Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009226 | Campylobacter fetus subsp. testudinum strain pet-3 isolate pet-3-1 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,WYL,DEDDh,csx23,cas10,csm3gr7,csx10gr5,csx19 | 0 | 5 | 2 | 0 |
1. NZ_CP009226
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009226_1 | 668865-670339 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009226_1
|
22 spacers
spacers of NZ_CP009226_1
>1.1|668899|34|NZ_CP009226|PILER-CR CTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTT >1.2|668967|32|NZ_CP009226|PILER-CR ATATTTACAACTCGATTTATTAAATTTGTTGA >1.3|668895|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT >1.4|668961|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT AAAATATTTACAACTCGATTTATTAAATTTGTTGAT >1.5|669027|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT AAGCATAGATTGCGGCTAATTTGTCCGTGGGATAGT >1.6|669093|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT TCTCTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTT >1.7|669159|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT TATAAAGAACTAACAGCTCTCTAGTTTCTGCTGATA >1.8|669225|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT CGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGCTA >1.9|669290|34|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT AAAGAAGCGTACGTGCATTCCGCACCTACTTTAA >1.10|669354|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT ACGGAAATTTCGTTGAAAGTCTTTGAAGTTTTAACG >1.11|669420|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT TCTTTTAATGCAGCTAAGATATCATCTATACCTTTT >1.12|669486|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTATTGCAATGTATGCGTCTTGCAGACACTCC >1.13|669552|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGAATTACTGCTTTTATGTTAGGGTCTATTTGGTGT >1.14|669619|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCGTGACGCCAACTAGCTTTTGTGCTAACTTAGC >1.15|669684|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGATAAGATTTTTGAAGAAAATGTAGCAAATGAT >1.16|669750|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATTAGCTATATTTATAAACTCCTATTTTGGTGTT >1.17|669816|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCGTACTCTCCTAACTCTTCAAATAAATTTCTTGTT >1.18|669882|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTCAATAGCTGTTTTTATCGGTAGCGCTATGGC >1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTACTATACGCTTCTTTAGCATTCTGTTTGGCT >1.20|670013|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTCGATTATTAGATCGCCCTCTACGTCTGCAAAA >1.21|670078|34|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTATCTCTGCTGGGAACACCCTTAATATTTT >1.22|670142|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAAGTTTTATTGCTGGTTTTAACTTAAGATTATTG >1.23|670208|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAACCCAAAAACGCTAAATTTGAGTGTGCAAAATAG >1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAACTATGTTGATGAAGCTTTAAAAAGAATAG >1.25|669225|34|NZ_CP009226|PILER-CR CGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGCT >1.26|669290|33|NZ_CP009226|PILER-CR AAAGAAGCGTACGTGCATTCCGCACCTACTTTA |
cas6,cas8b1,cas7b |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009226_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009226_1 >merge|NZ_CP009226|1|668865-670339|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR 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>NZ_CP009226.1|WP_023384766.1|667216_667954_+|YaaA-family-protein MKILFSPSESKMSGGSMDTPINFSWVFPNLNDKRLEILEIYNGFLKKANKNELQTLFGLKKENELEYYSSDLFSRPLMKAILRYNGVAYEHLNYRNLDESSRKIIDENTIIFSNLYGAILAKDMICDYKLKQGETIGGFRTEVFYKKYFSSVLDDFLDFDILDLRAGFYEKFYSITKPHTTIKFLKNGKVVSHFAKAYRGIVLRYIALNQISSLDEFYNMQIPNLKINKIIKNRLKTEIIVDIIG >NZ_CP009226.1|WP_023384765.1|666716_667220_+|HIT-domain-containing-protein MKHEFSPWRAEYFKTRKDGVMEHNCVFCDIAQNSQNDEENFVLFRAKNCFAVMNRYPYTLGEFMIIPYIHTDNIENLDKNIWFEMSDLVQLGVGVLKESLNANGVNIGMNLGSAAGAGIAEHIHYHVVPRWSRDTNFITTIAYTRVHGVPFLDQYHALKQAFQKVLK >NZ_CP009226.1|WP_023384764.1|665940_666717_+|indole-3-glycerol-phosphate-synthase-TrpC MILDEIISKTKINLENIKEKLPLCKLENALTSSYVPRDVKQVLKQKNSINIIAEIKKASPSKGVIREDFDPLEIAFEYEKAGVSAFSILTEPFYFQGSLEYMALVRRYTNTPILRKDFIVDIYQIAEARLYGADFILLIAKALDKFYLKTLFEYAKSLNLEVLMEIHDEIDLEKALFVDADIIGINHRNLQTFDMDMELCVKLMPLIPGGKIIVAESGLYSNSDLVNLKKQGADAFLIGEHFMRQKSIYNAVKDMKGE >NZ_CP009226.1|WP_023384763.1|664648_665944_+|putative-TPR-repeat-lipoprotein 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>NZ_CP009226.1|WP_039362181.1|661693_663616_+|hypothetical-protein MKFRKFAKILFVVGTAFFILGCETKDEKALNQDKLKFSDLPMAEQDRYISKDELDKLGSYLTLLDNRNIDINSDEIPAKSVDELRDKIADLMQKNRLLFADNEELAKKNLEIITKLREQTSLRESENKLISAKYIDSMNEVEKQHYKNINDLTKKINEVQKENIQSIKSYEQKIIGLENKIDELEKELSKKDTNFNEKVSSATKDQLAKNKELSQKNSYLLEQTEILKKQADALSKELDSKLADKKIQIDTLKQTILTKDNKINDLLAAHTNEIIELQNKHSKALDDLKNELNRQKNDYFGELNLKNSELAKLNTDFKEYKLKKDEELKNAENRVLANYKNIETQRLNAIKSDYERIIFEQNRTIAAFEGKMINLELKFKKELETKDANYANTLENLKQKALFLKNDEDRLRVEFDKNITSLKSQIALKNAQISDLDFKLKELENEKNDIKKIQNYEILNNMITKLNAQNEELKNYAKNALDEAKKMVLEAESRAKEQNDKLKNYYEELIKNIKNQDNQLILSDINVNSKKFLAEVSCLSLDKSAKLNKDCETKLNDMIKKYGKERIYEIKAAISDFKFLGDDKAGELKNVNLLNLKSTKDMLNAASKAISSRIKDPMLAYSKDVLLEQGGYGFVIKVYE >NZ_CP009226.1|WP_023384758.1|660730_661684_+|NAD(P)-binding-domain-containing-protein MENIYDVVVIGGGPFGIATVVEAKYNGFKNVLLLEKGDNHSQTIRKFYKDGKRVDKVYKGLDSQTHGNVEFFDGTKESTLNYFDNLLDSGKIDAVFNIEVESVKKDGDIFSIVTSKNTYKSKNVMIGIGRMGKPNKPEYKIPPSLTQIVNFNLNSCNCGENILVIGGGNSAAEYAIELSKCNTVTLCYRKEKFTRLNEINEAQVFEYFNDKKLNLKLGIDVISLDNENGKVKVNFSSNSSEIYDRIIYAIGGSTPVDFLQKCGIELNKDGEPIVDEHLQTNTPRLFVGGDIASKNGGSIVVALNDAHTVIDYIIKSK >NZ_CP009226.1|WP_080751570.1|659428_660676_-|glutamate-5-semialdehyde-dehydrogenase MLLKEQAKMEKLLNNLKNSSKSLSIITQTQRENLIINISNEIMNAKDEILSANKLDLDLAQDLSSALKDRLKLTSKSIENLCDSIKNIANLKEVIGVIKDGWQTKSGLKIEKITVPLGNIATIYESRPNVTAEVAALCIKSANGCALKGGKEARNTNLAIIKAIHKALQKCDLDKNCVVYLDIDRSEVEKLIKMDKYLDLIVPRGGENLVKFVSQNATIPVLKHDKGLCHIYVDEFADLDKALNICVNAKCSRPGVCNAAETILVHEAVANEFIPNLKKSLDQFNVIIFGCKKTAKIIDCELANEQNYSTEYLDFKLNLKIVKNLEESLEHISEFSSGHSEAVISENYSICEMFLNLVNSACVYANASTRFSDGGEFGFGAEIGISTNKLHARGPVGLNELTTYKYIIRANGQIR >NZ_CP009226.1|WP_023384755.1|657925_659269_+|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase-class-II MSKWNRDSWRDYNILQQPQYPDKNELKNAEDKLKSLPPLVFAGEVRNLKDELKNVTLGKSFLLQGGDCAESFSNFSANGIRDMFKIMLQMAIVLTFAGGCPVVKVGRVAGQFAKPRSSDFEDIDGVKLPSYRGDIINGFDFTKEARIPDPKRMIDAYYQSASTLNLLRAFSRGGLANLNEVHRWNLGFIKKAELDDKFEKLADELTGALKFMEACGVTTQNTPTLSETKLYTSHEALLLPYEEALTRVDSLTNEWYDCSAHMLWIGERTRGINDAHVHFLSGIKNPIGCKIGPDGKSSDIISLAQKLNPSNEPGRLNIIIRMGANKIEDRLPAILSDVKKEGLNILWSIDPMHGNTIKASSGFKTREFNNVMKEVKSFFEIHKSCGTIAGGVHLEMTGQDVTECVGGAFNVTEDSLGNRYETQCDPRLNADQALELAFLIADLVKKR >NZ_CP009226.1|WP_023384767.1|670539_670800_+|ribbon-helix-helix-protein,-CopG-family MKSYCLKLDDDTFAQLNQIVKNSKTTMAEFIRNALEQKLKETKGSLSYRLTTLSYCDKKESDEILDSLKHLNDDELKIAKKETINL >NZ_CP009226.1|WP_023384768.1|670796_671066_+|hypothetical-protein MKLEINYTKVSIKFFDKHKDIKDKFITNIGKFISGESVDIKALKGIEEPKLYRMRVGKFRVVFWINDKGELVIINVINADSRGGIYKGV >NZ_CP009226.1|WP_023384769.1|671366_671642_+|hypothetical-protein MVNPTLTFGVDLSALGSALKEIDKRTDKLSQNLNQGLKDAQKSYNNLQYIKNPLKIEETIAKLNKLKADIKKATIAKFDLKIDNAKKARRA >NZ_CP009226.1|WP_065839479.1|671804_674273_+|hypothetical-protein MQIRASLQYLWDNHANDGMFKNKRDIYNTIKMLIGYQDYAGNSFKNPNMAYIATKTNDKRMSDMVISRDSAGVTHLNKDKKMSETDKNIFDSKSVVETPKSQRKQQVLGVQMNTSKEHYSPTNNRIIPQNSKQVKPTSEAGDDMIAITKLKNEIDELKATKQGGKYLSSQVKAEVIDKSNELGKLIDERISQGKSINQTLVSEYKAQIQRARYQASKEAKPTSAPVKTEVKTEPTTNKYLSGIKELEKVDYDSLNAHQKDIYDVFAGKKSSTILKVSDIDDLATLEQGSRNAGARKIMIKHAGVEKTGGLNGDELVDIEQTLLKGKIDNNSFETGDDFIRYSYAYNKNGTTLQVVINEFNNGKKIFDYYSDRNFIDYNKKPQVSGNTLTKNGATNGIIPQNIDNINPASEAQNFFKTLSEYNNLRDNIAKNNKKIDNEHFTLSKSIHNEINGNLSKIFNLVKERDIAAKSRLKKLETMFKFKGVTGNEALKDYLDDLTLIHFNSFSKEELDFIKLTKDKIIKSQGDILAGANKARSFRYGNLDTADDLKNKVFKLFSDLNIKANNFFELEPLLLSHSAKENELRHIVSLDTVSNARLAMEKEANITPIKEFGTNYAEFYHDGSNAIKKLLIEKQGQVAGAFEKEGLGDIDLVWGIEGTSHSDGYGLSKIAKYHPEAVDNLDNIISKGEFYKDEKGRLNIKYNDDIVGLRENWLGNETVPWIISSYTKKAETSKGFNSASSITPSKENYSFTTQHNNIIPQNTKFDNTPTFLNKYPKLIDDLKWDKTLKFSSAPKSKEELKARQAFLNEFKILSSKEKIDIKI >NZ_CP009226.1|WP_144312847.1|675594_675945_+|hypothetical-protein MKNTSPLSKDEVVKHIDKTGVERVWKKSNTHIYEKHDTEPKDVVKALNSINTMAKNKDNKYINAFSDNGYFIVFNGNEIVTCYKPSQNKKEAFGYFKNASIYDKKEVIKWKIANLL >NZ_CP009226.1|WP_039362191.1|675920_676235_+|hypothetical-protein MENRKFTIEFYEIEWFIDLQSHIDNGDSQLDIIRPITKTRDKRIARIFDIFAPETEYIDKAKEYKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NZ_CP009226.1|WP_023384792.1|676421_676637_+|hypothetical-protein MSPEEFGLSQYERMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSVFKRYANVLNKVED >NZ_CP009226.1|WP_023384777.1|677107_677824_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYQLKVFLKLNQNVDFINSPEFLSTNLHKAMLGDEALRSIHMQRYLKPYSIGFLYSMKGKKDTFVSGEDMYFYVRSIDESFISKLRICLENSKNLGFNVYLSKFENLDIKQIDRLYTMSPATIVLKEGDKTIPWRRENSDITVLKEALISNLKNKYEYFLDKKIEIKDDIIELIEIKTNRAFAFRYKNGKIYAYRYQIHFSQNRLAQEFANIAMILGVGVKNTLGFGFCMRSNNAV >NZ_CP009226.1|WP_023384778.1|677813_679505_+|hypothetical-protein MLFELLDEFKKQLEKNKHIVTQNHILKDGVYARISDEKCEIFYVKTITEKIGKTAQKRTILYKQNGDIALNDDMQWFEQADYLSFLWDMNKAVLPNKKFHSINFLSLFFKLEESEYVKENLEEYFDIFRDYSAFNKAKDKEILSFYMDYIKDENRQNLITNSVVLSKKYFNDINDFAVQNNFKKCYIKFFIDKDFEIYEKESQIYIDLKIYNSNEHNIKYNNEIFGLSNFNMGMNSKKPFLEHKNRLFKIPYAISQKDALASKMLFDWLGSQNKRIIRDFNSIFISKFNKQSKAVVSDFEYVPVDKNKFKFDKFKLKNFMNIENGEKEILSFDDFKQVIDEQLYHKCLFGNLYNDEIRVSKRISEDMQNLLYQTRCSMVEYFDKFNNNEFYYVIQKYSNDFIKIAMQDSEFGRLNGKKSINLLLSIKEIKGEKVDIDGIKNRVISALTDDNVTKLSGNEYYFLVGNLAMYLVSKSKTWKKTFALTDPYTKARNTKKLKMALFIDFDRYNYDIFLENGILKKAFSLAQNCEDIVMSNNDQQMVLIGMMTKNIIKKPGEKDEISE >NZ_CP009226.1|WP_023384780.1|679488_680430_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-superfamily-protein-Cas7 MKLANRIYGIIGIKSTMANWNADFSGRPKSTGNGDIFASDKALKYPMKKMWESYGKNILFVKSLKQGKSKDGNDKLVPNTLGERYGLLFGDIKKAKSTKEVLSNLFNCIDVKNFGATFPEDGYNLSITGAVQIGQGFNKFGDINIEVQNILSPFADSRAKEKNENGEDASQSTLGTKIVTDEAHYFYGFCINPLAYNDYKEILGDDFGYDEDDYAEFKKAARFCATYFNSNSKFGCENEFAMFIETAVDAYLPDLSSYMDFICKDKNRSVNLEKIEKMIESSDVKKVEIYYNPLSLDVETKFDKFDIYSGNKI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009226_2 | 674841-675399 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009226_2
