Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009681 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain Gv69 chromosome, complete genome | 10 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,cas3,WYL | 10 | 4 | 15 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009681_1 | 476229-476307 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009681_1
>1.1|476252|33|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder CAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAGGTTGG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_1 >merge|NZ_CP009681|1|476229-476307|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATT >NZ_CP009681|1|1|476229-476307|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAGAATTT CAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAGGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAGAAATT
>NZ_CP009681.1|WP_000999713.1|475021_476008_-|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP009681.1|WP_001549145.1|474177_474591_+|hypothetical-protein MKPTKVILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDCDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >NZ_CP009681.1|WP_001790257.1|474038_474149_+|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP009681.1|WP_000544969.1|473221_473953_+|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP009681.1|WP_020444755.1|471906_473220_+|Mur-ligase-family-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHVHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVKVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP009681.1|WP_000949467.1|471114_471615_-|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_CP009681.1|WP_001790679.1|470940_471033_+|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NZ_CP009681.1|WP_000613733.1|470171_470726_-|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKIHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NZ_CP009681.1|WP_000140176.1|469033_470104_+|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_CP009681.1|WP_000548781.1|468256_468787_+|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >NZ_CP009681.1|WP_000636142.1|476479_477238_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP009681.1|WP_001110179.1|477454_477841_+|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP009681.1|WP_000149064.1|477855_478557_+|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_CP009681.1|WP_078102467.1|478553_479237_+|histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVMY >NZ_CP009681.1|WP_158500234.1|479246_479597_+|hypothetical-protein MPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_CP009681.1|WP_000153530.1|479586_480216_+|response-regulator-transcription-factor MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMDDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_CP009681.1|WP_000037075.1|480331_481549_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP009681.1|WP_000428172.1|481826_482102_-|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP009681.1|WP_000228666.1|482108_482573_-|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP009681.1|WP_000195429.1|482846_484019_+|IS256-like-element-IS256-family-transposase MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009681_2 | 1353477-1353562 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009681_2
>2.1|1353507|26|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_2 >merge|NZ_CP009681|2|1353477-1353562|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NZ_CP009681|2|2|1353477-1353562|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NZ_CP009681.1|WP_020444705.1|1352584_1353301_+|superantigen-like-protein-SSL12 MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENLNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP009681.1|WP_001063559.1|1351751_1352477_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP009681.1|WP_000739523.1|1350931_1351657_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN >NZ_CP009681.1|WP_000793605.1|1349492_1350494_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP009681.1|WP_001074342.1|1348537_1349470_-|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP009681.1|WP_078102483.1|1346809_1348300_-|YfcC-family-protein MFLFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGDIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKNDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGVLITQVLIYS >NZ_CP009681.1|WP_000149423.1|1346274_1346502_-|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NZ_CP009681.1|WP_001239288.1|1345022_1345970_+|TDT-family-transporter MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMIKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLKNVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIIFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPDIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKEKQDKFLRNASQ >NZ_CP009681.1|WP_001245802.1|1344585_1344774_-|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANSIFSNEN >NZ_CP009681.1|WP_000398672.1|1343540_1343675_-|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF >NZ_CP009681.1|WP_001802045.1|1353801_1354026_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP009681.1|WP_000765708.1|1353982_1354129_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP009681.1|WP_000848124.1|1354801_1355761_+|beta-channel-forming-cytolysin MKTHIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP009681.1|WP_000231632.1|1356237_1356471_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NZ_CP009681.1|WP_042857073.1|1357092_1357281_+|hypothetical-protein MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLYFYLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP009681.1|WP_000669537.1|1358102_1358453_-|complement-inhibitor-SCIN-B MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >NZ_CP009681.1|WP_000791587.1|1358606_1359104_-|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NZ_CP009681.1|WP_000584398.1|1359362_1359869_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP009681.1|WP_000739563.1|1360540_1360942_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY >NZ_CP009681.1|WP_001791789.1|1360901_1360994_+|hypothetical-protein MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009681_3 | 1357487-1357739 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_3
|
4 spacers
spacers of NZ_CP009681_3
>3.1|1357514|30|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder CATTTTTGTTAAGCTGACTTTTCGCCAGCT >3.2|1357571|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder TTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTC >3.3|1357514|36|NZ_CP009681|CRT CATTTTTGTTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATA >3.4|1357571|35|NZ_CP009681|CRT TTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG >3.5|1357627|36|NZ_CP009681|CRT CATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGT >3.6|1357684|35|NZ_CP009681|CRT TTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_3
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_3 >merge|NZ_CP009681|3|1357487-1357739|CRISPRCasFinder,CRT TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATATTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA >NZ_CP009681|3|3|1357487-1357626|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTTTTGTTAAGCTGACTTTTCGCCAGCT TCTATATTGGGGCCCCGCCAACTTGCA TTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTC TCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA >NZ_CP009681|3|1|1357493-1357739|CRT TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTTTTGTTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATA TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA TTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGT TGGGCCCCACCCCAACTTGCA TTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA
>NZ_CP009681.1|WP_042857073.1|1357092_1357281_+|hypothetical-protein MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLYFYLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP009681.1|WP_000231632.1|1356237_1356471_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NZ_CP009681.1|WP_000848124.1|1354801_1355761_+|beta-channel-forming-cytolysin MKTHIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP009681.1|WP_000765708.1|1353982_1354129_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP009681.1|WP_001802045.1|1353801_1354026_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP009681.1|WP_020444705.1|1352584_1353301_+|superantigen-like-protein-SSL12 MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENLNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP009681.1|WP_001063559.1|1351751_1352477_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP009681.1|WP_000739523.1|1350931_1351657_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN >NZ_CP009681.1|WP_000793605.1|1349492_1350494_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP009681.1|WP_001074342.1|1348537_1349470_-|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP009681.1|WP_000669537.1|1358102_1358453_-|complement-inhibitor-SCIN-B MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >NZ_CP009681.1|WP_000791587.1|1358606_1359104_-|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NZ_CP009681.1|WP_000584398.1|1359362_1359869_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP009681.1|WP_000739563.1|1360540_1360942_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY >NZ_CP009681.1|WP_001791789.1|1360901_1360994_+|hypothetical-protein MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC >NZ_CP009681.1|WP_000739209.1|1361310_1361640_-|complement-convertase-inhibitor-Ecb MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNFFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NZ_CP009681.1|WP_001803346.1|1361833_1362001_-|hypothetical-protein MKRIVILENVIVDNPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVKKFEILVKIMNRIHI >NZ_CP009681.1|WP_000049484.1|1362128_1362632_-|metallophosphoesterase MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF >NZ_CP009681.1|WP_000659317.1|1362624_1363212_-|XTP/dITP-diphosphatase MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGDKNV >NZ_CP009681.1|WP_001039659.1|1363223_1364024_-|glutamate-racemase MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009681_4 | 1680623-1680704 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009681_4
>4.1|1680647|34|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_4
