CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP009446	Francisella philomiragia strain GA01-2801 plasmid pFPK_1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP009445	Francisella philomiragia strain GA01-2801 plasmid pFPK_2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP009444	Francisella philomiragia strain GA01-2801 chromosome, complete genome	1 crisprs	cas3,DEDDh,csa3,cas4,cas1,cas2	0	0	9	0

1. NZ_CP009444

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP009444_1

• CRISPR_ID: NZ_CP009444_1
• CRISPR_location: 1324561-1324854
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: V-A
• Spacer_info: 4 spacers
• Cas_protein_info: cas2,cas1,cas4

Consensus repeat of NZ_CP009444_1

Consensus_repeat	Method
GGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGATN	CRT
GTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGATGC	PILER-CR

spacers of NZ_CP009444_1

>1.1|1324598|28|NZ_CP009444|CRT
GCGAATGTTCTGATTGGTGAGGGCAAAT
>1.2|1324663|27|NZ_CP009444|CRT
GCTGATGGTATCGACTCAACTACGCTT
>1.3|1324727|27|NZ_CP009444|CRT
GAGAGAGGCGGTTTTTGTCCAGTCGCA
>1.4|1324791|27|NZ_CP009444|CRT
ACTTGATACTATATACGAACATTTATA
>1.5|1324600|27|NZ_CP009444|PILER-CR
GAATGTTCTGATTGGTGAGGGCAAATC
>1.6|1324665|26|NZ_CP009444|PILER-CR
TGATGGTATCGACTCAACTACGCTTG
>1.7|1324729|31|NZ_CP009444|PILER-CR
ATAGAGAGAGGCGGTTTTTGTCCAGTCGCAG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009444_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP009444_1

>merge|NZ_CP009444|1|1324561-1324854|CRT,PILER-CR
GGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGATGCGAATGTTCTGATTGGTGAGGGCAAATCGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGATGCTGATGGTATCGACTCAACTACGCTTGGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAATAGAGAGAGGCGGTTTTTGTCCAGTCGCAGGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGATACTTGATACTATATACGAACATTTATAGGTCTAAAAACATTAAAAAATTTTGTTAATGTAGATT

>NZ_CP009444|1|1|1324561-1324854|CRT
GGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGAT	GCGAATGTTCTGATTGGTGAGGGCAAAT
CGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGAT	GCTGATGGTATCGACTCAACTACGCTT
GGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAATA	GAGAGAGGCGGTTTTTGTCCAGTCGCA
GGTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGAT	ACTTGATACTATATACGAACATTTATA
GGTCTAAAAACATTAAAAAATTTTGTTAATGTAGATT

>NZ_CP009444|1|1|1324562-1324792|PILER-CR
GTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGATGC	GAATGTTCTGATTGGTGAGGGCAAATC
GTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGATGC	TGATGGTATCGACTCAACTACGCTTG
GTCTAAGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAATAGA	GAGAGGCGGTTTTTGTCCAGTCGCAGGTCTA
AGAACTTTAAATAATTTCTACTGTTGTAGATAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP009444.1|WP_041268115.1|1315706_1315898_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP009444.1|WP_042518234.1|1315039_1315687_+|alpha/beta-fold-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|309968
NZ_CP009444.1|WP_042518266.1|1331031_1332978_+|BCCT-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|376718
NZ_CP009444.1|WP_042518260.1|1329289_1329739_+|acyl-CoA-thioesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|223894
NZ_CP009444.1|WP_042518252.1|1327847_1328963_-|linear-amide-C-N-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|225591
NZ_CP009444.1|WP_042518232.1|1312790_1313957_+|DUF819-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227792
NZ_CP009444.1|WP_042518264.1|1330135_1330894_-|RNA-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|349968
NZ_CP009444.1|WP_042518244.1|1324149_1324422_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	pfam09827_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	gnl|CDD|378256
NZ_CP009444.1|WP_042516855.1|1320583_1321375_+|IS481-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP009444.1|WP_035735605.1|1325741_1326317_-|outer-membrane-lipoprotein-carrier-protein-LolA	unknown	unknown	gnl|CDD|319983
NZ_CP009444.1|WP_035735573.1|1312271_1312742_+|glutathione-peroxidase	unknown	unknown	gnl|CDD|238207
NZ_CP009444.1|WP_042518262.1|1329753_1330107_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP009444.1|WP_042518253.1|1329041_1329293_+|glutaredoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|239510
NZ_CP009444.1|WP_012280962.1|1332970_1333450_-|tryptophan-rich-sensory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|320706
NZ_CP009444.1|WP_042518235.1|1316117_1317575_+|bifunctional-ADP-dependent-NAD(P)H-hydrate-dehydratase/NAD(P)H-hydrate-epimerase	unknown	unknown	gnl|CDD|238576
NZ_CP009444.1|WP_071659911.1|1322624_1323161_+|type-V-CRISPR-associated-protein-Cas4	cas4	cd09637_cas4_CAS-I:CAS-II:CAS-V	gnl|CDD|213941
NZ_CP009444.1|WP_042518239.1|1323164_1324169_+|type-V-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09634_cas1_CAS-I:CAS-II:CAS-III:CAS-V	gnl|CDD|213942
NZ_CP009444.1|WP_042518247.1|1324940_1325732_-|dienelactone-hydrolase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223669
NZ_CP009444.1|WP_042518251.1|1326728_1327811_+|radical-SAM-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|275338
NZ_CP009444.1|WP_042518233.1|1313953_1315024_+|dipeptide-epimerase	unknown	unknown	gnl|CDD|239435

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP009444.1|WP_071659911.1|1322624_1323161_+|type-V-CRISPR-associated-protein-Cas4	cas4	cd09637_cas4_CAS-I:CAS-II:CAS-V	9.9e-18	59.6	1.5
NZ_CP009444.1|WP_042518239.1|1323164_1324169_+|type-V-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09634_cas1_CAS-I:CAS-II:CAS-III:CAS-V	4.7e-55	181.5	0.3
NZ_CP009444.1|WP_042518244.1|1324149_1324422_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	pfam09827_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	1.1e-19	65.3	0.2

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP009444.1|WP_042518234.1|1315039_1315687_+|alpha/beta-fold-hydrolase	gnl|CDD|309968	pfam05057, DUF676, Putative serine esterase (DUF676). This family of proteins are probably serine esterase type enzymes with an alpha/beta hydrolase fold.	5.92615e-10
NZ_CP009444.1|WP_042518266.1|1331031_1332978_+|BCCT-family-transporter	gnl|CDD|376718	pfam02028, BCCT, BCCT, betaine/carnitine/choline family transporter.	0
NZ_CP009444.1|WP_042518260.1|1329289_1329739_+|acyl-CoA-thioesterase	gnl|CDD|223894	COG0824, FcbC, Predicted thioesterase [General function prediction only].	6.77929e-25
NZ_CP009444.1|WP_042518252.1|1327847_1328963_-|linear-amide-C-N-hydrolase	gnl|CDD|225591	COG3049, COG3049, Penicillin V acylase and related amidases [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	3.62466e-46
NZ_CP009444.1|WP_042518232.1|1312790_1313957_+|DUF819-family-protein	gnl|CDD|227792	COG5505, COG5505, Predicted integral membrane protein [Function unknown].	1.01857e-66
NZ_CP009444.1|WP_042518264.1|1330135_1330894_-|RNA-methyltransferase	gnl|CDD|349968	cd18095, SpoU-like_rRNA-MTase, SAM-dependent rRNA methylase related to SpoU-TrmH. RNA 2'-O ribose methyltransferase catalyzes the methyltransfer from S-adenosyl-L-methionine (AdoMet) to the 2'-OH group of ribose in tRNA or rRNA. It is part of the SpoU family of MTases, a subfamily of the SPOUT methyltransferase superfamily. The SPOUT methyltransferase superfamily is a large class of S-adenosyl-L-methionine (AdoMet or SAM)-dependent RNA MTases which are structurally characterized by a deep trefoil knot.	5.41497e-50
NZ_CP009444.1|WP_042518244.1|1324149_1324422_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	gnl|CDD|378256	pfam09827, CRISPR_Cas2, CRISPR associated protein Cas2. Members of this family of bacterial proteins comprise various hypothetical proteins, as well as CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) associated proteins, conferring resistance to infection by certain bacteriophages.	5.49897e-13
NZ_CP009444.1|WP_042516855.1|1320583_1321375_+|IS481-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	8.72976e-18
NZ_CP009444.1|WP_071659911.1|1322624_1323161_+|type-V-CRISPR-associated-protein-Cas4	gnl|CDD|213941	TIGR04328, hypothetical_protein_HMPREF9709_01098, CRISPR-associated protein Cas4, subtype PREFRAN. Members of this family are the Cas4 protein of a novel CRISPR subtype, PREFRAN, found in Prevotella bryantii B14, Prevotella disiens FB035-09AN, Francisella tularensis subsp. novicida, Francisella philomiragia, Butyrivibrio proteoclasticus B316, Helcococcus kunzii ATCC 51366, etc.	2.3173e-102
NZ_CP009444.1|WP_035735573.1|1312271_1312742_+|glutathione-peroxidase	gnl|CDD|238207	cd00340, GSH_Peroxidase, Glutathione (GSH) peroxidase family; tetrameric selenoenzymes that catalyze the reduction of a variety of hydroperoxides including lipid peroxidases, using GSH as a specific electron donor substrate. GSH peroxidase contains one selenocysteine residue per subunit, which is involved in catalysis. Different isoenzymes are known in mammals,which are involved in protection against reactive oxygen species, redox regulation of many metabolic processes, peroxinitrite scavenging, and modulation of inflammatory processes.	4.67347e-83
NZ_CP009444.1|WP_042518253.1|1329041_1329293_+|glutaredoxin	gnl|CDD|239510	cd03418, GRX_GRXb_1_3_like, Glutaredoxin (GRX) family, GRX bacterial class 1 and 3 (b_1_3)-like subfamily; composed of bacterial GRXs, approximately 10 kDa in size, and proteins containing a GRX or GRX-like domain. GRX is a glutathione (GSH) dependent reductase, catalyzing the disulfide reduction of target proteins such as ribonucleotide reductase. It contains a redox active CXXC motif in a TRX fold and uses a similar dithiol mechanism employed by TRXs for intramolecular disulfide bond reduction of protein substrates. Unlike TRX, GRX has preference for mixed GSH disulfide substrates, in which it uses a monothiol mechanism where only the N-terminal cysteine is required. The flow of reducing equivalents in the GRX system goes from NADPH -> GSH reductase -> GSH -> GRX -> protein substrates. By altering the redox state of target proteins, GRX is involved in many cellular functions including DNA synthesis, signal transduction and the defense against oxidative stress. Different classes are known including E. coli GRX1 and GRX3, which are members of this subfamily.	2.7418e-12
NZ_CP009444.1|WP_012280962.1|1332970_1333450_-|tryptophan-rich-sensory-protein	gnl|CDD|320706	cd15904, TSPO_MBR, Translocator protein (TSPO)/peripheral-type benzodiazepine receptor (MBR) family. This family contains tryptophan-rich translocator protein (TSPO), an integral membrane protein that is highly conserved from bacteria to mammals. In eukaryotes, it is mainly found in the outer mitochondrial membranes of steroid-synthesizing cells of the nervous system where it transports cholesterol into mitochondria. It is known to be highly expressed in metastatic cancer, steriodogenic tissues, as well as inflammatory and neurological diseases such as Alzheimer's and Parkinson's. TSPO is also known as the peripheral benzodiazepine receptor (MBR) and its ligands include benzodiazepine drugs, implicated in regulating apoptosis. In human, a single polymorphism A147T is associated with psychiatric disorders; the mutation causes structural changes in a region implicated in cholesterol binding. TSPO is homologous to bacterial tryptophan-rich sensory proteins, and their tryptophan residues are believed to be functionally important. In bacteria, TSPO acts as a negative regulator of expression of specific photosynthesis genes in response to oxygen/light; it catalyzes a photooxidative degradation of Proto porphyrine (PpIX). R. sphaeroides TSPO (RsTSPO) is involved in porphyrin transport, similar to human, while Arabidopsis translocator protein (AtTSPO) is regulated at multiple levels in response to salt stress and perturbations in tetrapyrrole metabolism.	4.11779e-42
NZ_CP009444.1|WP_042518235.1|1316117_1317575_+|bifunctional-ADP-dependent-NAD(P)H-hydrate-dehydratase/NAD(P)H-hydrate-epimerase	gnl|CDD|238576	cd01171, YXKO-related, B.subtilis YXKO protein of unknown function and related proteins. Based on the conservation of the ATP binding site, the substrate binding site and the Mg2+binding site and structural homology this group is a member of the ribokinase-like superfamily.	6.2741e-79
NZ_CP009444.1|WP_035735605.1|1325741_1326317_-|outer-membrane-lipoprotein-carrier-protein-LolA	gnl|CDD|319983	cd16325, LolA, LolA, a periplasmic chaperone. This family contains periplasmic molecular chaperone LolA which binds to outer-membrane specific lipoproteins and transports them from inner membrane to outer membrane (OM) through LolB, a lipoprotein anchored to outer membranes. There are five Lol proteins (LolA, LolB, LolC, LolD, and LolE) involved in the sorting and membrane localization of lipoprotein and are highly conserved in Gram-negative bacteria. LolA accepts OM-specific lipoproteins that are released from the inner membrane by the LolCDE complex and transfers them to the OM receptor LolB. Studies have shown that hydrophobic surface patches large enough to accommodate acyl chains of the OM lipoproteins and the structural flexibility of LolA are important factors for its role as a periplasmic chaperone.	2.44617e-16
NZ_CP009444.1|WP_042518239.1|1323164_1324169_+|type-V-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	gnl|CDD|213942	TIGR04329, hypothetical_protein_SbacW_07302_partial, CRISPR-associated endonuclease Cas1, subtype PREFRAN. Members of this family are the Cas1 endonuclease of a novel CRISPR subtype, PREFRAN, found in Prevotella bryantii B14, Prevotella disiens FB035-09AN, Francisella tularensis subsp. novicida, Francisella philomiragia, Butyrivibrio proteoclasticus B316, Helcococcus kunzii ATCC 51366, etc.	2.935e-179
NZ_CP009444.1|WP_042518247.1|1324940_1325732_-|dienelactone-hydrolase-family-protein	gnl|CDD|223669	COG0596, MhpC, Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) [General function prediction only].	5.85393e-06
NZ_CP009444.1|WP_042518251.1|1326728_1327811_+|radical-SAM-protein	gnl|CDD|275338	TIGR04545, rSAM_ahbD_hemeb, heme b synthase. Members of this family are AhbD (alternative heme biosynthetic protein D), a radical SAM enzyme in sulfate-reducing bacteria and methanogens that performs the last decarboxylations to synthesize heme b from Fe-coproporphyrin III. Members include DVU_0855, previously included in error in TIGR04055, the NirJ2 family thought to be involved in heme d1 biosynthesis. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Heme, porphyrin, and cobalamin].	7.19326e-141
NZ_CP009444.1|WP_042518233.1|1313953_1315024_+|dipeptide-epimerase	gnl|CDD|239435	cd03319, L-Ala-DL-Glu_epimerase, L-Ala-D/L-Glu epimerase catalyzes the epimerization of L-Ala-D/L-Glu and other dipeptides. The genomic context and the substrate specificity of characterized members of this family from E.coli and B.subtilis indicates a possible role in the metabolism of the murein peptide of peptidoglycan, of which L-Ala-D-Glu is a component. L-Ala-D/L-Glu epimerase is a member of the enolase-superfamily, which is characterized by the presence of an enolate anion intermediate which is generated by abstraction of the alpha-proton of the carboxylate substrate by an active site residue and is stabilized by coordination to the essential Mg2+ ion.	4.00149e-94

