Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_HG969193 | Bartonella tribocorum strain BM1374166 plasmid BM1374166, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_HG969192 | Bartonella tribocorum strain BM1374166 | 3 crisprs | cas3 | 0 | 1 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_HG969192_1 | 1165483-1165620 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_HG969192_1
|
1 spacers
spacers of NZ_HG969192_1
>1.1|1165534|36|NZ_HG969192|CRISPRCasFinder CGTAGCCGATTATCCTCTTAATCCCAGCAATTCAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG969192_1
The CRISPR arrays of NZ_HG969192_1 >merge|NZ_HG969192|1|1165483-1165620|CRISPRCasFinder TAAACGTTATCGACCAGGAGATCGAATTCTTGAACTTGGTGATGATGTTTACGTAGCCGATTATCCTCTTAATCCCAGCAATTCAGGTAAACGTTATCGACCAGGAGATCGAGTTCTTGAACTTGGTGATGATGTTTA >NZ_HG969192|1|1|1165483-1165620|CRISPRCasFinder TAAACGTTATCGACCAGGAGATCGAATTCTTGAACTTGGTGATGATGTTTA CGTAGCCGATTATCCTCTTAATCCCAGCAATTCAGG TAAACGTTATCGACCAGGAGATCGAGTTCTTGAACTTGGTGATGATGTTTA
>NZ_HG969192.1|WP_012231680.1|1164038_1165475_+|hypothetical-protein MAFPLLFPLAGAAFMAARAAPHIFRYIAPKAVTGANRLGQLITKSPVGKFVTKNPKSSAFTVGGAAIESMMTPEKAHAPNNPYLQSMQNPYGPFMPYTVPGVEMPLGVDQQPPMPNALEEAPEDLKTHVNEQMQSLAPASQTPPREPTDAEKFLQSNTYKFFQSDAYQKLKDLFAGMAESSSDGSGWDALASGVKRLNEGDKQRGQVNQTVEYLKSKGYSEEEAAIMARNPQMLSALLTGGKSPEGFQSYTNPETGELEYRPVKGSMQELEYNQKLQAQKEWEGRRIKNMFTTKQQLRAGLNDLKAAFKLIQKGKATGFKGWFSKKAGGSDGYKLDKLLEGIRGGVLRTVFENLKSMSSSGTVGTGPISNFESQALSSMFGSLDVGRDKEGLERTLKVIKTAFDFFNRHNDLQLYNALTGQPIDTPQEISEKYFVDSPVSQGGSASLPIISSREELDRYPLGTIVNYNGHPVYKGAKR >NZ_HG969192.1|WP_012231679.1|1163075_1163999_+|hypothetical-protein MGSETPSTTQQKQVQTSAPPAWMQNVFKRGGADAYNLYDTGMGGNVYGGPRVAPLSDQTLYGIGGLGSIPNHYQNRSLMNTIYNPTSSMMNLRHVASGGMMGENSYFKQALQEALDDSDTQINRYFSGIGRYATPDHREEVRKGRDSIYARAMLEQYNRDADRMMQANAMIDQANQNQLGASNNFLQGYGNAYSNAIQGGGVLDTHNQRVVDANRERWLEQDNSGWNRLNMLMNAGHGFARNYGTTTNNSTSSKMEGNSPWKNAGVIGSLALQAAPMAFGYMAGGPMGAALAAGAPYAFLDYMNKKQ >NZ_HG969192.1|WP_012231678.1|1162648_1163074_+|hypothetical-protein MAKVYLTTSWDMERIAPYLEDIIASFRAYVERFKHEITLQDLIEAICSGKKQLWLVLDDDARFLAAVTTQIQQTVLGKKRALICECSGKGVLDQVDNLQIAEDWARENGAFEIEILGRLGWKRALTKQGYGITMLYYRKEL >NZ_HG969192.1|WP_012231677.1|1161191_1162649_+|hypothetical-protein MVYFPIADYRPDVAVVNGSFTDTLVNVLPADGGYIPMPSAMVVSHPLEEKPLGCIAFRSGDGVKIIVGGKQKLYSYDSQTKGWKDISQSGVMYQANEDNQWSFALFGESIIAVNKNDKPQIFKVRSSERFEELGGNPPKAGLVKVWGDFVCLMQLTDHPNRIHWSGLNDATHWTVGDKDCYYHNFNDGEYVQGATESSNPLVFLRSAIYAGCFTLGSKVPFIFQKLQDKRGARSAASIACRGSDAFFAGDGGFYQMSADGQFLPIGFEKVDRTVFKSFDKFALDEMQGVIDPIDNRIYWSLKRGNNEQTTFVYDWGLQKWSTIQGKPFTLFPVFTTGYTLEQLDEISINLESLPASLDSPRWQSGAPMLGAFDENNCLVMFTGAPMEATVVSQEMGAPDGSFNFITKMFAEVDTTQGLLSIGERRLRNHQTPITWHKERECSYATGAYHGRSRNRYHRFKLRIPKNEPWTAITGFDVDLRPLGRG >NZ_HG969192.1|WP_012232363.1|1160482_1161190_+|hypothetical-protein MTRHYIRVRTGGPIPASQNVYHHRKTLSHMVSVIQDEIDDITDEYVAQIQESIFAAIRFCERETFYFNESRDVVFETRAGQGAYDATDTRHIETAVKIRSVYLCSDPHHKIELEHRSPFSLESSLSSEQRGTPVCYSYFDRKLHLYPTPDRAYQIQLILSPQRLSEIERVDEEHLWFVHAFDLIKARAKYELYKNILKEPDCATAAYNDFTEQLHELRAETSKRHNVTRIIPTDF >NZ_HG969192.1|WP_012232364.1|1160108_1160417_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MIFIHKTIEFDNWLKKLKDKKAKAIILQRVVRLKQGLLGDVKFFNSIGEVRIHYGAGYRIYFTQKGSDFILLLCGGDKSTQQRDIEQALKLKEEYSDENNPI >NZ_HG969192.1|WP_012232365.1|1159843_1160128_-|putative-addiction-module-antidote-protein MKTTPFKPEEYLEDIEVQQAFLNEAFKTGDAAHIADAIGIVARSQNMRALAKETNRERSGLYRSLSKTGDPKLSTLVAVLSALNLQLFVQSSTS >NZ_HG969192.1|WP_012232366.1|1159427_1159808_+|hypothetical-protein MADYLPEPLQGRNLHTQQVSFLRLNFSYENKENVMKIGTLPRGALIISIKAFIKTAFSDTKVKIGSTAGGTEFGELEIKQAGIKAATISNQKEFVPSDKEVTLYAKADKTVQAGQASIVVEFVTNH >NZ_HG969192.1|WP_012232367.1|1159036_1159417_+|hypothetical-protein MADQLPPPLQGRNLHTQQVSFLRLNISHKEKNLTEKIGILPRGALITSIKTFVKTAFSEAKLKIGSSYGGNEFGEKDIKAQTTQDFTPTDQKVFAPEDKEMTLYATRDKTTDAGECVVVVQFVANH >NZ_HG969192.1|WP_012231670.1|1157394_1158561_-|site-specific-integrase MALMNRLNARAVATLGAGKYNDGAGLLLHKRKDGGAQWIYRYTIHGRRREMGLGALRDVSLKQARELATGWRSVLREGRDPIKERNKQKREAISNLHYLKDIALDTFESRKAELKNDGKDGRWFAPLQLHILPKLGCFPVSEITQTEIRNTLAPIWHTKADTARTALIRLKLCLKHAAALGLDVDLQATEKARALLGKQRHKTQNFPAMDWKDIPAFYKTLCEASTLTQLALRLLILTGVRTNSLRHIREDQIEDDIWTIPAENMKGKRDTTKEFRVPLSSEALDILKQARLLSRNDFFFSATGRGPLAANCMAQYMQQTGLNACPHGFRSSLRDWLAETTDAPYEVAETILSHTVGGKVERAYRRTDYLEQRRVYMDKWAAYVTGQS >NZ_HG969192.1|WP_012231682.1|1167714_1168395_+|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein MPRYNPSVDQAIRQAAARYGLPESYLYRVAQVESGGNPNARNPRSSAGGLYQFIDSTAKQYGLQDRFDPMQAADAMGRLTLDNRNHLSRVLGRAPTDAELYLAHQQGAGGAARLLQNPHANAAQLVGSNAVGLNAGNNAMRASDFVNRVLQMYGGQPYRASPIVQGGFGNRDNMLEVLRALLASQEESSEEEESDEDDNPLMTPFMRAFYGPFYPKLGFILYRKIQ >NZ_HG969192.1|WP_038473551.1|1170047_1170827_-|hypothetical-protein MCKKYELTSEIKKIKHALTRNITSLYRIRALRDFDDIKAGALGGFIEKEVNLAHDGNCWVYDDACVYGHARVYDDAKIRHYSQVCGLVYGNAEVYSKAFISQYAKIYDQACVYGSAHVYGNVYGNAHVSGAARVLADAHIYDHAHISYDATVFSYARVYGHARVCGSACIYSHAKIYNYAVINGRAKIYGKVYGNARVGGSCEVYGSVYGNAKILHCATIWGRAYGNATINTKSKAKLVPKNCEVYQSDNVVKIIDKTE >NZ_HG969192.1|WP_012231684.1|1170931_1171510_-|hypothetical-protein MQKKFALTNETRVFGNHTLYRIQALKDFADVKAGALGGFIEKEDNLSHDGNCWVYDDALVFKNGHVYENARVFGKAVACGHIYGHARVYDNAIAAGYIYDNAHVYGNAVVSDNSRVYGNAHVYGKAIIYDNAYVYDNARVYENARIANDVHIYENAHIHGIAVIRENVGGSTKIKTYTERLSPYGELEIVWV >NZ_HG969192.1|WP_012231685.1|1171591_1172365_-|hypothetical-protein MSTITASKKYELTNENHTFEGITVHRIRALRDFDDVKAGALGGFIENESNLSHDGNCWVYDNATVFCNAVVSDNAKIRNDAIIARGSKVYGNAVVCDKAWVFGHDASIYDNAKISNNARICGLVYGNAMVCDNANVSPNAHIYDNARVYENAHVSGFVYGNSHVYGKSRIYGGACIYGNAHVFCNAWIKSFASIFDDAKVSGSARVGSFARIYENAKVYGKSNIDHDVQIYGNAVVNSREKITNDICDDNQSIKDAA >NZ_HG969192.1|WP_012231686.1|1172447_1173218_-|hypothetical-protein MTNILKNTPLLSNISNEIASVNQKEPAKKYEFIDDCEYIDGHFLTRIRALRDFDDVKKGDLGGYIESEDNLSHEGNCWVYNKARVFQNARVFGNAKVKSFFVDVYGNAQIYGNAIFEGRTLKDNAKLSGNAHASNAVVIEGNAQLYDNAYVTDYAHISDNAVICDNAHVGGNAKISGSAYICDDARVFDDAMVCDALISGNSYIHSNASLTANEDVCDDAYPEFGSEDDYYRHEYYADCEGYYDDDNDSEYESDAA >NZ_HG969192.1|WP_012231687.1|1174600_1179562_-|DEAD/DEAH-box-helicase MLQSLKSDHEHVTLRSLLEYYRQQAKSLRELGTLFENLVIAYLTKDPLHYGRYEKVETYYEWAKEREGWNKNDIGIDLVAKLRNQEGYVAIQCKFYQADHQISKKDIDSFIAASGKDIFKYRLLVDSTEVELSDNVNAMIKGQAIPVYRIDLRHMENSRIDWQIYATKKEVLLKSTKKPRPHQEEAIKKVCEGLKEADRGKLIMACGTGKTFTSLKIAETLAGKGKRVLFLVPSLALVSQTIREWTTDAQVPLRSFAVCSDTKVGKRRKNQEDIVGMETSDLVLPATTDAQALAKEACENLEDAMTVVFSTYHSIQVISDAQKEHGLPEFDLIICDEAHRTTGASLGSEDNESEFIKVHDNSIIRGKKRLYMTATPRIFSDTAKRRADEINAVLASMDDETLFGKQLHHYTFAEAVDNELLTPYKIVVLGINETYITPAIQEIIANENREIDLDDAAKIIGCYRALTKIDKQAAIDDDDTEPMQCALAFCKDINTSQYITKLFNKIIKSHIDDFLQTVPFLNCEVRHIDGTQSVKKRNEELDWLKEDTGQNVCRILSNVRCLSEGIDVPALDAIMFLHPRNSQVDVIQAVGRVMRRAPNKKTGYIILPIIIPSHLEAKKALKNNKRYRVIWQVLDALHSHDERLARTINQMSLGQDSSHTIEIIEIKRANELQELTTTVDEISIPSKTESSGHTIGTAESKTQSVSGGQGDLFPRSEFFDFVKAIFLDSFKITDYWGIWANNVAEIAQNHINHLKDMISDEKSEAFHAFDAFHKELKNNVNSEIKKEEAIEMLAQHLVTRPVFEALFDGNEFVQNNAISQAMDKILTELDKTNIEEKTKDLDKFYKSVTFCTAGITETHAKQNLIIKLYESFFAKAFKKTTDKLGIVYTPVKVVDFIIHSVDDVLRNEFGKSLGSRGVSILDPFTGTGTFITRLLQSNLIKPEDMEYKFRHDIHANEIVLLAYYIAAINIETTYHSLMKGEYIPFKHIGLTDTFRMLEEKNLLQELFKENSEYLEYQKKLDIKVIFGNPPYSVGQKNENDNAKNTPYPILDNRIRETYAAQSKVTNIRALYDSYIRAIRWASDRIDNAGVIGFVSGSGYIDKPTMDSLRKSLAKEFTSIYVLNLRGDIRKNMMNKNNAQEGENVFGNGSMTGIAVTLFIKNPNVSGDCKIYYHDIGDNLTTKEKLTALEYFGSIGGVMRESGWQLIKPDEHGDWIKQRDDSFATFLTLGDKKGNNNKKLFETFSRGIITTRDIWAYNASHQALANNMSNMIAFYNSEVERFNDAYTDTDRKKRAKAVNDFVNTDERKISWSRALKQDLVKGKIFEFEETYLTQSLYRPFTRQWLYYSRTFNEMVYQIPRIFPMEKVVENMVIQVASVGTMSGFSVLMSKDLPNLHAIDTGQCFPRYIYEDTTVSESKNERQSHLFTEANTTAGLQRRDAITDEGLAHFKAAYPNEKITKDDLFYYVYGLLHSEDYRARYADNLCKELPRIPCVKNADDFWKFVTAGRELGHLHVNYEDVEPYPVTFKKGNPKLTDISNPEKFYYVTEMKFAGNSKEKDKSTVIYNSNITITDIPLEAYEYIVNGKPALEWVMGRQCVKTDKKSGIVNDANRYAVETIGNPAYPLELFQRVITVSLETMKIVKNLPKLEIRETE >NZ_HG969192.1|WP_038474548.1|1180948_1181260_-|hypothetical-protein MVSSLETALIEIGVVKDHIKLVSNPEKYDAINRGHSLSKHRKGGLPYDEARKAMASHYTRLGNLDKARLTSIEKSIIDVRRENIKAMQKLYEKMQAKAIGIDF >NZ_HG969192.1|WP_012231625.1|1181465_1181771_-|hypothetical-protein MQKKLPKSYMTDAEREELRAGGLPQNSIYMVEAEAASKANDSKTTWEWLAMAEYPAHALLHLRHQRGAQFIRDMGFSTKNADEEYGPDWLDKGVVIGGHHF >NZ_HG969192.1|WP_158305290.1|1182233_1182383_-|hypothetical-protein MMCSFKNARGITHALRGGWHGRYGLAHCPAHDDRLLSLNKLAYLINYAH >NZ_HG969192.1|WP_007347430.1|1182480_1182681_-|DNA-binding-protein MTENDILLTDRESAKLLHMSVSTFRRHVTNGSLPKPLKFGFLSRWLQSDLLNVIEQAKQQRYNDVA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_HG969192_2 | 1341870-1341995 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_HG969192_2
|
1 spacers
spacers of NZ_HG969192_2
>2.1|1341918|30|NZ_HG969192|CRISPRCasFinder AAGCCTTCTTTTGGCAAAGGGACAACTTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG969192_2
The CRISPR arrays of NZ_HG969192_2 >merge|NZ_HG969192|2|1341870-1341995|CRISPRCasFinder CCCTTTGCCACTTTGTCTCCTTCACATCCAGTTTCATGATGCTCTGAAAAGCCTTCTTTTGGCAAAGGGACAACTTGTCCCTTTGCCACTTTGTCTCCTTCACACCCAGTTTCATGATGCTCTGAA >NZ_HG969192|2|2|1341870-1341995|CRISPRCasFinder CCCTTTGCCACTTTGTCTCCTTCACATCCAGTTTCATGATGCTCTGAA AAGCCTTCTTTTGGCAAAGGGACAACTTGT CCCTTTGCCACTTTGTCTCCTTCACACCCAGTTTCATGATGCTCTGAA
>NZ_HG969192.1|WP_012231828.1|1340978_1341437_-|hypothetical-protein MKTRGSHQLDFFQRPVFPCREPVAQIDLERFRSRIKRAMARALRECRYERSEVAERMAHYLGIGCLSKASLDAYVAESKQVDISLPRFKAFVRATGAFWLWDEVVSEDGLLLLQGDEARLAEIARLQQEQREIAARLKAMRATPVRIKRGQP >NZ_HG969192.1|WP_038473623.1|1339011_1340982_-|Mu-transposase-C-terminal-domain-containing-protein MKEWFSIAELAKAALPGLPKSKGGLRKILATTWRHQSELTRKVKGVSRPVVEVHISLLPEVARAALLVRSGGGCVKESDQKTSIWGRYEGLSKVHKRRCEERLKALCSMEDLLQAGMGVHDAASLCAVQFGVSRMSLFNWRQMVEGYERTDWLAALAPCYGEETVSQWAECHEEAWEVLCSDYLRSSRPAFSACYRRMVLVAREKGWEPIPSERALRRRFKAQVSKAVVVLAREGEEKAKKLYPAQRRDRSSLHALQAVNMDGHKLDVFVRVPWSLKPVRLYLIAIQDLYSGKILSWRLSDAETWEIVRLVIGDMVEAYGIPERMTLDNGRAFTSKWISGGVQNRFRFKIKADEPQGLLTSLGIQLQWTTPYSGQSKPIERAWRDLAEAISKHPFCAGAYTGNKPDAKPEDYGKRAIGFEAFKAHVGAQIVAHNAQAGRKAVNCAGRSFDETFAESLTAEGTIIRQATAAQRALWLLTSEALRTQKGTGEIHFYGNRYWARALNQHAGKKVIVRFDPDHLHQDLRVYDLNNRLLCMAECLADVGFYDQQAARLNGRLRKEYVRAVKAEKQLAAKLAPDHLADVYGRLEKKDDGLKSKLVVKPKVSRLMPNHAGNLAVKVQDDEALEPQEFSQHLHKALRRFSASDEGREVIKFPKR >NZ_HG969192.1|WP_038473618.1|1337622_1338654_-|AAA-family-ATPase MKYAINATVEKNPWARPKKQPDGAAQNRNSDDIALWNTLVDSVRALAQMNDWTKAEVARRIGMPDGTFSQWYAGSYAGQLGKQNAKVHQWVEALKETAGFLEKIPEKPAFQKNRIAGEIIDTLTLAQSTGDMVMITLDAGNGKTETCRHYRATRPHVYLVTASPHTRSVHGILNDMAAELEVVEYNPTRLTRAIGKRLERVGGGTLLIVDEAQNLTDEAINQLRHFVDINGTGLALVGNDEISGRLVHRQNGPSYAQIKSRLAMHLKRRKPYSEDIAARIHDWGIEDAGAIKFLTGIGLKAGALRQIDKTMMLARMAALGDGCEVTLKHVKAAWKNRDVEELA >NZ_HG969192.1|WP_012231825.1|1337356_1337626_-|hypothetical-protein MISLCDKELSDTLVGLYDDYQCGFDIGEKLKLCVDLALLLELELSVHRLGEADAVLEGQVAEVLAECDSSDRDEDKSNRVIYMDFGGSK >NZ_HG969192.1|WP_012231823.1|1336470_1337094_-|DUF3164-family-protein MNPQIELEGTRYMKDAKGALVPVNLIRPADLLEDETVRKIMGFAKELSARIARFNNHTIADLSDFDSLLAQEYGVERRGKKGNCTYTSFDGLQRIKVQVQESVDFGPQLQIAKSLLDECLNEWSADARPEIRAIITRAFNTDKEGKVNRGEIFMLLRLDIDDPRWKEAMRAIREAIRVTTSKEYVRFYERDTLESAWRAVTIDLAKT >NZ_HG969192.1|WP_038473614.1|1335842_1336460_-|regulatory-protein-GemA MSLAVLHMGKRALGLDDETYRALLYRLTGKQSAKDLNFSEKHLVIAEMKAFGFKPNGKRLEGKYAKKLQALWIAGWNLGIIRDRSDKALLAFVKRQTGIDHIRFLRDSDDACRAIEALKGWLQREGGVDWRGKNREDSWRKKPSIAILCAQWKCLNPDAMFELGAFHQSVMALSGKALGEMSGGDFREVMNVWGRKIRKGVKSEG >NZ_HG969192.1|WP_012231821.1|1335428_1335836_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MQEEIYSDFPALLREIADVAGSEAAWNMMRAFGGREVYIPGRLENADWLIEIVGFEEAEQLINHFCFNGSGVRLLIPLGRDAERRQKMMQALQKGWSVDAAAAVSGMHVRTAYRLKKRISSKEPQGLLFPEFYEY >NZ_HG969192.1|WP_012231820.1|1334760_1335342_-|peptidoglycan-binding-protein MISIDASFLHQLAPKLTHHARQDFIIVEMARVLPKALSYGELTTHLRIAHFLSQCAHESDGFFTLREYASGRAYEGRRDLGNVNPGDGVHFKGRGLIQLTGRNNYRRFTKFWRLIDEQAVDCEAFPEVLEKFPAALWSAVWFWQMKGLNKLADRDDVVGITKAINGGRNGLVHRLTYLNRAKKLLGIGGEVEA >NZ_HG969192.1|WP_012231819.1|1334476_1334764_-|hypothetical-protein MKPSYRGSKRYLWWSFWFAWGVIFLLIAGGLWGAPRIVDMAAISIPSMVAIIVGNLGVHRGFGSVDFSNRKHSHKQHSSVYDEVEITGWSDKRHV >NZ_HG969192.1|WP_012231818.1|1334142_1334484_-|hypothetical-protein MFSPLSKLSLGLLFWGGVMLAAFGFMKAQVLKAEKARDAYWRLEIAKVSLQARLEQERQREAAQKAGLQAQAVISSLEQKLTKMEEINAVLPTVPSGCLGLERVRLLNTQAKG >NZ_HG969192.1|WP_038473628.1|1342449_1342848_-|hypothetical-protein MVAAYNLWTPEAKREIFNPYSEAERLQMMLSCSLKAVSGSFRHVPIRYIIAPPHGLFDAALARQIAIHILHYQFEVPRRRIVAIQERQRTSISLSLQVINRRLEEPVFAKAYRRWAGRAMDLFLREMEKAAA >NZ_HG969192.1|WP_171815226.1|1342831_1342969_-|hypothetical-protein MSKDQYEIGQINCIALPHQAADWMGCFLRLGGQVFFIGGGYGCGL >NZ_HG969192.1|WP_038473706.1|1343044_1343338_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MTTTQKWDRHSILAELRRRNMTLAELAKAYQLSSSSVQHIWTRPNEKAERAIADFIGLPVEQVFSDRYPKSRRRIFKAAKHANTDSRTQSALRGNAA >NZ_HG969192.1|WP_012231832.1|1343490_1344021_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MARPEKEPKTELAQRLREIRRVLGNEERGVFAQRLNLQRTTLANYETGAHEPTSSAINAYHRVYNINPHWLVTGEGEMFSDMEKAKAAGFKPQTIPAGLMKKLGRIAYTTYRDEKIKLPPENIAELAAELCIKLQELVQNINDMEEVEATFPLLKIHLKRQIEAEKEHSKATQNSA >NZ_HG969192.1|WP_012231790.1|1344601_1345423_-|DNA-adenine-methylase MDILHKEKLKSVEPISPAAAYIGGKRRLAKTIVKIIEDIPHSIYAEPFVGMGGIFFRRKLIPSTEIINDFSGDVVNFFRVLQRHYHPFIELLAFQISSRETFERLQTQNPETLTDLERALRFLYLQRLSFSGKVAERTFRVETDRCARFNPFKLEGILKLIYRRLARVIIEHLDWSDFIVRYDRPNTLFYLDPPYFGVEDYYGKDLFKREDYQTMSMLLAQLKGKFLLSLNDVPEIRKTFSQFHIKEVRTIYSCNLSNNAIPAKELIITNCDI >NZ_HG969192.1|WP_012231791.1|1345565_1346549_-|phage-late-control-protein MRTHPFIEVRVGENLVHEVFYQRLLTATITDHVGNEADTFEAEFDDSGNDLEIPSSNSALHVTFGYQNSIRAFMGRFVVESVVSIGGSDGEILRLCGKSASMRKELKEQASEHFDHKTIAEIVEALAKRHGYQAKVSPQFTKQTLPYVVRTDQSAVDFLTRLADRMRARFLIKDHKFLFLSGDNLPALDIHKHDCSSWEFTLEPRTQYGTIETSYFDRAKGQQCQVKHQTGFTGPVRRLRSCYPSQEEAQAAAASESDRLCRAVGSGSLTLAGRPEIMADQPLLLQGFRKEINGSWKAATVTHRYEKQSGYTTEITFEAPNQGKEQK >NZ_HG969192.1|WP_012231792.1|1346548_1346803_-|tail-protein-X MKIPEKHLVVELEDMSLDLICFQHAMAVLGDRSQVGAIKGYCEATLQANPGIAGYGALLPRGLKVILPEFLSCEKNSVVKRLWD >NZ_HG969192.1|WP_012231793.1|1346799_1347270_-|phage-tail-protein MRDPLLMLGPHLFYVDWLNFQSFEEEFSASWVCLERFGEAPGLQFTGYGNDPKTIHGVLFPEEFGDRVAIDAITRTIRAAKPVQMIRWMSDNGYSAILHGSVVITSVTKDHDYISRSGQSGRIRYAISLLPFFDGGKPQGQYQEGYDQYSQGGETP >NZ_HG969192.1|WP_038473631.1|1347426_1349763_-|phage-tail-tape-measure-protein MDVSLVVRFVNHLQEGIASAKRDLRAFSLDVAHFQNQTRKHFKGWFDPEHLKEATAHAENAFIHARGRMVGAIAQTATLIAPLYKAMQFDQSMKGLEKVLDAPLDRLKELRRFALETSTKIPLAAREVLELMTSASQAGIGEQDLEAFSIYAAKAAVAFDMTGDQIGERFAKLRNVFKLNQEGIEDLGDAINHLSNHMAAKASEVSDFTNRATGAATMFKLTARETAAFGTAMISAGIVPESAARGFNTMSARIQAGGKHIEDAFSNIGLSRQKFMEDLEKDATGTLVRFFNVLGKSEQGMRSLIAIAGREFTGDFAKLVGNPQLLGQALDYVKDPQVFKGSVEQEADKQATGAMRQFELLQNRIVALGITIGEVLLPPLNSLMESVGGFVNGLMAWANEHPVLTGVIIKTIAALMAFNIALRVVRFTMAGTRLGLLQLMGSFIKMRVVSRTLKASWRGLVASGRSLGLMAAGLGGSALRLLRPMTLLVGALRGIAVSGAAFSASFGFIGTVIEVVGAAIASVVGGIFTPIGALIAAVVAVILASGFALWKYWDRFSSFVKGFARGITRAWGRAFEAVMRFFGADTATITKWKNIIAAAFDLSSHWQKFKQGLSSVSQSFAGLWEGVKQSFSNFWGWLKRFFVREKLTESAKAGMEQAGEDLASWIVDGFMSSISQLMDYCKSLPHRIKGWIGSIDVREFLPSFLGGKTSIQPIVQFAGASPVNSSAREPRDKDRSPITHNQNVTVHVNGARDPMATGRAVAHALQRARANALHGGTE >NZ_HG969192.1|WP_012231795.1|1349894_1350308_-|hypothetical-protein MTSLQTSLDVELQVPLVYKESDGKELTRHKLTFYRPNFKQARQLAVLIGPQLAKLVLLGLEEDKTTLSNDVLILKVCEALLTHEAMEGIAVLLADMSHESVELINRLDVIDIMAVLKAFFAFFPTRQSSLPDNLEQN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG969192_3 | 2365316-2365407 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_HG969192_3
