1. NZ_AP013356
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_AP013356_1 | 350415-350541 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_AP013356_1
|
1 spacers
spacers of NZ_AP013356_1
>1.1|350452|53|NZ_AP013356|CRISPRCasFinder AAGAAGAATTACAGAGCAAAGAAACCCCAGAAGGCAAGCATGATGGAGAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP013356_1
The CRISPR arrays of NZ_AP013356_1 >merge|NZ_AP013356|1|350415-350541|CRISPRCasFinder CTCTCTAGCGTTACTGAAGAGATTATTTCAAAAAAACAAGAAGAATTACAGAGCAAAGAAACCCCAGAAGGCAAGCATGATGGAGAGAGACTCTCTAGCGTTACCGAAGAGATTATTTCAAAAAAAC >NZ_AP013356|1|1|350415-350541|CRISPRCasFinder CTCTCTAGCGTTACTGAAGAGATTATTTCAAAAAAAC AAGAAGAATTACAGAGCAAAGAAACCCCAGAAGGCAAGCATGATGGAGAGAGA CTCTCTAGCGTTACCGAAGAGATTATTTCAAAAAAAC
>NZ_AP013356.1|WP_000699933.1|349723_350029_+|hypothetical-protein MKIMHQVRDFLDSCKQTIQKNSSEVFQKTKRAFFKEESQKIREQAVKIVEKRLKKEGMKLSDFNEEELKIMFEAEEKRLLEQIQTKHFKEVWEKGDNEQGK >NZ_AP013356.1|WP_000599146.1|348360_348765_+|Holliday-junction-resolvase-RuvX MILACDVGLKRIGIAALLNGVILPLEAILRHNRNQASRDLSDLLREKNIQVLVVGKPHESYADTNARIEHFIKLVDFKGEIVFINEDRSSIEAYENLEHLGKKNKRLAIKDGRLDSLSACRILERYCQKVLKNH >NZ_AP013356.1|WP_001862983.1|347563_348364_+|DNA-protecting-protein-DprA MKSHFQYSTLENIPKAFDILKDPPKKLYCVGDTKLLDTPLKVAIIGTRRPTPYSKQHTITLARELAKNGAVIVSGGALGVDIIAQENALPKTIMLSPCSLDFIYPTNNHKVIQEIAQNGLILSEYEKDFMPIKGSFLARNRLVIALSDVVIIPQADLKSGSMSSARLAQKYQKPLFVLPQRLNESDGTNELLEKGQAQGIFNIQNFINTLLKDYHLKEMPEMEDEFLEYCAKNPSYEEAYLKFGDKLLEYELLGKIKRINHIVVLA >NZ_AP013356.1|WP_000051415.1|347318_347552_+|cell-division-topological-specificity-factor-MinE MSLFDFFKNKGSAATATDRLKLILAKERTLNLPYMEEMRKEIIAVIQKYTKSSDIHFKTLDSNQSVETIEVEIILPR >NZ_AP013356.1|WP_001019069.1|346515_347322_+|septum-site-determining-protein-MinD MAIVVTITSGKGGVGKSTTTANLAIGLAESGKKVVAVDFDIGLRNLDMILGLENRIVYDVVDVMEKNCNLSQALITDKKTKNLSFLAASQSKDKNILDKEKVAILINALRADFDYILIDSPAGIESGFEHAILHADMALVVVTPEVSSLRDSDRVVGIIDAKSNRAKKGMEVHKHLIINRLKPELVANGEMISIEEVLKILCLPLIGIIPEDHHIISATNKGEPVIRTDCESAKAYQRITRRILGEEVEYVEFKAKRGFFSALKGIFS >NZ_AP013356.1|WP_001207734.1|345498_346491_+|ketol-acid-reductoisomerase