Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_022807 | Mycoplasma hyorhinis DBS 1050, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NC_022807
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
121853 : 137123
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022807|121853:137123|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022807|121853:137123|126413_127151_+|WP_014335382.1|DBSCAN-SWA MKKISIVSTPIGNLKDITLRALEILKDADVILCEDTRVSSKLLNHYQISNKHLISYHKFNEYKSLSKISLLLEQDKKIALISDAGTPLISDPGQILVEYCHNNFINLEVIPGPSAVTSAFALSGFNLPFIFIGFLKETSSQRVKQLEQFLPDISYVFFVSPYKLIATLEDIEKVFKNEAKLFLIKEMTKIHERYFLGSATDIKQALGENVKGEFTLVLRLESEIKLKVKKNKYEKYSKIFEKKVI >NC_022807|121853:137123|134489_137123_-|WP_014335387.1|DBSCAN-SWA 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14 | Streptococcus_virus(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
568192 : 577404
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022807|568192:577404|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022807|568192:577404|570303_570537_-|WP_013302284.1|DBSCAN-SWA MLKELLLGIIILISLCIMILSLLMSPHSNSFSGALVGSSDLDLFKVSKERGFRKFTKWAMFICGLLFLTIALIIRLL >NC_022807|568192:577404|573113_573998_-|WP_014335633.1|DBSCAN-SWA MNHLLTKLKTKVINFVLDFKSSWNLRLSLSLPYIIFSFIFIVIPLLLLFIKSVSPVEFENNYQSIKTNFSVVREASTWLIIWRSVYLGILTALICLIFALPYAFFVSTNKSKAFKIYAISLIVSPLVIFTIAKVFSLRALFVAIFDDEELNNQGFMLLGLVFLNFPFMVIPLYTVFRDMSKNLLEASADLGYNKFQTLIKVALPYGLKAIFSGIALVFLMAATSIVISDKLLPSGQQNQLIGNFINNSANLANPFDLAKTSSLVLITILVLLGIYGLIYFVPLAIMKFKGVEHD >NC_022807|568192:577404|576051_577404_+|WP_013302289.1|DBSCAN-SWA MSKISKIKAREVLDSRGNPTIQVEVWTEAGGHGSAIVPSGASTGTREALELRDGGTVYESNWFGGKGVQTAVDNVNNKIAVLLKGHCVLNQRKLDNMMLQLDKTENKSALGANAILGVSLAIAKAAADELKIPLYRYLGGTNAHQLPVPMLNVINGGEHASNTLDFQEFMIMPLGAKTFKQALQVANKIFHTLAKLLKKAGHGTQVGDEGGFAPNLKSHEEALDFLVKAIEEAGFRPATEGENAVAIAIDAAASELYHDGIYTFKKLKKAIEEKRQGFEPTRVQFTTEEMIQYFGHLFHTYPIISVEDGLAESDWKGFVRFTQKFGKTHQIVGDDLTVTNAKILAEAIEKKAINSILIKLNQIGTVSETLDTIELAHKAGYTTVISHRSGESEDTTIADLAVAVNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNRLLAIEEAIQSTAQYKGEKVFFNIKK >NC_022807|568192:577404|568192_570277_-|WP_014335631.1|DBSCAN-SWA