|
1 spacers
spacers of NZ_HG969192_3
>3.1|2365342|40|NZ_HG969192|CRISPRCasFinder ACCGGTAAGCGCTGCTCCAGCAGTGCTTCCACCAATAGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG969192_3
The CRISPR arrays of NZ_HG969192_3 >merge|NZ_HG969192|3|2365316-2365407|CRISPRCasFinder GTTCCAGCCAAAGCACCAAATGCTGCACCGGTAAGCGCTGCTCCAGCAGTGCTTCCACCAATAGCAGTTCCAGCCAAAGCACCAATTGCTGC >NZ_HG969192|3|3|2365316-2365407|CRISPRCasFinder GTTCCAGCCAAAGCACCAAATGCTGC ACCGGTAAGCGCTGCTCCAGCAGTGCTTCCACCAATAGCA GTTCCAGCCAAAGCACCAATTGCTGC
>NZ_HG969192.1|WP_012232465.1|2363263_2365126_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MAVPLLRLDRIFLTFGTTPLLNQACLSVEQGARIALVGRNGCGKSTLLKIAAGILEPHGGEIFRHPRVTLRYVSQNPDCLGFEDINAYMEAELDETSDVQWINTLRTNLGFSGGEKLETLSGGEKRRVSLLRAIAAKPDILFLDEPTNHLDLPTIEWLEGVLSSLRSAIVVISHDRRFLENVTRSTVWLDRGTTKRLEKRFSEFESWRDKALQEEAIEQHKLGRQIAREEQWLRYGISARRKRNVRRLSELKDLRQRHQTYKGQPGSALLSAAKSHDSGQLVLEAKKISKSYGERVIVKDFSLRIQRGARIGLVGPNGIGKTTLLSVLIGKEAVDSGTVRHGYNLSMALLDQQRIVNEEETLAHYLTGGRGDTLVINGQERHVVSYMKDFLFLPEQARTPLKEFSGGERARLMLARLLSRPANFLILDEPTNDLDMETLDLLQEFIADFAGTVLLVSHDRDFLDRTVTHMLAPEGDGHWVLYAGGYSDMMAQNKQALRLQRKEIELSHRKASSKPHAGAFSKQISSTDPSLIAREKKTPRRLSYKQVYALEKLPEEIAVLQNEIKKIEQELSDPALYRRDKERFERLSTALEKKKNTCTQKQEEWLELEILREEMEACSR >NZ_HG969192.1|WP_005774567.1|2360889_2361150_+|DUF2312-domain-containing-protein MNDTVTDQTHAISVNQLRSFIERIERLEEEKKTISDDIKDVYTELKGSGFDSKAVRSIIRLRKKEEHERMEEEAIIELYKNALGMN >NZ_HG969192.1|WP_012232464.1|2360145_2360673_-|DUF1036-domain-containing-protein MVCFENLHYREIFLILKKQCWAFETRLKVFLLSILLLFPFSVCVKADFRVCNTTQQSVGIALGYRTFSGWVSEGWWVVPVTECKTLIEGPLASRFYYFYAEGAQKKGNWAGSVTMCVQDSQFTIQGVHDCFPRGYQKAEFQEIDTGNQTSWMVQLTDDSLLNNSVVPSFSGSSPP >NZ_HG969192.1|WP_012232463.1|2358712_2360149_-|pyruvate-kinase MKRARKVKIIATLGPSSFSRLMIEKLFRAGADVFRLNMSHTDCDTMGDLVKSIREVEKIVQRPIGILVDLQGPKLRIGHFAKGQEDLCVGQSFTLDHRDVAGDARRVFFPHEDVFSALKPGDRLLIDDGRVELRAEVCDDHFVQCRVVAGTRISDRKGVSFPDTVLPFDSMTSKDKADLQALLQYPVDWVALSFIQRPEDIIAVRQLTKSKVSLMAKIEKPQALEHIEKIIEISDGIMIARGDLGVEMPLERIPALQMELIKACRLAGKPVVVATQMLESMITSPVPTRAEVSDVATAVYSGTDAVMLSAESASGRYPEEAVLMMDKIARQIEQDHTYAAQVGAQHPAPESTGTDAISLAARQIAETLALAAIVAYTASGTTGVRASRERPNRPIIALSPIVETARRLALVWGLHCVVSDDAKNLEDMVDRAAAIAFQEGFCQGGDRFLVTAGVPLGTPGATNLLRIASVSPDGTKGI >NZ_HG969192.1|WP_012232462.1|2355731_2356115_+|cell-division-protein-ZapA METVSVTIDGKNYRMACNKGQERHLIALAAQLDQYITHLKKNFGEIGDHRLSVMAGIMIIDEMEEIKRENKKLQEDYNALLRLHNEKERTMEKIMRDTTQRIENLTNQLLKDDQYSTNIQEQEQEDF >NZ_HG969192.1|WP_005774573.1|2355443_2355719_+|DUF4164-domain-containing-protein MNQETTVLQDALEHLEKALRTLEITIINRNAVIDKNNEWEEEIQRMNADRSHLAQALDKAEAQIERLESVNKEVSKRLIKAMETIRVVIDR >NZ_HG969192.1|WP_012232461.1|2353103_2355110_-|transketolase MTNTLQQNQMANAIRFLAIDAIEKANSGHPGLPMGAADIATVLYTQFLAHDPKNPRWPNRDRFVLSAGHGSMLLYALLYLSGYEDICIEDLKDFRQLGAKLAGHPEYGHAAGIETTTGPLGQGLANAVGMALAERLQNARFGDLINHYTYVLVGDGCLMEGISQEAISLAGHLKLHKLIVLWDDNNISIDGEISLADSTDQCARFKASGWNTVKVDGHSQTAIAHAIEEAKNSDKPTLIACKTTIGFGAPNKAGTNKVHGSPLGVREIAETRIALGWEAEPFVIPADILDNWRLAGLNAAKRRQKWEEKLAALSVSERVEFERLMRGDLVGGFDGAVDAYKQKLVEECPVVATRKASEMALEVINEVVSETIGGSADLTGSNNTKSSQMKSISANDFSGRYLHYGIREHAMGAIMNGLALHGGFIPYGGTFLCFSDYMRPAMRLSSLMGLRVIYVMTHDSIGLGEDGPTHQPVEHLACLRAMPNHLVFRPADAMETVECWQLALKARGTPSTLALSRQNLPLLRQEYEEENLCMLGAYELLTASDEAQVTLFASGSELQIAVKAHAVLEEKGIPTRVVSVPCFELFSQQSCSYQRALIGDAPIKIAIEAAVAQGWDRFIGCDGVFIGMEGFGASGTIDDLYAHFGITWENVVATAEGELEKIEEEKTK >NZ_HG969192.1|WP_012232460.1|2351898_2352906_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MTVRVAINGFGRIGRNILRALIESGRKDIEVVAINDLGSVETNAHLLRYDSVHGRFPGDVKVVGDAIDVGSGLIKVCAERDPVQLPWKDLDIDIALECTGIFTACDKAKAHLDAGAKRVLVSAPSEGADLTVVYGVNHQSLNKEHRVVSNASCTTNCLAPVAQVLHNTVGIENGFMTTIHSYTGDQPVLDTMHRDLYRARAAALSMIPTSTGAAKAVGLVLPELKGLLDGVSIRVPTPNVSVVDLTFTAKRSTTIEEINTAIATAARGSLKGILDTTQEKLVSCDFNHNPHSAIFHNDQTKVIDGKLCRVLVWYDNEWGFSNRMSDTAVAFAKTI >NZ_HG969192.1|WP_012232459.1|2350120_2351314_-|phosphoglycerate-kinase MVFRTLDDVDVLGKRVLVRVDFNVPMALGKVCDETRLVRHKETLVELQKRGAKLILLSHCGRPKGKIEPEFSLRPVVSVLEKIINQPVAFAPDCIGSTVQVAVEALQNGDVLLLENVRFYAGEEKNDCSFAGALAHNGDLYVNDAFSVSHRAHASVEGITRLLPSYAGRSLQGELQALEKGLGNPTRPVVALVGGAKVSSKLFVLNHLVEKVDTLVIGGGMANSFLAAQGIHVGKSLCEHTLMETVKKIIKKAQECHCTLLLPVDVVVGFRFEKDAPHRLYDIGDIPEEGMILDIGTRSIVHINSVIDKAATLVWNGPLGVFEMPPFDKGTIAVARHAAERSLTGRLVSIAGGGDTVFALNHADVANDFTYLSTAGGAFLEWMEGKVLPGILALMQP >NZ_HG969192.1|WP_038474306.1|2348973_2350005_-|fructose-bisphosphate-aldolase-class-I MTERLEDIALSLVQAGKGILAADESTATIGKRFESIGVESNEDRRRAYREMLFSAKEAMQNAISGVILFDETIRQKASTGQMLTNLIRDAGALPGIKVDTGAKPLAAFPQETITEGLDGLRERLKDYYTLGARFAKWRAVIAINADTLPTRGAINQNAHALARYAALCQELNIVPIVEPEVLMDGPSCGHSIARCFEVTGAVLQTVFKELFEARVVLEGMILKPNMVIDGKDARKAGVEEVAEKTVCVLKQTVPSAVPGIAFLSGGQSDQEATAHLSAMNSLGALPWKLTFSYGRALQAAALKAWAGKDENIAIAQKAFHHRAQMNHLAALGQWTKSQEKVSA >NZ_HG969192.1|WP_012232467.1|2365615_2366251_-|thiamine-diphosphokinase MTTFTILLNGDLSITDRLLNQIQNSRVIAADGGMRHAAALNVKPELWLGDFDSSDQTLIDKYNHISREVFPSDKDMTDSALACERALQNGAKKLILCGALGGERSDHSLSHMTQALMMAEKGISVLLTSGLEEGWPVLPKLASYDLPKGCLFSLIGFSDLKGLTLKGVKWPICDKNVSFGSSLTLSNRICGTFSCHLGSGKAILLASVPIP >NZ_HG969192.1|WP_012232468.1|2366396_2367995_+|M48-family-metalloprotease MKFAKLHRRDDLHCNPNPTHAIAQRNFLFRSLPYKVTFISFMLLLSACHTHLSQNDRLSSSSSETTKHTNNHNIYVTLSALQHPRILQMYGGVYHNAKLERFLAKIIRKLTIASHHLHQSYFITILNSESVNAFALPNGSIYITRGMLALANDSSEVAAILAHEMAHIRANHGILRLQKEAQLKMANHMSPHLLSSMNKKLHPPLKNKQQLAQFSRNQELEADSLALEMLQQAGYDSFALPRFLQTMEAYSHLQNISGTQNAPLDFLTSHPTTPQRIRLAIEKARKISKDNHKIIDRDSFFTSIDGMTFGGSFDTGFLRGNQFIHPQWRIAFSVPNNFTIEHSAQTVWASGPDKIAIRFDVVPHPAGISVSDYLKSGWIIGLDSSSIRPLTIQGLPNQEFTRPGFTHQGYLGQSLLGAQARATHEQWQFDVVVILFNNYIFRFLTAAPYNSPNFAEIAQKTVQSFHPLSTSQLKKLKPLKIRVVRVKQGENIANLANKMQHTPDKEKLFRILNALSPTQALSAGTKVKIITE >NZ_HG969192.1|WP_012232469.1|2368407_2369319_-|RNA-polymerase-factor-sigma-32 MGNLSNAVYKSSKNYSDADKSLGRNMMRSAMKAPYLERQKEHDLALRWKDKRDDDAMHQIAAAHMRLVIAIANRFKRFKMPLGDLVQEGYVGLLEAAARFEPDREVRFSTYATWWIRASIQDYILRNWSIVRGGTSSSQKALFFNLRRLRAKLVQDDSALSKQDIFRTIAEKLGVSVRDVETMDFRFSSSDNSLSVSVSENSDSPVAKMDVLVDESPLPDALIEQVIDGQRRTQWLYDALQILNERELEIIRFRRLNEEGATLEVLGEKLGISKERVRQIEARALQKLRSALLTVHSEDAYDI >NZ_HG969192.1|WP_038474323.1|2369918_2371505_+|hypothetical-protein