Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP007230 | Yersinia similis strain Y_sim_228 chromosome, complete genome | 3 crisprs | DEDDh,RT,WYL,cas3,csa3,DinG,cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas3f,cas1 | 0 | 16 | 11 | 0 |
NZ_CP007231 | Yersinia similis strain Y_sim_228 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP007230_1 | 1371851-1371967 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007230_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP007230_1
>1.1|1371881|57|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder TAGCCAATTCAAAATCAAAAAGTTACTAAAAGTCTAAAGATAATGGTCTGGCGTCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007230_1
The CRISPR arrays of NZ_CP007230_1 >merge|NZ_CP007230|1|1371851-1371967|CRISPRCasFinder TCGGCTGCTCAAATGTGCTTTGGACGTCAATAGCCAATTCAAAATCAAAAAGTTACTAAAAGTCTAAAGATAATGGTCTGGCGTCAATCGGCTGCTCAAATGTGCTTTGGACATCAA >NZ_CP007230|1|1|1371851-1371967|CRISPRCasFinder TCGGCTGCTCAAATGTGCTTTGGACGTCAA TAGCCAATTCAAAATCAAAAAGTTACTAAAAGTCTAAAGATAATGGTCTGGCGTCAA TCGGCTGCTCAAATGTGCTTTGGACATCAA
>NZ_CP007230.1|WP_025381813.1|1370802_1371561_+|DeoR/GlpR-family-transcriptional-regulator MKQTQRHDAIIELVRLQGYVSTEELVEHFAVSPQTIRRDLNELADQNKIHRHHGGAALPSSSVNAAYNDRKVMWSEEKARIAQRVASQIPDGATLFIDIGTTPEAVAHALMNHKGLRVVTNNLNVATLLTAKEDFRLILAGGEVRTRDGGIIGEATLDFISQFRLDYGILGISGIDMDGSLLEFDYHEVRTKRAIIENSRCVMLVTDHSKFGRNAMVNLGNMNLINYLFTDQQPPASVMKIIEQHEVQLELC >NZ_CP007230.1|WP_025381812.1|1369930_1370767_+|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease-GlpG MTRVIVISNLRLAQAFVDYMATHHVALEIRPDAQGAEIWLADDEQLSAVQHELEQFLLDPLNPRYQAASWQAGNVNSNLPYQRFSYLQTLRSQAGPLTLSVMVLCIAIYILMLMAGDMAVMSWLAWPYNSSQYLQIWRWVSHAFLHFSLLHILFNLMWWWYLGGQMEKRLGTSKLLVLTIVSAVFSGWGQSLFSGANFGGLSGVVYALMGYVWLTGERAPERGISLPRGLMAFSVLWLIAGYFDILGLSIANAAHVSGLIIGLLMAFWDTRNSARTVQ >NZ_CP007230.1|WP_025381811.1|1369583_1369913_+|thiosulfate-sulfurtransferase-GlpE MEQFEAISVEQAYLRWKEGKTALVDIRDPQSYEAGHAPGAFHLTNGSLHTFMQQTDFDQPVMVMCYHGNSSKGAAQYLLQQGFDVVYSIDGGFEAWARSYPQDIASESR >NZ_CP007230.1|WP_025381810.1|1366504_1369216_+|HTH-type-transcriptional-regulator-MalT MLIPSKLSRPVRLQNTVVRDRLLVKLSSVANYRLTLINCPAGYGKTTLIAQWAADQSNLGWYSLDESDNQPERFATYLIAAVQLATGGHCSKSEALSQKHQYANLSALFSQLFIELSNWDGPLYLVIDDYHLITNDAIHEAMRFFLRHQPENLTLIILSRTLPSLGIANLRVRDQLLELGMQQLAFNHQEAQQFFECRLSSPLEQGDSSRLCDEVEGWVTALQLIALSSRQPNSSAQKSAKRLAGLNASHLSDYLVDEVLDQVDSKARAFLLRCSVLRSMNDALIVRLTGEDNGQQLLEELERQGLFIHRMDDSAEWFCFHPLFATFLRQRCQWELALELPELHHAAAEGWMALGYPAEAIHHALAAGDVGMLRDILLQHAWSLFHHSELALLEQCLTALPYPLLVQNPELALLQAWLAQSQHRYSEVNTLIEQAELAMQERKIPIDEILRAEFDALRAQVAINAGKPDEAEKLATDALKYLPMAHYYSRIVATSVTGEVHHCKGELARALPMMQQTEQMARRHEAYHYALWALLQQSEILIAQGFLQAAYETQEKAFELIREQHLEQLPMHEFLLRIRSQVLWSWSRLDEAEEAARKGIDILANYQPQQQLQCLAMLAKCSLARGDLDNANVYIQRCETLQHGSQYHLDWITNADKPRVIHWQMTGDKVAAANWLRQTEKPGMADNHFLQGQWRNIARVQIVLGRFDEAEVVLDELNENARRLRLTSDLNRNLLLSNTLYWQTERKGEAQKALIESLTLANRTGFISHFVIEGEAMAQQLRQLIQLNALPELEQYRAQRILKDINQHHRHKFAHFDEIFVDKLLTHPHVPELIRTSPLTQREWQVLGLIYSGYSNDQIANELDVAATTIKTHIRNLYQKLGVAHRQEAVQQAQRLLQMMGYV >NZ_CP007230.1|WP_038402063.1|1363781_1366187_-|maltodextrin-phosphorylase MSQPMLKKDDFLAALTRQWQRFGLTSAQQMTPYQWWEAVSAALAEQLSAQPAPSKPKNVQRHVNYISMEFLIGRLTANNLINLGWYDTVEALLAEQQVKLSDLLEQETDPALGNGGLGRLAACFLDSMATVEQPATGYGLNYQYGLFRQSFRECKQQEAPDNWQRESYPWFRHNAALAVDVGFGGNLVKQADGRQLWRPAFTLRGEAWDLPVLGFRNGVTQPLRLWQATHQHPFDLTLFNDGKFLLAEQNGVEAEKLTKVLYPNDNHLAGKRLRLMQQYFQCACSVADILRKHHLAGRKLAELPDYEVIQLNDTHPTIAIPEMLRVLLDEHQLSWDAAWAITSKTFAYTNHTLMPEALECWDEKLVRSLLPRHFVIIKQINAQFKKRVNKQWPGNDEVWAKLAVHHNKQVRMANLCVVSGFAVNGVAQLHSDLIIKDLFPEYYQLWPNKFHNVTNGITPRRWLKQCNPALSGLIDDTLKVEWANDLDVLQDLEPYAEDPAFRQRYQQIKYDNKVKLAHYVKRVMGLVINPDAIFDVQIKRLHEYKRQHLNLLHILSLYRQIRDNPALDIAPRVFLFGAKAAPGYYLAKNIIYAINQVADKINNDPIVKDRLKVVFIPDYRVSVAELMIPAADVSEQISTAGKEASGTGNMKMALNGALTVGTLDGANVEIAEQVGDENIFIFGHTVDQVKAILAKGYQPKKYVKADPHLKSILDELASGAFSQGDKQAFDMMLHSLLEGGDPYLVLADFASYCQAQKQIDALYRDKDEWTRRAILNTARVGMFSSDRSIRDYQQRIWQAKR >NZ_CP007230.1|WP_025381808.1|1361672_1363769_-|4-alpha-glucanotransferase MDRKSLDQAATLAGIAASYINAHGKPQATLAETKEQLLAAMGRSLDAHDTQTANTPLPVVKVFTFGSPMQLPMAGSGDYHWQLQTENGELHQGRISAKKTLTLPASLPLGYHRLILEQDLQQWQCSIIVAPKRCYEPDALLQGKKLWGACVQLYTLRSERNWGIGDFGDLKQMLGQVGERGGSFIGLNPIHALYPANPHSASPYSPSSRRWLNVIYIDINGVEEFQQSEAAQHWWHQAETQQALAKSRESEWVDYPLVMQLKLAALRLSFPLFTARKAKDARVQAFRRFVEQGGRSLHQQAAFDALHAHLSEHDPMMWGWPVWPEKYRDGHSSAVADFCREHADEVTFYLWLQWLAASQFDDCFQSSQQRKMPIGLYRDLAVGVAEGGAETWCDRELYCLKASVGAPPDILGPLGQNWGLPPMDPHVMVARAYQPFIDLLRANMTSCGALRIDHVMALLRLWWIPYGQTADQGAYVKYPVDDLLAVLALESQRHHCMVIGEDLGTVPVEIVGKLRDSGVYSYKVLYFEHDSENIFRAPQSYPVQAMATITTHDLPTLRGYWQSDDLTLGNKLGLYPDQQILKQLYLDRERAKQGLLEGLHRYDCVPKKVGHKAALLSMSPVLNRGLQRYVADSASALLGLQPEDWLDMAAPVNIPGTTDEYPNWRRKLSASLEEIFADSQVNRLLKDLDKRRKNVSVG >NZ_CP007230.1|WP_025381807.1|1360745_1361321_+|Fe-S-biogenesis-protein-NfuA MITITDAAQSHFAKLLANQEEGTQIRVFVINPGTPTAECGVSYCPPDAVEATDTELKFEQLSAYVDELSVPYLQDAEIDFVTDQLGSQLTLKAPNAKMRKVDDSAPLMERVEYVLQSQINPQLAGHGGRVTLMEITPDGLAILQFGGGCNGCSMVDVTLKEGIEKELLQKFPELKGVRDLTEHQRGEHSYY >NZ_CP007230.1|WP_038402061.1|1359984_1360686_+|DNA-utilization-protein-GntX MLTIVSQCWLCQQPLYHNRHGICCYCQRHLPVLPPCCPCCGLPSTSTFLRCGRCLIAPPRWHHMMFVGDYAPPLSGLIKQLKFGGAPQLAPVLARLLLLRWLRHWRETRCRNNDKVIKPQRIVSVPLHHWRCWRRGYNQTDLLARPLAHWLGCDYTPLTLQRIQATPPQRQLTAAQRRKNVRGIFRCAESVRGQHIALLDDVVTTGSTLNEIAHLLWAQGIASLQIWCVCRTL >NZ_CP007230.1|WP_025381804.1|1359121_1359898_-|pimeloyl-ACP-methyl-ester-esterase-BioH MKQLYWYTCGEGDCDLVLLHGWGLNSGVWHCIIDRLAPHFRLHLVDLPGYGRSQDYGAMSLVDMAEIVAQQAPKQALWLGWSMGGLVASQIALSQPECVRGLITVSSSPCFTARDEWPGIKLEVLAGFQHQLSDDFHRTVERFLALQTLGTESSRQDARLLKSVVLQHQMPDVEVLTGGLEILRTADLRTALADFTLPFMRVYGYLDSLVPRKVASRLDRAWPQTQSVVMQGAAHAPFISHPDYFAKLILSFAEENKK >NZ_CP007230.1|WP_025381803.1|1358277_1358547_-|DUF1471-domain-containing-protein MNLLKNVAVALVISGLSFAAIAAKEITKQEAEANNYEKIGTVSTAGEAASPMDVKKELSKLADAKGGKYYVIIAEREKGKFDADADVYK >NZ_CP007230.1|WP_025381815.1|1373921_1375436_+|glycerol-3-phosphate-dehydrogenase 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MTSPFSYTSPVVSVDALKHSIAYKLMFIVGKDPTIATQYDWLNATLFAVRDRMVERWLRSNRAQLSQDVRQVYYLSMEFLLGRTLSNALLSMGIYDEIEQALDEMGLSLSELLEEENDPGLGNGGLGRLAACFLDSLATLALPGRGYGIRYEYGMFSQKIVNGQQMESPDNWLEYGNAWEFPRHNTRYKVRFGGRIQQEGSKIRWLETEEILACAYDQIIPGFDTDATNTLRLWSAQASNEINLGKFNQGDYFAAVEDKNHSENVSRVLYPDDSTYSGRELRLRQEYFLVSATVQDILNRHWAMHQTFNNLADKIAIHLNDTHPVLSIPEMMRLLIDEHKFTWMDAWDVVQQVFSYTNHTLMSEALETWPVDMIGKILPRHLQIIFDINDHFLKLVEEQYPDDKELLSRVSVIDENNGRRIRMAWLAVIASHKVNGVSALHSELMVQSLFADFARIFPNRFCNKTNGVTPRRWLGLANRPLAAVLDDSIGHTWRTDLSQLSELEKNLDYPSFLLALQKAKLENKKRLAGYIAEKLNIVVNPAALFDVQIKRIHEYKRQLLNVLHVITRYNRIIDAPDDNWVPRVVIFAGKAASAYYNAKQIIHLINDVAKVINNDPRINNLLKVVFIPNYSVSLAQLIIPAADLSEQISLAGTEASGTSNMKFALNGALTIGTLDGANVEIREHVGEENIFIFGNTTEQVEALRNSGYNPRKYYDEDPELHQVLTQIATGTFSPEEPYRYTNLFDSLVNLGDHYQLLADYRSYVDTQEQVDTLYRHRDEWSRKTLLNIANMGYFSSDRTIEEYADEIWHIKPVRL >NZ_CP007230.1|WP_025381817.1|1378123_1379554_-|glycogen-synthase-GlgA 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>NZ_CP007230.1|WP_025381819.1|1381036_1383025_-|glycogen-debranching-protein-GlgX MTVLTHGSPTPSGAYFDGAGINFTLFSAHAEQVTLCLFDEQGQERQIAMPARTGDIWHGYLPGGKPGQRYGYRVSGPFDPSRGHRFNPHKLLIDPRTRALEGKVGDDPRFTGGVNQPDVRDSAAALPKCIVIHEEYDWQGDKPPAIPWGNTVIYEAHVRGLTQLHPDIPPELRGTYAALAHPALIEHLKTLGITTLELLPVQFHIDEPRLQKMGLSNYWGYNVLAPFAVDPDYASGREGISPLREFRDAVKALHSAGIEVIIDVVFNHSAELDVFGPTLCQRGIDNASYYWLTPGGEYDNITGCGNALRLSHPYVTQWVIDCLHHWRDSCHVDGFRFDLGTVLGRTPAFDQHAPLFAALAADERLSACKLIAEPWDIGLGGYQLGNFPTGFSEWNDQYRDAIRGFWLRGDVPRGTFAQHFAASSHPFERRGRLPSASINQITAHDGFTLLDLLCFNQKHNQMNGEENRDGSDNNHSNNFGREGLVADAAIWQRRKACQRALLTTLLLSQGTPMLLAGDEQGHSQQGNNNAYCQNNILTWLDWGSADRALMTFTADLIRLRQQIPALTQDQWWRSGDGNVQWLDSQGQALSDAAWEQGCQQQLQILLSQRWLVLINATDQACEMHLPEGKWEGIPPFGSSDHAEPLTTWRGSAHTICVLVQKY >NZ_CP007230.1|WP_025381820.1|1383026_1385210_-|1,4-alpha-glucan-branching-protein-GlgB MSLLPDRQVINQLISGHYGDPFSILGMHETTQGLQICALLPDAREVWLVETESGRRIAQLTLEDPRGFFIAQLTRRKKSFRYQFAVTWQESPQIIEDPYRFGPLLQDIDSWLLAEGTHLRPYERLGAHLISLDGVPGVSFTVWAPNAQRVSVVGEFNFWDGRRHPMRLRRENGIWELFLPGVDAGQLYKFEIIDCHGQVRLKADPYAFEAQMRPETASLVSPIPDVVKSTAARRKANDLCSPVSIYEVHLGSWRRHTDNNFWLSYRELADQLVEYVKYMGFTHVELLPINEHPFDGSWGYQPLGLYAPTRRYGTPEDFKAFVAKFHQAGINVILDWVPGHFPSDEHGLSTFDGTALYEYADPREGYHQDWNTLIYNYGRNEVRNYLAGNAFYWMERFGIDALRIDAVASMIYRDYSRAEGQWVPNYYGGRENLEAIAFLRYTNQTIGVERPGSVTMAEESTDFPGVTLPPDTGGLGFNYKWNMGWMHDTLNYMQCDPVHRKYHHNLMTFGMLYAYTENFILPLSHDEVVHGKRSILDRMPGDAWQKFANLRAYYAFMWAHPGKKLLFMGCEFAQGREWNFDTSLDWHLLDDENGWHSGVQRLVRDLNHCYRQYAPLYEWDYQPAGFEWLVVDDHENSVFAFLRRDAEGHELIAISNFTPVPRYHYRVGIPQGGHYREVLNSDSAFYCGSNLGNQGGIDSYHVRSHNHEHSLLLTLPPLATIYLLREY >NZ_CP007230.1|WP_025381821.1|1385723_1387421_+|sensor-histidine-kinase 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NZ_CP007230_2 | 3604171-3605999 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP007230_2
|
30 spacers
spacers of NZ_CP007230_2
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DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007230_2
The CRISPR arrays of NZ_CP007230_2 >merge|NZ_CP007230|2|3604171-3605999|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NZ_CP007230.1|WP_025383485.1|3602161_3603550_+|APC-family-permease MAHDAAVVGTNQTGTNNRVQLRKTLTLVQVVMMGLAYLQPMTIFDTFGIVSGLTDGHVATSYAIALIAVLFTAVSYGKLVKRFPSAGSAYTYAQKSISPNVGFMVGWSSLLDYLFMPMINILLAKIYLEAIFPGVPSWIFVGALVSLMTLFNLRGINIVANLNSVIVVVQVAIMVVFMGLLIHGVYQGEGAGTLVSARPFYSENAHLVPMITGATILCFSFLGFDGISSLSEETPNAGKVIPKAIFLTALIGGIIFIAVSYCLQLYFPDISRFTDPEASQPEIMLFVAGKFFQSVILCFSCVTVLASGMAAHAGVSRLLYVMGRDGVFPEKVFGYVHPKWRTPAINVLLVGGVALSAISFDLVTATALINFGALVAFTFVNLSVIAQFYVRERRNSTFKDHFNYLILPMIGAGTVGVLWVNLESSSMTLGLVWGAIGLSYMVWKTRAFRRALPQFTEEPAQL >NZ_CP007230.1|WP_025383483.1|3600612_3601704_+|oxidoreductase MSANAIRVQVGPANYFSFPGAIDKLSEFYPQAALDKALWIYGERALAAAQDYLPKAFHGPQAVRAKFSTHCSQSTVTDLVSAAGGDRQVVIGVGGGAVLDTAKVVARQLGVPLVAIPTIAATCAAWTPLSVWYNEAGQALNFEIFNDANHLVLVEPRIMLHAPVDYLLAGIGDTLAKWYEAVVLSPQPETLSLTVRLGLQAALEIRNVLLKQSEAALQAVAQGELTQDFLDVVNAIIAGGGMVGGLGERYTRVAAAHAVHNGLTLLPQTERFLHGTKVAYGILVQTALLGQDEALQSLIVAFNQLGLPTHLAALGVDINDREAIDRVIGRILKPGESIHYLPIALNSDKIWAAIEQVEIAAQH >NZ_CP007230.1|WP_174407872.1|3598800_3599490_-|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MRDISLTLHQGEILGIAGLAGAGKTELCKALFGDTPSTLERGELSGKAWRPRSPDRSVAQGLALVPEERRKEGIFIDEGIPMNLSVAADDSFSRWSLFSRRQELSWAKELIERLGIRTSSPHQKLARLSGGNQQKVAIGKWLRGDAQVLIFDEPTKGVDIKAKQDLFSLIDQLAQQGKGIIYASGEFSELVGLCDRICVLWDGRIVAELNAAEVDEETLLLFSTGGTPQ >NZ_CP007230.1|WP_002211900.1|3597808_3598804_-|ABC-transporter-permease MSKELPLPDVQPWRHQLFDFLYKWGMLLTVVALIALFGLASDNFLDPNNIINILRSIAIVTVIAIGVSISLSIGGFDLSVGSTASLANAVVVSLFVWYGFGTTGAIILTLLICTLVGLFNAFLIVVLKIPDMLATLASLFVIQGVAMTYSRGGSITQSMLLPSGDMAEGVIPEIFSALGQVPVIVLIMLAVTVVVQLYLSLTKHGRRMYAIGGNPQAARLAGIRTVRYRVLAYVLSAQLAALGGILLASRIGSSQVNAGSGYLMDAVAAAYIGFSLAGSGKPNAFGTLIGAIILGVLQNGLVMLSVPYYAMDIIKGLVLAMALALTYIQKR >NZ_CP007230.1|WP_033849681.1|3597287_3597653_-|hypothetical-protein MAAKIISLIFLISFSTLAAEVNQNKVQQKNNLENFALSICLAEGFPDGEINSEAFSAVGAYVELGAYPVEAYEEVSELAKKFLEKKYISKNGESKLTVMKCIDLSQSGELSAIKDKYTRHI >NZ_CP007230.1|WP_025383480.1|3595803_3596631_+|SDR-family-oxidoreductase MKKVAIIGLGWLGMPLAQSLNRRGIDVVGSKTTPDGVDAARMSGINCYPLVLTPELICEPDDLAQLMAVDALVITLPASRTTAGGDHYFQAVQQVVDSALAFGVPRIIFTSSTSVYGETRGRIKESSPLQPVTVAGKTLMALEQWLHQLPHTSVDILRLAGLVGTDRHPGRFLAGKTGVKGGSQGVNLVHQEDVIAAIELLLNRPKGGHLYNLCAPLHPGKRDFYPACARALQLTPPEFAVEEQEGANREIDGSKICSELGFEYLYPDPSRMPLN >NZ_CP007230.1|WP_002231208.1|3595380_3595428_-|his-operon-leader-peptide MNRVQFNHHHHHHPD >NZ_CP007230.1|WP_002211896.1|3594198_3595098_-|ATP-phosphoribosyltransferase MLDKTRLRIAMQKSGRLSDESQELLSRCGIKINLQQQRLIAFAENMPIDILRVRDDDIPGLVMDGVVDLGIIGENVLEEELLNRRAQGDDPRYFTLRRLDFGGCRLSLAAPLDAEYTGPQCLQDTRIATSYPHILKQYLDKQGVRFKSCLLNGSVEVAPRAGLADAICDLVSTGATLEANGLREVEVIYRSKACLIQRDGEMSVDKQQLIDRLMTRIQGVIQARESKYIMMHAPSERLDEIITLLPGAERPTILPLAGDKSRVAMHMVSSETLFWETMEKLKALGASSILVLPIEKMME >NZ_CP007230.1|WP_025383479.1|3592875_3594195_-|histidinol-dehydrogenase MQPTNFNTLINWQQCSEEQQKALLSRPAINASERITAAVSDILDRVKAEGDSALRDFSQRFDHVQVADIRITASEIAAASARLSDDVKHAMAQAVRNIEIFHNAQKLPVVDVETQPGVRCQQITRPIASVGLYIPGGSAPLPSTVLMLGTPARIAGCQRVVLCSPPPIADEILYAAQLCGIQEVFQIGGAQAIAAMAFGSESVPKVHKIFGPGNAYVTEAKRQVSQRLDGAAIDMPAGPSEVLVIADSGATPAFIAADLLSQAEHGPDSQVILLTPDAAIAQAVAVEVEQQLALLSRADIARQALESSRLIVTNDLQQCIDISNAYGPEHLILQIRQPEEIIDQIDNAGSVFMGDWSPESAGDYASGTNHVLPTYGYTSTYSSLGLADFVKRMTVQQLTPQGLLGLASTIEILAQAEQLTAHKNAVTLRVTALTALNKE >NZ_CP007230.1|WP_025383478.1|3591724_3592873_-|histidinol-phosphate-transaminase MSQSNNITDLARANIRALTPYMSARRLGGNGDVWLNANEYPLGTEYQLTTQTFNRYPECQPKHVIERYAAYAGLPPEQVLVSRGADEGIELLIRAFCEPGQDAILFCPPTYGMYAVSAETFGVERRTVPAQADWQLDLPAIANNLDQVKVIYVCSPNNPTGNLINPADLQAVLALAQGRAIVAIDEAYIEFCPQASVSNWLKDYPNLVILRTLSKAFALAGLRCGFTLANSDIIQLLLKVIAPYPLSTPVADIAAQALSPQGIEQMRQRVSEVRANRAWLQSALQDCACVEQVFTSESNYLLARFTASSSVFNALWDQGIILRDQNKQPGLANCLRITIGTRQECERVIAALAPLPGIDNSNNIDNQNKTNSQTSSICKGTI >NZ_CP007230.1|WP_025383486.1|3606033_3607464_-|exodeoxyribonuclease-I MSDKNKQPTFYIHDYETFGQRPALDRPAQFAGVRTDLDFNIVEEPLVIYCKPADDYLPQPEAVMITGITPQHALANGVNEAEFSRQIHQAFSVPGTCILGYNNIRFDDEVSRNIFYRNFYDPYAYSWQGGNSRWDLLDVMRACYALRPEGIVWPENDDGLPSFKLEHLTKANGVEHLQAHDAMSDVYATIAMAKLVKQAQPRLFDYLYQHRSKHKINALIDIAQMTPLVHVSGMFGAARGNTSWVAPLAWHPENKNAVIMCDLAGDMSPLLELDSDTLRERLYTRRDKLQAQESAIPIKLVHINKCPVLAPAKTLLPENADRLGIDRQRCLQNLQLLRQNPQVRERVVALFAQAEPFTVADDVDTQLYNGFFSDADRATMKIIQQTEPQNLPALDLTFQDPRLEALLFRFRARNYPNTLNDREQQRWLQHRRSALSPERVQDYVLQLEQFYNQYEDDKEKLALLKALFEYAKGLVS >NZ_CP007230.1|WP_025383487.1|3607757_3608867_+|SDR-family-oxidoreductase MKKILLTGATGFLGGAVLEKLLLANSDFNYLLLVRANTLEQGLMRIRKNLEKFYLPNELINKININHILLGDLAEPDSFINDVRIDDVTHVINCAAIASFGNNPLIWKVNVEGTLAFGKRMAQVAGLQRFVHVGTAMACTPEADTVVNERVLSTENDAHLVEYTKSKSAIECLLAEHCPTLPLVFARPSIVVGHTRLGCQPSSSIFWVFRMALMLRKFMCSLDDHIDVIPVDYCADALLYILEYPNLPDNIYHISAGEKGSVSFSEIDQAMSVAAKQKPVGVNYSQVEYTALVQMRNQLKGIFGPCNERLMLKAMRLYGSFAMLNVRFSNERLLSLGMPRTPRFTDYIALCVESSHGMTIQQQMAVDFK >NZ_CP007230.1|WP_002217522.1|3609301_3609619_+|DUF496-family-protein MDNASKPTFQDVLEFVRMFRRKNKLQREIVDNEKKIRDNQKRVLLLDNLSEYIKPGMSIEEVQAIIANMRGDYEDRVDDYIIKNADLSKERRELSKKLKAMGEVK >NZ_CP007230.1|WP_025383488.1|3610060_3613288_-|inverse-autotransporter-beta-barrel-domain-containing-protein