Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009229 | Treponema putidum strain OMZ 758 (ATCC 700334) plasmid pTPu1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP009228 | Treponema putidum strain OMZ 758 (ATCC 700334) chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,casR,PrimPol,cas9,cas1,cas2,csn2,DinG,WYL,csa3,DEDDh | 0 | 2 | 1 | 0 |
1. NZ_CP009228
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009228_1 | 232873-232957 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009228_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009228_1
>1.1|232896|39|NZ_CP009228|CRISPRCasFinder TAATCATAGATAAACAGTGAGGCACCATTTGTACCGAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009228_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009228_1 >merge|NZ_CP009228|1|232873-232957|CRISPRCasFinder TGTTTATCGAAACTCCTAATAAATAATCATAGATAAACAGTGAGGCACCATTTGTACCGAACTGTTTATCGAAACTCCTAATAAA >NZ_CP009228|1|1|232873-232957|CRISPRCasFinder TGTTTATCGAAACTCCTAATAAA TAATCATAGATAAACAGTGAGGCACCATTTGTACCGAAC TGTTTATCGAAACTCCTAATAAA
>NZ_CP009228.1|WP_044977482.1|231779_232715_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKNFKKIFFVLAMLLAAGTMVFAGGAKEASLPSVDLTMDRAGDPVVLPAKVEKIVSMAPSTTEILIDLGVADKIIAADTNTQKDGLLKQDIPYFDMMKPDAEKLIALKPDVVFISGMSNSKGTTPFSPLIDAGICVVNIPSSSSIDAIYLDIAYIAAVVKQEGKGAKIIANMKKEIEAIRKKGASIAEDKKKTVYFEIGAAPYMYSLGTGTFINEMIEIIGAKNIFADQKNWIAVSEEMVLAKDPDIILTNVSYIPNPIDEIMARSGWTSLKAVKGKKVFGIDNNSSSRPNHNIIKALKEMAKAVYPEIYK >NZ_CP009228.1|WP_044977480.1|230760_231780_-|iron-ABC-transporter-permease MKLQFKLAGSVAACILVLILGVGIGSVFVPPQDIIKIIFSKIAQKEIYGIQETFAAIVWNVRLPRVLVAFLAGGSLAVSGAVMQSILKNPLASSYTMGVSSGAALGAAIVILTGFFLPLIPAFTLPLAGTIAGLFTVYVSVKFASLIDKNFENSTIILTGIVFSLFINGVITVIIALNRNGMARLIFWQMGSFAGQNIKNFNLLLPICAAGTFILTALSNEMDLLTFGEEQAKTMGVDTKKVKWTLLFLASALTGTVISFAGIIGFIDLISPHIVRKIFGAKHKIVIPMSFCIGGTAMVLCDMTARTVMSPQELPVGAITALAGAPFFFYVYFKGRRRN >NZ_CP009228.1|WP_044977478.1|229975_230755_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDYPLVDVKSVYAGYSKIPVLKDISFSVLKGESLCILGPNGCGKTTLLKTLAGLIGYSGEILLNGQNLKNIKRKDIAKKIAVLSQVSSIYFSYSVYDTVMMGRYVHREGGSFLSVSKKDRAYVEKCLRAVDIWELREKKIDELSGGQLQRVYLARTLAQEPDLILLDEPTNHLDLKAQTELILFLKEVCKKEDKTVIGVFHDINLTLQFADKLIFLKDGTIQASGKKDEILNREILQSVYGMDVAEWMKNSFNLWLTVF >NZ_CP009228.1|WP_044977476.1|229157_229979_+|hypothetical-protein METSTIIDGGTSFVIDSEKKTITVYVETADNSCVEVEGCAETIIESGTESTLSVKSSLIILRGNIIEFNCGGNPYTYGNQIKSLNVLGLKNLEKLNCSGNDLTELNIKGLNNLKVLACRYNRLSSLDVADLSALEFLWCSANLITDLNLPNMSSLKRLGCNNNKLEVLNLEGLTSLEYLWCGSNLLNKLNLTELKNLTSLNCEKNKLTELDLTGLTALEHLWCSKNLLTKLNLTNTLHLQSLDCSSNMLTELNTEELHDLQYLNSSGNRLPAT >NZ_CP009228.1|WP_044979651.1|227253_228858_-|ATP-binding-protein MSKIRKMPIGVQSFEVLRKENFIYVDKTELIWKLVNESRVHFLSRPRRFGKSLLLSTLKAYFLGQKELFKGLAIEKFEEAEKKKREIWQEYPVLYLDFNTGIYDTKEGLLNRLNSFLQEYEKIYGSTGLDLPDRFQNLIKAAYEKTGRQAVILIDEYDKPLLQTMWKDEALNETYRTILKGFFGVIKSADQYLRFAFLTGVTKFSKISIFSDLNNLRDLSLLSDYSAICGISQEELEADFKPEIKNLAEKNNLTYDEALAKLKQRYDGYKFSETGTNMYNPFSLLNVFADGRMRDYWFATGTPTFLVEYLKKAYYNIPDLDGNIQLDEQGLNEYRADPILPLPILFQSGYLTIKDYNDFAGLYRLGFPNDEVRYGFLHNLMPAYTSIRADKTGLSIWEFYEQIEAGDVDGFMQKMKGIISGIPYDNLTEKDLVLREQNYQTAVYLVFALMNQFVHTEVHCATGRADCIVEFKDKVYIFEFKLTSNETPENAVKQIKEKGYADKYSGRGKKIIAIGSSFDEEKRTIKDWKTEAII >NZ_CP009228.1|WP_044977475.1|226289_227120_-|Mrp/NBP35-family-ATP-binding-protein MSQTCNHECEGCNLTCNERTAAPNSFIERPNKLSSIKKVIAIISGKGGVGKSLITSLSAVQSQKKGYQCAILDADITGPSIPKAFGISETVVGNDSGIFPAKTKTGIDIMSVNLLLENETDPVIWRGPVIAGTVKQFWTDVIWKDIDFMFIDMPPGTGDVPLTVFQSIPVDGIIVATSPQELVSMIVAKAVNMAKKMNIPIIGLVENFSYFTCPDNGKDYHIFGESGIDEIALEYGIPVLAKLPIDPEIAKACDKGKIEDVDAPWFNPIVECIAKL >NZ_CP009228.1|WP_044977473.1|224888_226274_-|DNA-repair-protein-RadA MAKKKTGDLAHRCNNCGYTQARWLGRCPECGEWNTFEEVTINQDYSATERSIAEKFVKEAHSVPLDAIEANDAVRLSTGIAEFDRVLGGGAVKRSAILIGGEPGIGKSTLLLQAASASSSGSVKKVLYVSGEESGGQIRSRADRLNLPLKNIELLCTCRLEDVERVLNKVNPVFVIIDSIQTMYSADAGAVPGTINQLKLCAHELVSWVKERDSVLFLTAHVTKDGNIAGPKVLEHLVDTVISFERTEDDVRFLRALKNRFGSVDELGIFSMDESGLKAIDDPSSLFITNRTGPLPAGSAAVPVCEGSRVFMVEIQALTVPAKGAVTRVFSDKIDSARVSRIAAVLEKRIGLQFSDQDIYVNVAGGIRLKEPAADLAIALALYSARANIPAQKEGAYIGELSLAGEIRSVKKLKQRIKTAQSMGFTKVVSPPPSDSEAGDINISQLFKAEDLSSAIKKVFG >NZ_CP009228.1|WP_044901942.1|224362_224623_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelB/DinJ-family-antitoxin MAQTNINIRIDEDLKNQFEAFCSDIGMTMTTAFCVFAKAAVRKQKIPFEISTDPFYSESNMAHLRRGIEALNAGKWVEHELIEAGE >NZ_CP009228.1|WP_044977471.1|224105_224366_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MKKIWFDEAWEDYVYWQTQDKKTIKRINMLVKDIERRNFDGIGKPEPLKGELSGFWSHRIDEVNRLVYRVSKNTLEILSCRGHYED >NZ_CP009228.1|WP_044977467.1|223235_223463_-|hypothetical-protein MTREFRAVHGLGGDAAEDNFFWEWTKNYGGSYCTNIRYAGGQIFEYCFKGKGAKHNPFDGGLVTSKDAYVRPYLP >NZ_CP009228.1|WP_044977484.1|232959_234198_-|methylaspartate-ammonia-lyase MKIIDVVCAEGKTGFYFDDQKAIKMGAGHDGFFYTGKPVTEGFTSIRQAGEAISVMFILEDGQVAYGDCAAVQYSGAGGRDPLFLAKDFIPVIEKDIKPLFVGKEITNFREMAKTFEEHKVNGKRMHTALRYGISQAILDAVAKSQHITMAEVVVKEYKTGCKIKRIPIFTQSGDDRYLNADKMIIKQAEVLPHGLFNNVEEKTGKNGEKLLEYVKWLKNRVETMRTRKDYNPIFHIDVYGTIGDFTNNDVPKMTAYLKTLEAAASPFKLRIEGPMDMGDREKQMKALAALTKSLDDNGVKVELVADEWCNTLEDIQYFADNRAGHMIQIKTPDLGGINNTIEAILYCKEKGVGAYCGGTCNETNRSAEVIVNCSVAAGAAQQLAKPGMGVDEGYMIINNEMNRIVALANRK >NZ_CP009228.1|WP_044977486.1|234279_235737_-|methylaspartate-mutase-subunit-E