Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP007778 | Campylobacter lari RM16712 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. NZ_CP007778
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP007778_1 | 63148-63256 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007778_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP007778_1
>1.1|63173|59|NZ_CP007778|CRISPRCasFinder AACAATTAATAATAGTGGATCTATTTCAGGTTCTATTGAAAATAATAATGGTGATTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007778_1
The CRISPR arrays of NZ_CP007778_1 >merge|NZ_CP007778|1|63148-63256|CRISPRCasFinder ATATTAAAAATGATGGAGATTTAGGAACAATTAATAATAGTGGATCTATTTCAGGTTCTATTGAAAATAATAATGGTGATTTAAATATTAAAAATGATGGAGATTTAGG >NZ_CP007778|1|1|63148-63256|CRISPRCasFinder ATATTAAAAATGATGGAGATTTAGG AACAATTAATAATAGTGGATCTATTTCAGGTTCTATTGAAAATAATAATGGTGATTTAA ATATTAAAAATGATGGAGATTTAGG
>NZ_CP007778.1|WP_039640482.1|60196_60850_+|superoxide-dismutase-[Fe] MFELRKLPYEADAFGDFLSAETFAFHHGKHHQTYVNNLNNLIKDTEFAGKDLVYIIQNSNGGVFNNAAQVYNHDFYFDCIKPKTCCGCGCSLSDEFKVAVEKDFGSMENLKEEFIKGATGVFGSGWFWLVYNTQNQKLELVATSNAATPITEGKIPLLVVDVWEHAYYVDHRNARPAYLEKFYAHINWEFVAKAYEWAIKEGMNSVSFYANELHPLN >NZ_CP007778.1|WP_080749667.1|59637_60129_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MFLRLAGVVKESIVDGYGLRYVIFTQGCHHHCKGCHNPQTHDFNKGYLQDLASLYDEICKNPLLQGVTFSGGEPFMQAKNLSILAKHIKTLGLDLTIYTGFTYEELLEEKSKKELLILADVLVDGKFILEQKDLSLKFKGSKNQRIIDVAKSLEQGKVILFEK >NZ_CP007778.1|WP_039640477.1|57368_59648_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MKIKFIIKRDKSQVAFDIFKIKNAIFKANINSTDEKLNNDFLDKLCDEVVALLDEKHTQVEQIQDKVEEVLIKNTLINTAKSYILYRQKRTQIRNGSYDLLSLYDNLTFKDSKEADLKRENANINSDSAMGMMLKYGSEGAKYYVDECILPKHIANAHKNGDIHIHDKDFYMLTQTCCQIDLLKLFEKGFSTGHGSLREPNDIRSYASLACIALQANQNEMHGGQSIPNFDFAMAKGVTKTFQKEYKKAIKAFFEIKLGQSLDDHCFENINFKASSEKECFKELLRLNLNSDENFLKQVNTYAYKKALNETQNATFQAMEALIHNLNTMNSRAGAQVPFSTLNYGTDTSFEGQMVIENLLKATMRGLGNGETPIFPVQIFKVKEGINYNEKDPNYKLFKLAIECASKRLFPNFSFLDASFNAKYYKKGDYNSEVAYMGCRTRVMANVYDESKEITSGRGNLSFTSINLVRLAIEAKGNLELFYSLLKEKLELVYEQLLHRYKIQSLKKVKNFPFLMGEGIWIDSDSLKENDSVEKVIAHGTLAIGYIGLCESLIALIGSHHGQSQEARELGLQIVRFMREFVDEKALKDKLNFSLIATPAEGLSGRFLKLDQKKYGILKGITDKDFYTNSFHIPVDFPISIYNKIQIEAPYHELNNGGHITYVELNGDVSKNLESFERIIKCMKENNIGYGSINFPLDRDPVCGYSGVIDEFCPKCHRKENGIKFERIRRITGYLVGTLDRFNDAKKAEVHARIKHDFS >NZ_CP007778.1|WP_039640475.1|56330_56888_-|manganese-efflux-pump MDILSLIVLSFALAADAFAVSLCKGFSVKELKLRHYLIVGLYFGGFQALMPAIGYILGSSFGSFVEKIDHWIAFILLSIIGGKMIQESFKKDSCKENSNLFDFKTMIALAIATSIDALAVGVSFAFLKVDLFIALLCIGAITFIMCTLALKIGSKFGTYLKSKAEFLGGVILILLAVKILFEHLS >NZ_CP007778.1|WP_039640473.1|55575_56334_+|exodeoxyribonuclease-III MKLLSWNVNGLRAICDKNALDWIEKEEIDFIGFQEIKAHEDKFPKRIYEYPFKHMYSNSAKRAGYSGVMSLCNFDSEVKKCEFFDDDEGRVLEHSFKNVVLFNIYFPNGQKDEERLNFKMKFYNDFLVYLDKLLKEGKEIIICGDVNTAHREIDLTHPKANEKTSGFLPIERAWIDDLLKLGFIDTFRHINGDIKEKYSWWSYRMKARERNVGWRIDYFFISNGLKDKLKNAFIRDDIFGSDHAPVGIEIDI >NZ_CP007778.1|WP_039640470.1|53930_55478_-|lipidA/FlgG-phosphoethanolamine-transferase MKIFNISWLKFIILGAFYITSINLKLFSYIHENLHPYNNDISIILYIFIYFTLLVGIFALLFLPYLSKILMIFLIGVSSISSYFMINYGVIIDHDMIRNAIQTDQKEVSDLLHFNIFVYIFFTFMIPTFLIIKAKIEYHNIKKHLIIKFSTFIVAFIVAFGLLGIFSKSIVPFLRTYNEVRVYNTPFYQIYSAIKYIKLEVIPKKELQNIALDAKMEKDLNKTMILVIGETARANNYSLGGYTKNDTNFYTKNEPNLVYFNNVSSCGTATARSLPCMFSRHKRTTFDNSLYEENALDVLQRVGVQSVWLGNNSGGCKGNCDRIKHKLISKDYDENLLELVKEQLQSPYSSKIIVVHLQGSHGPAYFKRYPNEFKKFTPTCDTNELQQCSQEELTNTYDNTLLYTDFIIKNLINLLKQSPIQNALLLYISDHGESLGENGIYLHGMPYFIAPKEQTHIPMILWSKDSKLSQDLQSKKDYRLSQDNLFSSLLGYFGVNSKEYEANYDIFSKNLKENP >NZ_CP007778.1|WP_039640469.1|53559_53931_-|diacylglycerol-kinase MKPKYSLFKNASYALSGIKFLLKDEMAFKIEFAIILPLIFTSLFFPISFLEHFTLVFVLVLILIIEALNSAIEACVDLCTSEFHILAKKAKDCASAGVFFSVALAIITWSFILFDLVKEWMIK >NZ_CP007778.1|WP_039640467.1|53344_53575_-|hypothetical-protein MDDKVKTLCAKIFGKKRFEILEFLALHADDDGFVFTNIEELSKRLNISKPTIISTFKFLEEKALLEKLKNGLYKLK >NZ_CP007778.1|WP_039640464.1|52340_53336_-|dihydroorotase MILKNPLDMHLHLRDESMLELVAPFSAKDFKAGVIMPNLITPLTEINTLKSYKKRILKACKNEDFIPLMTLFFKDYDEKFLEKIKDELFAIKLYPAGITTNSDNGISSFDIEKLKPTLNAMSELNIPLLVHGETNDFVMDREANFAKIYEKLAKNFPKLKIIMEHITTKILCNLLKDYENLYATITLHHLMITLDDVVGGKMDPHLFCKPIAKRYEDKNALCELAFNGYEKVMFGSDSAPHPLHTKECCGCAAGVFSAPVILPVLAELFEKHSSEINLQKFISDNACKIHNLKFEKDKIITLEKQEWQVPQKYGDVVPFMAGKNISFMILS >NZ_CP007778.1|WP_080749666.1|52060_52357_+|TM2-domain-containing-protein MSEDKLQKLTLVKFKNAEFGLILSIAFGSCGVDRFYKGNWLLGCIKLSLLFLCVIFDTPMDIICVFAILLWYIADIFLVFFGIKKDNFKKIISFMKES >NZ_CP007778.1|WP_039640486.1|64962_65952_-|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MNISYEDAGVSIDNGNAFVEAIKPLVKETFNENVLGGIGSFSGAFAMPSGFKNPIMLAATDGVGTKLRLAIDSQKFDTIGEDLVAMCVNDLICNFATPLFFLDYYATAKLDVEVAKKVVAGIANGCKKANCALIGGETAEMPGMYHSNDFDLAGFSVGMAEKDEIDRRNFVKNGDILLALPSSGLHSNGYSLARKVLFEAQKLKFDDKIEGKNLIDILLEPTRIYVKDFLKLKPFINALAHITGGGLVENLPRVFPRGIGAIIRKHHLKTPEIFYQIGQSVEETEMYRSFNMGVGLVMVVDPSNVGKVLENSDAYVIGEVVLNEGVILE >NZ_CP007778.1|WP_039640488.1|66010_66613_+|dephospho-CoA-kinase MQNAYFVTSSIAGGKSSFIKIVQNLGFDALSADVIAHELLNKNANSIAKIFNNDDLIIAGKIDRKKLGAIIFNDLNAKKKLEDFLHPKIKEVILQKAQILDKKNKAFFIELPLFFENNHYHNLGKSILVYTPKEILLQRLMQRDNLDENEALKRINLQLDIEEKLKKADFVIKNTSDYENFEKNVLNFLKHTLKVMNEIL >NZ_CP007778.1|WP_039640490.1|66599_67349_+|diaminopimelate-epimerase MKFYKYCASGNDFVVFADSEKRDRSELAKILCNRYEGIGADGLIVVVPHDRYDFEWEFYNCDGSKASMCGNGSRAAAHFVHHYLKKSQYLNFLTGAGLIKSFVDDDIVEIKLSGVKDIKEAFEYKGRIWQGCNTGVPHIVTFVDDLNEFDVNLCKEVRKKYNANVNYAKVEDDEFIRVRTYERGVEDETLACGTGMGACFYLAYLNQKVKDDILVKPKSNESLYFRLEEDQIFFRGKVKCCFEADYNFT >NZ_CP007778.1|WP_039640492.1|67323_68031_+|mannosyl-glycoprotein-endo-beta-N-acetylglucosamidase MKLIIILLSSVLFLKAEFVAGFDEKYYTLSIKEKREVFIKKINALLDVSFKEIEKEKEFVNIFFREALKNNFRKLNSNAVQKLWSLKEKYRVKNLYDHKEYQMRIQKAPKSLAIAQAIIESATGTSRFAKEANNLFGEWTWGEKGLIPKERGEGKTHKIRIFDSLQESVDSYLLNLNRHDAYKEFRAWRWDTISENKKLDGKEAASHLEKYSEIKSNYTKLILSIIEQYKLDELD >NZ_CP007778.1|WP_039640494.1|68027_69089_-|ATP-binding-protein MKSLQFFYDNYPKFQKFDERKIQIQTHKNIVIKGGFASGKKNLILNFLSLYKSENILFIDCDDLKFQASALINLNSFLTYNPQIKFLALCNFAHDFDFASLKHLNLQIIISVCDSNFCLDQFEELHLDYLDFEEFLSLNKKYTDTKTMVSYFLHTGRNVILNHNFNTNSSYLKSFYTPLELTILKQIALELGSEFSVNELLKTLKNSIKISKDTLYKSIEKLESNYTLYFVKNLEKNLKKVYFWDFSLKNSLSIQKDFSALFENLILSELFKFEQEIFYTKHFDFYLPSLKNAFLCSPFKDKDLLSLKVKKILSKNQLALSTIYIITLSQRDEFFIEGVRVMILPFDEWALGN >NZ_CP007778.1|WP_012660810.1|69409_69721_+|30S-ribosomal-protein-S10 MERIRLKLKAYDHRVLDRTVAAIVEAVKRTGADIRGPVPMPTKIKRYTVLKSPHINKDSREQFEMRIHARMLDIVAATPDTVDSLTKLDLAPEVNVEVRAMGK >NZ_CP007778.1|WP_012660811.1|69730_70306_+|50S-ribosomal-protein-L3 MEYIVEKIGMSRTISTPSIPVTLLKLVQTKVCEVENGKALVAYVKGKANNKCIAGQQKKYNLSAEYNRFASLEVANTEAGDIDLNPLKEASILKVSFNSKGRGYSGVVKRHGFAGGPASHGSRFHRRHGSIGNREWPGRVQPGMKMAGHYGNVKVTVKNEVVSFDEENGILVVKGAVPGFNGAMGKIRIAK >NZ_CP007778.1|WP_039617137.1|70302_70917_+|50S-ribosomal-protein-L4 MSKVTVLNDKFEKASELDLPAKYAEVNPHNLYLYVKSYLASLRANTAHTKGRSDVSGGGKKPWRQKGRGGARAGSTRTNVWVGGAVAFGPTNNRNYFQKVNKKQKRLALERALADKAQNNALFSVDSLSIESGKTKDANAVIKKLGLKDALIVKDLLDEKTLLAFRNLANCYVVDISEVNAYLVSVFNAVIIEKAALESIVKEG >NZ_CP007778.1|WP_039617139.1|70918_71200_+|50S-ribosomal-protein-L23 MADITDIKTILYTEKSLNLQEQGVVVIQTSPKMTKNGLKEVLREYFGVTPVRINSLKMDGKVKRFRGREGQRNSFKKFYVKLPEGVSLESSEA >NZ_CP007778.1|WP_039617141.1|71201_72032_+|50S-ribosomal-protein-L2 MAIKTYKPYTPSRRYITGVSSDDITAKASVRSLLVKLPAHAGRNNNGRITSRHKEAGAKKLYRIIDFKRRKFGIEGKVEAIEYDPYRNCRIALISYRDGEKRYILQPKGLSVGDVVCAAESGLDIKPGNAMKLRNIPVGTIVHNIELKPGKGGQMIRSAGAYAQLMGKEEKYVILRLASGEMRQVLAECMASIGEVGNEEWSNVTIGKAGRNRHRGIRPQTRGSAMNPVDHPHGGGEGKKNSGRHPVTPWGKPTKGAKTRRKKASDKLIISRRKGK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
287977 : 296100
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP007778|287977:296100|DBSCAN-SWA TATGATAATTCGCTCCCAAACCCCATTGCGCTTAGGTTTAGCCGGCGGGGGTACTGATATAAATTTATATTGTAATCAATACACAGGTTATGTTTTAAATGCAACGATATCTTTATATGTGCATTGTACTTTGATAGAAAGAAATGATGAAAAAATCATCTTTGATTCATCAGATACAAATGTAAAAGCAGAGTATAAAAGCAAAGATTTTTTAGAAAATGATGGCAAGCTAGATCTTTATAAAGCAATTTACAATCGTTTAGTAAAAGAATATATTAAAAAACCTTTGAGTTTTTCTTTGCATACTTATTCAGATGTGCCAAGTGGTAGTGGGCTTGGCGGGAGTTCTACTTTGGTGGTGGGTATTATCAAAGCATTTGCTGAATGGCTGAATTTACCTTTGGGTGAGTATGAGATCGCACGTTTGGCATATGAGATTGAACGAGAGGATATGGCCATCGTAGGTGGTGCACAAGATCAATATGCTGCAACTTTTGGTGGGTTTAACTTTATGGAATTTTATGATCAAAAAAGAGTGATCGTTAACCCTTTGCGCATTAAAAATTGGATAGCAAGCGAACTTGAGGCTAGAGTTTTGCTTTATTTTACAAATATTACTAGAGAGGCTAAAGATATAGAAGAGCATAAAAAAGGAAAATTAGGAGATGAAAACTCTCTTAATGCTATGCATGCGATAAAACAAGATGCGCTAGATATGAAAGAAGCGCTATTTAGAGCTGATTTTGAAAAAATAGCTCAAATTTTAGGTAAGTCATGGCAGTCAAAGAAAATTATTTCTGATATAGTAAGTAATGATGAGCTTGAAAGAATTTATCATTTAGCTATGGATAATGGTGCCTATAGTGGTAAAACAAGTGGAGCTGGTGCTGGAGGGTTTATGTTTTTTATGGTTGATCCTATAAAAAAGTATAAACTTAAAAAAATTCTAAATGATCAACAAGGATATGTGCAAGAATTCTACTTCACTAAAGAAGGAGCAAAATCATGGAAAATTTAAATTTATATATAAAATCTCATTTTAGTGATTCAATTGATATTAAAACTAAGATTTTAAATGATAGTGATATGATCAGCTTAATTAAAGAGGTATCTTTAAAAGTGATCAACGCCTATAAAAATGGCAATAAAACTTTACTAGCAGGTAATGGAGGAAGTGCAGCTGATGCACAACATATAGCTGGAGAGTTTGTGAGTAGATTTTACTTTGACAGACCTGGTATTGCAAGTATTGCTTTAAGTACCGATACGAGTATTTTAACAGCTATTGGTAATGACTATGGTTATGAAAATTTATTTGCAAGACAGGTGCAAGCCCAAGGTATTAGTGGAGATGTGTTTATAGGAATTTCTACAAGTGGAAATAGTAAAAATATCTTAAAAGCTTTAGAGATTTGTAAAGAAAAAGGAATTTTAAGCATAGGTTTAACCGGAGTCAGCGGTGGTGCTATGAATGAACTTTGTGATTATTGTATCAAAGTGCCGTCATCTTGCACACCAAGGATTCAAGAAGCGCATATTTTGATAGGACATATCATCTGTGCTATAGTAGAAGAAGAGCTTTTTGGCAAGGGGTTTGATTGCAAGCTATAGTTTTAGCAGGAGGGCTTGGCACAAGATTAAAAAGCGTAGTGCAAGATTTTCCAAAGCCTATGGCGCCTATTAATGGAAAACCATTTTTAGCCTTTGTTTTAGAGTATTTAAAAAAACAAGGAATTGCTGAAGTTATTTTAAGTGTTTCGTATAAATATGAACTCATCCAAGAGTACTTTAAAGATGAATTTGATGGTATGAAAATACGCTATAACATTGAAAAAGAGCTTTTAGGTACAGGTGGAGCTATAAAAGATGCTTTGAAATTTATACAAAATCAAGCTTATATTTTAAATGGAGATACTATTTTTGATATTGATCTAAAAAAACTTGTTTTAAATGATAGCAAAATTTGCATCGCACTAAAGCAAATGCAAAATTTTGATAGATATGGTACCGTAAATGTTGATGATCAAGGTATTGTAATATCTTTTGAAGAGAAAGTATTTAAAAAACAAGGTTTAATCAATGGTGGCATATACTTGCTAAAAAAAGATATTTTTGATAAATTTGATCTAGAGAAAAAATTTTCTTTTGAAGAATTTTTGCAAGAAAATTTTGAACTGTTAAAAATGCAATCTCAAATTTTTGATGATTATTTTATCGATATAGGGATACCTGAAGATTATTTTTTATTGTGCGGTAAAAAATGACCCATTTAGAATATTTAGAATCACAGTCCATTCATATCATCCGTGAGGTGATAGCTGAGTTTGAAAAACCAGCTATGCTTTATAGTATAGGTAAAGATAGCTCAGTTATGCTTCATCTTTTACAAAAAGCATTTTATCCAAGCTTACCTCCACTTCCTTTGGTGCATGTAGATACTACATGGAAATTTAAAGAGATGATAGAATTTAGAGACAAACGTGCCAAAGAGCTTGGTATGGAGCTTATAGTCTATCAAAACTCTAAAATCAAAGAATTAAATCTTTCTCCATTTACGCATGGTTCATCCATGCATACAGATATTGCTAAAACACAAGGTTTAAAACAAATGCTTGATTTATATCAGTTTGATGCGGTATTTGGTGGTGCAAGAAGAGATGAGGAAAAATCGCGTGCAAAGGAAAGAATTTATTCTTTTCGTGATGAAAATCACTCATGGGATCCAAAAAATCAACGCCCAGAATTATGGGATATCTACAACGGTCGTCATAAAAAAGGTGAATCCATAAGAGTTTTTCCGCTGAGCAATTGGACTGAGCTTGATATATGGCAGTATATTTACAAAGAAAATATTCCTTTACCAAGTCTTTATTTTGCTAAAAAACGACCGGTAGTAGAGTACATGGGGGCTAAAATTTTAGTTGATGATGAGCGCATGCCAAAAGAACTTGCTAAAAATGCTAAAGAAGAATTGGTTCGTTTTAGAACCTTAGGTTGCTACCCGCTAACAGGAGCCATAAACTCAAGTGCTAGCAATGTTTTAGAAATCATCGAAGAACTTTTGCTTTCTAAAACAAGTGAAAGACAAGGTAGGCTTATAGACACTGATGAAGAAGCAAGTATGGAAAAAAAGAAAAAAGAGGGGTATTTTTAATGAAAACAAATGTAGAAAAATACCTAAAAGAACATGAAAATAAAGAGCTTTGTAGATTTATCACTTGTGGTAGTGTAGATGATGGCAAATCTACCCTTATAGGTAGAATGCTTTATGATGCAAAAATGCTTTTTGAAGATCAAATTTTATCTTTAGAAAAAGATAGCAAAAAGCTTGGCAATGCAGGGGAAAAGCTTGATTTTGCACTTTTAGTAGACGGTCTTGCAAGCGAGAGAGAGCAAGGTATAACCATAGATGTAGCATATAGATTTTTTACAAGTGAAAAAAGAAAATTCATCATAGCAGATACTCCAGGCCATGAGCAATACACTAGAAACATGGCAACAGGTGCTAGTACAGCTGATATTGCTATCATACTTATAGATGCTAGAAAAGGGGTTTTAACTCAAACTAAAAGGCATTCTTATATAGCGAGTTTACTTGGTATAAAACAATTTATTATTGCTGTGAATAAAATGGATTTGATTGATTATAATCAAGAAATTTTTAATACAATCTGTAAAAATTATCAAGAAATTTTACCATGCTTAAAAAATCATGAACATATTAAAACCCACTTTGTTCCTATATGTGCGCTAGATGGAGACAACATAGCTTCTAAAAGTATTAGTATGCCTTGGTATAGTGGAAAAACATTATCTGAGCTTTTAGATACTTTGCCTATTGCTACTAGTTTAAGCGATGAGTTTATCATGAGTGTGCAATATGTCAATCGCCCTCATTTAAATTTTAGAGGTTTTTGTGGAAATATTGCTAGTGGAAGTATAAGTGTTAAAGATGAAGTTGTGATTTTACCTTCTTTAAAAACAAGCAAAATAAAACAAATTATCACGCCTGATATTAAAAACCTAAATGCACTTGGTAAAAATGAAAATGTTCAAAGTGCTAAAAATGCTAGCTTTCCAAGTGCTATGACTTTAACTTTAGAAGATGAGATAGACATTTCAAGAGGCGATGTAATAGCTTCTAAAAACCATAGTATAGAAATTTCAAATTCTTTTAAAGCTATGGTAATATGGATGAGTGAAGTTGAGTTTAATTTAAATGAAAACTATCTTATCAAAATAGCAAATTTAACTACTAATGTAGTATTTGAAAAAATTGATTTTAAAAAAGACATTAATACTTTCAAAGAATTTCAAAGTAGTGAATTAAAACTCAATGATATTGCTAAATGCACCTTAAAGCTTAATAAAAAAACAGCCCTTAAAGCTTACAAGGACAATAAAACTTTAGGAAGCTTTATCATCATAGATAAATACTCTAATGAAACCTTAGCAGCGGGTATGGTAGAAGAAATTTTAGCAAGCGAAGAAAAGAGTAGAATTTACACTCAAGCAGAAATAGAACTTAATGTTTACATTAGAAAAAACTATCCTGAGTGGGGGTGTAAAAAAATATGAAAATTATTGTTGCATTAAGTATTTTAATTTTGCTTATTTTGTTAATTAGCAATAAAATTAAACCTTTTATTTTATTTGGTAGTGTAGCTGTGCTTTATTATCTTTTGGGGTATTTAAATTTAAGTACTTGGCTTAGCTCTTACACGAGTGAATCTTTAATAGTGCTTATTTTGCTTTTGTTAGTTTCACTGGCTATAGAAAAAAGCGTTGTGATAAGTTGGTGTTCTAAGTTTATCATAGGTAAAAATTATCACTTGTCGCTTTTAAAGCTTGGAGTTGTTACAGCTAGTATTTCAGCTTTTTTAAATAATACTGCAGTAGTGGCAAGTTTTATGAGTATTATAAAAAATAACAAATTTCAAGTCCCTTCTAAACTACTCATCCCACTTTCATATTTTTCCATAGTTGGTGGAACGATGACTTTGATAGGCACTTCAACTAACTTGATAGTCAATTCTTTTGTAGTACAAAATGGTTTGGAAAGCTTAAAGATTTTTGATTTTTTTGCGGTGGGTTTTTGTATAAGTATTGGCGTGCTTATAGTACTTTTGATTTTTAACTTTTTATTGCCTGAGTATAAAGAAAGAGAAAATGTCATCAATGAGTATTTAATCAATGCTAAAGTATTAAAAAATAGCTCATTAGTGGGGAAAACTATACAAGAAAATGGCTTAAGGAATTTGGAGTTTTTGTTTTTACTTGAAATTCAAAGAAAAGATGAGCTTATTACTCCTGTTAGTCATAATGAGCTTATAAAAGAAGGAGATGAGTTAATTTTTAGTGGAGATATTGCGCATTTAGAAGTTTTGAAAAAATTTGATGGCTTGCAAATTGACTCACAAGATTTAAAACTGGAAACATTAAATTTAATAGATGTTGTTATAAATTCTGAGTCAAACTTGATAGGAAAAAGTGTTAAGGAAGCAAACTTTAGAGCTAAATTTGATGCAGGGATTGTAGCTTTAAAAAGAGGCTCAAAAAATATTTCAAAAATCGGCCAAAGTTTATTACAAGCTGGAGATAGGCTTATTTTAAGTGTGGGTAAGGATTTTCACTCAAGAGATAATATCAATAAAAACTTCTACATTATCTCAAATATCATGCAAAATCAAAAGTTAAGTAATATCCAAAGTTTTATAGTGATTTTTGCGTTTTTAGCCATAATTGCTTTATCTGCTTTGGAATTAGTGTCTTTGCTTAAAGCGCTGCTAGTGTTTTTAGCTTGCTTGTTTGTATTTAAAATCATAAGTTTTGATGAAGTAAAAAGACGCTTTCCTTTGGAAATTTTTATCATAGTAGGATCTTCTTTGGCCATTACTAAAGTTTTGGTTGATAGTGGTTTAGCTAAAGATTTGGCTGAGTTTATTATAGGAACTTTTGGAGTGTATGGTTTATATGGTAGTTTTGTGGGAATTTATCTTTTAACCTTGCTTTTAACAGAAATCATTACTAATAACGCTGCCGCAGCTTTGGCTTTTCCTATTGCTTATAGTACCGCTTTAGCACTTGAAGTTAATCCAACTCCGTTTATATTAGCGGTTGCTTACGGGGCAAGTTGTGCTTTTTTAATGCCGCATGGTTATCAAACTCACTTGATGGTAGGTTCAATTTGTGGGTATAAAACAACTGATTTTATAAAAATAGGTTGGGTAGTTTCTTTGACTTATTCAGCTATTGTTTTAACTATAACTCCGGTATTTTTTAGTTTTTAAGGAAAAAAATGAGTAAAAATTTAACTTGGCATACAAGTAGCATTACAAAAACTCAAAGAGCTAAACTTAAAAATCAAAAACCATATGTTTTGTGGTTTAGTGGGCTTAGTGGCAGTGGTAAGTCTACTTTGGCTAATGCAGTTGAAAAAAAACTTTTTGAGCGAGGTTTTCATACTTATCTTTTAGATGGGGATAATGTGCGTCATGGACTTAATAAAGATTTGGATTTTGATGAGGTTTCAAGAGTAGAAAACATAAGACGTATAGGAGAGGTATGTAAGCTTTTTGTAGATGCTGGTATGATAGTACTTTGTGCTTTTATATCACCCTTTGAAAAAGATAGACAGCTTATAAAAGATCTTTTAGATGATGATGAATATATAGAAATATTTGTTGATACACCTTTGGAAATTTGCGAAAAAAGAGATCCAAAGGGACTTTATAAAAAAGCAAGAAATGGAGAGATTAAAAATTTTACAGGTATAGATAGTCCTTATGAAAAACCTAAAAACCCGCATATACATATAACAAAAGAAGATCTTAATGAGAATGTGGATATGATTTTGAGATTTTTAGACGAGAGAATATAATGTTTAAAGATTTTCATGATAAGTATAAATGTATTTTTATTCATGTGCCAAAGGTTGCTGGTAGCAGTATAGAAAGAGTGATATATCAAACAGATAGATGGCTTGTTGGACATGTAAAAGCAAGTGATTATGTAAAGCTTGATAGGGATAAATTTGAGAGTTATTTTTCTTTTGGTTTTGTGAGAAATCCTTATGATAGAATGGTTTCAGCGTATCATTATTTAAGAAGAGGAGGTGGAAATTTAGTGGATGAAACTTGGGCAAAAGAAAATATTTACAAGTATAATTCTTTTGAAGAATTTGTGTTAAATTTGCAAAACAATGATGAGCGAATAAAAATTTTAAATTGGATGCATTTTGTCCCACAGTATAAATATCTATGTGATAATGATAAAAATATATTGGTTAATTTTATAGGAAAATTTGAAAAATTAGATGAAGATTTTAAAAAAATTTTAAATATTCTTAAAAGAAAAGATAATCTTGTGCATGTAAATAAGAGTCAGCACGGTGACTATAAAGATTACTATAATTATAAAACACATAAAATTATAAGAGAAATTTATAAGAATGATTTTGAGATTTTTGATTATGATTTAGAGGATAAAAAATATTTTAATATTTCTGATAATGCTATCTTAAATATACTGCAAAATAAAATAGGATATAAGAGTGATGTGTTAGAAAATTTAAGATTGAAATATTTAACTCAAATTCAAAATTTAAATCAAAATATAAAACTTAAAGAACAAGTTATTCAAGATAATTTAACTCAAATTCAAAATTTAAATCAAAATATAAAACTTAAAGAACAAGTTATTCAAGATAATTTAACTCAAATTCAGTTATCAAATAATCAATTATCTTTTCAAACCAAATACGGCACAGCCAAGTCTCGTATTCACAACCAACTTTCTTATAAACTAGGTCAAGCTATGATAATAAATTCTAAATCTTTCCTAGGTTACTTAATAATGCCTATGGTATTATTAAGTATAATAATTTTACATAAACAAGAACATAAAATTTATCAAGAAAAAATAAAAAAAGATCCATCATTAGCTTTACCTCCATTAGAAAGCTATTCTGATTATCAAGAAGCCTTGAAACTTAAAAATCATCTTTCTTATAAACTTGGACAAGCTCTTGTAAAAGCTAATAAAACTTGGTATAAAGGAGGATATGTTAAAATATGGTTTGAAGTAAGGAAGTTAAAAAGGGAAATCAGAAAAAATTTGATATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP007778|287977:296100|287977_288994_+|WP_039640816.1|DBSCAN-SWA MIIRSQTPLRLGLAGGGTDINLYCNQYTGYVLNATISLYVHCTLIERNDEKIIFDSSDTNVKAEYKSKDFLENDGKLDLYKAIYNRLVKEYIKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGIIKAFAEWLNLPLGEYEIARLAYEIEREDMAIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYDQKRVIVNPLRIKNWIASELEARVLLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDENSLNAMHAIKQDALDMKEALFRADFEKIAQILGKSWQSKKIISDIVSNDELERIYHLAMDNGAYSGKTSGAGAGGFMFFMVDPIKKYKLKKILNDQQGYVQEFYFTKEGAKSWKI >NZ_CP007778|287977:296100|288981_289587_+|WP_039640818.1|DBSCAN-SWA MENLNLYIKSHFSDSIDIKTKILNDSDMISLIKEVSLKVINAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALSTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGISGDVFIGISTSGNSKNILKALEICKEKGILSIGLTGVSGGAMNELCDYCIKVPSSCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFDCKL >NZ_CP007778|287977:296100|292550_294266_+|WP_039640826.1|DBSCAN-SWA