CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_AP013357	Acinetobacter baumannii NCGM 237	1 crisprs	csa3,cas3,DEDDh,WYL,RT	0	0	9	0

1. NZ_AP013357

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_AP013357_1

• CRISPR_ID: NZ_AP013357_1
• CRISPR_location: 2462359-2462444
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_AP013357_1

Consensus_repeat	Method
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_AP013357_1

>1.1|2462382|40|NZ_AP013357|CRISPRCasFinder
GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP013357_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_AP013357_1

>merge|NZ_AP013357|1|2462359-2462444|CRISPRCasFinder
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA

>NZ_AP013357|1|1|2462359-2462444|CRISPRCasFinder
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA	GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG
CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_AP013357.1|WP_000795915.1|2461121_2461358_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_AP013357.1|WP_000251637.1|2470989_2471133_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_AP013357.1|WP_000983628.1|2463075_2463489_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_AP013357.1|WP_000107128.1|2452642_2453602_-|response-regulator-transcription-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|381147
NZ_AP013357.1|WP_000132044.1|2469580_2469898_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_AP013357.1|WP_002017921.1|2451991_2452105_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_AP013357.1|WP_001136759.1|2470291_2470720_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_AP013357.1|WP_001145693.1|2466764_2468174_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379634
NZ_AP013357.1|WP_000115408.1|2453598_2457063_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274362
NZ_AP013357.1|WP_000482091.1|2468489_2468969_+|CinA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224463
NZ_AP013357.1|WP_144313140.1|2464565_2466710_-|catalase-HPII	unknown	unknown	gnl|CDD|236886
NZ_AP013357.1|WP_000376215.1|2458933_2459389_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224439
NZ_AP013357.1|WP_000937460.1|2451267_2451903_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223836
NZ_AP013357.1|WP_000885229.1|2459545_2460157_+|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199
NZ_AP013357.1|WP_000432330.1|2463630_2464509_+|glucose-1-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|187613
NZ_AP013357.1|WP_000498477.1|2469982_2470204_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_AP013357.1|WP_000108365.1|2469253_2469475_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237171
NZ_AP013357.1|WP_001025680.1|2452214_2452499_-|N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|379642
NZ_AP013357.1|WP_001124846.1|2460227_2460839_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|182350
NZ_AP013357.1|WP_001990047.1|2457228_2458875_+|allantoin-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224374

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_AP013357.1|WP_001145693.1|2466764_2468174_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein	gnl|CDD|379634	pfam14518, Haem_oxygenas_2, Iron-containing redox enzyme. The CADD, Chlamydia protein associating with death domains, crystal structure reveals a dimer of seven-helical bundles. Each bundle contains a di-iron centre adjacent to an internal cavity that forms an active site similar to that of methane mono-oxygenase hydrolase.	1.51279e-18
NZ_AP013357.1|WP_000107128.1|2452642_2453602_-|response-regulator-transcription-factor	gnl|CDD|381147	cd19920, REC_PA4781-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of cyclic di-GMP phosphodiesterase PA4781 and similar domains. Pseudomonas aeruginosa cyclic di-GMP phosphodiesterase PA4781 contains an N-terminal REC domain and a C-terminal catalytic HD-GYP domain, characteristics of RpfG family response regulators. PA4781 is involved in cyclic di-3',5'-GMP (c-di-GMP) hydrolysis/degradation in a two-step reaction via the linear intermediate pGpG to produce GMP. Its unphosphorylated REC domain prevents accessibility of c-di-GMP to the active site. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	6.21476e-55