MNFYRISSLHQAKQLNKNKQLNKTRISKSVVWANIVIQAIFPLSIAFTPAVMAAETVEASDEKPRSTSQAEQSTANAATRLASILANDDSAKQASSIARGTAASAGNEALQKWFNQFGSAKVQLNLDEKLSLKGSQLDVLLPLTDSPDLLTFTQLGGRYIDDRVTLNFGLGQRHFFAQQMLGYNLFVDHDASYSHTRIGVGAEYGRDFINLAANGYFGVSGWKNSPDLDKYDEKVANGFDLRSEAYLPTLPQLGGKLIYEQYFGDEVGLFGVDNRQKNPLAVTMGVNYTPIPLFTVGVDHKMGRAGMNDTRFNLGFNYAFGTPLAHQLDSDAVAIKRSLMGSRYNLVDRNNQIVMKYRKQNLVTLELPGRVSGAARQTMPLVVNATAQQGIDRIEWEASALTLAGGKITGSGNNWQITLPSYLSGGEGNNTYRISAIAYDTLGNASPVAYSDIVVDSHGVNTKTSGLVATPEILPANASASSVIEFNIKDNANQPVTGIANELAFSLELAELPEELAKAKARSVPLKNVSHTLTEITESAPGIYQATLTSGSKPQLINITAQINGVLLADVQTKVTLIADQSTATLQTNSLQVTTNGSLADDTDANQIRTVVVDAYGNKLSGVQVNFTVGNNAKIAETTLSDKQGVATAVITSTKAGTYAVTAELNGVTQQIDVNFIPDAGTATLDDSDEYKLQWVTNGQVADGESANSVQLTVVDKFGNTVPNVDVAFTTDTGAIISEVTPTDANGVATAKIISSQAKNHTVKATLNGKEQTVEVNFIADTATAEITANNFTVEVDGQVAGSGTNQVQALVVDKKGNPVANMTVTFTATNGVTVETASAKTDDNGKVTTNLSMTNVGGTVSTVTATMSNSANVTSTQDKPVTFYPDFTKATLNTPANTYSGFNINSGFPTTGFKDTHFQLSPHGITGANSDYDWVSSHPNVSVSNTGAITLQDNPGGKVTITATWKQDSSKVFTYDFTLNYWVGLYSSTNLSWAQANASCINAGMRLPTNSEMSAGQGVRGVGSLFGEWGNLNAYPSFPTAQIIWTSIETNDFHIDTGLTHSASNETLAYMCIK >NZ_CP007230.1|WP_025383489.1|3614047_3614293_-|hypothetical-protein MCRKSLNQPFFDGHMNDGYMNDGYMNDGYMNNNHGVDTGSALPAALASFPLSMLYPPPFKMQGVSCPCSPLLLSVVNLKKK >NZ_CP007230.1|WP_025383490.1|3614476_3615781_+|MFS-transporter MSNFNHYPDSTLNSAIKKAWYRLMPLMFIMYFVAFIDRINVGFAKDAMSADIGLSQSAFALGAGIFFAAYALFGIPANLMMNKLGAKVWLSSTTVVWGLLSAGTGLVSNEYQFVILRFLLGVAEAGFYPGILLLASIYFPNKIRASVIGIFVLGVPAALTLGSPISGALLDMQGFLGQPGWFWMFLLEGVPAVGLGIFAFFYLDDSPATARYLNPEEKQALITQLSIEQSDTESSSVKAVLLSPKVWHLALIYGTIQVGVYGLIFFLPSQVATLLGSTLGFKESLVAAIPWAFSALGVYYIPRYADRKTHRRNPIATLNLVVAAIGLIISAYASPVLAIAALCLCAIGFLAVQPIFWTFPAQILSGKALAAGIGFCTTMGAFFSFLAPIIRVEAESLFNSPPAGLITLSLFSLLSATLIFSLKFWPSKATAEVI >NZ_CP007230.1|WP_025383491.1|3615789_3616212_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MSAPLPYIKPGERVIIYDGVCALCTGWVNFLIRHDRHHTVRLSAVQSKKGRALLEWAGLPTEKINTLVLIENQQVYLRSEAIFRVIANLPWPWRILSVLRIFPRPLRDGCYDGIALNRYRLFGRYDAVRTLKADHDRRFL >NZ_CP007230.1|WP_025383493.1|3616684_3617425_+|SDR-family-oxidoreductase MNLKGKKALITAAGQGIGFKTATLFARKGAEVIASDINIAALSNIPGITAMSLDVTDALAINDVAQEIGSIDVLFNCAGVVHSGDILTCSDQEWQFALDLNVTAMFHMIRAFLPGMIACHQGSIINMSSVASSIKGVSNRFAYSTSKAAVIGLTRSVAADYVTQGIRCNAICPGTVESPSLRQRIAVQAHAEGRSEADVFQAFAARQPIGRIGKAEEIAQLALYLASDASAYTTGTVHIIDGGWSN >NZ_CP007230.1|WP_025383494.1|3617472_3618315_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKLLRYGPVGEERPALLDEWGEIRDLSAHIDDISGKFLLPATLYKLRQLDTASLPLIRGEQRLGACVGHVGKFICIGLNYADHAAETGAEIPQEPVIFNKWTSAIIGPNDDIEIPRNSVKTDWEVELGVVIGTGGRYICEANAMSHVAGYCVVNDISEREFQFEHGGTWDKGKGCDTFGPIGPWLVTCDEIPDPHQLGLWLDVDGRRYQNGSTRTMIFKIPQIISYLSRFMSLQSGDVISTGTPPGVGLGQKPPVYLHAGQIMRLGIEGLGEQRQKTIQA >NZ_CP007230.1|WP_025383495.1|3618341_3619619_+|L-fuconate-dehydratase MTIITALRTEDVRFPTSLELDGSDAMNPDPDYSAAYVILDTDNPALSGHGLTFTIGRGNEICCVAIHALEHLIVGRDLASITANMGKFWREFTSDSQLRWIGPEKGAIHLATGAVINAVWDLWSKAEGKPLWRLVADMSPEALVRCIDFRYITDCITPEEALALLQQRAHNKALRLEKLQDEGYPCYTTSAGWLGYPDDKLRRLCQDAVDAGFDYLKLKVGRDLEDDIRRVRITREVLGPDRKLMIDANQIWETNEAISWVNQLAFAEPWFIEEPTNPDDIEGHRRIRQGVAPVKVATGEMCQNRIMFKQFIMREAIDVVQIDACRLGGVNEVLAVMLMAAKYDLPVCPHAGGVGLCEYVQHLAMIDYLCIAGTDKGRVIEYVDHLHEHFVHPCVIKNAAYMPPEQPGFSIEMHQSSIEKYRFRV |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP007230_3 | 4570153-4570841 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP007230_3
|
11 spacers
spacers of NZ_CP007230_3
>3.1|4570181|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT TTACGCGGGAGATATTGACTAGCAGGTAGATT >3.2|4570241|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATCCGTAGCGAGTCGCACGTACTCTGTGAC >3.3|4570301|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATGGGAGGTGATGTAATGAGCAAGGATGATT >3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTGCTTTCATTGTCATCTTATTAATCTCTCT >3.5|4570421|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCATGAGTGTCGTGCTCTAGTGGCTCGAAGCT >3.6|4570481|33|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCATATATTGTACTGATGCCTTAATCTCATTA >3.7|4570542|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTAATGGCTGCATTGCTTGGGTTTTATGTTG >3.8|4570602|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTGATAATATTCGAAAATTAGGCGCTATGAT >3.9|4570662|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTGCCTGAAACATGAAGCTAGCCCGGCAGGG >3.10|4570722|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATGGATGTTGGAAATATGAATCCTAATAA >3.11|4570782|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTACGATGCGACTTGACTAAAATGACAATTA |
cas1,cas3f,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007230_3
The CRISPR arrays of NZ_CP007230_3 >merge|NZ_CP007230|3|4570153-4570841|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGATTGTTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTACGCGGGAGATATTGACTAGCAGGTAGATTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATATCCGTAGCGAGTCGCACGTACTCTGTGACTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAATGGGAGGTGATGTAATGAGCAAGGATGATTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACACTGCTTTCATTGTCATCTTATTAATCTCTCTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGCATGAGTGTCGTGCTCTAGTGGCTCGAAGCTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTCATATATTGTACTGATGCCTTAATCTCATTATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCGTAATGGCTGCATTGCTTGGGTTTTATGTTGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTCTGATAATATTCGAAAATTAGGCGCTATGATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACACTGCCTGAAACATGAAGCTAGCCCGGCAGGGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTAATGGATGTTGGAAATATGAATCCTAATAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTTACGATGCGACTTGACTAAAATGACAATTATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_CP007230|3|3|4570153-4570841|CRISPRCasFinder TTTGATTGTTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTACGCGGGAGATATTGACTAGCAGGTAGATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATATCCGTAGCGAGTCGCACGTACTCTGTGAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATGGGAGGTGATGTAATGAGCAAGGATGATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ACTGCTTTCATTGTCATCTTATTAATCTCTCT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCATGAGTGTCGTGCTCTAGTGGCTCGAAGCT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTCATATATTGTACTGATGCCTTAATCTCATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGTAATGGCTGCATTGCTTGGGTTTTATGTTG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCTGATAATATTCGAAAATTAGGCGCTATGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ACTGCCTGAAACATGAAGCTAGCCCGGCAGGG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTAATGGATGTTGGAAATATGAATCCTAATAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTACGATGCGACTTGACTAAAATGACAATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_CP007230|3|2|4570153-4570841|CRT TTTGATTGTTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTACGCGGGAGATATTGACTAGCAGGTAGATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATATCCGTAGCGAGTCGCACGTACTCTGTGAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATGGGAGGTGATGTAATGAGCAAGGATGATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ACTGCTTTCATTGTCATCTTATTAATCTCTCT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCATGAGTGTCGTGCTCTAGTGGCTCGAAGCT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTCATATATTGTACTGATGCCTTAATCTCATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGTAATGGCTGCATTGCTTGGGTTTTATGTTG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCTGATAATATTCGAAAATTAGGCGCTATGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ACTGCCTGAAACATGAAGCTAGCCCGGCAGGG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTAATGGATGTTGGAAATATGAATCCTAATAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTACGATGCGACTTGACTAAAATGACAATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_CP007230|3|2|4570213-4570841|PILER-CR TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATATCCGTAGCGAGTCGCACGTACTCTGTGAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATGGGAGGTGATGTAATGAGCAAGGATGATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ACTGCTTTCATTGTCATCTTATTAATCTCTCT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCATGAGTGTCGTGCTCTAGTGGCTCGAAGCT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTCATATATTGTACTGATGCCTTAATCTCATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGTAATGGCTGCATTGCTTGGGTTTTATGTTG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCTGATAATATTCGAAAATTAGGCGCTATGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ACTGCCTGAAACATGAAGCTAGCCCGGCAGGG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTAATGGATGTTGGAAATATGAATCCTAATAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTACGATGCGACTTGACTAAAATGACAATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
>NZ_CP007230.1|WP_025384239.1|4568804_4569785_-|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MENAIHSSDLKTILHSKRSNIYYLEYCRVLVNGGRVEYVTDEGKQSLYWNIPIANTTVIMLGTGTSVTQAAMREFARAGVLVGFCGGGGTPLFAANDVEVNVSWLTAQSEYRPTEYLHDWVSFWFDDEKRLAAAVAFQRIRIAQIQQHWLSSHIQRESLFPVNHDQLLFILSRFEQNLANCLTSNDLMVQEAVLTKALYKLAANTVNYGDFTRAKRGGGIDLANRFLDHGNYLAYGLAATATWVIGLPHGLSVLHGKTRRGGLVFDVADLIKDALVLPQAFIVAMQGEEEQEFRQRCISGFQRTEALDVMIDGIKETAALCSQVPR >NZ_CP007230.1|WP_025384238.1|4565517_4568808_-|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MNILLISQCHKRALDETRRILDQFAERKGDRTWQTAITQEGLNTLRKLLRRTARRNSAVACHWVKSNNQSELLWIVGNLRRFNAQGTVPTNTTQRDILRSQDENSWHSVETIALLAGIAGLFHDFGKANILFQQGLQGQGKTYQPYRHEWVSLRLFQAFVEQKNDIQWLTALSQINPADETTLMSNLVKDGLDDYNNPLAALPPFAKTIAWLILSHHRLPVYPSKDYHRPPKVEEIDDWLHQQLMPVWNSTNMDSGDWREKDKLDVWSFPHGTPLQSAEWCKKAQKFAKRALRQPSLVNHGHLDQRFTSHMARLALMLADHHYSSLPATPSWQDKNYQVFANTHSKMRGVNAHSKTIEMKQRLDEHNIGVGQNALLLGRSLPHIRKTLPSITRHKGFKQRSVQEKYRWQDQAFDLAVTLRERSQQQGFFGVNMASTGCGKTFANARIMYGLADEKQGCRFSVALGLRTLTLQTGTALQQKLTLQKDDLAVLIGSQSVLQLYQLNNDKLEPRGTGSQSADKFFSEHQYVSYDGSLDDGRLSTWLSNNDRLKRLLCAPVLVCTIDHLIPATESLRGGKQIAPMLRLLTSDLVLDEPDDFDRNDLPALCRLVNWAGMLGSRVLLSSATLPPALVQALFNAYRAGRADYQQACGQPDTPVNICCAWFDEHGVAQQDIQQSTDFIQHHGDFITRRVGKLSTAEVLRRAELIPVSSASVKKGSVLDAMAAVMRDSMLRLHQAHHQTHPSEKTVSVGVVRMANINPLVAIAQRLYAMAAPENYRIHYCVYHSQHPLAVRSAIERRLDVTLTRYQPNALWQIAEIEHALQHHPEQHHLFVVLATSVVEVGRDHDYDWALAEPSSMRSFIQLAGRVQRHRQVAPPVANMHILQKNFKALTQRDPAIPVYCQPGFETTRCRLNTHDLDKLLLPSQYKVINAISRIQERTKLEPRDNFVDLEHLSLRLILQGSTEPLKYYAALWWRKQATWSGEQQRCTPFRQSSPDEQRNLWIDDEADKPVFKRLDSDQIEWKVSDGFQDVELTLAAGNSAWIDTDCLRIYQWLAESLNKELNEVSRQFGEVRLLPKKDGERWHYHPLLGVFGALD >NZ_CP007230.1|WP_025384237.1|4564015_4565362_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy1 MEENGLAAFIVSYIKSREQPKLEAFDKEAEKRLAGLTQAEDIALAQQEIAQQRQELIARYEVRNWLTDAANRAGQIKLATHAPKYTHSDSKSSGILNIELQSKKKDYFSSVDLAEQASDVIGNAAVFDLVKLLQSECEGGSLIKCLEQGDNSVLKLFSNDEELVEEWTTKFKSILNNEKFTSHKLAKQFYFPVGPDQYHLLSPLFSSSLAQAMHQRIAEARFSDQSKEAKVAHKTGKWHSEARVIYLKTAVQNIGGTKPQNISYLNSVRGGKVWLLPCGAPPWKNIQKPPIKYRSIFHDRSEFTVLARNNLWQMQQYLLGVKPLSNTMDIRAVRLACSDEIIDILFNYVAEIQNLDGTNGWSDGKDCKLKRSQQLWLDPNRAMDDPVFKLEREKGDWKQEVSQDFGYWLNRWLQHDELVFSYVEQREWSSLFKQRLREFEQGSLETWS >NZ_CP007230.1|WP_025384236.1|4563068_4564019_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MSSLIVLHQVRVENANAIAGLTYGFPAITHFLGYSHALSRKLQSSHGLTLRGCAVICHQQQVHAYSSGRDYVFSLTRNPLTKEAKTAAFNEEGRMHMTVSLVIECDGTIANGDDGANALENHLASLCLTQRLAGGTITNIRRVKVINYPETEAATRRLLCRLLPGFALLDRSELLAEHLNQLRQTNPQAEMLDAWLDFSALKIQAIPPQSDTPVESGAPAPWGYVGKPKTGYLVPIVTGYRAISPLYAPGEVDKTRDPHTPFRFVESLYGIGEWRGLHRIKDLRQLLWGYHQEGDNYLCRCALPASVDTYLLNDEE >NZ_CP007230.1|WP_002211867.1|4562046_4563051_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MAKATIKTASVLAFERKLSNSDAMMYAGNWGQTDNWQPIIIKEKAVRGTISNRLKNALASDPAKLDAEIQKANLQRVDVAALPFDTDTLKMSFTLRVLGNLATPSVCNDQEYQAELASVINGYISEQSFSVLAARYAENLANGRFLWRNRVGAEDIKVCITSQTKSYQFDSNEFSLRQFSQPSKELTALAQEIEQGLAGNGFAFFTVDAFVRLGNGQEVFPSQELVLDSNSKKSKVLYQIDGIAALHSQKVGNALRTIDDWYPDATELALGPIAVEPYGSVTSRGKAYRQPKQKMDFYTLLDNWVTKGTVPAVEQQHYVMATLIRGGVFGEKGE >NZ_CP007230.1|WP_025384235.1|4561481_4562036_-|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MDHYLDIRVLPDPEFSAQTLLEALFAKLHRALVATIPGRVGVSFPTAGKTLGSQLRLHGSRGDLLELQSAGWLKGLQDYCECSEILAVPADVKHRTIRRVQVKSSAQRLRRRSVSKGWLTEEQARLRIPDSHDKRCNLPFLRLKSRSSEQYFLLFIEQGTLQTSATTGEFSAYGLSVNATIPWF >NZ_CP007230.1|WP_025384233.1|4559991_4560729_-|LuxR-family-transcriptional-regulator MIINYFDNESINEDIKNYIQRRIKAYGNIRYSYLLMNKKLPLHPAIISNYPLDWVKKYKKNSYHLIDPVILTAKGKVAPFAWDDNSVINIKSTDSAVFNLAREYNIVNGYTFVLHDNNNNMATLNVSSGDDDSIFFDESIEVNKEKIQMLLILIHDKMLNLYNKNYHENNELNKKENKREIFSPRENEILYWASVGKTYSEVAIILGIKKSTVKFHIGNIVRKLGVLNAKHAIRLGIELQLIKPI >NZ_CP007230.1|WP_025384232.1|4558315_4559242_-|DMT-family-transporter MDRSPSLFTNKKFVFFGATFCCLLWGSAYPAIKNGYQLFNISPDDIPSKMVFAGYRFLLAGLVLLLFAVASGKAIGRLKKGQYQQIAILGLTQTAVQYVFFYIGLAYTTGVKGSIMNATGTFFSVLLAHYLYKNDRLTLNKIIGCALGFVGVMVVNVGSDFMDFNFSLLGEGSVVLAAFILSAASIYGKRISQTMDTTVMTGYQLAIGGLVLTLGGYLFGGHLSDFGWQALLLLGYLVLLSSVAFALWSLLLKYNRVGMVAPFNFLIPVSGAVLSAIFLHESILEWKNAIALALVCVGIVLVNKIKST >NZ_CP007230.1|WP_025384231.1|4556455_4558183_+|potassium/proton-antiporter MDAITINSLFLVGAVLVGASILLSSFSSRLGIPILVIFLAIGMLAGTDGLGGIAFDNYPAAYLVSNLALAVILLDGGMRTRASSFRVALWPALSLATFGVIITAGLTGLVAAWLFNLDIIQGLLIGAIIGSTDAAAVFSLLGGKGLNERVSATLEIESGSNDPMAVFLTVTLIAMIAAGETSLSWMFLVHLIQQFGLGIIIGLFGGGLLLLLINRMELANGLYPLLAVSGGILVFALATALNGSGILAVYLCGLLLGNRPIRNRAGILQTFDGLAWLSQIGMFLVLGLLLNPSDLLPIAIPALLLSLWMILFARPLSVFIGLLPFRSFNLRERVFISWVGLRGAVPVILAVFPMMAGLPNANLFFNVAFFVVLVSLLLQGTTLSFAARKAKLVVPPTLAPVSRIGLDIDMNNQWEQFIYQLSCDKWCIGATLRDLKMPQGTRIAALFRGKDLLHPTGSTRLKEGDILCVIGQEHDLPALGKLFSQSPNIQLDERFFGDFILDADAKLQDISQIYGLNLEPAIDKQQTLGQFVLYLFGGEPVIGDQIEWDGLTWTIAEMESDRVSRVGVKIVTDKA >NZ_CP007230.1|WP_025384230.1|4555888_4556134_+|hypothetical-protein MKKQEDIENGLAPDSNVNTEFPTLFALVSRLSGALDGAITGKDRSVLVNELSQFSVDNLPEQEKMLTAEILRRTLATLKRD >NZ_CP007230.1|WP_025384240.1|4571178_4572423_+|mechanosensitive-ion-channel-family-protein MQQRISQWLERLGMEFSDVMSLTMVIGLILLISVVIHLVLHRVVLATLQRRGQQSQRIWQQAITKHKLFQRVALLLQGIIINLQAVLWLQNGSQTQAVIVTAAQVWIMAFALLALFSLLDTLLALLRQSSVAHQLPLRGIFQGLKLVAAIFIGIMIVSLLMGRSPLLLLSGLGAMTAVLMLVFKDPILGLVAGIQLSANDMLKIGDWLEMPKYGADGAVTDIGLTTVKVRNWDNTVTTIPTYALISDSFKNWRSMSESGGRRIKRGINIDTTSVHFLSEQEQQRLTLNPLLQHYLSEKSQELNQYNQQIALDLSSPLNGRRLTNIGTLRAYLVAYLRAHPGIHQSMTLMVRQLAPTPEGLPLEVYAFTNTTIWAEYEGIQADIFDHIFAVVSEFDLRIHQTPSGNDMRSMLAKV >NZ_CP007230.1|WP_025384241.1|4572756_4574031_-|hypothetical-protein MKLLNTLVCIIGLTSFSSSAKLVNAEHLDALYQKVTVANKTELGLIHIYSEFPDYRWVKDPIEGVSAIDDVARAAIFYQRQYQATGSAADLEKIKSLVEFILYQRADNGYFYNFIYPDHSINKEYKTSVAEPNWWTWRALWALTQAYPTLVKTDNALAQRTRETIFATIDVIYKDFNFKQTRGEKEGVAVPEWLPHTAGDQASVLLMALSDAQALEAKPEIEKMMRSLAAGIMLMQVKDTSSPVNGAFLSWQNLWHGYGNSQAYALLVAGNRLGDRDMIKAAFNELDHFHPWLISNGLLNEFTVRQQGEKVTLIEQKKFSQIAYIIRPMVFANIKAWEISRDAVYLERAVDLSLWFFKNNPAQAQMYYPVTGIAFDGIDSATTVNKNSGAESTIEALLTLQLIESIPDAKRMLESALEKRNIKQ >NZ_CP007230.1|WP_025384242.1|4574069_4575185_-|hypothetical-protein MKHKKYLSLFLMAGICSVAQADNSPNVVNANNVENRTFFAGDKIRIVKDGGETIEAIVELSDDNIGIVRIPKDEKAYFHGNWLAEYKIEHFRNEGRSTNSRPVHEIVFADGRVNFGDTGWNTGFLLKQVRFTSDSRNESNHKVDFRMVEMEIRPAWSKSIDKHWFMFEGIYLGKTGYEKNRTTGGDNNIGGDGYGFRPYYRYQVSDRLSVNTDVKMLVEDKDARGADNGRFQFYEALVNVNYRVADNVHAGIEVFRKEGQDFNHNGTKTANVLEQELRPWVAWNMGKNNFLFKMEPQLRRIGGQDGYRETSKAQKYIFNYSYPIADRVYLVAEYFYRVEHDKKFWDRGVRDNKSYSDTTTHFGKLGINYIF >NZ_CP007230.1|WP_025384243.1|4575307_4576246_-|DUF1861-family-protein MMRHTPPANVAQLFADYQKRTAHNTFSTGRLEFTGVGDKDVYNITAPFTSAGQVVIAGRVEARDSEHSTIVFFSEQQGKWTPVENAPTFQLQDPFFTWIEDELIFGGVEINPHPDNPGQLIWHTVFFRGRDIHSLTRFASGPPGMKDIRLCHIQQGRIGVFTRPQGKIGGRGTIGYVEINNLEALTPETITSAELFEQQFNSEEWGGVNETHLLCDGTIGLLSHIACFDQHGRRHYYPGVFIFNPDTRNYTPIKIIAARDNLLPGAAKRPDLVDVIFPGGLIVLPNNGWRLYVGASDAEAHWIDIEDPFSGF >NZ_CP007230.1|WP_025384244.1|4576271_4577327_-|glycosidase MIRYSGNPLITPQDITPSHPGFKVECAFNAGITKLGDETIMLIRIAESVIPESEGITVVPLLMEISGHWQVTTRVFKHGDPAYDFSDPRLISDIADPSIVYLTSLSHLRVARSHDGVTFVVDDKPFIFPANGDEAFGCEDARITQIDGAYYINYSAVSEKGICTALAVTQDFTDVKRLGLIFCPDNRDACLFPEKINGKYMTLHRPAPKHFGKPEIWLASSMDLLHWGDHRHLLGTSQDPWDALKLGGGAQMLKTEKGWLQIYHGVDATQRYSLGALLLDLEQPTKILAKSQVPLLQPQAPYELHGFFGNVVFTCGALIENDSLRVYYGAADECMCLAEMPLAQLWQHLSV >NZ_CP007230.1|WP_025384245.1|4577439_4578264_-|carbohydrate-ABC-transporter-permease MKKNINSLIIHLVMFSLALSWLYPYIWMVLSSFKQSADVYTTGLFGSAYSLDNYRFLFENSGRVEKPFLKTLFNSLFISTVVTVAVTLSSMFIGFALAKMQFKGQSLFRNLLFLQMVFPASMFIIPQFVLVRELGLLNSYSAMIVPFLMSSWGIFMISQSFQGTPNDYIHAAKIDNASLWQIMIYLMMPLNKAIIAIVALFTFVGTWDNFLWPLIVIQDESKMPLSVLLATFSKSYGVYVGPVIAGAVIQTIPIVVLFILFRKYFMQGMSLSLK >NZ_CP007230.1|WP_025384246.1|4578264_4579140_-|sugar-ABC-transporter-permease MTFLKLKDKHVGSVLAASYLGYTSIFWFYPFIWLAVLSLTEWRFVGIPTFNGLNNFILVMQDPLFWKSMLNVMRFLMYYLPIVFISSFLFAFGLQKLKYGRTFVALSFLLANVSSGVAYSIVFSKIFSQNGPLNTFLYDWFGFTLPWLTSPDFAMLSIALVVTWKFVGYYGLILFSGLNSIPKEIYSAAELDNTRTIKRLFHITLPMINPQLIMVLVLAITVSFAIFTEPYLITGGGPLNSTTTPMIVMYETAFMKMQPSWAATMSIFIALISFGIILGVRKLLERKVEIV >NZ_CP007230.1|WP_025384247.1|4579248_4580535_-|carbohydrate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MLEKMKNTLISLAIASSCVVFTGCDNDAASAKNEKQDITLWIAPNNVQEAFWSEVVGEWNKQPDKKKVVFSTIPAAGSSEEAIMNAIASDRAPDISENIFTGFGSQLADLGQVVDLSTLDGYENLISRRQMTDIMENWRYNGKNYILPIYMNPVLFWWRGDLLKEQGFSEVPKTYDEVYALSEKYTIPDKRYAIQATSGRNWWDRWFDFIALYYAQSGGKPYIANQQASYDNQAGRDVLDFMHTLFSKKWTLYDFGQDDPLVTGKVLGAVRGPWDISRYQQQYPEILKHIKIGPMLVKDQQDKPHTFADGKGLVLFSHSKVKPEAWEFIQWVFSQPKFDKRWMELTGMPPARADLLTNPFFAEYYQEHPYAAAYAEYVNVAIPPVSSGETVEIQRSMTQMIEKTAFNTATPDEALRQSIKEVNAILKP >NZ_CP007230.1|WP_025384248.1|4580806_4581847_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MTTGKKRETLKTIAETLNVTHTTVSNVFNRPEKVSPELREKILAYAESINYHGPAGAGRFLRTGKCGTLGVIFNDNLSYVFSDRHDIALMRGIAEECEKNGINIALMPLKTNNALKKRMMGALVDGYILNATYNNDEVVQAALTSGLPVITTDIKLQNFTCVSIDDGAAMQAICHHLLAAGHKKFGIVSFPVKRLPGELTSLAEFSTDYDNGVAFGRISACITALAEAGIDLHTSYVAEQPHSETGGEKAAKALLAKEPGISAIICLSDRFAFGVYQFCQDHNIPVPGQIAITGFDDIDIQDPPVGLTTIRQPTVLKGREAARALISGQLANDISLDFELVVRDSA >NZ_CP007230.1|WP_025384249.1|4581863_4583252_+|phosphomannomutase/phosphoglucomutase MEKLTCFKAYDIRGKLGSELNEEIAYRIGRAYCQWLKPAKVVVGGDARATSAELKNALAKGLMDGGADVIDIGMVGTEEVYFATRFYGVDGGIQVTASHNPIDYNGMKLVKKDAQPISGDNGLYEIQRLAQDNHFAPPGVRGQLETQLVREHYVEHLLSYIDLNALLPMKIVVNAGNGAAGPTLDALEAALAKRKVPISFIKINHQPDSSFPNGIPNPMLPENQGSTRQAVCEHQADLGIAWDGDFDRCFFFDHLGNFIEGYYIVGLLAEKFLLTNNIGKATHNADKIIHDPRLTWNTIDIVQTLNGTAIESKTGHAFIKDAMRHHDAVYGGEMSAHHYFREFGYCDSGMIPWLLVIELLSKKTTSLFSLIESRKAKFPVSGELNFTVSDPKTKIQQIKQFYADSAIHVTGIDGLSMEFEHWRFNLRSSNTEPLVRLNIETRGDITLLEQKTAQLTQFLYPK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP007230_2 | 2.14|3604979|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604979-3605010 | 32 | NZ_CP009710 | Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 strain IP32953 plasmid pYAC_2, complete sequence | 19975-20006 | 0 | 1.0 |
NZ_CP007230_2 | 2.14|3604979|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604979-3605010 | 32 | NC_006154 | Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953, complete sequence | 13031-13062 | 0 | 1.0 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | NZ_CP054046 | Yersinia massiliensis strain 2011N-4075 plasmid unnamed1, complete sequence | 96208-96239 | 1 | 0.969 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | LR134252 | Klebsiella aerogenes strain NCTC9997 genome assembly, plasmid: 2 | 78835-78866 | 4 | 0.875 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | NZ_CP041249 | Raoultella electrica strain DSM 102253 plasmid unnamed2, complete sequence | 39159-39190 | 4 | 0.875 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | KF800937 | Vibrio phage AS51, complete genome | 4764-4795 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | MK820013 | Vibrio phage vB_VpaP_MGD2, complete genome | 38881-38912 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | KY290756 | Vibrio phage Vp670, complete genome | 14708-14739 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | JQ088079 | Vibrio phage phi-A318 RNA polymerase gene, complete cds | 1596-1627 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | MN807240 | Vibrio phage VP-HS15, complete genome | 21911-21942 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | KF322026 | Vibrio phage phi-A318, complete genome | 4766-4797 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | NC_047746 | Vibrio phage Vc1, complete genome | 30198-30229 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605519-3605550 | 32 | MT104467 | Pseudomonas phage MR4, complete genome | 5271-5302 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605519-3605550 | 32 | KJ749827 | Escherichia phage ECBP5, complete genome | 6165-6196 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | NZ_CP026049 | Raoultella planticola strain FDAARGOS_64 plasmid unnamed2, complete sequence | 7144-7175 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | NZ_CP026276 | Klebsiella oxytoca strain KONIH5 plasmid pKOR-ab4d, complete sequence | 129878-129909 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | NZ_CP008842 | Klebsiella michiganensis strain M1 plasmid pKOXM1A, complete sequence | 63620-63651 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | NZ_CP042546 | Klebsiella michiganensis strain C52 plasmid pC52_001, complete sequence | 158034-158065 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | NZ_CP013339 | Raoultella ornithinolytica strain Yangling I2 plasmid pKPYL1, complete sequence | 89333-89364 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605579-3605610 | 32 | NZ_CP036439 | Klebsiella pneumoniae strain ABFQB plasmid unnamed1, complete sequence | 112246-112277 | 5 | 0.844 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | MN855799 | Bacteriophage sp. isolate 97, complete genome | 13355-13386 | 6 | 0.812 |
NZ_CP007230_3 | 3.3|4570301|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4570301-4570332 | 32 | NC_028655 | Yersinia phage vB_YenP_AP10, complete genome | 1831-1862 | 7 | 0.781 |
NZ_CP007230_3 | 3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4570361-4570392 | 32 | MN693242 | Marine virus AFVG_25M170, complete genome | 2558-2589 | 7 | 0.781 |
NZ_CP007230_3 | 3.10|4570722|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4570722-4570753 | 32 | MN693034 | Marine virus AFVG_117M74, complete genome | 77014-77045 | 7 | 0.781 |
NZ_CP007230_2 | 2.9|3604679|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604679-3604710 | 32 | NZ_CP017464 | Staphylococcus pasteuri strain JS7 plasmid pSNJS701, complete sequence | 957-988 | 8 | 0.75 |
NZ_CP007230_2 | 2.9|3604679|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604679-3604710 | 32 | NZ_CP031281 | Staphylococcus pasteuri strain 3C plasmid unnamed1, complete sequence | 48044-48075 | 8 | 0.75 |
NZ_CP007230_2 | 2.20|3605339|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605339-3605370 | 32 | NZ_CP007795 | Azospirillum brasilense strain Az39 plasmid AbAZ39_p2, complete sequence | 339838-339869 | 8 | 0.75 |
NZ_CP007230_2 | 2.20|3605339|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605339-3605370 | 32 | NZ_CP032347 | Azospirillum brasilense strain MTCC4039 plasmid p2, complete sequence | 411124-411155 | 8 | 0.75 |
NZ_CP007230_2 | 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605519-3605550 | 32 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 326572-326603 | 8 | 0.75 |
NZ_CP007230_2 | 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605519-3605550 | 32 | MN855666 | Myoviridae sp. isolate 212, complete genome | 16396-16427 | 8 | 0.75 |
NZ_CP007230_2 | 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3605519-3605550 | 32 | MN855689 | Myoviridae sp. isolate 28, complete genome | 443-474 | 8 | 0.75 |
NZ_CP007230_3 | 3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4570361-4570392 | 32 | NC_010542 | Crocosphaera subtropica ATCC 51142 plasmid C, complete sequence | 14395-14426 | 8 | 0.75 |
NZ_CP007230_2 | 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604199-3604230 | 32 | NZ_CP022999 | Rhizobium sp. 11515TR strain 10195 plasmid p11515TR-A, complete sequence | 810926-810957 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604199-3604230 | 32 | NZ_CP024314 | Rhizobium sp. NXC24 plasmid pRspNXC24c, complete sequence | 1037617-1037648 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604199-3604230 | 32 | CP006880 | Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602c, complete sequence | 945975-946006 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | GU943054 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C24 genomic sequence | 4782-4813 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.9|3604679|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604679-3604710 | 32 | NZ_CP051645 | Staphylococcus caprae strain SY333 plasmid pSY333-41, complete sequence | 4392-4423 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.10|3604739|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604739-3604770 | 32 | NZ_LR723671 | Rhizobium flavum strain YW14 plasmid 2 | 29389-29420 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.11|3604799|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604799-3604830 | 32 | NZ_CP053978 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed2, complete sequence | 4218-4249 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.11|3604799|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604799-3604830 | 32 | NZ_CP009333 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 4, complete sequence | 18123-18154 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.12|3604859|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604859-3604890 | 32 | NZ_CP035092 | Paracoccus denitrificans strain ATCC 19367 plasmid unnamed1, complete sequence | 476926-476957 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.12|3604859|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604859-3604890 | 32 | NC_008688 | Paracoccus denitrificans PD1222 plasmid 1, complete sequence | 70459-70490 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604919-3604950 | 32 | NZ_CP013555 | Rhizobium phaseoli strain N931 plasmid pRphaN931c, complete sequence | 36311-36342 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604919-3604950 | 32 | NZ_CP013566 | Rhizobium phaseoli strain N831 plasmid pRphaN831c, complete sequence | 36311-36342 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604919-3604950 | 32 | MK408758 | Campylobacter phage CP20, complete genome | 159306-159337 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604919-3604950 | 32 | FN667788 | Campylobacter phage CP220, complete genome | 160926-160957 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604919-3604950 | 32 | FN667789 | Campylobacter phage CPt10, complete genome | 160080-160111 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_3 | 3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4570361-4570392 | 32 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 1674765-1674796 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_3 | 3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4570361-4570392 | 32 | NZ_CP041688 | Chryseobacterium sp. SNU WT5 plasmid unnamed1, complete sequence | 48803-48834 | 9 | 0.719 |
NZ_CP007230_2 | 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604199-3604230 | 32 | NZ_CP032685 | Rhizobium sp. CCGE531 plasmid pRCCGE531d, complete sequence | 157607-157638 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_2 | 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604199-3604230 | 32 | NZ_CP032690 | Rhizobium sp. CCGE532 plasmid pRCCGE532d, complete sequence | 157607-157638 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_2 | 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604199-3604230 | 32 | NZ_CP032695 | Rhizobium jaguaris strain CCGE525 plasmid pRCCGE525c, complete sequence | 1836282-1836313 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | NC_048184 | Synechococcus phage S-CBP3, complete genome, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 3 unordered pieces | 6377-6408 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | NC_020865 | Cyanophage KBS-P-1A genomic sequence | 28018-28049 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | HQ633062 | Synechococcus phage S-CBP3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 3 unordered pieces | 6377-6408 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | HQ317389 | Synechococcus phage S-RIP2 genomic sequence | 35633-35664 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_2 | 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604319-3604350 | 32 | NC_025461 | Synechococcus phage S-CBP3, complete genome | 14962-14993 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_2 | 2.7|3604559|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3604559-3604590 | 32 | NZ_CP023282 | Nostoc sp. CENA543 plasmid pCENA543b, complete sequence | 8976-9007 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_3 | 3.7|4570542|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4570542-4570573 | 32 | NZ_CP028344 | Vibrio parahaemolyticus isolate R13 plasmid pVpR13_19Kb, complete sequence | 8571-8602 | 10 | 0.688 |
