Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009268 | Clostridium pasteurianum DSM 525 = ATCC 6013 strain DSM 525 chromosome, complete genome | 3 crisprs | csa3,RT,c2c9_V-U4,cas3,DinG,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7b,cas8b1,WYL,DEDDh | 0 | 4 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009268_1 | 699979-700538 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP009268_1
|
8 spacers
spacers of NZ_CP009268_1
>1.1|700008|37|NZ_CP009268|PILER-CR TCAGATAATGCTACATGGAGAGGGGCTATAACACAAG >1.2|700074|37|NZ_CP009268|PILER-CR TTAATCATTATTTTCTCCTAACCAAATTCCATATTTC >1.3|700140|36|NZ_CP009268|PILER-CR TATATCAGGACAGTCATCTAATCTGCTAGTGTTTAG >1.4|700205|37|NZ_CP009268|PILER-CR TTGGAATAGTTAATACACAACTTACTTTTGAAGATTT >1.5|700271|37|NZ_CP009268|PILER-CR TTAATAATACCTTCCTGCAAATTCATAATTTTTTTGA >1.6|700337|37|NZ_CP009268|PILER-CR TTAATTTGGAAAACCTATATGAAAAGAGGATAGTGCA >1.7|700403|35|NZ_CP009268|PILER-CR TACAGCAGTTGCAAATAATGCAACTGCTACAGTAC >1.8|700467|42|NZ_CP009268|PILER-CR TCTACTTGGTTAAATGAATTAAGGAGAGAATAATAAGATATG >1.9|700009|36|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT CAGATAATGCTACATGGAGAGGGGCTATAACACAAG >1.10|700075|36|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT TAATCATTATTTTCTCCTAACCAAATTCCATATTTC >1.11|700141|35|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT ATATCAGGACAGTCATCTAATCTGCTAGTGTTTAG >1.12|700206|36|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT TGGAATAGTTAATACACAACTTACTTTTGAAGATTT >1.13|700272|36|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT TAATAATACCTTCCTGCAAATTCATAATTTTTTTGA >1.14|700338|36|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT TAATTTGGAAAACCTATATGAAAAGAGGATAGTGCA >1.15|700404|34|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT ACAGCAGTTGCAAATAATGCAACTGCTACAGTAC >1.16|700468|41|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT CTACTTGGTTAAATGAATTAAGGAGAGAATAATAAGATATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009268_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009268_1 >merge|NZ_CP009268|1|699979-700538|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAATCAGATAATGCTACATGGAGAGGGGCTATAACACAAGGTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAATTAATCATTATTTTCTCCTAACCAAATTCCATATTTCGTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAATATATCAGGACAGTCATCTAATCTGCTAGTGTTTAGGTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAATTGGAATAGTTAATACACAACTTACTTTTGAAGATTTGTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAATTAATAATACCTTCCTGCAAATTCATAATTTTTTTGAGTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAATTAATTTGGAAAACCTATATGAAAAGAGGATAGTGCAGTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAATACAGCAGTTGCAAATAATGCAACTGCTACAGTACGTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAATCTACTTGGTTAAATGAATTAAGGAGAGAATAATAAGATATGGTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAC >NZ_CP009268|1|1|699979-700537|PILER-CR GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA TCAGATAATGCTACATGGAGAGGGGCTATAACACAAG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA TTAATCATTATTTTCTCCTAACCAAATTCCATATTTC GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA TATATCAGGACAGTCATCTAATCTGCTAGTGTTTAG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA TTGGAATAGTTAATACACAACTTACTTTTGAAGATTT GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA TTAATAATACCTTCCTGCAAATTCATAATTTTTTTGA GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA TTAATTTGGAAAACCTATATGAAAAGAGGATAGTGCA GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA TACAGCAGTTGCAAATAATGCAACTGCTACAGTAC GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA TCTACTTGGTTAAATGAATTAAGGAGAGAATAATAAGATATG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAA >NZ_CP009268|1|1|699979-700538|CRISPRCasFinder GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT CAGATAATGCTACATGGAGAGGGGCTATAACACAAG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT TAATCATTATTTTCTCCTAACCAAATTCCATATTTC GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT ATATCAGGACAGTCATCTAATCTGCTAGTGTTTAG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT TGGAATAGTTAATACACAACTTACTTTTGAAGATTT GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT TAATAATACCTTCCTGCAAATTCATAATTTTTTTGA GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT TAATTTGGAAAACCTATATGAAAAGAGGATAGTGCA GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT ACAGCAGTTGCAAATAATGCAACTGCTACAGTAC GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT CTACTTGGTTAAATGAATTAAGGAGAGAATAATAAGATATG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAC >NZ_CP009268|1|1|699979-700538|CRT GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT CAGATAATGCTACATGGAGAGGGGCTATAACACAAG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT TAATCATTATTTTCTCCTAACCAAATTCCATATTTC GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT ATATCAGGACAGTCATCTAATCTGCTAGTGTTTAG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT TGGAATAGTTAATACACAACTTACTTTTGAAGATTT GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT TAATAATACCTTCCTGCAAATTCATAATTTTTTTGA GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT TAATTTGGAAAACCTATATGAAAAGAGGATAGTGCA GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT ACAGCAGTTGCAAATAATGCAACTGCTACAGTAC GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAT CTACTTGGTTAAATGAATTAAGGAGAGAATAATAAGATATG GTTGAACCTTAACATAGGATGTATTTAAAC
>NZ_CP009268.1|WP_003448320.1|696916_697723_-|AAA-family-ATPase MYKAFYGLTFDPFDKNLDLKYSFKSEDFSKAMNRLEFLKSVLGIGVITGEPGVGKSFLLRNFVDSLNPNLYKCVYIPISTLTVMDFYRALCDGLGIIHAQKKVTMFKQIQESIYTYSHSKNVIPVIIIDECQFLSNSILDDLRIIFNFHMDSKNYAMLILSGQPNFLLQLSRQVHEALRQRIIMNYCLKGLTHDECKPYITSMLKAAGCSEPIFTDDAFELIYSSTNGAIRPLNSLTRMCLISGANERLTSINSDTVYKSQSEIDLTI >NZ_CP009268.1|WP_004455390.1|695991_696297_+|DUF4325-domain-containing-protein MEKVIKVIDLLNSISADDDEKGNKVFNSIVNSANEKYDNIILNFEGISLINTAFLNNAMGKICGLEEFESGKVNVKVANFPKEAIELLREVLKTASEKYSK >NZ_CP009268.1|WP_143756617.1|694719_695991_+|hypothetical-protein MMNCIIYFLTDYYQKSLRSLAQTQADSYEEVLDKYKKIFISHLNYVKNKKCNFESCKFGCNNECSNLKEIIKNIDVNKIQDFFDTIKKIYINWIDAKTSDSLNELKTLLHNFKMIDFKAEDITKELFFKGRLSEQILTTWQMFHIPFNKRYLISNQRYSLTGQPLIYLGKSVIDVVEELEVSQEQLSLLKVSTFEIKENLRVYDLRNDIYNDVINAKIESRILGNDSKEIINEGKFFKNILSSICSFQKRKEHRNFSFCEEYVLPQVLAQTLKNELFHGIIYHSTKKFNNINFEISSEEDSWIQYIKRTKYKENVALFTHFNDEHVYDRNLYEKLTISTPIDIAKLNTIKIDDLKNIQAEINQTKKQDMISICETLLSKFDREFSQCCINEKKYRETNIGQLHIYHLYSIFNRILTQCNEEVK >NZ_CP009268.1|WP_004455387.1|694513_694711_+|hypothetical-protein MAELNKWFYNEKNVNEIDISDSLIINSFFPGTLITISIDYDKNEGAYENYFVKEFDLFQIFNIKE >NZ_CP009268.1|WP_004455386.1|693923_694526_+|hypothetical-protein MNIYFPKSLKSDKKGIEFISYVWGKCKKIYSYKIFWNLRFTSNIETNLLSVLGIIIDKLMKKGNKIFIELRDNKGILRTISSNIIEELFMKYSEFKFKALQYKYINFSIVNNEIDKYLNEDLKELRLKEFEKVKIILSELIANIKMHASSKQGSISAFIDIKKDELVVSVCNIGKTIKQNIEEKVNYNFDNDLDAILWLN >NZ_CP009268.1|WP_004455385.1|693176_693656_-|hypothetical-protein MESKSYYSKRVNCIILSILCWVLIFLICTKVLNDPDMITDTAVIILRIVIVVLVVVGLTTFIKAVDKRPIVTISKEGIEIQSFIFSNIFIKWDELKGINREKYTQLVASSSLVGFSTNYMLRFHRKQGRSVAVNLSLLDTQNNDFFKTLGDYIKMYKNA >NZ_CP009268.1|WP_004455384.1|692398_693106_-|hypothetical-protein MKTYKLSPEGLNKSISKILLRIIPLSLLVLVAVLYMNSANNSTSITTFFIIVILIAVVLTISIQRGLKNQKESLLSYELVISDNSIVKKQLSLPTIEIEYSDIITIEEITYKGLIIKTKDKYKVIGIPYYLIGYEEVKNTLSQYADIKKSTTPSLIKTSQYVLPILVVLALIIIIKSNNKYLVLPFGTAYILLSLWFIIEIFRNTQLNSKLKQKYLFLIFPLLAVILKMIIIFSA >NZ_CP009268.1|WP_004455383.1|691261_692287_-|LCP-family-protein MKKKKIFVPIIVVLLIIAIIGGGAYLYIDSKLSKMKTTEISKKPSDLGIDTKQFDQNTSKDIDKNYVNILLMGSDSRDPDTDPGLVDSIMILTIDKAHNKLKLTSLMRDMLIDNVVGEGVTEGTTLDRINVIYKQGGGKNGGGQYSIKAINSNFDMNIKDYVKVDFTHFDRIIDAVGGIDMYVSSSEVDVANNYIREVAKINGVTPKLLTTGGMQHLNGIQALGYSRIRYVGRQDFQRTERQRAVLTQVFSRLASMNPAEASTALDTIFPDVETSLSKTDILSYITYVITNKITTINQFRLPEDKAGYSFSKYIKGTYFLGWDKDKNVADLHQFIFEGDLK >NZ_CP009268.1|WP_004455382.1|690575_690935_+|hypothetical-protein MILYHFSNGKCDRLIPNLSSKRQLTEGNTTKEKITILTTNPNMFYENDNGDNFFKYRYIVKLDENDPYLHADDKFNGMLEKHNRSFHSKRVAFKWFFYENPLDYSAISEWDKKLCKFME >NZ_CP009268.1|WP_004455380.1|688261_689974_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MNWLKNLKLGKRLVMAFLVMTIYIVIVGAVGAVNMYRLNEGAKELYTVNLQNINNLNKFDANTMKFRLEIINLVESRNKDGIENTKSTGAALVSENNKILSDYKSSTLTQEEKALLDELDSKMSNWRAMCNNTINLMSDGRYDEAMNLSKESAEYRSEITKTVDELIVLTDKQAKAQYDNNISIFNVSIYIIAIVTLAGIAVAIIMGNRISSFLVGKINKILSFTDSMSRGDLSKSLEDLGSDEIGSIGRRLNKANDNIRTLVKEINDSVENMTASSEELSATTEEISTMMNVVNEAANRIAEGSENLSSVTEEISASSGEMDNNTERLTTKADETNKSSLEIKERALGIKEKASLSIEEGKSVYSEKEQSIVEAIKAGEVVSEVKVMAESIGNIAKQTNLLALNAAIEAARAGEAGKGFEVVAEQVKKLAEQSSNSVVSINNMVMSVENAFKSLSESSRGILDYISRSVQPTYQLLMDTGMQYEKDAEFINTLAKEVDYSSDEMKQMVSEVSGAIESAASTAQDSAEECQEIQSSVEEVTKAVNDITTSSQDLARLSQDITGMVKKFKL >NZ_CP009268.1|WP_004455545.1|700774_701947_+|C40-family-peptidase MNKKPIILLLAVAVSIGLILPAKYTYAATSHKTVISKSKSKPSPNLKSMTCIDTPRSGSFLNKNTLIGGWALNKSGVKEVQILVDGKFKGRAKIGISRQDVARVYPAYKNKNSGYNYILDYRSIGQGTHTITVKAIGKNNTSNTNSIKVNVNKLAPIVWIDTPTSGTNINKNFNVAGWALNGSGVKQVQVYVDNRLIGNAVIRKYRPDVARVFPKYNNRNSGYSLTISKDKIPSGNHTITVKVKGNDGVITSKSVKIKKAAPVSTKSSANKGQAVVNYAEKFKGIKYVWGGETPKGFDCSGYTKYVYNYFNIKLPHNAAQQYKYGKYVSKNSLKPGDLVFFGKTAGSIYHVGIYIGSGNYINEPKPGDKVKITVLRYMPDYYGAKRLISQ >NZ_CP009268.1|WP_004455544.1|702027_703008_-|LCP-family-protein MKKKVIIIPIFIILAFIIAFGAGTYFTINSKLSKLKTTNISKNATDLGIDTKQFNNTVEDNYVNILLLGVDTRDANTDTGRSDSIMILTLDKAHKKIKLTSLMRDLLVTNVGSKSQDKLTHAYAYGGPQLSLKVVNENFNMNIKDYVKVDFTHFDKIVDAVGGVDINVSDAEVKVLNGYITELAKLEKVTPQYLTSGGMQHLNGMQALAYARIRYVGDGDYQRTERQRTVLTQVFSKISSMGLTEASSMLDTILPNVETSLTKSDILSNTSYVLMNKINTVNQYRVPNDKPGYATNRMINGVFYLDWNREGNIADLHQFIFEGDLK >NZ_CP009268.1|WP_004455543.1|703602_704271_+|sugar-transferase MQNLELDKEVDVDLYRDRYSKSFLYYAGKRLIDICGSSIGLILLSPFLLVIIIAIKLDSKGPVIFSQERVGKNGRKFKMYKFRSMVVNAEELLIKLKDKNEMSGPMFKMKEDPRITKVGKFIRRTSIDELPQLLNVLKGDMSLVGPRPNLPREVAKFSDYHKLKLLAKPGLTCYWQVMGRNTIGFEEWMKLDIKYIEERNLWVDIKLIIRTFFMLFGDKNAH >NZ_CP009268.1|WP_004455542.1|704308_705616_+|UDP-glucose/GDP-mannose-dehydrogenase-family-protein MKIVVAGTGYVGLVTGACLSEVGHSVTCVDIDEKKVQLMKDGISPIYEPGLDELLKKNHEQGRLNFTTDYKAAYSDADVIFIGVGTPEKSDGSANLDYVYIVARQIAQNITRDCLVVVKSTVPIGTNDEVEEFLKDNLVKDVNIEVASNPEFLAQGTAVKDTLHAKRIVVGVESENAKNIMTEIYNRFNQPIVVTDRRSAEMIKYASNDFLALKISFVNEIANLCELVGANIEHVTEGMSYDTRIGDKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLADGWGYEIKTVKATIDVNENQKFRLIRKAKQKCKILKGLKVAVLGLTFKPGTDDLREAPSIPNVKMLLEEGAEVIAYDPVGEDNFKKLFPTEITYVQNPEEALKDADLAFLFTEWKEITGISLDKYKELMKKPVIFDGRNCYDLEEAEKAGVEYYSIGRPAVKS >NZ_CP009268.1|WP_004455541.1|705641_706691_+|mannose-1-phosphate-guanylyltransferase MLCALIMAGGKGERFWPLSTDEKPKQFLKLLGEETMIQMTVNRLKDLIPVERIFVVTGERYTKLVKEQLPELPQRNIIVEPMGKNTAPCIALSAFHIEKYYENATIAVLPSDHLIRNEEEFRNVIATADSFIEKHEDSIVTLGMKPDRAETGYGYIKCDKTDSIVKGLKIRNVEMFVEKPDEETAEEYLRDGNFLWNGGMFVWKAKNVLTLTEKYLKNTYDVLKEITCSLEEEYEEKLKTNYNLVDSVSIDYAIMEKAESIYVIPSEFGWDDVGTWYSVERYRDKDENNNVCVGNIININSKNNIIVGNNKPVIISGLDDIFVVESDDVILIGKKDDIKDIKDIKKTVL >NZ_CP009268.1|WP_034829769.1|706705_707818_+|glycosyltransferase-family-4-protein MKVALVHDWLTNMGGAERVVINFKEIYKDSPIYTTLYNPEKLDEELKNIDVRTSFLQNEKNLKKGHQSLLPFMPMAFESFDLNEYDIILSSSSSCAKGVVTNPNSMHVCYCHTPMRYGWEFYYEYANNWDMKKIKRNMLKYFINYIRVWDNVSSNRVDYFIANSQNVARRIWKHYRRESVVIHPPVRCKLFNISDIDEDYFLILSRLVPYKKVDLAVKAFNELGLPLVVIGDGVERQKLESIAKDNIKFLGRQPDSVIKEYYSKCRAFLFPGDEDFGITPLEAQASGRPVIAFGKGGALETVVENQTGVFFREQTVDSLKDAVKRFEGVKFDKQAIRKHAEEFDEEIFKEKIKSFIENSYVNFKKSFNVL >NZ_CP009268.1|WP_004455539.1|707830_709039_+|glycosyltransferase-family-4-protein MNILIVNTYYFPNIIGGAEISVKKLAEGLVANGHEVHIICTDVKDDNEIINGVNVHRIKLSNIYQPIELRNKNILKKMIGRINDIYNMFNRKKLKEAILEISPDIMHVNNIYGISPAIWNLAKDMEIKLVHTIRDYYLMCPKISMLKENKICNKKNIVCKVFCNINRNISNKVDFVTAPSQYTLDTFINDGFFNLSKKEKVFNAIDFDQKMVREIYFSKNFNISNDKIIKFVFMGSLNKNKGIDLLLKAFSEVRNKEIELIIAGKGPLEQMVNEYCNMDKRIHYKGFLREEKINAILRESHVLVAPSVWNEPFGRVVIDAYKNCMPVIAGNYGGLKEIVKNDFTGKLIEPNNKNEFIKTIEYFTNRSIIKQMLKNCMDELAEYSIQKQVEHFENIYKICLED >NZ_CP009268.1|WP_004455537.1|709082_710126_+|glycosyltransferase MKTCFCPYESKLNKYVEIIQDCLKLKNIEVYSIKSVLSNRKLFKEVSIYNFNWFENVDKSKIKMIPKIICKILFIKYLRIKKKKIIWTMHNKEPHNSKNNLLAQFMIKFMAVNSQKIVVLSNESKVTLKKFISEEEIEKKVKLIAHPNYLGSYKNSKVDDISNNNYLNLLFIGRVQPYKNIELLIDVSNSFYNKNVNFIIAGKPNTSEYGEMLKKSIKNKNIKTKFSFIEDEEMISLIKMSDAIILPYDIQSSLNSGTIMLAFSNKKTVISPLIGTLKDIKNENLYFTYEYSSQEEHKKKLKEAIINVTKKSRVEIRNMGERCFDYVKEHNSKELIAEKYEELYNNL >NZ_CP009268.1|WP_004455535.1|710140_711148_+|glycosyltransferase-family-2-protein MKKVVPIVIIEFNSYARTIKYIYDFLDSVIYEKVSFIIVDNGDSDNNYNSIKKEIKNKFESKYELNILENNDKRIKKAIKIIVKIKDIYIVDIVLIKAKENYGFAIGNNIGVSIAEKIYKVDHIIFSNSDIRFNESFNLKKLIEKLKSDSQIALVGPKIIGLDNEAQTPCEEKTIMERWNLLSIVWPLNRIFKIKFLNTSDDVIHINENYIPYRILGAFMLFDFKKFLEINMFDENTFLYAEELIIAEKLKQLDYKTYYCNSQILIHEQGGTTKKVLNNINKIKLRFNSEMYYYSRYKKVNNKIIFITKVLFNFYIFKLNIYHYFQNKFMKKINL >NZ_CP009268.1|WP_004455533.1|711317_712238_+|glycosyltransferase MKIGIIIVTYNRKECLLKSLKLYEQQSKLPSYILVVNNNSNDGTEKVLNDWKNDEKHFKKYVINLNNNIGGSGGFYTGLKKGLELDADWIWVSDDDAYPEKDALENIYKYVKSNDEKTIHKISTICGQVINNNKIDESHRKRLKKSFLKIDFIPVNKNEYDKESFELELFSYVGSAINKRYLKQAGLPEKDYFIYYDDTEHSYRLSKKGKIICLPSVKIIHDVDSRTSCDVDWKKYYGMRNRLLFLKKHFNIRYYIYSYVTQIIKCAIRDIIKSSLIENVQIRDALKDSRQNVLGLHSKYKPGWKP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009268_2 | 2831919-2834380 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP009268_2
|
37 spacers
spacers of NZ_CP009268_2
>2.1|2831949|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTGGTAGTTTAGATACAGATATAAGTCAATATGTA >2.2|2832015|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATGCTAAAGTTGCATTAACAATCATTTTTTGTGC >2.3|2832081|34|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCAATTTTATACCAAATGCCGCAGATATTTGT >2.4|2832145|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATACTTTTATAATTTCATCCTTTGTAACACCTTCC >2.5|2832211|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATAGATAAATTCACCTACCTTTCTATTTTTGTTTT >2.6|2832277|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGAAGAATATGAGCTCTTTACAAGTTCATTAATT >2.7|2832343|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATCTCTGCCAGTGCTATGTTTGCAATTGGTAAAGA >2.8|2832409|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTAACTTCTGAACACTCTTCAATCCATATTAT >2.9|2832474|37|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCACTAAATAAATAAACTCTATCGCCATCTTGTTTGG >2.10|2832541|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTAGGTGATTGCCAAGTTCCGTTGGAGTTCCAAG >2.11|2832607|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATATTCAAAACTAATTCCTTTTTAGTCATTACT >2.12|2832673|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAAATAAATTCAATTCTTCCGTAGAAAATGAAA >2.13|2832738|34|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATACATATCTCTTTGGTATAATTAGCTTCTC >2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATATGAGTATGGTCTTTATCACATTCTATTGCAA >2.15|2832868|37|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAACAAGAAACAAGTCTTATCAAATATGAAATGTC >2.16|2832935|37|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTTTTCATCGCCAAGATCAGCATACCAAATTTGC >2.17|2833002|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACTATTAGCAACTGCAACATCTTCTTCAACTTTT >2.18|2833068|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAATGTATGCTTTGGTATTGCACCTATCCTATTT >2.19|2833134|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTTTCTATCTCAGTCCAATACACAGTAATAAT >2.20|2833199|34|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTTCATCGCAATGAGGACAATCAAATTTTAC >2.21|2833263|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATCACTTCAACTTCCTCACTGTTTACAGTTACAA >2.22|2833329|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTTTTCTGTCAAGTTCTTTTTTTATTTTTTCACA >2.23|2833395|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAACTGGCTAGAAGAAACGAAACGGATGTAATAA >2.24|2833460|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAGTGATTCTTCATCCTGATAATTCCACTTAGT >2.25|2833526|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCTATTGTTACTGGTGTAGCTTTACCTGCTAGC >2.26|2833591|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTCTTTAAAATGTCTTTTGTGTTTAATACATTAT >2.27|2833657|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACAAAGGTTAATAGCTTAGCTTTTGTTTTGAGG >2.28|2833722|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACCTGTTACACTAAATTCATCAACCAAGATTTT >2.29|2833787|37|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACTTTTTCTCTGCTGTTAGACGGTATATCAACGCA >2.30|2833854|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTTTGCCTTTAATTCTTGTTTCTTGCCATTCACT >2.31|2833920|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTAGATGCTCTCTACAAGATATTGAGTTCACATAT >2.32|2833986|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAAGGAGCATAAGAGCATAGATAAAGATGACTG >2.33|2834051|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAACTATACCATCTACAGGAAGATGCAATATAGTC >2.34|2834117|37|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGACTGGCATTTAATTTTTTAGCAATTTCGACCTG >2.35|2834184|37|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTGGTACTTACCTTTAAAGCAATGCTGTTACTCAA >2.36|2834251|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAGTAAGACCACCAGTAATTGCAATCCCTGTCCA >2.37|2834316|35|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGAGCAAGGTAATGTAATTTAGATACTTAAAATT |
cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009268_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009268_2 >merge|NZ_CP009268|2|2831919-2834380|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NZ_CP009268.1|WP_003442548.1|2827000_2827708_-|hypothetical-protein MNIFQCDFKVYLLKNIFKKDIQECLSKLIDKSFYENPSMKNFHDENKIKKYSFNQLYPVEKNGIYKEGYIYNFQVRCIGEELKDHFIRHLTNEYTSNMKILTSISKKIIKRPIDRIYSISSLIVKIADTEKTQYWRNNHNEEDFFEYIRKSCIKKYEMLTGEVLDKELRLFNYERIDNVKPIATKFKDKKLLGDKVTLNIETSNEAQNISYMLIGTGVADMAPRGYGFINYQYVK >NZ_CP009268.1|WP_003442547.1|2825244_2826981_-|hypothetical-protein MINEICEVFNREYEKLEDNMITDDYTLALGDYARFTLEDTYDTLEFFKVDKNTDVEQDDYKYFAKLDLMSTLISMNKPIDSKKIIHSNNIYTFFIKKDNLDPKNGKLNDDIIDEYYNILKNPSLKYKNKRKSMELYLEMEEAYGKPNIELIDKINFWIKENIFSMEKQFSNEKTYLKLFYDTSLENYKGESEKYILPNIYNSTDYNVKINGKVYGLPDFNMGLNSKKPYLENKTRKSKLPILVARDKIIIQKKLFDYLMNHSAQGKNYLYIDKEIEGVSPKENNKNNFQGYFLRVTKGKEVQIEDSDSITRYNYNFINSIKVIPILEDGVGKDFKLLKGQLKNIGELKIAIDEVFFYKWLNGNLFTEAKKISINDSVLKRILIQLRYGFYTWFYKGDDSIVRSFWNKVTKEILYNSMSEGNINGAINQFNLRHTLLDYFENKNGGENMARIIENIRRDVDEKINIIKDEEYKVEIDNDKEYYFCIGQLMRYFYVINKSNSKNYSFLRPLLVANDDKFMKEQLKRLFVKYSYAITGSIRFNNMYYMVSAYESKEVVDQDTFIAGFLCPNLILKKKEENN >NZ_CP009268.1|WP_003442546.1|2824278_2825223_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MNRVYGVIGIKAIMANWNADFSGYPKTTNDGSIFGSDKALKYSIKKYWEDRGERILYMKSYKVDKDKMRPRSLEERYNQLFNTTLKNEDSTTVIKNLFSATDVKAFGATFAEEGNNISLIGAVQIGQGFNIYKKAFPEEQQILSPFRSDKKPKKGDEAKEANQSTLGTKITTDEAHYLYPFYINPISYNNYVEMDATEGYTEEDYKKFKEAALIGATALNTNAKAGCENEFAIFIETEEDTYLPNLAQFITFDEEDGNEASSRTLKFEQLNSLLDGVRDKVKNIEIYYNNYSLNIKGDTLEGARKFNIFTRKEL >NZ_CP009268.1|WP_003442545.1|2823537_2824275_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MQVIRFKLSGKTAFFKKPDVNTYYYFTYGTIHKIAVLGIMGSILGLGGYNKQSENSKNEVYPEFYEKLKESKIAIITCNDKGYITKKVQSFNNSVGYASLEQGGNLIVKEQWLQEPKWIIYVKIDEATEKFAEMLENKKAMFIPYLGKNDHFADITEPKRLNLKKSDNSNTVDSLFITKNFQVGNATINRKILSWKYQEYLPVSLDEELNQYQFEDFTATNKKVLSNSNVDLYRDDELDKVVYFF >NZ_CP009268.1|WP_003442544.1|2820886_2823514_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFNNIDIFKVKDHIDNLDNIYAHTNDKNPNEKEEKLTEHTKRTHDYFIMLVKQKNLENVFINLEKIFFQDKNIELINLWKEMTINCICMHDIGKINPGFQCDVMKNERYKHNNADDSKHSLLSSYFYISYFDEKIQNSLLSEEDKDYITYFMYINAYLISRHHGYLKDFREYKNSYEGHEGNSQEEINEEKENNFPDLKFNVLEKCICEVFLEDSFNEITYNRLKKNDKFNFNIYIYSKLLFSLLTASDYYATSEFMDGQKIADIGIITEELKGKFKNAFDNYAITKEIRNYGKNPVLDENYENINQLRSEITLESEKNYLKNKDKNIFYLEAPTGAGKTITSVNLASLMLNSDNRLNKLFYVFPFNTLVEQTEKGLMDIFQNNDEIKQNISVINSLTPIKTVDENEDYKDFKSKEDNKKIDYKRSLLNRIFLHYPFIITTHVNLFSYLFGTSREEGFPLIDICNSVIIIDEIQSYKNGIWKEIINFFNSYAEILNIKLVIMSATLPRLNKLVEGENDNFVYLINNRKHYFENHFFKDRVKFEILDLSKVDKDNKYEDAFKILSDNIEMESKSDDKILIEFIFKKSADRFFDYFKSNYDFKNTTGHEIKIITSDDNKIDRLEIINLAKEKNRKVIIVATQVIEAGVDIDMDLGYKNISILDSEEQFMGRINRSCLNAGRVKFFKLDSCGILYQSDVRKEKRFTLEDENIQGILRNKDFESYYKNIISEIEVRKKRKNDSGYLAFIKELNRLNFDKIKDYMKLIDEKVDQNKYTIFLSREIKDLHGNIIHGNEIWKEYENLLMDNKIDYAEKRVRLSEINSKLNYFIYKVKRVEQYNEVLGNIFYIENGEEYIVNGRFNNEKFIGETPDQANLIL >NZ_CP009268.1|WP_003442543.1|2820255_2820750_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKITGTIINYYFHCKRQCWLHANRINLEDNSEEVRIGKVLHELKAEGKKNTEISIDNIKIDKITEDYLVEIKKSDADSEAVKWQVLLYLKKLREKGIERKGKIEFIEKNKQDKKIIYIELTDKNEKNLNDFLYNIEQFLIEEEPPAVELKPKCKKCAYYEYCFI >NZ_CP009268.1|WP_003442542.1|2819064_2820066_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGKGTRFIMSQGEITRKDNSICFRRNSKNVYMPIEAIREIYFLNEVSLNTKFLDFVAKAGVVIHFFNYYGYYSGTFYPKEYLISGKMTIKQSEAFINNRIEIAKAFVKGIAANIYEVVYHYYKHDKKETKLFLDWIKKDFIDLMDKSSDIKQILFLEGQVWMQFYDNFKYFLPENFLMNKRVKRPPDNPMNAMVSFGNSILYARTISQIYHTHLNQSISFLHEPSEGRFSLSLDLSEVFKPAIVFKTIFDLVNNKRIQVSKHFDKKLNYCLLNEAGKKIFVEALETRFNNVFQHKKLKRKISYETAIKLDGYKLIKHLIEKREFTPFSLKEMM >NZ_CP009268.1|WP_003442541.1|2818775_2819063_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MPKEVNYNYAFVFYDVNEKRVNKVFKICKKYFKHHQKSVFRGNITPANLIKLRAEIKKIIDEREDFVSIIKLMSENSFREETLGVNANNSESLII >NZ_CP009268.1|WP_003442554.1|2834603_2835152_-|O-acetyl-ADP-ribose-deacetylase MNYKKYSSKIEIIKGDITKIQVEAIVNAANSRLAGGGGVDGAIHRAAGGEELHRECIKIIEEKGNCPPGKVAITSAGKLKAKYIIHTVGPIWRGGNNNEEETLSQCYWNTLKLAIENKIKTIAFPNISTGIYGFPKLPAAKIALNTVSKFVEENKDIEKVIFVCFDEENWGIYRGMLNSARK >NZ_CP009268.1|WP_003442556.1|2835335_2836118_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MNINSKNIIITGASSGIGARLLKKLLNYDVKIIAVARNIDMIPNNDKVIPFSCDISRQEEIDKLFEYAVNVFNHIDIFIANAGFAYCEEIAEANWQHTEEIYKTNVFSPIYSTEKMKEINVNKPYHMVITCSAVSTFPLPGYSLYCSTKAAMHMFAKTYRYEMRNRGRLTLVYPVATRTNFFTRAGGNDAPIPWPVQSVNIVADIIILGIKLNLKSIYPSVLFIIGSIINRIVPILFPICSKIFSINFYRWLKKNNMKPH >NZ_CP009268.1|WP_003442558.1|2836233_2836605_-|VOC-family-protein MKFKFDHYNFNVLDLERSLSFYREALGFEEVRRHNAEDGSFILVYLGDKETGFTLELTWLKDRKEAYNLGESEFHLAVKTDNFQDAHEHHKKMGCICYENEAMGIYFIMDPDGYWIEIVPNKK >NZ_CP009268.1|WP_003442561.1|2836860_2837601_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MNNYRAKINYLYNSGFTVETENYLLIFDYYKDSVSKGIKSIENGAISELNLKIPKKIIVFSSHSHFDHFNPVIFTWKKIRPDINYVLSNDITNIDNKDTNINILSPYEDLYLDNIYIKAFSSNDLGVSFLVKVDNINIFHSGDLNWWNWWDENGEFNLSMEKSFKSEIKKLEGIDIDIAFCPVDPRLKEYYYIGGEYFIKELNPKLFIPMHFGSKFSITTKFKEKVKYTNTTIIEIQKRGEEIIYS >NZ_CP009268.1|WP_003442563.1|2837713_2837977_+|hypothetical-protein MDKSLEETKQLNQKSAANKGNASAANSNFSNVTAGSSLEETRQLNQQSAANSGAANSSFSNTTASNSNLEETRQLNQKSAANKGTSK >NZ_CP009268.1|WP_003442565.1|2838195_2839086_-|DUF2156-domain-containing-protein MLQFKKLDLEDKELFDKYLKPFNFKSCEYSFTTLFIWKEACNIEYAVYDGVLILKKMDFNGKTHFMQPIGYDKNQLKEIFQVLDNYKIKNNMDYLFKDLECEFVEDLREYCPVEREIIEDRDNFDYIYPSNSLISLAGKKLHGKKNHYNQFVKNYDYYVKNIREVPIENCIESINKWLMHKGDVIDEYLKYEAQGIEAILKNKDKLEYNGIVVYVKDDIVGLTIGEKVNEEMAIIHIEKADPEIRGLYAFVNKTFVEQCFSDVQVINREQDLGKEGLRKAKQSYKPFEFVKKYIIQ >NZ_CP009268.1|WP_003442574.1|2839276_2840110_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MEILLLVFGSSFAVFFITMGMNSIIKRNSKTKFYFIGVIISFIIAFIGFWKIPINTENNLSNKNDVTMSKDQGSIITNLEAMDSQAVSSVIKNNPLNVSFINNGLNGAVLIQFDGKNILVDSGKTDNIKYIEDSLKGHSVKNIDSIILTTSDEDSIGAAADLIKNYNIKDIRYIEDSIKNGKSFKDIQSSAEVNNTIVKKIDSSYSINNAIISTSSITKGVKVDFKFPEDQYDSSIQAMSFVKDSFNNESNQNLRHSVTTSCDSLGNIVVSVAAYRN >NZ_CP009268.1|WP_003442575.1|2840187_2840931_-|SDR-family-oxidoreductase MGCLDGKVVLVTGSSRGIGRHIAIEMAKEGASIAINYLKDEVGAKETLMILNREGVYAKEYRVDVRDFEAVTAMMKDIIENFGKIDVLINNAGVSKIGLFMDHCESDYNEVFDANFKSVFNCTNAVIKYMLEKKKGSIINISSIWGNVGASCEVLYSASKGAINSFTKALGKELAPSNIRVNAISPGVIDTSMNSVFSDEDIKNIKEEIPMMRFGRCDEIGKLAVFLASDNSSYITSQIITIDGGML >NZ_CP009268.1|WP_003442578.1|2840962_2842066_-|rod-shape-determining-protein-RodA MRKWIIDARLLRQLDITLIITALAISIFGVMNIYSASGISYLRTQIIFIIMAILICYVILLIDYNIMSNYSEIIYWIGVVLLLATDIQDMSVNGANSWLKIGPLPAIEPAEFFRMALALIIAKKISYMEGDINRPKNLIKILFYTAIPTIMLYKQPNLGMAIICICISFGILFISGLNLKIIFGAIALIIPASFIVWKAHILKAYQMARITSFLHPELTEQTTGYQLTNSKIGIGSGGILGKGFLHGTQVAGGYIPEARTDFIFSAVGEQWGLIGAIVLLALYVIILYRILVTARNSKDNLGRFICIGTFAGLTFSIYQNIAMTIGLAPISGITLPLMSAGGSSIIANFMALALVLNVGMRKKKINF >NZ_CP009268.1|WP_034829953.1|2842201_2843329_-|rod-shape-determining-protein-RodA MGVSNLKKWIIDIRLLRQIDVPLVVVTLAIAIFGVMNIYSATRISSGTFYLRTQVIYILVAIVICYIILLIDYNLISNYSDVFYWIGIVLLLATELQGTVINGSNSWLKLGPLPAIQPTEFLKIALIIIIAKKVSTMDGSINEPRNLIKIIVYTMIPLILILKQPEMGLAVICIFIVSSILFISGLNLKIILGTIALGIVVCFIAWEVLLQPYQIARITSFLNPEAHQQSTGYQLINSKIGIGSGGFWGKGYLNSTQISGGYVPFAHTDFIFSVVGEEWGLIGTGTLLISYGILLYRILKISKMSKDILGKLVCVGTFASLTFSIYQNIAMTIGLTPISGITLPFMSAGGSSIISNFMALALVLNISMRKKKINF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009268_3 | 2991738-2991839 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009268_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009268_3
>3.1|2991762|54|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder CCTGAAGCTTCATCAAAAAAAGAAAATTATTCTCATAAAAAAGAAAAAACAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009268_3
The CRISPR arrays of NZ_CP009268_3 >merge|NZ_CP009268|3|2991738-2991839|CRISPRCasFinder ACTAATAATCAATGGACTTCAACACCTGAAGCTTCATCAAAAAAAGAAAATTATTCTCATAAAAAAGAAAAAACAGCTACTGATAATCAATGGACTTCAACA >NZ_CP009268|3|3|2991738-2991839|CRISPRCasFinder ACTAATAATCAATGGACTTCAACA CCTGAAGCTTCATCAAAAAAAGAAAATTATTCTCATAAAAAAGAAAAAACAGCT ACTGATAATCAATGGACTTCAACA