MRWKNKKIPEGEFMEMREEILQTWPTGKDVDLKESIDYLKKIPPEKNFAIKLEQADKEGITTAQPRAGVPLLDEHINLLKFLQDEGGADFLPSTIDAYTRQNRYEEGEAGIEASKRAGRSLMNGFPAVNWGVGPCRQVLEAVNLPLQARHGTPDARLLSEIIHAGGYTSNEGGGISYNVPYAKAVSIEHSIMCWQYADRLVGFYEENGVHINREPFGPLTGTLVPPSVAIAVGVIEALLAAEQGVKSITVGYGMCGNMTQDVAAVISLREITKDYMKKFGYKDTCITTVFHQWMGGFPADESRAYGLISLGSTTAALSGATKVIVKTPHEAFGIPTKEANAGGIKATKMVLNLLKGQRYPDSRVLAQEIELIKAETKCIMDRVYEIGGGDLVEGTIKAFEAGVIDIPFAPSQYNAGKVMPARDNDGCIRYLMPGNLPFTKDILDFNREKLEERAKADKREVDFQMSVDDVYAVSSGVLVGRPAKH >NZ_CP009228.1|WP_044977488.1|235885_236932_-|dihydroorotase-family-protein MIDSHVHLRDGLLSEKETIVHALSLACPAGFTAFFDMPNTNPPLTSGKAVLDRFALAEKSIKEAGFPAFYGVYGGLTSDSLQIEEMVLFYKKNFPRIVGFKMFAGHSTGNMGIVEKEEQRKVYASLKKFDYRGVLAIHCEKESLMNNSIFDIENPLTYSLARPPIAETESIKDQIELMQSEGFKGHLHVCHISTKEGIRLVSEAKKRGLNISCGATAHHALLNTDAYKKSGIFVKMNPPLREKEEQEAVFSSLISGGVDWIESDHAPHTYEDKKKGASGIPGFAGSLILLKELRKAGCSEKRLDELCGKAVNRIFKLNLAYKVPSNTEIEASLPSLRAGYPFDAFEFM >NZ_CP009228.1|WP_044977490.1|236959_237553_-|carboxypeptidase-regulatory-like-domain-containing-protein MSVIKGIVQDRNKQPVGYAKVALLTERFEVIISGEADEAGCFRLEAESKKYPYFIASKGFHQKFLDFWGYNIDLRNDLEINPVLGKTEIFSLIFFPSLDTDNTMMVYFRPMSLKLILEEQKSIAPELSTDDITVSINGDFYEIITMRVISETVNKGVEPIKAYALKIMLDGIEFDGKNKLEISVIKDDGYGEAVLFF >NZ_CP009228.1|WP_044977491.1|237618_239331_-|DEAD/DEAH-box-helicase MLITFKELGLDDIVLQAVEAKGFEEPTPIQVLAIPRLLSGEANVIAKARTGTGKTAAFGLPLVQELRSNTGKVRALILVPTRELAVQVAGELESFRIEEYPRITTVYGGAAIGPQLRSLKTGVEIVVGTPGRVMDHLERGSLKIEDIEYFILDEADEMLNMGFIEDIENIFSQANPEARVLMFSATMPKQILTIASDFMGDYEIVEEEPQEERASLTEQFFWVVREGDKTEALVRLIDTSPDFYGLVFCQTKIDADDVAKELDERHYEAAALHGDIPQSQREKILERFRSKKTRILVATDVAARGIDIEGISHVVNYAIPYDGPTYTHRIGRTGRAGAAGIAVSFVRPNEVKRIEYLRKHARGELKEGKIPSIEQVIEIKRTRILKETAAQIEKKMNEEKPEQGFAAFANKLTEYGDAQTVLSFILQMQYGSFLSPAHYKTIKPVRSEGRARKSDDDFLRLYIGVGRKDGITKRKLAEMLSRLLSIPERLVDDIEVMDKFSLATMPKNAANDALRLCKKKRGLPHMHIDIKSESPKSSGRIGKGKLGQKRKNGTQRKKESLGSASKYKRK >NZ_CP009228.1|WP_044977493.1|239416_240319_+|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MNYIDLLKTSAEKTNNCACMGLDPIFEAVPNKTGRVKDNLVNFFKELFGKMQERNLVPAAFKPNIGYYSALDKPREKDFSGSESLAEILSLIEKKFSGIPVILDSKRGDIARSSLNYAIEAFDGWKADALTVSPYMGSDSILPFISEKYSDKGAYILNRTSNPGAKDFQNLKTDSESKNNSELYIHVAKKIAFYAKEFPGTGAVVGATGMEELRVISDIYAQAGEVPMLIPGVGSQGGDAKTVMEVLKNTGCDLSLIRINSSSALTHPWKKAPVPENYLELCINNIEKLLTDTAINSISF >NZ_CP009228.1|WP_044977495.1|240308_241223_-|DUF4340-domain-containing-protein MKNFFKLKKYTQILIFANIFFLLSLIFLNIPKNEANVFNISFVLKQNIENIYEIVFTIPDNSLPPRFNELRLIKKKDKFILSTQSGEYKVQPALIERFFSVLSTKQNFKFVSNDIKQYINFGLDEDHAARLQLLRSDKTIIGDFVFGKNDTLGINRYVRIDARTKIFIMPDVLASFLTVKTNFWLDLQIYKYRFENNSIQLIEKNKQLITLSDKNKEKIDELETFLKQFSCIDIFPAFPITNSETQELNLTLGTGEKINIFLTPMESGDFILFDSGFSNSYVISGYTKRRIDSILDSIFEDSKN >NZ_CP009228.1|WP_044977500.1|243428_244211_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVQNLSKYYGSRKAPVVGCKNISFELKTGEITSLLGLNGAGKSSIINCISGYYTPDEGGAFIGPYSILNNGIEAKKLIGILYEQNPLYSNMTVYDFLYFAGQMHGIEKNKLNDALNEVIDFCEINEVKNNSIKSLSKGFKQRVGLAQAVLHNPPLIILDEPASGFDSVQVKDFEKKILRIAKEKTILICTHDLRQAAELCSNHILLNKGEIIAEGNLLEIKEQLQAEGCEFDSEINYSVLEKAFEFFAGINKNEFRKN >NZ_CP009228.1|WP_044977502.1|244215_248817_-|SpoIIE-family-protein-phosphatase MIKGKKHLKKFLNIFLMFLFFMSFLSAKEFYWESPSVISGRNGQFLQSASNGNISASVWEEVVKSSDDAGLIYISAGVYANKKWIINERIIPPISYTADIPSIASITVGNDDSILIALVKNRNTITILKSTDYGKTYTVKNITTEIYDLLSPQLSVASNGNYLMFVSHGADEKFSVFFSSSKNGLDWPDFKEFDFIKKTDRVFFPAHTAAEKNDVLIFQALDKNENISSYQLFSSFSSDGGSSWSEPIRITDDFNFNNQRPNLLYIRSEKSIFLVWEQSPYRREKSSTAYAVLDNKGMLTSPIEVLPSGDGTIFSPKVIAYNNKPLIAWSEDYNGKASVLIARKDDSNWVIDSVESITGSLLFVNPFFVDGNLHILWQEGIRSAKIMHVEPDYEVGKAQLQPLDFDSKTLDGKQKITMKIKFPNDSSGVAGYSYEWTKDAPPEFVEPVIKKLPNESVLVYEPEEDGLWYLGVRVCDYAGNWSEMSTISYERDIVPPSAPIFDLLALDKSGFLKSNTFDIQWNPPEFDIEGKPETAINGYIWNLSYLGTVDKFLLYIKNANPSFIDDTAVQEILSNNLNAELSTSKINSTLNKREFKNYENGLYALTVSAVDAFGNIGVPAVKYFALNKYIPYTYVADINTEQNLDGSISLSIVGKGFSAGGAVTALYIDADGSPPYDLTIDKKDFSILSDKLISNIKIDYLDPGKYYVGLMHSGRGIYFAGKTITFNDIGNIKLGNYKDSYKYNWLLSAMNSDFTDYFFIIFLTVFILLVMIFSITGVIYSIKETIKIKNEVTVLLSGGAMIFGKEKKISELKVRGMGLRLKFILFTTTLVISVILTLALPLGSRFSETQERLLAEGLASNTQVLLESLTSGAKAYLPSKNVLELGFLPSQTSALKEANFATITGVHIDNKKVSYNFVWASNDSDIISKIDSSEFIIGESELSLPDLEPVYQNLDKIDEEARENVGELAEEIQSLTNTAMEIALSTDSKSIERRNEIQSAINQMEEKLNSELSRLSAKGSGSYPEFNSKKLSRDVTNYLFYKPILYRQAGDQSSFIHGMVYVQVSTKGLIEQIDEATSTLYKIILLISLSALAAGIAGAYILSSIITAPIKKLVEHVAMISATEDKELLAGKDVKLKTKDEIGVLGTTINAMTNGLVEAAAASKDLTMGKEIQKMFLPLDLDEAGRKLTSGKSVDDNVEFFGYYEGARGVSGDYFDYIKLDDRYYAIIKCDVAGKGVPAALIMVEVATLFLDYFRDWSYKKQGLKIDRIVSRINDLLESRGFKGRFAAFTLCIMDSITGNVHFCNAGDNVINIYDAASKKMKEVILSEVSAAGVFPTFMIDMKGGFKVETVKLNPGDVLFLYTDGIEEAKRLFRNSKLEPVLCEEPGLEKDAEHETHTVGQDGEELGKPRVCEIIENIFARSSFSLKKWHNPIENEQFDFDFTNLEGTIEDAVIGLVSVEKIFRMYQDPKATERDMVQVDKKIDLFLNKHFRQYQTYCGHRVPNTSYNEYLYYTNVREDQQYDDLTILGVKKK >NZ_CP009228.1|WP_044977504.1|248813_251759_-|hypothetical-protein MNKRRFILSILIGIFSVSAFSKGAAEKDYASANSYFESSENTAALENIVEVIEAKPESIESGISLARKTMKNQAEFQQTFHELIALLKENPNNNIQRIAMIDKMEALESDIDPVLKEFLDKLKISSFYAIYRIKFNDIMNEGNALIKSQKYNDASKTFVKGLSMYDGESLNEDEYNRINNILSNSLDSVKSDTEQYEKTYAEFISDLNKYGNKAFSSAPSSIEKELNNLKNSASRLRSITGSLVRSGAVLKQIYSNEKKINSDAEETILPFAYRLTIGRDSAKEYEGIEGAMEAGVYEPLYTLLDRHWAEIERLWFESCNTFNFENDIPIQKNISLIEFHLKNLIEIYSLINTRSDSRFVKSVDTQSKKRNSFAELGNIINSTKEYYSRFLVLREKVERSPETYTGSSDELRNPNNVKITDLKAKIKELDGMIASINQLSQFLSVHKENDLAKEEEVLQSKQKLFLDNLDKTRLICYEEIAIINNKSGNQALAETKQRYDNFKNDVDKQKNENSDKTTPAEIRKELLSLNEIVNLDIRLLNDFIKNTDPSVEETSKIFAENKNGIEKTIDSLKNLSSVIETDLADTESILLKIQLAKNEADLRFEEAKRNLASGNFAAARRSIELSRTRTNNALELEENSEYRSMTDERLDKLGKEINDAENTVVVKDVREYLEKAKRDYFNTDFRQAEETLISARSRWAVTHVDPNEEVENWLTIVSTADTLKTGRTIPVSAPLYPQMIQLLNNANQLYLDAEQKIKSGQQKSALTDLNQAKDNIRQVLLIFPYNEIAGQLSLKIDKLIDPANFNEQFRRKVQTIRNDYKRNSQQAYSELLNLYSIDKNFSGLAALKDEIEIYLGLKFPSPNLKAIAESADLTKSAQAIYNSGDSLSFPIAIQQLDTAIKLNPQNVDAIQLKDSIQMSMGGAAVIVLSASDEAKYQQAIAELQRGNKIIAAALVEQLMQSPNARNSAKVRELKKRIDALL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009228_2 | 334447-334571 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009228_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009228_2
