Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010086 | Clostridium beijerinckii strain NCIMB 14988 chromosome, complete genome | 5 crisprs | DEDDh,RT,cas3,csa3,DinG,WYL | 0 | 3 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010086_1 | 1340091-1340296 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010086_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP010086_1
>1.1|1340117|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder TAAATAATAAGTTTTACCGTTTAATTCAAGTAAT >1.2|1340177|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder TAGATAATACCAAGCTCCGTTGTTTAAAAGCCAG >1.3|1340237|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder AGTATAATACCATTTACCGCCATCGCTAATCCAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010086_1
The CRISPR arrays of NZ_CP010086_1 >merge|NZ_CP010086|1|1340091-1340296|CRISPRCasFinder CCTGTTTTCATTGCTCCAGAGTCACTTAAATAATAAGTTTTACCGTTTAATTCAAGTAATCCAGTTTGCATATCTCCAGATGAATTTAGATAATACCAAGCTCCGTTGTTTAAAAGCCAGCCAGTTTGCATATCTCCAGATGGATTAGTATAATACCATTTACCGCCATCGCTAATCCAGCCAGTTTTCATTTCGCCAGACGATGC >NZ_CP010086|1|1|1340091-1340296|CRISPRCasFinder CCTGTTTTCATTGCTCCAGAGTCACT TAAATAATAAGTTTTACCGTTTAATTCAAGTAAT CCAGTTTGCATATCTCCAGATGAATT TAGATAATACCAAGCTCCGTTGTTTAAAAGCCAG CCAGTTTGCATATCTCCAGATGGATT AGTATAATACCATTTACCGCCATCGCTAATCCAG CCAGTTTTCATTTCGCCAGACGATGC
>NZ_CP010086.2|WP_041894871.1|1337282_1339262_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MSILSLKNISKYYKVKSSEKVYVLKDINLSFKKNELVAIIGESGSGKSTLMNLIGGLDSKYNGELFVNGDNIKKFKKRELDEYRKNKIGFVFQSFNLIPHLSILNNVAIAMTLSNVKKKERVKRAKELLIELGLKDHINKKPNQLSGGQKQRVAIARALVNDPEIIIADEPTGSLDSKTSMQVLEIMKSIAKAGKLVIMVTHSEKVASCCSRVIKIADGSINEDNKSFELEAAVGDEKNYEGSRYIRKRGKSLNSFNAIKLALTNMKEKAIRNIFISIGSSIGIMSLILMLAFGNGIKAYFNRTMNSYVNPLVIEVNMPSDDSETVDLDIATIQKPDINKQTPFKEDDIKKLSEIENVSSIEKGFNEISLGADSLSYNGKGSNVMRLSTISSNITESNLKEGTLPKDGEILINKTISDKVGEDIIGKKVTLSILVSQKVLKKEFIVSGIYTTAGGDLTSIMKSVFLNYSDLENWYSENKYELKSNVMYLNTPSEKYTDGIKEKVKELGYSGSSQEQMLNMFNSMISILTYVLSGISAVSLVVSAIMIVVIMYISVVERTKEIGIIKAIGGRRKDIRKIFVLEAFLIGCFSGIIGLAFAYALMRGINIKSIKLFGINLVLIKKSYAAFGLTLSIVISVLAGLLPANKAARLDPVESLRRE >NZ_CP010086.2|WP_041894869.1|1336365_1337244_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MSKKIKKAIIPAAGLGTRFLPATKAKSKEMLPIVDKPAIQYIVEEAIASGIEEILIITGRHKTCIENHFDKSVELEAELAKNNKEELLKIVRDISGMANIHYIRQKEPRGLGHAIYCARAFVGNEPFAVLLGDDIVYTNEYQKPCLKQLIDCYGEYKTSILGVQAVEPEHVSRYGIVNGIKIEDRVSKVKGLVEKPSIKDALSNTAILGRYIITPQIFEVLSRIKPGKGNEIQLTDALLELLKEEAIYSYNFEGKRYDVGDKLGYLKATVEYALRNSELRDGFTDYLKSIVI >NZ_CP010086.2|WP_041894867.1|1335333_1335855_+|VanZ-family-protein MKKIVILLCLFWMGFIFYMSGNNGTISHEQSTKVVNIIENAQRNQEKSQAENKDKAVSSSDSSQVNKNSINVQQEEASNLDHIVRKNAHAFMYMVLAILVCGALFSYNKSGKGMIIYILFICLFYAATDEFHQSFIPGRTSLVSDILVDFMGAMIGLGLFYLSYYKIYKRKRS >NZ_CP010086.2|WP_041894865.1|1334927_1335155_+|acyl-carrier-protein MEKLIELLQGVRDDVDFGTCTTLVDEGILDSFDIVEIVNVIDDEYDIEVPAIEIIPENFNSAEAIFNLIKRLLEE >NZ_CP010086.2|WP_041894862.1|1333401_1334913_+|amino-acid-adenylation-domain-containing-protein MEKSILYYLERSEKKFPNKVAFSDGKYELTYRKLVEEAKSIGSFLLENIGMRKAVVVYMEKGARNISAFMGAAYAGCFYVPLDAQMPVERINIILDTLKPAAIIYDDKTEKYLSLIETDCIKVLYDEIHMLPQNEEKLEAARRQMIDTDPLYILFTSGSTGIPKGVIVCHRSVIDYADWVVKTFELNENTTFGNQTPFYFSMSVLDIFATIRSGATLYIIPKMLFSFPVKLLEFLKEKEINTLYWVPSALSIVANLGALDVIKLPHLKKILFAGETMPTKQLNVWRRHVPDAVYANLFGPTEITDIGIYYIVDREFNDDEPIPIGVPCDNVDALVVDEDGQLVEECGKVGELLIRGSFLACGYYNNPEKTREAFIQNPLNKGYPETVYCTGDLVYWNENRELVYVSRKDFQIKHMGNRIELGEIENAMSALEGVDMCCCLYNKESDQIVAVYSGSLETKKLSQNLKKKLPRYMLPNVCYNRSSMPLNMNGKIDRKKLIEEYIK >NZ_CP010086.2|WP_041894859.1|1332027_1333386_+|hypothetical-protein MRNFKYKWFSGIIFIMVFIILSYGLAFALVPKGNYSRMTMREMYSEKKDFDVVFAGASLSQRDINPYIMDKELGENTFNYAFSQQMFVGTYYSLKELFAYHKPKLIVLTVDPDNFTSKEEKPIVFLSVSLYMKSFLNKLEYYFASSQDGSYLDRLFPWRGYDVKSPLDVVNNIYGKFDSFYTDYPKPGQVEAMENNKSGYVGKGFNKVDPSDQKGTLNYDNLKLPPANKNIGDINSKDTEYLKKISELCKENNCELILLTTPFPTFQILRVKNYFEFDNKVAEIAKNLNIQYYNYNLIKPELFKLKNNYFSDTEHLNAIGAEAFSKSLAAFLKMRENGDDMSKYFYKQDEYYASIDYVSSAWFNWKKSDSTITLKADSLHGSKVIPEYQFVLLDSETGQEHIIRDYDKSPDFVFDSKSYKKFKIRVNARGKGSKNNEEIRHYDEDVSKTIAN >NZ_CP010086.2|WP_041894856.1|1330442_1332041_+|MBOAT-family-protein MSFLQFNFCIFFVILILAYYILPKKVQWICLLIGSYIFYISAGVKTVGYIIFTTLTVWVGTIIISKISENMKIELTEKKETLTPESKKQIKALAKKKQRIIFWCVLLSNFGILAFLKYFDFLSKNITGLFNIVTHHGAVPMKLNLLLPLGISFYTFQSMGYLIDVYNGKYKAEKNLFKFALFISFFPQIVQGPINRFDKLSEQLYKTHRFDWQKFKYGLQLILWGLFKKMVIADRAITLVNETFKNYDNYGGAITVVGVLFYSLQQYADFSGGIDVAMGISELLGINMAVNFRRPYFSTSLSEFWRRWHITLGAWMRDYIFYPLALSKKMSKVSKLANKHIGRKAGRIIPVAFSNLVVFLVVGIWHGAYWHYIAWGLYNGIVIAFSTIAEPFYEWLKRVTKVNTECFSYHLFRILRTFFIVNLGWYFDRASNLNSSLYMLHNTVVNFKITQLLDGTIYKLGLKEQDFRILFWATVILFSVSVLQERGVKIREFLSKQNLVFRWAVFYALIFAVISFDASSGNLLGGFMYAQF >NZ_CP010086.2|WP_041894853.1|1327775_1329680_+|sensor-domain-containing-diguanylate-cyclase MSKSFTFKLYLIFSIIAILMPTLFIILVQQKIIISFEKWEISNFIYFMFTIILLLAIVVNKIIRAYIKLKQMKSNLNIGDRKYSNDVKLIDGESLFNEIDKINRSIRILKFENSILYDTAFAIYNMASIQELLDTILARLVTHTNADFGLIFLLEKDELKLKSHSNVLYEELEKTTFRIGEGLVGWTFYKEQGLLTDDVQKDFRYIRCISDTRAQITIPIKMHEKILGVLVLGSKKDSDFGESDFKLINTISGEIGLAINNAKLTAKLQKENQNNQRLFELTKRITSSMDLEEVSNMGIKIVTEIIEVHSCTLGIFDKVDENKINVISSYGDDKKGLEFSGTVEEAFKKKHMAEIKTDKGYIYSIPLLSKESCMGILHINTKNKLTIEEIELINGTITPLTSALENAFLYKNVERLATRDGLTGVYNHRYFQNMLDEYIRKVQKDENDLSMAMIDIDNFKKYNDTYGHPIGDLLLKKVVEVMRSILRDEDVIFRYGGDEFTIILPYTNSEDAGVIMEQIKNIISDYKFEIGDKEEEETEETALDVEVIKESMFKSEKLFNSNIFKKWISEKVGLSKSKSISNTFNITISVGISSLVDVNYDKEMLIKNADKASLKSKRNGKNQVTIWKPELNMD >NZ_CP010086.2|WP_041894850.1|1326362_1326902_-|hypothetical-protein MNMSVKKSKVKGEIKDDFSIEENESSDIFTFSEGELKLDGTLIKSFSFDSDEELIEHPAPPTIHDTTTNNNNSNNNNYNYSNNDSTNTTPNLNSHDIPYNPDVKNEILDHRTLKVNPNGRTPSVDGEAFDMVRSYTLRRSTVRILSKIKAIHIDDNVYLNTIVDEAIRYYYEYLKTQNK >NZ_CP010086.2|WP_041894848.1|1325278_1326328_+|galactose-ABC-transporter-substrate-binding-protein MFKKMLSIIMFLMIMSYMLFSFKEKATFASINVAEKRPVRVAVFLINFSDDYISLVRKDLEDIQEENPGKVEFTFYDAKSNQAVQNEQLDNVLKEGVDLIIMHLVKNRDELTVKRVTNQIAKANIPVIFFNREPLLSEIKRYNKSLYIGLDAKSDGTMEGEILANEWNTNRDSIDKNHDGIMQYVLLEGERNNLVAADRTKYSLLALSEAGVVTQELERVFAYWSRELAKEAIESLFLKTGPKIEVIIANDDSMALGAIEALQSYGYNLGDKEKNIAVVGVEGLPESQKLINEGLMLGTIFQDPKAMAEALYTIGMNMVKGRDPIEGTDYQFDQTGVAIRIPNQIIYKK >NZ_CP010086.2|WP_041894875.1|1340884_1341544_+|hypothetical-protein MKMRKILSMSALSLVVVCSTSIGALAAETQTTNKTDLLIKMLATQYISGTNQTGLFTGVKADTKIGTVVTDTFASEVKDTFKDSEVANKAMTKFENNKDATVKEVLQKATSSQENFERFKADFIEIAEKVQAMDKLKDDTDRADAEGKVIAIVNAYDKSLSVAFGKDAEGRTSAVIKKSGKTIIQLNSEDLQKVIDKANNFTWDDFNDTKNQIKNPSQN >NZ_CP010086.2|WP_041894877.1|1341605_1342910_+|hypothetical-protein MNKTRKSISVIIAILLVCSIIFAVLSIFLRAIVLNKNTYTNILDKNNTYEQITTSVYDKIDAILSAKNINYDIKESIITEDDIRKEADTMISGLIDYLETGENNIKPLNTEIYKQRVADILQSIFGNLKSDKNDLSYNSNIKLDNMAYSGHPVMFSNMVVNKEQSQVGQNTINVEKLMSKEEAEARVREILKEKGLTEEQAIEKARKKGITEEQALNILAGYGITIDDDSTGSTAEKTTSDTSNDNSPAQENQGDVKNSSEGSSNSKITNPTDQPGVSKSAKSQLENITKKLQSEAEDNINKEVEKINLNKMLGSSKLQKIAKVTSISYKLFWLFIILPFILMGMLIKINGGDFNSSLKYIRNAFLSSGLVLLAISSGAYFFKAYEKINISQAYLVDTISYTIKYFSNILLVYGAIIFVIGLLMFLPKLRRRLN >NZ_CP010086.2|WP_041894878.1|1343012_1344065_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MKSLKLRKIVASVVAALTIATLSPIGASAEWKQDSNGWWNTEGNSYSTGWRSIDGNWYYFDSTGYMKTGWANDGGTWYYLNPVSDGTKGAMKAGWIKDNGTWYYLNPVSDGTKGAMKTGWINDNGVWYFASTSGAMQTGVIEVNGKVYYLAANGAMATGNVTINGVVYTFAASGEAIGDKKPTPTLAFTSAGVPVKVSDPSDTTGTTIPTTTTGGGGGSHHSSGGSTVDSQQSAIDNKYAQEAVIPKITPVPSDDGKTATISVASVLAPAFIAELGQEKPDTIDGIEYLVKKDITISTADGTDVGITQNGLAEYTVKAGTKGTVTAVISLLNTKTGQLYYVSSSATTFQA >NZ_CP010086.2|WP_011968437.1|1345020_1346265_+|replication-associated-recombination-protein-A MRPLADLMRPNKLEDFVGQQHILGQGKPLYNLIAGKNICNCIFYGPPGTGKTTLANIMANYVDKKFYKLNATVASVKDIQDITNNIDSLLNYNGVVLYIDELQHFNKKQQQALLEFIEDGRITLIASTTENPYFVIHKAIISRCNIFSFKPLTTGDIIVGLKRSIQKLIDEGIEIEYSDEALEYIGEISQGDYRKAYNILELAVNSQVKQVRVISSEYIESLGQSSMRADSSGDEFYNLLSALQKSIRGSDPNAAVHYLARLIKGGNLTAIIRRISVIAAEDIGLAFPNALSVVNSGIELSLKVGLPEARIILSEIVVYLATLPKSNSAYLAIDSAMSDLENMNFGDVPMHLKDAHYSGAANLGVGGYKYPHDYPNHYVKQSYLPQELLGKIYYNEQNNKYEESLRKYWAEIKK >NZ_CP010086.2|WP_039772335.1|1346387_1346840_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKLSTKGRYGVRAMVDLASNYGGAPVSIKTISKRENLSEYYLEQLFSPLRRANMIRSIRGAQGGYVLCKPPKDITVGDIMTILEGPVEIADCIDGVECDSSDCCATKAVWEKIKRSIDDVMNSITLQDILDDYETIKNNKNNIKIVDRSE >NZ_CP010086.2|WP_041894881.1|1346842_1348024_+|cysteine-desulfurase-NifS MKNVYMDYSATTYVKPEVLEEMLPYFTEKFGNPSSFYGISRETKRAIDKAREQIAEALNCLPDEVYFTGGGSEADNWAIKGIASAHKNKGNHIITTKIEHHAVLHTCEYLEKNGFDVTYLDVDEEGFINLEDLRNAITDKTILVSIMFANNEIGTIQPIKEIGEICREKKVFFHTDAVQAVGNVPVDVKEMNIDMLSLAGHKIYGPKGIGVLYIKKGIKIDNLIHGGAQEKNRRAGTENIASIVGLGKALELATNNLEEHMKRLTALREKLIAGLLEIPYTKLNGPRGDKRLPGNVNVCFRFIEGESILLSLDFKGVCASSGSACTSGSLDPSHVLLAIGLPHEIAHGSLRLSMGEGSTEEDVDYVLEVVPPIIERLRNMSPLWDDFLKKGEN >NZ_CP010086.2|WP_011968440.1|1348025_1348463_+|Fe-S-cluster-assembly-scaffold-protein-NifU MIYSEKVMEHFQNPRNVGEIVDANGVGEVGNAKCGDIMKIYLKVEDNIIKDVKFKTFGCGSAIASSSMATELIKGKTLDEAWELTNKAVAEALDGLPPVKMHCSVLAEEAIHKAINDYRAKNGLEVIPMEEHSDEDLHAAVHGEE >NZ_CP010086.2|WP_041894885.1|1348474_1349551_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MKKKVLVGMSGGVDSSVAAYLLKQQGYDVIGATMQIWQHDEEFEEREGGCCSLSAVDDARRVCDKLDIPFYVLNFRDYFKEKVINKFVQEYIDGKTPNPCIECNKHLKFDELLRRARGIGADYVATGHYAKIEKRDDRYLLIRSDDDRKDQTYALYNFTQDQLEHTLMPCGDYEKTKIREIAKEIGLAVHNKKDSEEICFISDNNHGKYISEAEPNRVKPGNFVDKSGNILGQHKGIVYYTIGQRKGLGLSLGRPVFVTNINAKTNEVVLGSEDDIFKTELIATDVNFIPFDKLEKEIEVTAKIRYSAKPAEATLIPLPNGRVKVIFKEKQRAITKGQSVVFYDDEIVVGGGIIESII >NZ_CP010086.2|WP_011968442.1|1349962_1350259_+|hypothetical-protein MNIFKALKRYDEHGFNSKGFHKNGTKYDEYGFGKRGMHRNGTYYNEEGYDREGYDKKGYDRNGFNSAGFDKEGYNKNGYNILGYDRGGEYLEVRYKWK >NZ_CP010086.2|WP_041894887.1|1351049_1351550_+|PRC-barrel-domain-containing-protein MFKTRDFYFKKVYNIKGKKIGIIEDLYIDFFWGKIVGFKVSNSHLFSKNNYIDMEDVIDVGEDVIIENIKKGEGLTFKEIKYMEVIDTLGNVKGVLEDIIIDIQDYSIKAIVISSGLVDKMIKGKQIILLNRCILGEEYILYTGNEGVMFKTLPHNMDRHNAIKKA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP010086_2 | 1658747-1658830 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010086_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010086_2
>2.1|1658773|32|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder CAATTTAAATTAGAAGAAAGCACTCACCATAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010086_2
The CRISPR arrays of NZ_CP010086_2 >merge|NZ_CP010086|2|1658747-1658830|CRISPRCasFinder AAAAAAGCGCGAAGCGCAACCAAGATCAATTTAAATTAGAAGAAAGCACTCACCATATAAAAAAGCGCGAAGAGCAACCAAGAT >NZ_CP010086|2|2|1658747-1658830|CRISPRCasFinder AAAAAAGCGCGAAGCGCAACCAAGAT CAATTTAAATTAGAAGAAAGCACTCACCATAT AAAAAAGCGCGAAGAGCAACCAAGAT
>NZ_CP010086.2|WP_041895276.1|1657919_1658567_-|hypothetical-protein MNTNYKTQENKYTEKGNLTEITVLKKDGSELVCKIDTFDAKKVKEAGIWFAEWHKDFNNYLVQTLETAKVNGKTVSTKKSIQSVILDANPKTPIKHLNGNTLDNRKENLELYNRSLKNDCTKIDHDTMGIILRDKFGNHKDTALISMEDVNKVVKDGYNWVLYKKGSETMVVANTSEGRIRLDRLIMDPDETMKVHHINLNPLDNRRKNLENQPI >NZ_CP010086.2|WP_023974219.1|1657033_1657678_-|macro-domain-containing-protein MTNFKILFDDITKIKFDAIVNAANASLLGGGGVDGAIHKACGEKLLDECRQLNGCLTGRSKLTRSYNLSDHGVHWVIHTVGPIYRNNGSEEKYLRNAYRSVFEIAANYSEFYSKQCNEILNKNLYRFNTDKQRDFILKELDDYINDHPIKTIALPSISTGAYSYPLDEACNIALDEILSFINNSPDTFDEIAMVCLDEKTYNMYKSLYEERLQK >NZ_CP010086.2|WP_011968748.1|1656387_1656930_+|NADH-peroxidase MKKFVCTVCGYIYEGETAPEKCPVCGVGAEKFVEQSGDLAFADEHVIGVAKGVDKEVIDGLQANFVGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKANLQARVDAEHGACQGKKDLATLAKKLNLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFKGLLDRYFA >NZ_CP010086.2|WP_041895273.1|1655072_1655978_-|hypothetical-protein MFGYVTPLKAEMKVKDFARFKCYYCGLCCHIKKEFGNIPRMSLNYDMTFLGLLLDALNPEELEISHHRCSLHPTEKKIVIANNKALSYASAMNISLFYYKLLDDAHDDKNYKSKFLSLLLFPYKRKFPSSIIRINNNIAESLNKLSTLENSKSFNSIDEICDPFSDLVGGILRDYPYKLIDDGLDLRNTLYRLGYSIGKWIYLIDALDDLKSDMENKKFNPINFLYNKNSLTYDKFMEFIKPKIEFTILNCGYSCKENLEKLNLKRNEDILYNIIELGLMDKYMNIIKNPENTNETKRRDL >NZ_CP010086.2|WP_017211478.1|1654467_1655073_-|J-domain-containing-protein MNPYEILGVKPGASQDEIKSAYRKLIKQYHPDQYGDNPLKNLAQEKMIEINEAYEALTKNSGSNSYNSNSTSSYNNSSSNSYDFQEIRRLIQSGNYAAAESRLNSINNKSAEWHYLYGAIMLNKGWFDSALDHMNTAVNMDPNNFEYRQGLNSLRQRGNNYSNPYYRTTNTSNADMCNCCINLWCLDSLCECAGGDLISCC >NZ_CP010086.2|WP_017211479.1|1653789_1654284_-|hypothetical-protein MKAKYIAENGITIALTLIVLYAASILPVSTLTILTIASCLIPISIIRTSIKNTILVYVASSILSLFLIPTNIAVYYISFFGIYGIVKYFSEKLRNIPLELFFKLIAFNASLLVIYFIFTNLLADFNIDYPLYMIWIAGQIVLLVYDYALTIIISFYLKRIHNNI >NZ_CP010086.2|WP_017211480.1|1652596_1653619_+|pyruvate-kinase MYIIGTVGPNVKDRAVLKGIIESGVNALRFNFIHGSAEEFLEFLKMAKDIKSDIQVMLDLSGTKVRVSGKFQYIFKVYNGEVIYFCGEDKYSEVVKNSKNKIKVIPLNIKNKILNEKDYKQIGIKDNTMTFDIVDKVDGLIKATTIRGGVIRKWKGCNIKNLERKELPLNENDKDAIVWGVNNKVDIICQSFVEEKKDIDDIKLFLNSRKSNQFKPKIWAKIETLNGVNNIKSILGESDGIVIGRGDLIPETSIEDTPIYEERIIKEALGDKDKEIIIATHILNSMKNGKMPSISEVESIYNFIKIGATGFLLAGETSIGKAPIKTVEFLNNLIIKYRNI >NZ_CP010086.2|WP_011968743.1|1651969_1652452_-|DUF4883-family-protein MKKLTFAFTILFLCFTLSSCALQSPKYINFSVKPSNHYYIDEIKSKILNNQNFTLYVFDTNLYKEIEVPSEENSIIEDFVSALTTVNYSDESVDAKEPFRIKILFEDNSQYLFRIFNDSTISVSPWDGNYKEDIISIKDLPLRYNPFDFCNHIANKPLSK >NZ_CP010086.2|WP_041895270.1|1650882_1651722_-|PHP-domain-containing-protein MLKVDFHVHTSSSDGTLSPKEVVKRAHDNNVKYLAITDHDTLSGLDEAIEESLKYDITLIPGIELSTQHNNESVHLLGFFRDNNFKNDDLIRELTNIKDHRIMRAKLMVDKLKDEFNIEVSFEKILKKANDTIARPHIAREIVNCGYPYNLEEIFNKFIGKGCKAYVPTLKLSTGDGLKLLKKYNALVFLAHPKLINDSNIDELLLMNFDGIESIYFQNTQDETSRFLSLADEHNLLVSCGSDFHGDLESDDRHGDIGCMQFPSNYLSKFLSALDLPLL >NZ_CP010086.2|WP_041895268.1|1649398_1650796_+|aminopeptidase