Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP008713 | Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL chromosome, complete genome | 2 crisprs | csa3,cas3,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,cas2,DEDDh | 0 | 5 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP008713_1 | 116571-116865 | Orphan |
I-C
Consensus repeat of NZ_CP008713_1
|
4 spacers
spacers of NZ_CP008713_1
>1.1|116603|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTTGTGAATTATTTGATATAAGTCGCACCTC >1.2|116669|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTCTATTTCCAATGTTAGGCATAAAAAAATT >1.3|116734|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAATTAAATCTGATGTTGGTTTTCTGGTCCCG >1.4|116800|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGATAGACTAAAAGAATTACGTCTTTCAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP008713_1
The CRISPR arrays of NZ_CP008713_1 >merge|NZ_CP008713|1|116571-116865|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTTATTTGTGAATTATTTGATATAAGTCGCACCTCGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATGATTCTATTTCCAATGTTAGGCATAAAAAAATTGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATAATAATTAAATCTGATGTTGGTTTTCTGGTCCCGGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATAAAGATAGACTAAAAGAATTACGTCTTTCAAACAGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAGG >NZ_CP008713|1|1|116571-116865|PILER-CR GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TTATTTGTGAATTATTTGATATAAGTCGCACCTC GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT GATTCTATTTCCAATGTTAGGCATAAAAAAATT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AATAATTAAATCTGATGTTGGTTTTCTGGTCCCG GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AAAGATAGACTAAAAGAATTACGTCTTTCAAACA GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAGG >NZ_CP008713|1|1|116571-116865|CRISPRCasFinder GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TTATTTGTGAATTATTTGATATAAGTCGCACCTC GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT GATTCTATTTCCAATGTTAGGCATAAAAAAATT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AATAATTAAATCTGATGTTGGTTTTCTGGTCCCG GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AAAGATAGACTAAAAGAATTACGTCTTTCAAACA GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAGG >NZ_CP008713|1|1|116571-116865|CRT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TTATTTGTGAATTATTTGATATAAGTCGCACCTC GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT GATTCTATTTCCAATGTTAGGCATAAAAAAATT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AATAATTAAATCTGATGTTGGTTTTCTGGTCCCG GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AAAGATAGACTAAAAGAATTACGTCTTTCAAACA GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAGG
>NZ_CP008713.1|WP_005807572.1|115440_116175_+|DUF3644-domain-containing-protein MEEKEKLLKKSKEIFSLVSCMYCYYSGPYKIETVCILLCNAWELMLKAYIIGKKGKEGIVYKNKQNKGRTIGLNECISKVFTNKHDILRKHLESVIRYRNSVVHYTVDSFDLSLYSKIEYCIVNFKAKMCELHNVNMSDMIVNQANEEILKNDVDLYKYSKKSLCREINNVLKSLGIEFKIDSQTFELFDRVYGIKENKEYCLISNVNNRPSYRYSSRVLNFIVGLIQKNPNNIKEVLKNKIKK >NZ_CP008713.1|WP_042293988.1|114848_115100_-|peptidase-S24 MSPTMDAGDVVIVRKQQDVNSGDIAIVCVNGDEATCKKIIKHKDGISLVSLNLKYEPMYYDKNDIADKPIHIIGKVIELRRRF >NZ_CP008713.1|WP_042293986.1|113738_114674_+|hypothetical-protein MKQTVSELMKEGIRITRWEDTTGNTLDEIIEKLSSIPENNNDNACTRYLDWEVDKIFESNINIELSGQKIEYNAFKFSFTYVPVGYQKDDDVSSIKTGFIIVYKSKGKIRYIIDKNSDALSMLRKKLSYTGRSEVRRDTYPFKKYHFIWLIGKIYIGNNILEGSEGLNDLSICTIRGFKGDTENSLATIKAEGEDVIKSLSTSCFLIESDKLDQISMEMEYKHYKNISVKLMNKTINLLTNRCLGVSSDKDIFELILTLYIEIVPIIIQNYDNEVSSGQWNEEKYTEFLKRVAEDVNTGIKSKLKISTGEE >NZ_CP008713.1|WP_144238980.1|113242_113779_+|hypothetical-protein MLLTDFFNIAEYIRFIPSVRAYEFGLTIYIAIFEMIYQGILIIWDKYKLHISFIFYISEMDKSDVVPCARGCEGVFMINYFIKLHGNLNRLNKCKMYLDTNPILGSQTRSDYYCEGNTVVWDLDKIRNSCSAKMLKSGKLSLIKERDEYISLELRPKINKKWGIIFETNGFRIDEGRD >NZ_CP008713.1|WP_042293983.1|112700_113192_+|hypothetical-protein MKSKYGKLFKNLSDNTINCFEYGSVQEYYPFIQRIKQQGFNQCIITSDVMISIIEHFILRYNAEIISINFMVEDSELQIEINNILGLMRKSEAYWSVLKQRLLFLSENDCVEMKEVEFKICSGELNTLLSVKVNGVIVVGEFEFYEVSNIISTIIEDYLDCKY >NZ_CP008713.1|WP_042293981.1|111347_112538_-|site-specific-integrase MTGSLRKRGDKWYYSFEAARVDGKRKRIERVGGRTKKEAEAALRKALEDYENGEQFQKTNISVSDYMDLWFDAYVLLNCRYNTQRSYRLIIDKHIKPSLGILKLTSLTPGKLQDFINNKYLTGISKNHLNNIISLLSGSLNYSVHPMNFLKNNPMQYVKIPKYNNTKTTDKHKIITNDDFNAIIKRFPERSSFYIPLMIGYHTGCRIGEAMGLTWDDIDLDNNTININKLIYKKDTSWYFGEPKTTSSSRIINIGNTLKNALKYHKRYIDIKRLEYGEHYIKQYNINDKITTSSLNLKAPLLNMVCVKSNGMLLTPDSFKYASRVINYELGIPFNFHSLRHTHATLLVENGANIKDVQHRLGHNNIQTTLNTYTHNTDKLAKQSVDIFENIILPTY >NZ_CP008713.1|WP_042293979.1|109909_111295_+|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MVDVANKYIVKIEDYDSQGNGVSRIDDLVVFVPNTIVGEIVEICIEKVNKNFLRGRVNEVLSVSESRVLPICEIYEKCGGCNIQHMNYKEQIRFKESKIINTLNKIGDIRNIKMEKFYAMSIPYEYRNKVQVPFGLSDSGVKAGFYEKNTHNIINMDFCHIQFHEGNDIVKETREYIKKNNIKPYDESANYKKGCDYGLVRHLLIRKGYNTNEIMLVIVLTRDDEEFLNGYMDFILEKFKNIKTIIVNVNNEITNVILGKYERVLYGDGYIKDKINDFIFRIHSKSFFQVNTKQSEKLYSAAIEMCDLKFGDTLLDAYCGIGTIGICASRKIKQVYGIEEVKESIVDANENKIINNIKNIEFIHGKVEDEIFNLVNSGVNINAVILDPPRKGVKERVLHKIRDINCRKIVYISCDVSTLSRDAKILNSLGYKIDKIRGVDMFCQTYHVETIVRFTLRPSGF >NZ_CP008713.1|WP_005807584.1|108306_109728_+|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASDKYDILRELIEKGMNVMRLNFSHGDFEEHGNRIKLVRQISEELNKNVGIMLDTKGPEIRTKKFEGKVLLNQGDKFVIYTKEDIVGDSTRCSVTYEDLYKDVEVGGKILIDDGLVALEIEDVEDGKISCIVLNSGEISSNKGVNLPKSKIKLPALTEKDKNDLLFGIKNDVEYVAASFIRKSDDVIQIRKFLDLNGGDFIKIISKIENQEGLDNIDEIIDSSDGIMVARGDLGVEIPIENLPHWQKLIIKKCNDRGKFVITATQMLDSMIRNPRPTRAEASDVANAIHDGSDAVMLSGETANGKYPLEAYEIMDKIIVTTEQSLDYEGKLQKKLSKIEYKDVPNTIALFSCTTANEVGAKAILACTKSGATAKFVSRFRPECPIISITQMKKVARMLSIYWGVYTQTISETIDNTDMLIDLSVDKAKKEYNFKDGDLVVVSASVPANFKGHTNMLKVHEI >NZ_CP008713.1|WP_005807586.1|107319_108279_+|6-phosphofructokinase MKKIAILTSGGDAPGMNAAVRSVVRYALSKDIEVLGIHRGYHGLLHGEIESLSRRSVSDIIDRGGTFLKTARCLEFKQEEVRAQAYEILKSHNVDGLVVVGGDGSFTGAHLLSKFGLSTVGIPGTIDNDLPYTDYTIGFDTALNTILDAVRKLRDTSSSHERVSIVEVMGRNCGDLALYSALAGGAEAVIVPEYPFNREGLCKTILESKKNKKLHSLIILAEGAGNAEDLRKYIQQKIGLDTRATVLGHIQRGGIPTGRDRVLASVMGRKAVDTLLSNEVCAKVIGVKENTVFDMDIEEALKIEKKFNKDLYDLVNKLV >NZ_CP008713.1|WP_042293977.1|103751_107291_+|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MNDFVHLHVHSEFSLLDSSCKIRNLVERAKELGMTSLAITDHGVMYGCLEFYKACKMYGIKPIIGCEIYVANKSMDIKNADKDNFTSHLVLLVKDEIGYRNLLKIVSDSFIRGFYYKPRVDIEYLKEHSEGLIALSACLSGGISKYILRNDIDGAKNLSIIYKEIFKEDFYLEIQDHGIEDQKKVNNLLLEFSSELDIKLVVTNDVHYIKKDDANAHDVLICIQTGSNVDEERRMKYHGDQFYLKSKDEMYEAFPNYMDGLLNTIEIRDKCNFEYKFHENMPPKYIMDNSLEPFEYLKRLCYLGLINKYDEFSHEIEIFKIEDILDDSKFEILKEEIGKNITDTKKKLVDRVKYELNLINSMGFVDYFLIVWDFIKFCMEKSIPTGPGRGSVAGSIVAYVLNITKVDPIKYSLIFERFLNPERISMPDIDSDFCNERREEVISYVRDKYGDQNVSNIITFGTMAAKACIRDVGRAMNYPYGEVDKIAKMVPNMLNITIDLALLYNKELNDLYNNDLRVKKLIDISKRLEGLPRHTSIHAAGVIISPYNLTDLIPVKKDGDMLVTQFPMANLEELGLLKMDFLGLRTLTVINDCIKIIEKNKGIKIDLDNIDFDDQNVFNMIGDGKTCGVFQLESFGMTSFMKELKPNSIEDIIAGISLYRPGPMDEIPNYIKNKNNIGDIKYLTKELEDILNVTYGVIVYQEQVMEIVQKLSGYSLGRSDLVRRAMAKKKHEEMEKERKKFVYGYKDGEEIIKGCVNNGIDEKISHKIFDQMVDFASYAFNKSHAAAYAIIAYETAYLMRYYKSEYICALLNSVINNMDKVCYYIRFGESMNIKIFPPCVNNSHNKFIVEGEYIYFGLSAIKNLGEGACEKIVYYREKYGKFKNEYDFFKACVKCSINKKGIESIIKSGALDVFNISRSYLLMNFEKIVDGISKEFRENLEGQMNLFGLIGREDDKTFKLNNRDDLYDDSDKNLLFEKEVLGIYISGHPIHKYKEILDKVCTNSISDFYDDDMKINDGYEVVIGGSVREFKKIITKNNSMMCFLYVEDKYSSIECVVFPKVYEKFNYLINDNSIVIIKGVFKKNDDVFKIIVNEIIGIEEYDRFKLYILCKSLKEITNSFNKAKDILISNRGHVNVNLYSLEGKKVFRVNDYGVNLSNSLICELNKVFSQEFVKVIITK >NZ_CP008713.1|WP_081832567.1|116912_117626_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MDTNIIEKKKLGDKIKRIRLMRGLSQDELAKRCGYKARSTINKIETGINDVPRSKIRLIAQALDINESVLLNDQDHIEFINAQQPIQVISSAKLISYKNGLGLNVQACVKIPILGTVIAGIPISAIEEIIGWEEISPKLASQGEYFALVIKGDSMSPTMDAGDVVIVRKQQDVNSGDIAIVCVNGDEATCKKIIKHKDGISLVSLNSKYEPMYYDKNDIADKPIHIIGKVVELRRRF >NZ_CP008713.1|WP_042293990.1|117765_117969_+|DUF739-family-protein MDNIRLVDCIHKSGLKHKYIAGQLSLSKQGWSNKINNRTEFKLSEIKRLCALLNLDSKQRDHIFFED >NZ_CP008713.1|WP_005807562.1|118087_118303_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MILQKRLREMRNTLHLTQSKVAKDVDINERTYQRYENGDIEPKASNLFKLAKYFNVSTDYLLGLSDDPTRR >NZ_CP008713.1|WP_042293992.1|118421_118622_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MINKLKKLRLNAGLTQNYISHKVGLHPRNYQKIEQGKHLPRVDRALAIAKALNTTVEELFSNDKLR >NZ_CP008713.1|WP_005807558.1|118666_118885_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MANDILYTVPEVSKLIKTNPSYVYTLIRLGLLPALKLGSLKVRRTSLLDFLERFEGKDLTDLEHIRDLETGV >NZ_CP008713.1|WP_005807556.1|118889_119069_+|hypothetical-protein MIRKQIESLIGQVDDRTYAEALKMTEADIKANRLSFNLKTQIEDFILILINSIKIIRRK >NZ_CP008713.1|WP_042293996.1|119155_119422_+|hypothetical-protein MDPLTDELVIAYSVQPNDTEVKIVKLKLEEWDKDELKDILAGDFVTFETLEVVTPEELSDVASDWISFNDDLTDDEFIDSCVKNITKQ >NZ_CP008713.1|WP_042293999.1|119438_119738_+|hypothetical-protein MILTFKLDSNDTNGIKKLIALCENLLSFEETATPELEFVREEPKTDIKIDDLRNALIKLAKDKGKETAKDLLNEFNVEKLTDVNTSDYDRLLQRIREVQ >NZ_CP008713.1|WP_042294001.1|119737_120874_+|DUF2800-domain-containing-protein MLHAKLSASGAKKWINCPLSVVLESKMLNEETPYAKEGTLAHELSELKLRRELNLIGKESYDTEVSKLDYDDEMDKYTDYYCDVVMEIVNKYDRNYSTVRLEEKVDFSPWVPEGFGTSDVIIISDNTAEVVDLKYGKGVKVSADNNPQLMLYALGVLNDYNYICDIKEVNLTIVQPRLDSISSFKINVYDLLEWGEDIRVKALKAFNGDGDCVVGKHCDEGFCRARPICKAYADERLKIAKYDFRDPAELSSDDIADILGTVDELVRWSKTIKEYALTKALSGEEYKGFKLVEGRSNRAFNIDDSEVIEILKGGGFKESEVCETTLKSLSSLEKMIGKKNFKTMLGSHVIKPMGKPTLVPIDDVRPVYNSAVNDFNNI >NZ_CP008713.1|WP_042294002.1|120889_121450_+|DUF2815-family-protein MENLNTKVITGKVRFSYANVWEPKSINGSNPKYSISLLIPKSDTQTLNNIKQAIENAKKIGLSVFNGKVPANLKTPLRDGDIEKPDDEIYAGCYFVNANSVNKPGMLDKYKNPITNPEDFYSGCYGYASINFYAFNTNGNKGIACGLNNLMKIEDGEPLGGRVSAEIDFEGIDVATLNAEMDEIFG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP008713_2 | 738019-739498 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NZ_CP008713_2
|
22 spacers
spacers of NZ_CP008713_2