>2.1|334494|31|NZ_CP009228|CRISPRCasFinder CCGTCGCTCATAATTGCACCGCCGTAATCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009228_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009228_2 >merge|NZ_CP009228|2|334447-334571|CRISPRCasFinder TAGCCGTGTTTTCGGTAATGGTGCAGTTTGCTATATTGATGATGCTGCCGTCGCTCATAATTGCACCGCCGTAATCCATAGCCGTGTTTTCGGTAATGGTGCAGTTTGCTATATTGATGATGCTG >NZ_CP009228|2|2|334447-334571|CRISPRCasFinder TAGCCGTGTTTTCGGTAATGGTGCAGTTTGCTATATTGATGATGCTG CCGTCGCTCATAATTGCACCGCCGTAATCCA TAGCCGTGTTTTCGGTAATGGTGCAGTTTGCTATATTGATGATGCTG
>NZ_CP009228.1|WP_158506559.1|333283_333793_+|ABC-2-transporter-permease MGCFFPFWTSIHVFAAATKINRVEGINIGEDILLNSLPVSRKQIVISRYLIIFLFGISAMLLHITVSAVLKRPITIPEELFIIFVLCQFLYNVLFIPLEYFDNKKANTIKGIVFGLIIYFISNKNLNAPLTCIKNLKSVTPAIIITALIILSIPISIFLSIKIYEKKEF >NZ_CP009228.1|WP_044977570.1|332467_333106_+|ABC-2-transporter-permease MRQLLLTHIRKIKNNKQIFIILFLLSPIIIAATNNPLMFFFPYLVSMHLFSGMTKVERKEGIKQGEDILLNSLPVSRKEIVISRYLIILLFGLLMISTFLGFSFIISFLVKNPFQISSIFFINFFIIQFIYNILFIPLEYLSFAKAQIIKGLVYMGAIFVFSGIKKLNIYVLNFFNTFKENSFYIMIFIGVIILSIPVSIFLSIKIYEKKEF >NZ_CP009228.1|WP_044977569.1|331843_332158_-|hypothetical-protein MSTSNRKYKDSVFVDLFSEDEKAKENFLSLYNALHGTNLQLSCPVENIRLDNVIYMNIINDVSCLVDGKIIVLAEHQSTINENMPSQGMYFRVHSLTSSFRLTA >NZ_CP009228.1|WP_044977567.1|329768_331310_-|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MNKAISVLNKSNPISAEQVLELILEALRELVDYELAVVMGFEDKNVLRVRKAIGPLSSKLLDDFTINLNMRKDIARILDERKVFLFDENIPHVDTYDEIMKLPENHSCLVAPLYIGDKAIGMMTLDHRMCSRFTPEIVRFISTISKLISVALVQTDASQSLIKKTESLLLERNVLLTASTNVFKDMVGSSRAWTTVLDSIKLVAASDVPVLISGETGTGKEQAARTIHRLSNRAEKPFVPVNCSALVQSLAESEIFGHEKGAFSGAAALRKGRFELADGGTLFLDEVGDLPFDLQPKLLRVLQDGKFERVGGEKPVSVDVRIIAATNVDLAEAVSMGRFREDLLYRLDVFPLRLPPLRDRDDDTALLAEHFISDIRKRKGFENTSLSMAAIEKLMSMPWHGNVRELKNVVERAAILSQGGEIPAEHLVPGTREFYISNAAKKKPLKPAVNKEAEKDKVLPEDIKPFDEAQTEIIQKALSASNGKIYGKDGAAALLNLKPGTLQSKMKKLGIKY >NZ_CP009228.1|WP_044977566.1|328857_329487_+|DUF2715-domain-containing-protein MNRKIVFVCLVFALVFTGMLTAKSKGLNLEAGAAYTNHQLHTFSNNTKSDGFKYQGIKSKGLFGVNLGISYPLPKNWAVFANTTFAFNSTFVNDTMLGVGYIFKPGNVFDLFLGGGLAFGGSVFNWASGSASTTHKFFNIGAGINLTASFMFTNKIGMYAGISDTYYKPVSGKWSTKIGDNTSSGDISSSNMPDLAKSINGRLGVKIKL >NZ_CP009228.1|WP_044977565.1|326772_328767_+|UvrD-helicase-domain-containing-protein MNEFTEGLNPEQFKAVTTVNGPVLIIAGAGSGKTRVITFRIAHMLDKGIPQSQILALTFTNKAAKEMADRVKELTGKKLQNLTVSTFHAFGVKVLRSHIDKIGWRSNFSIYDETDRNQLIKECGRELKFSADALDVYKVGILFSNIKMGRKDWTDEHDSYKALYKEYQEGLKLYNAVDFDDLIMLPIKIFKEHPEVLAEYRDRYRYIMVDEFQDTSTQQYNFMKLIADKNICVVGDDDQSIYSWRGASFENIRNFEKDFPEMIEIKLEQNYRSTGTILAAANGVISHNLNRKVKALWSEKDSGRPIEIFIPENEAAEADFISDMILSLKQREGFKYSDFGVLIRANSLSRPLEESFLEVNIPYRMSGGTSFFQRKEIKDLISYLRVIANPDDDVNLLRIINTPRRGIGKKTLETLSTLATENSCSMRTSIRLLLENPPEDMRGKSIDDLKEFAELISSHRTQLLSGKGLAQKVRKLLDDIAYNEYLITEYQKSEKAAQFKMMNIESFLHSMDDWENNPDNWDGSLYDYLNRITLLTRDDTEEEKGEVNIMTIHSSKGLEFPVVFIAGAEDGLIPHARSVEENDGDVEEERRLFYVAITRAQQKLFITSCKQRRKQGGIAECTPSPFLDEIPSDLVEYHEPDAQAEEERIADIFSRMKKKFSINI >NZ_CP009228.1|WP_044977564.1|324862_326749_+|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MYRFSDYDVIVVGAGHAGIEAALASARMGEAVLLITQTLDSTGRLSCNPSIGGISKGNIVREIDALGGEMGKLADASMIQYRLLNKSRGPAVQAPRVQADKFLYSQLAKHAIELEKNLHVFQDTVIDIVSSNTNESGYVEKGCVQYVKTERGREFSAKAVVLATGTFMEGRIYIGEYESPDGRLGERAAIGLGSALAKKGFTVGRLKTGTPMRILRRSFDSSLTEEQEADEIMRPFSFSNAEIHRPYAKCYITHTNQETHDIIRENLHRAALFSGRITGTGARYCPSIEDKIKKFPERDRHHVYIEPEGLNTEELYINGLSSSLPEDVQDRMIRTIPCFKEVIITRPAYAVDYAYVSPIQLSSGLQTRRIEGLFLAGQINGTSGYEEAGGQGIIAGINAALFSRSLKFKDEKYVPFVLKRDEAYIGVMIDDLVTQGVDEPYRMFTARAEYRLNLRHDTADERLTERAYQIGLQTKEASDRLKEKLLTKEKIISLWKDIKITRELIAENPELKNHIGKSLADALHDPQVSLECICSIDENSKAYSAELLESAELEIRYEHYIAVQNRKIAKVKRMENTKIPADFDYDAVSGLSTESRTRLKEVRPETIGQASRIRGIRPSDIMLLSILL >NZ_CP009228.1|WP_044977563.1|323554_324847_+|M18-family-aminopeptidase MKKAEALMKFIDKSPSVYHAIKNAGEFLEAKGFVHLNREDSFELKPQGRYFVTNNGSALIAWQMPKSGNAENGFRIVGSHSDSPTFRIKPNPEIKVNNHYLKLNTEGYGGVILSTWFDRPLSAAGRVIIKTDNLLKPEVKLINFDKNLLTIPSLAIHMNREINDGYKFNKQKDTLPLIALINEKLEEKGFLMNLIAEEAGVRVDKILDFDLYLYDRQPGCFVGANDEFFSVGRIDNLGMACASIDALGDALPSNFVQVAAIFDNEEVGSKTAQGAGSPFLHDTLQRIIVSAAKGNAFEELQKALAKSFLISADQAHALHPNYTEKNDITNFPLMNKGPAIKVAASMSYTTDGISAAIFRDICARAGVPCQNFVNRSDMAGGSTIGPISVSNLNIKSVDIGNPILGMHSVRELGGTEDQEYITKAFAEFYK >NZ_CP009228.1|WP_158506558.1|323316_323490_-|hypothetical-protein MYGANSSYVYDEQIQNSFYEFEKYRKTNIGDISSVNGSCLEFIDEIIYKYLKQNLNL >NZ_CP009228.1|WP_044977562.1|322791_323298_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MVRLAELKDISRIAEINIYGWRNAYRGIVDDIFLFCELSVEKSIGRLKKELSSQSGSSAFYVYEDDGDGIIKGMMRTGMCRDDDKPDGFELMAIYVEKAFERSGVGSKLITYFEKEAKKLGMHELYIWVFQENRIARNFYELHGFKPDGKTQVHEALKAPEMRYVKIV >NZ_CP009228.1|WP_044977571.1|337976_338741_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MLKKFEDLTLQDDFMFCKVMQNSDLCKRLIDMILSDKIGKIAYISVQHSINTNEQAKSVRFDVLVQTENGKFYDVEMQVSNEKNIPKRMRFYQAAIDISFLDKGNFYNDLNDSFIIFICTFDAIWKNEPIYTFENICIEDKNISLQDGTKKVIINSEAFKSTEDKDLKEFLEYLKTGKAKSEFTRRIEEMIQTVKQNEQARQEYRLMSTFEMDARYKGIYETKRETAKILKQLGDSIQKIMQVTGLPEAEIEKL >NZ_CP009228.1|WP_044977572.1|339224_340013_-|leucine-rich-repeat-domain-containing-protein MTKFKTHKKKGAAAIVTASVLALIALFGMAACSNAAQPGTGTDGSTALPEAPFVEGGASLILSPDKLDIEVKATTSDGTPVTVEGCEETTLTSGTETVLHAKGRLVILKGNIKKLDCWDNQLTELNVQGCTALQELKCGFNKLTALDVQGLTVLRKLYCNFNQLTELNVQDLTALKELACHGNRLNAEAFTKLFNDLPQQANSDRANCVLYIEMPGFTDDNHTDFTAPPDLAVAFNNAKTVKKWKMYMYKVNGIWIGNWVEL >NZ_CP009228.1|WP_049992325.1|340112_342719_-|right-handed-parallel-beta-helix-repeat-containing-protein MKKLLKILTTIAAVLAAALLMATCKQFIDDPEEFLSYWSSEVVPINFSINESSQKSNDGALCIPSANDVTLTIKLRNPKNFTLVTPTSSADAGKIINFPGLSTQPEHGTDYTLTKTAPDTLQLTYKESFLKAHEWSNGGIGPEITLISTDGRKFSKKFSLNIEANTPPPKIGDITIAKTNEVDPHYVLCFTVDALVMNTTIPGGKLHKDLGLVIAKEGGEPTTIPLPIGSPGFAVVPADGLLPSALQIIDPVPSGIWKVCFKTGTKLTESTLPQKYTVRLIDRKGLSSAPKEAETLGYIASGGSSTDAWKNLKQAVESATSDGGVITVTGNVTATKHLGNNGAISVTTSLTIKGAGLTPVLNANKNADGKPAHRIFTVENGGELMLENITLTAGMATGASTAPLEEKCGGGIFVKEGGKAKLKNCTIKNCKADKFGGGICSEGELTLYGGTIGGSLPNANKAMLGGGICIQKNGSLTLKTTTISRNEADYGGAICVRESGSVSMESGSLMTNTASISGGGVDVDDSASFTMTGGEIKTNEANSGGGGVYAHSGTFTLSDIASIESNTAKGRNGGGIYVDSTGTLVIKGGSIKLNMATKTTGGVGNGGGVYVYGYGSFKGKLNMIGGSIEGNGAGKEGSNYYGSGGGVYIDGGTFTMTGGEIKTNNAKNGGGVALDEGGTLELSGSGKIINNTAAGGGGGIAVLHGTFTMSKGKVIGNTAAQEGGGVYVDANSTFKMHGGTIENNTSTLGKGVYVAGGDGTPTMLDANFIMGGEACVGNWVAGTLQDGNDVYLGENLHGGELVSIEIDKDNPITKSKVACITPKSYSPDETVLMMSDGSTDVGDYNDKFTVTLDGFTQWYVDSNGKLKN >NZ_CP009228.1|WP_044979662.1|343124_344030_+|hypothetical-protein MKKRTSFLIWFFVLIILGGTAFFLGWMQFSVPAGSYGVMLSKSGGYHDRLIIPGEFMWRWERLVPTNSKILIFNLKAQEIEYKNEGALPSADKFGLVMEQKNDFRWKFALKISASVKPESLISLVKNGSIKTQGDLDDFIRAKVEESAQKAANEFIEYFLSNPEEYERLKFQYAAFNDKISSDLKNRENTEIEIVSVQLSSDFLIPDLKLYTTIRDVYSEYEKARSKVFTDLMIEEGKSAASSKFRMNDLKEWGELLKQYPQLIDFLAVARSDASETLKALRELKAKMNSPQTGGTQGGGQ >NZ_CP009228.1|WP_044977573.1|344026_344842_+|uracil-DNA-glycosylase MVCTDESRRKKILYTFFRTASDYLSGFKTDEEYPDFADTVLPETTLSESAISETAFSKPEGAAGLTISSSDAKSGFESLEKVYAQIASCKACRLCERRHNTVAGEGPCEFSNFGNKIEVMVIGEGPGADEDAQGRPFVGKAGQLLDKMLAAIELYRTHNCYITNVVKCRPPNNRDPLPDETAACRDFLNAQIALIRPKAILVVGRVALQNLLETQEGIGKMHGKFFEYQNIPLMATYHPSALLRDVNLKRPAWEDLKLFRSRLNELPQQID >NZ_CP009228.1|WP_044977574.1|344855_346856_+|primosomal-protein-N' MAKWLTLTFNLPLYQNFTYKNIEEDGGSLVGKRASVQLGSRNLIGFIIEESDAFPKDSPVGEDKIKPIKRVVDKETIFGQAQIELASWISHFYICSFGEALSAILPSGKREVSFENLKWGAEFEDKNFSLSDEQKDAVEKIVSSNKKEFFYLYGLTGSGKTEVFLKAAEKIIAQGKAVIYLVPEIGLTHQVISAAVKRFGSQAAVLHSGLTGSERLNQWMRIRRGEALMIVGARSAVFAPAENIGLIIIDEEHDASYKSGSVPRYHARQTAMYLAVKHNCPVVMGSATPSLEAWNMIQNKKIKLLSLSKRLAGGSLPQIEIENISGLKGALSDRLISEIRKTKNEGKQTILFLNRRGFSHIFRCRSCGYEMLCKNCSVPMTFHKSENVMKCHYCGMQARPPSLCPECNSLDIGYAGVGTEFIEEEVSRSFPDCTVARVDTDTVSKKNSLENRLKDFKEGKIDILLGTQMIAKGLNFPKVRLVGIILADTGLQMPDFRAAERSFALITQAAGRAGRFSEDGLVIIQTLKPNHPSIVCAKNHEYEKFYEYELGQRKLLDFPPFKRLIRLVFRSKDLKKAELAAEGAVNILKYILSSQKNSDISPQDETEIMGPSECVLSMIAGNHRQQILLRSSNFPLIQNAASRFVKEYKPMTGIYIEVDTDPVNLM >NZ_CP009228.1|WP_044979663.1|346944_347811_+|FAD-synthetase-family-protein MDDFKIISWDALVETAQPVAAGSYFFPDGKETAISVGGFDGPHKGHDKLLRQVLNYAAENALVPGLVTFFRSPAAVKNKAYSGDVSSLRLRLKKFQELGFHFIVLIDFSASFAKIEGTAFFDILIKTIRMKYLAVGSDFFCGYRRGLGAADLKKIAPQKGFCFDSIDPVNISGSLKVSSSAIREAVSLGDFSLAKELLGYPFLFDFVSLPWEVKDKNSIFAPRAYITQILPQSGKYRVLVQKTNRQEQEAHCLINDDGLLLCFPEKDLKGFDLKDLNNFDTIEFICKE >NZ_CP009228.1|WP_002671840.1|347814_348084_+|30S-ribosomal-protein-S15 MAVTKEQKASIVKKFGASEKDTGDVKVQIALLTEKINQLTNHCKDHPKDAGSRRGLISMVGHRRSLLKYYRRTDIEGYRTILKELNLRK >NZ_CP009228.1|WP_044977575.1|348195_350292_+|polyribonucleotide-nucleotidyltransferase MRKRVTYKIGEHDLILETGHLAKQANGSIYAEYAGSAILATICASGQAQEGLDYVPLTVDYNEKYYAAGKIPGGFIKREGRPKDKEILVSRLIDRPMRPLFNKEFGREIQLVPTCISTDMINPPDILAVIASSAAVHISDIPFDGPVAAARVAYKNGEYIINPTFDQIETADMEIVVAGTKEGITMVEGGANEVSEEVMLTALEKAHEMIKALCKIQEDLRELAGKEKLPLVPLEAELENKQAIYDEAFPRLSKTLYLSTKMERRDESDKVKKELAEKYTEQLEDEIQLKLFNALFEEMEYNILRTNILDKGLRVDGRGTKDIRPITCEIGVLPRPHGSAVFTRGETQSLGVVTIGTVFDEQIYDDIEGDRRENFILHYNFPPFSVGEVGRLGTGRREIGHGNLAHRSLYPMVPKREKFPYTVRVVSEVLESNGSSSMATVCSGTLSMLHAGVPMKKPVAGIAMGLITEGNDRYAILSDILGEEDHLGDMDFKVAGTADGITGFQMDIKIAGVSPEIMKNALAQAKEGRMHILGIMNQCISSPNAELSKYAPRVEMMSIPEDKIGALIGPGGKNVKAISDKYNVTINTENDGTVTIYGKDGTSDIKGAKLIVKGITSDPEVGMIYDGTVKKIMDFGAFVEILPGKEGLCHISKLSRSRVEKVSDVLKEGQEIPVKLLEIDKLGRLNLSYIDALEERSK >NZ_CP009228.1|WP_044977576.1|350362_350797_+|dUTP-diphosphatase MEVFTKLKEGAVLPEYKTSGSAGADLRALIEKPIILKPMQRCLIPTGLSAELPKGIELQVRPRSGLALKHGITVLNTPGTVDSDYRGELAVLLINLGNEDFKIENGDRIAQAVIAQAIQADFVQKDELSNTERGAGGYGSTGIE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009228_3 | 1036305-1036536 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009228_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP009228_3
>3.1|1036339|32|NZ_CP009228|PILER-CR,CRT GCAAGAAAAAACAGCAGGCAATTGTACACCCG >3.2|1036405|32|NZ_CP009228|PILER-CR,CRT GCATAACTGCTGCCGTCTGAAAAGCTCTTTAC >3.3|1036471|32|NZ_CP009228|CRT ACGCTCAAGCACTGCAATGAGGGCTATGATAA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009228_3
The CRISPR arrays of NZ_CP009228_3 >merge|NZ_CP009228|3|1036305-1036536|PILER-CR,CRT GTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAAGCAAGAAAAAACAGCAGGCAATTGTACACCCGGTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAAGCATAACTGCTGCCGTCTGAAAAGCTCTTTACGTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAAACGCTCAAGCACTGCAATGAGGGCTATGATAAGTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGAAGATTCTGAC >NZ_CP009228|3|1|1036305-1036470|PILER-CR GTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAA GCAAGAAAAAACAGCAGGCAATTGTACACCCG GTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAA GCATAACTGCTGCCGTCTGAAAAGCTCTTTAC GTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAA >NZ_CP009228|3|1|1036305-1036536|CRT GTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAA GCAAGAAAAAACAGCAGGCAATTGTACACCCG GTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAA GCATAACTGCTGCCGTCTGAAAAGCTCTTTAC GTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGATGGATCTCAA ACGCTCAAGCACTGCAATGAGGGCTATGATAA GTTTGAGAGTAGTGTAATTTAAGAAGATTCTGAC
>NZ_CP009228.1|WP_044978323.1|1035536_1036211_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MKLVYPDIENQIIFSENTVNVLTIENKTFFTEFVSELFSQYSGYEGKFILSEDNKELSIPKICEMILNPINININNKQNLNKVYSILKQSISDEYNYIKTCTIKSKILKHIDDILLSLDVPLKRSEELDLISIFKSVNISFETENKNLLEKLIDYISASVELNQIRCFIFINLKQFLNFKDLSKLYKFARYIKTNLFLIEGTYTSIKEDCEKSYIIDNDLCEIY >NZ_CP009228.1|WP_044978322.1|1035234_1035540_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRVIVFFDLPVITPENRHNYSVFRKYLIKSGFIMQQKSVYSKLVLNLTNRDSIVKSIENNKPPEGLVEVLTVTEKQYARMEIIIGESKTEYLNTDERLVVL >NZ_CP009228.1|WP_044978321.1|1034357_1035230_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSWRTVVISNRAKLDLHLNHLVVRGEKTHKVFIEEISVLIIETTAVSITAALLNELIKQKVKIIFCDEKRNPASELIGYYGSHDTSEKIRLQIKWDKNIKQLVWTEVVTEKIRQQKYLLEKLNLPQANLLAEYIINIDINDKTNKEAHAAKVYFAALFGAGFSRSLDIPINAALNYGYSILLSAFNREITANGYITQLGIFHDNMFNPFNLGSDLMEPFRPLVDAEVFKLNPQKFEHEEKLRMVDVMNKKVFINNKEHYLNKAIEIFVHSIFDALNEKDISQIKFYRNEL >NZ_CP009228.1|WP_044978320.1|1030173_1034361_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKKEIKDYFLGLDVGTGSVGWAVTDTDYKLLKANHKDLWGMRCFETAETAEKRRLFRGARRRIERRRKRIKLLQELFSQEIAKIDEDFFQRMEESPFYAEDKTILQENTLFNDRDFTDKTYHKAYPTINHLIKAWIENKVKPDPRLLYLACHNIIKKRGHFLFEGDFDSENQFDTSVQALFEYLREDMELDIDADSKKIKEILKDSALKNSDKQNRLNKLLGLKSSDKQKKALTNLISGNKANFADLYDNPDLKDAEKNSISFSKDDFDALSDELASVLGDSFELLLRAKAVYNCSVLSKVIGDEQYLSFAKVKIYEKHKNDLTKLKEVVKKYFPIEYRNIFGYKQSENNNCNYSRYVGVCKSGSKKKVINKTASQEDFYKFLKDILLKRSDVPEANGILTEIETGTFLPKQISKNNAEIPYQLRKIELEKILTNAEKFFSFLKQKDENGLSHSEKIIMLLTFKIPYYIGPINTSHKQYFPDRSWVIKKENAPQEKITPWNFFDHIDKEKTAEAFITSRTNFCTYLIGESVLPKNSLLYSEYTVLNEINNLQIIIDGKNICDVKLKQKIYEELFKKYKKVTQKQISTFIKHEGICNKTDEVIILGIDKECTSSLKSYIELKNIFGKQVDEISTKNMLEDIIRWATIYDEGEGKTILKTKIKAEYEKYYSDEQIKKILNLKLSGWGRLSRKFLESITSEIPGFIEPVNIITAMRETQNNLMELLSSKFKFNENIKKINSGFEDTDKRFSYNSLVKPLFLSPSVKKMLWQTLKLVKEISHITQAPPKKIFIEMAKGAELEPARTKTRLKILQDLYNSCKNDADAFSSEIQYLLGKIENEDNLRLRSDKLYLYYTQLGKCMYCGKPIEIGHVFDTSKYDIDHIYPQSKIKDDSINNRVLVCSSCNKNKEDKYPLKPEIQLKQKKFWNFLQRNNFISIEKFNRLTRTTPISDDETAKFIARQLVETRQATKVAAKVLEKIFPETNIVYSKAETVSMFRNKFDIIKCREINDFHHAHDAYLNIVVGNVYNTKFTNNPWNFIKEKRDNPKIGDTYNYYKVFDYDVKRNNITAWEKEKTIITVKTMLKRNTPIYTRQAACKKGELFNQTIMKKGLGQHPLKKECPFSNISKYGGYNKVSAAYYTFIEYEEKGNKIRSLETIPLYLEKDIQKSQDGLKGYLTDQLGKKEIKILVPKIKINSLLKINGFPCHITGKTGASFVLRPAVQFCCSNDEVLYFKKIIRFNEIRSQREKMGKTISPYEDLSFRSYIKENLCKKTKNDEIGEKEFYGFLQKKNLEIYDMLLIKHKDTIYSKRPNSTTLDMLIKGRYEFINLKPEDQIRVMLEILKLFCTTREVIDLGLIKGKSEAGVTTLGKKISNLDSCILIYQSITGIFEKRIDLLKI >NZ_CP009228.1|WP_044978319.1|1027984_1029859_-|DNA-helicase-RecQ MTHGSKGSDNKKILTSPESILKQVFGYDEFRPFQKEIIDSLLQKKDVLAVMPTGGGKSLCYQIPALIFEGVTIVVSPLISLMHDQICGLETIGVEAVALNSSLDWEKYTDNIRRIKNGEVKILYAAPETLVSERCKELLSSIKVDCLTIDEAHCISEWGHDFRPEYRQLAEIRKLLKESVCLAITATATEKVRSDIKKMLKLKTPKEFIAGFNRKNIFLEVKEKQKPFEQASEFLKEHKGESGIIYCFSRKQADTLSVQLSVLGYNAKPYHAGLSDELRQKTQNDFINDDIEIIVATVAFGMGINKPNVRFVIHFDLPKSIEQYYQEIGRAGRDGNPAHALLLFSAADIFKLKFLMQDKSPDEVKKAEAMLSAISNYAQANSCRRRMLLKYFGENISEEKLKEIQGDAPCCDFCSREKIEKIDLTVPVQKFLSCVVRTGCRFGASYIIDVLLGSKQKRILENKHNDLSVWGIGTEFNREGWFALVRVLLTEDYLIKDEDYSVLSLTQKAKKELQAGTSILLPFNHGKENSIKKEAKQKPKPQISESKLDASGEAIVNALKQKRRELAEEARVPAYIIFSDKTILDLGLKKPATIAELDGVFGIGKAKKDKYGELIIKLIASNKK >NZ_CP009228.1|WP_044978318.1|1026479_1027961_-|DUF1538-domain-containing-protein MNILTDKFKEVLMSVLPIVILTTVLNFAFIHIDYQVFIRFLIGSVCIILGLALFLFGIEISVTKIGLQMGKEITKRNKIFILILGGFALGFLISIAEPDLQILASQVNTVTKSGIPALRLIVVVSVGVAAFVVFGILRTVFNISQKIVFAVSYGIIFLLALFSSAEFISIAFDSSGTTTGAITVPFILALAAGVSEMKKDSAASERDAFGLVGMASAGAILAVLALSVLGKTKEISADDFVFNLDVHAQIFYPFAEHFLPVLYECIMSLLPLTVIFLITNFISIKLRVKDLIPIIKGLIITLIGLFLFMWGAKSGFLDVGIAMGSRLGEIGTRPLILFIGALIGIVSILAEPAVYVLTVQIENVTSGHIPRKIVLIFLCIGVSFAVMLSLLRIIEPAFQLWHILLPGYIVSLLLSIIVPDLFVSIAFDAGGVASGPMTATFVLSLAQGLADSTPTANVLIDGFGIIAAVALAPIISLQILGLIFKIKSGGEQK >NZ_CP009228.1|WP_044978317.1|1025838_1026483_-|P-II-family-nitrogen-regulator MKDFSLLIILVPFGRARKIVRYAKDKGLTGATIMIAFGTVKSKLLDFLGIQETRKELILTAGHGDVLDGLMDNLNNKFNLTRKNFGIAFRMPLSFINIKNALEEKPVFKREEVKTMKSAIFTIVNRGKAGEVVDASLEAGARGGTIIHARGSGLNQTKVIFDMEIEPEKEIVLTIVDDDRLEKVVEAIRKKSDVEKDGHGILFVIPISKAYGIK >NZ_CP009228.1|WP_044978316.1|1024509_1025829_-|HlyC/CorC-family-transporter