MENEKKDLSKNAWNKYDEKEVQSIFEFCEGYKNFMSKCKTERECVKEVLRLAKAEGYEDIEEIIKNNKQLKSGDKVFANNKGKAVALFIVGSESIEKGLKILGAHIDSPRLDLKQNPLYEDSELALLDTHYYGGIKKYQWVTLPLALHGVVAKKDGTVIDICIGEDDNDPVVGVSDLLIHLAGDQMGKKADKVVEGEDLNVLVGSMPLKGSKKDAVKGNILKLLKEKYDFEEEDFLSAEIEIVPAGKARDYGLDRSMVMAYGHDDRVCSYTSLMAMFEIKEPDKTCCCLLVDKEEVGSIGATGMHSRFFENIVAEIIDRIEGYSDLKLRRCLTNSKMLSSDVSAAFDPNYPSVMEKKNSAFFGKGMVFNKYTGARGKSGSNDASAEYMAELRNIMEKHNVSIQTAELGKVDAGGGGTIAYILAQYNMEVIDCGVALHNMHAPWEVASKVDIFETMKGYKAFLIEA >NZ_CP010086.2|WP_041895278.1|1659164_1660532_+|MATE-family-efflux-transporter MIITETLKNILEDKKFIHKAISITVPITLQALLNTSLNLVDTVMIGSLGQSSIAAVGLANKVFFVFTLLLFGVVSGSSILTAQYFGKNDIKNIRRVLGMSLIIGLVGSIIFVIPSLICPQIVMSIFTPNENTIKIGASYLAIAAISYPLTAVTNVYVALLRGVNQVKAPVVITVFSICIKVMLNYTLIFGHFGVPALGVQGEAIATIIARTIECTCILAIVYYEKGPAAAKFKELISFNKNFTKLYASTVSPVIINEFMWGLGVTMYSLVYGRMGDGAVAAITITQTVEQIMTVVFQGISAATAVILGNELGANKLDDAESHAKYFIILQFIFALIMSATCLFIRSPIIMLFNVTESVAVDISRCLIVFSCYLPFKIFNWVNIVGILRSGGDTKAALMLDITGVWLVGIPFAYLGGMLLELQIYFVYAMVTFEEVYKFILGFRRYKQRIWLKNLV >NZ_CP010086.2|WP_017211473.1|1660730_1661765_+|phosphodiester-glycosidase-family-protein MDKQTNHKPRKKTHKRKKRKSNSRVLLKGLLDMFIFLAITTPLVLFFGPYDNTRKTFISTVLATRHAYLINDIIPQSALNKLLGIDEESDSQEVFQDMKKINVKYKVGNEINRYDIHTQRFDGYVLEVKNPLKMKVAMTKFLGKMGEKTSQMAEDNNAVAAINGGSFIDKSTDGTAYAGTGSEPGGFVISGGSVIYPKSGADEKKVENVIAFTKSGELVVGDHSLADLKKMNVQEAMCFRRPNIVINGIRQVKNKMEDGLNPRTAVGQKQDGTIILLVIDGRKITSPGASLYDVQEIMMERGAVNAGALDGGYSSTMYYKGNVINSPNAWDGERTVATAFYVEQ >NZ_CP010086.2|WP_041895282.1|1661779_1662820_+|hypothetical-protein MRNIKRRLAWCALALILQQCIFLYFDKVYLASDLNIKAEEVKDEDNVADKKTEINIKKGVSEIKVSSDARYVSYIEDGKLKTLDSNDDKEKVCDTDSGSEIVFYRWLNSEDNMIIIQKIKEKGAYYFEPISFDAKKGEARDLADFDLKKVRIKLESTKDEINNVVFSTLTHSLYIEVKKSSGKCDLYYANVMNQLKKVKSEKVIGNVVVPTTSTNAIMEENNNITILNTKGNVSIPNVKSAKILGADVNDNVYFGEVADNKIKNIYYSVLSDSQRKWNQLKLAKPVDKNDILIDYSGKVYVNSKSDNSVLELTSNKNIKYKGELVQSYSKGIISRDGNTLIKNKLE >NZ_CP010086.2|WP_011968754.1|1662939_1663191_+|iron-only-hydrogenase-system-regulator MSKIGVVSAILEHPKEVQDEFNDVVASFRGSIKGRMGIPFADELSVISIALTGESEETINDFTEQLDRIDGVSVKTSIAKIEV >NZ_CP010086.2|WP_041895285.1|1663467_1664244_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MNPIAFQIGTYEIRWYGILIALGVIVAILLANYNCKKKGIDFDIILDCFFIAFPIAIIGARAYYVIFEFENYKNNLIDIFNIRKGGLAIHGGLIGGFIATYVFFKIKKLNMLKYLDLAAPSIILAQAIGRWGNFMNGEAHGGEVSYSFISHFPSFIQKGMYIEGSYYNPTFLYESIWNIVVCLILLLILYKKKNNEDGVVVASYIALYSLGRVFIEGLRTDSLMLGNIRIAQLISIIGMVLGIVIVLYIKRKKAKNLT >NZ_CP010086.2|WP_039772128.1|1664332_1664911_-|serine/threonine-protein-kinase MRYILDVKECEFLGKGKEGAVYLTPEGYALKIFYNKKKAKNEADLLEKVNGSRFFPKVLFIANNMILRDYVEGDNLSSYIKKNGLSYNLSIEIINLIEEFKTLKFTRLDIRDAHIFVNKNEQIQVIDPRKVFVKKTPYPKEIIKVLVKSNVFEDFLKHVLSYKPKLIKYWIDGYNYFRYTSKKVIRIDMFAS >NZ_CP010086.2|WP_011968757.1|1665067_1665565_+|permease MNMTHYMSLLADNQPWNLIIFMAIPVICAETLTITEFFIIFNNVQKGGLRTLNKVVGIFDGIYFTGIFIYLLVNAVIPLTNTGGWHTWVDVLAVGFYLSGVIFLLPIALMELGLIFKNRTSREKAKIHFILIGGFLVVAHIAMIFGMVNPEIINNMSNMSQMPGM >NZ_CP010086.2|WP_041895288.1|1666015_1666657_+|lactate-utilization-protein MDINISWYKEEQINRTIKNLRQRNMDGFFVNNDNELKELLKQLIDENSVVGVGDSMTLFETGVIDFLREGNYTFLDKYREGITSEEKKGIYIQNFSADIFMCSTNALTESGELYNIDGNGSRVAPMIYGPKQVILITGTNKIVKDIEEAEKRVRNYAAPIDAKRLGKDTPCTKLGYCVDCKSPNRICNDFTIIRGQFVKGRIKVIIVGKQLGY >NZ_CP010086.2|WP_041895290.1|1666921_1668583_+|glutamate--tRNA-ligase MSFEKLADMIFGNVEHTTEYYIEKYPKRNLKEGARVTRYAPSPTGFQHIGGVFAALINERLASQSEGVFYLRIEDTDQKREVEGAIEDTIATMHNFGMDFSEGMTGEETSKGEYGPYRQSQRAEIYNTFAKDLLIKGLAYPDFCTPEELAELRERQIANKITPGYYGEYAKFRNITEEEAIKRIENGEKYIIRLKSPGNPEKRVEFHDLIKGDISFPENNQDVVLIKGDGLPTYHFAHAIDDYLMRTTDVIRGEEWLSSLPIHVQLFEVLGFEAPRYAHIPTIMKQDGGSKRKLSKRKDAEAAVSYYKEVGFPVVTVIEYLLNIVNSTYEEWRAENPKADYHEFEVHLEKMGKSGALFDLVKLNDVSKDRIAAMKAADVYEYYVAWAKEFDAEMYKLVTENETMAKEIFNIDKEGPKPRKDFAKWDEVKDKIFYFFDELFYKESAEQIELPKGVTLEAAKEILETYKKEFKFDVESQEAWFDDLKEIGIRLGYCANRKEFKANPDQYKGMISDVAGAVRAALTHRTNSPDIYTIMQIIGEENTRNRFDKFLNI >NZ_CP010086.2|WP_041895292.1|1668665_1670429_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MITKSTKKTKGLPIKTKLILVMILLLSVPVLVLGLVSYYVARGELENSGKVLLKNSVEMTLQVIDANQKLVDQGRLSLDDAQERVREYMLSEKQADGTRKINQNLSLGKSGYLLAYTQDGVEAVHPSLEGKSVLDYKDKKTGALFVKDQIKVANDGGGYLTYWWTLPNSDKISDKITYQKTDPHWGWVVCAGTYMNDFNIGSNNILITTLIILLSVIILGSAVIMIFAKHISTPIKEISNAVDTVASGNLNIKAIKIKNRDEIGNLNNSFNIMVRNVNDFISSVKDSINVVFDSSKLLDEIVAENTASINEVSDSVEEIAKGSNEQAKKTENGVIRVKNLSEKIDLVTRLTIETNDIAVKTTNISNRGLEAIDLLSKKSIENSKATEKTSAIIMEVDKTSIEIGSITEAISQISEQTNLLSLNAAIEAARAGEQGKGFAVVAEEVRKLASQSSMSASKVKELINGIQDKSKAAVKAIEDGKLIAKEQNNSVIDAKDIFVEILKSVEKITNDMKNLKTYSLEMENEKNEIVEVLETLSASTEESSAATEQISATTEQQLASVNQIAKHTQDLNKLAEKLRDAVNAFQV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP010086_3 | 3571711-3571799 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010086_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010086_3
>3.1|3571734|43|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder CTGCTGTAAATTAGTTAATCCTTTTAATTTGCTTATATCACTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010086_3
The CRISPR arrays of NZ_CP010086_3 >merge|NZ_CP010086|3|3571711-3571799|CRISPRCasFinder ACATTGGTTCCAGTTAAAGAAAGCTGCTGTAAATTAGTTAATCCTTTTAATTTGCTTATATCACTCACATTGGTTCCAGTTAAATAAAG >NZ_CP010086|3|3|3571711-3571799|CRISPRCasFinder ACATTGGTTCCAGTTAAAGAAAG CTGCTGTAAATTAGTTAATCCTTTTAATTTGCTTATATCACTC ACATTGGTTCCAGTTAAATAAAG
>NZ_CP010086.2|WP_041897273.1|3569688_3570384_-|methyltransferase-domain-containing-protein MDSTSIPVWELLQKQITWNQLSFIHNKKILDFGSGMGITASHFARDNEVVAIEPDNKMLSERITDNDYTQIHGDIQALKEFEDESFDVILCHNVFEYALQREDIAKEFARILKRDGVLSILKHNRVGRIMQMVVLLNNFEHANELLEGKNGKTEKFGDIHYYDDMDILKWSNDFEIEKILGMRTFWDLQQNQDIQKDEKWQKQMIAMEQNVCERDEFKAVASFHHLILKKK >NZ_CP010086.2|WP_041901046.1|3568721_3569141_-|hypothetical-protein MTNYASILTFLIAALILSILILFNTDIDQKAIGIIAFIGFALGFGLIFINLALPLDMDIYTMITRSYSEINGPVVSAELKRANLKYRTMETELTMHDNIKNENITITFFNQPSYDFRVGENINVKYLPHSRMGISYFHI >NZ_CP010086.2|WP_041897272.1|3568176_3568377_+|YvrJ-family-protein MEVNDLINLIVNNGFPVAVSAYLLIRLEKQIVGLSSSINKLNTIISAKLGVAIDIESSTDDSHKVA >NZ_CP010086.2|WP_155715483.1|3566755_3566923_-|hypothetical-protein MSFFDIFKSESSKVEIENLKTQNLKAKEIIISIIPFVDTKIKGYKGKVPEFIQYS >NZ_CP010086.2|WP_041897271.1|3566299_3566689_-|hypothetical-protein MSKKNKTIISVLVAFLIVVISVFKFSFSSGYKISIENKTDKTIGNLELKYKNGNTIKTISQVEPKKSLEYNIDTNSIQGENAIILTYKDNKGISYEESVVGYLEKGYSGKSNVFINEIDNNGNLGIEVK >NZ_CP010086.2|WP_041897269.1|3563443_3565120_-|ribonuclease-J MINKSKIKSKVKIIPLGGLGEIGKNLTVFEYEDEIVIIDCGMSFPDEELLGIDLVLPDITYLLRNKDKIKGFFITHGHEDHIGGLPYVLKQINVPIYATKLTLGLIGSKLEEHNILSDCTLNMVKPGDIIETGNFNIEFIRTNHSIADSVSIALHTPIGIIVHTGDFKIDFTPIDGEIIDLQRYAQLGKKGVLLLMADSTNATRSGYTMSEKTVGETLNNLFIKADGRVIVATFASSIHRVQQIANASIKNGRKIAFSGRSMEKISEVAMSLGYLFIPEEMIIDLNDVKKYPDNKVTIITTGSQGEPMAALTRIAAGNHRSIQLEKGDTVIISSTPIPGNKKAVSSVVDDLTEKGAKVIYEAIEDIHVSGHACEQELRLIQALLKPKFFVPVHGEYRHLLSHSKIAENMGMDKSNMFILEIGDVLELSRNKAEITNKVPAGRVLIDGLGVGDIGNIVLRDRKNLAKDGIITVVIVINKESKTVISGPDIITRGFVYVRDSEELMREIRRIVSKSVERCLDNDVTGWSEIKSAIRREVNTYVYTKMKRKPMVLPVITEI >NZ_CP010086.2|WP_052482851.1|3562433_3563216_-|hypothetical-protein MLGVTLTSTFSSLRLLRLAFICVESKYRFFQQLSVKDNFDNIINFAKEILESNVSKDAKQHPIFDVIRILGRGLQTDYMKYLLYIDGDEDNSVPNLSWSSVGFEERSYISNNQSKYLKIHDLKKEVKCKKKINLSTDLILPWPWHKDRLIRALIDIGEGRKKKKWKQDFNNHFVEVWLPMGIAWVNGGNHSITMGIVQGGELEPEYYYDISEVYKYVYCDGENFIRTEDNKVIAKVTNVEFAAIFEIGRLLVEKGLSFID >NZ_CP010086.2|WP_041897268.1|3561767_3562130_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MYKFTRCTYEELKTILEKHYLQLSGWRFIENEYVEKIESETGELIALIHYYFKDNFKTKSCYLAFFEVLKEYRGKDHGKEIIKQFLNSYSEEVYLTPYDDAIPFWEKCGFEGDATMHYNI >NZ_CP010086.2|WP_041897267.1|3560865_3561687_-|hypothetical-protein MIINIENIEKMKEDLCNILDITQKVLKDTILSFADECIDGIMYHEDRFIELAEEFVKNNQKIHINEIYVCHLTRHIGEPQELLPLKELLTGKNKFTHFLKKNGVTFSKKISYISMSYKGKEIDIKDLYDKDTCENEHVRLAGRLGCGGEADYCVNGYTFAIEPEGSMDDYYTYLMQGPELLQDLDNFFLTNMCQKYKKESQYYVSIFKVHLDDVIFDGRNSFNVRDDKEIKYLVLCFMFLLDYYRDSKTLLFNQIVRLDDFQSVKVSRNILME >NZ_CP010086.2|WP_167595045.1|3559805_3560621_-|hypothetical-protein MICLERMYNFFPESKKEVVEKYLWKEFENNLSGVNEVEIIDGANSIDMGLEGGDIEIEDTLNDYWEEQYGFIERLNEFINLWINQINIDVDKKTNIVKSDEDDLFLLFNYTLLLEKIYEIEKYNILHIHGCVDEWYDSSPVIGHGDSIKISEIKRRAYEAGEEFEEKECSICNALANYYERSYKDVQHYIFENRNFFERLNKVNKIYVIGHSLGKVDMPYFKEIKKHIKQDVIWNVYWHDDGDDIIFKQKIMSLGINNENINLIMSKEFFK >NZ_CP010086.2|WP_167595046.1|3574135_3574507_-|hypothetical-protein MHNSLLSGASLEGKVIDRQGEQVKLQLKIDDNQNNEEASWFRFAPPTGNMMYCMPVIGTDARLYFPNESSEEPIVTGCLRTNGSSSPLSIKFEDNVGVTLTILGSLYFIIFFINICVIDHRLK >NZ_CP010086.2|WP_041897276.1|3574841_3575183_-|hypothetical-protein MKRRNIFGDNKLTFKNKNFWRILLIPSSIITIIICLLSILNGNTQYLIDNYKDIIKGFFALSFIVGIIACAIDGYWIELKKFMKEDKKGKIIGIAIFLLILFKEIFQALRSGH >NZ_CP010086.2|WP_155715486.1|3575261_3577565_-|hypothetical-protein 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>NZ_CP010086.2|WP_041897278.1|3578078_3578603_-|hypothetical-protein MDYFLLKQDQRYTNIPRLKDVFNKIDVRNINLLNSHKIDDIVVFYANADKETNFLDILDNQLFLISHEMSKILKKYDEDIILKTIPLIDKINKKQKNYCLPIFEEVEALSEKAEFNLNKTVVKKIILDKEKIQDKRIFKIKEIFKPLIVIRLDVAESLLRRNYKGISLERVQVE >NZ_CP010086.2|WP_041897279.1|3578674_3579292_-|hypothetical-protein MIKAVIKSVNKKEILNKFVNKYVGDRWITEFNNIDEKYKNNKNSIQEDLKSQFADVCKLGIALQDQGLKGEIKYIYFSLLRTSLLENKGEFRIDLYDERWLLDKAECSVNINLDFIYTSLFKHMEELKEKKKEHVRTITDMDIEELMLLESNLYHILSVEFLRNVIEELLEVPSYKELKKSEDIKIMAGEFRDEADLIYPKEEVI >NZ_CP010086.2|WP_041897280.1|3579320_3580739_-|phage-tail-protein MSEEYIYTYGDFIISPYKFEKIKILKITRELNEHAKLYINGVISDENLDKYVEEADDETTIKISVKDDEGSIIDLFQGVISNIGIDASNDVRTLEIEALSKTVLMDIEKKSRTFQNENDTYEDIFKKINSEYDNAQVYDAVTNGANIDKLIVQYKETDWELIKRLASHFNAGVVAECQLTDIKYSLGASGDEKTHDIDEFNYSIKKGLHEYKVKAANDNYNLDDMNLISYEIITNKIMNLYSNVNFKGRNIYVYKCEIEMIDGVLSNKYVLRDEKGMKVRKIYNNKIVGMSLDGTILATQNDEVKINLDIDGNQDGNSAKWFEYSTVYSSEDGTGWYCMPEAGDAIRLYFPDNEEKNAYAISSVNLKSSNSEKRSNPDEKNIGTKYGKQIVMKPGAVEIVGGGNLLMRLTDDGGIEVNSDKKIILSAEDDIEINGKSKITIKGDEGINLTQAGANINIQDDLTMAGAKVKVQ >NZ_CP010086.2|WP_041897281.1|3580778_3581369_-|hypothetical-protein MGKMADEKILDLINAVEKREAQKDITNGPIKIGDRYYEFEEKDFFYEKLKMYIPKDYKDMPEAARKLKYPSENRPEIIKCNEDGSIAFTLNIIDSPLDEERVGELKDGMKMIIKKTNPANVFYEDGIIEVDSKNIGFFEFKSYAIDDALYTLMFFLEFEEKTLMGTFSCRYSDYEEWREVAFQVLKTIKVIRKEQE >NZ_CP010086.2|WP_041897282.1|3581829_3582030_-|hypothetical-protein MTELSTMLIEDVYKQGFEQGELKKSIEVAKIAINQGISDELISELVGLSIREIKIIRISIETNKTN >NZ_CP010086.2|WP_052482853.1|3582048_3582840_-|hypothetical-protein MDIFAEEGLKFFGIDKKVKDTGSTEIVVLEIKNMLMDYTFLMEDDTYIHFEFQTTNKGIEDLRRFRTYEALLNFQTGKDVVTYVVYSGDIKDPINEYKSGINYYKVNAISMANKDGDAIFNDIINKINNKEELSKQDIISLTFTPIMGGKLSKSDKIINAIRVVKDIDKDYRYDVESILYAFASKFLEGKDLEKVREEIKMTELGRSLIKEGKLEGKLEGKQENSIEIAKRAIKKGMSDELISELTELSIEQIQIIRKTIETN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP010086_4 | 5033871-5033967 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010086_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010086_4
>4.1|5033896|47|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder ATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTACTAATCGATACTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010086_4
The CRISPR arrays of NZ_CP010086_4 >merge|NZ_CP010086|4|5033871-5033967|CRISPRCasFinder CCATACTTGTATGGTAGTTATATTTATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTACTAATCGATACTGCCATACTTGTATGGTAGTTATGTTT >NZ_CP010086|4|4|5033871-5033967|CRISPRCasFinder CCATACTTGTATGGTAGTTATATTT ATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTACTAATCGATACTG CCATACTTGTATGGTAGTTATGTTT
>NZ_CP010086.2|WP_017209065.1|5033165_5033840_-|GntR-family-transcriptional-regulator MALEVNKNTTSKTIYYKLRDEIINLYLEPGTSISEKELSEKYSVSRTPVREALVRLAQEGLVNIYPQKGTVVSLIDLSAVEEGRFLREHLERAVVKEACKEFSQESLLALEMNLKLQKMYIENHDYKKLFEADEEFHKIIFEGSNKRRIWNSINDGSTEFQRIRMLRLVTNSSWDNIYLQHKEIFNAIKDKNIDIAEGFMKEHLNMVTFDKKKIKEAYPNYFKE >NZ_CP010086.2|WP_041899200.1|5031934_5032996_-|mannonate-dehydratase MKMGFRWYGEGNDTVTLEQIKQIPGVGGIVWALHDMAAGEEWPMEKILEVKKSADKYGFNMDVVESVNVHEDIKLGLPTRDKYIENYKKTIEKLAKVGVKVICYNFMPVFDWLRTDLYKKAEDGSTALFYEKAKIKDIDPMELVNKIASNPDLTMPGWEPERLKNLTQLFEAYKNVTEEDLWNNLKYFLEQIIPVAEINDIKMAVHPDDPPWPIFGLPRIVKNRDDLARLLKLVDNPYNCLTLCSGAIGSDPNNNVPAMIREFGNRIAFAHIRNVKIYENGDFIETSHRTCDGSLDICDIVKAYHEVGFTGYVRPDHGRHIWNEKCRPGYGLYDRALGIMYLWGIWDSLERNK >NZ_CP010086.2|WP_041899199.1|5030222_5031836_-|mannitol-dehydrogenase-family-protein MNNAKIVLSKESIKNTDLWEKAGIEIPKFDYDKMSASTKENPTWIHFGAGNIFRGFIAILQQELLNTGKVESGIVAVEGYDYEIIDEIYSPYDNLSLLVIMKPDGSLEKKVVGSIGESLAGDYLREKDWNRLKEIFSNPSLQIASFTITEKGYSVKNLSQQDTTDGLEHPVSIIAKVASLAYVRYQNGQLPIAFVSMDNCSKNGEKLHNAMETMIKKWIENGLVDKGFLEYINDTKKVSFPWSMIDKITPRPSQSVKDTLESVGFDSTKIVTTSKNTYIAPFVNAEGPQYLVIEDNFPNGRMPLEEAGVFLTDRETVERVETMKVTTCLNPLHTSLAVYGCLLGFNLIADEMKDSALKKLVEKIGYEEGMPVVVNPGILKPEDFIKEVVEVRLPNPYIPDTPQRIASDTSQKVGIRFGETIKAYNNKEDLDAKELKYIPLVIAGWCRYLMGIDDNGNVMELSPDPLLDELRKYVADIKLGSKESTESSLKPILMNEEIFGVNLYTVGLGEKIEGYFNELISGVGAVRSTLEKYLECK >NZ_CP010086.2|WP_041899197.1|5028399_5029812_-|glucuronate-isomerase MKNFMDENFLLSNQTAIELYHNYAKNLPIIDYHCHIDPKEIYENKKFNNITEAWLYGDHYKWRAMRSNGIGEKYITGDGNDYDKFLAWSETIPMSIGNPLYHWTHLELQRYFGINEPLDEDTAPEIWARANELLSGEGFNVRDLITKSNVETICTTDDPIDTLEYHIKLKEDTSFNVNVLPTLRPDKGIEINLDGFVSWVKDLEKVSEISIDNYDEFLKALDSRIKFFHSVGCRIADHGIDGVVVYADSTKEEAAAIFAKAMKGETVSIDEEKKYKTYTLRHVFKLYHDLGWTMQLHIAALRSNNTKMYKKIGVNTGFDSINDESIAYPLSRLLDSVDREDSLPKTILYTLNPKDNYVLGTMIGNFQGDGIPGKMQFGAAWWFNDNKDGMIEQMKALGNLGLLGRFVGMLTDSRSFLSYTRHEYFRRIACNLIGEWVENGEVPKNDKLLKRIVEGICYSNAKEYFGFDKK >NZ_CP010086.2|WP_017209061.1|5026855_5028361_-|MFS-transporter MSNKNRKITIARGVGYGLVDLMGGGAFTIIGAFLLFFYTTFAGLTPIEGASIIAIARIVDAVASLFIGSISDNFYKTKLGKLFGRRRFFLLIGAPLMADYVLLWVTGRSYAFYLVTYLLFEIIAAMVLIPWETLPAEMTKDFTDRTKLSASRMFISATGTFLATFVPGRLIAFFGDKSPQAYFINGLVFAIIYAICILISHKVTWERDLTPEMEQELLNGSTSKSFGEQLMTIVKVAGDYVSTFKIRAFRQHLAIYICSFTAKDLFNSVFIYFCVFNLGVSSTTAANVLSLSIIGIPVTILGGFLMIKVGPGNLYKMAYSIMIVCLLAFYGLYVGNLGSNIVLLFVIGTIYQVGRSLLEFTPWNVFPFIPDVDEMVTRQRREGLFAAVMTFTRKSSVAIATFVIGVVLQESGFVKGQATQSPQVVSTIATLLAVGCISLLVIALICAATFKLNKRTHGILVDEVERLKNNGSKEEVTPETKTIVENLTGYKYENVWKETVV >NZ_CP010086.2|WP_041899195.1|5026149_5026572_-|HIT-family-protein MSNKNNCLYCDKDEKLDNLMIEICKLEVSTLYLFKEQSHKGRCIVAYDKHVKELFELDDKELELYMKDVTRAAAMIKKTFSPDKINYGAYSDTLPHLHFHLVPKYKDGYSWGGVFEMNPQKKYLSDEEYMKRINLIKENL >NZ_CP010086.2|WP_012060236.1|5024705_5025263_-|methyltransferase-domain-containing-protein MWIKFLMEYFKSPRTVGAVAPSSKKLAEKMAHDIDFDHAKCIVEYGPGTGVFTDRLMKKIKDHTMLMLVEYNEEFCRELEEKYGEYNNVVIVNDSAENVDKYLKEYNIKEVDYVVSGLPFASLPKNMSNSILKKTKDILKKNGLFITFQYTLLKKGYIGSYFEDISLERVVLNIPPAYVLKCQNT >NZ_CP010086.2|WP_041899194.1|5022663_5024127_-|sugar-ABC-transporter-substrate-binding-protein MEILNFRLRKLSCIVLMILVGSILSACSQVGKVIVDTEPKEDRQKDYIEEVTTQTVTNEKSVDLAPLYDQVRNLKGQEALDFFESLKSKGLSDSDILEFFINLPLSDANKEITDIYKNEKFETYMSTYPTGKPYGDYKWTNGDGTKIKGAFSDLDLKLPFSNYVALKSGPVGDFNKKYRIGVAIHGFDQPWNVSLADAAQWEAERHPNVEVDVKDAQWDNDRMADIIDSFVLQKVDGILTWPMVESETTIAPVKRAIEAGIPVVSVDRMTGLEETTSRVTGNFPANGAQCGMYLIWKLAKEGSLNANVVLLRKPSGSTADANRTGHFLKVLSYFPDIHILKSYHDEDNTAEALANIQLALNEYPSIDVVFGTGDHEAIAAYDASKNANRLNSRKDAKKMMFLSIDDSKKAITSVKDGLFEVNTPYTPLISDIGMRTLLNIITKNGSMPHDIITPNIPMVTKDGDTIFGLKTQTPDQWYEYTFGAPIK >NZ_CP010086.2|WP_041899192.1|5020883_5022581_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKKISSVPGTIPLTIKSKLIISFSLIIFLVSAVGITSYMTMRSYLVQENIMIEKNVMANDIIILINSIPQDISKYILNPTAENKKIIDDKFININKNQEFIKDNVSGEKALKSFDAVSRMLESYSEENIKLFESKNATEMVEKNKLMNRFSKLIQNSMQEYMSVELDQQNKARADLAKKSNFTGVLIIVFIVSIGFFSIIFAIFFSIKLGKSLNKIVLLADDIANGNLQVEEYKVNSNDEVSLLASSFNEMTKNLRTMIKGIINNSKDLYESSTMIKDRAKESVKAVNQIAVSTQDAVDGSQYQFSEAKRTEEAVNRLIKMNSTIKEKSNNVLSSANKSLKIAEGGNEKVRSMLNQMNTIKEQVMNIQSVTGILKENSSQIETILDTISKITASTELLALNAAIEAARAGEYGKGFAVVSDEIRKLATSSATSTVEISKILTQIKNYINVLIKSMSIAVSEVMSGSEKVLEVEGAFKNIVESNNDVDGEIKNISDEILVMVNEINAIEKISKNICEISNKSLEGSTDISAIVEEQLATQEEFFASATTLANISSELANVVSKFRV >NZ_CP010086.2|WP_041899190.1|5019800_5020718_-|ribokinase MKSLCVIGSLNMDLVTTVENFPVAGQTVMGKAFNTFPGGKGGNQAIALGRLGSDVLMVGKIGEDMYGKRYLEVLRSNNVKSDGVSIEKGMSSGVAVIQVSNNGENNIIVVPGANAEVDINYIESKWSLIERADIFLFQLEIPLETAIATMKKLKKQGKTVILEPAPAVDLPDEIFKYVDYLTPNETELETLIGRKINSEENLVEAAKTLFDKGVRVIVAKLGSDGAAIIKKDKCTRVPGFIVDPIDTTAAGDSFNAGFAFALAKEKELKECVIFGNAVGAISTTALGAQEAMPTFERVDKFIRDR >NZ_CP010086.2|WP_041899201.1|5034186_5035866_+|MCP-four-helix-bundle-domain-containing-protein MLKNIKIINSIILMVILSTVVSLSIAIIGYNNMKTINSNSSSMYTIALTRIIKTEEIRQTFLNIRLNVNRISISEFNDDDVAAIDNDYSAINKMVEDYENLSLSTIETNNLSEFKKDSSAYYEQIKNLEKGNKLYGIDLEKFNQLGVEIQLFLDNLVTYSSNTANALHNDNMSLYIRSTKIFFITFFIGFILQILVSSSIILVIRKSIKEIMSDLDNVAAGDFSFEINTNLKNEFGRMKKSLKVTISNISSMLEEVQNSANVVNIQATNLLGASDEMSSSAQEINAAVQEVANAATEQSSDLMNVKTSLDSFADSLDQITSSINDVNSNIHNISSMAEDSNSKLEFLFNSIKDVNESFDTVRNKVVQLDNHVEQVNNITTIINSIADQTDLLALNAAIESARAGEVGRGFSVVAEEIRKLAEQSKVSASNISGLITNINNEAQIAVKTTDLGKDSLNNQSVLIEDSIKSFALIFKAINTILPRVDNINKSIENINIEKDLIISKTLDISGVSEENAASSEEIAASVQQINSSFNDVATSAQTLSNLTTSMMNEVSKFKL >NZ_CP010086.2|WP_041899203.1|5035947_5037123_+|extracellular-solute-binding-protein MKNFKFLNVTLVIVLMTTILTGCGSKNVSKSTQPITLNIIDVSGSMQLVGDSIDQFKAANPDLIGDVVVKKSTALEVPSLLKAQILSEDMKTNLIFTGIDGLSTCIDRDVIENIMPAYGSRFPDLESNYSSGAKATYDLVKGYAITYVYSPSGPFFTYNPDTVQNIPKTPDELLAFAKANPGKFTYARPAGSGPGRIFLQGLPYILGDKDPKDPKTWDKTWAYLKELNQYIDYYPAKTGTTFTELKDGKRSIIASQLGWDMNQRIIGGIPQTYQGFVLNNTTLVADAQYMAIPKGLSDEQKNVVLKLMAWLMTPKMQAITYDSGYFYPGPSVKNVSLDMAPKESQDKIKPAIRQSYEDSINTLPNSTQLDTTKFMDALNMWDQLFGTKVKR >NZ_CP010086.2|WP_041899205.1|5037202_5039065_-|APC-family-permease 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MLTTILNHNEAINNYILELNLPYSSALKNHMINLVSGITVTEGSKNLSSIYSKLTCNRHRSTGSRFLSSYSWNHEYVTDERIFHAISEISSTSKDDDVGFLIIDDTLSKKDISTKHIEGLDFHNSHADGNKPMWSHCLVTSHYTINDCSIPLNFKQYQRKKVFKNNPKKFKDKQQLAIELINEFTPATKTNYLLIDSWYTSAKILLHGLVNGCHSIGRIKSNRVIYPAGIKIGVDKFSKHIMPDETSIVTASNNKYYVYRYEGKLNDIENAVVLMSWSKQDLSDNPCFLISTDISLDNQTIISYYEKRWNIEVSYRYHKSSLGFDEFQVESSKSINRYWSMVFLTYTFLEIFRVKNSKTLKLKTLGDTISYFRNNYLVQIVSFAHACADNGIGLDSVISKLGLVA >NZ_CP010086.2|WP_017209069.1|5041030_5041327_+|hypothetical-protein MAQNHICELCNRNVSSITKHHLIPLEKGGEKFKTLSLCSTCHRQIHALFTNRELATHYRSLESLKKDIKIIKFLKFIENIPGDSYLDIKKSKHVRKSC >NZ_CP010086.2|WP_041899206.1|5041463_5041907_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNNITYEFINYKSKEFKEVSELRFKILFKPYNKIHKYDYDELDYSSIHLVALDEGAVVAYSRMTNYNMNGKMTNIVVSEEYVGKGIGIEMLKTHKIKAKELGIICLYLNARLDTINFYKKAGFQCKGNIFLSEKSGLELQPMYFKIS >NZ_CP010086.2|WP_167595053.1|5042194_5042350_-|hypothetical-protein MEKLRKGEHEKAMEKAKEMLDKGCGMGDIVEETKLSEENVMKAKRKWEDRS >NZ_CP010086.2|WP_023973089.1|5042502_5043564_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKTSTHRIAIPSILEVGKGNINNVGNLIKKAMFKSVLICFGEGLEELFGDSICNSLKEANIDISRIETISDVNFEKISVKAFEISNDVEALIGVGGGKAIDAVKYMSFLRKLPFISIPTSTSNDGFSSAGASLLVNGKRMSLPAKTPYGIIVDIDVIKSAPEKFIYSGIGDLVSNITALYDWKFEEENGRIIIDDFATMISKKAVNSFIRTEFKNIKDDLFLKELVDSLILNGISMEIAGDSSPASGSEHLISHALDKFLEMPQLHGIQVGIATYIMAKVQDHRFERISKILKETNFFEHAKTLKMKKKDYKKAIDIAPSIKPNRYTYIHVDENRILAKKIIDEDEILNYILI >NZ_CP010086.2|WP_012060250.1|5043659_5043971_-|hypothetical-protein MDKVNSLIKNTPIHLTTNTIVLIIVAIIALYILIKAIAGIIRIAALIGVCWFILMSIQSTNLINIPIIREAYTTVEKIIPSKELWTEALDKADKINKVVNDLK >NZ_CP010086.2|WP_041899208.1|5044054_5044246_-|PspC-domain-containing-protein MEKRLYLSATDKKLAGVCGGIAEYFGLDSTLVRIGWVILIVCAGSGLLLYIICALIIPKQPLL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010086_5 | 5924674-5924820 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010086_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP010086_5
>5.1|5924701|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder GAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTG >5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder CCAAGTTGCTCCATCTTGAACCCAACCTGTAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010086_5
The CRISPR arrays of NZ_CP010086_5 >merge|NZ_CP010086|5|5924674-5924820|CRISPRCasFinder CATAGCACCTGATCCATTTAAGTAGTAGAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTGCATAGCACCTGATCCGTTTAAGTAGTACCAAGTTGCTCCATCTTGAACCCAACCTGTAGCCATTGTACCATCAGCTTTTAAGTAGTA >NZ_CP010086|5|5|5924674-5924820|CRISPRCasFinder CATAGCACCTGATCCATTTAAGTAGTA GAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTG CATAGCACCTGATCCGTTTAAGTAGTA CCAAGTTGCTCCATCTTGAACCCAACCTGTAGC CATTGTACCATCAGCTTTTAAGTAGTA
>NZ_CP010086.2|WP_023974343.1|5923567_5923927_-|hypothetical-protein MKKNFLTRLAAVALVMGAVVTALPASATVWCENTLSGKSDASKTERIQGENIAFEVDGQRGSGTAYARKNTSGGGYKNIAALQVDTDSKVTYFDADGSTYFIKWKGDSDKSKALAWFEG >NZ_CP010086.2|WP_041900301.1|5921951_5923493_-|hypothetical-protein MMKLVKFYTKLFVKTPIFILSLVFSMYIFIFQLKSLNLSILEYTSVISYAIIASNLFFLVAASSILSKRSEIMEFLEKNRFKRYLIIILSGAIISVITSIMPIIIIIIFKNSSIEYSFVVKGILNFFIIWNLSNIISISIGASVGILLNRWTSLFISISIYSFFPINLFSPLLESKVLNKLFNIYSDSTTIQTNILCDEIFDISYVCDKVFVLCLILLMIILVKILLDKNKKVLGGISFLLIIFFIGDIVFINNNSIRYIHEYDVSNFDNVDYHIKSYEMNMNIGDDLKNDVSFNLDVDSNIDSITFLLDDLFKIEEIRIDGEAAKFTHEDDKVVLDYKTNEKKSINIEISYEGHIHIEDELGVATFYCNSDVMNLTNSLHWYPGLYNNSLVDYDININTSANIYSNLDVESRGNNFKVTGTASEVDLFAGQYKKVDDNGIEYIIPSTYNLEEFKTKLEKRVSSYLAKHEEEFSKDDIEVLRGKRYKKVIVGMRVNTNSYIKISNDTLLINYI >NZ_CP010086.2|WP_041900300.1|5921055_5921934_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MDNQLLVENINFSYGKNKVLNNISFYSSNGIASILGANGAGKTTLMRVLIGANKPSTGKILLNNENLLECSNNIIGYLPQNFDTYDNVTGYDFLSYVCDIKNVSSKEKKQHIDKVIQQFNLESIIYKNIRNYSGGCKRRLGIAQAVIGNPNIIIIDEPTVGLDPEQRLEFRHYLSEIGKERIVLISTHILEDVELYTNTILIINQGSIIFKGSTSDAIAQAKNNIYTMNVNIDELALINKKAMVIEEKRLENNMIKIKFIQTDDIVDKSELEKEVSLENAYVFLQKCETSLQ >NZ_CP010086.2|WP_041900299.1|5920391_5921099_-|hypothetical-protein MLTCFYKNVKLLYNNYYTIYDIKGKIIKFSFGILFLFLLISIYNPAPMEYMSLLSQKYKLVSVDNIYDYTIPMISCCIIAYAFYNDYKDNTHELISFFSGHKFNYILFCRWFLYTGIFLIGSFITALMYYRAVYFGGVQGILLALRFIPNIIFLTSAILLITTGTKSIYAGIFITTAYTICDYLSFGELFKILSIGANSYNFYYIISPGYYIANRLLILAIGIVNIYIAGRISSN >NZ_CP010086.2|WP_041900298.1|5918168_5920001_+|O-antigen-ligase-family-protein MTNSRNNSNEKSFNFFLLIAFILSIVPIIVRVAAVKLDENAIKIWGTTVKADLFSQRKSLLLMIFSVILIITCVIFFKKIFSRKDKLVNYILIACGVFILFTFLSAIFSKYRQVSFWGIFDRAEGFITIACYIILFLYSLYTFKTTNNYKYIITPLLILVFINSFLGLFQYIGQDLIKTSLGASIAGASSNSGIDLLNEKGTIYGTLASYNYMGSFVSIALPILFCYTIFEDDVMYKILSFIGTLLSFWLLFGSTARSGIVGVLGALIFGIIIFYKPLIKRWKGLLIGVVALIILIVGANFASKGSLFKRIPSLASDAFSIFKDTSDFDYTNYTPVKDIKYMDSTTEVVLPNDTLRITYESGNPVFKNSNGEVVPYALNGKVLSTDSEAFKNITFAFGKLDKKSVISDSLLLNINNQPTFLFKLNDNKVFNLIDMSTKNYIDLQTPETFGFKGKEKLGSSRGYIWSRSLPLLKNTMILGTGPDTFVFDFPQGDLIGKYYAYDTPNIVVDKAHNLYLQIAINYGVIALVGFIAMLLIYIIDSIKLYALKNTFEDKNQMLGAITCLGIIGYLFAGIFNDSVVGVAPIFWILFGVGIAINFMNRETARKKISK >NZ_CP010086.2|WP_041900297.1|5916735_5917872_+|glycosyltransferase MKKILFIASTLSHIENFHIPYLKKFKDLGYSVHVMGKLNNKSEILYADKIISVPFEKSMFSLKNFYLSLKIAKIINKNNYDIIIIHTSLAAFFARIGIILCLKKPKLVVNTVHGYLFDYNSSFFKKHIMILAEKLTKCVTNVIIVMNSLDYDIAKKYKLYKDNLYLINGMGIDPNSFPSISSKCKVALRNSHNFSEKDFILIYVAEFSKRKNQKFLINSMNKLISEGFSNIKLLFLGDGQFLDELKLYSQSLSINDNVFFAGYTKDTCTYYQMSDICVSSSRIEGLPFNIMEAMSVGLPIVASKVKGHIDLVIPNENGFLFNYNDIDEFCSYIKNIYKSTDLQYRMHIKSIELSKKYSLDSVLSNTVSIILNEYDLHL >NZ_CP010086.2|WP_041900296.1|5915314_5916739_+|undecaprenyl-phosphate-glucose-phosphotransferase MIKENQNLLNKINAISDIVILFISMTLAYLIRFYIFSPDTDYIRLITYIEFSVVIIPINLIIFNFFNLYHSFRTTSFIKECNQVIKSNTLLTAILLSLLFTLKLVHISRLVIVIFYFVNIMLVIAKRFFLRRTLSKMRTKGMNLKHVIIVGAGEVANEYLDVIKNNRNFGYSYSGYVANNSNFEGEKLGEYRDLCNVLDKYKPDEVVCALDISDAKHIEKVVSDCEKSGTKISIIPFCYKYIPSQPYIDQIGNIPLINLRRIPLDNLGNAFIKRSLDIIGSLVLIICTSPIMLITSIIIKLTSKGPIIFKQQRVGLNKNLFTMYKFRSMRVNNEEETGWSTNNDPRKTRFGSLIRKFSIDELPQFFNVLKGDMSLVGPRPELPHFVENFKDEIPLYMVKHQVKPGITGWAQVNGYRGDTSIKKRIEFDIYYIENWNILMDINILFRTAFKGFKNNEQIIKHNNPKNIENNGVQL >NZ_CP010086.2|WP_041900295.1|5913878_5914916_-|glycosyltransferase MFLSIVVPVYNVELYLNKCLESILACELKSYELILINDGSTDNSYNICLDFQQKYTEIKVLSQENKGLSNARNVGLNEARGEYIVFIDSDDYIISKSFYETIEEIKKNKNQKIDILISDFFRVSKEERIVSKINQIQESDEIIYGIKYMESFLKGYGCFWNTWRFVFCREFLIANKFKFKDGFLCEDIDFAVKTLLKTNNIAFYHNPYYCYKLGRESSIMNIVSEKRVRDYLIITEECMQLLRNNDEVIFSSRMKEKLLIEYVLNLTTIFEVDKTNRKTIKNLFKQTQYLFSMTKSNKIKCYNFIISLFGISSVAFVLLLLKKMRRIMRLWRTVIAEKENIMKKF >NZ_CP010086.2|WP_041900294.1|5912544_5913927_-|hypothetical-protein MENSDCRKRKYYEEVLRKHKNAADFYTVHKSMFKNMPDKLNNKDSIIYGTSISVIAPTLISYVLHVLQNSKKRGLERLYFLSRDGYIMYRIAIILCDYYKIDIECKYLYVSRRTLRAPLYSIDSDEAMKYFCENGARISARVILKRAGISNNNEDRILDKLNIKFKDKPLNEYDLTILGKKLRENKQFMEEALNYSKLSYNNISEYFLQEGLFDKKAYAIVDSGWIGSMQRNIRQILSYRGINKRMLGYYFGMYKDGKEEDGEYNCFYFSNKYKSLSRVLFNNNLFECMCSANHGMTIGYSKNRQGLIEPILKEYHNKWNVDLQLETIIKFTEEFVKVNKLEDIRMGKLHNITKKLLVGLMMFPNISEASVYGSIPFCDDSTEGYMINLANILNKRELRQYNIVYKIYEKMFYKKRGIKLNESFWINGTIQIMDISHKKLFNLNCIICEYIHYLSIKIKE >NZ_CP010086.2|WP_041900293.1|5909315_5912480_-|methyltransferase-domain-containing-protein MSEKSGEFVYDRKIDFRENTADYFVVKSIFDGAKVLELGCSTGYITKYLNSEKHCENSAVEISKKALDKVSSILKYSINNDLNFIEDWIDKLPDNYFDFIVCQDVLEHLIDPFKVLRILKGKLLPRGKFLISIPNVSHNTILMQLLKNRFDYKDVGILDRTHIKFYTKETFSEEAKKIGLKRIGHYITYLVPDGTGWETEYSQYSLEERNILLKHGDGHVFQNLFILGKEECFCEEESPLYNLSLDSYDEVRIYEDNSEKFYYYKDGEELEYIVQMNKTTSIEIEATIRPCEYSIKASVNGQPYNFWSLSAKDGNINTQSGNFVNIRNQRIYMKHKFSKGDVVKIIINRKSDAIKTLMLGEICMNNELNKIKGMIDKCDLISFDIFDTLVLRNVLFPKDIFRLLDTYIKDKYGIENFYNLRASLETKTREGTTNEDVNIEEIYDTISKELKFDCNDIKEKELELEKKFIVTNPFMKEIFDYAKSRNKRIFIISDMYLKESFIKNILDNLGYVGYEKLFVSCELNKTKATKSIYKHIIKTYQDVNIEKWLHIGDNYQSDVRNPESLGINAYYYKSIRERANISDESSVDIKTSIMRAIQYNKVYCGYTMPYWEEFGIKYIAPIYYGLSDWIARLNVENNNVVFLSRDGYIPKLVFDKIKKKRKLDLIDSMYLYTSRKAYQLPSMAYMSKGEMVECLTQSSEAFGHKLTINEMFRNASLDINDYLHIIKNFGFDSPDDIINADTRHMAKKVIQFLYDDIITVLKKKCELVEEYFEQENLFKYDRLNIVDIGWRGSIQYSMQKMFNHYYESKGIDKKANIYGYYLGTNQFVYADIVDNTFGYYFDYSIPWVHSSFCIENLMMYEFIFTCPQPQLSGFARENGGKIIPIFRDFVENSEYTSALQNAALKIIDEFIDYDEFLSGISVEGCTDLYRNFIINRDYNDMIEFKKISNLVSYDSEEKPYVTSYSKSEIKDNIEKIWEETKFNLWRYAYLIDEIQTKEEFEYFMKSNNIERFPKDFNIIKPYKFFSVRNFKKAIKHPRKALKALLKKIVTKILQ >NZ_CP010086.2|WP_041900303.1|5926958_5928173_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKNLKKIIAIILAVNTVSTIAPAANLGLLTTKAYAADKITNLTVEDSNGDNMSLYSESDCTDKHRVDSDDVQSGKTYYTRKTSADEINIDADGVDSDNIRVFEETSSDTEGKDIGEDVDLSSGTNIITVRVYNGDPGTVKYSDNSYVNEYKIRVKYSGSNDDDDEDSDNVYLSSITLMGGNIDFSKKVYTYDVQVPEDLSKITIRARPDCDSGKYDDYKVKINGVKVDKDDKFKDDVSLSKGKNVIDIKVEDDDDNERVYTLNITRGKDNSNNNSKSNEQAEVKTSQWVQVNGKWQYKDSTGNSVKNTWVQNYFVQADGNMATGWLNNNGKWYYLGDDGARKTGWQLVNGNWYYLDSQGTMQVGWIKDINNGKYYYLNNDGSMAYNTTVGEYKLGSDGAWYNK >NZ_CP010086.2|WP_041900304.1|5928316_5929561_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKNIKRVIAIVLAIGTISAATPASKINLLTTRAYASSTNDESTLDSLSLDDSDGNNVKLYDDNDYKNRVKENDVHEDETYYAKTSSNTVSVDISGPDDNFVRVFRDSSDSTKGKEVGDDIQLTDKSVVTDLIIKVYGKDLDGETVRNNEHDDDEYDLLNTYEVKVRHVDEDDSDKTDFDDIYLERLSIAGSTINLSNSITKYTYNVDSNVNQVAIKATPENDNYDVTIDGEDADYDDNYKRNVNLEKGQNIIKVEIEHNNKDRVYTLIINRGNVSSSNTNNGSTNTDTNTGSKDVKANQWVQTNGIWQYNDAEGKVVKNSWIQNYYLNSDGNMVTGWLNLNGNWYYFGTDGAKKVGWQQSSGKWYYLDSEGRMQTGWVKDRNGKYYYLNSDGSMAYNTKIGVYRLGADGAWIK >NZ_CP010086.2|WP_041900305.1|5929611_5931159_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MKKNMIKIVSIALALGIVSAAAPATNINVLTIKAYAANDNDDDYLDRLELNDEDGNNIKLYSDSDYDSKVNASDVEEGETYYAKTSSDTVSIDIDGPDEKYVRVFNGTSSSSKGKEVGEDVDLSDDSSTTTLTIKVYGKEPDDDMRYKDNDDYNVLSTYRIKVENANYNQNKDNDNIYLERLSVNNNKVELSKSELTYTYNVASDVKRVTIKATPEDDDYDVTIDNKNVQSADNYKKEVDLDEGTNEFEIELEDGDKDRVYTLIINRGNPSSNGTSSQDTAEPEHKDSIYLDKLSIDGRLFSLSQSQVNYSSNVPSDVNKVTIKAEPEKDFYTVKVNGDEVFEDDDYKTTVNLKDGENKIKVDVKNENSDEERAYTLTVIRGSVTSTQNNTTGGETNANKWVQVNGAWKYNDASGNSVRNTWVGNYYLLDSGNMATGWLNHSGSWYYLGSDGARKTGWQLVDGSWYYLDSQGKIQTGWIKDSNGKYYYLNSNGAMAYNTTVGGYKLGYDGAWIQK >NZ_CP010086.2|WP_041900306.1|5931389_5932664_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKNLKKIVAIALAIGAISAVAPATNINFLTTKAYASSDDDSNDETELESLQLLTESGSKIKLYTDSSYDSDDKVDADEVEDNEKYFAKTSSDTINIDIDGPSSKYVRVFKGTSDSTKGKKISSDISLDKDSTTTLTVRVYDEEPDDDVRLEDDDYSSEYTIKVKCTADSSDSDDEDSSDSSDDYDDIYLDRLSVDGQSISLSKSKVEYTYNVSSDTDEVTIKATPEDEDYDVTIDGDSVDDDDKYKSDVDLDKGENKIKIELEDGDDERVYTLIINRGGTSSTTGSTTNTASGSPSSATDVVATVTNKWVQVGGNWQYKDATGNTVKNTWVQNYFVQADGNMATGWLNYSGKWYYLGSDGARKTGWQQAGGKWYYLDSEGAMQTGWVRDLGSGKYYYLNSDGSMAYNTMIGKYKLGSDGAWIN >NZ_CP010086.2|WP_041900307.1|5932828_5934130_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MHKKIKYIIAATLVVAAVSGFAPSNNFLLGSVEAYASTYNDASNGELKSLDLTWGSGSKIKLLDSYSGDEVDLSSDTDYYVQLKGVSDFNVAAEVKGSGYVVKMFTSSSRSEKGEDVGQDVNIGSGYKDIYLRTYKSEEAYKEAYNDGDVSDCEKIYIIHARKESSTSEAEEDREYAYLDGIYLSDGSVDFSKNKTSYDVNVGEDVDKLTVRANPDDDDDYIEINGNSVYEDDNFEKTVNLDKGNNTITIYVEHEDEDTTYTLNVYRGKSANKTDSSNGQNFAIQTQEGSLNAWQRVDGKWRYVDGTGSVLKSTWWFDKDTGKNYYLGQDGFRTTGWFSDNNNWYYFNENGEMQTGWVNINKNWYYLNKSGAMQMGWLEDSTGNWYYLDGSGAMETGWIEDSNGKWYYLDSTGKMIKDSAIGAYKLGTDGELE >NZ_CP010086.2|WP_041900308.1|5934674_5936402_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKNIKRIIAITVAVNTISTISPTTLNTYFVGAKPVYASSYSPDDEQLKTLKIKSLDGETLDLRDGYNGDTVKLSDETEYYTKLTDDSDGIKITADAEGDDYVVKIFTSDAENATAYDPGDEILLGKGDTTLYIRTYKSKSEFNKVKNNVSNCKEEYTLNVRKTKESSYEDDSQDSIYLDNIDLSKGDIDFIKGKTSYDIKVDENVESMWIKAIPESNSDRVRVDGSLVDSSDNYKKTVSLDKGKNEIKIKVTDSKDNQRTYTLNVTRGDDSDNEDDIYLDHITLSEGDIDFSKDDNSYNVDLDESVSKITIGAEPEDSDYSVTIDGDEVRSSDDYEKKVSLDKGENVIKVNVEDELNDKKRTYTLTINRGKETDDSKDNNTEDTSDKKSQWVQTNDGWKYYDENGKVLKSSWLYDKDQKVYCYLDKDGLRVTGWHKDNEKWYLLDSKGAMLTGWQKDNEKWYLLGSDGAMLTGWHKETVDDQKKNTDASTNSGDNDTKKVDNWYYLNQDGSMRTGWLSDGGKWYFFNADGTMQKGWLIDYNSKYYLTEDGSMATGTRTINGKEYKFNDSGALIL >NZ_CP010086.2|WP_023974352.1|5936913_5937135_+|hypothetical-protein MSKEKMSSNENEKYYSGEELTDSHPSDPNDSELKKIKSMYLPDSKADHAPSEKSIEDANGLEHPEPVKPKSLI >NZ_CP010086.2|WP_023974353.1|5937233_5937485_+|hypothetical-protein MSQSKIPFSINPGDDYPMEEYSKENSSKSKASDSENAGKTTYSGERNAKSLNNANISRTNLDTELIDLNADGDSDESKYSDLI >NZ_CP010086.2|WP_155715590.1|5937530_5937674_+|hypothetical-protein MSKGKYPYVPTPEDVPAPDLSYIFSPESKNSGNKNDNENTDSQKRNS >NZ_CP010086.2|WP_041900309.1|5937740_5938007_+|hypothetical-protein MSKEKKVSHTSDVRDSSKKDFTNSYLPKMRTNYHPSRDDVESATGVDFPINMPNPAVDPIVVNNIANQEFDYTQDMLSPDNYEIDGDD |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010086_5 | 5.1|5924701|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 5924701-5924733 | 33 | MT446411 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH40, complete genome | 28967-28999 | 7 | 0.788 |
NZ_CP010086_5 | 5.1|5924701|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 5924701-5924733 | 33 | MT446412 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH41, complete genome | 156610-156642 | 7 | 0.788 |
NZ_CP010086_5 | 5.1|5924701|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 5924701-5924733 | 33 | MT446392 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH15, complete genome | 21954-21986 | 7 | 0.788 |
NZ_CP010086_1 | 1.1|1340117|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 1340117-1340150 | 34 | CP020755 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence | 533546-533579 | 8 | 0.765 |
NZ_CP010086_1 | 1.1|1340117|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 1340117-1340150 | 34 | NC_020385 | Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence | 274338-274371 | 8 | 0.765 |
NZ_CP010086_1 | 1.1|1340117|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 1340117-1340150 | 34 | NZ_CP021062 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence | 164608-164641 | 8 | 0.765 |
NZ_CP010086_5 | 5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 5924761-5924793 | 33 | KC821604 | Cellulophaga phage phiST, complete genome | 48350-48382 | 11 | 0.667 |
NZ_CP010086_5 | 5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 5924761-5924793 | 33 | KC821621 | Cellulophaga phage phi19:2, complete genome | 48359-48391 | 11 | 0.667 |
NZ_CP010086_5 | 5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 5924761-5924793 | 33 | KC821625 | Cellulophaga phage phi13:1, complete genome | 46260-46292 | 11 | 0.667 |
NZ_CP010086_5 | 5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder | 5924761-5924793 | 33 | HQ634192 | Cellulophaga phage phiST genomic sequence | 30544-30576 | 11 | 0.667 |
1. spacer 5.1|5924701|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to MT446411 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH40, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaagc Protospacer .*********** *** ************
2. spacer 5.1|5924701|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to MT446412 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH41, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaagc Protospacer .*********** *** ************
3. spacer 5.1|5924701|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to MT446392 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH15, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaggc Protospacer .*********** *** ************
4. spacer 1.1|1340117|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
taaataataagttttaccgtttaattcaagtaat CRISPR spacer taaataataggttttaccctttaaataatacagt Protospacer *********.******** ***** * * ..*.*
5. spacer 1.1|1340117|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
taaataataagttttaccgtttaattcaagtaat CRISPR spacer taaataataggttttaccctttaaataatacagt Protospacer *********.******** ***** * * ..*.*
6. spacer 1.1|1340117|34|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
taaataataagttttaccgtttaattcaagtaat CRISPR spacer taaataataggttttaccctttaaataatacagt Protospacer *********.******** ***** * * ..*.*
7. spacer 5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to KC821604 (Cellulophaga phage phiST, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
ccaagttgctccatcttgaacccaacctgtagc CRISPR spacer gttagttgctccatctgaaacccaaccaaattt Protospacer . ************* .********* . .
8. spacer 5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to KC821621 (Cellulophaga phage phi19:2, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
ccaagttgctccatcttgaacccaacctgtagc CRISPR spacer gttagttgctccatctgaaacccaaccaaattt Protospacer . ************* .********* . .
9. spacer 5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to KC821625 (Cellulophaga phage phi13:1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
ccaagttgctccatcttgaacccaacctgtagc CRISPR spacer gttagttgctccatctgaaacccaaccaaattt Protospacer . ************* .********* . .
10. spacer 5.2|5924761|33|NZ_CP010086|CRISPRCasFinder matches to HQ634192 (Cellulophaga phage phiST genomic sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
ccaagttgctccatcttgaacccaacctgtagc CRISPR spacer gttagttgctccatctgaaacccaaccaaattt Protospacer . ************* .********* . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
428539 : 486163
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010086|428539:486163|DBSCAN-SWA TTTAACCAAATGCAAGATGTTTAATTTGAGCTATATGAATAGTATTTCCTGTAATTGCATTTAGTACAAATGATATATTATGAGTAAGTATTTTTAGAGTAATTCTCAGCATTAACCCCCACTTTGACTTAGCTAGAACTCTTGCAATATTAAATTGGCCAGCTAATTGAGAAAAACTAGTTTCAACTCTCCGACGCGCTTTTGATAAAGCGTTATGAAGTCGTTTTTCTAGTGGTGTTTTACTATTTTTTCTCTTCAGCGATAAAAACAAGATTTCTTTTTCTTTAGCTAATGATACTTTAAGCTCATTACCGATGTATCCTTTATCAGCGAGTATCTTTATATTGGTGTTTGTTTGAATGAGTTCGAATACAGCATCTCTATCATCAGTATTAGCAGTCGTTAAAAGAAAATCTGTTATGAAACCATCAGTGGTAATTAAAGCGTGAAGTTTCAATCCAAAATAAGTTTCCTTTTTTGAAGCGCAATAACTATAAGTTGATATGTCCTTGAATAATTTACTAAAGTAGGCTCTTCCGAATTTGCATACTGGGATAGGCATACTGTCAATAATTCTAGTATCATCATCACTAAATATTGGCAGACTTGAAAAGTATCTTTGGATTTCTAAAATTACTTTGTATAAATTTCTTTTGGTTCTGTTAAATCTTGTTCTATCGCAAATATTAGGAAATAAATCTGAATAATTCTTTTTAACAAAATAGAACCAAGCTTTTTCAGAATCAATTGTAAGGGCTTCGCCTACGATACTAATTGTTATTATTTCTGAGTCTGAGAGCTTAGATTCAGAAATATTTCTTCTATTTTTGATGGATTCAGGAATTACTTCATTGTAAACATCATCGATTAACACAAAAGAAACTGTAAAAAAATCTTTTAAATTAGCAATTTTTTCAGTATTATAATAAGTGAACTCTAACATTTCAATCATCTCCTTATTATACTTTTAGTGTTAATTTAATTATAATTGGGATGATTAAATTTTGTTAGAGTTTTTCTTTATTAAATTTTAACTAGCACAACGCGTTAATTTAATATATTTTTAAATTAAGTTATATATTAGTTAAGAAATCGATTGAAAAATTTGATATATTAATTATATATTAAAATAATTATAAAGGGGTCAAACATATGAAAGAAATAGATTGCAGAGGATTATCATATCTACAAATAATAAGAGAAGTTAAGAAGTATTTTAATTCAATTGGAGAAGGAGAAGCTGTTGTAGTAGTAAATAATGAATTAGGGCGGTCCAATGTTATAAGGTATGCAGCACATAAAGGATATAAAGTAGATATGGAGGATGAAAAAAGTAGATTTTTAATAAAGATGGAAAAGAGAGGATGCTTAGAATCAGAAGATGAGGAAGAAATTTTTTCTATATTAATAACAAGAGATAAAATTGGTGAGGGAAATGATGATTTAGGAATAACTTTAATGAGTGAATATTTCGAAGCATTAAATGAGTATGATAAACTTCCAAAAGAAATTTTATTCTTAAATTCAGGGGTTAAGTTGTTTAAAAGGGATTCTAAGGCTATAGAAGATATAAGAATGTTATATAAAAAGGGCGTTAAACTTTTAATAAGTGATACATCCTTGGATTATTATAAATTAACAGAACAAATAACTTTTGGAGAAATAGCAAGCATGTATGATATGGTAGTTGCAATGAAGAAAGCAAAGAAATTAATAAAGCTTTAGGAATTAATAGTGGAGGATATTATAATGCCAGATTATGAATTAATTATTATTGGGGCAGGAATAGCTGGAATGACAGCTGCACTTGGAGCTGCAAGAGAGGGAATAACAAAAATACTAATTATTGAAAAAGAGTCTAACGTTGGGGGAATAATTAATCAATGTATTCATAATGGTTTTGGAAAAAACTTTCTAGATGAGCCAGTGACCGGTCCTGAGTATATTGATTTTATAGAGAGGCAGTTAGGAGAATTTGAAATAGAAATGCTTTTAGATACTACAGTTTTAGAAGTGACTGAAGGAAAGAAAGTTACATATGTAAATTCTAGAGATGGTATTAAAGATTTAACCGCTCAAGCGATAATATTTGCTATGGGAGCAAAAGAAACATATTCAGGAAATGTTATAATTCCTACCAATGGACTTACAGGAATATTCACTGTAGGAGAGGCTCATAAAATAATTAATTTAGATGGATATCTACCAGGAAGAAGGACTGTGATTATAGCGAAAAATAAATGGGGATTCATAGTTGCAAGAAGGCTTATAGTAGAGGGTGGAAATATAGAAGCGGTTGTCATTGAGAATACATTTGAGGAAATGGTTAATTCGGAAATACGAGATATTATTGATGGCTTTGATATACCAGTAATAGAGAATTCTAGAGTAACAGAAATTGAAGGAAAAACGCGAATTGAGAAGCTAAAAATAGTTAATTTAGATAATGAAGAAATAATAGAAAAAGAATGTGATTCACTTCTATTATCAGTTAATTTCTTGCCAGAAACAACCGTAATTAAAAAAACAAGTTTTGATATAAATTCTAAGACATCTGGATTTAAAGTAGTAGACTTTGCAACATCTTTAGAAGGTTTTTTTGCTTGTGGAAATGTTATATACGGAGAAAATGCGTTTTGGATAGAAGAAACTGATGGTATACAATGTGGAATTATTGCGGCTAGATTTGTAAAGGAAAGCATGTAGAAGTTAGGTAGAAATATATTAGCAGTAATATAATAAAAGCCAAAATTACTGCTAATTAGTTCACAGAATAATATGGGTTAAAAATAATTGAGAGCATTTTCATACATTAGGTGATGGCCAAGTGAATTCATGTGAATTCCATCTAAATAAATATCATCCCTATTAAATGTCAAATCGTAGAAATTGATAAATTGAAGATTGTATTTATTAGATAATTTAATTAGTTCATCCTTTAAATATGAAAGTTCTTTTTCTGCATAAGAATATAGATGCGAAGGAGAAAAAAGCGAATTTGCCATTTGGCCAATAATCTTAGGGGGAATTCCTAAAGTCACTTTTGAGCCTATATTTAGTCCATCATTAATCATTATTTCAATATTACTAATTATAAAAGGAATTTTGCGTCCTAGAAGAAGATCATTGCTACCTCCCATTATAAAAATTTTTGATGGAGAATAAATTAAAACATCATCATTATAGCGAGTAAGCATTGAAGTGGTAGTATCACCATTACAGGCTTTATTTAATGATGAAAGGGAGCGTTTTTGCGTAAGTTTGTAAACCCAAGAATTTTGTTTAGTTACCCCATATCCTAAAGTTAGGCTGTCTCCAAAGAAAATGATATCAAGCTTATTATTCATATATAGACTCCTTTTATGTAATTAGAATAGTTTGTTAAAGCACTTTTTACATATTAATGTTTTTCCTGAATCGGCTTTTACATAATCATCTGAAATAATGGCTTTATTGCAGATGCTACATATAATCATTTCGCTAGACATTAATGAGTTAGACGAGGTTTTTTTTGATTTTTTATCACGTTTATTTTCAGCATTGCAATCAAGTTTATCTTTTTGATAATTAGTTGCAGAACTACTAGTTTTATCAGATAGTATATTTTTTCTTATTGGAGAATATAATTTAGGTTTTAAGGAAGTAGTTCTTTTGACAACTTTATAGCTAAAATCATATTCACTTTCAGCAAAGAGTTCTAGTTCAAATCTTGGATTCTCTTTATCATAATATTCTTCTGTAAAGATTTTGGTTATCTGAGCATCATTTATAATTAATCCACTTTTTTCAATGCCATCAAATATACTTTTTGTAATATTAATGGTATCTGGATGACGCTTTTCACTTTTATAATATACTCTTAGTAAAGCTATTAGACTTTCAGAAAAAACAACATCAGGATTTTGATTTCTTGCAAGAAGTGCTATTTCCTGTTCGTATAGAGCATACCTATCATGATATTTTCCAGAGCTATGTGGTAGGATTGCACGTCCATTTAGATTGTGTAACTTAAAATTGGATTTTGTAATAGGTGATCCTTTAATTATAACTTTAGCATAGTTAGACATTTAAATTCTCCTCGTGAAAGTATATTTGTTATCTCAAATATACATCATATGTACCTTTTATACAACAAGTTAATATTACAATGAAATTGTGAGAATAAGATATATGTTAAGTGCATTTGTATAACTAGAAAAATTGAACTTTGATAATATTGTATAGATAAAGTATAATATTTTAGTAATTAAAATATAGAATAGTTTGCGCATTGAAAAGATATGATTTCATAAATATTAAGAAGATATTAAACAATATATAAATACGAGATTTTATCTTTTTTTTAAGATAAAATAGATTTAGATAAATTAAATAATGTTATAGTAAAGTATTTAATTTATCTAGTTCTTAATTTTAACTAATATATCAAAGTTTTCTCTTGTTAGATTAGTTAAAATTAAGTTATAAATAGGCTTAATCAGCTTATTTAGATAGATCAGAATAAATAATTTTATTTGAAGTGTAATAAAAAGAGGTATTAGATATGAATAAAAAAATAATTTTAGCAATAGAATCAAGTTGTGATGAAACTGCTGCTGCAGTAGTTGTGAATGGTAGAGAAGTTTTATCAAATATAATTGCTTCACAAATTGATACTCATAAAAAATTTGGAGGAGTGGTTCCAGAAGTTGCATCGAGAATGCATATTGAGGCAGTAGATAGTGTTGTAAAAGCCGCATTATTAGAAGCAGGAATTTCAATAGACGATGTTGACGCAATAGGAGTTACGTATGGACCAGGACTTGTTGGGGCACTTTTGGTTGGGCTTCAATACGCAAAAGGATTGGCATTAGGTTCTAAAAAGCCTTTAATTGGGGTTAATCATATACAAGGACATATTAGTGCTAATTTTATTGAGCATAAAGATTTAAAGCCACCTTTTGTCTCACTAGTGGTTTCAGGAGGACATACTTTTATTGTGCATGTAAAAGGATATAGGG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56 | Clostridium_phage(16.67%) | coat,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1221033 : 1231238
