Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015484 | Acinetobacter baumannii strain ORAB01 plasmid pORAB01-1, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
NZ_CP015485 | Acinetobacter baumannii strain ORAB01 plasmid pORAB01-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP015483 | Acinetobacter baumannii strain ORAB01 chromosome 1, complete sequence | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 7 | 0 |
NZ_CP015486 | Acinetobacter baumannii strain ORAB01 plasmid pORAB01-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015483_1 | 2385064-2385149 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015483_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015483_1
>1.1|2385087|40|NZ_CP015483|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015483_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015483_1 >merge|NZ_CP015483|1|2385064-2385149|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP015483|1|1|2385064-2385149|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP015483.1|WP_000795915.1|2383826_2384063_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP015483.1|WP_001124846.1|2382932_2383544_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP015483.1|WP_000885229.1|2382250_2382862_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP015483.1|WP_000376215.1|2381638_2382094_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP015483.1|WP_001990047.1|2379933_2381580_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP015483.1|WP_000115408.1|2376303_2379768_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP015483.1|WP_000107128.1|2375347_2376307_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP015483.1|WP_001025680.1|2374919_2375204_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP015483.1|WP_002017921.1|2374696_2374810_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP015483.1|WP_000937460.1|2373972_2374608_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP015483.1|WP_000983628.1|2385780_2386194_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP015483.1|WP_000432330.1|2386335_2387214_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP015483.1|WP_001990041.1|2387270_2389415_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP015483.1|WP_001145693.1|2389469_2390879_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP015483.1|WP_000482091.1|2391194_2391674_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP015483.1|WP_000108365.1|2391958_2392180_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP015483.1|WP_000132044.1|2392285_2392603_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP015483.1|WP_000498477.1|2392687_2392909_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP015483.1|WP_001136759.1|2392996_2393425_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP015483.1|WP_000251637.1|2393694_2393838_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1154392 : 1225290
