Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP009056 | Frischella perrara strain PEB0191 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
160543 : 168586
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009056|160543:168586|DBSCAN-SWA AATGAAACTTCCAATTTATATGGACTATGCTGCAACAACGCCGGTCGATCCACGTGTAGCAGAAAAAATGATGCAATATTTAACGTTAGATGGCGTTTTTGGTAATCCAGCCTCCCGTTCGCATCGCTATGGTTGGCAAGCAGAGGAAGCCGTTGATATCGCTCGTAACCAAATTGCAGATTTGATTGGCGCTGATTCGCGTGAAATTGTTTTTACATCAGGTGCTACCGAGGCAGACAATTTAGCAATAAAGGGGGCTGCACATTTTTATCAATCAAAAGGTAAGCATATTATAACTTGTAAAACCGAGCATAAGGCGGTATTAGATACTTGTCGTCAGCTTGAAAGAGAAGGTTATGAAGTTACTTATTTAGCGCCAGAATCCAATGGTCTGATAGATCTTAATAAACTTGAACAAGCCATGCGGGACGATACAGTCGTTGTCTCTATTATGCATGTAAATAATGAGCTCGGTGTTATCCAAGATATTGAAAAAATTGGTGAGCTATGCCGAAGCCGTGGTATTGTTTTTCATGTTGATGCGACGCAGAGCGTTGGTAAATTACCGATTGATTTAACAAAATTAAAAGTAGATTTAATGTCATTTTCAAGTCATAAACTGTATGGACCTAAAGGAATTGGTGGTTTATATGTAAGACGAAAACCTCGTATCCGGATTGAAGCACAAATGCATGGTGGTGGTCATGAACGAGGTATGCGTTCTGGTACTTTACCTGTACACCAAATTGTCGGTATGGGTGAAGCTTATCGTATTGCTAAAGAAGAAATGACTAGCGAAATGCCACGTTTACAAGCATTAAAAGAACGGTTATGGAACGGTTTGAAAGATATAGACGAAGTTTATCTTAATGGATCGATGGAAAACAGTGTAGCGAATATCCTTAATGTTAGTTTTGCATATGTTGAGGGTGAGTCATTAATGATGGCATTAAAAGATTTGGCTGTGTCATCAGGTTCTGCTTGTACTTCTGCCAGTTTAGAACCATCTTATGTGTTACGCGCATTAGGTCTTAATGATGAGTTAGCCCATAGCTCAATCCGTTTTTCTTTAGGCCGTTTTAGTACTGAAGAAGAAATTGATTATGTGATTAAGTTATTACACGATTCAATTGGTAAATTAAGAGAGTTATCGCCATTATGGGAAATGTTTAAGGATGGAATCGATCTGTCCCAAATTAAATGGTCGGCTCATTAATCACAATTAAACGAGGAAAATTTTATGGCATATAGTGATAAAGTAATTGATCATTACGAAAATCCTCGTAATGTTGGTTCATTTGATAAGAATGACCCAAATGTAGGCAGTGGTATGGTAGGCGCACCGGCATGTGGTGATGTGATGCGTCTACAAATCAAGGTCAATGATGAAGGTATTATTGAAGATGCAAAATTTAAAACTTACGGTTGTGGTAGTGCGATAGCATCAAGCTCACTGGTAACTGAATGGATTAAAGGTAAGTCTTTAGATGAGGCTAGTGCAATTAAGAATGTTGATATTGCACAAGAATTAGCTTTACCGCCAGTAAAAATACACTGCTCCATTCTTGCTGAGGATGCTATTAAAGCAGCAATCGAAGATTATAAAAACAAGAAAAATAAATAAGCTAGCTTTCAGGTAGGTATGTTTTTGAGCATATATTCTGGAACAAGTTACCTTTCAAAATTAGGTATTAGCTAATTTTTTGTAGTTGTTATACATAATGCTTCGTTTCTAGCAATGACGTTTATAGCATTATGGCAATATTTAATAGAGGAAGCAGATATGTCAGTTACTTTAACTGAAAGTGCAGCGGTACGTGTACAGTCTTTTCTCACTAATCGAGGTAAAGGTGTTGGTCTTAGACTTGGTGTAAAAACCTCCGGTTGTTCAGGAATGGCTTATGTTCTTGAATTTGCTGATGAAATAAATGATGATGATACAATATTTGAAGACAAATCAATCAAAATTATTGTTGATACAAAAAGCCTTGTTTATCTTGATGGAACCGAGTTAGATTTTGTCAAAGAAGGATTAAATGAAGGATTTAAGTTCAATAATCCAAATGTCAAAAATGAATGTGGCTGCGGCGAAAGTTTTAACGTCTAGTAGCTAAAACCTTTGAAAAGGGGACAAATATGAAAAATAACTATTTTGATTTATTAGCGTTACCAATGATATTACCGATCAATTTGTCCCAACTGAGTTTGAATTATCAACAGTTACAGAAGCAGTATCATCCAGATAATTATGCAACGGCTTCAGAAAGTGAGAAAATGGCGGTTGTTCAAAAATCAGCTACAATAAATGCTGCTTATCTAACTTTAAAAGATCCGATTAAAGCTGCCGAATATCGAGTAGCTTTAGAGGGAATTAATATCAATGAAGAACAGCAAACCATTCACGATAGCGAATTTCTGCAAGAGCAGTTTATGTTACGTGAACAGCTTGATGAAATTGATCAAGTTCATGATTTTGAAAGGTTAGAGTTATTTTACGATGAGATTCTCAAACGTAAAAACCAAGTTTATTTACAATTATTAGCTTACATTAATCAATCTAACTGGTTAGCTACCAAGCAACCATTATATCAACTTCGCTATTTCGTAAAGTTGATTGAACAAATAGAATTGCAACAAGAAAAACACTTTGATTTATAGTACTAATCTATAAATCATTTATTCTAAAGAGAACATTTCATGGTTTTATTACAAATCAGCGAGCCAGGGCAAACTCCCCCTCCACATGAACGACGTATAGCAGTTGGTATTGATCTGGGAACAACCAATTCGCTTGTGGCAACTGTGCGTAGTGGGCAAGCCGAAACTTTACCTGATTTAGAAGGTCATCATTTATTACCTTCTGTTGTTCATTATGGTTTTGATCATGATGGTAATAGTATCACCACTGTCGGTGAGAAGGCAAAAAATGGAGCAGCACTGGACCCAATTAATACGGTGAGTTCAGTAAAAAGAATGATGGGGCGTCATGTCGATGATATTGATTTTCATCATTTGCCCTATAAGATAACTGCCAGTGAAAATGGTGTGCCGATTTTAAATTTACCAAATAAATCAGTCAACCCGATTCAAGTTTCTGCTGATATTCTAAGAGCATTAATAGAACGGGCAAAACAGTCATTAGGTCAAGAGCCTGATGGTGTTGTCATTACATTACCTGCTTATTTTGATGATGCGCAGAGACAGGCAACAAAAGATGCTGCTAATTTAGCCGGTTTGCATGTTTTACGTTTGTTAAACGAACCTACAGCAGCTGCAATTGCTTATGGATTAGATTCTGCACAGGAAGGTGTAATTGCTGTATATGACTTAGGTGGAGGTACTTTTGATATATCTATCCTTCGTTTAAGTAAAGGCGTGTTTGAGGTGCTAGCCACTGGGGGAGATTCAAAATTAGGTGGCGACGATTTTGATCAGCAATTAGTAACATGGATTGTTGAACATGCTAAGATTGAGAAACCTGATGATCCCTTTATCCAACGTCAATTACTTGATTTGGCTAACCAAATTAAACAGCAGCTATCAATCAATGAAGAAGTTGGAATTGAATTTTACGGTTGGAATGGCAAAATTAGTCGTAGTGAATTCAATCAGTTAATTGAACCTTTAGTTAAGAAAACGTTGTTCGCTTGTCGTCGTGCATTAAAAGATGCCAATGTCACTCAAGAAGAAGTCGTTGAAGTTGTTATGGTGGGAGGTTCAACTCGGATCCCTTATATACGTGATAAAGTTGGACAGTTCTTTGGTCGTACTCCTTTAACGTCTATTGATCCTGATCGTGTTGTGGCGATTGGTGCTGCTATTCAAGCCGATATCTTAGTAGGTAATAAACCCGATGCAGATATGTTATTACTTGATGTAATTCCATTATCATTAGGTATTGAAACCATGGGGGATTTAGTAGAAAAAATAATTCCACGTAACACAACTATCCCTTGTGCTAGGGCTCAGGAATTTACAACATTTAAAGATGGTCAAACCGCTATGATGATCCATGTTCTACAAGGTGAACGTGAAACAGTTGCGGATTGTCGTTCTTTAGCTCACTTCACTTTGCATGGAATACCGCCAATGCCTGCTGGCGGTGCTCATATACGTGTTACTTTCCAAGTAGATGCAGATGGGTTATTAAGCGTCACTGCCATGGAGAAGTCTACTGGTATAAATGCGACAATTCAAGTCAAACCTTCTTACGGACTAACCGATAAAGAAATTGCATCTATGATCCAAGATTCATTAAGTTATGCCGAATTGGATAAACAAATTCGTCAGTTAGCAGAACAAAAAGTAGAAGCCGCACGAGTATTAGAAAGTCTAAATGCCGCACTTGAAAAGGATGTCGATTTATTATCACAATCCGAGCTTAATGCAATATTAGCCCAGAAACAAAATTTAGAGGATAAGATGACTGGCGAGAATAGTGCAGAGATCGAAAAACAGATAAAGGCATTAGATCTATTAACCCAAGATTTTGCGGCAAAAAGAATGGATCGATCAATTAAAGATGCGCTAACTGGCCATCGTGTTGATGATATATAAGCTTTGTATTTAATGAGAGAATAATTATGCCAAAGATTACTTTTTTACCTAATGCCGATCTTTGTCCAGAAGGTATAACCATTGAGGCCGAAAAAGGTGAGTCAATTCTAGATGCTGCTTTGCGCAATGATATTGAAATTGATCATGCTTGTGAAATGTCGTGTGCTTGTTCGACATGCCATTGTATCGTGCGTAAAGGTTTTGATTCTTTAGAACCAAGTGATGAGCAAGAAGATGATATGCTAGATAAAGCTTGGGGAGTTGAACCACAAAGCCGACTAAGTTGTCAGGCTATAGTTGAAGATGAAGATCTGACGGTGGAAATCCCTCGTTATAGTCTGAATCATGCTAAAGAAGATCATTAATTAAATCATCAGATGCCTTATAATATTTAAGGCATCTGGTTTTACAATTAGTGTTGTAAGATTTATCGTCTTTAATGTTGGTTAATTACTAATTTATTTAAATAATATTACCCACAATAAACCATGCTTTGCGTGAATTTAAAAAATCTTGGGCAGACATCGGTTTTTTGCCAGCTGGCTGTAATAGCGTCATATTTATGACACCATTTTGAGTTGCTATTTGGATACCTGATTTATCAGCTCGTAGAATGGTTCCCGGCGTCTTATCTGTTGTTTCAGATATAACATTTGCTTGCCATACTTTAATTAGTTCACCATTTATTTCAAAATAACTAACGGGCCAAGGGTTAAATGCTCGTATGCATCTTTCAAGTTGAGTTGCCGTCAAATTCCAATCTAATTTGGCTTCTTGCTTAGATAACTTAGTCGCATAGGTTACTTGTGATTCGTTCTGCTTTTCGGGTTTTGCTTTCCCTTCTATAATAAGCATTAAAGTCTTTAGTAAAGCATCTGGACCGATTTGTGCTAATTTATTATATAAAGTTGCACTGGTATCATCGTCTTCTATATGACATTTTTCTTTATATAGCATATCTCCGGTATCTAAGCCTACATCCATTTGCATGATCGTTATACCTGTTTCAGTATCACCAGCCCAACAAGCACGTTGGATAGGTGCAGCACCACGCCATCTTGGAAGTAACGAACCGTGAACATTTAGACAGCCATATTTAGGCATATCTAAAACGGTCTGTGGAAAAATTAATCCATATGCTACAACAATCATAATATCAGCATTCAGGTCAGCAATAATTTGTTGATTAGCTGAATCTTTTAAGCTTATGGGTTGATATACCGGAAGGTTATTTTGCAAAGCAAGTTGTTTAACGGGGCTGGCTGTGAGTTTATTACCGCGACCGGCTGGTTTATCTGGTTGGGTAAAAACGCCAATGACTTGATGAGGTGAATTTAGTAATGCCTGCAAGTGTTTAGCCGCAAAATCGGGCGTACCAGCAAATATAATTTTAAGTGATTTATTAGCTTTGTTTTCTGTCATACTTTTTACCTGTTAATCCTATCGGGATACATCATCATATACTCAATATATTATGAGATTTGTTGTATATACTTATATTATAGCAAATGATTGTTTTCAATGTGAGTGAGTTGGTTCTGGCTCAAATTAAGATTGTTATTAATATCATTACCTTTTTGATATATTCAATTGAAACAACGTGTGTCTAAAATGGGAAGAATAATGGCACTAATATTACATCCACGATAAGTACTAAACAGGTTAATGGTACGCCTACTTTAACAAAGTCGCTAAAGCTAAATCCTCCGGGTGCAACAATCATCGATTTTACTGGTGACGACACTGGTGTGATAAAAGAAGCAGACGTAGCAATGGCGACAGTCATGGCAAATGGATAAGGTGAATAGCCGAAGCTAAGAGCAATGTTAATGGCAATAGGGGCAATTAATATTGCCGTCGCAGTATTACTAATAAATAAGCCTACCAGTGAACAGAGTAGAAAAATAAACGTTATTGCTACATAAGGTCCATAACCACTTAGGTGTGCTTTTAGTAAATCAGAAAATAAATTAATCCCGCCTGTTTTATTTAATGCAATAGCGAAAGGCATCATACCAATAATAAGAATTAAACTTGGCCAATGAATTGATTTATAAGCACTTGCCATATCAATGCAACGTGTAAGTCCCATTAATAAACAGGCAATCAACGCGGCAACTACATTCGGAACTATACCACTAACCATTAAGATAATCATAATAGCAAGATTAATCAGTGCAGCAATAGCTTGAGAACTGGCTGGCGCTACGTCATCAATATCGGCAGGGAAATCAAGTACGACAAAATCATTCGTACGGGTTTGTAATTTTCGGATTGAGCCCCAATCACCGCAAACTAATAAGGTATCACTAATTTGTAACTTTTCTTCAAATAAATTGTTAGCTTCAATAGGTGCATGATTGCGACGAATACCAATTACCGTGAGATAGTATTTACTACGAAAATCAATTTCATTTAACGTTTTACCATATAATGACGATTCTGGTAGCAATGCTACCTCAGCCATACCCACTTCTTTTACTTGATCAGAAAAGTATTCGCCTCGTAGGATTTTAGGCTCTAACATGTAGGTATTTAAAAAATTTCGATAATCGTCATCAGAATTACAATAATCTAATAAAAGAACATCTCCTTGGTAAAATTCAGTCATCCTATTTACGGGGATGAGCACTTTTCTAAATTTCCGCCATCGTTCAATTCCAATTACGTTAACCCCTTGTTGGCTCCTAAGATGTAGATTATCAATTGTTTTACCAATGAAAGGTGAGCCAGGTAATATTTGGGCGCGATGCGCACGACCAGATAATTTATATTCTCGAATTAAATCGGTGATTTGCCTACGTGTTGGTGATTTTTGTGATTCATCTATTTGTTTTTTAGACACAAGCCAGTTACGGCTAATAACACAATAAAGCAATCCGACAATTAATACCCCAATACCAATAGGCGTGATTGAAAAGAATTTGAATCCTTCAAGTTCAACACGTTCCAATTCACTATTAACCACTAAGTTTGGTGCTGTGGCAACTAATGTCATCATGCCACTAATTAAAGCTGCAATGCATAATGGCATCATTAATTTCTTAACATGTATGCCTGAATGAGAGGCAATACTGATCACTACAGGAATAAAAATAGCAACGACACCAGTGGAACTCATTACAGAGCCTAATAAAGCAACACTCAACATAATTAATATAATGATTTGGATATCATTTTTACCAGCTACTTTAAGAATATACTCACTCATTTGATAAGAAATACCAGTTCTAACAAGACTTTCTCCAATAATAAATAACAAGGCTATCAAAACAATATTGGGATCACTAAAGCCAGATAATGCTTCGGTCGGTGTCAAAATACCCGTAACCATAATTGCTGTTATCGCAAGAATTGCGATTATATCCATACGTAATTTGGTAAAGGAAAAGAGTATGATAGTAATAAATAACAAACCACACACAATGAGTAATTGATATTGCTCCACTAGGGCAGGAGGTAAAAGAACAAGTAATTCTTGACCGAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009056|160543:168586|162325_162649_+|WP_039103304.1|DBSCAN-SWA MSVTLTESAAVRVQSFLTNRGKGVGLRLGVKTSGCSGMAYVLEFADEINDDDTIFEDKSIKIIVDTKSLVYLDGTELDFVKEGLNEGFKFNNPNVKNECGCGESFNV >NZ_CP009056|160543:168586|162678_163200_+|WP_039103305.1|DBSCAN-SWA MKNNYFDLLALPMILPINLSQLSLNYQQLQKQYHPDNYATASESEKMAVVQKSATINAAYLTLKDPIKAAEYRVALEGININEEQQTIHDSEFLQEQFMLREQLDEIDQVHDFERLELFYDEILKRKNQVYLQLLAYINQSNWLATKQPLYQLRYFVKLIEQIELQQEKHFDL >NZ_CP009056|160543:168586|165561_166521_-|WP_039103309.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTENKANKSLKIIFAGTPDFAAKHLQALLNSPHQVIGVFTQPDKPAGRGNKLTASPVKQLALQNNLPVYQPISLKDSANQQIIADLNADIMIVVAYGLIFPQTVLDMPKYGCLNVHGSLLPRWRGAAPIQRACWAGDTETGITIMQMDVGLDTGDMLYKEKCHIEDDDTSATLYNKLAQIGPDALLKTLMLIIEGKAKPEKQNESQVTYATKLSKQEAKLDWNLTATQLERCIRAFNPWPVSYFEINGELIKVWQANVISETTDKTPGTILRADKSGIQIATQNGVINMTLLQPAGKKPMSAQDFLNSRKAWFIVGNII >NZ_CP009056|160543:168586|165125_165464_+|WP_039103308.1|DBSCAN-SWA MPKITFLPNADLCPEGITIEAEKGESILDAALRNDIEIDHACEMSCACSTCHCIVRKGFDSLEPSDEQEDDMLDKAWGVEPQSRLSCQAIVEDEDLTVEIPRYSLNHAKEDH >NZ_CP009056|160543:168586|166705_168586_-|WP_110021842.1|DBSCAN-SWA MGQELLVLLPPALVEQYQLLIVCGLLFITIILFSFTKLRMDIIAILAITAIMVTGILTPTEALSGFSDPNIVLIALLFIIGESLVRTGISYQMSEYILKVAGKNDIQIIILIMLSVALLGSVMSSTGVVAIFIPVVISIASHSGIHVKKLMMPLCIAALISGMMTLVATAPNLVVNSELERVELEGFKFFSITPIGIGVLIVGLLYCVISRNWLVSKKQIDESQKSPTRRQITDLIREYKLSGRAHRAQILPGSPFIGKTIDNLHLRSQQGVNVIGIERWRKFRKVLIPVNRMTEFYQGDVLLLDYCNSDDDYRNFLNTYMLEPKILRGEYFSDQVKEVGMAEVALLPESSLYGKTLNEIDFRSKYYLTVIGIRRNHAPIEANNLFEEKLQISDTLLVCGDWGSIRKLQTRTNDFVVLDFPADIDDVAPASSQAIAALINLAIMIILMVSGIVPNVVAALIACLLMGLTRCIDMASAYKSIHWPSLILIIGMMPFAIALNKTGGINLFSDLLKAHLSGYGPYVAITFIFLLCSLVGLFISNTATAILIAPIAINIALSFGYSPYPFAMTVAIATSASFITPVSSPVKSMIVAPGGFSFSDFVKVGVPLTCLVLIVDVILVPLFFPF >NZ_CP009056|160543:168586|160543_161758_+|WP_039103300.1|DBSCAN-SWA MKLPIYMDYAATTPVDPRVAEKMMQYLTLDGVFGNPASRSHRYGWQAEEAVDIARNQIADLIGADSREIVFTSGATEADNLAIKGAAHFYQSKGKHIITCKTEHKAVLDTCRQLEREGYEVTYLAPESNGLIDLNKLEQAMRDDTVVVSIMHVNNELGVIQDIEKIGELCRSRGIVFHVDATQSVGKLPIDLTKLKVDLMSFSSHKLYGPKGIGGLYVRRKPRIRIEAQMHGGGHERGMRSGTLPVHQIVGMGEAYRIAKEEMTSEMPRLQALKERLWNGLKDIDEVYLNGSMENSVANILNVSFAYVEGESLMMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDELAHSSIRFSLGRFSTEEEIDYVIKLLHDSIGKLRELSPLWEMFKDGIDLSQIKWSAH >NZ_CP009056|160543:168586|161782_162166_+|WP_039103302.1|DBSCAN-SWA MAYSDKVIDHYENPRNVGSFDKNDPNVGSGMVGAPACGDVMRLQIKVNDEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWIKGKSLDEASAIKNVDIAQELALPPVKIHCSILAEDAIKAAIEDYKNKKNK >NZ_CP009056|160543:168586|163239_165099_+|WP_039103306.1|DBSCAN-SWA MVLLQISEPGQTPPPHERRIAVGIDLGTTNSLVATVRSGQAETLPDLEGHHLLPSVVHYGFDHDGNSITTVGEKAKNGAALDPINTVSSVKRMMGRHVDDIDFHHLPYKITASENGVPILNLPNKSVNPIQVSADILRALIERAKQSLGQEPDGVVITLPAYFDDAQRQATKDAANLAGLHVLRLLNEPTAAAIAYGLDSAQEGVIAVYDLGGGTFDISILRLSKGVFEVLATGGDSKLGGDDFDQQLVTWIVEHAKIEKPDDPFIQRQLLDLANQIKQQLSINEEVGIEFYGWNGKISRSEFNQLIEPLVKKTLFACRRALKDANVTQEEVVEVVMVGGSTRIPYIRDKVGQFFGRTPLTSIDPDRVVAIGAAIQADILVGNKPDADMLLLDVIPLSLGIETMGDLVEKIIPRNTTIPCARAQEFTTFKDGQTAMMIHVLQGERETVADCRSLAHFTLHGIPPMPAGGAHIRVTFQVDADGLLSVTAMEKSTGINATIQVKPSYGLTDKEIASMIQDSLSYAELDKQIRQLAEQKVEAARVLESLNAALEKDVDLLSQSELNAILAQKQNLEDKMTGENSAEIEKQIKALDLLTQDFAAKRMDRSIKDALTGHRVDDI |
8 | Tupanvirus(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
344892 : 359303
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009056|344892:359303|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009056|344892:359303|351759_352338_-|WP_039103529.1|DBSCAN-SWA MGVSLSKGGNVSLSKTDPGMKNVLIGLGWDVRATDGQDYDLDASVFLLAENGKVRNDLDFIFYNNLRSADGSVEHTGDNRTGEGDGDDESIKIKLDKIPANVAKLVFVVTIHDAAVRRQNFGQIEGAFIRLVNDDTQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLASVCAQYGINAS >NZ_CP009056|344892:359303|352376_353399_-|WP_039103530.1|DBSCAN-SWA MTTFLGFPIQTTIVFVCLLVGALFIDLFTHRKDKVISLRSAILWSVFWVIISLLFAVYLFYSYGSEVGSLFITGYALEKVLSIDNLFVMMAIFSWFSIPSKYWHRILYWGIIGAIIFRGIFVIIGTGLLSLGSYVELIFAFVVGWTAVMMLKNDDSDEEIEDYSQHLAYRLVKRIFPVWPKIYGHNFFINKKQVNEELAKPENKDLVINSGAKATIFATPLFLCLAVIEISDVMFAFDSVPAVIAVSREPLIIYSAMMFAILGLRSMYFVLDALKRYLVHLEKSVMVILFFIALKLFLNATDHLWGHGYNISASTSLIIVLTILALGIIASLLFPSKSEE >NZ_CP009056|344892:359303|355417_356326_-|WP_052236683.1|DBSCAN-SWA 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12 | Caulobacter_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
893491 : 901976
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009056|893491:901976|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009056|893491:901976|895079_895517_-|WP_052236744.1|integrase|DBSCAN-SWA MGNVDLKNRHAWVNIGSAKVKTKGIGIPLNSVALYVLENLKGKHPIHVFSYKGNPIKRANSKAWRNARKRAGLSDLRFHDLRHVWASRYSMNGTHPHALHLQDLGVWSKADTVRPYAHLSSRHLLVASENALSESVTNLTQRFLQ >NZ_CP009056|893491:901976|899510_900878_-|WP_039104212.1|DBSCAN-SWA MLLFLNVSIFSILLLGLIYIHFHYKTWTLSRKVFIALVAGLLFGIILQIIYSANNPAIISQSVEWFNIVGNGYVKLLQMIVMPLIFVSILSAVAKLHDAASLGKISSFVISMLLLTTLIAAIVAIIVSLSFNLSANELTSGIQEQARAIKLQEIKSNTLDNLSVPAMLLSFLPSNPFQDLAGLRSTSIMGVVIFAIFLGIAALKLLKDNQEQGATLLSGIIILQQWIMKLVRMVIQLTPYGVFALMVKMSATSDAKSMLSLGLFIIASYIAILIMFIIHGVLVMLVGESFIGYFKKITTIMAFAFTSRSSAAAIPLNIQTQETRFGVPNSIASFSASFGAIIGQNGCAGIYPAMLAMMIAPTIGIDLNLQFLVTLVFVVTISSIGVAGVGGGATYAALIVLPIMGLPIELVALLISIEPIIDMGRTALNVSGTMTSGIVTAHLLKQINKNQIEQN >NZ_CP009056|893491:901976|895932_896616_+|WP_039104204.1|DBSCAN-SWA MKRIILLSLFGLVLSACNTMKYNYVAETKQISYPDLNVVTKTFIGDDMVRQGTAALKDVIHFPQTTVVSRGVDFTIPAGEYSKVGEDQKYLFFGLNELNSGLTVRKSTFADIPAGIRTNKKDNELCIVTISGGSLCNSDASFFYQKKNVTYQNSFQQILIYNGKVGNKINIGYKEFNNDFVRPAFSNNVEYDLSESKTIRYKGAELEIIKATNQFIEYKVYSNFNLR >NZ_CP009056|893491:901976|898862_899366_+|WP_039104209.1|DBSCAN-SWA