>2.1|738051|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCGTTCTCCATAAATGCATAACAACCAACAC >2.2|738116|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGAGAGCCTGATAATGAAGGTTTGACTTATTG >2.3|738182|35|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTCTTTGCCTAATTTCTGCATACTCCGAAACTG >2.4|738249|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAAAAATCACAAATATGACTGGTTCTTTTAA >2.5|738314|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTGCTATACGGAAACAAAGCATAAAAGTATA >2.6|738379|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAATATCACTCATATTAATACGACTATATCTG >2.7|738445|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTCTCTGTGTAAGTCCCACCTTCTGGTAATA >2.8|738510|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCGATAATATATAAGGTTTTCATCTTAGCGTTA >2.9|738576|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCTCATATAATGCATATAATACTATATTTAT >2.10|738641|35|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATGCTTTTGGGTCTATATTGTTACTCTTAAAAG >2.11|738708|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCGGCTCTATCTATATAATCTTTTTTGAGCCAG >2.12|738774|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAAACAAAATCACTATTTTATGTGGATGTGG >2.13|738839|35|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATTTCCCGTACAGTAAATCCTTTACCGTACAA >2.14|738906|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTCGGAACATCACCATTATTAATCACATCAAT >2.15|738972|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAATACACGTATTATTTAGATTACAATCGTTT >2.16|739038|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCATTGACCTATTTCCTCCTTAATAAAACAAG >2.17|739104|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGATAAATTATATTGTTTTCCATTACATCTTTT >2.18|739170|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTGTATGCATTAGGTGTCCTTTTATTATCAAT >2.19|739235|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTGAATTATTTTCGAGGTGTTAATGGATAGAA >2.20|739301|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGGCTCACCATTAAATTTTAATTACTTTATG >2.21|739366|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTAAAGTAGCATATTCTAAGGGAAATAAAAT >2.22|739431|36|NZ_CP008713|CRISPRCasFinder,CRT CTAACCATTCAACAGGTGTATCAAGATAAGTATTAT |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP008713_2
The CRISPR arrays of NZ_CP008713_2 >merge|NZ_CP008713|2|738019-739498|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATATTCGTTCTCCATAAATGCATAACAACCAACACGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATAAAGAGAGCCTGATAATGAAGGTTTGACTTATTGGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTCTTCTTTGCCTAATTTCTGCATACTCCGAAACTGGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATGCAAAAAATCACAAATATGACTGGTTCTTTTAAGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTTTTGCTATACGGAAACAAAGCATAAAAGTATAGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTAAAATATCACTCATATTAATACGACTATATCTGGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATCTGTCTCTGTGTAAGTCCCACCTTCTGGTAATAGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATATCGATAATATATAAGGTTTTCATCTTAGCGTTAGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTATCTCATATAATGCATATAATACTATATTTATGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTAATGCTTTTGGGTCTATATTGTTACTCTTAAAAGGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATATCGGCTCTATCTATATAATCTTTTTTGAGCCAGGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATATCAAACAAAATCACTATTTTATGTGGATGTGGGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTCAATTTCCCGTACAGTAAATCCTTTACCGTACAAGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATCAGTCGGAACATCACCATTATTAATCACATCAATGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTACAATACACGTATTATTTAGATTACAATCGTTTGTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAATAATCATTGACCTATTTCCTCCTTAATAAAACAAGGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATCAGATAAATTATATTGTTTTCCATTACATCTTTTGTCGCACTTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATCCTGTATGCATTAGGTGTCCTTTTATTATCAATGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATATCTGAATTATTTTCGAGGTGTTAATGGATAGAAGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTCAGGCTCACCATTAAATTTTAATTACTTTATGGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATTGGTAAAGTAGCATATTCTAAGGGAAATAAAATGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAATCTAACCATTCAACAGGTGTATCAAGATAAGTATTATGTCGCATCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAGAA >NZ_CP008713|2|2|738019-739430|PILER-CR GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATTCGTTCTCCATAAATGCATAACAACCAACAC GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AAAGAGAGCCTGATAATGAAGGTTTGACTTATTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TCTTCTTTGCCTAATTTCTGCATACTCCGAAACTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT GCAAAAAATCACAAATATGACTGGTTCTTTTAA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGCTATACGGAAACAAAGCATAAAAGTATA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TAAAATATCACTCATATTAATACGACTATATCTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CTGTCTCTGTGTAAGTCCCACCTTCTGGTAATA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATCGATAATATATAAGGTTTTCATCTTAGCGTTA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TATCTCATATAATGCATATAATACTATATTTAT GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TAATGCTTTTGGGTCTATATTGTTACTCTTAAAAG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATCGGCTCTATCTATATAATCTTTTTTGAGCCAG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATCAAACAAAATCACTATTTTATGTGGATGTGG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TCAATTTCCCGTACAGTAAATCCTTTACCGTACAA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CAGTCGGAACATCACCATTATTAATCACATCAAT GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TACAATACACGTATTATTTAGATTACAATCGTTT GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AATCATTGACCTATTTCCTCCTTAATAAAACAAG GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CAGATAAATTATATTGTTTTCCATTACATCTTTT GTCGCACTTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CCTGTATGCATTAGGTGTCCTTTTATTATCAAT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATCTGAATTATTTTCGAGGTGTTAATGGATAGAA GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TCAGGCTCACCATTAAATTTTAATTACTTTATG GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TGGTAAAGTAGCATATTCTAAGGGAAATAAAAT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT >NZ_CP008713|2|2|738019-739498|CRISPRCasFinder GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATTCGTTCTCCATAAATGCATAACAACCAACAC GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AAAGAGAGCCTGATAATGAAGGTTTGACTTATTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TCTTCTTTGCCTAATTTCTGCATACTCCGAAACTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT GCAAAAAATCACAAATATGACTGGTTCTTTTAA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGCTATACGGAAACAAAGCATAAAAGTATA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TAAAATATCACTCATATTAATACGACTATATCTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT 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GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CTAACCATTCAACAGGTGTATCAAGATAAGTATTAT GTCGCATCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAGAA >NZ_CP008713|2|2|738019-739498|CRT GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATTCGTTCTCCATAAATGCATAACAACCAACAC GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AAAGAGAGCCTGATAATGAAGGTTTGACTTATTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TCTTCTTTGCCTAATTTCTGCATACTCCGAAACTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT GCAAAAAATCACAAATATGACTGGTTCTTTTAA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGCTATACGGAAACAAAGCATAAAAGTATA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TAAAATATCACTCATATTAATACGACTATATCTG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CTGTCTCTGTGTAAGTCCCACCTTCTGGTAATA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATCGATAATATATAAGGTTTTCATCTTAGCGTTA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TATCTCATATAATGCATATAATACTATATTTAT GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TAATGCTTTTGGGTCTATATTGTTACTCTTAAAAG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATCGGCTCTATCTATATAATCTTTTTTGAGCCAG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATCAAACAAAATCACTATTTTATGTGGATGTGG GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TCAATTTCCCGTACAGTAAATCCTTTACCGTACAA GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CAGTCGGAACATCACCATTATTAATCACATCAAT GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TACAATACACGTATTATTTAGATTACAATCGTTT GTCGCACCTTACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT AATCATTGACCTATTTCCTCCTTAATAAAACAAG GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CAGATAAATTATATTGTTTTCCATTACATCTTTT GTCGCACTTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CCTGTATGCATTAGGTGTCCTTTTATTATCAAT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT ATCTGAATTATTTTCGAGGTGTTAATGGATAGAA GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TCAGGCTCACCATTAAATTTTAATTACTTTATG GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT TGGTAAAGTAGCATATTCTAAGGGAAATAAAAT GTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAAT CTAACCATTCAACAGGTGTATCAAGATAAGTATTAT GTCGCATCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAGAA
>NZ_CP008713.1|WP_005806392.1|737557_737848_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLILVTYDVGLNFDDGAKRLRKVSKICENYGIRVQNSVFECVVDNLQFEMLKSDIDKVIDKERDSVRYYNLGNSGRKKVIHIGNKHSIDVEDVIII >NZ_CP008713.1|WP_042294564.1|736516_737545_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLLNVLYVTNEDAYLSKDGEDISIRISDQKPIKIPSHNLEGIVCFGYQGASTKLMAMCAEKNIGMSFHTPFGKFLCRVQGRVSGNILLRKKQYKISDDENKSCLIAKNFIIGKLVNYKNVLNRFKRDYRDKFDENMRRSIEYLSDTIKSVSKSEDLNSLRGLEGIGSKYYFDVFDNLILVDNKSFRFDSRNKRPPLDRVNALLSFVYVILSHDIESSLESVGLDPQAGFLHRDRPGRSGLALDMMEELRSYLCDRFVLKLINTRVIKENDFIVKENGSVFILEDARKNILTAWQKRKKDFIIHPFLNEKIEVGLIPYVQSLLLARYLRGDLEEYPPYLMK >NZ_CP008713.1|WP_041568929.1|735874_736516_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MISGIQHFIFCPRQWALIHIEQIWEDNVRTFNGHKFHKKVDDPYIFEKRGEIIISRSLPLISHKLSVKGISDCVEFHMRNDNLGAKLVGRNGSYDVIPIEYKVGDIKKDDSDISQLCIQAICLEEMFDTTIEKGYLYYGKLRRRVEVNFTNELRENIKELVEKMRYYFDNGVTPKARYKKQCINCSLYDICLPKLNCSYSKVKNYIDSYVEDI >NZ_CP008713.1|WP_005806398.1|734997_735861_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MLLSKRYEFVILFDVENGNPNGDPDSGNMPRIDPETGHGIVTDVCIKRKIRNYIEVVEGERQGFDIYVKNGAVLNEQHRKAYEAFELKPENKKLPKDEKLAKELTGYMCKNFYDIRSFGAVMSNEVNCGQVRGPIQLNFGRSIDPIFSQDLTITRCAVTNMKDLEKGQTMGRKQIVPYALYRMEGYVSAHLAQKVTGFNEEDLNILWQAIINMFEYDRSASHGKMATRKLYVFEHETALGNAPSHKLFDLIEVERKDKSKPSRHFNDYEISIDRDSLPKGVDLIEKL >NZ_CP008713.1|WP_042294562.1|733159_734995_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MILKELVDCYDLMVNSDKFEVSDSNFSNEKVSFKITIDEDGLITKIIDLREGSGAKKKTILVNVPYQSGRTSGIKPYFLCDNAKYFFGYEIDSKSLELKRCDQHIEASKNLHMEILENSYSKYKLILERFFDNHDKNLEIIKEKDPEVLKGGSIILRLKDDMKCIHEQGEVKKAFALYRQNKFENVEEVRGTCLINGDSNAPIAKIHKTIKGVSGSSISGAMIVSFNASSFESYGKSQGYNASISTENEFKYTTALNKLLSTDDNNMYLSGNTIVFWSSKLGAEEEQIIPAFMKDDDEVEDDNGETGGAKYNQEGVDKIESIIKLIKQGKTVNVDRINLDDSVNMYVLGLYGSRSRIFVRFWFKNSLEDFIKLTNKHFEDTKLKKKRKFSKKDFIYEEVGVKLSSILKTITPYGKSQNTPKTLINSLFKSILTGGVYPISIYNKILERIRAESGEDFAINHTRISFIKGYLKRYYRLNNLKDKEEEVTVSLNKESTNIAYNLGRIFAILEKIQMDSSNGATNIREKYLSSASSTPKSIFPNLLNLAQYHIAKINKENNTKFNYYDKVIGEILLNVNEFPAVFSSDEQGMFILGYYHQREDIYTSKKDKEEN >NZ_CP008713.1|WP_005806402.1|732482_733163_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MGFTLRVWGDYACFTRPEMKVERVSYDVITPSAARAIFEAIHWKPAIRWVIDEINVIKPIKFQTIMRNEVESVMSTQSIKKSINNKEEQFYIDSNKVRQQRNSMVLKDVEYIIKAHFEMTKHAGGSDDEKKHYNIFLRRARNGECFSQPYFGCREFSCNFELLENEDLPLNIQETRDLGWMLYDIDFVKKGDSYKGVKEYNPKFFRAEMIKGKVTIPKNLQMEVNK >NZ_CP008713.1|WP_042294560.1|730233_732465_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKYTEKLARRIEKEDGKIEYQKLIDHICGVSEFSEEFVSKFFLKNSGKILSILHDLGKYSDEFQDRIRGANIRVDHSTAGAIICDDLEKEFKGRGEYVIYKIFKYIIIGHHSGLLNYGTEMDDEGTISSRLNKRDILCDFSDWENEISIDDIKQINFSEEVLGFFKNNFSVQMLIRFLFSSLVDSDRLDAQRFIEGENSIVNSKKLMSLEEMLNVFNDFMKSKRLQESDNPINLIRNEIFNDCINKSRGDRGFYSLCVPTGGGKTLSSLGFALNHAKQNGHDRIIYSLPFTSIIEQNARVYSEIFGEENVLEHHCNFSFSNEIGEDEYSENQLKYKLAIENWDMQLIVTTNVQLFESMYSNKPSSARKLHNIYNSIIILDEAQVIPNEYLKPCIKALEELVRNYSCTVLFCTATQPEFKKNGLIENFDVVEIIDDTYKLFDDLKRVSGKFIGKKSVEDICNEMNSHKQVLTIVNTKKHAKEIFENLGDSEGNFHLSTNMYPNHRKEVIKIIRERLKNGEECRVVSTQLIEAGVDVDFPVVFRSIAGIDSIVQAAGRCNREGKQKNSTVYVFKPEEESHLGLGYLKLTSQIGEGIIDDFEDFLSIDAISKYFFELFIDTDHRQDKHKILKMINKHKKLEINYDFREINDEFRFIENLGAQVIVPINEGEKFLNILKYSNRGVKSVLRKLSGCSINIPNYILRELLRDGCVEQFSDDIFILKNIGMYDLKIGFDKDNLKNYEYII >NZ_CP008713.1|WP_042294559.1|729161_730091_-|ribokinase MNKVCILGSLNMDLVLKVNDIPKIGETILSNSSEKIAGGKGANQAIAAKRCGADVSMIAKIGKDENGRILKGKLKEDGIDVSCIFEDEQNPTGLALIMVNKNGNNSIIVVPGSNMKINDSEINKSISKIKESDILIAQFETNEEMTLKSFQKAKEFNKITILNPAPAKKIDIELLKLTDIIIPNETEAEVLTGIKITSIDDAKRAGKFFINQGVKFAIITLGENGALIIGNDFYELVKSFKVNAVDTTAAGDSFIGALSSKLNFKNLTRETLKESVYFGNKVSSITVQRKGAQPSIPYLEEVKKIYKEN >NZ_CP008713.1|WP_005806407.1|728760_729156_-|D-ribose-pyranase MKKTCLLNNSISSVISKMGHTDMIAIGDCGLPIPKETKRIDLALTKGIPSFLDTLKTTLTELEIEEIIIAKETEETSPKIFNEIKNLIGNAKITFVSHEIFKTNLKECKAVIRTGEQTPYANIILKSGVVF >NZ_CP008713.1|WP_005806409.1|727235_728741_-|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MNTRIPMLKMEGVSKIFPGVKALDNINITAYKGEVTALMGENGAGKSTLMKILSGVYQKDEGKIFIEGEEAHIKNIKSAEEYGVTIIHQEMSLINNLTIAENIFLGNEKFNKFTKKINKKLLVERSILFLDQIGCNLDPNKLVSSINVGEKQMVEIAKALTKNARIIIMDEPTTALTKIETQNLFKVIENLKKKGIAIIYISHRMEEIFAICDRVEVLRDGKYAGNALIKEIDNNKLIAMMVGRTIEEQFPYKKIEKGKVLLEVSNLTSKVGINNISFTVREGEIVGIAGLMGAGRTELAKTIFGYYKKEKGTIKLKGKRINIKNIQQAINNGICYLSEDRKKEGCILGLSVEDNMILSNLCKYENGFKIINKNKTKKDIDFYIKKLNIKTPNKDQLIKNLSGGNQQKVILAKWLLLSPDILIIDEPTRGIDVGAKKEIYELLNELKESGKAIIMISSDLPEVLGISDRILVMSEGKITGELNREEATQEKIMKLSVGINQ >NZ_CP008713.1|WP_042294565.1|739569_739938_+|DUF2442-domain-containing-protein MDKKIKYYLDRGMDYDMAKYFATAERTIIEVIPNNDYTLTLKFDNDEIRKYDCNDLIEKGTVFEFLSDYYNFKRVYLDESNVVSWDKDPNIDSNLNWSNKVDLSSDTLYVKSIPQDLGKMKL >NZ_CP008713.1|WP_042294566.1|740194_740620_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MIVSYPAVFYKYQEGNYGVSLPDFNVATCGEDLEDAIKMAIECLAGEIKWCKEQGEEIPKPTLDLDLVEVDERDEENNYVEFIKQIITVDADEYAKKYFNKSVKKNLTIPKWLNDEAVALNINFSKVLQKALLDEINRLKD >NZ_CP008713.1|WP_005806383.1|740678_740852_+|hypothetical-protein MKSCIALFYLILKTLLALTIFSFTGFGTYNFGINDIRVVQALTIYYIIRVNLYILNK >NZ_CP008713.1|WP_042294568.1|743062_744478_+|glycoside-hydrolase-family-1-protein MKQKFPENFLWGASSSAFQIEGGWDEDGKGKTVADFNSFKRSDKQADTKVASDFYHHWKEDIAMMKELGMQIYRFSLSWARIVPDGDGDINAAGIDFYNKLIDELIANGIQPFVTLYHFDLPYALVEKYNGWECRNCAFAFERYARVCFKEFGDRVKYWQVINEQNLMIRVNERMNIYVDDLWEADRIRAQMDYHMFLGHALAVNSCHELVEGGKVGPAVSSTCTYPLTNKPEDVWAAKMNDWLKTNYCLEMHINGEYPGYYMRYLRERNIVPKMEPEDVPILKSAKIDYIALNYYRTLCASYLPASEEHPIGERVYRDNEVDFDQYGYCRNEKNANLSASEYGAQIDPMGLRIVLNEYYRRYHLPMIITENGLGMADVLTEDGKVHDSYRIDYIRSHIQACANAIEDGVELIGYSPWSVMDLLSSHQGFRKRYGFIYVDRDDFDVKQLRRIKKDSFYWYKHVIETNGEEL >NZ_CP008713.1|WP_042294569.1|744539_745274_-|DUF1624-domain-containing-protein MNEKRYFILDGIRGFAVINMIIYHFIWDLVYIFRFDIPWFESEISYIWQQFICCTFIFISGFCEPLGTRKLKRGIIILGLGILIEIVTMIATPENRVRFGILTLLGSCAILIIPAKKFLEKFPSIFGLILSIALFLLTKNINDGYLGFNNLNLIKLPSNLYKNSITTYLGFPMPNFYSTDYFSLMPWIFLYISGYFSYQIFKRQGLLKYLKISKIKSLEWIGRNSLALYVIHQPLIYFLIILFL >NZ_CP008713.1|WP_042294571.1|745332_745758_-|hypothetical-protein MNTLRKIIKNTIIACIPFTILSTINANSSPLRRSKSLPNITFNNXFNENFRKFFEFGQPIMTTRTSASVSNLNDTDDFQKLRNEMVFSNNARAMQNGIFPRPMWKLYLDGSDFVDTYTGLKMPRVNNANISNATKVQYFFE >NZ_CP008713.1|WP_005806373.1|746017_746350_+|DUF898-family-protein MRPWYFEESEFDGKLAELLGINILSFLLIIVTLGIGFSWAMCMKEKYRINHTIINGQRLSFVGRGGDLFVNWLKWILLTIITLGIYGFLLSIKLRQWKVRNTIFDSYKVG >NZ_CP008713.1|WP_052341889.1|746575_747700_+|HNH-endonuclease MESLIEFLYSYKGMLVSIFITPIILFLMHQLYKYGCHKEKYPKVNLDKMNGKGIKFCVWGYTVWIVIIMPLGLLASLILFSIWKIYENSYYKSIKFKIIKKELSDYVTNCHELNEHIEELKDSYSGIEKKNYGRAEIEDNSRYNYKGAKQVDQKSKFTYDCSIAIYRAAEQQPFKYLCKYFNIDSTEESLEKFEDLLNKFSAAEEGKVVLNNELERIKRSLKNRKDIPFLINFLGMEKFIKEIGIIQRVDFNDLYFPVYTFRYRSPGGNKSSLCKIKLDIENLNEFVEYLSELVNFRKSVAGQRALMTSKLRESIKQRDNYTCKQCGLSTYDEPNLLLEIDHIVPISKGGLSTEENLQTLCWKCNRTKGAKLVS >NZ_CP008713.1|WP_042294572.1|747718_748324_+|hypothetical-protein MLRKLLIMMFIVAGIGVSTVSCGSNNNTNSTSNVMNNQDSTNVEDKVSEPKKEDKKDMTSAELDEALNNQPVKIIRTEYISQEDQFLRPDLLSAVFQNDSGVDIKNAVLGYVAWDSNNLPVKIQSQYDFTDGEYFKKVNYSDVNLVNGASYGENGGLSIGNDNIAKFKAIVVSYTDFDGNIWDNPLLEEFKKLYEDKKLAE >NZ_CP008713.1|WP_005806369.1|748362_748704_+|hypothetical-protein MKRSKLLLVSAILSTLYLIYIFIYFFNGISSSSNGAEALGVGLAGVLVAPHILFVGLGVLFNWIGWGMNKRWAALVSGILYFVSIFLMILYAIFVIVQVILCFVGYAKMKKEG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP008713_2 | 2.11|738708|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738708-738741 | 34 | NC_019507 | Campylobacter phage CP21, complete genome | 33170-33203 | 7 | 0.794 |
NZ_CP008713_2 | 2.11|738708|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738708-738741 | 34 | MT932329 | Campylobacter phage F379, complete genome | 100334-100367 | 7 | 0.794 |
NZ_CP008713_2 | 2.11|738708|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738708-738741 | 34 | HE815464 | Campylobacter phage CP21 complete sequence | 33170-33203 | 7 | 0.794 |
NZ_CP008713_2 | 2.4|738249|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738249-738281 | 33 | NC_009927 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2, complete sequence | 196199-196231 | 8 | 0.758 |
NZ_CP008713_2 | 2.9|738576|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738576-738608 | 33 | MT774394 | CrAssphage cr271_1, complete genome | 82022-82054 | 8 | 0.758 |
NZ_CP008713_2 | 2.14|738906|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738906-738939 | 34 | KX017520 | Salmonella phage 64795_sal3, complete genome | 37898-37931 | 8 | 0.765 |
NZ_CP008713_2 | 2.4|738249|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738249-738281 | 33 | NZ_CP053907 | Hymenobacter sp. BRD67 plasmid unnamed3, complete sequence | 60256-60288 | 9 | 0.727 |
NZ_CP008713_2 | 2.9|738576|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738576-738608 | 33 | NZ_CP014283 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence | 172855-172887 | 9 | 0.727 |
NZ_CP008713_2 | 2.20|739301|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 739301-739333 | 33 | MK250029 | Prevotella phage Lak-C1, complete genome | 178327-178359 | 9 | 0.727 |
NZ_CP008713_2 | 2.14|738906|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738906-738939 | 34 | NC_013855 | Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510a, complete sequence | 598489-598522 | 10 | 0.706 |
NZ_CP008713_2 | 2.14|738906|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 738906-738939 | 34 | NZ_CP013167 | Lactobacillus plantarum strain MF1298 plasmid pMF1298-12, complete sequence | 1184-1217 | 10 | 0.706 |
NZ_CP008713_2 | 2.20|739301|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 739301-739333 | 33 | NZ_AP018258 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid3 DNA, complete genome | 89683-89715 | 10 | 0.697 |
1. spacer 2.11|738708|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019507 (Campylobacter phage CP21, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
atcggctc--tatctatataatcttttttga--gccag CRISPR spacer --cgattctatatctttataatcttttttgaaggcc-- Protospacer **..** ***** *************** ***
2. spacer 2.11|738708|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT932329 (Campylobacter phage F379, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
atcggctc--tatctatataatcttttttga--gccag CRISPR spacer --cgattctatatctttataatcttttttgaaggcc-- Protospacer **..** ***** *************** ***
3. spacer 2.11|738708|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HE815464 (Campylobacter phage CP21 complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
atcggctc--tatctatataatcttttttga--gccag CRISPR spacer --cgattctatatctttataatcttttttgaaggcc-- Protospacer **..** ***** *************** ***
4. spacer 2.4|738249|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009927 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gcaaaaaatcacaaatatgactggttc----ttttaa CRISPR spacer taaaaaaatcacaaatttgaatggttcaggatt---- Protospacer ************** *** ****** **
5. spacer 2.9|738576|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774394 (CrAssphage cr271_1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tatctcatataatgcatataatactatatttat CRISPR spacer tttacaatataatgaatataatactatattacc Protospacer * * . ******** *************** .
