Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP007713 | Acinetobacter baumannii LAC-4 plasmid pABLAC1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP007714 | Acinetobacter baumannii LAC-4 plasmid pABLAC2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP007712 | Acinetobacter baumannii LAC-4 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3 | 0 | 0 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP007712_1 | 711754-711838 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007712_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP007712_1
>1.1|711778|37|NZ_CP007712|CRISPRCasFinder AGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAGAAGATTGATAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007712_1
The CRISPR arrays of NZ_CP007712_1 >merge|NZ_CP007712|1|711754-711838|CRISPRCasFinder TTTTAACTTTGGCGCAAGACAAGCAGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAGAAGATTGATAATCTTTTAATTTTGGCGCAAGACAAGC >NZ_CP007712|1|1|711754-711838|CRISPRCasFinder TTTTAACTTTGGCGCAAGACAAGC AGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAGAAGATTGATAATC TTTTAATTTTGGCGCAAGACAAGC
>NZ_CP007712.1|WP_001259501.1|711379_711748_+|YbaN-family-protein MRTLFWRTLVVIFITLGIIGAILPGMPTTVFLILAAWAASKGWPQMDAWLLNHPKYGPTLRDWRANGTVPRKAKWIATIMMTASGILMLFTSAPFWVKVFTDTTMLVVAIWLWLRPEPKLKD >NZ_CP007712.1|WP_001017534.1|710366_711275_-|DUF1853-family-protein MNIASIKTSYFEPWLQFSHPMVRQLAFTIASPNLLSQLPCSLTIRHSFQLHTDKNWEQHFQNYLPRLKQLDEAPEPLLQFMSRLKSTRLGLRFENLLWFWLQEDQYHPYQLLGHSIQKIDGAKTLGELDFLVLNQNTQEIEHWEVALKYYLGEGQLNLEQWSGLNRQDTLSKKLYHFTDKQFQFSEALGFKVQQRFAVLKGQLYLPLNLPQEQPIPEWVNLKRRLGTWGTEIPKSDFYRLERHEWLCPHQKASSNTAYWWTDGLYCQNINETRFYMFRHPALLSLKPSLIKNNGVLQETTSL >NZ_CP007712.1|WP_001984826.1|710124_710268_-|entericidin-A/B-family-lipoprotein MMKKVLVASVMVAFVLTGCNTFKGFGQDVSKAGDAVTNTAQKTENKM >NZ_CP007712.1|WP_001016575.1|708862_709999_-|succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MNHSDTLSLSLELLQQPSVTPIDHTCQTIMADRLAKVGFHIEPMRFGDVDNLWARRGTEGPVFCFAGHTDVVPTGRLDAWNSDPFAPEIRDGKLYGRGSADMKTALAAMVVASERFVAKNPNHKGSIAFLITSDEEGPAVNGTVKVIETLEKRNEKITWCLVGEPSSTHKLGDIVKNGRRGSLNAVLKVQGKQGHVAYPHLARNPIHEASPALAELCQTVWDNGNEYFPATSFQISNIHAGTGATNVIPGALEVTFNFRYSTEVTAEQLKQRVHEILDKHGLQYEIVWNLSGLPFLTPVGELVNAAQTAILNVTGTETELSTSGGTSDGRFIAPTGAQVLELGVLNATIHQINEHVDVHDLDPLTDIYEQILENLLAQ >NZ_CP007712.1|WP_015451615.1|708398_708827_+|hypothetical-protein MDQQELQHLITVSTGFIDAYIIECNDQVPMLLPQNIVLSAMDVKNGVKHIEWHDVKLPVYSVHNAIDQHAVALVIEGEDISQRFALICKTMPVSTRLRISEIVDEMDEHEAEQHPAVFKYVRMQHQRYYIPNLEYIEKTLGL >NZ_CP007712.1|WP_005119701.1|703845_708366_+|hybrid-sensor-histidine-kinase/response-regulator MKEILKTLTEAMTLPEDSYSEQDAEFLEIFIEEIEEIFVDLQPLINKWMQSENIATLTEIRRHFHTLKGSGRMIGAKSSAELAWAVEDTLNRVINQSLQLTPTIQSYVQLVFKFYFLKLVDNFKQKRAHTLDFRPLILLGQQLQQQQSLEPALEELLQLSNTLMAETVTGLELDYIEQDSLAEPIIQATHTEIEINLDETLTLFMEEAEEHLATIHQFLDQELHQYDSYNALIRALHTLRGSSAMAQVETIFEASTKVEHLFKILLQEELSSHSEEILLLQEYREFVRDSLELLSRYSSSEQLEARLQQFNQSWDAYVEQHGDRTDPLMPSHGLVSQLLQLDVSELLDAELDFEKGIRNEFPDYLERLSEQADLLLQHTHSQAMLGLHEYTSQLKESYEVLLDKPTLLQSDYIFEIYQKAHQQLIQLFDALAAGQRVGVVKQHQSILEELKLYTQYTPDLSNDLPQQDSTSFEPISNIEQEPEVVATVENFSDSVDWAVLGQSVQQDRQYISSTQVNRNFDADLLDIFLEEAEELLEGIDTDLNIWVGEQENFAALNNLMRYLHTLKGGANMVQATYLGLIAHELESIYERLIQKQLVATSDLIDFIRLVQDDLADRLQIMREQQLDYAAPYTINALKRAGQNSNFQPLPVVEAFDTESEIFSEQEVISEVIIDEIPVELEPALAELETHHDQVFDTAVTELATPVEMITTVTSQESEIAADEQDIEAVVEQTFLEEATELLEMAESLLKQWFEQRTNRSILLQLQRAVHSLKGGARMVGLEAVQAIAYQLENAFEQFALHHFNSNIYDHLLESAIAWLKDAIFNHNYQHFDGLQQSLENIQFFETTIQIPTKLTRADLFNSEPVMTFIQGDGTEPPPMMGAWEQTERLDQNNEMIRVSADLIEKMIDLSGENSINRSRIEMDLSQFSHTLVEMELAIQRLADQLRRMEGELETQIIAKHGIEHSRYTDFDPLEMDQYSSLNQLSKSLAESASDLVDFKNTLSDKIRDTESLLLQQSRIQAEIQEGLMRTRLVPFSRLLPRLQRIVRQTSTALNRPAELFVNNTEGELDRNILERLVTPLEHMLRNAIDHGLEDRMQRQQANKPETGRIELNIQRQGTDVVVVFSDDGQGIDVEKVRQKALLAGLIKPEQDLEQQDILQLIFHPGLSTAEQVTQISGRGVGLDVVQSDIKSLGGHVSVESIYGQGTTFTIRVPTTVAVSDALMVKVADQQFAIPLAQIDRIIRVSPASLEQYFESPQELFEYENKRYPLRYLSEFVGNQPIPRLNGVMYSLPVLMIKANNGQTVALLVDQLIGSRAQIVVKPIGQQFSSIGAIAGATILGDGQVCLILDGQNIARQIQSTQRHKQLSEAIYRQRESDERRLIMIVDDSVTVRKVTSRLLERQGYDVVTAKDGVDAIEQLENIKPDLMLLDIEMPRMDGFEVLNLVRHHDMHQYMPIIMITSRTGEKHRERAFSLGVSQYMGKPFQEEELLENIDALLVASDSEVKS >NZ_CP007712.1|WP_000505932.1|701620_703699_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MGFKLKKKSGNRGATGKSSVNFIAKIQSKIEQFASLFGESEKSKPILYAALLCLVCALISLAYLFYNVPRHNQLIRSLGELRLLSQTISKQATEATESGSQEAITKLQQSKKDFDENLLEIENIHGKSTDEYQKVEKIWGEVSKNIDLISSHQRVLNQLYDTNISISETVPEIQAEYNLMVDQMARQGLPSSQVIIAKNQVFIAERILRSINSVLSGTDGNVSTSDFSVDIETFGTYLNAELNGNAELGVDRIADPALRESLESIKSEYDKVLKSAAATVLKNGSQIVNVRQASSQIFSKSDVMLESLGHLSDVARKNWLTLFLGAVLILSLSGLIFSVFKLITLRSVMDKKRVARLQEEYDRNQNAILRLLDEIADLADGDLRSYATVSEDFTGAIADSINFAIDQLRDLVSRIHETSQEVARYTQDTQSITNQLAEASEHQAQEIAGASTAMNEMAQSIDQVSANASESAEVAQRSVQIASNGAQVVNRSIEGMDTIREQIQETSKRIKRLGESSQEIGNIVSLINDIADQTNILALNAAIQASMAGEAGRGFAVVADEVQRLAERSASATKQIETLVKTIQTDTNEAVISMEQTTTEVVRGANLAKDAGIALDEIQKVSGDLAKLIASISDAAKLQSASASHIATTMTVVQEITSQTTTATFDTARSVSELANMAESLRESVTDFKLPD >NZ_CP007712.1|WP_000729762.1|701037_701574_+|purine-binding-chemotaxis-protein-CheW MAANGFIELLRLSKRGNKNYASVQNEAQRWSGIAFEMRGQYFVAPLGEVSEVIYPPKYTPVPNTQSWVKGLANIRGRLLSVSDLAHFISGQRSSFSSTQKVLCISHHDQYVGLVVDQVLGIQHFNKKSFFSQSSDLEENLKEYCQGYFHQHNQHWHVFLFSRLLQNPHYMNASTKFIN >NZ_CP007712.1|WP_000101096.1|700614_700977_+|response-regulator MARILIVDDSPTETFRFKEILTKHGYDVLEASNGADGVTLAKAEQPDLVLMDVVMPGVNGFQATRQITRDEDTKHIPVVIVSTKDQATDRVWGKRQGAIDYLIKPIEEKQLIDVIKQFLN >NZ_CP007712.1|WP_000389061.1|700207_700591_+|response-regulator MEDAFQNLKVMVIDDSKTIRRTAETLLQREGCEVITAVDGFEALSKIAEANPDIVFVDIMMPRLDGYQTCALIKNSQNYQNIPVIMLSSKDGLFDQAKGRVVGSDEYLTKPFSKDELLNAIRNHVSS >NZ_CP007712.1|WP_000077301.1|711898_712402_+|L,D-transpeptidase MSQFKLEDADILIDLANQTLSLPKHNKFYVVSTGKNGIGEQENTGKTPRGWHRVAKKFGMQSPKNAVFIARQPTGEVYSSELAAQFPERDWILSRILWLDGLEEGFNKGEGHDTMQRYIYIHGTPDKEPMGVPMSHGCIRMRNEEIIELFDLVSEDALVYLSEQSLT >NZ_CP007712.1|WP_001198164.1|713478_714264_-|YdcF-family-protein MQVSKWIRIFLAVIGSILFLDGLFLAFLNKIHVGTLVPLVLGAFFCLYALFYYHLERFFFYHYRLHTLWRFGWLCFWIWLIGLGYFFNFIKENKDASQNLPAVKAIIVLGSGVENGQPSAILAKRLDTAAPVALSQPQAKVILTGGLDFSEKEPEALVMSRYLEQHFHIAKDRMILEDKSTSTELNLKNSKPLLEQAHISINQPIAIVTSDFHTPRAAAIAKKQGYTQVYMVAAETPLITRYNVWLREYFAYASGWLLNEY >NZ_CP007712.1|WP_000473032.1|714390_716937_-|PepSY-domain-containing-protein MFKKFLFQIHWFLGISAGLILSIMGVTGAIYSYDQQILKWVNTDSYVVQAQSSPKLTPAQLYQHFTTIQPEIKINSITIAKDPTASSVVNIEKEGERRGYNMMVNPYTAQVLPEVQGRKLLLLIQQIHRNLTAGEFGKQITGACALMLIYFVLSGLYLRWPKKHSARQWLALKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVIVFYLLFACTGLYWSYDWWRSGMFKVLGVEQPKMQGHSGSGRNKDQLPKIQLDNAQLITALNQTWSGFNNQIGRDYSTLTVNLPKKDDGKIELSFVDATPQHERARNQAVYNYKTANIEKMELYEDKKLNQKIMSSMLPVHRGSFFGPVYQFVAMLASLAMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQAARQSLAGHYIDQNAKPWLITYATQTGVAEQLAWSTATSLQEAHQPVQVKSVQQLTEADLQQHEQILFVISTYGTGEAPDLASNFAKKLLKTNLELQHVKYAVLALGSKEYPDTYCSFGYTVDEWLKNNGAKALFDIIEVDNANPADIQNWNQALVKATKLDLHAVNIEKVFDNWTLQQRDLLNPNSLGQPAYNIELTASHEAVWQAGDIAEIQPGNSPERINKFLQHHHILKNAVVDSLQVSIEKALWNKDLTGEIEPFANLDHLLEQLPTLPTREYSIASIPSQQVLRLVVRQQYDESGDLGLGSGWLTQHTEINQNVALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLHTRTRHNYTENWLIFGERQRAHDFFYASTIEAWQTMGMLKRLDLAFSRDQEQRVYVQDIIRQNAAELVNWIERGAVLYVCGSIDGMASGVDQALIHILGEEQVDELRQQGRYRRDVY >NZ_CP007712.1|WP_000125649.1|717094_717670_-|SdpI-family-protein MTAKTLYAYTLQPVPYEVSEAEQRNAQLLIWRSTNKISTKIWAIMGVILALAILGLIFIKNYSTVICWVAIVCVVLYYLGRKYGLEWYVKRKMNEFPVQEIKGIRLGVQPHGIVMRQQMGLQEGVGTIGWKNIYEWYNTPDFILVNFKVKDPKGQEQQGAYILPKRMDSKNFSFNTIRKHLKESVGEPKTL >NZ_CP007712.1|WP_001984830.1|717770_719945_-|TIGR01666-family-membrane-protein MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRSLHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVLFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFVDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASELASL >NZ_CP007712.1|WP_000003701.1|720072_721287_+|multidrug-effflux-MFS-transporter MSEQTAQRQYSIGWIMLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMAHDFGVSTQMVANTLPAYFFGLAIGQLVYGPLSDRIGRKKPLYFGLALYAVASLFCVLATNEWSLIAARILQALGGCVGVVMARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPMIGAWILIWFPWQAIFIALSIVGAICWLCVHFFFKETLAVDKRLKLSLYQVATLYGAIFKDASFRLPMFAGCLTGAALFCYISSAPAVFMDQYGLNQQEFAYVFGLNAFGIMLMSSLNKHLTTRVEITKRLKAGSMVQVTGASIVLIAGLISAAPLWLVMLGLFLAISGIGLTGPNAMALAMSKQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVLLNFLIWSASLNMGVMMVLFTLSGFIVVLKAIRQAKSQSLS >NZ_CP007712.1|WP_001047593.1|721314_722019_-|nitroreductase MNLEQVRLVDEAITSRHSVRAFLSTPIEPEVIKDILRVASRAPSGTNTQPWKVYVVTGHKRDEMVERVCAAQIEVSKNPELAEQYKETFAYYPEKWVSPFIDRRRENGWGLYGLLDIKKGEKEKMAAQQLRNFKLFDAPVGIFFTVNKAMGIGSKMDIAMMIQNVMVAAKARGLDTCPQAAWNHFHPLVLDILGAADDEELVCAIALGHADPEHIVNTFITPREPVENFAVFLD >NZ_CP007712.1|WP_002037080.1|722529_722733_+|hypothetical-protein MSLPLINKQFMKQGLAITIVTMKMNVTHATTEPQEIQQLGTDLNALFFNEKEKGTDSRVMTMACYSL >NZ_CP007712.1|WP_000490937.1|722915_723056_+|hypothetical-protein MFSGAMNLFYLKGAFSHVTFKGLVLGMMLLKLVTVIAIQVTLKVFP >NZ_CP007712.1|WP_001005337.1|723155_724631_+|alanine:cation-symporter-family-protein MNEQLNATLMSWVQFFNEPLWDFLVIFLLAVGIFYTVLTGAVQIRMFLQSIRVMKSSRTEGEDEHGLTPFQAFVTGLASRVGVGNIAGVAIAIAIGGPGAVFWMWVTAVLGMSSAFIESTLAQLFKVRDSNSKQFRGGPAYYITQGLRSKTFGVIFALALIFTYGFVFNSVQINAIANASSHAWGWDKANLIAHLGGVDLEISWVGLALVVMVALAIFGGIKRIAKFAEMFVPLKAGLYLSVALYIALSNYAILPDVLKLIVTEAFHFNAAAGGFFGAAVSMAMMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAAASDVKHPVNQGLVQMLGVFVDTFIVCTSTAIIILVSGVYQDAGFVGVELTQRALETQVGHWGADFLAVLLFLFCYSAVLGNYAYAESNVQFINNNPKVMFIFRIFVLVMVYFGAIGSVPLVWSMADLFMGIMATINLVAILLLTPMARTLLKDYRAQLKQGIKEPVFKINKYPELKKKVDSDIW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP007712_2 | 2341103-2341266 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007712_2
|
3 spacers
spacers of NZ_CP007712_2
>2.1|2341126|37|NZ_CP007712|CRISPRCasFinder GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG >2.2|2341186|16|NZ_CP007712|CRISPRCasFinder CTGGTTATTTTGTTGC >2.3|2341225|19|NZ_CP007712|CRISPRCasFinder ACCGTGTTGCTGTTGATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007712_2