MDSKIVQQNEILQDDILIEKHGRGKFEGFRFYANKNNTDQTTEEQCSIENEHLILAFSKRAIRFCACANGDFTLSSDGIVRWIGQPVGQLVATEDFFKPKLIVLADSQLIGESRDNVVKRLERFVTFHFETALKPLFDLRNADNLTDSTNSLALQLINSLGVIPRREVLDLVKNLAQESRAILRRLGIRFGAFHIYVAGMLKPVPVQAITLLWNLQNAGQNQTGLAEIFTALSAGRTSLSVDPTYNRQFYQLAGYRILGQRAVRIDILERLANLIRPALHWKQGSDPKPDGAYDGKSFFVTPAMMSILGANGNDMEEILKGLGYQSHSISNTVFEQNLLAHKASSLINGTTQEVPAAECVGSLWQTINTPKTAQEEQNTSSLNILSSSSRIEKHSHNTNHLPAAEPVGNFAKATPPKAEDKVVLLWYYKHQLHHHSQKRRDKSGHKWKNRPKSAVQKEGNANGNFPQEAPSQTKRSHKFHKSQDKRANYKPFQKEKRFNPDSPFAKLAVLRDQLSHHKNTHTLSSKEH >NZ_HG969192.1|WP_012232471.1|2371526_2371868_+|ferredoxin-family-protein MTHVVTDNCIHCKYTDCVEVCPVDCFYEGENMLVIHPDECIDCGVCVPECPAEAIVPDTEPGLEKWLELNLHYANKWPNLTTKKDPLPQAKEMDGVPNKLEKYFSENPGSGEE >NZ_HG969192.1|WP_012232472.1|2372173_2372758_+|CarD-family-transcriptional-regulator MASQHGTSSKTKEFATSEYIVYPTHGVGQIIAIEDQEVAGHKLKLFVIHFAKDKMDVKVPIAKALSVGMRKLSAGDSVERALKVLRGKARVKRTMWSRRAQEYDAKINSGDLICIAEVVRDLFRSNLQPEQSYSERQLYTAALERMAREIAVINSLSETEAINLIEMHLSNKPKREFKTEREETVENSKAVYAA >NZ_HG969192.1|WP_081458171.1|2373815_2373977_+|integrase MDLMNALKCQELPQHPRAGKYNDGAGLLLHKRKDGSAILFHGGFIVYHSQAPP >NZ_HG969192.1|WP_049776898.1|2375400_2375592_-|50S-ribosomal-protein-L32 MRRLADALKALAYIEDKNSGELRCPHAIDLKTGMYRGRSVLVVKTLAFYLSFRSAACAVRLML >NZ_HG969192.1|WP_005774555.1|2375789_2375969_-|50S-ribosomal-protein-L32 MAVPKRKTSPAKRGMRRSADALKAPTYIEDKNSGELRRPHHIDLKTGMYRGRSVLVVKD >NZ_HG969192.1|WP_012232475.1|2376394_2377300_+|polyprenyl-synthetase-family-protein MHEFTTLLAKHGHTVESRLSTLLSDHIQNGEISRPENLIKAMRYGVLNGGKRLRPFLVIQSAALFDIPVEHSLDVACALECVHCYSLIHDDLPAMDNDILRRGKPTVHVEFDEATAILAGNALLTFAFEIIAHKANTLSTDTRIKLITALAQSAGLGGMLGGQMLDLEAEKKPQENTDIITLQRMKTAALISFACQAGAIIGNASQELLTKLTAFGSYLGLAFQLTDDLLDVTANTQTLGKTAGKDETAQKATFVRLYGIEETQKKREALLTKAEALLYPFDDAKALPLQQAARFSATRKH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG969192_2 | 2.1|1341918|30|NZ_HG969192|CRISPRCasFinder | 1341918-1341947 | 30 | MN693707 | Marine virus AFVG_250M784, complete genome | 13714-13743 | 8 | 0.733 |
1. spacer 2.1|1341918|30|NZ_HG969192|CRISPRCasFinder matches to MN693707 (Marine virus AFVG_250M784, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aagccttcttttggcaaagggacaacttgt CRISPR spacer ccgccttcctttggctaagggacaagccga Protospacer ******.****** ********* ..*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
315304 : 423752
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_HG969192|315304:423752|DBSCAN-SWA 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108 | Acidithiobacillus_phage(14.29%) | tail,capsid,terminase,plate,integrase,head,tRNA,portal | attL 316540:316557|attR 430962:430979 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
476795 : 562029
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_HG969192|476795:562029|DBSCAN-SWA 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98 | Acidithiobacillus_phage(13.04%) | tail,capsid,terminase,plate,integrase,head,portal | attL 495292:495314|attR 572279:572301 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
578410 : 591239
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_HG969192|578410:591239|DBSCAN-SWA TTTACTGGACATGCATACCCCCTTCTTTCGTTAAATATAAAATTGCCAAAGCATCTGCTTCATTATCATCACAAGGCGCGTGACCTTTTGCACGCATTGTCTTAATCATTTCTTCTTTTGACGCATTCCCTTTTCCTGTCGTCGCTTTCTTAATCGTACCAACGGGAATGCCTTCATACGGTATCTGATGATGTTCACACCAAGCTGTTAGAGTTGCTAGAAAGCCCCCATAAACATGAGAAGCGTCTGTACCCACATGCCGACGTACCTCTTCAAAATACACCGCATCAATTTCATCAACAGACCTCTTTAGTTCAGAAAGCCATTTCTTAAAGCGCAGATAACGCATACCTCCGCCTTCAAAACGGCGTGATTGAAAATGTTCTGTATCACTTGTGATAAAACCATCTGCATCACAAAGCGCCCAGCCAGTCTTAGTCCCTAGATCAAGACAGAGAATGGTTTGTGCATGAGTGATCATAATCCCCCCTTAGGCTCTACGTATTTATATGCGTGCTGTGACAGAGCGCGTAATCATAAGTTTAAAAAATGGTCTAACTCAACTCAGACACACACTGCACGCATCACTTATTAATTTGATTTCTTCTTTTCTTTTTTCGATGAGGTCATCCCTTAAAAGATCAAGATTACTTTTGACTAAAGCTGTAAACAAAAGCAGCTCATTTAAGCGATAAAAAGATGACAACTCTTGAGAAAAATGATTATCAAACCAAGCTGTAAAAATTTGCGTAAAGACAGATGAAAACCATTGTTTAAAATCATCGTACGGCGATAACGGAAAATATTTTTTATCATCACGCGCAAAGATACTATGCAGTATATAGACAAGACAACCATTTGATAAGGGATCTATGCGTGTTTCAAAACATGTATCTTGAGGCGAACGGACACCATAATATATGTCTTCCCGCCCAATCTTATTAACAAGATCGATCAACTGAACTTTGCTTATAGAGATCTGTGGTTCATTTATCATCTATGATCTTTCTTCTTTAAGAGTGTGAATATCGTCTGTTTTGAAAAAATGTTTTTGAAAAAAAACTCGCAATGATTCATTGTTAATTAACAATCCTCATTTTTGGTTCAGATGACGCAAGAATTAAAAAACTTCTCCTGCAAAAACAAAATCGATCAATCTTGGTTCTTCTTTTTTGTTGATTAACTCAATGAGTTTATTATTTAATTTATCAATTAGCTCCATTTGTGAAGCCAGCTTTAATCTTTGTTCATACAGTGTCTTATTTTTTTGCTTAATTAAAGTGGATAGGTTTTCAAGTACTACTTGCTGTTGTTCAATTGACTTATCTCGCTCTGCAAGAGTGGCTTCATGCCATCTCATCCAACTATCAAATTTTGACTTATGCCATTCTTCTCGTTTTTTAAGAATTGTTGTGTGAGTTTCGTGTCGTTTCACAAGATCTTCTATGCTACAATCACGATCCGGTATCCGTCTAAATTCTTTCACCAATCTATCTCCATTCTTCATTTTCGTATTACAACCTATTAATCTACAAAACTGGGTGTAGATCTTCTTCAATATTCCGTTTCTCATGATCTTTCTTCTTTAAGAGTGTGAATTATGCTGTGGGTGTTTGTTATCAGCTGTAGTAAGTGGCACGCCCACCTCTTCAAGAGAGGGGCGTGGGTATAAATCGACATACCAGTCAACGGGACGAACAACACCATTGGTTGTCTTTTCAATCTTTAAGACAATTTCAGGCTCAGGAAACCGCAAGCCGCGTAAATACCTGTTAATCGTACTCTGTGCTACGCCAACTTGCTTCCCAAATTCGGCTTGAGATAGTTTATTTCGTGTGAGATATGATTTCAATTTTTCCATAATTCAAATAAATACCATAAAAGACTGTTTTAGTCAATAAAAAATACCTTTATGGACTTTGTTAAATAAGCAGTCTTGGTGTAAGGTCTAGAGCATGCATATAATTAAAAAATTGAGGAAAGATTTGGGACTCACACAGGTGAAATTGGCTGAAAAAGCTGGTACCACGCAACCTCAAATAAAACGGCTTGAAAAAGGTGAGCGAAAATTAACCAAAGAGTGGGCGGAAAAGTTAGCACCACATCTTGGTGTAAAGCCGTTTAATCTTCTTTTCCCAGAAAACGAGGAAATACATCCCATATCTAATGCTATTGGAATGATACCGGTGATAGGAAAAGTTGCTGCTAGCTCGTGGATGTCGGTCGAAGATATGGATTTTGGATTTGATGACATAGAATATGTACCCAGCACCTCGAAATACCCAGCTCACTTTCAATTTGCTTTAAAAATCGAGGGCAACTGCCTTAACAAAATTGCTCGTGATGGTGATCAACTTATTTGCGTAGACATAATAAAAGCCGGTATTAATGTGGAACCTAACGATCTCGTGATAGTTGAACGCAGCCGATTCAATGGTCAAATGATTGAGCGTACAGCTAAACGTATACGTCAAACTATTAGTGGATTTGAACTATGGCCTGAAAGTACTGAACCCAATCATCAAGAACCTATCAAAATAAATGGGGCAACTGATGGAGAGGAGATTCGTGTAGTTGGGAAAGTTCTTTGGATTTTAAGAAAACCCTGAAAGCACAAGGAGAAGCGGGAATGGGGACAGTAGACGAGAGCTTAAAAATAATAGCTGATAAAGTCAAAAATCATTCAGATACTATGTTAACTGAAGAAGCGGTCAAAACAGCGGTCGTTTTACCGTTTCTGCGCGCACTTGGGTATGATATTTTCGATCCACTTGAAGTCATTCCCGAGTTTACTGCTGATGCCGTTGGTAAAAAAGGTGAAAAAGTTGACTATGCTATCCGTATAGACGGTGAGATACGTATTCTTTTTGAGTGCAAACCGATATCTTGCGAATTGAGTTCAAAGCATTTAAGTCAATTATATCGATACTTTAGTGTAACGAATGCTAAATTCGCGATTTTGACAAATGGTCGATTTTTTCATTTTTACACAGATCTTGATGCTGCAAACAAGCTCGATAATAGGCCATTCCTTACTTTTGATGTAATAGAATACAATACTGTGGTACTTACAGAGCTTAAAAAGTTTGAACGCTCAGCATTTAATATTGAAAATATATTGGTGACAGCCGAGCAGCTCAAATATGTATCTGGAATAAAACAAAACATCCAAAAAGAAATAGAAAATCCGTCCGAAGGTTTTGTTCGTGTTGCTTGTGCGGATGTTTATGAAGGGCGCCTGACTGCTAATGTCTTAGAAATGCTCACAGGTGTTACTAAAAATGCGTTTCGCGAAGTAATATCTGATGCGGTAAAAAGTCGGCTTTCTAGCGCTTTACAAACAACAACTGAAACCGACAAGCAAGATAATATTGCTACATCTATTGGTAATGAACATGCCAGAATAACGACCGAAGAGGAAGTTGAAGGCTTCATGATTGTCAAGGCAATTGCGCGTGAAGTTATTTCTGCCGACCGTATTGTTATCAGAGATGCAAAGTCGTACTGCGCCATTTTAATTGACAATAATAACAGAAAGCCGTTGGTTCGACTGCACTTTAACAGAAAACGTAAGCAACTAGCCCTTTTCGATACTGATATTGATGAAAAAGTCGGTATTGAAACGCTAGATAATATTTATGATTTTGCAGACAGAATAAGAGAAACAGCAAAAAAATATTTATAAGATATTCTAACAACCTATGTATGCCCCGCTGAAGCGGGGTTTTTTGTTCGTCCGCAGTTTTGATAAAAAAACTACGGCGTTATCTACCCATCGATTGGCTCTGTCTGCACACTGCTCCAATTTTTCCTGCATATAAATTTCAAATACAGCTAACTGATTTATTTTTTTACGGGATACTAGGAAGTATCATGCCTCTACACTGAACGCTACAATACCCAAACCGATTCGTAATAAATATTAAAGTTCATTTATAAAAAAACCATTTTAGCATAAAATGACTTGACCATAATAATCCTTTACGGCATACTCCTCTATAACAACATATCACGAAGAAGCAAAAGCCGATCTGGTGTAGATTAAATTACATTAACACGAACAATCGCCAAGAGGCGTTAGGGAGGAAAAATTATGGATAAGCCAATTCTTATAAATTCTGATGAAATCTTATTAGTTGCCTACGATAAAGAGCAATACATTGCAGAGTCTGGACCACTTGATGCAAGCCAAGCTTTAAGCATTGTTGATGAGGTAGATGATGCAATCCAAATCTTTCGCATCAATCCTTCTGAGAAGAGTTGTGAAGATATCTCTGAAGATATTGCAGAAGCATATGTAGAAGCAAATATTGAAGATCTCTATGAGGATAGTGAGGTTCATTACTTTGTACGCGAAAGTGATGTTTACAATAGACTTTTAGACGAGATCGCAGAAGAAAAATATAATGATGAGGTCTACGGTACTTACGAACAACAACACCGTTTGCGTCCTTGTGATGTGCTTTAAAAATTCTAAAGGGCGTTTTTAAGAGCGCCCCCTTTTTCCCATCAATCCCAGCCAATATGAGGTCCGTAATGGAAAAGCTAATTGCTATCCAGCAAAATACAAATAAACACGAAACAATTCCCACCATGTCTAGCATTGAAATTGCAGAGTTATGCGGTAAAAGACATGGCCATGTAATGCGAGATATTCGTAAACTATTTAGCGAACTTAAAATCGACCTGAGTAATTTTGCTGGATTATACAAAGATTCAACAGGTCGTACTCTTCCTTGTTACCATCTTCCTAAACGTGAATCTCTTATTGTCATTTTAGGTTACAACACCGTGTTACGCGCAAAAATCATAGATTATTGGAAAAAATTAGAAGAGCAAGAAGCTAATCCTCAAATCGATTTTTCGAGCCCTGAAATACGAGCAGCTATCATGATGCATCTTAAAAATAAAATTAAACAGACGGCATAGGAGTTCATCATGAACACTCTCATAGAGATTAAAGAACAAATCATTGATCAGGAAATAGTTCAGACAGTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_HG969192|578410:591239|578968_579406_-|WP_038473333.1|DBSCAN-SWA MINEPQISISKVQLIDLVNKIGREDIYYGVRSPQDTCFETRIDPLSNGCLVYILHSIFARDDKKYFPLSPYDDFKQWFSSVFTQIFTAWFDNHFSQELSSFYRLNELLLFTALVKSNLDLLRDDLIEKRKEEIKLISDACSVCLS >NZ_HG969192|578410:591239|578410_578890_-|WP_012231087.1|DBSCAN-SWA MITHAQTILCLDLGTKTGWALCDADGFITSDTEHFQSRRFEGGGMRYLRFKKWLSELKRSVDEIDAVYFEEVRRHVGTDASHVYGGFLATLTAWCEHHQIPYEGIPVGTIKKATTGKGNASKEEMIKTMRAKGHAPCDDNEADALAILYLTKEGGMHVQ >NZ_HG969192|578410:591239|579529_579895_-|WP_122364095.1|DBSCAN-SWA MKEFRRIPDRDCSIEDLVKRHETHTTILKKREEWHKSKFDSWMRWHEATLAERDKSIEQQQVVLENLSTLIKQKNKTLYEQRLKLASQMELIDKLNNKLIELINKKEEPRLIDFVFAGEVF >NZ_HG969192|578410:591239|589949_591239_+|WP_012231101.1|DBSCAN-SWA MANVVVVGTQWGDEGKGKIVDWLSERADIVVRYQGGHNAGHTLVIDGVSYKLSLLPSGLVRGKLSIIGNGVVVDPHHFVAELKKLCDQGVKITPEILRIAENAPLILSLHRDLDAIRESGLSGLKIGTTKRGIGPAYEDKVGRRAIRVMDLAEKDTLMAKIERLLRHHNALRRGMGVAEIDSQALYDELMQVADKILPFMDCTWRLLDEGYREGKHILFEGAQGALLDNDFGTYPYVTSSNTVAGQACTGSGMGPGVIHYVLGIAKAYTTRVGEGPFPTEQINDIGEFLGTRGHEFGVVTGRKRRCGWFDAVLVRQMVAICGVQGIALTKLDVLDGLDEIKICIGYELDGRKIDYLPSSMGAQARVKPIYETLEGWKAKTAHTLRWEDLPVQAVKYIRYIEELINTKVALLSTSPEREDTILITDPFAN >NZ_HG969192|578410:591239|584447_585062_+|WP_012230962.1|DBSCAN-SWA MEKKYELTDEKAEFKGVTLHRIRALRDFGVIKKGNLGGFIEHENNLSHHGNCWVGGEAKIYDNAKVFGNAKVYGNARVSGFSHVFDKARVYGEAYIDGISDIYENACVFGSASVTGEANIFGNAQIFGHARVFASAQIYGNASVYDTAFISGKAKIYGNAKIYDCPLISIRAKVGGDAVICGDAFIQGNTEIINDEIVSTGERQ >NZ_HG969192|578410:591239|580364_581018_+|WP_004856665.1|DBSCAN-SWA MHIIKKLRKDLGLTQVKLAEKAGTTQPQIKRLEKGERKLTKEWAEKLAPHLGVKPFNLLFPENEEIHPISNAIGMIPVIGKVAASSWMSVEDMDFGFDDIEYVPSTSKYPAHFQFALKIEGNCLNKIARDGDQLICVDIIKAGINVEPNDLVIVERSRFNGQMIERTAKRIRQTISGFELWPESTEPNHQEPIKINGATDGEEIRVVGKVLWILRKP >NZ_HG969192|578410:591239|579994_580270_-|WP_038473334.1|DBSCAN-SWA MEKLKSYLTRNKLSQAEFGKQVGVAQSTINRYLRGLRFPEPEIVLKIEKTTNGVVRPVDWYVDLYPRPSLEEVGVPLTTADNKHPQHNSHS >NZ_HG969192|578410:591239|586166_586928_+|WP_038473337.1|DBSCAN-SWA MNELNTNLTEVNKTNDCEIKPTAMELILERALENDVNLDRLKSLLELREKEIERQERQNFVRDLSAMQTEYKNIEQNALNTHTKSTYTTLDKYIDAIKEPLAKHHFALFSRIKEQSSNDITVEMTLKHISGNEISTQGKFPVDATGSKNNVQAVGSTISYARRYLLGMLLNVTSDEDDIDGNTLIAGVTPEQMNEIKELMEQTQAKESDILSFIGVKNLTQMSYKQAQTVLFALKKKQRSQMNKAQQEQQTAV >NZ_HG969192|578410:591239|583347_584106_+|WP_012231093.1|DBSCAN-SWA MNTLIEIKEQIIDQEIVQTVNARDLHAFLEAKRDFSNWIKDRITRYNFIEGQDFVKTQDLRSPNLASAKSRAVIAINYYLTLDRAKELSMLENNQKGREARLYFIECEKRVKQAVTPQIDYSSPKAMIGFLNYLQGQIDQKDTIIEDLTPKAMALESLQRHDGLFGLTEAAKILEMQPKQFIQFLQQKGWIYRRAAGGNLLPYQDKIQKQLMDCPTITLQTSSGIEKVIPCAKITAKGIGVLSQELKRQSIH >NZ_HG969192|578410:591239|586929_587553_+|WP_012231098.1|DBSCAN-SWA MEQRTAEWFQARLGKVTASNIYNVLSKTAKGTPTNKYEDYKIKLITERLTEEVSQFYTTPAMQWGIEHEEDALKEYAFIYDTEIIGCGFIQHPTIKMAGASPDGFVGDDGLVEVKCPQSPNHLRFFIDDNIKPEYRAQMQFQMACTGRKWCDFISYDPRFTRQSTYLRMKIKRIHRDEEQIEQINQAVEVFLAEIEQEMQKILTKAA >NZ_HG969192|578410:591239|582502_582877_+|WP_012231090.1|DBSCAN-SWA MDKPILINSDEILLVAYDKEQYIAESGPLDASQALSIVDEVDDAIQIFRINPSEKSCEDISEDIAEAYVEANIEDLYEDSEVHYFVRESDVYNRLLDEIAEEKYNDEVYGTYEQQHRLRPCDVL >NZ_HG969192|578410:591239|588410_589568_+|WP_012231100.1|DBSCAN-SWA MLQKPSSRPKNTNFSSGPCSKRPGWTFDVLKNALVGRSHRSREAELKLAEVVNLTREILEVPSDHRIGIMPGSDTGAVEASLWSLLGERGIDMAAWESFGFGWNKDVVEQLKLSDVRRFEAPYGEIPDLTQLNFERDVVFTWNGTTSGVRIPNADFIPDKRAGLTICDATSAAFAQYLDFSKLDVVTFSWQKVLGGEAAHGMVILSPRAVERLENHVPAWPMPQLFCMTKNGKLNEDIFKGKIINTPSMLCVEDFLDGLKWAKSLGGAAALRARVEKNFSVIDAFVRKTPWLEYLAKDPEVRSNTSICLDIVDPVITALDTEKRVSFIKAVVNRLDEEGVAYDIGSYRDAPPGLRIWTGITIEASDLEILTQWLEWAFQVEKAQL >NZ_HG969192|578410:591239|581038_582094_+|WP_012231089.1|DBSCAN-SWA MGTVDESLKIIADKVKNHSDTMLTEEAVKTAVVLPFLRALGYDIFDPLEVIPEFTADAVGKKGEKVDYAIRIDGEIRILFECKPISCELSSKHLSQLYRYFSVTNAKFAILTNGRFFHFYTDLDAANKLDNRPFLTFDVIEYNTVVLTELKKFERSAFNIENILVTAEQLKYVSGIKQNIQKEIENPSEGFVRVACADVYEGRLTANVLEMLTGVTKNAFREVISDAVKSRLSSALQTTTETDKQDNIATSIGNEHARITTEEEVEGFMIVKAIAREVISADRIVIRDAKSYCAILIDNNNRKPLVRLHFNRKRKQLALFDTDIDEKVGIETLDNIYDFADRIRETAKKYL >NZ_HG969192|578410:591239|585550_586093_+|WP_012230958.1|DBSCAN-SWA MVKKYELTDEIDEIYLRKVYRIRALRDFRNVKKGDLGGFVEKEENLSHEGDCWIWYKAKVSHDAKVFGNAQIFENATITDNACVYDNAKVCGEASVEYNAQIFDNALVYDKARVFGFVYGNARVYGKAVICDNARIFGDIRILDDAYVSNQVNISGNFEIRGKTLMVPRSEHLVDYVGRF >NZ_HG969192|578410:591239|587631_587835_+|WP_007347214.1|DBSCAN-SWA MIFDDGDRYVTTRECAQLFSVSTTTIRNWVLQGEFPQPYKLGRAVRWRKKEILAFTPKKNREQITTN >NZ_HG969192|578410:591239|584118_584436_+|WP_012230964.1|DBSCAN-SWA MIKKKYKLTDETIKVDGTTLYRIRALKDFDDVKEGDLGGFVESEWNLSHDDNCWVGGNACIYQNAYISENAKVYDDAEVYNNAKVRGNAIVAGDTAFYGSDAILR >NZ_HG969192|578410:591239|582945_583338_+|WP_012231091.1|DBSCAN-SWA MEKLIAIQQNTNKHETIPTMSSIEIAELCGKRHGHVMRDIRKLFSELKIDLSNFAGLYKDSTGRTLPCYHLPKRESLIVILGYNTVLRAKIIDYWKKLEEQEANPQIDFSSPEIRAAIMMHLKNKIKQTA >NZ_HG969192|578410:591239|585065_585557_+|WP_012230960.1|DBSCAN-SWA MVKKYELTDETTWIYGNKLTYRIRALRDFGDVKAGDLGGFVEHERNLSHNGNCWVRGLSAVYDDAVVCDNAIIDVASQVSKNAKVFGNAQVTNGAKVSDNARIYDNACVSGTVIYENAQIYGNAKVGGDAHIYGNAKIYGNADLDYDDWIGGNSRISTGEKAW |
18 | Lactobacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
935743 : 1013986
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_HG969192|935743:1013986|DBSCAN-SWA 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60 | Tupanvirus(11.76%) | tail,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1018888 : 1028729