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_4 >merge|NZ_CP009681|4|1680623-1680704|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >NZ_CP009681|4|4|1680623-1680704|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>NZ_CP009681.1|WP_001018962.1|1679679_1680066_-|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP009681.1|WP_001065801.1|1679390_1679687_-|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP009681.1|WP_000571218.1|1678115_1679141_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP009681.1|WP_000520233.1|1677427_1678123_-|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP009681.1|WP_000732326.1|1676588_1677410_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP009681.1|WP_001637664.1|1673821_1675210_+|SAP-domain-containing-protein MKKIFYCFLLIFSILMIFGGINEVTQNKLTFIDIFMFAIFISLIVFSIVKLFKHNHLDYKSNKSNTNHKNISNSKTTQFNTVQSNDHIRKNNITHDIETNNTKKVKQVKSITNNKTNTLNKDQVKLNENVQENNQDLVIDVKDDNNNNYHYDLNANDILILHLNKNREVGKEVKNHFYLLENQINVDEILNKLINLDYLDIKSNFDVSLFYLKVPELKEILREYKLKLSGNKPELIERIKTNIDENAIKLPQVYVPTSKGNKIIGETEYILHFYNSPIISLGSAHKMAKEVLNIDDKIEYIYFYLLQQNQKSNNSDHRTANIINSLVLYYKKTNKDKDVIRKYTNYATYLSVTQGIHSAAFLYSSEENIIDRLFIYFNYHLEYYENMLFIDNVSRRLFKNLFYEDIKSFEDTDKNFCDEICELLFAQIYNNRNITLNNLPTINYVLEKIKKENEIRMTKYDF >NZ_CP009681.1|WP_001186979.1|1673222_1673795_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQQNSLEDFSNILKNFRKEEDLTLDTLSKYLGVSDVYVSKLENGKRFPSKNILFWYVLFMDQSQMHDDIEKLLTIFSENKKIRYEQLRTEYDEFVKKFREKQKKHSSKIQRKEIKLTMNEFNQYQIEEIDEPYFDLKWLLNQSEYKLFYSGIDNKNSLGFNEVLSESDKKMLSEIVNSVIQRIYNDENQK >NZ_CP009681.1|WP_000560872.1|1672829_1673051_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIAKVNYLKRLIAFEGLSLKDFASEIEVNSNFLNSIVNGKRTTSPKTANKIAKRLNVDIKDIFIFIEEKEEVK >NZ_CP009681.1|WP_000124597.1|1672556_1672829_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MARTKLKDIPTKENTISEPKQVVVKPLFAKPNALASIFGISYSSTNRILKEWEKDPKGVDDLYYSLSSTMTVISIPRFEEYMKKRHKKWM >NZ_CP009681.1|WP_000784891.1|1672389_1672545_-|hypothetical-protein MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENK >NZ_CP009681.1|WP_000932216.1|1680807_1681686_-|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP009681.1|WP_000660172.1|1681687_1681801_-|hypothetical-protein MKEKLLGTIIWSIATFYYSRMMEIMNLAILKIKIGGS >NZ_CP009681.1|WP_000290485.1|1681864_1682245_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE >NZ_CP009681.1|WP_000589549.1|1682402_1682759_-|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP009681.1|WP_001190695.1|1682902_1683223_+|thioredoxin-family-protein MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP009681.1|WP_000422909.1|1683372_1683912_-|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEGDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP009681.1|WP_000150017.1|1683994_1684711_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP009681.1|WP_000974460.1|1684858_1685281_+|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP009681.1|WP_000569884.1|1685679_1686174_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP009681.1|WP_000255561.1|1686328_1686946_+|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009681_5 | 1731955-1732035 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009681_5
>5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_5
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_5 >merge|NZ_CP009681|5|1731955-1732035|CRISPRCasFinder AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA >NZ_CP009681|5|5|1731955-1732035|CRISPRCasFinder AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA
>NZ_CP009681.1|WP_000958224.1|1730785_1731718_-|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP009681.1|WP_000513308.1|1729940_1730780_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP009681.1|WP_001224793.1|1729447_1729933_-|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP009681.1|WP_000057549.1|1728000_1729440_-|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLSDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP009681.1|WP_000134963.1|1726998_1727934_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP009681.1|WP_025175480.1|1726395_1726653_+|hypothetical-protein MRVGVWAPTQRISKRNSTGNASWGVGPNTENFEKKFYRQCELGCGPQHREIGFPISTDNASWRGPNTEAGGKSAYNNVQVGVGQR >NZ_CP009681.1|WP_000369722.1|1725147_1726059_-|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP009681.1|WP_001248939.1|1724155_1725151_-|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP009681.1|WP_001049165.1|1721942_1722530_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP009681.1|WP_000816295.1|1720797_1721700_+|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKALFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NZ_CP009681.1|WP_000662681.1|1732324_1735171_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP009681.1|WP_000638419.1|1737431_1737668_-|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP009681.1|WP_000538141.1|1737664_1738315_-|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP009681.1|WP_000749380.1|1738488_1739328_-|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP009681.1|WP_001790093.1|1739475_1739583_-|hypothetical-protein MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIIENVLNYMV >NZ_CP009681.1|WP_010956549.1|1739736_1740847_-|peptide-chain-release-factor-2 MELSEIKRNIDKYNQDLTQIRGSLDLENKETNIQEYEEMMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >NZ_CP009681.1|WP_001790092.1|1741015_1741120_-|hypothetical-protein MLWEESFYFTSVKYFKKCEEVVKRCYVLSFKKSV >NZ_CP009681.1|WP_000617735.1|1744107_1744680_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >NZ_CP009681.1|WP_001057965.1|1744740_1745415_-|ComF-family-protein MNNCLSCGAKLYENITIYNLFKKPNRLCDRCKENWDNIKLDIKARRCSRCLKHLNQDEAYCLDCKFLSAHFNLMEQLYCQFQYDGLMKEMIHQYKFLKDYYLCELLAHLIEIPQTSYDYIVPIPSSPAHDLSRTFNPVEAVLKAKGIRFDKILKMSNRPKQSHLTKKERLADENPFIIDTELDLNGKEILLVDDIYTTGLTIHRAGCKLYAKNIRKFKVFAFAR >NZ_CP009681.1|WP_001548033.1|1745407_1746490_-|DEAD/DEAH-box-helicase MDNVTRYKITESSQSSSQAYYHLSFELSEQQSYASEHIVRAIRKRQTILLYAVTGAGKTEMMFQGIQYARIQGDNIAIVSPRVDVVVEISKRIKDAFLNEDIDILHQQSRQQFEGHFVVCTVHQLYRFKQHFDTIFIDEVDAFPLSMDKNLQQALKSSSKVEHATIYMTATPPKQLLSEIPHENIIKLPARFHKKSLPVPKYRYFKLNNKKIQKMLYRILQDQINNQRYTLVFFNNIETMIKTFSVYKQKITKLTYVHSEDVFRFEKVEQLRNGHFDVIFTTTILERGFTMANLDVVVIDAHQYTQEALIQIAGRVGRKLECPTGKVLFFHEGVSMNMIQAKKEIQRMNKLALKRGWIDE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009681_6 | 1893246-1893338 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009681_6
>6.1|1893278|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_6
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_6 >merge|NZ_CP009681|6|1893246-1893338|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG >NZ_CP009681|6|6|1893246-1893338|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG
>NZ_CP009681.1|WP_001813976.1|1892289_1893117_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP009681.1|WP_078102485.1|1891191_1892142_-|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTNIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP009681.1|WP_000365354.1|1890417_1891137_-|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >NZ_CP009681.1|WP_000362972.1|1889633_1890434_-|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMSGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_CP009681.1|WP_000735558.1|1888991_1889498_-|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP009681.1|WP_001222133.1|1888113_1888830_-|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP009681.1|WP_001045421.1|1887156_1887945_-|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS >NZ_CP009681.1|WP_001018677.1|1886531_1886906_+|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP009681.1|WP_001553862.1|1884655_1885585_+|DMT-family-transporter MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NZ_CP009681.1|WP_000169042.1|1884236_1884461_+|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK >NZ_CP009681.1|WP_000901764.1|1893555_1894191_-|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP009681.1|WP_001021145.1|1894579_1896241_-|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP009681.1|WP_001819741.1|1896237_1896621_-|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP009681.1|WP_041205331.1|1896746_1896854_-|hypothetical-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMVYIYEALIKYGIVN >NZ_CP009681.1|WP_001200748.1|1896928_1897939_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP009681.1|WP_001788287.1|1898437_1898959_-|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP009681.1|WP_000180230.1|1898986_1900282_-|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP009681.1|WP_000477504.1|1900321_1900798_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP009681.1|WP_000633782.1|1900966_1901503_-|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP009681.1|WP_000808902.1|1901713_1902652_-|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009681_7 | 2157597-2157698 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009681_7
>7.1|2157621|54|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_7
