Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009170 | Thermoanaerobacter kivui strain LKT-1 chromosome, complete genome | 7 crisprs | cas3,Cas14b_CAS-V-F,DEDDh,cmr3gr5,cmr5gr11,cmr4gr7,cas10,cmr6gr7,cmr1gr7,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,csx1,csx20,cas4,csa3,cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b1,csx15,cas8b2 | 0 | 16 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009170_1 | 91970-92065 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009170_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009170_1
>1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTTCTGTCTCTCTTTCAATTTTTTAAAAGATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009170_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009170_1 >merge|NZ_CP009170|1|91970-92065|CRISPRCasFinder CAGTTCTAGCAGTTAGAACGAGTTGTAAACCTTTTCTGTCTCTCTTTCAATTTTTTAAAAGATTCAGTTCTAGCAGTTAGAACGAGTTGTAAACCT >NZ_CP009170|1|1|91970-92065|CRISPRCasFinder CAGTTCTAGCAGTTAGAACGAGTTGTAAACCT TTTCTGTCTCTCTTTCAATTTTTTAAAAGATT CAGTTCTAGCAGTTAGAACGAGTTGTAAACCT
>NZ_CP009170.1|WP_049684301.1|91476_91830_+|DsrE-family-protein MHITIQLNVPPYTNEDVDTAIHLAETLLKKGHKVSIFLFADSVLATNKLVKPMRADRNLPSKLQELSNNGAEIHICGLCAQYRGITEDMKIDNSVFSGLPEMASLIYNSDRYINLMP >NZ_CP009170.1|WP_049684300.1|90404_91421_+|YeeE/YedE-family-protein MDPRWQGLLVGILFGIVLQRGRICFNSAIRDVKMTKDNYLMKMALVAILVETIGFQLAAQLGWIKLNPLPLIPLAQIIGGFLFGMGMVLAGGCASGITYRIGEGYVTAFVAAVFFGVTASAVRGGPLSFINNWLGKPITTTNNPNGFYAAKDGAVNLTIANLLNINPWIIAIIFAILLLIIVIYWKTTERKVSGLNWITGGISLGIVGIIAYLSQKTYPLGITGGWVNLFRTTTANLDLTQPIPYNWMGMEIVGVIIGAFVAALIAKEFRFRAPKDPKTFAQVALGGILMGIGAGSAGGCNIGHILSGLPHLAISSIIFTIFAVLGNWLMVWYLFERR >NZ_CP009170.1|WP_049684299.1|90139_90382_+|sulfurtransferase-TusA-family-protein MSNEVKPTYTLDERGEVCPVPDVDTRRKLKEMKSGEVLEVLIDYALSKERIPAGVKDVGGEVISIEEIGPSEWRLLIKKL >NZ_CP009170.1|WP_049684298.1|89063_89957_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNIDNLKAFYKTVYYKSIYSAAKELYLSQPAISQQIKALEKDLKATLLKRSNRGVVPTLAGELVYQYAERILNLYDNMIKDLECYENDCVNRLTISCCPTIGQYALPCAIHEFKKRQKNLVVHIEHNFTPEVIYNVKEAGIDIGFIEGCYSDENIDCISLGEYKMHFVANGSWENKKLSKNKLFHYNFFVIHKKCSLRKIIEETLLSHGVDIKKLKIEMESPSIESIKSSVAAGHGLSILPYIAIKKELYTKTLSIVNVDDIDFTYNYSIIYNKKIYKKSKKDFIDFIKINGQNLFC >NZ_CP009170.1|WP_049684297.1|88822_89053_-|sulfurtransferase-TusA-family-protein MEQEIICMGEICPLPLLKTIKKLEEMKEGDILKVVVDHRCSLDNIESYFYKKDYVQGSILKINEVLTGVWEIYIKK >NZ_CP009170.1|WP_049684296.1|83052_83613_+|uracil-DNA-glycosylase MALLSLKDLYLECLHCTKCDLSKTRTNMVFGEGNLRSKIMFVGEGPGRDEDLQGRPFVGKAGQLLTKMLEDVGLKREEVYIANIVKCRPPNNRVPLQSEIDACLPYLRNQVAIIAPKIIVCLGATAAKAIIDKNFKITAMRGQWFERKGVKIIATYHPAAILRDPEKMVPAMEDFKKIKEEMNKLL >NZ_CP009170.1|WP_049684295.1|82487_83051_+|Fe-S-containing-hydro-lyase MYKKINTPLTEEIISQLKAGDLVLLSGEIYTARDEAHKRMVDSLNKGEKLPFKIKNSVIYYVGPCPPTPGQIVGSCGPTTSGRMDKYTPLLIELGLKGMIGKGYRSEEVINAMKKYKAVYFTAIGGAGALLAEKVKEAKVVAYEDLGTEAVYKFVVEDFPIIVTIDMYGNNLYEAEKEKYKLMQKGE >NZ_CP009170.1|WP_049684294.1|81624_82467_+|fumarate-hydratase MKEIEAKKITEIVKLLCIEANYDLPKDIFDALKERIKEEKSPLGREILKNIIKNAEIAKGKRVPICQDTGIAVVFVEIGQDIRIVNGNLKEAINEGVRLGYEEGYLRKSVVKSPIVRQNTKDNTPAIIHYNICEGDKLSITVMPKGAGSENMSALKMLKPSDGIEGIKNFVIETVQNAGPNACPPLIVGVGIGGDFEFAPYLAKIALLRSVGERNTDEMLAQLEEELLQEINMLGIGPQGLGGSTTAIDVHIETYPTHIASLPVAVNLGCHVTRHATFVL >NZ_CP009170.1|WP_049684293.1|80546_81440_-|adenine-nucleotide-alpha-hydrolase-family-protein MKCTVCRKPAIVKFPAHNSAFCEEHLDAFFMRQVSKTIEKYKMLPPKGRVVVAISGGKDSLVTTFVLKRLGYEVLGFFIDLAIEENNFSSRSREVVENFCKENDIPLEIVSLKEKFGKGIPDVAKRQDRICAICGVTKRHLMNEYTLSAKADALATGHTLDDMAKLLLANLFRWDLHHLSKGIPVLPEEPGFARKIKPLAFQAEEEIIAFAKLHNIKPVTAVCPYSREAKYIRYQEALDMLEEKSPGIKRSFYKNYTKYAHLFVDTSARPPKINCEVCGFPSVSPVCTFCRTWVKTD >NZ_CP009170.1|WP_049686151.1|78158_80375_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MKAFKVAANEIEKIIKNRFRRVAVIVLAFMPLLYSFLYLYAFWDPYSKLDKLPVAVVNEDKGGIYEGKSQNFGNEIVQKLKDNKEFKWDFVDYKKGIDGLKGNKYYFMIRIPEDFTKNIISVNSSTPKKAIIEYITNDKKNFLATQIGNKAIENIQIEIASSIRKGYIDSIFKSVDELGSGLKEASEAENKLATGTLELYNGAQKLNSSMNTALDVSKQIKDGALSLNNGISQALNGSTALYNGTNLLSQKFSDASNTEALLNGMNSLQNGITGINQGLNDASNSAIKLKDGINSLVNGYNQVGQNVSSFASSVSQLGNGLSQISTALDGAQAALKDYIAKHPEASSDPELQKALIAIAQSNAGINSMSQNLNSGLTQVQKLNTVLAQLQQASNTINNGMDSLASGLSYMCQASSQLVDGSNKLYSGVAQLSVGINTAGEKLKEISNGLYSLNNGIKSLSDGSSKLYNGANSLYNGMALLKDGTRQFADGAKSLYDNQRILARKLSDAAEKIDSSGITTAKKDMINEPIILDTRRLYPVKNYGIGFAPYFIPLSLWVGSLILFFLIDIFDKEKYEGMNNVSIQLGKFMSLALVGILQSVVSSFVLVEGLKLDVHNLFYYYLINAVMSLTFIAIIQLFVMLFGIAGKFFAVVLLMLQLTSSGGTFPMELLPKFFNVINPYLPMTYGVAGLREAISGNSIGVILHNISMIAGFGVLFLLFIILLAEKADKIEITQRLKQI >NZ_CP009170.1|WP_049684302.1|92277_92556_+|sulfurtransferase-complex-subunit-TusB MALIIVKKSPENKISEFLLKLALPHDKVIFIQDGVIFAIEKNLKTMVKDGVELFALKEDFIARGFEESESQIPLIDYEGWADLIERDEKIIS >NZ_CP009170.1|WP_049684303.1|92591_94001_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MNGEIKVAEFSDVKEYDLAVIGAGPGGYVAAIKAAKKGAKVALFEKDKLGGTCLNRGCIPTKAYARIAEVYDILKRAGEFGFDVKINTFEFAQAVKRKNEIVNELTEGIKALLKANGVDVFNAEAKVDKEKNILFGENKIKAKNIIIATGSSPAELPIEGINSKNVMNSDTILEMTSLPQSLCIIGGGVIGMEFAFIMNQFGVKVSVVEMMPNILPTLDKKISSSIKFVAQKRGIKIYTSSTVERIDEEENGGSIVTVKNGENIKRIYADKVFVSIGRKLNTDIGPIVELLEFEGKAIKVDEHMKTNVEGVYAVGDVTGKMMLAHVASAQGEVAVDNIFGESSTIDYMKIPAAVFTEPEIGYFGYTEEEAKKKFGEIKVGRFDFKHNGRAKTYGETEGFAKIISNEIGEIVGAWVVGNGASELVHVLSTACQSGITAENLKEVVYAHPTRSETIMEAVKDIFGESIHKV >NZ_CP009170.1|WP_049684304.1|94089_94464_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MEVLEGLYYSKDHVWLKIEGDKAYIGITDYAQDSVGDIEFIDLPEVGEELAAGDVLGVVESAKAASDVYMPVDGKVLEINNNVVDDPSLVNSDPYGNWLIVVEIKNKSQLEDLMTAEEYKKLLD >NZ_CP009170.1|WP_049684305.1|94900_95848_+|ROK-family-protein MGKILCGVDLGGTKISTGLVDEKGNIIKSIKIPTMAEKGPEEVIKRIEQSVYDVLKEAGLKISDLKGVGIGSPGPLDAKRGVVISPPNLPGWDNVPIVDILSHKLGVEVKLENDANAAAIGEHLFGAGRGIDNFVYITVSTGIGGGVIIQGKLYSGENSNAAEIGHHTINFNGPRCNCGNYGCFEAFASGTAIARFAQEGIQNGKDTMIRDLAKDGVVKSEHVFEAAKLEDEFAEELVDNEAFYLGVGISNIMAFYNPKRIAIGGGVSTQWEMLYDKMMETIKKKALKPNAEVCEVVKAELGENVGVLGAAALLL >NZ_CP009170.1|WP_003871546.1|95858_96431_+|DNA-3-methyladenine-glycosylase-I MNRCPWCLSDDIYIKYHDEEWGVPVHEDKKHFEFLVLESAQAGLSWITILRKRENYRKAYADFDPIKVSQYDEKKVEELIKNSGIIKNRKKIEASIHNAKRFIEIQKEFGSFDQYIWGFVNYKPIINAWEKIEDIPSKTELSDKISQDLKKRGFIFIGSTIIYSYMQAVGIVNDHLISCFRYKELVETFK >NZ_CP009170.1|WP_084574141.1|96571_96796_+|sigma-factor-G-inhibitor-Gin MVLHMESIATKRKCFICEQESQDGIEVLGKFLCTECQHKLINLSPLDEAYDFYRRKMIDIWEGYMKDIKYENRM >NZ_CP009170.1|WP_049684307.1|96863_98285_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MTAPLYEALMDYAKNQIIPFHMPGHKQGRTFPGEYLVNLAKIDLTEVPGLDNLHNPEGPILEAQKLAAKAFGARESFFLVNGTTSGIYAAMYAVLNPDDKILIMRNSHKSVYNGLVLTGTVPVYINPEIDYEDGIPMGIDINKLEEYLKKDEAIKAVVMTYPNYYGFCSDITGISDIVHKYNKILIVDEAHGAHFPFSNNLPHSSLQAGADIVVQSVHKTLSSFTQSSILHLNSDRVDTNRLKYSLSLFQSTSPSYILMSSLDLARDYMEKEGKERLRKAVQLADYARDEINKIEGIRCLGKEIIGKYGIVDFDKAKLTVSVKNLGIKGPEAEKFLRDNFNIQVEMSDAFNILAMVTLADDKSHIDSFIEGIKNLVAIKRDKEPVEEIKNYPDIPEMVLKPSQAVTKKAKLVPLDEAINSISANFIIPYPPGVPLVCPGERIKKDMVKYINVLYNKGIKILGLKNNNILVCEI >NZ_CP009170.1|WP_049684308.1|98281_98893_+|dTMP-kinase MKGKFITFEGIDGCGKTTQIKLLKEYLFKKGYNILVLREPGGTKVGEKIRDILLDKDNFIFPMTEMLLYASSRAQLVSEKIIPALQKGKIVIADRFVDSSYVYQGYARELGIETVKVVNEIATIGILPDITIYIDITPEEAMKRRGKREADRLEKESMEFHEKVREGYVKLIKQHPERFVIIDGMQEISKVHQCIITVIKKYL >NZ_CP009170.1|WP_049684309.1|98906_99236_+|cyclic-di-AMP-receptor MKLVLAIVQDEDVRRLMDGLTEGGFSFTRVASTGGFLRSGNTTLIIGVEDEKLDDVISIIEKKCKTRDRIITSPTPMGGATDIFLPQAVEVTIGGATVFVLDVEKFFRI >NZ_CP009170.1|WP_049684310.1|99245_99686_+|YaaR-family-protein MRIQEIKSLKVSSDIKSEYHRYDKVSKKFIDSLEEELEQFRQDKLNSILSELDSAAQKLKETLTLEDLLNYKKLVKKFLQEATNGMLKHTKKEYVDLRGRKKIYSLVEKVNDKLEKLTEDFLKDSKHIELLKMIDDIRGLLIDIYS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009170_2 | 709251-709344 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009170_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009170_2
>2.1|709280|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CAACTTTGGACAAGGCGGATACTGGATTAGCCCTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009170_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009170_2 >merge|NZ_CP009170|2|709251-709344|CRISPRCasFinder GTTTTGCAGCCAGTAATTGAGAGACTGAGCAACTTTGGACAAGGCGGATACTGGATTAGCCCTGAGTTTTGCAGCCAGTAATTGAGAGACTGAG >NZ_CP009170|2|2|709251-709344|CRISPRCasFinder GTTTTGCAGCCAGTAATTGAGAGACTGAG CAACTTTGGACAAGGCGGATACTGGATTAGCCCTGA GTTTTGCAGCCAGTAATTGAGAGACTGAG
>NZ_CP009170.1|WP_049684764.1|708010_708958_+|capsular-biosynthesis-protein MEEEISLRELIEVILKYKKTIIIVTLAATLVAAVLSFFIIKPTYEATTTLSVTDVTPETGFFGSNTTVILPGKDSDLPAVQSDSIEKDLSLLLSSLLKYPDMSVEAFKEEVTNPIVLMNTVKQLGLDPQKYTVENLKKQISVSVVNNTNLITVTVKENDPKLAAKIADTIAQNFRTYIIERNNRQTDKLIETLNKLITLQNDKIKEATAELNKVQTNSQDKLLIEQKQKQLDLLKSTRDIMLEKYNILELVKESDLGKQSILITSKALVPDKPVAPKKLLNIIIAFMLGLMVSIFIVFFMEYWKNTDPKRTTVKA >NZ_CP009170.1|WP_173402324.1|707074_707986_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MVKIKKAIIPAAGLGTRFLPATKAQPKEMLPIVDKPTIQYIVEEAIQSGIEDILIITGRNKRAIEDHFDKSVELELELKKKKKESLLHLVEDISNMVNIHYIRQKEPKGLGHAIYCARAFVGNEPFAVLLGDDIVDAEVPVLKQMMEQYERYNCSIIGVQEVPYEDVDKYGIVDSTPIEDRLYKVNNLVEKPKKEEAPSNIAILGRYIITPRIFEILEITPPGAGGEIQLTDALKTLLNYEAIYAYNFIGKRYDVGDKLGYLMATVEYALKREDLREPFKRYLLDVTRSLDPVMDEAAVTITQ >NZ_CP009170.1|WP_049684763.1|705678_707046_+|phosphoglucosamine-mutase MKLNENMFRMYDIRGVWEDDLTVESAELIGKAFGTYVRQKGIKDVLVGRDNRLSSRPIRDALIKGLTSTGCDVLDVGVLTTPAFYYSNVLYNYQAGMMITASHNPPQFNGFKVMVGPSTIYGDELKKLYYIAEKGEFEEGTGNVKYAYPINSYINMIKEKVKLGNRKLKVVVDCGNGTGSYFYPDVIYNLGCEVYPLYCESDPTFPNHFPDPVKEENLKDLIEEVKRVKADLGIAFDGDGDRIGVVDDKGNIIWGDMLMILYWREIMKKHPGADAIVEVKCSQALVEEIERLGGKPIFFKTGHSLIKAKMKELGAVFTGEMSGHMFFADEYYGFDDAAYAAARLLRILSNTDKSLSELLADVPKYPATPEIRLECDDEKKFDVVKGVTEYFKEKGYDIIDVDGARVLFDEGWGLVRASNTGPELIVRCEAKTKEKLEEIKKELSEALVKFGVKFK >NZ_CP009170.1|WP_049684762.1|705027_705570_+|antiterminator-LoaP MKKWYVIFTRSGYENKVRDIIESCFKQKEVKLLIPKRKIIEREKGQPVERIRLLFPGYVFVNAEMSDDLYYKISEVLKRGIFLKEGKRPAFVKEEEMKIILSLTKNSDLIDLSKGIMEGERVKIIEGPLKGYEGLIKKIDKRKKRAKVIFSIAGELKSVDLAIEVMENVSEQQRSLVYAY >NZ_CP009170.1|WP_049684761.1|703245_704592_-|amino-acid-permease MLEAAKRTGLNKKLTAIDLAALAIGSVVGTGIFVATGEGALRAGPAVIISYVIGGITAALAAFIFAELVTMFPVAGSTYTYAYVAFGELIAWIIGWDLLLEYLVSASAVASGWSGTFVGLLKSFGITLPEVIAKPPIWGGVMDLPAILVTAFVAWILYIGVRESATTNNIIVLLKIAVILLFLFLGFSHVKLSNLTPFAPYGWKGIMSAAAIIFFAYIGFDAVSTAAEETKNPKRDVPLGLMMAMVLILALYISVAVVLVGMVPYKQIIPDNALPGALMSIGINWGSALVATGAAVGMISTLLVTLYGQIRIFMVMARDGLLPEVFSHVHPKYRTPHINTIITSVVAAIIAGFLPLDIIIELCNIGTLSVFVIVSIGILVLRVKMPNVERKFRVPFVWVVAPLTMAFSLYLMASLPWVTWARFGIWMLVGLIIYFAYGKYHSVLNMQK >NZ_CP009170.1|WP_173402323.1|702289_702853_+|pyridoxal-5'-phosphate-synthase-glutaminase-subunit-PdxT MRVGVLGVQGSVKEHMDKLKLIKGIEAVEAKDRDTILTLDALIIPGGESTAIGKILVDFGLKDAILKLNERKVPIWGTCAGMILMAKHIVNDERIHLGIMDITVRRNAYGSQIDSFKTRLMIPAVSENEIEAVFIRAPYIESVGDGVRILAKYEGKIVAAQQDNLLATAFHPELTDDLSFYRYFLRL >NZ_CP009170.1|WP_004397232.1|701409_702288_+|pyridoxal-5'-phosphate-synthase-lyase-subunit-PdxS MNERYELNKNLAQMLKGGVIMDVTTPEQAIIAEKAGAVAVMALERVPADIRARGGVARMSDPKIIKEIKAAVSIPVMAKVRIGHFVEAQILEALGIDFIDESEVLTPADEMYHINKWDFKVPFVCGARNLGEALRRIGEGASMIRTKGEAGTGNVVEAVRHMRTINAEIKRLTTLREDELMAAAKELQAPYDLVKYVAQHGRLPVVNFAAGGIATPADAALMMQLGADGIFVGSGIFKSQNPEKMAAAIVKATTYFDRPEIIAEVSEGLGEAMASIDIRQLEEKDLYATRGW >NZ_CP009170.1|WP_049684758.1|699363_700992_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKISFLGAAKEVTGSCYLVETEKTKFLVDCGMFQGGEVEDELNYQEFIFDVNDIDFVLLTHAHIDHSGRIPLLYKRGYRKRIYATKATVDLCRYMLPDSGHIQEMESEWKNRKRKRAGKPLREPLYTADEAKDSLSIFYGVDYEEIIEPAQDVRVRFNDAGHMLGSSIIEVWVNEKGKETKIVFSGDLGNKKIPLLKEVTPIKSADYVLCESTYGNRLHEDIGDRAKKLMEIIIKTVKRGGNVIIPSFAVGRTQELLYELHKNRELYKDEIEFLNNVPVYVDSPLATSITNVFTKHPEYWDSEAQEYIKRGDLPLDFPNLHFTHSVEESKALNEIKTPVIIISASGMCEAGRIKHHLKHNLWRPECTILFVGYQAKGTLGRKLLEGEKNVKIFGEDISVKAEIEYIESFSGHADQKGILDWLSQFTDKPRKIFIVHGEDEAQEELADKIENQLGIETLIPSRYDTYNFEEDKLFTAEAEDKVKLSVELTNKIEEMKLRSDKALNKLQELINSKDITKDLSPIVSELNNINESLMKLYRELLD >NZ_CP009170.1|WP_049684757.1|698903_699344_+|DUF86-domain-containing-protein MTKSIIETINSKIGKLQKNLILLKKVSQEVTKENIKEDMLKYWGIERGIQISIECVIDIANIIISSLGLEKPDTYRETVLLLGKSNILPENFAQNISNMVSFRNILVHDYMKIDEKVIVDILKNHLDDFVKYIHYINKWIEENYYS >NZ_CP009170.1|WP_003871029.1|698470_698911_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MVQRDLKEVEEIFKRNLQYLKGKYDIKLIYVFGSYSKGTNTKNSDLDIAVLLGNGYDPMDKLALIGDLVSIFKRDDIDLVVLNSANPVLRHQVIKHGKLIFEENEDVKVEFEVKTLREYMDMEYFRKVQMDVIKEWVKSVVGDNSD >NZ_CP009170.1|WP_049684765.1|709756_710467_+|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MVAARNLIVADPKSPFAEAFRALRTNLQFTSVDKKVKSILITSSLPNEGKSTVVKNLAYSVALTGSKVIVIDADLRNPTVHKLLYLPNSRGLTNLLIDEGDYEAYLNIDNSYSNLHILTSGPIPPNPAELLGSNKMKKLLSNIQKDYDYVFIDSPPVVTVTDAVVLAPVVDGIILVIQAGKTEIEAVSRAKEILESVKANILGVVLNRVKESHKGYYYYYYYYDDNNPQHKKRRKR >NZ_CP009170.1|WP_019907510.1|710466_711246_+|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MVDIHCHILPNLDDGAESLDISKEMALIAVQDGIKSIVATPHYIEYEHEISKESILNTCQQVNEFLIQNCIDLKIIPGCEAFVSPTLVESYKKGEVMSINDMGKYILIELPVASYPEYIEDVIFDFKVIGVTPIIAHIERYSYVKGDFDIIYRLINEGALMQINSTSITGLFGDEIRYKSLELIKHNMVHFIASDAHTTRGRAPKISKALETLKKEGIEDAYIDYLISNSQKVINGEDIEVIEPIKKKLSWFHKIKRRF >NZ_CP009170.1|WP_049684766.1|711256_712168_-|LCP-family-protein MKKRKWSIFFLIVAIIASCAFFVYYKYIHITKHPESVFNNDNKNNISNSEQALSKSKIYIAFLGLDKDDERVHTIGNFRTDTIMIFSIDFNGKVVKVLSIPRDTYVDIPGFHKDKINAAYVYGGMGEKGYALSLKTISDFLGINVPYYISIDMQTIPDIVDAIGGVPLDVEVNMHSHGANLDKGYQILDGQKAYQYVRWRYDPMGDINRVKRQQKFIIAFASQLKSKAKDVSTYINLYNTFKGKLCTNLNYEQILALIYFVKDVSPDSIEKFTVPGDFYDLNGISYWKPDIEKLNEVLQEFTK >NZ_CP009170.1|WP_049684767.1|712344_713394_+|membrane-protein MSRKEISAFKVAASYIGTVVGAGFASGQEILQFFAYHGVKGTIGLVIAVFMFVFYGYIILRLGNRLNASSYKKVIMKAGGPLFGRVIDLVVTFFLFGALSAMIAGCGAIFEEQFGLPSAFGGVVMAVLSVVTVLTGIGGVISAISFVVPLLLLAIIIVGIFSLFYGPDITVITIADFPFKAAVKNFALSGVLYASYNLLMAVAILAPLGQKTNDRSKLRWGAILGGMGLGLGAFLIFFTILINMPTASLYEIPMLYVAGNISPVLKFVYSFILIAEIYTTAVGNLYGFAARFTEVGSVKYKIFTVASGGMALIASGFGFAKLVHHLYPIAGYGGIIMLIGLTYRIINHK >NZ_CP009170.1|WP_049684768.1|713449_714160_+|DUF2225-domain-containing-protein MSMLKYLIGLMLDGGVILGNKYLYDKKTVCPVCKKEFTYTKVRSSQLKVEERERDFYTKYKDGINPFFYEVIVCPNCGYAALESEFDRITNDKKEKILSLVTAKWVKREFSGERTPQKALEAYLLALYCSQIKEDKPIVFSKTCLRIAWIYRILNDKANEEKYLKYALDSYIKAYSGSDIYEEEVLLIYMIAELNRMLGNREEALKWYNKVINHPDRSRHNLIVNLARDGWQSLKE >NZ_CP009170.1|WP_049686198.1|714227_716903_+|calcium-translocating-P-type-ATPase,-SERCA-type MSYGKKQMQQTIYYFDKTDFTGLNSQEAQKRLLKYGPNILEEGHKVSPLQIFLNQFQDFMVMVLLAATLISALMGELADALTITIIVILNAVLGFIQEYRTEQSLEALKKLAVHIAKVLRDGEQKEIKASQIVIDDIIILEAGDKVPADAVLIESHNLEVDESILTGESVPVHKEAVNNVKRAAVTNSNVVYMGTIVTKGRGKAIVTATGMQTEMGKIAGMIKDIEEDETPLQKRLNKLGKVLVAGALAICGIVVVLGIIRGESLYYMFLSGVSLAVAAIPEGLPAVVTVSLAIGVQRMLKRNALIRKLPAVETLGCTNVICTDKTGTLTENKMTVTKVFCDEEVFEVKGDKSKEFTKIKNKERSAFRKMLEIGALCNNSKIKREKIKIGKEALEEEKYLGDPTEAAILSFSMKSGLSLELVENVKRIEEIPFDSYRKRMSVIVEISGEKYAYVKGAPDVMLDLCTYKYTEGKEVPLTVFDKKRILDINESFGREALRVLAFAYKKLPPKFPMVAEFIEKDLVFVGLEGMIDPPRREVYEAILKCKMAGIKPVMITGDHKITATAIAKELKILGENDKVITGQDLDKMGDKDLEKACTNISVYARVTPRHKLRIVRALRNKGFTVAMTGDGVNDAPALKEADIGIAMGKGGTEVAKEASSMILLDDNFATIVAAVEEGRIIYDNIRKFIRFLLSCNFGEVLTMFFAALMALKLPLAPIQILMVNLVTDGLPALALGMDPPEKDIMMMKPREAKESVFSRGLGIRIIIVGFLMAMSTLGSYVFALSYGTLERARTIAFATLVMVELIHAFECRSERNLIFEIGIFTNPYLVLAVLTSFLLFLATIYVPPLSVVFRTTVLTGYDWLVVVFFSSIEFVFNNLYTAYIVPLTKAK >NZ_CP009170.1|WP_049684769.1|716905_717241_-|hypothetical-protein MPKITVESKNNQYGIIYGRIDDYNWYALVQKEKVSYGINPVTLEKGDGKVSRLFVYKKFSSKIPNNFIKSVVADYRHKWNWLEKDKKELITRLVNYLELRYSLKVLKSKAK >NZ_CP009170.1|WP_003867735.1|717298_717706_-|nucleoside-diphosphate-kinase METTLAIVKPDGVKRGLIGEILKRYENKGLRLKAAKVITPTIELLEKHYEEHKGKPYYKPLIQYMSSGPVFAMVLEGENAVKIVRLLNGATKVEEALPGTIRGDFAISTTFNIIHGSDSIESAKREIALWFPELA >NZ_CP009170.1|WP_049684771.1|718345_719155_+|lipid-II-flippase-Amj-family-protein MIDAKRLMIVAFFTMVINLIDTLSYSIRPSGVRTRKLAVALSLFNIMAVISRLSNMIQAPFLGSIVDMAIKMDKVYLLQNDMRIVLFSATLGALIGAPLMPTFVSIFTVAINGMEGAGTVPKLILQVFRWKNFKKLKKKIVVPKLSMLKGVLEADIPKSFLIYNVIITSIYTTGIVSSLYAGAIIPEYRITASQLSGIVNGFATILFTVVVDPVAALITDQALNGKRPQSDVDKMAVLLVFGKIFGTLLAQLVFVPAAELILFVTKLIV >NZ_CP009170.1|WP_049684772.1|719264_719753_+|ribonuclease-H-like-YkuK-family-protein MYFINPTKGRMDIDKMFEDIMEFVEGDRQSSYKLMVGTDSQPGKSVCFVTAVIIYREGKGARYYYRKFYNKKIPSLKQRIFMEATYSIEVANQLFERLNQTDKKDINIEIHLDVGENGKTRDIIKEVVNMVLGCGFEAQVKPSSYGASKVADKHTKSMANIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009170_3 | 828243-828340 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009170_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009170_3