>NZ_CP009268.1|WP_003442933.1|2990932_2991259_-|hypothetical-protein MKFPILSKNSSLNIDNDNYTLEQLSEKLEIEQKELNKAIMEDRNKGVIAEELFDTIQTCIGMLNKLSEDGIDMRYLALKHEKKLIKLGWRWRGYIEFKTMIMERNLKK >NZ_CP009268.1|WP_003442931.1|2990172_2990766_-|hypothetical-protein MNNKDYLGKLFRTFDDFVSLVASRELEYIIFDAKYTTYFNNKMRKVLNEINRSKRDLELFVMFNTRGEIAIIDSKIVGKYIANYYNIQMEKYYKDIKLNKIVWDVINGKSKTKTKRDFMVISYKIIYKVLNEIYMDIKCNKSILNEYKFRYGLENYSRKNISTIVISILILEDICNYIGIEEDILLDYLRKIYDDNI >NZ_CP009268.1|WP_003442928.1|2989623_2989977_-|hypothetical-protein MNIVDVFTKSITNDEIEHKYEYRITKSNIEIYNYGVNNDVQSYGIEIERKDILNGKTINLERDSVYNISPHRHKVQQLTKLLYDNEVSPINAIEILGDYVDEYIIDFDNVLKEISIG >NZ_CP009268.1|WP_003442926.1|2988868_2989243_-|holo-ACP-synthase MILGVGIDIVEINRIRDAIEKNSLFLKKVYTQNEIEYLKSRNLRPEYAAGRFAAKEAVSKALGTGFMQFSIRDIEIDRNVKGKPVVILKGKAKQIANKFGDYKIHLSISHSKENAIAYAILEVI >NZ_CP009268.1|WP_003442924.1|2987368_2988868_-|NAD(P)H-hydrate-dehydratase MKFVSSNIIKKIDNYCINELGISELVLMENAALKVIKNIDLKDNSYFTVICGTGNNGGDGFAVARHLISLKKNVQVFFVGNVEKMTDSCRANYSILKNMEVNIIFIQDLKDIEHLEVYLVYSDVIIDALLGTGINRNVEGIYDTVISTINENSQFTVSIDVPSGLNSDTGDVMGNCIDSNKTITFELYKSGFLNYNSEKYTGEIIVEKIGIPEFVISEFHDGGFVTDKDIFKKKVAVRDKYSHKGNYGRVLIFAGSEQYTGAAYISTEGAVRSGAGLVTLCCDEDILQTLRSKFNEAMTISSKNIEGVNKLLANSNCVAVGPGMGDNENTYKVLNFVLKNSKCPVVIDADGINVLSKDLSILENSKVPVLITPHPGEMSRLTGLPVDYIEKNRIKVAKEFAKKYNVIVLLKGYNTVITKGNSVIVNSTGNSAMASGGMGDCLTGIITSFIAQGQDVIDAAVTGAFLHGYCGEMLSKEMFNVSASDVLDAIPYAIKKLQN >NZ_CP009268.1|WP_003442922.1|2986697_2987297_-|hypothetical-protein MKKILLIFISIVLILIVTGCGKGKNDKSSIAYLKDLKSYTTDMSIEVKNNKQKLDYSGRQMYFLGLGYRLELNNQRVLIYKDDKIYITDLQNGNKYITDMNFDDVYKISFLGNFIDLLYTNERIKTSYKTVNGKKYELINTDMPDSNRNISHGILYVDVNKKIPQKLVVYDIKENEKFIVNYKNFVPNCSVDKSLFRVN >NZ_CP009268.1|WP_003442920.1|2985479_2986640_-|alanine-racemase MFKHLRPVWAEINVDNLEFNMRGIKKLSKSNEIFGVVKADAYGHGAVDVAAVLLENGVTRLSVAVVSEAVELRRAGIECPIMILGYTPLSLADEILKYDIEQTVFSYEYALKLSSIAEKRHIKVKIHIALDTGMGRIGFLPDGKSIEDVYKISRLPNIEIEGLFSHFSTADEENKEYTYRQFEIFNSFYKKLKEKGVSVRIRHIANSAAIMELPNTHLDGVRPGIILYGYYPSGEVDKSRLELKPVMTLKTNIVHIKTLKKGEYISYGRKFTCEKDSIIATLPVGYADGYTRLMFGKAKVIINDKFAPVVGRICMDQCMVDISHIPEAKVGDEVILMGQSLNCKFDADDIAKNIDTINYEVVCMVSKRVPRVYVKHGKVTKIRNYV >NZ_CP009268.1|WP_003442919.1|2985038_2985359_-|CopG-family-transcriptional-regulator MSSSKRLVVNLSDTLCSEFDKALKEDCKKRSEFIREAIILYIEEKKKINFMEEMKKGYMEMSELNLEICEMGFCSDIKELKEYEVKLSESDLPDDDGGETRRYILC >NZ_CP009268.1|WP_003442918.1|2984722_2985073_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MVVKRGDIFYADLSPVVGSEQGGIRPVIIIQNDIGNKYSPTVIVAAITSQINKAKLPTHVEISSEEYGLNKDSVVLLEQIRTLDKKRLKEKIGHMTESDMEKVDKALLVSIALKCD >NZ_CP009268.1|WP_003442917.1|2983529_2984351_-|transketolase MQNDLKLLKENAVKIREDIITMLTESASGHTGGSLSAVEILTTLYFKEMNIDPENSKDENRDRFVLSKGHAAPALYSTLAERGYFNKSELKSLRKFGSILQGHPNMNYVPGIDMSTGSLGQGISAAVGMALAGKIDKKDYRVYALLGDGELEEGQVWEASMAAAHYKLDNLTAFVDHNGLQIDGKCEDVMSPEPVSNKFEAFNWHVINVNGHDFNELIQAIDEARKTKGRPTMIVCKTIKGKGVSFMEDQVSWHGVAPNKEQCDRALAEIRAE >NZ_CP009268.1|WP_003442939.1|2992567_2993686_+|hypothetical-protein MNKKAVSIIMMVALFTIIIGSNCFAAPTTDESAELKQTQNTKKQLEGKIKNLNTQIDDIIEKVDKNKKDMNKIDQDIQKTEEKLNTLEEHSKEQEILFKKRLRAIYISGGGNNYLDVILGSRSVSDLISSMDSISIVMKYDNKLVAQLQEQKNVINDKKKDLDDKNNQLTALKANNESILSNLNNDIKQQNKLLADAKEKENRLIAEQRAREEAEAQAAARAAAAAEQAKLAAAQAQAKKSVQVAQSENTSKKVASNPVSGSTSSPVPINRGAIPSGNSSNVLYMEATAYSDNGFTASGNKTHRDPNGYSTIAVDPRVIPLGSKVYVEGYGYAIASDTGGAIKGNIIDLYVHSDSEALSWGRRNVKVHIIGN >NZ_CP009268.1|WP_003442940.1|2993851_2997202_-|FtsX-like-permease-family-protein MKKTFFKNLFRDIKKSISRFLSIVIIIAIGVAFYAGVRATSPDMKISADYYFNNNNFMDFKLISTLGITEDDIEAIEKLKGISKAEGSYSIDGVIEKNNHSIVVNINSLPDKNSMNRINITEGRTIKSDKEVIVEERFLKEYKLNIGDIIVIKSGNKSNIKDNLKNDSFKIVGTAQSPLYISAQRQISSVGDGDVKGFIYILPEVFKNDVYTEMYVRCNNKESRYSLLKNEEYKNIMTEMEKQLKYAGIERNKIRYIQVLKNAEDKIDEAENKLVISRKEVENKVLQGRSKIEEARDKLNQGKVEFEKNESDFNKKISDAEKQISQGKVNIKIAKENIDLKDREIENGNIEIKKAKDKISHSENKLMESKLQAENRILKQMKAKLEKAKNNKDSMPFNPLYIREYNSIYNIYKNIKGKDFDSIYTNLNDSGFIDIFNGYFDIKVLKANFDKAALDISKGKQQIFTREQLLKEGEIKLKKGKSDVEVNKKRLSALEVKLDKKKKDGIARLSKEKINIKDSEKAINENIEKLNAEELKANSQLKLAEIEIQNNREKLKHIKNPQWYVLGRAFNIGYESFRQDSDRIDNIGKAFPLIFFLVAALVSLTTMTRMVQEKRIEIGTFKALGYSRLAIVSHYLIYSSLASIIGSIIGISFGFRLFPPLIMNAYGSLYTIPHYLTPFNANLALKASLIAIIFTTLASIGAALSELREVPALLMRPKPPKAGKTILAEKMSFLWKRLSFTKKVTARNIFRYKQRFFMTVIGIAACTGLIITGFALKEGIIGAMYKQFNEIYKYDMQINLNDYVDSEKKKNIYNSIIKKTNIKSALFIYSKNASVKEAGAGSEDVYIIVPESKDELNRYINLSMDDSTLTLGDEGVVITEKLSKLINKKVGDNFKINIEGKVVEGKISSITEQYIQHYIYISPSYYKKITGENIEFNSMYGTLYNSSNSSQENTLRMLKTIDEVNSVSFKNNIKVSLNKSIDSINSVVLVLIISAGILAFVVIYNLTNININERKRELATIKLLGFYDNELALYIYRENIILTIIGASAGILYGIFISKLIISSAEINAMMFIKSINFIYCIYSFMITIVFSFIVNLIMYNRFAKIDMIESLKNPE >NZ_CP009268.1|WP_003442942.1|2997204_2997909_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MENFIELKNVKKIYNMGEIIVKAVDDISFSIDKGEFVIILGASGAGKSTILNLLGGMDHVTEGSIYVDGKEISKYNKKMLTKYRREDIGFVFQFYNLVENLNALENVELAVEICKDAVNPKEVLKNVGLEARMSNFPSQLSGGEQQRVSIARALAKKPKLLLCDEPTGALDYSTGKSVLKLLLDTSQNYNMTVIVITHNSAIAPMANKIINVKNGKITSLKKNLKPVSIESIEW >NZ_CP009268.1|WP_003442943.1|2998127_2998808_-|ribose-5-phosphate-isomerase-A MNSDDLKRECAKEALKYIKNNSIIGLGGGSTISYLIDYIRENRNLNVKVVTPSFKTKMLCIDKGLEVLHTCVVDEVSIAFDGCDEVDEELNALKSGGGIHTKEKLIASMAEDYVLLVDKAKFSKTLTFKHPVVLEVLPDALKYVEKKLKKIGGVPILRTSAAKDGGTITENGNLLIDTDFNNVTNIQELENNLKNISGVIDTSLFTKVVTKVLITDEEGTKVISKN >NZ_CP009268.1|WP_003442945.1|2999066_2999765_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKSAIVTGASSGIGLEIAKVLLDMRYKVYGIARNFSKTDFQHENFIEIVCDITDINLLEKKIKDIRSGEKEIFILVNNAGIGYFGPHEEISTKKIHAMIATNLEAPIIFTHILLRDLKRNSGYIINISSITAKKSSPIGCAYSATKAGLSHFSESLFDETRKAGVKVVTIHPDMTKTDFYNNAKFKEGDLPESYITGECVSNVVEMILSQRPGTVLTDVTIRPQRHVIGKKK >NZ_CP009268.1|WP_051035246.1|2999928_3000957_-|DNA-repair-photolyase MKGRRFLSKLKIDLWNCKFSHIYVEEQALNYEISSKIIDNFNNSKVVKIDHYKDVFCRSHQNFVIQKNSPKLILAVKKNNFVYKGSQMCDSFGNSNFYYTSAVMNCIYNCEYCYLQGMYPSGNIVIFVNIEDSISEIEKMLKNHPVYLCVSYDTDLMALEGITGFLHKWIDTAVKHNNLKIEIRTKSASFELLKEIPCCDNVILAWTLSPKKVIEEFEIGTPFLQKRLENICQAIDRGWKVRLCFDPLLYINNWKIVYKEFIDTIFKNISGRRIYQVSIGVFRISKNYLKIINKLRTNSKILAYPFSVEDDICSYNEKHIEEMIVFVKNETMKYIYENKIYI >NZ_CP009268.1|WP_003442950.1|3000904_3001738_-|hypothetical-protein MIYFLTALYYEAKDIIFHYNMKKSMESTRFQVFKGKNEILIISGTGYIKSVAAVTYLLNCFGYNENDIFIDIGICGSTRYELEKGKIILCNKLIDNCSKKSFYPDMLFKHPFNEGTLESFAQVVEQDKLEKIEGDIVDQEGAFVYQAASIFAKPHNIHIIKIVSDILNPQSVTPEKIERLFVDSMQSIYIWLEKRVKINFYSEDIITEEEYNVLKLLSENIKLTSSMKMELNKLSTQYEIRNGNVIELLKEYTKFQCKSKNEGKKIFEQVKNRLMEL >NZ_CP009268.1|WP_003442954.1|3002052_3003141_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase-family-protein MSYSVFLPSYSIGTDAYDRIKELCPNYGKNIVVIGGKTAIEKVKKKIKSAVTDSTLEILDFIWYGGDSSFENVEMLKENPLIHKADIIFAVGGGRAIDTCKVLSHQINKPIFTFPTIASNCAACTSVCVMYDNKGVFKELYFRDKPAEHTFICTEIIAEAPKVFLWAGIGDALSKKYECTFSSRNDKLEHFNALGVQISKICTEPLLENGKKALEDCEANIASYELEQVTLDIIISTGLVSNLVINDYNSCLAHSIYYGMTELKQIEKNHLHGEVVSYGVLVLLLCDKQFDELNKVYNFCKSIGLPTKLSDLEVTKDELKIVISKVMQTGDIVHVPYEITYDMIEDSILKLEEYSNEPVKAV >NZ_CP009268.1|WP_003442956.1|3003326_3005015_-|diguanylate-cyclase MSEVDNKKKQINDIVSVVKLSSLLFSGMAFFKFVQKHFNISFSNFNYSLTIQFVIVSVLILTLIYSIWAFSTTKKFNKKYIIRIQIIENYIFVLIFLCIILLTGAHRSDFKFLFLFIIITTAIQSGMNQGLIIAFTSSIIVLTIDLIYAQGLMENIYFEKDLILAAVFILTAWPLGFYVKTERNHIEKLQNLANEDGLTGVYNHRFFHEALREKLISYKKENRPISLIFIDIDHFKHYNDLYGHQKGDQVLKIIGSLLKEIIVENGIAARYGGEEFAIILPDTLEQDAIKIAENIRYRIQETYFEGEENQPKGKITASMGVSTFPDKAENEVELIKCADDALYRAKFFNKNRVETYHSILDELKKEIEHKDIDLVTSIKTLISVINAKDRYTYGHVERVVFYSRLLAEKLGLSEEDKKKLVYGAYMHDIGKINIGEEVLNKKMPLNNEEWEVLKQHPANGVEIINPVKSLSYIAPLILHHHERYDGKGYPDNLKGENIPYLARILTVVDSFDAMTSNRPYSKIKSHSEAIEELKKCRGSQFDPDIADAFIEVIEENKDNITY >NZ_CP009268.1|WP_003442957.1|3005077_3005203_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MKKKLLIVVAAVTTVVASVIASSACVFFFYQPEEPKCLQKR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP009268_2 | 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2832802-2832837 | 36 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 35128-35163 | 2 | 0.944 |
NZ_CP009268_2 | 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2832802-2832837 | 36 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 86837-86872 | 2 | 0.944 |
NZ_CP009268_2 | 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2832802-2832837 | 36 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 95699-95734 | 2 | 0.944 |
NZ_CP009268_1 | 1.15|700404|34|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT | 700404-700437 | 34 | MN693625 | Marine virus AFVG_250M334, complete genome | 21803-21836 | 7 | 0.794 |
NZ_CP009268_2 | 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2832802-2832837 | 36 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 58184-58219 | 7 | 0.806 |
NZ_CP009268_2 | 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2832802-2832837 | 36 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 69182-69217 | 7 | 0.806 |
NZ_CP009268_2 | 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2832802-2832837 | 36 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 209310-209345 | 7 | 0.806 |
NZ_CP009268_2 | 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2832802-2832837 | 36 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 216497-216532 | 7 | 0.806 |
NZ_CP009268_1 | 1.7|700403|35|NZ_CP009268|PILER-CR | 700403-700437 | 35 | MN693625 | Marine virus AFVG_250M334, complete genome | 21803-21837 | 8 | 0.771 |
NZ_CP009268_2 | 2.26|2833591|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2833591-2833626 | 36 | NC_010371 | Finegoldia magna ATCC 29328 plasmid pFMC, complete sequence | 52485-52520 | 8 | 0.778 |
1. spacer 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acatatgagtatggtctttatcacattctattgcaa CRISPR spacer acatatgtgtatggtctttatcgcattctattgcaa Protospacer ******* **************.*************
2. spacer 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acatatgagtatggtctttatcacattctattgcaa CRISPR spacer acatatgtgtatggtctttatcgcattctattgcaa Protospacer ******* **************.*************