Protein sequences

>NZ_CP009444.1|WP_042518244.1|1324149_1324422_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2
MLIVSYDFSNNKVRAKFAKFLESYGVRLQYSVFELKYSKRMLDLILAEIENHYVPLFTNADSVLIFNAPDKDVIKYGYAIHREQDVVFID
>NZ_CP009444.1|WP_042518239.1|1323164_1324169_+|type-V-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1
MFSKNDIESKNIVFVNIFDGVKLSLSLGNIVIKDKETDEIKTKLSVHKVLALFIVGNMTMTSQLLETCKKNAIQLVFIKNSFRPYLCFGDIAEANFLARYKQYSTVKQDITLAKIFIVSKIRNQHNLVKSLRDKTPEQQEIVKKNKQLIVELENTISLAELMGIEGNVAKNFFKGFYGHLDNWQGRKPRIKQDPYNVVLDLGYSMLFNFVECFLRLFGFDLYKGFCHQTWYKRKSLVCDFVEPFRCIVDNQVRKSWNLGQFSVEDFGCKNEQFYIKKDKTKDYSKILFAEIISYKLEIFEYVREFYRAFMRDKEIGDYPIFCYETRRVYVNSQL
>NZ_CP009444.1|WP_071659911.1|1322624_1323161_+|type-V-CRISPR-associated-protein-Cas4
MTWLNDFIFCPYSIYLHNIYSNASDTTYYSSSQTKGRDAHKSIDKGIYSTKKDDLIGIDVINHKYGLVGKIDVFHKDKGLLVERKRQIKTIYDGYKYQLYAQYFCLQEMGYDVKAIKFYSMVDNKSYPIAIPTSAELEKFEKHIQTIKQYNPMDNSFRQNIEKCKFCIYANLCDKTDL
>NZ_CP009444.1|WP_042516855.1|1320583_1321375_+|IS481-family-transposase
MKMHKNIRLTPTDRKEIWRLYQTRCFTQSILAKKFRVSRQTILKVLKQCRSGIFYPKDSTNHRYKSMFYGIRRLAKVERKLELKLKAKAKQINKSYPGEMFNIDTKRLPAIKDSQLREYLFVGIDAYSRELYADILPDKSQFSSTMFLHRLVDECPYTIEIAYTDNGTEYKGTTDHEFVKACRQYKINQKFTRVARPQTNGKAERVIRTILEMWHDKTIFSSEEQRRTELRRFLNFYNTVKPHKGIDNLTPYEKLERYFKQNV
>NZ_CP009444.1|WP_042518235.1|1316117_1317575_+|bifunctional-ADP-dependent-NAD(P)H-hydrate-dehydratase/NAD(P)H-hydrate-epimerase
MQFLTEKQNREIEEYAITQGLNLIENASDEIVKLICNKFDKQSKVLVIAGSGNNGSDGIAAAIKLFSLGYEVDVYRVFPKGNLDNQNYYQEFLKLKTPLDKLPDINNYDVVIDGIFGIGLDRDLQGDILELVKVINQNSKYTLAIDVPSGLGAFNAKVYGEAIQANETITFLADKQGLYTGDGLDYAGQVTVKELIDNQNINITQSEYQVYKNDIQDINLDNILRKKKNTNKGTYGNLAIIGGNIGMNGALQLAGKSSLYSGCGKVSMISLDKDFRADMSIPELMTKSLEDIPKNLNTFSALVVGVGFDTTDDSQQVLQLIIDNLTQPAIFDADALNIISTNQQIREKFIQLENKIITPHPAEAARLLGCTTKEVQDDRFVAVRALAKKYNSTVVLKGAGSLICKDDEIYINTTGNQGMAVAGQGDVLSGIIGAFLAQGLDTLSASRLAVYVHGLAGDNIVKKLGGYVGIFPSRVAEEVCEVLNF
>NZ_CP009444.1|WP_041268115.1|1315706_1315898_-|hypothetical-protein
MKKIAILIISLILFNLGFSIHTNDNKFFEATQFNNKNCRYAHEVGHNSFSEPEMNLACKPRSE
>NZ_CP009444.1|WP_042518234.1|1315039_1315687_+|alpha/beta-fold-hydrolase
MSKDKVVILVHGFIKNSKDMSSLANFLKDSYDEVIAVDLPTTFVSVDVAVNKLCQIVKSIPSSKSLIFVAHSMGGIISCMTIDKLQLTNVEKCVFIASPFAGSRVADFGDRIPFYSRVLKPNKDLKVTDKYLEICNRVAEKVSVGLIAGNKYSKLNFLARLCLRDEHDGLVEVSSVFSINSLDRITLNKNHSQIHHDEETLTKVSFFLKTGRFLS
>NZ_CP009444.1|WP_042518233.1|1313953_1315024_+|dipeptide-epimerase
MSKIIDIKTSIIKIPLKRTFITAVRSTNHIDSLAVELTLDNRVKGYGVSPATTAITGDTLQGMQYIIREIFAQVILGSDLSDYKQTLELAFKKVMFNSAAKMAIDLAYHDLLAKEQNMSVAKLLGAKANSIVTDVSISCGSVAETIQNIQNGVEANFTAIKVKTGADFNRDIQLLKALDNEFSKNIKFRFDANQGWNLAQTKQFIEEINKYSLNVEIIEQPVKYYDIKAMAEITKFSNIPVVADESVFDAKDAERVIDEQACNMINIKLAKTGGILEAQKIKKLADCAGISCMVGCMMESPAGILATASFALAEGITVADLDPLDWVAKDLYSDYITFNEPNIILKDNLNGFGFNL
>NZ_CP009444.1|WP_042518232.1|1312790_1313957_+|DUF819-family-protein
MISTSLSYISSLLLICSLIVLLSSKSKSKLFEYFPAIVIIYFVIVVFSAMGFWDSKSLEIIQTRLQLQDLILPVMLFLMLIRCDIRVVIKLGRKLLIAFFGATVSIIIAFVIMYLTVGKYISPDAWKGFSALSASWMGGTGNMIAVKQALSTPDNQMGYILLTDSISYSIWFAFLFALISRANIFDKWTKAGCIEEHISKVDINNPYDVKGDINFVGIFVLITMAFTATDIAKILSSYLPATDLISAKTWTILLVTLFGFVGAMTPLAKIRSDSIIASIFLYFLVALIASGSSFKGFSQAPIYIVCGLMVLVIHAILMVIIAKIFRLNLAMCSIASLANIGGIAGAPILASAYTRSLVSIAVVMALLGFLIGTQGGLIVAKILSGFAI
>NZ_CP009444.1|WP_035735573.1|1312271_1312742_+|glutathione-peroxidase
MSIYDFKLTKNDGSEYSLPNNKVLLIVNVASKCGFTKQYRGLQHLHKLYPDLEIVAFPCNSFGGQEPGSDEEIKSFCETNYDVTFPIMKKTKVNGKDAEPLFEYLKERAKGVLGTEAIKWNFTKFLVSKDGETVIRYAPKTIPEDLISDIENFLKD
>NZ_CP009444.1|WP_042518247.1|1324940_1325732_-|dienelactone-hydrolase-family-protein
MLKTKFSLSFILFSIFFTFSMSNAQDSKNSSRIIKETANISLNIAGSNYDIFYQKSNRSLPVVIVVHGFSRSKDNMSGWESFLVDHGYFVVVPNLPFWANHSKNAEFISELINYIYSNSDYTSIINNDLALVGFSAGGLATLIATSENTRVKLWIGLDPVDVGNLGSQAAKNINCPTYIIAASASACNANNNYKNFITNLKENNLIKIDGAVHVDAEWPTSRFAELFCGRSTQQKRERFHDDVLTILDKSFKNESYIQNIKRY
>NZ_CP009444.1|WP_035735605.1|1325741_1326317_-|outer-membrane-lipoprotein-carrier-protein-LolA
MLKKVAIATSILVSGLVYAAPSADFAKVEEQLVKNDNYSGHFIQSRKIQGLDKPILASGEFELSKKDGLEWNQEKPFKSSLKATKDTITIKTADSPKSVFGEEDSPMVFSFTKIFLSVLEGDSKVIYDNFNTKFSGTTDNWTLVLTPKTELLSKALKEVTLKGGETITYVEVVDAQNNVMDIQFSDIEIDS
>NZ_CP009444.1|WP_042518251.1|1326728_1327811_+|radical-SAM-protein
MKHQLKWMAWETTRRCNLKCVHCRSSSECEVVGHPDFSSEEGFRIIDNIVEFASPVLVLSGGEPLLRADIFELAKYGANKGLRMALATNGSLVTDEICEKIKNSMISIVSLSIDGATAETHDDFRSQKGAFEATVNAAKLFKKHGIPFLINSSFTKRNQHEIKDVYKLAKSLEATAWYLFMIVPTGRGEELMQELIDVDDYQEILNWHYDMEADEQDMLVRPTCAPHYYRIRFERNKEDNAKVRSRALSFGTGGGKGCIAGQSICLLDVDGNVYPCSYLPVSAGNVKEKSFADIWQNSDVMHDMRDFSAYEGKCGSCEFIKICGGCRARAYNIHGSYLAEEPFCNHMPIKLKQSENNKNK
>NZ_CP009444.1|WP_042518252.1|1327847_1328963_-|linear-amide-C-N-hydrolase
MCTNVFINKNQYKIEARSMDFPINIAFKNGWGYVGIENVTDVVIDADKIPESRIAKWTSKYGYFCRLGFESYVTDGLNTQGFSYSILYLDGTVYPSYDDNDNRPALAVYELGNFLLAMAKDVADALELISEYQIVNSAVKLKDGIYIKNIPLHMCLRDANGNSAVIEFIGGKMYIHKNAGNVLTNAPTYEWHLSNIEEYKSLLQPLVNNNNPKFSDRVINYADTISSSRPEVAQLVGLPGDFSAAARFVRSYILSELMLEPKSNREAIFHAASIIANASVPPYEKSMTLWTTIKDLKNLAVAYKDNAVYQGTGPVGVYAMNIDNGYVTYDLNAMNFYDIPPAEQDSGLKLTSPNEIKQIIDMSAVVGLERQ
>NZ_CP009444.1|WP_042518253.1|1329041_1329293_+|glutaredoxin
MTQQFNKIVLYRMVTPEKTCPYGLKAKALFEEKGWCFEDHILKTRAETDAFKHKYNLETTPLIFIDDKQIGGYSDLLEFLGQK
>NZ_CP009444.1|WP_042518260.1|1329289_1329739_+|acyl-CoA-thioesterase
MNQQLKYFVLSTKVLPEHIDPNNHLNNIVYLQWMQDVAIEHVKANKVFDLTESQGLTWFAKKHTIEYLSQGFLGDDIAVVTWVESITKISTFRKYHIYRKSDKALLCKADTLWVMINAQKGRPAKIPTELAEIFDKYNDFEIDNIESLI
>NZ_CP009444.1|WP_042518262.1|1329753_1330107_-|hypothetical-protein
MSKCKTHQNHEHKHQDNCGHTRIKHGDHYDYLHDGHLHHEHNGHYDEHTLDVTTKNPDECKPIKDECCDHVHGPDCGHEAVPHGDHIDYIVDGRLHHPHGNHCDNHGPVEVIKNNKK
>NZ_CP009444.1|WP_042518264.1|1330135_1330894_-|RNA-methyltransferase
MKNLSQKLIKEIKKLHSPQGRKKSIYYVIEGLRCCDEALSRLPKEDLIALLTTENTDSISYPVDKKYILSEKDLNELTQTQNSQGVLILAKKKDTSSDFEFKDDFILVLDRIQDPGNIGTILRTAIAVGLTEIVLIDGTVDPFNPKAIRAGMGAQFSLKFRYFENLSAVRNYPTLKERKIWLTTPHEGVSCYSKEFKLSNSVLVFGEEANGIEDFSVGEKTMIPTLSNIESLNVAQAATIYLFEGLRQKMLK
>NZ_CP009444.1|WP_042518266.1|1331031_1332978_+|BCCT-family-transporter
MQREKGAYAPVFYPAIILAIVLSLSGIFYPNQFASHIQNLQNLILEKFGWAYILAMSVFLCLCLILMFSRFGDIKLGQEHDLPEYSNISWFAMLFAAGMGIGLMFYGVAEPLKHFLAPPNMSSDELVLVKEAMNTTFFHWGIEAWSVYAIVGLSLAYFAYRHDLPLLPRSVLYPILGRHIYGPLGHAIDVFAVLGTLFGVATSLGFGAMQVSAGMSFLTGLPDTVNMQVIYIVVIVALATISVGLGLEKGIKALSNFNIILAVLLLVFILLLGNSSVLVRDYIQNIGYYLSTIVNQTFNLYAYNQENQEWLKSWTLFYWGWWIAWSPFVGMFIAKVSRGRTIRQFTIGVLFIPVGFTFLWMTVFGNSAIEIAMNGNGEALKDAVNNNIPVALFEFLQHFPFSTLLSVLAVFLIVTFFVTSADSGALVIDILATGNAKQSITLQRIAWSVLSGLLAISLILAGGLQALQSATIISAFPLLFILFLMCVSLIKSLRLDYLRLKSIETHSTVVQFAKANTSWQKRLEAIAHKPSKDQAIEFLQKDVTTAIIEVADEMEKNGINTEVIRDHDHIQLAISIEGNEDFIYSVMLRSYQSKLGNYNRVEVLLSHGGQYYDIMGYSKDQVIADIVNQYDKHLHYLHLVVADKDIVN
>NZ_CP009444.1|WP_012280962.1|1332970_1333450_-|tryptophan-rich-sensory-protein
MNCNIKNKDYISLAAFIIVILGIGMSVGALTATSIPTWFAKLKYPFFAPPNWIFAPVWTILYIMIAISGWLVFKQKALREKVFIIYAIQLGLNFLWSFIFFCWHNIDLALLEISILWIFIAWNLKIFMDINKVAGYLLIPYLLWVGFAWILNLNYAMLN

