Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009366 | Yersinia enterocolitica strain WA plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP009367 | Yersinia enterocolitica strain WA chromosome, complete genome | 2 crisprs | csa3,DEDDh,RT,cas3,DinG | 0 | 0 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009367_1 | 4375839-4375930 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009367_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009367_1
>1.1|4375863|44|NZ_CP009367|CRISPRCasFinder GCGGATCATCTAATCAGGCATCAACCGAAATCTGATCGCATGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009367_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009367_1 >merge|NZ_CP009367|1|4375839-4375930|CRISPRCasFinder GGCAATGAAATTCTAACAACCGAAGCGGATCATCTAATCAGGCATCAACCGAAATCTGATCGCATGCTGGCAATGAAGTTCTAACAACCGAA >NZ_CP009367|1|1|4375839-4375930|CRISPRCasFinder GGCAATGAAATTCTAACAACCGAA GCGGATCATCTAATCAGGCATCAACCGAAATCTGATCGCATGCT GGCAATGAAGTTCTAACAACCGAA
>NZ_CP009367.1|WP_071882663.1|4374849_4375137_-|transposase MRKKSFTHEFKQECVNLVLQHKYPVTQAAETMNIGLSTLQRWLRQYRGESRGNTPIASAITPEQRRIQELEKQVRQLQSDNDLFKKGFGLLRHWK >NZ_CP009367.1|WP_144404894.1|4373987_4374929_-|IS3-family-transposase MKSRCGSYRATMTCLKKASAFFAIGNEQRQKVAVKLKKAGANIQQVCRCLSLTRSVFYARSRRLMIKPDVLMLHAAAKHVHAEMDATYGSRRMCIELREQGFNVGRYRVRQIMKNLLLVAKRPGRHRYPGGGKPAVVAANLLNRQFNPETLNTWWSGDITYLRTAQGWLYLAIVMDLCSRKIVSWAFSDKPDSDLTVRALRLAVNKRRPTGSVVFHSDQGAQYTSAQFQSCQQELDVTGSMSRKGNCLDNAVTERFFRSLKAERVNYRRYETRSQGIADVIDYIDSFYNLKRRHYRLGNISPDEYERRLQQCA >NZ_CP009367.1|WP_005174264.1|4371237_4372173_-|aspartate-carbamoyltransferase MVNPLYHKHIISINDLCREELELVLRTAASLKSHPQPELLKHKVIASCFFEASTRTRLSFETSIHRLGASVVGFSDSSNTSLGKKGETLADTMSVISTYVDAIVMRHPQEGAARLATQFSGNVPVVNAGDGANQHPTQTLLDLFTIQETQGRLDNINIAMVGDLKYGRTVHSLTQALAKFNGNRFFFIAPDALAMPAYILEMLAEKGIEYSLHESIEEVVPELDILYMTRVQKERLDPSEYANVKAQFVLRAADLNGAQDNLKVLHPLPRIDEITTDVDKTPYAYYFQQAGNGIFARQALLALVLNAELAL >NZ_CP009367.1|WP_004392342.1|4370761_4371226_-|aspartate-carbamoyltransferase-regulatory-subunit MTQDYKLQVEAIKCGTVIDHIPAQIGFKLLSLFKLTATDQRITIGLNLPSKRSGRKDLIKIENTFLTEQQANQLAMYAPDATVNRIDNYEVVKKLTLSLPEHIDGVLTCPNSNCISHNEPVDSSFKVKAKQGEIHLKCKYCEKEFDHQVVLQAD >NZ_CP009367.1|WP_005162498.1|4369859_4370246_-|2-iminobutanoate/2-iminopropanoate-deaminase MSRTISTELAPAAIGPYVQGVDLGSMIITSGQIPVDPKTGLVADDISAQARQSLENVKAIVEAAGLKVADIVKTTVFVKDLNDFSTVNATYEAFFTEHNAPFPARSCVEVARLPKDVKIEIEAIAVRR >NZ_CP009367.1|WP_005174267.1|4367228_4368158_-|alpha-E-domain-containing-protein MLSRTASELYWMARYLERAENITRVLDVTNRLSMMPTSNRVNFDLLVPLSLSNTQVLFAEHYPQVSMTHLLNFFVLDSNNPSSIFSCLQMAWNNAHAVRGSLSSEVWESINATWIEIKQLRRQGISAAGIDAFFDWVKERSHLFRGAVYGTLLRSDALYFIRLGTLIERADSTARLLDVKNQLLDNDDDPVREYYRMDTLLRAVSAREAYHSLYKQQLSREAIAELLILRNEIPRSLLACVNDMEQQLALIGGNRSNQPRRLVSILLAELRFSSITDVMADGLHVYLMDFLGKINAIADSIRQTYLEVQ >NZ_CP009367.1|WP_005174269.1|4366410_4367232_-|transglutaminase-family-protein MRLNVDHSTHYTYAQQVQHSTQYLRLTPQDSAHQRILSWQLTLPEEAICTTDAFGNVLHVLTLDKPHQAITIQAQGVVEIEDNVEDDSGDHLSPLVFLRHSPLTQPDAAIRQFAAGYCEGVSSAAGQLDCLTHLMGELLAKMPYSPGTTTVQDSAAQAFAAEQGVCQDHTHVFLACCRSLNIPARYVSGYLYTESSSHVATHAWAEVWLNGYWQSFDVTNNTCQPNQHLKLAVGIDYLDACPVRGIRRGGGYEDMQTIAAVHMLSTPRLDMSQ >NZ_CP009367.1|WP_005174271.1|4365652_4366387_-|proteasome-type-protease MTYCVAMRLSSGLVFASDSRTNAGVDHISTFRKLHLFQQDGERTLVVQSAGNLATTQSIVSLLQRRCLDCELTNLMNVPSMYEAATLLGETVREVINRDSGAQQNSGGTDFSCNLLLGGQIKGEGLRLFHIYPQGNFIEATQDTPYFQIGESKYGKPIIDRVLSYNTALDQAMQCALISMDSTLRSNLSVGLPLDVMIYPLDSFCTAQQYRITEEHPYFMMIRKGWGEGLVSIFSQLPELKLGA >NZ_CP009367.1|WP_005174276.1|4363604_4365266_+|alpha,alpha-phosphotrehalase MNNPIPWWQNGVIYQIYPKSFQDSTGNGYGDLAGVTQRLDYLQKLGVDAIWLTPVYVSPQVDNGYDVADYCAIDPAYGTLDDFKHLVEQAHQRGIRIVMDMVFNHTSTEHAWFKASTDRNSPYRQFYIWRDGEGDNLPNNWRSKFGGNAWQWHADSGQYYLHLFATEQADLNWEHQPVRDELKKVCEFWADIGVDGLRLDVINLVSKQQDFPDDFDGDGRRFYTDGPRIHEFLQEMSRDVFQPRGLMTVGEMSSTRLEHCQRYAALGGDELSMTFNFHHLKVDYLNGEKWSLMQPDRVELKQIFNQWQQGMHNRAWNALFWCNHDQPRIVSRFGDEGALRLPAAKMLAMVLHGMQGTPYIYQGEEIGMTNPNFSSIDQYRDVESLNMFAELSAKGRDADQLLAILATKSRDNGRTPMQWDRSHNAGFSQGTPWIEPCSNYGEINVDAALADADSVFYAYQFLIALRKQHDVFTFGDYQDLCPQHPDLWCYLRSWQGKQLLVVANLSGEPQQWQPEDIDLDGHWQLLMSSYGESAFQPQAMQLRAYEGIYWIRD >NZ_CP009367.1|WP_011817268.1|4362121_4363537_+|PTS-trehalose-transporter-subunit-IIBC MSKVKQQDIDQLIVLVGGRENIATVSHCITRLRFVLNDPAKAFPKEIEKLSMVKGCFTNAGQFQVVIGPEVDDYYQALIAKIGQNEADKEQTKLAARQNMTWFERGISHFAEIFFPLLPALISGGLILGFRNVIGDIPMSEGQTLAQMYPAWKTIYDFLWLLGEAIFFYLPVAICWSTVKKMGGTPVLGIVLGITLVSPQLMNSYLLGQQIPEVWDFSWFTIQKVGYQAQVIPSILAGLALGWIETNLKKIIPAYLYLVIVPVVSLLLAVFLAHTLIGPFGRMIGDGVAWGVKAVMTGSFAPIGAALFGFLYAPLVITGVHQTTLAIDMQMIQSMGGTPVWPLIALSNIAQASAVLGIIIISRKINEREISVPAAISAYLGVTEPAMYGINLKYRFPMLCAMIGSGLAGLICGLTGVMANGIGVGGLPGILSIKPQFWAIYSLAMLVAIVVPLVLTILVYKRKDSRGELPV >NZ_CP009367.1|WP_005162489.1|4375974_4376247_-|PTS-phosphocarrier-protein-NPr