Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP008926 | Streptococcus pyogenes strain ATCC 19615 chromosome, complete genome | 3 crisprs | DEDDh,csa3,cas3,DinG,csm6,cas9,cas1,cas2,csn2 | 0 | 1 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP008926_1 | 16130-16219 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP008926_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP008926_1
>1.1|16154|42|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder TAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP008926_1
The CRISPR arrays of NZ_CP008926_1 >merge|NZ_CP008926|1|16130-16219|CRISPRCasFinder ATCCAAAGATGCTGTTGAAGTTTATAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGATACCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA >NZ_CP008926|1|1|16130-16219|CRISPRCasFinder ATCCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA TAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGA TACCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA
>NZ_CP008926.1|WP_002989783.1|14904_15318_+|VOC-family-protein MKLNAIHHVAIIVSDYHLSKDFYVNKLGFEIIRENYRPDKHDYKLDLSCGRIELEIFGKVTSDPYYQAPPKRVSQPEFKSEACGLRHLAFRVTNIESYVDDLKSLGIPVEPIRHDDYTGEKMTFFFDPDGLPLELHE >NZ_CP008926.1|WP_038432331.1|14072_14822_+|sortase MVKKQKRRKMKSMSWARKLLIAVLLILGLALLFNKPIRNTLIARNSNKYQVTKVSKKQIKKNKEAKSTFDFQAVEPVSTESVLQAQMAAQQLPVIGGIAIPELGINLPIFKGLGNTELIYGAGTMKEEQVMGGENNYSLASHHIFGITGSSQMLFSPLERAQNGMSIYLTDKEKIYEYIIKDVFTVAPERVDVIDDTAGLKEVTLVTCTDIEATERIIVKGELKTEYDFDKAPADVLKAFNHSYNQVST >NZ_CP008926.1|WP_010922308.1|11566_14053_+|DNA-gyrase-subunit-A MQDRNLIDVNLTSEMKTSFIDYAMSVIVARALPDVRDGLKPVHRRILYGMNELGVTPDKPHKKSARITGDVMGKYHPHGDSSIYEAMVRMAQWWSYRHMLVDGHGNFGSMDGDGAAAQRYTEARMSKIALELLRDINKNTVNFQDNYDGSEREPVVLPARFPNLLVNGATGIAVGMATNIPPHNLAESIDAVKMVMEHPDCTTRELMEVIPGPDFPTGALVMGRSGIHRAYDTGKGSIVLRSRTEIETTQTGRERIVVTEFPYGVNKTKVHEHIVRLAQEKRLEGITAVRDESSREGVRFVIEIRREASATVILNNLFKLTSLQTNFSFNMLAIENGVPKILSLRQIIDNYISHQKEVIIRRTRFDKDKAEARAHILEGLLIALDHLDEVIAIIRNSETDVIAQTELMSRFDLSERQSQAILDMRLRRLTGLERDKIQSEYDDLLALIADLSDILAKPERIITIIKEEMDEIKRKYANPRRTELMVGEVLSLEDEDLIEEEDVLITLSNKGYIKRLAQDEFRAQKRGGRGVQGTGVNNDDFVRELISTSTHDTLLFFTNFGRVYRLKAYEIPEYGRTAKGLPIVNLLKLEDGETIQTIINARKEETAGKSFFFTTKQGIVKRTEVSEFNNIRQNGLRALKLKEGDQLINVLLTSGQDDIIIGTHSGYSVRFNEASIRNMGRSATGVRGVKLREDDRVVGASRIQDNQEVLVITENGFGKRTSATDYPTKGRGGKGIKTANITPKNGQLAGLVTVDGTEDIMVITNKGVIIRTNVANISQTGRATLGVKIMKLDADAKIVTFTLVQPEDSSIAEINTDRENSISKNKDN >NZ_CP008926.1|WP_002984645.1|10392_11376_-|L-lactate-dehydrogenase MTATKQHKKVILVGDGAVGSSYAFALVTQNIAQELGIIDIFKEKTQGDAEDLSHALAFTSPKKIYAADYSDCHDADLVVLTAGAPQKPGETRLDLVEKNLRINKEVVTQIVASGFKGIFLVAANPVDVLTYSTWKFSGFPKERVIGSGTSLDSARFRQALAAKIGVDARSVHAYIMGEHGDSEFAVWSHANVAGVGLYDWLQANRDIDEQGLVDLFISVRDAAYSIINKKGATFYGIAVALARITKAILDDENAVLPLSVFQEGQYEGVEDCYIGQPAIVGAYGIVRPVNIPLNDAELQKMQASANQLKAIIDEAFAKEEFASAAKN >NZ_CP008926.1|WP_023079447.1|8862_10233_+|FAD-dependent-oxidoreductase MSKIVVVGANHAGTACIKTMLTNYGDANEIVVFDQNSNISFLGCGMALWIGEQIAGPEGLFYSDKEELESLGAKVYMESPVQSIDYDAKTVTALVDGKNHVETYDKLIFATGSQPILPPIKGAEIKEGSLEFEATLENLQFVKLYQNSADVIAKLENKDIKRVAVVGAGYIGVELAEAFQRKGKEVILIDVVDTCLAGYYDRDLTDLMAKNMEEHGIQLAFGETVKEVAGNGKVEKIITDKNEYDVDMVILAVGFRPNTTLGNGKIDLFRNGAFLVNKRQETSIPGVYAIGDCATIYDNATRDTNYIALASNAVRTGIVAAHNACGTDLEGIGVQGSNGISIYGLHMVSTGLTLEKAKRLGFDAAVTEYTDNQKPEFIEHGNFPVTIKIVYDKDSRRILGAQMAAREDMSMGIHMFSLAIQEGVTIEKLALTDIFFLPHFNKPYNYITMAALGAKD >NZ_CP008926.1|WP_038432322.1|6894_8622_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKTYHHLLKRVLQDLLKKPLPVCILVIASFVQVGLSVYLPVLIGKAVDMSLSVNSWQTLKWLLGQMLVIIVVNTLIQWVMPLVYSRLLYQYSQQLKDKLLEKIHRLPFAYLDRQTIGDLVSRVITDTEQLINGLQMVFNQFILGLLTILCTIIAMAQIDWLMLILVLVLTPSSLFLARFIAQKSFHYAQAQTKSRGNLAQFTEEILRQEGLVQLFNAQEQSICDYHVLNKTYCEASQKAIFYASTVNPATRFINSVIYALLAGLGAVRIMAGLFSVGQLTTFLNVVVQYTKPFNDISSVLAEIQSSLACAQRLYDLLDIEIKEQEHFLTFKASAVKGQIDFEEVSFSYQKDRPLLKDINFSVPAGSKVAIVGPTGAGKSTLINLLMRFYELDAGSIKLDKVPIKCYAKEELRSITGMVLQETWLKDATVHELIAYGSEEASRDEVVAAAKAAHAHFFIMQLPKTYDTYLSASDDALSQGQLQLLAIARMFLKKPKVLILDEATSSIDIRTEAVIQEALKELMRGRTSFIIAHRLSTIQSADLILVMDQGRLVEWGTHASLMSKNGCYARLQKIE >NZ_CP008926.1|WP_038432321.1|5173_6898_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKRLRPYVKGYLKESILGPLFKLLEALFELLVPLLIANMIDISISQHNSQGILRVVLTLFGLATISLLLSVTAQYFSSKAAVGFTRQMTDDLFKKIMFLSKEDQDHLGYASLLSRLTSDSFQIQTGINQFLRLFLRAPIIVCGAMVMAYWISPSLTLWFVMMVIVLLTLVFVMSHLLGPLYLLIRRETDYLVRLTSQQLQGIRVIKAFNQTQKELQAFKQQNMLLSRHQYQAATLANVLNPMTFLVVNLTLLILIWQGSWQVAHRSLSQGMLVALINYLLQILAELLKMTMLMGTINQSVTAAKRINQVFVLADEAPLPLLKDGPISTHLLTIRHLTFTYPGAAEPSLYDIQLSADQGEWIGIIGGTGAGKTTLIDLICQTYSQYSGEISLNWQGEVPKTLTEWRNVIALVPQKAQLFKGTIRSNLLLGQSMPISDEELWRALELAQSKEFVAALPEQLEAPVEAFGRHFSGGQRQCLAIARALLKPKPILILDDASSALDNETRGRLFKALKEELSDVLVILVTQSIKNLQFADKILVLEQGHQLDFASHDQLKVSNALYQEMLALYVKGEQK >NZ_CP008926.1|WP_002984653.1|4564_5164_+|lysozyme-family-protein MFRLLKRACSFLLLFVIYQSFVIHHNVQRVLAYKPMVEKTLAENDTKANVDLVLAMIYTETKGGEADVMQSSESSSGQKNSITDSQASIEHGVNLLSHNLALAEEAGVDSWTAVQAYNFGTAYIDYIAKHGGQNTVDLATTYSKTVVAPSLGNTSGQTYFYYHPLALISGGKLYKNGGNIYYSREVHFNLYLIELMSLF >NZ_CP008926.1|WP_002989793.1|3586_4564_+|nucleoid-associated-protein MLDSYIKRIVIHQFSPNDTELLLSDRLVSITPRIDEYFRKKLAKVFSDEAKRGQFEANNTFFTTIGDDLLETSVTIAQLWKEAFVISEDQKTNDLVFVQFDKDGEPFFAFLRIALKEQFAHLSDNYEHPFTVTQNNLPSPTQTPDEALVINLKSGQYYLIEKRVKHNGSFANYFSEHLLKVTPEQSVKKSIKMIEQTAQKIAEHFNQDDFTFQSKMKSTLFKQLEADDVLSPEKLADQLFDDNLTARLTFVDQVKDVIPEPIKISDIDHSRQIKKLENQKLSLSNGIELTVPNAIYQDAEAVEFLLNDDGTYSILIKNIEDIKTK >NZ_CP008926.1|WP_038432319.1|2323_3580_+|serine-hydroxymethyltransferase MIFDKGNVEDFDKELWDAIHAEEERQEHHIELIASENMVSKAVMAAQGSVLTNKYAEGYPGNRYYGGTECVDIVETLAIERAEKLFGAAFANVQAHSGSQANAAAYMALIEAGDTVLGMDLAAGGHLTHGSPVNFSGKTYHFVGYSVDADTEMLNYEAILEQAKAVQPKLIVAGASAYSRSIDFEKFRAIADHVGAYLMVDMAHIAGLVAAGVHPSPVPYAHIVTSTTHKTLRGPRGGLILTNDEALAKKINSAVFPGLQGGPLEHVIAAKAVAFKEALDPAFKDYAQAIIDNTAAMAAVFAQDDRFRLISGGTDNHVFLVDVTKVIANGKLAQNLLDEVNITLNKNAIPFETLSPFKTSGIRIGCAAITSRGMGVKESQTIAHLIIKALVNHDQETILEEVRQEVRQLTDAFPLYKK >NZ_CP008926.1|WP_023610321.1|16419_17331_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MKTVRIFYNPNSGKKEDQLAGQVKDYFCQHGFSEDSVEVITPKDADQAFQLAKQAAKDKIDLVIPLGGDGTLNKIIGGIYEGGAHCLIGLVPSGTVNNFAKAMHIPLQITEALDTILTGQIKQVDICKANQQYMISSLTLGLLADIAADVTAEEKRRFGPLAFLKDSIRILKRNRSYAISLISHNHRIHLKTKFLLITMTNTIAGFPSFSPGAQADDGYFQVYTMKKVSFFKFLWHINDFKQGDFSKAEEISHFQANTLSLLPQAKKQAILPRARIDGDKSDYLPIQLDIIPKAISIIVPTED >NZ_CP008926.1|WP_002984629.1|17447_18098_-|hemolysin-III-family-protein MNQTFKQSLPLSFSEEVANSVTHAIGAFAMLILLPISASYAYQTYDLKAAIGISIFVISLFLMFLSSTIYHSMAYGSVHKYILRIIDHSMIYIAIAGSYTPVALSLVSGWLGYIIIVLQWGITLFGILYKIFAKRINEKFSLMLYIVMGWLVVFILPVIIQKTSLAFGLLMLFGGLSYTIGAVFYAKKRPYFHMIWHLFILLASALQFIAITFFML >NZ_CP008926.1|WP_011017769.1|18094_18535_-|DUF1836-domain-containing-protein MIFPSLPYWKDLPDLDLYLDQVLLYVNQCTDFSEVSDNKSLTASMINNYVKHGYVTKPIKKKYQKQQLARLIAISLFKTVFPIQDISRVLEELQAQADSESLYNTFVTCWNQKAPIEEDIPPIVQVACQTVKDYHKTIYLSQEVTQ >NZ_CP008926.1|WP_023610309.1|18753_19602_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MATIQWFPGHMSKARRQVQENVKHVDFVTILVDARLPLSSQNPMLTKIVGDKPKLMILNKADLADATRTKEWKAYYESQGIKTLAINSKEQSTVKKVTESAKELMADKIQRLRERGIQKETLRTMIIGIPNAGKSTLMNRLAGKKIAVVGNKPGVTKGQQWLKSNKELEILDTPGILWPKFEDELVGLKLALTGAIKDQLLPMDEVTIFGLNYFREYYPNRLTKRFKNIPLEEEAPEIIMTLTRQLGFKDDYDRFYTLFVKEVRDGKLGQYTLDQVGDMDAD >NZ_CP008926.1|WP_023610315.1|19591_20383_+|ribonuclease-HII MPTSIKAIKESLEAVTSLLDPLFQELATDTRSGVQKALKSRQKAIQADLAEEERLEAMLSYEKSLYKEGYQAIAGIDEVGRGPLAGPVVAVCVILPQHCKIKGLNDSKKIPKSKHETIYQAVKEKALAIGIGIIDNQLIDEVNIYEATKLAMLEAIKQLEGQLTQPDYLLIDAMTLDIAIPQQSIIKGDANSLSIAAASIVAKVTRDQMMANYDRIFPGYGFAKNAGYGTKEHLQGLKAYGITPIHRKSFEPVKSMCCDSTNP >NZ_CP008926.1|WP_011054501.1|20447_21284_+|DNA-protecting-protein-DprA MNHFELYKLKKAGLTNKNILNILDYQKHQEKSLSLRDMAVVSGCKHPSHFIEAYKQLDIQKLKMEFKQFPSISILDKHYPMALKEIYNPPVLLFFQGNLDLLEKPKLAIVGSRRSSDTGVKSVRKILKELGNRFVIVSGLARGIDTSAHLACLKNGGQTIAIIGTGLDRFYPKENRELQTFLGKNHLVLTEYGPREEALSYHFPERNRIIAGLSRGILVVEAKNRSGSLITCQIGIEEGRDIFAVPGNILDGKSEGCLQLIKEGATCVTSGMDILSEY >NZ_CP008926.1|WP_023610295.1|21391_23521_+|type-I-DNA-topoisomerase MGTKTTTKPKTGTKKSTTKKKSTAKKNLVIVESPAKAKTIEKYLGRSYKVVASVGHIRDLKKSSMSIDFDNNYEPQYINIRGKGPLINSLKKEAKAAKKVYLASDPDREGEAISWHLSHILGLDPEDKNRVVFNEITKDAVKNAFVEPRQIDMNLVDSQQARRVLDRIVGYSISPILWKKVKKGLSAGRVQSVALKLIIDRENEIKAFVPEEYWSIDGLFKKGTKKFQASFYGLDGKKMKLSNNDDVKAVLAKLKGDDFLVSKVEKKERRRNAPLPYTTSSLQQDAANKINFRTRKTMMVAQQLYEGIHLGENGTQGLITYMRTDSTRISPVAQNDAAQFISNRFGANYSKHGNRVKNTSGAQDAHEAIRPSSVNHTPEAIAKYLNKDQLKLYTLIWNRFVASQMTAAVFDTVKVNLEQNGVLFVANGSQMKFDGYMAVYNDSDKNKMLPEMEEGENVKKVSTSPEQHFTQPPARYSEATLIKTLEENGVGRPSTYAPTLEVIQRRYYVKLSAKRFEPTELGEIVNKLIVEFFPDIVDVAFTAEMEGKLDQVEIGEEQWQHVIDQFYQPFVKELNKAESEIEKIQIKDEPAGFDCDVCGHPMVIKLGRFGKFYACSNFPECRNTKAITKEIGVTCPICHKGQVIERKTKRNRIFYGCDRYPECDFTSWDLPVGRDCPKSGDYLIEKKVRGGKQVMCSNETCDYKEEKIK >NZ_CP008926.1|WP_023610318.1|23655_25002_+|methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)--C(5))-methyltransferase-(FADH(2)-oxidizing)-TrmFO MSQSTATYINVIGAGLAGSEAAYQIAKRGIPVKLYEMRGVKATPQHKTTNFAELVCSNSFRGDSLTNAVGLLKEEMRRLDSIIMRNGEANRVPAGGAMAVDREGYAESVTAELENHPLIEVIRDEITEVPNDAITVIATGPLTSDALAEKIHALNGGDGFYFYDAAAPIIDKSTIDMSKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTKEEFMAFHDALTTAEEAPLNAFEKEKYFEGCMPIEVMAKRGIKTMLYGPMKPVGLEYPDDYTGPRDGEFKTPYAVVQLRQDNAAGSLYNIVGFQTHLKWGEQKRVFQMIPGLENAEFVRYGVMHRNSYMDSPNLLTETFQSRSNPNLFFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGINAARLFKREEALIFPQTTAIGSLPHYVTHADSKHFQPMNVNFGIIKELEGPRIRDKKERYEAIASRALADLDTCLASL >NZ_CP008926.1|WP_011284801.1|25154_26561_+|pyruvate-carboxylase-subunit-B MIQFGGFSMQQQVAITETVLRDGHQSLMATRLSIEDMLPVLTILDKIGYYSLECWGGATFDACIRFLNEDPWERLRTLKKGLPNTRLQMLLRGQNLLGYRHYADDIVDKFISLSAQNGIDVFRIFDALNDPRNIQQALRAVKKTGKEAQLCIAYTTSPVHTLNYYLSLVKELVEMGADSICIKDMAGILTPKAAKELVSGIKAMTNLPLIVHTHATSGISQMTYLAAVEAGADRIDTALSPFSEGTSQPATESMYLALKEAGYDITLDETLLEQAANHLRQVRQKYLADGILDPSLLFPDPRTLQYQVPGGMLSNMLSQLKQANAESKLEEVLAEVPRVRKDLGYPPLVTPLSQMVGTQAAMNVILGKPYQMVSKEIKQYLAGDYGKTPAPVNEDLKRSQIGSAPVTTNRPADQLSPEFEVLKAEVADLAQTDEDVLTYALFPSVAKPFLTTKYQTDDVIKVTAFIKA >NZ_CP008926.1|WP_009881173.1|26603_26918_+|membrane-protein MTYSFIDILQVTLVSLFLVLTCLTGIMGLMMLSGKLLSQEKKTLSQQASSIPQEQEADKLSGEALETLLAKDELARIAVMTSLAYASQEESGKRFEVIAVERKS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP008926_2 | 116157-116258 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP008926_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP008926_2
>2.1|116181|54|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder CCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP008926_2
The CRISPR arrays of NZ_CP008926_2 >merge|NZ_CP008926|2|116157-116258|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATACCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACATAAAATTGGTATAGTCTAATTATA >NZ_CP008926|2|2|116157-116258|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATA CCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA TAAAATTGGTATAGTCTAATTATA
>NZ_CP008926.1|WP_002984451.1|114291_116106_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKALSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSRESTYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLTTTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >NZ_CP008926.1|WP_002989626.1|113760_114096_-|alkylphosphonate-utilization-protein MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVVKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >NZ_CP008926.1|WP_002992417.1|113013_113655_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKIPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >NZ_CP008926.1|WP_002992415.1|112374_113004_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKSDAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >NZ_CP008926.1|WP_014635494.1|111522_112359_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKGLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGKCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKDRQEKVAFTDSYMRNEQIIVVKKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVATANIKS >NZ_CP008926.1|WP_009880829.1|110379_111153_-|CAMP-factor-pore-forming-toxin-Cfa MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANLQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIEATVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDMGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKPFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQNALETALKS >NZ_CP008926.1|WP_014635492.1|108774_110010_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLLLSVAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVSVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMIPEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLIDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQRTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKKQLHHTHYRIVKM >NZ_CP008926.1|WP_038432363.1|107332_108655_+|sodium:alanine-symporter-family-protein MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGIYLTSRLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDANGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFAGSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQIVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLAVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFVLMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >NZ_CP008926.1|WP_002989648.1|104484_106803_-|DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLIKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEAAEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPFGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >NZ_CP008926.1|WP_002984469.1|103873_104122_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN >NZ_CP008926.1|WP_002984449.1|116281_116839_-|signal-peptidase-I MVKRDFIRNILLLLIVIIGAILLRIFVFSTFKVSPETANTYLKSGDLVTIKKNIQPKYKDFVVYRVGKKDYVSRVIAVEGDSVTYMDDIFYLNNMVESQAYLEKMKAHYLNHAPFGTLYTDDFTVATITADKYQKVPKGKYLLLNDNRKNTNDSRRFGLINASQIKGLVTFRVLPLSDFGFVEVE >NZ_CP008926.1|WP_002984447.1|117056_118559_-|pyruvate-kinase MNKRVKIVATLGPAVEIRGGKKYGEDGYWAGQLDVEESAKKIAELIEAGANVFRFNFSHGDHKEQGDRMATVRLAEEIARQKVGFLLDTKGPEMRTELFADDAKEFSYVTGEKIRVATTQGIQSTRDVIALNVAGSLDIYDEVEVGHTILIDDGKLGLKVIDKDIATRQFIVEVENDGIIAKQKGVNIPNTKIPFPALAERDNADIRFGLEQGLNFIAISFVRTAKDVEEVREICRETGNDHVQLFAKIENQQGIDNLDEIIEAADGIMIARGDMGIEVPFEMVPVFQKMIITKVNAAGKAVITATNMLETMTEKPRATRSEVSDVFNAVIDGTDATMLSGESANGKYPVESVRTMATIDRNAQTLLNEYGRLDSSAFPRTNKTDVIASAVKDATHSMDIKLVVTITETGNTARAISKFRPDADILAVTFDEKVQRALMINWGVIPVLAEKPASTDDMFEVAERVAVEAGLVQSGDNIVIVAGVPVGTGGTNTMRVRTVK >NZ_CP008926.1|WP_002984444.1|118621_119635_-|6-phosphofructokinase MKRIAVLTSGGDAPGMNAAIRAVVRKAISEGMEVYGINRGYAGMVDGDIFPLGSKEVGDKISRGGTFLYSARYPEFAQLEGQLAGIEQLKKHGIEGVVVIGGDGSYHGAMRLTEHGFPAVGIPGTIDNDIAGTDYTIGFDTAVNTAVEAIDKLRDTSSSHGRTFVVEVMGRNAGDIALWAGIASGADQIIVPEEEFDIEKVASTIQYDFEHKGKNHHIIVLAEGVMSGEAFAQKLKEAGDKSDLRVTNLGHILRGGSPTARDRVIASWMGSHAVELLKEGKGGLAVGIHNEELVESPILGTAEEGALFSLTEEGKIIVNNPHKARLDFAALNRSLSQ >NZ_CP008926.1|WP_002984441.1|119714_122825_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MFAQLDTKTVYSFMDSLIDLNHYFERAKQFGYHTIGIMDKDNLYGAYHFIKGCQKNGLQPVLGLEVEILYQERQVLLNLIAQNTQGYHQLLKISTAKMSGKLHMDYLCQHLEGIAVIIPSKGWSDTLVVPFDYYIGVDQYTDLSHMDSKRQLIPLRTVRYFAQDDMETLHMLHAIRDNLSLAETPVVESDQELTDCQQLTTFYQTHCPQALQNLEDLVSGIYYDFDTNLKLPHFNRDKSAKQELQELTEAGLKEKGLWKEPYQSRLLHELVIISDMGFDDYFLIVWDLLRFGRSKGYYMGMGRGSAAGSLVAYALNITGIDPVQHDLLFERFLNKERYSMPDIDIDLPDIYRSEFLRYVRNRYGSDHSAQIVTFSTFGPKQAIRDVFKRFGVPEYELTNLTKKIGFKDSLATVYEKSISFRQVINSRTEFQKAFAIAKRIEGNPRQTSIHAAGIVMSDDTLTNHIPLKSGDDMMITQYDAHAVEANGLLKMDFLGLRNLTFVQKMQEKVAKDYGCQIDIAAIDLEDPQTLALFAKGDTKGIFQFEQNGAINLLKRIKPQRFEEIVATTSLNRPGASDYTTNFIKRREGQEKIDLIDPVIAPILEPTYGIMLYQEQVMQIAQVYAGFTLGKADLLRRAMSKKNLQEMQKMEEDFIASAKHLGRAEETARGLFKRMEKFAGYGFNRSHAFAYSALAFQLAYFKAHYPAVFYDIMMNYSSSDYITDALESDFQVAQVTINSIPYTDKIEASKIYMGLKNIKGLPRDFAYWIIEQRPFNSVEDFLTRTPEKYQKKVFLEPLIKIGLFDCFEPNRKKILDNLDGLLVFVNELGSLFSDSSFSWVDAKDYSATEKYSLEQEIVGVGMSKHPLIDIAEKSTQTFTPISQLVKESEAVVLIQIDSIRIIRTKTSGQQMAFLSVNDTKKKLDVTLFPQEYAIYKDQLKEGEFYYLKGRIKERDHRLQMVCQQVQMAISQKYWLLVENHQFDSQISEILGAFPGTTPVVIHYQKNKETIALTKIQVHVTENLKEKLRPFVLKTVFR >NZ_CP008926.1|WP_002989617.1|123009_123381_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSWKFDEKSPIYAQIAQHVMMQIISQEIKSGDQLPTVREYAEIAGVNPNTMQRAFTELEREGMVYSQRTAGRFVTDDQKLIARKRRELAISELESFITNMTKMGFSHTEIIPVLTSFLKEDSQ >NZ_CP008926.1|WP_002992425.1|123380_124079_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAHLLQLHHVSKSYREKKAIDDLTITIPNGKIIGLLGPNGSGKTTLIKLINGLLQPNKGEIVIDGYRPCVETKKIISYLPDTTYLNENMRIKDMLEFFSDFYSDFDNSKATSLLRDLELDPEDRFKTLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYVLDEPIGGVDPAARDYILKTIINSYCENASVIISTHLISDIEPILDEVIFLKQGRLFLSGNADDLRQEYQQSIDSLFRETYKV >NZ_CP008926.1|WP_002984433.1|124088_124874_+|hypothetical-protein MFGKLLKYEFRSIGKWYFALNAFVIAIAAILSFTIKLFAQSNSDGLFGVLTNKMLPLTLGLTFGSLIAGSLLSTLLIIIKRFSKSVFGREGYLTLTLPVNSHQIILSKLLASFICSVFNTIILAFAIAIVIVPMFNINELLEGFFNSFKMDYFINMLTVLAYVLLSTFTSILLIYLSISIGQLFSNRRGLMAFIAYFILVILISVAATYVHSHIFNINTSADSFPFTEQKTIYLLILEQFIEMIMFYLATNFIIKNKLNLQ >NZ_CP008926.1|WP_002989607.1|125004_125619_-|TVP38/TMEM64-family-protein MTKRNSKAYILWQKIIKILGIIALIGTFFLAFWLYRLGILNDSNALKDLVQRYRLWGPFVFIVVQIIQIVFPVIPGGLTTVAGFLIFGPVTGFIYNYVGIIIGSIVLFLLVKTYGRKFILLFVNDKTFYKYERRLETPGYEKLFIFCMASPVSPADIMVMITGLTDMSLKRFVTILLITKPISIIGYSYLFIFGKDVISWFLQH >NZ_CP008926.1|WP_002989605.1|126359_126980_+|DUF3862-domain-containing-protein MTKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKEPQPSDSEIITPRLHQAAHQDKRANFEKIKLATVDSSFTGGTSLEELISLFGEPSQHDPKTAGEVTIDAYTWQFDQVTLTVNLYQNSSIVKTISNFTFARELGLSQKEYQQLQKGMSYEDVKKILTEPDNYSQASSSDHQTLQAIWVSGLKTDTSGANISLVFENNQLTEMSQVGLEE >NZ_CP008926.1|WP_002992581.1|127236_129501_-|glycogen/starch/alpha-glucan-family-phosphorylase MTRFTEYVETKLGKSLTQASNEEIYLSLLNFVKEEASHKAKNSAKRKVYYISAEFLIGKLLSNNLINLGIYKDIKEELAAAGKSIAEVEDVELEPSLGNGGLGRLASCFIDSISSLGINGEGVGLNYHCGLFKQVFKHNEQEAEPNYWIEDDSWLVPTDISYDVPFKNFTLKSRLDRIDVLGYRRDTKNYLNLFDIEGVDYGLIKDGISFDKTQIAKNLTLFLYPDDSDKNGELLRIYQQYFMVSNAAQLIIDEAIERGSNLHDLADYAYVQINDTHPSMVIPELIRLLTEKHGFDFDEAVAVVKNMVGYTNHTILAEALEKWPTAYLNEVVPHLVTIIEKLDALVRSEVSDPAVQIIDESGRVHMAHMDIHFATSVNGVAALHTEILKNSELKAFYDLYPEKFNNKTNGITFRRWLEFANQDLADYIKELIGDEYLTDATKLEKLMAFADDKAVHAKLAEIKFNNKLALKRYLKDNKDIELDEHSIIDTQIKRFHEYKRQQMNALYVIHKYLEIKKGNLPKRKITVIFGGKAAPAYIIAQDIIHLILCLSELINNDPEVSPYLNVHLVENYNVTVAEHLIPATDISEQISLASKEASGTGNMKFMLNGALTLGTMDGANVEIAELAGMENIYTFGKDSDTIINLYATASYVAKDYYDNHPAIKAAVNFIISPELLAFGNEERLDRLYKELISKDWFMTLIDLEEYIEVKEKMLADYEDQDLWMTKVVHNIAKAGFFSSDRTIEQYNEDIWHSR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP008926_3 | 1782348-1782442 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of NZ_CP008926_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP008926_3
>3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder CCAAAACCACTAGACATCTCAACATCTGGAACGGGAT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP008926_3
The CRISPR arrays of NZ_CP008926_3 >merge|NZ_CP008926|3|1782348-1782442|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCACTAGACATCTCAACATCTGGAACGGGATGTTTTAGAGCTATGCTATTTTGAATGGTC >NZ_CP008926|3|3|1782348-1782442|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTC CCAAAACCACTAGACATCTCAACATCTGGAACGGGAT GTTTTAGAGCTATGCTATTTTGAATGGTC
>NZ_CP008926.1|WP_002989949.1|1781582_1782245_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNLNFSLLDEPIPLRGGTILVLEDVCVFSKIVQYCYKYEEDSELKFFDRKMKTIKESEIMLVTDILGFDVNSSTILKLIHADLESQFNEKPEVKSMIDKLVATITELIVFECLENELDLEYDEITILELIKSLGVKVETQSDTIFEKCLEILQIFKYLTKKKLLIFVNSGAFLTKDEVASLQEYISLTNLTVLFLEPRELYDFPQYILDEDYFLITKNMV >NZ_CP008926.1|WP_002989951.1|1781251_1781593_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTDTAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSIYSKLLLNNTANNAMIGRLREHNPNKGNITLLTVTEKQFARMIYLHGERNNCIANSDERLVFLGEAFDES >NZ_CP008926.1|WP_032460891.1|1780385_1781255_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDAYKTELIHLSEIDILLLETTDIVLSTMLVKRLVDENVLVIFCDDKRLPTAMLMPFYGRHDSSLQLGKQMSWSETVKSQVWTTIIAQKILNQSCYLGACSYFEKSQSIMDLYHGLENFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSRDLEHPINAGLDYGYTLLLSMFAREVVVSGCMTQFGLKHANQFNQFNFASDIMEPFRPLVDKIVYENRNQPFPKIKRELFTLFSDTFVYNGKEMYLTNIVSDYTKKVVKALNNEGKGVPEFRI >NZ_CP008926.1|WP_038432938.1|1776282_1780386_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MDKKYSIGLDIGTNSVGWAVITDDYKVPSKKFKVLGNTDRHSIKKNLIGALLFDSGETAEATRLKRTARRRYTRRKNRICYLQEIFSNEMAKVDDSFFHRLEESFLVEEDKKHERHPIFGNIVDEVAYHEKYPTIYHLRKKLADSTDKVDLRLIYLALAHMIKFRGHFLIEGDLNPDNSDVDKLFIQLVQTYNQLFEENPINASRVDAKAILSARLSKSRRLENLIAQLPGEKKNGLFGNLIALSLGLTPNFKSNFDLAEDTKLQLSKDTYDDDLDNLLAQIGDQYADLFLAAKNLSDAILLSDILRVNSEITKAPLSASMIKRYDEHHQDLTLLKALVRQQLPEKYKEIFFDQSKNGYAGYIDGGASQEEFYKFIKPILEKMDGTEELLAKLNREDLLRKQRTFDNGSIPYQIHLGELHAILRRQEDFYPFLKDNREKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSRFAWMTRKSEETITPWNFEEVVDKGASAQSFIERMTNFDKNLPNEKVLPKHSLLYEYFTVYNELTKVKYVTEGMRKPAFLSGEQKKAIVDLLFKTNRKVTVKQLKEDYFKKIECFDSVEISGVEDRFNTSLGTYHDLLKIIKDKDFLDNEENEDILEDIVLTLTLFEDKEMIEERLKKYANLFDDKVMKQLKRRHYTGWGRLSRKLINGIRDKQSGKTILDFLKSDGFANRNFMQLINDDSLTFKEAIQKAQVSGQGHSLHEQIANLAGSPAIKKGILQTVKIVDELVKVMGHKPENIVIEMARENQTTQKGQKNSRERMKRIEEGIKELGSQILKEHPVENTQLQNEKLYLYYLQNGRDMYVDQELDINRLSDYDVDHIVPQSFLKDDSIDNKVLTRSDKNRGKSDNVPSEEVVKKMKNYWRQLLNAKLITQRKFDNLTKAERGGLSELDKAGFIKRQLVETRQITKHVAQILDSRMNTKYDENDKLIREVKVITLKSKLVSDFRKDFQFYKVREINNYHHAHDAYLNAVVGTALIKKYPKLESEFVYGDYKVYDVRKMIAKSEQEIGKATAKYFFYSNIMNFFKTEITLANGEIRKRPLIETNGETGEIVWDKGRDFATVRKVLSMPQVNIVKKTEVQTGGFSKESILPKRNSDKLIARKKDWDPKKYGGFDSPTVAYSVLVVAKVEKGKSKKLKSVKELLGITIMERSSFEKNPIDFLEAKGYKEVRKDLIIKLPKYSLFELENGRKRMLASAGELQKGNELALPSKYVNFLYLASHYEKLKGSPEDNEQKQLFVEQHKHYLDEIIEQISEFSKRVILADANLDKVLSAYNKHRDKPIREQAKNIIHLFTLTNLGAPAAFKYFDTTIERNRYKSIKEVLDATLIHQSITGLYETRIDLSQLGGD >NZ_CP008926.1|WP_038432936.1|1775170_1775803_+|TIGR01906-family-membrane-protein MVENTKLLCSWVWLLALAILITIYSTWLWYPLEVDHLKLEQVVFMSKDAILHNYNGLLNYLTNPFVTRLEFANFHSSADGLKHFADVKWLFHLTQVIFLGLLYPTLKTFTQRLKTKRFWLLQKPLILAALFPLMIGLMASFIGFEHFFTLFHQVLFVGDSSWLFDPLKDPVIWILPEVFFLHCFLFFMIVYEIILWSLVGLARWQRLNVE >NZ_CP008926.1|WP_038432934.1|1774406_1775171_+|TIGR01457-family-HAD-type-hydrolase MPYKGYLIDLDGTIYQGKNRIPAGERFIKRLQERGIPYLLVTNNTTRTPEMVRSMLANQFNVETGIETIYTATMATVDYMNDMNRGKTAYVIGETGLKSAIAAAGYVEELENPAYVVVGLDSQVTYEMLAIATLAIQKGALFIGTNPDLNIPTERGLMPGAGALNALLEAATRVKPVFIGKPNAIIMNKSLEVLGIQRSEAVMVGDNYLTDIMAGIQNDIATILVTTGFTRPEEVPTLPIQPDHVLSSLDEWRL >NZ_CP008926.1|WP_023080001.1|1773654_1774407_+|acyl-[acyl-carrier-protein]-thioesterase MGLSYQEELTLPFELCDVKSDIKLPLLLDYCLMVSGRQSAQLGRSNNNILVDYKLVWIVTDYEITIHRLPHFQETITIETKALSYNKFFCYRQFYIYDQEGCLLVDILAYFALLNPDTRKVATIPEDLVAPFKTDFVKKLHRVPKMPLLEQSIDRDYYVRYFDIDMNGHVNNSKYLDWMYDVLGCAFLKTHQPLKMTLKYVKEVSPGGQITSSYHLDQLTSYHQIISDGQLNAQAMIEWRAIKPIESETD >NZ_CP008926.1|WP_023080002.1|1772514_1773645_+|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MSKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIQNQPVDAYLKALIQEFYSYGIRDLKTLYIGGGTPTAITAKQLEYLLNHLERNLNLDDLEEFTIEANPGDLTPEKIAVLQRSAVNRISLGVQTFNNKQLKQIGRSHNEEQIYSTITNLKAAGFHNISIDLIYALPGQTLDQVKENVAKALALDIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLNLPTEDLEAEMFEYIISEMEANGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYFGCGAGASGYLNGIRYQNRVPIQHYLKAVEAGNARLNEEVLRKEEMMEEELFLGLRKKTGVSIQRFQEKFGVSFEERYGNIVRELQNQGLLVKDDAFVRMTKKGLFLGDSVAERFILD >NZ_CP008926.1|WP_023080006.1|1771810_1772452_+|hypothetical-protein MTKQQIEKLADLLPPFAATLYLDMIPEFQEGYASYVYQTPKQDIQKRRIKQLTKNFERLLDTPSFYVMPVTRKTAEQLLADKGLAYHLLSTVAANQVFAAAVNEDQTLFQVLRNGARVAFVILQEKGEFLEMTLGILETVTENEVPAAIVEAVQTYLLADMQEKLPSLSIMVSQESSKLFYQEQGFVLLAKGCKPGNENDSDVCQLVKYFSKP >NZ_CP008926.1|WP_011106808.1|1770331_1771687_+|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGEANVELTPELAFQLGRFGGYVLSQHETERPKVFVARDTRISGEMLESALIAGLLSVGIEVYKLGVLATPGVSYLVRTEKASAGVMISASHNPALDNGIKFFGNDGFKLADDQELEIEALLDAPEDTLPRPSAEGLGTLVDYPEGLRKYEKFLVTTGTDLSGMTVALDTANGAASVSARDVFLDLNAEIAVIGEKPNGLNINDGVGSTHPEQLQELVKETGADLGLAFDGDSDRLIAVDETGEIVDGDRIMFIIGKYLSEKGLLAHNTIVTTVMSNLGFHKALDKQGINKAITAVGDRYVVEEMRSSGYNLGGEQSGHVIIMDYNTTGDGQLTAIQLAKVMKETGKSLSELAAEVTIYPQKLVNIRVENSMKERAMEVPAIANIIAKMEDEMAGNGRILVRPSGTEPLLRVMAEAPTDAEVDYYVDTIADVVRTEIGCDN >NZ_CP008926.1|WP_002989943.1|1783092_1784925_+|elongation-factor-4 MNSQDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRHEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGDVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGIVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYVAASIKTVADTRVGDTVTLANNPAKEALHGYKQMNPMVFAGIYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVHTTDEDMIEVSNPSEFPDPTRVAFIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELSQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYDMSEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKIIVEKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDAKK >NZ_CP008926.1|WP_002989938.1|1786763_1787201_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB METSDELKQRIGDLSYEVTQHAATESPFTGEYDDFFEKGIYVDIVSGEVLFSSLDKFNSGCGWPAFSKPIENRMVTNHDDSSYGMRRVEVKSREAGSHLGHVFSDGPKEAGGLRYCINSAALKFIPYDQMEKEGYAQWLTLFDET >NZ_CP008926.1|WP_038432945.1|1787330_1788350_+|YeiH-family-putative-sulfate-export-transporter MSTHLRKLPGLLLCLLLALPAWCLGRLFPIIGAPVFAILLGMLLALFYEHRDKTEEGISFTSKYILQTAVVLLGFGLNLTQVMAVGMQSLPIIISTIATALLVAYGSQKWLCIDVNTATLVGVGSSICGGSAIAATAPVIKAKDDEVAKAISVIFLFNMLAALLFPSLGQLLGLSNEVFAIFAGTAVNDTSSVTATATAWDAIHHSNTLDGATIVKLTRTLAILPITLGLSLYQAKKEHDIVTEENFSLRKSFPRFILFFLLASLITTLMTSFGVSADSFHSLKTLSKFFIVMAMAAIGLNTNLVKLIKTGGQAILLGAICWVAITLVSLAMQLSLGIW >NZ_CP008926.1|WP_038432947.1|1788556_1788982_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MERKFLIGSHGRLASGLQSSIDILAGMGQALETIDAYVDDSDYTSQIDDFIAGVAADEQGLIFTDLLGGSVNQKMVTAVMNSGKDNIFLITNSNLATLLSLVFLKPGEALTKDEIVTVINESQVQLVDLSPATDSEDDFFD >NZ_CP008926.1|WP_002989934.1|1789000_1789492_+|PTS-system-mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-transporter-subunit-IIB MITQIRVDDRLIHGQVAVVWTKELNAPLLVVANDEAAKNEITQMTLKMAVPNGMKLLIRSVEDSIKLFNDPRATDKRIFVIVNSVKDACAIAKEVPDLEAVNVANVGRFDKSDPASKVKVTPSLLLNPEEMAAAKELVSLPELDVFNQVLPSNTKVHLSQLVN >NZ_CP008926.1|WP_011528593.1|1789508_1790318_+|PTS-mannose/fructose/sorbose/N-acetylgalactosamine-transporter-subunit-IIC MLVPATMAALAVLICFGGNYLTGQSMMERPLVVGLVTGLLLGDMKVGILMGASLEALFLGNVNIGGVIAAEPVTATAMATTFTIISHIDQKAAMTLAVPIGMLAAFVVMFLKNVFMNIFAPMVDKAAAANHQGKLVMLHYGTWIIYYLIIASISFIGILVGSGPVNAFVEHIPQNLMNGLSAAGGLLPAVGFAMLMKLLWTNKLAVFYLLGFVLTAYLKLPAVAVAALGAVICVISSQRDLELDAITRGAINKQTTFDSKESEEEDFFA >NZ_CP008926.1|WP_002989931.1|1790314_1791142_+|PTS-mannose/fructose/sorbose-transporter-family-subunit-IID MTSQDNLTKEDRKMLRSVFWRSWTMNASRTGATQYHAVGVIYTLLPVINRFYKTDKDKAEALVRHTTWFNATMHINNFIMGLVASMEKKNSEDPDFDASAITAVKASLMGPISGVGDSFFWGILRVIAAGIGISLASAGSAMGAVVFLLLYNIPAFIIHYYSLYGGYSVGAGFIKKLYESGGIKIVTKTSSMLGLMMVGSMTASNVKFKTILTVAAKGAKEAASIQDYLDQLFIGIVPLMVTLAAFWLLRKKVNINWIMFGIMFLGIILGLLGIC >NZ_CP008926.1|WP_038432948.1|1791277_1792927_+|sensor-histidine-kinase MRGEQVEEHFKKQLQDDISRHFSYQSLMLSLLLIGLFIIFSLAPQQLGLYRDINATATRYHRLISKQEALLDDLGKNSLLPFLNKNLSTADLSKHYFHLRHSSQTSPELLLFSPSQDLLFASNPHLGNVFSKSVYIQEVLRAAHPPKTLFKVAMDSEDGHYLMIIKPIIDQNQLKGYAFLVMSGKDFLHPTKTLTSELVIADKLDNTFTFSNREFIASSLDKINSQYLHHYFVFQDNRAFITRKVALQGGLWLYMYRPLIPMVSVMLFSLISSAVIFVILQRKSSGLANRIAAKNSRAINQMVRDMSAISRQEKRRIDLESQDEFQYLSDQINQMVERLQQLHDKTLDLETQKLLFEKRMLEAQFNPHFLYNTLETILITSHYDSALTEKIVIQLTKLLRYSLTDSSKPVLLKDDLSVIESYLVINQVRFEELQYSINLSPDLDSLAVPKLFLLPLIENAIKYGLKERHDVKINIACYYQDDHIIFSVRDNGSGIDAHHQKVIREQLEAGESHHGLINSYRRLKYHFSEVSLVFDQGDKQFNVSYHVKE >NZ_CP008926.1|WP_002984836.1|1792930_1793719_+|response-regulator-transcription-factor MYKLVIIEDEHIIRKWLRYAIDYKALDILVIGEAKDGKEGAVLIKESQPDIVLTDINMPIMTAFDMFEATKDQTYAKIILSGYADFPNARSAIHYGVLEFLTKPIEKAALWECLQTIIAKIEKQKGSNQKTDACVYIPLPQMTDQIPEVVKDILEWVHAHFQDKISTSRLAHDLGYSESYIYQNIKKHLQMPLSDYINQYRINQAIQLMQQEPDLMVYEIAQAVGIYDYRYFDRVFKKYLGQTVKAFKEEHFMKDTDRSKPC >NZ_CP008926.1|WP_038432949.1|1793712_1794759_+|extracellular-solute-binding-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP008926_3 | 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder | 1782377-1782413 | 37 | MK448672 | Streptococcus phage Javan117, complete genome | 7926-7962 | 7 | 0.811 |
NZ_CP008926_3 | 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder | 1782377-1782413 | 37 | MK448849 | Streptococcus phage Javan128, complete genome | 7830-7866 | 7 | 0.811 |
NZ_CP008926_3 | 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder | 1782377-1782413 | 37 | MK448850 | Streptococcus phage Javan132, complete genome | 12655-12691 | 7 | 0.811 |
NZ_CP008926_3 | 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder | 1782377-1782413 | 37 | MK448675 | Streptococcus phage Javan129, complete genome | 12135-12171 | 7 | 0.811 |
NZ_CP008926_3 | 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder | 1782377-1782413 | 37 | MK448673 | Streptococcus phage Javan119, complete genome | 11431-11467 | 7 | 0.811 |
NZ_CP008926_3 | 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder | 1782377-1782413 | 37 | MK448845 | Streptococcus phage Javan118, complete genome | 9809-9845 | 8 | 0.784 |
NZ_CP008926_3 | 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder | 1782377-1782413 | 37 | MK449010 | Streptococcus phage Javan90, complete genome | 10515-10551 | 9 | 0.757 |
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1. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK448944 (Streptococcus phage Javan452, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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2. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ccaaaaccactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer gttttatcgctagacatctcaacatctggaacgggat Protospacer . *.*.****************************
3. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ccaaaaccactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer gttttatcgctagacatctcaacatctggaacgggat Protospacer . *.*.****************************
4. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ccaaaaccactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer gttttatcgctagacatctcaacatctggaacgggat Protospacer . *.*.****************************
5. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
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6. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ccaaaaccactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer gtattatcgctagacatttcaacatctggaacgggat Protospacer .* *.*.********.*******************
7. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ccaaaaccactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer gtattatcgctagacatttcaacatctggaacgggtt Protospacer .* *.*.********.***************** *
8. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ccaaaaccactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer gtattatcgctagacatctcaacatctggtacaggtt Protospacer .* *.*.******************** **.** *
9. spacer 3.1|1782377|37|NZ_CP008926|CRISPRCasFinder matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ccaaaaccactagacatctcaacatctggaacgggat CRISPR spacer gtattatcgctagacatctcaacatctggtacaggtt Protospacer .* *.*.******************** **.** *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
158998 : 190226
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP008926|158998:190226|DBSCAN-SWA 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29 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase,integrase,protease | attL 157171:157186|attR 176020:176035 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
204237 : 313227
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP008926|204237:313227|DBSCAN-SWA ATTATATGACTCCTAAGCCTATTGACATTAACAAAATGACTTCAATCAAGTTATTAAAAATATGTAACAAGATAGCATCTTTTAAGTTTCCTCGTCTTTGATAGGCAACAAAGAGAAAAATGCCCATACAGCTGTACATGATAAATTCAACACTATTGGTGGCATGTGGTAAAGCAAAAACAAGAGAGGTCACTAAACCTGCCACCTTAAGTGATTTTCCTTTGAAGAGATCAATCATAGGAAATCCTCTAAAGACTAGTTCTTCCATAATAGGAGCGATAAAAGCTATCACAAGTACAAATAGGGCAGTATAAAGCGGGAAACCACCTTTGATAAGTCTAGCTAAGGTATGTATTGCAGCATCATTAGCACTCACTTGTTGACCAGACCATAGCTGGTTAACAAGGGTACCTACAATAGCTATCACACGGATGATTAACCAAAATAATGCTAAATAACCCCAGTCAACCAATCTCATTTTTTGCTGTTTAATAGGGGTGTCTTGCTTAGCTTGATAAAGACGCCATAATACAATAAGGACACTTCCAACAATAACCAAGTAGAAAATACCAATTCCCCAATTAAGTACCATAGGAATATCGTGTTGCTTTTGCAATAAAATCATCGGAAGGACATTGAAAACCATAGCCAGAATAATGAGCACTGCTATTTTTAAATAATTAATGAATCCTTTCATAAACAGTCTCCTTTTAGGCTAACGGTAAAATTGTCTGGTCATTGTTGCACTCTTAACGAGTAAATAGAGCTGAATTAACACCAAAACTAAGATGGCTGTTAACTCCACTTGACCAGTGAATAGATAGACAAAAAATAAAATCACATACAAGGAAGGGATGATGACTCCATTTAATGACAACACACTTTCAAACGATGTCTTATGATAGGCTTGTAACTCTGCCTCATCTAGAGCCATGATATTATGTTTTAATTCTTTCAAATTTGGAAAATAAGGAACATCGGTTCCCCGAATGGCATTGTAACGTTTCATGGCTAAAGCTTGAAAAGGAATGACCATTAATAATAAAAGGATATCCAGAAGCGGAATGGCCAGCATGGCATGCTGTGAATCATTAGTTAAGGTCAGACCAAGTAGCACATTGCACATGGATAAAATAGAAGCTACGGCAATCAATAACATGGTATAAGCATGCTTTTTATTCAGCTGACGGTAACCATTTTCAGAATAATCATCCTCTTCAATTGTGTTATAAACAGCTGTCTCTTTTTTCAGTTGCGTTAAAAAAACAAAAGAAAGTGTGAGGCCTGTGACAACTACTAGACGATTTAATAAGATAATCAGGTTAATCACATCATCTTTTAGGAACGTGAGCTGATCTAATCTCTCTCCATGGTAACCTAAAAAGGCTCCAACCATGCCACCTATAATCCCTCCCGCCAAACTTGATAGCAATAACATTTTTAACAAGCGTAAAAAACTATTCTTCTTCTTTTTCATTCCTCGACCTCCACTAGACGAAACACCTCTTCAACTGGTTCCTGAAATACCTTTGCAATTTTCATGGCAATTATAACTGATGGGGTGTACTCGTTACGCTCAATGAGACTGATGGTCTGCCTCGATACTCCTGCCAGTTTAGCCATTTCCGTTTGATTAATTCCATCTCTGGCTCGTAATTCTTTGAGCCGATTTTTAAGAATAACCTCCATTGCCATCTCCTTCATTCTTCTTTAACTTATAACTTACTTTCTAAAATAAGAAAAAGTATTCAACAGCAAGGCTAGTCCTGTAAAGCCCAAAACCAGATAACTCAAGGGTACTCCAAACCAGATTACCCTGATAAGATGATAACTTAAAATGAAAAGAGTCAGGATACTTGCCCATAAGCAAATCTGCCTCTTAAGTTTGATACCATGTGTCATTTTCTCTAACACCTCCTCATGTCTATTTGTTACTATCATTGTAACATATCTTTTTCTTTTTGACAACGATAATAGTCAAAAAGGTTATGATAATAGTCATTTCAAATATAAAAAACCAAGTTCTAAATAACTTGGTTTTTTATGGGTTTACACTGTTTCAGCAACTGCTGCTAGCAGCTCTGCAATTTTACTTGCATCGCTACCACCTGCCATAGCCATGTCTGGTTTACCTCCACCACGACCTGCTACAATTGGTGCCAATTCTTTGATCATGTTACCAGCGTGGACATCTTTGGTTTTGCTTGCAACAAGGACATTAACCTTCTCACCAATAGCTGCTACGAGAACAAGCACATCAGAGTAGTCTTTTTGTTTCCAGTTATCAGCAAATGTACGAAGTGCCCCTGCATCTGCAACATCAACTTGACTAGCAATGAAGCGCACGCCCTTAGCTTCTTGAACATCTTTAAAGACATCACCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTTTTTCTTTAAGTTCTGCATTTTCTTTTTGAAGATCACGAAGTGAGTCGCTAAGAGCTTGTACTTTAGCTGCTGCATCTTTCAATTGCGGAGCTTTTACAGTAGCAGCGATCTCTTTTAGGGCATCCTCTTGGTTACGATAAGCTTCAAAAGCTTGTCTACCAGTAACTGCAATAATACGACGAGTGCCTGAACCAATACCTTCTTCTTTGACAATCTTGAAGAGACCGATTTCTGAAGAATTATTTAAGTGAGTTCCACCACAAAGTTCAACAGAATAATTACCAATTTGAACCACACGAACCACTTTACCATATTTCTCACCAAAAAGCGCCATTGCTCCCATCTCTTTTGCGGTTTCAACGTCAGTTTCAGTCGTTGTGATTGTAAGAGCGTTCCAAATTTGCTCATTAACTTCTTGTTCAATGTGACGAAGTTCCTCATTGCTTACTGCTTCAAAGTGAGTAAAATCAAAGCGCAAGAATTCTTCTTCGTTCAATGAACCAGCCTGAGTTGCGTGTTCACCGATAACATTGTGAAGGGCTGCATGGAGCAAGTGAGTTGCTGTGTGGTTTTTCTCAACAGCCAAACGACGCTCTTTGTTGATTTCAAGTGTGTAGTTTGTTCCAACTGAAAGTGATGCTAAAACGTTTACAGTGTGTAGAGGTTGACCATTTGGTGCTTTTTGAACATCAACAACCTCAGCAACTGTGTCACCCTTATCATTTTTGATTCTACCTGTGTCAGCAACCTGTCCACCCATTTCAGCATAGAATGGTGTTTGAGCAAAGACAAGAAGGGCTTGACCTTCTGAAACAGCTTCGGTACGTTCATTATCAGCGATGATGACTGAAAGACTTGATTCAAGACTATATGTGTCGTATTCGAATCGTGATTCTTCAACAATACCAGCTAGGGTTTCATTTTGCATCCCCATTGAACCACCCCTAACAACAGCTGCACGCGCACGGTCTTGTTGTTCTTTCATGGCTGACTTAAAGCCTTCGTGGTCAATCTTGTAGCCTGCATCTTCTGCCAATTCCTCTGTCAATTCAACCGGGAATCCATAAGTATCATAAAGTTTGAAGATATCTTTACCTTCAAGTGTATCTTTACCTTCAGCTTTAAGCTGCGCAAGCAATGAATCCAAGTGACCGCTACCTGCATCGATAGTACGAGCAAATGTTTCTTCCTCACGTTTAACGATTTTCTCGATAAAATCACGTTTTTCAAGCACTTCTGGGTAGTAGCTTTCCATGATTTGTCCAACAGTTAGAACCAATTTGTAAAGGAAAGTTTCGTTGATGCCAAGACGGCGGCCATGCATAACCGCACGACGGAGAAGACGACGAAGAACGTAACCACGACCTTCATTTCCAGGAAGCGCACCATCACCGATAGCAAATGAAAGCGCACGGATGTGGTCAGCGATAACCTTGAAACTCATGTTGTCGCCATCTGGATCGTAAGTTTTACCTGACAATTTTTCTACTTCACGGATGATAGGCATGAAAAGGTCAGTTTCAAAGTTTGTTTTTGCCCCTTGCATAACAGCTGCAAGACGTTCAAGACCAGCACCCGTATCAATGTTTTTGTTTGGTAATTCTTTGTATTCTGAACGTGGTACGGCTGGGTCAGCATTGAATTGTGAGAGAACGATGTTCCAGATTTCGATGTAACGATCGTTTTCGATATCTTCAGCCAAGAGGCGAAGTCCGATATTTTCTGGATCGAAATCTTCACCACGATCGAAGAAAATCTCCGTATCTGGACCTGAAGGACCAGCACCGATTTCCCAGAAGTTATCCTCGATCGGCACCAAGTGACTTGGTTCAACGCCACAAGCAATCCAACGGTTATACGAATCCTTGTCATCTGGGTAATAAGTCATGTAGAGCTTGTCCTTAGGAAAGTCAAACCATTCAGGACTTGTCAAGAGTTCAAATCCCCACCCAATAGCTTCATTACGGAAATAGTCTCCAATTGAGAAGTTACCAAGCATCTCAAACATAGTATGGTGACGTGCTGTTTTACCAACATTTTCAATATCATTAGTACGAATTGATTTTTGTGCATTGGTAATACGTGGATTTTCTGGAATCACTGAACCATCAAAGTATTTTTTCAAGGTTGCAACACCTGAGTTGATCCAAAGAAGCGTTGGGTCATTCACAGGAACCAAGTTAGCTGAAGGCTCAACGCAATGTCCTTTAGATTTCCAGAAATCCAACCACATTTGGCGGATTTGTGCAGACGATAATTCTTTCATAAAAATTTAGATACAAAGAGTAAGAAAAACAGTGTTATGCTGAAGCTAGTAATGTAATCACACCAGTTGACACAGCTCGTCTTTCTTGCTAGGAGATCAGCTATAAGCCTGGCAGCCTAGTCTACTCTATTCCTTTCGTTGATTTCAAATAGTCCTCAATACAAAACAAGTCCATCTCACAGAGGGCGAAAACCGCGGTACCACCTCTATTCAATGAACTTGTCATTCTTAATTTACGATATCAATTGTTGTAAAGTTAAGTAGCATGTTTATCTAATTATCAATGACTCGCAGCAACCGTCACTTTTCTGTATCTAATCCTTGATAAACAA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114 | Streptococcus_phage(55.71%) | portal,integrase,terminase,protease,transposase,holin,capsid,tail,tRNA,head | attL 246649:246668|attR 290910:290929 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
413265 : 476220
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP008926|413265:476220|DBSCAN-SWA ATTATCTGCCAATGATGTCCCCTACTTCAAGTTTTCTACCAATGCCGTTTAAAAAGTCTATTATTGACATTTTAGGTTTACCAGCCGGTTGCACAACGATCAAGGACAAAGCACCTTGTCCAGTAGCTATTACCAAAGATTTTTTGGTTTTGACAATAACTTGTCCAGGTAATCCTTCTCCTTCAGCTAATTGAGCTTCGTAAATTTTTAAACGTTGCCCCTCTAAAAACGTATGCGCTACCGGCCAAGGGTTCATACCTCGAATATGATTGAACACTTCTTGATTAGACATTGTCCAATCTAATTTTTCATGTTCTGGAGAGATATTAGGTGAAAAAGTAGCTTGGCTGTGATCTTGAGGAATAGGTTTTAATTCTCCAGAAAGATAAGCTGGCAAACTATCCAAAAGTAAGTCTCGACCAATGATGGCTAATTTCTCAAAAAGAGTACCTACATTATCGGTTTCAAGAATTGGAGTGCTTGCTTTAGCGACCATGTCACCTGCATCCATTTCTTTAATCATTTCCATAATAGTAACGCCGGCCTCTTTATCTCCATTCATAATAGCATAATGGATAGGTGCTCCACCTCGATATTTAGGTAACAATGATGCATGTACATTAATAGCAAATGAAACTGAATCAAGTAATATTGTTGGTAAAAATTGGCCAAATGCTGCTGTAATAATACCATCTGCACCAAGTCCCATAATCTCAATGAGTTCTTGAGAGCCTGATAATTTTTCCGGCTGATAGATTGATATTCCATGCTCAAGAGCTAATTGCTTTACAGGTGTTACCTTAATATCTTTTTTGCGTCCAACAGCTCGATCAGGCTGAGTAACCACTCCTAAAATCTCATAGGCAGGATTATCTAGCAAGCCCTTCAATACAGTTGCTGAAAATTGGGGAGTTCCCATAAATAATAATTTTATCATGACTTTCCTCTTTGTATTTTTATTATATCATAACTGATCATCCTAGATTTAGTGATTTACCTTATAAAAATTGTTGCGGTTCACAATCAATAATTAGTTTTAAATGACGATTATCTGCTTCTTGACTCCAATCAAGAATACGATTGAGCGTCTCTTCTAGGTTATCTTCAAAACGGTATTTTAACAAAATTTGATAGTGGTATAAATTGTGTGTTCTAGCAATTGGCTTAGGAGTCGGTCCTAATATTTTAATATTATCCGATAAGTGACTCTTTAGCAGTTCTGTAACTTGATAAGCTTTTTTTACAACCGATGCTTCTAAACGATGCGAAAGCGTAATACCCACTGTAAAGTAGTAAGGGGGATAAGCCATCTGACGGCGAATCGCCATTTCATAACGGTAAAAGGCTTCAAAATCTTGTTTCTTAGCTAATTGAATAGCATAGTGATCGGGATTATAAGTTTGAATCAAGACTTCTCCTGGCTTATGGGCACGGCCTGCCCGACCAGCAACCTGTGTTAACAATTGAAACGTTTTTTCTGACGCTCGAAAATCTGGCAAATTTAAGGAGGTATCTGCATTTAGTACCCCAACTAAAGTCACATTTGGAAAATCCAGACCTTTGGCAATCATTTGCGTCCCTAACAAAATATCTGCTTCCTGGCGACCAAAACTATCTAGTATGGTTTTGTGACTTCTTTTTTTTCGTGTAGTGTCAACATCCATTCTCAAGATCCTAGCTTCTGGGATAACCCCTTGCAATTCATCAAAAGCTTTTTGAGTTCCAGTGCCATAATAGCGGATACTATTGCTATGACACTCAGGACAAGTAATTGGGATAGTTTTTTGAAACCCACAGTAATGGCAATTCATAGTTTTAGTATCCATGTGAAGGGTTAAAGAGATATCACAGTTGGGACATTTGTCCACATAACCACAGTCCCGACACATCACAAAACTAGAATAGCCACGTCTATTTAACATTAAGACAACTTGTTCTTTTTTAACCAAACGTTCTTTAATCTTATCAATCAAATATGGGGTAAAATTACTAACTGCTTGCTGTCCAATATAATCACGAAAATCAACAATCGTTACTTCTGGAATCTTAGCAAGAGGGTTTGCTCTTTGCGTTAATTGAATAAAATGATAGACACCCTTACTAGCCCTTGCTCGGCTTTCAATACTTGGCGTAGCAGAGCCCATAACCACAACTGCTTGATGGTGTTTAGCTCTGAGCAGGGCAACCTCTCTGGCATGGTATCTAGGGTTGCTTTCTTGTTTATAGGTTGATTCATGCTCCTCATCGATAATAATTGCACCAATCCGCTCTAGTGGGGAGAAAATAGCAGAGCGGGCACCAACCACAACCTTAGCCTGTCCTGTTTTTATCTTGCGCCACTCATCAAACTTTTCACCATCTGATAAGCCTGAATGCATAATAGCCACTTGCTTTCCGAAACGGGAAATAAAACGAGAGGTCATCTGAGGAGTCAACGAAATTTCTGGCACTAAAACAATGGCTGTCTTATCCTGTTTTAAAACCGCTTCGATGATATGAAGATAAACTTCTGTCTTACCCGAACCTGTAATCCCTTCAATCAAAAAAGGGTTACTCGGTTTCCCAATTTGTTCAACAATTTCAGTAACAGCTGACGCCTGCTGTTCATTTAAGGTTAAAAAAGAAGATGGTTTGATCTGGTCAAAATAGGACTCACTGCGATCAATTGGACGTTCGTCAATACGAATTAAGTGATTTGTCACAAAGTAAGTCACCACATCTCGAGAAAAGGCTTGATAAAGCGTTGCAAGTTTAGCTTCCTTCGTATGGGTTAGCAGATAGTCTTTTAATAATTGACGCTTTTTGGCACGACTAGAGATGGGATGTACCGCTAAGGTGTCTAAGTCGACGTGATAATATTTTTCTGTCTTTAGGTTTTTCTTGTCTTTGGCTAAATAACTAACAGTAATATGCCCAGCTTGTATGGCCTTAAGAGCTATTTTTTCCTTCTCGCGGTCTAAGGTAGAATATAAGACAGATGGTTTTCCTTCAAAAAGAAAGTCTCTATCAGGCTTTTTTAGACCTGACTCTGGCCTTAGCACTTTATCATAGTTAGAGTTAAGAAGATTAGGAATCATTGCTTTTAAGAGCGTGATTTTATAAGAAAAAACTGTTTTTCGAAGCTGATCAGCAAGGGTCAATTGTTCTTGGTTTAGGACTGGCTCAGGATCTAAAACGGTCTGAATCAGTTTAAGAGAGCTTGAATCTTCCTGGCCAAAACCAATAACAAAGCCTTGCAACAAACGATTCCCTTTTCCAAAAGGAACATGCACACGAGAACCAAGCTGCACGAGAGAAACTAACTCTTTTGGAATACCATAAGAAAATGGCTTGTCCGTTTGCATCAATGGAATATCTACAATCACATGAGCTACTTTTTCCATTTGCTTCTCCTTTTCTGTCATGGACATCGTACTAAATATGAAAAAATCTAAGATTTCTGAAACCTTAGATTTTTTCTCCTTCTTCTTCTTTTTCTTTGGCAATTTGTTCTTTGATTTTACGTTCCTCTTCCTCTTTGGCCAAGCGTTCTGCCTCAATCTTAGCACGGACAGCTTCACGTTTAGCTGAAGGATCTGGGTGAATCACAACGTTTCCTGATTCAATTTCTTCAAGTGCCTGAAGTGTTGACTTCACTGATTTAAATTCTTGAGTTGGAGTGGCACCAGCTTCTAGTTCATGGGCACGTTTGGCTTGTAAAATCACAAGTGAATACTTAGATGGTACTTTATCTAATAAGGTATCAATGGAAGGTTTTAACATCATAATGCTTACTCTTTTCTATTTAGCTTTAAAGGGATTTTTTGTTATTTTAATCATTTTATCATAACGACCAATCACGCGCTCCACACGAAAGTGTTCTGTCTCAATGATACGCTTAACCCGCTCAGCTGCCAAGGCAACTTCATCATTAACAACTGCATAATCGTATTCGCGCATAAGGGCAATTTCTTCTTTTGCTCTTTCAATACGTTGAGCTATGACTTCTTGACTATCTGTACCACGACCAACCAGGCGGTCTTCTAATTCATCTAAATCTGGTGGTGTTAAAAAAACAAAAACACCATCTGGTACTTTTGACTTAACCTGAAGAGCTCCTTGAACTTCAATTTCTAAAAAGACATCAATTCCCTTATCAAGAGTCTCATTAACATAAGTTAAAGGGGTGCCATAGTAATTACCAACATATTCAGCATACTCTAGCATTTGACCAGTTTTAATGAGTTCTTCAAATTCTTCACGTGTGCGGAAGAAATAATCAACCCCATCAACCTCGCCCGGTCTTTGCGGACGAGTCGTCATTGAAACCGAATATTCAAATTTATGATCTGGCGTTGAAAAAATTTCTTGTCTTACCGTTCCTTTTCCGACACCTGAAGGGCCAGAAAAGACGATTAACAAACCGCGTTCAGACATTGTATTCTCCTTATTAGTTGCTTTTTAATAGTTTATCAAAAAGACTAGTCTTTTTCAAGAACATTTTCAAAGGCAAGTCATAAAGAAAAAGAGGATAATTCCTCTTTTTCTACTTGGCATAATCAACCGCTCTCATCTCACGAATAACAGTTACTTTAATATTTCCTGGGTAATCTAGATTGTTTTCAATTTTTTCTCTTACTTTATGCGACAAAATGACAACCTGATCATCTGAAATTTTTTCAGGTTGAACCATAATACGAATCTCACGTCCAGCTTGTAGAGCAAAACTATTTTGTACCCCATCAAAACTTGTCGCGATTTCTTCTAAATCACGAAGACGCTTAATGTAATTCTCCATTGACTCATTACGAGCGCCTGGACGAGCCGAACTGAGAGCGTCTGCTGCAGCTACTAGCACAGCGATCACAGAATCTGGCTCCACATCTCCGTGGTGGCTAGCAATAGTGTTGACAACAACTGGATGTTCTTTGTATTTACGTGCAAATTCCATTCCAATCTCAACGTGACTACCTTCAACCTCACGGTCAATAGCTTTACCCATATCATGCAAGAAACCAGCA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74 | Streptococcus_phage(79.25%) | portal,integrase,terminase,protease,holin,capsid,tRNA,tail | attL 430119:430134|attR 476249:476264 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
645751 : 694137
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP008926|645751:694137|DBSCAN-SWA CTCAGTTCATAAATTCCGAATCTATTCCTAAAAAAATATCATCAACGGAAACCGCTAATGCTTGTGCAATACCTTTTAGCTTCTCATATTTTGCTCGCCTTAGCTTTTTAGTATCTTTTTCATACCTAGCAATCGTTCTGACAGAAATGCCTGTTAAGTGAGACAATTCCTGCTGTGTCATTTTCTTTGTTGTTCTTAACTCTTTTAAAGTTGATTTGGTCACAATTTTCCCTCCACACTAAAATGAGATTAGTTAATCATGTTAAGTTTATTATAAACTTCGGTTTTTATGAAGTCAAGTTTTTAGAGAGTTTTTAGACCATCTTTTACGATACCTTTTGCTTTAACCTCTTTTATGGTATCATATTTTATATAAAGAAAAGGAGAAAAATATGTCCGCCAAGAAAACTTTTTTTGCAAGTAATTTAAAGTACCTTAGATTAAAAAAGAACATGGAACAATTAGAACTTGCTAATCTCCTAGGACGAAAAAGCTCTTCTTCAATCAGTGAGTGGGAAAAAGGAAAATATACTCCAAAATCTGGTCTATTAAGTGATATTGCTGCTATCTTTGATGTTAGTTTAACCGCCCTAATGGAAGAAGATTTAACCTTAGAAAGTAAGGGAGTCTCTTATCAGTTGCCACAACGAGAGTTAGCGATGATTTCAGAACAATTATCCGAAAATAACTACACTAAGTGGGTTGACTTCGCACAAATTCTTTTAGAACAACAAGCTAAAGAAGATCGTGAATTAGATAACCACTAAGTCGGACTAGTCTATGACAAAAATAGTCCATTTCTAGACTTATTCTGTCATTAGCCAGACCCTTGCTGCTAATCCATCTTATCCATAGCGACTTTCTTACTGATACAGGCTAGTCTACTAACTGACATTGTTTTTATTGCCTCTTTTTATGTGTTATAATAGTTAGTATTAAATTAAGGAGAGTATAGTCTTATGATGAACATGCAAAACATGATTTATCATATTTTAGGTAACTTTGAATAACTTAAAAAGCCTTTAAATAAAGGCTTTTTTTGATTATCTTTTTAAATAGCATTTAAATAAACGGAATTAATTAAAATATTTTTGTCCCTTTTTTGTCCCTTTCACCTCAATTCCATTAGCACTTCTCCCGCTACTTCAACTGTCATAACCTCCCACGGTCTCACAGGCTCACCGGGCAAAACATAATCAAAAATCTGTCCGTTTTTACGCACGATCATAACTGTGTCTGCTGTGATATATCCATTGTCAATTGCTTGTTTAAACTCGTCGTATGTTAGCATTTTTACCCTCCTACTTATTTATTCGTATTTTACAGGAAATAATATAATTAAATTTAAAGGTCGTTTAAATTTAATTAACATCTTTTTTGTTACAAACTAAAATATTGATTGTTAGCGAATATTAAATAAAAAGAAATTTTAGCGTAATATTATTGATAAATTAATTTTATTAATTTTAAGTTTTTTTAATTTAAAGTGATATAATTAACCTGTAAATAATAAAAGGAGGACATGGATATGTCTAAATCAAATCGTCGTACTTGGCAAGGTTTAGTTGTTATTTTAATAGCTATTCTCACCACTTTTACCACAAGTACTGTTACGGCAGCCAGAAAAATTAGAAATTTCCCTGATACCACGGAAATTTTGTTAGGAACGAAGGCGACTGAGACACCAGGAATCTTACCATTCACTGGTAGCTACCAATTAGTTTTGGGCGATCTTGACAATCTGCAAAGGCCAACCTTCGCACACATCCAGCTAAAAGATCAAGATGAGCCTAATATTAAACGAAAAGGACTTAAATTCAATCCTCCTGGCTGGCATAATTACAAATTGACTGACGCTAATGGAAAAACAACTTGGTTAATGGACCGTGGCCATTTAGTTGGTTACCAATTTAGCGGCTTAAATGACGAGCCTAAAAACCTAGTTACAATGACAAAATATCTTAATACTGGCTTTAGTGACAAAAATCCTTTAGGAATGCTCTATTATGAAAATAGATTAGATAGCTGGTTAGCTCTACACCCTAACTTCTGGCTAGACTATAAAGTTACTCCTGTTTATCATAAAAATGAGTTAGTTCCTCGCCAAGTAGTTCTACAGTATGTTGGAATTGATGAAAATGGAGATCTACTTCAAATTAAGTTAGGTAGTGAAAAAGAAAGTGTAGACAACTTTGGAGTAACATCAGTTACATTAGATAACGTATCTCCTTTAGCTGAATTGGATTACCAAACAGGAATGATGCTAGATTCAACTCAAAACGAAGAAGATAGTAATTTAGAAACCGAAGAGTTTGAAGAAGCGGCTTAACATAAACTTATACTTAATAAAAATATCTAGATTGTGAACATTATCCCAAATGTTAGATTATTTATTTAATATTTGGGGTAATTTGTATAAAGTTAAATTTTGAAGAAAAATTAGTATAGGCTACTATCTGTGCTATTTTTTAAAAAAACAACGTCTATTTAGAAAGTCCCTTAAATAGGACTTTGAGAAATTAGTCTGTTTTAACGGCCTTTGTTGAGGATGATTGAATCGAGTAATATGTATAGTAGATTGAAAGAAAAAGGGTGATTTTATGAAAAGGTCCAAAAAAGCATCGTTACTTAGTGTTATTGTTGGAATGGCTTTAGCTGTGATACCAATTTAGATTGTTAATTATGACAATGAACTTATCGTTCTTTTAATGAGTATTTTTTTTAATGGGATAATTGTTTCCGCTTTTGAACTTATTAAAACATATGATGGTTTGCAGGAAGAATATAAAAAGCTAACTGTAGATAGATGGAAGAATACTATTTTACTGGCTTTCAATTCATTATATTTTGCTTCTATTTTGACAAATAGTCTATCAAATAATTTATCGACCATTTTATCAACTAATCGTTCTGACAAAGTAAGTGCAATATTTCTTACAGGTTGTTCTATTTTAGCACTACTTCCATTCCTCCTTCATAGGTTAATAAAACGAGAAATAGAAATTGAAAATGAAAGAAAAAAATTAAAAAAATAATTACTTATAACACAAAAAACCGCCCTCAATCAAGAGAGCGGTTGGCTTTTTATTTAAAGAGACAGTGACTAACTACAGTTGTTAAAACAAGTAAGAACATTAAAGAAAAATAAAATGAATGTCTCATGAGAAAATGACGCCATTTATGCCGACACCCATTATCACATTTTGACGAATAGCAGTTACCAAAATTTTTACCTGTAATTCTAGCTACCCACAGCAATAAAGAATACATCAATGTCAATACACCGATTAGCATTAGACTTGAGACAGTAATCATCCTTGATAAATCAAGAGTCTGAAGATCATTACCAATGTCAAATATCGCCCTTGCTACATCTATACCACCAAACATAACAAAAACAAAAGCTGAAAACACTCCTAAGATAGCAATAAAGTCTGTGTAGATTGAAGATTTTGTATTCCGAACATCATCCACTCCTTGCTTAACTTTTTGCAAAACACCGTCAGTCTCTGCGGATTGTTTTTTTAATTCGTCATTTGTAGCTGCAAGGTTAGAAGTTTCTTTTGCTAATGTGTTTAGCTCAGGGATAATCTTCTCCAGAACATCTTTAGCTTCTTGAGAGTTTTTAAGTATAAATTTTTTCTGAGTTTGAGCTAATGAATAATTGCTTTTTATTTTATCGAGGTTTTTTATCAAAATATCTTTTTGTGTATCAGTCCCTGAAAATTCCGAAATAATAAAGTCGATATTTGAGTTTAATTTCTCATTTTCTTCAACGCTATCTTCGTGACTATACACATATTCAGCAATTATTTCATAAGGAATTGTGACATTATCTTTAGCCATTTCCCTATGATAAACCTTTAATAAAGTGTCTTGATTATTTACTGGTGCTTTGCAAAAATTAGCATCTAGTAATAATTCCATAAACGCTGGAGCTATTGTACCCATATTTTAGCCCCTGGATTATGTCCAAAAAAGTCTTTTATTTCTTCGATTGTATATTTAATTCCTTGGACACCGTCCATTATTCTATCCTCATACTTTTTCCAAGGTGTATGGTCGTGAGTAATATCAACAAGTTCGAACGGGCCGAACCCATGCAGAGCATCAACTGTATTCTCAATCAATTGAGTATTCTCTACTTTTTGTGAGTCATATTCAGTTATCTCTAAGTCAGATAACTCCCCGAATGGGCTGACGCTGAATTCAACATATTCCATAATCATCTCGTCTGTAGAAATGGAAAAAGCTCCAAAACGTTTATATTCATGATAGACATCAGGAACAACCGGTCCATACTTCCACTTTTCCATACTCTCTTCAAAAAGCGGAGTTCCATTTTCAAGAATGTTTCTTACATTAACGAAGTATAATAATTTTTGCAATTTAAGGTTATTAATTTTGTAGCCTTTTTTATTTGAATACTCAATTATATAATTTGCAACAAATAACGCATGCATCTCAATTACACCTCCTTTTTCTTAATTATAACATATTTGTCAAGTACTATATCTTGTTAGCTAAAAAGTTAGCTAACACTACATCTTGATTAGGATACCAAAAAACAGCCCCCGCAAAAAGCGAGGGCATTTGTCTTATCTAATTTAATTTACCCCAAATACTGATGCGGTTGCCATCCTTATCAGTCTGCCCAATAGCTAGGTAGTCACGCATACCTGAATCTCCAACATAGCTAATCCAGTAATAGCCATTAGCGTAGCCCTCACTATCAAAGCTAACGGTATCGCCTTGCTTATAGCTACCTACTACTTCACTGGCTAGGCTTGGCCAACGTCTAATATTAATCTCTGCGACATCTAGGGTAAAAGTACCTGTTTTTGGTATCTCTACGATAGTGTCAGACGTTTGCGGCTCGGTTCTGACTGGTTGCGTGACTGTATCCCCTTGATATGGGGGGTAAAACCAACCTATCACGCCAGTAAAGTCACGAGTGTTAAAACGAGCTGGTGCACCGACATACAAAGCATCAGGATTGC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72 | Streptococcus_phage(30.51%) | portal,integrase,terminase,holin,tail,head | attL 662572:662586|attR 699556:699570 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
920938 : 940406
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP008926|920938:940406|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP008926|920938:940406|930506_930836_+|WP_000174505.1|DBSCAN-SWA MTLPENYRRVLNLIKVGADNPITGAEISLILKLEERSVQSIISSLITRYNIPIIGIRHGFNRGYFIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQERLSVLLNADLTSYKELLKGG >NZ_CP008926|920938:940406|929611_929944_+|WP_002992497.1|DBSCAN-SWA MKYRVETNPFSKDRYTPEQLEMFKNRQLSKNKAEAYFTRLYNQHIAWVIIANVMTEYVIKFRKSATSFEEAWDALDYQRTTEIVFRAVNGLPCSEKDSGELETYLSEVSA >NZ_CP008926|920938:940406|931111_931969_+|WP_011185073.1|DBSCAN-SWA MTIYEARGFSSYLYPYKGQLEPFDYIAQFKPLKPPEDIDIEEYKRTQAPYCLSGKVTAEKNGSYKRNNASLVYRDLIFLDYDEIETGVNLPKIVSETLWEYSYIIYPTIKHTPEKPRYRLVMKPSDVMTEATYQQVVKEIADKIGLPFDLASLTWSQLQGLPVTTGDPEDYQRYVNRGLDYPVPKNGSTPNRQVVTTYTPRPRSQRSITMRVIDTLFNGFGDEGGRNVTLTKFVGLLFNKWVDCDLETAYELVQIANSVTTKPLPIDEIDRTFTSIAKAEYRKRG >NZ_CP008926|920938:940406|927799_928000_+|WP_002992502.1|DBSCAN-SWA MTVGDKIKTIRLNLGETMEEFGKRFGTSKGTVNNWEKGRNLPNRNSLLRIAQLANQTVSDFLAITD >NZ_CP008926|920938:940406|930147_930510_+|WP_000206026.1|DBSCAN-SWA 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23 | Streptococcus_phage(64.71%) | holin,integrase | attL 924137:924157|attR 937707:937727 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1039029 : 1051332
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP008926|1039029:1051332|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP008926|1039029:1051332|1039029_1042755_+|WP_038432701.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAQLYLVNKNITEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKAEQDLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYECANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDDVKELWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGEIIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTTTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKDNFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQTDVLEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >NZ_CP008926|1039029:1051332|1050840_1051332_+|WP_023079042.1|DBSCAN-SWA MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKSRVLSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >NZ_CP008926|1039029:1051332|1046314_1047862_+|WP_038432705.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDNAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDITYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTTQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVVLKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIATAGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >NZ_CP008926|1039029:1051332|1047920_1049045_-|WP_038432708.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTFISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFTVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL >NZ_CP008926|1039029:1051332|1045587_1046142_+|WP_002986700.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI >NZ_CP008926|1039029:1051332|1042915_1044370_+|WP_038432703.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSSFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTENKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDRGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHVVDEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >NZ_CP008926|1039029:1051332|1044397_1045420_+|WP_014407190.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGVLGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYVATGKNNPVKFEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGQDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENIPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHDEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADASVVIK >NZ_CP008926|1039029:1051332|1049297_1050563_+|WP_038432711.1|DBSCAN-SWA MKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFANGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVETIVKPVLEGMVAEGRPYLGVLYAGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQKDGVTLGVVVASEGYPLDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGVKFAENSELLLSNGGRVYMLVTAEDSVKAGQDKIYTQLAQQDPTGLFYRNDIGSKAIRE |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1329081 : 1426554
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP008926|1329081:1426554|DBSCAN-SWA 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100 | Streptococcus_phage(20.69%) | transposase,bacteriocin,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1624644 : 1699882
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP008926|1624644:1699882|DBSCAN-SWA 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68 | Streptococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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