MQINNEQLFAFLKQPKSFIEIARKFNITFNENAQLSSYLSHLLESHLIFKNHKGLYFSPKILSSHIGVFHSTQKGFGFVELKDHQNSVFIPAKFTSSAQDYDEVKINVFQDELKPDKTYGVVTKVISRKLKFLIGKVIKNGDYFDFEPYNSFKNEVFFRWVSTKNLVLGEFVKVEILEYQKKFLKIALVQNIANENEKFWYLKVPIVDSGVEVEFNSNIEEELKQIPDAIETIEPNRVDLRSSTIVTIDGDDTKDFDDAISVEKLENNNYKLGVHIADVSYYVKEDTFLDDEAATRGTSIYLPNMVIPMLPEKLSNGICSLNPNVDRYTITMEAEIDKYGNNLSVKIYPSVINSKARLTYNQVNKYYENQEISFTNEVKLLLDDALELAKILRKYKENQGYVNLEIEETKVILDEEGYTKDLQIKKSGISEALIEDFMVRANENVSEFLAKRKFPVIYRIHDKPDIERIEEFNGVLKSLGVNVVIPYQLDSKSFADAVEKIKEQRLDNFIKIMILRTMQKAVYSPVNHGHFGLASKFYSHFTSPIRRYPDLLLHRIIRHFLFEHKKDLLHFERILEFQSKSTSELEQRAQTLERKVVSIKKTEYFSSRIGQKYRGQITSIKKFGFFVELENNVDVLVHISDLQTNEQEEFILSDDSFTLANKFYKYQLGQFVEVEILSIDIPFGKISAKVVLKN >NC_022807|568192:577404|573978_575319_-|WP_014335634.1|DBSCAN-SWA MTNFKKDEILISLVDVEKEFDGKKILNQINLDIKKGEFVTLLGPSGSGKTTILRLIGGFEWTTRGEIKFNGVDIKDVPPHKRDTATIFQDYALFPHLSVKGNIKFGLKLKRYPLNKEEIKPATLLRLEENKKQWALKAKQKMNELNKIQIEYEKHIEDPSVDAKTKKKYQNWLDDSDFKYSYWENFVSSKVEAFEKKYLTRKITKEEMEKEIAEIIELVGLKGNENKSIFELSGGMKQRVALARSLVIEPEIVLLDEPLSALDAKIRQKMQVFLKDIQQKLGLTFVFVTHDQDEALELSDRIAVIRNGKIEQYDKAKNIYDYPVNKWVANFIGDSNFFHAKFLGNNKVLLLDKEIKTIHSEFKTNQIVDALIRPEDIDIDLNFGFFKGIVVKNSYKGSYYFVDVKVNEKIIFVETNDNYDVGQEVFLKWDLDAIHLMTKEDESLTN >NC_022807|568192:577404|570579_572304_-|WP_014335632.1|DBSCAN-SWA MKFKLKSRYKWTIFSLILLLISSLMIAFKVNLPFRPLIMNYESYLSEPGKEELEKDFDYREFGDVSEFTKAIEDKRTIGGVGSDFQIARLVQKNLIQKIDWSKLFQNSQNEKLKKGFKTPANYYSLTKKEKEVVLARKRRTFESLIRPEVVSHIDEYDKFLVDEKGNKIDSDKDGIADRFWEFFVPYYTQDKVIAYTVGDYKNKNNEIVEIKPELLKNEKYRENKAFIQEKGIKFLDQTVAEIGKTLREYGYKYFEWTEAMRDNLLLGSEKIGNYTGIVTKDNYKQQIDDFVSYIKDITNKNFADLRFNYYSSSGLDLTTNLIDIEKKPEVGFIYNGDALDAHYSKDNFDWLKDGKTINIIRPKNNLTLLDGWILLKDISSDVVDKFYNSLYNSVYKGEDLSEDQMFKMALEKARYKDPEDDQIKSGYYLDYEKLPNLANFDFINYTPSFTNTFEFFKKTYFNDNVETVNALDDNNVETGDEIDLIKDKNGIVAANEATPTIAFEQLAATAEERASLFGLNIYLSQQPKQTIYGQRPEDFPNDTTYDIHYSFIAPVDENLDSNIRTYYIIKTKS >NC_022807|568192:577404|572293_573121_-|WP_013302286.1|DBSCAN-SWA MTRILDYIKEKEIWKKSYVWLILILFYIPIIFGAFFSFNAPSKKGFISTTWNSFSLQAFRDLSTKNFASALVNSIIIALVTALIVIIISLITVFALWKQRNKTVKSYVNISSNIPLINPDVITAVAMAIILSLLFGTLVATKEGLLRSIVSHIVMTLPYGILLLYPRSEKFSKTLFEASQDLGYNKFKTWFLIYLKYMIPAIILASVVIIFLSFDDFIITKITSNAQTVGTLLYQGTFKTWALLLGAIMLTMIVIGNVIWIRYKLNKSKRGKNEI |
7 | Mycoplasma_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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