Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP012543 | Lactobacillus paracasei subsp. paracasei JCM 8130 plasmid pLBPC-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_AP012542 | Lactobacillus paracasei subsp. paracasei JCM 8130 plasmid pLBPC-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_AP012541 | Lactobacillus paracasei subsp. paracasei JCM 8130 | 4 crisprs | DinG,WYL,DEDDh,cas3,csa3 | 0 | 0 | 14 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP012541_1 | 569457-569565 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP012541_1
|
1 spacers
spacers of NZ_AP012541_1
>1.1|569484|55|NZ_AP012541|CRISPRCasFinder GCGAACGCGTTTCGGAGTCGCACAAGTAGACCGATCTTTGGCCACTTAGGATTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP012541_1
The CRISPR arrays of NZ_AP012541_1 >merge|NZ_AP012541|1|569457-569565|CRISPRCasFinder GGTCCTTACACGTAGGTTTCTGGTCTGGCGAACGCGTTTCGGAGTCGCACAAGTAGACCGATCTTTGGCCACTTAGGATTGAGGTCCTTATACGTAGGTTTCTGGTCTG >NZ_AP012541|1|1|569457-569565|CRISPRCasFinder GGTCCTTACACGTAGGTTTCTGGTCTG GCGAACGCGTTTCGGAGTCGCACAAGTAGACCGATCTTTGGCCACTTAGGATTGA GGTCCTTATACGTAGGTTTCTGGTCTG
>NZ_AP012541.1|WP_123837385.1|568410_569331_-|IS30-family-transposase MAIITLIERSQIELMQHHTIQYIAATLGRSRISIRHELHRCPEGDYCAIIAQDHADTCRHRCGRHSILTPKLKRMVTEKLNLGWSPEMVGYAVHCAPHTIYHWIYQRQVDFQPSQLFDHGKRHKRRQDLRSRYNQAVGTSIEIRSESANRRTEKGHLEMDTVRGGRGSKAAVLTIVDRVTRLMATTKLENLSQNAVLKGFARLMVDFPGPVRSVTVDHGKEFSCDQALTKRYRIPVYFCHAYHPNERGTNERFNRELRYYFPKETQFDQVSETDIQQATALINNKPRKCLRWQTPVQAVSKPLSRW >NZ_AP012541.1|WP_003662788.1|567427_568252_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MNTKSLIISQDLCGVGQVSMSVALPLAAGLGLTPYVLPTALLSSHTGGLGANTYLDLSSEMPGILKHWQQLQLQPDGIYLGYLGQKAADQWDRWLPKFHAPLVLIDPVMADNGKLYKGFDAAYVATMQQLAHRATVLTPNITEAQLLLDEKPTTLTDPSAVTALAKRLHAQFDSAVLITGVPFHKQIAVVGIDASGTTLALAQPKETGHCFGTGDLFAAALATGLLKGQNLRQAAATGMVAARLAIKATLATDADPKYGLNLAGVIPALSKQLP >NZ_AP012541.1|WP_003662787.1|566831_567380_-|ECF-transporter-S-component MQTSHNTLKNIIFTGLFAAIIFIGISLLRIPIPAMVGRPFIHFGNPLMVLAILFLGGRLGGLAAVIGLGGFDLLNGYAATSWLTALEAIVMAIVVSALVKAFKHNDQPRNIIIIGILAGLTKIVTSYLTGVVEALMVGSVFKAAVVGAFLSLPATVINSIATAIIVPVLYFILRPLFRQFTN >NZ_AP012541.1|WP_016365907.1|565784_566579_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAEPIVTLSHIQKSFGSKDVLKDLNFTITPGSIVGYIGPNGAGKSTTVKMMLGLMQPDGGTIELFGQPIKPNDPSYKRRIGYVPESADVFDALTAREYLSLIGQLYGLSAADAEQKAFALADLVNLREAFDRRISSYSKGMRQLILIIASLLHNPDILFWDEPLNGLDANTVLVIEEVLQDLRDRGKTIFYSSHILDVVQKLSDRIIVLNDGMVVADGPFKSIAKEADTNLQQLFNDLTGFAEHGQKAQSFVDIVTGGESHETI >NZ_AP012541.1|WP_003662785.1|564070_565798_-|hypothetical-protein MKLFKKTSLDTADPTDTAALPLPKAFAWIARFRPLLEKRGIQFDQLRLILATKGLLAARESSGLGSMFNKRKRGQDASIKTAFLWNLFFGLILGLLMFLPTSILTTFTLFMTIQLLTSFLAILTTYSSLILDPRDRSVFASRGVNDQTLSFARLINICFYLGMTLLAMGGPGLVMAGIHYGPIVALGGLIGLLLSGVLSLVMALFVYLLVLRFFDGERLRNMLNLVQILLMIGIYVGGQLPNLLPRSMSLFGMSISGQFNWLFLPAVPAWFVGLPMLFAGQVTVLSLTLTALSVVVPIALTLIFLHFSGVFEAYLEKLNQGDARTRKLGWWFRGVSALLTRPGEERTYFTLGWRVLGSERDYKLRVYPQLAYGIILPLIFVGGGLRDMPFSSAKHFIAYAGIGVIVALAPALVNLRFSSQPQAMAIFQYVPFTTHGLLLRGVVKAMFARLFLPPLLFITILTTALGGFDALLASIAVIIFTYGMTLMMGWPLVGSQFPFASVYSANANFSGGALGFASIFFGVIIAMIVIGIGGFLGGWLFPLGLIVLGLTLGMLLGHFYRTNLRYELKIKTTQE >NZ_AP012541.1|WP_016365906.1|562928_563903_-|EamA-family-transporter MPRTEAHLARHTNQKLKGVSFAVIGAIFWGASGIFTQTLFTDAGVKPLWLVGIRLFFAGLLLLLWSGVQEPRMFLAIWKNRHDAILMIVFAFLGMVPSQLTYFLAINAGNAATATILQFLGPVFILLYVAFATHQMPRRIDFVSITLALIGTYLLVTRGHLTGLSLAPAAVFWGIMAGVSQALYTLLPRTLLAKYDARAVTGWSMLLGSLPFLPQYVLHPNPLLTLPDFGAIAFVIVFGTMFAYLLVLGSLNYIPPVATGMLSAFEPLTATTLAVTRLHIAFGPAEWLGGILIILNTLLQALPFNKIHHVQQRLTRQFSQKTKS >NZ_AP012541.1|WP_016383865.1|560831_562853_+|WxL-domain-containing-protein MKKRCHLLACLGMLLCTLLAPVTSVGAAVTWPTTSGYPAPPSFGDVDGLFSPTMGDSSLLTDPTSGHAVGLEINKDQANRSGAIWSKAPMFDLDKDSSYTMYFYMGNKPKSGEGMAFVLAAKPAAPTKVDTGSLGVWGVDHLPPNSKPQEVADTALPNSFAMVVDTQKNGTGDPGGYEQLSDFKSYYFGTGYPGQANMYRIDYPYWMTWLYFKIDNPSEQYRFGLGTQKNLYETPANGKWHKLQLDWKKDNLGGGTLTAKMTITRTKDPDYATEVIKWTKNDIQKYFSQGSTDPAPRKLYLGFTGTTSNVFEPHVVAIGAMPEAATVNGTVALMRGAETVEATTHLKVDDVLHYDYTVNVKATSQATWPESGTATMNVPKGKYFDYLKADGTPAKPGDTLPIKVTIGNSDYQAQGKGQPDGNQIAVTNMPQIPKGATATVKFSLPAKVKHHGLLETTPVQDKPIGTITGDGQTYDLKTPAGKDFLAYILDPETGELVLEKVPSFVFELKNGQTGYRNPTVMEMVKGLPMPTATNWDQANADQWLTNQQGREPTNSTGKVLSVKDTRPTKQGWHLTMQLSPFTLTDNSYVLGDNGNKLGGKARLVLTDQATQIAAIKDNNNATPVKNMAAGGTDWSLGTQTGNVAAYLGIEPTATAKAGQYQATATWLLTNAPK >NZ_AP012541.1|WP_016365554.1|559979_560681_+|WxL-domain-containing-protein MKIVTNFAIAFVTLMLAGFVGPHQSVMAADDLGPKKSSAQLTVDAGNIMIQQVPDLNFGGISVHEIVSGSFQRHPLKSNLVNPGPIKTATNANDGNATGLLQIADYRGTGAGWRLEAKMDALTDGKGHFLAGYVDLVGSQLTASNPDINPINPAGSNVPRLNFAKDNTSVSSTVVWQADAEAGTKSGQGQGNNQTTIGTGTALTLVATNTNVTIAKGRYQGAITWTLSNAPKG >NZ_AP012541.1|WP_016365555.1|559636_559996_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MTRSIWRFLISLIIVFGVLGEGIMAAHQVRAATSIGEVVVIDDRPKPDKDHNAPGTEVSKPKEEPSVPPRQQVDRLPQTSEGGQTWYPLIGFALLMMSSLRLQLRLKRKDRGDDDENRD >NZ_AP012541.1|WP_003563543.1|558783_559485_+|WxL-domain-containing-protein MKRVNYMSAGLIAMTLAGVMLPITSVFAADEPIKKTSVGEVRVGVDPDNPDPNNPDNPDGSKDILSLVKVPDLKFKSVSVEQLATGQQTLPLTSNTVTDKPVKNEPAGNASDGNNQGLLNITDYRGTGAGWKLEAQAGELKNAAGQKLAGSLLLAGVAKTDETDNNPTAISQAELVLEGSGVQVWNAASGQGQGRNTGVFTSADTVLKLSQNTAAYGGKYQTAITWTLTNAPS >NZ_AP012541.1|WP_003563579.1|569688_570561_-|methylenetetrahydrofolate-reductase-[NAD(P)H] MKINQCFKDHQVISFEVFPPRKNASNIALTPILNTLDAVKEADPDFVSVTFGANGNKPHMGTLEVAKLIKDEFDMEPVAHLPAAQLTREQVDAELRGFQDAGIDNILALRGDIPKSGRVSNDFPYACDLIEHIHQVGDFNVVAACYPEKHPESPDVVSDIHHLKEKVDSGASQLISQLFFDNQVFYRFRERAQLAGINVPIEAGIMPVINEHQIERMATMAGVNLPPKFVAMMQHFSGNKEAMRDAGIAYAIDQIVDLLVHGVDGIHIYTMDNPTVVKRIAAATQTIRNA >NZ_AP012541.1|WP_003662789.1|570538_572824_-|5-methyltetrahydropteroyltriglutamate---homocysteine-S-methyltransferase MTTTIIGYPRIGEHRELKFATQKYFKHQITAQELQEQVKALRQHNWETVQAAGINQIPTGDFSFFDNTLDVANLLNIVPKRYQALGLSPLDTYFAQARGYQGEAGDVKALAMKKWFNTNYHYLVPEFDQDTQIKVTDWQLFDQFEEAKALGINARPTLVGPYTLLKLSRFIDVTPDDFVTDLIAAYTDIIGRLHAAGAEWIQVDEPALVYDQTDADLALFERLYTPLLAQKQSAKVLVQTYFGDLTDSFDRIRKLPFDGFGLDFVEGHANLDLLKTQGFPADATLFAGIINGKNIWRTHYADALATIKTLAKITDKLVLSTSTSLLHVPYTLRNETHLKPEEKQYLAFAEEKLSELHELDAIFETGADHKAYQANVALFSKPRYAENKALNEKIAALTPADYTRTPERKTRLAIQAKAFKLPLLPTTTIGSFPQTAEVRRNRAKLRRHEITEEQYTAFNHKEEIEWIRFQEEIGLDVLVHGEFERNDMVEYFGENFGGFRFTDNGWVQSYGTRGVKPPIIWGDVYRTKPITVAETVFAQSQTDHLVKGMLTGPVTIYNWSFPREDLSQKTSVEQIALALEDEVLDLEKHGIKIIQIDEPALRENLPLRKKDWYPKYLDWAVPAFRLVGSKVKPETQIHTHMCYSQFGDIIKAIDDLDADVISFEAARSDFSLLDILKATHFQTHVGPGVYDIHSPRIPSKDEIVHIIHEILKRLPADHVWINPDCGLKTRDVPETKASLINMVAAAKQVRKELTHENQPVL >NZ_AP012541.1|WP_003662791.1|573824_575543_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MRVLFPYIKKYRWDVIWSVLAILIVAFATLWQPHLLQVIMNAIMKNDKQTVWINGLYLIGLAIIGIIGGIVNTIYAARVALGVATDLRADEYAKIQSLAYADVEKFSPSNLVVRMTNDINQVQQIIMGFFQQVTRIPILFVGAVILAIMTLPELWWVIAVMMILVFGVSFFSFSHMGKYFGRMQQLIERVNTLARENLMGMRVVKSFVQGANQIKTFAESSDEMRDVSVKIGNLFALLMPAFFLVANLAMAGSIWLIGQDITSHPSNLAAITSFINYLMQILFAIINGGFMLTFASRALVSLKRIQEVMDTKPSMTFVSGPHRDLDGAVEFDDVTFTYPGDEKPTISDISFKVKSGEMIGIVGATGSGKTTLAQLIPRLFDPDTGIVKVGGHDVRAVTEADLRKTVGFVLQRSTLFSGTIAENLQQGNPNVNLDAMRWAARIAQSAEFIERLPRTYNAEVEERSSNFSGGQKQRLSITRGVIGQPKILILDDATSALDAHSEKLVQEALAHELGDTTTIIIAEKISSIIKADRILVLDEGRLVGSGTHHDLVQHNDVYGEIYATQKALEEGV >NZ_AP012541.1|WP_003662794.1|575547_577329_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKDLKNAGKFYAHYLKPYWIEFLITTILVGISTWAIVVAPTYMGRAIEELATYVQQWMNPATRAQATFTTFNHTLAIFVLLYIIDATSILISSLLLSKISGYSTGTMRVGLFRKMQRMKVNYFDSHSDGDILSRFTSDLDNIFNAMNQALIEIFLSGAQFIGIIWMMFTQNATLAWITMASTPVAVGLSAFVMHQASVSVDRQQDDIGRLNGYINEQITGQKMLITNGLQQESVAGFQPYNAAVRKSNLRGQIWSGILNPLLMGLSLLNTAIVIFAGSWLALNGSLSQGAALALVVVFVNYAQQYYQPIVQLTSLFNMIQLAITGARRITEVREQPDEVDPPEGKTLDGLKHELLIDNVHFSYIPGKEILHGVTIKVDKGEMVALVGPTGSGKTTVMNLLNRFYDVDSGAITFDGVDVREFKLASLRQNVGIVLQDPQLFSGTIRDNIRFGDPDADQARVEAAAKQANIHDFIVSLPEGYDTFVSDEQSVFSAGQKQLMSIARTILTNPRLLILDEATSNVDTVTEAKIQAAMDNVIQGRTSFVIAHRLKTILNADKIVVLRDGNIIEEGSHEQLLAQNGFYAELYHNQMVFE >NZ_AP012541.1|WP_003662795.1|577490_578735_+|OFA-family-MFS-transporter MSKRRYLVAIAGILLHLMIGSVYAWSVFTGPIAKQTGWALSSVTVAFSIAIFFLGMSAAFMGRLVERFGPRLTGTVAALLYGSGILLTGLAVQLESLPLLYIGYGVVGGLGLGAGYVTPVSTIIAWFPDKRGLATGMAIMGFGFAAMLTGPIAQNLIAGIGLVPTMYVLGTAYLLIMLTAAQVIRKPRPGEVPAADIAKSVSLTGTAMTANQAVKTRSFRYLWLMFFINITCGIGLVAVASPMAQQQTGMSAATAAMMVGVVGLFNGFGRLAWATLSDLIGRPLTYTLIFTVDVAMLAGILVFSSPLLFGIALCLIMSCYGAGFSVIPAYLGDVFGTKQLGAIHGYVLTAWAVAGVVGPTLLSLSDQYFHSYTYSLIFFVALELVAFILSIRIRRQFSVVARDEKVTDSLEREH >NZ_AP012541.1|WP_003563589.1|579021_579738_+|trehalose-operon-repressor MRKYDVIYQDLKDKIEAEIYTTGSLLPSENTLQDMYQASRDTVRKALRLLKDDGFIQSQKGRGSIVINRQEYVFPVSGVVSYAELAKQLHLQTRTVVLANHFAALPAKSFKDVDPDVEVKQMRLLKRVRYLEKEPDIIDIDYLDPRVVPPIPESVARDSLYAYLEGQIGLEIAYATKEITVETATEEDRRYLNLPEGAMVVVVRSCSSLADTRKFQYTESRHRADRFKFHDFARRARP >NZ_AP012541.1|WP_003573845.1|579963_581610_+|alpha,alpha-phosphotrehalase MGFHNKVIYQLYPKSFYDSNGDGVGDLRGIIDKIDYLKSLHVDMIWFNPFFVSPQYDNGYDVADYRQIDPRFGTMADFDELAKKLKAAGIDIMLDMVLNHTSTEHAWFQKALAGDKHYQAYYYIRPPKPDGSLPTNWESKFGGPAWAPFGDTGNYYLHLYERRQADLNWHNPAVRQEAAAIINFWRAKGVHGFRFDVLNVIGKADKLVDAPPSVASKTLYTDTPIVQDYLKELAANSFGQDDNRVTVGEMSSTTIANSIAYTKPDNHELSMVFQFHHLKTDYKNGEKWSKVPYDFNALRDILHTWGQGLDQGGGWQALFWNNHDQPRAINRFGDVGQYRVKSAELLAAAIHLSRGTPYIYMGEEIGMTDPDYTSMADYVDVEAKNAYAALLGKGMSEKEAFGIILAKARDNSRTPMQWDASDHAGFTTGTPWLRPTNQAAINVQAELAHGEIFKFYQQLIALRKQYPVISDGSYTPFGTEIDRLYAYIRTYGTQQLLVLNNFSDKTMTVPLPEKFQTAKVLITNEATLTPTATMTLPPYATIGLLQKA >NZ_AP012541.1|WP_003662798.1|581700_583704_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MADTKKLQLMAPVSGLAMAITDVSDPVFSQKMMGDGFGIDPTDGQIAAPVDGRIMMIADTKHAIGIKADNGAELLVHLGIDTVELKGAPFEIDTAMDARVKAGDLIGSMDLDAIKKAGKKTTVIVAITNSKEVLDHLDVNAGEVNRGEEVAVMTPKPMAATAAAAPKNESKYAATARQIIADVGGSQNVNSLIHCITRLRFYLKDEQLPDVDTVKNIPGVIDVARANGQYQVVIGQAVTDVYDEVIKQLGPGYSNAEGTAQAIQETQLEAQDTSGWGRVKHGLQALIGTITGSMIPVIGLLAASGMLKGILNILTTWGGLSVKNPTYEIINAMGDATFYFLPVIVGFTAAQKLGSDPVIVGIIGAFLIYPSIAQIATTGKVSGTLLGMGINANFFGLPVHIANYTYSIFPMIFAAWMAAKLEPWIKSWMPLVLRMIFSPLVEIFLVGMTVVLVVGPLITVASGAITAGIQALLSLTPMISDAIIAGFYQVLVIFGLHWAVIPIITAQLSSAHPESVLNGIVSISMIAQGAGALAVWVKTKHNPALKGLSLSAFISACCGITEPAMYGVNLKYGRVFIFASIGAAIGGLVNGLLGVNMYGFTGSFLGFPSFAAPGWANNPNNLWNFWIASIVTLVAAFLLVYFFGYKDADANQAKTAPKKKRLGKTVE >NZ_AP012541.1|WP_003563595.1|584044_585349_+|serine/threonine-transporter-SstT MYKRYKDVSLILKIVIGIIVGAVLGVMVPSWSFIDVLGKLFVGALKAIAPLLVFLLIMSAISKYRSGAKNHFGTVIVLYLSATLFSSIAAVAVSYLFPIKLVLPGAMKIAESAPKDLGTVVTSLLTNAVANPISALVEGNYLAILFWSLLIGSGLRLTSAVTKKVVTELADTVSAVAQNVIQFAPFGIVGLLHESLSKTGVKGVMAYGQLLMLLVATMVFVYLVVYPFMVWLMTRQNPYPLTFWTLKVSGIPAFFTRSGAVNIPINLKASKDLGLNEESYAISIPLGGSANSGGAAITVSIMTLATANTMGVHVSIFLALLLCFLSAISATGVSGIAGGSLLLIPMAASLFGISNDIAMQVVGIGFIIGVVQDSVETAVNSASDLLFTATAEYADDRREGHPVDIRAKVKAAGKGTAEVVTPEKANEAEESEQV >NZ_AP012541.1|WP_003662800.1|585570_587046_+|amino-acid-permease MGQVWQRLIRKEDPSVYEDKDSHLPRVLRVRDFLALGVGTIVSASIFTLPGVVAAKHAGPAVSISFLVAAIVAGLVAFAYAEMSAAMPFAGSAYSWINVVFGEFFGWIAGWALLAEYFIAVAFVASGLSANFRGLLAIIGVNFPKALANPVGTDGGMVDLVAVVVMVLVGLLLSRGVSSAARVENILVVMKVLAILLFLVVGLTAIHPENFHPFFPAYHLNADGTPFGGWQGIYAGVSMIFLAYIGFDSIAANSAEAIDPEKTMPRGILGSLLIAVFLFVSVGLVLLGMFPYQDYANNAEPVGWALRHSGHAVVAVVVESIAVLGMFTALIGMSMAGSRLLYSFGRDGMLPQKLGKLNSRKLPNHALAVLITIGVLIGAFFPFAFLAQLISAGTLIAFMFVTLGIYRLRPREGQDIAKPRFRMPLYPVLPAVAFLGSLIVFLGLDIQAKLYSGVWFLIGCAIYFLYGMRHSALTKGSAVEQETAALGQEKD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP012541_2 | 650403-650510 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP012541_2
|
1 spacers
spacers of NZ_AP012541_2
>2.1|650427|60|NZ_AP012541|CRISPRCasFinder GGGTCCTTATGCGTAGGTTTCTGGGCCGGTTTGCGCGTTTCGGAGTTCAGCAATATCAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP012541_2
The CRISPR arrays of NZ_AP012541_2 >merge|NZ_AP012541|2|650403-650510|CRISPRCasFinder CAGGGCTTTGGTCGTTTAGGTTCGGGGTCCTTATGCGTAGGTTTCTGGGCCGGTTTGCGCGTTTCGGAGTTCAGCAATATCAGGCAGGGCTTTGGTCGTTTAGGTTCG >NZ_AP012541|2|2|650403-650510|CRISPRCasFinder CAGGGCTTTGGTCGTTTAGGTTCG GGGTCCTTATGCGTAGGTTTCTGGGCCGGTTTGCGCGTTTCGGAGTTCAGCAATATCAGG CAGGGCTTTGGTCGTTTAGGTTCG
>NZ_AP012541.1|WP_003563758.1|650152_650296_+|hypothetical-protein MASLSKEQKKALIAKVEKERQDHPEKKSKKSGFETIDEEAERLESEN >NZ_AP012541.1|WP_003662849.1|646928_650054_+|SMC-family-ATPase MQLKQLHMQFFGPYADAVVDFDDFRTSPLFLISGPTGSGKTTIFDALIYALYGETSGERDGEQMRSNFAGNSDLTKVTLTFDHDGKHYLIERQPPQLQSKKRGDGLTEVKAKVLLAISSDEKQVAEYRKKNQVQEQLDAVLHLDASQFRQIVLLPQGDFRRFLDADSNAKEDLLRDLFGTQLIQRWQTAMLAQMKAKGAAIQDQERMLDVLMSQFDFETAPDEHATMADKLSLMRATVASQAKVVTARQATAAQSHQRYQEAQTALQQGQQLAQAFTEREQAATALAKLAEQKQTHQKQLKQIEQLTWVQQHENAAQRVQKAGQDLKAAIVQSEQTQAAVTTTEQKFSLDKQALARLQAKSDQIEAQKKQLNSLQAVQQQLTAIAEQNKQVIKQAAIVNEAELALAHAQQQLTDAQTVKTQQQTSLDNLRLDELITTVNTQRNLLAALVPQAANYQEAQADVAQLSMAIKKTKVTLEQAETQVAATASHLNKLQQTQIRQQIAHLAAKLEPDSPCPVCGSTSHPHPALVVDEPLVSEAALKQADQERQKAAARKTMVETQLANLETQLKTAKAKTTQAMQAFTEHWQEQAKLIAGVADKTGILQQLTALKTLAATNEHQLTEAQTEHAALQVALKKSDKAITTGTTKVQQCEASLNTARIDAAEAQSALKTMQKNLPAEATDLATVAAQATTLQTTITTYQAQLQEAQARVNALDRQLAGLQADEKHAAAQVTALTKEQAEAKATFTIAVTQYFGADGKQRFAELQLRVSQLPLLNEQVQTYEHTQLKQQTLLDAANKTIGTQAQPQLDQLEAEATAAETTATNDQTALIKISQTHDAAEKLAKQAATIFTANQTALAAYADLQTLATVMNGNGPKKLSLERYVLQAYLQEILNVANSRLQVLSNNRYQFVLHTSLGTQKIHSGLEIDVYDDQVGEKRAVQTLSGGESFIAALSLALALGEVIQQESGGINIDALFVDEGFGSLDANSLDVAMNALESLEGESRLIGIISHVTELRDNIPDQLQVEPAGTGRSRLKILHSA >NZ_AP012541.1|WP_003592493.1|645807_646929_+|exonuclease-SbcCD-subunit-D MRFLHTADWHIGKKLNDFDLLEDQQAVFEQLVETAEQHKVDAIVIAGDLYDRALPSEAAVSVLDNMLIKLNRDHGYPLLVISGNHDSAVRLRTGRAWYAATKMFVNTQVAEAFAPIELDGVQFFLLPYFEPFAVRDYFQDKTITNVAQAIRPIVVKMKTLFKPNMRHILVSHFFAAGSDHSASETKVNVGGLDAVPLDDLAAFDYVALGHLHNHHALHGEPKIQYSGALLKYAVSEAHQEKGVYIVDTETMDREFVPLKPKHDLIELKASYADLTAPAYYQQQDRDAYIGIDLTDTQVIPNVMAQLRQIYPRIISLRRENGVNAVKPLQERQRDLDPMSLLQTFFKDMTQDDLSAAQIKWAKAGLTTAKKEQA >NZ_AP012541.1|WP_003563745.1|645120_645747_-|HAD-IA-family-hydrolase MNTFIFDIDGTLLDNVEAYLYGLQKTLRRHGREVPIHELTWTNGRAGVDSLAELGFSAAEIPEVHEQWREDSKEFLTDIAWFPGMQHALNQLKQTYKLGLVTSKDKTQFIEEDKKFHFSPYFDAIVVAGEAKRNKPFGDPITLARERLGSEPASTIYIGDTPTDAQAAADAKVAFALAGWTTPPSNEVMPRVAVLQQASDLLTLPTLA >NZ_AP012541.1|WP_003563743.1|643900_644677_-|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MLKDERLLTIRNLVDRKGIVTVNEIGESLGVSTMTVRRDLEELADQKELVRIHGGAQSTNFKPLTELSRNEKRSIHVNEKRKIAATIAALIIPGDTIYIGPGTTNEMIAQYLKKPDVRIITNSLPVFQSFQDRADFFSLQLIGGRLRARSGAFIGSLANEMLAHLTTTKAFISVNGIADNHISNASPEEGQTQRIALDNAGMKLVVADHFKLNRQDFYSFYDLDQTDGLITDPGISRDDLQHYNTFTHVITDKTNKGE >NZ_AP012541.1|WP_003573960.1|643467_643896_-|galactose-6-phosphate-isomerase-subunit-LacA MDVIIGADKDGFAMKEQVKKYLEDHQYRVKDMTPEPAEDFVDSSLAVTKELLSGDAHKAIMFDRYGVGSAMASNKVKGMVTAVVEEENTAHMTAEHNGAKAIAIGTGITGYDRALVIIQRYLDTEYAGGRHQIRLDMLEKMI >NZ_AP012541.1|WP_003662847.1|642904_643423_-|galactose-6-phosphate-isomerase-subunit-LacB MIIAIGNDHIVTMQKIEISNMLKDMGYTVIDEGTYDTHRTHYPIYGKKVAEDVADGRADLGIVMCGTGIGISTAADKNEGIRAAMCDDVTSAVYARDQLNANVLGIGGATVGIHMIQDIVKAYLDATYKETPENKKIIDKIDNIAKPNPEQKDNPHFFDTELEKWAEGVYHD >NZ_AP012541.1|WP_003662846.1|641864_642866_-|tagatose-bisphosphate-aldolase MTVTLTAGQYKHLQQLSDDNNVISALAIDQRGSLKKMLAAAANKPADETTIVDFKKAVSEELTKYASSILLDPEYGLPAAKVRAPQAGLLLSYEKTGYDATEPGRFPDLIDDQSALRIKNEGGDAVKFLLYIDPDEPDAINDRKYAFVERVGAEAKANDLPLFLELVSYDGTLNETGTAAWAKVKPDKVIKITKEFSKPQYNVSVLKVEVPVDQKFVEGFTDEGMTPVYTKEEAAKYYKAQSDATDLPFIFLSAGVSNELFLEELKFAKQAGSTFNGVLCGRATWKPGVKPFAAEGEAAGKAWLQTEGKANIDRLNKVLAETATPWTDKVEHA >NZ_AP012541.1|WP_003662845.1|640811_641750_-|tagatose-6-phosphate-kinase