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015483|1154392:1225290|DBSCAN-SWA ATTAGTAGCTTTCTGGTACTGCACTTAAGAATTCACGGCGCGCTTCTTTATCGGTTTTAAAATCTCCGACAAATGAAACTGTACGGGTGGTAGATTCTTGTTTACCTACACCACGCATCATCATACACATATGTGCTGAATCGATGACTACAGCAACGCCACGAGCACCAGTCACTTCTGCAACAGCTTCAGCGATTTGCTGAGTAAGGTTTTCCTGAATTTGCAAACGACGAGCAAACATCTCGGTAATACGTGCAAATTTAGATAAGCCAAGAACTTTGCCTTCTGGTAAATAGGCAACATGAACACGGCCATAGAATGGGAGAAGATGGTGTTCGCAGAGCGAATAAAATTCAATATTCTTCACCAATACCATTTCATGGTTATCTGATGGGAAAACAGCATTATTGGTGACTTCTTCTAAAGTTTTACTATAGCCAGAAGTTAAATATGAAAAAGCTTTAGCCGCACGCACAGGCGTATCTTTAAGGCCGGGACGATTAAGGTCTTCACCGACGGCAGTCAGAATATTTGCGTACGATTGCTGCATTGACATAAGACGTATAAATTTACTCTATTAGACAAGCTCGGCATTGTATCAGAAACATGACCTGATGTTCATAAATCCTCGCACTATATTTATTTTGGTTTTTCCGTACGCTTGATAAAAGATGAATAAATTTCATGTTTTTTATCGTTAATAGTCAAGTGTTTGGACATGAAATGTGCGCTTAATATTGATAAGTTCTAAATGATCGCCTAATGGCATCATATTTGCACAGAAGCATTATTATAAAGCATAAGGATAAAACATGTTAGAACGTCCAATCACCTTCTTTTTCCGTGGTGGTCAGCAGCAAGTAGAAAATATAGTACCCACAATGACGGTTTTACAATTTCTGCGAGAATATACTCAAACTGGTAAGACTAGGCAGACTGGTACAAAAGAGGGATGTGCTGAGGGCGATTGTGGTGCATGTACAGTAGTGATTGGTGAATTGGTCAATGACAACCTGCAATTACGTAGTGTGAATGCGTGTATTCAGTTTTTACCAACTTTAGATGGTAAAGCCTTATTTACAGTAGAAGACCTTCATAGCTTATTGCCTGTACAAGATGGCACACTTCATCCTGTACAACAGGCGATGGTCGATATACATGGTTCACAATGCGGTTTTTGTACACCCGGTTTTATCATGTCGTTATGGTCAATGTATGAAAATGAACAACAGTCTCTAAGCAAAGATAAAATCAGTGATTATCTTTCTGGAAACTTATGTCGCTGTACAGGCTATCGCCCTATTTTAGATGCAGCACAAAAAGCTTATGACTATCCACGTGTGGTATTAGAACGTCAAAAAGTAATTGATGTATTAAAAGAGATCAGAACATTACCTGCATTGTATTTGAATGATCAAAAGCAGCAATTTTTTGCACCCAAGACTTTGCAGGATTTTGCTACTTTACGTTTACAGTTGCCGCAAGCACGTATTGTTGCAGGTAGCACAGATGTAGGTTTGTGGGTAACAAAGCAGGGCCGTGATTTGGGCGATATGCTTTATATTGGTCAAGTTGAAGAGCTAAAAAAGATTGTAGTCACAGACCTTGCTTTAACGATTGGGGCAAATGTAAGTTTGAGCGATGCACTCATTAAAATTTCAGATTTTTATCCCGATTTTCAAGAATTACAGCGCCGTTTTGCTTCCATGCCGATTAAAAATGCAGGCACACTAGGGGGAAATATTGCCAATGGTTCGCCTATTGGTGATTCAATGCCGGCATTAATTACGCTAGGTACACGATTGATTTTGCGTGTAGGTAAGCAGACTCGTGAAATTGCTTTGGAAGACTTTTATTTAGACTATCAAAAAACAGCATTACAACTTGGTGAGTTTGTTGAGGCGATTGTTATTCCGCTTCGTGAAGGGCAGACACGTTTTAAATTTGCCAGCTATAAAATTGCCAAACGATTTGAGCAAGATATTTCTGCGGTATGTGCAGCTATTTCTTGTGAGTTAGATAATGATGATGTCACTCACAATGTAAGAATTGCTTTTGGTGGCATGGCAGCTATTCCCAAACGTGCAAAATATGCAGAAGCCATATTAGAAGGCCAGCAAATTACAGCAGAATTGATCGTTCAGGCGCAGCAGGCATTGTCGCAAGACTATCAGCCTTTAGATGATGGACGTGCTAGCTCAGCGTATCGTTTACACGTCGCGAAAAACTGTTTAAAGCGCTTTTATTTAGAAAAAATTCTGTCTCAAACACTCACTCGTGTGAATGACCTGATTGCTATGGTGGAGATCTAATATGAATCAAACCATTGACTTAAATATTTCTAAAAAATCAGCTAAAGCAGGTGATTCGATTCCACACGAAAGTGCACATTTACATGTGACTGGGCAGGCAACTTATATTGATGATTTACCCGAGCTTGAAAATACCATGCATTTGGCAGTTGGATTTTCAAATTGTGCCAAAGGCAAAATCAGTAAGTTTGATTTGGATGCAGTACGTCAAGCTGATGGTGTCCATGCAGTTTTTTCTGCAAAAGATATTGAGGTTGAAAATAATTGGGGGCCAATTGTTAAAGATGATCCAATTTTTGCCGAGGAACAGGTTGAGTTTTATGGACAAGCCTTGTTTGTGGTTGTGGCCGAGAGTTATCAGCAAGCCCGTCAGGCAGTTCGCTTAGCAAAAATTGAGTATGTGCCCGAAACCCCAATTTTAACGATTCAAGATGCGATTAAAAAAGAATCGTGGGTGTTGCCGCCTGTTGAATTTAGCCATGGTGAAGTTGAGCAGGCATTTCAAAACGCAGCACATCAACTTTCAGGTGCTATTGAGCTGGGTGGGCAAGAGCATTTTTATCTTGAAGGGCAAATTTCCTATGCGATTCCACAAGAAAATCAGAGCTTAAAAGTCTATTGCTCGACACAACATCCAACCGAAATGCAGTTACTGATTTGTCATGCATTAGGCATGAATATGCATCAGGTCAGCGTGGAAAGTCGCCGTATGGGTGGCGGTTTTGGTGGTAAAGAGTCACAGTCAGCGCAGTGGGCATGCATTGCATCTTTGGCAGCAAAAAAAACGGGCCGTCCGTGTAAATTACGCTTAGATCGTGATGATGACATGAGTGCTACAGGCAAACGTCACGGTTTTGCTTATGAGTGGTCTGTAGCTTTTGATGACACTGGTATTTTGCAAGGCTTAAAGGTGCAATTGGCTTCAAACTGTGGTTTTTCGGCTGATCTTTCTGGGCCAGTGAATGAACGTGCGATTTGCCATATTGGCAATGCCTATTATCTAAATGCAGTTGAGCTACGTAACTTACGTTGTAAAACCAATACTGTTTCCAATACGGCATATCGTGGTTTTGGTGGACCGCAAGGTATGTTTGTCATTGAAAATATTATTGATGACATTGCTCGTTATTTAGGTTGTGATCCAGTTGAAATTCGTCAGCGCAATTTCTTTGCCGAGCAGCCCGGTGGTGGACGTGACCGTATGCACTATGGGGCAGAAGTCCGTGATAATGTTGCGCCAAAATTGGTAGCCGAACTATTGCAAAGTAGTGATTACGCGAAGCGTAGACAGACTATTCATGCCTTTAATCAGAACAATGACATCATTAAGCGTGGTATTGCGTTAACCCCATTAATGTTTGGTATTTCATTTAACGCCGTGCATTACAATCAGGCAGGTGCACTGGTCTATGTGTATATGGATGGTACTGTCGCGATTACACATGGTGGTACAGAAATGGGACAGGGGCTATATACCAAAGTACGGCAGGTTGCTGCACATGAGTTGGGTTTACCCATCGATAGCGTTCGTTTAATTGCAACCGATACTTCTCGTGTGCCAAATACTTCGGCAACTGCAGCATCGAGTGGCGCAGATCTAAACGGTAAAGCTGTTCAAAATGCCTGTATTAAAATTCGTGAGCGTCTGGCAAAACTTGCAGCCGAAATAAGTCAAAGTGAAGCTGACCAAGTCCAGTTTGAAGATAGTATGGTTTCAACAGCGAATGGTCATTCATGGACATTTCCTGACTTGGTTCAACGGGCATATATGGCACGTGTACAACTATGGGATAGTGGTTTTTATAAAACGCCAGAAATTCACTATGATCAGGTCAACCATTTAGGGCGTCCATTTTTCTATTATGCCTATGGTGCAGCGGTTAGCGAGGTCGCAATAGATACCTTAACTGGGGAAATGAAAGTATTACGTGCTGACATTTTGCATGACGTTGGGCAGTCAATTAACCCTGCAATTGATATTGGGCAAATTGAAGGTGGGTTTGTGCAAGGGATGGGATGGCTCACGACAGAAGAGTTGTATTGGCAGCCGCAGGGTCCACACGCAGGCCGATTATTTACCCATGCACCTTCAACTTACAAAATCCCGACCAGTGTGGACATTCCTCATATTTTTAATGTCAAACTATTTAATAATCAAAATCAGGCAGACACCATCTATCGCTCTAAAGCGGTAGGTGAACCGCCATTTATGTTGGCATTATCGGTTTTCTCTGCAATTCGTCAGGCAGTACAGGCGGCTATTCCAGAAAATGCACCGCTCGTACTCAATGCTCCGGCAACTCCCGAGGAAATTTTACGTGCAATTGCTATTGGACGGGGACAAGCTTTGGCTGCTCGCCCACAGGCTAAAATGTAGAAGATTATGCAACATTTACAATGGTGGACTGATTTTGTAGCGTGGCAAGCCGATGCGTTGCCTATGGTATTAGTCACAGTGGTCCGTGCTGATGGTTCAACACCACGAGAGGTTGGTGCAACGATGTTGTTGCGATTTAATTTGCAACAGCAATGGCAGCAGTCAGATACGATCGGTGGTGGGCATTTAGAGTTTCAGGCGATTGATATTGCTAAAGCAATGTTAAAAGAATCGGAAACTTGTGTGAGGCGTATTGAACGCTTTAACCTCAGTGCTCGGCTTGGGCAGTGTTGTGGCGGAGTAATGTGGTT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81 | Acinetobacter_phage(95.77%) | terminase,integrase,capsid | attL 1169182:1169198|attR 1221637:1221653 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1376438 : 1403914
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015483|1376438:1403914|DBSCAN-SWA 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25 | Escherichia_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1585258 : 1638205
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015483|1585258:1638205|DBSCAN-SWA 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77 | Acinetobacter_phage(95.45%) | capsid,integrase,transposase | attL 1585081:1585098|attR 1638713:1638730 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2645365 : 2698429
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015483|2645365:2698429|DBSCAN-SWA 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45 | Escherichia_phage(26.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2774149 : 2801777
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015483|2774149:2801777|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP015483|2774149:2801777|2790169_2790388_-|WP_001277696.1|DBSCAN-SWA MSCMLTLEEIEIKRQELERHLEDVMSVELSKWQSENKLCVSDVNIRLANVVSLGGPKHNVVTGVSVDLDNEL >NZ_CP015483|2774149:2801777|2795499_2795652_-|WP_001291451.1|DBSCAN-SWA MSEKQINMSDAQYILSTKLILVPFLQIKISRAMAIYGFTFERLKAIALIN |
35 | Acinetobacter_phage(92.86%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2805735 : 2818082
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015483|2805735:2818082|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015483|2805735:2818082|2812944_2813148_+|WP_000845537.1|DBSCAN-SWA MKTEIIEALALELTKATIADTDPSTINIKSADLWVKTYQESLKAVEEALKELKPKPKATSKPISGMS >NZ_CP015483|2805735:2818082|2805735_2806212_-|WP_001277128.1|DBSCAN-SWA MSAVLKTQQMDWSKYTIDGWLEQFGAWCETVRMKGGDLPDGLHINQIYWLMREAGKEVQKSKSYIRCEISDYEADQIQALLRSLLNSDKTDFTTKFALICLIKNKVENKGLLKVAQETNQSKAQVAIMVSCARFYLLGHDKRLRQNGGSNENIHCKTI >NZ_CP015483|2805735:2818082|2814316_2814640_+|WP_000064463.1|DBSCAN-SWA MSNFKKHPDGYKSFLGRDDKGLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGFKTPLNVFRFQTDYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKTKRGFTGSR >NZ_CP015483|2805735:2818082|2808131_2809013_-|WP_000064627.1|DBSCAN-SWA MSNFVPNSFQVPNAFVDEVLNKISDAACKIYLVICRKTRGWNKEMDSISLTQFEEITGKSRPTVVKCLNELIKVGLVVEQPSTIHGNTFKLGNDTSVGLVLKFPSKNFLLPEIYGQTSKNSLPLLVKNFNYTSKNFLPLLVKIFNTQSITIKNNSQSNKKINKKRGSVSEKPKTEKPNEFNPRSVELPACVDSELWNNFVDMRISIKKPLSENAVKLILKKLISFGPLANQSLENSIIGNYQGVFEPRQNQIQENPQSHNVPEEPGYFTQMYAESNRSNVIDVTPVSQDFGGY 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23 | Acinetobacter_phage(95.45%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3009116 : 3017212
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP015483|3009116:3017212|DBSCAN-SWA 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CAGCTAACTCAAAAAAATCATCATCAAACCAATCTAGCTGATCTCTTCCAAACGATTTCCTATATTTACTTAACTTATTTTTTTGTCTTCTTCTCAATTGATCATTATCTGATGGTAATTGAACACCAGCTAAATCACAGGAATCTTGGAATTTCAATAAAATTTCTGACTCATAATTTTGATCTACACTCCAATTTGTCTTAACCCACCCAATATTTTTTTTATTACGATAAAAGGTTGGTTTTAAATCCCAATCACTTTCTCCATGTCCCGATAAATGATCGATTTGTCTAATGTACTATACCCTTTAAAATCTTTTATCTTAAAAAAAGGAAAATTAACAGCTGATGGGTTAAATTCCAATCTTAATTGAGTCATAAGATCTTTTACATGTAATTTATCTGGACGAATAAAAGTTATAAACTCCTCAAAATCATTAAACGTAATTTCAAAATGAGAATCATTATTTACTAATTGATCGTAGTATTTATTACCCATTTTGATTTACCCATTTATCAATTTTATACATTAGAAATTCGTTCAATTTAAAACCTACAAAAAATTGCTTTCATAATTACTTGCTATGATTAGATTCAAAATTTAAGGCGCTAATTAAGCGCCTTTTTTCATTAATTTTCTTATTTTATCTCCAACAAAAGCACTAGAAAGTAAGGGTTTAAATTGCTCTAATAAGGATTCAGCATCATGTGATATAAGCTTGTTGCCGTTAACATTCATTTCACATGGGAAGCCATCAGGACTTATCACTAATATTGTTATATCAAATCTTTGTGTTTTGTCATCTGTTGCAGAAACATAGAGAACACGCGACTCAGGCTCTTGAGATTCAATTTTTACATCTGTAATTGGAAGTGAAGTAAGACCCGTTAATAAACCTAACGTATTAAACCCTTTTTTTCTCCAACCAAATTCAACTTTATTATTTGTTGCTTTCTTAACTGCTTGGTCTACTTCAAATAATACATTATCAATTTCTTCAATACTTTTGTCTCTGGTTACAGAGGATTGCATACCCTCTTCAACTGCTAAACTTAAATCTAAATGCATTTTGTTTTCTCCAACTTTAGACAGATAGGCAAATGATCTGAAGGGTTACTAAATGAATCATTATGTAAAGAACTAATCATCTTATCATCAAAGACAAGAACTAGATTATCATCCAAATTCCATCCATCACGGAAAAAGTTTCCTGAAACTAAGATTTGATCATAAATGTGCCAGTGATGGAACTCATTTTTAGTACAGTGATGGGTACCTGAGGGTTGATCTTCCTTAATTTGTAAAAATTTCCAAAAAGGATTGTAAAACAGTGAAGAATTATTAGAGATAACTTTTTGATCCCTAGTACTTCTTAACCCCTCTAATATTGCCGAATCATAAGGTTCAACATTAAAATCCCCTAAAACAACAAACTTCGTTTTATTGAAAAATTTTTTTTCATCATTAGTATCTTTTTTAATAAATGATGCGACTGTTCTTCTTTTTTCCTTATTATCATTTAATTGAGATAACCAATGAGTAACATAAAATATAATTCTTTCTTCTAAGTGCCCACTTAGAAATTCATATTTTTGAAAGACTTTAAGCTTATTCTTTTCTTCACCATCGACTTCTACTTTTGATTGAACAAAATCAAAAGTATTTTTAAATATTACACATGTATCAAAATATAAGCCTCCATAATTTTTTCGATAAATATTGTAATCATAGCCCATCCCAATAAGTTGAATACTATTATCTATAAACTCCATATCCTCAGGTGAAACCTCACAAAGACATAAAAAATCAAAATCGAGTTTCAAGAGCCCTTGAATTACCCTAGAAACTTTTATTTTTTTATCAACTTTTGATTTATTCCATCTATTTCCTATAGGAGGAGATAAATTTATATTCCAAAAACCGACAAATAAACTTTGGTTCATGAGTTAGTACCAATCCAATTTTCTACTTCATTCGCATACCAAGTCATAAGCTCTACTCGCTCATCCCAATATTCGGCACGGTTATAAATTTTACTTGTCTTATCTGCTTTTGTTGTTTTGTTCACGTGGGCAATTTGATAATCGATAACCTCACCACGGAACAATTTACTTTCATTAGCATGAGTCGAAAACAATGAACGAAAACCATGAGTAACCATTTTATCTGTGTAGCCCATTCTTTTTATCATTGTGAGAACCGACTCAGATGTCATGTGCTCATAAGGTTTTCCACGTTTTTTAAATATGTACCCATCATCTGTTTTGACGCTTTCGAGTTCCTTAAACAAAGCATAGATTTGCGGTACCAGTGGGACCATTAATTCTTTTCTTTTTTTCATTCGCTCTGCAGGAATTATCCAGACTTTGTTTTCAAAATCTATCTCTCCAGTATCCCACCTAGCTTTTAACAATTCTGTTATTCGGGTTCCGGTATAACAAACTAAAAGCATGGCCATTTTTACTATTGAGCTAGAATGACTCGCTTTCATGCGTTTAAAGAATTCTGGCATTTCACTCACAGGTAAACAAGGATGGCTGTCAGATTCATATTCAGGTATTACATCCTCTACTAATGTACATGGATTACGATCTGTATAATCTGAGGCAATTGCAAAATCAAATACTTGCTTTCCAAGTCTTAATGCTCGGCTTGCTGTTTCTAAAGTACCCTTTGCAACAATTTCTTTAATTTTCTTCGAGATGTGCTTTCTTTCAACTTCATTAATTGGAAGATTTTTAAAATCCTCGGTTAGATATGCAAGTCGATATTCGACTGTGTCATAGTATTTTTTGCTGGTCCATTGTGATTTCATGATACTCAACCATTCCTCAACCACCTTATGGACTGGTGGAGAATTGGCGACCTTGCCCTGATATTCTAATTTTAATTGTCTTGCTAGTTGGCGTGCTTCTTTACATCCCATAATAGGATATTCACCCAACATCTTTTGATTTTGCTTTCCATTTTGGCGATAAGACAAAACCCATTTCTTTTTTCCATTAGGAAAAACGGAAATGTTTAATCCTTCCCCATCTGCTACTGAATATCTAGATTCTTTAGGTTTTAATGACTTTACTTGGGCATCCGATAGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP015483|3009116:3017212|3012516_3013026_+|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ >NZ_CP015483|3009116:3017212|3014727_3015183_-|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NZ_CP015483|3009116:3017212|3009116_3009488_+|WP_001260065.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR >NZ_CP015483|3009116:3017212|3010351_3011380_+|WP_000805204.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWEKDNAGTDSPIFVVQEKKIVWGLDPASDSVEITNIVDADDESTYKSIDDFFESLKATDKHALNGLAIEEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NZ_CP015483|3009116:3017212|3015173_3016058_-|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NZ_CP015483|3009116:3017212|3011811_3011991_+|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND >NZ_CP015483|3009116:3017212|3013022_3013232_+|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NZ_CP015483|3009116:3017212|3016054_3017212_-|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NZ_CP015483|3009116:3017212|3011520_3011811_+|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA >NZ_CP015483|3009116:3017212|3009658_3010339_+|WP_000643997.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NZ_CP015483|3009116:3017212|3011983_3012520_+|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NZ_CP015483|3009116:3017212|3013228_3013444_+|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI >NZ_CP015483|3009116:3017212|3013444_3013615_+|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK |
13 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 3009961:3009975|attR 3021872:3021886 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
14817 : 34004
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015484|14817:34004|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015484|14817:34004|25159_26020_+|WP_001099771.1|DBSCAN-SWA MNVAKLLANAKKNKDALKSRESTIKPKPGKNNYVLLGDWNQERNEEFYKPFSQHFIKDYSKVTDGKPETTVHVCMSKTFDEDCPICDAIAEAGRLIGANATDEQIKTLEDAKASTVYLLNVLEVDDSGKHDGQPKALQVGKLTLSSILDMMDDWGEAIFVDHQVVTINREGTGLNTKYNVLPGSKKVHVDPEVFKRMIDLDDYVKQANEERKRLALGAIRRAAGLYAPAEPTHVPAERTIGTSSALASDVTDVSYKDVTTSSLDVTEIDLGDELEALLDDAHQEAS >NZ_CP015484|14817:34004|30225_30606_+|WP_000234226.1|DBSCAN-SWA MVIERQPHTVNGKRIGTFYSVDGKYVMYLLLARGEKTKLLDIKNSSWRMPSMALMEAKRRGCKYIGVTHRMGKKFLYYIARSADWYGEHSAPSSFRGEFQRTLRTEAFLFNSTHTTKYIAKSIKIR >NZ_CP015484|14817:34004|23928_25017_+|WP_000034357.1|DBSCAN-SWA 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16 | Pseudomonas_phage(45.45%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
48007 : 110526
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015484|48007:110526|DBSCAN-SWA AATGAATAAACCTACTCCTAAAACTTATCGTACAACCAACTGGTCTTCCTATAATCGCGCTCTCATTAATCGGGGTAACATTTCCATTTGGTTTGATCCAAACACTCAGTGGTATGCACAACCACAAGACAAGCAAGGTCGAAATCAAACTTACTCCGATAAGGCTATTCAATGCTGTTTAATGATCAAATCTTTATTTAGACTCTCTTTACGCATGGTCACAGGTTTTGTTCAAAGTCTGATTAAACTTTGTGGATTAAATTGGACCGCACCAGATTACAGTACGCTTTGTCGAAGACAAAAACATATTAATATTGCGATTAGCTATCAAAAAAGTAGTGATGGGCTACATCTACTCGTCGACTCAACTGGCTTAAAGTTTCTAGGTGAAGGCGAGTGGAAACGTAAGAAACATGAACCTGAATATCGTTGCCAATGGCGTAAGCTTCATATTGGCATCGATGCTGAAACCTTGCAAATACGTGCAGTACAGCTTACTATAAATAATGTGAGCGATTCGCAAGTACTCGGTGATTTACTTGATCAAATCCCGTTGAATGAGCAGATTGATTCGGTCTATACCGATGGTGCTTATGACACGAAGCACTGCAGACAAGTCATTCTAGATCGAGATGCACATGCGGTCATTCCGCCAAGAAAAAATGCAAAACCATGGAAAGATCAGAAATTGAGATCTTTAGAGCGGAATGAGTTACTGAAAACAGTTAAACGTTTAGGAAGAACGCTTTGGAAAAAATGGGCAGGCTATCATCGTCGAAGTTTAGTTGAAACCAAGATGCATTGCATCAAACTATTGGGGGATAAACTCAGTGCGAGAAACTTTCAGAGCCAAGTGAATGAGATTCATGCTCGTGTGGCAGTATTAAATAAATTTACAGAATTAGGTCGTCCTCATACCCAAGTTGTCACTTGAATTCTGTTCAAATGAGCAGAGTGTTGTCTTTTAAATCTTTGTGCAACAAAGCCGCTAACGACTAAAGTTTCACCGGCTTTAGGCTGACCAATGTCTAACAACCCCATATAAGCAGTAAATCCTGGCATTCCCAAAATATCCAATGCCCAAGATGGATGTTCAGGTTGCATACCTAAGCTTTGACATACAGTCCCATTAGAAATTGCGTAGCCCTGCCAGCCATTTCCTGAAAGAACCCACTCGCCTTCTTTGAATTTTGGGTTTTTAGAGGCCACTACTTGACTGACTCTTCCACCGACCATCACTTCGCCAATTTCAACCGGTGCTGCATATGAGGGAGCATCACTCATGCGACCACACATATAAGGATCGAGTGACAAGTAAATGGTCTTTAACAATATCTCGCCTTATTTAAGTTCATTGAGTTCAACTTGCTCAATACGAAAATCGCTGTGTTTTGGCTCACCGAGTGGCCGTTTAGCTAAAACGATGCGTTGGTTAATAACTGTTTCCACTCGCATAACTCCATGTTTTGTATAAAAGTATTTCTATTGATAATTGAGACTGTTGATTAAAACGTCTTTACATCAATTGTAGATGAGTTATAATAAAAAAAATACGACTGGTCTATTTTTTACAATAGAGTAAATAATTAATATGAAGCCTAATCCTATTAAAAAGTCTGAAGCGAAGCGCTTACACATTCTTAACACTAGTTCAGACCTGATTTTGCATAAAGGTTTTACCGGTGTAGGATTACAGGAAATTTTACAGAACTGTGAGATCCCCAAAGGCTCGTTTTATCATTACTTCCAATCCAAGGAAGCTTTCGGATGTGAATTGGTACAGCATTATGTAGACAATTACCAAGTCCGTTTAAATGATGTATGGCGTAGTGATAAATCCCCTTATCAAAAGCTAATTGAGTATTTTAATTTATGGATAGAAGATCCTGTAACACAGTGTGGTTGGGCGGATAGCTGTTTAATTGTGAAACTTGCCGCAGAAGTTGCCGATCTATCTGAAGATATGCGCTCGATTATGTCCGCTGGCGTCGATGATGTAATCGAACGTATTGCTGGTTTAATTGATTTGGGAAAACAGGATCAGTCTATCCAGGCAGATACTGAGGCCTCGACGTTGGCACAAGTACTTTACCAAATGTGGTTAGGTGCAGCATTACTGAGTAAATTGCAAAAAGATAAAACACCATTACATCAAGCTCTGAGAGCAACTAAATTTCTATTAAAAAGTGAAGATTCATAAAAATTAGATTAAATATCAATTACATAATTAATGACAGCAGCCCAATGATTACTTATTAATGTGTTGCTATTAGATCAATTTACAATCCATGAGTATAGCGCACAATGAATTCTCCTTCTAAAGCCCTCATGTCTCGTATTTTAGTCGGATATTTAGGCTTATATCCCACACTATTACTGGTACTTACTTTATTAAAGCCAATTACTCAGCATCAAAGTTTCCCGATGATGGTGTTGATTGAAGTCATAGTATTAGTGCCAGTAACGCAACTGATTTCTTTCCCACTGGCAGGTTGGCTCATTACACAGCTAAAAAATTTTAAGAATTTGTTTTAAGAAGAATTTATGCTGGCAACAGCAATCCTAAGTCCTTATTTTGCCAACCACAACGGTTGGCAAAATAACTCACTTAGTCAATACTAATCTGCGTAAGCTGGATAATCAATATAGCCTTTTTCTGTCCCACCATACATAGTGCTTGCATCTACTGGATTCAATGGCCAGCCATTGGCGATGCGATCGGGTAAATCTGGATTCGCAATAAATGGGCGTCCAAATGCAATTAAATCGGCCAGTCCTGCCTCTAAAATTCGAGTCCCTCTTTCTGCCGTATATCGACCTGCATAAATAATCCGACCACTGAAAGTGTCTCTGACATCTCTACGAAAATCATGAGGAAGTTCTGGTGCATTATCCCAATCAGCTTCTGCAATCGATAAATAGGCAATCCCAACTTCTTCAAGTATTTTTATGGCTTCAATATAAGTCACATGTGGATCATCTTCAACCAACCCTATGTAAACACGATCTTCCTCTGTACTTTCAAATAGCGGGGCAAAACGCACTCCTAAACGATCTGCACCAACCACCTCAGCAACTGCCTCTACTACTTCACGTAAAAAACGCAAACGATTGTTTAGTGATCCACCATATTCATCTTCACGGTGGTTACTATGTGCAGAGATAAATTGATTCACCAAATAACCATTTGCACAATGAATTTCAACTCCATCAAAACCAGCAGCCAAGGCATTGCGTGCTGCTTGAGCATAGAGTTGCACTAATTCTTTAACTTCTGCATTGCTTAAAGCACGTGGCATTGAAGGATCAGCCAAGGTCCCAGCATTAGGCCCGGTCTCAATAAACACTTTAACATTACTATCAGCCCTAATAGCCGAGGGTGCGACCGGTGATGCATGATTAGGTTGCAAAGATGTATGTGAAACACGCCCAACATGCCAAAGTTGTGCAAAAATAATGCCTCCTTTAGCATGCACTGCTTCAGTCACTTTACGCCATCCAGCAATCTGTTCAGGGCTGTAAATACCGGGAGTCCAAGCATAGCCTTGACCACGTGGCTCGATTTGCGTACCTTCGGTGACCATAAATCCTGCCCCGGCACGCTGTTGATAATAGGTTGCCATCAGTTCATTTGGAATATTCCCTGGCTGAGTACTGCGCGACCGCGTTAATGGTGGCAATACAATACGGTTTCGCAAAACATAAGGGCCTAAGCTTAAGTTTTGAAAAAGTATGCTGTCTTTCATTTCATTGTATCCAAGTAATCATGACTTAATTGATCTAAATTAAAAAATACCCTTCCTTCCTGTATATAGAAAAATAAAGGAAAGAAAGCTATTAACTCAGACCCTCCACCATTAAGTGAGGGTTATTTTGCTTATTGCACCCGTTGCTCAGAGTCAGAAGTTATTCACTGCTAAGCACCACAACAGACGCTAGCTACTCTTTATTTCAACAATTGAAGTAATGCTGTAGCAGTTGCAGCAGAAGAGGCTGGATTTTGTCCAGTAACCAGCAAGCCATCTACTTGAACATGTACTTGCCAATCATCTACTTTAGAATAATGACCACCATTTTCTTTAAGCATGTCTTCGACTAAAAATGGTACAATTTCAGTCAAGCCTACAGCAGCCTCCTCAGTATTGCTAAAACCAGTGACTAATTTACCGCTGACTAAAGGCGCTCCATTACTCGCTTTCACATGACGAAGAACACCTGGGGCATGACACACTGCTGCAACAGGTTTGCCAGACTGAATCGCCTGTTCAATCAGAGAAATTGAAATCGGATCTTCTGCTAAATCCCACAATGGACCATGCCCGCCTGGATAAAACACCGCATCATAATCAGCTACAGAAATTTCGCTAAGTTTATGCGTCTGTGCCAATGCTTGCATTGCAGTTGGATCAGCTTCAAAACGATGAGTGGCTTCAGTTTGCGCATCGGCTAAATTACTTTTAGGATCTAGTGGTGGCTGCCCACCTTGAGGCGACGCCAGCGTAACTTCAGCACCAGAGTCAATAAAGATGTAATACGGTGCAGCAAGTTCTTCTAGCCAGAAACCTGTTTTCTTACCAGTATTGCCAAGTTGAACATGTGAGGTTAAAACGACTAAAATTTTCATGTTATTTCTCCGATAATTTTCATGATTGAGGAGCATTGTTGCATGATCACTTGCTGTGTGGCGTGAGCATGCCAGATAGCTTATTTAGATGCTCGTCGCAAGAATTTGGCGACTGATCTCTAATGAAACATTTTTGTGTTCGCCTAGCCGTGTCAGATTGTGTGATTTAAGTTGCGTAATGATGATCTCAATATCTGTCTCCCCCAGTCCATAATCGCTAAGACGAGTCGGCAATCCAAGTTGCTCAAAGAAGGCTCGAGTACGAGCAATAGCCGTATCAATACGTTGTTCTTCATCACCTTCGACAATCTGCCAGACACGAGCTGCATACTGTAGTAATTTTTCTCGCTTCTCTTGACGACGCACTTGTAGATTG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63 | Salmonella_phage(28.57%) | tail,terminase,portal,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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