Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP007471 | Haemophilus influenzae strain C486, complete genome | 2 crisprs | DinG,DEDDh,cas3,WYL | 0 | 1 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP007471_1 | 713677-713756 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007471_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP007471_1
>1.1|713700|34|NZ_CP007471|CRISPRCasFinder CATCGCCATTAAGTACCACGAAATCTTTCGCCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007471_1
The CRISPR arrays of NZ_CP007471_1 >merge|NZ_CP007471|1|713677-713756|CRISPRCasFinder AATTTTCCCTTCATTGATAACTTCATCGCCATTAAGTACCACGAAATCTTTCGCCTTAATTTCCCCTTCATTGATAACTT >NZ_CP007471|1|1|713677-713756|CRISPRCasFinder AATTTTCCCTTCATTGATAACTT CATCGCCATTAAGTACCACGAAATCTTTCGCCTT AATTTCCCCTTCATTGATAACTT
>NZ_CP007471.1|WP_005686687.1|711046_711403_+|dihydroneopterin-aldolase MDRIFIEELTVFAQIGVYDWEQQIKQKLVFDLEMAWDCKQAAETDDVAYCLNYAEVSQVIIDYVESKPFLLIERVAYEVADLLESRYQLQGLKIKLSKPKAVAQARNVGVLVIRGCLK >NZ_CP007471.1|WP_044345428.1|710364_710964_-|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY MSLFALFYMLFAYLLGSVSSAILICRIAGLPDPRQNGSHNPGATNVLRIGNRKSALAVLIFDMLKGMIPVWAGYYLGLTQFELGMVALGACLGHIFPIFFQFKGGKGVATAFGAIAPISWAVAGSMFDTWIFVFLVSGYSSLSAVISALLVPFYVWWFKPEFTFPVALVCCLLIYRHHDNIQRLWRGQEDKVWAKFKKK >NZ_CP007471.1|WP_044345425.1|708620_710324_-|nitrate/nitrite-two-component-system-sensor-histidine-kinase-NarQ MYTKGSVSTRIAKYLFIILIVAGVISSLSLAIMSSNKYDAEAINISGSLRMQSYRLLYEMQDQPESVETNLRRYHISLHSSALLEVQNQFFTPNVLKHSYQNILQRWTNMEKYARQQDVKNYSKQLTNYVADVDYFVFELQRFSEQKWILGVSVLGFAMLLILLMVSYVIWYTNREVVKPLHLMTKASMQVQMRQFNHIPLDTRKQNELGTLARVFTQMSTELGQLYSRLEEAVNEKTQKLRQTNRTLSTLYQSAQLLNTNTINDKILNQVLNYIFISNHLNFVKVEVMGAEHWDITLGKQDANNELQIETLSVDNEELGVLSWQAGLPCPDPRIMQNLAQMLARALYFHKNLRQKEQILLMEERSIIARELHDSLAQVLSFLQIQLTLLKHNLKKEDEQSKEKSLAIIANFEQALSGGYAQLRELLATFRLTIQEANLQLALEQVIDSLRSQTTMQMNVNCQLPSQSLNPQQLVHVLQIVREATTNAIKHSQGTVIEISARINAEGEYEILVEDDGVGIPNLEEPEGHYGLNIMAERCRQLNAQLHIHRREQGGTQVKITLPHTLY >NZ_CP007471.1|WP_042603014.1|707585_708611_-|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MQNLQPFHTFHIQSNAREIIEAHSIEQLQQVWANSKSENLPTLFLGQGSNVLFLDDFNGIVILNRLMGITHEQDANFHYLHVNSGENWHKLVEWSINNGIYGLENLALIPGCAGSAPIQNIGAYGVEFKDVCDYVEVLNLNTNETFRLDTEQCEFGYRESIFKHRYQQGYVITAVGLKLKKDWQPILKYGSLVEFDPKTVTAKQIFDEVCHIRQSKLPDPNEVGNAGSFFKNPVVSLEHFEKIKKHHENLPHFPQADGSVKLAAGWLIDQCNLKGFQIGGAAVHEKQALVLINKSRATGQDVVKLAHHVRQTVAEKFGVYLQPEVRFISATGEVNSEQIIT >NZ_CP007471.1|WP_005668897.1|707249_707561_-|DUF2322-family-protein MNFKEILEILPKIDHLTGLNVMNGETIIHNIPAIQGKLGSLRLYNALAEKFNGKLNRTSAQQGVEWFAEHVEDAKANPGKHPNIDLLFKVIDENLNLTLIPLC >NZ_CP007471.1|WP_005663931.1|706266_707112_-|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoH MDKETQMMLVPQGSIEGYIRAANEYPMLTAEEEKELAERLYYHEDLDAAKKLILSHLRFVIHVARGYSGYGLPQADLIQEGNIGLMKAVKRFNPEVGVRLVSFAVHWIKAEIHEYVLRNWRIVKVATTKAQRKLFFNLRKTKQRLGWFNENEVDMVANELGVSKEDVIEMESRMSGADVGFDLPTDDAETETYSPALYLEDKSSNFAAALENENFESQATEQLGAALQSLDARSQDIIKARWLDDNKATLHDLAAKYNVSAERIRQLETNALKKLKSAVNF >NZ_CP007471.1|WP_005686693.1|705294_706227_+|tRNA-dihydrouridine(16)-synthase-DusC MRVILAPMQGVLDPFVRELLTEVNDYDLCITEFVRVVDQLLPEKVFYRLCPELKNQGFTSSGTPVRVQLLGQHPECLAENAIRAIDLGSHGVDLNCGCPSKTVNGSNGGAALLKQPELIYRATQALRQAVPSEFPVSVKVRLGWDDISQAFEIADAVEQGGVTEITVHGRTKADGYRADRINWKKISEVRERLSIPVIANGEIWHWQDGQDCLSQTGCQDLMVGRGALNIPNLSHVLKSNVEKMPWYEIQKILQKYANVENEYDSGFYHVARIKQWLRYLNKEYDEANQVFDKIKTCQTAEDLKLRLNDK >NZ_CP007471.1|WP_005686695.1|704428_705295_+|co-chaperone-DjlA MGFIGKIIGVFLGWKVGGFFGAIAGLILGSIADKKLYELGSVSSSFFKKKTTRQDLFMQTTFAVLGHLSKSKGRVTEEDIQLANQLMIQLKLDDAGRKLAQDAFRRGKESDFPIRQVIREFRIGCGQRADLLRMFLQVQVQAAFADSELHENEKEVLYVIAEELGLSRMQFEQMIAMEMAARAFTQGGFYQQYQQGAYQGGYQYQQQNSGGYQHASGPTLNDAYKVLGVTESDEQSTVKRAYRRLMNEHHPDKLVAKGLPPEMMEMAKEKTQQIQAAYDLICKAKGWK >NZ_CP007471.1|WP_005686697.1|703708_704350_+|orotate-phosphoribosyltransferase MEQYKRDFIEFALSRNVLKFGEFTLKSGRKSPYFFNAGLFNTGADLARLGEFYAAAIQASAVDFDVVFGPAYKGIPIGTSVSVALFNRYGIDKPVCFNRKEVKDHGEGGNLIGSPLQGKILLVDDVITAGTAIRESMELISANQAELAAVLIALNRKERGKGELSAIQEVERDYQCQVLSIIDLDDLMQFIEQDPRYSSHLPEMRAYRAEFGV >NZ_CP007471.1|WP_005663925.1|702968_703685_+|ribonuclease-PH MRPNNRENNQPRQIKITRNYTKHAEGSVLVEFGDTKVLCTATVEDAVPRFLKGQGQGWVTAEYGMLPRSTHSRMQREAAKGKQGGRTMEIQRLIARSLRAMVDLKALGERAITLDCDVIQADGGTRTASITGAAVALCDAINSLIENGTLKTNPIKGLVSAISVGIVDGQAVCDLEYVEDSAAETDMNVVMMEDGRMIEVQGTAEGEPFSHEELLTLLDLAKQGCNQIFIAQREALGL >NZ_CP007471.1|WP_050951492.1|714251_715946_-|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein MKMRPRYSVIASAVSLGFVLSNSVMALVPNAGSLNRELEQRQIQPEAKPSGELFNQAAKSPYTAQYKQELKFPLTQVQILDRNNQEVAADELAHILKNYVGKEVSLSDLSNLANEISEFYRHNNYLVAKAILPPQEIEHGTVKILLLKGNVGEIRLQNHSALSNKFVSRLSNTTVNTSEFILKDELEKFALTINDVPGVNAGLQLSAGKKAGEANLLIKINDAKRFSGYVSVDNQGNKYTGRYRLAAGTKVNNLTGWGDELKLDLLSSNQANLKNARIDYSSLIDGYSTRFGVTANYLDYKLGGNFKSLQSQGHSHTLGAYLLHPTIRTPNFRLSTKVSFNHQNLTDKQQAVNVKQKRKINSLTAGIDGSWNLIKDGTTYFSLSTLFGNLANQTSEKKHNAVENFQPKSHFTVYNYRLSHEQILPKSFAFNIGINGQFADKTLESSQKMLLGGLSGVRGHQAGAASVDEGHLIQTEFKHYLPVFSQSVLVSSLFYDYGFGKSYKNSQFLAPGVKNNVKLQSVGAGLSFSDAGSYAINVSVAKPLDNNIDNADKHQFWLSMIKTF >NZ_CP007471.1|WP_044345432.1|716021_718217_-|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor MRFSKLSLAITTTLVTANALAQSVELDSINVIATRDPSRFAYTPEKQSKDSLLSKQATSVAAALEDIPNVDIRGGSRSIAQKPNIRGLSDNRVVQVIDGVRQNFDLAHRGSYFLPMSLIQEIEVIKGPSSSLWGSGALGGVVAMRTPNALDLLKNNDKFGVKIRQGYQTANNLSERDVSVFAANDKFDVLLSGFYNNADNLRTGRGNKLNNTAYKQFGGLAKFGWQINDANRVELSHRETRFKQTAPGNNEVENELTNEKIIDQINEFHKSNNSSPPKAKPSEEEFYSGVKTRFGSVSYLSDQQIPDQSTVFNYYLTPDNPYLNTHIALYNNKTIEKEQRKVSGVKDQTKLTTRGINLRNSSELSHISFVYGVDYMRDKIRTERGTNNTDAKFRAEPYNANSNTTGVYLIAHIPLFGEKLLVSPSVRYDHYDTSSKTVKYKDNHLSPATKLTWIVTNWLDFTAKYNEAFRAPSMQERFVSGAHFGANTLGLDQVNRFVANPNLRPETAKNKEITANLHFDSLFKQGDKFKIEATYFRNDVKDFINLKIFNNPNPNPNPNPNPNTNPNTNTNTNTNTNRAFLPTKSQYQNITNARLSGIELQAQYQTERLTLFTNYGSTKGRDKDSGEALSNIAASKIGVGADYALVKDKFTVGATITHYAAQHRVPKDHAVTYPSYILTDLRATYAPLKGEWKNLRLDFALENLFDRKYQPAFSLMEGTGRNAKISAVYSF >NZ_CP007471.1|WP_044345434.1|718538_719582_-|glycosyl-transferase MPLFTEAPKSLCILRLSAVGDVCHALAVVQHIQAYYPQTEVTWIVGKTEMGLLSGIPNITLIPYDKKTGWKGVLSLWKQLKNKQFDALLNMQTAFRASILSLGIKAKFKIGFGEKRSREGQWLFVNRRITDPSSPHVLDGFMAFAEYIGVPKAEPKWELAISQDDDKFADQFIDFSRKNLLISPCSSKAEKDWLIERYAEVANIAHQHNVNVIFCSSPAKRELEIVEKITALCHFTPTNIAGKTNLKQLTALISKVDLVLSPDSGPAHIATTQGTPVIGLYAYHNPLRTAPYKNLDNVVSVYEENAQKEFGKPSSELPWATKLKGKNLMAEIQVEPVIEQMKKLGLF >NZ_CP007471.1|WP_044345436.1|719658_720384_+|3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid-kinase