MKIIVALSILILLILLISNKIKPFILFGSVAVLYYLLGYLNLSTWLSSYTSESLIVLILLLLVSLAIEKSVVISWCSKFIIGKNYHLSLLKLGVVTASISAFLNNTAVVASFMSIIKNNKFQVPSKLLIPLSYFSIVGGTMTLIGTSTNLIVNSFVVQNGLESLKIFDFFAVGFCISIGVLIVLLIFNFLLPEYKERENVINEYLINAKVLKNSSLVGKTIQENGLRNLEFLFLLEIQRKDELITPVSHNELIKEGDELIFSGDIAHLEVLKKFDGLQIDSQDLKLETLNLIDVVINSESNLIGKSVKEANFRAKFDAGIVALKRGSKNISKIGQSLLQAGDRLILSVGKDFHSRDNINKNFYIISNIMQNQKLSNIQSFIVIFAFLAIIALSALELVSLLKALLVFLACLFVFKIISFDEVKRRFPLEIFIIVGSSLAITKVLVDSGLAKDLAEFIIGTFGVYGLYGSFVGIYLLTLLLTEIITNNAAAALAFPIAYSTALALEVNPTPFILAVAYGASCAFLMPHGYQTHLMVGSICGYKTTDFIKIGWVVSLTYSAIVLTITPVFFSF >NZ_CP007778|287977:296100|294274_294856_+|WP_039640828.1|DBSCAN-SWA MSKNLTWHTSSITKTQRAKLKNQKPYVLWFSGLSGSGKSTLANAVEKKLFERGFHTYLLDGDNVRHGLNKDLDFDEVSRVENIRRIGEVCKLFVDAGMIVLCAFISPFEKDRQLIKDLLDDDEYIEIFVDTPLEICEKRDPKGLYKKARNGEIKNFTGIDSPYEKPKNPHIHITKEDLNENVDMILRFLDERI >NZ_CP007778|287977:296100|294855_296100_+|WP_039640830.1|DBSCAN-SWA MFKDFHDKYKCIFIHVPKVAGSSIERVIYQTDRWLVGHVKASDYVKLDRDKFESYFSFGFVRNPYDRMVSAYHYLRRGGGNLVDETWAKENIYKYNSFEEFVLNLQNNDERIKILNWMHFVPQYKYLCDNDKNILVNFIGKFEKLDEDFKKILNILKRKDNLVHVNKSQHGDYKDYYNYKTHKIIREIYKNDFEIFDYDLEDKKYFNISDNAILNILQNKIGYKSDVLENLRLKYLTQIQNLNQNIKLKEQVIQDNLTQIQNLNQNIKLKEQVIQDNLTQIQLSNNQLSFQTKYGTAKSRIHNQLSYKLGQAMIINSKSFLGYLIMPMVLLSIIILHKQEHKIYQEKIKKDPSLALPPLESYSDYQEALKLKNHLSYKLGQALVKANKTWYKGGYVKIWFEVRKLKREIRKNLI >NZ_CP007778|287977:296100|291129_292554_+|WP_039640825.1|DBSCAN-SWA MKTNVEKYLKEHENKELCRFITCGSVDDGKSTLIGRMLYDAKMLFEDQILSLEKDSKKLGNAGEKLDFALLVDGLASEREQGITIDVAYRFFTSEKRKFIIADTPGHEQYTRNMATGASTADIAIILIDARKGVLTQTKRHSYIASLLGIKQFIIAVNKMDLIDYNQEIFNTICKNYQEILPCLKNHEHIKTHFVPICALDGDNIASKSISMPWYSGKTLSELLDTLPIATSLSDEFIMSVQYVNRPHLNFRGFCGNIASGSISVKDEVVILPSLKTSKIKQIITPDIKNLNALGKNENVQSAKNASFPSAMTLTLEDEIDISRGDVIASKNHSIEISNSFKAMVIWMSEVEFNLNENYLIKIANLTTNVVFEKIDFKKDINTFKEFQSSELKLNDIAKCTLKLNKKTALKAYKDNKTLGSFIIIDKYSNETLAAGMVEEILASEEKSRIYTQAEIELNVYIRKNYPEWGCKKI >NZ_CP007778|287977:296100|290236_291130_+|WP_039640823.1|DBSCAN-SWA MTHLEYLESQSIHIIREVIAEFEKPAMLYSIGKDSSVMLHLLQKAFYPSLPPLPLVHVDTTWKFKEMIEFRDKRAKELGMELIVYQNSKIKELNLSPFTHGSSMHTDIAKTQGLKQMLDLYQFDAVFGGARRDEEKSRAKERIYSFRDENHSWDPKNQRPELWDIYNGRHKKGESIRVFPLSNWTELDIWQYIYKENIPLPSLYFAKKRPVVEYMGAKILVDDERMPKELAKNAKEELVRFRTLGCYPLTGAINSSASNVLEIIEELLLSKTSERQGRLIDTDEEASMEKKKKEGYF >NZ_CP007778|287977:296100|289574_290240_+|WP_039640821.1|DBSCAN-SWA MQAIVLAGGLGTRLKSVVQDFPKPMAPINGKPFLAFVLEYLKKQGIAEVILSVSYKYELIQEYFKDEFDGMKIRYNIEKELLGTGGAIKDALKFIQNQAYILNGDTIFDIDLKKLVLNDSKICIALKQMQNFDRYGTVNVDDQGIVISFEEKVFKKQGLINGGIYLLKKDIFDKFDLEKKFSFEEFLQENFELLKMQSQIFDDYFIDIGIPEDYFLLCGKK |
8 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
519302 : 529571
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007778|519302:529571|DBSCAN-SWA AATGGAAAATAAAACAGATTTAATTTATGGTTTAGAAGATAAACCACCTTTTACTAAAGCATTTTTTGCTGCTTTAGTGCATTTAATGGCTATGTTTGTGGCTGTAATTACACCTGCTTTACTAATTTGCAAGGGTCTTGGAATAGATGATACTAATACAGCTAGAATTATTTGTATGTCGCTTTTTGCTTCAGGTGTTGCTTCACTTTTGCAGATTAAAACTTGGGGTCCTATAGGGAGTGGACTTTTATCTATTCAAGGAACTAGTTTTAACTTTGTTGCGCCTATTATACTAGGCGGCCTTGTTTTAAAAAATAATGGTTTATCGCAAGAAGCAATGCTTGGAGCTATTTTTGGTACTTTAATGCTTTGTTCAACTACTGAAATGATTATTTCTCAAATTTTACCTTTTATCAGAAGAGTGATTTCGCCTTTGGTTTCAGGTATAGTAGTGATGATTATAGGTCTTAGTTTGATTAATGTTGGTCTTGTGAGTGCAGGAGGTGGATTTGCGGCTAAGGCAAGTGGTGAGTTTGGTTCTTTGCAAAATTTATTATTAGCCGGAGTTGTGATTTTAAGTATTATTATATTAAATCGTTTTAACAATGCTTATATAAGAATTTCTTCTTTGTTTATAGCTATGATAATAGGCCTTTTAGTGGCTATGACTTTTGAAAATTTTAGCTTTAATTTTAATGAAAATTTACCTTTAATGTTTTTACCTGATCCTTTGCACTATGGTTTGAGTATTGATTATAATCTCATTTTACCTTTGATTTTGGTTTTTATGGTAACTTCTTTAGAAACTATTGGTGATATTAGTGCTACTAGCGAAGTTTCTAATCAGCCAGTTAAAGGTGAACTTTATGCAAAAAGATTAAAAGGTGGAGTTTTGGCAAATGGCTTTAATTCCTTTGTTTCAGCCTTTTTTAATACTTTTCCAAACTCATGTTTTGGGCAAAATAATGGCGTCATAGCTTTAACAGGTGTTGCAAGTCGTTATGTAGGGTTTATTGTAGCTTTTATGTTGATGATTTTGGGTTTATTTCCTATTGTGGCTGATATTACTTTGCAAATTCCAGAGCCTATTTTAGGTGGGGCAACTTTAGTAATGTTTGGTACTATAGCTGCAACGGGGGTTAGGATTATTTCTAAAGAAAATTTAAATCGTCGATCTATTATCATTATAGCTATGAGTTTGGGTATAGGACTTGGAGTTTCTAATAATCCTGATATTTTAGAATTTATGCCAATGTGGTTTAAAACTTTATTTTCTTCAGGGATTGCAGCAGGTGGGATTACAGCTATTATTTTAAATTTTGTTTTCCCTCTTGAAGAAAATAATAAAAATAAAGTAAAATAATAAAAAACAAGGAAAAATGATGAAAAAAATGATACTAATAGCAGGGCCTTGTGTGATAGAAAATGAAGAGCTTGTTTTTAAGGTTGCACAAGAGCTTGAATGCTTTTTAAAAGATGATAGAATTGATTTTTATTTTAAATCAAGTTTTGATAAAGCAAATAGAACTAGTATTAATAGTTTTAGAGGACCAGGTCTTGAAAAAGGTTTGGAAATTTTGCAAAAAGTTAAAGATAAATTTGGCATGCAAATTCTTACTGATATTCATGAGAGTTCTCAAGCAAGTATTGCAGCTGAAGTTGTAGATGTTTTACAAATTCCAGCTTTTTTGTGTAGACAAACCGACCTTTTAGTGGCAGCTGCCAAAACAAAAGCTAAGGTAAATGTAAAAAAAGGTCAATTTTTAAATCCTGAAGATATTAAATACAGCGTGGCTAAAATTTTACAAACTAGAGGCATTAACGAAGAAGGTTTTGAAATAGCCAAAGAAAATGGGATTTTCGTAGCTGAGAGGGGTTCTAGTTTTGGTTATGGAAATTTAGTTGTAGATATGAGAAGTTTGGTTATCATGAGAAAATATGCTCCTGTTGTTTTTGATGCTACTCATAGTGTGCAAATGCCAGGAGCAAATGGTGGAAGTAGTGGAGGCAAAAGTGAATTTGTAGAGCCTTTAGCAAGAGCTGCAGCTAGTGTAGGTGTGGATGGATTTTTCTTTGAAACGCACATTGATCCTTGTAAGGCTTTATGCGATGGACCAAATATGCTTGATCTTTCAAGACTTAAAAATTGCGTAAATACGCTTTTAAAAATTCAAGAAATCATTTAAAAAGGAAAAATATGAAGATAATAGAGGGAAATTTAAGTTTAAAAGGTGATGAAAAAATTGCAATTATCAATGCAAGATTTAATCACATTATCACAGATCGTTTAGTTGAGGGTGCTAAAGATGCTTTTTTAAGACATGGGGGTAAAGAAGAAAACTTAAGTCTTATTTTAGTGCCAGGTGCTTTTGAAATTCCTTTTGCACTAAAACAAGCTTGTGAGAGTAAAAAATTTGATGGAATTTGTTGTGTTGGAGCGGTAATTCGTGGAAGTACGCCGCATTTTGATTATGTAGCGGCTGAAACTACTAAAGGTATAGCAAGTGTAGGGCTTGGAGCTAATATACCTATAAGTTTTGGAGTTTTAACAACTGATACTTTAGAGCAAGCTATAGAAAGAGCGGGTAGTAAAGCAGGTAATAAAGGTTTTGAAGCTATGCTTACTGTGGTTGAAATGCTTAATTTAATTCAAAAAATTAAGGCTTAAAATGGCTACTAGACACCAAGTAAGACAAAGTATAGTTTCTTTGCTTTATGCAGCACAGTTAAATCAAGAAAATAAAGATTTTATCAATGAATTTTTAGATGAGAAAAAAATTCGCAATGATCAAAGAAAATTCACTCTAGATTTATATAATGGCATTAATGAACAACTTATTTTGCTTGATGAGAAAATTAATGAGTGTTTAAAAGAGCATAAGTTAGATGGAGTGGCTAGTATAGAAAAGGCTATTTTACGCTTGGGTGCTTATGAGATTTTATTTACTTCTACACAAAAAGCGATTATTATCAACGAAGCTATAGAGCTTGCAAAGGAAATGGCAGGGGATAATGCTCCTAAATTTATCAATGGGGTGTTAGATAAAATCAACAAGGAAAAACAATGAAGCTTTGTGTGGCTTTTGATGTAGCAAGTTATGATGAATGCATAAATTTAGCTAAAGAATTAAAAGGTTTAGATCTTTGGGTTAAAATAGGACTTAGATCGTATTTAAGAGATGGAATAAAGCTTTTAGAGGCGATTAAAAAAGTGGATGATTTTAAAATCTTTTTAGATTTAAAGCTTTATGATATACCAAATACTATGGCAGATGCTTGCGAAGAACTTGCTAAGCTCGATGTAGATATGTTTAATATCCATGCAAGTGCAGGTAAAAGTGCTATGTGTATGATTATGGAGCGTTTAAATGCTTTAAGTAAAAGACCTTTGGTGCTTGCTGTGTCTGCTTTAACTAGTTTTGATGAGCAAGAATTTTTTAGTATATATAAACAAGATATTAAACAAGCTGTTAAAGATTTTTCTAAAATTAGCTATGAAAGTGGTCTTGATGGCATGGTTTGCTCGGTATATGAAAGTTTATTGATAAAAGAAAACACTAATTCAAATTTTATCACATTAACCCCTGGAATTCGCCCCTTTAAAGAAAATTCAGATGATCAAAAAAGAGTAGCTGATATACAGTGTGCTAAGGATAATTTGTCAGATTTTATTGTGGTTGGAAGACCTATTTATAAAGCAAAAGAACCTAGAAAGGTTTGTGAGGATATATTAAAGCATTTAAAATAAGCCTTAAGGCTTATTTTAAATATACTTTCATTTTTTTATTTTCCAAAATAATTCCATCATCGTCGCTAATAATTTGAAAATCTCCGTTGAAATTTCTTAAGAAATTATCTTCAAATTTCATAGACTCTTGATCACAAAGCATTTTTGTTGATGCAAGATTATCTTCTATTTTTATACTATTTCCTTGATCTTTATAGCCACCAAAAAATCTATTACATCCTGCTATTCCAAAAAGTCTTTTGTCTTTATTATCAAAACTAATACTTGCTTTAGAATTTTGAGGAAGTTCATAGCTTTTTCCATTAGCTTCATAAGAGCTTATAGTAAATTCTTTATTTTGCAAATCATCTGTGCTTAAATTTGCCACAGAACACCCACTAAAAATAGCTAAACTTGTTATACTTAATGTAATTATTTTTTTCATTTTGATTCTCCTTATACATGAAAATGTTTTAATTCATCTTCTAAATTTTGACAAACTACATTTAACTCATGAGCAACATCAAGTAAAATTTTTGAAATTTCTTCATTTTTATCACTTAATTTTACTGTTTCTTGCATTTTATCAAGTAATGATTGTAAAGTTTCTTGTGTGCTTGAGATTTTTTGCATACAAGCATTTGCTAATTCTCTTGCATTTTCATTGCAAACCTTTACTTCATTAGTTCCTTCAACAAGATCTTTTGCATCTTGATTTAAAGAATTAATTTCTTTGGCGTTATGTTTTAGTTCTTTGGAAACTTCATTGATACTATCTACTAATTGCTTGGTGACAATAGCAATATTTTTTAAAAATTCTTCTGAGTTTTGAGCAAGATTTCTTACATCTTCAGCAATAACTGAAAATCCACGACCAAATTCCCCAGCACGTGCTGCTTCAATACCTGCATTTAATGATAAAAGATTAGTTTTATCGGCAATTTCTCCCATCATATCAGATGCTTTTTTAATCTCTTCTGCTTGTTTTTCCATAACTTCAACTTTTTGAGATAAAACATCTTCATTTTCTGCAACCACTCTTACTTTGTCTACTATCTGATTTAGTGAATCAAGCATGGCATTTAAAACTTCAAAAGATTTTGTATTTGCCTTGTTTGCATTATTTGAAAGTTCGGCAAGATCTTGCAATTCTGTATGTATTTGCTCACTTAAGTGATAAGATTCATCGGTTTTTGTATGACCTTCTTTTGTTCTATTTGCTAAATCAAGTGCATTAGCATTTAAAAGTTTAGATTGCTTATCTACCATTTGA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GTGATTATGACTTTCTACTTTAAATACAGCCGCCATTCCTTTACCTATATCTATTACTCCAGCGTTTTCACCAGGACCTTGGATTACCCAAGGAGCTTTAGTTGGAAAGCCATTAAGGTATTTTTTACTTGATTTATATGAGCAATGCTCGCTCCACATAGCAGAAATTACTCCAAGCTCTAGCAAATTAGGTTCTCTACCTAGTATGTTTAAAATTTCTTGATATTCCTCATCGCTAATTTTGTGTTGTTTTATAATTTCTTTGTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007778|519302:529571|525091_526624_-|WP_039641116.1|DBSCAN-SWA MKALISVSDKEGVVEFASELVKLGFELLSTGGTYKLLKENNLQVQEVSDFTQSPEMFEGRVKTLHPKIHGGILYKREDESHQKQAKEHNIESIDLLCVNLYPFKKTTILTQDFDEIVENIDIGGPAMIRSGAKNFKNVIVVCDILDYDKIIQALKDNTLDLDFRRALMIKAYEHTANYDAYIANYMNERFNGGFGASKFIVGQKVFNTRYGENPHQKGALYEFDDFFTHNFTTLKGEASFNNLTDINAALNLASAFDKAPAVAIVKHANACGFAIKENLLQSYIHALKCDTLSAYGGVVAINGTLDKELAQKINEIYIEVIIAANVDDDALEVFKDKKRIKIFTQKAPFLTRAYDKYDFKHIDGGFVYQDSDEVREDELKNAVLKSERKASEQELKDLEIAMKIAAFTKSNNVVYVKNGAMVAIGMGMTSRIDAAKAAINKAKEMGLDLNGCVLASEAFFPFRDSIDEASKIGVKAIIEPGGSIRDEDIIKAANEYGIALYFSGIRHFLH >NZ_CP007778|519302:529571|519302_520664_+|WP_039625621.1|DBSCAN-SWA MENKTDLIYGLEDKPPFTKAFFAALVHLMAMFVAVITPALLICKGLGIDDTNTARIICMSLFASGVASLLQIKTWGPIGSGLLSIQGTSFNFVAPIILGGLVLKNNGLSQEAMLGAIFGTLMLCSTTEMIISQILPFIRRVISPLVSGIVVMIIGLSLINVGLVSAGGGFAAKASGEFGSLQNLLLAGVVILSIIILNRFNNAYIRISSLFIAMIIGLLVAMTFENFSFNFNENLPLMFLPDPLHYGLSIDYNLILPLILVFMVTSLETIGDISATSEVSNQPVKGELYAKRLKGGVLANGFNSFVSAFFNTFPNSCFGQNNGVIALTGVASRYVGFIVAFMLMILGLFPIVADITLQIPEPILGGATLVMFGTIAATGVRIISKENLNRRSIIIIAMSLGIGLGVSNNPDILEFMPMWFKTLFSSGIAAGGITAIILNFVFPLEENNKNKVK >NZ_CP007778|519302:529571|523059_523473_-|WP_039641112.1|DBSCAN-SWA MKKIITLSITSLAIFSGCSVANLSTDDLQNKEFTISSYEANGKSYELPQNSKASISFDNKDKRLFGIAGCNRFFGGYKDQGNSIKIEDNLASTKMLCDQESMKFEDNFLRNFNGDFQIISDDDGIILENKKMKVYLK >NZ_CP007778|519302:529571|522365_523049_+|WP_039641111.1|DBSCAN-SWA MKLCVAFDVASYDECINLAKELKGLDLWVKIGLRSYLRDGIKLLEAIKKVDDFKIFLDLKLYDIPNTMADACEELAKLDVDMFNIHASAGKSAMCMIMERLNALSKRPLVLAVSALTSFDEQEFFSIYKQDIKQAVKDFSKISYESGLDGMVCSVYESLLIKENTNSNFITLTPGIRPFKENSDDQKRVADIQCAKDNLSDFIVVGRPIYKAKEPRKVCEDILKHLK >NZ_CP007778|519302:529571|520683_521487_+|WP_039641104.1|DBSCAN-SWA MKKMILIAGPCVIENEELVFKVAQELECFLKDDRIDFYFKSSFDKANRTSINSFRGPGLEKGLEILQKVKDKFGMQILTDIHESSQASIAAEVVDVLQIPAFLCRQTDLLVAAAKTKAKVNVKKGQFLNPEDIKYSVAKILQTRGINEEGFEIAKENGIFVAERGSSFGYGNLVVDMRSLVIMRKYAPVVFDATHSVQMPGANGGSSGGKSEFVEPLARAAASVGVDGFFFETHIDPCKALCDGPNMLDLSRLKNCVNTLLKIQEII >NZ_CP007778|519302:529571|523484_525077_-|WP_039641114.1|DBSCAN-SWA MFKSIGAKISLAMISTLLISFIIMQIILQKDSQQTTDRISRANLDTLSTSVFQTLRMAMNLGDPAIIEQAIKEAGEIEGIKDIKIYPSKSTVELFEMQKYTKSNESIINEQFNKPEIKAVEINNDQGHYLRLIRPLIANEGCLACHANAKKGDVLGVMDMYNDLKHVDDDLASSARTYIIIFSIALLFTVFAVLYILKIVVGNPVLDLLKHAKELASGDGDLRARINIKSTDEIGKACTYINQFIEKIQNAVISTNENSQMVDKQSKLLNANALDLANRTKEGHTKTDESYHLSEQIHTELQDLAELSNNANKANTKSFEVLNAMLDSLNQIVDKVRVVAENEDVLSQKVEVMEKQAEEIKKASDMMGEIADKTNLLSLNAGIEAARAGEFGRGFSVIAEDVRNLAQNSEEFLKNIAIVTKQLVDSINEVSKELKHNAKEINSLNQDAKDLVEGTNEVKVCNENARELANACMQKISSTQETLQSLLDKMQETVKLSDKNEEISKILLDVAHELNVVCQNLEDELKHFHV >NZ_CP007778|519302:529571|526620_527391_-|WP_039641118.1|DBSCAN-SWA MLFVLLVLAILAFYWYYKTWGKDDLLGSFKKGAKSFSQGFKQGYHEERIDGFKRRLNYYVIALLAKIAKSDGRVSENEANMISQILDYNAKDSREREFLKQSFNEHKNTLNDTYEVAKELIKEVPLPQQERINILNVLVAMALIDGELNSIKKDVLKAIVKAFNLDINILERLLNSMQTQKVGMNLQKACEILGVSENVNLQELKKRYRELAKKYHPDILNANNSDEAKIKEGVKKFQEVNESYEFLKQYVERKNQ >NZ_CP007778|519302:529571|521498_521969_+|WP_039641107.1|DBSCAN-SWA MKIIEGNLSLKGDEKIAIINARFNHIITDRLVEGAKDAFLRHGGKEENLSLILVPGAFEIPFALKQACESKKFDGICCVGAVIRGSTPHFDYVAAETTKGIASVGLGANIPISFGVLTTDTLEQAIERAGSKAGNKGFEAMLTVVEMLNLIQKIKA >NZ_CP007778|519302:529571|521970_522369_+|WP_039641109.1|DBSCAN-SWA MATRHQVRQSIVSLLYAAQLNQENKDFINEFLDEKKIRNDQRKFTLDLYNGINEQLILLDEKINECLKEHKLDGVASIEKAILRLGAYEILFTSTQKAIIINEAIELAKEMAGDNAPKFINGVLDKINKEKQ >NZ_CP007778|519302:529571|527393_529571_-|WP_039641120.1|DBSCAN-SWA MDKEIIKQHKISDEEYQEILNILGREPNLLELGVISAMWSEHCSYKSSKKYLNGFPTKAPWVIQGPGENAGVIDIGKGMAAVFKVESHNHPSFIEPFAGAATGVGGILRDVFTMGARVVAGMNSLKFGNIHDKKIGKHQKYLVKGVVSGISHYGNCMGVPTIGGECAFDECFNGNILVNAFALGTCKIEDIFYAKAEGIGNPVIYVGSKTGRDGLGGAVMASDSFNESSKSLRPTVQIGDPFAEKLLMEACLELFKTDYIVGIQDMGAAGLTSSSFEMAGRSGSGMKLYLDKTPMREEGMTPYELMLSESQERMLICAKKGYEEKVIEIFNKWGLDAAIIGEVTDTGKMELFWHDELVGLIPIEPLSEKAPMLDRPVAKPKYLDEIKNYQFNLNIPTQEAFEKLLADENVSNKAYIYEQFDSSVQTNTLKSDGALGANSIRIKENNCLLSMAIECNSRLNYVNPKIGAAAAVASAGRKIACSGARPLAISDCLNYGNPQNPEVMWQFAQGCEGIKLACKELNTPVVSGNVSLYNETDGVSIFPSPTIACVGVNEKAENVLKSYFSKDTSAIYLLGESKGAFGGSLIAKVLDQKVAGELEDIDFNAELKLWDFLLKANEAKLLDCANSIGIGGLAITLAKMSAKANLGIEVKTDFEDKSFIFEESPTRVIVGVKNEEKFIKFANEMRIKFTKLGNLNEKDFILDDIKISLAKLQTIYFNKFNEYLG |
10 | environmental_Halophage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
946016 : 957206