NZ_AP013357.1|WP_000115408.1|2453598_2457063_-|response-regulator	gnl|CDD|274362	TIGR02956, sensor_protein_TorS, TMAO reductase sytem sensor TorS. This protein, TorS, is part of a regulatory system for the torCAD operon that encodes the pterin molybdenum cofactor-containing enzyme trimethylamine-N-oxide (TMAO) reductase (TorA), a cognate chaperone (TorD), and a penta-haem cytochrome (TorC). TorS works together with the inducer-binding protein TorT and the response regulator TorR. TorS contains histidine kinase ATPase (pfam02518), HAMP (pfam00672), phosphoacceptor (pfam00512), and phosphotransfer (pfam01627) domains and a response regulator receiver domain (pfam00072). [Signal transduction, Two-component systems].	3.64852e-57
NZ_AP013357.1|WP_000482091.1|2468489_2468969_+|CinA-family-protein	gnl|CDD|224463	COG1546, CinA, Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) [General function prediction only].	5.88094e-21
NZ_AP013357.1|WP_144313140.1|2464565_2466710_-|catalase-HPII	gnl|CDD|236886	PRK11249, katE, hydroperoxidase II; Provisional.	0
NZ_AP013357.1|WP_000432330.1|2463630_2464509_+|glucose-1-dehydrogenase	gnl|CDD|187613	cd05355, SDR_c1, classical (c) SDR, subgroup 1. These proteins are members of the classical SDR family, with a canonical active site tetrad and a typical Gly-rich NAD-binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	1.69173e-160
NZ_AP013357.1|WP_000937460.1|2451267_2451903_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223836	COG0765, HisM, ABC-type amino acid transport system, permease component [Amino acid transport and metabolism].	2.9036e-64
NZ_AP013357.1|WP_000885229.1|2459545_2460157_+|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.70108e-23
NZ_AP013357.1|WP_000376215.1|2458933_2459389_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224439	COG1522, Lrp, Transcriptional regulators [Transcription].	8.76675e-40
NZ_AP013357.1|WP_000108365.1|2469253_2469475_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|237171	PRK12678, PRK12678, transcription termination factor Rho; Provisional.	5.30417e-06
NZ_AP013357.1|WP_001025680.1|2452214_2452499_-|N-acetyltransferase	gnl|CDD|379642	pfam14542, Acetyltransf_CG, GCN5-related N-acetyl-transferase. This family of GCN5-related N-acetyl-transferases bind both CoA and acetyl-CoA. They are characterized by highly conserved glycine, a cysteine residue in the acetyl-CoA binding site near the acetyl group, their small size compared with other GNATs and a lack of of an obvious substrate-binding site. It is proposed that they transfer an acetyl group from acetyl-CoA to one or more unidentified aliphatic amines via an acetyl (cysteine) enzyme intermediate. The substrate might be another macromolecule.	1.0722e-24
NZ_AP013357.1|WP_001124846.1|2460227_2460839_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit	gnl|CDD|182350	PRK10276, PRK10276, translesion error-prone DNA polymerase V autoproteolytic subunit.	2.36027e-39
NZ_AP013357.1|WP_001990047.1|2457228_2458875_+|allantoin-permease	gnl|CDD|224374	COG1457, CodB, Purine-cytosine permease and related proteins [Nucleotide transport and metabolism].	9.5172e-23

Protein sequences

>NZ_AP013357.1|WP_000795915.1|2461121_2461358_+|hypothetical-protein
MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS
>NZ_AP013357.1|WP_001124846.1|2460227_2460839_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit
MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR
>NZ_AP013357.1|WP_000885229.1|2459545_2460157_+|LysE-family-translocator
MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI
>NZ_AP013357.1|WP_000376215.1|2458933_2459389_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator
MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG
>NZ_AP013357.1|WP_001990047.1|2457228_2458875_+|allantoin-permease
MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA
>NZ_AP013357.1|WP_000115408.1|2453598_2457063_-|response-regulator
MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ
>NZ_AP013357.1|WP_000107128.1|2452642_2453602_-|response-regulator-transcription-factor
MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH
>NZ_AP013357.1|WP_001025680.1|2452214_2452499_-|N-acetyltransferase
MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK
>NZ_AP013357.1|WP_002017921.1|2451991_2452105_+|hypothetical-protein
MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS
>NZ_AP013357.1|WP_000937460.1|2451267_2451903_-|amino-acid-ABC-transporter-permease
MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT
>NZ_AP013357.1|WP_000983628.1|2463075_2463489_+|hypothetical-protein
MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII
>NZ_AP013357.1|WP_000432330.1|2463630_2464509_+|glucose-1-dehydrogenase
MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG
>NZ_AP013357.1|WP_144313140.1|2464565_2466710_-|catalase-HPII
MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEEEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA
>NZ_AP013357.1|WP_001145693.1|2466764_2468174_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein
MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN
>NZ_AP013357.1|WP_000482091.1|2468489_2468969_+|CinA-family-protein
MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR
>NZ_AP013357.1|WP_000108365.1|2469253_2469475_+|hypothetical-protein
MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR
>NZ_AP013357.1|WP_000132044.1|2469580_2469898_+|hypothetical-protein
MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI
>NZ_AP013357.1|WP_000498477.1|2469982_2470204_-|hypothetical-protein
MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF
>NZ_AP013357.1|WP_001136759.1|2470291_2470720_-|hypothetical-protein
MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS
>NZ_AP013357.1|WP_000251637.1|2470989_2471133_-|hypothetical-protein
MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1081101 : 1127741	58	Mannheimia_phage(17.24%)	transposase,tail,head,plate,integrase	attL 1082071:1082087|attR 1108387:1108403
DBSCAN-SWA_2	1210787 : 1276213	80	Acinetobacter_phage(95.83%)	transposase,terminase,capsid,integrase	attL 1225577:1225593|attR 1272560:1272576
DBSCAN-SWA_3	1380819 : 1414779	28	Streptococcus_phage(22.22%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	1579964 : 1673773	111	Acinetobacter_phage(95.06%)	transposase,capsid,terminase,holin,integrase	attL 1618713:1618772|attR 1670172:1671354
DBSCAN-SWA_5	2175566 : 2273007	111	Acinetobacter_phage(26.09%)	protease,portal,capsid,terminase,integrase,head,holin,tRNA,tail	attL 2224291:2224312|attR 2262894:2262915
DBSCAN-SWA_6	2564080 : 2605096	36	Faecalibacterium_phage(40.0%)	transposase,plate	NA
DBSCAN-SWA_7	2834188 : 2864439	36	Acinetobacter_phage(93.55%)	transposase,terminase,capsid	NA
DBSCAN-SWA_8	2867856 : 2880204	24	Acinetobacter_phage(95.65%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_9	3231977 : 3340305	103	uncultured_Caudovirales_phage(22.86%)	transposase,tail,portal,capsid,terminase,head,holin,tRNA,plate,integrase	attL 3231970:3232029|attR 3318225:3319313

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_AP013357|1081101:1127741|DBSCAN-SWA
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MVITEQNGARILNALSTSLKLVFKNAFDAAPSNYAKVAMEVPSTGASNTYAWTDRFPALRKWIGDKAVKKLTGHAYILVNEDYEATVEVDRNDIEDDNLGMYTIETQAAGQSAKEWPDDLVFTVLTKGFEEKCYDDKPFYSTDHKVGEGKNAKVFSNKLTKALSVSTLAAAQASLGAAMTMMQELKDSEGKPLNLKANLLVVPPALREVANALMTTDRLEDGKVNPYKGEFEVLVCPWLETKTEWHLLDASRPVKPIVYQPRKKPNFVAQFDMNSDSVFMRKKYRYGVEARGVAGFGLWQMAVGSTGTQA
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MSNNPLHESLEPDFFSDVPAVLLKYQQKWVSDKTPLKVAEKSRRIGLTWAECADATLECASDRNAGGQNVYYVGYNKDMTVEFIQACAMWARVYDLAASELEEGIWEDGDKQIQTYIIRFPNSGFRIEALTSRPSNLRGRQGRLIIDEAAFHDDLPGLLKAALAFLILGGCVRVISTHEGEDNPFNELINEIRSGKRKGSVHRITFSDAVAQGLYSHTVCLRKGIAYDPDEEKEWVDDVYGFYGDAANEELDVVPSKGGGRWLPHSLLESKKDSTVPVIRFHAPKGWDDFSNVSEEARNAEVLEFFNEHLKPLIEALPKKTTSYYGLDFARKVNACSFWPLVEQTNTRKRIPFLFEMFKVPYKQQEEFLKLIVAILPNFSKGAHDAGGNGGYLAEAMQVIYGERIEAIMLTEAWYRENTPHFKASLEDGDIENMPADQDVIEDHRAFVMVNGVARIPAQGKSNSNNKDRHGDSAIAHLLADYASNHPSAPIEFIPLPSREEIETNPDDYDGWVDTAGCW
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MSIPAGIKTPGVYTDVNINTLRTGLPANEQKVLFVTLDVLSGQFTPVDVYDTAGADSKFGKNSQAGRMIKAAVKTNRLVNAQAIALAVDGVRTQKALHTESGDAVLAEDGALIEP
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MSGSNSTVSLTLQIRGQQAAQEMKRISDQQVQATTKINTQWTQIGSAQAKFVNTVRAGTRETLNTARAGDQLLRTNKLLEGVLRQQGALLKQQVGSAQQLANWTKQVEQSSKRTHQSTQQTMSLWQKGTAVTGGAIAGGMYFSNALQKPRDYDQQLTYIAATATGGQGMAPEARLAARGQLNEYIKAAVRGGGGTREDAAEAANTLIASGKYELNNVAPALNTAVKTAFATGAMATDAATLTTRMQDFGITDLQRGHDIAVRGGQLGSFEYKDMSKWLAQQMAAASAVGYSGEKGLVELVAMNQVAMKTAGTADEAGNNVVNLLAKLSSREFSKSISDAVIAQSGDPTKSDGKKKPKQVFDWNTYAIQQREQGVYGVEAFVKLLERQLAGNAQYTKLQKQAASSNSVTRKAALEDMSNIAMGSEIGNIIADRQALMAALSVVYNKDTLNDLRKQLPNASGTVAADFDMVSRTEWAKDQAMNQEKLFAQSKAYDAISESLGGLKDTITKSAAENENLAGVTYGAAVAVGGLALAAGAAAFTLKTMGGIKTPDLPSTTGGLASKASNAAKIAGLVGAAYTGYQIFKPIDDAGYSMVSDLLAKVGIGSGGERPDFVQQAIEQSKAQQASAEEKSSQLIAEQQKQNQLSQEMINKINTLINVTGQNKTINFSGGLLGAISENAAAEEKRHGASNVPFYLQRH
