Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_AP010873 | Candidatus Ishikawaella capsulata Mpkobe plasmid pAst, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_AP010872 | Candidatus Ishikawaella capsulata Mpkobe | 0 crisprs | cas3,DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_AP010872
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
134038 : 145786
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP010872|134038:145786|DBSCAN-SWA ATTATAATGCTTTAAAGTCTATGTCATACTGCAGCAAAAATTTAAAAACTTCTGTTTCATCTATCATCTTAATACCCAGTTTTTGAGCTTGTTGAATTTTGTTATAACTCGGGTTTTTCCCATAAATCAATAAATCAGATTTTTTAGAAATATTATTATTTATTTTTGCTCCTAACAAAATAATACGATATTTAAGTTCTTTACGTTGTATTTTAATAAAAGATCCAGTTAATACAATAGTTTTTTTAAAAATTAAATTATTAATCTTATTTATTTTTGAAAAATTAACAGTAGGCCAATATACTCCAGCTTCTTGTATTAATTGATCAATGACCATTCTGTTGTTCTTTTCATGCATAAAATTATATATATATTTAGCAGATATATTTCCAATATTTTTTATTGCAGACAGTTCATTAAAAGTAGCATCCATAATATTTTTTAATGAGCCAAAATGATTAGTTAAATTATTTGCTGTAGCTTCTCCAACTTCTCTAATCCCTAATGCATAAATAAAACGCGCTAATGTCGTTTTTTTTGATTTTTCAATAGAATTGATTAATTTTTTTGCCAATTTATTACTAATCCTGTCTATAGTAATTAAATTAGCAATAGTTAATTGAAAAAAATCGAAGGATGTTTTTAAAAAGTTTTTTTGTATAAGAGCATCTATGATTTTATCTCCTAAACCCTCAATGTTCATTGCTGATCGAGAAGCAAAATGTTTAAGCATCTCTTTTCTTTGTGATTTACAAATTAAGCTACCAGTACAACGAGAGATAGATTTACCTTCAATGCGCTCTACAGTTGAACCACAAATAGGACAGTGCTCAGGAAATAAAATGTTATTTCTATTGATAGTTTTATAGTTTTTAAGTACACTGATAATTTTAGGAATAACATCGCCACTACGCCTGATGACTACTTTATCACCTATAGATAACCCTAATCTTTTTATTTCATTTTCATTATGTAAATTTACATTGCTAATTGTTACTCCTGCTATCTTAACAGGTTTCAGTCTAGCAACAGGTGTTATCACTCCAGTACGACCTATTTGAAAATCTACCTTAAGCACAGTAGATATTTCTTCTTGTGCTGGAAATTTGAAAGCAATAGCCCAGCGTGGGGCTCGGATTGAGTAGCCGATTTGATTTTGCAGCTCTATGGAATCAACTTTGATTACTATGCCATCAATATCAAACCCTAAATTAATACGTTCTTGTTTAATCTTATCATAAAAAGAAAAAACTTCTTCGATATTATTAACTACACTAATATTCTCATGAATGGGTAATCCCCATGATTTAAACAGTTGTAGTTGTTTCCAATGACTATTGGGTAATTTACTATATCCTTCTATAAATCCCGCACTATAACAAAAGAAATTTAATGGTCTTTTAGCTGCAACAGATGGATCAAGTTGACGTAGGCTACCAGCAGCAGCATTGCGAGGATTAGTAAATATTTTACCACCTATTTTATTAGCTTCAGAATTAATTTTTTTCAATCCATCCTGCATCATGATAATTTCACCACGGATGTCTAATAACCTAGGTAGGTTATTTCCTTGAAGATAAATTGGTATCGCACGAATAGTTCGTACATTTTTTGTAATATCTTCACCATAATTTCCATCTCCACGAGTTGCAGCACGAACTAATACACCATTTTCATAAATTATACTGACTGCCAATCCATCGAATTTCATTTCACAACAAAATTTTATAATACTATTACTTTTTTGAAAAAATTTTTGTATCCTTGTATTAAATTTTTTATAATCTTCTTTATTAAAGACGTTATCTAAAGAGAGCATAGGAATGCTGTGTGTTACTTGTTTAAAAAGCATAACAGGTTTATCACCTATACGTTGTGTAGGTGAGTCAGGATGAATTAGTTGTGGATATTGTTTTTCTAACTCATGCAGTTCTAATAATAAGCTGTCGTATTTAGCATCAGATATTTTTGGAGCATCCATTACATAATAAAGATGTGCATGGTAGCGTAAAATAAAACGCAGTTTATTTACTCTTTTTTTTATATATTCCATAATATTTTACAGATAAAAAAATTATTTAGAGAAATCTGTTATAACCGTTACGGTGTTTTTTTATTATTAATACAATAATTTTATATATCTAATTAAATGATAACTAATTTAAATTTGATGATATATCAATCAAAAAATATTAATAGAATATCTTAAATAAGATATACAAAATATAAACTTTATTTAGAGGGCTTAAATAATGAGTAATATATATACTGATAATTCTTTAACAATTGGTAATACTCCGTTAGTACGTCTTAACAAGATAGGAAATGGTAATATTTTAGCAAAAATTGAATCGCGTAATCCTAGTTTCAGTGTAAAATGTCGCATAGGAGCTAATATGATTTGGGATGCCGAGAAACGTGGTATTATCCATGCCAATCGAGACTTAGAATTAATAGAACCCACTAGCGGTAATACTGGAATAGCATTAGCTTATGTAGCTGCTGCTCGTCAATATAAATTAACTCTCATCATGCCAGATACCATGTCTATGGAACGTCGATCTCTACTCCAAGCATTGGGCGCGAAATTAGAATTGACAGATGGTAAAATGGGTATGAAAGGAGCTATAGATAGAGCAGAAATGATTGTTAATAATAATCCTAAATATTATGTGCTTTTACAACAATTCAGTAATCCAGCTAATCCTGAAATACATGAACTAACAACTGGTCCAGAAATATGGAAGGATACTGATGGGCAGATTGATATTTTTATTGCCGGGGTTGGAACAGGAGGTACTTTAACAGGAGTGAGTCACTATATCAAAAATACTAAAAATAAAAAAGATCTGATTAGTGTAGCAGTAGAGCCTACTGATTCTCCTGTTATTAGTCAAGCTTTATCCGGTAAAAAGATTAAAGCAGGTCAGCATAAAATTCAAGGTATTGGTGCTGGATTTATTCCTGCTAATTTAAATCTTAATTTAGTAGATCAAGTAATTACCATTACTAATGAAGAAGCAATAACAACAGCTCATTGTTTAATGAAAAAAGAAGGCATTCTAGCTGGAATTTCTTCAGGAGCTGCGGTAGCCGCTGCTTTAAAAATACAACAAACAAAAAAATTTTCCAACAAAACCATAGTAGTTATCTTACCTTCTTCTGCAGAACGTTATTTAAGCTCTATACTTTTTAAAAGTTAATAAGATTACATGTGACAGACATTATCCTTATTAAGGATTATTATCAAATATTTTTAATAAACATTATAGATATTAATGCATAAAAGAGGATATTTTTATTAAAATAATTGCAGGAAATATGATATTTAAAAGAAATATGAATGCTCTAGTAAGCTATTTTAAAAGAGAGAAATACTCTTATCATTTGTTATGTTATAAATATAAAAGGAAAATTTAATGAATTTCGATAAGATACCAGCTGGTTTAAATTTACCCAAAGATATCTATGTAATCATTGAGATTGGAGCTCATTCTACTCCGGTGAAATATGAAATAAATAAAGAATCTGGCCATTTATTTGTAGATCGTTTTATGTCGACTACTCTTTGTTATCCATGCAATTATGGTTATATAAATAATACCTTATCTTTAGATGGAGATCCAGTCGATGTTTTGGTACCTACCCCACATCCTTTATACTCAGGATCTGTAATACGTTGTCGACCAGTTGGAATGCTAAAAATGACTGATGAATCAGGTAAAGATGTAAAAATAGTTGCTGTACCTCATAATAAGGTTTCAGAAACATATAAATATGTCAAAAATATCACTGATTTACCAGAATTACTACTGAATCAAATTAACCATTTTTTTCAACACTATAAGGACTTAGAAAATAATAAGTGGACGAAAATAGATAGTTGGGCTGATATTAAATCAGCTGAGCTGGAAATTATCAATTCATTTCAACGTGCTCAAGAAAATAGTTAATTAACTAAGAAATGAAGGATATTCAATTGCTCATTAATGGACAAAGACATTAAACATGTTTATGTCTTTCCCAAATAGCATGACCTTAATTAGTTAAATATAACAATCAAAAATTATGCTTTAATAAAATTTATTATATGTTGACAAAATAATGTAGGGTGAGAAAGAAAAGGTGCATGTGCTGCTTTCTGCATTATAATTGATTTGCTATTAGGATACATTTCATCCAATAACCGTGATATGCTTCGTGGTACTAATCCATCAAGAGCGCCGTATATCCTTAGAAAAGGACAAGACACTTGAAGGAGTGCATTTCGTAAGTCGGTATTGCATAAAATATTTAAACTATTTTCCAGTGCTGATAATCGTGGTATGGAACACGATAATATAACTTTATTAAAAGTATGAATATCTTTTATAGCAGTTTGACTACCTATAGTTTGTAATATAAAGAAACGTTCTAGAGTACGATAAAAATTTTTGTTAAGCTGTTTTTTTATCTCAATTAATGTTTGCATTTTAATGCCAGGCCAGTGTACTTTTTTGATAAAGCACGGTGAAGATGCTACAGTAATGAGTCCTTTTATTTTGTGTGGTTGTGTTATAGCTAAATAACTAGCCACTAAACCACCTAAAGACCAACCTAAAACGAAGCTATCTTCAGGAATTATAGGAACTAAAAATTGTGACATTTCTCTCAAAAGAGTTGCTTCATATCTTTGATTATAACCAAAACCAGGTAAATCTATAAGATACACACGAAAATAAGGATTTAACCAGGATAATATGGTATCCCATATTTTTGCATTTAATCCCCATCCATGCAATAATACTAGATTAATAGTACCGTGTCCACACGTATGGTAATAAAATGGTTTCATAAATATTTTCCAAAATTATTTTTTACATATTTAACTTTTTTAAAATGTTTTATTATATTTTTATAAACTATATATAGTTTATAAGTATATATTTTAAATAAAGAGAGAGATTACATGATCAGCATTAGTGCAGTTGCTCAAGAGCATTTTATAAAATTACTAGCAA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GCAGCGACCAGAAGAAATTTAGAAATAACACAAAATTTTTCAGGAACTTCTGAAAATACTTTGGTATCTGTGATAGATAAGACAGTGACTCCCATGGGAAGTCGCATGTTAAAAAGATGGCTAAATATGCCCTTACGTAATAACTTGAAAATTAAGAAACGTCAGGAAGCTGTACTAGAGTTGAAAGAAATAAGTATAGAAGAAGTAAAAAGTTTATTACGACCAGTAGGTGATTTAGAACGGATATTAGCTCGTTTAGCACTATATACTGCTCGTCCAAGAGATTTGTCAGGTATGCGCAATGCCTTAAGACAGTTGCCTAAATTAAAACTAGCCTTAGTAAAAGTACAATCTCCTTTAATAATAGGACTTATGAGACAATTAGGAGAATTCAGTGAACTGAGCAAACTCTTAGAAAAAGCTATAATTGAAACACCTCCACTTCTAATACGTGATGGTGCAGTTATTGCTACAGGATATAGCTCTGAATTAGATAAATTAAGATCTTTATCAGAAGGAACTAATGAATATTTATCTTTATTGGAAATAAATGAACGTAAAAAACTAGGAACAGATTCATTGAAGGTTGGTTTCAATAGAGTACATGGATACTATATTCAAATTAACAGTAATCACAGTCATTTAGTTCCTATCCATTATATCCGTAGTCAAACACTAAAAAATGTTCAACGTTATATTACTCCTGAATTAAAAAAATATGAAAATTCCATGATGACAGCCAGAGCTAGATCATTATTATTAGAAAAAAAACTATATAATGAAATATTAGAATTTATCATACCTTATTTAAAATCGCTTCAATCTTGCTCAGCATCATTATCAGAGATTGATGTATTAAGTAATTTGGCTGAACGTGCATATACTTTGAATTATTGTCGTCCTATCTTAAAAGAAGATCCATGTATTAAAATTATAAATGGTAGACATCCAGTTGTTGAACAGGTAATCAAAGAACCATTCATTGCCAATTCCCTAGAGCTTTCTCCAAACAGACGCATGATTATTATCACTGGTCCTAATATGGGAGGTAAAAGCACATATATGAGACAAGCAGCTTTGATTGTATTACTAGCTTGTGTTGGTAGCTATGTTCCAGCGGAAAAGATGAATATTGGTCCTTTAGATAGAATATTTACACGTATTGGTGCTGCTGATGATTTAGCTTTAGGACGTTCTACATTTATGATAGAAATGATAGAGACAGCTAATATTATGCACAACGCTACGGCAAATAGTTTAGTATTAATTGATGAAATTGGTCGCGGCACTTCAACTTATGATGGTTTATCGCTAGCTTGGTCTTGTGTAGAAAAATTAGCAAAAAGTATTAAAGCAATGACTCTATTTTCAACTCATTATTTTGAATTAACTAAATTAACAAAGACCATAGAAGGAGTCTTTAATATTCATTTTAATGTAATAGAATATGAAAATAATATTATATTTATGCATAAGATACAAGAAGGAGCTAGCAATAAGAGTTATGGATTAGCAGTTGCAGCTTTAGCTGGAATACCTAAGGAAATTATTAAGAATGCTTCAGAAAAGCTGAGACAATTAGAGTATGCATCCGATATAACTAAAGATACCTATCACAATAAGTGTATAGCAAATAATCAATTAACTAATAAAAATTCAATAATACAGAAACTCTCAGACATAAATCCTGATTTGATCTCTCCTTATCAAGCATTAAAGTTGATTTATGATTTAAAATCATTAATATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP010872|134038:145786|143263_145786_+|WP_173401953.1|DBSCAN-SWA MIQQYLSIKSSYPEILLFYRMGDFYELFYEDAKKVSELLDIALTTRGNSAGNPIPMAGIPYHALDNYLNKLMQLGESVAICEQIGETSKCRSLVERKVVRIVTPGTITDESLLPERKDNLIAAIIMNSSGYGYATLDIGSGNFIISEFNKIDIMDSEIQRTNPAELLYPEDFEELKLIKHLPVIRRRPVWEFDLDTACQQLNLHFGTRDLKGFGVEDANLAIRAAGCLIQYVKDTQKTSLPHINSIHIEHQKDIVIIDAATRRNLEITQNFSGTSENTLVSVIDKTVTPMGSRMLKRWLNMPLRNNLKIKKRQEAVLELKEISIEEVKSLLRPVGDLERILARLALYTARPRDLSGMRNALRQLPKLKLALVKVQSPLIIGLMRQLGEFSELSKLLEKAIIETPPLLIRDGAVIATGYSSELDKLRSLSEGTNEYLSLLEINERKKLGTDSLKVGFNRVHGYYIQINSNHSHLVPIHYIRSQTLKNVQRYITPELKKYENSMMTARARSLLLEKKLYNEILEFIIPYLKSLQSCSASLSEIDVLSNLAERAYTLNYCRPILKEDPCIKIINGRHPVVEQVIKEPFIANSLELSPNRRMIIITGPNMGGKSTYMRQAALIVLLACVGSYVPAEKMNIGPLDRIFTRIGAADDLALGRSTFMIEMIETANIMHNATANSLVLIDEIGRGTSTYDGLSLAWSCVEKLAKSIKAMTLFSTHYFELTKLTKTIEGVFNIHFNVIEYENNIIFMHKIQEGASNKSYGLAVAALAGIPKEIIKNASEKLRQLEYASDITKDTYHNKCIANNQLTNKNSIIQKLSDINPDLISPYQALKLIYDLKSLI >NZ_AP010872|134038:145786|139622_140417_-|WP_041068772.1|DBSCAN-SWA MKQYLKLMKKVLEKGAKKNDRTGVGTISIFGAQMIFDLQKGFPLVTTKKCHVRSIIYELLWMLQGDTNINFLKRNKVNIWNKWADNDGNLGPIYGKQWRSWQTVNGRIVDQISQVLEQIKYDPDSRRMIVSSWNVGELSQMALPPCHILFQFYISAGKLSCQLYQRSCDIFLGLPFNIASYALLMHIIAQQCNLKVGNFIWTGGDIHLYNNHIEQAHIQLARKPRSLPKLIINHKSDSLFNYNFKDFKIIGYNPYPPIFAEVAV >NZ_AP010872|134038:145786|138103_138871_-|WP_041068766.1|DBSCAN-SWA MKPFYYHTCGHGTINLVLLHGWGLNAKIWDTILSWLNPYFRVYLIDLPGFGYNQRYEATLLREMSQFLVPIIPEDSFVLGWSLGGLVASYLAITQPHKIKGLITVASSPCFIKKVHWPGIKMQTLIEIKKQLNKNFYRTLERFFILQTIGSQTAIKDIHTFNKVILSCSIPRLSALENSLNILCNTDLRNALLQVSCPFLRIYGALDGLVPRSISRLLDEMYPNSKSIIMQKAAHAPFLSHPTLFCQHIINFIKA >NZ_AP010872|134038:145786|137456_137990_+|WP_041068764.1|DBSCAN-SWA MNFDKIPAGLNLPKDIYVIIEIGAHSTPVKYEINKESGHLFVDRFMSTTLCYPCNYGYINNTLSLDGDPVDVLVPTPHPLYSGSVIRCRPVGMLKMTDESGKDVKIVAVPHNKVSETYKYVKNITDLPELLLNQINHFFQHYKDLENNKWTKIDSWADIKSAELEIINSFQRAQENS >NZ_AP010872|134038:145786|136289_137240_+|WP_041068761.1|DBSCAN-SWA MSNIYTDNSLTIGNTPLVRLNKIGNGNILAKIESRNPSFSVKCRIGANMIWDAEKRGIIHANRDLELIEPTSGNTGIALAYVAAARQYKLTLIMPDTMSMERRSLLQALGAKLELTDGKMGMKGAIDRAEMIVNNNPKYYVLLQQFSNPANPEIHELTTGPEIWKDTDGQIDIFIAGVGTGGTLTGVSHYIKNTKNKKDLISVAVEPTDSPVISQALSGKKIKAGQHKIQGIGAGFIPANLNLNLVDQVITITNEEAITTAHCLMKKEGILAGISSGAAVAAALKIQQTKKFSNKTIVVILPSSAERYLSSILFKS >NZ_AP010872|134038:145786|142418_143129_+|WP_041068781.1|DBSCAN-SWA MFTWTALYNVWFALGTLTVLEIVLGIDNIIFLSLVVSKLPYNMQNRARLLGIIMAMIMRVMLLMCVTFIGRMTHPIFHLFHHEFSIRDLFLFNGGFFLVWKSSREIYETIKDRTISTNDNYQPSFIYVIIQIMFLDIIFSLDSVITAVGLSNNLHIMICAILISVFFMLYAAKIIGEFIEKHPSIKILALTFLNLVGWMLVLESERIFIVKSYIYFAMLFSIIVEILNWLRTNNIY >NZ_AP010872|134038:145786|134038_136090_-|WP_041068758.1|DBSCAN-SWA MEYIKKRVNKLRFILRYHAHLYYVMDAPKISDAKYDSLLLELHELEKQYPQLIHPDSPTQRIGDKPVMLFKQVTHSIPMLSLDNVFNKEDYKKFNTRIQKFFQKSNSIIKFCCEMKFDGLAVSIIYENGVLVRAATRGDGNYGEDITKNVRTIRAIPIYLQGNNLPRLLDIRGEIIMMQDGLKKINSEANKIGGKIFTNPRNAAAGSLRQLDPSVAAKRPLNFFCYSAGFIEGYSKLPNSHWKQLQLFKSWGLPIHENISVVNNIEEVFSFYDKIKQERINLGFDIDGIVIKVDSIELQNQIGYSIRAPRWAIAFKFPAQEEISTVLKVDFQIGRTGVITPVARLKPVKIAGVTISNVNLHNENEIKRLGLSIGDKVVIRRSGDVIPKIISVLKNYKTINRNNILFPEHCPICGSTVERIEGKSISRCTGSLICKSQRKEMLKHFASRSAMNIEGLGDKIIDALIQKNFLKTSFDFFQLTIANLITIDRISNKLAKKLINSIEKSKKTTLARFIYALGIREVGEATANNLTNHFGSLKNIMDATFNELSAIKNIGNISAKYIYNFMHEKNNRMVIDQLIQEAGVYWPTVNFSKINKINNLIFKKTIVLTGSFIKIQRKELKYRIILLGAKINNNISKKSDLLIYGKNPSYNKIQQAQKLGIKMIDETEVFKFLLQYDIDFKAL >NZ_AP010872|134038:145786|138985_139567_+|WP_041068769.1|DBSCAN-SWA MISISAVAQEHFIKLLANQEKGTQIRVFIINPGTIHAECGVSYCPLDTIEQTDIEIKFNNFCVYIDKSSVPYLKGAEIDLSIDNLGSQLTLKAPNAKIAKLADDDNAPLIDRMRYLINTKINPQLANHGGYVNIVEITNENYVILEFSGGCNGCSMINVTLKQGIEKELIKYFPEIKGVCDVTKHQYGQHSYY >NZ_AP010872|134038:145786|141675_142362_+|WP_041068778.1|DBSCAN-SWA MSKPFNLHNPPIDEKTLLLRAQKLAGCTIQELALKAGITVPINLKNNKGWVGILIELNLGAYGNNRAIQDFPHLGIELKTIPINSEGYPLESTFICMASLRGNIGITWNNSYVYHKLTRVLWIPVEGKQNIPLNIRRVGAPVLWSPNAHEEHLLRQDWEELIDMIALGEIENITSSYGEYMQLRSKSANKQIFTEAIGNNGQIILTTPRAFYLKKKFTSSLLARYFLL >NZ_AP010872|134038:145786|140413_141280_-|WP_041068775.1|DBSCAN-SWA MINYITLPKINPIFLSIGPLSFHWYGLMYVIGFIFAKWLALRYVRKPHSDWKEDEVQNLLCLSFIAAIVGGRIGYVLIYRFDLFIKDPLFMFKIWNGGMSFHGGLIGVIFIVFCFSYSTNRDFLKISDFIAPLVPFGLGAGRLGNFINGELYGRVAPNIPWAMLFHNSYNEDLNFVKIHPEYQKMLNIYSVLPRHPSQIYELMLEGVLLFIIIKIFICKPRPRGSTSGVFLISYGLFRIILEFFRQPDPQLGLFHKIISMGQILSIPMIISGVIIVIWSYHYHECYKI |
10 | Ralstonia_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
288743 : 296812
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP010872|288743:296812|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP010872|288743:296812|296452_296812_+|WP_041069065.1|DBSCAN-SWA MNDIAFVFTHAPHGSSSGREGLDLVLASANFVKKIALFFIGDGVLQLVCFQKPEKILARNYIVSFGILPLYDVKHYYACYESVKERGLQIHEPRILSVEIIPSKKIRLILHTFSTIITF >NZ_AP010872|288743:296812|289940_291056_+|WP_041069045.1|DBSCAN-SWA MLDEVYMSRALELAKRGRFTTSPNPNVGCVIVKNNHIIGEGWHQRAGEDHAEINALKKITVNKQAEGATVYVTLEPCSHFGKVPPCCNALINAGIKRVVAAMTDPNPRVNGRGFHLLKQAGIEVKQGLMINQAKMLNRGFIKRMKTGLPFIRLKLAMSIDGRTAMQTGESKWITSVTSRRDVQVMRAESSALLSSGMTIQTDNPSLTVRWKELDEENKKFLSESTLRQPTRIIIDSKNLVTPEHHIINQPGETWLIRHIFDNNKWHNKVKQIIAPLKDGKIDITSLINILGNLEINDILVEAGAKLSGSFIKAHAVDEIIIYIAPKILGTTARGLCELNHLTELKDAFKFKFTDMSQLGKDIRLTLLPDND >NZ_AP010872|288743:296812|288743_289754_+|WP_084121341.1|DBSCAN-SWA MGEKRLVKFQYKGIQVVLPDKRKKYPHCFVAYDFMRWNKISLILSILLLIFSIISIYKKGFNLSMDFTGGTVIEIQLEKPVDLSLLRKVFINSEFTTYKLKKIGYLDIILNLSNHNNYSEEEIGNKILSIINKVTSQRTYIKRIELIGPSIGPDISQSGIAALLIALFCILIYVGIRFEWHLAMGVVLSLIHDIIITLGIVSYFHLEIDLTIIASLMSIIGYSLNDSIVVSDRIRENFRRICCTTPYEIINISLTQVSERTLITSFTNLVVILILLVLGGELLQGFALIMLIGISIGTLSSICVASSIALILGLKHECSVVNKTKKQDNDYPFIYF >NZ_AP010872|288743:296812|291593_292013_+|WP_041069051.1|DBSCAN-SWA MKISARHNARELAVQAIYSWQLSNNNIGEIEDHFLSENNTSDIDINYFKELLVGVISNRNDLDNLMKPYLSRQLKHVGQIEKAILRLSLFELNSRRDIPYRVVINEGIELAKTFAAKDSYKFVNSILDKVAFFLRYKKY >NZ_AP010872|288743:296812|293871_295053_-|WP_041069058.1|DBSCAN-SWA MTNFNRICLTWISWLSYALTGALVIVTGMLIKNIAQYFALPISNISFIFTFLNAGILIAIFLNAWLMEIIPLKSQLIFGFFLMILALTGLIKYHNLMVFSVCMLILGIISGITMSIGTYLITHLYHGKQRGPRLLFTDSFFSMSGVLFPIITGKFLIHNISWYWVYCTIGIIYISIFLLSLIIEFPVIHKITEIGNMKKEKWGIGVFILSISALCYILGQLSFISWIPTYATENMKMNILYAGKLVGNFWLSYMFGMWFFSFLLKFCDLHRVLVVLTGLSTFIMRWCISTNSTNMLLWLMVTLGFSSSAIYTLIITLGSLQTKQPSPKLINCILTCGTVGTMLTFIVTSPIVAKSGIHNALITSNILYLIVFIMCLLMGYFTKHRQNEKICFE >NZ_AP010872|288743:296812|295240_295810_+|WP_041069061.1|DBSCAN-SWA MLLLIDNYDSFTWNIYQYFCELGEKVNVVRNNAISLEEIEKLSIDYLVISPGPGNPDSSGISLAAIHYFAGRLPILGICLGHQVIAQAYGARIICSSYMMHGKTSSVTHNNTGVFYNLNNPLTVTRYNSLIIDFNSLPDCFELTAWSKTNEVCEIMGIRHKTLAIEGIQFHPESILSEQGHQLFKNFLK >NZ_AP010872|288743:296812|291105_291570_+|WP_041069048.1|DBSCAN-SWA MKVIKANILAPDANVAIIIARFNHFINNSLLDGALDVLQRVGQVRDSNITVIWVPGAYELPLIANVLSKSNKYDGIIALGTIMRGSTAHFEHLASEVSKGISDVTINSYMPIAFGILTTDNIEQAIERAGSKAGNKGAEAALTILEMINILKAL >NZ_AP010872|288743:296812|296075_296456_+|WP_041069063.1|DBSCAN-SWA MRYTLLVTGPAYGSQQASSALLFAKKLIELKQDLKNIFFYREGVLNANKFITPASDEYDMVREWQYLHNTFSVKLQICISAALRRGIVDMRGNTPCHISNLQGGFELTGISDLTEAIIHCDRLIQF >NZ_AP010872|288743:296812|292360_293794_+|WP_041069054.1|DBSCAN-SWA MIRIVWLRNDLRIRDNKALYAACSDLISEVRVVFIATPKQWQKHHMSAYQSTFIYKNLIKVQQSLAQCGIPFVYHECNYFEDAIIWLKYYCNKEQVKELFYNCQYEINEHKRDQKLKKILMGHVVCKSFHDYTLLEPGSILNNNSEMYKIYTPFRKKVINTLKKSNVFSLPSPQRYYRNTITVKPIPKFDYPFNESSQEFPLGEESALNLLEIFCSTKITSYATQTNLPSLYSTSYLSPYLAVGIISPRQCLNTLLNHYPNLLENNIAVSWFNQLIWREFYNHTLAKYPFLCMGKPYIDWTNNIVWNTDEEHLIAWQNGYTGYPIIDAGMRQLNSTGWMHNRIRMITASFLVKDLLIDWRIGEKYFMLHLLDGNLALNNGNWQWISSTGNNSWPYFRSFNPTTQGKKIDPNGDFIRKWLPELNEVPSKYIHNPHDWAQHSKYKIDYPLPIIDHNEARQKMLMAFKKAKKCSKRIFST |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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