Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756 | Clostridioides difficile strain 630Derm chromosome 1 | 22 crisprs | csa3,RT,WYL,cas3,cas14j,DEDDh,DinG,cas14k,cas5,cas7,cas6,cas2,cas1,cas4,cas8b2,PD-DExK | 4 | 46 | 10 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_1 | 146708-146786 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LN614756_1
>1.1|146733|29|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_1
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_1 >merge|NZ_LN614756|1|146708-146786|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAATGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAACTGTTTATAATGTGGATAATATTATA >NZ_LN614756|1|1|146708-146786|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAA TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC TGTTTATAATGTGGATAATATTATA
>NZ_LN614756.1|WP_003432598.1|145687_146227_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >NZ_LN614756.1|WP_003436320.1|143314_145666_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDDLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >NZ_LN614756.1|WP_009892490.1|141757_142942_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase 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>NZ_LN614756.1|WP_003421107.1|127102_127534_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >NZ_LN614756.1|WP_003435654.1|126251_126983_+|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >NZ_LN614756.1|WP_011860635.1|125416_126220_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQLVYLGAIIATRFIAI >NZ_LN614756.1|WP_003435657.1|124556_125423_+|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >NZ_LN614756.1|WP_003435660.1|123735_124569_+|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >NZ_LN614756.1|WP_009900804.1|159278_160067_+|TIGR00159-family-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_2 | 148720-148809 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LN614756_2
>2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_2
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_2 >merge|NZ_LN614756|2|148720-148809|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAATAAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGCTGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >NZ_LN614756|2|2|148720-148809|CRISPRCasFinder TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACAGAAT AAACTGAACGCATGTGAAGTTTGTTTGTTGGCGC TGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>NZ_LN614756.1|WP_003432598.1|145687_146227_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >NZ_LN614756.1|WP_003436320.1|143314_145666_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase 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>NZ_LN614756.1|WP_003421107.1|127102_127534_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >NZ_LN614756.1|WP_003435654.1|126251_126983_+|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >NZ_LN614756.1|WP_011860635.1|125416_126220_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQLVYLGAIIATRFIAI 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MITNDKRIRIITGHYGSGKSEFAMNYVVKLRDMVSGKVAIADLDVVNVYFRTREKKELMKSLGIQPIDSSINAPTLDLPAVSAEVMSPMVDHSYNSVIDLGGDNVGARVIGRFSHLLKEGDYDMLFVINANREKTQTSEEVIQYIKEIEKSSKLKVTGLINNTHLIRFTTIDDVLRGQKVAKEVSEKCNIPIRYVACLENLVEQLPKDLEGEIFPIKLYMREDWM >NZ_LN614756.1|WP_003420706.1|164261_164477_+|4Fe-4S-binding-protein MAKGKVSFNQERCKGCGLCVEACPVKIIQLDSNVINKKGYNPATVFEMEKCIGCASCATMCPDVVITVERD >NZ_LN614756.1|WP_003432442.1|164505_165585_+|3-methyl-2-oxobutanoate-dehydrogenase-subunit-VorB MAKILMKGNEAFGKAAIEAGCKYFFGYPITPQSELPEYLSRELPKIGGAFVQAESEVSAINMVYGGAGAGARVMTSSSSPGVALKQEGITYAVGAEVPCVVLNVMRGGPGLGSIQPSQADYFMSTRGGGNGDYRTPVFAPATVQEAVDMIMEAFDVADYYRSPVMVVADGMIGQMMEPVEFRAPEKKRELPPKDWATVGTKGKRKPNVINSLYLEPEVLEDHCWHLQEKFDAMEKNEVQYEMYKTEDAEFVFAAYGTTSRVVKSAIDILREEGIKAGLIRPKVLWPFPFEAFNQIPNARNILTVEMSMGQMVEDVKMAVEGKLPVYFHGRPGGMTPTPAEIVEKAKKIIAGELVAGGAR >NZ_LN614756.1|WP_003420710.1|165584_166337_+|MFS-transporter MAVVFKKTEGLQDTQTHYCPGCTHGIIHRLVGEVLEELGVLGDAVGVVPVGCSVLGYKYFNCDTQEAAHGRAPAAATGIKRVHPENTVFTYQGDGDLASIGTAEIVHAAARGEKITTIFVNNTTYGMTGGQMAPTTLVGQRATTAQSGRNAETQGYPIRVSEMLATLTGAVFVERVAVDTPAHVRQAKKAIKKAFQVQQAGLGFGIVEVLSTCPTNWGLAPNDALQWLRDNMIPYYPLGNFKNVEVEEVK >NZ_LN614756.1|WP_003420711.1|166337_166895_+|2-oxoacid:acceptor-oxidoreductase-family-protein MSTARVICAGFGGQGVMSMGQLLTYAGMLEGKEVSWLPSYGPEMRGGTANCAVTVSNEPVGSPLITDDATAAILLNIPAFEKFKDDVIPGGKIIVNSSLIKEKVDRTDVDVYYIPANELAAELGNDKVANMIMLGAYLKVSDTVDIESVLEAFKKVFGPRKEKFVPLNREALQKGMDATCSKATN >NZ_LN614756.1|WP_011860638.1|167064_168411_+|phosphoglucosamine-mutase MRKYFGTDGVRGVANTELTCDLAYKLGRAGGFVLAQGDHRVKVVVGKDTRISGDMLEASLIAGLMSVGCDVITVGIIPTPAVAYLTRKYGADCGVVISASHNPVEYNGIKFFNKNGYKLDDEIELKIEEYIDDIDKIDCLPIGENVGRKLHEHCAQRDYVDYLKSIISTDFKGLKVVLDCANGASYKVAPIVFDELGASVISINSSPDGNNINYKCGSTHPEQLQRAVLEHNADLGLAYDGDADRLIAVNEKGQIVDGDHIMILSALNLKKNNKLAQDTLVVTVMSNIGLTIAAKENGINLSTTAVGDRYVLEDMVKNGYNLGGEQSGHMIFLDYNTTGDGVLSSLILANIILQEKKPLSEIASIMSQYPQVLVNATIKNENKNKYMEYPEIKTEIERIESILDGNGRVLIRPSGTEPLVRVMLEGKEEGQIKELATNLANLIQEKLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_4 | 1130873-1131099 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_4
|
3 spacers
spacers of NZ_LN614756_4
>4.1|1130902|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder GTTTGAGAACGCTGTATAAAGCTTGTAGCTAGTTCTT >4.2|1130968|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder GTTGCATCATTAAATATTTTCCCTACAAACTCTTTTC >4.3|1131034|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder AGTACATACAAAGAGTCTATAAAATTATCTATAAAGG >4.4|1130904|38|NZ_LN614756|PILER-CR GTTTGAGAACGCTGTATAAAGCTTGTAGCTAGTTCTTG >4.5|1130970|38|NZ_LN614756|PILER-CR GTTGCATCATTAAATATTTTCCCTACAAACTCTTTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_4
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_4 >merge|NZ_LN614756|4|1130873-1131099|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAGTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGTTTGAGAACGCTGTATAAAGCTTGTAGCTAGTTCTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGTTGCATCATTAAATATTTTCCCTACAAACTCTTTTCATTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGTACATACAAAGAGTCTATAAAATTATCTATAAAGGGTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAAT >NZ_LN614756|4|4|1130873-1131099|CRISPRCasFinder GAGTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GTTTGAGAACGCTGTATAAAGCTTGTAGCTAGTTCTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG GTTGCATCATTAAATATTTTCCCTACAAACTCTTTTC ATTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AGTACATACAAAGAGTCTATAAAATTATCTATAAAGG GTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAAT >NZ_LN614756|4|2|1130876-1131033|PILER-CR TTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGT TTGAGAACGCTGTATAAAGCTTGTAGCTAGTTCTTGTT TTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGT TGCATCATTAAATATTTTCCCTACAAACTCTTTTCATT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
>NZ_LN614756.1|WP_003429855.1|1129403_1129565_+|hypothetical-protein MNNFLLNVIAGVIASLIFCLICKVFLKVKSHSTRGKSKSGWEFDFKIKFHKFK >NZ_LN614756.1|WP_003429853.1|1128622_1129063_+|phage-portal-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >NZ_LN614756.1|WP_003429851.1|1128080_1128551_+|phage-tail-tube-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >NZ_LN614756.1|WP_011861032.1|1126753_1128064_+|phage-tail-sheath-family-protein MALGGGTFVTQNKILPGSYINFISAKRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKEIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >NZ_LN614756.1|WP_011861031.1|1126575_1126752_+|hypothetical-protein MNKTLSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENDLYSFSEVEEIINSFMKGVS >NZ_LN614756.1|WP_009901504.1|1126145_1126583_+|hypothetical-protein MLNNIIDGISVKLDKSFGEKYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKTPYPSGRELKKNSFDVHYFPHSEDKNFEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKSNDTDKMDTVELFGGLKRGDNFE >NZ_LN614756.1|WP_011861030.1|1125727_1126153_+|HK97-gp10-family-phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKGGKGWVKGQHFLTISEMELQGQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >NZ_LN614756.1|WP_003429844.1|1125380_1125728_+|hypothetical-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKVAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >NZ_LN614756.1|WP_009888836.1|1124985_1125387_+|hypothetical-protein MENNIIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNKILTFRCLRW >NZ_LN614756.1|WP_009896624.1|1124742_1124976_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLNVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >NZ_LN614756.1|WP_011861034.1|1131228_1131789_+|lipoprotein MKKKVCFLFSILIVICLAIVGCSNSESPEESSKNNEPKKEEKKDKEVVIGEKIISDKMEITINNIEFSYDVLPKVKESLYTHYPAESGKVYIDIAADIKNTQKQELNCSDLLTIEANYNDGYKYSSQTIVEDETTGFTYDNISSIDPLETKGVRFIIDCPDEVKTSDKPVILSFTFDGNKYVYKMK >NZ_LN614756.1|WP_011861035.1|1131832_1132402_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MDDIVEYIFCSECGAKCLKGSKFCSECGTEIADIKMLNESIIKEKEYDLKGIDLQHVMQETSFIKASSVRRLKELTGIELDDCRKILEEPYQKYYNENADMLEEKRKKEDDISKIRKAKEEKKEKEKIACCPACGSTSLTTHKKGFGIGKAITGATIAGGIGLVAGNIGAKKVRVTCLNCGKQFWAGKK >NZ_LN614756.1|WP_011861036.1|1132472_1134824_+|tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIESILTRIEQSIGKADEQQRKFNDDINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQMTSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIVNVTDSLYVLGAVGYSVFNGFIDLLSSPTFQGFANMMIVGISLITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLYKTAVIAGALVTAIQVVWIALQTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAIFNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNCATALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTFGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSFKKGYEVGQNLENKIKDAFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDRFGSAGLNSPLNNAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >NZ_LN614756.1|WP_011861037.1|1134839_1135529_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein 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>NZ_LN614756.1|WP_009901352.1|1137505_1137766_+|DUF2577-domain-containing-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPMQIAFGTIESVNPLIVKIEQKASFEEFFLIQTETFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >NZ_LN614756.1|WP_011861039.1|1137770_1138190_+|DUF2634-domain-containing-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVHSKYGNIKAEKVVSV >NZ_LN614756.1|WP_011861040.1|1138190_1139240_+|baseplate-J/gp47-family-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLSATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYIAIERISEKTYKMKCETAGPIFELGKLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNMQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHKVTVTGVVSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >NZ_LN614756.1|WP_011861041.1|1139232_1139850_+|YmfQ-family-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHEKLNDLSSDQFLEDLTPSGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDSIVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSNIKPCNMTLDYTRVLISKDNYMNFGITTLMGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF >NZ_LN614756.1|WP_011861042.1|1139861_1140665_+|phage-tail-protein MAIDKSYYTIITDVGKAKIANASVTGNKVGFVKIQLGDGGGSEYTPTESQTALKNVVWEGNIGNTTTDETAPNCIILESLIPSSVGGFMIREIGYLDDENNLIAISKYKECYKPSIEQGAVVDMKVKTVLIVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDIQELETKIGTINTKIDTTKTELTSNIETAKTELSNKIGDTTQLNTTDKTNIVSALNEVKTSVDSIETTAEKTSYNNATSKLTATTVQGAIDEVVAKIENFNEVNISIQNDMLPI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_3 | 1130303-1130729 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_3
|
6 spacers
spacers of NZ_LN614756_3
>3.1|1130332|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGAGTCTTTATATGGTAGAGGTGGAATATATAAGT >3.2|1130398|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTCTTCAATATCTCCTAATCGTTCAATATAATTCTC >3.3|1130465|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTGTATGCCATCTAAATGCATCATACAAACTTATTT >3.4|1130531|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATACTTCCTAATGCAATCAAATAAGTACCTAAAATC >3.5|1130597|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT TTCGCAACTTATGATGGTGAAATGATTACATTAACAG >3.6|1130663|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT AATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_3
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_3 >merge|NZ_LN614756|3|1130303-1130729|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGTAGAGTCTTTATATGGTAGAGGTGGAATATATAAGTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATAACTCTTCAATATCTCCTAATCGTTCAATATAATTCTCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATACTGTATGCCATCTAAATGCATCATACAAACTTATTTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTATACTTCCTAATGCAATCAAATAAGTACCTAAAATCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTCGCAACTTATGATGGTGAAATGATTACATTAACAGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGGGTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAATG >NZ_LN614756|3|1|1130303-1130596|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTAGAGTCTTTATATGGTAGAGGTGGAATATATAAGT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AACTCTTCAATATCTCCTAATCGTTCAATATAATTCTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACTGTATGCCATCTAAATGCATCATACAAACTTATTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACTTCCTAATGCAATCAAATAAGTACCTAAAATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT >NZ_LN614756|3|3|1130303-1130729|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTAGAGTCTTTATATGGTAGAGGTGGAATATATAAGT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AACTCTTCAATATCTCCTAATCGTTCAATATAATTCTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACTGTATGCCATCTAAATGCATCATACAAACTTATTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACTTCCTAATGCAATCAAATAAGTACCTAAAATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCGCAACTTATGATGGTGAAATGATTACATTAACAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGG GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAATG >NZ_LN614756|3|1|1130303-1130728|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTAGAGTCTTTATATGGTAGAGGTGGAATATATAAGT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AACTCTTCAATATCTCCTAATCGTTCAATATAATTCTC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT ACTGTATGCCATCTAAATGCATCATACAAACTTATTT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACTTCCTAATGCAATCAAATAAGTACCTAAAATC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTCGCAACTTATGATGGTGAAATGATTACATTAACAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AATATAACAAAGTGGATGTTCTCTAAAAATAAAGAGG GTTTTAGATTAACTATGTGGTATGTAAAT
>NZ_LN614756.1|WP_003429855.1|1129403_1129565_+|hypothetical-protein MNNFLLNVIAGVIASLIFCLICKVFLKVKSHSTRGKSKSGWEFDFKIKFHKFK >NZ_LN614756.1|WP_003429853.1|1128622_1129063_+|phage-portal-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYVASNRFLDKEGKPVEWELKVLSSEEDEALRRKCTKRVKVIGNNGKHTGQYTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTSFEDKVEEAKN >NZ_LN614756.1|WP_003429851.1|1128080_1128551_+|phage-tail-tube-protein MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >NZ_LN614756.1|WP_011861032.1|1126753_1128064_+|phage-tail-sheath-family-protein MALGGGTFVTQNKILPGSYINFISAKRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKEIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >NZ_LN614756.1|WP_011861031.1|1126575_1126752_+|hypothetical-protein MNKTLSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENDLYSFSEVEEIINSFMKGVS >NZ_LN614756.1|WP_009901504.1|1126145_1126583_+|hypothetical-protein MLNNIIDGISVKLDKSFGEKYTIYSEDVEQGINEPCFFIVPLNPSKTPYPSGRELKKNSFDVHYFPHSEDKNFEINEIAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKSNDTDKMDTVELFGGLKRGDNFE >NZ_LN614756.1|WP_011861030.1|1125727_1126153_+|HK97-gp10-family-phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEELTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYASYVEYGHRTKGGKGWVKGQHFLTISEMELQGQVDKIIEKKLLILLKGVFDA >NZ_LN614756.1|WP_003429844.1|1125380_1125728_+|hypothetical-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKVAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >NZ_LN614756.1|WP_009888836.1|1124985_1125387_+|hypothetical-protein MENNIIDEIEKRLESFGYILKDGDKWLIGFVREKIENIIKLDCNIKTMPIELKEIEVDMIVGEFLFTKKNMGQLDIESINFEAVEKSISEGDTKVDFAIGSGSQTPEQRFDSLIAYLTTYGKNKILTFRCLRW >NZ_LN614756.1|WP_009896624.1|1124742_1124976_+|hypothetical-protein MAQVRKLNRILTIEECKIDDFLEMGYDLIDETGKAVKYGKSLNVKDLIAENNILRSKVESLEEENKQLKEKNKLTKK >NZ_LN614756.1|WP_011861034.1|1131228_1131789_+|lipoprotein MKKKVCFLFSILIVICLAIVGCSNSESPEESSKNNEPKKEEKKDKEVVIGEKIISDKMEITINNIEFSYDVLPKVKESLYTHYPAESGKVYIDIAADIKNTQKQELNCSDLLTIEANYNDGYKYSSQTIVEDETTGFTYDNISSIDPLETKGVRFIIDCPDEVKTSDKPVILSFTFDGNKYVYKMK >NZ_LN614756.1|WP_011861035.1|1131832_1132402_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MDDIVEYIFCSECGAKCLKGSKFCSECGTEIADIKMLNESIIKEKEYDLKGIDLQHVMQETSFIKASSVRRLKELTGIELDDCRKILEEPYQKYYNENADMLEEKRKKEDDISKIRKAKEEKKEKEKIACCPACGSTSLTTHKKGFGIGKAITGATIAGGIGLVAGNIGAKKVRVTCLNCGKQFWAGKK >NZ_LN614756.1|WP_011861036.1|1132472_1134824_+|tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIESILTRIEQSIGKADEQQRKFNDDINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQMTSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIVNVTDSLYVLGAVGYSVFNGFIDLLSSPTFQGFANMMIVGISLITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLYKTAVIAGALVTAIQVVWIALQTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAIFNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNCATALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTFGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSFKKGYEVGQNLENKIKDAFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDRFGSAGLNSPLNNAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >NZ_LN614756.1|WP_011861037.1|1134839_1135529_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGAFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSREMGGKVLFNTNIKVSLEEYAISEDADNGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >NZ_LN614756.1|WP_011861038.1|1135521_1137492_+|C40-family-peptidase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRVEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSAHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIDLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNSNNKDEKKNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKVFKNKLSNTGNIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFGSVDEGIKRGISNLSRNYIHTGRKTLESIRDKYAPLYDSPLNKDWVPGVGKFYKQITGNAYSSNSAGTGVGSNEEAEKNLKDTTYQVQNNNSNTLTNNNSKVSKVIQEAKNQLGKPYAWGGNGPKSFDCSGLMVWAFKRGAGINLKRVSADQSKDSRGKLLCNINDVKAGDLVFFAYNKGKGNVHHVGLYIGNDQYIHAPQTGDVVKISSLSGRQKKKHDFARARRFF >NZ_LN614756.1|WP_009901352.1|1137505_1137766_+|DUF2577-domain-containing-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPMQIAFGTIESVNPLIVKIEQKASFEEFFLIQTETFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >NZ_LN614756.1|WP_011861039.1|1137770_1138190_+|DUF2634-domain-containing-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVHSKYGNIKAEKVVSV >NZ_LN614756.1|WP_011861040.1|1138190_1139240_+|baseplate-J/gp47-family-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLSATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYIAIERISEKTYKMKCETAGPIFELGKLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNMQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHKVTVTGVVSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >NZ_LN614756.1|WP_011861041.1|1139232_1139850_+|YmfQ-family-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHEKLNDLSSDQFLEDLTPSGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDSIVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSNIKPCNMTLDYTRVLISKDNYMNFGITTLMGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF >NZ_LN614756.1|WP_011861042.1|1139861_1140665_+|phage-tail-protein MAIDKSYYTIITDVGKAKIANASVTGNKVGFVKIQLGDGGGSEYTPTESQTALKNVVWEGNIGNTTTDETAPNCIILESLIPSSVGGFMIREIGYLDDENNLIAISKYKECYKPSIEQGAVVDMKVKTVLIVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDIQELETKIGTINTKIDTTKTELTSNIETAKTELSNKIGDTTQLNTTDKTNIVSALNEVKTSVDSIETTAEKTSYNNATSKLTATTVQGAIDEVVAKIENFNEVNISIQNDMLPI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_5 | 1216153-1216241 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_5
|
1 spacers
spacers of NZ_LN614756_5
>5.1|1216180|35|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder AATCTGAGTGAATACGAAGGTTGTTCGTTGACGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_5
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_5 >merge|NZ_LN614756|5|1216153-1216241|CRISPRCasFinder GTGCGTTAGCACTTTAAGTAACGGAATAATCTGAGTGAATACGAAGGTTGTTCGTTGACGTGGTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT >NZ_LN614756|5|5|1216153-1216241|CRISPRCasFinder GTGCGTTAGCACTTTAAGTAACGGAAT AATCTGAGTGAATACGAAGGTTGTTCGTTGACGTG GTGCGTTAGCACTTTAAGCAACGGAAT
>NZ_LN614756.1|WP_011861074.1|1213277_1214252_+|glucosaminidase-domain-containing-protein MARKLIKNLGKSKSVKRVKLLFKKIFITVFIVASIVAIFNITKYFEELYKVRDLKSTKIEYYMDVADEAGDGKVQLSWKALLAIDMVIHDEDLSNIKKKDTLDIGEKFIVEDKNDKGEKVYKVKKFNKVLSELKFDSSQKSRARKYMKDLEYTYLGNKQLDSSDEKIKFIKKLEDSAIREYIDYGILPSITIGQAILESGWGNSKLTKQSNNLFGIKADKAWKGKSVEISTSEHYNEKIVASFRSYNSLQDSVKDHSLFLINNKRYRKHGLFEAKDYISQAQALENAGYSTAEDKKGNRIYAELLIDVIRSYNLQLIDNKVETK >NZ_LN614756.1|WP_003437003.1|1212075_1213200_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing) MNDIKVMTVFGTRPEAIKVAPLIKELEKRENIKSIVCVTAQHREMLDQVIETFNINVDYDLDIMEKGQSLNDITCKILNKLPLILNKENPNIILVHGDTTTTLATSLTAFYNKTLVGHIEAGLRTYDKYSPFPEELNRQLTGIIADMHFAPTNLARKNLISEGKPNNNIFVTGNTAIDALKMTIKENYNHPIIDEIGNDRMILLTSHRRENLGKPMKNIFRAIKRIVDDFEDVQIVYPIHLNPKIRTIADEIFGKFPEKIHIIEPLDVADFHNFLNKSYMIMTDSGGIQEEAPSLGKPVLVLRDKTERTEGIEAKTLKLVGTNEDRIYNSVSDLLINKDNYVQMSKASNPYGDGNASKYIVDIIIKKFNCKYLN >NZ_LN614756.1|WP_021360388.1|1210948_1212022_+|hypothetical-protein MNKFKLKRSILISLIILIFIFIVYFVSIELKDRSLVNNQYKGKIKSANLSVDYEINQVMKDIDKLGLNTVNVPIIINVESINSDIMSIDNNSKEKAIKLIKKLNKKGISTILEAYPWIENGKLYETDWNPINKKRFFYTWQNAILNELIIDVANPLDVNVLNIGSNFVHLEEYQQNWGEIIDFVQSKFDGLVTYRTNWWYTKKDDLSSKLFYEQKLNNNFFDKLDFISIAAYFELSNKPVNTVDELISALHSSTVNNRGQNIKQEIYNLYKAHRKPIFFGELGFSNRESASSQPWNHTPSKAVNGEEQARCFEAYKKVFENEDWINGFSVFCVGKIDDEKNFYPSKESIKVIKSWYE >NZ_LN614756.1|WP_009895990.1|1208818_1210900_+|cellulose-biosynthesis-cyclic-di-GMP-binding-regulatory-protein-BcsB MKKFIISIISLVLFFSNISLIYKVNADETKVKNYKFERDITIDGVIGSNSTFFEVNKNWDIEEVLLHLNFSKSQILNGDVSSLTVLINNVPIKSIKLNAKTNYKNTLEVLVPKDYIIQGYNEIKIKTYKTISDKICQDDSNTGNWMVIHKESYISIRYKQKKVENSINEYPYPYAEIENNHKLDTTIVVPDNMTRGETTAVFNLASAFGKITKNDDLKLDVKLYSEMKNWSDDNIIYIGKPENTAEEILDILSIKEQTLLSSNCIIKQVDSPYNKNKKMMVVIGSNEDDLIKASNLLIENRLSNQVLSSSVLVNKETNIKINREQKLNLGHLTLKDLGYSDFLLEGAFNQQALFDVKIPTGKVLDDGSKIILNLRYSDNLDFEKSLVTVSINDVIVGSKKLDRSHSNNDKLELKIPKDIDNKNYYQVKLTFNLSIKNSNCVTRESNNPWAYVSNNSYLALSTKENETLSFENYPYPFVRDDEFNDLTVIMPDYSGSQAMTWMFRLGVTLGANINSHNGNINVIRGKEFSDKYKDTNIVVFGVPHNNSVIKMLNNNLNIKFDKNYSNFISNDKISFIDDYGKNISTIQLIKSPYNNQKNIMVISSMNEKNLYLGMDYLLNKSKVNDLKGDTLIIDEYGEVEDLAYNLKSKKEVKDSSWNMSINKTTKVFLMISFITIIVVMILSMLYIKKYKRR >NZ_LN614756.1|WP_003437008.1|1207539_1208796_+|glycosyltransferase-family-2-protein MRDLNVSEYLFVFSLFSIWSLLLINIILAMGGYIFYFKNFDKEIKEIDEYPMISILVPAHNEAKVIGRTVESLLLLNYPKSKMELIVINDNSSDNSKEILENIKDRYNNYNFTIINTDSLTGGKGKSNALNIGYTISKGDFIAVYDADNTPDKNALRYLVQTIVMNDELGAVIGKFRTRNKNKNLLTKFINIETLSFQWMSQAGRWQLFNLCTIPGTNFILRRSIIEEIGGWDSKAIAEDTEISFRIYKLGYKIKLVPQSITWEQEPETVKVWIKQRTRWAKGNIYVLMKYIKNIFKQGRNKIVFDIAYFFSVYFLFLTSVIISDILFVLSISKLVEISIPINFFLIWILSYLLFIIEVSISLTIEKGEATIENIFIVAIMYFTYSQLWLFVAIKGMIEYLKDIIFKREVKWYKTERF >NZ_LN614756.1|WP_011861073.1|1205826_1207491_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MMFKIFNKSLLKLVVVLSIVLTISNFSLSSYASEITSSTDKVLIIYDSKKETAYNRDILNIMRTLLGRFSSDIELLKLSNYDGEINKNYYSHIFILGINENSYNNDKNTKNLISSLNSYKGTICWLGYGIENLLEHKKYNLDYVGKTNNIVSVNYRGKSYNLDEHYVFNIVESKDTSNKVIGSINDTLNKYPYIINDKNLFYVSKLDLDGVLFYIFCDSLNDIFNIKTFDKGRIFVRIEDVHAFREPKNLVEIADYLSSKNIPFTIALIPAYVNPKNHKVITLSESPEIVKAIKYMQDKGGTVILHGYTHQYKKEEVSGEGYEFWDGKKDEPLKENMKIFVKDRVLNGLRVCIENGIYPLAFEAPHYAMESEGYKELKKYFSTYMGQHQNNDKKFSTNTYPYIIRDTEEFNIFIPENLGYIDPEDKFTFQNIKENLDKLSIVRGFSGGFFFHSYLNIEYLKNTIEYLEKQNIEFMNLRDFNNWVKVDEIQIRNSGDEIIVNYDKDLDEITKSDTRFKSISNISKVLIFIVSISVLIFVIIFIYFKRIDKKKFLK >NZ_LN614756.1|WP_003437011.1|1204988_1205837_+|GGDEF-domain-containing-protein MNRINKKIDLLILALLVFIFLIVGIVILSIRTENKLNVFIMLAIIFFIIMLTYLSNSVVGLITSSIIIFMYTSYILYNNITHNMDVEFISYMWIIATPVSSIIMGNLNKSINELQNTNKKLSEQYKELVTIDSETGLRNLKIFYNDVNMEISKSIRHNTDFSLMIVKLPYYGNLQTIFGENKTNKIVKYIGSNIIECTRNEDIIYSLQKDMIGILMPNTSLEGSKVVKDRIKKRIKELNLDLNNRGKYVNIDVKIAFLQYKSSFGDSINFKNIVEEELQYDV >NZ_LN614756.1|WP_009895984.1|1203706_1204759_+|spermidine/putrescine-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIKFKKAISLIAVGMMIVTLFTGCNKATDSTKVLNVYNVGDYIDESLIDKFEKETGIDVQYSTYDTNEMMYQKVKSGSTHYDLVFPSDYMVEKMKNEGLLEKLDFKNIPNMKYLDKSFLNPVYDKTNEYSVAYMWGTLGILYNKKEVKDPMDSWNILWNPKYKGNIMMFDSVRDTIGITLKKLGYSMNSVNPKEINEAKNLLMKQKDLVLAYVNDEGKDRLLGGEVAMGMLYSGDAVTLMEQNPDLDYAIPKEGTNKWVDAMCVPTTAQNKKEAELFINFLLDPENAKVNAEYIGYSTPNTGALKLLDPEITQNPVAYPSKEVLDKCETFEDIGENIKLYDKAWIELKSK >NZ_LN614756.1|WP_032506555.1|1202921_1203707_+|ABC-transporter-permease MLKLKKITSNIYLALVFLFLYAPIFALVLFSFNDSKSMARWNGFTWKWYGQLLQNESIMSALYYTIVIAILASVISTIVGTISAIGIHKMRGKSKKLILNVNYLPILNTEIVTAVALMSLFVFVKMEFGFTTMLLAHIMFCLPYVILSVLPKMKQLPDNIEDAAMDLGATPIYALRKVILPQIKPGIVSGFLIAFTMSIDDFIISFFNAGNGVSNLSIEIYGMARRGIKPEINALSTIMFAVVLGLLLLANKKESIVRGIK >NZ_LN614756.1|WP_003432157.1|1202091_1202928_+|ABC-transporter-permease MKRKSFLAYPYVVWSAIFVIIPLILVVFFSFTKESGGGYAFTLENYKEVIDPIYMKVFGRSILLAGGATLICLIVGYPVAYIISKARVSRRGSLILLFILPMWMNFLLRTYAWVAILGKNGLLNTFLGWFGIQPLAILYTNFAILLGMVYNFLPFMVLPIYTALSKMDNDLINAAHDLGANNMTVFRKIIFPLSLPGVMSGITMVFMPAVTTFAISRLLGGGKIMLVGDLIEQQFTVVGDWNFGSAISIFMMIVILISMSIMSKFGDESDKEGGGLLF >NZ_LN614756.1|WP_011861075.1|1219846_1221865_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase 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MRRNTKLLTTGILSMAIVAPTMAFATESNAMENNADLNINLEKKSIVLGSKSKVSVKFKEKPDADSIKLKYKCYDMPLNTTLNYNQSTGAYEGIINYNKDPEYLNVWELQGITINSKTNPKTLNRQDLEKMGLNLKDYNVTQECIIEDITSRKDVNKYLRKTSSPITELTGSDRYETAVKISKEGWKNGSDKVVIINGDVSIDGIISTPLATTYNAPILLVEKNNVPNSVKSELKRLNPKDIIIIGDENAISKTTANQIKSTVNASQTRLNGSNRYETSLLIAKEIDKNHDVEKVYITNANGGEVDALTIAAKAGQDKQPIILTDKDSITDNTYKWLKSEDLQNAYFIGGPQMISTNVINKVNGITKDSVTNNRVYGADRHETNANVIKKFYTDDELEAVLVAKSDVLVDALAAGPLAANLKSPILITPKTYVSAYHKDNLEAKSANKVYKIGGGLTSKVMSSIASSLSKHNTTPTEPGNSGGKTVMIDPGHGGSAPGNSSGGMIEKDYNLNTSLATTEYLRSKGFNVIMTRDTDKTLSLGNRTALSNSLKPDLFTSIHYNGSTNKQGHGVEVFYKLKDKNGGTTKTVATNILNRILEKFKLTNRGIKTRVLPSDSTKDYLYVLRSNDMPAVLVECAFLDNENDMSLINSSAKVKEMGTQIGKGIEDSLK >NZ_LN614756.1|WP_011861077.1|1224623_1226537_+|hypothetical-protein 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>NZ_LN614756.1|WP_011861079.1|1233144_1236972_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_6 | 1440053-1440936 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_6
|
13 spacers
spacers of NZ_LN614756_6
>6.1|1440082|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCTTTCATAGCATCCTCTTCTGAACATTCATCACT >6.2|1440148|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTAAGTTAACTCATACATACCACCTTCCCCATAAA >6.3|1440214|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTATAAATCTTTAAATAGCCTTCTAAGCGTCTACTA >6.4|1440281|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTATCAACATCATCTAATTTTTTTGTCACTGTA >6.5|1440346|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT >6.6|1440412|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAACAAGTGTAGGATAAACTTTCCTTGCCCAGTATA >6.7|1440479|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACAAAATTTGCGAGTACACTTATTTCTAATATATC >6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAA >6.9|1440610|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACTCGTGCTATTTTTTTTACACGCCTAAGAGGTA >6.10|1440675|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAAAAATCTAGGAAAAACTATTGTAAAAGCGTTTA >6.11|1440740|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGATTACATGGGCAGTTTTTTATTATAGAGTGTTA >6.12|1440806|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAATCTTATTAAAGATTATTCAAAGTCTTTTGATT >6.13|1440872|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_6
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_6 >merge|NZ_LN614756|6|1440053-1440936|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAGCTTTCATAGCATCCTCTTCTGAACATTCATCACTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTAGTAAGTTAACTCATACATACCACCTTCCCCATAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTATTATAAATCTTTAAATAGCCTTCTAAGCGTCTACTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGACATTATCAACATCATCTAATTTTTTTGTCACTGTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTAAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGACAAACAAGTGTAGGATAAACTTTCCTTGCCCAGTATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTAACAAAATTTGCGAGTACACTTATTTCTAATATATCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGATAAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTGACTCGTGCTATTTTTTTTACACGCCTAAGAGGTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCGAAAAATCTAGGAAAAACTATTGTAAAAGCGTTTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTGATTACATGGGCAGTTTTTTATTATAGAGTGTTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAAATCTTATTAAAGATTATTCAAAGTCTTTTGATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACTGTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >NZ_LN614756|6|3|1440053-1440936|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAGCTTTCATAGCATCCTCTTCTGAACATTCATCACT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAGTAAGTTAACTCATACATACCACCTTCCCCATAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TATTATAAATCTTTAAATAGCCTTCTAAGCGTCTACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACATTATCAACATCATCTAATTTTTTTGTCACTGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACAAACAAGTGTAGGATAAACTTTCCTTGCCCAGTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAAAATTTGCGAGTACACTTATTTCTAATATATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATAAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGACTCGTGCTATTTTTTTTACACGCCTAAGAGGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CGAAAAATCTAGGAAAAACTATTGTAAAAGCGTTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTGATTACATGGGCAGTTTTTTATTATAGAGTGTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAAATCTTATTAAAGATTATTCAAAGTCTTTTGATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >NZ_LN614756|6|6|1440053-1440936|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAGCTTTCATAGCATCCTCTTCTGAACATTCATCACT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAGTAAGTTAACTCATACATACCACCTTCCCCATAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TATTATAAATCTTTAAATAGCCTTCTAAGCGTCTACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACATTATCAACATCATCTAATTTTTTTGTCACTGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACAAACAAGTGTAGGATAAACTTTCCTTGCCCAGTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAAAATTTGCGAGTACACTTATTTCTAATATATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATAAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGACTCGTGCTATTTTTTTTACACGCCTAAGAGGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CGAAAAATCTAGGAAAAACTATTGTAAAAGCGTTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTGATTACATGGGCAGTTTTTTATTATAGAGTGTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAAATCTTATTAAAGATTATTCAAAGTCTTTTGATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG >NZ_LN614756|6|2|1440053-1440936|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAGCTTTCATAGCATCCTCTTCTGAACATTCATCACT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAGTAAGTTAACTCATACATACCACCTTCCCCATAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TATTATAAATCTTTAAATAGCCTTCTAAGCGTCTACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACATTATCAACATCATCTAATTTTTTTGTCACTGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAAGAATTAACTAATGTGAATTTTTTAGACATGTCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ACAAACAAGTGTAGGATAAACTTTCCTTGCCCAGTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TAACAAAATTTGCGAGTACACTTATTTCTAATATATC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG ATAAGAGTGGTTTAAGAAAATAAGTTATTTTTCAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TGACTCGTGCTATTTTTTTTACACGCCTAAGAGGTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG CGAAAAATCTAGGAAAAACTATTGTAAAAGCGTTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG TTTGATTACATGGGCAGTTTTTTATTATAGAGTGTTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AAAAATCTTATTAAAGATTATTCAAAGTCTTTTGATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG
>NZ_LN614756.1|WP_011861148.1|1437669_1439097_+|cell-wall-binding-protein-Cwp26 MKIKKLLTIGLSLSIFIASCPISANALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSIDKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMNDKIVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTVAKNNAIVLVDNDSNKSVLKSTTKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYEPNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDVRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVCNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKIYN >NZ_LN614756.1|WP_009896138.1|1436657_1437479_-|tetratricopeptide-repeat-protein MIISKKITAILVSFLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTNLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETEKDEDKDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPLAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKYLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLRGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >NZ_LN614756.1|WP_011861147.1|1435015_1436533_-|recombinase-family-protein MSVAIYLRKSRADEEAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKIKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHVSYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKASDIDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLSTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVINKAVYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEDQ >NZ_LN614756.1|WP_003419254.1|1434708_1434993_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MCNEISLLDILGTEANYVLDEVELKVQVGKLYEQLNKILTPREREIVQLRYGLTPYGYKTQREIAQKLDISRSYVSRIEKKALKKLEKELVQES >NZ_LN614756.1|WP_003438168.1|1432947_1434612_+|penicillin-binding-protein-2 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MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEEIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRDPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >NZ_LN614756.1|WP_003438166.1|1430967_1431642_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFATIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKESKRGDVDGIK >NZ_LN614756.1|WP_003438164.1|1429716_1430796_+|endolytic-transglycosylase-MltG MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPSGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFPYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAVLDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIKSIEAALYPEKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKK >NZ_LN614756.1|WP_009896135.1|1428178_1429504_+|pyrimidine-nucleoside-phosphorylase MRMYDIIKKKRDNLELSKKEINYFIENYSKGDIPDYQASALLMSIYLNKMNKQETVHLTEAMMNSGDMINLSEIDGIKVDKHSTGGVGDKTTIALIPLVASCGAPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFSTEMEISKFIDSVNKSKIAVCGQSAKVAIADKKIYALRDVTATVDNISLISSSVMSKKLASGADAIVLDVKTGDGAFMKTLEESFELAKSMVDIGTGMNRDTIGIVTDMDEPLGFAVGNSLEVIEAIETLKGNGPKDLVELCEVLGAYMLVLSKVAHDFEDGVEKIRESIKSGTAIQKLKEFIENQGGNKDVVDDYSLFKKSKYKYPVKSTKSGYISKIKAEDVGVSAMILGAGRETKDDILDLSAGIILEKKVGDYVNEGEVLAYMYYNDEQKLSLAKGRFIDSYSIVDSKIEKNKLIYGIVTKEEIKKF >NZ_LN614756.1|WP_011861146.1|1427162_1427975_+|purine-nucleoside-phosphorylase MFEKIAQSSKFINSKSNIKPKIGLILGSGLGDLANDIEDPVTIKYSEIPNFPVSTVAGHAGQLVIGKLEGKEVIAMQGRFHYYEGYSQKEATFPVRVMKELGVEILIVTNAAGGVNKEFKAGDLMLIRDHINFSGSNPLVGKNDDRFGARFPDMSDAYSSKYVDVVKNCAKECNIDVKEGVYMFFSGPNYETSAEVRMAQILGADAVGMSTVPEVIVASHSNIGVIGISCITNMAAGILNQPLSHEEVIETTQKVKSEFMNLVKTTVKNL >NZ_LN614756.1|WP_003438173.1|1442119_1442275_+|hypothetical-protein MALDVKIEVKIIKDVVILNITHWKKETSLLTVKIARSQGDLSYVKYFANES >NZ_LN614756.1|WP_009889000.1|1442553_1442772_+|hypothetical-protein MKILQQFKPYKYDKEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWEEFNEVAKEVAINIAMKKVETVES >NZ_LN614756.1|WP_011861151.1|1443992_1444376_-|hypothetical-protein MRKKFFIGILIVLIISVIAILNIKNDKNVFIGESENWKAKFVTTEGHSKLEIKYKNSKDVVEQKFNYSYQFIDGEDAVVVVKNEILEVGQEKAIKIQRPGLYSNRESSYKLIISWNGNEETINLKKK >NZ_LN614756.1|WP_003433383.1|1444502_1444847_+|hypothetical-protein MNYRLKKSVTTILSLLIMTILLPTNASASKVEDSSMKVMYSEKQVTDMDKLYDMAKNGITDVKSSNEKGIIKNARTGESIYVDSISTTQLLEVKQSKNLTSKIYSKTVFLILIQ >NZ_LN614756.1|WP_009889006.1|1445029_1445245_+|hypothetical-protein MHINQTGFISNGLGIKQQQKKEPTSNSFSYNAPSSWKPVGRDSVQYNCGFELIATLVREGSSWAFNFIVQP >NZ_LN614756.1|WP_009902375.1|1446230_1446548_-|hypothetical-protein MNFRNIYLILMGLGIIILTTIISLIEIKIGFCNEKYFNKLESKYGNIDRKRTIKLEVLYRYVTGFEYIAIGLFTKRLDITIIAIILVATITVILYYLVRKRYITI >NZ_LN614756.1|WP_011861154.1|1447608_1447998_+|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MKINKLPHAELKLMKYIWGVDDVLASRDIIEDMKLKYDWKKSTTLTFLKNLVDKGFLTTDKVDRCMHYTIAIKEKDYLKVETKSFFSFMHNNSFKSFISALHDDEVLDSKSLDKLEEYFKNLKEGDIDD >NZ_LN614756.1|WP_009889012.1|1448322_1448832_+|glycopeptide-resistance-protein-VanZ1 MKSRKHNITKGLFIVYIIILTWIILFKLQFDISSLETMNLRSINLVPFAGSLIINNRVDISEIILNVAIFVPFGIYVCMLKEEWSFIKKVIPIFITSLAFETLQYIFALGASDITDLIGNTLGGIIGIAVFMLLSKIFKNNTIKIINVLALIVTIIVVLFLGLVIFANL >NZ_LN614756.1|WP_003419284.1|1448933_1449128_-|hypothetical-protein MSVIVMCSRCGKEIDKYRNKYITYYEKNTNAEIKVCINCALDLLEKTRENQELNIQEFQDTIIL >NZ_LN614756.1|WP_021361826.1|1449643_1450036_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MAALKSFEKPLTPEEEIEYLTKFKIENDKSAKDTLIERNMRLVAYIAKKYNNSTEDQDDLISIGTIGLIKAIETYNIDKGTRLATYASRCIENEILMNIRSNKKNKTQVSLQDPIGTDKEGNEINTILYM |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_7 | 1650492-1651316 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_7
|
12 spacers
spacers of NZ_LN614756_7
>7.1|1650521|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAACCACTCAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATT >7.2|1650587|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGACATTTTAACCATAGACTATTTTACAAACAAACTT >7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAGATTTAAAAGTTAACAACATAAAAATGATAGATA >7.4|1650719|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTGAACAATAAAACAATCATCTAAAGACGAAGAAAA >7.5|1650786|39|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAATCCAGAAGATGATACACTTCTTGAACAATATATTG >7.6|1650854|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATCAATATATATTTTATAAGCATAAGTTTTACGCAT >7.7|1650921|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAACGTCATATATATCATCTTTAGTTGTAAGAGCA >7.8|1650987|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTATGTCAAATTATTAGAAACTAAAAACCTAGTTGG >7.9|1651054|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATCTAAAAAAAACGACTTATATCCCATTTCTACA >7.10|1651120|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTAGAAAAGGACTATTAGGAAGCAAAGAAAAAAT >7.11|1651186|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTAAATCCTAGAGCATAACCAATTTTCGTAGGC >7.12|1651251|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_7
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_7 >merge|NZ_LN614756|7|1650492-1651316|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTAAAACCACTCAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGGACATTTTAACCATAGACTATTTTACAAACAAACTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGGAGATTTAAAAGTTAACAACATAAAAATGATAGATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGGTGAACAATAAAACAATCATCTAAAGACGAAGAAAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATAATCCAGAAGATGATACACTTCTTGAACAATATATTGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTATCAATATATATTTTATAAGCATAAGTTTTACGCATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAACAACGTCATATATATCATCTTTAGTTGTAAGAGCAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTTATGTCAAATTATTAGAAACTAAAAACCTAGTTGGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAATATCTAAAAAAAACGACTTATATCCCATTTCTACAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAATTTAGAAAAGGACTATTAGGAAGCAAAGAAAAAATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAGTAAATCCTAGAGCATAACCAATTTTCGTAGGCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAAATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >NZ_LN614756|7|4|1650492-1651250|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAAAACCACTCAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGACATTTTAACCATAGACTATTTTACAAACAAACTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGAGATTTAAAAGTTAACAACATAAAAATGATAGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGTGAACAATAAAACAATCATCTAAAGACGAAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAATCCAGAAGATGATACACTTCTTGAACAATATATTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTATCAATATATATTTTATAAGCATAAGTTTTACGCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACAACGTCATATATATCATCTTTAGTTGTAAGAGCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTTATGTCAAATTATTAGAAACTAAAAACCTAGTTGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATATCTAAAAAAAACGACTTATATCCCATTTCTACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATTTAGAAAAGGACTATTAGGAAGCAAAGAAAAAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGTAAATCCTAGAGCATAACCAATTTTCGTAGGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAAT >NZ_LN614756|7|7|1650492-1651316|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAAAACCACTCAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGACATTTTAACCATAGACTATTTTACAAACAAACTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGAGATTTAAAAGTTAACAACATAAAAATGATAGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGTGAACAATAAAACAATCATCTAAAGACGAAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAATCCAGAAGATGATACACTTCTTGAACAATATATTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTATCAATATATATTTTATAAGCATAAGTTTTACGCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACAACGTCATATATATCATCTTTAGTTGTAAGAGCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTTATGTCAAATTATTAGAAACTAAAAACCTAGTTGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATATCTAAAAAAAACGACTTATATCCCATTTCTACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATTTAGAAAAGGACTATTAGGAAGCAAAGAAAAAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGTAAATCCTAGAGCATAACCAATTTTCGTAGGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA ATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >NZ_LN614756|7|3|1650492-1651316|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAAAACCACTCAATTCTTAAAAGATACTGCAATTATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGACATTTTAACCATAGACTATTTTACAAACAAACTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGAGATTTAAAAGTTAACAACATAAAAATGATAGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGTGAACAATAAAACAATCATCTAAAGACGAAGAAAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAATCCAGAAGATGATACACTTCTTGAACAATATATTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTATCAATATATATTTTATAAGCATAAGTTTTACGCAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACAACGTCATATATATCATCTTTAGTTGTAAGAGCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTTATGTCAAATTATTAGAAACTAAAAACCTAGTTGG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATATCTAAAAAAAACGACTTATATCCCATTTCTACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATTTAGAAAAGGACTATTAGGAAGCAAAGAAAAAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGTAAATCCTAGAGCATAACCAATTTTCGTAGGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATATAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGAA ATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA
>NZ_LN614756.1|WP_009902496.1|1650059_1650212_+|hypothetical-protein MDNFLQGVLASLVASLIVYLNSKLFKKVKSHSGRSDFSFELKIKFKKNKH >NZ_LN614756.1|WP_003438549.1|1647580_1648936_-|MATE-family-efflux-transporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASVAVFAICMAFSGPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLVFLKKNFSTLDSNLNKVA >NZ_LN614756.1|WP_003429358.1|1646794_1647463_+|diphthine--ammonia-ligase MKEVLKLADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVEKIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >NZ_LN614756.1|WP_011861207.1|1646299_1646728_+|DMT-family-transporter MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGAFFIVN >NZ_LN614756.1|WP_003438546.1|1645599_1646193_-|DUF308-domain-containing-protein MNFCYNCSIDFGGDFMYTNFNIDFNNFNKKENAIKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >NZ_LN614756.1|WP_011861205.1|1644545_1645481_-|TIGR01212-family-radical-SAM-protein MDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDIVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMMETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNKIDDTLKARNSYQGCKFV >NZ_LN614756.1|WP_011861204.1|1643330_1644275_+|EamA-family-transporter MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKINKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKICYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVTGGRLDFQGLNAFGLLLGVLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYAAGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >NZ_LN614756.1|WP_009902485.1|1641582_1643013_-|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MNLDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGHLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNVDLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYRFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >NZ_LN614756.1|WP_003419819.1|1640798_1641383_-|zinc-dependent-phospholipase-C-family-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >NZ_LN614756.1|WP_003438534.1|1639925_1640705_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MIKHIFCDLDGTLYENGTITKEDIVAIEEIEKKGVQFNVATGRIFKQAHNIIKDSLDMNGYYVCENGSFIYDKDYNVIFKRTIDDNLVKKVIDRFESSDAQLYFKYKGDVIVGSDTTAFRHYSSDFIVDPDFEKRSSFDNLIGNIGVCSENLEELSRIELYLKSEFSEVLEIYFSGTYTLNIVPKSVSKRGSIEHVIKTLNVSPDEVATIGDSPNDICMLEGFKYSFAMSKAREDVKQSANYVVDSVKSAIDVIMEINS >NZ_LN614756.1|WP_009902497.1|1651641_1653375_-|diguanylate-cyclase MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDINEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDENRCMVLGRYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLIKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLESGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQVNSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIEEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >NZ_LN614756.1|WP_009889222.1|1653614_1654460_-|GGDEF-domain-containing-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKTYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLEALRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >NZ_LN614756.1|WP_011861208.1|1654490_1656725_-|EAL-domain-containing-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQYIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIKLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFDFKDNSFYNKLENDKEFLSEISHVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRRWIDNNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYSVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLAELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSEKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEASEHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNILSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYVDVNKIKNLTKI >NZ_LN614756.1|WP_003429371.1|1657508_1658318_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKMYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >NZ_LN614756.1|WP_011861209.1|1658462_1658702_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYRGDRKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNIDRNWCKDKK >NZ_LN614756.1|WP_003429374.1|1658888_1659065_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >NZ_LN614756.1|WP_003429376.1|1659569_1660244_-|MgtC/SapB-family-protein MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >NZ_LN614756.1|WP_003429379.1|1661094_1661460_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKIRAEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELRQSNKTFSELQHNIYGINQKMLIQQLKELRDFGIIDKISSAGYPLHVEYFLTNRGKKMLKAVEIMQEIGIEYMLEHGQQEILDNKGICYNK >NZ_LN614756.1|WP_003438593.1|1661924_1662710_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIVKIDNTLEKEFWQYVSHEESLNLFIIGYVENYGFSSQYQDIWSQVEDGNITSIILKNKSTLIIYSFKNNFNIGEMKNHIKDLDVESISGKKCVIDRLISKYKDFYEKLDNKFCVLKEIKEIDFSNMKEYKIENAQEKDIDEIGKLLNRSDYKVSKNYIEERKVHLKEGNVRAYFIRNDDTMISTVSTGMETSFLAMVVSVSTDKRYRGKGLASYMVYNLSKELLLEGKVPCLFYNNDVAGKIYHNIGYKEINEWTILFK >NZ_LN614756.1|WP_021366524.1|1662806_1663601_-|delta-lactam-biosynthetic-de-N-acetylase MIGAFALILFGIASINFKSLDKTKTQISSPTLDTHEYDWYFNPREDGKQPSPIKEADFFKKYGAYYVGNPNEKVIYLSFDAGYESGNTPKLLDTLKKHNAKAQFFVVESYIKSNPELIKRMEKEGHLVCNHSKSHPSMAGITDFEKFKEEITSVEKAYKDVTGKEMPKYFRPPMGKFSEQSLKYTQDLGYKSIFWSFAYVDWYEKKQPTHEFAKNKIYSRTHPGAIVLLHPNSSTNTEILDEVLTHWEKEGYKLKTLDYLNNKK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_8 | 1761576-1762131 | TypeV |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_8
|
8 spacers
spacers of NZ_LN614756_8
>8.1|1761605|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCTATTATTGGTATATTAAATGATTCTAATAATTC >8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTCACATTGACAGCTCAAGATAAACATGGAATT >8.3|1761736|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATCGTTTGATTGGAAGTATAAATTATAATGACC >8.4|1761802|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGAAAGTTTAAAAGTTTTAACTATAAATTCAGTTG >8.5|1761868|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTTTCTAATGCTTTTTTTACATATGGAGCTAAC >8.6|1761933|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCATCAGCCTTATCCTGTGCAAATAATAGTGCCAAG >8.7|1761998|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGGT >8.8|1762064|39|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCAAAGTTGGACTAGCTTCATCTTTTAATTTTACAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_8
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_8 >merge|NZ_LN614756|8|1761576-1762131|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATCTATTATTGGTATATTAAATGATTCTAATAATTCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATGTTCACATTGACAGCTCAAGATAAACATGGAATTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTAAATCGTTTGATTGGAAGTATAAATTATAATGACCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATGCTGAAAGTTTAAAAGTTTTAACTATAAATTCAGTTGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTCTTTTTCTAATGCTTTTTTTACATATGGAGCTAACGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCCATCAGCCTTATCCTGTGCAAATAATAGTGCCAAGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATAGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGGTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTCAAAGTTGGACTAGCTTCATCTTTTAATTTTACAAGTGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >NZ_LN614756|8|5|1761576-1762131|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATCTATTATTGGTATATTAAATGATTCTAATAATTC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTTCACATTGACAGCTCAAGATAAACATGGAATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTAAATCGTTTGATTGGAAGTATAAATTATAATGACC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GCTGAAAGTTTAAAAGTTTTAACTATAAATTCAGTTG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCTTTTTCTAATGCTTTTTTTACATATGGAGCTAAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCAGCCTTATCCTGTGCAAATAATAGTGCCAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCAAAGTTGGACTAGCTTCATCTTTTAATTTTACAAGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >NZ_LN614756|8|8|1761576-1762131|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATCTATTATTGGTATATTAAATGATTCTAATAATTC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTTCACATTGACAGCTCAAGATAAACATGGAATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTAAATCGTTTGATTGGAAGTATAAATTATAATGACC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GCTGAAAGTTTAAAAGTTTTAACTATAAATTCAGTTG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCTTTTTCTAATGCTTTTTTTACATATGGAGCTAAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCAGCCTTATCCTGTGCAAATAATAGTGCCAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCAAAGTTGGACTAGCTTCATCTTTTAATTTTACAAGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >NZ_LN614756|8|4|1761576-1762131|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATCTATTATTGGTATATTAAATGATTCTAATAATTC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATGTTCACATTGACAGCTCAAGATAAACATGGAATT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTAAATCGTTTGATTGGAAGTATAAATTATAATGACC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT GCTGAAAGTTTAAAAGTTTTAACTATAAATTCAGTTG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TCTTTTTCTAATGCTTTTTTTACATATGGAGCTAAC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CCATCAGCCTTATCCTGTGCAAATAATAGTGCCAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT AGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTCAAAGTTGGACTAGCTTCATCTTTTAATTTTACAAGT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
>NZ_LN614756.1|WP_009902545.1|1758823_1760917_+|GGDEF-and-EAL-domain-containing-protein MNKHNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEKNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTSLNKPIKINEFHEISNNKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVKNPLVYWKKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLDIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSIQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYNQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTESHKIIGVEVLLRWTNDKCKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >NZ_LN614756.1|WP_071605615.1|1757247_1758171_-|DUF2520-domain-containing-protein MGSGKVGTSLANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTNIKKMKDICFSIEGDNEQDDLVIQNFIDDLGNQFFIRDKDTSSTYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLDKKDEDIYKILSLNLLKIIALGNDNSLKGIKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >NZ_LN614756.1|WP_003439367.1|1756445_1757273_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIESIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVNTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >NZ_LN614756.1|WP_009902543.1|1755578_1756427_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKHGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAVKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPENIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >NZ_LN614756.1|WP_003439365.1|1754966_1755149_-|hypothetical-protein MFKDKIDECVHIMTAYIASLKEYYSFIETQIGDFIKKYGEDVVELCLHRVMILLCECGLA >NZ_LN614756.1|WP_003439363.1|1753220_1754135_-|DUF2935-domain-containing-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYTVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSVAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVNPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKNAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >NZ_LN614756.1|WP_011861240.1|1752183_1752831_-|lactate-utilization-protein MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEMGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTVASPAVVQRFQDVNTPCYINGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >NZ_LN614756.1|WP_009896453.1|1751447_1752017_+|lipoprotein MKKFIICIIMFAISVLVLAGCTNDNKIKNEVDSMFNSIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSAKKKEFNITLELVKSGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >NZ_LN614756.1|WP_011861239.1|1750543_1751443_+|4Fe-4S-binding-protein MKLLSKVNNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKVPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAIVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIHGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >NZ_LN614756.1|WP_009889347.1|1750383_1750533_+|hypothetical-protein MSNFIKDNKKGISIIAISIIFIALGTYRGETNTVLTKAIMICLECIGIG >NZ_LN614756.1|WP_032506863.1|1762298_1762583_-|hypothetical-protein MFVRVKIVIGATIRYLIKHKVNYCNKKSLDKLELKYGNIDREKAVKLEIFYQYLIELEYIEMSLLIRRLDTAITSLALVSIITIASYYLIRKNV >NZ_LN614756.1|WP_009893097.1|1762789_1763608_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >NZ_LN614756.1|WP_003439379.1|1763740_1765861_-|ferrous-iron-transport-protein-B MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFVIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIENVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >NZ_LN614756.1|WP_003420037.1|1765886_1766114_-|ferrous-iron-transport-protein-A MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >NZ_LN614756.1|WP_003427501.1|1766440_1766881_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >NZ_LN614756.1|WP_003439382.1|1767032_1768022_+|DUF2232-domain-containing-protein MIYGGSVLNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRNLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLLNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVIGLIIINAFLNKKINIRLSQSNIVNKQINLLIEK >NZ_LN614756.1|WP_009889364.1|1768498_1769707_+|tyrosine--tRNA-ligase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAKEAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVKEDGFDLIEVLVSNEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >NZ_LN614756.1|WP_009896478.1|1769767_1770649_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPNRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKVLGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >NZ_LN614756.1|WP_003439388.1|1771034_1771979_+|DMT-family-transporter MQKNKKEGALLKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMGKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >NZ_LN614756.1|WP_009889371.1|1772201_1772747_+|NADH-peroxidase MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_9 | 1940781-1941794 | TypeV |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_9
|
15 spacers
spacers of NZ_LN614756_9
>9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAG >9.2|1940877|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGG >9.3|1940943|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAAT >9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATT >9.5|1941074|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAG >9.6|1941140|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCT >9.7|1941205|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA >9.8|1941270|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC >9.9|1941337|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT >9.10|1941402|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA >9.11|1941468|35|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC >9.12|1941532|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG >9.13|1941598|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT >9.14|1941663|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA >9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_9
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_9 >merge|NZ_LN614756|9|1940781-1941794|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAACGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGCGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAGGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTTGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAAGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTTGTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT >NZ_LN614756|9|6|1940781-1941794|PILER-CR GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT >NZ_LN614756|9|9|1940781-1941794|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT >NZ_LN614756|9|5|1940781-1941794|CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT AAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
>NZ_LN614756.1|WP_011861291.1|1940345_1940585_+|hypothetical-protein MECYLKRTLIIFSEAFLSISFKTRKYLFIVIFILVCPNLSEMIFILVPARRRIIRIDNIVSIYKYVGVLKLINYSILIL >NZ_LN614756.1|WP_009896806.1|1938862_1940134_-|amidohydrolase-family-protein MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQDSITDTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPIQSHLSENYDEIEWVRSLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >NZ_LN614756.1|WP_009889555.1|1937467_1938223_+|DUF1835-domain-containing-protein MAHICFEDICYLLLKEAMKLKLIPHNKIVLFEDDLSIGNIFDVNNYELRENIFKIRNVFENNPKLLFKPDLLEDRKLSKCRNIIIWCANNPKDLCGVYYVVSKFQDKNIKIALVDEKKTEDALIRYSFTSEMSPEDFPFFLDKTLEIGFNEKLEFKNKWDVLVKENSIFRALVGNEIKSVEETYFDKYILRNISDKWQPLIEVVANCMFEDEMRVKDWFILWRLEKMASLKIVKIKGSKGDFYSDKEIRKV >NZ_LN614756.1|WP_011861290.1|1936173_1937292_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MVVVEKAYKFRMYPNKKQQELINKTFGCCRFVYNKYLAKRIDVYKNNKETFTYKQCSSDLTNLKKELKWLKEPDKFSLQNALKDLDNAYKKFFKEKTGFPKFKSKKINRFSYKTNFTNGNIMYCGQHIKLPKLGMVKIRDKQVPQGRILNATISKEPSGRYYVSLCCTDVDIEAFENTNNHIGLDLGIKEFCISSCGEFIENPKYLKKSLNKLAKLQRELSRKTIGSLNRNKARLKVARLQEHIANQRKDFLQKLSTKLIKENDIICIEDLQVKNMIKNHKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKNLNIREWICPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >NZ_LN614756.1|WP_004454504.1|1934837_1935155_-|pyrimidine/purine-nucleoside-phosphorylase MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >NZ_LN614756.1|WP_011861289.1|1932394_1934752_+|HAD-IC-family-P-type-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFDNGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKIANDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYKAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMALAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >NZ_LN614756.1|WP_011861288.1|1930514_1931972_+|aminomethyl-transferring-glycine-dehydrogenase-subunit-GcvPB MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDQDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINVLKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPVIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >NZ_LN614756.1|WP_011861287.1|1928040_1930515_+|aminomethyl-transferring-glycine-dehydrogenase-subunit-GcvPA MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEKVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGAESEKFIQNLVTNDISTLKINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEDYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSIIVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAMNQTRKSKIVVSKTIHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >NZ_LN614756.1|WP_011861286.1|1926719_1927235_+|HXXEE-domain-containing-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKIYENYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILTVITENQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >NZ_LN614756.1|WP_009889552.1|1924464_1926195_+|Na+/H+-antiporter-NhaC-family-protein MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE >NZ_LN614756.1|WP_018112776.1|1942202_1942490_+|hypothetical-protein MKKILYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKNDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >NZ_LN614756.1|WP_004454500.1|1943028_1943580_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSINTVIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESIHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >NZ_LN614756.1|WP_162835944.1|1943764_1944733_+|pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MVMRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIVLTLNDSGLKYLSTDLYEEL >NZ_LN614756.1|WP_011861293.1|1945027_1946872_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MQKRILRNFIFTGKNILSKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPMSIVLIILSVIILAFYAFFEFTSVIICLNKSIKYEKIGLFELFKISFENSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPEYILDYIKSDIILNIIYMIFLLIIYISVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYAIYHSGIIFIGIWTKYCTDMEFLKNVFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVNISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHINGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIEEASNAKADYAEIDVQETKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDIYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >NZ_LN614756.1|WP_011861294.1|1947176_1947707_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNALIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >NZ_LN614756.1|WP_009889562.1|1948809_1948986_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >NZ_LN614756.1|WP_011861295.1|1949560_1950583_+|membrane-protein MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILMISIFITPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDVGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRIVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVVSNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGAMSLCFLVIKSDCISR >NZ_LN614756.1|WP_011861296.1|1950596_1951484_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIENLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDADYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKYLNSKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDINSIVLRIVSEDIPSEDNIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >NZ_LN614756.1|WP_009896816.1|1951489_1952263_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLIFFGFFLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLVANGLILSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAIKFMSVTPNWIMMSQQMVKYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF >NZ_LN614756.1|WP_004454491.1|1952374_1953100_+|response-regulator-transcription-factor MENRVLIIDDEVEILKLLETVLKKEGLNNIYTAKTKKEGLELFKSINPDLIVLDIMLPDGEGYDICKEIRKTSNSPIIFLSAKTEELDKLLGLAIGGDDYVTKPFSPKEVAFRVKAHLRRLSYFSDAQNESKNLNNNEEKIISFGPYILNESRAELIKDGKSIGLSAKELKILSLFAHNQNQIISKEKLWDKVWGEDYVGFDNTIMVHIRKIREKLEDNPSKPEYILTIKGLGYKLAVKED |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_10 | 2258328-2258495 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_10