The CRISPR arrays of NZ_CP007712_2 >merge|NZ_CP007712|2|2341103-2341266|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTGGCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCGCGGTTATCATTTTGCTGTTGTTGCTGGTTATTTTGTTGCTGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTTACCGTGTTGCTGTTGATTACGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG >NZ_CP007712|2|2|2341103-2341266|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTG GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG CGGTTATCATTTTGCTGTTGTTG CTGGTTATTTTGTTGC TGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTT ACCGTGTTGCTGTTGATTA CGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG
>NZ_CP007712.1|WP_000132045.1|2340669_2340987_-|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDM >NZ_CP007712.1|WP_000498477.1|2340363_2340585_+|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP007712.1|WP_002037036.1|2339922_2340276_+|hypothetical-protein MEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLISKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP007712.1|WP_000251635.1|2339435_2339579_+|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSKNDGMHEASDPATSHDMNKNS >NZ_CP007712.1|WP_001984002.1|2338176_2338467_-|hypothetical-protein MFFLYRFVLVSLLTIGVLNLMGCRPMSKNEFNTRCVWAGHDLSACNCIYNSLEQHYSPQFVESLPKLSLQNIDAKMNFVETMNQTMQQCQLSASKH >NZ_CP007712.1|WP_000119785.1|2337269_2338175_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSYFDINRSGELAIFIRVVELGSFSAVARACNMTPSAVSKLISRLEKRLGVRLLNRSTRQFQLTSEGCQFYEQGIQILNDLDELEQSVTANHIPKGRIRIHTSFSYWTHFLLPCISLFNQRYPEIELEAHLSDEVINLVEQRIDVAIRTGPLKSSNLVARSLGSTYKHYVCSPVYIEKYGCPEHPDELHEHQLLDVSYQRQNKTWLFKKATQEISLTPSKVLKVNHGEAILQLALAGAGIAQLNEFQIRNALQQKQLVKILEDWNIHASEEFHAVWIGHDKYVPNRVRTFLDFLVEHASIN >NZ_CP007712.1|WP_086378801.1|2334590_2335874_+|DcaP-like-protein MKILNTTIQKSLLAVSVTLLMSSAFAGQVNPEIEQLRQEIKELRAMLQTNMEAQKSLAQKRVEQAAPVVTQAPQPIQQTLTKSGAEFNLYGYIRADASYQIKGASTMYNNISGVPLENTPEESAQKDQLHSTVYVTRFGLNFKTPTAVGDVGGKLEMDFFGAATRDQFRIRHAYLTFDKWLIGQTWSTFIAPEYYPETIDAGTFVGSALLRSPLVRYSDNLTANTSFAVSVEDPKYTAATDPDNKMRLPALVGRLNHKFANGSMLSGRSFVAEKRTNNDSEWAWGVGLGGKYQITPDTLLKADYYHVKGDGRFLLWSNSGYAIDDQNNMHSNEFDTVSLGITHQFTPQIRSTSGYGYMKAKDDNRFAELQRTSTTQNKQLWQGWVNALYNPYKPITLGIEYVYGERETFDNRNGIDNRFNMIASYDF >NZ_CP007712.1|WP_001029900.1|2333675_2334347_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAKDFNSPKVVEGYDAHIRKLIPGYEVIHQQVDAILQSVLRPDAHILIVGCGTGYELEYLLKRHPNWQFTAVDPSLTMLQKAQEQVEILGKSAQVTFVHGETSALPLESCFDAALSILVAHFIADDIKPAFFKDIYKRLKEKAPLLTYDLMTCVNPQQLQALHYLCLAQGLTEEQCQKMLERMAEDFFSLTTEGYIKLLEETGFESVQPYTQILTYQGFIAKK >NZ_CP007712.1|WP_001183735.1|2331924_2333619_+|AMP-binding-protein MQQERLSYASGPSTQPLLGMTIGEQFDQACQQYAEKEAIVSFHQNRRLTYKALQDEVNAFACSLLKLGLKKGDRLAIWSPNCVEWTITQFAAFKAGIILVNLNTAYKSHELEYVLNKVSCKGLIIASQFKTTDYQELLTKIAPELTTCIDKVLSSERLPHLKFVIKIDDQQHTGIYRFSDLLTTPTSEQLEQLKQLARQLQFDETINIQFTSGTTGNPKGTMLTHHNILNNGYFVGEGIRLTPQDKVCISVPLFHCFGMVMGNLACVTHGATMVYPSAVFNPLETLKAIHQERCTAAYGVPTMFIATLEHEQFNDFDLSSLRTGIMAGSPCPREIMQRVIDRMHMSEITICYGMTETSPVSVQSSVNDSIDKRVSTVGHVHPHVEIKIVDLEGQIVPQGTLGELCVRGYSVMAGYWGEEEKTREVIDAAGWMHTGDIAEMDQDGFIKIKGRIKDVVIRGGENLFPKEIEDFLYTHPDVSDVQVIGLPDAKYGEELCACIILHEHHQVDEDSIRQFCKEHISHNKVPRYVRFFNEFPMTASGKAQKFKLQEIMRAELNLTGNVFD >NZ_CP007712.1|WP_002060665.1|2331219_2331813_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MQERMEQNRKSILSSARKIISEGGFKDAQIQTIAEQAGVSSGLVYRYFDNKSQVLIEVLSDAINTELLVIESITESDLSAKQKLHKAVATFVKRALNSPQLAYSLMFEPVDSTVEHERFRVKQLIKQSIKKILADGNASGEFVLDDLNTAALCVVGAMTYVVVEPLDPAQNTKFDHAHKDYFSKQIADFCVDAVQKK >NZ_CP007712.1|WP_010326927.1|2341636_2342662_-|IS30-family-transposase MEYIKLSYHHLNFEDRTALMLESRKEGFSARKFAELIKRHPSTIYRELKRNSINDVYQARYASDNTFARRRRGHRKLKIDSILWKFIVEAIRCLWSPQQIAKRLKTFPDLDQTMNVSHTTIYSTIRALPKGELKKDLLSCLRHENKKRKANGEPKKDSILQDIKTIHERPAEVQERKIPGHWEADLIKGKDNKSSIATLIERNTRLCILATLPDAKAESVRKALTEALKYLPAELRKTLTYDRGREMAEHKILEEDLGIDVYFCDPHSPWQKGTCENMNGLIRQYLPKGIDLNQADQHYLNQVAMSLNTRPRKALDWLTPLEKFAQLVDYHKTFQTVAPHV >NZ_CP007712.1|WP_032002804.1|2342706_2343168_-|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLAE >NZ_CP007712.1|WP_001145679.1|2343482_2344892_+|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLAKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPSEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNKYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP007712.1|WP_148307300.1|2344946_2347091_+|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEQGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLNYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTIIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP007712.1|WP_000432325.1|2347145_2348024_-|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLEEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFAMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP007712.1|WP_044099013.1|2349062_2350433_+|stress-induced-protein