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	14436 : 23486	8	Klosneuvirus(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	34630 : 80394	50	Salmonella_phage(25.0%)	holin,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_3	394832 : 438952	51	Acinetobacter_phage(42.86%)	transposase,protease,integrase	attL 403397:403456|attR 441228:441558
DBSCAN-SWA_4	517372 : 529140	11	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	838610 : 851743	10	Salmonella_virus(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_6	1162356 : 1233055	56	Bacillus_phage(40.0%)	transposase,integrase,tRNA	attL 1201693:1201752|attR 1233017:1233882
DBSCAN-SWA_7	1481840 : 1541879	54	Staphylococcus_phage(25.0%)	plate,transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	1600665 : 1655746	54	Tupanvirus(22.22%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	1869609 : 1934188	52	Bodo_saltans_virus(33.33%)	transposase,protease,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP009444|14436:23486|DBSCAN-SWA
CATGAATTCAATACTAGAAGAATCTAATTTACCTAAACTTGCTGAGTTTAAAACTGATGAAGTCAAGCCAGCAATAGACTATCTTTTTGAGCATGCCGAAACCAATCTACAAAAAGCACTTCAAGAACAAAATCCTAGCTGGCAAACTCTCCTACAATTAGAAGTAGATGATGAGAAAATAAGCCAAGCATTTTCTACAATTGCTCATATGAATGCTGTTTGTAATTCTAAAGAGTTACGCGAGAGCTACGAATACGCTGTAACAAAACTTACAGATTACTATACCAAGCTTGGACAAAATAAAGATTTATACAATCTATATAAACAAATTCAAAATCACGAGCTTAATGCTGAACAAGCCCAAGCCATAAAAAAAGCTATTGTCGGATTTGAGCAATCAGGCGTAAATCTTGACGAATCAAAAAGAAAAAGATTGCAAGAGATCTCGCAAGAGTTAGCTCAGCTAACTACAAAATTTGAAAATAATGTGTTAGATGCTACTATGGACTGGCTCTACACCACAAATGATGAGAAAGAGCTAAAAGGTCTGTCTCAAAATAATATTGAATCAGCAATAAATAAAGCTAAACAAAAAAATATTTCTGAAAAATATGCATTAGGAATAGATATTCCAACATACCTAGCAGTATTGCAACAAGCTGACAATCGCAAATTACGTGAGAAACTATATAAAGCATACTGTACTAGGGCATCAAAAGAGGCAGACAACAAAAACTTCGATAATGATGACAATATTGAAAAAATCCTAAAACTACGTGCTGAAAAATCGCAAATACTGGGTTTTGATAATTATGCAGAGAATTCTCTATTTACCAAAATGGCAGAATCTCCAACCGAAGTACTTGAGCTACTTAATAATCTTCTTCAAAAATCATTACCTCAAGCAAAAAAAGAACTTAATGAATTACGTAGATTTGCTGAAGATGCAGGACTAGTAGATGCTCTTCAACCATGGGATACAGCATATTACTCTGAAAAACTCAAAAAAGCTAAATTTGACTTTACAGAGGAAGAGCTTAGAGAATATTTCCCATTAGAGAGAGTTTTGGAAGGACTATTCAAGATACTTAATAAAATCTATAATCTAGAAATCACAGAAAATAGAAACTATACAAAATATGTTGCAGAGCAACAAACTTTTGATTTTTTCAAAGATGGCGAATATATTGGTAGTATAATTTGTGATTTTTTTGCTCGTGATAATAAGCGTGGTGGCGCATGGATGGATGGCTCACGCACAGCATTTATCAAGTTAGATGGCTTAGCTCAAAAACCTGTGGCTTATGTAAACTGTAACTTTATGCCACCATCAAAAGATGGTGCAAACCTAACTCATAGTGATGTCGTAACATTATTTCACGAGTTTGGTCATGCTCTTCATCATATCTTATCACGTGTAACTATTGCTTCAATTTCTGGAACTAATGGAGTTGAATGGGATGCTGTGGAATTACCTAGCCAATTCATGGAGAATTTCTGCTGGTGCGAAGAAGGACTAGCACTTATATCCGGATCACGCGATGGTAAAGCCCTTAGTAATAAACAAATTGATAAACTTGTAGGCACTCGATATTTCCAATCTGCATTGATGATGGTTAGACAACTTGAATTTGCTATATTTGATATGAATATCCACTACAAAAAATTAACTACCGCAACTGAAGTTCAAAATGAATTAGATAGCATTAGAGAAAGAGTCAACTTACTTAAAACTCCTAGCTACAATAGATTCCAAAATGGATTTTCGCATATTTTTGCTGGAGGTTATGCTGCTGGATACTACAGTTACAAATGGGCTGAAATACTTTCTTCAGATGTGTTTTCACGTTTTGAAAATGAAGGAATCCTTAGTAATAAAGTTGGTAATGACTTGTTAGAAAACATAATTTCAAAGGGCTCTTCACGTGATGCTATGGATAACTTTGTAGCATTTATGGGGCGTAAACCAAATGAAGAAGCTCTACTTCGACACAGTGGGATTAATTAAAGTAACAAAGCTAAATGTGGTTATAGATCTTTAATCTACCAATAACATTTATTCGTACAATATATATCACAGTTATAAAAACTTCTAAAAATATGAAAACAATTGAAATAGGTAATAAAGCTGAAGAACAAGCCTCTAAATTTTTACGAACTATAAACTTACAAATTCTAGCTCAAAACTTCAGAGCCTTACCTTATGGTGAAATTGATATTATTGCTTTAGACCAAAACACTCTTGTATTTATCGAAGTAAAATATCGTAGCAAAACAAAATTTGCTAAAGCAGAAGAAATGCTAACTTACAGTAAACAGCAAAAACTTATTAATGCAGCAAATATTTTCTTACAAGAGAATCCTAAGTTTGAAAACTACGAATGTAGATTCGATTTAATAGCAATTAACAAAGAAGATATTAATAACTGGATAAAAAATGCTTTTATCTTAAATTAAAGCTCTTGAGAAAGTTCTATAAGCTTTTTAGCTTGCAATAACTGATAAGCATCGGTTTCATCATTTAGATTGAGATTAAGATGTCCAACCTTTCTGCCCTTACGTGGTTCTTTGTTATAACTGTGAATCTTAACTCTATCAAGTGCTGCTAAATCTTTTGTAGCTGGCATACCACCAATACAATTCAACATCACTGTTTTACGACTTGTTGTATCTCCCAAGATCAAACCTGCGATAGCTCTAACATGATTTTCAAATTGTGAGGTAATTGAGCCATCAACACTCCAGTGTCCACTATTATGCACTCGCGGAGCTATCTCATTGACTATTAACTCATCACCTTTGACAAAGAACTCTATAGCTAAAGTACCTACATAGGCAAACTCTTTGACTAATGTTTTAGCTATCTGTTGTGCTTTTTCAGCTAAAACCGGATTTTCAAAAGGCGCTTCGGATTCAACTATAATACCTTGCTTATGAGTGTTTTTAGCTAATGGATAAAAAGCTATATTGCCTTTAATATCAGCTGTGCATATTTGTGAAACTTCATAATCAAAGTCGACAAAAGCCTCATAAATAAGACCATCTGGAGCATTTTTAAGAGCATCCCAAGCTTTTGATATATCTTCTTGAGATTTCATCACAAATTGACCTTTGCCATCATAGCCAAATCTACGTGTTTTGACTATAGCCGGTAGTCCATAATCTTGTACTGCTTTTTCAAGCTTGTCTAGACTATTAATATTTACAAATTTAGCAGTAGCTATACCATGATCTTGCATAAAAGATTTCTCAAGTAATCTATCTTGAGAGATAGCAATAGCTTTCGCAGATGGATATACATTTACATCATGATTAATTGCTTTGATAAGCTCATGAGATATATTTTCATTCTCAAAAGTTATTACATCAAACTGTTTTGCCCATGTAACTACATCATTAATTTGATCTAAATCAATATCTGTTACACTTTTTACAACCTCTTCGGCGCAATCACCTGTTTTACCAAGACAGTGAAACTCTAGACCTAAAGGCGTACCAGCTATACTTAGCATCCTTGCAAGTTGACCTGCTCCAATAATACCTATTTTCATATTACTGTTCCCTCGGATTAGGATTATCTAGTACTGATTGAGTTTGATCTGCTCTAAACTTAGCTAATGCTTGACCAACTTTTGAATCTACAAGCTGCAATATACTTGCTGCAAAAAGAGCAGCATTTTTAGCCCCTGCCACACCAATCGCAAAAGTAGCAACTGGAATACCCGCTGGCATCTGTACGATAGATAATAAGCTATCTTTGCCACTTAACGTGCTAGACTTCACAGGTACACCTAATACTGGTAGATCTGTTTTTGCAGCAACCATACCAGGTAGATGGGCTGCACCGCCAGCACCTGCAATTATTACTTTTAGGCCTCTAGACTTGGCTGTCTCAGCATAATCGAACATTTTGTCAGGAGTTCTATGAGCTGAAACAACCTCACATTCATAGCTAATACCTAGATTCTCTAAAATATCACAACACTCTTTCATTGTGCTCCAATCAGATTTAGAGCCCATGATTACACCAACATCTATACTCATCTCTTTGTCTCCCTTATATGTCATCTTATGGCTTGACCATAGGATCCATTTATAATGATGCTCAACACCTTACTTAGATTCTACGATCAAGTCGTAGAATGACACTACTGAATTATTTGCTTCCAATTTTTAATAACTTCTATCCAAGCTTTACTCTCGAGAGCTTGTACTTTTTCTTTTAAGCTTTCAGCAATATCATCTTTTGTTACATCACATTTCAACTGCAAAACTATATCACCTCCATCAACCTCTTCACTTACTTGATGGATAGTACACCCAGATACACTATCTCCAGCGTCAATAACTGACTGATGGACAGCCAAATCCATTAATCCTGCGTGCTTTGGTAATAGTGATGGATGAATATTTAGAATTTTACCCTCAAAAGCCTTTATAAAGACTGGACTTAAAATACGCATAAAACCAATTAGTAAAATCAAATCAGGATTATATTTCTGGATTTCTTCGACAAGAAGCTTATCATAAACCTCTCTTGACAGACCTTTTGAAGCTATGAATTTATTAGCTATATTTCGATCTTTTGCTCTTTGTAAAATATAAGAATCTTGCTTATTAGAAATAACCAAACTTATCTCAGCATCTATTTGCCTATCAGCTATAGCATCTATTATAGCCTGCATATTAGTCCCACGCGTAGAACCCAATACAACAAGTTTTAGCCTAGACACTTCTAAAGCTCCTGATACTTATTACCACGTAGTAAATTCATATGCTTAATACGCTTATTAATAAGCTCTTTGGTACCTATATCAGGACGGTGAAATAACTTACCGTAAATATTTTTGACTGCGTTTTCAGCTTTTTGCTCAGCTTCAGCTATTGTATCACCTAGACCTAATACTGCTATTGCCCTAGAGCCTGTACCAATTAATTTACCATCTCTAAAATCTACAGCTCCTAAGAAAATTTCAACATTATCAGGGCATTTTGAAATATCTATTTCAAAATTTTTAACTGATTGATTTGGATATCCTAGTGGTACTAGATATTTACATACACTAGCTTGATTTTTAAATTCAGCTTTTACCTTATCAAGAGTACCGTTAGTTATTGCTTGCACTATCTCAACAAAATCTGTTTCAAGTAAAGTTAGCAAATTCATAGCCTCTGGATCGCCAAACCGAGCATTATACTCAATAACTTTTGTGTCATCTTTGGTAGCCATAAAACCACCATACAGAATACCCTGATAAGGTTCGCCAAACTTATCGGCCAATGCTTTTGCAACTTTCTCATTTATCTCTTTTGCTCTAGCTATATCAGAGTCTGATAAAAATGGTAAGCTATGATTAGCATCTGAATAAGTACCCATACCACCAGTATTTGGGCCTTTATCGTCTTCATGTGCACGTTTGTGATCTTGTACAGCTGGCATATGGATAAAATGCTCTCCATCAGTGAAAGATATCAAAGAGAATTCTTGACCAACAAGCTTCTCCTCAATCACAAATTCCTTACCTGCATCTATCAACGACTGACAATGCTTGAGAGCATCACTCATTGTATGTAAATGATCACCCCATACAAGAACTCCTTTACCACCCATTAGACCATCTGCTTTTATGACGAACTGATTTCTATACTCCTTGAGAGTCTCTTCCACACCATCCATGGTTGAGAACTTCCTAAAGAAAGGATTTGCTCCTATATCATAGTCACGGATTAGATCTCTTGTGAAACCTTTTGATGTTTCAAGTTGAGCAAGCTTCTTAGTTGGGCCAACCACACCTATACCATTTGCTTTAAGAGTATCAGCAAGACCAACTTCAAGCGGCGCCTCTGGACCAATAATAGCTATATCAATACTCTCTGCTTTTGCATACTCAAGAACTTCTTCACAGTTACAAATATCACCAACCTTATATCCCTGAGCTATTCTATCAATACCAGGATTTACTGCTGTACTTATACAAAAGAGGTTATTCTTAACAGCACTTCTTTTAACCGCCTCAGCTATTGCATGTTCTCTACTTCCTGAACCTACTAAAAGAATATTCACTTGACTCTCCGCATTTAAATAATTTGCAACATTTTTTGCAATTCTTTGACTAATATTTTTGATATCCACAGGTACTTCAAACTTTTGACCAGTTATCATCTCAAAAAGTGTTATGTATTTTTGTGATAGATCTACAACCAACTCTTGTGGCGCTTGTGGCAAGACATCATCATTATATGGATCGCAGTTTTTTGCAAACCATAATCTAAAAAATTCTTTATCAATATTTTCTGGCTCTTCACCATTTTCAAATCTCTCAGCATAGCTATCTTTTAGCCAAAATCTTGAGCTATCAGGTGTATGAATCTCATCTATTAAAATAATTTCGCCAGTCTTTTCATCAACTCCAAACTCATACTTTGTATCGGCTAATATCAAACCATGTTCTAAGGCTTTCTGCTGACCAAATTCAAATAACTCTAAGGCTTTTTGTGAAGCAAAACCCCATTGCTCTTGAGTTAACCAACCCTCTTTGACGATATCTTCGGCTGAAATTGGTCTATCATGGTCTTGTTCTTTTGTTGTTGGTGTTAGAATGTTTTGTGGCAGCTTTTGATTCTTTTTCAAGCCCTCTGGGAGAATATTACCACAATAATCACGGCTACCATTTTTGTAGTGTGTCCACAATGATGTCGAAGTTGAGCCAGTTATATAGCCTCTGACTACGAACTCAATTGGCAAGACCTTTGCTTTTCTTGCTATTACGACATTTGCATCTGGGGATGCTATAAAATGATTTTTGACAATATGAGCAGTTTCTTTGAACCACCAAACTGATGATTGAGCAAGAATCTGACCCTTAAATGGAATAAACCCTAACGATCTATCAAAAGCTGACTGTCTATCAGTTGATATCAAAATACTTTTATCATCAGTAAAGTACATATCTCTAACTTTACCAATGTATTTATCTTTGATATTAAGATCTGTTGATTTTAAAACGTTTTGTATATTATTGATGATGATTTGCTTATCAATCATTAGATAATTTCCACCTTGCCTGTATTTGTAATCTTACCTATTTGATATAGTTTGGTATTTGTATGCTTTTTAGCTAACTCTTTCATCTTATCAAATTGATCTTGGCTAGCTATTATAGTCATACCTATACCCATATTAAATGAGCGATACATCTCAAACTCACTAATATCGCCAATTCTTTGCATAACTCTAAAGATAGCAGGAGTTTGAAAGCTATCTTTAGAGATATCTGCACCTAATCCTCGAGGTAATACTCTTGGGATATTTTCTATAAAACCACCACCTGTAATATGTGCCATACCTTTGATATCAACACCATTATCTAAGAAATCATGGATAATATTAGTATAGTTAATATGCGGCTCTAGCAACACATCACCAATAGTTTTGCCATCTAGCTCTGGATATGTATCAGTATGCTTATTACCAGCAACATCAAAGAATAATTTACGCGCGAATGAATACCCGTTCGTATGCAAACCTGATGAACTAAGACCAAACACAACATCGCCTTCTTTGATATTCTCGCCATTGATGACTTTATTCTTATCAACGATACCTGTAATGACACCCACCATGTCAATCTCACCTGCTTGATACACCCCTGGCATTTCAGCAGTTTCACCACCAACAAGAGATACTCCACATTCAGCACAAGCTTTTGACATACCTTTTACAAGCTCTTCCATAATTGCTGGATCAAGCTTATCATGAGCAACATAATCTAGAAAAGTGATTGGTTTAGCACCCATCACAACAATATCATTTGTCGCAGCTGAGAAAAGATCATAACCAAGATTCTCAAACTTGCCACACATTACTGCAACTTTAGTTTTAGTTCCAACACCATCTATTGATTGTACTAAAACAGGATCATCATAGTTATTGATGATATCTTTTAGTGAATAAAGAGACCCAAAACTTCCTAAACCTGTCAAAACATTCTTTGTAAATGTTTTTTTGACATGTTCTTTCATTCTATTAACAGCTTCATTACCTGCTTCAATATTTACGCCAGCATCTTCATATTTTAAGCTTGCCATGTTATTTCCTTTCTATATAAATTAGCATACCCGAGCAAGCGGGAATCTTTTCAATCTCATCCATTAGCCTAGAGATATCCACCCAAGAGGATATAACTTGCCATAACAAATTCACTACCTATTTAACTCCTGAGCACACTGAAAAGTATTATAAAGAAGCTCTGTAATAGTCATTGGTCCAACACCGCCTGGTACTGGAGTAATCGCAGCAACTTTATCTTTGACAGCTTCAAAATCAACATCGCCAACTATTTTACCATCGACATGATTAATACCAACATCTATAACCACAGCACCATCTTTGACCATGTCAGCTGTGATAAAACCTGGCTTACCTACAGCTACTACCAAAATATCTGCTTTAGTTGTATGAGATTTGAGATCTTTAGTAAACCTATGACAGGTTGTAACAGTTGCTTTGGCATTTAATAGTAACTGAGAGACAGGTTTGCCGACTACATTACTAGCCCCAACTACTACTGCATGAGCACCTTCTGTCTGTATACCATACTCTTTAAGCATAGTCAGGATACCTTTGGGTGTACACGACTCTAGACACTTTTTATCTCTAAGCTGTAGTCTACCAACATTTGCTGGATGAAAGCCATCCACATCTTTTTCTGGCTTGATAGCATAGATAACTTTTTGTTTGTTTATGTGAGTTGGTAATGGTAGCTGTACTAAAATAGCGTGCACACTAGAATCATCGTTTAACTTATCAATTAATTCTAACAACTCTTGCTCAGTTGTTGCTTCAGGAAGTGTTATAACTTCTGAATTTATACCAACTTTTTCACAGGCTTTTTCCTTTGAGCCTACATAAGTCTTACTAGCAGGATCATCGCCGACGATTATTGCCACTAATTTAGGAACTATGCCAGTTTGTTCTTTGTATTCTCGAAGTTGATCGGTCAATCTCTCTTTTAGATCTATAGAAAGCTTTTTGCCATCGATTAAAGTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP009444|14436:23486|21479_22523_-|WP_042516848.1|DBSCAN-SWA
MASLKYEDAGVNIEAGNEAVNRMKEHVKKTFTKNVLTGLGSFGSLYSLKDIINNYDDPVLVQSIDGVGTKTKVAVMCGKFENLGYDLFSAATNDIVVMGAKPITFLDYVAHDKLDPAIMEELVKGMSKACAECGVSLVGGETAEMPGVYQAGEIDMVGVITGIVDKNKVINGENIKEGDVVFGLSSSGLHTNGYSFARKLFFDVAGNKHTDTYPELDGKTIGDVLLEPHINYTNIIHDFLDNGVDIKGMAHITGGGFIENIPRVLPRGLGADISKDSFQTPAIFRVMQRIGDISEFEMYRSFNMGIGMTIIASQDQFDKMKELAKKHTNTKLYQIGKITNTGKVEII
>NZ_CP009444|14436:23486|16535_16892_+|WP_042516844.1|DBSCAN-SWA
MKTIEIGNKAEEQASKFLRTINLQILAQNFRALPYGEIDIIALDQNTLVFIEVKYRSKTKFAKAEEMLTYSKQQKLINAANIFLQENPKFENYECRFDLIAINKEDINNWIKNAFILN
>NZ_CP009444|14436:23486|17987_18479_-|WP_013922212.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP009444|14436:23486|14436_16443_+|WP_042516843.1|DBSCAN-SWA
MNSILEESNLPKLAEFKTDEVKPAIDYLFEHAETNLQKALQEQNPSWQTLLQLEVDDEKISQAFSTIAHMNAVCNSKELRESYEYAVTKLTDYYTKLGQNKDLYNLYKQIQNHELNAEQAQAIKKAIVGFEQSGVNLDESKRKRLQEISQELAQLTTKFENNVLDATMDWLYTTNDEKELKGLSQNNIESAINKAKQKNISEKYALGIDIPTYLAVLQQADNRKLREKLYKAYCTRASKEADNKNFDNDDNIEKILKLRAEKSQILGFDNYAENSLFTKMAESPTEVLELLNNLLQKSLPQAKKELNELRRFAEDAGLVDALQPWDTAYYSEKLKKAKFDFTEEELREYFPLERVLEGLFKILNKIYNLEITENRNYTKYVAEQQTFDFFKDGEYIGSIICDFFARDNKRGGAWMDGSRTAFIKLDGLAQKPVAYVNCNFMPPSKDGANLTHSDVVTLFHEFGHALHHILSRVTIASISGTNGVEWDAVELPSQFMENFCWCEEGLALISGSRDGKALSNKQIDKLVGTRYFQSALMMVRQLEFAIFDMNIHYKKLTTATEVQNELDSIRERVNLLKTPSYNRFQNGFSHIFAGGYAAGYYSYKWAEILSSDVFSRFENEGILSNKVGNDLLENIISKGSSRDAMDNFVAFMGRKPNEEALLRHSGIN
>NZ_CP009444|14436:23486|22637_23486_-|WP_012279910.1|DBSCAN-SWA
MTLIDGKKLSIDLKERLTDQLREYKEQTGIVPKLVAIIVGDDPASKTYVGSKEKACEKVGINSEVITLPEATTEQELLELIDKLNDDSSVHAILVQLPLPTHINKQKVIYAIKPEKDVDGFHPANVGRLQLRDKKCLESCTPKGILTMLKEYGIQTEGAHAVVVGASNVVGKPVSQLLLNAKATVTTCHRFTKDLKSHTTKADILVVAVGKPGFITADMVKDGAVVIDVGINHVDGKIVGDVDFEAVKDKVAAITPVPGGVGPMTITELLYNTFQCAQELNR
>NZ_CP009444|14436:23486|18583_19168_-|WP_042516846.1|DBSCAN-SWA
MSRLKLVVLGSTRGTNMQAIIDAIADRQIDAEISLVISNKQDSYILQRAKDRNIANKFIASKGLSREVYDKLLVEEIQKYNPDLILLIGFMRILSPVFIKAFEGKILNIHPSLLPKHAGLMDLAVHQSVIDAGDSVSGCTIHQVSEEVDGGDIVLQLKCDVTKDDIAESLKEKVQALESKAWIEVIKNWKQIIQ
>NZ_CP009444|14436:23486|16888_17986_-|WP_042516845.1|DBSCAN-SWA
MKIGIIGAGQLARMLSIAGTPLGLEFHCLGKTGDCAEEVVKSVTDIDLDQINDVVTWAKQFDVITFENENISHELIKAINHDVNVYPSAKAIAISQDRLLEKSFMQDHGIATAKFVNINSLDKLEKAVQDYGLPAIVKTRRFGYDGKGQFVMKSQEDISKAWDALKNAPDGLIYEAFVDFDYEVSQICTADIKGNIAFYPLAKNTHKQGIIVESEAPFENPVLAEKAQQIAKTLVKEFAYVGTLAIEFFVKGDELIVNEIAPRVHNSGHWSVDGSITSQFENHVRAIAGLILGDTTSRKTVMLNCIGGMPATKDLAALDRVKIHSYNKEPRKGRKVGHLNLNLNDETDAYQLLQAKKLIELSQEL
>NZ_CP009444|14436:23486|19170_21480_-|WP_042516847.1|DBSCAN-SWA
MIDKQIIINNIQNVLKSTDLNIKDKYIGKVRDMYFTDDKSILISTDRQSAFDRSLGFIPFKGQILAQSSVWWFKETAHIVKNHFIASPDANVVIARKAKVLPIEFVVRGYITGSTSTSLWTHYKNGSRDYCGNILPEGLKKNQKLPQNILTPTTKEQDHDRPISAEDIVKEGWLTQEQWGFASQKALELFEFGQQKALEHGLILADTKYEFGVDEKTGEIILIDEIHTPDSSRFWLKDSYAERFENGEEPENIDKEFFRLWFAKNCDPYNDDVLPQAPQELVVDLSQKYITLFEMITGQKFEVPVDIKNISQRIAKNVANYLNAESQVNILLVGSGSREHAIAEAVKRSAVKNNLFCISTAVNPGIDRIAQGYKVGDICNCEEVLEYAKAESIDIAIIGPEAPLEVGLADTLKANGIGVVGPTKKLAQLETSKGFTRDLIRDYDIGANPFFRKFSTMDGVEETLKEYRNQFVIKADGLMGGKGVLVWGDHLHTMSDALKHCQSLIDAGKEFVIEEKLVGQEFSLISFTDGEHFIHMPAVQDHKRAHEDDKGPNTGGMGTYSDANHSLPFLSDSDIARAKEINEKVAKALADKFGEPYQGILYGGFMATKDDTKVIEYNARFGDPEAMNLLTLLETDFVEIVQAITNGTLDKVKAEFKNQASVCKYLVPLGYPNQSVKNFEIDISKCPDNVEIFLGAVDFRDGKLIGTGSRAIAVLGLGDTIAEAEQKAENAVKNIYGKLFHRPDIGTKELINKRIKHMNLLRGNKYQEL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_042516843.1|14436_16443_+	M3 family metallopeptidase	A0A1V0SID3	Klosneuvirus	2.6e-50	26.8
WP_042516844.1|16535_16892_+	YraN family protein	NA	NA	NA	NA
WP_042516845.1|16888_17986_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_013922212.1|17987_18479_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.5e-20	42.5
WP_042516846.1|18583_19168_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	7.5e-22	36.9
WP_042516847.1|19170_21480_-	phosphoribosylamine--glycine ligase	A0A0M4JBD3	Mollivirus	2.3e-26	31.3
WP_042516848.1|21479_22523_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A1D7SQF5	Cyanophage	5.4e-55	36.3
WP_012279910.1|22637_23486_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.4e-32	40.7