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007778|946016:957206|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007778|946016:957206|946744_947140_-|WP_012661666.1|DBSCAN-SWA MNLEVKCPILGFEDTKNMNFYKIDEVFYRLKSLDGKDFSFVMIDPYMIRPDYDFEVPDYYQELLALNEQTNFGVFVIVAINEPLEESTVNFLAPVVMNYDNNSLVQVILDTSKYPNYFQSEKISAFIKQTK >NZ_CP007778|946016:957206|956165_957206_-|WP_039641713.1|tRNA|DBSCAN-SWA MHFEEKIALNKALFSSLYNEEIQCFKSPLKAYRTRAEFSIYHHENGEISYAMFENKKKNPIEKFDIADEKIQKHMPILLNNLSENLKHKLFGVEFLATKLDLSITLLFHKNIELIAQDLQELAEKLNLKLIARSRGKKLVFNGENLRQALKINTNEFLYEFNNDCFIQPNTFINEKMIEWVISCIGSDFKQDLLELYCGYGNFTIALARNFNKVLATEISKKNIEFALKNCVLNSIENIAFTRLSSEELSQALKKEREFNRLKGIDLDSFKISHVLVDPPRAGLDLSVIELIKNYENIIYISCNPITLKENLEILCQSHEILNLAFFDQFANTPHLECGVHLRKKA >NZ_CP007778|946016:957206|955688_956111_-|WP_148308702.1|DBSCAN-SWA MNFYKGFLILFQKITYTNRKILYQVNEILKPFGLKSSDWRVFVYLNQHGCSTLAPICEFYQMDKAILSRVVSKLAKLEYIEFLKADDKREKIITLSAKGKEIFLDANAYIRKYERKILDILDVKDQERLLKLLDYINEKI >NZ_CP007778|946016:957206|950365_951742_-|WP_039642556.1|DBSCAN-SWA MMKNIVLVGIGLSILSCANSIYFMDIISFGFSLSLFLLFVFTFILLKKEDQFSDKILDLSRELKNGNFDSRIVYIKYSNKKLKEIADNLNNTIDGLEAYLREINTSIACSQKGEYFRRAIPEGLKGIFVHNINFINKALDDIEKTGKSVFKNALSRELMDLSLNSQNKNLNDLSSALNGIIKLMREVFGDIKVISDTAQKNGLEVGNLQDSISSMMQVADESKNAVDTFASNAQSINAIVEVIRDIADQTNLLALNAAIEAARAGEHGRGFAVVADEVRQLAEKTQKATGEITLAIQVMNQEISSIQENSEKVFDIANSSNSKIADFSEAFRELEDKSSHLGKEFIKFASDLTLSAMKIDHILYKSDVYLTLNGSQEKLQNLDPISTLCKDEDAKSIFCPLISQSEMDSKSEKIQKSANKAIEVAKKENISKEDYDSIISDIRELEKDSKLIMDKLEA >NZ_CP007778|946016:957206|946016_946745_-|WP_039641701.1|DBSCAN-SWA MSEIYILGNGAMASAIAKGLKDTYKVVIVARDLKKASSLNLEVLSYEEFDLEDKNVILAFKPYALEEVAVKLKGKARWLISVLANTTFEQLHCVNAQNYIKIMPNTAAEFKASATAYLMENDSYKDEILSLLNTFGKAISLQNEKEFDVAMVLSGCAPAFLALVAESLVNAGVKNGLKNELSYELTRACFESFSALFNHTHPAIIKEKICSPAGVTIRGVEALEKRALRGAFFEAFNASLNK >NZ_CP007778|946016:957206|947972_950351_+|WP_039641703.1|DBSCAN-SWA MKLENTQNYPTKLPVLVEDELFLYPFMITPIFLNDMQNIKALDTALQNESMIFVAPSKIEGGRGFDDIYNCGVIGTIMRKVPLPDGRIKILFQGYAKAKIVERISDDPLLALVDLIHQEPLCSTKKEAIIEVVREKAKALSTVSHYFPPDLLRTIEEDVEPSRICDLILNSIKIKKQQAYEFFIETNLETKLLNLIDYLAKEIEANKIQKEIKNKVHSKIDKVNKEYFLKEQLKQIQRELGSDIQKESEVEEYNKKLEKKKTFMYEEAYKEIKKQIQKYERIHQDNSEASMVQTYIETVLDIPFECSSKKKLNLKDVSLQLNSDHYALEKPKERIEEYFAVKELLEKRKIKDRDGAKVILCLVGPPGVGKTSLANSVAKALKRELVRIALGGLEDVNELRGHRRTYIGAMPGRIIQGLIEAKQSNPVVVLDEIDKLSRNHRGDPSAVLLEILDPEQNTKFRDYYLNFNIDLSKIIFIATANDTSLIPPALKDRMEFIELSSYTPQEKFQIAKNYLIPDEIKKHGLKEKEISFDDEAIELIVNEYTRESGVRNLRRKIAEVCRKCVKKLLLEENTRHIQINTKNLKDFLSKKVFEIEKHEKENKIGQVNGLAWTAVGGDVLKIEAIKIKGKGELTLTGSLGDVMKESAKIAQSLIKNLIDENQIKTPKNLSYKEDESIYNQYNLHIHVPDGATPKDGPSAGITITTAIASIFSDKKVRSDVAMTGEIDLMGNVLPIGGLKEKLIAAYKADIKTAIIPHKNYERDLKDIPEEVVKNMKIIGVKTLNEVLKIALA >NZ_CP007778|946016:957206|954504_955677_-|WP_052241409.1|DBSCAN-SWA MGLSKKYNLFNINFFCIFGINFAICLVFYMSTISSTDYVLGVLNLQTSTAGLIMGAFVIGALLSRLYFGSIIDDVNIKKVIVFSLLFYLFINLMYLKFYNVYFLILIRFLAGVCYGICSCACGAAIARIIPSNKRGVGIGYYATSVVLTSALGPFLAIKLDSINQFWLSFLIACLSIVFALILSIFLKVRRFKKHHHIKRKFSIYNYFEKSVLNLALVTFLLACPFGAIIAYMSAYTQSLNLAFAGSMFFVIYAGFSMVFRPLAGKVFDKYGANIVMIFSFLSFIVCLLLLTFALNFYMIILAGVFCALGYANATSSAQALAIKLAPKEKMGLANSTFFIALDFGIGVSPYLLGIIEPSIGFANVYAFCALLVVMALILYCLLIIKKVSY >NZ_CP007778|946016:957206|951749_952241_-|WP_039641706.1|DBSCAN-SWA MSLEKILTSDVLITSKTNLKGEIIYANEDFLKYSDYEINEILYKPHSIMRHPDMPRTVFKYLWDNIQLKREVFAFVKNKTKFDDYYWVFANVTASCDTNENILNYYSVRRKPKAEAIKTIEEIYKVLIRKEKEGGIKAGLEELNAVVKSYGMSYNELITQIQK >NZ_CP007778|946016:957206|954076_954436_-|WP_052241448.1|DBSCAN-SWA MKNIAIIGLSPNQNKPSHFVSKYLQDLGYKIYPIYPKEDFILNERVYRNLKEIPFEVDTVVMFRKASFANEIFEDLLSKKIKNFWMQLDIINEEIMQKCKKYGINCVQDRCIKIELQKG >NZ_CP007778|946016:957206|952324_952816_-|WP_039641708.1|DBSCAN-SWA MSQEKILEPDTLITSKTDLKGDIIYANDDFLKYAGYKMNEILYKPHNIVRHPDMPKTVFKCLWDYIQDGKEIFAFVKNKTKQNDYYWVFTNVTASFDNQGNIINYYSVRRKPKREAISTIEQVYKILLEAEKTGGIKAGMEELIKIVNSYGMSYNQLILELQK >NZ_CP007778|946016:957206|952862_954074_-|WP_039641709.1|DBSCAN-SWA MVELNKIYQAKQKIADFVLKTPFVHSSFLSEFLETDVFLKCENLQKTGAYKIRGAYNTIANLTKEQKQAGVIAASAGNHAQGVAISAKKFGIEAVIVMPEATPLLKVSATKNLGAKVILKGDNFDEAYAYALNYAKEHHLNFIHPFENESIIAGQGTLMLEMLDEISDLDMILAPVGGGGLISGVASAAKQINPAIKVIGVSAKGAPAMYESFKSKKIINSKAVRTIADGIAVRDVNKINFDIILECVDDFIQVDDEEIANAVLYLLEKHKITVEGAGASAVAALLHKKIDLKNHKKIGVILSGGNIDVQMLNIIIEKGLFKAFRKMLINVTLVDKPGALSALSDAIKEAQANIVKIDYDRFSTKLDYGDAMISITLETKGKEHQELVRKILYDKGFNFNEIL >NZ_CP007778|946016:957206|947316_947973_+|WP_039618532.1|DBSCAN-SWA MKKLFIFSLIIAGLFLGACSSKKAEDLYNLSSMEWYQQIIKDLQEKNLEAADKHYTSMAAEHIADPLLEQTLLILAQAHISEEEYEMANFYLDEYLNKFGDSKNVAYIRYLKIKAKFDSFAVPNRNQALMLKTIEEINEYNQNYPNVQYNDLIDTMLTKFNLAVFYLDTSIAELYEKKNREQSYEIYKQKIENSDFNKIDMIKPELPWYRKIFEEGIM |
12 | Salmonella_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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