Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022886 | Helicobacter pylori BM012A, complete sequence | 3 crisprs | c2c9_V-U4,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022886_1 | 653278-653375 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022886_1
|
1 spacers
spacers of NC_022886_1
>1.1|653301|52|NC_022886|CRISPRCasFinder TTCATTTTTAAAATTATCGCTTGCTTTTGGCAAGCTCTTTGATTGTTGGTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022886_1
The CRISPR arrays of NC_022886_1 >merge|NC_022886|1|653278-653375|CRISPRCasFinder TTAAAAACGCTAAAAAGGATTTTTTCATTTTTAAAATTATCGCTTGCTTTTGGCAAGCTCTTTGATTGTTGGTTATAAAAAACGCTAAAAAGGATTTT >NC_022886|1|1|653278-653375|CRISPRCasFinder TTAAAAACGCTAAAAAGGATTTT TTCATTTTTAAAATTATCGCTTGCTTTTGGCAAGCTCTTTGATTGTTGGTTA TAAAAAACGCTAAAAAGGATTTT
>NC_022886.1|WP_023591950.1|652828_653083_-|hypothetical-protein MPNSSTKKDYTKYSEKQLVNLIHQLERKIKKMQNDRVSFKEKMAKELEKRDQNFKDKIDALNELLQKISQAFDDKRDCCKTRQS >NC_022886.1|WP_023591949.1|651273_652419_-|YbfB/YjiJ-family-MFS-transporter MRVFVCFLGVFVSNGLARFGYVVLIPLLILSGSLTPHQSFQLGIAVLMGYVFGSFLIQFLSPLMSLESIAKISFGLIALSFLICYFDSIPFFWLWIWRFIAGVASSALMILVAPLSLPYVKEHKKALVGGLIFSAVGIGSVFSGFVLPWISSYNIKWAWIFLGGSCLIAFILSLVGLKTRSLRKKSVKKEESAFKIPFHLWLLLISCALNAIGFLPHTLFWVDYLIRHLNISPTIAGTSWAFFGFGATLGSLISGPMAQKLGAKNANIFILILKSIACFLPIFFHQISLLNLSIFIMGAATTANINLFSMMALKIAGAKHFAKASSWVVFSFGIFQALFSYLFTIFLGDLGYVLIFVICGACLVLSFIVLFPIKMQTAINK >NC_022886.1|WP_023591948.1|650305_651268_+|GTP-binding-protein MPKIPITLITGFLGSGKTSFLSEYLNQIDHQGVALIINEIGQAALDQRILSVQYCGEKMLYLNAGCVCCNKRLDLMESLKATLNNYEWRGEILRRIIIETTGLANPAPILWTILSDTFLGAHFEIQSVVACVDALNARTHLTNNEAREQIVFADSVLLTKTDLQNDSAALMKLKERLQSINPSAEIFDKRAIDYESLFSRKNRAHRVILPAKDSHSQGFETLSINFEGAMEWSAFGIWLSLLLHQYGTQILRIKGIIDIGSGFLVSVNGVMHIVYPPKHILKDQNGSHLVFITRHLEREKILNSLKGFKDFLGIKGFETP >NC_022886.1|WP_023591947.1|649943_650306_+|hypothetical-protein MCVLCGELISSFHWSDENYGSDENLKEPNALISTNENARERKRARLKRVRLLNQILAFYGLKINDWQGAKFVLCDKKGQSVIVNDLGDLWGKAQKLAKKEMDALDSNLLAFLNQNTQATH >NC_022886.1|WP_023591946.1|648740_649850_-|site-specific-DNA-methyltransferase MQDYRTLTLENIYAPDEITDALSLLQSCGIESIVNPSNITLNFDIVDLKMLESTTQNTLVQKTLEELYKIRSFSSQNGKIVFKSFNKAKKVANKKQNAKARLTYESYKKEFSKETNEIQSCLNQIYCEDSLEFLKKLPNNCIDIVLTSPPYNFGINYNATQDTNLWQEYFNTLFAIFKECIRVLKSGGRIIVNIQPMFSDYIPTHHFISKFFIDEGLIWKGEILWEKNNYNCKYCTWGSWKSPAAPYLKYSWEFIEIFCKNSLKKEGDKDSIDITDDEFKKWVYGKWNFAPERNMKQYGHDAMFPEELVKRCLKLFSYQNDIILDPFNGAGTTTKVAKQLGRHFIGIDISEKYCEVARARLKEVTNLFN >NC_022886.1|WP_023591945.1|648037_648730_-|hypothetical-protein MSSIEDIIRVYNSVVKDIDKDAQEQDSRAYGGVIRSAKGKLLEHISEEIVKIAWQNIGAKADRLEINSNKIKIPIKDSYIENIANKQVRAYILERKKDYYYGLSVDKHIFVDNQLVMGIECKAYTENAMLKRILVDFHLLKTLYPNISCYLFQLESQLGGDYSALPETLLGSKPTHSIMSYFESVNLNIVTLLKGERDINQPIHKNFKPLDEQILNKTIKLMENELKVYS >NC_022886.1|WP_023591944.1|647102_647984_+|polysaccharide-deacetylase MAKEILVAYGVDIDAVAGWLGSYGGEDSPDDISRGLFAGEVGIPRLLKLFKKYHLPATWFVPGHSIETFPEQMKMIVDAGHEVGAHGYSHENPIAMTAKQEEDVLLKSIELIKDLTGKAPTGYVAPWWEFSNITNELLLKHGFKYDHSLMHNDFTPYFVRVGDSWSKIDYSLEAKDWMKPLIRGVETDLVEIPANWYLDDLPPMMFIKKSPNSFGFVSPHDIGQMWIDQFDWVYREMDYAVFSMTIHPDVSARPQVLLMHEKIIEHINKHEGVRWVTFNEIADDFLKRNPRKK >NC_022886.1|WP_023591943.1|646211_647090_+|carbon-nitrogen-hydrolase-family-protein MKAKNPAKRILKTAVIQMQSKPYALNENLQLALNLAKEAHNKGANLIVLPELFDSGYCVNDKDAEFGIDFKAIEHGELKNESLRALNNFAKSNKVHLVACSIEKTNKKLYDSAYIISPKGKIVGKHRKIYLWGDEKSRFRRGKKYEVFTLDFGDFSAKVGLQICYEIGFGVGANLLALQGAEILIYPSAFGKARAYNWDLLSRARALENGCFVCACNHSGEETNAQLKQTLEFAGDSRIIAPNGKIIAQATKLNEVVIAEMDLNEVALQRQKIPYLQDFDTKLTKKGFGKLT >NC_022886.1|WP_023591942.1|645723_646128_+|hypothetical-protein MCQIKCLLVLLSINIVSAIIVYFFQAFQGVLNFEGGFLGFFIVALSSYYGVKKRLDLRKQNSIEKEEKQKFQKFALGLEMSFNVWRLGGYGVLLGILGALLFLHLFNGLIFLIGVFVSSLSSALLRFLNNNGKF >NC_022886.1|WP_001885479.1|645444_645708_+|AtpZ/AtpI-family-protein MKKPKYYKFIEGANYLSLGLSMVVAILMGVAIGYGLKKLTHVSWLFWLGVIWGVLASFLNVYKAYKNMQKDYEELAKDPKYTQNKTK >NC_022886.1|WP_023591952.1|653737_655969_-|Hop-family-adhesin-BabA MKKHILSLTLGSLLVSTLSAEDDGFYTSVGYQIGEAAQMVTNTKGIQQLSDNYEKLNNLLTRYSTLNTLIKLSADPSAVNAARENLGASAKNLIGDKANSPTYQAVLLAINAAVGFWNVLGYATQCGGNADGQESTSSTTIFNNEPGYRSTSITCSLNGYKPGYYAPMSIENFKKLNEAYQILQTALKNGLPALKENNGTVNVTYTYTCSGEGNNNCSSKATGVSKQDGGTKTETKTIDGKSVTTTISSKVVNSGASSNTSHVSYTEITNKLDGVPNSAQALLAQASTLINTINSACPFFSVTNNSSPNAPKMEPTKGKLCGFTEEISAIQKMITDAQELVNQTSVINNHEQSTPIGNNNGKPFNPFTDASFAQGMLANASAQAKMLNLAHQVGQTINPENLTGNFKNFVTGFLATCNNKSTAGTNGTQGSAPGTVTTQTFASGCAYVGQTITNLENSIAHFGTQEQQIEQAENIADTLVNFKSRYGELGNTYNSITTALSSIPNAQSLQNVVSKKNNPYSPQGIETNYYLNQNTYNQIQTINQELGRNPFRKVGIVSSQTNNGAMNGIGIQVGYKQFFGQKRKWGARYYGFFDYNHAFIKSSFFNSASDVWTYGFGADALYNFINDKATNFLGKNNKLSVGLFGGIALAGTSWLNSEYVNLATVNNVYNAKMNVANFQFLFNMGVRMNLARPKKKGSDHVAQHGIELGLKIPTINTNYYSFMGAELKYRRLYSVYLNYVFAY >NC_022886.1|WP_023591953.1|656268_657024_-|HugZ-family-heme-oxygenase MLNRIIEHMNAHHVEDMKGLLKKFGQVHHAENVAFKSVDPQGIVIGYNHNQTLRIEFNHEVKDPKDYKNAIIELCQSVEKTHDLKGVEEEVKAFKESFDSVCLATLHPSGHVVCSYAPLMSDGKQYYIYVSEVAEHFAGLKNNPHNVEVMFLEDESKAKSAILRKRLRYKTNARFIERGAEFDKAFDSFIEKTGGAGGIKTIRTMQDFHLIALDFKEGRFVKGFGQAYDILGDKIAYVGDKGNPHNFAHKK >NC_022886.1|WP_023591954.1|657084_658710_-|arginine--tRNA-ligase MHTLIKGVLEEILEEEVIIEYPKDREHGHYATPIAFNLAKVFKKSPLVIAEELALKISAHEKTQGLFDSVVACKGYINFTLSLDLLERFTQKALELKEQFGSQIKSERSQKIFLEFVSANPTGPLHIGHARGAVFGDSLAKIARFLGHEVLCEYYVNDMGSQIRLLGLSVWLAYREHVLKESVTYPEVFYKGEYIIEIAKKANNDLEPSLFKENEETIIEVLSGYAKDLMLLEIKDNLDALGIHFDSYASEKEIFKHKDAVFERLEKANALYEKDSKIWLKSSLYQDESDRVLIKEDKSYTYLAGDIVYHDEKFKQNYTKYINIWGADHHGYIARVKASLEFLGYDSNKLEVLLAQMVRLLKDNEPYKMSKRAGNFILIKDVVDDVGKDALRFIFLSKRLDTHLEFDVNTLKKQDSSNPIYYIHYANSRIHTMLEKSPFSKEEVLQTPLTNLNAEEKYLLFSALSLPKAIESSFEEYGLQKMCEYAKTLASEFHRFYNAGKILDTPKAKELLKICLMVSLSLSNAFKLLGIEIKTKISAKD >NC_022886.1|WP_000508588.1|658712_658952_-|twin-arginine-translocase-TatA/TatE-family-subunit MGGFTSIWHWVIVLLVIVLLFGAKKIPELAKGLGSGIKNFKKAVKDDEEEAKNEPKTLDAQATQTKVHESSEIKSKQES >NC_022886.1|WP_000551229.1|659022_659643_-|guanylate-kinase MHNDFNLLILSGPSGAGKSTLTKYLQEKIPKTHFSLSTTTRKPREGEVDGLHYNFVSEEEFKQGIEKGQFLEWAIVHNHYYGTSKIPVEKALKEGKIVIFDIDVQGHEILKKHYPNACSVFISTKNQEILKERLLLRGTDSKETIEKRLINAYKEMQCLESFDYLIINEDLEKSKEIILSIAKTLVHRLKAFNFEKICKAWKNESL >NC_022886.1|WP_023591955.1|659635_661240_-|hypothetical-protein MKMILFNQNPMITKLLESVSKKLELPMENFNHYQELSACLKEDPEWILIADDEYLEKLDQADWLELKEIISQNKNSVCMYKKGNEAQPFLEGFEMKIKKPFLPTEVLKILQKKLGSNINELEPSQNLDPTQEVLETNWDELENLGDLEALVQEEPNNEEQLLPTLNDQKEKEEVKEEVKETPQEKEKPKDDEIQEGETLKDEEVSKELETQEELEIPKEETQEQAKEQEPIKEETQEEPIKEETQEIKEEKQEKTQDSPSTQELEAMQELVKEIQENSNEDKKEIQENTETPQDVEIPQAQDKETQELEIPKEETQENAETPQDVENQAQEIQDKEIQETQEIQENTETQESAEIPQDVEIPQDVEIPQDVEIPQDVEIPQDVENPQETPQEKETPQTQEKETPKDENTQESVQNLQEKEIQEAQDETPQEDHYESIEDIPEPVMAKAMGEELPFLNEAAAKIPNNENDIKTPKESDIKTPQEKEESDKTSSPLELRLNLQDLLKSLNQESLKSLLENKTLSIKITLEDKKPNA >NC_022886.1|WP_023591956.1|661381_661924_+|endonuclease MLNKFKKIVGVSVLVGCLGVLQAKNSLFVLPYEQRDALNSLVSGISNARESVKIAIYSFTHRDIARAIKSVASRGIKVQIIYDYESNHNNKQSTIGYLDKYPNTKVCLLKGLKAKNGNYYGIMHQKVAIIDDKIVFLGSANWSKNAFENNYEVLLKTDDTETILKAKSYYQKMLGSCVGF >NC_022886.1|WP_162146321.1|661932_662670_-|outer-membrane-beta-barrel-protein MRTLLKMLVGASLLTHALIAKEESAAPSWTKNLYMGVNYQTGSINLMTNIHEVREVTNYQTGYTNIITSVNSVRKLTNMGSNGIGLVMGYNHFFHPDKILGLRYFAFLDWQGYGMRYPKGYYGGNNMITYGVGVDAMWNFFQGSFYQDDISVDIGVFGGIAIAGNSWYIGSKGQELLGITNSRAVDNTSFQFLFNFGLKALFVDEHEFEIGFKFPTINNKYYTTDALKVQMRRVFAFYVGYNYHF >NC_022886.1|WP_023591958.1|662799_663513_+|flagellar-basal-body-L-ring-protein-FlgH MKKALYLGAVAFSVAFSMVSANEPKIDFNPPSYVEETPSKEFIPELNKLGSLFGQGERPLFADRRAMKPNDLITIIVSEKASANYSSSKDYKSASGGNSTPPRLTYNGLDERKKQEAEYLDDKNNYNFTKSSNNTNFKGGGSQKKSEDLEIVLSARIIKVLENGNYFIYGNKEVLVDGEKQILKVSGVIRPYDIERNNTIQSKFLADAKIEYTNLGHLSDSNKKKFAADAMETQMPY >NC_022886.1|WP_023591959.1|663530_664214_+|pseudaminic-acid-cytidylyltransferase MRAIAIVLARSSSKRIKNKNIIDFFNKPMLAYPIEAALNSKLFEKVFISSDSMEYVHIAKNYGASFLNLRPKVLADDKATTLEVMAYHMKELELKDEDIACCLYGTSALLQEKHLKNAFETLKENTDYVFTCAPFSASPYRSFSLENGVQMAFKEHFNTRTQDLKTLYHDAGLLYMGKAQAFKEMRPIFSPNSIALELSPLEVQDIDTLEDLELAKLKYSRLKNACQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022886_2 | 1337084-1337223 | TypeV-U4 |
NA
Consensus repeat of NC_022886_2
|
1 spacers
spacers of NC_022886_2
>2.1|1337134|40|NC_022886|CRISPRCasFinder CTCTCCATCATGCTTGCCCTCTAGGGTTTCTTTGCTTTGT |
c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022886_2
The CRISPR arrays of NC_022886_2 >merge|NC_022886|2|1337084-1337223|CRISPRCasFinder AATTCTTCTAGTTTTTTTGAAATGATTTCTTCAGTAACGCTAGAGAGCCTCTCTCCATCATGCTTGCCCTCTAGGGTTTCTTTGCTTTGTAATTCTTCTTGTTTTTTTGAAATGATTTCTTCAGTAACGCTAGAGAGCCT >NC_022886|2|2|1337084-1337223|CRISPRCasFinder AATTCTTCTAGTTTTTTTGAAATGATTTCTTCAGTAACGCTAGAGAGCCT CTCTCCATCATGCTTGCCCTCTAGGGTTTCTTTGCTTTGT AATTCTTCTTGTTTTTTTGAAATGATTTCTTCAGTAACGCTAGAGAGCCT
>NC_022886.1|WP_038420164.1|1336705_1337044_-|lysozyme MLRLNKLILAASFLIVDSEGFSPSVYTDKTGHPTIGYGYNLSVYSYWGKRITKAYGLLTDILKKNHKALLSYGWYKNLDAMRRMVILDLSYNLGLSGLLKFKQSIKAIEETE >NC_022886.1|WP_023592477.1|1335324_1336206_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MPFVEEEFEILKPTKALFLVRDVLKCSLKEAQRHLDKQRLKHNQQVVRKSQMIQGVVSLIHFKPNEKTQVLVFETKDFGVFDKPHQVYTHPKGYFYHESLLDCIQSHFSKNAHPAHRLDYETSGLVLAGKTLQSVKDLKALFMQKKVKKTYLALAHGLVEKSMKIDKPILTPQNIQKDLRIRSKISPLGKPSITLVEPLSYNPFLDISLLKITPLTGRTHQIRLHLSSINHRIVGEGLYGVADENAREYLQLKRENNAPLLMLHASSLEFEFKGANYKITSQIPKRFMPFLKD >NC_022886.1|WP_023592476.1|1333774_1335325_+|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKQKLKAQIKERVASIAYNEKGFPSPFLFKDLKKAALKIIEAMQINTEILVVGDYDADGVISSAIMAKFFESLNYKHVRIIIPNRFIDGYGISKKFLEKHHAPLIITVDNGINAFEAARFCKEKNYTLIITDHHCLHHDEIPDAYAVINPKQPDCDFIQKEVCGALVAFYLCYGIHQLLGKEKSHSSELLCLAGVATIADMMPLTFFNRFLVSKALYFLQKESLGAMGFLRQREVFRKRSLKASDISFNIAPLINSAGRMQDAKMALDFLSANNFQDGYFLYERLKACNLKRKMIQQQVFEEAFKHAMVGEKIIVAFKDDWHEGVLGIVASKLVEATQKPSLVFTFKEGVYKGSARSSSNIDLIDALNGVSSLLLGYGGHRQACGLSVGKNNIISLFETLENFDFKVLPFCKTEPPLTLKLKDIDRELLEIIEAGEPYGQENPEPLFQARNLEVIEEKIIKESHQILRFKDKECVKEAIYFNAERFLKAGEKVSAIFSVELDECSNEPKMFVKSLL >NC_022886.1|WP_023592475.1|1332149_1333766_+|CTP-synthase-(glutamine-hydrolyzing) MDRAKFIFVTGGVLSSLGKGISSSSIATLLQHCNYQVSILKIDPYINIDPGTMSPLEHGEVFVTSDGAETDLDIGHYERFLNRNLTRLNNFTTGQIFSSVIENERKGEYLGKTIQIVPHVTDEIKRRIRSAAKGLDFLIVEVGGTVGDMEGMFYLEAIRQLKLELGNEKVINVHVTLIPYIQTTNELKTKPTQHSVQELRRLGVTPQIILARSPKPLDKELKNKIALSCDVEQDSVIVATDTKSIYACPILFLQEGILTPIARRFNLNKLHPKMAAWNTLVEKIIAPKHKVKIGFVGKYLSLKESYKSLIEALIHAGAHLDVQVNIEWLDSENFNEKTDLEGVDAILVPGGFGERGIEGKICAIQRARVEKLPFLGICLGMQLAIVEFCRNVLGLKGANSTEFNQRCEYPVVYLIGDFMDQNHQKQVRTYNSPLGGTMRLGEYECEIMPNSLLEKAYKKPNIKERHRHRYEINPKYRQEWENKGLKVVGFGANHLIEAIELEDHPFFVGVQFHPEFTSRLQSPNPIILDFIKSALHKS >NC_022886.1|WP_023592474.1|1331223_1331892_-|hypothetical-protein MAENSFKNVSTQPKVFFLLPVKTLFLLGGIFSAFFILIAGLVFFDYAHLMDNAIFNFARSTPFNSSPILTLILQNIANLGSSQFVLPLSLLVGVFLSLYRRNLALGVWFVLSVILFEALLESLKHLFAHPVQWLSHSANFPNATALSLTLFYGLLILLIPHLITHQTLKNVLFYSLFGLIFLIGLALIVLGVSFSSVLGGFCLGALGACFSIGIYLSVFQKI >NC_022886.1|WP_023592473.1|1329476_1331180_-|flagellar-M-ring-protein-FliF MDLKVLLQRIVDFFIKLNKKQKIALIAAGVLITALLVFLLLYPFKEKDYTQGGYGVLFEGLDSSDNALILQHLQQNQIPYKVSRDDTILIPKDKVYEERITLASQGIPKTSKVGFEIFDTKDFGATDFDQNIKLIRAIEGELSRTIESLNPILKANVHIAIPKDSVFVAKEVPPSASVMLKLKPDMKLSPTQILGIKNLIAAAVPKLTIENVKIVNENGESIGEGDILENSKELALEQLHYKQNFENILENKIVNILAPIVGGKNKVVARVNAEFDFSQKKSTKETFDPNNVVRSEQNLEEKKEGAPKKQVGGVPGVVSNIGPVQGLKDNKEQEKYEKSQNTTNYEVGKTISEIKGEFGTLVRLNAAVVVDGRYKIALKDGANALEYEPLSDESLKKINALVKQAIGYNQNRGDDVAVSNFEFNPITPMLDNATLSEKIMHKTQKILGSFTPLIKYVLVFIVLFIFYKKVIVPFSERMLEVVPDEDKEVKSMFEEMDEEEDELNKLGDLRKKVEDQLGLNATFSEEEVRYEIVLEKIRGTLKERPDEIAMLFKLLIKDEISSDNAKG >NC_022886.1|WP_000201853.1|1328427_1329459_-|flagellar-motor-switch-protein-FliG MATKLTPKQKAQLDELSMSEKIAILLIQVGEDTTGEILRHLDIDSITEISKQIVQLNGTDKQIGAAVLEEFFAIFQSNQYINTGGLEYARELLTRTLGSEEAKKVMDKLTKSLQTQKNFAYLGKIKPQQLADFIINEHPQTIALILAHMEAPNAAETLSYFPDEMKAEISIRMANLGEISPQVVKRVSTVLENKLESLTSYKIEVGGLRAVAEIFNRLGQKSAKTTLARIESVDNKLAGAIKEMMFTFEDIVKLDNFAIREILKVADKKDLSLALKTSTKDLTDKFLNNMSSRAAEQFVEEMQYLGAVKIKDVDVAQRKIIEIVQSLQEKGVIQTGEEEDVIE >NC_022886.1|WP_080261103.1|1327661_1328441_-|flagellar-assembly-protein-FliH MSLNSRKNLIQKDHLNKHDIQKYEFKSMANLPPKTNPNGASLETPNHPEEPLEKKAIENDLIDCLLKKTDELSSHLVKLQMQFEKAQEESKVLIENAKNDGYKIGFKEGEEKMRNELTHSVNEEKNQLLHAITALDEKMKKSEDHLMALEKELSAIAIDIAKEVILKEVEDNSQKVALALAEELLKNVLDATDIHLKVNPLDYPYLNERLQNASKIKLESNEAISKGGVMITSSNGSLDGNLMERFKTLKESVLENFKV >NC_022886.1|WP_023592471.1|1325808_1327659_-|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-synthase MQNKTFDLNPNDIVGLELVCQTLRSRILEVVSANGGHLSSSLGAVELIVGMHALFDCQKNPFIFDTSHQAYAHKLLTGRFESFSTLRQFKGLSGFTKPSESAYDYFIAGHSSTSVSIGVGVAKAFCLKQALGMPIALLGDGSISAGIFYEALNELGDRKYPMIMILNDNEMSISTPIGALSKALSQLMKGPFYQSFRSKVKKILSTLPESVNYLASRFEESFKLITPGVFFEELGINYIGPINGHDLSAIIETLKLAKELKEPVLIHAQTLKGKGYKIAEGRYEKWHGVGPFDLDTGLSKKSKSAILSPTEAYSNTLLELAKKDEKIVGVTAAMPSGTGLDKLIDAYPLRFFDVAIAEQHALTSSSAMAKEGFKPFVSIYSTFLQRAYDSIVHDACISSLPIKLAIDRAGIVGEDGETHQGLLDVSYLRSIPNMVIFAPRDNGTLKNAVRFANEHDSSPCAFRYPRGSFALKEGVFEPSEFVLGQSELLKKEGEILLIGYGNGVGRAHLVQLALKEKNIECALLDLRFLKPLDPNLSAIIAPYQKLYVFSDNYKLGGVASAILEFLSEQNILKPVKSFEIMDEFIMHGNTALVEKSLGLDTESLTDAILKDLGQER >NC_022886.1|WP_023592470.1|1324003_1325794_-|elongation-factor-4 MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLADCLISECNAISNREMKSQVMDTMDIEKERGITIKAQSVRLNYTFKGEDYVLNLIDTPGHVDFSYEVSRSLCSCEGALLVVDATQGVEAQTIANTYIALDNNLEILPVINKIDLPNANVLEVKQDIEDTIGIDCSNANEVSAKAKLGIKDLLEKIITTIPAPSGDFNAPLKALIYDSWFDNYLGALALVRIMDGSINTEQEILVMGTGKKHGVLGLYYPNPLKKIPTKSLECGEIGIVSLGLKSVTDIAVGDTLTDAKNPTFKPIEGFMPAKPFVFAGLYPIETDRFEDLREALLKLQLNDCALNFEPESSVALGFGFRVGFLGLLHMEVIKERLEREFSLNLIATAPTVVYEVHLTDNSIKYIQNPSELPPENHIACIKEPFVRATIITPSEFLGNLMQLLNNKRGIQEKMEYLNQSRVMLTYSLPSNEIVMDFYDKLKSCTKGYASFDYEPIENREAHLVKLDVRVAGDVVDALSIIIDKNKAYEKGRALVETMKELIPRQLFEVAIQASVGNKIIARETIKSVGKNVTAKCYGGDITRKRKLLEKQKEGKKRMKAIGKVELPQEAFLAILKID >NC_022886.1|WP_038420166.1|1337605_1337911_-|hypothetical-protein MKIMHQVKDFLDFCKQTIHKNSNEAFQKTKRALFKEKSQKIREQAVKIVEKRLKKEGMKLSDFNEEELKIIFEAEEKRLLEQIQTKHFKEVWEKGDNEQGK >NC_022886.1|WP_080261104.1|1338098_1338575_-|sel1-repeat-family-protein MPPKQSRSLQTSFRKSYGRGVEKNLIKAAYFYSKACDLKDGGGCGNLGVLYQNGQGVEKDLTKAAYLYSKACELKDGLGCKDLGSLYYNGKGVEKNLIKAAQLYTKACELKEGGGCGALGGLYYNGDGVKRDSKKAAQYISKACKLGDQEACEALKEK >NC_022886.1|WP_023592489.1|1342206_1342539_-|hypothetical-protein MKIIIDNSGSMNENGKKEALQLWLLAFEQLAKNKNTDMQKWDLKGLKGEFEDALLLNDGHFTEEIQVKSSVAFGADANMIKLKEISSKVFDSAEIFQVLHFMKKVDAIKQ >NC_022886.1|WP_023592490.1|1344372_1345236_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MSDCKMSRVSRELFNNIKSFLHHKLKTMIRIQSVNDLQLVLKWQDRVLECQSLIALKELNRKLYNQGIRHTIMMQGLFLFFEYFDNRIKLKSLHDLAEEQVIDFLFGLAKNRKPSSMAKYVMYLRQFFDYLDKKRNYSFDFELKNLSFAKKETHLPKHLNKNDFKAFVQALLKYHPKTSFEKRNQCILLLIALGGLRKFEALDLELKNIALENNHYRLLIKGKNNKERYAYIEKEFLQIPLNAWLSDTKRLKSFKGRFVFKKAKNNTTQKTCSLKGYKQKLKYYNNL >NC_022886.1|WP_023591539.1|1345286_1345940_+|IS607-like-element-IS607-family-transposase MNKRMLSIGQASKLLGVTIQTLRNWDKKDLLKPDELTKGGERRYKLESLRRINRNIVFNQDELKTIAYARVSSHDQQDDLIRQVQVLELYCARCGFNYEVIQDLGSGMNYYKKGLTKLLNLILDNQVKRLVLTHKDRLLRFGAELVFSICEAKEVEVVIINKGDENVRFEEELAKDVLEIITVFSARLYGSRSKKNKKLLDEMQEVITNNVSYLNHA >NC_022886.1|WP_023591540.1|1345914_1347174_+|transposase MSAISITHKIALKPNNKHITYFKKAFGCARLAYNWGLAKWKENYQLGIKTNHLQLKKEFNALKKSQFNFVYEVTKYATQQPFIHLNLAFNKFFRDLKKGLVSYPKFKKKREFQGSFYIGGDQIKIIQTVNTDYLKIPNLPPIKLTEKLRFQGKIHNATITQKGDHFYVSISCGIDESEYKRTHKLQESHNKLGIDIGIKSFVSLSNGLNIYAPKPLDKLTRKLVRISRQLSKKIHPKTKGDKTKKSNNYLKHSKKLTHLHEKIANIRLDFLHKLTSSLIRHSSSFCLESLKVKNMFKNHRLAKSLSDVSMSVFNTLLEYKAKYSNKEILRADTYYPSSKTCSNCQKVKQDLKLKDRVYQCLECGFELDRDINAAINLLKHLVGRVTAEFTPMDLTALLNDLSNNRLATSKVELGIQQKS >NC_022886.1|WP_023592491.1|1347269_1347548_+|hypothetical-protein MFKSRLNSWILLGIFGLLVVVFWDVIKYKIEDLKHAHYLSQVKEREEYYKNHIEEALKKDSECLEKGGDKADCSAAMRIAAGERIRRMLEIK >NC_022886.1|WP_023592492.1|1347549_1348812_+|P-type-conjugative-transfer-protein-TrbL MAAPLLALPFLSNPLVLGALAVIGTGAYLLYNKQDSLVMQADGLYSDILGFFISFSNKILKEIGEPLANVVQPFGMVLGVLLILLYSFKRYQNNDLFEIKTFLMLFVFVGYLSLYHYAFKSDGSSSVNGRSSFAFQNHVTEIFDAPANLLNAGISNVVKEYQTNSAGEYKKIDARHSITNANISFHVRQILSSLNKLYEVFTINNGLSPKTLIAAVLLLVILGLEFFLLFKVFCYVFMTYLEKIIYLSLVIFMLPLGFFQQTRGFLVSYVKKIISLTFYMPLLLLLVLFNSFALQYAIKVGGSNEIVAKFGIIVVIGISLAFIQKVPEMINAIFGTQGGLTDAKSFVYQGVQIASAGAGAIAGSLKSAGRSAFGRTLESYKDAKSTINSTTANMRDMPGHPGVRVGVETIELPKSHRASK >NC_022886.1|WP_038420169.1|1348884_1349568_+|hypothetical-protein MQDLQHFKNDITLILSRERLDTYDSLEQYKENLKLISFITPKISSLEIYLRNALDYCLTQIKGSDWVFSEYSLTNLINEQKEKKKEITHSLILSKMSLGAVIRLIFCYKLEGVILDLKRINFKSYYPNNKNALFINNKKNPLSSASKVHIALNLLWTIRNRAYHWENLLKTKPNNRPRITTYFTGLKDNDRAKIPMNISVEPSKIVLFLDDLIKSIGNKDLENLSSL >NC_022886.1|WP_023592495.1|1349855_1350533_-|type-IA-DNA-topoisomerase MKDSVIIIESPNKVEKIKQLTGAEVYATIGHFTNLIGVDIENNFACKFEIKEDKAKKINFLINACRDKKVYIATDPDREGYGIGYQFYEKIKNVASEIYRAEFHEITPSGIESGLKNAVLFSRSNTNLYQSFLGRIASDQVVGFALTSYLRKSLNLSELSAGRVQTPALALICQRDQEIRDFDKLDAEEKVEYQIQANIVCNEKEAIIKHVRVLSLKFLSSLILM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022886_3 | 1445086-1445170 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_022886_3