MHQFQQDNQYFIFNFDRTFEQATEFFQAEFWQKQERVIGSAKGRGTTYFLQTEDWFGVNCALRHYYRGGLWGKLNKDRYRFSALETTRSFAEFHLLQRLYEAGLPVPKPIAARIQKGKLGICYQADILTEKIENAQDLTALLQTQTLPKETWTQIGRLIRKLHDLQICHTDLNAHNILLQQAEQEQKCWLIDFDKCGKKSGDFWKVQNLNRLKRSFEKEVGRMNIQFTEQNWADLTAAYHQ >NZ_CP007471.1|WP_042603012.1|720395_720983_+|RdgB/HAM1-family-non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase MKQKIVLATGNKGKVKEMADVLSDFGFEVIAQTDLGIESPEETGLTFVENALLKARYASEKSGLPAIADDSGLVVSALNGAPGLYSARYAGEEGNDAKNREKLLAELAHVAQDKRQAKFVSCIVFLQHPTDPSPIISEGECCGVIGFEEKGENGFGYDSLFFSPEQGCTFAELETVEKKKISHRAKALSVLKSKL >NZ_CP007471.1|WP_042593467.1|721141_722038_+|glycosyltransferase-family-8-protein MNIIFSSDNYYAPYLAVSIFSIIKNTPKKINFYILDMKINQENKTIINNLASEYSCKVFFLPVCESDFQNFPKTIDYISLATYARLNLTKYIKNIEKAIYIDVDTLTNSSLQELWNIDITNYYLAACRDTFIDVKNEAYKKTIGLEGDFYFNAGILLINLNKWKEENIFQKSINWMNKYNNVMKYQDQDILNGICKGKVKFINNRFNFTPTDRDLIKKKNLLCVKMPIVISHYCGPNKFWHKKCSHLNCHIGNLLLKEMDKIIDIPSSWYDHFEKIPFLIKIKRLRKRIRDKLIYGIY >NZ_CP007471.1|WP_005653397.1|722751_723075_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MTLNITSKQMDITPAIREHLEERLAKLGKWQTQLISPHFVLNKVPNGFSVEASIGTPLGNLLASATSDDMYKAINEVEEKLERQLNKLQHKSESRRADERLKDSFEN >NZ_CP007471.1|WP_044345440.1|723264_723894_-|outer-membrane-protein-assembly-factor-BamC MKKIILNLVTAIILAGCSSNPETLKATNDSFQKSETSIPHFSPLATGGVQLPKADDAYSLPNIEVKKGENIDIRPPLIPLAIIQNSITKFDGERSLIVYPKQQAKLYNLQQVKRLLKDEGISSTTDGSILTTDWAKTERIGDKSIEIKYQIEQVMTADVSALTVSILHMRRDGIIFTPNVSDKQYYTSERLNRIVLTLTTAYNKQLQDL >NZ_CP007471.1|WP_005692198.1|724004_724901_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MSAQNPLFSGSIVALVTPMNHYGEVDFSCLEKLVEHHIEAGSNALVSVGTTGESATLSIEENVKVIEKTVEFAKGRIPIIAGAGANATSEAITMTKLLRDSGVAGCLSVVPYYNKPTQEGMYQHFKAIAECTDLPQILYNVPSRTGSDMKPETVARLAEIENIVGIKEATGDVSRIVKIKQLAGKNFIVLSGNDTTGLEAIKLGAEGVISVTNNIAAKDMADMCRYALAGDFDKAEEINARLMRLHHDLFIESNPIPVKWAAYRLGLIKSPHLRLPLTTLSEEIQPKVEDALKIAGLL >NZ_CP007471.1|WP_005653400.1|725001_725469_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MNPLSVGNQAPAFTLLNQQEKFVSLSDFRGKKVLIYFYPKALTPGCTTQACGLRDSKSELDALGLVVLGISPDAPKKLAQFIEKKELNFTLLSDPDHQVAEQFGVWGEKKFMGRTYDGIHRISFLINESGTIMQVFDKFKIKDHHQMIIDYLRSL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP007471_2 | 1120352-1120439 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007471_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP007471_2
>2.1|1120377|38|NZ_CP007471|CRISPRCasFinder CAAGATTTTCTTTGAGCCTCTTTTTGTCACTTTGTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007471_2
The CRISPR arrays of NZ_CP007471_2 >merge|NZ_CP007471|2|1120352-1120439|CRISPRCasFinder ACCTTCCCCCGCAAGCAAGGGAAGGCAAGATTTTCTTTGAGCCTCTTTTTGTCACTTTGTGATACCTTCCCCCGCAAGCAGGGGAAGG >NZ_CP007471|2|2|1120352-1120439|CRISPRCasFinder ACCTTCCCCCGCAAGCAAGGGAAGG CAAGATTTTCTTTGAGCCTCTTTTTGTCACTTTGTGAT ACCTTCCCCCGCAAGCAGGGGAAGG
>NZ_CP007471.1|WP_005631918.1|1119634_1120270_-|endonuclease-III MNKTKRIEILTRLREQNPHPTTELQYNSPFELLIAVILSAQATDKGVNKATEKLFPVANTPQAILDLGLDGLKSYIKTIGLFNSKAENIIKTCRDLIEKHNGEIPENREALEALAGVGRKTANVVLNTAFGHPTIAVDTHIFRVCNRTNFAAGKDVVKVEEKLLKVVPNEFKVDVHHWLILHGRYTCIARKPRCGSCIIEDLCEYKEKVEF >NZ_CP007471.1|WP_005658210.1|1118202_1119576_-|sodium-dependent-transporter MTTNNKQRQTWSSRLTYVMTVAGATVGFGATWRFPYLVGENGGGAYVLLFCIAMIIIGIPMILVENVIGRRLRVNSIDAFGDKILDKGKGISKYWKILGYMGLLGAFGIMAYYMVLGGWVISYIISLISGTLDISAPITKDIAKNFYDLHIGNSPYEIIFYTLLFVIVNYIILAKGIIGGIERSVKYLMPLLFIFLIGMVIRNVTLPGAMEGITFYLKPDFSKITPQLFIFVLGQVFFALSLGFGVLITLSSYLNKEENLIHTAVITGFTNTIIAVLAGFMIFPSLFTFGIEPNAGPTLVFQSLPIVFSHLWAGKFFAIIFFGLLLIAALTTSITIYEVIITALQEKLRMRRGKAIVLTLGGIFLLGNIPAILGDNLWKNVTIFGKSIFDFYDYASGNILFMLTALGCAIFVGFVLKDEAKKELSSTKYSTFIKIWFNYVKFVVPVIILVIFISNLF >NZ_CP007471.1|WP_044345583.1|1117123_1118179_+|molybdenum-ABC-transporter-ATP-binding-protein-ModC MLQINVKKQLGQLALQANIQLPDQGVTAIFGLSGSGKTSLINLVSGLIQLDEGFIRLNDRTLVDMESQESLPIHLRKIGYVFQDARLFPHYTVKGNLRYGMKNVSQDDFNYIVDLLGITHLLKRYPLTLSGGEKQRVAIGRALLTDPDILLMDEPLSALDVPRKRELMQYLERLSKEINIPILYVTHSLDELLRLADRVVLMENGIVKAYDSVEKIWNSPIFAPWKGESEQSSVLALPVHLHNPPYKMTALSLGEQVLWIHQVPANVGERVRVCIYSSDVSITLQKPEQTSIRNISRGQVAQIEIQDSRVDLAVLVEGNKIWASISKWAQNELRFAVGQDVYVQIKAVSVM >NZ_CP007471.1|WP_080334647.1|1116447_1117137_+|molybdate-ABC-transporter-permease-subunit MEISAINLSLSVAVSSMLWSLPLAIFVAWLLARKNFYGKSLITGVIHLPLVLPPVVIGYLLLVAMGRNGFIGKYLYQWFGLSFGFSWKGAVFSSAVVAFPLVIRAIRLSLENIDIKLEQAAQTLGASAWRVFFTITLPLSLPGVLAGLVLGFARSLGEFGATITFVSNIAGETQTIPLAMYSFIQTPGAEEQTARLCLFAIILSLISLLLSEWLSKRMQKKLGQGNVAD >NZ_CP007471.1|WP_005644814.1|1115509_1116274_+|molybdate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLTKISTALLIAGLGFSFAASAKVTVFAAASMTDALQQVAKDYAKQNPKNEVVFSFASSSTLAKQVEEGAPADIFVSASNKWMKYLSEKDLTVKETEKVLVGNDLVLIAPAKSAVNSVDIAKGEWINALKDSYLSVGDPAHVPAGQYAEEALTKLNLWDKVQDRLARAKDVRGALALVERAEAPYGIVYSTDAKVSQQVKTVAVFPADSHKPVVYPVSIVKGHDNADSRDFLKYLESDAAKKVLVGYGFSAK >NZ_CP007471.1|WP_005688015.1|1114598_1115372_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKNTEILLTIKLQQALFIDPKRVRLLKEIQQCGSINQAAKNAKVSYKSAWDHLEAMNKISPRPLLERNTGGKNGGGTVLTTYAERLLQLYDLLERTQEHAFHILQDESVPLDSLLTATARFSLQSSARNQFFGRVAQQRIIDSRCVVDVNVNVQGLPTPLQVSITTKSSARLKLITEKEVMLMFKAPWVKISEQPLANQPNQFPVNIKSLNEEEAILQFAESDIEFCATVHQPNQWQIGQQVWIHIDQEQIILATLG >NZ_CP007471.1|WP_014550665.1|1113709_1114495_+|glycosyltransferase MSLYIKENPQFLRECFESLVAQTRQADEIVLVFDGTVTPELESVVTEFETKLPLKLVKLPQNRGLGKALNEGLLHCDYDWVFRMDTDDICVPERFEKQVAFIEQHPETIIFGGQIAEFGENINDIVAYRNVPTSAQEIIKFTQKRCPFNHMTVAYQKSAVINCGGYEDLQEDYYLWIKLVAQGLYMANLPDILVYARVGNGMVSRRRGVNQAKAEWRLFKLKYRLGIQGLLSGLFTFALRFGSRLLPTSLLKNLYQTFLRK >NZ_CP007471.1|WP_005688019.1|1112805_1113690_+|glycosyltransferase-family-2-protein MLSIIVPSYNRKAEVPALLESLTQQTSSNFEVIIVDDCSKDPVEVTQSYPFVVKVIRNETNQGAAESRNIGARASKGDWLLFLDDDDRFMPEKSEKILQVIEQNPDINFIYHPAKCEMVNEGFSYVTQPIEPQEISTERILLANKIGGMPMIAIKKEMFLKIGGLSTALRSLEDYDFLLKLLQEPSFTPYKINEPLTYCTFHTKRSSVSTDTTNTQKAIDYIREHYVKTVEQARNFDINASYILAYPHIMNLSRKATKYYFDIFKKTKSIKQFIITLVILISPKLAINLKRLGK >NZ_CP007471.1|WP_005688021.1|1112020_1112794_+|glycosyltransferase-family-25-protein MLKKYLISLDKDIQRRKLFFSQKNTEDFQIFSAINTMQKDWDELASIFNIEQFKAHYFRNVTKGEIGCTLSHLSVYQKIIEDNDIAEDSYALVCEDDALFHSDFQQNLTALLSEKLEAEIILLGQSKINNFNDTDLEINYPTTFSFLCKKTGNVNYAFPYKSYFAGTVGYLIKKSAARRFIQQISQNKPFWLADDFLLFEQNFNIRNKVVRPLMVIENPVLISNLESVRGSLSNNLLKKLMKYPLKKIFAIKKNLAN >NZ_CP007471.1|WP_005658225.1|1110947_1112009_+|glycosyltransferase-family-4-protein MKKIGFFIMNIESAGGTERVSINVANALAKQGYDVSFISIGGNKPFFQVDEKINIYAMNKLPYSLKKDYFSITKKLRELVKELQLDTLIVVDGAIMLFSALALVNLNIKHILWEHYSFNFTGNRLVRTLGKYLAVTTCDKIVTLTEAEKTLWQEKFKTNNIITIANPNTLLPKNKLAKWENKTILSVGHLFSYKGFDYLLKVWQVLAKKYPDWNLKIVGSGEEEENLKNLAKALDIEDSVNFTPRTNDVSFYYESSSIYCLPSQTEGLPLVVIEAMAFGLPIVAFNCSPGVKQLVEHKENGFLCEKNNIEEMVKGLDLLINNPELYQQMSDKSRLMSEDYGIEKIIEEWKGIL >NZ_CP007471.1|WP_005689725.1|1120454_1121162_-|electron-transport-complex-subunit-E MTDLTEKNTALEEEKIESAVENQQKSIWKEIFAQGIWKNNPAVVQLLGLCPLLAVSSTATNALGLSLATMLVLTCTNTVISLFRQYIPKEIRIPIYVMIIATTVTAVQLLMNAYTYTLYQSLGIFIPLIVTNCIIIGRAEAFASKNSLLHSIWDGFSMGLGMALSLTILGALREIIGQGTIFEGIENLFGEQAKFLTHHIYHTDSSFLLFILPPGAFIGLGLLLAIKNRIDNVKK >NZ_CP007471.1|WP_005689723.1|1121163_1121787_-|electron-transport-complex-subunit-RsxG MGTVKITSRYGILLGFIALLCTIISAGIYFLTKDKIDAVIAAQQRELLLQVIPQDYFNNNLLESAVIPQDKNFVGIQKIYFAKKDGNISAYAYETTAPDGYSGDIRLLVGLDPKGEVLGVRVIEHHETPGLGDKIERRISNWILGFTNQSINEHNLSEWAVKKDGGKFDQFSGATITPRAVVNQTKRSALIMLNNQALLQQLSTQVK >NZ_CP007471.1|WP_005688002.1|1121786_1122863_-|electron-transport-complex-subunit-RsxD MFKMVSSPHTHSGKLTARIMLWVILAMMPAFFTQIYYFGFGVLLQSALAIGTAIIAEFIAIKLRGKKPLNYLSDFSVALTALILAMAIPPYAPYWVIIIGTLCAVLLGKQVYGGLGQNPFNPAMIGYVILLISFPLQMTTWMPPINLLQEPPTFSDAFSLIFSGLTTDGFTLSQLTHNIDGITQATPLDSAKIFYKSHNQLSDFYELIKLPIFMGNGTDFAQGWWQINVAFLAGGIFLILKRIIHWQIPVAMLVTFFCLATATAFTGFTHLSAISQLVSGAMMFGAFFIATDPVTASITPRGKIIFGALVGLFVYLIRYHGNYPDGVAFAILLSNICVPLIDHYTRPRVSGYPTKGRK >NZ_CP007471.1|WP_044345584.1|1122867_1124823_-|electron-transport-complex-subunit-RsxC MADVLSRFNSGKLWDFKGGIHPPEMKSQSNSQPLRHLPLGTDFYIPLKQHLGTTGNLLIKEGDYVLKGQALTKGDGLRMLPVHAPTSGTIKSIKPYVATHPSGLDEPTIHLQADGLDQWIERNPIDDFSTLSPEQLIHKIYQAGIAGLGGAVFPTAAKIQSAEQKVKLLIINGAECEPYITCDDRLMRERADEIIKGIRILRYILHPEKVVIAIEDNKPEAISAIRNALQGANDISVRVIPTKYPSGATKQLIYLLTGIEVPSGERSSSIGVLMQNVGTMFAIKRAVINDEPLIERVVTLTGNKIAEKGNYWVRLGTPISQILSDAGYQFDKHFPIFAGGPMMGLELPNLNAPVTKLVNCLLAPDYLEYAEPEAEQACIRCSSCSDACPVNLMPQQLYWFARSEDHKKSEEYALKDCIECGICAYVCPSHIPLIQYFRQEKAKIWQIKEKQKKSDEAKIRFEAKQARMEREEQERKARSQRAAQARREELAQTKGEDPVKAALERLKAKKANETESTQIKTLTSEKGEVLPDNTDLMAQRKARRLARQQAASQVENQEQQTQPTDAKKAVVAAAIARAKAKKLAQANSTSEAISNSQTAENEVEKTKSAVEKTQENSTALDPKKAAVAAAIARAKAKKLAKTQTTLENNQE >NZ_CP007471.1|WP_005650033.1|1124823_1125405_-|electron-transport-complex-subunit-RsxB MTFLFIVITLLALIFGAILGFASIKLKVEADPVVEKIDAILPQSQCGQCGYPGCKPYAEAICNGDEITKCIPGGQTTIVKIAEILGVDVPTMEGIEEPIEKVAFIDENMCIGCTKCIQACPVDAIIGTNKAMHTIIPDLCTGCELCVAPCPTDCILMIPVKKNIDNWDWKFDAKLVIPVMNVDGSEKKLVVGE 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP007471_1 | 1.1|713700|34|NZ_CP007471|CRISPRCasFinder | 713700-713733 | 34 | MH572422 | Microviridae sp. isolate SD_MC_8, complete genome | 4166-4199 | 9 | 0.735 |
1. spacer 1.1|713700|34|NZ_CP007471|CRISPRCasFinder matches to MH572422 (Microviridae sp. isolate SD_MC_8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
catcgccattaagtaccacgaaatctttcgcctt CRISPR spacer ttttaccattaagtaccacaaaatcattcggata Protospacer . *..**************.***** **** *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1237266 : 1243944
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP007471|1237266:1243944|DBSCAN-SWA TATGGCTACGATAACTAAACTTGATATTATTGAATATTTAAGCGATAAATATCACTTATCTAAACAAGATACGAAAAATGTAGTGGAGAACTTTTTGGAAGAGATCCGTTTATCGCTAGAATCTGGTCAAGATGTGAAATTATCAGGATTTGGTAATTTTGAATTACGCGATAAGTCATCTCGCCCAGGGCGTAACCCAAAAACAGGTGATGTTGTGGCAGTTTCTGCTCGCCGAGTTGTCACATTTAAACCTGGGCAAAAGTTACGTGCTCGTGTAGAAAAAACTAAATAGTAAGCAACAAAAAGTGCGGTGAATTTCTACCGCACTTTTCATATGAAAAGGTATGAAAGTATATAAATTATTTTTAATCGCTACTGCCTCGCTGTTTTTATTCGCTTGTTCCAGTTTTCAAAACGATGATTATGCGATGAACTATAAAGGTCAAATCGGCGATCCTATTATGGCTATAGCCATGTTGAGCGAACAACAACATGAATGGGCAGGTACACCTTATGTGCTCGGCGGTGTTTCACGCCGTGGGGTAGATTGTTCTGGTTTTGTGCAGAAAACTTTCTTCGATCGTTTTAATCTTCGTTTGCCTAGAAGCACTGTTGAACAAGCTAATTATGGTAAACATGTACGCAAAGAAGATATTCAAACTGGCGATTTAATTTTCTTTAAAACTGGCCGAGGCCCTAATGGTTATCATGTGGGGATTTATGTAAAAGAAGATAAATTCCTTCATGCTTCCACCAGAGGGGGAGTCGTCTATTCTTCAATGAATAACCCTTATTGGTCAAAAGCCTTCTGGCAAGTCAGACGGATTTAGAAAATATAATGCTGGAATTTTCCAGCATTTTTTATAATGATTTTTTTCAAATTTGGGAGATAAAAATGCCCTCAAACTTAACCGCACTTCAAATTCAACTTGAAATTTTACGCCTTATTCCAAAAACTCGTTTTATTACCGCAGAAGAAATCTTACAAAAACTTGCTGATATTGGCGTTCAACGTGATATTCGTTCAATCCAACGCCAGCTAGAAAGTTTGTCTCAACAGTTTGAAATTGAGCGAGATATGCGTGATAAACCTTATGGATATCGATGGAAATCAAATGCTAAAGGCTTGGATTTACCGATTTTAAATGAACAGCAATCACTTGTGCTTATGCTTGCTAAACAATATCTCAATGGCATTTTGCCTTCTAGCATTATGAACTCAATGGAGGCGTTCTTTCAACAGGCCGAATATAATTTGGTTTATGACAGCCATAAAAAATCAGGGGCAGAATGGCTTAATAAAGTTTCTATTGCCCCAACTAGTCAGCCGTTATTACCTGCCAAAATCAATCCAGAAATTTTTTCTCAAATTAGTACCGCACTTTATCAAAATCGATTTTTGCAGGTGCATTATCGGAGTATTCACGGTAAAGAACATAAGGCACAGGTCAAGCCATTGGCTTTGGTTCAACAAGGACCAAGTAGCTATTTAGTCGCACAATATGAGAATGGCGATATTTTACACCTTGCTTTGCATCGCTTGCTTAAGGTAACAGTGAGTACAATGATATTTGAACGCCCTGATTTTAATTTGAAATCTTATGTAGAAAGCCAAAAGTTTGGTTTTACCTATGGTCGAAAAATTCGATTAACTTTCCGCATTAATAAAGATATTGGTGGCTTTTTAACAGAAACACCATTATCAATGGATCAAACAGTAAAAGATTGTGGCACTGAATATGAAATTTCCGCTACCGTGATTAAGAGTGCTATGCTGGAATGGTGGATAGCCCATTTTGGTGAAGATTACCAAGAAATTGACCGCACTTATTTAGACGAAAATGCCTAACGACATAAATTGTCGCTTCATCTTTTATCATTAAGCCATCAACAGAGAGGACATTAAAATGAAGAAAATTGTTTATATTGATATGGATAATGTGATGGTTGATTTTCCGTCTGGTATTGCAAAATTAGATGAGAAAACCAAGCAAGAGTACGAAGGTCGATATGATGAAGTAGAGGGTATTTTTAGCTTAATGGAGCCAATGCCTAATGCGATTTCTGCTGTGCATAAATTGATGAAAAAATATCATATTTATGTGCTTTCTACTGCGCCTTGGCATAATCCATCCGTTTGGAGTGATAAAGTAAAATGGATTCAACATTATTTCGGTGAAGAAAAAGGTTCAGCCTTATACAAACGATTGATTTTATCCCATCATAAAAATCTCAACCAAGGCAATTATTTAATTGATGATCGCACTAAAAATGGAGCTGGTAAATTTCAAGGTGAACATGTTCATTTTGGTACAGAACAGTTTGCTAATAAAAGGAGCCTGAAAAATGACAGAGAAAAATAAACCAATTTGCGTGGTATTAACGGGAGCTGGAATTAGTGCCGAAAGTGGTATTCCTACTTTTAGAGCTGAAGATGGATTGTGGGCAGGGCATAAAGTAGAAGAAGTTTGCACGCCCGAAGCCTTGCAAAAGAACCGTGCGAAAGTGCTTGATTTCTATAACCAACGCCGTAAAAATGCGGCAGCAGCTAAGCCAAACGCTGCGCATCTCGCCTTAGTTGAACTAGAAAAAGCCTATGATGTAAGAATCATCACGCAAAATGTGGATGATTTACATGAACGTGCCGGCAGCTCGAAGGTGTTGCATTTACACGGTGAATTAAATAAAGCTCGCAGTAGCTTTGATGAAAGTTATATTGTGGATTGTTTTGGTGATCAGAAATTAGAAGATAAAGATCCAAATGGACACCCAATGCGCCCTTACATCGTCTTTTTTGGTGAAATGGTGCCGATGTTAGAACGAGCGGTTGATATTGTGGAACAAGCAGATGTTGTGTTAGTGATTGGTACTTCATTACAAGTTTATCCAGCCAACGGCTTAGTCAATGAAGCTCCAAGAAAAGCGCCAATTTATCTGATTGATCCTAACCCAAATACAGGCTTTGTTCGTAAGCAAGTTATTGCAATAAAAGAAAAAGCAGGCGAGGGTGTGCCGAAAGTGGTGGCAGAGTTATTAGAGAACACCAAAAACTCATAGAAAAATGACCGCACTTTTCACATAAATAGCGAGTTTTATATCACTATACTGTATGACTGATGAATTAACGAGAAACGTATGCATCCAGTAATTGAATTTTATTTAGAACAAAGAAAAAGCCAACATAATTTATCTTTGCAAGATATGCGGGCAATGCCAAAAAGAATGATTGGCGATGCTTATTTTTATATTCCTTGGCTTTTACCTGTTACTGAAAGTTCCAAATGGAATCGTTCAGTACCGGTTTTTAACGAAGAAGACCTGGCTATTTTTATTGGAGATGAAGCAATTCAAAATAAATATTTACATTCTATTGATATTATTCTGGATTACTTCTGTTTATATCGTGAAGATAATAAAATATTCCCTAAACCTGAATTAACTGAACGTAAAGTTTGGCTACGCAATATTGGGCATGAAAGTAAGAAGATTTCCCGCATCATTCGTAGTTTAAATTATTGCGGTCATACTGAGTTGGCTAAAAGTTTACAGCAACTGGCAATAAAATTAGGTCAAGAAAAAGGCGTAATTCAAGAAGAAACCATAGGGATTTGGACAAATCTACTTAAATAATGAGGATAAAATAATGGTAACAGAAGAGTTTAAAAAAGTGGCAGTATCCTTCGCTGGAGGAGATGGCGGAAATCCTAACTCAGATGTTTGGTTTTGTGGGTTAGAATGGGGGATTGGTGATGAAGCTTCTCCTGATGATTTTATAAGAAATTTAGTTTAAGCCCTAAATTAATACCGCACTCTTGGTTAGAGGACGATTTTGATGGTAGTTGGACTACGCAATATAATCAAAAATTATGTTGGTTTTTGTGGTACTACTATAATTTAGATTGGAAAAGTGGTGAAAGCTATGAGTATTTTGTTAGTACTTATAATGTGCTTTATCCACAGGGTATTGGTTTTAAACTAAATATGCTACCAATCAATTTCAAAAATAGAGCATCAATTCAATGGAATGAACAATTCATTAAGATGACAGGATTTGAAACATTCGATCAATATAGAGAATGGTGTGTTGAAAATCGTGGTGCTTTTTATCGTCAACTTATAGATGAATGTAATCCTAAAGTTATTATTTGTACGGGAGTCACTGAAAAAGATAACTTCTTTAAGTTTTTTACTGGAGAAGCCGTATATGAAACTAAAGCGTTGAAAGAATTTAATATCTTCTATCGCAAGTACAATGATACTTTAATTTGTGTTTGTCCGTTTTTTGGTGGTCCAAGTGGCATTAATTCTTACGACAAAATGGAAGCATTAGTAGAGTCAGTAAAAGAATTATGTAAATAAATTTTTTATTAAGTTTAACATTGATAGATAAATAGCGACTTCGGTCGCTATTTATCATTACTTCTCTTGTTTTTGCTTAAGCATGTGCATAATAAGCCTAATAAGCGTTTCTTTTTGTTTCGGATCAGATTCAGCAACTAATAAAGTGAGTGCTGCAAGCCCAGTATCATTGATAACTGGATGCCCATTATGATCAAACAAACGCCCATTTCTATGTAAGAAATCTACAAATAAAAATGCGCCACTACGTTTATTACCATCTGAAAAAGGATGATTCTTGACGACAAAATAAAGTAAATGTGCCGCTTTTGCTTCAATGCTTGGATAAGCAGGTTCACCAAATACACTTTGATCTAAATTGCCTAGAATCGCAGATAAGCCGTTATCTCGTTCACGTCCAAATAGATCACTTGCTTCACCTTTTGCCATCAGCTGTGATTTTAACTCTGCTAGTGCAGAACAGGTTTCTGCATAAGTCGGTAATGTACCGCCTTGCTGTGTTTGTGGTTCGGCAAGTAAACCTTCATCATATTGTTGTAGCCATAAAAACGTATGCGTATAACGGCTGACAATATCCACTAATCCGCGACCGCTTTCTAGCGTTAATTCTGATGAATTTGCCGTTTTTTGAATAAGCGCAAGTGCTTGTTCTAATTCGTGACCATTTTGCTGTAAACGTTTTTGGTTAATAGTATAGCCTTGAGTCAGATATTCTTTTAAACGTGCAGTTGCCCAAATTCTAAAATTTGTTGCAGACTTAGACTTCACTCGATAGCCTACAGAAATAATAGCATCCAGATTATAATGTTTAACCTTACGAGTAACTTGCCTTTTTCCTTCTTGTCGAACTACCGAGAAATCCTCGGTAGTTAAATTTTCATCAAGTTCTTCTTCATTAAAAATATTTTTTAAGTGTAGGCCTATGTTATCTGAGCTAGTATCAAAAATATTTGCCATTTGTGCCTGGGAAAGCCAAACGGTGCCATTTTCAAATCTCACTTCCACTTGCGTTGTGCCATCTTGAGCTTGGTAAATTTCAATCGGGTTTTGGTTATTCATATTATTTTCCTTAATAACTTACATGTATATATAACCAGATAAATATGCATATTGCAATACAGATCATCTTATTTGCAAAAAATCTTCTAAAAATAACCGCTTTCAATATTCGCAAACGACACAAGTTGTCGCTTCCTTTCATATAATTTTTCCATAAAGGGAGATTTTTTACTTCTTACATATCTATCAAGCCTTTAATTAATAAAAAGGAGCAAATAATGGCAATGAAAGTAATTATGGCAAGAGATCCACTTTTTGAGGATGTAAAAAAATATGTGCAACAACAAAAAGTTGCATCTTGCTCAATGATTCAACGCAGATTTATGTTGGGTTTTAATCGAGCTGGGCAAATTTTAGAACAGTTGGAACAAGCGGGTATTATTTCATCAATGAAAAATGGACAGAGAAAAGTATTATGAAAAATGATTTGAATTATGCTGTGGAACTTATCCGCAAAGCGGATGGCATTTTAATTACAGCTGGTGCGGGTATGAGCGTGGATTCTGGGCTGCCCGATTTTCGCAGCGTTGGCGGATTTTGGAATGCTTATCCTATGTTTAAAGAACATAATATATCTTTTGAAGACATCGCGACGCCATTAGCTTATAAGCATAATCAGGAACTTGCCTATTGGTTTTATGGACATCGATTAATTCAATACCGAAATACTATTCCTCACGAAGGGTATCAGATTTTAAAACGCTGGGCGGGAGATAAATCTCATGGATATTTCGTTTTTACCAGTAATGTGGATGGGCATTTTCAAAAGGCTGGTTTTGATGATAGCCATGTTTATGAAGTACACGGTACTTTGGAGCGTCTTCAATGTGTCAATAATTGTCGAGGATTAAGTTGGTCTGCATCAAGTTTTCAACCTGTCGTGGATAATAAAAATTTATGTTTAACCAGTGAAAAACCACATTGTCCTTATTGTGGTGGCTTTGCTCGTCAAAATGTACTAATGTTTAATGATTGGAGTTATGTAAGTCAATATCAGGATTTTAAAAAAGTGCGGTTAGAATCGTGGTTAAAAGAAGTGCAAAATCTTATCGTCATCGAACTGGGAGCGGGGAAAGTTATTCCTACTGTGCGTTGCTTTTCTGAACGTACGGCGAAAGCAAAAAAGGGTGGATTTATCCGTATTAACCCACAAGATGCTGGTGTGCCGAAAATGCACTTTTTAAGTCTAGAAATGAAAGCGTTAGATGCGCTAAAAGCGATTGATCGCCTTCTAAATCCTTCTCAACAAGCGGTTGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP007471|1237266:1243944|1243098_1243944_+|WP_005688189.1|DBSCAN-SWA MKNDLNYAVELIRKADGILITAGAGMSVDSGLPDFRSVGGFWNAYPMFKEHNISFEDIATPLAYKHNQELAYWFYGHRLIQYRNTIPHEGYQILKRWAGDKSHGYFVFTSNVDGHFQKAGFDDSHVYEVHGTLERLQCVNNCRGLSWSASSFQPVVDNKNLCLTSEKPHCPYCGGFARQNVLMFNDWSYVSQYQDFKKVRLESWLKEVQNLIVIELGAGKVIPTVRCFSERTAKAKKGGFIRINPQDAGVPKMHFLSLEMKALDALKAIDRLLNPSQQAVE >NZ_CP007471|1237266:1243944|1239611_1240322_+|WP_005671438.1|DBSCAN-SWA MTEKNKPICVVLTGAGISAESGIPTFRAEDGLWAGHKVEEVCTPEALQKNRAKVLDFYNQRRKNAAAAKPNAAHLALVELEKAYDVRIITQNVDDLHERAGSSKVLHLHGELNKARSSFDESYIVDCFGDQKLEDKDPNGHPMRPYIVFFGEMVPMLERAVDIVEQADVVLVIGTSLQVYPANGLVNEAPRKAPIYLIDPNPNTGFVRKQVIAIKEKAGEGVPKVVAELLENTKNS >NZ_CP007471|1237266:1243944|1238160_1239114_+|WP_044345631.1|DBSCAN-SWA MPSNLTALQIQLEILRLIPKTRFITAEEILQKLADIGVQRDIRSIQRQLESLSQQFEIERDMRDKPYGYRWKSNAKGLDLPILNEQQSLVLMLAKQYLNGILPSSIMNSMEAFFQQAEYNLVYDSHKKSGAEWLNKVSIAPTSQPLLPAKINPEIFSQISTALYQNRFLQVHYRSIHGKEHKAQVKPLALVQQGPSSYLVAQYENGDILHLALHRLLKVTVSTMIFERPDFNLKSYVESQKFGFTYGRKIRLTFRINKDIGGFLTETPLSMDQTVKDCGTEYEISATVIKSAMLEWWIAHFGEDYQEIDRTYLDENA >NZ_CP007471|1237266:1243944|1241681_1242683_-|WP_044345634.1|DBSCAN-SWA MNNQNPIEIYQAQDGTTQVEVRFENGTVWLSQAQMANIFDTSSDNIGLHLKNIFNEEELDENLTTEDFSVVRQEGKRQVTRKVKHYNLDAIISVGYRVKSKSATNFRIWATARLKEYLTQGYTINQKRLQQNGHELEQALALIQKTANSSELTLESGRGLVDIVSRYTHTFLWLQQYDEGLLAEPQTQQGGTLPTYAETCSALAELKSQLMAKGEASDLFGRERDNGLSAILGNLDQSVFGEPAYPSIEAKAAHLLYFVVKNHPFSDGNKRSGAFLFVDFLHRNGRLFDHNGHPVINDTGLAALTLLVAESDPKQKETLIRLIMHMLKQKQEK >NZ_CP007471|1237266:1243944|1240400_1240895_+|WP_005688182.1|DBSCAN-SWA MHPVIEFYLEQRKSQHNLSLQDMRAMPKRMIGDAYFYIPWLLPVTESSKWNRSVPVFNEEDLAIFIGDEAIQNKYLHSIDIILDYFCLYREDNKIFPKPELTERKVWLRNIGHESKKISRIIRSLNYCGHTELAKSLQQLAIKLGQEKGVIQEETIGIWTNLLK >NZ_CP007471|1237266:1243944|1242901_1243102_+|WP_005688188.1|DBSCAN-SWA MAMKVIMARDPLFEDVKKYVQQQKVASCSMIQRRFMLGFNRAGQILEQLEQAGIISSMKNGQRKVL >NZ_CP007471|1237266:1243944|1237266_1237557_+|WP_005688173.1|DBSCAN-SWA MATITKLDIIEYLSDKYHLSKQDTKNVVENFLEEIRLSLESGQDVKLSGFGNFELRDKSSRPGRNPKTGDVVAVSARRVVTFKPGQKLRARVEKTK >NZ_CP007471|1237266:1243944|1239172_1239628_+|WP_005688179.1|DBSCAN-SWA MKKIVYIDMDNVMVDFPSGIAKLDEKTKQEYEGRYDEVEGIFSLMEPMPNAISAVHKLMKKYHIYVLSTAPWHNPSVWSDKVKWIQHYFGEEKGSALYKRLILSHHKNLNQGNYLIDDRTKNGAGKFQGEHVHFGTEQFANKRSLKNDREK >NZ_CP007471|1237266:1243944|1237609_1238095_+|WP_005688175.1|DBSCAN-SWA MKVYKLFLIATASLFLFACSSFQNDDYAMNYKGQIGDPIMAIAMLSEQQHEWAGTPYVLGGVSRRGVDCSGFVQKTFFDRFNLRLPRSTVEQANYGKHVRKEDIQTGDLIFFKTGRGPNGYHVGIYVKEDKFLHASTRGGVVYSSMNNPYWSKAFWQVRRI |
9 | Sodalis_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1315054 : 1327027