|
2 spacers
spacers of NZ_LN614756_10
>10.1|2258364|36|NZ_LN614756|PILER-CR TAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCT >10.2|2258436|30|NZ_LN614756|PILER-CR TAGAGGCTCTCAGAGAAGTTATAAGATGTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_10
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_10 >merge|NZ_LN614756|10|2258328-2258495|PILER-CR TAAAAATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACTTAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCTCTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACCTAGAGGCTCTCAGAGAAGTTATAAGATGTTTAGTAACTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACT >NZ_LN614756|10|7|2258328-2258495|PILER-CR TAAAAATTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACT TAAGACTAGCAGACTCATAAGCAATTAGTTGCCTCT CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACCTAGAGG CTCTCAGAGAAGTTATAAGATGTTTAGTAA CTTTACATACCACATAGTTGATATAAAACT
>NZ_LN614756.1|WP_003431034.1|2257769_2257970_+|cold-shock-protein MNNGIVKWFNNEKGFGFISMEGRDDVFAHFSAIQTSGFKSLEEGQQVSFDIVKGARGPQAENITIL >NZ_LN614756.1|WP_009897136.1|2257367_2257544_+|hypothetical-protein MFGNKMDKCTHVLTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >NZ_LN614756.1|WP_009897134.1|2255591_2256077_-|SH3-domain-containing-protein MISELMLKNFRKSSINFKTKIKLNLREKPDINSLKLKSIPEGKIVKLKCVDGIWAEVESNYDKGWLLYKYLERLSNAKNNSNDTIKNRKKNYIGNIRTNGLSLELRNDRTLESKVITTIPDGFKVEVCYSVGKWARVNINKNEKRYSGYVYNQYIEEHLSL >NZ_LN614756.1|WP_011861413.1|2254837_2255236_-|hypothetical-protein MNKKKKLIGIAISFLLIISIINPLQVEAEAIIESSVYISSIKENYTYDNTKFKTIKSKSRHKSRKYNKSKVKLKKRSIRTKKYGYQTINKYKRQNARRHNILTKLILFIIVIFLVIVLVVLIFIKRKKKKFY >NZ_LN614756.1|WP_003435247.1|2253436_2253988_-|tryptophan-transporter MKTNTKKLTLNAILLAMGLLIHQITPAIGLPMKPDVPLAMLFVILVLNRDDYKTCLIAGIVTGIFTALTSSFPGGQIPNVIDKTLTANIVFLLMNISYNMPFIKKLAKKTQDTVVVAIIMPIGTLVSGTIFLLAAQAIVGLPGASFTALFLAVVLPAVLINLVAGIFLFKIVSLSIRRVSYQA >NZ_LN614756.1|WP_009897130.1|2251172_2252609_-|cell-wall-binding-protein-Cwp28 MKFYKRILTLTLSISFVFANIQLVDAISSVEKIQGKNKYEIAGKIADKNAYKTAILINTSNSIADGLSASGLAGALNAPILLTEKNTIPTETSARLKNVSKVYIIGGTYSISTSVENSLKSKKMKVVRIKGNDRIKTSYNVAKEINSIKKVNTVMLTNAYKGEADAISIASVAARDKAPIILTNGQSIPFSTSGLKSYVIGGTASMSTTLVNNTKSTRLGGSTRFETNKAIINKFYKDAREFYIAGAYELTNALVGSSLSKHGPMVLVNDGSNKSILKNAKKITSIGYIDSNIVQQCLNITNGIGDINTGVVKNVKPTTKTIKDGMYKVGKDISAGEYLITSNSGSYASYYEVTSDSTGNADSILSNDIFSGTRYITLKNGQYIKIEDSTMTLAKYAKAQKAKNGKFGNGMYKIGLEIPAGEYIIMSNSSDAYYEVRNDSLGNAEGIVTNDTFSGRRYITVEEGQYLILNDCYLIENE >NZ_LN614756.1|WP_003435252.1|2249488_2250925_-|tRNA-(N6-isopentenyl-adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase-MiaB MSKRKQVTIPIEKIQEQDKYIEQIHRQNEEYFNRTGKRKLVFTQTFGCQMNEHDSEKLCSMLEEMGYQMSMMVEESDLIIYNTCAVRENAELKVYGNLGQLKHLKGKNPDMKIAVCGCMMQQPHVVEELRKKYKHVDLIFGTHNLYKFPQLLTESINSDKMLVDVWDVDGEVIEGLRSNRKFELKAFVNIMYGCNNFCTYCIVPYTRGRERSRTPEDIINEIKELVANGTKEITLLGQNVDSYGKTLENPVSFSELLRKVNDIEGIERVRFMTSHPKDISDEVIYAIRDCDKVCEFLHLPIQCGSSSLLKKMNRHYTKEYYLEIIEKAKKEVPGIAFSTDLMIGFPGETEEDLLDTLDVVEKVRYDSAFTFIYSKRQGTPAAKMENQIPEDIKHDRFNRVLEAVNRISAEINDGYKDRIVEVLVEGRSKNNENKFAGRTRQNKLVNFEGGNDDLIGKLVMVKITEPRTFSLNGILVNN >NZ_LN614756.1|WP_009889960.1|2248743_2249082_+|DUF3784-domain-containing-protein MFAVGFVVIIALAFFILSVLLFNGKASMLLAGYNSMSKKEKARYDKKKLCRSSSIVTFIVSIMLFIMAFLGYRIESGQMDEKKMVPFSIIFIIVILSSVFFNILYSNKKCKK >NZ_LN614756.1|WP_003435254.1|2247834_2248446_+|CoA-pyrophosphatase MINDIKNKFKNYKPYINGYKNMKRASVLIPIVEINNTHYILFEVRSKNLKHQPSEISFPGGKIESGETPYEAVIRETCEELGTFSDNIEVISSLDLLITPVKFIIHPYLGYIKNINNLNINKDEVDHTFLVPIKYLLENPPNTYSNTVKVFPDENLPYGSIPNQKDYKFESGSYPILFYKYKDYVIWGMTAKILENFLNFLSE >NZ_LN614756.1|WP_003428797.1|2246079_2246436_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDIDNNFEEFPNIEERQKDFNCSIGFTMTVIGSKWRAIILWHILKQEPIRYSQLKKEVVHISHKILSQELKYLERDGLIKRISYPTIPPKVEYLSTKRGKSLESILLELCNWGKQYMR >NZ_LN614756.1|WP_021361892.1|2258720_2258903_+|integrase MFKFYNNATLMFLPGTNIKTISERLGHADIKITMNSYSQFLEEMDREAFENLSKILFIVF >NZ_LN614756.1|WP_011861415.1|2258973_2259819_+|lipoprotein MNIIKSITLLLTLLIVILMTGCSPRESASEVAKKYIDKMNSGDYETAYSLLSKDSKKKISIENLEEFQNILVSTKRIISYKIGKEKIIKKYKHDGKEYKNVVKLEETFNIKNLLYKKDDSLKVNRYFVVENNKYKLLLYESFKKEFGINSMDLAQLKLNDFGLKYFKEVDLILKKAIAINPTDSKLYYAQACNYMNFDGFPGYSDTTYNALDSINKSLKYLDKNDSDYKKNASNIYNLKGVILMFHKRFDEAQQYLNKALYFNKDNEDPKYNLNTIKKHLN >NZ_LN614756.1|WP_003424195.1|2260042_2260207_-|hypothetical-protein MFGKPKESVRFLDFNDVAEKFGEKKAVAIFDAIAGKKSKEHIIKDIEKLVKNEV >NZ_LN614756.1|WP_003435227.1|2260747_2261080_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MNTREMKEYRVFYNKKLSETDEFFRVFGSLDDKTYSEGAISKKNKELMGLAISILSRCDECICYHIEGCINSGASKDEIIEAIKIGVIGGGSITYPNARFAIKILEEFNI >NZ_LN614756.1|WP_003435225.1|2261323_2261965_-|SdpI-family-protein MKKAINKQFILSTLICFIPFIVSIYFYNRLPNEVAIHFDNYGNPDNYAPKVIAAFGVPLLMLCIHLYTWFRLENEPKKANFSNVIQNLSKWGVAILSVIIQIMMVLYSTGVSLESNFYTGLILGIIVILFGNYLPKCKRNYSVGIILPWTLNDEDNWNKTHHLAGWIWLIGGILLIINAFINIPFYNIFVIFVIVILPFIYSYLMYKISGKNN >NZ_LN614756.1|WP_009889969.1|2261945_2262239_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MGFPETFKALSDPIRREILVMLRENKMSAGEISEKFNMTNATISYHLSQLKKAGLIFETKYKNFIFYEINISVFEEVMLWFSQFMEKGEKDNEKSDK >NZ_LN614756.1|WP_071605632.1|2262631_2262691_+|IS3-family-transposase MTEYIYYYNNKRIKKINLA >NZ_LN614756.1|WP_011861417.1|2263206_2263959_-|TSUP-family-transporter MFSVIFLCIGGFLAAFVDSIAGGGGLISMPVLMAIGVPVHLAIGTNKFAASAGCISSAYRYAKSGKINNNLLKKLVPFTIIGSVLGVRCVLSISEEILNVLVVVMILIVAIYTFISKNLGQEDNFEAVNKKNLRLGMLMALIMGFYDGFFGPGTGTFLTFGFIKIYGYDFLHASANTKILNLTSNITSLLLFMINGQVDYKIAIVFALVMIMGAYVGAKVAIKKGSKMIKPIFLVMALFMVVKLVYQTLV >NZ_LN614756.1|WP_011861418.1|2264017_2265673_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEYFSESNNEVQKFDWGEVMWIHEPSKTQFNRLSAGIVRFFPGNYQEKHFHLSEEQLLYVIQGEGIQIIDGKKVNIKETSIVYCPPYSEHEIINTGKIDLVILITYVPHKFSSLRQIPIVFSENNIQELVNVNIIENLANQISNILKLRISVYDLKYKEIFETKKENKFCDICKNIKQCTKKLVKSINNDNFEKVYHCEYGVSSLEIPIVLEENIVGYIECGNFIVYKSIDIDKNLSELSSSSGIDIKYINKIYNEFPLNPKSRLYVLKENLLMMSEFIQEIAKRNFFENQLSIKDEEILKSRKENIRLEEALKKANSRLLEEEYIINPIDMFNNSSKEYPFELELYIEKEIKNMNLEGVYNLIDTNKLRYNDVRDTIQEMIFVLSRTVLRDLEDLKLISYLRNKYNKKISLVNSDEDLWNVLFEFSKECIDKNRAFWRKDKGNLIENINEYIKKYYKENINLNSISDVFFISPNYLSSIFNERNKVSITEYINLLRIEESKKYLLDRSMSISDICKKVGFNNSSYFSQIFKKFNSITPNEYRKNMLDNKY >NZ_LN614756.1|WP_021361893.1|2266945_2268025_-|alpha/beta-hydrolase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_11 | 2620234-2621185 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_11
|
14 spacers
spacers of NZ_LN614756_11
>11.1|2620263|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA >11.2|2620328|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAAC >11.3|2620393|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATC >11.4|2620458|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTC >11.5|2620523|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTT >11.6|2620589|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGA >11.7|2620656|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTG >11.8|2620721|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAAT >11.9|2620788|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGC >11.10|2620855|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTT >11.11|2620921|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTC >11.12|2620988|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTT >11.13|2621055|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAG >11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_11
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_11 >merge|NZ_LN614756|11|2620234-2621185|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAATATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTCATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACTTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >NZ_LN614756|11|10|2620234-2621185|CRISPRCasFinder ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >NZ_LN614756|11|6|2620234-2621185|CRT ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTAGTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >NZ_LN614756|11|8|2620299-2621185|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATATAAAATGGGATTAGTAAAAAACACAACAGGAAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTCTTCGTCTTTAGATGATTGTTTTATTGTTCATC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATTTTTATCACCTGAGATAGTAATAGTCGCTTTGTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ATAATGTATTGAAAAATCAAATAGGCGTGCAACTTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTATGCTTGTTTATTATATTTATTCAATAGTCATGAGA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CCACGCATTTTAGTTCAAATTCGAAGTTTTTGGCTG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC CTATCCTTTCATTCATTTAAAATTTATTCCTTTCAAAT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACGACGTTGAGATTGCGGAGCTTCTCAACCTTGTACGC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GTTCATCAGATGGATATGCAAATGGAGATATAAAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTTATATCAGTCTTTTTAGTCGCTGTCTGAATCTCCTC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTATCTAAAAGATGATAATAGCTACATTTTGTACGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC TTGTAGATTTTGTAAGTAATGGTTTTTCGGAAAAAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAAATAAGCTATGAAGCTAAAGGAGAAATGAAAGGAG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>NZ_LN614756.1|WP_021361915.1|2619890_2620043_-|hypothetical-protein MKNCRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >NZ_LN614756.1|WP_004454578.1|2618744_2618906_-|hypothetical-protein MCENLLDNMYIEKRKEEYRIKLLKIRETDIDIYNKLESIVYKLSEKKLEKNNK >NZ_LN614756.1|WP_011861514.1|2617952_2618417_+|hypothetical-protein MDFGEVKSELSDKDLKDNEEALNKYKKYYLKVYKYYSEMDSIKSIQDIEIEQSRLKGQLQKNSNPIFALYISIMAVVFSTTINLTFDLSDITNYFIRMIMTLLFIVLLIFLVNKGILPIAIPYRNNIQFYTTALDVLEDMKNKILRERKYKKRR >NZ_LN614756.1|WP_009897465.1|2617499_2617817_+|hypothetical-protein MDFGNINLILIGIIVIIGTTIIYLIKPKTAFCSKKYFNKLESIYGNIDKKKTVKLEVLYRYVTGLEYIAIGLFTRRLDITIIAIILVAIITTALYYLIRKKYITI >NZ_LN614756.1|WP_011861513.1|2616920_2617217_+|hypothetical-protein MYFKTYILKREVNNKQLEITRSFDLDNLICTATEILKDNEIDLIITDEVNNVVWRNEKSTPPARECLVIAIEVYWWYTSIFLLYHINYVIKKNYLNRF >NZ_LN614756.1|WP_009897459.1|2616488_2616902_+|hypothetical-protein MKVKSKRSFIVGIIVCVLCCASLVIYCILKDKRFLISSFLLIVIAIFNFCNAFSRKGIVEELHDSTDERDLYLTMKTSHILVKIMNYTLFTFTFLFIIAYSAWKNQSLLVIAITLCVIEIFLFVAYLLINIFLEKKE >NZ_LN614756.1|WP_003423177.1|2616271_2616505_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKTKVREFRTNMGLTQQQLADLVHVSNRTIISIEKEQYSPSLMLAYRMAQVFGTTIEELCCLKENKEMEDKKHESKE >NZ_LN614756.1|WP_009897458.1|2615678_2616053_-|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MKISKLPEAELKVMRYICEANKVLTSRELVAAMEEKYEWNESTTFTVLKRLERREFLSTEKIGKLTHYNILVKEKKYLRFETKEFLKNIHKNSISSLMSALHGEDDEVDEDKLSELEECFKNLK >NZ_LN614756.1|WP_004454566.1|2614374_2615067_-|response-regulator-transcription-factor MYNILVVDDDKEIVDSIEIYLKSEGFKIYKAYDGMKALEIITENDIHLILMDIMMPKLDGIKATVKIREERNIPIILISAKSEDTDKIIGLNIGADDYITKPFNLLELIARVKSNLRRYVTLGNYEDTCKEILKSGALELNTLTKEVKIDGENIKMTPIEYKIIELLLENKGRVFSIDEIYEKVWNEESFNSENTVAVHIRRIREKIEINPKEPRFLKVVWGVGYKIEKF >NZ_LN614756.1|WP_009897457.1|2612118_2614179_-|sensor-histidine-kinase MEKYRVLKLVSLIIISISFPLTILLVTIGLAEPKYNIQKTSTKSGIFDISDDFYDSNIFDEGTMASLLPKFKLSVGGKLTSKEKGKFQQEGKSIDLSSSDSEYDKIMINEQASEEYLSYLKNIKVYVINTYTGVFYTNTSYASLYDFKQKTKSYCNVEIINKIGKSSYIKTINGEKFELNNLSLELNEVDEGFEAYVSFPEEPTIEDGIVYTNFQIFKQATEKVRLFFVASLSLAIICLLSIILYIKIKGEVLKRNNVFLLIYSKIPMEFNVILVSISIAILTIYALAVSYHIDVIALVSLSLLIVSNNIFFINVQLSYLENKMCIFKTSIIVRVILWLIKTVREVSNAIKKVSLARKVIVIVIISLALIMVISTRSIGMGLLFSICIFLGFTIYITKRLSYLSYVIEGTERIKKGELDYKIKITGNDNFTSLAENINNIGEGLDRAIEEQVKSERMKSDLITNVSHDLKTPLTSIINYVDLIKKEESIQPEYINDYINVLESKSKRLKLLIEDLFEASRVSSGNIELQISKIDLVQLLRQSIGELEEKLSKNNLYLKLNVPNDKVYIWADGRRMYRVFENLLSNIAKYSLEETRVYIDVYDYGENVKVTMKNISSYELNFDPSEIMERFKRADESRNTEGSGLGLAIARDLVALQGGKFYIEIDGDLFKANLEFQKYEEEITNME >NZ_LN614756.1|WP_011861517.1|2621451_2622375_-|SHOCT-domain-containing-protein MVGAFVLPNYAITLSEMSNLWGNFTMWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMALVSVLFFTYSIYLCATWKDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVEKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAITQEEYNKKKKELLE >NZ_LN614756.1|WP_004454589.1|2622568_2622721_-|hypothetical-protein MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >NZ_LN614756.1|WP_009897482.1|2622994_2623318_-|hypothetical-protein MARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >NZ_LN614756.1|WP_004454592.1|2623353_2623608_-|hypothetical-protein MENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >NZ_LN614756.1|WP_011861518.1|2625331_2625709_-|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MKEEILIEKLLRVELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVDKRYLARYIINFQSYYKIIIDNKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMHSLTTIHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >NZ_LN614756.1|WP_011861519.1|2626512_2627007_+|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MKNKKGFTLVELLVVIAIIGILAIVALPALFKNIEKAKIAKLEADISAIKSASLSYYADESKYTDGGMISWVKKDGKIIINGGFKDDPLADKIENLGMPYNGSYLLMSSPGHEKYLELSILPEGEISKSGLDKLKSDYGSSIDIKNDQNKIDIVIKLLNDKSNT >NZ_LN614756.1|WP_004454601.1|2627395_2627566_+|hypothetical-protein MHVYQPKTSEYLLNTSAKSYLSSIVFLFDYITKNESRYAFFIIDFPFLSLDIFYKF >NZ_LN614756.1|WP_011861520.1|2628393_2628744_+|DUF3796-domain-containing-protein MIQKKFFMGFCGFLGFLSLRYFSSGNVADLTYIGFFAFFSNFIIAKINGDKADERYVQDEKAAMAFTGQLAIIELFILWCITIVSRNVELMCVLLSITYAITLNVYAIKLYILEEK >NZ_LN614756.1|WP_003423163.1|2628745_2628946_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MPKFICNLKKYRQLKELTQEQLAEKVGVRRETIMRLEAGKYNPSLKLAIDISKIVDTPIDELFIFD >NZ_LN614756.1|WP_009890506.1|2629268_2629445_+|hypothetical-protein MFRDKMDKCTHMLTAYIGSSYDYCDFIDTQLDDFILEYGEKVVESCLHQVMVLVSKYN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_12 | 2782867-2783024 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_12
|
2 spacers
spacers of NZ_LN614756_12
>12.1|2782895|38|NZ_LN614756|PILER-CR AATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >12.2|2782961|38|NZ_LN614756|PILER-CR ACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACC |
cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_12
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_12 >merge|NZ_LN614756|12|2782867-2783024|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT >NZ_LN614756|12|9|2782867-2783024|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAA TAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTG AAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATAC AAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTG AAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT
>NZ_LN614756.1|WP_011861555.1|2781777_2782725_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEVTIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLYQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAMQEGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAIFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >NZ_LN614756.1|WP_003430913.1|2781000_2781759_-|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >NZ_LN614756.1|WP_004454735.1|2779700_2780999_-|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKKINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLKEIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >NZ_LN614756.1|WP_003430911.1|2779307_2779658_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >NZ_LN614756.1|WP_003416618.1|2778965_2779145_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >NZ_LN614756.1|WP_003430905.1|2778492_2778936_-|GatB/YqeY-domain-containing-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >NZ_LN614756.1|WP_009890655.1|2777884_2778382_-|tryptophan-rich-sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >NZ_LN614756.1|WP_003430900.1|2777128_2777692_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >NZ_LN614756.1|WP_009890653.1|2776679_2776916_-|YabP/YqfC-family-sporulation-protein MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >NZ_LN614756.1|WP_011861554.1|2775323_2776667_-|sporulation-protein-YqfD MISFIRGYYVIVVEGVGLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKDFKNVYRGSKFDIKVKQKTGVPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKASYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKRNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNSNNSQNNNSNNN >NZ_LN614756.1|WP_011861556.1|2783165_2785574_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKNIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCALHDLGKINSIMQQKMEINNKISYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKDILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSISKVQEEIYEYIEKGILEKEEFNLKDIESYINSILNVDFKFGEDVLDYDYIDKLSESMFIDSDYNNGQIDDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDNMILNEIYKSQGNLEKNNIEFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRSSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSINFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEDALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKNTTKNILKDILKTNSIFTMGIRKTILDDYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGINKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >NZ_LN614756.1|WP_011861557.1|2785600_2786398_-|CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYTNMRKGKDKEKFLLQGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIRKKLESPCKYANLGRKEDFVIPSEKGCFVKEVELKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPYKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >NZ_LN614756.1|WP_011861558.1|2786413_2787430_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYRDKVHAKTSIATITYDLRRILHQEYGWNLSNIVFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKEKGSISKASPLRIIPFRSLNSYRGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEREENEVLRDENFPTTQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVMGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNKFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >NZ_LN614756.1|WP_011861559.1|2787449_2788925_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFCELLMDLKNELEKNDYKLKFTCELNRNYLSLESAEYIDPKYISDYILENQLFKVFKNGKKETLEKIFSNIDNLTYVNFIEELDKSSATEKQKEGIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLENMETNVKRIVDIVIKSNIEIDEIDKLDLKQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRIDIDTNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPMNTRNLGKKMINNGNLSNLKELLLDNISVLRQLTGTSREMDFVSSSYNIGLYIKFCWIVDGREEYKMKNYIESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGLMQSSELELNTNVGLFIQEIMK >NZ_LN614756.1|WP_011861560.1|2788929_2789667_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESIRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKEREFYYINAYAGTFFLKGNMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >NZ_LN614756.1|WP_153309814.1|2789767_2789944_-|hypothetical-protein MNLNRIKEIIKKGLKRFMKVVVNLFCNKLFHRMLYIISISVVVKITMDINLYISILKY >NZ_LN614756.1|WP_011861561.1|2790402_2791512_+|sn-glycerol-3-phosphate-ABC-transporter-ATP-binding-protein-UgpC MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDEIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLILSVDNSRVHIFDKETTLAIR >NZ_LN614756.1|WP_011861562.1|2791541_2792309_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNAIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQSHIDFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGELDSKADFNFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGIKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >NZ_LN614756.1|WP_011861563.1|2792496_2793870_-|MFS-transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLASAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGKWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFINIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRKVE >NZ_LN614756.1|WP_003416574.1|2793905_2794841_-|ROK-family-protein MYYIGVDIGGTGIQAGVVDNYGKIIFRSECKTVIEKGFEGILNDIKIMIYKLLEDNKLTMSDIKSIGFGVPGFINKEGLVTCVNLKWNKKAFNKELKRRFPDVEIHGENDATVAALGEAKFGSMKGANVGVLYTLGTGVGGGIVINQKVFSGAHGLGSEIGHQIIGENYFNCNCGNNGCVETFCSATAIIKYSQKLIEEGEKSRILDLAEGNLENVNAKMVFDAYRENDLVAIKVINRFKEYLAKTFANTINSLDPEIISIGGGISKSSDIILDGIEDLVRKFVLYKTEDIATITCATLGSDAGIIGAAFL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_13 | 2864782-2865207 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_13
|
6 spacers
spacers of NZ_LN614756_13
>13.1|2864811|39|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG >13.2|2864879|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATACTTTAATACGTCAAATTAGACTTGACCTAAACAA >13.3|2864946|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCTGATGTTCCTAAGTCTGCTACTTCTATAGC >13.4|2865011|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTGCTCTATATCGCGTTAGGCAAATACAAGGATA >13.5|2865077|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAATAAAAGTCAATTAGAAATGTTTATGGAAAACA >13.6|2865143|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTCCCGAAACTGAAAGAAATCAATGGACACCTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_13
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_13 >merge|NZ_LN614756|13|2864782-2865207|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTATACTTTAATACGTCAAATTAGACTTGACCTAAACAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTTTTCTGATGTTCCTAAGTCTGCTACTTCTATAGCATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTTTTGCTCTATATCGCGTTAGGCAAATACAAGGATAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAACAATAAAAGTCAATTAGAAATGTTTATGGAAAACAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTATTCCCGAAACTGAAAGAAATCAATGGACACCTTTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >NZ_LN614756|13|10|2864782-2865207|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATACTTTAATACGTCAAATTAGACTTGACCTAAACAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTTCTGATGTTCCTAAGTCTGCTACTTCTATAGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTTGCTCTATATCGCGTTAGGCAAATACAAGGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AACAATAAAAGTCAATTAGAAATGTTTATGGAAAACA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATTCCCGAAACTGAAAGAAATCAATGGACACCTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >NZ_LN614756|13|11|2864782-2865207|CRISPRCasFinder ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATACTTTAATACGTCAAATTAGACTTGACCTAAACAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTTCTGATGTTCCTAAGTCTGCTACTTCTATAGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTTGCTCTATATCGCGTTAGGCAAATACAAGGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AACAATAAAAGTCAATTAGAAATGTTTATGGAAAACA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATTCCCGAAACTGAAAGAAATCAATGGACACCTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >NZ_LN614756|13|7|2864782-2865207|CRT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATACTTTAATACGTCAAATTAGACTTGACCTAAACAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTTCTGATGTTCCTAAGTCTGCTACTTCTATAGC ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTTTTGCTCTATATCGCGTTAGGCAAATACAAGGATA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AACAATAAAAGTCAATTAGAAATGTTTATGGAAAACA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TATTCCCGAAACTGAAAGAAATCAATGGACACCTTT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>NZ_LN614756.1|WP_011861577.1|2863933_2864317_-|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MLNKKLPDAELKIMKYIWNTGYKTVISKDVADEIEKTYAWKHTTTITLLARLTKKGFFISQRIGKHVHYRVLIKEKEYLKIEGKRIFGGLHKNPLSELISKLHDGEEITEEKIIEIGNWIKSWKDED >NZ_LN614756.1|WP_003431031.1|2862760_2863756_+|asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLARKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >NZ_LN614756.1|WP_004454813.1|2861011_2862640_+|aspartate-4-decarboxylase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELLDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINENKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEDLFKFISKTASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWQKIKK >NZ_LN614756.1|WP_009890721.1|2859135_2860353_-|threonine-ammonia-lyase MMNVTLTDVKEARETIKNIVKRTDLLESVKLSEKTGANVFYKCENLQKTGSFKLRGACNKIASLTDEEKANGVIASSAGNHAQGVALGAKMTGIKSTIVMPATAPLAKVSATKGYGAEVVLNGAVYDDAYAKAVEIQKETGATFLHPFNDKYVIAGQGTISLEIFEQLDNKVDTILCPVGGGGIISGVAVAAKALNPNVKIVGVQTANIPSMKESIKNGKVTTAFNDTTIADGIAVKTPGDLTFEIINELVDEIVVVEETEIAESILFMMESQKIVSEGAGAVCTAAILSGKYVPAKDENVVCIISGGNIDINTLYRIIGVALAKEGRRYSFSTIMEDKPGNFAELTRIISENGGNILSANQGKLSAGEALGKQSAEFILETIDYDHIARIKKAIEEKGFKIIEL >NZ_LN614756.1|WP_003416451.1|2858660_2859041_-|RidA-family-protein MKHEVIHTNDAPAALGPYSQAIKAGNLLFVSGQVPLVPETMEVVEGDVQAQTAQSLKNLKAILAESGADFSNVVKTTVFIKDMNEFGAINEVYAEYFGENKPARACVEVARLPKDVKVEIEVIAVL >NZ_LN614756.1|WP_009897702.1|2857894_2858377_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MLNFFKKNKSYKLHAVVSGNSINIEKVNDSVFSKKLMGDGVAIIPNSDVVVAPCNGKVTVLTESKHAFGMVSDEGVEILVHIGIDTVSLQGEGFKNEVSQGDTVKKGSPIISFEREKINSQGIDCTTIIIVLNHSEFSEINCMVENEVVAGQDTVIEIMK >NZ_LN614756.1|WP_003431027.1|2857058_2857874_-|PRD-domain-containing-protein MRVVKIFNNNALSTVTNDRKEAILLGLGIGFNKRPGDKVNEDKIEKIYYVQDHMQTKFLELLKNVSPEVMDASQQIISLIPGNEGKFNNKGILSLVEHISFAIDRMKNNVFLPNLMLLDIKMMYSKEFELGVKALEIIYRVCHIHLPEDEAGYIALHFVNLQSNDNLAYDTLKFVKGSIDLIKECYGLELDESSLSTLRFRTHLKFLAQRIFKNEICQDDKMIEMYDYLINNHPKNKEYLEKLNVYIEKEFRYKLDKPEKIYLLLHLTKIL >NZ_LN614756.1|WP_009890719.1|2855457_2857008_-|PTS-transporter-subunit-EIIC MKEKLLGGLETFAKAMVQPLMYLSSAGILMVVGVLLTNDMLLGVLPFFKWEPIQIFGSLIYNCIMAIINNLAVIFAIGIPAALAKKEKHKAALIGFMSYIIYLTASNTMLTSLGQLAKESKMLGLIGTGQATILGIQVVDTSVFGGIILGCIAGYVFNRTSNKTFKGALQIYSGANFSFICMFFVSILIGVVSNFIWPLAQQGIASLANVIKDTGTFGLFLYGFLERILVPTGLHHLIYTPFQFSDLGGVLKVGADTVSGAYAIVMTEMNLPVERFSDSIYYMATGFTKMFGYIGIGAAFIYTAYKQNKKKVKATIIPLIITAVLASVTEPLDFMFVFCAPLLFFVHAVIAGLFIALLKIFDVTALCGGNLLVSIIMNTTVGVEKTHWPVMMILGLAQIIVYFVVFSFLIKKFNYKTPGREDESTATGEEQSKQLNLDAGIENIIDGLGGKENINTVENCITRLRVNVKDESKINEDIINLTPNSGIVRKGKDIQIIFGLHVHEVRRAVEDFLEAY >NZ_LN614756.1|WP_011861576.1|2854008_2855361_-|6-phospho-alpha-glucosidase MIITIVGGGSTFTPGIVKSIALREKELELEEIRLFDIDKERQDKVAVVVNWILKEDVKTDVKLTVTNCEKEAYTDATFIFAQMRVGKYEMREQDEKIPLKYGCVGQETCGCGGMAYGLRTIQPMIKVIDDVEKYAKKDYWILNYSNPAAIVSEACRKLRPNARIINICDMPIAIIDMIAGSLNINDVHNIRYDYFGLNHFGWFTSIDYKHRDLMEEIKEYIKENKILLPKSYIENLNKSRSTGNRHAVSSWIHVWESVYTMLESFPKYLPNTYLTYYLLSKETVEHSNINCTRANEVMESREKDLFEGVRHYLETGEISEKAFYAGSHGDWISDLAVSIKNDTRSRFLVITENRGAIPNMPYDAMVEIPAYIGKDGPEVIARGPIPLFQQGLMMQQLNSEKLIVEAYIENSYEKALQAFTLNKTIPSMNVAKEILDEMIEVNKEYWPELR >NZ_LN614756.1|WP_009897697.1|2853119_2853878_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNIINKIFWQEDRIGMITNNLEADTHSHCMLQLFLGIEDSIEITVNEKLVKCNCIIVDKNISHSFSARKKVYYSAIIEPTSIYAEQLTSKMNDFGYWICDNNGLEKLRQQGTFLIDNSSKEQYLRFMEMLNNYLNIPITLKHYDDRITELLNLLRTCNCDNHTISSFADKVSLSASRLSHLFKEQIGIPLKSYILFHQMECAFRELLSGKNVTEASMTAGFDTPSHFAGTVKRMMGMPVSLSLKDSEFLKVY >NZ_LN614756.1|WP_004454815.1|2865492_2865651_-|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYIASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >NZ_LN614756.1|WP_011861578.1|2866009_2867380_-|cell-wall-binding-protein-Cwp29 MKLKKLLSLGLVSMFVAGFPISANALETIYTIQGKDKYETAALIADEQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPIFLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETLLKDKGIEAKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMSDKLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVASPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSNHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLVSRILFYNPDGEDFFEYK >NZ_LN614756.1|WP_011861579.1|2867593_2868712_+|site-specific-integrase MNIKSAFIRKRGEKFYVYVEYIEETTGKIKQKSYGSYEKKKDAEKHLIEIKSTINNNKFVAPKDITFVERCYKYIDMNKNNWSPYTVTSTKSWVKNYIEPFFKNLKLTEVNPSSVQAFVNYNFNNSTFTSAKVRYSFLSSVIREAYRLREIQENSCDFIKLPSKEKYSTNEIYNREEVLLLIEKLLGNNIEIPILLMLLLGLRMGEATGLRWSDVDLDNNLINVNQILVYSNGKISFKEPKTPKSKRALSAPKELIEKLKIEKLRQSKLKLQGILENKNNLVCLNTNLNPFLPSSLRKTFHNFTKKNNLKKIRIHDLRHTSATLLLLGGTNMKVVSERLGHTDIKITMNRYSHVLKEMDKEASDNLSELLFK >NZ_LN614756.1|WP_011861580.1|2869028_2869697_-|VanZ-family-protein METVTNNQSGVEIQLSLFEAIKDLLLINPIFLLGIILIGIFLVVIFKKNSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFGEYIRLSQLGETFFNPNINLIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDIDDLLTNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKPHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFS >NZ_LN614756.1|WP_003416419.1|2870550_2872971_-|leucine--tRNA-ligase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVEAFVQKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNIVVK >NZ_LN614756.1|WP_003416416.1|2873324_2873675_-|ribosome-silencing-factor MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELAKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >NZ_LN614756.1|WP_003431048.1|2873791_2874364_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-(symmetrical)-YqeK MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >NZ_LN614756.1|WP_003416411.1|2874364_2875054_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKNADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >NZ_LN614756.1|WP_004454825.1|2875329_2875968_+|recombination-regulator-RecX MGIITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIIERVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYNKGINRSTINEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >NZ_LN614756.1|WP_011861581.1|2876120_2878124_+|alpha-amylase-C-terminal-domain-containing-protein MKSEKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGFFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHPLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEIKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNNFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILPKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVIHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYHNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEIKPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAISLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLNFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFSSTPPSSKMPIASRTAIVLLDNGI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_14 | 3096795-3097120 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_14
|
5 spacers
spacers of NZ_LN614756_14
>14.1|3096821|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TAGCATCTTTCCATATTTGTCTAAATAGTAAGAC >14.2|3096881|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder CTGCATTATTCCTGTTTTGTCAAAGTAATACTTA >14.3|3096941|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TACTGCTAAACCATCAGATCCTAGATAGTATTTC >14.4|3097001|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TTGCATTACTCCATCTGAGTTAAAGTAATAAGTT >14.5|3097061|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TACTCTTGCTCCATCAGTTCCTAAATAATATTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_14
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_14 >merge|NZ_LN614756|14|3096795-3097120|CRISPRCasFinder TTCCCATCTATTTTTTGAGAACCAGTTAGCATCTTTCCATATTTGTCTAAATAGTAAGACTTACCATCTATTTGTTGCCATCCTGTCTGCATTATTCCTGTTTTGTCAAAGTAATACTTATTACCATCTATTTCTTGCCATCCTGTTACTGCTAAACCATCAGATCCTAGATAGTATTTCTTTCCATTCTTTTCTTGCCATCCTGTTTGCATTACTCCATCTGAGTTAAAGTAATAAGTTTTTCCGTCTATTACTTTCCATCCAGATACTCTTGCTCCATCAGTTCCTAAATAATATTTTTTGTTATTAATTGTTTTCCATCCTGT >NZ_LN614756|14|12|3096795-3097120|CRISPRCasFinder TTCCCATCTATTTTTTGAGAACCAGT TAGCATCTTTCCATATTTGTCTAAATAGTAAGAC TTACCATCTATTTGTTGCCATCCTGT CTGCATTATTCCTGTTTTGTCAAAGTAATACTTA TTACCATCTATTTCTTGCCATCCTGT TACTGCTAAACCATCAGATCCTAGATAGTATTTC TTTCCATTCTTTTCTTGCCATCCTGT TTGCATTACTCCATCTGAGTTAAAGTAATAAGTT TTTCCGTCTATTACTTTCCATCCAGA TACTCTTGCTCCATCAGTTCCTAAATAATATTTT TTGTTATTAATTGTTTTCCATCCTGT
>NZ_LN614756.1|WP_009893715.1|3094815_3095625_-|DUF3800-domain-containing-protein MFIDESGRADINHEDPFTLTGVIFEYKYAVSQGDYVCSLRKEMDAFKEYCFGTSNIGIHLTDISRKSRAFEKFDDSQIKLFYDELPLFLSRLECTIISVTVDKARLKKYYAPSKEPYVVAFIHVLQNFYSFVNNETVESARIVIESRDDVSNLKVQKAFFDVFNNGTIYLDIDEELRDKVKGFIIAKKEDADYREGLEIADILCNPLSRARRGLIEANPKCMQYGEKNKIFKSVRNKIYTPTSVNDIRNWGFKEVPIVEPVGPWLEKMR >NZ_LN614756.1|WP_009890955.1|3093726_3094608_+|LysR-family-transcriptional-regulator MNLYHLRYFVTLAHLEHYTKAAENLSITQPSLSHAISLLENELGVALFEKEGRNIVLTKYGKIFLKDVEKSLEILDSSVKSLKITGTGEGQIDLAFLRTLGTDFIPDIVHKFLKSNPAKSIDFKFHTGVTTDIIQGLKERKYDIAFCSKLEKEKGIEFIPVAKQDLVLIVPYSHPLAAKDTIDLKETIPYPQIVFNQRSGLRYIIDDMFKKINQQPNIVYEVEEDQVIAGLVAKNFGIAVVPNMNMLSFTKVKVIQIIHPSWERNFYLAFIKDRYLPPAIKNFKNFVIKNAQL >NZ_LN614756.1|WP_004455019.1|3092465_3093314_-|sugar-phosphate-isomerase/epimerase MNNQKNLNIPITISSYTLGTEVSFRDRVRIAKEAGFDGIGLRAENYIDAKNAGVTDEEMIAILNEYDMKVTEVEYITQWGREEDRTEAQREKEQNVYHMAHLFNVKHINCGLLEMIPEEQIITALGELCDRAGELIIGLEFMPYSGVPDLATAWRVVKGCNRENAMLILDTWHWARAKQTAEDLAPVPADKIVSIQVCDVLETPYEKLRDESLHDRLAPGEGYGNTEEFVKIIKEHNISPRVIGAEVISDSLISKGLSTAAETVFNATKKVLDKAWSEVSPK >NZ_LN614756.1|WP_004455018.1|3090464_3092387_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKISSMFTPIRIGSMTVPNRFVVPPMGNNFANTDGTLSETSKAYYLERALGGFGLITIESSVVDKKAKGGPRKPCLYDDSTIDSFKNVIDACHDAGSKVSIQLQHAGSEGNEKVAGHPLKAASAIPASNGRNTPLAITTEEIYELIESYGDAALRAQKAGADAVEVHCAHGYLVSSFISQRTNKRVDEFGGCFENRMRLPRLIIENIRKKVGNSLAILCRINSTDDVPGGIDVHDSSVIAAYLEDCGIDGLHVSRSIHIHDEYMWAPTTLHAGFSAELVTEIKKAVSIPVITVGRYTEPQFAELMVRQGRCDLVAFGRQSLADPEMPNKAKNGKLDEMIPCIACLQGCVPNMFQGKPIACLANPILGHEAELKPAEISKEVLVVGGGVGGMLAAWVCAKRGHNVTLVEKSEVLGGQMRLAAYPPGKGDITNLVRSYISKCNQYGVKICTNTEATVELIKEKSPDVVIIATGATPLVLPIPGINDSGLIHAVDLLDGKKSCGKKVLVVGGGMVGCEVAAFLGEQEHEVTVIELREEVGADVISEHRKFLMNDFENYNIHTITGAKVSKFYDDGVDYLLTDGTEHDLKGFDSVVLAMGSRNYDPLSEVIKEVVKETYIVGDAVKARRALDATKEAFEVALNI >NZ_LN614756.1|WP_162835937.1|3089519_3090389_-|shikimate-dehydrogenase MVMEISGRTGLFALIGTPVGHSKSPVMYNYSFKKLDLDYRYLAFDITVDKVKEALLAIKTFNIKGANVTMPCKSAVTEYMDELSPAARIIGACNTIVNDNGKLVGHITDGVGYVRNLKENGVEVKGKKITIMGAGGAATAIQVQCALDGAREISIFNPKDDFYKRAEQTVENIKKDVPECVVNLYDLEDTNKLYEEIESSDILTNATLIGMKPYDNETNIKDTSVLRKDLVVTDVVYNPKKTKMIEDAEANGCKAIGGLGMLLYQGAEAFNLYTGLEMPVEEVNELCFK >NZ_LN614756.1|WP_004455016.1|3088102_3089320_-|MFS-transporter MNNKKYYPTAIALYFSYFLLGIGISILGQYKPEFSSMWGAKTLSDGTLDVSIVLAVIAALGLGRLISYPFAGPISDKYGRKVSGLIGNFLHAIFFVGIVFSPNFYIAYVFAIIGGAANSFLDTCVTPSCMEIFASLGTIANMFTKFTIALAQFLLPFIIGFVAANSISFKVIFIVTAILIVVDAFLIAVLPFPPANNVIDNKGKTVKSEKMKFTPTSIALVCIGFTCTSTFVLWLNCNQELGKLYGMADPTKIQSFYSMGVICAVLITSLLIKKYIKPIRILVIYPIIALLMLLVVYFVQTPTICMLGGFVIGYSAAGGVLQLTTSTANEMFPTNKGKITSIVMIASSIANYVILNIAGIITKSGGVNGPKYVVLFNVAITFVGILLALFVNMRYEKEKVYDYDV >NZ_LN614756.1|WP_016728660.1|3086001_3087867_-|HIRAN-domain-containing-protein MENVFKRLQEFNGYDGYKESFEMNYLCIYESIPLREQVELANNLVDEILNMYKSESNEIYLLEDSNSKSLICYFEIFMKKINTLVKEMIIDEKWLYKLTKELIYKSKKVEYVKLGLVLSEKYLNVENLREVVDTFSKSGEYVFYLSNTIKKLEFYNTYLFNLSKKATGSIKVFAIVNMENLDSKINSYLIEDGYKDTKYERLLMNYIISIVDLNEYLEKRDLDKEKINNLARLICNYLLSVEFKYIGNKLELVNRFLPTVVNYGTNFESLYSIFLIAINVLKDENIECNKIEFEKEINDILLSEKWKNIYFEALRDASGKTEDIIKMSEIYDVNLSFDDLLPYLNRDIRDFEVYWHISKKGTTSSRLKLLNFFEETFKIDDLIGKMKDIEKDKLTQEYYDDMLFFIVLKGSKSLYPEGKNISLKGIFGNINEVRKESINILKRYREKLSLEELKIVKEAYEKEKNVILKDELRRVLYESNNLKKEFVNIEKIKVDEHGKDIYLTSIAVAGSRFRNREYLEKELEKSKIYYLTREKDNLYDEKAIKIVGETGYVIGYVPRKENYILSNLLDGGKLLYCRVTEYNLYEDCIYANVYLSYKDVIETVENSLKMVLDKSRIKLIN >NZ_LN614756.1|WP_004455014.1|3084459_3085824_+|amidohydrolase MSQLLIKNAYLITMNADREVYENGSILIENNIIKEVGKFDINIVDKDAEIYDAKGKILMPGLVNTHVHLSQQLGRGLADDVVLLTWLRERIWPYESSFNYEDSLISSTACCVELIKSGVTTFLESGGQYVDAMVEAVDKTGLRACLAKSVMDTGDGLPEAWQKTTDEEINTQLDLFHKFNNTSNERIKIWFALRTIFNTTEELLVRTKELADKYNTGIHMHIAEIADEISFVKQNNGVGTVEYLDKLGVLGPNLLAAHTVWLTHKEIDLFRLHDVKVSHDPGSAMKVVLGFASIPEMLEKGIPVSIGTDGAPSNNRMDLMRDMYLTSLIHKGRTLNPTVVPAEEVLEMATINGAKCALLEKEIGSLEVGKKADMIILNPDTIHCLPMHNPIGNIVYSMTSENVDSTICDGKWLMKERKVLVVDESELLNKVKKQASKIKDKAEVKIPSKFKIIK >NZ_LN614756.1|WP_003421552.1|3082937_3084281_+|NCS2-family-permease MVPNTNNVQPGGNNSSLSFLDKMFKFSERGSSLKTEVIGGVTTFLTMAYIVFVNPAILSEAGMDKAALITVTILATAIGTLIFAILGNAPFALAPGMGLNAFFTYSLVIGAGIPWQTGLGVVFLSGCVFFTLAVTGLRKTIADAIPRELAVASSAGIGLFLAFVGLKNMGVIIANPDTIVSLADFTPTVLIALFALILMAILEYKKVKGGILISIVVATIISVIFGFVELPTAIISTPPSIAPVAFKLDIVGALKFSLIGPIFSFMFIDMFDSLAFLITCCKQMGLEDENGEIKDLGRMLYADVSSTLIGSFLGTSTVTTFGESASGIAAGARTGLASIVTAALFLATLIFTPLLGIVPTYAAAPALVMVGVFMFESIKQIDFADSKIAVPAFVTVLLMPLTYSISIGLCFGFISYIIMHVVAKETDKISITLWIIGLLAVVNLVLS >NZ_LN614756.1|WP_011861651.1|3081781_3082435_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MTKIIKVQKPKFTGELEIIENLEDILEDIFNDEKIFNKIIENEVISDLDSVRVSFESCIFRNVSFENCNLKKIDLLDVVFENCNLSNTFFDGGSIYRVEFKNSKLIGVRFDDCILKNVLFKDVLGKYSNFSFSKFKIVSILDSNFENSVFQEVKGDNLVFEYTNLKKANFNGTKLSGIDFTTNNIEGIEIGIDDIRGAIFDVSQAIDLTKLMGIIIK >NZ_LN614756.1|WP_011861656.1|3097879_3098893_-|UDP-glucose-4-epimerase-GalE MAVLVAGGAGYIGSHTAIELLESGYEVVIVDNLSNSNSIVVDRIKELSKKPVKFYNIDIRNKDEMHIVFKENNIESIIHFAALKAVGESVEKPIEYYSNNLISTLNLFELMREYGVKKFVFSSSATVYGDPHTCPILEDFPLSVTNPYGRTKLMIEQMLVDISKADKSLDIALLRYFNPVGAHKSGRIGEEPNGVPSNLMPYITKIAVGKLKELSVYGNDYPTHDGTGVRDYIHVLDLAAGHVKALQKLEENPGLVVYNLGTGKGYSVLDLVKAFSKASGKEIPYKIVGRRAGDVAMCYADSSKAEKELGWKAKYELEEMCEDSWRWQSMNPNGYEE >NZ_LN614756.1|WP_014466379.1|3098916_3099786_-|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MTVKKAIIPAAGLGTRFLPATKSQPKEMLPIVDKPTLQYIIEEAIESGIEEILIITGRNKKSIEDHFDKSVELELELEQKGKTEMLEMVRDISNMVNIHYIRQKEPKGLGHAIYCAKSFIGDEPFAVLLGDDIVDSDVPCLKQLIDTYNEYKTTVLGVQKIAKEDTNKYGILDVKHIEDRVYKVKDMVEKPAIEEAPSDIAILGRYIITPAIFSILEKQTPGKGGEIQLTDALQTLGKQEAIYAYNFEGRRYDVGDKIGFLEATIDFALKRENLKDDLMDYMRKKVSEK >NZ_LN614756.1|WP_004455025.1|3099983_3100304_-|hypothetical-protein MSSKYNVWTFNYEFLGLDSGDEKNNEVYYEIDLDEILNENYIDEDIDSGLDSDGNSILGELISEMDIDEDVSVDMTYQELEVDLEDLDSYLDEDIDSDIKGILDEI >NZ_LN614756.1|WP_011861657.1|3100293_3102285_-|hypothetical-protein MLKLGEKIIYELSDGFELSGISRYSKEYKKLHITNLGNIIISKSDEVNEDTGVKYIYSFSDNKEKLEAVLEDSQIIVYGNNLPFYIKSENSSKNVTANLTMKITLDEYDLICKSQREFIFYLKDNMTILSLDDNKFYMGGINKDNEKFIFISGKNRFEINFDDIERYILEDKRVSLKGYFHMEREGIIVRSVSIFNNNIDSVVPSDLNERVKDNQKIGNLPKDCEIVFCKISGNIDGFDYKNTNMLLVKYQDQLIFINKKSKKTIVKSAKDNCSKLNLGEDIILYDNKNVFNLHINDKNREIMQIDDLKDIENEIVGYTLKHAPFFIQEDFDSLTILKSFQKEIISIKNSDIKDIVINKEFENENSNFVETEIKFNNQKVLLNLSKSMVQKLMQDVFIYAKQPLLKENSIEVIYKNWSKAMNDMIIFNFFGNIYYMKSEFDKILEKELNDEIRIEVINSLYKQIQEQRNNLDLLSAYMPRILENQEIDLFEKYNTKLDVQVFKQIKNLLSDLSYNISSYLNEVEKSLDNIIFVISGEDKKKYNYRMLKESESASLDVFLKQAISRLNHLVENMYPYYVDETSREMFKLFELLWKNYRNIDDDSIKEILFERITNTYVFKQLTLNNSTKERRKDIIEKIYNSVDYGTNKLDENMFFTGGIKYVK >NZ_LN614756.1|WP_011861658.1|3102407_3104951_-|SPOR-domain-containing-protein MKVLSENNIIRNTVLNVTASFLKQESKINEKLDGVLEKKFEKVEFNEAKYAELLKFNILFYKTLARNTEPLIGKWIVDKYIPEIDELEKDLELTTAKCRKYVNKAMKEGLDSLKANDLNSFLAYDKMELSERRRRLEKDYKVLNLYKDLLNISLRKISLEKKECGDLFLKNQADAKRELKREIIFCVNKILASNKDVVPNNVEENNEQDKVEIKATEIEDLQLGKDNSENDMLLNEIKNSKVKHESKSNDIESKFIDKLNSLNNESVSQTIHNEYKKLCGLEELHSVEGYGFGKEIIKDFACATVVLEFLKRRNRDLIEGAMRLTIIGEFGPENFKEFVDYVIKNKTEISEDTWNKAQNLIKDNYSELENHEIASKRTRRNKDIDIEEYIYMIKNADKDICFRSSISIEDDAEEGVKEEIDSNNQDIGDVVEDKDTTDKEYDSNKEDIIEPENKKSKKKAKLFGFIKKDNEEVEQEEENLNDISPDIILDKPVENNQVKSEEIEQNELKEIKQEEPSQHIEEERSVKIEKPINNNLDEKVSSNNESKLEKESKNLEDKKAKEIKEEKLENEKSVVIPIKKKENSNKKSKNSSKDKYRENKKEMKNYVSDKEDSLDDEEVVSKKSRLKETIIAVVIVVIVGVGYFITVGNNKKNDKENIPKSSTQQQANNKLTEEEKKAQAEKEKKEAEEKAKAEKEAQEKAQAEKKAKEMEAYKDGKGVYYTVYAGSLKVEKTAKETAKEYEAKGISSTIIQENGYYKIKIGDYSQYGEAQEKCNELAKKSIDTYIAMYDKYYDYKLEELKESAPSLSAEELKQKYEDLRSELKNKSGYREYVKHLDKLYEEIVEGA >NZ_LN614756.1|WP_009903304.1|3105694_3106372_+|sortase-SrtB MKKLYRIVINIILVLVILYSGFNIYSKLTKYNHDTKISSELQKKEYKKEDLSKINSDFKFWLSVENTNINYPVVQSKDNSYYLDKDFYKKDSISGTLFMDYRNKSIDDKNIIIYGHNMKNKTMFNNLNKFKDADFFKKNNKIKITLNGKEFLYDVFSAYIVESDYDYLKTNFNNESDYQNYINDITSKSLYKSPIKVNSNDKIVTLSTCTYEFDDARMVIHGRLI >NZ_LN614756.1|WP_009897898.1|3111764_3112703_+|delta-lactam-biosynthetic-de-N-acetylase MFRKVLHYLTLLSISIFFIVGCSNSQNNQNENQNKETQLQEDKEKIDSGKDTSNVIVSDGTDKPSKATTNNDNNKLDVSSLDNTTLDWFYIPNNKHKTPEVNTDIEFKFSDYDALYNGPTKDGQKTLYLTFDEGYENGYTTKILDTLKQNQVKAVFFVTAPYIKENKDLVKRMVSEGHIVGNHSKTHPSMPTKTSNLKNFNDELYDVEKLYKDVTGKDMVKFFRPPMGKYSEKSLAMTKNLGYKTVFWSFAYRDWDTDKQPSHEEATQKIMDNLHDGSILLLHAVSKTSTEILNDFISNARKLGYEFELLEY >NZ_LN614756.1|WP_011861659.1|3113074_3114448_-|transporter MVLTGAHYIYILFMVIILITMIMKKDTIVPCILGVFFMGLFFEKNIFGAITAVFNSFIISLNELGPIILIIAIMVALSKALEANNAIQYMVRPFSRVIKNSNTAFFVTGFVMLVLSWFFWPTPAVALVGAVFLPVAMRAGLPAIGVAVALNLFGHGLALSTDFVIQGAPSITAGAAGVAVSYVINDGMILFWVMGIVTISMAFYTLKRDINKGMFREELKGFESEEVEEFNGKSKIATILVALGFLADIIAMYVFDLKGGDASALLGGTAVFLIIIINVINFGKDSLENVCENIIDGFVFGIKIFGAIIPIAAFFYMGEVAPLTGVFGKVLAPGSQGLLSDIGIALSQTIPLNKFAVSGIETVVGAITGLDGSGFSGISLVGSLASVFGTAINASVGALAALGQISGIWVGGGCLVPWGLISAAAICGVSPIELAKRNFVPVITGLVVTTIVAMFII >NZ_LN614756.1|WP_004454160.1|3114676_3115999_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MINKIKPSKLGVILLIYVVISAAVAFILNIPFYSAVESIVKDVSEGKVYFKREVNQLMDNFQTYVNNNGIRADDGDDIAKWNSDNWFVSMKIYKGNKVFYDTLYYPNEVPDKSEENEFYSSPMARNYEIQFSDIKANIVVVALFRFRFQNFIEAISITFMALTFIITFLLLFSRKIKYLRKIEMGIKIVESGSLKYRIPVKGNDELSSLASSINEMSHTLENQLIKEREMKNKNKDIVTSISHDVRTPLTSVICYLDLIKDHKYNSPEQLEQYIKNVRSKAYQIKDLTDDLFTHFVNSGEEVSKGYEKINANEFIFQLLLDSSYTLEEKGFHITIENELYNQYHIYVDVTQFRRIFDNLCSNIIKYARKDKPIVFLIKVEDSKLLIIQKNRVSNFSKNVESFGIGIKNCEKIVAYHNGSINVNSDDKEFAIEISIPAKES >NZ_LN614756.1|WP_003426384.1|3115991_3116696_-|response-regulator-transcription-factor MNKEIPKKILVADDNPEIREIVEILLTGEGYEVIMATNGEEAVNLVDSTIDLIILDVVMPVKTGFVACNEIREKTTAPILFLTAKTQDSDKVIGFSAGGDDYLSKPFSYSELISRVKSLLRRYYIYQGKEKEREPNILKTKELCVNLDTQDVTLNGEPVFLTTIEYSILILMLKNRKKVFSSENLYETIWDEQYFYTANNTIMVHIRNLRKKLEKDQKNPQYIKTAWGKGYYID |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_17 | 3152527-3152617 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_17
|
1 spacers
spacers of NZ_LN614756_17
>17.1|3152552|41|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder ATCCTCATTTTGATTTGTTATATACTTAAGAGATTTATATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_17
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_17 >merge|NZ_LN614756|17|3152527-3152617|CRISPRCasFinder TCTGTTTTACTGCTTCTATACAAATATCCTCATTTTGATTTGTTATATACTTAAGAGATTTATATGTCTGTTTTACTGCTTCCATACATAC >NZ_LN614756|17|15|3152527-3152617|CRISPRCasFinder TCTGTTTTACTGCTTCTATACAAAT ATCCTCATTTTGATTTGTTATATACTTAAGAGATTTATATG TCTGTTTTACTGCTTCCATACATAC
>NZ_LN614756.1|WP_004454130.1|3150501_3151080_-|accessory-gene-regulator-B-family-protein MFKRYAEKMTSVLICNNMIDNNESKVYSYGFEILIAFIVNITTMLFIGFLFGKFTYVLFFLMCYCPIRQFSGGYHADNYFRCLLTFIFIILSTILIIENINIDLFKNIIMIIASVSWVGICVLCPIEHRSNPISDREKLVYKKTAIFISTVVLLITILSLSLSIFVDYFTYSAFAMFWIFVMLVLGKLKAKV >NZ_LN614756.1|WP_003426457.1|3150325_3150472_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MKKFIVRFMKFASSLALSTAILSANSTCPWIIHQPKVPKEISNLKKTN >NZ_LN614756.1|WP_011861666.1|3148641_3150021_-|thioether-cross-link-forming-SCIFF-peptide-maturase MSMIHKFSMNGYNIVLDVNGGAVHVLDDVAYDLLDFYKEKSKEEILEILKSKYQEEKINEAYEEILNLEKEGLLYTEDTYQYHPSFVHREPVVKALCLNVAHDCNLKCKYCFAAQGDFGGEKELMSFEVGKAAIDYLIANSGSRKNLEIDFFGGEPLMNFEVVKQLVDYGRSVEKDYNKNIRFTITTNGVLLNDEIIDYINENMHNVVLSLDGRKEVNDNMRPTLNDKGSYDITLPRFKKLVEKRSKDKYYYIRGTFTRDNLDFSKDVMHFADLGFKLTSVEPVVGDESNPYALREEDLPKIFEEYEKFAVEYADRQLQGDGFKFFHFMIDLNQGPCVIKRITGCGAGNEYLSVTPNGDIYPCHQFVGNEEFKMANIFDEEIVLPENLKNMFREAHVYTKEECKQCWNKFYCSGGCHANAINFNSDISKPYELGCEMQRKRTECSIMIQAKLMLEGATN >NZ_LN614756.1|WP_004454132.1|3148115_3148613_-|gamma-carbonic-anhydrase-family-protein MIRDYLEDKPLIDESVFVAKSADVIGNVKIGKDSSIWYNAVVRGDEGPITIGENTNIQDCSIVHGDTETIIGNNVTVGHRSIVHGCKISDNVLIGMGSIILDNAEIGEYTLIGAGTLITSNKKFPPGVLIMGSPGKVVRELTEEDKKYIDESYEWYLEAAQNQKY >NZ_LN614756.1|WP_009891005.1|3146153_3147818_-|AarF/ABC1/UbiB-kinase-family-protein MRISYRNLKRYREIGYVLIKYGFSFIVERLNIEGIAYKIPLFDPPEEIKNMTTGERMKRVLEELGPTYIKIGQILSTRKDLLDQDIIDEISKLRDDVEKFDSNIAIDIFKEEVGLSIEEIFLEFKEEPIAAASIGQVYEGVLKTGEEVIVKIQRPNIEKIIKSDLEILRTIANTLKDLKKDFNLDLVQMIEEFQTQLMRELDYTFEAINATKFSRIFKNSDEVYIPKVYSEYNTKKILVMEKVNGTKLSDVEKIRRLGYNTKTIVEIGVRSFFTQVLSHGFFHADPHPGNIFVVAKNKIAYIDFGMIGIIDNKTLNQLNEIALAGVEKNVDKIIYLLIEMDALNGEADIKGLRQDLLYLIHYYYDISIEKINVTDILNELFRFFRQYKIVMPAQFVTLAKTVITLEGTSRTLNTDFSFGSMGKEFMKHHYKSKFNPKNVVLSSRQNVEEILLDIKTIPKQLKAILKNIERNNIKMQIEDVKMTRLENCIIELTSQISLSLVLASIIVGSSLIIASPNIENNIWIKFTAIAGFFISFIIGLCLVIRSIRSKYKKD >NZ_LN614756.1|WP_011861665.1|3143690_3146141_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKKWILKYKGKIEESEFSKKLNISPEICQILKNRGICTEKDSEIFMNPSLDYLRDPFLMKDMQKAVDRIKLAVEKNEKIWIYGDYDVDGVSSTSILCLYFKSIGYNVDYYIPNRLEEGYGINEDAIKLISSRGCDLIISVDCGITSVSEVNTANDLGIDVIITDHHECQSEIPSAFAVINPKQEDCNYPFDSLCGCGVAFKMIQALTPKEEFKTSMYNYLEIVTLATICDIVPLIDENRIIVKNGLKSMKEGKNIGLRELIKVCGVESDKIGSSHIGFAIGPRINASGRLGYSYLGVELFTTQSQEEAVEIASILEEKNNERQMIEAKMYHEAEEMLKSNSRYNDDKVLVLAKEGWQHGIIGIVASKLTEKYYKPTILLGIENGEATGSARSIKGFNIFEALIKCKDLMTKFGGHEQAAGLSLDSDNVEILANEINKFADYNLTEDDMIENVNVEFELQENVINLNLVEELHKLEPFGLNNPNPRFIVRNYILKDLKVIGKNQQHLKLSIEKEKSYECIGFNMSHLKSMYKVGDKVDVLFQLDENNYMGNRKVQFLLKDIRLARPKSASNDKLSLKLMSKIIPKDTQSLYNISVSDFELFDGNTDINIFDYFEKDTLIISNSINGFYRAMSDISLIDLDFNINYNIIEDDSKNTDKLELIFSPNIDKIDLKRYNNIILYDYLYNKGEYSYIYENKREESEIIKYYNKTDLLYLKNVVSNIVPSRDEFITIYKQALIKKEIDLDMVNIRETFNVIPLKFFTILNVFRELNLLDFNLNYEKNSVLIRILPKPQKKLDLNESLILNNLKNLEKQYNSSY >NZ_LN614756.1|WP_003426450.1|3143165_3143678_-|adenine-phosphoribosyltransferase MDLKNFIRNIDDFPKPGIDFKDVTTLFKDGDAFKYAVDSIVEELKDKDVDLVIGPEARGFLMGTPVAYALGVGFVPIRKPGKLPGEVESYEYGLEYGTDTLEIHKDAIKKGQKVAIVDDLLATGGTMEAAAKLVEKLGGEVVSMQFLIELKFLNGREKLSNYDVNSLIKY >NZ_LN614756.1|WP_003422921.1|3140884_3143092_-|bifunctional-(p)ppGpp-synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate)-3'-pyrophosphohydrolase MHDKELQEIIEKIKVYAPNANFEMVEKAYNLAKKAHEGQYRKSGEPYFIHPLAVANILIEMELDIETITAGLLHDVVEDTEYTYEDIKKEFGKEVADLVDGVTKLGQIKYRSKEETQSENLRKMFLAMAKDIRVILIKLADRLHNMRTLKYMPPEKAKYKAKETLEIYGGIAHRLGISKIKWELEDRALRFMDPEGYYDLVSRVSMKRSQREDYIQGIVELLKDKFKDLSIPCDVYGRPKHFYSIYRKMQKKHKTFEEIFDLTAVRILVDNVKDCYAVLGIVHTLWRPIPGRFKDYIAMPKPNMYQSLHTTVVGPDGEPLEIQIRTHEMHNIAENGIAAHWKYKEGISSKESKVEEKLQWLRQMMEWEKDLKDPQEFMDALKEDVFNSQVYVFTPKGDVIELPAESTPIDFAYRVHTNVGNKCVGAKIDGRIVPIDYKLQNGNIVEVLTSSNSNGPSRDWLNIVKTPNAKSRIRQFFKKERREENVDRGNTILEREFKKHDIPQKDPLVEKYMALVAKKFNQPSVEDLIATVGYGGIMSSQVVSKVKDLYLKEVKKAKKEQQIQEEDLNKHNISETEYSKKRKKNASQGIIVKGLDNILVRFAKCCNPLPGDEIVGYITKGRGVAIHRADCPNANNNGDFFQNRLVEVSWSSAGKGKFEAEIQIKAIDRRGIVNEITHIVAMDKLSLNGINARKGKDSIVSINLLVEVNDTEELKILMKKLKAIPGVESIYRMTN >NZ_LN614756.1|WP_003426448.1|3140410_3140860_-|D-tyrosyl-tRNA(Tyr)-deacylase MRAVVQRVSSSKVTVDENTIGQINKGLLVLLGVTHDDKSSDVDYMIDKILNLRIFEDENDKMNLSLMDIGGELLVVSQFTLYGDCRKGRRPGFSNAARPELANNLYEEFVKKAKDKGVTVGTGQFAAHMMVELTNDGPVTILLDSSKSF >NZ_LN614756.1|WP_004454137.1|3139781_3140396_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MIIKKFVDSYFGVNTYVLGDEKTKKCAVIDPGGSLVETLSFVKENELNIEYIILTHGHGDHIGYVKDIKEKTGAKVVAHVDEKELLNDKNKNLSYTMRCGAQEFDADIYVNDKDKLELGELKMTFLHTPGHTQGCMCIRVEDEMFTGDTLFAGSIGRTDLYSGDFNQMEKSLKKLCKYEDAVRVYPGHGPTSTLGVEKKTNPYM >NZ_LN614756.1|WP_011861667.1|3153221_3153887_+|hypothetical-protein MKGNIVQYNFADIEEEVYSLDYAIAWNTNEENVNIIPFTNKFCKESIESFCLGKINNFVEILNEGFVENHHYVHLDKMISVPKKKVNLVYQQDTHGYLLRDDNDNLIPAKITSEQSKSISSKMELFCAGEEKCLINILLKADPSYILDVDSIKDKNILNLGYESIDRYKEYNFDDDKILIFFINKKRYSVIMKKTNNSDNDLVSRNNAIKELFTNKAGNLN >NZ_LN614756.1|WP_011861668.1|3154392_3157095_-|EAL-domain-containing-protein MKNVSKKFFVCTIIVLITFLCFSKFAIYVFDKQEKKETKVVENMLNVYKNNIILNLTEKFNYSKDLTSVLVSNNYSIDKLKPIADEILKNNSCIYISVVEKYNVAAFFSNSVKKDIINTPIQELNYSYSLANSIKGLVVEGPSKDQFSNGDVFLITNPIYKNGEYWGEITVALDAKKVVDSFNLNKLKESGFEYELWRVHLDNGSKSTIEISTKDFNFSKSHEIKFKLPTVWTLSIVYKNGWNNKNIDFIVFVILLIISILIGVMTFIYIEKKSISKELNQQSLKNLETGILNREGFLIKLQEHLNRKNNEIVLLYICITNYSKFAPVMSFEKRQDYLTHIVKNLDNYIKSSHFIARISEEGFVLALEENCDKNELLNIEKGISLELLRKIKVENKQVFLTIGYGSSRCVDDRKDAESLLLSAIEDYERRFPAMSPIHDFTKKCEDMLDEKKQIVFGEYPDLEINKLSKVIYKYYKKVQRIMYKDYNIDIGNRRGYMRDVEVLIDYNSERMLYLFLIDICKFGKFNELFSIEIGDVILKEVSNKLKTIFSNYLYRINGDVFLGISIDKESYLDTLHKVNEVFNSSLSVEDVLFDVKCNIGICQYPYHGENPYDLLEKVQIALEYAKKDVKSNVKVYDKELTEEIYHENNIIKDLKKGLEEQTLEVWYQPIFNVSKNCYIKAEALIRLRNKEGGYYSAYEVITYAEKHGLIKDVGLYVLKKACDVTTKIKDKNIDFEQMQLNLSVQQIVHKQCANDILSCIENCGLDKKYICVEVTETVLMETFEIVNVTLDKLKKEGISIALDEFGSGFSSINYLANLPIENLKIDKELVEQITYSKKQFELLKTIVQIAKINGMDIVAEGVETKETLDLVVTSGVNLIQGHYFSEPLSEDKFIELMIEE >NZ_LN614756.1|WP_011861669.1|3157120_3158671_-|GGDEF-domain-containing-protein MRYKKRNIDKSSELSFQSLAKYFITFYIVIILIILSMFCINTIWVMKKDNQDLLSTTSNRIEDRVGETIKLLNSLSKDNYIIDNSVNGIDKSKELSMYSDEFGYMMICFVDKNIIVWDEEGGNISLAGRDYMQKLFATKKYQVTDSFAAGADGKTLNYTIASPIIKNGNVDGCVFAAIYFDEIKDILKQGKGQQQQNFILFGSENQIMNLTSDETAYGEKYMKLSQKTKYLGTNAKKVEKDMFNNKSGDYWAFENGKLYFMSYKPIKNTNWSLFCKVNFLDIFALNLIPMGAILSVITLVFIILICMEKSFMKKRMEVIDMLLGSVQELEKRIYQTERPSEVDFKEIIQLTSKGLTDGLTGVVTRTVFFDQIYNRVEMEENDKLSVISFVDLDDLKCINDLYGHEIGDMVLKNVGYVLREYEIKYNGLIGRYGGDEFVMLLSGFTSREEVEDLLDEIAIRLHTEVLTDDGIIQTHCSVGAVVCSVKDNKDIDNLLKQADEALYYVKRNGKGNYHLV >NZ_LN614756.1|WP_003431795.1|3158993_3160706_-|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MAYKGIGASPGVALGKALVVEHSELVIEKKSIDNVEAEIAKLEDAVAVSKEELVKVKEKASEELGAEEAEIFEAHLLVLEDPELIGSAIDKIKTESVNAEYALNEIKEMFVSMFESMDNEYMKERAADIKDVTNRILRHILGIKVVDLSALSEEVVLIAHDLTPSDTATMNKKMVLGFLTDIGGRTSHTAIMSRTLEIAAIVGLNDITSKVKDGDFVVFNGDTGEVIVNPDEETINKYTELKAKYEDERKALQLLKGKPSVTLDGKHVELAGNIGTPNDIEGLIKNDAEGVGLYRTEFLYMDRDSFPTEEIQYEAYKAVLEGMDGKPIVIRTLDIGGDKELSYLSMEPEMNPFLGYRAIRLCLDRKDIFKTQLRALYRASVHGRLRIMFPMISSLEELLQAKEVVKEVLAELDSEGVAYAKDVEIGMMIEVPSAAVISDVLAKHVDFFSIGTNDLIQYTCAVDRMNQKISYLYNQFNPAVLRLIKTVIDNAHKEGKWAGMCGESAGDQKMIPILLGMGLDEFSMSPISILPARKLITSVKESDMKKLADDVLNMGTAEEIKSYIEKTFNI >NZ_LN614756.1|WP_003422895.1|3161059_3161320_-|HPr-family-phosphocarrier-protein MEKVVSIKNASGLHARPAGMFVKKAAEFKSTVEVVAKDKTVNAKSIMGIMSLGLAQGEELKLVVNGEDEEVALAAMVELVESGFGE >NZ_LN614756.1|WP_003431793.1|3161512_3162724_-|patatin-like-phospholipase-family-protein MKGLVLEGGGTKGAYQIGAYKALRELGIEFQGVTGTSIGALNGAYIIQNDIEVMEDIWLNYDYTHFMNIDRETYERFKNVDFTTKNLNAVFELINKARKNEGIDISPLRQLMETTLNEDIIRKSKKDFGLVTVWWDKKINPYPLYIEDIPKGRLIDYLIASSSLPIFQTNMMDDKLYLDGMFCDNMPIGLLEDKGYEDVVVIRLIDDFIGKMNLNRHQNINIKTIIPSEYLGGSLNKDRDNVEKNIRLGYLDTMKAYERCTGIKYYFDVEYKYNEEYCFDKFRSMSNETIQYICNLLNIKRDASLRTVMESVIPKLGEVLGLPKDFSYKDLFYCIYEKKLEENNINRIKLYDFNKVIDVVNTNIDSNRNLASNFEVRPKISIKKNKNTKLLTNCIIKDIKNQS >NZ_LN614756.1|WP_003431790.1|3162955_3164689_-|N-6-DNA-methylase 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MNKNSMTRIYSLNKIIFIIIGILGIVLLTRHIEVDIKVLILILLTLFSINVFISYLKIKLYEDKINLGLINNSDKFINITKDENFLKHVQNYIISNEKENCVMACFDLCRLKLINDIYGYELGDEVLNNILSNLKNYFGKEAIYGKLKSDVFVLIIKLENREQKIPYLVNLIKNKIVILSQIDSFKMDINIEASIGIYKFNNNEIDIKKAIDNADMARLKSKGLKHIEYVEFDNAMEEEIQSIMKIERDLFLAIKNKEFVIHYQPKVDSSTGNIIGSEALIRWLHPSLGMVGPNKFIPIAEKNGLINNIGRWLIQEVFITINKWISEGINVLPVSINLSRVELYKNDLVDFFKLMFNTYNIPKELIELEITETTALRDVKFISERLYEIKSLGMNISLDDFGVGNSNFINLKGIPLDIIKIDRSLILDIVTNTKTKFMVKAIVNLSHDLNVTVICEGVEDMHQVKVLSELGCNFIQGYVFFKPLDEMNYKKLLTDGSYINLKDTLLDKCMTVEEE >NZ_LN614756.1|WP_011861670.1|3166991_3167897_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKKKLLDGKITLIICKSVKIYTKKDEEMSKGNNNNNSRNKSKKTSHLNRKKRKLNKKKLAVLICFTVLFLFIAFKATQGVVALVKSMDKSNKTSQQQNVNSEQFDLGNEEENKKKKYTVFIDPGHGGNDKGTESKTSNRYEKDLNLQIAKKLANKLSKQKDIQVVVSRTDDTYISLKDRAILANNSSADVLVSIHLNAEKNGNTATGIETWYRNKATDGSKELAQTVQSTIVSYVKVRDRGIVENNFEVLRESNMPAILIECGFLTTPSEEQKIINEKYQDQLAEGIVQGVLSYLDSKGNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_15 | 3151753-3151928 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_15
|
2 spacers
spacers of NZ_LN614756_15
>15.1|3151778|41|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TAATTCTGTCTGATTTTCTACATATTTAAGAATTTTTCCAT >15.2|3151844|59|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TCTTTCTGTTGGTATCTTTACATAACTTAATATTTCTTTTATTTCAAGTTCTTCAAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_15
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_15 >merge|NZ_LN614756|15|3151753-3151928|CRISPRCasFinder TTTCTCTTACTGCCTCTAAACATATTAATTCTGTCTGATTTTCTACATATTTAAGAATTTTTCCATTTTGCTTTACTGCTTCTACAAATATTCTTTCTGTTGGTATCTTTACATAACTTAATATTTCTTTTATTTCAAGTTCTTCAAATGAACCTCTTACTGCTTCTATACATATA >NZ_LN614756|15|13|3151753-3151928|CRISPRCasFinder TTTCTCTTACTGCCTCTAAACATAT TAATTCTGTCTGATTTTCTACATATTTAAGAATTTTTCCAT TTTGCTTTACTGCTTCTACAAATAT TCTTTCTGTTGGTATCTTTACATAACTTAATATTTCTTTTATTTCAAGTTCTTCAAATG AACCTCTTACTGCTTCTATACATATA
>NZ_LN614756.1|WP_004454130.1|3150501_3151080_-|accessory-gene-regulator-B-family-protein MFKRYAEKMTSVLICNNMIDNNESKVYSYGFEILIAFIVNITTMLFIGFLFGKFTYVLFFLMCYCPIRQFSGGYHADNYFRCLLTFIFIILSTILIIENINIDLFKNIIMIIASVSWVGICVLCPIEHRSNPISDREKLVYKKTAIFISTVVLLITILSLSLSIFVDYFTYSAFAMFWIFVMLVLGKLKAKV >NZ_LN614756.1|WP_003426457.1|3150325_3150472_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MKKFIVRFMKFASSLALSTAILSANSTCPWIIHQPKVPKEISNLKKTN >NZ_LN614756.1|WP_011861666.1|3148641_3150021_-|thioether-cross-link-forming-SCIFF-peptide-maturase MSMIHKFSMNGYNIVLDVNGGAVHVLDDVAYDLLDFYKEKSKEEILEILKSKYQEEKINEAYEEILNLEKEGLLYTEDTYQYHPSFVHREPVVKALCLNVAHDCNLKCKYCFAAQGDFGGEKELMSFEVGKAAIDYLIANSGSRKNLEIDFFGGEPLMNFEVVKQLVDYGRSVEKDYNKNIRFTITTNGVLLNDEIIDYINENMHNVVLSLDGRKEVNDNMRPTLNDKGSYDITLPRFKKLVEKRSKDKYYYIRGTFTRDNLDFSKDVMHFADLGFKLTSVEPVVGDESNPYALREEDLPKIFEEYEKFAVEYADRQLQGDGFKFFHFMIDLNQGPCVIKRITGCGAGNEYLSVTPNGDIYPCHQFVGNEEFKMANIFDEEIVLPENLKNMFREAHVYTKEECKQCWNKFYCSGGCHANAINFNSDISKPYELGCEMQRKRTECSIMIQAKLMLEGATN >NZ_LN614756.1|WP_004454132.1|3148115_3148613_-|gamma-carbonic-anhydrase-family-protein MIRDYLEDKPLIDESVFVAKSADVIGNVKIGKDSSIWYNAVVRGDEGPITIGENTNIQDCSIVHGDTETIIGNNVTVGHRSIVHGCKISDNVLIGMGSIILDNAEIGEYTLIGAGTLITSNKKFPPGVLIMGSPGKVVRELTEEDKKYIDESYEWYLEAAQNQKY >NZ_LN614756.1|WP_009891005.1|3146153_3147818_-|AarF/ABC1/UbiB-kinase-family-protein MRISYRNLKRYREIGYVLIKYGFSFIVERLNIEGIAYKIPLFDPPEEIKNMTTGERMKRVLEELGPTYIKIGQILSTRKDLLDQDIIDEISKLRDDVEKFDSNIAIDIFKEEVGLSIEEIFLEFKEEPIAAASIGQVYEGVLKTGEEVIVKIQRPNIEKIIKSDLEILRTIANTLKDLKKDFNLDLVQMIEEFQTQLMRELDYTFEAINATKFSRIFKNSDEVYIPKVYSEYNTKKILVMEKVNGTKLSDVEKIRRLGYNTKTIVEIGVRSFFTQVLSHGFFHADPHPGNIFVVAKNKIAYIDFGMIGIIDNKTLNQLNEIALAGVEKNVDKIIYLLIEMDALNGEADIKGLRQDLLYLIHYYYDISIEKINVTDILNELFRFFRQYKIVMPAQFVTLAKTVITLEGTSRTLNTDFSFGSMGKEFMKHHYKSKFNPKNVVLSSRQNVEEILLDIKTIPKQLKAILKNIERNNIKMQIEDVKMTRLENCIIELTSQISLSLVLASIIVGSSLIIASPNIENNIWIKFTAIAGFFISFIIGLCLVIRSIRSKYKKD >NZ_LN614756.1|WP_011861665.1|3143690_3146141_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKKWILKYKGKIEESEFSKKLNISPEICQILKNRGICTEKDSEIFMNPSLDYLRDPFLMKDMQKAVDRIKLAVEKNEKIWIYGDYDVDGVSSTSILCLYFKSIGYNVDYYIPNRLEEGYGINEDAIKLISSRGCDLIISVDCGITSVSEVNTANDLGIDVIITDHHECQSEIPSAFAVINPKQEDCNYPFDSLCGCGVAFKMIQALTPKEEFKTSMYNYLEIVTLATICDIVPLIDENRIIVKNGLKSMKEGKNIGLRELIKVCGVESDKIGSSHIGFAIGPRINASGRLGYSYLGVELFTTQSQEEAVEIASILEEKNNERQMIEAKMYHEAEEMLKSNSRYNDDKVLVLAKEGWQHGIIGIVASKLTEKYYKPTILLGIENGEATGSARSIKGFNIFEALIKCKDLMTKFGGHEQAAGLSLDSDNVEILANEINKFADYNLTEDDMIENVNVEFELQENVINLNLVEELHKLEPFGLNNPNPRFIVRNYILKDLKVIGKNQQHLKLSIEKEKSYECIGFNMSHLKSMYKVGDKVDVLFQLDENNYMGNRKVQFLLKDIRLARPKSASNDKLSLKLMSKIIPKDTQSLYNISVSDFELFDGNTDINIFDYFEKDTLIISNSINGFYRAMSDISLIDLDFNINYNIIEDDSKNTDKLELIFSPNIDKIDLKRYNNIILYDYLYNKGEYSYIYENKREESEIIKYYNKTDLLYLKNVVSNIVPSRDEFITIYKQALIKKEIDLDMVNIRETFNVIPLKFFTILNVFRELNLLDFNLNYEKNSVLIRILPKPQKKLDLNESLILNNLKNLEKQYNSSY >NZ_LN614756.1|WP_003426450.1|3143165_3143678_-|adenine-phosphoribosyltransferase MDLKNFIRNIDDFPKPGIDFKDVTTLFKDGDAFKYAVDSIVEELKDKDVDLVIGPEARGFLMGTPVAYALGVGFVPIRKPGKLPGEVESYEYGLEYGTDTLEIHKDAIKKGQKVAIVDDLLATGGTMEAAAKLVEKLGGEVVSMQFLIELKFLNGREKLSNYDVNSLIKY >NZ_LN614756.1|WP_003422921.1|3140884_3143092_-|bifunctional-(p)ppGpp-synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate)-3'-pyrophosphohydrolase MHDKELQEIIEKIKVYAPNANFEMVEKAYNLAKKAHEGQYRKSGEPYFIHPLAVANILIEMELDIETITAGLLHDVVEDTEYTYEDIKKEFGKEVADLVDGVTKLGQIKYRSKEETQSENLRKMFLAMAKDIRVILIKLADRLHNMRTLKYMPPEKAKYKAKETLEIYGGIAHRLGISKIKWELEDRALRFMDPEGYYDLVSRVSMKRSQREDYIQGIVELLKDKFKDLSIPCDVYGRPKHFYSIYRKMQKKHKTFEEIFDLTAVRILVDNVKDCYAVLGIVHTLWRPIPGRFKDYIAMPKPNMYQSLHTTVVGPDGEPLEIQIRTHEMHNIAENGIAAHWKYKEGISSKESKVEEKLQWLRQMMEWEKDLKDPQEFMDALKEDVFNSQVYVFTPKGDVIELPAESTPIDFAYRVHTNVGNKCVGAKIDGRIVPIDYKLQNGNIVEVLTSSNSNGPSRDWLNIVKTPNAKSRIRQFFKKERREENVDRGNTILEREFKKHDIPQKDPLVEKYMALVAKKFNQPSVEDLIATVGYGGIMSSQVVSKVKDLYLKEVKKAKKEQQIQEEDLNKHNISETEYSKKRKKNASQGIIVKGLDNILVRFAKCCNPLPGDEIVGYITKGRGVAIHRADCPNANNNGDFFQNRLVEVSWSSAGKGKFEAEIQIKAIDRRGIVNEITHIVAMDKLSLNGINARKGKDSIVSINLLVEVNDTEELKILMKKLKAIPGVESIYRMTN >NZ_LN614756.1|WP_003426448.1|3140410_3140860_-|D-tyrosyl-tRNA(Tyr)-deacylase MRAVVQRVSSSKVTVDENTIGQINKGLLVLLGVTHDDKSSDVDYMIDKILNLRIFEDENDKMNLSLMDIGGELLVVSQFTLYGDCRKGRRPGFSNAARPELANNLYEEFVKKAKDKGVTVGTGQFAAHMMVELTNDGPVTILLDSSKSF 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MKNVSKKFFVCTIIVLITFLCFSKFAIYVFDKQEKKETKVVENMLNVYKNNIILNLTEKFNYSKDLTSVLVSNNYSIDKLKPIADEILKNNSCIYISVVEKYNVAAFFSNSVKKDIINTPIQELNYSYSLANSIKGLVVEGPSKDQFSNGDVFLITNPIYKNGEYWGEITVALDAKKVVDSFNLNKLKESGFEYELWRVHLDNGSKSTIEISTKDFNFSKSHEIKFKLPTVWTLSIVYKNGWNNKNIDFIVFVILLIISILIGVMTFIYIEKKSISKELNQQSLKNLETGILNREGFLIKLQEHLNRKNNEIVLLYICITNYSKFAPVMSFEKRQDYLTHIVKNLDNYIKSSHFIARISEEGFVLALEENCDKNELLNIEKGISLELLRKIKVENKQVFLTIGYGSSRCVDDRKDAESLLLSAIEDYERRFPAMSPIHDFTKKCEDMLDEKKQIVFGEYPDLEINKLSKVIYKYYKKVQRIMYKDYNIDIGNRRGYMRDVEVLIDYNSERMLYLFLIDICKFGKFNELFSIEIGDVILKEVSNKLKTIFSNYLYRINGDVFLGISIDKESYLDTLHKVNEVFNSSLSVEDVLFDVKCNIGICQYPYHGENPYDLLEKVQIALEYAKKDVKSNVKVYDKELTEEIYHENNIIKDLKKGLEEQTLEVWYQPIFNVSKNCYIKAEALIRLRNKEGGYYSAYEVITYAEKHGLIKDVGLYVLKKACDVTTKIKDKNIDFEQMQLNLSVQQIVHKQCANDILSCIENCGLDKKYICVEVTETVLMETFEIVNVTLDKLKKEGISIALDEFGSGFSSINYLANLPIENLKIDKELVEQITYSKKQFELLKTIVQIAKINGMDIVAEGVETKETLDLVVTSGVNLIQGHYFSEPLSEDKFIELMIEE >NZ_LN614756.1|WP_011861669.1|3157120_3158671_-|GGDEF-domain-containing-protein MRYKKRNIDKSSELSFQSLAKYFITFYIVIILIILSMFCINTIWVMKKDNQDLLSTTSNRIEDRVGETIKLLNSLSKDNYIIDNSVNGIDKSKELSMYSDEFGYMMICFVDKNIIVWDEEGGNISLAGRDYMQKLFATKKYQVTDSFAAGADGKTLNYTIASPIIKNGNVDGCVFAAIYFDEIKDILKQGKGQQQQNFILFGSENQIMNLTSDETAYGEKYMKLSQKTKYLGTNAKKVEKDMFNNKSGDYWAFENGKLYFMSYKPIKNTNWSLFCKVNFLDIFALNLIPMGAILSVITLVFIILICMEKSFMKKRMEVIDMLLGSVQELEKRIYQTERPSEVDFKEIIQLTSKGLTDGLTGVVTRTVFFDQIYNRVEMEENDKLSVISFVDLDDLKCINDLYGHEIGDMVLKNVGYVLREYEIKYNGLIGRYGGDEFVMLLSGFTSREEVEDLLDEIAIRLHTEVLTDDGIIQTHCSVGAVVCSVKDNKDIDNLLKQADEALYYVKRNGKGNYHLV >NZ_LN614756.1|WP_003431795.1|3158993_3160706_-|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase 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MKGLVLEGGGTKGAYQIGAYKALRELGIEFQGVTGTSIGALNGAYIIQNDIEVMEDIWLNYDYTHFMNIDRETYERFKNVDFTTKNLNAVFELINKARKNEGIDISPLRQLMETTLNEDIIRKSKKDFGLVTVWWDKKINPYPLYIEDIPKGRLIDYLIASSSLPIFQTNMMDDKLYLDGMFCDNMPIGLLEDKGYEDVVVIRLIDDFIGKMNLNRHQNINIKTIIPSEYLGGSLNKDRDNVEKNIRLGYLDTMKAYERCTGIKYYFDVEYKYNEEYCFDKFRSMSNETIQYICNLLNIKRDASLRTVMESVIPKLGEVLGLPKDFSYKDLFYCIYEKKLEENNINRIKLYDFNKVIDVVNTNIDSNRNLASNFEVRPKISIKKNKNTKLLTNCIIKDIKNQS >NZ_LN614756.1|WP_003431790.1|3162955_3164689_-|N-6-DNA-methylase 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MNKNSMTRIYSLNKIIFIIIGILGIVLLTRHIEVDIKVLILILLTLFSINVFISYLKIKLYEDKINLGLINNSDKFINITKDENFLKHVQNYIISNEKENCVMACFDLCRLKLINDIYGYELGDEVLNNILSNLKNYFGKEAIYGKLKSDVFVLIIKLENREQKIPYLVNLIKNKIVILSQIDSFKMDINIEASIGIYKFNNNEIDIKKAIDNADMARLKSKGLKHIEYVEFDNAMEEEIQSIMKIERDLFLAIKNKEFVIHYQPKVDSSTGNIIGSEALIRWLHPSLGMVGPNKFIPIAEKNGLINNIGRWLIQEVFITINKWISEGINVLPVSINLSRVELYKNDLVDFFKLMFNTYNIPKELIELEITETTALRDVKFISERLYEIKSLGMNISLDDFGVGNSNFINLKGIPLDIIKIDRSLILDIVTNTKTKFMVKAIVNLSHDLNVTVICEGVEDMHQVKVLSELGCNFIQGYVFFKPLDEMNYKKLLTDGSYINLKDTLLDKCMTVEEE >NZ_LN614756.1|WP_011861670.1|3166991_3167897_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKKKLLDGKITLIICKSVKIYTKKDEEMSKGNNNNNSRNKSKKTSHLNRKKRKLNKKKLAVLICFTVLFLFIAFKATQGVVALVKSMDKSNKTSQQQNVNSEQFDLGNEEENKKKKYTVFIDPGHGGNDKGTESKTSNRYEKDLNLQIAKKLANKLSKQKDIQVVVSRTDDTYISLKDRAILANNSSADVLVSIHLNAEKNGNTATGIETWYRNKATDGSKELAQTVQSTIVSYVKVRDRGIVENNFEVLRESNMPAILIECGFLTTPSEEQKIINEKYQDQLAEGIVQGVLSYLDSKGNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_16 | 3152035-3152324 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_16
|
4 spacers
spacers of NZ_LN614756_16
>16.1|3152060|41|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder CTCTTCTGTTTGCTTATTTACATACTGTAGAGCCATATAAC >16.2|3152126|41|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TTTTTCTGTCTGTTCATTTACATAATACAATGCAAAGTCAT >16.3|3152192|41|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TTCTTCAGTTTGCTCTTTTACACAAGATAGTGCACTGTAGT >16.4|3152258|41|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder ACTATTACTTTGTTCCTTTACATAAGCTAAAGATTTTCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_16
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_16 >merge|NZ_LN614756|16|3152035-3152324|CRISPRCasFinder CAATTCTTACTGCTTCCAAACAAATCTCTTCTGTTTGCTTATTTACATACTGTAGAGCCATATAACTTCTTTTTACTGCTTCCATGCATATTTTTTCTGTCTGTTCATTTACATAATACAATGCAAAGTCATTCTGTTTTACTGCTTCTATACATATTTCTTCAGTTTGCTCTTTTACACAAGATAGTGCACTGTAGTTTTCTTTTACAGCTTCTAAACATATACTATTACTTTGTTCCTTTACATAAGCTAAAGATTTTCCATCTTTTTTTACAGCTTCTAAACATATG >NZ_LN614756|16|14|3152035-3152324|CRISPRCasFinder CAATTCTTACTGCTTCCAAACAAAT CTCTTCTGTTTGCTTATTTACATACTGTAGAGCCATATAAC TTCTTTTTACTGCTTCCATGCATAT TTTTTCTGTCTGTTCATTTACATAATACAATGCAAAGTCAT TCTGTTTTACTGCTTCTATACATAT TTCTTCAGTTTGCTCTTTTACACAAGATAGTGCACTGTAGT TTTCTTTTACAGCTTCTAAACATAT ACTATTACTTTGTTCCTTTACATAAGCTAAAGATTTTCCAT CTTTTTTTACAGCTTCTAAACATATG
>NZ_LN614756.1|WP_004454130.1|3150501_3151080_-|accessory-gene-regulator-B-family-protein MFKRYAEKMTSVLICNNMIDNNESKVYSYGFEILIAFIVNITTMLFIGFLFGKFTYVLFFLMCYCPIRQFSGGYHADNYFRCLLTFIFIILSTILIIENINIDLFKNIIMIIASVSWVGICVLCPIEHRSNPISDREKLVYKKTAIFISTVVLLITILSLSLSIFVDYFTYSAFAMFWIFVMLVLGKLKAKV >NZ_LN614756.1|WP_003426457.1|3150325_3150472_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MKKFIVRFMKFASSLALSTAILSANSTCPWIIHQPKVPKEISNLKKTN >NZ_LN614756.1|WP_011861666.1|3148641_3150021_-|thioether-cross-link-forming-SCIFF-peptide-maturase MSMIHKFSMNGYNIVLDVNGGAVHVLDDVAYDLLDFYKEKSKEEILEILKSKYQEEKINEAYEEILNLEKEGLLYTEDTYQYHPSFVHREPVVKALCLNVAHDCNLKCKYCFAAQGDFGGEKELMSFEVGKAAIDYLIANSGSRKNLEIDFFGGEPLMNFEVVKQLVDYGRSVEKDYNKNIRFTITTNGVLLNDEIIDYINENMHNVVLSLDGRKEVNDNMRPTLNDKGSYDITLPRFKKLVEKRSKDKYYYIRGTFTRDNLDFSKDVMHFADLGFKLTSVEPVVGDESNPYALREEDLPKIFEEYEKFAVEYADRQLQGDGFKFFHFMIDLNQGPCVIKRITGCGAGNEYLSVTPNGDIYPCHQFVGNEEFKMANIFDEEIVLPENLKNMFREAHVYTKEECKQCWNKFYCSGGCHANAINFNSDISKPYELGCEMQRKRTECSIMIQAKLMLEGATN >NZ_LN614756.1|WP_004454132.1|3148115_3148613_-|gamma-carbonic-anhydrase-family-protein MIRDYLEDKPLIDESVFVAKSADVIGNVKIGKDSSIWYNAVVRGDEGPITIGENTNIQDCSIVHGDTETIIGNNVTVGHRSIVHGCKISDNVLIGMGSIILDNAEIGEYTLIGAGTLITSNKKFPPGVLIMGSPGKVVRELTEEDKKYIDESYEWYLEAAQNQKY >NZ_LN614756.1|WP_009891005.1|3146153_3147818_-|AarF/ABC1/UbiB-kinase-family-protein MRISYRNLKRYREIGYVLIKYGFSFIVERLNIEGIAYKIPLFDPPEEIKNMTTGERMKRVLEELGPTYIKIGQILSTRKDLLDQDIIDEISKLRDDVEKFDSNIAIDIFKEEVGLSIEEIFLEFKEEPIAAASIGQVYEGVLKTGEEVIVKIQRPNIEKIIKSDLEILRTIANTLKDLKKDFNLDLVQMIEEFQTQLMRELDYTFEAINATKFSRIFKNSDEVYIPKVYSEYNTKKILVMEKVNGTKLSDVEKIRRLGYNTKTIVEIGVRSFFTQVLSHGFFHADPHPGNIFVVAKNKIAYIDFGMIGIIDNKTLNQLNEIALAGVEKNVDKIIYLLIEMDALNGEADIKGLRQDLLYLIHYYYDISIEKINVTDILNELFRFFRQYKIVMPAQFVTLAKTVITLEGTSRTLNTDFSFGSMGKEFMKHHYKSKFNPKNVVLSSRQNVEEILLDIKTIPKQLKAILKNIERNNIKMQIEDVKMTRLENCIIELTSQISLSLVLASIIVGSSLIIASPNIENNIWIKFTAIAGFFISFIIGLCLVIRSIRSKYKKD >NZ_LN614756.1|WP_011861665.1|3143690_3146141_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MKKWILKYKGKIEESEFSKKLNISPEICQILKNRGICTEKDSEIFMNPSLDYLRDPFLMKDMQKAVDRIKLAVEKNEKIWIYGDYDVDGVSSTSILCLYFKSIGYNVDYYIPNRLEEGYGINEDAIKLISSRGCDLIISVDCGITSVSEVNTANDLGIDVIITDHHECQSEIPSAFAVINPKQEDCNYPFDSLCGCGVAFKMIQALTPKEEFKTSMYNYLEIVTLATICDIVPLIDENRIIVKNGLKSMKEGKNIGLRELIKVCGVESDKIGSSHIGFAIGPRINASGRLGYSYLGVELFTTQSQEEAVEIASILEEKNNERQMIEAKMYHEAEEMLKSNSRYNDDKVLVLAKEGWQHGIIGIVASKLTEKYYKPTILLGIENGEATGSARSIKGFNIFEALIKCKDLMTKFGGHEQAAGLSLDSDNVEILANEINKFADYNLTEDDMIENVNVEFELQENVINLNLVEELHKLEPFGLNNPNPRFIVRNYILKDLKVIGKNQQHLKLSIEKEKSYECIGFNMSHLKSMYKVGDKVDVLFQLDENNYMGNRKVQFLLKDIRLARPKSASNDKLSLKLMSKIIPKDTQSLYNISVSDFELFDGNTDINIFDYFEKDTLIISNSINGFYRAMSDISLIDLDFNINYNIIEDDSKNTDKLELIFSPNIDKIDLKRYNNIILYDYLYNKGEYSYIYENKREESEIIKYYNKTDLLYLKNVVSNIVPSRDEFITIYKQALIKKEIDLDMVNIRETFNVIPLKFFTILNVFRELNLLDFNLNYEKNSVLIRILPKPQKKLDLNESLILNNLKNLEKQYNSSY >NZ_LN614756.1|WP_003426450.1|3143165_3143678_-|adenine-phosphoribosyltransferase 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MHDKELQEIIEKIKVYAPNANFEMVEKAYNLAKKAHEGQYRKSGEPYFIHPLAVANILIEMELDIETITAGLLHDVVEDTEYTYEDIKKEFGKEVADLVDGVTKLGQIKYRSKEETQSENLRKMFLAMAKDIRVILIKLADRLHNMRTLKYMPPEKAKYKAKETLEIYGGIAHRLGISKIKWELEDRALRFMDPEGYYDLVSRVSMKRSQREDYIQGIVELLKDKFKDLSIPCDVYGRPKHFYSIYRKMQKKHKTFEEIFDLTAVRILVDNVKDCYAVLGIVHTLWRPIPGRFKDYIAMPKPNMYQSLHTTVVGPDGEPLEIQIRTHEMHNIAENGIAAHWKYKEGISSKESKVEEKLQWLRQMMEWEKDLKDPQEFMDALKEDVFNSQVYVFTPKGDVIELPAESTPIDFAYRVHTNVGNKCVGAKIDGRIVPIDYKLQNGNIVEVLTSSNSNGPSRDWLNIVKTPNAKSRIRQFFKKERREENVDRGNTILEREFKKHDIPQKDPLVEKYMALVAKKFNQPSVEDLIATVGYGGIMSSQVVSKVKDLYLKEVKKAKKEQQIQEEDLNKHNISETEYSKKRKKNASQGIIVKGLDNILVRFAKCCNPLPGDEIVGYITKGRGVAIHRADCPNANNNGDFFQNRLVEVSWSSAGKGKFEAEIQIKAIDRRGIVNEITHIVAMDKLSLNGINARKGKDSIVSINLLVEVNDTEELKILMKKLKAIPGVESIYRMTN >NZ_LN614756.1|WP_003426448.1|3140410_3140860_-|D-tyrosyl-tRNA(Tyr)-deacylase MRAVVQRVSSSKVTVDENTIGQINKGLLVLLGVTHDDKSSDVDYMIDKILNLRIFEDENDKMNLSLMDIGGELLVVSQFTLYGDCRKGRRPGFSNAARPELANNLYEEFVKKAKDKGVTVGTGQFAAHMMVELTNDGPVTILLDSSKSF >NZ_LN614756.1|WP_004454137.1|3139781_3140396_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MIIKKFVDSYFGVNTYVLGDEKTKKCAVIDPGGSLVETLSFVKENELNIEYIILTHGHGDHIGYVKDIKEKTGAKVVAHVDEKELLNDKNKNLSYTMRCGAQEFDADIYVNDKDKLELGELKMTFLHTPGHTQGCMCIRVEDEMFTGDTLFAGSIGRTDLYSGDFNQMEKSLKKLCKYEDAVRVYPGHGPTSTLGVEKKTNPYM >NZ_LN614756.1|WP_011861667.1|3153221_3153887_+|hypothetical-protein MKGNIVQYNFADIEEEVYSLDYAIAWNTNEENVNIIPFTNKFCKESIESFCLGKINNFVEILNEGFVENHHYVHLDKMISVPKKKVNLVYQQDTHGYLLRDDNDNLIPAKITSEQSKSISSKMELFCAGEEKCLINILLKADPSYILDVDSIKDKNILNLGYESIDRYKEYNFDDDKILIFFINKKRYSVIMKKTNNSDNDLVSRNNAIKELFTNKAGNLN >NZ_LN614756.1|WP_011861668.1|3154392_3157095_-|EAL-domain-containing-protein MKNVSKKFFVCTIIVLITFLCFSKFAIYVFDKQEKKETKVVENMLNVYKNNIILNLTEKFNYSKDLTSVLVSNNYSIDKLKPIADEILKNNSCIYISVVEKYNVAAFFSNSVKKDIINTPIQELNYSYSLANSIKGLVVEGPSKDQFSNGDVFLITNPIYKNGEYWGEITVALDAKKVVDSFNLNKLKESGFEYELWRVHLDNGSKSTIEISTKDFNFSKSHEIKFKLPTVWTLSIVYKNGWNNKNIDFIVFVILLIISILIGVMTFIYIEKKSISKELNQQSLKNLETGILNREGFLIKLQEHLNRKNNEIVLLYICITNYSKFAPVMSFEKRQDYLTHIVKNLDNYIKSSHFIARISEEGFVLALEENCDKNELLNIEKGISLELLRKIKVENKQVFLTIGYGSSRCVDDRKDAESLLLSAIEDYERRFPAMSPIHDFTKKCEDMLDEKKQIVFGEYPDLEINKLSKVIYKYYKKVQRIMYKDYNIDIGNRRGYMRDVEVLIDYNSERMLYLFLIDICKFGKFNELFSIEIGDVILKEVSNKLKTIFSNYLYRINGDVFLGISIDKESYLDTLHKVNEVFNSSLSVEDVLFDVKCNIGICQYPYHGENPYDLLEKVQIALEYAKKDVKSNVKVYDKELTEEIYHENNIIKDLKKGLEEQTLEVWYQPIFNVSKNCYIKAEALIRLRNKEGGYYSAYEVITYAEKHGLIKDVGLYVLKKACDVTTKIKDKNIDFEQMQLNLSVQQIVHKQCANDILSCIENCGLDKKYICVEVTETVLMETFEIVNVTLDKLKKEGISIALDEFGSGFSSINYLANLPIENLKIDKELVEQITYSKKQFELLKTIVQIAKINGMDIVAEGVETKETLDLVVTSGVNLIQGHYFSEPLSEDKFIELMIEE >NZ_LN614756.1|WP_011861669.1|3157120_3158671_-|GGDEF-domain-containing-protein 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MKGLVLEGGGTKGAYQIGAYKALRELGIEFQGVTGTSIGALNGAYIIQNDIEVMEDIWLNYDYTHFMNIDRETYERFKNVDFTTKNLNAVFELINKARKNEGIDISPLRQLMETTLNEDIIRKSKKDFGLVTVWWDKKINPYPLYIEDIPKGRLIDYLIASSSLPIFQTNMMDDKLYLDGMFCDNMPIGLLEDKGYEDVVVIRLIDDFIGKMNLNRHQNINIKTIIPSEYLGGSLNKDRDNVEKNIRLGYLDTMKAYERCTGIKYYFDVEYKYNEEYCFDKFRSMSNETIQYICNLLNIKRDASLRTVMESVIPKLGEVLGLPKDFSYKDLFYCIYEKKLEENNINRIKLYDFNKVIDVVNTNIDSNRNLASNFEVRPKISIKKNKNTKLLTNCIIKDIKNQS >NZ_LN614756.1|WP_003431790.1|3162955_3164689_-|N-6-DNA-methylase MDDISQDNFLLSKEYENSLDVDTKKASGIYYTPKIIVDYIVKKTLKNHDIIKNPYPRILDISCGCGNFLLEVYDILYDLFEENIYELKKKYDENYWTVDNIHRHILNYCIYGADIDEKAISILKDSLTNKKVVNDLDESDIKINLFCCDSLKKKWRYKFDYIVGNPPYIGHKKLEKKYKKFLLEKYSEVYKDKADLYFCFYKKIIDILKQGGIGSVITPRYFLESLSGKDLREYIKSNVNVQEIVDFLGANIFKNIGVSSCILTFDKKKTKETYIDVFKIKNEDICINKFETLEELLKSSKFEHFNINQRLLSDEWILVNKDDETFYNKIQEKCKYSLEDIAISFQGIITGCDKAFILSKDDVKLNLVDDKFLKCWIKSKNINKYIVDKSEYRLIYSNDIDNENTNKRILDEIIGLYKTKLENRRECKSGIRKWYELQWGREKLFFERKKIMYPYKSNENRFAIDYDNNFSSADVYSFFIKEEYLDKFSYEYLVGILNSSVYDKYFKITAKKMSKNIYDYYPNKVMKIRIFRDNNYEEIENLSKQIISILLNKSIDKGKVEKLQIKMDNLIMDSLGI >NZ_LN614756.1|WP_003426473.1|3164728_3165127_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MISEDVDYSIRIIRAIFNNGEDKPIDAKMILKSEDIPILTLYRLLRKLCANNILTFNKEDGKTYMLNVSLDTISLRTIVEVIDGKIYINKCTRYVSNCSNCLKGCKVNRELLEIEKEIYKLLSRKSIRQILE >NZ_LN614756.1|WP_004454122.1|3165129_3166677_-|EAL-domain-containing-protein MNKNSMTRIYSLNKIIFIIIGILGIVLLTRHIEVDIKVLILILLTLFSINVFISYLKIKLYEDKINLGLINNSDKFINITKDENFLKHVQNYIISNEKENCVMACFDLCRLKLINDIYGYELGDEVLNNILSNLKNYFGKEAIYGKLKSDVFVLIIKLENREQKIPYLVNLIKNKIVILSQIDSFKMDINIEASIGIYKFNNNEIDIKKAIDNADMARLKSKGLKHIEYVEFDNAMEEEIQSIMKIERDLFLAIKNKEFVIHYQPKVDSSTGNIIGSEALIRWLHPSLGMVGPNKFIPIAEKNGLINNIGRWLIQEVFITINKWISEGINVLPVSINLSRVELYKNDLVDFFKLMFNTYNIPKELIELEITETTALRDVKFISERLYEIKSLGMNISLDDFGVGNSNFINLKGIPLDIIKIDRSLILDIVTNTKTKFMVKAIVNLSHDLNVTVICEGVEDMHQVKVLSELGCNFIQGYVFFKPLDEMNYKKLLTDGSYINLKDTLLDKCMTVEEE >NZ_LN614756.1|WP_011861670.1|3166991_3167897_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKKKLLDGKITLIICKSVKIYTKKDEEMSKGNNNNNSRNKSKKTSHLNRKKRKLNKKKLAVLICFTVLFLFIAFKATQGVVALVKSMDKSNKTSQQQNVNSEQFDLGNEEENKKKKYTVFIDPGHGGNDKGTESKTSNRYEKDLNLQIAKKLANKLSKQKDIQVVVSRTDDTYISLKDRAILANNSSADVLVSIHLNAEKNGNTATGIETWYRNKATDGSKELAQTVQSTIVSYVKVRDRGIVENNFEVLRESNMPAILIECGFLTTPSEEQKIINEKYQDQLAEGIVQGVLSYLDSKGNK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_18 | 3261178-3261389 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_18
|
3 spacers
spacers of NZ_LN614756_18
>18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder CAATACCTCTGGTATTGGCGGATTTATTATA >18.2|3261261|52|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TATAACTATAGTATCCTCTGTATCAGATGAACTTGATGGTTTCCTTGGTTTA >18.3|3261339|25|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder TACTATTGGTTCATCTGTATTTGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_18
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_18 >merge|NZ_LN614756|18|3261178-3261389|CRISPRCasFinder TCTTCTGATGGTGGTACTGGAGGATTCAATACCTCTGGTATTGGCGGATTTATTATATCTTCTGATGGTGGTACTGGTGGATTTATAACTATAGTATCCTCTGTATCAGATGAACTTGATGGTTTCCTTGGTTTATCTGTGCTTGGTGGTACTGGTGGATTTACTATTGGTTCATCTGTATTTGGTGGTGCTGGTGGATTTACTGGTGGATT >NZ_LN614756|18|16|3261178-3261389|CRISPRCasFinder TCTTCTGATGGTGGTACTGGAGGATT CAATACCTCTGGTATTGGCGGATTTATTATA TCTTCTGATGGTGGTACTGGTGGATT TATAACTATAGTATCCTCTGTATCAGATGAACTTGATGGTTTCCTTGGTTTA TCTGTGCTTGGTGGTACTGGTGGATT TACTATTGGTTCATCTGTATTTGGT GGTGCTGGTGGATTTACTGGTGGATT
>NZ_LN614756.1|WP_011861706.1|3259924_3260587_-|zinc-metalloprotease-Zmp1 MRPSKKLLIAIISIFLISSVPVSAHADSTTIQQNKDTLSQIVVFPTGNYDKNEANAMVNRLANIDGKYLNALKQNNLKIKLLSGKLTDEKEYAYLKGVVPKGWEGTGKTWDDVPGLGGSTVALRIGFSNKGKGHDAINLELHETAHAIDHIVLNDISKSAQFKQIFAKEGRSLGNVNYLGVYPEEFFAESFAYYYLNQDTNSKLKSACPQTYSFLQNLAK >NZ_LN614756.1|WP_009897998.1|3258840_3259803_+|EamA-family-transporter MKKGYVYIILTTLFFSSMEISLKTVTNDFNPLQITLSRFFVGGLVLLPFAVKRLRALSLSITKSDLKYFAFLGFMCVVVSMSLYQLAVLNTKASVVAVLFSCNPVFVMLLAYLILKEKIYRHNVISLILEVLGIIVIINPLHTKLTLSGIFLTLSSAIIFSMYTVFGKRKTLKFGGIVVTCFSFIFGSLEMLILVLLTKINFIADILNKNKLHVFANIPIFSGYTLHNMPIMIYVFVFVTGVGYALYFMAMEATSTSLTSLVFFFKPVISPILALLILKEIIPINMVVGILLIVIGSIISIIPTIITQMHNKHVEALYKE >NZ_LN614756.1|WP_003436139.1|3257480_3258671_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MISNKMQTLVANSSVIRAMFEEGKKLSDIYGEENVFDFSIGNPSVEPPETIKAVINDILNEESPNLVHGYMNNSGYEDVRDAIAEHINKKDGLNLTRENLIMTCGAAGGLNIILKTLLNPGDEVIAFAPYFGEYKNYTENYDGKLIEVPTNIETFEPDLDALKNAITPKTRALIINTPNNPTGVIYSEELLKNLGELLDSKQKEFNTSIYLISDEPYREIIYDGAKVPCVLKYYRNSFIGYSYSKSLSLPGERIGYIVANGQMDDFDDVMSSLNVANRILGFVNAPSLFQRVIARSLDAEVDVNIYKKNFDLLYNSLIDMGYSCVKPNGTFYLFPKAPIEDDKKFCNDAKQFNLLLVPGSSFGCPGHFRVSYCVSYDKVKSSLPAFEKLAKLYNLK >NZ_LN614756.1|WP_003436142.1|3256728_3257175_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDFKNLQYESLSYIICNLQKNFKLYCEKCLKPYKLTNGLYFYLIYINKNRNCSLNDVSTEFEVDKAHTTRTISRLEQDGYIEKIQNPNDSRAFQLRVTDKGEEVLGDIKNIFSKWDNHIKKEFSDTEYKELVKNLHVVKDIKTAVEEE >NZ_LN614756.1|WP_011861704.1|3255632_3256727_-|oxidoreductase MYCNLLKPIKIGNLELKNRVSFAPTSMGLKLEEKIKKFSDIAKSGVALITLGDVSIRPSFHKVAISLSDEDGVMKYKKIVDEIHNSGAKVSAQLFCSDYDVNLIKDTMKMGITSHDEIKKIMNDGVKDYITNMTKGEIKNIINLFKVTALNAKKAGFDMIQIHGDRLVGSFSSSIFNNRNDEYGGTCDNRSRFASEIISSIRDEVKDIPIDYKFAIRQENPHYGNAGVLLSEVEYFVKKFESLGVNSFHVTLANHSKLEDTIPTNNHPYFKDEGCFLYLADEVKKHTNLPVCGVGKLSSPDFIESIISNNRVDMVSMSRQLLADSNWLQKVKDGRVDEIKKCCYCNKKCADALQTRSQFGCILD >NZ_LN614756.1|WP_003436147.1|3255026_3255557_-|flavodoxin-family-protein MKSLVLYSSLTGNTKKIAYTIYDEIQEEKDIKDVNELVDYGIDYENYDIVFLGYWVDKGICDKNSKQVLENIHNKKIALFGTMGASKKGSYGASIIEKIESIIPKDNEILGSFICQGKIAEGLKAKYKEMLKLSPDNEHIRQQLNNHEESQSHPDEQEIYEASMFAKNMMIKASIV >NZ_LN614756.1|WP_003436150.1|3252714_3254091_+|hypothetical-protein MKYKIGFLTTSYFMSDKFKQALKELNDTCEITFIELKGENPFNNLPNIYYEQVDNFDGFVCSGIVPYSELIINIKDIKVPLNFLKLDERDFYKYLFKLLNSQKDIDFTKSFMDFLREDNNYYDIYSLIDSNKCPYTIKDFNIPQPVYDFKKLNDKLLEIHLDLLRDNKINLSFTRNYIISCELNKLGYDCIYMVPSTESILNTFKSLVNEITLQNLDKNKSATCIVTVNSSEYINEDLIFKNDEIQNQIYNTILNSLSRHGFYGVQVKKNDMKIEIHTTKEMLNNMTNNYTDFFISEDLKEIKYSLNIGWGIGNTNIHAEQNARQANGKSASLNGNCTFIVNDTNDTIGPLYSNKNSNNIEDSSIANKVASFIPLSNTNVSKIMCMINDRNSNNVSAEILADYMNITLRSANRILSILYKAGIATIVNTKLDNQRGRPKKIYKVDFLSFLNKMQKLNS >NZ_LN614756.1|WP_011861703.1|3251274_3252447_-|M20-family-metallopeptidase MNTYLNEISKFVDENREEIVSLWKEIVNMESYTHCKESVNKLAERLKLEFEKEGLDCELVDVGDNGSTLIGTLGSNIDKKPIIFSGHMDTVFETGTFGENPFKIIEGKAYGPGVLDMKGGIIISLYVIKALNKIGYKERPIKIVFSGDEEIGHKDSTGADVILREAKGGLCAFNMETGLVDNSLCVGRKGRIGCNIHVKGVETHAGNDFEGGRNAIEEMANKILRIQKLTNLDVGTTVSVSVIKGGRVENSIPEDCSIKVDLRFEKVEEMENVKEQVREICKETYIEGTSTEVNFISEMMPFETTEDVMRFHTFVNEVSKENGFGELNAKRLGGSSDASYLTIANVPTICSFGVRGEWNHTSREYAVVDSMFERVKLISTVILNLDKFEV >NZ_LN614756.1|WP_003431751.1|3250613_3251261_-|membrane-protein MDVTAGDNKVTWKGYLSLFVLIVLFSGVFKDSQGFLKALDFANLTGSFGTIADGVDFMGKGGTGAKDGFLFALTLIPTVCFAVGLIDVVESMGGMKAASKIFNPLLRPLLGIPGIAGIAFVSSFTSSDVASIMTKELFESGEITDDERTIFVAYQYAGSAVILNTINTQAPLLPIALLALGPIILIEIFCKILGANLVRLIIGVRNKKNKAKEAV >NZ_LN614756.1|WP_011861702.1|3250105_3250612_-|nucleoside-recognition-protein MSQQNTGNAINSKPKKTAVEIFMGGAKKGFYIGVEQILPAMIMGYVIVQFLQLTGLVDILGNIFGPVMGIFGLPGESVVVLIAAFFAKAAGAATAANLFAQGLITAPQATILIMPCMLMGTLVGHYARIVLVANASTKYRMLLLAVPIFDAIVGMLIVRVLLTVMGLM >NZ_LN614756.1|WP_003426667.1|3264205_3265384_-|cation-transporter MFSKILVKTFIRDSENVQNTDVRNKYGYVAGVVGILSNLLLFVIKVFIGMLTSSIAIMADAFNNLSDMASSAITMIGFKLASKPADKEHPFGHGRIEYLSALIVAFMVMLVGLQFVKSSIERIVNPIPVKFEVIPLILLIASIMIKIWLSRFNKFMGNKIDSSALKAVSLDALGDVFTSSCVVISFIVARFTNFPIDGYVGIVVSLVILYAGFSLVKDTINPLLGEAPDEEMVNSIIELLLSYKYIIGTHDLIIHNYGVGRCIASIHAEIPSNIDIMEIHEIIDTAEREISEKLDIYLVIHMDPICLEDKEVMSAKKELEEILKKNSLVKSMHDFRIVGKGSKKNLIFDIVVNPSEFSKNMSEDDLKEDITKLVKEINPEYNCVIVVDKDFI >NZ_LN614756.1|WP_009898004.1|3266008_3268783_-|calcium-translocating-P-type-ATPase,-PMCA-type MRYYNKPTKEVLKYLKTNPEIGLDDNEVEERKLRYGLNEFTIKEGRTFWDELGESLTEPMILILIGAAVISSFVGELHDALGILGAIFIGISIGIITEGKSKKAAHALSKLTENIEVKVLRNGKIIKISKNDLVPGDIVYIETGDMIPADGRLIQSINLKLREDMLTGESDDVAKNADAVLDMEVVYSKTEIIEQDAIPAKQVNMVFGGTLVAYGRGIMVVTHTGDKTEMGKIAQNLSNEDQQTPLQIKLGKLGAKIAGISGIIATLLCMFMIIQMQRKGMLILDTSSVLSFLQSLEPAKNAYMVCIALIVATVPEGLPTMINITLAITMQKMAKINALVTKKEACETIGSVSVICSDKTGTLTQNKMMVEVAYVDGKYISGGEYQSNSYFEQNCIVNSTADIEKEDNSFKYIGSATECALLLYHNDKNYNEMRKQTYLISQIPFSSEEKKMSTLIRQEDSDILLSKGAPEVLLKKCSYVQQGKNIVPITPKVEKSILDEIKKLQIKSMRTLGFAYKKMSNSKTEVAMTSEGELNLIGNSRSYMKEDNLVFSGFVGIVDPLREGVKDSIDKAFNAGVDVKMLTGDNINTATAIGNELGLLNDGKKAVEATYIDVLTDKELREEIKGISIVARSKPDTKMRIVSALQKSGEVVAVTGDGINDAPALSQADVGIAMGISGTEVSKNAADIILTDDSFSTIVEGIKWGRGIYENFQRFIQFQLTVNIVAFIIAIISQLTGKDMPFTTIQLLWVNIIMDGPPALALGLEPVRDYVLKRKPINRHSGIIARSMFVNIIINAILIITIVFTQSAFNILGATSEEQGTVIFSLFAFSALFNALNCREFGLNSTIPNFFKNKLALQIIVVTGIIQIIFTQVFQSFFNSVSLDFDMWIKIILFASTILLSNEFVKLILRTMKNSRTMNFNSKN >NZ_LN614756.1|WP_003436123.1|3268954_3270211_-|serine-hydroxymethyltransferase MLKTTKISDPELYKIVADELVRQEHNIEMIASESTAPTEVLELSGCVFTNKTEEGYPGARFQAGSEEADKLETLAIKRAKEVFGAEHVNVQPYSGSTANYCVYSSILKPNDTVLSMRLDQGGHLTHGSAVNFLHDIYKYEFYGVDPNTGRIDYDALEAKAKECRPKLIIAGASSYPRLIDYERISKVAKEVGAYFMVDMAHVAGLVAAKVIPSPVPYADFVSSSTTKTFCGPRSGIVLCKAEHAKKLDKGVFPGTLGSIHLNTVAAKAFSLLYLSTDKFKKIMEQVVVNAQTLASELISHGFSIVSGGTDNHIVMVDLRSKNLTGKQFEKALEYVGITVNKNVIPDDPQSPFVTSGVRIGLTSISQRGLKEKEVIQIAGIMNKVAENIDNKEVLDECKAEAQELISKFPLYPEGYFED >NZ_LN614756.1|WP_009891132.1|3270282_3271785_-|AbgT-family-transporter MRALNVVERAGNKLPDPVTIFLLLCIIVVILSAVISNLGVEEIHPSTKEVVKVVNLLEKEQIQSYLGSIVTNFQSFAPLGLVLVTMLGAGVAEKSGFMEVLMKKGISKVPQKLVTVAIVFAGMLSHTAADVGFIILPPLAALVFLGIGRHPLVGMFAAFAGVAGGFAANVMLSTTDVLLAGFTIPAAQMMDPSYQGNPAMNLYFAFISAIVLTFAGAFVTEKFIAPRFTKYNDSTNDKDIQELSELENKGIKYALLSLLVVVVVIVALCIGDNAFMKDPETGSILSSNAPLMKGIVPIITIIFLTPGLVYGKVSKKIKSDKDLVSMMGSSMSDMGGYIVLAFIASQFINLFNLSNLGTILSITGAKLLAESGIPSYGLIIGFILLSGFINLFVGSASAKWAILAPIFVPMFMLLDFNPALTQIAYRIGDASTNPISPLFPYFPVILAFARRYDKDIGIGTVISNMIPYSVVFTLIEIIILLLFMGIGIPLGPGGGISYVL >NZ_LN614756.1|WP_003436121.1|3271875_3273066_-|amidohydrolase MHELILISEKYKEDILDFFTDIHMHPELSFKEFRTTKAIKDLLVSLDIEILDLGMETGVVGLLKGKYDGPTVALRGDIDALPIYEEVDIKYKSRYDGIMHACGHDIHTSCLVGCAYVLSHIRDSLHGNVKFIFQPAEEVNKGAKMLVERGVMENPKVDAIFGLHNHPDIPCGKIGVKLGGLMAAVDTIKIEVNGFGGHGGIPNRTIDPIVASSAIIMGIQTIVSRNISPLESAVISIGTINGGTANNVISEKVDMTGTCRSFSNEVRKKISENLENIVCEIARGYQATAKLDYLFDLPAVINSKEMYAIACKSVCDLYSEDAIVDPIPSTGGEDFSIFMEKAPGFFYWLGVGNKEQDCIYQWHNPKFKADKNSILVGTNVLCQSVINYMDKLKNKI >NZ_LN614756.1|WP_003436120.1|3273304_3274393_-|membrane-protein MSDKVNMKNIICIAGAYLATAIGSGFATGQEILQFFASQGYMGLIGALISMVLFSFLGAEVITRGRELKLKEPTRIYTFYCGKILGKFYEWFSPIFLFGILIVMISGAGSTLTEYYGINPYLGRVLMAVATLITVSMGLEKLVSILGRIGPVIAVFTIAVGLISLFKHFDGLSMVGEAMKNIEVTKASESPIVSGVIYNTLNIIVMIVFLTGMGASIESKKDAFWGGLLGGIVFMTAGIVMYLAMISDIGNLYMKEIPSLYLADNISPIVGVCFSVALILGIYTTAVPLLWSVTNRIVEDEHPKFKLVTTVIAILACIGGFLPFGKLVNILYPYTGYMGLLILVCMVYKAITCRKKSTQSQE >NZ_LN614756.1|WP_003436119.1|3274677_3275376_-|response-regulator MRRALIIDDEEAVLKIITHFIEMKDMPIKIVGKATSGDEAVDKIIGLEPDIVFIDIQMPIYNGLEVIEKTSHLSKKINFVVITAFNYFEYAQKALRLNVKDILLKPLDMKEFTKSVEKIIGYQYTNNDLLNEILEYINLNYSNDLKLNDCARLFLTNPSNISRIFKSNLNTTFISYLNHIRIEKSIELLENTTKSINEIAEIVGYNSLNNFYKNFKIEKGMTPKVYKLNTKN >NZ_LN614756.1|WP_011861709.1|3275489_3276995_-|histidine-kinase MKIQNTEWGYIEWKHTYDENNPKQAMNIYIAVTMPGKKHFNHVHYGQEQMIYILEGEGLYIINGVWKPFYQGMIFYIESGSTHETINTGDREIKELIVSNNVDDVGESEIIDINPNNYLKKTLINYSESTLNLYAAVESIRGQFIDPFKIPLIIYDDSWNIVLKNPYFPLFCFEKCNPMKFPQNCDCMNQKSSNQFVCEYGITIYNIPILYKSNSIGVIRGGYVLLSDLNLDTEHNNLYDIPEGAARSIKRLLKQISKNIINFCSFNDIRKDLQEKEKTIARTYHYGEQLEMNLKVAQDMVTNLRINHHFLFNTLNSMASIALDDGSYDLYSAIIDLSRMFRYTMRSDLRFVELESEILYIKNYLNLQKLRYGDALKVKYLIPEKLYNLSVPFNFIQPIVENAFTHGFRDIDTEKRIEIIARLDSQYAIIEIHNNGTILDGNNIDKIKAGIRSNNGHGLSLIYTKFTSAYGNNFDMDIKSSDNEGTYIMIKIPIENYKEYV >NZ_LN614756.1|WP_011861710.1|3277410_3278682_-|serine--tRNA-ligase MLDIKRIRENLDCIKKAMERRGEKDFNLDEVVKLDDERRKILQEVEVMKNELNTASKNIPNLIKEGKDVENEKIKLKELSDKIKVIDQNLKEVEDKMEYLLMRIPNVPHPEVPQGETDEDNVEVRTWGKTTTFDFESKAHWEIGTELGILDFETASKITGSRFTLYKGLGARLERALLNFYLDTNTKVNGYTEVIPPFMANRNSFLGTGQLPKFEEDMFKIEGLDYFMIPTSEVPLTNIHANEILKFEQLPINYTAYTPCFRSEAGSAGRDTRGLVRQHQFNKVEMVKIVAPEESYNELEKLTNNAETMLQLLNLPYRVVKICTGDLGFTASFKYDVEVWMPSYNRYVEISSCSNCEDFQARRAGIRFKRDKDSKTEYVHTLNGSGLAIGRSVAVILENYQQEDGSVVVPEVLRAYMGVSVIK >NZ_LN614756.1|WP_011861711.1|3279497_3281102_-|amidohydrolase MKAKIYYNGNIITMEDSICGDAILIKDKIIKKIGTKEEVFALKNKDTEIIDLQGKTLMPSFIDSHSHLIAFATTLKLVPLEDATSFKDIVKKIQDFKESNNIKKGDWIIGFSYDNNFLEENKHPDKSVLDSASSENPILISHASGHMGVANTLGLKQLGVTNETRDPEGGHIGRVEGSEEPNGYLEENAFFNVASKIKQPSSNEIFNSIEKAQNIYLSYGITTAQEGLMEENQFNILKAMANQNKLKMDVVGYVNLKKSKSVVDNNREFIKKYINRFKIGGYKIFLDGSPQGKTAWLSRPYENSDDGYCGYPIYKDEEVEKFIDISLKEKMQLLTHCNGDAAADQLIDAFEKVLNLKEQSSENNIRPVMIHAQTVRADQIDDMKVINMIPSYFVAHTYYWGDIHIKNLGEDRAFKISPLKTTIEKGLIYTLHQDTPVIAPNMLETVWCAVNRITKKGIQIGENEKISPLDALKGVTINAAYQYFEEDKKGSIKEGKLANLIILDENPLTIDPMKIKDIKVLQTIREGEVLYSLK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_19 | 3354042-3354269 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_19
|
3 spacers
spacers of NZ_LN614756_19
>19.1|3354071|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder CCTTTATAGATAATTTTATAGACTCTTTGTATGTACT >19.2|3354137|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder GAAAAGAGTTTGTAGGGAAAATATTTAATGATGCAAC >19.3|3354203|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder AAGAACTAGCTACAAGCTTTATACAGCGTTCTCAAAC >19.4|3354079|38|NZ_LN614756|PILER-CR CCTTTATAGATAATTTTATAGACTCTTTGTATGTACTA >19.5|3354145|38|NZ_LN614756|PILER-CR GAAAAGAGTTTGTAGGGAAAATATTTAATGATGCAACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_19
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_19 >merge|NZ_LN614756|19|3354042-3354269|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTTTAAGTCCACATAGTTAATATAAAACCCTTTATAGATAATTTTATAGACTCTTTGTATGTACTATTTACATACCACATAGTTAATATAAAATGAAAAGAGTTTGTAGGGAAAATATTTAATGATGCAACCTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGAACTAGCTACAAGCTTTATACAGCGTTCTCAAACCTTTACATACCACTTAGTTAATATAACTCT >NZ_LN614756|19|17|3354042-3354269|CRISPRCasFinder ATTTTAAGTCCACATAGTTAATATAAAAC CCTTTATAGATAATTTTATAGACTCTTTGTATGTACT ATTTACATACCACATAGTTAATATAAAAT GAAAAGAGTTTGTAGGGAAAATATTTAATGATGCAAC CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAGAACTAGCTACAAGCTTTATACAGCGTTCTCAAAC CTTTACATACCACTTAGTTAATATAACTCT >NZ_LN614756|19|11|3354051-3354202|PILER-CR CCACATAGTTAATATAAAACCCTTTATA GATAATTTTATAGACTCTTTGTATGTACTATTTACATA CCACATAGTTAATATAAAATGAAAAGAG TTTGTAGGGAAAATATTTAATGATGCAACCTTTACATA CCACTTAGTTAATATAAAAC
>NZ_LN614756.1|WP_011861034.1|3353351_3353912_-|lipoprotein MKKKVCFLFSILIVICLAIVGCSNSESPEESSKNNEPKKEEKKDKEVVIGEKIISDKMEITINNIEFSYDVLPKVKESLYTHYPAESGKVYIDIAADIKNTQKQELNCSDLLTIEANYNDGYKYSSQTIVEDETTGFTYDNISSIDPLETKGVRFIIDCPDEVKTSDKPVILSFTFDGNKYVYKMK >NZ_LN614756.1|WP_011861035.1|3352738_3353308_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MDDIVEYIFCSECGAKCLKGSKFCSECGTEIADIKMLNESIIKEKEYDLKGIDLQHVMQETSFIKASSVRRLKELTGIELDDCRKILEEPYQKYYNENADMLEEKRKKEDDISKIRKAKEEKKEKEKIACCPACGSTSLTTHKKGFGIGKAITGATIAGGIGLVAGNIGAKKVRVTCLNCGKQFWAGKK >NZ_LN614756.1|WP_011861036.1|3350316_3352668_-|tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRNMTTSINTTINSLERLQGRLNNPLNTGGIQTSQQSLNNIESILTRIEQSIGKADEQQRKFNDDINKGASNTDRLLGSVKKVVGTYMGLKTIGGLANLSDQMTSTNARLNMINDGQLSDGGLNKMIFQSAERSRASYLDTAQIVSRIGMNAGSAFSSTREIVSFAEQLNKKFVIAGASTEEMNSALLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIKSIADYLDVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLAASAETNAQFEKMPLTIGQIFTSIKNNAVMIFGAIQKKIEDTVSSGGFRTFIVNVTDSLYVLGAVGYSVFNGFIDLLSSPTFQGFANMMIVGISLITQGFGWLLTVLGSVINFISQGWSIIQPILITSIVLWGLYKTAVIAGALVTAIQVVWIALQTFWTNLLNGSLLTNIMMNIAAKISTDALSGSMLLLITTIVMVVAAVALVIAAIFVAVAIFNHFAGTSISATGVVVGAFYFLGTCIYDVFAGAWNIVMAFAEFFVNSFNIVIYNVQLLFYKFQNFVINAMGDVGGSFDNCATALANAFVSAANIAIKGINGVIKTLNLIPGVNIKTFGSLDKIDSFVKQYKDYQKTLKEPVKPAEWKAPTMKLKNPVDSFKKGYEVGQNLENKIKDAFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDRFGSAGLNSPLNNAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMVVSAEGIV >NZ_LN614756.1|WP_011861037.1|3349611_3350301_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGAFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSREMGGKVLFNTNIKVSLEEYAISEDADNGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >NZ_LN614756.1|WP_011861038.1|3347648_3349619_-|C40-family-peptidase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYSNKTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRVEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEESGKRDVYIAQDSAHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNALGDIRVRAGCLVPVFLDLGDIDLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNSNNKDEKKNGPAQSTTSKEDNDMINKLNKVFKNKLSNTGNIFVKYSNAYKVNAALMAAISIHETGNGSSSLCKNKNNFFGMKGMSFGSVDEGIKRGISNLSRNYIHTGRKTLESIRDKYAPLYDSPLNKDWVPGVGKFYKQITGNAYSSNSAGTGVGSNEEAEKNLKDTTYQVQNNNSNTLTNNNSKVSKVIQEAKNQLGKPYAWGGNGPKSFDCSGLMVWAFKRGAGINLKRVSADQSKDSRGKLLCNINDVKAGDLVFFAYNKGKGNVHHVGLYIGNDQYIHAPQTGDVVKISSLSGRQKKKHDFARARRFF >NZ_LN614756.1|WP_009901352.1|3347374_3347635_-|DUF2577-domain-containing-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPMQIAFGTIESVNPLIVKIEQKASFEEFFLIQTETFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >NZ_LN614756.1|WP_011861039.1|3346950_3347370_-|DUF2634-domain-containing-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVHSKYGNIKAEKVVSV >NZ_LN614756.1|WP_011861040.1|3345900_3346950_-|baseplate-J/gp47-family-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLSATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYIAIERISEKTYKMKCETAGPIFELGKLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNMQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHKVTVTGVVSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >NZ_LN614756.1|WP_011861041.1|3345290_3345908_-|YmfQ-family-protein 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MAQTINAKDTVSAKKAECFITIEGKRYNFMQAIDLEAKMEKNKSEVPILGRTTKGNKTTGSTNTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSAVGRQTVVLKDCNMDSGIITKFDADGEYLDEDMDFTFEDWELVEKFNLLAGME >NZ_LN614756.1|WP_011861032.1|3357076_3358387_-|phage-tail-sheath-family-protein MALGGGTFVTQNKILPGSYINFISAKRATSSLSDRGIVAIPLELDWGIDEDVFQVTSDDFEKYSVKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCTIATAKYSGIRGNDLKVTVTTNIDDNAKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDATLEASAGLVFTGGTNGEAVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGCLATTTEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKSDADYEGVVSVENKIKEIGLVESSLIYWAAGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKTGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVN >NZ_LN614756.1|WP_011861031.1|3358388_3358565_-|hypothetical-protein MNKTLSKEDNYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENDLYSFSEVEEIINSFMKGVS >NZ_LN614756.1|WP_009901504.1|3358557_3358995_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN614756_20 | 3354413-3354838 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_20
|
6 spacers
spacers of NZ_LN614756_20
>20.1|3354442|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT CCTCTTTATTTTTAGAGAACATCCACTTTGTTATATT >20.2|3354508|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT CTGTTAATGTAATCATTTCACCATCATAAGTTGCGAA >20.3|3354574|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATTTTAGGTACTTATTTGATTGCATTAGGAAGTATA >20.4|3354640|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATAAGTTTGTATGATGCATTTAGATGGCATACAGT >20.5|3354706|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGAATTATATTGAACGATTAGGAGATATTGAAGAGTT >20.6|3354773|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTATATATTCCACCTCTACCATATAAAGACTCTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_20
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_20 >merge|NZ_LN614756|20|3354413-3354838|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTACATACCACATAGTTAATCTAAAACCCTCTTTATTTTTAGAGAACATCCACTTTGTTATATTATTTACATACCACATAGTTAATATAAAACCTGTTAATGTAATCATTTCACCATCATAAGTTGCGAAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGATTTTAGGTACTTATTTGATTGCATTAGGAAGTATAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAATAAGTTTGTATGATGCATTTAGATGGCATACAGTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGAGAATTATATTGAACGATTAGGAGATATTGAAGAGTTATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACACTTATATATTCCACCTCTACCATATAAAGACTCTACATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >NZ_LN614756|20|18|3354413-3354838|CRISPRCasFinder ATTTACATACCACATAGTTAATCTAAAAC CCTCTTTATTTTTAGAGAACATCCACTTTGTTATATT ATTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC CTGTTAATGTAATCATTTCACCATCATAAGTTGCGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GATTTTAGGTACTTATTTGATTGCATTAGGAAGTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAATAAGTTTGTATGATGCATTTAGATGGCATACAGT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAGAATTATATTGAACGATTAGGAGATATTGAAGAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTTATATATTCCACCTCTACCATATAAAGACTCTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >NZ_LN614756|20|8|3354413-3354838|CRT ATTTACATACCACATAGTTAATCTAAAAC CCTCTTTATTTTTAGAGAACATCCACTTTGTTATATT ATTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC CTGTTAATGTAATCATTTCACCATCATAAGTTGCGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GATTTTAGGTACTTATTTGATTGCATTAGGAAGTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAATAAGTTTGTATGATGCATTTAGATGGCATACAGT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAGAATTATATTGAACGATTAGGAGATATTGAAGAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTTATATATTCCACCTCTACCATATAAAGACTCTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >NZ_LN614756|20|12|3354545-3354838|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GATTTTAGGTACTTATTTGATTGCATTAGGAAGTATA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAATAAGTTTGTATGATGCATTTAGATGGCATACAGT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GAGAATTATATTGAACGATTAGGAGATATTGAAGAGTT ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC ACTTATATATTCCACCTCTACCATATAAAGACTCTAC ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>NZ_LN614756.1|WP_011861034.1|3353351_3353912_-|lipoprotein MKKKVCFLFSILIVICLAIVGCSNSESPEESSKNNEPKKEEKKDKEVVIGEKIISDKMEITINNIEFSYDVLPKVKESLYTHYPAESGKVYIDIAADIKNTQKQELNCSDLLTIEANYNDGYKYSSQTIVEDETTGFTYDNISSIDPLETKGVRFIIDCPDEVKTSDKPVILSFTFDGNKYVYKMK >NZ_LN614756.1|WP_011861035.1|3352738_3353308_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MDDIVEYIFCSECGAKCLKGSKFCSECGTEIADIKMLNESIIKEKEYDLKGIDLQHVMQETSFIKASSVRRLKELTGIELDDCRKILEEPYQKYYNENADMLEEKRKKEDDISKIRKAKEEKKEKEKIACCPACGSTSLTTHKKGFGIGKAITGATIAGGIGLVAGNIGAKKVRVTCLNCGKQFWAGKK >NZ_LN614756.1|WP_011861036.1|3350316_3352668_-|tape-measure-protein 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>NZ_LN614756.1|WP_009901352.1|3347374_3347635_-|DUF2577-domain-containing-protein MSQELLQIIKKAAMDAVETSNPMQIAFGTIESVNPLIVKIEQKASFEEFFLIQTETFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >NZ_LN614756.1|WP_011861039.1|3346950_3347370_-|DUF2634-domain-containing-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYEHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVHSKYGNIKAEKVVSV >NZ_LN614756.1|WP_011861040.1|3345900_3346950_-|baseplate-J/gp47-family-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAIELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLSATNTIAKGVFNIDIPLDSRFNLGEYNYIAIERISEKTYKMKCETAGPIFELGKLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNMQNYKDEVNKIQDVGGVKVYPVWDGGGTVKLVIINSNFKVPSEDLVNLVQEEIDPIGHQGQGLGLAPIGHKVTVTGVVSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINDVKSNLTIDSNSIVVRGEVVG >NZ_LN614756.1|WP_011861041.1|3345290_3345908_-|YmfQ-family-protein 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NZ_LN614756_21 | 3412704-3413979 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NZ_LN614756_21
|
19 spacers
spacers of NZ_LN614756_21
>21.1|3412733|35|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA >21.2|3412797|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT >21.3|3412862|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT CTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT >21.4|3412928|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGTCGTAACGTGTCAATCCTATTGGGTTTTAGATA >21.5|3412993|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGAAAGAGCTATTGAAGCATTAAACAGAATACAGG >21.6|3413058|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTCTACTGTTGCATCATTTAGTGACCTAGCACTTTG >21.7|3413124|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTATATAAGTATGCAGGTGAGGGGATTTTTTGATA >21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTAAAAAATTACTACCTTTAAGTTGACCTTTTAAA >21.9|3413256|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATATTAGATAGAATAGGGATAAATGAAGAATATG >21.10|3413321|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGAGATAGAAATTATTTTTATTATACGTTTTTTTGT >21.11|3413387|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTGTTCTATTTTTTTATCTAGTAACTTAATTGG >21.12|3413453|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTACATATAAATAAATTCAAAGCCATGAAATTCG >21.13|3413518|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGGATACTTTCTTTTCTTGCATCAGCATTTTGTTTCA >21.14|3413585|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAATATAATGTTTAGTATAACTAAATAATTTTGA >21.15|3413650|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTATGGTACTCTTACAAGAGTAGAAGGTGTATACCT >21.16|3413716|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAATAAGATAACAACAATAGAATATAAAAATATCGT >21.17|3413782|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTAAAATCTGTGAAAAATGCTTGGATGCCAACTCG >21.18|3413848|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTATTCAGATGCATATAAAAACGCAGGTCAAACCTT >21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATTGAAGTAATAAAGAAAATAAGCTATGAAGCTAA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_21
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_21 >merge|NZ_LN614756|21|3412704-3413979|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NZ_LN614756.1|WP_011861766.1|3412214_3412643_-|N-acetyltransferase MIKKLNSKDINKIMEIWEKSTIKAHDFISKEYWQNNYNTVKNEYIPISDTFVYDDGDEIKGFISIIDKRFIGALFIKPKYQNLGIGGKLLDYATKKYKSLSLAVYKDNKKAVVFYNKKGFNIVKEQVNEDSGFKEYIMEYSK >NZ_LN614756.1|WP_009898073.1|3410980_3411760_+|hypothetical-protein MKVNENNINNIDEELDELSRKVYLESPDFWISISDKIIDKVFDEMLLFFAVKYNYFNIVCFAIENNYLDLNMPSKNKKYTNIMEHLLDTSKQNEDKKIYNYLLSLNKGNNLDERPILDELNCNISSDTFEKKDIYLPKYLCPSCNSNIFDTGYKVSNDITYKFSSKEAEPIEMCSEVSSIRCCNCDELLEDITLDKLYNLCKIQNCNNCGSNLTKVGIIAKKKMNFDENTEKFKDVSTSYCCGNCDSEINLSQREHFKI >NZ_LN614756.1|WP_009891255.1|3410111_3410657_-|biotin-transporter-BioY MKNTKVNIQDLTKMSICVALLCISSYIYIPLPFTPAGVTAQTIMINLIALILTPRQAFSTVGVYIMIGLIGIPVFGGGTSGIGKLLSPTGGFYFGFLFAALIISLLKGRNNDIKRYILITIFVGMPIIYFMGTVFMCYFNQMTVEAALFAAVVPFLIGDTIKSVIASFLGTKLNNVLRRNL >NZ_LN614756.1|WP_011861765.1|3408943_3410080_-|thiolase-family-protein 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MTGRNKSFTLITILFLTSLFLTMGYIYIEDTKHLLMSEAKIHIKEVAVQGSQLAQRQIEKDLDVLNIFSNYYASNPDIPNEEKMKNLLDEMENQKFYTMAIVDINGNAENTKGDKFSVKDREFFKNSIKGKKYVSSPYVDEVNKSIKKIAISVPLLNNDKVVGVLYCTYNINTLMKLINISFYENNSISYVVKNNGTIILHPQGDSLSKNIYKLLKQDNDIQEVNRLKKELQENKTGATVLNMLEERRYLGYATMDNGNSENNYIKDWNLIFSIPETVVFSNSKQIINRAVYAVLSIVLIFIAIIFYIIYIKKSNEKEILSLAYEDKVTYIGNQNKFYRECSKYLLDKPSLNYIIVYFDINNFKMINDTFGYEFGDNLLITIAKALKEELTEGEVYARLSSDYFAIFCDYKNGRNKIIRKLDNIRSNIESNLSIVFEISLCVGIYFVEEGEVDIQKAVNKANMARSVAKGKNINYAIYNEDVRNKLSEESMILDDIKIALVKNQFEVYYQPKFSLVTGEMIGSEALIRWNHPEHGFISPAVFIPIAEKSKLILKIGRFVFERVCNDLYEWKKQGKKIVPVSVNLSRVELYQPDIVKFINKTIKMYNLSSDFIEIEITETVAINELNILKNVLNELRTYGFSISMDDFGTGYSSISCLRDMPIDILKLDKSFLGGIEHDERSRNIAKSIVSLAKSLDLVVIIEGVESKEQAELMKQFGCDLVQGFYFARPMPAKNFLDLL >NZ_LN614756.1|WP_003439780.1|3414162_3414429_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIVTYDIVEARSLNRIRRILRKYLTWTQNSVFEGNITEGKLHKCISEIENIIDNSEDSIYVYEIKNPNSIKKKCYGIDKYSDEMFI >NZ_LN614756.1|WP_011861768.1|3414431_3415412_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MYKDYYIISNGDIKRKENTIYYYNLEGEKKILPVEQVDDIHIYGEVDLNTKLINYISKYGVMLHFYNYYGYYSGTYYPRKKNVSGFSLVCQSACYLDKNERLYLAKSFVESASYHILRNMRYYKVDESLIDTIKDELNDLNDVKEISELMGKEGRIRKTYYKSFNQILKDDFEFYKREKRPPKDPVNALMSFGNSIMYTNVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPIIIDTIIFSLINNKRINKNDFEYQDKICYLSEKGKKKFLQEFENKMQTTIKHRNLNRKVSYRMFIRLECYKLIKHFINDERYKVLKVWW >NZ_LN614756.1|WP_009903365.1|3415414_3415933_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MPIDLEVLKVQGVKINYYYVCKRKLWLFSKGITMEQNSSRVLSGKIVHEDSYKRMKNKEILIDDILKLDIIKDEYVKEVKISSKMKEADEMQLYYYLYYLKNSMGIEKKGTINYVKEKKQEELILTEEKERIIENTLININEINMQLSPPKIEKKHYCTKCAYYEFCFVKEE >NZ_LN614756.1|WP_011861769.1|3415980_3418302_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MLYAKSNPVETLREHTDELLKQMNVLRESYGKNINSLDFLEEEIFWQLLDFVIEFHDIGKAFSPFQELIKSRMDTKINEPKIVTHLENNVGHNYLSPAFIDYSYIDRKKNKELRAVLNQVIVYHHERDIFIDKDFKNLIQKILDEDLINKVYELQHEFKVRYPIKTEKLSKVYLQSVEKRIDKNHKYYNLYIMLKGILHRLDHSASAHEVVECNNVINIGEQTENYLMKEFGSLREAQSFAKSNRNKNIILIAPTGMGKTETALIWIDKDKAFFTLPLRVSINALFDRAKNIVGVGESNDTFLGLLHSTAIDYLEESNQENSSEIVDLAKLLSCKLTFSTIDQIFKFPFLYRGYEKVYSTLAYSKVVIDEIQAYSPEIAAVLVKGIEMIHKIGGRFMIMTATMPTIYIDELKKRGVMNSNLAELTCNTEKIRHCVSIVENSIDENLGKIIQSGMNKKVLVIVNTVKSAVEKYELIEEIVKPKGIDVNLNLLHSMYIQEDRAKLEKYIKEFADSDSNGIWITTQLVEASLDIDFDELHTENSTLDSLFQRFGRCYRSREYEENSPNIFIYTEKATGIGSIYDKDIVEKGLELLKTFINGKECVKMKEKYKVEMVKILYSKESLEGTAFEKRFTSALNILDTITPYSLGSKDAQNILRNIEGYTVIPEDIYNKIEETLIKDYEELGQELINAYSNDDRQLINKIKSKRKKARREIIKKTVNLPIYKAKQNVIDIQVKGLEDLKILLYKYDIYENKHTKQIFGKGVLISNEIDQFI >NZ_LN614756.1|WP_003439785.1|3418312_3419014_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVLKLDLFQETACYKKPFAMKITETYPLPPYSTINGLIHKILNATEYIPFNISVQGTYESIFNNYQTTYFYKKDSITSMPMNSHMLLNVNLIIHIGGDFDLLEEIYDSLLNYDEHLSLGRKEDLVRINDIRFVEVNKFEVDEDIQLDDYENYKLSECNIRMPIYIPKTSLQDTDIDGISYRLNNYYDNNAVEDKKRVWNKVDSYYVEDGNTISIGDILLDNEGDLLYFNNIN >NZ_LN614756.1|WP_011861770.1|3419015_3419930_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKRGLTFTVIAQAQSLNYGEGIGNISELKKLSRDDGNMYTFASRQCLRYDIVRLAAELFNWNLQVVDKEKGTIQFKDNISIRESEEMDLFGYMKTNKKDEKDKKGGSLTREATVRLSNAISLEPYRSDMDFLNNKGFADRIGEHPNLANIEQHLSYYTYTVTIDLSKIGKDGEIELDNKEKCRRVVEFLEIIKVLNRNIRGRQENLSPLFVVGGVYEIANPFFLGRIKLKGDKNGFKINKQAIEEVIQGTFLGKDLKEFTYVGMVDGVFINKEEFKGLFEDNFLSVDKFFGQLVKEVKEYYGVN >NZ_LN614756.1|WP_011861771.1|3419931_3421809_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MKLRVYRGDWFFNMGIVGFLNIIKKADKQAEIFIMEDYIEFDSLFLENFHEYYFNYFMDEYDVSKRIKKNIDYSINFIKSKPDRIKDGIKKIKDSVKQQNDKIKKFDEEKFNLIKEKLDSMSKIKSYDEFDSLEALVDETIDIFKIKSINDRLTANLYKYVVQDNYFGQVSFFNVAKAKLDLDGLKQVMFNDYLRQIIYFGELEDLLEENDYDKLKNYLNDRLNSIDKDINEKKVSKSSINTIEKIMKEINKNFIKKNKSIEDIKEYMDSLEVCEMCGLYKGILDEYSESNFAPLGVSTNNARNMFWNQAYVPSICDICKLILFCTPAGATYTRKNYLINEENEFYLFVNMDTCINELFERNNSLKVQKSESSDSKDENPFNQLIKSIVEENTLKSEWQLRNILFVEFKASIDSKKCKINYFNIPTYLAKFFTDKYANKKIQSIYDYKLKSNVLDLLLKNRDLKHITNNILRNKVKNDMESNNKSNISGIDCFRVVQLRVLINSYKKGVYKMDSKNLEKNDEKLKIIYYLGCDIHDYFVNKNSKNKIDGVSYKLLNSVKVGNKSDFMDTIIRVFMSAEKQIPAFILDIEIEKDLDFESIGHAFISGLISGKYEGKDKLPNEKEEK >NZ_LN614756.1|WP_011861772.1|3421814_3422552_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKMKIEFSTGCIPISYNSLFMSIIKEAIRKSNEDYYKNMYYYKEKNNKKTKNFTFSVYIKKYSIEGDNFIIEDKVILNISTPDLELGFHIYNGLMTSKKCLYKDYELTRIRIDLSREKKVTEERVLFNALSPICVKSKEGKFLEITDDRYIEELNYITNEVVKNYRGNGLKRKLEFENVGFKKVVVKESLREFKKITGKEYQYINGYKGKFILKGDIDDLNLIYNLGIGFRRAQGFGDVDILEWR >NZ_LN614756.1|WP_011861773.1|3422629_3423547_-|WYL-domain-containing-protein MMILIQSRGKMKCKELSEELEVSERQIKSYKMYLEQAGIFINSTPGIYGGYEIDKCNSISLIKLLDSEVSILDMINSQLEYNNDIYKNEFNNIVEKIKAVLNTGEKSDTYMDYFTVQAQRNCDYESEKNKCNEIIRAYTTKHKFWIEYYSLNSGNSERIVHPYGLFNYKSDTYMVAFCEKRFKFIDFKLCRIKDYKVLEEKYNVDKSFSWDEYSKNSIGIYKGEEINVVIKISHPFSTIIKEKVWVNNQQIIEYDDKSIMFKAKMRGYEEIKSWILSMGAYVEVVEPDRLRNDILSEIEKMKKIY >NZ_LN614756.1|WP_011861774.1|3423826_3425743_-|ABC-transporter-permease MNIKQFAINNISRNIKAYLGYLASIVISSSLLFSFIMFTSHPDLDVSQFPDYLKEGLKMSKIIAYLFLFFFVFYSVSVFLKSRYKEFGILYITGISKRQVMKLIFIENMIINIVSSVIGIIIGLIFAKIFLVVMSTFLELSPLKFYIPFNAILSTLIYFMILAVLTSIFTSFIVKENQVLKLLKGTKTPKPEPKTSLMLAILSICLFIIAYYNAITSTDQYTTYLRLVPVTSLTIVATYLFFSQFSVFFMKKLKLNKRFYRKNTNMLWISNLIYKVKDNARIFFLITITSAVAFTAIGTVYSFWKDVERQINLIYPNTIYYSTMTLHNDTKKPDSKEKDKERMMFIENNLKKENVDYTRINGEFKTVFPKKSDFNVRIMKESKYLEITETIGIKPISFEDNECISLLSSSLPGNKNVKENIIVGNRGLKVAKQVEECVMPAYYKNMYVVKDNFYDSIESKFIVDRFTAFEVEDSSKTIEICREFENKFNNESGMQPYLFFSKELMIGTGKLMYSTFIFLAIFIGLIFFVTTSSFLYNKFYMDCQVDKKKYEQLNKLGMTYNEIKKASTIEIGIVFLFPYVVAVIHSIFALTALKNSFDIEVASSAVLVMGSLFLVQIVYFLIVRNNYLKEIRLNLVNF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_22 | 4153025-4153110 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN614756_22
|
1 spacers
spacers of NZ_LN614756_22
>22.1|4153049|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder AAACAAACTTCACATGCGTTCAGTTTATTCTGTTGCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN614756_22
The CRISPR arrays of NZ_LN614756_22 >merge|NZ_LN614756|22|4153025-4153110|CRISPRCasFinder AAAGTGCTAAAGCACGTCGCCAACAAACAAACTTCACATGCGTTCAGTTTATTCTGTTGCTAAAAGTGCTAAAGCACGGCGCCAAC >NZ_LN614756|22|20|4153025-4153110|CRISPRCasFinder AAAGTGCTAAAGCACGTCGCCAAC AAACAAACTTCACATGCGTTCAGTTTATTCTGTTGCTA AAAGTGCTAAAGCACGGCGCCAAC
>NZ_LN614756.1|WP_003427633.1|4149430_4149622_-|DUF378-domain-containing-protein MKKVALILAIIGALNWGAIGILGTDLIGSIFGGTYEMVSRIIYFIVGLAGLYLIPSLMSDDRE >NZ_LN614756.1|WP_011861997.1|4147866_4149276_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MFIINELNKIVNEEVISFHMPGHKKGQVYKKLGYKDILKNLYKMDTTEILGTDNLHFPEGIIKNSQKKASRVFKSDYTCYLVNGSSCGIQSAIMSVCSPKSKIITNRDCHQSVINGCILGDIDIEYVPCEISEETNVLKGISISNVIDIIDKNLDAKAVLLTYPTYYGMTYDLEYICNYAHSKKMVVIVDEAHGAHLGLSERLPKTALEQGADIVVQSTHKTLPAFTQSSMIHIQGDRVDIDKILNMLRITESSSPSYLLLSSLELAVDIYENKGKELMEELLNNIITFKNKVDSNINIYDTNDKTKIFISSKNMGLTGYELENILRNKYNIQVELSNYYGVLLICTIGNTAEDFSSLETALNNVVKEDFKFEKLENKKYPVVIPKKILTPREAFYKTKKSVKIYDSIGKVCGECIVPYPPGISVISPGEVISKEIIDYLMFCHSKGMIVSGLKDVDLNFIQVIDLEDI >NZ_LN614756.1|WP_009892113.1|4147046_4147736_-|thymidylate-kinase MKGKLIIIESGSDASGKATQTEILYERLKKEGYMIKKVEYPNYESPSSALVKMYLKGDFGKNASDVDPYIASTFFTADRYASFKTDWEEFYNEGGIIIADRYTTSNMVHQASKMDICDREEYLNWLADYEFNLFKIPQPDCVIFLDVPIEFSKKLMENRKNKITGEEKKDIHESDIEYLEKSYNNALYIADKYDWKKINCVLDNKLRSIESIHNEIYKIVLDSIKPMER >NZ_LN614756.1|WP_003435878.1|4146108_4147044_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MYFENIIGQDFAKKYLTNSIKKNKLNNAYMFEGMDGIGKKKFADELSKLLLDYENLENSPDYVLIKPDGNSIKIAQIRNLQSDIVIRPHKDYKIYIINNAEKMTVEAQNALLKTLEEPPNYAIIILVTNNKESLLETIKSRCDIIKFSPIPIEDLKRYLINTGIEEERAQLLAIFSRGSIENALNLSQSSEFSMMREDIQQYIQIMLDKNIVEILNIPNNMEKYRGKIIALLDMMINYFRDIILLKENVNKNMLINVDKLVFIQNMSGKISYSQLSKIIDIIEDAKSKIKSNCNFNISIQVMSLNIYEVIK >NZ_LN614756.1|WP_003427637.1|4145218_4146112_-|stage-0-sporulation-family-protein MIKIVGIRFKSAGKIYYFDPVDFNIEQDMDVVVETARGLEYGKVVVGPKDMDESELVSPLKPIIRIATEEDKKVYLENKEKAKETFELCQQKIKEHELTMFLIDCEYTFDRNKLIFYFTAEGRIDFRELVKDLAAIFKTRIELRQIGVRDEAKSIGGLGPCGRKLCCSSWLGDFQPVSIKMAKDQSLSLNPTKISGICGRLFCCLKYEHDVYSEAIEKMPVVGALVQSDDGKGKVVEVNPLLEQIKVEFQDKTVKIYTREDIKILREPKKCDGCGGKCKDNDGLDEATLRELKKLED >NZ_LN614756.1|WP_003435875.1|4144394_4145141_-|tRNA1(Val)-(adenine(37)-N6)-methyltransferase MQLKDSERIDDLQLKGLKIIQDTNGFCFGIDAVLLANFTKIKKDAKVVDLGTGTGIIPILIAGKSEAKKIIGVEIQEDVYEMATRSIKLNGLEERVEIINEDIKYIDKVLDINGYHVVTSNPPYMHIDGIKNPNDKKAISRHEVRCNLEDVIRAASRLVMPRGKFFMIHRPTRLVDIITLGRKYKLEPKVIQFVHPRPQKAPNLVLVQFVKDGRPELKILDPLYVYGEDGNYTKELKAIYNNKDIGEL >NZ_LN614756.1|WP_003435873.1|4143560_4144394_-|16S-rRNA-(cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase MSGKLYICPTPIGNLEDITYRTLRTLKEVDLIAAEDTRHSIKLLNHFEISKPLTSYHEHNKDSKGDYLINKLIDGENIALISDAGMPGISDPGEEIIKQAIQNNIEIEVLPGATAFVTALVGSGMDTHRFVFEGFLDRDKKVRKAQLEELKEESRTIIFYESPHRLKDTLKDMLKILGNRNISINRELTKKYQEIIRENIETTIKIFEEKEVRGEFVLIVEGFHGEKSKKENYDGLTDREYVLKLIESGMNKKDAIKIVCKDRKLKKDVVYKQVLDL >NZ_LN614756.1|WP_011861996.1|4142833_4143538_-|HDIG-domain-containing-protein MEIGKIIIESLKREDTHKIFTELDNKHELEKIIPKISCMKSVGECKYHVVNCFEHSINALKELEIVLNDKDFFPIHLRKHVSNYLNTYIEEGINKLHVLKLGTFLHDIGKPDSMTLDETGRVHFTNHEKIGAQIIDNMGIKLELSTETYRLISKYVRYHMILLSLYKKNDLSRKELINVFNLVDEDTIGVIMLGYADIVSTVKLLGKSGEVSVLKTYMEYILTNYLYKSNYTHV >NZ_LN614756.1|WP_003421494.1|4142217_4142646_+|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDVTDYRIIEILQDDGRISMKDLGKIVGLTSPAVSERVKRLEESGVIEGYKAIVNPDSLGRVIKAFIHISLPSNGYTEFIESAAKDPRIVECHHITGDDCLLLKVIVKDMYELENVIDTIKKIGSTKTSVILSTPIQAKSIL >NZ_LN614756.1|WP_003427657.1|4140750_4142181_+|nicotinate-phosphoribosyltransferase MRNLTLLTDLYQLTMLNGYFEKNIHEDIVVFDMFFRKNACDGGYTIVCGIDQVVEYIDNLHFSDEDLEYLKNLNLFSDKFLKFLKEFKFTGDIYAVEEGTIMFPNEPLITVKAPLYQAQLIETALLTIVNFQSLIATKASRVCFAAQGDPVFEFGLRRAQGPDAGIYGARAAVVGGCAGTANVLAGKMFDIPIIGTQAHSWVQKFDNELEAFQAYADVYPDKCLLLVDTYDVLNSGVPNAIKVFKNISEKGYKPMGIRLDSGDLAYLSKEAKKQLDNAGFSDISITASNDLDEYTITSLKAEGATINSWGVGTKLITSFDSPSLGGVYKLAASCEKGVLEPKIKISENPEKINNPGYKKVIRIYNEDNKAEADLIMLHDEVIDESKPLEIFHPTYTWKTKVFTNYKVKELLKPLYIKGRCKYNKKAVLEIKNHVQYELSTIWEQYKRLSKPHIYKVDLSRNLWYLKTQMIDSKKVL >NZ_LN614756.1|WP_016728535.1|4154983_4155178_-|hypothetical-protein MFQVINFLCLFCVGFLVLDVMIYFCKDAMDIFEGTTNVNKVKSINVWADRVRANSYSYENKIAK >NZ_LN614756.1|WP_011861998.1|4155486_4157016_-|lysine--tRNA-ligase MKNNQQSNEEAQIQEDLSEVLQVRRDKLKKLQESGRDPFKESRYDRTHYSMDIKDNFDSLEGKTTKIAGRIMSKRIQGKAGFIDIQDQEGRIQSYVRLDAIGEEEYSVFSTYDIGDIVGIEGEIFKTKKGEISVKAKSVVLLCKSLQVLPEKYHGLKDQELRYRQRYVDLIVNPEVKNAFLIRTKALKALRAYLDDRGFLEVETPILNTIAGGANARPFITNHNTLHIPMYLRIANELYLKRLIVGGFDKVYEMGRMFRNEGMDLKHNPEYTAIELYQAYADYTDMMEITENVIAHMAEVATGSMIVNYQGTEINFTPPWKRMSMEDCVKEYSGVDFSTINTDEEALEVAREKGIEIKPGMRRGEVINAFFEEFGEDKLIQPTFITHHPVEVSPLSKRNVEDPRRTDRFEAFANKWELANAFSELNDPIDQKGRFIDQLRKRELGDDEAFEMDEDFLKALEVGLPPTGGLGIGIDRVIMLLTNSPSIRDVLLFPTMKLIDNNSNKEEEN >NZ_LN614756.1|WP_003422204.1|4157030_4157510_-|transcription-elongation-factor-GreA MEENKEFLLTQEGYDKLEEELENLKVVKRKEVAERIKVAISFGDLSENAEYDEAKKEQAQVEERILKLENMVRKAVIIDESKIDLNVVTIGSIVKVKDLEFDEEVEYTIVGSTEADPYDGKISNESPVGKALLGRAAKEVVEVQVPDGVAKFEILEIRR >NZ_LN614756.1|WP_003434962.1|4157618_4158587_-|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MKIGNLELKNKVFLSPMAGVTDLPFRLICKEQGCGLLYTEMINGKALCYDDENTKKMLKIEEEEHPVAVQIFGSEPEFMGRAAEIMNDYSNEILDINMGCPAPKVVKNGDGSALMKNPKLAEEVLRAVVKNSKKPVTLKIRKGWDDNSVNAVEIAKIAEDCGISALAIHGRTREQFYTGKADWDIIAEIKKNLSIPVIGNGDVFTIEDSINMLDKTGCDAIMIGRGAQGNPWIFKRINHYMNTGEILPEPTLNEKISTAIKHLKLAVEEHGEYVAVREMRKHIAWYLKGLRNSAKLRDEINKIEDYQEVVSKLEYYMEDSLT >NZ_LN614756.1|WP_011861999.1|4158723_4159494_-|type-III-pantothenate-kinase MLLVFDVGNTNMVLGIYKGDKLVNYWRIKTDREKTSDEYGILISNLFDYDNVNISDIDDVIISSVVPNVMHSLENFCIKYCKKQPLIVGPGIKTGLNIKYDNPKQVGADRIVNAVAGIEKYGAPSILVDFGTATTFCAISEKGEYLGGTIAPGIKISSEALFQSASKLPRVELAKPGMTICKSTVSAMQSGIIYGYVGLVDKIISIMKKELNCDDVKVIATGGLAKLIASETKSIDYVDGFLTLEGLRIIYEKNQE >NZ_LN614756.1|WP_009892118.1|4159512_4160103_-|ECF-transporter-S-component MMNTSASVRKVNVRKMTIIGVLSAISIMLSMTPLGFIPVGPTKATIMHIPVIIGAIMEGPIVGAAIGFIFGISSLLNAITNPTVTSFVFINPLVSILPRVMIGVLAYYVYQLIIKATNKVYISGLITGAIGSLLNTAGVLGMIYVLYADKYLHAMGKSGSAGKVIMALAAANGVPEAIVGALVVAAVATVLKKSKK >NZ_LN614756.1|WP_009892121.1|4160286_4161255_-|P1-family-peptidase MYNNILDIEGLKVGQVEDRNGLTGCTVVICEEGATCGVDVRGSAPGTRETDLLDPVNMVQKVHAVVLAGGSAYGLESTCGVSRYLEEKGIGFDVGVGKVPIVVGAVLFDLGVGSFKCRPDLKMGYRACEVANTDILNQGNYGAGCGATVGKIRGQEYAMKGGIGSYSIKLDNGLIVSALIAVNALGDVYENGKVIAGALNDKKTETIDTYKLMKQGESKGGFSVDNTTIGIIATNAKLTKAGCKKISQMGHDGYAKSIFPIHTPHDGDTIFTISTGEIEADITLVGSLAVEVVEKSIINAVKKADSVENIMAYKDIVKKREI >NZ_LN614756.1|WP_009903819.1|4161247_4162225_-|biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-ligase MRDKIIEIILNNKSEFISGEELSKQLGVSRAAIWKHMKALKEEGYNIESVNKKGYRLAENPTDLLSPQNIYYKLDTEFIGKNIEHLDTIDSTNEHAKRIAINSVDGTVILSEHQDMGKGRLGRRWDSKPHEGIWMSIILKPDMEPFKAPFITLIAGASVTKALNNLGANTLIKWPNDVILNGKKICGILTELSAEIERTNYVVLGIGINVKIMDFEQEIADKATSLYKEGYMLSRVDIVRNVLTEFEKLYLDYTVNNSKEKTLKICRDYSAIIDKNIYVLKGDNRELVKCLDINEEGNLLVQRSDGSIKEIISGEVSIRGEKGYV >NZ_LN614756.1|WP_009892124.1|4162539_4164510_-|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MNKLLKGAGFYLLVFIIIVGIVQFSGKPTEKIKDLKFSEVYRELTDENISRLYFVNQTSVEGTIKDTNTKFKSYVPTEVMGNKLADEVLDQAKAGKLTFGGEAKPSTPWFVEMLPTLLLIFFMVIIWFVFMNQSQGGGGKVMSFGKSKAKVHKDDEKTRVTFKDVAGLDEEKEDLQEVVDFLKNPKKYIELGARIPKGMLMVGPPGTGKTYLSRAVAGEAGVPFFSISGSDFVEMFVGVGASRVRDLFEQAKKSAPAIIFIDEIDAVGRKRGAGLGGGHDEREQTLNQLLVEMDGFGVNQGIIIMAATNRPDILDPALLRPGRFDRQVVVGTPDVKGREAIFKVHSRNKPLSDDVKMDVLARRTPGFTPADIENLMNEAAILTARKREKKIKMETIEEAITKVIAGVAKKSKVISEKERRLTAYHEGGHAVCAHVLEEVSPVHQVTIVPRGRAGGFTMQLPVEDKFYATKNEMKENIVVLLGGRVAEELVLKDVSTGASNDLERVTATARSMVTKYGMSSKLGPMSFDSDDEVFLGNSFSSKRNYSEEVAFEIDQETKRIVDGAYDKTRSILQENMDRLEYVAQALLIYETLDAEQFVKAFNKELPLNEIENAVTEENSSKEVEEQLTIKLEKDEEERNNVIDINKNLEDKSDKDK >NZ_LN614756.1|WP_003434952.1|4164543_4165932_-|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MIFDKVLSTINKHNLIQKGDKIVLGLSGGPDSVCLLHVLNRLKKDFNIEIYAAHLNHQIRGIEAQKDALYVSKLCEDMGIIFFVKSINVPKYCENEGLSLEEGARKLRYEMFYEIKDKIKANKIAIGHNLNDQAETVMMRIMRGTGLKGLKGIDYIRDNCIIRPILDVERNEIEEYCEAYNLNPRIDKTNLENIYTRNKIRLDLLPYMKDNFNSNVIESIVRMSNSLKSDNDYIEKEAEAKFREVSNIKEKGFVEINLDDFVCLHDAIKVRVLRNSIKHILGDTNFVDQRHIEDIMSLEDNSKVNKMLTLPRNIFVYRKKDSIILTNEEIVNEEIEFYYNVPSNGFIKIKELKQIIETQVMSIDRYKSMKLDNSSKGFDFNKVKGGIVIRSRRQGDKIKLAMGSKKVKDLFIDLKIPREERCKIPIITDSEGIICVGDYKISENYKIDENTKEVLKINFNKL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756_2 | 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 148748-148781 | 34 | NZ_LN614756.1 | 17851-17884 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_2 | 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 148748-148781 | 34 | NZ_LN614756.1 | 131191-131224 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_2 | 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 148748-148781 | 34 | NZ_LN614756.1 | 138138-138171 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_2 | 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 148748-148781 | 34 | NZ_LN614756.1 | 3109731-3109764 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_5 | 5.1|1216180|35|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 1216180-1216214 | 35 | NZ_LN614756.1 | 131253-131287 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_5 | 5.1|1216180|35|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 1216180-1216214 | 35 | NZ_LN614756.1 | 138200-138234 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_8 | 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761671-1761706 | 36 | NZ_LN614756.1 | 1108944-1108979 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_22 | 22.1|4153049|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 4153049-4153086 | 38 | NZ_LN614756.1 | 12384-12421 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_22 | 22.1|4153049|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 4153049-4153086 | 38 | NZ_LN614756.1 | 3109739-3109776 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_2 | 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 148748-148781 | 34 | NZ_LN614756.1 | 12396-12429 | 1 | 0.971 |
NZ_LN614756_2 | 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 148748-148781 | 34 | NZ_LN614756.1 | 1216118-1216151 | 1 | 0.971 |
NZ_LN614756_5 | 5.1|1216180|35|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 1216180-1216214 | 35 | NZ_LN614756.1 | 17913-17947 | 1 | 0.971 |
1. spacer 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 17851-17884, mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 131191-131224, mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 138138-138171, mismatch: 0, identity: 1.0
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer **********************************
4. spacer 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 3109731-3109764, mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 5.1|1216180|35|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 131253-131287, mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 5.1|1216180|35|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 138200-138234, mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 22.1|4153049|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 3109739-3109776, mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 12396-12429, mismatch: 1, identity: 0.971
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11. spacer 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 1216118-1216151, mismatch: 1, identity: 0.971
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12. spacer 5.1|1216180|35|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to position: 17913-17947, mismatch: 1, identity: 0.971
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_LN614756_3 | 3.2|1130398|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1130398-1130435 | 38 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 118413-118450 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_3 | 3.2|1130398|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1130398-1130435 | 38 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 127275-127312 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN614756_6 | 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1440545-1440580 | 36 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 30027-30062 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_6 | 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1440545-1440580 | 36 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 29788-29823 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN614756_8 | 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761671-1761706 | 36 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 42830-42865 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_8 | 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761671-1761706 | 36 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 45842-45877 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_8 | 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761671-1761706 | 36 | LN681542 | Clostridium phage phiMMP03, complete genome | 44801-44836 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_8 | 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761671-1761706 | 36 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 46164-46199 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_8 | 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761671-1761706 | 36 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 43079-43114 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_8 | 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761671-1761706 | 36 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 45167-45202 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_8 | 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761671-1761706 | 36 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 45323-45358 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_8 | 8.4|1761802|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761802-1761838 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 8824-8860 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN614756_9 | 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1940810-1940847 | 38 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 3275-3312 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1940810-1940847 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 3267-3304 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1940810-1940847 | 38 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 3214-3251 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1940810-1940847 | 38 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 3214-3251 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.2|1940877|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1940877-1940913 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 17655-17691 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941009-1941044 | 36 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 31710-31745 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941009-1941044 | 36 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 31202-31237 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941009-1941044 | 36 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 30715-30750 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941009-1941044 | 36 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 30311-30346 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.6|1941140|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941140-1941175 | 36 | FN668942 | Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence | 3429-3464 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_9 | 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941729-1941765 | 37 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 33648-33684 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN614756_11 | 11.13|2621055|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2621055-2621090 | 36 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 15888-15923 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_11 | 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2621120-2621156 | 37 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 5459-5495 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_11 | 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2621120-2621156 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 5458-5494 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_11 | 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2621120-2621156 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 5450-5486 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_11 | 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2621120-2621156 | 37 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 5397-5433 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_11 | 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2621120-2621156 | 37 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 5397-5433 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN614756_20 | 20.5|3354706|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3354706-3354743 | 38 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 118413-118450 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_20 | 20.5|3354706|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3354706-3354743 | 38 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 127275-127312 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN614756_21 | 21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413190-3413226 | 37 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 120870-120906 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_21 | 21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413190-3413226 | 37 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 129732-129768 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_21 | 21.9|3413256|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413256-3413291 | 36 | NZ_CP020426 | Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence | 3077-3112 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_21 | 21.9|3413256|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413256-3413291 | 36 | CP011970 | Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence | 118888-118923 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_21 | 21.9|3413256|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413256-3413291 | 36 | LN681537 | Clostridium phage phiCD211, complete genome | 127750-127785 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_21 | 21.18|3413848|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413848-3413884 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 13484-13520 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_21 | 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413914-3413950 | 37 | LN681539 | Clostridium phage phiCD505, complete genome | 5442-5478 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_21 | 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413914-3413950 | 37 | JX145341 | Clostridium phage phiMMP02, complete genome | 5441-5477 | 0 | 1.0 |
NZ_LN614756_21 | 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413914-3413950 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 5433-5469 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN614756_21 | 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413914-3413950 | 37 | KX228400 | Clostridium phage CDKM15, complete genome | 5380-5416 | 0 | 1.0 |
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NZ_LN614756_4 | 4.3|1131034|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 1131034-1131070 | 37 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 14321-14357 | 1 | 0.973 |
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NZ_LN614756_19 | 19.1|3354071|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3354071-3354107 | 37 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 14352-14388 | 1 | 0.973 |
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NZ_LN614756_21 | 21.5|3412993|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3412993-3413028 | 36 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 41962-41997 | 1 | 0.972 |
NZ_LN614756_21 | 21.5|3412993|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3412993-3413028 | 36 | NC_048642 | Clostridium phage CDKM9, complete genome | 43238-43273 | 1 | 0.972 |
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NZ_LN614756_21 | 21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3413190-3413226 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 120408-120444 | 1 | 0.973 |
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NZ_LN614756_4 | 4.2|1130968|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 1130968-1131004 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 10852-10888 | 2 | 0.946 |
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NZ_LN614756_8 | 8.7|1761998|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1761998-1762034 | 37 | MF547663 | Clostridioides phage LIBA2945, complete genome | 121441-121477 | 2 | 0.946 |
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NZ_LN614756_9 | 9.11|1941468|35|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941468-1941502 | 35 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 38247-38281 | 2 | 0.943 |
NZ_LN614756_9 | 9.11|1941468|35|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941468-1941502 | 35 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 38400-38434 | 2 | 0.943 |
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NZ_LN614756_10 | 10.1|2258364|36|NZ_LN614756|PILER-CR | 2258364-2258399 | 36 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 4485-4520 | 2 | 0.944 |
NZ_LN614756_10 | 10.1|2258364|36|NZ_LN614756|PILER-CR | 2258364-2258399 | 36 | LN680008 | Clostridium phage phiCDHS1 gp04 gene for putative capsid protein | 1022-1057 | 2 | 0.944 |
NZ_LN614756_10 | 10.1|2258364|36|NZ_LN614756|PILER-CR | 2258364-2258399 | 36 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 15950-15985 | 2 | 0.944 |
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NZ_LN614756_19 | 19.2|3354137|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3354137-3354173 | 37 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 10852-10888 | 2 | 0.946 |
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NZ_LN614756_19 | 19.4|3354079|38|NZ_LN614756|PILER-CR | 3354079-3354116 | 38 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 15461-15498 | 2 | 0.947 |
NZ_LN614756_19 | 19.4|3354079|38|NZ_LN614756|PILER-CR | 3354079-3354116 | 38 | NC_009231 | Clostridium phage phiC2, complete genome | 14352-14389 | 2 | 0.947 |
NZ_LN614756_19 | 19.4|3354079|38|NZ_LN614756|PILER-CR | 3354079-3354116 | 38 | LN681541 | Clostridium phage phiMMP01, complete genome | 14321-14358 | 2 | 0.947 |
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NZ_LN614756_4 | 4.5|1130970|38|NZ_LN614756|PILER-CR | 1130970-1131007 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 10851-10888 | 3 | 0.921 |
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NZ_LN614756_19 | 19.5|3354145|38|NZ_LN614756|PILER-CR | 3354145-3354182 | 38 | NC_011398 | Clostridium phage phiCD27, complete genome | 10852-10889 | 3 | 0.921 |
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NZ_LN614756_18 | 18.3|3261339|25|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3261339-3261363 | 25 | HQ634174 | Cyanophage MED4-213, complete genome | 98055-98079 | 4 | 0.84 |
NZ_LN614756_18 | 18.3|3261339|25|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3261339-3261363 | 25 | GU071101 | Prochlorococcus phage P-HM1, complete genome | 15695-15719 | 4 | 0.84 |
NZ_LN614756_9 | 9.3|1940943|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1940943-1940979 | 37 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 27152-27188 | 5 | 0.865 |
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NZ_LN614756_7 | 7.6|1650854|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1650854-1650891 | 38 | NZ_CP016840 | Brochothrix thermosphacta strain TMW 2.1564 plasmid pL21564-1, complete sequence | 16051-16088 | 6 | 0.842 |
NZ_LN614756_10 | 10.2|2258436|30|NZ_LN614756|PILER-CR | 2258436-2258465 | 30 | MN694267 | Marine virus AFVG_250M705, complete genome | 29033-29062 | 6 | 0.8 |
NZ_LN614756_11 | 11.11|2620921|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2620921-2620958 | 38 | AY855346 | Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome | 9402-9439 | 6 | 0.842 |
NZ_LN614756_11 | 11.11|2620921|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2620921-2620958 | 38 | NC_007917 | Clostridium phage phi CD119, complete genome | 9402-9439 | 6 | 0.842 |
NZ_LN614756_11 | 11.11|2620921|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2620921-2620958 | 38 | NC_028996 | Clostridium phage phiCDHM19, complete genome | 9648-9685 | 6 | 0.842 |
NZ_LN614756_18 | 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3261204-3261234 | 31 | MG869618 | Polaromonas sp. E5S plasmid pE5SP1, complete sequence | 53570-53600 | 7 | 0.774 |
NZ_LN614756_9 | 9.13|1941598|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941598-1941633 | 36 | NZ_LR134399 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 2, complete sequence | 251200-251235 | 8 | 0.778 |
NZ_LN614756_9 | 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941729-1941765 | 37 | NZ_CP017256 | Clostridium taeniosporum strain 1/k plasmid pCt3, complete sequence | 5594-5630 | 8 | 0.784 |
NZ_LN614756_18 | 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3261204-3261234 | 31 | LR606148 | Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5 | 444883-444913 | 8 | 0.742 |
NZ_LN614756_7 | 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1650653-1650689 | 37 | NZ_KY940428 | UNVERIFIED: Bacillus sp. (in: Bacteria) strain PUMK-07 plasmid pMK-07, complete sequence | 17267-17303 | 9 | 0.757 |
NZ_LN614756_7 | 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1650653-1650689 | 37 | NZ_CP047087 | Bacillus paranthracis strain BC307 plasmid pCE2, complete sequence | 27140-27176 | 9 | 0.757 |
NZ_LN614756_7 | 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1650653-1650689 | 37 | NZ_CP041978 | Bacillus pacificus strain NCCP 15909 plasmid unnamed1, complete sequence | 209260-209296 | 9 | 0.757 |
NZ_LN614756_7 | 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1650653-1650689 | 37 | CP041980 | Bacillus paranthracis strain NCCP 15910 plasmid unnamed, complete sequence | 192210-192246 | 9 | 0.757 |
NZ_LN614756_7 | 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1650653-1650689 | 37 | CP041752 | Bacillus paranthracis strain NCCP 14796 plasmid unnamed2, complete sequence | 23649-23685 | 9 | 0.757 |
NZ_LN614756_7 | 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1650653-1650689 | 37 | NZ_CP040343 | Bacillus cereus strain DLOU-Weihai plasmid unnamed1, complete sequence | 251192-251228 | 9 | 0.757 |
NZ_LN614756_9 | 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941729-1941765 | 37 | NZ_CP047434 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6 | 24856-24892 | 9 | 0.757 |
NZ_LN614756_18 | 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3261204-3261234 | 31 | NZ_MK748464 | Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-PNG-07060 clone Ren-PNG-07060, complete sequence | 24257-24287 | 9 | 0.71 |
NZ_LN614756_18 | 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3261204-3261234 | 31 | NZ_MK748465 | Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-PNG-07113 clone Ren-PNG-07113, complete sequence | 24334-24364 | 9 | 0.71 |
NZ_LN614756_18 | 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3261204-3261234 | 31 | NZ_MK748462 | Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Bali-16-03 clone Ren-Bali-16-03, complete sequence | 24337-24367 | 9 | 0.71 |
NZ_LN614756_18 | 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3261204-3261234 | 31 | NZ_MK748463 | Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Pal-02 clone Ren-Pal-02, complete sequence | 24326-24356 | 9 | 0.71 |
NZ_LN614756_9 | 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941729-1941765 | 37 | NZ_CP035115 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed2 | 17114-17150 | 10 | 0.73 |
NZ_LN614756_9 | 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1941729-1941765 | 37 | NZ_CP035567 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed1 | 50389-50425 | 10 | 0.73 |
NZ_LN614756_11 | 11.1|2620263|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT | 2620263-2620298 | 36 | NZ_CP045274 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence | 47033-47068 | 10 | 0.722 |
NZ_LN614756_11 | 11.13|2621055|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2621055-2621090 | 36 | AP014113 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S46-C200, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 269-304 | 10 | 0.722 |
NZ_LN614756_14 | 14.1|3096821|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3096821-3096854 | 34 | MN856057 | Bacteriophage sp. isolate 161, complete genome | 9470-9503 | 10 | 0.706 |
NZ_LN614756_14 | 14.1|3096821|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3096821-3096854 | 34 | MN855979 | Bacteriophage sp. isolate 144, complete genome | 12547-12580 | 10 | 0.706 |
NZ_LN614756_3 | 3.5|1130597|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT | 1130597-1130633 | 37 | LC557520 | Staphylococcus phage vB_SsapH-Golestan101-M DNA, complete genome | 15673-15709 | 11 | 0.703 |
NZ_LN614756_11 | 11.10|2620855|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2620855-2620891 | 37 | NC_018878 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence | 269698-269734 | 11 | 0.703 |
NZ_LN614756_14 | 14.1|3096821|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder | 3096821-3096854 | 34 | NZ_CP022366 | Azospirillum sp. TSH58 plasmid TSH58_p04, complete sequence | 547093-547126 | 11 | 0.676 |
NZ_LN614756_20 | 20.2|3354508|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT | 3354508-3354544 | 37 | LC557520 | Staphylococcus phage vB_SsapH-Golestan101-M DNA, complete genome | 15673-15709 | 11 | 0.703 |
1. spacer 1.1|146733|29|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac Protospacer *****************************
2. spacer 3.2|1130398|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aactcttcaatatctcctaatcgttcaatataattctc CRISPR spacer aactcttcaatatctcctaatcgttcaatataattctc Protospacer **************************************
3. spacer 3.2|1130398|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aactcttcaatatctcctaatcgttcaatataattctc CRISPR spacer aactcttcaatatctcctaatcgttcaatataattctc Protospacer **************************************
4. spacer 3.2|1130398|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aactcttcaatatctcctaatcgttcaatataattctc CRISPR spacer aactcttcaatatctcctaatcgttcaatataattctc Protospacer **************************************
5. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ************************************
6. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ************************************
7. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ************************************
8. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ************************************
9. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************
10. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************
11. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************
12. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************
13. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************
14. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************
15. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************
16. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************
17. spacer 8.4|1761802|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gctgaaagtttaaaagttttaactataaattcagttg CRISPR spacer gctgaaagtttaaaagttttaactataaattcagttg Protospacer *************************************
18. spacer 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag CRISPR spacer ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag Protospacer **************************************
19. spacer 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag CRISPR spacer ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag Protospacer **************************************
20. spacer 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag CRISPR spacer ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag Protospacer **************************************
21. spacer 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag CRISPR spacer ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag Protospacer **************************************
22. spacer 9.1|1940810|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag CRISPR spacer ctagaattagaactcattattaaaaccattcttgcaag Protospacer **************************************
23. spacer 9.2|1940877|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taatctgacacatacaaagttgaacctagtggtacgg CRISPR spacer taatctgacacatacaaagttgaacctagtggtacgg Protospacer *************************************
24. spacer 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt CRISPR spacer tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt Protospacer ************************************
25. spacer 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt CRISPR spacer tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt Protospacer ************************************
26. spacer 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt CRISPR spacer tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt Protospacer ************************************
27. spacer 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt CRISPR spacer tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt Protospacer ************************************
28. spacer 9.6|1941140|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttttaacttttcagttctcacaggcgtttcatct CRISPR spacer ttttttaacttttcagttctcacaggcgtttcatct Protospacer ************************************
29. spacer 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcaatatctatattaagtttatttttaaaaacatctt CRISPR spacer tcaatatctatattaagtttatttttaaaaacatctt Protospacer *************************************
30. spacer 11.13|2621055|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag CRISPR spacer ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag Protospacer ************************************
31. spacer 11.13|2621055|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag CRISPR spacer ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag Protospacer ************************************
32. spacer 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
33. spacer 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
34. spacer 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
35. spacer 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
36. spacer 11.14|2621120|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag CRISPR spacer aaaataagctatgaagctaaaggagaaatgaaaggag Protospacer *************************************
37. spacer 20.5|3354706|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaattatattgaacgattaggagatattgaagagtt CRISPR spacer gagaattatattgaacgattaggagatattgaagagtt Protospacer **************************************
38. spacer 20.5|3354706|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaattatattgaacgattaggagatattgaagagtt CRISPR spacer gagaattatattgaacgattaggagatattgaagagtt Protospacer **************************************
39. spacer 20.5|3354706|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaattatattgaacgattaggagatattgaagagtt CRISPR spacer gagaattatattgaacgattaggagatattgaagagtt Protospacer **************************************
40. spacer 21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaaa CRISPR spacer tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaaa Protospacer *************************************
41. spacer 21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaaa CRISPR spacer tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaaa Protospacer *************************************
42. spacer 21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaaa CRISPR spacer tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaaa Protospacer *************************************
43. spacer 21.9|3413256|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaatattagatagaatagggataaatgaagaatatg CRISPR spacer aaatattagatagaatagggataaatgaagaatatg Protospacer ************************************
44. spacer 21.9|3413256|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaatattagatagaatagggataaatgaagaatatg CRISPR spacer aaatattagatagaatagggataaatgaagaatatg Protospacer ************************************
45. spacer 21.9|3413256|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaatattagatagaatagggataaatgaagaatatg CRISPR spacer aaatattagatagaatagggataaatgaagaatatg Protospacer ************************************
46. spacer 21.18|3413848|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gttattcagatgcatataaaaacgcaggtcaaacctt CRISPR spacer gttattcagatgcatataaaaacgcaggtcaaacctt Protospacer *************************************
47. spacer 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa CRISPR spacer aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa Protospacer *************************************
48. spacer 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa CRISPR spacer aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa Protospacer *************************************
49. spacer 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa CRISPR spacer aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa Protospacer *************************************
50. spacer 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa CRISPR spacer aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa Protospacer *************************************
51. spacer 21.19|3413914|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa CRISPR spacer aaattgaagtaataaagaaaataagctatgaagctaa Protospacer *************************************
52. spacer 2.1|148748|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaactgaacgcatgtgaagtttgtttgttggcgc CRISPR spacer aaactgaacacatgtgaagtttgtttgttggcgc Protospacer *********.************************
53. spacer 4.3|1131034|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agtacatacaaagagtctataaaattatctataaagg CRISPR spacer agtacatacaaagagtttataaaattatctataaagg Protospacer ****************.********************
54. spacer 4.3|1131034|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agtacatacaaagagtctataaaattatctataaagg CRISPR spacer agtacatacaaagagtttataaaattatctataaagg Protospacer ****************.********************
55. spacer 4.3|1131034|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agtacatacaaagagtctataaaattatctataaagg CRISPR spacer agtacatacaaagagtttataaaattatctataaagg Protospacer ****************.********************
56. spacer 4.3|1131034|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
agtacatacaaagagtctataaaattatctataaagg CRISPR spacer agtacatacaaagagtttataaaattatctataaagg Protospacer ****************.********************
57. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ctaagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ***********************************
58. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ctaagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ***********************************
59. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ctaagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ***********************************
60. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ctaagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ***********************************
61. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ataagagtggttaaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ************ ***********************
62. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ataagagtggttaaagaaaataagttatttttcaaa Protospacer ************ ***********************
63. spacer 8.4|1761802|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gctgaaagtttaaaagttttaactataaattcagttg CRISPR spacer gctgaaagtttaaaagttttaactataaattcagtgg Protospacer *********************************** *
64. spacer 8.8|1762064|39|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ctcaaagttggactagcttcatcttttaattttacaagt CRISPR spacer ctcaaagttggactagcttcatcttttaattttacaatt Protospacer ************************************* *
65. spacer 8.8|1762064|39|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ctcaaagttggactagcttcatcttttaattttacaagt CRISPR spacer ctcaaagttggactagcttcatcttttaattttacaatt Protospacer ************************************* *
66. spacer 8.8|1762064|39|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ctcaaagttggactagcttcatcttttaattttacaagt CRISPR spacer ctcaaagttggactagcttcatcttttaattttacaatt Protospacer ************************************* *
67. spacer 9.4|1941009|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tggtatatcatactcgtgcattgcctgctccacatt CRISPR spacer tggtatatcatactcgtgcattgcctgctctacatt Protospacer ******************************.*****
68. spacer 9.6|1941140|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX905163 (Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ttttttaacttttcagttctcacaggcgtttcatct CRISPR spacer ttttttaacttttcagttctcacaggtgtttcatct Protospacer **************************.*********
69. spacer 19.1|3354071|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cctttatagataattttatagactctttgtatgtact CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtact Protospacer ********************.****************
70. spacer 19.1|3354071|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cctttatagataattttatagactctttgtatgtact CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtact Protospacer ********************.****************
71. spacer 19.1|3354071|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cctttatagataattttatagactctttgtatgtact CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtact Protospacer ********************.****************
72. spacer 19.1|3354071|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
cctttatagataattttatagactctttgtatgtact CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtact Protospacer ********************.****************
73. spacer 21.5|3412993|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
aagaaagagctattgaagcattaaacagaatacagg CRISPR spacer aagaaagagctattgaagtattaaacagaatacagg Protospacer ******************.*****************
74. spacer 21.5|3412993|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
aagaaagagctattgaagcattaaacagaatacagg CRISPR spacer aagaaagagctattgaagtattaaacagaatacagg Protospacer ******************.*****************
75. spacer 21.5|3412993|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
aagaaagagctattgaagcattaaacagaatacagg CRISPR spacer aagaaagagctattgaagtattaaacagaatacagg Protospacer ******************.*****************
76. spacer 21.5|3412993|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048642 (Clostridium phage CDKM9, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
aagaaagagctattgaagcattaaacagaatacagg CRISPR spacer aagaaagagctattgaagtattaaacagaatacagg Protospacer ******************.*****************
77. spacer 21.7|3413124|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
atttatataagtatgcaggtgaggggattttttgata CRISPR spacer atttatataagtatgcaggtgaggggattttttgaaa Protospacer *********************************** *
78. spacer 21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaaa CRISPR spacer tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaat Protospacer ************************************
79. spacer 21.8|3413190|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaaa CRISPR spacer tattaaaaaattactacctttaagttgaccttttaat Protospacer ************************************
80. spacer 4.2|1130968|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gttgcatcattaaatattttccctacaaactcttttc CRISPR spacer gttgcatcattaaatatcttacctacaaactcttttc Protospacer *****************.** ****************
81. spacer 4.2|1130968|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gttgcatcattaaatattttccctacaaactcttttc CRISPR spacer gttgcatcattaaatatcttacctacaaactcttttc Protospacer *****************.** ****************
82. spacer 6.13|1440872|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact Protospacer *..*********************************
83. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681539 (Clostridium phage phiCD505, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacactaacagctcaagataaacatggaatt Protospacer *********.*.************************
84. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacactaacagctcaagataaacatggaatt Protospacer *********.*.************************
85. spacer 8.7|1761998|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
aggagataacttctattaaagataactttgatgtggt CRISPR spacer aggaaatgacttctattaaagataactttgatgtggt Protospacer ****.**.*****************************
86. spacer 8.7|1761998|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
aggagataacttctattaaagataactttgatgtggt CRISPR spacer aggaaatgacttctattaaagataactttgatgtggt Protospacer ****.**.*****************************
87. spacer 9.3|1940943|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
aaaagcgttcttaaatcgttacttaactcttgcaaat CRISPR spacer aaaattgttcttaaatcgttacttaactcttgcaaat Protospacer **** .*******************************
88. spacer 9.11|1941468|35|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tgaactttaatcggttttatacaacaatataacgc CRISPR spacer tgaactttaaccggttttatgcaacaatataacgc Protospacer **********.*********.**************
89. spacer 9.11|1941468|35|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tgaactttaatcggttttatacaacaatataacgc CRISPR spacer tgaactttaaccggttttatgcaacaatataacgc Protospacer **********.*********.**************
90. spacer 9.11|1941468|35|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tgaactttaatcggttttatacaacaatataacgc CRISPR spacer tgaactttaaccggttttatgcaacaatataacgc Protospacer **********.*********.**************
91. spacer 9.11|1941468|35|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tgaactttaatcggttttatacaacaatataacgc CRISPR spacer tgaactttaaccggttttatgcaacaatataacgc Protospacer **********.*********.**************
92. spacer 10.1|2258364|36|NZ_LN614756|PILER-CR matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
taagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer taagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer ******.************************.****
93. spacer 10.1|2258364|36|NZ_LN614756|PILER-CR matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
taagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer taagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer ******.************************.****
94. spacer 10.1|2258364|36|NZ_LN614756|PILER-CR matches to LN680008 (Clostridium phage phiCDHS1 gp04 gene for putative capsid protein) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
taagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer taagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer ******.************************.****
95. spacer 10.1|2258364|36|NZ_LN614756|PILER-CR matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
taagactagcagactcataagcaattagttgcctct CRISPR spacer taagaccagcagactcataagcaattagttgtctct Protospacer ******.************************.****
96. spacer 11.1|2620263|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer acaattattaattgttttattaataaaatcacagca Protospacer **********************.*.***********
97. spacer 19.2|3354137|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaac CRISPR spacer gaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaac Protospacer **************** **.*****************
98. spacer 19.2|3354137|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
gaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaac CRISPR spacer gaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaac Protospacer **************** **.*****************
99. spacer 19.4|3354079|38|NZ_LN614756|PILER-CR matches to LN681542 (Clostridium phage phiMMP03, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
100. spacer 19.4|3354079|38|NZ_LN614756|PILER-CR matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
101. spacer 19.4|3354079|38|NZ_LN614756|PILER-CR matches to NC_009231 (Clostridium phage phiC2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
102. spacer 19.4|3354079|38|NZ_LN614756|PILER-CR matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
cctttatagataattttatagactctttgtatgtacta CRISPR spacer cctttatagataattttataaactctttgtatgtactt Protospacer ********************.****************
103. spacer 22.1|4153049|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aaacaaacttcacatgcgttcagtttattctgttgcta CRISPR spacer aaacaaacttcacatgtgttcagtttattctgttgctt Protospacer ****************.********************
104. spacer 4.5|1130970|38|NZ_LN614756|PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gttgcatcattaaatattttccctacaaactcttttca CRISPR spacer gttgcatcattaaatatcttacctacaaactcttttct Protospacer *****************.** ****************
105. spacer 4.5|1130970|38|NZ_LN614756|PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gttgcatcattaaatattttccctacaaactcttttca CRISPR spacer gttgcatcattaaatatcttacctacaaactcttttct Protospacer *****************.** ****************
106. spacer 6.8|1440545|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ataagagtggtttaagaaaataagttatttttcaaa CRISPR spacer ataagagtggtttaagaaaataagttatttttaatc Protospacer ******************************** *
107. spacer 6.13|1440872|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactattttttatact Protospacer *..********************** **********
108. spacer 6.13|1440872|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
aacaaaaaagatacatctgtaactaatttttatact CRISPR spacer agtaaaaaagatacatctgtaactattttttatact Protospacer *..********************** **********
109. spacer 8.8|1762064|39|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ctcaaagttggactagcttcatcttttaattttacaagt CRISPR spacer ctcaatgttggactagcttcatcttttagttttacaatt Protospacer ***** **********************.******** *
110. spacer 19.5|3354145|38|NZ_LN614756|PILER-CR matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaacc CRISPR spacer gaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaaca Protospacer **************** **.*****************
111. spacer 19.5|3354145|38|NZ_LN614756|PILER-CR matches to NC_011398 (Clostridium phage phiCD27, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
gaaaagagtttgtagggaaaatatttaatgatgcaacc CRISPR spacer gaaaagagtttgtaggtaagatatttaatgatgcaaca Protospacer **************** **.*****************
112. spacer 18.3|3261339|25|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to MN694568 (Marine virus AFVG_250M879, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tactattggttcatctgtatttggt CRISPR spacer tcaatttggttcatctgtatttggt Protospacer * ********************
113. spacer 18.3|3261339|25|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to HQ634174 (Cyanophage MED4-213, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tactattggttcatctgtatttggt CRISPR spacer tgctattggtgcatctgtatttgaa Protospacer *.******** ************.
114. spacer 18.3|3261339|25|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to GU071101 (Prochlorococcus phage P-HM1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
tactattggttcatctgtatttggt CRISPR spacer tgctattggtgcatctgtatttgaa Protospacer *.******** ************.
115. spacer 9.3|1940943|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
aaaagcgttcttaaatcgttacttaactcttgcaaat CRISPR spacer agaattgttcttaaatcgtcacttaactcttgtaaat Protospacer *.** .*************.************.****
116. spacer 1.1|146733|29|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tacgataagttacagcaatacgaatcatc Protospacer *...******** *******.****** *
117. spacer 7.6|1650854|38|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016840 (Brochothrix thermosphacta strain TMW 2.1564 plasmid pL21564-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
ctatcaatatatattttataagcataagttttacgcat- CRISPR spacer atatcattatctattttataagcataagtttt-caaata Protospacer ***** *** ********************* *. **
118. spacer 10.2|2258436|30|NZ_LN614756|PILER-CR matches to MN694267 (Marine virus AFVG_250M705, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tagaggctctcagagaagttataagatgtt CRISPR spacer caaaggctcttagagaagttttaagagctt Protospacer .*.*******.********* ***** **
119. spacer 11.11|2620921|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tttatatcagtctttttagtcgctgtctgaatctcctc CRISPR spacer tttatgtcagtctttttagtcgctgtctgtgccacttc Protospacer *****.*********************** ..* *.**
120. spacer 11.11|2620921|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tttatatcagtctttttagtcgctgtctgaatctcctc CRISPR spacer tttatgtcagtctttttagtcgctgtctgtgccacttc Protospacer *****.*********************** ..* *.**
121. spacer 11.11|2620921|38|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
tttatatcagtctttttagtcgctgtctgaatctcctc CRISPR spacer tttatgtcagtctttttagtcgctgtctgtgccacttc Protospacer *****.*********************** ..* *.**
122. spacer 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to MG869618 (Polaromonas sp. E5S plasmid pE5SP1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer cagcacctctggtactggctgatttatcttt Protospacer **..**********.**** *******. *
123. spacer 9.13|1941598|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134399 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttcgtaaaataacaattatctggaatatg--agaagtt CRISPR spacer tcagtaaaataactattatcaggaatatgctggaaa-- Protospacer *. ********** ****** ******** .***.
124. spacer 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017256 (Clostridium taeniosporum strain 1/k plasmid pCt3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tcaatatctatattaagtttatttttaaaaacatctt----- CRISPR spacer tcaatatttatattaactttattttta-----gtcttcattt Protospacer *******.******** ********** .****
125. spacer 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to LR606148 (Rhizobium sp. Q54 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer cgagcaacttggtattggcggatttatgata Protospacer *.* ..****************** ***
126. spacer 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY940428 (UNVERIFIED: Bacillus sp. (in: Bacteria) strain PUMK-07 plasmid pMK-07, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ggagatttaaaagttaacaacataaaaatgatagata CRISPR spacer tatgatttaaatgttaaaaacataaaaatattataaa Protospacer . ******** ***** ***********. ** * *
127. spacer 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047087 (Bacillus paranthracis strain BC307 plasmid pCE2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ggagatttaaaagttaacaacataaaaatgatagata CRISPR spacer tatgatttaaatgttaaaaacataaaaatattataaa Protospacer . ******** ***** ***********. ** * *
128. spacer 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041978 (Bacillus pacificus strain NCCP 15909 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ggagatttaaaagttaacaacataaaaatgatagata CRISPR spacer tatgatttaaatgttaaaaacataaaaatattataaa Protospacer . ******** ***** ***********. ** * *
129. spacer 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP041980 (Bacillus paranthracis strain NCCP 15910 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ggagatttaaaagttaacaacataaaaatgatagata CRISPR spacer tatgatttaaatgttaaaaacataaaaatattataaa Protospacer . ******** ***** ***********. ** * *
130. spacer 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP041752 (Bacillus paranthracis strain NCCP 14796 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ggagatttaaaagttaacaacataaaaatgatagata CRISPR spacer tatgatttaaatgttaaaaacataaaaatattataaa Protospacer . ******** ***** ***********. ** * *
131. spacer 7.3|1650653|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040343 (Bacillus cereus strain DLOU-Weihai plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ggagatttaaaagttaacaacataaaaatgatagata CRISPR spacer tatgatttaaatgttaaaaacataaaaatattataaa Protospacer . ******** ***** ***********. ** * *
132. spacer 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcaatatctatattaagtttatttttaa---aaacatctt CRISPR spacer tttatatctttattaattttatttttaaattaaataa--- Protospacer *. ****** ****** *********** ***.*
133. spacer 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK748464 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-PNG-07060 clone Ren-PNG-07060, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer tgcagcctctgatattggcgtatttattact Protospacer .. .******.******** ********.
134. spacer 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK748465 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-PNG-07113 clone Ren-PNG-07113, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer tgcagcctctgatattggcgtatttattact Protospacer .. .******.******** ********.
135. spacer 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK748462 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Bali-16-03 clone Ren-Bali-16-03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer tgcagcctctgatattggcgtatttattact Protospacer .. .******.******** ********.
136. spacer 18.1|3261204|31|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK748463 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Pal-02 clone Ren-Pal-02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
caatacctctggtattggcggatttattata CRISPR spacer tgcagcctctgatattggcgtatttattact Protospacer .. .******.******** ********.
137. spacer 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035115 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcaatatctatattaagtttatttttaaaaacatctt CRISPR spacer ttacaaaatagattaagtttattttaaaaaacattcc Protospacer *.* * ** ************** ********...
138. spacer 9.15|1941729|37|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035567 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tcaatatctatattaagtttatttttaaaaacatctt CRISPR spacer ttacaaaatagattaagtttattttaaaaaacattcc Protospacer *.* * ** ************** ********...
139. spacer 11.1|2620263|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045274 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301B, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
acaattattaattgttttattagtgaaatcacagca CRISPR spacer tgaattcttaattgttttattagagaaatacctttt Protospacer **** **************** ***** * .
140. spacer 11.13|2621055|36|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP014113 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S46-C200, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ttgtagattttgtaagtaatggtttttcggaaaaag CRISPR spacer ttgtagattttttaagtaatggttttaaaattagga Protospacer *********** ************** .. *...
141. spacer 14.1|3096821|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to MN856057 (Bacteriophage sp. isolate 161, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tagcatctttccatatttgtctaaatagtaagac CRISPR spacer agacttcttaccatatttgtctacatagtcattt Protospacer ..* **** ************* ***** * .
142. spacer 14.1|3096821|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to MN855979 (Bacteriophage sp. isolate 144, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tagcatctttccatatttgtctaaatagtaagac CRISPR spacer agacttcttaccatatttgtctacatagtcattt Protospacer ..* **** ************* ***** * .
143. spacer 3.5|1130597|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC557520 (Staphylococcus phage vB_SsapH-Golestan101-M DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ttcgcaacttatgatggtgaaatgattacattaacag CRISPR spacer attaagacttttgatggagaaatgattacatttgatg Protospacer *.. .**** ****** ************** . *
144. spacer 11.10|2620855|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018878 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gttcatcagatggatatgcaaatggagatataaagtt CRISPR spacer caatagaagatggttatgcaaatggagatatgaaaaa Protospacer .* ****** *****************.**.
145. spacer 14.1|3096821|34|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022366 (Azospirillum sp. TSH58 plasmid TSH58_p04, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tagcatctttccatatttgtctaaatagtaagac CRISPR spacer cctcatatttccatatttgtcaaaatatggaaga Protospacer . *** ************** ***** .*..
146. spacer 20.2|3354508|37|NZ_LN614756|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC557520 (Staphylococcus phage vB_SsapH-Golestan101-M DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ctgttaatgtaatcatttcaccatcataagttgcgaa CRISPR spacer catcaaatgtaatcatttctccatcaaaagtcttaat Protospacer * . ************** ****** ****. ..*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
284242 : 297851
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN614756|284242:297851|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN614756|284242:297851|289570_290647_+|WP_009895312.1|DBSCAN-SWA MLTYKESGVDIDEGNRAVDLIKGKIKGTYDGNVVGDLGNFSGLYSLKDFVGMKEPVLLASTDGVGTKLKIAQMMDKHDTVGIDLVAMCVNDLICQGAKPLFFLDYIALGKLVPEHIEKIVGGIADGCKMSGCALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFSVGIADKEKIVSGNNVKSGDVLVGISSSGVHSNGFSFIRKIFLETYNYKMEQYVEELGMTVGEALLTPTKIYVKLALDVLAKHDIKAIAHITGGGLIENITRVIPKGLGLDINKKSWEKPPIFKMIEGFNAVDERELHKSFNMGIGLVLIVDKENADDVVNFINNRENDNADYVDKKYSELLEDKAYIIGEVVDSHEGVELC >NZ_LN614756|284242:297851|284242_284641_+|WP_003435056.1|transposase|DBSCAN-SWA MYKSNKNIVYDCKYHIVFCPKYRKPVLVGEVEKMLKEILPYKADELGAEIIEMETDKEHVHLLISCDPQYGIHKVVKGLKGFSSRVLRENFPHLKSSMPSMWTNSYFVGTVGSVSLEVVKQYIENQQVRTKK >NZ_LN614756|284242:297851|284637_285801_+|WP_003435058.1|transposase|DBSCAN-SWA 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|
11 | Synechococcus_phage(30.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
441066 : 458627
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN614756|441066:458627|DBSCAN-SWA 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22 | Streptococcus_phage(78.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
590989 : 612072
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN614756|590989:612072|DBSCAN-SWA 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25 | Streptococcus_phage(76.19%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1093453 : 1148967
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN614756|1093453:1148967|DBSCAN-SWA 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84 | Clostridium_phage(97.53%) | holin,tail,integrase,terminase,capsid,plate,portal | attL 1093280:1093302|attR 1149153:1149175 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1527489 : 1601681
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN614756|1527489:1601681|DBSCAN-SWA 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70 | Clostridium_phage(42.86%) | tail,integrase,plate,transposase,portal,tRNA,protease | attL 1526712:1526730|attR 1603158:1603176 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1681443 : 1691170
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN614756|1681443:1691170|DBSCAN-SWA TATGATTCTTATGATAGACAATTATGATTCTTTTGTATACAACCTAGTCCAATATATAGAAGAATTAGGGGAAACAGTTGTAGTAAAAAGAAATAATGAAATCAAAATAAGTGACATTGAAGAACTAAATCCAGAGGTAATTGTGTTATCTCCAGGACCGTGTTCTCCAAAAGAAGCTGGTATTTGCATAGATATTGTTGAGCATTTTAAGGGGAAAAAACCTATACTAGGAATTTGTTTAGGTCACCAAACTATTGGACATGTTTTTGGAGGAGATATTATAAAAGCACAACAGCCTGTGCATGGAAAAGTATATAGTATCAACCATACTAATAAAGGAGTTTTTAGGGGACTTAAAAATCCTTTAAATGTCACTAGGTATCATTCACTAATAATTGATTCCAATACAGTTCCAAAAGAATTAGAAATTACAGCAATTACTGATAAAGGGGAAATAATGGGGATTAGGCATAAGAAATATTTAATAGAAGGAGTACAGTTTCATCCAGAAGCTATTTTGTCAGAGTATGGTCATGAAATGCTTAAAAATTTTATAACAGAAGCTAGAGAAAGGGTACATGTGTAATATGATAAGAGAGATAAATACTAAATTAAATTCTTTTGAGATATTTACTATTTTTAGAAATGAACATGACAGTTTTATATTAGACAGTGCTATGGATAAAGAAAAATTGGGAAGATATTCTTTTATAAGTAGCCAACCATTTAAGGTATTAAAGTATAAAGATACTGATGAAAATCCTTTAGAAGTTTTAAAAGAAGAACTACATAAGTATAGGGTTGTAAATGATACTAATCTTCCATTTGTAGGAGGTGCTGTGGGATATTTATCTTATGATTTAGGTAATTACATAGAAAATTTACCTAGAACTGCTGTAGATGATATTGAGATGCCTGATATGTATTTTGGATTTTATAATCATGTAATAGTTATAGACCATCTTGTGCAAAAAACTTATATAGCTACTCCAAACATAGATATCGAATTAGAAGAAAAGATAATAGATAATATAGAACAAAGAATATTAAAAGAAGAGAAAAAAGGTATAGATAGCATATGTTATGAAGAAAAAGAAGTAACACCTATAAGACTTAAATCTAATTTTACAAAGGAAGAATTTAAAAATGCAGTTCAAAGTGTTAGAGAGTACATAAGACAAGGAGATATATATCAAGCTAATTTAACACAAAGGTTCAGTGGAGAAACAGAACTTACAAGCTTTGAATTGTATAGGGACTTAAGAAGATTTAGCCCGGCACCATTTGGGGCATTCTTAAACTTTGAAGATGCACATATATTATCAAATTCTCCAGAAAGATTTATAAGATGTGTTAATAAGAGAATAGAAACTAGACCAATAAAAGGTACTCGTCCAAGAGGGAAAGATAAAAAAGAAGATTTAAGACTTCAACAAGAACTTAGAAATAGTGAAAAAGATAGAGCTGAACTACTTATGATAGTAGATTTAGAAAGAAATGATATTGGCAGAATATCTAAAACTGGAAGTGTTAAAGTTCCAGAGCTATTTGTAATTGAACCATATGCAAATGTAAATCACTTAGTTTCCACAGTTGTAGGTGAGTTAAAAGATGATAAAGATGCTACTGATGTAATAAAAGCAACTTTTCCAGGGGGGTCTATAACAGGAGCACCTAAGATTAGAGCAATGGAAATTATAGACGAATTAGAGCCAACGCAAAGAAATGTATATACTGGTTCAATAGGTTATATAGGTTTTAATGGTGATATGGATTTTAATATAGCAATTAGAACAATAATCAAAAATGACAAAAAAGTCTACTTTCAAGTTGGAGGAGGAATGACTTGGGATTCTGACCCAGATGAAGAATATCAAGAAACACTTGATAAAGCTAAATCCATAATGAAGGCTTTGAGGGGATATTATGAAGAATAATGTAGGTTTTGATAGTAGTTTAAGTAAATTTGGAATTGGTTTGTTTGAAACTATTAGAGTTAAAAATGGAATAGCAGTAGATTTAGATATCCATATAGAAAGAATGCTAAGCTCAATAAATTGTTTGGATTTAGATATAAACTATAAAAAAGATTTCTTGATAAATGAAATTGTTACATATATAAAAAAAGAAAATGTCATTAATAAAGCACTTAGAATTACTGTTTTTGATGAAGGTTATAATATATCTATTAGGGATATTCCATATAATCAAGAGACGTATGAGAAGGGGTTTAAATTAGCTATATCTCCAATAGTTAGGGGGAATAGTTTAATTCATAGACATAAGACTACTAATTATTTTGAAAACATATATACCAAAAATATCGCAAATAAGACTGGTTATAATGATGGTATATTTTTAAATTCAGAAGGTGTAATATTAGAATGTTCTATGAGCAATATTTTCTTTATAAAAGGAGAAAGAGTGTACACTCCTAGTGATAGATTACCGATATTAAATGGAATAATAAAAAAAAGGATTATAGAGATTTGTGACGAATTACATATAGAGTTGATAGAAAATGAAATTAATATATCAGAAATTAGTAGTTTTGATTTTGTTTTTGTCACAAATAGTCTTATGGGCGCTATAAAGGTTACAGAAATTGACAAAATAAAATTTAATAAAGAAAATGTTGTTTTTGATAAAATAGTGAAGTTATTAGAATAAATTAAAATATTAACAATTTGTTGGAGACAAAAGATGATAGGTTGTATTTATGAAGTATACAATGAAGAGATAACTAAAATAATAGAAAACCAAAACACTTTGGCTGTATATTTAGTGGGTTCTAGTAAAGACGTAGATTTTACTCTTTATGATGTAGAGATAAACGATATTGATGTGTTCGTTTTTGTAAAAGAAGGGGAAAAACAAGAGAGAATACTGTTTAAAAAAAAGGGAATAGAATTTGATGTAAATTACTTTTCAAAAGATGGTGTAAAAAAATTATTATCAAATAGGGAATATTTCTTTGTGAAAGAAATGAAAGATGCTAAAGTACTGTTTGATAGGGAGAATATATCACATATTATAAAAGATATAAGTAGAAATATTTACTTAGAAGGACCTAGTAAAATGTCATTAGAGGAAAAGTCTTTTATAAAGCAAGATATTGGAGCAAAAATATCGAATTTAAAAAATAAAGAAAAATTTGATGTTTTTGAATATCATTTTTTGACGAATTTATATTTAAAAGATATAATAATTGGGTACTTTAATATAAATGATAAATGGGTACCAAAAGACAAAAAATTGCTAAAAGTTTTAAAAAAAGAAAATAATGAGCTTTTTGAACTAGTGTCAAAAGTAAGTGAAAATTATGACTATCAAAGACTTTTAGATGTTTATAATTATATTTTTAAAGAAATTGAGACAAAAGAGGTTATAAAACTAATCTTCTAGTCACAAATCAATGGGGGGAGTTTAAATGAATAAAGTTGATAAAGAAAAGATACAACATGCAGTAAGAGAAATACTAGAGGCAATTGGGGAAGACCCAGATAGAGAAGGTCTAATCGAAACTCCAAATAGAGTTGCTAGGATGTATGAAGAGATATTCTCTGGTCTTAGTGAAGAACCAAGAGACCATTTAAAAGTTCTTTTTGCAGATGAAAAACATGAAGAGTTAGTATTGGTAAAAGATATTCCATTTTATTCATGTTGTGAGCATCATCTAGTTCCTTTCTTTGGAAAAGCTCATATTGCTTATTTACCAAAAGGAGGAAGACTTACAGGGCTTTCTAAACTTGCTAGAGTAATAGATACATTGGCAAAAAGACCACAATTACAAGAAAGAATCACTAAAAATGCTGCAGATATAATAATGGAAGAATTACAACCTTATGGTGTCTTAGTAGTAGTAGAAGCTGAACATATGTGCATGACAATGAGAGGCGTAAAAAAACCAGGTTCAAAAACTGTTACATCAGCAGTGAGAGGAATATTTGAAAAGGACATTGCGTCTAGAGCCGAGGCTATGAGTTTGATTACTATGAAGTAGCAATTTATTATAGATATAATCATTTATTGAGATAAAATTTAATTTAAGGGAGTGTCATTAATTGTGTTTGATTATGGTAAAAGAACTTATATAATGGGAATATTAAATGTAACTCCAGATAGTTTTTCTGATGGAGGAGATTTTAATAACTTGGACATAGCAATACAACATGCAAAAGATATGGTTGACCAAGGTGCAGATATAATAGACCTAGGAGGAGAGTCTACACGCCCAGGTCATAGCTATGTAGACTCAGACGAAGAGCTAAGAAGAGTAATCCCTGTAATAAAAAAACTTAAACAGGAATTGGATATACCAATATCAATAGACACTTATAAGGCAGATGTTGCAGAAGAAGCATTAAAATTAGGTGTCACTATGGTAAATGATGTTTGGGGTCTTAGAAAAGATAAAAATATGGCTTCTGTAATAGGAAAATATGATGCAGAAGTGTGTATAATGCATAATCAAGATGGGACAAACTATGACAAAGATATAATGGAGTCAATAAAAGACTTTTTTAAGGTAAGTATAGAAATGGCAATGAGTTGTGGTGTAAAAAAAGAAAAAATAGTACTTGACCCAGGTGTAGGATTTGGCAAGGATTTTGAACAAAATATTGAAGTATTGAGAAGATTAAATGAATTAAAAGATTTAGGGTATCCTATTTTGCTTGGGACATCCAGAAAATCAGTAATAGGAAAAGTACTTCCAGTTGAGCCTAAAAAAAGATTAGAAGGTACAATAGCTACTACTGTTCTTGGTATAAGAGATGGCGTAGATATAGTTAGAGTACATGATGTTTATGAAAATTTAATGGCAGCTAGAATGACTGATGCAATATATAGAAAGTAGGTATAATATAATGGATAAAATATTACTTAGTAATCTAGGATTCTATGGATATCATGGTGTTCTTAAAGAAGAAAATTTTCTAGGTCAGAAATTCTTTGTCGACATGGAACTTTATATTGATTCAAGAGAAGCAGGTCTTAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN614756|1681443:1691170|1681443_1682028_+|WP_011861216.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDIVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSINHTNKGVFRGLKNPLNVTRYHSLIIDSNTVPKELEITAITDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHV >NZ_LN614756|1681443:1691170|1685538_1686300_+|WP_021363468.1|DBSCAN-SWA MGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSDEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRKDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIMESIKDFFKVSIEMAMSCGVKKEKIVLDPGVGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK >NZ_LN614756|1681443:1691170|1686668_1687175_+|WP_003438641.1|DBSCAN-SWA MNKAYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDVLFFNDVVSTDERLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEELIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >NZ_LN614756|1681443:1691170|1690003_1691170_+|WP_003429425.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >NZ_LN614756|1681443:1691170|1682029_1683379_+|WP_021359151.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVVNDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIIDNIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTPIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDAHILSNSPERFIRCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKKEDLRLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >NZ_LN614756|1681443:1691170|1687155_1687941_+|WP_003419887.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >NZ_LN614756|1681443:1691170|1686310_1686676_+|WP_011861219.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVMVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRARDE >NZ_LN614756|1681443:1691170|1688195_1689986_+|WP_009896376.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >NZ_LN614756|1681443:1691170|1684145_1684847_+|WP_009896367.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEITKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDVNYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISHIIKDISRNIYLEGPSKMSLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDVFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF >NZ_LN614756|1681443:1691170|1684872_1685445_+|WP_003429416.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK >NZ_LN614756|1681443:1691170|1683368_1684112_+|WP_003438634.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAVDLDIHIERMLSSINCLDLDINYKKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDIPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVYTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3176194 : 3185147
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN614756|3176194:3185147|DBSCAN-SWA 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CTTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTTAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAACTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCATCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTCAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAATCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTCTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTACTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAAATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTGATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTGTCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTTCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATAACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATATTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTTTTTTTAAAACTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAATACTTTACTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATCTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTGTACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCTCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACTTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAGTTATAATCTTTTTGATACTTTTCTTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTCTCATCAAATCTTGTATAGTCTTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTTATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTGTCTATGCCTACATTTCTGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAGCTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTGTCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN614756|3176194:3185147|3178191_3179283_-|WP_003431768.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLAKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLNMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >NZ_LN614756|3176194:3185147|3184307_3185147_-|WP_009897935.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL >NZ_LN614756|3176194:3185147|3179288_3180584_-|WP_011861675.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKIKDMEELGIEYYSIGR >NZ_LN614756|3176194:3185147|3176194_3178108_-|WP_009897930.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFTTNDIIISVCIYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFVATLAYLIPIYIINKLLGFDYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNPELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKDIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >NZ_LN614756|3176194:3185147|3180609_3181362_-|WP_003426498.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV >NZ_LN614756|3176194:3185147|3182339_3183089_-|WP_003422862.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYRRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >NZ_LN614756|3176194:3185147|3183117_3184293_-|WP_009891031.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRDIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK >NZ_LN614756|3176194:3185147|3181409_3182318_-|WP_004454111.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLEIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3337498 : 3386080
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN614756|3337498:3386080|DBSCAN-SWA 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75 | Clostridium_phage(84.72%) | holin,tail,terminase,capsid,plate,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3854723 : 3873562
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LN614756|3854723:3873562|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LN614756|3854723:3873562|3861946_3862435_-|WP_029677135.1|DBSCAN-SWA MRIYIANLGKYNEGELVGAWFTPPVDFEEVKERIGLNDEYEEYAIHDYELPFEIDEYTPIEEVNRLCEMVEDLPEYIQEELSELQSYFGSIEELCEHEDDIICHSGCDDMADVARYYLEESGQLGELPAHLQSYIDYAAYGRDMELEGTFVVTNHGVYEILR >NZ_LN614756|3854723:3873562|3872977_3873562_-|WP_003436212.1|DBSCAN-SWA MSLVPHVIEQTGQGERSYDIYSKLLKDRIIFIGEEINDAIASLVVAQLLFLESEDPDSDIIIYINSPGGSATSGFAIYDTMNYVRCDVSTICIGMAASMSAFLLAGGTHGKRCALPNSEIMIHQPMGGAKGQATDVKIAVDNILKIKERLDKILSENTGKSIEDIRRDTDRDNFMTALEAKEYGLIDYIMNRNE >NZ_LN614756|3854723:3873562|3861464_3861857_-|WP_005427021.1|DBSCAN-SWA MKKIRSYTSIWSVEKVLYSINDFKLPFPITFTQMAWFVVSVFAVMLLGNLPPLSFIDGAFLKYFGVPFALTWFMCQKTFDGKKPYGFLKSVLAYLVRPKLTYAGKPVKLEKEYPAQPITAVRSDIYGISD >NZ_LN614756|3854723:3873562|3865367_3866765_-|WP_011861922.1|DBSCAN-SWA 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17 | Streptococcus_phage(78.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3912190 : 3921183
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LN614756|3912190:3921183|DBSCAN-SWA ATCACTCCACCTCATTTCTCTGTACGGGCGGTCTGGTATCAAAGGCGTGTAGTAATTCTTCAAAGACTGGGTGTATCTGCACCACACCGACACGCCCGTATAAGTCCTGCAACAAACATTGTCCGTTCTCCAAATCACGCAAGCGTTTCTGGTTGTTCTCGTCGTCCTTGTCGATACCGAAAAATTCTAAGGTCTGCTTTATCTCGTTAATATCAGTAGAACGGAAAGCGAATTTCAAACCGATATTGTTTTTCAGACTTTCTTTTGACACATCATAGGCAGACTGGGTAACAAAATATACGCCTGCCTGCATAGCTCGTCCAGCACGAACCAGTTTATTAGAAAGCGTTTCACCTTGTGCCACATTTAAGAACGCCCACGCTTCGTCCAAATCGACAATCTTAAAAATGCTTCTGTCCGAATGGATAAAATCAAGGGCAAAGGTACTAATCACAATCAGCATAGACACCGACAACAATTCAATGGTCGTGTATTCCTCAAAAGTGGTATCTTTATCTGGTAATACTAAGTCCGCTACTTGAATGATATTGAGCTGGTTATCCAGACTGATAGCATTTTCCACCGTACCGTCTGAAAACAGCAGATGTGCAAAATCATAGTCCGTGAAGCTGTCGATATGGTCTGCGATATTGCGTGAGATTGCGGTATCTTCTTTTCTAAGTTCCTCTATCACATGAAGCAAGCCCCTTGTTTCACTCTGGGTAACGGAACGCACCGCCTTACGAAGTACGGGGAATTTTTCGCCGTCCCTAGAGGAAATACCCGTAAGGAATGTCAAGATGTCGATTGCCAGACTTTCAGCGTCTTTGACATTCTTCATAATCACGAATGGGTCAAGAAGTCCTGCATTGTCCTTGTCGCTGGTCAGGTTTACGATATTGATTTCATTGGCGATTTCTGGGAGCGTTTCTTTCCAGTTGCCTCTCTCGGCTTTGGGGTCTAAAATGACTGCTTGACCGCCAAACAGCACCGCATAATACACCAGAAGATTGTTGCAGAACGACTTTCCACCGCCAAGACTTCCGACAAAGGCAGAAGCTAAAGCATTGGTAACTGTCCCCTTTACGCCCTGCGAAGCTAAAGACGGTTGCAGGTACACATTTCTTCCCGTATCAACGGAATAGCCGATATAGATACCCGTAGTTTCCCCTAACTGCTGTGTCGCTCCAAAGCCAAGCCCAGCCAAGAAGTCTGATTTTACATACTGCACATAATCATTGATATATCGCCTGCTGGCAGGAAGAAATTCAGAGTGAAGCCCCAGCATATCCCCAGCAGGACGTACCAGCTTTACATTGAGGTCGTCGTAAAAGTCCTTTACTTCATCACAACGGCGTTTTAATTCGTCCAAATCATCAGCACAGACACGGATAACATAAGAGAGCTTATACATACTTTCTTTTGTCTGGTCTAAATCGGTTTCCAGCTCGTCCACGCTGTCTAATGCGTCCACCACATTTGAGCTGGTTTCACTTCCAGCTTGATAGGCGTGATTATCCAAATCTTTCAATTCCTTTTTCTTGTTGCGGACTGTCGTTAATGCTTTTCGGTTTTCCACGATTTCTACATTCATGCTCGTATCAACGGGAAAGGTAAATTGCTGTTGCTGGAAGTAGAATATTTCACTTGACGGAAAATCAAGCTCCCCAACAATCGCATTGACGGTAAAGTAAGACACATAGCTTTCCTTGTCCTCATGTTCCAAGCGTAAATACCGCTGGCTTTCCTCAATCACACATCTTGTCGGACGGATAAGGTCGTAATATTTTATCAGCGTTTCTTTCTTGTATTTCTTTTTTGGTAACTGGTACTCATAATCTTCATAAGCGACACCGTCCCTGCCGTAAAGATGTTCCATGAGATACCCAAAATCATTGATTTCCAAGCGACGCACCTTAAAGCGACGGGAGATTTTATTTTCCAGTAACTTTTCCATTTTCATGTAACGGTTAATTTCATCATTCGGCATGGAAACAAAGTCGTTCATCAACGTGTGGTTCACTTCATGGAGAAATTCCTTGAACGTCAGCCACGCCGATTTTTTGATGTTCTTCAGATTGAGCTGTTCTTCCGTAACCATGAGCTTAAAGCCAAGAAAAAAGCGGTAGTCCACTTGATTGTCCCCAATCATAGATACTAACGCTTCGGTCTGTTCGTCTATCTTCTGGACTGCCACCTCACGAAGTTTCCCCGTAACCAGCTTCTTTGACTGTTCCTGCATACTTCTAATTGAGCTTTCCGTCGCAATCTGCAACGCATGAATTTTACCCTCACGGGACTGTGCGATAAGCTGTCGGAAACTGTCATGCACGATAAATTTCTGCTCTGTGGATAAGAAAGAATAGTTGTACGGTATCAGCTCATAGTAAGCGAACACCTCATTGTCCTTGTTCCAGACAAGGTTGTTGTCAATATATTTTATCGGGAACATAGTTCACACTCCTTACTGCCGTGATTGTTTCATTCAAGGTTTGCTTATGCAGTTTTACGGCTTTTCCTGCATAAGTGATTTTTGGTCGCAGGGCATAGGTTATCTGTGATTTCAAAAAGCTGTACGGCTTCTTTCCGTCAAAGGTTTTCTGCGACATAAACCAAGTGAGAGCAACGGGAATACCAAAGTATTTGAGAAATGCTCCCTCAATCATGGAAAGTGGGGGCATATCCCCAAACAGAATGATGATAAATTCCGTAATCACAAACCATGTAATCTGTGTAAAGGTAACGGGAAAGGGCAAGTTAAAGTCATTGATTGCATACAAGACTTTTTCCACGTTCCAGATACCCGTGTAGCTTTTAATCTTTTTCAAGTTCTTTCAGCTCCTTTCGTAAGTTTCTAAATGGAAAAGGACAGCCATGTTTCAGACTGTCCCGTAAAGAGAAATACGCTGTCAGTAGCAACAATCCTTGTCGCTGATCTTCCAGCGTTAATATGGTATCTCGCACATACCTCGGCTTGTTTCAATGAAGCAACCACCCATATCCAAATCTCGCCCGTAGGCTTCATAGTCAATGTAATTTTGTAAGCTGGGTGGAATATCCCCCAGTACCTGCAATTCGTCTATGTAGTAATAGGCAACATCTGTCATGCTTTCACAGTCGGGATAATAATAAATATCGTCCTTGTGTTCCATGACTTCTTCCAGCGTCCCATAGTGGCTGATAAATTCGTCCAGACACTCTACAATATAGTCGGGAAGTTCCTCTATCATTTCATACATCTCATTGAGTTCTTCAATGGAAATATACTCGCCAATCGCAATGGGGAAGTTGTCGGTATCATGGATTGCGTATTCCTCATACTGTTCATTCAAGCCGATTTTTTCTTTTGCATCTTCCTCGTCAATGGGAAATGTGAACCAAGCACCGACTAAATAGCCCTCATTGTATTTGCCGAGATTAGCAATATAAACCGCCATATCATCAATCATAAGCACCACCTCATTTCTTACTCTGGCAGTTCAAAGATACCGTGTTCTGTTACTAAAAACTTCCCGTGTTCCTGCAAGTGCAAAGCGTAGGCTTCAAAGTCAAAATAGTATTCTTGACAGTCCTCGGATAAATGCTTGAATGTCGGGTCATTCATCAGCTTTTGCCTTGCAACATCAATCATGCTTTTGCAGTCGGGATAAACCGTAATCACGTTCCTGCAAATATAAAGTGCTTCTAAATTTTCATACACGGAAAGAAGCGTTGTATATTCTTCCTGCATATCGCTTGAAAGCTGGTGGTACATAAAATCTAATTCGTTGAGCTGGTACACGCTGGTATGTTCATGGACTTCATCAGCAAAGGGCAGTACCTTTTCGATAATGCGGTACTCTTGACTTTCTGCACCAATACCTAATTTTTCTTCAAACTCGGCAACATCTATCGGCAGGTCGAACCAGTATGATGTTGTTTCTTCGCCAGTTGTTCCTCTCGTTTCCACCAGCACCCTTGTTTCCTGCATTGTTCTTCACGTCCTTTCTGTTGTTTCATCACATCTTTTAAGGTCTGGTATGACATACCAAACACATATTTAGAAAAATCTTCTAACTGTTTTTCTTCATAATTGGCAAGGTTCAGCCGTTTCATTTCATGCCACACCTTACGCTTGTAAGAGGGCAGGTCGGAAATATAATCACAACCGACTTTTACCTGCATATCCTTAAAAATATCGTTCATTTCATCACTCCAATCTGATTTTAGGTAAGAAAAAAGCAGTCAATCCTAAGACTAACTGCTTTATGTGTAAGTATGAATTTGTTTAAGTGTAACTGATTTGCCATGTGTACTCGTAAAGTTTACTGTATGTTTGACTTTTAAATAAATATATACAATCAATCATTTGTAACTTGCCGTCTTTTTCAAATTTACTTATTATCAGATTATCTTCATAGATATATGCTAAGAAAGTATCATACTCTGCATAGTATTTTTCTCTAAAAAGATTTGACTCTCTAAAATCTTTTTCTAAAGCAATTCTTATACTATCTAAAGCATATTTAAAGTTATAACGAGTATTAAAACTAAACTTGTATGGAAAAAAGAAAAATAAGTTTTTCTTGAAAGTAAGCAATTTCACATAGGTTTGTACATCAAATTCAATCGTTCCATACTCATATTTCTCTGTAAGACAAGAATGTAAACTTTCACAATCATAATCCCGCAACGAAGCAAATAACCTAGTTACAGTCATTTGTGTATTTGGTCTTCTCGGTGGACACTTACCAATTACACCATCACAGAATTTCTGTATTTGACCAGTAAGTTCTTTTGAAGCATGAAGTCTTGTTGTGCTTTCAAGTAATTTAAAGTCCATTTGATAATTAGGTGAGTTACAATCACATTCTCCATGATTTTCAGATTTAGGTGGTACATATTCTGCAAAATTTGATTTTTCTCTAAAATAGATTGATTTATTAACTAATTCCAACAAGTATTTTTCATAATTACAATTTTCTTCATCTTTAATAAAATTTTTGTTTATGAATACTGCATGTAAAATATCCACTCTCATTTCATCTGAAATCATAAGCACTTTTATTCCTTTCAAAAAATAATTTATCGTACCCACATTATAACATTCTCATATTACAGCAACAATAAAATTCGTTATGCTCCAATAATCTTATTGAACAGCTCTAACAGTACATCTTTCACACCGCCAGCATTGAATACCAATCCGACAGCAATCAAGGCAACTACCAAGAAGCCGATAAGTTTTGAAAACTCACGCTTGAACCCTAAGTAGATACCAATAACCACAATCGCCATAAGCACTAAGCTCTGTGCGTTGCTTAAAAACCAAGTGTAAAGATTTTGTCCGAAATTCATTTAATTGTCCTCGCTTTCTTTTAATTGTTTCATTTCATAGTCAGCTTCTTTGCCGACACTCATAATACACATCAAGACTACGCCGATCCCATTCCCAGAGATACCAGCAGGAAGTCTTTTACTAATTCCCACATTTTTTATAACTCCTAACTTTTTACTAAATCTTTTGCAGGGGTCGTCTGCTGTTTGATTATCATTTCATGCTTTTCTGTGAGCTTTGCCTGCTGTTCGATTGTTTCCATGTAGTCTGTACCGTTTCCTTTATCAATCTTTTTCAGCATTTTCAAGGTCGGTGCTACCTGCCTTTGTACCCAACGCAATGTACGGTCTAAGGTATAAGGCTCTGGCTTTGTCGTCAGTTTCAGACTTTGCCGATTATCTCCAATAAACCACGCCCAGCGGTCATTGAGTTTCCAGTCATTTTTTCGTTTGTCGGGTTCTTCATCAACAAACCGCACATACTGGTTGATGACAGAAAAGGCGGTCTGCTCTGCGTCATAATAGGTCAGCAAATCCCGTACTGCATAATAGGCACGTTCATTCCGAAGCCGTATCTCAAAACGATTGATAATGTCCGCTTCTTCCAGCGGTATCCCTAACTTGACATACTGCTCATAGTCCTTTTCATAGATACAGAAATACACATCAGATTTCAGCGAACCAAGATAAAGGGTACGTCCCATATATTCGTCCTCTCTGTGCTTGATAAGCTCGCCCGACTGGTAAAACTTATAACTTCTAGACTTTCCGATATATTCCCGTTTCCTGCATTTTTCCGCAAGCTCTGGAATATCCAAAATGCCCGTATGGTCGTTGATAGCAAGGTCGATACGCTTCATCACGCCACCGTCTACGAGTGCGTCCATGAGGAAGTCATACCAGCTTCTTTGTTGTGCCAGCAGGTAACTTTCAAACTGTCGGCAACCACGCCCCTTTAACTCTAAAAGGACACCTTTTTCTTCATCAGCCGAAGTATAAATAAAGATGTCCCCTAAAGAGTAATGCTCCGTATAACTGTAATGTCCGTAATCTTCATGGAGCATATAATTGATATTCAGTTTTAATATATCTTTGATGATATGCTGTATATCCAGCGTGGGAAAACGAATTTTCACATAATCAAACAGCATGGTAAGCGGTGTTTCTGGATTGAACCTTGCCAGTTCCTTATGCAGAGTATGAAGAAGTTCCTTTGACGGCTTCATTTTTCCGCTTTCTATCTTGTTGAGATATTCCCTTGTGATACCAGAAGCCACCGCCAGCCTGCCTTGTGAGATACCGTAAGCAATCCGTTTTTCCCGTAATTCTTTTATCCATTGTTCTTCATTCAGAACCATACCTCCAATCTGTAATGTGTGAAGTTTTTTAAGGCGACTTCACAACTGAATTTTGCTAGGAAACCATGCGATAAGCCCTATGTTTCCTATGTTTTTCGTCTATTGTCTATTTGTAAACGTACCCCTCTGTTAGATACCGAGGGGTTTTACCTGCTGGCGTGGCTTACGCCACACCAGCAACGGCTAGTCCGTGCCGTCGCCTTTCGCTTCGCACGTTGCCGTCCCGTCCTGCCTTGCTTGTGCAAGAGAACCGATTGTCTGCAAAAAATCATGTCCTTTCGGGACTAAAGGCGTGTAAAATTCACTTATGACGCTTGTTCCCACATCACAATATCCACGCCCTTTGATACGCTTCTGGAAAAACTGCTTTTTCACATCTGAACCAAACAGCATACCATATCCTAACTCGCTGATACGCCCCAATCCCACACGGAAATTGAAGTTATCTCTGATACCGTCCGAGAAATATTTTGCGTCTGGTCGCTGGCAGGCAACGATAAGGAAATAACCTGCTTGTCGTCCTAACATGACGATTTTCTTTAACTGGCTAAGTAAGCCCACACTTTCTTTTGTCCCCAGCATTTCAAAAAACGCCACATATTCATCAAAGATAAGAAAGCAGGGGGGCAGTCCCAGATAGGCGTAGTTTTCGCCCGTCTTATAGTCTGGGTATCGCTTCATTTCCTCGCTTCGCTGTACCATTCCCTCATAAAAGGAATTGACGCAGTCTATCATTTCTTCTTTGGTGTGATACACATTTCCCATGACTGTCCCCAAGTCCGCAAGGTCAGCGTTCTTCGGGTCTAAGATGTAAAGGACAGCGTTGGTGTGCAGTAGGGCTTCAATGAGCGTCAGCAGAAAGTAAGTCTTACCGCCACCAGTCCCACCAGCGATAAGGGCGTGAGGGAGTGCGTCATATTCCCAGACAAGATTTTTCATCAGCCTAAGACAGCCGTTTTCTGCCCGTACTTCATCAATGGTAATACGGTTTGCTATCATGTCATAAAGCAGGGTATATTCAATATAGCCGTCATGTAAGGTCTTGTCGGTCAGCTCACAATACAAACCACTTTCCAGTTTATCCTCTAACCGTAAGAGCTGGTCTTGATATTTCCCCAGCGTGATTTCACAGCGGATATGAAGCAAGCCTTTTTCCATTTGATAATAAATCTTTGGAAACCAGACGATTTTTTCCCTTGATCTGCTTTGCAGGTCAGTAAAAAAACCGTCGTCTTGTATGGTATCAGCTTCATACCACTTATTTTCCAGTATCATTCTTGCCAGCTTTTGACGGTGCAGGAGCTTCTTGAAACTGTCGTAACATAAACGGTAATACAGAAAAGCGACTAATGCACAAACACCAGTCGCTATCAGTACGGTTATGAAGTTGTAAGGGGAAAGCGTCAAGCCGTTTTCTAACAAGCTGAAATGCTCCCAATCGGTACGCATGAGCTGTTTTGTATTTAATAGCAGTATAACCGCCACGAACACAAACAGAAGCGTCCTTATGGAAAAGTGATAGACAAGGTGCTTATCGCTGGCTCTGATACGCTTTCCCTTATATTTTAATCGTTCCATGCTTGCTCCTTATTGCTTATTTTTTCGGCTGTCCCTGCGGTGCATGGTTCTGTGGATTGCCTGCGTTCTGATTGCCTTTATTCTTCAACACAATATCCTCTGCCTTTACATACCAGTCCACCTCTGCACCCGTATAAGTCTTTCTTGATACGGTATCGGCTACTGGATTGACAAGCTCCACAACTGCATTGTACGGAAATTCTCTTAACGGTACTTCTGGCGGTACAGACACGGGGATAATTCCCCCATGCAGACTGCACTTCAAATCATAGATACGCTTTTTAAGCTGGGTACTCGGTGTCCCGTCCTCATTCTGCAAGAACACATCACGCACCGCTGTAAATTTTAATTCTCCAAATGTTTTCTCTTTGTCAATAACAAAACCGTTTGATAATCTCATAATTTCTTCACTCCTTTACTTTTCTTCAACAGCTACAATATCATCAGCAAACAACACATAATCAGTATGTCCCATATCCCCGATTGCGTAACCCCTGCCGTGTAACTTCGGATTGACAAGTTTTACTTTCTGTTCATACTTGAAATGTTTTTCGCCAGCCTGCACGGGAATTTCCACCACCACATTTTCGCCTTTCTGTACGTCAGAATAAAGGTTATAGCTTCGTTTGGCTACGACCTTGCGGTTATTTTTATCCCTTTCAAAGATAGGCTCGCTTTCTCCTGCAAATTCAAGAGTTCCAAAAGACTGTGCCATATCTGGCACGACATATTTCATTTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LN614756|3912190:3921183|3912190_3914641_-|WP_011861947.1|DBSCAN-SWA MFPIKYIDNNLVWNKDNEVFAYYELIPYNYSFLSTEQKFIVHDSFRQLIAQSREGKIHALQIATESSIRSMQEQSKKLVTGKLREVAVQKIDEQTEALVSMIGDNQVDYRFFLGFKLMVTEEQLNLKNIKKSAWLTFKEFLHEVNHTLMNDFVSMPNDEINRYMKMEKLLENKISRRFKVRRLEINDFGYLMEHLYGRDGVAYEDYEYQLPKKKYKKETLIKYYDLIRPTRCVIEESQRYLRLEHEDKESYVSYFTVNAIVGELDFPSSEIFYFQQQQFTFPVDTSMNVEIVENRKALTTVRNKKKELKDLDNHAYQAGSETSSNVVDALDSVDELETDLDQTKESMYKLSYVIRVCADDLDELKRRCDEVKDFYDDLNVKLVRPAGDMLGLHSEFLPASRRYINDYVQYVKSDFLAGLGFGATQQLGETTGIYIGYSVDTGRNVYLQPSLASQGVKGTVTNALASAFVGSLGGGKSFCNNLLVYYAVLFGGQAVILDPKAERGNWKETLPEIANEINIVNLTSDKDNAGLLDPFVIMKNVKDAESLAIDILTFLTGISSRDGEKFPVLRKAVRSVTQSETRGLLHVIEELRKEDTAISRNIADHIDSFTDYDFAHLLFSDGTVENAISLDNQLNIIQVADLVLPDKDTTFEEYTTIELLSVSMLIVISTFALDFIHSDRSIFKIVDLDEAWAFLNVAQGETLSNKLVRAGRAMQAGVYFVTQSAYDVSKESLKNNIGLKFAFRSTDINEIKQTLEFFGIDKDDENNQKRLRDLENGQCLLQDLYGRVGVVQIHPVFEELLHAFDTRPPVQRNEVE >NZ_LN614756|3912190:3921183|3915655_3916159_-|WP_011861950.1|DBSCAN-SWA MQETRVLVETRGTTGEETTSYWFDLPIDVAEFEEKLGIGAESQEYRIIEKVLPFADEVHEHTSVYQLNELDFMYHQLSSDMQEEYTTLLSVYENLEALYICRNVITVYPDCKSMIDVARQKLMNDPTFKHLSEDCQEYYFDFEAYALHLQEHGKFLVTEHGIFELPE >NZ_LN614756|3912190:3921183|3914618_3915017_-|WP_011861948.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTGIWNVEKVLYAINDFNLPFPVTFTQITWFVITEFIIILFGDMPPLSMIEGAFLKYFGIPVALTWFMSQKTFDGKKPYSFLKSQITYALRPKITYAGKAVKLHKQTLNETITAVRSVNYVPDKIY >NZ_LN614756|3912190:3921183|3917304_3917526_-|WP_009265886.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYTWFLSNAQSLVLMAIVVIGIYLGFKREFSKLIGFLVVALIAVGLVFNAGGVKDVLLELFNKIIGA >NZ_LN614756|3912190:3921183|3920457_3920841_-|WP_011861955.1|DBSCAN-SWA MRLSNGFVIDKEKTFGELKFTAVRDVFLQNEDGTPSTQLKKRIYDLKCSLHGGIIPVSVPPEVPLREFPYNAVVELVNPVADTVSRKTYTGAEVDWYVKAEDIVLKNKGNQNAGNPQNHAPQGQPKK >NZ_LN614756|3912190:3921183|3915134_3915638_-|WP_011861949.1|DBSCAN-SWA MIDDMAVYIANLGKYNEGYLVGAWFTFPIDEEDAKEKIGLNEQYEEYAIHDTDNFPIAIGEYISIEELNEMYEMIEELPDYIVECLDEFISHYGTLEEVMEHKDDIYYYPDCESMTDVAYYYIDELQVLGDIPPSLQNYIDYEAYGRDLDMGGCFIETSRGMCEIPY >NZ_LN614756|3912190:3921183|3916077_3916374_-|WP_011861951.1|DBSCAN-SWA MNDIFKDMQVKVGCDYISDLPSYKRKVWHEMKRLNLANYEEKQLEDFSKYVFGMSYQTLKDVMKQQKGREEQCRKQGCWWKREEQLAKKQHHTGSTCR >NZ_LN614756|3912190:3921183|3916456_3917245_-|WP_161807965.1|DBSCAN-SWA MKGIKVLMISDEMRVDILHAVFINKNFIKDEENCNYEKYLLELVNKSIYFREKSNFAEYVPPKSENHGECDCNSPNYQMDFKLLESTTRLHASKELTGQIQKFCDGVIGKCPPRRPNTQMTVTRLFASLRDYDCESLHSCLTEKYEYGTIEFDVQTYVKLLTFKKNLFFFFPYKFSFNTRYNFKYALDSIRIALEKDFRESNLFREKYYAEYDTFLAYIYEDNLIISKFEKDGKLQMIDCIYLFKSQTYSKLYEYTWQISYT >NZ_LN614756|3912190:3921183|3917672_3918863_-|WP_011861953.1|DBSCAN-SWA MVLNEEQWIKELREKRIAYGISQGRLAVASGITREYLNKIESGKMKPSKELLHTLHKELARFNPETPLTMLFDYVKIRFPTLDIQHIIKDILKLNINYMLHEDYGHYSYTEHYSLGDIFIYTSADEEKGVLLELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYDFLMDALVDGGVMKRIDLAINDHTGILDIPELAEKCRKREYIGKSRSYKFYQSGELIKHREDEYMGRTLYLGSLKSDVYFCIYEKDYEQYVKLGIPLEEADIINRFEIRLRNERAYYAVRDLLTYYDAEQTAFSVINQYVRFVDEEPDKRKNDWKLNDRWAWFIGDNRQSLKLTTKPEPYTLDRTLRWVQRQVAPTLKMLKKIDKGNGTDYMETIEQQAKLTEKHEMIIKQQTTPAKDLVKS >NZ_LN614756|3912190:3921183|3920856_3921183_-|WP_011861956.1|DBSCAN-SWA MEMKYVVPDMAQSFGTLEFAGESEPIFERDKNNRKVVAKRSYNLYSDVQKGENVVVEIPVQAGEKHFKYEQKVKLVNPKLHGRGYAIGDMGHTDYVLFADDIVAVEEK >NZ_LN614756|3912190:3921183|3919046_3920441_-|WP_011861954.1|DBSCAN-SWA MERLKYKGKRIRASDKHLVYHFSIRTLLFVFVAVILLLNTKQLMRTDWEHFSLLENGLTLSPYNFITVLIATGVCALVAFLYYRLCYDSFKKLLHRQKLARMILENKWYEADTIQDDGFFTDLQSRSREKIVWFPKIYYQMEKGLLHIRCEITLGKYQDQLLRLEDKLESGLYCELTDKTLHDGYIEYTLLYDMIANRITIDEVRAENGCLRLMKNLVWEYDALPHALIAGGTGGGKTYFLLTLIEALLHTNAVLYILDPKNADLADLGTVMGNVYHTKEEMIDCVNSFYEGMVQRSEEMKRYPDYKTGENYAYLGLPPCFLIFDEYVAFFEMLGTKESVGLLSQLKKIVMLGRQAGYFLIVACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVGLGRISELGYGMLFGSDVKKQFFQKRIKGRGYCDVGTSVISEFYTPLVPKGHDFLQTIGSLAQARQDGTATCEAKGDGTD |
11 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN614756.1|WP_011860989.1|1100682_1100883_+|hypothetical-protein |
1100682_1100883_+
Protein sequences of NZ_LN614756.1|WP_011860989.1|1100682_1100883_+|hypothetical-protein>NZ_LN614756.1|WP_011860989.1|1100682_1100883_+|hypothetical-protein MNKEKMAEFYSSKWRINLLIDTQKDLAYSLADVKGNYPAYLRKEYENLEDAFNKVIAGEGKLLSEL |
66 aa aa | NA | NA | NA | 1093453-1148967 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 8.2|1761671|36|NZ_LN614756|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LN614756 position: 1108944-1108979, mismatch: 0 atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt CRISPR spacer atgttcacattgacagctcaagataaacatggaatt Protospacer ************************************ |