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP009444|34630:80394|DBSCAN-SWA
TTTACACATTTTGTTTAAAATATCTCTCTAGTTTCTCATATGGAGTTAAATTATCAATCCCCTTGTGAGGCTTAACAGTGTTATAAAAATTCAAAAATCTTCTAAGCTCAGTTCTTCTTTGTTCTTCAGATGAAAAAATAGTTTTGTCATGCCACATTTCCAAAATAGTACGAATTACTCTTTCTGCTTTACCATTTGTCTGAGGTCTAGCTACTCTAGTAAATTTTTGGTTGATTTTATATTGCCTACAAGCTTTAACAAATTCATGGTCAGTAGTACCTTTATATTCAGTGCCATTATCAGTATAAGCTATTTCTATCGTATATGGACATTCATCAACCAAACGGTGTAGAAACATTGTAGATGAGAATTGACTCTTATCAGGCAAAATATCAGCATAAAGCTCCCTAGAATAAGCATCTATGCCTACAAATAGATATTCTCTAAGCTGTGAATCTTTTATCGCTGGTAATCGTTTAGTATCAATATTAAACATTTCTCCTGGATAAGACTTGTTAATCTGTTTAGCCTTAGCTTTGAGTTTTAACTCTAGCTTCCTTTCAACTTTAGCTAATCTACGAATACCATAAAACATACTCTTGTATCGATGGTTTGTACTATCTTTCGGATAAAAAATACCGCTACGACATTGCTTTAATACTTTCAATATTGTTTGTCTAGATACTCTAAACTTCTTAGCTAATATTGATTGTGTGAAACATCTTGTTTGGTACAGTCGCCAAATTTCTTTTCTATCTGTTGGAGTCAGCCTTATATTTTTATGCATCTTCATCGTTTACATTTTATCCTAAAGTATTATGTAAACAACCCGGTTAATTCTTACAGAAGTACCATTTAAAACAATTTCAAAAATGATAACTGCTAACACAGGTGCTCCAATAAGAAATATTGCCATAAATTTTATTAACATTGACAAAACTATCTCTACAGGATGAAAACGTAGTCCTGTGGTAACATCATAATCCAAATCAATATGATGAACCTTATGAAATCTCCATAACAATGGTAAATAGTGAAATAATACATGCTGAAGATATATTGTAAAATCTAGAGCTAAAAAAGCTACTACAATCTTAAACCAGGCAGGTATATCAAAAAGATTCAATAATCCTAAATTATATTGCTGACAAAATATAGCCACTCCAACAGCAGCTGTAGGAAATAAGATTCTTAATATCAAAGTATCTAAAAACACTAGCAATAGGTTATTAAACCAACGAGAGACTTTAGAAATCTTTAATTTGCGCATAGGAGCGACAATCTCCCAAATAGAAATCCCAAGAAGAATAAATAGAAAAAAACCTAACCTAGCTATAACCTCATAACTCATAATCTAATCCGTAATAACCCCACACCACATTCTAGTGCCTCCACCTCCTAGAGGTTTTGGAGTATCTGAGTAATTATCGCCTCCTTCATGAATCATCAAACTATGTCCCTCAAGCTCTTCTAAAGAATCAAGTCTTGGTGCTACCACAGGTTCAGTCGCTGTACCATCAGCATTTACAACCAGCTCTGGTAAATCCCCTTTATGTCCATTGTCATTATAAGGACCAAGATGTTTACCAGTATTATCAGGATCCCAATGCCCACCTGCAGCCATACCACCATCATCACAACTAGGATTAATATGGATATGCATACCGTGTACACTTGACGCTGGTAAATTATATAAATAAGGAGTAATAAGCATACCCTCTTGCTTACCATCATGAATATAAGGAGATATTGTAACCGTGCCCACTTCTTTTTGAGTTTTAACATCTTTCATATGGACAATTAATTCAAAATCATGATTAAGGTCATACTCTTTCTTCTCAGGCATAAGTGAACAATTCGCCAACAAAAACGTAATCATCCCAACACCTAATAATTTATAAACATTATTCATATATACACCTCTAAAAATTGTAGCTTATACATTTACAATCATACAAATATTTATTTTTTTAATCCATAGTTTAAATTGCAATTAATGTTATCAACTATAAAAAAATATATAATCTAAAGTATGTTGCTAAGAGGAGAATTTTATGAATAAAATACTATCGATCATTTTTATGACTATTCCATTAATTAGCTTTGCAGATACACCTAGTTGGCAAAATTTTGATAAACAAAAAGCCTTAGCTAATCTAAGTAAACAACAATACTATGTAACTCAACAAGGTGGTACTGAAAGAGCTTTTAATAACGAATATTGGAATAACCATAAACAAGGTATTTATGTTGATGTGGTATCTGGTGAACCTTTGTTTAGCTCTACAGATAAGTATGATTCTGGAACTGGGTGGCCAAGCTTCACAAAACCTATAGATAATTCATTTATCAAAACCAAAAATGATAATAGCTGGTTTATGAGTAGAACGGAGGTTCTGTCTAAATATGCAAACTCTCATCTAGGTCATGTCTTTGACGATGGTCCGCAACCTACCGGCAAAAGATATTGCATGAATTCCGCAGCTTTGAGATTTATACCTAAAGAAGATATGCAAAAAGAAGGTTATGGTAAATATTTATACCTATTCAAATAAACCTTTGATGTAATTATTTGTTAAAACTTTAATAAGTGCTATCATTTAAATACATTATGTTTAAATAAGGATAGAGGTAATGGACAGTATATTTTTTGGCCAAATTATTTTTAATATCTCTATCATATTATACTGTGTCCAGTTTATTCCACAAATAATACACAATTATAAAAACAAAAACTCTCTATCTAATATTAGTGTATTAACTCAACTTGGGATTTTCATAACCGTATTATGTGACATTATACAAACTATTAGTTTTGGATATGAATGGCAGTATGCAACAGTTGCCATAATATATTTAATAGGAGTATCCATACAACAGCTACAAATTTCTATTTTTCACAAGAAATTACCTGAAATAGTTAACTTCAGCTTTATTATTCTGTTTATGCTTGCATTGCTTGCGATGGGTTCTGATAATGAAAAAATATATAGTTTAATAGAATACATTGGCTTTATTGTAAATACATTGTATTGGTTACCACAAATTTACAAAAACCATAAACAAAAAAGAGCTGACGGTTTTTGCTTATGTTTTATATTGATAGCATTAATAGGAACTAGCCTTTATATAGCAAGTAGTTTTATACTCTCATGGGGACCAACATTTACACCAAATGCATTAATAATTCTTCCTGCATTGATAATACTTTTAGTACAGAAATTTTATTACAAAAAATAACTCTTGTATTACAATAATTATCCAATAATAGCTAGATTTTAGTTAACTACGACCATATAATTTATTAATAAATTAAATATTGAGTTTAATAAATTTATTACGCATGGAACTATCAACCAACACTCAAGAACTTAGTGAACTAATCCTAAATATATCGCTCGTAATCTTTTTGATACAATTTGTTCCTCAGGTTGTGCACAACTCAAAAAATAAAGAAGCTCTAAATAATATAAGTATGTTTACTCAATTTAGTCTACTTACTTTTACACTTTGTTGTATTGTACAAATAGTTAGTCTAAACCTTGATTGGAGATTTCTAGTTATCGCGATGGGTTGTCTAATTGGAATCACAATACAACAATTACAAATATCTTTTAATAACAAAAGAATGCCTGAAGTAATCAATTTGGTTTTTGTGATGCTAATTACAATTGCAATATTAGCTATTCGCTATAAACCTAATATTATGTATACAATCACAACTATTCTTGCAGTGTTGATATGCTTTATATACTGGTTACCTCAGACATACAAAAATCACAAGCAAAAACTTTTTACAGGATATTGCTCACCATTTATTATCTTAGCTTGGTTAGGACTTTTGTGCCTCGTAATTAATAGCTTCTTGCTTTGCGCGCCACCAAGTATAAGAATAGGACTGATTGCAGTAACTGTAACAATACCTTTATTAATTGTTCAAAAACTGTTCTATAAAAACTCAAAAACCTAACCTAAACATCTTTAAACTAAAAAATCTAAAAATCCTAATATATAAAAAGCTAATAAGTTTAATCTTACATACTAGGGCAATATTAGAAACAAAGAAGCTTTTTGTCTAAAATGGATATTAGATTAGACAAATTTAGTTATCATTTATGCTATTATAAAAAAATACACTATTTATTATTGTTGACTATGTCAGGAAATACTTTTGGTAAAATTTTTACAGTAACAACATGTGGCGAGAGCCATGGTGATTCACTTGCAGCGATTATCGATGGTTGCCCAAGTAATATCCCTCTCTGTGAGGCAGATATACAACTTGAGCTAGATAGACGCAAACCAGGTCAATCAAAATTTACAACTCAACGCAAAGAGCCTGATGAGGTTAAAATCATCTCGGGTGTTTTTGAAGGTAAAACTACAGGAACTCCAATAGGCCTAATAATAAAAAATCAAGATCAAAAATCAAAAGATTATGGTGAAATAAAAGATAAATTTCGCCCAGGTCATGCTGATTATACATATTTCAAAAAATATGGAATTCGTGATTATCGTGGTGGAGGAAGATCTTCTGCTAGAGAGACAGCAATGCGTGTAGCTGCTGGTGCAATAGCAAAAAAAATGCTTAAACATCATGGCATCGAAATTTTTGGCTTCTGTTCCCAAATTGGTGATCTCAAGATCGACTTTATAGAAAAAGATTTTATTAATCAAAATCCCTTTTTCATAGCTGATAGAGATGCTATTACAAGCTGTGAAAGCTTAATTCATAATATTCGTAAGCAAGGAGACTCGATCGGTGCAGAAGTTACAGTCATCGCTACTGGCTTAGAAGCAGGACTTGGTAGACCAGTTTTTGATAGGCTTGACGCAACTATTGCTTACGCTATGATGAGTATTAATGCTGTAAAAGCAGTCAGCATTGGCGATGGCTTCGACTGTGTTGCTCAAAAAGGCAGCGAACATCGCGATGAAATAACTCAAAAACAAGGTTTCTTAACAAACCATGCCGGGGGAATATTAGGTGGTATATCAAC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MSIGIILLIIIAIAAVYIVMTYNKLIAEIETVKNSEKQIDVQLDRRAKVFDSLVNVVKKYMDYEQTTLKQVVALRNQANLAKANGDIQERINAENQISDLAKGINVQFENYPELKANQNVIQLQEEITSTENKLAFAKQALNDSIERYNAHKKSFFAGMVVNIFKKLNEEFVYWNISEEKKQQLEDSRVEL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_042516855.1|34630_35422_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_004286440.1|35983_36541_-	superoxide dismutase family protein	Q9MC02	Salmonella_phage	2.3e-36	52.7
WP_042516856.1|36683_37184_+	peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB	NA	NA	NA	NA
WP_042516857.1|37263_37869_+	PQ-loop repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042516858.1|37972_38599_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042519096.1|38784_39843_+	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	3.4e-81	45.5
WP_012279925.1|39845_40448_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_012279927.1|41214_42585_+	DNA repair protein RadA	NA	NA	NA	NA
WP_012279928.1|42588_43128_+	CvpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_042516860.1|43124_44123_-	NAD(P)-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_035735071.1|44435_45086_-	peptidase C39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_035735070.1|45227_45593_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_042519100.1|58888_59809_-	bile acid:sodium symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004286486.1|59945_60083_-	DUF2256 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517741.1|61432_62224_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_042516872.1|63907_64138_-	TIGR03643 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_042516873.1|64160_64883_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	Q56AQ6	Bacillus_thuringiensis_phage	6.2e-34	37.1
WP_042516874.1|64985_66305_-	30S ribosomal protein S12 methylthiotransferase RimO	NA	NA	NA	NA
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WP_042516880.1|71919_72282_-	chorismate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_035735051.1|72293_73250_-	4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase	NA	NA	NA	NA
WP_042516881.1|73230_73695_-	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_042516882.1|73876_75133_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_173405548.1|75129_76233_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_042516884.1|76306_78022_+	aspartate-alanine antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_042516855.1|79602_80394_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP009444|394832:438952|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP009444|394832:438952|434593_435217_-|WP_042517150.1|DBSCAN-SWA
MGNIANKWFDIDYLLNKELYKEVAKLTPKQLAENLAFRKYFLNLKVYNSSYKASFFWERDRLLDSKIKHYHYVLDNDYTKLDYIAKKADLNYVAGTNELNILVNTTSTLDDVAKAIKKMVKLHRAEYSITTNKKDVINSFVKNKYLQILDLMIFCKFENKKFRAIDVNEFIFYDDPKEVSNLTSKKYGIIPKALKKVSKEYISRLFF
>NZ_CP009444|394832:438952|427939_428212_-|WP_042517134.1|DBSCAN-SWA
METKEQNRLNLSDIVKTTRISKNITQTELATKLGISKQYICDIENNRKPISIELAKEFAKVLEQSERDFVEMTLQELLIKNNLNYCVIVI
>NZ_CP009444|394832:438952|430564_431461_-|WP_042517139.1|DBSCAN-SWA
MNITKFNQFISQLGYQLPNDFNYSIGINQIVRFKDVNKLKDNKNLWLHRLSLNSYVFGDWSRNEKHIYNDNREYTKQEYKHYYKAKQKQEYLEYKEHRAIANACVNEYSKLADVDPQHPYLVKKQVLPCFGMKQKGNAIVVPIFGTIAPFEGDLQSLQYILPDGFKQFRKGAKYKGGCFNVNDNGTDYFIYAEGLATSLSILRYVQKRLIRATIICCFTCGNLEPVISYMRRIYPKAYFEIWADKDKSRVGQETAIKIAERFDNIKVRLPDLTPEQVEQGYSDFNDWFNLHGVFNNEK
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MNTTLQTQSNNLKCSISGVETLVPSSDNTAHKISVESNENISNGCNCISNQYTLSQLIYWYINLYIINSLLALAKLFCLVGRNGEYKSQFTGKYPLLGLVLVSNLPDYISKNKTKRG
>NZ_CP009444|394832:438952|394832_395297_+|WP_042517099.1|protease|DBSCAN-SWA
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MEMWHDKTIFSSEEQRRTELRRFLNFYNTVKPHKGIDNLTPYEKLERYFKQNV
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MKKSKKSNQKNEPKELIQLVEIEPRSTASEDPDTVEQNHYKEMIKIIKRKPYHYMDMLQDLPIPDGYQIVIKHRLKHLEEHQRTRILNKYIKKWWLFWEIDPYTPHQKCDHWLQDYLKKLKEKN
>NZ_CP009444|394832:438952|410110_410764_-|WP_042517113.1|DBSCAN-SWA
MEVLNKKSELDIYIISTVCIVGIAVSLACNLVYFFWYKIDVFGYTFIFSLAGFFYPITFAVVDLIAYLKKGFFPIFIAIVMRLADGLFSNIPSLSETFQNHAYMPPDSLKHLSNSVTALAPNLSSLWYHGVIVSTITVVTEILIFKKILKIFNNAPLAIIMATSLTIFVHNMLLDYSMLKSFDNHWNIIFGNYILNILMVSLYALIVAVILKVRKQN
>NZ_CP009444|394832:438952|432424_432634_-|WP_013922665.1|DBSCAN-SWA
MKVSKECKNQKVFEHLNSGMTLTPAEAYREYGTMRLGAIVYDLKQKGYHIENTNPRGKYAVYKMVKFTK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_042517099.1|394832_395297_+|protease	hydrogenase maturation protease	NA	NA	NA	NA
WP_042517102.1|395306_395696_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_035737259.1|395783_397463_-	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	2.7e-40	26.4
WP_042517104.1|397675_398896_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_012280250.1|398911_399124_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517105.1|399271_400558_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_042517107.1|400538_401498_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_144402801.1|401672_401903_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_173405532.1|402010_402172_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_173405533.1|402215_402506_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_042516855.1|402583_403375_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144402802.1|403390_403669_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
403397:403456	attL	NA	NA	NA	NA