MANTRYEDDNNSSGTSNRGFASMDPERVREIASKGGRAAHASGNAHEFTSEEAREAGRAAHASGNAHEFTSEEAREAGALSHKNDDRNGRGRSRYDDDEDDDRGRSSGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSSGRGRGRSRRDDDDDDDDRRGRSDGRGQNSRNQKRDAYGRFTS >NZ_CP007712.1|WP_000795915.1|2350493_2350730_-|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP007712.1|WP_001124837.1|2351012_2351624_+|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTDNQTDFTSKLKIQQIHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFQPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP007712.1|WP_000885222.1|2351694_2352306_-|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILFVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNQSGSEKAQSWLSWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHMISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP007712.1|WP_000376213.1|2352462_2352918_+|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVAKDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP007712_3 | 2662341-2662442 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007712_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP007712_3
>3.1|2662365|54|NZ_CP007712|CRISPRCasFinder TCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007712_3
The CRISPR arrays of NZ_CP007712_3 >merge|NZ_CP007712|3|2662341-2662442|CRISPRCasFinder GAGGATAAACAAAGCAATGCTTTGTCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAAGAGGATAAACAAAGCAATGGTTTG >NZ_CP007712|3|3|2662341-2662442|CRISPRCasFinder GAGGATAAACAAAGCAATGCTTTG TCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAA GAGGATAAACAAAGCAATGGTTTG
>NZ_CP007712.1|WP_000465452.1|2659987_2660683_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MFFKQFFEKESSTYTYMLGCEETRVAVLIDPVASDIEIYAKELEQHQFTLIYTLDTHVHADHITAADLLRERFHCKSVLHRNSDVSCGDILITDGCMLKVGNLSIEARYTPGHTNACTSYLVGNMIFTGDALLIDGCGRTDFQQGSAGTLYDSIHKQLFSLPDETIVYPGHDYKGRLSSTIGYERLNNSRLGQNRSREDFIELMNNLNLPYPKQIDKALPANQACGSISQL >NZ_CP007712.1|WP_001096433.1|2658524_2659796_-|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MAKLNFELEQDFYILFEQLKALFPNAILFLVDTSTQAIHYKFNTDDISVESMAALTQDHHNQYLEINTPKMRRRFIYQEHDIYIAEHRIIGKLHILQPVSIENDIVDGVELTEQLQDLAKVFNSCSPEMTRMFSIIQRVAITEFPVLVRGESGSGKELVAKAIHDYSQRKNKIFVAINCAALNSNILESELFGHVKGAFTGAIRDHKGVFERAAGGTLFLDEIAEIPLELQAKLLRVLETGEFTPVGGEKPIQANVRIITATHKALREEAKAGRFRHDLLYRLRVIPIFIPPLRERKVDIPIIVDQILKESSTQLYTMPRHVNQKAMQVLLNYDWPGNVRELKNTLLYALTMANGKDEIEVEDLPNELLNADDYIKLPETNAELSPENVQAALEKYNHNLNMVANIFGISRTTLWRYRQKHKL >NZ_CP007712.1|WP_032002782.1|2657543_2658455_-|bestrophin MIVRDKSNVFKLLFAWKGTILPKVLPALSFVVLISACVVWLSYYHWIQIPTVPAIGFTIFGVILSICTGFRNNACYDRWWEGRKLWGALIANARHIVRDSHVLSNEQREHLIHQVLIICNLLRDRLRQQTVEPTKFLEHAYLNNSSLNYLNEHINAPQFVLENIQKDLVKALKDGEISDIIYGTLTRHIVELGNIQAGCDRIAGTPLPYSYSVLLHRAVYCFCFILPFSLEAALGIWTPLIVGLIAYMFLGLDALSAQIEEPFGLQENDLPLDSIVRLIERESLSSLGQPLPPIIEAQNNNLL >NZ_CP007712.1|WP_000642319.1|2656437_2657496_+|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAARFYDRGDIRIEDIPEPEVTPGTVGIKVAWCGICGTDLHEFMEGPIFIPPCGHPHPISGESAPITMGHEFSGVVYAVGEGVDDIEIGQHVVVEPYIVADDVPTGPGDNYHLSKNMNFIGLGGRGGGLSEKIAVKRRWVHPISNKIPLDQAALIEPLSVGHHAYVRSGAKAGDIALVGGAGPIGLLLSAILKAKGLKVIITELSAKRKEKAKESGVADYILDPSEVDVVSEVMKITNGDGVDVAFECSSVNKVLDTLVAAVKPTGVIVIVSIWSHPASINVHSVVMKELDVRGTIAYVNDHQETIKLVEEGKINLEPFITQRIQLDDLISQGFETLIHNNESAVKIIVHP >NZ_CP007712.1|WP_000238436.1|2655622_2656408_+|acetoin-reductase MVKGLKNKVALVTGAAQGIGRGIALRLAQEGAHIALVDMKQDRLNDVQQEIQALGVNASTFIADVSDREQVYAAINHAEQTLGGFDVMINNAGIAQVQAIADITPDEFQKIVDINIGGVLWGIQAAAAKFKQREHKGKIINACSIAGHDGFALLGIYSATKFAVRALTQAAAKEYASHGITVNGYCPGIVGTDMWVEIDKRFAEITGAAIGETYKKYVEGIALGRAQTPDDVAALVAFLASEDSDYITGQSILTDGGIVYR >NZ_CP007712.1|WP_001271394.1|2654192_2655596_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSAAQFDLIVIGAGPGGYVAAIRAAQLGLKTAIVEEQHLGGICLNWGCIPTKALLAGAELATQFKHAGQFGFQVSQLDFDVQKLVQHSRQVSAQLVQGIDYLLKKNQVTVFNGRAQLTAKEKIEVTDAQGNSQVLSAPHIILATGAKARHVPQLPVDGTYVWSYKEALVPEQLPKSLLVVGSGAIGSEFASLYQDLGCQVTLIDLAKQILPTEDAEVAQFVRKQFEQKGMKVITDAVVQSIQIENEQVHCVVETANDVQTLVFDRVLSAIGVQPNTTGLGLERLGVELNPQGFVAIDDYCKTNVAGLYAIGDVAGAPCLAHKASHEAMICIEKIAGVANVHSLDRSQIPGCIFTHPQVASIGLTENAAKAKNLPIRIGKFSLTANGKALAIGDASGFVKTVVHAETGELLGAHMVGHEVTEHIQGFAIAKYLEATDESLAQVIFPHPTLSEAMHESILASMQRAIHM >NZ_CP007712.1|WP_001289733.1|2652646_2654182_+|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSEIKTLEIPKWGLSMEEGTIAQWLIKEGDSFNKGDEICEIETTKIVNVLEAPFAGTLRKILAKDGDTLPVGGLIAVCADSEVSDAEIEKFIASLGGSAAQAPEAPSEQSKAETSAPVAEKTAQPQTAAASASAPAKVAKDDYAVPESLQGYQTSNELFATPHALKLAEKHNVNLAKVTGSGREGRISVQDIQKAVQASGGQWPDVRQQTQAKVVKSTADDSQVLATPVARRLAKQWGINLNDCRVSGTRGRVCKEDVEAVYYRNNPVSVSEQPVQCAAQPQSTVTTVAMNGMRKAIASRLQAAKRNAPHFRLVVDLNVEALQKLRKQINETVPQVKLSINDMLIKAAAAALIKVPEVNVQFDEATQSILQFSQADISVAVAIPNGLITPIVKAANQKSLAQISDDMRDLATRAKTGKLQPDEFQGGSFSISNLGMLGIKQFDAIINPPQGAIMALGASESRAVVENGNVVVREIVTATLSCDHRVIDGAVGAKFLASFKQFVENPALILV >NZ_CP007712.1|WP_001133053.1|2651625_2652645_+|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MPNKSFRNAIKEAIESEMRRDPTVFVVGEDVRGGHGGKNTEENQLEGFGGVLGVTKGLWTEFGSERVIDTPITESAIIGMAAGAAATGLRPVADLMFMDFYGVCHDMLYNQAAKFRYMFGGKAKAPMVVRGMIGAGFSAAAQHSQSPYNVFAAVPGLKVVVPSSPYDVKGLLIQAIRDDDPVVFCEHKMLYDIKGEVPDDAYTIPFGVANYTREGTDVTIIALGLMVHRANEVADKLAKDGISVEVVDPRTISPLDEEGILESVASTGRVVIVDESAARCGFGHDVAALIAQKGFHYLKAPVELVTPPHTPVPFSPVLEKEWIPSVERIEQAVRKTLEA >NZ_CP007712.1|WP_001177517.1|2650649_2651612_+|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MQLTEEQLLAAYKRMRDIREFEDRLHEENTNGDIPGFIHLYSGEEAVAVGICENLTDKDYITSTHRGHGHCIAKGCDIHAMMLEIFGKDDGLCRGKGGSMHIADLDKGMLGANGIVGGGPPLAIGAALTAKTLKTGGVGLSFTGDGGSNQGLTFEAMNMAVVLKLPVIFVFENNGFGEGTGHDYAVGSKDIAGRAAGFGLPAVKVDGTDFFAVYEAAQTAIERARRGEGPSVIETITNRFYGHFEGDPGLIRSKEEVEFIKENKDPLKIFREKVKGKIDEAKLDEIDAASKANVDDAVAKARAAAYPKPEQLLTDVYVSY >NZ_CP007712.1|WP_000364551.1|2649298_2650285_-|lipoyl-synthase MDLKRQIETGIKLRGIDKVSRIPIKILPTEELPKKPEWIRAKITDFEEIQRIKNLLRQQKLHSVCEEAACPNLPECFAGGTATFMIMGDICTRRCPFCDVAHGRPMPLDENEPKHLAETVANLNLKYVVITSVDRDDLHDGGAAHFVKCIEEIRNRCPDTLIEILVPDFRGRLETALSTLSLSPPDVFNHNIETVPRLYKAMRPGSDYQHSLNLLKRFKKYCPDIKTKCGLMVGLGEIEAEVIALLNDLKDHDVDLVTIGQYLQPSKSHAPIHRFVNLQEFERYTQHGQRLGFKNIWSAPMVRSSYFADRQYFGESAPKPFSREDVLS >NZ_CP007712.1|WP_000925651.1|2662542_2663334_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLLLVVEGIVIGFLLGLTGAGGGILAVPALMTSQGWSVAQAAPIGLLAVALSTLIGTIEGLFKKIVRYRAAIWIALIGAPMAHIGILIANTISPIWLMLMFSLVMFTVGYRLINNRVSDFHNPPCQVNPSTGRFIWNFKTGGVLASIGIIAGLLTGMLGVGGGFVIVPALRKVTNLDMHSIVATSLMIIFLISGMSIVMHIAEGFQYPVAITSAFALACAFGMLLGRRAIRFIPSAIVQKVFALMVFAVAIYMVIKIVNLTNI >NZ_CP007712.1|WP_000822394.1|2663443_2664448_+|hypothetical-protein MKRINVAICGFGRIGQQIAELLLNRSTYYKQKYQIDARLVGVCNSSSGLIDQEGLQASKWLDKTQYQAGLTEQKFLKQVQADVIIETGPSDYVTGGKGLFYLNYALTHSMNAIAVSKGALVVEGKKLINLAHQHNKKLFFSGATAAALPTVDLFEYNLAGCQILEIESVFTGTTNFILNDMLQHECAFTESLEKAQARGIAEPNSSFDVDGWDTAAKITILANTVLGVDVKIQDIPRQGISHVTTEHIRDWKKENIIPRLVGFIHIKNQQIQTGVELRLVPANHPFAHLQGSNKCIRVLTQEMGEFVVSGGASAPLATAAAALKDFELMLKTGC >NZ_CP007712.1|WP_001023744.1|2664480_2665398_-|EamA-family-transporter MNILLYVAVVLIWGTTWIGIAVQSHYATPVVAILWRFAISALLLWVVLLFSGKLQRIALKDHLFCMLQGLCVFGLNFICFYTAVKYVNSGLESVIFSMAVFFNAINALIFFKQKPSPNFAPAALLGLSGIVLLFWHDLINSQFNAQLLMGIGLCAIGTYGFSLGNMISVRHQKRGLNIFSTNCYAMTYGALVMLILALFTGQDLMPPMNFPFLSSVLYLAVFGTVIGFSAYFSLVGRIGAAKAAYSTLLFPLVALTVSTFFEGYEWTLNAVFGILLILLGNYLMFSKFEIGKKLFSSQKNCEKQA >NZ_CP007712.1|WP_000331400.1|2665564_2666419_+|AraC-family-transcriptional-regulator MAYQTLEQLQQSKAKLHETVVLDENMQLAFWSNQQDRVSVCSDHHTLSLYIQDGYESYQKTPAGWKNGGGPGRFCLLPEHQESTWDIRGGLKFVHLYYTDQHLRDVAEKIWDKEPNQIELNEVVFNDDERIRALYQFFLLDCDWQDSSNHLQMSTTASLLLNHLIRKYSSVQWQQPTIKGGLAPHKLKYIQEWIEDHLDQALTLSDLANVVNLSEYHFAHMFKQSMNMAPHQYVMQRRLTKAKGLIQSSQLSLQDIALVCGFSSASHLSHRFKQFYGMSPSQLR >NZ_CP007712.1|WP_004835232.1|2666415_2666811_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTVTIPHDIQSSDCQRVSQVLARVGEKWSILIVMTLASHPHRFSEIKRRINGISQRMLTLCLRGLERDGLVKRTVYPVVPSHVEYELTPLGHSLTEPVIALGQWAQQHIADIDAARAAFDAAQEKPITLDT >NZ_CP007712.1|WP_000771644.1|2666906_2667515_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKLLQIDTSILGEQSVSRQLTSSVIRQLSTAYPDAEIIHHDFALEPIPHLSDAEFLAWQGVEPNNEIAQQRVARNTQYLDEFLSSDIVVIGAPMYNFSFPSQLKAWLDRLSVAGKTFRYTENGPQGLVEGKRVIIASSRGGVYSEGSPAEALDYQETYIKAFFNFIGVTDITFVRAEGIAFGPEARQTALDNAAAQIAQLAG >NZ_CP007712.1|WP_001186401.1|2667598_2668948_-|chromate-efflux-transporter MQQKQLNTPDDSVEQVTFWQAILFWLKLGFISFGGPAGQIAVMHQELVEQKRWISEKRFLHALNYCMLLPGPEAQQLATYIGWLMHRTTGGLVAGILFVLPSLFILIGLSWVYIKFGDVPVISGIFYGIKPAVTAIVFHATYRIGSRSLKNKFLWFVAIAAFFAIFFLKLPFPLIVLSAGIAGYLASKKYPELFSSAAGHKASQKDYGPAIIDDDTPTPEHAKFHWLRLAKLIFVAIALWLLPILALGAYFGWHHSYTQMAWFFTKAALLTFGGAYAVLPYVYQGAVNHFGWLSPTQMIDGLALGETTPGPLIMVVAFVGFLGGVNHSLLGSEHLFFAGALGAVIVTWFTFLFSFVFIFAGAPIIESTHNEIKFTAPLTAITAAVVGVILNLALFFSYHVLWPQGFSGHFDIVAALITVAAFIALFRFNINVLYVIFASALVGLAVTFF >NZ_CP007712.1|WP_000080821.1|2669189_2669933_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSQLPQDPKNHKPLYDQLRELILNKIVNGEYAVLSQIPSENEFAEQFGVSRITVRQALNQLQLEGYIFKVPGKGTFVSKPKTFQNISSLQGFAEAMSSAGHEILNRVISAELKQVPMHVVPKLKLPVKANVYEIQRVRLLNRQPVSYELTYLSEHIGLKLKEKAIDLRTTDIFKALEQECDIPLGHADLSIDATVADEELAALLQVEIGTPVLRVERLTHDANGQPIDYEYLYFSGDTFQYRLRIHR >NZ_CP007712.1|WP_000448778.1|2669961_2671695_+|fumarate-reductase/succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit METKYFEFDIVVIGGGTAGPMAAIKAKQENPNLKVLLIEKANVKRSGAISMGMDGLNNAVIPGYATPEQYTKEITIANDGVVNQTTVYAYAKHSFTTIQQLDQWGIKFEKDETGEFAVKKVHHMGAYVLPMPEGHDVKKVLYRQLKRAQVKINNRIVTTKLLKNEQGAINGVLGFDCRSGDFYVIKTKAAILCCGAAGRLGLPASGYLMGTYENPTNAGDGYAMAYHAGAELANLECFQINPLIKDYNGPACAYVTGPLGGYTANSKGERFIECDYWSGQMMWEFYQELESGNGPVYLKVDHLAEETIQTIEEILHTNERPSRGRFHEGRGINYRQDMVEMHISEIGFCSGHSASGVWVNEKAETSVKGLYSAGDMAAVPHNYMLGAFTYGWFAGVNAAQYVNAVEDSELNQSEIEAEKARIFAPLDCSEGLPPEQVEYKLRRFVNDYLQPPKTRQKMEIGLKRFEEIKQDIKRISARNPHELMRAAEVSFIRDCAEMAARASLFREESRWGLYHYRADFPQKNNSDWFCHAHLKKDEHGNMVSFKKPIEPYVVPINQDEAVSYDRLRIQKDVALAD >NZ_CP007712.1|WP_000864074.1|2671715_2671961_+|ferredoxin-family-protein MAFIFKEVQHRTVAPVIIDEDKCIADKGCTVCVDVCPMDLLAIDPTTQKAYMQFDECWYCMPCEKDCPTDAVKVNIPYLLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP007712_4 | 2933335-2933479 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007712_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP007712_4