|
1 spacers
spacers of NC_022886_3
>3.1|1445111|35|NC_022886|CRISPRCasFinder CGCTTCAAGGGAGTTTTCTTTGATCTCTGCATGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022886_3
The CRISPR arrays of NC_022886_3 >merge|NC_022886|3|1445086-1445170|CRISPRCasFinder CATGCGAGAAGTAGTGGTTCAAGAACGCTTCAAGGGAGTTTTCTTTGATCTCTGCATGGGCATGCGAGAAGTAGTGGTTCAAGAA >NC_022886|3|3|1445086-1445170|CRISPRCasFinder CATGCGAGAAGTAGTGGTTCAAGAA CGCTTCAAGGGAGTTTTCTTTGATCTCTGCATGGG CATGCGAGAAGTAGTGGTTCAAGAA
>NC_022886.1|WP_023592564.1|1443860_1444907_+|NAD(P)-dependent-alcohol-dehydrogenase MRVPSKGFAIFSKDGHFKPHDFSRHAVGPKDVLIDILYAGICHSDVHSAYSEWKEGIYPMVPGHEIAGVIKEVGKEVKKFKVGDVVGVGCFVNSCKACKPCKEHQEQFCTKVVFTYDCLDSFHDNEPHMGGYSNNIVVDENYVISVDKNAPLEKVAPLLCAGITTYSPLKFSKVTKGTKVGVAGFGGLGSMAVKYAVAMGAEVSVFARNEHKKQDALSMGVKHFYTDPKQCKEELDFIISTIPTHYDLKDYLKLLTYNGDLALVGLPPVEVAPALSVFDFIHLGNRKVYGSLIGGIKETQEMMDFSIKHNIYPEIDLILGKDIDTAYHNLTHGKAKFRYVIDMKKSFD >NC_022886.1|WP_001126880.1|1442680_1443691_+|glucokinase MPKTETYPRLLADIGGTNARFGLEVAPRQIECIEVLRCEDFESLSDAVRFYLSKCKESLKLHPIYGSFAVATPIMGDFVQMTNNHWTFSIETTRQCLDLKKLLVINDFVAQAYAISAMQENDLAQIGGIKCEINAPKAILGPGTGLGVSTLIQNSDGSLKVLPGEGGHVSFAPFDDLEILVWQYARSKFNHVSAERFLSGSGLVLIYEALSKRKGLEKVAKLSKAELTPQIISERALNGDYPICRLTLDTFCSMLGTLAADVALTLGARGGVYLCGGIIPRFIDYFKTSPFRARFETKGRMGAFLASIPVHVVMKKTPGLDGAGIALENYLLHDKI >NC_022886.1|WP_023592563.1|1442010_1442694_+|6-phosphogluconolactonase MGYQLFEFENLKDCHKALIERFKEFFNTALKKHHQVSIAFSGGRSPIGLLQKLSVLDLKWHACLISLVDERIIDTSHKDSNTKLLHDYLLQNNALKASFTPLLPKKISGDTNALFHFANQHFKQPHLAILGMGTDGHTASLFPETSAFLNEEKENIVLTKPINAPYERLSMSVNALENCEKLFLSISGVEKRGVLERALKENAPYSLPIARILHSKKVTTEVFYAKN >NC_022886.1|WP_023592562.1|1440722_1442000_+|glucose-6-phosphate-dehydrogenase MLDFDLVLFGATGDLAMRKLFVSLYEIYTHYGFKKDSKIIASGRKELSDEEFLALLCEKTQLHSREKGEEYLAHISYFCVRLDNPKDFEELSKIATKNKPLIFYFSISPSFFATTAQHLAKNALNHANTRLILEKPLGHDLKTCKEIFQSISAFFKEEQIFRIDHYLGKKGVQNILELRLNNPILNILWDQISAVEICVYETLGVEERGEFYDKIGALRDMVQNHLLQVLSLIATDLPNDLKDLRKEKIKVLKTLQPPKDFKKQVIRAQYQGYRDENKVHKESQTETFIAIKAFLDTPKFKGVPFYLKHAKKMPRNQASVKIHFNAVNTLEFFLSQDKITLTLQDHQNPLILETHNKQEFLQPYAKLLYDAIQNNHNNFAHQLELEASWVFIDTLIEGFMNNATPLYSYESHHLNESEFLKPLYQ >NC_022886.1|WP_023592561.1|1438829_1440656_-|phosphogluconate-dehydratase MPKHSLEQIKEKITERSKKTRELYLENIFNPKNQPKIESLGCANIAHVTASMPEHLKMPLGSHKRKHFAIITAYNDMLSAHQPFKNYPDWIKKELQEHNAYASVASGVPAMCDGITQGYDGMELSLFSRDVIALSTAVGLSHNVFDGAFFLGVCDKIVPGLLIGALSFGNLASVFVPSGPMVSGIENYKKAKARQDFAMGKINREELLKVEMQSYHDVGTCTFYGTANSNQMMMEFMGLHVANSSFINPNNPLRKVLVEESAKRLASGKVLPLAKLIDEKSVLNALIGLMATGGSTNHTLHLIAIARSCGVILNWDDFDAVSNLIPLLAKVYPNGSADVNAFEACGGLAFVIKELLKEGLLFEDTHTIMDTKTQKGMQNYTKTPFLENDQLVYKDAVNHSLNTDILRPVSEPFAANGGLKILKGNLGRAVIKISAIKDEHRKVKARAIVFKTQSEFLERFKNKELERDFVAVLPFQGPKSNGMPELHKLTTNLGALQDMGYKVALVTDGRMSGASGKVPSAIHLSPEGALNGAIIKIKDGDWIELDAPNNALNVLEKDFEKRGINPLFLETLENLEKPSFGLGRELFTSLRLNVNTAEEGGMSFGIKV >NC_022886.1|WP_023592560.1|1438184_1438811_-|bifunctional-4-hydroxy-2-oxoglutarate-aldolase/2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate-aldolase