|
8 spacers
spacers of NZ_CP009226_2
>2.1|674871|37|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTT >2.2|674938|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATATCAGTAGGCACGGTAACTTTAAATCCTATT >2.3|675004|37|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTACTAGTTATGTGACTTGTATATATGCTTCCTAC >2.4|675071|35|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCT >2.5|675136|35|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGCATTATGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGC >2.6|675201|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATA >2.7|675267|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGCCAAAAAGAGAGCTAAAACTACTTTTTTCATCG >2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT CTAAGACTTACACCTGTTTTTGATACATTAGAAAACA |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009226_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009226_2 >merge|NZ_CP009226|2|674841-675399|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTGATATCAGTAGGCACGGTAACTTTAAATCCTATTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTATTACTAGTTATGTGACTTGTATATATGCTTCCTACGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCTGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACATAGCATTATGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGCGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACCACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATAGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACGAGCCAAAAAGAGAGCTAAAACTACTTTTTTCATCGGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACCTAAGACTTACACCTGTTTTTGATACATTAGAAAACAGTTTGCTGATAACAAAGCTCGTATTAAAAT >NZ_CP009226|2|4|674841-675332|PILER-CR GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTGATATCAGTAGGCACGGTAACTTTAAATCCTATT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TATTACTAGTTATGTGACTTGTATATATGCTTCCTAC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ATAGCATTATGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC CACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC GAGCCAAAAAGAGAGCTAAAACTACTTTTTTCATCG GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC >NZ_CP009226|2|2|674841-675399|CRISPRCasFinder GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTGATATCAGTAGGCACGGTAACTTTAAATCCTATT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TATTACTAGTTATGTGACTTGTATATATGCTTCCTAC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ATAGCATTATGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC CACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC GAGCCAAAAAGAGAGCTAAAACTACTTTTTTCATCG GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC CTAAGACTTACACCTGTTTTTGATACATTAGAAAACA GTTTGCTGATAACAAAGCTCGTATTAAAAT >NZ_CP009226|2|2|674841-675399|CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTCGGCTAGGTCTACCGTTGGCATTACTTTAAAATTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTGATATCAGTAGGCACGGTAACTTTAAATCCTATT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TATTACTAGTTATGTGACTTGTATATATGCTTCCTAC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GAAAGATACTTACCATTAGGAGAATAGTCATTGCT GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC ATAGCATTATGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC CACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC GAGCCAAAAAGAGAGCTAAAACTACTTTTTTCATCG GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC CTAAGACTTACACCTGTTTTTGATACATTAGAAAACA GTTTGCTGATAACAAAGCTCGTATTAAAAT
>NZ_CP009226.1|WP_065839479.1|671804_674273_+|hypothetical-protein MQIRASLQYLWDNHANDGMFKNKRDIYNTIKMLIGYQDYAGNSFKNPNMAYIATKTNDKRMSDMVISRDSAGVTHLNKDKKMSETDKNIFDSKSVVETPKSQRKQQVLGVQMNTSKEHYSPTNNRIIPQNSKQVKPTSEAGDDMIAITKLKNEIDELKATKQGGKYLSSQVKAEVIDKSNELGKLIDERISQGKSINQTLVSEYKAQIQRARYQASKEAKPTSAPVKTEVKTEPTTNKYLSGIKELEKVDYDSLNAHQKDIYDVFAGKKSSTILKVSDIDDLATLEQGSRNAGARKIMIKHAGVEKTGGLNGDELVDIEQTLLKGKIDNNSFETGDDFIRYSYAYNKNGTTLQVVINEFNNGKKIFDYYSDRNFIDYNKKPQVSGNTLTKNGATNGIIPQNIDNINPASEAQNFFKTLSEYNNLRDNIAKNNKKIDNEHFTLSKSIHNEINGNLSKIFNLVKERDIAAKSRLKKLETMFKFKGVTGNEALKDYLDDLTLIHFNSFSKEELDFIKLTKDKIIKSQGDILAGANKARSFRYGNLDTADDLKNKVFKLFSDLNIKANNFFELEPLLLSHSAKENELRHIVSLDTVSNARLAMEKEANITPIKEFGTNYAEFYHDGSNAIKKLLIEKQGQVAGAFEKEGLGDIDLVWGIEGTSHSDGYGLSKIAKYHPEAVDNLDNIISKGEFYKDEKGRLNIKYNDDIVGLRENWLGNETVPWIISSYTKKAETSKGFNSASSITPSKENYSFTTQHNNIIPQNTKFDNTPTFLNKYPKLIDDLKWDKTLKFSSAPKSKEELKARQAFLNEFKILSSKEKIDIKI >NZ_CP009226.1|WP_023384769.1|671366_671642_+|hypothetical-protein MVNPTLTFGVDLSALGSALKEIDKRTDKLSQNLNQGLKDAQKSYNNLQYIKNPLKIEETIAKLNKLKADIKKATIAKFDLKIDNAKKARRA >NZ_CP009226.1|WP_023384768.1|670796_671066_+|hypothetical-protein MKLEINYTKVSIKFFDKHKDIKDKFITNIGKFISGESVDIKALKGIEEPKLYRMRVGKFRVVFWINDKGELVIINVINADSRGGIYKGV >NZ_CP009226.1|WP_023384767.1|670539_670800_+|ribbon-helix-helix-protein,-CopG-family MKSYCLKLDDDTFAQLNQIVKNSKTTMAEFIRNALEQKLKETKGSLSYRLTTLSYCDKKESDEILDSLKHLNDDELKIAKKETINL >NZ_CP009226.1|WP_023384766.1|667216_667954_+|YaaA-family-protein MKILFSPSESKMSGGSMDTPINFSWVFPNLNDKRLEILEIYNGFLKKANKNELQTLFGLKKENELEYYSSDLFSRPLMKAILRYNGVAYEHLNYRNLDESSRKIIDENTIIFSNLYGAILAKDMICDYKLKQGETIGGFRTEVFYKKYFSSVLDDFLDFDILDLRAGFYEKFYSITKPHTTIKFLKNGKVVSHFAKAYRGIVLRYIALNQISSLDEFYNMQIPNLKINKIIKNRLKTEIIVDIIG >NZ_CP009226.1|WP_023384765.1|666716_667220_+|HIT-domain-containing-protein MKHEFSPWRAEYFKTRKDGVMEHNCVFCDIAQNSQNDEENFVLFRAKNCFAVMNRYPYTLGEFMIIPYIHTDNIENLDKNIWFEMSDLVQLGVGVLKESLNANGVNIGMNLGSAAGAGIAEHIHYHVVPRWSRDTNFITTIAYTRVHGVPFLDQYHALKQAFQKVLK >NZ_CP009226.1|WP_023384764.1|665940_666717_+|indole-3-glycerol-phosphate-synthase-TrpC MILDEIISKTKINLENIKEKLPLCKLENALTSSYVPRDVKQVLKQKNSINIIAEIKKASPSKGVIREDFDPLEIAFEYEKAGVSAFSILTEPFYFQGSLEYMALVRRYTNTPILRKDFIVDIYQIAEARLYGADFILLIAKALDKFYLKTLFEYAKSLNLEVLMEIHDEIDLEKALFVDADIIGINHRNLQTFDMDMELCVKLMPLIPGGKIIVAESGLYSNSDLVNLKKQGADAFLIGEHFMRQKSIYNAVKDMKGE >NZ_CP009226.1|WP_023384763.1|664648_665944_+|putative-TPR-repeat-lipoprotein MYWCRAALIFTLFLAGCADKQSVGAKKNETFFKYSDINTTMDLESMKGFYLLGDAKSKDALEVFYTLYKTTKKPIFLKESLKIAFVIKDERLDELITDARSVLNGDYDAIRIEIGYYILKSQIKEAKELALNLIQKESGNSINHSILATIYLFNDEPIRALKEFKKAYEIDDSEENLLKLVDMLDNKLDRTNEAIRYLNNWIEENGCSKPVCFTLLNIYSAKGELDLMTEMYIKLYEAYEESDFLNRALEILLYKKDVVTAKELLEKYGFNEPILMGIYAELKEFQKAYDVAQDLYSRSQNPEYMARMAIYKYEQSSKNISKFELDMVVKLFEGSVYALNSPLYFNYYGYLLIDYGIDVKKGLDIVKKAYILDPNSPYIIDSIAWGYFKLGECKEAKMWMDKIQSDTKFMKEDEAKAHKTAIDKCFNKGTK >NZ_CP009226.1|WP_039362183.1|664301_664673_+|YkgJ-family-cysteine-cluster-protein MLKKPGFDYCFDSSKCEVCGAKCCTGDSGYIWINEAEMESLSSHLKLSLSEFKKLFTYRVGVRFSLKEKEYNGAYACLFFDENNKNCSVYEFRPKQCRTFPFWDYFKKHFNELEKECIGVERL >NZ_CP009226.1|WP_023384761.1|663612_664308_+|methyltransferase MKLFQLKDGYRYNSDSLFLYDFISKNKIFGNLLDVGCGCGILGLLLKRDFVNLNLSSIDIQEINSTITQLNADVNSLVATVICDDFSKFKSEMKFDFIVSNPPFYSDQITKSQKEHINISRYSSSLDPLSFFKCVNANLKPQGTLYFCYDARRVGEILPILSSFKLKLTKLRFVHSKVSESSKLVLFEAKKSSKSMCEIYPPLIVFDGNEFSDEAKEIFKKSDTKSEIYEC >NZ_CP009226.1|WP_144312847.1|675594_675945_+|hypothetical-protein MKNTSPLSKDEVVKHIDKTGVERVWKKSNTHIYEKHDTEPKDVVKALNSINTMAKNKDNKYINAFSDNGYFIVFNGNEIVTCYKPSQNKKEAFGYFKNASIYDKKEVIKWKIANLL >NZ_CP009226.1|WP_039362191.1|675920_676235_+|hypothetical-protein MENRKFTIEFYEIEWFIDLQSHIDNGDSQLDIIRPITKTRDKRIARIFDIFAPETEYIDKAKEYKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NZ_CP009226.1|WP_023384792.1|676421_676637_+|hypothetical-protein MSPEEFGLSQYERMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSVFKRYANVLNKVED >NZ_CP009226.1|WP_023384777.1|677107_677824_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYQLKVFLKLNQNVDFINSPEFLSTNLHKAMLGDEALRSIHMQRYLKPYSIGFLYSMKGKKDTFVSGEDMYFYVRSIDESFISKLRICLENSKNLGFNVYLSKFENLDIKQIDRLYTMSPATIVLKEGDKTIPWRRENSDITVLKEALISNLKNKYEYFLDKKIEIKDDIIELIEIKTNRAFAFRYKNGKIYAYRYQIHFSQNRLAQEFANIAMILGVGVKNTLGFGFCMRSNNAV >NZ_CP009226.1|WP_023384778.1|677813_679505_+|hypothetical-protein MLFELLDEFKKQLEKNKHIVTQNHILKDGVYARISDEKCEIFYVKTITEKIGKTAQKRTILYKQNGDIALNDDMQWFEQADYLSFLWDMNKAVLPNKKFHSINFLSLFFKLEESEYVKENLEEYFDIFRDYSAFNKAKDKEILSFYMDYIKDENRQNLITNSVVLSKKYFNDINDFAVQNNFKKCYIKFFIDKDFEIYEKESQIYIDLKIYNSNEHNIKYNNEIFGLSNFNMGMNSKKPFLEHKNRLFKIPYAISQKDALASKMLFDWLGSQNKRIIRDFNSIFISKFNKQSKAVVSDFEYVPVDKNKFKFDKFKLKNFMNIENGEKEILSFDDFKQVIDEQLYHKCLFGNLYNDEIRVSKRISEDMQNLLYQTRCSMVEYFDKFNNNEFYYVIQKYSNDFIKIAMQDSEFGRLNGKKSINLLLSIKEIKGEKVDIDGIKNRVISALTDDNVTKLSGNEYYFLVGNLAMYLVSKSKTWKKTFALTDPYTKARNTKKLKMALFIDFDRYNYDIFLENGILKKAFSLAQNCEDIVMSNNDQQMVLIGMMTKNIIKKPGEKDEISE >NZ_CP009226.1|WP_023384780.1|679488_680430_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-superfamily-protein-Cas7 MKLANRIYGIIGIKSTMANWNADFSGRPKSTGNGDIFASDKALKYPMKKMWESYGKNILFVKSLKQGKSKDGNDKLVPNTLGERYGLLFGDIKKAKSTKEVLSNLFNCIDVKNFGATFPEDGYNLSITGAVQIGQGFNKFGDINIEVQNILSPFADSRAKEKNENGEDASQSTLGTKIVTDEAHYFYGFCINPLAYNDYKEILGDDFGYDEDDYAEFKKAARFCATYFNSNSKFGCENEFAMFIETAVDAYLPDLSSYMDFICKDKNRSVNLEKIEKMIESSDVKKVEIYYNPLSLDVETKFDKFDIYSGNKI >NZ_CP009226.1|WP_039363197.1|680429_681191_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAISFKLSGKFAHFKKPDVNEYVYFTYNNIPKPTLLGLLGAIIGLKGYAQKTYNNKKDKKSLLNNENRSNEPEFYERLKHLKICIIPLVKYGKFSKKIQVFNNSVGYASTEEGGNLIVREQWLENPSWQILIEDDGSVEFETISQYLFDKKAKFIPYLGKNDHFADISEVEKIDLAESKKDKIVIKSLFFDNLAKQVDDPDDEISYLFNEFYPIGFNELMFYKLEKTTFTNQICQAMDGKWYEFKDGTICFF >NZ_CP009226.1|WP_023384784.1|681178_683569_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MLLLNIYLAHTAPNKDPETLQAHCDLTKEYLQKIKNSKNLNDIIKNLANQILNDDVILEFFDDFIINHDLGKMNPAFQRFKMENKEFNEASGESTHSNHSFNKLKDKYRDFFSNSTDQDIDKIICVFYYLLSNVLNHHGHLKDGFDDKYLKISDKEEDFDTLDKKFYNSKKRTDFDFELFILIKLHFSLLIASDFYATSEYMNDIKIDDFGVFDKDKKEIIYSKFREFYSSLKPRSDIDILRSDIFQKSSKTLYDNLDKNIFYLEAPTGSGKTLTSLNLALNLLNLNSNLNKIFYVFPFNTLISQSKSIFESIFGDEFDISVINSITPPKFNKGNDQENSESKYDKTYINRVFYNHPFILTSHVALFKTLFGISKEENYGLFSLANSVIILDEIQSYRSNLWEFMALFFDSFAKHLNIKFIIMSATLPKISNLLKNNDDKWCDLLANSNYFQNTLFKDRVKVDFSLLEIGQDELFETIVSKIKEHKKDKILVEFIKKSSARDFYNFIRFKFDGYDIFELSGDDNKLYQKIVIAKLKNSNTKAIVVATQVIEAGVDIDMDIGFKDIATFESEEQFLGRINRSALKPGSLAYFFDYDNASMIYKNDSRIKFSLKDDGLKKCLIDKNFNPYYEKLLYELKCENSRVNGGFNSVRENFQKYISSINFIKISENMQLINDDRVRIFLPFKIDVSDFDMSEYGDVEHFMDGNFLDGKKIWEAIICLNEVKEYGKRKIEALSLNSLADIFSFNVFMVDDLLSISSQMRYGYIYIEDCDGFIDENGKFDRTAFAKKFNNEDLLL >NZ_CP009226.1|WP_023384785.1|683565_684051_+|Dna2/Cas4-domain-containing-protein MKITGTLINYFFHCKRQCYLFYNRINLEDNSEDVKIGKVLHEIKFEDEIKFENIALDKITDEYVIEFKKSDSDETASMWQLLFYLKKLKEIGILRKGLLEFGENRNLPTKRLKVELTTHKELELEQIYSQISELMSLKTPPDPLKSSLKCKKCAYFNYCFI >NZ_CP009226.1|WP_023384787.1|684059_685061_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MPKLHTRYIFSMGELSRKDNSLAFKNEKGTTYIPIVGIREIYCMNEVSMNSKLFDFLAKNGITIHFFNYYGNYSGSFYPKKHLISGRIITSQVEALATRNIIAKSIVKGIALNMHEVLYHYYRHGKTELKPLLDYLKLKVPNMLINANTIPQIMFIEGQIWSKFYDSFELFLDESFSLAKRVKRPPDNPMNAMISFGNSLLYTKTISAIYQTHLEQSISYLHESSDARFSLSLDLSEVFKPIIVFKTVFELINLKKINIKKHFEKKVEFCLLNEAGRKIFVESFEERLNESFLHSKLGRKVSYKTALKLEGYKLIKFICEAREFIPFSLKDKR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009226_3 | 685861-687008 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009226_3