MALPVYYDKDIDLGVIQSLQVGIIGYGAQGEAQALNLRDSKVKARIGLYQGSLSVSKAKKEGFEVLEVKELVQNSDVIMALLPDELHKEVLEKEVIPFLKEGQIVGFAHGFSVHFNQVVLPKGVGAILVAPKGPGSALREEYLKNRGLYHLIAIEQESSIHNAKAVALSYAKAMGGGRMGVLETSFKEECESDLFGEQAVLCGGLEAIVRMGFETLIKAGYPEELAYFECVHEVKLVADLLHYKGVEGLRKHISNTAEFGAIKAREPMGKLLKKRMQKILKKIQNGSFAKDFLLEKSLNYPRLNTERKALKETKIEQIGEILRAPFNHKK >NZ_AP013356.1|WP_001168317.1|344467_345250_-|NAD+-synthase MQKDYQKLIVYLCDFLEKEVQKRGFKKVVYGLSGGLDSAVVGVLCQKVFKENAHALLMPSSVSMPENKTDALNLCEKFSIPYTEYSIAPYDAIFSSHFKDASLTRKGNFCARLRMAFLYDYSLKSDSLVIGTSNKSERMLGYGTLFGDLACAINPIGELFKTEVYELARRLNIPKKILNKPPSADLFVGQSDEKDLGYPYSVIDPLLKDIEALFQTKPIDTETLAQLGYDEILVKNITSRIQKNAFKLELPAIAKRFNPE >NZ_AP013356.1|WP_000833936.1|343532_344471_-|tetraacyldisaccharide-4'-kinase MKSDKPFLERYFYDPTLLQKGLIFALYPFSLIYQGIATLKRKTAKKHDFKIPIISIGNLIAGGSGKTPFILEIAPRYQEVAVVSRGYQRDSKGLVVVSVKGNILVSQKTAGDEAYLLALNLKQASVIVSEKRELGVLKALELGAKIVFLDDGFRFNFNQFNLLLKPKVPPYYPFCLPSGLYRESIKSYEEAHLVVTEDKDYQRITSISRPTKRMLLVTAIANPSRLDAFLPKEVVKKLYFKDHAPFNLELLEKEFYQNNATSLLVTSKDLVKLQDCNLPLSVLNLKLEICPKVLEEIDHYILSYPYNTKERL >NZ_AP013356.1|WP_000742697.1|343057_343600_+|UDP-4-amino-4,-6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine-N-acetyltransferase MKKNYSYKNIQAIDFTNLNDGEKLLVLEFRNHPNTALWMYSTFISLKTHLQFIEDLKNSPNHRYFLFKEEGVYLGVGSITKINFFHKHGYLGIYKNPFLKNGGETILKALEFIAFEEFQLHSLHLEVMENNFKAIAFYEKNHYELEGRLKGFISKDKEFIDVLLYYKDKKGYNDQSLLKL >NZ_AP013356.1|WP_080012148.1|342167_343061_+|CMP-N-acetylneuraminic-acid-synthetase MQPFEKRMPVKILCDCFLTSGLGHVRRCEKILSFIEKLGVEASLYLHKQNNISAFLEGVGGNDFLITDSYCLNSKDFYLLKEKAKSLMVIEDTEHAKGFYPKNTKILNFTLNALKHYHHLSKDYQYYLGVGFYPVDARFIYDRPINTENKEVLITLGGSEQKTLKEIVKILENKNVNLHIISPYTPKNPPKNTHYYSPLNPLEFSSLMKSCACAISAAGQTLYELALSQTPSLILPIASNQIIQSKEFESLGIFKQTSLKTLAKDFENLQIQKNQAWAKNLVFGDKLEGALREFLEI >NZ_AP013356.1|WP_015056036.1|350630_350987_+|hypothetical-protein MIVDSEGFSPSIYTDKTGHPTIGYGYNLSVYSYEGKRITKTYGLLTDILSYGWYKNLDAMRRMVILDLSYNLGLNGLLKFKQFIKAIEDKNYALAVERLQKSPYFNQVKKERQGIWKF >NZ_AP013356.1|WP_001862993.1|350974_351241_+|hypothetical-protein MEILKLEGCEKHCKKKYAIEKVIKEVGLELKSKSVMPYFFNEYDLTKNANRKEPERLRSQIISILMKTPKGREILKEYLNEGCILLGE >NZ_AP013356.1|WP_000393582.1|351546_351933_+|DUF1294-domain-containing-protein MEFASIVWLLIVNILIFILMLVDKNSADQKMWRIPEKALWVLSLLGGSVGFLVAMVVSHHKILKPEFKYGVSLIYLIESTILYFVSKDLSWIVALTIFSLSLILVAFKIFLLKDNPNKRFKNNKRDKK >NZ_AP013356.1|WP_001862999.1|352708_353044_+|hypothetical-protein MENDVKEDLEQARPKLEPEKQKQEPEEQKQEKQDKQEQKPKQEKEESKSKEQEENKKQKRSSYIFWGCIIGLCIVVIIAKIIAFGGSSEEAKADKPKNSLSMLKNFYLPIL >NZ_AP013356.1|WP_010875469.1|353163_353946_+|hypothetical-protein MDKFLDWHYSVKGDYSELALFVAKKIGLSAEDAVANVLQEKLLGKDYKQRLDAITKKLSKTYGSLLNQHEKFVSETALKGVDTDLSQNAKILDTLGDEVARKLKANFTGAIGATAGVSGLAIAAKLTPKLMAKIGAKLGAKVGGKFLAKIGTALSGSWTCGPFVPACTIGLWFGSDAAFNYIDEWLHRDDFKKEILNNINEVKENLKNSYKQQFNDSFVKISQEFQKSFKNAPVVEKKTIKEHIGDLNQTPEEDNQKINQ >NZ_AP013356.1|WP_001117124.1|353939_354836_-|RNA-pseudouridine-synthase MPFVEEEFEILKPTKALFFVRDVLKCSLKEAQRHLDKQRLKQNQQAVRKSQIIQGVVRLIHFKPNEKTQALVFETKDFGVFDKPHQVYTHPKGYFYHESLLDCIQSHFGKNAHPAHRLDYETSGLVLAGKTLQSVKDLKALFMQKKVKKTYLALAHGLVEKSMKIDKPILTPQNIQKDLHIRSKISPLGKQSITLVEPLSYNPFLDISLLKITPLTGRTHQIRLHLSSVDHRIVGEGLYGVADENAREYLQLKRENNAPLLMLHAASLEFEFKGAIYKIASPMPERFMPFLKDLSFFY >NZ_AP013356.1|WP_000810700.1|354835_356386_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKQKLKAQIKERMASIAYNEKGFPSPFLFKDLKKAALKIIEAMRTNTEILVVGDYDADGVISSAIMAKFFESLNYKHVRIAIPNRFMDGYGISKKFLEKHHAPLIITVDNGINAFEAARFCKEKNYTLIITDHHCLHHDEVPDAYAVINPKQPDCDFIQKEVCGALVAFYLCYGIHQLLGKEKSHSSELLCLAGVATIADMMPLTFFNRFLVSKALYFLQKESLGAMGFLRQREVFRKRSLKASDISFNIAPLINSAGRMQDAKMALDFLSANNSQDGYSLYERLKACNLKRKMIQQQVFEEAFKHAMVGEKIIVAFKDNWHEGVLGIVASKLVEATQKPSLVFTFKEGVYKGSARSSSNIDLIDALNGVSSLLLGYGGHRQACGLSVEKNNIISLFETLENFDFKVLPFCKTEPPLTLKLKDIDRELLEIIEMGEPYGQENPEPLFQAKNLEVIEEKIIKESHQVLRFKDKECVKEAIYFSAERFLKAGEKVSVLFSVELDECSNEPKMFVKSLL >NZ_AP013356.1|WP_000373222.1|356394_358011_-|CTP-synthase-(glutamine-hydrolyzing) MDRAKFIFVTGGVLSSLGKGISSSSIATLLQHCNYQVSILKIDPYINIDPGTMSPLEHGEVFVTSDGAETDLDIGHYERFLNRNLTRLNNFTTGQIFSSVIENERKGEYLGKTIQIVPHVTDEIKRRIKSAAKGLDFLIVEVGGTVGDMEGMFYLEAIRQLKLELGNEKVINVHVTLIPYIQTTNELKTKPTQHSVQELRRLGVTPQIILARSPKPLDKELKNKIALSCDVEQDSVIVATDTKSIYACPILFLQEGILTPIARRFNLNKLHPKMAAWNTLVEKIIAPKHKVKIGFVGKYLSLKESYKSLIEALIHAGAHLDTQVNIEWLDSENFNEKTDLEGVDAILVPGGFGERGIEGKICAIQRARLEKLPFLGICLGMQLAIVEFCRNVLGLKGANSTEFNQRCEYPVVYLIGDFMDQNHQKQVRTYNSPLGGTMRLGEYECEIMPNSLLEKAYKKPSIKERHRHRYEINPKYRQEWENKGLKVVGFGSNHLIEAIELEDHPFFVGVQFHPEFTSRLQSPNPIILDFIKSALSKS >NZ_AP013356.1|WP_000829924.1|358270_358939_+|hypothetical-protein MAENSFKNVSTQPKVFFLLPAKTLFLLGGVFSAFFILIAGLVFFDYAHLMDNAIFNFARSTPFNSSPILTLILQNIANLGSSQFVLPLSLLVGVFLSLYRRNLVLGVWFVLSVILFEALLESLKHLFAYSIQWLSRSANFPNATALSLVLFYGLLILLIPHLITHQTLKNVLFYSLFGLIFLIGLALIVLGVSFSSVLGGFCLGALGACFSIGIYLSVFQKI >NZ_AP013356.1|WP_000364750.1|358982_360686_+|flagellar-M-ring-protein-FliF MDLKVLLQRIVDFFIKLNKKQKIALIAAGVLITALLVFLLLYPFKEKDYTQGGYGVLFEGLDSSDNALILQHLQQNQIPYKVSKDDTILIPKDKVYEERITLASQGIPKTSKVGFEIFDTKDFGATDFDQNIKLIRAIEGELSRTIESLNPILKANVHIAIPKDSVFVAKEVPPSASVMLKLKPDMKLSPTQILGIKNLIAAAVPKLTIENVKIVNENGESIGEGDILENSKELALEQLHYKQNFENILENKIVNILAPIVGGKNKVVARVNAEFDFSQKKSTKETFDPNNVVRSEQNLEEKKEGASKKQVGGVPGVVSNIGPVQGLKDNKEPEKYEKSQNTTNYEVGKTISEIKGEFGTLVRLNAAVVVDGKYKIALKDGVNTLEYEPLSDESLQKINALVKQAIGYNQNRGDDVAVSNFEFNPMAPVIDNATLSEKIMHKTQKILGSFTPLIKYILVFIVLFIFYKKVIVPFSERMLEVVPDEDKEVKSMFEEMDEEEDELNKLGDLRKKVEDQLGLNASFSEEEVRYEIILEKIRGTLKERPDEIAMLFKLLIKDEISSDGAKG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_AP013356_2 | 1166146-1166234 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_AP013356_2
|
1 spacers
spacers of NZ_AP013356_2
>2.1|1166175|31|NZ_AP013356|CRISPRCasFinder TCAAGGGAGTTTTCTTTGATCTCTGCATGGG |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP013356_2
The CRISPR arrays of NZ_AP013356_2 >merge|NZ_AP013356|2|1166146-1166234|CRISPRCasFinder CATGCGAGAAGTAGTGGTTCAAGAACATTTCAAGGGAGTTTTCTTTGATCTCTGCATGGGCATGCGAGAAGTAGTGGTTCAAGAACATT >NZ_AP013356|2|2|1166146-1166234|CRISPRCasFinder CATGCGAGAAGTAGTGGTTCAAGAACATT TCAAGGGAGTTTTCTTTGATCTCTGCATGGG CATGCGAGAAGTAGTGGTTCAAGAACATT