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_HG969192|1018888:1028729|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_HG969192|1018888:1028729|1019517_1019796_-|WP_012231568.1|DBSCAN-SWA MKIDTNFLCDLWMALFKFSNHRGIGDKNCNAIVEVMELIEKVLVLKLQNELPNITKILAMITNFGSSELPHSMDSLLRTYEPNFESPIRKVA >NZ_HG969192|1018888:1028729|1021101_1021680_-|WP_012231073.1|DBSCAN-SWA MKLIIHQKWYLQQVKDTFTSLQAPRLNWALRNALNTAAKQVERFTEKQVTDISSAQIKRIRRGVYIKDKATAQFLETDIIGSGTPIPLKFFKARETKRGVTYTLFKKKEILPHGFIMGGSFPKRVELKMGGNVFQRDDGDQFPIAKQEGPSIAKVMSKPEIASAIAQYANERLTKNIQRQLKRQEYAANKKG >NZ_HG969192|1018888:1028729|1023134_1023671_-|WP_012231576.1|DBSCAN-SWA MAKRKKHAKRGRPRIKGCIREPNGRISRTKMPHDPIEKLAIEMRAKRFGLTIEEAKNPLSGTYIGRLYLKGVINQDQYDVAQKYIEVRNDYLCAKTLPSAIYDKMPSSSDEAARKKWIEFATKQFLNMQEVIKETQNLYKQHNFYAALQYLVSEDQELPYLVPSLRIVLNALQKHCGY >NZ_HG969192|1018888:1028729|1023681_1024128_-|WP_038473476.1|DBSCAN-SWA MLNKVILIGYLGADPESKTMNSGAEIVNFRMATSESYTDKNTHQKVDKTEWHSVVVFNPHLAKIALQYLHKGSKVYIEGKLQTRKWQDKNGHDRYTTEIVLSQYKGELHLLDAKKEQSAHPSPITSQSYAIASGTQDYSASLNDSVPF >NZ_HG969192|1018888:1028729|1024368_1024560_+|WP_038473479.1|DBSCAN-SWA MKREALLRELRKEARKRGLHYSEAPDAGKGSHYLVTFGDKTTVIKSGELTPLYVKIIKKQLGI >NZ_HG969192|1018888:1028729|1026407_1026827_-|WP_012231586.1|DBSCAN-SWA MGNEALQMLDEKASEEEIKAMFLMLSGGLKSQPGEDEKATAVAYLFSLDGLSRWAIKTATRDVMKGKAEGLSTTFMPASADLLLYCEKLEDDIRTTVKGIFTSLDRPEIKPKGEPVSAEKWDKLMQMLEKTEIGLNPFQ >NZ_HG969192|1018888:1028729|1026819_1027923_-|WP_012231587.1|DBSCAN-SWA MSTKLAWTRLNTDQWLFKLSDLPPMEVNVYVKLRIRMLHTREPLLNDAGILSHFTCCSVKRFEKALNYLFRSGHIICLEDGRLWSSDVEEELNNSNENLNKFSERAKKAAQAKWEKHHKAKTMSDAKNAKHDANGMLKDAKHDACGDFSNAQAMLNDAINNNNNIYNKKTKTIVLAKKEIGSENLQTTDLVHKPIEVHDLESHAEQIETVETNHPPLHEQESIPEKAKRVKANRGCRLPDDFEPDYDFAIAEGLPPERIKVEIAKFRDYWRSKAGANATKTDWQATWRNWVRNAKDYKQGENYGTQTNSQTGQQRGRAYRITQHMSDFKNADSPYKFLFEDDAKPSIPLVSGQKAITCRSGENYLVG >NZ_HG969192|1018888:1028729|1025868_1026246_-|WP_012231584.1|DBSCAN-SWA MEILKRRFFKKRKQPIQKMHKKFIATAVGYVPWGDGAAEYFYNLYEYEDGTRECEKFDGGQYYTIPEKADFSTKAQVKAWVYGGAIPKSVLNYEPLIDEINKEIKKLSEASEKTMIRYQLISETT >NZ_HG969192|1018888:1028729|1018888_1019170_+|WP_012231565.1|DBSCAN-SWA MAIVSFKHKGLKLFFETGSHKGIQSAHAKKLANILVILDTISSPEQVTIKSYRLHALTGDLKGYWSMRVSANWRVTFRFIGTDIELVDYQDYH >NZ_HG969192|1018888:1028729|1022477_1022873_-|WP_012231571.1|DBSCAN-SWA MKRFFALVHKDEDSAFGVQFPDFEGLFSASDEEENLIINATEALQLYCEDMDTVPVPLKFEEVIQQKAVKKALSEGAFLIQVPFIENDSEVVRTNISIERGLLRAIDNCAQERGLTRSAFLATAARHELNI >NZ_HG969192|1018888:1028729|1027912_1028260_-|WP_012231588.1|DBSCAN-SWA MSNGMPWIRFHLYDWISGTDGMTLEQRGAYMTLLVRMYDKKAPIKTDFQTLARACNCSQKKFATIVEYLMRNDKLIEIDGGLWNTRVEEELNNFSEELDNFTSNNNEEKEVKYVN >NZ_HG969192|1018888:1028729|1024629_1025058_+|WP_012231580.1|DBSCAN-SWA MEYTYQAKFETDPDGGFVVTFPDVPEAITAGENRVEALENAVEALGLALRSYSMRGLPLPVPQQYKGLVEITVDAWNALKLAVVEAFNEANITKTELAHRLGKKETEARRILDPNYPTKLQTLEQALSVLGKQVVITIKNAA >NZ_HG969192|1018888:1028729|1019792_1020506_-|WP_012231569.1|DBSCAN-SWA MAQYLIDIHQTSIDGDTVQTVDARDLHAFLEIGKDFSTWITDRINKYNLVENQDFVCSPILGSKGRGGHNRKDYHLTLSVAKELSMVENNKKGREARLYFIECERRLKQVATPQVDLANALENPLTIKQLLLESINQLEDLRNEVSTLTPKAEALEGLKRSDRLFGLIDYLRKHDWVYRRAPGAPLLPYQDKIKKGFMNCPAITIQRPDGTEKVLPSTKITSRRLACLREQIHGGVL >NZ_HG969192|1018888:1028729|1019185_1019473_+|WP_007346872.1|DBSCAN-SWA MMYNPPHPGGILREELLDTLGLTVTEAANRLGVARLTLSRVLNCNAAISINLALRLEMAGLNDAEFWLKLQQKHDLWQARHNNPISYIAPLEAAS >NZ_HG969192|1018888:1028729|1021683_1022004_-|WP_012231570.1|DBSCAN-SWA MKVIITKPMCVVGDNKSTVRFETSTPNNPFVEISNQVYARLKRANAAKPFVDVKTKIKPDKTIEQIKQVKKEPNQTSSETVTEEPSFEKPKAPTASKPSISTPQKA >NZ_HG969192|1018888:1028729|1025106_1025655_-|WP_012231582.1|DBSCAN-SWA MNTLIKISEKIIEQEIVQTVNARELHAFMEIGKRFATWITDRINQYTFEEGKDFIKTQDLRFPKLGSAKSRAVTVIEYHLTLDMAKELSMVERNEKGRQARRYFIECEKKLKSQSVDYDRDTRFDFPKDWDKMSPTKKAVYIYGPLHMHLVKAFTLVEESKQYKTLIEEAKQVLEKSVVRAA >NZ_HG969192|1018888:1028729|1022869_1023070_-|WP_012231574.1|DBSCAN-SWA MEQNSRKIIAKLKRDGFELVKVKGSHHKFEKDGKVVIVPHPKKNLPIGTARSIAQQAGWFKKGEEE >NZ_HG969192|1018888:1028729|1028252_1028729_-|WP_012231589.1|DBSCAN-SWA MINNTRTILCLDLGSKTGWAICGADGHIVSGVMNFQPRRFEGGGMRYLRFKRCLSEIKQAVGSIDAVYFEEVRRHVGTDASHVYGGFLATLTAWCEHHQIPYEGIPVCTIKKATTGKGNASKEEMIKVMRAKGHAPEDDNEADALAILYLKKEGGTHV |
18 | Mannheimia_phage(10.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1033038 : 1111325
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_HG969192|1033038:1111325|DBSCAN-SWA 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57 | Edwardsiella_phage(25.0%) | integrase,portal,terminase | attL 1069637:1069670|attR 1126089:1126122 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1242368 : 1363935
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_HG969192|1242368:1363935|DBSCAN-SWA 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116 | Ochrobactrum_phage(77.59%) | tail,plate,tRNA,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1449871 : 1520474
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_HG969192|1449871:1520474|DBSCAN-SWA 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64 | Ochrobactrum_phage(78.95%) | transposase,tail,plate,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1527907 : 1536353
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_HG969192|1527907:1536353|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_HG969192|1527907:1536353|1533437_1536353_+|WP_012231937.1|DBSCAN-SWA MTHQKYISIRGAREHNLKNIDLDLPRDKLIVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLEVMQKPDVDRIDGLSPAISIEQKTTSRNPRSTVGTVTEIHDYMRLLFARIGIPHSPATGRPIESQTVSQMVDQIMSLPEGTRIFIMAPLVRGRKGEYKKELTELLKKGFQRAKVDGKFYEIPDIPALDKKYKHDIDVVVDRIVVQKDITSRLADSIETCLQLANGLAIVEMADQPLAQKETAKESAHKSKNDTHKRLLFSEKFSCPVSGFSIPEIEPRLFSFNNPFGACPLCDGLGIKKAMDPLKIVPNKNLTLKDGAIAPWAKSDSLYYSQTLEALGKAYGFKLTDQWCKLSDEAQQAILYGTKRNEISFIYRNDSRSHKMTQPFEGIIPNMERRWKETDSAWSREEIERYMSSSPCPACHGYRLKPEALAVKIHGMHIGQISDLSILKADDWFANIHQYLTEKQRNIAVRILKEIRERLAFLNHVGLEYLTLSRNSGTLSGGESQRIRLASQIGSGLTGVLYILDEPSIGLHQRDNERLLEMLRHLRDLGNTVIVVEHDEDAILTADHVVDMGPAAGVHGGKVIAQGTPQEIIENQASLTGQYLSGKMAVRMPTERRKISKSKTLKVIGAKGNNLKNISANIPLGTFTCITGVSGGGKSTFLIETLFKAASHQIMGSHHSPARYDKIEGLEFLDKVIDINQSPIGRTPRSNPATYTGAFTPIRDWFAELPESKARGYKAGRFSFNVKGGRCEACQGDGVIKIEMHFLPDVYVTCDVCKGKRYNRETLEIKFKGQSIADILDMTIEKAEEFFHAVPAIHNKMETLIKVGLGYIKVGQQATTLSGGEAQRIKLAKELARKTTGRTLYILDEPTTGLHFHDISKLLEVLHELVEQGNTVIVIEHNLDVIKTADWIIDLGPEGGDRGGEIVAVGRPEDIIKVPASYTGKFLKDVLQRQSLYNSNA >NZ_HG969192|1527907:1536353|1529574_1532358_-|WP_038473713.1|DBSCAN-SWA MTDLTPQPERDVLSGIEPISIIDEMQRSYLDYAMSVIVSRALPDVRDGLKPVHRRILHAMNEMGLVFNKPYRKSAGVVGEVMGKFHPHGDASIYDALVRMAQDFSLRNPLIDGQGNFGSVDGDPPAAMRYTECRLEKVSEELLADIDKDTVDFQDNYDGREREPVVLPARFPNLLVNGSGGIAVGMATNIPPHNLSEVVDGCIALIDNPDITLDQIIEIIPGPDFPTGGIILGRSGVRSAYETGRGSIIMRAKVDIEEIRSGRQAIIVSEIPYQVNKATMIEKMAELVRDKRIEGISDLRDESDRDGYRVVIELKKDVVAEVVLNQLYRYTPLQTSFGCNMVALNGGKPEQMTLLDMLRAFVAFREEVVSRRTKYLLRKARERAHVLVGLALAVANIDEIIALIRKAPDPQTARAQLMERRWPAMDVAPLIKLIDDPRHIIHEDGTYNLSEEQARAILELRLQRLTALGRDEIADELNKIGVDIADYLDILASRVRIMHIVKDELSALREEFATPRRTVFGFGSAEMESEDLIAPEDMVVTVSHSGYIKRVPLNTYRAQRRGGKGRSGMSTKDEDFVTRLFVANTHTPVLFFSSRGIVYKEKVWRLPLGTPQSRGRALINMLPLQQGERITTIMPLPEDEASWSALDIMFATTRGTVRRNKLSDFVQVNRNGKIAMKLDEEDEILSVETCTEHDDVVLTTANGQCIRFPVLDVRVFAGRNSVGVRGINLAKGDKVISMTILEHVEATSFERSAYIKRVMNERRAAGADADVEDIISLDEEDGGGETDLTDERYAELHAREQMLLTVSEFGYGKRSSSYEFRISGRGGKGIRATDPSKTAEIGKLVAAFPVKAQDQIMLVSDGGQLIRVPVEGIRTAGRSTKGVTIFNTAEGERVVSVERISEPEDDTRSLEDEGEKHSDIVNMSEEE >NZ_HG969192|1527907:1536353|1529043_1529550_-|WP_012231934.1|DBSCAN-SWA MKIAFYAGSFDPLTNGHLDVLKGCFVLADKVVVAIGLQANKKTLFSFEERVDFITQVGKDLLGADSNRLQVLSFNNLLIEKAREVGASFLIRGLRDGTDLDYEMQMAGMNGIMAPELQTVFLPASVSGRAITSTLVRQIASMGGDVTPFVPSNIAQALHSKFQSVRGE >NZ_HG969192|1527907:1536353|1532598_1533105_-|WP_012231936.1|DBSCAN-SWA MAGSLNKVILIGNLGSDPEIRRLNSGDQVANLRIATSESWRDRNTNERKERTEWHNIVIFNENLVKVVEQYLKKGSKIYIEGQLQTRKWQDQNGNDRYTTEIVLQKYRGELQMLDGRGGASGEQGVGQGGSYSGGFADSSSNQRNTFGQNNSQVGESFSHKLDDDVPF >NZ_HG969192|1527907:1536353|1528438_1529041_-|WP_012231933.1|DBSCAN-SWA MYRRIFAVLMCVFCFFSLHAVADNSSSASPTSDASLLVLSLKDGDVIIRLRPDLAPKHVAQIKKLTEEGAYNNVVFHRVIPGFMAQTGDVKFGKKGSRDFDLKRVGMGGSNYPNIPAEFSKQPFKRGTVGMARSQDPDSANSQFFICFDDAAFLNGQYTVVGEVIKGMDVVDKIKKGTASNNGSVTNPDVIHAATLQIER >NZ_HG969192|1527907:1536353|1527907_1528420_-|WP_012231932.1|DBSCAN-SWA MAENKNLENTLVLETTKGRVVIELFADLAPCHVARIKELVREGAYDNVIFHRVIDGFMAQTGDVQFGKKDSEEFNLSRAGMGGSEKPNLTAEFSNLSHKRGTVSMARSQNPNSANSQFFICFADAPWLDRQYSIWGQVVEGMENVDKIKRGEPVADPDTITKAVIAADEK |