|
17 spacers
spacers of NZ_CP009226_3
>3.1|685891|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT >3.2|685957|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA >3.3|686023|35|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT >3.4|686088|37|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTGATGATAACTTTTTGGCTCTTTTGTGTGATATT >3.5|686155|35|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT >3.6|686220|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA >3.7|686286|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG >3.8|686352|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT >3.9|686418|36|NZ_CP009226|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG >3.10|686484|41|NZ_CP009226|PILER-CR GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCCAGTTTG >3.11|686555|37|NZ_CP009226|PILER-CR TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT >3.12|686622|35|NZ_CP009226|PILER-CR TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT >3.13|686687|36|NZ_CP009226|PILER-CR AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA >3.14|686753|37|NZ_CP009226|PILER-CR TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT >3.15|686820|36|NZ_CP009226|PILER-CR TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG >3.16|686484|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCC >3.17|686549|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT >3.18|686616|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT >3.19|686681|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA >3.20|686747|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT >3.21|686814|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG >3.22|686880|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT AAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTAT >3.23|686946|33|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT CCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009226_3
The CRISPR arrays of NZ_CP009226_3 >merge|NZ_CP009226|3|685861-687008|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCTTTGATGATAACTTTTTGGCTCTTTTGTGTGATATTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCCAGTTTGTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCTGTTTACTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACGGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACAAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAATCCCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTAGTTTACTAATCACAAAGTTTATATTAAAAT >NZ_CP009226|3|5|685861-686879|PILER-CR GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTTTGATGATAACTTTTTGGCTCTTTTGTGTGATATT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCCAGTTTG TAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTAAT TTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCTGTTTAC TAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTGCC ATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCATGTTTGC TAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTGGG GGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACAGTTTGC TAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTTTG CTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGTGTTTGC TAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAAGTA ATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACGGTTTGC TAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC >NZ_CP009226|3|3|685861-687008|CRISPRCasFinder GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTTTGATGATAACTTTTTGGCTCTTTTGTGTGATATT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCC AGTTTGTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT GTTTACTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAATC CCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTA GTTTACTAATCACAAAGTTTATATTAAAAT >NZ_CP009226|3|3|685861-687008|CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTTTGATGATAACTTTTTGGCTCTTTTGTGTGATATT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCC AGTTTGTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT GTTTACTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC AAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAATC CCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTA GTTTACTAATCACAAAGTTTATATTAAAAT
>NZ_CP009226.1|WP_023384789.1|685057_685357_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MTNYNYAYVFYDISDKESEAGKRRVAKVFKLCKKYFLHHQKSVFKGEITPSNFIKFKSAVEKLIDKNIDVITILRLIRKDDIDEMTLGGLDFVKNEMFL >NZ_CP009226.1|WP_023384787.1|684059_685061_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MPKLHTRYIFSMGELSRKDNSLAFKNEKGTTYIPIVGIREIYCMNEVSMNSKLFDFLAKNGITIHFFNYYGNYSGSFYPKKHLISGRIITSQVEALATRNIIAKSIVKGIALNMHEVLYHYYRHGKTELKPLLDYLKLKVPNMLINANTIPQIMFIEGQIWSKFYDSFELFLDESFSLAKRVKRPPDNPMNAMISFGNSLLYTKTISAIYQTHLEQSISYLHESSDARFSLSLDLSEVFKPIIVFKTVFELINLKKINIKKHFEKKVEFCLLNEAGRKIFVESFEERLNESFLHSKLGRKVSYKTALKLEGYKLIKFICEAREFIPFSLKDKR >NZ_CP009226.1|WP_023384785.1|683565_684051_+|Dna2/Cas4-domain-containing-protein MKITGTLINYFFHCKRQCYLFYNRINLEDNSEDVKIGKVLHEIKFEDEIKFENIALDKITDEYVIEFKKSDSDETASMWQLLFYLKKLKEIGILRKGLLEFGENRNLPTKRLKVELTTHKELELEQIYSQISELMSLKTPPDPLKSSLKCKKCAYFNYCFI >NZ_CP009226.1|WP_023384784.1|681178_683569_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MLLLNIYLAHTAPNKDPETLQAHCDLTKEYLQKIKNSKNLNDIIKNLANQILNDDVILEFFDDFIINHDLGKMNPAFQRFKMENKEFNEASGESTHSNHSFNKLKDKYRDFFSNSTDQDIDKIICVFYYLLSNVLNHHGHLKDGFDDKYLKISDKEEDFDTLDKKFYNSKKRTDFDFELFILIKLHFSLLIASDFYATSEYMNDIKIDDFGVFDKDKKEIIYSKFREFYSSLKPRSDIDILRSDIFQKSSKTLYDNLDKNIFYLEAPTGSGKTLTSLNLALNLLNLNSNLNKIFYVFPFNTLISQSKSIFESIFGDEFDISVINSITPPKFNKGNDQENSESKYDKTYINRVFYNHPFILTSHVALFKTLFGISKEENYGLFSLANSVIILDEIQSYRSNLWEFMALFFDSFAKHLNIKFIIMSATLPKISNLLKNNDDKWCDLLANSNYFQNTLFKDRVKVDFSLLEIGQDELFETIVSKIKEHKKDKILVEFIKKSSARDFYNFIRFKFDGYDIFELSGDDNKLYQKIVIAKLKNSNTKAIVVATQVIEAGVDIDMDIGFKDIATFESEEQFLGRINRSALKPGSLAYFFDYDNASMIYKNDSRIKFSLKDDGLKKCLIDKNFNPYYEKLLYELKCENSRVNGGFNSVRENFQKYISSINFIKISENMQLINDDRVRIFLPFKIDVSDFDMSEYGDVEHFMDGNFLDGKKIWEAIICLNEVKEYGKRKIEALSLNSLADIFSFNVFMVDDLLSISSQMRYGYIYIEDCDGFIDENGKFDRTAFAKKFNNEDLLL >NZ_CP009226.1|WP_039363197.1|680429_681191_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAISFKLSGKFAHFKKPDVNEYVYFTYNNIPKPTLLGLLGAIIGLKGYAQKTYNNKKDKKSLLNNENRSNEPEFYERLKHLKICIIPLVKYGKFSKKIQVFNNSVGYASTEEGGNLIVREQWLENPSWQILIEDDGSVEFETISQYLFDKKAKFIPYLGKNDHFADISEVEKIDLAESKKDKIVIKSLFFDNLAKQVDDPDDEISYLFNEFYPIGFNELMFYKLEKTTFTNQICQAMDGKWYEFKDGTICFF >NZ_CP009226.1|WP_023384780.1|679488_680430_+|CRISPR/Cas-system-associated-RAMP-superfamily-protein-Cas7 MKLANRIYGIIGIKSTMANWNADFSGRPKSTGNGDIFASDKALKYPMKKMWESYGKNILFVKSLKQGKSKDGNDKLVPNTLGERYGLLFGDIKKAKSTKEVLSNLFNCIDVKNFGATFPEDGYNLSITGAVQIGQGFNKFGDINIEVQNILSPFADSRAKEKNENGEDASQSTLGTKIVTDEAHYFYGFCINPLAYNDYKEILGDDFGYDEDDYAEFKKAARFCATYFNSNSKFGCENEFAMFIETAVDAYLPDLSSYMDFICKDKNRSVNLEKIEKMIESSDVKKVEIYYNPLSLDVETKFDKFDIYSGNKI >NZ_CP009226.1|WP_023384778.1|677813_679505_+|hypothetical-protein MLFELLDEFKKQLEKNKHIVTQNHILKDGVYARISDEKCEIFYVKTITEKIGKTAQKRTILYKQNGDIALNDDMQWFEQADYLSFLWDMNKAVLPNKKFHSINFLSLFFKLEESEYVKENLEEYFDIFRDYSAFNKAKDKEILSFYMDYIKDENRQNLITNSVVLSKKYFNDINDFAVQNNFKKCYIKFFIDKDFEIYEKESQIYIDLKIYNSNEHNIKYNNEIFGLSNFNMGMNSKKPFLEHKNRLFKIPYAISQKDALASKMLFDWLGSQNKRIIRDFNSIFISKFNKQSKAVVSDFEYVPVDKNKFKFDKFKLKNFMNIENGEKEILSFDDFKQVIDEQLYHKCLFGNLYNDEIRVSKRISEDMQNLLYQTRCSMVEYFDKFNNNEFYYVIQKYSNDFIKIAMQDSEFGRLNGKKSINLLLSIKEIKGEKVDIDGIKNRVISALTDDNVTKLSGNEYYFLVGNLAMYLVSKSKTWKKTFALTDPYTKARNTKKLKMALFIDFDRYNYDIFLENGILKKAFSLAQNCEDIVMSNNDQQMVLIGMMTKNIIKKPGEKDEISE >NZ_CP009226.1|WP_023384777.1|677107_677824_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYQLKVFLKLNQNVDFINSPEFLSTNLHKAMLGDEALRSIHMQRYLKPYSIGFLYSMKGKKDTFVSGEDMYFYVRSIDESFISKLRICLENSKNLGFNVYLSKFENLDIKQIDRLYTMSPATIVLKEGDKTIPWRRENSDITVLKEALISNLKNKYEYFLDKKIEIKDDIIELIEIKTNRAFAFRYKNGKIYAYRYQIHFSQNRLAQEFANIAMILGVGVKNTLGFGFCMRSNNAV >NZ_CP009226.1|WP_023384792.1|676421_676637_+|hypothetical-protein MSPEEFGLSQYERMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSVFKRYANVLNKVED >NZ_CP009226.1|WP_039362191.1|675920_676235_+|hypothetical-protein MENRKFTIEFYEIEWFIDLQSHIDNGDSQLDIIRPITKTRDKRIARIFDIFAPETEYIDKAKEYKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NZ_CP009226.1|WP_023384791.1|687317_687629_+|hypothetical-protein