>NZ_AP013356.1|WP_001265981.1|1164920_1165967_+|NAD(P)-dependent-alcohol-dehydrogenase MRVQSKGFAIFSKDGHFKPHDFSRHAVGPKDVLIDILYAGICHSDIHSAYSEWKEGIYPMVPGHEIAGAIKEVGKEVKKFKVGDVVGVGCFVNSCKACKPCKEHQEQFCAKVVFTYDCLDYFHDNEPHMGGYSNNIVVDENYVISVDKNAPLEKVAPLLCAGITTYSPLKFSKVTKGTKVGVAGFGGLGSMAVKYAVAMGAEVSVFARNEHKKQDALSMGVKHFYTDPKQCKEELDFIISTIPTHYDLKDYLKLLTYNGDLALVGLPPVEIAPALSVFDFIHLGNRKVYGSLIGGIKETQEMMDFSIKHNIYPEIDLILGKDIDTAYHNLTHGKAKFRYVIDMKKSFD >NZ_AP013356.1|WP_001126886.1|1163748_1164759_+|glucokinase MPKTETYPRLLADIGGTNARFGLEVAPRQIECIEVLRCEDFESLSDAVRFYLSKCKESLKLHPIYGSFAVATPIMGDFVQMTNNHWTFSIETTRQCLTLKKLLVINDFVAQAYAISAMQENDLAQIGGIKCEINAPKAILGPGTGLGVSTLIQNSDGSLKVLPGEGGHVSFAPFDDLEILVWQYARSKFNHVSAERFLSGSGLVLIYEALSKRKGLEKVAKLSKAELTPQIISECALNGDYPICRLTLDTFCSMLGTLAADVALTLGARGGVYLCGGIIPRFIDYFKTSPFRARFETKGRMGAFLASIPVHVVLKKTPGLDGAGIALENYLLHDKI >NZ_AP013356.1|WP_000542222.1|1163078_1163762_+|6-phosphogluconolactonase MGYQLFEFENLKDCHKALTERFKEFFNTALKKHHQISIAFSGGRSPISLLQKLSVLNLKWHECLISLVDERIIDTSHDDSNTKLLHDYLLQNNALKASFIPLLPEKISSDTNALFNFANQHFKQPHLAILGMGTDGHTASLFPETSAFLNEEKENIVLTKPINAPYERLSMSVNALENCEKLFLSISGVEKRGVLEKALKENAPYSLPIARILHSQKVTTEVFYAKN >NZ_AP013356.1|WP_000883625.1|1161790_1163068_+|glucose-6-phosphate-dehydrogenase MLDFDLVLFGATGDLAMRKLFVSLYEIYTHYGFKNDSRIIASGRKELSNEEFLTLLCEKTQLHSREKGREFLAHISYLCVRLDNPKDFEELSKIATKNKPLIFYFSISPSFFATTAQHLAKNALNHANTRLILEKPLGHDLKTCKEIFQSISVFFKEEQIFRIDHYLGKKGVQNILELRLNNPILNILWDQISAVEICVYETLGVEERGEFYDKIGALRDMVQNHLLQVLSLIATDLPNNLKDLRKEKIKVLKTLQPPKDFKKQVIRAQYQGYRDENKVHKESQTETFVAIKAFLDTPKFKGVPFYLKHAKKMPHNQASVKIHFNAVNTLEFFLSQDKITLTLKDHQNPLILETHNKQEFLRPYAKLLYDAIQNNHNNFAHQLELEASWVFIDTLIEGFMNNATPLYSYESHHLNESEFLKPLYQ >NZ_AP013356.1|WP_001124018.1|1159898_1161725_-|phosphogluconate-dehydratase MPKHSLEQIKEKITERSKKTRELYLENIFNPKNQPKIESLGCANIAHVTASMPEHLKMPLGSHKRKHFAIITAYNDMLSAHQPFKNYPDLIKKELQEHNAYASVASGVPAMCDGITQGYDGMELSLFSRDVIALSTAVGLSHNVFDGAFFLGVCDKIVPGLLIGALSFGNLASVFVPSGPMVSGIENYKKAKARQDFAMGKINREELLKVEMQSYHDVGTCTFYGTANSNQMMMEFMGLHVANSSFINPNNPLRKVLVEESAKRLASGKVLPLAKLIDEKSILNALIGLMATGGSTNHTLHLIAIARSCGVILNWDDFDAVSNLIPLLAKVYPNGSADVNAFEACGGLVFVIKELLKEGLLFEDTHTIMDTETQKGMQNYTKTPFLENNQLVYKDAINHSLNTDILRPVSDPFAANGGLKILKGNLGRAVIKISAIKDEHRKVKARAIVFKTQSEFLERFKNKELERDFVAVLPFQGPKSNGMPELHKLTTNLGALQDMGYKVALVTDGRMSGASGKVPSAIHLSPEGALNGAIIKIKDGDLIELDAPNNALNVLEKDFEKRGINPLFLETLENLEKPSFGLGRELFTSLRLNVNTAEEGGMSFGIKV >NZ_AP013356.1|WP_001152804.1|1159253_1159880_-|bifunctional-4-hydroxy-2-oxoglutarate-aldolase/2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate-aldolase MQDKIIEVLQISPIVPVVVIENIKDAVPLAQSLIEGGIPIIEVTLRSSCALEAIELIAKNMPKMRVGAGTILNPTQLEQAQNRGAEFLISPGLTIKLLEHAKKKDMPLIPGVSSSSEVMQALELGYSALKFFPAEYCGGVKLLNAFNGPFKGVKFCPTGGISADNMRSYLNLENVLCVGGSWLTPKNLIQNKEWDKITEICKRALALR >NZ_AP013356.1|WP_000892717.1|1158311_1159184_-|Sel1-like-repeat-protein-HcpC MLENVKKSFFRVLCLGALCLGGLMAEQDPKELVGLGAKSYKEKDFTQAKKYFEKACDLKENSGCFNLGVLYYQGQGVEKNLKKAASFYAKACDLNYSNGCHLLGNLYYSGQGVSQNTNKALQYYSKACDLKYAEGCASLGGIYHDGKVVTRDFKKAVEYFTKACDLNDGDGCTILGSLYDAGRGTPKDLKKALASYDKACDLKDSPGCFNAGNMYHHGEGATKNFKEALARYSKACELENGGGCFNLGAMQYNGEGVTRNEKQAIENFKKGCKLGAKGACDILKQLKIKV >NZ_AP013356.1|WP_162481329.1|1157651_1158098_+|IS200/IS605-family-transposase MNKDRGMRKNHYPLRGYISTNRSKHNLKAHLILVCKYRKKLLQGDLNNFIKSVIDEIATQSNFIIIAMESDIDHLHLMVQYIPRMSISSIISRIKQITTYRVWRDKRFIPLLQKHFWKEKTFWTDGFFVCSIGEANPETIKAYIENQG >NZ_AP013356.1|WP_000930565.1|1156316_1157600_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MLNAIKFRIYPNAQQKELISKHFGCSRVVYNYFLDYRQKQYAKGIKETYFTMQKVLTQIKRQEKYHYLNECNSQSLQMALRQLVSAYDNFFSKRARYPKFKSKKNAKQSFAIPQNIETKTETQTIALPKFKEGIKAKLHRDLPKDSVIKQAFISCIADQYFCSLSYETKEPIPKPTIIKKAVGLDMGLRTLIVTSDKIGYPHIRFYQKLEKKLTKAQRRLSKKVKDSNNRKKQAKKVSRLHLACSNTRDDYLHKISNEITNQYDLIGVETLNVKALMRTYHSKSLANASWGKFLTMLEYKAQRKGKTLLSIDRFFPSSQLCSYCGVNTGKKHESITKFTCPHCQTTHHRDYNASVNIRNYALGMLDDRHKVKTDKARVGIIRSDYTHHTNECVKACGASSNGVSSKYGNILDLASYGAMKQEKAQSL >NZ_AP013356.1|WP_015056078.1|1156009_1156348_+|hypothetical-protein MFFKSNLILSFIGTCLNAYEKDNELWALAKIYDIEAVLDLLNNEKSTSPAVYCYYEKDNAVIVDKPMLINHLAIVEQGHWDKKDRNSIDNSKINILDLNYPTAKAIGLFLAS >NZ_AP013356.1|WP_000576584.1|1167464_1168772_+|hypothetical-protein MIFLKKSLYALLFSGFLTPPLMKAASFVYDLKFMSFNFNLVAPANNPYWNSLTKMQGRLMPQIGVQLDKRQALMFGAWFIQNLHTHYSYFPYSWGVTMYYQYIGKNLRFFLGIVPRSYQIGHYPLSAFKKLFWFIDPTFRGGAFQFKPAYDPNRWWNGWFEGVVDWYGGRNWNNQPKKKNYDFDQFLYFVSSEFQFLKGYLGLGGQLVVFHNASHHSMGDNYPYGGNSYLKPGDVTPQWPNGYPYFSQKNNPQGGEIGKYSNPTILDRVYYHAYLKADFKNLMPYMDNIFMTFGTQSSQTHYCVRYASECKNARFYNSFGGEFYAQAQYKGFGIFNRYYFSNKPQMHFYATYGQSLYTGLPWYRAPNFDMIGLYYVYKNKWVSVRADAFFNFLGGGDGYHLYGKGGKWITTYQQFLTLTIDTRELIDFVKSKTSK >NZ_AP013356.1|WP_001863208.1|1168778_1169441_-|outer-membrane-protein MNKTTVKILMGMALLSSLQAAEAELDEKSKKPKFADRNTFYLGVGYQLSAINTSFSTESVDKSYFMTGNGFGVVLGGKFVAKTQAVEHVGFRYGLFYDQTFSSHKSYISTYGLEFSGLWDAFNSPKMFLGLEFGLGIAGATYMPGGAMHGIIAQNLGKENSLFQLLVKVGFRFGFLHNEITFGLKFPVIPNKRTEIIDGLSTTTLWHRLPVAYFNYIYNF >NZ_AP013356.1|WP_000486467.1|1169730_1170291_+|pyruvate-flavodoxin-oxidoreductase-subunit-gamma MFQIRWHARAGQGAITGAKGLADVISKTGKEVQAFASYGSAKRGAAMMAYNRVDDEPILNHERFMQPDYVLVIDPGLVFIENIFANEKEDTTYIITSYLNKEELFEKKPELKTRKVFLVDCLKISMETLKRPIPNTPMLGALMKVSGMLEIGAFKEAFKKVLGKKLTQEVIDANMLAIQRAYEEVQ >NZ_AP013356.1|WP_000656174.1|1170306_1170699_+|4Fe-4S-binding-protein MKDWNEFEMGAVLFPFEKNAQSEMEKHNDERHYTEQSYFTTSVAHWRVAKPVHNNNICINCFNCWVYCPDAAILSREGKLKGVDYSHCKGCGVCVDVCPTNPKSLWMFEEQIEPATALTQWPQKQEKKKS >NZ_AP013356.1|WP_001129867.1|1170708_1171932_+|2-oxoacid:ferredoxin-oxidoreductase-subunit-alpha MAKSIELQEIEVWDGNTASSNALRQAQIDVIAAYPITPSTPIVQNYGSFKDNGYVDGEFVLVESEHAAMSACVGAAAAGGRVSTATSSQGLALMVEVLYQASGMRLPIVLNLVNRALAAPLNIHGDHSDMYLSRDSGWISLCTCNPQEAYDFTLMAFRIAEHQKVRVPTIVNQDGFLCSHTVQNVRPLSDAVAYQFVGEYQTKHSLLDFDKPVSYGAQAEEEWHYEHKAQLHHAIMSASSVIEEVFNDFAKLTGRQYHLTKTFQLEDAEIAIFALGTTYESAIVAAKEMRKKGIKAGVATIHSLRPFPYERLGQDLKNLKALAILDKSSPAGTMGAMFNEVTSAVYQTQGTKHPVVSNYIYGLGERDMTIAHLCEIFEEINEDALKGTLTHPTQQFVGLHGPKMSFF >NZ_AP013356.1|WP_000238135.1|1171944_1172889_+|pyruvate-ferredoxin-oxidoreductase-subunit-beta 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
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| DBSCAN-SWA_1 |
1018054 : 1061701
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP013356|1018054:1061701|DBSCAN-SWA 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36 | Helicobacter_phage(50.0%) | integrase,protease,tRNA,transposase | attL 1037408:1037423|attR 1057974:1057989 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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