>3.1|828275|34|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GTGTGAGCACCTTCCCAACGGCAACCTTAAGCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009170_3
The CRISPR arrays of NZ_CP009170_3 >merge|NZ_CP009170|3|828243-828340|CRISPRCasFinder CGCCGTCGTTTTTATAAGGGGAATAGAAACCCGTGTGAGCACCTTCCCAACGGCAACCTTAAGCGGCGCCGTCGTTTTTATAAGGGGAATAGAAACCC >NZ_CP009170|3|3|828243-828340|CRISPRCasFinder CGCCGTCGTTTTTATAAGGGGAATAGAAACCC GTGTGAGCACCTTCCCAACGGCAACCTTAAGCGG CGCCGTCGTTTTTATAAGGGGAATAGAAACCC
>NZ_CP009170.1|WP_049684858.1|827041_827440_-|polymer-forming-cytoskeletal-protein MFQRKEQVLEVNPDKIDTVIGKNSTFEGTIKSQGTLRIDGNFTGQIETKGNIIIGESAKVEANITTDNIILSGEVKGNIFAKGQLQLTSTGKLSGDIEVQNLIIEDGAIFDGKCKMLKSPQSNPVKNDEQKK >NZ_CP009170.1|WP_049684857.1|825575_827012_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNKITIDKNKNIPLYMQVYSQIKRFIENGSLPGGYKLPTIRSLAKELGVNNITIINAYKLLEQNGYVYTKVGSGTYVCEDIKKDDEMEENIKSLDQGQFALRKGMINFASSSPNPELFPVEDFRELINRVLKRDGGYAFEYQDTKGYKPLRESVKEFVKKDQIFTSIDNIQIISGGQQGIDVVSKALINFEDAIIAERPTYSWALASFESRGAEILEVELQKDGIDLEELEDKLKKFKPRFIYVIPNFHNPTGITYSEEKKKKLISLAEKYETYVVEDDFASELSFTKEKTLPLKAYDKHDRVIYIKSFSKVYMPGLRLGFIIAPERFVSSFLKAKYVSDLSTSGLMQRAFDLYLRENIWVKHVESIKQVMYERFSEMGRRLENLKNYTEFEHPKGGFYFWLKLKNNLSAKSLYSKCLDRNLMIVPGDIFFMGKKENSFVRLSFASCEVKEIAKGIEILGEILKGYFDENNNVYVPII >NZ_CP009170.1|WP_049684856.1|824266_825442_-|beta-aspartyl-peptidase MFLLLKGGEVYSPEPLGRKDILICNGKILKIADEIKATNEFGNVETVDLKGFIVVPGFIDQHVHIAGGGGEGGPITRTPEIKLSDIIKGGITTVVGLLGADGITRSMASLLAKARALEQEGITTYIYTGAYELPTRTLTGSVRSDLVLIDKVIGTGEIAISDHRSAQPTIEDLTKLAAEARVGGLLGNKPGVVHLHVGDGIRGLTPIFEIVKNTEIPITQFVPTHINRIGHLFEQGLKFIEMGGVIDLTSDIKPDAHTKTALTPKEAIKKIVENKLPIEKVTMSSDSNGSIPVFDENKRLVKVMVGSAQTLYRDLREVIVEGILPIEQAIKIITENVAKVLNLYPNKGCIKEKSDGDIVILDNNLNIHSVIAKGRFMINEKKSVKKGMFEE >NZ_CP009170.1|WP_049684855.1|823497_824079_+|ANTAR-domain-containing-protein MSQWRIVLADSSDLSRQFIKNVLLANGHLVYEARDGGSAIRLCRALAPDLVIADLNLTNMNGFEIGRIINEADIAPVILMTPTLSRDFIEEVRKYSVFSYLLKPIDRTVLLATVEFVIENYKKFRSMKEEIQKLKHELEARKKIEKAKGYIMKAKGLSEDEAYKTMRKMSMDLSIPMEIIADMILKEYQEYKT >NZ_CP009170.1|WP_049684854.1|822142_823477_+|type-I-glutamate--ammonia-ligase MGKKYSKEDVLKLANEYGVEYVHLQFSDIFGVMKNVSIPVEELNKALNNEIMFDGSSIDGFVRIEESDMYLRPDPDTFVIFPWRTNSGVEARLICDIYNYDGTPFEGDPRYVLKRNLEEAKKLGYQFNVGPECEFYLFLTDEKGNLTTITQDNASYFDMAPVDLGESARKEMVSTLKQLGFQIEASHHEVGPGQHEIDFKYDDALTTADNVMTFKMVVRIIAQKHGLHATFMPKPVFGIAGSGMHMNMSLTKDGKNAFYDLSDPIGLSKVCYNYIGGIIKHAKAMTAITNPIVNSYKRLVSGYEAPVNIAWSARNRSPLIRIPAKRGESTRIELRSPDPTSNPYLALAVALAAGLDGIKNNITPPPPVNANIYHMNKEELENLGIERLPGSLEEALNELEKDEVIKEALGDHVYTKFLEAKRAEWDEYKIYVTQWELDQYLSKF >NZ_CP009170.1|WP_003870304.1|821702_821984_+|hypothetical-protein MWNYKLKKISVLSVFKFTLIYGIVIGLILGLIGGLFGGLFANSFGAFGAGIIGGLIGGIVYGIIFSIVSAFGAWLFNVVSGWIDGIDILVEKK >NZ_CP009170.1|WP_049684852.1|820405_821230_-|hypothetical-protein MKKYSKIVCALLIFLLLFSLSGCKNKQQNKPQKKPQTSQKTELPKELSKIEEDIEKIIKEVQKIKEKTQTAQNAQKDKKDEKKEKDKNKSKQITQKTPEEKSWEQVDKLTKDIHINWNSLNPIAVKAGAKLNLINSMSAAINDFTITTNKKSKIDVLISANNVYKYIPDLEDLFQTETPTDIKRLKFYAQDISFKSEVQKWDEVSKDIIDMNSVWKTLKPKLPKEAKNSADKFEAGLSELEKAVKSQNKVLIKIKADVLLQDIKSLEKTSKPKK >NZ_CP009170.1|WP_049684851.1|819269_820259_-|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MGVNVAIVGATGMVGRTFLKVMEDRNFPVDQLYLFASSKSAGQKITFRGNEYIVEELTEESFKRDIQIALFSAGATISKHFAPIAASHGIVVIDNSSAWRMDENVPLVVPEVNPEDISWHKGIIANPNCSTIQMVVPLKPLHDKYKIKRIVVSTYQAVSGAGKKGVDDLERSLRGEPCQVFPHPIANNCIPHIDSFTPNGYTKEELKMINETKKIMGDSSIKVSPTTVRVPVANSHSESVNVEFARPYEMKELIEILKNAPGVVVEDDPQNNIYPLATYASGRDKVFVGRIRRDETVYSGLNMWIVADNIRKGAATNAVQIAELLIKNM >NZ_CP009170.1|WP_049684850.1|818362_819256_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MPVFKGSGVAIVTPFNEKGVNFEKLGELIEWHIKEGTDAIIICGTTGEASTMTQEEQQAAIKFTVEKVAGRIPVIAGTGSNNTAHAVEMSEYAQSVGADALLVITPYYNKTTQKGLVAHFTEIARHVDIPIIVYNVPSRTSLNMQPETFLEISKHVDNVVGVKEASGDIVQVAEIARIMGKSFEIYSGNDDQVIPIMSLGGLGVISVTANIIPAKIHEMTIAYLNGDIEKARDMQLELNPLNRALFIETNPIPVKTAMNLMGFNVGPLRLPLVEMSDKNLEYLKSVLAKYGLLKEAH >NZ_CP009170.1|WP_049684849.1|817607_818363_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-reductase MIKIIIHGCNGKMGKVIAKLAAESPDFKVVAGVDKNTSPLDFPVYSDLKEVKEEADVVIDFSYHEAVPDMVKAAAQKKLPVVIATTGLSEEELKVIEEASKEIPIFKSANMSLGVNILINLVKEAAKILQQDFDIEIIEKHHNMKKDAPSGTALMIADAINQVLNDKKEYVYGRHTKTEQRKPNELGIHAVRGGTIVGEHQVIFAGHDEVITISHSAQSREIFGYGALKAAKFIINQNPGLYNMEDLVKKG >NZ_CP009170.1|WP_049684860.1|828583_828925_+|hypothetical-protein MKKGIILGIVMGIIAIVSNIIVNGFYTSFVYYSNYLFLAGTAVGLLGGILYISYWINDLKTVKKIYYHEELPEKRKEIEFMERWGSYLVIAMIVMWLLSLVFVLVGEMFTSIK >NZ_CP009170.1|WP_049684861.1|828972_829224_+|YkuS-family-protein MGKKVAVESQLSNIKNYLKERGYEVVELEEYLLSKNNFNAYDAVVITGQSRNMLGMDDISTKAAVIDATGMTPFDVEERIKRL >NZ_CP009170.1|WP_049684862.1|829235_829439_+|hypothetical-protein MVSVEQLRTVGKNCKDFELDQSLYANNFSMSIANGDRSCEICRHWDVNRKICRIGVFDDVLSSLDQS >NZ_CP009170.1|WP_049684863.1|829655_830132_+|HDIG-domain-containing-protein MNRVLQYFKSLTAGIYDRDYEFLKKFLTKRELEYFNRLPVYEKRHSLDVCYTLMDKYKVKDEELLKAALFHDIGKIKVKITPDKKAIAVLIKKIPPLARYLEKRLYFLQVYYNHAEYSGEICKEIGLSDKVIYIVKHHHDKNVKDEDVIKLQRADKEN >NZ_CP009170.1|WP_049684864.1|830368_831520_-|amidase-domain-containing-protein MDTKKYYKPILLLLALIFLTYFSISFFNKTIETVADNKEEIKTVLDEFFKRRGSVLLSGDIREIEGFYDKSSTYGKWALDHERRRIEYVKGWSEKRDLKFTEAESFYRIKSVKAGENSIWVYLVETMKMGYAYNIKSDVINYMGLGIRHSIQLVKVDGKWLIRRDWYYDPLDEDSAFIDVSPAEGIIPEITPASSKPVTEEESKPKKKGKYDREGAVAYADKYAGAAWGSGNNYEYNKKYRDYNGLGGDCTNFASQVLHEGGGLPMDYVWNFNGKDSSTAWAQAPALFNYLIYTGKGKLIAKGYYLDMVQPTEQHPKGAIREIEKGDLICYEEKGEIVHFGVVTGFDSIGIPVVNTHTSDRYHVPFDLGWDKRVIYRFIHIND >NZ_CP009170.1|WP_049684865.1|831695_832418_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKGVSKSYNKGKIKAVDNIDLVVNPGEIFGFLGPNGAGKTTTIKMIVGLLSHDTGEIKVDGIDIDKNPIEVKKRIGYVPDSPDIYDKLTGIEYLNFIADVYGVSEKDRKERIEYFLEAFDLKNAIGDLIQSYSHGMKQKLLITAALIHNPSVWILDEPMVGLDPKSAFLLKELMAEHTKAGFTVFFSTHVLEVAERLCDKIAIINKGKIIACGTMEEIKSQHERESLEKIFLELTEK >NZ_CP009170.1|WP_049684866.1|832414_834079_+|hypothetical-protein MREFLSLLRTQMKVYYSISAMRYKYFVKKKDLWEIVLALFGMAVGGGTLLFMYIMYLNSMYAASMLINQPQLMPVTVLLLAQLLTLVFGFFWTISVFYFSDDINILLPLPIQPYKIVLSKYSIILLNEYVTLAFLMLPAIFIYGIGTQAGILYYLVSFIVFIFTPIIPLSIAAIASVLIMRFVNLKRKKDLYTVIVSILALIFFFTIQFFINRIPQNGEQQAIENFILQNANLAKMISRSFPPALWGAVSMTNYNTLSGFLNLLMFIAVSIIFTAVLAVSAQKMYLKAVISGQEVEAKRKEVSLKKEIVRSSLLKALLVREWKLFIRVPVYAMNVLPVAIIIPFVFLVSFVGNPQIGLEMAIKYTSAPDGWFWVSMIGLFFSLFVAGSNSLSSTSFSREGKMFYISKLMPVEPALQLKAKWIFGIIITIVIILPTYVLGWYLFKIHLLSMVILIVLMLIGISAVNILSLLIDAMKPSFEWENPQKAMKGNLNVLLSLILTTILIGCIVGIVLLLKKLYVSEIIITLIIGILLILLNLGVYLLAKSAVKKLYKGE >NZ_CP009170.1|WP_049684867.1|834094_835009_+|signal-peptide-peptidase-SppA MSKKALIGLIFIVLIISTVIASIFLTMPQENKSVPSVSNTIGVITIEGVIGETNILGIPQVTGDPVEQIRKAQEDSTVKAVVVKINSPGGSAAKSVEIYTELKRLKETGKKVIISMGDAAASGGYMAACGGDIIVANPATITGSIGVIMQYTNYEGLYNKLGLKEITIKSGPYKDMGSPTRDLTPEEKKILQGVIDDTYEQFVEIVSEGRKMPIDKVKELADGRIFTGRQALKVGLVDKLGDFYDAVDIAAKEAGIQGKPVLKYYTTPNPLSILFGSGAKSNLEGTGLEILRLLFIDKWSLNYK >NZ_CP009170.1|WP_049684869.1|835793_836081_+|hypothetical-protein MIHQTQFYFNTRRILSEKANGRLEDYTKQWHLRQEEIKRIILSAKQEEKRKYKEEDIEEWLRVSLPILEGPFAGKSWIKYVLKELTRANGLAVGI >NZ_CP009170.1|WP_049684870.1|836380_837403_+|DUF1646-domain-containing-protein MVTALVVILVLILLLPFVVKQVEHNLEYFLFTMGIISVIVSKQFSAELFFHIFKNPLIYYITLAVLIAGLIFTLLKEKLKIGVEKVADKISLRLFAFIIIVILGLMSSIITAIIASLVLVEVVNYLPLTRKNKINLIVIACFSIGLGAALTPVGEPLATIVVSKLHADFFYLARLIGIDIIIAILALGLIGTFFAKRESGIGEPTEDVEADENIKEVFIRAFKVFVFIFALELLGTGFKPIIDLYIVKMKSEILYWVNTISAIVDNATLAAAEISPSMTPEQIRAILMGMLISGGMLIPGNIPNIISAGKLKIKSTEWARIAVPLGAILLIVYYIVLFVI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009170_4 | 1407904-1412526 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009170_4
|
69 spacers
spacers of NZ_CP009170_4
>4.1|1407934|38|NZ_CP009170|CRT CTAAATGTTGCAAAAGACGCATACCACTGTGTAAGATG >4.2|1408002|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACCTCCTCTATTTCAATTTCTAACCTCGGAATATT >4.3|1408068|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAATGAATTTAAAGCTAAGCCATCTCAGTTTTTTTG >4.4|1408134|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATAGACGTGCTTTTAGCAAGGTCAGGTGTTAAAAG >4.5|1408200|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAATTTGGCAGAAAAGGAGGATACAGATGGACATGAG >4.6|1408267|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTGCTGCGATTTTAGCAGCAATAGACATTCTTTGTT >4.7|1408334|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTTGACACTCCAGAACCAGTGCCTGCAGGAGTGTA >4.8|1408400|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTGCTTTGACGGTATGTAAACGGCAATCCTCCTGGT >4.9|1408467|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGCTCCCGACTTCAGCCATTGCCTTCACCATCCCAA >4.10|1408534|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTGCAGAGCTAATCATCAGCCCAGAGCCGTTGTGCG >4.11|1408601|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTATCTTTCAAAAGCAGTGCATCGTTCAAATTGT >4.12|1408667|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTTTAACACCGCTGTTTAAAGTCAACAAAAGCGATA >4.13|1408734|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACCAGAGCCAACCAGTTTACGGCTTGTATCTACCG >4.14|1408800|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCTTTCATTTCATGTGTTGCACCTATGATGGCATA >4.15|1408866|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCACATGTGGGGCGCGTAAGAAATACCCCACCCGGCA >4.16|1408933|38|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTCTGCATATCCGCCCCATTCTAAATAGCTGCCACTAC >4.17|1409001|35|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CACTTCAAACGACAAGTCACGCATTTTCATCACCC >4.18|1409066|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCCGTCCAGGAGGGAGTTTATTACATCGTCTCCCTCC >4.19|1409133|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGTATATGACTTCCATGTATGCCCTTTGGGTAGTA >4.20|1409199|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CACAATGATTAAAGAACCACTCTGATGGGCGCCCTG >4.21|1409265|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACCAAGAAGCGCGCAGGCGCTTCTTGGTAGATTTCC >4.22|1409331|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTGCTTCGTTTGTCAAGGGACACCTTTCCGGTAGC >4.23|1409397|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTCCTCCCACTCCGGAGGAACATCCGGAGGTAGGC >4.24|1409463|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGCAGGTCCGCCAGTATGGGGAAAATTGTCAAAGTC >4.25|1409530|35|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGCTTTTTCAGCCTTTCTTAATGCTATGTCGCTA >4.26|1409595|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTCTTGCAATGCGTTGCACAAGCTGTCATGACA >4.27|1409661|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGGAGGTAGAGCAGTCATGAAGTACCGCGTTTTTA >4.28|1409727|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGATAAAACCGCAGGACCTTTTTGCCGTGCTGCAGAG >4.29|1409794|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGCGTGGTGCGGGGTGCCCGGAGGGTGCGAACGTGG >4.30|1409861|35|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTTCAAGGTTATATAAGTCAAACAGATTATTTG >4.31|1409926|38|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTTCATGGCGCAGGATAGCAAAATGCATTCTCAGAAA >4.32|1409994|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGTTTTGCTCCTGAGATTTTCGCTCCATCGTTCTT >4.33|1410060|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAGCTAAGCTGGGAAACATCGGCTGGGGCATTGCTG >4.34|1410127|38|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACACCGCACGTGGGAGCCCGGCACTGGGTACAGGGGTT >4.35|1410195|39|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAACGTAATCGCTGTGGTAGGTGAGGCGGCTTGGATGGC >4.36|1410264|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTCCTTTACTCAGCTTTTACTTTATCTCTTCCCATT >4.37|1410330|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGAAAGCCCGCCAAGCTTTGTTGAAAATTCTTGTAC >4.38|1410396|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGGAAGAGGAAGCAGAAGCGGAAGTATTTGCAGAC >4.39|1410462|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGTATGCTCTGCTCATAAAAGGATTAGCCCGCATTT >4.40|1410529|36|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGACCATGCTAAGGGTACGGTGACGGTAAAGATGGA >4.41|1410595|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACATGGTGCTACAGGAAGAAAACGGAGACTGGGTGC 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cmr1gr7,cmr6gr7,cas10,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr3gr5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009170_4
