Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_AP014521 | Candidatus Tachikawaea gelatinosa strain UwTKB | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_AP014521
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
646077 : 656222
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP014521|646077:656222|DBSCAN-SWA AATGAAGTTTAATAAAGAGAAATCTTTTATTTATAATATGGGATTAGTTCCGATTGTAATAGAAAAAACACATTATGGTGAACGTGCTTATGATATTTATTCGCGACTTCTTAAGGAAAGAATAATATTTTTAACAGGCGCAATAGAAGATAATATGGCAAATTTAATTGTAGCACAGATATTATTTTTAGAAGCAGATAATCCTGAAAAAGATATTTATTTATATATAAATTCACCAGGAGGAGTAATTACTGCTGGTATGTCTATTTATGATACAATTCAGTTTATTAAACCCGATGTAAGTACTATATGTATAGGTCAGGCATGTTCTATGGGTGCTTTTTTATTAGCTGTAGGAAAAAAAGGAAAACGTTTTTGTTTGCCTAATGCAAGAGTTATGATTCATCAACCGATGGGTGAATATCATGGACAGGCAACAGATATTGAAATTCATGCTAAAGAAATTTTAAATGTAAAAAAACGCATGAATATATTAATGTCAAAACATACTGGAAAAAGTTTAGAAGAAATTCAAAAGGACACTGAAAGAGATTGCTTTTTATCTGCAGAAGAAGCATTGCAATATGGCTTAATAGATTCGATCCTAAAAAATCGTAAATAAAATTATATGCTATTTTTTATAATTAAATAAAATGACAAAAAATATAAAAAATTTTGATATTCTTATTTACCAATAATTTCTATTTAGAGAAAAAGGTAAAAAAATGACGGAAGATAGTAAAAACGATTCTGAAAAGTTATTACATTGTTCTTTCTGTAATAAAAGTCAAGATGAAATAAAAAAATTTATTGCAGGATTATCTGCTTATATTTGTTATAATTGCATTAGTCTGTGTTATAAAATTATATCTGAAGATACTAAAACAGTTACAAAAAAAGTTAAAAAAGAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAATATTTTTAACACCTAAAAAAATTTATTCTAACCTAGATGATTATGTTATAGGGCAAGAAAAAGCTAAAAAGGTTTTAGCAGTTGCTGTCTATAATCATTATAAACGTATAAATAACGATATTAAAGATGATGTAGAAATTGGTAAAAGTAATATATTACTAATTGGACCAACTGGTAGTGGTAAAACTCTACTAGCTGAAACATTAGCACGTCATTTGGAAATTCCTTTTACAATAGCAGATGCTACTACTTTAACAGAAGCAGGATATGTTGGTGAAGACGTAGAAAATATTATTCATAAACTTTTACAAAAATGTGAGTATGATGTTAAAAAAGCACAAAAAGGTATTATTTATATTGATGAAATTGATAAAATTTCAAGAAAATTGGATAATCCATCAATTACTAGAGACGTCTCAGGAGAAGGGGTACAACAAGCTTTATTGAAATTGATTGAAGGAACTGTTGCAGCTATACCCCCACAAGGAGGGAGAAAACATCCCCAGCAAGAATTTTTATATGTAGATACTTCTAAAATATTATTTATTTGTGGTGGATCATTTGATGGATTAGAAAAATTAATTGAAAAGCGTATAGAAAGTAGCTCAACAATAGGTTTTGGAGCAAAAATAAAAACTATTAAATCAAAAAAATTTAAAGAAAAAGAATTGCTTACTCAAGTAGAACCTGAAGATTTAATAAAATTTGGTTTAATTCCAGAATTTGTAGGAAGGTTACCAATAGTTGCAACTTTAAATGAATTAAATGAAAAATCGCTCATAAAAATTTTATGTAAACCAAAAAATGCGTTAACAAAACAATATAAAAAACTTTTTCAATTTGAAGGAATAGAACTAGAATTTCTTGAAGAAGCATTGATTTTTATTGCTAAAAAAGCAATACTGCGTAATACTGGAGCTCGTGGTTTACGATCTATTATAGAAATAGCTTTACTTGAAACCATGTATAAAATTCCTTCTATAAAAGGAATTAAAAAAATAGTTATAGATAAATCTGTTATTCAAAAAAATTCTGAGCCAGAATTAATCTATAATCATGAAAGAAACAAAAATTTTCCAACAAATTGATCTTAAAAGGAGGAAAAACTGTTTCATCTTCTATTTATCACATCTTTAGTATTAAATTTAATCTTATTATTTAATGCTTCCTTTATTCATAATAATACCTATGAGCTGAATTGCATATTTTTCTCATTATGCAGTGATGATCTAGAAAAAATACACTACCTACTATATGGGGAGAAAATCTTATGAATCCTACTGATCATTCTAAGTGGATTAAAATTCCCGTCTTACCGTTGCGTGACGTAGTGGTATATCCTCATATGGTAATTCCGTTATTTGTTGGCCGAGAAAAATCAGTAAAATGTCTTGAATTTGCTATGAAACATGAAAAAAAAATCATGTTAGTTGCACAAAAAGATGCATCAACGGATGACCCTAATATTAATGATCTTTTTTTTATTGGTACCATTGCCTCAATTTTACAAATGTTGAAATTGCCCGATGGAACAATAAAAATATTAGTTGAAGGATTACAACGTGCACGTGTTATAAATTTGATAGAAGAAAATTGTTTTATTGCAAAAGTTGAATTAATATCAATGTTTACGATAGAAAAAAAAGAAGAAAAAGTATTAATTCGTACTGCAATTAATCAATTCGAAAACTACATTAAACTAAATAAAAAAATTCCTTCTGAAATATTAACTGCACTAAATAACATAGAAAATGCTGAACATATAGCAGATACTATTGCTGCTAATATTCCTTTAAAATTATCTGATAAACAATTAGCATTAGAAATGCTTAATACCAAAGAAATTTTTGAATATCTTATTGCTATGATGGAAGCGGAAATTGATTTATTACAAGTAGAAAAAAACATTCGTAATCGTGTCAAAAAACAAATGGAAAAAAGTCAACGAGAATATTACTTAAACGAACAAATGAAAGCTATTCAAAAAGAATTAGGAGAAATAGAGGATTTTCCAGATGAATATGAAGCTTTAAAAAGAAAAATAGACAAAGCTAACATGCCAAAGGAAACAAAAGAAAAAGTAGATTCAGAATTACAAAAATTACGCATGATGTCTCCTATGTCTGCTGAAGCAACAGTTGTGAGAAGTTATATTGACTGGATTATTCAAGTACCTTGGAGTAAAAGAAGTAAAATAAGAAAAGCTTTAAATACAGCTCAAAATATGTTAGATGATGATCACTATGGACTAGATCGTGTAAAAGAAAGAATTATGGAATATCTTGCTGTACAAAGTCGTGTTAACAAAATAAAAGGTCCAATTTTATGTTTAGTAGGACCACCAGGAGTAGGAAAAACTTCATTAGGACAATCTATTGCTAAAGCAACAGGAAGAAAATATGTTCGTATGGCATTAGGTGGAATAAGAGATGAAGCAGAAATTAGAGGACATCGTAGAACTTATATTGGATCCATGCCTGGAAAAATTATTCAAAAAATAGCAAAAGTTGGAGTAAAAAATCCTCTATTTTTGCTTGATGAAATAGATAAAATGTCTTCTGATATGAGAGGCGATCCAGCTTCAGCATTATTAGAAGTCCTTGATCCAGAACAAAATGCAACATTTAATGATCATTATCTTGAATTAGATTATGATTTATCTGATATTATGTTTGTTGCAACATCGAATTCTATGGATATTCCTTCTCCTTTATTAGATCGTATGGAAGTGATTCGTTTATCTGGATATACTGAAGAAGAAAAATTAAACATTTCTAAAAAACACCTAATTCCTAAACAAATAAAAAGAAATGCTTTAAATAACAACGAAATCAATATTGATGATACTGCTATCATTGATATTATTCGTTATTATACTCGTGAAGCAGGAGTAAGAAATTTAGAACGTGAATTATCAAAAATTTGTAGAAAAGTTGTAAAATCTATTGTAATTGACAAACTTAAAGAATCTGCCAATATCACCAAAAAAAATTTAAAAAAATATCTTGGAATTAAAAATTATAGATATGATCGTAAAGCAGAAAAAAACAATATTGGACAAGTTACAGCTCTTGCATGGACTGAATGTGGAGGTGATTTGTTAACAATTGAAAGTGCTTATGTAGCTGGAAAAGGTAAGTTAATTTATACTGGTTCTTTAGGTGAAGTAATGAAAGAATCTATTCAAGCTGCGTTAACAGTTGTAAGATCAAGATCAAATATATTAAACATAAATAGTAATTTTTATGAAAAAATTGATATACATGTACATGTTCCAGAAGGAGCAACTCCAAAAGATGGACCTAGTGCTGGTATAGCAATGTGTACTGCTTTAATTTCTTGTTTAACTAATAATCCTGTACGCTCTGAAATAGCCATGACAGGTGAAATTACTTTAAGAGGTGAAATATTATCAATTGGAGGATTAAAAGAAAAATTACTTGCTGCTCATAGAGGTGGTATAAAAACAGTTATTATTCCCTATGAGAACAAACATGATTTGGAAGAAATTCCTTTAAATATTATTGGTAAACTAAACATTTGTCTTGTAAAACATATTGAAGAAGTATTTAGTTTATCTTTAGAAAAAGCTCCTTTTTCTTCTTCCAGAAATAATTGGAAAGGATCTATTAGTCAATCTACTGAAAAACTAATTCAATAAATGGATAATATAACTAGAAATATGTCAATTATTTATTTTTGTTTTATGCTATATAATAATATTTTTAATTGTATAAAAATAATTTTTTAATACATTAACATTATTTTTTATTTTTTAATATATCTAACAAGAAAAACGTTATTATAGTTATAATATTAATATTTATTAAGGAGATAAATGGAGTGAATAAATCACAGTTAATAGAAAAAATTGCTATAGATGCTGATATTTCAAAAGTAACAGCAGGACGTGTTTTAAATGCATTTATGGGTTCAGTTTCTAACGCATTAAGAGCTGGTGAAGAAGTTACTTTAATTGGATTTGGTACTTTCTCTGTACGTAAAAGAGCTGCTAGAATTGGAAGAAATCCTCAAACAGGCAAAGAAATTACAATTCCTGCTGCAAAATTTCCAGGATTTCGTCCAGGAAAAATATTAAAAAAAGTTATTAATGAATAAAATAGATAATAAATATATTAAAAAAAATTTAATTATATTAACAAAATATGTTACAATATCAAAAATATGCTCTGGTTTTTGACTAGCATATAAAATCTGTTAGTCATATCACGATATATATCTATGAACCCGGTCAGGTCTGGAAAGAAGCATCCGTAATAGAATAATATATATGCTGAAATCTGACTAACAGATCATTTTTAAAAAATTATAATGTGCATTAAAAAATGGAAAAAAAAACAATTCTTTTAATCAAAAAATTGATTAAAAACGTTCCAAATTTTCCCAAACCTGGAATTATATTTCGTGATATTAGCAATATCTTAGATAATCCTCAAATTTATTCTCAAATAATTTTATGTATATCTAATCATTATTATGATAAAAAAATAACTAAAATTGCAGGAATAGAAGCTCGAGGTTTTTTGTTTGGTGCACCTGTTGCTTTAAATTTAGGTATTGGTTTTGTTCCAATACGTAAGCCAAATAAGCTACCTAGAGCAAAATATAGCGAAAAATATAATATGGAATATTCTTCAAATTCTTTAGAAATACACAAAGATGCTATTTCTTCTGTAGATAAAGTTTTAATTATTGATGATATTTTAGCTACTGGATCAACTGTCAGTGCTGCGGTTAAATTAATCAGAAAAACAGGAAAAGTAAACGATGCAGCATTTTTAATGAGTTTACATTTTCTAAAAGCGGATAAAAAACTAGAAAAAATTAATATTAATTGTTTTAATATAATAAAAATAACAAAATAGTAAGTTTTTTGTAAACTTTTATAAAAATATGATATAAAACATAAAAATGATTTATCAAGTATTAGCTAGAAAATATAGACCTCAAACATTTTCGGAAATAAATGGACAAACACATATAATAACAGCATTGAAGAATGCATTATCATTAAATCGACTACATCATGCATATCTTTTTTCTGGTACTCGAGGAATTGGAAAGACTACAATAGCTAGAGTTTTAGCAAAAGGATTAAATTGTAAAAAAAAAATTACTGATAATCCGTGTAGAAAGTGTCAACATTGTTTAGATATCGAAAATGGTACAAGTATTGATTTAATAGAAATTGATGCTGCATCGCAAAGTAAAGTAGAAGATATTAGAAATGTTTTAGACAACATACAATATTACCCTTTACATTGTCGTTTTAAAATCTATCTTATAGATGAAGTACATATGCTTTCTCGGTATAGTTTTAATGCTTTATTAAAAACTTTAGAAGAACCTCCTAATCATGTTAAATTTATATTAGCAACAACGGATCCTAATAAATTACCTACAACAATTATATCACGATGCTTACATTTTTATTTACAAAAATTAACTATTAATGAGATTACAAAAAAGTTACAAGATATTGTAAATAAAGAAAAAATTAAAACTGAACTTAACTCATTAACATTAATTGCTAAATCATCTGATGGTAGCATGAGAGATGCTTTAAGTTTAACTGATCAAGCTATAGCTTTAGGTAATGGAAAAATAAATTTTATAGATTTAAAATATATTTTAGGGATTATTGATGAAAAATATTCTTTGTTAATATTTGAATCTTTGGTTAAAGGTAATATTAAAAAAATTATGTGTTTATTAGATGATATTGAAAAAAATGGTCAGTTATGCGAAAACTTATTAATTGAGATTTTATCTTGGATACATCATATTGCTATTTTACAAATTTTACCTGATAGTCTTCCAGAAGAAAAAAAAAAATATTTAGATATATTAAATAATTTAGCTATTTCTGTTTCACCTAGTGATATTCAATTATATTATCAAATATTTTTATTAGGGAGAAAAGATTTTTACTACGCTCCTTGCAATAGAACAGGAATAGAAATGATAATTTTGAAAGCCATTGCTTTTCATCCAAAAGTTACAGAATCTTATAAAACCATTCAAAGTTAATATTAGTTAAAACAAGCTATATTTAATTTTTTCTTTAAGATTACCATGCTACAAATTTATTAAAAAATATTTTTATTGATTATTATCTAGTAAAATATAATTATTAAAATAAGCGAGAAAAATATGTTTAACAAAGGTGGAATAAACAATTTAGTAAAACAAGCTCAACAAATGCAAGATAAGATGTCTAAAATACAAGAAGAAATTAATTTATTGAAAGTAACTGGAGAATCTGGTGCAGGTTTAGTAAAAGTTACTCTTAATGGTGCTTATAATTGCCAAAATGTTCAAATTGATTCTGATTTGTTAAAAAACAATTCTGATAAAGAAATTTTAGAAGACTTAATCGCTGCAGCTTTTAATGATGCCGCAAGACGAATTGAAGAAGTTCAAAAAGAAAAAATGTCATCTGTCTCTTCTAATTTAAATTTACCTTCAGGATTTAACATGCCATTTTAAAAAAATCTTATATATGTATAATAACAAAAATTTATTTTTAATAAAAAAAGATATTCTCTTGAATTTTTTATTTCAGTCCCCATTTCTTTCTGGAATTTGAAAATAAATATTTAGGATATAAAATTCTATGACCCAAAAAGAAACATATAATTTTCAATCAGAAGTAAAACAACTACTAAAACTGATGATTCATTCTTTATATTCTAATAAAGAAATTTTTTTACGAGAACTTATCTCTAATGCTTCGGACGCAGCTGATAAATTAAGATTTTTAGCTCTTTCTAATCCATCGCTATATGAAAATGATACTGATTTATGTGTAAAAATATCGTTAGATAAAAAAAATTGCTTAATTAAGATTAGCGATAATGGCATTGGCATGAAAAAAAAAGAAGTAATTGAAAACCTTGGAACTATTGCTAAATCAGGTACAAAAAATTTTTTGGAATCTTTAAAAACTGAAAGCGAAAACAAAAATGCACAGCTTATTGGAAAGTTTGGTGTAGGTTTTTATTCAGCGTTTATTGTATCTGATAAAGTTTCTTTGCATACTCGTGCAGCAAATGTTTCGGCTGATGAATCAGTTTTATGGCAATCTACAGGAGAAGGAGAATATACTCTTACACAAAAAGAAAAGAAAAAACGAGGTACTGAAATTGTTTTGCATATTAAAAAATCAGAAAAAGAGTTTCTTGATGTTTGGCGATTGAAAAGTATTATTAGTAAATATTCTGACCATATTTCTTTACCTGTAAAAATGGAAATGGAAGATGAAAAAACAAAGCTATTTAAATGGGAACAAGTGAATAAAGCTCAAGCAATATGGACACGAAAAAAATCAGAAATTAGCATAAAAGAATATAAAGATTTTTATACAAGTATTACTAATGATTCTGTTGAACCAATAATTTGGACACATAACCATGTTGAAGGAAAACAAGAATATATTGTTTTACTATATATTCCTTCTAATACTCCATGGGATTTGTTTCATCGCGATAATAAACATGGTTTAAAATTATATATACAACGCGTTTTTATTATGGACGATACCGAACAACTTTTACCGAACTATTTACGTTTCGTAAAAGGTATTGTAGATTCAAATGATTTACCATTAAATATTTCCCGTGAAATTTTACAAGAAAATCACTTAATTAGTAATTTAAAACTTGCGATCACAAAACGTATTTTACATATTCTTGAAAAATTATCTAAAGATGATAATGAGAAATATCAAAAATTTTGGAATACTTTTGGATTAGTATTTAAAGAAGGAGCTGCAGAAGAACATATAAATAAAAAAGAATTTATGAATTTATTAAGATTTTCTTCAACGTATCAAAATAATCCTGAACAAAACGTATCTTTAGCAGATTACATTAGTAGAACAAAAAAAGATCAAAAAAATATTTATTATATTACTGCTGATAATTATATATCTGCTAAAAATAGTCCTCATTTAGAACAGTTTAAACAAAAAAATATTGAGGTATTATTATTATCTGACCGTATTGACGAATGGATGATTAGTTATTTTACAGATTTTGAAAATAAATCTTTTAAATCTGTGAGCAAAATCGACAAAGATCTAGAAAAAATTGACAAAGAAAATTTACAAGATAATAAAAAAAATCAAGAAAAAGAATTTGCACCATTTTTACAAATTATAGAAAAACAGCTAAAAAATCGCGTAAAAAAAGTAAAATTAACGTATGCTTTAACTAAAACTCCATCTATTTTAACGACAGATACTGAAGAAATGAGTACTCAGATGGCTAAACTTTTTAAAGCAGCTGGGCAAGCAGTGCCAGATATCAAATATATTTTTAATATTAATCCTCAACATATCTTAATAAAACACATTATTAAAGTATCAGACAAAGTTATTTTAAAAGACTGGATAGAACTATTATTTGAAGAAGCATTATTAGCTGAAAAAGGTACTTTAGAAGATACTAATAAATTTATTAATCGAGTTAATCGTTTATTATTTCCTTAAAATAAATTAAATGTGAATTAATATTTCTTTTTCATATAAGTTTTTTAAAAAAAATTATGCGTATTATCCTATTAGGAGCTCCTGGTACAGGGAAAGGTACACAAGCTAACTTTATTACAAATAAATATCATATTCCTCAAATTTCTAGTGGAGATATTTTACGTAAGTTTTTAAAAAAAGAATCTAGTGAAAGCAATCATTTAAAAAATGTAATTAAAAAAGGAGAATTAGTTAACGATAAAATAATAATTAATTTAATAAGTGCACGTTTAAAAAAAAAAGATTGTAAAAATGGCTTTTTACTGGATGGATTTCCTCGAACAATTAATCAAGCTATTTATATGAAACAGGAAAAAATTAAAATTGATTTTGTATTAGAGTTTAGTCTTGATGTTCCGTCTATTATTAAACGTGTTACAGGACGTCGAATTCATGAACCGTCTGGTCGAATTTATCATATTAATTTTTGTCCACCTAAAAATTCTGAAAAAGATGATATTACAGGAGAAAAATTAACTATTAGATTAGATGATCAAGAACATATATTAAAGAAACGTTTACAACAATATAATAAATTAACTATACCTCTTATTAACTTTTATAAACAAGAAGTTAAATTAAGTGGAATACAATATCATATAATTAACATGAATAAAAATGTTTATGAAATTCGTCAACGTTTATTAAAAATTTTCAATGTATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP014521|646077:656222|648276_650667_+|WP_082018175.1|DBSCAN-SWA MNPTDHSKWIKIPVLPLRDVVVYPHMVIPLFVGREKSVKCLEFAMKHEKKIMLVAQKDASTDDPNINDLFFIGTIASILQMLKLPDGTIKILVEGLQRARVINLIEENCFIAKVELISMFTIEKKEEKVLIRTAINQFENYIKLNKKIPSEILTALNNIENAEHIADTIAANIPLKLSDKQLALEMLNTKEIFEYLIAMMEAEIDLLQVEKNIRNRVKKQMEKSQREYYLNEQMKAIQKELGEIEDFPDEYEALKRKIDKANMPKETKEKVDSELQKLRMMSPMSAEATVVRSYIDWIIQVPWSKRSKIRKALNTAQNMLDDDHYGLDRVKERIMEYLAVQSRVNKIKGPILCLVGPPGVGKTSLGQSIAKATGRKYVRMALGGIRDEAEIRGHRRTYIGSMPGKIIQKIAKVGVKNPLFLLDEIDKMSSDMRGDPASALLEVLDPEQNATFNDHYLELDYDLSDIMFVATSNSMDIPSPLLDRMEVIRLSGYTEEEKLNISKKHLIPKQIKRNALNNNEINIDDTAIIDIIRYYTREAGVRNLERELSKICRKVVKSIVIDKLKESANITKKNLKKYLGIKNYRYDRKAEKNNIGQVTALAWTECGGDLLTIESAYVAGKGKLIYTGSLGEVMKESIQAALTVVRSRSNILNINSNFYEKIDIHVHVPEGATPKDGPSAGIAMCTALISCLTNNPVRSEIAMTGEITLRGEILSIGGLKEKLLAAHRGGIKTVIIPYENKHDLEEIPLNIIGKLNICLVKHIEEVFSLSLEKAPFSSSRNNWKGSISQSTEKLIQ >NZ_AP014521|646077:656222|655574_656222_+|WP_041063420.1|DBSCAN-SWA