6. spacer 2.14|738906|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX017520 (Salmonella phage 64795_sal3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cagtcggaacatcaccattattaatcacatcaat CRISPR spacer catactgcgtatcaccattattaacaacatcaat Protospacer ** * * ..**************. ********
7. spacer 2.4|738249|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053907 (Hymenobacter sp. BRD67 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gcaaaaaatcacaaatatgactggttcttttaa CRISPR spacer gcaattaatcacaaatatgactggcgaacaaaa Protospacer **** ******************. . **
8. spacer 2.9|738576|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014283 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850636, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tatctcatataatgcatataatactatatttat CRISPR spacer atctttccataatgcatctagtactatatttat Protospacer ..*. .********* **.************
9. spacer 2.20|739301|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250029 (Prevotella phage Lak-C1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tcaggctcaccattaaattttaattactttatg CRISPR spacer ctattcaaaccatttaattttaatttctttata Protospacer ..* * ****** ********** ******.
10. spacer 2.14|738906|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013855 (Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510a, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
cagtcggaacatcaccattattaatcacatcaat CRISPR spacer cagccggaacatccccattattaacctttatgaa Protospacer ***.********* **********.* . ..*
11. spacer 2.14|738906|34|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013167 (Lactobacillus plantarum strain MF1298 plasmid pMF1298-12, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
cagtcggaacatcaccattattaatcacatcaat CRISPR spacer taagattatcatcaccatttttaatcacttcaac Protospacer .*. * ********** ******** ****.
12. spacer 2.20|739301|33|NZ_CP008713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018258 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid3 DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
tcaggctcaccattaaattttaattactttatg CRISPR spacer cgcatggcgccatttatttttaattactttatg Protospacer . . *.***** * ****************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
111347 : 189910
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP008713|111347:189910|DBSCAN-SWA ATTAATATGTAGGCAATATTATATTTTCAAATATATCTACTGATTGTTTAGCTAACTTATCTGTATTATGGGTATAAGTATTAAGTGTAGTTTGAATATTATTATGTCCTAGTCTATGTTGTACATCTTTAATGTTAGCGCCATTTTCAACTAGTAATGTAGCGTGGGTGTGTCTTAATGAGTGGAAATTAAAAGGTATACCTAATTCATAATTAATAACACGCGACGCATATTTAAATGAATCTGGTGTTAATAACATTCCGTTACTTTTTACGCACACCATATTTAATAAAGGTGCTTTTAAATTTAGAGAACTTGTTGTGATTTTATCATTTATGTTGTATTGTTTTATATAATGTTCTCCGTATTCTAAGCGTTTAATATCAATATATCTTTTATGATACTTTAGTGCGTTTTTCAAGGTATTACCTATATTAATTATTCTGCTAGAGGAGGTGGTCTTAGGTTCACCAAAATACCAAGACGTATCCTTTTTATATATTAGTTTGTTAATATTGATTGTGTTATTATCTAAATCAATGTCATCCCACGTTAAACCCATTGCTTCACCTATGCGACAACCAGTATGATAACCAATCATTAAAGGGATATAGAAAGATGATCTTTCGGGAAAGCGTTTTATTATAGCGTTAAAATCATCATTAGTTATAATTTTATGTTTATCTGTAGTTTTGGTATTATTATACTTAGGAATTTTAACATATTGCATAGGGTTATTCTTTAGAAAATTCATAGGATGTACTGAGTAGTTAAGGGAACCACTCAATAAGGATATTATATTATTTAGATGATTTTTTGATATACCAGTTAAATATTTGTTATTTATAAAATCTTGTAATTTACCAGGAGTTAAAGAAGTTAATTTTAAAATGCCTAAAGAGGGTTTAATATGTTTATCTATTATTAATCTATAAGAGCGTTGAGTATTGTATCTGCAATTTAACAGTACATAAGCATCAAACCATAAATCCATATAATCTGATACGGATATATTTGTTTTTTGAAATTGTTCACCATTTTCGTAATCTTCCAAAGCCTTTCTTAAAGCTGCTTCAGCTTCTTTTTTGGTTCTACCTCCAACTCTTTCAATTCTTTTTCTTTTTCCGTCGACCCTAGCTGCCTCAAACGAGTAATACCACTTGTCTCCTCGTTTTCTGAGACTTCCAGTCATATTTTAAGATCTCCTTTCATTTTATAAAAATATAGATTAATTCGAGTTTAAAATATAGTCGTAATTGAAATACTTATATTATTAAGTTTTGTTCATTTTTGTAACACAAAAATAAATAAAAGCTGATATATTATATATAAAGCTTTGGAAGGAGGGATTTGGATGAAGAGCAAATATGGTAAATTGTTTAAGAATTTATCTGATAATACTATTAATTGCTTTGAATATGGTTCAGTTCAGGAATATTACCCCTTTATCCAAAGGATAAAACAACAAGGTTTTAATCAATGTATTATAACTTCAGATGTAATGATATCTATAATAGAACATTTTATTCTAAGATACAATGCTGAAATTATAAGTATAAACTTTATGGTTGAAGACAGTGAATTGCAGATTGAAATTAATAATATTTTAGGTTTGATGCGTAAGAGTGAAGCTTATTGGAGTGTACTTAAACAGAGGTTATTATTTTTAAGCGAGAATGATTGCGTAGAAATGAAAGAAGTTGAATTTAAAATATGTAGCGGTGAACTTAATACGCTTCTTTCGGTAAAAGTTAATGGTGTAATTGTAGTTGGTGAATTTGAATTTTATGAAGTTTCTAATATAATTTCCACGATTATTGAGGATTATTTAGATTGCAAGTATTGAGTATTTTTGCTAAATTCTTTTTTAGGCCGATAATATTCCCGTTAGTAGCTATGTTATTAACAGATTTTTTTAATATTGCCGAATATATCAGATTTATTCCTTCTGTACGTGCGTATGAATTCGGCTTAACCATATATATAGCAATATTTGAGATGATATACCAAGGCATTTTAATTATTTGGGACAAATATAAGTTGCATATAAGCTTTATTTTTTACATAAGTGAGATGGACAAGTCTGATGTTGTGCCGTGTGCTAGAGGTTGTGAAGGTGTTTTTATGATAAATTATTTTATTAAGCTGCATGGTAATTTAAATAGATTAAACAAATGTAAGATGTATTTAGATACGAATCCTATTCTTGGATCGCAAACAAGATCAGATTATTATTGTGAAGGAAATACTGTGGTTTGGGACTTAGATAAAATTAGAAATAGTTGTAGCGCAAAAATGTTAAAATCAGGTAAATTAAGTTTGATAAAGGAGAGAGATGAATATATCTCGTTAGAATTGAGACCTAAAATAAACAAGAAGTGGGGGATTATTTTTGAAACAAACGGTTTCAGAATTGATGAAGGAAGGGATTAGAATTACTAGATGGGAAGATACGACGGGCAATACTTTAGATGAGATAATAGAAAAATTATCTAGCATACCAGAAAATAATAATGATAATGCTTGTACTAGATATTTAGATTGGGAGGTAGATAAAATATTTGAAAGTAATATAAATATAGAATTGAGCGGCCAAAAAATAGAATATAATGCTTTTAAATTTTCATTTACATATGTTCCTGTTGGGTATCAGAAAGATGATGACGTATCATCTATTAAAACTGGATTCATAATTGTGTATAAGAGTAAGGGTAAGATAAGATATATAATAGATAAAAATTCTGATGCTCTTTCTATGTTAAGAAAAAAATTATCTTATACAGGAAGAAGTGAAGTTAGACGAGATACTTATCCATTTAAGAAATATCACTTTATATGGCTAATAGGTAAAATATATATAGGAAACAATATTTTAGAGGGATCTGAGGGACTAAACGATTTAAGTATCTGTACTATTCGAGGGTTTAAGGGTGATACGGAAAATTCATTGGCAACGATTAAAGCAGAAGGAGAAGATGTAATTAAGAGCCTTAGCACTTCTTGTTTTTTGATAGAAAGCGATAAGTTAGATCAGATTAGCATGGAGATGGAATATAAACATTATAAGAATATAAGTGTCAAATTAATGAACAAAACCATAAATTTATTAACTAATAGGTGTCTTGGTGTATCTAGCGACAAAGATATTTTTGAGCTTATATTAACTTTATATATTGAAATAGTGCCTATAATAATACAAAATTATGATAATGAAGTTTCATCAGGTCAATGGAATGAGGAAAAATATACAGAATTTTTAAAACGCGTTGCCGAAGATGTAAACACAGGAATTAAAAGCAAGTTAAAAATATCGACTGGAGAAGAGTAAAAATACAAATTTATATTACAAGTTTTTAAAAACCCACCTACTGATAATTTCAGATTGAAATCTTATATTTTTCAAATATTTTTAAAGAATCATTAGTCGCACCTCACGCAGGTGCGTGGATTGAAGTTGTTAGATAAATAATGAAAACCGCTCGATTAATTAAGCGAGCGGTTTTTAAAATCTTCTACGTAGTTCTATAACTTTACCAATTATATGTATGGGTTTATCTGCAATGTCATTTTTATCATAGTACATAGGCTCATATTTTAAATTTAGAGACACAAGGCTTATACCGTCCTTGTGTTTTATTATTTTTTTACATGTTGCCTCGTCACCATTAACGCAGACTATAGCTATGTCTCCAGAGTTAACGTCTTGTTGTTTACGGACTATTACGACATCTCCAGCATCCATTGTGGGAGACATAGAATCTCCTTTGATTTTCAAAGCAAAATAGTCACCTTGAGATGCAAGTTTAGGTGATATCTCTTCCCAACCGATAATTTCTTCAATCGCCGATATTGGGATACCCGCTATAACAGTACCTAGTATGGGTATTTTAATAGCTTTATTGGATTGATCAGATCTGGAATCATTTTTATATCTCCTTTTTGATTTAATTTTACAAAGAATTAGACATAAAAGTAAAGATAATAGTTTTATCTGACAAATTAATGGGCAATATAAGTTTAGAAATTGTAGTATATTTGGGTATAACTTGTTATAATTATTGGTGAAGAAGGAGATAATATGGGGGTGTTTAAAGATGGAAGAAAAAGAAAAGTTGCTTAAAAAATCTAAAGAAATTTTTAGCTTAGTTAGTTGTATGTATTGTTATTATAGTGGTCCTTATAAAATTGAAACTGTTTGCATTCTATTATGTAATGCTTGGGAATTAATGCTGAAAGCTTATATAATCGGTAAGAAGGGGAAAGAAGGAATAGTATATAAAAATAAACAGAATAAGGGTAGGACTATTGGATTAAATGAATGTATAAGTAAAGTATTTACGAATAAGCATGATATATTACGTAAACATTTGGAGTCTGTAATTAGATATAGAAATTCGGTTGTACATTATACAGTTGATAGTTTTGACTTATCTTTATACTCTAAAATAGAGTATTGTATAGTGAATTTTAAAGCGAAAATGTGTGAACTTCACAATGTTAATATGTCCGATATGATAGTTAACCAGGCTAATGAAGAAATCTTAAAAAATGATGTCGATTTGTATAAGTATAGTAAAAAGAGTTTGTGTAGGGAAATAAATAATGTATTGAAATCTTTGGGAATTGAGTTTAAAATCGATAGTCAAACCTTTGAATTGTTTGATAGGGTGTACGGAATTAAAGAAAATAAAGAGTATTGTCTTATAAGTAATGTTAATAACAGGCCATCTTATAGATATTCATCAAGAGTTTTAAATTTTATCGTAGGATTGATACAAAAAAATCCTAACAATATTAAAGAAGTCTTAAAGAATAAAATAAAAAAATAAGCTAACCCCAGGGGCAAAGGAATTCTTGGTTTAATTTATTAAATTAAACCTACTCCTATTTAGGAACCCAGCCTTATCCATCCCAAGTTAGCTTACATTTATATAATATGTACATATCGTGTATATTATTCATATACACTTACATTGTACAATAAGTAATTTATAAAATCA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85 | Clostridium_phage(18.52%) | plate,holin,integrase,portal,capsid,head,terminase,protease,tail | attL 104807:104823|attR 134792:134808 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
771907 : 842779
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP008713|771907:842779|DBSCAN-SWA 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72 | Clostridium_phage(32.43%) | plate,holin,tRNA,capsid,portal,integrase,head,terminase,protease,tail | attL 807141:807200|attR 841315:841402 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1514473 : 1602119
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP008713|1514473:1602119|DBSCAN-SWA 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100 | Bacteriophage(14.71%) | plate,holin,tRNA,capsid,portal,integrase,head,terminase,tail,protease | attL 1563964:1563982|attR 1607752:1607770 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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