The CRISPR arrays of NZ_CP009170_4 >merge|NZ_CP009170|4|1407904-1412526|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder 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>NZ_CP009170.1|WP_049685368.1|1407462_1407819_-|NifB/NifX-family-molybdenum-iron-cluster-binding-protein MRIVVAAESKNVSMHFGHCERFALFDIENGEIKNELFIPNPGHRLGFLPGFLKEQGAECVIAGGMGASAVGLFNQNGINVITGASGFIKNLVKRYIEGTLISTGSVCEKHEHKGHYES >NZ_CP009170.1|WP_084574335.1|1407245_1407449_-|4Fe-4S-binding-protein MEKVWYPIIDYSKCTSCGACKNICNRGVFKQTSGKPVVENPQNCIYGCRDCQKSCKVGAIIYISEDW >NZ_CP009170.1|WP_049685367.1|1406569_1407160_-|IS607-family-transposase MLLTIKKVKELYDISRITLINWEKEGLITPVRTPKGRRRYKKEDIEKLLGMLGEKPKPKVVLYARVSTKKQEEYLKNQIRRLEEYANSQGWQYEVIFEIASGVNENRRGLLKLLNKIKRGEVEKVVIEYPDRLARFGFEYLKFFMESFGVELIVLNGKENEEDTNKELAEDLIAIVTSFAARIYGQRGKKHDSDTG >NZ_CP009170.1|WP_049685366.1|1402154_1403246_-|hypothetical-protein 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NZ_CP009170_5 | 2268103-2273799 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009170_5
|
85 spacers
spacers of NZ_CP009170_5
>5.1|2268133|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTGTAATTGTTTTTGTGTATCTTATGCGCTTTCCTG >5.2|2268199|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GGTTGTAGGAGACAGCAAGCGTGGCGAATACCCTGT >5.3|2268265|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GTATCCGGTGTGTCAGTAGGAAGCACCGCTGTCACCT >5.4|2268332|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AACAGCTGATTGACAAGCAGCTGATTGACAAACAGC >5.5|2268398|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GCTCCAGAAAAATCAAGGCTTCCGGGCATTTGAATATA >5.6|2268466|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AACTACACGAGAGACTGAAAAAATACAGCAACGAA >5.7|2268531|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTATCCTCCGCCAAGAAGGTGCTTTCTTAGCTGCTT >5.8|2268597|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TAGTGCCCTATAACGGTGCAAATATCCTGCGTAGT >5.9|2268662|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTATTTCTGTTTTAAAGGGTAGCAAAAGGGTTGCATT >5.10|2268729|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GGTTCTCCGCCTGCCGGAGGTTGCCACTCCGGCAGG >5.11|2268795|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TCTAGTAAAACTAGAAGATGGAGAGAGGAGGTTGTCCT >5.12|2268863|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTGCTCTTTTGTAAGTTCTTCTACATTACTTGTACTG >5.13|2268930|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GAGGGAACCGCCAAGGTTCTCTCGGAAATATTAGGAAT >5.14|2268998|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TAGCAACGCCTATGATTGAAAGCCCGACTATAACCG >5.15|2269064|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TGGAAAATCGTGATTTAGAAAAAATCATTGAAACATT >5.16|2269131|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder ATGCAAAAATTCAAATCGACTACACAGACCCTTTCAT >5.17|2269198|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TGCCGGTTTTCCAAGTATTTCTGATATTTTATTAAT >5.18|2269264|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CCCATGTCGCCATTTTTATTCATCCTCCTTTTTTGT >5.19|2269330|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AACGCTGTCCGAGATTGACGCTGCCTTGGCACAGGT >5.20|2269396|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder ACAGGATAGCCTGCAAAGGTATTCGGTCTGCCAGCT >5.21|2269462|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GAAGAAGGCCAAACAAAAAATGCAATCGTATGGTTT >5.22|2269528|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTCCATACCCTTCTTCATGTCAGCGAGTATCTCGC >5.23|2269593|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GAGGTGAAGTAGTAAAGGTTTGGCTTACAGCGCATGA >5.24|2269660|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTTCCACCTTCCCATCATCCCCTTTCAGAAGGTCGC >5.25|2269726|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GGGCTTGAGTACGATATACCGGAACCGGATGATTT >5.26|2269791|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AGCGGGGTATGGGGGAGGGGAATACTAGCATATTCC >5.27|2269857|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GAAAAACGAATGCTTCAGGACTTTCATGAACGGGGA >5.28|2269923|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TCGATGACTTGGGTAAAGAAAACGTGTCTGAATACA >5.29|2269989|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CAGTATGCACACGTTGTAATGGAAGCGGTTGGATAA >5.30|2270055|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTGACGAGATAAAAAATCCGCGGGGCGATTAGGCCTT >5.31|2270122|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GCGGTGCGGATAAAGGGTTTCCCACGCTGGAAACCTC >5.32|2270189|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AGCTATACTAAGGGCACGATGTTTTCCGCTAAAAAT >5.33|2270255|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TGGTACCGGGTTCCCGTACTCTCAGTAGCAAACGAG >5.34|2270321|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GCCTACCGGCGGGAAAATATTTTTCGGCAGTGCAGA >5.35|2270387|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GAGTATTTCTAAACCCGCCGGTGGCCGGGGCGGGATA >5.36|2270454|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder ATCACTAGCTAATTTTTTTATTTGTCTTCTAATGCG >5.37|2270520|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTTTGTTATCAGGTCTAATCTGCCTTCAGTCCACGCAT >5.38|2270588|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AATATTTAAAAGAGGGTAAAAATGTTATATATGATG >5.39|2270654|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TAAGGGCAGTATAGAATATTTTAAAGTTGCATACAC >5.40|2270720|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TCAGGATGGCAGTCGCTGGGGGAAATGCTTACCTCAGC >5.41|2270788|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AACAAGCATGATAGCAGCACTAATGCCCCTTGGGATTT >5.42|2270856|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GATATTAAGAAAACGGCTGAAGATTACTACATCGG >5.43|2270921|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAGACGAAAAGGGGCTAAAAATTAGGGCTAAATTGGCG >5.44|2270989|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAGACGAAAAGGGGCTAAAAATTAGGGCTAAATTGGCG >5.45|2271057|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder ATCATATGCAGAGTTTTGCAGATTATTATTTTGTACC >5.46|2271124|41|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTGCTGGTGGCTGTTCCTGGCAGTAGCTCTAGCAGTAGTAA >5.47|2271195|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TAAGATACTCTATTTCTTCTTCCGTTAGCTCAGGA >5.48|2271260|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TCTTTTGTATCCATTCTTATCCTCTCCATTCTTCG >5.49|2271325|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GGATAAAAATATCCTTATAAGGACTGCATCAAGTGA >5.50|2271391|40|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AGGATGGCCTCTATATAGGCCAGATTTCTTTTGTTATTTC >5.51|2271461|40|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAGAGTGAGTAATTATGAAGAGTCCATATTCAAGAATGCT >5.52|2271531|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTGGGCGTGCAATGGGTTTTGAGTCGTATACGCATT >5.53|2271597|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TACGATGAAGAGAAGAAAAACGAAAGATTGTATGTAC >5.54|2271664|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TAGCAGTTCCGCCAGTATGGGAAAATTGCCAAGGTTC >5.55|2271731|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AATATGGAAAGAGTCAGGTGTAGACGTTGCAGAAGA >5.56|2271797|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TAAGTCAACCAACTGCTTAATCACTCCGGAATAGTTCT >5.57|2271865|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAGAAAAGGCAATAAATATGTGTATTTCTCTACTCC >5.58|2271931|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AGCATTATCCTCATCTTCACCTCCTTCATCTACTTC >5.59|2271997|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AGCATTATCCTCATCTTCACCTCCTTCATCTACTTC >5.60|2272063|39|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAGAACTAATCAGGCTAGAAGAAGCAGTAAAAACATCAT >5.61|2272132|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GTAGAGCACTGCTAAGTAAAGGTTTTGTTTTGTATGG >5.62|2272199|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTCCAGCATACTTACAAACATCTCAGCAAACTTCTT >5.63|2272265|39|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder ACGGGATACCAAACTCTCCAAATTGGTATCCCGCTTTTG >5.64|2272334|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder ACGTACTTTTACCTCACTAGCATTTAGAGTTACTGC >5.65|2272400|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TATAAATGCGTCACTCTCTTTAAATTGTGCTTCTAAA >5.66|2272467|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTACCCGGGAGTACAACGGCTAGGAGGTGGTCTGT >5.67|2272532|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTGGGTATAAAAATATGAGTGCCCTCACAAATTTAT >5.68|2272598|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AGGACGGAGAAAAGTATTTTTTGCTTCGCGTAAAAGG >5.69|2272665|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAATGAATTTGTGGCAACTCATCTACTGTGTTATTTT >5.70|2272732|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AATAGGCGCTTGTCCTGATAGCCGTTCAGCTTTCTTAT >5.71|2272800|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder ATCTGTGCGCAAAAAAATAAAGCTGTTCACAGGTTT >5.72|2272866|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAAAGATACCTTTATGTGCAGGGAGGTTGCAGAGGT >5.73|2272932|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AATAATCCCCCAAATGGATACACTCGTTATCAACAAT >5.74|2272999|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTTTTTCTCTTGTTCTCAGCAGCTGCAGATAGTCTA >5.75|2273065|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AGTGTTATTATAGAGAATACAAATGCTTTTGCATCA >5.76|2273131|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TATAGAAGAATGGATTGAACAGCATTATAAAGATTT >5.77|2273197|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTGCAAGCTTCCATTTTGTTTTGACTGCCACTCTT >5.78|2273262|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTATGTCCAATATGAGAACAGGTGTATCTGCTTATGTT >5.79|2273330|38|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder TTTTTCATGCGAAAAGAAGTACTTGTTCGGATTGTGCG >5.80|2273398|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAGGCATAAATTTGGCTCAGAATCGTTTCTAAAATG >5.81|2273464|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AAGGCACAAATTTGGCTCAGAATCGTTTCTAAAATG >5.82|2273530|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AATTACAAGAAGATATGCGCATCTGGGAAGTATCCGG >5.83|2273597|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder ATGGCTACTTCCATTCCGCATCCTATATCTACTCCAA >5.84|2273664|39|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder GCACAATAGGACAGGCGCAAGAGGAAGGAAAAGAAAAGG >5.85|2273733|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder AGGACATTTGGAACATGAGGGGAATATTTTTTCTAAC >5.86|2268133|37|NZ_CP009170|CRT CTGTAATTGTTTTTGTGTATCTTATGCGCTTTCCTGG >5.87|2268199|37|NZ_CP009170|CRT GGTTGTAGGAGACAGCAAGCGTGGCGAATACCCTGTG >5.88|2268265|38|NZ_CP009170|CRT GTATCCGGTGTGTCAGTAGGAAGCACCGCTGTCACCTG >5.89|2268332|37|NZ_CP009170|CRT AACAGCTGATTGACAAGCAGCTGATTGACAAACAGCG >5.90|2268398|39|NZ_CP009170|CRT GCTCCAGAAAAATCAAGGCTTCCGGGCATTTGAATATAG >5.91|2268466|36|NZ_CP009170|CRT AACTACACGAGAGACTGAAAAAATACAGCAACGAAG >5.92|2268531|37|NZ_CP009170|CRT CTATCCTCCGCCAAGAAGGTGCTTTCTTAGCTGCTTG >5.93|2268597|36|NZ_CP009170|CRT TAGTGCCCTATAACGGTGCAAATATCCTGCGTAGTG >5.94|2268662|38|NZ_CP009170|CRT TTATTTCTGTTTTAAAGGGTAGCAAAAGGGTTGCATTG >5.95|2268729|37|NZ_CP009170|CRT GGTTCTCCGCCTGCCGGAGGTTGCCACTCCGGCAGGG >5.96|2268795|39|NZ_CP009170|CRT TCTAGTAAAACTAGAAGATGGAGAGAGGAGGTTGTCCTG >5.97|2268863|38|NZ_CP009170|CRT CTGCTCTTTTGTAAGTTCTTCTACATTACTTGTACTGG >5.98|2268930|39|NZ_CP009170|CRT GAGGGAACCGCCAAGGTTCTCTCGGAAATATTAGGAATG >5.99|2268998|37|NZ_CP009170|CRT TAGCAACGCCTATGATTGAAAGCCCGACTATAACCGG >5.100|2269064|38|NZ_CP009170|CRT TGGAAAATCGTGATTTAGAAAAAATCATTGAAACATTG >5.101|2269131|38|NZ_CP009170|CRT ATGCAAAAATTCAAATCGACTACACAGACCCTTTCATG >5.102|2269198|37|NZ_CP009170|CRT TGCCGGTTTTCCAAGTATTTCTGATATTTTATTAATG >5.103|2269264|37|NZ_CP009170|CRT CCCATGTCGCCATTTTTATTCATCCTCCTTTTTTGTG >5.104|2269330|37|NZ_CP009170|CRT AACGCTGTCCGAGATTGACGCTGCCTTGGCACAGGTG >5.105|2269396|37|NZ_CP009170|CRT ACAGGATAGCCTGCAAAGGTATTCGGTCTGCCAGCTG >5.106|2269462|37|NZ_CP009170|CRT GAAGAAGGCCAAACAAAAAATGCAATCGTATGGTTTG >5.107|2269528|36|NZ_CP009170|CRT CTCCATACCCTTCTTCATGTCAGCGAGTATCTCGCG >5.108|2269593|38|NZ_CP009170|CRT GAGGTGAAGTAGTAAAGGTTTGGCTTACAGCGCATGAG >5.109|2269660|37|NZ_CP009170|CRT TTTCCACCTTCCCATCATCCCCTTTCAGAAGGTCGCG >5.110|2269726|36|NZ_CP009170|CRT GGGCTTGAGTACGATATACCGGAACCGGATGATTTG >5.111|2269791|37|NZ_CP009170|CRT AGCGGGGTATGGGGGAGGGGAATACTAGCATATTCCG 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cas10,cmr1gr7,cmr3gr5,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7,cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009170_5
The CRISPR arrays of NZ_CP009170_5 >merge|NZ_CP009170|5|2268103-2273799|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NZ_CP009170.1|WP_148307274.1|2267290_2268019_-|hypothetical-protein MSETAATVPNNQTYPAQELINRINGHNYPYSYAVIAHPYGAHPWSDWNATGFCGMELLSQETVVKPDTISRWFTLLRSGLSSTMSSGRFMVGIGTSDCHNFQAPGFAGFTWAYATSYSSTNRAAIWDAIKSGRVSASGRKDLGYFTVNGAVQGSVLNVTPGSSLQFKLVQTPVTGRKCTKITVFNKDQVAVYTVTNPSTSVIYWNTIAPSTDGFYVVKFEFTKTDGSDLSEVWANPVFINVP >NZ_CP009170.1|WP_049686047.1|2266817_2267102_-|hypothetical-protein MDVLPLYWGSLIGALWGALSYVILVVPEIRETIHDYLGYGMKYLLLFLPSLWVAPIFGNWAVHGFWGTALPLGASVAAGAIAGALVGTIFFRKR >NZ_CP009170.1|WP_049686045.1|2263424_2266139_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MEKVWLLKLKAFLHDPPHKHWIISMDNEECIKKFQLQEKGRCHEILIKSKVIEPLLGEDLTEEEEKLIEKADTQAYPVNRILPPVAVKIRGEDVIFFDIFNKKIYYDILAETDYETENKRFLELIEKLATNYKLSQINKEEKAKILFLFLWRFYQKIFHWIKIHPADTRAPNHSIYDHLVQTSTLVSALPKPAFLLFTIGPVQSFIATARKTSDLWAGSYMLSYFIWESMKFVVEHYGPDVIVYPNLLGQPLVDLWLSSKVFGNSFTDLAQTEFDEWFKEWNRVPRSESLEGKLTIANMPNKFLAIVPVNEGEALKLGEECEKNFKEQLKRLAKKTAQRLEGILNRDRDLEKIQLQIENQLLKYFQVYWAVMPWFEEEESPEEALAGYREIIGETELYHTISEFTKHVNKILGKNQEKSKKYRDFSIAYSLLLELTEKLLGTRKSIREFEQLEQKGRKCSLCGEFEVLPLDWEKLRSKEKGLVKEKEQLCGVCLAKRLFPKRMKEELNLSEELKFPSTSEMAAIGEKRRIAENKEFIAEFKELFKEFKQKFMLPNTVSVPKLKDNQLFEIDGQWLMKESYREEYIKSEYAENFEIEDFQNMAQKIRKLLETYKINPSRYYAILQMDGDHMGKWLKGENSPSIMETLHPKVGEHIKQHAKDNLSLILYKKHPTTPSLHQTLSRKISTFALQEVRKIVEEKHYGKLVYTGGDDVLALLPVEEVLGCAYELQNAFKEVLSSEASMSAGIVIVHHKYPLYLALKEVQLAQKKAKDERQYNRNAFCLKFIKGSGAPKECGGKWELIDFLKELIEHFKKEEFSSTFPYQFFEVVDRLYDDKNKEQVLGILRNELKRIFIRQSRNRDDLEKYADEILLPKFDEIVSKTPNGVMNFANMLIIARSIAMEARI >NZ_CP009170.1|WP_049686042.1|2261151_2262075_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MRNYECKLQIVTPIIMGGARKNSLELREQSINGILRWWFRFYGGLKYQDLQDLQKRESEVFGSTNRAKRFYIRILQKPQSTEKAYLCMNDRRKKGENGAVANYNERVRISYAPNQEFILNFRFMPHFLKEYEKDFKNSILCLSLFGGIGARWRRGFGSIVVEEFILCGEELEEIKKEINEKLMELNIQRDVSKIKPLQEFINFTNTKIFLIKPKNEFWNSYESAMNDLRDNLYRALKHELKTSEVSYSPKGSKRKTSPLIIQIKKNAKNHYFGVILVWQEWPQKKPVEDFLTKLKKYEFIEINPPGE >NZ_CP009170.1|WP_049686041.1|2260012_2261146_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr3 MIKFKITPYDVVFFGSGRPFNVGDVVYSIFPHPHTLAGAICAKIHAHTKIDTSKILKNVYGPFIEKGGKLYFPKPSSILGERKKEKIENIFHARPYELNTKLFRKENTNADSNIKTFPLYMGKEDIGTFPAFISIEGLRKWLKGEKIEIHEILQYKEIFTKEERVGIKMDSTVNAVGGEEDALYRIEFMRLKEDVSLVVWIEFDFEAEEIRKTGFSDENKLMEIFNQPPRALKIGGEMRNAFYEVGRENFLEFLRENLGVSQMVKVRAGDIVKVLFLTPGVFPDFKFSVEGFEVFSLALDKYTIVGRYSPKLKIRKTVRAFPSGTVMWFEAKRDMLLVNPAFILHEDGGYSFKIPNGEQDFIGSNLILIGKEEVKNV >NZ_CP009170.1|WP_009609733.1|2258970_2260020_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKESALITFYAETPVHMGAGQSVSYVDLPVQRERHTAFPIFWSSGIKGVIRDTCYRIWRDRDKVNLIFGPEEDSDFSSCISITDAKILLYPVRSVRGVFAWITCPFVLKRFKDELESAGINEVNKNFEVIDNLHLKDGEAVIPKESISVLEINDKQVAFEEFVFSIKNTSQNISEVVKFIKNLLPKTFLTTDIEKHFAIVSDDTFRDFVNYAVEVRTRVRIDQKTGTVKEGALFTEELIPSESVFYSLLFISDPYFGIDDEFYSCLLEVKEKTQGKLNWEEAKNKIEKKEWLEKVKNKEFYLKKAWEGNYFNSAEVLDNLHEILNGTILQLGGDETTGKGFMRVKIYP >NZ_CP009170.1|WP_049686040.1|2258537_2258945_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MVEGLKVKTLEQERANFCLEEVKNLPKEKDKRDKYKANARRLPAFIVSNGLISTLAFYKSKEETKPVYYTLNKWLQKRGYIPRDKDALEEFVNKDFQILRLATTEILALANWLKRTVEIEIKEEKANSLGEREGQ >NZ_CP009170.1|WP_049686039.1|2257560_2258541_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIKSFSDLVRVVYKDDSKIAWDKCENFSLAFSKLIRRELIESGKEGAKNAFLTSLASYSMRSLDFDAYLSKVNLQVEDLSKQGYQPILRQYKITTASRLVIGLGVEHPLETSLTIHHLFGIPYIPGTALKGVCRMVSFWDIAIEEARGEEIEEGEIENLQKELYEGLIFDRSSSKDKGKEDSPKRVLHKLLFGTQDFKGLFLFLDAFPVINNNVSLFDVDIINVHYKSYYSDDTGKTPPGDWENPIPIPFLTVKENTSFNFSVLFDKIRFKELIKKEIPSEVKGAIDFLKDDTFLKELVENWVKKALTEFGIGAKTRLGYGYFKIL >NZ_CP009170.1|WP_049686038.1|2256804_2257437_-|tRNA-(guanine-N2)-dimethyltransferase MQSNKIIVLEGRLKRFYEVLQKRQKDLVVFVDDVTNEHNFSAILRTCDAVGVMRVYYFSEAKNGIEINEAVSMAANRWLFIERVYDREKAIKELKGRENLQVVVTWLDESSKDFREIDYTKPTLLVVGNELKGVSEDILNLADERIVIPMMGMVQSLNVSVATGIILYEALKQRLDKGMYLKPTLSEKEIEEIIMKWNNDIIARRKERRK >NZ_CP009170.1|WP_049686036.1|2256009_2256558_-|DUF4416-family-protein MGKVKEVLPVKLFCGFIYKEEDVVEEAIEKLKEKWGEIDLEAGPFPFDFTDYYEEKMGKDLKKRFVSFEKLLSPDESYEWKLFTNSAEEIFSKEGKRKVNIDPGYIDMAKVVLFSTKNFYHRIYLGKGIFAEVTLYYTKGKYEFLPWTYPDYKTKEYTEFFIKLREVYSFQIEKLRSDKNAR >NZ_CP009170.1|WP_049686048.1|2274301_2274565_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILVYDVNVNRVNKVLKTARRYLTWVQNSVLEGELTEATYRALKNDLTRIIDPEEDSVLFYILGNTKYTKRELLGIKKGGEEWIY >NZ_CP009170.1|WP_049686049.1|2274601_2275594_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MQKTLYLFANGRLYRKDNTICVEGEKERKYFPVESIRDIYVFGEVDLNKKFIEFAEDKEIILHFFGYYGNYVGTFYPREHYNSGYIILRQAEHYLDSTKRLDLAKRFVQGAVANIVQVLKYYQNRGKDLESYLYAISLLEESVSSVSSVEELMALEGNIRRYYYESFNTILDDTPFILKNRSKRPPTDPLNALISFGNSLVYTKILTEIYKTHLDPRIGYFHTTNFRRFTLNLDVAEIFKPIYADRVLFTLLNKNVIKEDDFENQGGVFLLKERGRRLYVQEFEDKLRTTFYHRRLKRNVSYQTLIRLELYKIEKHLIGEELYEPFVSRW >NZ_CP009170.1|WP_049686295.1|2275636_2276161_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MSTLFSLEEELSKVIGSYVQAFFICPRQVWLMSRQVCPDEDNIFLQIGRLIQKQAYSRERKEVHIEHLALDMIKRGEKTLVIAEVKKTSKAIEAARMQLAFYLYELKNMGIEAEGELLFPEERKKEILILTPEWEGKVEKVKQEILELINQPLPPSPHRGRYCSKCAYAEFCWA >NZ_CP009170.1|WP_049686050.1|2276157_2278626_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MVYYAHREQKALYRLGAHLVFVALKSAEDIIKLPNGKELVFPATIAGFGHDFGKYTSYFQDYLLKEQTNPYKDHAFISAIWSTFLVGKEGLKDWDELMVFMSVLWHHRDLGNIEEYLVSPLEMEDYYEKTLDPNKARRLEIIEQQIKDLKKHAKAVSFSLNKARQWLIKMLSAKDLPVLSVLKQNCEELLNEFFDDWKNVYTSLHKKWRKFYREKRAKSGELNEYFKMVSLFSVLINNDKLHSGRVREVKRVDFPPNLVVIYKEKHFTPSGEPKIVDIRQKVFEQAAERIKNAPLEQRFFTLTAPTGSGKTLAVINAAFILRERLKEIYGTAPKIIYALPFTSIIDQTYEVMHQIFSKTVDQFSSTPSPYLLKHHHLSEIFYQDREEEDMRAFDEAMLLIESWKSEVVVTTFVQLLHTLIGNRNRMLKKFSQLNLSILIMDEVQNIPVEYWPLVIKVLKEAAEYFDLRLILMTATRPEWFGPGEAIELAGEAQDIIGYFNELSRVRLKIEGGEKSIEDAVKIFVNNYKKDKSYLVISNTIRSSIEFYEKLTMLMPEADVYYLSTNIIPLQREERIKKIKEILRRGEKPIVISTQVVEAGVDLDFDEVWRDIGPIDSVIQAAGRCNRNFKHGKGIVRLFELVNENGEIMAPSVYGAVHIHCAKQVFSERREFDEKEFPVLVEQFFEMVREKKDQSKSIGLLEAMSYCRFTKAQNDTYGVSDFQLIKNRWDLVSVYVALDDKAEEVWNFYQREVIKASNRKARWEAFYKIKKDFGRYIISVPAKVLINKVDIGKTIPYLSRDLVDEFYDPNTGFKLKEEGTWIY >NZ_CP009170.1|WP_049686051.1|2278580_2279381_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MLEAVTFIGKNLGVDEEMLSYLIEDLSSPKQEEEQYLVKLKFFEEGEELKFNFDLEEIPEEYKSRKDFLFRWRFVGNASGNIPQIFLTVSNLNYLMGSTLSNLYQTLLRRSRQHSELALSIDKILKGYFVVLPNGESLFDIRKIGFPLKDDKLKENLNELDNFLQQLNQYQKEQTDKKAQKEIKDIIKKAKELIKKKDLAKLVAQELSEEIAKKIGVKKRQIALWTIVLNNKPLIDLSPYDDVIIEYRTEGFEKEVIEGYCSICGEKKDRVSPTAFKRLEFFKPYITDKIGFASELNEKGFSRNFLICEECFNSLLVAERYMLSNLGFRIGNLSFLLLPSLLLTHDLEGWKMDFSNIVGKLRKKTQNIVDFTGQVRSIADEKEFEKELRRVLYEMEEEGIENQALLTFLFYQKTQSEFRVLSLIEDVAPSWLFGLFKKSNQLSHLAAKLLGGDCRDWWLDLTRLYYLLPLREGDKTEHKKLLYLYHGLLKREPIDYDFLVTQFVTLARLYLTDSLAGTNQERRRIAQENRDWILSQEILRAGFLIKLLQEEKLLKGVKNLTEVSEMLEVKPEIKNYLLEMKYSEPQAALFLMGYLISEVGKGQYSSGHKSKPILDKINYQGMSFKKVQQLSNLIFEKLRQYDKLRFNEQVYSEMKKLMDKYRGEKDWPLTSEENVFYILSGYAFGSRMSGKKENLEEKEEEE >NZ_CP009170.1|WP_049686053.1|2282496_2283363_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIPLYQEAQNIEMWKKYQKNFNAGLWYDKFFYQWEKDWTIAKDGKKDGKKDGKKEWIQSVTSGDIGDPSLIQEALTRLLSLVTTLGGSYMCYKTQWRFVTGLGRKHPIENGFVWHHTLGVPYLPGSSFKGLVRSWAEEWSEIDPKEIEKIFGPKGKGKSDKAGSVIFFDVLPIKAIKLEADVMTPHYSPYYLQEKNKIEKAPGDWYAPGDWYDPVPIPFLTVASDQTFVFAIAPRIKEGKEDIFKLQEWIKEALSWAGAGAKTSVGYGRFEPHEEAQRKLAQSLKKEG >NZ_CP009170.1|WP_049686054.1|2283359_2283788_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MRPSIAQERAKHALNEIRKINNDNGRYSSDNKNKYASYVESLPATILANGLGQAMATLLAQAKGDKEDLHYVLYNSIQSWLCRDHSQAPYRNAEDLMEAIVNSSRETYIQAQMEALAYLEWLKKFAVAFFKKETVVEKEETS >NZ_CP009170.1|WP_043883753.1|2283784_2284615_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MKGSILSLFAETSLHPGVGQVVGAVDLPVAREKTTGYPVIVGSSLKGALRDKAEQVWGEKEEKLKRIFGESNQAGSLLITDARLLLLPVRSLPGPFKWVTCPYILERLKRDGELMGLSWDFDIPDPGDKALVQEEMGELFLEEIVFSTSKGKDLNKIVETLKEFIPHDSVKKRLETQLVIIDDKEFQYFAQYGLPVNARNVLNKNKTSDNLWYEEVIPPDTLFYSLIFERKLTEDQNDLYEVESLFKDSPYLQVGGNETIGQGWCRIQWFSGGESR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009170_6 | 2344710-2347139 | Unclear |
I-A,II-B,III-A
Consensus repeat of NZ_CP009170_6
|
36 spacers
spacers of NZ_CP009170_6
>6.1|2344740|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT AAGAAAGATGTAGAACGTGGTGAAGTTCGTATTAT >6.2|2344805|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TGATTTTTTATCCCAAATGCTGAAGCGATCTGTTTGA >6.3|2344872|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TGATTTAGCTTCCCGACCTTGAATTCATCAACGTA >6.4|2344937|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT GTATGGCGATCCTGTTGATATTGTATATTTTAATGA >6.5|2345003|39|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TATTACACAGATTTTTTGATATATTAAAAAAATAACTTT >6.6|2345072|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT AGCATGTAAGTACAGTTGTACTTGCGTATAGTATTG >6.7|2345138|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TTATGAATGCTGTTTTTGCCAAATTTTTGGTTAGCTT >6.8|2345205|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT AAGAGTATACCAGAAGGTCATTTATCACACAAACAT >6.9|2345271|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT CAACCGAAACATCCAGATTAATAGGCAACGAATAGAA >6.10|2345338|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT CGGCAGGAGTAATTCCCAGGTCCGCTTCTGTTTTAT >6.11|2345404|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT ATAAATCCACCAGCGGAAGCAGAATTTACAATACAAT >6.12|2345471|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT GTGGATGTAATTGATTATGGTCTTGCTGCTTTTGCAG >6.13|2345538|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TTATGAATGCTGTTTTTGCCAAATTTTTGGTTAGCTT >6.14|2345605|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT AAGAGTATACCAGAAGGTCATTTATCACACAAACAT >6.15|2345671|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TTAAATTATGCTTTACTACCTCGTATGTATAATACGA >6.16|2345738|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT CAAAAGCAAGAGAACAACTAGTTGAGGATATAAAAAA >6.17|2345805|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TTCTTTCAGCTTTGTTTCATTGAAGGTTTTTATCTC >6.18|2345871|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT GAATATCCACCTTTAATTAATATGTACCAATAAATTG >6.19|2345938|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TGTCAATATCACAGCAAACTAACTTGCCTTTTACGT >6.20|2346004|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT TGTACACGAATGTGAATTTTATTCGTTAGCAAACTA >6.21|2346070|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT CTAAGGCTTTTACATAATCAAAAAACAGTTTGCTTCT >6.22|2346137|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT CAAAAATACACTCACAAAATCACCCTTTCAATATTTT >6.23|2346204|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT GATATAAAACACAACCAATTCAGTATATATTCATAC 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cas6,cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009170_6
The CRISPR arrays of NZ_CP009170_6 >merge|NZ_CP009170|6|2344710-2347139|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NZ_CP009170.1|WP_049686103.1|2343431_2344289_-|YitT-family-protein MRRKSELINTLEKYGFLFIGALLVATALEIFLVPNNIIDGGITGISIMLSYLTNLPLGIFIFILNIPFLVFGYKQIGKTFVGLTFFAVTVLSVSVTVLDKAPVLTNDTLLASVFGGIILGIGVGLVIRYGGSMDGTEIVAIAISEWTGFSVGEIILFFNIFILGSAGIVFTWDRAMYSLITYFIAFKVIDLAIEGLDEAKAVMIISEKVDEIAEVVIAQLGRSVTFWEGKGGYTGQSKRILYAVVTRLEIAKLKLIIKEIDEGAFVTIHDVYDVFGGKLQKRPIH >NZ_CP009170.1|WP_049686102.1|2343080_2343251_-|XapX-domain-containing-protein MKATLLALVTGIIVGLIFSFLKLPLPAPNVLPGVAGIIGIYLGGVFFEYIIKLIGK >NZ_CP009170.1|WP_049686101.1|2341762_2343004_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MRSIFWRLIISFFVVVAIPVGAIYYFAVDDKVMHVFITVATVSVVLSLLLSVIISLNITHPIKKLTEEFKKVQNGDFTAKVDLKRKDEIGTLIASFNVMMENMRSILKDVSTFAQSTKETANTLFKSIEQSNITFQQISKAVEEIATGASEQAKDTSNAADMVQNIGESIDNSAKFFKAVEKSTVNADKLSQNGMQTINSLKEKSAVTKESIDEVVTAINELQANSHHIEKIIEVITGIADQTNLLALNAAIEAARAGEAGKGFAVVAEEVRNLAEQSRQAASEIAKIISEIEQKTDKTVEKANVVKEIADDQAHQVETTYAVFNEIKSSIDTITENIHMLNNAVMELSRYKDEIIGSIANITAVSEETAASTEEVAASTEEHMKFIDEIKESSEKLLKSATSLEDILSKLVA >NZ_CP009170.1|WP_049686100.1|2340138_2341521_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MKLYDVIIVGGGPAGLFTALELIDKKEGLKILLLEKGKDIQKRVCPINAYGSRCANCKPCAITCGIGGAGAFSDGKLTLTSEFGGVLDEYMPKSQLNDLISYVDSIYVKFGGTTEVHGTDREKIREIEKRAQAADLKLIPAVIKHLGTEKCFDIIKNMRDNIGQKVEIKTETPVAEIIVENGKVKGVVTEKGEEYYGKYIVVVPGREGAEWFKREADRLGLETKNNAVDIGVRVEIPAVVMEDITKEIYESKFIYYSKSFDDRVRTFCMNPYGKVVIENNNGIKTVNGHSYKDIKTDNTNFAILVSKEFTHPFNRPIEYGRYIAELANMLGDGVLVQRLGDLLAGRRSTPERIKRGLVEPTLKDATPGDLSLVLPYRFLQSIIEMLQAMDKVAPGVYSKHTLLYGVEVKFYSSRVKLTDKFETQIQNLFAAGDGAGITRGLAQASVSGVVVAREILNRVK >NZ_CP009170.1|WP_049686099.1|2338842_2340123_-|adenylosuccinate-synthase MSTLVIVGTQWGDEGKGKITDYLAEKADVVVRYQGGNNAGHTVEKEGVQYKLHLIPSGILYPEKICIIGNGVVIDPASLIGEIENLKKQGISVNNLKISDRAHIVFPYHIRQDELEEISKGKNDLGTTRKGIGPCYMDKSERIGIRVCDLIKPTVLEEKLRRNVEKKNKLFRDLYGAEGFGFEEIYEKYLDYAEKIKPFVTDTTVLLYDLIKSGKKVLFEGAQGTLLDLDLGTYPYVTASHPIAGGVTVGAGIGPTMIDEVMGVVKAYTTRVGKGPFPTELFDENGDFLREKGHEYGTTTGRPRRCGWLDVVILRYSIRVSGITYFALTKLDTLTGLKKIKICTGYKFNGEIITDFPASLEDLAQCEPVYEELEGWDEDIQSAKSFEELPYNAQKYVRRIEELMGIKAAIISVGPERGQTIVLRNF >NZ_CP009170.1|WP_049686098.1|2333524_2335843_-|EAL-domain-containing-protein MVNGKKLPSEKKNKSFIEESKKSIAYLQKKEEFLSRIFENEQMLIVVWALDGRVVWFNRYTQAVIGITVEEQTERIDVSSIIPRDTISRIKENLDDIEYRGIHYKCENPMALKDGRQIYIMWHNSIIWDDEGNRYVVSTGIDITDLKNAERRLEEANNNLVALNEELMAQQEELSAMNEELMAREEELRQNLIEIQRQQDELKRSEERYRLVVEGASDGLWDWDLITDTAYISERWKDIIGLDKEVVNNYYETWTKLIHPRDVKTVINNLRNHLEKKTPFYLCEYRIKTKDGRYIWVLSRGKALWDEEGRAIRMAGSHTDITERKQMESKLKYMAFYDPLTGLPRREVFMDRLKIAMADAKRNGKKLAVFFVDLDNFKTINDSLGHHIGDRLLKKIARKLKACLRESDTVSRVGGDEFVILLPDIMDIDDTNKVANRILELFNQPIKFNNHELYVTISIGIAIYPDHGKNERAIVKNADIAMYKAKRDGKNSFQYFDSITRKEVEVASTIRRDLRLALEKGQFFLCYQPLVDIRTGKVTSMEALLRWQHPKKGLISPIHFIPIAEETRQIISIGEWVLRAACRQMKEWLNMGYSGFNVSVNVSVHQLQQPDFAKVVFDILNEIELEPRYLELEITETILIEAMETVVRNLYRLKEVGVKIIIDDFGTENSSFKYLQKFTVDGLKIDRSFVSEIKVEVNKAIVDAIIFLGHRMKLGVTAEGVETKEQLDCLIESGCDKVQGYYFSKPLPPDEAIRMVQKESNYFIFNAWRNRT >NZ_CP009170.1|WP_049686097.1|2330985_2333085_-|glutamine-synthetase-III MAQNTLSDIFGSNVFNDSVMRERLPKATYKALRKTIDEGIPLEPAVAEVVANAMKDWAIEKGATHFTHWFQPLTGITAEKRDSFISPTQDGRVITEFSGKELIKGEPDASSFPSGGLRATFEARGYTAWDCTSPAFIKDNTLYIPTAFCSYTGEALDLKIPLLRSMEALSKQALRVLKLFGNTTAKKVITTVGPEQEYFLIDKKMYDKRKDLILTGRTLFGAKSPKGQEMEDHYFASIKERISAFMKDLDEELWKLGIPAKTKHNEVAPAQHELATVYNTANIASDHNQLTMELMKKIALRHGLVCLLHEKPFAGVNGSGKHINWSMSTDDGQNLLDPGHTPHENAQFLVFLCAVIKAIDEYADLVRVAAATPGNDHRLGANEAPPAIVSVFLGEQLTDILEQIENGGATTSKQGGVLKVGVSTLPALPKDSTDRNRTSPFAFTGNKFEFRMVGSSSSIANANFILNTIVAESLSQIADRLEKATNFDEEVQLLLKEIVRKHKRIIFNGNGYSEEWVKEAEKRGLPNIRSTVEAIPALIKEKNVKLMEKHGVLSKVELESRYEISLENYIKTINIEALTMLDIAKQQILPAVINFATKIAESINSVKATGLNVDISAQTELLGEVSSLMSEFKKNISELENAVNEASNMNGDSYSKACYYRDVIFTKMGILREIGNKLETIVDAELWPLPTYADMLFNI >NZ_CP009170.1|WP_049686096.1|2329495_2330836_-|ammonium-transporter MVKKIYLLFSLMFMFLIIPKLVFASTGKINTGDTAFVLFSAALVMIMTPGLAFFYGGMVSSKNVISTMMQSFIIIAIVSIQWILFGFSLSFGSDVRHIIGNLQWLGLKNVGFEPYDAYSATIPFMAFMIYQLMFAIITPALITGAFAERMRFGSFLLFTLLWTTLVYAPIAHWVWGNGGWLKNLGALDFAGGTVVHISSGISGLIAAILIGKRKNVNIIPHNIPMVIMGTAILWFGWFGFNAGSALAVNGIAVNAFVVTNTAAAAAALGWVIVEWKVNGKPTLFGAASGAVAGLVAITPAAGYVTVVSAIIIGVIAGILCYFSVNYLKHKFKYDDSLDAFGIHGIGGTWGAIATGIFATKVVNPAGANGLIYGNVHQFIIQIISVIAVYAFASIMTYAILKFISLFMDLRVSEEEEESGLDISQHGEGAYNNIELKYNYFSYYDNN >NZ_CP009170.1|WP_049686095.1|2329058_2329397_-|P-II-family-nitrogen-regulator MKKIEAIIRPEKLEIIKDQLGKFDIHGMTVYPVMGCGNQKGWTEVYRGNEYFINLLPKVKVEIAVADHQTEKLVKLISEVARTGEIGDGKIFVVNLENVIRVRTGERGEKAL >NZ_CP009170.1|WP_049686094.1|2328290_2329001_-|type-1-glutamine-amidotransferase MQVLIIQHVSQEGPGLIAEIFSKKGWKLDIRVMNQPGAILPKTVADYNAVIILGGPMGAYEEEKYPYLYQVQELIRDAIERRIPVLGICLGGQLIARALGATVKPNPVKEIGWYKIHLTEAGEKAFLFQDLPEEFWAFQWHGDTFELPEGAVLLAEGDTCTNQAFAYQDCAWALQFHPEVTPIIVSYWTEIYQEELIEFAGPGAVAQLKEETKRLWEKNQEVFSRFWANFCRLLDV >NZ_CP009170.1|WP_049686105.1|2347376_2348132_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIRITLLPEENKSLNINYNYFLSGWIYNTLKKANKEYAEELHTRGYSYGKKVFKLFTFSQLRSKNLKIVNENIMFLDKTYLYITSPKKEFLLNFVTEVLNNNILKLQDYEFKIETVEILKEPEFDKGENKFICLSPIVTSTAAEIDGKRKSVNLPLHDPRFVENLKNNLIEKYYVIYNTLPDNLSLNINFDMEYYSKNPKGKRIRYKNVYVKGYMVPFTMSGNIELIKVAYDCGIGEKNSAGFGMIQKIR >NZ_CP009170.1|WP_049686106.1|2348141_2348405_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVLIVYDVEEKRVAKVNKFLKTYLNWVQNSVFEGELTEAQLNRIVLWFKGHLDLECDSVLIYTASSEKWLSKRVIGVEKNSTDNIL >NZ_CP009170.1|WP_049686299.1|2348406_2349399_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRSVYINTNGRLSRKDNTLYLESETYGKKPIPVNNTQEIFLFGEIDLNTRLINFLGQNNITLHVFNYYGYYSGSFYPREHLPSGFLLVKQVEKYKDEYERLKIAKEIINGATHNILKNVKYYSNRKEGLDEYVERIENERKNVKDAKTISELMGVEGRIRNIYYSAFEIIIDGKFEFKNRTMNPPDNPINALISFGNSMMYSTVLTEIYNTQLNPTISYLHEPGERRFSLSLDISEIFKPIIVDRIIFSLVNQKMIREEHFDQELGMCYLNEKGRVIFQREFDEKLATIIKHPKLNRSVSYRRLVRLECYKLIKHILDEEEYEALKMWW >NZ_CP009170.1|WP_049686107.1|2349410_2349902_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MNLVTGTEINYYFVCKHKLWLFTHGINMEHNSDYVDIGNALHEKSFTREDKEILIDGRIKIDFVRNQLEIHETKKSKAMEEATKYQILYYIYYLKMKGVDGVTGVIHYMDNHSKEEITLREQNEEKIKQIIEEINKIKEMDKPPQKVKSKVCTKCSYYELCFC >NZ_CP009170.1|WP_049686108.1|2349924_2352153_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MGKKILAKSSEYGEETLIQHTQKALNVLKSLKEAYPEVLEICGDEKFYEYLFAAIFLHDFGKAAEGFQKMLKEAKPWGYRHEIISAGFISCLPYSEDVKKDIALAIITHHKDLYELQEGYSTLTPPGKDNYIKRLKELEKNISYLQFMLDKVPEWSKEFLGYEISLNQIKSIEEIEDAFCWAAKEYLNDYEDKKITNEKRKLFLRGFLTACDHLSSASQEEVVKAVSNMKEIFKFPVYRDTQLKAMSTKGSAVLIAPTGYGKTEASLLWSDNNQNEVKGKRIFYLLPYTASINAMYNRFKDTFGDDRVALLHGKAVYFLYKEFTKSGEDYFSAVTKAKTKYNLSQKIFKPYKVLTPFQILKHFFGVGGFEQHIGEMTGGLFILDEVHSYDPHTTALILESLKYLKEEYKVEVLIMSATLPKFLKELFMKELNIGCLIEPSKEELKKIARHKVSVIEGDVFSNIGKIIKDTKENKNVLVVCNTVGHAQKVYSELKEYTDKSALLHSRFILKDREKIEQNLDNVQLLVGTQAIEVSLDIDFDALYTEPAPIDALIQRFGRVNRKGYKGVSPVYIFSQGSEVDKNVYKNQQVVSKTLELLREWDILSEDLIQNLVDEVYKEGYVGKDYEEFIRAKESFRNVIKQLYPFIETKHLKEEFYELFDNREVVPYVFKEEYLEKVKNKEYFEATGYIVGISQRRYIALKKQNLIEDQDYNIGFAYCEYDKDLGLLIDKPYSNIFADDFQY >NZ_CP009170.1|WP_049686109.1|2352145_2352772_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MRVLRVHLVGWTASFRYPIFVTGYQPTLPVPPVSTIYGLISAAKGEYVTPQDTKVGYVMRSDAKGVDLETIYMLSNDNSVKSNVYKREFLLNPDLYIYLTNLSFKEAFKKPEYSLLLGRSSDLIMVTEIKEIELIQKHGRKRVGGTVVPFCEEGIWGPLQALPMYFSNTIPREVIGIKPYYVLGDFIEYEGDSFLYDEELEWGVYIHG >NZ_CP009170.1|WP_049686110.1|2352778_2353792_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNVNGFILVDAPASALNNAGPDVGAKTENTIAVKKIRRGRGEYVYVSGQAFRYWVRSSLKNIFGWELSPIERDSKIAFTAANPFKYPDDDMFGYMKAIGKKSGSTLTRVSPFKCSPLISVTPVNIVNDFGVMARHEGDPVPYEHEFYSTVLKGIFSLDLDSVGRFSSVNKTGYMNITEAYKEEWEAHNCTVEEDGKVVTLPAEVRAKRASELIGVLPYIFGGAKQTFHLTDVSPKFIVLAILNCGNNIFMNIAVDDRGEAAINVKALKEVILDYQENIISDVYIGKREGFMDEYNEDLRQMTDELNRTLSNIKVHLLTVNEAVSEFQQVVSGFYKR >NZ_CP009170.1|WP_049686111.1|2353784_2355164_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MNNIFTYTGNPFVDAGITAMLVWLGKEKPEDIEDYEVKNLIDEITDLYTKDGWNKIMYSIFPNSKLTNPSVKDKKGEYTKFLNELLSEVTVLGNGGNCIACGRRNYKRQFTKTQVPLTGTSDFINFFSYGKEGADYCSVCALAIQFSPLIFYKAGNLVCLQSNNKEAEKIYANKCKTFIDMQKATKNYTGCNDEGYTNPVNALFHLASDIILTYDRRDWQKDNTNIRLYYFTNFNQPPIDNLSIFDMPDKIFKFLAYALQHEEKDNWKKVIKRGYISTKKVNLEDEEKYKNLRNDVYERLLRGESILGYFVDTSERKTLVGWSFLEYYMKGVRGLEEKRLETIKRVSDDIAELIKAKGNVRRLTQLETAKTYGEFRNVLRLVIKDRINAGFERPLFTIDEYEKYLFPEGNLSWKETQDLIIFRLYEQLHNWLTGNEEIKEIVIGEESDNEIEKEELSYE >NZ_CP009170.1|WP_173402341.1|2357273_2357414_+|hypothetical-protein MKTKAKQLSLSDIYDNVLSFFEEDKPKFIKLFDSFIDLSELIPPSI >NZ_CP009170.1|WP_049686113.1|2358983_2359406_-|hypothetical-protein MIDLKTGEIIVNSDLILSPKLSLEEFKKTRYYTGQDEKMYMSIGGPHKIDGRDFYISLYFKDSFLKEVSLAMDSPLIKEWNNEPKRKEIHDEYLRSKGIKLERKWDEENYKADVAEFEWGKIVSDFDSKGYTSDILIIYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009170_7 | 2369455-2369548 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009170_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009170_7
>7.1|2369484|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder CTGACAAGCTTGGGCATCAGTAATGCCCGTATGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009170_7
The CRISPR arrays of NZ_CP009170_7 >merge|NZ_CP009170|7|2369455-2369548|CRISPRCasFinder GTTCTACTGTAACTTAGAAGTTTTTTGTGCTGACAAGCTTGGGCATCAGTAATGCCCGTATGCTTGTTCTACTGTAACTTAGAAGTTTTTTGTG >NZ_CP009170|7|7|2369455-2369548|CRISPRCasFinder GTTCTACTGTAACTTAGAAGTTTTTTGTG CTGACAAGCTTGGGCATCAGTAATGCCCGTATGCTT GTTCTACTGTAACTTAGAAGTTTTTTGTG
>NZ_CP009170.1|WP_049686119.1|2368114_2368915_+|AAA-family-ATPase MFTQYFGMKFNPFSKEISVNDLYISEDIAELNARLKYLQETRGIGLIVGEAGSGKSTALRKYVESLNRSSYKPCYFALSTLTVREFYQALAMILGETPSYKKVTLFHQIQRAITELYYSQKITPVIILDEIQLVSNDVLEDLRIIFNFNMDSQNPYILILSGQPHIRNKLALNVNSALRQRITVKYMMQGLKKEEIQDYIKTRMKIAGMMDDIFTPSAYEAIYSLTKGLPRIINNLVTASLLYAYSKRLREIDEEVIYQAQNEISL >NZ_CP009170.1|WP_148307276.1|2366828_2368097_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MISPVLNGQVKNQKEYFDALSDKPIEIPYIGMRRYTPKTLRGWLYQYLRGGIEALKPGYRSDRGKYRKIDFELSERIKQKKLEHPEMPNKLLYETLIGEGIISPDKVSLSTFYRFLKNIPVKSLDKEKEGKTKRFSHEYINELWQTDVMYGPYIKEGKIKRQTYLIAYIDDASRLCTYAHFYYTQNFLALRDSFKEAVLRRGIPKMLYTDNGKIYRSTQLEYICASLGTSLIHAEPFSPHSKGKIERFFHTVRMRFLSTIDPTSIKSIDELNMMFFKWLEEDYNRKEHSSIGISPLDFFMSQISRINMCGDIDMLNECFLIRVNRKVNKDATLKVENILYETEEKFKNIRLEVRYDPQWLKDNTPLLLYYEGKKVGEAYKVNFHENAKISAAYIKGKNDVSENEEISDFTKHKVISFNDIID >NZ_CP009170.1|WP_148307275.1|2366242_2366881_+|hypothetical-protein MQIVFHVDNIEEYLHKGKDYNFPAPPDRCPHPDCKCKVKLKKHGFYYRYYLNGAICIKIAIRRYICPVCKRTLSYLPDFCIPHFQYSFNMVVKSLKETLTREKTLSSFISDLKRNFPTILFSRQHIYFYTKRIINNLSFIIYGLRQINPYIKLSETNSQRERAREILDIKACTTLLPTVLCSLPKIISGLSHIILTDKSGVKRTGKKSERIF >NZ_CP009170.1|WP_049686118.1|2365474_2365675_+|hypothetical-protein MEEKIKHEHEHTHPEIHHSHSHKHDDGTIHEHKHTHASVTHTHEHVHEPEKVEKHEHEHPEHKHEQ >NZ_CP009170.1|WP_084574303.1|2364543_2365326_+|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MRGICRAIFLFNKGIIDAVYDLVPAVKIQIAFYEVYGAEGIRAFFKTAEYAKKKGLIVIADVKRGDIADVAMMYSKAYLQNEYIDAITVNPYMGENTILPYISDCTKYGKGIFILVKTSNKGSGTIQNIKTEEGYFFEKVAEMANKMADSLIGNYGYSSIGAVVGATCTEEAKILRTKMHRSYFLVPGYGAQGATADDVADCFNDDGLGAVINSSRKIIFAYRNGYWKDVYTEEEYAQTSREEVILMRDLINNCLMKKRS >NZ_CP009170.1|WP_049686116.1|2364245_2364524_-|transcriptional-regulator MSDFHFRQKEPSPTFVNGKIEILYDSKVIAVHDKHYRLRSISQATFFPVMMKIQKSFVNELKNIRKSLGLTQKDASVQALISMEALRKIEWF >NZ_CP009170.1|WP_049686115.1|2363400_2364108_+|SurA-N-terminal-domain-containing-protein MKKGKTLILISLSIFLIFILAIVAFSFSAANPQEKANELQFNNVVKKVSAFFKSNKDKLQGDIIAEVNGIPIYKNEFELRKELTLASGVQTDNIDDYILQKLIKEKVQEYLANKYNVKVSQNEINAYIEKEKKEFNEYPEAKKKLNELIAASGMTEDEYWNTYENYNVRRMLLFGKLYNSIIEEGINSGKLKKTEEMTSEMQNEYRKYVDSIINEYVKDAKISINDKYKDMFKGF >NZ_CP009170.1|WP_148307287.1|2361446_2361728_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MVIKLLTEKIAIEYEKIVKEEEVNEMKIKLNDNQIKILALEAKGYKELGIAETLGIEVVTVKYHKRKIVEKLRVKNIKEAVIKAIKLGLVDLD >NZ_CP009170.1|WP_049686113.1|2358983_2359406_-|hypothetical-protein MIDLKTGEIIVNSDLILSPKLSLEEFKKTRYYTGQDEKMYMSIGGPHKIDGRDFYISLYFKDSFLKEVSLAMDSPLIKEWNNEPKRKEIHDEYLRSKGIKLERKWDEENYKADVAEFEWGKIVSDFDSKGYTSDILIIYK >NZ_CP009170.1|WP_173402341.1|2357273_2357414_+|hypothetical-protein MKTKAKQLSLSDIYDNVLSFFEEDKPKFIKLFDSFIDLSELIPPSI >NZ_CP009170.1|WP_173402342.1|2369641_2369815_-|hypothetical-protein MKKAIALLALVAFLLGIVTYINVKPSYINDKKVMQQYMLAEEREPRVHGEPIYQGKN >NZ_CP009170.1|WP_049686120.1|2370310_2371960_-|hydroxylamine-reductase MKMFCYQCQEALKNTGCTTVGVCGKTADVANLQDLLIFTLKGISFLNLKAREVGVNKEKSDRFLIEGLFSTITNVNFDRNFFLRRIKEAVALREEIKEDLRKAGVKVDEYESIDAISWTYGTDADIEAISQEVGVLSTEDEDIRSLRELITYGVKGMAAYAYHAYQLGYKDDNIFRFMEKLLAKVLDDSLTVDDYVALAMETGKYGVDTMALLDKANTSTYGHPEIKKVNIGVRNNPGILVSGHDLKDLEQLLEQTAGTGVDVYTHGEMLPAHYYPAFKKYPHFVGNYGNAWWQQDKEFELFNGPILMTTNCLIPPKDSYKDRVYTTGVVGFEGVKHIPEGPDGKKDFSEIIEHAKRCKPPVEIERGEIIGGFAHNQVLQLADKIVETVKTGAIKRFFVMAGCDGRMKSRTYYTEFAKALPKDTVILTAGCAKYRYNKLNLGDINGIPRVLDAGQCNDSYSLAVIAMKLKEVFGLNDINELPISYNIAWYEQKAVIVLLALLYLGVKNIHLGPTLPAFLSPNVTKLLVEKFGIGGITNVEDDLKMFLGV >NZ_CP009170.1|WP_173402343.1|2372075_2372765_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MDEPVRELKYLRKISYFSELEEQQLKKLYNITTLKPIKKGCIIFTEGQKGEAIYFVKTGKVKISKISSVGREYTIKIMEEGDVFGESTLFIGGEYPATAEAIEDSEILELKNKDIEDLILKDTQIALSIIKMLAKRLKYIAVVIENLALRDSVGRTASILLTFARERGTPIKEGILVEIDLKRQELANLAGTSRENITRILSQMDRDGIIKLGKDKILIKDLEELRKML >NZ_CP009170.1|WP_049686122.1|2372768_2374103_-|replicative-DNA-helicase MEWSKIPPQNIEAEQSVLGSMLLSRNAIIDVSEIIKADDFYKESHKKLFEVMMNMFEKDIPVDLVTVVDELRKRNMLEAVGGIDYIASLSSNVITTANVSYYAKLIKEKATLRRLIEASSEIMELSYQGDDVESVLDIAEQKIFDIAQGRNTTNFSPIKDVLMNTFYKIEELYKNKGQLTGIPSGFPDLDLKTAGFQPSDFILVAARPSMGKTSFALNIAQNAALSTGLPVAIFSLEMSKEQLVSRLICSTANIDSQKLKTGNLDEDDWMKLAAAMTPLSKAPIYIDDTPGISVMDIRAKCRRLKLEKGLGLVMIDYLQLMQGRGKAENRQQEISEISRSLKSLARELNVPVITLSQLSRAPETRSDHRPILSDLRESGAIEQDADIVMFLYRDDYYHKDSEKKNIAEVIIAKHRNGPTGVVELLWLAQYTKFVSLDKYRMEEG >NZ_CP009170.1|WP_049686123.1|2374124_2374568_-|50S-ribosomal-protein-L9 MKVILVKDVKNVGKAGEIVNVSDGYGRNYLLPRGLAIEATDSNMKALNERKKAEEKKMQQELEKAKEMAQKLSGISLVLKVKAGENGKLFGSITSKNVQEALKEKGFDIDKKKIAFNETVKTTGTYYADIKLFQGITAKVRVDVVAE >NZ_CP009170.1|WP_049686124.1|2374564_2376532_-|DHH-family-phosphoesterase MDKKFYRIISSVSVINILLSVILIAFMFYYNKIIASISLIILLYVLLSEYFGIKKKQLELDRYLENLFFNVDKASKSVLAKMPIPAVVLNSKGEILWYNSSYAQAFNENEEIKKLIKRYLSSKIDDRKNQIEFNGKYYSVLKIDSQLKRKKGEDLSCTLLFLDNTEYIQLKKSLVYDRPVVGHIIIDNYEEAMMAIEDIKKAVISSEIEKKLSEWASSIKAFMKKYDDDKYLIIFKEEGLKNLEENKFEILDKVREIGEDIKIPLTLSIGIGADAGDFLALNEYASSALDLALGRGGDQAVIKRGDKISFYGGRTQAVEKRTKVKARVIAHAIRELIKESSTIFIMGHNFMDFDSLGAAIGMYRACMSLDKKAYIILDKSNVAIDELVKKIQSTKGYEDLFIKSSEVKNMVDQNSLLIVVDTHRPSYLTYPEIVDIVDRIVVIDHHRRGKEFIDKALLVYLEPYASSACELVTEILQYIADKIDLKTVEAEALMAGIAVDTKNFTFRTGSRTFEAASFLRRKGADTTSVKQLFQNDLASYVIKSSIVKSAEILDNGIAIAISPANANNLIIAQAADELLTIKGVQASFVLLKREEDVAISGRSLGDINVQVILEKLGGGGHLTVAGAQVKKPIEEVLQDLKNAIKEYFEEEGEDK >NZ_CP009170.1|WP_049686125.1|2376550_2377459_-|DUF2232-domain-containing-protein MDARKLTNAAMMTAMAVVITLVGVYVPLLFLLFFLIPAPIAITCVRSSESYAVAASFAVFIVNVIFTDIITAFISLFFALQGFLIGYLILKKRKASEIVIDTSVVSVFSIIVIFYFIKIAFNINVIDQFFKIFDMSTKQVLSIYKGHPDISSIKSTLMALEQMVKMSLPASIIITVVSIILINYIVIAKVLKTQRVSIDTLPTFENWRMPYITGWIFIGALIYQYFLEKPEIITTNIIILLSLGFTLGGMSVVKYYLTHKLNVKPLLCNLILVFLFIFPLTSWLLTILGIADTSMNLRKYML >NZ_CP009170.1|WP_049686126.1|2377463_2377772_-|MazG-like-family-protein MKNNFEIAKNIMSIENLKINLLGKVYSLFKAFNEDEAGEVLIDNLCDILISAYLLGEKLGYDFEEMDEQVIKKLKLQIIDKNFDGDYNFSGLERYIKGRKRE >NZ_CP009170.1|WP_049686127.1|2377852_2378119_-|30S-ribosomal-protein-S18 MTTANTTTKDSAAAKKRGRKAKKRVCAFCSDNIDKIDYKDVARLRKYITERGKILPRRITGNCARHQRQLTKAIKRARQIALLPYTVE >NZ_CP009170.1|WP_049686128.1|2378134_2378587_-|single-stranded-DNA-binding-protein MLNKVILIGRLTKDPVMRYSANMVPVTTFTLAVNRNYVSQSGERPTDFIPIVTWRKLAEICANNLKKGRLIAVTGSIQTRSWDDNSGNRHWVTEVVADDVRFLEPKSGFGSSGNAEENRDFDEGFDSVFEDIPEEFEGFTPIESEDDLPF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009170_5 | 5.83|2273597|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 2273597-2273633 | 37 | CP003185 | Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262, complete genome | 47454-47490 | 4 | 0.892 |
NZ_CP009170_5 | 5.83|2273597|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 2273597-2273633 | 37 | NC_019956 | Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01, complete sequence | 107683-107719 | 4 | 0.892 |
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NZ_CP009170_5 | 5.31|2270122|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 2270122-2270158 | 37 | NZ_CP030289 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gaminara str. SA20063285 plasmid pIncI1.1, complete sequence | 37596-37632 | 8 | 0.784 |
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NZ_CP009170_1 | 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 92002-92033 | 32 | MN453779 | Aeromonas phage PS2, complete genome | 57055-57086 | 9 | 0.719 |
NZ_CP009170_4 | 4.30|1409861|35|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1409861-1409895 | 35 | MH892361 | Streptococcus phage SW12, complete genome | 24456-24490 | 10 | 0.714 |
NZ_CP009170_5 | 5.38|2270588|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 2270588-2270623 | 36 | MF001355 | Proteus phage PM2, partial genome | 62321-62356 | 10 | 0.722 |
NZ_CP009170_5 | 5.38|2270588|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 2270588-2270623 | 36 | KP890823 | Proteus phage vB_PmiM_Pm5461, complete genome | 77451-77486 | 10 | 0.722 |
NZ_CP009170_5 | 5.42|2270856|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 2270856-2270890 | 35 | NZ_AP023206 | Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-1_lncX3, complete sequence | 109442-109476 | 10 | 0.714 |
NZ_CP009170_5 | 5.76|2273131|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 2273131-2273166 | 36 | LR135896 | uncultured phage genomic DNA containing rbcL region region | 81432-81467 | 10 | 0.722 |
NZ_CP009170_5 | 5.161|2273131|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR | 2273131-2273167 | 37 | LR135896 | uncultured phage genomic DNA containing rbcL region region | 81432-81468 | 10 | 0.73 |
NZ_CP009170_6 | 6.22|2346137|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT | 2346137-2346173 | 37 | MK448932 | Streptococcus phage Javan42, complete genome | 7520-7556 | 10 | 0.73 |
NZ_CP009170_6 | 6.22|2346137|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT | 2346137-2346173 | 37 | MK448669 | Streptococcus phage Javan11, complete genome | 7520-7556 | 10 | 0.73 |
NZ_CP009170_4 | 4.18|1409066|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1409066-1409102 | 37 | MT840185 | Bacteriophage sp. Joined_contig_19 genomic sequence | 66464-66500 | 11 | 0.703 |
NZ_CP009170_5 | 5.38|2270588|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder | 2270588-2270623 | 36 | MK295204 | Shigella phage vB_SdyM_006, complete genome | 79903-79938 | 11 | 0.694 |
NZ_CP009170_5 | 5.123|2270588|37|NZ_CP009170|CRT | 2270588-2270624 | 37 | MF001355 | Proteus phage PM2, partial genome | 62321-62357 | 11 | 0.703 |
NZ_CP009170_5 | 5.123|2270588|37|NZ_CP009170|CRT | 2270588-2270624 | 37 | KP890823 | Proteus phage vB_PmiM_Pm5461, complete genome | 77451-77487 | 11 | 0.703 |
NZ_CP009170_4 | 4.6|1408267|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1408267-1408303 | 37 | KC699836 | Bacillus phage SIOphi, partial genome | 129800-129836 | 12 | 0.676 |
NZ_CP009170_5 | 5.123|2270588|37|NZ_CP009170|CRT | 2270588-2270624 | 37 | MK295204 | Shigella phage vB_SdyM_006, complete genome | 79903-79939 | 12 | 0.676 |
1. spacer 5.83|2273597|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP003185 (Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
atggctacttccattccgcatcctatatctactccaa CRISPR spacer acagctacttccataccgcatcctatatccactccaa Protospacer *..*********** **************.*******
2. spacer 5.83|2273597|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_019956 (Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
atggctacttccattccgcatcctatatctactccaa CRISPR spacer acagctacttccataccgcatcctatatccactccaa Protospacer *..*********** **************.*******
3. spacer 5.168|2273597|38|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR matches to CP003185 (Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
atggctacttccattccgcatcctatatctactccaag CRISPR spacer acagctacttccataccgcatcctatatccactccaac Protospacer *..*********** **************.*******
4. spacer 5.168|2273597|38|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR matches to NC_019956 (Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.868
atggctacttccattccgcatcctatatctactccaag CRISPR spacer acagctacttccataccgcatcctatatccactccaac Protospacer *..*********** **************.*******
5. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to MN692961 (Marine virus AFVG_117M41, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer ttttgctttctcttttaattttttaagagatt Protospacer ***. *.*******.**********.*****
6. spacer 5.22|2269528|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to MG018930 (Pseudomonas phage ventosus, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
ctccatacccttcttcatgtcagcgag---tatctcgc CRISPR spacer cttcatacccttcttcatgtcagcaagagcaatct--- Protospacer **.*********************.** ****
7. spacer 5.107|2269528|36|NZ_CP009170|CRT matches to MG018930 (Pseudomonas phage ventosus, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
ctccatacccttcttcatgtcagcgag---tatctcgcg CRISPR spacer cttcatacccttcttcatgtcagcaagagcaatctc--- Protospacer **.*********************.** *****
8. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KP670395 (Staphylococcus schleiferi strain 5909-02 plasmid p5909-02, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer ttttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer ***. ***************.***** **
9. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_019774 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tttaacattctccttaaattttttaaaagatt Protospacer *** .****.** ****************
10. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026078 (Staphylococcus aureus strain FDAARGOS_7 plasmid unnamed) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
11. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KM521836 (Staphylococcus epidermidis strain 12-00322 plasmid p12-00322, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
12. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KP890694 (Staphylococcus xylosus strain 378 plasmid pSX01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
13. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KR230047 (Staphylococcus epidermidis strain SP1 plasmid pSP01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
14. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT780704 (Staphylococcus aureus subsp. aureus RN4220 plasmid pRM27, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
15. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT780705 (Staphylococcus aureus subsp. aureus RN4220 plasmid pGO400, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
16. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KT373969 (Staphylococcus pseudintermedius strain HR547/11 plasmid pKM01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
17. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ922127 (Staphylococcus aureus strain 417 plasmid pLRSA417, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
18. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_KU882681 (Staphylococcus lugdunensis strain Tlug15G-4 plasmid pT15G-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
19. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030382 (Staphylococcus aureus strain ER03761.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
20. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030491 (Staphylococcus aureus strain ER02837.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
21. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030606 (Staphylococcus aureus strain ER02693.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
22. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_013653 (Staphylococcus aureus plasmid pPR9, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
23. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030388 (Staphylococcus aureus strain ER01062.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
24. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_007792 (Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
25. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030522 (Staphylococcus aureus strain ER01564.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
26. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_005054 (Staphylococcus aureus plasmid pLW043, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
27. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030554 (Staphylococcus aureus strain PS00003.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
28. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030614 (Staphylococcus aureus strain ER01560.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
29. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_013338 (Staphylococcus aureus plasmid SAP068A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
30. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030618 (Staphylococcus aureus strain ER04440.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
31. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030671 (Staphylococcus aureus strain ER00951.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
32. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_012547 (Staphylococcus aureus plasmid pGO1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
33. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_005024 (Staphylococcus aureus plasmid pSK41, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
34. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_013320 (Staphylococcus aureus plasmid SAP014A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
35. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_013339 (Staphylococcus aureus plasmid SAP069A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
36. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_013342 (Staphylococcus aureus plasmid SAP079A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
37. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_013343 (Staphylococcus aureus plasmid SAP080A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
38. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_013344 (Staphylococcus aureus plasmid SAP082A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
39. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030538 (Staphylococcus aureus strain ER02094.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
40. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030556 (Staphylococcus aureus strain ER03750.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
41. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030639 (Staphylococcus aureus strain ER04165.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
42. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030435 (Staphylococcus aureus strain ER00610.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
43. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048644 (Staphylococcus aureus strain SR153 plasmid pSR01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
44. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030526 (Staphylococcus aureus strain ER02703.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
45. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030600 (Staphylococcus aureus strain ER00658.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
46. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP017321 (Staphylococcus aureus strain MI plasmid pMI, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
47. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to AP012550 (Staphylococcus aureus plasmid pN315G DNA, complete sequence, strain: N315G) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
48. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026963 (Staphylococcus aureus strain FDAARGOS_6 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
49. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030429 (Staphylococcus aureus strain ER03760.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
50. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030648 (Staphylococcus aureus strain ER03556.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
51. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_020535 (Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
52. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030407 (Staphylococcus aureus strain PS00002.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
53. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030559 (Staphylococcus aureus strain ER01457.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
54. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030483 (Staphylococcus aureus strain ER03913.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
55. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040620 (Staphylococcus aureus strain J01 plasmid pJ01-01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
56. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_MH587578 (Staphylococcus aureus strain WG1647 plasmid pWBG615, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
57. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030591 (Staphylococcus aureus strain ER02989.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
58. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP030453 (Staphylococcus aureus strain PS00001.3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer tcttacaatctctttcaatttttcaaaagttt Protospacer *.*. ***************.***** **
59. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NC_017543 (Paenibacillus polymyxa M1 plasmid pPPM1a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tttctgtctctctttcaattttt-----taaaagatt CRISPR spacer tttctgtctctctttctctttttcctcctcaa----- Protospacer **************** ***** * **
60. spacer 4.29|1409794|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020540 (Sphingobium herbicidovorans strain MH plasmid pSHV1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
aagcgtggt---gcggggtgcccggagggtgcgaacgtgg CRISPR spacer ---cgtgccacggcggcgtgcccggaggatgcgaacgtgt Protospacer **** . **** ***********.**********
61. spacer 5.31|2270122|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to CP053327 (Salmonella enterica subsp. salamae serovar 58:c:z6 strain 2013K-0366 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
-gcggtgcggataaagggtttcccacgctggaaacctc CRISPR spacer ggctatgc-gataaagggttccccacgatggaaacaag Protospacer ** .*** ***********.****** *******
62. spacer 5.31|2270122|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030289 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gaminara str. SA20063285 plasmid pIncI1.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
-gcggtgcggataaagggtttcccacgctggaaacctc CRISPR spacer ggctatgc-gataaagggttccccacgatggaaacaag Protospacer ** .*** ***********.****** *******
63. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to MN032614 (Aeromonas phage PS1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer aagccttctctctttaaatgttttaaaagtta Protospacer *. ********* *** ********* *
64. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to MN698241 (Pelagibacter phage HTVC027P, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer catctgtctctctgttaattttttaggtaatc Protospacer . *********** *.*********.. .**.
65. spacer 1.1|92002|32|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to MN453779 (Aeromonas phage PS2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tttctgtctctctttcaattttttaaaagatt CRISPR spacer aagccttctctctttaaatgttttaaaagtta Protospacer *. ********* *** ********* *
66. spacer 4.30|1409861|35|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MH892361 (Streptococcus phage SW12, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aatttcaaggttatataagtcaaacagattatttg CRISPR spacer gatttcaagcttatatgagtcaaacaaaaaaagcc Protospacer .******** ******.*********.* * .
67. spacer 5.38|2270588|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to MF001355 (Proteus phage PM2, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aatatttaaaagagggtaaaaatgttata----tatgatg CRISPR spacer gtgatttaaaagaaggtaaaattgttataggaccat---- Protospacer . **********.******* ******* .**
68. spacer 5.38|2270588|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to KP890823 (Proteus phage vB_PmiM_Pm5461, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aatatttaaaagagggtaaaaatgttata----tatgatg CRISPR spacer gtgatttaaaagaaggtaaaattgttataggaccat---- Protospacer . **********.******* ******* .**
69. spacer 5.42|2270856|35|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP023206 (Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-1_lncX3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gatattaagaaaacggctgaagattactacatcgg CRISPR spacer aaaatgaagaaaaccgctgaagattacttgggtga Protospacer .* ** ******** ************* . .*.
70. spacer 5.76|2273131|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to LR135896 (uncultured phage genomic DNA containing rbcL region region) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tatagaagaatggattgaacagcattataaagattt CRISPR spacer tatagaagaatgggttgaacagtatttagcttggtt Protospacer *************.********.*** . . **
71. spacer 5.161|2273131|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR matches to LR135896 (uncultured phage genomic DNA containing rbcL region region) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tatagaagaatggattgaacagcattataaagatttg CRISPR spacer tatagaagaatgggttgaacagtatttagcttggttg Protospacer *************.********.*** . . ***
72. spacer 6.22|2346137|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448932 (Streptococcus phage Javan42, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
caaaaatacactcacaaaatcaccctttcaatatttt CRISPR spacer aaaaaatacactcaaaaaatgacccttgaggtctatc Protospacer ************* ***** ****** ..* * *.
73. spacer 6.22|2346137|37|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448669 (Streptococcus phage Javan11, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
caaaaatacactcacaaaatcaccctttcaatatttt CRISPR spacer aaaaaatacactcaaaaaatgacccttgaggtctatc Protospacer ************* ***** ****** ..* * *.
74. spacer 4.18|1409066|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT840185 (Bacteriophage sp. Joined_contig_19 genomic sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
cccgtccaggagggagtttattacatcgtctccctcc CRISPR spacer gaaccccaggaaggagtttattacatcgtatccgggt Protospacer .******.***************** *** .