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010086|1221033:1231238|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010086|1221033:1231238|1229729_1231238_+|WP_041894708.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKEGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYKYLKENGLNVIEINEVTDFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNEEHMNTLKGRNIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLEFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISDKNDYKVVMEEIETNGETSYKTKKKLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLADDEEEYPEYLSVSYKKMQSLRYGENSHQTAAVYASTMLDGAMNTFETLNGKELSYNNFKDVDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVAIGKDSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAEEMVKIFLEVIAAPEYDEDALEILKTKKNLRVLKFHNTPKADKYMVTVDGAMLVQEEDNKLVEEIKVVTEKKPTDEEMNDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALKRGKGATILASDAYFPFGDVAETAAKAGIKAIIQPGGSIRDQESIDVCNKYGISMVFTGYRHFKH >NZ_CP010086|1221033:1231238|1229104_1229716_+|WP_041894705.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTDLQSVIDAVENNYMNVKIEMVIGSRDNIYALERAKKHNIDTFVVNRREYGEESSNKILELTKGKVDLIVLAGFLAILDGEILKEFDNRIINIHPSLIPSFCGPGMYGLKVHEAVIKSGVRFSGCTVHFVNSEVDGGAILLQEVVPVYFEDDAETLQKRILEKEHEILPKAIKLISENKIRVIDGRVKIEE >NZ_CP010086|1221033:1231238|1228115_1229117_+|WP_017210866.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYKSVKLIKEYAARTMSQYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAADLVKGISDGCVDSDCALIGGETAEMPGFYSDGEYDMAGFAVGIADKDKIINGSNIKDGDKLIGIASSGIHSNGYSLIRKIFPDLNEEFNGEEVWKTLITPTKIYVKPVLKLLESYEIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGGDFTAVINKDSYPLPAIFERIIEKGVDKEHMYNTFNMGIGFVLAVKDEDVEPIIKALVEMGEKAYEIGYVTSGGEGICLK >NZ_CP010086|1221033:1231238|1221033_1224780_+|WP_041894698.1|DBSCAN-SWA MLNIRSVFVEKKKGFNVEAQSLLNDFRDNLGVTGLEDVRLVNKYIISDIPEEYYNKALHTIFSEATVDVVYESELPMNEGEIAFGVEYLPGQYDQRADSASECLALLTAEDKVEIKSAKVVVLKGNLSKDDIEKIKKYYINPVDSREVDINSKDLSSLSNIPKDVQILDGFTSKTLDQLKEFHSGQGLAMSIDDLLMIQDYFKGEKRDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTILEDVQIEDNKYTAPIKASYEGYIKSRSYVYGEKEKNKTLMDMAVISMKELRKRGKLEDLDISEEINACSINVKIETDKGMEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVPIEDTLEGKLPQRKITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVEEVYHPNYAAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPALGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSLNECGAEVQKGNAPTERKLQRLFRNSKAAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKEDADEFIRLSNEENLEANLVAHVTDTDRLRLFWRGKNIVDLKRTFLDTNGATQKTNVTVKAPVDYPYVVADIDVKEEWINNLRKLNVSSQQGLAERFDATIGHGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIPVLDGESTDATLMTFGFNPELGTWSPYHMAYYAVIESISKLAAMGGDYRKARLTFQEYFERLGSESSRWGKPFAALLGAYEAQMAFETAAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKARKIISPEFKEAGSSLVLLQTEKLEDGTINLDKLKKNLDVLYKLIQDEKVISASAVKYGGVSETVTKMTLGNRIGAEIDNLTKDELFGFNYGTIVLEVKNGVNVEEEFKECLYKEVGKTISSAVIISKEYDLNLNIEDLEKTYEEKLKSVFKIKTKDVEGKVETVLYDKKSTLSPKLKVAKPKVVIPVFPGNNCEYDCARAFEKEGAEVTQVVFRNITKEALNDSIERLAKEISTAQILMIPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNEKISNSVMELLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIISTKVVSNKSPWFSEVNVGDIHSVAISHGEGRFVAPESLIKELIANGQVATQYVDFDGNVSLNMPFNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGTDLYRNIPGDFDQKIFKAGVEYFK >NZ_CP010086|1221033:1231238|1226630_1228046_+|WP_041894702.1|DBSCAN-SWA MSNPNFELIMDPSNDKFKDECGVFGVYTNKPIDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIDIHKGLGLITEAFKQEDLQKLKGHIAIGHVRYSTAGGKGIENAQPILVSSKMGPIAMAHNGTLVNADVIKELLEDGGQIFHTTTDSEVIACLIARSAKKGFAKAVVDAMSAVRGSFALTIMSKDRLIGARDPHGIRPLSLGKIEEGYILTSESCALDAIGAEFVRDIEPGEIVIIDSEGIHSYRYSENTKCQTCAFEYIYFARPDSRIDGLEVHTTRVKAGEQLYKEHPLDADVVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKSNLEGKRVILIDDSVVRGTTSKHLVESLRRVGVKEVSFLLASPSVKYPCYFGIDTPYRSELVAANNTIEEIRDMIGADYLGYLSEEGVYKSCGDREEFCMGCFNGVYPVATPVEKEI >NZ_CP010086|1221033:1231238|1225225_1225705_+|WP_041894700.1|DBSCAN-SWA MQVAIFFGSKSDTEVMRGAANALKEFGVEYKAFILSAHRVPEKLEETLEEIQAQGCQVIIAGAGLAAHLPGVIASKTVLPVIGVPVKAALEGVDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNDELKNKLKEFRLNMKKKFIEENAEGVEL >NZ_CP010086|1221033:1231238|1225704_1226412_+|WP_011968398.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKKIYATDKADEVIVYYKDDATAFNGEKKGQIEDKGIMNNAITSVLFEILEKAGVKTHFIEKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFKLKTTVFELSYKDDSLGDPLINDYHAVGIGATTFEELKVIYDMTAKINDTLKAVFKEQNINLIDFKVEFGRCADGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILKRISK |
7 | Cyanophage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1264848 : 1276372
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP010086|1264848:1276372|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP010086|1264848:1276372|1270008_1270917_+|WP_041894757.1|DBSCAN-SWA MKILITGCNGQLGNELQSIIKSGKAEIDEVSVSIRKSEVIALDVDELDITNLTQVKEILNDVKPDVVINCAAATNVDGCEGNKDFAFRVNSIGPRNLSIICEEIGAKLVQVSTDYVFSGISNRPLTEYDLTAPYSVYGKTKLLGEQYVQQFCSKYFIVRTAWLYGYIGKNFVYTMMRLGKEKDIIKVVDDQRGSPTHANDLAYHILKLIETEEYGIYHCTGKGECTWYEFAKMIIELSGEKCEVKPCTSEEYITPAKRPEYSSLDNMMLRNTVGDEMRDWKEAIKSFIEKVMKGDSHQEGVE >NZ_CP010086|1264848:1276372|1270916_1271966_+|WP_041900837.1|DBSCAN-SWA MKTYLVTGGAGFIGSNFVLYMLNKYKDIKIINLDKLTYAGNLENLKSIENDERYTFVQGDICDKELVSSLFEKYEIDYVTHFAAESHVDRSIKQPEVFVKTNVLGTVNMLNCAKNAWETENGFKEGVKFLHVSTDEVYGSLGAEGYFMETTPLDPHSPYSSSKASSDFMVKAYYDTYKMPINITRCSNNYGPFQFPEKLIPLLINNCLKHKELPIYGDGMNIRDWLFVEDHAKAIDMVINNGRPGQVYNVGGHNERANIQIVKTVISYIHENVDKEVNESLIKYVTDRKGHDRRYGIAPDKIKKELGWYPETTFEVGIKKTIKWYLDSAEWMINVTSGDYQKYYERMYK >NZ_CP010086|1264848:1276372|1275349_1276372_+|WP_052482729.1|DBSCAN-SWA MYTKYQISIIVPVYNVEKYVEKCVESLLKQTFKNYEIILVDDGSTDSSYEIIKKIEEDNDNVSVITQKNQGQGKARSEGIKQAKGEYLTFVDSDDWVSEDYLEKLYNSLKDNNADISVCNVAWVMEKSNEIISFKAFNFSTLTSEEAINELLLDKSVNSYTWGKLYKKDIFIRNKVDFPPRMLYEDLAVIIQTFYYANKITFINDNCYYYLQSEKSSTRTPNINCIYHRLKALKLVKDFLVKNNEFDKYKKIYTHFCLFHLYLMQKQIYFWNFKEHEKQVIHNVMEYIEEKSITKDMLRKTFLTKQQKLEILTFNKSKALYRLVTIYYSLKSRISNKIDI >NZ_CP010086|1264848:1276372|1274069_1275326_+|WP_041894763.1|DBSCAN-SWA MKIESTNGIELNLINIKSSIVYKLMSFIIFFTFIFSYQLRCGLLGDKIGGLNITVLALIILLFLLYFNNIDKKYMILVYIVNMCVFISAIYSNKSIYKGFVVCGYFTIPLILIGINLKKNLFIEFTNKYIKVLNILMIIITVMGVLDIATNQRLMVFVSKFMTSKTQELINTQIDASIANYRMYSLMGHPLFNTQLYLMFYAININYTRYFNKILDTRIVTFITILGIVLTKSKSGMILLVICLLVQHAKKIKIRNFIISFLAIVFLFFAGIFNTTIERFDGSLTSGRNEMWDLIQQSNMYPIKVFSGYGLGATFRYNDIIKNASSAFEYPVRMFSFEIGMLPSILIFSCLLYPILKLIRRRQYSLAIAYSIIFADVNTYNGLSLQSDNMIILCLFILTILNISSYALKIKERSGHSV >NZ_CP010086|1264848:1276372|1272876_1274058_+|WP_041894761.1|DBSCAN-SWA MKICFVTSNIFSSGGVQRVTTVLANELVKYNEVDILCASDKYKPNYELYNLNKSINVEINGIMHKKRLISKLVCKSLMILNNKTGIFNKNKCINILNKVYFPGKIQKNFLEYLNTKKYDVIIAVEALYSMLIGSIANELNAKTIGWQHNSYEAYFQTKDKYCWNIDKMFKRNISMLDKCVVLTEHDKNEIKEKMGIKSICIYNPLSFTSEQKSNCNNRNILSVGRLVQEQKGFDLLLDAYKIVSKKHPNWKLIIVGDGPDKEKLENKILELQLINNVEIRPFTTNVNYYYLNSSIFVSSSRWEGFGLVITEAMECGLPVVAFANSGPKEIINKDGINGVLVPTKNVKELALQIIKLIENYNKRKDMSIKAIERAQDFNVKSVVEKWRRVLELL >NZ_CP010086|1264848:1276372|1271997_1272849_+|WP_041894759.1|DBSCAN-SWA MVSIIIPTYNRANTLVRCIKSLLNQTYSDFEIIIVDDRSTDNSEAIIKNICDSRIKYIKHEKNLGANAARNTGIKYAVGEFIAFQDSDDEWVNNKLEIQLRELKNSNADIVASSFIRYMGKRKTLLPKEKIKDNCAAIRLLRKNYISTQTVLGKAECFKNNEFDKKLPRFQDWELMIRLTRKYKIHFINRPLANVYVQDDSITKKPLKAIEALKIIMSKHKELFDNDHVAKAGFYNLLGDIYLSMNDFKHCYYIKSLKYNKLNYKTYIRICIYYIKSISQKLK >NZ_CP010086|1264848:1276372|1264848_1266198_+|WP_041894748.1|DBSCAN-SWA MKIVVAGTGYVGLVTGACLSEVGHNVTCVDIDEKKIQKMKQGISPIYEPGLGELLKKNNDNGKLDFTTDYKNAYKDADLVFIGVGTPEREDGSANLDYVFNVCKQISDNIEKDCLVVVKSTVPIGTNDKVEEFLKENLKNNDIHVEVASNPEFLAQGTAVLDTLYAKRIVIGVESEKAENIMKEIYKPYNQPIIVTNRRSAEMIKYASNDFLALKISFINEIANFCEMVGADIEDVAKGMSFDPRIGDKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLANDNGYELKTIKATIEVNQNQKYKLFREAKQRVGSLKGLKVAVLGLTFKPGTDDLREAPSIPNVRRLLDEGAEVVAYDPVGEDNFKRIYPNIKYVETPEETLEGAHMAFIFTEWDEIKKISPDQYIELMNNPILFDGRNCYKINDMRNFEIDYYSVGRKAVLNLKNKSNKEVAATIM >NZ_CP010086|1264848:1276372|1269344_1269926_+|WP_041894754.1|DBSCAN-SWA MKNFNFNLTRIDGVYIIEPKTFGDSRGYFMETYSKEQFCEAGLSMNFVQDNESKSSKGVLRGLHFQKKHSQGKLVRVTKGEVFDVAVDLRTGSPTYGQWEGVILSDKNKKQFYIPEGFAHGFLVLSDEAVFNYKCTDFYSPEYDGGVMWNDPEINIEWPLDLIKNIILSEKDKTHPNLKELDLREYKDFIYKK >NZ_CP010086|1264848:1276372|1266215_1267424_+|WP_052482728.1|DBSCAN-SWA MKHVFIIGSKGIPAKYGGFETFVEKLTEGKKSREIKYHVSCLSNNTKTFEHHVARCFNVKVPDIGPAKAVYYDIAALKECIKYIRKNSIKMPIVYILACRIGPFVGHYKKKLNKLGGTLIVNPDGHEWKRAKWNKFIRRYWKVSERYMVKHADLLVCDSKNIEKYIKEDYKKYSPKTTFIAYGADIKKSKLPDDDIILRQWYKDKNIKKKEYYLVVGRFVPENNYETMIAEFMKSKTNKDFVLITNVEKNKFYDELRNKTEFYKDKRIKFVGTVYNQEILKKIRENAYGYLHGHEVGGTNPSLLEALAITDLNLLLDVGFNKEVAEDGAVYFNKENNNLANLINRLENVDEIYIKSLGSKAKDRIKKGYTWSYIIDKYENMFDENKTVYGEVDSNQSAIIQI >NZ_CP010086|1264848:1276372|1267540_1268407_+|WP_041894749.1|DBSCAN-SWA MNNKVCALIITYNIDEKIIEVANSIVNQVELLVIVDNSSKPQTIKLLERLNKNPKIKVIFNKENCGIAKALNQGINFTKENKYEWILTLDHDSVCEKDMIKNMISCLNDYDNKDNIGILTPKIFEIHKQNFISKSSHQERKYIKVKDCIQSGSLINLKVFDKIGYFNEDLFIYHVDFDFCQRLLKANYDIVQCNNVTLYHEEGYKVVKRFLWKKVFYNNYSSSAIYYITRNTIYMCKTYNVIYIKRIVKDFIFITLFDQKRKERLFYFLKGIHDGILNKYGKLEIIPK >NZ_CP010086|1264848:1276372|1268419_1269358_+|WP_041894751.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPVTKAMSKQMVPIYDKPMIYYPLSVLMLAGIRDILIISTPRDIVNFNELFRTGEDLGLNIEYAVQEKPNGLAEAFIIGEGFIGDDNVAMVLGDNIFYGQGFSKHLKKAASLKSGACVFGYYVQNPKEFGVVEFDRSGKVISLEEKPENPKSKYAIPGLYFYDNSVIEKAKKLKPSERGELEITDLNKAYMKDGALKVQLLGRGMAWLDTGNHVSMLQASNFVEAIQHTQGTYIACLEEIAYRQGWISSQKVIELSKSLMKTGYGKYLVDIVQEIESEKASEEIAAANYSIGGNYEKF |
11 | Escherichia_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1317228 : 1323271
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP010086|1317228:1323271|DBSCAN-SWA TCTACCTATATAAATTTTTTGATTTTTTTGATATATAAACACGAACAAAATCCTCAAAGATTAAAAGATCTTTAAGAGTAATCTTATCATCTTCTAACAATTTTGTTAGAGTTTTTACTTTATTGGCTTTTTTAGAATAACGTATTTTAGTTTTGGTCTTATTTAAATTAGCAGAAGAATCAACGCTAATTAAGTTTTCATATTGGTCAAAACCAAGAAGAAAGTCTGTAGTGACATTATAGTATGAGGCTAAGCGTTTCAAGTGATCATATATTGGTGCTGCTTTACCAGTTTCCCATTTAGAAAGCATGCTTCCAGTAATATTAATATCAAATGTTTTATTTATCTCAGAGGCTAGCTGATCTAGAGTAATATTCTTTTTTAATCGCAAGTTCTTAAGGATTATACCTGTTATATTCATATTTCTCCTCCATAATGTAAAAGATTACTTTGGAGATAAGTATACAACTGTAAGTGACAAAAAGCAAGAAAATAATTTGAAAAAAATTCCAAAAATAATCATTGACACGTATAGCAGCAGGCGTATAATTAAATTAACGGTGGCAACTTAAACAAAATGTTGTTACGACAAAATTATATAAGGGGGAATATAGTATGTCAAAGTCACAAGCTCAATATAATAAATTTAAGGAATTCTTATTGGTGAATAACATCAAACAAAGTGAGTTAGCAGAACACATTGGCAGATCAAGCTCTTTTGTTAACAATGCGTTAAATGGAAGAGGCGCAAGATTTACTTCAGAAGATTTAAACGCAATAAGATGCTTATTTAATATTAAAATAGGTGAATATTTTTAATATATATCATCTGTAAACGGTAACATTATGATATTTATGTTTGGTGGGGGGAGTATGGCTGAAAGAGATTTAAAATTCATTTATGGGAACGAGATAGGGATAATATTAGGTATAAATGCAAAGAAAACAATCAAAGAATTATATGAAGAGAAGCTAGAAAAAAGTCAAAGTAGACATATAAATCTTAAGGAAAAATATGAAGAAATTTATTGGTTTAATACTTTAAAGGAGATTTTATGTAAAGAATTTACCATAAGAAGTGGTAAGAAGGTAAGAAAAGAATTAAAAACAATTATTGATGAAGAATATGAATTTATGTGTTGTAAAGTAGATAGAAGAATAGTTGGTGAAAATTCTATTTTACTTTGCAGCATATATAATGGAATTAACTTTGATGAAGAAATAAATAAAAATGTTTTTCTTGAATGTCAACATAATATGAGAGTTACAAAAGCCGATAAATGCTATTTTGCATGTTTAATCAACAGCAGAAAATTTGTATTTAAAGAGATACATAGAGATGAAAAGGTGATTTCAGAGATAGTTAATGAAGAAAAAGTATTTTTTTATGATCATATCTTAAAGGAAATTTCGCCTATGTGACTAAAAATATAGATAAATAGCCTATATACTGGAGTTTAGTTATGGCTGTTTATCTATATTTATATAGTTTCAAAGATTACTTTATTTTTTGGGAGAATTATAGAGTTATTAAATCTGCGTATATTTACCAACTGTGAGTACAGCTTATAATGTATATTGCAAAAATAATTCTTCACGATAATTGTAAAAATACTACAAGAATTTTAGCCATAATTGTGAATTGCGCATTGCAGAAATGTGAATTGCCAATTGTGAATTGTGCATTGTGAATTTCAACATATATGTACCATTTAAGTCAGGTTGAAGAGAAGAAAATGAGTGAAAATAAATCTAAAAGGGAGTACTGAATATTTTAAGTAAAAATTAGGTAGGGGACGATATTTATGAAGGGGATAGAGTGGATTAAGCTAAATACAAATATGTGTGAAGATGAAACAATGAGATTAATTGACTCACTACCATTAAGAGATTCTGCAAATTATGTATGGATAAGACTGCTTTTACAGGCGGGAAAGGTTAATGATGGTGGACTAATATATTTAAAAAAAGACGTGCCTTATACTAAAGAAATGCTGTCTATATTATTTAACAGGCCACTAGATATTATAGAAAAGGTTCTAGATATATTAGAATCTTTTAAGCTTATCAAAATATATGAAAATAACATAATAAAAATATGCAACTGGGAAAAACATCAAAATATTGAAGGAATGAAAAGAGTAAAAGAGGGTACTCGTGAAAGAGTTAAAAACTTTAGAGAAAGAAAGAAAAAAGAAAAGGAACTTGTAGAGAAGAAATTAAATACTGATGAAGCCTGTAATAATGCCATAAATGAAGGAAGTGATACCAATAAAATTAACAAAAATAAAAACCGTAACGCAAATGTAACGCTACAGAAGGAGAAGAGAGAAGAAGATAAAGAACATAAGAAAAAGAATATAGATAAAAAAGAGAATAAAGAAAAAGATAAGGTAAATGATGTTGCTTTAACAAAAGAAGATGATGAAACTTGTGATAAAGCTCATAAACAGACTAAAATTGTCTCTTCGTCTCATGATGAAATAAAATCACAGGCTATTAGAATTATAAAAACTTTAGAAGAAAATAATAAAATCATAAGAGGGTTTACTTTAAGCTGGGTAATAAAAGTGTTAATGACCCATAAAGAAAAGTATATAGAAATGGCTGTTAGAGAAGCTATAGAAAGAAATAGGCTTGATGTAAATTATATTAATGGTATCTTTAAAAACTGGCTTAAGGAAGGATATCCAAAAGACTATGAAGATATGGAATTTAATAATTGTAATGCGGTCAATTCAGCAGCTGTTAAAGAGAAACCAAAACTTAGATTTATTAACTTTGAGCCTAGGCAGTATGATTATGATGATTTAGAGAGGAAGCTTCTAGGATGGACAGAAGATAGTTAATAAGGGGGAATGGTTAATGAGATATGTTAAAGGAATTGATATATCAAATAATAATGAAAGTATTGATTTTGATAAAGTTTCAGAAGATAACATAGAATACGTCTATATGAAAGCTACTGAGGGGAAGACTTTTCAAGACAGCAGATTAGAGGAATTTTATAATTCATGTAAAAGTAATGGCCTAAAGGTTGGAGCTTATCATTTTCTAGTTAGTACAAGCTCTCCACAGGCTCAGGCAGAAAACTTTTATAAAAAGATTAAAGACTGCGCATGGGACATGATTCCTATGCTTGATATTGAATCTGAATTTGATGAATTGTGTGATTATATAATAAGATTTATAAATGCATTTAAGGAATTAAGTCCTCTTCAATTAGGAATTTACTCTTATACAGGATTTTTATCAAATATAGAAGAGATAAAAAGTAAAATAAAAGATTATCCTTTCTGGGAAGCAAATTATAATAATGATCCCTGGAACCTTCCTTCAAATTTCTTTACCAATAGAATAGGGCATCAATATACTGAAAATGGAGATATATCAGGGGTAAGTGGAAAGTGTGATGTGAATTTATTTACACAAGGTGTTTTGCTTAAAAATAATATGTACTTAGGAACTTGGATAAATGAAAATGATAAGTGGTGGTATAAGCATAATGATGGAACCTTTACTAAAGATGATTGGGAATTTATAAATGGAAAATGGTATTTCTTTGATGCAGAAGGCTGGATGATTCATGATTGGAAAAAGTATGGAGATAGTTGGTATTACTTTGGAGATTACAATGATGGAGCTATGAAAACTGGATGGTATTATGATGAGAAATCTTCAAAATGGTATTACTTTAATGAGGAAGGTATAATGCAGACAGGATGTATAAAGATAGATGACAAATGGTATCGTTTTGATAATAATGGAGCAATGGAAACTGAATGAATATAAAAATCCATATTAGGTAGGATTGTTAAATTTAGTATACTTATACGCAGTAATAACATAGTAAGATTAAAAATTCTAAAATTTTAAAAGAAAAATATGGTATAATTAAATAAAAATGGTTAGGGGGATGAGCAATGGAAAGGCTTAAATTAATAAAAGTGATATCTGGTTTACTAGTAGTAGCATCAGTATCAGTATTAAATCCTATAGAAATATATGCTGCAGAAACTGAAGGAAACTCAGTTCAATCAACGGATACTATAGTAAATAATGTTGGATCAGAATTAAAGGTTAATTCCGAAAAAGAATCAGATAAAAGTCTTAATAATAAAGATACAGTAAGCGTAACAGGAGTAATGTTGAATGAATCAAGCGCAGTTATTAATCAAGGAGATACTTTAAAGCTAAAGGAAACAGTATTGCCAAGTACTGCAGACAATAAAAAAGTAACATGGAAATCTAGTAATACAGATGTAGCAAAGGTAAGTTCAAGTGGAGAGGTAAAAGGAATATCACAAGGAACTACAACAATTACATGTACAGCAAATGACGGAAGTGGAAGATCAGATACATGTAAAGTAACAGTTTATTATTCTTATTACAACAAAATAGGATTATTAAATAAAGATGGCAGTGCAATGGAACTTTATAGCGATGACAAATATAATAGTAATAATATAGTTAGCGAAGCAAAAAATAAGAGAACTTATTATGCAAAAGCGTCATCAGATAATATAAGTGTTAATATAAAAAGATTAGACGAAAAGTATATTAAAGTATTTAGGGTGACCTCATATTCAGATATTGGTGAGGTGAGAAGAGCAAAGCTTGTTGATAATGATAATATTGTTTTAGATCCAGGAACAACAACTCTTATTATAAGAGTATATAATAATAAACCAGATTCAAGCATAAAATATGAAGATGATAATAATATCTTAAATGAATACGAAGTTAAAGTGGAGTTAGATAGGTGAATTTAATCTTGAAATTAATATAAAAGGTTTTAAAATTAAGTTTAAAACAAATGAAAAGAACGCCCCATCATCACAAGAGTAAGCGTTCATTTTCTAACAATTAATTAAAATCTAATAGCCCTAAAACATAAAAACGTTCTAGGATTAGCTTAGTGTTACCAGCACTAAGCTTTTCTTATTTATATTATATCAAATTTTCAATAAAAATAAACATTTATCTTAAATTATTTAAATTAGGCTATAGAATAATGAGTATCACAAAGGAGTCAGATACTTGTAAAAAACACTAAGAATAAGCAGTGCATTGAATAAGTATTTAGTGCAGTTTTTTGTTTTAGTGAAATTAGTTATAGGGTATAATATTACTATAATCAATATAAAGTATCAATACGTATGAGAGAGGAAGTGAAGCTTGTGTGTAGATTAAATCCCAAAGTTGATTTTGCATTTAAAAAGCTATTTGGAAGTGAAGAGAACAAAGATATTCTTATTTCGTTTATAAATTCAATGTTATCAGAGAATCAACAAATAAAAGATGTATATCTTAAAAATCCATATAATATAGCAAATTATAGAAAAGACAAAATGAGCATACTGGACATTAAAGCAGTAGATGATAAGGGAATCTGGTATGATATAGAGATGCAGCTTTCAGAGCAGATTTTCTATGAAAAGAGAGCCTTTTATTATTGGGCAAAAGTATATTCAGATCAATTAGAAGGCGGATATAATTATGATAAGTTAAGAAAAACAATATCTATAAATATTCTTGACTTTGATTATTTGGATGAAGAAGAATTTCATAATGTATACAAAGTTTACAATGAAGAAAGTAAGAAAGAATTATCCTCTGTATTTGAAATGCACTTTTTAGAATTAAATAAATTCAAAAAGGATTTTAAGGATGTAAGAACAGCTTTAGATAGATGGATAGTTTTTTTAAACAGAGCATATGAGCTTGAAAAGGATAAAATTCCAGAAGAATTAGCAGTAGATGAAGCAGTAAAGAAGGCTGTAGAAAGATTGGACGTTATGTATTTGGATAAAGATGAAAGAGAAATATACGAAAATGATTTAAAAAGACTTAGAGATTACATAGCGGAAATGAAAACAACTGAAATAAGAGGAATAGAAAAAGGAATAAAAAAAGGAATAGAAGAAGGAGAAAATAAAAAGGCTTTTGAGATAGCTAAAAATTTATTGGATGTTTTAGATAATGAAACTATAGCTCTTAAAACAGGATTAAATATAAATGAAATAGAAAAGTTAAGATTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP010086|1317228:1323271|1317842_1318046_+|WP_041894834.1|DBSCAN-SWA