELFLDESFSLAKRVKRPPDNPMNAMISFGNSLLYTKTISAIYQTHLEQSISYLHESSDARFSLSLDLSEVFKPIIVFKTVFELINLKKINIKKHFEKKVEFCLLNEAGRKIFVESFEERLNESFLHSKLGRKVSYKTALKLEGYKLIKFICEAREFIPFSLKDKR >NC_022759.1|WP_023384785.1|674039_674525_+|Dna2/Cas4-domain-containing-protein MKITGTLINYFFHCKRQCYLFYNRINLEDNSEDVKIGKVLHEIKFEDEIKFENIALDKITDEYVIEFKKSDSDETASMWQLLFYLKKLKEIGILRKGLLEFGENRNLPTKRLKVELTTHKELELEQIYSQISELMSLKTPPDPLKSSLKCKKCAYFNYCFI >NC_022759.1|WP_051349890.1|671817_674043_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MILEFFDDFIINHDLGKMNPAFQRFKMENKEFNEASGESTHSNHSFNKLKDKYRDFFSNSTDQDIDKIICVFYYLLSNVLNHHGHLKDGFDDKYLKISDKEEDFDTLDKKFYNSKKRTDFDFELFILIKLHFSLLIASDFYATSEYMNDIKIDDFGVFDKDKKEIIYSKFREFYSSLKPRSDIDILRSDIFQKSSKTLYDNLDKNIFYLEAPTGSGKTLTSLNLALNLLNLNSNLNKIFYVFPFNTLISQSKSIFESIFGDEFDISVINSITPPKFNKGNDQENSESKYDKTYINRVFYNHPFILTSHVALFKTLFGISKEENYGLFSLANSVIILDEIQSYRSNLWEFMALFFDSFAKHLNIKFIIMSATLPKISNLLKNNDDKWCDLLANSNYFQNTLFKDRVKVDFSLLEIGQDELFETIVSKIKEHKKDKILVEFIKKSSARDFYNFIRFKFDGYDIFELSGDDNKLYQKIVIAKLKNSNTKAIVVATQVIEAGVDIDMDIGFKDIATFESEEQFLGRINRSALKPGSLAYFFDYDNASMIYKNDSRIKFSLKDDGLKKCLIDKNFNPYYEKLLYELKCENSRVNGGFNSVRENFQKYISSINFIKISENMQLINDDRVRIFLPFKIDVSDFDMSEYGDVEHFMDGNFLDGKKIWEAIICLNEVKEYGKRKIEALSLNSLADIFSFNVFMVDDLLSISSQMRYGYIYIEDCDGFIDENGKFDRTAFAKKFNNEDLLL >NC_022759.1|WP_039363197.1|670903_671665_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAISFKLSGKFAHFKKPDVNEYVYFTYNNIPKPTLLGLLGAIIGLKGYAQKTYNNKKDKKSLLNNENRSNEPEFYERLKHLKICIIPLVKYGKFSKKIQVFNNSVGYASTEEGGNLIVREQWLENPSWQILIEDDGSVEFETISQYLFDKKAKFIPYLGKNDHFADISEVEKIDLAESKKDKIVIKSLFFDNLAKQVDDPDDEISYLFNEFYPIGFNELMFYKLEKTTFTNQICQAMDGKWYEFKDGTICFF >NC_022759.1|WP_023384780.1|669962_670904_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-superfamily-protein-Cas7 MKLANRIYGIIGIKSTMANWNADFSGRPKSTGNGDIFASDKALKYPMKKMWESYGKNILFVKSLKQGKSKDGNDKLVPNTLGERYGLLFGDIKKAKSTKEVLSNLFNCIDVKNFGATFPEDGYNLSITGAVQIGQGFNKFGDINIEVQNILSPFADSRAKEKNENGEDASQSTLGTKIVTDEAHYFYGFCINPLAYNDYKEILGDDFGYDEDDYAEFKKAARFCATYFNSNSKFGCENEFAMFIETAVDAYLPDLSSYMDFICKDKNRSVNLEKIEKMIESSDVKKVEIYYNPLSLDVETKFDKFDIYSGNKI >NC_022759.1|WP_023384778.1|668287_669979_+|hypothetical-protein MLFELLDEFKKQLEKNKHIVTQNHILKDGVYARISDEKCEIFYVKTITEKIGKTAQKRTILYKQNGDIALNDDMQWFEQADYLSFLWDMNKAVLPNKKFHSINFLSLFFKLEESEYVKENLEEYFDIFRDYSAFNKAKDKEILSFYMDYIKDENRQNLITNSVVLSKKYFNDINDFAVQNNFKKCYIKFFIDKDFEIYEKESQIYIDLKIYNSNEHNIKYNNEIFGLSNFNMGMNSKKPFLEHKNRLFKIPYAISQKDALASKMLFDWLGSQNKRIIRDFNSIFISKFNKQSKAVVSDFEYVPVDKNKFKFDKFKLKNFMNIENGEKEILSFDDFKQVIDEQLYHKCLFGNLYNDEIRVSKRISEDMQNLLYQTRCSMVEYFDKFNNNEFYYVIQKYSNDFIKIAMQDSEFGRLNGKKSINLLLSIKEIKGEKVDIDGIKNRVISALTDDNVTKLSGNEYYFLVGNLAMYLVSKSKTWKKTFALTDPYTKARNTKKLKMALFIDFDRYNYDIFLENGILKKAFSLAQNCEDIVMSNNDQQMVLIGMMTKNIIKKPGEKDEISE >NC_022759.1|WP_080669814.1|667575_668298_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MDVKIYQLKVFLKLNQNVDFINSPEFLSTNLHKAMLGDEALRSIHMQRYLKPYSIGFLYSMKGKKDTFVSGEDMYFYVRSIDESFISKLRICLENSKNLGFNVYLSKFENLDIKQIDRLYTMSPATIVLKEGDKTIPWRRENSDITVLKEALISNLKNKYEYFLDKKIEIKDDIIELIEIKTNRAFAFRYKNGKIYAYRYQIHFSQNRLAQEFANIAMILGVGVKNTLGFGFCMRSNNAV >NC_022759.1|WP_002850371.1|666895_667111_+|hypothetical-protein MSPAEFGLSEYESMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSVFKRYANVLNRVED >NC_022759.1|WP_023384775.1|666394_666709_+|hypothetical-protein MENRKFTIEFYEIEWFIDLQSHIDNGDSQLDIIQPITKTRDKRIARIFDIFAPETEYIDKAKEYKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NC_022759.1|WP_023384791.1|677787_678099_+|hypothetical-protein MEKRKLYICIDEKGWHITDDNKKNSWLNDDELDGSFAEVFGVNGKIGFLGEWAWNDNFLNLTSDKLNEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NC_022759.1|WP_023384792.1|678285_678501_+|hypothetical-protein MSPEEFGLSQYERMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSVFKRYANVLNKVED >NC_022759.1|WP_023384796.1|679241_680687_+|acetyl-CoA-carboxylase-biotin-carboxylase-subunit MIHKILIANRGEIAVRIVRACKDLHIKNVAIYTEPDRECLHVKVADEAYQIGKDPIKGYLDSKRIVEVAKACGADAIHPGYGFLSENYEFAKEVEDAGLIFIGPNSDIIRKMGNKNIARFLMKKNGIPVVPGTEKLNSETIETIKDYAMKIGYPVILKASGGGGGRGIREVWNEDELESNYESCKREAKAFFNNDEVFMEKFIEKPRHIEFQILGDNYGNLIHLCERDCSIQRRHQKVIEIAPCPTISEDLRKRMGVAAVAAAKAVGYTNAGTIEFLLDDYNNFYFMEMNTRIQVEHGVTEEITGVDLISRQIRIAAGEILDIEQSEVRPQGVSIEARITAENVWKNFAPSPGRITGYFPALGPGVRVDSHIYQDYAIPPFYDSLVAKLIVKGTSYDLAVSKLERALDEFKIEGVRTTLPFLLAISKRRHFRRGFFDTSYIEERLQDILENTQDHHQENKEEVIAAIAAAIKKVKEDRAKE >NC_022759.1|WP_023384797.1|680693_680930_+|hypothetical-protein MNDFFDSLKNIKNELVKEQKSQEVKVPKKPKPNPNRDEFKDIFTEPNEIEMPDAKEHRLKDEFLEFIKHSDVKKLERD >NC_022759.1|WP_039362197.1|680916_681633_+|arginyltransferase MREIDFCTLDTLCPYLKDRNSRSMYRYVSQCSFDYNSNLVKHGYRRFGSYFSKPVCDGCDECKSIRIDAFNFKFTKSHRRIINKNSNTKIVVSKPYISQKHIDLYEKYHKFMHEKRGWEYYDLDFRRYYSVYVEGAGDFGYEIDYFVDDELVCVDLVDIVDDGISSIYCYWDIDFAHLSLGKFSLLNQIKIALKNDLRWIYLGFYVKDCASLAYKGEYKPYETLKKYCDMDEKPIWEF >NC_022759.1|WP_023384799.1|681688_682513_+|adenylosuccinate-lyase MQITQTLESITITTDDCDLFLNLSNKIRQSFANAIGNRDKVIIFYNENELVQRKYFLKLIGKIYANSVGKGIDFLLTHHKNIKLVYKKPNSLQILINVDVKFENSRVVFDLKNSEELFTKYLIRGLGDTRHEYFESKKILVISPKTTENVELLDNILNFREHLKYIVNFNYDKKSYDEFKKRAKILTSKTYIRRFSMLANLLEEHFETLGCKATDDFETVRTNYLNLTKVYHPDKHVGEPNEVQKSYIDKFQKIGLAYEALKPYFKEQKSFISA >NC_022759.1|WP_023384800.1|682557_683331_+|pyridoxine-5'-phosphate-synthase MKLGVNIDHVAVLREARAVNDPQIIHAMFEAVSGGADQITIHLREDRRHINEDDVKNIINLSPIPVNLECSISSEIIDIVCALKPHRATIVPEKREELTTEGGLSLDSLNLKNVISKLNDNDIKVSLFIDPKKNDVTVSKELGATCVELHTGAYANTFLMLNSNLNHTKYKINSLNLKRSELEILLNSELTRIKEAANLGINLGLEVAAGHGLNYQNVIAIAAIKDIFELNIGQSIVAKSVFVGLKNAVKEMMELVK >NC_022759.1|WP_023384801.1|683327_684251_+|4-hydroxy-L-threonine-phosphate-dehydrogenase-NAD-dependent MNLPKIAISVGDINGVGIEIALKSHNEIKNICSPVYFINNELLNSAANILKFTIPNDFEIFECGNSFNIKPGHVSKKSGKFSFVSFQNALLYTQNKHAQALVTMPINKESWKKAGVPYVGHTDALGKYFGKNAIMMLGCEELFVALYTDHLALKDVSAKIKAKNLALFLVDFYNSSKFENIGVLGFNPHASDNETIGGKEEKEIIKAIKLANNRLKKEVFTGPLVPDAAFTKSSLKRCNRLVSMYHDVGLAPLKALYFDKSINVSLNLPIVRTSVDHGTAFDIAYKGKAEIKSYIEAIKFAIKSCGY >NC_022759.1|WP_051349891.1|684385_685867_+|inorganic-phosphate-transporter MWGYNYIPSNHLLLFILASIFGLFMAFNIGGNDVANSFGTSVGAKTLTLKQALIIAAVFELSGAVFAGAEVTNTIRSGIVSLPKGDVNPMVFVIIMISALFSSGAWLFIATKKGLPVSTTHSIVGGIVGAGMMMGFIYYNGSKTFDMVQWSEIGRIALSWVISPVMGGVMAYLIFGYIKSKIIIPSSRIQSEIKSLKRARKTYKDQYIKELSNKSEAEQIKELRRIAIIDEDECEGENCDFRDKIKAMKEEEKNIDGTVFMRTHIPIVAGVAAMIIAGSMLFKGLKHMDFNLSIIQTIWIIFVIGIAAYLASFAMVNLMKKDNPQKGINRIFGWFQIFTASSFAFSHGANDIANAVGPFAAILDVLKNNTINETTPIPSIAMATFGIALVVGLWFLGKEVIATVGTKLAEILPTTGFSAELASSIVILIATKMGLPISSTHVLIGAVLGIGVYNRNANWGMLKPIGLAWVITIPISMIGSAIGFLAIKNIMGL >NC_022759.1|WP_023384803.1|685937_688784_+|flagellar-hook-associated-protein-FlgL MRITNQLINFNNLSNYQTNAKSIYDINERYSSGLKIQNSYDNSSIYVDGTRLEYEINLLDQVKQTSTKATEFSKNSDKALNDFVAKLTEFKTKLIQAGNNIHNETSRNAIANDLEGLKKHLIDIANSSINGQFLFSGTALDTKPIDSAGNYKGNNQSINAAIGANQTTAYNIDGQTLFLGKDNDYKKILTTNVSLIDNKTKLTSDATNYLNAANKILDLIGGNYRSEELVAQIGKMNPELDFADPTALADTTFYMQGRKPNGETFSTKFKVTADSSIQNLLDNIGYALGNDKNGKNSVVSVTINNSGQIEVTDLKSGNQMTELHLFGLTDVQGPETFKVGDRDIVIDPATHTDFKVTTEKRTVGGVSTDVLIVDSVNPAGEKYEITQIAGGDLSIQQVDKTTGANIGAATNVTPAAGKLVLNPADLAAGGVTAADFRAYDPADIKTLSDKGARDENGNWVSSANLTDTKTITQNVENGNVYLTEFIKSGFEDVLGNKSDAIDYNKLQFEKTDNKLSSNVSQVVKGTNEYATNSTKLSAVAGQALQANPNSNITMNIKSKDGTNYEVKLNFTDTNSNTTQRYPTITVTPLDDNWEKPATATPVYYGNVYSGKYNEATKMTDGVITQADDMTYQQLNDIVSMVAAGNLPSGQPNTNVIANIDTASRSTYADANALKTALKNGVTDVQAQGIIDRVVDASGIAYPIDFTANGDALRDIKDAILGDQDYVTSRYNEYNTAVKSASSTINTTLDYRGNMVVTDKTASKTDIEVTLFEDHGRGNIEFTDMYKRDAAGNIEVDAAGNRIIDTYQSTSGSLFSFTSNNAISIDEPSVDIFKDLDDMIQAVRDGSYRGNPDASDPRTTGIQGALKKIDHLMDHINKQHTQIGSYTNSLTATGDRATTLKVNVSSVKSEIMEADIGETYLMFQQRLLAYQAMLQATAKTSQISLLNYI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022759_3 | 3.23|665544|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665544-665578 | 35 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 40033-40067 | 0 | 1.0 |
NC_022759_3 | 3.23|665544|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665544-665578 | 35 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 31407-31441 | 0 | 1.0 |
NC_022759_3 | 3.12|664823|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 664823-664858 | 36 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 35430-35465 | 3 | 0.917 |
NC_022759_3 | 3.12|664823|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 664823-664858 | 36 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 36009-36044 | 3 | 0.917 |
NC_022759_4 | 4.1|676363|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 676363-676397 | 35 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 35749-35783 | 3 | 0.914 |
NC_022759_4 | 4.1|676363|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 676363-676397 | 35 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 35691-35725 | 3 | 0.914 |
NC_022759_2 | 2.1|657991|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 657991-658025 | 35 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 8720-8754 | 5 | 0.857 |
NC_022759_2 | 2.1|657991|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 657991-658025 | 35 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 79746-79780 | 5 | 0.857 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | NZ_LR214954 | Mycoplasma neurolyticum strain NCTC10166 plasmid 4 | 14482-14516 | 7 | 0.8 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | MN657127 | Psychrobacter sp. strain ANT_P59 plasmid pA59P4, complete sequence | 5846-5880 | 8 | 0.771 |
NC_022759_3 | 3.20|665348|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665348-665382 | 35 | MN694111 | Marine virus AFVG_250M218, complete genome | 36202-36236 | 8 | 0.771 |
NC_022759_2 | 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659109-659144 | 36 | NC_048682 | Raoultella phage Ro1, complete genome | 105668-105703 | 9 | 0.75 |
NC_022759_2 | 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659109-659144 | 36 | MK024806 | Proteus phage Mydo, complete genome | 113504-113539 | 9 | 0.75 |
NC_022759_2 | 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659109-659144 | 36 | MT178275 | Klebsiella virus KpS8, complete genome | 41028-41063 | 9 | 0.75 |
NC_022759_2 | 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659109-659144 | 36 | NC_048647 | UNVERIFIED: Klebsiella phage KNP2 genomic sequence | 31769-31804 | 9 | 0.75 |
NC_022759_2 | 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659109-659144 | 36 | MT939253 | Klebsiella phage vB_KpnM_Seu621, complete genome | 40991-41026 | 9 | 0.75 |
NC_022759_2 | 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659109-659144 | 36 | KX452695 | UNVERIFIED: Klebsiella phage KPN2 genomic sequence | 31769-31804 | 9 | 0.75 |
NC_022759_2 | 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659109-659144 | 36 | NC_048656 | Klebsiella phage vB_KpnM_BIS47, complete genome | 23877-23912 | 9 | 0.75 |