3. spacer 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acatatgagtatggtctttatcacattctattgcaa CRISPR spacer acatatgtgtatggtctttatcgcattctattgcaa Protospacer ******* **************.*************
4. spacer 1.15|700404|34|NZ_CP009268|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693625 (Marine virus AFVG_250M334, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
acagcagttgcaaataatgcaactg-ctacagtac CRISPR spacer acagcagttgcaaatactgcacctgattctaata- Protospacer **************** **** *** .* .*.**
5. spacer 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
acatatgagtatggtctttatcacattctattgcaa CRISPR spacer acaagtggacatggtctttgtcacattccattgcaa Protospacer *** .**...*********.********.*******
6. spacer 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
acatatgagtatggtctttatcacattctattgcaa CRISPR spacer acaagtggacatggtctttgtcacattccattgcaa Protospacer *** .**...*********.********.*******
7. spacer 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
acatatgagtatggtctttatcacattctattgcaa CRISPR spacer acaagtggacatggtctttgtcacattccattgcaa Protospacer *** .**...*********.********.*******
8. spacer 2.14|2832802|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
acatatgagtatggtctttatcacattctattgcaa CRISPR spacer acaagtggacatggtctttgtcacattccattgcaa Protospacer *** .**...*********.********.*******
9. spacer 1.7|700403|35|NZ_CP009268|PILER-CR matches to MN693625 (Marine virus AFVG_250M334, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tacagcagttgcaaataatgcaactg-ctacagtac CRISPR spacer gacagcagttgcaaatactgcacctgattctaata- Protospacer **************** **** *** .* .*.**
10. spacer 2.26|2833591|36|NZ_CP009268|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010371 (Finegoldia magna ATCC 29328 plasmid pFMC, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tattctttaaaatgtcttttgtgtttaatacattat CRISPR spacer tttttattaaaatgtgatttgtgtttaatacacttg Protospacer * **. ********* ***************.*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
201573 : 272279
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009268|201573:272279|DBSCAN-SWA 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56 | Pandoravirus(22.22%) | transposase,protease,tRNA,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2061123 : 2069448
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009268|2061123:2069448|DBSCAN-SWA TATGAGCGATTTAGTAAATGGTTATATTAATTATATTAGCAATAAAAAATTGAGTTCTAATACTCTTGATGCCTATACAAGAGATATAAAAAAATTTCACGAGTTTGTTATGAGTAAAAAGGAAAATATAGAAGAAGTAGATGTAGTAATTGTAATGGCTTATGTGCAGAATTTAAAGAAAGAAGGTAAAGCAAATTCATCTGTTATACGAAATATAGTTTCTATAAGAAATTTCTATAAGTATTTGATAAATATGGGTAAAATTGATGTGAACCCTGTAATACAATATCAATCTCCTAAAATAAAAAGAAGATTACCAGCAATTTTAACGGTTGAAGAAGTAGATAAACTTTTATCTATGCCGGATTGTGAAACCAATAAGGGAATTAGAGATAAGTGTATGCTTGAAATAATGTATGCTACAGGCATAAAGGTAACAGAGCTTTTGAATCTTACCATATATGATGTAGATACTAAACTTTCCTATATTAAATGCAAAGGATTAAAGGGAAAAGAGAGGATAATACCTATAGGGTCTTATGGAATAAAATGGATTGGGAAATATTTAAAAGTAAGGTCACAACTAAATTTAAATAATTTGGACTTTTTATATTTTAATCTTCAGGGAAATAAAATGACAAGACAGGGTTTTTGGAAGATAGTAAAGCATTATGCAGAGGAAGCTCAAATTGACAAACCTATAAATTCTTATACTATAAGACATTCTTTTGCAGTGCATTTATTGCAAAATGGTGCGGATATAAAGACAATTCAAGAATTACTGGGACACAGTGATTTATCTACAACCCAAATTTATTCAGGTATATATAAAAAGAGTAAAATTGCAGAAATATATAAAAAAGCACATCCTAGAGCCTAGTATATAATAGTGATTTGCTTTTTATATTTTAGATAAAGATGATAGCTGATTTTTATATATTCTGTAGATAGGAGAGAAAATTTATGAATAGGGTTATATTGGTAGTACTTGATAGCGTTGGAATAGGAGAAATGTCGGATTCAAAGTTGTATGGAGATGATGGAAGTAATACTTTGGGTAATATAGGGAAAAGCATTGGGGGACTAAAACTTCCTAATATGGAAAAGCTTGGCCTTGGAAATATAAATTCTATTGAGGGAGTAAAAAGAATTCACGATCCTATTGGTAACTTTGGTAAATGTGCCGAACTGTCAAATGGAAAGGATACTGTTACAGGTCACTGGGAGATATCTGGAGTAGTACTAAAGAAACCTTTAAAGACTTATCCTGAAGGCTTTCCAATAGAAATTATTAGGGAATTTCAAAATAAAATAGGAAGAAAGATCCTTGGTAATAAAGTAGCTTCCGGTACGGAAATTATTAAAGAACTTGGGGAGGAACATGTGAAAACAGGTTATCCTATAATATATACTTCTGCAGACAGCGTGTTTCAAATTGCAGCTCATGAAGAGGTAATTCCTCTTTCAAAGTTATATGATATGTGTAAAATAGCAAGGAATATGTTTACAGGAGAAAATTTAGTGGGAAGAATAATAGCAAGACCTTTTTTGGGTATTAAAGGTAATTATACTAGAACCTCAAATAGACGAGATTTTGCACTAGATCCTTTTGATAAGACTATGTTAGATTACATAGAAGAAGATAAATTAAGTGTTATGGCAGTAGGAAAAATAGAGGATATATTTAATGGAAAGGGAATAACTGAAGCCGTTCACATAAAAAATAATAATGAAGGAATAGACAAAACTATTGAGTATATGAAAAGTGAAAAAAACGGATTAATATTTACAAATTTAGTAGATTTTGATATGCTCTATGGACATAGAAATGATATAAAGGGCTATGCTGATGCATTAATGAAATTTGATAAGAGGCTTCCTGAAATAATGGAGGTTATGAAAAAAGAAGATGTTTTAATTATAACTGCAGATCATGGCTGCGATCCTACAACTAGAAGTACAGATCACTCCCGGGAATATATACCACTACTTGTATATGGTAAATCTATAAAGAATTCTGTAAATATAGGTATGAGACAGTGCTTTTGTGATATAGGCAAAACTGTTTTAGATATATTGAAAATTGATAATAATTTATATGGAAAGAGTTTTAAAGAAAAGTTAATTTAGGAGAAAAGGTATATGGATAATAATACTATAATTAAAAGTGTAGAATATATAAGAGGAATTACTGATATAGTGCCTAAAATAGGCATAATACTTGGTTCTGGTCTTGGAGAAATAGCAGAAGATATCGAAAATAAGATTATAATAAAATACAGTGATATTCCCAATATGCCTATATCTACAGTAAAAGGGCATGCAGGTCAATTTGTAATAGGTGAATTTTCAGGAAAAAATGTTATAATTATGCAGGGGAGATTCCATTATTATGAAGGCAATTCCATGGAACTTTTGGCATTGCCTATTTACATTATGAAATATTTAGGGGTGGAAAATTTAATTGTAACCAATGCTGCCGGGGGAGTAAATACTAATTTTGTTCCTGGAGATTTAATGTTAATCAAGGATCATATAAATTTTGTATTTAATAACCCTCTTATAGGAAAAAATCATGAGAAAATAGGATCAAGATTTCCAGATATGTCCTGTGCCTATAGTGAAAAGTTAATAGATATAGCAAAAGAAGTTTCAAATAATTTAAATATAAATATTAAAGAGGGAGTCTATTTAATGATGACGGGTCCTTGCTATGAAACCCCTGCAGAAATTAGAATGATCAGAATATTAGGTGGAGATGCGGTTGGAATGTCTACAGTTCCAGAGGTAATTGCAGCTAATCATTGCAATCTAGAAGTACTGGGCATTTCCTGCATTACAAATATGGCGGCAGGAATATTAAATAAACCATTAGACCATGCGGAGGTAATGGAAATTTCCTATAAAGTCAAAGATAATTTTAAAAAGCTTATAAATGATATAGTAGGAGAAATATGATTTTATATTGTAGAGCTGAATATAGAAAATAAAATTAAAATAATTTATAGTAGGACTTTTAATATTATGTGAGGTGCGTTATATGGATATTTTACAGGAGATCAATAAGGCTAAGGAGTACATATTAAATTTATATAATAAAAAAATAGATGCTGCCATAATACTTGGTACAGGTTTAGGGAGTATAGTAGATGAGGTAGAGAATAAATTGGTAATAGCATATAAAGACATACCGGAATTCCCAGTATCTACGGTAGCTGGTCATGCAGGAGAATTAATAATTGGAAAGATTAATAAAAAATCTGTGATTATAATGAACGGAAGATTTCACTACTATGAAGGTTATTCTATGGATACAGTAACTTTTGGAGTAAGAGTAATAAATGCACTTGGTATAAAAGATATAATTATAACAAATGCTGCAGGTGGCATGAATCCTCATTTTAAAGCGGGAGATTTAATGATTATAGAAGATCATATTAATTTTATGGGTACAAATCCTCTCATAGGTAAAAATTATGAAGAGCTGGGACCAAGATTTCCGGATATGTCTGAAGCTTATAATAGTGAACTTATTGTATTAACAGAAAAGAGTGCAAAAGAATTAGGATATGAAATTAAAAAGGGTGTTTATGCTGCTGTTACAGGTCCTAATTATGAAACACCGGCGGAACTTAGAATGCTTAGAACATTAGGAGGGGATGCCGTTGGAATGTCTACAGTTCCAGAAGTTATAGCAGCTAACCATATGTCTATGAGAGTTCTCGGAATATCTTGCATTACAGATATGGCCATAGCAGATAATTTAGAACCTTTAGATCATAGAAAGGTTTTAGAAACTGCAGCCAAAGCTCAAAATAAATTTGTTTCCATAGTAAAATCCGTAATAGAGAAAATGTAGTCAAAGGGGAAGCTAAAAATGAGAGTAGTGGATTTAATAAATAAGAAGAAAGATGGAAAAATTTTAAGTAAAGAAGAAATTCAATTTATAGTTTCAGGATATACTAATGGACATATACCAGATTATCAAATGGCGGCTTTTTTGATGGCAATATATTTTAAGGGAATGAACAGAGACGAAATATCAAATCTTACTCTTTCCTATATAGAGTCTGGAGATATTATTGATTTGTCTAGTATTGATGGTATAAAGGTAGATAAGCATTCTTCAGGAGGTGTAGGAGATAAAATTTCATTAATTGTTATTCCTTTAGTAGCTGCTCTAGGCATACCCGTTGCTAAAATGTCAGGCAGAGGACTTGGACATACAGGAGGCACTATAGATAAATTGGAGTCAATTGAAGGTTTTAATACAAATTTGGATATGAATACATTTATAGATAATGTAAATAAATATAAGATGGCCATTGCAGGTCAAACTGCTAATTTAACACCTGCGGATAAAAAGACTTATGCCTTAAGAGATGTAACAGGCAGTGTAGATAGCATACCTCTAATTGCAAGTTCTATAATGAGTAAAAAAATAGCTTCTGGGGCAGATGCCATTGTACTGGATGTAAAAGTAGGTGCGGGAGCTTTTATGAAATCTTTAGATAAGGCTAAAGAACTTGCAGAGACTATGGTAGATATAGGAAAATCTTTAAATAGAAAAACTATAGCTATAATAACTAATATGAATGAACCTCTTGGGCGTGAAGTTGGAAATGCAAATGAGGTAAGGGAGGCTATGGAGGTTTTAAAGGGAAATGGATCAGAAGATGAAACTACAGTAGCTTTAACTATAGCTTCTTACATGAGTATATTAGGTGGCGTTTTTGAGGATTTTGATTCTGCTTATATGAAACTGAAGCATATTATAAAGTCTGGAAAGGCTATAGAAAAATTTAGAGAATTCGTTAGAATTCAAGGTGGCAATACAGACATAATAGGCAATCCCGATATGCTTCCAAAGGCAAAAAATAATATTGAAATAAGAGCAAAGAAAGATGGGTATATAAAATTTATAAAAGCTGATAATATAGGTTTAGCAGCCATGTTATTAGGTGCAGGAAGAAAGAATAAAGAAGATACAATAGATTTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009268|2061123:2069448|2068851_2069448_+|WP_034830758.1|DBSCAN-SWA MVKNYNIEQLEIEGVLNKEKYFSIIESLLFVSGEPMKVKNISEIIECDLHYTKKLLKEMIYNYENNVRGIKLISINDNYQLVTKPDNSSYIQKLLKTNTRQSLSQASLEALAIIAYKQPVTRIDIDEIRGVKSDRAISSLQEKNLIKECGRLDAPGRPILYGTTEEFLRYFELSNLQELPKIEEFVESFKDIIEEDED >NZ_CP009268|2061123:2069448|2061123_2062002_+|WP_003444245.1|DBSCAN-SWA MSDLVNGYINYISNKKLSSNTLDAYTRDIKKFHEFVMSKKENIEEVDVVIVMAYVQNLKKEGKANSSVIRNIVSIRNFYKYLINMGKIDVNPVIQYQSPKIKRRLPAILTVEEVDKLLSMPDCETNKGIRDKCMLEIMYATGIKVTELLNLTIYDVDTKLSYIKCKGLKGKERIIPIGSYGIKWIGKYLKVRSQLNLNNLDFLYFNLQGNKMTRQGFWKIVKHYAEEAQIDKPINSYTIRHSFAVHLLQNGADIKTIQELLGHSDLSTTQIYSGIYKKSKIAEIYKKAHPRA >NZ_CP009268|2061123:2069448|2062085_2063252_+|WP_003444249.1|DBSCAN-SWA MNRVILVVLDSVGIGEMSDSKLYGDDGSNTLGNIGKSIGGLKLPNMEKLGLGNINSIEGVKRIHDPIGNFGKCAELSNGKDTVTGHWEISGVVLKKPLKTYPEGFPIEIIREFQNKIGRKILGNKVASGTEIIKELGEEHVKTGYPIIYTSADSVFQIAAHEEVIPLSKLYDMCKIARNMFTGENLVGRIIARPFLGIKGNYTRTSNRRDFALDPFDKTMLDYIEEDKLSVMAVGKIEDIFNGKGITEAVHIKNNNEGIDKTIEYMKSEKNGLIFTNLVDFDMLYGHRNDIKGYADALMKFDKRLPEIMEVMKKEDVLIITADHGCDPTTRSTDHSREYIPLLVYGKSIKNSVNIGMRQCFCDIGKTVLDILKIDNNLYGKSFKEKLI >NZ_CP009268|2061123:2069448|2064162_2064981_+|WP_003444259.1|DBSCAN-SWA