MRIILLGAPGTGKGTQANFITNKYHIPQISSGDILRKFLKKESSESNHLKNVIKKGELVNDKIIINLISARLKKKDCKNGFLLDGFPRTINQAIYMKQEKIKIDFVLEFSLDVPSIIKRVTGRRIHEPSGRIYHINFCPPKNSEKDDITGEKLTIRLDDQEHILKKRLQQYNKLTIPLINFYKQEVKLSGIQYHIINMNKNVYEIRQRLLKIFNV >NZ_AP014521|646077:656222|651938_653057_+|WP_052459577.1|DBSCAN-SWA MIYQVLARKYRPQTFSEINGQTHIITALKNALSLNRLHHAYLFSGTRGIGKTTIARVLAKGLNCKKKITDNPCRKCQHCLDIENGTSIDLIEIDAASQSKVEDIRNVLDNIQYYPLHCRFKIYLIDEVHMLSRYSFNALLKTLEEPPNHVKFILATTDPNKLPTTIISRCLHFYLQKLTINEITKKLQDIVNKEKIKTELNSLTLIAKSSDGSMRDALSLTDQAIALGNGKINFIDLKYILGIIDEKYSLLIFESLVKGNIKKIMCLLDDIEKNGQLCENLLIEILSWIHHIAILQILPDSLPEEKKKYLDILNNLAISVSPSDIQLYYQIFLLGRKDFYYAPCNRTGIEMIILKAIAFHPKVTESYKTIQS >NZ_AP014521|646077:656222|646077_646698_+|WP_041063411.1|DBSCAN-SWA MKFNKEKSFIYNMGLVPIVIEKTHYGERAYDIYSRLLKERIIFLTGAIEDNMANLIVAQILFLEADNPEKDIYLYINSPGGVITAGMSIYDTIQFIKPDVSTICIGQACSMGAFLLAVGKKGKRFCLPNARVMIHQPMGEYHGQATDIEIHAKEILNVKKRMNILMSKHTGKSLEEIQKDTERDCFLSAEEALQYGLIDSILKNRK >NZ_AP014521|646077:656222|650849_651125_+|WP_041063413.1|DBSCAN-SWA MNKSQLIEKIAIDADISKVTAGRVLNAFMGSVSNALRAGEEVTLIGFGTFSVRKRAARIGRNPQTGKEITIPAAKFPGFRPGKILKKVINE >NZ_AP014521|646077:656222|653643_655518_+|WP_041063418.1|DBSCAN-SWA MTQKETYNFQSEVKQLLKLMIHSLYSNKEIFLRELISNASDAADKLRFLALSNPSLYENDTDLCVKISLDKKNCLIKISDNGIGMKKKEVIENLGTIAKSGTKNFLESLKTESENKNAQLIGKFGVGFYSAFIVSDKVSLHTRAANVSADESVLWQSTGEGEYTLTQKEKKKRGTEIVLHIKKSEKEFLDVWRLKSIISKYSDHISLPVKMEMEDEKTKLFKWEQVNKAQAIWTRKKSEISIKEYKDFYTSITNDSVEPIIWTHNHVEGKQEYIVLLYIPSNTPWDLFHRDNKHGLKLYIQRVFIMDDTEQLLPNYLRFVKGIVDSNDLPLNISREILQENHLISNLKLAITKRILHILEKLSKDDNEKYQKFWNTFGLVFKEGAAEEHINKKEFMNLLRFSSTYQNNPEQNVSLADYISRTKKDQKNIYYITADNYISAKNSPHLEQFKQKNIEVLLLSDRIDEWMISYFTDFENKSFKSVSKIDKDLEKIDKENLQDNKKNQEKEFAPFLQIIEKQLKNRVKKVKLTYALTKTPSILTTDTEEMSTQMAKLFKAAGQAVPDIKYIFNINPQHILIKHIIKVSDKVILKDWIELLFEEALLAEKGTLEDTNKFINRVNRLLFP >NZ_AP014521|646077:656222|651352_651892_+|WP_041063415.1|DBSCAN-SWA MEKKTILLIKKLIKNVPNFPKPGIIFRDISNILDNPQIYSQIILCISNHYYDKKITKIAGIEARGFLFGAPVALNLGIGFVPIRKPNKLPRAKYSEKYNMEYSSNSLEIHKDAISSVDKVLIIDDILATGSTVSAAVKLIRKTGKVNDAAFLMSLHFLKADKKLEKININCFNIIKITK >NZ_AP014521|646077:656222|646801_648094_+|WP_041063412.1|protease|DBSCAN-SWA MTEDSKNDSEKLLHCSFCNKSQDEIKKFIAGLSAYICYNCISLCYKIISEDTKTVTKKVKKEKKEEKKIFLTPKKIYSNLDDYVIGQEKAKKVLAVAVYNHYKRINNDIKDDVEIGKSNILLIGPTGSGKTLLAETLARHLEIPFTIADATTLTEAGYVGEDVENIIHKLLQKCEYDVKKAQKGIIYIDEIDKISRKLDNPSITRDVSGEGVQQALLKLIEGTVAAIPPQGGRKHPQQEFLYVDTSKILFICGGSFDGLEKLIEKRIESSSTIGFGAKIKTIKSKKFKEKELLTQVEPEDLIKFGLIPEFVGRLPIVATLNELNEKSLIKILCKPKNALTKQYKKLFQFEGIELEFLEEALIFIAKKAILRNTGARGLRSIIEIALLETMYKIPSIKGIKKIVIDKSVIQKNSEPELIYNHERNKNFPTN >NZ_AP014521|646077:656222|653180_653516_+|WP_041063416.1|DBSCAN-SWA MFNKGGINNLVKQAQQMQDKMSKIQEEINLLKVTGESGAGLVKVTLNGAYNCQNVQIDSDLLKNNSDKEILEDLIAAAFNDAARRIEEVQKEKMSSVSSNLNLPSGFNMPF |