MILTVTLNPSVDVSYPLEHLKIDTVNRVKTVRKTAGGKGLNVSRVIHMLNHEITATGFIGGYFGKWLENQLDRDGIDHDFFPIDAETRSSIAMLHDGGEQTEILEAGPTIAAEDAEKFLSHFDSLLDKSDLITISGSMPQGLPADYYTQMIAHAGQKNVKVLLDTSGATLKSALEAPVKPLLIKPNEEELGGLLNRDVDKTDYTALKHDLMDPIFDGVDWIVVSLGAAGAFVKHLDKFYHAAIPKIKVVNPVGSGDSTLAGLAMGIHDGKSDEDIMKTAMTTGMLNTMEAETGFVNPAKFDEYFAKVTIESY >NZ_AP012541.1|WP_003662844.1|640109_640790_-|DUF4867-family-protein MSTIDQLRTLNPDKTIHSLDEAAFADYGVTYAQYDVSELKTFMDQHVTIPAPSEANLYIPSNPDMERIPVVQQIGRDVYAGLPIEAGECAGHADALTAVEFHQGSEVNVFFTDVVMVIGKRGQMHDGQFNAEKDAKLFFVPAGTVVEFFSDTLHYSPCEAHASGFKFIVMLVRGSNQPLPADYHTDNKLIVKQNKFQVVHASRTDKIKQGIQVGVTGELVQVKHLD >NZ_AP012541.1|WP_003573966.1|650954_651431_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MANEVLNRRNNELMNNVNDPFFDNLARRFFGPVSDWMDWATPAITSTAVNGLLTDVKETKDAYEVHVDVPGIDKNNIKMNYHDGVLSINVHKDDITDHADKNGNVMMSERNYGTMSRSYQLPNVDASNIKAAYQDGVLNITMPKLTESKESGHNIEIQ >NZ_AP012541.1|WP_003659920.1|651424_651658_-|hypothetical-protein MFRFLIAPFRALQKNHPNDHTYRWDDFNDSMITATAAILIDFCLLTHGFCPLTAEVPLLFMLAMQSVNLGSADDEHY >NZ_AP012541.1|WP_003592500.1|651830_652934_+|A/G-specific-adenine-glycosylase MTNKLMNWPPEKVAAFQKALLNWYDQHARQLPWREDHDPYHVMVSELMLQQTQVQTVIPYYERFMNQFPTVGALAKAPEAEVLKAWEGLGYYSRARRLQQAAKQIVADYGGVWPQTSETLQTLSGIGPYTAGAIASISFGEPVPAIDGNAFRVFARLFKVDADIARPQTRQLFFDLIQPLMPKDRPGDFNQAVMDLGSSYMSANHPDPAHSPVRDFDASYRDGVVSAYPVKTKKPRPVLHRYFALVICSEKGYLLEQRPSTGLLADLWMFPLVDMADLESTMMSAQLDEVSTLFAASSGMQLTFADLGAKTVKHTFTHQQWQLTLIGVETAASDLSFLPARWVKADHFSELALPTVQKKLNAALGMN >NZ_AP012541.1|WP_003569189.1|653144_653930_+|alpha/beta-hydrolase MTVNVTRDIAYGDAALQKLDFYEPEKSNGAAILDIHGGGWFRGEKNKEGEMAERFAALGYTVAVPNYRLAPEAFFPAARDDVLAAFSWLREHTKGLQLGVFGSSAGGSLSVDVGLAEGVPTVSWSGIFDIRQWFADHPAVVAQPDTKTDFVKTASAKIDQGGRNDPFYKWFILNYVDSDETKFPEVEPFDRLTAQAGPLYLANSQEEIIPISGIYQLAHAAEKLGLPVTLQSIPGGQHAEGYLDEAWQGTVAFFAQYLLKG >NZ_AP012541.1|WP_003563776.1|653932_654601_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase METLVVVSHPEIEKSDTQQFLKASAASLSQVVWHHLDSRLPFDVTAEQQAITSADRLIFQFPLYWYMAPASLHQWLTDVWLKQFVYDARGGLLHGKSLGFVVTFSQPATAYQLGGSVGFSISQFLTPYAALAAKTGLTLLPPLTIAQFANQTDLEHQQLLVRYQQYLTLDHPDRPDEQAQWFIDRLSGNADTQLLADQLAAQTDDIDRLRLTLHELKAGESE >NZ_AP012541.1|WP_003583702.1|654597_654777_+|hypothetical-protein MTTDEQWLVNAAAVQEKQATSYENAAFFKALQAFVTQQAKRRESLEGEIDGRSWNHEQW >NZ_AP012541.1|WP_003573971.1|654854_655379_+|DUF308-domain-containing-protein MQTMFDRLQRWSWLRGLLMILIGAWILIAPRQVYRSFLWIVAAVLIIAAIPKLIDGFSARKASGTYGTSLFTGGFYLLLALMVPVIVRPLMSLGPLLLGIVLMIYGVNKILSARNRQQFVNVSVWPTVIYGVVLLIMGFIMALNPFRTVMMVFSFFGGLLVVMGILQLFTRPRA >NZ_AP012541.1|WP_011674244.1|655611_656244_+|hypothetical-protein MHKFDWREVERDEYSRSEEPSFVKLTTRSYITAMGVAPDRVTDQAFTSLAAAVTQIAERISEGPDAGIDIPNFKAYHPYPLQAVWSGGDKISKRHIFRLWLKQPLFIHEDQFEAALTQLHFEPAIAQQLHLEQLAEGFEIQSFNSTPLTDEAPAIARIQTVINRDHLVPKFDDRHREVYLEGYQGEVPVLYRVPLDENFGEVGDEQVAYN >NZ_AP012541.1|WP_003563790.1|656315_657137_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MANEFPQVMTIGGTDSDGSAGVQADLHSFFMRGVYGATILTAAVAGNSYGIQDSMVMPLPFIDAQFKSLAADLHIRAAKTGMLADRALVQNIIKNWQQYDFGALVVDPVIITKHGAMLLEQDAYDAVKNELIPLATVVTPNHYEAEHLTGMKLDTDAQTEAAAHQLQDSGAKNIVLKGAHDDPTQPTVRDFVLLESGKSFWLSEPYHATDRVNGTGDTLSAVITAEIGKGNSVEEAIRIAKRFTNQAIGHPIAVGHQYGPINHWANKIVYPQF >NZ_AP012541.1|WP_003563792.1|657310_658372_-|hypothetical-protein MLNLNDAHLAALITKPLTVAQARQQIGTAYQQEADRLANSPLWESNDEALTALLASYTNLLGNKLYQALQNLTSIPTPFLQTLWLQDTTADAHHSEIAVIQTTQDDNNTLLTIVDPLSDDAKLKAVNLPTLLQITAADSNAMTYDAETVKALSALAKALNQGGYRFTTVDETVLQPVNGLSFKTRFDNLKPLVAKKAVIKAGDFSIGTSLDQDAKVLGYQVLDEDGHDWQDLGSEEVKNDRFEWASTTVPQELVNHRLKLIIRVSAGSNSPALDELFVIASNNAILMRQGAKAGVYELPLPNQKIFTVMINPANNMVYLKYPDPETQIIELNHQYPFIGEWLKAVLPQKRAFN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP012541_3 | 1808375-1808445 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP012541_3
|
1 spacers
spacers of NZ_AP012541_3
>3.1|1808398|25|NZ_AP012541|CRISPRCasFinder ATCTAAACGCGCTCACTGGCCCAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP012541_3
The CRISPR arrays of NZ_AP012541_3 >merge|NZ_AP012541|3|1808375-1808445|CRISPRCasFinder AAACCGGCTCAGTTCACGCTCTTATCTAAACGCGCTCACTGGCCCAGAAAACCGGCTCAGCTCACGCTCTT >NZ_AP012541|3|3|1808375-1808445|CRISPRCasFinder AAACCGGCTCAGTTCACGCTCTT ATCTAAACGCGCTCACTGGCCCAGA AAACCGGCTCAGCTCACGCTCTT
>NZ_AP012541.1|WP_011674604.1|1807125_1808283_-|serine-hydrolase MSGKHRYIWLGVMLILCAVSIGAGTYLWQQNSRSAVNTKSKSAKTVTKAVRQDRGKSKEEILAMTLDRAATTTEGQPLEQELTNDKFIGSALIIKHGKVVFNNGVGDADTTTHRRNGPTTLFQIGSIQKAVTAVALAQLAASGKLSLDDPVGKYLTGIKTGDQVTLRMMVAMRSGFSLRKYQPTVMDDANIIQWSIANLTYLPQDNYAYQAVNYVLLAGVIEKVAGRSYEQQVKNNIFDRLNLKHTGFLPAMLTDPERAITYTGPAANPYQTAIGEPAVWYNRELGTGNVYTSTGDLYRLLRGIDTGKVLPLSTLKTLRNRNDGVYNAGIYNHADFYSTNGVVAGQMASTAISHDGQNAVILLSNYNSHALNLHDLAVHLFSELG >NZ_AP012541.1|WP_003566079.1|1804157_1806818_-|cation-translocating-P-type-ATPase MANKPPYALSSEAVLKQEQTSLTGLTKEAAQTRLNENGPNELAQAEKKGMLARFLDQFKDFMIIVLLVAALIAGFLLSEWADAGIILAVVLLNAVFGVFQESKAEEAIDALKEMSTPNAHVRRGDQVLTIPSSQLVLGDIVLLEAGDVVPADLRLVESANLKIEESALTGESVPVDKTTAPLDADDVGIGDRTNMAFMNSNITYGRGVGVVIATGMQTEVGRIAGMINSAEETNTPLQENLKSLGKTLTVMILVIAVIVFAVGIWRQAASLPEMFLTAVSLAVAAIPEGLPAIVTIILALGTQKMAKRHALVRKLPAVETLGSTDIIASDKTGTLTQNKMTVEKVYYDGQLNDASAGIHGGNPLMTIMNFANDTQVQDDGKLLGDPTETALVAYGKTQNYDVAKALTGEPRIAEVPFDSERKLMTTVHRRADGKLLVATKGAPDELLKRVTDLATGENTAPLSDSERDAILKANKDMATQALRVLGMAYKVIDTLPEKVDSDTVENHMIFAGLVGMIDPERPEAEAAVAEAKAAGIRPMMITGDHRDTAEAIAVRLGIIDQGDDDAVITGAELDQQSDDEFAKNVAKYSVYARVAPEHKVRIVNAWQKKGKVVAMTGDGVNDAPALKAADIGIGMGITGTEVSKGASDMVLADDNFATIVVAVEEGRKVFSNIQKAIQYLLSANLGEVLTLFMMTMLGWDLLAPVHILWINLVTDTFPAIALGVEPTEPGIMKQKPRGRKSNFFSGGVGPAVIWQGILEGLLTLGVYWIAITYPVHSGSAAIHADALTMAYATLGLIQLFHAFNVKSIHQSLFTVGAFRNKAFNWAILASFVLLAVTILVPGFNGLFHVTSLDWHQWITVLGAGVAMIVIVEIVKVFERARRKQRA >NZ_AP012541.1|WP_003594949.1|1803583_1804021_-|hypothetical-protein MNKQQMKLANYGTTINAVVEATQDNQEKMAPLFEPLRKAIDENKLADYDLEAYQQTQTVFSEGTSNYEALLVKLQQVAAPVRLLGPHHTLVRDFAAFTEACKAMTASLHADRQVDVAAFNAAEKAQDEAIQKFTKQIQKISVMLS >NZ_AP012541.1|WP_003566076.1|1802101_1803097_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRMLGLIFIMAAFLGIAYFQTGTTTPQTQATPTVGILQLTTHPALDAIHKGIIDGLKEKGYVAGKNVKIDFQNAENDQSNLKSMSERFTEEHAAATVGIATPSAQALANVNQKTPIILGAITDPVAAKLVKNVKRPGGNITGVSDQAPIAAQLKLIRQIMPNAKTLGVIATSSDDSAQTQAKMVEKLGPKQGFTVKRYAISSTNDLNQVATQMVSQVDAIFVPTDNTVASAMQTLVAVANTRKVPIFPTVDTMVEQGGLATIGLDQHHLGVLTGRMLADILSGKTKPATTPIHFETTGKLILNEKQAKLLGIDLPSSLIKTAEAKGTVIK >NZ_AP012541.1|WP_003660558.1|1801205_1802105_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MSIGVSAIGQGLLYGLIGLGLFLTFRVLDFPDMTVEGTFPFGAAVAVSAITHGISPIVATLLATGAGMLAGLATGLLTTKGKIPVLLAGILVMTGLFSINLRIMGRANLSLLHQANLFQTAFLKDLPPYFNSVVIGVIVAVVVVGLLMLFLNNQLGQAFIAAGDNPSMARSLGIDPDHQMVLGLMVGNGLVGLAGGLLAQNNGYADVNMGIGIIVIGLAAIIIGEVVFGELTLSQRLVAVILGSILYRFVLLVVLALGFNADDLKLISAVVLAIAIMVPQIDHRLRLRRVLQKGVQAHG >NZ_AP012541.1|WP_003579766.1|1800460_1801213_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MAELTLTNVTVNIPVGTEVKTLLQDVNLTVAKGEFVTVLGNNGAGKSTLFNAITGDMPVSGGTITLADQTLNGKRPEQRARHIARVFQDPKMGTAPRMTVAENLLLASHRGQRLTLRSRGMTASKAALKTLAAKTGNGLADALDKPTEQLSGGQRQALSLLMATMRKPDLLLLDEHTAALDPHTSQAIMQLTNEIVSDQQLTCLMITHQVEDALRYGNRLIVLDAGKIVADFDQAKKAAMSRDDVLAFFS >NZ_AP012541.1|WP_003594944.1|1799866_1800319_-|SprT-family-protein MTDQELQARVETISLKAFHQPFRHHAVFNNRLKTTGGRFHPADMNLDFNPKLFAVYPASVTDGIIKHELVHYHLYDHHRGYQHRDHDFKQLLTAVGGSRFAPPLPVNGHQYVYVCTHCGRQFVRRRHIDVRRYACGVCRGKLRLQKTLAS >NZ_AP012541.1|WP_003594941.1|1799409_1799874_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MLREAQFIDLGAIVHLYQQLTAEMATMAPETYRPLTSDNRQYFADYLQNDLARLFVTETAGTLSGFALVVLARTGDNAEFVPQHFAQLIDLYVIPAQRHQGLAKQLMDAVTAFAKSHDATFIQLNVLNANQTAQQVYAKAGFEPVSLILQKPLN >NZ_AP012541.1|WP_003660559.1|1798076_1798682_-|ECF-transporter-S-component MTQRGKAYNIAIIGILGALIILQAYIPMLGYVQIFPAWPAISTIHLTVIIGGIVLGYGGGASLGLLWGLTSLIRAYTSATDPVTLLLFRNPIIAIVPRVMVGLVAAFIFHQLFKKKQTPLAQTVKMVFAGVVGALTNTLLVIGFTWLMFASKAAQIVPGADATNLGWLLMTALAINAVAEALLGGIVTPILGHALLRFRRK >NZ_AP012541.1|WP_003566065.1|1796858_1797998_-|M20-family-metallopeptidase MTEEEQVVDLLSAMVKIPSVAAKEGQVADLIETFLAPELKAGLIKRERISYAPGRDNLVLTIGNPNAQRWLGVDGHMDVVDPGNVNKWQFPPFSAHVEDGKLYGRGATDMKSGLAAAVVAFKQAAHEKLDHGIQLMATVGEEVDNDGARQLSAAGYGDRLTGLLVAEPGNSNVDAAERGIIDYTLTAHGKAAHSSRPDLGANAIHGLFAFANAALTATAPLQAKEDPILGHATHNIDIIHGGNQINSIPESAYLRGNIRTTMIADNDAFIAALKQAAKTTVPKGVRLSLSIDSVLGAAAASPDNDLIQLVQTARQRAGLNRGQVAYRTGITDAALFYHDGLDLAIYGPGNETSHETDEYVTLKDVFDSVKVFKDVFMNY >NZ_AP012541.1|WP_041091527.1|1808549_1809377_-|ammonia-dependent-NAD(+)-synthetase MRPLQAEIIKALGVQATIDPETEVRRSVDFLKAYLKKNTFLKTYVLGISGGQDSSLAGALTEKAMQEMRAETGDDAYQFIAVRLPYGEQADEADAMAAIDFMHADVVKRVNIKPSVDAMVAAVEADGSKISDFNKGNIKARMRMITQYAIAGNNAGAVIGTDHAAEAVTGFYTKFGDGGADLTPLYRLDKRQGAALLKVLGAPAHLYEKAPTADLEDNRPALPDEVALGVKYKDIDDYLEGKDVTDQAAETIEKWYQKTAHKRHLPITVFDNFWK >NZ_AP012541.1|WP_003566087.1|1810575_1812039_-|nicotinate-phosphoribosyltransferase MTTQLGEGLTLHTDFYELNMMNTFFEQGISERNAVFEVFFRDLPFGSGFAVFAGLEHVMDYLNHLKFSEDDLAYLQSQTDYSDAFIDYLRHLKFTCTVKSALEGDLVFNNEPIWQIEGPLAQAQLVETAVLNMINYQTLVATKAARIRSVAGADPLMEFGTRRAQETAAALWGTRAAYIGGFNATSNVLAGKEFGIPISGTHAHSLVQAYGNDYDAFKAYARSNKDVVFLVDTYDTLRSGVPAAIKVANEFKGKINFLGVRIDSGDMAFISKRVRQQLDDAGYESAKIYASNDLDENTIQNLKMQGAKIDIWGVGTRLITAYDQPALGAVFKLVSIEDAAGKMRDTIKLSNNAEKVSTPGKKQVWRITRQDDGKSEGDYVALADETIDTQRSLYMFHPNFPYINKTVKNFEAKPLLQTIYDKGQQVYHTPPLQEVQAYATRSTNALWDEYRRILNPQDYPVDLSQRVWDNKMDLIKAVKSAVADREE >NZ_AP012541.1|WP_003566099.1|1812401_1813103_-|GntR-family-transcriptional-regulator MDAPVYIQIHNAIRADIEAGKWRVGDRIPSERDLAVTFKVSRMTLRQAIQTLVDEGILERRVGSGTYVANQKVQEKMSGVTSFTDLMQAQGKVPSSKTVSYHVAQPTSSEVEKLKLEPKEQVLRMERIRYADKIPISFETAAVPYNLVKNFTKKEMTASFYHTLEKKGGYVLGGAQQTVSAMLASERISEYLDIKRGEAILRLRQVSFLQDGTPFEYVRTQYVGERFEFYLER >NZ_AP012541.1|WP_003575514.1|1813127_1814273_-|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase MTVTVLKHATIYTGLERIDDGYVRFDDKILAVGDMFDYRAQSGEQTFDLQGKTLIPGFIDVHAHGGYGFDAMDGDADQIDEMATKMMTHEGVTTLFATTMTQSTENIDKAMRGVKQAAERNHIIQGVHLEGPFISKVFKGAQPEEYIKNPNVDLVKQWQELSGGLVKLITYAPEDEGSQAFEDYLLAHNIVPSVGHSNATREQMLHSKATHVTHLYNAQRGLRHREPGVTGHAMLEDNMYCELICDGFHIVPDMLRLAFDQKGPERIELVTDSMRSKGMPEGKSELGGQTVYVKDKQARLKDGTLAGSVLMYKDAFKNAMSFMDASLFDAVEMSSVNQAREFNLTSKGTLEVGKDADINVLDRNNDLVATYSYGVKHDTED >NZ_AP012541.1|WP_003594962.1|1814379_1815177_-|pyrroline-5-carboxylate-reductase MTIGFIGAGNMARAIITGLLAKNAVTPEEIVLHGGQPIHYEPYAAKIGAKAVASNQAVADTADIVFLAVAPKLGVPILKTIGPTLKQRQVPIVSMLTGVLLATLEDALGSQDQPILRIMPNVNVAINAGMTAYAANDSVAGQLDGLLDLLNVLGKTMALPEDQFSTFVALAGSSPAFVYLFIDSLSRAGVKYGLTKKQATAIAAQAVMGSAQNVLASEQSPFDLIDQVSSPGGTTVAGLLAMEQAGLMSAVIKGVDATIAKDRQG >NZ_AP012541.1|WP_003594964.1|1815189_1817166_-|S9-family-peptidase MAIKATDLFKLVSLSYPSATDDGYFVQENRISEADNTYYQRICFVNHRGGTIAYGFDQKHDRHPLLSPDQQWLAFLSQASDKTTQVFLQAVNGGTAKQFSAEKEGVSYFGWQADSQALFIQTTVGAKPKKTDKQWPQPVTVSRVPYKLNGVGLLPEHVAYELRVQRLRQKTSRLVMGREHEFEVGAISPDGQTLAFTAERLPDDPNDFSQATYLLNLADQQVTMVNDQLPQAALSPEAFSADGKQLLLVGSDNHLPNVSQSHLWHYDLATKTLQDVADDIDFDIPGHVNGDFQQDLSEKVADFATADYYLTIGFDHGKTSLYAGGPDEQLTPLIGGRRHVTDYALTPDHHGVVFTESTMTVPSRLSYFDLATEEEHVIYDPNRRVTRDMGLVTPQTFNFQRDGFEIEGWYFPPQQATASHPAILYVHGGPAVGYGYTFFHEMQFLAAQGYGVICPNPRGGLGYGEAFTAAVIKHYGQGDYEDCMASVDEALKLDTTIDPDRLYVAGGSYGGFMTNWIVTHTHRFKAAVTQRSIANWLSMYGTSDIGYFFTPWELEGKWTGDLSDVKSLWDFSPLAHIDFAQTPTLVMHSENDQRCPIGQGEEFYIGLKLHGVDTKFMRFPNATHELSRSGLPNLRLARLAALVDWFKTHSATEESHQA >NZ_AP012541.1|WP_011674606.1|1817494_1818322_-|metallophosphoesterase MVKIAFSVDNHFDVNRVDGFEMLKKQAAYLVEHDYQIYVNAGDTYNDFTKSLAYFRALQAEVGSAVTIRFLAGNHDMVNGATYDEIQSAVDPLYLHEKILPVPGTNAVIIGNNGWYDYSLGQLGNMKTDAEYAQWKRAFWIDSAIDAPVTDAARMQRVLTTTKAALQANQTHQMIYVTHFVPIREAMEYTVDRPPWQMATALMGSAKLGDLLTGRVSAVVFGHEHFRDAPKLLSGTTYYHQPLGYGLKRLFEWQSQDWWTEWRQTLVTLTVPTLS >NZ_AP012541.1|WP_003566109.1|1818383_1819850_-|peptide-MFS-transporter MNNSKDRTFMGHPRGLLTLSMTEFWERFSYYGMRAILIYYMYYAVEKGGLGFDQPTALSIMSIYGSLVYLSATIGGFISDRLLGSRRTVFWGGVLIMLGHIVLSLPIGATGLFGSIVLIVLGTGLLKPNVSEMVGSLYPEDDLRRDSGFSIFVMGINFGSLIAPIFVPWMADKVNFHAGFSLAAIGMFVGLIFYVIDGRKYINPADNTAPDPLKPEDVRPLVIRVVVAIAAVGVILLAMAGFNALTIANVISLITLIAIGLPIWYFVLMIRSKKVTKTERSRVIAYIPLFLAAMIFWAIEEQGSVVLALFAAQQTKLDFGFFKILPGNFQTLNPLFILLYGPLFAWLWMKLGKRQPTSPKKFYLGLIFAGASYLWMVIPVMLFGSSAKVSPLWLVMSWAIVEIGEMLISPVGLSVTTKLAPKAYSSQMMSMWFLADASAQAVNAQIVRFYTPNHEVAYFAIVGLVSVGFAVVLAFFTPRIEKLMQGVN >NZ_AP012541.1|WP_003591104.1|1820324_1822643_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MLDLKHIKKYYQTGDYTTKALDDVSVQFREQEFVAILGPSGSGKTTLLNVIGGLDRYDSGDLLLHGRSTKNFKEADWDAYRNNSVGFIFQSYNLIMHLSILENVELGLTLSGVSAADRRKKAEAALTKVGLKAHMGKQPNQLSGGQMQRVAIARAIVSEPSILLADEPTGALDTETSEEIMRLIADLSRERLVIMVTHNPQLAHEYAERTIEFKDGKILSDSRPFKDEEKTASFDLHRTKMSYFTALKLSFTNIMTKKGRTFLTAFASSIGIIGIAVVLALSSGFQKQIDNTQAETLAQFPITISTNATSLTAGAADNTKTSTFKTTSTVVAKQSASDKAQHTNKLNQKYIDYVNGISKKLTDNIGYTYGTGMNLLRDVNGTIKPVQFSTAKPSSNQTQRGLASASSSVYPVDREGGTSYLKKNYEVVAGSYPKHDGDVILIVDRDNSTNINALKNLGFDVKDGQKVKFNQIVGTKIKAISNNAYYQNVAGNVYVPTKDYANAYKQNDNRELTVAGVLRTRSKTSDGLLSQGFAYSDRLTKDLVALNKDSDVVKAQRASDVNIFTNQSVDKATKDQLITALGGSETPTQITIYPTSFKDKDKILSYLDKFNRGKKKADQVVYTDLAGTISSMTGGIMSAITIVLVAFAGISLVTSMIMIAILTYTSVLERTKEIGVLKALGARRKDITRVFDAETIILGVSSGILGIIIAWLLTFPINAILYSMTELPNVAQLNPIHAVILILISTILTVLGGHIPARMAANKDAAIALRAD >NZ_AP012541.1|WP_003594971.1|1823068_1823443_-|hypothetical-protein MAVWRMMFARPQFKHRQIKRMVDDLNREGNFGGMPIHRITLTRQTRELIYVDLEFQLTTGLTQPLFEQMAKYILVAVAGLAHAPQPIYLAAMANPFAKLNISYYIYPDHSLDLIYWQPLLRKPT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP012541_4 | 1820049-1820166 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP012541_4
|
1 spacers
spacers of NZ_AP012541_4
>4.1|1820078|60|NZ_AP012541|CRISPRCasFinder AAACGCGTTTATGAGGAGCGCGAGCTGGTCCGAGTATAAACCGGAGCATAAAGTTGCCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP012541_4
The CRISPR arrays of NZ_AP012541_4 >merge|NZ_AP012541|4|1820049-1820166|CRISPRCasFinder GGTCCTTATGTGTAGGTTTCTGGGCCAGCAAACGCGTTTATGAGGAGCGCGAGCTGGTCCGAGTATAAACCGGAGCATAAAGTTGCCGCGGTCCTTATGTGTAGGTTTCTGGGCCAGC >NZ_AP012541|4|4|1820049-1820166|CRISPRCasFinder GGTCCTTATGTGTAGGTTTCTGGGCCAGC AAACGCGTTTATGAGGAGCGCGAGCTGGTCCGAGTATAAACCGGAGCATAAAGTTGCCGC GGTCCTTATGTGTAGGTTTCTGGGCCAGC
>NZ_AP012541.1|WP_003566109.1|1818383_1819850_-|peptide-MFS-transporter MNNSKDRTFMGHPRGLLTLSMTEFWERFSYYGMRAILIYYMYYAVEKGGLGFDQPTALSIMSIYGSLVYLSATIGGFISDRLLGSRRTVFWGGVLIMLGHIVLSLPIGATGLFGSIVLIVLGTGLLKPNVSEMVGSLYPEDDLRRDSGFSIFVMGINFGSLIAPIFVPWMADKVNFHAGFSLAAIGMFVGLIFYVIDGRKYINPADNTAPDPLKPEDVRPLVIRVVVAIAAVGVILLAMAGFNALTIANVISLITLIAIGLPIWYFVLMIRSKKVTKTERSRVIAYIPLFLAAMIFWAIEEQGSVVLALFAAQQTKLDFGFFKILPGNFQTLNPLFILLYGPLFAWLWMKLGKRQPTSPKKFYLGLIFAGASYLWMVIPVMLFGSSAKVSPLWLVMSWAIVEIGEMLISPVGLSVTTKLAPKAYSSQMMSMWFLADASAQAVNAQIVRFYTPNHEVAYFAIVGLVSVGFAVVLAFFTPRIEKLMQGVN >NZ_AP012541.1|WP_011674606.1|1817494_1818322_-|metallophosphoesterase MVKIAFSVDNHFDVNRVDGFEMLKKQAAYLVEHDYQIYVNAGDTYNDFTKSLAYFRALQAEVGSAVTIRFLAGNHDMVNGATYDEIQSAVDPLYLHEKILPVPGTNAVIIGNNGWYDYSLGQLGNMKTDAEYAQWKRAFWIDSAIDAPVTDAARMQRVLTTTKAALQANQTHQMIYVTHFVPIREAMEYTVDRPPWQMATALMGSAKLGDLLTGRVSAVVFGHEHFRDAPKLLSGTTYYHQPLGYGLKRLFEWQSQDWWTEWRQTLVTLTVPTLS >NZ_AP012541.1|WP_003594964.1|1815189_1817166_-|S9-family-peptidase MAIKATDLFKLVSLSYPSATDDGYFVQENRISEADNTYYQRICFVNHRGGTIAYGFDQKHDRHPLLSPDQQWLAFLSQASDKTTQVFLQAVNGGTAKQFSAEKEGVSYFGWQADSQALFIQTTVGAKPKKTDKQWPQPVTVSRVPYKLNGVGLLPEHVAYELRVQRLRQKTSRLVMGREHEFEVGAISPDGQTLAFTAERLPDDPNDFSQATYLLNLADQQVTMVNDQLPQAALSPEAFSADGKQLLLVGSDNHLPNVSQSHLWHYDLATKTLQDVADDIDFDIPGHVNGDFQQDLSEKVADFATADYYLTIGFDHGKTSLYAGGPDEQLTPLIGGRRHVTDYALTPDHHGVVFTESTMTVPSRLSYFDLATEEEHVIYDPNRRVTRDMGLVTPQTFNFQRDGFEIEGWYFPPQQATASHPAILYVHGGPAVGYGYTFFHEMQFLAAQGYGVICPNPRGGLGYGEAFTAAVIKHYGQGDYEDCMASVDEALKLDTTIDPDRLYVAGGSYGGFMTNWIVTHTHRFKAAVTQRSIANWLSMYGTSDIGYFFTPWELEGKWTGDLSDVKSLWDFSPLAHIDFAQTPTLVMHSENDQRCPIGQGEEFYIGLKLHGVDTKFMRFPNATHELSRSGLPNLRLARLAALVDWFKTHSATEESHQA >NZ_AP012541.1|WP_003594962.1|1814379_1815177_-|pyrroline-5-carboxylate-reductase MTIGFIGAGNMARAIITGLLAKNAVTPEEIVLHGGQPIHYEPYAAKIGAKAVASNQAVADTADIVFLAVAPKLGVPILKTIGPTLKQRQVPIVSMLTGVLLATLEDALGSQDQPILRIMPNVNVAINAGMTAYAANDSVAGQLDGLLDLLNVLGKTMALPEDQFSTFVALAGSSPAFVYLFIDSLSRAGVKYGLTKKQATAIAAQAVMGSAQNVLASEQSPFDLIDQVSSPGGTTVAGLLAMEQAGLMSAVIKGVDATIAKDRQG >NZ_AP012541.1|WP_003575514.1|1813127_1814273_-|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase MTVTVLKHATIYTGLERIDDGYVRFDDKILAVGDMFDYRAQSGEQTFDLQGKTLIPGFIDVHAHGGYGFDAMDGDADQIDEMATKMMTHEGVTTLFATTMTQSTENIDKAMRGVKQAAERNHIIQGVHLEGPFISKVFKGAQPEEYIKNPNVDLVKQWQELSGGLVKLITYAPEDEGSQAFEDYLLAHNIVPSVGHSNATREQMLHSKATHVTHLYNAQRGLRHREPGVTGHAMLEDNMYCELICDGFHIVPDMLRLAFDQKGPERIELVTDSMRSKGMPEGKSELGGQTVYVKDKQARLKDGTLAGSVLMYKDAFKNAMSFMDASLFDAVEMSSVNQAREFNLTSKGTLEVGKDADINVLDRNNDLVATYSYGVKHDTED >NZ_AP012541.1|WP_003566099.1|1812401_1813103_-|GntR-family-transcriptional-regulator MDAPVYIQIHNAIRADIEAGKWRVGDRIPSERDLAVTFKVSRMTLRQAIQTLVDEGILERRVGSGTYVANQKVQEKMSGVTSFTDLMQAQGKVPSSKTVSYHVAQPTSSEVEKLKLEPKEQVLRMERIRYADKIPISFETAAVPYNLVKNFTKKEMTASFYHTLEKKGGYVLGGAQQTVSAMLASERISEYLDIKRGEAILRLRQVSFLQDGTPFEYVRTQYVGERFEFYLER >NZ_AP012541.1|WP_003566087.1|1810575_1812039_-|nicotinate-phosphoribosyltransferase MTTQLGEGLTLHTDFYELNMMNTFFEQGISERNAVFEVFFRDLPFGSGFAVFAGLEHVMDYLNHLKFSEDDLAYLQSQTDYSDAFIDYLRHLKFTCTVKSALEGDLVFNNEPIWQIEGPLAQAQLVETAVLNMINYQTLVATKAARIRSVAGADPLMEFGTRRAQETAAALWGTRAAYIGGFNATSNVLAGKEFGIPISGTHAHSLVQAYGNDYDAFKAYARSNKDVVFLVDTYDTLRSGVPAAIKVANEFKGKINFLGVRIDSGDMAFISKRVRQQLDDAGYESAKIYASNDLDENTIQNLKMQGAKIDIWGVGTRLITAYDQPALGAVFKLVSIEDAAGKMRDTIKLSNNAEKVSTPGKKQVWRITRQDDGKSEGDYVALADETIDTQRSLYMFHPNFPYINKTVKNFEAKPLLQTIYDKGQQVYHTPPLQEVQAYATRSTNALWDEYRRILNPQDYPVDLSQRVWDNKMDLIKAVKSAVADREE >NZ_AP012541.1|WP_041091527.1|1808549_1809377_-|ammonia-dependent-NAD(+)-synthetase MRPLQAEIIKALGVQATIDPETEVRRSVDFLKAYLKKNTFLKTYVLGISGGQDSSLAGALTEKAMQEMRAETGDDAYQFIAVRLPYGEQADEADAMAAIDFMHADVVKRVNIKPSVDAMVAAVEADGSKISDFNKGNIKARMRMITQYAIAGNNAGAVIGTDHAAEAVTGFYTKFGDGGADLTPLYRLDKRQGAALLKVLGAPAHLYEKAPTADLEDNRPALPDEVALGVKYKDIDDYLEGKDVTDQAAETIEKWYQKTAHKRHLPITVFDNFWK >NZ_AP012541.1|WP_011674604.1|1807125_1808283_-|serine-hydrolase MSGKHRYIWLGVMLILCAVSIGAGTYLWQQNSRSAVNTKSKSAKTVTKAVRQDRGKSKEEILAMTLDRAATTTEGQPLEQELTNDKFIGSALIIKHGKVVFNNGVGDADTTTHRRNGPTTLFQIGSIQKAVTAVALAQLAASGKLSLDDPVGKYLTGIKTGDQVTLRMMVAMRSGFSLRKYQPTVMDDANIIQWSIANLTYLPQDNYAYQAVNYVLLAGVIEKVAGRSYEQQVKNNIFDRLNLKHTGFLPAMLTDPERAITYTGPAANPYQTAIGEPAVWYNRELGTGNVYTSTGDLYRLLRGIDTGKVLPLSTLKTLRNRNDGVYNAGIYNHADFYSTNGVVAGQMASTAISHDGQNAVILLSNYNSHALNLHDLAVHLFSELG >NZ_AP012541.1|WP_003566079.1|1804157_1806818_-|cation-translocating-P-type-ATPase MANKPPYALSSEAVLKQEQTSLTGLTKEAAQTRLNENGPNELAQAEKKGMLARFLDQFKDFMIIVLLVAALIAGFLLSEWADAGIILAVVLLNAVFGVFQESKAEEAIDALKEMSTPNAHVRRGDQVLTIPSSQLVLGDIVLLEAGDVVPADLRLVESANLKIEESALTGESVPVDKTTAPLDADDVGIGDRTNMAFMNSNITYGRGVGVVIATGMQTEVGRIAGMINSAEETNTPLQENLKSLGKTLTVMILVIAVIVFAVGIWRQAASLPEMFLTAVSLAVAAIPEGLPAIVTIILALGTQKMAKRHALVRKLPAVETLGSTDIIASDKTGTLTQNKMTVEKVYYDGQLNDASAGIHGGNPLMTIMNFANDTQVQDDGKLLGDPTETALVAYGKTQNYDVAKALTGEPRIAEVPFDSERKLMTTVHRRADGKLLVATKGAPDELLKRVTDLATGENTAPLSDSERDAILKANKDMATQALRVLGMAYKVIDTLPEKVDSDTVENHMIFAGLVGMIDPERPEAEAAVAEAKAAGIRPMMITGDHRDTAEAIAVRLGIIDQGDDDAVITGAELDQQSDDEFAKNVAKYSVYARVAPEHKVRIVNAWQKKGKVVAMTGDGVNDAPALKAADIGIGMGITGTEVSKGASDMVLADDNFATIVVAVEEGRKVFSNIQKAIQYLLSANLGEVLTLFMMTMLGWDLLAPVHILWINLVTDTFPAIALGVEPTEPGIMKQKPRGRKSNFFSGGVGPAVIWQGILEGLLTLGVYWIAITYPVHSGSAAIHADALTMAYATLGLIQLFHAFNVKSIHQSLFTVGAFRNKAFNWAILASFVLLAVTILVPGFNGLFHVTSLDWHQWITVLGAGVAMIVIVEIVKVFERARRKQRA >NZ_AP012541.1|WP_003591104.1|1820324_1822643_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MLDLKHIKKYYQTGDYTTKALDDVSVQFREQEFVAILGPSGSGKTTLLNVIGGLDRYDSGDLLLHGRSTKNFKEADWDAYRNNSVGFIFQSYNLIMHLSILENVELGLTLSGVSAADRRKKAEAALTKVGLKAHMGKQPNQLSGGQMQRVAIARAIVSEPSILLADEPTGALDTETSEEIMRLIADLSRERLVIMVTHNPQLAHEYAERTIEFKDGKILSDSRPFKDEEKTASFDLHRTKMSYFTALKLSFTNIMTKKGRTFLTAFASSIGIIGIAVVLALSSGFQKQIDNTQAETLAQFPITISTNATSLTAGAADNTKTSTFKTTSTVVAKQSASDKAQHTNKLNQKYIDYVNGISKKLTDNIGYTYGTGMNLLRDVNGTIKPVQFSTAKPSSNQTQRGLASASSSVYPVDREGGTSYLKKNYEVVAGSYPKHDGDVILIVDRDNSTNINALKNLGFDVKDGQKVKFNQIVGTKIKAISNNAYYQNVAGNVYVPTKDYANAYKQNDNRELTVAGVLRTRSKTSDGLLSQGFAYSDRLTKDLVALNKDSDVVKAQRASDVNIFTNQSVDKATKDQLITALGGSETPTQITIYPTSFKDKDKILSYLDKFNRGKKKADQVVYTDLAGTISSMTGGIMSAITIVLVAFAGISLVTSMIMIAILTYTSVLERTKEIGVLKALGARRKDITRVFDAETIILGVSSGILGIIIAWLLTFPINAILYSMTELPNVAQLNPIHAVILILISTILTVLGGHIPARMAANKDAAIALRAD >NZ_AP012541.1|WP_003594971.1|1823068_1823443_-|hypothetical-protein MAVWRMMFARPQFKHRQIKRMVDDLNREGNFGGMPIHRITLTRQTRELIYVDLEFQLTTGLTQPLFEQMAKYILVAVAGLAHAPQPIYLAAMANPFAKLNISYYIYPDHSLDLIYWQPLLRKPT >NZ_AP012541.1|WP_003566828.1|1823582_1824005_-|hypothetical-protein MHTRCQEPNYVEVVNQNLERLLVFETVFKEYVHTCKNIEKGNCYASESLDHLRLYFTKNVMKFCTFVDSVDAEAAPCNYAAFHKVLVNGLRGIRGGVLNMLQAIGTDKVDHDRFAAGLAEQQAARAEIDTAFSKILDPIF >NZ_AP012541.1|WP_003591108.1|1824567_1825998_+|MFS-transporter MKGYPKQYPLDRQTLFGINTMGLMSTTAYYLYTAVLMMFITDYSGIYSGVPGKAAAVATTLLFVGRLWDAVNDLWTGYLIDISPRTRWGKFKPYVLIGSLLAGILGMMLFHIPQNFSNFGKEVYLYIVYFLFMFAATIIVTVPLTSTMSADQEVRAKLISWPRITSNIVGVVFAFFMAIATYLGTKRNPNIPLTVDLIVIPFLILSLIGIVMVKEGPVTEEAKPPRLRDIGQMIKINHPFRINLYFTFVGGFVWALLTATSLYYIKYAFGVKNLGTQSMYFGLLTLITLVAGTLISQKAMQYISAIRGVQWCYLAMAPFLVIMFIINEIHVIDNPWVFYLLIGIVMTIAGAQFVPANLIIMETMDYNRLKLNAGMEATINAVNMFLQKLQSGLATIGVGAALLIVGYNAQTLEKATHVPDNLLQSLGVVLFAIPAVFSFLAYLIARHYPLQGAARDEMYAALAAKRVTNTQSSKSK >NZ_AP012541.1|WP_011674607.1|1826092_1827229_+|alpha-L-fucosidase MTRPSAVNIHRTNPPDWFKQADFGIIIHWGPYSVPAYAPVNIPDYGTLIKTKSLGYLFEHQPYAEWYGNSMLLPNSPVAAYHRTHYGNTSYADFAKTFKQTAQNVDVQAWAAAFANAGAKYVVIVTKHHDGFVMFDPHTNNPYEPDYHLNFDFVGELAQAVRAHGMRFGTYYSSLLDWTFPHLPIKDYGSFLLGNDKSQTYKDYVWHQWHELIDRYHPDVLWSDIGYPDDHRLETLFKYYYQQVPEGLVNDRWQQFPDWMRTSWIRPIFNLVAAQVIKRDQHHSDDLSEVKYYDYRTLEYRTDWPQTNRYFEMTRGMDKSFGYNRLSRPEDYITADDIKQLIAELRSKRGRLLLNVGPDMNGQIPSAQLSILQQLSNR >NZ_AP012541.1|WP_003594977.1|1827337_1827655_-|glutaredoxin MAIHFVIYEKPNCESCRLTKRWLAEHGQHFRTTNHRGESNLVDINANDPLKRAWSHQKIVKFREAGYDRFPVVRVRDDATGDVLATWGGFRPEALASWTAINQLG >NZ_AP012541.1|WP_003594979.1|1827825_1829493_-|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MTSKQSFSSSDITSQSGYFSALKATVETAFYGENVKQVTTIAQAYALAKTAPGVIITDLPIKHTAELGLPPDAKVLVANDGRVVGRTAAARQIIGQPDVDETKLAAIAREAVFLGSRKTFLRGDVTVGLSSDFAIKAHLMLPEAYANNLYTYLLNFQIDTPQRNAEYEQSRPLPEDDIYLYADPDWHDPAYPNGLAVFDPTHNAAIVLGLRYFGELKKGTLTLAWATAHRNGFVACHGGMKQYTRQDGDFTMAAFGLSGSGKSTITLASHGDQYPVKVLHDDAFVIDRQTGATTALEPSYFDKTQDYPLSDPGIQYFLTVQNVGVTLDAAGKKTLVTQDIRNGNGRTVKSRYVTPNRVDHLTESIDAIFWIMKDDTLPPVVKLEDPDLAAAFGVTLATKRSTAENVIGDVDRDHLVIEPFANPFRSYPLGEDYQDFHQLFEQRQTACYILNTGSYNGQNVKPADTLGAIAKIVDETAAFKPFGLLPKMRYLPLSGFNVDFGDNDYRARLRQRLEDRLAFIATKDVDHDGYDRLPIDASRALEDVIAALDQQAAAM >NZ_AP012541.1|WP_003566823.1|1829707_1829875_-|FeoB-associated-Cys-rich-membrane-protein MATWIIGGIVVLIIAVVAYRTFFKKNKAGCSQCEEVGCPLIDHAKMVQANNRRKA >NZ_AP012541.1|WP_003660538.1|1829910_1832022_-|ferrous-iron-transport-protein-B MAIRETLALVGNPNSGKTTLFNALTGAKQHIGNWPGVTVERKSGRLKADNALVIQDLPGTYSLSPYSSEEIVTRDFLLNDQPDLVLNVVDATNLERNLYLTLQVMETGRPLIVALNMMDVLVKTGHRTINLKKLSYALQVPVIATTATKPAALQELVQTIQAPLPKPYAFPEYDARLESALTMLEDVIDQKVPADRLRWYAIKVFEKDPQVVKQLAFSSDEQHQMNEILRTAEHVFDDTTDSIIVNARYDFIARVIAMCVVDKDDFVMLMSDKIDRIVTDRYLALPIFVLVMWAVYYLSIQTIGTIGSDYLNDTVFGGWLPSVVGGTLKSWAVAPWLSGLIVDGLIGGIGSVLGFLPQIMMLFLCLGILEDCGYMARIAFVMDRLFHRFNLSGKSFIPILIATGCGVPGIMATRTIESEKDRRMSIMLTTFMPCSAKLTVIALVSGTFFPSNSWVAPSAYFMGIIAVICSGIFLKKTALFAGPPAPFVMELPAYHLPRLTNLYRSVMSRARAFVQKAGTIIFLSCVLLWFLSNFNFGLQMVDENDSMLRALGTIIAPVFAPLGFGDWHATVATLAGLIAKENCVGTLHISFGAGSASGFGQALRATYPAMAGYAFLVFNLLGAPCFAAIGTMYKEFGDARWTWRAVGYQTGVAYLLTMLIYQGSLVVSGQASVMSIGLVLVAILLIVYGLLIKRPVPAIAASF >NZ_AP012541.1|WP_003660535.1|1832699_1833452_-|hypothetical-protein MHRQETKSKKGLIWGIAILAVVLLGGGIWFGVHQQAQAKAAAASASSSKAAVRSRASAKKMREATQASEKAKDPVYKDFAADGLSFNQVQAAKQLDVTAVGDSVMLGSEYLYKELFPKIYFDAGVSRQIYEAPDLFKSLAASGKLADTVIIGLGSNGTFTDAEFASIMNTLGSKRQVYWINVHADTTWTDEVNRDLVSMSHRYQNLHIVDWHKASEGHDDWFVADKTHPTTEGQTHYVATVAKAVLAKVK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