6 | uncultured_Mediterranean_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1930765 : 1971991
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_HG969192|1930765:1971991|DBSCAN-SWA 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51 | Ochrobactrum_phage(82.05%) | transposase,tail,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2239977 : 2257742
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_HG969192|2239977:2257742|DBSCAN-SWA 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MSTIYDWSLRASENAYCDGLINWSDGQRPSSVNNSARGMMQRVREYLSDTSGVIESTFTVDVGQQTTLIRLQSQSRFLKYKNGISLCFKAKSKNVGATTIALNDLSAKPVYKATELGISPLSGGEFQKGCIYSLVYRADAWHVLNPTPVSLPSEPILPVYPAGTIGIFGMQVLPEGWLLCDGKAYLRSEYSALYKAIWIRWGGSDSVTHFNVPDLRGVFLRGVDDDREIDRFRYLGTFQTDSMRKHEHGGHTVTIFNDENEEESWYGDMTIIWGYTLNDQQRLKLAERLGVRAEDIRVRHSLAFPHTHLHMRDVALTSSGVSETRPINMSVVFAIKT |
18 | Brucella_phage(20.0%) | tail,portal,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2264381 : 2272027
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_HG969192|2264381:2272027|DBSCAN-SWA ATCACTCTAAGATCTCCTTCTCTTTAACCAAATATAAAATTGCTAAAGCATCCGCTTCATTATCATCACAAGGCACATGCCCTTTCGAACGCATTGCCTCTATCATCTCTTCTTTCGACGCATTCCCCTTCCCCGTCGTCGCTTTCTTAATCGTACTTACGGGTATCCCCTCATACGGTATCTCATGATCTTCACACCACGCCGTTAATGCTGCTAATAAACCACCGTAAACATGCGCTGCATCGGTTCCAACATGACGCCTCACCTCTTCAAAATACACCGCGTCAATATCACCTGCTGTATGCTTTATCTCATTAAGCCATTGCTTAAAGCGTAAATAACGCATTCCCCCGCCTTCAAAACGACGGGGTTGCAAACTCATCGTACCACTGAATATATGACCATTTCCCCCTCGTATCGCCCACCCCATCTTCGTACCTAGATCAAAACAAAGAATCGTGTTAATCACCGCACCACTCCATACAAAACGTATTTTATAAGATTGTTTTTTTCTGAAAATGAAGGAAAGAAGGGTGTATAGAATATGGAAATACCACTTGATATACTCAGTAGTATCATCTCTGCTCTCATTGGTAGTACGATCTCGTTTTTGCTGTCATGGTGTGTGAGAAACGCAGACCTAAAAAGAGCAGAGAAAACTCGACGAGAAGATTTATGCAATGTAGAAAAACAGTTTAACCATTTAGAAGACCAAAATAAATCATTGCAAAAGCAAGCTACATTAGCAGAAAAACACGTCAATTTTTTACTAAAAACAAAAGAAGAGCTGGATTTAGGACCATCGCTACTTTTTAAGCCTAATAGCCCCACTCCAGATGAAGATGACCCTAATAATGGCCCCATCAGTATAATAGTACGTATCATAAATCCTACCGAACGAATAATTCAAATGGATAATATCTGGATAGATAAAAAGTGCCCTTTCGAATTTTATAAGATAAAGTGTTGTCCTCCTAGACTTAGTCAAACGATAGAAATTTATCCAACATCATCAAAGCACATTAATCTTATAAATCCTAAAACTAAACCACAAATACTATTTAATGGATACACTGTTGCTCCATTTAACATCGACCCAAGAGAAGAAATTAAATGGGAGATTTTTATCCTGCCCCAAAATTTAGATAAAGCAGCTTCTCCACTCTTCATTTTAGAACACACCTCATCAAATCATCCCCAAAAAACAATGAAGTCTATTTTTTGGACACATTTCGTCGGTTGTTTTTCAGGCTAAGCTCATCCTCTAAATCCCATATTATTTTGTTTTTTTCGTCTATCTCATCTCTCAATTCTTGTGTCAGTTTAAACCAGTAATAAACTTGATAGAGCAGATAAAAATTAGTAGCCATAAAAATAGCTGTAGGTATCATTGCCATCTCTCTCTCCTCACTTACTTTTCTTCTTATTTTTATGAGACTTTTCTTTTACAGATTCACCACGCTGCTTAAGCTCTTGTGTAAGTTTTTCTATTTCTTCACCACGTGATTTAGCTTCTGCTTCAAGGGTATCTATAATTTCGTTTTTTCGTTGTAATTTTTTTCTGTACTCGTCTCTAGTTTCTTTAAGTCTCTTAATTTCCTCTTCATATTTTTCTACATTCTCATCATATCCACTAATGATCTCTCTAATTTCTTCGCGTTCTTTTTTTAAAGCCCTAGCTGCAAATTCTTCATCTTCAATCTTCCTTTTTAAGCGCCTTAACTTGATCTCGATAATACAAAGCAAAACGAAACATCACTCCGCATAAAAGCAATGCTCCAAACACCACACACACAACTATCGCTATCATTTCATTTAAACTCATTTTGATCTCCTTAATGCTGCAAAGTCTCGCCGGTGTGATCAACACCGCGGCTCTTGCAAATTTTCGACAATGGGGAGCGTTGCTCTTGCATTAATGACTGCAAACGCTCGGGATAAAAAAAATCTTCGGGACGCAAATCTATCCCATGATCACGCGCATAGGTTAATAATTTTTGTTGGTGTTTTGCTGGGATAAAATCATGCCATCTAGAAACAGATGACACATCTCTTTGCACTATAACTGCTACAGTTTTTAAGCCACCTAAATATTTTATAATTAATCTCGCAGGCATATGTAATCTCCATAACAGTGCAATAAATAATTGCGTTTTATGCACAAGTCAACAAAATTATGCGTTTTTGTCATTTTTACACATTTGCATAAAAATATATTTTCAAGGATTATACAAACTATGGAACAAGATATTCAGTCCAAACTTAAGCTATGGATTAAAGAGCGTCTTAAAGAACGAGGACACGGCGCACAAACATTATTAGCATTACATTTAGAGCTACACCCGTCAGCAGTGAATCGCATGCTTAATACCTATCAGAATGGGAAAACGCGAGATATAACAATAGATGAACTAGTGAAAATTTCTGAATTTTTTAATGAACCTCCACCCAGTTTTTATAAAGAAGTAGACTTGGATTTTATGAAAATATGTGCATCGCTTGATCCAGTCGACAAAGAAGCGGTGCTTGATTTTCTTGAATTATTAAAAAAATTAAAAACAAAATAAGTAAGAATTAACTGCTCTTTTTCATTAAATAATGAGAAAACAGATTCTATTTTTTTATCTATATCGCTCATAAACATCTCCTAAATTGTGGATAGCGCATAAATTAATTATATATTTTAAGATTTATTTTTGCGTTTTATGCAAAATTTTAGTTGACTTGTGCATAAAATACAATTATCACAGCACCATACCCCGAAAAAAAAATCCTATGTCAAGGCGTTTTTTTCAAAATGTATTTAAATATTTGATAATGGAGGCGTTTATGGAAAAACCAGTGTTTATAAATTCTGATGAAATTCTCTTAGTCATCTGCGAAAATGAAGAACAAAATCTCGCTAAATCTGGCCCGTTCTTAGAAGAAAAGGACATGATCAAATTTATCGACCAAGCCGATAATGCTGTTCAAATCTTCCGTGTGGAACCAACAACTAATCGTTGTGAAGATATTTCTGAAGATCTTGCCGAATGCTATCTTAAAGAACGTGAAGAACAGTGCTTCAATGGAAACATACCTCACGACTTTGTTCTACACAGCTCCGCATACGATTTTTTTTTAGAAGAAATCGAACAGCAGCGATATGAAGATGAAACTTACGGTACTTATGAACAGCAGCACCGTCTAACTCTTTCGGATGTCATTCCAAACTACCCATCCTATACACACTATAGAGGGCGTTTTTAAGAACGCCCCTTCTCTCATCAAGATTGGTAATTAAAAGAGATCATAAAAATGGATAATCCTATCACTATTACAAATAACACCATTAACGAAGAAAGCGTTCAAACAGTCAACGCACGTGAATTGCATGCCTTTTTAGAAGTAGGTAAACATTTCTCTACTTGGATTAAAGACCGCATCAAAAAATATAACTTATTAGAAAATAAGGATTATTTAGTTTTACCCAATTTTGGGGAAAACCTCCAAGGTGGTCGTCCTTCTAAAGATTATGCTCTCACTCTAAACGTAGCCAAAGAACTTTCTATGATTGAGAACAATAAGAAAGGTAGAGAGGCCCGTTTATACTTTATCGAATGTGAGCGGCGTGCAAAGCAGGCAGCAATACCACAACAAATCGACTATTCAAGTCCAAAAGCTATGATGGGCTTTTTGAATTACCTACAAGGACAAATAAATCAACAAGATACTATCATTGAATATTTAAAACCAAAAGCAATGGCTTTGGAAAGCTTGCAACGCTCTGATGGGCTCTTCGGTCTTACTGAAGCTGCTAAAATTCTCGAAATGCAACCAAAACAGTTCATTCAGTTCCTACAGAAAAAAGGATGGGTGTATCGACGCACTTTCGGGGCTCCTTTGTTGCCTTATCAAGATAAAATCCAAAAAGGTCTTATGGATTGTCCTACACACACTGTTCAAACCGAAAATGGAACAGAAAAAGTCATTCCTTCAGCAAAAATTACAACAAAAGGCATGGGGGTGCTGTCTCAAGAAATGAAACGACAAAACATGCATTAAGAGGAGGTTATTATGATAAAAAAGAAATACGAACTGACCGATGAAGTGGATGAAGTTGGCGGACACACGCTTTACCGCATACGTGCATTAAAAGATTTTGGATATGTCAAAAAAGGTGACCTTGGTGGTTTTATACAAAAAGAGAGCAACTTAAGCCATAAGGGAGACTGTTGGATTTTTGGCAATGCACAAGTTTATGATAATGCCAAAGTTTATGGTGATGCGCGGATTTATGGGAATGCACTCGTTTCTGAAAATGCACAAGTTTCCGATTATGCCGAAGTTGGTGGTTCTTCTGTTAGAGATAATGCCAAAATTTATGGCTATGCACGGATTTATGAAAATTCTGTTATAGGGGGGAGTGTACACGTTTACGGAAATGCTAAAATTTATAATCAAGCATATATTCGCTGTCGTGTAGACATTGCTGGAGATTGTAAAATTAGTGGATCCACCGTGATCTTAGATCGTGAGAAGCAATAAACCATGGAAAAAAAAATACGAACTTACTGATGAAACTCTATAGCCTTAAGAGATAGGCTTCTAATAACCAAATAACCATTTTTCAAAACAAGCGTGGTTCACGCCACGGGTGCATCATACGTAAAATAAGGAAACAATAATGACAAATTCTCCTTTAACAACAATGGCAAGCAAATATGGCTTTTCTCATGAGCAATTCCGTAAAACAATTATTAAAACATGTATCAATCATAATTTCTCTGATGAAGAATTCGCTGCTTTTATATCGGTGGCAAATACTTATGGGCTTAACCCATTAACAAAAGAAATCTACGCACTCCCTAAAAGAGGTGGCGGCATTATCCCTGTTGTCTCTATTGATGGCTGGATTAAGATCATTAAATCTAATCCTCAATTTGATGGTATGACCTTTCAAGATCAACTCGATAAAGACGGTAATATCATTGCCATTAAATGCGCTATTCGTCTCAAAGGTATTCAAGACCCTATCGAAGTCACCGAATATTTAAATGAATGCAAACAAAAAAGTGACACTTGGCAAAAATACCCCGCTCGTATGTTACGTCATAAAGCAACTATACAATGCGCTCGCTATGCTTTTGGTTTTTCTGGCATTTATGAAGAAGATGAAGCAGCGCGTATCAATGAAGCAAGCCGGAATACACAAATACAATTTGTTTCTCATACCATGCTCGAACAAATCAAACTGTTAATTAAAGAAACACAAACGAATGAAAATATTCTTCTCTCTTACGCAAATGTCGAAAACATAACAGATCTGTCTTGTGAAAAAGCACAAGAGATTTTAGAGCTATTGGAAAAAAAGCAAAATATTCAAAAAGAAAGAGCTCTACAATCTCACCCGCAACAAGAGCAAATAGACGCGCCTATACAAGATGCCGAATATATTCATATCCAAGATATCGAATATGCACCAACTCAACAACAAACGGCGGTGTGAGATGGAACAAAGAACAGCACAATGGTTTCAAGCACGGTTAGGAAAAGTCACCGCTTCAAACGTTTATAACGTTATTAGTAAAACAGCAAAGGGAACCCCTACAAGTAAGTATGAAGATTACAAAATCAAACTTATGACAGAGCGTTTAACGGGTGAAATAAGCCAATCTTATCCAACGCCGGCTATGCAATGGGGCATTGAACATGAAGAAGATGCTCTAAAAGAATATGCATTCATTTATGATACAGAAATCACTCAATGTGGTTTTATCCAACACCCCACAATCAAAATGGCGGGGGCTAGCCCTGATGGGCTTATTGGTGAAAACGGTTTAATCGAAATCAAATGCCCACAATCAATCAACCATTTACGCTTTTGTATAGATGATGAGATCAAACCAGAATATCATGCGCAAATGCAATTCCAAATGGCTTGTACGGAACGTCAATGGTGTGATTTTATCAGTTATGACCCACGCTTTACCGGAGTTTCATCTCACTTGCGTATGAAAATCAAACGCATCTACCGTGATGACAAACAAATTGAACAGATTAATCAAGCGGTCGAAGCTTTTTTAGCAGAAATAGAACAAGAGATACAAAGAATCTCTACAAAAGCCGCTTGAAACTATGGGGGTGCTTATCCTCACCAATGCCTCCTAGCACCCCCACCCTTTAATTATTATAAATAAGAAGGATTTCTTTAAATGAATGAAGAAAAATTAACAGAATCAATAGAAAAAGTAAGTATATTTGAACGGGCTTTATTATCAATGCGCTTGCAAAGACTCGTCAATATACAAGATCTTTCAATTTATCTTGGAATGTCTATGACGTGCATTAGAGAGCTTGTAAAAGATGGAAATTTCCCTAAACCAATAAAAGAAGGGCGATATTTAAAATGGGATATCGTTGAAATTGACCGCTATATTGAAAGCAAAAAAGCCGAAAGAAACTCTATAGAGATACCACCACTATCGTAAACAATCAACGCCCAGTCACAAAAGATGACCACTGTTCTAAAAGAACACGACGCTGTTCTAAAAAATCAGTCCTCATATAAGCTTTTGTGACTGAATTCCCCACTGAATGAGACAACGTAAATTCCGCAATTTCAAATGATGTTGATGTTGTCTCTGCTATCCAATCACGAAGACTAGATCTGAATCCGTGTGGTCGATATGCAATCCCTCTATCTTTCATAAATTTAGAAAGTGTCATATCCGATATAGGATTTCCAGAGTTTCCAACAAACAAAAATCCATTTTTTTCGATTGTTTTTGCTTTTTCAATAATAGAAATCGCTTCATCTGTAAGTGGTACGCGAAAATCAAAAACCTTTCCAACTATTCCCTTCATATTTTCTTTTGGGATTGTCCATATTGACTGATTAATCTCCTCCAACCGTATATGCCTAATTGGCATTGAACGAACGCCGGTTAGAATTAAAAGCTTTAAGGCTAAATTCGATACAACATTATCATCTAAAGATTGATAAAAAGCTGGAACTTCTTTCCATGGCATTGCTGGAATATTTTGAACATTTTGAATAAATTTTCCCAATAAAGCTTTTGCTTTTGGTACCAATTGCATGTCCACATCTATACCACGCGCTGCGGCATGTTTTATAGCAATATTCAAACGCGATAAAGCCTTGCTTGCTGTTTCGTTTTTGGTTTTCCAAATAGGGGATAAGCATTCTTTTATATCAATCTGCGTCAATTCAGTAATTGCTATATCTCCAAGTTTAGGAAAAACATGCAATGTGAGAGGTGTTAACCACCTTGCTGCGGTTCCTTCATTTTTCAATTCGCTTTTTTTAGCTTCAAAAGCACTTAAAACTATTTCTCTTAAAGAAATACTATCAACCGCTTGTCGTAACTTTTCATTTTTCCTTTTACGAATCGGGTCAATACCTTGTTGCAAAAGATCACGGCAAGCTGTAGCCTTAAGCCTTGCTTCTTTCAAAGATACAACGCTACAAGAGCCTAACCCCATTTCACGACGTTTTTTATTGAAATCGAATCGAAAAACCCAACGCCCTTGATTCTGTGCTGTTTTGATAAGCCATAATCCAGCCCCATCTGCATATTTACCTTTAGGCAAATTTTTTACGGATAAGGTGGATAATCTATCACGCGTTCTTGTTTTCCTAATCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_HG969192|2264381:2272027|2269046_2269868_+|WP_012232388.1|DBSCAN-SWA MTNSPLTTMASKYGFSHEQFRKTIIKTCINHNFSDEEFAAFISVANTYGLNPLTKEIYALPKRGGGIIPVVSIDGWIKIIKSNPQFDGMTFQDQLDKDGNIIAIKCAIRLKGIQDPIEVTEYLNECKQKSDTWQKYPARMLRHKATIQCARYAFGFSGIYEEDEAARINEASRNTQIQFVSHTMLEQIKLLIKETQTNENILLSYANVENITDLSCEKAQEILELLEKKQNIQKERALQSHPQQEQIDAPIQDAEYIHIQDIEYAPTQQQTAV >NZ_HG969192|2264381:2272027|2270854_2272027_-|WP_012232391.1|integrase|DBSCAN-SWA MIRKTRTRDRLSTLSVKNLPKGKYADGAGLWLIKTAQNQGRWVFRFDFNKKRREMGLGSCSVVSLKEARLKATACRDLLQQGIDPIRKRKNEKLRQAVDSISLREIVLSAFEAKKSELKNEGTAARWLTPLTLHVFPKLGDIAITELTQIDIKECLSPIWKTKNETASKALSRLNIAIKHAAARGIDVDMQLVPKAKALLGKFIQNVQNIPAMPWKEVPAFYQSLDDNVVSNLALKLLILTGVRSMPIRHIRLEEINQSIWTIPKENMKGIVGKVFDFRVPLTDEAISIIEKAKTIEKNGFLFVGNSGNPISDMTLSKFMKDRGIAYRPHGFRSSLRDWIAETTSTSFEIAEFTLSHSVGNSVTKAYMRTDFLEQRRVLLEQWSSFVTGR >NZ_HG969192|2264381:2272027|2270574_2270850_+|WP_012232390.1|DBSCAN-SWA MNEEKLTESIEKVSIFERALLSMRLQRLVNIQDLSIYLGMSMTCIRELVKDGNFPKPIKEGRYLKWDIVEIDRYIESKKAERNSIEIPPLS >NZ_HG969192|2264381:2272027|2269869_2270493_+|WP_012232389.1|DBSCAN-SWA MEQRTAQWFQARLGKVTASNVYNVISKTAKGTPTSKYEDYKIKLMTERLTGEISQSYPTPAMQWGIEHEEDALKEYAFIYDTEITQCGFIQHPTIKMAGASPDGLIGENGLIEIKCPQSINHLRFCIDDEIKPEYHAQMQFQMACTERQWCDFISYDPRFTGVSSHLRMKIKRIYRDDKQIEQINQAVEAFLAEIEQEIQRISTKAA >NZ_HG969192|2264381:2272027|2267209_2267629_+|WP_012232385.1|DBSCAN-SWA MEKPVFINSDEILLVICENEEQNLAKSGPFLEEKDMIKFIDQADNAVQIFRVEPTTNRCEDISEDLAECYLKEREEQCFNGNIPHDFVLHSSAYDFFLEEIEQQRYEDETYGTYEQQHRLTLSDVIPNYPSYTHYRGRF >NZ_HG969192|2264381:2272027|2266215_2266497_-|WP_012232383.1|DBSCAN-SWA MPARLIIKYLGGLKTVAVIVQRDVSSVSRWHDFIPAKHQQKLLTYARDHGIDLRPEDFFYPERLQSLMQEQRSPLSKICKSRGVDHTGETLQH >NZ_HG969192|2264381:2272027|2266617_2266947_+|WP_012232384.1|DBSCAN-SWA MEQDIQSKLKLWIKERLKERGHGAQTLLALHLELHPSAVNRMLNTYQNGKTRDITIDELVKISEFFNEPPPSFYKEVDLDFMKICASLDPVDKEAVLDFLELLKKLKTK >NZ_HG969192|2264381:2272027|2268439_2268907_+|WP_122364100.1|DBSCAN-SWA MKKKYELTDEVDEVGGHTLYRIRALKDFGYVKKGDLGGFIQKESNLSHKGDCWIFGNAQVYDNAKVYGDARIYGNALVSENAQVSDYAEVGGSSVRDNAKIYGYARIYENSVIGGSVHVYGNAKIYNQAYIRCRVDIAGDCKISGSTVILDREKQ >NZ_HG969192|2264381:2272027|2264924_2265635_+|WP_012232381.1|DBSCAN-SWA MEIPLDILSSIISALIGSTISFLLSWCVRNADLKRAEKTRREDLCNVEKQFNHLEDQNKSLQKQATLAEKHVNFLLKTKEELDLGPSLLFKPNSPTPDEDDPNNGPISIIVRIINPTERIIQMDNIWIDKKCPFEFYKIKCCPPRLSQTIEIYPTSSKHINLINPKTKPQILFNGYTVAPFNIDPREEIKWEIFILPQNLDKAASPLFILEHTSSNHPQKTMKSIFWTHFVGCFSG >NZ_HG969192|2264381:2272027|2267677_2268424_+|WP_012232386.1|DBSCAN-SWA MDNPITITNNTINEESVQTVNARELHAFLEVGKHFSTWIKDRIKKYNLLENKDYLVLPNFGENLQGGRPSKDYALTLNVAKELSMIENNKKGREARLYFIECERRAKQAAIPQQIDYSSPKAMMGFLNYLQGQINQQDTIIEYLKPKAMALESLQRSDGLFGLTEAAKILEMQPKQFIQFLQKKGWVYRRTFGAPLLPYQDKIQKGLMDCPTHTVQTENGTEKVIPSAKITTKGMGVLSQEMKRQNMH >NZ_HG969192|2264381:2272027|2264381_2264849_-|WP_012232380.1|DBSCAN-SWA MINTILCFDLGTKMGWAIRGGNGHIFSGTMSLQPRRFEGGGMRYLRFKQWLNEIKHTAGDIDAVYFEEVRRHVGTDAAHVYGGLLAALTAWCEDHEIPYEGIPVSTIKKATTGKGNASKEEMIEAMRSKGHVPCDDNEADALAILYLVKEKEILE |
11 | Acidithiobacillus_phage(16.67%) | integrase | attL 2266429:2266444|attR 2272305:2272320 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2462884 : 2557387
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_HG969192|2462884:2557387|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_HG969192|2462884:2557387|2522787_2523771_-|WP_012231791.1|DBSCAN-SWA MRTHPFIEVRVGENLVHEVFYQRLLTATITDHVGNEADTFEAEFDDSGNDLEIPSSNSALHVTFGYQNSIRAFMGRFVVESVVSIGGSDGEILRLCGKSASMRKELKEQASEHFDHKTIAEIVEALAKRHGYQAKVSPQFTKQTLPYVVRTDQSAVDFLTRLADRMRARFLIKDHKFLFLSGDNLPALDIHKHDCSSWEFTLEPRTQYGTIETSYFDRAKGQQCQVKHQTGFTGPVRRLRSCYPSQEEAQAAAASESDRLCRAVGSGSLTLAGRPEIMADQPLLLQGFRKEINGSWKAATVTHRYEKQSGYTTEITFEAPNQGKEQK >NZ_HG969192|2462884:2557387|2515652_2516591_-|WP_012232583.1|DBSCAN-SWA MSHIQFERIALIGIGLIGSSLARVIKKKNLSAQISIATRRQETLERARELELGDFYTTDNAEAVEGADLVIISVPVGASAEVAKNIHDHLKPGAIVSDVGSTKELVITEMAPLLPKTVHFIPGHPIAGTEYSGPDAGFADLFINRWCILTPFAESDATAVARLTAFWEACGARVEKMEPKHHDLVLAIVSHLPHLIAYNIVGTASDLEKVTNSEVIAYSASGFRDFTRLASSDPVMWRDICLHNKEAILEMLGRFSEGLAFLEQAIRLGDGETLFNFFTRTRAVRRNIIAAGQEIDAPDFGRHSVSQRGDVK >NZ_HG969192|2462884:2557387|2547583_2547925_-|WP_012232192.1|DBSCAN-SWA 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MSVSTHIEIKETGLEAALSFLQKGADSSMGTLAQGIGRLIQESTRRRIQSEKNSPQGEKWKNNHARTSILFASGALSRSIDMKASPEQVMVGSGLVYARIHQLGGVIRPKNGKTLRFFLKSSKAQRFVCVHQVTMPARPYLGLSEQNKVEIVKAAEDWLERVFS >NZ_HG969192|2462884:2557387|2550530_2550812_-|WP_171815229.1|DBSCAN-SWA MMERNPYMVRDCLIALRSGFLKYEMNGIFLHAQDVRELTEYLRRLAGYNHILGHELLRCRWQLKAGCVPHRGEVVPFRRFQETQEEIKNESTN >NZ_HG969192|2462884:2557387|2550808_2551078_-|WP_012231825.1|DBSCAN-SWA MISLCDKELSDTLVGLYDDYQCGFDIGEKLKLCVDLALLLELELSVHRLGEADAVLEGQVAEVLAECDSSDRDEDKSNRVIYMDFGGSK |
89 | Ochrobactrum_phage(67.5%) | tail,protease,plate,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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