NZ_CP007230_3 | 3.7|4570542|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4570542-4570573 | 32 | NZ_CP028143 | Vibrio parahaemolyticus strain R14 plasmid pVpR14_20Kb, complete sequence | 6002-6033 | 10 | 0.688 |
1. spacer 2.14|3604979|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009710 (Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 strain IP32953 plasmid pYAC_2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agcgtgcattgacgtgattaacccatcatgac CRISPR spacer agcgtgcattgacgtgattaacccatcatgac Protospacer ********************************
2. spacer 2.14|3604979|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_006154 (Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agcgtgcattgacgtgattaacccatcatgac CRISPR spacer agcgtgcattgacgtgattaacccatcatgac Protospacer ********************************
3. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054046 (Yersinia massiliensis strain 2011N-4075 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatact Protospacer *****************************.**
4. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR134252 (Klebsiella aerogenes strain NCTC9997 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtgatgacaaacgggcaggagatgga Protospacer ******** ****************.****
5. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041249 (Raoultella electrica strain DSM 102253 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtgatgacaaacgggcaggagatgga Protospacer ******** ****************.****
6. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF800937 (Vibrio phage AS51, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer aagcaaggaactgccaaggcttatcagctttc Protospacer ** .*****************.******.**.
7. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK820013 (Vibrio phage vB_VpaP_MGD2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer aagcaaggaactgccaaggcttatcagctttc Protospacer ** .*****************.******.**.
8. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY290756 (Vibrio phage Vp670, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer aagcaaggaactgccaaggcttatcagctttc Protospacer ** .*****************.******.**.
9. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JQ088079 (Vibrio phage phi-A318 RNA polymerase gene, complete cds) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer aagcaaggaactgccaaggcttatcagctttc Protospacer ** .*****************.******.**.
10. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN807240 (Vibrio phage VP-HS15, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer aagcaaggaactgccaaggcttatcagctttc Protospacer ** .*****************.******.**.
11. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF322026 (Vibrio phage phi-A318, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer aagcaaggaactgccaaggcttatcagctttc Protospacer ** .*****************.******.**.
12. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047746 (Vibrio phage Vc1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer aagcaaggaactgccaaggcttatcagctttc Protospacer ** .*****************.******.**.
13. spacer 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT104467 (Pseudomonas phage MR4, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ataata-gaagaaagctaagtaagttcagtaag CRISPR spacer -caatagggagcaagctaagtaagttaagtaag Protospacer .**** *.** ************** ******
14. spacer 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ749827 (Escherichia phage ECBP5, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ataata-gaagaaagctaagtaagttcagtaag CRISPR spacer -caatagggagcaagctaagtaagttaagtaag Protospacer .**** *.** ************** ******
15. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026049 (Raoultella planticola strain FDAARGOS_64 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtgatgacaaacgggcaggagattga Protospacer ******** ****************.***
16. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026276 (Klebsiella oxytoca strain KONIH5 plasmid pKOR-ab4d, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtgatgacaaacgggcaggagattga Protospacer ******** ****************.***
17. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP008842 (Klebsiella michiganensis strain M1 plasmid pKOXM1A, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtgatgacaaacgggcaggagattga Protospacer ******** ****************.***
18. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042546 (Klebsiella michiganensis strain C52 plasmid pC52_001, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtgatgacaaacgggcaggagattga Protospacer ******** ****************.***
19. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013339 (Raoultella ornithinolytica strain Yangling I2 plasmid pKPYL1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtgatgacaaacgggcaggagattga Protospacer ******** ****************.***
20. spacer 2.24|3605579|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP036439 (Klebsiella pneumoniae strain ABFQB plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
gtcagcgtcatgacaaacgggcaggggatgct CRISPR spacer gtcagcgtgatgacaaacgggcaggagattga Protospacer ******** ****************.***
21. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855799 (Bacteriophage sp. isolate 97, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer agttaaggaactgccaaggcttatctgcatga Protospacer *.*******************.*** ** *
22. spacer 3.3|4570301|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028655 (Yersinia phage vB_YenP_AP10, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aatgggaggtgatgtaatgagcaaggatgatt-- CRISPR spacer tatgggaggttatgtaatgagtaag--ttactgg Protospacer ********* **********.*** * *.*
23. spacer 3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693242 (Marine virus AFVG_25M170, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
actgctttcattgtcatcttattaatctctct CRISPR spacer tatggtttcattgtcattttattaatcacgat Protospacer ** ************.********* * *
24. spacer 3.10|4570722|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693034 (Marine virus AFVG_117M74, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttaatggatgttggaaatatgaatcctaataa CRISPR spacer ggaaatgatgttagaaatataaatcctaatac Protospacer ** ******.*******.**********
25. spacer 2.9|3604679|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017464 (Staphylococcus pasteuri strain JS7 plasmid pSNJS701, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgactgctaatattaaaaaagagcattggtat CRISPR spacer agcttgccaatattgaaaaagagcattatttt Protospacer * .***.******.************. * *
26. spacer 2.9|3604679|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031281 (Staphylococcus pasteuri strain 3C plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgactgctaatattaaaaaagagcattggtat CRISPR spacer agcttgccaatattgaaaaagagcattatttt Protospacer * .***.******.************. * *
27. spacer 2.20|3605339|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007795 (Azospirillum brasilense strain Az39 plasmid AbAZ39_p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
-atcgataaaggatcggaaagacggcagaaaga CRISPR spacer aggcgac-gaggatcggaaagacggcggacagc Protospacer . ***. .*****************.** **
28. spacer 2.20|3605339|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032347 (Azospirillum brasilense strain MTCC4039 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
-atcgataaaggatcggaaagacggcagaaaga CRISPR spacer aggcgac-caggatcggaaagacggcggacagc Protospacer . ***. *****************.** **
29. spacer 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataatagaagaaagctaagtaagttcagtaag CRISPR spacer tttaaagaagaaagctaagtctgttcagtctt Protospacer * * *************** *******
30. spacer 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855666 (Myoviridae sp. isolate 212, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataatagaagaaagctaagtaagttcagtaag CRISPR spacer taaagttaagaaagttaagtaagttaagtaac Protospacer ** *******.********** *****
31. spacer 2.23|3605519|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855689 (Myoviridae sp. isolate 28, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataatagaagaaagctaagtaagttcagtaag CRISPR spacer taaagttaagaaagttaagtaagttaagtaac Protospacer ** *******.********** *****
32. spacer 3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010542 (Crocosphaera subtropica ATCC 51142 plasmid C, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
actgc-tttcattgtcatcttattaatctctct CRISPR spacer -ttacgtttcattgtcactttattaatctataa Protospacer .*.* ***********..********** *
33. spacer 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022999 (Rhizobium sp. 11515TR strain 10195 plasmid p11515TR-A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atgcatatccatctctaattcaacttgacgcg CRISPR spacer atgcatatccatctctacatcaacggcagctc Protospacer ***************** ***** * .
34. spacer 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024314 (Rhizobium sp. NXC24 plasmid pRspNXC24c, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atgcatatccatctctaattcaacttgacgcg CRISPR spacer atgcatatccatctctatatcaacggcagttc Protospacer ***************** ***** * .
35. spacer 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP006880 (Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602c, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atgcatatccatctctaattcaacttgacgcg CRISPR spacer gtgcatatgcatctcgaattcaacagaagcag Protospacer .******* ****** ******** .* *
36. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU943054 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C24 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer ctgcaaggaattgccaaggttcatcagcagct Protospacer .******.********.******** .*
37. spacer 2.9|3604679|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP051645 (Staphylococcus caprae strain SY333 plasmid pSY333-41, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgactgctaatattaaaaaagagcattggtat CRISPR spacer tcccacctaatgtaaaaaaagagcattgggga Protospacer * * *****.* *************** .
38. spacer 2.10|3604739|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR723671 (Rhizobium flavum strain YW14 plasmid 2) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cggaagcattcggcgagcgagaacttaacatt CRISPR spacer atgaagcattgggcgagcgggaactggacgcc Protospacer ******** ********.***** .**...
39. spacer 2.11|3604799|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053978 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aagaatgtttaaatgggataaggacggcaact CRISPR spacer tagaatgtttaaaagggttaaggagtggcttt Protospacer ************ *** ****** * .*
40. spacer 2.11|3604799|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009333 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aagaatgtttaaatgggataaggacggcaact CRISPR spacer tagaatgtttaaaagggttaaggagtggcttt Protospacer ************ *** ****** * .*
41. spacer 2.12|3604859|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035092 (Paracoccus denitrificans strain ATCC 19367 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agcaggaacagactgttgtgacggataataac CRISPR spacer cgcaggaacagaccgttctgacggtcaccggc Protospacer ************.*** ****** .* ...*
42. spacer 2.12|3604859|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008688 (Paracoccus denitrificans PD1222 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agcaggaacagactgttgtgacggataataac CRISPR spacer cgcaggaacagaccgttctgacggtcaccggc Protospacer ************.*** ****** .* ...*
43. spacer 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013555 (Rhizobium phaseoli strain N931 plasmid pRphaN931c, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcgccattgccggtaattcttacattaaaat CRISPR spacer aactttcttgacggtaatccttacattaaaag Protospacer * .. *** *******.************
44. spacer 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013566 (Rhizobium phaseoli strain N831 plasmid pRphaN831c, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcgccattgccggtaattcttacattaaaat CRISPR spacer aactttcttgacggtaatccttacattaaaag Protospacer * .. *** *******.************
45. spacer 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK408758 (Campylobacter phage CP20, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcgccattgccggtaattcttacattaaaat CRISPR spacer aaccacgatgccgttaattctttcattaaaaa Protospacer * *. ***** ******** ********
46. spacer 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN667788 (Campylobacter phage CP220, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcgccattgccggtaattcttacattaaaat CRISPR spacer aaccacgatgccgttaattctttcattaaaaa Protospacer * *. ***** ******** ********
47. spacer 2.13|3604919|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN667789 (Campylobacter phage CPt10, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcgccattgccggtaattcttacattaaaat CRISPR spacer aaccacgatgccgttaattctttcattaaaaa Protospacer * *. ***** ******** ********
48. spacer 3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
actgctttcattgtcatcttattaatctctct CRISPR spacer cctgcattcattttcatcttattatcggttat Protospacer **** ****** *********** . .* *
49. spacer 3.4|4570361|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP041688 (Chryseobacterium sp. SNU WT5 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
actgctttcattgtcatcttattaatctctct CRISPR spacer ttttttttcattttaatcttattaatcttaat Protospacer .* .******* * *************. *
50. spacer 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032685 (Rhizobium sp. CCGE531 plasmid pRCCGE531d, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atgcatatccatctctaattcaacttgacgcg CRISPR spacer atgcatatccatctctacatcaatggcagttc Protospacer ***************** ****. * .
51. spacer 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032690 (Rhizobium sp. CCGE532 plasmid pRCCGE532d, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atgcatatccatctctaattcaacttgacgcg CRISPR spacer atgcatatccatctctacatcaatggcagttc Protospacer ***************** ****. * .