75. spacer 5.38|2270588|36|NZ_CP009170|CRISPRCasFinder matches to MK295204 (Shigella phage vB_SdyM_006, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
aatatttaaaagagggtaaaaatgttatatatgatg CRISPR spacer gcgatttaaaagaaggtaaaattgttataggtccat Protospacer . **********.******* ******* .*
76. spacer 5.123|2270588|37|NZ_CP009170|CRT matches to MF001355 (Proteus phage PM2, partial genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aatatttaaaagagggtaaaaatgttatatatgatgg------ CRISPR spacer gtgatttaaaagaaggtaaaattgttata------ggaccatt Protospacer . **********.******* ******* **
77. spacer 5.123|2270588|37|NZ_CP009170|CRT matches to KP890823 (Proteus phage vB_PmiM_Pm5461, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aatatttaaaagagggtaaaaatgttatatatgatgg------ CRISPR spacer gtgatttaaaagaaggtaaaattgttata------ggaccatt Protospacer . **********.******* ******* **
78. spacer 4.6|1408267|37|NZ_CP009170|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KC699836 (Bacillus phage SIOphi, partial genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
cctgctgcgattttagcagcaatagacattctttgtt CRISPR spacer aacgctgcgatcttatcagcaatagacatagagttaa Protospacer .********.*** ************* *
79. spacer 5.123|2270588|37|NZ_CP009170|CRT matches to MK295204 (Shigella phage vB_SdyM_006, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
aatatttaaaagagggtaaaaatgttatatatgatgg CRISPR spacer gcgatttaaaagaaggtaaaattgttataggtccatt Protospacer . **********.******* ******* .*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
23041 : 31960
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009170|23041:31960|DBSCAN-SWA TATGAAGTTAAAAGGAGCGCAAGTAGTTATAGAAGTTTTAAAAGAGATGGGCGTTGATACTATATTTGGCATACCAGGAGGAGCAGTTATTCCCATTTATGATGCTCTTTATGACTCTGATATAAGGCATATTTTAGCTACTCACGAGCAAATGGCAGCCCATATGGCAGATGGTTATGCAAGAGTTACGGGAAGGGTAGGGGTTTGCTTTGCTACCTCTGGCCCCGGTTCTACCAATCTTGTAACGGGTATAGCTAATGCTTATATGGATTCAGTACCTGTTGTGGCGATAACAGGACAGGTTCCTACAAATCTCATAGGGAAAGACGCTTTTCAAGAGGTTGACATAACAGGAATTACAATGCCTATAACTAAACACAACTTTATTGTAAAGTCTCCTGATAAACTGGCAGATACAATAAGGCAGGCATTTGCAATAGCCAAAAGTGGAAGGCCTGGTCCTGTGTTAGTAGATATTCCAAAAGATATACAAAACGCCGATATAGAATATGTAAAAGGAATAGGAGATAGTATTGATATAAAAAACGATATCAATGGAGTAGTTTCGCAAAAAGAATTAGACAAAGCTATAGAGCTTATTTTGCAAAGTAAAAAACCTGTAATCTTTGCAGGAGGAGGAGTGATTTGGGGAGAAGCATCAGAGGAACTTATAGAATTTGCAGAGAAGACCAATATACCTGTTGCTACTTCTTTAATGGGGTTAGGATGCTTTCCAGAAGACCATCCTTTGTCATTAGGTCTTATTGGCATGCATGGAAGCAGATTTGCAAATTTGGCTGTGTATAAATCAGACCTTGTGATAGCAATAGGGACGAGATTTAGCGACAGAGTTGCTGGCAAAGCAGGGGGACTTGCTCCCAATGCTAAAATAATCCATATTGATATAGATCCTGCAGAATTAGGGAAAAATATAGAAGTAGATGTAGCAGTTATAGGCAAAGTTAAAGAAGCATTGAAACTTTTAACGGATAAACTTCCATTCATTGAAAGAAAAGAATGGTTAGAGGAAATTTCTTTCTTGAGAGAAAAGCACGGATTGAAGTATAAAAACGATGAAGTTTTGAGGCCTCAGTGGATAGTAGAAAAAATTCAACAGCTTTCAAACGATGACCTTATAATAGCCACTGAAGTGGGACAAAATCAAATGTGGGCTGCGCAGTATTATAAATTTAAACAGCCCAGGACTTTTGTTACCTCAGGAGGACTAGGGACAATGGGCTTTGGGCTTCCTGCTGCAATAGGTGCACAAGTGGGAAAGCCAGATAAAAGAGTTGTAAACATTGCAGGTGATGGAAGTTTAAGAATGAATATACATGCACTGGAAACTGCTGCTGTATATAATATTCCGGTTATAACGGTACTACTCAACAACCAAACTTTAGGAATGGTAAGACAGTGGCAAAATCTTTTGTATGACAAGAGATTTTCGCAGACAGATTTGAACGCAAATTTGAATTTTGCTAAGCTTGCAAATGACTTTGGAGTAGAAGGAATAAGAGTTACAACAAAGGAAGAATTCGAAAAAGCTTTTAGAAAAGCCTATAGCGAAAATAGACCTTTTATGATAGAATGTATTATAGACAAAGATGAGATGGTGCTTCCTTTTATTCCTGCAGGTGGTACTGTTGAAAATACAATTGGATAAAACCTTCGGGGATCGGTGAAATTCCGTACCGGCGGTATAGCCCGCGAGCCTTTTGGCAGACTCGGTGAAATTCCGAGGCCGACAGTTAAAGTCTGGATGGGAGAAGGAGAAATATTCCCCAGGGAATATATTCTCTGGGGTTTTTTAACCCTGAAGGTTTAACCTTCAGGATTTTTTAGTACAGGAGGGATTAAATTGGAAGAATATATGGAAAGGGCTTTAACACTGGCTGAAAAAGGATGGGGATACACAAACCCTAATCCGCTTGTGGGTGCTGTAATAGTTAAAAATGGCAAAATAATTGGTGAGGGTTATCATGAATATTTTGGAGGCCCACATGCTGAAGTAAATGCATTAAAAAATGCAGTTGAAGATGTTACAGGTTCTACTATGTTTGTAACACTTGAACCTTGTAGCCATTATGGCAAAACGCCTCCTTGTGTTGAAGAAATAATTAAATCTGGCATTAAGAGAGTATATATAGCGATGGAAGACCCAAATCCTAAAGTTAGCGGGAACGGTATAAAAAGGTTAAAAGAGGCGGGAATAGAAGTACATGTGGGGATGATGGAGAAAGAAGCGAGGAAACTCAACGAAATATTTGTTAAATATATTACGACAAAATTTCCCTTTGTGATATTAAAATCTGCTATGAGTATTGATGGTAAGATTGCTTGTTATAATGGAAATTCTAAATGGATTACAAATGAGAAATCAAGAAAATTTGCTCATAAAATAAGAGGACGTGTATCCGCGATTATGGTTGGGGTAAATACAGTAATTAAGGATAACCCAATGCTTACAACAAGGTTGGAGGGGTATAAAAATCCTGTAAGGATTATTGTGGATAGTAGAGGTAGAACGCCATTTGCCTCAAATGTAATAAGAGACAAAGCGGCAAAAACGATAATTGCTACAACAGAACTTATGCCAAACAGTGTAAAAAAGAAACTTGAAGGTATGGATATTGAAGTTATTATATTAAAAAACGACAATGGAAAAGTACCTTTAAAAGAGCTAATGATAAAACTTGGAGAGAGGGGGATTGATAGTGTATTGATTGAAGGCGGTGGGACATTAAATTGGTCTGCACTTAAAGAGGGAATTGTTGATAAAGTTATGTTTTTTATATCACCTAGAATAATAGGAGGAAAAAATGCTTTAACACCTGTAGAAGGTATAGGTTTTTCGGATATAGGAAATTCAATAGAATTAAAAGATGTGGAGATTGATAGAATAGATGATGATATACTAATAACAGCATATGTAAGAAAGTAGGTTATGGCGTATGTTTACTGGAATTATAGAAGAAACAGGAACTGTTAAAAATATTATACATGGTACTTTTACAAAAATTGTTATAAAATGTAGTAAAGTCCTTGAGGGAACAAAAATAGGTGATAGTATAGCAGTTAACGGTGTATGTTTAACTGTTACTAATATGTCAAACGAAAGTTTTGCAGCTGACGTTATGCCTGAAACCTTGAGAGCAAGCAATTTAAAAGATTTAAAAATTGGAAGCATTGTCAATCTGGAAAGAGCACTTCAAGTTGGAAGGAGAATGGGTGGGCATATCGTAACTGGTCATATAGATTGCGTTGGAAAAATCATAGACAAAAGGCAGGAAAAAAATGCTTTTATATTTAAGATAGCTATCAATAAAGAATTTACAAAATACATTGCCCGTAAGGGAAGTATTGCGGTTGATGGTATAAGTTTAACGGTTGTTGAGGATGGATATGATTATTTTACTGTTTCAGTTATTCCACATACAATGCTTAAGACCACATTGGGTTATAAAGGTGTAGGAGATAGTGTAAATATCGAAGTTGATATACTTTCTAAGTATGTAGAAAAACTAATAGGGAAAAAGGATATAAAAGATTTATTAAAAGAAAATGGATTTATATAGATGCTGATGACTTCTCTAAGTTAAGGAGGAAAGACCGATGTTTGATAGGATAGAAGATGCAATAGAAGATATAAAGCAAGGGAAAATGATTATTGTGGTAGATGATGAAAATAGGGAAAATGAAGGCGACTTAGTTATGGCAGCAGAAAAAGTTACAGGAGAACACATTAATTTTATGATAAAATATGGACGGGGTCTTGTATGTGTTCCAATGACAGAAAAAAGACTTAATGACCTTGGCATTTACCAAATGGTTGAGAATAACACTGACCATAAAGAAACTGCTTTTACTGTATCTGTAGATTATAAAGAATGTACCACTGGTATTTCTGCATTTGAAAGAGCACTGACGGTGAAGAAATTAGTAGATGATAATTCAAAGCCAGAAGATTTTACAAAGCCGGGACATATTTTTCCTTTAAGAGCCAAAGATGGTGGCGTCTTAGTAAGAGCAGGACATACAGAAGCAGCTGTAGACCTTGCAGTTCTTGCAGGACTCAAACCCGCTGGAGTAATATGCGAAATCATAAAAGACGATGGAAATATGGCAAGGTTGCCTGACCTTTTGGAGTTTGCAAAAAAATTTGGGTTGAGGATTATATCTATTGAAGATTTAATAGAGTACAGAATGAAAAATGAAATACTTGTGAGAAGGGTAGCACAGGCGAAACTTCCAACAAAACATGGGAATTTTGAAATTGTCGGGTATGAAGAAATATTAACAGGAAAACAGCATGTAGCTCTGATTAAAGGAGACATAAATAGGGACCCTGTACTTGTGAGGATACATTCTGAATGTCTTACAGGGGATATATTGGGGTCATTAAGATGTGACTGTGGTGACCAGCTTCATGCGGCAATGGAAAGAATAGGACAGGAAGGAGGAGTACTAGTCTATCTGAGACAGGAAGGAAGGGGTATAGGACTTTTAAACAAGATTAAGGCGTATCATTTGCAGGATCAAGGGTTTGATACTGTTGAAGCGAATATTAAGCTTGGTTTTCCACCTGATTTAAGAGAATACAGCATAGCTGCACAGATTTTGAAAGATATGGGGGTTAAAAAGATAAGGATTATGACAAATAATCCACAGAAAATTAGGGAATTATCAGAATGTGGACTTGAGGTTGTAGAAAGGGTTTCTATAGAAATTTGTCCAAATCATTATAATGAAAAATACCTCAAAACAAAAAAGGAAAAAATGGGACATCTAATTTTGGAAGTGTAAAATGCTACAAAGAAATAAATTGAATGTGATTATCAAGTATATAATGAAAGATTATTAATAAGGAGAGTGTATAGTTTATGAAAATATATGAAGGAAAACTTATAGCAGAAGGAAAGAAATTTGGAATTGTGGTAAGCAGATTCAATGAATTTATAACGAACAAACTTCTCGAAGGGGCACTTGATGCTTTAAAAAGGCATGGTGCTTTAAATGAAGACATTGAAATTGCGTGGGTACCTGGAGCATTTGAAATACCACTTATAGCTAAAAAGATGGCTGAATCTAAAAGATATGATGCAGTAATTGCACTTGGAGCAGTGATAAGAGGAGAGACACCCCATTTTGATTACGTTGCAAATGAGGTATCAAAAGGTATTGCAAAAGTATCACTTGACACAGATGTTCCGGTTATATTCGGCGTTCTTACCACAGATACAATTGAGCAAGCTATTGTAAGGGCGGGAACAAAAGGTGGGAATAAAGGTTTTGAGGCAGCCGTTACAGCAATAGAGATGGCAAATCTAATGGATGAAATAAAATAAGGGCAAAATGCCCTTATTTTATTTCCAAGGAGGGATAATTTCTGCTTTTTGAAGAGCTTTAAATACTACCACAAATACAGGTCCTATTATAAGTCCTAAAGCACCAAAAAGTTTTACACCTATAAACATAGATAAAAGCGTAACAAGAGGATGAAGTCCTATACTCTCACCTACGATCTTAGGCTCTATCATCTGCCTCACAACTACCACCAAGCCGTACAGTATTAAAAGATATATTCCTACCATGTAGTTTTTCATTATGATGTTATAAAGAGCCCATGGTATCATGACAGCACCAGAACCTAGTACGGGCAATGCATCTACAATGGTTACAAGAAGACCCAATAAAAATGGATAGTCAAAACCTATCATTGCAAGACCTATGGACACCTGTAAAAATGTTATAAGCATTATTGTGGCAGCTGCCCTAAGATAGCCGAAAAATGTCTTTAAAAGGTCTACCTGAATATTTTTTGCATGCTGTGCCCAATGAGATGGAATCTGCCTCTTTATAAAATCCAGTATAAGCTGCTTATCTTTGCTTATAAAAAAAGTAGCAACAAGTGTTATCAAAGTCATAAAAAAGAAATTGGGCAGTTTTGTCGCAAAATTCAAAAGCCATGTAGCGAGATTTTTTGCAAATAATGATATGTAGTTTAATATAGACTGCATATTGCTTTCAATAAGGGATGTGATATTTGGTGGCAATGATATGTAATACATTCTTATTCTGTCAACAAGATTTAAAATTATGTCATTAATAGTATTTGCATAATTTGTGCTTATTTCCGCAAGAGAACTTAGTTCATATATAAGTTGTGTTATTGATATTGCAATAAGTGATCCTATCACACCTATTAATATCAAAAGTAAAATAAAGGATGCTAATCCTCTCGGCACCTTTAATTTTTTCTCTAAGAAATTTACACCAGGATCGATTATCACAGAGAGAAGCAAAGCCACTACAAATGGCATCAAGAAAGGAATAATTTTAAATATGATTAAGTAAAATATAATAAAGACAGCAACAATGAGCAGTGTTTTTTTTATTATATCACCGTATCTCAATAGAAAATTATTCACCGTTTTGACCTCCTTCCTTTTTATTATAATATGAGAATTGATAAAAGTCTATCATTAAGAGTAATTGTTGACTGTAATAAAAAAATCCGCCGAAACGGATTTTTAAAGGGCGGTTTTTATTTTTGCTATTTCTTTTGATTTTTGCGCAAGTTCCTTTCGCGTTATGATTCCTTTTTCTACTAATAAATCTATTAGAGAAAGTAAAGCCAACAAGTTTTTGTACTCTGTATCTTTTATTTCTGCTAAATCTAAAAGATATTATATCTCTCTCATTTTACATCTCTCCCAAATAATTCTTTAATTTTATTATTGACATATATTAGAAAAATATGCAGAAGGGATAAAAAAATTAGAATTTGTTTGAAGTTTATGTTATAATATCACTGTACTTTTAAGTGAGGAGAGTAAATATGAGCAAAGATGTGCGAAGAGAAATATTAAGCTGGATACTGACTATAGCTCTTGCTTTTTTAATTGCAATGTTTATAAGAACTTATGTTTTTGAATTGGTGGATGTACCTACGGGTTCAATGTTAAATACTATTCATGTAAATGATAAATTCATTGTAAACAAATTTATATACAGGTTTGAACCTATAAGAAGAGGAGACATTGTCGTATTTCGCTTTCCCGACGACCCAAAAGTAAATTTTGTAAAGAGAGTTATAGGGATAGGTGGAGATGTGATTGAAATAAAAAATGGAGTTTTAATAAGAAATGGCAAGGTGGTGGAAGAGCCTTATATAAAAGAACCCATGAAAGGAAATTTTGGCCCTTATGTAGTTCCTCCCAATCATTATTTCATGTTGGGAGATAACAGAAACCAGTCTTTAGATAGTAGGTTTTGGAAACATAAATATGTATCTAAAGATCAGATTTTGGGAAAAATAGTTTTTAGAATTTGGCCTCCCGATCGTATAGGTTCTATGGAAGGAAAATAGACTATTGAAATTAATTTGGTTAAGTAGTATAATATTAGCCAAACATAATATTATTGCAATGAAGGGACGAGTAGTAAGTATAAACTTTTAAGAGAGCTGGTGGTGGGTGCGAACCAGTAAGTTTTACTTATGAATTCCATCCCGGAGCTAAGGTGTAATGACCTTCGGGCGACCGTTAAATCATGTGGAGGGCTTATTTTAAGCCGAAAGAGGGTGGCAACGCGGTATTCCCGTCCCTTTGTGGGATGGGAATTATTTTTTAGGGAGGTGTGTTAGATGTTAGATGTGAAGAGAATAAGAAGTAATCCAGAGGCTGTGAAGCAGGCTATTGAGCTTAAAAAAGAAAATGCAAATATTGATGAGTTTTTGGTATTAGATGAAAAAAGGCGAGAAATGCTTACAGAGTTAGAAGCTTTAAAAAATAAAAGGAATGTAGAGTCAGAAAACATTGCTAAACTAAAAAGAGAAGGTAAAGACGCAAGTAGGCTGATAGCTGAAATGAAAGAATTATCTGACAAAATCAAAGAGATGGAGCAACAGCTAAAAGAGGTAGAAGAGAAATTAGAACAAATTTTGTGGACAATCCCCAACATACCCCATGAAAGTGTGCCAATAGGCGACAGCGATGAAGATAATGTTGAAATAAGAAGATGGGGTGAACCGAGAAAATTTGACTTTGAACCAAAGCCTCATTGGGAAATAGGGGAAGAACTGGGTATTTTGGATTTTGAAACTGCTGCGAGAGTGACAGGTTCCAGATTTACTTTTTACAAAGGCCTTGGGGCTCGATTAGAAAGAGCGCTCATAAACTTTATGCTGGACTTACACATTGAAAAACACGGGTATACTGAAGTATTTCCTCCATTTATGGTACATAGAAGGAGCATGTTTGGTACAGGTCAGCTTCCTAAATTTGAAGAAGATGCTTTCAAAGTCTATGATACCGATTATTTCTTAGTACCTACTGCTGAAGTGCCGGTTACCAATATGTACAGAGATACAATAATAGATGGAGATAAACTTCCAATATATCATTGTGCTTATAGCGCATGTTTCAGACAAGAAGCAGGTTCTGCAGGAAGAGATACGAGAGGCCTTATAAGGCAGCACCAGTTCAATAAAGTTGAGCTTGTCAAATTTACAGAACCAGACAAGTCTTACGAAGAATTAGAAAAAATGACTAAAGATGCTGAAGAAGTCTTACAGGCGTTGGGCCTTCCTTACAGAGTAGTAGCTATATGCACAGGAGATTTAGGCTTTACTGCTTCTAAAAAATACGATATAGAAGTGTGGATGCCAAGCTATGGACGATATGTAGAAGTTTCTTCTTGTAGCAATTGTGAAGACTTTCAGGCGAGAAGAGCCAACATAAAATACAGGCCTAAAGATGGAGGAAAAGCACAATATGTCCATACTTTAAATGGTTCTGGAGTTGCTGTAGGAAGGACTTTTGCTGCAATATTAGAAAACTATCAGCAAAAAGATGGTTCAGTTGTCATACCGGAAGTTTTAAGACCTTACATGAGAGTAGATGTTATAAAGAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009170|23041:31960|24901_25984_+|WP_049684256.1|DBSCAN-SWA MEEYMERALTLAEKGWGYTNPNPLVGAVIVKNGKIIGEGYHEYFGGPHAEVNALKNAVEDVTGSTMFVTLEPCSHYGKTPPCVEEIIKSGIKRVYIAMEDPNPKVSGNGIKRLKEAGIEVHVGMMEKEARKLNEIFVKYITTKFPFVILKSAMSIDGKIACYNGNSKWITNEKSRKFAHKIRGRVSAIMVGVNTVIKDNPMLTTRLEGYKNPVRIIVDSRGRTPFASNVIRDKAAKTIIATTELMPNSVKKKLEGMDIEVIILKNDNGKVPLKELMIKLGERGIDSVLIEGGGTLNWSALKEGIVDKVMFFISPRIIGGKNALTPVEGIGFSDIGNSIELKDVEIDRIDDDILITAYVRK >NZ_CP009170|23041:31960|29881_30412_+|WP_049684261.1|DBSCAN-SWA MSKDVRREILSWILTIALAFLIAMFIRTYVFELVDVPTGSMLNTIHVNDKFIVNKFIYRFEPIRRGDIVVFRFPDDPKVNFVKRVIGIGGDVIEIKNGVLIRNGKVVEEPYIKEPMKGNFGPYVVPPNHYFMLGDNRNQSLDSRFWKHKYVSKDQILGKIVFRIWPPDRIGSMEGK >NZ_CP009170|23041:31960|28406_29471_-|WP_049684260.1|DBSCAN-SWA MNNFLLRYGDIIKKTLLIVAVFIIFYLIIFKIIPFLMPFVVALLLSVIIDPGVNFLEKKLKVPRGLASFILLLILIGVIGSLIAISITQLIYELSSLAEISTNYANTINDIILNLVDRIRMYYISLPPNITSLIESNMQSILNYISLFAKNLATWLLNFATKLPNFFFMTLITLVATFFISKDKQLILDFIKRQIPSHWAQHAKNIQVDLLKTFFGYLRAAATIMLITFLQVSIGLAMIGFDYPFLLGLLVTIVDALPVLGSGAVMIPWALYNIIMKNYMVGIYLLILYGLVVVVRQMIEPKIVGESIGLHPLVTLLSMFIGVKLFGALGLIIGPVFVVVFKALQKAEIIPPWK >NZ_CP009170|23041:31960|23041_24706_+|WP_049684255.1|DBSCAN-SWA MKLKGAQVVIEVLKEMGVDTIFGIPGGAVIPIYDALYDSDIRHILATHEQMAAHMADGYARVTGRVGVCFATSGPGSTNLVTGIANAYMDSVPVVAITGQVPTNLIGKDAFQEVDITGITMPITKHNFIVKSPDKLADTIRQAFAIAKSGRPGPVLVDIPKDIQNADIEYVKGIGDSIDIKNDINGVVSQKELDKAIELILQSKKPVIFAGGGVIWGEASEELIEFAEKTNIPVATSLMGLGCFPEDHPLSLGLIGMHGSRFANLAVYKSDLVIAIGTRFSDRVAGKAGGLAPNAKIIHIDIDPAELGKNIEVDVAVIGKVKEALKLLTDKLPFIERKEWLEEISFLREKHGLKYKNDEVLRPQWIVEKIQQLSNDDLIIATEVGQNQMWAAQYYKFKQPRTFVTSGGLGTMGFGLPAAIGAQVGKPDKRVVNIAGDGSLRMNIHALETAAVYNIPVITVLLNNQTLGMVRQWQNLLYDKRFSQTDLNANLNFAKLANDFGVEGIRVTTKEEFEKAFRKAYSENRPFMIECIIDKDEMVLPFIPAGGTVENTIG >NZ_CP009170|23041:31960|27923_28388_+|WP_049684259.1|DBSCAN-SWA MKIYEGKLIAEGKKFGIVVSRFNEFITNKLLEGALDALKRHGALNEDIEIAWVPGAFEIPLIAKKMAESKRYDAVIALGAVIRGETPHFDYVANEVSKGIAKVSLDTDVPVIFGVLTTDTIEQAIVRAGTKGGNKGFEAAVTAIEMANLMDEIK >NZ_CP009170|23041:31960|30688_31960_+|WP_049684262.