>4.1|2933381|53|NZ_CP007712|CRISPRCasFinder CCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007712_4
The CRISPR arrays of NZ_CP007712_4 >merge|NZ_CP007712|4|2933335-2933479|CRISPRCasFinder AAATTAACCATAACTATGTTCATCTCGCGCTTCGCCAAAGCTTTAGCCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATACAAATTAACCATAACTATGTTCATCTTGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG >NZ_CP007712|4|4|2933335-2933479|CRISPRCasFinder AAATTAACCATAACTATGTTCATCTCGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG CCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATAC AAATTAACCATAACTATGTTCATCTTGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG
>NZ_CP007712.1|WP_000616034.1|2933050_2933284_+|hypothetical-protein MIQRISHHDLEHVYATAVNTIQSQMNFQDAVAQLEEVARAGHGKAALFLAELYYQGFRVERDSMKAQYWQKLATMQA >NZ_CP007712.1|WP_000185571.1|2932475_2932835_-|hypothetical-protein MTNTIDGFVFDNPPKEEQIIELAHYHRKLLDEAIFHQEIHLGDYCLAQRKRVFDYARQLDPNQKAWFYQVYDGELRKIADEDELHPADAEEGLSIFAMLLVLVIIAAILYFSVIRSLMG >NZ_CP007712.1|WP_000955081.1|2932048_2932375_-|hypothetical-protein MLTFKENFLKLKSELKADQCFNLVVIIIIGCIFMLSYLALLGPVNSEQYQRIVQLSRQATYPRTQDMAELIMAQSEIHRAEYLKLMHAYQFEHNHIKQYPALAQEDTQ >NZ_CP007712.1|WP_001187342.1|2930834_2931941_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MQQQSNMQNKFLIDAEIGDDDVTLPNLPAIDVPIVESPVKQEVKAEEVVEAAPSTEPEQPKSGFFGRMKEGLSKTRRNFTDGMVNILIGGKEIDDELLEEVEEQLLVADIGVDATKTIITNLTERTARGDLIYSHSLYKALQEELVALLAPRVKPLHIDPNKSPYVILMVGVNGVGKTTTIGKLAKRLQGEGKKVMLAAGDTFRAAATEQLQIWGERNDIAVVAQGHGADSASVIFDAFESARAKGIDVLIADTAGRLHNKSNLMEELKKVKRVMQKIDATAPHEIMLVVDAGTGQNAINQVQEFDQAVGLTGITITKLDGTAKGGVLFNIASRTHVPIRFIGVGEKIDDLRPFSAKSFVAALFETEK >NZ_CP007712.1|WP_000102943.1|2930049_2930646_-|nitroreductase-family-protein MSTFLDKIKNRRTIYAIGKNVALDRTKIEETIREAVKHSPSAFNSQSSRVVTLYGESHAKFWNLVREALRKIVPADAFAGTNAKIDSFVAGVGTVLFYEDQAVVKSLQEQFELYADNFPVWSEHSSAIAQFATWTALSELGLGASLQHYNPIVDADAAEAFDVPATWKLRAQLVFGSVEAPAGEKAFISDEDRFKTFN >NZ_CP007712.1|WP_000175351.1|2929152_2929824_-|DUF2057-domain-containing-protein MTLRLSVAAMGLLLSGSVFSAVTITAPEEIVILAVNGQEVNSGLFRSSKNNYKVDAGETSLSVRYQEYFEHLSGEHDIVKSGVVTIQTPALKDGQTYKLAMVDAPKQFEQAKKYAEQPTVALYNSNNELIVQQTGANNEARPWFASGLLGKVTDFTTKSSKQQPDAVYAVAKPTTTQANAPVATTMPPTGVAQTNDQRLAEIWKKSSKAERQKFMAWLAEQSN >NZ_CP007712.1|WP_000593796.1|2928555_2929080_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIKLNFRLAEFSDIPTLVELINQSYREQQGRSWTTEVEYVKGQRINKEQLKHQLELPNSVLLIGEIDSSKVVTCIGLTFQSNTVEIGTFCTDPHVQNMKIGRCVLEYAEQFALHKVPELDSAIMYVLNVRSELIAYYERRGYIKTGNHEPYPLDANVGLPLIPIKLIEMKKDLK >NZ_CP007712.1|WP_085916945.1|2928243_2928543_+|cyd-operon-YbgE-family-protein MMATAMTASNQRKAQAFAMAISFLLALPLAVILLVHPSLMLDANGHYNHSQLMLVMVGISGGFIYGVGFVPHFWLWKWLFSPWIAWPLMLLGYYIWFLT >NZ_CP007712.1|WP_000270276.1|2928141_2928243_+|cytochrome-bd-I-oxidase-subunit-CydX MWYFAWILGILMACFAGVLSALYIEHHQNLDEE >NZ_CP007712.1|WP_000575163.1|2926982_2928128_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIEYELLKIIWWVLVGVLLIGFALTDGFDMGSMALMPFVGKTDNERRAAINTIAPHWDGNQVWFITAGGALFAAWPMVYSVAFSGMYWALLLVLFALFLRPVGFDYRSKLENTQWRNSWDWGLCIGGAVPALVFGVAFGNLFLGIPFSLDSTLRSEYSGSFFALLNPFALVCGIVSLSMLCAHGGAWLMLRTDGALKQRSAKATQIMAAIFLVCFLVIGAWLYFGQVPGYSYAAAVDPNAALNPLAKEVVTNNNPGWMNNYSSYPITKVAPVLAILGAIIAFFTASKAKAGLSFAGTSLMIVGAILTAGFALFPFLLPSSVNPNSSLTMWDAVSSHRTLGVMTVAACIFVPIILIYTSWSYYKMWGVITNKHIESNSHSLY >NZ_CP007712.1|WP_077163451.1|2933761_2934094_+|DUF2750-domain-containing-protein MIKIYILRTMMYCGVLWGLFDEGWAIKSDQEDFIFPFWLNGVQAHRYAKTHWPNYKPRKITPKDFHESLLPTLTRLKVTPALFNSSHRKLKLSTQQMHHFFFNHPKWQVA >NZ_CP007712.1|WP_000156920.1|2934234_2934666_+|CBS-domain-containing-protein MTIVAQVIKNKSEQAIFTISPEATVLEAITIMAEKGIGALVVAEGEQVVGILSERDYTRKVTLMERSSYSTTVAEIMTAKVITVGLNNTVEECLQLMTDRHLRHLPVLDNGKLVGFISIGDLVKAAMEDQKVLIEQLKQYISG >NZ_CP007712.1|WP_000129939.1|2934716_2935925_-|aspartate-aminotransferase-family-protein MTDITLAPVQPDQPTHLMATYGRQAISFVRGRGAYLYAQDGTEYLDALTGIAVCGLGHAHPAIAEAIAEQAATLVHTSNLFEIPWQTAAAQKLAEVSGMEEIFFSNSGAESNEGAIKIARKFGTQQGISLPKIIVAEQSFHGRTLATLSATGNKKVQDGFAPLVEGFIRVPFGDIEAIQEAALQHPDIVAILIEPIQGEGGINTAPQGFSYLEEVRQNCNQHNWLMMLDEIQTGNGRTGKYFAYQHTNIIPDVLTTAKGLGNGFPVGAVMTQGKAVGLLGPGSHGSTYGGTVLGSRVVYTVIDTIQKENAVENAAVVGNYIVDQLRAQLSDKNVQVRGFGMMIGIQLPKDCAELVAIARDEYKLIINVTAGSVVRLLPPINMTQAQADILLERLVALITNYL >NZ_CP007712.1|WP_000138830.1|2936152_2936494_+|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin MTEQARDTEALIRDQIAKHPVLLYMKGTPQFPQCGFSARAVEALSQIGRPFAYVNILENPDIRATLPKIANWPTFPQLWVNGELIGGSDIMLEMFQNGELKPLIEQYSAAPEA >NZ_CP007712.1|WP_000121851.1|2936540_2936864_-|hypothetical-protein MSYQLVELENATANIICPICKLAVIDWTQEQYVQPCEHTVFIAMDLGFEFVADRFEQVMNQNVDELHEDPNMNIFDAITTTPYKNLTILKADLGVDGLFRYVGISVC >NZ_CP007712.1|WP_000954523.1|2937107_2938010_+|LysR-family-transcriptional-regulator MLTDLDDFYCFALVVEHGGFSAAERVTDIPKSKLSRRVYNLEENLGVRLIQRSSRHFAVTDIGMDIYRHAQVMMNAAQAAHDLVDHLSIQPRGVVKVSVPVDIAQNQLPKILPAFLKKYPEIRLQLIVSNRRVDVINEGIDIALRVRSKLDDDPSLVLRQFALIEQSLFASQAYLNEFGNIKSPDELSDHRILSLSEEHLDQQFILHGPDNQLKKVKVSPTIMGTNIYMLAQLASQNCGIALLPDTAAEDFVKSGQLVQILPDWKAAHGIFHAVYPSRRGLLPAVRVFIDYLVEHLSEHP >NZ_CP007712.1|WP_001202783.1|2938061_2938856_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MRASTVTIKTEQDLEKLRVSGRLAAQVLEMIGEYVKPGVTTEYLDNICNDYIVNTLKVIPANVGYHGFTKTICTSVNEVVCHGIPSQNKILKDGDIINIDVAIIKDGYFGDTSRMYYVGNVNPHAKKLVETTYEAMVAGIHVVKPGATLGDIGYAIQSVAHREGYSIVREYCGHGIGKVYHEQPNILHYGQRGQGLVLKKGMVFTIEPMVNAGKPQVKELNDGWTVITQDHSLSAQWEHMVAVTDTGFELLTPWPEGVGNYPEI >NZ_CP007712.1|WP_001186687.1|2939208_2940510_+|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MQQLRTGDIIALGFMTFALFIGAGNIIFPPIVAQQAGDHVWLAAIGFLITAVGLPVITIMALSRMQGSIEIISSPLGRIASLILTVVCYLSVGPLFATPRTATVSYEIGFSSYFGTSSSSLLIYSAIYFAFVTVVSLYPNKLLDTVGHVLAPLKIIALAILGIAAVMIPAGYVPTPINHYVNSPVSEGFVNGYLTMDTLGALVFGIVIIQAIYSRGVTDNKLVTKYAIIASLISGVGLTLVYLSLFKLGLGSHEVAPNAANGAVILHAYVQHAFGNMGSLFLTGLIFLACMVTAIGLTCACAEYFAQLTKLPYKLLVFILVGFSFIISNLGLTKLIAVSVPVLSAIYPPAIVVIMLSFFWKFWHKPSFIVGSVTSIALIFGIIDGLKVAGFGDYLPNFLQHLPLNEQNLAWLIPSLVVLVVTTLIDKVKHKSI >NZ_CP007712.1|WP_000838061.1|2940701_2941121_+|heme-binding-protein MKSKYYLTLADAEFLMEEAQKYAIEHNFKVSIAIVDETSSLLLMKRLDGASPLTTHLCLEKAKCSSMSGRPSKFYEELLQNGRLGFLSMPSAKGMLEGGKAIIYEGQILGAIGVSGVQSFEDAEIAQHAIDVFLKKQCS >NZ_CP007712.1|WP_000949688.1|2941380_2941626_+|hypothetical-protein MLSLHFNKQVFINTLNSKDSVVYGVTTLALMLTLLFQGMIKGNLKPEYFMYAMVVSFVFCVWAFVDHKMRKLAKRRLSQQK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
780484 : 847139
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP007712|780484:847139|DBSCAN-SWA 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58 | uncultured_virus(30.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1167181 : 1181979
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007712|1167181:1181979|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007712|1167181:1181979|1167992_1169492_+|WP_000893694.1|DBSCAN-SWA MLERPITFFFRGGQQQVENVVPTMTVLQFLREYTQTGKTRQTGTKEGCAEGDCGACTVVIGELVNDNLQLRSVNACIQFLPTLDGKALFTVEDLHSLLPVPDGTLHPVQQAMVDMHGSQCGFCTPGFIMSLWSMYENEQQSPSKDKISDYLSGNLCRCTGYRPILDAAQKAYDYPRVVLERQKVIDVLKEIKALPALYLNDQKQQFFAPKTLQDFAVLRLQLPQARIVAGSTDVGLWVTKQGRDLGDMLYIGQVEELKKIVVTDHALTIGANVSLSDALIKISDFYPDFQELQRRFASMPIKNAGTLGGNIANGSPIGDSMPALITLGTRLILRVGEQTREITLEDFYLDYQKTALQLGEFVEAIVIPLREGQTRFKFASYKIAKRFEQDISAVCAAISCELDNDDVAHNVRIAFGGMAAIPKRAKYTEAILEDQQITAELIVQAQEALSQDYQPLDDGRASSAYRLHVAKNCLKRFYVEKILSQTLTRVNDLIAMVEI >NZ_CP007712|1167181:1181979|1171875_1172859_+|WP_001164242.1|DBSCAN-SWA MQHLQWWTDFVAWQVDALPMVLVTVVRADGSTPREVGATMLLRFNLQQQWQQSDTIGGGHLEFQAIDIAKAMLKESETCVRRIERFNLSARLGQCCGGVMWLLFEKILPAEIASDLSGSLQAWRAGKHIWRNVSYQYASTWQTMDMEQQPSSEFHSGCSEEWQFGQQIQPNTMQVLICGAGHVAEAIVRCLLPIGVRVKWIDPRDDIFPSDLLEQVQCLTTDTLDAEIEHFDRSGAILILTHDHQLDLQLCFTALKPMAKPFAYVGMIGSKSKRAIFEKRMQVRGYTSETLQRLVCPIGIEGISSKQPATIAVAVVAQLLQVFDVKK >NZ_CP007712|1167181:1181979|1181403_1181979_-|WP_000566785.1|DBSCAN-SWA MIDNYDSFTYNIVQYFGELNQEVKVVRNDQVTLEDIERWQPKYLVIGPGPCSPSEAGISIPAINHFAGKIPLLGVCLGHQSIGQAFGGKIVRAKTVMHGRLSDMYHSNKGIFSNLPSPFSATRYHSLVIDQETLPECLEVTCWTNEADGSMEEIMGVKHKTLPVEGVQFHPESILSQHGHQIFKNFLDIYA >NZ_CP007712|1167181:1181979|1173574_1174381_-|WP_000608310.1|DBSCAN-SWA MINIQNTILGKIVDRKHEELAARLKQRNLQDVEELAKAATPVRGFANALQHKRPGVIAEIKKASPSKGIIRADFNPAEIAQQYEQAGAACLSVLTDVDFFQGADENIAIARNHCTLPALRKDFLVDPYNVVEARALHADCILLIVACLSDQQLEEMSKTAFEHQLDVLVEVHDEEELERALKLSEQCLLGVNNRNLKTFDVDLNTTIRLKKLLPASRLLITESGIATPDDVRMMQEHDIHSFLVGESFMKQPRPDQAFTALFGQPQTV >NZ_CP007712|1167181:1181979|1167181_1167730_-|WP_001187844.1|DBSCAN-SWA MQQSYANILTAVGEDLNRPGLKDTPVRAAKAFSYLTSGYSKTLEEVTNNAVFPSDNHEMVLVKNIEFYSLCEHHLLPFYGRVHVAYLPEGKVLGLSKFARITEMFARRLQIQENLTQQIAEAVAEVTGARGVAVVIDSAHMCMMMRGVGKQESTTRTVSFVGDFKTDKEARREFLSAVPESY >NZ_CP007712|1167181:1181979|1175795_1178528_+|WP_000281148.1|DBSCAN-SWA MYLNNLKYVGALKNKRSFIFVFVALFHPLKSYAQETVEQTQNQAKPDKVVRVAVTGSRISKAQKDGPTSVTVITAADIEKQGFSNAFDALNNLTQNTGFVQGADYGNTFTPAANAISLRGLGPNHTLTLINGHRVADYPVPYDGSVNFVNLANIPTAIIDRIEILNGGASAIYGSDAIAGVVNIILKKKTDGTQFNIKAGGTKEGGENLRLQLSGSKTLDKLSLVYGVELSGREPIWAADRDFMKSRTRLGEKPDTIVGRKNADTGKYLSIGGCQAFNGLFNGSVNNIGQAGADNCASGLARPTYWTVQTQNRSQNGYLGLDYELNDKTQLFADFLIGANQIENNTRSPIWTSLAATSGYFLNQDSGNYEIWNCRFAPEELGGVERINKKWKELSSNLNFGIRGDIGETSWSYEAAYNGSIYTSQLRRQGLLRSNVDEYFLGQQLGTDADGIPIYSPHLDRLSRPLTASEFESISGTTKEKDKSWAQSLTLSANGDVFKLPAGTAKLATVAEIGRQGFSIKPDQAVENGEFYNTSSSGEYSGTRTRQALGAELFLPLAKPLNLTLSGRYDRYALSDNSIDKLTFGSGLEFRPHPTLLVRGNYATSFRAPDMNYLFLNKQKGYFASTTDYLRCSQTGQPLDKCSFKDYAPGANYTLTGNKELKPEDGKSYGAGFVWSPTNKFDISVDYWDIKIDNLVTNLSADKILRLEADCRLGNQDINSAACIDALARVERNPANAVVDPNVIKNINIVPINAASDHTRGIDFTSRWRWKTDSFGNFLWTINYSRVLEHEYQQSKDGEKDDYLKDLSIPDWRDRFNTSLSWSFGDWASTVLVNRYGKIPNGDQTAYLSPTYLVNWSGTYQISPKASASIIINNLFDKVKRDDTGGWPYYPVGSYSPFGRQGWLEFNYKF >NZ_CP007712|1167181:1181979|1169493_1171869_+|WP_001076827.1|DBSCAN-SWA