MEKRKLYICIDEKGWHITDDNKKNSWLNDDELDGSFAEVFGVNGKIGFLGEWAWNDNFLNLTSDKLNEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NZ_CP009226.1|WP_023384792.1|687815_688031_+|hypothetical-protein MSPEEFGLSQYERMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSVFKRYANVLNKVED >NZ_CP009226.1|WP_023384796.1|688771_690217_+|acetyl-CoA-carboxylase-subunit-A MIHKILIANRGEIAVRIVRACKDLHIKNVAIYTEPDRECLHVKVADEAYQIGKDPIKGYLDSKRIVEVAKACGADAIHPGYGFLSENYEFAKEVEDAGLIFIGPNSDIIRKMGNKNIARFLMKKNGIPVVPGTEKLNSETIETIKDYAMKIGYPVILKASGGGGGRGIREVWNEDELESNYESCKREAKAFFNNDEVFMEKFIEKPRHIEFQILGDNYGNLIHLCERDCSIQRRHQKVIEIAPCPTISEDLRKRMGVAAVAAAKAVGYTNAGTIEFLLDDYNNFYFMEMNTRIQVEHGVTEEITGVDLISRQIRIAAGEILDIEQSEVRPQGVSIEARITAENVWKNFAPSPGRITGYFPALGPGVRVDSHIYQDYAIPPFYDSLVAKLIVKGTSYDLAVSKLERALDEFKIEGVRTTLPFLLAISKRRHFRRGFFDTSYIEERLQDILENTQDHHQENKEEVIAAIAAAIKKVKEDRAKE >NZ_CP009226.1|WP_023384797.1|690223_690460_+|hypothetical-protein MNDFFDSLKNIKNELVKEQKSQEVKVPKKPKPNPNRDEFKDIFTEPNEIEMPDAKEHRLKDEFLEFIKHSDVKKLERD >NZ_CP009226.1|WP_039362197.1|690446_691163_+|arginyltransferase MREIDFCTLDTLCPYLKDRNSRSMYRYVSQCSFDYNSNLVKHGYRRFGSYFSKPVCDGCDECKSIRIDAFNFKFTKSHRRIINKNSNTKIVVSKPYISQKHIDLYEKYHKFMHEKRGWEYYDLDFRRYYSVYVEGAGDFGYEIDYFVDDELVCVDLVDIVDDGISSIYCYWDIDFAHLSLGKFSLLNQIKIALKNDLRWIYLGFYVKDCASLAYKGEYKPYETLKKYCDMDEKPIWEF >NZ_CP009226.1|WP_023384799.1|691218_692043_+|adenylosuccinate-lyase MQITQTLESITITTDDCDLFLNLSNKIRQSFANAIGNRDKVIIFYNENELVQRKYFLKLIGKIYANSVGKGIDFLLTHHKNIKLVYKKPNSLQILINVDVKFENSRVVFDLKNSEELFTKYLIRGLGDTRHEYFESKKILVISPKTTENVELLDNILNFREHLKYIVNFNYDKKSYDEFKKRAKILTSKTYIRRFSMLANLLEEHFETLGCKATDDFETVRTNYLNLTKVYHPDKHVGEPNEVQKSYIDKFQKIGLAYEALKPYFKEQKSFISA >NZ_CP009226.1|WP_023384800.1|692087_692861_+|pyridoxine-5'-phosphate-synthase MKLGVNIDHVAVLREARAVNDPQIIHAMFEAVSGGADQITIHLREDRRHINEDDVKNIINLSPIPVNLECSISSEIIDIVCALKPHRATIVPEKREELTTEGGLSLDSLNLKNVISKLNDNDIKVSLFIDPKKNDVTVSKELGATCVELHTGAYANTFLMLNSNLNHTKYKINSLNLKRSELEILLNSELTRIKEAANLGINLGLEVAAGHGLNYQNVIAIAAIKDIFELNIGQSIVAKSVFVGLKNAVKEMMELVK >NZ_CP009226.1|WP_023384801.1|692857_693781_+|4-hydroxythreonine-4-phosphate-dehydrogenase MNLPKIAISVGDINGVGIEIALKSHNEIKNICSPVYFINNELLNSAANILKFTIPNDFEIFECGNSFNIKPGHVSKKSGKFSFVSFQNALLYTQNKHAQALVTMPINKESWKKAGVPYVGHTDALGKYFGKNAIMMLGCEELFVALYTDHLALKDVSAKIKAKNLALFLVDFYNSSKFENIGVLGFNPHASDNETIGGKEEKEIIKAIKLANNRLKKEVFTGPLVPDAAFTKSSLKRCNRLVSMYHDVGLAPLKALYFDKSINVSLNLPIVRTSVDHGTAFDIAYKGKAEIKSYIEAIKFAIKSCGY >NZ_CP009226.1|WP_023384802.1|693846_695397_+|inorganic-phosphate-transporter MSRDNRDNLFALIFFIISVVAFFMWGYNYIPSNHLLLFILASIFGLFMAFNIGGNDVANSFGTSVGAKTLTLKQALIIAAVFELSGAVFAGAEVTNTIRSGIVSLPKGDVNPMVFVIIMISALFSSGAWLFIATKKGLPVSTTHSIVGGIVGAGMMMGFIYYNGSKTFDMVQWSEIGRIALSWVISPVMGGVMAYLIFGYIKSKIIIPSSRIQSEIKSLKRARKTYKDQYIKELSNKSEAEQIKELRRIAIIDEDECEGENCDFRDKIKAMKEEEKNIDGTVFMRTHIPIVAGVAAMIIAGSMLFKGLKHMDFNLSIIQTIWIIFVIGIAAYLASFAMVNLMKKDNPQKGINRIFGWFQIFTASSFAFSHGANDIANAVGPFAAILDVLKNNTINETTPIPSIAMATFGIALVVGLWFLGKEVIATVGTKLAEILPTTGFSAELASSIVILIATKMGLPISSTHVLIGAVLGIGVYNRNANWGMLKPIGLAWVITIPISMIGSAIGFLAIKNIMGL >NZ_CP009226.1|WP_039362202.1|695467_698314_+|flagellar-hook-protein MRITNQLINFNNLSNYQTNAKSIYDINERYNSGLKIQNSYDNSSIYVDGTRLEYEINLLDQVKQTSTKATEFSKNSDKALNDFVAKLTEFKTKLIQAGNNIHNETSRNAIANDLEGLKKHLIDIANSSINGQFLFSGTALDTKPIDSAGNYKGNNQSINAAIGANQTTAYNIDGQTLFLGKDNDYKKILTTNVSLIDNKTKLTSDATNYLNAANKILDLIGGNYRSEELVAQIGKMNPELDFADPTALADTTFYIQGRKPNGETFSTKFKVTADSSIQNLLDNIGYALGNDKNGKNSVVSVTINNSGQIEVTDLKSGNQMTELHLFGLTDVQGPETFKVGDRDIVIDPATHTDFKVTTEKRTVGGVSTDVLIVDSVNPAGEKYEITQNPGGDLSIQQVDKTTGANIGAATNVTPAAGKLVLNPADLAAGGVTAADFRAYDPADIKTLSDKGARDENGNWVSSANLTDTKTITQNVENGNVYLTEFIKSGFEDVLGNKSDAIDYNKLQFEKTDNKLSSNVSQVVKGTNEYATNSTKLSAVAGQALQANPNSNITMNIKSKDGTNYEVKLNFTDTNSNTTQRYPTITVTPLDDNWEKPATATPVYYGNVYSGKYNEATKMTDGVITQADDMTYQQLNDIVSMVAAGNLPSGQPNTNVIANIDTASRSTYADANALKTALKNGVTDVQAQGIIDRVVDASGIAYPIDFTANGDALRDIKDAILGDQDYVTSRYNEYNTAVKSASSTINTTLDYRGNMVVTDKTASKTDIEVTLFEDHGRGNIEFTDMYKRDAAGNIEVDAAGNRIIDTYQSTSGSLFSFTSNNAISIDEPSVDIFKDLDDMIQAVRDGSYRGNPDASDPRTTGIQGALKKIDHLMDHINKQHTQIGSYTNSLTATGDRATTLKVNVSSVKSEIMEADIGETYLMFQQRLLAYQAMLQATAKTSQISLLNYI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009226_4 | 1146424-1146525 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009226_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009226_4
>4.1|1146448|54|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder GATGTTTAAATTTGCTGAACCTTTATTGCTATGACCACCATAGATATTATATTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009226_4
The CRISPR arrays of NZ_CP009226_4 >merge|NZ_CP009226|4|1146424-1146525|CRISPRCasFinder TATAGTTCCACCAGATATATTTACGATGTTTAAATTTGCTGAACCTTTATTGCTATGACCACCATAGATATTATATTGTATAGTTCCACCAGATATATTTAC >NZ_CP009226|4|4|1146424-1146525|CRISPRCasFinder TATAGTTCCACCAGATATATTTAC GATGTTTAAATTTGCTGAACCTTTATTGCTATGACCACCATAGATATTATATTG TATAGTTCCACCAGATATATTTAC
>NZ_CP009226.1|WP_039362588.1|1142131_1142701_+|recombination-protein-RecR MQKQKLEKFNELVSCFEKIPGVGKKSALKYAYHVALGDSFFGLNLAHTIEDAVRFLRHCSMCGGISENEICDICSDINRDKTTLCIVETPKDILTIEHSNSFSGLYFVFDDANKLDKLKSNIKENGINELIFALTPSINSDGMMLYIEDKLKDFDVSFTKIAQGIPTGVSLENVDILSLSKAIKDRRSL >NZ_CP009226.1|WP_039362587.1|1140894_1142151_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKYSLTTKITIIFAIGFTVICALFFMFSKLQHESVLDKVKENQYNSINWLLSLYKKSNMPEDWEQYFKNFNLAYIKDPNLEKLILNNGDLIERVDTPIGIIETIFYANELFLRIKNQSVVITLQSTLKGTNDSLLIGFIITIALFISLYVSIFKSLLPLKNLRDDIRKFAAGNMDSICCKNIVKGDDEIAEVAYEFNNAACKIKELIMSRQLFLRTIMHELKTPIGKGRIVSEMLDDETQKDRLVAIFERLNILINEFAKIEQLLSKSYALQYENYHFSLILDQTKDILLLDDFDNKVSVDIKEDALLRVDFQLFCLAIKNLIDNALKYSDDKKAIIICDKEYICIKNRGNPLEKPIKHYKQAFIRDNTSKSTGMGLGLYIIEHICAMHKFEFLYEYTDGYHTFFITFKKPTNAKTKA >NZ_CP009226.1|WP_023385407.1|1140226_1140898_+|response-regulator-transcription-factor MINVLMIEDDPEFAQILSEYLLKFNIKVTNYEDPYLGLSAGIKNYDLLILDLTLPGMDGLEVCKEIREKYDIPIIISSARSDVNDRVVGLQIGADDYLPKPYDPKEMHARIISLIRRYKKTNEIQEETTDTAFKVDDKRHEISYSGNVLTLTPAEYEILEYLIKQHSFSVSREQLVYHCKSLKDKDSKSLDVIIGRLRSKIGDSSKSPKHIFSVRGIGYKLIG >NZ_CP009226.1|WP_023385405.1|1138943_1140032_-|molecular-chaperone-DnaJ MEFDYYEILEVSRDADGETIKKAYRKLALKYHPDRNQGDKEAEEKFKRINEAYEILSDENKRSIYDRYGKDGLSGSGFDEGFDLGDIFSSFFGGDFGGTRSSRNSYKYPLDIEVNITLNFNEAVFGCEKEIKYSYKVPCETCNATGAKDGKKSTCSHCGGRGKISHRQGFMNFVQTCPYCAGTGEIIKDKCSDCSGNGYNETSDNIKINIPQGVDNGNRIRIQSKGNKSSNGSGDLYVRINVRDDEHFVRNGDDVYIEIPVFFTQAMLGETIKIPTLRGESELKLPVGAKDKQQFVLENEGIQNTHTKLKGRLIAQIAINTPKKLTDEQKELLEKLQNSFGIKSGESSGDEGIFDKIKSWFK >NZ_CP009226.1|WP_002849757.1|1138652_1138913_+|30S-ribosomal-protein-S18 MAEKRKYSKKYCKYTEAKVEFIDYKDTTLLKYCLSERFKIMPRRLTGTSKKYQEMVEKAIKRARHVALIPYIVDRDNVVTNPFEGM >NZ_CP009226.1|WP_039362580.1|1138010_1138640_+|single-stranded-DNA-binding-protein MFNKVVLVGNLTRDIELRYAQSGSAIGSTGIAVTRKFSGANGEKREETCFIDITFFGRQAEIANQYLNKGSKVLVEGRLKFDQWQDQNGNNRSKHSITVESMEMLGSQTQGGFRDSHQDQTNSQYSNTSYSSNYQNPTGYQNDSNMNSGYRQQESFAQKAPKRAMNEQPYEEKIPEIDIDSDLPAQSQNRQNKPKQNIDVNIDDEEIPF >NZ_CP009226.1|WP_023385402.1|1137602_1137989_+|30S-ribosomal-protein-S6 MKHYELLFILKPTLTEDEAKVKVDFIKEVITKNGGEIANVIEMGTRKLAYKIDKYERGTYVVIYFKAPTQLIAELVRNVRITEEIIRFLTVKYENKREISAWDKLSKGQKLMPAKKELKAPEKPVEAE >NZ_CP009226.1|WP_023385400.1|1136517_1137510_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta MYKKEFQNLLNSNRLPNYFLLFGNEEYQVEIFAKEFISKFKKENLLSLYFDEYDFGIAKSHLMESSLFCDSSTLHIKTDKKIPAKELKYLIDLCKKNANNAFIYELHEGDMKTIFDTKKVFGENFVRFFAPNTPAEGVSLLMYHAEKLGLNIQTSALYQIYSLQNESLYLASSELNKLANLTKTINDDSVKKLVFSLNGVSFELFFNKLIALQNIKDDYFSYTNDSNFNEIALINSLYSSFFRLFKIQTYVKINGKFDIEKAIGYTPPPTILNQIKSQALSIKTELYMDIFMKLNSIEYDIKTKKDIDKECFLLSSILSIQNLIAKNSKS >NZ_CP009226.1|WP_023385399.1|1134596_1136525_+|VacB/RNase-II-family-3'-5'-exoribonuclease MKEFLNALANGVDDKFIKIDEREILRVLEQIKAVKKHKNKFYLNDGYVCGKLDISSGGTGFLMPYDARFKQDIIIENRDLNGAHFGDIVLAKLTKSKKSRLHATMIAVLAMANETSVVYTKKFGQVIMGVSIPNALTIALKASQKSLKELPIGTVLKINNLDNDITEVLGVLSDPSIDEKISLAIYNKKNLFPKICENEAKSFGDSVDKSMYPNRVDLTNLPFCTIDPVDAKDFDDAIYYDVKNRTIYVAIADVSEYVAAYSGIDKEAKFRGFSIYFPHIAIPMLPRALSENICSLKPNCNRLAFVFKISLDESLEPVKEELFEAVIHSKKRFNYDEVDEILALNLKADDEIQEWILPLFETAKKLKFKRLQNGFDFRSKELRMSISPNGDILKTAYEKETPSHSLIEDCMLLANKAAAKKINHGIFRNHAPADLKKINTLLDDLAVLGIEATYESDLVALISKIQTQADSLNIREDVDKLIIKAQKRAEYASKPTGHFGLGFDLYSHFTSPIRRYSDLILHRLLKANLANNAKLFNYLLLDIEGVCRGLNELEREADRVAWDFMDRKFARWAENHIDEVFRCYISEVGNQTIAKLDDEIKGARIYIENFTCSLLASVMVQIKEVDIPNAKIIGKVVQKLDV >NZ_CP009226.1|WP_039362576.1|1133787_1134600_+|HDOD-domain-containing-protein MNQAIYKSIKTLPPLDDTIVRIQQICNDENSNINDLITVIQKDPMLTANILRSANSPLYGFSREITDINRAVTLFGMATIRGFALCGAIKKSFSIDLSPYNIRDSQFMEIATTQNALAFNWYNKIDRELLNILSPASFMMEIGKIVIAKEILENDKSAAFKDALAHISTPSELSDLETDMVGISNEEVTVKIFEQWNLETEMIDAILYSNSPDDAPNHIRASSIALKIIKNSVNIFGILSDENIQSTLTLLDTYGLEQAKFIDAVKKVKG >NZ_CP009226.1|WP_039362592.1|1147027_1147825_-|shikimate-dehydrogenase MRYFAVFGNPINHSISPRLHNLALQGFGLDGFYSRVHLTDGLKLVDTFDKLRLSGANITVPFKEVVLEQCDEIDETAKNIGSLNTLVKKNGKIFGYNTDAPGFMLAISEFKDIKNALILGAGGTARAICYILQKNGIDVEILNRTDKKEQFKNYSFFTPQSYAPKGYDLVVNTTSAGLADDFLPTDQDILKQIFASSKFAFDVIYNKSTPFLNLANSCSLTCKDGKDMLLFQAVLAFNAFYENKFENEKIKTFMQQAFHLSKFRY >NZ_CP009226.1|WP_023385417.1|1147824_1148592_-|SPOR-domain-containing-protein MEENNKGLQDILLDKNEDDKSSKIRKILISVAGLVILFVIVLIVMKLLNGGSPSTDTKEESLALPAEPELRVETNQPTTAPTNEIFEQVPIISDTNPKDNFENIVNEYKNNQAAINNNQTVAAPLKTPEPATTVKDNTPKAETNKNITPKVPTQKKAESAAKPAQKPVAVKPVKTGNLASGNYIQVASLSKVNSNDPFIKKIKENGFDYHAYETTVNGKNVVKILIGPYSGAELNTNMEKIRKNISSGAFLFKVQ >NZ_CP009226.1|WP_023385419.1|1148602_1149145_-|DUF1882-domain-containing-protein MQSIDLTLIKMITDHYYIKRDAILNKIEYKGRHFFDKFERVDEPLNYNIQKEHEEHKIIAAHSLISKNDKIENIVFDYNGRTPERFWHRAQLMLREEGFINFTAYESKTPGHLHLYVHKGHTTLSEGYQIANRLSVMLAQKLPQEWRMFPTLDLPREFNILALPYALYQKERGASWSKHM >NZ_CP009226.1|WP_039362597.1|1149144_1150389_-|serine-hydroxymethyltransferase MSLESFDKDIYSLVNKELERQCNHLEMIASENFTYPDVMEVMGSVLTNKYAEGYPSKRYYGGCEFVDEIEQIAIDRCKKLFGCEFANVQPNSGSQANQGVYGAFLKPGDKILGMDLSHGGHLTHGSKVSSSGKYYESFFYGVELDGRINYDKVEEIANITKPKMIVCGASAYAREIDFKRFREIADSVGAYLFADVAHIAGLVVAGEHNNPFPHCHVVSSTTHKTLRGPRGGIIMTNDEEFAKKINSSIFPGIQGGPLMHVIAGKAVGFKHNLSDEWKVYAKQVKANAKKLGEILIKRGYDLVSGGTDNHLVLVSFLNKEFSGKEADIALGNAGITVNKNTVPGETRSPFITSGIRVGSPALTARGMKEGEFELIANRIADVLDDINNSSKQEKIKAELKELAHKFIIYDKAMF >NZ_CP009226.1|WP_039362598.1|1150385_1151900_-|lysine--tRNA-ligase MIFENELELTRLAKADELRSLGVNPYPHFLKRDMSINEFKTKFAYIKDLNDDEKRADEEVTISGRLKLKRVAGKSTFANMEDENDNIQIYYSLGSIGEEDYTKFKKNLEVGDIVLVTGYAFITKTGEFSIHASKIVLASKAISPLPEKFHGLTDIEMRYRQRYLDMIMDKDVRADFVKRSLIISTIRRFFEDRGFLEVETPMMHPIAGGANAKPFITHHNALDVDRYLKIAPELYLKRLIVGGMEAVFEMNRCFRNEGMDLTHNPEFTSIEFYWAWHNYFEVMDLTEELFAVLLDRLNLPKIIEFDGKSIDFSKPFARVKYIDAIVEIGGISRDIATNKEKILARLKADKFEANDKLDLGHLQAELFDNYVEDKLINPTFIVDFPISISPLSRRSDADKNVAERFELFIAGRELANAFNELNDPIDQYERFKSQIEAKDAGDDEAHEMDEDYCQALGYGMSPTVGWGLGVDRLVMLLLNKKSIRDVILFPAMKPLKTENKENKK >NZ_CP009226.1|WP_023385424.1|1151910_1152375_-|transcriptional-repressor MTNVDNIEYDTLLDRFKKVLRDNGLKYTKQREILLKTLYNNSDHFTPEQLYLYIKDSHPDLNLGIATVYRSLNLLEESGMVTSISFGAQGKKFELATKPHHDHMICRTCGNIIEFEDPIIEKRQSIISKEHGFKLTGHMMQLYGVCQECSKKKN >NZ_CP009226.1|WP_039362600.1|1152371_1152950_-|CvpA-family-protein MNFVTWFDIIVIALVVILGIKGIINGLVKEVFGLIGLIGGVIIASRNAQSVGDLISSHIYQLNDSSSFFFGFLATLILFWFVCLIAGNIFSKMLSLSGLGFLDRILGFFIGSAKIFLVFAIFCAIISNISVLSQKIEPYFENSKVYPVLLASGKFIMNIDLNRTKQDVIEKFDNEPMSVDSNETNSTKEDSQ >NZ_CP009226.1|WP_023385428.1|1152949_1154011_-|type-IV-pilus-twitching-motility-protein-PilT MNIETLLKTVMHNKASDLHLVSRSEPQIRIDGSLRPLEGKVLDGSDIENLCYVILTDAQKSELEENRDLDFALELPGIGRFRGNCYYTMNGSLAAAFRMIPLNVPSLDDLSAPKIFKELVKKEKGLVLVTGGTGAGKSTTLAALLNEINLTERKHIITIEDPVEFVHQNKNSLFSHRNVGTDTKSFARALKYALREDPDIILVGDLRDPETISIAIAAAETGHLVFGTLHTNSSVQTINRIVDSFNETEQAQVRNMLSLSLNAIISQTLVPKADNGRFAIYEILINNHAISNLIRENKSHQIYSQIQLNQQNTGMQTQTQAMEKAVKMGIITKENAIRYSTNQQELAGKLGVI >NZ_CP009226.1|WP_039362602.1|1154016_1154304_-|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatC MQIDDKMLEKLEKLSALKIPDHNREEFKSQLGKIVDFVDILNELDLGDIEATVSTIGGGTPFREDISKEGDVIDGILAHAPKKQNRYFEVPKIIE >NZ_CP009226.1|WP_039362604.1|1154514_1155075_+|hypothetical-protein MAIKDDLNYIKTEISSQEQFLENAIRSERFIKKNKKIIIAIVAAAVIALIAYAVLNQIKSSNIAESNSAYTTLLSNPNDKKAKQTLIEKNPSLFALYAIKTAYDSNSTEILDEASNLTSDPLLKQILQNAKGDNSDGLLSTYNSLVKGYELLTQNKLPEAKIEFSKIPSNSPLEPVAKNLEHYQGK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP009226_1 | 1.14|669619|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669619-669653 | 35 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 11187-11221 | 5 | 0.857 |
| NZ_CP009226_1 | 1.14|669619|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669619-669653 | 35 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 77279-77313 | 5 | 0.857 |
| NZ_CP009226_2 | 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT | 675333-675369 | 37 | NZ_CP008809 | Campylobacter fetus subsp. fetus 04/554 plasmid pCFF04554, complete sequence | 8753-8789 | 6 | 0.838 |
| NZ_CP009226_2 | 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT | 675333-675369 | 37 | NZ_CP018792 | Campylobacter sp. RM8964 plasmid pVIC8964, complete sequence | 22032-22068 | 6 | 0.838 |
| NZ_CP009226_2 | 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT | 675333-675369 | 37 | NZ_CP018794 | Campylobacter sp. RM12175 plasmid pVIC12175-1, complete sequence | 22299-22335 | 6 | 0.838 |
| NZ_CP009226_1 | 1.2|668967|32|NZ_CP009226|PILER-CR | 668967-668998 | 32 | MN090155 | Escherichia phage vB_EcoS_PHB17, complete genome | 378-409 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP009226_2 | 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT | 675333-675369 | 37 | NZ_CP043436 | Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354 plasmid p3226, complete sequence | 2677-2713 | 7 | 0.811 |
| NZ_CP009226_2 | 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT | 675333-675369 | 37 | NZ_CP008812 | Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608 plasmid pCFV97608-2, complete sequence | 17906-17942 | 7 | 0.811 |
| NZ_CP009226_1 | 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669947-669982 | 36 | NC_048682 | Raoultella phage Ro1, complete genome | 105668-105703 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP009226_1 | 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669947-669982 | 36 | MK024806 | Proteus phage Mydo, complete genome | 113504-113539 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP009226_1 | 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669947-669982 | 36 | MT178275 | Klebsiella virus KpS8, complete genome | 41028-41063 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP009226_1 | 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669947-669982 | 36 | NC_048647 | UNVERIFIED: Klebsiella phage KNP2 genomic sequence | 31769-31804 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP009226_1 | 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669947-669982 | 36 | MT939253 | Klebsiella phage vB_KpnM_Seu621, complete genome | 40991-41026 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP009226_1 | 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669947-669982 | 36 | KX452695 | UNVERIFIED: Klebsiella phage KPN2 genomic sequence | 31769-31804 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP009226_1 | 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669947-669982 | 36 | NC_048656 | Klebsiella phage vB_KpnM_BIS47, complete genome | 23877-23912 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP009226_1 | 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 669947-669982 | 36 | NC_028659 | Klebsiella phage vB_KpnM_KB57, complete genome | 41815-41850 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP009226_1 | 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 670275-670309 | 35 | MN694401 | Marine virus AFVG_250M993, complete genome | 30035-30069 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP009226_1 | 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 670275-670309 | 35 | MN694800 | Marine virus AFVG_250M236, complete genome | 29596-29630 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP009226_1 | 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 670275-670309 | 35 | MN693884 | Marine virus AFVG_250M237, complete genome | 29408-29442 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP009226_1 | 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 670275-670309 | 35 | MN693720 | Marine virus AFVG_250M228, complete genome | 28243-28277 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP009226_1 | 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 670275-670309 | 35 | MN693802 | Marine virus AFVG_250M1131, complete genome | 11417-11451 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP009226_1 | 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 670275-670309 | 35 | MN694277 | Marine virus AFVG_250M238, complete genome | 11130-11164 | 11 | 0.686 |
1. spacer 1.14|669619|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
agcgtgacgccaactagcttttgtgctaacttagc CRISPR spacer ggctggactccagctagcttttgtgctaacttagc Protospacer .** *** ***.**********************
2. spacer 1.14|669619|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
agcgtgacgccaactagcttttgtgctaacttagc CRISPR spacer ggctggactccagctagcttttgtgctaacttagc Protospacer .** *** ***.**********************
3. spacer 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP008809 (Campylobacter fetus subsp. fetus 04/554 plasmid pCFF04554, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacattagaaaaaa Protospacer *. *..****.************************ *
4. spacer 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018792 (Campylobacter sp. RM8964 plasmid pVIC8964, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacattagaaaaaa Protospacer *. *..****.************************ *
5. spacer 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018794 (Campylobacter sp. RM12175 plasmid pVIC12175-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacattagaaaaaa Protospacer *. *..****.************************ *
6. spacer 1.2|668967|32|NZ_CP009226|PILER-CR matches to MN090155 (Escherichia phage vB_EcoS_PHB17, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
atatttacaactcgatttattaaatttgttga CRISPR spacer ttgttcacaactcgattttttaaatttgcgca Protospacer *.**.************ *********. *
7. spacer 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043436 (Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354 plasmid p3226, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacgttagaaaaaa Protospacer *. *..****.***************.******** *
8. spacer 2.8|675333|37|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP008812 (Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608 plasmid pCFV97608-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacgttagaaaaaa Protospacer *. *..****.***************.******** *
9. spacer 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048682 (Raoultella phage Ro1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
10. spacer 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK024806 (Proteus phage Mydo, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
11. spacer 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT178275 (Klebsiella virus KpS8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
12. spacer 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048647 (UNVERIFIED: Klebsiella phage KNP2 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
13. spacer 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT939253 (Klebsiella phage vB_KpnM_Seu621, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
14. spacer 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX452695 (UNVERIFIED: Klebsiella phage KPN2 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