MQDKIIEVLQISPIVPVVVVEDIKDAVPLAQSLVEGGIPIIEVTLRSSCALEAIELIAKNVPKMRVGAGTILNPTQLEQAQNRGAEFLISPGLTIKLLEHAKKKDMPLIPGVSSSSEVMQALEWGYNALKFFPAEYCGGVKLLNAFNGPFKGVKFCPTGGISTDNMRSYLNLENVLCVGGSWLTPKNLIQNKEWDKITEICKRALALR >NC_022886.1|WP_023592559.1|1437242_1438115_-|Sel1-like-repeat-protein-HcpC MLENVKKSLFRVLCLGALCLGGLMAEQDPKELVGLGAKSYKEQDFTQAKKYFEKACDLKENSGCFNLGVLYYQGQGVEKNLKKAASFYAKACDLNYSNGCHLLGNLYYSGQGVSQNTNKALQYYSKACDLKYAEGCASLGGIYHDGKMVTRDFKKAVEYFTKACDLNDGDGCTILGSLYDAGRGTPKDLKKALASYDKACDLKDSPGCFNAGNMYHHGEGAAKNFKEALDRYSKACEMQNGGGCFNLGAMQYNGEGVTRNEKQAIENFKKGCKLGAKGACDILKQLKIKV >NC_022886.1|WP_023592558.1|1436300_1437053_+|SDR-family-oxidoreductase MAHILVSGATSGFGLEIAKAFLQKNHVVFGTGRRKENLQELQLAYPKHFIPLCFDLKNKLETKRAIETIFSMTDRIDALINNAGLALGLNKAYECELDDWEIMIDTNIKGLLYLTRLILPSMIEHNQGTIINLGSIAGTYAYPGGNVYGASKAFVKQFSLNLRADLAGTNIRVSNVEPGLCGETEFSMVRFKGDKIKAQSVYENTIYLKPQDIANIVLWIYEQPLHVNINRIEIMPVSQTFAPLPTHKNP >NC_022886.1|WP_023592557.1|1434744_1436280_+|hypothetical-protein MKKLLYTTLALLLIGLLTTYLILFTEWGNKIIASYIEKKINPNERYLSVKTFKLRFNSLDFKAQANDDSTLILKGDFSLLKQSVDLNYHIDIKNLRSFKEWIPYPLRGAIITSGNIKGHRKALMIQGVSNVAQSHTAYNALLDDFKLSHLSLNAQDANLEDLLYLINRPAYANAKVSLQADFNSLKPLEGHLILTANNALINNALINQMFHLNLKDTLIFSLSHSSDFKESKAISDTTLTSPLGNFTALKSEYLFSILKLNAPYTLEIPNLAKLYNITNHPLKGSLTLKGAIEQSPKLLKVSGHSNLLDGALDFTLFNKDLKGRFSNISTLKALDLFHYPKFFQSIADANLDYDFIAKQGALKARLKNARFLKNAFSDFLYSISKFDITKEIYNDANLVSQINQQRLLSSLSLKSPKTQLKIHNGLLDLNTKQMDMLMDAEILKFIFKMKLQGNMHQPKFSLILNEKAIQQNLQQGLKEILKNDTLKKGLDHLLKDDKLKEKLEKGLKGLF >NC_022886.1|WP_023592556.1|1433178_1434213_-|UDP-glucose-4-epimerase-GalE MALLFTGACGYIGSHTARAFLEKTKENIIIVDDLSTGFLEHLKALEHYYPNRVVFVQANLNETHKLDAFLNKQQLKDPIEAILHFGAKISVEESTRLPLEYYTNNTLNTLELVKLCLKHAIKRFIFSSTAVVYGESDFSLNEESPLNPINPYGASKMMSERILLDTSKIADFKCVILRYFNVAGACMHNDYTTPYTLGQRTLNATHLIKIACECAVGKRKKMGIFGTNYPTRDGTCIRDYIHVDDLANAHLASYQTLLEKNKSEIYNVGYNQGHSVKEVIEKVKEISNNDFLVEILDKRQGDPASLIANNAKILQNTPFKPLYNNLDTIIKSALDWEEHLLRFQ >NC_022886.1|WP_023592566.1|1446392_1447700_+|hypothetical-protein MIFLKKSLYALLFSGFLIPPLIKAASFVYDLKFMSFNFNLVAPANNPYWNSLTKMQGRLMPQIGVQLDKRQALMFGAWFIQNLHTHYSYFPYSWGVTMYYQYIGKNLRFFLGIVPRSYQIGHYPLSAFKKLFWFIDPTFRGGAFQFKPAYDPNRWWNGWFEGVVDWYGGRNWNNQPKKKNYDFDQFLYFVSSEFQFLKGYLGLGGQLVIFHNASPHSMGDNYPYGGNSYLKPGDATPQWPNGYPYFSQKNNPQGGEIGKYSNPTILDRVYYHAYLKADFKNLMPYMDNIFMTFGTQSSQTHYCVRYASECKNARFYNSFGGEFYAQAQYKGFGIFNRYYFSNKPQMHFYATYGQSLYTGLPWYRAPNFDMIGLYYLYKNKWLSVRADAFFNFLGGGDGYHLYGKGGKWFVMYQQFLTLTIDTRELIDFVKSKIPK >NC_022886.1|WP_023592567.1|1447706_1448369_-|outer-membrane-protein MNKTTVKILMGMALLSSLQAAEAELDEKSKKPKFADRNTFYLGVGYQLSAINTSFSTESVDKSYFMTGNGFGVVLGGKFVAKTQAVEHVGFRYGLFYDQTFSSHKSYISTYGLEFSGLWDAFNSPKMFLGLEFGLGIAGATYMPGGAMHGVIAQNLGKENSLFQLLVKVGFRLGFLHNEITFGLKFPFIPNKRTEIIDGLSTTTLWHRLPVAYFNYIYNF >NC_022886.1|WP_000486466.1|1448648_1449209_+|pyruvate-flavodoxin-oxidoreductase-subunit-gamma MFQIRWHARAGQGAITGAKGLADVISKTGKEVQAFASYGSAKRGAAMMAYNRVDDEPILNHERFMQPDYVLVIDPGLVFIENIFANEKEDTTYIITSYLNKEELFEKKPELKTRKVFLVDCLKISMETLKRPIPNTPMLGALMKVSGMLEIEAFKEAFKKVLGKKLTQEVIDANMLAIQRAYEEVQ >NC_022886.1|WP_000656174.1|1449224_1449617_+|4Fe-4S-binding-protein MKDWNEFEMGAVLFPFEKNAQSEMEKHNDERHYTEQSYFTTSVAHWRVAKPVHNNNICINCFNCWVYCPDAAILSREGKLKGVDYSHCKGCGVCVDVCPTNPKSLWMFEEQIEPATALTQWPQKQEKKKS >NC_022886.1|WP_000124331.1|1449626_1450850_+|2-oxoacid:ferredoxin-oxidoreductase-subunit-alpha