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_7 >merge|NZ_CP009681|7|2157597-2157698|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >NZ_CP009681|7|7|2157597-2157698|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>NZ_CP009681.1|WP_000956132.1|2156623_2157580_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP009681.1|WP_000394698.1|2155843_2156506_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP009681.1|WP_000763768.1|2155293_2155701_+|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP009681.1|WP_000421410.1|2154202_2154781_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP009681.1|WP_000793009.1|2152934_2154203_-|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP009681.1|WP_000264071.1|2151430_2152897_-|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP009681.1|WP_000424966.1|2149864_2151406_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP009681.1|WP_000237797.1|2148603_2149797_+|site-specific-integrase MVKDPIKKAKNGTYYFRANLGYDSKGKKIQKYRSGFTTKKEAREEYSKLLLMKPEELSENKDKMTFKHYIFEIFLPWYKTQVKLRTYENRLPTIKKHFSYFDKMAVSDIEPIDVQNWQLKLSKKCKSSYVRAVQGLFSVAMDRAIVLGITTTNPSKIIGNVKKQKSKIEFWTKEEFEKVISLIYKEDYYQHFLFISLWFLFMTGMRIGEATAIQWEDIDFDSGVLTINKTLYYKNQSNYRFVEPKTKASVRHIVLDKCTLTYLSEWKEVQQNLIQTDFVMSYNGIPTQKHTLSYAIERYAKLAGIHRIRIHGLRHSHASLLISMGENPLIIKDRLGHEDIETTLGTYGHLYPNSNFEVANKLNGAISFKEAKQNYDTSPKNQFTVDYLRNKEMKKVQ >NZ_CP009681.1|WP_000633907.1|2148376_2148577_+|DUF3173-family-protein MITVTKKDLVELGYGTSFSADIIKKAKELMITKGHIYYQSRKLDRVPREAVEEILGIRFSNENRSE >NZ_CP009681.1|WP_000845143.1|2147648_2147879_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKTAYPRVPFPLIVKATDGDVEAINQIVKHYRGYTSKRSLRRMTDEYGNSHMVIDETLRGRMETKLISKILSFEIK >NZ_CP009681.1|WP_001789518.1|2158370_2158472_-|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK >NZ_CP009681.1|WP_000991007.1|2158556_2159945_+|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH >NZ_CP009681.1|WP_001289311.1|2160025_2160781_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP009681.1|WP_000052781.1|2161272_2161842_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP009681.1|WP_000930486.1|2161857_2163381_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP009681.1|WP_001795623.1|2163459_2163753_+|hypothetical-protein MINLIYTTRCAIMLKVCTSRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLVQPIMQLFIDKAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >NZ_CP009681.1|WP_000746687.1|2163825_2164452_+|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP009681.1|WP_000868248.1|2164706_2165090_+|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP >NZ_CP009681.1|WP_000158374.1|2165155_2165737_-|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP009681.1|WP_000211676.1|2165914_2166124_+|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFNPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009681_8 | 2414456-2414606 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_8
|
2 spacers
spacers of NZ_CP009681_8
>8.1|2414484|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA >8.2|2414541|38|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder GTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_8
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_8 >merge|NZ_CP009681|8|2414456-2414606|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA >NZ_CP009681|8|8|2414456-2414606|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA GTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC AACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA
>NZ_CP009681.1|WP_000495671.1|2413346_2414438_+|lytic-regulatory-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP009681.1|WP_000019744.1|2412100_2413081_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP009681.1|WP_000003759.1|2411778_2412099_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP009681.1|WP_001024094.1|2410961_2411627_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >NZ_CP009681.1|WP_001127960.1|2409588_2410527_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP009681.1|WP_000808817.1|2409327_2409558_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP009681.1|WP_000123393.1|2407282_2408656_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP009681.1|WP_001123303.1|2406411_2406825_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP009681.1|WP_000070866.1|2405768_2406212_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP009681.1|WP_000160304.1|2404937_2405648_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_CP009681.1|WP_001802298.1|2414937_2415042_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP009681.1|WP_000115564.1|2415728_2416865_-|SAP-domain-containing-protein MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF >NZ_CP009681.1|WP_001790138.1|2417153_2417246_+|hypothetical-protein MFIFKTTSKSHFHNNVKSLECIKIPINKNR >NZ_CP009681.1|WP_000370924.1|2417950_2418808_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE >NZ_CP009681.1|WP_000908176.1|2418875_2419658_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMFAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP009681.1|WP_000334465.1|2419889_2421695_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP009681.1|WP_000083807.1|2422375_2423914_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP009681.1|WP_000927363.1|2423948_2426081_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP009681.1|WP_001292149.1|2426092_2426527_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP009681.1|WP_000648718.1|2426526_2427633_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVEDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAAYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009681_9 | 2538617-2538810 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_9
|
3 spacers
spacers of NZ_CP009681_9
>9.1|2538640|33|NZ_CP009681|CRT CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG >9.2|2538696|36|NZ_CP009681|CRT TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA >9.3|2538755|33|NZ_CP009681|CRT CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_9
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_9 >merge|NZ_CP009681|9|2538617-2538810|CRT TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA >NZ_CP009681|9|2|2538617-2538810|CRT TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG TGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACT TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA
>NZ_CP009681.1|WP_001790034.1|2538386_2538557_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNGMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NZ_CP009681.1|WP_000066900.1|2537910_2538261_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP009681.1|WP_000184419.1|2536597_2537809_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP009681.1|WP_000951058.1|2536164_2536605_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP009681.1|WP_000600967.1|2535238_2536003_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP009681.1|WP_001549681.1|2534995_2535247_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP009681.1|WP_000413865.1|2533341_2534607_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMKTSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP009681.1|WP_020444778.1|2530057_2533225_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMLTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP009681.1|WP_001161085.1|2529553_2529871_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP009681.1|WP_000051206.1|2529144_2529309_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP009681.1|WP_000230173.1|2538951_2539974_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP009681.1|WP_000643988.1|2539993_2540593_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP009681.1|WP_000866971.1|2540599_2540833_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP009681.1|WP_000808500.1|2540838_2541285_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP009681.1|WP_000602937.1|2541298_2541784_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP009681.1|WP_000259718.1|2541780_2543040_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFVDGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP009681.1|WP_000134528.1|2543102_2543597_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTLIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSNQ >NZ_CP009681.1|WP_000503817.1|2543598_2544105_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIDGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP009681.1|WP_000076929.1|2544135_2545140_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKYRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP009681.1|WP_000913019.1|2545311_2545917_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009681_10 | 3040015-3040098 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009681_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009681_10
>10.1|3040041|32|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder ACACCCTAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009681_10
The CRISPR arrays of NZ_CP009681_10 >merge|NZ_CP009681|10|3040015-3040098|CRISPRCasFinder TTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGACCCACACCCTAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC >NZ_CP009681|10|9|3040015-3040098|CRISPRCasFinder TTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGACCC ACACCCTAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCT TTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC
>NZ_CP009681.1|WP_000491382.1|3039410_3039764_-|DUF3147-family-protein MFSIGSAILHFVIGGIAVALASIIADKVGGKLGGIIATMPAVFLAAIIALALDHRGTQLVEMSMNLSTGAIVGILSCILTVFLTSLYIKHKGYRKGAIFTVVCWFVISLAIFSIRHL >NZ_CP009681.1|WP_000779134.1|3038947_3039343_-|DUF3147-family-protein MKLTLMKFFVGGFAVLLSYIVSVTLPWKEFGGIFATFPAVFLVSMFITGMQYGDKVAVHVSRGAVFGMTGVLVCILVTWMMLHMTHMWLISIIVGFLSWFISAVCIFEAVEFIAQKRLEKHSWKAGKSNSK >NZ_CP009681.1|WP_001054111.1|3038125_3038695_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNLSKQIKKYRERDGYSQEYLAEKLYVSRQSISNWENDKSLPDIHNLLMMCDLFNVTLDDLVKGTIPFAPDIKAQRSLNLWTYVMLIFMTLAAILTGPLVVYWNWAWGITVIVIYGIGYYASMKIEDFKKVHKMDNYDRIVAFMNGKDPSEVQTTKARNIKTGVLSFIAFVGAIILIALISMHLANKFL >NZ_CP009681.1|WP_001059079.1|3037798_3037999_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEQENGGDVFVHFSGIASDGYKTLEEGQKVTFEITEGQRGDQAVNVQTV >NZ_CP009681.1|WP_000089284.1|3036511_3037315_-|S8-family-serine-peptidase MSRNLIHLSIGVAIFIISFSFYLLNQPNNWAWSSLNICINDSKPSNVKVAILDTGINNTRINNNFVTKRYNAINNHNQITTDSNHATQVASIITYGEHKEKLIGISKSVSIYDVKVLDDNLKGDIDNIIKGITWSIKNDVNIIHMSFGFQRYNKELHDAIKNAKNKGIILVAAAGNNMDDYSDYPARFNEVYSITAIDKNNKPFIYAPTKKIDFKAPGVDVYTKGSKDELLTVNGTSFAAAYFTAYLTNNLEFRNDLPHILKEYPIK >NZ_CP009681.1|WP_000790915.1|3035743_3036493_-|hypothetical-protein MKNKIIILFLAIIITFTYGNFAEASVVIKEANINNSNSKINTNKINENIYSKNNRNYIDNNFKSKDLNIESSLEHDLNTDKITVDASLKDNYNNKLDKTYDVKFLRIVNENDFKAEFTDQDTGEKIIYDTNEVKASIAPVVAVLVGFIAKQGLKKAIQKYGKTVVTSMIRTSPQVAAQAAKKLGYSATKHVSHGKKVFKKNSKGRPQYISVDKDGHRGGAWKGASSIKNLGSKKTRSGTYDANLKRIGD >NZ_CP009681.1|WP_000586234.1|3035244_3035742_-|hypothetical-protein MIINLETQQIHFDLEHEIPYFQSPEKNRIRLDIDVLNKKQISNIINVIFNNQSKTKCTFLSEYLYPVKFREKTRIGRFFNITNWYEEIHSADEKYVIATIKNIKNKDLIDYSLYIKKGLVEPFIVFYNQENIFYISNAVIDIISVSKDTLGYIKSEFNDHCASPY >NZ_CP009681.1|WP_000672024.1|3033966_3034158_+|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAIIVIVLSTVTTPIIGIPAGLLGGAYYLKRREEKGK >NZ_CP009681.1|WP_000143675.1|3031994_3033875_+|peptide-resistance-ABC-transporter-permease-subunit-VraE MTFNHIVLKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFIITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSVKTDVTTAKVTVIEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIILFLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTLTSMAPNDFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFSKNYYETITVDNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNVINIHLNNDLVVKGTKNETFRVTQEDKDKVYPLNLSFNSPVIEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKKKAQAIAKQFGDKIITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIIVYTLIYIVFALIAFVHSNKLIKKTI >NZ_CP009681.1|WP_020444822.1|3031246_3032005_+|peptide-resistance-ABC-transporter-ATP-binding-subunit-VraD MTILSVQHVSKTYGKKHTFQALKDINFDIQKGEFVAIMGPSGSGKTTLLNVLSSIDQISSGSVIANGQELNKLNQKALAKFHKESLGFIFQDYSILPTLTVKENIMLPLSVQKMSKATMEENYKAITTALGIYDLGNKYPSELSGGQQQRTAAARAFVHKPQIIFADEPTGALDSKSANDLLQRLEEMNKSFDTTIVKVTHDPVAASFAERVIMLKDGQIHTQLYQEGRSKQAFYEDIVHLQSVLGGVSNDI >NZ_CP009681.1|WP_000742839.1|3040316_3041156_-|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MKKPFSKLFGLKNKDDIIGHIEENRNSNVESIQIERIVPNRYQPRQVFEPNKIKELAESIHEHGLLQPIVVRPIEEDMFEIIAGERRFRAIQSLNLPQADVIIRDMDDEETAVVALIENIQRENLSVVEEAEAYKKLLEIGDTTQSELAKSLGKSQSFIANKLRLLKLAPKVLLRLREGKITERHARAVLSLSDSEQEALIEQVIAQKLNVKQTEDRVRQKTGPEKVKAQNLRFEQDVTQARDEVGKSIQAIQQIGLHVEHKDKDHEDYYEIKIRIYKR >NZ_CP009681.1|WP_000215590.1|3041198_3041918_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MTVEWLAEQLKEHNIELTETQKQQFQTYYRLLVEWNEKMNLTSITDEHDVYLKHFYDSIAPSFYFDFNQPISICDVGAGAGFPSIPLKIMFPQLKVTIVDSLNKRIQFLNYLASELQLQDVSFIHDRAETFGKGVYRESYDVVTARAVARLSVLSELCLPLVKKGGQFVALKSSKGEEELEEAKFAISVLGGNVTETHTFELPEDAGERQMFIIDKKRQTPKKYPRKPGTPNKTPLLEK >NZ_CP009681.1|WP_000249657.1|3041917_3043795_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MVQEYDVIVIGAGHAGVEAGLASARRGAKTLMLTINLDNIAFMPCNPSVGGPAKGIVVREIDALGGQMAKTIDKTHIQMRMLNTGKGPAVRALRAQADKVLYQQEMKRVIEDEENLHIMQGMVDELIIEDNEVKGVRTNIGTEYLSKAVIITTGTFLRGEIILGNMKYSSGPNHQLPSITLSDNLRELGFDIVRFKTGTPPRVNSKTIDYSKTEIQPGDDVGRAFSFETTEYILDQLPCWLTYTNAETHKVIDDNLHLSAMYSGMIKGTGPRYCPSIEDKFVRFNDKPRHQLFLEPEGRNTNEVYVQGLSTSLPEHVQRQMLETIPGLEKADMMRAGYAIEYDAIVPTQLWPTLETKMIKNLYTAGQINGTSGYEEAAGQGLMAGINAAGKVLNTGEKILSRSDAYIGVLIDDLVTKGTNEPYRLLTSRAEYRLLLRHDNADLRLTDMGYELGMISEERYARFNEKRQQIDAEIKRLSDIRIKPNEHTQAIIEQHGGSRLKDGILAIDLLRRPEMTYDIILEILEEEHQLNADVEEQVEIQTKYEGYINKSLQQVEKVKRMEEKKIPEDLDYSKIDSLATEAREKLSEVKPLNIAQASRISGVNPADISILLIYLEQGKLQRVSD >NZ_CP009681.1|WP_000362509.1|3043861_3045241_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MDLDTITSISTPMGEGAIGIVRLSGPQAVEIADKLYKGKHLLNDVPSHTINYGHIIDPESKEVVEEVMVSVLRAPKTFTREDIIEINCHGGILTINRVLELTMTYGARMAEPGEFTKRAFLNGRIDLSQAEAVMDFIRSKTDRASKVAMNQIEGRLSDLIKKQRQSILEILAQVEVNIDYPEYDDVEDATTEFLLEQSKEIKQEINRLLDTGAQGKIMREGLSTVIVGKPNVGKSSMLNNLIQDNKAIVTEVAGTTRDVLEEYVNVRGVPLRLVDTAGIRETEDIVEKIGVERSRKALSQADLILFVLNNNEALTQEDYTLYEVVKNEDVIVIVNKMDLEQNIDINEVKDMIGDTPLIQTSMLKQEGIDELEIQIRDLFFGGEVQNQDMTYVSNSRHISLLKQARQTIQDAIDAAESGVPMDMVQIDLTRTWEILGEIIGETASDELIDQLFSQFCLGK >NZ_CP009681.1|WP_001789343.1|3045384_3045738_-|ribonuclease-P-protein-component MLLEKAYRIKKNADFQRIYKKGHSVANRQFVVYTCNNKEIDHFRLGISVSKKLGNAVLRNKIKRAIRENFKVHKSHILAKDIIVIARQPAKDMTTLQIQNSLEHVLKIAKVFNKKIK >NZ_CP009681.1|WP_000240855.1|3045857_3045995_-|50S-ribosomal-protein-L34 MVKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLSA |
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22. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to position: 316708-316736, mismatch: 2, identity: 0.931
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca Protospacer ********************..*******
23. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to position: 465558-465586, mismatch: 2, identity: 0.931
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaggaaattctacagacaatgca Protospacer ********.***********.********
24. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to position: 825132-825160, mismatch: 2, identity: 0.931
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca Protospacer ********************..*******
25. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to position: 1353596-1353624, mismatch: 2, identity: 0.931
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26. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to position: 1597919-1597947, mismatch: 2, identity: 0.931
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27. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to position: 1680610-1680638, mismatch: 2, identity: 0.931
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca Protospacer ********************..*******
28. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to position: 2735188-2735216, mismatch: 2, identity: 0.931
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca Protospacer ********************..*******
29. spacer 9.1|2538640|33|NZ_CP009681|CRT matches to position: 1050065-1050097, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcatcttctg Protospacer ********** ***************.******
30. spacer 9.1|2538640|33|NZ_CP009681|CRT matches to position: 1142753-1142785, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********** *************** ******
31. spacer 9.1|2538640|33|NZ_CP009681|CRT matches to position: 1353543-1353575, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********** *************** ******
32. spacer 9.1|2538640|33|NZ_CP009681|CRT matches to position: 2815963-2815995, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********** *************** ******
33. spacer 9.2|2538696|36|NZ_CP009681|CRT matches to position: 316701-316736, mismatch: 2, identity: 0.944
tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer tgcattgcctgtagaatttcttttcgaaattctcta Protospacer *******.****************.***********
34. spacer 9.2|2538696|36|NZ_CP009681|CRT matches to position: 465551-465586, mismatch: 2, identity: 0.944
tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer tgcattgtctgtagaatttcctttcgaaattctcta Protospacer ********************.***.***********
35. spacer 9.2|2538696|36|NZ_CP009681|CRT matches to position: 825125-825160, mismatch: 2, identity: 0.944
tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer tgcattgcctgtagaatttcttttcgaaattctcta Protospacer *******.****************.***********
36. spacer 9.3|2538755|33|NZ_CP009681|CRT matches to position: 1142753-1142785, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********************..***********
37. spacer 9.3|2538755|33|NZ_CP009681|CRT matches to position: 1353543-1353575, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********************..***********
38. spacer 9.3|2538755|33|NZ_CP009681|CRT matches to position: 1726595-1726627, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgactttccgccagcttctg Protospacer *********************.*.*********
39. spacer 9.3|2538755|33|NZ_CP009681|CRT matches to position: 2815963-2815995, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********************..***********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009681_5 | 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder | 1731981-1732009 | 29 | MN693281 | Marine virus AFVG_25M371, complete genome | 6448-6476 | 7 | 0.759 |
NZ_CP009681_1 | 1.1|476252|33|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder | 476252-476284 | 33 | NZ_CP009619 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence | 270866-270898 | 8 | 0.758 |
NZ_CP009681_3 | 3.2|1357571|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder | 1357571-1357599 | 29 | NZ_LR215032 | Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2 | 268766-268794 | 8 | 0.724 |
NZ_CP009681_3 | 3.2|1357571|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder | 1357571-1357599 | 29 | MN856116 | Myoviridae sp. isolate 525, complete genome | 4992-5020 | 8 | 0.724 |
NZ_CP009681_3 | 3.6|1357684|35|NZ_CP009681|CRT | 1357684-1357718 | 35 | KY971610 | Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome | 73937-73971 | 11 | 0.686 |
1. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to MN693281 (Marine virus AFVG_25M371, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer cacttagaagaaatcctacaaacaatgca Protospacer . .. *.*******.**************
2. spacer 1.1|476252|33|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009619 (Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
caaaaaagaaattctacaggcaatgcaggttgg CRISPR spacer gaaaaaagaaatgctacaggtaatgcagcactt Protospacer *********** *******.******* .
3. spacer 3.2|1357571|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR215032 (Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
ttgtttgttggaattggtgatcctatttc CRISPR spacer actgttgttggaattggtggtccaattaa Protospacer . ***************.*** ***
4. spacer 3.2|1357571|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to MN856116 (Myoviridae sp. isolate 525, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
ttgtttgttggaattggtgatcctatttc CRISPR spacer ggcattgttggaattggttttcctattgt Protospacer ************** ******* .
5. spacer 3.6|1357684|35|NZ_CP009681|CRT matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ttgtctgttgaaattggtgatcctatttctctctg CRISPR spacer aaagctgttcaaattggtgaccctatttcatgtgg Protospacer . ***** **********.******** . . *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
44376 : 100788
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009681|44376:100788|DBSCAN-SWA 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48 | Streptococcus_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 43861:43877|attR 86708:86724 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
374386 : 450895
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009681|374386:450895|DBSCAN-SWA 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101 | Staphylococcus_phage(81.58%) | holin,integrase,protease,head,portal,capsid,tail,transposase,terminase | attL 368816:368832|attR 398623:398639 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
512158 : 570256
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009681|512158:570256|DBSCAN-SWA 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55 | Staphylococcus_phage(86.96%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
579649 : 615515
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009681|579649:615515|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(88.24%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
766303 : 778705
