Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026051 | Proteus mirabilis strain FDAARGOS_67 chromosome, complete genome | 5 crisprs | c2c9_V-U4,DinG,csa3,DEDDh,cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3,RT,PD-DExK | 1 | 8 | 7 | 0 |
1. NZ_CP026051
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026051_1 | 946311-946644 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of NZ_CP026051_1
|
5 spacers
spacers of NZ_CP026051_1
>1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT TAATGAAGCAAAAGAAAACGGAATTAAAGTCA >1.2|946401|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTTCTCTTCTGCATCGGTACCCCCATGTGC >1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGATAAGGAACATCAGACAACAGCATCAGGC >1.4|946523|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTATCCAGAAAAACCTGAGCAATCACTCACT >1.5|946584|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTCAATTCCCCTTTGTCTAAATGGTCTAAAG |
cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026051_1
The CRISPR arrays of NZ_CP026051_1 >merge|NZ_CP026051|1|946311-946644|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTATCCCCGTATACACGGGGAACACTAATGAAGCAAAAGAAAACGGAATTAAAGTCACGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACAGGTTCTCTTCTGCATCGGTACCCCCATGTGCCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACGGGATAAGGAACATCAGACAACAGCATCAGGCCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACAGTATCCAGAAAAACCTGAGCAATCACTCACTCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACACTCTCAATTCCCCTTTGTCTAAATGGTCTAAAGCGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP026051|1|1|946311-946644|CRISPRCasFinder TAATTTATCCCCGTATACACGGGGAACAC TAATGAAGCAAAAGAAAACGGAATTAAAGTCA CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC AGGTTCTCTTCTGCATCGGTACCCCCATGTGC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GGGATAAGGAACATCAGACAACAGCATCAGGC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC AGTATCCAGAAAAACCTGAGCAATCACTCACT CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC TCTCAATTCCCCTTTGTCTAAATGGTCTAAAG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP026051|1|1|946311-946644|CRT TAATTTATCCCCGTATACACGGGGAACAC TAATGAAGCAAAAGAAAACGGAATTAAAGTCA CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC AGGTTCTCTTCTGCATCGGTACCCCCATGTGC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GGGATAAGGAACATCAGACAACAGCATCAGGC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC AGTATCCAGAAAAACCTGAGCAATCACTCACT CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC TCTCAATTCCCCTTTGTCTAAATGGTCTAAAG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC >NZ_CP026051|1|1|946372-946644|PILER-CR CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC AGGTTCTCTTCTGCATCGGTACCCCCATGTGC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC GGGATAAGGAACATCAGACAACAGCATCAGGC CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC AGTATCCAGAAAAACCTGAGCAATCACTCACT CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC TCTCAATTCCCCTTTGTCTAAATGGTCTAAAG CGGTTCATCCCCGTATACACGGGGAACAC
>NZ_CP026051.1|WP_036918635.1|944918_946142_-|alanine-racemase MPLAIRYLALLPLFVITACQQPVNYNPPATQVAQVQPAIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGKQSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPIMIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMAQATSYNVEELIGDLDMAKRLDAIAKQQNKVIPIHLALNSGGMSRNGLEVDNKSGLEKAKQISQLANLKVVGIMSHYPEEDANKVREDLARFKQQSQQVLEVMGLERNNVTLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSNIASINYYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIAGQRVPVLGKTSMNTVMVDITSLNNIKPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >NZ_CP026051.1|WP_036918632.1|942441_944841_+|membrane-bound-PQQ-dependent-dehydrogenase,-glucose/quinate/shikimate-family MKISHFYRWIVFIILTILALYFTVLGGYLVSLAGSPFYLFTGVMLLIIAACFLSRKKSTLLLFNFLFLITIVWSIWESGFDFWALAPRLDIIFILGLLLIPFTLNNNVYTCRTNKIGLFTLLATTLIIILGSSLTDPHAINGQFTQQQPTNSISPIGVNDNDWPAYGRTQAGIRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTGDEKRANDAVEITNEVTPIKIEDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYNQNNSAEFAKSLDVRQPSISDECPEKVFLPVNDGRLIAVNAQTGNACRDFGQNGEINLLASMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTQEPSGVIRGYDVNSGKLIWVFDTGAEDPNVMPGKETQFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSVLALKGSTGELLWHFQTTHHDLWDMDVPSQPSLVDIKTDKNETIPAIYIVTKTGNVFVLDRRDGTPIVPVTEKPVPTSVKYGPQTQGEHYSPTQPFSALNLAPKNKLQGSDMWGGTMADQLLCRIAFHQFNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPQDSQAIDAGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLTKNELVWQQRFGTIRDSLPNLVELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIGGKQYVVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNL >NZ_CP026051.1|WP_004247166.1|942067_942211_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP026051.1|WP_004247166.1|941526_941670_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP026051.1|WP_004247166.1|940985_941129_+|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP026051.1|WP_017827864.1|938505_940650_+|phosphate-acetyltransferase MSRTIMLVPTDTRVGLTSVSLGVIRSMEQKGVRLSVFKPIAQPRVKGALDQTTAIIRSHSTIQSAEPLNMDYVESLLSSNKKDVLMEEIVARYHENTADAEVVLIEGLVPMRKHPFAQSLNYEIAKTLGAEIVFVTALGNNTAEQLKERIEFARAEFGGVKNQNITGVIVNKLNAPVDDQGRTRPDLSEIFDDSSKAIISNIDLNTIEKNSPLPLLGCIPWNFDLIATRATDMAKHLNATIVNKGDIETRRIKSVTFCARSIPHMLEHFRPGSLLVTSADRPDVLVSACLAAMNGVEIGAILLTGGYQIDAPIKQLCERAFETGLPIFMVNSNTWQTSLNLQSFSLEVPADDHERIEKIQNYVAQHINNQWIDSLTANSERPNRLSPPAFRYQLTELARKAKKRIVLPEGDEPRTVKAASICAERGIATCVLLGDPEEIRRVAAAQGVELGTGIELVNPKEVREIYVPRLVELRKNKGMTEVVAREQLEDNVVLGTLMLEKGVVDGLVSGAVHTTANTIRPPLQLIKTAPGSSLVSSVFFMLLPEQVYVYGDCAINPDPTAEQLAEIAIQSADSAKAFGIDPRVAMISYSTGNSGAGSDVEKVREATRLAQEKRPDLIIDGPLQYDAAVMADVAKSKAPNSPVAGKATVFIFPDLNTGNTTYKAVQRSADLVSIGPMLQGMRKPVNDLSRGALVDDIVYTVALTAIQASQQENA >NZ_CP026051.1|WP_004243716.1|937225_938428_+|acetate-kinase MSSKLVLVLNCGSSSLKFAIINPENGEEFLSGLAECFNLPEARLKWKMDGQKHEAALGAGAAHSEALNFIVNTILAEKPELSQQIAAIGHRIVHGGEKFTKSVVITDEVIKGIEAAIPFAPLHNPAHLIGIEEARKAFPHLINKMVAVFDTAFHQTMPEEAYLYALPYSLYKDHSIRRYGAHGTSHFFVSREAAKMLNKPVDELNVITCHLGNGGSVSAIVNGKCVDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPAIVFHLHDTLGMSVEDINKLLTKESGLLGLTEVTSDCRYVEDNYETKADAKRAMDVYCHRLAKYIGSYCALMEGRLDAIIFTGGIGENAAMVRELSLKKLALLGFEVDHQRNLDARFGKSGTITTDNSRLAVVIPTNEELVIAQDASRLTA >NZ_CP026051.1|WP_004243712.1|936378_936834_-|DUF412-domain-containing-protein MNEPTVTPPGFFKKLRLGNEYLKTWPVEKQLAPVFPENRMIKATRFGIRYMPPIAIFTLTWQIALGGDLGPAITTALFACSLPMQGLWWLGKRAATPLPAVLLNWFYEIREKFEQAGIALAPVEKTPTYLSLAHLLKRAFKQLDRSFLDDV >NZ_CP026051.1|WP_023843594.1|935743_936238_-|YfbU-family-protein MEMTHAQRLILSNQYKMMTMMDPDNAERYRRYQTIIERGYGLQLRELDRDFDEMSEETCRTIINIMEMYHALQVSRENLKSPEMPDARRVAFMGFDAATESRYLSYVRFMVNTEGRYTHFDSGSHGFNSQTPMWEKYQRMLAVWLACPRQYHLSSVEIQQILNA >NZ_CP026051.1|WP_004243707.1|935046_935709_-|sugar-phosphatase MTITCKGFLFDLDGTLVDSLPVVEYCWALFGERVGVSTQEINNYIHGKPAIESIRHFMPNATQAQIEETFRWLEKLEATQTEGLAPLPGAIELINRLNDLAIPWAIVTSGTVPIASTRQSVTGIPEPKHWVTAECITQGKPNPEPYLLGAKKLGLAPKECVVFEDAAAGIYSGLDAGCQVIAVHAPISLPRRNEIDLIIDSLNDLQIDKENQQVVIKHKC >NZ_CP026051.1|WP_017627993.1|946702_946999_-|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMIVVVTEAVPPRLRGRLAVWLLEVRAGVYVGNVSARIREMIWQQINEFAEDGNVVMAWGTNTESGFDFQTYGENRREPIDFDGLRLVLFKPYKEDV >NZ_CP026051.1|WP_036918638.1|947001_947922_-|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFIPLRPIPIKDRHSMIFIGMGRIDVKDGAFVVIDEINGERMLIPVGSLACILLEPGTRISHAAVKLAATVGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDKLLYQAKLALDNDLRLKVVRKMFELRFGESAPLKRSVDQLRGIEGARVRKQYQMLAKKFKIDWKGRRYDPKDWEARDIINRCISAATACLYGVTEAAILAAGYAPAIGFVHTGKPLSFVYDIADIIKFDTVVPVAFKVASYKAIAPDREVRIACREAFRKYQTLNKLIPLIEEVLSAGEITPPEPPIDAQPPAIPQAHPFGDEGHREK >NZ_CP026051.1|WP_036918640.1|947922_948600_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRISIDYSADYLHSLLANKLPDGYTIHQLLWRLFTEEKERSFLYRLEIGKNGKPIFYILSSIAPTTKNNFFKIETKPFLPKLVKKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKRHRHDVLMHAKKQAQLDGKDYSHDDIHHLMQQAALNWISSDDRLNKWGISLTQLPDIKAYTPERIKKPSGKIMSFSSVDYQGVLTIEEPHLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRNI >NZ_CP026051.1|WP_036918643.1|948599_949337_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTTQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP026051.1|WP_036918645.1|949349_950384_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKNWVELIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP026051.1|WP_052124564.1|950423_951011_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATTEDIERWATIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQKNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP026051.1|WP_036918648.1|950997_952596_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRDGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVRYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLKSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFTEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP026051.1|WP_036918650.1|952592_955286_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDIGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWSLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKNEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDGWFNAFNQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEDQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTETVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARQLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKINKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDHYYQYDHLIGFCERQELS >NZ_CP026051.1|WP_004243721.1|956179_957436_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP026051.1|WP_012368108.1|957446_957734_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026051_2 | 955532-956049 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of NZ_CP026051_2
|
8 spacers
spacers of NZ_CP026051_2
>2.1|955561|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCAT >2.2|955622|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACAC >2.3|955683|33|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTG >2.4|955745|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCG >2.5|955806|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAA >2.6|955867|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATAGCGATTAACATTAGTAACATTGAACG >2.7|955928|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTT >2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAG |
cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026051_2
The CRISPR arrays of NZ_CP026051_2 >merge|NZ_CP026051|2|955532-956049|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATTCATCCCCGTACATACGGGGAACACTTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCATCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACACCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACGACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACGATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAACGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACGAAATAGCGATTAACATTAGTAACATTGAACGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACAGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTTCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACACTAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAGCGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP026051|2|2|955532-956049|PILER-CR CGATTCATCCCCGTACATACGGGGAACAC TTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCAT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GAAATAGCGATTAACATTAGTAACATTGAACG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP026051|2|2|955532-956049|CRISPRCasFinder CGATTCATCCCCGTACATACGGGGAACAC TTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCAT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GAAATAGCGATTAACATTAGTAACATTGAACG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >NZ_CP026051|2|2|955532-956049|CRT CGATTCATCCCCGTACATACGGGGAACAC TTATTACGCTCACCGCGTGCTGGTCTAGTCAT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TGGGGTTCAGCGGGCAAGCGGTATTCGAACAC CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TATTGAGATCCCACGATGAAAAGGAACGTACTG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GACAATCGACAAATATTCACCCAACAAATCCG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATCAGGAAGCGGTAGATACCGAGGTGAGTAA CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GAAATAGCGATTAACATTAGTAACATTGAACG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AGCCTGCTCTTCACCAGAAAGACCATGAATTT CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TAATGGCTCATCGGTGTTAAAGTTATCCATAG CGGTTCATCCCCGTGCATACGGGGAACAC
>NZ_CP026051.1|WP_036918650.1|952592_955286_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDIGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWSLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKNEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDGWFNAFNQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEDQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTETVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARQLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKINKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDHYYQYDHLIGFCERQELS >NZ_CP026051.1|WP_036918648.1|950997_952596_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRDGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVRYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLKSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFTEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP026051.1|WP_052124564.1|950423_951011_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATTEDIERWATIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQKNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP026051.1|WP_036918645.1|949349_950384_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKNWVELIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP026051.1|WP_036918643.1|948599_949337_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTTQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP026051.1|WP_036918640.1|947922_948600_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRISIDYSADYLHSLLANKLPDGYTIHQLLWRLFTEEKERSFLYRLEIGKNGKPIFYILSSIAPTTKNNFFKIETKPFLPKLVKKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKRHRHDVLMHAKKQAQLDGKDYSHDDIHHLMQQAALNWISSDDRLNKWGISLTQLPDIKAYTPERIKKPSGKIMSFSSVDYQGVLTIEEPHLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRNI >NZ_CP026051.1|WP_036918638.1|947001_947922_-|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFIPLRPIPIKDRHSMIFIGMGRIDVKDGAFVVIDEINGERMLIPVGSLACILLEPGTRISHAAVKLAATVGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDKLLYQAKLALDNDLRLKVVRKMFELRFGESAPLKRSVDQLRGIEGARVRKQYQMLAKKFKIDWKGRRYDPKDWEARDIINRCISAATACLYGVTEAAILAAGYAPAIGFVHTGKPLSFVYDIADIIKFDTVVPVAFKVASYKAIAPDREVRIACREAFRKYQTLNKLIPLIEEVLSAGEITPPEPPIDAQPPAIPQAHPFGDEGHREK >NZ_CP026051.1|WP_017627993.1|946702_946999_-|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMIVVVTEAVPPRLRGRLAVWLLEVRAGVYVGNVSARIREMIWQQINEFAEDGNVVMAWGTNTESGFDFQTYGENRREPIDFDGLRLVLFKPYKEDV >NZ_CP026051.1|WP_036918635.1|944918_946142_-|alanine-racemase MPLAIRYLALLPLFVITACQQPVNYNPPATQVAQVQPAIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGKQSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPIMIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMAQATSYNVEELIGDLDMAKRLDAIAKQQNKVIPIHLALNSGGMSRNGLEVDNKSGLEKAKQISQLANLKVVGIMSHYPEEDANKVREDLARFKQQSQQVLEVMGLERNNVTLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSNIASINYYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIAGQRVPVLGKTSMNTVMVDITSLNNIKPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >NZ_CP026051.1|WP_036918632.1|942441_944841_+|membrane-bound-PQQ-dependent-dehydrogenase,-glucose/quinate/shikimate-family