MNEPPPQWLYILLLITLLFLSMIFSSGETAFLSVNKLKIKYLREKKNKKAARVEKILKDKQKFLTTSLIGNSLVNILISVILTALLVKLVGAKGLSIAVTAATIAILIFGEILPKSIALVFSEPLALKFSGFILFLIKLLAPIEWLFLGFTKFFLKFLGVKNFQSNEALTDEDLKDFFDVHQEHGDLRSEEKAVLEKILSYGDITVKNIMTPRPDIIGLTSDVNPKEIIELSHSSRFSRFPVYKEDIDEIIGIFYIKDFLFSEAAAKDFLQESKEKFDIKKYLRKPVLVFENTELSKLQEIFRKEKQNMVVVIDEYGGTLGIATLEDLNEEIFGNIADEYDTDDAAAEDPNLDNINDESTQNINQTILGSMRLSDLNEDLGTSLSSDYYDTIGGLIMEKCGEVPQIGSTIKIENYNFTVIKTEGNRISELQVNIAGDEE >NZ_CP009228.1|WP_044978315.1|1023214_1024513_-|HlyC/CorC-family-transporter MKFELALIIIEFIALLLCAFFFSASETAVTAITRAEYKAIKKSRTKKNKTLAFLIERKDEIVSATLIGTNFVNTLSSALITAFVIDMYGQQYIPAATAITTVLIIIFAEILPKAIAAYNAVEITKTFLVPLSAVRFLLKPLIFIFSLMSNSIIKFVSKRQNNQSSELSEDYLETLINISLADGTFQTGEHELIKRAVRLHELKLQSIMTKKEDIVSLDINSSLETMISIFRKTMFSRLPVYKGEKDKIIGSVHYKDILFYKSHKAETDINKIIRKALFIPKTANIFSAIKTMSKNKRNMAFVIDEYGSAAGLITIDDISTAIFGSIQDEYTKTKTNPLNGMKIVDGTHILIPGGVPIVQLNRILNTDFHSDYNDTIGGLILETAEYLPKEGEKINIGEIEFKIEKVEMGKIIFLIADVSKITAGAQFPKAFL >NZ_CP009228.1|WP_044978314.1|1022253_1023252_+|MoxR-family-ATPase MIDTSYKTIVENFKAKMAERIVGQQELIEGILTAYIAGGHVLLEGVPGLAKTLIVKTFAELSNVSFKRIQFTPDLLPADLIGTLIYQQSIGKFSVRRGPIFANIVLADEINRAPAKVQSALLEAMAEGQVTIGENSYSLPVPFFVLATQNPIEQEGTYPLPEAELDRFLLKLFVPYPSIEEEINIVNNFSSLKPNENKASLGQSEPILTPENLETLRNAVEQVKCSPEITSYIVSIIAATRPVKNVKQDDYIHGNYLSYILYGASPRAGIAIQKCAKIKALFNGRDYVIPEDVKAVAYAALRHRLKLSYEAAADNLTADDIIEKLLGIVPQP >NZ_CP009228.1|WP_044978324.1|1036745_1037186_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEKLYTMNQIAEMLELSVRTIQNYLKEGKLTGKKIGSQWRFTEKDLKRLFSDESFIDEKNIDENHRLQKFLKKDSIETPEIFSILHYPYKKDFKLKELMKKINENIEKANKCQFYFASTANTFKFFLEGDIESVINLQKIIDENFN >NZ_CP009228.1|WP_044978325.1|1037255_1038812_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKAYKHFFMAMAVLALVSAMTSLVVPFLLSFWAKTDAEMNLKRFFIVISVLVLMFLLKTAIIFLRENFAKHFNIKNAKNIIEKILGLKYDTIISHGNMNLVERMAQAVNNMYIYMTGDAVQIWSSIISTIIILIAIFFDNFIIGLILLVLIPINYLGYKSLNAELKKHSQVMQTSTSAGFQEILSIVNQTDYLKQCPDHDIVLSQLRPALDKIYGSMAQVNKYAQTSSSFISSLNSMLQTVCILLVMYNYLSGANQVLPVVIYTIVLPLFFSNISIITNINLNKNNLKVSQEFIAFLDSEQEKDSNETIRSIEKIEFDIGAIQIGEEIFKANIKDKFIKGDIVWVQGKSGSGKSSLMKQLVKFRKTSEILINEKPISSINNTCIRSLIDYIPQNNSIINGTIRDNLFLNKSHSIETEEKLKKSELLSTILQNKNFDTIIMDMGANLSGGEKQKLAIARSLYSDAEVLIFDEVTANIDAESTILILNAIKNICKNKIVFIISHDTLPENFANKVIRME >NZ_CP009228.1|WP_044978326.1|1040362_1041091_-|hypothetical-protein MAKKHTQVDDIIETMQKNGGYATLAHLNQNVDTSSWKTKTPFESIRCYLQRSDEFFKIQPGLWALTNYRESVLKKFQIKENRKEQIETFTHSYYQGLIVDIGNMKNLKTYVPAQDKNKLFLDKKLGQISTMTDIPEFTYPKITNRAKTIDIIWFNEREMPTAFYEVEHSTNIINSLNKFFELQDFRARFCIVADKKRKNEFDDKISQSIYRPIKSLVDFVDYEMLANQHSKMAELFKNTLVL >NZ_CP009228.1|WP_044978327.1|1041453_1042902_+|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate-ligase MQISLENIKNKKVTVMGLGLNGGGLATAQFFARYGAEVTVTDLKTSEELRPSIEKLSAFKNIRFVLGEHRIEDFREADLVIKNPGVKFEGNVFLEAAKQIESDVSVFLSLSKAPILAVTGSKGKSSTVSALYYGLKKLGYNAFLGGNITVSPLSFFEETSCDTPVVLELSSWQLADLKNKKLLKPKIAIITPIMPDHLNWYGTMEKYVADKKIIYENMDKSDYLICNFDDGWGKIFAEETRANVFWYSEKKLPKEYRGVFFNKNQEGLYNLSGEEKILLSKEAKVPGLKLKQNVLNAGLALLLYQKIHKPENLKGNDILKDNNIKEQSEFIRKFMDEYSGIEHRLEFFYETNGIKFYNDTAATIPEASAAALEAFDKPPVLICGGTNKNLNFIPLAEKANLAKSLYLLAGTGTDLLIPLLKEKAIEYNGPFDSLDALLFSLKENAVNNDIVILSPGAASFGMFKNEFERGNKFKEKVKKIFC >NZ_CP009228.1|WP_044978328.1|1042970_1043213_+|hypothetical-protein MPTLQVHDLPDEIYSQIYLLAQKEHRTIGQQTILMLQDSIDKRIGNKSKRQLVLKKMEDLNIETDQLPNPVALLREDRER >NZ_CP009228.1|WP_044978329.1|1043209_1043608_+|PIN-domain-nuclease MILILDASAAIEIALNMKNAEVFKNSCMEADIILAPDIYPSEITNVFWKYRIFSNLDLIKCEKGIEYCIDLIDDFVDTRFLCNEVYAEAVKYKHPAYDIFYLIAARRNNAKLLTCDKKLKKIAIEMGVKLIA >NZ_CP009228.1|WP_044978330.1|1043620_1044667_+|alpha/beta-hydrolase MKRKRKLILLIAVVMFVLFILPMGIAYFIYRDTFGLRYTTTSYMRRNIEEFEGLKLKKYFFTSNKGQKLTAYKYYKEDSGYKGLIIIAHGFGGGGHNSYMDIADYLAGSGYLVFSYDATGNDESEGREVGGLPQGIIDLDYAIRFVKENKEFTNLPIMLFGHSWGGYSVGSVLNLHKDIAAAVTVSGFNSSIGMIKDNGGSFIGKWINFFMPYFSLIEKIKFGKYANYSCIKGFENSDTKVMVIHSSDDDAVSFENNYKQFYKKFGNNSRFTFIEYDNRGHSYLYYTDEARSYGKKLSEDFTSFKKSLQVEITPEIRAEYFKKHLDKKQFFEIDKGLMEKIVSFYDKN >NZ_CP009228.1|WP_044978331.1|1044663_1046208_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLQLLKKNKFLFSITFLLVAMTAFLNTYSSKILQISIDKTIEGNGKVEYVFLFAAFGFAAALILFIENLAETKLRKDCRLTLRNNIANYMTCENRIEHHKDKTKYYELFINSCDYFSSEAICNLMDALYNVNAIIFGLVTMYFIFPPFIIFCFVSMAFSFLMFKKIDPKLDELSNTFIEKRSGYYNYIQDILTGHFTIFINRAKKYFVQRTKKEFENYENYRYKYSANRDLLLNIVNFPSIVINVLMIIFLFYFILKGKATVGSVAGTLGLSALISSSFENLFYNIVSIRSGLLILDKKYFKVKIPLSETKIATKAIISIEIKNLNFSYGDNPVFTDFNISLKNGFYYLQAESGKGKSTLIKLITKELPAPDNSIFINGKDINSYTEDELIGEISYIPQENFIINGTIEDNLFVPVEQKQKELDLVCAFTLANTLHEKGGLDEKSISGGETRRLNLARNLDLSKSVIILDEPFKNVEREIYKKIEHNLLQITDKIIIAVTHENIEDKNAIVINI >NZ_CP009228.1|WP_044978332.1|1046182_1047751_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MYILIFILKTIQTVVSTGILYFFGFAIDEFTKNPSPEKIKLIIFYALLEILFVVIHHLCQRGIFFIRKKFALLYSQNLSNAIFNIPPEDFLKHETDYYFTAFKDQIPKIQTSYLLGRIHVASSLVGILLTVFVLISFHFSLPIIMLSSFIIGKFVTKIIEPHIDKMSSQEIRLQEEYNAETNENQRGLPFYILNGKRNLLFTRQVSANNTFENQSCKIEIKKTAFEWIMILTSMCLAVAGLAFAIFLFTKNKITIGMLSSTILYMNVFSQKLEGLLKLFIEVRYGKTSKEKIDKIIKSKRNKILSAEEFKTLNLSDVSFSYNTKDGESIPILKNINLQINKGDKILLTGKSGSGKSTLIKLILNLLKPNTGKVYFNDKLISDNEYLPFYFINQNFHLFKTSIEDNIFFGDKKQKEPYVFARLEKFYDKDITALDTDGVQISGGEKERAALARIFAGSYKNIIMDETFAGLDFENYKFIQNKFLDDKELTYIEISHREIDTEKFDYIFTLEGGKLNVTTVKEK >NZ_CP009228.1|WP_044978333.1|1047725_1049021_-|glycosyltransferase-family-4-protein MKILHCLAQLPMKTGSGVYFSTLVEGMIKKGHENAVLYGTQLPFAEKTFNESLPDKLQGSVKEYPVKFLSDYEQKEKTVFNADIPFPIAGMSDIMPYTSTVYSEMNDEMYQKWISVFEKTLLRAREEFNPDVIISHHLFILTSLVKKIFSGKKIIGISHGTDIRQIKKNPWIKTWYIQNLDKLDLYFTVSPKDITEVQTIFSANLEKIKLAGGGFNPDIFNDKDRHIFDGTFKLCYAGKISDSKGVFELAKTLPLILKKYPNTELTLIGNTTEEQKNILLKNADYSENLKIVNASSQICMCKILKQNDIFILPSYYEALGLVAVEALACGLFTVTTEIEGLINLLGEKINTSGIIEFVKLPRIYDVDKAYEEDKPAFVKALAEKIMLQMERLKSQKDFYSPVAEEIKKHSWDSIIDRVEKEIKDVYIDFYS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009228_4 | 1591393-1591560 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009228_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009228_4