MSKSQAQYNKFKEFLLVNNIKQSELAEHIGRSSSFVNNALNGRGARFTSEDLNAIRCLFNIKIGEYF >NZ_CP010086|1317228:1323271|1317228_1317648_-|WP_041894831.1|DBSCAN-SWA MNITGIILKNLRLKKNITLDQLASEINKTFDINITGSMLSKWETGKAAPIYDHLKRLASYYNVTTDFLLGFDQYENLISVDSSANLNKTKTKIRYSKKANKVKTLTKLLEDDKITLKDLLIFEDFVRVYISKKSKNLYR >NZ_CP010086|1317228:1323271|1318100_1318649_+|WP_052482742.1|DBSCAN-SWA MAERDLKFIYGNEIGIILGINAKKTIKELYEEKLEKSQSRHINLKEKYEEIYWFNTLKEILCKEFTIRSGKKVRKELKTIIDEEYEFMCCKVDRRIVGENSILLCSIYNGINFDEEINKNVFLECQHNMRVTKADKCYFACLINSRKFVFKEIHRDEKVISEIVNEEKVFFYDHILKEISPM >NZ_CP010086|1317228:1323271|1319032_1320076_+|WP_052482744.1|DBSCAN-SWA MKGIEWIKLNTNMCEDETMRLIDSLPLRDSANYVWIRLLLQAGKVNDGGLIYLKKDVPYTKEMLSILFNRPLDIIEKVLDILESFKLIKIYENNIIKICNWEKHQNIEGMKRVKEGTRERVKNFRERKKKEKELVEKKLNTDEACNNAINEGSDTNKINKNKNRNANVTLQKEKREEDKEHKKKNIDKKENKEKDKVNDVALTKEDDETCDKAHKQTKIVSSSHDEIKSQAIRIIKTLEENNKIIRGFTLSWVIKVLMTHKEKYIEMAVREAIERNRLDVNYINGIFKNWLKEGYPKDYEDMEFNNCNAVNSAAVKEKPKLRFINFEPRQYDYDDLERKLLGWTEDS >NZ_CP010086|1317228:1323271|1322407_1323271_+|WP_041894842.1|transposase|DBSCAN-SWA MCRLNPKVDFAFKKLFGSEENKDILISFINSMLSENQQIKDVYLKNPYNIANYRKDKMSILDIKAVDDKGIWYDIEMQLSEQIFYEKRAFYYWAKVYSDQLEGGYNYDKLRKTISINILDFDYLDEEEFHNVYKVYNEESKKELSSVFEMHFLELNKFKKDFKDVRTALDRWIVFLNRAYELEKDKIPEELAVDEAVKKAVERLDVMYLDKDEREIYENDLKRLRDYIAEMKTTEIRGIEKGIKKGIEEGENKKAFEIAKNLLDVLDNETIALKTGLNINEIEKLRL >NZ_CP010086|1317228:1323271|1320092_1321013_+|WP_041894837.1|DBSCAN-SWA MRYVKGIDISNNNESIDFDKVSEDNIEYVYMKATEGKTFQDSRLEEFYNSCKSNGLKVGAYHFLVSTSSPQAQAENFYKKIKDCAWDMIPMLDIESEFDELCDYIIRFINAFKELSPLQLGIYSYTGFLSNIEEIKSKIKDYPFWEANYNNDPWNLPSNFFTNRIGHQYTENGDISGVSGKCDVNLFTQGVLLKNNMYLGTWINENDKWWYKHNDGTFTKDDWEFINGKWYFFDAEGWMIHDWKKYGDSWYYFGDYNDGAMKTGWYYDEKSSKWYYFNEEGIMQTGCIKIDDKWYRFDNNGAMETE >NZ_CP010086|1317228:1323271|1321150_1321993_+|WP_041894839.1|DBSCAN-SWA MERLKLIKVISGLLVVASVSVLNPIEIYAAETEGNSVQSTDTIVNNVGSELKVNSEKESDKSLNNKDTVSVTGVMLNESSAVINQGDTLKLKETVLPSTADNKKVTWKSSNTDVAKVSSSGEVKGISQGTTTITCTANDGSGRSDTCKVTVYYSYYNKIGLLNKDGSAMELYSDDKYNSNNIVSEAKNKRTYYAKASSDNISVNIKRLDEKYIKVFRVTSYSDIGEVRRAKLVDNDNIVLDPGTTTLIIRVYNNKPDSSIKYEDDNNILNEYEVKVELDR |
7 | Clostridium_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1765922 : 1779584
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP010086|1765922:1779584|DBSCAN-SWA TGTGAAGTATTATATATATCGTGGCAAGAGAATTCATGTGGTTGATAAAGACCTTGTATTTCGTTTTGCTGCTACCTATTTAGTATCTATTTTTCTTCTAGTCATTCTGCTGCTTCATAGTAGAACAATTATGCGGATTGACTGGAAGAATATATCATTGTTAAATCAAGGTGAGGTTCACCTTGATATTCCATATATGATTATAAGTATAGTAATAGCAGCAGCTGTATGTTTAGTTGCTGCTATTACTTATTATCAGCACTATATAGATTATATTAAGCAGTTATTTCATAGGCAGAAGCTTGCAAGAATGATACTAGAAAATAAGTGGTATGAAGCAGAACAGTTACAATCAAACAGTTTTTTTAAAGATCTCTCTTCTGGAAAGACAAAGGAAAGAATAACTCATTTTCCAAAGATGTACTATATGTTAAGAAATGGTTTGATTCATATTCAAGTAGAAATTACATTAGGTAAATATCAAGACCAGCTTTTACATCTTGAAAAGAAGCTTGAAAGTGGTTTATATTGTGAGCTTACCGATAAGGAGTTGAAAGATTCTTATGTGGAATATACACTACTTTATGATACAATAGCAAACCGTATTTCTATTGAAGATGTACAGGCTGAACATGGTAAATTAAGATTAATGAAAAATATCTACTGGGAATATGATAAGCTTCCTCATATGCTTATTGCAGGTGGTACAGGTGGAGGAAAAAGTTATTTTATTTTAACATTAATTGAAGCTCTGCTGCATACCGAGTCTATACTTTATGTTCTTGACCCTAAAAATGCAGACCTTGCAGACTTAGAAGCTGTTATGCCAAATGTTTATTATAAAAGGGATGATATGATTTCATGTATTGATAGTTTTTATGATGGAATGATGAAACGTAATGAGGATATGAAGCAAATGAAAGGATATAAAACAGGTGAAAATTATGCTTATTTGGGTTTGCCTGCTAATTTTCTTATCTTTGATGAATATGTTGCTTTCATGGAAATGCTGGGGAGTAAGGAAAGTGCCGCAGTTCTTAACAAGTTAAAACAGCTTGTTATGCTTGGAAGACAGTCAGGATATTTTTTGATTCTTGCATGCCAAAGACCAGATGCGAAATATCTTGGGGATGGAATTAGGGATCAATTTAATTTTCGTGTAGCATTGGGGCGTATGTCAGAAATGGGTTATGGAATGATGTTTGGGGAAACTGACAAGGATTTTTTCTTAAAGCAAATTAAAGGAAGAGGGTATGTAGATACAGGTACAAGTGTTATATCTGAATTTTATACTCCACTTGTACCTAAAGGTCATAATTTCTTAGATGAAATAGATAAATTAGTTGTAAAAACAGAAAAAACAGATTAAAGTTTGGAGGTGTTTAATTTCATGCAAGAAATGTATTCTATTGAAAATGTTGAAGAAATTATAGGTTATGATGAATACATTAAGGATTTTGAAGAGCAGGCAGCAGAGTTTTGTAAAACATCTGGTACTAGAATATTACAAAGTGTTTTTTCTGAATTTACTGCTGATATGATTTGCAGTGTTTATTTAGATTATGGACAAACAAAAGCAGAATATCCTATAAGATTTGAGTTTAATATTAACGTGGAAGATGGACAAGTGTTAGTGTCTTATCTTGGTTTTAGTTAAAAAAGTTTAAAACAACAAGAAAACAAGAAGCAGGCAGGAAGTGCAGGCGGCGTGCGAAGCGAAAGCCGCAGGTGATTTCTGTCTGCTTGCAGGTGTGGCGATAGCCACGCCTGCATATAATTAGCCCCCCGTATCTAACAGGGGGGCACAAATCAACTAGAAACAGGAAATGAAAAATGCGGAAACCCTTTATTTATAAAGGGTGAGGTAAATTTAGAGGGTATGTGAATTAGATCAATTATTGTTCACATACCCTTTTTTGCTTGGAGGGATTTTAACTGAATAAAGACGCATGGGTACAGGAAGTAAAGGAAAAGCGCTTAGAATATGGCATCTCACAAAACAGACTTGCGGTTGAAGCTGGAATAAGCAGAGAATATTTAAACAAAATTGAAAATTTAAAAGTAACGCCGACGCAAGAAATACAAGATTCCATCATGAAAGCGTTGGAACATTTTAATCCAGATGCTCCACTGGAAATGTTATTTGACTATGTCAGGATTCGTTTTCCAACTCTTGATGTTAAGCACATTGTGGAAGATATTTTAAGGCTGAAATTTTCCTATATGCTCCATGAGGATTATGGTTTTTACTCTTATTCAGAGCATTACTGTATGGGTGATATTTTTGTACTGGTATCTGGAGAAGAAGAAAAAGGTGTGCTGTTAGAACTAAAAGGGCGTGGCTGTCGTCAGTTTGAAAATTATCTGTTGGCACAAGAGCGAAGCTGGTATGAATTTTTTATGGATGCGCTGGCTGAAGGAGGTGTGATGAAGCGGCTTGATCTTGCCATAAATGACAGAGTAGGAATTTTAAATATTCCCAATCTTACAGAAAAATGTAGACAAGAAGAATGTATTTCTGTGTTTCGTAGTTTTAAAAATTACCGTAGCGGCGAGTTGGTGAGGAAAGATGAAAAAGAATGTATGGGGAATACGCTGTATATTGGTTCTTTACAAAGTGAAGTTTACTTCTGTATCTATGTGCGCCCATAAGGGCTTGGTTTAAGAATGTGTAGTAACGATACACTAGGGTATAAATACCTTTAACGCCCTATCAACATTCGACTTATCTGAAAGGGAAACCAGACAGGGAGTGAAGCATGTCGAAAAAGTCATAAGTTAAACAGTTATCAGTTTACGACTGAATGGCGAGTTGAAAAATAAGAATAAGGATGAAAGCTAAACTGCCTGAATGACAGTCTGACTAGGATATAGAACCTCTTAATGGAACGATAACTATTTACGTTAAGTGAATTTGGGTAATACACACATCGTAGATACGTGTATTAATGGTATTTCCAGATTCAAGTCTTTTCATAGGAATAGATAAACAGACGAATGTCACATCCGCTATCTTATGTAGTTAGTCTACCAAGTACTAAATGGGGATTGCCTAAGTTAGAATGCTAGAAATAGCTATGTGCAATGCCAATATGGTGATAAATTTCAAGAGGAAACTCAAGAAAGATGGCACTGAATATCTAATATGGTAACGGAGATTTCGTAGTAGTCGGGGCTAGGGAAAGCCTAGTACAGGGCGAAGGGAATCAACTTATTAAGTTTAATGAATTTTAGGAAGGAGCGTGATGCTCAATGAGAAATCCAGAAGTGATATTAGACAATCTAGTCAAGCAATCAACAAAAGCTGAATATCAATTTCAAAGATTATATAGAAATTTATTCAACAAACAGTTCTATATTATGGCATATGGAAGAATTGCTCATAAAACAGGTAATTTAACAAAAGGTGTTGATAATGAAACCATTGACGGCTTTAGTATGAAACAAATCCATCAGTTGATTGATTTAATGAAAACTGAACAATATCAACCAACACCTGTTAGACGAGTATATATTCCGAAAAAGAATGGTAAGAAAAGACCATTGGGAATACCAAGTTTCAAAGATAAATTAGTTCAAGAAGTTATCCGAATGATTTTAGAAGCAATTTATGAAAGTCAGTTTTCTAAATATTCACATGGGTTTAGACCAAACAAGAGTTGTCATACAGCTCTATCACAAATACAAACAAACTTTATTGGTACCAAATGGTTTATTGAGGGAGATATCTGCTCTTTCTTTGACAACATTAATCATCAAATAATGATTAATCTTTTACGCAAAAGAATTCAAGATGAGCGATTTATACGTTTAGTTTGGAAATTTTTAAGAGCAGAATATTTGGAAGATTGGAAATACCACAAAACATATAGTGGTACTCCTCAAGGCGGAATTATCTCACCTCTTCTTTCCAATATTTATCTTCATGAATTGGATACATATATGGAAGAATACCGAACAAAGTTTAATAAAGGTAAAAAACGGAAAATGAATCCTGAATATCATAGATATGCAAGCAAAGCTTCTAAAAGGAAACAAAAGTTGAAGAATCTTGATATGAGTGATGGTGAACGAAATGTACTACTGCAAGAGATTAAAGAATTTAAAAGTAAAATGCATGAGTTACCATCAAAACTAGCGTTTGATGAAACTTTTAAGAGAGTATCTTATACAAGATACGCTGATGATTTTATTATTAGCGTTATTGGTTCAAAGGTTGACGCACTAACTATCAAGAAAGACATTGAACAATTCCTTAATGAAAAGCTAAAAATCCAACTTTCAGAGGAAAAAACACTTATCACCCATCATTCTAAATTTGCAAAATTTCTTGGATATGAAATTACCATTTCAAGAAATCAAAATATTAGTACAGATTGCATGGGTGTTAAAAAGCGTGTACATGGAAGTAAAGTAAAACTCTACATTCCACAAAGTGCATGGGTAAATAAATTGAAAGATTTAGGAGCTTTTAGAATTGATAAAAATGGAACTTGGAAACCTACTCCCAGACCTTATCTGATGAACTTGAATGATTTAGAAATTTTAAGCACTTATAACTCGGAAATTAGAGGTTTGCACAACTATTATAAATTGGCAAACAATGCAACTGTTTTACAACACTTTGCTTATTTTATGAAGTACAGCATGTATAAAACCTATGCTTCTAAATATCAATCATCAGTTCGTAAAATTTTACGAAAGTATCAAGTAAATAATTTGTTTCAAGTTAAGTATGAAACAAAAAAAGGTACAAAAGTAAGAACCGTATATAACGAACGTATCGTGCGTGAGAAAAGACCAGATACAAGTGCTAACGTTGACAATATAGCTAATACGCTAGTTTATCGTTCACAAACAGAATTAACCCAAAGGTTACTGGCTGATAAGTGTGATTGGTGTGGTAAAGAAAATAGTGAAGTTGAAGTACACCATATACGGAAATTAAAAGACTTAAAAGGAAAAGCTAAATGGGAAAAAGCCATGATAGCTAGAAAAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP010086|1765922:1779584|1769173_1770982_+|WP_061114818.1|DBSCAN-SWA MRNPEVILDNLVKQSTKAEYQFQRLYRNLFNKQFYIMAYGRIAHKTGNLTKGVDNETIDGFSMKQIHQLIDLMKTEQYQPTPVRRVYIPKKNGKKRPLGIPSFKDKLVQEVIRMILEAIYESQFSKYSHGFRPNKSCHTALSQIQTNFIGTKWFIEGDICSFFDNINHQIMINLLRKRIQDERFIRLVWKFLRAEYLEDWKYHKTYSGTPQGGIISPLLSNIYLHELDTYMEEYRTKFNKGKKRKMNPEYHRYASKASKRKQKLKNLDMSDGERNVLLQEIKEFKSKMHELPSKLAFDETFKRVSYTRYADDFIISVIGSKVDALTIKKDIEQFLNEKLKIQLSEEKTLITHHSKFAKFLGYEITISRNQNISTDCMGVKKRVHGSKVKLYIPQSAWVNKLKDLGAFRIDKNGTWKPTPRPYLMNLNDLEILSTYNSEIRGLHNYYKLANNATVLQHFAYFMKYSMYKTYASKYQSSVRKILRKYQVNNLFQVKYETKKGTKVRTVYNERIVREKRPDTSANVDNIANTLVYRSQTELTQRLLADKCDWCGKENSEVEVHHIRKLKDLKGKAKWEKAMIARKRKTMILCHKCHVNLHYGRLD >NZ_CP010086|1765922:1779584|1767311_1767578_+|WP_061114817.1|DBSCAN-SWA MQEMYSIENVEEIIGYDEYIKDFEEQAAEFCKTSGTRILQSVFSEFTADMICSVYLDYGQTKAEYPIRFEFNINVEDGQVLVSYLGFS >NZ_CP010086|1765922:1779584|1775328_1777662_+|WP_041895424.1|DBSCAN-SWA MKQSKLKKQKVKFNWQCVMKIAITVLMVLVIAVFLLAMVGTVAHAAGLVDDTVKAGNEYSKYPLDNYQLDFYVDNSWDWLPWNWIDGIGKQVMYGLYAITNFIWTISLFLSNATGYLVQEAYSLDFITATAESIGKNMQTIAGISTSGFSTNGFYGGFLLIFILILGIYAAYTGIIKRETTRVINAVVNFIVVFVLSAAFIAYAPDYIEKINGFSADISNASLSIGTKIVMPDSKSQGKDSVDLIRDSLFAIQVKQPWLLLQYDNSDIKAIGENRVEKLISTSPDTNNGKDREEIVKSEIEDKENTNLTITKTINRLGMVFFLFIFNIGISAFVFMLAGIMIFSQVLFIIYAMFLPISFLLSMIPTFEGMTKRAIMKLFNTIMSRAGITLIVTTAFSISTMFYNLSTGYPFFLIAFLQIVTFAGIYFKLGDLMGMFSLQSGESQSMGRQILRRPRMLMLAHMHRLQHKLGRSISANGKKSNVGKKSSNTAGASASRAAKADHTRPDGKQEENFDKTSFGRKAGETAGKVMDTKDRIQDTAGQLKEQAKDLPVNAKYALYHGKSKIKNGISDFKSSVTDTRKARQQGRKDKEDKRRATIAERRSKMEEALKGKNQNSTEPNKMANSTHERPATAETQGRKVYHDKSDRTGTIRKDTRASTNDRKSTDRPNERIVREPGEQPKGSNIDSSSSKKERKIAKPDKAPIKAERKFVSDSHNTRDSNVEKKPPKAVYPALREKEPQKQLIKERRITIKRGIGSQKKVKITNAATVVKKRGQKK >NZ_CP010086|1765922:1779584|1771922_1772423_+|WP_041895418.1|DBSCAN-SWA MEMQVYIANLGKYNEGELVGAWFTPPIDIEDMKEKIGLNGEYEEYAIHDYELPFDIDEYTPIEEINRLCSLAEELEGTPIEAEMREIQRNFFSSFEEMAEHVDDIIHFPDCDDMADVARHYIEETGVLGEIPASLQNYIDYESYGRDLEIEGNFLVTAHGVFEYIG >NZ_CP010086|1765922:1779584|1777658_1778660_+|WP_041895426.1|DBSCAN-SWA MKAKHIIIMISSIFVLMFSMLLIVAILFSDEKNGGNSNIEYGGVNVSAEVLAYKPIVEKYAKEYGISEYVNYLLAIMQVESGGTLQDVMQSSESEGLPANTLSAEESIKQGCKYFASLLKAAKNKDCDINTVVQSYNYGGGFIDYVASRGKKYTFELTESFANEKSGGSKVNYDNPIAVKENGGWKYSYGNMFYVLLVSEYLTSEKFDDATVQDIMNEALKYEGWKYVYGGYTPTTSFDCSGLVQWCYGKAGINLPRTAQEQYDVTQHIPLAEAKAGDLVFFHSTYDAGTYITHIGIYQGNNRMFHAGNPIGYADLSSSYWQEHLVGAGRIQK >NZ_CP010086|1765922:1779584|1771614_1771836_+|WP_041895417.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYNWFLTNAQSLVLMAIVVIGVYLGFKREFSKLIGFLVIALIAVGLVFNAAGVKDILLQLFNKIIGA >NZ_CP010086|1765922:1779584|1778678_1779584_+|WP_061114819.1|DBSCAN-SWA MNFIKREKKVKQPKPKKLRVYKVNTHKKTVLALWVLLIASFCFAVYKNFTAININTVHETKVIDKEIVDTHKVENFVKNFAKDYYTWQPSQSSIENRNEGIKKYLTEELQALNVDTIRRDIPTNSAVQDVEIWAVKQSEEKQFQVIFRVDQFITEGENKKNVRSAYEVVVYVDDSGNMVIIKNPTICSIPAKSSYQPKAKESNGTVDAATTGEINEFLKTFFKLYPTATEKELSYYVKDSALKPIGKDYVFAELLNPIYIKKENQIQVSVSVKYLDQQTKATQISQFDVMLEKDKNWMIIK >NZ_CP010086|1765922:1779584|1772878_1775332_+|WP_041895422.1|DBSCAN-SWA MAYPIKYIENNLVWNHDGECFAYYELIPYNYSFLSAEQKFIVHDSFRQLIAQNRDGKIHALQISTESSIRATQERSKKEVTGRLKEVAYEKIEEQTEALISMIGDNQIDYRFFIGFKLLLNDQEVTIKNIKKEAANALSDFLKDVNHKFMGDFVSMSNNEIGRFTKMEKLLENKISRRFKVRRLDKNDFGYFIEHLYGQTGTAYEDYEYYLDSRKFKHETLVKRYDLLKPTRCLIEENQRYLRIEHEESTTYTAYFTINSIVGELDFPSSEIFYYQQQQFTFPIDTSMNVEIVSNKKALSTIRNKKKELKDLDNHALESDTETSSNVMEALDSVNELETSLDQSKESMYKLSYVVRVSAPDLDELKRRCNEVKDFYDDLNVKLVRPFGDMMGLHNEFIPASKRYMNDYIQYVTSDFLAGLGFGATQMLGETEGIYIGYNLDTGRNVYLKPALASQGVKGSVTNALAAAFVGSLGGGKSFSNNIIVYYSVLFGAQAVIVDPKAERGRWKETLPEIAEEINIVNLTSEESNKGLLDPYVIMKRPKDSESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAIRAVTKSEKRGLLLVIDELRAENTTISNSIADHIESFTDYDFAHLLFSDGSISQSISLEKQLNIIQVADLVLPDKETSFEEYTTMELLSVAMLIVISTFALDFIHSDRSIFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSMKLVRAGRAMNAGVYFVTQNTDDLLDEKLKNNLGLKFAFRSTDINEIKKTLEFFGVDKEDENNQKRLRDLENGQCLVSDLYGRVGVIQFHPIFEELLHAFDTRPPVRREVEQ >NZ_CP010086|1765922:1779584|1765922_1767290_+|WP_041895365.1|DBSCAN-SWA MKYYIYRGKRIHVVDKDLVFRFAATYLVSIFLLVILLLHSRTIMRIDWKNISLLNQGEVHLDIPYMIISIVIAAAVCLVAAITYYQHYIDYIKQLFHRQKLARMILENKWYEAEQLQSNSFFKDLSSGKTKERITHFPKMYYMLRNGLIHIQVEITLGKYQDQLLHLEKKLESGLYCELTDKELKDSYVEYTLLYDTIANRISIEDVQAEHGKLRLMKNIYWEYDKLPHMLIAGGTGGGKSYFILTLIEALLHTESILYVLDPKNADLADLEAVMPNVYYKRDDMISCIDSFYDGMMKRNEDMKQMKGYKTGENYAYLGLPANFLIFDEYVAFMEMLGSKESAAVLNKLKQLVMLGRQSGYFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSEMGYGMMFGETDKDFFLKQIKGRGYVDTGTSVISEFYTPLVPKGHNFLDEIDKLVVKTEKTD >NZ_CP010086|1765922:1779584|1772502_1772895_+|WP_041895421.1|DBSCAN-SWA MKKIRSYTSIWSVEKVLYSINDFKLPFPITFTQMTWFVLSLFAVMMLGNIPPLSMINGAFLKYFGIPMAITWFMCQKTFDGKKPYGFLKSAIAYFIRPKITYAGKPVKLHNQKMNEAITVVRSEVYGISD |
10 | Streptococcus_phage(88.89%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1868483 : 1918343
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP010086|1868483:1918343|DBSCAN-SWA 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MVAGHLQEKKGYFYMVLSYKDLNGKRKTKWLPTGLVIKGNKKKAEIMLMDARRNFKVTSEIGDENILFSDFMLSWLEMMKNNIEVTTYASYSNCVKKRVAPYFKEKKILLKDLQPKHIQAYYQHELNDNKISANTVIHYHANIRKALQYAVKIDMIPSNPADKVERPKKQRFVGSFYDGEEINNLFEIVKNSKIELAVILAAFYGLRRSEIVGLKWDAIDFKNKSITIKHTVTEVSVEGKVIIVEKDRTKNKSSYRTLPLVPQFEDLLLKIREQQYINRKICKSSYCNEYLKYIYLDEIGERIKPGYITQHFQIVLDKNNLRKIRFHDLRHSCASLLLANGVRMKEIQEWLGHSDFSTTANIYAHLDYSTKIASANVMVNCLNDKKFSLKIEENLEENMINKKSHTTR |