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007471|1315054:1327027|DBSCAN-SWA AATGACACAAAAATTCGAAATGGCAGACCGTTTTAATCCGTCTGCGGTAGAACAAGCCCTTTATCAACATTGGGAAGAGAGCGGTTATTTTAAACCGTCTGAAAATGAAAATGCGCCGAGCTATTGCATTGCAATTCCGCCGCCGAACGTAACAGGTTCTTTACATATGGGACACGCATTCCAACAAACCTTAATGGATACCTTAATCCGTTTTAACCGTATGGAAGGGCATAACACCTTATGGCAAGCGGGGACAGACCACGCAGGTATTGCAACCCAAATGGTGGTGGAACGTAAAATTGCGGCTGAAGAAGGCAAAACTCGCCACGATTATGGTCGTGAAGCGTTCATCAACAAAATTTGGGATTGGAAAGCTTATTCAGGTGGCACAATCAGCCAACAAATGCGCCGTTTAGGGAACTCAATCGACTGGGAACGTGAGCGTTTCACCATGGACGATGGTTTATCGAATGCAGTAAAAGAAGTGTTTGTTCGTTTGCACGAAGAAGGTTTGATTTACCGTGGCAAACGCTTAGTAAACTGGGATCCAAAACTTCACACCGCGATTTCTGATTTAGAAGTGGAAAATAAAGAGAGCAAAGGTTCTCTTTGGCATTTCCGTTATCCGTTAGCAAATGGTGCAAAAACGGCAGATGGTAAAGATTATTTAGTGGTGGCAACTACACGTCCAGAAACTATGTTGGGCGATACAGCGGTGGCGGTGCATCCTGAAGATGAACGCTACAAAGATTTGCAAGGTAAGACGGTAATTCTACCGCTTGCAAACCGTGAAATTCCGATTATTGCGGATGAATATGTGGATCGTGAATTCGGTACAGGTGTCGTGAAAATCACCCCAGCACACGATTTCAACGACTACGAAGTGGGTAAACGTCATAACTTACCAATGGTAAATGTATTGACGCTGAACGCAAATATTCGTGATGAAGCGGAAATTATCGGTACTGACGGCAAACCACTTGCTGGCTATGAAGCGACAATTCCTGCGGATTACCGTGGCTTAGAACGTTTTGCTGCGCGTAAGAAAATTGTCGCAGATTTTGAAGCACTGGGTTTATTAGACGAAATTAAACCACACGATTTGAAAGTGCCTTATGGCGACCGTGGCGGTGTGCCAATCGAGCCGATGCTAACCGACCAATGGTATGTGAGCGTGAAGCCGCTTGCTGATGTGGCAATTAAAGCGGTGGAAGATGGCGAAATCCAATTCGTGCCGAAACAATACGAAAACCTTTACTTCTCTTGGATGCGTGATATTCAAGATTGGTGTATTTCTCGCCAACTTTGGTGGGGACACCGTATTCCAGCGTGGTATGACGCGGAAGGCAATGTTTATGTCGCACGTAACGAAGAAGAAGTGCGGTCAAAATATAACTTAGATTCTGCGGTTGAACTCAAACAAGATGAAGACGTATTAGACACGTGGTTCTCATCAGGTTTATGGACGTTCTCTACTTTAGGTTGGCCAGAGCAAACTAAAGAGCTCAAAATGTTCCACCCAACGGATGTGTTAATCACTGGTTTTGACATCATCTTCTTCTGGGTTGCACGTATGATTATGTTTACGATGCACTTCGTAAAAGATGAAAACGGCAAACCCCAAGTACCATTCAAAACGGTGTATGTAACAGGCTTGATCCGTGATGAACAAGGTCAAAAAATGTCGAAATCAAAAGGTAACGTGCTTGATCCAATCGATATGATTGACGGTATCAGCCTTGAAGATTTACTTGAAAAACGCACTGGTAACATGATGCAGCCGCAATTAGCAGAGAAAATTGCAAAAGCGACCCGTAAAGAGTTTGCTGAGGGTATTGCCGCTCACGGCACAGACGCATTGCGTTTCACATTAGCTGCGTTAGCTTCAAACGGTCGTGACATCAACTGGGATATGAAACGTTTAGAAGGTTACCGTAACTTCTGTAATAAATTATGGAATGCAAGCCGTTTCGTCTTAACGAATGACAAATTAGATTTAAGTCAAGGCGAAATTGAATTCTCATTAGCGGATCGTTGGATTCAATCTGAATTCAATCGCACAGTGGAAACTTTCCGTAGCTCATTAAGCCAATATCGTTTCGACCTTTGTGCCAATGCGATTTATGAGTTTACTTGGAACCAATTCTGTGACTGGTATTTAGAATTGACTAAACCAGTATTTGCCAACGGCAACGCAGCACAAATCCGTGCGGCAAGCCAAACCTTGGTTCACGTGTTAGAAAAATTATTACGTTTAGCGCATCCGCTTATTCCATTTATTACCGAAGAAATTTGGCAAAAAGTGAAAGGATTTGTCGGCATTACGGCTGACAGCATTATGCTGCAACCTTTCCCACAAGTGGAAGAGAACGGCTTTGATCTAGAGGCAGAAGCTGAAATTGAGTGGTTAAAAGAAGTGATTGTTGCGGTACGTAATATTCGTGCAGAAAGCAACATCGCACCAAGCAAAGGTTTAGATCTGTTATTCCGTAATTTAAGTGCAGAAAATGCAAAAATTCTCGAAAAACAGACCGCTCTTTTAAAAGCCATGGCGAAATTAGACAACGTTCAAGTGTTAGCCGCAAACGAAACAGCACCACTTGCCGTAGCGAAATTAGTCGGCAATGCTGAATTGCTTGTGCCAATGGCTGGATTTATCAATAAAGAAGCAGAGCTTGCCCGTTTAACTAAAGAGATTGAAAAATATCAAAACGAAGTGAAACGTATCGAAAACAAACTTAGCAATGAAGCTTTCGTGGCTAAAGCACCTGAAGCAGTGATTGCGAAAGAACGTGAAAAACAAGCAGAATACCAATCTGGATTAGAAAAAATCCAAGAGCAGTATAAGGCGATTGAGGCGTTGTAACAAAACATAAAAAGTAGGCATTATGCCTACTTTTTATTTTTGATTTAGTCCTAAAAAATCTCCAACTTCATGTTCGAGTTGGCTCATTGTGATCAGAGCCTCTTGGGTTTTCTTAGCTTCATCTTCATCAATAACACTCATTGCAAAGCCCACACGAACAAGCACCCATTTGCCAAGTAAATCGGCTGGATTTCCCGTGCAGACTAGTGAAATATTTACTTCACGTTGTACGCCACATACATCTACTGTGGCAAGTTGAAGAGAATTTTCATCAATTTTGACAATTTGACCGGAACGCCTAAACACATAATATTTTTACTCCTATTAGTATTTAAGCTGAAATTTAGTGATTTCTATGTTATTAAAATTAATAAATATTATTAAAAACTAACCGCACTTTTTCTTGATCTTTGACGCCCGCAGAACTTTCCACCCCAGAATTAAGATCTAAACCTAAGCAACCTTGCGCAATGGCTTGTTCCACATTATTTGGTGAGATACCTCCAGCTAAAATAATCTTGTGTTTAAGATTTTCAGGAATTAATGACCAATCAAAGGTTTTACCCGTGCCACCTTGTTGGTTCGCTGTTTGGCTATCAAAAATATAACGATCCACATTCAAATCATCTGTAAAATCGACCGCACTTTGGGCTTCAGTATTGACCGAAATCGCTTTCCAGATTTGCGTGTTTTTTGGTAGTTGCTGGCGAAGTGCAGTAATAAATGCTTCAGTTTCTGCACCATGTAATTGCACCGCATAAAGCTGCAACTGGCTGGCTATTTTGACGATAAAGTCAATTTCTTGATTCTGAAAAACACCAACAAATCGAAGTGGTGCAACGGTTACTAATTCTTGCGCTTGGCGTAAACTCACACAACGTTTTGAATGTTCTACGAAGATTAATCCGCCGTAAAGTGCCCCGTTTTCGTAAACGATTTTGACATCTTGCGCGCGCGTTAAACCGCATACTTTATTTTCTCCAAAAATCACTGAGCGAACCGCATTATTCAAATCTTGGTTGCCCATTAAGCTACTCCCAATTAAGAAACCATGCGCCACCTTTTGTAATTGATGAATTTGCTTGTGATTGTAAATGCCTGATTCGCTAATAATACGTACATCAGCAGGAATACAGTCGGCGTATTTTTCAGTGAGTTCAACAACACGATTTAAATCCACAGTTAAATCGTGCAAGTTACGATTATTGACACCAATAATTTTCGCACCAAGCGCAAGGGCGCGTTCAAATTCTTCTTCATTACTGGTTTCTGTCAATACGCCCATGCCAAGAGAATGCGCAAGCTCTGCCAGCACACGATAAGTCTCATCGTTTACCACAGAAAGCATTAATAAAATCGCATCCGCTTGATAGTAGCGAGCAAGGTAAACTTGATATTCGCTAATCATAAAATCTTTGCAAAGCACAGGTTGGCTCACGATACCGCGAACTAACGGCAAGAACTCAAAATTGCCTTGGAAGTATTTTTCATCTGTCAGAACAGATACAGCGGACGCATAATGTTTATAGACATTGGCGATTTCCTCCAAATTAAATTCAGCACGAATTAATCCCTTAGAAGGAGAGGCTTTTTTACATTCCAAAATGTAAGCGGGCTTTTGATGCGTACCTTTTGCTAACGCATCATAAAAAGAGCGGTCAGAGTTTTGAATGTTTTGTTTAAATTGTGAAAGGGGAAATTCCTTTTCTTTTGCTTTAACCCATTGTGCTTTATCAAGCACGATTTTTTGTAGCACCGTAGCGGAATCAATGGGTTTGGTAAAATCTTGAGTGATCATCATTTTTCTTCTTATTGTGGTGTATCAAATTAGCTTTTTATTAATATGTGGTTAATTTCTGTAATGTTTCAAAGGCTTTACCTGATACAAGATGTGCCAGTACATTTTGCACATTTTGTTTTAAATCATCGTAACCGAATAATTTCAATAATAATGCCGTATTTGCAGCCACCGCATTAGCATGTTCAGCTTTTCCTTTACCTTGTAAAAGTGCGGTCAGATATTGGGTATTTTCTTGTGGTTCACCACCGCGAAGACTTTCGAGGGATTGCGTTTTTAAGCCAAAATCTTCAGGCGTTAAAGTGAAATATTCAATTTTGCCATTTTTAATTTCTG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AATCCTTTACCATCTTCGCCAACAAGATTAAATCTATCAATAATTCCACTAAATAATTTTTCTTCTTCATGCTGTTCTGCTACATACCACTGCAGGAAGTTAAAAGTAGAGTAGTCTTTGCTTTCAAAAGTAACTTCAACTAATTCATTGATTTTTGACGTGACTAATTTTTCATGTTCTAAAGTTATTTCAAAAACTTCTCTTAATGAAGAATAATCATGTTTAGGAGCATCAATTTTTCCTAAAATAGGCATACCACTAGTTTCACTTACATAATTAAACAGTTTTTGCATATGTTCTAATTCTTCATCAGCATGACGAAGTAAGAAGGTAGCAGCCCCCTCATAACCGTGTTTTGAACACCATGCACTCATTTGTAAATAAACATTAGAAGAGTAGAACTCTAAGTTAATTTGGTCGTTCAGCTTGTTTATGATTATTTGATTAAGCATAACTAATTCCTTTCCATTTTGATTGATAAAATGCAATAAAGCGTAATTTGCGGCAATCATTTTAAATTCACAAATGATAATTGCAAGTTTTTTTATCAAAAATTTTGATATAACTAATTAATTTTAAAAAGAAAAATAAAAAACAATTATTATCATTTACATAATTCTATAAATTAAATATGACGTTGTCACAATAAAACTAACAAATTTTAAATTAGTATTAGATATGTCTTTACTTTCCTCCTTAGATTTGGATGAAAATTTAGATTATCGAGTAAACATGAAAACTTACCAACTTTTATTAAACCTAAAGATCGTTATCAATTAATTGACAAATGTAATATCATTCTGCTAGAAAAACACGGTCAAATTTACCTGTACTTTTCTTATAACTACTTTCTTTTGATTATCCATTTAAAATTTTTCATATTGTCATCAAACTGTCACAATTATTTTCTACACTTCGCTACGCAATCTAAATAACACTCAAGGAGAATTTGTTATGTTTATGCATAAAATGAAAAAAAATCTTATTATCGTTTTAACCTTAGGTACGTTACCTTTTGCTCAAGCTAATAGCATCACTGGTGCTGGAGCGTCTTTCCCTTATCCAATTTATGCGAAGTGGGCATCTTTATATGAGAAAGAAACTGGGAATAAAGTTAATTATCAATCCATCGGTTCGGGCGGCGGACAACAGCAAATTATTGCAAAAACGGTTGATTTTGGTGCCTCTGACGATCCAATGAAATCCGAATTATTACAACAACACCAACTAGTCCAATTCCCTGCGGTTATCGGTGGTATAGTGCCTGTTGTTAATTTGCCTGAAATTAAACCTGGTAAATTAAAGTTATCAGGTAAGCTGTTAGCAGAAATCTTCCTTGGTAAGATTAAAAAATGGAACGATCCTGACTTAGTTGCATTAAATCCAACGCTTCCTTTACCAAATAAAAACATTATTGTGATTCATCGTTCAGACGGCTCTGGAACAACATTTGGCTTCACTAATTATCTATCTAAAGTTTCGAACGATTGGAAAAATCAAGTTGGTGAAGGTAAATCAGTGAAGTGGTTAACAGGTCAAGGTGGAAAGGGGAATGAGGGAGTTGCTTCTTATGTTCGCCAAATGAAATACAGCATTGGTTATGTAGAGTATGCCTATGCCAAACAAAATCAGCTTGCTTGGATTTCATTACAAAATCAAGCAGGGCAATTTGTACAGCCTTCTAATGAAAGTTTCATGGCAGCTGCAAGTCACGCAAAATGGCACGAAAAGGCAGGAATGGGTGTTATATTAACCAATGAAACGGGGGAAAAATCTTGGCCAATTACGGCGGCGAGTTTTATTTTATTAAATAAATATTCTGACAATCCTGAAACAACTAAAAATGTATTAGCCTTTTTTGATTGGGCATTCTCAAGAGGGCAAGATGCGGCAACTGAATTAGATTATGTGCCAATTCCAGCTGATGTGGTGTCTACCATTAAAAGTCAATGGAAAACAGAGCTAAAACAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007471|1315054:1327027|1321840_1323397_-|WP_005687196.1|DBSCAN-SWA