15. spacer 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048656 (Klebsiella phage vB_KpnM_BIS47, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
16. spacer 1.19|669947|36|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028659 (Klebsiella phage vB_KpnM_KB57, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attttactatacgcttctttagcattctgtttggct CRISPR spacer ctgatataatacgcatctttagcattctggttggta Protospacer * **. ****** ************** ****.
17. spacer 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694401 (Marine virus AFVG_250M993, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
18. spacer 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694800 (Marine virus AFVG_250M236, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
19. spacer 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693884 (Marine virus AFVG_250M237, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer taaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
20. spacer 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693720 (Marine virus AFVG_250M228, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
21. spacer 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693802 (Marine virus AFVG_250M1131, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
22. spacer 1.24|670275|35|NZ_CP009226|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694277 (Marine virus AFVG_250M238, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaaaactatgttgatgaagctttaaaaagaatag CRISPR spacer caaaaactatgttgatgagcctttaaagccttcga Protospacer *****************. *******. ...
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
22250 : 32070
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009226|22250:32070|DBSCAN-SWA TTTGAAGATAATTAAACGTGATGGAAGTTTGCAAGATTTTGCAAGTTATAAAATAGAAAATGCAATAACAAAAGCTTATAAAAGTGCCATTAAAAAACCAAATGCAGAGCTTATAAAAAATGTATTGTCTATGGTAAAAGACAAAATGAGCGTCGAAGAAATTCAAGATATCATAGAAAAAGCACTCTTTGATAGCGGCGATTTTAGTGTGATGCGAAGTTTTATGCTTTATAGACATACTCATACTATGCAGCGCGGTGGTGAGCTTGATGAGCGCACAACTTATATAAACTCGACTCAAACCATAGAAGAGTATATCGGAAAGTCTGATTGGCGTATTATGGCAAACTCAAATACGAGTTATTCAAACGCTGGACTTATAAACAACACAGCTGGAAAAGTCATCGCAAACTATTGGCTAGACGCTGTTTATAATGATCATGAGGGCGCAGCTCATAGAAACGGCGATTATCACATACACGACCTTGATTGTTTGACTGGATACTGCGCTGGTTGGAGTCTTAGAGCTTTGCTAAATGAAGGATTTAACGGTGTAAGAGGAAGAGTCGAGAGTAGGGCGCCAAATCATTTTAGAGAAGCTTTATATCAAATGGCGAATTTTCTAGGGATTTTACAAAGCGAATGGGCAGGAGCGCAAGCATTTAGCAGTTTTGACACCTACCTTGCACCTTATGTTTTTAAAGATAAACTTAGCGATAAAGAGATCAAAAAAGCTCTTACTAGCTTTATATTTAACTTAAATGTTCCTGCTCGTTGGGGTCAAAGTCCATTTACGAACGTTACTATCGATATGGTTCCTCCAAGTGATTTAAAAGGACAAATTCCTACTAAAAACGACATTCATTTATTTACAAATTTAAATGATGAAGAGTTGGAAGCTGAGTGTAAAAAACGGGGTCGTTCAAATCTTAAAGATATGACTTACGGTGATTTTAAACCCGAAATGGATAGGATAAATATCGCTTTTTACGAGATACTTACGCAGGGCGATAAATGTTCGCAGCCATTTACGTTTCCTATACCGACTGTAAATATCACCGAAGATTTTGACTGGGATAGCAAGGTTGCTACAAAGCTTTTTGAAAATACCGCCAAAATGGGTTCTAGCTATTTTCAAAATTTCATCGGATCTCAATATGTGAAAGATGAGTTTGGCAACCGCATTCCAAATGAAAAAGCCTATAAACCAGGCGCTGTTCGTTCTATGTGCTGTAGATTGCAGCTTGACTTACGTGAGCTTTTAAAGCGTGGCGGCGGACTTTTTGGAAGTGCTGAGATGACAGGAAGTATCGGCGTAGTTACTCTAAATTTAGCGAGGCTTGGATATCTTTTTAAAAATGACAAAAAAGCTCTTTATGCAAGACTTGATGAGCTATTAGAACTAGCAAAAAGCACACTTGAAAAGAAGCGTAAATTCATAAATGAGATGTACGAAAGAGGTCTTTATCCATACACTGCACGGTATCTTAAAACGTTCAATAACCATTTTAGCACTATCGGAATAAACGGTGCAAATGAGATGATACGAAATTTTACGAATGATAAGGAAAATATAACTACTAAATTTGGTATAGAGTTTGCAAAAGAGCTTATAGAGTATCTAAGAGCTAAGATGATAGAGTTTCAAGGGGCTACTGGAAATTTATACAACCTTGAAGCAACTCCGGCTGAGGGAACGACTTATCGCTTTGCTAAAGAAGATAAAAAACGCTACCCAGATATCATTCAAGCGGGATTTGATGAAAAAGTATATTATACGAACTCGACTCAGCTTCCAGCGAATTTCAGCAGCGATCCGTTTCATAGTTTAAATTTGCAAGACGAGCTTCAAAGCAGCTACACAGGCGGAACGGTCTTTCACTTGTATATGAATGAAAGACTAAGTAGTGTCTCGGCTTGCAAAAAGCTTGTAAAAAATATAGTAGAAAACTATAAGCTTCCGTATATCACGATAACTCCTGTATTTAGTATATGTCCAAAACACGGATATATCGCAGGTGAGCATGAGTATTGTCCAAAATGCGATGAGGAGATTTTGAGTTTAGCTTGACTTATCTTTTTTCTGTTTTGTTTAGAGTTTGCTAAAAGTTTTTAGTTGCGTATTATAAATTTAAAAAAGATTTTTATATGTATTTGAATTATCAAATTTAAGCCCTTTTTTGATAAAATCGTCATAAAATTTAAAGGTAAAATGCAGATGAATTTAATCCTAAATACGGATAGTTACAAAATTTCGCACTATCTCCAGTACCCAAAAGATGTGAATTACGTAAGTTCCTACATAGAATCACGCGGCGGTAGGTGGAACAGAGTTTTATTTTATGGCTTACAAATGTTTTTGATGGAGTATCTAAGCAAAAAAATCACGTATGAAGATATAGAAGAGGCAAAAGATTTTATAAAATTTCACGGACTTTCATTTAATGAAGATAGTTGGCGATACATAGTAGATGAGCACGGCGGCGCACTTCCACTTGAGATAGAAGCGGTAAAAGAAGGCAGCATCGTTCAAACTGATAACGTGCTGTTGCAGATACGAAATACTGATCCAAAACTTCCTTGGCTTGTGGGCTACCTTGAGACGGCTATTTTAAGGGCTATTTGGTATCCAGTTGCCGTGGCTACGAATAGTTATTTTTGTAAGCAAAATATTTTACAGTTTTTAAATGAGACTGGAACTCCTGATCTTATCGACTTTTGTCTGCATGATTTTGGTGCGCGCGGTGTGAGTAGTTTTGAGAGTGCAGGTATCGGTGGAAGCGCTCATATGGTAAATTTCAAAGGCTCAGATACGATAACTGGAGCTGTATTTGCTAAAAAGTACTATGACGCTGATATGGCGGCATTTAGTATCCCAGCAAGTGAGCATAGCACGATGACTACTTGGGGAAAAGAGAATGAAAGCGATGCTTATAAAAATATGGTTGATAAATTCGGTAAAAGTATTTTTGCTTGCGTGATTGATAGTTATGATACGCTAAATGCGATAGAACTTTGGGGAAAATTATTTGATGAGGTTAAGACAAAAGGTGGTCGCGTCGTGCTTCGCCCAGATAGCGGAAATCCAGTAACAATGGCTAGCGAGTGCTTAGAAAAGATGATGGATATAGCGGGATTTAGTGTAAATCAAAAAGGCTACAGAGTACTTCCAAAACATATCAGGCTGATTTATGGCGATGGTATAAATCCGCAAAGTTTAGTTGATATTTTAAATGAGCTTAAACTTAGAAAAATAAGTGCGGATAATATCGTTTTTGGTATGGGTGGGGCGCTTTTGCAACATCTTAACCGCGATACTCTTAAATTTGCGATGAAAGCAAATGCTGTATCAAAAGACGGTAAGCGCTGGACAGATGTGAAAAAAGATCCTATCACCGATCCTTCAAAACGCTCGAAATCCGGACGTCTTGCACTGGTAAGAAAAGGAAATTTGTTTAAAACTGTTCGATTAAACGAGCTAAAAAAAGAAGAAAATAAACTTAAACCAGTTTTTAAAGACGGTAAAATCCTAAGCAAAGTAAGCTTTGATGATATCAGAGCTAGGGTTAGAGAATTTAATTAAAGGATAAAATATGAAAAAACAAGAGATACTAACTAAATTCAAAGACAAACGTACAAAATGCGTGGTTTATACTAGAGTTATGGGTTATCACAGACCAGTTGAGAGTTTTAATCTTGGAAAACAAGGTGAGCATAAAGAGAGAGTCAAGTTTTTAGAACCTGCTAAATGTTAGATAAATTTATCTATGATATCACGCCTTTTAGCGTTGTTGATTATCCTGATGAACTCGCTTGTTTGGTGTGGTTTGCGAAGTGCAATATGCGCTGCGTTTATTGCTACAACAAAGATATAGTTTTGGGTGAGGGCAAGTTTGATATGCATTATCTAAGCGAGTTTTTAAATTCACGCCAAAACCTTTTAAGCGCGGTAGTTTTAAGCGGTGGGGAATGCACTAAAAGTTTGCATTTTAGTGATGTTTTGAAGCTAGCTAAAGATCTTGGATATAAAACCAAAGTCGATACGAATGGAAGCAATCCTGAGATTATAGAAGAAAATTTGAGTTTGATCGATTTTATATCGCTTGATTTTAAAGCTCCAAAAGCTAAATTTGAAACGATCACCGCGTCAAATTTATATGATAAATTTATAAAAACACTTCAAATTTTACTAAAAAACAGAGCTAAATTTGAGTGCAGAACGACTATCCACGCAGATATACTAAACGAAAATGATATCAGCGATATGGCAAAAGTTTTAGAGCAAAACGGATATCGCCAAACTTACTATCTGCAAAACTATTTTGAAGCCTCAAATTTAGGAAATTTACAAAAACCAAAAGCTAAATTTGATCCAAATTTGATAAACTCAAATTTAAGCATTGCGCTTAGGAATTTTTGATTTTATTAAAATTAGATAAAAGCCATTTTTAGCTTTTATCAACTGTTTTATCTAATGACTCTAGCTCCACTAAGCGGCGGTGAAAATACAAAAAGTTGCTTAGGTTCTATATCCACAAAAAATTCTAAAACACAACGTACTAGTCCGACTCTATTTTCTATCGGCACATTTGGATTTTCAAATGTTCCTAAACACTCATTTGTTTTTAGAACGAGTGAGCGTAGTTGCATAGCTCCGCTACTTGTCGGTATGATCTGAAAAATAGTCTCAAACTCGCCGCTATCATAGTCTTGTTTGCAGTTTTTCAACGCTAAAAATCCGCTAGGAGCGATCTGAAGGCACATTTTTACGTCGGCTGCTACTTGAAACTGCACGTATCCAAAAGGAAAAGAATTTGCAAACTTATCAGCTTTTTTTATTTTAGGATCTACTCCTAAATCATTTAAAAACCAGTTTTGGTAATTAAACTGCCCTGAAAATCGTTTTATATTTATAGGAATTCCGGTGTTTGCATTGCGTATTTGAAAGGCGTCGGTTATGTTTTCATTTGCGAAAATTATGCTTATAAAGAAAAATATTATGGTTAAGACTCTCATCAGTTATCTCCAAATTTTCTAAAATTTACTGGAAAATGGTCTGAAACCAAGTGAGTTCGCAGGTTGGCTAACATTAGCACGGCTACGAGCGCAGTTTCTACAATACCTCCAGCTGAGTTTCCCACTATAGCCCAGTCAAGAGTTCCGCCGCTTCTTTGAGTAGGCGCAGGTGGCGCTAAAAATGTTACTCTGATACGAGTTTCTAAGCCAAGAGTTCCTCTTAAACTCTCAGGTGAGCGGTTAAAATCTCCTAATATCATCCAAGTGATATCTGGCATATTTCTAAATCTATCAAATACCGAGTTTATTATCGCTGGAGCATCAATTCCACCATTTGCTAAGGCGTGTATGTTGAAAAATACATCGTTTCCTATCCTTATACCGATGAGCGGACGAGAAGCTACCGTAGGAGGTGGTAAGATGATGATTTCATCAGCTATGATGCGTGAAACGATAGCTAAATTTACTCTATTAGCTCCAGTATCGATTTGAGCGTAATATACATAGACTTGAAACGGTCTAGATATACTACCTAGTTGCCATAAATGCTCAGTTACGATAGTTCCGCCTTGATTTATGCTTCTACCAGTAGGATGAGCGGTTTGTGGTAAATTTCCTGCTTCTTGAATAGCTAAGATATCTGCTGGATTTTCACCGCTGATTATTTGGCGGATACTTATATTCCATTTGCTTTCTGTAACAGCGGAACTACCTTGTAAGTTCCAAGTAGCGAGTTTATAGTCTTCTGGTTTTGCAAAACTTAAAGTTGCCATAAATATAATCATAACAATCTTTCGCATTTTTACTCCTAATATAATAGTCTTCCGACTTGCGGTGGTGGAAGCAAATACCATTGCTGGTCGATAGTATCAGTGCATTTTGTAGTAAGATTTATCGCTCCAAAAACGTCAAAACCAAACAGGTTATCAACAGGTGTTTGTAAGCACGAATTTGTAGCTTTGTTATAAATTTGCACCGCTCCGTTTGTCATAGGGCGAAGTACGAATTTTTGAAAAGGATTGTTTTTGTTGCAAGGTGAATGGATCACACCGTTTTTATAAGTATTCATGCAAGTCGTACGAGTGTTGAAATTTACTATCATTACTTCATTATCTGGTAGTAAAATCAGACGCCAAACACGGTAACCTCCTAAATTACCGCTCGTATATAGCGCGTATCCCCATAGCCAGTTTCCAGGCGATGAATACCAAACGGTGATCGCAACTCCGTTTGCACCCATTATCACGAGAGAATCGCTTGTTCTATCAAATAGATCAGGCGGGATACCTTGTAGGTTTATAGTCGGTTGTTTAAAATTTAGATCTGCTTTACCAAAAACGCTTCCTAATGGGTCTGTTTTTTGAGTGCTTATCTCTGTTATTTTTGATGAGCAAGCATTAAAAATAGTCATACAAAATAGCAAAATAAGACTATTTTTGATATGTTTTAAGATAGTTTCAGTCATAAATTTCCTTTTTTTAATATTTTGATTTTAGTAGTTTTTAAGATACTGTTTTGGCTAAGTAAATTTAAAAGCCGCAAAAGTTTTTTCATAAGATTTTCCTATAATGATATTTGTAAAATTTAATAAATAAAAATAAATAAATTTTAAATAACTACTGAAAATATAACTTTTAAAATCGTAAATTTAGTTTCAGGTATTTTAAAACTTATTTAGATAAAATCTAATCCACTTTAAAATTTGAAAGACTTATGATGAATAGAAAAAAAATTTATAATCCAAGCTCAGACGAGACTTTAAACGATAGAAAAGTATTTGGTGGAAATCCTCACGGAATTCTAAATTTCACAAAAGCAAAATACACATGGGCACTCAAGCTTTGGGATCTTATGGAGGCAAATACGTGGTTTCCAAAAGAGGTCGATACCACCGATGACGTGCGCGACTACGCTTGCAACCTTACGACTGCTGAAAAGCGTATGTATGATCTTGTTTGGAGCCAACTCATCTCTATGGATAGTTTTCAAACAAACAATCTAGCCGATAACATAAATCCTTATATCACCGCTCCTGAGATAAACGCGATCTTAGCGCGTCAAGCTTACGAAGAGGCAAATCACTCAAAAAGTTACGCCGTAATGGTAGAAGCGATCTGTGATAATACCGATCTCATCTATGAAATGGAAAAATACGACGACGTTTTACGTAAGAAAAACGACTACATTTCAAGCGTGTATGAAGAGCTTGCAGGTGAAGTTACTGATGAAAAAATGCTCCTTGCTATGGTGGCAAATCAAATTCTTGAAGGCGTCTATTTTTACAGCGGATTTACAGCGATTTACGCACTAGCTCGTGCTGGAAAAATGCTAGGAAGCGCTCAGATGATACGCTTTATCCAAAGAGATGAGATAACTCACTTGCTTTTATTTCAAAATATGATAAACTCAGTTCGCAAAGAGCGTCCAGATCTATTTACAAGTGAAGTAGAAACTAAAATTTATGAGATGTTCAAAAAGGCCGGAGACCTTGAGATAGAGTGGGGAAAATACATCACGGGAAATCAGATAATGGGATTTACTGATGATATTATAGAGGAGTATATCCACTACCTTGTTGATGATAGGCTAGTTTCTATCGGGCTTAAAAAGCTTTACAATGCAAAACATCCGATAAAATGGGTTGATGATTTTGCTAAATTTAATGATCAAAAATCAAATTTCTTTGAAAGTAAAGTTACGAATTATAGTAAAGGAAGCCTTACTTTTGATGATTTCTAATCTAGGATTTTTACATCTAAATTCTGCTGGAACTATAAATAGGACTAGTGAGTTTTTAAATTTAGTAAAAGATATAAAACCGGGCGAATTAGTGCTAGCAAGTGAGCTTTGCGTTAGTGGATATGAAAATTTAGGCGATGAGTTTGAAAATGAGCTTATCGCAAATTTAAAAAACGTCTTACTTGCTGGAGCTTTTCTCGGTTTTACTCATTTTAGTGGTGGTTTTAATGAATTTGTACTTTTAAACGGCGATAAAGAAATCCATAAACAGAAAAAAGCGATTTTATTTACTCCAAATTTAGAACAAGATAAGTTCAAAGCTGGAAAAGTTGAAGATATAAATTTATTTGAAATATGCGGCGTCAAGATAGGCGTTTTGATCTGTTTTGAATTGCGTTTTACTGAGCTTTGGGAAAGGCTAAAAGGCGCGGATATCATTCTTGTGCCATCGCTTTGGGGAAAAGAGCGCAAAAGACATTTTGAAGTTTTATGTGAAGCTTTAGCTCTGCAAAATCGCTGTTATGTGATCGCTTGTAGCGACAGAGATCTAAAATTCGGAGCAGTTTTTAAGCCAAATGGTGAGATTGCAAAAAGTTTTAAATTTGAACTTGATTTGGCTAGTGAGTTTAAAAAATCTTTAGGGCTTATTTAATTTAAATACTACTATAAGCAAATTTTATGTATAATTCCCCTTTGTTAAAGGGAAAAAATGGATAGTTTAGAGCGCGCTAGATGTCAAAAAATGGCTGATGATATAGCCGATGTTATAGAGCTGACGCCTATGGTTTATAAGGCGTTTTGTAGTACTCCTCGTACTGATTTTGTTCCAGTTTCTGTTAATGCTTTTAAGCTAGATGCTCATCCCATCGGCGGTAATCAATGGATTAGTTCGCCTCTAACAGTAGCTAAAATGACGCTTGCTTTGGAAGCTGAAAATTGTGATAATATACTCGAAATTGGTTGCGGAAGTGGCTATCAAGCTGCGATTTTAAGCAGGCTTGCTCATAGAATTTTTAGTATTGAGCGTATAGAAAAACTTGCAAATGAAGCCAAAGCAAAGATGAAAAAACTTGATTTTAATAATGTAAATATAAGATATGATGATGGAAATGTAGGCTGGAAAAGTTACGCTCCATATGATAGGATAATACTTAGTTGCGCTTGCTCAAGTGTTCCAACTAGGCTTTTTGAACAGTTAAAAGATGATGGAATTTTAGTAGCTCCTATCAAAGAAAATAATAAACAATTTATAGTTAAATTTAAAAAAATCGGCTCAAATTTAGAAAAAATAGTTCTTGATGAGTGTGAATTTGTTCCTTTATTAGATGGCAGAGAGTAGTTTTTAAGAGTATATTTCTCTTATTTAACTTTTTTGTGTATAATTATGCTATCAAAAAAATAATTAAGGAGAAATTATGGAATTAAGAACACTACCTTTTAACCCAGCTACAAATGCTGTTGTAAGCGAAGAAACCTGTAGCTATCACTATGGAAAACATCATCAAACTTACGTGAATAATTTAAATAACCTCATAAAAGGTACAGATTTTGAAGGTGCTGATCTTTTTGAGATTTTAACTCATTCCGAAGGTGCGATTTTCAATAACGCTGCTCAAATTTACAATCATGATTTTTACTGGGATTGCATAGCTGCTAAAACAGATATTAGCGATGAGTTAAAAGCTGCTTTGCAAAGTGATTTCGCAGATTTTAAATCTGAGTTTTTAAAAAGCGCTACTACTTTATTTGGCGCTGGATGGACTTGGCTTGTTTATAATCCAAATTCGCATAAACTTGAGATAAAAAACACTAGCAACGCAGGAACGCCAGTGACTGAAGGTTTGATCCCGCTTTTAGTAGTTGATGTATGGGAACATGCTTACTATATCGATGCAAGAAATGCGAGAGCTGCTTATTTAGAGAAATTTTATGAAAATATAAATTGGGACTTTGTAAGTGCCGCTTATGAATGGGCTAAAAAAGAGGGTTTGAGCTCAGTTAAATTTTATATAGATGAAATTTATAAAGGTTCAGGCTGCTGTGGCGGACATTGCGGTTGTCATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009226|22250:32070|28073_28730_-|WP_023383974.1|DBSCAN-SWA MTETILKHIKNSLILLFCMTIFNACSSKITEISTQKTDPLGSVFGKADLNFKQPTINLQGIPPDLFDRTSDSLVIMGANGVAITVWYSSPGNWLWGYALYTSGNLGGYRVWRLILLPDNEVMIVNFNTRTTCMNTYKNGVIHSPCNKNNPFQKFVLRPMTNGAVQIYNKATNSCLQTPVDNLFGFDVFGAINLTTKCTDTIDQQWYLLPPPQVGRLLY >NZ_CP009226|22250:32070|25997_26669_+|WP_039361597.1|DBSCAN-SWA MLDKFIYDITPFSVVDYPDELACLVWFAKCNMRCVYCYNKDIVLGEGKFDMHYLSEFLNSRQNLLSAVVLSGGECTKSLHFSDVLKLAKDLGYKTKVDTNGSNPEIIEENLSLIDFISLDFKAPKAKFETITASNLYDKFIKTLQILLKNRAKFECRTTIHADILNENDISDMAKVLEQNGYRQTYYLQNYFEASNLGNLQKPKAKFDPNLINSNLSIALRNF >NZ_CP009226|22250:32070|28981_30004_+|WP_023383975.1|DBSCAN-SWA MNRKKIYNPSSDETLNDRKVFGGNPHGILNFTKAKYTWALKLWDLMEANTWFPKEVDTTDDVRDYACNLTTAEKRMYDLVWSQLISMDSFQTNNLADNINPYITAPEINAILARQAYEEANHSKSYAVMVEAICDNTDLIYEMEKYDDVLRKKNDYISSVYEELAGEVTDEKMLLAMVANQILEGVYFYSGFTAIYALARAGKMLGSAQMIRFIQRDEITHLLLFQNMINSVRKERPDLFTSEVETKIYEMFKKAGDLEIEWGKYITGNQIMGFTDDIIEEYIHYLVDDRLVSIGLKKLYNAKHPIKWVDDFAKFNDQKSNFFESKVTNYSKGSLTFDDF >NZ_CP009226|22250:32070|27264_28065_-|WP_023383973.1|DBSCAN-SWA MRKIVMIIFMATLSFAKPEDYKLATWNLQGSSAVTESKWNISIRQIISGENPADILAIQEAGNLPQTAHPTGRSINQGGTIVTEHLWQLGSISRPFQVYVYYAQIDTGANRVNLAIVSRIIADEIIILPPPTVASRPLIGIRIGNDVFFNIHALANGGIDAPAIINSVFDRFRNMPDITWMILGDFNRSPESLRGTLGLETRIRVTFLAPPAPTQRSGGTLDWAIVGNSAGGIVETALVAVLMLANLRTHLVSDHFPVNFRKFGDN >NZ_CP009226|22250:32070|25842_26004_+|WP_039361595.1|DBSCAN-SWA MKKQEILTKFKDKRTKCVVYTRVMGYHRPVESFNLGKQGEHKERVKFLEPAKC >NZ_CP009226|22250:32070|24467_25832_+|WP_039361593.1|DBSCAN-SWA MNLILNTDSYKISHYLQYPKDVNYVSSYIESRGGRWNRVLFYGLQMFLMEYLSKKITYEDIEEAKDFIKFHGLSFNEDSWRYIVDEHGGALPLEIEAVKEGSIVQTDNVLLQIRNTDPKLPWLVGYLETAILRAIWYPVAVATNSYFCKQNILQFLNETGTPDLIDFCLHDFGARGVSSFESAGIGGSAHMVNFKGSDTITGAVFAKKYYDADMAAFSIPASEHSTMTTWGKENESDAYKNMVDKFGKSIFACVIDSYDTLNAIELWGKLFDEVKTKGGRVVLRPDSGNPVTMASECLEKMMDIAGFSVNQKGYRVLPKHIRLIYGDGINPQSLVDILNELKLRKISADNIVFGMGGALLQHLNRDTLKFAMKANAVSKDGKRWTDVKKDPITDPSKRSKSGRLALVRKGNLFKTVRLNELKKEENKLKPVFKDGKILSKVSFDDIRARVREFN >NZ_CP009226|22250:32070|30713_31343_+|WP_023383979.1|DBSCAN-SWA MDSLERARCQKMADDIADVIELTPMVYKAFCSTPRTDFVPVSVNAFKLDAHPIGGNQWISSPLTVAKMTLALEAENCDNILEIGCGSGYQAAILSRLAHRIFSIERIEKLANEAKAKMKKLDFNNVNIRYDDGNVGWKSYAPYDRIILSCACSSVPTRLFEQLKDDGILVAPIKENNKQFIVKFKKIGSNLEKIVLDECEFVPLLDGRE >NZ_CP009226|22250:32070|26716_27265_-|WP_039361599.1|DBSCAN-SWA MRVLTIIFFFISIIFANENITDAFQIRNANTGIPINIKRFSGQFNYQNWFLNDLGVDPKIKKADKFANSFPFGYVQFQVAADVKMCLQIAPSGFLALKNCKQDYDSGEFETIFQIIPTSSGAMQLRSLVLKTNECLGTFENPNVPIENRVGLVRCVLEFFVDIEPKQLFVFSPPLSGARVIR >NZ_CP009226|22250:32070|31419_32070_+|WP_023383981.1|DBSCAN-SWA MELRTLPFNPATNAVVSEETCSYHYGKHHQTYVNNLNNLIKGTDFEGADLFEILTHSEGAIFNNAAQIYNHDFYWDCIAAKTDISDELKAALQSDFADFKSEFLKSATTLFGAGWTWLVYNPNSHKLEIKNTSNAGTPVTEGLIPLLVVDVWEHAYYIDARNARAAYLEKFYENINWDFVSAAYEWAKKEGLSSVKFYIDEIYKGSGCCGGHCGCH >NZ_CP009226|22250:32070|22250_24320_+|WP_023383965.1|DBSCAN-SWA MKIIKRDGSLQDFASYKIENAITKAYKSAIKKPNAELIKNVLSMVKDKMSVEEIQDIIEKALFDSGDFSVMRSFMLYRHTHTMQRGGELDERTTYINSTQTIEEYIGKSDWRIMANSNTSYSNAGLINNTAGKVIANYWLDAVYNDHEGAAHRNGDYHIHDLDCLTGYCAGWSLRALLNEGFNGVRGRVESRAPNHFREALYQMANFLGILQSEWAGAQAFSSFDTYLAPYVFKDKLSDKEIKKALTSFIFNLNVPARWGQSPFTNVTIDMVPPSDLKGQIPTKNDIHLFTNLNDEELEAECKKRGRSNLKDMTYGDFKPEMDRINIAFYEILTQGDKCSQPFTFPIPTVNITEDFDWDSKVATKLFENTAKMGSSYFQNFIGSQYVKDEFGNRIPNEKAYKPGAVRSMCCRLQLDLRELLKRGGGLFGSAEMTGSIGVVTLNLARLGYLFKNDKKALYARLDELLELAKSTLEKKRKFINEMYERGLYPYTARYLKTFNNHFSTIGINGANEMIRNFTNDKENITTKFGIEFAKELIEYLRAKMIEFQGATGNLYNLEATPAEGTTYRFAKEDKKRYPDIIQAGFDEKVYYTNSTQLPANFSSDPFHSLNLQDELQSSYTGGTVFHLYMNERLSSVSACKKLVKNIVENYKLPYITITPVFSICPKHGYIAGEHEYCPKCDEEILSLA >NZ_CP009226|22250:32070|29993_30656_+|WP_039361602.1|DBSCAN-SWA MISNLGFLHLNSAGTINRTSEFLNLVKDIKPGELVLASELCVSGYENLGDEFENELIANLKNVLLAGAFLGFTHFSGGFNEFVLLNGDKEIHKQKKAILFTPNLEQDKFKAGKVEDINLFEICGVKIGVLICFELRFTELWERLKGADIILVPSLWGKERKRHFEVLCEALALQNRCYVIACSDRDLKFGAVFKPNGEIAKSFKFELDLASEFKKSLGLI |
11 | Enterobacteria_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1375803 : 1385136
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009226|1375803:1385136|DBSCAN-SWA TTTAAAACTCATTGGCAACACCTATCTCAAAATATATAAATCCAAGCTCTTTTAAAATATTTCTATCATACTGATTTCGCCCATCAAATATAATAGGAGTTTTAAGGCGATTTTTCATCTCTATAAAATCAGGAGCCCTAAACTCGCTCCACTCAGTCAGCAAAGCTAAGCAATCAGCTCCGTTTAGTGCGTCGTATTTGTTTGGGGCATAAATCACATCTAAATTTTTAAAATAAATTTTAGCTTCAGCGTAAGCTTTTGGATCAAAAACTTGCACTTTAGCTCCATTTTTTATAAGTAAATTTATAATAGTTATAGAAGTTGCTTCTCTCATATCATCGGTATTTGGTTTAAATGCAAGCCCCCAAATAGCTATGGTTTTACCTTGTAAATTACCATTAAAATATGCATTTATCTTATCAAAAATCACTCGTTTTTGAGCTTTATTTCTATCTTCAACTGCCTTTAAAACTAAAGGATCTATACCGTTTTGTTTAGCGGTGTAGATGAGCGCTTCAACGTCTTTTGGAAAACAGCTCCCGCCATAACCACATCCAGGATAGATAAAACTATATCCTATGCGAGAGTCACTTCCGATACCGCGCCTAACCATATTTATATCAGCTCCGACTTTTTCACAGATGGTAGCCATCTCATTTATAAAACTGATTTTAGTAGCAAGCATAGAGTTTGCGGCGTATTTCGTCATCTCCGCACTCTTTACGTCCATCTCTATAAGGCGGTTATGATTTTTCATAAATGGCGCGTAAAGCTCTCTTAAAGCGTTAAATCCAAACTCACTACTAGCTCCTACCACAACGCGATCAGGCTTTAAAAAATCCTCAACAGCAGCTCCTTCTTTTAGAAACTCAGGATTGCTAACTACTTCAAATTTGATCTCTACGCCTCTATTTTGCTGCTCTTTTGATATAACTTCGCTTACTTTATGCGCAGTTCCTACTGGAACGGTACTTTTATCGACCACGACGAGTGGGCGCTGCATATGTTCGCCTATGCTTTTTGCAACTTGCAAAACATATCTTAAATCCGCTTGTCCATCTCCACCCATAGGCGTACCGACTGCTATAAAAACAACATTGGCAAAGCTTAAAGCTTCTTTGATATCTGTGCTAAATCTTAAATTTTGCTTCTCATAATACTCGATTACTATCTCTTTAAGACCTGGTTCATAAATTGGGATAATGCCTTGTTTTAGATTTTGTATTTTTTCTTCTGCGACGTCTATACAAATAACATCGTTACCCATCTTTGCAAAACAAGCTCCACTGACTAATCCAACATATCCTGTACCTACTACTGCTATTTTCATGCAAAATTTCCTAAAAATTTATTTGATAATTATAGCAAAATATTTTCATATAAGGTATAATAAACAAAAAAGCTTTAAGGTTGATTTTAATGGAATATATTAAAACAAACAGTAAGAAAGAGTGCGAAATACCTTGCCATTTTTTAGATAAAAGCAGTGTATCTATTGTAGTTCCTTGTTACAATGAGGAAGCTTCTATATCCATATTTCAAAAAGAAATCATAAAAATATTAACAAATATCAAAGACAAAATAAACTCAAACTTTGAATATGAAATTATTTTTATAGATGATGGAAGCCAAGATAAAACAGCTGTAGAAATAAAAAAATTATGTAATAAATTTAATAATACTCACCTTATTAAATTTTCGCGTAATTTTGGTAAAGAAGCCGCTATTTTAGCAGGTTTTAGAATGGCAAAAAATAGCAGCATAGTCTTAATAGACGCAGATCTACAACATCCTGTATATCTGATAGAAAAGATGTATGAAATTTGGTATAACAATGAAGCAGATATCATCTATGCTATAAGAAAAGATAGAAAAGGCGAAAGCTTTTTAAAAAGCAAACTAAGTGAAATATTTTATAAAATTTCAAATATCATCTCAGACGTAAAATTAAAGCCAGGGGTAAGCGACTTTAGATTAATGGATAAAAAAGTTGTTGATATCTTAGTAGCAATGAATGAATATCATAGATTTAGCAAAGCCATGTTTGAGTGGGTAGGATTTAAAAAAACAGCGTTAGAATATGATTATGCCCCAAGGATTAGTGGTAAAACTAGCTGGAGTTATATGAAGTTATTTAAATATGCTATAGAAGGTATGATAAGTTTTTCGACTACACCTCTAAAAATATCATTTTGGATAGGGTTGATGATAAGTTTTATATCCGGAGCTTATGGAATTTTTATCGTTTTTGATACTATCATAAATGGAAATACTGTAAAAGGCTACCCCTCAATGCTTACTATAATACTATTTTTAGGAGGAATACAGCTAATATTTTTAGGAATTATAGGGCAATATATAGCAAGAATTTATGAACAAGTAAAAGATAGACCGCACTATATAGTTGAAGAGGAGATTTAGCACAGTGAATTTAAAACACAATTTAAAAAAAGAGCTACTATTTACTATAGCAACTATTAAAAAATTTTTCAAGTATAAATACTTCTATAAATATTTTATTTTCATTTTTGGGCTATATTTTACAGGATATTTTGCACTAATAATAAATAATGTTAATTATGGAGATGACTATCATAGAGCTACATATGGAGATTTTGGATTTCAGATATGGAGCAGATTTTCATCAGAGTTTTTATCAAAAATATTTCATATAAGCCTAAATAGAAATGTAGAAATATCGCCTCTTTTACAGATAATCGCGATTGCTATCTTATCTATTGGGTCAATGATTTTAGTAAAAACGGTTTTAAAAAGATATACTTTTTGGGGGCTTGCTGCTAGCTTACCTTTGGGGCTTAGTCCATTTTTTTTAGAAAATATGAGTTTTAAATTTGACAGTGTGTTTATGGCGATATCATTAGTTTCACCAATCATTCCTTTTCTATTTTTAAAAAATAAAATAGCATTTTTTATAATATCTATTTTGTGTTTAGAATTGACCTTGACCACATATCAAACAGGAAATGCGGTGTATATAATGTTATCTTTATTTATAATATTGAGTTATATATTAGAAGGTAAAAATTATAAGCAGATTATTAAATGTGCTATGTTGCTTATACTAGCATATATTTCATCACTTCTTATATATAAGTTTTTTATTTTAAATGAATATTCTGGAGAATGGTATGCATCAAAAAGTGCATTTGAACTAAATAACTTGATTCCAGGAGTAAGTAAAAATTTAAAAACAGTACTGAAAATATATGAAGATGTTTTTAAACATACTATTTTTGTACCTATATTTGCACTTGGGATAATTGGATTTTTATTTGCCTGTATAAAAGTATCTAAAATATGCAAATTTTGGACTCTTATCGTTGGTTTAGGATTTATAGTCTTTGGAATTTTATTATCTTATGGTGCTTATTTGGTATTAGAAAAACAGATTTTTAGTGATAGAACTTTTAATGGTATAGGTATGTTTTTAGCAATTATATTTGTATTTTTATTTAAAATAAATATAAAAATATATAAGTTTTTTAGCAAAACCATATGTTTTATATTAGCTTATTCACTTATAATAGAAGCTACTGCTTGGGCAAATGTATTAAAAGAGCAAACAGAATATGCAAAATACAGAGTTGAGCTTATGTTGCATGATTTTTATAAAATGATACCAAAAGATAATAAATTTGGCTTTACCTCTGAAGTAAATAAAAACAATTTTATGTCTCCAATAGCATTAAACACGTCAAAAACATTTCCTATAATAATGAGAAATCACGCTATAGATAATATGCTAGATGCAAATTGGCTATTCAACTCTTATGGACTTATGGCTCATTATGAACATTGGACACCGATACTCTCAAAAGGTCTATGCGGACAAAAAGATAAAAAGCCAGTTGAGATCGTAGAAAATCCGCTCCATAAAATCACAAAATATGATAACAACTGTTTTGTTATAGAGTTTTTATAAATGAAATTATCTAGTTCATATTTTTTACGATATTTATGCGTAGGAGTATTCAATACTATTGTTGGTTTTGGAGTTATATTTACCCTTATGTATATTGGATATAGCGCAGAAATCTCAAATTTAATAGGCTATATTTGCGGAATTATTTTCTCATATTTTATGAATAAATTTTTTACTTTTAATACAAAAAATAGGAACAAAAAAGAGTTTATAAAATTTATAATAGCGATGCTTATCTCTTATGCATTAAATCTATTAATGCTTAAAATCTGTCTGAGTTTAGGTATAAATGCATATATAGCCCAACTATTTGCAGGAGCCGCGTATACTGTAAGCGGCTTTTTAATAAGTAAATTTTGGGTATTTAAACTAAACAGTTAGCTATTTTAACTTCTTCTCCCACTCTAAAGCTGAGCTAATGATGAGCTCTAAACTCTCGCGAGTCGGTTTCCAACTAGTTTTATTTCTAAGTTTGCTAGCGTCTGATATAAGCATCGCTGGATCGCCCTCCCGGCGAGGGGCGTTTAATACTTTAAAATCCACTCCACTAACTTTTTTAGCTGTCTCAATGACTTCTTTTACGCTAAATCCTCTGCCATAGCCAACGTTAAATATATCACTATCATTTGTTTTTAGATATTCAAGTACGGCCAAATGAGCACTTGCAAGATCTTCTATATGGATATAATCCCTTACGCAAGTTCCATCTTTCGTAGCGTAATCACTCCCAAAAATACTCATACTCTCTCTTTTCCCAGTAATCGTCCCAGTGGCTACTTTGATAAGATGAGTCGCGTTTGGATAGTTTTGACCGATAAGCCCGTCCGTGCTTGCTCCAGCTACGTTAAAATAACGCAAGATACCAAATTTAAAATCCCTGTTTGCAAGTGCGGCGTCTTTTAAGATCCATTCTGTCATAAGCTTGCTTCTACCATATGGATTTATCGGATTTTGCTCACTTGTTTCATCGACTACGCCGCTACTAGGCTCCCCATAAGTAGCAGCAGTCGAGCTAAATATAAACTTACTCACGCCGTGTTCAACAGCTAAATTTATTAAATTTGCAGCGTTTGCTGTGTTATTGAGATAATATTTCAGTGGTTTTACCGTACTTTCAAACACTTCTATATATGCTGCAAAATGTATGATCGCTTCAAATTTGCGTGTCCTAAAAATCTCCCTAAGGCTAAAAGTATCTGTCAAATCGCACTTTATAAACTCAAATTTATTTATATTTTCAAGCGTTACTAACGCCTCTTTGCTTCCTGTGTAGAAATTATCTATGACAGTGATGTTATGCCCGCCCTCTTCTAACAGAGCTTTTAAGACGTGAGAGCCGATATATCCAGCTCCTCCGGTTATCAAGATATTCATTTTTCGCCTTCGTTTTACTTTAAATTTAGTGATTATTATAGCTAGTTTGGGCTTAAAGATTATCTTGCATTCTAAATATATAAAACGAAATGAAAAATAAAACTATAAATCCAAAAGAAATCAAATTTAAAACTTCCCAACCACCACTTGCTAGCACAAATCCAACGCTAGAACTTGCTAACAAATTTGCTCCAAAAACGCTAATAGCATTTAGACTTTGTAAGCGTAGTTTATACTTTGAGTTTATAGCATTTAGCATAAACATTCCACGATTAAAACTAAACACCCAGCCCACACCAACAAAAGGCGTATCAAATATCAAAGTGCCGATATTTGCCAAATTTGGTCCTAAAATACCACCCATTATCCCACCTGCTACAACAAAAGCTGTAGCTCTGTTTTTATCATTTTGCGTGGTTAAATTTAGAGCTTCACTAGCTAAAATCTATAAAATTGATTGAGCGCAGTGAAAAATCCAAGCAAGAAAGTTGCAAAACAAAATAGATAAAATAGCCCAGACATTAGTGAAAAAATAGCAAAACCAGCCCCCAAACAACCTATCAAAGAAACACATAAAAAGACTTTTTTCTACCAAATCTTTACATTAAATTTGATGAAAATAGCTAGTTTTGGCTTAAAAAATGTCTGCTTTTAAAGCGTATATCACCAATCCCTCTTCTTACTTTCCAGCTTTTCATTCATATATTCCCAACCTTTCATACACCATTCAAGCTCGGCTGAGTCTTTAGCATATCTATCAGTACATTCCCATTTACCTTGTCCTAACTGTCTATAGATAGAGCCTTCATTGTGATATTTTCTCTCAAAAGCGTTACTTGCTTCGTTTATAGGCCACGCACCAGCGCTCATAGCAAACGCTATGGCTAAAAAACATACTTTTTTCATATTTTATCCTTTATTTTGTTAAATTATTGTCACTTCTAACACGTAAAAATACAGGAAATCTAGGCTTAGCGTATTTGGTTAAATTTTGATATTTATAAGTAATGATAGTACCGACTTTTGGCGGATCTGCCCTTTGCTCATCGCTAAATCCAGAACCGATCTTAAGCTCTATGTTACTAAAAATATCAACGCAAATAAGCGAACCCAAAAGCCCTTCAAATTTACCTTTACCGCTTTGTAGTTTAACGACTCTACATTCGCTATCTTTAAACTTTTTGAGCTTTAAAATTTCACCGCTTCTACCGTTTTTATAAGGCGCGTTTTCATTTCTTACGACTACACCCTCACCGCCACCGCTAATAACCTCATCTAAAAACGCAAAAGCGTCTTGATTTGAGTTTATTTTTATTTGTTCTATTACTCGTATAAACTCATTTGGACTCTCTTTTAAAAACTCGCGCAACACTTCTAGTCGCTCACGCAAATTTCCCTTAGCATTTGGCACGTCAAATACCATAAATTTGATATTTTCCCAACCTTTATCATCAAAAGAATTCACTACAGAACTAATAAACTCAAACTCTCCTCGTCCGCTCCACAGCTCACCATCTATAGCAAAGCTCGGAAAATCTTTTAGCCACCACTTTGGAGCGTTGATGATCTTAGCATTTCTGCTTTTCAAATTCTTACCATCCCAGATAGCTCTCACACCATCATACTTTTCACTCGCCAACCAACCGCTTAAATTTTCATCATTATACTCTTTTAATAGCATAACTTCGGCTTTTAAACCTAAAAATATGGCTAATAATAGAGCTAAAAACTTCAAATTTTTACTTTATAATAGTCCATATACCACTGCACAAATCTTGCAACTCCGTCATTTACGCTAGTATTTGGCTTATAGCCAAAGTCCTCTACTAGATCACTCACATCAGCGTAGGTTGAAGGAACATCGCCTGCTTGAAGCGGCATAAGATTTTTTTTGATTTCTCGTCCTAATTTTATCTCAATCGCCTTTATGTAGTCCATTAGCGAGGTTGGAGAGTTGTTTCCGATATTGTAAATTTTATAAGGCGCGTTTGAAGTAGCTGGATCGGGATTTTTAGCGTCCCAAGCCAAATTTGGAGTAGCTGGATTATTCACGCATTTCATTATACCTTTTACGATATCAGCTACGTAAGTGAAGTCTCTTTTCATCTTTCCGTAGTTATAAACATCGATAGCTTTACCCTCTAGAGCAGCTTTAGTAAATAAAAACAGAGCCATATCCGGACGTCCCCACTCGCCATAAACGGTAAAAAATCTTAGTCCAGTCGTGCTAAGCCCAAAAAGATGACTATAAGTGTGAGCCATAAGCTCGTTTGATTTCTTGCTTGCGGCGTATAGACTGATAGGATGATTTACACTATCGTGGGTGGAAAACGGCATTTTTTCATTTAGTCCATAAACTGAGCTTGAACTTGCATATACTAGGTTTTTCACGCCGTGATGGCGACAGCACTCAAGTATATTTGTAAAGCCTAAAATATTGCTATTTATATAAGCGTGTGGATTGATGAGTGAGTAGCGAACTCCTGCTTGCGCGGCTAAATTTATGACACAGTCAAAAGAGCTCTCTTCAAAAAGCTTTTGCATAGTTTTAAGATCACTTAAATCTGCTTTTATAAAGCTTAAATTTGGATAAATACCAGATCTAACCACTATATTTTCTTCTATATTTTCACGTTTTATACCAAGCTCGTTTAGCCTTGCGTATTTTAAATTTATATCGTAATAATCATTTATACAGTCAAATCCTACCACCGTGTCGCCGCGTCTGGCTAGCTCACGGCTTAGATGAAATCCTATAAATCCCGCTGTTCCAGTAACTAAAATCTTCATAAGCCGCCCTTAAATTCGTTTGATTTTATAAGATAAGCATTTACCAAAGTCTATTTTAGCAAACTCTTTGTGCGCCACAGCCAAGATCACGCAGTCGTGTCCGCTCAAATTTAAACTCTCTAAAAGCTCCACGCCATACTCTTTTTTCACATCATTTGCGTCCGCCCAAGGATCATAAACATCTACATTACAACCAAACTCTTTAAGCTCTTTTATCACATCGATAACTCTTGAGTTGCGGATATCAGGGCAGTTTTCTTTAAAAGTGATCCCAAGCACCAAAACCTTAGCACCATTTACTTTCAAGCCATTTTTTATCATCATTTTAACAGACTGATTTGCATGGTAAATTCCCATATTGTCATTTATCCTACGTCCTGCTAAAATGATCTCTGGATGATAACCGATCTCTTCAGCTTTATGCGTAAGATAGTATGGATCCACGCCGATGCAGTGACCTCCAACTAGTCCTGGTCGGAAATTTAGAAAGTTCCACTTCGTAGCTGCTGCGTCAAGCACTTCATTTGTGTCTATCTTCATCTTGTCAAATATCATCAACAGCTCATTTACAAAGGCGATATTTATGTCACGTTGCGTATTTTCTATGACTTTTGCGGCTTCAGCTACTTTTATACTACTAGCTTTATAAACCCCTGCTTTTATGATCTTACTATAAACAGCTTCTACGGTTTCAAGGGCTTTAGGACTACTTGCGGAGATGATTTTTTTGATTTTCGTGACCGTATGCTCTTTATCACCTGGATTTATACGCTCAGGACTGTATCCACACTCAAAATCCACACCAAATTTAAGTCCGCTAGTCTCAAGCACCGGCACACACTCATCTTCAGTAACTCCTGGATAAACCGTGCTTTCATATACTACTATATCGCCTTTTTTAAGCACTTTTGCTAAACTCGCGCTTGATTTATAAAGCGGAGTGAGATCTGGGCGATTATTTTTATCTATCGGTGTTGGAACAGTGACTATGTAAAAGTTGCACTCTTTTATATCATCTAAATTTATACTAAATTTCATACCGTTTTTTAGCACTTTGGTCATCTGTATAGCGTCAAGTTCAAGAGTTCTATCGATACCATTTTTTAGCTCATTTATTCGTTTTTCATTTAGGTCAAATCCTACAACACTAAAAGCGTCGCTAAACGCCGCAGCTAAAGGCATTCCGACGTATCCAAGACCGATAATCCCTATTTTTATATCTCTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009226|1375803:1385136|1379745_1380126_+|WP_023385743.1|DBSCAN-SWA MKLSSSYFLRYLCVGVFNTIVGFGVIFTLMYIGYSAEISNLIGYICGIIFSYFMNKFFTFNTKNRNKKEFIKFIIAMLISYALNLLMLKICLSLGINAYIAQLFAGAAYTVSGFLISKFWVFKLNS >NZ_CP009226|1375803:1385136|1381171_1381483_-|WP_023385746.1|DBSCAN-SWA MGGILGPNLANIGTLIFDTPFVGVGWVFSFNRGMFMLNAINSKYKLRLQSLNAISVFGANLLASSSVGFVLASGGWEVLNLISFGFIVLFFISFYIFRMQDNL >NZ_CP009226|1375803:1385136|1380126_1381119_-|WP_023385745.1|DBSCAN-SWA MNILITGGAGYIGSHVLKALLEEGGHNITVIDNFYTGSKEALVTLENINKFEFIKCDLTDTFSLREIFRTRKFEAIIHFAAYIEVFESTVKPLKYYLNNTANAANLINLAVEHGVSKFIFSSTAATYGEPSSGVVDETSEQNPINPYGRSKLMTEWILKDAALANRDFKFGILRYFNVAGASTDGLIGQNYPNATHLIKVATGTITGKRESMSIFGSDYATKDGTCVRDYIHIEDLASAHLAVLEYLKTNDSDIFNVGYGRGFSVKEVIETAKKVSGVDFKVLNAPRREGDPAMLISDASKLRNKTSWKPTRESLELIISSALEWEKKLK >NZ_CP009226|1375803:1385136|1378227_1379745_+|WP_023385741.1|DBSCAN-SWA MNLKHNLKKELLFTIATIKKFFKYKYFYKYFIFIFGLYFTGYFALIINNVNYGDDYHRATYGDFGFQIWSRFSSEFLSKIFHISLNRNVEISPLLQIIAIAILSIGSMILVKTVLKRYTFWGLAASLPLGLSPFFLENMSFKFDSVFMAISLVSPIIPFLFLKNKIAFFIISILCLELTLTTYQTGNAVYIMLSLFIILSYILEGKNYKQIIKCAMLLILAYISSLLIYKFFILNEYSGEWYASKSAFELNNLIPGVSKNLKTVLKIYEDVFKHTIFVPIFALGIIGFLFACIKVSKICKFWTLIVGLGFIVFGILLSYGAYLVLEKQIFSDRTFNGIGMFLAIIFVFLFKINIKIYKFFSKTICFILAYSLIIEATAWANVLKEQTEYAKYRVELMLHDFYKMIPKDNKFGFTSEVNKNNFMSPIALNTSKTFPIIMRNHAIDNMLDANWLFNSYGLMAHYEHWTPILSKGLCGQKDKKPVEIVENPLHKITKYDNNCFVIEFL >NZ_CP009226|1375803:1385136|1381782_1382025_-|WP_023385748.1|DBSCAN-SWA MKKVCFLAIAFAMSAGAWPINEASNAFERKYHNEGSIYRQLGQGKWECTDRYAKDSAELEWCMKGWEYMNEKLESKKRDW >NZ_CP009226|1375803:1385136|1375803_1377132_-|WP_023385738.1|DBSCAN-SWA MKIAVVGTGYVGLVSGACFAKMGNDVICIDVAEEKIQNLKQGIIPIYEPGLKEIVIEYYEKQNLRFSTDIKEALSFANVVFIAVGTPMGGDGQADLRYVLQVAKSIGEHMQRPLVVVDKSTVPVGTAHKVSEVISKEQQNRGVEIKFEVVSNPEFLKEGAAVEDFLKPDRVVVGASSEFGFNALRELYAPFMKNHNRLIEMDVKSAEMTKYAANSMLATKISFINEMATICEKVGADINMVRRGIGSDSRIGYSFIYPGCGYGGSCFPKDVEALIYTAKQNGIDPLVLKAVEDRNKAQKRVIFDKINAYFNGNLQGKTIAIWGLAFKPNTDDMREATSITIINLLIKNGAKVQVFDPKAYAEAKIYFKNLDVIYAPNKYDALNGADCLALLTEWSEFRAPDFIEMKNRLKTPIIFDGRNQYDRNILKELGFIYFEIGVANEF >NZ_CP009226|1375803:1385136|1383918_1385136_-|WP_023385753.1|DBSCAN-SWA MRDIKIGIIGLGYVGMPLAAAFSDAFSVVGFDLNEKRINELKNGIDRTLELDAIQMTKVLKNGMKFSINLDDIKECNFYIVTVPTPIDKNNRPDLTPLYKSSASLAKVLKKGDIVVYESTVYPGVTEDECVPVLETSGLKFGVDFECGYSPERINPGDKEHTVTKIKKIISASSPKALETVEAVYSKIIKAGVYKASSIKVAEAAKVIENTQRDINIAFVNELLMIFDKMKIDTNEVLDAAATKWNFLNFRPGLVGGHCIGVDPYYLTHKAEEIGYHPEIILAGRRINDNMGIYHANQSVKMMIKNGLKVNGAKVLVLGITFKENCPDIRNSRVIDVIKELKEFGCNVDVYDPWADANDVKKEYGVELLESLNLSGHDCVILAVAHKEFAKIDFGKCLSYKIKRI >NZ_CP009226|1375803:1385136|1382035_1382854_-|WP_023385750.1|DBSCAN-SWA MKFLALLLAIFLGLKAEVMLLKEYNDENLSGWLASEKYDGVRAIWDGKNLKSRNAKIINAPKWWLKDFPSFAIDGELWSGRGEFEFISSVVNSFDDKGWENIKFMVFDVPNAKGNLRERLEVLREFLKESPNEFIRVIEQIKINSNQDAFAFLDEVISGGGEGVVVRNENAPYKNGRSGEILKLKKFKDSECRVVKLQSGKGKFEGLLGSLICVDIFSNIELKIGSGFSDEQRADPPKVGTIITYKYQNLTKYAKPRFPVFLRVRSDNNLTK >NZ_CP009226|1375803:1385136|1377221_1378223_+|WP_023385740.1|DBSCAN-SWA MEYIKTNSKKECEIPCHFLDKSSVSIVVPCYNEEASISIFQKEIIKILTNIKDKINSNFEYEIIFIDDGSQDKTAVEIKKLCNKFNNTHLIKFSRNFGKEAAILAGFRMAKNSSIVLIDADLQHPVYLIEKMYEIWYNNEADIIYAIRKDRKGESFLKSKLSEIFYKISNIISDVKLKPGVSDFRLMDKKVVDILVAMNEYHRFSKAMFEWVGFKKTALEYDYAPRISGKTSWSYMKLFKYAIEGMISFSTTPLKISFWIGLMISFISGAYGIFIVFDTIINGNTVKGYPSMLTIILFLGGIQLIFLGIIGQYIARIYEQVKDRPHYIVEEEI >NZ_CP009226|1375803:1385136|1382850_1383909_-|WP_039362737.1|DBSCAN-SWA MKILVTGTAGFIGFHLSRELARRGDTVVGFDCINDYYDINLKYARLNELGIKRENIEENIVVRSGIYPNLSFIKADLSDLKTMQKLFEESSFDCVINLAAQAGVRYSLINPHAYINSNILGFTNILECCRHHGVKNLVYASSSSVYGLNEKMPFSTHDSVNHPISLYAASKKSNELMAHTYSHLFGLSTTGLRFFTVYGEWGRPDMALFLFTKAALEGKAIDVYNYGKMKRDFTYVADIVKGIMKCVNNPATPNLAWDAKNPDPATSNAPYKIYNIGNNSPTSLMDYIKAIEIKLGREIKKNLMPLQAGDVPSTYADVSDLVEDFGYKPNTSVNDGVARFVQWYMDYYKVKI |
10 | Tupanvirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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