MLVNKNIKTAVELKPDSPNNENLDKKFNITDILTIWGIWARQQTLMHNKPYITTLACDHKPELILDDFEIVLIDSLITKLGRLKSIKSQNEYKVLKLFYFGELITIHDRSVIALQTISNIANKMHCDETNIKEIKRNAENYVIGLLAMQTMLTGIESDLFNRINLNN >NZ_CP009056|893491:901976|895504_895690_-|WP_052236745.1|DBSCAN-SWA MLDKVPAIKMLPEPPPRQVMLLHAQEKRLVDALSDHLIPIVLFALATGLRMSNITGFLWEM >NZ_CP009056|893491:901976|893491_893959_-|WP_039104200.1|DBSCAN-SWA MLKKIEIFTDGSCLGNPGPGGYAAILRYKQNERILSEGYYRTTNNRMELLAAIVALEAVKEKCYITLYSDSQYLRNGIMSWIFNWKKNGWKTSQKKTVKNADLWRRLDNVATVHQIDWHWVKGHAGHEENERCDVIAKEAANSPSKTDEGFIENN >NZ_CP009056|893491:901976|901172_901976_+|WP_110021801.1|DBSCAN-SWA MILTISLVANQAYADRLDDIQTRGEIKIAVFDSNPPFGYVDGKSKKIVGLDADYAKAIAEALNVKLKLVPTNPANRIPLLTAQKADLIVANFTVTSERAKAVDFSLPYFATGQKFVARKGVLKTPDDLKKMRIGADKGTVMEITLREQYPTAKVISYDDTPFAFTALKNGVVQAITQDDAKLIGLLANLPTKQREEFEISPFSITKEYQAVGIPKGEKRLLQEVNKMLLSLEEKGEAVNIYNRWFGPETPTAMPRGEFKIGEVEFSN >NZ_CP009056|893491:901976|898514_898697_+|WP_039104207.1|DBSCAN-SWA MYKITAQVKKGMQSWGTVILYRDFEMNKNDLIKSFESYVIDFEREIKVDVEVKNFQCIKI >NZ_CP009056|893491:901976|894046_894814_+|WP_039104202.1|DBSCAN-SWA MNANKTLVPNRQIILDTETTGMNQNGKNHYEGHRIIEIGAVEVVNRRLTGNHFHVYINPERLVDPEAFAVHGISDDDLRDKPLFKDIANDFIKFIDGGELIIHNAPFDVGFMDYEFRMAGINFVTASHCIVTDTLAMARRLFPGKRNNLDVLCERYQIDNSHRTLHGALLDAEILAEVYLAMTGGQTLLSFNQEENSSNNSISDKIAMEKIKRDNFNLKIIRANSSELAEHGRSLDKIDKKSGGSIWRKLDDLSS >NZ_CP009056|893491:901976|897689_898334_-|WP_039104205.1|DBSCAN-SWA MNNLGKRIKARREELGLTQQEIAEKVGIKQQSYQAIESGETKKPRNLYELSIALKCDLAWLLSGKEKEINNVEMVKIISHQVPLISYVQAGIWREICEIKDSTGFDYVMTSLELSEKAFALEIKGDSMEPEFKEGDIIIVDPIVKPMPGEFVVAINGDAEATFKKYREIGYDNFERMQFELVPLNPDYTTLSSLKQDIKLIGTMVEHRIFRRKR |
10 | Salmonella_phage(14.29%) | integrase | attL 889508:889522|attR 905324:905338 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1234060 : 1286321
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009056|1234060:1286321|DBSCAN-SWA 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53 | Vibrio_phage(11.54%) | tail,holin,plate,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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