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009681|766303:778705|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009681|766303:778705|768357_769497_+|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP009681|766303:778705|774827_775346_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP009681|766303:778705|775591_776077_+|WP_000093392.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSDTNSLAHTKWNCKYHIVFAPKYRRQVIYGKIKKDIGIILRQLCERKGVEIIEAEACKDHIHMLVSIPPKLGVSSFVGYLKGKSSLMIFDRHANLKYRYGNRKFWCKGFYVDTVGRNKKVIENYIRNQLQEDIVADQISMEEYLDPFTGEKNKKRKKKE >NZ_CP009681|766303:778705|776515_778705_+|WP_041205401.1|DBSCAN-SWA MNNEYPYSADEVLHKAKSYLSADEYEYVLKSYHIAYEAHKGQFRKNGLPYIMHPIQVAGILTEMRLDGPTIVAGFLHDVIEDTPYTFEDVKEMFNEEVARIVDGVTKLKKVKYRSKEEQQAENHRKLFIAIAKDVRVILVKLADRLHNMRTLKAMPREKQIRISRETLEIYAPLAHRLGINTIKWELEDTALRYIDNVQYFRIVNLMKKKRSEREAYIETAIDRIRTEMDRMNIEGDINGRPKHIYSIYRKMMKQKKQFDQIFDLLAIRVIVNSINDCYAILGLVHTLWKPMPGRFKDYIAMPKQNLYQSLHTTVVGPNGDPLEIQIRTFDMHEIAEHGVAAHWAYKEGKKVSEKDQTYQNKLNWLKELAEADHTSSDAQEFMETLKYDLQSDKVYAFTPASDVIELPYGAVPIDFAYAIHSEVGNKMIGAKVNGKIVPIDYILQTGDIVEIRTSKHSYGPSRDWLKIVKSSSVKGKIKSFFKKQDRSSNIEKGRMMVEAEIKEQGFRVEDILTEKNIQVVNEKYNFANEDDLFAAVGFGGVTSLQIVNKLTERQRILDKQRALNEAQEVTKSLPIKDNIITDSGVYVEGLENVLIKLSKCCNPIPGDDIVGYITKGHGIKVHRTDCPNIKNETERLINVEWVKSKDATQKYQVDLEVTAYDRNGLLNEVLQAVSSTAGNLIKVSGRSDIDKNAIINISVMVKNVNDVYRVVEKIKQLGDVYTVTRVWN >NZ_CP009681|766303:778705|766303_767308_+|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP009681|766303:778705|772532_774806_+|WP_000594993.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP009681|766303:778705|770050_772330_+|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP009681|766303:778705|767309_768335_+|WP_001019172.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP009681|766303:778705|769515_769776_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(37.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
909365 : 996375
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP009681|909365:996375|DBSCAN-SWA 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104 | Staphylococcus_phage(73.68%) | holin,integrase,head,terminase,tRNA,portal,capsid,tail,protease,plate | attL 914329:914348|attR 959994:960013 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1376832 : 1436154
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP009681|1376832:1436154|DBSCAN-SWA 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70 | Staphylococcus_phage(82.14%) | holin,head,tRNA,capsid,tail,terminase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1487811 : 1496284
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP009681|1487811:1496284|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP009681|1487811:1496284|1493719_1493983_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP009681|1487811:1496284|1493046_1493718_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP009681|1487811:1496284|1489401_1490886_-|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP009681|1487811:1496284|1487811_1488378_-|WP_000238664.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP009681|1487811:1496284|1494690_1495815_-|WP_001010412.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP009681|1487811:1496284|1490864_1493054_-|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP009681|1487811:1496284|1495801_1496284_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP009681|1487811:1496284|1493982_1494687_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP009681|1487811:1496284|1488380_1489409_-|WP_000030812.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1516027 : 1556651
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP009681|1516027:1556651|DBSCAN-SWA TATGAATAGTTCATGTAAATCTAGAGTATTCAATATTATAAGCATCATAATGGTTTCAATGCTTATTTTATCACTAGGCGCATTTGCTAATAACAATAAAGCCAAAGCCGATTCACACTCTAAACAGCTAGAAATTAATGTTAAGAGTGACAAAGTACCTCAAAAAGTAAAAGATCTAGCACAACAACAATTTGCTGGTTATGCTAAAGCATTAGATAAACAAAGTAATGCAAAAACTGGTAAATATGAACTTGGCGAAGCTTTTAAAATTTATAAATTTAATGGTGAAGAAGATAATAGTTACTATTATCCAGTTATAAAAGACGGTAAAATTGTTTATACTTTAACACTTAGTCCTAAAAATAAAGATGATTTAAACAAATCAAAAGAAGACATGAATTACAGTGTTAAAATTTCAAACTTCATCGCTAAAGATTTAGACCAAATTAAAGATAAAAATTCAAATATCACTGTTCTTACTGATGAAAAAGGGTTTTATTTTGAAGAAGATGGCAAAGTTAGATTAGTAAAAGCTACGCCTCTACCTGGTAATGTAAAAGAAAAAGCAAGTGCTAAAACAGTTTCAGCAAAATTGAAACAAGAGTTAAAAAATACAGTAACACCTACTAAAGTTGAAGAAAACGAAGCGATACAAGAAGATCAAGTTCAATATGAAAATACATTAAAAAACTTCAAAATTAGAGAACAACAATTCGATAACTCATGGTGTGCAGGATTCAGTATGGCAGCATTATTAAATGCAACTAAAAATACAGACACTTATAATGCACATGATATTATGCGTACATTATACCCTGAAGTAAGTGAGCAAGACCTTCCTAATTGTGCAACATTCCCTAATCAAATGATTGAATACGGTAAATCACAAGGCAGAGATATTCATTATCAAGAAGGCGTACCATCATATGAACAAGTTGATCAACTTACAAAAGATAATGTAGGAATTATGATCCTTGCACAAAGTGTATCTCAAAACCCTAATGACCCACATTTAGGACATGCGCTAGCAGTTGTTGGTAATGCTAAAATTAATGACCAAGAAAAACTTATTTACTGGAATCCTTGGGATACAGAATTATCAATCCAAGATGCAGATTCAAGCCTATTACATTTATCATTCAATCGTGATTATAACTGGTATGGTTCAATGATAGGTTACTAAAAAGTAATATAGATATTGATTAAAGGCAGGTAAAACTATGTATCAACTACAATTTATAAATTTAGTTTACGACACAACCAAACTCACACATCTAGAACAAACCAATATCAATTTATTCATTGGTAATTGGAGTAATCATCAATTACAAAAATCAATTTGTATACGTCATGGCGATGATACAAGTCACAATCAATATCATATTCTTTTTATAGATACGGCACATCAACGCATTAAATTTTCATCTATTGATAATGAAGAAATCATTTATATTCTTGATTATGATGATACACAGCATATCCTCATGCAAACGTCATCCAAACAAGGTATTGGCACTTCGCGACCAATCGTTTATGAGCGCTTAGTATAACTAATTTAAATGATTTCACTTCATAAAGCGGGTTGGCGAGAATTCAATTTCTCACCAGCTCGTTTTTTCATTGTAATAATAATCTTTAACATTTATTCTTTCTCTATTAATTTTTCTCAAACTATCTTATCTTTATGATAATTAATTAAAATGCCCTTTTAAATTCTTATAAAATAAAAAAGCCACCTATCGTCGCTAATAAACGACGCAAGTGACTTAATATCATATTCAAAATAACTTATGGGAATTTAGGGAATTGATCGAAGTCAGGATCACGTTTTTCTTTAAACGCATCACGGCCTTCTTTCGCTTCATCAGTTGTGTAATAAAGCAATGTTGCATCCCCAGCCATTTGTTGTAAACCAGCTAAACCATCTGTGTCAGCATTCATAGCTGCTTTAAGGAATCGTAACGCTGTTGGTGAGTGTTTCATAATCTCTTTACACCATTGCACAGTTTCATCTTCAACTTTCTCTAAAGGTACCACTGTATTTACTAGACCCATATCTAAAGCTTCTTGTGCATTGTATTGACGACATAAGTACCAAATTTCACGTGCTTTCTTATGTCCAACGATACGTGCTAAATATCCTGAACCATAACCCGCATCAAATGAACCTACTTTAGGACCAGTTTGTCCAAAAATAGCATTATCAGCAGCAATCGTTAAGTCACAAACAACATTTAGTACATTACCGCCACCTACAGCATAACCTTTTACCATCGCGATAACCGGTTTTGGAATAATACGAATTAAACGCTGTAAATCTAATACATTTAAGCGAGGGATTTGGTCTTCACCTACATAACCACCATGTCCACGTTTCTTCTGGTCACCACCAGAACAGAATGCTAAATCACCTTCACCAGTTAATACGATAACTGAAACGTTTTGATCATCACGTGCACGTGAAAATGCGTCAATCATTTCAGCAACTGTTTTAGGTGTAAACGCATTGCGTACTTCAGGGCGATTTATTGTTACCTTAGCAATCCCTTCGTAAAATTCATATTTGATTTCATCATATTCTCTAAGTGTTTCCCATTGTCTGTTAGTCATTTTGCTCCTCCTTTAAAAATCCTAATATCATTGTATCAAATTCATCACTATCTTCCACATGAATTGTATGACCTGTAGCAGAAATTAATTTACATTTACTATTAGGAATTAAATTTGCCATTTTTTTCGCAATCTGTACAAATTTTTCATCATATTCTCCAGCTAATATTAATGTTGGTACTTTAATTTCTTTCAGGCGCGGCCATAAGTTTGGCATTTGACCTGTACCATAATCTCTTAATGCTTTGGCCATTTTATGTGGCGATTGAGACAATCGTTGTTGTCTTATTTGATGTTGTATTTCAACTGGTAATTCTAGTTGCGATTGAAATAATGGCAACTTTTCCCAATCATTAACAAATAATTCAATACCTGCTATGTCTAATACTTTAGCACGTGCATCATCAACAAGACGGCGTTCCAATTGATTTGCTTCTTCTTTAATACCTGGTGACGTACTTTCTAATATCAAATTAGATATAGGGATGTGACCATTAATTGCATAATATAATGCAACACGCCCACCCATTGAATATCCAAACAATGTTATTGATTTATCTTTATATTTATCTAAAATTCGGTCTAACAACGTCGTAATATAATCAAAATTCCACGTTTCATCCATTGAAGACTGATCTTCGCCATGGCCTGGTAAGTCTATAGTGATGACATGATAGTTATCAGTAAATTTTTCGATGTGATTATGATAAGTACGGCTGTCGCTAAGAAATCCATGCAGAAATACTAAAACTTGATTGGTCTCAACGTTTGCTTCATAAAATTTATAATGTGTCATGAATCATTTCACTCAATTTCTGGTATAAAATTTGATGCTGTTTAAAGTTATCTTCGCGATTCGTTATCAATTCATAAATCGTCGAAGTTTCAGATAACAATGTGGCATTTTTAAATTCTGAAACACTGTTAAAACGTTTAAAATCGAATTGATATAACTTAGCTGTATACTCGAAATCCAATCCCGTCGGTGTGCCAAACAACCGTTCAAAATAGTCAGTTGCACTTTCTTTTTGTGGTAAATATGAAAAAATACCGCCACCATCGTTGTTCAATAATACAATATTCATCTGAATATTATTTAATTTTGACATTAATAGTCCATTCATATCATGATAAAATGATAAATCACCTATCAATAATGTTATTCGTTTATGCACAGCCATACCCAGTGCAGTTGAAACGATACCATCAATACCATTCGCACCACGATTCGCATAGACATCTATATTTTTATTCAATAACAAGTTATCTACATCTCTGATAGGCATACTATTACTAATAAATAATGCATCTTTTTCAGATGTTTTCTTAATCAATTCACCAACGAATGCACTCTCATCTGTAGCTTGTTCCAAATAACATTTAATTTCTTTACGCCCTTTTTTCTCTAAGCATTGCCATTTTTCTAACCAACTTACGCGATTAACTGTCGTGTCTTCCATTAATGACCTAAAGAAATCATTCGCAGAAATCTCATATGAAATATCTGGCGCTATCGGAAAGACATCAATCTTATCATTGTTTTGCACTAATATTTGAAATGCATCAGTTTTCTTTAACCATTGATTTAACTTTTTAGAAATCACTGGTTTCCCAACACGAATTACGAAATCCACATTTAAGTCTAAGCCGCTTCTAAACAGCAAATCATATGTACAGATAACATTCGGATGATCAAATTTTCTTAAATGACTTAAAGGATCAGCTAAAATAGGCAAATCATATATCGTTGAATACGTTAGTATTTGATCAACTTCTTGGTGCTGCATATCCCCTACAATAATTAAACCTTTTTTCTTATTTAAAATGTGTCTTAATGCCGATGCATCTATACTTTTTTGATAGTGCGGTAAAATCTTCATCTCAGAAGTTAACAATTCTGTTGCATTCAAATCAGGTGTTAACGGATCTCTAAATGGCAAGTTAAAATGAATTGGCCCTTTATGTGGTCCATATAAATATTGACTAGCAATTTGCATTTGATAGTAAATTGCATCAATGGTCTCTTTACTATCATCCGCAATAGGCATATCGAACTCATAACTTACATAATTATTAAACATATTTACTTGATTAATCGCTTGTGGTGCGCCTACACTTCTTAATTCATGCGGACGGTCACTTGTTAAAACGATTAAAGGAATTCTACTAATTTGGCTTTCAGCAATTGCAGGCGTATAATTCGCTGCTGCTGTACCTGACGTACATAATATAGCGACAGGTCTTTCACTGCCTTTAATTAACCCAACTGCAAAAAACGCTGCACTTCGCTCATCGGGGTGTATCCATGTTTTAATATTTGGATGTGCTTCAAATGCAAGTGCAAGTGGCGTTGAGCGTGATCCCGGACTGATAACTACTTCCCTTACGCC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42 | Enterococcus_phage(16.67%) | protease,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1664487 : 1673051
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP009681|1664487:1673051|DBSCAN-SWA ATTAATCCTCTAACGGTATATCATCCACAATCACAGTATGATTAGGATTAGCGTTAGATACATCTTTCACTGCCTTATCTAATTCCTCATCGTCTCCGTCCCATTCACCAATGTTAATGAATATAGGCACATTGCCGTTAATATCATGCTTATCTGTAAATAACTTATAGTATTTCCCCAACATATCACGAGCTTTTAAACGATCACTAGGCTTAATTGGTACCTCTATCAGTTCAACATGTTCGTTATAGACTAGCTGTACTTTGCCACTTTGTGGATTCTCTTTATATTCTCCACGCTTGACTACAACTTCTTTCGTTTCTGTTTCATCACCGACTGCCGCATTCGTAAGCACATGTAGTAACTCTTTTGCGGTTAATACATTCTCATCTATAATCTTATCTTTTTGTTCTTGTATATATTGCTTGATGTGTGGCTTCTTCAATAACCTACACCCTGTCACATGTGCGCTATTTGCGCTATAGCCTGCTTTTATGGCACTTTGTGTTACATTAAGTGTTCTTATATACTCATTCACAAAACGCGCTTGTTTTGCTGTTAAATCACTCATTCTATCACCTCCACAATTTTATCTAATAAAGTTTCATACCATAATCTTACAGATTGTTCTGAACACTCTAAGACATTGCTAATATCTTTAAAACTACGTCCTTGTATCAAAGAATCGAAAATATAAAACTCTTTATCATTAGCTACTCGGTCAACAATCATTTCTAAGTGATTCTTTACAATATGATCATCAATGTTATCGTCTGTCATCCATTCATTAGAATTTTCATCACCTATTGAAAAGAATTCATCAGTATTTATATCATCATCTATTAATACATCACTTCTAGTTCGCTCATGATAATCACAAACGAAGCCTTTTATTTGCTGTTTATCCATTGTTACACCACTTTTACATGTGAAGATTGGTGATAAGCATTTACTCGTGCAATCTTGCTATTTTCAATTGCTATATTTCTTTGTTTTTGACGTTCTGAACGTTGTTTAATACTTGCTTGATACAAATCAACCTGTAAGCGTTCAATGACGTTGTAGGGCTTATATCGTCCATTTGAACGCATATATTTTACAACTTGCTTCTGCTCTCTTTCTGTATAATGATTTAGTACCGTTTTCAACAACACCATATTACTTATAGATCGATTTTTATAGTTTTGTAATCTTGCCTTTGTTTCAATAATTTTGATAACTAGTTTTTCAATTGGATATGAGACAGACACGACCCCCATTATTTCATCACATGTTGTTGTCGATGCACTCATATGGTACATACTTTCAATTTGGAATTCACACATCTTAATTTTCTTATTAATAAATGCTGGGTTAAATTGCGTTAATAGTTGATAATCAGATAATTTATTGTCACCATTACGATAATATAAACAATTCTTCGTTTTAAGCAGTTTCATTTATTCACCCCTATAAACAGAGCCTACCCGAATTGGATAGGCAATCATTGCTATTTAATAATCCTGTTTTGCTTAGCTAAATTTTGTAGCGTTGTACCATATTGCTTTTGCTTAGACTGTTCTGATTGTTGTAACTCACTTGAAATCTCCTGCATATTGTTTTTAATATCCAAATCAACTGCATTTATTAATAGATTTGTATCTTCTTCATTTAAACCAAATGCATTTGCGACCTTTTTAGTATTATTTAACTCGTATTTTGTTTCCATTTAATTACCCTTTCTTTTTAACGTTTTAAAAACAACTTGTTATTGTGTTCGTATGGCAAATCATTACCATTAATATATGATGTAAATATATTTTCTCTAAAGTAGCCATTCAATGCTTCCCTAGCCTCTTTATCATCATATAATTGTTCTTGACTATAAATACTCGCATATTGCTGATGCTCATCTTCATATCTATCATTAATATCTTCTATTTCATCAATGATCTCATTATATGCATCGACTACCTTTTTTAATTTACCTAAAGCTGATTGTTTTTCTGATTCATATAATGATGACAACTCGCTTTGATGTTTTAATAACTCAATTGTCTTTTGATATTTAACTTCTTTCGATACACTTTTCTTTGTCTCTAAGCGTTTATTAAGTGCTTTTAGTTTCTTTTCATCAGCATCTGTTGCTTGATATAGGTTATCTGCCTTGTCATCTTGTCCATCCATGATTAACTGTTTGTATGTGGACTTATCTAACTTTATTTTACTTTCCAATGCATTACGCTCTTGTTCCAATTCTTGTATAGCCTTGCGTTGATCTAATACAAATTGGTTGTATTCTTTAAAGTACGATTCAGTTTTCATTTTTATCCCCTTTACACTTCAATTCGTTTCAAAGCTTCATAGCGTTTCATACTACCATCAGCTAGCTTTTTAATACTTCTCATTGCTTGTAGCTTCTCTTGTTCTGTCGTAATGATGTAATAACCACGTTCACTAGGTTTATAACTACATCCGATAGGATAGCCATAATCATATACTAATGAATTGATTACTTTTCTTAACCATCGTTCATTGCTTGAATTATATTCATATCCTAATTGATTTAAGATTTTAGTTTTAGTAATATACTTATTAGACGTATTTTTTATCACATTGAAAACTTGCAGGTGTTCGGTGGGTAAATGATACGTCTCTTTTTCTGCGATACTTTGCATTTCTACACCCCTTTCTTTTAATTATTCCATACCTAAATTATACCATTTTTACAGGTCTAAAACAAACTTACGTTCGCTTTATAGCGCGTTTTATCAATTGTTTAGCTTACCTCGTATAACACTTATAAAACAATATTATAAAATTAATAAGGAGCCTTTTATATCACTTGAATACAGAACTTAAGTTCGGTAAAATAACGCGAACGAATTACGAACGAATTTATTTACTACCCTATGATAAAAACACAAACTTTAGCTTGTATTAGCGTTAATAAAATTCGTGTATCTTGTATAAACCTTGTACTTTTATATTAGGAGCCACACACTACATGTGACCCCTCATAACATTATTCACTTAGGCTATAGTAAGAAGCTTTTAGATCATTTAACTTACGTTCTAAAGCCTTGTAATCCTCTTGTGTAGCCTTCTCATCTTGTACAAACTCAGTTACTAATCTCAACCCCTCAACTAACTCTGGTGCTGGTTCATTGATTCCCGTAGCTAACTGATACAACATTTCAATATTCGCTATCACATCAGTATTACTCGATTGAATGCCCTCAAGTGTATCTGTATCAAATCCATTTTCTAGGTACTCAAACACATCACTATTATTTGATTCTGCATAAGTTTCTAGCCCATACATAAAATACTCATCTTCAAATAATTGACTGGCCATCATATCACTAATAGAAAGCTGTTTACCGTCATGTAATTCATAACCTACATAATGCCCCTCTATGCTTCTTATAAGTCCCTCAGTGTGTTTAGGTGACGCTAATTCAAATGATTGCCTTACTTTACAATCTTTAATATATACATGACCGAATAACTTCCCGTTCATCACCACATAACACATATCAAACGGATCATTATATAACTTAAAGCAATACGGTTGTACTTTACTATGTTCTAATAATCCCGTGTAGTACCTTAATAACGTGCCTGCTCGTGTTTCAAATTGATTTACGATAGTTTCTATGTTCATTTGATTTTCTCCTCTTTATTTATTCTTAATACCATAGGCACCCATGAGGGCACGTCAGTTTGTTGTCCATCTTCTGGATAACAAATAGCTAATGGTAAATTAGGAACTCTACCATCCAACAAATAACGCATTACAAAACTACCTCTATACACTAAATCAAGTTGTTCACTTTTAACTAATTCAATCAACGCAAACATTGTAATTTTGTTCCATCCACTCCAAAACACTACATTCTCATCCTTATCGTGTGTGATACTAGTTCTCCCTAAATAGTCATGATTCATTTCTTTAAACAAATCTTCTAACTGATATATCGGTATCTCCTTATATTCTTTTACATAATCGTATATATACTTTTTAAGTTGTTCTTTATCCATGTGTAACCTCCAGCATTAATTCGATGTTTTTTATTTTAGTAGGGGACTAGTCCCCAGTGAGTCCCCAGTGATTCTTTTACTTCGGGTACTATCAAACTCTTGTCACTACGTTACTTTATGCAAAAAGTACCCGTTGTACCCGTATTTTATATAATAGGAAACCTGTATTATATGAATGTTCTTACAAAACAACTTATTTTAATTAAATACTATTAATAAACATTGGGTACTTCGGGTACTTATGGCTTTAGAGACTTGATATTACTGCGTTTATTGAGTACCCGTTTTATTTTTTTATTGGGTACTCAACGGGTACCGATGGGTACTTATCAATAATCAGAATTAGGATTATATGAATTAGAAAAGTCAAAACCCAATTCTTCAAGTACTTCTCGCCTTATAGCAAATCCCCTATACTTTACCGTTTGATGTTTGACCTGTTTTTGTAACCTGTCTTTTTCACCTTTAATTAAATATCCTTTTTTGTCCCATTGTCCAGTGATGGTTTGCAATTCGTGTGTTAACTTCTCTTTGACTGTTTCACCTAATATACATAAATAATCACGTTTATATATAGCTTTGATGTCGCCATTTTTGACTGAACTATAACCATCACCAGCAATATTATTTCTATTCGCATCTAAATATTGTAATAGTTCCTCTAACAGTTGCTTAGGTTTATCAATTGTCTTATTGTTTTTAACCATGCTGTCATAGGCTTGTTCAATAATTTTAAAATGATCATGTTCAAATCCATCAATATCATTCAAAACCTCACCGGTAACTTGTAGTAACGCAAAGGCACGTCCTAACCGTTGCATGATTTCATTACTACCTTTTTGATTAAAATACCGTTGATAGCTCTCAAAAGCTTTCTTATACACGTCTTTTTTAGACTCATATTGTTTAATAAATGCCAACCCTAACGTTCCATAGTTCTCCCTAAACGATTTGTCTAATGTGGTAAAATCAAAATTATCTGGATATGGTGGATCTTGTAGTGTAACTACACGTGCTGATACACCCGCTTTTTCATCAGCCATATTTGCGATAGATGATTCACCAGTAGAAATTAAAATATTTCGCCATTCTTTTTTAGCGTTTAGTGTTAAATTAATATTACTTCTTGATTTACTTTCGCCACTAGAAAAGTTATATGTGGCACTGGTAACAAACTTAGGATGTGTGTTACGTGTATCATCTTTAAACATTGGAAATGAGTTCAAAAATGACGCCATCGATTCAATACTATTTTGAGTAGAACTCCATGTCGTAATAAGGTCACTGGTTCCCCAAACACTTGATACTAAGTTGAGTGTGAATGTTTTACCTGTGGATGTACTACCTGATATTTCTACAATAAAGGGCTGTAATCCAAATTCTCTTAATAAAACCGAACCTAAAGATGCATACAACATAACCATCACCATTGGTAAATCTTTTATTTGAGCAAACACCTTTTTAGAGTAACCTTGTAGTGTTCCTTTACTTCGAAAAGAGTCTATTAACTTTTGAAACCCTTTATCATTGCTAAACAACTTGACATTGCTGTCTTTCATTACTTCTTGATAAGGATAAATAAAATAACCTTTCACATGCCCCAAACGCGTTGCAACTTTAACATTTAATGGTGGGTTATACCGTTTAGATACATTAATATAGTCAACAAGTTTAGTAGATGTCGACGATGTTACATCTAGCTTTTTATTAACCAATTTCAAGAGTTGACGACTATCTGAAATTTCTTCGGCACTCACTGCTATATTTACAGGCGTTTTATTGTCATAGAAAAGCATATTAAAGCTGACTTCGTTACTTTCAATATCTTCAAAGCGTTCAGTGATTTGAGGGATTGTACTTGTGATAAAAACCTTTTTATCTGGCTCGCCTTCTTTTTTACTTGGTATAAGTTGATTTAAGGCAATACCGCATTGATGATGTTCAATTTCATAACCTTTCGGTATAATTTCTTGTAAGGCACTATCTTTTTTATTAATTTTTTCAATTTTATCAAGTACATCACTTTTACCTGTTTCCATACAAAGCTCCTTTCTAATTGTTATAGTGTTTATTTAATATCGATTGAAAAGTAGCGTTGATTTCTTGTTCTTTCATAGGTGGTTTACATGCGAATTGCCCCCATAATAAAGCAAATGAATAAACAATATAATCATTAACGTGACATCTCAATAAATGACCCACCAAACTAGCCAGTGCATTGTTACGATTGCCTTCGGTTGTTCCAAAGCTTAACTCACGCCAGTACGCACTATCACGTCGCGTGTATCCTATAACATTAGGACTAACATTTGATTGTTCAAACCCCTTTGACCACTGCTCGAGCATATCAACATCCATAATTGGACAGTCATTCACTCGCTTAATAAATATGTGCCCTTTTTGAATAACTGGTAATGCAAAACATCTACTTGGCTGATATGAACCTTCATCAACTTTATGACCAATTTTATTTGCTAATACTTTTGTATATTTACGATAATCATCTGCACTTATTCGCTCATTCAGAGGGATATACAGGCGTATTCTAGCTTGTTCAGTTCTGTGCGAGTAACTTGTGTGCCAAAACCATGCAACATTGCTTAAAGCTGAGCTGATTGCTTCATGTAATTGCTTTAAATCATTTATTTCATCATAATCAATTACAATCACATCTCTGTATATGACATTATTATCATTGCGATGCTTTTTGATAATTTCACCGCGATCATTTGCACCGTTTTTAATATCACCGTAAACAGCAACACCACGTGCATACTTATAATTTGCTTCTATAGGTACAGACAGTTTATTAACCAACTTACTCCATTTAGGTTTTGAAAAGCTCTTAAATGAACGTGAGTCTAAACTTTCATAATGTACCACTGAAACATGTGTGTCATATTCTAATTTAATTTCATTCATTTTTTGCACCTCTTAATGAAACAACAGAGCAAAGATGTTATAATAAGAATGTGTAATTTCTATATTACTCTGCTACTTTTATTGAATTCTTTGCGTCATCTGATACCTCGCCAAAGTTCTCAGATGATGCTTTTTCAATTTCATGAAATTTTTGTATAAGTTCATCGAACTCTTTTAAATAAACCTGTAATAACTCAACTGTATGTTCATTTTGTATACGATGTTCTAAATAGCTAGCAGAAAAATTAATATGTTCCCGTTTTGTTTCTAATTCATTTTTGACAAATTTATCTTCAACAAACCAACCATGTTTGATAGCTACATCATTGTTTTTTTCTTTTATCACTTCAATATCACACATTACATCTTTAATTTCCCAATTCATTTATAATTCCTCCACTTCAATATTTCCCACAATGTAATCTAATGCCCACTCTAACATCCCAATCACGTGTCCTTTGCGATCTGTTTTATGTTTATGTTCACCTTTTTCATCTATGACACTATAACGATAAACGTGTTGTGTTTCTTTCATGACATCACTTAGCGTCATCGTTACTTCATCAAGAATTAAAAATGCTTCATCTTCAAAATCTAATTCAGCAAGAATATTGAACAATCCATTATGAACTAACTTTAAAGCACATTCATAAAATGCTGTATCCTCATTGAGATAACTAATATCATCATAAGTTTTACTTTTCTCGTATAATACTACTTCTAATACTTTAACCACTTTTGATAATTGATATTTTTGTTTGATTTTCATCTTAACTACCTACCTTTTTCTTATTTTTAATTTCTGTAATTTTTGATAAATCCATTTCTAAACACGCAACTTGAACATCTTTACTAACATCAGGAAAGCACTGTTCAAATACTTTTGGCGGTATATTTAACATTAAATTATGTTGAGTATCTTTAATGTTGTACCAGCCAACTACTGTTTTTGTAATAATCACTTGTTTTCGCACGTTGTAATCTCTCCTGTTAAATTAAATCCATAAGTTACCATCATGCCGTACACACTAAAAGCGACATACATGTTAGATATTGCTAGTAATAGTATTGTTAACAATGAAACTAAGCAAATATAAGTTAAGTACATTTTCATTGCCTTGCCTCCTACATCCATTTTTTATGACGTTTCTTCATGTACTCCTCAAATCTAGGAATACTGATAACCGTCATAGTTGATGACAATGAATAATACAAATCGTCAACACCTTTAGGATCTTTCTCCCACTCTTTTAAAATACGATTTGTCGAACTATACGAAATACCAAAAATACTTGCTAGCGCGTTTGGTTTAGCAAACAGTGGTTTTACTACAACTTGTTTTGGTTCACTGATTGTATTTTCCTTAGTCGGTATATCTTTCAACTTTGTTCTAGCCATTTATTTGACCTCCTCTTTTTCTTCTATAAAGATGAAAATATCTTTTATATCAACATTGAGTCTTTTCGCTATTTTATTAGCTGTTTTTGGGGATGTCGTTCTTTTACCATTAACAATGGAATTCAAAAAGTTAGAATTCACTTCTATTTCGCTTGCAAAATCTTTTAAACTCAATCCTTCAAATGCAATCAAACGTTTCAAATAATTCACTTTAGCAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP009681|1664487:1673051|1672389_1672545_-|WP_000784891.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENK >NZ_CP009681|1664487:1673051|1668128_1668509_-|WP_000356938.1|DBSCAN-SWA MDKEQLKKYIYDYVKEYKEIPIYQLEDLFKEMNHDYLGRTSITHDKDENVVFWSGWNKITMFALIELVKSEQLDLVYRGSFVMRYLLDGRVPNLPLAICYPEDGQQTDVPSWVPMVLRINKEEKIK >NZ_CP009681|1664487:1673051|1671816_1672200_-|WP_020444649.1|DBSCAN-SWA MKIKQKYQLSKVVKVLEVVLYEKSKTYDDISYLNEDTAFYECALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHKTDRKGHVIGMLEWALDYIVGNIEVEEL >NZ_CP009681|1664487:1673051|1668838_1670548_-|WP_000447459.1|DBSCAN-SWA METGKSDVLDKIEKINKKDSALQEIIPKGYEIEHHQCGIALNQLIPSKKEGEPDKKVFITSTIPQITERFEDIESNEVSFNMLFYDNKTPVNIAVSAEEISDSRQLLKLVNKKLDVTSSTSTKLVDYINVSKRYNPPLNVKVATRLGHVKGYFIYPYQEVMKDSNVKLFSNDKGFQKLIDSFRSKGTLQGYSKKVFAQIKDLPMVMVMLYASLGSVLLREFGLQPFIVEISGSTSTGKTFTLNLVSSVWGTSDLITTWSSTQNSIESMASFLNSFPMFKDDTRNTHPKFVTSATYNFSSGESKSRSNINLTLNAKKEWRNILISTGESSIANMADEKAGVSARVVTLQDPPYPDNFDFTTLDKSFRENYGTLGLAFIKQYESKKDVYKKAFESYQRYFNQKGSNEIMQRLGRAFALLQVTGEVLNDIDGFEHDHFKIIEQAYDSMVKNNKTIDKPKQLLEELLQYLDANRNNIAGDGYSSVKNGDIKAIYKRDYLCILGETVKEKLTHELQTITGQWDKKGYLIKGEKDRLQKQVKHQTVKYRGFAIRREVLEELGFDFSNSYNPNSDY >NZ_CP009681|1664487:1673051|1671495_1671816_-|WP_042857089.1|DBSCAN-SWA MNWEIKDVMCDIEVIKEKNNDVAIKHGWFVEDKFVKNELETKREHINFSASYLEHRIQNEHTVELLQVYLKEFDELIQKFHEIEKASSENFGEVSDDAKNSIKVAE >NZ_CP009681|1664487:1673051|1667490_1668132_-|WP_001019777.1|DBSCAN-SWA MNIETIVNQFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPYCFKLYNDPFDMCYVVMNGKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKQLSISDMMASQLFEDEYFMYGLETYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPAPELVEGLRLVTEFVQDEKATQEDYKALERKLNDLKASYYSLSE >NZ_CP009681|1664487:1673051|1665975_1666194_-|WP_000448775.1|DBSCAN-SWA METKYELNNTKKVANAFGLNEEDTNLLINAVDLDIKNNMQEISSELQQSEQSKQKQYGTTLQNLAKQNRIIK >NZ_CP009681|1664487:1673051|1665053_1665266_-|WP_025174984.1|DBSCAN-SWA MTDDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE >NZ_CP009681|1664487:1673051|1672201_1672405_-|WP_001231375.1|DBSCAN-SWA MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQCFPDVSKDVQVACLEMDLSKITEIKNKKKVGS >NZ_CP009681|1664487:1673051|1672556_1672829_-|WP_000124597.1|DBSCAN-SWA MARTKLKDIPTKENTISEPKQVVVKPLFAKPNALASIFGISYSSTNRILKEWEKDPKGVDDLYYSLSSTMTVISIPRFEEYMKKRHKKWM >NZ_CP009681|1664487:1673051|1666211_1666790_-|WP_000846290.1|DBSCAN-SWA MKTESYFKEYNQFVLDQRKAIQELEQERNALESKIKLDKSTYKQLIMDGQDDKADNLYQATDADEKKLKALNKRLETKKSVSKEVKYQKTIELLKHQSELSSLYESEKQSALGKLKKVVDAYNEIIDEIEDINDRYEDEHQQYASIYSQEQLYDDKEAREALNGYFRENIFTSYINGNDLPYEHNNKLFLKR >NZ_CP009681|1664487:1673051|1666801_1667143_-|WP_001190598.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRKVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKLQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIEV >NZ_CP009681|1664487:1673051|1672829_1673051_-|WP_000560872.1|DBSCAN-SWA MIAKVNYLKRLIAFEGLSLKDFASEIEVNSNFLNSIVNGKRTTSPKTANKIAKRLNVDIKDIFIFIEEKEEVK >NZ_CP009681|1664487:1673051|1665397_1665925_-|WP_000771358.1|coat|DBSCAN-SWA MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSDYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKARLQNYKNRSISNMVLLKTVLNHYTEREQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNIAIENSKIARVNAYHQSSHVKVV >NZ_CP009681|1664487:1673051|1664487_1665057_-|WP_001281786.1|terminase|DBSCAN-SWA MSDLTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYYKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGDDEELDKAVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED >NZ_CP009681|1664487:1673051|1670561_1671431_-|WP_001002711.1|DBSCAN-SWA MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLVNKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKNGANDRGEIIKKHRNDNNVIYRDVIVIDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSYSHRTEQARIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWSKGFEQSNVSPNVIGYTRRDSAYWRELSFGTTEGNRNNALASLVGHLLRCHVNDYIVYSFALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN |
16 | Staphylococcus_phage(85.71%) | terminase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1760400 : 1775187
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP009681|1760400:1775187|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP009681|1760400:1775187|1764869_1766975_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP009681|1760400:1775187|1771638_1772556_+|WP_000429014.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP009681|1760400:1775187|1769022_1769523_+|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP009681|1760400:1775187|1773235_1773778_-|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP009681|1760400:1775187|1771446_1771548_-|WP_001790641.1|DBSCAN-SWA MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS >NZ_CP009681|1760400:1775187|1763780_1764752_-|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP009681|1760400:1775187|1760400_1761162_-|WP_000616842.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP009681|1760400:1775187|1768136_1769003_+|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP009681|1760400:1775187|1761158_1762115_-|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP009681|1760400:1775187|1762101_1763073_-|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP009681|1760400:1775187|1769863_1771369_+|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP009681|1760400:1775187|1763111_1763267_-|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP009681|1760400:1775187|1774128_1775187_-|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP009681|1760400:1775187|1766937_1767336_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1787159 : 1792821
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP009681|1787159:1792821|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATACTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTGCTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAGCATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATGGGGCTGACCCAAAAGTAGCTCCTCTATTTATCTTTTGAAAGTGAATACAAAAATAAAGCACACTCTGCTATAATATAGGTGATTAATCCATTTGAGAGAGGTGCTTTATCATGTATCAAAATTATACCATAAACCAACTTTGTTTGCCTATAGATCTTGAAATTAAATTAGAAGAAAATGATTTTGCTCATGCCATTGTGCAGTTTGTTGACTCTATTCCCGATGAAGTCTTTCTTCCTTATTATCAATCTATGGGTAGACCCCAATATCATCCTCGTATGCTACTTTCCATTATTCTTTGTGCCTATATTCAAGGGGTTTATTCGGGCCGCCAAATACAAAATATGCTGATAGATAGTATTCGGATGCGCTACTTATCTCAAGAGCAATTCCCTAACTTTCGTACTATTAATCGTTTTCGCGTTCATCCGATTATGAACGATATTCTAGATCATTCATTTGTTCAATTTCGTGAGCTACTGGTTCAAAGTGGCTTAATCAGTGGCAGTGCTCTATACATTGATGGTACAAAAATTGAAGCGGATGCGAATAAATACTCTTTCGTTTGGAAAAAAAGTATTTTAAAGTATAAGGATAGCCTTGATCAAAAAGCCCTTGAAAACTACCAACAAATGGTGGAAACAAAAATCTTACCTGAGTTAATAGATGATTTAAAGGATGAACTTTCTATAGAAGAGATTGAAAGGATTCGTCAATCTTTGGAAGAAAAGGAAAATCAATTAATTGAAGCGATTGACCAAACCGAAACAGTAGAAGAACGAAAATTACTTCGTAAAGAAAAATCTGAAGTTCATAAGCAGAAGAAGCGATTCGATGATTTTGCCCAAAGAAAAATGAGCTACGAAGAACAATTAGTGATTATGGGTGTACGCAATAGTTTCTCAAAGACGGATCATGACGCTACTTTTATGCGAATGAAAGAAGATCACATGCTTAATGGCCAACTAAAACCAGGTTATAATATTCAACTTGCGACAGAAAATCAATTTGCTCTTGCTTATGATTGTTATCCAAATCCAACAGATACACGAACATTTATCCCATTTCTTGAAAAGATTGAATCAAAAATAGGTTTACCAGAAAATATTGTCGCAGATGCCGGTTATGCAAGTGAAGAAAATTATTGTTATGTGTTAGACGAAACAGAATCCACCCCCATCATTCCGCATCAAGGTTACTTAAAAGAGAAGAAACGCGCCCATAAACAAAATCAGTTTCATCGAGATAATTGGACTTACAACGAGTTGGATGATTACTATATTTGTCCCAATCAGAAAAGAGTAGTGTTCTCACATTATTCACAACGTAAAGATAGAAATGGATTTATTCGAAACTTCAAAATCTATGAATGTGAAGATTGTACAGGATGTCCATTGAGAGAGAAATGTACCAAAGCAAAAGAAGGAAAAAATCGACGTTTGAATATTAATCCAACCTGGGAATATATAAAAATAAAAGCGAATGAAAAGATAGAAAGCAAAGAAACAGCCTCATACTATGCGCAGCGAAAGATAGATGTCGAAACAGTTTTTGGAAACATTAAACAAAATATGAAATTTAAAAGATTCCATGTCCGAGGAGCTGAAAAAATTTTTAAGGAAATGGGACTTGTATTTCTTGCGCACAATTTTAGGAAATTAGTAACTAGAGTAAGGAAATATGAGGGAAAAACAATCATACAAAACCAAATATAGGGGGAAAATCCTCTATATTTCATCCAAAAAAAACAAAAATCGAAGACATCTTTCACGGGTGCCTTCGATTTTTTGGTTCAAAAGGGACTAATGGGTCAGCCCCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP009681|1787159:1792821|1789221_1790826_+|WP_000284571.1|transposase|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >NZ_CP009681|1787159:1792821|1788294_1788888_-|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP009681|1787159:1792821|1792107_1792821_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP009681|1787159:1792821|1791014_1791683_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP009681|1787159:1792821|1787159_1788311_-|WP_001217785.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP009681|1787159:1792821|1791684_1792104_+|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV |
6 | Pandoravirus(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2125564 : 2133731
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP009681|2125564:2133731|DBSCAN-SWA AATGACAAATATCTTCGAAAAAATCGTAAATGATTTAAATTTAGAACAAAAAGATGTTGTGGAAAGTGAAGATAACCTTTATGTAAATGCATGTCCTGGGAGTGGGAAAACAAGGGTACTTACAAGGAAAATTGCTTACCAAGCAATTAAACACGATGGATCACTAAAAAGAATAATTGCTATCACATACACTAATAGAGCTGCTGAAGAAATTAAGGAACGCCTAAGTTTACTTAGTATAGATGATGATATTAATATTTGGGTGGGGACAATACATCAGTTTTGTCTTGAATTTATTATTTATCCTTTTAAAATGAATCTCTCAAGAGTATCAAAAGGATTTACAATTATTGATGATTATACTCAAAGAGCTTACGTCAGCCAAATTAATAATATGCTGAATTTAAATCTCAAAACGTATGAACTGAACAAAATTGATTTGTCACTTTCTCATGATTTTAAAATTAATGAAGTTCAGTATACTCAAGTTTCTGAAATGTATCACACTATGTTGGAAAAAAATAAAGAAATTGATTTTGATATGATTTTACTAGTAGCGTATAAAATTTTAACTGTAAACAGTAACGTTGCACGTAATATTGCTAGTAATATAAGGGCGATTTATGTGGATGAATTTCAAGATACTAGAGAATTACAATACAATGTAATAGCTAAATTACTTCAAAACAACCCTCAAATTCAGTCAATGTTTGTTGGAGATATTGACCAAGCAATTTATGGATCATTAGATGGTATAGCTAAATCAGTTGAAGAACTAGAAATGCTAACTAGTCACACTTTTCAATCAAAGACGCTACATGGCTGTTACAGGTCTAATCAGAGATTAGTAGACTTCTACTCTAATTTTCAGAGTTGTCCTTACGAGATTGAAAGCAGAGGGAATAATAAAAACGACCGTGGTTTTATAAGTTATGATTGCAAAGTTACTAAGGAGGATTTACCCAACATAATAAAAAATATAATAAAGGAAAAGATTGAAAGCGGCATTCATGAAAAAGATATTTGTGTACTTGCTCCTCAACACTATCCTCTGTTTTCACTGGGTGAGTATTTAAAGAAAGAATTACCGTATTGCAATTTTGATGCTATAAATATATCACCAATTAAGGTAAATAATCATAGTTTATTTTTCAAGTTAGCAATTTTGTACTTTACTGAATCAGGTGAAAAGGTTCGAAGAAGAAAGCTAATTGCAAACGATATTTTAATTATATTAAAAAATGAATTTGGAATAGAAGTTAAAGATTATTTTATTGACTTAGATTTATTACAGCTAATAAACAGTGTGAAAAGAATGTATAGTGGAGACGACAACGGTGTTGATTTATACAAATTTGTTACCAAACATATATTTGTTAATCTTAATATTGACGAGAAAAATTACCCGTCTATTTTTAAGCACTATCTATTTTTTATTAACGAAGTAGAAGATCGGATAAAAAATAATTCATTATCTAGTAGTGTATCTAGTTTTAAGAAGATGTTTAAATCTCGAGATGGTATCACACTTACTACAGCACATAAAGTTAAAGGAAATGAGTATGATACTGTTATCGCTATTAATCTTCTAAACGGGAAAATTCCTCATTGGAATGAAATTTTTAATGTTTCTGATAAAGGAATTAGTTCAGCGAGAAAACTACTATACGTAATTTGTTCAAGAGCAAAAAATAATTTATTTCTTTTCTCAGAGGTGGGTTATTTTACGAGTAAAGGAGACTTGCTTTATCCCACTCAATTATTAGATAAAATAGAATTTGATTATAATATTTAAAATACCTAGGTAGTCGTTGTTTTAAATATAGTAGGAATCGGACGCTCAGTACGGAGCGTCTATTTTTTTACCCAATTTTGAAAGGAAGTGAACTTATGAAAATAAAAAATCAAGAATCAAAAGGTCGCTCTCCCCCCTTTAAAACCATCACACAAATAAGATTCATTCAAACATAAAAACAGAAAGGATAGGTAAAAATATGGAACTTAAATATGTCATTCCCAATATGGAAAAAACATTTGGACAATTAGAATATGCTGGTGAAGGGAACATTGAACAACGTCGAATAAATGGCAGACCAACCATTCTCTCTCGTAGTTACAATTTATACTCAACGATTCAACGAGCAGATGATATTGTTGTCATTCTTCCCTCCGAAGCTGGCGAGAAACATTTTGAATCCGACGAAAAAGTCAAACTCATCAACCCACATATTACCGCAGAAGGTTATAAAATTGGCAATCGAGGATTTACCAATTACATTATGCACGCAGACGATATGGTGAAAGCATAAGAAAGGAAAGGTGAAAAAATATGAGATTAGCAGAAGGTATTGTGATTGAAAAAGACCAGACATTTGGCACATTGAAATTTTCCGCCTTGCGTCGTGAGGTTCGTATCCAGAATGAAGATGGTACGGTTTCCGAAGAAATTAAAGAACGTACCTATGACTTAAAATCAAAAGGACAAGGACGCATGATACAAGTCAGTATCCCCGCTTCTGTTCCTTTGAAAGAATTTGACTACAACGCAGAAGTGGAATTAATCAATCCTGTGGCAGATACCGTAGCGACGGCTACTTTTCGAGGGGCAGACGTTGATTGGTACGTGAAAGCAGACGATCTTGTATTAAAAGGACAGACAAAACCTCATCAGAAATATAAAAAAGAAGCGTCCGAAAGTGAAAAATAGGTGTTGCTTATGACAAACACACCATTGATTTTGAAAGAAATTCCGAAAGATGAAGCCATTTCTTTTATTCGGCAATACCATTATTCAAAGATACTCCCTAGATTGTGTAAATACTTTCTAGGGATTTTTTCAGAAGAAAAATTATTAGGCGTTGTGGAATTAGGCTGGGGTACGCAACCCCTACAAACCATACGCAAACTCTTTCCCGACAGTTCCCTTCAAACCACAGATTATTTAGAAATTGGAAAGATGTGTTTTCTTCCAGAAATGAATCAAACCAATTATTTTGGCAGTCAAGCTCTTTCAGCTCTAATTAAGTGGTTGAAAGAACATACGGACTGTCATTTTTTATATACACTGGCAGATGGAATTGAGGGAAAATGTGGCTATGTCTATCAAGCGTCCAACTTCTTTTACTGCGGGTATTTCAAGACAAGTGTCTATCGTGATAAGCAGTCATGGGAAAAGATACACCCTCGAAGTGCTCGCCTTTTATTAGAGGAAAATGCTCGCTTTGAACAGGTAGAGAAAAAGCATTGGCTTTCCCAGGCATTTTGCGAATACAAAGGGATTGAGAAAATCAATGGACGCATGTTTCGCTATCTCTATCCGTTGACAAAAGAAGCGAAAAAACTGTTAGGACACACTCTCTATCGACGTCATTATTATCCGAAAGAAAAAAATTTACGCTTTGAAAAGCGAATCGCTTATCAGAAATATGAAGCCATTTCTCAACCAACTTTTGATAAACAGGCTCGTATCTACAATACACAATTATTTTGATAGGTGGAAAGGAGGATTTTTATGCCATTGCTTCATGACAGAGGAGAGCGAATCAAAGCCAACGATAAGCACTTGGTCTATCATTTTGTACTAATTTCATTGCTGGTAGTTTTTCTAGTCGTCCTACTCCCTTTTCATTGGAGAACGTTACAATCGGTGAACTGGCAAGCAGTTCAGTTAGATACATTTTTCTATCAACTTCATACGCCATACTTTTGGAGCAGTATTCTCACTGCTCTTTTTGTATGCGGACTTATCAGCTGGCTTTATTATCACTATCGTATAGATTCTATAAAACAGTTAGAGCACCGTCAAAAGTTAGCTCGTATGATTTTAGAAAATCATTGGTATGAAGCCGAAGAAACTCAATCAGAGGGATTCTTTAAAGATTTACCCAGCAAGAAAACCAAACAACGAATCCGCCATTTTCCTAAAATATATTATCGAATGAAAGATGGACTAATCCATATTCATGTAGAAATCACCTTAGGGAAATATCAAGATCAGCTTTTGCACCTAGAAAACAAACTAGAAACAGGATTGTATTGTGAATTAGTGGAAAAAACGTTGAAAGATTCTTATGTAGAGTATGTCCTACTTTATGATACTATTGGCAATCGAATTGGCATTGAAGACGTGGTAGCTCAAGATGGACGTGTCAAATTGATGGAATCGGTCTATTGGGAGTTCGATTCTCTCCCTCACATGTTAATTGCTGGGGGCACTGGTAGTGGAAAATCCTATTTTATTCTCACATTGATTGAATCTCTCCTGCATACAAATGCAAAGCTTTATATTCTTGACCCTAAAAATGCTGATTTGGCAGACTTAGGGGCGGTCATGAATAATGTCTATTACCGTAAAGAAGATATGTTGGCATGTATCAATCAATTTTACGAAGATATGATTGATCGCAGTGAAACCATGAAACAACACCCTAACTATAAAACAGGAGAAAATTATGCTTATCTTGGTTTGTCTGCCAATTTTCTTATTTTTGATGAATATGTGGCAATGATGGATATGCTAGGTCGTGAAAGTACCACCGTTATTCATAAACTCAAACAAATTGTAATGTTAGGACGACAAGCAGGCTTCTTTTTAATTCTTGCCTGTCAACGTCCAGACGCAAAATATTTTAGTGATGGGATTCGGGACAACTTTAACTTCCGTGTGGCTTTGGGTCGTATGTCTGAAATGGGCTTTGGTATGATGTTCGGAAGCGATACACAAAAACAATTTTTCTTAAAACCCATCAAGGGAAGAGGTTACGTGGATACAGGAAAAAGTGTGATTAGTGAGTTTTATACACCCCTTGTACCAAAAAGGTACGATTTCTTAGGAGAAATAGGAAAAGTCATTCAAAAAAAGCAATCTGAGCCTGTACCGCACGAAGTGAAAGGTACAGGTTCAGACTTGCTTTGATTGGTGTGGCGTTAGCCACGCCAATCCTTTAGCCCCCTCTATCTAACAGGGGGGCACAAATACAACTGAAAACAGGCAATTCTCATCAACCAATGTTGATGGTACAAAGGATTGCGGAAAATATGAAAGGTGTAAACTCAAGGGTCATAGTTTACATCTTTTTTAGATTGGAGGTTTGCGAATGGAAAACGAAAAAATTTGGATTAAGGAATTGAAAGAAAAGCGACTGGCTTATGGCGTTTCTCAAAATAAACTGGCGGTTGCTTCTCATATTACCAGACCTTACCTATCGGATATTGAAACAGGCAAGGCAGTCCCTACTCAACAGGTGAAAGAAGATTTACTGAACGCTTTGGAACGCTTCAATCCCGATAACCCATTGGAGATGTTATTCGACTATGTACGGATTCGATTCCCTACCAATGATGTGGCTCAAATTATCGGTGAGGTTTTACGTTTGAATATGGATTATATGCTACACGAAGACTTTGGCTATTATTCTTATCCCGAACACTATCGTTTCGGTGATATTGTTGTCCTAGTCTCTCATGATGTAAGTAAAGGTGTTTTATTAGAACTGAAAGGAAAAGGCTGTCGGCAGTTTGAAAACTTTCTATTGGCTCAACATCGGAGCTGGTATGATTTCTTTCAAGATTGCATGGAACATAAAGGTATTTTCAAACGCTTGGATTTAGCTATCAACGATAAAACAGGGATTTTGAATATTCCAGATTTGGCAAAGAAATTTAAACAGGAAGAATGCATTTCCGTCTTTCGAAGCTTTAAAAATTATCGCAGTGGTGAATTGGTTCACCGTGATGAAAAACCATACATGGGAAACACACTTTATATTGGCTCATTAAAAAGTGAAGTCTATTTCTGTATATATGAGAAAGATTATGAGCAATACGTGAAAAATGATGTTCCCTTAGAAGACGCAGAAGTAAAGAATCGGTTTGAAATTCGGTTAAAAAATGACCGAGCCACCCAAGCCATGAAAGATTTATTGGCACATCAACAGGCGGAAAAAACAGCCTTTGAAATTATCAATCGCTATATCCGCTTTGCAGATAAAGACGACACTAAACGTCGGAGTGATTGGAAAACTAATGAACGTTGGGAATGGTTTATCGGTAAAAATCGTGGAGCATTACGCCTAACCACACAGCCAGAGCCTTATTCTTTTGAACGAACATTGAACTGGTTACATCATCAAGTCGCCCCTACATTAAAAATCGCAAGCATTTTAGATGTTCTCAACGGTACAACCATTATCTCCACCATGATTCAGGAAGCCAAACTGACAGAAAAACATGAGAAATTAATTGAACAACAACATCTAGCCATGGAGGATTTGATTACATGAGCCTTTTAACAAAAGAATTAAAGAAGTTAGGGTTTCAGTGTGGCATTGAGTTTCAAGCGTATATACAAAATACAGGGAAATATACGTCTCTCATTATTGAGGGAAAACGGCAAGCTGGTGATACCATCTATACCTATGATTTTTACAAGGTGAGATTTTATAATAATTATACCAATCGAGTAACCGTCTATGGAGAGCATTTAACCCCTTTTCAATTATTAAGGCGTGTAAAAAGCTATATCTATTATCGAGAAAAATATCTTAAGGAAAGGAGGACAATCACATGAATTTTGGGCAGAATTTGTACAACTGGTTCTTGGATAATGCACAGTCATTGGTATTGTTAGCGATTGTTGTCATTGGACTGTTTTTAGGTTTTAAACGAGAATTTTCAAAACTCATTGGCTTCTTGATTATTGCTCTAATCGCCGTCGGACTTGTGTTCAATGCAGCTGGCGTGAAAGATGTGTTATTAAACTTATTTAACCGAATCATTGGTGCTTAACAGATATTTTTCATGATAAAATAGGAAGTATATATTTTGTTATGAAAGGATTTATGAATATGTTTACAAATGATCAATTTAAATCTCTTTTAATTAAAACATTAGAAAGAAAGAGCTCTTCAAATTATTATGAAGGAGGTAATGAGATTGTTTCTAAAATGAAAATATCAGAGGTAACTTTAGATGAGACTGACGATTTTACTTATTATAAAGGATATAAAAAGGGCTGGAATACGCTTTGCACATATCTTAAAATAAGAGTTCCTTTTGATGATTTAGACTTTTTTGAAAGTCATAAAGATTTGATTACCCAGACAGCAAGCTCCATATATGATAAACAAGGTGATAATGTATTAGTGGATACTATTTTAGTACCACTTCCAGAGAATTACGAAGTAATTAACTTTAGTCAGTTGAAAATTAGTGATGTGGTTTCACAAGCTATTGAAGACGCTGAGTCTTTTATGAGTAATGGTGAATATCAACGTGCCTTTGACAGAGTTCACACTGCTTTTCATGGATATTTAATTGAAATACTAAAAAAATATGAAATTACAGTTCCTAGAGACGAAAATCTATCTAAATTATATAGTAGGATACAACAATTAATTGAAAAAGAAATTCAACCTACTGAACTTGCTGATATAGTGAAGACAACGATAAGGTCATCAAATGGAATGATTAGCTCTCTTAATGAAGCAAGAAATAGGCATTCACTTGCACACCCTAATACAAATATTATTGGAAAGAGAGAAGCAAAACTAATAATAGGTATTTCAAGTACAGTTACAGATTATATTAGCGGATACCTTGATAAGTAGCGTCATTAACTGATTGCTACTTTTTTTATGACTATTTTTATAAAAAGGATGTGATAAGAATTGGAAATGAAAGTCTATGTGGCAAATTTAGGACGGTATAATGAAGGTGAATTAGTCGGAGCATGGTTTACTCCACCAATTGATGAGGAAGAAATGGCAGAAAGAATCGGTTTAAATGAGGACTACGAAGAATATGCAATACATGATTTTGAGCTTCCTTTTGATGTGGACGAATACACGCCGATTAGTGAAATCAACCGTCTATGTGAAGCCATTCAAGAAATCGAAGGTACACCTATTTATAATGAACTCAAAGAAATTCAAGGCATGTGGTTTAGTAGCTTGGAAGAATTACTGGAAAACAAAGAGGATATTCATTGTTATAGTGATTGTGATTCGATGGAAGATGTCGCCCGTTATTACGTGGAAGAAACAGGACAGCTTGGTGAAGTCCCTTCCAATTTACAAAATTATATTGACTACCAATCTTTGGGACGTGATATGGAAATAGAGGGTAATTACCTAGTTACCTCTCATGGGGTATTTGAATATTGTCAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP009681|2125564:2133731|2128279_2129053_+|WP_000185761.1|DBSCAN-SWA MTNTPLILKEIPKDEAISFIRQYHYSKILPRLCKYFLGIFSEEKLLGVVELGWGTQPLQTIRKLFPDSSLQTTDYLEIGKMCFLPEMNQTNYFGSQALSALIKWLKEHTDCHFLYTLADGIEGKCGYVYQASNFFYCGYFKTSVYRDKQSWEKIHPRSARLLLEENARFEQVEKKHWLSQAFCEYKGIEKINGRMFRYLYPLTKEAKKLLGHTLYRRHYYPKEKNLRFEKRIAYQKYEAISQPTFDKQARIYNTQLF >NZ_CP009681|2125564:2133731|2131840_2132131_+|WP_000055376.1|DBSCAN-SWA MSLLTKELKKLGFQCGIEFQAYIQNTGKYTSLIIEGKRQAGDTIYTYDFYKVRFYNNYTNRVTVYGEHLTPFQLLRRVKSYIYYREKYLKERRTIT >NZ_CP009681|2125564:2133731|2127892_2128270_+|WP_001234191.1|DBSCAN-SWA MRLAEGIVIEKDQTFGTLKFSALRREVRIQNEDGTVSEEIKERTYDLKSKGQGRMIQVSIPASVPLKEFDYNAEVELINPVADTVATATFRGADVDWYVKADDLVLKGQTKPHQKYKKEASESEK >NZ_CP009681|2125564:2133731|2127557_2127872_+|WP_000421279.1|DBSCAN-SWA MELKYVIPNMEKTFGQLEYAGEGNIEQRRINGRPTILSRSYNLYSTIQRADDIVVILPSEAGEKHFESDEKVKLINPHITAEGYKIGNRGFTNYIMHADDMVKA >NZ_CP009681|2125564:2133731|2129074_2130478_+|WP_001130245.1|DBSCAN-SWA MPLLHDRGERIKANDKHLVYHFVLISLLVVFLVVLLPFHWRTLQSVNWQAVQLDTFFYQLHTPYFWSSILTALFVCGLISWLYYHYRIDSIKQLEHRQKLARMILENHWYEAEETQSEGFFKDLPSKKTKQRIRHFPKIYYRMKDGLIHIHVEITLGKYQDQLLHLENKLETGLYCELVEKTLKDSYVEYVLLYDTIGNRIGIEDVVAQDGRVKLMESVYWEFDSLPHMLIAGGTGSGKSYFILTLIESLLHTNAKLYILDPKNADLADLGAVMNNVYYRKEDMLACINQFYEDMIDRSETMKQHPNYKTGENYAYLGLSANFLIFDEYVAMMDMLGRESTTVIHKLKQIVMLGRQAGFFLILACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVALGRMSEMGFGMMFGSDTQKQFFLKPIKGRGYVDTGKSVISEFYTPLVPKRYDFLGEIGKVIQKKQSEPVPHEVKGTGSDLL >NZ_CP009681|2125564:2133731|2130659_2131844_+|WP_020444628.1|DBSCAN-SWA MENEKIWIKELKEKRLAYGVSQNKLAVASHITRPYLSDIETGKAVPTQQVKEDLLNALERFNPDNPLEMLFDYVRIRFPTNDVAQIIGEVLRLNMDYMLHEDFGYYSYPEHYRFGDIVVLVSHDVSKGVLLELKGKGCRQFENFLLAQHRSWYDFFQDCMEHKGIFKRLDLAINDKTGILNIPDLAKKFKQEECISVFRSFKNYRSGELVHRDEKPYMGNTLYIGSLKSEVYFCIYEKDYEQYVKNDVPLEDAEVKNRFEIRLKNDRATQAMKDLLAHQQAEKTAFEIINRYIRFADKDDTKRRSDWKTNERWEWFIGKNRGALRLTTQPEPYSFERTLNWLHHQVAPTLKIASILDVLNGTTIISTMIQEAKLTEKHEKLIEQQHLAMEDLIT >NZ_CP009681|2125564:2133731|2125564_2127358_+|WP_000181735.1|DBSCAN-SWA MTNIFEKIVNDLNLEQKDVVESEDNLYVNACPGSGKTRVLTRKIAYQAIKHDGSLKRIIAITYTNRAAEEIKERLSLLSIDDDINIWVGTIHQFCLEFIIYPFKMNLSRVSKGFTIIDDYTQRAYVSQINNMLNLNLKTYELNKIDLSLSHDFKINEVQYTQVSEMYHTMLEKNKEIDFDMILLVAYKILTVNSNVARNIASNIRAIYVDEFQDTRELQYNVIAKLLQNNPQIQSMFVGDIDQAIYGSLDGIAKSVEELEMLTSHTFQSKTLHGCYRSNQRLVDFYSNFQSCPYEIESRGNNKNDRGFISYDCKVTKEDLPNIIKNIIKEKIESGIHEKDICVLAPQHYPLFSLGEYLKKELPYCNFDAINISPIKVNNHSLFFKLAILYFTESGEKVRRRKLIANDILIILKNEFGIEVKDYFIDLDLLQLINSVKRMYSGDDNGVDLYKFVTKHIFVNLNIDEKNYPSIFKHYLFFINEVEDRIKNNSLSSSVSSFKKMFKSRDGITLTTAHKVKGNEYDTVIAINLLNGKIPHWNEIFNVSDKGISSARKLLYVICSRAKNNLFLFSEVGYFTSKGDLLYPTQLLDKIEFDYNI >NZ_CP009681|2125564:2133731|2133236_2133731_+|WP_000870467.1|DBSCAN-SWA MKVYVANLGRYNEGELVGAWFTPPIDEEEMAERIGLNEDYEEYAIHDFELPFDVDEYTPISEINRLCEAIQEIEGTPIYNELKEIQGMWFSSLEELLENKEDIHCYSDCDSMEDVARYYVEETGQLGEVPSNLQNYIDYQSLGRDMEIEGNYLVTSHGVFEYCQ >NZ_CP009681|2125564:2133731|2132390_2133170_+|WP_000675717.1|DBSCAN-SWA MKGFMNMFTNDQFKSLLIKTLERKSSSNYYEGGNEIVSKMKISEVTLDETDDFTYYKGYKKGWNTLCTYLKIRVPFDDLDFFESHKDLITQTASSIYDKQGDNVLVDTILVPLPENYEVINFSQLKISDVVSQAIEDAESFMSNGEYQRAFDRVHTAFHGYLIEILKKYEITVPRDENLSKLYSRIQQLIEKEIQPTELADIVKTTIRSSNGMISSLNEARNRHSLAHPNTNIIGKREAKLIIGISSTVTDYISGYLDK >NZ_CP009681|2125564:2133731|2132127_2132349_+|WP_001009054.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYNWFLDNAQSLVLLAIVVIGLFLGFKREFSKLIGFLIIALIAVGLVFNAAGVKDVLLNLFNRIIGA |
10 | Streptococcus_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2136883 : 2152897
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP009681|2136883:2152897|DBSCAN-SWA 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14 | Streptococcus_phage(76.92%) | integrase | attL 2141046:2141060|attR 2156976:2156990 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
2188602 : 2282189
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP009681|2188602:2282189|DBSCAN-SWA 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MSILEKIFKTRKDITYMLDLDMIEDLSQQAYVKRLAIDSCIEFVARAVAQSHFKVLEGNRIQKNDVYYKLNIKPNTDLSSDSFWQQVIYKLIYDNEVLIVVSDSKELLIADSFYREEYALYDDIFKDVTVKDYTYQRTFTMQEVIYLKYNNNKVTHFVESLFEDYGKIFGRMIGAQLKNYQIRGILKSASSAYDEKNIEKLQAFTNKLFNTFNKNQLAIAPLIEGFDYEELSNGGKNSNMPFSELSELMRDAIKNVALMIGIPPGLIYGETADLEKNTLVFEKFCLTPLLKKIQNELNAKLITQSMYLKDTRIEIVGVNKKDPLQYAEAIDKLVSSGSFTRNEVRIMLGEEPSDNPELDEYLITKNYEKANSGENDEKEKDENTLKGGDEDESGD >NZ_CP009681|2188602:2282189|2216985_2217426_-|WP_000335332.1|DBSCAN-SWA MCKSKILLKNIFSEESEVKDLTEEKYNQDYEALTFSFKEETYQSRLAKKTPTKSGYFVTCWTKDEDNYNRPYKIEEFADYLIVAVIDDELNGYFLFPRELLVEKGILASSKYQGKMAFRVYPKWCNQLNKTAGQTQKWQCKYFFEY >NZ_CP009681|2188602:2282189|2251096_2252758_-|WP_000625088.1|terminase|DBSCAN-SWA MISNKYVDEYINLWKQGKIILNKERIDLFNYLQKHIYSRDDVYFDEQKIEDCIKFIEKWYFPTLPFQRFIIANIFLIDKNTDEAFFTEFAIFMGRGGGKNGLISAISDFLSTPLHGVKEYHISIVANSEDQAKTSFDEIRTVLMDNKRNKTGKTPKAPYEVSKAKIINRATKSVIRYNTSNTKTKDGGREGCVIFDEIHYFFGPEMVNVKRGGLGKKKNRRTFYISTDGFVREGYIDAMKHKIASVLSGKVKNSRLFAFYCKLDDPKEVDDRQTWEKANPMLHKPLSEYAKTLLSTIEEEYNDLPFNRSNKPEFMTKRMNLPEVDLEKVIAPWKEILATNREIPNLDNQMCIGGLDFANIRDFASVGLLFRKNDDYIWLGHSFVRQGFLDDVKLEPPIKEWEKMGLLTIVDDDVIEIEYIVDWFLKAREKYGLEKVIADNYRTDIVRRAFEDAGIKLEVLRNPKAIHGLLAPRIDTMFAKHNVIYGDNPLMRWFTNNVAVKVKPDGNKEYIKKDENRRKTDGFMAFVHALYRADDIVDKDMSKALDALMSIDF >NZ_CP009681|2188602:2282189|2233747_2233924_-|WP_011447039.1|holin|DBSCAN-SWA MDRWWLSEYKEVVPMVALLKSLERRRLMITISTMLQFGLFLIALIGLVIKLIELSNKK >NZ_CP009681|2188602:2282189|2192925_2193720_-|WP_001096887.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >NZ_CP009681|2188602:2282189|2246678_2247083_-|WP_000114225.1|DBSCAN-SWA MSVKVIGDKALERELEKRFGIKEMVKVQDKALIAGAKVIVEEVKKQLKPSKDTGALINEVSFSKPEWINGKRTITVHWRGSKDRYKIVHLIEYGHVQKETGKFIKPKAMGGVNRAIRQGQNKYFETLKRELKKL >NZ_CP009681|2188602:2282189|2254208_2254409_-|WP_000265039.1|DBSCAN-SWA MWITMTIVFAILLLVCISINSDRAREIQALRYMNDYLLDEVIKTKGYNGLEEYRIELKRMNNDIKK >NZ_CP009681|2188602:2282189|2263990_2264152_-|WP_000066020.1|DBSCAN-SWA MSNIYKSYLVAVLCFTVLAIVLMPFLYFTTAWSIAGFASIATFIFYKEYFYEE >NZ_CP009681|2188602:2282189|2255733_2256267_-|WP_031868690.1|DBSCAN-SWA MTFTLSDEQYKNLCTNSNKLLDKLHKALKDREEYKKQRDELIGDIAEVKRKAKAFDEIDNLIYEVFEMMNCFKFSFINENKELILDSESNIFFSLKDCANKLDLVVKFIHWVSRSCIENMSPERTQVFLQTGFELYIGKHLTKKDYEYMYTCFGNGLNSDGAYSYARRLLNIPEGIQ >NZ_CP009681|2188602:2282189|2218991_2219411_-|WP_000397416.1|DBSCAN-SWA MEFTYSYLFRMISHEMKQKADQKLEQFDITNEQGHTLGYLYAHQQDGLTQNDIAKALQRTGPTVSNLLRNLERKKLIYRYVDAQDTRRKNIGLTTSGIKLVEAFTSIFDEMEQTLVSQLSEEENEQMKANLTKMLSSLQ >NZ_CP009681|2188602:2282189|2205018_2205408_+|WP_000886005.1|DBSCAN-SWA MAFTLSAIQQAHQQFTGVDFPKLFKAFKDMGMTYNIVNIQDGTATYVHQSEDDIVTSSVKSNHPVAQKSNKTIVQDVLTRHQQGQTDFETFCDEMAEAGIYKWHIDIQAGTCTYIDLQDQAVISELIPQ >NZ_CP009681|2188602:2282189|2234073_2234370_-|WP_042857037.1|DBSCAN-SWA MGWFKKHEHEWRIRRLEENDKTMLSTLNEIKLGQKTQEQVNIKLDKTLDAIQKEREIDEKNKKENDKNIRDMKMWVFGLVGTIFGSLIIALLRMLMGI |
111 | Staphylococcus_phage(76.06%) | holin,integrase,head,terminase,portal,capsid,tail,transposase,protease | attL 2224378:2224397|attR 2273944:2273963 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
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NZ_CP009681.1|WP_000979209.1|2256263_2256611_-|hypothetical-protein |
2256263_2256611_-
Protein sequences of NZ_CP009681.1|WP_000979209.1|2256263_2256611_-|hypothetical-protein>NZ_CP009681.1|WP_000979209.1|2256263_2256611_-|hypothetical-protein MMLKFKAWDKDKKVMSIIDEIDFNSGYILISTGYKSFNEVKLLQYTGFKDVHGVEIYEGDIVQDCYSREVSFIEFKEGAFYITFSNVTELLSENDDIIEIVGNIFENEMLLEVMR |
115 aa aa | NA | NA | NA | 2188602-2282189 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009681 position: 2211260-2211232, mismatch: 1 tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaagcaatgca Protospacer *********************.******* 2. spacer 5.1|1731981|29|NZ_CP009681|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009681 position: 2211315-2211287, mismatch: 1 tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaagcaatgca Protospacer *********************.******* |