MDILQEINKAKEYILNLYNKKIDAAIILGTGLGSIVDEVENKLVIAYKDIPEFPVSTVAGHAGELIIGKINKKSVIIMNGRFHYYEGYSMDTVTFGVRVINALGIKDIIITNAAGGMNPHFKAGDLMIIEDHINFMGTNPLIGKNYEELGPRFPDMSEAYNSELIVLTEKSAKELGYEIKKGVYAAVTGPNYETPAELRMLRTLGGDAVGMSTVPEVIAANHMSMRVLGISCITDMAIADNLEPLDHRKVLETAAKAQNKFVSIVKSVIEKM >NZ_CP009268|2061123:2069448|2063264_2064080_+|WP_003444257.1|DBSCAN-SWA MDNNTIIKSVEYIRGITDIVPKIGIILGSGLGEIAEDIENKIIIKYSDIPNMPISTVKGHAGQFVIGEFSGKNVIIMQGRFHYYEGNSMELLALPIYIMKYLGVENLIVTNAAGGVNTNFVPGDLMLIKDHINFVFNNPLIGKNHEKIGSRFPDMSCAYSEKLIDIAKEVSNNLNINIKEGVYLMMTGPCYETPAEIRMIRILGGDAVGMSTVPEVIAANHCNLEVLGISCITNMAAGILNKPLDHAEVMEISYKVKDNFKKLINDIVGEI >NZ_CP009268|2061123:2069448|2066480_2067692_+|WP_003444263.1|DBSCAN-SWA MIKRSRLISSALCAAIMSTTLLFTPVWTEAEVLELEPSDNKNQNSSSIDVDAKSALLIEPSTGKVIYEKNSHEKFAPASVTKIMTMLITMENVDSGKIKLNDKVTVSENAKKMGGSSMILDTGEVRTVEELLKGIAIASGNDAAVAMAEYLGGSEDGFVKKMNEEAQKLGMKDTHFENCTGLSAQGHLTTAYDIALMSKELLKHPQILKYSGTYMETISEGRKSPIELVNHNKLVRFYKGCDGLKTGFTDEAKYCISATATKDGVRMLAVIMGAPTYKVRNRDASMLMTYGFSKFESKKIVKKDSIVEKVNLNKKGDKFFLAKAGEDLDLVVPRDNNIKIDHKCVYNENAKGFKKGDEVGYCEFYQDGNVCGKVKLYCDRDVKKGGILSHFKYNLGRVFDNAI >NZ_CP009268|2061123:2069448|2068109_2068868_+|WP_003444265.1|DBSCAN-SWA MSINIKLNNFEGPFDLLLHLIKRNKMDIYDIKIYDITSQYLSYIKTMKEMDLEITSEFIVIAANLLEIKSKLLLPKNKVEELEEEGKDPRMDLVSKLVEYKKYKLAADFFKEREDIKGEVFTKKPEIIEDMDKKSSSTEELLKNISMLDLFNLYDNLINTYLSKINKENVISKEIPIDKFRIEDKIEELMSTFKDKKRIFFSDVKKECNSKMEIVVTFLALLELIKLRSVRVIQQANFNEIYIERIFDGEEL >NZ_CP009268|2061123:2069448|2064999_2066301_+|WP_003444261.1|DBSCAN-SWA MRVVDLINKKKDGKILSKEEIQFIVSGYTNGHIPDYQMAAFLMAIYFKGMNRDEISNLTLSYIESGDIIDLSSIDGIKVDKHSSGGVGDKISLIVIPLVAALGIPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIEGFNTNLDMNTFIDNVNKYKMAIAGQTANLTPADKKTYALRDVTGSVDSIPLIASSIMSKKIASGADAIVLDVKVGAGAFMKSLDKAKELAETMVDIGKSLNRKTIAIITNMNEPLGREVGNANEVREAMEVLKGNGSEDETTVALTIASYMSILGGVFEDFDSAYMKLKHIIKSGKAIEKFREFVRIQGGNTDIIGNPDMLPKAKNNIEIRAKKDGYIKFIKADNIGLAAMLLGAGRKNKEDTIDFSAGITVNKKYGEKVSKGDTVFVLHTNIENYTEAENIVKNSFSISKVKPAAIKYVYDIIK |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2085265 : 2135147
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009268|2085265:2135147|DBSCAN-SWA TATGGAACAAATTAAAAACTTCAATACTACTACTGGTTTAACAGATTATGAGATAAGTATGATAAAAAATATAATGAAAAAATACAATATAAATGTAAAGTATATAGAAAAGATAAGAAGTGTTTACAAGATAAAGACAGAAGATAAATTTTTATGTTTAAAAAAAATGAAACATGGAAAGATGAAGCCTGTAAATGGAAATATTTTAGTACAAGAATTAAAGAAGAATAAATTTAATAATGTACCTATGTATATAAAAACTAATAATAATAAGCTCTTTGTAAAATATAAAGGATTTATATTTTATCTAATTGAGTGGATTGATGGCGAAGAATGTAGAATGAAAAATTTAGATGAAGCCGTAAATTGTGCTAAATTGCTGGGGGAATTTCATTTAGCAACTAGTAAAATAGAAAACAAAAAATTATACAACATAAAAGATGATAGTAGGAAATGGGATAAAGTTTTTATAAAATATCTAAATGATATAAAAAGATATGAAAAGATTATAGACAAAAAAGATATTGTAAGTGAATTTGATATATTATATAAAGAAAATATAAGTTATTTTTATAATCAGGGTATTTTTGCATTTAATTTGTTATATAAATCTCACTATAATAAATTAATAAGTTCTAAAGAAAAAACAATATGCCATGATAGTTATTATTATCAAAATATAATAAAAAAGAATGATGATTATTATATAGTAGATTTAGATAGTATTATTATTAATTTAAAAATTTACGATTTAGGAAAGATGATAAGTAGGCTCATGTACAGCAGCCATTATAAATGGAATTTTAATAAAGCTAAGATTTTAATAGAAGCATATAACTCAGTAAATAAACTTTCTTATGAAGAAATGGAAACTATGTTAGCTTATATTGTATTTCCAAGGAAGTTTTGGAAACTAGGAAAGAAAAGATATGTAAAGAATAAGAATTGGATAGAAAATAAGTATATACACAAGTTAAAAAGAATTATCGAGTTAAAAGGAAAAGAAAAAAAATTTGTTGAAGAATATAAAATTTATTTATATGATTTTATTTGAAAATAATTTAACGAATTGACAATAATAATATAAATATTTATACTTATGCATATACAATAATAAATTTATAAAAGTGTCAATTCTAGGGCTGATTGATTTAAATCAGCTTTTTAAAACTCCGTGAGTTTATATTTATGGATGCTTTAAATCAATATAAAGTATAAGAGGGTTAGTATGTACAATTGTATAGATTTAAATAAAACAAATATTTATAATTTGAAAAAGCTTACGGCTTTTAGCCCTAAATTTAATAATTTAAACAAAGATTTTTTCAATATTTATGATAATTCTAATTTTATACAGAAACATTTTCAAAGAAAAAGAGTGAAAATTTTAAATTATGGTGAAGAATCTATTGGATATATATGGACTACTAATAATTTCAGGGCAGTATATACTATAGAAGCAATGAGTGTAGTATCCAATAATAATTTAAATTTAAAGAAATGTTATGAGAAGTTATTACATTCAGTAAGTAATAAGGGTGTTTTTATATATGAATGTGAAAAAAATGACTATAATTTTAAAACTTTAAAAGATATAGGTTTTAAAATTTTAAATGGAACATTAGAGATGAAATGTAATTTAGACAGAGAATATAATTTCAACGTGAAAGGTGATATAGTCATTGAAAATTTAGTTTTGAACAGAGATGAAAAAAAGAGATGTGCAATTCAAAATGCCATATTCAAAAAGGATGGGAGAACACCTCTTACTGTTGAAGATATTTATTTTGACCAATGTCAAAATTATTACTTTGATAAAGGATGCTTTTTTATAAAGCTTAAAGGATTTGTCATAGGATATGGACAGATAATAATTAACGATGGCATTCCTGTAATTGTTAATTTTGGTATACTGGAGAATTTTAGAGGTAAAGGCTACGGCAGATTATTTTTATTATTTTTAATTTCAAAAGCTAAACAACAAAAGTTTAGAGAGATATTTATAAGAGTAGATTCTTCAAACACTATAGCTTTCAATTTGTATAGAAGTGTAGGTTTTGAAATAGAAAAAGAAATATGTACCTGGAAATTTAAATCTTAATTATATATTTTTTTACACAAAAAACTGTCGCACTAATTTTTTAGTGCGACAGCCCCTCTTTAAATATTACTCTTCGAAAAGATCACTAAAAGGTACATAGGATGTAGGAGTATTTAATAAACTTCTGTTAGGAACTCTTTCAAAATACATTCTATCTTTAATTGTTTCATATTTTAATTCTTCATCTTTTGTCTCTAATTTAGCATCATACATATAAATCTCTCCTCCTGTAAAGTAGATTTATTTCTATGTTAGTATTCTCAATATATGTATAAATAATTCTATTGATTTACAAAAAATTTAATTATTCTAATATATATATAGGCAAAAAAATTTCCGATTTAAATCTGATGACTACCATCCGTAATACTTCCAGCTTCTATAAAGTGGGAGATAACGGCTGTTACGTCTCTGGATAACAATTTCTTTGTTTATGAACTTTTATTTTAATATAAAATAAAGTATAATGTATTAGTTAAGAGCAAGTTATTGATATTAAAAATTGTACTTTAGCTAATTTAAGTTAATTATGAATAAATATAATACTGCTATATTGAGTTCTATATTTAAAAATAAAGAATAAAATTTTTAATTTATATGAATTGATGAATATAGTTTGATTTAAGTACTAGGATAATAATTCAATGGATAAAGCAAAAGAGGTGTAATAAATGGAGAAAAATATCAAGAAATTTTATATAGAAACTTGGGGTTGTCAGATGAACGAGGAAGATTCTGAAAAACTTTCAGGAATGTTAAAATTAAGTGGCTATGAAAGAACTGAGGATAAGAAAAAAGCCGATTTAATTATATTTAATACCTGCTGTGTAAGAGAAAATGCAGAACAAAAGGTATATGGAAATTTAGGGGCATTGAAAAGTGTAAAAGAAAAAAGGCCAGATTTAATTATTGCAATTTGTGGATGCATGATGCAGCAGGAAAATATGGCAGATGATATTATAAAAAGATTTCCCTTTGTAGATATAATTTTTGGAACTCATAATTCGCATATGCTTCCAGAATATTTAAATAGAGTTAAGCAGGAAGGTAAATCTATTATTGAAATATGGGATAAAGAAAAGGGAATAGTTGAGGGCCTACCTGTAGATAGACTTAGTAAAATCAAAGCCTTTGTAACTATAATGTATGGATGCAATAATTTCTGTACTTATTGTATAGTTCCCTATGTAAGAGGTCGTGAGAGAAGTAGAACACCAGAGGACATAGAAAAGGAAATAATGGAACTTGTAAAAGAAGGATATAAAGAGATAACCTTACTTGGTCAAAATGTAAACTCATATGGAAAAGATTTTACTCCTGCTTTAGATTTTGCAGACTTACTTATGAGAATAAATAAAATTGAAGGATTGGAGAGAATAAGATTTATGACTTCCCATCCAAAAGATCTATCTCTTAAAGTAATAGAAGCTATTAGAGATAGTGAAAAAGTTTGTAAGCATATACATTTGCCAGTGCAATCTGGTTCTTCAAAAATTCTTAAAAAAATGAATAGACACTATGATAGAGAATATTATATGAAACTTATAAAAAATATAAAAGAACAAATTCCGGGTATAGCCCTTAGTACAGATATTATTGTAGGATTTCCGGGAGAAACAGAAGAAGATTTTAATGATACATTAAAACTTATAGAAGATGTGGAATATGATTCAGCCTTTACATTTTTATATTCCCCTAGAAAGGGAACACCAGCCTCACAGATGGAAGAAGAAATGATCAGTGAGGAAGTAAAACACGAGAGATTTAACAGACTTGTGACTTTGGTAAATGATATTAGTGCAAAGAAAAATAGAGAATATCATAATAAAATTGTGGAAGTCTTAGTGGAAGGTACTAGTAAAAATGACGAAAATAAGCTTATGGGGAGAACGAGAACGGGAAAACTTGTGAACTTTGAAGGATTAAGGGAGAACATAGGTAATTTAGTTAAAGTAAAAATAACAAAAGCTCAATCTTTTTCACTATATGGTGAAGAAGTTTAAAGTATATTTAAAGATTAATTTTATTCAGGTAGGGAGTTGTAGATATGGGATTAACACCAATGATGCAGCAATACATAAATGTAAAAGAAAAATGTAAAGATTGCATATTGTTTTTTAGACTTGGTGATTTTTATGAGATGTTTTTTGAGGATGCTAAAATAGCCTCTAGAGAGCTTGAACTTGTTCTTACTGGTAAAGATTGTGGACTTTCTGAAAGGGCACCTATGTGTGGTGTGCCCTTTCACTCTGCTAATATGTATATAACTAAGCTGATAAGTAAAGGTTATAAAGTTGCAATTGGAGAGCAGCTGGAGAACCCGGCATCAGCTAAAGGTATAGTTAAGAGAGGAATAGTTAAAATAGTTACTCCTGGAACTTATACAGATTCCTCTTTCTTAGAGGATACAAAGAACAACTATATAATGAGTATTTTTATAGATAAAAGTAAATTTGGTATTAGTATAGCTGATGTTTCAACTGGAGAGTTTAACTGTACTTCCTGGGATATGGAAGGAGATTTAATTATAAATGAAATATCAAAATATTCTCCTAAGGAGATATTGGTCCAGGAGAGTTTAAATGTAGAATTATTAGAATCTATAAGAGAAAGATTCAATTGTTCTTTTACTAAATTTAAAGATGAATTTTTTAATAAGGATGCTTATGAAAATTTAAAACAGAAATTTTCAAATTTTGATGAAAAAAAATTCAATGATTTAATTGTAGCAAGTTCCAATGGATTATTGAGATACTTGATGGATACTCAAAAGGTTTCTCTAGCACATATTGATAATATGAATTATTATAATGTTGTTGACTATATGAGTATAGATGCAAATTCAAGAAGAAATTTAGAACTTACGGAAACTCTTAGAGAAAAAAGTAAAAAAGGCTCT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42 | Paenibacillus_phage(22.22%) | bacteriocin,transposase,protease,coat,integrase,tRNA | attL 2113377:2113392|attR 2116548:2116563 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2552198 : 2609099
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009268|2552198:2609099|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_phage(23.81%) | portal,tail,transposase,head,terminase,integrase,tRNA,capsid | attL 2598426:2598445|attR 2611758:2611777 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2646735 : 2661108