MKISHFYRWIVFIILTILALYFTVLGGYLVSLAGSPFYLFTGVMLLIIAACFLSRKKSTLLLFNFLFLITIVWSIWESGFDFWALAPRLDIIFILGLLLIPFTLNNNVYTCRTNKIGLFTLLATTLIIILGSSLTDPHAINGQFTQQQPTNSISPIGVNDNDWPAYGRTQAGIRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTGDEKRANDAVEITNEVTPIKIEDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYNQNNSAEFAKSLDVRQPSISDECPEKVFLPVNDGRLIAVNAQTGNACRDFGQNGEINLLASMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTQEPSGVIRGYDVNSGKLIWVFDTGAEDPNVMPGKETQFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSVLALKGSTGELLWHFQTTHHDLWDMDVPSQPSLVDIKTDKNETIPAIYIVTKTGNVFVLDRRDGTPIVPVTEKPVPTSVKYGPQTQGEHYSPTQPFSALNLAPKNKLQGSDMWGGTMADQLLCRIAFHQFNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPQDSQAIDAGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLTKNELVWQQRFGTIRDSLPNLVELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIGGKQYVVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNL >NZ_CP026051.1|WP_004243721.1|956179_957436_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP026051.1|WP_012368108.1|957446_957734_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL >NZ_CP026051.1|WP_004243724.1|957763_958207_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLKTLLTPDVVQVIPQVKDWREAIKIACQPLIDKGCIEPRYVDAIYKSHEQIGPYYVLGPGIAMPHARPEEGVNQLSLALTIIEKGVEFGADENDPVKLLIVLAATDNDSHINAIVKLAELFDNQDDIDTLLQAKSKAEVLAVINHY >NZ_CP026051.1|WP_036918652.1|958433_959480_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MIKTRKRRNTGRVTLQEVAKHAGVGSMTVSRALRTPELVSDKLREKVNQAVAELGYIPNASAGALASAQSHIIAVLLPSFTDKASADFMQSLQQILSHHHYQILVGCYEYQLHKATDVINMLLQSNPAALVAFGSQLSDVQFLHISNANVPVVSVASQSNEQSAISIDCGYEKAAFDLTHYLIQQGKRCVGYVGALQGQRLHHQQITGWSRALLKNYLNAEQSVTTPDPASMAYGRQALTEILLRQPELDAVICSHESIALGMMFECQRRLIKIPQDLAIACLEGSENSAQIAPSLTSIHFNYHKIGKEAGKHLIALLQHLRDEVDNAMFENTVINYAYRLELGQSTP >NZ_CP026051.1|WP_004243726.1|959476_960019_-|NUDIX-hydrolase-YfcD MEQENTAVVEWVDIVDEKNEVVAQATRQQMRAENLRHRATYIVVHDGMGKILAQRRTETKDFYPGWLDATAGGVVQQGENALESARREAEEELGIAGVPFAEHGQFYYDDESCRVWGSLFSCVSHGPFALQPEEIEEVCWLTPLEITERCDEFTPDSLKALSLWLTRNNSTRLDTKETTD >NZ_CP026051.1|WP_004250689.1|960215_960830_+|glutathione-S-transferase-N-terminal-domain-containing-protein MIDLYYANTPNGQKITLFLEEVAMPYTLHHVDIGKGDQFKPEFLAISPNNKIPAIVDNAPADGGEPLSIFESGAILIYLAEKSGKLLSHDLREKMTQLQWLFWQVGGFGPMLGQNHHFTRYAPEKVPYAINRYTKETERLYQVLESRLAQSPYLGGNDYSIADIATYTWARYHDTHHIDLADYPAVEKWLNTISQRPAAKKLFG >NZ_CP026051.1|WP_036918654.1|960894_961800_+|TIGR01777-family-protein MNILITGGTGLIGRALICQLALDKHNITVLSRSPQKVYSHFCNEMACWTHLDDKENLNQFDAVINLAGEPIADKRWTPEQKQTLVNSRCKLTQKLVDLIKASDSPPGVLISGSAVGFYGDQGENNVTEETPPKDEFTHQLCAKWENIALDAQTPLTRVCLLRTGIVLSTKGGALPKMSPPFKLGLGGKLGNGKQYMPWIHIDDMVNAIVFLLNNNNTQGAFNLTAPHPVQNKAFTTTLAHILKRPAFMTVPATILKLMMGESATLVLGGQQAFPKKLLDAGFSFRYPQLEGALEDIIRHKK >NZ_CP026051.1|WP_017827869.1|961819_962401_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKLIVGLTGASGAIYGIRLLEILKSVPSVETHLVISQAARRTISLETDYSLKDIHALADIIYDDRDIGATISSGSFRVNGMVILPCSIKSLSGIVHSYTDTLVTRAADVVLKEGRKLVLCVRETPLHLGHLRLMTQAAELGAIIMPPVPAFYFQPKTIDDIVNQTVNRVLDQFDIDLPDDLFQRWQGDKPAR >NZ_CP026051.1|WP_004243730.1|962522_964040_-|amidophosphoribosyltransferase MCGIVGIAGVNPVNQSIYDALTVLQHRGQDAAGIATIDENNGFRLRKANGLVKDVFETRHMLRLKGTIGIGHVRYPTAGSSSASEAQPFYVNSPFGITLAHNGNLTNAHLLRRQLFETARRHINTTSDSEILLNVLAYELDRFDHFPLEPDNIFTAVAAMHKKLRGAYACVALIIGHGLLAFRDPYGIRPLVLGKRTLEDGRSEYMVASESVALDTLGFEFLRDVAPGEAVYITEQGQLFTRQCAENPQLVPCLFEYVYFARPDSFIDKISVYNARLRMGQKLGAKIAKEWEDLQIDVVIPIPETSCDIALEIAHILNKPYRQGFVKNRYVGRTFIMPGQQERRKSVRRKLNANRAEFRDKNVLLIDDSIVRGTTSEQIVELAREAGAKKVYFASAAPEVRFPNVYGIDMPNANELIAHGREVDEIRKLIGADGLIFQDLSDLIAAVQEENPDINQFECSVFDGVYITKDIDQGYLDYLENLRRDDEHKIRDQHEAENLEIYNEG >NZ_CP026051.1|WP_004243731.1|964070_964562_-|colicin-V-production-protein MVWIDYAIIAIIGFSALVSLIRGFVREALSLITWGCGFFVASQFYPYLAVYFTRFEDELVRNGIAIVTLFIATLIVGAVINYVISSLVQRTGLSGTDRVLGICFGALRGVLIVSALLFVLGAFTPMADSADWQRSELIPQFNHIIRWFFDYLQNASSFVSEKM |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026051_3 | 1226678-1226820 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026051_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP026051_3
>3.1|1226701|37|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA >3.2|1226761|37|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026051_3
The CRISPR arrays of NZ_CP026051_3 >merge|NZ_CP026051|3|1226678-1226820|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGGTGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAAGGTGATATCAATTTTACAGGTGGCGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTATGGTAATACCAACTTTACTGGTGG >NZ_CP026051|3|3|1226678-1226820|CRISPRCasFinder GGTGATATCAATTTCACAGGTGG TGGCGCTGGTAATGTCATTAAATCTGATGTTACACAA GGTGATATCAATTTTACAGGTGG CGGCATAGCAAATGTAATAAAACATAACTCTAATTAT GGTAATACCAACTTTACTGGTGG
>NZ_CP026051.1|WP_036905137.1|1224761_1224989_+|hypothetical-protein MIHIPASGFIYMASIIKSMLENPCINKEFEKLIAADLLPILQNETNMTENFTALHLIKKTNNRRIILYKNLFIIN >NZ_CP026051.1|WP_164527127.1|1224614_1224761_+|hypothetical-protein MAINEKFVQEISSINYNNGIFSLYFVGQDPHKIAQGIMPEKDEELALK >NZ_CP026051.1|WP_004244067.1|1221343_1223941_-|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase MLEEYRKHVAERAAEGVVPKPLDATQTAALVELLKSPPKGEEEFLLDLIVNRVPPGVDEAAYVKAGFLTALAKGETTSPLITPEKAVELLGTMQGGYNIHALIEALDNDKLAPIAAKALSHTLLMFDSFYDVEEKAKAGNVYAKQIMQSWADGEWFTERPELAEKITVTVFKVTGETNTDDLSPAPDAWSRPDIPLHALAMLKNAREGIEPDQPGSVGPIKQIEALNKKGFPLAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFMGDDIPYVPNKRGGGVVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIEVDVSKLNMGDVIDIYPYKGEIRNHETNELLETFALKTEVLIDEVRAGGRIPLIIGRGLTSKARSALGLPPSTLFRHAKAVEQSDRGFSLAQKMVGRACGRDGIRPGEYCEPKMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVRFKGKMQPGVTLRDLVHAIPLYAIKEGLLTVEKKGKKNIFSGRILEIEGLPELKVEQAFELADASAERSAAGCTIKLDKAPIIEYLQSNIVLLKWMIAEGYGDRRTLERRITAMENWLADPQLLEADADAEYAAVIEIDLNEIKEPILCAPNDPDDARLLSEVANSKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLDQHKGQLPTRLWVAPPTKMDAAQLTEEGYYSVFGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRLGTGANVYLASAELAAVASLLGRLPEPQEYLDFINKVDETAEDTYRYLNFDQLEQYTDKATQVIFQTTV >NZ_CP026051.1|WP_004244066.1|1220801_1221173_-|YacL-family-protein MDYEFQRDLTGGILARFSMDHEAIGYWLNDEIQGDISLIDQILTEMDEVKGSEKQWQLIGKEYSLSIDDEEIMVRANTLHFETDDLEEGMSYYDNESIAFCGLDDFATMLQKYRLFILENRRS >NZ_CP026051.1|WP_004248539.1|1219849_1220710_-|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS MNELPASLDEATGWFVANQELFIQYAVNIVAAFLILFIGLFVAKMVSKGVARILTLRHIDATVVTFLSVLVRYTVIAFTLIAVLGRLGVQTASVIAVLGAAGLAVGLALQGSLSNFAAGVLIVIFRPIRAGEYVMIGAVEGTVRDVQIFSTTLRSADDRIIVIPNSKIISSEVINLSREPNRRTQIIVGVAYDADIDKVKKVLGDVVAQDKRIQHNQGVTIRLHEMAPSSLNFVVRVWTTNDDAWPVYWDLMENFKRALDANNIGIPFPQMDVYMHQAQNTVMKAE >NZ_CP026051.1|WP_004244063.1|1219057_1219681_-|arginine-exporter-ArgO MLTTFFQGFLLSAAMILPIGAQNAFVLQQGSKKQYHLMSAFLCALSDVILISGGVFGGSALLSQSEYLLLLITWGGVAFLLWYGWNAFKTAFTKEIELSQHKNQVKSRWRVIVTLVAVTWLNPHVYLDTFVVLGSIGGQLSAELRPWFTFGAVFASISWFFALSLLAAWFSPILSQVTAQRIINLFVGCVMWFIALQLAAQGWKNLF >NZ_CP026051.1|WP_004248538.1|1218232_1218967_-|oxidative-stress-defense-protein MKVKAMVLASMLALGAPSIALAGAVPEGPHITTSGNATIKATPDMATLNIQVSEKAKDAAQAKKQVDERVAKYFAFLKENGVTKEDIDAANIRTQPNYEYDKKAERSVINGYTATRTVDVKIKKLDQLNTLLDGALAAGLNEINNVEFGVNDPEQYKAKAREVAIKNAIQQASSVAKGFGADLGAVYSVSYRAPEATPYPIARMKMDAMALSAPSPEAVKETYQQQSIEFKDYVDVVFELKTAK >NZ_CP026051.1|WP_017827180.1|1217636_1218065_+|hypothetical-protein MADIATLIAKWRNGLEVEIYTENYEFRYGRIKSSRFNASGEESVYYATYFHTRAKPKDNDPLLIITFDPVVGQDDFMFIETIIDHRTYFGSPGAGKTKSHIERRSSDLKRRIENGKKISSEPSSSVQNVNKNNNDSPDQENK >NZ_CP026051.1|WP_004244060.1|1217347_1217569_+|hypothetical-protein MSTFIRRSRNVALAIDAGRKSGSANIEGNTPADIQASLLKSLGEFTASIPTTKQQPYVKGSHGANHKKTYFGR >NZ_CP026051.1|WP_004244059.1|1216245_1217145_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP MKRPDYRALQALDAVIRERGFERAAQKLCITQSAVSQRIKQLENLFGQPLLVRTVPPQPTEQGQKLLALLHQVEMLEEQWLGDENSGSTPLLLSLAVNADSLATWLLPALHPVLTQLPIRLNIQVEDETRTQERLRRGEVVGAISIQPQALPSCLVDQLGALDYLFVASPDFAQRYFANGVTKSSLLKAPAVAFDHLDDMHQAFLQQNFGLSPGSVPCHIVNSSEAFVQLAKQGSTCCMIPHLQIADELKSGELIDLTPGLCQRRMLYWHRFAPESRTMRKVTDALLDYGRKVLKQDEE >NZ_CP026051.1|WP_004244077.1|1239271_1240699_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSTEIKAQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVLVERHSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKALSEHGVVFDAPKTDIDKIRIWKDKVISQLTGGLAGMAKGRKVNVVNGEARFTGSHTLSVEGSEGTTTITFENAIVAAGSRPIELPFIPHEDPRVWDSTDALQLKTVPERLLVMGGGIIGLEMGTVYHALGSQIDVVEMFDQVIPAADKDVVKVFTKRISKKFNLMLETKVTAVEAKEDGIYVTMEGKKAPAEPQRYDAVLVAIGRVPNGKLLDAGKAGIEVDDRGFIHVDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVISGKKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGMTEKEAKEKGVSYEVATFPWAASGRAIASDCADGMTKLIFDKETNRVIGGAIVGSNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDIALTIHAHPTLYESIGMAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP026051.1|WP_036918802.1|1240900_1242772_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MSIEIKVPDIGADEVEVTEVMVKVGDHIEEEQSLITVEGDKASMEVPSPQAGIVKEIKIAVGDKVETGSLIMIFDTEEGAQAPAQEAAPAPSAAAPAASELKEVHVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTISEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVSTGSLIMVFEVAGSAPAPSASAPAPAASAPAASAIKDVNVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTIAEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVKTGSLIMTFEVAGAAPAAQAPAAPAASTSAAPAPSAPAKAPASAPAAKEEFVENEAYVHATPVIRRLAREFGVNLAKVKGTGRKGRILREDVQSYVKELIKRAESAPANAGGGLPGMLPWPKVDFSKFGEIEEVELSRIQKISGANLSRNWVMIPHVNLFDEADITEVEEFRKQQNKEAEKKKLDVKITPLVFVMKAAAKALADMPRFNSSISEDGQKLILKKYINIGIAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGILELSYELAEVSKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGTTGFAPIVNAPEVAIMGLSRSSMKPVWNGKEFVPRLMLPMSLSFDHRVIDGADGARFITLINQYMSDLRRLVM >NZ_CP026051.1|WP_004244080.1|1242784_1245451_-|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSDMLKNDVDPIETRDWLQAIDSVIREEGVERAQFLIDQVLKQARNGGLDIALGGSVHSDYINTIPVEDEPAYPGNLELERRIRSAIRWNAVMMVLRASKKDLELGGHMASYQSSATLYEVCFNHFFRAHNDNDGGDLVYFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLNNFRQEIGGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLSAIYQAKFLKYLDHRGLKDTTKQRVYAFLGDGEMDEPESKGAITIAVREKLDNLCFVVNCNLQRLDGPVTGNGKIVNELEGIFAGAGWNVIKVMWGDRWDALLRKDTSGKLIQLMNETLDGDYQTFKSRDGAYVREHFFNRYPETAALVKDMTDDEIWALNRGGHDPKKVFAAFQKAKETKDKPTVILAQTIKGYGMGETAEGKNIAHQVKKMNMDGVKHFRDRFNIPVSDEKVAELPYITFDKDSEEYKYLHARRQELEGYLPARRTRFDEKLEIPTLEDFSQLLEEQSKEISTTIAFVRALNVMLKNKSIKDRLVPIIADEARTFGMEGLFRQIGIYSPNGQQYTPQDREQVAYYKEDVKGQILQEGINELGAGASWLAAATSYSTNNLPMIPFYIYYSMFGFQRIGDLCWAAGDQQARGFLIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSLTIPNCISYDPAFAYEVAVIMQDGLERMYGDKQENVYYYITTLNENYHMPAMPAGAEEGIRKGIYKLESLEGAKGKVQLLGSGSILRHVREAAQILSTEYGIGSDVYSVTSFTELARDGQDCERWNMLHPSEEPRVPYIAQIMNDAPAVASTDYMKLFAEQVRTYVPADDYRVLGTDGFGRSDSRENLRHHFEVDTSYVIVAALGELAKRGEIDVKVVEEAIKKYNINPEKVNPRLA >NZ_CP026051.1|WP_012368227.1|1245614_1246385_-|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR MAYTKIRQPKLSDVIEQQLEHLILEGTLRPGEKLLPERELAKQFDVSRPSLREAIQKLEAKGFLLRRQGGGTFVQDNLWQSFSDPLAQLLSGHPESQFDLLETRHALEGIAAYYAALRGTDDDLERIKASHARIIDAHDKGDIAAESDAVLQYQLIVTEAAHNVVLLHLLRCMVPMLEQNIRQNFEFLYTRKEMLTAVSEHRTQIYQAIINREPEAAREASHRHLAFIEDVLLDMSREHTRRERSLRRLQQHPDLF >NZ_CP026051.1|WP_004250361.1|1246711_1247254_-|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD MEIKQGWLTGVKHVPSPNYDNRPEGEIPSLLIIHNISLPPGQFGGPYIDQLFTNTLAVDDHPFFNEIAHLRVSAHCLIRRDGEIVQYVPFTARAWHAGVSFYKGREKCNDFSIGIELEGTDECDFTPQQYQQLSTLTQQLIEHYPGIKENITGHSDVAPGRKTDPGPHFNWSYYRALLAK >NZ_CP026051.1|WP_004248548.1|1247464_1247908_+|prepilin-peptidase-dependent-pilin MNTLNYHSTENGFTLMELMIVIAIISILSSVAIPAYHGYIQKAALTDVLQTLSPYRSAVELCHYEHQYNQCHADASFMPQQFRSRYLTDIHVANGVISAKGKAQLEGLTIVMTPATNSKETLPHWQINCTSTNTALQKLCHKVFKSH >NZ_CP026051.1|WP_004248550.1|1248006_1249110_+|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component-TadA MNNTIHTATEFIEQLLRHSLAQRVSDLHLEPQQNSLRIRARIDNHLVLFSPPDNQLANEILTRLKILANINIAEKRLPQDGQFNWSYQKNNYSIRVATLPTLYGEKIVLRLMNNLQQPQLAQLGFQTIHLTLLKKYLTQPQGMILVTGPTGSGKTLTLYSCLQYLNKDNRNINSIEDPIELPIHGINQTQITEKAGITFATILRALLRQDPDVIMIGEIRDQQTAEIAIKAAQTGHLVLSTLHTNSTQATLARLANLGIAKDLIDSCVKLIISQRLVRCLCSNCKYPSPEQKNFIINNQQIILPNWQATGCQFCYSGYKGRTAIYDCFELAKQSLPSPYALFNSGIELIKKGITSLDEVYQVVGDIE >NZ_CP026051.1|WP_036918804.1|1249106_1250306_+|type-II-secretion-system-F-family-protein MKLHFIYRYNALTYQGKWLSGNVVAQSKHEVIDQLIQQQKLPVKIRLYRVIIFQNSDKQYRIQLLEQLALLLHSGLALLPALTLLKEECRYLHWQCVLNDIIFHLNQGGALSKQLSRYPLYFPANLTHFIYIGEESGKLDEVLLLQTTQLKNQRDLIKKIIKAFQYPLFLLLTLIVITISMLSYVLPEYQSLYSAFNTELPTLTLTLIRCSQWFSQYSLIILLFILIISYSYYTIKHHNAKFRDIEQRCWLNLPYLGILLRYHQLHIIFQIMTITQQAGLPLLQGLKIITEQLTHSLYQRALTDMIAHITQGKSLSSFMRHNPLFPPICYQFISSAENSGQLQFFCQQLTHWFYHQLEERLDSVKTWLEPILMTLIALITGTLIIAMYLPVLQLGDTIH >NZ_CP026051.1|WP_004244087.1|1250583_1251198_+|dephospho-CoA-kinase MTYTVALTGGIGSGKTTIANGFASLGVPLVDADVIARLVVEPDSPGLKALQQHFGDTILLPDGKLNRAQLRHIIFQNQQEKAWVNQLLHPLIQQETQKQIQQIRAPYFIWVVPLLVENKLTHLADRILVVDVTEEEQITRTMQRDGVSRDHVLKILQAQAKREQRLAVADDIIENHDNSLNQDEQIKQLHQHYLELAQKSNTGQ >NZ_CP026051.1|WP_036918808.1|1251200_1251953_+|cell-division-protein-ZapD MSEETSTIIFEHPLNEKMRSWLRIENSLIQLNSFQSINSLSSALSFFRAVSEFIEVLDRGEIRAELLKELEKRQKKLQQWLSFPNVDKEIVSHIINELSESACALSKAPRIGQHLKQDKIISLVKQRLSIPGGCCSFDVPTLHLWLNLPQTVRTEKLTCWQEGLYPLQNALNALLTLIRQSDTFKSVLSHNGFYQDSTEEGELLRIKLLASQQIYPQVSGHKNRYAIRFLPLDSEHGTIPSELPFEISCC |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026051_4 | 1716535-1716803 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026051_4
|
4 spacers
spacers of NZ_CP026051_4
>4.1|1716552|46|NZ_CP026051|PILER-CR TCTGTAGATGGTAGTACCATTACTGTCTGTGCGAGCTGAACCTGTG >4.2|1716615|46|NZ_CP026051|PILER-CR GAGATAGATGGTCTCACCGTTACTATTTGTACGGGTAGAGCCTGTG >4.3|1716678|46|NZ_CP026051|PILER-CR TAGGTAGATGGTATTACCATTATTACTTCTACGGGCGTAACCAATA >4.4|1716741|46|NZ_CP026051|PILER-CR TAAATATGTGATCTGACCGTTACTACCTATACGGGTTGAACCAATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026051_4
The CRISPR arrays of NZ_CP026051_4 >merge|NZ_CP026051|4|1716535-1716803|PILER-CR ACCTGACCACTTTTATCTCTGTAGATGGTAGTACCATTACTGTCTGTGCGAGCTGAACCTGTGACTTGACCACTTTTATTGAGATAGATGGTCTCACCGTTACTATTTGTACGGGTAGAGCCTGTGACTTGACCACTTTTATTTAGGTAGATGGTATTACCATTATTACTTCTACGGGCGTAACCAATAACTTGACCACTTTTATTTAAATATGTGATCTGACCGTTACTACCTATACGGGTTGAACCAATAACCTGACCACTTTTATT >NZ_CP026051|4|3|1716535-1716803|PILER-CR ACCTGACCACTTTTATC TCTGTAGATGGTAGTACCATTACTGTCTGTGCGAGCTGAACCTGTG ACTTGACCACTTTTATT GAGATAGATGGTCTCACCGTTACTATTTGTACGGGTAGAGCCTGTG ACTTGACCACTTTTATT TAGGTAGATGGTATTACCATTATTACTTCTACGGGCGTAACCAATA ACTTGACCACTTTTATT TAAATATGTGATCTGACCGTTACTACCTATACGGGTTGAACCAATA ACCTGACCACTTTTATT