NC_022759_2 | 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659109-659144 | 36 | NC_028659 | Klebsiella phage vB_KpnM_KB57, complete genome | 41815-41850 | 9 | 0.75 |
NC_022759_3 | 3.20|665348|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665348-665382 | 35 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 74530-74564 | 9 | 0.743 |
NC_022759_3 | 3.20|665348|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665348-665382 | 35 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 13936-13970 | 9 | 0.743 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | NZ_CP041194 | Weissella cibaria strain CBA3612 plasmid pCBA3612-01, complete sequence | 17879-17913 | 10 | 0.714 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | NZ_JN106352 | Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain KCTC 13302 plasmid pMBLT00, complete sequence | 4165-4199 | 10 | 0.714 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | NZ_CP042423 | Leuconostoc lactis strain CBA3622 plasmid unnamed3 | 13813-13847 | 10 | 0.714 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | NZ_CP042423 | Leuconostoc lactis strain CBA3622 plasmid unnamed3 | 64926-64960 | 10 | 0.714 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | NZ_CP042388 | Leuconostoc lactis strain CBA3625 plasmid unnamed, complete sequence | 7949-7983 | 10 | 0.714 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | KT895374 | Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome | 38469-38503 | 10 | 0.714 |
NC_022759_2 | 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659437-659471 | 35 | MN694401 | Marine virus AFVG_250M993, complete genome | 30035-30069 | 11 | 0.686 |
NC_022759_2 | 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659437-659471 | 35 | MN694800 | Marine virus AFVG_250M236, complete genome | 29596-29630 | 11 | 0.686 |
NC_022759_2 | 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659437-659471 | 35 | MN693884 | Marine virus AFVG_250M237, complete genome | 29408-29442 | 11 | 0.686 |
NC_022759_2 | 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659437-659471 | 35 | MN693720 | Marine virus AFVG_250M228, complete genome | 28243-28277 | 11 | 0.686 |
NC_022759_2 | 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659437-659471 | 35 | MN693802 | Marine virus AFVG_250M1131, complete genome | 11417-11451 | 11 | 0.686 |
NC_022759_2 | 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 659437-659471 | 35 | MN694277 | Marine virus AFVG_250M238, complete genome | 11130-11164 | 11 | 0.686 |
NC_022759_3 | 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 665085-665119 | 35 | NZ_CP010908 | Candidatus Pantoea carbekii strain US plasmid pBMSBPS1, complete sequence | 10408-10442 | 11 | 0.686 |
1. spacer 3.23|665544|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagcaaacgcacttttaaaggctggagacgctata CRISPR spacer tagcaaacgcacttttaaaggctggagacgctata Protospacer ***********************************
2. spacer 3.23|665544|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagcaaacgcacttttaaaggctggagacgctata CRISPR spacer tagcaaacgcacttttaaaggctggagacgctata Protospacer ***********************************
3. spacer 3.12|664823|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttgatgaaaatggcgagagacttttaacaaaggcgg CRISPR spacer tcgacgagaatggcgagagacttttaacaaaggcgg Protospacer *.**.**.****************************
4. spacer 3.12|664823|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttgatgaaaatggcgagagacttttaacaaaggcgg CRISPR spacer tcgacgagaatggcgagagacttttaacaaaggcgg Protospacer *.**.**.****************************
5. spacer 4.1|676363|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
agagaagcaaggcttaaaaatgttcgcagatggtg CRISPR spacer agaaaagcaaggtttaaaaatgttcgcagatggcg Protospacer ***.********.********************.*
6. spacer 4.1|676363|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
agagaagcaaggcttaaaaatgttcgcagatggtg CRISPR spacer agaaaagcaaggtttaaaaatgttcgcagatggcg Protospacer ***.********.********************.*
7. spacer 2.1|657991|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
tagcctcgtaaaacatcttgtcgctctcttttttg CRISPR spacer tcgcttgataaaaaatcttgtcgctctcttttttg Protospacer * **.* .***** *********************
8. spacer 2.1|657991|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
tagcctcgtaaaacatcttgtcgctctcttttttg CRISPR spacer tcgcttgataaaaaatcttgtcgctctcttttttg Protospacer * **.* .***** *********************
9. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214954 (Mycoplasma neurolyticum strain NCTC10166 plasmid 4) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer tttttaaaacaatatttttatttttaaagtatttt Protospacer ******** *******.********** * .**
10. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN657127 (Psychrobacter sp. strain ANT_P59 plasmid pA59P4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer ataagaaatcaatattattatttttaatttcaatg Protospacer * *********** **************. *
11. spacer 3.20|665348|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694111 (Marine virus AFVG_250M218, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gctgttttcatcttgtctcctttttttcttaaaat CRISPR spacer caggtttccatcttgtctcctttttgtcttaatta Protospacer ****.***************** ******
12. spacer 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048682 (Raoultella phage Ro1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