>4.1|1591448|58|NZ_CP009228|CRISPRCasFinder CCACAAGGGACGCAGAGGAACTTGAAAAGGGGCTTTTCTAAGATATTCTTTAATTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009228_4
The CRISPR arrays of NZ_CP009228_4 >merge|NZ_CP009228|4|1591393-1591560|CRISPRCasFinder CTTTGCGAAGTTGAGCGAAGCTCAGCGCTTTGCGGGCTTGGCGGTTTATGTTTAACCACAAGGGACGCAGAGGAACTTGAAAAGGGGCTTTTCTAAGATATTCTTTAATTTACCTTTGCGAAGTTGAGCGAAGCTCAGCGCTTTGCGGGCTTCGCGGTTTATGTTTAA >NZ_CP009228|4|3|1591393-1591560|CRISPRCasFinder CTTTGCGAAGTTGAGCGAAGCTCAGCGCTTTGCGGGCTTGGCGGTTTATGTTTAA CCACAAGGGACGCAGAGGAACTTGAAAAGGGGCTTTTCTAAGATATTCTTTAATTTAC CTTTGCGAAGTTGAGCGAAGCTCAGCGCTTTGCGGGCTTCGCGGTTTATGTTTAA
>NZ_CP009228.1|WP_044978747.1|1590337_1591264_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MSTSNRKYKDSVFVDLFSEDEKAKENFLSLYNALHDTKLTAIENLKNIRLDQVLYMTFYNDVSYLVDNKIIVLAEHQSTINPNMPLRCLEYISRLYETLFESKEKYSRKLLNIPTPEFYVFYNGEEAYPSDKNLKLSEAFIERGTETNLELTVKVININRQNRHPVLENCRTMQEYSIFVETVRKWKEIDAQNGFEKAVEECIENNILREYLKRKTKEVLNMLLAEYDYETDIAVQRAEEREIAFAEGIEQGIEQGIEQGIEKGIQQGFADGSYQTKLETAKLMKHANCELDFIMQMTGLTKEEIEQL >NZ_CP009228.1|WP_044978746.1|1589279_1590158_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MTTSNRKYKDSVFVDLFSEDEKAKENFLSLYNALHSTNLPLSCPVENIRLENVMYMNIINDVSCLVDGKIIVLAEHQSTINENMPLRFLEYIARLYEKLQAPTDRYLRKLSKIPAPEFYVFYNGTEDYPETTVLKLSDAFITKLEHAPLELTVQVLNINTDKANKVLAACKPLEEYSLFVKEVRKQTQLDSENGFTNAVKICIEKGILKEYLQRKSREVINMLVAEYDYDTDIAVQREESLRIGIRQGVQQGFADGSYKKALETAKLMKHANCELDFIMQMTGLTKEEVESV >NZ_CP009228.1|WP_044978745.1|1588892_1589111_-|hypothetical-protein MLVAEYDYDTDIAVQREESLRIGIQQGIKQGFADGSYQTKLETAKNLIGLRLSIEDIAQATGLTKEEVEAIN >NZ_CP009228.1|WP_044978742.1|1587347_1588058_-|DUF4469-domain-containing-protein MLKYSLRENLLTPAPDDYMAQAQDVRSYTLDEIIDLMMQKGSTLTRADVAAVLQIYGEVCASLIADGSAVNTPLMNTSLSISGVFNGANDSFDKKRHTVNLNLTAGSLLREAVTKVKCEKTEGASTGPYITEVADIVFGKVNEVLTKGGVVQLVGSRLKFDAKDASQGIFFVPETGAPVRAAVTAENKPARLMAIIPADLAAGNWYIEVRTKMIGSSQKSKTLKTGRFDKPLTCTA >NZ_CP009228.1|WP_049992351.1|1585826_1587143_-|leucine-rich-repeat-domain-containing-protein MKQINLRRAVNLTALVLAAGLLIGLTGCKPKVDPKYNYKVEHLQQNIADDNYTLYETETLSGKADETTSAAAKPYAGFTAQGFSQAAIKADGSTVVQIKYDRKTITLKLNLDGGTTTTPLTDGEDSTKLLTGKFGAKIPELTNLKKDPLIFDGWEPELPSTFPALPAETYKALWATKYRITVKGDERTVISENILTIDQGKTWNDIKAEATGKVSLTTEWNNEDNNGDYGIYEWRLGDENGIKLVDTYPIDKHMTVYAVTNYTRFNIKGKAIETVNDKGYNGSKPKGKIIIPEGITGIRTDQYDTGYDGAFYNCTGITSISLPASLTYIGRRAFCGCTGLQTINLPASLKSIGVGAFRDCTGLTSITLPATLKEIGREAFVDTNLESAVFEDPTGWRRYGYSGGYQDIVANDLRDPSKAAKYLCKYEGGYALFIWKKD >NZ_CP009228.1|WP_044978741.1|1585110_1585617_-|hypothetical-protein MCENRKKEDNNICPNLCCCIIFTVSNIVLIIAFVTLYIFRKNDWEVEVFIICSIITVVMSVLNILFCILNFLYYKEKNKNHLLTEAYDKALKKLEDDRDKHMVDTPKKDIDKKTKKKNIRKPMKVHKPKILNLPKKLLLSIGITKKPSPKYSKLIVKTSLQNKELFYG >NZ_CP009228.1|WP_044978740.1|1584284_1585118_-|hypothetical-protein MADTTKNEKDRPTAKDMYDYLWRARDFELKHLWQRSVFLAVFLLGIASAYALYIKDIFIPNLNPNQITATLNAVKKEVDGSTKYTLIINPNSNLEIKDSIKKDKPFSALFMPGAVPIVICLLGIIFSVLWIIMGKGSKAWYELYESNLAAMSDNPLFWKDKAEAESALDKIFCNKKTGRYTEYVFGHLKNRHNDPIDKNLLSTVAGSFSVSKVNIMIGIISLKFFILALFFHIYWLCKNLFTDPLPPILIIFPITAIFLFLLFSRLKKKLGSSYFDN >NZ_CP009228.1|WP_044978739.1|1582128_1584228_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKKKKHFSIRKKLLIVFGLLIMLGGVIQGSVSWYTFRKAMIRDVEERLTDKADDIATLVESIIDVDFEYLRGVARIPDLNDDSLSYPQKSARLQQELSSDNDGAFLNICDLNGNTYYMDGRVVSVADRHWYKTALEGNYFISEPYLSPDTGKIHVVFSLPIYNTDGEISGVMCAGLQGLILSEDIKELVIGKTGYCYMMSKDGTIIAHRDNKLVSGFVNYQKLAETDAELKSAAEFQKKALQDQEPGVGYYTLDGEKNIGAYAKMERSGWTIVIRAPVNEFLISLNTLTRAIIMSVILILLVTIVISFIISTKMVGPVQTAVNVLRDIAQGEGDLTVQLPLIGNDEVTQLSEYFNETIEKIRLSIKSVDVNAGTMQSIGDELAGNMTETASAVNQISANVEGIKQQAIAQAASVGQTSATVEEIISTIKKLDERIELQASSVARSSASVEEMVANIGSITQTLEKSDDAIKNLATATADGKDTVLNSNTITQKIAEESGSLLEASSVIQHIASQTNLLAMNAAIEAAHAGEAGKGFAVVADEIRKLAEDSAAQGKTITAVLKTFSNEIEVLSASSKTVEEKFNTIFSLSEEVKTMSNSLTEAMREQENGSKEVLAAIRDINAVTVEVKEGSAEMLRGGEQTAEEMQKLDGLTRVITDGMNEMAAGVIEINNAVQEVNEITQKNKISIENLADEVKKFKI >NZ_CP009228.1|WP_044978738.1|1581400_1582000_+|RdgB/HAM1-family-non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase MKIYLASGNINKKREVQELLPSHRIVLPKDEGMEFDPEETGSTFFENSMIKAKALYDIVKAPVLADDSGLCVDFLNGAPGVHSARYGSIEGEHVSAEAGIIKVLNELKGVKKRSAFFACCIVFLLNENRFYSVQEICEGTISEAPSGAGGFGYDPIFFVEKLGKTFAELTSEEKNSISHRGKALVSISKLIEPLKTSIF >NZ_CP009228.1|WP_044978737.1|1580457_1581471_+|hypothetical-protein MIISLEKGEEFVNTYNSGNTNSSIKEKIVMEIFEIVYVNLEKFGVYFKDEDLRSDFLFQFYYRIPKILKNYKPSLSSFYTYLTNHLHFYYLTFKCKNIRREINDTVIAGQEGTRWEHLMGEYDLDENFNFYVAEPESKYCKIQKPNSLLPECKISKQELENRRTLYFNMPLEHRKIFLLACKACFFLDDDLIDKIAAEIKIAPELLCSIIQDLKTACFKRFEKINNCICNRNRYYVKIQLFRYLLFHTHNTKCQLDKLCFSLKHNRYLWQKSKKLNKVQLKSPSSRDIQKYINVYKGTIDKNIAKVLKIWYTSGHEDISGIRKYKQKAGSSRAASVS >NZ_CP009228.1|WP_044979748.1|1591756_1593547_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MHKKSTFLKFAAYYKPYKFLFFFDLFCALLVSAVDLVFPQVIRYLTRIIPKIRRGEVLLFSDKTIFSFDVQASAIVYLGLIIAAILLGLYIIRYFAQYFITSWGHIMGARMERDMRNDLFNHMQRLSFSYYDQNKTGDMISRIVSDLFDISELAHHGPENLFISFLKIIGSFSLLCFINVRLTLILASVTSLMFIFTFFQNKKMRKIFMLNRKTIAGINSQVQDTLSGIRVVQSFANEELESKKFDTANEAFVHSKYINYRQMGEFFAVNGLLQGLFFIVTVLAGSFFVAKNELTIPDLTIYVLYINIYIAPINLLINFTEMFQKGAAGFKRFLQIVETAPDITEKEDAVELKDVKGNIKYENVDFSYNETTTILKNISIDIPAGKTLALVGPSGGGKTTICSLLPRFYDVLNGKISIDGKDIRDLTLKSLRENIGIVQQDVYLFGGTIKENIAYGKPEASDEEIIEAAKNAHIHDFIMSLEEGYDSYVGERGVRLSGGQKQRISIARVFLKNPPILILDEATSALDTENEILIQRAIEELSEERTTIVIAHRLSTIRNADRILVVTDEGIMERGTHEELLSLNGIYANLRKLDEF >NZ_CP009228.1|WP_044978748.1|1594540_1595785_+|U32-family-peptidase MEILSPAGNFEKLDYAWEYGADAAYIGLKNFSLRAKADNFSGEEYKNISLLKEEYKKRGLTKKLYCAINISFHNEDLKKLLEETKYFKQYPFDAFIVQDLGAARILKENFPDIPLHLSTQANCINYEAVRVYKDLGFSRVVLGREASLEDVSEIKQRVPEMELECFVHGAMCISYSGRCLISAYLTDRSANAGECTHSCRWNYKMYCEKGGHFFVEESERKGELFPVEEGENYTALFSSKDLCMIDHLDKMKEAGADSLKIEGRMKSIYYTALTARAYRKKIDFLDGKIGEKEAAPFIQELYKTAHREFTTGFYFSSAEANKTTAGESKSPYMLAGKIGKRLSENEYEFISMNKIDSGLPLEYVGPDICSIEDRDYVLLKPDTREKMDWVCHGHPCIIKTDKPIAEKFLVRCKE >NZ_CP009228.1|WP_044978749.1|1595807_1596548_+|copper-homeostasis-protein-CutC MKNIKIEICAGSLEDAVLAEKAGASRVELNSSLFLGGLTPSLGTLKLVKKETHLEVMTMVRPRAAGFFYSSYEYKTMLEDAKLFIDNGADGIVFGFLKKDGTIDAKRCEAMIKIAGRADRVFHRAIDVVPDPLKALDELISLGFTRVLTSGQEPTAYEGADLIAKMVKRAKGRIEILPGGGITEKNASKIIKLTGVDQIHFAALKRREEPSTRANPSIYYGGGLYPPEDSIEVAGLDEMIRVRESL >NZ_CP009228.1|WP_044978750.1|1596625_1597390_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MLKKFEDLTFTDDFMFCKIMQNEDLCKGLIEMILSDTIGKITYISVQHNISTYEQAKSVRFDVLVQAEDGKLYDIEMQVSNERNIPKRMRFYQAAIDISFLDKGNSYNNLNDSIIIFICLFDVIGKNRPIYTFENLCIEDKNTPLQDGTLKVIINAEAFNNTEDKELKEFLEYIKTGKVKNEFTREIEAMIQKVKQNEQARQEYRLMSTFEMDARDKGAYDNKRETAKLMKKRGYPVPEILLMTGLTESEIEKL >NZ_CP009228.1|WP_044978751.1|1597655_1598534_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKKLFKITLQNDYAFKRVFGTEENKDVLQDLLECILDIPSETITGLELLDKEFYKEILTEKLGILDIKLRLKDGTFVDIEIQNVWHRDFDARTLYYWSKMYNEGIKQGQDYTNLPKCITINLIGKGFNKNKRLHNKYLVLEQDTKEPLASKLEIHILNLEKAKVLEGSQFRDNKMKRLLNWLKFIETDNSEVRKMLEQESPMMRKANTAISVMEMSPRDKWLYDSRMKYEHDRASCINEGYQQGIEQGIEQGISQGAYQNKLETAKLLKQLGDSIQKIIQVTGLSKEDIQKL >NZ_CP009228.1|WP_044978752.1|1601358_1602219_+|hypothetical-protein MEKNYRKLGVLILIFLGLVGAGTLVVYQKLPAGLPAGQSSGSPVGHPTGEQAELSKTETAELEKPKQESENTEPKKEEPKRVVPKKETPRKEVPKKAEPKKIEPKKASKAKESEVSADHVQPAEPPEKPSMGISLADRDKKTFNWSLGLLAEANMNSPDGYAMGTGLYTLFMLPLKLKIGHLSLGAKALYSNDFKKHHIFDAALLFRWNFYDFPKIKKRDSGFFIQLEGGAVFGLKEREPSKLFMYALGEAAFGYRFTINNLFIEPYLRGGYPVIWAIGISGGFRI >NZ_CP009228.1|WP_044978753.1|1602215_1603430_+|SUMF1/EgtB/PvdO-family-nonheme-iron-enzyme MKKNFVLFLVILFVSVTACKNPFFKNMLDKDSGSEGSGDWNSQSSDIGSFEDAGYFVKIIPPVNGIIGVKRDYSLHPSGWTNNPDNWTSYWPGYYEGVFIEGRKVKLSPYKIGKTEVTYELWHEVLTWAEGKGYTFANKGRKGSAGTGAAPTDTGKKEPVTTISWRDCIVWCNAYTEKEKGIGECVYRKKDNHTVVLKDATATTDCDAAYADMSKKGYRLPTNVEWEYAARWQGSDGTNADKYGAVYLTKLWSGSGMKKPIGFKDLPLPPEGESWKSLRDEFNRVAVYYLWWNGHRWTGQTPPTTKTSVVASKDANTLGLYDMSGNVWELCWDWFLSDPAEGDVLDLDGFVSDPHGPYSGWSRVMRGGSFGSYAGHSTVGSVYPIGPSSLMYGAGVGFRLACRP >NZ_CP009228.1|WP_044978754.1|1603936_1604218_+|BrnT-family-toxin MEFEWDAEKNKRNIKKYGIAFEMAAKFFLDDKRIERYDAEHSSIDEHRYKTIGMVNKVLTVIYTERKTAIRIISARLAEQEEIDEYYKNYEFR >NZ_CP009228.1|WP_044978755.1|1604688_1605453_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MIKKFEDLTFTDDFMFCKVMQNTDLCKRLIEMILSDTIGKIAYISVQHNINTYEQAKSVRFDVLVQTENGKFYDVEMQVSNEKNIPKRMRFYQAAIDISFLDKGNFYNDLNDCFIIFICTFDAIDKNRPIYTFENICLEDKNISLQDGTKKVIINAEAFKDTKNKELKEFLEYLKTGKTKSEFTREIEAMIQTIKENEQARQEYRLMSTFEMDARYKGIYETKRETAKLMKMEKLDMSLIKKITGLPEEEIEKL >NZ_CP009228.1|WP_084224524.1|1606103_1606403_+|PD-(D/E)XK-nuclease-family-transposase MLAENSEMMKKANAAISVMEMSPKEKWLYENRMKYEHDKASWKHVGYQEGIEAGIQESLDKGAYQKALETAKLMRMHNYPIAEICTMTGLTKEEVEAIN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009228_3 | 3.1|1036339|32|NZ_CP009228|PILER-CR,CRT | 1036339-1036370 | 32 | NC_020051 | Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02, complete sequence | 106644-106675 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP009228_2 | 2.1|334494|31|NZ_CP009228|CRISPRCasFinder | 334494-334524 | 31 | NZ_AP022566 | Mycolicibacterium alvei strain JCM 12272 plasmid pJCM12272, complete sequence | 231755-231785 | 9 | 0.71 |
1. spacer 3.1|1036339|32|NZ_CP009228|PILER-CR,CRT matches to NC_020051 (Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gcaagaaaaaacagcaggcaattgtacacccg--- CRISPR spacer acaagaaaaaacagccgtcaattg---actcatct Protospacer .************** * ****** **.*.
2. spacer 2.1|334494|31|NZ_CP009228|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022566 (Mycolicibacterium alvei strain JCM 12272 plasmid pJCM12272, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
ccgtcgctcataattgcaccgccgtaatcca CRISPR spacer aggtcgctcatgactgcaccgccgtcgcacg Protospacer *********.*.*********** .. *.
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1546078 : 1605453
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009228|1546078:1605453|DBSCAN-SWA 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45 | Bacillus_phage(25.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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