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MKTRCPACGATNSLDALLGHGEASKAFVASLNLVGDLATPLVKYLGMFRSQNRELTFERTAKLLGEIAADINAQQIKRGHHSYPAPKAAWIWAINTMLERRDQGKLQLPLKNHGYLYEVISSFKPENAPAPTERRAAVPLEKTEAERAAEQAEHERQKHIRPNFSVTEMLGFTKMNEKQPERGLKNIPKEQLMAHVVKHKHPDETLEQCYQRLKAAETQEQTN
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MKKFILVVGLLVLTGCSKEKVAEQGEIQAASEAQVSQNKWQYHHEKNPIDDSFTVLAYVESDEPLKLDGIQTRPSLVLRCQENKFDVYFALKNSVDSVGRDYKSSNITLRFDAEKAVDYSMRRGDDLQTLFFSNPIEMIDPLLKHDKLALKFTTTNKNVAFVSFDIRGLQYVISPLENACKLK
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MTIGARLKEERERLGYTQPVFAELAGTTKKSQIDYEKDLTQPKAGYLAAIAEVGADIGYIVTGNKSPQLQNSDFAYEFDLVNVYDVSVSAGDGAVCLGETEPTSRLAFRKDWLARHGLYAKDLVIVYAKGDSMEPTIHDKEPLLINTIDKELTDGFIYVVRNHENFWVKRVQRQFNELLLLSDNEKYLPMKLDLNESTDVEIIGRWIPPSRGTFY
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MERIFVDGNLPVAIELKQAKKTIKCTKYVMSSLTALEYVEAQAKITGLQYIAISDIVAMLKLVDEAGNQYEPTYEDIAQTSSFNLIHFNEKKAELEAKVKAAN
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MSCTVFKSTNPVDQSINVFPPKGYISSVRIVRNYDVENGDIFKFRNDNTKEFKVVGGTITCPSQGVTTPVTEVVLGTVRDIFLKLDERREFAYLAWKDKDRIMGVSSDDGSAFYGAIADYSLGLHAEDVVSINGICISSGSFNQRVNSWDVSEVIDAGFTFAEAINFDREINWYAPKIQWMNAFLLNAKKFNKDITIRGAKPKSMSSFLEGASSFNSKINIDTSECDNFSGMFVAASKFNQPINFNFGKAVLLNTFLSGASSFNQPIDFGNMPLLTEAYYLFADSKMNSPIKFNAPNLTDASGWFSGNTVFNSTITGSFRSVASMAFMFWYASSFNQPINDWDIRNVSNFMGFLTAATSFNQDLSSWPAKFNVNANIEGVSVAPNWSTENYDKYLNALWLDVGTTRRNEWANGTSPRVVLASVKRSAASKDAVSGLTGAGWTIIDGGLA
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MTIQLEPYQIFLILSTVISTVWGMFKLLGNQISNSIQQNFESTNQKIEEVSRQHLKGQEDLRKLEREFLQFQADMPFRYIARDDYIRGQTVIEAKLDAVAEKLEKVQIKQGINP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_010326927.1|1081101_1082127_-|transposase	IS30 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	8.8e-26	30.7
1082071:1082087	attL	NA	NA	NA	NA
WP_001023216.1|1082362_1083130_+	5'/3'-nucleotidase SurE	A0A1B1ITZ2	uncultured_Mediterranean_phage	2.0e-54	45.3
WP_000550750.1|1083244_1084075_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	A0A292GJG6	Xanthomonas_phage	7.6e-12	45.7
WP_000886770.1|1084176_1085106_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_000192292.1|1085163_1087782_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_000428302.1|1087948_1090138_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_001242511.1|1090140_1090542_+	lactoylglutathione lyase	NA	NA	NA	NA
WP_001984712.1|1090675_1091647_+	bile acid:sodium symporter	NA	NA	NA	NA
WP_001200845.1|1091840_1092065_+	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_000263028.1|1093112_1093562_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041114745.1|1093681_1094119_-	regulatory protein GemA	A0A0C4UQU3	Shigella_phage	2.6e-11	32.6
WP_000905312.1|1094115_1094328_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000855699.1|1094321_1094609_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041114746.1|1094605_1095319_-	DUF2786 domain-containing protein	A0A2H4JCP9	uncultured_Caudovirales_phage	5.0e-28	39.2
WP_001043038.1|1095621_1095909_-	HU family DNA-binding protein	A7KV42	Bacillus_phage	2.4e-21	61.8
WP_000288872.1|1095913_1096081_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000101704.1|1096103_1096607_-	host-nuclease inhibitor Gam family protein	A0A2K9VGT9	Faecalibacterium_phage	7.6e-15	33.5
WP_000857165.1|1096606_1097278_-	hypothetical protein	A0A2H4JFV8	uncultured_Caudovirales_phage	9.5e-29	48.0
WP_041114747.1|1097267_1097498_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000752926.1|1097494_1097713_-	TraR/DksA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_000810199.1|1097901_1099179_-	AAA family ATPase	Q6QIE1	Burkholderia_phage	3.6e-93	47.3
WP_000184212.1|1099188_1100940_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	Q5ZR04	Pseudomonas_phage	1.1e-100	36.5
WP_000064374.1|1100942_1101827_-	DUF3102 domain-containing protein	Q6QID9	Burkholderia_phage	2.8e-28	34.5
WP_001985437.1|1101839_1102136_-	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_001249250.1|1102119_1102287_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000550335.1|1102330_1102537_-	DNA-binding protein	A0A0S4L0D0	Pseudomonas_phage	3.0e-10	54.5