WP_052471061.1|403715_404741_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_052471062.1|404786_405371_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_042517110.1|406401_407322_-	ribokinase	NA	NA	NA	NA
WP_042517112.1|407438_410015_-	aminopeptidase N	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	2.2e-25	24.2
WP_042517113.1|410110_410764_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517115.1|410764_412126_-	bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase TrpC/phosphoribosylanthranilate isomerase TrpF	NA	NA	NA	NA
WP_042517116.1|412218_412632_-	GyrI-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517118.1|412656_413247_-	HD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_173405549.1|413257_413935_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_042519141.1|414065_415073_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	2.8e-40	37.5
WP_042517123.1|415069_415648_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	7.4e-30	38.5
WP_042517124.1|415651_417196_-	anthranilate synthase component 1	NA	NA	NA	NA
WP_004286833.1|417196_417484_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_004286832.1|417938_419435_-	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_042517126.1|419917_421393_+	chromosomal replication initiator protein DnaA	NA	NA	NA	NA
WP_004286830.1|421430_422534_+	DNA polymerase III subunit beta	B4UTW9	Rhizobium_phage	6.8e-32	25.3
WP_042517128.1|422535_423684_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517130.1|423842_425372_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_042517132.1|425368_425836_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004286827.1|425926_426232_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004286826.1|426327_427200_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_035737292.1|427349_427538_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_167524317.1|427544_427721_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517134.1|427939_428212_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_042517135.1|428455_428830_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517137.1|429120_430575_-	DUF3987 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517139.1|430564_431461_-	toprim domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517140.1|431477_431996_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517142.1|432000_432354_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013922665.1|432424_432634_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052471063.1|434061_434277_-	AlpA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_042517150.1|434593_435217_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517152.1|435327_435606_-	type II toxin-antitoxin system mRNA interferase toxin, RelE/StbE family	NA	NA	NA	NA
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WP_042519143.1|435908_436145_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517155.1|436134_436659_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517157.1|437713_438952_-|integrase	site-specific integrase	B7SYF8	Stenotrophomonas_phage	6.9e-33	26.1
441228:441558	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP009444|517372:529140|DBSCAN-SWA
TATGAAAAACATCAGAAACTTTTCGATAATTGCACATATTGACCATGGTAAGTCGACTTTGTCAGATAGATTTATACAGGTATGCAATGGTCTTAGTGAGCGTGAAATGAAAGAGCAAGTCCTAGACTCTATGGATATAGAAAGAGAGCGTGGAATCACTATCAAGGCACAATCTGTAACTTTAGACTATGTAGCTAGAGATGGTCAAACATATCAGCTTAATTTTATTGATACTCCTGGGCATGTTGATTTCTCTTATGAAGTATCGCGATCATTAGCGGCTTGTGAGGGTGCTTTGTTAGTTGTAGATGCAGCCCAAGGTGTAGAAGCTCAGACAGTAGCTAATTGCTATACTGCTATTGAGCAGAATTTAGAGGTTATACCAATTCTAAATAAAATTGACTTACCATCTGCAGAACCTGATAGGGTTGCAGAAGAGATTGAAGAAATTATTGGTATCGATGCAACTGGAGCAACTACATGTAGTGCTAAGACGGGCATAGGTGTTGAAGATGTTTTAGAAACAATTGTTGCTAAAGTTCCAGCACCAGAGGGTGATGTTAATGCAAAACTACAAGCTTTAATTATAGATTCATGGTTTGATAATTATCTTGGAGTGGTTTCCCTTGTAAGAATCAAAAATGGTACCCTTAAGAAGGGAGAGAAGTTTAAGGTTATGTCAACTGGAGTTTCATATCAGGTTGATAGAGTTGGGGTATTTACACCAAAGATGAAAGACCTAGATCATTTAAAAGCTGGTGAGGTTGGTTTTATTGTCGCGGGTATTAAGGATATTCATGGAGCTCCGGTAGGTGATACTCTGACTCATACGCATAATCCAACTGATAAGCCTGTTCCAGGATTTAAAAAAGTCCAGCCACAAGTTTATGCAGGGATGTTTACTATAAGTTCTGATGATTATCCTGATTTTAGAGAAGCTTTGGATAAGCTAAGTTTAAATGACGCTTCATTATTTTTCGAGCCAGAGGTTTCGCAAGCTCTAGGTTTTGGCTTTAGGTGTGGTTTCTTGGGTATGCTTCATATGGAGATTATTCAAGAAAGATTAGAGAGAGAGTACAACCTTGATTTAATCACTTCAGCTCCAACAGTTGTCTACAAGGCTGTCAAAAAGGATGGTGAAACTATAGATGTTGATAACCCATCAAAATTGCCAGAGCCAGGTGCAATAGCAGAGATACATGAGCCAATTGTGAGAGCGAATATTCTTGTTCCAAAAGATTATGTTGGAAGTGTAATTACGATATGTGTTGAGAAAAGAGGTGTCCAGGTTGACCTTAACTATGTTGGTAGTCAGGTTTCTATAACTTATGATTTACCGATGATTGAAGTGGTATCAGACTTCTTTGATACTCTTAAATCTGTTACAAAGGGTTATGGATCTTTGGACTATGAGTTAATTCGTTATGAAGCAGCAGATATGGTTCGTTTAGATGTACTTATTAATGGCGATAAAGTTGATGCTTTAGCAAGTATTGTGCATAAAGATCAAGCTAAATATAAAGGTAGAGAACTAGTTGAGCGCCTTAAAGAACTAATTCCAAGACAAATGTTTGAAGTTGCTATTCAAGCCGCTATCGGAGGAACTATTGTTGCCAGAAGTACAGTTAAAGCATTGCGTAAGAACGTTTTAGCAAAATGCTATGGTGGTGATGTTTCGCGTAAGAAAAAACTGTTAGAGAAGCAAAAAGAGGGTAAAAAAAGAATGAAGAATATTGGTTCTGTTGAAATTCCTCAAGAAGCTTTCTTGTCAGTTTTGAAGAAGTAATATTTATAATTATTACTATTTGTAGTGACAGATCATTGATCTGTTAACTTATATTAATCTATCTTAAGACAGCACACTGTGCTGTCACTACAGAAAGGTATAGATATTTAAATATGCAAAATAAAAAAATAATAGTAGGTATCTCAGGAGGTGTCGATTCGTCTGTTTCAGCGCTGCTTTTAAAACAGCAAGGCTATGATGTAACCGGTGTATTTATGAAAAACTGGGAAGAAGATGATACTGATGAGTTTTGCTCAGCAGAGCAAGATATTGCTGATGCTCAAGCAGTCTGTGATTCTATTGGTATACCTTTTAAGAAAATAAACTTTGCTGCGGAATACTGGGATAATGTCTTCGAGCATTTCCTTACAGAATATAAAGCTGGTAGAACGCCTAATCCAGATATCTTATGTAATAAAGAGATTAAGTTCAAAGCCTTTTTGAGCTATGTACATCTATTAGGAGGCGATTATATCGCTACAGGGCATTATGCTCGTACTAAGGTGGCTGATGATGGTTCGGTACAGTTAGTCAAAGGCCTTGATGATAGTAAGGATCAAACATACTTCTTATATACGCTTGGTCAAGAGCAGTTAAAACAGACGATGTTTCCTATTGGCGATATTGAAAAATCTAGAGTACGTGAGATAGCCAAAGAGAATAATTTGGTAACATTCGATAAAAAAGATAGTACAGGGATATGTTTCATAGGTGAGCGTAAGTTCAAAGATTTTCTATCAAAGTTTTTGCCAGCTCAAAAGGGTGAAATACATGATGAAAATGGTATCAAGATTGGTATGCATGATGGGCTTATGTACTATACGATTGGACAAAGACAGGGTCTTGGTATAGGTGGTGTGAAAAATCGTCCTGAGATACCGTGGTTCGCAGCCCAAAAGGATTTAGAAAACAATGTTTTGATTGCTGTTCAGGGTCATGATCATCCAATGTTATTCAAAGACACATTACAGGCTATAGACCTTAGCTGGGTAGCTGGATCTGCTCCAGCAGATAGTTTTAGATGTAGTGCTAAAGTTAGATATAGGCAAAAAGATCAACCTTGTAGCGTAGAGGTAAATAATGATGGTTCAGTTAATGTAGTTTTTGATGAACCACAAAGAGCAGTCACTCCAGGACAATCTTTAGTCTTTTATGACAATGATGTTTGTTTAGGAGGAGGTATAATTATCTAGATTTCTATCAATATTTACAGATTATAGATTAATTATTATCACTTGCTAGAGTTGTTTTTTGAGTGTCTGTGACGTCAGCTTGTTTTTCTTGAGTTGAGCTAGGGATAGAGCTACCACTTGTAGCTGTCTCTAAAGTACTGCCACTATTGGCGATAATATCATCGACAGCGCTATCTTGATCTGCTTTTGTAATTAACTCATGATCTAATGTTGCAGCATCACTTGAAATTTCTTGGCGAGTATAGCTAGATTTGCTAGTGGTAGTATCAACTACATCATTCAAATAAACTCCAACTTCTTTTTTAACATCCTTTTGACTCTTCAGAACGTCTCTCTGCATAAATTGTGCTTCATGTACTGTATCAATAGTCATATGTGTATATAAATATTCAGGATCAATAATATAAGGTCTAAGAGAAGTGTTATATTCCTTCTCTAGCTCAGGGAAGTTGACTGTATATGCTACTTTGATACGTTTTCTACCATTACTATCTGTTATTAGCATTGCAACAAGATCAGCATCTATCTTATAGTCTTTTCTGACTAAGTGATATTGTTGTTTTCTATCTAGTACTATTTGTCTAACAGGAGTTGCATATACATTTTCAGTCTTTATTGGTTTACTAACAGTTGTGATTCCTGCTTTTTGAAGCTCTGCCATAGCACGATCACCATAGTTATCTTTAGCCAATCTAAGATCAATTTCAATCATTTTAGCAAGTACTTTTTCTCTAAAATCTCTAGTTTGTTTTAGATCAAATGCAAGACATGTTCCTGTACCATCTTTTTGGAAACAGCCATTTCTCTTATCTATTAGTACAAAAAGCTTTCTAGTTTTATCATAATATAACTGGTAATCAGGAGTATTATCGCCGTGACCTAGATAAACGAATTGGTCATTAGATAACATTCCACATGAGGCAACAGCTAAAATTAATAGTAATAGTGATATTTTACTGAATATTTTACGCATATTTTAAATTCCATGATTTAACAAACAGTTTCAAGACATAATTCTTGCTTAGTGACGCTGAAAAGTAAAGCCTTGATTATAGGAAAATACTAAAAATTAAGCATTGGCATTTTCTTGCATCAATTTTTTATATTTTTTCTCAATCATTTTTCGCTTAAGTGGACCAAGATGATCAAAAAAAGTAACACCATTTAGATGATCTATTTCATGTTGGATACATCTTGCTAAGAAATCATCTTTTTCAACTTCAATCTCTTCACCAAACTCATTAAGTGCTTTTATCTTAACTCTAGTTGCTCTATTTACCTTAGCAGAAACTCCAGGAAAAGATAGGCAACCTTCTTCATCAATTATCTTACCACTCTGGTCGATTATCTTAGGATTGATGATAGTAATTATTTTAGGAGTCTCACTCTCTAAGTTATCATACATTATAAAAAATCTCTTTTTTATACCAACTTGTATTGCAGCTAATCCTACACCATTTGCTTCTATCATTAATTCAGTCATTTCAGCTATTGTTGCTCGAAAATCATCATCTATCTCTTCTAGTGAGACCTCTTGTGCAATTTCTTTGAGTATAGGATGAGGATATTTTAGAATCTCTAAAGACATATTTTATACTCCTTGTTCTAATATATCTTTTTTCATTTTTGCCATAGTTAGAGCTGCTTGGACACAGTATTTACCTTTGTGCCCCTTTTTACCGCCGACTCTTTCTAATGCTTGTTCTTTGTTGTGTGTAGTTAATATACCAAAGATTACAGGAAGGTTATACTCATGCATAACTCTTTGTGTGCCATAACTTACTTGATCACAAACATAATCATAGTGGTCTGTCTCACCTCTGATTACGCAACCAAGAAGTACAACAGCATCAACTTGGTTAGTCTCTGCTAAAAGTTTAGCAGCATAAGGCAGCTCTACTGCACCAGGAACTTTTTTGATATATATTTGACTATCTTTTAGACCTTGAGCATAAGCTTCTTCTAAGGCTCCTTCAAGCATTTTATCTGTTATTAATGAGTTAAATTCACTTACGACAATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_042517268.1|521941_522385_-	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	4.2e-25	43.6
WP_042517271.1|522388_523600_-	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	6.2e-87	44.3
WP_042517275.1|523592_524198_-	riboflavin synthase	A0A1V0SE20	Indivirus	7.2e-20	37.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MHQISYRKDIDGLRAFAVLSVVLFHLQINWIKSGFLGVDIFFVISGFLITKIIVRDLQDGTFSIKNFYLRRIRRILPALIFVLAFSSFFAWLILLPQDLLNYAKSMGSAIASISNLFFFKTLNFGYFATDSSIIPLLHTWSLGVEEQFYIAWPVILIILFKLNTSSKKYLLTITSLLIIVSVAIFFYKHFPKFYYLPINRGFELLFGCFLAISLNNRQQKSPNKTLLDIYSFVSLILMAIPIFLISVNYPSFWMIVTCLGATLFIYSGSLGYTPFINRIFSIKPFVAIGVISYSLYLWHWPIIAYLNYLSITITIDIAVIVITLSIILATISYLFVEKPFRHKFKFSFLKSLILLWIIPLVISICFYTASKHQGFGFNHPNIDQNKLTFKYGFDKVDHNGCFYNFDVDSSVTTDNPYYTTYREQYSEKLCKLYPNKKSTILVLGNSHARSDWPMISEWVKNADLNATLLSMSLNSPKAPYPDELGQHTGNKIMDQRFDFAQRAVAKNSDYKTIIIASLEGVGINKFNIFGEIAKTALKNNKNIILIIDTPYLGYPAHGFIQNKNTSNLCAINKIHTNCDISSKTYHKWLEPQLKMYKKLKDKYPNQVFVINPSKAICGSTSCKTSINGIPIFADSHHLNYLGSELLGKQYIKEFGNPIAKILS
>NZ_CP009444|838610:851743|841198_841483_+|WP_042517628.1|DBSCAN-SWA
MKDNLILDKSFNFSIRVVKLYKYLCENRKEYVLSKQLVRSGTSIGVNINEAQACQSKADFIAKMCIASKEARETKYWINLLIKTDYLDKDDKNV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_012280619.1|838610_839984_+	mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase	A0A1V0SH58	Hokovirus	2.7e-54	31.0
WP_012280620.1|840012_841152_+	GDP-mannose 4,6-dehydratase	M1HAR7	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	9.5e-122	59.4
WP_042517628.1|841198_841483_+	four helix bundle protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517629.1|841575_842715_+	GDP-L-fucose synthase	D1LW79	Prochlorococcus_phage	3.1e-88	45.9
WP_042517630.1|842912_843803_+	glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RfbA	I7I009	Enterobacteria_phage	2.9e-102	61.3
WP_042517631.1|843799_844372_+	dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase	I7HJC4	Enterobacteria_phage	2.1e-37	52.6
WP_042517632.1|844520_845396_+	dTDP-4-dehydrorhamnose reductase	A0A1D8EQE2	Escherichia_phage	7.5e-42	40.9
WP_042517634.1|845439_847491_-	acyltransferase	A0A1R3Y5Q6	Salmonella_virus	2.8e-55	33.9
WP_052471089.1|847625_849626_-	acyltransferase	A0A1R3Y5Q6	Salmonella_virus	5.0e-49	34.8
WP_042517637.1|849751_851743_-	acyltransferase	A0A1R3Y5Q6	Salmonella_virus	6.2e-52	29.3