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDVKRIRSNPEAVKQAIELKKENANIDEFLVLDEKRREMLTELEALKNKRNVESENIAKLKREGKDASRLIAEMKELSDKIKEMEQQLKEVEEKLEQILWTIPNIPHESVPIGDSDEDNVEIRRWGEPRKFDFEPKPHWEIGEELGILDFETAARVTGSRFTFYKGLGARLERALINFMLDLHIEKHGYTEVFPPFMVHRRSMFGTGQLPKFEEDAFKVYDTDYFLVPTAEVPVTNMYRDTIIDGDKLPIYHCAYSACFRQEAGSAGRDTRGLIRQHQFNKVELVKFTEPDKSYEELEKMTKDAEEVLQALGLPYRVVAICTGDLGFTASKKYDIEVWMPSYGRYVEVSSCSNCEDFQARRANIKYRPKDGGKAQYVHTLNGSGVAVGRTFAAILENYQQKDGSVVIPEVLRPYMRVDVIKK >NZ_CP009170|23041:31960|25994_26618_+|WP_049684257.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEETGTVKNIIHGTFTKIVIKCSKVLEGTKIGDSIAVNGVCLTVTNMSNESFAADVMPETLRASNLKDLKIGSIVNLERALQVGRRMGGHIVTGHIDCVGKIIDKRQEKNAFIFKIAINKEFTKYIARKGSIAVDGISLTVVEDGYDYFTVSVIPHTMLKTTLGYKGVGDSVNIEVDILSKYVEKLIGKKDIKDLLKENGFI >NZ_CP009170|23041:31960|26655_27846_+|WP_049684258.1|DBSCAN-SWA MFDRIEDAIEDIKQGKMIIVVDDENRENEGDLVMAAEKVTGEHINFMIKYGRGLVCVPMTEKRLNDLGIYQMVENNTDHKETAFTVSVDYKECTTGISAFERALTVKKLVDDNSKPEDFTKPGHIFPLRAKDGGVLVRAGHTEAAVDLAVLAGLKPAGVICEIIKDDGNMARLPDLLEFAKKFGLRIISIEDLIEYRMKNEILVRRVAQAKLPTKHGNFEIVGYEEILTGKQHVALIKGDINRDPVLVRIHSECLTGDILGSLRCDCGDQLHAAMERIGQEGGVLVYLRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDQGFDTVEANIKLGFPPDLREYSIAAQILKDMGVKKIRIMTNNPQKIRELSECGLEVVERVSIEICPNHYNEKYLKTKKEKMGHLILEV |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
349498 : 401005
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009170|349498:401005|DBSCAN-SWA ATTAATACCTATCTCTAAGGAAGAACCTATTTAACAACACACCACTGATAAATCCTCCTATATGCGCCCACCAGGCTATTCCACCAACCGTTGTACCACCAATGACAGAGTAGACCGTGCCGGAATAGAGCTGGGTCAGGAACCATAGGAAGAGATAGACTACGGCGGGTATCGGGAGAAAGACTGGAACCAGGAAAAAGGTTGGTACCAGGGTGATTATCCTTGCCGACGGGAATAATACGAAATATGCACCCATAATGCCTGCAATAGCTCCAGAAGCTCCTACCACCGGCACTGGTGAGATGGGGTTAAAAACCAGGTGAAATACACCTGCGATTACCCCACTAAGGAGGTAGAAAATGAGGAATCTTATATGGCCCATCCTATCTTCAACATTATCTCCAAAAAGCCACAATATCCACATGTTGCTAATTAAGTGAAATATGTTACCATGAAGAAACATACTGGTGATAAAAGGGTATAAGTCGCTGCCGGAAAGCGGTACACCGGATATAATCAGTTTTGTAATTTTTGCCGGTATAAGCCCGTATTTGTAAACAAATGCAGCAAAAGTGCTGTATGAAGCACTTGAAAGAGTGAAAAATATGAGCGAATTTATTATTATGAGCAGAAGCGTAATGAGGGGTGGTCGTCTGCTCGGTATATTATCCCTGATTGGAAACATCTTTAACCCTCCACTTTTTTATTCTACCTTTGCAGGAAAACCGAGTTCCGTATCAAATCAAAATTATATTAAGATTATAGCACAAGTAATTCTAAAAAAATAATATTATCATGATTAAGTAAATTTATTAACTACCAGGGAAAGAGGAGGTTATTCTCCTCAATTTTTATTTCTAATTGTAAAATATTAGGCGAAAAATGCATTTTCGTTCCCAAAAATGACACTTTCGTTCCAAATTTCACAAATTTTATTTTAAATATTTTATAATATTTAAAAAGCCCTTTAAATTTCTGGGGGTATAAAAAGTGAATTTTTTATGTTCACAGGAGGAACTAATTTCTTCATATGAGCGATGTAGGAAAATTGGTATTGAACCTTCAATAACTCTGCCATTAGTGATATTAAATCCAGAAGATTTGCAAAAGAAAATACATAAAAATAAAGAACTCATAGAAGCTTTTCGTATGAGTATAGAAGAGAATTGGGTAAAAGGTGAGTATCTATTTTTGCTTACTGACATTGAAGGATATTTATTGGATGTAAAATGCAGCACAAAAGAGAAAAAGTGTATAAAAGATTCAGGCTTTGAACGGGGAGTATCCTTTAGAGAAGAAAGCTGTGGGACAAATGCGATTTCAATGGCAATGCGATTAAAACGAATAGTTTACATAAGACCTCAGGAGCACTACTGTGACATATTCAAAAAATGGCACTGCATTACTTCACCTATAATAGTAGAAAATGGGGAAATAGTAGGCTATGTGGATATATAAACTATTGATAAAAAAATTGCAGATGAAGTATCAATGGTAATAAAACTGCTAGCTGAGAAAATAGCAACTGAGTATGAAAAGAGAATAAAAGAAAAAGAGGTAAATGAGATAAAGATAAAATTAAATGACAGCCAGATAAAAATACTGGAATTAGAGGCAAAGGGATACAGAGAATTAGACATAGCAGAAGTTCTTGGGATAGAAGTTGTGACTGTGAAGTATCACAAGAGAAAGATAGTAGAAAAACTTGGAGTAAAAAATATCAAAGAAGCAGTAGCAAAAGCGATTAAGTTAAACTTGATAGATATAGACTAAAATTTGGGGCTATACTTTAGTATAGTTTTTTTGTTCATTTATGTAAACATTAACTGGAAATGTAATAAAGACTATACCAAAGTATAGTAGACATTGAGAAAAATGTATATTATAATAGCTGTAGAAAAGTTTGGTAGATTAGGAGGGATATAAACAATAATATGTTTTTTAATAGGGGTAGAATCCATAGAGACAAACTCACTGAAGATAACGCCCATATTTTTGAGGATATTGACCTGGTTTTGAAAGATAGAGGTCAAATAATCATGAGAGAACTCATTAATAAAAAGGCGGAAAGTCCGATAAGAAGGAAGAGGTTTAAGGATGTTAAAGCCACAAAGATGAGCAATGATAAGATTATTGCGGAGATAATCTAAAAGGTCAGAAATTGTACCGAATCTTAAAGCTTAATAACAATAAAAGTTCTAAACATTGCATGATGAGAATAACCCTTACGGCTAGGGCTAGAGGAAGGGAATTCAGGTATTGAAGACAAGCCTAGATTTTTAAACATAGAAAAATAGAAATTAATTTTAGACTAAGAAGTAAAGAGTTCAGCTATATTTAAAAGTAATTGAAGCTTATACATGTAGGATTTCCTTCTTCTTAAAAAATTTTTTTATAGTGTATATATAATAATTCGACAAATGGGAGGGGAAATCCTACATAAAAGATAAAAAATTCAAGAGTGATAGGAAAAAAGTATGTCTGTAGAATGGTTTAAATGAAGGCTTCTGAATTTTGCACAAGTCTAATATCAGAAAGGATAGGAGGTGAGAAAATGACATATGTAAAACCCACGATTCAAACACTAGGTTTTAATAATATTAATTTAAACAAGATGATGGAATTTACGGGGAACTGGTCATATATTTTATTACCAAATATAGTAATCGTCCAAACTTATGCTATAACACTAACTCTATATAGCTATGAATGAGATTTTCAATCATAATATATAATTTAGCATAAAGTTTGTAATAATTTCTATTTCTTGATAATTTGGATGACATAAGAGATAAAAAATAAAAATATGTTATTAATTTTATCGTAAATATGATGCAAAAAATTAACCTTACCGATCAAAAGTTGAGTTTAAGTATTCCTTTTAATAGCTTGTTTGCCTCAATGTATCACTTAAATGCGTTATGAAGTATCACTAATATAGTTATAATATGATAATATGAAATACGATTTGTTAAATTGTAAAAATAGAAACGAGAATTAAAGTAGCTTATAAGTGAAAAGTAAGAGAATATAGGAATGTGATTTTAGAATTAGATGGAAATGAACAACTACCAAAAAATTTATTTAATAGAGGGAGTAGCGTAGGATAAAGGGGGGAAAGATAATGTTTTTAACTAAGGAGAAAATAAATCCACATTTTGTAAAAATTTTAAATGTTACGCCTATTTTTTGTGAATCAAATTTGATTTTTTGGCGTGAGGAAAATGCAGGATATTATACAGTTATTCCTAAAAATTTCCCTTTTATAAACTATTTAATTATAAATCCAACAGGTAAAAAAATTTTAGATCTTTGTAATGGTGAAAATACACTTCAAAAAATATGTAATGAATTGATAAATTTATATCCCGAGGTACCTAAGGAGGAAATTACCAAAGATATTGCTGAAATATTATTTGATTTTTCACGATGTAATTTAATACAGTGGAAAGGGGGGAATAATCCATTTATGTACATTAATGAAAAGAAATTAGACAACGGTGATATTATAAGTACTGCTTTAGAGAATGAACTAAAAGAAATTTGTCAATATTTTGAGAGCATTCTTGCAAATTATAAACAACAAAAAGGTAGGTTGACTTATATTAATCCAATAATTCAACCTAATGATTATTTGAGCGAATTAATATTGCGCCAAAAATTATTTAATTATTCTGAGGAATTTTTCTTGTTAAAAGAGAATAATAAAATTAATGGCATTATTACATTGCTCATACCAGTTGAGAAATATTCTACTGTAGCAACAATAGGTGTTATGGATGTAAATAGAGAATACCTAACATCTATGATTGACTATATAGTAGAAGTTATTCCTCATATAGCAGTAAAGGAAATAACGAAAATCGAATTACAATTATTAAAAGACGCAAATATAACCCAATTGATAGAAAACTTGATAAAAAATACTGGATTTATAAATGAAGGCACATTAAAACATGAATTAGGGGAAAAAGACTTGTGCATTTATTCATATTTTTTAGTATAACTTTTCCTAATTATTTTTCAATATATCTTTTACTTTATTATTTAGAAAGGAGTAAATAAATAATCATGGAAGAGCAAAGTATGTCAATTAACTATGCTGAAGTCTTGAAAGGGCCGCATCAATTAGCATTTGATATAACTAACAAATGTAATTTTAGGTGTCTTCATTGTTATAACTCAAGTGGCGAAAATATAGTTGTAAATAACGAATTAACTGATGAGGAAGTTATAAATTTCATAAAAGAAATAGGGGAGATGAAATTATTTAATGTATGTTTTCGCGGTGGAGAACCATTAATTAGAAAAGAATTAATTTATAAATGCGCTAAACTATTAATTGAAGCAGGGACAACCTATGTGTCACTGGTAACTAATGGTTATTTGATGACAGAAGATATAGCTTATCAATTGAAAAAAAGTGGTATTGACCGCATACAAATAAGTATTGATGGAGCGTGCCCTACCACTCATGATAAGTTGAGAAATAAAAAAGGTGCTTTTGATAAAGCTATTAAAGCTATTAAAATATTAAAAAATGTAGGAATATCAAATATTGATGTATCATTTTGTCCAACATCTTTTAATATTGCTGAATTTGATGAAGTACATAGTTTATTAAATGAGTTGGGAATAAAAGAGTTACGGGTACAACCGCTAATGCTATTAGGAAGAGCAAATCAGCATTTAAATAAAATAATGCCTACACAATTTCAGTATAGGCAATTAGTAAAGCGTATACATGCTATAAATTTAAGAGGAAAGAACCCAATAGTCGAATGGGGAGATCCTGTTGACCATTTAATAAGATTTAGAACTATAGCTGCAAATTGTGTTAGCTATGTTTCTATTAGGGCAAACGGCGATATTGTAGCATCTCCTTATCTTCCTTTAGTAGTTGGAAACATTCGAAAATATAAATTTAGTGAATATTGGAAAGCAGGTCTTGTAACACTTTGGCAAAATGAATTGCCAAAAAAAAATGGCACAAAATATAC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49 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
551340 : 565761
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009170|551340:565761|DBSCAN-SWA 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12 | Synechococcus_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
753399 : 764513
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009170|753399:764513|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009170|753399:764513|753399_754902_+|WP_049684799.1|transposase|DBSCAN-SWA MLSKKQDARHQIEFVSIDQLVPKDHLLRKIERVIDFSFIYDLVKEKYSEDHGRPSIDPVVLIKILFIQYLFGIPSMRRTIAEIKTNVAYRWFLGYGLTEEIPHFSTFSQNYIRRFKGTDIFEKIFTKILEEAIKHGLVNAEEVFIDSTHVKASANKKKYTKEIVEKEARTYQEKLEEEINKDREAHGKKPLKKIKKIKTKEVKVSKTDPDSGMLNKNGKEKIFAYSFHTACDKNGFVLGVKVEAANVHDSVMFQEVLEEVEKRVRKPKAIAVDAGYKNPYILKTIFDRQIIPSVPYTRPKTKDGFMKKHEFVYDEYYDCYICPQNEILTYVTTNREGYREYKSNPEKCKNCPLREKCTQSKDYTKRIFRHIWEGYVEEAEHLRHTPYCKEVYERRKETIERVFADLKEKHGLRWTTLRGKEKLSMQAMLVFAAMNLKKMALWLWRKGKGPFDISKLYSLFGVLKKILSRYIQPLLSVLRKQGLKFCFVNKLKDREKILYL >NZ_CP009170|753399:764513|757852_758080_+|WP_049684801.1|DBSCAN-SWA MKEKASKLLIIITGFVISACGLLNLIILSDSSKKIFLIVGPLLIVCGIIAIIFGFNILKKGNSRRVLEKFHQIGG >NZ_CP009170|753399:764513|764309_764513_+|WP_049684810.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MNTIKEEELLTINGGDNGFFSKVGFVAGYLTYYLMKGASYTQPSAFEIMKKSREKERNKELLLQGLV >NZ_CP009170|753399:764513|759599_759830_+|WP_049684803.1|DBSCAN-SWA MLGSEKERFFERRYKMDSEFKVLNETELRDVNGGGILYYIGYAVGYIGGMIFNAPIDYPPASMSSNTVWGSVFNQN >NZ_CP009170|753399:764513|758757_758907_+|WP_173402326.1|DBSCAN-SWA MDGVNFLMEKLNKFPVIKVSLLFIIVTLVVLSGIKIGEIVGKFVYYLLH >NZ_CP009170|753399:764513|758486_758666_+|WP_003870880.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MELMNVVGFNEISENELYDINGGIAPVVIAGIIVGGAFVIGLGIGAYVGYKEAERADRK >NZ_CP009170|753399:764513|761717_761993_+|WP_049684805.1|DBSCAN-SWA MEVALSMNEFMELTEEDLMVVDGGGPMLAAYPVDWKGLYNEVVGGFLGGAAGAIATGNIEKALVSGIGGAVAGGVKYYVKNPWPTYFFMIY >NZ_CP009170|753399:764513|763030_763300_+|WP_049684807.1|DBSCAN-SWA MEAVIPMNEFMELTEDDLIVVDGGVDWAAVAAGTGIVLGAAGLAVSAGLAFIPVAVILGAGTAGEIALAGLTVAASGIGGATIGYGFSH >NZ_CP009170|753399:764513|764062_764230_+|WP_148307279.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MLYLTEDELQKINGGNPWETLGKLGTLIGIIDAVYDFGKGFVDGFKAAYARDRDK >NZ_CP009170|753399:764513|760093_760870_+|WP_049684804.1|protease|DBSCAN-SWA MNKDNQIFENIIIYLGIYFLCSLLIAGILMVFIGNIDFNIMTLLSSILTIVCLFLLFKNRNISLYRYCSFKKIKFSELILLIFMGLIFNMVLEIMNFTLELYKHFPDYYKYQDFYNKIGNYKVNFLTVFLSVVIIAPIVEEIIFRGLIFNELRKELSIYTAIIIQSAIFAIIHGSLYQGFYAFLLGIFLSVMYYLTGSIWAPIIIHISSNLIGLLGGLFDNIIHNMNKIESTFYFFLGCILLIITIKFFYSQRKKCYM >NZ_CP009170|753399:764513|763373_763703_+|WP_049684808.1|DBSCAN-SWA MGSKKMEKLLFFLTFLISIIAVLSSLIFLMNLLVSGNIANTNIIVVIALIFDPCVILILNYIVYTKNYKYSPLKQPDEVKEKIIIGFIWAISIVVLLTIVLAIITNLSF >NZ_CP009170|753399:764513|759430_759613_+|WP_049684802.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MEAVLPMNGFMELTEEDLMMIDGGKGFLHGAGFWIGLIDMAIDFGNGVVDGFKDGLNAWK |
12 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2106233 : 2149568
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009170|2106233:2149568|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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