WP_000151899.1|1102637_1103285_+	hypothetical protein	A0A2I7S9A5	Vibrio_phage	6.1e-25	35.5
WP_002008043.1|1103284_1103836_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000028719.1|1103919_1104420_+	glycoside hydrolase family 108 protein	A0A0M3LSH2	Mannheimia_phage	8.8e-56	65.8
WP_001037051.1|1104416_1104800_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000155183.1|1104796_1105141_+	hypothetical protein	Q6QIC4	Burkholderia_phage	2.6e-14	40.4
WP_000006949.1|1105137_1105449_+	hypothetical protein	A0A0S4L0A3	Pseudomonas_phage	3.8e-25	52.0
WP_000090430.1|1105457_1106003_+	DUF3486 family protein	Q6QIC2	Burkholderia_phage	1.4e-43	49.7
WP_041114748.1|1106002_1107562_+	hypothetical protein	A0A2H4JF57	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-156	55.5
WP_000968697.1|1107646_1107850_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000035039.1|1107827_1108097_-	DUF1883 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000250507.1|1108319_1109939_+	DUF935 domain-containing protein	A0A0M5MS00	Ralstonia_phage	1.7e-103	40.3
1108387:1108403	attR	NA	NA	NA	NA
WP_002122178.1|1109938_1111189_+	phage protein F	I6PBD2	Pseudomonas_phage	3.8e-71	37.6
WP_002122250.1|1111185_1111689_+	phage virion morphogenesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_002122168.1|1111777_1112863_+	hypothetical protein	A0A0M5N0Q6	Ralstonia_phage	1.4e-34	32.6
WP_000221867.1|1112859_1113279_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000237123.1|1113282_1114215_+|head	Mu-like prophage major head subunit gpT family protein	A0A2P9JZJ2	Alteromonadaceae_phage	7.8e-90	55.4
WP_024436661.1|1114226_1114655_+	DUF1320 domain-containing protein	A0A0M3LP98	Mannheimia_phage	7.4e-19	37.6
WP_045126800.1|1114693_1115263_+	DUF1834 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_002004678.1|1115262_1115610_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041114749.1|1115620_1117966_+	CotH kinase family protein	H7BUR7	unidentified_phage	9.4e-07	22.8
WP_041114750.1|1117984_1119334_+	BspA family leucine-rich repeat surface protein	NA	NA	NA	NA
WP_000382697.1|1119333_1119549_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002004681.1|1119545_1120355_+	hypothetical protein	A0A2H4JFT7	uncultured_Caudovirales_phage	2.2e-16	28.7
WP_001287673.1|1120480_1120858_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000439581.1|1120859_1121171_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_024436600.1|1121200_1121434_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041114751.1|1121437_1123534_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A0M3LPB6	Mannheimia_phage	8.9e-41	31.8
WP_024436602.1|1123621_1124797_+	DNA circularization N-terminal domain-containing protein	F6MIL2	Haemophilus_phage	1.9e-16	21.6
WP_001153724.1|1124786_1125842_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000973841.1|1125838_1126321_+|plate	phage baseplate assembly protein	A0A0M3LPA3	Mannheimia_phage	9.8e-12	39.3
WP_001273710.1|1126328_1126691_+	phage GP46 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000331141.1|1126694_1127741_+|plate	baseplate J/gp47 family protein	A0A0M3LQN4	Mannheimia_phage	6.2e-27	27.4

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_AP013357|1210787:1276213|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_000893683.1|1211598_1213098_+	xanthine dehydrogenase small subunit	A0A0P0IVM8	Acinetobacter_phage	6.1e-286	100.0
WP_001076817.1|1213099_1215475_+	xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit	A0A0P0I429	Acinetobacter_phage	0.0e+00	100.0
WP_001164226.1|1215481_1216465_+	xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC	A0A0P0IKN7	Acinetobacter_phage	2.0e-189	100.0
WP_000066126.1|1216475_1217171_-	Smr/MutS family protein	A0A0P0IDT4	Acinetobacter_phage	5.8e-122	100.0
WP_000608304.1|1217180_1217987_-	indole-3-glycerol phosphate synthase TrpC	A0A0P0IR83	Acinetobacter_phage	7.9e-147	100.0
WP_001982145.1|1217996_1219046_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	9.8e-190	100.0
WP_000281127.1|1219401_1222134_+	TonB-dependent receptor	A0A0P0I887	Acinetobacter_phage	0.0e+00	99.9
WP_000960548.1|1222213_1224913_+	M1 family metallopeptidase	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	0.0e+00	100.0