MTVKQTVEIKNKLGMHARPAMKLFELVQSFDAEVMLRNDSGTEAEASSVIALLMLDSAKGRQIEVEATGPDEIQALAAVIELFNSGFDED >NZ_CP009367.1|WP_005162486.1|4376247_4377099_-|RNase-adapter-RapZ MVLMIVSGRSGSGKSVALRALEDMGFYCVDNLPVVLLPQLASTLADRNISAAVSIDVRNMPESPEVFEHAMTQLPDSFSPQLLFLDADRNTLIRRYSDTRRLHPLSTKNLSLESAIDEESDLLEPLRSRADLIIDTSEMSVHELAEMLRTRLLGKRERELTMVFESFGFKHGIPIDADYVFDVRFLPNPHWDPKLRPMTGLDKPVISFLDRHTEVHNFIYQTRSYLELWLPMLETNNRSYLTVAIGCTGGKHRSVYVAEQLADYFRARGKNVQSRHRTLEKRK >NZ_CP009367.1|WP_005162484.1|4377177_4377660_-|PTS-IIA-like-nitrogen-regulatory-protein-PtsN MINDPALQLSSVLNIECTKSSVHCSSKKRALEIISELAAKQLNLPSQVVFDAVLTRERMGSTGIGSGIAIPHGKLEEDTLRAVGVFIRLEQPIAFDAIDNQPVDLLFALLVPADQCKTHLHTLSLVAKRLADKTVCRRLRAAQSDDELYQIITELPPETE >NZ_CP009367.1|WP_005162480.1|4377830_4378118_-|ribosome-hibernation-promoting-factor MQLNITGHHVEITDALREFVTTKFAKLEQYFDRINQVYVVLSVEKVKQIAEATVHVNGGELHASSEQEDMYAAIDILVDKLARQLNKHKDKLKQH >NZ_CP009367.1|WP_005174257.1|4378141_4379575_-|RNA-polymerase-factor-sigma-54 MKQGLQLKFSQQLAMTPQLQQAIRLLQLSTLELQQEIQLALESNPLLEQTDLHEEIEAKETIDSESLDTREALEQKDMPEELPLDATWDEIYTAGTPSGMGNDYSDDELPVYQGETTQTLQDYLMWQVDLTPFSETDAAIATSIVDAVDETGYLTVPLEDILESMGDENVALDEVEAVLKRIQHFDPIGVAARNLRECLLVQLSQYDKDTPYLAEARLVISEYLDLLGNHDFRTMIRLSRLKEDTLKEAIALIQSLDPRPGQSINTGESEYVIPDVLVRKDKGHWTVELNADSIPRLKINQQYAAMGSNTRNDSDGQFIRSNLQEAKWLIKSLESRNETLLKVARCIVEQQVAFFENGPEFMKPMVLADIAQAVDMHESTISRVTTQKFLHSPRGIFELKYFFSSHVNTDSGGEASSTAIRALVKKLVAAENPAKPLSDSKLTTLLCEQGIMVARRTVAKYRESLSIPPSNQRKQLV >NZ_CP009367.1|WP_004392029.1|4379637_4380363_-|LPS-export-ABC-transporter-ATP-binding-protein MATLIAEKLAKAYKGRKVVEDVSLKVKSGEIVGLLGPNGAGKTTTFYMVVGIVQRDAGRIVIDDEDISLLPLHERALRGIGYLPQEASIFRRLSVFNNLMAVLEIRKDLSSEQRQERADELMEEFHITHLRDSLGQSLSGGERRRVEIARALAANPKFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIIEHLRDSGLGVLITDHNVRETLDVCERAYIVSQGHLIAHGTPQEILADEQVKRVYLGEEFRL >NZ_CP009367.1|WP_005162470.1|4380369_4380915_-|lipopolysaccharide-ABC-transporter-substrate-binding-protein-LptA MKSKNKILHFLLASSLLAASLPALALTGDTDQPVLVDSVKQALDMGANTVTFTDNVVIKQGTIEIKADKVVVTRPGGDQSKMVIEGFGNPVTFYQMQDSGKPVKGHGQKLRYEVANDFVVLTGNAYLEQLDSNIKGDRITYLVKKQQMEAFSDKGKRVTTVLLPSQLQDKGPAASGQKKSN >NZ_CP009367.1|WP_005174254.1|4380898_4381462_-|LPS-export-ABC-transporter-periplasmic-protein-LptC MSKTRLWITLSLALIALALIGWNISGFNQQDTQATIDDNEPSSQSQHTVTVVFNPVGQLNYKLVAEEVQNFSAQQLTWFTRPVMTMFDENAVATWTVRADRAKLTDDKMLYLYGHVEVDSLTPDAQLQKIKTDNAQVNLITQDVSSDDEVTLFGVGFTSNGMKMRGNLRDKTAELIEKVKTSYEIQK >NZ_CP009367.1|WP_005174251.1|4381458_4382022_-|3-deoxy-manno-octulosonate-8-phosphatase-KdsC MDSTVYLDTCYGPVASSVMERAANIRLLICDVDGVMSDGLIYMGNQGEELKAFNVRDGYGIRCLITSGIEVAIITGRNAKLLEDRANTLGITHLYQGQSDKLVAYNELLVALKCLPEQVAYIGDDLIDWPVMAQVGLSVAVADAHPLLIPKAHYVTRINGGRGAVRELCDLILLAQGKLEGAKGLSI >NZ_CP009367.1|WP_005174250.1|4382035_4383040_-|arabinose-5-phosphate-isomerase-KdsD MSSSDLQPSMDLQPRVDFQQAGKQVLQIEREGLAQLDQYINDDFTQACEAIFNCHGKVVVMGMGKSGHIGCKIAATFASTGTPSFFVHPGEASHGDLGMITPQDIVLAISNSGESNEILALIPVLKRQKIQLICMSNNPESTMGKAADIHLCIKVPQEACPLGLAPTTSTTATLVMGDALAVALLQARGFTQEDFALSHPGGALGRKLLLRISDIMHTGADIPHVSPDASLRDALLEITRKNLGLTVICDDLMMIKGIFTDGDLRRVFDMGIDLNNAKIADVMTSGGIRVRPTMLAVDALNLMESRHITAVLVADGDQLLGVVHMHDMLRAGVV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009367_2 | 4414505-4414757 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009367_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP009367_2
>2.1|4414559|64|NZ_CP009367|PILER-CR AGAACCCGGCTTACCGGTCAACTCCACTCATTCCGCAAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTGTTT >2.2|4414677|60|NZ_CP009367|PILER-CR AGCGGCTTACCAGTCAACTCCACTCATTCCGCAAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTGTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009367_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009367_2 >merge|NZ_CP009367|2|4414505-4414757|PILER-CR AGAGGAATGACTGTCCACGACAGAACCCGGCTTACCGGTCAACTCCACTCATTCCGCAAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTGTTTATGTGATATATGGTTGAGAGGAATGACTGTCCACGACGCTTTTCACCAAAAGAAAGCGGCTTACCAGTCAACTCCACTCATTCCGCAAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTGTTTATGTGATATATGGTTGAGAGGAATGACTGTCCACGACGCTTTTCACCAAAAGAA >NZ_CP009367|2|1|4414505-4414757|PILER-CR AGAGGAATGACTGTCCACGACAGAACCCGGCTTACCGGTCAACTCCACTCATTC CGCAAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTGTTTATGTGATATATGGTTGAGAGGAATGACTGTCCA CGACGCTTTTCACCAAAAGAAAGCGGCTTACCAGTCAACTCCACTCATTCCGCA AACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTGTTTATGTGATATATGGTTGAGAGGAATGACTGTCCA CGACGCTTTTCACCAAAAGAA