>NZ_CP026051.1|WP_036919039.1|1715382_1716396_+|16S-rRNA-(guanine(1207)-N(2))-methyltransferase-RsmC MSSLSPASEVILRHLDHFADRHVLIAGDLQDTLASQIQAKSVRAYTNQYHQWLPLLKSMGDNAFFGLAADQSFVKYCDTLIYFWPKNKNEATFQLRSLCASLSVDTEIFIVGENRSGVKSATELMNGIAKLKKIDSARRCSLFFGSLTYQTLFDRNNWWQTYRYDDLTVMALPGVFSQTALDEGSRLLLSTFDDAMVGDLLDMACGCGVIATVLGKKNPMLKLTLCDVNAAAISSSIATLNVNELEGRVIASNVYSAVEETYDWIVSNPPFHDGLGTSYQAAEDIIRLAPNFLKKGGKLRIVANVFLPYQDILDHVFGSHEVLASTGKFKVYQATKK >NZ_CP026051.1|WP_004245653.1|1714842_1715253_-|DNA-polymerase-III-subunit-psi MSRKDRMLAQLGIRQWVLRKPAVLKGEHSVQFPDTTRLLIITDDVVDLNNGLFSDIFSTMGIDKSEIYCITSEDVSLLTGSFTPACWLLGTDITLPAQYTSLRSPSLHQLYFDANAKRDLWKQIYQHEDHFPIKPC >NZ_CP026051.1|WP_004245652.1|1714427_1714874_-|ribosomal-protein-S18-alanine-N-acetyltransferase MKTISPLNPADLPLAWEIEKLSHSFPWSEETFYSNQGDHYFNLKICIDNIMVGFAITQLILDEATLFNIAIHPDYQGKGYGKALLLELIDNIERKDIATLWLEVRESNQKASNLYESIGFNSVSVRKNYYPTATGKEDAIIMAYPIKF >NZ_CP026051.1|WP_036919037.1|1713303_1713657_-|hypothetical-protein MREIDEVINVPNIGPVVVTSHEQERSVEWFSDRVPKHPWKALASRLFSSSLTKAILPEKVALHKNQKYSNKADIWLHSNSDLHFVVVQSGAMKTLVTVFRLNKSLKKSQNEIKMCVR >NZ_CP026051.1|WP_036919035.1|1711640_1713284_-|AAA-family-ATPase MKSRLKNLYKYLIENRKHEVNGWHKAYRDFYSQVAQIRERITSGEGLSQNDEAFLKQLIYEKSNGIASRGLSVLSNDNFQSFIKNKNFISALEKFILIPNSENFTIFSDTWSNQGKSNNPVLVNRVAAACTLEVSTTVDSGKFNQVFSWLIREGIIPVYPTEENQSWFAKNIFLLKSIKSEFDNELREGKTDEFYLSQFVWVLYENLSNPFSLKKQIIKYGAPGTGKTYQARLQTSLMFDIWKEEFASNSRLTHASQIELVQFHPSFSYEDFMEGLRPVLGSNGNSQLRLQNGVFKEFCRSAGKWEIDVYGLGLAQKWESLTIKELLPFRERLSGEHWRDVFEISDTSKLVSEAVPPFFFIIDEVNRAELSRVFGELMYCLEYRGTRGCVKTQYANLNNEHTGMLKDAKGYLFFIPTNIYLIGTMNTIDRSVESFDFALRRRFRWEEVVPDMALLKYHLNQFCKAWLPLVDNLERLNELIAKEPLLGNDYQIGHAYLMDLKYATSLTVSEVRERVWDDCIRPLLQEYLRGTGKETELISSFGKAFGV >NZ_CP026051.1|WP_036919032.1|1710209_1711637_-|McrBC-5-methylcytosine-restriction-system-protein MWLFDIIKNGTLVDNQSYFVSEGILKNRRLGKSITLRTKSKGQWTYPHNDESAIWHFLNSVSRDVEKTLNDNISDALILFNDEDYEHNTDGGFIDVSGTDARNFNLDTGNLIGFVKRGDYSLKISSRFGDAFLQYIIADADGFLELENIGGESHTDGYEWLLAYLWNIKFKRAYRLGLPKTYITRNDRISRVRGTINATDYFQNKSSGKYLCSYREHSYDSPATSLFIKAYEAVAHYSFCHQTRNIYSAFLTANQGIKRSQQEILRTSHFTNPFYNDYNVLIDLSKQVIGRKGSDFDSQQDSSAFFFDISMLFEYFIRKLIKRDGLRLLGKFELCQEIASGALSGYMRKLEPDLVIEIDERLFVFDVKYKAFDSQFGVKREDLFQLHTYIGQYGNIAAIKGCGFIYPISEERWASLNLEKTQGVISDIIHQQGQEIPFHVLFLKIPEDTYIDFNRKMKEQCSIFIDALYSKVLNQ >NZ_CP026051.1|WP_036919029.1|1707860_1709450_-|peptide-chain-release-factor-3 MSNPIFQQEVARRRTFAIISHPDAGKTTITEKVLLFGQAIQRAGTVKGRGSNQHAKSDWMEMEKQRGISITTSVMQFPYADCLVNLLDTPGHEDFSEDTYRTLTAVDCCLMVIDSSKGVEDRTRKLMEVTRLRDTPILTFMNKLDRDIRDPMELMDEVETELKIACSPVTWPIGCGKLFKGVYHILRDETYLYQTGQGHTIQNSRVIKGLDNPELDEAIGDDLAVQLRDELELVLGASHEFDHEAFLAGELTPVFFGTALGNFGVNHMLDGLVKWAPAPMPRQTDMREVTAAEETFTGFVFKIQANMDPKHRDRVAFLRVVSGMYDKGMKLHQVRTKKDVVISDALTFMAGDRSHVEHAYPGDIIGLHNHGTIQIGDTFTQGEMLKFTGIPNFAPELFRRIRLRDPLKQKQLLKGLVQLSEEGAVQVFRPLANNDLIVGAVGVLQFDVVVARLKGEYSVEAIYESVNVSTARWVECSNEKKLEEFKRKNEQHLALDGGDNLTYIAPTMVNLNLTRERYPDIEFHQTREH >NZ_CP026051.1|WP_036919027.1|1707104_1707452_-|BON-domain-containing-protein MNQQKIKLVLALVTGMTVTMISTATIAETSWYNEIDKTTSNVNNELSDTAISKKIEETLLPNPSIDSGSLSIRTEFGHVTVAGFVKNADQEKQIIQIIEKIDGVKSVESSVNIQG >NZ_CP026051.1|WP_004245643.1|1705946_1707008_-|patatin-like-phospholipase-family-protein MGKYIPVTLNNITALEFQSSLPQGKVALVCEGGGQRGIFTAGVLDEFMRSQFDPFDLLLGVSAGAQNLSAFACGQRGYARRVINRYTTNNQFFNPIRFVRGGNLLDLDWYIETTSKEMPLNMPKALRRFDSGREFYMVASRSDNFKANYFQPEKSTWLDIVKASSAIPAFYRNGVLFQDVVYHDGGISDAIPVKEAYRRGCRTIVVIRTVPSEYQYTTEWVDKMGKWFENGRFQRFLNMAQVHIETYTDTLRFIQSPPEDAVIIEIYPPTTLQSSALGSRLSALNHDYHVGRRCGRYFLATIGQHFSKKKFQQHDKKIFSLFENEAKADKAEDAEIIQKGTRSVHPEVRSVQE >NZ_CP026051.1|WP_004249416.1|1705167_1705950_-|metal-dependent-hydrolase MSRFIDTHCHFDFPVFYHDLENSLALAQQAQVKKIIIPAVAQWNWDAVTELSRYNNALYCALGLHPLYIEAHTEQHLIELKTRLKTTPRCVAMGEMGLDNYMTNPHPEKQQQFLIAQLKLAIEFDLPVILHSRKTHDNLSAILRRYSVPRKGVIHGFSGSLQQAERFVQQGYFIGVGGTITYPRAQKTRRAIASLPLERLLLETDAPDMPVSGFQGEPNRPERILAVFSSLCELRQESAEVIANQLYLNSLQLFQLTDDA >NZ_CP026051.1|WP_004245657.1|1717312_1717576_-|DUF1435-family-protein MAKSTRISSVSSWTSRISLWEMLAVASLFTVITHSIAGTAAFTLVLVISMLLSTIMLFHKKLQMWVMIPAGVVITYSLMTFFLTYHG >NZ_CP026051.1|WP_004245658.1|1717770_1718313_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKKNIRLLTHNEIPRVWEIDRTELIERLYVLQQGQLVLSEQRFDMKGWPEGEAEHYTPVLLESAERGAPFWGVFEDDKLVAAASVDPQWRGQDNTLLQLSFLHISHQQRGQGLARILFDYCVEYAKQKGASGLYISSTPSENSVNFYQHMGCRLIDVPDTELYEREPEDIHLVLNFNKED >NZ_CP026051.1|WP_036919045.1|1718309_1719947_-|Na/Pi-cotransporter-family-protein MLTLLHLLSSVALLVWGTHIVRTGIMRVFGSDLRRILGKSINKKSNAFLAGVGVTALVQSSNATALLVISFVTQGLISITPALVIMLGADVGTALMARVLTFDLSWLSPLLILLGVMTFLSRKKERIGQLGRVGIGLGLIILALQLIVTSAEPITHASAVQAIFTSLSGDTILALLVGAIFAMVSYSSLAAVLLTATLSATGFMPLYISLCIVIGSNIGSGLLALISSRGQSISSRQVVIGSLFFKLIGALLVLPWITIIATKIQQYDFSPAEVIIYFHVIYNLVRCVLMLPFVGPMAKLCQKLVPELPVTGTEVAPRYLDPSAVDTPSLAIANAVRETLRLGDVVEQMLQRFQALMEGDRLQKREISQLEEEVELLHSSIKLYMAQIQQHDLGTEDSRRWAEIIDTAMNLQQSSAIIARMSGEVVNKSLDHHLNLSEEGRRELQTLLERLQSNLNLAMSVFVSGNMEHARKLRRAKHRFRLLNQRYSFAHVERLHLHNMQSIETSSLHTSLLGDMKRLNSLFCAVAYHALERSGSSSELVNLQQ >NZ_CP026051.1|WP_004249299.1|1720375_1721815_-|alkaline-phosphatase MSLRYQRSALSVVVATLFTSVGFSSFAAPVTADTILAQDRAAKGNITEFGGARRITSDQTEALKAALNNHQAKNVILFIGDGMGDSEITVARNYAEGAGGFFKGIDALPMTGQYTHYSLDRKTQKPNYVTDSAASATAWASGVKTYNGALGIDVFGKDHQTILELAKANGKATGNVTTSEIQDATPAALFSHVTGRKCYGPVETLAKCSTNALENGGRGSISEQLLVTRADITLGGGAKSFAQTATAGEYKGKTLEQQAIERGYQIVKDAKSLEAITLANQDKPVLGLFHDGNMAVAWEGPKATYQGNLKNPPLECKPNSKLDPNAPTLAQMTKKAIDLLKTNENGFFLQVESASIDKQDHNANPCGQIGETVALDEAVQIGLDFAKQNGDTLIIVTADHAHSSQIIEADVKSSGLTQALITKDGAVMVVNYGNSETDSQEHTGAQLRVAAYGPHAANVVGLTDQTDLFFTMRDAMGLK >NZ_CP026051.1|WP_004250182.1|1722024_1723569_-|DUF3327-domain-containing-protein MICALMASFSSFANCLSITENKEITGQFNHDKALCFSTHLQSQRYAELDVKGIQNLQLANQDGTHIRRLLKDVPVDGQQQKIRFLLPETANYQFIAQGEVGVQWHITLKTYPYQPLDKDAGIALTSPRLQMLAQDLTASNIQLFWQQIQQEGTPLVEPYDNHNKRVTFLWQGAQSNVYLLGSPAGDHDPLTRLANSDIWYRSYIVPNDTLMQYKLAPDVPVIENATAAQQRRAILTTAQADPFNLHPSPSKADDRYNYFSLLSLDYPRECQLPDILDRAMNGNTSISRFHSEILNNDREIALYLPAQKMTTPRLLVLFDGQIYRQQYGIDRFFDKLIEEGKLPPIAILFVDSIDSDRRSVELPPNPDFHRFLADELLVWLEQEKGLQVAAKETIVSGSSYGGLASAWVAFNRPDRFGKVLSMSGSYWWAPENEAPEWLIRQYQQADKKPLQFFLEAGLFESREGTGGILNNNRQLKQVLQQRGYPVQSLEMASGHDYISWCEALYIGTKALTND >NZ_CP026051.1|WP_004250181.1|1723754_1724894_-|YdcF-family-protein MAQPSRISLQIKKTVISLAIAALGFTASSSALAYQKVHQPDNSYQQYISQRQTVDMLIQDALEAFKSPARVSDAGFTGKLPSNMEVVAQKLQQAYKLEPYRLDLLFSAASAYVYNNQIERAVTIYKQILEAAPDDIDALIYVTSWTRFEGKDKESEAYFNKLKSLNPAKAEELSRFFAQVDRVSKMPLSDKLTPADLATLNKTKGNNAIVTLGYALNPDGTMNQILIDRLNKTLEVAKQLPDAMIVVTGGVPKAHQTEGKLMADWLVKKGIPAERIFQDNYARSTVENALFSRYALTKHRIKTAVIISSGSHVRRADVIFTVASWQSGPSDITYLTVVAPDKPLAELQKTSKSDLQGIYRDGLKALGLWSFRSYPLEER >NZ_CP026051.1|WP_004249296.1|1725211_1726456_-|multifunctional-transcriptional-regulator/nicotinamide-nucleotide-adenylyltransferase/ribosylnicotinamide-kinase-NadR MGSFDYIKQAIKKNGYTLQQVADESQMTKGYLSQLINNKIKSPSAQKMSALHQFLGLEYPLQQKTIGVIFGKFYPLHTGHIYLIQRACSQVDELHVILCHDEPRDKELFINSAMSQQPTVSDRLRWLLQTFKYQKNIRIHEFNEHGIEPQPHGWEMWSEGIKAFLQEKQIAPDFIYTSEREDASQYEAFLGIETVLVDPERSFMNISGSQIRQAPFKYWEYIPTEVKPFFVRTVAILGGESSGKSTLVNKLANIFNTTSAWEYGRDYVFSHLGGDEMALQYSDYDKIALGHAQYIDFAVKYANKVAFIDTDFVTTQAFCLRYEGKEHPFVQALIDEYRFDLVILLENNTPWVADGLRSLGSDKERRRFQTLLIEMLDKNNIEYVKVDPPDYDERFLRCVELVRELLMMQSKHIE >NZ_CP026051.1|WP_004249295.1|1726467_1727859_-|DNA-repair-protein-RadA MAKAAKRAFVCNECGADYPRWQGQCSACHAWNTITEVRLAAAPSARNDRFSGFAGDAKGISRVQKLSEISLEALPRFSTGFKEFDRVLGGGVVPGSAILIGGNPGAGKSTLLLQTMCRLATEMKTLYVTGEESLQQVAMRAHRLGLPTTELNMLSETSIEQICLIAAQEQPKLMVIDSIQVMHMADIQSSPGSVAQVRETAAYLTRFAKTNDIAIIMVGHVTKDGTLAGPKVLEHCIDCSVMLDGETDSRFRTLRSHKNRFGAVNELGVFAMTEQGLREVSNPSAIFLSRGDEVTSGSSVMVVWEGTRPLLVEIQALVDHSMLSNPRRVAVGLEQNRLAILLAVLHRHGGLQMSDQDVFVNVVGGVKVTETSADLALLLSLVSSFRNRPLPRDLVIFGEVGLAGEIRPVPSGQERIAEAAKHGFKRAIVPNANMPKKNPPDMKVYGVKKLSDALSVLDDLDDF >NZ_CP026051.1|WP_036919048.1|1727892_1728870_-|phosphoserine-phosphatase MSNSLTYCYLPDEIRKWPGLPLSLSGEEVMPLDYRAGDSGWLLYGRELDKKRISEFQHKLGMAIVVVSSWRIDDYQVVRIAGSLTRRIRRLSDECGLDVVPFGQIPRLRSPGLLVMDMDSTAIQIECIDEIAKLAGVGDKVAEITEQAMQGEMDFSESLKLRVAQLAGADANILQKVMDNLPLMPGLTSLVRKLQAMDWQIAIASGGFTYFADNLKQRLRLVAAVANQLEIKDGKLTGKVKGPIVDAKYKAQVLTRLAKDLDIPLEQTIAIGDGANDLKMLRKAGLGIAYHAKPKVYAQAKVAIRHADLMGVMCILSAGLKHEER >NZ_CP026051.1|WP_004249293.1|1728979_1729672_+|YtjB-family-periplasmic-protein MLKDKLKFKLQKTAIILICIALLAFLMQGASYFSRANQHARITQFEELAKTLAEQVAFSLSNYMDDSSKDNVNPHIIANLNHLTHDSRVLDASLYWQDGTQIAHSGENVTVKERLALEGQKSGGSFNHQLVVPIPGQDQPKGFLRLTLDTHQLVTESGQVDNTTNLLRVMLLVALAIGFLLSHSLLQLTPVHWQQSPYLLTASLPTRHEKEDDEQKSDQQKETENRSEVK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026051_5 | 2603383-2603474 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026051_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026051_5
>5.1|2603407|44|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder TATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATTTATTATCTTGAAATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026051_5
The CRISPR arrays of NZ_CP026051_5 >merge|NZ_CP026051|5|2603383-2603474|CRISPRCasFinder ATAGCTTAGAAAAATAAGTACTAATATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATTTATTATCTTGAAATAGATAGCTTAGAAAAATAAGTGCTAA >NZ_CP026051|5|4|2603383-2603474|CRISPRCasFinder ATAGCTTAGAAAAATAAGTACTAA TATATTTTAAAAGATAAAACAGAATATTTATTATCTTGAAATAG ATAGCTTAGAAAAATAAGTGCTAA
>NZ_CP026051.1|WP_004249675.1|2601795_2603271_+|ketol-acid-reductoisomerase MANYFNTLNLRQQLSQLGKCRFMSRDEFADEANYLKGKKVVIVGCGAQGLNQGLNMRDSGLDIAYALRQEAIDEKRASWRRATENGFEVGTYEALIPQADLVVNLTPDKQHSAVVQAVQPLMKSGAALGYSHGFNIVEVGEKIRDDITVVMVAPKCPGTEVREEYKRGFGVPTLIAVHPENDAKGEGMAIAKAWAAATGGHRAGVLESSFVAEVKSDLMGEQTILCGMLQAGSLLCYDKMVAEGVEPGYAGKLIQFGWETITEALKQGGITLMMDRLSNPAKMRAYALSEQLKEIMAPLFAKHMDDIISGKFSETMMADWANDDKNLLTWREETGASAFENYPEYEGKISEQEYFDHGVLMVAMVKAGVELAFDTMIEAGIIAESAYYESLHELPLIANTIARKRLYEMNVVISDTAEYGNYLFSFAAVPMLKEFMTRLQSGDLAKHVPDSGTDNAQLRDINEAIRQHPIEIVGKKLRGYMTDMKKIAVAN >NZ_CP026051.1|WP_004246362.1|2600735_2601623_-|HTH-type-transcriptional-activator-IlvY MDIRDLKLFLHLAESCHFTKTAQAMHVSPSTLSRQIQRLEEQLGHPLFLRDNRQVTLTDAGEQLKRYAQHTLLQYKQLKHTLNQNSPSLSGELRLFCSVTAAYSHLPPILDRFRAENPLVEIKLTTGDAADAVDKVISDEADLGIAGKPEKLPENICFEKIGEIPLVLIAPALPGNVRHLATQEKPDWLNIPFIIPEHGPSRQRIALWFKRHRIQNPLIYATVSGHEAIVSMVALGCGIALIPQVVVDNCPEPVRNRISLLDNISLVEPFELGVCGLHKRLQEPVISAFWRLLHH >NZ_CP026051.1|WP_004246363.1|2599175_2600750_+|threonine-ammonia-lyase,-biosynthetic MAAFRPLTSAPSSAEYLKAALSAPVYEAAVVTPLQEMAKISQRLENTILVKREDRQPVHSFKLRGAYNMIAGLTPEQKAKGVVTASAGNHAQGVALSANRMGVKALIVMPIATADIKVDAVRQFGGEALLYGANFDEAKAKAIALAKEMGYTFVPPFDHPAVIAGQATLAMELLQQDVHLDRIFVPVGGGGLIAGVAVLIKQLMPEIKIIGVEAEDAACLKAALEAGHPVELPRVGLFAEGVAVKRIGDETFRLCQKYVDDVITVDSDAICAAVKDLFEDVRAIAEPSGALALAGLKKYVEEHQIKGERLAHVLSGANVNFHGLRYVSERCELGEKREALFAVTIPEQKGSFLRFCQILGQRVVTEFNYRYSDADPENARIFVGVRLSQGLQERKEIVQQLTEAGYQVSDLSDDEMAKLHVRYMVGGRPNQPLKERLFSFEFPEAPGALMKFLKTLGTYWNITLFHYRSHGTDYGRVLVAFELPETEGRFERHLDALGYEYHDETGNPSFQLFLSPQTASLVVE >NZ_CP026051.1|WP_004249676.1|2597321_2599172_+|dihydroxy-acid-dehydratase MPKYRSATTTHGRNMAGARALWRATGMTDADFGKPIIAVVNSFTQFVPGHVHLRDLGKLVAEQIEAAGGVAKEFNTIAVDDGIAMGHGGMLYSLPSRELIADSVEYMVNAHCADAMVCISNCDKITPGMLMASLRLNIPVIFVSGGPMEAGKTKLSDQLIKLDLVDAMIQGANPNVSDADSEQIERSACPTCGSCSGMFTANSMNCLTEALGLSQPGNGSLLATHADRKTLFINAGKRIVELTKRYYEQDDLSALPRNIAKKEAFENAMILDIAMGGSTNTVLHLLAAAQEGDVDFKMEDIDRLSRQVPHLCKVAPSTQKYHMEDVHRAGGVMGILGELDRAGLLNRNVNNILGLSLPETLAQYDVMLSQDEQVKSMYQAGPAGIRTTKAFSQDCRWPTLDTDREQGCIRSKAHAYSQDGGLAVLSGNLAQDGCIVKTAGVDEDNLVFSGPAKVYESQDDAVEAILGGKVVAGDVVIIRYEGPKGGPGMQEMLYPTSYLKSMGLGKACALITDGRFSGGTSGLSIGHVSPEAANGGIIGLVEEGDIVDINIPNREINLRVDEKTLAARREAQLARGDKAWTPKDRQRQVSFALRAYASLATSADKGAVRDKSKLGG >NZ_CP026051.1|WP_036919567.1|2596322_2597249_+|branched-chain-amino-acid-transaminase MTKQADYIWFNGEMVPWAEAKVHVMSHALHYGTSVFEGVRCYDSHKGPVVFRHREHMQRLHDSAKIYRMPVAQSVDELMEACHETLRKNQLVSAYIRPLVFIGDVGMGVNPPEGYKTDIIIAAFPWGAYLGEEALDKGIDAMVSSWHRAAPNTIPTAAKAGGNYLSSLLVGSEARRHGYQEGIALDVHGYLSEGAGENLFEVKDGVIFTPPFTSSALPGITRDAIIKLAKDLGYEIREQVLSRESLYLADEVFMSGTAAEITPVRSVDGIQVGIGRCGPVTKAIQKAFFGLFTGETEDKYGWLDPVNP >NZ_CP026051.1|WP_004246366.1|2596033_2596312_+|acetolactate-synthase-2-small-subunit MNQHNITIEARFCPEILERILRVIRHRGFHICSMNMNITESNYINLALTVSSQRPVDLLCSQLTKLADVAGIQVLHQQQKEKLQFISALSAM >NZ_CP026051.1|WP_004246367.1|2594387_2596037_+|acetolactate-synthase-2-catalytic-subunit MNGAQWLVQALRKQRVETVFGYPGGAIMPVYDALYDGGVEHVLCRHEQGAAIAAIGFARSTGTTGVCIATSGPGATNVITGLADALLDSVPVVAITGQVASNLIGTDAFQEVDVLGLSLACTKHSFLVSDVNELPRVVSEAFSIAKQGRPGPVLIDITKDVQLADASHLADYPLPQEQEFPYPEHEIAQALQMLAQAKKPILYVGGGVAMSQGVEALRSFVKQTQIPVVSTLKGLGCANAFDANYLGMLGMHGTKAANYAVQRSDLLIAVGARFDDRVTGRLNTFAPNAKVIHIDIDYAELNKLKQAHIALLGDAKVLLPKLSQPLAIEAWQEEVQQLIAEYAWRYDHPGEAIYAPLLLKQLSDAKPENSIVTTDVGQHQMWSAQHMTFDAPENFITSSGLGTMGFGIPAAIGAQIARPDACVICVSGDGSFMMNVQELGTIKRKQLPIKLVLLDNQRLGMVRQWQELFFEQRYSETILTDNPDFVALAKAFDIPGQRITEKAQVAEAIKCLLTSDGPYLLQVSIDDAENVWPLVPPGASNDEMMEKSK >NZ_CP026051.1|WP_017827031.1|2594156_2594258_+|ilv-operon-leader-peptide MNTIVLVISLIIVSVVVIINPLCGAALGRRKAN >NZ_CP026051.1|WP_036920151.1|2592179_2593712_-|YifB-family-Mg-chelatase-like-AAA-ATPase MALAVIYTRASLGISAPLITIEAHISQGLPGLTLVGLPETVVKEAKDRVRSALINSGYSYPAKRITINLSPADLPKEGARYDLPIALAILIASEQLISDKLNSYEFIGELALSGKLQKVNAVIPSILSANKDNRISIISIEHQSEVSLLPNKSALLASHLLDICHHLENNTPLIEAKNNINHKTIENQNNKDISDIIGQNNAKRAAEITAAGNHNILFLGPPGTGKTMLAQRINTLLPPLTAKEALDVLIISSLSNTIHHDGKWPLRPFRAPHHTASAVALTGGGSIPKPGEITLAHHGILFLDELPEFDRRVLDALREPLDARKITISRAKAKISYPANVLLVGALNPSPTGHYQGTHNRTPVKQVLRYLSKVSGPFLDRFDLSVEMPLLPQGALLQSTHTNESSSIIRARVLQARERQFQRSGKLNTYLSSKEIEHFCQLHTEDALFLEETLNKLGLSIRAWHKILRVSRTIADLENEQKIQRNHLIEALSFRAMDRLMIYLQKQLEG >NZ_CP026051.1|WP_004246370.1|2591793_2592132_+|DUF413-domain-containing-protein MAESFITTNRFFDNKHYPRGFSRHGDFTIKEAQILERHGQAFNELDLGKREPATEAEKLFVAMCRGEREAATVEEKIWKKYTSRISRPKRFHTLSGGKPQLDPSDDYTDSDD >NZ_CP026051.1|WP_004246360.1|2603525_2603795_-|type-II-toxin-antitoxin-system-mRNA-interferase-toxin,-RelE/StbE-family MRKVSYSGQFKKDLKLAEKRGKDINKLKEIILLLVQGKRLPAQLKDHPLTGNWKPRRDLHIEPDWLLIYKIDNDTVHFDRTGSHSDLFK >NZ_CP026051.1|WP_004253075.1|2603795_2604044_-|hypothetical-protein MSIKSELIATKVDIELKEAFVAIARNKHRPASQILRDLIRVYVESNQTQPNEKTLNTFAKTDKGDDVFYAEDAHDLFKKLDI >NZ_CP026051.1|WP_004249673.1|2604216_2606238_+|DNA-helicase-Rep MRLNPGQQKAVEYVSGPCLVLAGAGSGKTRVITNKIAYLIRQCRYSAKQIAAVTFTNKAAREMKERVAQTLGKQEAKGLMISTFHTLGLEIIKREYKALGIKSNFSLFDDQDQSALLKELTVDLLEEDKDLLSQLKSQISNWKNDMLTPEQVIGRAQSQQDHTFAECFRRYEQHLLSCNVLDFDDLISKPTLLLRTNEEVRARWQQRIRYLLVDEYQDTNTSQYELVKWLVGERARFTVVGDDDQSIYSWRGARPQNLVLLQKDFPQLNVIKLEQNYRSSGRILKSANILIENNPHVFEKRLFSELGYGDELRVLTANNEEHEAERVAGELIAHHFINKTNYKDYAILYRGNHQSRIFEKYLMQNRIPYRISGETSFFSREEIKDILAYLRVITNPDDDAAFLRIVNKPRREIGPMTIQKLGEWAKVRDKSLFNACFDLGLSQTLTGRGLSALQAFSQWMARIVQQSEREPLLAVRDLLHEMDYESWLYETSSSAKAAEMRMKNINQLFSWMSEMLEGDELHEPMTLSQVVNRFTLRDMMERGETDEELDQVQLMTLHASKGLEFPHVFLVGMEEGILPHQSSIDEDNVEEERRLAYVGITRAQKTLTFTLCKERRQYGELIRPEPSRFLYELPQDDLHWDTNKKKVLSAQEKQEKGQKGVAGLKAMLARHKP >NZ_CP026051.1|WP_004246357.1|2606312_2607821_-|guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate-diphosphatase MLKSSSLYAAIDLGSNSFHMLVVREIAGSIQVLSRVKRKVRLAAGLNKENELSEQAMERGWQCLRLFSEYLRDIPAEQIRVVATATLRIAKNADIFVAKASEILGNTVHVISGEEEARLIYRGVAHTTGGAEQRLVVDIGGGSTELVTGTGAKTTQLMSLSMGCVTWLERYFSDRSLTEENFAQAQQAAKAILAPVAEKLIQQGWQVCVGASGTVQALQEIMIAQGMDELITLPKLERLKQKAIECGKLEELEIEGLTFERALVFPSGLAILIAIFETLHIENMILAGGALREGLVYGMLHLPIEQDIRQRTLRNIQRRFQIDIEQAHRVQQLAEHFFIQVSKSWQLDNRCRELLSSACALHEIGLSVDFRQAPSHASYLVSHLDLPGYTPAQRRLIASFLRNQKGIIDLAPLNQQNALPINQAYRLVRLLRLAIIFASRRRDDTLPALRLRTEDEKLIITLPHQWIAEHPLRAENLHEEIQLQSYVHWPLMLEEQNNSRIG >NZ_CP026051.1|WP_004246356.1|2607824_2609123_-|ATP-dependent-RNA-helicase-RhlB MSKTYLTEKKFSDFALHPKVIEALEKKGFSNCTQIQALTLPITVKGHDIAGQAQTGTGKTLAFLTSTFHYLLTHPAKEGHEKNQPRALIMAPTRELAVQIYTDAQPLAQSTGVKMGLAYGGDGYDEQLKVLNNGVDIVIGTTGRLIDYVKQGHINLNAIQVVVLDEADRMYDLGFIKDIRWLFRRMPNAAERMNMLFSATLSYRVRELAFEQMNNPEYVEVEPEQKTGFSIKEELFYPSNEEKMRLLQTLIEEEWPERCIIFANTKHRCDDIWAHLAADGHRVGLLTGDVPQKKRLRILEDFTQGNIDILVATDVAARGLHIPSVTHVFNYDLPDDCEDYVHRIGRTGRAGKSGNSISLACEEYALNLPAIETYIQHAIPVSKYNSDALLTDLPEPKRRHRPRQGQPRRNNSAPRRGNNTQRNNRNKRPSHS >NZ_CP026051.1|WP_004246355.1|2609242_2609569_+|thioredoxin-TrxA MSDKILHLSDNTFDVDVLQATGPVLVDFWAEWCGPCKMIAPILDEVATEYAGKLTVAKLNIDENPATAPKYGIRGIPTLILFKNGAVAATKVGALSKTQLKEFLDENI >NZ_CP026051.1|WP_004246354.1|2610130_2611390_+|transcription-termination-factor-Rho MNLTELKNTPVSELIALGENMGLENLARMRKQDIIFSILKQHAKSGEDIFGDGVLEILQDGFGFLRSSDSSYLAGPDDIYVSPSQIRRFNLRTGDTIAGKIRPPKEGERYFALLKVNEVNFDKPENARSKILFENLTPLHANNRLRMERGNGSTEDLTARVLDLAAPIGRGQRGLIVAPPKAGKTMLLQNIAANIAHNYPDCVLMVLLIDERPEEVTEMQRLVKGEVIASTFDEPASRHVQVAEMVIEKAKRLVEHKKDVIILLDSITRLARAYNTVVPSSGKVLTGGVDANALHRPKRFFGAARNVEEGGSLTIIATALVDTGSKMDEVIYEEFKGTGNMELHLSRKIAEKRVFPAIDYNRSGTRKEELLTSQDELQKMWILRKIIHPMGEIDAMEFLINKLAMTKTNEEFFDFMKRS >NZ_CP026051.1|WP_004246352.1|2611784_2612876_+|UDP-N-acetylglucosamine--undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminephosphotransferase MDILKMSTNVFYVFLFSFAFLFVARKVAKKIGLVDKPNYRKRHHGLIPLVGGISVYFGIVFAFYVSDIYIPHKELYLICAGILVFIGALDDRYDISVKIRATIQALVGIAMMVFGGLKLESLGHAFGPWDMHLGPFGYIVTLFAVWAAINAFNMVDGIDGLLGGLSCVSFGALGILLYQSGSSALAFWCFSFIAAILPYIMLNLGVCGKKFKVFMGDAGSTLIGFTIIWLLISSTQVDPHPINAVTALWIIAIPLMDMVAIMYRRLRKGMSPFSPDRQHIHHLIMRAGFTPRQAFVLITLAAAVLAAIGIIGENLSFVPEWVMLALFLLAFVMYGYCIKRAWRVARFIKRYKRRLRKATQLKH >NZ_CP026051.1|WP_004249670.1|2612899_2613958_+|ECA-polysaccharide-chain-length-modulation-protein MNSENNVSRQGFSPDNELDIRGLCCALWSGKRWIIGFALLFALIALGASYLMQPKWSAIAMTERPTVNNLGSYYSQSQFLRNLDTQINPSVTVSQLSIPDEAYQEFVTQISAFDTRREFWLQTDYYKQRKENDAQADAALLDELINNIQFTPADEKKLVNDQLKLIAETANDSSQLLNEYIAFANKRAAEHLNEEVIAAWATRTQSMKALVKRQEMAAQAAYQRQINLLKQSIKVAEKQGISQKQTSIAIDELPDSKLFLLGVPLLQSQLETLMATGPDFDSDYDQNTAMLSTLAVGAKLQDNFQTYRFLRTPEDPVKRDSPRRAFMMVLWGAIGVLVGAGVALVRRSSLKK >NZ_CP026051.1|WP_004246349.1|2614087_2615218_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing) MKVLTVFGTRPEAIKMAPLVHALANDDSFEAKVCVTAQHREMLDQVLNLFEIKPDYDLNIMKPGQDLTDITCRILEGLKPVLASFQPDVVLVHGDTTTTMAASLAAFYQQIPVGHVEAGLRTGNLYSPWPEEANRTIAGHLAMYHFAPTETAKLNLVREAVADKNIFVTGNTVIDALFWVSERVMGNQTLLDELAVQYPFIQPERKMILVTGHRRESFGGGFERICQALAEIALAHPDVEVVYPVHLNPNVSEPVKRILHGINNIKLIQPQDYLPFVYLMNHAYLILTDSGGIQEEAPSLGKPVLVMRDTTERPEAVEAGSVRLVGTDTKRIVSEVTSLLTDENAYHQMSKATNPYGDGHACQRILEALKNNQVTL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026051_4 | 4.4|1716741|46|NZ_CP026051|PILER-CR | 1716741-1716786 | 46 | NZ_CP026051.1 | 1716804-1716849 | 2 | 0.957 |