49 | Shigella_phage(20.0%) | coat,transposase,integrase | attL 1857331:1857347|attR 1899283:1899299 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2500985 : 2536373
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP010086|2500985:2536373|DBSCAN-SWA 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38 | Clostridium_phage(41.38%) | portal,terminase,tail,capsid,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3168301 : 3177473
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP010086|3168301:3177473|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP010086|3168301:3177473|3171715_3171958_+|WP_041896897.1|DBSCAN-SWA MKASGIVRKLDPLGRIVIPKEIRKVLGIDEGDSMEIIKVDNGVVVRKYIKGCIFCGSDKDVVEFNGAVVCDGCRKALGQM >NZ_CP010086|3168301:3177473|3169627_3170932_+|WP_041896895.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATNMHDDEKMKLIDAMPNRDTIHYVWIRILLLGGKLNANGKVFLSEEKPLTAKMLAVLFSRPLEDIKIALKVLSNFGMIEIDSNKVIRIVNWDKHQNIEGMERVREQNRKRVENHREKKKEEKNAAKSNKEETQEDQILEEHIDLETNQDLNENVELEERNNLERKKDYSGNSSIEENKALGKNDILENWGVREEISEDTAIDDKSNTVTNTANIISIMETSDNNCTVTKNTSNVTVTQQNKKEMENKKKNKKEKKEIDKDKNIEGKKNTGFDINNKGSAYDEEVSQSNLFKKHNNTKSESGEEEDINLKALELMHYHEKITGKPGGCDYVALRSAIDIHGERMVKMAMDVGFEKNCPDIKYAIGVLKNWRRDGYPEDHMEVKKNGVRSNGKSNTADKNEFAGFKPKEPRKLTEAERKRIEENLI >NZ_CP010086|3168301:3177473|3168929_3169154_+|WP_041896890.1|DBSCAN-SWA MYSKLKGIMVEKRITQQELAEKLKITASALNYKVNGKSDFSVTEAKFISDFLGKTIEELFIIDDFNNMKTDKNA >NZ_CP010086|3168301:3177473|3170981_3171608_+|WP_041901018.1|DBSCAN-SWA MQPLAVACECRKIEKLKNEWKYSGINVEQSKLTFSSFEVWNNASQRMKDTAAAYCTDFDEIKYKRRNSILLCGQVGSGKTHCSIAVALNFLKQRIKVVYMPYRDVITKIKQNMIDEEYYTKTISKYQLCEVLLIDDLFKGKINETDTNIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLTFDEGVASRIYEMSKDYVVEIEKDISNNYRLK >NZ_CP010086|3168301:3177473|3172544_3172763_-|WP_041896900.1|DBSCAN-SWA MEYSLSMIFLTTSGEKSTLSVSGVKPTLTKDEVNALMETVITKNIFKTNSGDLVKKSGAQVTQRQVTKFDVA >NZ_CP010086|3168301:3177473|3169270_3169492_+|WP_041896894.1|DBSCAN-SWA MEPVLYTVYEATELLKVNKNSVYDLLRNNVIRGLKLGSLKITRTELMKFLEENNDKDLSNLEDIKDLTFGNDV >NZ_CP010086|3168301:3177473|3168301_3168676_-|WP_041896888.1|DBSCAN-SWA MSKFPTRLKELREEKGLLGKDFAKIMSVEPATVTNWEKGNRFPKDDVLIKIADYFDCSTDYLLGRTDDKLAKVYSGTLHNQTIEIEIDKGYPHELTPEDVQNILKQLDAVGLDVNKLIENFKNK >NZ_CP010086|3168301:3177473|3173840_3177473_+|WP_052482845.1|DBSCAN-SWA MGIKKLMIGQKLFLGFGIVILIMLVVIGNSYMNFIKESEAVEWSVHTYGVIRESDELLNSIINMETGARGYVITGDKSFLEPFNQGESSYEQQYNKLKGLTVDNLDQQQRLIDLDKQYREWLNWEKTKIITNRQKVTEGQSELQDVIAIVQSGEGKTMMGNMRLILGEINSEEERLLQNRNTNLVKMENETKTIMLAGGITATVVAAIIASLVVRMILKPVKVVTNTFKEIAEENVNLEARLEINSKDELGDMAKYFNIFMTKLKDLIIENRNQSWLSAGRAELSEELRGIEDINELNLQIISYICRYVDAQIGRIYILTDENTYKLCGGYADKTNGELPDEFNCGEGLVGQSALEKKSILIKNVPENYMKITSGVGEAIPRNILVVPCIYHNEVECIVELGVFNEFTDVQLKFMEQVNENIAISINLTKAQLKMKELLNKTLVQAEELQVQQEELRQNNEELEEQAIILKHSEMNLQTQQEELKVSNEELQEQARELEIQKKVISESNEKLRNANSEIKKKAEDLKLANQYKSEFLANMSHELRTPLNSILVLSQLLENNKDSEILTDKQREYARTIHSSGENLLRLINDILDLSKVEAGKMDINFEEVYLVELAEDIKRLFNPISLQKGLAFEVRIEEGISEKIVSDRQRLQQIISNLLANAFKFTSEGLIRMNIYKTKEHDIEYFDIKGAASNLISIEVTDTGIGIPEDKQKLIFEEFKQVDGTISRKFGGTGLGLSISKELAHLLGGTIYLKSKEGMGSTFTLVISSYSSDNIDLKQLEGESYSIKNINKETNTTVNDENGSMVSEINYEEIKGKSERLLLIIEDDKQFLGILSELAEKKGYKVLSVNNGEEGIKLAERYKPEAILLDIGLPDISGWVVADKLKSMEVTMNIPIHVISGRDDMVSVERQKNLVEWIKKPANLEEIDNLFNNIEVNMPKKLKKLLIIDENSEEVNSIYNNLSEKGFEVTLLDNGLHAYNLMKTEKYDCMILDLKLKDMTGIEFLEKLEEENSINFPILIHTKEDITQDDEAKLKKYVDNIIIKGKRSVDRLIDEASLFFNNVDLNLEDKKIQNIKYNHELESSLINKKVLIIDDDMRNVFSLSSALQEKGISVIVGRNGAEGIEKLHENLDIDLIIMDVMMPEMDGYTAMKKIRKEPKLQNIPIIAVTAKAMKDDRQKCIEAGANDYLTKPIEIDRLISLLRVWLYK >NZ_CP010086|3168301:3177473|3173064_3173289_-|WP_041896902.1|DBSCAN-SWA MAVTKTIDSVSLSIEVQKGLDKAGDPIYTKKTFSGIKTDATPDNVYAVADAIKGVMEANTRDYFINESSSLANS |
9 | Paenibacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3654908 : 3661484
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP010086|3654908:3661484|DBSCAN-SWA TTTAATCCTGCCCTAAAGCCTTTCTGCATCCATCGCAAACAACTGCTCCATTAAATTCAATAACATCTTTATCACTTCCACAAAAAATGCATCCTTTAATATATTTTTTAACAACCACCCCATTATCAACCTTAATTATTTCCATGGAATCTCCCTCATCAATTCCTAGTACCTTTCTTATTTCTTTTGGTATTACAATCCTTCCAAGTGGGTCGAGCTTTCTTACTATTCCTGATGCTTTCATTTTTGCATTCTCCTCATATAAATTATTTCTTGCATTGAATTACACTTGTCTTTTCCTCTAATATCTCTATTTTCTTTTCTAAAATCACATTTTCGTAACCTAGCTTAGGCACAATCTAGGAAACTCCTACTCACATTCGTTCATAGGAGTAAGTGCGAGCAGCCAAATATGAAAGCTCACTTTTTGCTCTCTTACTTAAGCCTATAATTATTACTAATATCCTTCTCAATTTCTACAACATAATCTTTTGACATTTCATATATTCTTGAAGCAACCCCTTCATCAAATGTCAGTAATCTGTCAATAGAGAATTCGCTGCTGACTATGATAGGCAGAAAATTAAGATACCTGTAATTAATAATTTCAAACATAATATTTGTATCTGTTTCATTGATTTTTCCCTTAAAGAGATCATCAATAAGTAGAACCTCACATAATTGATACTTTGAAATGGTCCTAGTATAATATTCTTCATCAATCATATTTTGTTTTACCTTTGTGATTACATCACGATAAGGCATGTACACCACTTTAATTCTTTGTTTTAAAAAGTTTAATGCGACAGCAATGCTGCAGTGCGTTTTACCGCTGCCAACCTGTCCACATAATAAAATACTATTTCGCCTATTATCTTTTATTTCATCAAAATCAGTACAATATGCTGCTGCAGTGTCCTTCATCCTTTGTGACGCATTATTCCAAACTTCAAAACTAGAAAAAGTAAGTTTACTTTGTTCAACATTAATTCCTGAATACTTCCACTCATTCTTTAGTTTTTCTATTTTCCTGCATTCACAGGCTACAGCAAGAGGCTGCATATGTTCCTGGGGGATAAGTATCCATCCAGTATCACAGCATTTATCACATTTATATGAGGTTTTCTTCAATCCTCTTTCGTTCAGCTTCTGTAAGTTTTCGCGGTTCCTTTGGCTTGAATCCTGCAAATTCATTTTTATCTGCTGTGTTACTCTTTCCATTGCTTCTAACCCCATTTTTCTTTACCTCCATATGATCTTCTGGATACCCATCTCTCCTCCAGTTTTTTAATACCCCAATTGCATACTTTATGTCAGGACAATTTTTCTCAAACCCAACATCCATGGCCATCTTAACCATTTTTTCTCCATGGATATCAATAGCTGATCTAAGAGCAACATAGTCGCATCCTCCTGGCTTTCCTGTTATTTTTTCATGATAATGCATAAGCTCTAAAGCTTTAAGATTTATGTCCTCCTCTTCCCTGGATTCACTTTTAGTATTATTGTATTTCTTAAATAGATTCGACTGACTAACGTCCTCATCACAAGCTGAGCCTTTATTATTTATATCAAAACCATTATTATTTTTACTCTCTATGTTTTTATCTTTATCTGTCTCTTTTTTCTCTTTCTTATTCTGCTGCGTTACTGTAACGTTACTTTTATTTCGTGTAACGTTACTATTATTTTTAGTAACAATACAATTATTATTATCAGTTTCTAAAATGTTTTTACTGATATCTTCATTATTATCAATAATTTCTAAACTAATATTATTACCTGCTTCGCTAGTAGTAATATTAGTTTTATCATTAATATACGTATTTCCAGAAGCTTCTTCATTAGTTTCTAAATTTTCTAATATATCATTTTTACCTAGATCTTTGTTTTTTTCTATATTAGAATTCTCAGCGTAATCTTTCTTTCGTTCTAATTCATTAGTTTTTTCTAATTCTACACTTTCATTCAAATCTTGATTTTCTTCTAAATCTATAAATTCTTCTAAGACTTGATCTTCCTGAGTTTCTTCCTTATTACTTTTAGCTGCATTCTTCTCTTCTTTCTTCTTTTCTCTATGATTTTCAACTCTTTTTCTATTTTGCTCACGGACCCTTTCCATTCCCTCTATGTTCTGATGCTTATCCCAGTTCACAATTCTAATTACTTTATCAGAAGCTATTTCAATCATGCCAAAGTTAGATAATACTTTTAATGCAACCTTAATATCCTCTAAAGGCCTAGAAAATAATACAGCCAACATTTTGGCAGTAAGAGGTTTTCCTTCCGACAAGAAAACCTTTCCATTAGCGTTAAGTTTTCCACCAAGTAAAAGTATTCTTATCCAAACGTAATGAATTGTATCCCTGTTAGGCATTGCATCTATTAACTTCATTTTTTCATCATCATGCATATTAGTAGCTAATTTAATCCATTTAATATCTGCCATTATTTTCACGCTCCCATAAATAAAATTGTCTAAACCTTTCGAGACCATTCCATGATGGGTTTAACTCAATTAACTTACAAACATCTATATAACATTTAAAAATCCTAAAATTCATTTGTAAGTCCTCACTTTCTTTTTATACATTTCTATCAAAAGTTGAATCCCTGTACATTCTAGCTCAAGGTGTATGAAAATAATTTTACATTTATATTTTTAATTTAAGATTACTATTTTCTTAATTCAACTAAAATTTCTTTTAATAATTCTTCCACAGCTTGTCCTTCTATAACAATAACTATTAGCGTAACATAATACTCTTAAATTACAATATATGCGTTGCAATTTACACTGCACATTTCACAATTACGTATAAAATTCTTGCAATATTTTTAGAATTGTGATGAAGAATTATTTTTGCAATATATATAATCAATTTTAGATTTCTAATACTATATATAAAGTCAATACATTTTACTCTTTAAGTAATTTATTTATTAAAAAAAATCTCTATTGGATTATTTATATCTAATAGTTTTATCATCTTATCGATTTCATTAGAACCAAATATTCCTTTATTAAGTTTATTACCTAAGGTTTTTGGAGACATTCCTAATTCCCTTGCCAGCTTTTCCTGAGTATATCCTTTTGCTTTTATCTTTCCTTTTAACTCATTAACTAATATCATAAATGCTCCCCTTTCGTTACTCGTTAAGTAATATTTTATATATTATGCCTATTATTGTCAATACTTCTTACGTAACTTTTTCTATATAATGGAAAATAGTTGTTGCATATCCGGAAACAGATGTTATAATAAATTATATTAATAGTCTCCAAATTAGAATGATTTTTTTAATTTGCCTAACTGCAGTAAACAAAATAAATAAAAAGTTATTAAGTTTTATTAGAACGCTTCGATTTTATTATAGATTATCAATAAATTATATTAATTGATAATCTATAATTTACTTACTTTTAATATAGAACTAAGAGGTGATATAAAATGGGTTTGAAAGAAAATATCAAAAATAGACGATTAGAATTGAATCTCACATTAGAAGATGTTTCTAAAAGATTATCTATTAGTAAGCCAACACTTCAAAGATATGAAAGCGGTGTAATCTCTAATATACCTTCTGACAAAATCGAAAAACTTGCAGTAATATTAGAAACAACTCCATCTATTTTAATGGGATGGGATGAAAACAAAATAAAAACACGTTTACAACTATCAGAAGAATTAGAATATTTATTAAAAAAATATAATTCTTTAGATAACCTAGGTAAACATACGGTAAACACAGTATTAGAAATGGAATTTAATCGTTGCTCACAACTTAATAATCAGGATAAGAGCTTTTAATTTCTTGTCTATAATGGGAAATTATTTAATAAAAATAAATTAAAATAAAATACCGAAATTAAATTACAGCACTTCTAATTAATTGTACAAATAAATCTATCGCTGATATATAACCTTTTAATTATTAATTTTCATATATAATTAATAATGCTGTATAATTCACTCTAGAATAATACAGCACTTTCATTTCTTGCTTTAAGCTATATTTAAATTTCAAGTTGCTTTTAATTACACCTTCCTCACGTATAAAAATATTGGACCTTTTCTATTCTCATACTTTTATTTTCATTGCTGCAACTAACTGACCATTTTTATATTTTGTAAATTCTATAATAATTTCTCTTCTATATTTTATGGCCGTTGTTATGCCAACTTCATCAAGATATTTGAACTTCTCATCTTCATGGAATTCTACAACTTTAAATTTAACAAATTTACCTGGATATTATTCTTAGACTTCCTGCTATTTCACATGAATAAACCTTCCTTTATTTATTCTAAGCTGCTCATAGATTATAGTTAAAGTTCAAATTTACTTTATGATTTATTCTTTCTAATTATTTATATCAAAAAATAGCAAGTTAGTTTCCTAATTTTAAACAAGACTATAAATTTGAATTTTGAAGTCTACGTACTCTATCTTCTATAGTTGGATGAGTGCTAAATAGGTTCATTAATCTTTTCGCACTTAGAGGATTGACTATAAACATATGGCTTACTGCAGGATTTACGTCCATAGGAACCACTCTTGAAGCCTGATCTAACTTAAGTAATGCTTTAGAGAGTCCCCTGCTATGTCCTGCAATCCTCGCTCCTGTACTGTCAGCAAGATATTCTCTAGATCTTGATACTGCCATCTGTACTAACATAGCAGCAATAGGTCCTAAAATAATTAATGGTAAAGCTGCTAGGAATCCTGAGCCTTCTTCTTCATCACTGTTACCCATGCCAAACATTAACGCCCATTGCGCCCAATTAGCCATTGTTGTGATTACTCCTGCCATTACAGCTGCAATAGTACTTATAAGCACGTCCCTATTCTTAATATGTGCCAGTTCATGAGCAATAACACCTTCTAATTCTTCATAATTTAGTATATTTAATAATCCTTGTGTAACAGCAACAGCTGAATGCTTAGGATTTCTTCCTGTTGCAAACGCATTAGGCTGTGTAGAAGGTGTAATATAAAGTCTTGGCATTGGTATTCCTGCATTTGCTGTCAATCTTTCCACCATATTATAAATTTCAATATTATCATTTCTTGTTAATGGCTTAGCTCCAGTCATAGATAGTGCAATTTTATCACTAAACCAATAACTCCCTCCATTCATAACTAATGCAAGCACCAAAGCCATCAGCATCCCTGATTGACCTCCAATACCTCTTCCTATTAATACTACTAATATCGTCAGGACACTCATCAAAAGTAAAGTTTTAATTTGATTTCCTAAACCACTCATTTTGTTTTCCTCCTTTTACTTAATTACTAAAACATTTTGATAATTTTTCTCAATTTAGAAATTTATGTAACAAAAAGACTCTATAGCTAGAACACTTTCTAACTATAGAGTCTCACTAAGCATTTTTTGCTTTCAAAGCCGGGATCTCTCCGTAATGACGACTTTGAATCCTGTTATAATTAACAGGCAGTTACTCCCCCTATAAATGAGATTATCACTGTCTTTTTATTATTGTTATTAACAATAATACTATTAAATAAAAAACTTGTCAATATTATAAAAATCTTAACATGATAAACTTTTATTGATTTATCCTTACATAATTGTTATCTTATTTTAAACAAGTTTTTTAATTACTTTTTAAAGTTATTATAGTTCATACAAAAAATCAAAATTTATATTGTTTTTGTATGAAACTTCAAATATATTCAAACAATATATACAGCTTAAATGCAAATTTATCTGAAGGAAGCTACAAAAATGTCTACTAGAAAACATTTATTTAAGTTTTTATTAATTACATTTATAGCCGCTATATTTAATTTAGCTATATGGTATTACATGGGTTCTGAAAGAGCTTTAGAATTTCTCGGAGGATATATTATTGAATTGAGTCTTAGTGTCGATAATCTTTTTCTCTTTTTATTAATTTTCTCAAGCTTTGGAATTACTGCTAAACATCAAAAAAGAATTTTAACTTATGGAATTTTTGGTGCTATTATTCTAAGATTTATATTTGTTTTATTAGGAATTGCAATTATTAATGCATTTAAATGGATTATATATATATTTGGTATACTTCTTATTATAAGTGGTATAAAAATGATGATTAATAAAGAAGATGATGTATCATTTGAGAATAGTAAACTAATTAAACTTCTAAAAAAAATGATACCTGTAACTAAAGAACTTCATGACGAAAAGTTTTTTGTGAAAATAAACAATGTTCTTCATGCAACACCATTATTTGCAATATTATTTTTAATTGAAGGATCAGATTTACTATTTGCTATTGATTCAATTCCTGCAATATTTGCAATAACAACTAATGTTTTCATTGTATATACATCAAATATTTTTGCAATATTAGGTCTTAGAAATTTATATTTTCTTTTAGAAAAACTACACAGCATCTTCGAATATGTTAAATATGGAGTAGCCTTAATACTTATATTTACTGGTATAAAGCTTGGAATATCATTTAAGTATCATATATCTATAGGGATTTCTATTTCTGTTATTATACTAATTCTTGTAATAAGTGTAATTGCCTCTATAATAATTAGTAGAAGAACCAAAAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP010086|3654908:3661484|3658359_3658719_+|WP_041897339.1|DBSCAN-SWA MGLKENIKNRRLELNLTLEDVSKRLSISKPTLQRYESGVISNIPSDKIEKLAVILETTPSILMGWDENKIKTRLQLSEELEYLLKKYNSLDNLGKHTVNTVLEMEFNRCSQLNNQDKSF >NZ_CP010086|3654908:3661484|3659324_3660179_-|WP_041897340.1|protease|DBSCAN-SWA MSGLGNQIKTLLLMSVLTILVVLIGRGIGGQSGMLMALVLALVMNGGSYWFSDKIALSMTGAKPLTRNDNIEIYNMVERLTANAGIPMPRLYITPSTQPNAFATGRNPKHSAVAVTQGLLNILNYEELEGVIAHELAHIKNRDVLISTIAAVMAGVITTMANWAQWALMFGMGNSDEEEGSGFLAALPLIILGPIAAMLVQMAVSRSREYLADSTGARIAGHSRGLSKALLKLDQASRVVPMDVNPAVSHMFIVNPLSAKRLMNLFSTHPTIEDRVRRLQNSNL >NZ_CP010086|3654908:3661484|3657843_3658041_-|WP_023975159.1|DBSCAN-SWA MILVNELKGKIKAKGYTQEKLARELGMSPKTLGNKLNKGIFGSNEIDKMIKLLDINNPIEIFFNK >NZ_CP010086|3654908:3661484|3654908_3655151_-|WP_041897337.1|DBSCAN-SWA MKASGIVRKLDPLGRIVIPKEIRKVLGIDEGDSMEIIKVDNGVVVKKYIKGCIFCGSDKDVIEFNGAVVCDGCRKALGQD >NZ_CP010086|3654908:3661484|3655342_3655969_-|WP_012058443.1|DBSCAN-SWA MQPLAVACECRKIEKLKNEWKYSGINVEQSKLTFSSFEVWNNASQRMKDTAAAYCTDFDEIKDNRRNSILLCGQVGSGKTHCSIAVALNFLKQRIKVVYMPYRDVITKVKQNMIDEEYYTRTISKYQLCEVLLIDDLFKGKINETDTNIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLTFDEGVASRIYEMSKDYVVEIEKDISNNYRLK >NZ_CP010086|3654908:3661484|3660629_3661484_+|WP_081098849.1|DBSCAN-SWA MQIYLKEATKMSTRKHLFKFLLITFIAAIFNLAIWYYMGSERALEFLGGYIIELSLSVDNLFLFLLIFSSFGITAKHQKRILTYGIFGAIILRFIFVLLGIAIINAFKWIIYIFGILLIISGIKMMINKEDDVSFENSKLIKLLKKMIPVTKELHDEKFFVKINNVLHATPLFAILFLIEGSDLLFAIDSIPAIFAITTNVFIVYTSNIFAILGLRNLYFLLEKLHSIFEYVKYGVALILIFTGIKLGISFKYHISIGISISVIILILVISVIASIIISRRTKK >NZ_CP010086|3654908:3661484|3656018_3657356_-|WP_041897338.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATNMHDDEKMKLIDAMPNRDTIHYVWIRILLLGGKLNANGKVFLSEGKPLTAKMLAVLFSRPLEDIKVALKVLSNFGMIEIASDKVIRIVNWDKHQNIEGMERVREQNRKRVENHREKKKEEKNAAKSNKEETQEDQVLEEFIDLEENQDLNESVELEKTNELERKKDYAENSNIEKNKDLGKNDILENLETNEEASGNTYINDKTNITTSEAGNNISLEIIDNNEDISKNILETDNNNCIVTKNNSNVTRNKSNVTVTQQNKKEKKETDKDKNIESKNNNGFDINNKGSACDEDVSQSNLFKKYNNTKSESREEEDINLKALELMHYHEKITGKPGGCDYVALRSAIDIHGEKMVKMAMDVGFEKNCPDIKYAIGVLKNWRRDGYPEDHMEVKKNGVRSNGKSNTADKNEFAGFKPKEPRKLTEAERKRIEENLI |
7 | Paenibacillus_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4241007 : 4250743
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP010086|4241007:4250743|DBSCAN-SWA CCTATTGAACTATTTTAATACCCATATTGGGACTTACTTTTACATTATCTGCAAAACCATTGGTTATTTTATCTGTTATTTTAAAATACAAAGTATCACTTGTCCTATCAGTTATAGCTGGCAGTGTCTCATTAATATACAATTGCATTTTTCCTGATAACTTAGCGCTGACTTCTTGAAATTTTGACTGTAGTATTTGTATATCTCCTTTAGTTGCGACTACTACATTTGGATCTATCTTAAGATCTATGCTGCTTGCATTGCTGACTTCTAATACAATTTTTATAACTAAATCTTTTGTGCTTCCTTCTAAAATTGTTGGTTTATAGGTTTCTGATAATTTGGTGATGGCAATCATATCTCCAGCGTCATCAAAAATACCAGCTTCTCTGATGAAAAACCCTCCATCGGCTGCTGGTATTACTGTTTCTACAACTATCCAGTTTTCATTTGATTCATCAACTGAAATTGCACTTATATTTCCTGACCAAACTTCTTTTACAATTGAGGTTTGATCTTCTGAAGGTTCATAATATGATCCGTTTCCATCTCCAACTTTTAGGGTTTTAAAATTCACTTTACTACCTGAAACCGCTGAAGCCGATAATTTTTTTGTCCCTAATTTTGTTAACATTGTATAAAATTTTTCTGCCAAATTAACTCATCTCCTTACTGGGATATATTGTTATGCTTTCTGAACCTGTACATTGACCGATACCACTTTCCATTTTTCCGCTGGATTCAATATTTTTAGCTCTCCATGGATAAACTGTCATAGTCTCTCCCATAATTGATGCTAAGCCATAGTACATTTGTGATTGATTCATAGATATTAGTTTATACTTAACACCTAAATGTGCCGGCTTAGCTATTTCTATTGAGTCGTACAAACTATCTAAAGCATAAGGAAAGCCTGTATCACTTATTAAATTCACTTGGAAATAGTATTCTGGGTTATTCTGAATTATTTCAGCTTCTGAAACAAAGCTTTTACAGATCTGCTTTATTACTTCAACTGTTGTTGTGCCTTTAGAGTTAAGCTTTGCTAATACCCTTGCTCTTCTTTCTTCAATTGATTTAGCATTATTTGTAGTTATTCCAACTCGTTTTTCCCATAGTTTCAAGCCCCATTCAGTTGCAGTTTGGGGCAAAATTTGCAGGAATAAATCTGAAATATCCAAACCTAATTGGTCAAAGCTACTTCCGTAAGCATTAAATATTTCCTGGAAAATATAGCTATTTTTTATTTCATCAATAACATATCTCTCTATCTTATCTTTTGACTCATTTCCACTATTTTCACTTGAAGCACTTGCAATCTTAATATTTTTAAATGCTTCTAAATCAGCTGTATTATTCATAAGTTACCCCTCCCAAAGATGCCTTATCTTCATCAGCTGTAATTATATTTTTAGTATCATTGTTTATTTTTACTGAAGATATATCATTAACTCCAGCTGTCATTACTACCTTTGCCTCAACAGTATTTATTTTTACAACTCCGCCTACTGGAATTGTTTTAAAATAATTATCAAGAGACTCTTTTATATTGTCTTTAACATCCTTTATATCAAATCCATCTAATACAGTGAGACCAAGTATATTAACATCAATTTTTAATGGATTGACTGATACTACAGTTACTGTGGCCCCTATTGGTGCCTTACCACTTCCTTGACCATCTTCTGGATCTATATATTGTTTAACTTTTTGTACTATAGTATCATCTAGCTCCATTCCATTATTTCCTGCAACTATTACCTTTACAGTACCATTTCCATTCATTCCATTGCTTTTATCCCAAAGAGGTTTTACTTTCACATACTCAACACCAGATATTTGAAGTGCCCATTTTTCATAATCATATATATTTCCACTGCTGCTTTCTTCTCTTTCTTTAGATATGATCCTTTCTAACAAATTTTCACTAGTTTCAGTATCAGTTCCACTGGTAGTTGCACTTTCATTTTTCACACTAGTTATCCCATTTATTTTAATTGGTATTTCAACAATAGCATTAGCTGGAACATTATATTTTGAACCTATTTCTATTGCTTTAATTGCTAGTATGCATTTCCCATCTTTAATTTTTCCTTGAGATGTCACCTTATATTTCAAGCCTTCAACAGTTTGAACCATGCTGTTTTCATATATTATAGAATTTTCTAACCCTGAAAAAGTCACTTGCCCCACTGAATATAAACCTTGTTTCCTCTCTAAACCATGTCTTGCTGCATCTTTATCTATAAATTTATCATATTCATCTTGAGGAACCTCTGGAGCTTCCTCACCAAATACTAATTTCAAAATTGTATCTAATGCCTTATAATAATCTGCTATGGTTTTAGCAGATGGAGCAATAGCATCATATACAAAATATCCTTCACTTTTTGATATTCCAGAATCAATACTATCTAGCATTTGTGATCTTAAATTTTCTTCAGTATTATTTTCATACATCAATTGTCACCTCCCCACAATCAGTTATTGCTGTAAAAGTTATGGTTAAAATATCATTGTTTTTATCCACCTCAAAGTTTTTTACACCTAATATGTGCTGATTTTCCTTTAAGCACTCTAAAGTTAACCTTTTAGCCTCACTTTCAATTAAACTTTTACTGAACCCTTTACCAATTATTTTTTCAAATTCATTGCCATATGCATCGCTGTAAATTGGATATTTTCCTTTGCTGGTTTTAAGAGCTTTCCATATCCATATTTTTAATGCTTCTATTCCTTCTACAATTTGAAATTTCCCATCTTTAAGTTTGAAATCATTTTTTTCAAAGTCCCAAGCATATTCTTTAGGAATATCTTTAGTTTTCTCTTCTTGTGAAAATGCCGCAAGTTTATTTGCCATGTTTAAATTTGCTTCAGGTAATATACTAATCACTACATTTCACCACCTTGCAAAGTATTATCCATGTTTGATTATCCTTAGTAGGTAAGACTGCTAGCTCATCACCAATTTTAATTGTATCTAGAAAGCTTACTGCAGTACCATCAGTATTTGTTACTGATGCTTGTCTTGAATATCCCGACAATAAATAATCAGCTATATAAAGATCATCCTTATATAGCTGCAAATCATTTGTTTGAATTATTATTTCAGGAGGTGGAGAATTAACCTTAGCAATGCATATGGAAAGAGGATTACTTTCTGCACCTTTTCTTTTCATTAAATTTAACATTTTTACATATGGATCCATTAGCTATCAACCTCCTGTAAATCCATTTTGTTGCTTAAGCTTACTGTAAGCTTCATTGTATATTTTCCTGTTCCACATTCCCAGGTATGAGTATCAGCATTAACATAAAGAGTTGCATCTTTCAATATGTCTAAATACCATATTTTTGCCTTAACAGCATATCCTGTTAAGCAGCTGTAATTACCAATGGCTTCAATTTCTATTTCTTCACTGAAGCCATATAACTTATTTTGTGCTACTTCATATGTGCTTTTATCATCTTCCACTGTGTACGATGTCTGAAAAACACCATATCTTTTTACTAGCTCTGAATTTTCCACTTGATCTACATAGTTATTGTTAGCATCAAAAATTTTTACTCTGTTTATCATATTTTCTAAAGAATCTTTGTAACTCATATCTATTATGTTGTTATTGTACAAATCCACATTAGCAGATTGAAGCAAATAATCTGATATTATTTGCCCCTTCTCAATTACATTGAACATATCAGCTTTCATAATAGGAACATATTGTTTTCCATTTTGCTTGCTAACTTCACTATAGCACTGCATTATTATGCTATAATAACTCTTATCTGGACATAACCTATCTATTGGAACCCCAGTTGTCACCACATCACCAACTTTTATGTTTAATTCTTCACAAGCTTTATATACAACACTTTCTGGAGACATATTCTTAATATTCATGCTTGTTGATGAACTCATGATGAACCTCATATAATCATAGCAAGTAAAAGTTTCCTCCTGATTCGAACTTCCTAAAGTCCTATCTACAACTTCACCTCTAAAAATTTCTCCATAAGTTTCATCTACAATCTTTATTAATGTTCCTGGACATATTTGAACTCTAGGCTCATTTATATCTGATAAGGAATATAACATACTAAATGAGCATTTTCTTGCAGGCTGATCTATTGATGCTGATAATTCAATACTTTTGCAAACTGGAGTTATATCTGTTAAAAGCCATCCTTCATATAAGCTGTATATTTTAATCATATATTACCACCCAATATATTATTTACATCAGTTAAACTAAAGCTTGCCCCCCACTGACCTACAATTTTTTCATTTAACTTCAATGCCTTATACTGCTTTAATGCTAATGTAAAGTTTATATCTCCAGTTCCATCATTTTCTCCATACTCAAAAGTTTCTATAGAGAATAGATCATTGATATCTGTGTTTGTAAGTATGACTCTTATTGGCTTTTTACTTTTTCTCCAAGCTTCTATTTGTGCAACGCACTCAAATGGTTTAGGAATATCTGAATATGCACAAAATTTATATTTATGAGCAGGAAAAAAGCTCTCAAAAGATATTTCTGAAAGCTTTGAATCTCCTAATATATTTATTTCTCCAATTGATTCTACACTAACTACTGAATTGTTGTTAGCTAATTTAAGTGAATAACTAGAAGGTGGTACAGGAAGTTGTAACCATGTATCGTCTTGATTAAACCAAAATTCTATCATTTTAAAATACCTCCTAACTCATTCCAAGAGCTGTTTGACTCAATTTATTGGCTAGAGCTGTTGCAATTTTATCTATATCGCTTTCTTCTCTGATTATTATAGAATCTGCAATCTTTGCTATTGTTATTGCAAATCCATTTTGTGCGCTATCATCTTTAGTTGATCCAGAAGCTCCTTTAAATCCTTGGCTGCCAGTTTTATTTCCTGATGATAAGTTTTTATTTACACCAGTTTTTATTCCTACTGCAAGATCTTTAATTGGTTCAGTTACTAAATGAGTATTAACCTTAATACCACGGCCCATGCCTTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP010086|4241007:4250743|4241007_4241661_-|WP_041898183.1|tail|DBSCAN-SWA MAEKFYTMLTKLGTKKLSASAVSGSKVNFKTLKVGDGNGSYYEPSEDQTSIVKEVWSGNISAISVDESNENWIVVETVIPAADGGFFIREAGIFDDAGDMIAITKLSETYKPTILEGSTKDLVIKIVLEVSNASSIDLKIDPNVVVATKGDIQILQSKFQEVSAKLSGKMQLYINETLPAITDRTSDTLYFKITDKITNGFADNVKVSPNMGIKIVQ >NZ_CP010086|4241007:4250743|4243891_4244215_-|WP_041898191.1|DBSCAN-SWA MDPYVKMLNLMKRKGAESNPLSICIAKVNSPPPEIIIQTNDLQLYKDDLYIADYLLSGYSRQASVTNTDGTAVSFLDTIKIGDELAVLPTKDNQTWIILCKVVKCSD >NZ_CP010086|4241007:4250743|4248304_4248709_-|WP_041898197.1|DBSCAN-SWA MNLVEQLLKIDAGKIEVPSKEVKLKLAKLGNMEITFTCNAISMEKYNEIQERVLQVDKKGNIQGFATAQAKIETVLAGVPELRSEELMKHFKAPTPKELMNKIFLPGEVDILADTVTEISGVESTNKKEDIKNS >NZ_CP010086|4241007:4250743|4245708_4248129_-|WP_041898195.1|DBSCAN-SWA MPFELDSALLKVIDGAQKSQKAIDSLSPVASKASESVKAISKASESVDKLESSFKNTRDAVGNTRSAVSDLIQAFTDNTGERSIENIGEKAKGVVKSISNVSKAAKDMRTSFKNTKDEIENVKNTASNLYKAFAGTDLGKKSINFIGKQASKVSQKFPKSNGGKASGVLNKGGQAIGKAVDGVQNTKKAIEGLAPVASKATESVQAITKASESVGKVKNSFNDTKDSVGNVRTSVSDLIQAFTNNTGERSIENIGQKAKEVVKSISNASKTVEDLATNFINAKDEIKNVKSTVSDLFKTFKDNDLVKKATDGIGKRASKVAQKIPKLNSAKASKTVKSAGIGGKGSNVLNIAKQSMGKVGALTPSLSAPLQGIAGSFEKIKGVVSKSFSSIFGIFTKLPLPLQIIIGVVGLLAVAFATNFGGIRDIVMGVFGKISGAVKGAIDTFKKTGSAAQGIGALFTNLFGPKVGNIVTQTINKIIAVVKSIVTFIQANMPKIKSIIQNVFKGIQSVWNSILKPVLTFAIQIFSQLISFVISNWPRIKQTITTVMTAIKTVISTALNMIMAFWNVHGQTIKAVVSSAFNIIKTVIMTVLNVITGVIKTVMQVINGDWSGAWNTIKSTVGTVFNGAIDIIRNILNAIGSIFKDMAKTAISWGKDMIMGIVDGIKGAVGYIEDAISGVADRIRSFLHFSVPDKGPLTDYETWMPDFLKGMGRGIKVNTHLVTEPIKDLAVGIKTGVNKNLSSGNKTGSQGFKGASGSTKDDSAQNGFAITIAKIADSIIIREESDIDKIATALANKLSQTALGMS >NZ_CP010086|4241007:4250743|4245215_4245695_-|WP_012059571.1|DBSCAN-SWA MIEFWFNQDDTWLQLPVPPSSYSLKLANNNSVVSVESIGEINILGDSKLSEISFESFFPAHKYKFCAYSDIPKPFECVAQIEAWRKSKKPIRVILTNTDINDLFSIETFEYGENDGTGDINFTLALKQYKALKLNEKIVGQWGASFSLTDVNNILGGNI >NZ_CP010086|4241007:4250743|4242359_4243466_-|WP_041898187.1|plate|DBSCAN-SWA MYENNTEENLRSQMLDSIDSGISKSEGYFVYDAIAPSAKTIADYYKALDTILKLVFGEEAPEVPQDEYDKFIDKDAARHGLERKQGLYSVGQVTFSGLENSIIYENSMVQTVEGLKYKVTSQGKIKDGKCILAIKAIEIGSKYNVPANAIVEIPIKINGITSVKNESATTSGTDTETSENLLERIISKEREESSSGNIYDYEKWALQISGVEYVKVKPLWDKSNGMNGNGTVKVIVAGNNGMELDDTIVQKVKQYIDPEDGQGSGKAPIGATVTVVSVNPLKIDVNILGLTVLDGFDIKDVKDNIKESLDNYFKTIPVGGVVKINTVEAKVVMTAGVNDISSVKINNDTKNIITADEDKASLGGVTYE >NZ_CP010086|4241007:4250743|4249177_4249609_-|WP_012059574.1|tail|DBSCAN-SWA MPQAKDIINGTWGEVWINGEYVSEVSALQAKVTLTKVDVNFTRDLWKRSKVTGIEGKGTLKLHHISSRMAILMKDNIKQGKQTVCTIISKLADPDSVGAERVVLKDVTFDELTLADWEVKKNVEDTIAFTFSGYDFLDLIEPQ >NZ_CP010086|4241007:4250743|4243458_4243899_-|WP_041898189.1|DBSCAN-SWA MISILPEANLNMANKLAAFSQEEKTKDIPKEYAWDFEKNDFKLKDGKFQIVEGIEALKIWIWKALKTSKGKYPIYSDAYGNEFEKIIGKGFSKSLIESEAKRLTLECLKENQHILGVKNFEVDKNNDILTITFTAITDCGEVTIDV >NZ_CP010086|4241007:4250743|4241662_4242367_-|WP_041898185.1|DBSCAN-SWA MNNTADLEAFKNIKIASASSENSGNESKDKIERYVIDEIKNSYIFQEIFNAYGSSFDQLGLDISDLFLQILPQTATEWGLKLWEKRVGITTNNAKSIEERRARVLAKLNSKGTTTVEVIKQICKSFVSEAEIIQNNPEYYFQVNLISDTGFPYALDSLYDSIEIAKPAHLGVKYKLISMNQSQMYYGLASIMGETMTVYPWRAKNIESSGKMESGIGQCTGSESITIYPSKEMS >NZ_CP010086|4241007:4250743|4244214_4245219_-|WP_041898193.1|DBSCAN-SWA MIKIYSLYEGWLLTDITPVCKSIELSASIDQPARKCSFSMLYSLSDINEPRVQICPGTLIKIVDETYGEIFRGEVVDRTLGSSNQEETFTCYDYMRFIMSSSTSMNIKNMSPESVVYKACEELNIKVGDVVTTGVPIDRLCPDKSYYSIIMQCYSEVSKQNGKQYVPIMKADMFNVIEKGQIISDYLLQSANVDLYNNNIIDMSYKDSLENMINRVKIFDANNNYVDQVENSELVKRYGVFQTSYTVEDDKSTYEVAQNKLYGFSEEIEIEAIGNYSCLTGYAVKAKIWYLDILKDATLYVNADTHTWECGTGKYTMKLTVSLSNKMDLQEVDS >NZ_CP010086|4241007:4250743|4249621_4250743_-|WP_041898199.1|tail|DBSCAN-SWA MGEPSVEIIFKEAGITAAKRGTRGVVALILKDTMPANYSNPIKMDTIDEIPEALSDFNKEQIKLAMIGYQNPPKQVIAYIEAPDAANYSEAQNYLETIKWDYVVVPSIGQTADGKADTEANITSRATDFATWIKQLRSAKDIRVKAVLPHCPADSEGVINFATDDIKTAARTYTAAEYCSRIAGMLAGTSLNISATYAPLAEVVDVPHLKKEERDAAIDAGKLILINDGKKVKIDRAVNSFVTTIENKGEDFKKIKIVDIMDLIHDDIKSTAEDNYIGKYPNDYDHKCLLVAAINGYFEGLELDGLLDSSIEGQNRAEIDLDAQKACLKSQGIDISTMKDQEIKESNTGSQVFVKGQVVILDAIEDIKFQIYI |
11 | Clostridium_phage(90.0%) | plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
6090190 : 6103791
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP010086|6090190:6103791|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP010086|6090190:6103791|6097877_6098099_-|WP_009172902.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYNWFLSNAQSLVLMAIVVIGVYLGFKREFSKLIGFLVIALIAVGLVFNASGVKDILLQLFNKIIGA >NZ_CP010086|6090190:6103791|6090190_6091096_-|WP_061114936.1|DBSCAN-SWA MNFIKREKKVKQPKPKKLRVYKVNTHKKTVLALWVLLIASFCFAVYKNFTAININTVHETKVIDKEIVDTHKVENFVKNFAKDYYTWQPSQSSIENRNEGIKKYLTEELQALNVDTIRRDIPTNSAVQDVEIWAVKQSEEKQFQVIFRVDQFITEGENKKNVRSAYEVVVYVDDSGNMVIIKNPTICSIPAKSSYQPKAKESNGTVDAATTGEINEFLKTFFKLYPTATEKELSYYVKDSALKPIGKDYVFAELLTSVYTRKGNQVQVSVSVKYIDQQTKATQISQFDLILEKENNWIIVG >NZ_CP010086|6090190:6103791|6102135_6102402_-|WP_061114817.1|DBSCAN-SWA MQEMYSIENVEEIIGYDEYIKDFEEQAAEFCKTSGTRILQSVFSEFTADMICSVYLDYGQTKAEYPIRFEFNINVEDGQVLVSYLGFS >NZ_CP010086|6090190:6103791|6098731_6100540_-|WP_061114818.1|DBSCAN-SWA MRNPEVILDNLVKQSTKAEYQFQRLYRNLFNKQFYIMAYGRIAHKTGNLTKGVDNETIDGFSMKQIHQLIDLMKTEQYQPTPVRRVYIPKKNGKKRPLGIPSFKDKLVQEVIRMILEAIYESQFSKYSHGFRPNKSCHTALSQIQTNFIGTKWFIEGDICSFFDNINHQIMINLLRKRIQDERFIRLVWKFLRAEYLEDWKYHKTYSGTPQGGIISPLLSNIYLHELDTYMEEYRTKFNKGKKRKMNPEYHRYASKASKRKQKLKNLDMSDGERNVLLQEIKEFKSKMHELPSKLAFDETFKRVSYTRYADDFIISVIGSKVDALTIKKDIEQFLNEKLKIQLSEEKTLITHHSKFAKFLGYEITISRNQNISTDCMGVKKRVHGSKVKLYIPQSAWVNKLKDLGAFRIDKNGTWKPTPRPYLMNLNDLEILSTYNSEIRGLHNYYKLANNATVLQHFAYFMKYSMYKTYASKYQSSVRKILRKYQVNNLFQVKYETKKGTKVRTVYNERIVREKRPDTSANVDNIANTLVYRSQTELTQRLLADKCDWCGKENSEVEVHHIRKLKDLKGKAKWEKAMIARKRKTMILCHKCHVNLHYGRLD >NZ_CP010086|6090190:6103791|6102423_6103791_-|WP_041900427.1|DBSCAN-SWA MKYYIYRGKRIHVADKDLVFRFAATYLVSIFLLVILLLHSRTIMRIDWKNISVLNQGEVHLDIPYMIISIVIAAAVCLVAAITYYHHYIDYIKQLFHRQKLARMILENKWYEAAQVQSSSFFKDLPSGKTKEKITHFPKMYYKLINGLIHIQVEITMGKYQDQLLHLEKKLESGLYCELTDKELKDSYVEYTLLYDTIANRISIEYVQAEHGKLRLMKNIWWEYDKLPHMLIAGGTGGGKSYFILTLIEALLRTNSILYVLDPKNADLADLEAVMPNVYYKKDDMISCIDIFYDGMMKRNEDMKQMKGYKTGENYAYLGLPANFLIFDEYVAFMEMLGSKESTAVLNKLKQLVMLGRQSGYFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSEMGYGMMFGETDKDFFLKQIKGRGYVDTGTSVISEFYTPLVPKGHNFLDEIGKLVVKTEKTD >NZ_CP010086|6090190:6103791|6096876_6097269_-|WP_061114939.1|DBSCAN-SWA MKKIRSYTSIWSVEKVLYSINDFKLPFPITFTQMTWFVLSLFAVMLLGNVPPLSLINGAFLKYFGIPMAITWFMCQKTFDGKKPYGFLKSAIAYFIRPKITYAGKPVKLHNQKMNEAITVVRSEVYGISD >NZ_CP010086|6090190:6103791|6091114_6092116_-|WP_041895426.1|DBSCAN-SWA MKAKHIIIMISSIFVLMFSMLLIVAILFSDEKNGGNSNIEYGGVNVSAEVLAYKPIVEKYAKEYGISEYVNYLLAIMQVESGGTLQDVMQSSESEGLPANTLSAEESIKQGCKYFASLLKAAKNKDCDINTVVQSYNYGGGFIDYVASRGKKYTFELTESFANEKSGGSKVNYDNPIAVKENGGWKYSYGNMFYVLLVSEYLTSEKFDDATVQDIMNEALKYEGWKYVYGGYTPTTSFDCSGLVQWCYGKAGINLPRTAQEQYDVTQHIPLAEAKAGDLVFFHSTYDAGTYITHIGIYQGNNRMFHAGNPIGYADLSSSYWQEHLVGAGRIQK >NZ_CP010086|6090190:6103791|6092112_6094443_-|WP_061114937.1|DBSCAN-SWA MKQSKLKQKGKFNYQYAMKIAITVLMVLVIAIFILAMVGTVAHAAGLVDDTVKAGNEYSKYPLDNYQLDFYVDNSWDWLPWNWIDGIGKQVMYGLYAITNFIWTISLFLSNATGYLVQEAYSLDFITATAESIGKNMQTIAGISTSGFSTNGFYGGFLLIFILILGIYAAYTGIIKRETTRVINAVVNFIVVFVLSAAFIAYAPDYIEKINGFSADISNASLSIGTKIVMPDSKSQGKDSVDLIRDSLFAIQVKQPWLLLQYDNSDIKAIGENRVEKLISTSPDTNNGKDREEIVKSEIEDKENTNLTITKTINRLGMVFFLFIFNIGISAFVFMLAGIMIFSQVLFIIYAMFLPISFLLSMIPTFEGMTKRAIMKLFNTIMSRAGITLIVTTAFSISTMFYNLSTGYPFFLIAFLQIVTFAGIYFKLGDLMGMFSLQSGESQSMGRQILRRPRMLMLAHMHRLQHKLGRSISANGKKSNVGKKSSNTAGASASRAAKADHTRPDGKQEENFDKTSFGRKAGETAGKVMDTKDRIQDTAGQLKEQAKDLPVNAKYALYHGKSKIKNGISDFKSSVTDTRKARQQGRKDKEDKRRATIAERRSKMEEALKGKNQNSTEPNKMANSTHERPATAETQGRKVYHDKSDRTGTIRKDTRASTNDRKSTDRPNERIVREPGEQPKGSNIDSSSSKKERKIAKPDKAPIKAERKFVSDSHNTRDSNVEKKPPKAVYPALREKEPQKQLIKERRITIKRGIGSQKKVKITNAATVVKKRGQKK >NZ_CP010086|6090190:6103791|6097363_6097864_-|WP_061114940.1|DBSCAN-SWA MEMQVYIANLGKYNEGELVGAWFTPPIDIEDMKEKIGLNGENEEYAIHDFELPFDIDEYTPIEEINRLCSLAEELEGTPIEAEMREIQRTFFSSFEEMAEHVDDIIHYPDCDDMADVARYYIEEAGALGEIPASLQNYIDYEAYGRDLEIEGNFLVTAHGVFEYIG >NZ_CP010086|6090190:6103791|6094439_6096893_-|WP_061114938.1|DBSCAN-SWA MAYPIKYIENNLVWNHDGECFAYYELIPYNYSFLSAEQKFIVHDSFRQLIAQNRDGKIHALQISTESSIRATQERSKKEVTGRLKEVAYEKIEEQTEALISMIGDNQIDYRFFIGFKLLLNEQEVTIKNIKQGAANALSDFLKDVNHKFMGDFVSMSNNEIGRFTKMEKLLENKISRRFKVRRLDKNNFGYLIEHLYGQSGTAYEDYEYYLPSKKFKHETLVKRYDLLKPTRCLIEENQRYLRIEHEESTTYTAYFTINFIVGELDFPSSEIFYYQQQQFTFPIDTSMNVEIVANKKALSTIRNKKKELKDLDNHAFESDTETSSNVMEALDSVNELETNLDQSKESMYKLSYVVRVSAPDLDELKRRCNEVKDFYDDLNVKLVRPFGDMMGLHNEFIPASKRYMNDYIQYVTSDFLAGLGFGATQMLGETEGIYIGYNLDTGRNVYLKPALASQGVKGSVTNALAAAFVGSLGGGKSFSNNIIVYYSVLFGAQAVIVDPKAERGRWKETLPEIAEEINIVNLTSEESNKGLLDPYVIMKRPKDSESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAIRAVTKSEKRGLLLVIDELRAENTTISNSIADHIESFTDYDFAHLLFSDGSISQSISLEKQLNIIQVADLVLPDKETSFEEYTTMELLSVAMLIVISTFALDFIHSDRSIFKIVDLDEAWSFLQVAQGKTLSMKLVRAGRAMNAGVYFVTQNTDDLLDEKLKNNLGLKFAFRSTDINEIKKTLEFFGVDKEDENNQKRLRDLENGQCLVSDLYGRVGVIQFHPIFEELLHSFDTRPPVRREVEQ |
10 | Streptococcus_phage(88.89%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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