52. spacer 2.1|3604199|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032695 (Rhizobium jaguaris strain CCGE525 plasmid pRCCGE525c, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atgcatatccatctctaattcaacttgacgcg CRISPR spacer atgcatatccatctctatgtcaatggcagttc Protospacer ***************** ****. * .
53. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048184 (Synechococcus phage S-CBP3, complete genome, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 3 unordered pieces) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer ctgctaggaattgccatggctcatcagctact Protospacer . *****.***** ***********. .*
54. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020865 (Cyanophage KBS-P-1A genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer cagccaggaattgccaaggctcatctgcgacc Protospacer * . *****.************** ** ..
55. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ633062 (Synechococcus phage S-CBP3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 3 unordered pieces) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer ctgctaggaattgccatggctcatcagctact Protospacer . *****.***** ***********. .*
56. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ317389 (Synechococcus phage S-RIP2 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer cagccaggaattgccaaggctcatctgcgacc Protospacer * . *****.************** ** ..
57. spacer 2.3|3604319|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025461 (Synechococcus phage S-CBP3, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aattaaggaactgccaaggctcatcagccttt CRISPR spacer ctgctaggaattgccatggctcatcagctact Protospacer . *****.***** ***********. .*
58. spacer 2.7|3604559|32|NZ_CP007230|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023282 (Nostoc sp. CENA543 plasmid pCENA543b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaccgcccagatttctcgcattgagcaaata CRISPR spacer aaactgcccagatttctcccattatttgtcaa Protospacer ****.************* ****. .. *
59. spacer 3.7|4570542|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028344 (Vibrio parahaemolyticus isolate R13 plasmid pVpR13_19Kb, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgtaatggctgcattgcttgggttttatgttg CRISPR spacer tgcttcttctgaattgcttgggttttctgttt Protospacer .*. . *** ************** ****
60. spacer 3.7|4570542|32|NZ_CP007230|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028143 (Vibrio parahaemolyticus strain R14 plasmid pVpR14_20Kb, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgtaatggctgcattgcttgggttttatgttg CRISPR spacer tgcttcttctgaattgcttgggttttctgttt Protospacer .*. . *** ************** ****
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
422587 : 483183
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP007230|422587:483183|DBSCAN-SWA TATGAGCACACTAAGAATCCCCATCGCACTACAGCAAGCGGTTATGCAGTGCCTGCGTCACCATTTGCAACTGGCTAACCAGTATCTTGGCACCGCGTATCCGGAGCCAAAAATTAATTGTCATCAGCGTGGTACCAACGCGGGCAGTGCCTATCTGCAATCATTCGAAATTCGTCTTAACCCAGTATTATTGTTGGAGAATAAACAGCCGTTTATTGATGAAGTCGTACCACATGAATTAGCGCACTTGCTGGTTTACCGCCAATTCGGCCGCGTAGCCCCCCATGGCAAAGAATGGCGATGGATGATGGAACACGTCTTAAAAGTACCCGCCAGCCGCACCCACCAATTTGAAGTGGCGTCAGTGCGCAGTAAGACCTTCAATTATCAATGCAAATGTCAGCAACATGCTTTAACCATTCGCCGCCACAATAAAGTGCTGCGAGGAGAGAGTGAATATCACTGCCGGAAGTGTGGGGATAAACTCCAGTTCATCGCAATAAATCCCAATTAATGACTAACGTTACTTGTTATAAAACAGCACGTTAACTTGCCATTCATCATGATTATCTATAACATGCGTACTTTTCATTATCGGGCTGTTTTGAGATATGTTACGCAATATTTTGTTCTTGCTAGTTTTATCTTCTCCACTGTTTCCTCTGATCAGTCACAGTCACGGCATCAATAACTTCTCCCAGGCAAAAGCGGTGGCCGCTAAAATTCACCAAGATGCACCTGGCAGCTTCTACTGCGGTTGCCAAATCGACTGGCAAGGTAAAAAAGGTATCCCTGACCTAAACAGTTGTGGCTATCAACCCAGAAAAAATGCAGCGCGAGCCGCGCGGATTGAATGGGAACATGTGGTTCCTGCCTGGCAATTTGGTCATCAGCGCCAATGCTGGCAAGAGGGGGGCCGTAAAAATTGTGCCAAAGATCCGGTCTATCGTCAGATAGAAACTGACTTGCATAACCTGCAACCTGCTATTGGTGAAGTGAATGGTGACCGTAACAATTTCATGTATTCACAATGGAATGGCGGCAATGGTCAATATGGTCAGTGTGCGATGAAAGTGGATTTTAAAAATAAATTGGCAGAACCACCGGTACGTGCACGTGGTGCCATTGCCCGCACCTACTTTTATATGCGCGATCAATATCAACTGCGCCTTTCCAGCCAGCAAAGTAAACTCTTTGGTGTCTGGGATCGTCAATATCCCGTCACTGACTGGGAATGCTTACGCGATGAGCGAATTGCGAAAATTCAAGGTAATCATAATCCTTATGTGCAACGCGCTTGCCAGCGGCCAAAAAGCTAATTGAGCCATATTTTCAGATCAATCGCCCCCCATCATACCTTGTTGCGGATGACGTTAGTTTCTAATGGGGTGGCGTTATTTCCTGGTGGGCTGCAATTTTCGATTGGCTGAAACTTCCCTGCCTCTGCTATCCTTAGGTGCTTATTTATTTTGCGTTTATTTCGCGCGGTACTCATCACCGCACGGTATGATTTTCGTTTCAGGACTTAGAGCAAACCCATGCGTATACCCCGCATTTACCACCCACAGCCTTTGCAGGCCAATACCGAACTGGCGCTCACTGATGAAGCAGCAAATCATGTAGGCCGCGTACTACGGATGACTGAAGGGCAAAGCCTGCAATTATTTGACGGCAGTAATCAGATTTTTGACGCTGAAATTATACGGGCAGATAAAAAGAATCTGATTGTCCGACTCGCTGAAGGGCAATGGGAAGATCGGGAATCCCCCCTGAATTTACATTTGGGGCAGGTTATTTCTCGTGGGGAAAAAATGGAATTTACCGTCCAGAAATCCATTGAGCTAGGCGTTAATGTGATTACCCCTCTGTTTTCAGCACGCTGTGGCGTTAAGCTTGATGGCGAACGTCTGACGAAAAAAATTCAGCAGTGGCAAAAAATTGCTATCGCCGCCTGCGAACAATGTGGCCGGAATAAGATCCCAGAGATCCGCGATGCCATGCAACTTGCTGACTGGTGTGCTGAATCCGATGACAGTTTGAAACTAAATCTGCACCCACGTGCCAGCAACAGTATTAATACTCTCCCTTTCTCACTCAACAAAGTGCGTTTGCTGATTGGCCCAGAAGGTGGCCTCTCTGCTGATGAAATTGCGATGACCTCACGCCTCGGATTTACTGATATCCTGCTGGGGCCACGAGTTCTGCGGACAGAAACTACAGCCCTTACCGCAATTACTGCGTTGCAGGTGCGGTTTGGCGATCTGGGATAAACCCATTTCCCACTAGGAGAAAAGAATGATTAAGCTCGGTATCGTAATGGACCCTATTTCGTCCATTAACATCAAGAAAGACACCAGTTTCGCTATGCTGTTAGAAGCACAGCGCCGTGGCTGGGAATTGCATTACATGGAGATGGGGGATCTCTATATGCGTGGGGGTGATGGCCGCGCACGTACCCGCCTACTCAATGTGAAGCAGGATAAAGAGAGCTGGTTTAGTTTTGGGGCTGAACAGGACTTACCGCTATATGATCTTGATGTCATTCTGATGCGTAAAGATCCGCCGTTTGATACCGAGTTTATCTATGCCACCTATATTCTGGAACGTGCAGAAGATAAAGGCACACTGGTGGTGAATAAGCCACAAAGCCTACGCGATTGTAACGAAAAACTGTTTACGGCCTGGTTCCCAGAATTAACACCGGATACGCTGGTCAGCCGCAGTAAAGACCATATCCGCAAATTCCATCAAGAACACGGCGATATCATCCTGAAGCCATTAGATGGCATGGGTGGCACCTCAATATTCAGGGTAAAACAAGGTGACCCGAACCTCTCGGTTATCATTGAAACACTGACCGAATTAGGCAGCCGCTTCTGCATGGCACAAAACTTCTTACCGGCCATTAAAGAAGGCGATAAACGCGTGCTAGTGGTTGATGGCGAGCCTGTGCCTTACTGTCTGGCACGTATTCCGGCCCAAGGTGAAACCCGTGGCAATCTGGCTGCCGGTGGCCGCGGCGAAGCCCGCCCACTGAGTGAAAGTGATTGGGAAATTGCCCGCACAGTTGCACCAATACTGAAGCAAAAAGGCCTAATTTTTGTTGGGCTGGATATCATTGGCGATCGCCTGACTGAAATTAACGTCACCAGCCCGACCTGCGTACGTGAAATCGAAGCGGCCTTCCCCGAGATTTCTATTACCGGTATGTTAATGGACGCCATTGAAATACGTTTGGCTGACAAAAAAGCCTAATACATAAAAACGGGGGGTGGTGTTTTTCTAAGCGCTACCCCCGTGACTTTATCCTCATTTATCCGCATACTGGCACCAGTTCATCCATTAACTCAGCGAATTCCCTATATAATATAATGAATTTACAGCATCATTTTCTTATTGCCATGCCCTCACTTCAAGACCCTCAATTTAAACGCTCGGTTATCTATATCTGCGAGCATAACGAAAAGGGGGCGATGGGTTTAGTGATTAACAAACCCTTGGAACAGTACACCGTAGAAACGATACTGGACAAACTGAAGATCAAATCCCCCTCACGCGATCCAGCAATACGTTTAGATAACGTGGTATTAGCCGGTGGGCCTCTGGCTGAAGACCGTGGATTTATTCTGCATTCACCGCAGGAAGGCTTTGCTTCCAGTATTCATATTTCACCAGAGACGATGATTACCACCTCCAAAGATGTGTTGGAAACACTGGGAACATCGGGGCAACCTAAAGATTTGTTAGTGGCTCTGGGATATGCAAGCTGGCAGCAAGGGCAGTTAGAACAAGAGTTACTGGATAATGTCTGGCTGACCACTGAAGCCGATACCAATATTTTATTCGACACGCCAATTACCGAGCGCTGGCAGGCCGCGGCCAATAAACTGGGCATTAATATCTTTAATATTGCTCCGCAAGCAGGACATGCCTGATGGCTAACCGCACAATTATTGCTTTTGATTTCGGTACCAAAAGTATCGGTGTCGCTATCGGTCAGGAAGTCACCGGAACGGCCAGAGCGCTAACGGCGTTTAAAGCACAAGATGGCACCCCAGATTGGCAGAAAGTCGAAAAACTGTTGAAAGAGTGGCAGCCCAATTTAGTCGTCGTCGGCCTGCCACTCAATATGGATGGCACTGAACAACCACTAACCGCCAGAGCTCGTCGGTTTGCCAACCGTTTACATGGGCGCTTTGGTGTACAGGTAGCCTTACAAGACGAACGCCTCAGTACGGTAGAGGCCCGCGCCAATCTGTTTGACCGCGGTGGCTATCGCGCTCTGGATAAAGGCAGTGTCGATGCAGCCTCTGCGGTTATCATTTTGGAAAGCTGGTTTGATGAGCAAGCAGGTTGAACCCGCTATGTTCTGTTGGGCACCTGCTGTTTCCTGCTTTCCATTCCCGCTATCTGAATAAGTAATCCCTGCATAACGTTGTATACTTAATAACTTTGTATACTGCGGCTATGCCAATCAGCGGTTTAAAATATTGCGCACCTCTTGCAGGTGTTTTTTTACATTTATTGAGGTTTTCTCATGACAAAAGTAACTGTTGCTGCGACTCAAATGGCCTGTTCTTGGGACCTGCCGAAAAATATTGAAAATGCCGAAAAACTGGTACGTCAGGCGCATGCCAAAGGCGCACAGATCATCCTGATTCAGGAACTGTTTGCCGCACCTTACTTCTGTATTGATCAAAGCCCAGAGCACTACTCACTGGCCCAGGAACTGGGTAATAGTCCATTAATCAAACACTTTTCCAAGCTTGCCGCTGAGCTTGAAGTAGTACTACCGCTGAGTTTCTTTGAGAAAGCCAATAATGCTTACTATAACTCGCTAGTCATGATTGACGCCGATGGCTCGGTGTTGGACGTCTACCGTAAAACCCACATTCCTAATGGCCCGGCTTATCAGGAAAAACAGTTCTTTATCCCTGGCGATACAGGTTTTAAAGTTTGGCAAACTCGTTATGCCAAAGTGGGCGTAGGCATCTGTTGGG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49 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(14.29%) | protease,integrase,tRNA,transposase | attL 416570:416585|attR 487206:487221 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
505236 : 545802
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007230|505236:545802|DBSCAN-SWA ATTAATGGTGGATCTGCGTGAGATCTTCATCACTTAGACCCGTCATTTTCATTACCGTGGCACGGTCAAGGCCATTGGCCAACATAGTGCGGGCAACTTCCAACTTGCCTTTCTTAAGCCCATTAGCCTCGCCGATCTGTATTCCTTCCACTCGGCCTTCTTGACGGCCTTCTTGTTTCAATTTTTGGGCAATCGTCATAAGTAACTCCTTGTGCTGTGGCGAACGACGGGCCAGTTCCCAGATAAAGGTTTTCGGGGTAGCAGCGTCGCCATCTTGTAGCATGTAATTCATCAATGATATTAGCTGATCATCCGTAGTGTAACCGCTAGATAACAGTATGACCAATTGATCCGATAATTCGGACATATCGCGCCGACGAATGTGTTTCTGTAACAGTTCCAGCATAGCAATACCCCGATGGGTCATGATTTCATCATCGGGGATCACCGTCACATCAACCAGCGGGAAATTACCGCTATAGAGCTGATCAGCAAGTGTTGGCAGGCTGAACGTTTGCAGCCAGCTCATTGGATACGGGTACGGCGTGACCTGCCCATGGTAGAACAAAATAGGAATAACCAGCGGCAGCTTGTCGTTACCTGCATCAAGATGGCGTTGCATGGCCGCGATGGCATAGCGCATCAACCGAAAAGCCATATGCTTGTCGGGGGTACTTTGATGTTCAATCAGCGCGTAAACATATCCGTCCTGCGTCTGCGTTTTTAGCGAGTAAAGCACGTCAGAATAGTAGGGGCGCAGGTCATTTTCGATAAAACTACTGGATTCCAGCTGTAAAGTATTTAGGTCACAGATTTTCCGGAATTCAGGTGGTAAATGAATCTCCAAAAAGTCGCGGGCAGTTTGTTGATGGGTAAGAAATTGTTTAAAAATAGCATCATGGGGCGTAGGGGTCGTTTTCATCGGGCGATGATAGTCATGGATATCAGTGTGAGCAATCACTCACAACCACTTTAGGACAAACTGGACATTAGCCTCTAATACCATAGATACCAACTAGCTACATGCCATAGCAGACCATGTTTGCGAATATACCGCAGATAACCCTTTATCAGGGTTATCTCAGACTGCTGACAAACCCCGATGACGCGATCTTGAACGGTGAGGATAGGCAGAGGAGTAAAGCGTCCGCGCCAAGGATGGCGCGGCTCGAGCCTACATGGATGTATTTACGGCGTCTTTACGATCTGCCTGTTCTCTCCGTCGCGGGCACTTTGTCAATAACCTCAGATAACCCTTTATCAGGGTTATCTCAGTATTCAGTATCGTCCACAGATGTCTGCATCAGATCATCGATACGAATGATTAATGGTGGATCTGCGTGAGATCTTCATCACTTAGACCCGTCATTTTCATTACCGTGGCACGGTCAAGGCCATTGGCCAGCATAGTGCGGGCAACTTCCAACTTGCCTTTCTTAAGCCCATTAGCCTCACCGATCTGTATTCCTTCCACTCGGCCTTCTTGACGACCTTCTTGGTGGCCCTCTTGACGACCTTCTTGTTTCAATTTTTGGGCTATCGTCATAAGTAACTCCTTGTGCTGTGGCGAACGACGGGCCAGTTCCCAGATAAAGGTTTTCGGGGTAGCAGCGTCGCCATCTTGTAGCATGTAATTCATCAATGATATTAGCTGATCATCCGTAGTGTAACCGCTAGATAACAGTATGACCAATTGATCCGATAATTCGGACATATCGCGCCGACGAATGTGTTTCTGTAACAGTTCCAGCATAGCAATACCCCGATGGGTCATGATTTCATCATCAGGGATCACCGTCACATCAACCAGCGGGAAATTACCGCTATAGAGCTGATCAGCAAGTGTTGGCAGGCTGAACGTTTGCAGCCAGCTCATTGGATACGGGTACGGCGTGACCTGCCCATGGTAGAACAAAATAGGAATAACCAGCGGCAGCTTGTCGTTACCTGCATCAAGATGGCGTTGCATGGCCGCGATGGCATAGCGCATCAACCGAAAAGCCATATGCTTGTCGGGGGTACTTTGATGTTCAATCAGCGCGTAAACATATCCGTCCTGCGTCTGCGTTTTTAGCGAGTAAAGCACGTCAGAATAGTAGGGGCGCAGGTCATTTTCGATAAAACTACTGGATTCCAGCTGTAACGTATTTAGGTCACAGATTTTCCGGAATTCAGGTGGTAAATGAATCTCCAAAAAGTCGCGGGCAGTTTGTTGATGGGTAAGAAATTGTTTAAAAATAGCATCATGGGGCGTAGGGGTCGTTTTCATCGGGCGATGATAGTCATGGATATCAGTGTGAGCAATCACTCACAACCACTTTAGGACAAACTGGACATTAACCTCTAATACCATAGATACCAACTAGCTACATGCCGTAGCAGACCATGTTTGCGAATATACCATGTGGCATTTCTCCCAGTTAACGCAGGACTCGCAACTTGGCATTGTGACACCAGCCCACCCCGTCTGAAGTGTACAATAATTGCCATAATTACTCCCACCCGCTTGTGTCCAGTAGCGTGCCACCGGGATTTTATTCGCAGGACAAACCGGGTTATTACCGTTGATGACATCAACTTTACCGTGGGTTCCCCACACGCCAGATTGACAGGAAAGCAAAGCTCCAGAGACATCGCGGCTGACCAGACCATTTGAACCGCACTCGCTGCCAGCGCTATTTACCTGATCCAGTTGTAAAACTTCACCGACAGAGAGACGCCCATCTGAGCGTATATTTCCGCCTTTAATCTGGCCTCCGGTAACAATACCTTTATTATTGACTGACCTAACCCAGTCATTGTCCGACATATAAAATCCACCACCGTAGCTCTCGTTGAGCCAGCCCTTATCGCCGCGTGATATCAACCAGCCTTGTTGGCTGCGGATATTGCCTTCGGCGGTGACATCAACAGCATTAATATTACCGCTGAAACGCCCCTCAATGGCGTTTACCGTGCCGGTGTTATTCAGGTTATTTCCTCCCATATCAATACTCGTGTGCATGCGGTTAAAGTCTGGTTTACCCGTAACGGCAAAGCGATAAAGTCGGTCACTTTCATTGCGTGCGTCACTCAGTTCGTCAGTGGTTAATAACGCAGCCACATGCCCAGTTGAGGTACTGAGACCAAAGCTGTTTAGCGGTACGCTCCAACTCCCCATTGCACCCGTAACATAGGCATCATTCCACACATACCCGCCCAGCCCCTCAATATCTGCGGAAATAATCCGTAGTGCTTTGTAAGGTAAACGGCTTCCGCCTTGTGTAACTATCAGCGCTTGCAATTGCTCGGTTCGCATCGCGTTGCGTACTATCGCAGCCTGAAAACGTTGTCCGGTTGTCGTGGTATCACTGAAGCCGCCTGGCAAGAAACCGGTGTTCTTTAACATCGCTGTCGTCACCATAACAGGCTGATTGGTGCCAGCAGAGGCTAATAGCTTGTCATAGTGACGGCCCACGTATCCTTTAAGGGCAAATTTGAAGCGCGATAACTGCACGGCCGTAACCTGATATTCCTTTTGCTTTATATAGTCACCGTAAATGGACGTTGCCCAAATCACTACGATGACCAAAATGAGCAAGGCAATCCCGGTGCTCATCATCGCCCAGCCACGATGCAATGCTCTGGTTTTAAACGTCATGAATTACCACATCAGCAAAGGATCATAGACCTTGACGCTCATCGCCAGCAGTGCGGCATGACCCAGCCAGGGCCCGAGTGGCCCGCCGGTTTTCACATCACCTGACATCAAGTGCCATAGTATGAATCCGCAAAGCCCAACACAGAGTACCAACAGCGCTAAAGGCCAAGCCAGCCAAGCTCCAATAGCAGTAGCAAACCAGACATCGCCTAGCCCCAGCACCTCAGATTGTGCGTAATACCCGAAGACTATCCGAACCGATCCGCAAAACAGGAGTAACGCGATGGCTGTCATACTGTGTGAAAGAAGCTCATCGTTGCCAGCCGCAGCAAGCAGTCCTGCGGCCAGGAAACTCCAGGTAAATTCCTGCGGTAACCAGCCGGAAAGCCGATCAATGAGACTAAGCCGGTATACAAAAGGAACAAACAGCATTGAGGTCATATTGCTGAACACCCGTCCCTCGAATGGAGCCACCGCAATCACCGTCATTGCTACTGCATGGAGCCAGTGATAACGCAATCGAGTGGCTGATTGTTGCTTGAAGGCGGATAAAGAATGATGGCGTTTGAGGAACAGACTGACTTGTCGGGTGATTGGATCAAGTAACCGCAACGCCAGCAAAAATAACAGCGGCACAAATAACCAGGGGAGTGCCAACGTGATGATGGTCAACCGTTAACCGTGAAGGTAAGTGTATTCATCCCGATTCTGCCAGTGTCCTTCACGCAGGCTGTGCCCGCATTTTCGGCAGTGATATTTCCATCACTATAAACGGTGCTATTGATGGTAATACCAGAAATACTGCCGCCAGCACTGAGGCGTGTGGTTATGGCAATACACACATTCTGCGGAACTTTCTGATAGGTCAGGGTAAAACCGTGATTGAAACCGTTCGCAGTTACAGGAGCAACAATAACCTGCCCACCCCATGTATTCCATAGCGTTGCGGTGCTGGCGGTAACATTACCTTTCGTCATCATGTTCTTAGGTACGCCACCGACCTGAATAAGTATGCCAGTCATTGTTGTCCCACTGGCAAAACTGTAGCCATTACGCCCTTTTAGCAGCCCTTGCGTGGACGTTATGATGCTCTGCACATTGGCAGACTCCAAGGCGATATCCTTTCGGTTCCACAGCGTATAAATACCGCCCGGTACAACCGCAATCACGACGATGACTACAAGCGCTACGCCACCGCTCTCAAGGATACCCCAGCCACTATGAGGTTGTTTTCTGGATGCTACTGGTAATGACATTATCGGATCCCTTATTACATTGAGTCACTGGTCATATCCTGAATTTGCATCACCATAGACAAGATGAGTAAGAAGAAACTGAAAATCAGTAACAGAGAGAAAAA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45 | Sodalis_phage(37.5%) | integrase,transposase | attL 531343:531357|attR 539130:539144 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
579284 : 611896
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007230|579284:611896|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP007230|579284:611896|600811_603040_-|WP_025381271.1|DBSCAN-SWA MELIELNHKLSELVPYSNFKLDNRNSFKLLEAIKEYTHNIPFNNDGGFWDDFFFMCENEPEKLAKLYLAETDSDGELLPHQAFILAILQILETPRALLNILPGAHRSLYYRDLLGLSSRQAQPDQVALSIALNPTVTEKLLVKETLFEAGQDALGNPLHYALDASLLANRGYISDLRWLRQDESEQWFIAAPLDVQDQVELPATGIRLFSETVGERPVVNGCLIQAALLAMAEGERVITLAFAQPVTASQFASVEISSGDRWLALTPVVTSPKVTFTLSDQEPAISAPDNLDGLIFEQPVLRLQVAKGQQLPKVVTVSVEQRPVEGVDSLPEVKTATAANILFDLYYLTPFGYSLSAEPAQEDPSLYLGFADIEPGQTLSLYWKLKSPMQPKVDWYYLNQSNQWAALNAWVDDGTQNLYQDGGWSLVLPADAANQASQMPTDRYWLKGVVSVPAQEGSWRNYPLLQGVIYNAMTATLINATTISDSHFLPALSAESIQRTVEPIPEVSSVVQPWASWGGRMAESHGEFFDREAQRLSHRNRALTWGNMATLLKARYISIFDVKYPTHDELTQVSASEQQQLTVIPANHYSDSDDALRPVLNPARLAEMADWLEQRDSLWASITVTNPSYIDVYINYQVIFTSGVNPDFGYRQLRQSLSETYMPWSSSEQRAVIMNNNIGYFQLLATIQQHPLVERVTHLTLQREDTIISPSETASVNAEDNEVLVLVWKDDDIAQRRGKNHE >NZ_CP007230|579284:611896|611578_611896_+|WP_025381282.1|holin|DBSCAN-SWA MELDTPSLEVIIIWLIIGLLAAWGGLVRYIIDIKEKNKEWDSKEVLSQIVISNFSGFLGGFLSFESGVSLYITFAISGLFGTMGSSGIHYLWRKFFSHGDKNEHK 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>NZ_CP007230|579284:611896|579284_579593_-|WP_019083256.1|transposase|DBSCAN-SWA MRKKSFTHEFKQECVNLVLQHKYPVTQAAETMNIGLSTLQRWLRQYRGEIRGNTPIASAITPEQRRIQELEKQVRQLQSDNDLLKKASAFFAMEMNNDKKSR >NZ_CP007230|579284:611896|603131_603548_-|WP_025381272.1|DBSCAN-SWA MSEAIVIDGDLLMFEPMFGARSVTVISPGKIRGTGHAQINGKKTCILGDEKNVRIPATYTTNTHVIPGSGTVTISSLDSSQQVRHCTSGAPLIVKGQQFTATFLVEAPATSPNIEPDNTLDSSGKGRFITQQNFATVN >NZ_CP007230|579284:611896|603544_603967_-|WP_025381273.1|DBSCAN-SWA MENQILTQLYGRGWAFPPLFSLEKGAVMAEGAEDVRQSLQILFSTEPGERLMRADYGCGLNDFMFENIRNELIAEIESRIQDGILRYETRADITDIQVSQSLNRSNTLQMRVAYRLRGSEINQKIQGSLALAEGKTAEVA >NZ_CP007230|579284:611896|587778_590211_+|WP_025381263.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP007230|579284:611896|609620_610688_-|WP_025381280.1|tail|DBSCAN-SWA MTTSTSYPGVYIEELNSLALSISNSATAVPVFAVGENSNIVDEGEATRINSWMDYLNLAGDFNHSDKLAISLRAYFTNGGGYCYLIKTSDLEAVIPTLDDVTLLVAAGENIQVAVDTLCQPGKGLFAILDGPKTALTINGVEDAQSKYTATPFAAVYYPWLTADWADADIPPSAVMAGVYAAVDLSRGVWKAPANIALKGGLEPKFLVTDDLQGVYNSNRAFNMIRNFTNTGTTVWGARTLEDKDNWRYIPVRRLFNTAERDIRRAMSFAVFEPNSQPTWERVRAAVSNYLYDLWRQGALAGNSEEEAYFVQIGLGVTMTADQINEGKMIIKIGMAAVRPAEFIILQFTQDVEQR >NZ_CP007230|579284:611896|586077_586734_-|WP_025381261.1|DBSCAN-SWA MELYLDTSDVAAVKRLARVFPLAGVTTNPSIVASGKRPVDVVLPELREALGGKGRLFAQVMAPRAEQMVEEAKKLRKIINDLVVKVPVTAEGLAAIKLLKAEGIPTLGTAVYGAAQGLLSALAGAEYVAPYVNRVDAQGGDGIQTVKDLQQLLTLHAPGAKVLAASFKTPRQALECLMAGCESITLPLDVAEQIISAPAVAAAVEKFEKDWLTAFGGL >NZ_CP007230|579284:611896|581826_582477_+|WP_025381257.1|DBSCAN-SWA MLEIFDVRYDELTDIRSEDLYKLRKKTFKDRLNWEVNCSNGMEFDEYDNSDTRYLLGIYQGQLICSVRFIELHLPNMITHTFNALFDDVVLPKRGYIESSRFFVDKTRAKLLFGSHYPISYLFFLSIINYSRHNGYTGIYTIVSRAMLTILKRSGWQVEVIKEAHITEKERIYLLHLPIDRDNQARLLLQVNQRLQDSCSVLNTWPISLPVMPESA >NZ_CP007230|579284:611896|606908_608135_-|WP_025381278.1|tail|DBSCAN-SWA MERTQPGVTLTDSIISTRQGVIATAVPVFIGYTDYTAKEKTETVAIRVDSLADYIQTFGDQSLMAFAVRHYFDNGGEQAFILPLAGNMPSDVMTESEADNLISALQDVSVSATIAGEPRITLILAPDISRLNDSLITSNLTHQNLWSAGWAALLELSQAKPNLFVLLDAPDDVALARHCLQRLSSTYRQWGAAYWPRVETTYRNTSVEGAEAQRIVLSPTAAIAAVIQCTDNNVGVWKAPANVVLTQVIRPVKSHLQSDELFNASESSLNLVRSFPGKGIRIWGCRTLENSDNTPWRYLQTRRLVSYVAANLAQLTRMYTFEPNNELTWMKCKGQSCNWLRQLWLQGGLYGTQEDEAFNVLLGLNETMTEEDVRAGKMIMKIELAVLFPAEFIEINLVFDTRTGALLS |
26 | Shigella_phage(14.29%) | holin,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2072906 : 2152092
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP007230|2072906:2152092|DBSCAN-SWA AATGAAAATAGAGCTAGTCACACACAAGACGGGTGAGCAGATACCAATAATGCTGGATGCTTCTGGTATGCCAGTAGTTTTACCTAATGAGTTTATCCTTGCCAGACGATCCCTTAGTACCAATACATTGGTTCGGAATCTGAGAGAGTTGTCAGTGCTTTATCGTTGGTTGGATAAATCAAATTGTGACCTATCTGCGAAATTATTGGCTCAAAACTCATTCAACGAAGCGGAATTAAAAGGTAGTTTGGTCGAAGCGTTAAGAATTGATCAGGTCAATGGAAAGATAAGTACTGTAGCACCGAACACCTTCAATCAACGGTTAACAACTATCCGACAATTTCTTAGTTGGTGCATGGACGTACTAATAAGTCAGTTACCCTTGTCTTCCTTGAATTATGAGCGCTTGAGGGAGAGAAAGTCATTTTTACTAAAAACGCTAGATGATAGCTTTATGTCTGCCACACCAATAAGAACAAGCCTTCGTAAAGGACTAAATGAGGCTGAAGTTGATTTTCTCCTTGAGATATTGCGTCCCGATGGCGAGCAAGGTTTTGGACGAGATTCTGCTGTAAAGTTCAGAAATTATATATCTGTGGGGTTGATGCTATTTTGTGGTTTAAGACCGGGAGAGCTGCTTAGTCTCAGAGTGGAGGATGTCGAAATTGGTGCGATTTCAGCGATAAAAATTGAGCGTAGATCGCCAGACCCACTGGATTTAAGACGACCCAGACCTCAAATAAAACGTAATGGTCGAGTGATTCCGATTGAGAATAGGCAGTTTGCATTTTCTTTGAATGAGTACATTGTTACTTGGCGCGAAATGCTTGAAAGTAAAAGCCAAAACGAATCAGACTATTTAATCTTGAGTGATGAGGGTGTGCCTTTGTCGCAATCCTCAATTACACAGTTTTTTCAGTTGTTGCGCTCGCAATACGCTGACTATCTTCCTGATAACTTAACGGCCAAGTCTCTCAGGCATACATTTTCATCCCGGCTTGAGAGAGTGTTGCGTGTATCAGGAATGGATGAACAGCGCAGAAGAGAAGCGCTAGCCTTGCTGCGTGGCGATAGTAGTTTGGATTCACAAGATATTTACATAGCCCAAGAAGTGGAAGAGCAGGCGATCAAGTCATTGAAGCGGTACCAGGCTGAAATTATGTCAGAGAGGTAGCCTTAGTGAAGACAAGATTATCGAAACCACAGGCTGTCTGGCAGTCTTGGCCTGAGGTCGAGAGGCTAATTACCCGTGAAGGAAAGGAAGTCGATATATCCGGAGATACTTGGAGGTTACCGTATTCTTCGCGGGATAATTCAACCCTGATTTTCAAAAAGATAATTAACTCCGAAATAAGAGAAGCACTCAAGGACCATGTTGCTGATCGGCTAAAACGAGTATCAACCCATGCGGGCTATGCAGCATATCAGGATGTCTGGAGGGAAGTTCTTCGACATTGGGGACACCCGGTATCTAAAGTTGATACGGAGTCGCATCTAATAGACCTTTTTGAATCCGCTATCAATCGTGCTCGGTCACGAAAAAAGTTGTGGTCAATGTATAGACCGATTCAGTGGTATATCTGGAGCGCGGACAACAATCCAGAATATGGATTTTCCGAAATTTATGCACAAGAACTTGAGTCTCTAGAGCTACCAGGAAATCCGAAAGGTGAAGCTGTTCGGATGGAAGATCCCGAAAGTGGTCCCCTGCACAAGTCTCTTGAGTTACCTCTCTTAATTAATGCCCTCAAATTGGATGAGGTGCAATCATTAGAGTATTTGCAGCAGAAAGTTGTCGTTGCCTTATCCGTAGCGTTTGGGCGCAACCCGGCTAACCTAATATTTCTACGAGAGTCTGATTTTGAGCAGTTAGCTCCCGGAGGTGCGGACCCATGCTACATCATTCGCATGCCGAGGATTAAAAAGCGATTTGTGAACCCAAGAGACGATCTTTTGGATGAATATCTCGACCCACATTTTGGTTCTATGATTGAGCAGCTGATCGAAATCAGTAAGTTGGTGCCGTTGAGCTATGCGGATAGGGCCTTTGCTAATCCGGAAGAGCGACCATTGCTAATTAACAGGAATGGAAATAAAGCGGCCATTTTATCCAAAGACGTTGATAACGCATTTAACCTGACAAGTAGCGATATATCACGTTTACTCAATGCGTTCGTAAAACGCCACAATATTATCTCTCCGCGTACTGGCGAATTAATACGAGTAACGCCAAGGCGGCTGCGCTATACCTTGGCAACAGGTTTGGCTGCCGAAGGAATCAGTAAGCGTGAGCTGGCCAGAATACTGGATCATACTGATACCCAGCATGTGAATGTCTATTTTGAGATAGCCGGCAGAATAGTTGAACACCTCGATAAAGCCACGGCGAAAGGATTCTCGAAATACCTCAATTTCTTCAAAGGTAAACTGATCGAAGCTGATGAAGATGCTGTCAATGGTGAGCGAGATGACAAGCACCTGACTTTTGTAGATGAGCAAAATCCCGCAGATCAATCTGATATTGGAGTATGTGGTGAATCCAGCGTCTGCCACCTTGATCCGCCTTACTCATGCTATTTGTGCCCCAAATTTCAGCCTTATCGGCATGCTGACCATGAGCATGTATTGGAATGTCTGCTGGCTGGTCGCGAAGAGCGTTTAAAAAAGTACGAGAATGCCCGGCTTGGCATACAGCTGGATGAGGTGATCGCGGCGGTCGCTCAAGTGGCTATGCTCTGTGAAGAAGGGGGGTACAATGTCTGATGGTCGCTCTAATCGTAAGGCCAAGGTAATCCCTTTCATTGATAGACTTGAGCGTGACAGGAAGGCAAACCTCCGGGCATTAGTCAGTAAAGCAAAGCTAATGAGGCCGGAAGGGTTCGAGTCGGTTGTTTGGGATGACCCTGTGTGGCAAGTCAATGCTGGCCGCTTGGTCAAGCTCACAGGCAAAAACTCGAAAACAGCATCGCTTGCTTTTTTAATTTCTCCAAAGCTTGGCTCTGATCCTTTGAGTGATAGCTGGGAGACGATTGCTAAGGCATTATTTGTTCTCCGATTTCACAGGAAACATCAATCAGCTCCCAATCAGCGTAATTTCATTACAGCCATTGGGTATGTCTCATATTCTGCTAAACAGTTGGGGCAGGATCTGGCTAGGCTCACAGCAGAAGCACTGGATAATGCATGTGAATTAATTTCAACACATTACAGCGAAGCTACTGCCTATAACCTTCACAAGCATGTTGCAGAGTTCGGTGCGCACTGTGATGCGAATGGTTTATGTAGGGTTTTATTGCATTACAAATACGTCAAGATGAAGCGTCCAACTAGCACGGGAGGACTCAATCATAAAAGGTTGGATGATCCTGAAGTTCTGGAAACGAAATCGGACAAACTTGTCGAGCCTGCTGTGTTTCGAGTTATCGGCGAGCTTTATTTAAATGTTCCCAAAGATCATAAATACCGATTCTATATTCTGATGTTGGCTCTGTTTACTTGTACTGGGCGTCGATTCAGTGAAGTTTCATTGATGCCCAATCAACAACTGTCTTTTGATGATAAGGGTAATGCCTATATTGAATATTTTCCGAGAAAAGCCAGCCGAGGTGATACGTTCACGCCAAAGCGTAGGCTCTACTTGCCTACAGAAGTGATCTCGATCGTCGGTGACGTGCTTGTTGAGTTGGCAGACATCACTGAACAGGCGCGTTCAACAGCGAAAGAAATGTACGAGGTCGGTGGGCCAGACTTGAGGTTTTTGGCTACCATGCCTGAAGATAAAAGACTATATGCTGCTGATTTAACAGAAATGGGTATAAGTCATTCGGTGCTGGTTTCTACGGGTTGGCTCAGGAAGAAAAACCTTGCTTGGCTAGATCGTGGTGCCTTGACCAAGCAGGGGGGGAAGCCTGGCAACCCCATTTACTACACCGATAAAGCGGGTATGAAAAAATATTGTTTTCGTGATTTCTCCGACGCATTCCTATCAGTCTTGCACACTGATCAGTTTGGCAAAGAATACTATTTAAAAGATCTTTTATTCATCCGTACGCTCGGGCTTTCCAGTGGAACCTACGCCCACTGGCTGGCGACAAGCTGTAGTCAGTCAATGTTCACCACCTTCCTCCGCTATTTCCCTGCTCTTGCAGCGGAATACGCATCCAGCAGTATCGAGGTAGACTTCACCAGTCACCACTTCCGTCACACGCTCAATACCCTGCTTGACGAGGGCGGGTTAAGTGATCTGCTGCAAACTGAATGGTTTGGTCGAACAAACCCAAGAGACACCAAAGCATATCAGCATACATCCCGTGAAAAACGAACGCTGATGCTTCGTGAAGACATCAAAAAAGGCTTGGTTGGGGGCCAGTTAGCTGAGCAAATCAAAGTGGTTCCGGTGGAAGTCCAGGATGCCATTCTCAAAGCACGAATTCAGGCTGTGCATGATGTAGGTACGGGTATCTGCATTCACAATTTCTCTCAAACACCCTGCGAACGACATTTGCAGTGTTCGGCGGACTGCAAAGACTACGTGTGGGCAAAAGACGATAAAGGCCGACTGGACGAGCAGAAGCGCCAATATGCCCTTACCGCACTAGCACGAAAAAATGCTGAAAAGCAGCTGAGTAGCAATAAGCCGAAAAAGAGCGCTGACTGGCTGGTTCACAACGATAAAAAACTCAAAACGCTGGCTGCACAACTGGCTGATAACGGGGTGGAGCACTTCGACCCCGAGCAATATTTAAACGAGGTAGAGCATGGTTAAGCGCTTCAGACGTATGTCCGGCAGTGACATCAATATAATCGTTGCCGATCTAGATCGTTGGGCGTTGGGCGAGCTTGGCTCAAAACTCACGTGGGCTGTACTGGAAGAACGCTTTGGCTTTAGCCGTCAGTCGCTCCAGGCCAAATCTGAGATCAAAGCAGCTTATGACAACGCCAAACGAGCACTGTCGGGCGGTATGGTGAAAACCAAAGAGCAGGCAACTAAAGAAGCGGAA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59 | Staphylococcus_phage(10.0%) | protease,integrase,tRNA,transposase | attL 2066234:2066255|attR 2149624:2149645 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2985594 : 3060724
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP007230|2985594:3060724|DBSCAN-SWA 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75 | Enterobacterial_phage(12.77%) | terminase,capsid,portal,holin,protease,tRNA,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3195249 : 3240989
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP007230|3195249:3240989|DBSCAN-SWA ACTATTTGACCTGCGCACTCCTGAGATCTTCGCCCGCTTCCCAGATCCGGTATTTAACTTCCACCCCTTGCGGCACATAGACCACAATTGGCAGGCGGCTGTTATAACGCTGCATTGCCGCGTCGCCCAAATTAGCGGTGACAAATTTCACTTGCGGTTTACTGTCTTCAGGGCAAGCCATCATGGTTGAGGCGGGTTGTGAGATTTTATCCATCACCAGATAATCGAATCCCCAACCAGATAATGTTCTGGTTTCCAGATTGCCGCCGAGCATGTGGCGGTTACAGTCAACGTTGAGAGTTTTACCGATCAGCAACTCGACTTTAAAGCGGCTTTCATCTTTTTGCGGATCAAGAAAAATGACCTGTCGACTCATACCTTTATCGGCTTGTGGATAAGGTGCGATTTTTTCTAACGGTTGTTGCTGATTGAGAGGCGTAGGCGTTTCAGCAATGGCATTGATTGATGCCGCTAGTAACACACTGGCTAATATGATTGAACATTTTTTCATCTTTTTTCTCTCAGTTTTATCAACAAGGTATTTCTAAAGCTCGATTTCAATGTCGCCCACGGGCTGACAGCAGCAGGGCAGGATCTCCCCTGCTTGTATAAAAGCGAGTGGCTGCTGCAAATAACAGACTTCACCTTTCAGTAAACGCATGCGGCAAGAGCCGCAATAACCTGATCGGCACTGATATTCAACCGGTAACTGATGGTGTTCCAGCGTTTCTAGCAAATTGCGGCTACTGGCCGGAACACTAAGCTGAGCTCCGGTGGTATTCAAGGTTACAATCGTTTTCACGGATTACAGCTCGAAATCACTCAGATCGTCAGCACTGATTTCTGAATCAATCTGACCGACCAAATAGGAGCTGACTTCCACTTCTTGTGGTGCGACCTGGACGTTATCGGAAACTAACCAAGAATTGATCCATGGAATAGGGTTGGTGCGGGTGCTAAATGGCACGCCCAGACCGACTGCCTGCATACGGATGTTCGTAATATATTCTACGTATTGGCACAGGATCTCTTTGTTCAGTCCGATCATTGAGCCATCACGGAACAGGTATTCCGCCCACTCTTTCTCTTGCTGTGCCGCCAGTACAAATAGGTCGTAGCACTGTTGTTGGCACTCTTCGGCAATTTCTGCCATTTCCGGATCATCCTCACCCAAGCGCATCAGGTTGAGAATATGTTGTGTGCCAGTCAAATGCAGTGCTTCATCGCGGGCAATCATTTTGATAATTTTTGCGTTGCCTTCCATCAGTTCACGTTCGGCAAAAGCGAAAGAACAGGCAAAACTGACATAGAAACGAATAGCTTCTAAGGCATTAACGCTCATTAGGCACAGATAGAGCTGTTTTTTCAAATCACGCAATTTTACTACCACGGTCTTACCATTAACCTGGTGGGTGCCTTCCCCCAGCAGATGGTAATAGCTGGTCATCTCAATCAAATCATCGTAATAAGCTGAGATATCTTTTGCGCGTTTAAGGATCTCTTCGTTGGTCACGATATCATCAAAAACAACTGATGGGTCGTTAACGATATTGCGGATGATATGCGTGTAAGAGCGTGAGTGGATAGTCTCTGAGAACGACCAGGTTTCCACCCAGGTTTCCAGCTCAGGAATTGAGATCAACGGCAACAGCGCTACGTTAGGGCTACGGCCTTGAATGGAGTCCAGCAAGGTTTGGTACTTCAGATTGCTGATAAAAATGTGTTTTTCGTGATCAGGTAATGCGTTGTAATCGATACGATCGCGTGATACGTCGATCTCTTCAGGACGCCAGAAGAAAGAGAGCTGTTTTTCAATCAGTTTTTCGAAAATCGCGTGTTTTTGTTGGTCGAAACGTGCCACGTTGACGGATTGACCGAAGAACATGGGTTCGAGTAACTGATTATTTTTATTTTGTGAAAAAGTGGTATAGGCCATGGTTTCCTCAGGGGTCGTGCAAAGGACAAATAGCGTAATAGGCAAATAGCATCGCGTAACGGGCAAATCGGTCGCGTAACGGACAAATAAAAAAGGCCCTGTAACGGCGGTAGCGTCAGAGTGAGTTACCCCAGTTACCCGTGGCATAAACAACGCCATTATGGATAACCGGGGAGGGCCTGAACTAAAAACTAAATCTTACATGCGCCGCCTTCGCAGTCGTCATCACCCGGCAGACTCGATTGAATGTCTTCTTGCACATCATCAGCACCGTCACGGGTATTTTGATAGTAAAGCGTTTTCACACCAAATTTATAGGTGGTCAGTAAATCTTTCAGCAACTGCTTCATCGGTACTTTTCCTGATGGGAAGCGGGTTGGATCATAATTGGTGTTCGCCGATATCGCTTGATCGACAAATTTTTGCATCAAACCAACCAACTGCAGGTAGCCGTCATTATTAGGCATTTCCCACAGCAGCTCGTAAGCGCCTTTCAAGCGTTCATATTCAGGCACTACTTGACGCAGAATGCCATCTTTAGAGGCTTTGATGCTGACGTAACCCCGCGGTGGTTCAATACCGTTGGTCGCATTGGAGATTTGCGATGAGGTTTCAGATGGCATCAATGCCGATAACGTGGAGTTGCGCAGCCCGTGAGTCTGAATCTCTTTACGCAGTGCTTCCCAATCGTAATGTAGAGGCTCACTGCTGATGGCATCCAAATCTTTCTTATAGGTATCGATCGGCAAAATACCTTGTGAATACGTGGTTTCGTTAAACCACGGGCAAGCGCCTTGTTCACGGGCCAGTGCGTTAGATGCTTTCAGCAAATAGTACTGAATGGCTTCGAAAGTCCGGTGTGTCAGGTCATTGGCACTGCCGTCAGAATAACGCACGCCGTTCTTCGCCAGATAATACGCAAAGTTAATTACCCCAATCCCCAAGGTACGGCGGCCCATGGCACCACGCTGTGCTGCTGCAATCGGGTAGTCCTGATAATCCAGCAAGGCATCCAGTGCACGTACTGCCAGTATGGCCAGATCTTCTAAATCATCGAGGCTATCAATGGCACCGAGGTTGAACGCTGACAAAGTACAGAGCGCAATTTCACCATTCTCATCGTTGATGTCATTCAGCGGCTTGGTCGGTAATGCAATTTCCAGGCATAGGTTAGACTGGCGCACTGGGGCAATTTTAGGATCAAACGGGCTGTGCGTGTTGCAGTGGTCAACGTTTTGAATATAGATACGGCCAGTAGAAGCACGCTCTTGCATCATCAAAGAGAATAGCTCAACCGCTTTCACCCGTTGCTTACGAATACTGCTGTCTTGCTCATATTTGACATACAGGCGTTCAAATTCATCCTGATCGGCAAAGAACGCGTCATATAACCCCGGTACATCAGAAGGGCTAAACAAGGTGATATCTCCACCTTTCAACAGACGCTGATACATCAGTTTGTTGATTTGCACACCGTAATCCATATGACGGACACGGTTACCTTCAACACCACGGTTGTTTTTCAGTACCAGCAGGCTCTCGACTTCCAGATGCCACATTGGGTAGAACAACGTGGCCGCGCCGCCGCGAACACCACCCTGTGAGCAGGATTTAACCGCAGTCTGGAAGTGTTTATAGAATGGAATACAACCCGTATGAAATGCTTCACCGCCACGGATTGGACTACCCAACGCGCGGATACGGCCTGCATTGATACCGATACCGGCACGCTGTGATACGTATTTCACGATAGCGCTGGAGGTGGCATTAATAGAATCCAGGCTGTCACCACATTCAATCAGTACGCAAGAGCTGAACTGGCGGGTGGGGGTACGCACACCCGCCATGATAGGTGTTGGCAGTGAAATTTTAAACGTAGAGATAGCGTCGTAGAAACGCTTGATGTAATCCAGACGGGTTTCACGCGGGTAGCCGGAGAACAGGCAAGCTGAAACCAGAATGTACAGGAATTGGGCACTTTCATAGATCTCACCGCTCACGCGGTTCTGCACCAGATATTTACCTTCCAACTGCTTAACCGCAGCGTAGGAGAAATTCATATCGCGCCAATGGTCGATGAAAGTGTCCATCTGCTCAAATTCTTCTGCGGTGTAATCTTCCAGCAGATGTTTGTCATATTTACCCATTTCTACCATTTTCGACACATGAGCGAAAAGCGTAGGGGGTTCAAACTGCCCATAGGCTTTTTTACGCAGGTGGAAAATGGCTAAACGGGCGGCCAGATACTGATAATCCGGTGCATCACGGGAGATCAAATCTGCGGCGGCTTTGATGATTGTTTCATGAATATCAGAGGTTTTGATGCCATCATAAAACTGAATGTGTGAACGCAATTCTACTTGTGATACCGATACGTTATGTAAACCTTCGGCGGCCCAGTCGATGACCCTGTGGATTTTATCCAGATTGATGCGTTCTTTGCTGCCATCGCGTTTAGTAACAAGTAGGCTTTGGTTCATGTGCTCTTTTACCTTTAGTGTGTTTGTAGCGCGTGAGCTAAGGGATCAACAGGCCGTTTTTTCAAACTGCGAGTTGAATTTTCAAGCACTGACTTGTGCCATCGCTCAGTATACAAACACAATATATAGTGGGTGGGTGTTGGACAGATAACAAGATAGTGAGTATTGAGGCTTTTGGCAAGTGAACAAAACGGGATAATTGTGTGGATAACTTGGGGGTTAATTGTTACGAATGCCTTATAAGCTGCGCCATTACTGGGACTTACTACTTATCCCTCTGGGGGATAAGATTTTGCGGAAAATCTTAAAAATTTGATCGTTTGCCGTTTTATTAAACATTATAAAAGGACCCTGTAATTTATCGCTTTTGTTGCTGAAAAAAACGCTTTCTGCCTGATCTGGCGATTAACAGCATATAAACTGATAACAGAGCGTGTGAAAAACCAAGAAGAGCAGGTGTTTAGCCCTGCTCTCAGTGGGTTCTACGACTGATCTATTCGCTGTCCCGTTGAGTATGCACCATATAATTCACATCAACATTGCGGCCAAGCTTAAAATGGTCGGTGATCGGGTTGTAATGTAGC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39 | Pseudomonas_phage(25.0%) | protease,tail,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3453887 : 3512147
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP007230|3453887:3512147|DBSCAN-SWA 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77 | Burkholderia_phage(27.27%) | plate,integrase,terminase,protease,holin,head | attL 3467900:3467923|attR 3512366:3512389 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3761681 : 3808085
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP007230|3761681:3808085|DBSCAN-SWA 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60 | Shigella_phage(11.63%) | plate,integrase,capsid,terminase,transposase,holin,tail | attL 3759839:3759855|attR 3813021:3813037 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
4336916 : 4472846
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP007230|4336916:4472846|DBSCAN-SWA 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117 | Escherichia_phage(29.27%) | plate,coat,transposase,protease,tRNA,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4477114 : 4488363
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP007230|4477114:4488363|DBSCAN-SWA TCTATTCTCTTGTCCCCGTTAATTGCATCACTACGGGCTCATGCTGTACACAGAGATCCATTTCTAGTGCTACCCCTAATGCAGCCAAACACCCATCAATAAACCCTTCTGCTGTTTGTAAGCGTACTGAGACTTGATTGTGGGAAATTCCTAATTTCCCAGCCATCGCACGTAACGGCATGCACTTGATGTAATACAATTCAAGCAAAGTACAAAGGTAGGGATTTTTCTTTTTCAAAACATTCATCGCAGAACTGATGATCAATCCATCATCGTCACTACATGAAGCACGTGATTTACGTGTACAAGGCAATAACCCTTTAAATCCAGCGGCAATAGGCGAATAGTAAACACTCCCTCCTTTATTTGCAGCCCATGCCCCCCATAGTTCCAAAATATGCTGAATATCTCGCCCTGGTTTATTCTGCTTCTCCAGTAAGATCTTCTTCGCAGGCATTACAACTTCCCCTCCTTGCGCAAAATCTGCTGAGTACGCATCACTCCTTCTGCGTGGAACAAGCGAAGCTCATCACTGGAATATTCTGTTTTTACTCTGCCATCACAAGCATCGTGGCATGCACTACAGGACCATGCACCTTGGACATCGTCTGGTTTTATGGCGATCCCACAGGTTCCGGCCAAACGGTAATGAGCCAGCACCGTTGTCTCAGGGTTATGATTACAAACGCCAAAAATCCGTATTTGGTATTCTCTGCCTCTGGCCTCTTTACGGAGATTTACCTTCTTCATGCAAACTCCAACAACCGTAATGCCACGCCTTCCGCTTCCTGTTGAGCCCGAAAACTGCGATGGAGAATGGAGTTCCAAAGCACATTAAAAACGGCTTTATAAAGCGACTGGAAAGTATCTTCGTCCATGTTGGCAAAGCTAATGGACTTGGGAATACGTTGGTGTAACCCGTTGGGTAATATCACTTCATCGTAATATCCCGCTTCAACGATTGCCCAGCCTCGATATGGTTCGAATGACTTGAGTAAGGCAATGTCTTTTGTGCGGAGTTGGCCGACCTCAAACAGATATTCATCAGCAACAGCGGTAAGCGTTTCACTGTATTGTTGGCCGGATACTCTGATGAGGTAATTTACAAAACCATCAACAAGCTGGCGTTCTTGGGGGGTAAGCACACCACCGGCGGGTGTCCAGTAGTCAAAGCCAAACTGCAAGAGTTTGAAAAACCGTTTGTGGAATTGGTAATTGCGGACACGCCTGAATTCAGCCTGTATCCACTCACCGATTTTAATACGTTGCAGAAAATCGCTGTCCTCGACTGTCGCCGGGATCAAGATTGTTGGTGCGGATTTTTCTAACTTTAATAACTGCGCCATAACGTCTCCGATATAGCGCATCAATGTCAGTTACCCAGTTGTTCAGGCCGGGACAACGCTTATTTTAAAAAAATACCAATTCCTGTCAATCAAGCATTTCCTTAAGTAACTCTCTGAGAGTATCTGTAGAAACCACCCTGTCATTAAAAGACAATTTTCTAATTAATAAGCATTTCTTTTGAGCGGTGATTAAAACTCTCTCGTCATTATTGCAATCAAATCTACCAACAATATTACCGTCTTTGCAGCGAACTATGGCATAGCCAACCTTTGGCAGCTCTAATATATCCATTAACCATAACCTCACTGCTCATAAAACCATTTGTCCGCACTTTCCCACGTTTCTTGCAGGATGGTTACAATCCCCTCTCTTTCTGTATCCGTTACCCGAAGTATGGATGCCCCATCAGATGCCGCGCGGCGAACTGAAACAGAACATTCCGGAAACTGCACAGACAACCGCTTTATAAGTTCTGTTTGTAACGCTTGTTCTGCTCCCTTAGGCAGTTTTTTAGTGCGATCAATTGAGACTTCGATTTTCATCGCTTCACCTCACCCGACAATTAACTGTGTTTTTATACAGTATTGCAGTGAGATTTTTCAAGATCTTTTTTTCACTGTTAAAATGTAACCAACTATAAGCAATAGCTTTTATTACCGCTCACTGTTAAAGCAGGTCTCTAGAGTTTTACGCTGCTGTTCAAATAATTTTAGCCGTTCCTGACGCTTGGATTGCTCTCGCGCTAAACGTTTTTGGTGCTCTCGAATACGCTGCTCTCTCGACTGCTGTATATCAGCCAATAACGCCGAAACGTAGGAGTGCACCCTCGTCTGCCCATTTTTTGATGGTTGAACATTATTCACATTTGGAAAGGGCAGATATTTATTGGCTATCGGTGCTGGCAACAATCCGGCATTTTGAGCAGTGGTGATCGCTTGAACTCGTTTTTCCGTATCCCACCCCTGCGAAACTCGCCAACATGGTGATTTATTTTCTGCTTCAGCAACTGCGACCAATCGCTCGTAAGTCTGGATAAAGGCCATACGTGCCCCCACTTTGTCACCGGATTCAAGTACAGGCAAAGCAACGGCCCATGCTTGCGACATTTCATCAGTCCACACCACCGTGTTTGACTCATCCTGAGCAGGAAGTGACAGTGCCCATGCTTCGTTTGCAGCAGGCCTTGTATCCGGTTTCTGCATCCGGTCAATAATTGCCTTAAGTGTCAGCTTTCCCGCATGTTCTTTGCGAACACGAACCAATGCCTTACAAATCTCGTCGTAGGGATAATCACCGAGGTCATCGACCATCAGCATCACCAACGATGACTTGATTTCATGCCCAAGCGCTTCTGCTGTGACATGCAAACGGCTTGATAACTCTTCCTGTTCGAAATCACTCAGCATTCTGACCCCCATTGGCGGCGCGACGTGCCCGAAGCATTCGAATAGTCTCATCAGCCGCGTTCAGGTTAGTTTGGGTACTGTCGATTTGTTTCGCTCTGGCTGCCGTCATCGTTCTGCCAGTAGCCCATTGCGTGTGCAGTGATTCAGCATCGGCCAGCAAACATCCGACAGGGTGAAGCTTTTGAACGTAAAACGTGTTGTTCACCGAGAGGTAAAATTTAGCGACATGTGGCGCAGCCTCCATCCCGACTCGTTCCACGAATTGCTTGATCTGACTGCTCACTTTGGCATTTCGTACAGGGTCTACCCCATACCGCTCCCAATACCCGTTTTTGTAGGCCTCCCACGTTTTTCGACAGGCTTCCCTCAGCGGTGTTTCCTCCGGTTTTGATTTCGATGTTGTTTTTCGGGTAGCGGGCGGCTGAGTCGGCACGCAACAGATCTTATTCTCTGTAGTAATCTCTGTAGTATTCTTTGTAGTAATCTCTGTAAGATCGAATCGGGGATTTACCTCTCCGCGAACTGGGGTTTCCCTTGCTCGGGGAGAAGGGTTTTCGGACTTCGCGGGCAAGGGTTTCACCGTTTCCCGAATCAGGGAAACCCCGTTTCGGGAATCTGATAACTTGTTATCAATGATCTCATTCAACCGATCACAATCAACTCGGTAGTACATTTTGTGCTCAAGTCGTTTGTTTGTTTCGATTAAGATACCTCTTGATACAAGCTGCTTACGCGCTGTTTTTTGCTGTTCAACAGTTAGCCCTGTTTCCTCTTGAATCTCTTCCTGGGTTTTCTGAACACCTAATTCAGAATGAGCTTTATCCTGCCAATAGAAAATTTGGCCGAAGAAAATAACGGCATGAGGACTCCCCATGTATTTAACAAGACCGGGGTAGTAAGCTACTGGTCGTCCAAAATCCAGTAATAAATCAGACGGACGCATTTCCCCTCCCCATCAAAGTTTGTTTATTCGTCGGTAAGCCATCTGTTGGGTTAGGATAAATATCACCACGAACCTCATGAGGGGTAATTTCCCAATCAAGAACTTCACACAATGAAATAACTCTGTTGGCAGGTACTTGGCTGTTAAACCAGAAGCTAACAGCTTGGGGTTTAGTCCCTAGCTCCTTCGCGATTTCGGTTTGGCTTTTTAACCCGCAGATGCGTCGTTTAAGTTGTTTATTCATAGTATCTCCTTTACTTAAAGAGAAAATATACAAGCAAATGTGGCGAATTTCTAGATTATCTTGTTAAAGACTTGAAGTGATACCTACAAGGAGAGCTTGTATAATGTTCATCATGAAAGAAGAAAATAAAAATTTCGCTTATCGGATCCAGTCTGTTTTACAAGAAACAGGGTGGAATCTCTCCGAATTGGCCAGAAGAGTAATGGTAAGCCCTCAAGCCACACAGCAGTGGTCGAAGGGAGAAACAACTGCGCGCGGAGAACGTCTAAAAAGACTTTCAGCCCTCACAGGAAAACCATCACACTGGTTCTTCATGCCTCCTGGGGAGGAGTTGACTGATAACGAAATGCAAACCTTGATGACCAACTCCGCACTAGACGACAAAGAGCAAGCGCTTTTGGCCCTCTTTAATCAAATGCCAGAAGCTGAAAAAAATCGACTTATAGTTCACGCCAAATCCGTTTTGCATGAGTTAGACCTACTCAAAGGTGATGTGGCTAATATAATCAAGGACATATCCAAGTAATAAAAAGTGCCAGCGTCAAAAGCTGGCTTTTTCTTGTTTTTGATTTAAAGTTTTACTAGAAACACACTTTACAAAAACCAGTTTTTCTTGTAATTTATTCCACATACAGAAATCGCATCATTGTCAGATTCAAGTTCCGCAGCCCAGCGTTAAGGGCAACAGCAAACAGGCAGGACGCCCACGAAGTAGCCGCCAGCGGCGTATGAAGAGCTGGATGATTTGCTGGTAATGAATGAGGTTACAAGCTAATGAGCAAGCAACAACAAATCAAATATCTCATCGAGTGCTACACGATTCCCTTTGAGACAGCTTATGAAAAATTATCCGTTAAAGTCTGGAACATGATGATGGAAGCCGAAGAGATTAGAGATTAATTGCCATAATATTCCTCACCGCCCAGCTAGCGGTGGCGGTAATAACACTAGCAGTATGTGATTGGGTTTTTATATGCGTTACTTATTTTACTAATGCACATACAGACAGCTCGGAAAGACGAGCACTCAAAAAGAAAGGTTCAGGCTTCCATCAATTAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP007230|4477114:4488363|4487109_4488363_-|WP_025384177.1|DBSCAN-SWA MESKVVVPAEGKKITVDAQGKLVVPHNPIIPFIEGDGIGVDVTPAMINVVDAAVKKAYNGERKISWMEIYTGEKSTHVYGKDVWLPEETLDLIRDYRVAIKGPLTTPVGGGIRSLNVALRQQLDLYVCLRPVRYYEGTPSPVKHPELTNMVIFRENAEDIYAGIEWKAGSPEAEKVIKFLREEMGVKKIRFPEQCGIGVKPCSEEGTKRLVRAAIEYAITNDRESVTLVHKGNIMKFTEGAFKDWGYQLAREEFGGELIDGGPWVKIKNPNNGKEIIVKDVIADAFLQQILLRPAEYDVIACMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANIGDDCALFEATHGTAPKYAGQDKVNPGSIILSAEMMLRHMGWFEAADLIVKGVEGAIQAKTVTYDFERLMKGAKLLKCSEFGDAIIEHM >NZ_CP007230|4477114:4488363|4477569_4477863_-|WP_025384164.1|DBSCAN-SWA MKKVNLRKEARGREYQIRIFGVCNHNPETTVLAHYRLAGTCGIAIKPDDVQGAWSCSACHDACDGRVKTEYSSDELRLFHAEGVMRTQQILRKEGKL >NZ_CP007230|4477114:4488363|4484114_4484285_+|WP_167330755.1|DBSCAN-SWA MSLGKTEKESIGNRKEHILDALYYRRKGLRKAKQSCLNLAKLERLNQRYFLGEQPF >NZ_CP007230|4477114:4488363|4484295_4484919_+|WP_025384173.1|DBSCAN-SWA MQTKAVYKAIAAVAKDLSEIGIAKNSRNAQQGFQFRGIDAVYNALSPALVRNGLVILPRIVERTVSERTTLKGASLFYVVVKAEFDFVATEDGSTHTVTTFGEAMDTGDKATNKAMSIAYKYAAFQAFCIPTEETAADPDAETHHPAPRNCDEILADFTAQATDCQNVDELQSIYKAAWNAMASSAEHQQKCIEVYKLRASELKRMA >NZ_CP007230|4477114:4488363|4483941_4484118_+|WP_156170211.1|DBSCAN-SWA MIISIRGGTSMGAASKNGILYIQHHPSNRLSSASFEPPRSKKSLWQQFIELINLRLEP >NZ_CP007230|4477114:4488363|4480795_4481053_-|WP_025384169.1|DBSCAN-SWA MNKQLKRRICGLKSQTEIAKELGTKPQAVSFWFNSQVPANRVISLCEVLDWEITPHEVRGDIYPNPTDGLPTNKQTLMGRGNASV >NZ_CP007230|4477114:4488363|4477114_4477570_-|WP_025384163.1|DBSCAN-SWA MPAKKILLEKQNKPGRDIQHILELWGAWAANKGGSVYYSPIAAGFKGLLPCTRKSRASCSDDDGLIISSAMNVLKKKNPYLCTLLELYYIKCMPLRAMAGKLGISHNQVSVRLQTAEGFIDGCLAALGVALEMDLCVQHEPVVMQLTGTRE >NZ_CP007230|4477114:4488363|4485860_4486991_+|WP_025384176.1|integrase|DBSCAN-SWA MMARPRKYNIDIPGLSCYTDARTQKVYWRYKHPITGTSHGLGTNAEEAKTIATEANKRLAEQQLRNTLAIKDKVIRTLGGSICVSTWLDQYLKIQDERLEAKEITENTVKQKISPIKAMREKLGMKSIHDVDTRDIANILDEYKKRGHSRMAQVVRTTLIDVFREAQHAGEVPPGYNPALATKNPYNRISRERLSLDEFNSILSVINPPFGYMKNAMLLALITGQRESDICNMKFSDIWDDFLHVEQKKTGAKVAFPLSLRCNAINMTLEEVIGMCRDNVVSPFLIHYTHNSSHSRRGAQVKPNTMSYNFKKMRDLSGLKWDKGTPPSFHEIRSLAARLYKAQNMNAKEILGHKSQNQTDRYIDTRGKEWTIVTAL >NZ_CP007230|4477114:4488363|4482806_4483064_-|WP_025384171.1|DBSCAN-SWA MRTTQQFSITLPNEMAEMVRSRVASGDYASESEVIREGLRALHERDKAVEAWLSNTAAPALDAIRKNPTEGRSLEQVRAAIRNGK >NZ_CP007230|4477114:4488363|4477859_4478459_-|WP_025384165.1|DBSCAN-SWA MAQLLKLEKSAPTILIPATVEDSDFLQRIKIGEWIQAEFRRVRNYQFHKRFFKLLQFGFDYWTPAGGVLTPQERQLVDGFVNYLIRVSGQQYSETLTAVADEYLFEVGQLRTKDIALLKSFEPYRGWAIVEAGYYDEVILPNGLHQRIPKSISFANMDEDTFQSLYKAVFNVLWNSILHRSFRAQQEAEGVALRLLEFA >NZ_CP007230|4477114:4488363|4485634_4485886_+|WP_025384175.1|DBSCAN-SWA MARTQLLRDWAIEEFGEKECPSYITLLSYAKNKMIYPPPKKAGRYWRVDKGARFVGVIAQPVITPKDDPRLLRILSDGSPTKI >NZ_CP007230|4477114:4488363|4478762_4479002_-|WP_025384167.1|DBSCAN-SWA MKIEVSIDRTKKLPKGAEQALQTELIKRLSVQFPECSVSVRRAASDGASILRVTDTEREGIVTILQETWESADKWFYEQ >NZ_CP007230|4477114:4488363|4478544_4478751_-|WP_025384166.1|DBSCAN-SWA MDILELPKVGYAIVRCKDGNIVGRFDCNNDERVLITAQKKCLLIRKLSFNDRVVSTDTLRELLKEMLD >NZ_CP007230|4477114:4488363|4479113_4479866_-|WP_025384168.1|DBSCAN-SWA MLSDFEQEELSSRLHVTAEALGHEIKSSLVMLMVDDLGDYPYDEICKALVRVRKEHAGKLTLKAIIDRMQKPDTRPAANEAWALSLPAQDESNTVVWTDEMSQAWAVALPVLESGDKVGARMAFIQTYERLVAVAEAENKSPCWRVSQGWDTEKRVQAITTAQNAGLLPAPIANKYLPFPNVNNVQPSKNGQTRVHSYVSALLADIQQSREQRIREHQKRLAREQSKRQERLKLFEQQRKTLETCFNSER >NZ_CP007230|4477114:4488363|4484942_4485245_+|WP_144236101.1|DBSCAN-SWA MTEKERILKEIALDALKAFDCAQKGQSHPRIYKHGYVYAGMLRRINTIASMNPPLPKWMSQEKESSRRKALSAYFASLPESNRQSYIRTSNTSGRGGFGD >NZ_CP007230|4477114:4488363|4483397_4483919_+|WP_025384172.1|DBSCAN-SWA MTNQLIPVFNGTISNETTLLCDARDLHAFLGIGKVFAAWITSRIAEYGFTENQDYILLSQIGKQTPGRGGHNRKDYHLTLDTAKELAMVERNEKGHQIRRYFIECEKKLRQLATSPEQSKHSKVLLRFYGEKLISSQHLPDNYFIGPMETFIEVLQRKGLLIINPDDLKKIAY >NZ_CP007230|4477114:4488363|4481156_4481579_+|WP_025384170.1|DBSCAN-SWA MFIMKEENKNFAYRIQSVLQETGWNLSELARRVMVSPQATQQWSKGETTARGERLKRLSALTGKPSHWFFMPPGEELTDNEMQTLMTNSALDDKEQALLALFNQMPEAEKNRLIVHAKSVLHELDLLKGDVANIIKDISK |
17 | Escherichia_phage(16.67%) | integrase | attL 4479435:4479449|attR 4487907:4487921 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
4791906 : 4799285
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP007230|4791906:4799285|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP007230|4791906:4799285|4791906_4794330_+|WP_025384405.1|DBSCAN-SWA MNNNKTPLTGSMSRREFIQTSAVVTGAAAIASSITLPFSVHATSEQAPAAAEESIKYSACLVNCGSRCPLKVHVKNGEIIKIANEAIYDDSTFGLHQIRPCLRGRSVRWKTYNPDRVKYPMLRVGKRGEGKFKRISWDEATTIVADNLKKTIVQYGNEAIYYQYGSGSTGANLQGRNACKRMLSLIGGYLDQHGTYSTAQINTVMPYVYGNLDETLLDEIKNSDLVVMFGHNLAETRMSGGGQYIETVQALGQSRAKVIIIDPRMTDSVTTLNAEWIPIFPGTDAALVAALGHVLIKENLTDESFLQQYCVGWDANTLPASAPANGSYKDYILGLGADGTEKTPEWASEITGISPTRIIQLARELGNARAAWISQGWGIQRTANGEQASRSIMMLPLMTGNIGRAGTNTGAWGGNVKYPVPGFSIPNPVKTAIPCFMWTDAIFRGTEMTAKNAHVKNKEKLDTNIKFLWNYASNVIANQHSDLNKTNTILQDESLCEFILVWENHMTNSAKYADLLLPDVTSVESNDLIDNSYASGAYHYVTRMQNTIEPLWECRPSYDVLAEIATKLGVGDAFTEGHTQQEWIEISYNKMRDKNPALPPFSDTNNKGIIDRVFADSSQYIALKDFRDDPLNNPLKTPSGKIEIYSEALATLAHEWQLAPGDRITAVAEYCPTPEGVSDQETLKTYPLQMTGFHVKGHTHSTYYNVAMLREAVPHQFWMNPIDAQARGIQQGEQVEIFNSRGRIHIAVKITERVLPGVIAVPQGAWRNLNKDGIDVGGCINTLTTLRPSPLAKGNPQHTNLVEVKRA >NZ_CP007230|4791906:4799285|4794960_4795737_+|WP_025384407.1|DBSCAN-SWA MHELPLVFFTVLGQTAVGLFTLVWLSNKLGMTTPQQLKQANIVGLILVMAGLLIGTLHVGQPLRAINMLLGVGRSPMSNEILLSGLFVAMACGTVFFSTLVKNSLLATLCNFATVLVGLAFAWSMTQVYQLTTVPNWDTSYTSLQLWMTVLVGGGAFAMLTGARQLGAIALLAGAIVTLVNKPGYLTFLGQGSAELSSQQTLFWGIQILLLVLGVFVAAAALLKDKIPRVTLVVCASALIIGELAGRIAFYNLWQVPM >NZ_CP007230|4791906:4799285|4794341_4794959_+|WP_025384406.1|DBSCAN-SWA MKQYGFFVDSTKCTGCKTCQVSCKDEKNLDLGPKLRRVYEYGGGSWTQQDNIWVQNVFSYYLSIACNHCSSPTCVTGCPTGAMHKREEDGLVVVNQDLCVGCRYCEMRCPYGAPQFDAKKQLMTKCDGCYERVAQGDKPVCVDSCPQRALDFDEISVLRDKYGDENAIAPLPHAHLTQPNLVIRGHRDAKPSGDTSGRIQNPKEV >NZ_CP007230|4791906:4799285|4796096_4796693_+|WP_025384408.1|DBSCAN-SWA MLLNTTLPRILGACFYYPPQSDTVQRLFPLLPQIAELFPWPDHVSMVQYCQQMPDISPTLLEYDFSILFEGQGEMPAPPWGSVYLDKENILMGASTLQYREFLAEQGWVSQSPLREPEDQFGLMLLSWVNLVEQHNKNAASVLLTAHLLPWAYRYLEQVSAAQVEYPVYPLLAKIATCYLKTLQTELGLSPLPRELYR >NZ_CP007230|4791906:4799285|4798577_4798652_+|WP_144236130.1|DBSCAN-SWA MKYFFMGISIMLVIWVGTFMLMVE >NZ_CP007230|4791906:4799285|4798760_4799285_-|WP_025384410.1|DBSCAN-SWA MKNRYSLPQIVLHWLTLLMIILTYSAMLLSDTVPDEDRTFVRNLHFNFGISVWLLMLVRLWLRQRNLTPAISPPLPNWQLLGVHLSHWGLYLMFLSLPILGVLTQAYGGRTWLLLGWQVPQWLTPNTDVRDYLKQTHVFIANLGYFVIGIHGIAALYHHYIRRDDTLRRMMPGK >NZ_CP007230|4791906:4799285|4796689_4797259_+|WP_038402310.1|DBSCAN-SWA MIKNKPVARDERYYKAYMESRTISRRGLFRGLLKGVQPSTPTAPSDIAAPPPLRPPYAIGEPLFQQSCTGCGICMTACEENLIVMVNQRPELNFSTQYLSTPYCSRCQACSTACQTGALSSAEFQIAARPSVKNTCQNTYIYCDSCADYCEKQALTWQANQPPTLVPELCDGCGECVFRCPAMVLEMQI >NZ_CP007230|4791906:4799285|4797856_4798288_+|WP_025384409.1|DBSCAN-SWA MFSYPASYTVDEASGEYHIHYRDFPELSSVTYSLEDVELEAQEGIKNGIAAEMEERRRIPAPSALQPGDIAVHVPILVRLKAELHNAMLASDTRKADMARKLSLNAAQMDRLLDVYYASKVEALEQALYLLGFEVDVTVRKIV |
8 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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