WP_000566784.1|1225008_1225584_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.2e-110	100.0
1225577:1225593	attL	NA	NA	NA	NA
WP_000529848.1|1225707_1225977_-	hypothetical protein	A0A0P0J067	Acinetobacter_phage	8.7e-42	100.0
WP_016062494.1|1225977_1226331_-	hypothetical protein	J7I0Y4	Acinetobacter_phage	1.2e-62	100.0
WP_050514046.1|1226327_1226666_-	hypothetical protein	J7HXR6	Acinetobacter_phage	3.4e-27	74.4
WP_000654844.1|1226666_1226918_-	hypothetical protein	A0A0P0IVN4	Acinetobacter_phage	1.4e-38	98.7
WP_041114755.1|1226919_1227996_-	hypothetical protein	A0A0D4DBR8	Acinetobacter_phage	1.3e-136	72.6
WP_004793763.1|1227992_1229114_-	ATP-binding protein	A0A0D4DBX7	Acinetobacter_phage	1.3e-211	99.7
WP_002134806.1|1229125_1229449_-	hypothetical protein	A0A0P0IRC4	Acinetobacter_phage	1.5e-56	99.1
WP_004793760.1|1229451_1229892_-	hypothetical protein	A0A0N7IRE9	Acinetobacter_phage	3.1e-73	97.2
WP_000065151.1|1230088_1232356_-	N-6 DNA methylase	J7I0U9	Acinetobacter_phage	0.0e+00	100.0
WP_002053039.1|1232488_1232704_-	hypothetical protein	A0A0P0I8I5	Acinetobacter_phage	1.6e-30	98.6
WP_025468028.1|1232718_1233483_-	helix-turn-helix domain-containing protein	J7I4M9	Acinetobacter_phage	7.0e-137	96.0
WP_000165919.1|1233560_1233746_+	hypothetical protein	J7HXD2	Acinetobacter_phage	1.4e-27	98.4
WP_000041063.1|1233755_1234112_+	hypothetical protein	J7I452	Acinetobacter_phage	8.8e-58	98.3
WP_002059537.1|1234167_1234443_+	hypothetical protein	A0A0P0IVP2	Acinetobacter_phage	4.4e-41	98.9
WP_001084131.1|1234439_1234736_+	hypothetical protein	J7HXM0	Acinetobacter_phage	1.4e-48	98.0
WP_004834286.1|1234732_1235089_+	hypothetical protein	A0A0D4DBI9	Acinetobacter_phage	9.7e-57	98.3
WP_033503110.1|1235147_1236041_+	hypothetical protein	A0A0D4DBT2	Acinetobacter_phage	3.5e-156	97.6
WP_000993074.1|1236037_1236808_+	ATP-binding protein	A0A0D4DBZ2	Acinetobacter_phage	1.2e-147	99.6
WP_002053068.1|1236804_1236939_+	putative phage replication protein	A0A0D4DCC7	Acinetobacter_phage	8.1e-17	95.5
WP_033503114.1|1236925_1237273_+	hypothetical protein	A0A0P0I8A5	Acinetobacter_phage	4.6e-35	59.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_AP013357|1380819:1414779|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MTNSNDSVTLRLMTEHDLAMLYEWLNRSHIVEWWGGEEARPTLADVQEQYLPSVLAQESVTPYIAMLNGEPIGYAQSYVALGSGDGWWEEETDPGVRGIDQSLANASQLGKGLGTKLVRALVELLFNDPEVTKIQTDPSPSNLRAIRCYEKAGFERQGTVTTPDGPAVYMVQTRQAFERTRSVA
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MIVLGLETSCDETGLALYDSELGLRGQVLYSQIKLHAEYGGVVPELASRDHVRKLIPLMNQLLEQSGVKKQEIDAVAYTRGPGLMGALMTGALFGRTLAFSLNKPAIGVHHMEGHMLAPLLSSQPPEFPFVALLVSGGHTQLMAAHGIGQYELLGESIDDAAGEAFDKVAKMMNLPYPGGPNIAKLALSGDPLAFEFPRPMLHQGLDFSFSGLKTAVSVQLKKLNGENRDADIAASFQEAIVDTLVKKSVKALKQTGLKRLVIAGGVSANLRLREQLETSLAKIKAQVYYAEPALCTDNGAMIAFAGYQRLKAGQHDGLAVTTTPRWPMTELTIPE
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MIGQQRNILATLGIDVWIPRTQVCQKNNAHTLWRDQVVEPHESITVPTIDVPAFEQKNTQPQVFEIPKVVEEPPIVVAEVSQPEILVEKPKVIAQETITPFELQAYCLEKCVIFVDVTALETEEKQLWVNIQKAKVGQYSELRWPFPLAAYQDQRGVGSYIQGFLDAVATEKKILCLGKCTYIQHANIIHLASLKEMLDKPLLKKRLWQLMQDNNE
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MTNGLEDFSYDEVSTENSTQSEQAKKVLGHFIQGRIVSKTARKQPVYNPATGEISKEVEIADAQTVNEAVQAAEQAFPAWRDTPVIKRARVMFKFKQLLEQNAEKICALIGQEHGKISHDAQGELQRGIENVEYACGAPELLKGEFSKNVGPDIDSWSEFQPLGVVAGITPFNFPAMVALWMFPMALVCGNCFILKPSEKAPSVVLFLAELLKKAGLPDGVFNVVNGDKEAVDALLHHPRIQAVSFVGSTPIAEYIYRTATSTGKRCQALGGAKNHAIIMADADIDNVVTSLLGAAFGSSGERCMALSVAVAIGDEVADVVIDKLTQEMKKLKFGHYADASNDFGPLITQAHKDKVQAYIQSAEQQGAKIVVDGRDAKPAGYEKGFFVGPTLIDQVTPNMTSYQQEIFGPVLQVMRVNTMQEAMQLINDHEYGNGTCIYTRDGEAARYFSSHIQVGMVGINVPLPVPVAYHSFGGWKRSLFGDLHAYGPDGVRFYTRRKTITQRWPSAQVREAKQFSMPTLN
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MSLARNATASQSPTQTNGYERHQPDQTLLYQLVEQHYPAFKASLEAQGQHLPRYIQQEFNDLLQCGRLEYGFMRVRCEDCHHERLVAFSCKRRGFCPSCGARRMAESAALLIDEVFPKEPIRQWVLSFPFQLRFLLARHPQLMGQVLSIVYRTLSTHLIKKAGYTKASAQTGSVTLIQRFGSALNLNVHYHMLFLDGVYAEDDYGKQRFHRVKAPTYDELNTLAHTLSHRIARCMEKRGILERDAENTWLTLEEGEDDTLTQLHGASVTYRIAVGPQQGRKVFTLQTLPGREDKADSSSRVANHAGFSLHAGVMAEAHQRDKLERLCRYISRPAVSEKRLALTANGQVRYELKTPYRNGTTHVIFEPLDFIAKLAALVPKPRVNLTRFHGVFAPNSKHRVQVTPAKRGKKPDKSEGLDTNWRDKSPAERHRAMTWMQRLKRVFNIDIEVCEHCGGHVKVIASIEDPKVIEQILKHLKQKTAKANAAKQRELPPERAPPLTPSLFDPSQSRLFD
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MLYVVQGKDNPKLWKNIVSVSELHLINETSLLNNNYTASIRYRSQDTPVKVTQNENGYIFEFSAPQWAPAVGQSLVLFQENECLGGGVISEIH