MARSIELQEIEVWDGNTASSNALRQAQIDVIAAYPITPSTPIVQNYGSFKDNGYIDGEFVLVESEHAAMSACVGAAAAGGRVSTATSSQGLALMVEVLYQASGMRLPIVLNLVNRALAAPLNIHGDHSDMYLSRDSGWISLCTCNPQEAYDFTLMAFRIAEHQKVRVPTIVNQDGFLCSHTVQNVRPLSDAVAYQFVGEYQTKHSLLDFDKPVSYGAQAEEEWHYEHKAQLHHAIMSASSVIEEVFNDFAKLTGRQYHLTKTFQLEDAEIAIFALGTTYESAIVAAKEMRKKGIKAGVATIHSLRPFPYERLGQDLKNLKALAILDKSSPAGAMGAMFNEVTSAVYQTQGTKHPVVSNYIYGLGERDMTIAHLCEIFEEINEDALKGTLTHPTQQFVGLHGPKMSFF >NC_022886.1|WP_000238135.1|1450862_1451807_+|pyruvate-ferredoxin-oxidoreductase-subunit-beta MVKEVKTLKGFSQSAEKFQGSHLLCPGCGHGIIVREVLNAVDGPIVLGNSTGCLEVCSAVYPHTSWDVPWIHIGFENGSTAISGVEAMYKALTNKGRYQGQKPKFVAFGGDGASYDIGLQFISGCMERGHDMTYICLDNENYANTGGQRSGSTPLGASTSTTPAGSVSFGKKEKKKDIVNIMASHGVPYVAQLSPNKWKDMNKKIKTALDTEGPCFINALSPCTTEWKFESNKTIELADMAVDSLMFPLFEIFNGRELKITYRPRNIIPVRDYLGAQKRFKHLFKKENEHIIEELQKDVNERWEYLQRREEAKV >NC_022886.1|WP_023592568.1|1451916_1453239_+|adenylosuccinate-lyase MLERYANEEMKALWNEQTKFETYLEVEKAVVRAWNKLGRIQDSDCEKICSKAAFNLERIKEIEKTTKHDLIAFTTCVAESLGEESRFFHYGITSSDCIDTAMALLMTKSLKLIQKSVKNLYETLKNRALEHKDTLMVGRSHGVFGEPITFGLVLALFADEIKRHLKALDLTMEFISVGAISGAMGNFAHAPLELEELACEFLGLKTANINNQVIQRDRYARLACDLALLASSCEKIAVNIRHLQRSEVYEVEEAFSTGQKGSSAMPHKRNPILSENITGLCRVIRSFITPMLENVALWHERDMSHSSVERFALPDLFITSDFMLSRLNSVIKNLVVYPKNMLKNLALSGGLIFSQRVLLELPKKGLSREYSYSIVQENAMKIWEILQQGAFKNADENLFLNALLNDERLKKYLSEDEIKACFDYSYYTKNVGAIFKRVFG >NC_022886.1|WP_023592569.1|1453304_1454138_+|outer-membrane-protein MKRALYLVLGLSYALHADSFKDVLTKGDYTFFNKKVVSPIKRYADRSAFYLGFGYQLGSVQHNYSNLNLFQQFNKSQILFSDGLSPVFKNSYVSNGFGVQVGYKWVGKHEETKWFGFRWGLFYDLSASLYGQKESQFIIISTYGTYMDLLFNAYNGDKFFAGFNLGIAFAGVYDKVSDALLYQALLLDTFGGKVDPNGFQFLVGLGVRLGSKRNQFGFGIKVPTYYFNHYYSMNNISNNSGDVLKVLRFLEYGINSLLYQVDFRRNYSVYFNYTYSF >NC_022886.1|WP_023592570.1|1454142_1456119_-|excinuclease-ABC-subunit-B MPLFDLKSPYPPAGDQPQAIETLTKSLKNNNHYQTLVGVTGSGKTYTMANIIAKTNKPALIMSHNKTLCAQLYSEFKAFFPHNRVEYFISHFDYYQPESYIPRRDLFIEKDSSINDDLERLRLSAATSLLGYDDVIVIASVSANYGLGNPEEYLKVMEKIKVGEKRAYKSFLLKLVEMGYSRNEVVFDRGSFRATGECVDIFPAYNDAEFIRIEFFGDEIERIAVFDALERNEIKRLDSVMLYAASQFAVGSERLNLAIKSIEDELALRLKFFKEQDKMLEYNRLKQRTEHDLEMISATGVCKGIENYARHFTGKAPNETPFCLFDYLGIFEREFLVIVDESHVSLPQFGGMYAGDMSRKSVLVEYGFRLPSALDNRPLKFDEFIHKNCQFLFVSATPNKLELELSKKNVAEQIIRPTGLLDPKFEVRDSDKQVQDLFDEIKLVVARDERVLITTLTKKMAEELCKYYAEWGLKVRYMHSEIDAIERNHLIRSLRLKEFDILIGINLLREGLDLPEVSLVAIMDADKEGFLRSETSLIQTMGRAARNANGKVLLYAKKTTQSMQKAFEITNYRRTKQEEFNKLHNITPKTVTRALEEELKLRDDEIRIAKALKKDKIPKSEREKIIKELDKKMRECAKNLDFEEAMRLRDEIAKLRTL >NC_022886.1|WP_023592571.1|1456188_1456905_-|hypothetical-protein MNYPNLPNSALEITNQPEVKEITNELLKQLQSALNSNSLFTEQVELSLKGIVRILEVLLSLDFFKNANEIDSSLRNSIEWLTNAGDSLKTKMKEYEGFFSDFNTSMKANEQEVTNILNANTENIKSEIKKLENQLIETTTRLLTSYQIFLNQARDTANNQITENKTQAITNINQAKESATTQINTNKTQAITNINEAKTTANNEITANKTESLEAIKTEKKQATSEIIEAKKRSLSKH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
167846 : 230893
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022886|167846:230893|DBSCAN-SWA 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54 | Helicobacter_phage(41.67%) | tRNA,transposase,integrase | attL 214706:214765|attR 226449:228479 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
332396 : 379625
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022886|332396:379625|DBSCAN-SWA 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32 | Helicobacter_phage(50.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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