13. spacer 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK024806 (Proteus phage Mydo, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
14. spacer 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT178275 (Klebsiella virus KpS8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
15. spacer 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048647 (UNVERIFIED: Klebsiella phage KNP2 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
16. spacer 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT939253 (Klebsiella phage vB_KpnM_Seu621, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
17. spacer 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX452695 (UNVERIFIED: Klebsiella phage KPN2 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
18. spacer 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048656 (Klebsiella phage vB_KpnM_BIS47, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
19. spacer 2.18|659109|36|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028659 (Klebsiella phage vB_KpnM_KB57, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
20. spacer 3.20|665348|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gctgttttcatcttgtctcctttttttcttaaaat CRISPR spacer actattttcatcttgtccccttttttttgttttgt Protospacer .**.*************.*********. * .*
21. spacer 3.20|665348|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gctgttttcatcttgtctcctttttttcttaaaat CRISPR spacer actattttcatcttgtccccttttttttgttttgt Protospacer .**.*************.*********. * .*
22. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041194 (Weissella cibaria strain CBA3612 plasmid pCBA3612-01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer cattcaaatcaatatccttatttttaagtataaat Protospacer . **.**********.*********** * .. *
23. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_JN106352 (Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides strain KCTC 13302 plasmid pMBLT00, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer cattcaaatcaatatccttatttttaagtataaat Protospacer . **.**********.*********** * .. *
24. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042423 (Leuconostoc lactis strain CBA3622 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer cattcaaatcaatatccttatttttaagtataaat Protospacer . **.**********.*********** * .. *
25. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042423 (Leuconostoc lactis strain CBA3622 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer cattcaaatcaatatccttatttttaagtataaat Protospacer . **.**********.*********** * .. *
26. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042388 (Leuconostoc lactis strain CBA3625 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer cattcaaatcaatatccttatttttaagtataaat Protospacer . **.**********.*********** * .. *
27. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT895374 (Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer aatttagatcaatattcttattcttaaataactct Protospacer ****.***************.**** * ..*
28. spacer 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694401 (Marine virus AFVG_250M993, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
29. spacer 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694800 (Marine virus AFVG_250M236, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
30. spacer 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693884 (Marine virus AFVG_250M237, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer taaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
31. spacer 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693720 (Marine virus AFVG_250M228, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
32. spacer 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693802 (Marine virus AFVG_250M1131, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
33. spacer 2.23|659437|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694277 (Marine virus AFVG_250M238, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
34. spacer 3.16|665085|35|NC_022759|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010908 (Candidatus Pantoea carbekii strain US plasmid pBMSBPS1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tttttaaatcaatattcttatttttaatttcgctt CRISPR spacer caaatatattaatattcttatttttaattaatgat Protospacer . ** **.******************* *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
22251 : 32072
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022759|22251:32072|DBSCAN-SWA TTTGAAGATAATTAAACGTGATGGAAGTTTGCAAGATTTTGCAAGTTATAAAATAGAAAATGCAATAACAAAAGCTTATAAAAGTGCCATTAAAAAACCAAATGCAGAGCTTATAAAAAATGTATTGTCTATGGTAAAAGACAAAATGAGCGTCGAAGAAATTCAAGATATCATAGAAAAAGCACTCTTTGATAGCGGCGATTTTAGTGTGATGCGAAGTTTTATGCTTTATAGACATACTCATACTATGCAGCGCGGTGGTGAGCTTGATGAGCGCACAACTTATATAAACTCGACTCAAACCATAGAAGAGTATATCGGAAAGTCTGATTGGCGTATTATGGCAAACTCAAATACGAGTTATTCAAACGCTGGACTTATAAACAACACAGCTGGAAAAGTCATCGCAAACTATTGGCTAGACGCTGTTTATAATGATCATGAGGGCGCAGCTCATAGAAACGGCGATTATCACATACACGACCTTGATTGTTTGACTGGATACTGCGCTGGTTGGAGTCTTAGAGCTTTGCTAAATGAAGGATTTAACGGTGTAAGAGGAAGAGTCGAGAGTAGGGCGCCAAATCATTTTAGAGAAGCTTTATATCAAATGGCGAATTTTCTAGGGATTTTACAAAGCGAATGGGCAGGAGCGCAAGCATTTAGCAGTTTTGACACCTACCTTGCACCTTATGTTTTTAAAGATAAACTTAGCGATAAAGAGATCAAAAAAGCTCTTACTAGCTTTATATTTAACTTAAATGTTCCTGCTCGTTGGGGTCAAAGTCCATTTACGAACGTTACTATCGATATGGTTCCTCCAAGTGATTTAAAAGGACAAATTCCTACTAAAAACGACATTCATTTATTTACAAATTTAAATGATGAAGAGTTGGAAGCTGAGTGTAAAAAACGGGGTCGTTCAAATCTTAAAGATATGACTTACGGTGATTTTAAACCCGAAATGGATAGGATAAATATCGCTTTTTACGAGATACTTACGCAGGGCGATAAATGTTCGCAGCCATTTACGTTTCCTATACCGACTGTAAATATCACCGAAGATTTTGACTGGGATAGCAAGGTTGCTACAAAGCTTTTTGAAAATACCGCCAAAATGGGTTCTAGCTATTTTCAAAATTTCATCGGATCTCAATATGTGAAAGATGAGTTTGGCAACCGCATTCCAAATGAAAAAGCCTATAAACCAGGCGCTGTTCGTTCTATGTGCTGTAGATTGCAGCTTGACTTACGTGAGCTTTTAAAGCGTGGCGGCGGACTTTTTGGAAGTGCTGAGATGACAGGAAGTATCGGCGTAGTTACTCTAAATTTAGCGAGGCTTGGATATCTTTTTAAAAATGACAAAAAAGCTCTTTATGCAAGACTTGATGAGCTATTAGAACTAGCAAAAAGCACACTTGAAAAGAAGCGTAAATTCATAAATGAGATGTACGAAAGAGGTCTTTATCCATACACTGCACGGTATCTTAAAACGTTCAATAACCATTTTAGCACTATCGGAATAAACGGTGCAAATGAGATGATACGAAATTTTACGAATGATAAGGAAAATATAACTACTAAATTTGGTATAGAGTTTGCAAAAGAGCTTATAGAGTATCTAAGAGCTAAGATGATAGAGTTTCAAGGGGCTACTGGAAATTTATACAACCTTGAAGCAACTCCGGCTGAGGGAACGACTTATCGCTTTGCTAAAGAAGATAAAAAACGCTACCCAGATATCATTCAAGCGGGATTTGATGAAAAAGTATATTATACGAACTCGACTCAGCTTCCAGCGAATTTCAGCAGCGATCCGTTTCATAGTTTAAATTTGCAAGACGAGCTTCAAAGCAGCTACACAGGCGGAACGGTCTTTCACTTGTATATGAATGAAAGACTAAGTAGTGTCTCGGCTTGCAAAAAGCTTGTAAAAAATATAGTAGAAAACTATAAGCTTCCGTATATCACGATAACTCCTGTATTTAGTATATGTCCAAAACACGGATATATAGCAGGTGAGCATGAGTATTGTCCAAAATGCGATGAGGAGATTTTGAGTTTAGCTTGACTTATCTTTTTTCTGTTTTGTTTAGAGTTTGCTAAAAGTTTTTAGTTGTGTATTATAAATTTAAAAAAGATTTTTATATGTATTTGAATTATCAAATTTAAGCCCTTTTTTGATAAAATCGTCATAAAATTTAAAGGTAAAATGCAGATGAATTTAATCCTAAATACGGATAGTTACAAAATTTCGCACTATCTCCAGTACCCAAAAGATGTGAATTACGTAAGTTCCTACATAGAATCACGCGGCGGTAGGTGGAACAGAGTTTTATTTTATGGCTTACAAATGTTTTTGATGGAGTATCTAAGCAAAAAAATCACGTATGAAGATATAGAAGAGGCAAAAGATTTTATAAAATTTCACGGACTTTCATTTAATGAAGATAGTTGGCGATACATAGTAGATGAGCACGGCGGCGCACTTCCACTTGAGATAGAAGCGGTAAAAGAAGGCAGCATCGTTCAAACTGATAACGTGCTGTTGCAGATACGAAATACTGATCCAAAACTTCCTTGGCTTGTGGGCTACCTTGAGACGGCTATTTTAAGGGCTATTTGGTATCCAGTTGCCGTGGCTACGAATAGTTATTTTTGTAAGCAAAATATTTTACAGTTTTTAAATGAGACTGGAACTCCTGATCTTATCGACTTTTGTCTGCATGATTTTGGTGCGCGAGGTGTGAGTAGTTTTGAGAGTGCAGGTATCGGTGGAAGCGCTCATATGGTAAATTTCAAAGGCTCAGATACGATAACTGGAGCTGTATTTGCTAAAAAGTACTATGACGCTGATATGGCGGCATTTAGTATCCCAGCAAGTGAGCATAGCACGATGACTACTTGGGGAAAAGAGAATGAAAGCGATGCTTATAAAAATATGGTTGATAAATTCGGTAAAAGTATTTTTGCTTGCGTGATTGATAGTTATGATACGCTAAATGCGATAGAACTTTGGGGAAAATTATTTGATGAGGTTAAGACAAAAGGTGGTCGCGTCGTGCTTCGCCCAGATAGCGGAAATCCAGTAACAATGGCTAGCGAGTGCTTAGAAAAGATGATGGATATAGCGGGATTTAGTGTAAATCAAAAAGGCTACAGAGTACTTCCAAAACATATCAGGCTGATTTATGGCGATGGTATAAATCCGCAAAGTTTAGTTGATATTTTAAATGAGCTTAAACTTAGAAAAATAAGTGCGGATAATATCGTTTTTGGTATGGGTGGGGCGCTTTTGCAACATCTTAACCGCGATACTCTTAAATTTGCGATGAAAGCAAATGCTGTATCAAAAGACGGTAAGCGCTGGACAGATGTGAAAAAAGATCCTATCACCGATCCTTCAAAACGCTCGAAATCCGGACGTCTTGCACTGGTGAGAAAAGGAAATTTGTTTAAAACTGTTCGATTAAACGAGCTAAAAAAAGAAGAAAATAAACTTAAACCAGTTTTTAAAGACGGTAAAATCCTAAGCAAAGTAAGCTTTGATGATATCAGAGCTAGGGTTAGAGAATTTAATTAAAGGATAAAATATGAAAAAACAAGAGATACTAACTAAATTCAAAGACAAACGTACAAAATGCGTGGTTTATACTAGAGTTATGGGTTATCACAGACCAGTTGAGAGTTTTAATCTTGGAAAACAAGGTGAGCATAAAGAGAGGATCAAGTTTTTAGAACCTGCTAAATGTTAGATAAATTTATCTACGATATCACACCTTTTAGCGTTGTTGATTATCCTGATGAACTCGCTTGTTTGGTGTGGTTTGCGAAGTGCAATATGCGCTGCGTTTATTGCTACAACAAAGATATAGTTTTGGGTGAGGGCAAGTTTGATATGCATTATCTAAGCGAGTTTTTAAATTCACGCCAAAACCTTTTAAGCGCGGTAGTTTTAAGCGGTGGAGAATGCACTAAAAGTTTGCATTTTAGTGATGTTTTGAAGCTAGCTAAAGATCTTGGATATAAAACCAAAGTCGATACGAATGGAAGCAATCCTGAGATTATAGAAGAAAATTTGAGTTTGATCGATTTTATATCGCTTGATTTTAAAGCTCCAAAAGCTAAATTTGAAACGATCACCGCGTCAAATTTATATGATAAATTTATAAAAACACTTCAAATTTTACTAAAAAACAGAGCTAAATTTGAGTGCAGAACGACTATCCACGCAGATATACTAAACGAAAATGATATCAGCGATATGGCAAAAGTTTTAGAGCAAAACGGATATCGCCAAACTTACTATCTGCAAAACTTTTTTGAAGCCTCAAATTTAGGAAATTTACAAAAACCAAAAGCTAAATTTGATCCAAATTTGATAAACTCAAATTTAAGCATTGCGCTTAGGAATTTTTGATTTTATTAAAATTAGATAAAAGCCGTTTTTAGCTTTTATCAACTGTTTTATCTAATGACTCTAGCTCCGCTAAGTGGCGGTGAAAATACAAAAAGTTGCTTAGGTTCTATATCTACAAAAAATTCTAAAACACAACGTACTAGTCCGACTCTATTTTCTATCGGCACATTTGGATTTTCAAATGTTCCTAAACACTCATTTGTTTTTAGAACGAGTGAGCGTAGTTGCATAGCTCCGCTACTTGTCGGTATGATCTGAAAAATAGTCTCAAACTCGCCGCTATCATAGTCTTGTTTGCAGTTTTTCAACGCTAAAAATCCGCTAGGAGCGATCTGAAGGCACATTTTTACGTCGGCTGCTACTTGAAACTGCACGTATCCAAAAGGAAAAGAATTTGCAAACTTATCAGCTTTTTTTATTTTAGGATCTACTCCTAAATCATTTAAAAACCAGTTTTGGTAATTAAACTGCCCTGAAAATCGTTTTATATTTATAGGAATTCCGGTGTTTGCATTGCGTATTTGAAAGGCGTCGGTTATGTTTTCATTTGCTAAAATTATGCTTGTAAAGAAAAATATTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022759|22251:32072|24468_25833_+|WP_039361593.1|DBSCAN-SWA MNLILNTDSYKISHYLQYPKDVNYVSSYIESRGGRWNRVLFYGLQMFLMEYLSKKITYEDIEEAKDFIKFHGLSFNEDSWRYIVDEHGGALPLEIEAVKEGSIVQTDNVLLQIRNTDPKLPWLVGYLETAILRAIWYPVAVATNSYFCKQNILQFLNETGTPDLIDFCLHDFGARGVSSFESAGIGGSAHMVNFKGSDTITGAVFAKKYYDADMAAFSIPASEHSTMTTWGKENESDAYKNMVDKFGKSIFACVIDSYDTLNAIELWGKLFDEVKTKGGRVVLRPDSGNPVTMASECLEKMMDIAGFSVNQKGYRVLPKHIRLIYGDGINPQSLVDILNELKLRKISADNIVFGMGGALLQHLNRDTLKFAMKANAVSKDGKRWTDVKKDPITDPSKRSKSGRLALVRKGNLFKTVRLNELKKEENKLKPVFKDGKILSKVSFDDIRARVREFN >NC_022759|22251:32072|31421_32072_+|WP_023383981.1|DBSCAN-SWA MELRTLPFNPATNAVVSEETCSYHYGKHHQTYVNNLNNLIKGTDFEGADLFEILTHSEGAIFNNAAQIYNHDFYWDCIAAKTDISDELKAALQSDFADFKSEFLKSATTLFGAGWTWLVYNPNSHKLEIKNTSNAGTPVTEGLIPLLVVDVWEHAYYIDARNARAAYLEKFYENINWDFVSAAYEWAKKEGLSSVKFYIDEIYKGSGCCGGHCGCH >NC_022759|22251:32072|28074_28731_-|WP_023383974.1|DBSCAN-SWA MTETILKHIKNSLILLFCMTIFNACSSKITEISTQKTDPLGSVFGKADLNFKQPTINLQGIPPDLFDRTSDSLVIMGANGVAITVWYSSPGNWLWGYALYTSGNLGGYRVWRLILLPDNEVMIVNFNTRTTCMNTYKNGVIHSPCNKNNPFQKFVLRPMTNGAVQIYNKATNSCLQTPVDNLFGFDVFGAINLTTKCTDTIDQQWYLLPPPQVGRLLY >NC_022759|22251:32072|28982_30005_+|WP_023383975.1|DBSCAN-SWA