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MLTMNVKAMLADFLTFVTPKSMHKARFSVLLDAVTALAKDACCTVTAIGRAMPGSSDKVSIKRADRLLNNPNLQRELPLIYAALTASIVGHKTKPMILVDWSNADTAKRHFILRASIAADGRALTLLQKIAAAEDYTCPHLHGAFLKQLKAMLPKDCKPVIVTDAGFKVPWLKQVRKLGWHYVARVRGNVKLKLAEQDKFISVNQLYRQAKKDPKSVGKIMLAQTQHYETQAVLVGKGYKLLKRDKNKTYKEPWLLVSSLADCHGYADKIAKCYSSRMQIEESFRDQKSHRYGLGSDLHGTKKKSRLEILLLLAALVNWFHYLLGSAAEKAGLHLRYQANTVKNRRVLALNFLGILLCKEPKQRIRRQYYQQGLKQILQWVVQWDWAVIKQADS
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MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIINATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM
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MFPNQLTFYFNYRISGDTSGGLQLFGLIGLIYGPIIFALTMVLLRLYTIEFKDFLERQDNS
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MTTLKNQITDALKTSMRAKDMATVTVLRSLQAAIKQIEVDERIELDDAQVLAVIEKQIKQRKESIKAFEGAGRDDLASKEQAEAEVLSQFLPEAMTEEELDSLIEQTIAAQEATSMKDMGKVMNSLRPIIAGRADPAQVSAKIKAKLA
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>NZ_AP013357|1380819:1414779|1386574_1386790_-|WP_001136722.1|DBSCAN-SWA
MPQVKLKEGEPVDVAIRRFKRSCEKAGVLADVRKREFYEKPTQERKRKKAAAVKRYQKKLARESVRTTRLY
>NZ_AP013357|1380819:1414779|1413219_1414779_-|WP_000753551.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKKTPQSLPDDVELLKKMLLEQTQKLERKLAQKDKRIAKLERVNQQLSDKLQQLLERYNLKKYQKFSPSSETYEGDGEVLNEAEQLIEDESVATEPDNQTTESAEKAAKPRRPRIAPELPRVDVIHDIDDKTCTCCGHALHQMGEEVSEQLEFVPAQIRVLRNVRLKYSCRQCETNGTKVEIKIADVPPAVIPKSMATPSLLAQIISSKMHYGLPLYRQEQLFNQAGIELSRQTMSRWLISCAEKLKPLLALMKAELLKQPVLWADETTVNVLDVEKSTCYMWVYGCGLEQSTGPKLVLFDYQDSRSSIHPTDFLAGFAGYLQVDGYAGYEKTHATLVGCWAHARRKFVEAQKAQGKGKTGKADVALNHIQKLYALESQLKTVPPDKKYDARQTLAKPLLEQFKSWLDKSSESVTKESLLGAAITYSLNQWPKLMRYLDDGRLNIDNNRAERAIKPFVIGRKAWLFANTKSGAQASAALYSLVETAKINGLEPYDYLCRLLTELPKANTHEQLQQLLPY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000665946.1|1380819_1382709_+|protease	M48 family metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_000580181.1|1382809_1383460_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000758326.1|1383471_1384437_+	D-glycerate dehydrogenase	M1NSB9	Streptococcus_phage	3.8e-15	28.3
WP_002000697.1|1384583_1386011_+|protease	M48 family metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_000209410.1|1386101_1386548_-	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	1.9e-17	40.8
WP_001136722.1|1386574_1386790_-	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_000636263.1|1386935_1387946_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	2.1e-125	66.3
WP_000744455.1|1387948_1389052_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000190819.1|1389155_1390037_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_000461855.1|1390215_1391724_+	DUF3336 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000912071.1|1391710_1392514_+	protein kinase	B6VC32	Iragoides_fasciata_nucleopolyhedrovirus	1.0e-05	33.9
WP_000802863.1|1393140_1394058_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_001989184.1|1394155_1395538_+	aspartate aminotransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000181284.1|1395648_1397217_+	CoA-acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_001067858.1|1398537_1399242_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
WP_014454105.1|1400271_1400826_+	aminoglycoside N-acetyltransferase AAC(6')-Ib'	NA	NA	NA	NA
WP_002075262.1|1400918_1401551_+	type B-3 chloramphenicol O-acetyltransferase CatB8	A0A2R8FE91	Brazilian_cedratvirus	3.5e-25	40.1
WP_001206316.1|1401608_1402400_+	ANT(3'')-Ia family aminoglycoside nucleotidyltransferase AadA1	NA	NA	NA	NA
WP_000679427.1|1402563_1402911_+	quaternary ammonium compound efflux SMR transporter QacE delta 1	NA	NA	NA	NA
WP_000259031.1|1402904_1403744_+	sulfonamide-resistant dihydropteroate synthase Sul1	NA	NA	NA	NA
WP_000050481.1|1404148_1405690_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_000359986.1|1407088_1407862_+	ArmA family 16S rRNA (guanine(1405)-N(7))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_077252464.1|1407842_1408124_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002026779.1|1408343_1408529_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002001451.1|1408577_1409762_+|transposase	IS4-like element ISEc29 family transposase	A0A0F7LAS3	uncultured_marine_virus	4.5e-50	35.4
WP_000052512.1|1410160_1411636_+	ABC-F type ribosomal protection protein Msr(E)	A0A1B0RXA0	Streptococcus_phage	2.3e-160	59.0
WP_000155092.1|1411691_1412576_+	Mph(E) family macrolide 2'-phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_000753551.1|1413219_1414779_-|transposase	IS66-like element ISAba24 family transposase	S5VTD3	Leptospira_phage	4.0e-70	34.2

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_AP013357|1579964:1673773|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_AP013357|2175566:2273007|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001295038.1|2205605_2207336_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	6.7e-18	28.5
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WP_138140468.1|2215972_2218558_+	TonB-dependent receptor	A0A0P0I887	Acinetobacter_phage	4.0e-43	26.6
WP_000525879.1|2218667_2219384_+	energy transducer TonB	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_AP013357|2564080:2605096|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000174668.1|2572964_2573648_-	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_000106979.1|2574065_2574974_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000301495.1|2858041_2859382_-	DUF4055 domain-containing protein	A0A0P0IDW1	Acinetobacter_phage	3.4e-235	92.2
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WP_000729387.1|2860673_2861189_-	DUF2280 domain-containing protein	A0A1B1P9C2	Acinetobacter_phage	3.2e-45	61.3
WP_000435230.1|2861247_2861889_-	hypothetical protein	A0A0D4DBV4	Acinetobacter_phage	6.3e-115	88.7
WP_000378523.1|2861857_2862292_-	hypothetical protein	A0A0P0IVP9	Acinetobacter_phage	7.4e-67	84.7
WP_001136773.1|2862352_2862808_-	hypothetical protein	A0A0P0HSF5	Acinetobacter_phage	2.7e-80	95.4
WP_010326927.1|2863413_2864439_-|transposase	IS30 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	8.8e-26	30.7

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_AP013357|2867856:2880204|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000462878.1|2868730_2869123_-	hypothetical protein	J7HXM5	Acinetobacter_phage	1.2e-07	57.8
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WP_001003671.1|2869450_2870251_-	hypothetical protein	A0A0P0IDV1	Acinetobacter_phage	2.8e-144	95.5
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WP_000602535.1|2871127_2871352_-	hypothetical protein	A0A0P0I444	Acinetobacter_phage	3.2e-34	97.3
WP_001180660.1|2871423_2871696_-	hypothetical protein	J7I0V3	Acinetobacter_phage	7.2e-36	90.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_AP013357|3231977:3340305|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_031561837.1|3272321_3273083_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_031561834.1|3273162_3273360_+	hypothetical protein	A0A0D4DBH0	Acinetobacter_phage	3.1e-12	70.5
WP_031561832.1|3273366_3273591_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_031561830.1|3273593_3274034_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_031561828.1|3274030_3274261_-	hypothetical protein	A0A2H4J8L3	uncultured_Caudovirales_phage	8.0e-12	50.0
WP_041114827.1|3274257_3274551_-	ogr/Delta-like zinc finger family protein	NA	NA	NA	NA
WP_079270930.1|3274665_3274863_+	Com family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_041114828.1|3274828_3275632_+	DNA adenine methylase	A0A2H4J8Q1	uncultured_Caudovirales_phage	4.1e-87	60.8
WP_041114829.1|3275619_3277122_-	DNA primase	A0A2H4JAV0	uncultured_Caudovirales_phage	1.0e-91	46.6
WP_004842352.1|3277118_3277541_-|tail	phage tail protein	Q9ZXJ9	Pseudomonas_virus	4.7e-34	52.1
WP_041114830.1|3277546_3280489_-|tail	phage tail length tape measure protein	A4PE52	Ralstonia_virus	1.2e-131	45.0
WP_025469641.1|3280485_3280605_-|tail	GpE family phage tail protein	A0A0M4R2P3	Salmonella_phage	3.7e-05	52.8
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WP_038342600.1|3281012_3281531_-|tail	phage major tail tube protein	F1BUU2	Erwinia_phage	8.3e-49	56.1
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WP_033856123.1|3291186_3291636_-|head	head completion/stabilization protein	A0A2H4JCS4	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-14	32.7
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3318225:3319313	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_085940413.1|3339215_3340305_+|transposase	IS4 family transposase ISAba1	NA	NA	NA	NA