1. spacer 4.4|1716741|46|NZ_CP026051|PILER-CR matches to position: 1716804-1716849, mismatch: 2, identity: 0.957
taaatatgtgatctgaccgttactacctatacgggttgaaccaata CRISPR spacer taaataggtgatctgaccgttactacctgtacgggttgaaccaata Protospacer ****** *********************.*****************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026051_1 | 1.2|946401|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946401-946432 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 314-345 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP047287 | Proteus cibarius strain G11 plasmid p52, complete sequence | 15649-15680 | 2 | 0.938 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP053373 | Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-51, complete sequence | 11938-11969 | 2 | 0.938 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP047341 | Proteus cibarius strain ZF1 plasmid pZF1-cfr, complete sequence | 21213-21244 | 2 | 0.938 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP045009 | Proteus cibarius strain ZF2 plasmid pZF2-cfr, complete sequence | 38543-38574 | 2 | 0.938 |
| NZ_CP026051_2 | 2.2|955622|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955622-955653 | 32 | MK047642 | Phage NG55, complete genome | 29355-29386 | 2 | 0.938 |
| NZ_CP026051_1 | 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946462-946493 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 22316-22347 | 3 | 0.906 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP024317 | Borrelia miyamotoi strain Yekat-6 plasmid pYkt6-lp72, complete sequence | 64738-64769 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP024391 | Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-lp72, complete sequence | 8781-8812 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP024206 | Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-lp72, complete sequence | 64744-64775 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP024334 | Borrelia miyamotoi strain Yekat-1 plasmid pYkt1-lp72, complete sequence | 8793-8824 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP024352 | Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-lp72, complete sequence | 64754-64785 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP024372 | Borrelia miyamotoi strain Izh-14 plasmid pIzh14-lp72, complete sequence | 64732-64763 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026051_1 | 1.2|946401|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946401-946432 | 32 | KY653119 | Morganella phage IME1369_02, complete genome | 22144-22175 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026051_1 | 1.5|946584|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946584-946615 | 32 | NZ_CP016535 | Planococcus antarcticus DSM 14505 plasmid pPA05-1, complete sequence | 10610-10641 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP021873 | Borrelia miyamotoi strain CA17-2241 plasmid lp72, complete sequence | 64299-64330 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP017108 | Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_1 sequence | 241259-241290 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP017109 | Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_2 sequence | 313-344 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN693749 | Marine virus AFVG_250M1175, complete genome | 34448-34479 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN694794 | Marine virus AFVG_250M1172, complete genome | 35153-35184 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN694703 | Marine virus AFVG_250M1171, complete genome | 35067-35098 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN694422 | Marine virus AFVG_250M844, complete genome | 33167-33198 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN693830 | Marine virus AFVG_250M842, complete genome | 32714-32745 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN693633 | Marine virus AFVG_250M1174, complete genome | 5264-5295 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN693832 | Marine virus AFVG_250M1173, complete genome | 5265-5296 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN694319 | Marine virus AFVG_250M843, complete genome | 32834-32865 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN694684 | Marine virus AFVG_250M1170, complete genome | 5262-5293 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN694707 | Marine virus AFVG_250M1176, complete genome | 5266-5297 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_2 | 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955989-956020 | 32 | MN693767 | Marine virus AFVG_250M1169, complete genome | 35260-35291 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NC_017398 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-5, complete sequence | 3757-3788 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP009356 | Vibrio tubiashii ATCC 19109 plasmid p251, complete sequence | 85349-85380 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NZ_CP046625 | Streptococcus sp. CNU G3 plasmid p1_CUN_G3, complete sequence | 19764-19795 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | MN695335 | Synechococcus phage B23, complete genome | 59407-59438 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | MN695334 | Synechococcus phage B3, complete genome | 59404-59435 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026051_1 | 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946462-946493 | 32 | HM559717 | Synechococcus phage S-CBP4 genomic sequence | 2028-2059 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026051_1 | 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946462-946493 | 32 | NC_025464 | Synechococcus phage S-CBP4, complete genome | 41633-41664 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026051_1 | 1.4|946523|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946523-946554 | 32 | LN713926 | Pseudomonas fluorescens SBW25 plasmid pQBR57, complete sequence | 75728-75759 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NC_014660 | Acinetobacter phage Ac42, complete genome | 164709-164740 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | MK554696 | Fusobacterium phage Fnu1, complete genome | 3398-3429 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | MN013077 | Klebsiella phage vB_KaeM_KaOmega, complete genome | 88020-88051 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_1 | 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946462-946493 | 32 | NZ_AP014659 | Bradyrhizobium diazoefficiens strain NK6 plasmid pNK6a, complete sequence | 114908-114939 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_1 | 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946462-946493 | 32 | NZ_CP049701 | Bradyrhizobium sp. 1S5 strain 323S2 plasmid pB323S2b, complete sequence | 35291-35322 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_1 | 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946462-946493 | 32 | NC_015062 | Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01, complete sequence | 74390-74421 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_1 | 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946462-946493 | 32 | KC139649 | Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 38950-38981 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_1 | 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 946462-946493 | 32 | KC139634 | Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical protein gene, partial cds; and capsid related protein, hypothetical proteins, tail length tape measure protein, hypothetical protein, enolase-like protein, hypothetical protein, tail protein, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, DNA methylase, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 18673-18704 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_2 | 2.6|955867|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 955867-955898 | 32 | AP013360 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G1, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S40-C16 | 17101-17132 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | JQ691611 | Cronobacter phage CR9, complete genome | 91093-91124 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP026051_1 | 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT | 946340-946371 | 32 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 18539-18570 | 10 | 0.688 |
1. spacer 1.2|946401|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggttctcttctgcatcggtacccccatgtgc CRISPR spacer aggttctcttctgcatcggtacccccatgtgc Protospacer ********************************
2. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047287 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p52, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer taatgatgcaaaagaaaacggaattaaagtta Protospacer ****** ***********************.*
3. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053373 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-51, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer taatgatgcaaaagaaaacggaattaaagtta Protospacer ****** ***********************.*
4. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047341 (Proteus cibarius strain ZF1 plasmid pZF1-cfr, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer taatgatgcaaaagaaaacggaattaaagtta Protospacer ****** ***********************.*
5. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045009 (Proteus cibarius strain ZF2 plasmid pZF2-cfr, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer taatgatgcaaaagaaaacggaattaaagtta Protospacer ****** ***********************.*
6. spacer 2.2|955622|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047642 (Phage NG55, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
tggggttcagcgggcaagcggtattcgaacac CRISPR spacer tggcgttcagcgggcaaccggtattcgaacac Protospacer *** ************* **************
7. spacer 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
gggataaggaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer tggataaggaacatcagataacagcatcagac Protospacer *****************.***********.*
8. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024317 (Borrelia miyamotoi strain Yekat-6 plasmid pYkt6-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer tattgaagcaaaagaaaaaggaattataccct Protospacer ** *************** ******* * .*
9. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024391 (Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer tattgaagcaaaagaaaaaggaattataccct Protospacer ** *************** ******* * .*
10. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024206 (Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer tattgaagcaaaagaaaaaggaattataccct Protospacer ** *************** ******* * .*
11. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024334 (Borrelia miyamotoi strain Yekat-1 plasmid pYkt1-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer tattgaagcaaaagaaaaaggaattataccct Protospacer ** *************** ******* * .*
12. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024352 (Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer tattgaagcaaaagaaaaaggaattataccct Protospacer ** *************** ******* * .*
13. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024372 (Borrelia miyamotoi strain Izh-14 plasmid pIzh14-lp72, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer tattgaagcaaaagaaaaaggaattataccct Protospacer ** *************** ******* * .*
14. spacer 1.2|946401|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY653119 (Morganella phage IME1369_02, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
aggttctcttctgcatcggtacccccatgtgc CRISPR spacer agattgctttccgcatcggttcccccatgtgc Protospacer **.** ..***.******** ***********
15. spacer 1.5|946584|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016535 (Planococcus antarcticus DSM 14505 plasmid pPA05-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tctcaat-tcccctttgtctaaatggtctaaag CRISPR spacer -ctcgacatcccctttgactaaatcgtctaagg Protospacer ***.*. ********* ****** ******.*
16. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021873 (Borrelia miyamotoi strain CA17-2241 plasmid lp72, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer tattgaagcaaaagaaaaaggaattgtacccc Protospacer ** *************** ******. * .*
17. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017108 (Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_1 sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taatg-aagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer -aatacaagcaaaagaaaaatgaattaaataga Protospacer ***. ************* ******** *
18. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017109 (Lactobacillus salivarius strain CICC23174 plasmid pLS_2 sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taatg-aagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer -aatacaagcaaaagaaaaatgaattaaataga Protospacer ***. ************* ******** *
19. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693749 (Marine virus AFVG_250M1175, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
20. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694794 (Marine virus AFVG_250M1172, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
21. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694703 (Marine virus AFVG_250M1171, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
22. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694422 (Marine virus AFVG_250M844, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
23. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693830 (Marine virus AFVG_250M842, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
24. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693633 (Marine virus AFVG_250M1174, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
25. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693832 (Marine virus AFVG_250M1173, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
26. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694319 (Marine virus AFVG_250M843, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
27. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694684 (Marine virus AFVG_250M1170, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
28. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694707 (Marine virus AFVG_250M1176, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
29. spacer 2.8|955989|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693767 (Marine virus AFVG_250M1169, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--taatggctcatcggtgttaaagttatccatag CRISPR spacer cgtaat--ttcatcggtattaaaattatccatca Protospacer **** .********.*****.******** .
30. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017398 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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31. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009356 (Vibrio tubiashii ATCC 19109 plasmid p251, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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32. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046625 (Streptococcus sp. CNU G3 plasmid p1_CUN_G3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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33. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN695335 (Synechococcus phage B23, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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34. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN695334 (Synechococcus phage B3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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35. spacer 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HM559717 (Synechococcus phage S-CBP4 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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36. spacer 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_025464 (Synechococcus phage S-CBP4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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37. spacer 1.4|946523|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN713926 (Pseudomonas fluorescens SBW25 plasmid pQBR57, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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38. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014660 (Acinetobacter phage Ac42, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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39. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK554696 (Fusobacterium phage Fnu1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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40. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN013077 (Klebsiella phage vB_KaeM_KaOmega, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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41. spacer 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP014659 (Bradyrhizobium diazoefficiens strain NK6 plasmid pNK6a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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42. spacer 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049701 (Bradyrhizobium sp. 1S5 strain 323S2 plasmid pB323S2b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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43. spacer 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015062 (Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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44. spacer 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC139649 (Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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45. spacer 1.3|946462|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC139634 (Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical protein gene, partial cds; and capsid related protein, hypothetical proteins, tail length tape measure protein, hypothetical protein, enolase-like protein, hypothetical protein, tail protein, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, DNA methylase, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gggataaggaacatcagacaacagcatcaggc CRISPR spacer acgctggggaacatcagaaatcagcatcagca Protospacer . * *..*********** * *********
46. spacer 2.6|955867|32|NZ_CP026051|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013360 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G1, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S40-C16) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gaaatagcgattaacattagtaacattgaacg CRISPR spacer agtatcaagattaacagttgtaacattgaacc Protospacer .. ** . ******** * ************
47. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to JQ691611 (Cronobacter phage CR9, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
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48. spacer 1.1|946340|32|NZ_CP026051|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taatgaagcaaaagaaaacggaattaaagtca CRISPR spacer agatgaaggaaaagaaaacagaattttaactg Protospacer .****** **********.***** *....
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
32668 : 102026
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026051|32668:102026|DBSCAN-SWA TCTACTCCTGAATACGTGTTTCAATAATACCGCCACCTAAACAGACTTCGTCTTGATAGAAAACGGCCGATTGCCCCGGTGTAACAGCAGCAACAGGATAGTCAAAACGGACTTCAATTTTATCTTCATCTAATGGTGTTACTGTACACGGAATATCAGCTTGGCGATATCGTGTTTTCACCGTGCAACGAAAAGCTTCGGTAATAGGCTCTCTTGCGACCCAATGAAGTTGTTGAGCAATTAAGCCTACGGACATTAATCGAGGGTGTTCATGACCTTGTGCGACAATTAATATGTTATTTGCAACATCTTTATCGACTACATACCAAGGATCTTCGCTACCTTCTTTTGTGCCACCGATACCCAGACCTTTACGTTGACCTAAGGTGTGGTACATCAACCCTTGATGTTCACCAATGGTTTCGCCATCTACGGTGACGATAGGACCCGGTTTGGCAGGTAAATAGCGCGATAAGAAATCAGTAAACTTGCGTTCACCGATAAAACAGATCCCCGTAGAGTCTTTTTTCTTGGCGGTGGCTAAATCAAGCTTCTCGGCAATTTTTCTCACCTCAGGTTTTTCCATTTCACCGACAGGGAAAAGGCTTTGGGCGATTTGCTGATGACTTAATGTATATAAGAAGTAGCTTTGATCTTTGTTGTTATCAACACCGCGCAGTAATTGGCTTTTACCATCAATATCACGGCGACGAACATAGTGGCCCGTTGCAATATAATCGGCCCCTAAATCTTCAGCTGCATATTCTAAAAATGCTTTAAATTTTATCTCTTTATTACATAGAATATCGGGATTAGGGGTGCGGCCAGCTTTATATTCAGATAAAAAGTGTTCAAATACATTATCCCAATATTCAGCGGCAAAATTGATAGTGTGAAGTTCTATGCCAAGCTTATCGCACACGGCTTGCGCGTCGGCAAGGTCGGCAGAAGCTGAGCAATATTCTGTATCGTCATCTTCTTCCCAGTTCTTCATAAACAGACCAACGACCTGATATCCCTGTTCCTTAAGAAGATAGGCTGAGACGGATGAATCTACGCCACCGGACATTCCAACGATGACTTTTTTTTGGCTGTTATCTGACATGAATGGATCTCACTGCGGAAAAATAAGCGCCATACTTTACCATATCACTATCAAGGGTGCATCAAACGAATACATTTTTTGCCTTCTTAACTATGAAAGTCATTGTTAAGAGGCAAATGTTGAACCAAAGCTATCCAGTAAAGAGAGTGGATAACGTTCATTTTGTTGATAACAAAGAATACTTTCTTTTACCAGCGGTGAACGTAATTGTTGGCTATTGATTATCTCTTGCGCGGTCACCCAGTAGCAGCCATTAATATCATCGTCATGTGGTTGTGTGGCTAATTGTTCTGGTGCTTCTATCAAAAATAAAAAACGCAAAAATGGCGTATTGTCCGGTGCCACCCACTGATGTAATTTTAGAAAATACTGTACCGGCAAGGTTAAACCGGTTTCTTCCCATAACTCTCGTTGTGCCGCTTGGATCAGGGTTTCATTTGCTTCTAAATGTCCTGCGGGTTGATTCCATGTGGCTCTGCCATTTACCGTTTCTTCAACAACTAAAAATTTATTGTTTGCATGAACAATACAAGCAACAGTGATATGTGGTTTAAACAAAATTAATCTCCTTCCATTGACCCGGTAATAGATTATCCAAGGTAATATTTCCCATGCTAAAACGAATTAAGCGTAATGTGGGATAACCAATATGGGCAGTCATACGTCTAACTTGGCGGTTTTTTCCTTCAAATAAAGTGATTTTTAACCAGCTAGTCGGAATAGATTGACGCTCTCTAATAGGTGGAAATCGCGTCCAAACCCACGTTGGCTGTTCTACCCTTTCAATTTTTGCAGGTAGTGTTTTCCCATCCTTTAGGTTAAGTCCTTCACGAAATTGTTGTAACGCTATCTCTGTGGGAATGCCTTCTACTTGAGCATAGTAGACTTTCCCTGTTTTTTTATTTGGTTGAGTTAATTTGGCCTGTAATTTGCCATCATTTGTTAATACTAACAGACCTTCACTATCTCTATCTAACCGTCCTGCCGCATAAATATCAGGAATGGGGATAAAATCTTTTAGCGTTTTTCTACCGCTGTCATCGGTAAATTGCACAAGGACATCAAAGGGTTTATTAAAGATAATCACTTTACGCTCACCTCTAGGGCGAGAAGGTTTTTTTTGTCCTGCTAGTGCGTGAGATTTGCGTAGTTTCGATCTATTGTTAAATTGATTTGCCATAGCTATTTTTTGTCAAAAATGGGAGATTGATTATACCTTAAAAGAGAAGCGATTGGCGTTAGCTGAATAATCAAGTAGTATTGACAGGTCTCTTACAAAAAATTAACAAAGCGTGCGCTTACATGAAAGGAGAGGTAAATGGAAAGCAAAGTAGTTGTTCCGGCTAATGGTGCTAAAATTACATTAGATGCTAAAGGTAAGCTTGTTGTTCCAAATAATCCGGTTATCCCTTATATCGAAGGGGATGGTATCGGTATCGATGTCACGCCAGCAATGTTAAAAGTTGTTGATGCAGCGGTTGAAAAAGCTTACGGCAATGAACGTAAGATTGAGTGGATGGAAGTCTACACCGGTGAAAAATCAACACAAATTTATGGTAAAGATGTTTGGCTGCCAGAAGAAACCTTAGATCTTATTCGTGAATATCGTGTTTCTATTAAAGGTCCTCTTACTACACCAGTAGGTGGTGGTATCCGTTCATTAAATGTGGCACTACGCCAACAACTCGACCTTTACGTTTGCCTGCGCCCAGTGCGTTATTACAAAGGCACTCCAAGCCCAGTAAAACACCCAGAACTGACGGATATGGTTATCTTCCGTGAAAACTCAGAAGATATCTATGCCGGTATTGAGTGGAAAGCCGGCTCAGCAGAAGCTGATAAAGTGATTAAGTTCCTGCAAGATGAAATGGGTGTAACCAAAATTCGCTTCCCACAAGATTGTGGTATCGGTATTAAGCCATGTTCAGAAGAGGGGACTAAACGTTTAGTTCGCGCAGCGATTGAATATGCAATTGATAACGATCGCGACTCCGTTACATTGGTGCATAAAGGTAATATTATGAAATTTACCGAAGGTGCCTTTAAAGATTGGGGTTACGAATTAGCCCGTGAAGAATTTGGTGGTGAGCTGTTAGATGGTGGTCCTTGGGTTAAAATTAAGAACCCTAAATCAGGCAAAGATATTATTGTTAAAGATGTTATCGCAGATGCATTCTTACAACAAATCCTGTTACGCCCAGCCGAGTATGATGTTATCGCTTGTATGAACCTAAATGGCGACTATATTTCTGATGCATTAGCAGCACAAGTTGGTGGTATTGGGATTGCTCCTGGCGCTAATATTGGTGATGAGTGTGCATTATTTGAAGCGACTCACGGAACAGCACCAAAATATGCCGGACAAGATAAAGTTAACCCAGGCTCTATTATTCTCTCCGCGGAGATGATGCTACGCCATATGGGTTGGACAGAAGCCGCTGACTTAATCATTAAAGGTATGGAAGGCGCGATTGAAGCGAAGACCGTTACTTATGATTTCGAACGTCTAATGGACGGCGCTAAATTGCTGAAATGTAGCGAGTTCGGTGACGCGATTATCAAACATATGTAATTGTTGATTTGATAAATAGTTAACGGGAGCTTATTAGTTCCCGTTTTTTATTATCAATATTGAAACGGTTATCAAAAAGTTATCAAAACGAGTTATCAAAACCGCCTGAAATTTGAGCAATTAAATCACGATTTTTATCCAATCTTTCCCTCGATCATCATGGTATTTATCCGTTTGAATTTGGTTTTTATGACCTAGTAAATCTTTAGTGTTTATACCTTGTGCTCGATATAACCTTTCAGATAAAGAGCGCTGTTCATGAAATGTTGCAGGCGTTCCTTCTCCCCAATCGATATCCGTTTTATTTCTCGCCTTTTTAAAGTTAGTCGTTAGCGTATTTGCAGTAACTTGATCACCACGTTTAGATTGTGAAGTGGTATGAAAATAATGAATAAGATAAGGGCTAATAACGCGATCACGACAACGAGCAACAACTTCACGTAATGACATATTTAATTGTTCAGAACGTAGTGATAATGGAATAGCTAATTTGGTGCCAGTTTTTTCTTGGATAATATGTAAATGATCATCCCAAATATCACTAAACTTCATTGCCGAGATATCACCTAATCGTTGGCCTGTAATAAGTGCAAGCAACATGGCATTGCCCATATAACGATGTTGTTTGTCAGCAATCTCAAATATCTTTTTCCATTCATCAAAATTAAGGCGTTGGCGAGTTACTTTTCGTTTCGGTTGTTTAGTGGCGAGGGCAGGGTTATAACCAGGAGGAACTTCACCTGCATGTTGTGCTTCTTTAAATACATCAATTAAAACAGAACGAATAACTTGTGCCATTCTGTGCTGGCCATTAGATTTATACTCATCAAGAATTTCAGCAATATCTCTGGCATCAACAGCTGGTAATGGTTTCATGGATAAGGCTTGCCTCATTAAATCGACTGGCTTCCTTTTTTGTTTATATGTATTTGGCTTTATATCACCTTCTTTTAAACGTTCTTCTTGAATAGCCCAGTATTTATCTAACCAAGTATTAACCGTGATTTCTTTACCTTTAATTTTTGCCACCCGATCACTAATAGCCATAACTTGCCGGCTTCGTTGTTCTGCTAACCTTGTATTAGCTTCAATGGCTATTGCTTTGGCCTCGGCTTCATTGTCACCGAGGGCATGATATTTACCTGTTACAGGATGGCGGTAACGCCAATAAACCTTGCTGGCTTTACGACTAAGTAATGGATAAAGGTTAGGAATATTGACGTTATTCTTACGAGGTCTGGCAGCCATCTTTGAGGATCCTTTGTAAAATAGGGTTATCGTTGTTATTGATAACCGGTGATGTCAAATTACCGACAAGGTCAG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87 | Morganella_phage(19.51%) | lysis,portal,terminase,integrase,protease,capsid,tail,transposase,head,tRNA | attL 34942:34956|attR 70806:70820 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
864270 : 881197
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026051|864270:881197|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026051|864270:881197|876803_878291_-|WP_036918594.1|DBSCAN-SWA MSIKQTRYVDIASAVIGASTAPMRKLTARIFSTNPKIPAGKVLEFTSGQVDAFLGADSPEAQFARQYFSYVSPAPVSKPKELQIASYEPMGRAPTLFGGPVATLDKLKLIEEGELTLVIGDVTKKISKLSLQDVTSYSDIASVIQAKLNAESEPQFASCYVTFNAMDSAFLISGGVQEKAQISVNNSPLADALGLSQGQTSEGNASQTALEAFMAAEAISDSFGSATFLTELSIEQSVELAEYVAGENVKYQLYLSVPDQQAEMYSKALMNTASTGLNLKTEENFFVQALPMAIMAATDFERTNATTNYMYRQFGITFPSQVTTDMVADRLDKLRVNYYGETAVSGSEISFYQRGFLCGNGANPVDMSVHANEQWLKAYIAQQWLSLLLSTRGIPANKDGEARAMMIIAGAVTKALNNGTIQTGKALTEVQKIAITDAAGDDLAWHDVQNKGYWYNAEIVEQTGPGNLPEYTMKYVLIYGKGDWVRKVEGSHNLV >NZ_CP026051|864270:881197|879701_880001_-|WP_004248367.1|holin|DBSCAN-SWA MKENPDLWEQICIVLYSMKEQGISALLAGGMAILRSLYNAGGWKKTFLDGLMCAMFAWFIKDILLLFSINHQFAYLASVFIGYVGIEPVSKLLIRKNRS >NZ_CP026051|864270:881197|876340_876793_-|WP_004243628.1|DBSCAN-SWA MNDISATGLSLIIQASKTFPAGIPITTFSDEGDPLDLPTVNITQTAVDINGNLVSWSSPTPQTVTINVLAGSEEDENLAILFDANTARRGRRPASDVITLVASYGDGSITTARNGRITGGCRGNSVAGVGRLKSKQYTFIFQDFDRVRAR 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MTKIFKIPFATQGDKTVVPVEIQTDGSVSYTQGYGYDYERDQVTDPAAKDIEREKMNSLFHDITESIGEMQLQGFAKWSEAGKPYAIRSVVYHNNKVWQSKIENNNIEPIAGNAWAELKADITANEVGAYNKAEADKRFQPVGKYQAEGYSYAKAESDTKYQPKGNYAPAGNYANKGDSYTKAESDGKYQPKGNYQASGDYATNTNLKNELNKKFDKGNIAQATGTSTAHVISQKAATDAFQPKGNYQPKGNYALVGASYTKTESDNKYQPKGNYLATGYSYSKSESDGKYQPKGNYAIVDASYTKTESDNKYQLKGNYVPTSRKINGKQLNTDIKLTAEDIGALTQSQADARYLAKNTNIEGGIGSYILGNTNSANVGDIISGGSINRASITNYYVSTSSTEDRFHTILLSGTISGSWKALAKTSGNRGSRPPESGGTTLFVRVA >NZ_CP026051|864270:881197|868962_869619_-|WP_017628011.1|DBSCAN-SWA MNIQQFDYHSDLLQAILWQYENADKLKSLAHFKADYFHQSTVLFWQNWYRDIFNIDTANDFGLAVWGRILDVPLGIDISPSEKTKIGFGFGKKKANFNANFRRNTDYTLSLTLDQKRMLIRMRYFNLTQSPTVTNINQFLKRFFWRGESKVFVLDPFDMTYMYYVFNFNPDERLRLLLENFDLMPRPSGVGVKYRIITKKAFGYGSYRKNFLKSNFGE >NZ_CP026051|864270:881197|869615_870803_-|WP_036918580.1|plate|DBSCAN-SWA 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MHELPLVFFTVLGSSAAGLFLIAYISKKLGQIDEQQLRNANILALILMLVGLGIGGLHVGQPLRFFNMLLGVGRSPMSNEAFLSGVFTGFAFATVALTIMKKWRGLREICNLFTVIFGLAFVWSIPQVYHIPTIANWNTDYTTLQFWMTLLIGGGVLAMVSGARRLGALSFIIGAIITFAARSGYVSFLSFNGPELSAEQSLFWGFQLAVLALGIVVVGFSALKAQTSKVTLATCAAAVVIAELSGRIAFYNLWHITM |
22 | Burkholderia_phage(30.77%) | lysis,holin,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1384979 : 1401832
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026051|1384979:1401832|DBSCAN-SWA 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MTQEQKREIEQLLEPHQLKVLMLITLLSTWLEAEECDETRNMIWAVLTVVYSIRDEMNEAVEGK >NZ_CP026051|1384979:1401832|1400959_1401832_+|WP_004244243.1|DBSCAN-SWA MSARIIDGKTIAQTIRSEVAEKVKQRIKIGKRAPGLAVILVGDNPASQIYVASKRKACDEVGFISRSYDLPDTTSEADLLNLIDTLNEDNTIDGILVQLPLPAGIDNVKVLERIHPDKDVDGFHPYNIGRLCQRAPKLRPCTPRGIVTLLERCNIPMNGLNAVIIGASNIVGRPMSLELLLAGCTTTVTHRFTKDLRFHVEHADLVVVAVGKPNFIPGEWIKPGAIVIDVGINRLENGKVVGDVDFAQASQRAGWISPVPGGVGPMTVATLIQNTLQACEEYHDPDIGNN >NZ_CP026051|1384979:1401832|1388226_1388568_-|WP_036918873.1|DBSCAN-SWA MEKLQRLASTIAQIYVDNLKAETGETLVTYNGITGKVTPELLAAGLFDNAVFAVKADGEEIDVEGKAYDLLSPLINLSTKPYSLTGQAYKLINFLNVQALKAGSTLSTLSVVH >NZ_CP026051|1384979:1401832|1395695_1395869_-|WP_072021451.1|DBSCAN-SWA MRNPQPNDFYTHKNNSETVKVLSVQFNRVTFQRDGFDSPVIVPLSQFSNEYTYAGRA >NZ_CP026051|1384979:1401832|1397542_1397938_-|WP_036918890.1|DBSCAN-SWA MKKKNHPSQVASQNNVASSILSKNPPKKHRARLYMLGTGINGFTENEILIHCRLSSGRNYPNELERLLNIELERIDEPNPDGIGSHYRYRFKTAQDVQKVINLINKRAEQGNYQPIDNALINNILSLYPTK >NZ_CP026051|1384979:1401832|1388567_1388741_-|WP_072271821.1|DBSCAN-SWA MSKQKRTFKPVSIDSEIIERVKKFKEKQGEKDFFIQRAPISQLIQGLLINALHNEGF >NZ_CP026051|1384979:1401832|1393126_1393471_-|WP_036918880.1|DBSCAN-SWA MIMKNFKVNSLANSYAAAIYHDITTRNGGDWFSMKVGNKTIEVAIIDGVKGIRMLVDSYLLKALKGQYPTWEAVAIGLIEQCVINGYVTGYGREVWQSMINDMGDSFADKGAFQ |
20 | Morganella_phage(50.0%) | integrase | attL 1378667:1378686|attR 1400559:1400578 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1663346 : 1672214
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026051|1663346:1672214|DBSCAN-SWA TTTATTCTTGTTCATTGATTAACTCTTGTTTCTGCTCTGGCTCTTTTTCGAGATCGTCAATATTAAAGACTGCGACATTATCCATCAGCACTTGTGCTTTATCGTTTAACATCATGGTAGAAGAGGCGGCGAGATCGACCAAAGAGGCATTTTGTTGTACTACCGTATCCATTTGATTAATTGCTACTGCAATTTGTTCGACACCAAGACGTTGCTCTTCCGACGCTAAACTAATCCCTTGCATGATCTTGTTTACTTTTGAAATGGAAGAGACAATCTCTTGCATGCACTCACCGCTTTTATTCACTAAATTTGTACCATAGGTAACATCATTGATAGATGCTTTAAGAACTTGGCTAATCTCTTTTGCTGCTTCAGCACTTTTTGCGGCTAAGTTCCGTACCTCAGCGGCCACAACGGTGAACCCACGCCCTTGTTCGCCTGCTCTTGCTGCTTCTACGGCAGCATTTAAGGCCAAAATATTAGTTTGATTGGCTAATTTATTAATAACATCATTAATTTCCCCAACTTTCACTGCACCTTGTTCTATTTTCTTCATCGATAATACAGCTTCTTTCATGACATTAGCGCCATCCATAACAATGTCAGTAGATTGATTAATAATATTATTTGCTTCAATTGTATTATCGGTATTGTTAGCAACGGCTATTTTGATCTGCTCCATACTGGCAGCGGTTTGTTGTAACGCACTGGATTGTTCTTCTGTACGAGATGAAAGCTCTTGATTACCAGAAGCAATTTTAAATGCGCCCCCTTTTATATCCATAGCCTCTTTTTTGACAGAAAAGATTGTCGAGGTTAATGCTTTTTGCATATCACTGACACGAGAAAAAAGTTTACCAAACTCATCATTTTTTACTTGTGGTACAGAAAAAACCAAGTCAGCATTACCTACTTTATTTAATATCTCAGACAATGTATTAAGATTAGAAACAAAGGTTTTATTGATCCAATGAAGCACAAAGTACAAAACAATTAATAAAATAATTAATGAGATAATTGTTGAGTAGATAGAAAACTCAACCATTGAATCTTGTTTATGAGTAAGGTAGAGACTATTTTTATTTCTAGTCTGAATATATTTTTCAAATAATTGATCAAGATGTTCAAAATCTTGATCAAATTGATTAGCTTTTATCTTTATTGTCGCTAATTTATTAGGATCTAAAACTAATTTATCTATCAGATTATAAAATAACGTCGAAATATCATCAGCATTTTTTTGTGCTGCAACAGTCATTTTCTTCTCTTTCACCCATGTTTCCATGGTGTTTTTAGCCATGATAGCTAGCTTTTTATTTTGCTGAATAATTTTGTTACGATCTGCGACACGACTATCTTTGTCTTGTAATAGATAATTGACATTAGAACGCATAATAGCCAGTTGATAACGAGCCATCAACACATCGTCATAACGTGCAGATAAGACATCAACTTGAGTAAAATTGTTTTGCATTTTATAAATAAAAAATGAAGATAAGGCAGACGATAGAATAAAAATCAATAACAGTAAAGAAGAGCCTAATTTTACGGTTCGTTTAATACTCATGATAAAAATACCTATATGCGCATATCGATAAGATTTATTTTTTATCGACACAATGATATTTTTATTTAATTATTAGAGATAACACTAGGTCATTGATTTTTATTTTAAATAAATTTTTATATCATAAACAAAATAAGTTATTTTTAATAACTGCTATAATTATTGGTATATTATAAAATAAAACAAACCAATTCTTTTAAAACATAATCCGCTATCAATTAGTGCATTCTTCTTTATGCTCAATATCAATTTTCATTTTATATGACTAATATCATCAACGATTAAAAATAAAAACCTTATTTTTTCAATAAGATACTGATGATACTATCTCATTTTGAGAACAATGATATAATAGGCGCTTTACCTCATAAACTCTGATGATTTACGGAGCTCAATATTTATGCAACCACAATTTGAAAACGCAAAAAACACCGTAAAAACATTATCAGTGTTTGATTTTGATGGTACTTTAACCTATCACGATAGCTTTATCCCTTTTCTAAAGTTTGCCTTTGGGCGTCGTAAATTTGCTCGTCGTATTATCAAAATGGTATTCCCCACATTACGTTGTTTTAGACGTAAACTGACTCGTGATGAATTAAAAGAAGTGCTGATTAAAACTTTTTTAACCGATATCAAAGAAGAATGGCTCAAAGAAAAAGCCGAAGCCTTTTGTAAAGCTTACTGGACTAAGTTAATGCGTCCTGCAGGTTTATTAGCCGTTGCTGAAGAGATTAACCGTCATGCTGAAGTGACCATTTGTTCAGCTTCTCCAGCTATGGTGTTGCAACCTTTTGCGGATCGACTTGGTATAAAGTTAATAGGAACAACACTTGAAGTGGTTGATGGTGTGCTGACAGGAAAAATCATTGGCAATAACTGCCGTTGTGGCGAAAAAATCAAACGATTAGAGCGTGTCTATGGCGATCTTACTCAATACCACTTAAGAGCGTGGGGCGATTCACGTGGTGATCATGAATTACTCTATGCTGCACAAGATCCACATTGGCGCTATTTCCACACAGGAAGTAATAAGTCAAAAAAATCACCTATTAAAATAACGCTTAAAAAAGACTCATAAGTGATTATATAAAAATAAAGCGGGAAACGTATTTTCCCGCTTTATCCATAAACTAACTATTTATCTAGTCATCTTGGCGCTTTTATTAGCGAAAGATTAAATATTGACGCCATGTTGTGCGGCTAGTGCGCCTAAACCACCCGCAAAACCTTGGCCTACTGCTTTAAATTTCCAATCTGAACCATGACGATAGAGTTCACCAAAGATCATCGCCGTCTCCGTAGAGGCATCTTCAGAAAGATCAAAACGTGCAATTTCAGTGTTATTGTCGTTATTATAAACGCGCATAAAACTGTTGCTCACCATACCAAAGTTTTGTTTGCGGTTTTCAGCATCGTAAATAGTGACAGCAAAAACCAGTTTTTTCACTTCAGCAGGAACTTTGGATAAAGTGATTTTGACTTGTTCATCATCACCTTCGCCTTCTCCAGTACGATTATCGCCTTGGTGTTCAACACTACCACATTGGCTCACTTTATTATTAAAGAAGATAAAACTTGCATCTGAAAGCACTTTTCCATCTTCACCGACCATGAATACTGACGCATCTAAATCAAATTCAGCGCCATCTGTCACGCGGGCATCCCATCCTAAACCAACCATAGCCACCGTCATGGTTGGTGCTTCTTTAGTTAGCGAAACATTACCACCTTTAACAAGGGAAACAGCCATATCAAAGCTCCTACTGTGTTGAATAAACTGACAATTAGGAATAACTGCCAGTAATTTGTGATTTCATAACATACGATTAAGAGGCGTTAATACCATATTGCGCACATACTGAGCCTAAGCCCCCTGCATATCCTTGGCCTACAGCACGGAATTTCCACTCACCGTTATGACGATATAACTCACCAAATAACATCGCCGTTTCCGTTGATGCATCTTCCGTTAAATCATAACGAGCAACTTCAATTTGGTTGTCATCATTAACTAAACGAATAAACGCACCAGATACCTGACCAAAGCTTTGACGACGCGCTTGCGCTTCATGGATAGTCACTACAAAGATAATTTTTTCGACATCACTGGGGATGGTATCTAGTTTGATTTTTAGTGCTTCATCATCACCATCACCTTCACCTGTTCGGTTATCACCAGTGTGAACAACAGAGCCGTCGGCAGATCTTAAGTTGTTATAAAAAATGAAATCGGCATCGCTACGTACTTTTCCATTAGCGGCTAACAGAAATGCAGATGCATCTAAGTCAAAATCTTGACCATCTGTAGAACGGGCATCCCAACCAAGTCCGACTAGGACGTTTTTCATCGTTGGGGCTGCTTTGCTTAAAGAAACATTACCACCTTTAGAAAGAGAAACGCTCATCTTCAACCTCTTCAATTTATGTTGCGATATTCTAATTTCCCAAGAATATCGGTTATCATTATTTACCTTATTTATTCTTTTTTTCTGGGAATACAAAACTTGCCAGAATACCCAGAGCAAGAACACCAAGCACTACGAATAGGCTGGTTGTCGCGGAAATGCTATATCCATGCTGCCAAATATGATCTGTTGCATTAAGCCCCAGCTTTACAGCAATAAAGAACAGCAATGCAATAACCGCTTTTTCAAGGTGAATCAGATACTGTTTTAATGCCTCTAACACAAAGTAGAGAGTACGTAAGCCCAAAATAGCGAACATCATTGCACTATAAACAATCAGTGGCTCACGACTAACGGCAATGATTGCAGGCACCGAATCGAAAGCAAACATCACATCAGAAAGCTCTACCACCGCCACACACAACATAAGCGGTGTCGCATATAACGCAGCTTTTGTACCTCGCCCGATAGTTATGTCTTTGTTTTCCGGTTTTGCTAACTCTGCATCAACCTCTTTTTGTGTTAATAAGAAGGCATGTCCAGTAATTTTTGGCCATATAGGGAAAAATCGTTTTACTAAGCGATAAGCAAGGTGCTGTGAATAGTCTTCAATTTCTTCACTATCATTCCCACTTCTCAGCATCATTACGGCTGTCCAAGCAACAATCAGAGCAAAGACTATCTCAACGTAAGGCCCTAAACTTAATAAGCCGGTACCAATAGCAACAAAGATCGCACGGAATACAATGGCACCAATGATCCCCCAATACAGAATGCGGTGACGGAAACGATCAGGAACCGCAAACCAAGAGAAAATCGCCATCATGACAAATAGGTTATCGACAGACAGTACTTTCTCTAATGCATAACCCGTCACGAATAAGCTTGCAACTTCTGCACCATGGTGGACGTATAAAAAACCCGCGAATGCCATGGCAACGACTACCCAGAATATTGACCAAAAAACAGCATTCTTTAACGTTATCGGCTTATCTGCACGATGCATAAATAAATCGATAAAAATAGCGCCTATCGCAAGTACAACAAAAACAATGACAGTTTCTGTCGGAAAACCAATATGTGTGGATACCATAATTATTCCTAAACGGTTCCCTATATAAAATTAATTACAAATCAAACTCTGCGGGCTCAAAGCCTAATGCAACGGCAATAGCACGCACCGCCTCTTTTTCGTCATTGTCAAAATCACCATCACTTTTCGCAACAGCAATACCGACACGGATCGCTAATTGTGCAGCTTCTGGCTGATCTTTCATTGCCAGAATATACTTCATCGTTTCACCTTTACCGACTTCAGTATCAAATTCAAAACTGCTAATTAGCTTATTAAAGAATTCGATCACCTCGGAGGTATCAAAGACTTTAAGCTCTTCTGATGCTTTTAAAAAACCGAGCATCTTCTGCTTTTCTTCAGAACTCACACCATCGCTGGCAATAGCGATACGAGCACAAACTGCGACCGTACCTTGCATAAATTTTTTGTTTTTAAAACGACTGACTTGCTTAGTTAACTCCGCTCGCCCGGAATTAAAACCTTCTTTTAATTTATTGAAAAAACTCATTTTTATTCTCCTTATTTCGTGTATTCACTTAGATCCAGCAGTCCAGCGAAATCCCCATCCGTAGGCATTATCCATATCGCGATGGCCTTTAAAAAATTCATTGAGACGTTCAACTTTGATTGATCCGTTTTCATTAACAAGTCGTGCGATGGCACACATAGCTCGACCATTATTACCATCCGTTAAACGTGTTTCGATAGGTGGTTGCTCGGGAACATGAATAGTGACCACACCATCTGTTTTACTCCAGTTAGGAACCCCTTCATAAATAAAAGTAAAAATAAGCACTTGCTTGATATTTTTCCATTCACGTCCATTGATAAAAATCCACTCGCCACCCGCTACATCACCAGTGCGATCATCACCTTGTAACTCAACATAAGGCATGCGATTAAAATCACCGAATCCATTTCCTAAGGCTTGGATCACTGACTTATAACCATCTTGTAGTTCAACAAAGGCGCCAATATCTAAATCAATACCTTTGTTACCACCAAATAATCCACCTAATAACCCGGAACCACCGCTTTTACTTTCTCGATGCCAATCGAGGTTAATGCGGATTTTGCCGAAATCATCCTTTTTAGTTAAGCTAATTGCCGGTTTCTCTTTAGTTAGCGAAACCTTGCTTAACTTCACTGAGCTCGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTTCAGGATCAGCAATATCAACACCAAAATATTCCGCCAATGGTTTTAATCCACCGTTAAATCCTTGTGCAATAAACCGAAATTTCCAGCTTCCATTGCGACGGTATAGCTCACCTAAAATTAATGCCGCTTCAGTGCGTCCATCGATATCAACATGGCCGTTCGCAACGACATTATTGTTAGCATCAACTTGAATAGACAAATGTTGTAGATGAGCAATGGTTTGTTGCCCCTCACAAGTAGCTGTAAAAGCAATTCTATCGACATCAGGACGTAAGCGAGTTAAGTCAACCGTAAACGACGTGCTATTACCTGCTGTTGCATAAATAATAGTACGGTCATCATTAGTGGTTTGACCATAAAACACCATATCAGCATCACCGTTCACTTTTCCTGAGGCATAAAGCCTAAATGCAGATACATCAACAGGTGAGCCTGAGTGAATACGCACCATTAACGTTTGATCAGGTACGGATATATTTCCGCCAGGTGTTAGGGTCATTTATCGCACCACCGTCGCCAAAATATCTGGCATCATCTCGTCAATGACAAGCCCTTTACAAGGTGAGCCAAAAGCCGTGAAATCCCATTGTCCGTGATTACGTTGTAAAGCGGCAATCACGATCCCAGTATGAGCGCCTTGTTCCGTTAATTTGTAATGAGCAAGCTCTTTATTGGTTGTTTTATCGACAACTCGACAAAACGCATTTTCAACTTCATTAAAGGTCTGCCCACGGAAACTATTGACAGTGAAAACCAAATATTCAACCAATGAAGGAAGACGATTTAAATCAACAAAAATAGTTTCATCATCACCATCACCCTCTCCTGTTAAGTTATCTCCTGAGTGAATAACGGACTGACAAGTTGATTTTAGTTTACGAAACCAAATAGTATCGATTTGTTTACCATTTACATCGAGTAATACACAACTTGCATCTAAATCTATCGAATTATTACCACCAAAGAGTCCACCGAGAAATCCCTTTTTCTTAATAGGATCCCAGCCTAAACCAAACATTAGGTGACTCAGTGCAGGGGCTTGTTTACTGAGAGAGACTGTCTGATCCTTGCGTAATGAAACCATAATTAACTCCCTTCAAAGGTAGAATGAAACAACAATATCACTTGCATATAAATACAAATTATAAATCATCATATCATGATGAAGTAGTTCGGCAAGTCTATTTTTATCAACTTACTTCAAGAGATTGTAAACATATTGAAATAAAAGAAATTTTTATAGATAAACACAATTAAAACTTAAGTTAAAAACAAAAAATACCGCATTAACCTAATTATTTTAAATTAAAGTAAAATAGATCACATTATGATTGACATGATAAAATAGAAACTTCATGATGAGAAAACAGGTTTTAGCTTAAACATTCACAGTATGTGACGTTATGTTCAACACGGCTTAGCTTATACCCAGATAAATGCACTTAAAAAACTAATTAGTACGGATAATAAAGAATAATGAATAGTTTGATTGGCTCTTCTGTTTATCGTCGCCAACTCACTTGTGGCACATTAAGCGTAACGCCAAATTGCTCATTAGAACATCTTGATGAACTTTTTGATATTGCGGAAAGACGCAACCCTAAGCGCGCTTTTTTGTTTGTCAGTAAAGTATTAGGGCGCCATATTCCTGTTTCACCTAAGAAAATGCGTGAAACTTATCAACAAATGGCCAAACAATTTCCTCAATCACTCGAAGGCCCTATTCTTTTTATTGGTATGGCAGAAACTGCGGTCGGTTTAGGTGCGGGGATTTTTGATGAAGTAAGAGATCGCTATCCTCAAGCCCTCTACCTTACTTCAACGCGCCATCCTATTGCTGATGGTGAATTATTCTGTAAATTTAAAGAAAATCACAGTCATGCAACTGATCACCTACTTTATTTGCCTCATAACCTAGAACAACGCCAATGGATCCAGCAAGCGAAAACCATTGTGTTAATTGATGATGAAGCAACCACAGGTAATACCTTTCTTAACTTGCTGTCTGCATTACGTGAAGAAGGTAAGTTAACACAAATTAAGCAGATTATTGCTGTCACATTAACCGATTGGAGTGGTGATGCTCTGCAAAAGCGTTCACCATTACCCATAACAACCTTCTCTTTAGTGCAGGGAAAATGGCAATGGCAAGCCAATCCCGATGCACCATTACCTGTTATGCCAAATGTCAATATTACTGCTTCAGGACAGGTTGCTATCACAGGAAAACAAAGCTGGGGACGCTTAGGCATGACAACCCCTGCTAATGATCTTGGCCTATTTATTCATGTTTCTGAGGGTGAAAAAATATTGGTTTTAGGCTCTGGTGAATTTGTCTGGGAACCCTTTTTATTAGCAGAACGCTTAGAAAAACAAGGGGCTATTGTAAAATATAGCTCGACGACTCGCTCACCTATTGCCACTAATTTTGCTATCCAATCAGCGATAACTTTTACTGATAATTACGGATTAGGCATTCCTAACTTTGTCTATAACGTGGCTCATCAGCAATTTGATCGCATTCTGCTTTGTTGTGAAACCCCTGCCGAAAGTATTGATAGTCAACTTATTGAGGCTCTCTATAAAGTTGCCCCTATTGTTGAAGTAATTAGCTATGACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026051|1663346:1672214|1665315_1665996_+|WP_004245602.1|DBSCAN-SWA MQPQFENAKNTVKTLSVFDFDGTLTYHDSFIPFLKFAFGRRKFARRIIKMVFPTLRCFRRKLTRDELKEVLIKTFLTDIKEEWLKEKAEAFCKAYWTKLMRPAGLLAVAEEINRHAEVTICSASPAMVLQPFADRLGIKLIGTTLEVVDGVLTGKIIGNNCRCGEKIKRLERVYGDLTQYHLRAWGDSRGDHELLYAAQDPHWRYFHTGSNKSKKSPIKITLKKDS >NZ_CP026051|1663346:1672214|1666744_1667323_-|WP_004249446.1|DBSCAN-SWA MSVSLSKGGNVSLSKAAPTMKNVLVGLGWDARSTDGQDFDLDASAFLLAANGKVRSDADFIFYNNLRSADGSVVHTGDNRTGEGDGDDEALKIKLDTIPSDVEKIIFVVTIHEAQARRQSFGQVSGAFIRLVNDDNQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLGSVCAQYGINAS >NZ_CP026051|1663346:1672214|1666092_1666668_-|WP_004245603.1|DBSCAN-SWA MAVSLVKGGNVSLTKEAPTMTVAMVGLGWDARVTDGAEFDLDASVFMVGEDGKVLSDASFIFFNNKVSQCGSVEHQGDNRTGEGEGDDEQVKITLSKVPAEVKKLVFAVTIYDAENRKQNFGMVSNSFMRVYNNDNNTEIARFDLSEDASTETAMIFGELYRHGSDWKFKAVGQGFAGGLGALAAQHGVNI >NZ_CP026051|1663346:1672214|1667390_1668416_-|WP_004249445.1|DBSCAN-SWA MVSTHIGFPTETVIVFVVLAIGAIFIDLFMHRADKPITLKNAVFWSIFWVVVAMAFAGFLYVHHGAEVASLFVTGYALEKVLSVDNLFVMMAIFSWFAVPDRFRHRILYWGIIGAIVFRAIFVAIGTGLLSLGPYVEIVFALIVAWTAVMMLRSGNDSEEIEDYSQHLAYRLVKRFFPIWPKITGHAFLLTQKEVDAELAKPENKDITIGRGTKAALYATPLMLCVAVVELSDVMFAFDSVPAIIAVSREPLIVYSAMMFAILGLRTLYFVLEALKQYLIHLEKAVIALLFFIAVKLGLNATDHIWQHGYSISATTSLFVVLGVLALGILASFVFPEKKNK >NZ_CP026051|1663346:1672214|1663346_1664915_-|WP_004245601.1|DBSCAN-SWA MSIKRTVKLGSSLLLLIFILSSALSSFFIYKMQNNFTQVDVLSARYDDVLMARYQLAIMRSNVNYLLQDKDSRVADRNKIIQQNKKLAIMAKNTMETWVKEKKMTVAAQKNADDISTLFYNLIDKLVLDPNKLATIKIKANQFDQDFEHLDQLFEKYIQTRNKNSLYLTHKQDSMVEFSIYSTIISLIILLIVLYFVLHWINKTFVSNLNTLSEILNKVGNADLVFSVPQVKNDEFGKLFSRVSDMQKALTSTIFSVKKEAMDIKGGAFKIASGNQELSSRTEEQSSALQQTAASMEQIKIAVANNTDNTIEANNIINQSTDIVMDGANVMKEAVLSMKKIEQGAVKVGEINDVINKLANQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFTVVAAEVRNLAAKSAEAAKEISQVLKASINDVTYGTNLVNKSGECMQEIVSSISKVNKIMQGISLASEEQRLGVEQIAVAINQMDTVVQQNASLVDLAASSTMMLNDKAQVLMDNVAVFNIDDLEKEPEQKQELINEQE >NZ_CP026051|1663346:1672214|1671068_1672214_+|WP_017827550.1|DBSCAN-SWA MNSLIGSSVYRRQLTCGTLSVTPNCSLEHLDELFDIAERRNPKRAFLFVSKVLGRHIPVSPKKMRETYQQMAKQFPQSLEGPILFIGMAETAVGLGAGIFDEVRDRYPQALYLTSTRHPIADGELFCKFKENHSHATDHLLYLPHNLEQRQWIQQAKTIVLIDDEATTGNTFLNLLSALREEGKLTQIKQIIAVTLTDWSGDALQKRSPLPITTFSLVQGKWQWQANPDAPLPVMPNVNITASGQVAITGKQSWGRLGMTTPANDLGLFIHVSEGEKILVLGSGEFVWEPFLLAERLEKQGAIVKYSSTTRSPIATNFAIQSAITFTDNYGLGIPNFVYNVAHQQFDRILLCCETPAESIDSQLIEALYKVAPIVEVISYD >NZ_CP026051|1663346:1672214|1668450_1668906_-|WP_004245607.1|DBSCAN-SWA MSFFNKLKEGFNSGRAELTKQVSRFKNKKFMQGTVAVCARIAIASDGVSSEEKQKMLGFLKASEELKVFDTSEVIEFFNKLISSFEFDTEVGKGETMKYILAMKDQPEAAQLAIRVGIAVAKSDGDFDNDEKEAVRAIAVALGFEPAEFDL >NZ_CP026051|1663346:1672214|1668930_1670091_-|WP_036919012.1|DBSCAN-SWA MTLTPGGNISVPDQTLMVRIHSGSPVDVSAFRLYASGKVNGDADMVFYGQTTNDDRTIIYATAGNSTSFTVDLTRLRPDVDRIAFTATCEGQQTIAHLQHLSIQVDANNNVVANGHVDIDGRTEAALILGELYRRNGSWKFRFIAQGFNGGLKPLAEYFGVDIADPEPAPAPAPAPAPAPSSVKLSKVSLTKEKPAISLTKKDDFGKIRINLDWHRESKSGGSGLLGGLFGGNKGIDLDIGAFVELQDGYKSVIQALGNGFGDFNRMPYVELQGDDRTGDVAGGEWIFINGREWKNIKQVLIFTFIYEGVPNWSKTDGVVTIHVPEQPPIETRLTDGNNGRAMCAIARLVNENGSIKVERLNEFFKGHRDMDNAYGWGFRWTAGSK >NZ_CP026051|1663346:1672214|1670091_1670676_-|WP_004245609.1|DBSCAN-SWA MVSLRKDQTVSLSKQAPALSHLMFGLGWDPIKKKGFLGGLFGGNNSIDLDASCVLLDVNGKQIDTIWFRKLKSTCQSVIHSGDNLTGEGDGDDETIFVDLNRLPSLVEYLVFTVNSFRGQTFNEVENAFCRVVDKTTNKELAHYKLTEQGAHTGIVIAALQRNHGQWDFTAFGSPCKGLVIDEMMPDILATVVR |
9 | Caulobacter_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
3483561 : 3492096
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP026051|3483561:3492096|DBSCAN-SWA CTTACTCATTTGGTGTCTCCTTATCCAGTGCTTGTAACAACATTCCTTTCGAAATTAAACCGATATAACGGTTTTTTTCATCAATAACAGGGATCGCACAGGGAGATTGCGCAACAGTAGAAATCAGTTCATTTAATGGTGTATCACCATTAATCGCACAAGGTTCAGTTAAAATAGCGGATCCAATAGGTTGCTTCGCTTTTAATGCTTCTTCAAGAGAAGTGACAGAAACAATACCTGCAAATTTCCGTCCTCGCTCAATTAAATAACCAAAGTTTCTATCTTCATCTTCCAGTACTTTTAATGCTGAACGGGGACCAAAACCTGGCGCAATATGCAGTAGTGTTTCTGGGCGACGTTTAGCAATATCTTTAGCGCTAAATACATGACTGATATCAACGCCACGGAAGAAGGTACGTACATAATCATTGGCTGGATTATTAAGAATTTCATCAGGGGTACCTATTTGTACCACCACACCACCTTGCATAATCGCGATACGATCGCCAATACGCATGGCTTCATCCAGATCATGAGAAATAAATACAATGGTGCGTTGTTTATCACCCTGTAAGCTTAATAACTCATCTTGCATTTCTGTTCGGATTAATGGGTCAAGTGCGGAGAATGCCTCATCCATTAATAAGATATCAGGATCATTGGCCAGTGCACGAGCAAGCCCAATACGTTGTCGCATCCCACCGGATAACTCATCCGGCCAAGATTGAGCATGAGAGCTTAAGTTAACTTGCTCTAATGCTGCCATGGCTTTTTCATAGCGCTCTTCTTTGCTAATGCCTGCAAGCTCCATACCAAATGCTGTATTATCGAGTACATTCATATGAGGCATTAAAGCGAATGATTGAAACACCATACTGATTTTTTTACGTCGAACTTGTCGTAAATCTTTATCAGACATGGTGGTGATGTTTTCACCATCAATAAGGACTTCGCCTTTAGTGGGATCTATCAGACGATTGAGAAGGCGCACTAATGTAGATTTACCAGAGCCTGATAATCCCATGATGACAAATATTTCGCCTTCTTCAATGGCCAGATTGGCATTTTGCACACCAACGGTTAACCCTGTTTTATCAAAGATTTGGTCTTTGTTCATACCAGATTCTAATAATTCAAAGGCACGTTTAGGGTGCTCACCAAATATTTTATATAGGTTTTTTACTTCGAGTTTAATTGCCATGCAATATCTATTTTCCTATTTAAATATGAAAGGAATAAATTAAATGTTAATAAATTAGTTTGTTGTTTTTCCTAAATTGAGATTTTTAGTAGGGGAATTACCCTATCATAATGAACAAGCCTGACAACCCTATGTTAATTATAATTAAACAAATAATTTTGTGATTTTTTTAGGTTTTTTTTGATAATTAATATTTAAATAAAGTAAAATTATAGAAAAGAAAGAAGTCAAAAAAACCATACTAACTGTATGAAATAACATTATTTTTATTCAGATGTTAATTTTAATTATCATCACAATAGAAATAACAACAAAATAAAAAAATGTAAAAAGATACTAATAAAATAAAAATAGAAAAAAATGCATTAACATTAAAAAATCTTATGATTTTTAAGGGGTGATCTTAAGTTATCGATAACTAGTCATAAAAATCATTCGTAAAAAATTGATAATTCTGGTTAATGGGACGGTAAAAATCACACAATCAGGTTGTTTTTCAAGCAAATAAAAAGGCACTAAAAAATAAGTTTTATTTTTCAGTGCATTATATTAATCGATTAATTCATAATTAATATGAATGTATTCTGTTTTTTTACTATAGAGGGTTAGCTAGAAATCCCAGTCATCATCTTCGGTATTGATCGTTTTACCGATAACATAAGAAGAGCCTGAGCCAGAAAAGAAATCATGATTTTCATTTGCATCTGGCGATAGTGATGAAAGTATTGCTGGACTAACATTAGTTATTTCATCTGGAAATAGTGCTTCATAACCTAAATTCATCAGCGCTTTATTCGCATTATAATGAAGGAATTTTTTTACATCTTCTGTCCAACCGACAGAGTCGTAGAGATCTTCTGTATATTTAACTTCATTATCATATAAATCTAATAATAATGAGAAAGCAAAGTCTTTAATATCTTGTTTCTCTAATGATGATTTATTTAATAACTGATTTTGGAATTTATAGCCAATATAATAACCATGCACAGCTTCGTCACGAATAATTAAACGAATTAAGTCGGCTGTATTGGTTAATTTCCCTCGACTTGACCAATACATTGGTAAATAAAATCCAGAATAGAATAAAAAAGACTCTAAAAATACACTGGCAATTTTTTTCTTTAATGGATCACTATCTTGATAATAACGCAGAATAATATCTGATTTCTTTTGCAAATAGGTATTTTCTTCACTCCAACGATAAGCATCATCAACATCTGTTGTTAAGCAGAGTGTCGAAAATATCGAGCTATAAGAGCGAGCATGTACCGCTTCCATAAAACAGATATTCGATAATACCGCCTCTTCATGAGGAGTCTGAGCATCAGGCATTAAGGTTGGTGCCCCGACCGTATTTTGTATCGTATCGAGCAGTGTAAGCCCTGTAAATACACGGATAGTCAACTGTTTTTCAGCTTGGGTTAAGGTATTCCATGAAGGTATATCATTAGAAAGTGGAATTTTTTCGGGTAACCAAAAATTCATGGTTAAACGGTTCCAAACTTCTAAATCTTTTTCGTCTTCAATACGATTCCAATTTATCGCATTAACACGACTTAAATAAGATGCAGACATAGTAACACTTTCCTTATCATTATTATTAAAGGGCGCATGAAACACAGCCTTTTATTTCTGTGCCGGCTAATGCTGTTTGTCTAATACGAATGTAATACAAGGTCTTTATACCTTTACGCCATGCATAAATTTGTGCTTTATTAACATCCCTTGTGGTTGCTTCATCAGAAAAGAATAATGTTAGCGACAATCCTTGGTCGATATGTTGTGATGCTTGGGCATAGGTATCGATAATTTTTTCTGCGCCAATTTCATAAGCATCTTGATAAAAATGACGGTTTTCATTGGTCATAAAAGGGGCGGGGTAATAAACCCGACCGATTTTACCTTCTTTTCTTATTTCAATCGGTGCCACAATGGGGTGAATACTCGATGTAGAGTGATTGATATAAGAGATTGATCCTGTTGGTGGTATTGCTTGTAAGTTTTGATTATAAATACCGTGAGTCATAATCGAGAGCTTAAGTTTTTGCCAATCTTCTTGGGTTGGAATATGAATATTGGATTGGCTAAATAGCTGGTGGACTTTTTGGGTTTTAGGTAACCACTGTTTTGATAAATATTTATCAAAATACTCCCCAGTGGCATATTTTGACTGTTCAAACCCTTTAAAGCGCTGTTTAGTCTCTATCGCTAATTGGTTAGAGGCTAAAAGGGCATAGTATGTTACGGTATAGAAATAGATATTGGTAAAATCAAGTCCTTCTTCTGAACCATAATAAATCCCTTCACGGGCTAAATAACCATGTAAGTTCATTTGCCCTAAGCCAATGGCATGAGATGCTTGGTTGCCTTTTTCAATAGAAGGTACAGATTCTATTTTAGTCATTTGTGCCACACTCGTCAGTGCTCTGATGGCAACATTTACGGTATGTGCAAAATCTGGTGAGTCCATCGCCATGGCGATATTCATTGATCCGAGATTACAGCTAATATCATGACCAATTTGTCGATAACTTAAATCAGGATTGTATTCACTGGCACTATTTACTTGTAAGATTTCTGAGCATAAATTGCTCATATTAATTCGGCCCGCAATCGGATTTGCGCGATTGACGGTATCTTCAAACATAATATAGGGATAACCTGATTCAAATTGAATTTCAGCTAAAGTTTGAAAAAATGCCCGTGCTTTAATTTTTTTCTTACGTATCTCTGCATTGTTGACCATTTCAGTATATTTTTCGCTAATACTGATTTCTGACATAGGAACGCCATATACTCGTTCTACATCATAAGGTGAAAATAGATACATATCTTCGTTGCGTTTAGCTAATTCAAAGGTGATGTCGGGAATAACGACACCTAATGAAAGCGTCTTAATACGTATTTTTTCATCAGCATTTTCTCGTTTTGTATCTAGAAAATGATAGATATCAGGATGATGAGCATGGAGATAAACCGCTCCAGCACCTTGTCTTGCGCCTAATTGATTGGCATATGAGAAGGCATCTTCAAGCATTTTCATTACCGGTACTACGCCAGACGATTGGTTTTCAATGCGTTTTATGGGGGCTCCTGCTTCTCGTAAATTAGTCAGTAAGAAAGCAACACCTCCGCCACGTTTCGACAATTGCAACGCAGAATTGACTGCTCGGCCAATGGACTCCATGTTGTCTTCGATACGTAATAAAAAACAAGAGACCAATTCGCCACGCTGTTTTTTTCCACAATTTAAGAAAGTAGGGGTTGCAGGCTGGAAACGGCCACTAATTATCTCATCGACAAGGTGAGTGGCGAGTTTGGTATTCCCCTGTGCTAGGGTTAAGGCAACCATACAAACACGATCTTCATAGCGTTCGAGATAACGCTCACCATCAAAGGTTTTTAAGGTGTAACTGGTGTAGTATTTAAATGCACCTAGGAACGATTGAAAGCGAAATTTTTTGCTATAGGCATGCTTAAAAAGCTGTTTGATAAACGGGAAATCGTACTGCTCTAATACTTGTGCTTCGTAGTAGTGTTGTTGCACCAGAAAATCGAGCTTTTCTTTTAGATCATGAAAAAACACCGTATTTTGATTAACGTGTTGACGAAAAAAATGGTGGGTGGCTAATTTGTCTTTATCAAACTGGATATTGCCTTGCTCATCATAGAGATTGAGCATGGCATTTAAGGCGTGATAATCGAGTTGTTCTATAGAATGGGTCATGTTTTTTATCTCATTCACTTTTTAGTCATTATTTGCTTGCTGACCAAAATGTGCTTAATCCGGTTTTTACACGTTTAACATCTTCAGGCGTACCAAGTAACTCAAAACGATAGAGAAAAGGGACTTGGCATTTTTGTGCAATAATGTCACCTGCTAAGCCGTAAGCAGAGCCAAAATTGGTATTTCCTGAAGCAATAACACCGCGTATTAATTGGCGATTTTCAGGGATATTTAAAAACTGGATCACCGCTTTAGGCACTGCGCCTTTAACGCCACCGCCACCATAAGTTGGGCAGAGCAACACAAAAGGTTGTGTGGCTTGTAGTGGTTCATCCTCTTTTATCCTTGTCGCTTGTAGATTAAGTTTTTGTACGAAGCGGTGACAATTTTCTGAGCGACTAGAGAAATAAATTAAAGGGGCAGTCGATTGCATAAGTTGCTCCTTTAGCGCGCTATTTGACGAATTTTATCTGGGCAAAAGCCAGACCAATGTTCGTCACCATTAACGACAACCGGTACTTGGCGATATCCCATAGAAACTATTTTTGCTAATGCTTGAGTGTCTTGGGTGAGATCAACCGCAGTGAAAGGAATTTTTTGTTGTTGTAATGCGCGCTCGGTTGCACTGCATTGAACACAATTTGGTTTGGTATAGAGGATCACAGACATAGAATAACCCTTATAAAAATGTGAATGTGTCTGCTCACAGTCACAATGAAAAGTGCTTAAATACTATATATAGGTTTATTCTTTTTCAACCACACTAGATATGGTGTTTTTTATTCTTGATAATGATTATTATTAAAATTAAGCAGTTAGCAGATTTATTTTATTTTCTTATCGCTCATTTGAGCAATTTTTATTAGGTATAGTAGAAAATTAGATGATTGATTTACTTACAAAGCATGTTTTAATCTTGATGATACAGACAAATCAATAGAGAACACATTATGTACCAAGATTATCTCAATACGCCGAAAGGTTTTCCAAAGCCTTATATATCCATTACCGCAGATGATGATGGCATCACCAGCCTTAACTTTGTTAGTGAAAAAGAGGCGTTAGTTAATTCAAATGCCATAATTGACCTGTGTATAAAACAGTTAAAAGAGTATTTTTCGGGTAAACGAACCCTATTTTCAGTGCCACTAGCGCCAAAAGGAACCGAATTTCAAATACGCGTTTGGCAGACTTTACAGTCTATTCCTTATGGTGAAATTTGGAGTTATAAAAAGTTGGCACTTACATTAGGTTCCGTCAACTATTGCAGAGCGGTAGGAATGGCAAATTCACGTAACCCAATCTCGTTAATTATTCCTTGCCATCGCGTCATTGGTCATAATGGTAAGTTAGTAGGCTATACTGGGGGACTTGATATCAAACGTTGGCTATTACACTATGAAAAAGTGGATATTGATGAATAGTTCATATTGTAAGTATTAAGCACTATTTCTTAAGTGATTAATGGCTTAAGTTATGGGATTTGTCTGAATAATAATCGTTTAACAGAAAAAAAATACGCGTTTCGTGATCTAGACTGTGGACAGCGAATCATCATTTTTGTTTTACTATAGCCAACGCAAAACGCTTGCGTTTATTTTCTATTTTAAAGGTAAACTTGATGTCTAAATTAAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAACGAAACTAAAGGTTTTGGTTTTATCACTCCAGAAGATGGCAGTAAAGATGTGTTCGTCCACTTTTCCGCTATTGTTTCAGAAGGTTTTAAAACACTTGCTGAAGGTCAAAAGGTAGAGTTTGAAGTTACTGACGGCGCGAAAGGGCCATCTGCTGCAAACGTTGTCGCTATCTAATTAACGACTTCTCCAAAAGTAAAAAACGTTTTTGAAATGACCCCCAATAGTTGGACAACCAATTATTGGGGGTCTTTTTATGTCAAATACAGGGGGGATTTAAACATCATCATTGCCAATCAATGGTCAGCGGATGAAGCATTTCAGACACTTTCTGAACAGTATTTATTAAAATAAATTAAAACTATTTTACTAAAAGCTGACTATCTTGTTCTGCCTTCTTTTTAGCCTGCTGAAAACGAAGAAGTAACTCATTTTTCTGGACTTTAATAGCGTTATAGTCAACATTGTCGTTTTTCTTTTTAGATATTTGTTTGTATAACAAAATAAGCCTCCTCAACGTAAACATTTAAATTTTTCGATTCAGCGTACTTATTAATTAATCGAATATAAACTCTTCTGAGCTCTTCACTGTATGCTTGGAAAGTCAAAATATCTATTTTTTCAGTTTGTGCTATCAAAAGAATAATGTCAATGAGTGTTATGTAAAGATACCGAGTTTCTGATGATGTCAAATTAATTGAATCTGGCGGTTTATCAAACATATCACAATTTTGATAGTTTTCAGTCTCTATATTATAAAAACTAACAACACTAATAGTTAAATTTTTTATATTTTCGGCATATAACTTATTAATTAATGAATGATAATTTTCATCTCGGCAAAAAATAAGCCTGTAAATAACACTCCTTTTCCTATTATTGGAAAAAATAAATTTAATATCTATATATTTAAAGATATCAAAACCAATAAGCTCATCATGTAAAATGTAATGTGAATGGTGAGGCATTTAATTTCTCATTATTATAAAAATAATTGAATTAATTTAATAACAATTAAATCATCAAGATACCAACAAAAAATTTCATTTATTAGATATAAAACCCTCATCAAAAACAATAATAAAAAACCTAAAAATAACAAAAATTGAAAATAGATAATAATAAATTAAACTGTTTTCTTAAAAATACTATTTGAAATACTCTAATAGTTGGACAACCCATTATTGGGGGTCTTTTTATGTCAAATACAGGGGGGATTTAAACATCATCATTGCTACTTAGGGTGACAATGCTTGCCACACTGCATAACTCTCGCTCGTTTTGATGATGAAAAAAGACTTGAGAAATTTAAAGAGGAGCTTGCGTATTTAGCTGCGGGATAAATACCGTGGTTGAAAGTTTTTTAAATTATTAAAATCAAGAATACATCATAGCTATCATTTTAAAATATCAATGAATGTATTGATAAAATTGGCTAATTTATTGAGTAATACCACCGGGAACAAAATCAAATTAAAAGGCCTGACATTGGTTGAATATTAAGTTCAGGCCTTATAAATCGCTTAACTAAAAGAGTACAACTTTATGATTAACGGTTTTTATCTTGTTAAAGAGACTACATTTCACGGAGTAGCCAGAATGCGAATGCCGTCATCAGAAACGAGCCCGCTAAGTTTGCCCCCATGGTGCCTAATGCCCAGCCTATTCGTCCTTCATTAAATAAGGCGACCACCTCAACAGAAAAAGTAGAAAAGGTGGTTAAGCCACCACAAAAACCTGTGGTAAGCATGATTTTCCAAATAGGGTCAATATTGGGAGCTTTACTAAACCAAGCAATGCCAAAGGCGATAATAAAGGCACCAATACAGTTAGCGACCAAGGTCCCCGTTGCAAAATGGGGAAAAAGAGAATTAAGGCGGTAGCTAATTAGCCAGCGTAGTACGCTACCTAAACCACCGCCGATAAATACAGCTATTGCAATGTTAAGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP026051|3483561:3492096|3489441_3489915_+|WP_004246069.1|DBSCAN-SWA MYQDYLNTPKGFPKPYISITADDDGITSLNFVSEKEALVNSNAIIDLCIKQLKEYFSGKRTLFSVPLAPKGTEFQIRVWQTLQSIPYGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLHYEKVDIDE >NZ_CP026051|3483561:3492096|3485370_3486339_-|WP_004247427.1|DBSCAN-SWA MSASYLSRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTQAEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDAQTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEENTYLQKKSDIILRYYQDSDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSSLEKQDIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTEDLYDSVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDEITNVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF >NZ_CP026051|3483561:3492096|3488935_3489160_-|WP_004246071.1|DBSCAN-SWA MSVILYTKPNCVQCSATERALQQQKIPFTAVDLTQDTQALAKIVSMGYRQVPVVVNGDEHWSGFCPDKIRQIAR >NZ_CP026051|3483561:3492096|3483561_3484761_-|WP_004247426.1|DBSCAN-SWA MAIKLEVKNLYKIFGEHPKRAFELLESGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTKGEVLIDGENITTMSDKDLRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELAGISKEERYEKAMAALEQVNLSSHAQSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVDISHVFSAKDIAKRRPETLLHIAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFAGIVSVTSLEEALKAKQPIGSAILTEPCAINGDTPLNELISTVAQSPCAIPVIDEKNRYIGLISKGMLLQALDKETPNE >NZ_CP026051|3483561:3492096|3490112_3490322_+|WP_004246068.1|DBSCAN-SWA MSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIVSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI >NZ_CP026051|3483561:3492096|3491721_3492096_-|WP_004246058.1|DBSCAN-SWA MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTLVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPNIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALFNEGRIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM >NZ_CP026051|3483561:3492096|3488519_3488924_-|WP_004246072.1|DBSCAN-SWA MQSTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNLQATRIKEDEPLQATQPFVLLCPTYGGGGVKGAVPKAVIQFLNIPENRQLIRGVIASGNTNFGSAYGLAGDIIAQKCQVPFLYRFELLGTPEDVKRVKTGLSTFWSASK >NZ_CP026051|3483561:3492096|3490624_3491113_-|WP_004246061.1|DBSCAN-SWA MPHHSHYILHDELIGFDIFKYIDIKFIFSNNRKRSVIYRLIFCRDENYHSLINKLYAENIKNLTISVVSFYNIETENYQNCDMFDKPPDSINLTSSETRYLYITLIDIILLIAQTEKIDILTFQAYSEELRRVYIRLINKYAESKNLNVYVEEAYFVIQTNI >NZ_CP026051|3483561:3492096|3486364_3488491_-|WP_004252248.1|DBSCAN-SWA MTHSIEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFDKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYDFPFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTKLATHLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGVPMSEISISEKYTEMVNNAEIRKKKIKARAFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYNPDLSYRQIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFAHTVNVAIRALTSVAQMTKIESVPSIEKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEGLDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIETKQRFKGFEQSKYATGEYFDKYLSKQWLPKTQKVHQLFSQSNIHIPTQEDWQKLKLSIMTHGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIVAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHFYQDAYEIGAEKIIDTYAQASQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDVNKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL |
9 | Mycobacterium_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
3531702 : 3576483
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP026051|3531702:3576483|DBSCAN-SWA CTCACAATTCAACGTAGCCATTACCTCTATCATCAAGGTATTTATCTGTCATTCTCATAGATTTGTGGCCAAGTATTTTCTTTGCAAACTCAGCACTTTTTTCTTCTTCATATAATCTTGCAGATAAACTTCTAATTTCATGAAATGTTGGTTTATTTTCCAAATACTCAGGTAGGGCTTCGATAAACTTACCTCTTAATGTTTTTGCTGTGGTATTGCCACAGATTTTATCTGAGTTCCTATTCATGAGATTTAAAACATCTTTAATAGAATAACCAATAGACTCAAGTCTTAATGAGAGTGGTATTGCTACTTTAGAACCTGTTTTTATTTGGGTGACATACAGCCTATCATTTTTTATATCATCCCACTTCATATTGATAATATCGCTAATGCGCTGAGCTGTAAGGACCGCTAGTAGAAACATATGCCTATATTTGTCATTTGTGTGCTCCAAGGCGTATTTAAACTCTTCTAGCGATAACCTTGAGCGCTGAACGCTTGTTTTTGGCGGCTTTGTCACGGAAACGGGATTTTCCTTTATCACACCATCCGCAATGGCTTCATTAAAAGCATCTAGCATAGTGGACCTTAGTAATTTTGCCATTGCCTTTTTAGGGTACTCTGAAATAAATGTGGCTACATCTCTTGGTGTTACATTCTCAATTGGACAGTCATTAAAGTGTAATTTGATTAACTTTATTCTTGATTCGTAATCGTAGAGCGTCTTCTCTTTTAACCCCCGGCTGTTTACCTTCCCCCTATAAGTATCAAGCCACTCATGCAATGTTACACAGTGAACATTATTAATTCTGTCAACTAATGGCTCTTTAGGTTTATAAATAGCTAAATTGGCTTGTATGGCTTCGGTTATTGCCAATGATTTGTTTGAGCCAACAGAAAATTCCTTTTTAGTTCTTACATCCCTGTAATAGTAAATCCCTTTACGCAAATACAAGTTAGGCGGTAGCCCCTTGTTCTTTGCACTTCTGCTTCTGCCCATTAATTTTCTCCATTAAATATTGCGGTTCCCTTACCATTTTGTCATTTGTTAGAATTGTCCACGGCTCTAACTCATATTCTCTACCAACCTTTTCTGGAGCAGGGTATAACCTACCTTCCTTTATATAGCGAGATAATTGCCGTGGACTTCTAGGTTTGGCGAAATATTTATTATTCCATTCTGATAATGTTATCCGCTTCATTTATTGTTTCTCCTATTTACTTTTTTTATTCCTTTTATATTAATTGAATACTTTCTTCCGCTTGGTCGCCATATACATCCCTATCACCGTATTTCTCTCGAGCAAATAATTCGATGCGAGGAACATCTCCGTATAATTCTTCTAAACGATGATGTACCTCTTTGAGCTTTTAGCTGTGTTCATCTAAGCACAAATAAATAACTTGTCGAACACTTGCAGATTGACGAGGTAATCCATTTCCTCTTGTGGCTATTAAACACATTTCGATATTTTGACGAATATAATTACCACAATTAATTTTCGTCTCATTATTTAATATTTCCATGAAATCGAAAAAGTCCTTTGGCTGTTTTTTATTTATTCTATCTTCTGCATTTTTATTTAATTTAACCCATGCGAACCCAAACATATTTTTAACTTTAAAATCCCAAGCTTCAGCTAACCTGATAGCCTCGAGTACAAAATTGCCTGTATACCACATGGCAAGAACTGCGTTATCAGATGCAATAGAATGAATAGAGATATGGGTTAAATTGAAGAGGGAGGTTGTTGGATAATGATTTTTAGCAGTACCGTTTGAAACTTTATTTTTGTAATCCCACGGAGGATCACAATAGATAAGGTCGTATTTTTTCATTTAACCTCCTTAAGAAAAGAGATCCAGTGCGTCTTATCATTTTTCCCTACACGCTGTACTGCTGTTGGTTTTTGGCCTGTTAGTGTTAAAATTTGTTTAACAGGTATTTGGGTTTCATTCCATTTGAACAGCAATGTTCTTCCAGGCCTAAGCACTCTAAATGCTTCACTAAACCCTTTACTTAAATCTTCTCTCTATGAGTCTTTATTTAACGAACCGTATTTTTTAAACATCCAACTATTTTTACCAACTCTCATTAAATGAGGAGAGTCAAATAGCACTTAATAAAATGAATTATTTTGGAAAGGAAGATTTTTAAAATCAGAAATAATATCTGGTGTTATATTTAAAATTCTTCCATCACATAAAATATGTTCTTCAGCTCTAATATCATTAAATAAAACTCGGTCGTCTTGTTTATCAAAATAAAACAAGCGAGAGCCACAACACATATCAAGTATTGGCTTCATTGTATCCTCTAAAGATTAGGTGTAAAAACCTGCTAGTGCAGGTTTAAATTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTCATTCAAAAAGTATTTTCCTTTCTTATTACTGAAATCTTTTATTATTATTAATTTCATCCTAATTGGGAATTTATCGTTTGAGAGTTTATCTATTACCACATTTTTTATAAATTTCGTGAGCCCTTCAGTAAAATAATTTATTTCTTCAACAAGTTGAGCGGTAGATGATGAACATGAATGCCTTTCGCGCATCGATTCGTTAATAAATCCTCCATGCTCAATATGCACTGGTTGGTATTGTATTAACTCGTCAGTACAATCTAAAGCTATAAAAGCGCATGAAATATGCTTACCTTGCTCGATCATGATTTTTTTATATTTTGTTTCAAAGTCATCAATTGCGAAATCCATTATATTAAGTATAGTTGTTTCATGACTATTTAATGCAGCACTCAGGCTCCTCTTTACTATATCATCTCTTTCTTTTTGCATTTTTAATGAGTCATTTTTTTGCCAAAAGTAAACAACAATAGTCGCAAATAAAGCTAATGCAGATAAAAATGCAAATACGGTAGATAGATAGGAGAAGATAATGCTCAGTTTGTCTTTTCCTTTAGCATCGGTGACAAAGATATCGATAATGAAAATACCAAATACAATTAAAGATACTGAAGTTAATGATATCCAAAAAATAAAGTTTTTAACTTTTGATGAGATTTCAATCATTGCATATACCTAGTGTAAATATAATATAGTACTCACAATCATATGACTAATCCACTGTCACATAACATTTCCTAAATTATATTAATCAAATGTCGTGGATACATAAGCCCAATCGGCGCAAAAGGAATATCATCATCAAAATCCATTGGAGGTTCATTACGCTTAGGAGATTGTTGAAGGCTCCATCCGTGTTGATGAGGTGATGGTTGTGATTTCTGGCTACCAGCCTGATTGTTGTTACCTAAAATTTGCATTGAGCCATTAATATTCACTACAACTTCCGTGCTGTATCTGTCTTGTCCATTTTGATCTTGCCATTTACGTGTTTGTAATTGACCTTCGATATAGACTTGTGAACCTTTACGCAGATATTCGCCAGCAATTTCGGCGAGCTTTCCAAATATCACAACTCTATGCCATTCGACACGTTCCTTGGTTTCACCTGATTGTTTATCTTTCCATGAATCGCTGGTGGCTAATGTAATATTAGTAACTGCATCGCCATTTGGGAGGTAACGCATTTCAGGATCTTGACCTAGATGTCCTATCAATAAGACTTTGTTTACACCTTTACTTGCCATTACATCGCCTCCAATTCTGATTTTCTGATGTTATATACTTCCTTTGCTTTTGATTGTTCAGGCGTTTTCCTGAGTAACTTCCATGTTTCACCAAATTCTTTTTTCAAAATATTGAGATCTGTAATAGCCATTGCTGAATTAGTAAAATCTTTCAATATTTGATCTGGTGTTCTCGGTGCTACATTGTGGACTTCTGCATCAGCATCGATTGCCGTTTCTTCGGTTGGTATACAAAATGTTTGGAAAGCTGCGTATTTATATGCAATAGACATGGCTTTATTTGTGGCTTTGTCTCCGCTATCCATTGCTTCACCATAAGTCACAACCGTGTGTTTGCTTCCGTCTTCAACAGAAACAAATTCAAACTCAGCTTTCACTACGACATAGAATAACAAGCTACCTCTTTGTGTTTGTCTTTCCGTGACGGTACGTTCAATGATCCGTGGAAGAATAAGTAATCCATGTTTAACTAGAGCAGGGGCAAGGGCGTTATATACTGCATCGATTCCTCTGAACATAAATCCTTGTTGTTGGTTTACACTTCCTTTTTTAATGCCCGTTTCAGCCATTTCTCTAGCAACATTACTAATAGCTTTGTATACAGCAGTCATATTAATCCCCTAAATATTGACCCTGACGGCGATCGCTTCCGTAGTAATCGACTTCAAACTTATTACTCGGTGCAGAATTCCTTTCCGCATCACGTAATGCCTGAATATGAGCAGGTAGAGGAGGGTGATTTTTCGATGCGTCCAAGTTCATGTGTAGCAGTTCCATTGCTAATCGTTTTTCCCTGTCTGGCGCACTCGTATTTGGCAAACACCCCTCAATCATTGCAATAGCTTGAGCCAGAGCTTCCTCTCTGTTTTTTGCTAATGACGGTGATGTTAATTGGGGGTATTTATCGGTAGGGTATGAGTTAGAAACGTTCATTGAAAATCTCCTGAAAAGTCCTTGAGAGGCATAGACAATCCTTGTCGTCCTAACACTTCCGTTTGATACATAAATTCATCGTGTTCGCGTTCCTGCGATTCTTTACGCTTCCTGCGTAATTCTTCTAGCCATTGTTGATGCTGAGTCACGCAGCCCTCCTTAGCTTAGAAATGCGCAATATCCTGCTAATAAAGGCTTCCTTGCCTATCGCATTGATAGTCCGTTCAAGCGATTCATCGTCACAATCGAGCACATATTCCATTGCCTCAACTGAGTCAATCTCCGTTAACTTGGCCAACTCACTGAAACTTCCTGTCTCAATACTAAGCTTGCTACTTTCGTCAAATTCCATGACTGTTTTACCGTCTATTACCCGAGTTCCGTTCGAGTAGCTGTATGAAATTTGCATAATCACCTCAATTTACAAATGTCGGT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63 | Morganella_phage(51.22%) | lysis,capsid,integrase,tail | attL 3531616:3531634|attR 3583388:3583406 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
3750099 : 3828712
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP026051|3750099:3828712|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_phage(17.65%) | tRNA,plate,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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