MNRKKIYNPSSDETLNDRKVFGGNPHGILNFTKAKYTWALKLWDLMEANTWFPKEVDTTDDVRDYACNLTTAEKRMYDLVWSQLISMDSFQTNNLADNINPYITAPEINAILARQAYEEANHSKSYAVMVEAICDNTDLIYEMEKYDDVLRKKNDYISSVYEELAGEVTDEKMLLAMVANQILEGVYFYSGFTAIYALARAGKMLGSAQMIRFIQRDEITHLLLFQNMINSVRKERPDLFTSEVETKIYEMFKKAGDLEIEWGKYITGNQIMGFTDDIIEEYIHYLVDDRLVSIGLKKLYNAKHPIKWVDDFAKFNDQKSNFFESKVTNYSKGSLTFDDF >NC_022759|22251:32072|22251_24321_+|WP_023383965.1|DBSCAN-SWA MKIIKRDGSLQDFASYKIENAITKAYKSAIKKPNAELIKNVLSMVKDKMSVEEIQDIIEKALFDSGDFSVMRSFMLYRHTHTMQRGGELDERTTYINSTQTIEEYIGKSDWRIMANSNTSYSNAGLINNTAGKVIANYWLDAVYNDHEGAAHRNGDYHIHDLDCLTGYCAGWSLRALLNEGFNGVRGRVESRAPNHFREALYQMANFLGILQSEWAGAQAFSSFDTYLAPYVFKDKLSDKEIKKALTSFIFNLNVPARWGQSPFTNVTIDMVPPSDLKGQIPTKNDIHLFTNLNDEELEAECKKRGRSNLKDMTYGDFKPEMDRINIAFYEILTQGDKCSQPFTFPIPTVNITEDFDWDSKVATKLFENTAKMGSSYFQNFIGSQYVKDEFGNRIPNEKAYKPGAVRSMCCRLQLDLRELLKRGGGLFGSAEMTGSIGVVTLNLARLGYLFKNDKKALYARLDELLELAKSTLEKKRKFINEMYERGLYPYTARYLKTFNNHFSTIGINGANEMIRNFTNDKENITTKFGIEFAKELIEYLRAKMIEFQGATGNLYNLEATPAEGTTYRFAKEDKKRYPDIIQAGFDEKVYYTNSTQLPANFSSDPFHSLNLQDELQSSYTGGTVFHLYMNERLSSVSACKKLVKNIVENYKLPYITITPVFSICPKHGYIAGEHEYCPKCDEEILSLA >NC_022759|22251:32072|26717_27266_-|WP_023383971.1|DBSCAN-SWA MRVLTIIFFFTSIILANENITDAFQIRNANTGIPINIKRFSGQFNYQNWFLNDLGVDPKIKKADKFANSFPFGYVQFQVAADVKMCLQIAPSGFLALKNCKQDYDSGEFETIFQIIPTSSGAMQLRSLVLKTNECLGTFENPNVPIENRVGLVRCVLEFFVDIEPKQLFVFSPPLSGARVIR >NC_022759|22251:32072|25998_26670_+|WP_023383970.1|DBSCAN-SWA MLDKFIYDITPFSVVDYPDELACLVWFAKCNMRCVYCYNKDIVLGEGKFDMHYLSEFLNSRQNLLSAVVLSGGECTKSLHFSDVLKLAKDLGYKTKVDTNGSNPEIIEENLSLIDFISLDFKAPKAKFETITASNLYDKFIKTLQILLKNRAKFECRTTIHADILNENDISDMAKVLEQNGYRQTYYLQNFFEASNLGNLQKPKAKFDPNLINSNLSIALRNF >NC_022759|22251:32072|29994_30657_+|WP_023383977.1|DBSCAN-SWA MISNLGFLHLNSAGTINRTSEFLNLVKDIKPGELVLASELCVSGYENLGDEFENELIANLKNVLLAGAFLGFTHFSGGFNEFVLLNGDKEIHKQKKAILFTPNLEQDKFKAGKVEDINLFEICGVKIGVLICFELRFAELWERLKGADIILVPSLWGKERKRHFEVLCEALALQNRCYVIACSDRDLKFGAVFKPNGEIAKSFKFELDLASEFKKSLGLI >NC_022759|22251:32072|30714_31344_+|WP_023383979.1|DBSCAN-SWA MDSLERARCQKMADDIADVIELTPMVYKAFCSTPRTDFVPVSVNAFKLDAHPIGGNQWISSPLTVAKMTLALEAENCDNILEIGCGSGYQAAILSRLAHRIFSIERIEKLANEAKAKMKKLDFNNVNIRYDDGNVGWKSYAPYDRIILSCACSSVPTRLFEQLKDDGILVAPIKENNKQFIVKFKKIGSNLEKIVLDECEFVPLLDGRE >NC_022759|22251:32072|27265_28066_-|WP_023383973.1|DBSCAN-SWA MRKIVMIIFMATLSFAKPEDYKLATWNLQGSSAVTESKWNISIRQIISGENPADILAIQEAGNLPQTAHPTGRSINQGGTIVTEHLWQLGSISRPFQVYVYYAQIDTGANRVNLAIVSRIIADEIIILPPPTVASRPLIGIRIGNDVFFNIHALANGGIDAPAIINSVFDRFRNMPDITWMILGDFNRSPESLRGTLGLETRIRVTFLAPPAPTQRSGGTLDWAIVGNSAGGIVETALVAVLMLANLRTHLVSDHFPVNFRKFGDN |
10 | Enterobacteria_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1374828 : 1384161
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022759|1374828:1384161|DBSCAN-SWA TTTAAAACTCATTGGCAACACCTATCTCAAAATATATAAATCCAAGCTCTTTTAAAATATTTCTATCATACTGATTTCGCCCATCAAATATAATAGGAGTTTTAAGGCGATTTTTCATCTCTATAAAATCAGGAGCCCTAAACTCGCTCCACTCAGTCAGCAAAGCTAAGCAATCAGCTCCGTTTAGTGCGTCGTATTTGTTTGGGGCATAAATCACATCTAAATTTTTAAAATAAATTTTAGCTTCAGCGTAAGCTTTTGGATCAAAAACTTGCACTTTAGCTCCATTTTTTATAAGTAAATTTATAATAGTTATAGAAGTTGCTTCTCTCATATCATCGGTATTTGGTTTAAATGCAAGCCCCCAAATAGCTATGGTTTTACCTTGTAAATTACCATTAAAATATGCATTTATCTTATCAAAAATCACTCGTTTTTGAGCTTTATTTCTATCTTCAACTGCCTTTAAAACTAAAGGATCTATACCGTTTTGTTTAGCGGTGTAGATGAGCGCTTCAACGTCTTTTGGAAAACAGCTCCCGCCATAACCACATCCAGGATAGATAAAACTATATCCTATGCGAGAGTCACTTCCGATACCGCGCCTAACCATATTTATATCAGCTCCGACTTTTTCACAGATGGTAGCCATCTCATTTATAAAACTGATTTTAGTAGCAAGCATAGAGTTTGCGGCGTATTTCGTCATCTCCGCACTCTTTACGTCCATCTCTATAAGGCGGTTATGATTTTTCATAAATGGCGCGTAAAGCTCTCTTAAAGCGTTAAATCCAAACTCACTACTAGCTCCTACCACAACGCGATCAGGCTTTAAAAAATCCTCAACAGCAGCTCCTTCTTTTAGAAACTCAGGATTGCTAACTACTTCAAATTTGATCTCTACGCCTCTATTTTGCTGCTCTTTTGATATAACTTCGCTTACTTTATGCGCAGTTCCTACTGGAACGGTACTTTTATCGACCACGACGAGTGGGCGCTGCATATGTTCGCCTATGCTTTTTGCAACTTGCAAAACATATCTTAAATCCGCTTGTCCATCTCCACCCATAGGCGTACCGACTGCTATAAAAACAACATTGGCAAAGCTTAAAGCTTCTTTGATATCTGTGCTAAATCTTAAATTTTGCTTCTCATAATACTCGATTACTATCTCTTTAAGACCTGGTTCATAAATTGGGATAATGCCTTGTTTTAGATTTTGTATTTTTTCTTCTGCGACGTCTATACAAATAACATCGTTACCCATCTTTGCAAAACAAGCTCCACTGACTAATCCAACATATCCTGTACCTACTACTGCTATTTTCATGCAAAATTTCCTAAAAATTTATTTGATAATTATAGCAAAATATTTTCATATAAGGTATAATAAACAAAAAAGCTTTAAGGTTGATTTTAATGGAATATATTAAAACAAACAGTAAGAAAGAGTGCGAAATACCTTGCCATTTTTTAGATAAAAGCAGTGTATCTATTGTAGTTCCTTGTTACAATGAGGAAGCTTCTATATCCATATTTCAAAAAGAAATCATAAAAATATTAACAAATATCAAAGACAAAATAAACTCAAACTTTGAATATGAAATTATTTTTATAGATGATGGAAGCCAAGATAAAACAGCTGTAGAAATAAAAAAATTATGTAATAAATTTAATAATACTCACCTTATTAAATTTTCGCGTAATTTTGGTAAAGAAGCCGCTATTTTAGCAGGTTTTAGAATGGCAAAAAATAGCAGCATAGTCTTAATAGACGCAGATCTACAACATCCTGTATATCTGATAGAAAAGATGTATGAAATTTGGTATAACAATGAAGCAGATATCATCTATGCTATAAGAAAAGATAGAAAAGGCGAAAGCTTTTTAAAAAGCAAACTAAGTGAAATATTTTATAAAATTTCAAATATCATCTCAGACGTAAAATTAAAGCCAGGGGTAAGCGACTTTAGATTAATGGATAAAAAAGTTGTTGATATCTTAGTAGCAATGAATGAATATCATAGATTTAGCAAAGCCATGTTTGAGTGGGTAGGATTTAAAAAAACAGCGTTAGAATATGATTATGCCCCAAGGATTAGTGGTAAAACTAGCTGGAGTTATATGAAGTTATTTAAATATGCTATAGAAGGTATGATAAGTTTTTCGACTACACCTCTAAAAATATCATTTTGGATAGGGTTGATGATAAGTTTTATATCCGGAGCTTATGGAATTTTTATCGTTTTTGATACTATCATAAATGGAAATACTGTAAAAGGCTACCCCTCAATGCTTACTATAATACTATTTTTAGGAGGAATACAGCTAATATTTTTAGGAATTATAGGGCAATATATAGCAAGAATTTATGAACAAGTAAAAGATAGACCGCACTATATAGTTGAAGAGGAGATTTAGCACAGTGAATTTAAAACACAATTTAAAAAAAGAGCTACTATTTACTATAGCAACTATTAAAAAATTTTTCAAGTATAAATACTTCTATAAATATTTTATTTTCATTTTTGGGCTATATTTTACAGGATATTTTGCACTAATAATAAATAATGTTAATTATGGAGATGACTATCATAGAGCTACATATGGAGATTTTGGATTTCAGATATGGAGCAGATTTTCATCAGAGTTTTTATCAAAAATATTTCATATAAGCCTAAATAGAAATGTAGAAATATCGCCTCTTTTACAGATAATCGCGATTGCTATCTTATCTATTGGGTCAATGATTTTAGTAAAAACGGTTTTAAAAAGATATACTTTTTGGGGGCTTGCTGCTAGCTTACCTTTGGGGCTTAGTCCATTTTTTTTAGAAAATATGAGTTTTAAATTTGACAGTGTGTTTATGGCGATATCATTAGTTTCACCAATCATTCCTTTTCTATTTTTAAAAAATAAAATAGCATTTTTTATAATATCTATTTTGTGTTTAGAATTGACCTTGACCACATATCAAACAGGAAATGCGGTGTATATAATGTTATCTTTATTTATAATATTGAGTTATATATTAGAAGGTAAAAATTATAAGCAGATTATTAAATGTGCTATGTTGCTTATACTAGCATATATTTCATCACTTCTTATATATAAGTTTTTTATTTTAAATGAATATTCTGGAGAATGGTATGCATCAAAAAGTGCATTTGAACTAAATAACTTGATTCCAGGAGTAAGTAAAAATTTAAAAACAGTACTGAAAATATATGAAGATGTTTTTAAACATACTATTTTTGTACCTATATTTGCACTTGGGATAATTGGATTTTTATTTGCCTGTATAAAAGTATCTAAAATATGCAAATTTTGGACTCTTATCGTTGGTTTAGGATTTATAGTCTTTGGAATTTTATTATCTTATGGTGCTTATTTGGTATTAGAAAAACAGATTTTTAGTGATAGAACTTTTAATGGTATAGGTATGTTTTTAGCAATTATATTTGTATTTTTATTTAAAATAAATATAAAAATATATAAGTTTTTTAGCAAAACCATATGTTTTATATTAGCTTATTCACTTATAATAGAAGCTACTGCTTGGGCAAATGTATTAAAAGAGCAAACAGAATATGCAAAATACAGAGTTGAGCTTATGTTGCATGATTTTTATAAAATGATACCAAAAGATAATAAATTTGGCTTTACCTCTGAAGTAAATAAAAACAATTTTATGTCTCCAATAGCATTAAACACGTCAAAAACATTTCCTATAATAATGAGAAATCACGCTATAGATAATATGCTAGATGCAAATTGGCTATTCAACTCTTATGGACTTATGGCTCATTATGAACATTGGACACCGATACTCTCAAAAGGTCTATGCGGACAAAAAGATAAAAAGCCAGTTGAGATCGTAGAAAATCCGCTCCATAAAATCACAAAATATGATAACAACTGTTTTGTTATAGAGTTTTTATAAATGAAATTATCTAGTTCATATTTTTTACGATATTTATGCGTAGGAGTATTCAATACTATTGTTGGTTTTGGAGTTATATTTACCCTTATGTATATTGGATATAGCGCAGAAATCTCAAATTTAATAGGCTATATTTGCGGAATTATTTTCTCATATTTTATGAATAAATTTTTTACTTTTAATACAAAAAATAGGAACAAAAAAGAGTTTATAAAATTTATAATAGCGATGCTTATCTCTTATGCATTAAATCTATTAATGCTTAAAATCTGTCTGAGTTTAGGTATAAATGCATATATAGCCCAACTATTTGCAGGAGCCGCGTATACTGTAAGCGGCTTTTTAATAAGTAAATTTTGGGTATTTAAACTAAACAGTTAGCTATTTTAACTTCTTCTCCCACTCTAAAGCTGAGCTAATGATGAGCTCTAAACTCTCGCGAGTCGGTTTCCAACTAGTTTTATTTCTAAGTTTGCTAGCGTCTGATATAAGCATCGCTGGATCGCCCTCCCGGCGAGGGGCGTTTAATACTTTAAAATCCACTCCACTAACTTTTTTAGCTGTCTCAATGACTTCTTTTACGCTAAATCCTCTGCCATAGCCAACGTTAAATATATCACTATCATTTGTTTTTAGATATTCAAGTACGGCCAAATGAGCACTTGCAAGATCTTCTATATGGATATAATCCCTTACGCAAGTTCCATCTTTCGTAGCGTAATCACTCCCAAAAATACTCATACTCTCTCTTTTCCCAGTAATCGTCCCAGTGGCTACTTTGATAAGATGAGTCGCGTTTGGATAGTTTTGACCGATAAGCCCGTCCGTGCTTGCTCCAGCTACGTTAAAATAACGCAAGATACCAAATTTAAAATCCCTGTTTGCAAGTGCGGCGTCTTTTAAGATCCATTCTGTCATAAGCTTGCTTCTACCATATGGATTTATCGGATTTTGCTCACTTGTTTCATCGACTACGCCGCTACTAGGCTCCCCATAAGTAGCAGCAGTCGAGCTAAATATAAACTTACTCACGCCGTGTTCAACAGCTAAATTTATTAAATTTGCAGCGTTTGCTGTGTTATTGAGATAATATTTCAGTGGTTTTACCGTACTTTCAAACACTTCTATATATGCTGCAAAATGTATGATCGCTTCAAATTTGCGTGTCCTAAAAATCTCCCTAAGGCTAAAAGTATCTGTCAAATCGCACTTTATAAACTCAAATTTATTTATATTTTCAAGCGTTACTAACGCCTCTTTGCTTCCTGTGTAGAAATTATCTATGACAGTGATGTTATGCCCGCCCTCTTCTAACAGAGCTTTTAAGACGTGAGAGCCGATATATCCAGCTCCTCCGGTTATCAAGATATTCATTTTTCGCCTTCGTTTTACTTTAAATTTAGTGATTATTATAGCTAGTTTGGGCTTAAAGATTATCTTGCATTCTAAATATATAAAACGAAATGAAAAATAAAACTATAAATCCAAAAGAAATCAAATTTAAAACTTCCCAACCACCACTTGCTAGCACAAATCCAACGCTAGAACTTGCTAACAAATTTGCTCCAAAAACGCTAATAGCATTTAGACTTTGTAAGCGTAGTTTATACTTTGAGTTTATAGCATTTAGCATAAACATTCCACGATTAAAACTAAACACCCAGCCCACACCAACAAAAGGCGTATCAAATATCAAAGTGCCGATATTTGCCAAATTTGGTCCTAAAATACCACCCATTATCCCACCTGCTACAACAAAAGCTGTAGCTCTGTTTTTATCATTTTGCGTGGTTAAATTTAGAGCTTCACTAGCTAAAATCTATAAAATTGATTGAGCGCAGTGAAAAATCCAAGCAAGAAAGTTGCAAAACAAAATAGATAAAATAGCCCAGACATTAGTGAAAAAATAGCAAAACCAGCCCCCAAACAACCTATCAAAGAAACACATAAAAAGACTTTTTTCTACCAAATCTTTACATTAAATTTGATGAAAATAGCTAGTTTTGGCTTAAAAAATGTCTGCTTTTAAAGCGTATATCACCAATCCCTCTTCTTACTTTCCAGCTTTTCATTCATATATTCCCAACCTTTCATACACCATTCAAGCTCGGCTGAGTCTTTAGCATATCTATCAGTACATTCCCATTTACCTTGTCCTAACTGTCTATAGATAGAGCCTTCATTGTGATATTTTCTCTCAAAAGCGTTACTTGCTTCGTTTATAGGCCACGCACCAGCGCTCATAGCAAACGCTATGGCTAAAAAACATACTTTTTTCATATTTTATCCTTTATTTTGTTAAATTATTGTCACTTCTAACACGTAAAAATACAGGAAATCTAGGCTTAGCGTATTTGGTTAAATTTTGATATTTATAAGTAATGATAGTACCGACTTTTGGCGGATCTGCCCTTTGCTCATCGCTAAATCCAGAACCGATCTTAAGCTCTATGTTACTAAAAATATCAACGCAAATAAGCGAACCCAAAAGCCCTTCAAATTTACCTTTACCGCTTTGTAGTTTAACGACTCTACATTCGCTATCTTTAAACTTTTTGAGCTTTAAAATTTCACCGCTTCTACCGTTTTTATAAGGCGCGTTTTCATTTCTTACGACTACACCCTCACCGCCACCGCTAATAACCTCATCTAAAAACGCAAAAGCGTCTTGATTTGAGTTTATTTTTATTTGTTCTATTACTCGTATAAACTCATTTGGACTCTCTTTTAAAAACTCGCGCAACACTTCTAGTCGCTCACGCAAATTTCCCTTAGCATTTGGCACGTCAAATACCATAAATTTGATATTTTCCCAACCTTTATCATCAAAAGAATTCACTACAGAACTAATAAACTCAAACTCTCCTCGTCCGCTCCACAGCTCACCATCTATAGCAAAGCTCGGAAAATCTTTTAGCCACCACTTTGGAGCGTTGATGATCTTAGCATTTCTGCTTTTCAAATTCTTACCATCCCAGATAGCTCTCACACCATCATACTTTTCACTCGCCAACCAACCGCTTAAATTTTCATCATTATACTCTTTTAATAGCATAACTTCGGCTTTTAAACCTAAAAATATGGCTAATAATAGAGCTAAAAACTTCAAATTTTTACTTTATAATAGTCCATATACCACTGCACAAATCTTGCAACTCCGTCATTTACGCTAGTATTTGGCTTATAGCCAAAGTCCTCTACTAGATCACTCACATCAGCGTAGGTTGAAGGAACATCGCCTGCTTGAAGCGGCATAAGATTTTTTTTGATTTCTCGTCCTAATTTTATCTCAATCGCCTTTATGTAGTCCATTAGCGAGGTTGGAGAGTTGTTTCCGATATTGTAAATTTTATAAGGCGCGTTTGAAGTAGCTGGATCGGGATTTTTAGCGTCCCAAGCCAAATTTGGAGTAGCTGGATTATCCACGCATTTCATTATACCTTTTACGATATCAGCTACGTAAGTGAAGTCTCTTTTCATCTTTCCGTAGTTATAAACATCGATAGCTTTACCCTCTAGAGCAGCTTTAGTAAATAAAAACAGAGCCATATCCGGACGTCCCCACTCGCCATAAACGGTAAAAAATCTTAGTCCAGTCGTGCTAAGCCCAAAAAGATGACTATAAGTGTGAGCCATAAGCTCGTTTGATTTCTTGCTTGCGGCGTATAGACTGATAGGATGATTTACACTATCGTGGGTGGAAAACGGCATTTTTTCATTTAGTCCATAAACTGAGCTTGAACTTGCATATACTAGGTTTTTCACGCCGTGATGGCGACAGCACTCAAGTATATTTGTAAAGCCTAAAATATTGCTATTTATATAAGCGTGTGGATTGATGAGTGAGTAGCGAACTCCTGCTTGCGCGGCTAAATTTATGACACAGTCAAAAGAGCTCTCTTCAAAAAGCTTTTGCATAGTTTTAAGATCACTTAAATCTGCTTTTATAAAGCTTAAATTTGGATAAATACCAGATCTAACCACTATATTTTCTTCTATATTTTCACGTTTTATACCAAGCTCGTTTAGCCTTGCGTATTTTAAATTTATATCGTAATAATCATTTATACAGTCAAATCCTACCACCGTGTCGCCGCGTCTGGCTAGCTCACGGCTTAGATGAAATCCTATAAATCCCGCTGTTCCAGTAACTAAAATCTTCATAAGCCGCCCTTAAATTCGTTTGATTTTATAAGATAAGCATTTACCAAAGTCTATTTTAGCAAACTCTTTGTGCGCCACAGCCAAGATCACGCAGTCGTGTCCGCTCAAATTTAAACTCTCTAAAAGCTCCACGCCATACTCTTTTTTCACATCATTTGCGTCCGCCCAAGGATCATAAACATCTACATTACAACCAAACTCTTTAAGCTCTTTTATCACATCGATAACTCTTGAGTTGCGGATATCAGGGCAGTTTTCTTTAAAAGTGATCCCAAGCACCAAAACCTTAGCACCATTTACTTTCAAGCCATTTTTTATCATCATTTTAACAGACTGATTTGCATGGTAAATTCCCATATTGTCATTTATCCTACGTCCTGCTAAAATGATCTCTGGATGATAACCGATCTCTTCAGCTTTATGCGTAAGATAGTATGGATCCACGCCGATGCAGTGACCTCCAACTAGTCCTGGTCGGAAATTTAGAAAGTTCCACTTCGTAGCTGCTGCGTCAAGCACTTCATTTGTGTCTATCTTCATCTTGTCAAATATCATCAACAGCTCATTTACAAAGGCGATATTTATGTCACGTTGCGTATTTTCTATGACTTTTGCGGCTTCAGCTACTTTTATACTACTAGCTTTATAAACCCCTGCTTTTATGATCTTACTATAAACAGCTTCTACGGTTTCAAGGGCTTTAGGACTACTTGCGGAGATGATTTTTTTGATTTTCGTGACCGTATGCTCTTTATCACCTGGATTTATACGCTCAGGACTGTATCCACACTCAAAATCCACACCAAATTTAAGTCCGCTAGTCTCAAGCACCGGCACACACTCATCTTCAGTAACTCCTGGATAAACCGTGCTTTCATATACTACTATATCGCCTTTTTTAAGCACTTTTGCTAAACTCGCGCTTGATTTATAAAGCGGAGTGAGATCTGGGCGATTATTTTTATCTATCGGTGTTGGAACAGTGACTATGTAAAAGTTGCACTCTTTTATATCATCTAAATTTATACTAAATTTCATACCGTTTTTTAGCACTTTGGTCATCTGTATAGCGTCAAGTTCAAGAGTTCTATCGATACCATTTTTTAGCTCATTTATTCGTTTTTCATTTAGGTCAAATCCTACAACACTAAAAGCGTCGCTAAACGCCGCAGCTAAAGGCATTCCGACGTATCCAAGACCGATAATCCCTATTTTTATATCTCTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022759|1374828:1384161|1374828_1376157_-|WP_023385738.1|DBSCAN-SWA MKIAVVGTGYVGLVSGACFAKMGNDVICIDVAEEKIQNLKQGIIPIYEPGLKEIVIEYYEKQNLRFSTDIKEALSFANVVFIAVGTPMGGDGQADLRYVLQVAKSIGEHMQRPLVVVDKSTVPVGTAHKVSEVISKEQQNRGVEIKFEVVSNPEFLKEGAAVEDFLKPDRVVVGASSEFGFNALRELYAPFMKNHNRLIEMDVKSAEMTKYAANSMLATKISFINEMATICEKVGADINMVRRGIGSDSRIGYSFIYPGCGYGGSCFPKDVEALIYTAKQNGIDPLVLKAVEDRNKAQKRVIFDKINAYFNGNLQGKTIAIWGLAFKPNTDDMREATSITIINLLIKNGAKVQVFDPKAYAEAKIYFKNLDVIYAPNKYDALNGADCLALLTEWSEFRAPDFIEMKNRLKTPIIFDGRNQYDRNILKELGFIYFEIGVANEF >NC_022759|1374828:1384161|1381060_1381879_-|WP_023385750.1|DBSCAN-SWA MKFLALLLAIFLGLKAEVMLLKEYNDENLSGWLASEKYDGVRAIWDGKNLKSRNAKIINAPKWWLKDFPSFAIDGELWSGRGEFEFISSVVNSFDDKGWENIKFMVFDVPNAKGNLRERLEVLREFLKESPNEFIRVIEQIKINSNQDAFAFLDEVISGGGEGVVVRNENAPYKNGRSGEILKLKKFKDSECRVVKLQSGKGKFEGLLGSLICVDIFSNIELKIGSGFSDEQRADPPKVGTIITYKYQNLTKYAKPRFPVFLRVRSDNNLTK >NC_022759|1374828:1384161|1380196_1380508_-|WP_023385746.1|DBSCAN-SWA MGGILGPNLANIGTLIFDTPFVGVGWVFSFNRGMFMLNAINSKYKLRLQSLNAISVFGANLLASSSVGFVLASGGWEVLNLISFGFIVLFFISFYIFRMQDNL >NC_022759|1374828:1384161|1377252_1378770_+|WP_023385741.1|DBSCAN-SWA MNLKHNLKKELLFTIATIKKFFKYKYFYKYFIFIFGLYFTGYFALIINNVNYGDDYHRATYGDFGFQIWSRFSSEFLSKIFHISLNRNVEISPLLQIIAIAILSIGSMILVKTVLKRYTFWGLAASLPLGLSPFFLENMSFKFDSVFMAISLVSPIIPFLFLKNKIAFFIISILCLELTLTTYQTGNAVYIMLSLFIILSYILEGKNYKQIIKCAMLLILAYISSLLIYKFFILNEYSGEWYASKSAFELNNLIPGVSKNLKTVLKIYEDVFKHTIFVPIFALGIIGFLFACIKVSKICKFWTLIVGLGFIVFGILLSYGAYLVLEKQIFSDRTFNGIGMFLAIIFVFLFKINIKIYKFFSKTICFILAYSLIIEATAWANVLKEQTEYAKYRVELMLHDFYKMIPKDNKFGFTSEVNKNNFMSPIALNTSKTFPIIMRNHAIDNMLDANWLFNSYGLMAHYEHWTPILSKGLCGQKDKKPVEIVENPLHKITKYDNNCFVIEFL >NC_022759|1374828:1384161|1381875_1382934_-|WP_023385751.1|DBSCAN-SWA MKILVTGTAGFIGFHLSRELARRGDTVVGFDCINDYYDINLKYARLNELGIKRENIEENIVVRSGIYPNLSFIKADLSDLKTMQKLFEESSFDCVINLAAQAGVRYSLINPHAYINSNILGFTNILECCRHHGVKNLVYASSSSVYGLNEKMPFSTHDSVNHPISLYAASKKSNELMAHTYSHLFGLSTTGLRFFTVYGEWGRPDMALFLFTKAALEGKAIDVYNYGKMKRDFTYVADIVKGIMKCVDNPATPNLAWDAKNPDPATSNAPYKIYNIGNNSPTSLMDYIKAIEIKLGREIKKNLMPLQAGDVPSTYADVSDLVEDFGYKPNTSVNDGVARFVQWYMDYYKVKI >NC_022759|1374828:1384161|1376246_1377248_+|WP_023385740.1|DBSCAN-SWA MEYIKTNSKKECEIPCHFLDKSSVSIVVPCYNEEASISIFQKEIIKILTNIKDKINSNFEYEIIFIDDGSQDKTAVEIKKLCNKFNNTHLIKFSRNFGKEAAILAGFRMAKNSSIVLIDADLQHPVYLIEKMYEIWYNNEADIIYAIRKDRKGESFLKSKLSEIFYKISNIISDVKLKPGVSDFRLMDKKVVDILVAMNEYHRFSKAMFEWVGFKKTALEYDYAPRISGKTSWSYMKLFKYAIEGMISFSTTPLKISFWIGLMISFISGAYGIFIVFDTIINGNTVKGYPSMLTIILFLGGIQLIFLGIIGQYIARIYEQVKDRPHYIVEEEI >NC_022759|1374828:1384161|1380807_1381050_-|WP_023385748.1|DBSCAN-SWA MKKVCFLAIAFAMSAGAWPINEASNAFERKYHNEGSIYRQLGQGKWECTDRYAKDSAELEWCMKGWEYMNEKLESKKRDW >NC_022759|1374828:1384161|1379151_1380144_-|WP_023385745.1|DBSCAN-SWA MNILITGGAGYIGSHVLKALLEEGGHNITVIDNFYTGSKEALVTLENINKFEFIKCDLTDTFSLREIFRTRKFEAIIHFAAYIEVFESTVKPLKYYLNNTANAANLINLAVEHGVSKFIFSSTAATYGEPSSGVVDETSEQNPINPYGRSKLMTEWILKDAALANRDFKFGILRYFNVAGASTDGLIGQNYPNATHLIKVATGTITGKRESMSIFGSDYATKDGTCVRDYIHIEDLASAHLAVLEYLKTNDSDIFNVGYGRGFSVKEVIETAKKVSGVDFKVLNAPRREGDPAMLISDASKLRNKTSWKPTRESLELIISSALEWEKKLK >NC_022759|1374828:1384161|1382943_1384161_-|WP_023385753.1|DBSCAN-SWA MRDIKIGIIGLGYVGMPLAAAFSDAFSVVGFDLNEKRINELKNGIDRTLELDAIQMTKVLKNGMKFSINLDDIKECNFYIVTVPTPIDKNNRPDLTPLYKSSASLAKVLKKGDIVVYESTVYPGVTEDECVPVLETSGLKFGVDFECGYSPERINPGDKEHTVTKIKKIISASSPKALETVEAVYSKIIKAGVYKASSIKVAEAAKVIENTQRDINIAFVNELLMIFDKMKIDTNEVLDAAATKWNFLNFRPGLVGGHCIGVDPYYLTHKAEEIGYHPEIILAGRRINDNMGIYHANQSVKMMIKNGLKVNGAKVLVLGITFKENCPDIRNSRVIDVIKELKEFGCNVDVYDPWADANDVKKEYGVELLESLNLSGHDCVILAVAHKEFAKIDFGKCLSYKIKRI >NC_022759|1374828:1384161|1378770_1379151_+|WP_023385743.1|DBSCAN-SWA MKLSSSYFLRYLCVGVFNTIVGFGVIFTLMYIGYSAEISNLIGYICGIIFSYFMNKFFTFNTKNRNKKEFIKFIIAMLISYALNLLMLKICLSLGINAYIAQLFAGAAYTVSGFLISKFWVFKLNS |
10 | Tupanvirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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