12704 : 57570
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP012541|12704:57570|DBSCAN-SWA 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45 | Faecalibacterium_phage(30.0%) | bacteriocin,protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
129273 : 178593
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP012541|129273:178593|DBSCAN-SWA CATGGCCATTATAACCTTAATTGAACGATCTCAGATAGAACTGATGCAACACAACACGATTCAATACATCGCCGCGACCTTAGGCCGCTCTCGTATTTCTATTAGGCATGAGCTTCACCGTTGCCCTGAAGGTGATTACTGCGCCATTATAGCTCAGGATCATGCCGATACTTGTCGGCATCGTTGTGGTCGGCACTCGATTTTAACGCCTAAGTTGAAGCGGATGGTAACTGAGAAGCTAAACCTAGGTTGGTCCCCTGAAATGGTCGGTTATGCCGTTCACTGTGCGCCACACACGATTTACCACTGGATTTATCAAAGACAAGTCGATTTTCAGCCAAGCCAACTCTTTGATCACGGTAAACGTCATAAAAGAAGACAAGACCTTCGGTCGCGCTATAACCAAGCAGTAGGCACCTCAATTGAGATTCGCAGTGAGTCAGCTAATCGGCGAACCGAAAAAGGACATTTAGAGATGGATACAGTTCGCGGTGGTCGCGGGTCAAAGGCTGCTGTTTTGACCATTGTCGATCGGGTGACACGTTTAATGGCGACAACTAAGCTTGAAAACTTATCACAAAATGCTGTTCTCAAGGGATTTGCAAGACTGATGGTGGACTTTCCGGGTCCGGTTCGATCAGTGACGGTTGATCACGGTAAAGAGTTTTCCTGCGATCAGGCGCTTACAAAGCGCTATCGGATACCGGTTTACTTTTGCCACGCCTATCACCCGAATGAACGGGGCACAAATGAACGGTTCAATCGAGAACTTCGCTACTATTTCCCGAAGGGAACACAGTTTGATCAGGTTTCAGAGACCGATATTCAACAAGCCACAGCGCTTATCAATAACAAACCTAGAAAATGTCTCCGTTGGCAAACCCCAGTTCAAGCAGTGAGCAAGCCTCTTTCTAGGTGGTAACTTTATTATTGCAATCTAGGCCAGACTTAGTTGTTTTGGGAGGTGATCTGATCGCGGGACCTATGCCTTTGGAAACGTTGTCGTTATTAAAACGCGTTTCCACCACATTCAAAACTGTGGGAATTATGGGAAACAACGATCAAGATATCGTTGATATTTATGCAAAAAAAAGAGTTGGACTATCTAGAAAGGCAACTGAGCAATTGACTTGGATAGCAAATCAATTGAGCTATAAGCAAGTGTCTTTCCTAAGAAACTTACTTCCCAGTATTAGTATTGGAAATTATTTCTTTTGTCATGCTGTGAAAAATGATAACACTACTGTTTTTTCTCCACGACAAAATAAAGCCTACATAGAGGCTTTATTTAAAGGAGTTCAAGAATCGTATATTATTTGTGGACATACTCATATACAGTTTGAATTGTCCTTGCCTAATAAAAAGATTATCAACGCAGGCAGCATAGGCATGCCATTCTCAAACCAATTTGGCGCGCAATGGTTGTGGCTGGAGGATAACAGAATTGAATATAAAAGAACCATTTTCAATCAACAAGCTGCAATACAATTGATTAGTCAGACTGAATACCCCTTCAAGAACGAATTTATTGCGAATAACCTTCGAAGTACAATATCCTTGAGTCAAGGATATAGCATCTTAAATACACTAATTCGCGCCCAAAATGCGCAACACGATTTAAGTTAATACGTAAAAGCATCTGGAATTATTTCTCAATTAAGCCGCTTGATGTTAAAGATCAGTGAGTATGAATTCCCTGTTAACCGCCTTAGTGAATTCGAAACAGATTGCCTAGGCCTCTTTAAAGTCATGGGTAACGACTGAAAATACTATTGAGGGGTATTGTCTATGCAACTTGGCAGCTAAGCGGTGATTTCACCACAGAAATAACGTTCGGTGGCATCGAGATTGGACACGTATTACCAATAGTGTCCTTGGTTAAACAGATGTTGTGGATCATACTTTGTTATCAGTTTTCTCAGTTTGCGACCTGTTTCTTCCGGCCAAATACGTTGACTTTCTTCTATCGATAGATCACTTGAGTAGGAACTATAGACACCCGTCCCTAAATCTTGTAGTGGGCCAAAAACCTCCTTAGCATGAGGCTCTGTGTCCTTTTGCAACCACATAGCTAAGAATACTTTCGCTTTTCGATCATGCCATGCAGTTTCATCAGCATTAATGGTATTTAGCGGGCCGTCAATTGCTCTCATTTCAATACCAATGATTCCTGGAGAAACAAGTATTTTGCTGATAATATCGCCACCCCAGTTTACAATTCAAGTGCAACACCCTGACGACTAGACCATAAAGGCCATGAAGACCTATTCTTGTTAGTGCTAGCTAAACAAGAAAGCAGGAATCTTCATGACCCACTCTCAGACTAACACTCACAAGCATTACCAACAACTCAGTTTTAGCGACCGTGCTACAATTCAGGCCCTTCAGGCTGCTGGTGACACCGCGACCGTGATTGCACAGAAGCTTCATCGCAGTAAAGCGACAATCTCACGAGAAATCACGCGTGGATCTGTAACTCAGCTCGACTCGAAGCGTCACTCGCATCAAGTCTATCTTGCGGAAACTGCCCAAGCCATGCACGACCGTAAACGCGATAGAACCGGTCAATACGCCTTTCTTAAGACCGGCCGTGCGTTCTTCAAGGCTCTCTCCAGGGAGCTTACTCGTAAGCCGCGCGTACACAGCGTTGATAGCTTCGTACACTTCTATCGCGACCAGGGCAAGGCTTGCCCTTCAACGACAACTGTGTATCGCTACATCGACGCCGGGCTGCTTGAGCTAGACAACATGACACTTCCCAAGAAGCTCCGACGCCGCATCAAAGGCTATAAGAACGCCCACAAGCGCAAGAATAAGAAGATATACGGCGACTCAATCGAGTTGCGTCCTGCGGCCGTGAATGACCGCACAGGCGTGGGACATTGGGAAGGCGACTTGGTCAAGGGTATTCGCTTAGCTGATGAGCCAGCATTAATGACGCTCACAGAACGGTACAGCCGGACTGAGATCATCGTCAAGATTCCTGACTATCATGCGGGCACCCGCCTTAAAGCCTTGCAGGACACGATCGACGACTACGGGGCCAAGGAATTTGAGAGTATCACTTTTGACAATGGTTCCGAGTTTGCCAAGTTATCAGAGATTGTTGGAACCCAGATTTACTTCGCACATCCGTACTCGCCTTGGGAGCGTGGCACAAACGAGAACGCCAATGGACTGCTTAGGGAATTCTTCCCGAAAGGGAAGTCTCTCAGAGCAGTTACCCTGGTTGAAATTCAAGCAGTCCAATCCGCACTGAACCATCGTCCCAGACGTATTCTGAACTATCTTCGCCCATGCGATTACTACCGATGCATGGCGTAACAGCCTAGACCACTATCAAGAATTCGTTATCATCGTTGCACTTGCCTTGAAAATTGAGGTGATAATATCGCCAATATTAGGATTCATGGCATCCAGTAAAATATTTTTTACGAAAACAGGTTGTTGTCCAGAATGCGGGATATGAGGAGCCTTGACCAATTCAGCATAGCTTTTTGTCTCTAATTGATGTTTATTCACTTCAGAAAGGCTTAGAGCTGATTTAAACAAGGCTTTCGCATCAGAATTTATAGAACCTGCCCAAAAATTACTAGCATTAATGTGAACAGTATTTCTATTCTCGGCAGTCAACATGAGATTGCTGCTCATTTTACTAGATGCGTGAGTTATCCAACTTTGCCATTGCTGAATGAACTTTGTCAAATTGCTCGTTTGGGATTCAATGGTTTGTACAGTAAATGGTAGCGAAATATCGGATTTCTCTTCAACCAACTTACTTGCTTTAAAAGTGAACGCTGTCACCATTCCTAACTGTGAATTTCCACCTCGAATACCCCAAAAAAGATCAGGATACTTTTGATGATCAGTCACACGGATCTCACCATCAGCGGTTACTAGTCTAGCGCTGACAATATGATCGATTGTCAACCCTAGACGACGAACGAGTAAGCCAATGCCACCACCTGTGGCGAGCCCACCAACACCTGTATCACCAAAATCACCACTTGAGATGATTAAATTAAACGGACGTAAAGCCTCGGCAACATCTCCCCAGACTGCGCCTGCTTGAACCTGAACCAATCCCTGTTCCGCGTCAGTGACAGTAACGCTATTTAACTGTGAAATATCTAAAATGATACCGCCATCATTCACCGAAGCCATTGAAATGCCATGACCGCCGCTACGAAATGAAAACGGAATACTGTGGCTAACACTTTCTCTAATTTTTTTGACGTATTGAATGCTAGCAATGACATCACGCTCTGTCGTTGCCCTTAAGATTAGCTTTGGACGACCGGTGACAAAATAATTTGAACACATAAGTTCATAGTCATCAGAAGTGGGATCAATTGCAATCTTCTTTAGTGCTACTGGTAACTTAGGCCACGTGGCGTTAACATCGTTATTCATCAAATTCCTCCTAAAAATTTTTTCATGGTTGGTAAAAATTGCTCTTACAGATACTAAAAAATGATTCATCATCAGCGACAGTCGTCTATGTTAGAAAACGCCTTTATTAGGCTCTGCGGCTAAACATTCTCATTCTAGTATACTTTTTGACGAAAAGTGAAAGGAAGAGACATGAAGACTTCAAAAACATAAAAACTCTTACCCTAGCGTGAACGTGGACTTCACAAAAAATCTTGATGTTTGTTTATCAGCAGCATTTGAAGACCAACACCTTGAACCGTGATGAGAACGATGCTTACAGTAGAAAGATCAGGCTAAGCACAGACAGATCGCCAAGTAAGGATCAAAGAAATTTGTTCTGGTATACTAACCAGAGGGGGTAGAATGCCATGAAAATTGTACTGATCGTTTGCATCGTCATCGCGATAGCTGCTGGGTATGTAGCGAATAAGAGGCGGCAAAGACAATGATAACAGGTTCAATTTCTTTGCTTGTCATACCTCAAGCTTCCGTGCTATACTCCATGACGGTGCCAAACCACGGTGAGTTCGTAACGATCGGCGCGTAAGCGTTCAGAAGGTCGAAGC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46 | unidentified_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
295799 : 400759
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP012541|295799:400759|DBSCAN-SWA ATCAGGCGGCCATTTGGCTCGTAAGTGTTGCAATTTCAACTTGTAAGGGGGTCTGGTAGCCCAGTGAACTATGAATTCTCTTCCTATTGTAGAAAGCATGCACATATTCAAAAAGGACGGCAGCGGCAGTTTCATAATCTTCAAAGACCGGCACTGGATAAACACATTCCTTTTTGAGGGAAGCGTGAAAGGATTCCATTGGCGCATTATCATACGGACAACCCTTACGGCTGTATGAGTGGCGGATATGTAGTTCAGTTAAACGTTGATTGTAATTATCGCTGGTATACTGTGATCCTAAATCCGTATGGATAATCAGGTCCCCAGTAATGGTTCGATTTTTAACCGCGCTTTCAAGGGTCTTTAAGACTAAATCAGTATCCATCTTTTTTGAGAACGAATAGCCGATAATCCGTCGTGAGTGCAGGTCCATGATGGTTGATAAGTAACACCAGCCATTACGCTTCGTTTGAATATAGGTCATATCAGCGGTCCATTTTTGATTTAAACCAGTGGTCGAGAAATCCTGCTTAAGCAAGTTGGGACGCTGTTCAACCTTGGTTTTGGAAGCCGAAGCCGCTTTCCACTTATTGACGGTAACGGAGTGGATATCCAGTTCCTTCATGAGCCGGGAAATCCGTCGTGGACTGCACCGAAGCTGCAGTGGTTGAAGTTCCAGATTCAATTCATGGTGGATCTTCATAACACCGTATCGCTGCTTAAATTCCGCAAAGATCCGCAGAATCCGTTGTTTCAAGTCCGCATCTTCGGCCCGGCGTTTTGAAGGTTTGGGGGATCGATAACGATAATACTGAGCTCTGGAAACACCGAGGATTCGGCACATCTTGGTTACCTGGTGGTGATGGCTTTCTTGGTGAATGTAATCAAAGATATTGGTTACTTCTGCGCAAGGAAGCCCAGGGCTTTTTTTAGGATTTCGTTCTCCTCAGACAGCGAAGCCAGTCGCTTTTCCATCGCTTTGATTTCGTCTGGCGATTTACCGGATTGAGTTTTGGCCTGGCCCTGGATCCACATATGAACTGTTGAATAGCCAATGCCATATTCTCTGGCCAGTTGAGCAGCTGATTCGCCTTGCTTATATAGGTTGATAATGTTTTGTTTGAATTCTTTGTCGTAACGAGTTGGCATGTAAAAATTCCTTCCTTTTGAGAGACGATTTATTCATTATACCCTCTCTTAAAAGTTGTCTCAGGAATCAGCTTACATCCACTGATATTCTTGCTCGATTCTCGAACACTTTCTTTGCTCATCGGATTGACAAGATGGTTGATCAAAATAACTACAAAGGTATCGAACGTTACTTTCTCGCTGGCGCGCTTCCGTGGGCGCTGTCACGGATGATTCCAGTTGGCTTGGCTTTGGCATTTGGCGGCGGCTTCGTTACCGACCTTGCCCATGTTTTGAATACCAGCTGGAAATGGTTAGGCGATGGCTTGGCAACAGCTGGTGCCGTCTTGCCTGCTGTTGGGTTTGCCATTCTGTTGCATTACCTGCCACTTAAGAAACACTTCCCATACCTCATTATGGGCTTTGTTTTCACCGTGCTGTTCACGACACTGTTTGGCAGCGTTCAGACCTTGGGTACCGCAGTTGCTGGGGTAGCTAAAGGGTTCACTGCTTCCTTCAACGGTTTGTCCATGCTTGCTATGGCATTGATTGCGTTTGCCTTTGCTGCGATCAGCTATCAACAAACAACAAAGCTGCACGATATCGCAGTTGGCAATGGTAATACAGATGCAGCATCAGGCACAGCCGCAAACAAGACTAATGAACAGGGGGAAATCACCGATGATGAACTCTAATAAACCTACGTACAAATTGACCGATAAAGATTTCCGGCAGATTAACCGGCGCAGCCTGTTCGGCTTCCAGTTGGGTTGGAACTACGAACGGATGCAAGGTTCGGGTTATCTTTACACCATTTTGCCGCAATTGCGCAAAATCTACGGTGATGGCACACCAGAGCTCAAGAAAGTCATGAAAACCCACACCCAGTTCTTCAACACGTCAAACTTCTTCAATACCATCATCACTGGGATTGATTTGGCGGTCGAAGAAAAAGAAGGGATTGCTGGCGAAGAAACTGTTGCCGGGATTAAAACCGGTTTGATGGGGTCCTTCGCTGCTATCGGTGATTCAATCTTTGCTGCCTTGATTCCAGCTATTTTCGGGGCGATTGCTGCACAAATGGCAACGCAAGGCAACCCAGTTGGGGTCTTCATCTGGATCGCTGCTCAAATTGCCGTCATGGTATTTCGTTGGAAGCAATTGCGAATTGCTTATAACGAAGGGGTTTCGTTGGTCACAACAATGGCGCATCGATTGGCTGCTTTGACTGACGCTGCTACCTTGATGGGTGTCTTCATGGTTGGTGCCTTGGTCGCAACCATGATCAATGTTAAGATTGGTTTTGCGCCGAAGATCGGCAGTGTACCATTGGATTTCCAGAAATACTTTGACTTGATCATTCCAAAACTGCTTCCAGCCTTGATTGTTGGCGCGGTTTACTGGTTGCTTGGTCGTAAGCATATGACCTCAACCCGGGCGATTTTCATCGTATTGATCGTTTCGGTGCTGCTGTCGGCACTCGGTGTCATTGCTAAGGGTTAATTTGGTATCAGAAACGTTTTAAAGGAGTCTTTCGATATGAGTAAATTAGTTTTGATTAGTCACGGGCAACTGTGTGAGGAGCTTAAGAAGAGCGCTGAAATGATCATGGGTCCCCAAGACGATATTGCCACCGTTGCACTGTTGCCAAATGAAGGTCCGGAAGATTTTCAGGCCAAGTTTAAAGCTGCTGTAGAGGGGCAAGACGATGTTGTCGTCCTTGCCGACCTTAAAGGCGGAACGCCGAATAACGTCGCAGCCCGTGTCTTGGCTGAAGGCGGCAAGTTCGACCTGTATTCTGGCATGAACCTGCCGATGGTCATCAGTTTCCTGAATGCCCAGATGTTGGACATGAAGCCAGATCTGATCGGCGATGGTAAGGCTGGCATTGCTTATATCAATGACATTGTGAAGCATTAATCAGCCAAAAGGTTCATGGAAAGCTCGTGTCGAGTTGTGACGCGGGCTTTTTCTGTACGACGGATTTACAATTCAAGTGCAACAAATTAGTCAAATAGAAAAGACTCATAGCCTGAGTCCTTGTAAAATGGAATCACCACAAGACCAACTACAAGGAGAACTCGACTATGAGTCCGTACACCCATCTTACCTTAAAAGACCGTGAATCGATACTGCTTGGTATCTCTACAGGCAAAACTCTTGATACCATCGCCAAAGAGATAGGTCGTTCCAAGAGTACAGTCAGCCGTGAAATTGCACGTAACGGCGGCTGGCGGAACTATTCGGCAGCCACCGCTCAGGACCGCTACCGGCGGGTTCGCTTGGCTAGCAGGCGTCCTCGGATCCTCGATCGACCGGGGACTCGTGACGCTGTCATTCGATATATCACGGTGCTACATTGGTCGCCTGAGCAGATTGCCGGTCGCTTGTCACTAGAAGGCAGTCCTATTCGCATCAGCTATTCGACTATCTACAGAGGTATCTACCTAGATAATCTCGGTGTTCCATTGAAGAGCCATGGTGCTCGCGGGCTACCAAGGCTGCTTCGACACCGAGGCAAGACGCGCAAAATCAAAGGCACCATAAATGAACGCCGGGGGCGCTTCAATGACGTGCCATCAATTCACGACCGACCCCGGTCGGCAGAAAATCGCAGCTGGTTTGGTCACTGGGAAGGCGATACAGTACGCGGTAAAACAGGACACTCTGCATTAGTAACATTAGTTGACCGTAAATCACGCTATCTGCTTTCGAAGCGAACGGCCAACGCAAAAGCTGACACTGTTAGAGACGTCATGATTGAGCTGCTTGGTGCCTTACCAGCTAACCGAGTAAGAACAGTGACTCCTGACCGTGGAAGGGAGTTTGCCCGGTACAGGGAGCTGGCAGAACGTCTGAATACAAAGGTCTTCTTTCCTGACCCACACGCGCCTCAACAACGAGGAACTAACGAAAACACCAACGGACTGATTAGAGAATACTTTCCCAAGAACACAGACCTAGACCTTCAGAGCGACCAGGAAATTGAGACTTACATTGAACAACTGAATAATCGACCACGCAAGGTCTTAGGCTGGAAGACGCCATCAGAAGTCTTCATGGGTAAAAAGTTGCACTTGAGTTGACAATTCGTCACGCTAAAAATGAATTGCCTTAGTTAACAGAATGGCCCTGACGTCAAGAAAATAGTTAGATTTTTCAATAATTGCTTACTTAACCCTAGATTGCAATAATAAAGTTACCACCTAGAAAGAGGCTTGCTCACTGCTTGAACTGGGGTTTGCCAACGGAGACATTTTCTAGGTTTGTTATTGATAAGCGCTGTGGCTTGTTGAATATCGGTCTCTGAAACCTGATCAAACTGTGTTCCCTTCGGGAAATAGTAGCGAAGTTCTCGATTGAACCGTTCATTTGTGCCCCGTTCATTCGGGTGATAGGCGTGGCAAAAGTAAACCGGTATCCGATAGCGCTTTGTAAGCGCCTGATCGCAGGAAAACTCTTTACCGTGATCAACCGTCACTGATCGAACCGGACCCGGAAAGTCCACCATCAGTCTTGCAAATCCCTTGAGAACAGCATTTTGTGATAAGTTTTCAAGCTTAGTTGTCGCCATTAAACGTGTCACCCGATCGACAATGGTCAAAACAGCAGCCTTTGACCCGCGACCACCGCGAACTGTATCCATCTCTAAATGTCCTTTTTCGGTTCGCCGATTAGCTGACTCACTGCGAATCTCAATTGAGGTGCCTACTGCTTGGTTATAGCGCGACCGAAGGTCTTGTCTTCTTTTATGACGTTTACCGTGATCAAAGAGTTGGCTTGGCTGAAAATCGACTTGTCTTTGATAAATCCAGTGGTAAATCGTGTGTGGCGCACAGTGAACGGCATAACCGACCATTTCAGGGGACCAA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91 | Lactobacillus_phage(20.0%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
440975 : 569331
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP012541|440975:569331|DBSCAN-SWA 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111 | Lactobacillus_phage(46.67%) | integrase,transposase | attL 476127:476186|attR 502280:503667 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
623729 : 693123
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP012541|623729:693123|DBSCAN-SWA 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58 | unidentified_phage(18.18%) | head,tail,transposase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
822777 : 902878
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP012541|822777:902878|DBSCAN-SWA 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92 | Lactobacillus_phage(86.27%) | capsid,integrase,head,portal,protease,holin,tRNA,terminase,tail | attL 812838:812856|attR 898861:898879 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
950729 : 960072
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP012541|950729:960072|DBSCAN-SWA AATGGCAAACGATAAAATTGTGATCCATGGGGCTCGTGCCCACAATTTAAAGAATATTGATGTGACGATACCCCGCAATAAACTGGTCGTGATGACCGGCCTATCTGGTTCAGGTAAGTCCAGTCTGGCTTTTGATACGCTTTACGCCGAAGGTCAGCGTCGTTACGTGGAAAGTCTCTCAGCATATGCCAGACAGTTTCTGGGACAGATGGAAAAACCGGATGTCGATTCGATTGACGGCTTAAGTCCGGCGATTTCGATTGATCAGAAAACCACTTCAAAAAATCCCCGATCAACTGTGGGAACAGTCACTGAAATCAACGATTACTTGCGCTTGCTGTGGGCACGTGTCGGGCATCCGATTTGTCCAAATGATGGTACACCGATTACCAGTCAAAGTGTTGAACAGATGGTGGATCGCGTTTTAGCCTTACCTGATAAGACCCGGATTCAAATTCTGTCACCAGTGGTGCGTCGCAAGAAAGGCAGTCATAAAAAAGTCTTCGCCAAAATCATGCGTGAAGGTTATGTCCGGATGCGTGTTGATGGTGAAGTTGTTGATGCAACGGCTGATTATGAACTGGATAAAAATAAGTCGCATGACATTGATATTGTGATTGACCGAATTGTGGTTAAGCCTGAGGCGCGCAGTCGGCTTTTCGACTCATTTGAAGCAGCTCTGCGGTTGTCAGAAGGGTATGCCAACGTGGACGTGATTGGCGGTGAACCACTGCGCTTTTCCGAACATTTTGCCTGCCCGATTTGTGGCTTTACGATTGGCGAAATGGAACCACGACTATTTTCATTCAACGCTCCTTTTGGCGCTTGCCCAGAATGTGACGGGTTGGGTGTTAAGCTGACAGTTGACATGGATTTGGTGCTGCCAGAACCGAGTATGACTTTGGCAGAAGGGGCAATCGCGCCATGGAATCCAATCAGTTCCCAGTACTATCCGGAACTGCTGGCTCAGGCGGCGAAAACCTTCAAAGTACGAATGGACGTACCCTTTAACAAGCTGACCCACCGTGAGCGGAATGTGGTGCTTAATGGGAGCGACGGCAAGTTATTCCATTTTCATTATGAAAATGACTTTGGCGGTGTACGCGATGTTGATGTGCCTTTTGAAGGGGTGCTGAATAACATTTCCCGCCGATATGCAGAAACGAATAGTGATTTTACTCGCCAGCAGATGCGCAGTTATATGACAGCATTGCCGTGCCCGGTTTGTCACGGCAAACGGCTGAATCGGCAGGCTTTGGCTGTTAAAATTGAAGGTCGCGATATTGCAGAAGTTTCTGATCTTGCCATCAAGGATGCCCTACCATTTTTCAAAACCGTGCATCTTAGTGAAGCCGAAAGCGTCATTGCCCAACCAATCGTGAAAGAAGTCGTTGACCGCTTGACATTCTTGGTCAACGTTGGTCTTGGTTATCTCACATTGAGTCGTAGTGCTGGTACACTATCCGGCGGCGAGGCTCAGCGAATTCGCCTAGCTACCCAAATCGGTTCGAATCTGAGCGGCGTCATGTATGTGCTTGATGAACCATCTATCGGCTTGCATCAACGCGACAACGATCGCCTGATTGCCTCCTTGAAAAAAATGCGCGATCTTGGCAACACGTTGATTGTGGTCGAACATGATGAAGATACGATGCGCGCCGCCGATTATCTGATTGATGTCGGACCGGGGGCTGGCGAACACGGTGGCCGCATCATGGCATCCGGTACCCCTAAACAAGTTGCACGTGTGCGCAAATCAATCACTGGCCAATATTTATCAGGGCGCAAGTTTATTCCGGTACCACTAAAACGGCGACAAGGTAGTGGCAAAGTGATTCGTTTGGAAGGCGCCACTGACCACAACTTAAAAAACATCGACGTTGATTTTCCATTAGGTAAATTCATCGTGGTTTCTGGTGTTTCTGGGTCAGGTAAATCTACTTTGGTTAACTCGATTCTTCGGCGTGCATTGGCTCAAAAGTTAAATCATAATTCTGAGAAACCGGGTCCATACAAAAAGATTCTTGGCTATAAAAATATTGAAAAGCTGATCAATATTGACCAAAGTCCAATTGGCCGCACACCGCGGAGCAATCCGGCTACCTATACGAGTGTTTTCGATGACATCCGCGGGCTATTTGCCGAAACCAACGAAGCTAAATTACGTGGTTACAAAAAAGGCCGCTTTAGTTTCAACATTAAGGGTGGTCGCTGTGAGAACTGTAAAGGCGACGGGATCATCAAGATTGAAATGAACTTTTTACCTGATGTTTACGTGCCTTGCGAAGTTTGCCATGGCAAACGGTATAACTCTGAAACCCTCGAAGTAACGTATAAGGGCAAGAATATTGCTGAAGTGATTGATATGACTGTCGAAGAAGCCACTGACTTCTTCAAGAATATTCCAAAGATTCGGCGCAAGTTGCAAACCATCGTGGATGTTGGCCTTGGTTACGTTAAGCTGGGACAAAGCGCTACCACCTTGTCTGGTGGCGAGGCTCAACGGATGAAGCTTGCAAGCGAACTGCAGAAGCTTTCAACCGGCAAGAATTTTTATATTCTTGACGAACCCACCACTGGTCTGCATACGGATGATATCAAGCGGCTGCTGGAAGTGTTGGAACGGCTAGTCGATGAAGGCAATACCGTACTGGTTATCGAGCATAATCTAGATGTCGTCAAAACAGCTGACTGGGTCATTGATCTTGGCCCTGAAGGCGGAGACGGCGGCGGTCAGATCATCGCCACCGGCACACCTGAACAGGTGGCCAATGTGGCCGATAGTTATACTGGCCAATACTTGAAACCAATCCTCGTTCGCGACACTCAACGGACTAAGGAAGCTGCGCAAACATCAACTAAGAATGAAGCGCAGGCAGTAAGCAAGAAGTAGATTGACTGACCAGGTTGGACCATCATTCACGGCGGTTAATAAGGGCAAACAATGACACCAAAAATTGTTTGCCTTTTTGATATGGGAAATTTATTAGAATTTTCGAGACACTAGTACCAAGGCGGAGCAATCGTAGACCGGATGGGGATCAGCAGTACAAAAAGCACGGCGACCGCGTTTTGTTACTGATGTTGTTAGGCGACTTCGAGACCGCGAGCTTTGCGGGCTTGGAGCGTTGTCTCCGGTCTAGCAACGCGTCGCCAGCCCAGAAACCGACTTGTTTCACACTCTGATTTGCTCATTCTCGTGCTTAATATTATGATGAATAGGATTAAGAAAGTAGGGAAATAGATGTTAAATCGAAAAAGTTTTGGTTTTGACTGGGGGCAGTTTATCACTGGTATCCTGTTCCTGATCGCCGCATTTGTCGTCATGCGCTATCCGCTGGCAACATTGAAAACGGTGACCTTTATCTTTGCTGTTGTTGCCATTATTCGTGGGATTGCGATTTTAGCAGGGTATTCAACGCTTCGCCAGCTCACTGGTAAACTAGCTTGGGTATCGCTCTTGATGGGGATTTTTGACCTTGTTATTGGTGTCATTTTCCTGGTCAACAGTAATTTTGGTGTTGCAACGATTACCATGATGTTTGCAATCTGGTTCTTAGTTGATTCAGTTGGTTCACTATTCAACGTGGGCCATTTGCGGATTGCAGGTACTGGCTGGTTTGTCCTTTACCTCGTTTTGGATATTCTGGCAGTGATTGTGTCTTTGATGCTGTTCATGCAGCCAGTGGTTGCGGCCATCACGTTGGTCACATTATTGTCGATGTTTTTCGTCCTATTCGGCATCGAATGTATTGTCCTTGCCTTTGCACGACGCAATATTTAATGAACATCGCTTTTATTTAACCTGATGCAGCTGATTCATTGCGCTGCATCAGGTTTTTTAATAACAACGCTTGATGATGCGGTGAAAAGAAACCGGGGATCGATAGGAATGACACGCCCGGCATGTTATACTTGAATAAATATGATCAAAAAGGAGCCTTTTATGACTGAAAGTTTGGATCTTGTCATTATCACCGGTATGTCCGGTGCCGGTAAAACCGTTGCCATGCAGGCATTCGAAGACCTGGGATATTTTTGCGTCGATAATATGCCTCCAGCTTTGTTGCCGAAGTTTTGGGAATTGGTAAAAGAATCCGGAAAGATCACGAAGGTCGCGCTTGTTGTCGATCTGCGCAGTCGTGCTTTTTACGATCAGATTATCGATATGCTCGCTAATTTGGACAACAATGCCTATGTTCATTCTCGCATCTTATTCTTGGATGCAACTGATGAAGAGCTGGTTTCTCGGTACAAGGAAACCCGTCGCTCTCATCCGTTGGCCATGGAAGGCCGATTGATGGACGGCATTAAAAAAGAACGTGCATTACTCACAGAATTACGCAATCGCGCGCAGGTTGTGATTGATACCACGACCTTAAGTCCACGTCAGTTACGGGAAAAGATTTTCCTTAACTTTAAGGAAAGCGGTAGTCAACCAGCATTTCATATTGAAGTCATGTCATTCGGGTTTAAATACGGATTACCAATAGACGCTGATATTGTCATGGATGTCCGTTTCCTGCCTAATCCTTTTTACATTAAGGATTATCGGCCCAAGACTGGGCTTGATCCGGAAGTTTACAATTACGTGATGGATAATGAAGATGCCGAAAGTTTCTATAACAAGTTTTATGATCTATTGTCTGAAATCATGCCAAAGTACAAGGCAGAAGGCAAAACCAGCGTAACGATTGCGATTGGCTGCACAGGCGGCCAGCATCGGAGTGTGGCTTTTGCCGAGCGGATTGGTAAGGCGTTTTCAGATGCATATGCCGTTGATATCACGCATCGAGACATTAAGAAGCATAAGGAGACGGTGAATCGCTCATGAGTCGTGAAACTAAATTTATTCGGGTCATCCGCGGTCGGCGTCCAAAGGTGGTTGTCATTGGCGGTGGAACAGGCTTGCCGGTCATTCTGCATAGTTTGCATGAGCAAGATGCAGATGTGACTGCAATTGTGACTGTTGCCGATGACGGCGGTTCATCAGGGACAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP012541|950729:960072|953972_954512_+|WP_003564246.1|DBSCAN-SWA MLNRKSFGFDWGQFITGILFLIAAFVVMRYPLATLKTVTFIFAVVAIIRGIAILAGYSTLRQLTGKLAWVSLLMGIFDLVIGVIFLVNSNFGVATITMMFAIWFLVDSVGSLFNVGHLRIAGTGWFVLYLVLDILAVIVSLMLFMQPVVAAITLVTLLSMFFVLFGIECIVLAFARRNI >NZ_AP012541|950729:960072|950729_953621_+|WP_003661316.1|DBSCAN-SWA MANDKIVIHGARAHNLKNIDVTIPRNKLVVMTGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMEKPDVDSIDGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVGTVTEINDYLRLLWARVGHPICPNDGTPITSQSVEQMVDRVLALPDKTRIQILSPVVRRKKGSHKKVFAKIMREGYVRMRVDGEVVDATADYELDKNKSHDIDIVIDRIVVKPEARSRLFDSFEAALRLSEGYANVDVIGGEPLRFSEHFACPICGFTIGEMEPRLFSFNAPFGACPECDGLGVKLTVDMDLVLPEPSMTLAEGAIAPWNPISSQYYPELLAQAAKTFKVRMDVPFNKLTHRERNVVLNGSDGKLFHFHYENDFGGVRDVDVPFEGVLNNISRRYAETNSDFTRQQMRSYMTALPCPVCHGKRLNRQALAVKIEGRDIAEVSDLAIKDALPFFKTVHLSEAESVIAQPIVKEVVDRLTFLVNVGLGYLTLSRSAGTLSGGEAQRIRLATQIGSNLSGVMYVLDEPSIGLHQRDNDRLIASLKKMRDLGNTLIVVEHDEDTMRAADYLIDVGPGAGEHGGRIMASGTPKQVARVRKSITGQYLSGRKFIPVPLKRRQGSGKVIRLEGATDHNLKNIDVDFPLGKFIVVSGVSGSGKSTLVNSILRRALAQKLNHNSEKPGPYKKILGYKNIEKLINIDQSPIGRTPRSNPATYTSVFDDIRGLFAETNEAKLRGYKKGRFSFNIKGGRCENCKGDGIIKIEMNFLPDVYVPCEVCHGKRYNSETLEVTYKGKNIAEVIDMTVEEATDFFKNIPKIRRKLQTIVDVGLGYVKLGQSATTLSGGEAQRMKLASELQKLSTGKNFYILDEPTTGLHTDDIKRLLEVLERLVDEGNTVLVIEHNLDVVKTADWVIDLGPEGGDGGGQIIATGTPEQVANVADSYTGQYLKPILVRDTQRTKEAAQTSTKNEAQAVSKK >NZ_AP012541|950729:960072|955558_956587_+|WP_003564250.1|DBSCAN-SWA MSRETKFIRVIRGRRPKVVVIGGGTGLPVILHSLHEQDADVTAIVTVADDGGSSGTIRNYINVVPPGDIRNVLVALSELPSLYLDIFQYRFNTTDAFFAGHAIGNLIIAALSEMKGGIFPAVQQLSEMMQVDGHVYPASNTPLTLNAEFTDGTKLSGEAEITAAGKNIKHISVSETDPANGKPEAVKEVIDAIMDADVVVLGPGSLFTSILPNLMIENLGDAVKKTQAEVIYIVNIMTQKGETQHFTDADHVRVLNEQMGENFVDTVLVNIEPVPDNYLDHQKYNEILTPVKHNYQGLRDMGCRVISEDFLKLRDHGVFHDGDKVAKEILNLAFQVSGKTRR >NZ_AP012541|950729:960072|954674_955562_+|WP_003564248.1|DBSCAN-SWA MTESLDLVIITGMSGAGKTVAMQAFEDLGYFCVDNMPPALLPKFWELVKESGKITKVALVVDLRSRAFYDQIIDMLANLDNNAYVHSRILFLDATDEELVSRYKETRRSHPLAMEGRLMDGIKKERALLTELRNRAQVVIDTTTLSPRQLREKIFLNFKESGSQPAFHIEVMSFGFKYGLPIDADIVMDVRFLPNPFYIKDYRPKTGLDPEVYNYVMDNEDAESFYNKFYDLLSEIMPKYKAEGKTSVTIAIGCTGGQHRSVAFAERIGKAFSDAYAVDITHRDIKKHKETVNRS >NZ_AP012541|950729:960072|956591_957539_+|WP_003593901.1|DBSCAN-SWA MASFASLVKKELTQLEVHPEHAKAELSALIRMNGSLTLMAHRFVLNIQTENPAIARRIYSLIRQVYHHEANLVVHRKMKLKKNYQYIVRLTEGVNDILSDLSILDPDTMAISTTVPASVLKEPQRMRSYLRGAFLASGSVNNPETSRYHLEIYSLYDNHNAGILKMMNHFNLNARTVERRSGYIVYLKEAEKIADFLQVIGATNAMLKFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCENANMNKTIDAAQKQIENINYLKNHVGLDNLPAKLREIAVLRLAHPDVSLQELGAMMPSGQISKSGVNHRLRKLNQIAEGYQQPEEA >NZ_AP012541|950729:960072|957924_958380_+|WP_003569571.1|DBSCAN-SWA MVKPITLNEQLCFAIYKAQKQYNHFYSQALAPFKLTYPQYITLLSLYEHGTMSVKQVGQTLELDSGTLTPLMKRLEKDGWISRKRSTEDERRVDVSLTQKALDARDQIFEHVGSCMELMNLPKPEYDHIKSEVSRVDEHLSAIPDGAFPEA >NZ_AP012541|950729:960072|958496_959087_+|WP_003564255.1|DBSCAN-SWA MLVPTVVEQTSRGERAYDIYSRLLKDRIIMLSGEVNDQMANSVIAQLLFLDAQDSEKDIYLYINSPGGVITSGLAMLDTMNFIKSDVQTIAIGMAASMASVLLAGGTKGKRFALPNSTILIHQPSGGAQGQQTEIEIAAEEILKTRRKMNQILADATGQTIEQIKKDTERDHYMSAQEAKDYGLIDDILVNKNTQK >NZ_AP012541|950729:960072|959409_960072_-|WP_003593905.1|DBSCAN-SWA MKKKKPIYKRIWFWIIVVLFIIVGVNMTGSKTNNSNTAAESSSSSAADKSDQQSSVASEATSESKTANVPAEYQSALNKGTTYASAMNMSKAGVYDQLVSQSGEKFSAEAAQYAIDHLKADWNKNALNKAKSYADSMHMSKAGIYDQLTSQSGEKFTAEEANYAIENVKADWNKNALAKAKTYQKDMDMSPDAVREQLTSENGEKFTADEANYAIQNLNK |
8 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1833934 : 1897521
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP012541|1833934:1897521|DBSCAN-SWA 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68 | Lactobacillus_phage(75.47%) | capsid,head,integrase,portal,protease,holin,tRNA,terminase,transposase,tail | attL 1833789:1833808|attR 1876615:1876634 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1917487 : 1995027
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP012541|1917487:1995027|DBSCAN-SWA 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82 | Lactobacillus_phage(46.67%) | head,integrase,protease,holin,transposase,terminase,tail | attL 1953377:1953395|attR 1993476:1993494 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2026742 : 2094958
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_AP012541|2026742:2094958|DBSCAN-SWA 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52 | Acidithiobacillus_phage(12.5%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2361677 : 2489548
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_AP012541|2361677:2489548|DBSCAN-SWA 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119 | Staphylococcus_phage(15.38%) | transposase,protease,tRNA,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2494511 : 2519025
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_AP012541|2494511:2519025|DBSCAN-SWA 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22 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2711422 : 2779502
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_AP012541|2711422:2779502|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(20.0%) | transposase,protease,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2805987 : 2871611
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_AP012541|2805987:2871611|DBSCAN-SWA 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55 | unidentified_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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