>NZ_CP009367.1|WP_005174220.1|4413256_4414156_+|16S-rRNA-(cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase MNQHDRAVISASTLYVVPTPIGNLGDITHRALEVLKGVDLIAAEDTRHTGLLLQHFAINARLFALHDHNEQQKADHLLAKLQEGQSIALVSDAGTPLINDPGYHLVRRCREAGIRVVPLPGACAAITALSAAGLASDRFCYEGFLPAKTKGRKDTLQALIEEPRTLIFYESTHRLLESLRDMVTVLGPQRYVVLARELTKTWESIHGAPVGELLAWVQEEETRRRGEMVLIVEGHKVQVDDALPAAALRTLALLQKELPLKKAAALAAEIHGVKKNALYKYALEQLDGDQVQQEDDIQR >NZ_CP009367.1|WP_005174221.1|4411220_4413194_-|penicillin-binding-protein-activator MLSSTFVRSKAGLVPVVLAALILAACSGRAPQTPPPTNIQDEASANSDYYLQQLQQSSDDNKADWQLLAIRALLREGKLPQAAEQLGTLPANLSDTQRQEQQLLTAELLVAQKNNPAAADILGKLDATQLSANQQVRFYQAQIAANQGKATLPLIRAFIAQEPLLKDKAHQDNIDGTWQALAQLTPQELNNIVINADENVLQGWLDLLHIYQDNKQDPDLLKAGIKDWQNRYPQNPAAKNLPTALTQISNFSQASTAKIALLLPLSGSAQVFADAIQQGFTAAQNGLPVNTPAPVTPDATTTTPTDATATPVTDIATPAPVATPVATSNAQVKIYDTTTQPVAALLAQAQQDGATLVVGPLLKAEVEQLSTTPSTLNILALNQPEVSTNSPNICYFALSPEDEARDAAHHLWSQEKRMPLLLTPRGAFGDRVAKAFAEEWQKQGGQTVLQQNFGSTAELKQAINSGAGIRLTGQPVSVSSAPAAAPASVTIAGLTIPAPPVDAPVVSTSAGGNIDAVYIIATPAELTLIKPMIDMATSTRSKPALFASSRSYQAGAGPDYRLEMEGIQFSDIPLMAGANPALMQQAAAKFANDYSLVRLYAMGIDAWTLSNHFAEMRQIPGFQVSGTTGDLTASADCVITRKLPWLQYRQGMVVPAA >NZ_CP009367.1|WP_005174223.1|4410808_4411162_-|YraN-family-protein MSHRDTGTHYENQARHYLERAGLVFKAANVTYQNGEIDLIMRDGDTWVFVEVRFRRNALFGGAAASVTYSKQQRLLRAATIWLAQRNACFATTPCRFDVFAITGSELEWLPNAFNAD >NZ_CP009367.1|WP_005174225.1|4410162_4410753_-|DnaA-initiator-associating-protein-DiaA MLDRIKGCFTESIQTQIAAAEALPDAISRAAMTLVQSLLNGNKILCCGNGTSAANAQHFAASMINRFETERPSLPAIALNADNVVLTAIANDRLHDEVYAKQVRALGHAGDVLLAISTRGNSRDIVKAVEAAVTRDMTIVALTGYDGGELAGLLGPQDVEIRIPSHRSARVQELHMLTVNCLCDLIDNTLFPHQDD >NZ_CP009367.1|WP_005166550.1|4409576_4410152_-|divisome-associated-lipoprotein-YraP MKVGYIFAMLFSALLLQGCVGAVVVGSAAVATKSATDPRSVGTQVDDGTLEARVVNALSKDQQIKSQTRFVVTAYQGKVLLTGQSPTAELSNRAKQIAAGVDGATEVYNEMRLGKPVDLTTASMDTWITTKVRSQLLTADSVKSSNVKVTTENGEVFLLGLVTQQEGQSAAQIASQVSGVKHVTTAFTIVK >NZ_CP009367.1|WP_005162387.1|4408770_4409496_+|monofunctional-biosynthetic-peptidoglycan-transglycosylase MISVRRGLNWLWYWGKRAVIGIVALWLAGILIFAFLPVPFSMVMIERQLGAWLTGDFSYVAHSDWVPMDEISPYMALAVMAAEDQKFPEHWGFDVGAIESALAHNQRNQNRIRGASTLSQQTAKNLFLWDGRSWVRKGLEVGLTAGIELVWTKRRILTVYLNIAEFGDGIFGVEAAARHFFNKPASKLSASEAALLAAVLPNPLRFKANAPSGYVISRQQWILRQMRQLGGKDFIQANDLD >NZ_CP009367.1|WP_005174227.1|4408120_4408774_+|isoprenoid-biosynthesis-glyoxalase-ElbB MKTVGVVLSGCGVLDGTEIHESVLTILALDRAGARIAFFAPDKPQLHVINHLSGEESTEQRNVLVESARIARSLIKPLSVANSEDLDALIVPGGFGAAKNLSDFAIKGSECAIDPDLVKLTQSMHKANKPIGFMCISPVMLPKLLGKPVRLTIGNDPDTIEAVEIMGGEHIICPADDVVVDAENKVVTTPAYMLAASISEAAKGIDKLVAKVLDLTE >NZ_CP009367.1|WP_011817254.1|4405401_4407738_+|aerobic-respiration-two-component-sensor-histidine-kinase-ArcB MKQIRVLAQYYVDLMVKLGLVRFSLLLASVLVLLAMVVQMAVTFVLSGSVETLDLVRSIFFGLLITPWAVYFLSVVVEQLEESRQRLSRLVDKLEVMRYRDLELNKQLTENIAQLNQEIVEREKAEKAHLQVVDKLKEEMGHREQAQVELGQQSALLRSFLDASPDLVYYRNEDNEFSGCNRAMELLTGKSEKQLVGLTPKDVYAPDIAEKVMETDEKVFRHNVSLTYEQWLVYPDGRKACFELRKVPFYDRVGKRHGLMGFGRDITERKRYQDALENASRDKTTFISTISHELRTPLNGIVGLSRILLDTELDSEQLKYLKTIHVSAITLGNIFNDIIEMDKLERRKVQLDNQPIDFTGFMADLENLSGLLVQPKGLKFIMEPQLPLPEKVITDGTRLRQILWNLIGNAVKFTQQGEIVVRVRRESNDRLIFEVEDSGMGIPEDEQDKIFAMYYQVKDSNGGRPATGTGIGLAVSKRLAQSMGGDITVKSVQGAGSCFTLTIKAPAVQAASSAPSGDDTPLPALHILLVEDIELNVIVARSVLEKLGNSVEVAMNGHDALAMFKPDDFDLVLLDIQLPDMSGLDIARQIRADYGQQSLPPLVALTANVLKDKKEYLDAGMDDVLSKPLSVPALTAMIKQFWDHKPSSAAKKQEHIVMQTHESLLDTAMLEQYIDLVGPQLIHQSLEMFEQMMPSYLAVLDSNMTARDQKGITEEAHKIKGAAGSVGLRHIQQLAQQIQTPTLPAWWDNVQDWVDELKSEWRNDVQVLREWAAEAEKK >NZ_CP009367.1|WP_005174232.1|4404203_4405106_+|TIGR01212-family-radical-SAM-protein MQLQQLVNMFGADLQRRYGEKIHKLTLHGGFSCPNRDGTLGRGGCTFCNVASFADEQMQQQGIAQQLAEQAKKANRAKRYLAYFQAYTSTYAEVNALAVMYEQALAEADIVGLCVGTRPDCVPDAVLDLLSGYHQQGYEVWLELGLQTANDKTLKRINRGHDFACYQQTARRARARGLKVCCHLIVGLPGEEQAQCMETLEKVVVTGVDGIKLHPLHIVEGSIMAKAWRAGRLSELALEDYVLTAGEMIRHTPADIVYHRISASARRPTLLAPLWCANRWTGMNELNNYMLAHGGQASAL >NZ_CP009367.1|WP_005174234.1|4399045_4403506_-|glutamate-synthase-large-subunit MLYDKSLERDNCGFGLIAHIEGEPSHKVVRTAIHALARMQHRGAILADGKTGDGCGLLLQKPDRFFRMVAEERGWRLAKNYAVGMMFLSQDEELAKASRRIVEEELQNETLSIIGWREVPTNPDVLGEIALSSLPRIEQIFVNAPAGWRPRDMERRLFVARRRIEKRIANDKDFYVCSFSNLVTIYKGLCMPADLPRFYLDLADLRMESAICLFHQRFSTNTVPRWPLAQPFRYLAHNGEINTIAGNRQWARARAYKFKTPLIPDLQDAAPFVNETGSDSSSLDNMLELFLSGGMDLIRAMRLLVPPAWQNNPDMDTDLRAFFDFNSMHMEPWDGPAGIVMSDGRYAACNLDRNGLRPARYVITKDKLITCASEVGIWDYQPDEVVEKGRVGPGELMVIDTRSGKILHSAETDNDLKSRHPYKEWMEKNVKRLVPFEDLPEDQVGSRQLDDSQLETYQKQFGYSSEELDQVIRVLGEIGQEATGSMGDDTPFAVLSSGPRIIYDYFRQQFAQVTNPPIDPLREAHVMSLATSIGREMNVFCEAEGQAHRLSFKSPILLFSDFQQLTTLEGEHYRADRLDLTFAPAETDLEQAVLALCEEAERKVRDGAVMLVLSDRAIAPNRLPVPAPMAVGAIQTRLVEKNLRCDANIIVETASARDPHHFAVLLGFGATAIYPYLAYESLAKLVDTQAIDKKYRDVMLNYRNGINKGLYKIMSKMGISTVASYRCAKLFEAVGLHRDLTNLCFQGVVSRIGGASFSDFQQDLQNLSKRAWLKRKPLDQGGLLKFVHNGEYHAYNPDVVSTLQTAVHSGEYSDYQIYAKLVNERPIATLRDLLAIKPQGTPIPVDQVEPAESLFKRFDTAAMSIGALSPEAHESLAIAMNSLGGFSNSGEGGEDPARYGTNKVSRIKQVASGRFGVTPAYLVNADVIQIKVAQGAKPGEGGQLPGDKVTPYIAKLRYSVPGVTLISPPPHHDIYSIEDLAQLIFDLKQVNPKAMISVKLVSEPGVGTIATGVAKAYADLITIAGYDGGTGASPLSSVKYAGCPWELGLVETQQALVANGLRHKIRLQVDGGLKTGVDIVKAAILGAESFGFGTGPMVALGCKYLRICHLNNCATGVATQDEKLRRDHYHGLPERVVNYFQFIARETREIMAELGVSQLVDLIGRTDMLLELDGISAKQNKLDLSPMLKTATPHPGKALYCTENNPPFDKGLLNKELLAQAEPYIEAKQSKTFYFDIRNTDRSVGAALSGAIATKHGDQGLATDPIKAYFSGTAGQSFGVWNAGGVELTLTGDANDYVGKGMAGGRIAVRPPVGSNFRSHEASIVGNTCLYGATGGKLFAAGRAGERFAVRNSGAITVVEGIGDNGCEYMTGGIVCVLGRTGINFGAGMTGGFAYVLDEDGEFRKRVNPELVEVLDVDQLAIHEEHLRGLITEHVQLTGSSRGEEILANWPEWVTKFALVKPKSSDVKALLGHRSRSAAELRVQAQ 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