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP009444|1162356:1233055|DBSCAN-SWA
CCTATTTTATAAAACCAGTTTTTTTCATGTATATAGTCAATAATGACACAGCTGCTGGAGTTACTCCAGGAATTCGAGATGCTTCACCTAAGGTAGTTGGCTTTTGTTCTGATAATTTTTGAAGTACTTCATTAGAAAGTCCTTTCACTTGTGAATAGTCAAAGCTTTCTGGTATTGTTTTTGATTCAAGCGTTGATATTTTGGCTATATCTTTGCTTTGACGTTCGATATATCCTGAATATTTAGCAGAGATTTCTATCTGTTCGATTACAGACTCATCTTCTAGTTTTAAATTTGTATCAGGAATTTGTTGTAATTTTTTATAGTCTAGTTCTGGACGCTTTAGTAAGTCAAAAAGCGTACTTTCTCGAGACATTTTTTTGTCTAGGAATTTTTCCAGCTCACGAGCTTTTTGCGTTTGAGGACCTATCCAAGTATTTTTCATTATAGCTATATTTTCATCTATAGCTGTTTTTTTTTTGATAAAAATCTCTTGGTCTTGCTTGTTTAGTAGCCCTAGTTCGCATGCTTTGTCTGATAGTCTTAAATCTGCATTATCTTCACGCAATATAAGTCTATATTCAGCGCGAGATGTAAACATACGATAAGGTTCTTTGGTGCCTTTTGTTATCAAATCATCTATCAAAACACCCATATAGCTATTTGAGCGCGTTGGATACCATGATTTATCACTATCTATACTGATTGCGGCATTTATTCCAGCTACTAAGCCTTGAGCACCTGCCTCCTCGTAGCCTGTAGTACCATTGATTTGTCCTGCAAAAAATAAGTTTTTGATATGTTTGGTCTCAAGAGTAGGTTTGAGATCTCTCGGATCAAAGAAGTCATATTCGATTGCATAACCAGGTCTCATAATAAAGGCATTTTCGAAGCCTTTAATTGAGCGTATATACTCACACTGTACTTCAAATGGTAAGCTAGTTGATAGTCCGTTAGGGTACAGCTCAATACTGTTTAAGCCCTCGGGTTCAACAAAGATTTGATGTCTATCTTTCTCAGCAAATCTTACTACTTTATCTTCAATAGATGGACAGTAACGAGGACCAATGCCTTCTATTAATCCACTATACATTGCTGACTTGTCAAGATTGTTTGTAATGATCTCATGAGTCTTTGAGTTGGTGTATGTTATGTAACAAGGTATTTGTCTTGGATGCTCAATTTTTCCTTTCGAAAAAAATGAGAAATATGGTGTTGGAGTATCACCGTGTTGTACATCCATAACACTAAAATCGACACTTCGGCTGTCTATACGTGGAGGAGTACCTGTTTTAAGTCTATCAACTCTAAATGGTAATGCTCTTAAGCGAGCAGCTAATGCATTTGATGGTTGATCTCCTGCGCGACCACCTTCCTTTGAAACTTGCCCAATATGTATCTTACCACCTAAGAATGTACCTACAGTGAGTACAACTTTTTTTGATTTGAAAGTGATGCCTGTTTTAGTTATAGCGCCACATACCGTATCATTCTCAACGACCAAATCATCTACAGAATCTTGGAAAATATCTAAATTTTCTTGATCATTTAATAGAGAGTTAATAGCCTTTTTATATAGAACTCTATCAGCTTGAGCTCTTGTCGCTCTTACAGCTGGACCTTTGCGAGAGTTTAAAATTCTAAACTGTATACCAGCCATATCAATGGCTTTTGCCATGATACCACCCATGGCATCTATCTCTTTAACTAAATGACCCTTACCGATACCACCGATAGCAGGGTTACAAGACATTTGTCCAATTGTGTCAATATTGTGAGTGAGTAATAAGGTTTTTGCGCCTATACGTGCTGAAGCAGCAGCAGCTTCTACGCCTGCATGACCGCCACCAACAACAATAACATCATAAGTGTTGTTATAAATCATAAAGATATAAATGTGTATTTTATTTAAATGCTCTTAAATTTTACTACATTTTGAAGCAAAAATAACTACTCTAATGATATTAATTAAGCAACTTTTGCAATATAATTCTTAGTATATTAAGTGTCCTTGAAGTTGATTTATCAGTGCTTAGCATCAGTGAAATATATCATAAATATGTTGACCAAGATCCTATGAAGGTATTTCAGGATGGAGCTATCAAATCTGCAATTATACTTTTTTCATTTTTAGCTATTACAGCATTTTTTGATATCGACAAAAATCTTGTTATTATAATTATCTTGTTCATGGCTAATTTGGCTGGAAGTATTCTATTAGGAAGTATCCAAGCCAAACGTTTAGCCTTTGCCCTATATATGGTTATAGCTATCGTCATAGTTAATATATCTCCATATGTACATCCTCTTTTTGAAACTAACTTTATGCTAATAGTATTTGTCGCTTTTATAGCATTTTGGTTTAGAAGGTTTGGAGAAGCTTTTACTGTATTTCCTATGATGATTGTAGTTATTACTTGTATCTGTTTTGTGCGTTATCCGTTGGAAAAAGATAATCATTTACATTTTACTCTTACAGCTATTTTGATTGGTTTGATTGTTTATTTGGTGATTATTAGAAACTACAAGCTAATGAAAGCTAATGATGTTAGTAAAGTATTTAATGAGTTTTTGAAAAATTTTGTGCGTAACTATATTGATACATTTGAAAAAGCAAAATACAGAAGATTTACTCAATCAAATATTGTTGAAGTAAGTAATTTAAAATACCAAAATATAAATTCTTTTAAAAACCATGGTTTGATGTTCTTGAGAAAAAGCCGTCAAGAACAGTGGCGATATTTAAGCCATAACTTGGTGGTTTTTAATCGTTTAACATCTAAGTTTTTATTAGTCTATAAAAAACTTACAGTTGACTATGTTCGTTTAGGGTTTGAAGAAGAAGAAGCAAAAAATCTATCACAAGACTTAGAGAAAATTTATAAAAATACAATGATTTTGATGTTATACATACAAAAGCCAGCTAAGACTTTTGAAAAAAAGTCAGAGGATATATCTCATCTGAAATATAAATTTGAAATGAACTATATCTATAAATATCAAAATGATAAACAAAAAAGGAAGCTTTTGTTTAGTAGTTTATTGTTTTTAGATGATATGTTGATTGGTTTGGAAAATATCAGAGAGGCATGCTATGATCTTATTTAAGGATAGGTATATAGATAAACTCTCTGATACAACATTATTAGCTATAAGGGTTTTTGTAGCATCTATAGTAGGTTTAATAGTTTGTTATTTAATATTTAGTTTAAGTGGTGACGATGGCTTTAGAGATAGAATATATTGGGTAGTCATTGCGGTAGTAAGTGTTGCAGCTAGTACAAGTACTAGTGTAGTTTATACAAGAGCTAAGGCGATTGTTATTTTCTCATTGTTGGGTACCTCAATAGGATCTGTAGTATTGTTGCTAATTCAAAAAAATATCCCCCATAATTTCACATTGGTGGCAGGATTATGCTGCTTTGCTTTAGCACTATATGTGTATACGATGTTTTTAAATTATGCGACTAGTGTTTTTTTTATACATGTATATCTGGTAATGTATTTTGGACTATTTATTGGTTGGGATAAAGAATTATTTTTTGTCAGGGTCACATGTGTAGCAATCGGAACATTAAGTATAGTTTTGATAACTTTCCTTACAAGGGGACGAAAAAATAGAGTACTTTTTGATAGGGATATGTATAGAATTTATTCTGAACTTAAAGATCTTGTTAATAAAGTTGATCGTAGCGTAGAAAATAGAAAGATTATTTCATTAATAGAAAAAAGTATTAAGCTTAATGAGACTCTTGCGAATGCTAAATATGAGTTTTCTGAGACTAAAAAGTATTATGAATATAAGAAAGTATTAATACTTATAGATGAGTTATTAATTAATCTAAGGACATATAGAACTCTATTTATGCAGCAAAAAAAGCATGATGATAGTTTATATAAGGAATTTGTGCATTTTACTAAAGAGCAAATTCAAAGTAATTTTAAGAAAATAACTATTAGATATGATAGATTATTAGCTCAAAAGTAGTTTAGTTTATTTCACTTTTATTCATGTATTCTTTATTGAAATTAGTTTTGAGATAATTTATTAAAGAGCTTATTCTTTTAAGCTGATGTTTTACTGGTAGTGAAATAATAGAAAGTTTTGTTTCTTCTCTATATTCAGGCAATATTTCGATTAATTTACCATTTTTGATATCAGCATCTACATAAATATCAACTAATCTGGTGATTCCTAATCCTAAAAGGGTAGCTTGTTTCATAACTCTGCCATTAGTTGCATGAAAACCATTGTTATGAATATGGAGAGTATATTTATCATTTATGGAGTTGAAATTCCATTGCTTAATACTACCGTAAATTAGAGGTATATCTTCAAGCTGTCTTGGATCAGATATCTTGGTATATTTCTTAATAAAATCTTTACTAGCTACATATTTAGTAAAAACTGTTCGAAGTGGAGAGATTATTAAATTTGAGTCGGGTAGGTTACCCATACGGATAACTAAGTCATAATCACTATCTATTAGGCTAATTCTATTGCTAGAAAAATCTAAATGGATATTAACTTTAGGATGTAGCAGCTGGAATTTCAAAACTAAAGGAGCAATAACATCTTCACCAATAATTCCTCCAACACAATTGATTTTTATATTGCCACTTATTTCATTATGTTCTTGGCTAGTTAATTGTGTTGCTATATCAAGGTCTTGGAGAGCCTTCTTACATTTCTTATAATAATCTTGTCCTATTTCAGTAAGACGAACGTGTCTGGTGCTTCTATATAGTAGTTGAACTTTAAGATGGTTTTCTAAGTCCTTAATATTCTGGCTTAGGTTTGATTTGGCCATTCCTAATATATCTGCTGCCTTTGTGAAGCTTTGCTGTTCAGCGACGTGAATGAAACAGTGAATACCTCGCCAATGAATATTGTTCATTATTCAATAACAATGTTTTATGATTGTTGGTATTTATCAGTTTAATAAGTTTATATACAATTTACAATCATTAAAACGATGTGAAAATTAAAACAAAAAATA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_144402815.1|1231426_1232275_-	hypothetical protein	W8CYF6	Bacillus_phage	8.6e-11	34.3
WP_042516855.1|1232263_1233055_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
1233017:1233882	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP009444|1481840:1541879|DBSCAN-SWA
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MNNSKIITVDGPSGVGKGTLSKKLAKYFDYKLLDSGAIYRIAALHCYNAGANLDNQDDVCDKLESLDISFKVENDSIIVLLNNADVTKAIRTEQTGMLASKTSAYPKVRQMLHDKMLSFATDAGLVADGRDMGTVVFPDAKYKFFLDASSEVRAQRRYDELLTKGENPDFDKIKNDIEQRDFQDRNRKVAPLKHADDAILVDTSNLSIEEVFQKVLNHINNL
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MSNYIFIVSAPSGAGKSSLLKAFLETEIGKENFAVATSHTTRDPRIGETNGKEYHFVSIIEFEKMLDANGFIEYAKVFKNYYGTSKSEIDKLLAQGKNIILEIDWQGAQQTRSIYGNKAKSIFILPPSMDELRKRLETRNTDSKDIIDYRMSQAESEISHADEYDYQLVNDDFSQSLEQLCKYFEENIQS
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MFFKNLTAFKITDINIDIFEDSMNKLAFIPCSNSQKSSRGFTNPFIKDEQCLFKFNHLAAFCLLTEEKILPAQVINQQAQEYIQELELTRYVSKKEKAQIKEDMEQKLLPLAFSKFRKVHGYLDLTNNYLIIDSVSEKQIIEVLDLLHRCEARFEPVIKEETDILTEWLVEDTYPVDIEIAEKCKLTSAIGDSIANISCQGSSMLNDNIKSFIDSGGYITELAITWKEQLAMTANTKLQFKSIKFLDGIKDLNKEDNVGHEVDLLLMADIFAELITAMQSWIKEDESL
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MQKIVQNQTTESLIRKDLQKFSAYSSARSLKVDGDIWLNANESPYNDEYLYNRYPEPQPKRLVEKLAKIYDVDASNLLVTRGSDEGIDLLFRLYCEYQKDSAFAVEPTFGMYKIAAQLQGVDYKTLKLKEENNFEINVTELLANIPDNCKLLFLCTPNNPTGKSIPLADIEQILSELAGNCVVVVDEAYIEFSNEKSVSSIINKYENLVVLRTLSKSFGMAGLRLGVVITNSDRIVWLRKILAPYPIPKTTESTILAMLDAENLANIASQIAEVKEQREHLYQALSQMKIVDKLWSSDANFILVRFRESIFNKLIDNKIVVRSMAHFFNDEKVLRISIGTVSENKRLIEVLQKLSSEYETK
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MEYRKYICIVCGLIYDEAEGWPEDGIEPGTRWEDVPEDWECPDCGVGKDEFELLEE
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MKANDYIPQSRVTITYDMEVNGTKKKKELPFKQLLIGDLSLGNSKERKHELPNRKIYELSSPNLSEVMKSMGIKLNINVPNHIKNNGEDINIDLDVDSMKIFDPNTIAQMVPELATLLEAKKLIQEFSATIDNNRKLRNLLNNGINNQEAIKKIQEELPLIEDYNFNQNSTGEI
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MTKTLMHQEASSSFEKVANQLKLNKDIVKTIVKTLKEKNIKRVITVARGSSDCVANYAKYLFETQLGFSVSSLPPSITTIYNKNIGDENTLAIGISQSGGSPDLRLALEGCKKAGCTTLAIVNLEKSPLADSADLVLPVRADAENAVAATKSVITSLVALVNIVAEYNQDQALLDSLNNLPKALEKSLNSDWTPAIEELKKSKNMFVIGRGFGFPIVQEMALKFKETCGIHAEAFSSAEVLHGPFALMNQTFTTFTILQHDESAQGTREIVKRMTDLGVRTVFATTDNQSDAKVHLHIDVKTHPILETVVILQKFYLMVNELALSLGYNPDSPSNLKKVTETV
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MQRLKNKVALITGSARGIGKATAELFSNEGATVIVSDINDSLGNQTVKDINSSNCEYKHLDVSIEDDWIIISKYVRSKFGKLDILVNNAGITGFIESSGPHNPEDLDMDSWQKVHSINSNGVALGCKYAIKLMKENGGSIINISSRSGLVGIPQAVAYASSKASVRNHTKSVALYCADMGYNIRCNSIHPGAILTPMWDEMLPKDKDQKQAAIKTIAQDIPLKKMGEAKDVAYAALYLASDESKYVTGIELNVDGGILAGSSAAPSDRKE
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>NZ_CP009444|1481840:1541879|1516714_1517719_-|WP_042518528.1|DBSCAN-SWA
MKIIIRILAIVLLALITTSVYAVPAKGTFTAESSCQAYISKNKMTNPDNTYVIAGQTYSIQEKNKDTNPDWFRVFISNASESQLRWVSSSCGIADIEEGGDTPAKQCIQEPGLADSYVLALSWQPAFCETYGFSAGKQECKNLPVDSAAAKSFSLHGFWPNQDTCGTNYGFCGAQKQSDFCNYAPLNLDDKTMELLHSVMPGYNDSSCLQRHEWYKHGTCQLHDQNQYYTQAATFVNQINDSKLEQLFSQNIGKDITIEQFDNAFNQSFGAGTSNKVYLNCKDGVLVDVYISLPKNADEPNQKDLSALLANAPNANQSTCPNTFKISNFSHNVG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_042517741.1|1481840_1482632_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_042518482.1|1482702_1484277_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518484.1|1484295_1485501_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
WP_042518487.1|1485521_1486154_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518489.1|1486198_1487683_-	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_042518491.1|1487682_1488207_-	type VI secretion system contractile sheath small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_042516855.1|1489601_1490393_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_042518493.1|1490376_1492335_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052471078.1|1492671_1494051_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042517741.1|1494330_1495122_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_042518495.1|1495373_1497824_-	family 20 glycosylhydrolase	A0A076G5S5	Staphylococcus_phage	3.8e-11	23.4
WP_042518498.1|1497940_1499317_-	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_042518500.1|1499369_1500401_-	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518503.1|1500598_1501873_+	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_042518505.1|1501896_1503288_-	YdiU family protein	A0A075BSJ0	Microcystis_phage	2.7e-46	32.1
WP_004287936.1|1503397_1504015_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012279604.1|1504102_1504273_+	rubredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_042518507.1|1504281_1505154_+	1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_042518510.1|1505158_1506715_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004287940.1|1506997_1508815_+	translational GTPase TypA	NA	NA	NA	NA
WP_042518512.1|1508886_1509699_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_042518514.1|1509724_1511470_-	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_042518516.1|1511590_1512508_-	VacJ family lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_042518518.1|1512586_1513789_-	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
WP_052471079.1|1513781_1514342_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_042518523.1|1514334_1514640_-	RnfH family protein	NA	NA	NA	NA
WP_012279615.1|1514639_1515071_-	type II toxin-antitoxin system RatA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_012279616.1|1515145_1515619_+	SsrA-binding protein SmpB	W5RAM5	Staphylococcus_phage	1.3e-24	44.3
WP_042518525.1|1515620_1516391_+|tRNA	tRNA 2-thiocytidine(32) synthetase TtcA	A0A0U2S5Z2	Escherichia_phage	4.2e-65	47.5
WP_042518528.1|1516714_1517719_-	ribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_042518530.1|1517759_1518383_-	bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP diphosphatase HisIE	NA	NA	NA	NA
WP_042518533.1|1518391_1519165_-	imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF	NA	NA	NA	NA
WP_042518535.1|1519158_1519884_-	1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5- phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4- carboxamide isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_042518537.1|1519884_1520481_-	imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH	NA	NA	NA	NA
WP_042518539.1|1520477_1521554_-	bifunctional histidinol-phosphatase/imidazoleglycerol-phosphate dehydratase HisB	NA	NA	NA	NA
WP_042518541.1|1521540_1522626_-	histidinol-phosphate transaminase	A0A1X6WGT4	Pacmanvirus	2.8e-14	22.6
WP_042518544.1|1522630_1523929_-	histidinol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_041268127.1|1523938_1524829_-	ATP phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004287960.1|1524830_1525127_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004287836.1|1526214_1526472_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518548.1|1526474_1527341_-	recombination-associated protein RdgC	NA	NA	NA	NA
WP_042518550.1|1528011_1529004_+	rhodanese-related sulfurtransferase	NA	NA	NA	NA
WP_042518552.1|1529134_1530061_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_042518554.1|1530144_1531197_+	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	1.3e-61	36.8