MNQTIDLRVSKKSAKAGDSIPHESAHLHVTGQATYIDDLPELENTLHLAVGFSNCAKGKISKFDLDAVRQAEGVYAVFSAKDIEVENNWGPIVKDDPIFAEEQVEFYGQALFVVVAESYQQARQAVRLAKIEYVLETPILTIQDAIEKESWVLPPVEFSHGEVEQAFQNAAHQLSGAIELGGQEHFYLEGQISYAIPQENQSLKVYCSTQHPTEMQLLICHALGMNMHQVSVESRRMGGGFGGKESQSAQWACIASLAAQKTGRPCKLRLDRDDDMSATGKRHGFAYEWSVAFDDSGVLQGLKVQLASNCGFSADLSGPVNERAICHIGNAYYLNAVELRNLRCKTNTVSNTAYRGFGGPQGMFVIENIIDDIARYLGCDPVEIRQRNFFAEQPSAGRDRMHYGAEVRDNVAPKLVAELLQSSDYAKRRQTIHAFNQNNDIIKRGIALTPLMFGISFNAVHYNQAGALVYVYMDGTVSITHGGTEMGQGLYTKVRQVAAHELGLPIDSVRLIATDTSRVPNTSATAASSGADLNGKAVQNACIKIRERLAKLAAEISQSEADQVQFEDSMVSTANGHSWTFPDLVQRAYMARVQLWDSGFYKTPEIHYDQVNHLGRPFFYYAYGAAVSEVAIDTLTGEMKVLRADILHDVGRSINPAIDIGQIEGGFVQGMGWLTTEELYWQPQGPHAGRLFTHAPSTYKIPTSVDIPHIFNVKLFNNQNQADTIYRSKAVGEPPFMLALSVFSAIRQAVQAAIPENAPLVLNAPATAEEILRAIAIGRGQDLAVRPQAKM >NZ_CP007712|1167181:1181979|1172869_1173565_-|WP_000066126.1|DBSCAN-SWA MSNKDSSLSKEQQKLLKQFKKQISNPHSSKIANQPESKKSQAESEELEDTHLFKQAVAGVKPINNSNIADVKTPRAKKVDAQTLAKRAAAEGGRDTEHAELSDTQAALNPVASQATLSYRIATLQHKVFEDLKAGKMRWFEAVDLHGCTIEQARDAVLQIIQMAKDENQNVIKIVHGKGPEAVLKTYVNGWLRQHRDVLAFVSAPENQGGTGAVLVLLKRAEKNPKFEQKK >NZ_CP007712|1167181:1181979|1174390_1175440_-|WP_001982145.1|DBSCAN-SWA MNIQQALNHITKNIHLTQPQMEEIMRSIMQGEATEAQIGALMMGLRMKGESIDEMTAAARVMREFAIKIDVSDIKHLVDIVGTGGDGQNLFNVSTASSFVIAAAGATIAKHGNRGVSSKSGSSDLLEQAGIHLDLDMQQTERCIREMGVGFLFAPNHHKAMKYAAGPRRELGIRSIFNLLGPLTNPAGVKRFVIGVFSDELCRPIAEVMKQLGAEHVMVVHSKDGLDEISLAAPTTIAELKDGEITEWTLNPEDVGIESQTLNGLVVADATASLKLIKDALSKNKSDIGEKAANMIALNAGAGIYVAGITKTYAQAVAFAQDIIYGGQALEKMSVLAEFTKTLKQSQAD |
9 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1226737 : 1239249
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007712|1226737:1239249|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007712|1226737:1239249|1230944_1231133_+|WP_017724812.1|DBSCAN-SWA MTLTEIKFRLITIAEKRKRPYFDMIVVKEVHEAFKNNTYHELKNYVLAEMEISVLNMVELGK >NZ_CP007712|1226737:1239249|1232634_1232937_+|WP_032002897.1|DBSCAN-SWA MSEFKVGDKVVVKDTPFWPDDHFIQTVKAEHIGQWYMNSWRLAEPAEVQAGFRKGCKAFDDYWCGRSERYELKATEMPNDMGDDFPIENHISPLCKSKDV >NZ_CP007712|1226737:1239249|1238688_1239249_+|WP_032002913.1|DBSCAN-SWA MSVSKVTICNNALSMIGGQQIASFEEDSKLAQTCRNIYDTTRLSILRSHPWSCAKKRQILSPISTYPSFGYAHAFPLPSDYVLIISANTERYEVENRYILADTEVVYLEYVFDNDNEQTWDAMLVEAMTYKMASKLCKPITGSDAAGQSAEAQYQYLIKQARTVNGQERPSQDVQYAESSYYLERF >NZ_CP007712|1226737:1239249|1232116_1232434_+|WP_032002893.1|DBSCAN-SWA MKPEQFIREYGPNTFRISMSFVNTAKYLVVHEGEIDFTDEIKPHHGDRVFERDVVKRLVESVDLVNSLGGLKAARSEAHKDCFAYNQLLLAAIAAYESIYGGGDE >NZ_CP007712|1226737:1239249|1232426_1232642_+|WP_032002895.1|DBSCAN-SWA MSNFGKCEICGRDGKLVRQELIPYNPILKIEPWVFRYYMCQWHRAVETKRGLLFEPMEYIADEVILGASHE >NZ_CP007712|1226737:1239249|1233571_1233751_+|WP_032002901.1|DBSCAN-SWA 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22 | Acinetobacter_phage(40.0%) | head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1459514 : 1526251
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP007712|1459514:1526251|DBSCAN-SWA 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60 | Enterobacteria_phage(25.0%) | transposase,tRNA,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1549321 : 1612675
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP007712|1549321:1612675|DBSCAN-SWA 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74 | Acinetobacter_phage(76.09%) | terminase,transposase,holin,protease,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1649282 : 1694869
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP007712|1649282:1694869|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_phage(20.0%) | integrase,terminase,transposase,protease,tail | attL 1647668:1647683|attR 1701080:1701095 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1766594 : 1836605
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP007712|1766594:1836605|DBSCAN-SWA 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57 | Vibrio_phage(15.38%) | transposase,holin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1881334 : 1945692
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP007712|1881334:1945692|DBSCAN-SWA 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58 | Acinetobacter_phage(44.44%) | transposase,integrase | attL 1932326:1932340|attR 1943180:1943194 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2966167 : 3004801
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP007712|2966167:3004801|DBSCAN-SWA 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32 | uncultured_virus(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3016711 : 3058412
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP007712|3016711:3058412|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP007712|3016711:3058412|3021050_3021854_-|WP_004886741.1|DBSCAN-SWA MNYPNDSLKSIQNAWYKQLVNFRAWYMPETQLTADWKLRAIGNAIKACPSRMMDDSEAMLSEYRKSQKHVEESKVLLPVMLTATALTDQPPDVNQLLPVPDFIETVIDEKRVKVRLVPTTVRAQIAFFATNPNDLRSVIGQFCAYMSSNDNRRFNVPFQQWNDHVFNSTFTVFENELFPSPVPSEAINLSISTVDIQLVGYTPNVIGFGGPFDQNTGNGYEPDGSATEQPAINDKVVVQADQYTSLDHQRVKGDRETGEITVERIDD |
58 | Acinetobacter_phage(35.0%) | transposase,terminase,integrase,tail | attL 3020996:3021010|attR 3061728:3061742 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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