179079 : 188690
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009367|179079:188690|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009367|179079:188690|186967_187363_+|WP_005173442.1|DBSCAN-SWA MSAHSIRQVIAACDQAISERNFDELMKYYAPDAALVIKPGMIVRGKDNIRKAFIAISDHFKNQLVVEQGEMQVIEGAGDALVIMETVLHFPDEQGGVVTTTRRATYVFRHENDGSWICTIDNSYGTSLLDG >NZ_CP009367|179079:188690|186262_186688_+|WP_005173443.1|DBSCAN-SWA MNNITLYHNPACGTSRNTLEMIRNSGAEPTIIYYLETPPSRDVLMKLIADMGISARALLRKNVEPYETLGLAKDCFTDNQLIDFMLQYPILINRPIVVTSLGTRLCRPSEVVLEILSDDQKGAFTKEDGEKVIDDAGKRLK >NZ_CP009367|179079:188690|184374_184725_+|WP_005173445.1|DBSCAN-SWA MTLTSLQLFKNLSDETRLGIVLLLKEMGELCVCDLCTALDESQPKISRHLAMLRESGLLLDRKQGKWVHYRLSPHIPSWAAQVIEQAWLSQQDDVQAIARKLTSANCSGSGKAVCI >NZ_CP009367|179079:188690|184959_186249_+|WP_005173444.1|DBSCAN-SWA MLLAGAIFILTIVLVIWQPKGLGIGWSATLGAILALVSGVVHIADIPVVWNIVWNATATFIAVIIISLLLDECGFFEWAALHVSRWGNGRGRLLFTYIVLLGAAVAALFANDGAALILTPIVIAMLLALGFSKRATLAFVMAAGFIADTASLPLIVSNLVNIVSADFFHLGFTEYASVMVPVDIAAIIATLVMLHLFFRKDIPPSYDLARLKEPALAIKDQATFRTGWIVLLLLLIGFFVLEPMGIPVSAIAAVGAIILFAVAKRGHAINTGKVLRGAPWQIVIFSLGMYLVVYGLRNAGLTEYLSGVLSVLADNGLWAATFGTGFLTAFLSSIMNNMPTVLVGALSIDGSTASGVIKEAMIYANVIGCDLGPKITPIGSLATLLWLHVLSQKNMTITWGYYFRTGIIMTLPVLFVTLTALALHLSLNL >NZ_CP009367|179079:188690|187445_188690_+|WP_005173439.1|DBSCAN-SWA MVVTDLDALNILSTPIWVVLPKNQEILFANKEARKIAGDIQLSRMRNGRFSAHAQQHLHAYLPALAVDDHVIEIWTIQTEENAFPLSCRLSLTQLEPYGVVIIFEGLYISESVVTQPASSKLMAKAYSRSEQSFYEQFFSTNTAPMLLIDPSKEGLIVDANQAATRFYGYSRDEMCRKHTWEINSMGKDVLPVMNEVAKLPGGHKPLNFIHKLADGNTRHVQTYAGPVELDGIRLMLCIIHDITEQKRLEQALEYAALKDPLTDLGNRRQFFPLVEHAHAQSQRYGQNFSLILLDVDHFKNINDQLGHHKGDEVLIFLARTLESIIRECDIVFRWGGEEFTILLPSTNLKGALQLAESIRETIQMICQPNLPQLTVSIGVAQHQVGEDTDSLFKRMDEALYRAKASGRNRVLAA >NZ_CP009367|179079:188690|182987_184130_+|WP_005173446.1|DBSCAN-SWA MPKFNHYDLALLNPSFDSPLVDALTELELLRHLRLETAVHPLLFAQLKSIFHMLESLGSARIEGNHTTLADYVESKVEGAEDSTDQLKEIGNIEHAMNFIDEHLHAGEDITEYFVRELHAMTVNGIEREGDKTPGAYRSHGVSIAQSTHLPPEFIHVPAYMHELVEFMNRADAPKYDLMKVALAHHRFGWIHPFGNGNGRTVHLLTYSLLIKYGFNVKTSGRVLNPTAVFCHDRERYYSMLAEADTGAVEGLEHWCLYVLTGISAELKKVDKLSNLHFLNSKILYPALEYSKGRGVINETESTILKRTISQGTVKANDLKGVLPGLKSAQITYQIGKLVDRGLLQPVEVGSRIYTAGFSKSDLMRGVIHALRKEGFIPDF >NZ_CP009367|179079:188690|180187_181705_+|WP_032909124.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSEQKTQVAEQAQELNSELQARREKLAALREKGIAFPNDFRREHLSDQLHAEYGEKTNEELEALDIEVTVAGRMMTRRIMGKASFVTLQDVGGRIQLYVSRDDLPEGVYNEEFKKWDLGDILGARGKLFKTKTGELSIHCSELRLLTKALRPLPDKFHGLADQETRYRQRYLDLIANDESRNTFKVRSQVMSGIRRFMVEKGFMEVETPMMQVIPGGASARPFVTHHNALDIDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFEINRNFRNEGVSPRHNPEFTMMELYMAYADYKDLIALTEELFRTLTETVLGSSVVQYGDQTFDFGKPFAKLTMKEAICKYRPETNVADLDDMDKAVAIAESLGIKVEKSWGLGRVQCEIFEETAESHLIQPTFITEYPAEVSPLARRNDDNPFITDRFEFFIGGREIGNGFSELNDAEDQAQRFADQVSAKEAGDDEAMFYDEDYVTALEHGLPPTAGLGIGIDRMVMLFTNSHTIRDVILFPAMRPVK >NZ_CP009367|179079:188690|179079_180177_+|WP_011817019.1|DBSCAN-SWA MFEINPVKNRIQDLSDRTAVLRGYLDYDAKKERLEEVNAELEQPDVWNEPERAQALGKERSSLEEIVTTIDQLDQGMDDVTGLLELAIEADDEETFNEAVAELDILDGKLGQLEFRRMFSGEYDSANCYLDLQAGSGGTEAQDWASMLLRMYLRWAEAKGFKTEIIEESDGDVAGLKSATIKIIGDYAFGWLRTETGVHRLVRKSPFDSGGRRHTSFSSAFVYPEVDDDIDIEINPADLRIDVYRASGAGGQHVNKTESAVRITHIPTNIVTQCQNDRSQHKNKDQAMKQLKAKLYEFEMQKKNADKQMLEDNKSDIGWGSQIRSYVLDDSRIKDLRTGVETRNTQAVLDGDLDKFIEASLKAGL |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
389720 : 399108
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009367|389720:399108|DBSCAN-SWA TTCAATATGCTTCACATTTAGGCAACCAGTCGGCCTCGCAGTCTTCACTTAATATCAGATTGGTTTGCATCCCTTGGTTCGTCTTACGCTTCAACAAGGCTATTTCATATTCGCTCAAGGTTTGTGGCACAGCGCGCCCGAATGCGGTCAGGCTCATTGGCCGTTGATGGCCGCGCGCCTCCATAAATGACAGGTAAGCGTGATACAGGTATTTACGCGGGTTGGCCGGAATAATATTAGCATTCCCCATATACAGACCATTGGGCGTATTAACCGCCAGCAGATAACCACAAAAATCAACCAGCGGGTCAGCACCGCGTTTAATTTCCAGCGCTTCATCCGAGTTCTGCTGTGCTTCAAGTAGCGCACGGGCATCATTAGGAGCATTAAAACGCTGCATCAGGTGACGCACAATCACCGCCAGTTCACCGGTAATTTTTGCCAGTAATAGCGGGTCGCGCTCATTGGCCGGAATGACTTCCGGGAACGGCAGGATAACCCGGCGACGGGATACGCCGCCGCTGCGGTCACTGAACTGCATCGGGTTATTATTGACGGCCAGAATCACCGCCGGGATATGAGTGGAATAGGCATCACGGTATTTCGGGTCTATGGCGACAGCATCACCGCCAGTGATGGCTTTAATGCCCGCACCGTCACCGCTCCAGCGCTCTTGGTCTGGCAGGATAATCAGAGAGAAGCCCACCACAGAAGCACGTTCCCGCGATGACTCCAGCGTATCGATAGTAGCTGAGGTGGTATTGTCTTTACCGGCCAGCAAGCTGGCAATGGAGGCCATCACGCTTTTGCCACTGCCGCCCGGTCCGGTCACCTCAAGGAACAGTTGCCAGTCATAGCGGTTCGCCAACACCATATAAAGCGCCGCGAGAATACGCGCCTGTTTTTCGTGTTGTTGCCCGGCGGCCCGTGTTAACCAGCGCCAAAAGTGCGGGGCATGGTCGGACAGATTTTCCCCGGCTTTGGGCGGGGTGTAATCGACACTGTTTACCGTGCGTAGCCAGTGCGTTTTCTGGTGTGCGCTGAACTGGCCGGTAGTGGTATCAAATACCCCGTTACGAAAACCTATCAAGTGCCGGGCGGGTGTTCCCATTTGTGGCACCATCAGCTTAAGTGTATCGAGTACGCTGTTTATCCCTGATGCTGAGAACGGGGCGCGGATTTTATGGAACAAGGCGGCAATTTCCCGGCTGAGTAACCGATACGGCAGCACCTGCCACGCCCCGTTCTCATATCGGCACAGGTCTTCACCCACCTGTGGCACGGCCAACAAGTGTTGATAGTGCTCTGCCAGCAACTCGGCCTTTTCACTGGCGCTCATGGCTTTCAGGTCGGCGTCACTGAGCGTATCAAACGGGCTGGGCTGTTGCGGCTGATTAAATGCCTGTAACTGGGTCAGGGTAGCCAGTTTGCCTTGCTGCTGATAAACGTCGTTCCAGTCACCCACAACCGGCGGCAACGCCAGCTTACCGCCGCTCAATTGGGCGGCCTCGGTTGCGCGGGTCTGGCCGGTGCCGTTCTCGTCATTATCGGCGGCCAGCAATAGCAGTGCATCCGGGTAGTGAGTACGCAACTGTTGCGCCAGCGCGGACAGATTGTTAGCACTGAGCGCAACACAAACACTTTCCCCGGTCAGGTGATGCACTGTTAGCCCGGTAGCATAGCCCTCGGTCAGCCAGATAACGGCGTTGTCCCGCCCGGGCAAGAAATGACAGGCCGCTTTCACCTGCCCCCCGGCCAGTGTGCGCTTGTCACCGTTGGCGTTAATCAACTGGATGTTGACTACCTCACCGGTGTTGTCGGTCAGGGGGAATAACAGGTCGCCGGGTTGATAGGTAATACCGCCCACATGCAACGATTGACCGTGTAATGTCAGCGCCTCCAGCTCCGGCCAGCCTTTGGCGGTCAGATAGGCATTCCCGGCCAGTGATTGGGCGACAGTCAGCAACTGTCTGGCCTGTTCTGCGGCCCGCTGCCGTGCCTGCGCTTTCTCCTGCGCGTCCTGTCCGGCATCATGTACCGGTAATGTCGGGTGTGACGGCTCCCCTAACACCTCGGCTACTTTGCAGGCGGCTTCCTTGGGTGTGACCGCCAGCGCCTTTTCAACCAAATTCAGGCCATCACCGCCGCCGCACTGGTTACAAAACCATGTGCCACGCCCTTGCAGGTTATCAAAGCGAAAACGGTCTTTACCGCCACACATTGGGCAGGGCTGCGCCCGACCGCCAGCGGTGATGTGAATACCGAGCGCCGGGAGCAATACCGGCCACTGGCCGGTGGCTGCACGTGAGGTGTGTGAAACGCTTAATGTTGTCATTCTCTGTTTCTCCTCAGTGCAGGGTGGTTTGACTGGTTGTAGTTATCTGCGCTTGGCACAGCTCATCCATCATTTTTTGCCCCAGTACCGTCAGGCGCGGCGGAGCCAGCAGAATATCCGGCTGAACCATGTCACTGAGCATGGTGCAGGCCATATCCATACCGGCCTCTGGCCCGTGCTGGCGCACATAATAGCCCTCAATATCCATCGCAATCGCCATTTGCAATTCATCTAGCGAGTAACCAAGGCGTACTCCGTGAGACACGCAGGTATCAAGATAGGCATGGGCTAACGCACGGCGATAAACAGCGGTACGGACTTCAACGGGCAAACAGGATTGATTTAGGGTATTCATGCGATAGGTGCCTCCATGCGGGATAAGATTTGTGATTCGCAGGTGTTCATTACCTGTCCGAGTTGGTCAGTCAGTAGCGCCACCATTGAGGCGAACGATTCAGGCGACGGTGGGGTAATGCCGTGCAACAGGCTGCTTTGCGTTTCCAGCATATCGAGGAACGTCACACCGACATTGTGTGCATGTTGGAGGCGTAAGAAATCAGCATGAGGGATGCTGTACTGCGTATCACAGTCATAACGGGCGGCAAGGGTATTCATGCGACTTCCCCCAGTGGCAGACGGCCAGCAAACGACAGGATGTAGTCACGGGTTAAACGCAGGCGGGCATTCTTCTCACTGCTGGCGGTGGTACGCAACATGCAGGGACGCGCCGTTAATTCAGTACGACGAACAGCAGCAAACAGGTAGATAAATTGCGGGTGTAACGGGGTGAGGGATGTAGCCATAGTGGCAGCCTCCAATAAGTATTGGTTATTGCTACCACCGAAGTTCCTACGCTTATGGGTGGTAGCCCAGACGGGGGTAGGAATACCGGCCTTATTGGAAACCGGCCAGCCCGAAGGCTGCCCCGCCTGGGCCACCATTGCTTGATAACGACAGCGGTATAGAAACCACTGCGTAAAAAACTGGTAGGCCGAGGCCACGACATAAAAAAACACGCATGGCGCGTGTTGAGTCGCCAATAAGTAACACGGGTTCCTACGCCCGGCTGCCGATTTTGCGACAGCACGGCGACTATAACGCAAGGCCTGCAAAAAATGCAAGCCAGAGAAAAGCCCTTTTTGCGGGATGAATGTCATCGGTTTAACAATCAGTCTGAATATCAGGCTTGGGCTGAGTAGGAGCACGGGAGTAGAAATTGGCCTGTGCTGGCGTACTCGGCGTATTGCCCGACATCACTTGCACCACGCCGTTTAGCTGGCTGCGGTACTTGGGTAAAGCAAGGCCGGGTTGTTGCTGTGCAATCTGGAACGCTTCAGCGATGTACTGCACGTCGCCCTCATTCAGAGTGAAGAATTGCTCGCCGATTTTTAGGGTGATCATGCTGATACCCCCTGACGGTTAGCAATACGCTCTGCCATCCAACCCTCAATCTCAGAGGCCAGCCATGCGACGTTCTTACCGCCGAGGGAAATCTGTGCGGGGAAGTGGTCACGGCTAATCAGTTCATAAATGGTCGAGCGGGATAAGGCGGTGGTATTAATCACTTCCGGCAGACGCATAAAGCGGTCACGCGGGTAGTGTATTGCCATTGGGGGGGGTGTATTGGATAAAGTCTGTTGTGTCATTGCAAGCATGTAAAGCTACCTTGTTGTTGTCCGGCCATATACCGCCGGGTTTGCTGGGATTCAGTTGGGTAGCCCCCTATTGTGAGAATATTTTTACCTGATGCAACAAGCCGTTGTTGTGTGGTTCAGCAAACTCACCAAACCGAACTCATCCTAGAAACTCGCCGCATTTGCCTTCTTTTGCCTTTATTTGCCTTTGTTTGCCTCTATGACTATTTCGCTTATTTTTCACTCTCATTTCATTGGAGTAGTTGGAATATAAAATTAATTTTAATGCAAAAACAGTATAAGTGATTGGTTAATTATCACTCTGTCTGAATGGTTTTTTAGCTAGCCAGAGAAAAAGCTCTTTTTAACCCAGTGAACAGTAGTGAACACTTGGTGAATAGTTTCAAGTGAACTGTTCACTCTTTTATTTATTGATTATTAATACTTTTTTCTTAAAGTGAAGAGTAGTGAACAGTTTTTATAAAACTATTATTTTTATGGCCTTATTTAAGCTGATGTAGAGCGTGTGTTGTATGGGAAATGGCACAACGGGCATTAATTGAGGCGTTGTGTGAGAGCTTGCAAAATGACTCCACATTGACTGAGACGGAGTTATAACTAGATGAGCCAAACAACCCCACACCCAGTAACACCCGCCCTTGAAAATTTTAAAGCGGCGAAAGCGCAACACCTGAAGAATGAAGAAACCTACGAAGAAATTATTGCGTCCATTGCCCGCAGCCAGCAAAAGCAGCGCGACGCCGAAAACCAGAGCCAACAGGCTGACGGCAGTTGGCGCAAATTGTTTCGCAGTCTGCGCGGTGAAATGACGGATGAGCTGCAAACCGAACATATCCGCCGGATTTCACAGCGAGAGCTGGCACAAGAATTTGGACATCTGATTGAAGAGCTGGAGTTGGATAAAGATTACACGTCACTGCAATTATGTGCTTCTGCAAAACCCTATAAAGACACACATAAAGTAGCGTTGATGGAATATGCGAGGCTGGAAATGTCTGCTGCGATGAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009367|389720:399108|393215_393404_-|WP_032902977.1|DBSCAN-SWA MQYIAEAFQIAQQQPGLALPKYRSQLNGVVQVMSGNTPSTPAQANFYSRAPTQPKPDIQTDC >NZ_CP009367|389720:399108|389720_392054_-|WP_032912806.1|DBSCAN-SWA MTTLSVSHTSRAATGQWPVLLPALGIHITAGGRAQPCPMCGGKDRFRFDNLQGRGTWFCNQCGGGDGLNLVEKALAVTPKEAACKVAEVLGEPSHPTLPVHDAGQDAQEKAQARQRAAEQARQLLTVAQSLAGNAYLTAKGWPELEALTLHGQSLHVGGITYQPGDLLFPLTDNTGEVVNIQLINANGDKRTLAGGQVKAACHFLPGRDNAVIWLTEGYATGLTVHHLTGESVCVALSANNLSALAQQLRTHYPDALLLLAADNDENGTGQTRATEAAQLSGGKLALPPVVGDWNDVYQQQGKLATLTQLQAFNQPQQPSPFDTLSDADLKAMSASEKAELLAEHYQHLLAVPQVGEDLCRYENGAWQVLPYRLLSREIAALFHKIRAPFSASGINSVLDTLKLMVPQMGTPARHLIGFRNGVFDTTTGQFSAHQKTHWLRTVNSVDYTPPKAGENLSDHAPHFWRWLTRAAGQQHEKQARILAALYMVLANRYDWQLFLEVTGPGGSGKSVMASIASLLAGKDNTTSATIDTLESSRERASVVGFSLIILPDQERWSGDGAGIKAITGGDAVAIDPKYRDAYSTHIPAVILAVNNNPMQFSDRSGGVSRRRVILPFPEVIPANERDPLLLAKITGELAVIVRHLMQRFNAPNDARALLEAQQNSDEALEIKRGADPLVDFCGYLLAVNTPNGLYMGNANIIPANPRKYLYHAYLSFMEARGHQRPMSLTAFGRAVPQTLSEYEIALLKRKTNQGMQTNLILSEDCEADWLPKCEAY >NZ_CP009367|389720:399108|393451_393709_-|WP_005172884.1|DBSCAN-SWA MLAMTQQTLSNTPPPMAIHYPRDRFMRLPEVINTTALSRSTIYELISRDHFPAQISLGGKNVAWLASEIEGWMAERIANRQGVSA >NZ_CP009367|389720:399108|394310_395012_+|WP_005172881.1|DBSCAN-SWA MSQTTPHPVTPALENFKAAKAQHLKNEETYEEIIASIARSQQKQRDAENQSQQADGSWRKLFRSLRGEMTDELQTEHIRRISQRELAQEFGHLIEELELDKDYTSLQLCASAKPYKDTHKVALMEYARLEMSAAMKTLSPELIRAAKIMVSANELYTDSSPAKALGTLTATLLSLAGLYSFDMEKESILAELTLQQPQPGYVDSALNNSPIKCARLFEAIKVKREKLNPAGEQ >NZ_CP009367|389720:399108|396358_397582_-|WP_005172873.1|DBSCAN-SWA MSLKIRHTQKNTVSAINSIQSLCEALDISQYELNVALSTPDSERYTPSEIEKSDGSLRKIYNPKSFLRKIQRRINRRIFNLYTVKGRERKNPPILWASYLFGSIPNQFLDENIEQKDYIACARVHCQSKSLLKVDIQNFFDNVQDIHIEDIFNNFFFFNEDVSRALTNICCFEGHLVQGALTSSYLSCLCLYDIEGKIVDRLTRKNLRYTRLVDDITVSSTVSNYDFSYAKDIIINMLHEKDLPVNLKKTQCYYTSTSPLTVHGLRVSFSEPRLPSDEARRIRASVRNIESLSSETNYRTTHAYRKDFNRCMGRVNKLKRVNHSQHESLFNRLVKLAPLPSKKDIDRVSVSLLRLENDYKNGKHDTYWYWKRYYRIHERLNILQRTFTREASAFRSRVKVVPPTYIQ >NZ_CP009367|389720:399108|392405_392669_-|WP_005172893.1|DBSCAN-SWA MNTLAARYDCDTQYSIPHADFLRLQHAHNVGVTFLDMLETQSSLLHGITPPSPESFASMVALLTDQLGQVMNTCESQILSRMEAPIA >NZ_CP009367|389720:399108|392067_392409_-|WP_005172896.1|DBSCAN-SWA MNTLNQSCLPVEVRTAVYRRALAHAYLDTCVSHGVRLGYSLDELQMAIAMDIEGYYVRQHGPEAGMDMACTMLSDMVQPDILLAPPRLTVLGQKMMDELCQAQITTTSQTTLH >NZ_CP009367|389720:399108|392665_393211_-|WP_005172890.1|DBSCAN-SWA MTFIPQKGLFSGLHFLQALRYSRRAVAKSAAGRRNPCYLLATQHAPCVFFYVVASAYQFFTQWFLYRCRYQAMVAQAGQPSGWPVSNKAGIPTPVWATTHKRRNFGGSNNQYLLEAATMATSLTPLHPQFIYLFAAVRRTELTARPCMLRTTASSEKNARLRLTRDYILSFAGRLPLGEVA >NZ_CP009367|389720:399108|397911_399108_-|WP_005172869.1|integrase|DBSCAN-SWA MARTTRPLTHTEVQKAKAIDKDLTLHDGDGLFLLVKTTGKKIWRFRYQLPNSSKRTMISLGAYPALSLADAREIRAEKLAMLVRGTDPQTRAGEEAEKLQIAEESIFVNVARKWFELKESHVSAAHAKDIWRSIEKDILPSIENIPIQELKARTLIQVLEPIKARGALETVRRLVQRINEIMIYAVNVGLIDANPASGIGNAFERPKKQHMPTIRPEELPKLMRTIAMSNLSIPTRCLLEWKLLTLIRPSEASATAWAEIDIENKQWCIPAERMKAKRDHIVPLSEQALELLEIMRPISSNRQYVFPSRNNPSNPMNSQTANAALKRIGYGGKLVAHGLRSIASTAMNEAGFNADVIEAALAHSDKNEVRKAYNRSTYFEQRKELMSWWGASCKRNNN >NZ_CP009367|389720:399108|395014_395260_+|WP_005172879.1|DBSCAN-SWA MMRCPVCKHASHTRASRYLSEQTKEAYYQCQNIECSCTFKSIESVDKIITRPPVKEPEIIPDVILPERKVLNRYGSNARIH >NZ_CP009367|389720:399108|395588_396341_-|WP_005172876.1|DBSCAN-SWA MNIFLFLKKYLLLSKIQSIPLRILLLFLYAITITGIVTFGISAILTGTQEGYFEKDFCFNNTCIKNAATGYSQSILILQAMFILLGIVASIGGIIVALMGYINSVSVSALGNHISHFKIFQEYLSYEINKRDRLSPASFDIFKWYNIIFNKSRSGSTSVSDEYCALVLKLNNIISNSNAACTKANKGSFSYVSHQINIVSTLIEFGIVQPRLPRNDFYEVEDQIIALIANINREFCYSTSVPELIKRDYR |
11 | Enterobacteria_phage(66.67%) | integrase | attL 389240:389254|attR 399127:399141 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
953511 : 1022485
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009367|953511:1022485|DBSCAN-SWA 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72 | Cronobacter_phage(60.53%) | tail,transposase,head,tRNA,capsid,holin,terminase,protease,portal,integrase | attL 943590:943604|attR 1030015:1030029 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1221038 : 1316263
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009367|1221038:1316263|DBSCAN-SWA 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96 | Erwinia_phage(34.15%) | tail,lysis,plate,transposase,head,capsid,holin,terminase,portal,integrase | attL 1268048:1268065|attR 1278889:1278906 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1339630 : 1406274
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009367|1339630:1406274|DBSCAN-SWA 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61 | Bacillus_phage(14.29%) | transposase,coat,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2030080 : 2042209
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP009367|2030080:2042209|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP009367|2030080:2042209|2036706_2036943_-|WP_071530598.1|DBSCAN-SWA MLYYTSSIDLIEGNVMKVNDRVTVKTDGGPRREGVVLEVEQFSEGVMYLVSLEDYPAGVWFFNEIDSHDGTFVEPLHK >NZ_CP009367|2030080:2042209|2030080_2032783_-|WP_005168752.1|DBSCAN-SWA MTKFQKTGTARSNNNKKPFTIALEAKNSLDQTLSKLNANLNGLTEEDAKERLELYGLNEVAHEKAPPALIQLLAAFNNPFIFVLMILAAISFVTDYWLPLQRGEETDLVGVSIIVTMVLISGLLRFWQEYRTNKAAEALKSMVRTTATVLRRSSHSAQPAKQEIAIKQLVPGDIILLSAGDMIPADLRLIKSRDLFISQAILTGEAIPIEKYDAMGAIAPKSVEADASSESELLELSNICLMGTNVASGTAMAVVVATGGHTYFGSLAKSIVGNRAQTAFDRGVNSVSWLLIRFMLVMVPIVLLINGFTKGDWSEAALFALAVAVGLTPEMLPMIVSSNLAKGAIAMSRRKVVVKRLNAIQNFGAMDVLCTDKTGTLTQDRIILEHHLDTRGSNDGRILQLAWLNSFHQSGMRNLMDQAVIKFSRGKPEIDALRSFNKVDELPFDFIRRRLSIVVKDEQQHQTLICKGAVEEMLSICTHVREGDAIYPLDETRRTSLLALATQYNEDGFRVLLLATRELGTQLSELPLNIDDERELVVQGLLTFLDPPKESAEAAIAALRENGVAVKVLTGDNPIITAKICRDVGLEPGEPLSGLDIENMDDVTLAREVELRTVFTKLTPLQKSRVLKMLQSNGHTVGFLGDGINDAPALRDADVGISVDTGTDIAKESADIILLEKNLMVLEEGVIKGRETFGNIIKYLNMTASSNFGNVFSVLVASAFIPFLPMLAIHLLLQNLMYDISQLSLPWDKMDKEFLRKPRKWDAKNIGRFMLWIGPTSSIFDITTFALMWFVFAANSVEHQALFQSGWFIEGLLSQTLVVHMLRTQKIPFIQSTAALPVLLTTGVIMAIGIYIPFSPLGTLVGLQPLPWQYFPWLAGTLISYCVVAQLMKQFYIRRFGKWF >NZ_CP009367|2030080:2042209|2039056_2042209_+|WP_005168742.1|DBSCAN-SWA MTAQQEVKPQATPALSQILFRRDWENPQITQYNRLEAHPPFYSWRHLDAAQNDTPSPQRQLLNGQWSFSYFTQPESVPDEWVEHDLPEAISMPVPSNWQLHGYDIPIYTNVQYPIPVDPPRVPQNNPTGCYSYNFTLEPDWILSGQTRIIFDGVNSAFYLWCNGRWVGYSQDSRLPAEFDLTPYLKAGNNRIAVLVLRWSDGSYLEDQDMWRMSGIFRDVSLLHKPDIHLRDIHISTHLSPEFSSAHLEVMAAVNIPLLDINNSQVTKAYQIQVQLWLADSLVASLRQPLGTQPIDERGHYTDRTHLSLRVDHPLLWSAEQPALYRTVVSLLDSQQKLIEAEAYDVGFRQVAIHQGLLKINGKAVLIRGVNRHEHHPQTGQAIDEESMLQDIILMKQHNFNAVRCSHYPNHPLWYRLCDRYGLYVVDEANIETHGMQPMRRLADDPQWFSAFSERVTRMVQRDRNHPCIIIWSLGNESGHGATHDALYRWIETNDPTRPVQYEGGGANTQATDIVCPMYARVDEDQPFPAVPKWAIKKWIGLPNESRPLILCEYAHAMGNSFGGFARYWQAFRQYPRLQGGFVWDWVDQSLTRNDENGQPYWAYGGDFGDSPNDRQFCMNGLVFPDRTPHPSLYEAQCAQQFFQFSLVSTSPLIIKVTSEYLFRNSDNEHLYWRIELAGKSVLEGSFPLDLLPESTQQFSLTERLPAICGPGDLWLNVEVRQVEETPWSPSHHRCAWFQWRLPHSLAVLSRGLSDSATSNNLKLHQDIQHITVTHQQQHWQFNRQTGLLEQWCVGGENRLLTPLRDQFVRAPLDNDIGISETTRIDPNAWVERWKKAGMYQLEQRCLSLHADTLSQAIQISAEYIYEFAQEQLLHTHWLYRFDQQGHMTIDVRVQVATSLPSLARVGMCCQLSDIYENVEWLGLGPHENYPDRQLSAQHSHWSQPLDQMHTPYIFPSENGLRCNTSMLSYGNWQLTGQFHFGISRYSTQQLMAASHQHLLRSEAGTWLNIDGFHMGVGGDDSWSPSVHADNLLTNEIYQYQVCWQYKDSI >NZ_CP009367|2030080:2042209|2037845_2038880_+|WP_005168744.1|DBSCAN-SWA MKPKSATLDDVARQAGVSYQTVSRVLNRAPHVSLKTRHKVELAMVELNYVPNRVAQQLAGKHSLTLGLATTDLSLHAPSQIAAAVKRKARELGYNVVIAMADDHSEHACQLAINELLAQRVDGILVNVPLKPKRSQKITEQCADTPVLFLDVDPQSAAFSVLFDPKIGAIQGANHLIALGHQQIVLIGGPKDAISAQLRHQGWLQALDNASLTPQAVYYGEWSALSGYQATQTLIASNTPFSAILVANDQMALGVLRALHEINVDIPREVSVIGYDDTADSAYFQPPLTTIRQNFRLLGEECVSRLIVRLHHTIEPPSHSLSLATELIIRQTTAPVNPTWHKNE >NZ_CP009367|2030080:2042209|2032999_2033698_-|WP_005168749.1|DBSCAN-SWA MALTPFVVNLLLAMCLGALIGAERQWRQRMAGLRTNALVATGAAVFILSSYATSPDSPGRIAAQVVSGIGFLGAGVIMREGMNIRGLNTAATLWCSAGIGVLCGLGLYWNAVAATAVILCANILLREAAQRINMQPQQQAVDLEVRYRIQVTCGAEDEVLVRTLILQALNGVALRLQSLCSADIAKPGQLEVCAEIMATPAAQKEIESIVCRVSLERSVSAIHWRIASELPV >NZ_CP009367|2030080:2042209|2034834_2036574_+|WP_005168746.1|DBSCAN-SWA MKRGSTHKPLDIKITPEHNKDTKVFFVNNMRLVTLFIAILAGILLLFAAAIGTSGYFLKQSNQSLEEATQELDIRLGLSNSSNHLRTARLILIQAASSARIGDATGYQQGLKNAENRISQSQQMFNLYYNRPIKSETDTALDGPLKKAYEQYRDDGMKLMLEATKEGHFEEVISLEAEKLNQLDDAYNEPLLKAVKYRTERANEINQSAQQEARLGYMLMGGAFILAILLTLIAFLVISKVIIKPINRLVARIQRIAQGDLTQHPAPFGRNEIGVLGNNIQQMQDSLSSTVEAVRSSAESIYQGSSEIALGNTDLSARTEQQAASLEQTAASMEQLTATVKQNAENAHHASQLAANASGKAAQGGDIVNDVVSTMDKISLSSMKIAEITNVINSIAFQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFAVVASEVRNLAQRSADAAKEIESLIEVSVDLIGDGSILVSDAGKAMNEIVTAVTHVTDIMGEIASASDEQSRGISQVAQAVSEMDNVTQQNASLVQEASAAAASLEQQAEILTQAVAVFHLNGRNPAPALKTPAPTSIGQNKTGGNKKPTDDSLNWETF >NZ_CP009367|2030080:2042209|2037151_2037364_-|WP_002210893.1|DBSCAN-SWA MSNMMKGQVKWFNESKGFGFITPADGSKDVFVHFSAIQDQGFKTLAEGQNVQFSIENGAKGPSAANVTAI |
7 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2520586 : 2575889
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP009367|2520586:2575889|DBSCAN-SWA 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52 | Escherichia_phage(30.0%) | transposase,tail,tRNA,integrase | attL 2561294:2561339|attR 2575899:2575944 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
4235943 : 4253169
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP009367|4235943:4253169|DBSCAN-SWA 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26 | Escherichia_phage(18.75%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
4256925 : 4315749
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP009367|4256925:4315749|DBSCAN-SWA TATGTCCACAAACACATCTCTGGCCTCGGCGAACCTGAGTTTAACGCAGAGCAAACATGACCGGTTACTTCGCAGCGTTCGCAAGGGATGGACACCACCACCGCGCATTAGCGTACCTGACTGGGCTGACCGCTACCGTAAACTGGCAAAAGAGGCGGGGAGTACATCAGGAAATTGGGAAACCACCACGGTAGAGATTGCCCGTGGCCCGATGTTGGCGGCGACGGAATCAGGGGTGCATATCATCACCGTGATGTGCTGCACCCAGTTGATGAAAACAGCATTGCTGGAAAATCTGTTTGGTTACTTTGCGCATCTCGATCCCTGTCCAATGTTGTTATTACAACCCAAAGAAGACGCCGCCGAGCAATTTTCGAAAGAACGAATTACTCCCTTAGTCAGGGTGACACCGGCACTTCGCCAGTTGGTGGGCGGTAACAAACAGAAAAATTCAAAAGAGACATTGCTATACAAATCCTTTACCGGTGGGTTTCTGGCACTGGCGGGGGCCGGTAGCCCAGATAACCTTGCCCGTCGCCCGATCCGTGTATTGCTGGCCGATGAGGTAGATAAGTATCCAATCACCCGTGAGGGTGACCCGATAACGCTGGCAGAAGAACGCACCGCGACCTTTGGTCTGAATTGGCTATCTGTCCGGGCCTGCTCTCCGACCGTTGAAGATGAAAGCCGAATAGCGGCCAGCTATGAAGAGTCGGATCAGCGTCGGGCATCGATAGCATGTCCACACTGTGGTCACCGCCAATTCCCTGATTTCTTCAAGCATGTTCACTGGCCATCAGAGGGAGACAAGCACCATACAAAATTAGCCATGATCCACTGTGAAAGCTGTGGTTCTGGCTGGTCAGAGGGTGACCGGCTAAGAGCGTTACGCACCATCCAATGGCATCAGACCAAGCCATTTGAATGTTGCGACCAGCGCCATGTACCGCTAAATGCTTATGAGCAAGCCTGGCATGTTGATGATCAGACGGCGCTGGGTGTTGTATGGCGCTGGTCTGAATCTGAGCGCCACGCGGTGCATCGGGCAGTTTGTCCCATTTGCGGTAAGTTGGGGGTTGATAATATCCACGCCGGTTTTCAGGCCTCCAAGTTATTCAGCCCGTGGCAGAAAGATAAACCGTCTGATATCGCTGCTAAATACCTTAAAGCCAAGGGTGATCCGGATAAGGAGCTAGCCTGGTGGAATACCCAGATGGGCCTGCCTCATCGACCCAACTACGGTAAACGTCTGCCAGTAGATGAACTGCTGGCGCGAAGAGAAGTATTTGATGCTGAAATACCCGAAGGTGTTGCCGTCCTGACCGCAGGTATTGATACCCAGGCTGACCGGTTAGAAATTGAAGTGGTGGGTTGGGGTAAAGATGAGGAGAGCTGGTCTGTGGCGTTTGACGTTATTGAGGGTGATCTTGAAACGGCTGAACCCTGGCTCAGGCTCGATGCTTATCTCAAGCAAATCTGGCGGCGCTCGGATGGTCGAGGTTTTACCATCATGGCGGCCTGTCATGACTCCGGTGGCAACCACACACAAAAGGTCTATGAGTTTGCCAAAGAACGTCTGGCTCGGCGGATATGGGCCATCAAAGGGGAGTCAGCTACTGGTGGTAAGCGCTCTCCTATTTGGCCTAACAAACGGCCGACCTCAAAGAATCGGTCGCAGTTCCGCCCGGTCATTATTGGGGTGAACTCGGCAAAAGACTCCATCCGCGCCCGTCTTCATCTGGATAAGCCCGGCCCCGGTTATATGCATTTTTCAACCGATCGGGATATGGGCTATTTCAGCCAGTTAACCGCTGAACGGCTGGTGATGAAAGAGGCGGCGGGGCAGCGTTACAGCGTATGGGAATTACCTCACGGCAAGGCTAACGAAGCGCTGGACTGTCGGGTTTATGCCTACGCAGCGCTGGCGGGTTTGTTCCATTTGGGCCTGAAATTAAACACCCGTGCAATGCTGATTGAATCCGAACCCGATAAAGTTTTGCATCCTGCTCGTTTTGAATCAGAAGAAAAAACCAGCCTGCGCCTACCGGGGGCCATTATTCAGGAAGCTGAACCTCCTACCACAAAAAGCATCGCCAGCCGATTGGCATAAGGATTTCTATGTTCCATGCAAACACCAGCCTGCTGGCCGGTGCGATGAGTCGTGCCCAATTGCAAGAAGCATTAAACCGTGCGCAGCAAGCCTATATCGAATTATCCACGGGTTCAAAAGGCGTCTCTTTCTCCTATGCGCAAGGGGATGGTACTCGCTCAGTGACCTATCAGCCGACTGATATCGGTCAACTGATGGGATTAATTCAACTTCTTCAGGCCCAGCTAGGCATCGTTAAACATCCCCGTAGGGCGTTAAGGTTTCGTTATTGATGAAAAACCCAGTAAGGATTTTAGGTCCTGACGGTCGCCCCTTGCCGCCATCCCAATCAAGGGTATCAATGCTAAATGGCTCCAGTGGTGTTCCCTATGACGCTGCTGATCAATTCAGTGACACTATGGCTAACTGGCAACCATCACTATGGTCACCAGACAACGAAATTAATCCCTCCCGTAATCAGGTTGTTGCTCGTGTTCGTGACATGGTGCGCAATGATGGTTGGGCCTCGGGCAGCGTGACCCGCATTTTGGATAATGCCGTGGGGGCGTCTTTTCGTCCGCTTGCCAAAGTCGATTATCGAACTCTGGCGCTGATGACTGGCAATCCTCAATTTGACGCGAAATGGGCGGATGAATATGGACGGGCCATTGAATCAGGCTGGCGAATTTGGGCGAATGACCCAAACCGTTATTGTGATGTGGAAAGAAAGAAAACCGTCGCGCAACTACTGCGGCTTGGTTTCCGCCACAAGCTGACTGACGGTGACGCGCTCTGTGTGATGCAATATCGACCTGACCGCCTTGGCTATGGTCGGGCGCAGTATGCCACGACCATGCAAATCATTGATCCCGACCGGCTAAGCAATCCGCAAGAGAAATTCGACATGCCGAATATTCGCGGTGGGATAGAAATTGATGAGGATGGTGTCCCTATTGCTTATCACATCCGCAAAGCTCATATCGGTGACTGGTGGAGCGGTAAAGAAACCATGACCTGGGAGCGCATCCAGCGTGAAACTGACTGGGGCCGCCCCATCGTTATTCATGACTTTGATAGCGATCGGGCCTCCCAGCATCGCGGTATCAGTATTTTCACTCCCATCGTCCAGCGCCTGAAAATGCTGATTAAGTACGATGAAGTGGAATTGCAGTCATCAATCCTGAACTCCATTTTCGCTGCTTTCATCACGTCGCCTTATGACCCCGGTCTGGTTGCAGAATCTCTCGATACGGGTGATGACGTGATTAAGTATCAGAAAATGCGTCGGGAATATCACGACGAAAAACGCCTTTCATTACAAGGTGGTGCACGTATTCCGATACTGGCACCCGGTGAAAGTATGACCGCGCTTAATGCGGTTCGACCAACCAGTAACTTTGTCGCCTTTGAAAGTGCCGCGCTGAGAAATGTTGCGGCGTCATTGGGGATATCTACTCAGCAACTGACTCAAGACTGGTCCGATGTTAACTACAGTTCCGCGCGTTCCGCCATGCTGGAAGCGTGGAAAACGCTGACCCGCCGCCGCGATGACTTTGCGGCAGGGTTCGCTCAGCCCATCTTGTCGTGCTTTATCGAAGAATTACATGACTTAGGTGAGGTTCCTTTACCTGCTGGCGCACCTGATTTTCTCGCGGCGAAAGCGGCATATTGCCGTGCTCAATGGATGGGGCCAGGGCGGGGCTGGGTTGATCCGGTGGCTGAGAAGAAAGGGGCCATTCTTGGCATGGAAGCCGGACTCTCTACTCTCGAAATGGAGGCGGCTGAAAACGTGGGTGAAGACTGGGAGGAATTGCTGGATCAGCGCCAGCGAGAACGTGAGGCATATATTGAACGTGGATTGCCGATCCCTACATGGTTGCAAGCTGAAACCTTTGCACCCGATCAGCCTACAGCCAACCAACAACAAAAATCGGAGGCACCGTGAATCTTCCACATTTAGCCCAGCGACTGTTTAACACCCCGTTGGCACTTCATCCGCACAAGGCTGAAGTCGTTATGGCGGCGTTGACTGACCGGTTCGGCCTGACGCGCATTCAGTCGAATGCCGATTGGGCCGACGAAGAGGATGATTTCTTTTCACGCAAGGGTCGTGATTGTGGTTATGACGTCATCGAGGGCATAGCAGTTATTCCGATTCAGGGCACGCTGGTGCAAAAGTTAGGCACCTTGCGACCCTACAGCGGCATGACCGGCTATGACGGTATTCGCGCCAGCTTTCTGACTGCAATCAATGATGATGCTGTTAAGGGCATTTGTTTTGATATCGATTCACCGGGCGGAGAAGTCGCCGGCTGTTTTGATTTGGTTGATGAAATTTATGCTGCCCGTGGCGCTAAACCCATTTGGTCAATCCTGTCCGAAAATGCCTATTCAGCCGCTTATGCACTGGCCAGTGCCGCAGATCGGATTATCGTCCCGCGCACCGGGGGGGTTGGCTCTATCGGCGTCATCGTGATGCATGTTGACTGGTCACAGCGCATAAAAAGCGATGGGGTACAGGTCACGATCATCACTTTTGGCAGCAGAAAAGCTGAATCAAATCCCTACGAAGCATTAAGCGAAGAGGCAAAGAAGTCCATTCAGTCTGATGTTGACGAGATGGGTCGCTTGTTCGTGAATACCGTTTCCCGCAATCGCGGGATAGCAGAGAGAACCATCAGAGACACCGAGGCGGCATGTTTCTTAGCGGCTGATGGTGTGCAGTTGGGGCTGGCTGATCAAGTTGCCCCGCCTGATGTCGCATTCCGCGATTTATTAACATTGGTTGGAGAAAGATAATGGCGAAAATTAAAGGTTTTTCACACCTGTTTGGTCGAGGGGCCAAAGCAACAGAAGAGACTGAGGACGATAAGGACAAGGCCAAAAAAGCCAAAGGTCGTCAGGCTGAAGA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57 | Salmonella_phage(10.34%) | tail,plate,transposase,head,tRNA,capsid,terminase,portal,integrase | attL 4274965:4274979|attR 4318825:4318839 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4336506 : 4392029
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP009367|4336506:4392029|DBSCAN-SWA 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54 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(18.18%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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