MNIQTQAFIAVTAQSIPYYADTTAIFNTLCQPNSNSLLLDSAEIGSKNSLQSLILVNAAVKITCLGHNVTFKALNKNGKQVLKEIHPKLTALGKISAVNFEDEFSVQFSPLDNQLDEDNKLQSATIFDGLRVVSTLYQHSQTPIFLGGLFAYDLVANFIPMDGITLKNDGINCPDYSFYLAEHLITIDHQNQQATLKSFCFAQEEQVNIAKTSLSIAQKLKNIDHVLSIKSASDEVKTNFDDPEFTGIVKALKHHINIGDVFQIVPSRRFSLACPNTLASYAQLKQNNPSPYMFYMNDEDFILFGASPESALKYAPENRQLEIYPIAGSRPRGFDAHGNIDPELDARLELELRLDHKEQAEHLMLVDLARNDIARVCQNGTRKVAELMQVDRYSHIMHLVSRVVGKLRPELDALHAYQACMNMGTLTGAPKIKAMQLIYQFEQQKRHSYGGAVGYLTSDGHFDTCIVIRSAFVQNGIAHVQAGCGEVLDSDPQMEADETRHKAAAVLKAIRQVNTQAK >NZ_CP007471|1315054:1327027|1321246_1321828_-|WP_044345677.1|DBSCAN-SWA MANILFLDNFDSFTYNLVDQFRVLGHNVTIYRNDCDLEKLVETALNTLDTILALSPGPGTPSEAGILLPLIERLKNKVPIIGICLGHQALIQTFGGKVVHAGEVLHGKVSRISHDNEAMFKDLANPMPVARYHSLMGQDLPKEFIVNAEYNGIIMAIRHRDLPICAFQFHPESILTVQGSQLLQQSIEWLLNR >NZ_CP007471|1315054:1327027|1323502_1324267_-|WP_044345679.1|DBSCAN-SWA MAIKSVQNQTYPCKHYVFVDGNIFWDKAKSILEQFPDVIPIYLPMNTGKNGILNGAINAAATFLVEEDIICYLDDDNQLREDHVESLVNVIEQGADFAYSLRSFYDSNHQFICNDDFDSLGNWNTKSDIFVDVKIEDIQKQIHFTFNEVNGHIDTNCYAVPREIAQKTSYSWNTPLIGDRSFLSVLKSLGLIGQTSGKYTVKYRADFNKLIAVRRVFPQLSLSDEDNNNLSAQILEVINQQNIEYYGGRPWAKE >NZ_CP007471|1315054:1327027|1324499_1324997_-|WP_005650592.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEIIETTYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSILDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >NZ_CP007471|1315054:1327027|1325016_1325505_-|WP_005650594.1|DBSCAN-SWA MLNQIIINKLNDQINLEFYSSNVYLQMSAWCSKHGYEGAATFLLRHADEELEHMQKLFNYVSETSGMPILGKIDAPKHDYSSLREVFEITLEHEKLVTSKINELVEVTFESKDYSTFNFLQWYVAEQHEEEKLFSGIIDRFNLVGEDGKGLFFIDRELATLE >NZ_CP007471|1315054:1327027|1319757_1320759_-|WP_042594026.1|DBSCAN-SWA MQHNQLLEQLYSGHSLSTSESTALFNAVIQGELSNEQIAAMLIALKVRGANTEEITGAVAASLQNAKVFPRPDYPFADIVGTGGDGQNTINISTASAIVAASMGAKVAKHGNRSVSSKSGASDVLTALGVNVNVTPEQARQALDEIGVCFLFAQQYHSGFRHVAPVRAALKTHTIFNILGPLINPARPTYHLLGVYAPELVKTYAETAVALEHQHSFVVHGSGLDEVALHGETQVAEIKNGKIEYFTLTPEDFGLKTQSLESLRGGEPQENTQYLTALLQGKGKAEHANAVAANTALLLKLFGYDDLKQNVQNVLAHLVSGKAFETLQKLTTY >NZ_CP007471|1315054:1327027|1315054_1317919_+|WP_044330129.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTQKFEMADRFNPSAVEQALYQHWEESGYFKPSENENAPSYCIAIPPPNVTGSLHMGHAFQQTLMDTLIRFNRMEGHNTLWQAGTDHAGIATQMVVERKIAAEEGKTRHDYGREAFINKIWDWKAYSGGTISQQMRRLGNSIDWERERFTMDDGLSNAVKEVFVRLHEEGLIYRGKRLVNWDPKLHTAISDLEVENKESKGSLWHFRYPLANGAKTADGKDYLVVATTRPETMLGDTAVAVHPEDERYKDLQGKTVILPLANREIPIIADEYVDREFGTGVVKITPAHDFNDYEVGKRHNLPMVNVLTLNANIRDEAEIIGTDGKPLAGYEATIPADYRGLERFAARKKIVADFEALGLLDEIKPHDLKVPYGDRGGVPIEPMLTDQWYVSVKPLADVAIKAVEDGEIQFVPKQYENLYFSWMRDIQDWCISRQLWWGHRIPAWYDAEGNVYVARNEEEVRSKYNLDSAVELKQDEDVLDTWFSSGLWTFSTLGWPEQTKELKMFHPTDVLITGFDIIFFWVARMIMFTMHFVKDENGKPQVPFKTVYVTGLIRDEQGQKMSKSKGNVLDPIDMIDGISLEDLLEKRTGNMMQPQLAEKIAKATRKEFAEGIAAHGTDALRFTLAALASNGRDINWDMKRLEGYRNFCNKLWNASRFVLTNDKLDLSQGEIEFSLADRWIQSEFNRTVETFRSSLSQYRFDLCANAIYEFTWNQFCDWYLELTKPVFANGNAAQIRAASQTLVHVLEKLLRLAHPLIPFITEEIWQKVKGFVGITADSIMLQPFPQVEENGFDLEAEAEIEWLKEVIVAVRNIRAESNIAPSKGLDLLFRNLSAENAKILEKQTALLKAMAKLDNVQVLAANETAPLAVAKLVGNAELLVPMAGFINKEAELARLTKEIEKYQNEVKRIENKLSNEAFVAKAPEAVIAKEREKQAEYQSGLEKIQEQYKAIEAL >NZ_CP007471|1315054:1327027|1326022_1327027_+|WP_074031221.1|DBSCAN-SWA MKKNLIIVLTLGTLPFAQANSITGAGASFPYPIYAKWASLYEKETGNKVNYQSIGSGGGQQQIIAKTVDFGASDDPMKSELLQQHQLVQFPAVIGGIVPVVNLPEIKPGKLKLSGKLLAEIFLGKIKKWNDPDLVALNPTLPLPNKNIIVIHRSDGSGTTFGFTNYLSKVSNDWKNQVGEGKSVKWLTGQGGKGNEGVASYVRQMKYSIGYVEYAYAKQNQLAWISLQNQAGQFVQPSNESFMAAASHAKWHEKAGMGVILTNETGEKSWPITAASFILLNKYSDNPETTKNVLAFFDWAFSRGQDAATELDYVPIPADVVSTIKSQWKTELKQ >NZ_CP007471|1315054:1327027|1318286_1319720_-|WP_080317233.1|DBSCAN-SWA MMITQDFTKPIDSATVLQKIVLDKAQWVKAKEKEFPLSQFKQNIQNSDRSFYDALAKGTHQKPAYILECKKASPSKGLIRAEFNLEEIANVYKHYASAVSVLTDEKYFQGNFEFLPLVRGIVSQPVLCKDFMISEYQVYLARYYQADAILLMLSVVNDETYRVLAELAHSLGMGVLTETSNEEEFERALALGAKIIGVNNRNLHDLTVDLNRVVELTEKYADCIPADVRIISESGIYNHKQIHQLQKVAHGFLIGSSLMGNQDLNNAVRSVIFGENKVCGLTRAQDVKIVYENGALYGGLIFVEHSKRCVSLRQAQELVTVAPLRFVGVFQNQEIDFIVKIASQLQLYAVQLHGAETEAFITALRQQLPKNTQIWKAISVNTEAQSAVDFTDDLNVDRYIFDSQTANQQGGTGKTFDWSLIPENLKHKIILAGGISPNNVEQAIAQGCLGLDLNSGVESSAGVKDQEKVRLVFNNIY >NZ_CP007471|1315054:1327027|1317952_1318225_-|WP_005659477.1|DBSCAN-SWA MFRRSGQIVKIDENSLQLATVDVCGVQREVNISLVCTGNPADLLGKWVLVRVGFAMSVIDEDEAKKTQEALITMSQLEHEVGDFLGLNQK >NZ_CP007471|1315054:1327027|1320811_1321198_-|WP_005662273.1|DBSCAN-SWA MITVFGLKSKLAPRREQLAEVIYNSLHLGLDIPKGKHAIRFLCLEKEDFYYPFDRSDDYTVIEINLMAGRMEGTKKRLIKMLFSELEYKLGIRAHDVEITIKEQPAHCWGFRGMTGDEARDLDYDIYV |
11 | Acinetobacter_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1604082 : 1612600
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007471|1604082:1612600|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007471|1604082:1612600|1605184_1605820_+|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >NZ_CP007471|1604082:1612600|1604082_1604766_+|WP_005686508.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARAIVQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLNYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >NZ_CP007471|1604082:1612600|1606435_1608619_+|WP_074032815.1|DBSCAN-SWA MMDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLFGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQRRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYSAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDDAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLATLEKVR >NZ_CP007471|1604082:1612600|1604758_1605184_+|WP_044345781.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYESGAKKAMVIDFSDLKSIVKKIILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE >NZ_CP007471|1604082:1612600|1608738_1609710_+|WP_074032816.1|DBSCAN-SWA MVIPTFIAITFITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFRYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLNNEFWIDTPTGFMLIDSWISGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIVVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >NZ_CP007471|1604082:1612600|1606218_1606452_+|WP_005647470.1|DBSCAN-SWA MRGKRIKSLFINSIKIAFKAYNFDVEFKDIGESRLILFLKCSTLLLIYSQILLFHKIDGTIITVNLNRLKIVYDGYF >NZ_CP007471|1604082:1612600|1611616_1612600_+|WP_005686497.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEQPTEGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQHTDGKLIACFHID >NZ_CP007471|1604082:1612600|1609724_1610612_+|WP_005686499.1|DBSCAN-SWA MSDTPSTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYDGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFVIVLLSCAFGTSLGLVSGYYGGMLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAVMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >NZ_CP007471|1604082:1612600|1610621_1611614_+|WP_005686498.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTNLLTLDNKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKRARKDRTLELLRLVGIPDPESRMNVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAADRIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLASLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1640625 : 1717963
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP007471|1640625:1717963|DBSCAN-SWA 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87 | Haemophilus_phage(48.89%) | integrase,plate,head,protease,tail,terminase,transposase | attL 1684285:1684306|attR 1729037:1729058 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1780268 : 1789336
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP007471|1780268:1789336|DBSCAN-SWA TATGTTTAACAAAATTTTTTCGTGGTTTGAAAACCGTTTAAATCCCTATCCAGAAAGCAGTCCAACAACACCTAAAAAAGGTTTGTTCCGTTTTATTTGGTCTAGTATTGCAGGAATGAAAGGTTGGATTCTTTTGCTCGCAATTTTAACCGTCGGTACAGGTGTAATGGAAGCAGTATTATTCCAATTTATGGGGACACTTATAGATTGGTTAGGCACATTTACGCCTGAAAAATTATGGCAAGAAAAAGGTCATTTATTAATTGGAATGGCAGCCCTATTACTTATTAGCATCGTTTGGGGATTTTTAGCTTCAACCGTGCATTTACAAACCTTACAAGGCGTATTTCCAATGCGATTACGTTGGAATTTTCATCGTTTAATGCTTGGACAAAGTTTAAGTTTTTATCAAGACGAATTTGCAGGTAGAGTATCCGCAAAAGTAATGCAAACCGCCCTTGCAGTACGTGACACAGTACTTACACTTGCGGATATGTTTGTATATGTCATCGTATATTTTATTACATCAGGATTAGTTCTCGCAGCATTAGATTCTTGGTTCTTACTGCCATTTATTGCTTGGATTATACTCTTCGGTTTGATCCTACGAATCCTCATTCCTAAACTATCAAAAACCGCACAACGACAAGCTGATGCTCGTTCTTTAATGACGGGACGCATTACAGATGCTTATTCCAATATTGCTACAGTAAAATTATTTTCTCACGGCTCACGCGAAGCTACTTATGCCAAGCGTTCAATGCAAGATTTTATGGTAACAGTACACGCCCAAATGCGTTTGGCAACATCACTAAATTCTCTCACTTACGCTACAAATATTCTACTTACATTAAGCACCGCAATACTTGGCATTATTTTATGGAAAAATGGTCAAGTTGGCGTGGGGGCAATAGCGACTGCAACTGCAATGGCATTACGCGTAAACGGGCTTTCTAGTCGGCTTATGTGGGAATCTGCCCGATTGTTTGAGAATATCGGCACCGTAAACGACGGAATGAATACTTTAACTAAACCTCACACCATTGTAGATAAACCACAAGCATCGCCGTTACAAGTGAAACAAGGGGAAATTAAGTTTAACGATATTACCTTTGCTTATGATCCAACAAAACCATTACTTAATCATTTCAATCTCACTATCAAACCAGGGGAAAAGGTTGGGTTAATCGGTCGTTCTGGTGCAGGAAAATCTACGATTGTGAACTTATTGCTGCGTTTCTATGAAGCACAACAAGGCGAAATTACCATTGATGGACAAAATGTACTCAATGTGCAACAAGAAAGCTTACGTCGCCAAATCGGTTTAGTTACTCAAGACACTTCTCTGCTACATCGCTCTGTTCGTGACAATATTATTTATGGACGCCCTAATGCCACAGATGAAGAAATGGTTTTAGCTGCTGAACGAGCGGAAGCCGCTGATTTCATTCCATTCCTCACTGATGCTCAAGGTAGAAAAGGCTATGATGCTCATGTTGGAGAACGCGGGGTAAAACTTTCTGGTGGTCAGCGTCAGCGTATTGCTATTGCTCGTGTCATGTTAAAAGACGCACCAATTCTATTGTTAGATGAAGCCACAAGTGCATTGGATTCAGAAGTGGAAGTCGCGATACAAGAAAGTCTCGATAAGATGATGGAAAATAAAACTGTGATTGCCATTGCCCATCGTTTATCCACCATCGCAGCGATGGATCGCCTGATTGTGCTTGATAAAGGACAAATTGTCGAACAAGGTACGCACGCCGAATTACTAGAGCTCAATGGTCTGTACGCTAAACTTTGGAATCATCAAAGTGGCGGATTTTTAAACGAAAGTGCTGAATAATATTGCGTTTATCATATTTAATTAATTGCACTGTAATCAAACTAATTAAAAAATTAGTCTAATTTAATAGCTAAAGAAAAGTGCGGTAAATTTTACCGCACTTTTTTTGCTAGATATGTAGCATTTAATTCACGACTTCAGCAGTATATTTCAGCTTGTGAATCGCATCGAATAATTGTTGGTTTGTAACTTTGGGATCTTCCACAACTGTCACTAAACCATCTTTAATAGATGCTTTTGTTGAAATAACGCCATCGATATTACGCAATTCTTTATTAACCAAATAAGCGCAAAGCTGGCAATTCATTTCTTTTACTTTTAGCACAATTTGTTTGGTTTCATTCGCATGGGCGAAAGAAACGGCAAACAGCGAAAGCAAAAGTGCGGTAGATAATTTCTTCATTTTTATTCCTAATTCGCTAATTCTAAAATCCAAGGCAAAATTGTTGGATAGGTTAAGAAAAAAATCATCACGATAAATACAATCCAATAAAGTACGACAAGTTTTTTACGGGAAATATATTTGCTACAAATGATTTTTTTGGAAAACATCAACAGCCAAAATCCATAGGCAAAGGCACATAATGAAACGATAAGCATAGGAATACGCAAATAATCATATTCGCCCAAGCCAATCAACCATGTGGATGACACGCCAAATACTAAATAGATTAAAGGCGCAATACAGCACAACGTTGATGCCACCGCGGCACTAAGTGCGGTGGCTATGGCAACCCAAAAGGATTTATTAGAGTTTTTTAGAGATGTAGTCATATTTAAATTCTTTTGGATCAAAGGAATTTAACGGATCGCCACCCACTTCAGCATACGGATAGCCGAAGTTATTGATTGGAGCAAGTTCTGGTTGAGGATATAAATCGAAATCACGGGCATGATTAAATCCCACCCAGTTTGCTTCCCAGTTACCAAACAAATATTTTGCTACAGCTTGTGTATCTTTATCTTCAACAGATTTTTTCTCTGCTAAACGCATTTTAGCCACGTCTGCGGAATCAACTGGTACCCATCCAAATCCTGCAAGGTAGAATTCAGCACGGCAGTGTTGGCCACCACTTACGTTTGCGATGCCTTGTTCATTCGCACTACCAAAAGCACCTTTGGAATATTTACCCATTTTCTCTGCCGCCCCTAAGCGAATACCAAAAATTTCACGAGCTGGGATGCCTGACGCACGAGCAAGTGCCACAAATACAGAGTTAATATCGGTACATTTACCTTTTAATACGCCAGTGGTAAGAATTTTTTCGACATCGCCGTCACCACAACCTAATACAGAATTATCACGTTCCATATTTTTTACGATCCACTGATGAATAAGTTCTGCTTTCTTAAAAGGATTAGTTTCTTTACCTACGATTTTGTCAGCAAATTCTTTCACTATGCCATCAGTTTTAATATGTGGAGTCGCTTTTAAGTATTCTTGTACATCCACGGAATACTGAATATCTTTTGGCGGAGCATAATTCTCTAAAGCGCCTTTCACCATTGGCTCACGGTCTTTTGTTTCAATGACCATAGTAACTTTTAAATCACGCTTTTGTGCATCTTTATCCCAAGTGGCAAATAAGGTTTTCGCACCGTATTTATTGTTTTCTGTTACATAGGCATTCATGTAATTACCTTCAAAGTGAATCGATTTCACTTGTTGGTATTCCCCATTAAATGGCAATGGAACCCATAAATTGGTTTGTCCTTGCGAGCCTTTTGGCACAACTAAATCGTAGGTTTGCGTGAATTCGTAAAGATGGGTGTCTGTATTGTAGTTTGGAATATTGGTGTTTGCATGAGCTAACGAGCCACACGCAGAAAGCACCGCAACTGCGATAAGTTTCTTCATGAAGAGATCCTCTAGTTAATAATAGTTAAACTTAACATATTAGATAAACTAATACGCCACTATGCTAACGGATTTTTAAATCAATAGTCAATTTGTTATTCCAAAATTTATTAAAACATCAACCTACTAAAATATCCTATAAATAATATACCTATTAATGATTAATTGATTTGGCTCAAGTAAAATTTCTATACAAAGATTATAATTAACTCGTTTTAGTTATTACTCAATCTTACTGTGGGGGACGATATTATGAGTAATTTTAATCAACTAAGTCGCCGAGATTTTGTCAAGGCGTCATCTGCGGGGGCTGTACTGGCAGTTTCAGATCTTACTTTACCTTTCAATGTAATGGCTAAAGAGACACAACACCTCAATGAAAATAGTCAGGAACGTATTGTTTGGAGTGCTTGTACAGTAAACTGTGGTAGCCGTTGTCCATTACGAATGCACGTAAAAGATAACCGAATCACTTATGTGGAAACCGATAATACGGGGACAGAAACATATAATCTTGATCATCAGGTTCGTGCTTGTCTACGTGGACGTTCTATGCGTCGTCGAGTGTATAACCCAGACCGTTTAAAATATCCAATGAAACGTATAGGTAAACGCGGAGAAGGCAAATTCAAACGAATCAGTTGGGATGAGGCTTTAACTGAAATTGCAGACGCATTGAAACGCAATATCGAAAAATATGGTAATGAATCAATTTATTTAAACTATGGTACGGGAACACTCGGTGGCACAATGGCTAAATCTTGGCCACCTGCATCCACTATGATTGCTCGTTTTATGAATTGTATTGGTGGATATTTAAACCATTATGGTGATTACAGCACCGCACAAATTGCAGTCGGTTTAGATTATACCTATGGTGGTGGTTGGGCATTGGGAAATGGAATGGCTGATATTGAAAACACCAAATTAATAGTGTTATTCGGTAATAATCCTGCAGAAACTCGTATGAGTGGAGGTGGTTTAACTTATTGTATTGAACAAGCCAAAGCTCGTTCCAATGCCAAAATGATTATTATCGATCCTCGTTATAATGATACTGGTGCAGGGCGTGAAGATGAGTGGATCCCAATTCGTCCAGGCACTGATGCAGCCCTCGTTTCAGCTCTTGCTTATGTAATGATTCAAGAAAATCTCGTGGATCAACCTTTCTTAGATAAATATTGTGTTGGTTATGATGAAAAAACATTACCCGCTGACGCCCCTAAAAATGGTCATTATAAAGCCTATATTTTAGGTTATGGTGATGATGGTATCGCTAAAACCCCTGAATGGGCGGCTAAAATCACGGGTATTCCAGCGGAGAGAATTATTAAACTCGCACGTGAAATTGGCAGCACAAAACCTGCCTTTATTTCCCAAGGTTGGGGGCCTCAACGTCGTAGTAATGGAGAATTAATCTCTCGTGCCATTGCGATGTTACCAATCTTAACGGGTAATGTTGGAATTCACGGTGGTAACACTGGTGCTCGTGAAAGTGCGTACAGCATTCCATTTGTGCGGATGCCTACGCTGAAAAATCCCGTGAAAGCAAGCATTCCAATGTTTTTATGGACAGATGCAATTATTCGTGGCACGGAAATGACCGCACTTACAGATGGTATTCGTGGTGTTGATAAATTATCGTCCCCAATTAAAGTAATTTGGAATTACGCAAGTAACTGCTTGATTAATCAACACGCACAAATCAATCGTACTCACGATATTTTACAAGATGATACCCAATGTGAAATGATCATTACTATTGATAATCATATGACATCTACTGCCAAATACAGTGATATTTTATTACCAGATTGTACAGCTTCAGAACAAATGGATTTCGCTTTAGATGCCTTTGTATCCAATATGGCATATGTCATTTTTGCAGATCAAGTGATCAAACCATCTTTTGAATGTAGACCTATTTACGATATGTTGAGTGATTTAGCTGAGAAAATGGGCGTAAAAGAAAAATTTACTGAAGGAAGAACACAAGAGGAATGGTTACGCCATATTTATGAGCAATCTCGAGAAAAATTACCTGAATTACCTACTTTTGAAGAATTTAGACAACAAGGTATTTTTAAAAAGGTTGATCCTAATGGCTTTAAAGTTGCATACAAAGATTTCCGTGATAATCCAGAAGCCCATCCACTTAAAACGCCATCTGGCAAAATTGAAATTTATTCTTCTCGTCTAGCTGAAATAGCAAAAACTTGGAAATTAGCAGAAGATGAAGTAATTCATCCTTTACCAATTCACGCCCAAAGTTTTGAACATTACGGTGATCCATTAATGGAAAAATATCCGTTACAACTAAGCGGTTTTCACTATAAAGCGAGAACCCATTCAACTTATGGCAATGTGGATGTATTAAAAGCAGCTAATCCACAAGAAGTTTGGATGAATCCTATTGATGCAGAACCTCGTAATATTAAAAATGGCGATATGATTCGTATCTTTAATGATCGAGGCGAAGTACGTATTAATGTAAAAATTACACCCCGTATTATTCCGGGGGTTGTGGCATTAAGCGAGGGGGCTTGGTATGCACCAGATAAAGATCGTATCGATCATTCAGGTTGCATTAATGTACTTACGACACAACGCCCATCACCGCTTGCGAAAGGTAATCCGCAACATTCTAATTTAGTTCAAGTGGAACGTTTGTAGGGGGATAATTATGGAACAATATGGTTTTTATTTTGATTCTGAACGCTGCACAGGCTGCAAAACTTGTGAATTAGCTTGTAAGGATTACAAAGATCTTGGCACAGAAGTCAATTTTCGTCGTATTTATGAATATACAGGTGGTCAGTGGAATCAACAAGCAGATGGATGCTGGCATCAAAATATATTTGCTTATTACATGTCTATTTCTTGTAATCATTGTGCAGATCCTGCTTGTACAAAAGTTTGCCCAACTGGTGCAATGCACAAAAATGCAGATGGTTTCGTGATCGTCAATGAAGAAATTTGTATCGGTTGTCGTTATTGCCATATGGCGTGTCCTTATGATGCACCACAATATGATGCACAAAAAGGTCATATGACAAAATGTGATGGATGTTATTCTCGCGTAAAATCAGGTCAAAAACCGATTTGTGTTGATGCCTGCCCACTACGTGCATTGGATTTCGCTCCTATTGATGAACTTCGAGCAAAATATGGCATACAAGCCTCCATCGCACCACTACCACCGGCTGATATCACTCAACCAAATTTAGTGGTAAAACCCAATAAACACGCTCGTTTAAGTGGCGATACAAGTGGGTTCTTAGGAAACCCAAGAGAGGTGTAAAATGAATACAGGATTATATGAACTGCCACTAGTATTTTTTACAGTTTTGGCACAAAGTGCGGTCGGTGCTTGGCTTGTTTTCACATTTGTACTATTAAATGAGAAAAATACAAAAAGTCGCACTTATATTCATAAAGTAATGCTTGTGATTTTGGCTTTGCTAGGTATTGGATTTATTGCTTCCATTATGCATCTTGGCTTACCTATACGTGCATTTAATTCACTTAATCGAGTCGGCTCATCAATGATGAGTAATGAAATTGCCGCTGGTGCAATATTTTTCGCATTAGCAGGTTTCTACTGGCTGATTGCAATTTTAGGTAAAATGCCGGTTTCACTTGGAAATGTATGGCGAATTGTGACCGCTCTTATCGGCATACTATTTATGTATGTAATGAATCAGGTTTACCATATTACAAGCATACCAACTTGGAATAATGCATTAACCTCTTGGTCATTCTATCTTACCGTTGTATTAGGTGGATTAACATTAAGCTATGCGTTATTAATCCCTAATAAACAACGTGAATATCAGCTTCAGCATCTGCCAAGTTTATTTGCCATTGGAGTATTATTGGTCGCAATAGTAGCCATATATCAAGGCTTCAATTTACACAATATTCACAGTGCTATTCAAAATGCCGCTGACCTCGTACCAAATTATGCCATAATGACCGTAACTCGCTTATGTTTACTTTCCATTGTAGCTTTCCTCTTATTCCGAGTGAAAAACATAGGACTATTAGGTATTTCCGTTCTATTAACGTTAGTAGCTGAAGGAATCGGTCGCGTATTATTTTATGGATTACATATGACTTATGGTATGGCGATTGGTGGTTAAATTATGTTGAGGCGTATAGCATACGCCTCAATTTTTAGAAACGTTAATTAGTAATATTTAACCAAACCTCATATCCCCATTCACTAATGACAAATTGTTTTCGGAGATACTATGCAAAATACTCTTCAACAAATTTCTATTTATGGGCGTTTACTCGGTGCAGTATTTTACTATGAGCCTAATGATGCACGACTTACTGATATTTTGACATTCTTTCGCCAACCAAATTGGATGCAAGAATGGGAAATTTCATTTGATGTAAAAACACATAAAAAAATCACCGCACTTATTGAAAAAGGGCTGCAACAAAATATCACTGAACAATATCAGTATTTATTTATTGGTCCAAATGAATTACCTACGCCACCTTGGGGATCCGTATATCTTGATCCTGAATGTGTTATTTTTGGTAATTCTCTCTTAGCATTACGCGATTTCTTACAACAACATCAAATCGCATTTCAAACGCAACAAGATGAACCAGAAGATCATATTGGCTTAATGCTAATGCTTGCTGCATATTTAGCAGAAAATCGACCGCACTTATTAATCGAATTTCTACGTGAACACTTCTTAACTTGGGCGTATCATTTCCTTGAACAACTAAGCAAAATAGAAAATTCTGATTTTTATCAAGCTCTTGCATTACTTACCATAAAAACTTTACAACAATGGCAAGTAGATTTACATATTAATGTACCGACAGTAAGATTTTATCGATAATGAAAAACGAAGCCTATTATCAGGCTTATTTAAGCCACCATCATATTTCTCGTAGAGGACTATTGCGTCATGTATTTCCAGCTACAAAATCAACAATAGAAAAAACGCAGTCTCGTCCTCCCTTTTCAGCACGAGAAGATTTATTTTCCGCCGTCTGCAATGGTTGTGGGGAATGCGCTTCAGCTTGCCCTAATGGTTTAATTCAACTAAAACAGCAACAAGCCACCCTTGAAATTGACTACGCACCTTGTGATTTGTGTGGTAAATGCGCAGAAGTTTGTCCGACAAATGCACTACATCCTAATTTTCCAGCAGATACATTACTTCGTCCACAATTTTCCTCAGCCTGTTTAATCCTACAAAATCAAACCTGTCCAGACTGCCAAACCGCTTGCCCACAACAAGCAATCTCCAGCACTTTAGAGATTGATAATGAACGTTGCAATGGGTGCGGAGAATGTAAAATTACCTGTTTTGTCGCAGCCATTACACTTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP007471|1780268:1789336|1782861_1783971_-|WP_044345896.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDTHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYAPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKIVGKETNPFKKAELIHQWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARASGIPAREIFGIRLGAAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYISKKL >NZ_CP007471|1780268:1789336|1780268_1782113_+|WP_044345895.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESSPTTPKKGLFRFIWSSIAGMKGWILLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLIDWLGTFTPEKLWQEKGHLLIGMAALLLISIVWGFLASTVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLADMFVYVIVYFITSGLVLAALDSWFLLPFIAWIILFGLILRILIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLNSLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSSRLMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNDITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLTDAQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLNESAE >NZ_CP007471|1780268:1789336|1782237_1782516_-|WP_012054520.1|DBSCAN-SWA MKKLSTALLLSLFAVSFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNIDGVISTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >NZ_CP007471|1780268:1789336|1786654_1787272_+|WP_042601957.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRAKYGIQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKHARLSGDTSGFLGNPREV >NZ_CP007471|1780268:1789336|1788224_1788836_+|WP_005686307.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLIEFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >NZ_CP007471|1780268:1789336|1782524_1782842_-|WP_105872514.1|DBSCAN-SWA MATALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIVSLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLVVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >NZ_CP007471|1780268:1789336|1787273_1788113_+|WP_005686309.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMLVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFALAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVLLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMAIGG >NZ_CP007471|1780268:1789336|1788835_1789336_+|WP_005656004.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >NZ_CP007471|1780268:1789336|1784223_1786644_+|WP_044345898.1|DBSCAN-SWA MSNFNQLSRRDFVKASSAGAVLAVSDLTLPFNVMAKETQHLNENSQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIEKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVSALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGDDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTASEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDEVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPRNIKNGDMIRIFNDRGEVRINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL |
9 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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