9 | Agrobacterium_phage(12.5%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
690975 : 701937
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP014521|690975:701937|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP014521|690975:701937|692156_694442_-|WP_041063458.1|DBSCAN-SWA MNHSLFVTKRDGRKELINLDKIHKVLNWAANGLNNISISQVELRSHIQFYNGIKTSDIHETIIKSAADLISCETPDYQYLAARLTIFHLRKKAYGQFDPPKLYDQVVRMVHLGKYDTHLLSDYTEKEFNEMDKFIDHWRDMNFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGTIYESTQFLYILIAACLFSKYSSNKRMDYIRRFYDATSTFKISLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECDDSLDSINATSSAIVKYISQRAGIGINAGRIRAVGSPIRGGEASHTGCIPFYKHFQSAVKSCSQGGVRGGAATIFYPIWHLEVENLLVLKNNRGIEDNRVRHMDYGIQINKFMYQRFLTDKKIALFSPSDVPNLYEYFFSNQKKFEKLYIKYEKNKDIRKKYIKSTDLFSLIMQERSSTGRIYIQNVDHCNTHSPFNAKIAPIRQSNLCMEIALPTKPLKHINDSSGEIALCTLSAFNLGTIKDLNEFEELANLSVRALDALLDYQDYLIPAAKISAMGRRSLGIGVINFAYYLAKNNVRYSDGSANNLIHKTFEAMQYYLLKASNELAKELGSCPYFNETNYAKGILPVHTYKKSLDEICNEPLHYDWEDLSKKIKIHGLRNSTLSALMPSETSSQISNATNGIEPPRGYISIKASKDGILRQIVPEYELLKNKYELLWDIPSNKGYFQLVGIMQKFIDQSISSNTNYDPSKFANGKIPMKKLMQDLLTAYKLGIKTLYYQNTRDGAKDMQEEMVLFFQEEGCRDGACKI >NZ_AP014521|690975:701937|700077_700371_-|WP_041063463.1|DBSCAN-SWA MKIRPLHDRVIIKRKEVEAKSAGGIFLTGSAAGKSTCGEVLAIGNGRILENGEVKKLDVKVGDVVIFNEGYNAKTEKIDNEEVLIISESDILAIVES >NZ_AP014521|690975:701937|695098_697651_+|WP_041063460.1|DBSCAN-SWA MTTFEQKIKLISIEDELKNSYLDYAMSVIIGRALPDVRDGLKPVHRRILYAMRELGNDWNKSYKKSARIVGDVIGKYHPHGDSAVYESIVRMAQSFSLRYPLIDGQGNFGSVDGDPPAAMRYTEIRMKKIASEFLCDLEKDTVNFIENYDNTEQLPEVLPTKIPSLLVNGSSGIAVGMATNIPPHNLKEVINGCLAYIKNKNISIEELMNFISGPDFPTAGIINGNQGIKDAYRTGRGKIYIRARSRLEINHKTARNTIIVYELPYQVNKARLIEKIAELVKEKRLEGVHSLRDESDKDGMRMIIELKRDSIGEIVLNNLYSMTQLQTSFGINMVALHQGKPKTMNLKEIIIAFIDHRKEIVLRRTIFELNRSRDRVHILEGLLIAILNVDKIISIIRLSIGTKEAKETLINYSWSFKNLGENINAFGENKLLFDIFKNNFSSANKNEYYYLSEKQAQSILELKLQKLTGLEHQKIFKEYNTIVENIYALEKILDNKNILMEVIYQELKDIKNRFGDKRLTEIHNATLNLNIEDLILQKDVIVTLSHKGYVKYQPLNDYAAQHRGGKGKSAAKTKEEDFIDRLLVTKTHDTILCFSNRGRLYSMKVHQLPEANRYSRGRPIVNLLPLEKNERITAILPINEYKEEINIFMASAKGTVKKTAISELIRSRNAGIIAVNLREDDELIGVAFTKGTNTILLFSSTGKVVCFNESSVRTMKRTASGVRGIKLAKDDYVVSLIVSNEKIPGTILTVTKKGYGKRTEINKYPIKSRGTRGVISIKVTQRSGPVISAIQVFENDQIMIITDTGKLVRIRVSEVSTLGRNTQGVILIRTLKEESVVGLQRVVVESEIF >NZ_AP014521|690975:701937|698384_700037_-|WP_041063461.1|DBSCAN-SWA MAAKDVKFGNDARAKMLRGVNILADAVKVTLGPKGRNVILDKSFGAPAITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKANDTAGDGTTTATVLAQAIVKEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVIAAVEELRILSVQCDDSKAITQVGTISANSDESVGALIAQAMEKVGKEGVITVEEGTGLQDELDVVEGMQFDRGYLSPYFINKQETGIVELENPYILLADKKISNIREMLSLLEAVAKSGKPLLTIAEDVEGEALATLVVNTMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDIAVLTGGTVVSEEIGMELEKTSLEVLGQAKRIIINKDTTTIIDGSGDESAIHGRVNQIRQQIEEATSDYDKEKLQERVAKLAGGVAVLKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGVVAGGGVALVRVAETISNLTGQNEDQNIGIKVALRAMEAPLRQIVSNAGEEPSVVANNVKSGKDNYGYNAATEQYGDMMDFGILDPTKVTRSALQYAASVAGLMITTECMVTDLPKGDTPDLSSASGMGGGMGNGMGGMM >NZ_AP014521|690975:701937|690975_692106_-|WP_041063456.1|DBSCAN-SWA MLYTTFSQKKNNQLIEPMFFGQPVNIARFDQQKYHVFENLIEKQLSFFWRPEEIDVSHDRIDYKNLPDHEKHIFISNLKYQTLLDSIQGRSPNVAFLPIVSLPELETWIETWSFSETIHSRSYTHIIRNIVRDPSIVFEDIVDNQHIVERAKNIASYYDKLIQMISYWNLLGQGKHKINDKIINVDLYALKKQLYLCLISVNALEAIRFYVSFACSFAFAERGLMEGNAKIIRLIARDEALHLTSTQHILNLMRNGEDDLEMKKISKESEQECFDLFKDVAMQEKEWAKYLFYDGSMIGLNNDILSEYIEYVTNIRMNAIGLKLPFKTRSNPIPWINTWLVSDNVQMAPQEVEVSSYLVGQIDSSIKKDDFKSFKL >NZ_AP014521|690975:701937|700506_701937_-|WP_041063466.1|DBSCAN-SWA MKRLIWFRNDLRISDNQAVHAACKNNIDSKILAIFLAPIQQWKKYHISAKQINFIYENLSYLEEKLWEIDIHLIYHECTDFEDCINFLIYFCKNENIKEIFYNRQYEFDEKNRDFKLENILKSHGVDCKKFDNTLIFKPGTILNKKKNLYRRYIPFKKKFLKKLAKNTYKLLKYPKKFTFKKFTKNTCVPNFYQSKFFKAGEQSALNHLTFFLKNLSKNYNNTRKIFHNTDSTSNLSPYLTIGVLSPQQCFCILNNLYPNFLEKKHFSLYWFDQIIWREFYQHIIYGYPLLSMNQPFIKWTEDIKWKNNIYQIEAWKSGETGYPLIDATMRQLNTTGWIHNRLRMISASFLTKNLLVNWKIGEEYFMSKLLDGNFSANNSGWQWCASTGIHITPYFRIFNPSLQGRLYDIKGKFIKKWLPELRDVPNKYIYTPYNWTKSKKYQLKYPKPIIDYNYSKKNAILEYSKAKEKNNKQNK >NZ_AP014521|690975:701937|697671_698241_-|WP_041063688.1|DBSCAN-SWA MPSYLINNLRIGAKILFENKPYVIESNDFTKPGKGQAFNKVKIRQLINGKLIEKTFRSTELINTADIFDCTLIYLYQEGELYYFMNNNNFDQLSVEQKIIGDNYQWLKNQVEYIITLWNNVPISITPPNFLELKIIKTDPSIKGETSTATTKNAILSTGASIKVPSFIEIGETVKIDTRSKSYVSRVIK |
7 | Pseudomonas_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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