WP_042518556.1|1531183_1531852_+	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_035736024.1|1531838_1532153_-	cupin domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518558.1|1532259_1533870_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518560.1|1533905_1535396_-	L-aspartate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_042518562.1|1535398_1536262_-	carboxylating nicotinate-nucleotide diphosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_042518564.1|1536271_1537297_-	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_042518566.1|1537316_1537889_-	guanylate kinase	A0A223FN12	Murmansk_poxvirus	1.3e-15	30.1
WP_042518568.1|1537997_1539743_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	4.5e-54	32.9
WP_004287850.1|1539808_1540087_-	peptidylprolyl isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_042517741.1|1541087_1541879_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP009444|1600665:1655746|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP009444|1600665:1655746|1633515_1634019_+|WP_004287576.1|DBSCAN-SWA
MLSQKLLDALNDQFNYELESANLYLAMAGYTSDLGLGGFTNWFMAQYEEELFHAKKIMKFIYDKNGRIEVKSVAAPQNNFNSLLEAFETTLEHEQEVTTRFYNLMDIALEEREHATKSFLQWFIDEQVEEEATVGDMINKIKIVKDSGLYLLDQEAAKRNFNAPNLG
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MNSKYYFRACTVWLIGATFFFYEFFLRVLPNSLHQEIVDSFQATAFSFSLFGGAFYLCYSALQVPVGFIFDKYGIKKSLFFATIACALGALLFSLTSSIYVAIFARCLMGIGAAFGFLGLLIISTQWFPVRYMGILSGSTQILGTLGPILAGGPLLFFVSYLDSWRLVILISAIVGIFLAALILIFVKEGAKASETLSKQEVNSEIKGNLLNKNLITIYFYAFFIYCSIPTLGAIWGVSLLETKGFTATQASYSVAFLWLGLGIGSPFFGFLYDKFKNKVNMLFVVSLLGFVCVCALLFMDLSHTMSMIVLFLIGCAAAGQTLSFTVIANYRAEKPKSIFFGINNTVVMLSGFVVPIIVGILVNSFNLDISVALMILPIAFLVALMVSLKLTTIQKC
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MEYNYDIIIIGSGPGGEGAAMKATRNGQKVAIIEDDAIGGGCNNWGTIPSKTLRQLSREVWYNKKNFDFPDMLDNAFEVVLKQREIKKNRFANNEIDVFYGFASFLDKNKIKISRKNGSTEIITAKKFILATGSRPYQPDDIDFTHPRILDSDKLLELKDKNIKSITIYGAGVIGCEYASILGTLDIQVNLINTRDKLMSFLDDEIIETLTNHFTVNQKINLMHNETYKSIKAKGDKVITTLNSGRIIESDYVLFALGRAGNTNGLNLDKIGVEYSPQRGLVNVNDNYQTTQPNIYAVGDVIGFPSLASSAFNQGRFAATHIIDGSCNDKLVEDIPTGIYTRPEISCIGKTEEQLTAENIPYESGRAYFKDLARAQISGSETGMLKILFHKETFEILGIHCFGHRVSEIIHIGQAIKSMPGKHNTIRYFLNTTFNYPTMAEAYRIAAIDGVNKLKPKNKQCVPEHK
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MIISIEAIDKILPQTQCQKCTYDDCYSYAKAITNGEKHNKCITGGEKTLKELSKLLNKPEIPLDSSLGEYKPRAVAKIDESMCIGCEKCLLACPVDAIVGSKKFMHTIIESECTGCELCIEPCPMDCISLVDLATDMQPSNLDEKQYTQQKNHYRDRYEYHKYRVNQTKAKQRAVYKNIATAQEIDKKAYIAASLAKYKNRKKSTPTPNNE
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MRNIKKISKVNIHFNQPKGLHIIAFMTFCICLCIGPFMTILNSYGDIDLFYNRNDYLFVIFFAGIFGCISNYLFGSTKSIVHGLQLIIIAMILSFIHNIILFSCSVLWIGVAIVIVNLLFNLSAFYLKTDLRRIYGFIGVYSSALLGIAIGIISYITIFKDMYNFKIFYLFITIFLLVFFLKNSYKLNTSLTNQTERFNISFYGVLLIFFIFSFILFYLLQNLNVFSSLNLVILPLSLIYLHILTISNNKESGINLLKYVYFSLGLLAVNKIFYLSFLRYENVMNPKYLNSPLSTSLFLLAGYFICIIIYFGWRFKLITLRIESITKSHIIKTMLYIETFRVFILMIAIFTNNVLFCNLALIFATILALVLNIFIVPIYFSLGKILAGGRNEVITTSLLYLIFSSLIFVSFLYDISISL
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MIKRLKQKWFWSKNSEQGPPDLEEMIKKFFGKKSKKNDDDNESIYSKNANKNKPMFEKPPVAKIASIVIALLIVAWVGFGFYVVQPAEQAAVLRLGKFSKMVEPGLHWHPIGIDKVYKENVQELKTTSLKRDMLTSEENIVHISFTVQYRIVDLEKYLFANVNTTQLLQQALESAVRQVVGENKLEQILTTNRAVITQQVRKEMEALLQSYNTGIYISEVIMQPAQAPEAVKSAFDDVIKAREDREREQNEAEAYANRVVPVAQGKAQRIVDQANAYKQKVVLEAQGEVAQFEQLLPIYKKSPDIVMNQMYFNTISNVLQHNKIFLIDGDGAKNIFYGLDNTQKQALLPNAQGGN
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MAKMKFGSVEETVVTQQEFTLEKALETLKDETIAIIGYGVQGPAQALNLRDNGFNVIIGQRANSKSWDKAIEDGWVAGKSLFNIAEATAKGTIVVNLLSDAGQIASWNTIKENLKSGDLLMFSHGFGVTYNEKTSIIPPADVDVALVAPKGSGTSVRRLFLAKKGINSSYAIYQDATGNAEKRTLAYGIGVGSGYLFETTFEKEVYSDLTGERGVLMGALAGIIEAQYEVLRANGHSPSEAFNETVEELTQSLVPLVAENGMDWMFANCSTTAQRGALDWAPKFRDATKGVFAELYNEVKNGNEAQRTIDKNSHADYRKDLEKELEELSQKEVWQAGKTVRSLRPNK
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MQKKSFAILSVFVLFLLVIIYFFSTANLSKSSFNNQQGLYLVKQAFPQYKVIKTFDTGIHLQAYILEDKKDPTKRTVTFTSEDGDVIVNGELLAWDRNQNKLTSLNQIYANYFTSSPQASDLYLDIKKYATYIQQGSDDAPHKFYAIIDPNCRYCASLFDASQPAIKSGDLAVRWIPIGSLQNSPDVVRSIFNSKDPLQALIEYHNTKKYNESLTKPNEKAENNMRLSTDISGFPTIIYKTPEGALKISGGNKLPLTEAKIAEKDNIKKVNEFLLLTSNSF
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MTQVMTPKTIVHELERHIIGQNDAKKAVAIALRNRWRRMQLDDEMRQEVTPKNILMIGPTGVGKTEIARRLAKLADAPFIKVEATKFTEVGYVGKDVESIIRDLVETAVKMKREEAKQKVTEKAAILAEDRILDVLIPPARASESKVGFANEPAEDAQSKKEKENKTREIFRKKIQNGELNDKEIEIEVSVAPKSIGVMGPPGMEDMTNQLQDLFSSLSSDKKKTKKMRIKDAIKLVKDEEAAKLINEEDIKARALESVEQNGIVFLDEIDKVCKKSGTSGADVSREGVQRDLLPLVEGSTVSTKYGMIKTDHILFIASGAFHVAKPSDLIPELQGRLPIRVELKSLEIEDFVRILKEPDCSILKQYIALMKTEGVELSFEEDAIRKIAEISFQVNEEVENIGARRLHTVMERLLEEISFDAPDLENKSINITTDYINEKLSGLVKNKNLSQYIL
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MNNRLSFLAITIWLTCAVFFMYEFLLRTILGTFEHQIISDLDLSILTFSILSSTAYQLTYGIMQIPVGIITDKLGLKKALTLAILVCALGVGLFGVSNSFGAALVYRVMIGFGASFGFLCLLIAVYDWLPHKHIGLFIGLSQFIGVLGPMLAAGPLESLSQAGGIDWRYVFIILAIIGVVLAGITIVIVKNNDQSGESGKNRFIILNTPTSVMKEIQSIFSNKQIWLIAVFSATTYLAIEYLSENATKSFLSLNGFDAKFSSYLITLAWLGYGIGCPTLGAISDRIKRRKPVMIFAICLTFVSLATIIFFPINQAILYLSFICLGLGASGQSIGFAIIAEQSSSGCRAAALGVNNFLIMLSVGVGSPIISEVFDLFSNQGKNPSITSYQTSLSLLLVFTALGVLISIFFIKETFCRSKKEVIFVDVK
>NZ_CP009444|1600665:1655746|1616344_1617313_-|WP_004287592.1|DBSCAN-SWA
MSEDLMIFSGNASKKLACEVAKELGATLGNATVGRFKDGEIHVVLNENVRGKDVFVIQSTCPPSDNLMELILLIDALKRSSAERVTAVLPYFGYARQDRRSKSARVPISAKVVANLLQAVGLDRILSVDIHAEQIQGFFDIPFDNAFATKIFLEHVRKNPEKYENIKIVSPDMGGVVRARSVAKNLGVEIAVVDKRRPRPNVAEVMNIIGDVEGKHCILVDDIMDTGGTMCQAAKALVEKGGAAKVSAFCVHPLLSGDAIKNIENSAIEELIVTDSIPLKPHAEACNKIKVITLAPLLAQIVEKTNGEESVSDIFRIDGLVD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_042518633.1|1600665_1601856_-|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	A0A2I2L594	Orpheovirus	3.3e-08	26.0
WP_042518635.1|1601968_1602871_+	lipoate--protein ligase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518636.1|1602874_1603624_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004287605.1|1603812_1604364_+|protease	ATP-dependent protease subunit HslV	NA	NA	NA	NA
WP_004287604.1|1604371_1605739_+|protease	ATP-dependent protease ATPase subunit HslU	A0A2H5BJT2	Erwinia_phage	3.0e-45	29.2
WP_042518638.1|1605828_1607280_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_035735504.1|1607358_1608519_+	NAD-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_012280895.1|1608614_1610015_+	Si-specific NAD(P)(+) transhydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_004287600.1|1610017_1610866_+	prepilin peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_012280894.1|1610875_1611721_+	DsbC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518640.1|1611729_1612614_+	class A beta-lactamase	A0A1B0VBP7	Salmonella_phage	1.3e-41	35.4
WP_042518642.1|1612606_1613182_+|tRNA	aminoacyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_042518644.1|1613201_1614293_+	redox-regulated ATPase YchF	NA	NA	NA	NA
WP_042518646.1|1614304_1614583_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518648.1|1614598_1615858_-	DUF21 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004287593.1|1615952_1616243_-	50S ribosomal protein L25	NA	NA	NA	NA
WP_004287592.1|1616344_1617313_-	ribose-phosphate pyrophosphokinase	A0A2K9L2G2	Tupanvirus	9.1e-41	32.2
WP_042518651.1|1617516_1618524_+	succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004287590.1|1618516_1619800_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_042518653.1|1619809_1621090_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_042517741.1|1621211_1622003_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_042518655.1|1622216_1623050_+	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_042518657.1|1623033_1624203_-	cation:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_012280884.1|1624465_1624927_+	hypothetical protein	M4QRU0	Micromonas_pusilla_virus	2.9e-21	38.6
WP_004287585.1|1624957_1625254_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_042518660.1|1625257_1625842_-	cytochrome b/b6 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518662.1|1625845_1627264_-	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
WP_035735477.1|1627279_1627933_-	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_042518664.1|1627943_1629137_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_052471087.1|1629219_1630143_-	MerR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_042518666.1|1630218_1630734_-	crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC	NA	NA	NA	NA
WP_042518668.1|1630872_1631619_-	YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_035735468.1|1631636_1632296_-	isoprenoid biosynthesis glyoxalase ElbB	NA	NA	NA	NA
WP_042518670.1|1632324_1633308_-	lipoyl synthase	NA	NA	NA	NA
WP_004287576.1|1633515_1634019_+	ferritin	NA	NA	NA	NA
WP_042518671.1|1634022_1635495_-	peptide MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	6.1e-20	22.8
WP_042518674.1|1635642_1636848_+	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518676.1|1636968_1637613_+	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_042518678.1|1637614_1638250_+	RnfABCDGE type electron transport complex subunit B	NA	NA	NA	NA
WP_004287572.1|1638242_1638881_+	endonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_012280872.1|1638877_1639309_+	DUF1841 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004287570.1|1639308_1640568_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004287569.1|1640682_1641369_+	Bax inhibitor-1/YccA family protein	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	1.9e-29	40.3
WP_042518680.1|1641415_1644835_+	transcription-repair coupling factor	NA	NA	NA	NA
WP_042518164.1|1644884_1645655_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_042518682.1|1645786_1646830_-	ketol-acid reductoisomerase	NA	NA	NA	NA
WP_004287566.1|1646854_1647172_-	acetolactate synthase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_042518683.1|1647176_1648874_-	biosynthetic-type acetolactate synthase large subunit	A0A0P0CDR3	Ostreococcus_lucimarinus_virus	2.9e-58	30.8
WP_012280868.1|1649021_1650704_-	dihydroxy-acid dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_004287563.1|1650727_1652524_-	threonine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_012280867.1|1652672_1653266_-	YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_004287561.1|1653262_1653748_-	low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_004287560.1|1653750_1654677_-|protease	protease modulator HflC	A0A2K9KZA2	Tupanvirus	2.6e-08	22.7
WP_042518686.1|1654678_1655746_-|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP009444|1869609:1934188|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_042518948.1|1871439_1872891_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_042518951.1|1872903_1873962_-	asparaginase	NA	NA	NA	NA
WP_004288186.1|1874072_1874540_-|tRNA	tRNA (uridine(34)/cytosine(34)/5- carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)- methyltransferase TrmL	NA	NA	NA	NA
WP_042518953.1|1874541_1875513_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_004288189.1|1875525_1875804_-	ribosome assembly RNA-binding protein YhbY	NA	NA	NA	NA
WP_035735236.1|1875814_1876723_-	DNA polymerase III subunit delta'	NA	NA	NA	NA
WP_042518954.1|1876730_1877747_-|protease	protease SohB	A0A2H4UUF9	Bodo_saltans_virus	4.3e-17	27.4
WP_004288192.1|1877759_1878389_-	glutathione S-transferase N-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_042519294.1|1878479_1878794_+	TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein	NA	NA	NA	NA
WP_012279794.1|1878815_1879079_+	oxidative damage protection protein	NA	NA	NA	NA
WP_042519296.1|1879173_1880940_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_042518956.1|1880964_1881921_-	glycosyltransferase family 2 protein	B9UDL7	Salmonella_phage	2.3e-52	39.5
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WP_035735197.1|1924889_1926812_+	1,4-alpha-glucan branching protein GlgB	NA	NA	NA	NA
WP_042519003.1|1926872_1930085_+	type I pullulanase	NA	NA	NA	NA
WP_042519005.1|1930094_1930937_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_042519007.1|1930942_1931815_-	homoserine O-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_042519009.1|1931786_1933097_-	O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase/cysteine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_042517741.1|1933396_1934188_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA