CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP010302	Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 00-0949 plasmid pTet, complete sequence	1 crisprs	NA	0	3	0	0
NZ_CP010303	Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 00-0949 plasmid pVir, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP010301	Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 00-0949, complete genome	1 crisprs	DEDDh,WYL,cas14j,cas2,cas1,cas9	0	1	4	0

1. NZ_CP010302

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP010302_1

• CRISPR_ID: NZ_CP010302_1
• CRISPR_location: 8486-8785
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP010302_1

Consensus_repeat	Method
TATTACATTTAAGTCAATTTTATTTGAAAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP010302_1

>1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder
GTCCCTATTTTCCATATGTTATTTTCGTAAAAATGTCAAAAAT
>1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder
TAAGTCAATTTTATTTGAAAATAAGAGGAGCATTTAGCAATTTTTGTTGACTTTAATGTAAGTGTA
>1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder
AATTCTAAAATTGCTGCCTATTGACATAGATGTGATACTTTGATATAATTTATTTCGAAGATTAAAATATT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010302_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP010302_1

>merge|NZ_CP010302|1|8486-8785|CRISPRCasFinder
CATTACATTTAAGTCAATTGTTTTTTTAAAGTCCCTATTTTCCATATGTTATTTTCGTAAAAATGTCAAAAATTATTACATTTAAGTCAAAAATTATTACATTTAAGTCAATTTTATTTGAAAATAAGAGGAGCATTTAGCAATTTTTGTTGACTTTAATGTAAGTGTATATTACATTTAAGTCAATCTTATTTGAAAAAATTCTAAAATTGCTGCCTATTGACATAGATGTGATACTTTGATATAATTTATTTCGAAGATTAAAATATTTGTTACATTTAAGTCAATCTTATCATCTTT

>NZ_CP010302|1|1|8486-8785|CRISPRCasFinder
CATTACATTTAAGTCAATTGTTTTTTTAAA	GTCCCTATTTTCCATATGTTATTTTCGTAAAAATGTCAAAAAT
TATTACATTTAAGTCAAAAATTATTACATT	TAAGTCAATTTTATTTGAAAATAAGAGGAGCATTTAGCAATTTTTGTTGACTTTAATGTAAGTGTA
TATTACATTTAAGTCAATCTTATTTGAAAA	AATTCTAAAATTGCTGCCTATTGACATAGATGTGATACTTTGATATAATTTATTTCGAAGATTAAAATATT
TGTTACATTTAAGTCAATCTTATCATCTTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP010302.1|WP_002828964.1|12637_12901_+|TrbC/VirB2-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368210
NZ_CP010302.1|WP_043012953.1|7662_7941_+|EexN-family-lipoprotein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010302.1|WP_002801148.1|8802_9021_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|224514
NZ_CP010302.1|WP_043012949.1|2488_3877_-|relaxase/mobilization-nuclease-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367497
NZ_CP010302.1|WP_079394723.1|16252_16804_+|Rha-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|378235
NZ_CP010302.1|WP_002779778.1|4621_4903_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010302.1|WP_002803413.1|11134_11749_-|resolvase	unknown	unknown	gnl|CDD|184041
NZ_CP010302.1|WP_002801138.1|11745_12153_-|vapd	unknown	unknown	gnl|CDD|225846
NZ_CP010302.1|WP_002809052.1|12143_12467_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010302.1|WP_043012952.1|6318_7545_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226990
NZ_CP010302.1|WP_014517324.1|8035_8311_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010302.1|WP_002779713.1|1538_2393_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010302.1|WP_002826068.1|4931_5543_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010302.1|WP_002790340.1|9013_9217_+|addiction-module-toxin,-HicA-family	unknown	unknown	gnl|CDD|224638
NZ_CP010302.1|WP_043012956.1|15698_16256_+|Rha-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|378235
NZ_CP010302.1|WP_038834598.1|960_1554_-|peptidase-C39	unknown	unknown	gnl|CDD|225810
NZ_CP010302.1|WP_043012954.1|9220_11014_+|AAA-family-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|238545
NZ_CP010302.1|WP_043012955.1|12919_15688_+|VirB4-family-type-IV-secretion/conjugal-transfer-ATPase	unknown	unknown	gnl|CDD|273346
NZ_CP010302.1|WP_043012951.1|5546_6200_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010302.1|WP_043012950.1|3876_4428_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP010302.1|WP_002828964.1|12637_12901_+|TrbC/VirB2-family-protein	gnl|CDD|368210	pfam04956, TrbC, TrbC/VIRB2 family. Conjugal transfer protein, TrbC has been identified as a subunit of the pilus precursor in bacteria. The protein undergoes three processing steps before gaining its mature cyclic structure. This family also contains several VIRB2 type IV secretion proteins. The virB2 gene encodes a putative type IV secretion system and is known to be a pathogenicity factor in Bartonella species.	1.41658e-06
NZ_CP010302.1|WP_002801138.1|11745_12153_-|vapd	gnl|CDD|225846	COG3309, VapD, Uncharacterized virulence-associated protein D [Function unknown].	2.07007e-09
NZ_CP010302.1|WP_002801148.1|8802_9021_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin	gnl|CDD|224514	COG1598, COG1598, Predicted nuclease of the RNAse H fold, HicB family [General function prediction only].	2.74784e-11
NZ_CP010302.1|WP_043012949.1|2488_3877_-|relaxase/mobilization-nuclease-domain-containing-protein	gnl|CDD|367497	pfam03432, Relaxase, Relaxase/Mobilisation nuclease domain. Relaxases/mobilisation proteins are required for the horizontal transfer of genetic information contained on plasmids that occurs during bacterial conjugation. The relaxase, in conjunction with several auxiliary proteins, forms the relaxation complex or relaxosome. Relaxases nick duplex DNA in a specific manner by catalyzing trans-esterification.	0.000102527
NZ_CP010302.1|WP_079394723.1|16252_16804_+|Rha-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|378235	pfam09669, Phage_pRha, Phage regulatory protein Rha (Phage_pRha). Members of this protein family are found in temperate phage and bacterial prophage regions. Members include the product of the rha gene of the lambdoid phage phi-80, a late operon gene. The presence of this gene interferes with infection of bacterial strains that lack integration host factor (IHF), which regulates the rha gene. It is suggested that Rha is a phage regulatory protein.	4.6937e-29
NZ_CP010302.1|WP_043012952.1|6318_7545_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|226990	COG4643, COG4643, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	5.84709e-28
NZ_CP010302.1|WP_002803413.1|11134_11749_-|resolvase	gnl|CDD|184041	PRK13413, mpi, master DNA invertase Mpi family serine-type recombinase.	1.1543e-37
NZ_CP010302.1|WP_043012955.1|12919_15688_+|VirB4-family-type-IV-secretion/conjugal-transfer-ATPase	gnl|CDD|273346	TIGR00929, CAG_pathogenicity_island_protein_23, type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family. Type IV secretion systems are found in Gram-negative pathogens. They export proteins, DNA, or complexes in different systems and are related to plasmid conjugation systems. This model represents related ATPases that include VirB4 in Agrobacterium tumefaciens (DNA export) CagE in Helicobacter pylori (protein export) and plasmid TraB (conjugation).	0
NZ_CP010302.1|WP_002790340.1|9013_9217_+|addiction-module-toxin,-HicA-family	gnl|CDD|224638	COG1724, COG1724, Predicted RNA binding protein (dsRBD-like fold), HicA family [General function prediction only].	6.85308e-14
NZ_CP010302.1|WP_043012956.1|15698_16256_+|Rha-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|378235	pfam09669, Phage_pRha, Phage regulatory protein Rha (Phage_pRha). Members of this protein family are found in temperate phage and bacterial prophage regions. Members include the product of the rha gene of the lambdoid phage phi-80, a late operon gene. The presence of this gene interferes with infection of bacterial strains that lack integration host factor (IHF), which regulates the rha gene. It is suggested that Rha is a phage regulatory protein.	1.84696e-36
NZ_CP010302.1|WP_038834598.1|960_1554_-|peptidase-C39	gnl|CDD|225810	COG3271, COG3271, Predicted double-glycine peptidase [General function prediction only].	2.50461e-37
NZ_CP010302.1|WP_043012954.1|9220_11014_+|AAA-family-ATPase	gnl|CDD|238545	cd01125, repA, Hexameric Replicative Helicase RepA. RepA is encoded by a plasmid, which is found in most Gram negative bacteria. RepA is a 5'-3' DNA helicase which can utilize ATP, GTP and CTP to a lesser extent.	1.8911e-13

Protein sequences

>NZ_CP010302.1|WP_014517324.1|8035_8311_-|hypothetical-protein
MCKIIKYLDYARLNTLEKLYFDLTIMLIVTFLSFLFLVFEFFIYENIAVFFQDCFLMSVIFIIGMIGLFHICKGLRKYKEILKSNKREEFI
>NZ_CP010302.1|WP_043012953.1|7662_7941_+|EexN-family-lipoprotein
MKNTIKLALLGAVITGVFSACSSEPKTVQYYEDPKNATELEAKIKECDKNANSAKTDTECANAYKARYSKSLQNFHNEAISDEEAAKYLKKK
>NZ_CP010302.1|WP_043012952.1|6318_7545_+|hypothetical-protein
MPQKRIYLYVPFKDKEKAKSLGAMWDDKEKKWFAPKTLDKNIFSQWLYPHQNKEFSFDENEVLTAFKSALENQGLIIEGLPIMDGKIHRVKTTNDKGRELSGAYSGFLDDYPAGFMQNFKTGIKENWKMPIEKNQSNNIKNSQKLHEQIKKDQELREKEILTLQEKTALKLEDEYNNAKWANSNHAYLKKKGFDENFYLKQDKMGSLLIPLKDENGKLWSVQRIFPNGDKIIGVIKTQEEKDQGVEYLAKKQGCFHIIGAKSLEHCKEFIITEGFATAATIYKALNKPVIMGVDAGNLSKIVETLKNKFENTPITLIADNDKKRELKGLSNVGVETAKEIQQRFSDIKVIIPKISDQEAGQGVSDFNDIFLNKGLDEVKKQLNFIDFHNKLKAFKSMEKTQPEKEITR
>NZ_CP010302.1|WP_043012951.1|5546_6200_+|hypothetical-protein
MNNTINFNELFSQIRLSSYDNNIVKHYDNLKCVGKITPKLATLEIILRNKLDNKLSEKDNDWIKNSNDEKIKKSKEEIEHREKNRILSHHQYLSRISLGTIIHLIKENKLQNSIMDLKNINFRNYNQYNRNFFFENGIKLRFRNTHKVDIVLSLLQNLRNRSYHWENILKTTEKNGKHYPRLTTKIKNTHIGVDPQKIDFFLSDLIKTFNEKILEYC
>NZ_CP010302.1|WP_002826068.1|4931_5543_+|hypothetical-protein
MEKDYKIKVTDVSELNEQYKEAIQEGTYEGEDVNKFFNTIKTFDVAESLLKKDFSNQYIKFDIITDKEKIPLNIRLGDKNFQKGIEHLINIGSSKLIKENINPEIKKDLNNRLGIYKPKIYDEMLDGTFKAIKNLSEVANKDVGVMILEFANSYSETREKFEKKQINKSSFFKEKMNEFFKKKLNKILPDREISNEKTYSRSR
>NZ_CP010302.1|WP_002779778.1|4621_4903_+|hypothetical-protein
MLKESKLIEELKREYDEKLKKLRQKEKENKERIYKKLSSALFKDFEINEDFKNEFNLLVEKFDCKNTKNILDKINNLYDFNHRNDKIDTAKKQ
>NZ_CP010302.1|WP_043012950.1|3876_4428_-|hypothetical-protein
MNKNNNCVIKVSKDDKIILEYIKSETNASYSKIISILLKKFNSCDTDEKNKINDEISKNKFYTSDENKIIKLKLTENEVNILKEISKNTGFSSITKQAKFLLLNSIKNEKLFTNIEIDEFIKTRTEINAIGKNIYQLLKILRSGNSVKINENNLNKTMDSIRDKIDILSDQLGAIIEKNNERI
>NZ_CP010302.1|WP_043012949.1|2488_3877_-|relaxase/mobilization-nuclease-domain-containing-protein
MSRSIRIFDDEIIAKKVFTKIENASKLPLNYINKNRDKYTKDIKTGKLVSKNMFRKNTEVVVKITSGSKNSQALSKHLDYISRDGNVELITNDFDRYAGEDEILEVKRIFKNEGSPIPLYKEGAKEKRHTINMVFSMKEHSTTPKEKLQQAVITTLKRMYPNNFFILAFHGDTDNPHCHVCLKVADKNGKRINPKKADLANLRAEFAKALNELGIEAKATNKKQREVEINQEFSVKLNTNNEINQAPKIKMHYYQIMDFGEANYQFSTDKNAKKSYYVSYKTKKGITTIWGQDLERVVRENKVLRGEYARFKIVGQEEYEIKRKAKINNKWQEVVKTLKKPIWEVSVIGREKDLKQINKAKTTKKYKIIQDKGVNNERDYTKQYRQRVLQELGNKSTIRRETAQERNSMRILSKQPMVHNTKRTQMLLHINALNQLQQGERGRSDNILRWTSARNNEIKRDG
>NZ_CP010302.1|WP_002779713.1|1538_2393_-|hypothetical-protein
MKKIILILAVLSGCLFASDELNIDSLFKKQIGLRSITSLSLLSTGNPHSYYIYPNIGVNGDLNVWNDTKQLYLNQTFIYTLTPNFDLLISGGGNYARQEYNNIISGAFTSKNTLNFDSLWIGFIYTGESIADFVPQIKFQTAIIQREKTVLQTKNFYFQSQNLEASLRGYSDPVVYSIYTGFGYNAQRKFKIAKIDYGNSIYFGGNLSIILSPKITLDLGAEQRFQTEQKINGVKNSEIRSIPTISGGSTYSINQDTAVSVSASLGGSSAAPDAIFGINLWKKF
>NZ_CP010302.1|WP_038834598.1|960_1554_-|peptidase-C39
MEKILKIALMVALLPLFLKAEFVVKSYQEIKNEKVVRQNYEESCGAASLATLINTLDDNNLTELDLLKTMSGQKLYTDMVSFADLNDAVKKLGYESKSYKVDRKILENIISVPILVKIEDDPRFPHFVVIINHKGNYLQILDPSYGEYISSKREFYSVWDRYNKGGFALVVNPKKQLKDYKLNLPKPLNFEIEHFGF
>NZ_CP010302.1|WP_002801148.1|8802_9021_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin
MLLNIIIEKDQDGYFARILELEGCVSQGNTYEEALVNIKEAGELYLESLANEEKRIIENKTTSIIPMVLANA
>NZ_CP010302.1|WP_002790340.1|9013_9217_+|addiction-module-toxin,-HicA-family
MPELPRMTAKEAEKLLLQNDFSIDRQKGSHRIYKKGLYRMVIPHHSGEILHPKIIKQLFEIIEVAKD
>NZ_CP010302.1|WP_043012954.1|9220_11014_+|AAA-family-ATPase
MPKRNTIETITLGLFSDEDVSIICEDTIKLERGSVAVLSGNSEVGKSFLALKVCANAINDGLKPFFWSVEDKNKAILERIKNIESFYSFNTAELEFSNELPKINKEPINCLKEELNELADCDLIVLDTFSAFFSTLGFKDQNNQNDVQNFFNILTDIAKSNNQAILLLHHLDKKGESLMGSSVIINTPRLVYKLSFEKGEDKNSTTYRLLEVLKDNNNINAGEFQKTIKVLQNSSIDEPSIVNLRANSIDSNTLEIINKKDISAVSVNELAKGYVTMNENRGVFYLSSRKLTDTNFYKVFKENDNKIDFKMTGANGSSYAISLKNSLLTQTHRNILDALFLYIKKNVDTSVIKKYQENFWDMEVRLEPYKFLKQYLNKNSNNYSWLKQKFTEISRFAYDLAFTQNVEDKDKKTITQRDKGILMFDSVERITKENGTIVSVFVLTVRREYIKKLETESTLSYDDDLSKILINLNSLVAQDLIRFLTSFPDKKILSYSEFCEIKAYKFYKENSIISRQKKEIIKLKDKLIEFGINIYGKGVEFADYDDEFFHNKYKNENDLFFIYQSNNKVKRYIKRDDPMNQLNTKDNKFLLQKSLFG
>NZ_CP010302.1|WP_002803413.1|11134_11749_-|resolvase
MNIAYIRVSTNKQELDSQKLEIMEYCHKNNIILDEILEVKISSTKSQEKRKIKDLKQRLQSGDLLIATELSRLGRSMLEIINLVLEFNANNINFLFLRQRELSNFNNPSSKLILSIYAYLAENERDLISQRTKAGLENAKASGKKLGRPKGSLNSIYDKDIDKIQTLLDKDLSIRSIWKLFYKDSGKTYDGLLWFIKKRKLKQK
>NZ_CP010302.1|WP_002801138.1|11745_12153_-|vapd
MGINRKAINFDLSTKSLEKYFKDTREPYSLIKKFMLENGFEHRQYSGYTSKEPIDERRVARIVTKLAKKFTWFGECVKEFDITEIGEQYSLKDTIQNLCIKEINKQAGYNKDFHGKFKEFTQKTPKNQKLKDLER
>NZ_CP010302.1|WP_002809052.1|12143_12467_-|hypothetical-protein
MAYPLLGTRIVLDEEKILKEGKYNLEDMYKMIDEYAKESGMIKINKETYHCKGDKYDLGCMTLFIYKYLIDSEWFTKNAKEWIWISEKEGNSDLISASKAEGEGIWE
>NZ_CP010302.1|WP_002828964.1|12637_12901_+|TrbC/VirB2-family-protein
MKIKLLSLILLSPIFVFAAGGIDKVNTFMQNLSTALYALGAVLLTIAFMWGGSKIMFQGQTLREVAPIFIGGVIFGSASAIAGYIIT
>NZ_CP010302.1|WP_043012955.1|12919_15688_+|VirB4-family-type-IV-secretion/conjugal-transfer-ATPase
MEKNPLFKGLTRPPMIFGVPMTPFVIAMGCIILIAFYSQNIFLVGFSIPVFFIMKAMTKRDDFIFRLMFLKMRFFSNPASKNYHKVKTYSTNSYRQMPPNSNFPKISVFGLNAEPNFEKLIPFSSLINDSVVITKDYFLMTTWEIGGISFEAEEDDELDIKNDLLNMLFKSFANESVSFYFHNCRYSIEDKLTSKFNNAFLEEIDRKYYESFKQGTLRKNSLYLTLIFNPLKVKIEKTTFMKSSFENKRKTISVFLAKFSEFADRLEANIKDFNPKRLKTYSKDDKTYSEQLEFYNYLLGGKFNPIRVLPSPIDQYLNGNLQNIQFGHDTIQFNQNDSTKRFARCIEIKDYTNETFAGILNILMYLDVEYTITQSFSPIPRVDAKSAISKQKKQLIATEDDGFSQVEQIDEALDQLTNGEISFGKYHFSILVYGNTIKEAKDNANCVITEMNGLGFGVTLATIALPATFFSQLPSNFAIRPRINLISSINYSSLIALHNFSMGKRDKNCWGDAVSILKTPNKQPYYFNFHQSSGANKNDFGELFLANTLILGQSGGGKTVFMNFIVDQMMKYASKDTFPDDIPEENRKFTAIYLDKDKGALGNILCAGGRYISIENGKPTGFNPFMVESTQENIRQLQSLMKLLVTRNNEILTTREEEMLNNAVNSLMKGFEKEERKYPISLLLENLTENVDDDNSLKSRLALFKKGKQFGWVFDNEYDNLDFPDDINLFGIDGTEFLDDKDVSGILSYYILWRVMSLADGRRLCIDIDEAWKWLENEIVQEEVKNKFKTIRKQNGFLRLATQSVEDFLKLKNATTLIEQSATMVFLPNPKAKEEEYVNGIGLSYDEYMIIKSFKPSKRQFLIKRQDEKVICTLDLSSLGNENLKILSTGTAHIDTIEKIFSQENKSLDEKVLELKEFYKNS
>NZ_CP010302.1|WP_043012956.1|15698_16256_+|Rha-family-transcriptional-regulator
MSNKVIINKQQVQFGTKGNQIFCTSLDVAKVFDKEHKNILRDIENILNDLREIGDLQCKLNFELSFKVRKIQGFKGRERKYPYYNLTRDGFSLLAMGFTGKEALQWKILFINAFNEMEKLLQKEIKSPNKYLTDLMELIYPNLPQNDYKVSVIITDNPYSKEAKNVFSLNYLVDNRTPKDPKKLQ
>NZ_CP010302.1|WP_079394723.1|16252_16804_+|Rha-family-transcriptional-regulator
MSDKVIINKQEVQFGTQNNQIFCTSLDIAKVFGKQHKHILELIGEKFNNNEIKNFCEPNFRLSFKTRKIEGFRGKERKYPYYQLTKDGFSFIAMGLTGRKADKFKIEFINAFNEMEKLLQKEIKSPNKYLTDLMELIYPNLPQNDYKVSVVITDNPYSKEAKNVFSLNYLVDNRTPKDPKKLQ

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NZ_KJ646012	Campylobacter jejuni strain 11601MD plasmid p11601MD, complete sequence	39941-39983	0	1.0
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NZ_CP045793	Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid p1CFSAN032805, complete sequence	2486-2528	0	1.0
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NC_017282	Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet, complete sequence	33077-33119	0	1.0
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NZ_CP013035	Campylobacter coli strain HC2-48 plasmid pccdm1, complete sequence	5467-5509	0	1.0
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NZ_CP007752	Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence	6598-6640	0	1.0
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NZ_CP014745	Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence	72195-72237	0	1.0
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NZ_CP023546	Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid pCFSAN032805_1, complete sequence	3058-3100	0	1.0
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NZ_CP017026	Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence	77858-77900	0	1.0
NZ_CP010302_1	1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8516-8558	43	NZ_CP011017	Campylobacter coli strain FB1 plasmid pFB1TET, complete sequence	25203-25245	0	1.0
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NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP043764	Campylobacter jejuni strain BfR-CA-14430 plasmid pBfR-CA-14430, complete sequence	30221-30291	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP007750	Campylobacter jejuni subsp. jejuni M129 plasmid pTet-M129, complete sequence	4964-5034	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP017418	Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-1, complete sequence	13276-13346	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP017866	Campylobacter coli strain YF2105 plasmid pCCDM105L, complete sequence	41149-41219	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP017879	Campylobacter coli strain BG2108 plasmid pCCDM108L, complete sequence	4413-4483	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP017416	Campylobacter jejuni strain MTVDSCj07 plasmid pMTVDSCj07-1, complete sequence	13715-13785	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP017872	Campylobacter coli strain BP3183 plasmid pCCDM183, complete sequence	6394-6464	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP020775	Campylobacter jejuni strain YH002 plasmid pCJP002, complete sequence	21210-21280	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_MK541988	Campylobacter coli strain CVM N61740F plasmid pN61740F, complete sequence	9158-9228	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_MK541989	Campylobacter coli strain CVM N61925F plasmid pN61925F, complete sequence	32943-33013	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NC_022354	Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid unnamed, complete sequence	34573-34643	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NC_022355	Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1, complete sequence	18255-18325	11	0.845
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NC_006134	Campylobacter coli plasmid pCC31, complete sequence	21087-21157	12	0.831
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	CP002030	Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet, complete sequence	19124-19194	12	0.831
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP048762	Campylobacter jejuni strain ZS004 plasmid pCJFEX, complete sequence	17409-17479	12	0.831
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP028373	Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence	38592-38662	13	0.817
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NC_006135	Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet, complete sequence	21372-21442	13	0.817
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP014743	Campylobacter jejuni strain WP2202 plasmid pCJDM202, complete sequence	74736-74806	13	0.817
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP044166	Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416	3004-3074	13	0.817
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP022471	Campylobacter jejuni strain jejuni plasmid pRM1246_ERRC, complete sequence	17520-17590	13	0.817
NZ_CP010302_1	1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder	8685-8755	71	NZ_CP017419	Campylobacter jejuni strain MTVDSCj16 plasmid pMTVDSCj16-1, complete sequence	13302-13372	13	0.817

1. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ646012 (Campylobacter jejuni strain 11601MD plasmid p11601MD, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045793 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid p1CFSAN032805, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_017282 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013035 (Campylobacter coli strain HC2-48 plasmid pccdm1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007752 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014745 (Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023546 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid pCFSAN032805_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011017 (Campylobacter coli strain FB1 plasmid pFB1TET, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044168 (Campylobacter jejuni strain AR-0415 plasmid pAR-0415, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040609 (Campylobacter sp. CFSAN093226 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017861 (Campylobacter jejuni strain TS1218 plasmid pCJDM218, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043764 (Campylobacter jejuni strain BfR-CA-14430 plasmid pBfR-CA-14430, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007750 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni M129 plasmid pTet-M129, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048762 (Campylobacter jejuni strain ZS004 plasmid pCJFEX, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK541988 (Campylobacter coli strain CVM N61740F plasmid pN61740F, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK541989 (Campylobacter coli strain CVM N61925F plasmid pN61925F, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_022354 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX686749 (Campylobacter coli strain Tx40 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007182 (Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_006134 (Campylobacter coli plasmid pCC31, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007180 (Campylobacter coli RM5611 plasmid pRM5611_48kb, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010073 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 01-1512 plasmid pCj1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023544 (Campylobacter jejuni strain CFSAN032806 plasmid pCFSAN032806, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to CP002030 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017418 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017419 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj16 plasmid pMTVDSCj16-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017866 (Campylobacter coli strain YF2105 plasmid pCCDM105L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017879 (Campylobacter coli strain BG2108 plasmid pCCDM108L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017416 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj07 plasmid pMTVDSCj07-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017872 (Campylobacter coli strain BP3183 plasmid pCCDM183, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020775 (Campylobacter jejuni strain YH002 plasmid pCJP002, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_022355 (Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|8516|43|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017869 (Campylobacter coli strain MG1116 plasmid pCCDM116L, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.977

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35. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040609 (Campylobacter sp. CFSAN093226 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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36. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010073 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 01-1512 plasmid pCj1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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37. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to CP002030 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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38. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045793 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid p1CFSAN032805, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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39. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_017282 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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40. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023546 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid pCFSAN032805_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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41. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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42. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017861 (Campylobacter jejuni strain TS1218 plasmid pCJDM218, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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43. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043764 (Campylobacter jejuni strain BfR-CA-14430 plasmid pBfR-CA-14430, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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44. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048762 (Campylobacter jejuni strain ZS004 plasmid pCJFEX, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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45. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK541988 (Campylobacter coli strain CVM N61740F plasmid pN61740F, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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46. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK541989 (Campylobacter coli strain CVM N61925F plasmid pN61925F, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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47. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_022354 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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48. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX686749 (Campylobacter coli strain Tx40 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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49. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007182 (Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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50. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_006134 (Campylobacter coli plasmid pCC31, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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51. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007180 (Campylobacter coli RM5611 plasmid pRM5611_48kb, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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52. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023544 (Campylobacter jejuni strain CFSAN032806 plasmid pCFSAN032806, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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53. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017418 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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54. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017866 (Campylobacter coli strain YF2105 plasmid pCCDM105L, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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55. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017879 (Campylobacter coli strain BG2108 plasmid pCCDM108L, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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56. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017416 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj07 plasmid pMTVDSCj07-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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57. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017872 (Campylobacter coli strain BP3183 plasmid pCCDM183, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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58. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_022355 (Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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59. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ646012 (Campylobacter jejuni strain 11601MD plasmid p11601MD, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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60. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013035 (Campylobacter coli strain HC2-48 plasmid pccdm1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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61. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007752 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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62. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014745 (Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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63. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044168 (Campylobacter jejuni strain AR-0415 plasmid pAR-0415, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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64. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007750 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni M129 plasmid pTet-M129, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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65. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020775 (Campylobacter jejuni strain YH002 plasmid pCJP002, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.909

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66. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011017 (Campylobacter coli strain FB1 plasmid pFB1TET, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.894

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67. spacer 1.2|8589|66|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017419 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj16 plasmid pMTVDSCj16-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.894

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68. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX686749 (Campylobacter coli strain Tx40 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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69. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007182 (Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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70. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ646012 (Campylobacter jejuni strain 11601MD plasmid p11601MD, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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71. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045793 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid p1CFSAN032805, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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72. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_017282 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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73. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013035 (Campylobacter coli strain HC2-48 plasmid pccdm1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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74. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007752 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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75. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014745 (Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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76. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023546 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid pCFSAN032805_1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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77. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007180 (Campylobacter coli RM5611 plasmid pRM5611_48kb, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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78. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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79. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011017 (Campylobacter coli strain FB1 plasmid pFB1TET, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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80. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044168 (Campylobacter jejuni strain AR-0415 plasmid pAR-0415, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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81. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010073 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 01-1512 plasmid pCj1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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82. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023544 (Campylobacter jejuni strain CFSAN032806 plasmid pCFSAN032806, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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83. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040609 (Campylobacter sp. CFSAN093226 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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84. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017861 (Campylobacter jejuni strain TS1218 plasmid pCJDM218, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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85. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043764 (Campylobacter jejuni strain BfR-CA-14430 plasmid pBfR-CA-14430, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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86. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007750 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni M129 plasmid pTet-M129, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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87. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017418 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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88. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017866 (Campylobacter coli strain YF2105 plasmid pCCDM105L, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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89. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017879 (Campylobacter coli strain BG2108 plasmid pCCDM108L, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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90. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017416 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj07 plasmid pMTVDSCj07-1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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91. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017872 (Campylobacter coli strain BP3183 plasmid pCCDM183, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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92. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020775 (Campylobacter jejuni strain YH002 plasmid pCJP002, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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93. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK541988 (Campylobacter coli strain CVM N61740F plasmid pN61740F, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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************************************************************

94. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK541989 (Campylobacter coli strain CVM N61925F plasmid pN61925F, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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95. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_022354 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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96. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_022355 (Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.845

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97. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_006134 (Campylobacter coli plasmid pCC31, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.831

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98. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to CP002030 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.831

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99. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048762 (Campylobacter jejuni strain ZS004 plasmid pCJFEX, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.831

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100. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028373 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain huA17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 13, identity: 0.817

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101. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NC_006135 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 13, identity: 0.817

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***************.**************************.*****************

102. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014743 (Campylobacter jejuni strain WP2202 plasmid pCJDM202, complete sequence) position: , mismatch: 13, identity: 0.817

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***************.**************************.*****************

103. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044166 (Campylobacter coli strain AR-0416 plasmid pAR-0416) position: , mismatch: 13, identity: 0.817

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***************.**************************.*****************

104. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022471 (Campylobacter jejuni strain jejuni plasmid pRM1246_ERRC, complete sequence) position: , mismatch: 13, identity: 0.817

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***************.**************************.*****************

105. spacer 1.3|8685|71|NZ_CP010302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017419 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj16 plasmid pMTVDSCj16-1, complete sequence) position: , mismatch: 13, identity: 0.817

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*************** .*******************************************

2. NZ_CP010301

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP010301_1

• CRISPR_ID: NZ_CP010301_1
• CRISPR_location: 1447090-1447169
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP010301_1

Consensus_repeat	Method
TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP010301_1

>1.1|1447113|34|NZ_CP010301|CRISPRCasFinder
TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010301_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP010301_1

>merge|NZ_CP010301|1|1447090-1447169|CRISPRCasFinder
TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTCTTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAATCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC

>NZ_CP010301|1|1|1447090-1447169|CRISPRCasFinder
TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTC	TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA
TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP010301.1|WP_043012928.1|1440860_1442354_-|hydrogenase-small-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|224654
NZ_CP010301.1|WP_002857989.1|1436005_1437373_+|adenylosuccinate-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|176469
NZ_CP010301.1|WP_002857891.1|1453996_1456066_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226093
NZ_CP010301.1|WP_002855518.1|1449847_1450267_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010301.1|WP_002858404.1|1456564_1457326_-|NTP-transferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224134
NZ_CP010301.1|WP_002855324.1|1443853_1445056_-|phosphoglycerate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234613
NZ_CP010301.1|WP_002857981.1|1452815_1454000_-|capsule-polysaccharide-modification-protein-KpsS	unknown	unknown	gnl|CDD|226092
NZ_CP010301.1|WP_002780456.1|1442357_1443182_-|enoyl-ACP-reductase-FabI	unknown	unknown	gnl|CDD|181416
NZ_CP010301.1|WP_002855528.1|1443185_1443857_-|triose-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|234589
NZ_CP010301.1|WP_002855307.1|1450263_1451625_-|cytochrome-P450	unknown	unknown	gnl|CDD|225035
NZ_CP010301.1|WP_002780453.1|1445058_1446057_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|223135
NZ_CP010301.1|WP_002858304.1|1451621_1452743_-|membrane-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP010301.1|WP_002855470.1|1446116_1446662_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223985
NZ_CP010301.1|WP_002852383.1|1447471_1448842_-|phosphoglucosamine-mutase-PgmL	unknown	unknown	gnl|CDD|100091
NZ_CP010301.1|WP_002852401.1|1433015_1433378_+|RidA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|129116
NZ_CP010301.1|WP_002855429.1|1448963_1449500_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL	unknown	unknown	gnl|CDD|181433
NZ_CP010301.1|WP_002858462.1|1456062_1456575_-|adenylyl-sulfate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|235498
NZ_CP010301.1|WP_002779147.1|1438803_1439028_+|ferrous-iron-transport-protein-A	unknown	unknown	gnl|CDD|224830
NZ_CP010301.1|WP_002855339.1|1446689_1447016_+|ribosome-silencing-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|223870
NZ_CP010301.1|WP_002825806.1|1449499_1449847_+|holo-ACP-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|223807

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP010301.1|WP_043012928.1|1440860_1442354_-|hydrogenase-small-subunit	gnl|CDD|224654	COG1740, HyaA, Ni,Fe-hydrogenase I small subunit [Energy production and conversion].	1.23293e-155
NZ_CP010301.1|WP_002857989.1|1436005_1437373_+|adenylosuccinate-lyase	gnl|CDD|176469	cd01597, pCLME, prokaryotic 3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase (CMLE)_like. This subgroup contains pCLME and related proteins, and belongs to the Lyase class I family. Members of this family for the most part catalyze similar beta-elimination reactions in which a C-N or C-O bond is cleaved with the release of fumarate as one of the products. These proteins are active as tetramers. The four active sites of the homotetrameric enzyme are each formed by residues from three different subunits. CMLE catalyzes the cyclization of 3-carboxy-cis,cis-muconate (3CM) to 4-carboxy-muconolactone in the beta-ketoadipate pathway. This pathway is responsible for the catabolism of a variety of aromatic compounds into intermediates of the citric cycle in prokaryotic and eukaryotic micro-organisms.	0
NZ_CP010301.1|WP_002857891.1|1453996_1456066_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein	gnl|CDD|226093	COG3563, KpsC, Capsule polysaccharide export protein [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NZ_CP010301.1|WP_002858404.1|1456564_1457326_-|NTP-transferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|224134	COG1213, COG1213, Predicted sugar nucleotidyltransferases [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	3.82934e-76
NZ_CP010301.1|WP_002855324.1|1443853_1445056_-|phosphoglycerate-kinase	gnl|CDD|234613	PRK00073, pgk, phosphoglycerate kinase; Provisional.	0
NZ_CP010301.1|WP_002857981.1|1452815_1454000_-|capsule-polysaccharide-modification-protein-KpsS	gnl|CDD|226092	COG3562, KpsS, Capsule polysaccharide export protein [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NZ_CP010301.1|WP_002780456.1|1442357_1443182_-|enoyl-ACP-reductase-FabI	gnl|CDD|181416	PRK08415, PRK08415, enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabI.	0
NZ_CP010301.1|WP_002855528.1|1443185_1443857_-|triose-phosphate-isomerase	gnl|CDD|234589	PRK00042, tpiA, triosephosphate isomerase; Provisional.	2.79646e-86
NZ_CP010301.1|WP_002855307.1|1450263_1451625_-|cytochrome-P450	gnl|CDD|225035	COG2124, CypX, Cytochrome P450 [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	1.74847e-77
NZ_CP010301.1|WP_002780453.1|1445058_1446057_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase	gnl|CDD|223135	COG0057, GapA, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase/erythrose-4-phosphate dehydrogenase [Carbohydrate transport and metabolism].	2.96117e-168
NZ_CP010301.1|WP_002855470.1|1446116_1446662_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase	gnl|CDD|223985	COG1057, NadD, Nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase [Coenzyme metabolism].	3.16494e-57
NZ_CP010301.1|WP_002852383.1|1447471_1448842_-|phosphoglucosamine-mutase-PgmL	gnl|CDD|100091	cd03089, PMM_PGM, The phosphomannomutase/phosphoglucomutase (PMM/PGM) bifunctional enzyme catalyzes the reversible conversion of 1-phospho to 6-phospho-sugars (e.g. between mannose-1-phosphate and mannose-6-phosphate or glucose-1-phosphate and glucose-6-phosphate) via a bisphosphorylated sugar intermediate. The reaction involves two phosphoryl transfers, with an intervening 180 degree reorientation of the reaction intermediate during catalysis. Reorientation of the intermediate occurs without dissociation from the active site of the enzyme and is thus, a simple example of processivity, as defined by multiple rounds of catalysis without release of substrate. Glucose-6-phosphate and glucose-1-phosphate are known to be utilized for energy metabolism and cell surface construction, respectively. PMM/PGM belongs to the alpha-D-phosphohexomutase superfamily which includes several related enzymes that catalyze a reversible intramolecular phosphoryl transfer on their sugar substrates. Other members of this superfamily include phosphoglucosamine mutase (PNGM), phosphoacetylglucosamine mutase (PAGM), the bacterial phosphomannomutase ManB, the bacterial phosphoglucosamine mutase GlmM, and the phosphoglucomutases (PGM1 and PGM2). Each of these enzymes has four domains with a centrally located active site formed by four loops, one from each domain. All four domains are included in this alignment model.	0
NZ_CP010301.1|WP_002852401.1|1433015_1433378_+|RidA-family-protein	gnl|CDD|129116	TIGR00004, RutC_family_protein, reactive intermediate/imine deaminase. This protein was described initially as an inhibitor of protein synthesis intiation, then as an endoribonuclease active on single-stranded mRNA, endoribonuclease L-PSP. Members of this family, conserved in all domains of life and often with several members per bacterial genome, appear to catalyze a reaction that minimizes toxic by-products from reactions catalyzed by pyridoxal phosphate-dependent enzymes. [Cellular processes, Other].	1.81634e-55
NZ_CP010301.1|WP_002855429.1|1448963_1449500_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL	gnl|CDD|181433	PRK08455, fliL, flagellar basal body-associated protein FliL; Reviewed.	2.19231e-91
NZ_CP010301.1|WP_002858462.1|1456062_1456575_-|adenylyl-sulfate-kinase	gnl|CDD|235498	PRK05541, PRK05541, adenylylsulfate kinase; Provisional.	1.00012e-100
NZ_CP010301.1|WP_002779147.1|1438803_1439028_+|ferrous-iron-transport-protein-A	gnl|CDD|224830	COG1918, FeoA, Fe2+ transport system protein A [Inorganic ion transport and metabolism].	1.69416e-22
NZ_CP010301.1|WP_002855339.1|1446689_1447016_+|ribosome-silencing-factor	gnl|CDD|223870	COG0799, COG0799, Uncharacterized homolog of plant Iojap protein [Function unknown].	8.97235e-38
NZ_CP010301.1|WP_002825806.1|1449499_1449847_+|holo-ACP-synthase	gnl|CDD|223807	COG0736, AcpS, Phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase) [Lipid metabolism].	3.71491e-40

Protein sequences

>NZ_CP010301.1|WP_002855339.1|1446689_1447016_+|ribosome-silencing-factor
MQERIDLIVKILDEKKAEDIKTIDMSEQEYFVKYVIIAATLGERHALSLIDELKTQLKAKGEEFLNIDSSEEWSVIDLGDILIHLLTPEHRGIYNIEELLENLKKGRV
>NZ_CP010301.1|WP_002855470.1|1446116_1446662_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase
MKIALFGGSFDPPHNGHNSVILEALEKLDIDKLIIMPTYINPFKQNFSADEKQRFLWVKKLWGHFPKVEICDFETKQKRPVPSIESVKYLYKLYNPSKFYLLIGADHLEKLHLWHDFEKLNSLVEFVIANRNDIEIPKNFKDLKTDKKIASSFIRNTLNTNEVCEEIKDEVKKYYEKLQKN
>NZ_CP010301.1|WP_002780453.1|1445058_1446057_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase
MAVKVAINGFGRIGRCVARIILERNDIELVAINDTTDIELTKYLFKYDTVHGEFKGSVDSEGDDLVVNGKKIKVFKSRNVKDLDFAKHGAQIVLECTGAHLTMAKCQEFIDMGVQKVIMSAPAKDDTPTYVLGVNSELYKGESIISNASCTTNCLGPVCRVLQDNFGIEKGLMTTIHAYTNGQSIIDAKAKDKRRSRAAAQNIIPTSTGAAKAMKLVMPELNGKLHGQSMRVPVIDVSSVDLTAQLSRKVSKDEINEAFRKAAATNLKGILMVDDDERVSSDFITCSYGAIVASDLTQVIADDFIKVIAWYDNEWGYSSRLVDMAVYIANKA
>NZ_CP010301.1|WP_002855324.1|1443853_1445056_-|phosphoglycerate-kinase
MSDIISIKDIDLAKKKVFIRCDFNVPQDDFLNITDDRRIRSAIPTIRYCLDNGCSVILASHLGRPKEISSKYSLEPVAKRLARLLDKEIVMAKDVIGEDAKTKAMNLKAGEILLLENLRFEKGETKNDENLAKELASMVQVYINDAFGVCHRAHSSVEAITKFFDEKHKGAGFLLQKEIDFASNLIKHPARPFVAVVGGSKVSGKLQALTNLLPKVDKLIIGGGMAFTFLKALGYDIGNSLLEEELLEEANKILTKGKNLGVKIYLPVDVVAAPACSQDAPMKFVPAQEIPNGWMGLDIGPASVRLFKEVISDAQTIWWNGPMGVFEIDKFSKGSIKMSHYISEGHATSVVGGGDTADVVARAGDADEMTFISTGGGASLELIEGKELPGVKALRSKENE
>NZ_CP010301.1|WP_002855528.1|1443185_1443857_-|triose-phosphate-isomerase
MIFAANLKCNHTRASFKIYAKILNKTMGVKCDDIIVFPPSIAFLENENNFIQGAQNFYPCVNGAFTGELGKEHLDEFGIKCVLIGHSERRALGDEEFIKAKFDFAKEHGYKIVFCIGENLDTKNSGKTLEFLKKQLEIIDLNYEKLIIAYEPIYSIGTGVSAQSTDIAKVLEFLASLTKVPLLYGGSVNENNIKEILSVNHCGGVLIGSAALKVENFIKLIKG
>NZ_CP010301.1|WP_002780456.1|1442357_1443182_-|enoyl-ACP-reductase-FabI
MIMKGKKGLIVGVANNKSIAYGIAKACFDQGAELAFTFLNDALKKRVEPIAQEFNSNFVYELDVNNNEHLDSIAEKIKKDLGEIDFVVHAVAFAPKEALENSFLETSKEAFDIAMQTSVYSLLSLTRAVLPILKDKGSILTLSYLGGVKYVPHYNVMGVAKAALESSVRYLARDLGVKGIRVNAISAGPIKTLAASGIGDFRMILKYNEINSPLKRNVSIEDVGNSAMYLLSDLANGVTGEIHYVDAGYNIMGMGDVEKNEEGQTVLCWDNQKG
>NZ_CP010301.1|WP_043012928.1|1440860_1442354_-|hydrogenase-small-subunit
MAKLSNEELKNILEDRIKKLENSTLKEDKVINEESVKILARHLSLGNEIPALAQRFFQIAPKTKLVWLHLCECTGCSESLLRSELPSFDELIFDFFSLEYHETLMAANGTKAEELLEHVLEEDFILAVEGGVAAIDTFFLTIGAQGESGYEILEKLAAKAKAIFAVGTCSSYGGIQAAYPNPSKTCGISEVLSQKVVNIAGCPPSDINIIATLSFFALFGVLPELDEQNRPVWAYGKCLHDMCERKAKFESGIFAEHFDDEAAKNGACLFKIGCKGPYTYNNCPKVKFNAKTSWPVAAGHGCIACSEKNFWDEFGNYEKPMANIFSYAKLCNEELKQEFFLEEQIKILEQIDFEFESNIKLILQNIAKNKLGALLVENYKKSFEKNYTFIEQNFDENPMPSKDFWKYLEISFILVKGEFLKDKNDFLIAAKNYAFKHASPYDFKLNMNAEKPKLDVSKSFRMTLIYLCGGLDFEGIAYSILKTFGDNITKISSLKAS
>NZ_CP010301.1|WP_002779147.1|1438803_1439028_+|ferrous-iron-transport-protein-A
MTLNELKDGQKAIIVNLNAHKELKNRLLSFGFIKNKNLKKIHSSLKNATIMVELDTSCVILRSDEAKTIEVNLI
>NZ_CP010301.1|WP_002857989.1|1436005_1437373_+|adenylosuccinate-lyase
MTGISVFDHRLLADSWSTQEMRAIFCEQNRIQKWLDVEAALAKAQAKLKIIPKKAADEIAKKAHYKFMDMDFIFAEFKKTKHPLVPTVRGLEKACDNNLGEYVHFRVTTQDIIDTGLVLQFKEAMTLVKSELKAIAKALAKLAKTHKNTAMMGRTLALQALPITFGHKVAIWLSELDRHFERILELEKRLYVGSIVGAVGTKASLSDECNEVEKLTLENLGLEVPNISWQSTRDRFIELGFVLGNINATFNKIAHQLLILSHNEIDEVAEPFGKGQVGSSTMPHKRNPAVSENAVTVSNAFKANLAILSDIERHEHERDGQVWKMEWKLLPEMFLMLSVVLANMKFALSDLEVKKDKMLKNLDTLKGFVLAERVMFALSDHYGKQHAHEIVYENAMLGIEQQKTFKEVLLADTRVSQVLKEKDIDALLDATSYVGYAPKLVDEFLAKIKNSAILK
>NZ_CP010301.1|WP_002852401.1|1433015_1433378_+|RidA-family-protein
MSNYPKAIGPYSAYREVNGLLFISGQLPINPASGEIESSDIKEQTKQSLKNIGAILEENGISYDKVIKTTCFLADINDFVAFNEIYAEFFKAPYPARSAFAVKDLPKKAKVEIEIIAQKG
>NZ_CP010301.1|WP_002852383.1|1447471_1448842_-|phosphoglucosamine-mutase-PgmL
MLDVIFREYDIRGLYGKELNEKSVKAIGFCLGQTMLNKGCKNVSVGYDARYSANELFNYLVSGLNKAGIKIYDIGLVPTPLGYFSLYEGLKFDANVMITGSHNPKDYNGFKITINKESFFGVELKEFSKEVYKHLDDDIEENLEVEKYDILSLYVKFMCEQFSFLKDFNYKFGVDCTNGAAGVVIKPLIKALNLKAHVMFAKPDGQFPNHAPDPTEEENLSAIREFLNQNQDYSLAFAFDGDADRMVALSKTYVFCGDELCYLFAKNIPNPRILGEVKCSKNLFDEVAKFGTIFMGKTGHSNIKKMMKEKDIDLAAEVSGHIFFKHRYFGYDDGIYAFLRALELVYKGFDLESMIKALPKLYTTPEIKIPVNEEEKFKLVEEFQKEIEKGALKGVKSLCEIDGARIDFGDGWALLRASNTSPYLITRFEATSLERAKELESTVFSLFNEIKARLKN
>NZ_CP010301.1|WP_002855429.1|1448963_1449500_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL
MDEELENEETKKKKGGSLVIIIVILLFVLLLSIMGVIAWLISSSSSDESEVKEAPKEEAKADKPKVSAPTQRGSDFANIGPMYPLDPFTLNLLSDSGSRYVKCTIELEQNSELLKPELDKKVPVIRDIIIRTLTAKTFEEVSTQKGKERLKDELVGKINEILTDGFIKNVYFTDFVVS
>NZ_CP010301.1|WP_002825806.1|1449499_1449847_+|holo-ACP-synthase
MRVGCDIIAISRIEKIHSRHGKNFLDKFLSPKEQILIKNPATLAGLWAAKEAASKALGVGICELCSFFDIEISKDEKNAPKLKYSQKITKDFNITQTSLSISHDNGFAIAIVAIV
>NZ_CP010301.1|WP_002855518.1|1449847_1450267_-|hypothetical-protein
MKRVRTKIRANFRRRVKRTLKGSLKEKLAGTILLCAIVPLAVLGYLFIVIIGTFFNTARARQGVRALDHFVNASLFNGYAWESVSSHAWRERNRKKWARIVIKITDFFQKDHCKRANKREQPVVDFIISRNLDKQTIGK
>NZ_CP010301.1|WP_002855307.1|1450263_1451625_-|cytochrome-P450
MSECPFFPKPYKNKASTLLTFLLKRRSWLDGLYERSYKMQTGYVKMPNFDLYVINDTKEVKRMMVDEVREFPKSAFLHELLSPLLGESIFTTNGEVWKKQRELLRPSFEMTRINKVFNLMSEAVADMMDRFSKYPNHAIIEVDEAMTFITADVIFRTIMSSKLDEEKGKKILNAFVTFQEQSVHTAMRRMFRFPKWLSYVLGDRKRAKAGDVIRQVLSDIIKPRYDMADNAEFEDILGSLLLVVDADTNKRFSFEEILDQVAMLFLAGHETTASSLTWTLYLLSLYPKEQEKAYEEITQVLQGGAIEISHLRQFKYLTNIFKESLRLYPPVGFFAREAKKDTQVRDKLIKKDSGVVIAPWLIHRHEEFWTNPHGFNPSRFEGEYKKDAYLPFGVGERICIGQGFAMQEAILILANILKTYKLELEEGFVPDVVGRLTVRSANGMRIKFSKREL
>NZ_CP010301.1|WP_002858304.1|1451621_1452743_-|membrane-protein
MDREVFYIAGYDPKSYRFYYDLFKKNLKDYSHAFNIKADLSKIEKNEQFPFFQISCEGVQTKYHFLTWNDIVKKNWSENYKDALADCYSFFRIYTITGLFIKFGKESIYQLITGYYPFFYVLFSLLFSLVLAFGSFAFLQNYMHFSLAIIIGCFLGFLLNHFLFKLGKKLAVFWIARICAFCATWQDKKTGTMQERIKLFANTIVDKLKQNENKQDYELVLVAHSVGTIVCIEVLECILRQNLDLSLLHKLKILTLGECIPLVSYQKKADEFRKKLEFVSRFDLKWYDYTSIIDGACFPQVDFFRTSGVNAKFTPPFLSAKFHTLYEKHEYKKIKRDKNKAHFLYLYSISVKGDYDFFSFIIMPKFLEEKVKI
>NZ_CP010301.1|WP_002857981.1|1452815_1454000_-|capsule-polysaccharide-modification-protein-KpsS
MRFSTKIKKEFSGKNVLLLQGPVGNFFHHLAVKMRKNQTKVFKLNFNGGDFFFYPSGTRCKCDEKDLENFYRDFFQNKKIDAILMYNDCRIIHAKAIKVAKELGIEIWIFEEGYLRPYCITLEKDGVNANSSLPRDKNFYLSQNIFTKESIKEIPGGFKFMAFDAFLYWLFAFILAPFFNNKLHHRTLYPFEFLFWFRSLYRKYLYKITEKKLNEKIYNLEKKYFLAILQVYSDTQIKYHYKKSIEHFIEETILSFANHARAKSYLVFKHHPMDRGYKNYFKLINDLSRKYHVEGRVLYVHDTHLPVLLRKALGCITINSTVGLSAILEGCPTKVCGNAFYNFEGLSYPKKLQFFWREAHAYKPNPVLVCNFKKYLLQTNQFNGNFYKNFFLDK
>NZ_CP010301.1|WP_002857891.1|1453996_1456066_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein
MKYYSISKKLIANVRNFYTISLYKKNLKIKKDDLFFGWGRKKSGLKAMNLAKKYKAKFILLEDGFIRSLNLGVENSPSFSMVKDDIGIYYDATMPSKLENLLNTCEFKDEEIKQAKKAIELIKKYKISKYNNNLDIPDNYFQKDEKRVLIITQTANDASLEFGLAKDFKTLDMIKDAIKENPKSTIYIKIHPDVLSGKKQSDLDLNSLPKECILITENFNPIALLEFFDKVYTKTSGMGFEALMQECECICYGMPFYAGWGLTKDKLECKRRMQKRSLEEVFYAAYILYAEYFNPYLNQKSNIFDTIQTLAKYKDIEKVNSNKLFMLGFTLWKRHFIKPFFKAKDNEIIFLNSLKSLARYKLKENDKFFIWGKRIDYNALKTTLIKKAQDENLLHFTPKISLVEDGFIRSISLGSDLTRPFSLIVDDKGLYIDPNKASKLEELLQNEIFDENMLNRAKNIIKILLENRFSKYNGLKHEDLKINAKIGQKIILIPAQVEDDASMILGGFGLSTLDLLKEVRAKNQDAYIIFKPHPDVLSGNRVGLKDETLILEFCDEIVKDCSIDSAIKIADEIHTITSTSGFDALLRAKKVFTYGMPFYAGWGLTKDKYRCERRIRKLSLEELVAGALIIYPRYINPKTKTLCEIEVCLDIMLNLQKAYFSKKYIKLAIDFKTFMLRKIRRFYEFLAKK
>NZ_CP010301.1|WP_002858462.1|1456062_1456575_-|adenylyl-sulfate-kinase
MKNNPYIIWLTGLAGSGKTTIGQALYEKLKLKYKNLIYLDGDELREILGHYAYDRQGRIDMALKRAKFAKFLNDQGMMVIVTTISMFNEIYDYNRKQLKNYYEIYIECDMHELIQRDQKGLYTKALNKEIDNVVGVDIEFDKPEADLVINNSCRNNLEEKVELIIKKLAL
>NZ_CP010301.1|WP_002858404.1|1456564_1457326_-|NTP-transferase-domain-containing-protein
MNAIILAAGFGSRLMPLTKDQPKCMVEYKNKKIIDYEIEALKSAGINEIAVVGGYLNDVLKNYLNKYDIEHFFINSKYDKTNMVHTFFCAKDFMLKCIEEKQDLIISYADIVYFQDCVQKLINAKEELAIVVDKSWCKLWSKRFANPLEDAETLKMTNGYIIELGKKANAYDEIEAQYIGLFKFSYQFLSEVIAFYEMLDRDILYDNKNFENMYMTSFLQALIEKYNNAKAVEIDGNWCEIDFMSDLEVQIEK

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP010301_1	1.1|1447113|34|NZ_CP010301|CRISPRCasFinder	1447113-1447146	34	MH752385	Bacillus phage Ray17, complete genome	8509-8542	10	0.706

1. spacer 1.1|1447113|34|NZ_CP010301|CRISPRCasFinder matches to MH752385 (Bacillus phage Ray17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

ttttttagctttatactcagccttactcatataa	CRISPR spacer
cttacaagctttatactcagccttattgatcgtt	Protospacer
.** . *******************.* **    

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	604883 : 673470	85	Campylobacter_phage(43.59%)	terminase,tRNA,tail,protease,transposase,plate,integrase	attL 664313:664330|attR 681068:681085
DBSCAN-SWA_2	1143523 : 1201246	71	Campylobacter_phage(31.25%)	head,terminase,tRNA,tail,transposase,plate,integrase	attL 1179022:1179042|attR 1209048:1209068
DBSCAN-SWA_3	1284428 : 1327783	58	Campylobacter_phage(100.0%)	head,terminase,tRNA,tail,portal,capsid,integrase	attL 1286935:1286952|attR 1304937:1304954
DBSCAN-SWA_4	1465749 : 1472385	8	Tupanvirus(16.67%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP010301|604883:673470|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_002852365.1|606725_607586_+	NAD(+) kinase	NA	NA	NA	NA
WP_014516734.1|607585_609109_+	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_014516735.1|609214_610459_+	bile resistance response regulator CbrR	NA	NA	NA	NA
WP_002858473.1|610449_611265_+	TatD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_002852087.1|611264_612383_+	lytic transglycosylase domain-containing protein	A0A218M4G6	Pasteurella_phage	1.6e-09	34.1
WP_002852227.1|612342_613170_+	septal ring lytic transglycosylase RlpA family protein	F5B3X9	Synechococcus_phage	5.6e-23	50.0
WP_002858506.1|613175_613664_+	HAD-IIIA family hydrolase	A0A140XBD6	Dickeya_phage	5.1e-16	42.0
WP_002855039.1|613654_614170_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_002852252.1|614151_614613_+	organic solvent tolerance protein OstA	NA	NA	NA	NA
WP_002852258.1|614609_615206_+	YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_002852364.1|615202_615697_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_002852196.1|615697_617503_+	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
WP_010891873.1|617623_619414_-	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	1.4e-159	47.4
WP_019108583.1|619410_619869_-	di-/tripeptide transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	9.9e-30	50.4
WP_002859995.1|619811_620126_-	amino acid transporter	NA	NA	NA	NA
WP_019109092.1|620164_620365_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_079261378.1|620376_620625_-	peptide transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	1.0e-17	57.8
WP_019109091.1|620651_620846_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002873342.1|620971_621520_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010891874.1|621512_622619_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_002852114.1|622605_623481_-	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
WP_002852226.1|623477_624797_-|protease	ATP-dependent protease ATPase subunit HslU	A0A191ZC11	Erwinia_phage	6.2e-40	28.6
WP_002781630.1|624793_625336_-|protease	ATP-dependent protease subunit HslV	NA	NA	NA	NA
WP_002781628.1|625335_625779_-	50S ribosomal protein L9	NA	NA	NA	NA
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681068:681085	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP010301|1143523:1201246|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_002852712.1|1147673_1148441_-	flagellar type III secretion system protein FliR	NA	NA	NA	NA
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WP_043012893.1|1171714_1172755_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002790002.1|1172754_1173642_+|head	head protein	A0A2K9VH18	Faecalibacterium_phage	3.5e-63	43.7
WP_019108985.1|1173641_1173911_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_002878913.1|1174612_1175002_+	DUF882 domain-containing protein	A0A1X9Q0V8	Human_gokushovirus	6.5e-22	46.3
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WP_043012894.1|1176114_1177641_+|terminase	phage terminase large subunit	A0A0M3LQB7	Mannheimia_phage	4.9e-49	31.1
WP_002870186.1|1177637_1179020_+	DUF935 family protein	A0A0M3LRU4	Mannheimia_phage	8.2e-11	22.7
WP_002870187.1|1179012_1180146_+	hypothetical protein	A0A1C6ZDL9	Pseudomonas_phage	5.1e-27	34.2
1179022:1179042	attL	NA	NA	NA	NA
WP_002918728.1|1180284_1180764_-	hypothetical protein	A7YGZ0	Campylobacter_phage	2.8e-06	30.2
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WP_002791413.1|1181712_1182099_-	hypothetical protein	D5GVQ0	Campylobacter_virus	2.7e-36	56.4
WP_002791414.1|1182095_1182368_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_002806832.1|1182607_1183093_-	host-nuclease inhibitor protein Gam	A0A2K9VGT9	Faecalibacterium_phage	3.2e-18	34.0
WP_043020465.1|1183287_1183626_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002865075.1|1183699_1184131_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002824157.1|1184186_1184372_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002795448.1|1184368_1184560_-	DNA-directed RNA polymerase sigma-70 factor	NA	NA	NA	NA
WP_002790751.1|1184556_1185414_-	AAA family ATPase	A0A0M3LP72	Mannheimia_phage	9.6e-26	31.2
WP_043012897.1|1185501_1187619_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_002790505.1|1187619_1187820_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_020836814.1|1188099_1188789_+	helix-turn-helix domain-containing protein	S5FUZ3	Shigella_phage	7.7e-10	28.4
WP_002889833.1|1189166_1191026_-|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
WP_002777340.1|1191113_1191611_-	bipartate energy taxis response protein CetB	A0A1B0V854	Salmonella_phage	1.8e-21	41.6
WP_002790076.1|1191628_1193008_-	bipartate energy taxis response protein CetA	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	5.9e-17	55.6
WP_043012899.1|1193128_1193623_-	energy taxis response protein CetC	A0A1B0V854	Salmonella_phage	3.6e-17	39.3
WP_002868577.1|1193891_1195268_+	cation:dicarboxylase symporter family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_002889830.1|1195264_1196071_-	inverse autotransporter beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_043012900.1|1196212_1197739_+	inorganic phosphate transporter	M4QMY4	Ostreococcus_lucimarinus_virus	6.7e-38	27.3
WP_002927156.1|1197746_1198925_-	metal-dependent hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_002859277.1|1198934_1199831_-	NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_043012901.1|1199827_1201246_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
1209048:1209068	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP010301|1284428:1327783|DBSCAN-SWA
ATTATATTTTAAACTGAACTTTTAAAATTTCTTTTAATTCATTTATCGCTTTAATATTTTCTTGAATTTTAAATGGCTCTTTAAAAGCAAAATCAATCGTTTTATCAAGATGCAAATAACAATGTTCAGGCTTATTAAAAGCTCCAAAAGCAACCTTTAAAAGCAAATTCTCATCTTGTTTATAGATGCTTTCAAAATGCAAGAAAAAATCATCTTTTTTTATAGTAATATTTTTAAAGTTCTGCTCTATTTTTTTCAAATCCTCTTTAGAAAATTCAACCGATGAGAGATTAAATTCATTTAACTCATAGTTTTTACACTCTTGGTTAAAATTCCACACCCAAAGATCATATATATTTTTTTCTTGCTTTTTCCATCTATCTTCATATTTGCTTGAAATTTCTAAATTTTCATTTTTTCTAAGGCTAAATTTTGGAGCAGGAAAAGTCAAAAATTGCTCTAAAGTAAAATTAAAATACTCAAAACTATCTGTTCTAAGCTCAAAACGACCATTTTGAACTAAAACCCTAGCACATTCTTTGCAAAAATCTTTCCCAATAACTCGCCTATGAGGCTTTTTATCCCAAGGAACAGGGAAATGTAAAAAAATCTTTTCAACTGATTTTGATTTTAATACACTCAATAACAATCTCGCATCACTTTGGATTAGCAAAATATTATTTACATTTTGTGCTTTAGCAAGTTTAGCCACTTGAGTTAAAGCTGGGTTGTAAATTTCCACCCCTAAAATTAAAACATTTGGATTTTCTTTTGCTTGATAAAGCAAATGTCTTCCTGATCCAAAGCCTATTTCTATATAAATTTTACCTTGAAGTCTAGATAAAAGCTCATCAAAATTATCAACAATAAATGGTGTTTTTTCAATTAAAGCATTATTTTTAAGTCCAAAAGCTTCATTGATAATATCCTCACAAAAACCTTCTTTAAAGATTTTTAAAGCCTTTTGCAAATAACCTATTTTAGAAGGTTTTGTATGTTTATCGCCTTTAATCACAAAACCATTTTGTGCTTTTTTAATCTGCAGAAAAAAACTCTCTTCTTGAACCTTTGTATAAATAAGACTAACATTATCATTCTTAGCAAGCCAAAGAAATTCAACATCATCCTTACTATAAGGCAGATTTATTTCTTTGATCTTTTTACTTTTAAAATTTGGCACTACTGAGCCGCCTTAACTTTGCTTGAAGGTTCTGAACGAAGCCCGGCTGAATCAATAGCAATAACTTCATAACTATATTCCACCCCTGGCAAAGCTTTTACATCTTTTAATCGCTTTTCTTTAATGCCTTTAAAAACTGCATTTTGCTCCCCGCCATAGCGTCTTACTTCATACTCAACAGCTCTAGTATCATTATCACTCCATTCTAAATTTATCCCTTCGCTTGCACTTTGAGCCAAAATAATACTAGGAGCCAAAGGGTTGCCTAAAGTTTTACCTTCTACACCATCTTTTGGCATAGGACTTTCAAGACCATCTTTATCCACCATTGTTACTTTATAATACTTGCTTTTACCTGCTCCTTCTACTATATCCTCATAAGAATTTTTATCAGTCTTTGCCAAAACACTAAAAGGAAGGAAGCTTGAGCTCGTAGAATAAACTTTATAATAAGAAAAATCTTCATACGTAGGAGCATCCCAAGTTAAAATGATTTTACTAGAACCATCTGTGCTAGCACTTAAATGCTCAACTTGAGGAGGTAAAGCCTTGCTTGTAGAACTTACAACTTGACTTGACCCACTCTTTATCCCATTAAAACTCACAGCAATAATTCTATAACTTGAATTTTCATTAGGCTTTAAATCACTATCGATGTATTCAGCGTTTAAACGATTTTTTACTTCTGCAATTTTTTTAAATTCTTTATCATCACCTTTGGTTCTTTCAATAATATAAGAATCAACCCTAAAATCAGGATGCGGACGCCAAATAAGTTTAATACGATTAGGCAAATTAGTCACAGCTTGAACAAAAGGAACAGCTTCAAGTCTTGGAGCTGTGCTCACTTCTATAACCTTGCCATCTTCTGAAATTTGTCCTTGCTCATTAAAGCTTTTCATCATATAACGATACTTAGTACCAGGCTCTAATTTAGTATCTACATAATGAGTTTGAAACTTATCTTTAATAGTGCCTACAAGTTTAAAATCAGGATTTTCATCACTAGAACGATACAAATAAAATCCTTTAATATTTTCATTATATAAAGGCTCCCATTCAAAAGCAATATTACTCATATCACTAAGACTTTTTAAACTTTCAACCTTTGGCAAGCTTTCATTTACAGCAGGCTCTTTACTTGAAGCTAGCGAATTCATTTGCGAAACACTACAAGCGCTAAGCAAAAGAGTTAAAAAACTCAAGTAAAAACTCAAGCGAAATCTTTTCATCATTCTCTCCTAAATTAATTTGTTCAAACATAATATTTTTAAAATCTTCCATCAAAGGTGCTTTAACAAAAATTTGTTCTTTGGTTTTTGGATGGATAAAATACAAAAAATAAGCATGTAACATTATCCTACAATCATACTTACCCTTATAACCATACAAACTATCACCTAAAATATAGCGATTTAAACTAGCCAAATGCGCTCTAATTTGATGAGTTCTTCCTGTAAAAAGCTTAGCAGCCATCAAAGTTAAATTTTCAGTTTTTACTACATTTATAAAAGCTGATTTTGCGTTTTTACTGAATTTATTTTCCTTATCTATGGCTATTTTTTTAATAGCATTAGAAGGCGAACGCATTAAAAATTTTTCTACTATAATTTTATCTTCTTTTAGTGGCAAATCAATTAACGCAAGGTAAATTCTTCCCATGCTTTTATCTGCAAGCTGTTCACTTAATTTTTGATGGGTGAAATTATTTTTCGCTATTAGTATAGCTCCGCTTGTATCTTTATCTAATCTATGGACAAGACCAGCTCTTATCTCTCCTCCTAAATTTGATAAAGTATATTTTTTTTCTATTAACCAATCCACCAAAGTGGCATTTTTAACGCTACTTGCTCCATGAACGACTAAATTTGAAGGTTTATTTAAAACAAGCAAGTCTTCATCTTCGTATAACACATCAATATCAAAATCCACTTCAAACTGAGGTTTTATCTCATTGCAAAGCTTTAAACTTGCAATAGAAATAATATCACCATTTTTAAGCTTAAATGAATTTTTATCTTGAATTTTATCATTAACCTGTACACAATCTTTTTCTATAAGTAAAGCAACTTGATTGCGACTTTGGTTTAATTTTTTAGCCAAAAATACATCAAGCCTTGAATTTTCATCTACTAAAAAAGTTTGCATTTTTTCCTTAGAGGTTTTGATAAATTTAAAATTTTAGTTTATAATTATAGCTTTATATTACCAACTGAAGGCAAATTTTGTTTAGATTAGATAGAAGAATTTTAACTCATTTTGACTATATACAACCCATTTTATTTTTACCCATAATTCTTATTTCATTTTTCTTAATCTTTGAAGCTAATCCTTTTTTAGCAGAAAAACAGTTTGTTTATGCCTGTGTGGGATTGTTTGCTTTTATGGTTTTTTTCTTCTTTCCCATAAGGAAATTTATTTGGATTATTCCTGTTGCTTATTGGATTAATATTTTTTTATTGCTAAGCGTAGATATTTTTGGGGTTGAAAAATTAGGTGCTAAAAGATGGCTTGAAATTCCTTTTACTCACTTTACTATACAACCTTCTGAAATTTTTAAACCTAGTTTTATTTTAATGCTTGCCTATCTTATTTATCAAAATCCTCCTCCAAAAAATGGATACAAACTTAAACAATTCATCAAACTTAGCTTTTACATCATCTTGCCTTTTTTGCTAATTGCAAAAGAACCTGATTTAGGAAGTGCTATGGTTTTACTACTTGTTGGTTTTGGAGTGCTTTTTATCATGGGAGTTCATTATAAAATTTGGTTAAGTATTGTTATAGCTATAAGTGTTAGCTCTCCTATTATTTATACACATCTTTTAAAACCCTACCAAAAGCAAAGAATTCATGATTTTATTTCAGAAAAACCAAGTTATCAAGTAGCCCAATCAATGATAGCTATTGGAAATGGTGGTTTAACCGGAAAATCTCAAGATGAAGCTACGCAAACTCATTTTAAATTTTTACCTATTTCAACTAGTGATTTTATTTTCGCTTACATGATAGAAAGATTTGGATTTATTGGGGGATTGACATTAATTATATTTTATATTTTACTTATTTTTCATCTACTTAGTTTAAATTATAAACTTAAAGATGATTATTTTGCTAGAGTTGCTATTAATTGTGTTGCATTATTTATTTTTATTTATGCGGCAGTAAATATTTCAATGACTATAGGTTTTGCACCAGTAGTTGGGATCCCTTTGCCTTTTTTTAGTTATGGTGGAAGTTCTTTTACTATTTTTATGATTTTTTTTGGAATTTTACAGCATTTAATCACTTTTAGATATTTTTGGACGGATATAAAGGCTAAATAAAATATTTTTAAGCATTAATAAGATATAATTTTATCTTTTAATTCAACTTAGGCGGATTTATAGCTCAGTTGGTTAGAGCAACCGGCTCATAACCGGTTGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTAAATCCACCATTACTCTTTTTTATCAAATCCCTATTTTGCTTTAATATATTAATCAAATGCCTATAATAAAATGTTTTAAAGCTTGTTCTATATCGTTCTTTTATATTCCAAAATGTGCTATAATGTTCTTAAAAAAGTGGGTCACTTTTCCAAAAATGGGTTACAAAATGGGCTACTTTTTACACCAAAATAGACACTAAAAAAGAGAGAAAAATTAATGGCAAAAATTAACAAACTTACCGATAGTTTTTTAAAAAGCATTAAATGCGAAAGTGATAAAAAATTTATAAAATTTGCTGATCCGAGTTTAAAAGGCTTATATGTTTTTATTTATCCTAGTGGTAAAAAATTATTTAAAATAAGACAAGCAAAT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MQEAKSILDVLSFRKTEEKEELRKCFNFSDEVFEKGLNFLHTNDEISIEAVSDGLFEKTIISIKVSK
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MENYDIDIYGNPIKVKKPSREFKGQSLIYFPKSYVVIDLETTGFDPKCNEILEIVALRYENNEKIAEFSKLIKVSFLPSFITEFTGINEDMIKNCNDISQTLKEFDDFLKSGDILVAHNAHFDINFLYDNFMCYLNKPFSFDFVDTMRLSKLINQELAHHRLKDLCNQYNICYENAHRGEKDCELTHLCLMELKKTAFDNSLIENDVLVNNGLKTQIRQTQTKAKDIQAKIQEFDISHPLYNQNCVITGILGRFTRSQAMQIIADLGGINQDSVTKKTNILILGDNDYRAMIKGGISNKLKRARELILKGQDLKIISENVFYDMIF
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MFRLDRRILTHFDYIQPILFLPIILISFFLIFEANPFLAEKQFVYACVGLFAFMVFFFFPIRKFIWIIPVAYWINIFLLLSVDIFGVEKLGAKRWLEIPFTHFTIQPSEIFKPSFILMLAYLIYQNPPPKNGYKLKQFIKLSFYIILPFLLIAKEPDLGSAMVLLLVGFGVLFIMGVHYKIWLSIVIAISVSSPIIYTHLLKPYQKQRIHDFISEKPSYQVAQSMIAIGNGGLTGKSQDEATQTHFKFLPISTSDFIFAYMIERFGFIGGLTLIIFYILLIFHLLSLNYKLKDDYFARVAINCVALFIFIYAAVNISMTIGFAPVVGIPLPFFSYGGSSFTIFMIFFGILQHLITFRYFWTDIKAK
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MAKFGKIEKLLSTKEVAEYLGFTPLKIRKMRMRVNQNKFNFPKGIKIGSTFKYEKAEIDKWLQTCKVI
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MSNAPVIINNVEVNLNIKENKVFINSLDLAKVFNKNHRHILQTTKNQPQNDFTESNFILSTYKDKKGELRPCYNLTRDAFSLLVMGFTGQKAYKWKIEFIKAFNEMEKRLRNIEYEKHDKLAFHQSLGYKSQLEQQKTNFNNEIKALKYDLIQTKEELDACKGALEVLKRRKDFGNEENLRLLQEELAKYGLVIFNELDFALWSENLTKNIIGETKRKLDDLTRHNYELLKEKFDKRISYFKDKK
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MSNKPYLENEIKALKYQLLIEKQKHKKTKEKVFKLKNIQGEKYEKLKAEFAKNQLFVFRDDELFLWVESLMRELKTKILCTNDELSKKACDILVFKLEKRRKNFNY
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MTIYKLCKCGKKIQTHLRTCEECDKTFKKIANKRYDCFKRDKQSSDFYNSVAWRKLRNAFINKNPFCIRCGKFAKIVDHIIPIKQGGKKLSEENLQSLCLACHNEKTKNELKG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_002858203.1|1284428_1285607_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_072224431.1|1285606_1286842_-	fibronectin type III domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_002858282.1|1286786_1287755_-	RluA family pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
1286935:1286952	attL	NA	NA	NA	NA
WP_002864601.1|1287832_1288933_+	rod shape-determining protein RodA	NA	NA	NA	NA
WP_002787311.1|1289271_1290447_+|integrase	site-specific integrase	X2KXI6	Campylobacter_phage	1.7e-222	100.0
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WP_043012741.1|1291001_1291739_-	phage protein	X2KM03	Campylobacter_phage	1.4e-134	100.0
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WP_002788578.1|1299714_1300098_+	Cro/Cl family transcriptional regulator	X2KPM6	Campylobacter_phage	1.0e-43	100.0
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WP_002858176.1|1302032_1303811_+	NTPase KAP	X2KLG0	Campylobacter_phage	0.0e+00	100.0
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WP_002857883.1|1303980_1304400_-	hypothetical protein	X2KX19	Campylobacter_phage	6.3e-55	100.0
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1304937:1304954	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_002788272.1|1322819_1323992_-|portal	phage portal protein	X2KR48	Campylobacter_phage	3.1e-216	100.0
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WP_002788257.1|1327492_1327783_-	hypothetical protein	X2KM44	Campylobacter_phage	2.6e-15	97.4

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP010301|1465749:1472385|DBSCAN-SWA
TTCAATTATTGATTAGAAAATGATAATAATCCTCAGGCACACCAATATCTATAAAATAATCATCAAAAATACAAGCCCTAGCCTTTAGTTTTTTATAATTTTCTTGTAAAAACTCTTCAAAAGAAAATTTTTCCTGCAAAGCAAAATCATTAAAAATATCTTTAGTTAAAAGATAAATTCCACCATTGATTAAACCTTGCTTTTTAAATACCTTTTCCTCAAAAGAAATTACAAGATCTTGTTCATCAACATTTACTGTGCCGTATCTATCAAAATCATTCATTTGTTTTAAAGCAAGACAAATTTTACTTTCATTTAGCTTTAATTTACTTAAATCTATGTCAAAAAAAGTATCACCATTTAAAACATAAGCTTCATTTTTTACAAATTTCAAAGTCTCTTTTATGGCTCCGCCTGTTCCTAGAGGCTCTTTTTCGATGCTGTATTTTATTTTTATACCTAAAAACTCATCTTTAAAATACTCTTTTATCACTTCATATTTGTATGATACTGCTAAAATTACTTCTTTTATACCTTGCTTTTTAAGATACTCAAAAATAAATTCTAAAAAAGGCTTATCATTTATCGGTGCCATAGGCTTTGGAATGTCTTTTATAATACTTTTAAGTCTTGTTCCTAAGCCGCCACAAAGTATTATTGCTTGCAAGAAAAACCTTTACCAAAAAGCTCTTCTTCGACAATAGCACAAATAATATGTCCTATTAAAATATGCGCTTCTTGAATTCTTGGCGTGCAAGTTGAAGGCACTTTTATACAATAATCACAAAGTTCATTCATAGCCCCGCCACTAGCTCCACTTAAGCCTATACTTATGATTTCTTTTTGTTTGCAAAACTCTAAAGCTTTTAAGATATTTTTACTATTTCCACTTGTTGAAATGCCTATAAAAACATCTCCCTTAACACCTTGAGCTTGCACTTGTCTAGCAAACAAATTTTCATAACCATAGTCATTACCAATAGCTGTTAATATGCTAGTATCTGTAGTAAGTGCAATACTTGCGATACCGGGTCTATCAAAATAAAACCTACTTACAAATTCCCCTGCAATATGCTGTGCATCTGCAGCACTGCCACCATTTCCTGCTAATAAAGTTTTGTTACCATTTTTATAAGCTTTTATGACTTCTAATGAAGCATTTTTAATAAGAGTTATCAAATTCTCATCTTTTAAAATTTGTTCTTTTACTAAAATAGAATCTGCAAAATGTCCTTTTATATAGGAATTTAAATTCTCCATGATTTAACCCCCTCTTTTGTAAATGAAAAATCTTGCACATAACCTTGCTCTTTTCTTAAAGCTTTGATTAAGTTGTATTTTTTAGTAGGATCTACGAAGAAAAACATAAATCCACCAGCTCCTGCTCCGCTGGTTTTGCCACTATAGGCTCCGTTATCTATAGCAAGTTTATAAATTCTTTCAAGCTCATCATTACTAACGATTTCTGAAATGATTTTTTTTGACCGCCAAGATTTTCCTAAAATTTGCGCCAAAGTACCAAAATCGGCTCTAAATAAAGCTTCTTTCATCTTTATAGCATCTTGTTTTATCGCGTGCATGGCTTCTAAAGATTTTTCATCTCCAAGCTTTCCTTTTTTATGCTCTTCTATATCTTTTGCTTCTCTTGTGATATTTGTAAAATAAAGCACAGTTCTAGCTTCAAGCTCACTAGCTATCCAGTTTTTAATACGCAAAGGATTAACAATGACTCTTTTATTGTTATAAAATTCCATAAAATTAAAACCACCAAAAGTTGCGGCGTATTGATCTTGTGCTCCACCTACTATGCCTAAATCTTCTCTTTCTATCTCGTAAGCAAGTTTAGCGATTTCATATTCTCCTAAAGGTAGATTAAGCCATTCTGCAAAGGCTTTTATAACCCCTACAACCAAAGTTGAGCTTCCGCCCAAGCCACTACCACTTGGTACATCCGAATAGGTATGCAAAGAAAAACTCAAAGGTTTTTTTGTAAAATCTTTTACAATGCGATTATAAATACTTTTAAAAATATCTAATTTTCCATCATTTCCTAAGAATTCTTTACTTTCGTACTCACAGTAAGAATTTGTATCAGGAGAATCAAAAATGATTTTTCCATCTTCTCTTTTGATCAAAGTACAATGTATGTATAAAGATATAGTCGCATTTAAAACATAACCTGTATATTTATCACAATATAAATTTATATCAGTCCCACCACCTGCTAGACCGAGACGAAGAGGAGTTTGTGTGCGTATGGTTTTCATAAATCTCCTAATTTATTTATCATATCCAATCAAGTAAAATATTTTGAATATTACATTTATTAATCAATTGCTTTAACTCCCCTATCTTTTTCTCTGAATCATCAAACATATATTCATGTGTTTCACAAGCAATATAATCAATTTTTTTATATATTTTTTTTTCAATAATTTTTTTCATTATCTCAAACTCCATTCCTTCAATATCAAGTTTTAGAAAATAAATCCTTTTATGTTGTGTTAAAATTTCATTTTCGATAAACTCGCATAAATCAATTACTTGAACTTTATATGTTTTTTCCGTCTGACTGTCTTGTACACTTTCAACTATACGATTGCCTTGAGATAGTATCCTATTTCCAAACATAATAAAATCTGTTTCATAATTTCTGTCCGATACTGCTTTTTGAAAAAGTTTTACATTTATATTATTTTCATATTTTTTTCTTAAAAAATAATTTAAATAAATATTTGGCTCAAAGATATAACTTTGCCCGCCACAATGTAAAATAATATCAGTAATTAAGCCTGCATGTCCACCACAATCAATACATACTGGACGATATCCATCCCCCCCCCCATATTTATCGACATAAAGCATCTTGTAAAAAATATCATAATATTGTTTTGGAATTCTGGCATTATCTAATAACAAATTTAATCTACCAAGCCCTTGTGGATCGGCTATAGCACCCTGAATTAAATGCAATGCATTATAAACATTTTCTTGCTTATTCCAATGGTTTAATACTTGCAACTCTGAAATTATCCTTTCTACATCAGCTATTGGTTTCCTAGCTTGCTGATGATTATCAATTTGATAAATCAAGCCATTTAGAGCCTCTTTTAATACTTCCAATTGTTCTTTTTTCATTATTTATCTCCTTTAATTTTAATTAAAATTTGCAAAGCGATTAACTTTCATCATTTTAAACGCTCTTAAAAGCTCTTTAATACCATCTTCTAAAGTATTATCTGGTTTCCAACCTGTAGCCTCTAATTTAGTATTTGAAACCAAATAATCTCTTTTATCTGGATCTTCACCTATGTTGGCTGAATGGATATAAAAATCAGGAATATACTTTTTAATTGTTTCAGCAAGCTGTCTTTTGGTCAAATTTGCAGAACTTAATCCCATGTTATAAGCCTGACCCTTCATCTTATCATAATTCTCAATTCCATGAATAAATCCTTTAACCACATCGCGAACATGAATATAATTGCGTCTAAAATGCTCTTCAAAAAGCACTATAAATTTATCTCTATATGCACGATAAGTAAAATCATTAACAAGTAAATCAAGTCTCATTCTAGGTGAAATTCCAAAAACAGTAGCTAAACGAAAAGTCACACAATTTCCTTTATCGAGCAAATATTGCTCCGCATGCACTTTATCGATCCCATATTCTGAGATAGGACGCAAGGGAGATTCTTCAGTACACATTGCATCTTTTTCTCCTATACCATAACCGCTGTTTGTATTGGGATAAATAAATATTTGAGAAGGACTTGCAAAATCACTTATCATTTTTACGGCTTCATAATTGATCATTTTAGCTAATTTTGGATTTCTTTTACAAAGTGGAGCTCCAACTAAAGCAGCTAGAGGAATAATAATATCAGCTTTTGCTACCTCTTGCCTAATAAGATTTTCATCCATAGCATCACCATTTATAAAAGTAAAATTTTTATTATGAAAACAAGATAAAAGAGAAATTTGATCAAACATCAAATTATCAATCACACAAACTTCATAACCTTTTTCAAGTAAAATCGGCGTTAAAACCGAACCTATATAACCTGCACCACCTGTAATTAAAACTTTTTTTGACATACTTTTCCTTTCGTCTTTGAAAATCAATTTTGTGTTTTATACCATTCATACATCATTTTAATACCATCTTTAAGTTCAATTTTATGCTTCCAACCTAAAGAATGAATTTTTGAGCAATCCATAAGTCTATCCATTGTGCTATCCGGTCTAGAAGTATTGAAAACTAGTTCTCCGCTAAACCCAACTATATTTTTTACCATCAAAGCAACTTCTTTGATTGAATAGTCAATACCTGTCCCTATATTAATATGGGTATTTTTACTTTTTCTATCTTTAATAAGATCTTTAAAATCAATATTTTGCATCGTATAGATAGCTACATCGGCTAGATCGTCACTATGAATAAATTCTCTCCTAACTTTTCCAGTGCCCCAAATTTCTACACTTTTTTTACTAATTCCAAAATTATGCAAATATTCTTTTGCTTCTTCAAAATTATTCATTTTCAAATCTTGAAGGATTTGAGTTATATTACCCTCGCTTAACAATTTTGCTAAATGAAATTTTCTAAGCAATGCGGGTAAGACTCTTGATTTTCCAAAATCAAAATTTGCTTTAGTTCCGTAAAGATTATTTAAAACAAGAGTAATGAAATTAGTACCATATTGAATATTATAACTTTCACACATTATAGCTCCAGCTATTTTGGCTGCACCAAAAGAATAAGCGCCATATTCTAAATCACCTTGAAATAAATATTCCTCTTTCAATGGGTTTTTAGCATTCTCAGGATACATATACCCAGAACCAAAAAATACCAATTTTTTAACATTATTAAGAAATGAATTGTGAATAACATTGTTTTGAATCATCAAATTTTCATAAATAAAATCAGCCCTTTGAGCGACATTTGCAGCACCACAAGGTAAGACTGCAGTCAAAAAAACATATTCTGGCTTTTCTTCTTTAAAAAATTTAGCAACCGCTTGCTGATTAACCAAATCAAGCTCTTGCCTTGTTTTTAAAACAAGATTATTAAATCCTCTTTTTTGTAAGTTTTCTACCAATGCTGTACCTGCGGTTCCTTTGTGCCCCGCTATATATATTTTTGAATTTGTTTGCATCAATAACCTCTAAATCGTATTGGAATTTCTGGATTTGAAATCCAAGGAAAATCTAAATTTTTAAATCCCCCTGCGACATCTCTATATTTCATAATATCAAGATTAATCAAATTTTTTCTTAAATAACTAACCTCCAAAGTGGTACTAAAAAATAATCCTTGAGAATAAAAAATTTTCCCATGGTTGTGAAAATGTGTATGCATTGGAACAAAATATTCATTAAGTTTTTTTAGCAAACTTATTCTTTTTTCCACCCCATCTTGCTCCTCAGGATTGCACCCATGAAATTCAAATATAACTTGTGAGAAATATTTATTTAAAATACTTATATCAATATTTTCAAGCATATCCCATTCGCAATTTTCAATATCACATTGCAAAATATTTGGCTTGCTCTCATCTAAATTATTATCTTTTAAAGCTTGTACCAAAGTAATTGTATTCTCATTATTTACATTACCTATAAATTTTTTATGAAAAACAATATTTTCATGGTCATAAGGACATTTTTCTATACTAGCATCATATTCTATCACCTTAAATCCCCTCTGAGCCATTTCTAAATCCCAAGGAGAACTATCCGAAACACCCAAAGAAAGAGCTTTTGCATTAATATCACTCATATCCCCCCCCCCATTATACATCACATAACCACCATCTCCATTACCACCTATTCTTAACAAATCACACAAAGGCAATTCCAAAGGTCGAATGAGATTTAAATAATTTATAATATTTTGATAACATTGTTCATTATTATTTATACGAATATAATTTCTATCTCTTGCTTGTAATAATAAAAGTAAAATTTCTTTATCTTTTTTATCAATATCTAAATTCGAAATAATATTTGACATTAAGATTTGATAGGACAATTGATTGCTAAGTTTAATATTATTATTTAATTCTTTTAATAATTTTTCCATAATTTATCCTTTATTTTTAGTTGCAAGAATATCGCGATCGGAAAGAATAGGCGTATTTGTTGGCCAATCTATACCAATTCTTTCATCATTCCATGCATAAGTAAATTGATCAGGTGCATCCATATATTCCCCCTCATAAGCAAGTTTATAATAATACACTGCTTCCTTTGAACTCACATAATGAGAATTTCCCATATTTGGTGGTAATAAAATAAGTTGCTGATTTTTATAACTTATAATAAATTTCTCCCATTTTAAATAAGTTGGGGAATCTTTTCTGCAATCAACCACAACTTGATGCACTTCTCCATAGACACAAGTTACAAGTTTGTAAGTTTTCACATCTCCGTGTATTCCACGTAAAACATTAAAATGGGAATTTATAAATTTGTCATGCTTAAATTTAATTCCATCTGGAACCAACTTGCTTAAATATTCATCTGTAAAAGCTGTCCAAATTTCACCTCTTAAATCTCTAAATTTATTAGGAGTTATAATATACACTCCTTTTAAAATTTTTGATTCTTGTATATCAAATTCTATTGCCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP010301|1465749:1472385|1469869_1470910_-|WP_002864205.1|DBSCAN-SWA
MQTNSKIYIAGHKGTAGTALVENLQKRGFNNLVLKTRQELDLVNQQAVAKFFKEEKPEYVFLTAVLPCGAANVAQRADFIYENLMIQNNVIHNSFLNNVKKLVFFGSGYMYPENAKNPLKEEYLFQGDLEYGAYSFGAAKIAGAIMCESYNIQYGTNFITLVLNNLYGTKANFDFGKSRVLPALLRKFHLAKLLSEGNITQILQDLKMNNFEEAKEYLHNFGISKKSVEIWGTGKVRREFIHSDDLADVAIYTMQNIDFKDLIKDRKSKNTHINIGTGIDYSIKEVALMVKNIVGFSGELVFNTSRPDSTMDRLMDCSKIHSLGWKHKIELKDGIKMMYEWYKTQN
>NZ_CP010301|1465749:1472385|1470909_1471836_-|WP_002852387.1|DBSCAN-SWA
MEKLLKELNNNIKLSNQLSYQILMSNIISNLDIDKKDKEILLLLLQARDRNYIRINNNEQCYQNIINYLNLIRPLELPLCDLLRIGGNGDGGYVMYNGGGDMSDINAKALSLGVSDSSPWDLEMAQRGFKVIEYDASIEKCPYDHENIVFHKKFIGNVNNENTITLVQALKDNNLDESKPNILQCDIENCEWDMLENIDISILNKYFSQVIFEFHGCNPEEQDGVEKRISLLKKLNEYFVPMHTHFHNHGKIFYSQGLFFSTTLEVSYLRKNLINLDIMKYRDVAGGFKNLDFPWISNPEIPIRFRGY
>NZ_CP010301|1465749:1472385|1466995_1468015_-|WP_002858413.1|DBSCAN-SWA
MKTIRTQTPLRLGLAGGGTDINLYCDKYTGYVLNATISLYIHCTLIKREDGKIIFDSPDTNSYCEYESKEFLGNDGKLDIFKSIYNRIVKDFTKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGVIKAFAEWLNLPLGEYEIAKLAYEIEREDLGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYNNKRVIVNPLRIKNWIASELEARTVLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLEAMHAIKQDAIKMKEALFRADFGTLAQILGKSWRSKKIISEIVSNDELERIYKLAIDNGAYSGKTSGAGAGGFMFFFVDPTKKYNLIKALRKEQGYVQDFSFTKEGVKSWRI
>NZ_CP010301|1465749:1472385|1468904_1469846_-|WP_002858299.1|DBSCAN-SWA
MSKKVLITGGAGYIGSVLTPILLEKGYEVCVIDNLMFDQISLLSCFHNKNFTFINGDAMDENLIRQEVAKADIIIPLAALVGAPLCKRNPKLAKMINYEAVKMISDFASPSQIFIYPNTNSGYGIGEKDAMCTEESPLRPISEYGIDKVHAEQYLLDKGNCVTFRLATVFGISPRMRLDLLVNDFTYRAYRDKFIVLFEEHFRRNYIHVRDVVKGFIHGIENYDKMKGQAYNMGLSSANLTKRQLAETIKKYIPDFYIHSANIGEDPDKRDYLVSNTKLEATGWKPDNTLEDGIKELLRAFKMMKVNRFANFN
>NZ_CP010301|1465749:1472385|1468034_1468886_-|WP_002857889.1|DBSCAN-SWA
MKKEQLEVLKEALNGLIYQIDNHQQARKPIADVERIISELQVLNHWNKQENVYNALHLIQGAIADPQGLGRLNLLLDNARIPKQYYDIFYKMLYVDKYGGGDGYRPVCIDCGGHAGLITDIILHCGGQSYIFEPNIYLNYFLRKKYENNINVKLFQKAVSDRNYETDFIMFGNRILSQGNRIVESVQDSQTEKTYKVQVIDLCEFIENEILTQHKRIYFLKLDIEGMEFEIMKKIIEKKIYKKIDYIACETHEYMFDDSEKKIGELKQLINKCNIQNILLDWI
>NZ_CP010301|1465749:1472385|1471839_1472385_-|WP_002858190.1|DBSCAN-SWA
MAIEFDIQESKILKGVYIITPNKFRDLRGEIWTAFTDEYLSKLVPDGIKFKHDKFINSHFNVLRGIHGDVKTYKLVTCVYGEVHQVVVDCRKDSPTYLKWEKFIISYKNQQLILLPPNMGNSHYVSSKEAVYYYKLAYEGEYMDAPDQFTYAWNDERIGIDWPTNTPILSDRDILATKNKG
>NZ_CP010301|1465749:1472385|1466402_1467008_-|WP_002857991.1|DBSCAN-SWA
MENLNSYIKGHFADSILVKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSKNILKALEFCKQKEIISIGLSGASGGAMNELCDYCIKVPSTCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFSCKQ
>NZ_CP010301|1465749:1472385|1465749_1466415_-|WP_002857908.1|DBSCAN-SWA
MQAIILCGGLGTRLKSIIKDIPKPMAPINDKPFLEFIFEYLKKQGIKEVILAVSYKYEVIKEYFKDEFLGIKIKYSIEKEPLGTGGAIKETLKFVKNEAYVLNGDTFFDIDLSKLKLNESKICLALKQMNDFDRYGTVNVDEQDLVISFEEKVFKKQGLINGGIYLLTKDIFNDFALQEKFSFEEFLQENYKKLKARACIFDDYFIDIGVPEDYYHFLINN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_002857908.1|1465749_1466415_-	D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase	A0A2K9L821	Tupanvirus	4.1e-08	26.6
WP_002857991.1|1466402_1467008_-	D-sedoheptulose 7-phosphate isomerase	A0A067XQR2	Caulobacter_phage	2.2e-16	35.0
WP_002858413.1|1466995_1468015_-	D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase	A0A222YW25	Synechococcus_phage	2.7e-59	40.7
WP_002857889.1|1468034_1468886_-	FkbM family methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_002858299.1|1468904_1469846_-	NAD-dependent epimerase/dehydratase	A0A0F7LC08	uncultured_marine_virus	1.0e-73	46.1
WP_002864205.1|1469869_1470910_-	GDP-L-fucose synthase	M1HWW2	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.7e-69	44.4
WP_002852387.1|1470909_1471836_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002858190.1|1471839_1472385_-	dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase	A0A1D8EQH2	Escherichia_phage	6.1e-18	32.4