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009268|2646735:2661108|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009268|2646735:2661108|2652392_2652872_-|WP_003447544.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDVDKMKGAAKALKEFDIEYRVHILSAHRVPEKLSQVIQDLEAEDFDCIIAGAGLAAHLPGVIASHTTLPVIGVPINAALNGLDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSLKYPDLKEKLIQYRKDMKSKFISENEEGVEL >NZ_CP009268|2646735:2661108|2658822_2661108_+|WP_003447537.1|DBSCAN-SWA MDAKKKELILEGLCCPNCAAKIENKSKNISGVESANMDFVSKKLTLEIKDENEIIRILDETKDIIKKLEPDVKIIDTSAKIDSTNIHEEASANKKFKIAALIAGVILYIITFFLSDASTLRLIVSIAAYLLIGGNVLMKSLKNILRGEVFDENFLMSIASIGAFAIKQYSEGIAVMLFYEIGETFQDMAVDRSRRSITKLMDIKPEFANVKVNDSFKKVHPEEVSIDDIILIKPGEKVPLDGVILEGTSMVDTSDLTGESLPREVSSGSTILGGFINQNGVLTVKVTKPFTESAVSKILDLVQNASSKKAQTENFITKFAKYYTPVVTLSAVLLAIIPPLIIPDDTFSQWIYRALVFLVVSCPCALVISIPLGFFGGIGGASKKGILVKGSNYLEALYNVRTVVFDKTGTLTKGVFKVTKINATNNFTEDELLKYAALAENYSNHPIAKSILKCYEDKYGKLESVPNSHIAACKVKAKCQNIMPNTINLKKLKTSSSAGKISKSILNPCKNTNINTDTSNYSELAGYGIKTTVNGKNILAGNLKLMKKENIAYEDSNTIGTIIHIAVDNLYAGYIVISDEIKTDAANTIKDLKTLGIKKTIMLTGDAAKVGTAIGNKLNIDEVYSELLPNEKVDKFEILYSMKSPKEKILYVGDGVNDAPVLARADVGAAMGGLGSDAAIEASDVVIMTDEPSKIVTAIKIARKTQFIVWQNIIFALGIKAVILILGALGFANMWEAVFGDVGVALIAVFNSMRALNVKKL >NZ_CP009268|2646735:2661108|2653471_2657233_-|WP_003447542.1|DBSCAN-SWA MDNTVRRIFVEKRGGFNVEALELLKDIKENLNIKQLSSIRILNRYDISGISDEEFEKSKKIIFSEPVTDNVFNEKIEIKDNDIVFAVEYLPGQYDQRADSADQCIRILSQNEDSKVATAKLYILEGDLKEEDIKNIKNYCINPVDSREALLEKPDTLESEAEIPENVKILKEFSSLSEEALEQFRISEGLAMSLADLKFCQEYFKNTEKRNPTYTEIKVIDTYWSDHCRHTTFDTKLNNVEFEKGKFNKIVKQTFEEYENSKVNLKREDKATCLMDVALMAMRELKAEGKLQDLDTSDEINACSIEKEVDIDGKKEKWLIMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGCIRDPLSGRVYVYQAMRVTGSGDPRTKIEDTLQGKLPQRKITVGAAHGYSSYGNQIGLATGQVTEVYHDNYVAKRLEVGAVIGAAPKENVVREKPQSGDIIVLLGGRTGRDGCGGATGSSKEHDEKSILTCGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNTEASKLIKKCNDFGAGGVSVAIGELSDGLDINLNLVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVVTEKDADKFISLALEENLEAVKVAVVTEDRRLKLRWRNSYVVDISRDFLDTNGVRQEIDVYVKKPKKSLNYFEKDEKIKDVKKKWFSTLKNLNVCSQKGLVERFDSTIGAGSVFLPFAGKYQMTPTEAMIAKVPVLKGETNTATIMAHGYNPNLSSWSPFHGAVYAVVEAVAKVVSCGGRYDTIRLTLQEYFERLGKTPERWGKPLAALLGAYHAQKMFGIPAIGGKDSMSGTFKDMDVPPTLVAFAVDVVNANKVVSQEFKNSGNTVVLVKAARDENELPDFEVLKKNYKRIHKIIEKGRVLSSYTVKQGGVAEAITKMCLGNKIGFTFNKNVSEELLFEHCYGSIILEIDKEENIKKVMDGANYIVLGKTNSNADINYDKIEFSIEELLEQWTKPLESVFPTKTQVSSEKIENGVWDKRSTKAPVIKYAKPRVFIPVFPGTNCEYDSARAFEKAGAETSVKVFKNLTPELIKESVDYIAKEIDKSQMIMLPGGFSAGDEPDGSGKFIASVLRNSKIAESIMKLLKERDGLMLGICNGFQALIKLGLVPFGEIRDIDEDCPTLTYNNIGRHVSRMVDTKIVSTLSPWFSQVNCNEVYTIPVSHGEGRFVGKEEVIKKLFENGQVATQYVNFKGNPTYDIDFNPNGSMQAIEGITSPDGRILGKMGHSERIGNNIAKNIPGNKDQKIFESGVKYFK >NZ_CP009268|2646735:2661108|2658276_2658648_+|WP_003447538.1|DBSCAN-SWA MSNKEIENIESCNCNVIHEDIITKVKNNMIDEELLYDLSDLYKVFGDTTRIKILHVLSISEMCVCDISALLGMKQSSVSHQLKTLRQAKLVKYRRSGKVVYYSLDDNHVVEIFNQGLAHITEK >NZ_CP009268|2646735:2661108|2657445_2657970_+|WP_003447540.1|DBSCAN-SWA MSSKNNLRKLVTIALLLAIGMVLYQITPPFVMGMRPNFLLAMMFIAIILADDYKLTILIGLVSGIYCAIISTFPGGQVGNIVDKLITCQVVFLMFRAMKNRVPKQIMVAIIGFVCTAVSGTVFLIVASIVAGLPSTFTALVLSVVVPATIINTVVSIILYNAVNVSLKYSGTYR >NZ_CP009268|2646735:2661108|2648626_2649244_-|WP_003447550.1|DBSCAN-SWA MYKIAVLISGGGTNLQSIIDKVKAGYLDCKIEIVISDNEKAYGIERAKENDIYAVALSKKQYGDKLSDEILKISQERNVDLIVTAGFLSIIKGDLLKKFKNRIINIHPSLIPSFCGKGMYGLNVHEAAIEYGVKISGCTVHFVDEGTDTGPIIIQKSVPVFAEDTAEELQKRVLEKEHEALPEAIKLIETGKVKVHERKVIIENN >NZ_CP009268|2646735:2661108|2646735_2648238_-|WP_003447551.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVYNKDKVLDLAKFLIEKDVEIISTGGTYRYLKENNIAVTEVEEVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGILAIRDNTEHMKAIKAKGIKPIDMVVVNLYPFFDKVQEDLTFEEKIEFIDIGGPTMIRAAAKNFQDVVVLTDVNDYEDAINQIDKNGDVDFESKKKFAGKVFNLMAAYDAAVSRFLLGDEVYPEYLNMSYKKSMDLRYGENPHQSAAYYVSTATKGAMKDFQQLNGKELSYNNIKDMDIAWKVACEFEEPMCCALKHNSPCGAAIADNIHDAYVRAFECDPTSIFGGIVAVNKKLDAATAEELVKIFLEIVIAPDFDEVALEILKTKKNLRVIKAEHKPQDHREYAKVDGGILVQSSDDKLIDELKYVTEKKPTEEELKQLLFGMKVVKYVKSNAILVVKDGMAKGIGGGQVNRIWPTIEALDRAKDGTLLVSDAFFPFNDVVEEAAKHNIKAIIQPGGSIRDQDSIDACNKHGIAMVLSGIRHFKH >NZ_CP009268|2646735:2661108|2651682_2652393_-|WP_003447546.1|DBSCAN-SWA MTKKELLYEGKAKKVYATDKEDEVIVYYKDDATAFNGVKKGQIEDKGELNNSITSMLFELVEKHGVKTHFIEKLNDREQLCKKVDIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGVEEGSPLKTTVFEICYKNDDYDDPLINDTHAVALGFSTFEELKTIYAMTDKVNEILKEFFLKQNIKLIDFKLEFGKTADGEILLADEISPDTCRLWDATTNEKLDKDRFRRDMGNVKEAYVEILNRIAGK >NZ_CP009268|2646735:2661108|2649231_2650227_-|WP_003447549.1|DBSCAN-SWA MVTYKDAGVNIEEGYETVSKIKNYAKKTYSKNVLNNLGSFAGMFALGNYKNPVLVSGTDGVGTKLAIAFKLKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYMACGKLESETASQIVKGVSEGCLQAESALIGGETAEMPGFYKDGDYDLAGFSVGIVEKDEIIDGSKIQDKDVLIGISSSGVHSNGFSLVRKLVPDMDIDFNGKKVGEVLLEPTKIYVKPVLKLMEKFEIRGMAHITGGGFHENIPRMFKGDFQAVINKDSYELPEIFKYLMSLGVKEEDMYNTFNMGIGFVLCVKEEDKDAVINELKEFGEKAFEIGYVKAGGNGVCIK >NZ_CP009268|2646735:2661108|2650247_2651657_-|WP_003447548.1|DBSCAN-SWA MIDLEQDKLKEECGVFGIFSKENIDVSHLTYYGLYALQHRGQESAGIAVCNNGNIDVHKGMGLVTDVFDNDSLDKMIGNAAIGHVRYSTTGGSCASNAQPIVSNFEMGSIALAHNGNLVNTDIIRELLQYGGTSFETSIDTEVVLKLIAKNAAKGIENAITDAIQAIKGSFAIVILTEDKLIGVRDPNGIRPLCIGKFDDNSYVMCSETCALDAVGAEFVRDVNPGEIVIIDKEGIKSINFAEKTKCETCVFEYIYFARPDSVIDGISVYNSRELAGEELYREAPVEADIVIGVPDSGLAAAAGYAKASGIPYGIGLIKNRYVGRTFISPTQELREKAVAVKLNPLKVNIEGKRVVIIDDSIVRGTTSKKLVDILRKAGAKEIHFRVSSPIIKYPCYFGINIASRKELIGGHKTVEEIREFIGADSLGYLSIDALLKTLGKENNFCLGCLNAVYPVSAPMEVEKERFEV |
10 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2843854 : 2901867
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP009268|2843854:2901867|DBSCAN-SWA 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|
49 | Bacillus_phage(21.43%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3682971 : 3785301
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP009268|3682971:3785301|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP009268|3682971:3785301|3694988_3695405_-|WP_003446380.1|DBSCAN-SWA MDINKKLYDTYKQLMEVKGQCSCKLIDELKMSELTLRQIEYIKKFDQQECITTSKLAEILDLSKPSVTEMIKKFIKLDCIYKEKCHKDGRVYYIYLTERGKCIARFDELTTKRVVDRIMGSLNEDEINTLIDLLSKVK >NZ_CP009268|3682971:3785301|3715120_3715642_-|WP_003446000.1|DBSCAN-SWA MKKIIDVDMDKCLGCHTCEMECAIEHSNSKNLFSAIQEIPIPQYRMSVEFINGSNIPWQCRHCDYAPCETVCPTASIGRKNDEAPIVINKSKCIGCKMCIQVCPFGVLKISKADNTVIKCDFCIKRLEGEKEPACVKGCPTNALKLITLEELSNKKKEATKQRFLSAFKNDDD >NZ_CP009268|3682971:3785301|3778361_3778688_-|WP_003445883.1|DBSCAN-SWA MSKLKSITANCPIDLTINILSGKWKIAILWNLSKGAVRFNELKRMLPGITHKILTMQLRELERDKMIYRKVYNEIPPKVEYGLTEVGKSIRPVLKSMCDWGKEYKNLI >NZ_CP009268|3682971:3785301|3752944_3753397_-|WP_034830067.1|DBSCAN-SWA MKNNKLYNAIVEVNTKGTFQQQAWSLCREEKTYKKLIIEYRKQIADIDGINVPVLKKDLELMLNKYEIRLDNVKNEMCYLNKRIIDSLEVIEPFVDVEVFVELFGLDYNDYDENESFYNNLLTSSTRVGHVCRQGLIWNEKILISEMEEK >NZ_CP009268|3682971:3785301|3685229_3686300_-|WP_003446396.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP009268|3682971:3785301|3694581_3694803_-|WP_003446383.1|DBSCAN-SWA MRDEVIEVLDEIRPALQRDGGDVKFIDVTEDGVVKVELQGSCSGCPFSQMTVKNLIETELKNKIPEVKAVVGV |
102 | Clostridium_phage(47.37%) | portal,tail,transposase,protease,head,terminase,integrase,tRNA,capsid | attL 3731790:3731849|attR 3768454:3768529 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
4024668 : 4081958
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP009268|4024668:4081958|DBSCAN-SWA AGTGCATAAAATAGAATATCATATAGTATGGGTAACAAAATATAGATATGAGATGTTAAATAAAAGTATGAAAATAAGATTAATAGAATTAATAAAGCAGAGATGTGACGCAAGAAATATAAAAATATTAAAAGGATGTATTGTATAAACTATAACTGTGCCAAATAATAATTAAAAATCTGTCCACTAGTATTTTCCAAACCTTTTATACAAACAATATTTAGGTAATAATATTTTGTATAAGAGGAAGTGCAGAGGGTGATAGATTTGAATCAAAAACAGGATATTATATTAAAACATATTAGAGAAGGTAAATCTCAAAGACAAATAAGTAAAGAAACAGGAATATGTAGAGAGACCATAAGAAAATATGTTAGAGACTACGAAAATAAGCTTATTGAAGTAAATGATGACTTAGGTGAAATAGACAAAATTAATATTATTAATGATATAACATCTAAACCTAAATATATTTCATCTCCAAGAGTTAAAAAGGCTTTAACCGATGAGGTTATAGAAAGGCTTAAACAATTTTTAAGAGAGAATGAACAGAAACGATTAAGTGGATTATCTAAACAGCAGAAGAAAAAAATTGATATGTATGAGGTTTTGCTTGAAGAAGGCTATAATATCAGCTATCCATCTGTGGTAAATGCTGTAAACAGCATAGAAAGGAAAAAACGCGAAGCGTATATACGTCAGGAATACTCTCCAGGAGATATAGTAGAATTTGATTTTGGAGTAGTGAAATTACAAATGAATGATGGCACTATAAAGGAATTTCAATTGGCAGTATTTACGGCAGCTTACAGCAATTATAGATGGGCTAGATTATTTCCAAAACAGAATACAGGATGCTTTTTAGAAGCCCATGCTTCATTCTTTAAACATATTAAAGGTAACCACAGAACAGTTGTTTATGATAATACTAGAGTTGCCGTAGGTAAGTTTGTAGGGCATACAGAAAAAGAACCAACAGATGCTCTTCTAAAGCTGTCGCTATATTATAAATTCAGATTTAGATTTTGCAATGCTTACAGTGGTAATGAAAAAGGGCATGTAGAGAGAAGTGTAGAATTTATACGAAGGAAAGCATTTTCAAGAGAGCATACATTTATATCATTAAATGAAGCTAACGCTTATCTTGATGAAGTGCTAAATAAATTAAATTCAAGAACCTTATCTAATTCAAATAAGTCACCGTTTCAACTATTAGATGATGAACGAGAGTACTTATTACCGGATATGCCTCTATATGAAACAGCTTCTATTTCAGATCTAAGAGTAAATAAATATTCAACGATTATGGTAGATTCCTGTTATTACTCTGTACCAGATGATTATGTAGGCACAATGGTACGATGTAAGATATATACCACTAAAATTTTAGTTTTTTATAATGAAAAAGAAATAGCTACACATGATAAAGTTTATGGTATGAACTTGTGGCATATAGATATTATGCATTATTCTAAAACGCTTTTTAGAAAGCCAAAAGCACTTATTAATAGCACAGCCTTTAATCAAATGGATAATGTGCTAAAAGAAATTTACTCTAAATATTTTAACAGTAATGACCGAGATTTTGTGAAACTTATTGAATTAGTTGGTAACTATGGTCTTGTAACTATTAATAATGCCATCAAAAATCTACAGGAAGTATGCCCAACTAATATAAGTATTGATAAAATTGAATTTATCTGTTCTAGAAAGGATGATCCTAAAATTATATATCTGGAAGATCATGATGATGAAATTATGAATAATTCACTTAATATTTTAAATGAATTTAACAGTCTTCTAAAGCAGTAAAAGATGTTTATTTTGTTTTGGGTATCTTAAAAAAATCCGTTAGGATTGAGTTTACAAGATTATATATGTATAAGGAGAAAAGCATGATTGTTACTAAAAAATATATAAATGACTTAAGAGAACATTCATTTTTAAATATATCGAAAGATATGGAAATTTTTATTCTTGAGAAGTTTGGCAAAGAGCCAGAAGCAGACGAAGAAGGATATGTTTATGAATATACAGAACAAGATATTTATGAACAGATAAGGAAAATACTTAGAGCTAAGTAAGTACTTAATTTTAATCTACTACTTGAAAATATCTTTTTTAACCATATATATTGTGTTTCAAAAAAACATTCAAGGGAGTGACTTTATGGATGCTAAGAATTCATTTATTAGTGATATAAAAACATATGCTAAAATAATGAAGCTGGGAGTTATAAAAAGTGATATTGAACAGTCAATTGAAGATGCTAACACTAATAACCTTAGTTATGAGGAATTCCTATATGGACTTCTTCAAAAGGAATGTGATATAAGAAAGTATAATTTGACTCAAAGCAGAATTAGAACAGCCAGTTTCCCCTATAAAAAATATTTAGAAGATTTATCAATTGAAGATTTACCAGCTGACGCTCAATTGAAGTTAAAGCACCTTAGCGGCTTAAAATTCATAAAGGACGGGCAGAACGTAATTCTTTCTGGAAACTGTGGAACAGGGAAAACACACATTGCTATCGCATTAGGAATAAAGGCATGTTTAGAAGGATATAAAGTATTATTTACAACTGTACCTCTTTTTATTACACAATTAAAAGAATTAAAATCTACTAAAAGTTTAAGAGGATATCAAAATAAACTTTCTAAATATGATTTAGTTATATTAGATGAATTTGGATATATATCTTCTGACAAAGAGGGGGCGGAGCTCCTGTTTACTAATATCTCTTTAAGAGCAGGCCAAAAATCCACAATAATTACAACTAATCTTTCTTTTGACAGGTGGGGTGAAATATTTGGCGATCCTGTGATGACTGCTGCAATGACCGATAGGTTGACTCACAAATCTTACGTTGTTAACATGAATGGAAATTCTTATAGAATGAAAGAAACTAAGGCTTGGTTAGACACTCTTGAAAACTAATTTCCATCTTTTGGTGGAAAGGATTTTAATTATATTTTGGACTGAAAATTATGTATAAAATACACCTTGCTGTTCTATCTTATGCATGGAAAGAATGGCCTTTATAACTATAGTAGTATTAGGACCAATACTCTTTGCCCATGAAATAAATCTTTCTGCATTCCAAGTAATATATTTTTTATGGTCTTCAGGTATGTGTTCTTCAACAGTACTATATTGGCCTTCTCGGCCGTGTAATTTGGGGTGGGAACAAATACGATGATTGTTATAAAAAACTTCAATTATATTACGTGTAATTCGTGCATCTACTTTATGTTTAATATATTCATAAGGAACACTATAGTTCATTTTCTCCACATTTATATGGTAATTAAATTGAACTGTGGCAATTTTCCATGTAGATAATTCATATTGAGTTTTTGGTAACGGAATAAGTGCTAATTTTTCTTCTTCAAGAAAAGTACTTAGCCTGCTTCCAGGCTTCTTTTGGAATGGCTTATTATTGAATTCATATAATTTTGAGCTTATAGCTTCATTCAATTCTCTAAGTGAAAAGAATTTTTGATGACGAAGTGCTACAATAATCCAAGTGGAGATAACACCTACAGTGCCTTCGGCATTAGGCTTATCTTTGGGTTTTCTAACACGAGCTAGAATTACTGCTGTTCCATAATGCTCAGCCATTTCATGATAAGTTTTATTTATAACAGGAGTATACCAAGATGTTCTTTACACACCTGTTTTCAAATTATCCGGAATAAGAATTCTTGTAACTCCACCAAAAAACTTATAGGCATTAATGTGGGCAGTAATCCAACATTCCTGATTTGGGGATGTAAAAGCCTCAACGTAAGCATATTGACTAGATGATAACACGGCAACAAAAATGTAGGCATTGATAATATCACTAGTATTTCTATCAACAATAGGTGATGTTTGGCCTGCCCAATCAACTTCTAATTGCTCACCAGGTTTGCGGTTGATATGCATTGTAGCTTTTGTTACATTGGCATAATCGCGATAATATTTGCAAAATTGAGTATACATAAAAGGGACTTCATTGCTCAACCTGTATGCTTCGCAATACTCATTCCAGAGTAAGCTAAGGGTTACACCACTTTTAGCCATTTCCTTGTGGATATACTCACAGTCTGGAAGTCTTCTTGAAGAAGAGAGAATTCGTTGTGGAAAAAGTTTTTAATCAACTCATCATCTGACATATCTTGAGGTAATGGCCATCCAATTCCACAAGCTTCAGCACGTTTTAAAGTCCTTGATACGGTGTTGCGAGAACACTCGCAACTTAATGCAATACTACGCTGACTAATACCTTGATTATACAATCGTAGTATTTCTCTATATCTGGTCATAATAATATGACCTCCTTTGAATTTATTTACACTAAAAATAGCTTATAAACTCATTATTGACAAAAAATATGTAGGTGAATCACCCAGCGTTAAGGTGGCTCAAATTATTCCGTGAAGGTGGCTCACTTTCAACATATCAAGTGCTCTAACAGAGCATATTATTCACTATTTTGTCAAATTCCACACAATTACCATTGTGTGGAACTCATAATCTTCAATTTTAATAATTTTATAATAATCTCTTATTATTTTTTTAACATTAAAGGAACTACTACTATACATATTAATATCAAAGCTAAAATAATTACTATTATTGCACTTTTCTTTTTAGATATCTTTGCTACTGTAGAAATTCCTATAGCCATTAATACCCATTGCCATATAGTGAATATATCATATGATTTTAATATTGTATTAATATAATTAGGATTAGTTTGTGCTGAAATATTCATCGGTTTTTTACTTATAAGCATATATAAAATTTTTATTATTAAACCTATAACTGTAGCCATATAAGCAGTAGTATAAATTGATACTACCTGTCCATATTTAATTTTGCCTTTTGCTGCTTTTATGAATAACATATATACAAAAGAAGCTATAAATATTGTTATTAGAGCAATTATTATAGTTGTTATTATTATTACTGGTATAGAAGAGATAACACTAGTGGTACTCTTTACTATACTA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56 | Streptococcus_phage(18.75%) | holin,tRNA,transposase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
4268821 : 4325166
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP009268|4268821:4325166|DBSCAN-SWA TGTGAAAGATGTTGAACCTCCAAAATATAAAAGAAAAGAAGCAGATCACTATGAAGTATCTGAGGTAGCATTATTAGTAGATGCTTTGGAGAGTGAGCCGCTTAAATATAGGCTTATGGTTTTACTTACTTTATCCTGTGGATTAAGAGCTGGAGAATTAACTGGACTTAAATGGGATGATATAAATTTTAAAGAGAATACAATTAAGATAAATAAGGCTACCCAATACCTCCCCATGAAGATGTATTTGAGAAGGATCCTAAAAAATGAAACATCAGAAAGAATTATATCTGTGCCTGAACATGTTATGGATCTATTATCTGTTTATCAAACTGAATATGAAAATAAACAAGAAAAGCATGGAGATTTATGGGAAGATACTAATTATATATTTACTAAATGGAATGGACTGCATATACATCCTGAAACACCAGGCAAATGGTTTAGCAAAATGTAAAAAAGGTATAACTTAAAAAAATAACATTTCACCAGCTTAAGCATACATATGCTACTTTGTTAATTTCTAGTGGACAAGAAATAAAATCTGTTTCAAAAAGATTAGGACACAGTAACACAACTACGACATTAAATATCTATACTCATACTGATAGATCCTCAGACAAAAAAGCGGCCGAAGAAATGGAGAAAATTTTATTTAAGAATGATGAAAAATGAGGTTGATTTTTGAGGTTTTTATACCTTTTTAGGCATTTGTGTTCCCAACTTTGTTCCCAAGTGCCATTTTTATAGGTTTATGATAAAAATAAAAACCTTGTAACACGTTGACATTACAAGGTTTTACTGGTGCTTCCGAAGTGATTTGAACACTCGACCTACTGATTACGAATCAGTTGCACTACCAGCTGTGCTACGGAAGCATATATTCACTATTTTACCAATATATTATACTACAAAATAAAACTCAAATAAACTTTATTTGAATAATCAGAATAATAAAACTTGAAAATATTACTATTCCAAGTTTTATCTATCTTTATATTAATGCATTTATAACCAACACCCCTATTAATCCCATAACTGAAATTATTGTTTCTAATGTTGACCAAGATTTCATTGTCTCACTAATGCTAAGTCCAAAATATTCTTTAAACATCCAAAAACCAGGATCGTTTACATGTGAAAATATAAGACTTCCTGCTCCCGTTGCCAGTACCATTAAAGCTGGATTTACACTTGAAGAAGAAATCATTGGTAAAACTATTCCTGCAGTAGTCATAGCAGCAACTGTAGCTGATCCCAAAGATAAGCGTAATATAGCTGCTATTGTCCATGCTAAAATTAAAGGTGATATATTTGTTCCTGACATAATTGTTGCTATATATTTACCAACTCCACTATCAATAAGAACCTGTTTTAAAGCACCGCCGCCAGCTACTATCAATAATATCATAGCTATCCCACTGGCTGCTTTAGCTACACTTTTCATTACATCTTCCATCTTTTTACCTCGCATTATTCCTAAGGTAAATATGGCCACTACAACAGATATAAACATCGCCATTAAAGGACTACCGATAAATTCTGCAAACTGTCTTAATTGAGAGGTCTTTGCCAATGTCATTTCACATATAGCAGAAAAAGCCATTAATATAGGTGGAATTATAGCTGTCAAAACGCTTGCTGAAAAACTCGGCATTTCTTCTTCACTAACAATTTCTGTTTTAAATAAATTTTTATTTGCCTTATGATCAAATTTCTTTGTAAATTTGGTCAAAACTGGCCCAGCTACTATTACTGTAGGTATAGCTATTATAATGCCATAAATTAAAGTCATACTAACGCTTGCCCCATATATTGTGGCTATAGCTACAGGCCCTGGATGAGGTGGTAAAAATCCATGAGTAACTGATAATGCTGCTGCCATGGGAATTCCTATATAAAGTAATGGCAATTCAGCAAATTCAGCAATAGTAAAAACTAATGGTATAAGAAGCACAAAACCAACTTCATAGAACATAGCTATACCAACAATAAAACCTGTAAGAACCACTGCCCACTGTATTCTTTTTATACCAAACTTATTAATAAGGCTTCTGGAAATTCTTTGAGCTGCTCCAGAATCTGCTATAAGCTCTCCAAACATAGCTCCAAAACCTAAAATTAATGCTAAACTACCTAATGTACCTCCCACACCATTTTGTATAGAGGTTATAGTCTTAGCTGGTGTCATTCCTTCAGCAAGCCCAACCACTAGTGCTACAAAAATCAATGATATAAAACCGTTTAACTTGAACTTAATCATAAGTATTAGTAACAATATAACACCCATGAGGACAATAAATAATGGCATAAAAATCCCTCCCAAACATTTTTTAATTTTAGGTAAATAACTAATTTTATATTTCTGTTTTTTACCACATTATTTTTCTAAAACGAATAAAAGAATAGTTATATGAAATGACAACATTGATACTCATTGCTATAGGAAATAAAAATATCAAGATATAGATATCGCAATTAAACTATAATTTAAATAAGCTATTTATTATCAATATTTAATTATAAAATTAAATATTGACACTTAATTTACTATAAGTAAACATTTTCAGTAAATGTTGTTTTAAATTCGGCAAGAAATTCAATCATTAATTAAGGAAAATTATTATCTAAAAACTTTAGAAAAAATTATCAAATATTAATTATAAAAATTTACTTACCGAATTTATCTAATTTGTATATCAATTAAACTTTATTATATAATTACTCCATATATCCACCCTTCATTGGTGATACAGCACATTTTGTATATATACCTAGTACACCTTTAGTAAATCTAGGTGAAGGTTTTACCCATTTTTCTTTTCTTCCTTTTAATATAATATCAATCTCCTGTGGTGTTTTTTCTTCACCAGCTACCCCTATTATATCAAGACTTCTTTCAGGTATATCTATTTTTATAAGATCTCCTTCTTCAACAAAAGCTATTGGGCCACCTTCACTTGCTTCTGGTGAAACATGTCCTATAGCTGGTCCTCTAGTTGCTCCAGAAAATCTTCCATCTGTAATTAATGCTATAGATTCTACTAATTCTTCATCTGATGCTATAGCCTCTGTAGTGTAAAACATCTCTGGCATTCCAGATCCCTTAGGGCCTTCATATCTTACAAATACTGCATCTCCAGGTTTTACTTTTTTAGTTAATACTGCATTTATAGCATCCTCTTCACAATCAAAAACTCTAGCTTTTAAAGTTACTTTCATTAATTTTTTAGATACAGCAGAATGTTTTACTACTGCTCCGCCAGGTGCTAAATTTCCTTTAAGTATAGCTATTGCACCTTGTTTTTGTATTGGATTTTCCTTAGTCTTTATTACATCTTCTTTTTTAACTCCAAGTTTTTCAATAAGCTCTTTGTGTTTTTCATAATATCCGCTTTTCTTTATATCCTCTAAATTTTCACCTAAAGTTTTACCTGTAACAGTCATTACATCTAAATGTAAGAACTCTTTTATTTCTTCCATTATTGCAGGTACTCCACCAGCATTCCAGAAATATGATCCTGGATAAAAACCACTTGGTCTTACATCAAGAATGTATGGAATTTTTTTATGAATTTCATCAAATAGTTCTGGTTCTATATCTATTCCTAATTCATGAGCTATAGCTGGAATATGAATTAATGCATTACTTGAGCCTGCAATAGCCGCATGTACCATGATTGCATTTTCAAAAGCATCTTTAGTCATTATATCTGAAGGTTTTATATCCTTTTCTATTAATTTAAATACTTGTTTCCCTGCTTCTTTTGCAGCTTCTTTTAAATTATCAAAAACAGTTGGAATTAATGCTGTTGCTGGTAAAGCCATACCTAATGCTTCTGACATAACCTGCATTGTTGCTGCAGTTCCCATAAATGAACAAGCACCGCACGTAGGACAGGCATTATGTTTATAGTATCTATATTGTTCTTCAGTTATTTCTCCTCTTTTATATTGAGCATCATATTTACCAATTTGCTCAAGTGTCAAAAGATTAGGTCCAGGCCCCATACATCCACCTGGCAAAAATATAGCTGGCATATTTAATCTGGCAATTGCCATTAAATGTGCGGGAACGGCTTTATCACAACTTGTTGTAAATACACCAGCATCATAAGGTGTAGCTTGAACATGTATTTCAATTAAGCTTGCCATTATATCTCTAGAAGGAAGTGAATAATTCATACCATCATGTCCTTGAGACTCTCCATCACATATATCTGTTGCAAAGAATTTAGCACCTCTACCACCATTTTCATATATACTATCAAATACTTCATTTACTAAAGAATCTAAATGTGCACTACCGGGATGGCTATGTCCATAACTACTTTCAACTATTATCTGTGGTTTTCCAAGATCTTCAACCCTCCAACCTGATCCAAGTCTCAATGAATCAATTTCTGGAGCTTTCTGTCTTATTTCTTGACTTTTTAACATTCAAATCACCTCATATTTAATAGAATCAATTGTATTACAACTTAAAAAAATAATTTATTATTTTTTTATATTTAAAGTTTAGAATAACTTACTTGTATTACAACTTTATAATACTCTGTAAACGTTTTTTAGTCAATAGATTTTTAAATTAAATGTTAAATAATTTTTTTATTATGTATTAAATATTGTGGATAATAAAAAAGTTATAATTTAAATATAATTTGTAAATACACTTATTAAATAGGATTGAGTATTATAAGTCTTATATTATAGCATTTATAACTAATACACCAACTAATCCCATAACTGAAATTAAAGTTTCAGCAACCGACCAAGACTTTATGGTCTCTCCTATACTTAAACCAAAATACTCCTTAAACATCCAAAATCCTGGATCGTTTACATGAGAAAATATAACACTTCCAGATCCCGTTGCTAATACCATTAATGAGGGATTTACATGAGTTGTAGCTATAAGTGGTAATACAAGTCCAGCTGTGGTTAATGAAGCTACCGTAGCTGATCCCAAAGCCAGTCGTAATACAGCTGCAATAGTCCAT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MKDVEPPKYKRKEADHYEVSEVALLVDALESEPLKYRLMVLLTLSCGLRAGELTGLKWDDINFKENTIKINKATQYLPMKMYLRRILKNETSERIISVPEHVMDLLSVYQTEYENKQEKHGDLWEDTNYIFTKWNGLHIHPETPGKWFSKM >NZ_CP009268|4268821:4325166|4269333_4269495_+|WP_158380949.1|DBSCAN-SWA MLISSGQEIKSVSKRLGHSNTTTTLNIYTHTDRSSDKKAAEEMEKILFKNDEK |
59 | Clostridium_phage(81.08%) | holin,transposase,protease,terminase,integrase | attL 4288049:4288066|attR 4334481:4334498 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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